View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF2138_high_30 (Length: 290)

Name: NF2138_high_30
Description: NF2138
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF2138_high_30
NF2138_high_30
[»] chr6 (128 HSPs)
chr6 (19-277)||(13913060-13913317)
chr6 (26-277)||(11147177-11147428)
chr6 (26-277)||(12827710-12827961)
chr6 (26-277)||(20029832-20030082)
chr6 (26-277)||(25787719-25787969)
chr6 (19-277)||(29765546-29765803)
chr6 (26-277)||(7375686-7375936)
chr6 (26-277)||(20062583-20062833)
chr6 (19-277)||(8653671-8653928)
chr6 (19-277)||(18925690-18925948)
chr6 (19-277)||(18826166-18826423)
chr6 (19-277)||(27166371-27166628)
chr6 (26-277)||(25986099-25986350)
chr6 (19-277)||(18834562-18834819)
chr6 (20-277)||(17042633-17042890)
chr6 (19-250)||(5845095-5845325)
chr6 (26-277)||(26044231-26044481)
chr6 (19-277)||(16123464-16123722)
chr6 (20-277)||(17064206-17064463)
chr6 (23-277)||(4292741-4292994)
chr6 (39-277)||(28251493-28251730)
chr6 (39-277)||(28356640-28356877)
chr6 (19-273)||(31572425-31572678)
chr6 (19-250)||(17745737-17745967)
chr6 (26-277)||(9123059-9123311)
chr6 (26-277)||(27505959-27506212)
chr6 (26-277)||(9112422-9112674)
chr6 (19-277)||(9933599-9933856)
chr6 (19-277)||(22308801-22309058)
chr6 (26-277)||(31542825-31543077)
chr6 (26-277)||(27372849-27373102)
chr6 (26-277)||(27463199-27463452)
chr6 (20-277)||(7751163-7751420)
chr6 (19-273)||(17741635-17741887)
chr6 (26-277)||(12855038-12855290)
chr6 (26-277)||(12865564-12865816)
chr6 (19-277)||(25735486-25735742)
chr6 (26-277)||(17984637-17984889)
chr6 (26-277)||(32961856-32962108)
chr6 (26-277)||(32972475-32972727)
chr6 (26-277)||(33199345-33199597)
chr6 (26-277)||(34807087-34807339)
chr6 (26-277)||(34817719-34817971)
chr6 (19-277)||(25686677-25686933)
chr6 (19-277)||(25518701-25518956)
chr6 (26-277)||(3661400-3661651)
chr6 (26-277)||(3672064-3672315)
chr6 (26-277)||(17982428-17982680)
chr6 (26-277)||(26025476-26025728)
chr6 (26-277)||(26036050-26036302)
chr6 (26-277)||(26864805-26865057)
chr6 (26-277)||(26875429-26875681)
chr6 (26-273)||(31982557-31982805)
chr6 (26-277)||(16930468-16930719)
chr6 (26-273)||(27341711-27341959)
chr6 (26-273)||(27402451-27402699)
chr6 (26-273)||(27413110-27413358)
chr6 (26-277)||(29384769-29385020)
chr6 (26-277)||(4630890-4631142)
chr6 (26-277)||(16959639-16959890)
chr6 (26-277)||(32300970-32301222)
chr6 (26-277)||(32311659-32311911)
chr6 (43-277)||(25675196-25675429)
chr6 (19-277)||(25679249-25679505)
chr6 (26-277)||(12716761-12717014)
chr6 (26-277)||(12727410-12727663)
chr6 (19-264)||(19289322-19289565)
chr6 (26-277)||(27384450-27384701)
chr6 (26-277)||(27474863-27475114)
chr6 (26-277)||(27504362-27504613)
chr6 (119-277)||(6158317-6158475)
chr6 (19-209)||(12953126-12953315)
chr6 (103-277)||(25722886-25723059)
chr6 (19-251)||(31931434-31931664)
chr6 (20-209)||(18498632-18498820)
chr6 (27-209)||(11205965-11206146)
chr6 (30-252)||(11235521-11235741)
chr6 (19-209)||(18555281-18555470)
chr6 (162-277)||(13928341-13928456)
chr6 (52-252)||(7586210-7586408)
chr6 (30-252)||(21128103-21128323)
chr6 (30-209)||(17608401-17608579)
chr6 (30-209)||(20635595-20635775)
chr6 (27-252)||(17047573-17047795)
chr6 (30-209)||(22386678-22386858)
chr6 (30-189)||(14051495-14051654)
chr6 (26-117)||(26022881-26022972)
chr6 (88-193)||(29917951-29918056)
chr6 (88-193)||(9717777-9717882)
chr6 (30-189)||(14070176-14070335)
chr6 (232-283)||(5845324-5845375)
chr6 (88-193)||(15954637-15954742)
chr6 (88-193)||(32544199-32544304)
chr6 (122-193)||(16877180-16877252)
chr6 (122-193)||(22076517-22076589)
chr6 (122-193)||(22802108-22802180)
chr6 (122-193)||(14100550-14100620)
chr6 (88-193)||(21235058-21235164)
chr6 (88-193)||(20488028-20488133)
chr6 (88-193)||(20730814-20730919)
chr6 (121-193)||(12423227-12423300)
chr6 (122-193)||(13435499-13435571)
chr6 (122-189)||(15531738-15531806)
chr6 (122-193)||(16336094-16336166)
chr6 (122-193)||(17381488-17381560)
chr6 (122-193)||(18435523-18435595)
chr6 (162-198)||(19625816-19625852)
chr6 (107-193)||(19623932-19624018)
chr6 (88-193)||(16265260-16265365)
chr6 (88-193)||(19086092-19086197)
chr6 (139-193)||(21625086-21625140)
chr6 (140-193)||(19066128-19066181)
chr6 (141-193)||(12348980-12349032)
chr6 (237-277)||(16123143-16123183)
chr6 (122-193)||(17316635-17316707)
chr6 (122-193)||(33352036-33352108)
chr6 (162-193)||(21618252-21618283)
chr6 (88-193)||(15302134-15302239)
chr6 (120-193)||(19482717-19482791)
chr6 (139-193)||(26589584-26589638)
chr6 (139-193)||(26972336-26972390)
chr6 (243-277)||(32761860-32761894)
chr6 (125-193)||(24116798-24116867)
chr6 (156-193)||(26943578-26943615)
chr6 (166-198)||(18172139-18172171)
chr6 (166-198)||(19875844-19875876)
chr6 (122-193)||(23284531-23284603)
chr6 (162-198)||(25592625-25592661)
[»] chr2 (108 HSPs)
chr2 (19-277)||(26867107-26867364)
chr2 (19-277)||(18768842-18769099)
chr2 (19-277)||(27978318-27978575)
chr2 (19-277)||(28064847-28065104)
chr2 (19-277)||(26879696-26879953)
chr2 (19-277)||(38586022-38586280)
chr2 (19-277)||(24414958-24415215)
chr2 (26-277)||(21172402-21172652)
chr2 (26-277)||(28721252-28721502)
chr2 (26-277)||(28731840-28732088)
chr2 (26-277)||(2561532-2561782)
chr2 (19-276)||(967440-967695)
chr2 (19-276)||(24275062-24275317)
chr2 (19-276)||(17969146-17969401)
chr2 (26-277)||(29244263-29244515)
chr2 (26-277)||(29254842-29255094)
chr2 (26-277)||(7005742-7005994)
chr2 (26-277)||(43082688-43082941)
chr2 (26-277)||(43093297-43093550)
chr2 (26-277)||(17857372-17857624)
chr2 (19-277)||(22774395-22774652)
chr2 (20-277)||(36784740-36784989)
chr2 (26-277)||(9897509-9897761)
chr2 (26-277)||(9908097-9908349)
chr2 (26-277)||(24327669-24327921)
chr2 (26-277)||(36251779-36252031)
chr2 (26-277)||(11388744-11388996)
chr2 (26-277)||(24338339-24338591)
chr2 (26-277)||(40222374-40222626)
chr2 (26-277)||(40251235-40251487)
chr2 (26-277)||(1099130-1099382)
chr2 (26-277)||(4099825-4100077)
chr2 (26-277)||(4220524-4220776)
chr2 (26-277)||(9773241-9773493)
chr2 (26-277)||(10267035-10267287)
chr2 (26-277)||(10277612-10277864)
chr2 (26-277)||(18392572-18392824)
chr2 (26-277)||(22914799-22915051)
chr2 (26-277)||(32217915-32218167)
chr2 (26-277)||(34790152-34790404)
chr2 (26-277)||(34804295-34804547)
chr2 (26-277)||(39170030-39170282)
chr2 (19-264)||(19497940-19498183)
chr2 (26-277)||(4209932-4210184)
chr2 (26-277)||(9762705-9762957)
chr2 (26-277)||(11395107-11395359)
chr2 (26-277)||(11405423-11405675)
chr2 (26-277)||(21650467-21650718)
chr2 (26-277)||(22960267-22960519)
chr2 (26-277)||(34477970-34478221)
chr2 (26-277)||(43355064-43355315)
chr2 (26-277)||(27221422-27221675)
chr2 (19-277)||(22763691-22763948)
chr2 (26-277)||(30488758-30489011)
chr2 (26-277)||(35253023-35253276)
chr2 (26-277)||(35263632-35263885)
chr2 (26-277)||(35274257-35274510)
chr2 (26-277)||(43345449-43345700)
chr2 (26-236)||(16768984-16769195)
chr2 (19-264)||(19299959-19300202)
chr2 (19-264)||(19312966-19313209)
chr2 (132-277)||(28374450-28374595)
chr2 (88-277)||(22779842-22780030)
chr2 (134-277)||(24425487-24425629)
chr2 (27-264)||(20646557-20646791)
chr2 (19-209)||(19356356-19356545)
chr2 (19-129)||(24427670-24427780)
chr2 (30-206)||(1083884-1084061)
chr2 (30-209)||(24814633-24814813)
chr2 (88-209)||(22755395-22755516)
chr2 (88-193)||(28711765-28711870)
chr2 (88-193)||(31800954-31801059)
chr2 (122-193)||(28550985-28551057)
chr2 (122-193)||(33074187-33074259)
chr2 (88-193)||(6574191-6574297)
chr2 (122-193)||(1587100-1587171)
chr2 (164-252)||(21025488-21025575)
chr2 (122-193)||(22776355-22776427)
chr2 (122-193)||(22781733-22781805)
chr2 (30-193)||(23392735-23392898)
chr2 (122-193)||(31328033-31328104)
chr2 (122-193)||(31334754-31334825)
chr2 (122-193)||(31968110-31968182)
chr2 (139-193)||(22802440-22802493)
chr2 (139-193)||(28701296-28701350)
chr2 (162-198)||(20568137-20568173)
chr2 (122-193)||(22188169-22188241)
chr2 (122-193)||(24377062-24377134)
chr2 (122-193)||(24575996-24576068)
chr2 (122-193)||(30557388-30557459)
chr2 (122-193)||(40332048-40332120)
chr2 (122-193)||(44840395-44840467)
chr2 (88-186)||(6392562-6392659)
chr2 (88-174)||(20152112-20152198)
chr2 (88-193)||(22317521-22317626)
chr2 (122-190)||(10009820-10009889)
chr2 (122-190)||(22258162-22258231)
chr2 (122-193)||(38781359-38781432)
chr2 (122-193)||(13964045-13964117)
chr2 (122-193)||(14581476-14581548)
chr2 (122-193)||(19540377-19540449)
chr2 (166-198)||(24440794-24440826)
chr2 (122-193)||(25037326-25037398)
chr2 (122-193)||(25041433-25041505)
chr2 (122-193)||(30666950-30667022)
chr2 (122-193)||(34322003-34322075)
chr2 (122-193)||(39037709-39037781)
chr2 (162-190)||(41121789-41121817)
[»] chr8 (99 HSPs)
chr8 (19-277)||(18153808-18154064)
chr8 (19-277)||(18158327-18158584)
chr8 (19-277)||(18769088-18769346)
chr8 (19-277)||(16747073-16747330)
chr8 (26-277)||(19225013-19225263)
chr8 (26-277)||(19418431-19418681)
chr8 (26-277)||(23457255-23457505)
chr8 (26-277)||(23469411-23469662)
chr8 (26-277)||(19429006-19429258)
chr8 (26-277)||(30314647-30314897)
chr8 (26-277)||(20161180-20161430)
chr8 (26-277)||(20196037-20196287)
chr8 (19-277)||(40213120-40213378)
chr8 (19-276)||(3843595-3843850)
chr8 (29-277)||(31215097-31215344)
chr8 (26-277)||(6318467-6318718)
chr8 (26-253)||(30325227-30325453)
chr8 (47-277)||(1750193-1750423)
chr8 (26-277)||(3220710-3220962)
chr8 (26-277)||(19139358-19139610)
chr8 (26-277)||(19128826-19129078)
chr8 (26-277)||(15780660-15780912)
chr8 (26-277)||(26120988-26121240)
chr8 (19-276)||(20259570-20259825)
chr8 (19-276)||(21046200-21046455)
chr8 (26-277)||(15791249-15791501)
chr8 (26-277)||(18449448-18449700)
chr8 (26-277)||(6151148-6151400)
chr8 (26-277)||(9856422-9856674)
chr8 (26-277)||(26111310-26111562)
chr8 (26-277)||(36292997-36293249)
chr8 (26-277)||(36303600-36303852)
chr8 (36-277)||(6576470-6576712)
chr8 (26-277)||(210104-210355)
chr8 (26-277)||(252487-252738)
chr8 (26-277)||(723727-723978)
chr8 (26-277)||(848918-849169)
chr8 (26-277)||(3348577-3348829)
chr8 (26-277)||(3359174-3359426)
chr8 (26-277)||(9341222-9341474)
chr8 (26-277)||(9368366-9368618)
chr8 (26-277)||(32088220-32088471)
chr8 (26-277)||(241902-242153)
chr8 (26-277)||(29076809-29077060)
chr8 (26-277)||(29087060-29087311)
chr8 (26-277)||(32077647-32077898)
chr8 (19-262)||(7018348-7018589)
chr8 (19-246)||(22135841-22136066)
chr8 (26-277)||(36078013-36078266)
chr8 (26-277)||(36088599-36088852)
chr8 (26-277)||(6161103-6161355)
chr8 (26-277)||(44481169-44481421)
chr8 (26-277)||(44491785-44492037)
chr8 (19-276)||(23370626-23370876)
chr8 (26-275)||(13688519-13688770)
chr8 (19-209)||(22167042-22167231)
chr8 (26-277)||(43248404-43248647)
chr8 (19-209)||(22211407-22211596)
chr8 (26-154)||(795257-795384)
chr8 (27-209)||(23271223-23271405)
chr8 (88-264)||(19461090-19461264)
chr8 (88-264)||(19558768-19558942)
chr8 (51-209)||(28903349-28903507)
chr8 (51-209)||(8031923-8032081)
chr8 (30-209)||(40003097-40003277)
chr8 (51-209)||(17519161-17519320)
chr8 (30-206)||(21540820-21540997)
chr8 (29-193)||(15425273-15425437)
chr8 (88-209)||(29379504-29379626)
chr8 (29-193)||(15336208-15336372)
chr8 (29-193)||(15516577-15516741)
chr8 (30-193)||(45568021-45568184)
chr8 (122-193)||(13430748-13430820)
chr8 (122-193)||(45538559-45538631)
chr8 (88-193)||(1237563-1237668)
chr8 (88-193)||(23185346-23185452)
chr8 (122-193)||(36105154-36105226)
chr8 (88-193)||(21932809-21932914)
chr8 (29-193)||(9320436-9320599)
chr8 (122-190)||(14989574-14989643)
chr8 (122-193)||(16207265-16207337)
chr8 (122-193)||(19943194-19943266)
chr8 (122-190)||(18151769-18151839)
chr8 (139-193)||(6407703-6407757)
chr8 (139-193)||(17797399-17797453)
chr8 (108-193)||(22673724-22673809)
chr8 (88-193)||(24551200-24551305)
chr8 (88-193)||(30421549-30421654)
chr8 (88-184)||(18121235-18121331)
chr8 (240-277)||(28691193-28691230)
chr8 (122-193)||(43639741-43639814)
chr8 (162-198)||(26833036-26833072)
chr8 (122-193)||(40845507-40845579)
chr8 (166-198)||(17687986-17688018)
chr8 (122-193)||(21288362-21288434)
chr8 (122-193)||(21300981-21301053)
chr8 (122-193)||(24646297-24646369)
chr8 (122-193)||(24833177-24833248)
chr8 (122-193)||(39693494-39693566)
[»] scaffold0068 (2 HSPs)
scaffold0068 (19-277)||(7711-7969)
scaffold0068 (19-277)||(10558-10816)
[»] chr5 (157 HSPs)
chr5 (19-277)||(21705941-21706199)
chr5 (19-277)||(21703094-21703352)
chr5 (19-277)||(19478038-19478296)
chr5 (19-275)||(34062659-34062914)
chr5 (19-273)||(17446662-17446915)
chr5 (19-277)||(19464008-19464266)
chr5 (19-276)||(17457278-17457534)
chr5 (26-277)||(20797732-20797983)
chr5 (26-277)||(43043644-43043895)
chr5 (26-277)||(23406483-23406733)
chr5 (26-277)||(34782893-34783143)
chr5 (26-277)||(36084498-36084748)
chr5 (19-275)||(34051998-34052253)
chr5 (26-277)||(30069879-30070130)
chr5 (26-277)||(34771948-34772198)
chr5 (19-273)||(106159-106412)
chr5 (33-277)||(10754530-10754773)
chr5 (29-277)||(20551852-20552099)
chr5 (26-277)||(24926113-24926363)
chr5 (26-277)||(24983394-24983644)
chr5 (26-277)||(36228776-36229026)
chr5 (46-277)||(43621853-43622084)
chr5 (26-277)||(1109119-1109369)
chr5 (19-273)||(20624805-20625058)
chr5 (29-277)||(8521878-8522125)
chr5 (26-277)||(1121877-1122127)
chr5 (26-277)||(42395017-42395266)
chr5 (26-277)||(31448589-31448841)
chr5 (45-277)||(21414191-21414422)
chr5 (26-277)||(31418698-31418950)
chr5 (19-277)||(37406692-37406942)
chr5 (26-277)||(22559473-22559725)
chr5 (26-277)||(27622739-27622991)
chr5 (26-277)||(5290548-5290800)
chr5 (26-277)||(27603390-27603642)
chr5 (19-276)||(20416940-20417195)
chr5 (28-277)||(39352524-39352774)
chr5 (19-276)||(32753912-32754167)
chr5 (29-277)||(20562377-20562609)
chr5 (26-277)||(27203829-27204081)
chr5 (26-277)||(31843995-31844247)
chr5 (26-277)||(6130825-6131077)
chr5 (26-277)||(7032098-7032352)
chr5 (26-277)||(15993301-15993553)
chr5 (26-277)||(16003863-16004115)
chr5 (26-277)||(22146557-22146809)
chr5 (26-277)||(22157140-22157392)
chr5 (26-277)||(40401055-40401307)
chr5 (26-277)||(9377434-9377686)
chr5 (26-277)||(14557989-14558241)
chr5 (26-277)||(14568626-14568878)
chr5 (26-277)||(23306881-23307133)
chr5 (26-277)||(24816858-24817110)
chr5 (26-277)||(24827446-24827698)
chr5 (26-277)||(36582530-36582782)
chr5 (26-277)||(36593085-36593337)
chr5 (26-277)||(40390393-40390645)
chr5 (26-277)||(5301119-5301376)
chr5 (26-277)||(6975844-6976096)
chr5 (26-277)||(6986334-6986586)
chr5 (26-277)||(9335992-9336243)
chr5 (26-277)||(9346579-9346830)
chr5 (26-277)||(14030080-14030332)
chr5 (26-277)||(14040633-14040885)
chr5 (26-277)||(23296313-23296565)
chr5 (26-277)||(24807949-24808200)
chr5 (26-277)||(39490922-39491174)
chr5 (26-277)||(39502112-39502364)
chr5 (26-277)||(23362146-23362399)
chr5 (26-277)||(15694004-15694255)
chr5 (26-277)||(22676152-22676404)
chr5 (26-277)||(22686043-22686295)
chr5 (26-277)||(23707479-23707730)
chr5 (26-277)||(24567126-24567377)
chr5 (26-273)||(27042184-27042432)
chr5 (26-277)||(27460197-27460449)
chr5 (26-277)||(27470596-27470848)
chr5 (26-277)||(35215541-35215794)
chr5 (26-277)||(35226125-35226378)
chr5 (26-277)||(40513961-40514214)
chr5 (26-277)||(17607097-17607349)
chr5 (26-277)||(17617711-17617963)
chr5 (26-277)||(30227470-30227721)
chr5 (26-277)||(30237997-30238248)
chr5 (26-277)||(31348571-31348823)
chr5 (26-277)||(31359185-31359437)
chr5 (26-277)||(36687732-36687984)
chr5 (26-277)||(36698298-36698550)
chr5 (26-277)||(42042821-42043072)
chr5 (26-277)||(42053396-42053647)
chr5 (26-277)||(14446971-14447224)
chr5 (26-277)||(14457583-14457836)
chr5 (26-277)||(15740003-15740256)
chr5 (26-277)||(15769163-15769416)
chr5 (26-273)||(27052808-27053057)
chr5 (26-277)||(33951772-33952025)
chr5 (19-252)||(13533778-13534009)
chr5 (19-264)||(20168115-20168358)
chr5 (26-277)||(37729223-37729476)
chr5 (26-277)||(37740539-37740792)
chr5 (26-273)||(17718958-17719207)
chr5 (26-273)||(17729610-17729859)
chr5 (19-209)||(13523051-13523240)
chr5 (27-209)||(36095755-36095936)
chr5 (27-209)||(36097212-36097393)
chr5 (131-277)||(23392753-23392898)
chr5 (19-209)||(35543231-35543420)
chr5 (26-277)||(23372547-23372802)
chr5 (26-154)||(31833641-31833769)
chr5 (114-277)||(39362350-39362514)
chr5 (51-209)||(40228553-40228710)
chr5 (51-252)||(13405010-13405209)
chr5 (26-110)||(39364685-39364769)
chr5 (51-209)||(1915311-1915469)
chr5 (51-193)||(11208087-11208229)
chr5 (51-209)||(20215201-20215360)
chr5 (162-277)||(31815199-31815314)
chr5 (30-209)||(23478241-23478421)
chr5 (51-192)||(40032869-40033009)
chr5 (30-206)||(25111966-25112143)
chr5 (30-206)||(25171057-25171234)
chr5 (30-193)||(32160638-32160801)
chr5 (122-193)||(4886985-4887057)
chr5 (88-193)||(15516900-15517004)
chr5 (26-118)||(23696979-23697072)
chr5 (29-193)||(26765370-26765533)
chr5 (29-193)||(28139478-28139642)
chr5 (122-193)||(7745795-7745867)
chr5 (122-193)||(10848736-10848808)
chr5 (122-193)||(33933230-33933302)
chr5 (139-193)||(20550876-20550930)
chr5 (29-193)||(26759021-26759184)
chr5 (122-190)||(30115942-30116011)
chr5 (122-193)||(9088932-9089004)
chr5 (122-193)||(30742944-30743015)
chr5 (88-193)||(33022598-33022699)
chr5 (88-193)||(89524-89629)
chr5 (139-193)||(14086641-14086695)
chr5 (88-193)||(26784284-26784389)
chr5 (139-193)||(42243662-42243715)
chr5 (140-193)||(35932108-35932161)
chr5 (122-193)||(11993851-11993923)
chr5 (122-193)||(13545614-13545686)
chr5 (122-193)||(25096928-25096999)
chr5 (122-193)||(25154898-25154969)
chr5 (122-193)||(29138508-29138580)
chr5 (122-193)||(31117840-31117912)
chr5 (122-193)||(35986334-35986406)
chr5 (164-198)||(16607518-16607552)
chr5 (125-190)||(25930261-25930327)
chr5 (124-193)||(41566536-41566606)
chr5 (122-193)||(3245543-3245615)
chr5 (122-193)||(9398836-9398908)
chr5 (122-193)||(19536403-19536475)
chr5 (122-193)||(21660175-21660247)
chr5 (166-198)||(26119927-26119959)
chr5 (122-193)||(28464441-28464513)
[»] chr4 (107 HSPs)
chr4 (19-277)||(4987352-4987610)
chr4 (19-277)||(15207336-15207592)
chr4 (26-277)||(10909494-10909745)
chr4 (19-277)||(11535925-11536182)
chr4 (19-277)||(24713511-24713767)
chr4 (19-277)||(47152002-47152259)
chr4 (19-277)||(5873449-5873706)
chr4 (19-277)||(10695719-10695976)
chr4 (26-277)||(18077828-18078079)
chr4 (19-277)||(3370794-3371052)
chr4 (19-277)||(11515115-11515372)
chr4 (19-277)||(31266720-31266977)
chr4 (19-277)||(3390534-3390792)
chr4 (19-277)||(10300614-10300871)
chr4 (19-277)||(14836026-14836283)
chr4 (19-277)||(19581320-19581577)
chr4 (26-277)||(40470510-40470760)
chr4 (26-277)||(5022822-5023072)
chr4 (19-277)||(16317409-16317667)
chr4 (26-277)||(40454271-40454521)
chr4 (30-276)||(18763024-18763269)
chr4 (26-277)||(25657222-25657473)
chr4 (30-277)||(18752413-18752659)
chr4 (19-277)||(16305185-16305443)
chr4 (19-276)||(49001903-49002158)
chr4 (19-276)||(55651404-55651659)
chr4 (26-277)||(27814867-27815119)
chr4 (26-277)||(48371217-48371469)
chr4 (26-277)||(52703874-52704126)
chr4 (26-277)||(461243-461495)
chr4 (26-277)||(14843575-14843827)
chr4 (26-277)||(22007097-22007349)
chr4 (26-277)||(30936994-30937246)
chr4 (26-277)||(450662-450914)
chr4 (26-277)||(17918138-17918390)
chr4 (26-277)||(17928786-17929038)
chr4 (26-277)||(19944249-19944501)
chr4 (26-277)||(21996499-21996751)
chr4 (26-277)||(24028007-24028259)
chr4 (26-277)||(30926416-30926668)
chr4 (26-277)||(10751090-10751342)
chr4 (26-277)||(10964859-10965111)
chr4 (26-277)||(15561001-15561253)
chr4 (26-277)||(16255955-16256207)
chr4 (26-277)||(16266548-16266800)
chr4 (26-277)||(36018422-36018674)
chr4 (26-277)||(36028975-36029227)
chr4 (26-277)||(55745174-55745426)
chr4 (26-277)||(55755785-55756037)
chr4 (26-277)||(4948421-4948673)
chr4 (26-277)||(19954884-19955136)
chr4 (26-273)||(49518221-49518469)
chr4 (26-277)||(10740516-10740768)
chr4 (26-277)||(10954285-10954537)
chr4 (26-277)||(24640333-24640586)
chr4 (26-277)||(18130162-18130413)
chr4 (19-209)||(23509197-23509386)
chr4 (26-277)||(27656686-27656939)
chr4 (26-277)||(27667259-27667512)
chr4 (19-264)||(18774613-18774856)
chr4 (19-209)||(8997268-8997457)
chr4 (19-209)||(16819364-16819553)
chr4 (27-264)||(18007018-18007252)
chr4 (28-209)||(33378279-33378461)
chr4 (51-252)||(14778412-14778611)
chr4 (51-252)||(17993763-17993962)
chr4 (51-209)||(14710790-14710947)
chr4 (51-209)||(36210119-36210278)
chr4 (27-149)||(19242114-19242235)
chr4 (122-193)||(1672350-1672422)
chr4 (122-193)||(1674825-1674897)
chr4 (122-193)||(14604985-14605057)
chr4 (164-264)||(19244002-19244101)
chr4 (28-193)||(10692719-10692884)
chr4 (28-193)||(10906485-10906650)
chr4 (122-193)||(6517446-6517518)
chr4 (122-193)||(16853464-16853536)
chr4 (122-193)||(17398752-17398824)
chr4 (122-193)||(22190807-22190879)
chr4 (88-193)||(19884630-19884735)
chr4 (122-193)||(3105497-3105569)
chr4 (122-193)||(9751618-9751690)
chr4 (122-193)||(20977418-20977490)
chr4 (122-193)||(25651182-25651253)
chr4 (122-193)||(37435613-37435685)
chr4 (122-193)||(39419812-39419884)
chr4 (88-190)||(8105566-8105667)
chr4 (134-193)||(29121344-29121403)
chr4 (238-277)||(39526082-39526121)
chr4 (122-187)||(16848508-16848574)
chr4 (122-191)||(40860628-40860698)
chr4 (122-193)||(3395551-3395623)
chr4 (122-193)||(13576192-13576264)
chr4 (122-193)||(38513839-38513911)
chr4 (122-193)||(56533140-56533211)
chr4 (88-193)||(412929-413035)
chr4 (162-193)||(6641686-6641717)
chr4 (123-193)||(16939978-16940049)
chr4 (88-193)||(22675598-22675704)
chr4 (162-193)||(54679932-54679963)
chr4 (88-193)||(10072863-10072968)
chr4 (88-193)||(45833322-45833427)
chr4 (88-193)||(55380218-55380323)
chr4 (162-198)||(10661240-10661276)
chr4 (162-198)||(10875385-10875421)
chr4 (122-193)||(19621139-19621211)
chr4 (122-193)||(23750483-23750555)
[»] scaffold0002 (4 HSPs)
scaffold0002 (25-277)||(117147-117398)
scaffold0002 (51-209)||(475305-475464)
scaffold0002 (51-209)||(481825-481984)
scaffold0002 (30-209)||(156681-156861)
[»] chr3 (171 HSPs)
chr3 (19-277)||(13261590-13261847)
chr3 (19-277)||(28169142-28169399)
chr3 (19-277)||(11163889-11164147)
chr3 (19-273)||(4456976-4457229)
chr3 (19-277)||(27883444-27883701)
chr3 (19-276)||(4404333-4404589)
chr3 (26-277)||(24706471-24706722)
chr3 (19-277)||(18851609-18851866)
chr3 (26-277)||(6500920-6501171)
chr3 (26-277)||(9535676-9535926)
chr3 (26-277)||(16666044-16666294)
chr3 (19-273)||(8740048-8740301)
chr3 (19-277)||(9380573-9380831)
chr3 (19-277)||(9391119-9391377)
chr3 (19-277)||(11216638-11216896)
chr3 (19-273)||(16076990-16077243)
chr3 (26-277)||(6490266-6490517)
chr3 (26-277)||(23635777-23636028)
chr3 (19-277)||(1064199-1064456)
chr3 (26-277)||(7804435-7804685)
chr3 (26-277)||(9993810-9994060)
chr3 (26-277)||(12237531-12237781)
chr3 (26-277)||(12249357-12249607)
chr3 (26-277)||(48337309-48337559)
chr3 (19-277)||(1053770-1054027)
chr3 (19-277)||(8995873-8996130)
chr3 (26-273)||(933695-933941)
chr3 (26-277)||(7794524-7794774)
chr3 (26-277)||(9981802-9982052)
chr3 (26-277)||(19887271-19887521)
chr3 (19-277)||(38314759-38315017)
chr3 (19-277)||(9006425-9006682)
chr3 (19-277)||(14581198-14581456)
chr3 (19-273)||(16671083-16671336)
chr3 (19-277)||(1783987-1784246)
chr3 (19-277)||(1794399-1794658)
chr3 (26-277)||(17909919-17910169)
chr3 (26-277)||(29461130-29461380)
chr3 (19-273)||(17281354-17281607)
chr3 (26-271)||(29471988-29472232)
chr3 (28-277)||(16391531-16391780)
chr3 (87-277)||(12567187-12567376)
chr3 (26-277)||(10626858-10627109)
chr3 (26-277)||(10655180-10655431)
chr3 (26-277)||(4174673-4174925)
chr3 (26-277)||(6220618-6220870)
chr3 (26-277)||(13383180-13383432)
chr3 (26-277)||(37885645-37885897)
chr3 (26-277)||(13121729-13121981)
chr3 (26-277)||(13131972-13132224)
chr3 (26-277)||(13372586-13372838)
chr3 (26-277)||(13393774-13394026)
chr3 (26-277)||(14465658-14465910)
chr3 (26-277)||(19778452-19778704)
chr3 (26-277)||(19789089-19789341)
chr3 (26-277)||(23767961-23768213)
chr3 (26-277)||(39672799-39673051)
chr3 (19-277)||(13199160-13199418)
chr3 (26-277)||(6180444-6180696)
chr3 (26-277)||(14476290-14476542)
chr3 (26-277)||(20683697-20683949)
chr3 (26-277)||(23647815-23648067)
chr3 (26-277)||(23757365-23757617)
chr3 (26-277)||(37759737-37759989)
chr3 (26-277)||(37866512-37866764)
chr3 (19-277)||(2246428-2246684)
chr3 (87-277)||(15216257-15216446)
chr3 (26-277)||(526450-526702)
chr3 (26-277)||(5579550-5579802)
chr3 (26-277)||(5627934-5628186)
chr3 (26-277)||(5865610-5865862)
chr3 (26-277)||(5876209-5876461)
chr3 (26-277)||(20673112-20673364)
chr3 (26-277)||(20721180-20721432)
chr3 (26-277)||(41683745-41683997)
chr3 (26-277)||(41694314-41694566)
chr3 (19-277)||(29933476-29933733)
chr3 (19-277)||(29982630-29982887)
chr3 (26-277)||(8774724-8774977)
chr3 (26-277)||(8785309-8785562)
chr3 (26-277)||(504084-504336)
chr3 (26-277)||(4743805-4744056)
chr3 (26-277)||(5510763-5511014)
chr3 (26-277)||(5520941-5521192)
chr3 (26-277)||(5536938-5537189)
chr3 (26-277)||(12286895-12287147)
chr3 (26-277)||(12296717-12296969)
chr3 (26-277)||(13557641-13557893)
chr3 (26-277)||(24383435-24383687)
chr3 (26-277)||(24659967-24660219)
chr3 (26-277)||(28314148-28314400)
chr3 (26-277)||(28324764-28325016)
chr3 (26-277)||(35187444-35187696)
chr3 (19-277)||(29947263-29947519)
chr3 (19-277)||(29996417-29996673)
chr3 (26-277)||(18484111-18484364)
chr3 (26-277)||(38194791-38195044)
chr3 (26-277)||(38205327-38205580)
chr3 (26-277)||(4754391-4754641)
chr3 (26-277)||(5547522-5547773)
chr3 (26-277)||(24670547-24670799)
chr3 (19-277)||(29906098-29906354)
chr3 (26-277)||(39382757-39383010)
chr3 (26-277)||(10099135-10099386)
chr3 (26-277)||(11272299-11272552)
chr3 (26-277)||(39372120-39372373)
chr3 (104-277)||(14321598-14321771)
chr3 (26-277)||(16476345-16476597)
chr3 (19-209)||(15651055-15651244)
chr3 (19-209)||(15662690-15662879)
chr3 (19-252)||(21736171-21736402)
chr3 (27-264)||(27172900-27173135)
chr3 (19-159)||(17961412-17961551)
chr3 (55-252)||(51989086-51989282)
chr3 (23-159)||(18006361-18006496)
chr3 (51-209)||(10529243-10529401)
chr3 (162-277)||(16348552-16348667)
chr3 (26-129)||(16386141-16386243)
chr3 (27-246)||(31113935-31114152)
chr3 (51-209)||(41045640-41045797)
chr3 (30-209)||(15850884-15851065)
chr3 (166-277)||(16493245-16493356)
chr3 (30-209)||(15833281-15833459)
chr3 (30-206)||(51340886-51341063)
chr3 (103-209)||(17021975-17022082)
chr3 (51-209)||(22151142-22151301)
chr3 (30-193)||(45861693-45861856)
chr3 (28-193)||(2561061-2561226)
chr3 (30-206)||(12752727-12752904)
chr3 (30-209)||(13148141-13148321)
chr3 (28-174)||(49990134-49990280)
chr3 (88-193)||(40799807-40799912)
chr3 (29-193)||(5213452-5213615)
chr3 (88-193)||(24775655-24775760)
chr3 (88-193)||(47405542-47405647)
chr3 (122-193)||(25398376-25398448)
chr3 (88-193)||(2784998-2785102)
chr3 (88-193)||(11909145-11909250)
chr3 (139-193)||(12726351-12726405)
chr3 (139-193)||(47207690-47207744)
chr3 (139-193)||(53056848-53056902)
chr3 (125-193)||(21605775-21605844)
chr3 (122-190)||(30054341-30054410)
chr3 (122-193)||(1728136-1728208)
chr3 (122-193)||(6090698-6090770)
chr3 (122-193)||(21636791-21636863)
chr3 (122-193)||(22140730-22140802)
chr3 (139-193)||(11868253-11868307)
chr3 (88-193)||(14955361-14955465)
chr3 (139-193)||(18121743-18121797)
chr3 (139-193)||(18142873-18142927)
chr3 (88-193)||(28582039-28582144)
chr3 (139-193)||(29855393-29855447)
chr3 (88-193)||(33583163-33583267)
chr3 (156-193)||(12388993-12389030)
chr3 (156-193)||(16032526-16032563)
chr3 (164-277)||(16487098-16487211)
chr3 (122-193)||(16658739-16658811)
chr3 (122-193)||(20646120-20646192)
chr3 (122-193)||(38177764-38177836)
chr3 (122-193)||(46796488-46796560)
chr3 (122-193)||(49642883-49642955)
chr3 (122-193)||(49666526-49666598)
chr3 (142-193)||(49553610-49553661)
chr3 (139-193)||(11223548-11223601)
chr3 (88-193)||(20627552-20627657)
chr3 (122-190)||(37412571-37412640)
chr3 (122-193)||(46349965-46350038)
chr3 (122-193)||(9700157-9700229)
chr3 (166-198)||(16880026-16880058)
chr3 (122-193)||(31303352-31303424)
[»] chr7 (124 HSPs)
chr7 (26-277)||(1367682-1367932)
chr7 (20-277)||(18441243-18441499)
chr7 (26-277)||(15888326-15888576)
chr7 (26-277)||(21769940-21770190)
chr7 (29-277)||(19985810-19986058)
chr7 (26-277)||(9171038-9171288)
chr7 (26-277)||(31116508-31116759)
chr7 (19-277)||(40054750-40055008)
chr7 (20-277)||(18419162-18419418)
chr7 (26-277)||(589265-589515)
chr7 (26-277)||(9170237-9170487)
chr7 (26-277)||(14745666-14745917)
chr7 (26-277)||(9159782-9160032)
chr7 (19-277)||(30049564-30049822)
chr7 (26-277)||(44280549-44280799)
chr7 (26-277)||(3165787-3166037)
chr7 (26-277)||(20491059-20491309)
chr7 (19-276)||(26209547-26209802)
chr7 (26-277)||(5685570-5685822)
chr7 (26-277)||(9433315-9433567)
chr7 (19-277)||(3476338-3476594)
chr7 (26-277)||(541136-541388)
chr7 (26-277)||(9443911-9444163)
chr7 (26-277)||(20989704-20989956)
chr7 (30-277)||(21003005-21003253)
chr7 (28-277)||(6867222-6867472)
chr7 (28-277)||(6877854-6878104)
chr7 (19-277)||(29590039-29590295)
chr7 (19-276)||(15216363-15216618)
chr7 (26-277)||(467578-467830)
chr7 (26-277)||(11096106-11096358)
chr7 (26-277)||(24930600-24930852)
chr7 (26-277)||(26653322-26653574)
chr7 (26-277)||(26699651-26699903)
chr7 (26-277)||(37344251-37344503)
chr7 (19-276)||(12734165-12734420)
chr7 (26-277)||(454796-455048)
chr7 (26-277)||(2705609-2705861)
chr7 (26-277)||(4222661-4222913)
chr7 (26-277)||(8617437-8617689)
chr7 (26-277)||(8628000-8628252)
chr7 (26-277)||(17950115-17950367)
chr7 (19-277)||(13682367-13682623)
chr7 (26-277)||(2716213-2716465)
chr7 (26-277)||(4212062-4212314)
chr7 (26-277)||(17960721-17960973)
chr7 (26-277)||(48710488-48710740)
chr7 (87-277)||(8933634-8933823)
chr7 (87-277)||(38593732-38593921)
chr7 (26-277)||(166933-167185)
chr7 (26-277)||(177525-177777)
chr7 (26-277)||(9085335-9085586)
chr7 (26-277)||(9095049-9095300)
chr7 (26-277)||(11005236-11005488)
chr7 (26-277)||(8002061-8002314)
chr7 (26-277)||(8012706-8012959)
chr7 (26-277)||(22089174-22089426)
chr7 (26-277)||(22099789-22100041)
chr7 (26-277)||(26390093-26390345)
chr7 (26-277)||(26400735-26400987)
chr7 (26-277)||(40042106-40042357)
chr7 (26-277)||(40052655-40052906)
chr7 (26-277)||(1987591-1987844)
chr7 (26-277)||(1998212-1998465)
chr7 (26-277)||(42865878-42866131)
chr7 (26-277)||(42876504-42876757)
chr7 (26-277)||(24734804-24735056)
chr7 (26-277)||(24744751-24745003)
chr7 (26-236)||(26294067-26294278)
chr7 (19-252)||(24882443-24882674)
chr7 (131-277)||(6044208-6044354)
chr7 (19-151)||(38403331-38403462)
chr7 (133-277)||(48382304-48382449)
chr7 (51-209)||(8998998-8999155)
chr7 (51-207)||(11087110-11087265)
chr7 (30-189)||(602636-602796)
chr7 (19-79)||(48382236-48382296)
chr7 (51-209)||(13174668-13174827)
chr7 (122-193)||(30944446-30944518)
chr7 (88-193)||(16112007-16112112)
chr7 (88-193)||(33691835-33691940)
chr7 (88-193)||(48237025-48237130)
chr7 (125-193)||(4821440-4821509)
chr7 (122-193)||(21283496-21283568)
chr7 (122-193)||(27871681-27871753)
chr7 (122-193)||(44467027-44467099)
chr7 (88-193)||(9069492-9069597)
chr7 (88-193)||(30945479-30945584)
chr7 (122-193)||(1292993-1293065)
chr7 (122-193)||(4494540-4494612)
chr7 (88-191)||(28622481-28622584)
chr7 (122-193)||(35952811-35952883)
chr7 (107-193)||(21692236-21692322)
chr7 (88-193)||(23280081-23280187)
chr7 (139-193)||(8182911-8182965)
chr7 (139-193)||(24788122-24788176)
chr7 (139-193)||(28409020-28409074)
chr7 (122-190)||(4412088-4412157)
chr7 (156-193)||(14426545-14426582)
chr7 (156-193)||(22578144-22578181)
chr7 (140-193)||(24794838-24794891)
chr7 (122-193)||(331608-331680)
chr7 (122-193)||(2265642-2265713)
chr7 (122-193)||(9709925-9709997)
chr7 (122-193)||(19711136-19711208)
chr7 (19-51)||(38593935-38593967)
chr7 (122-193)||(41842396-41842468)
chr7 (122-193)||(48806002-48806074)
chr7 (162-193)||(19237166-19237197)
chr7 (107-193)||(21695350-21695436)
chr7 (88-193)||(14193044-14193149)
chr7 (162-191)||(13894123-13894152)
chr7 (156-193)||(14425445-14425482)
chr7 (164-193)||(19339373-19339402)
chr7 (139-192)||(32264842-32264895)
chr7 (122-193)||(2913731-2913803)
chr7 (162-198)||(7488023-7488059)
chr7 (122-193)||(12174464-12174535)
chr7 (122-193)||(13138018-13138090)
chr7 (166-198)||(13172470-13172502)
chr7 (122-193)||(16316680-16316752)
chr7 (122-193)||(29935481-29935553)
chr7 (141-193)||(33605668-33605720)
chr7 (122-189)||(48062947-48063015)
[»] chr1 (118 HSPs)
chr1 (19-277)||(18381864-18382121)
chr1 (19-277)||(20441277-20441535)
chr1 (26-277)||(7689418-7689669)
chr1 (19-263)||(20195667-20195910)
chr1 (26-277)||(4250525-4250775)
chr1 (26-277)||(39194054-39194304)
chr1 (19-277)||(39586958-39587216)
chr1 (19-277)||(9050447-9050705)
chr1 (19-277)||(47195250-47195508)
chr1 (19-277)||(14388086-14388343)
chr1 (20-277)||(11195027-11195283)
chr1 (26-277)||(5973760-5974011)
chr1 (26-277)||(154249-154499)
chr1 (26-277)||(35012918-35013169)
chr1 (19-275)||(675436-675690)
chr1 (26-277)||(23580286-23580538)
chr1 (26-277)||(148174-148424)
chr1 (19-277)||(17957229-17957487)
chr1 (20-276)||(41132577-41132831)
chr1 (19-277)||(18310932-18311189)
chr1 (26-277)||(19187833-19188086)
chr1 (26-277)||(4167254-4167506)
chr1 (26-277)||(4177910-4178162)
chr1 (26-277)||(12730542-12730794)
chr1 (26-277)||(12741135-12741387)
chr1 (26-277)||(12897943-12898195)
chr1 (26-277)||(5639670-5639922)
chr1 (26-277)||(5650227-5650479)
chr1 (26-277)||(21877762-21878014)
chr1 (26-277)||(21895197-21895449)
chr1 (26-277)||(33084557-33084809)
chr1 (26-277)||(10997744-10997996)
chr1 (26-277)||(12614276-12614528)
chr1 (26-277)||(21863656-21863908)
chr1 (26-277)||(19178954-19179207)
chr1 (26-277)||(7507297-7507549)
chr1 (26-277)||(7517894-7518146)
chr1 (26-277)||(12623741-12623993)
chr1 (26-277)||(51629147-51629399)
chr1 (26-277)||(51656408-51656660)
chr1 (26-277)||(2538531-2538782)
chr1 (26-277)||(3171617-3171870)
chr1 (26-277)||(3182219-3182472)
chr1 (26-277)||(5833213-5833466)
chr1 (26-277)||(5843815-5844068)
chr1 (26-277)||(35401124-35401377)
chr1 (26-277)||(35404351-35404604)
chr1 (26-277)||(35648650-35648903)
chr1 (26-277)||(35637998-35638251)
chr1 (26-277)||(38095071-38095324)
chr1 (26-277)||(38105696-38105949)
chr1 (26-277)||(47607890-47608143)
chr1 (26-277)||(47618498-47618751)
chr1 (26-277)||(36236390-36236641)
chr1 (26-277)||(36246937-36247188)
chr1 (19-252)||(46180865-46181096)
chr1 (19-209)||(20798929-20799118)
chr1 (133-276)||(12946818-12946961)
chr1 (19-252)||(22609960-22610191)
chr1 (19-261)||(45070630-45070870)
chr1 (19-209)||(20883910-20884099)
chr1 (19-209)||(23926923-23927112)
chr1 (51-252)||(5929600-5929799)
chr1 (27-252)||(28474100-28474323)
chr1 (55-252)||(44200912-44201108)
chr1 (51-252)||(19037903-19038103)
chr1 (30-209)||(17370917-17371097)
chr1 (51-209)||(28379892-28380049)
chr1 (51-252)||(52350670-52350869)
chr1 (30-208)||(19170360-19170539)
chr1 (51-209)||(20251671-20251828)
chr1 (30-209)||(22655352-22655532)
chr1 (51-209)||(22019232-22019391)
chr1 (88-209)||(22642828-22642950)
chr1 (141-252)||(23064935-23065045)
chr1 (30-190)||(21543904-21544064)
chr1 (122-193)||(1900311-1900383)
chr1 (50-193)||(25448608-25448751)
chr1 (122-193)||(36134156-36134228)
chr1 (88-193)||(22464851-22464956)
chr1 (122-193)||(21702780-21702852)
chr1 (51-209)||(26548282-26548441)
chr1 (122-193)||(35040132-35040204)
chr1 (51-193)||(22600224-22600366)
chr1 (88-193)||(2327482-2327587)
chr1 (139-193)||(22153841-22153895)
chr1 (88-193)||(32785979-32786084)
chr1 (117-193)||(7745132-7745209)
chr1 (122-193)||(19215578-19215650)
chr1 (122-193)||(21135202-21135274)
chr1 (122-193)||(22427399-22427471)
chr1 (122-193)||(30572163-30572235)
chr1 (122-193)||(46088955-46089027)
chr1 (123-193)||(37642215-37642286)
chr1 (122-193)||(39201034-39201104)
chr1 (28-193)||(2266962-2267127)
chr1 (139-193)||(2268515-2268569)
chr1 (88-193)||(10757354-10757459)
chr1 (122-191)||(21121108-21121178)
chr1 (105-170)||(24028751-24028816)
chr1 (122-193)||(14263493-14263566)
chr1 (28-190)||(2834562-2834725)
chr1 (122-193)||(16235338-16235410)
chr1 (122-193)||(23024754-23024826)
chr1 (122-193)||(29215763-29215835)
chr1 (122-193)||(33256393-33256465)
chr1 (122-193)||(33276565-33276637)
chr1 (122-193)||(48570273-48570345)
chr1 (162-193)||(21191907-21191938)
chr1 (159-198)||(23054370-23054409)
chr1 (125-193)||(35401777-35401847)
chr1 (139-193)||(44821587-44821641)
chr1 (140-193)||(21204965-21205017)
chr1 (88-193)||(23036569-23036676)
chr1 (122-190)||(34255561-34255630)
chr1 (88-188)||(38282500-38282600)
chr1 (122-193)||(1577833-1577905)
chr1 (122-193)||(10250952-10251024)
[»] scaffold0047 (2 HSPs)
scaffold0047 (19-277)||(32860-33117)
scaffold0047 (26-277)||(40409-40661)
[»] scaffold0407 (2 HSPs)
scaffold0407 (20-277)||(12072-12328)
scaffold0407 (87-277)||(15903-16092)
[»] scaffold0267 (1 HSPs)
scaffold0267 (29-277)||(6175-6423)
[»] scaffold0028 (3 HSPs)
scaffold0028 (26-277)||(54080-54330)
scaffold0028 (26-277)||(14632-14884)
scaffold0028 (122-193)||(5674-5746)
[»] scaffold0497 (1 HSPs)
scaffold0497 (19-277)||(10244-10501)
[»] scaffold0322 (1 HSPs)
scaffold0322 (27-277)||(6842-7092)
[»] scaffold0272 (1 HSPs)
scaffold0272 (19-276)||(13565-13821)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (39-273)||(1-235)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (19-277)||(5338-5595)
scaffold0042 (183-277)||(12896-12990)
[»] scaffold0391 (1 HSPs)
scaffold0391 (26-277)||(2175-2425)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (19-277)||(36691-36949)
[»] scaffold0084 (3 HSPs)
scaffold0084 (19-277)||(56738-56995)
scaffold0084 (88-172)||(464-548)
scaffold0084 (117-193)||(32447-32524)
[»] scaffold0747 (1 HSPs)
scaffold0747 (26-277)||(2848-3098)
[»] scaffold0133 (2 HSPs)
scaffold0133 (26-277)||(42477-42727)
scaffold0133 (26-277)||(31180-31432)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (26-277)||(52058-52313)
[»] scaffold0017 (4 HSPs)
scaffold0017 (19-277)||(175367-175624)
scaffold0017 (165-277)||(180424-180536)
scaffold0017 (27-209)||(40369-40551)
scaffold0017 (27-209)||(58915-59097)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (19-277)||(35580-35836)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (20-228)||(40546-40753)
[»] scaffold0410 (1 HSPs)
scaffold0410 (19-276)||(15772-16027)
[»] scaffold0027 (1 HSPs)
scaffold0027 (26-277)||(6798-7050)
[»] scaffold0012 (4 HSPs)
scaffold0012 (19-277)||(140847-141104)
scaffold0012 (19-277)||(127689-127945)
scaffold0012 (27-252)||(7632-7856)
scaffold0012 (122-193)||(215569-215641)
[»] scaffold0481 (1 HSPs)
scaffold0481 (19-264)||(12795-13038)
[»] scaffold0386 (1 HSPs)
scaffold0386 (26-277)||(12404-12656)
[»] scaffold0739 (1 HSPs)
scaffold0739 (19-264)||(2037-2280)
[»] scaffold0099 (2 HSPs)
scaffold0099 (26-265)||(19290-19538)
scaffold0099 (25-251)||(16912-17153)
[»] scaffold0105 (3 HSPs)
scaffold0105 (26-277)||(8009-8262)
scaffold0105 (26-277)||(36913-37166)
scaffold0105 (41-277)||(47547-47785)
[»] scaffold0627 (1 HSPs)
scaffold0627 (119-277)||(8019-8177)
[»] scaffold0163 (1 HSPs)
scaffold0163 (19-209)||(29517-29707)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (19-264)||(689-932)
scaffold0090 (19-264)||(5069-5312)
[»] scaffold0073 (1 HSPs)
scaffold0073 (19-209)||(58344-58533)
[»] scaffold0752 (2 HSPs)
scaffold0752 (19-264)||(1863-2106)
scaffold0752 (19-209)||(1248-1437)
[»] scaffold0201 (2 HSPs)
scaffold0201 (108-277)||(7362-7530)
scaffold0201 (159-196)||(19137-19174)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (19-209)||(28820-29010)
[»] scaffold1477 (1 HSPs)
scaffold1477 (139-277)||(1617-1755)
[»] scaffold0547 (1 HSPs)
scaffold0547 (19-209)||(761-950)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (19-209)||(59316-59504)
scaffold0007 (88-199)||(143031-143142)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (162-277)||(35115-35230)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (51-252)||(61119-61318)
scaffold0005 (122-193)||(212321-212393)
[»] scaffold0280 (2 HSPs)
scaffold0280 (27-209)||(17861-18044)
scaffold0280 (122-193)||(2802-2874)
[»] scaffold0177 (1 HSPs)
scaffold0177 (30-209)||(20432-20611)
[»] scaffold0655 (1 HSPs)
scaffold0655 (51-206)||(5014-5170)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (19-110)||(38120-38211)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (30-209)||(6577-6757)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (51-209)||(61629-61788)
[»] scaffold0422 (1 HSPs)
scaffold0422 (88-209)||(11695-11816)
[»] scaffold0544 (1 HSPs)
scaffold0544 (19-117)||(9907-10005)
[»] scaffold0570 (1 HSPs)
scaffold0570 (51-209)||(1727-1886)
[»] scaffold0269 (1 HSPs)
scaffold0269 (51-193)||(7181-7324)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (30-193)||(38157-38319)
[»] scaffold1321 (1 HSPs)
scaffold1321 (30-209)||(990-1170)
[»] scaffold1263 (1 HSPs)
scaffold1263 (30-209)||(1183-1363)
[»] scaffold0477 (1 HSPs)
scaffold0477 (165-277)||(6166-6278)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (30-205)||(16831-17007)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (117-193)||(165018-165095)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (51-193)||(3967-4110)
[»] scaffold0906 (1 HSPs)
scaffold0906 (165-265)||(4468-4568)
[»] scaffold0443 (1 HSPs)
scaffold0443 (51-154)||(1116-1218)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (88-193)||(15694-15799)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (122-193)||(7348-7420)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (164-264)||(22050-22149)
[»] scaffold0471 (1 HSPs)
scaffold0471 (122-193)||(3271-3343)
[»] scaffold0249 (1 HSPs)
scaffold0249 (122-193)||(17837-17909)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (122-193)||(9122-9194)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (122-193)||(27501-27573)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (19-67)||(16553-16601)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (122-193)||(25737-25809)
scaffold0056 (139-193)||(34876-34930)
[»] scaffold0185 (1 HSPs)
scaffold0185 (139-209)||(9281-9352)
[»] scaffold1331 (1 HSPs)
scaffold1331 (88-193)||(1771-1876)
[»] scaffold0859 (1 HSPs)
scaffold0859 (122-188)||(2951-3016)
[»] scaffold0479 (1 HSPs)
scaffold0479 (139-193)||(9954-10008)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (122-193)||(15811-15884)
scaffold0247 (122-193)||(25471-25544)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (88-193)||(1869-1974)
[»] scaffold0774 (1 HSPs)
scaffold0774 (171-252)||(6346-6426)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (162-198)||(379-415)
[»] scaffold0337 (1 HSPs)
scaffold0337 (122-193)||(14615-14687)
[»] scaffold0227 (1 HSPs)
scaffold0227 (122-189)||(22643-22711)
[»] scaffold0217 (3 HSPs)
scaffold0217 (122-193)||(18998-19070)
scaffold0217 (122-193)||(22203-22275)
scaffold0217 (125-193)||(9530-9599)
[»] scaffold0210 (1 HSPs)
scaffold0210 (122-193)||(1627-1699)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (122-193)||(21043-21115)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (162-198)||(31851-31887)
[»] scaffold0004 (3 HSPs)
scaffold0004 (122-193)||(211365-211437)
scaffold0004 (162-193)||(244356-244387)
scaffold0004 (122-194)||(377630-377703)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (122-193)||(90127-90199)
[»] scaffold0251 (1 HSPs)
scaffold0251 (88-193)||(7639-7742)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (139-193)||(36847-36901)
scaffold0120 (139-193)||(42104-42158)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (139-193)||(99277-99331)
[»] scaffold0022 (2 HSPs)
scaffold0022 (139-193)||(37387-37441)
scaffold0022 (139-193)||(135447-135501)
[»] scaffold1359 (2 HSPs)
scaffold1359 (156-193)||(727-764)
scaffold1359 (156-193)||(1827-1864)
[»] scaffold0414 (1 HSPs)
scaffold0414 (240-277)||(2550-2587)
[»] scaffold0178 (1 HSPs)
scaffold0178 (240-277)||(27001-27038)
[»] scaffold0607 (1 HSPs)
scaffold0607 (139-191)||(5991-6043)
[»] scaffold0567 (1 HSPs)
scaffold0567 (122-193)||(9873-9945)
[»] scaffold0473 (1 HSPs)
scaffold0473 (141-193)||(2763-2815)
[»] scaffold0352 (1 HSPs)
scaffold0352 (122-193)||(893-964)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (122-193)||(9923-9995)
[»] scaffold0065 (1 HSPs)
scaffold0065 (122-193)||(1657-1729)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (122-193)||(78438-78510)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (122-193)||(60770-60842)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (122-188)||(84362-84429)
[»] scaffold1204 (1 HSPs)
scaffold1204 (243-277)||(2390-2424)
[»] scaffold0861 (1 HSPs)
scaffold0861 (139-193)||(5019-5073)
[»] scaffold0226 (1 HSPs)
scaffold0226 (244-277)||(19175-19208)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (125-193)||(87672-87741)
[»] scaffold0772 (1 HSPs)
scaffold0772 (166-198)||(948-980)
[»] scaffold0439 (1 HSPs)
scaffold0439 (122-193)||(6812-6884)
[»] scaffold0364 (1 HSPs)
scaffold0364 (166-198)||(10474-10506)
[»] scaffold0161 (2 HSPs)
scaffold0161 (126-193)||(10180-10248)
scaffold0161 (126-193)||(14844-14912)
[»] scaffold0069 (1 HSPs)
scaffold0069 (122-193)||(5397-5469)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (162-198)||(144913-144949)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 128)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Original strand, 13913060 - 13913317
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13913060 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattatcttcaaattcattcccatcttgaaggaaca-t 13913158  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |    
T  13913159 ttctgcaggcagagttgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacaaagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttatcgaa 13913258  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13913259 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 13913317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 11147428 - 11147177
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  11147428 tcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 11147329  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 225  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  11147328 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaatagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 11147229  T
Q  226 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11147228 tactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 11147177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 12827710 - 12827961
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||    
T  12827710 tcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcgcaaattctgca 12827809  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 225  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  12827810 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 12827909  T
Q  226 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12827910 tactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 12827961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 20030082 - 20029832
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  20030082 tcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 20029983  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 225  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  20029982 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 20029884  T
Q  226 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20029883 tactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 20029832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 25787719 - 25787969
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  25787719 tcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 25787818  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 225  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  25787819 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 25787917  T
Q  226 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25787918 tactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 25787969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Original strand, 29765546 - 29765803
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29765546 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 29765645  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  29765646 t-ctgcaggcagagctgttgtcttgtctgatagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaa 29765744  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29765745 ggacaagtacccagtgttcttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 29765803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 7375936 - 7375686
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||     
T  7375936 tcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgct 7375837  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 225  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  7375836 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 7375738  T
Q  226 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7375737 tactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 7375686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 20062833 - 20062583
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  20062833 tcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttaggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 20062734  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 225  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  20062733 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 20062635  T
Q  226 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20062634 tactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 20062583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Original strand, 8653671 - 8653928
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |    
T  8653671 gttgagttcctttgatcatccaccaataatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggattagcttcaaattcattcccgttttgaaggaaca-t 8653769  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    |||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  8653770 ttctacaggcatagcttttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaa 8653869  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8653870 ggacaagtattcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 8653928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 18925948 - 18925690
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18925948 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaaca-t 18925850  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgc 217  Q
    |||||||||||   ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  18925849 ttctgcaggcatgactgtttttcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacga 18925750  T
Q  218 aggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  18925749 aggacaagtactaagtgttctccaaatgaccgttgatgtctccctttcaattcttcgttc 18925690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 18826423 - 18826166
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18826423 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtaaagtcctttgaaggatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 18826324  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |    
T  18826323 t-ctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataacgaa 18826225  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18826224 ggataagtacccagtgttcttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 18826166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 27166628 - 27166371
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27166628 gttgagtttctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgaagtcctttgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaat 27166529  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |    
T  27166528 t-ctgcaggcagagccgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagtgtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataatgaa 27166430  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27166429 ggacaagtacacagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 27166371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 25986099 - 25986350
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  25986099 tcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcagcttcaaatttattcccatcttgaaggcacaaattctgca 25986198  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 225  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  25986199 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaatagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 25986298  T
Q  226 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    | ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  25986299 tgctcagtgctattcatatgaccgttggtacctccctttcaattcttcgttc 25986350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 18834819 - 18834562
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18834819 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggaaaagtcctttgaaggatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 18834720  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |    
T  18834719 t-ctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataacgaa 18834621  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  18834620 ggacaagtacccagtgttcttcaaatgaccgttgatacctcccttttaattcttcgttc 18834562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 20 - 277
Target Start/End: Original strand, 17042633 - 17042890
Alignment:
Q  20 ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatt 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17042633 ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgaagtcctttgaagtattaacttcaaattcattcccatcttgaaggaacaaat 17042732  T
Q  120 tctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcag 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  |||| |     
T  17042733 tctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacaaagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaacgctgaaaacgaaa 17042832  T
Q  220 gacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||||||||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  17042833 gacaagtacccagtgctttgcaaaagaccgttgatacctcccttgcaattcttcgttc 17042890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 19 - 250
Target Start/End: Original strand, 5845095 - 5845325
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  5845095 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgcagtcctttgaagaatcggcttcaaattcattcccatcttgaatgaaca-t 5845193  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |    
T  5845194 tcctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataacgaa 5845293  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgt 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5845294 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgt 5845325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 26044231 - 26044481
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  26044231 tcctttgatcattcaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 26044330  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 225  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  26044331 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-agcagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaac 26044429  T
Q  226 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    | ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26044430 tgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 26044481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 16123722 - 16123464
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||    
T  16123722 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatactttgactgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattacaatcttgaaggaac-at 16123624  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtac-ttcgtcaactctgttaacgc 217  Q
    || || |||||  | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |     
T  16123623 ttatgaaggcatggatgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttttgtcaactctgttaaaga 16123524  T
Q  218 aggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  16123523 aggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcaaatcttcgttc 16123464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 20 - 277
Target Start/End: Original strand, 17064206 - 17064463
Alignment:
Q  20 ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatt 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17064206 ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgaagtcctttgaagtattaacttcaaattcattcccatcttgaaggaacaaat 17064305  T
Q  120 tctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcag 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||  || | |     
T  17064306 tctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacatagtagtggaggtagttgttgtacacttgtactttgtcaacgctgaaaatgaaa 17064405  T
Q  220 gacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||||||||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  17064406 gacaagtacccagtgctttgcaaaagaccgttgatacctcccttgcaattcttcgttc 17064463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 23 - 277
Target Start/End: Original strand, 4292741 - 4292994
Alignment:
Q  23 agttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttct 122  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4292741 agttcctttgatcatccactagtaatcttttgcctgatttaggtgtagtcctttgaaggatcagcttcaaattcattcccatcttgaaggaaca-tttct 4292839  T
Q  123 gcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggac 222  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | | |||||    
T  4292840 gcaggcagagctgttgtcttgtcctgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgatgaagaaggac 4292939  T
Q  223 aagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4292940 aagtatccaatgcttttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 4292994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 39 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 28251730 - 28251493
Alignment:
Q  39 caccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttg 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||||    
T  28251730 caccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttg 28251631  T
Q  139 tcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtactcagtgctct 238  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |  |||| |||||    
T  28251630 tcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgttcagagctct 28251532  T
Q  239 tcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
     ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  28251531 ccaaatgaccgttgatacctcccttttaattcttcgttc 28251493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 39 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 28356877 - 28356640
Alignment:
Q  39 caccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttg 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||||    
T  28356877 caccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttg 28356778  T
Q  139 tcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtactcagtgctct 238  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |  |||| |||||    
T  28356777 tcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgttcagagctct 28356679  T
Q  239 tcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
     ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  28356678 ccaaatgaccgttgatacctcccttttaattcttcgttc 28356640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 19 - 273
Target Start/End: Original strand, 31572425 - 31572678
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  ||||| |    
T  31572425 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattcccatcttgatagaaca-t 31572523  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    |||||||||||  |  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| |    
T  31572524 ttctgcaggcatggtcgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtagtttgtcaactctgataacgaa 31572623  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttc 273  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31572624 ggacaaatactcagtgcttttcaaaagaccgttgatacctccctttcaattcttc 31572678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 19 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 17745967 - 17745737
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17745967 gttgagttcctttgattattcaccagtaatgattttcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaaca-t 17745869  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |    
T  17745868 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtaatggttgtacacttctactttgtcaactctgataacgaa 17745769  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgt 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17745768 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgt 17745737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 9123311 - 9123059
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  9123311 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaaggtacaaattctgca 9123212  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  9123211 ggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 9123112  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||   ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9123111 gtgctcagtgctatccatatattcgttgatacctccctttcaattcttcgttc 9123059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 27505959 - 27506212
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  27505959 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 27506058  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac--aagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 223  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||   ||||    
T  27506059 ggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctactaacgagagaca 27506158  T
Q  224 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||| ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27506159 agtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 27506212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 9112674 - 9112422
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||    
T  9112674 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaaggtacaaattttgca 9112575  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  9112574 ggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 9112475  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||   ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9112474 gtgctcagtgctatccatatattcgttgatacctccctttcaattcttcgttc 9112422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 9933856 - 9933599
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||  || | |||||||||| |||| |||||||||||||| |    
T  9933856 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgattttggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattccttcctatcttgaaggaaca-t 9933758  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |    
T  9933757 ttctgcaggcagagttgttgtcttgtcttgtagcatagacagaaacatagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataaagaa 9933658  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  9933657 ggacaagcacccagtgcttttcaaatgaccgttgatacctcccttttaattcttcgttc 9933599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Original strand, 22308801 - 22309058
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |  ||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  22308801 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcatgatttgggtgtagtcctttgaggaatcaatttcaaattcattcccatcttgaaggaata-t 22308899  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |    
T  22308900 ttctacaggtagagctgttgtcttgtcttgtagtgtagacaaaaacagagtagtggagttagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataacgaa 22308999  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    | |||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  22309000 gaacaattacccagtgcttttcaaacgaccgttgatacatccctttcaattcttcgttc 22309058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 31543077 - 31542825
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  31543077 tcctttgattatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtacaaattctgca 31542978  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  31542977 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 31542878  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31542877 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 31542825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 27372849 - 27373102
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  27372849 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 27372948  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac--aagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 223  Q
    ||||  |||||||||||||||||||| || |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||   ||||    
T  27372949 ggcatggctgttgtcttgtcttgtagtgtagacaaaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctactaacgagagaca 27373048  T
Q  224 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||| ||||||||| | || ||  | |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27373049 agtgctcagtgctatccatatatctgttgatacctccctttcaattcttcgttc 27373102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 27463199 - 27463452
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  27463199 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 27463298  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac--aagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 223  Q
    ||||  |||||||||||||||||||| || |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||   ||||    
T  27463299 ggcatggctgttgtcttgtcttgtagtgtagacaaaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctactaacgagagaca 27463398  T
Q  224 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||| ||||||||| | || ||  | |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27463399 agtgctcagtgctatccatatatctgttgatacctccctttcaattcttcgttc 27463452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 20 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 7751420 - 7751163
Alignment:
Q  20 ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatt 119  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |    
T  7751420 ttgaattcctttaatcatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagagttagcttcaaattcattcccatcttgaaggcgcacat 7751321  T
Q  120 tctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcag 219  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| |       
T  7751320 tctgcaggcaaggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctagtaaagaga 7751221  T
Q  220 gacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||||||| ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7751220 gacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 7751163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 19 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 17741887 - 17741635
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||| ||||  || | ||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  17741887 gttgagttcctttgatcatacaccagtaatcttatgcttgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaaca-t 17741789  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  | |    
T  17741788 ttctgcaggcagagatgttgtattgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-ttagagaa 17741690  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttc 273  Q
    ||||||| || ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  17741689 ggacaagcacccagtgcttttcaaatgattgttgatacctccctttcaattcttc 17741635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 12855038 - 12855290
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  12855038 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 12855137  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  12855138 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 12855237  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12855238 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 12855290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 12865564 - 12865816
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  12865564 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 12865663  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  12865664 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 12865763  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12865764 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 12865816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 25735742 - 25735486
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| |||||||||||||| |    
T  25735742 gttgagttcctt-gatcatctaccagtaatcctttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaaca-t 25735645  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | || | |    
T  25735644 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacatttgtactttgtcaactct-tcaatgaa 25735546  T
Q  219 ggacaagtactcagtgc-tcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||||||| || |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25735545 ggacaagcacccagtgctttttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 25735486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 17984889 - 17984637
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  17984889 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 17984790  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  17984789 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 17984690  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17984689 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 17984637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 32962108 - 32961856
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  32962108 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 32962009  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  32962008 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagagagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 32961909  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32961908 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 32961856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 32972727 - 32972475
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  32972727 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 32972628  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  32972627 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagagagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 32972528  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32972527 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 32972475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 33199345 - 33199597
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||| |||||||    
T  33199345 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcctatcttgaatgtacaaattctgca 33199444  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  33199445 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 33199544  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||| | | || ||  |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  33199545 gtgctcagtgttatccatatatccgttgatacctccctttcaatttttcgttc 33199597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 34807339 - 34807087
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  34807339 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 34807240  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  34807239 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagatagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 34807140  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34807139 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 34807087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 34817971 - 34817719
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  34817971 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 34817872  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  34817871 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagatagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 34817772  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34817771 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 34817719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 25686933 - 25686677
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| |||||||||||||| |    
T  25686933 gttgagttcctt-gatcatccaccagtaatctttttcttgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaaca-t 25686836  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || | |    
T  25686835 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtagaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaatgaa 25686737  T
Q  219 ggacaagtactcagtgc-tcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25686736 ggacaagcacccagtgcttcttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 25686677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Original strand, 25518701 - 25518956
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||  || | |||||||||||||||  ||||||||||||| |    
T  25518701 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgttgtgctatgaaggatcaacttcaaattcattcctgtcttgaaggaaca-t 25518799  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || | |    
T  25518800 ttctggaggcagagctgttgtcttgtcttgtaacgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaatgaa 25518898  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||| |||| ||| | ||||||||||    
T  25518899 ggacaagcacccagtgcttttcagatgaccgttgata-ctcctttttaattcttcgttc 25518956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 3661400 - 3661651
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  3661400 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaa-ttctgca 3661498  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  3661499 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 3661598  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3661599 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 3661651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 3672064 - 3672315
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  3672064 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaa-ttctgca 3672162  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  3672163 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 3672262  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3672263 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 3672315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 17982680 - 17982428
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  17982680 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctctgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 17982581  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  17982580 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 17982481  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17982480 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 17982428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 26025476 - 26025728
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  26025476 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 26025575  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  26025576 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 26025675  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  26025676 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattctttgttc 26025728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 26036050 - 26036302
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  26036050 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 26036149  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  26036150 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 26036249  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  26036250 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattctttgttc 26036302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 26864805 - 26865057
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||  ||||||    
T  26864805 tcctttgaatatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaaatctgca 26864904  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  26864905 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 26865004  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26865005 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 26865057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 26875429 - 26875681
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||  ||||||    
T  26875429 tcctttgaatatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaaatctgca 26875528  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  26875529 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 26875628  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26875629 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 26875681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 26 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 31982805 - 31982557
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  31982805 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 31982706  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  31982705 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 31982606  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttc 273  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  31982605 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttc 31982557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 16930468 - 16930719
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||    
T  16930468 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttaggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaatt-ctgca 16930566  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  16930567 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 16930666  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16930667 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 16930719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 26 - 273
Target Start/End: Original strand, 27341711 - 27341959
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  27341711 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 27341810  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  27341811 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 27341910  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttc 273  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  27341911 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttc 27341959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 26 - 273
Target Start/End: Original strand, 27402451 - 27402699
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  27402451 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 27402550  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  27402551 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 27402650  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttc 273  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  27402651 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttc 27402699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 26 - 273
Target Start/End: Original strand, 27413110 - 27413358
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  27413110 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 27413209  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  27413210 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 27413309  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttc 273  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  27413310 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttc 27413358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 29384769 - 29385020
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    |||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||    
T  29384769 tcctttaattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaatt-ctgca 29384867  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  29384868 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 29384967  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29384968 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 29385020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 4630890 - 4631142
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  4630890 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 4630989  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  4630990 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 4631089  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || |  |||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4631090 gtgcagagtgctttccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 4631142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 16959639 - 16959890
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  16959639 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttaggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaa-ttctgca 16959737  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  16959738 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgcacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 16959837  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16959838 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 16959890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 32301222 - 32300970
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  32301222 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 32301123  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  32301122 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 32301023  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || |  |||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32301022 gtgcagagtgctttccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 32300970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 32311911 - 32311659
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  32311911 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 32311812  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  32311811 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 32311712  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || |  |||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32311711 gtgcagagtgctttccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 32311659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 43 - 277
Target Start/End: Original strand, 25675196 - 25675429
Alignment:
Q  43 agtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgtctt 142  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25675196 agtaatcctttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaaca-tttctgcaggcagagctgttgtctt 25675294  T
Q  143 gtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtactcagtgc-tcttca 241  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | || | |||||||| || |||||| | ||||    
T  25675295 gtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacatttgtactttgtcaactct-tcaatgaaggacaagcacccagtgctttttca 25675393  T
Q  242 aatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  25675394 aatgaccgttgataccttcctttcaattcttcgttc 25675429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Original strand, 25679249 - 25679505
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| |||||||||||||| |    
T  25679249 gttgagttcctt-gatcatctactagtaatcctttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaaca-t 25679346  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | || | |    
T  25679347 ttctgcaggaagagctgatgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacatttgtactttgtcaactct-tcaatgaa 25679445  T
Q  219 ggacaagtactcagtgc-tcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||||||| || |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  25679446 ggacaagcacccagtgctttttcaaatgaccgttgatacctacctttcaattcttcgttc 25679505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 12717014 - 12716761
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttga-aggaacaatttctgc 124  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||    
T  12717014 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgc 12716915  T
Q  125 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 223  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   ||||    
T  12716914 aggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaaagagagaca 12716815  T
Q  224 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  12716814 agagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcatcgttc 12716761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 12727663 - 12727410
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttga-aggaacaatttctgc 124  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||    
T  12727663 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgc 12727564  T
Q  125 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 223  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   ||||    
T  12727563 aggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaaagagagaca 12727464  T
Q  224 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  12727463 agagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcatcgttc 12727410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 19289565 - 19289322
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||  ||   ||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  19289565 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttggatgtagtcctatgaaggatcgacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaa- 19289467  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || | |    
T  19289466 ttctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaatgaa 19289368  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctcccttt 264  Q
    ||||||| || ||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||    
T  19289367 ggacaagcacccagtgcttttcaaatgaacgttggcacctcccttt 19289322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 27384450 - 27384701
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||  |||||||    
T  27384450 tcctttaatcatccaccagtgatcctttgcctgatatgggtgtagtcctttgaagagttagcttcaaaatcattcccatcttgaaggcgcacattctgca 27384549  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 225  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| |   ||||||    
T  27384550 ggcaaggctgttgttttgtcttgtagcgaagacaaaaacagagtaatggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctagtaaagagagacaag 27384649  T
Q  226 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    | ||||||||| | || ||  ||||||  |||||||||||| ||||| ||||    
T  27384650 tgctcagtgctatccatatatccgttggaacctccctttcaattctttgttc 27384701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 27474863 - 27475114
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||  |||||||    
T  27474863 tcctttaatcatccaccagtgatcctttgcctgatatgggtgtagtcctttgaagagttagcttcaaaatcattcccatcttgaaggcgcacattctgca 27474962  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 225  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| |   ||||||    
T  27474963 ggcaaggctgttgttttgtcttgtagcgaagacaaaaacagagtaatggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctagtaaagagagacaag 27475062  T
Q  226 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    | ||||||||| | || ||  ||||||  |||||||||||| ||||| ||||    
T  27475063 tgctcagtgctatccatatatccgttggaacctccctttcaattctttgttc 27475114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 27504362 - 27504613
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||  |||||||    
T  27504362 tcctttaatcatccaccagtgatcctttgcctgatatgggtgtagtcctttgaagagttagcttcaaaatcattcccatcttgaaggcgcacattctgca 27504461  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 225  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| |   ||||||    
T  27504462 ggcaaggctgttgttttgtcttgtagcgaagacaaaaacagagtaatggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctagtaaagagagacaag 27504561  T
Q  226 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    | ||||||||| | || ||  ||||||  |||||||||||| ||||| ||||    
T  27504562 tgctcagtgctatccatatatccgttggaacctccctttcaattctttgttc 27504613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 119 - 277
Target Start/End: Original strand, 6158317 - 6158475
Alignment:
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||      
T  6158317 ttctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgag 6158416  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |||||| | ||||||||| | || |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  6158417 ggacaaatgctcagtgctatccatatgaccgttgttacctccctttcaattcttcgttc 6158475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 12953315 - 12953126
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  || | ||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  12953315 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaa- 12953217  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactct 209  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12953216 ttctacaggcagagctgttatcttgtattgtagcgaggacacactcagggtcgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 12953126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 103 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 25723059 - 25722886
Alignment:
Q  103 atcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgt 202  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  25723059 atcttgaaggaaca-tttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtagttgtacatttgtactttgt 25722961  T
Q  203 caactctgttaacgcaggacaagtactcagtgc-tcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||||||| | || | ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25722960 caactct-tcaatgaaggacaagtacccagtgctttttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 25722886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 251
Target Start/End: Original strand, 31931434 - 31931664
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||  || | ||||||||||||||| | |||||||||||||     
T  31931434 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatattttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctaacttgaaggaacaa- 31931532  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || |      
T  31931533 ttctgcaggcagagttgttaacttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaatgag 31931631  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgtt 251  Q
    ||||||| || ||||||| ||||||||| ||||    
T  31931632 ggacaagcacccagtgcttttcaaatgaacgtt 31931664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 20 - 209
Target Start/End: Original strand, 18498632 - 18498820
Alignment:
Q  20 ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatt 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | ||  || | ||||||||||||||  ||||||||||||||| |    
T  18498632 ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctataaaggatcaacttcaaattcattcttatcttgaaggaacaa-t 18498730  T
Q  120 tctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactct 209  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18498731 tctgcaggcagagctgttattttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 18498820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 27 - 209
Target Start/End: Original strand, 11205965 - 11206146
Alignment:
Q  27 cctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcag 126  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | || || |||| ||| |  ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  11205965 cctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttggatattgtactatgaaaaatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaaca-tttctgcag 11206063  T
Q  127 gcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactct 209  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| | ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11206064 gcagagctgttatcttgtgttgtagcatagacaaaagcagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 11206146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 30 - 252
Target Start/End: Original strand, 11235521 - 11235741
Alignment:
Q  30 ttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggca 129  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | ||||| |||| ||| |  ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  11235521 ttgatcatccacctgtaatcttttgcctgatttggatattgtcctatgaaaaatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaaca-tttctgcaggca 11235619  T
Q  130 gagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtact 229  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | || | |||||||| ||     
T  11235620 gagctgttatcttgtcttgtagcgtagacaaaagtagaatagtggaggtagtggttgtacacttgtaatttgtcaactct-tcaatgaaggacaagcacc 11235718  T
Q  230 cagtgctcttcaaatgaccgttg 252  Q
    ||||||| ||||||||| |||||    
T  11235719 cagtgcttttcaaatgaacgttg 11235741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Original strand, 18555281 - 18555470
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||  |||  || | ||||||||||||||| ||||||| |||||||     
T  18555281 gttgagttccttagatcatccacgagtaaacttttgcctgatttgggtgtagtcctacgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgagggaacaa- 18555379  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactct 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18555380 ttctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 18555470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 162 - 277
Target Start/End: Original strand, 13928341 - 13928456
Alignment:
Q  162 aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccc 261  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13928341 aacaaagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttatcgaaggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccc 13928440  T
Q  262 tttcatttcttcgttc 277  Q
    ||||| ||||||||||    
T  13928441 tttcaattcttcgttc 13928456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 52 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 7586408 - 7586210
Alignment:
Q  52 ttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtag 151  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7586408 ttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaaca-tttctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtag 7586310  T
Q  152 cgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgtt 251  Q
    ||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || | |||||||| || ||||||| ||||||||| ||||    
T  7586309 cgtagacacaaacagagtcgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaatgaaggacaagcacccagtgcttttcaaatgaacgtt 7586211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 30 - 252
Target Start/End: Original strand, 21128103 - 21128323
Alignment:
Q  30 ttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggca 129  Q
    |||||||  ||||| | ||| |||||||||||||| ||| ||||| |||| |||    ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  21128103 ttgatcaatcaccaattatcttttgcctgatttggttgttgtcctatgaagaatcgcattcaaatccattcctatcttgaaggaaca-tttctgcaggca 21128201  T
Q  130 gagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtact 229  Q
    ||| |||| |||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || | |||||||| ||     
T  21128202 gagatgttatcttgtcttgtagcgtagacacaaacagagtcgtggaagtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaatgaaggacaagcacc 21128300  T
Q  230 cagtgctcttcaaatgaccgttg 252  Q
    ||||||| ||||||||| |||||    
T  21128301 cagtgcttttcaaatgaacgttg 21128323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 30 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 17608579 - 17608401
Alignment:
Q  30 ttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggca 129  Q
    |||||||  ||||| | ||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||  || |  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  17608579 ttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggttgttgtcctatgaaggatcacgttcaaattcattcctatcttgaaggaaca-tttctgcaggca 17608481  T
Q  130 gagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactct 209  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17608480 gagctgtttttcttgtcttgtagcgtagacaa-aacaaagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 17608401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 30 - 209
Target Start/End: Original strand, 20635595 - 20635775
Alignment:
Q  30 ttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggca 129  Q
    |||||||  ||||| | ||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  20635595 ttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaaca-ttgctgcaggca 20635693  T
Q  130 gagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtacttcgtcaactct 209  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  20635694 gagctgtttttcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactttgtactttgtcaactct 20635775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 27 - 252
Target Start/End: Original strand, 17047573 - 17047795
Alignment:
Q  27 cctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcag 126  Q
    ||||||||| | ||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  17047573 cctttgatctttcaccattaaacttttgcctgatttggatgtagtcctttaaagaattaacttaaaattcattcctatcttgaaggaacaa-atctgcag 17047671  T
Q  127 gcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagag-tagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 225  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||    ||||| | |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||   ||   | ||||||    
T  17047672 gcagagctgttatcttgtcctgtagcgaggacacactcagagttcgtggaggtcgtggttgtacatttgtactttgtcaactcttaaaa---aagacaag 17047768  T
Q  226 tactcagtgctcttcaaatgaccgttg 252  Q
     || ||||||| |||||||||||||||    
T  17047769 cacccagtgcttttcaaatgaccgttg 17047795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 30 - 209
Target Start/End: Original strand, 22386678 - 22386858
Alignment:
Q  30 ttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggca 129  Q
    |||||||  ||||| | ||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||  || |  || |||| ||||   |||||||||||||| || |||||||||    
T  22386678 ttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttaaaatccattaatatcttgaaggaaca-ttactgcaggca 22386776  T
Q  130 gagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt-gtacttcgtcaactct 209  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  22386777 gagctgtttttcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttggtactttgtcaactct 22386858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 30 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 14051654 - 14051495
Alignment:
Q  30 ttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggca 129  Q
    |||||||  ||||| | ||| |||||||||||||| ||| ||||| |||| |||||  ||||||| |||||  |  |||||| |||| ||||||||||||    
T  14051654 ttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaagaattaatttcaaatccattctgaatttgaagaaaca-tttctgcaggca 14051556  T
Q  130 gagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtac 189  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  14051555 gagctgtttttcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggaagtggctgtac 14051495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 26 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 26022972 - 26022881
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaa 117  Q
    ||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  26022972 tcctttgattattcaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggattaggtttaaattcattcccattttgaaggcacaa 26022881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 88 - 193
Target Start/End: Original strand, 29917951 - 29918056
Alignment:
Q  88 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 186  Q
    ||||||| |||||||||  |||| |||||  || |||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29917951 ttcaaatgcattcccattgtgaatgaacatctt-tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcatagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttg 29918049  T
Q  187 tacactt 193  Q
    |||||||    
T  29918050 tacactt 29918056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 88 - 193
Target Start/End: Original strand, 9717777 - 9717882
Alignment:
Q  88 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 186  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||||| | | |||||||||||||||| | ||||||||||| |   ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9717777 ttcaaatccattcccattgtgaaggaacattgt-tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtatcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttg 9717875  T
Q  187 tacactt 193  Q
    |||||||    
T  9717876 tacactt 9717882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 14070335 - 14070176
Alignment:
Q  30 ttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggca 129  Q
    |||||||  ||||| | ||| |||| ||||||||| ||  ||||| |||| |||||  ||||||| |||||  |  |||||| |||| ||||||||||||    
T  14070335 ttgatcaatcaccaatgatcttttgtctgatttggatgatgtcctatgaagaattaatttcaaatccattctgaatttgaagaaaca-tttctgcaggca 14070237  T
Q  130 gagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtac 189  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  14070236 gagctgtttttcttgtcttgtagcgtagaaaaaaacagagtagtggaggaagtggctgtac 14070176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 232 - 283
Target Start/End: Original strand, 5845324 - 5845375
Alignment:
Q  232 gtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttcatctca 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  5845324 gtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctca 5845375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 88 - 193
Target Start/End: Original strand, 15954637 - 15954742
Alignment:
Q  88 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 186  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||   | |||||||||||||||| | ||||||||||||    ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15954637 ttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatcat-tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagaagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttg 15954735  T
Q  187 tacactt 193  Q
    |||||||    
T  15954736 tacactt 15954742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 88 - 193
Target Start/End: Original strand, 32544199 - 32544304
Alignment:
Q  88 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 186  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||   | |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  32544199 ttcaaatccattcccattgtgaaggaacatcgt-tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacagaaacagagtagtggaggtagtggttg 32544297  T
Q  187 tacactt 193  Q
    |||||||    
T  32544298 tacactt 32544304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Original strand, 16877180 - 16877252
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16877180 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagaggcaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 16877252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 22076589 - 22076517
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22076589 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 22076517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Original strand, 22802108 - 22802180
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22802108 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtggttgtacactt 22802180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 14100620 - 14100550
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||| |||||| |||| ||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14100620 tgcatgcagagttgttttcttgtcttgtagcagagacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 14100550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 193
Target Start/End: Original strand, 21235058 - 21235164
Alignment:
Q  88 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaa-cagagtagtggaggtagtggtt 185  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||  ||| ||||||||||||||| | |||||||||||||   |||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  21235058 ttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatcttc-gcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaatatcagagtagtggaggtagtggtt 21235156  T
Q  186 gtacactt 193  Q
    ||||||||    
T  21235157 gtacactt 21235164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 88 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 20488133 - 20488028
Alignment:
Q  88 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 186  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||   | |||||||||||||||| | |||||||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20488133 ttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatcgt-tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagatacaaaaacagagtagtggaggtagtggttg 20488035  T
Q  187 tacactt 193  Q
    || ||||    
T  20488034 taaactt 20488028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 88 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 20730919 - 20730814
Alignment:
Q  88 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 186  Q
    ||||||| ||||| |||  ||||||||||  || || ||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  20730919 ttcaaatgcattcacattgtgaaggaacatctt-tgtaggcagagctgtttttcttgtcttgtagctgagacaaaaacagagcagtggaggtagtggttg 20730821  T
Q  187 tacactt 193  Q
    |||||||    
T  20730820 tacactt 20730814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 121 - 193
Target Start/End: Original strand, 12423227 - 12423300
Alignment:
Q  121 ctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||| |||| | |||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12423227 ctgcaggcagagttgtttttcttgtcttatagcggagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 12423300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Original strand, 13435499 - 13435571
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13435499 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaatatagagtagtggaggtagtggttgtacactt 13435571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 122 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 15531806 - 15531738
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtac 189  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   |||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  15531806 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaagacagagtagtggaggtagtggttgtac 15531738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Original strand, 16336094 - 16336166
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  16336094 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtgtagatagtggttgtacactt 16336166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Original strand, 17381488 - 17381560
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  17381488 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagaatagtggaggtagtgattgtacactt 17381560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Original strand, 18435523 - 18435595
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  18435523 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagtgtactggaggtagtggttgtacactt 18435595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #107
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 162 - 198
Target Start/End: Original strand, 19625816 - 19625852
Alignment:
Q  162 aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtact 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19625816 aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtact 19625852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #108
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 193
Target Start/End: Original strand, 19623932 - 19624018
Alignment:
Q  107 tgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19623932 tgaaggaaca-ttgctgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcaaagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactt 19624018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #109
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 16265365 - 16265260
Alignment:
Q  88 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 186  Q
    ||||||| |||||||||   |||||||||  || ||||||||||||| || | |||||||||||||   ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  16265365 ttcaaatgcattcccattgcgaaggaacatctt-tgcaggcagagctatttttcttgtcttgtagcagagacacaaacagagtagtggaggtagtggttg 16265267  T
Q  187 tacactt 193  Q
     ||||||    
T  16265266 cacactt 16265260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #110
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 193
Target Start/End: Original strand, 19086092 - 19086197
Alignment:
Q  88 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 186  Q
    |||||||||||||| |   |||||||||| ||  |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||  ||| ||||||||||| |||||||||    
T  19086092 ttcaaattcattccaagtatgaaggaaca-ttgatgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttg 19086190  T
Q  187 tacactt 193  Q
    |||||||    
T  19086191 tacactt 19086197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #111
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 193
Target Start/End: Original strand, 21625086 - 21625140
Alignment:
Q  139 tcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  21625086 tcttgtcttgtagcacggacaaaaacaaagtagtggagatagtggttgtacactt 21625140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #112
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 140 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 19066181 - 19066128
Alignment:
Q  140 cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||||   ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19066181 cttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacactt 19066128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #113
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 193
Target Start/End: Original strand, 12348980 - 12349032
Alignment:
Q  141 ttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||   |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12348980 ttgtcttgtagtagggacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 12349032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #114
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 16123183 - 16123143
Alignment:
Q  237 cttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  16123183 cttcaaatgaccgttgatacctccctttcaaatcttcgttc 16123143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #115
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 17316707 - 17316635
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||    
T  17316707 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacaaaaacatagtagtgcagatagtggttgtacactt 17316635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #116
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 33352108 - 33352036
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    ||||| |||||||||| | |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  33352108 tgcagacagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtgattgtacactt 33352036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #117
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 162 - 193
Target Start/End: Original strand, 21618252 - 21618283
Alignment:
Q  162 aacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21618252 aacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 21618283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #118
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 88 - 193
Target Start/End: Original strand, 15302134 - 15302239
Alignment:
Q  88 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 186  Q
    ||||||||||||||||   || ||||||| | | |||||||| ||||||| || ||||||||||||   ||||  ||| ||||||||||| |||||||||    
T  15302134 ttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgt-tgcaggcatagctgttatccttgtcttgtagcagagacactaactgagtagtggagatagtggttg 15302232  T
Q  187 tacactt 193  Q
    |||||||    
T  15302233 tacactt 15302239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #119
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 120 - 193
Target Start/End: Original strand, 19482717 - 19482791
Alignment:
Q  120 tctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||    ||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  19482717 tctgcaggcagagctgttattcttgtcttttagtagagacaaaaacagagtagtgcagatagtggttgtacactt 19482791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #120
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 193
Target Start/End: Original strand, 26589584 - 26589638
Alignment:
Q  139 tcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    ||||||||||||||   ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26589584 tcttgtcttgtagcagagacagaaacagagtagtggaagtagtggttgtacactt 26589638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #121
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 26972390 - 26972336
Alignment:
Q  139 tcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    ||||||||||||||   |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26972390 tcttgtcttgtagcagagacaaatactgagtagtggaggtagtggttgtacactt 26972336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #122
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 243 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 32761894 - 32761860
Alignment:
Q  243 atgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32761894 atgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 32761860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #123
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 193
Target Start/End: Original strand, 24116798 - 24116867
Alignment:
Q  125 aggcagagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||   ||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24116798 aggcagagctgttatccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactt 24116867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #124
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 193
Target Start/End: Original strand, 26943578 - 26943615
Alignment:
Q  156 gacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26943578 gacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacactt 26943615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #125
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 166 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 18172171 - 18172139
Alignment:
Q  166 gagtagtggaggtagtggttgtacacttgtact 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18172171 gagtagtggaggtagtggttgtacaattgtact 18172139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #126
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 166 - 198
Target Start/End: Original strand, 19875844 - 19875876
Alignment:
Q  166 gagtagtggaggtagtggttgtacacttgtact 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19875844 gagtagtggaggtagtggttgtacaattgtact 19875876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #127
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Original strand, 23284531 - 23284603
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||  ||||  ||| ||||||||||| || ||||| |||||||    
T  23284531 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagataatggttatacactt 23284603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #128
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 162 - 198
Target Start/End: Original strand, 25592625 - 25592661
Alignment:
Q  162 aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtact 198  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  25592625 aacagagtagtggagatagtggttgtacaattgtact 25592661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 108)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Original strand, 26867107 - 26867364
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26867107 gttgagttcctttgatcatccaccaacaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 26867206  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  26867207 t-ctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaa 26867305  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  26867306 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcaatgcttcgttc 26867364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 18769099 - 18768842
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  18769099 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaa 18769000  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  18768999 ttctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaa 18768901  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18768900 ggacaaatactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 18768842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 27978575 - 27978318
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  27978575 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattctcatcttgaaggaaca-t 27978477  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |    
T  27978476 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataacgaa 27978377  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27978376 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 27978318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 28065104 - 28064847
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  28065104 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattctcatcttgaaggaaca-t 28065006  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |    
T  28065005 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataacgaa 28064906  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28064905 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 28064847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Original strand, 26879696 - 26879953
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26879696 gttgagttcctttgatcattcaccagcaatcctttgtctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 26879795  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |    
T  26879796 t-ctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactttgttaatgaa 26879894  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26879895 ggataagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 26879953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 38586280 - 38586022
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  38586280 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaac-at 38586182  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtac-ttcgtcaactctgttaacgc 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| |     
T  38586181 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttttagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttttgtcaactatgttaaaga 38586082  T
Q  218 aggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  38586081 aggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcaaatcttcgttc 38586022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 24415215 - 24414958
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||     
T  24415215 gttgagttcctttgatcattcaccagtaatcatttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattctcatcttgaaggcacaaa 24415116  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |    
T  24415115 ttctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactttgttaacgaa 24415017  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |||||| ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24415016 ggacaaatactcagtgctatccaaatgatcgttgatacctccctttcaattcttcgttc 24414958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 21172652 - 21172402
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  21172652 tcctttgatcattcaccagtaattctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 21172553  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 225  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||     
T  21172552 agcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgaaggacaaa 21172454  T
Q  226 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21172453 tactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 21172402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 28721502 - 28721252
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  28721502 tcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaggaattaacttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 28721403  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 225  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||      
T  28721402 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaga 28721304  T
Q  226 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28721303 tactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 28721252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 28732088 - 28731840
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  28732088 tcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttggatgtagtcctttgaggaattaacttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 28731989  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 225  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  28731988 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggt--tacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 28731892  T
Q  226 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28731891 tactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 28731840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 2561532 - 2561782
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||    
T  2561532 tcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattatcttcaaattcattcccactttgaaggcacaaattctgca 2561631  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 225  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  2561632 gacatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 2561730  T
Q  226 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    | ||||| ||| | ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  2561731 tgctcagcgctgtccaagtgaccgttgataccttcctttcaattcttcgttc 2561782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 19 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 967695 - 967440
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||   || | ||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  967695 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctgtgacggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaaca-t 967597  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || | |    
T  967596 ttctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaatgaa 967498  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgtt 276  Q
    ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  967497 ggacaagcacccagtgcttttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgtt 967440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 19 - 276
Target Start/End: Original strand, 24275062 - 24275317
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||   || |  |||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  24275062 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgacggatcaaattcaaattcattcctatcttgaaggaaca-t 24275160  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || | |    
T  24275161 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcatagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaatgaa 24275259  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgtt 276  Q
    ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24275260 ggacaagcacccagtgcttttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgtt 24275317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 19 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 17969401 - 17969146
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  17969401 gttgagttcctttgatcatccaccattaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggattaacttcaaattcattcctatcttgaaggaac-at 17969303  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || | |    
T  17969302 ttctgcaggcagagctgttgttttgtcttgtagcgtagacaaaaatagagtagtggatgtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaatgaa 17969204  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgtt 276  Q
    |||| || || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17969203 ggacgagcacccagtgcttttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgtt 17969146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 29244263 - 29244515
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  29244263 tcctttgattatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtacaacttctgca 29244362  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  29244363 ggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 29244462  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29244463 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 29244515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 29254842 - 29255094
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  29254842 tcctttgattatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtacaacttctgca 29254941  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  29254942 ggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 29255041  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29255042 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 29255094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 7005994 - 7005742
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  7005994 tcctttgattatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtacaacttctgca 7005895  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  7005894 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 7005795  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7005794 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 7005742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 43082688 - 43082941
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  43082688 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtacaacttctgca 43082787  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   || ||    
T  43082788 ggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagactagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagataa 43082887  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaa-atgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | ||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43082888 gtgctcagtgctatccaatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 43082941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 43093297 - 43093550
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  43093297 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtacaacttctgca 43093396  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||   |||||||||||||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  43093397 ggcatgactgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagactagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 43093496  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaa-atgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | ||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43093497 gtgctcagtgctatccaatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 43093550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 17857624 - 17857372
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  17857624 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtacaaattctgca 17857525  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  17857524 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 17857425  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17857424 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 17857372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Original strand, 22774395 - 22774652
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| |||||||||||||| |    
T  22774395 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaaca-t 22774493  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || | |    
T  22774494 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaatagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaatgaa 22774592  T
Q  219 ggacaagtactcagtgc-tcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  22774593 ggacaagcacccagtgcttcttcaaatgaccgttgatacctcccttttaattcttcgttc 22774652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 20 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 36784989 - 36784740
Alignment:
Q  20 ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatt 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||   || | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36784989 ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcatttgagggatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatt 36784890  T
Q  120 tctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcag 219  Q
     ||||||||       ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || ||    
T  36784889 -ctgcaggc-------ttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgatagcgaag 36784798  T
Q  220 gacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||||||||  || |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36784797 gacaagtatccaatgctttccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 36784740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 9897761 - 9897509
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  9897761 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 9897662  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  9897661 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 9897562  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9897561 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 9897509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 9908349 - 9908097
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  9908349 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 9908250  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  9908249 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 9908150  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9908149 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 9908097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 24327921 - 24327669
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  24327921 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtacaaattctgca 24327822  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||   ||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  24327821 ggcatgactgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 24327722  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24327721 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 24327669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 36252031 - 36251779
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  36252031 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 36251932  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  36251931 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 36251832  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36251831 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 36251779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 11388996 - 11388744
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  11388996 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 11388897  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  11388896 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 11388797  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11388796 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 11388744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 24338591 - 24338339
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  24338591 tcctttgattatccatcagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtacaaattctgca 24338492  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  24338491 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 24338392  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || |||| |||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24338391 gtgctcaatgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 24338339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 40222374 - 40222626
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  40222374 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 40222473  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  40222474 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 40222573  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40222574 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 40222626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 40251235 - 40251487
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  40251235 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 40251334  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  40251335 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 40251434  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40251435 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 40251487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 1099382 - 1099130
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  1099382 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 1099283  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  1099282 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 1099183  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1099182 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 1099130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 4099825 - 4100077
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  4099825 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 4099924  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  4099925 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 4100024  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4100025 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 4100077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 4220524 - 4220776
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  4220524 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 4220623  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  4220624 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 4220723  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4220724 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 4220776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 9773493 - 9773241
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  9773493 tcctttgattatccaccagtgattctttgcctgatttaggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 9773394  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  9773393 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 9773294  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9773293 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 9773241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 10267035 - 10267287
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  10267035 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 10267134  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  10267135 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 10267234  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10267235 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 10267287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 10277612 - 10277864
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  10277612 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 10277711  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  10277712 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 10277811  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10277812 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 10277864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 18392824 - 18392572
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  18392824 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 18392725  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  18392724 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 18392625  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18392624 gtgctcagtgctttccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttc 18392572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 22915051 - 22914799
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  22915051 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 22914952  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  ||| |||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  22914951 ggcatggctattgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 22914852  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22914851 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 22914799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 32217915 - 32218167
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  32217915 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 32218014  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  32218015 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 32218114  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32218115 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 32218167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 34790404 - 34790152
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  34790404 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 34790305  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  34790304 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgaagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 34790205  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || || |||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34790204 gtgcttagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 34790152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 34804547 - 34804295
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  34804547 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 34804448  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  34804447 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgaagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 34804348  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || || |||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34804347 gtgcttagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 34804295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 39170282 - 39170030
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  39170282 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 39170183  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  39170182 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 39170083  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39170082 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 39170030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 19498183 - 19497940
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||  || |  |||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  19498183 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcatgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaagttcaaattcattcctatcttaaaggaaca-t 19498085  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || | |    
T  19498084 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagagtagacacaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaatgaa 19497986  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctcccttt 264  Q
    ||||||| || ||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||    
T  19497985 ggacaagcacccagtgcttttcaaatgaacgttggcacctcccttt 19497940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 4209932 - 4210184
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  4209932 tcctttgattatccaccagtgatcatttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 4210031  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  4210032 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 4210131  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4210132 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 4210184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 9762957 - 9762705
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  9762957 tcctttgattatccaccagtgattctttgcctgatttaggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 9762858  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  9762857 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaaagagagacaa 9762758  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9762757 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 9762705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 11395359 - 11395107
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  11395359 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 11395260  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  11395259 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 11395160  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  11395159 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattctttgttc 11395107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 11405675 - 11405423
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  11405675 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 11405576  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  11405575 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 11405476  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  11405475 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattctttgttc 11405423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 21650718 - 21650467
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||    
T  21650718 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaatt-ctgca 21650620  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  21650619 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 21650520  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21650519 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 21650467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 22960519 - 22960267
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||  | |||| |||||||    
T  22960519 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattctcatcttgagtgtacaaattctgca 22960420  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  ||| |||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  22960419 ggcatggctattgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 22960320  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22960319 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 22960267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 34477970 - 34478221
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  34477970 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaa-ttctgca 34478068  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  34478069 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 34478168  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34478169 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 34478221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 43355064 - 43355315
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  43355064 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaa-ttctgca 43355162  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  43355163 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 43355262  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43355263 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 43355315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 27221422 - 27221675
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttga-aggaacaatttctgc 124  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||    
T  27221422 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgc 27221521  T
Q  125 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 223  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   ||||    
T  27221522 aggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagaca 27221621  T
Q  224 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27221622 agagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttc 27221675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Original strand, 22763691 - 22763948
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||  |||| |||   || |  ||||||| |||||| |||||||||||||| |    
T  22763691 gttgagttcctttgatcatccaccaataatcttttgcctgatttggatgttctcctatgacggatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaaca-t 22763789  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | || | |    
T  22763790 ttctgcaggtagagctggtgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttatcaactct-tcaatgaa 22763888  T
Q  219 ggacaagtactcagtgc-tcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  22763889 ggacaagcacccagtgcttcttcaaatgaccgttgatacctcccttttaattcttcgttc 22763948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 30489011 - 30488758
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaag-gaacaatttctgc 124  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||   | |||| ||||||    
T  30489011 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcgttcccatcttgagttgtacaaattctgc 30488912  T
Q  125 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 223  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   ||||    
T  30488911 aggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagaca 30488812  T
Q  224 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||| ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30488811 agtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 30488758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 35253023 - 35253276
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttga-aggaacaatttctgc 124  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||    
T  35253023 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgc 35253122  T
Q  125 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 223  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   ||||    
T  35253123 aggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagaca 35253222  T
Q  224 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||| ||||||| | | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35253223 agtgctcagtgttatccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttc 35253276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 35263632 - 35263885
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttga-aggaacaatttctgc 124  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||    
T  35263632 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgc 35263731  T
Q  125 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 223  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   ||||    
T  35263732 aggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagaca 35263831  T
Q  224 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||| ||||||| | | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35263832 agtgctcagtgttatccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttc 35263885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 35274257 - 35274510
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttga-aggaacaatttctgc 124  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||    
T  35274257 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgc 35274356  T
Q  125 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 223  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   ||||    
T  35274357 aggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagaca 35274456  T
Q  224 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||| ||||||| | | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35274457 agtgctcagtgttatccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttc 35274510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 43345449 - 43345700
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||  | |||| |||||||    
T  43345449 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcatttccatcttgagtgtacaa-ttctgca 43345547  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  43345548 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 43345647  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |  ||||||||| | || ||  || ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43345648 gagctcagtgctatccatatatccattgatacctccctttcaattcttcgttc 43345700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 26 - 236
Target Start/End: Original strand, 16768984 - 16769195
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  16768984 tcctttgattattcaccagtaatactttgcctgatttgggtgtggtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtacaacttctgca 16769083  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||   |||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  16769084 ggcatgactgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 16769183  T
Q  225 gtactcagtgct 236  Q
    || |||||||||    
T  16769184 gtgctcagtgct 16769195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 19300202 - 19299959
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||  || | ||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  19300202 gttgagtacctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttggatgtagtcctatgaaggataaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaa- 19300104  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || | |    
T  19300103 ttctgcaggcagagctgttatcttgtctggtagcgtagacacactcagagttgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaatgaa 19300005  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctcccttt 264  Q
    ||||||  || ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  19300004 ggacaaacacccagtgcttttcaaatgaacgttgacacctcccttt 19299959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 19313209 - 19312966
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||  || | ||||||||||||| | |||||||||||||||     
T  19313209 gttgagtacctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttggatgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcatttctatcttgaaggaacaa- 19313111  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| | || | |    
T  19313110 ttctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgtagacacactcagagttgtggagatagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaatgaa 19313012  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctcccttt 264  Q
    ||||||| || ||||||| ||||||||| |||||| || |||||||    
T  19313011 ggacaagcacacagtgcttttcaaatgaacgttgaaacatcccttt 19312966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 132 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 28374595 - 28374450
Alignment:
Q  132 gctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtactca 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28374595 gctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaagtactca 28374496  T
Q  232 gtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  28374495 gtgctctccaactgaccgttgataccttcctttcaattcttcgttc 28374450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 88 - 277
Target Start/End: Original strand, 22779842 - 22780030
Alignment:
Q  88 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgt 187  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  22779842 ttcaaatccattcctatcttgaaggaaca-tttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaatagagtagtggaggtagtggttgt 22779940  T
Q  188 acacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtactcagtgc-tcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |||||||||||| ||||||||| | || | |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  22779941 acacttgtactttgtcaactct-tcaatgaaggacaagcacccagtgcttcttcaaatgaccgttgatacctcccttttaattcttcgttc 22780030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 134 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 24425629 - 24425487
Alignment:
Q  134 tgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtactcagt 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  24425629 tgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatactcagt 24425531  T
Q  234 gctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  24425530 gctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaatttttcgttc 24425487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 27 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 20646791 - 20646557
Alignment:
Q  27 cctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcag 126  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  20646791 cctttgatcatccaccagtaatcttttgccttatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttt-tgcag 20646693  T
Q  127 gcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagt 226  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||  ||||||||     
T  20646692 gcagagctgttttcttgtcttgtagcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaac-aaggacaagc 20646595  T
Q  227 actcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctcccttt 264  Q
    || ||||||| ||||||| | |||||  ||||||||||    
T  20646594 acccagtgcttttcaaattaacgttggcacctcccttt 20646557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Original strand, 19356356 - 19356545
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||  || | ||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  19356356 gttgagttcctttgatcatccatcagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctataaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaa- 19356454  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactct 209  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||| |    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  19356455 ttctgcaggcagagctgttaacttgtcttgtaacgaggagacactcagggtcgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgccaactct 19356545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 19 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 24427780 - 24427670
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  24427780 gttgagttcctttgatcattcaccagtaatcctttgactgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaa 24427681  T
Q  119 ttctgcaggca 129  Q
    |||||||||||    
T  24427680 ttctgcaggca 24427670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 30 - 206
Target Start/End: Original strand, 1083884 - 1084061
Alignment:
Q  30 ttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggca 129  Q
    |||||||  ||||| | ||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| ||  |||||||||| ||||||||||||    
T  1083884 ttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggttgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctattctgaaggaaca-tttctgcaggca 1083982  T
Q  130 gagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtacttcgtcaac 206  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  1083983 gagctgtttttcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggtcgtacactttgtactttgtcaac 1084061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 30 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 24814813 - 24814633
Alignment:
Q  30 ttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggca 129  Q
    |||||||  ||||| | ||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| ||  |||||||||| ||||||||||||    
T  24814813 ttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctattctgaaggaaca-tttctgcaggca 24814715  T
Q  130 gagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt-gtacttcgtcaactct 209  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| || || | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  24814714 gagctgtttttcttgtcttgtagcgtagaaaaaagcggagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtactttgtcaactct 24814633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 88 - 209
Target Start/End: Original strand, 22755395 - 22755516
Alignment:
Q  88 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 186  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||| |    
T  22755395 ttcaaatccattcctatcttgaaggaaca-tttctgcagacagagctgttatacttgtcttgtagcgcagacaa-aacagagtagtggaagtagtggtcg 22755492  T
Q  187 taca-cttgtacttcgtcaactct 209  Q
    |||| ||||||||| |||||||||    
T  22755493 tacaccttgtactttgtcaactct 22755516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 88 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 28711870 - 28711765
Alignment:
Q  88 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 186  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||   | |||||||||||||||| | |||||||| ||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28711870 ttcaaatccattcccattgtgaaggaacatcat-tgcaggcagagctgtttttcttgtcttttagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttg 28711772  T
Q  187 tacactt 193  Q
    |||||||    
T  28711771 tacactt 28711765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 88 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 31801059 - 31800954
Alignment:
Q  88 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 186  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||   | |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  31801059 ttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatcgt-tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttg 31800961  T
Q  187 tacactt 193  Q
    |||||||    
T  31800960 tacactt 31800954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 28551057 - 28550985
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28551057 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 28550985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Original strand, 33074187 - 33074259
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33074187 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 33074259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 6574297 - 6574191
Alignment:
Q  88 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaa-cagagtagtggaggtagtggtt 185  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||  || |||||||||||||||| | ||||| |||||||   ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  6574297 ttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatctt-tgcaggcagagctgtttttcttgttttgtagcagagacaaaaaacagagtagtggaggtagtggtt 6574199  T
Q  186 gtacactt 193  Q
    ||||||||    
T  6574198 gtacactt 6574191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 1587171 - 1587100
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1587171 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaa-aacagagtagtggagatagtggttgtacactt 1587100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 164 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 21025575 - 21025488
Alignment:
Q  164 cagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttg 252  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | || | |||||||| || || |||| ||||||||| |||||    
T  21025575 cagagtcgtggaggaagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaatgaaggacaagcacccaatgcttttcaaatgaacgttg 21025488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 22776427 - 22776355
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||   ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  22776427 tgcaggcagagctgttatccttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtactggagatagtggttgtacactt 22776355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 22781805 - 22781733
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||   ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  22781805 tgcaggcagagctgttatccttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtactggagatagtggttgtacactt 22781733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 30 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 23392898 - 23392735
Alignment:
Q  30 ttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggca 129  Q
    |||||||  ||||| | ||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||| | ||  |||||||||| ||||||||||||    
T  23392898 ttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggttgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccatttctattctgaaggaaca-tttctgcaggca 23392800  T
Q  130 gagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||| || ||||||||||||   |||||    |||||| |||| |||||||||||||||||    
T  23392799 gagctgttatcattgtcttgtagcagagacaaacttagagtaatggaagtagtggttgtacactt 23392735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 31328104 - 31328033
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31328104 tgcaggcatagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 31328033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 31334825 - 31334754
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31334825 tgcaggcatagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 31334754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 31968182 - 31968110
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    ||||||||||| |||| | |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31968182 tgcaggcagagttgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 31968110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 193
Target Start/End: Original strand, 22802440 - 22802493
Alignment:
Q  139 tcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    ||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22802440 tcttgtcttgtagcagagacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 22802493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 28701350 - 28701296
Alignment:
Q  139 tcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  28701350 tcttgtcttgtagcagggacaaaaacaaagtagtggaggtaatggttgtacactt 28701296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 162 - 198
Target Start/End: Original strand, 20568137 - 20568173
Alignment:
Q  162 aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtact 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20568137 aacagagtagtggaggtagtggttgtacaattgtact 20568173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 22188241 - 22188169
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||   ||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22188241 tgcaggcagagctgttatccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactt 22188169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Original strand, 24377062 - 24377134
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24377062 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactt 24377134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Original strand, 24575996 - 24576068
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  24575996 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacacaaactaagtagtggaggtagtggttgtacactt 24576068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 30557459 - 30557388
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||||   ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30557459 tgcaggcatagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaa-aatagagtagtggaggtagtggttgtacactt 30557388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Original strand, 40332048 - 40332120
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgtct-tgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||||   ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  40332048 tgcaggcagagctgttatccgtgtcttgtagcagagacaaaaacagagtaatggagttagtggttgtacactt 40332120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Original strand, 44840395 - 44840467
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||||| | || ||||||| ||||   ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44840395 tgcaggcagagctggtatccttgtcttatagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 44840467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 88 - 186
Target Start/End: Original strand, 6392562 - 6392659
Alignment:
Q  88 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 186  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||   | ||||||||||||| || | |||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6392562 ttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatcgt-tgcaggcagagctatttttcttgtcttgtagcagagacaa-aacagagtagtggaggtagtggttg 6392659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 88 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 20152198 - 20152112
Alignment:
Q  88 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtgg 174  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||  || |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| |||||||||||||    
T  20152198 ttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatctt-tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtgg 20152112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 88 - 193
Target Start/End: Original strand, 22317521 - 22317626
Alignment:
Q  88 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 186  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||||| | | |||||||||||||||| | ||||||||| |||   || || ||| || ||||||||||||||||||    
T  22317521 ttcaaatccattcccattgtgaaggaacattgt-tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgcagcagagataaaaactgaatagtggaggtagtggttg 22317619  T
Q  187 tacactt 193  Q
    || ||||    
T  22317620 tatactt 22317626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 10009889 - 10009820
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtaca 190  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  10009889 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtaca 10009820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 190
Target Start/End: Original strand, 22258162 - 22258231
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtaca 190  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||   ||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  22258162 tgcaggcagagctgttatccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtaca 22258231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Original strand, 38781359 - 38781432
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaac-agagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38781359 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaaatagagtagtggatgtagtggttgtacactt 38781432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 13964117 - 13964045
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||||   ||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13964117 tgcaggcggagctgttatccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactt 13964045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Original strand, 14581476 - 14581548
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||| ||||| | |||||||||||||   ||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  14581476 tgcaggcagaactgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaatcagagaagtggagatagtggttgtacactt 14581548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Original strand, 19540377 - 19540449
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||||||   ||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19540377 tgcaggcagagctgttattcttgccttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactt 19540449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 166 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 24440826 - 24440794
Alignment:
Q  166 gagtagtggaggtagtggttgtacacttgtact 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24440826 gagtagtggaggtagtggttgtacaattgtact 24440794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 25037398 - 25037326
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    ||||||||||| |||| || ||||||||||||   ||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25037398 tgcaggcagagttgttatccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactt 25037326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 25041505 - 25041433
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    ||||||||||| |||| || ||||||||||||   ||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25041505 tgcaggcagagttgttatccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactt 25041433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Original strand, 30666950 - 30667022
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    ||||||||| |||||| || ||||||||||||   ||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30666950 tgcaggcagcgctgttatccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactt 30667022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 34322075 - 34322003
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||    |||| || ||||||||| || ||||||||||||||||    
T  34322075 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagaaacaaaaatagagtagtgaagatagtggttgtacactt 34322003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 39037781 - 39037709
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||| ||||||| || ||||| ||||||   ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39037781 tgcaggcatagctgttatccttgtcatgtagcagagacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacactt 39037709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 162 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 41121817 - 41121789
Alignment:
Q  162 aacagagtagtggaggtagtggttgtaca 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41121817 aacagagtagtggaggtagtggttgtaca 41121789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 99)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Original strand, 18153808 - 18154064
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18153808 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcctatcttgaaggaacaat 18153907  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  18153908 tt--gcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaa 18154005  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18154006 ggacaagtactcagtgctctccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 18154064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Original strand, 18158327 - 18158584
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18158327 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 18158426  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |    
T  18158427 t-ctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagagtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactccgttaacgaa 18158525  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18158526 ggacaagtactcagttctctccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 18158584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 18769346 - 18769088
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  18769346 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaa 18769247  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  18769246 ttctgcaggcatagctgttgtcttatcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaa 18769147  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  18769146 ggacaaatactcagtgttcttcaaatgaccgttgatacctccctgtcaattcttcgttc 18769088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Original strand, 16747073 - 16747330
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  16747073 gttgagttcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttaggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcatttccatcttgaaggcacaaa 16747172  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  16747173 ttctgcaggcatagttgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaa 16747271  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16747272 ggacaaatactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 16747330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 19225013 - 19225263
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  19225013 tcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgttgtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 19225112  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 225  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  19225113 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 19225211  T
Q  226 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    | ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19225212 tgctcagcgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 19225263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 19418431 - 19418681
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  19418431 tcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 19418530  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 225  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||     
T  19418531 ggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggaaaaa 19418629  T
Q  226 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19418630 tactcaatgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 19418681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 23457505 - 23457255
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  23457505 tcctttgatcattcaccagtactcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 23457406  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 225  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||     
T  23457405 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggaaaaa 23457307  T
Q  226 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  23457306 tactcagtgctatccaaatgaccattgatacctccctttcaattcttggttc 23457255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 23469662 - 23469411
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  23469662 tcctttgatcattcaccagtactcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 23469563  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 225  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||     
T  23469562 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagaggagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggaaaaa 23469463  T
Q  226 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  23469462 tactcagtgctatccaaatgaccattgatacctccctttcaattcttggttc 23469411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 19429006 - 19429258
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  19429006 tcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 19429105  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||    
T  19429106 ggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggaaaa 19429205  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
     |||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19429206 atactcaatgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 19429258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 30314897 - 30314647
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  30314897 tcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 30314798  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 225  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  30314797 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgaggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 30314699  T
Q  226 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    | || || ||| | ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  30314698 tgctaagcgctatccaaatgaccgttggtacctccctttcaattcttcgttc 30314647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 20161430 - 20161180
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||    
T  20161430 tcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccactttgaaggcacaaattctgca 20161331  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 225  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  20161330 gacatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 20161232  T
Q  226 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    | ||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  20161231 tgctcagcgctgtccaaatgaccgttgataccttcctttcaattcttcgttc 20161180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 20196037 - 20196287
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||    
T  20196037 tcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccactttgaaggcacaaattctgca 20196136  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 225  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  20196137 gacatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 20196235  T
Q  226 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    | ||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  20196236 tgctcagcgctgtccaaatgaccgttgataccttcctttcaattcttcgttc 20196287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 40213378 - 40213120
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  40213378 gttgagttcctttgatcatccaccagtaattctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaac-at 40213280  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtac-ttcgtcaactctgttaacgc 217  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |     
T  40213279 ttctgcaggcatgactgttgtcttgtcttgtagtgtagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttgtacttttgtcaactctgttaaaga 40213180  T
Q  218 aggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  40213179 aggacaagtacgcagtgctcttcaaacggccgttgatacctccctttcaaatcttcgttc 40213120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 19 - 276
Target Start/End: Original strand, 3843595 - 3843850
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  || | ||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  3843595 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaaca-t 3843693  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || | |    
T  3843694 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaatgaa 3843792  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgtt 276  Q
    ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3843793 ggacaagcacccagtgcttttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgtt 3843850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 29 - 277
Target Start/End: Original strand, 31215097 - 31215344
Alignment:
Q  29 tttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggc 128  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || || |||||||    
T  31215097 tttgatcatccaccaataatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcataaattatgcaggc 31215196  T
Q  129 agagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtac 228  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| | |    
T  31215197 atagctgttgtcttgtcttatagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaatgaaggacaaatgc 31215296  T
Q  229 tcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31215297 tcagtgct-atcaaatgacagttgatacctccctttcaattcttcgttc 31215344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 6318718 - 6318467
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||| || ||||    
T  6318718 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgagtgtactcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaggacacaaattatgca 6318619  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 225  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||     
T  6318618 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgagggacaaa 6318519  T
Q  226 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    | ||||||||| | || |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||    
T  6318518 tgctcagtgctatccatatgaccgttggtacatccctttcaattcttcgttc 6318467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 26 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 30325453 - 30325227
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  30325453 tcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 30325354  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 225  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  30325353 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgaggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 30325255  T
Q  226 tactcagtgctcttcaaatgaccgttga 253  Q
    | || || ||| | ||||||||||||||    
T  30325254 tgctaagcgctatccaaatgaccgttga 30325227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 47 - 277
Target Start/End: Original strand, 1750193 - 1750423
Alignment:
Q  47 atcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgtcttgtct 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  1750193 atcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgttttgtct 1750292  T
Q  147 tgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtactcagtgctcttcaaatga 246  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||| | |||||||    
T  1750293 tgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatga 1750392  T
Q  247 ccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  1750393 ccgttgatacctcccttttaattcttcgttc 1750423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 3220710 - 3220962
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  3220710 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaaggtacaaattctgca 3220809  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  3220810 ggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgaagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 3220909  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  3220910 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacttccctttcaattcttcgttc 3220962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 19139358 - 19139610
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  19139358 tcctttgattatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtacaacttctgca 19139457  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  19139458 ggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 19139557  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19139558 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 19139610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 19128826 - 19129078
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  19128826 tcctttgattatccaccagtaatccttttcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtacaacttctgca 19128925  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  19128926 ggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 19129025  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19129026 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 19129078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 15780912 - 15780660
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  15780912 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 15780813  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  15780812 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 15780713  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |||||||||||| | || ||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  15780712 gtactcagtgctatccatatatccgttgatacatccctttcaattcttcgttc 15780660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 26120988 - 26121240
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||||    
T  26120988 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaatttattcccatcttgaacgtacaaattctgca 26121087  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  26121088 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 26121187  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26121188 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 26121240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 19 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 20259825 - 20259570
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  || | |||  |||||||||| |||||||||||||| |    
T  20259825 gttgatttcctttgatcattcaccattaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaactttgaattcattcctatcttgaaggaaca-t 20259727  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | || | |    
T  20259726 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgcagacacaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttttcaactct-tcaatgaa 20259628  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgtt 276  Q
    ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20259627 ggacaagcacccagtgcttttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgtt 20259570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 19 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 21046455 - 21046200
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  || | |||  |||||||||| |||||||||||||| |    
T  21046455 gttgatttcctttgatcattcaccattaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaactttgaattcattcctatcttgaaggaaca-t 21046357  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | || | |    
T  21046356 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgcagacacaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttttcaactct-tcaatgaa 21046258  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgtt 276  Q
    ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21046257 ggacaagcacccagtgcttttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgtt 21046200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 15791501 - 15791249
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  15791501 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 15791402  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  15791401 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 15791302  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  15791301 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacatccctttcaattcttcgttc 15791249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 18449448 - 18449700
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||  | |||| |||||||    
T  18449448 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccattttgagtgtacaaattctgca 18449547  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  18449548 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 18449647  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18449648 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 18449700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 6151148 - 6151400
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  6151148 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 6151247  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  6151248 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 6151347  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  6151348 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccatttcaattcttcgttc 6151400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 9856674 - 9856422
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  9856674 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 9856575  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  9856574 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtagaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 9856475  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  9856474 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatatctccctttcaattcttcgttc 9856422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 26111310 - 26111562
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  26111310 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtacaaattctgca 26111409  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||   ||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  26111410 ggcatgactgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggttgtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 26111509  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  26111510 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctctctttcaattcttcgttc 26111562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 36292997 - 36293249
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  36292997 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 36293096  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  36293097 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 36293196  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36293197 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 36293249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 36303600 - 36303852
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  36303600 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 36303699  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  36303700 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 36303799  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36303800 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 36303852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 36 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 6576712 - 6576470
Alignment:
Q  36 atccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctg 135  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||  ||||    
T  6576712 atccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctg 6576613  T
Q  136 ttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtactcagtg 234  Q
    |||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   ||||| | |||||||    
T  6576612 ttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaaatgctcagtg 6576513  T
Q  235 ctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6576512 ctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 6576470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 210355 - 210104
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||    
T  210355 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaatt-ctgca 210257  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  210256 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 210157  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  210156 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 210104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 252487 - 252738
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  252487 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaa-ttctgca 252585  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  252586 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 252685  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  252686 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 252738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 723978 - 723727
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||    
T  723978 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaatt-ctgca 723880  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  723879 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 723780  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  723779 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 723727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 849169 - 848918
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||    
T  849169 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaatt-ctgca 849071  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  849070 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 848971  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  848970 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 848918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 3348829 - 3348577
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  3348829 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 3348730  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  3348729 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 3348630  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  3348629 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattctttgttc 3348577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 3359426 - 3359174
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  3359426 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 3359327  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  3359326 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 3359227  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  3359226 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattctttgttc 3359174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 9341222 - 9341474
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  9341222 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 9341321  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  9341322 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 9341421  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  9341422 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattctttgttc 9341474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 9368366 - 9368618
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  9368366 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 9368465  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  9368466 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 9368565  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  9368566 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattctttgttc 9368618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 32088471 - 32088220
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||    
T  32088471 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaatt-ctgca 32088373  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  32088372 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 32088273  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32088272 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 32088220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 241902 - 242153
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  241902 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaa-ttctgca 242000  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  242001 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 242100  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |  ||||||||| | || ||  | |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  242101 gagctcagtgctatccatatatctgttgatacctccctttcaattcttcgttc 242153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 29076809 - 29077060
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||  | |||||| |||||    
T  29076809 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattccttcccatcttgagtgtacaatt-ctgca 29076907  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  29076908 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 29077007  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29077008 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 29077060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 29087060 - 29087311
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||  | |||||| |||||    
T  29087060 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattccttcccatcttgagtgtacaatt-ctgca 29087158  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  29087159 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 29087258  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29087259 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 29087311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 32077898 - 32077647
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||    
T  32077898 tcctttgattatccatcagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaatt-ctgca 32077800  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  32077799 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 32077700  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32077699 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 32077647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 19 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 7018589 - 7018348
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  || |  ||||||| |||||| |||||||||||||| |    
T  7018589 gttgagttcctttgatcatccaccaataatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaaca-t 7018491  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || | |    
T  7018490 ttctgcaggcaaagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacacaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaatgaa 7018392  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccct 262  Q
    ||||||  || ||||||| ||||||||| |||||  ||||||||    
T  7018391 ggacaaacacccagtgcttttcaaatgaacgttggcacctccct 7018348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 19 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 22136066 - 22135841
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22136066 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaacaa- 22135968  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||      
T  22135967 ttctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacatgctcagggtcgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tgaacgag 22135869  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatga 246  Q
    | ||||| || ||||||| |||||||||    
T  22135868 gtacaagcacccagtgcttttcaaatga 22135841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 36078013 - 36078266
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaag-gaacaatttctgc 124  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||    
T  36078013 tcctttgattatccaccagtgatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgc 36078112  T
Q  125 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 223  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   ||||    
T  36078113 aggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagaca 36078212  T
Q  224 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36078213 agagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 36078266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 36088599 - 36088852
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaag-gaacaatttctgc 124  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||    
T  36088599 tcctttgattatccaccagtgatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgc 36088698  T
Q  125 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 223  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   ||||    
T  36088699 aggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagaca 36088798  T
Q  224 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36088799 agagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 36088852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 6161103 - 6161355
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  6161103 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 6161202  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  | |||||| |||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  6161203 ggcatggttgttgttttgttttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 6161302  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  6161303 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccatttcaattcttcgttc 6161355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 44481169 - 44481421
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  44481169 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 44481268  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  44481269 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 44481368  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || |  |||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44481369 gtgcagagtgctttccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 44481421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 44491785 - 44492037
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  44491785 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 44491884  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  44491885 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 44491984  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || |  |||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44491985 gtgcagagtgctttccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 44492037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 19 - 276
Target Start/End: Original strand, 23370626 - 23370876
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  |||  || | |||  |||||||||| ||||| ||||||| ||    
T  23370626 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatctttttcctgatttgggtgtagtcctacgaaggatcaactttgaattcattcctatcttaaaggaac-at 23370724  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || | |    
T  23370725 ttctgtaggcagaggtgttgtcttgtcttgta-----gacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaaagaa 23370818  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgtt 276  Q
    ||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  23370819 ggacaagcacccagtgcttttcaaatgaccgttggtacctcccttttaattcttcgtt 23370876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 26 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 13688770 - 13688519
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttga-aggaacaatttctgc 124  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||    
T  13688770 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgc 13688671  T
Q  125 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 223  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   ||||    
T  13688670 aggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtggtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagaca 13688571  T
Q  224 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgt 275  Q
    ||| ||||||| | | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13688570 agtgctcagtgttatccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgt 13688519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22167231 - 22167042
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22167231 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaacaa- 22167133  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactct 209  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||| |  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22167132 ttctgcaggcaaagctgttatcttatcttgtagcgaggacatgctcagggtcgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 22167042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 43248404 - 43248647
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  43248404 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtacaaattctgca 43248503  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||         ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  43248504 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacaga---------gtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 43248594  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43248595 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 43248647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22211596 - 22211407
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  || | ||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  22211596 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaa- 22211498  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactct 209  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22211497 ttctgcaggcagggctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 22211407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 26 - 154
Target Start/End: Original strand, 795257 - 795384
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  795257 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaa-ttctgca 795355  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgt 154  Q
    ||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  795356 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgt 795384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 27 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23271405 - 23271223
Alignment:
Q  27 cctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcag 126  Q
    |||||||||||  |||| | ||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  23271405 cctttgatcatttaccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcctatcttgaaggaaca-tttctgcag 23271307  T
Q  127 gcagagctgttg-tcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactct 209  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||| ||||    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23271306 gcagagctgtttatcttgtcttgtagcgtagacacaggcagagtagtggaagtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 23271223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 88 - 264
Target Start/End: Original strand, 19461090 - 19461264
Alignment:
Q  88 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgt 187  Q
    |||||||  ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||  | |||||| |||||||||||||||||    
T  19461090 ttcaaatctattcctatattgaaggaaca-tttctgcaggcagagctgttatcttgtcttatagcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgt 19461188  T
Q  188 acacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctcccttt 264  Q
    || ||||||||| ||||||||| | || | |||||||| || ||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||    
T  19461189 actcttgtactttgtcaactct-tcaatgaaggacaagcacccagtgcttttcaaatgaacgttggcacctcccttt 19461264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 88 - 264
Target Start/End: Original strand, 19558768 - 19558942
Alignment:
Q  88 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgt 187  Q
    |||||||  ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||  | |||||| |||||||||||||||||    
T  19558768 ttcaaatctattcctatattgaaggaaca-tttctgcaggcagagctgttatcttgtcttatagcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgt 19558866  T
Q  188 acacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctcccttt 264  Q
    || ||||||||| ||||||||| | || | |||||||| || ||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||    
T  19558867 actcttgtactttgtcaactct-tcaatgaaggacaagcacccagtgcttttcaaatgaacgttggcacctcccttt 19558942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 51 - 209
Target Start/End: Original strand, 28903349 - 28903507
Alignment:
Q  51 tttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgt 149  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  28903349 tttgcctgatttggttgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaaca-tttctgcaggcagagctgtttttcttgtcttgt 28903447  T
Q  150 agcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtacttcgtcaactct 209  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  28903448 agcgtagacaa-aacagagtagtggagctagtggttgtacactttgtactttgtcaactct 28903507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 51 - 209
Target Start/End: Original strand, 8031923 - 8032081
Alignment:
Q  51 tttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttg-tcttgtcttgt 149  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  8031923 tttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaaca-tttctgcaagcagagctgtttatcttgtcttgt 8032021  T
Q  150 agcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactct 209  Q
    ||||| ||||  | |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  8032022 agcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacatttgtactttgtcaactct 8032081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 30 - 209
Target Start/End: Original strand, 40003097 - 40003277
Alignment:
Q  30 ttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggca 129  Q
    |||||||  ||||| | ||| |||| ||||||||| ||| |||||  ||| |||||  ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  40003097 ttgatcaatcaccaatgatcttttgtctgatttggatgttgtcctaagaagaattacgttcaaatccattcctatcttgaaggaac-atttctgcaggca 40003195  T
Q  130 gagctg-ttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtacttcgtcaactct 209  Q
    |||||| || |||||||||||||||| ||||    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  40003196 gagctgtttttcttgtcttgtagcgtagacacagtcagagtcgtggaggtagtggttgtacactttgtactttgtcaactct 40003277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 51 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 17519320 - 17519161
Alignment:
Q  51 tttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgt 149  Q
    ||||||||||||||  || ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||||||||||    
T  17519320 tttgcctgatttggaagttgtcctatgaaggatcatgttcaaatccattcctatcttgaaggaaca-tttctgcaggaagagctgtttttcttgtcttgt 17519222  T
Q  150 agcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtacttcgtcaactct 209  Q
    ||||| ||||  | |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||    
T  17519221 agcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacactttgtactttgttaactct 17519161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 30 - 206
Target Start/End: Original strand, 21540820 - 21540997
Alignment:
Q  30 ttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggca 129  Q
    |||||||  ||||| | ||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| ||  |||||||||| ||| ||||||||    
T  21540820 ttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggttgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctattctgaaggaaca-tttatgcaggca 21540918  T
Q  130 gagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt-gtacttcgtcaac 206  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  21540919 gagctgtttttcttgtcttgtagcgtagacataaatagagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtactttgtcaac 21540997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 29 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 15425437 - 15425273
Alignment:
Q  29 tttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggc 128  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||| | | ||||| ||||  || |  ||||||| |||||||||  |||||||||| | | |||||||    
T  15425437 tttgatcattcaccaatgatcctttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacattgt-tgcaggc 15425339  T
Q  129 agagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    | ||||||| | |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15425338 atagctgtttttcttgtcttgtagcaaagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 15425273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 88 - 209
Target Start/End: Original strand, 29379504 - 29379626
Alignment:
Q  88 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 186  Q
    ||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||  | |||||| ||||||||||||||||    
T  29379504 ttcaaatccattcctatcctgaaggaaca-tttctgcaggcagagatgtttttcttgtcttgtagcgtagacacaatcagagtcgtggaggtagtggttg 29379602  T
Q  187 tacac-ttgtacttcgtcaactct 209  Q
    ||||| || ||||| |||||||||    
T  29379603 tacactttctactttgtcaactct 29379626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 29 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 15336372 - 15336208
Alignment:
Q  29 tttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggc 128  Q
    ||||||||  ||||| | |||||||||||||| ||| | | ||||| ||||  || |  ||||||| |||||||||  |||||||||| | | |||||||    
T  15336372 tttgatcagtcaccaatgatcctttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacattgt-tgcaggc 15336274  T
Q  129 agagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    | ||||||| | |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15336273 atagctgtttttcttgtcttgtagcaaagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 15336208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 29 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 15516741 - 15516577
Alignment:
Q  29 tttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggc 128  Q
    ||||||||  ||||| | |||||||||||||| ||| | | ||||| ||||  || |  ||||||| |||||||||  |||||||||| | | |||||||    
T  15516741 tttgatcagtcaccaatgatcctttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacattgt-tgcaggc 15516643  T
Q  129 agagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    | ||||||| | |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15516642 atagctgtttttcttgtcttgtagcaaagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 15516577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 30 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 45568184 - 45568021
Alignment:
Q  30 ttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggca 129  Q
    |||||||  ||||| | ||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| ||  ||| |||||| ||||||||||||    
T  45568184 ttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggttgttgtcctatgaaggatcacattcaaatccattcctattctgagggaaca-tttctgcaggca 45568086  T
Q  130 gagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||| | |||||||| |||||| ||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  45568085 gagctgtttttcttgtcttatagcgtagacataaacagagtagtgaaggtagtggtcgtacactt 45568021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 13430820 - 13430748
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13430820 tgcaggcagagctgttatccttgtcttgtagcagggacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacactt 13430748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 45538631 - 45538559
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45538631 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 45538559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 88 - 193
Target Start/End: Original strand, 1237563 - 1237668
Alignment:
Q  88 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 186  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||   | |||||||||||||||| | ||| |||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1237563 ttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatcgt-tgcaggcagagctgtttttcttctcttgtagcagagacaacaacagagtagtggaggtagtggttg 1237661  T
Q  187 tacactt 193  Q
    |||||||    
T  1237662 tacactt 1237668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 88 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 23185452 - 23185346
Alignment:
Q  88 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt--cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggtt 185  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||  || |||||| ||||||||| |  |||||||||||||   ||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  23185452 ttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatctt-tgcaggaagagctgttttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagcagtggaggtagtggtt 23185354  T
Q  186 gtacactt 193  Q
    ||||||||    
T  23185353 gtacactt 23185346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Original strand, 36105154 - 36105226
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36105154 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagcagtggaggtagtggttgtacactt 36105226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 88 - 193
Target Start/End: Original strand, 21932809 - 21932914
Alignment:
Q  88 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 186  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||   | |||||||||||||||| | |||||||||||||   |||||  || |||||||||||||||||||||    
T  21932809 ttcaaatccattcccattgtgaaggaacatcgt-tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaacactgagtagtggaggtagtggttg 21932907  T
Q  187 tacactt 193  Q
    |||||||    
T  21932908 tacactt 21932914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 193
Target Start/End: Original strand, 9320436 - 9320599
Alignment:
Q  29 tttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggc 128  Q
    ||||||||  ||||| | ||| |||||||||| ||| ||| |||||  |||| || |  ||||||| |||||||||  ||||| |||| | | ||||| |    
T  9320436 tttgatcaatcaccaatgatcatttgcctgatatggttgttgtcctaagaatgatcaatttcaaatgcattcccattgtgaagaaacattgt-tgcagtc 9320534  T
Q  129 agagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    | ||||||| | |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9320535 acagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 9320599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 14989643 - 14989574
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtaca 190  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14989643 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtaca 14989574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Original strand, 16207265 - 16207337
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16207265 tgcaggaagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 16207337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Original strand, 19943194 - 19943266
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctg-ttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19943194 tgcaggcagagctggttttcttgtcttgtaggagagaccaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 19943266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 122 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 18151839 - 18151769
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt--cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtaca 190  Q
    |||||||||||||||| |  |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18151839 tgcaggcagagctgttttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtaca 18151769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 193
Target Start/End: Original strand, 6407703 - 6407757
Alignment:
Q  139 tcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    ||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6407703 tcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 6407757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 193
Target Start/End: Original strand, 17797399 - 17797453
Alignment:
Q  139 tcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    ||||||||| ||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17797399 tcttgtcttatagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 17797453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 193
Target Start/End: Original strand, 22673724 - 22673809
Alignment:
Q  108 gaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    ||||||||||| | |||||| ||||||||| | |||||||||||||   ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  22673724 gaaggaacaatgt-tgcaggaagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacaaagtagtggagatagtggttgtacactt 22673809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 193
Target Start/End: Original strand, 24551200 - 24551305
Alignment:
Q  88 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 186  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||   | || ||||||||||||| | ||||||||||||    ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  24551200 ttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatcgt-tgtaggcagagctgtttttcttgtcttgtagtagagacaaaaacaaagtagtggaggtagtggttg 24551298  T
Q  187 tacactt 193  Q
    |||||||    
T  24551299 tacactt 24551305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 30421654 - 30421549
Alignment:
Q  88 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 186  Q
    ||||||| |||||| ||  |||||||||| | | |||||| ||||||||| | |||||||||| ||   ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30421654 ttcaaatgcattcctattgtgaaggaaca-tctatgcaggaagagctgtttttcttgtcttgttgcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttg 30421556  T
Q  187 tacactt 193  Q
    || ||||    
T  30421555 taaactt 30421549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 88 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 18121331 - 18121235
Alignment:
Q  88 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggt 184  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||   | |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  18121331 ttcaaattcattcccattgtgaaggaacatcgt-tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacagaaacagagtagttgaggtagtggt 18121235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 240 - 277
Target Start/End: Original strand, 28691193 - 28691230
Alignment:
Q  240 caaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28691193 caaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 28691230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Original strand, 43639741 - 43639814
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaagaa-cagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||   ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43639741 tgcaggcagagctgttatccttgtcttgtagcagagacaaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 43639814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 162 - 198
Target Start/End: Original strand, 26833036 - 26833072
Alignment:
Q  162 aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtact 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26833036 aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttatact 26833072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 40845579 - 40845507
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    ||||||||||| |||| | ||| |||||||||   ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40845579 tgcaggcagagttgtttttcttctcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 40845507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 166 - 198
Target Start/End: Original strand, 17687986 - 17688018
Alignment:
Q  166 gagtagtggaggtagtggttgtacacttgtact 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17687986 gagtagtggaggtagtggttgtacaattgtact 17688018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Original strand, 21288362 - 21288434
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||   |||||   || ||||||||| |||||||||||||||||    
T  21288362 tgcaggcagagctgttatccttgtcttgtagcagagacaaactcaaagtagtggaagtagtggttgtacactt 21288434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Original strand, 21300981 - 21301053
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||| ||| || ||||||||||||   |||||   |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21300981 tgcaggcagagcagttatccttgtcttgtagcagagacaaactcagagtagtggaagtagtggttgtacactt 21301053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Original strand, 24646297 - 24646369
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||||   ||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24646297 tgcaggcggagctgttatccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactt 24646369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 24833248 - 24833177
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||| |   ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24833248 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtaacagagacaa-aatagagtaatggaggtagtggttgtacactt 24833177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Original strand, 39693494 - 39693566
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||||   ||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39693494 tgcaggcaaagctgttatccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactt 39693566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 2)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 7969 - 7711
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  7969 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaa 7870  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  7869 ttctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaa 7770  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7769 ggacaaatactcagtgttcttcaagtgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 7711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 10816 - 10558
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  10816 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaa 10717  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  10716 ttctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaa 10617  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10616 ggacaaatacttagtgttcttcaagtgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 10558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 157)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Original strand, 21705941 - 21706199
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  21705941 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaa 21706040  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  21706041 ttctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaa 21706140  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21706141 ggacaaatactcagtgttcttcaagtgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 21706199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Original strand, 21703094 - 21703352
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  21703094 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaa 21703193  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  21703194 ttctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaa 21703293  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21703294 ggacaaatacttagtgttcttcaagtgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 21703352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 19478296 - 19478038
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  19478296 gttgagttcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaa 19478197  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  19478196 ttctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggacgtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaa 19478097  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19478096 ggacaaatactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 19478038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 19 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 34062914 - 34062659
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  34062914 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccaacttgaaggaaca-t 34062816  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  34062815 ttctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaa 34062716  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgt 275  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34062715 ggacaagtactcagtgttctccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgt 34062659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 19 - 273
Target Start/End: Original strand, 17446662 - 17446915
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  17446662 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccaacttgaaggaaca-t 17446760  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  17446761 ttctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaa 17446860  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttc 273  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17446861 ggacaagtactcagtgttctccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttc 17446915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 19464266 - 19464008
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  19464266 gttgagttcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaa 19464167  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |    
T  19464166 ttctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggacgtagtggttgtacacttgtactttgtcaactttgttaacgaa 19464067  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19464066 ggacaaatactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 19464008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 19 - 276
Target Start/End: Original strand, 17457278 - 17457534
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  17457278 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccaacttgaaggaaca-t 17457376  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  17457377 ttctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtatacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaa 17457476  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgtt 276  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17457477 ggacaagtactcagtgttctccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgtt 17457534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 20797983 - 20797732
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  20797983 tcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 20797884  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 225  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  20797883 ggcatagctgttgtcttgtcttgcagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 20797784  T
Q  226 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    | ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20797783 tgctcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 20797732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 43043644 - 43043895
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  43043644 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttggatgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 43043743  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 225  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  43043744 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaagcagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 43043843  T
Q  226 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    | ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43043844 tgctcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 43043895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 23406733 - 23406483
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  23406733 tcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 23406634  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 225  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  23406633 ggcatagctgttgtattgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 23406535  T
Q  226 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  23406534 tactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctcccttttaattcttcgttc 23406483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 34783143 - 34782893
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  34783143 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 34783044  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 225  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  34783043 gacatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 34782945  T
Q  226 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    | ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34782944 tgctcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 34782893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 36084748 - 36084498
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  36084748 tcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaggaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 36084649  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 225  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  36084648 ggcatagctgttgtcttgtcatgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 36084550  T
Q  226 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36084549 tactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 36084498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 19 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 34052253 - 34051998
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |    
T  34052253 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcatttccaacttgaaggaaca-t 34052155  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |    
T  34052154 ttctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaatagactagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaatgaa 34052055  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgt 275  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34052054 ggacaagtactcagtgttctccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgt 34051998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 30069879 - 30070130
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  30069879 tcctttgatcatccaccagtaatcctatgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 30069978  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 225  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||     
T  30069979 ggcatagctgttgttttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtcaacgaaggacaaa 30070078  T
Q  226 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    | ||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30070079 tgctcagtgctatccatatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 30070130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 34772198 - 34771948
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  34772198 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 34772099  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 225  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  34772098 gacatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtggtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 34772000  T
Q  226 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    | ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34771999 tgctcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 34771948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 19 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 106412 - 106159
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  106412 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaaca-t 106314  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |    
T  106313 ttctacaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagaaaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataacgaa 106214  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttc 273  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  106213 ggacaagtacccagtgcttttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttc 106159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 33 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 10754773 - 10754530
Alignment:
Q  33 atcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagag 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||    
T  10754773 atcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatag 10754674  T
Q  133 ctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtactcag 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||||    
T  10754673 ctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgtaggacaaatgctcag 10754575  T
Q  233 tgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
     ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10754574 agctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 10754530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 29 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 20552099 - 20551852
Alignment:
Q  29 tttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggc 128  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  20552099 tttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaaatctgcaggc 20552000  T
Q  129 agagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtac 228  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||    
T  20551999 atagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aatagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatac 20551901  T
Q  229 tcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  20551900 tcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaaatcttcgttc 20551852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 24926113 - 24926363
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  24926113 tcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaggaattaacttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 24926212  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 225  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  24926213 ggcataggtgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 24926311  T
Q  226 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  24926312 tactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccttttcaattcttcgttc 24926363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 24983394 - 24983644
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  24983394 tcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaggaattaacttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 24983493  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 225  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||     
T  24983494 ggcatagttgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaatgaaggacaaa 24983592  T
Q  226 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24983593 tactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 24983644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 36229026 - 36228776
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  36229026 tcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaggaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 36228927  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 225  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  36228926 ggcatagctgttgtcttgtcttgtggcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 36228828  T
Q  226 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||||||||| | | |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  36228827 tactcagtgttatccaaatgaccgttgatacctcccttacaattcttcgttc 36228776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 46 - 277
Target Start/End: Original strand, 43621853 - 43622084
Alignment:
Q  46 aatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgtcttgtc 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  43621853 aatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgcaggcatagctgttgtcttgtc 43621952  T
Q  146 ttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtactcagtgctcttc-aaat 244  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | | ||||    
T  43621953 ttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatactcagtgctatccaaaat 43622051  T
Q  245 gaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43622052 gaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 43622084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 1109119 - 1109369
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||    
T  1109119 tcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccactttgaaggcacaaattctgca 1109218  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 225  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  1109219 gacatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 1109317  T
Q  226 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    | ||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  1109318 tgctcagcgctgtccaaatgaccgttgataccttcctttcaattcttcgttc 1109369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 19 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 20625058 - 20624805
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  20625058 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattctcatcttgaaggaaca-t 20624960  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| |    
T  20624959 ttctgcaggcatagctgttttcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtggtggaggtagtggttgtacacttgtactttatcaactctgataacgaa 20624860  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttc 273  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20624859 ggacaagtacccagtgcctttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttc 20624805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 29 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 8522125 - 8521878
Alignment:
Q  29 tttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggc 128  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  8522125 tttgatcattcactagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgcaggc 8522026  T
Q  129 agagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtac 228  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| |      
T  8522025 atagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataacgaaggacaaatga 8521927  T
Q  229 tcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  8521926 tcagcgctatccaaatgaccgttgataccttcctttcaattcttcgttc 8521878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 1121877 - 1122127
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||    
T  1121877 tcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccactttgaaggcacaaattctgca 1121976  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 225  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  1121977 gacatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 1122075  T
Q  226 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    | ||||| ||| | ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||    
T  1122076 tgctcagcgctgtccaaatgaccgttgatacattcctttcaattcttcgttc 1122127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 42395266 - 42395017
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||    
T  42395266 tcctttgatcattcaccaataatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcatttccatcttgaaggcacaaattctgca 42395167  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 225  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  42395166 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaa-aacaga-tagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 42395069  T
Q  226 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    | ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42395068 tgctcagcgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 42395017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 31448841 - 31448589
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  31448841 tcctttgatcatccaccagtaattctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 31448742  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac-aagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  31448741 ggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgcagacaaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaaccaaggacaa 31448642  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
     | ||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31448641 atgctcagtgctatccatatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 31448589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 45 - 277
Target Start/End: Original strand, 21414191 - 21414422
Alignment:
Q  45 taatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgtcttgt 144  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21414191 taatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaaca-tttctgcaggcagagctgttgtcttgt 21414289  T
Q  145 cttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtactcagtgctcttcaaat 244  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||     
T  21414290 cttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataacgaaggacaattacccagtgcttttcaaac 21414389  T
Q  245 gaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21414390 gaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 21414422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 31418950 - 31418698
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||    
T  31418950 tcctttgatcatccaccagtaattctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaaggcataaattctgca 31418851  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac-aagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  31418850 ggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgcagacaaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaa 31418751  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
     | |||| |||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31418750 atgctcaatgctatccatatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 31418698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 37406942 - 37406692
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||     
T  37406942 gttgagttcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattaattctcatcttgaaggaacaa- 37406844  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |    
T  37406843 ttctgcaggcataactgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaatagagtagtggagatagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataacgaa 37406744  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |||||||||||||||| |       ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37406743 ggacaagtactcagtgtt-------tgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 37406692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 22559725 - 22559473
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  22559725 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaaggtacaaattctgca 22559626  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  22559625 ggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 22559526  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || |||||||||   || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22559525 gtgctcagtgctaaccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 22559473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 27622739 - 27622991
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  27622739 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtacaacttctgca 27622838  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  27622839 ggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 27622938  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27622939 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 27622991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 5290548 - 5290800
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||||||    
T  5290548 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattaccatcttgaacgtacaacttctgca 5290647  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  5290648 ggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 5290747  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5290748 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 5290800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 27603390 - 27603642
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  27603390 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtacaacttctgca 27603489  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  27603490 ggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtatacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 27603589  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27603590 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 27603642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 19 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 20417195 - 20416940
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||  || | |||||||||||||||  ||||||||||||| |    
T  20417195 gttgagttcctttgatcatccaccaataatcttttgcctgatttagatgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctctcttgaaggaaca-t 20417097  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || | |    
T  20417096 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaatgaa 20416998  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgtt 276  Q
    ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  20416997 ggacaagcacccagtgcttttcaaatgaccgttgatacctccctttcaatttttcgtt 20416940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 39352774 - 39352524
Alignment:
Q  28 ctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcagg 127  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  39352774 ctttgattatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtacaaattctgcagg 39352675  T
Q  128 cagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagt 226  Q
    ||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||||    
T  39352674 catggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagt 39352575  T
Q  227 actcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
     ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39352574 gctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 39352524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 19 - 276
Target Start/End: Original strand, 32753912 - 32754167
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  32753912 gttgagttcctttgatcatctaccattaatctttttcctgatttgggtgtagtcctatgaaggattaacttcaaattcattcctatcttgaaggaaca-t 32754010  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || | |    
T  32754011 ttctgcaggcagagctgttgttttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaatgaa 32754109  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgtt 276  Q
    |||| || |  || |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32754110 ggacgagcatccaatgcttttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgtt 32754167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 29 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 20562609 - 20562377
Alignment:
Q  29 tttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggc 128  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||               |    
T  20562609 tttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaagg---------------c 20562525  T
Q  129 agagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtac 228  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| || |||    
T  20562524 atagctgttgtcttgtcttgtagcatggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggaaaaatac 20562426  T
Q  229 tcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20562425 tcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 20562377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 27204081 - 27203829
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  27204081 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 27203982  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  27203981 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 27203882  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27203881 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 27203829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 31844247 - 31843995
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  31844247 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 31844148  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  31844147 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 31844048  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31844047 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 31843995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 6131077 - 6130825
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  6131077 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 6130978  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  6130977 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 6130878  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6130877 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 6130825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 7032098 - 7032352
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  7032098 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtacaaattctgca 7032197  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac---aagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggac 222  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||    
T  7032198 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagac 7032297  T
Q  223 aagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |||| ||||||||| | || ||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  7032298 aagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctctcaattcttcgttc 7032352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 15993301 - 15993553
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  15993301 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 15993400  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  15993401 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagattagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 15993500  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15993501 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 15993553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 16003863 - 16004115
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  16003863 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 16003962  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  16003963 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 16004062  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || || |||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16004063 gtgcttagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 16004115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 22146809 - 22146557
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  22146809 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 22146710  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  22146709 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 22146610  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22146609 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 22146557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 22157392 - 22157140
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  22157392 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 22157293  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  22157292 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 22157193  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22157192 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 22157140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 40401307 - 40401055
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  40401307 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtacaaattctgca 40401208  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||   ||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||   |||||    
T  40401207 ggcatgactgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctatttacgagagacaa 40401108  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40401107 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 40401055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 9377434 - 9377686
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  9377434 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 9377533  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  9377534 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 9377633  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9377634 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 9377686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 14557989 - 14558241
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  14557989 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 14558088  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  14558089 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 14558188  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14558189 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 14558241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 14568626 - 14568878
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  14568626 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 14568725  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  14568726 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 14568825  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14568826 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 14568878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 23307133 - 23306881
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  23307133 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 23307034  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  23307033 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 23306934  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23306933 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 23306881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 24816858 - 24817110
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  24816858 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 24816957  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  24816958 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 24817057  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24817058 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 24817110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 24827446 - 24827698
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  24827446 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 24827545  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  24827546 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 24827645  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24827646 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 24827698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 36582530 - 36582782
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  36582530 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgaacaaattctgca 36582629  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  36582630 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 36582729  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||  |||||||| | || ||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  36582730 gtggtcagtgctatccatatatccgttgatacatccctttcaattcttcgttc 36582782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 36593085 - 36593337
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  36593085 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgaacaaattctgca 36593184  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  36593185 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 36593284  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||  |||||||| | || ||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  36593285 gtggtcagtgctatccatatatccgttgatacatccctttcaattcttcgttc 36593337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 40390645 - 40390393
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  40390645 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtacaaattctgca 40390546  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||   |||||    
T  40390545 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctatttacgagagacaa 40390446  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
     | || |||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40390445 ttgcttagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 40390393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 5301119 - 5301376
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||     
T  5301119 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtacaacttctgct 5301218  T
Q  126 ggcagagctg-----ttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcag 219  Q
    ||||  ||||     ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||       
T  5301219 ggcatggctgttgtcttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcagctctattaacgaga 5301318  T
Q  220 gacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
     |||||| ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5301319 aacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 5301376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 6976096 - 6975844
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  6976096 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 6975997  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  6975996 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 6975897  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  6975896 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattctttgttc 6975844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 6986586 - 6986334
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  6986586 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 6986487  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  6986486 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 6986387  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  6986386 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattctttgttc 6986334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 9336243 - 9335992
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||    
T  9336243 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaatt-ctgca 9336145  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  9336144 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 9336045  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9336044 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 9335992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 9346830 - 9346579
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||    
T  9346830 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaatt-ctgca 9346732  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaa-cagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  9346731 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacaaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 9346632  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9346631 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 9346579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 14030332 - 14030080
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  14030332 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 14030233  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  14030232 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 14030133  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  14030132 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattctttgttc 14030080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 14040885 - 14040633
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  14040885 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 14040786  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  14040785 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 14040686  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  14040685 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattctttgttc 14040633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 23296565 - 23296313
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  23296565 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcatttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 23296466  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  23296465 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 23296366  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23296365 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 23296313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 24808200 - 24807949
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||    
T  24808200 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaatt-ctgca 24808102  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  24808101 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 24808002  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24808001 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 24807949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 39490922 - 39491174
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  39490922 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 39491021  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  39491022 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 39491121  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  39491122 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattctttgttc 39491174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 39502112 - 39502364
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  39502112 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 39502211  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  39502212 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 39502311  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  39502312 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattctttgttc 39502364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 23362399 - 23362146
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtccttt-gaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 124  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  23362399 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtccttttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgaacaaattctgc 23362300  T
Q  125 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 223  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   ||||    
T  23362299 aggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagaca 23362200  T
Q  224 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||| ||||||||| | ||  |   ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23362199 agtgctcagtgctatccatttattcgttgatacctccctttcaattcttcgttc 23362146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 15694004 - 15694255
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||  | |||||| |||||    
T  15694004 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattccttcccatcttgagtgtacaatt-ctgca 15694102  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  15694103 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 15694202  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15694203 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 15694255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 22676404 - 22676152
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  22676404 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 22676305  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  22676304 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 22676205  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |   |||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  22676204 gagttcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattctttgttc 22676152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 22686295 - 22686043
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  22686295 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 22686196  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  22686195 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 22686096  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |   |||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  22686095 gagttcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattctttgttc 22686043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 23707730 - 23707479
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||  | |||||| |||||    
T  23707730 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattccttcccatcttgagtgtacaatt-ctgca 23707632  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  23707631 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 23707532  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23707531 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 23707479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 24567377 - 24567126
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||  | |||||| |||||    
T  24567377 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattccttcccatcttgagtgtacaatt-ctgca 24567279  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  24567278 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 24567179  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24567178 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 24567126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 26 - 273
Target Start/End: Original strand, 27042184 - 27042432
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  27042184 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 27042283  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  27042284 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggtggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 27042383  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttc 273  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  27042384 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttc 27042432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 27460449 - 27460197
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  27460449 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 27460350  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  27460349 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 27460250  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |  ||||||||| | || ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  27460249 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctctctttcaattctttgttc 27460197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 27470848 - 27470596
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  27470848 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 27470749  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  27470748 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 27470649  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |  ||||||||| | || ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  27470648 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctctctttcaattctttgttc 27470596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 35215794 - 35215541
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaag-gaacaatttctgc 124  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||    
T  35215794 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgc 35215695  T
Q  125 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 223  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   ||||    
T  35215694 aggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagaca 35215595  T
Q  224 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||| ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35215594 agtgctcagtgctttccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttc 35215541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 35226378 - 35226125
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaag-gaacaatttctgc 124  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||    
T  35226378 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgc 35226279  T
Q  125 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 223  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   ||||    
T  35226278 aggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagaca 35226179  T
Q  224 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||| ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35226178 agtgctcagtgctttccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttc 35226125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 40513961 - 40514214
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttga-aggaacaatttctgc 124  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||    
T  40513961 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgc 40514060  T
Q  125 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 223  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   ||||    
T  40514061 aggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagaca 40514160  T
Q  224 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||| ||||||| | | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40514161 agtgctcagtgttatccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttc 40514214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 17607349 - 17607097
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  17607349 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 17607250  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  17607249 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 17607150  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || |  |||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17607149 gtgcagagtgctttccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 17607097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 17617963 - 17617711
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  17617963 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 17617864  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  17617863 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 17617764  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || |  |||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17617763 gtgcagagtgctttccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 17617711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 30227470 - 30227721
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||  | |||| |||||||    
T  30227470 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattccttcccatcttgagtgtacaa-ttctgca 30227568  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  30227569 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 30227668  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |  || |||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30227669 gagcttagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 30227721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 30237997 - 30238248
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||  | |||| |||||||    
T  30237997 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattccttcccatcttgagtgtacaa-ttctgca 30238095  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  30238096 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 30238195  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |  || |||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30238196 gagcttagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 30238248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 31348823 - 31348571
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  31348823 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 31348724  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  31348723 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 31348624  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || |  |||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31348623 gtgcagagtgctttccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 31348571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 31359437 - 31359185
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  31359437 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 31359338  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  31359337 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 31359238  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || |  |||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31359237 gtgcagagtgctttccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 31359185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 36687984 - 36687732
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  36687984 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 36687885  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  36687884 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 36687785  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || |  |||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36687784 gtgcagagtgctttccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 36687732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 36698550 - 36698298
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  36698550 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 36698451  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  36698450 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 36698351  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || |  |||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36698350 gtgcagagtgctttccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 36698298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 42043072 - 42042821
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||  | |||| |||||||    
T  42043072 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattccttcccatcttgagtgtacaa-ttctgca 42042974  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  42042973 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 42042874  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |  || |||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42042873 gagcttagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 42042821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 42053647 - 42053396
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||  | |||| |||||||    
T  42053647 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattccttcccatcttgagtgtacaa-ttctgca 42053549  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  42053548 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 42053449  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |  || |||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42053448 gagcttagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 42053396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 14446971 - 14447224
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaag-gaacaatttctgc 124  Q
    |||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||    
T  14446971 tcctttaattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgc 14447070  T
Q  125 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 223  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   ||||    
T  14447071 aggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaaagagagaca 14447170  T
Q  224 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||| ||||||||| | || ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  14447171 agtgctcagtgctttccatatgtccgttgatacctccctttcaattcatcgttc 14447224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 14457583 - 14457836
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaag-gaacaatttctgc 124  Q
    |||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||    
T  14457583 tcctttaattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgc 14457682  T
Q  125 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 223  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   ||||    
T  14457683 aggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaaagagagaca 14457782  T
Q  224 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||| ||||||||| | || ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  14457783 agtgctcagtgctttccatatgtccgttgatacctccctttcaattcatcgttc 14457836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 15740256 - 15740003
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaag-gaacaatttctgc 124  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||    
T  15740256 tcctttgattatccaccagtgatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgc 15740157  T
Q  125 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 223  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   ||||    
T  15740156 aggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagaca 15740057  T
Q  224 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||| ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15740056 agtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 15740003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 15769416 - 15769163
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaag-gaacaatttctgc 124  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||    
T  15769416 tcctttgattatccaccagtgatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgc 15769317  T
Q  125 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 223  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   ||||    
T  15769316 aggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagaca 15769217  T
Q  224 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||| ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15769216 agtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 15769163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 26 - 273
Target Start/End: Original strand, 27052808 - 27053057
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  27052808 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 27052907  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgt-acacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 223  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| |   ||||    
T  27052908 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggtggtagtggttgtaacacttgtactttgtcaactctattaatgagagaca 27053007  T
Q  224 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttc 273  Q
    ||| ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  27053008 agtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttc 27053057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 33951772 - 33952025
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttga-aggaacaatttctgc 124  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||    
T  33951772 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgc 33951871  T
Q  125 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 223  Q
     ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   ||||    
T  33951872 gggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagaca 33951971  T
Q  224 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||| ||||||| | | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33951972 agtgctcagtgttatccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttc 33952025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 19 - 252
Target Start/End: Original strand, 13533778 - 13534009
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  || | ||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  13533778 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaa- 13533876  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    ||| || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| | || |      
T  13533877 ttctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaatgag 13533975  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttg 252  Q
    ||||||| || ||||||| ||||||||| |||||    
T  13533976 ggacaagcacccagtgcttttcaaatgaacgttg 13534009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 20168358 - 20168115
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||  || | ||||||||||||||| ||||||| |||||||     
T  20168358 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttggatgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgagggaacaa- 20168260  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    ||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | || | |    
T  20168259 ttctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggaggtagtggttgtacatttgtactttgtcaactct-tcaatgaa 20168161  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctcccttt 264  Q
    ||||||| || ||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||    
T  20168160 ggacaagcacccagtgcttttcaaatgaacgttggcacctcccttt 20168115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 37729223 - 37729476
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttga-aggaacaatttctgc 124  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||    
T  37729223 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgc 37729322  T
Q  125 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 223  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   ||||    
T  37729323 aggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagaatagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagaca 37729422  T
Q  224 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||| |  |||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37729423 agtgcaaagtgctttccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 37729476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 37740539 - 37740792
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttga-aggaacaatttctgc 124  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||    
T  37740539 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgc 37740638  T
Q  125 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 223  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   ||||    
T  37740639 aggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagaatagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagaca 37740738  T
Q  224 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||| |  |||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37740739 agtgcaaagtgctttccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 37740792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 26 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 17719207 - 17718958
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttga-aggaacaatttctgc 124  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||    
T  17719207 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgc 17719108  T
Q  125 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 223  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   ||||    
T  17719107 aggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagaca 17719008  T
Q  224 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttc 273  Q
    ||| |  |||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  17719007 agtgcagagtgctttccatatatccgttgatacctccctttcaattcttc 17718958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 26 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 17729859 - 17729610
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttga-aggaacaatttctgc 124  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||    
T  17729859 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgc 17729760  T
Q  125 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 223  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   ||||    
T  17729759 aggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagaca 17729660  T
Q  224 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttc 273  Q
    ||| |  |||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  17729659 agtgcagagtgctttccatatatccgttgatacctccctttcaattcttc 17729610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Original strand, 13523051 - 13523240
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  || | ||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  13523051 gttgagttcctttgatcatccaccaataatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaagatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaa- 13523149  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactct 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    ||| || |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13523150 ttctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 13523240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 27 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 36095936 - 36095755
Alignment:
Q  27 cctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcag 126  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  36095936 cctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttggatgtagtcctatgaaggattaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattt-tgcag 36095838  T
Q  127 gcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactct 209  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36095837 gcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 36095755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 27 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 36097393 - 36097212
Alignment:
Q  27 cctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcag 126  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  36097393 cctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttggatgtagtcctatgaaggattaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattt-tgcag 36097295  T
Q  127 gcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactct 209  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36097294 gcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 36097212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 131 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 23392898 - 23392753
Alignment:
Q  131 agctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtactc 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  23392898 agctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatactc 23392800  T
Q  231 agtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |||||| | ||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  23392799 agtgctatccaaatgacctttgatacctcccttttaattcttcgttc 23392753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 35543420 - 35543231
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  || | ||||||||||||||  |||||||||||||||     
T  35543420 gttgagttcctttgatcatccacaagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcatatcttgaaggaacaa- 35543322  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactct 209  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||    ||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35543321 ttctgcaggcagagctgttatattgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtcgaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 35543231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 23372802 - 23372547
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcc-tttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaac--aatttct 122  Q
    ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  ||||  ||||| |    
T  23372802 tcctttgattatccaccagtgttcctttgcctgatttgggggtagtccttttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgaacaaaattttt 23372703  T
Q  123 gcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagt-ggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcagg 220  Q
    | |||||  |||||||| || ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |    
T  23372702 g-aggcatggctgttgttttttcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtgggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagag 23372604  T
Q  221 acaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |||||| ||||||||| | ||  |   ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23372603 acaagtgctcagtgctatccatttattcgttgatacctccctttcaattcttcgttc 23372547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 26 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 31833769 - 31833641
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  31833769 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 31833670  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgt 154  Q
    ||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  31833669 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgt 31833641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 114 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 39362514 - 39362350
Alignment:
Q  114 acaatttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgtt 212  Q
    |||| |||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  39362514 acaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctatt 39362415  T
Q  213 aacgcaggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||||   ||||||| ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39362414 aacgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 39362350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 51 - 209
Target Start/End: Original strand, 40228553 - 40228710
Alignment:
Q  51 tttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgta 150  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40228553 tttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaaca-tttctgcaggcagagctgttatcttgtcttgta 40228651  T
Q  151 gcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactct 209  Q
    |||| ||||  | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  40228652 gcgtagacacaagcagagtcatggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcagctct 40228710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 51 - 252
Target Start/End: Original strand, 13405010 - 13405209
Alignment:
Q  51 tttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgta 150  Q
    |||||||||||||| ||| ||||  ||||  || |  ||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13405010 tttgcctgatttggatgttgtccaatgaaggatcaagttcaaatccattcctttcttgaaggaaca-tttctgcaggcagagctgttatcttgtcttgta 13405108  T
Q  151 gcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgt 250  Q
    |||| ||||  | |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | || | |||||||| || ||||||| ||| ||||| |||    
T  13405109 gcgtagacacaatcagagtcgtggaggtagtggttgtacaattgtactttgtcaactct-tcaatgaaggacaagcacccagtgcttttctaatgaacgt 13405207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 26 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 39364769 - 39364685
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaa 110  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39364769 tcctttgattatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaa 39364685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 51 - 209
Target Start/End: Original strand, 1915311 - 1915469
Alignment:
Q  51 tttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgta 150  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  1915311 tttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaaca-tttctgcaggcagagttgttatcttgtcttgta 1915409  T
Q  151 gcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtacttcgtcaactct 209  Q
    |||| ||||  | |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  1915410 gcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacactttgtactttgtcaactct 1915469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 51 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 11208229 - 11208087
Alignment:
Q  51 tttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgt 149  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| |||| |||||  ||||||| |||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  11208229 tttgcctgatttggatgttgtcctatgaagaattaagttcaaatccattcttattttgaaggaaca-tttctgcaggcagagctgtttttcttgtcttgt 11208131  T
Q  150 agcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11208130 agcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttatacactt 11208087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 51 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 20215360 - 20215201
Alignment:
Q  51 tttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttg-tcttgtcttgt 149  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  20215360 tttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaaca-tttctgcaggcagagctgtttatcttgtcttgt 20215262  T
Q  150 agcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtacttcgtcaactct 209  Q
    ||||| ||||  | |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  20215261 agcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacactttgtactttgtcaactct 20215201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 162 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 31815314 - 31815199
Alignment:
Q  162 aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccc 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   ||||||| ||||||||| | || ||  |||||||||||||||    
T  31815314 aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccc 31815215  T
Q  262 tttcatttcttcgttc 277  Q
    ||||| ||||||||||    
T  31815214 tttcaattcttcgttc 31815199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 30 - 209
Target Start/End: Original strand, 23478241 - 23478421
Alignment:
Q  30 ttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggca 129  Q
    |||||||  ||||| | ||| |||||||||||||| ||| |||||  |||  || |  ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  23478241 ttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggttgttgtcctaagaaggatcacattcaaatccattcctatcttgaaggaaca-tttctacaggca 23478339  T
Q  130 gagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtacttcgtcaactct 209  Q
     ||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  23478340 tagctgtttttcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacactttgtactttgtcaactct 23478421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 51 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 40033009 - 40032869
Alignment:
Q  51 tttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgta 150  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  40033009 tttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaaca-tttctgcaagcagagctgttatcttgtcttgta 40032911  T
Q  151 gcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacact 192  Q
    |||| ||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40032910 gcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacact 40032869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 30 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 25112143 - 25111966
Alignment:
Q  30 ttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggca 129  Q
    |||||||  ||||| | ||| |||||||||||||| ||| ||| | ||||  || |  ||||||| |||||| ||  |||||||||| ||||||||||||    
T  25112143 ttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggttgttgtcttatgaaggatcacattcaaatccattcctattatgaaggaaca-tttctgcaggca 25112045  T
Q  130 gagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt-gtacttcgtcaac 206  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  25112044 gagctgtttttcttgtcttgtagcgtagacataaatagagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtactttgtcaac 25111966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #121
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 30 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 25171234 - 25171057
Alignment:
Q  30 ttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggca 129  Q
    |||||||  ||||| | ||| |||||||||||||| ||| ||| | ||||  || |  ||||||| |||||| ||  |||||||||| ||||||||||||    
T  25171234 ttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggttgttgtcttatgaaggatcacattcaaatccattcctattatgaaggaaca-tttctgcaggca 25171136  T
Q  130 gagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt-gtacttcgtcaac 206  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  25171135 gagctgtttttcttgtcttgtagcgtagacataaatagagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtactttgtcaac 25171057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #122
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 30 - 193
Target Start/End: Original strand, 32160638 - 32160801
Alignment:
Q  30 ttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggca 129  Q
    |||||||  ||||| | ||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| ||  | | |||||| ||||||||||||    
T  32160638 ttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggttgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctattctaagggaaca-tttctgcaggca 32160736  T
Q  130 gagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||| | ||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32160737 gagctgtttttcttatcttgtagcgtagacataaacagagtagtggaggtagtggtcgtacactt 32160801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #123
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Original strand, 4886985 - 4887057
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4886985 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 4887057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #124
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 88 - 193
Target Start/End: Original strand, 15516900 - 15517004
Alignment:
Q  88 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 186  Q
    ||||||| |||||||||   ||||||||| | | |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15516900 ttcaaatgcattcccattgagaaggaacattgt-tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaa-aacagagtagtggaggtagtggttg 15516997  T
Q  187 tacactt 193  Q
    |||||||    
T  15516998 tacactt 15517004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #125
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 26 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 23697072 - 23696979
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaat-aattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||  | |||||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  23697072 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtggagtccttttaaagaaaaaccttcaaattccttcccatcttgagtgaacaat 23696979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #126
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 29 - 193
Target Start/End: Original strand, 26765370 - 26765533
Alignment:
Q  29 tttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggc 128  Q
    ||||||||  ||||| | |||||||||||||| ||| | | |||||  |||| || |  ||||||| |||||||||   ||||||||| | | |||||||    
T  26765370 tttgatcaatcaccaatgatcctttgcctgatatggttattgtcctaagaatgatcaatttcaaatgcattcccattgagaaggaacattgt-tgcaggc 26765468  T
Q  129 agagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    ||||||||| | |||||||||||||   ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26765469 agagctgtttttcttgtcttgtagctgagacaa-aacagagtagtggaggcagtggttgtacactt 26765533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #127
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 29 - 193
Target Start/End: Original strand, 28139478 - 28139642
Alignment:
Q  29 tttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggc 128  Q
    ||||||||  ||||| | || ||||||||||| ||| | | ||||| ||||| || |  |||||||  ||||||||   |||| |||||| | |||||||    
T  28139478 tttgatcaatcaccaatgattctttgcctgatatggttattgtcctatgaatgatcaatttcaaatgtattcccattgagaagaaacaatgt-tgcaggc 28139576  T
Q  129 agagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    ||||||||| | |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28139577 agagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 28139642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #128
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 7745867 - 7745795
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7745867 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaaccgagtagtggaggtagtggttgtacactt 7745795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #129
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Original strand, 10848736 - 10848808
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10848736 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 10848808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #130
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Original strand, 33933230 - 33933302
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33933230 tgcaggcaaagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 33933302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #131
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 139 - 193
Target Start/End: Original strand, 20550876 - 20550930
Alignment:
Q  139 tcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    ||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20550876 tcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 20550930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #132
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 193
Target Start/End: Original strand, 26759021 - 26759184
Alignment:
Q  29 tttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggc 128  Q
    ||||||||  ||||| | |||||||||||||| ||| | | |||||  |||| || |  ||||||| |||||| ||  |||||||| | | | |||||||    
T  26759021 tttgatcaatcaccaatgatcctttgcctgatatggttattgtcctaagaatgatcaatttcaaatgcattcctattatgaaggaatattgt-tgcaggc 26759119  T
Q  129 agagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    ||||||||| | |||||||||||||   ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26759120 agagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaa-aatagagtagtggaggtagtggttgtacactt 26759184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #133
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 30116011 - 30115942
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtaca 190  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30116011 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtaca 30115942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #134
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Original strand, 9088932 - 9089004
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    ||||| |||||||||| | |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9088932 tgcagacagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 9089004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #135
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Original strand, 30742944 - 30743015
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30742944 tgcaggtagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 30743015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #136
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 88 - 193
Target Start/End: Original strand, 33022598 - 33022699
Alignment:
Q  88 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgt 187  Q
    ||||||| |||||| ||  ||||||||||  || ||||||||||||| |   |||||||||||||   ||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  33022598 ttcaaatgcattcctattgtgaaggaacatctt-tgcaggcagagcttt---cttgtcttgtagcagagacaaaaacatagtagtggaggtagtggttgt 33022693  T
Q  188 acactt 193  Q
    ||||||    
T  33022694 acactt 33022699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #137
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 89629 - 89524
Alignment:
Q  88 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 186  Q
    |||||||||||||| |   |||||||||| ||  |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||  ||| ||||||||||| |||||||||    
T  89629 ttcaaattcattccaagtatgaaggaaca-ttgatgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttg 89531  T
Q  187 tacactt 193  Q
    |||||||    
T  89530 tacactt 89524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #138
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 14086695 - 14086641
Alignment:
Q  139 tcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    ||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14086695 tcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagcggttgtacactt 14086641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #139
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 193
Target Start/End: Original strand, 26784284 - 26784389
Alignment:
Q  88 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 186  Q
    ||||||| |||||||| | || ||||||| ||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||    |||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  26784284 ttcaaatccattcccagcatgtaggaacatttt-tgcaggcagagttgttattcttgtcttgtagcagacacacaaactgagtagtggaggtagtggttg 26784382  T
Q  187 tacactt 193  Q
    |||||||    
T  26784383 tacactt 26784389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #140
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 193
Target Start/End: Original strand, 42243662 - 42243715
Alignment:
Q  139 tcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    ||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42243662 tcttgtcttgtagcagagacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 42243715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #141
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 140 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 35932161 - 35932108
Alignment:
Q  140 cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||||   ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35932161 cttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacactt 35932108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #142
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Original strand, 11993851 - 11993923
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||| ||||||| | ||||| |||||||   ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11993851 tgcaggcatagctgtttttcttgttttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacactt 11993923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #143
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 13545686 - 13545614
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttg-tcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||||||||||   ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13545686 tgcaggcagagttgtttatcttgtcttgtagcagagacaaaaatagagtagtggaggtggtggttgtacactt 13545614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #144
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 25096999 - 25096928
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||| ||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25096999 tgcaggcatagctgttattcttgtcttgttgcagagacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 25096928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #145
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 25154969 - 25154898
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||| ||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25154969 tgcaggcatagctgttattcttgtcttgttgcagagacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 25154898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #146
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 29138580 - 29138508
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    ||||||||||| |||| | |||||||||||||   ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29138580 tgcaggcagagttgtttttcttgtcttgtagcagagacacaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 29138508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #147
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Original strand, 31117840 - 31117912
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    ||||||||| |||||| | |||||||||||||   ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  31117840 tgcaggcagcgctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggatgtacactt 31117912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #148
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 35986406 - 35986334
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||   |||||   |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35986406 tgcaggcagagctgttatccttgtcttgtagcagagacaaactcagagtagtggaagtagtggttgtacactt 35986334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #149
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 164 - 198
Target Start/End: Original strand, 16607518 - 16607552
Alignment:
Q  164 cagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtact 198  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16607518 cagagtagtggagatagtggttgtacacttgtact 16607552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #150
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 25930327 - 25930261
Alignment:
Q  125 aggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtaca 190  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  25930327 aggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtagagatagtggttgtaca 25930261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #151
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 124 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 41566606 - 41566536
Alignment:
Q  124 caggcagagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||   ||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41566606 caggcagagctgttatccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactt 41566536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #152
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 3245615 - 3245543
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||||||||    ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  3245615 tgcagacagagctgtttttcttgtcttgtagtagagacaaaaacagagtactggagatagtggttgtacactt 3245543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #153
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 9398908 - 9398836
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||  ||| ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  9398908 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttatacactt 9398836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #154
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 19536475 - 19536403
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||  |||  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  19536475 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacacaaactaagtagtggagatagtggttgtacactt 19536403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #155
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Original strand, 21660175 - 21660247
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    ||||||||||| |||| || ||||||||||||   |||||   |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21660175 tgcaggcagagttgttatccttgtcttgtagcagagacaaactcagagtagtggaagtagtggttgtacactt 21660247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #156
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 166 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 26119959 - 26119927
Alignment:
Q  166 gagtagtggaggtagtggttgtacacttgtact 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26119959 gagtagtggaggtagtggttgtacaattgtact 26119927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #157
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 28464513 - 28464441
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| |||    ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  28464513 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttatagtagagacaaaaacagagtagtagagatagtggttgtacactt 28464441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 107)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Original strand, 4987352 - 4987610
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  4987352 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaa 4987451  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |    
T  4987452 ttctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctcttaacgaa 4987551  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4987552 ggacaaatactcagtgcacttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 4987610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 15207592 - 15207336
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15207592 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaa- 15207494  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  15207493 ttctgcaggcataactgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaa 15207395  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15207394 ggacaagtactcagtgctttccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 15207336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 10909494 - 10909745
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  10909494 tcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 10909593  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 225  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  10909594 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaag 10909693  T
Q  226 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10909694 tactcagggctctccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 10909745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Original strand, 11535925 - 11536182
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11535925 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaaca-t 11536023  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |    
T  11536024 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataacgaa 11536123  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11536124 ggacaagtacccagtgcttttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 11536182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Original strand, 24713511 - 24713767
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24713511 gttgagttcctttgatcatctaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaaca-t 24713609  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |    
T  24713610 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtg-acaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataacgaa 24713708  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  24713709 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttaatacctccctttcaattcttcgttc 24713767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 47152259 - 47152002
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47152259 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 47152160  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    | |||||||||  | ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  47152159 t-ctgcaggcatggttgttgtcttgtcttgtagcgtagataaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaa 47152061  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47152060 ggacaagtactcagggctctccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 47152002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Original strand, 5873449 - 5873706
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  5873449 gttgagttccttggatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaatttcattcccatcttgaaggaaca-t 5873547  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |    
T  5873548 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacaaagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactatgttaatgaa 5873647  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5873648 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 5873706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Original strand, 10695719 - 10695976
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10695719 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatctcgaaggaacaat 10695818  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    | |||||||||  ||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  10695819 t-ctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagaaaaaaacagggtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaa 10695917  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10695918 ggacaagtactcagggctctccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 10695976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 18078079 - 18077828
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  18078079 tcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 18077980  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 225  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  18077979 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagaggagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 18077880  T
Q  226 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    | ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18077879 tgctcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 18077828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Original strand, 3370794 - 3371052
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  3370794 gttgagtttctttgatcacccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtccttttaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaa 3370893  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  3370894 ttttgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtggtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaa 3370993  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  3370994 ggacaaatactcagtgcacttcaaatgaccgttgatacctccctttcaaatcttcgttc 3371052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Original strand, 11515115 - 11515372
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  11515115 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattctcatcttgaaggaaca-t 11515213  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||| |    
T  11515214 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttttactttgttaactctgataacgaa 11515313  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11515314 ggacaagtactcagtgcttttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 11515372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 31266977 - 31266720
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31266977 gttgagtttctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaaaatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaaca-t 31266879  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  31266878 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaa 31266779  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  31266778 ggacaaatactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctcctttacaattcttcgttc 31266720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Original strand, 3390534 - 3390792
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||     
T  3390534 gttgagtttctttgatcacccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtccttttaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcataaa 3390633  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  3390634 ttctgcatgcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtggtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaa 3390733  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  3390734 ggacaaatactcagtgcacttcaaatgaccgttgatacctccctttcaaatcttcgttc 3390792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Original strand, 10300614 - 10300871
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10300614 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaaca-t 10300712  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |    
T  10300713 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagataaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataacgaa 10300812  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  10300813 ggacaaatactcaatgcttttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattctttgttc 10300871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 14836283 - 14836026
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||     
T  14836283 gttgagttcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttaggtgtagtcctttgaagaattagctttaaattcattcccatcttgaaggcacaaa 14836184  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  14836183 ttctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaa 14836085  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |||||| ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||    
T  14836084 ggacaaatactcagtgctatccaaatgatcgttgatacctccctttcaattattcgttc 14836026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Original strand, 19581320 - 19581577
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19581320 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgtctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaaca-t 19581418  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |    
T  19581419 ttctgcaggcatggctgttttcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacaaa 19581518  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  19581519 ggacaagtactcagtgttttccaaatgatcgttgatacctcccttttaattcttcgttc 19581577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 40470760 - 40470510
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||    
T  40470760 tcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaaatctgca 40470661  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 225  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  40470660 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 40470562  T
Q  226 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    | ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  40470561 tgctcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttaaattcttcgttc 40470510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 5022822 - 5023072
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||| |||  |||||||    
T  5022822 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagctccaaattcattcccatcttaaaggcacatattctgca 5022921  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 225  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  5022922 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaac 5023020  T
Q  226 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    | ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5023021 tgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 5023072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Original strand, 16317409 - 16317667
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16317409 gttgatttcctttgatcatccaccagtaattctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaaca-t 16317507  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgc 217  Q
    |||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16317508 ttctgcaggcatggctgtttttcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacga 16317607  T
Q  218 aggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||||||| |||| |||| ||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  16317608 aggacaaatacttagtgttctccaaatgaccgttgatgtctccctttcaattcttcgttc 16317667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 40454521 - 40454271
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||    
T  40454521 tcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttaggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaaatctgca 40454422  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 225  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  40454421 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 40454323  T
Q  226 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    | ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  40454322 tgctcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttaaattcttcgttc 40454271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 30 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 18763269 - 18763024
Alignment:
Q  30 ttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggca 129  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  18763269 ttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgcaggca 18763170  T
Q  130 gagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtact 229  Q
     | |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||    
T  18763169 taactgttgccttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgct 18763071  T
Q  230 cagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgtt 276  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18763070 cagagctattcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgtt 18763024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 25657222 - 25657473
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  25657222 tcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 25657321  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactc-tgttaacgcaggacaa 224  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  25657322 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-agcagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactcttgttaacgaaggacaa 25657420  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
     | ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  25657421 atgctcagtgctatccaaatgaccgttgatacctctctttcaattcttcgttc 25657473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 30 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 18752659 - 18752413
Alignment:
Q  30 ttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggca 129  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  18752659 ttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgcaggca 18752560  T
Q  130 gagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtact 229  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||    
T  18752559 tagctgttgccttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgct 18752461  T
Q  230 cagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
     || ||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18752460 tagagcaattcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 18752413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Original strand, 16305185 - 16305443
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  16305185 gttgatttcctttgatcatccaccagtaattctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattctcatcttgaaggaaca-t 16305283  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgc 217  Q
    |||||||||||  | |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||     
T  16305284 ttctgcaggcatggttgtttttcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttatactttgtcaactctgttaacga 16305383  T
Q  218 aggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||||||| |||| |||| ||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  16305384 aggacaaatacttagtgttctccaaatgaccgttgatgtctccctttcaattcttcgttc 16305443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 19 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 49002158 - 49001903
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  49002158 gttgagttcctttgatcatccaccattaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctgtgaaggattaacttcaaattcattcctatcttgaaggaaca-t 49002060  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || | |    
T  49002059 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaatgaa 49001961  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgtt 276  Q
    ||||||| || || |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  49001960 ggacaagcacccaatgcttttcaaatgactgttgatacctccctttcaattcttcgtt 49001903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 19 - 276
Target Start/End: Original strand, 55651404 - 55651659
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||  || |  |||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  55651404 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgactgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaaattcaaattcattcctatcttgaaggaaca-t 55651502  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || | |    
T  55651503 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaatgaa 55651601  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgtt 276  Q
    ||||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  55651602 ggacaagcacccagtgcttttcaaatgaacgttgatacctccctttcaattcttcgtt 55651659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 27815119 - 27814867
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  27815119 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaaggtacaaattctgca 27815020  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  27815019 ggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacataaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 27814920  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  27814919 gtgctcagtgctatccatatatccgtttatacctccctttcaattcttcgttc 27814867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 48371217 - 48371469
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||    
T  48371217 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaaggtacaaattatgca 48371316  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  48371317 ggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 48371416  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  48371417 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacccccctttcaattcttcgttc 48371469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 52703874 - 52704126
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  52703874 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtacaaattctgca 52703973  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  52703974 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 52704073  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  52704074 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 52704126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 461243 - 461495
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  461243 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 461342  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  461343 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 461442  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  461443 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 461495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 14843827 - 14843575
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  14843827 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 14843728  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  14843727 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 14843628  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14843627 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 14843575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 22007097 - 22007349
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  22007097 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 22007196  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  22007197 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttagtcaactctattaacgagagacaa 22007296  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22007297 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 22007349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 30937246 - 30936994
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  30937246 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 30937147  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  30937146 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 30937047  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30937046 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 30936994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 450662 - 450914
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  450662 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 450761  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   || ||    
T  450762 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagataa 450861  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  450862 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 450914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 17918138 - 17918390
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  17918138 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 17918237  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||   |||||    
T  17918238 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactctgtcaactctattaacgagagacaa 17918337  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17918338 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 17918390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 17928786 - 17929038
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  17928786 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 17928885  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||   |||||    
T  17928886 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactctgtcaactctattaacgagagacaa 17928985  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17928986 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 17929038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 19944501 - 19944249
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  19944501 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtacaaattctgca 19944402  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| ||||||| |||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  19944401 ggcatggctgttgttttgtcttatagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 19944302  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  19944301 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatagctccctttcaattcttcgttc 19944249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 21996499 - 21996751
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  21996499 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 21996598  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  21996599 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtagaggtagtggttgtacacttgtacttagtcaactctattaacgagagacaa 21996698  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21996699 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 21996751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 24028259 - 24028007
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  24028259 tcctttgataatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 24028160  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  | |||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  24028159 ggcatggttgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 24028060  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24028059 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 24028007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 30926668 - 30926416
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  30926668 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagctttaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 30926569  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  30926568 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 30926469  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30926468 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 30926416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 10751342 - 10751090
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  10751342 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 10751243  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  10751242 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 10751143  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  10751142 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattctttgttc 10751090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 10965111 - 10964859
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  10965111 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 10965012  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  10965011 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 10964912  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  10964911 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattctttgttc 10964859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 15561253 - 15561001
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  15561253 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 15561154  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  15561153 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 15561054  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15561053 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 15561001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 16255955 - 16256207
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  16255955 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaagttctgca 16256054  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  16256055 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 16256154  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  16256155 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattctttgttc 16256207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 16266548 - 16266800
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  16266548 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 16266647  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  16266648 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 16266747  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  16266748 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattctttgttc 16266800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 36018422 - 36018674
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  36018422 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 36018521  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  36018522 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 36018621  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36018622 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 36018674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 36028975 - 36029227
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  36028975 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 36029074  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  36029075 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 36029174  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36029175 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 36029227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 55745426 - 55745174
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  55745426 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 55745327  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  55745326 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 55745227  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  55745226 gtgctcagtgctttccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttc 55745174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 55756037 - 55755785
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  55756037 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 55755938  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  55755937 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 55755838  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  55755837 gtgctcagtgctttccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttc 55755785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 4948421 - 4948673
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||  |||||||    
T  4948421 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtggtcatttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacatattctgca 4948520  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  4948521 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 4948620  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4948621 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 4948673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 19955136 - 19954884
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||    
T  19955136 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctggtttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattctcatcttgaacgtacaaattctgca 19955037  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  19955036 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaaaagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 19954937  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  19954936 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatagctccctttcaattcttcgttc 19954884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 26 - 273
Target Start/End: Original strand, 49518221 - 49518469
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  49518221 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 49518320  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  49518321 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 49518420  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttc 273  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  49518421 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttc 49518469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 10740768 - 10740516
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  10740768 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctaatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 10740669  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  10740668 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 10740569  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |  ||||||||| | || ||   ||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  10740568 gagctcagtgctatccatatattcgttgatacctccctttcaattctttgttc 10740516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 10954537 - 10954285
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  10954537 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctaatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 10954438  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  10954437 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 10954338  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |  ||||||||| | || ||   ||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  10954337 gagctcagtgctatccatatattcgttgatacctccctttcaattctttgttc 10954285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 24640333 - 24640586
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttga-aggaacaatttctgc 124  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||    
T  24640333 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgc 24640432  T
Q  125 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 223  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   ||||    
T  24640433 aggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagaca 24640532  T
Q  224 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||| ||||||| | | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24640533 agtgctcagtgttatccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttc 24640586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 18130413 - 18130162
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  18130413 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 18130314  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  18130313 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 18130214  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |  ||||||||| | || || | | ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  18130213 gagctcagtgctatccatat-atccttgatacctccctttcaattctttgttc 18130162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Original strand, 23509197 - 23509386
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  23509197 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggattaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaa- 23509295  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactct 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23509296 ttctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 23509386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 27656686 - 27656939
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttga-aggaacaatttctgc 124  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||    
T  27656686 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgc 27656785  T
Q  125 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 223  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   ||||    
T  27656786 aggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtggtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagaca 27656885  T
Q  224 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||| ||||||| | | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27656886 agtgctcagtgttatccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttc 27656939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 27667259 - 27667512
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttga-aggaacaatttctgc 124  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||    
T  27667259 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgc 27667358  T
Q  125 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 223  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   ||||    
T  27667359 aggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtggtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagaca 27667458  T
Q  224 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||| ||||||| | | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27667459 agtgctcagtgttatccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttc 27667512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 18774856 - 18774613
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  || | ||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  18774856 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaa- 18774758  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||     || || |||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||| | || | |    
T  18774757 ttatgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacacttagggtcgtggagatagtggttgtacaattgtattttgtcaactct-tcaatgaa 18774659  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctcccttt 264  Q
    ||||||  || ||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||    
T  18774658 ggacaaacacccagtgcttttcaaatgaacgttggcacctcccttt 18774613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 8997457 - 8997268
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||  || | |||||||||||||||  |||||||||||| |     
T  8997457 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctataaaggatcaacttcaaattcattcctgtcttgaaggaac-ac 8997359  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactct 209  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8997358 ttctgcaggcagaactgttatcttgtcttgtagcgaggacatactcagggtcgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 8997268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 16819553 - 16819364
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||  || | ||||||||||||||| ||||||  |||||||     
T  16819553 gttgagttcctttgatcatccaccattaatcttttgcctgatttggatgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgtgggaacaa- 16819455  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactct 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16819454 ttctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcaaggacacactcagggtcgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 16819364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 27 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 18007252 - 18007018
Alignment:
Q  27 cctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcag 126  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  18007252 cctttgatcatccaccagtaatcttttgccttatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttt-tgcag 18007154  T
Q  127 gcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagt 226  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||  ||||||||     
T  18007153 gcagagctgttttcttgtcttgtagcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaac-aaggacaagc 18007056  T
Q  227 actcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctcccttt 264  Q
    || ||||||| ||||||| | |||||  ||||||||||    
T  18007055 acccagtgcttttcaaattaacgttggcacctcccttt 18007018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 28 - 209
Target Start/End: Original strand, 33378279 - 33378461
Alignment:
Q  28 ctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcagg 127  Q
    |||||||||  ||||| | ||| |||||||||||||| ||| ||||| |||| ||| |  ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  33378279 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaagaatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaaca-tttctgcagg 33378377  T
Q  128 cagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtacttcgtcaactct 209  Q
     ||| ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  33378378 tagaactgtttttcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactttgtactttgtcaactct 33378461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 51 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 14778611 - 14778412
Alignment:
Q  51 tttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgta 150  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14778611 tttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctttcttgaaggaaca-tttctgcaggcagagctgttatcttgtcttgta 14778513  T
Q  151 gcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgt 250  Q
    |||| ||||  | |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | || | |||||||| || ||||||| ||| ||||| |||    
T  14778512 gcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacaattgtactttgtcaactct-tcaatgaaggacaagcacccagtgcttttctaatgaacgt 14778414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 51 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 17993962 - 17993763
Alignment:
Q  51 tttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgta 150  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| | |||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  17993962 tttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctaacttgaagggaca-tttctgcaggcagagctattatcttgtcttgta 17993864  T
Q  151 gcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgt 250  Q
    |||| ||||  | |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | || | |||||||| || ||||||| ||||| ||| |||    
T  17993863 gcgtagacacaagcagagttgtggaggtagtggttgtacaattgtactttgtcaactct-tcaatgaaggacaagcacccagtgcttttcaagtgaacgt 17993765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 51 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 14710947 - 14710790
Alignment:
Q  51 tttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgta 150  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  14710947 tttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctttcttgaaggaaca-tttctataggcagagctgttatcttgtcttgta 14710849  T
Q  151 gcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactct 209  Q
    |||| ||||  | |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  14710848 gcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacaattgtactttgtcaactct 14710790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 51 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 36210278 - 36210119
Alignment:
Q  51 tttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttg-tcttgtcttgt 149  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  36210278 tttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacattcaaatccattcctatcttgaaggaaca-tttatgcaggcagagctgtttatcttgtcttgt 36210180  T
Q  150 agcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtacttcgtcaactct 209  Q
    ||||| ||||  | |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  36210179 agcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacactttgtactttgtcaactct 36210119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 27 - 149
Target Start/End: Original strand, 19242114 - 19242235
Alignment:
Q  27 cctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcag 126  Q
    |||||||||||  |||| | ||| ||| |||||||||| ||| ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  19242114 cctttgatcatttaccaatgatctttttcctgatttggatgttgtcctatgaatgatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaac-atttctgcag 19242212  T
Q  127 gcagagctgttgtcttgtcttgt 149  Q
    ||||||||||| |||||||||||    
T  19242213 gcagagctgttatcttgtcttgt 19242235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Original strand, 1672350 - 1672422
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    ||||| |||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1672350 tgcagacagagctgttattcttgttttgtagcgtagacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 1672422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Original strand, 1674825 - 1674897
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    ||||| |||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1674825 tgcagacagagctgttattcttgttttgtagcgtagacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 1674897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 14605057 - 14604985
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14605057 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcatagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 14604985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 164 - 264
Target Start/End: Original strand, 19244002 - 19244101
Alignment:
Q  164 cagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctt 263  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||  |||||||| || ||||||| ||||||||| |||||| |||| ||||    
T  19244002 cagagttgtggaggtagtggttgtacaattgtactttgtcaactct-tcaacaaaggacaagcacccagtgcttttcaaatgaacgttgacaccttcctt 19244100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 193
Target Start/End: Original strand, 10692719 - 10692884
Alignment:
Q  28 ctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcagg 127  Q
    |||||||||  ||||| | ||| |||||||||| ||| | | ||||| ||||| || |  |||||||   |||||||  |||||||||| | | ||||||    
T  10692719 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaatgatcaatttcaaatgggttcccattgtgaaggaacattgt-tgcagg 10692817  T
Q  128 cagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    || ||||||| | |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10692818 catagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 10692884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 193
Target Start/End: Original strand, 10906485 - 10906650
Alignment:
Q  28 ctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcagg 127  Q
    |||||||||  ||||| | ||| |||||||||| ||| | | ||||| ||||| || |  |||||||   |||||||  |||||||||| | | ||||||    
T  10906485 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaatgatcaatttcaaatgggttcccattgtgaaggaacattgt-tgcagg 10906583  T
Q  128 cagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    || ||||||| | |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10906584 catagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 10906650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Original strand, 6517446 - 6517518
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6517446 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 6517518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Original strand, 16853464 - 16853536
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    ||||||||||| |||| | |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16853464 tgcaggcagagttgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 16853536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 17398824 - 17398752
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||   ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17398824 tgcaggcagagctgttatccttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagttagtggttgtacactt 17398752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Original strand, 22190807 - 22190879
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgtctt-gtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||   ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22190807 tgcaggcagagctgttatctttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacactt 22190879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 88 - 193
Target Start/End: Original strand, 19884630 - 19884735
Alignment:
Q  88 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 186  Q
    ||||||| |||| ||||  ||||||||||  || |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| |||||| |||||||| |||||||||    
T  19884630 ttcaaatgcatttccattgtgaaggaacatctt-tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagattagtggagatagtggttg 19884728  T
Q  187 tacactt 193  Q
    |||||||    
T  19884729 tacactt 19884735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 3105569 - 3105497
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||||||| || ||| ||||||||   ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3105569 tgcaggcagagctgttatccttgccttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 3105497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 9751690 - 9751618
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||||   ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9751690 tgcaggcatagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacactt 9751618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Original strand, 20977418 - 20977490
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  20977418 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtgcagatagtggttgtacactt 20977490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 25651253 - 25651182
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    ||||||| |||||||| | |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25651253 tgcaggccgagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 25651182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 37435685 - 37435613
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| ||||   ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37435685 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttatagcagagacaaaaacaaagtagtggaggtagtggttgtacactt 37435613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 39419884 - 39419812
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  39419884 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtaatggaagtagtggttgtacactt 39419812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 88 - 190
Target Start/End: Original strand, 8105566 - 8105667
Alignment:
Q  88 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 186  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||   | |||||||||||||||| | ||| |||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8105566 ttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatcgt-tgcaggcagagctgtttttcttatcttgtagcagagacaa-aacagagtagtggaggtagtggttg 8105663  T
Q  187 taca 190  Q
    ||||    
T  8105664 taca 8105667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 193
Target Start/End: Original strand, 29121344 - 29121403
Alignment:
Q  134 tgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||| |||||||||||| |   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29121344 tgttttcttgtcttgtaacagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 29121403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 39526121 - 39526082
Alignment:
Q  238 ttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39526121 ttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 39526082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 187
Target Start/End: Original strand, 16848508 - 16848574
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgt 187  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||    ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16848508 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtaggagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgt 16848574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 191
Target Start/End: Original strand, 40860628 - 40860698
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 191  Q
    ||||| |||||||||| || ||||||||||||   ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40860628 tgcagtcagagctgttatccttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacac 40860698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Original strand, 3395551 - 3395623
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||   ||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3395551 tgcaggcagagctgttatccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactt 3395623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 13576264 - 13576192
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  13576264 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagcagtggatgtagtggttttacactt 13576192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Original strand, 38513839 - 38513911
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||||||| | || ||||||||||   ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  38513839 tgcaggcagagctgtttttctcgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtgaaagtagtggttgtacactt 38513911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 56533211 - 56533140
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||||||||   ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  56533211 tgcaggcagagctgtttttattgtcttgtagcagagacaa-aacagagtagtggaagtagtggttgtacactt 56533140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 88 - 193
Target Start/End: Original strand, 412929 - 413035
Alignment:
Q  88 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaa-gaacagagtagtggaggtagtggtt 185  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||   | |||||||||| ||||| | ||||| |||||||   ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  412929 ttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatcgt-tgcaggcagaactgtttttcttgttttgtagcaaagacaaagaacagagtagtggaggcagtggtt 413027  T
Q  186 gtacactt 193  Q
    ||||||||    
T  413028 gtacactt 413035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 162 - 193
Target Start/End: Original strand, 6641686 - 6641717
Alignment:
Q  162 aacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6641686 aacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 6641717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 123 - 193
Target Start/End: Original strand, 16939978 - 16940049
Alignment:
Q  123 gcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||   |||||| |||| || ||||||| ||||||||||||||||    
T  16939978 gcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagtagggacaaaaacatagcagtggagatagtggttgtacactt 16940049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 88 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 22675704 - 22675598
Alignment:
Q  88 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaa-cagagtagtggaggtagtggtt 185  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||||| | | || |||||||||| || | |||||||||||||   ||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  22675704 ttcaaatgcattcccattgtgaaggaacattgt-tgtaggcagagctatttttcttgtcttgtagcagagacaaaaaactgagtagtggaggtagtggtt 22675606  T
Q  186 gtacactt 193  Q
    ||||||||    
T  22675605 gtacactt 22675598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 162 - 193
Target Start/End: Original strand, 54679932 - 54679963
Alignment:
Q  162 aacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54679932 aacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 54679963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 88 - 193
Target Start/End: Original strand, 10072863 - 10072968
Alignment:
Q  88 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 186  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||  || |||||| || |||||| | |||||||| ||||   ||||| |||| |||||||||| |||||||||    
T  10072863 ttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatctt-tgcaggtagggctgtttttcttgtcttatagcagagacaaaaacatagtagtggagatagtggttg 10072961  T
Q  187 tacactt 193  Q
    |||||||    
T  10072962 tacactt 10072968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 88 - 193
Target Start/End: Original strand, 45833322 - 45833427
Alignment:
Q  88 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 186  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||   | ||||||||||| |||| | ||||| |||||||   ||| | ||||||||||||||| |||||||||    
T  45833322 ttcaaatccattcccattgtgaaggaacatcgt-tgcaggcagagttgtttttcttgttttgtagcagagaccaaaacagagtagtggagatagtggttg 45833420  T
Q  187 tacactt 193  Q
    |||||||    
T  45833421 tacactt 45833427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 88 - 193
Target Start/End: Original strand, 55380218 - 55380323
Alignment:
Q  88 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 186  Q
    |||||||||||||| |   |||||||||| | | |||||||||||||||| |  ||||||||||||   ||||  ||| ||||||||||| |||||||||    
T  55380218 ttcaaattcattccaagtatgaaggaacattgt-tgcaggcagagctgttattattgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttg 55380316  T
Q  187 tacactt 193  Q
    |||||||    
T  55380317 tacactt 55380323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 162 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 10661276 - 10661240
Alignment:
Q  162 aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtact 198  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  10661276 aacagagtagtggagatagtggttgtacaattgtact 10661240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 162 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 10875421 - 10875385
Alignment:
Q  162 aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtact 198  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  10875421 aacagagtagtggagatagtggttgtacaattgtact 10875385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 19621211 - 19621139
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||   ||||  ||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  19621211 tgcaggcagagctgttatccttgtcttgtagcagagacacaaactgaatagtggagatagtggttgtacactt 19621139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Original strand, 23750483 - 23750555
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||  ||| ||||||||||| || |||||||||||||    
T  23750483 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagataatggttgtacactt 23750555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 4)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 25 - 277
Target Start/End: Original strand, 117147 - 117398
Alignment:
Q  25 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgc 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  117147 ttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaattt-tgc 117245  T
Q  125 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  117246 aggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagcggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaa 117345  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  117346 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacatccctttcaattcttcgttc 117398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 51 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 475464 - 475305
Alignment:
Q  51 tttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttg-tcttgtcttgt 149  Q
    ||||||||||||||  || ||||| ||||  || |  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  475464 tttgcctgatttggaagttgtcctatgaaggatcatgttcaaattcattcctatcttgaaggaaca-tttctgcaggcagagctgtttatcttgtcttgt 475366  T
Q  150 agcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtacttcgtcaactct 209  Q
    ||||| ||||  | |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  475365 agcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacactttgtactttgtcaactct 475305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 51 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 481984 - 481825
Alignment:
Q  51 tttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttg-tcttgtcttgt 149  Q
    ||||||||||||||  || ||||| ||||  || |  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  481984 tttgcctgatttggaagttgtcctatgaaggatcatgttcaaattcattcctatcttgaaggaaca-tttctgcaggcagagctgtttatcttgtcttgt 481886  T
Q  150 agcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtacttcgtcaactct 209  Q
    ||||| ||||  | |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  481885 agcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacactttgtactttgtcaactct 481825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #4
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 30 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 156861 - 156681
Alignment:
Q  30 ttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggca 129  Q
    |||||||  ||||| | ||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| |    
T  156861 ttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaacaa-ttctgcaggta 156763  T
Q  130 gagctg-ttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtacttcgtcaactct 209  Q
    |||||| || |||||||||||| ||| |||     || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  156762 gagctgtttttcttgtcttgtatcgtagacgcacgcatagtcgtggaggtagtggttgtacactttgtactttgtcaactct 156681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 171)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 13261847 - 13261590
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13261847 gttgagtccctttgatcatccactagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 13261748  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13261747 t-ctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtgaaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgca 13261649  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13261648 ggacaagtactcagtgttcttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 13261590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Original strand, 28169142 - 28169399
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28169142 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcatttgtctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 28169241  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  28169242 t-ctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgca 28169340  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28169341 ggacaagtactcagtgttcttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 28169399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Original strand, 11163889 - 11164147
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||     
T  11163889 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctaatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcaaaaa 11163988  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  11163989 ttctgtaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaa 11164088  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  11164089 ggacaaatactcagtgcacttcaaatgaccgttgatacctccctttcaatttttcgttc 11164147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 19 - 273
Target Start/End: Original strand, 4456976 - 4457229
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  4456976 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccaacttgaaggaaca-t 4457074  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  4457075 ttctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaa 4457174  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttc 273  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4457175 ggacaagtactcagtgttctccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttc 4457229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Original strand, 27883444 - 27883701
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27883444 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgagtgtagtcctttgaagaatcaatttcaaattcattcccatcttgaaggaaca-t 27883542  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |    
T  27883543 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataacgaa 27883642  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  27883643 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctgtcaattcttcgttc 27883701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 19 - 276
Target Start/End: Original strand, 4404333 - 4404589
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  4404333 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcttgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccaacttgaaggaaca-t 4404431  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  4404432 ttctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaa 4404531  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgtt 276  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4404532 ggacaagtactcagtgttctccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgtt 4404589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 24706722 - 24706471
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  24706722 tcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 24706623  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 225  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  24706622 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaatagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 24706523  T
Q  226 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24706522 tactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 24706471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 18851866 - 18851609
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18851866 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttaaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 18851767  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |    
T  18851766 tt-tgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtatacttgtactttgtcaactctgttaacgaa 18851668  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |||||  ||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18851667 ggacatttactcagtgttttccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 18851609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 6501171 - 6500920
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  6501171 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgca 6501072  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 225  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  6501071 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaac 6500972  T
Q  226 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    | ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6500971 tgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 6500920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 9535676 - 9535926
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  9535676 tcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 9535775  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 225  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  9535776 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagcatggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 9535874  T
Q  226 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9535875 tactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 9535926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 16666294 - 16666044
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  16666294 tcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgaagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattcacatcttgaaggaacaatt-ctgca 16666196  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  16666195 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacaaagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataacgaaggacaag 16666096  T
Q  226 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16666095 tacccagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 16666044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 19 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 8740301 - 8740048
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8740301 gttgtgttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgaagtcctttgaaggatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggagcaat 8740202  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |    
T  8740201 t-ctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataacgaa 8740103  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttc 273  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8740102 ggacaagtactcagtgttcttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttc 8740048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 9380831 - 9380573
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  9380831 gttgagatcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaaa 9380732  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| |    
T  9380731 ttctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacatttgtactttgtcaactatgttaacgaa 9380632  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9380631 ggacaaatactcagtgcgcttcaagtgactgttgatacctccctttcaattcttcgttc 9380573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 9391377 - 9391119
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  9391377 gttgagatcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaaa 9391278  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||| |    
T  9391277 ttctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggtggtacatttgtactttctcaactctgttaacgaa 9391178  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9391177 ggacaaatactcagtgcgcttcaagtgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 9391119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 11216896 - 11216638
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  11216896 gttgagatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaa 11216797  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  11216796 ttctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaa 11216697  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |||||| |||||| ||  |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11216696 ggacaaatactcaatggacttcaaatgatcattgatacctccctttcaattcttcgttc 11216638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 19 - 273
Target Start/End: Original strand, 16076990 - 16077243
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16076990 gttgagtttctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaaca-t 16077088  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |    
T  16077089 tgctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataacgaa 16077188  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttc 273  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16077189 ggacaagtactcagtgttcttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttc 16077243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 6490517 - 6490266
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  6490517 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgca 6490418  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 225  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  6490417 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaac 6490318  T
Q  226 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    | ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  6490317 tgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctcccttttaattcttcgttc 6490266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 23635777 - 23636028
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  23635777 tcctttgatcattcaccagtaatccttttcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 23635876  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 225  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  23635877 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 23635976  T
Q  226 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    | |||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23635977 tgctcagtactatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 23636028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Original strand, 1064199 - 1064456
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1064199 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaaca-t 1064297  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |    
T  1064298 ttctgcaggtagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataacgaa 1064397  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1064398 ggacaaatacctagtgctcttcaaacgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 1064456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 7804685 - 7804435
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  7804685 tcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtccttttaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 7804586  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 225  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  7804585 ggcatagctgttgtattgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 7804487  T
Q  226 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  7804486 tactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctcccttttaattcttcgttc 7804435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 9994060 - 9993810
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  9994060 tcctttgatcatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 9993961  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 225  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  9993960 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgtaggacaaa 9993862  T
Q  226 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    | ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9993861 tgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 9993810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 12237781 - 12237531
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  12237781 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgca 12237682  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 225  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  12237681 ggcatagctattgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaac 12237583  T
Q  226 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    | ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12237582 tgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 12237531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 12249607 - 12249357
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  12249607 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctaatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgca 12249508  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 225  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  12249507 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaac 12249409  T
Q  226 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    | ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12249408 tgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 12249357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 48337309 - 48337559
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  48337309 tcctttgatcattcaccagtaatcctttgtctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 48337408  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 225  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||     
T  48337409 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaattctgttaacgaaggacaaa 48337507  T
Q  226 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  48337508 tactcagtgctgtccaaatgaccgatgatacctccctttcaattcttcgttc 48337559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Original strand, 1053770 - 1054027
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1053770 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctaatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaaca-t 1053868  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |    
T  1053869 ttctacaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacaaagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataacgaa 1053968  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  1053969 ggacaagtacctagtgctcttcaaatgaccgttgatatctccctttcaattcttcgttc 1054027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 8996130 - 8995873
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8996130 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcgacttcaaattcattcccatcttgaaggaaca-t 8996032  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |    
T  8996031 ttctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataatgaa 8995932  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8995931 ggacaaatactcagtgcttttaaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 8995873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 26 - 273
Target Start/End: Original strand, 933695 - 933941
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  933695 tcctttgatcattcaccagtaatcctttgtctgatttggatgtagtcctttgaagaattagtttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 933794  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 225  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  933795 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 933893  T
Q  226 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttc 273  Q
    ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  933894 tactcagagcacttcaaaagaccgttgatacctccctttcaattcttc 933941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 7794774 - 7794524
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  7794774 tcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtccttttaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 7794675  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 225  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||     
T  7794674 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggaaaaa 7794576  T
Q  226 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  7794575 tacttagtgctatctaaatgaccgttgatacctcccttttaattcttcgttc 7794524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 9982052 - 9981802
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  9982052 tcctttgatcatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 9981953  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 225  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||      
T  9981952 ggcatagatgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgtaggacaga 9981854  T
Q  226 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    | ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9981853 tgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 9981802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 19887521 - 19887271
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  19887521 tcctttgatcattcaccagtaatcgtttgcctgatttgggtgtactactttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 19887422  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 225  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||     
T  19887421 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggagttagtggttgtacacttgtgctttgtcaactctgttaacgaagtacaaa 19887323  T
Q  226 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19887322 tactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 19887271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Original strand, 38314759 - 38315017
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  38314759 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaaacagcttcaaattcattcccatcttgaaggaaca-t 38314857  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgc 217  Q
    |||||||||||   ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  38314858 ttctgcaggcatgactgtttttcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacga 38314957  T
Q  218 aggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||||||| |||| |||| ||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  38314958 aggacaaatacttagtgttctccaaatgaccgttgatgtctccctttcaattcttcgttc 38315017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 9006682 - 9006425
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9006682 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcgacttcaaattcattcccatcttgaaggaaca-t 9006584  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |    
T  9006583 ttctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataatgaa 9006484  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  9006483 ggacaaatactcagtgcttttaaaatgcccgttgatatctccctttcaattcttcgttc 9006425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Original strand, 14581198 - 14581456
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  14581198 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttggatgaagtcctttgaagaattaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaaa 14581297  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  || | |    
T  14581298 ttctgcaggtagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagggtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaacgctgaaaatgaa 14581397  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  14581398 ggacaagtacccagtgctttgtaaatgaccgttgatacctcccttgcaattcttcgttc 14581456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 19 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 16671336 - 16671083
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16671336 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgaagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattcacatcttgaaggaacaat 16671237  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |    
T  16671236 t-ctacaggcagagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaagagaaaagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataacgaa 16671138  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttc 273  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16671137 ggacaaatacccactgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttc 16671083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 1784246 - 1783987
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1784246 gttgagttcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattaacttcaaattcattcccatcttgaaggaac-at 1784148  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgt-tgtcttgtcttgtagcgtggac-aagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacg 216  Q
    |||||||||||  ||||| | |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1784147 ttctgcaggcatggctgtgtttcttgtcttgtagcgtggacaaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacg 1784048  T
Q  217 caggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
     |||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  1784047 aaggacaagtacttagttttctccaaatgaccgttgatgtctccctttcaattcttcgttc 1783987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 1794658 - 1794399
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1794658 gttgagttcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaac-at 1794560  T
Q  119 ttctgcaggcagagctg-ttgtcttgtcttgtagcgtggac-aagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacg 216  Q
    |||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1794559 ttctgcaggcatggctgtttttcttgtcttgtagcgtggacaaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacg 1794460  T
Q  217 caggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
     |||||||||||| |||  ||| ||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  1794459 aaggacaagtacttagttttctccaaatgatcgttgatgtctccctttcaattcttcgttc 1794399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 17910169 - 17909919
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||| | || |||||||    
T  17910169 tcctttgatcattcaccagtaatccttttcctgatttgggtgttgtccttttaggaattaacttcaaattcattcccatcttgaaggcataaattctgca 17910070  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 225  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  17910069 ggcatagatgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 17909971  T
Q  226 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17909970 tactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 17909919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 29461380 - 29461130
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||    
T  29461380 tcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccactttgaaggcacaaattctgca 29461281  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 225  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  29461280 gacatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 29461182  T
Q  226 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    | ||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  29461181 tgctcagcgctgtccaaatgaccgttgataccttcctttcaattctccgttc 29461130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 19 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 17281607 - 17281354
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||  ||| ||||||||||| |    
T  17281607 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgccagatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattttcattttgaaggaaca-t 17281509  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |    
T  17281508 ttctgcaggtatagctgttgttttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataacgaa 17281409  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttc 273  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17281408 ggacaagtacccagtgcttttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttc 17281354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 26 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 29472232 - 29471988
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||    
T  29472232 tcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccactttgaaggcacaaattctgca 29472133  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 225  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  29472132 gacatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 29472034  T
Q  226 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttct 271  Q
    | ||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  29472033 tgctcagcgctgtccaaatgaccgttgataccttcctttcaattct 29471988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 16391780 - 16391531
Alignment:
Q  28 ctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcagg 127  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || |||  |||||||||    
T  16391780 ctttgatcatccaccagtaattctttgcctgatttgggtgtactcatttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagggtacacattctgcagg 16391681  T
Q  128 cagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagta 227  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |     
T  16391680 catagctgttgttttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtatacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatg 16391581  T
Q  228 ctcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||||||| | | |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16391580 ctcagtgttatccaaaagaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 16391531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 87 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 12567376 - 12567187
Alignment:
Q  87 cttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  12567376 cttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatt-ctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtgaaggtagtggttg 12567278  T
Q  187 tacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12567277 tacacttgtactttgtcaactctgttaacgcaggacaagtactcagtgttcttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 12567187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 10627109 - 10626858
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  ||   ||||||    
T  10627109 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataataatcttcaaattcattcccatcttgaaggcgcagaatctgca 10627010  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 225  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||     ||||||    
T  10627009 ggcaaggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaagcagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactatgtcaactctgttaataggagacaag 10626910  T
Q  226 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    | ||||||| | | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10626909 tgctcagtgatatccatatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 10626858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 10655431 - 10655180
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||    
T  10655431 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataatcttcaaattcattcccatcttgaaggcgcaaaatctgca 10655332  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 225  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||     ||||||    
T  10655331 ggcaaggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaagcagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactatgtcaactctgttaataggagacaag 10655232  T
Q  226 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    | ||||||| | | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10655231 tgctcagtgatatccatatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 10655180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 4174925 - 4174673
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  4174925 tcctttgattatccaccagtaatcctttgcctaatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtacaacttctgca 4174826  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  4174825 ggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgcagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 4174726  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4174725 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 4174673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 6220870 - 6220618
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  6220870 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtacaaattctgca 6220771  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  6220770 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 6220671  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6220670 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 6220618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 13383432 - 13383180
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  13383432 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 13383333  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||    
T  13383332 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgaaagacaa 13383233  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13383232 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 13383180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 37885645 - 37885897
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  37885645 tcctttgattatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtacaacttctgca 37885744  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  37885745 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 37885844  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37885845 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 37885897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 13121729 - 13121981
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  13121729 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgaacaaattctgca 13121828  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  13121829 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 13121928  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13121929 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 13121981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 13131972 - 13132224
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  13131972 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgaacaaattctgca 13132071  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  13132072 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 13132171  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13132172 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 13132224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 13372838 - 13372586
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  13372838 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 13372739  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| | |||||    
T  13372738 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactttattaacgaaagacaa 13372639  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13372638 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 13372586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 13394026 - 13393774
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  13394026 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 13393927  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  13393926 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 13393827  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13393826 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 13393774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 14465658 - 14465910
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  14465658 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgaacaaattctgca 14465757  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  14465758 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 14465857  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14465858 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 14465910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 19778452 - 19778704
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  19778452 tcctttgattatccaacagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtacaaattctgca 19778551  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  19778552 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 19778651  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19778652 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 19778704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 19789089 - 19789341
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  19789089 tcctttgattatccaacagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtacaaattctgca 19789188  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  19789189 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 19789288  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19789289 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 19789341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 23767961 - 23768213
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  23767961 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 23768060  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  23768061 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 23768160  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23768161 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 23768213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 39673051 - 39672799
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||   |||| |||||||    
T  39673051 tcctttgattatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgaacatacaacttctgca 39672952  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  39672951 ggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 39672852  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  39672851 gtgctcagtgctatccatatatccgttgataccttcctttcaattcttcgttc 39672799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 13199418 - 13199160
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||| | ||    
T  13199418 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggatc-at 13199320  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac--aagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacg 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || |    
T  13199319 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcatagacaaaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaaag 13199221  T
Q  217 caggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
     |||||||  || ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||    
T  13199220 aaggacaaacacccagtgcttttcaaatgaccgttggtacctcccttttaattcatcgttc 13199160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 6180696 - 6180444
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||    
T  6180696 tcctttgattatccaccaatgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtacaaattatgca 6180597  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  6180596 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 6180497  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6180496 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 6180444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 14476290 - 14476542
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  14476290 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgaacaaattctgca 14476389  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| ||||||||||| || |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  14476390 ggcatggctgttgttttgtcttgtagtgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 14476489  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14476490 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 14476542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 20683949 - 20683697
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  20683949 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 20683850  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  20683849 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 20683750  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20683749 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 20683697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 23647815 - 23648067
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  23647815 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcatttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 23647914  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  23647915 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 23648014  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23648015 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 23648067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 23757365 - 23757617
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  23757365 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 23757464  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||   |||||    
T  23757465 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaaatctattaacgagagacaa 23757564  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23757565 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 23757617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 37759737 - 37759989
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  37759737 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 37759836  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  37759837 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 37759936  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37759937 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 37759989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 37866512 - 37866764
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  37866512 tcctttgattatccaccagtaatcctttgcccgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtacaacttctgca 37866611  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||   |||||    
T  37866612 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagttgaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaacactattaacgagagacaa 37866711  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37866712 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 37866764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Original strand, 2246428 - 2246684
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  2246428 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaac-at 2246526  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | || | |    
T  2246527 ttatgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcatagacaaaaacagagtagtggaggtagtagttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaatgaa 2246625  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||||||  ||  |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| | | ||||||||    
T  2246626 ggacaaacacctagtgcttttcaaatgaacgttggtacctcccttttaatccttcgttc 2246684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 87 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 15216446 - 15216257
Alignment:
Q  87 cttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15216446 cttcaaattcattcccatcttgaaggaaca-tttctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttg 15216348  T
Q  187 tacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  15216347 tacacttgtactttgtcaactctgataacgaaggacaggtacccagtgctcttcaaatgatcgttgatacctcactttcaattcttcgttc 15216257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 526702 - 526450
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  526702 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 526603  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  526602 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 526503  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  526502 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 526450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 5579802 - 5579550
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  5579802 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 5579703  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  5579702 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 5579603  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5579602 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 5579550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 5628186 - 5627934
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  5628186 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 5628087  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  5628086 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 5627987  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5627986 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 5627934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 5865862 - 5865610
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  5865862 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 5865763  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  5865762 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 5865663  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5865662 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 5865610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 5876461 - 5876209
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  5876461 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 5876362  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  5876361 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 5876262  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5876261 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 5876209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 20673364 - 20673112
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  20673364 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcttgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 20673265  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  20673264 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 20673165  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20673164 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 20673112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 20721180 - 20721432
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  20721180 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 20721279  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  20721280 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 20721379  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20721380 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 20721432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 41683745 - 41683997
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  41683745 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 41683844  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  41683845 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 41683944  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41683945 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 41683997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 41694314 - 41694566
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  41694314 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 41694413  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  41694414 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 41694513  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41694514 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 41694566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 29933733 - 29933476
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataatt-agcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaa 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||  ||  |  ||||||| |||||| ||||||||||||||     
T  29933733 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcgaagttcaaatccattcctatcttgaaggaaca- 29933635  T
Q  118 tttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgc 217  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || |     
T  29933634 tttctgcaggcagagctattgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaaaga 29933536  T
Q  218 aggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |||||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  29933535 aggacaagcactccgtgctttccaaatgaccgttgatacctctcttttaattcttcgttc 29933476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 29982887 - 29982630
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataatt-agcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaa 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||  ||  |  ||||||| |||||| ||||||||||||||     
T  29982887 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcgaagttcaaatccattcctatcttgaaggaaca- 29982789  T
Q  118 tttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgc 217  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || |     
T  29982788 tttctgcaggcagagctattgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaaaga 29982690  T
Q  218 aggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |||||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  29982689 aggacaagcactccgtgctttccaaatgaccgttgatacctctcttttaattcttcgttc 29982630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 8774724 - 8774977
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaag-gaacaatttctgc 124  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||    
T  8774724 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaacttctgc 8774823  T
Q  125 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 223  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   ||||    
T  8774824 aggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagaca 8774923  T
Q  224 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||| ||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8774924 agtgctcagtgcttttcatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttc 8774977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 8785309 - 8785562
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaag-gaacaatttctgc 124  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||    
T  8785309 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaacttctgc 8785408  T
Q  125 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 223  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   ||||    
T  8785409 aggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagaca 8785508  T
Q  224 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||| ||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8785509 agtgctcagtgcttttcatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttc 8785562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 504336 - 504084
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  504336 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 504237  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  504236 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 504137  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  504136 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 504084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 4743805 - 4744056
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  4743805 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaa-ttctgca 4743903  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  4743904 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 4744003  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4744004 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 4744056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 5510763 - 5511014
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  5510763 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaa-ttctgca 5510861  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  5510862 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 5510961  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5510962 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 5511014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 5520941 - 5521192
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  5520941 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaa-ttctgca 5521039  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  5521040 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 5521139  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5521140 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 5521192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 5537189 - 5536938
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||    
T  5537189 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaatt-ctgca 5537091  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  5537090 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 5536991  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5536990 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 5536938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 12287147 - 12286895
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  12287147 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 12287048  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  12287047 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 12286948  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |   |||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12286947 gagttcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 12286895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 12296969 - 12296717
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  12296969 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 12296870  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  12296869 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 12296770  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |   |||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12296769 gagttcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 12296717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 13557641 - 13557893
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  13557641 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaactcattcccatcttgaacgtacaaattctgca 13557740  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
     |||  |||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  13557741 tgcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 13557840  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||| ||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13557841 gtgctccgtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 13557893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 24383687 - 24383435
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  24383687 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 24383588  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  24383587 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 24383488  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  24383487 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattctttgttc 24383435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 24659967 - 24660219
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  24659967 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 24660066  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  24660067 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 24660166  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |  ||||| ||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  24660167 gagctcagagctatccatatatccgttgatacctccctttcaattctttgttc 24660219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 28314400 - 28314148
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  28314400 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 28314301  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac-aagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  28314300 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacaaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 28314201  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||| | | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28314200 gtgctcagtgttatccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttc 28314148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 28325016 - 28324764
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  28325016 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 28324917  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac-aagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  28324916 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacaaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 28324817  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||| | | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28324816 gtgctcagtgttatccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttc 28324764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 35187444 - 35187696
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  35187444 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 35187543  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  35187544 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 35187643  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  35187644 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattctttgttc 35187696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 29947519 - 29947263
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| |||||||||||| |||    
T  29947519 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcttgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaa-aat 29947421  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | || | |    
T  29947420 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaatagagtagtataggtagtggttgtaaacttgtactttgtcaactct-tcaaagaa 29947322  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  29947321 ggacaagcactccgtgcttttcaaatgaccgttgatacctctcttttaattcttcgttc 29947263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 29996673 - 29996417
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| |||||||||||| |||    
T  29996673 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcttgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaa-aat 29996575  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | || | |    
T  29996574 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaatagagtagtataggtagtggttgtaaacttgtactttgtcaactct-tcaaagaa 29996476  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  29996475 ggacaagcactccgtgcttttcaaatgaccgttgatacctctcttttaattcttcgttc 29996417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 18484111 - 18484364
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttga-aggaacaatttctgc 124  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||    
T  18484111 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgc 18484210  T
Q  125 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 223  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   ||||    
T  18484211 aggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagaca 18484310  T
Q  224 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||| ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18484311 agtgctcagtgctttccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttc 18484364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 38194791 - 38195044
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttga-aggaacaatttctgc 124  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||    
T  38194791 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgc 38194890  T
Q  125 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 223  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   ||||    
T  38194891 aggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagaca 38194990  T
Q  224 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38194991 agagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttc 38195044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 38205327 - 38205580
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttga-aggaacaatttctgc 124  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||    
T  38205327 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgc 38205426  T
Q  125 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 223  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   ||||    
T  38205427 aggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagaca 38205526  T
Q  224 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38205527 agagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttc 38205580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 4754391 - 4754641
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||    
T  4754391 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaaaataa-cttcaaattcattcccatcttgagtgtacaatt-ctgca 4754488  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  4754489 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 4754588  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4754589 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 4754641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 5547773 - 5547522
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||||| ||| |    
T  5547773 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaatt-ctgta 5547675  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  5547674 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 5547575  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5547574 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 5547522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 24670547 - 24670799
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  24670547 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 24670646  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||   ||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  24670647 ggcatgactgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 24670746  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |  ||||| ||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  24670747 gagctcagagctatccatatatccgttgatacctccctttcaattctttgttc 24670799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 29906354 - 29906098
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| |||||||||||| |||    
T  29906354 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcttgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaa-aat 29906256  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | || | |    
T  29906255 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaatagagtagtataggtagtggttgtaaacttgtactttgtcaactct-tcaaagaa 29906157  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  29906156 ggacaagcactccgtgctttacaaatgaccgttgatacctctcttttaattcttcgttc 29906098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 39382757 - 39383010
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttga-aggaacaatttctgc 124  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||    
T  39382757 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgc 39382856  T
Q  125 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 223  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   ||||    
T  39382857 aggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagaca 39382956  T
Q  224 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||| ||||||| | | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39382957 agtgctcagtgttatccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttc 39383010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 10099135 - 10099386
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  10099135 tcctttgaatatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaa-ttctgca 10099233  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   | |||    
T  10099234 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagaggcaa 10099333  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10099334 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 10099386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 11272552 - 11272299
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttga-aggaacaatttctgc 124  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||    
T  11272552 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgc 11272453  T
Q  125 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 223  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   ||||    
T  11272452 aggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtggtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagaca 11272353  T
Q  224 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||| ||||||| | | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11272352 agtgctcagtgttatccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttc 11272299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 39372120 - 39372373
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttga-aggaacaatttctgc 124  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||    
T  39372120 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgc 39372219  T
Q  125 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 223  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   ||||    
T  39372220 aggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagaca 39372319  T
Q  224 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||| ||||||| | |  | ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39372320 agtgctcagtgttatctatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttc 39372373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 104 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 14321771 - 14321598
Alignment:
Q  104 tcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtc 203  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14321771 tcttgaaggaaca-tttctgcaggaagagttgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtc 14321673  T
Q  204 aactctgttaacgcaggacaagtactcagtgctcttc-aaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14321672 aactctgataacaaaggacaagtactcagtgttcttcaaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 14321598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 16476345 - 16476597
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    |||| |||| ||||||||   ||||| |||||| || |||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||  |||  | |||| |||||||    
T  16476345 tcctgtgattatccaccaaggatcctgtgcctgtttggggtgtagtcctttgaaggataagcttcaaattcattcccatggtgagtgtacaaattctgca 16476444  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaa-cagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  16476445 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacaagaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 16476544  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16476545 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 16476597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 15651244 - 15651055
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||  || | ||||||||||||||| || ||||||||| ||     
T  15651244 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttaggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctattttgaaggaa-aaa 15651146  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactct 209  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15651145 ttctgtaggcagagctgttgtcttttcttgtagcgaggacatgctcagggtcgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 15651055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 15662879 - 15662690
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||  || | ||||||||||||||| || ||||||||| ||     
T  15662879 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttaggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctattttgaaggaa-aaa 15662781  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactct 209  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15662780 ttctgtaggcagagctgttgtcttttcttgtagcgaggacatgctcagggtcgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 15662690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 19 - 252
Target Start/End: Original strand, 21736171 - 21736402
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  || | ||||||||||||||| ||||||  |||||||     
T  21736171 gttgagttcctttgatcatctaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgtgggaacaa- 21736269  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || |      
T  21736270 ttctgcaggcagagctgttaacttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaatgag 21736368  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttg 252  Q
    ||||||| || ||||||| ||||||||| |||||    
T  21736369 ggacaagcacccagtgcttttcaaatgaacgttg 21736402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 27 - 264
Target Start/End: Original strand, 27172900 - 27173135
Alignment:
Q  27 cctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcag 126  Q
    ||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||    
T  27172900 cctttgatctttcaccattaatcttttgcctgatttggatgtagtcctttgaagaattaacttcaaattcattcctatcttgaaagaacaa-atctgcag 27172998  T
Q  127 gcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagag-tagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 225  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||    ||||| | |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||  || |   | ||||||    
T  27172999 gcagagctgttatcttgtcctgtagcgaggacacactcagagttcgtggaggtcgtggttgtacatttgtactttgtcaactc--ttcaataaagacaag 27173096  T
Q  226 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctcccttt 264  Q
     || ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||    
T  27173097 cacccagtgcttttcaaatgaccgttggcacctcccttt 27173135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 19 - 159
Target Start/End: Original strand, 17961412 - 17961551
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| || ||||||||| ||||| | ||||||||||||| | |||||||||||||||     
T  17961412 gttgagttcctttgatcatccaccagtgatctgttgcctgatttggatgcagtcctttgcataatcaacttcaaattcattgctatcttgaaggaacaa- 17961510  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca 159  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  17961511 atctgcaggcagagctgttttcttgtcttgtagcgcggaca 17961551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 55 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 51989282 - 51989086
Alignment:
Q  55 cctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcg 153  Q
    |||||||||| ||| ||||| | || ||| |  ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  51989282 cctgatttggatgttgtcctataaagaatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaaca-tttctgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcg 51989184  T
Q  154 tggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttg 252  Q
    | ||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || | |||||||| || ||||||| ||||||||| |||||    
T  51989183 tagacacaaacagattcgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaatgaaggacaagcacccagtgcttttcaaatgaacgttg 51989086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Original strand, 18006361 - 18006496
Alignment:
Q  23 agttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttct 122  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| || ||||||||| ||||| | ||||||||||||| | |||||||||||||||  |||    
T  18006361 agttcctttgatcatccaccagtgatctgttgcctgatttggatgcagtcctttgcataatcaacttcaaattcattgctatcttgaaggaacaa-atct 18006459  T
Q  123 gcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca 159  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  18006460 gcaggcagagctgttttcttgtcttgtagcgcggaca 18006496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 51 - 209
Target Start/End: Original strand, 10529243 - 10529401
Alignment:
Q  51 tttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgta 150  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10529243 tttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaaca-tttctgcaggcagagctgttttcttgtcttgta 10529341  T
Q  151 gcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt-gtacttcgtcaactct 209  Q
    |||| ||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  10529342 gcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacacttcgtactttgtcaactct 10529401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 162 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 16348667 - 16348552
Alignment:
Q  162 aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccc 261  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  16348667 aacaaagtagtggaggtagtggttgcacacttgtattttgtcaactctgttaacgaaagacaaatactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccc 16348568  T
Q  262 tttcatttcttcgttc 277  Q
    ||||| ||||||||||    
T  16348567 tttcaattcttcgttc 16348552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 26 - 129
Target Start/End: Original strand, 16386141 - 16386243
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16386141 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtccttttaagaattagattcaaattcattcccatcttgaaggaac-atttctgca 16386239  T
Q  126 ggca 129  Q
    ||||    
T  16386240 ggca 16386243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 27 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 31114152 - 31113935
Alignment:
Q  27 cctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcag 126  Q
    ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||  |||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  31114152 cctttgatcattcaacattaatcttttgcttgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaaaccattcctaacttgaaggaaca-tttctgcag 31114054  T
Q  127 gcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagt 226  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || | ||||||||     
T  31114053 gcagagctgttatcttgtcttgtagcgcagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaatgaaggacaagc 31113955  T
Q  227 actcagtgctcttcaaatga 246  Q
    ||  |||||| |||||||||    
T  31113954 acctagtgcttttcaaatga 31113935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 51 - 209
Target Start/End: Original strand, 41045640 - 41045797
Alignment:
Q  51 tttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgta 150  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41045640 tttgcatgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctaacttgaaggaaca-tttctgcaggcagagctgttatcttgtcttgta 41045738  T
Q  151 gcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactct 209  Q
    |||| ||||  | |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  41045739 gcgtagacacaatcagagtcgtggaggtagtggttgtacaattgtactttgtcaactct 41045797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 30 - 209
Target Start/End: Original strand, 15850884 - 15851065
Alignment:
Q  30 ttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggca 129  Q
    |||||||  ||||| | ||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| |||||    
T  15850884 ttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaaca-tttctggaggca 15850982  T
Q  130 gagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtgg-ttgtacac-ttgtacttcgtcaactct 209  Q
    ||||| || | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||    
T  15850983 gagctatttttcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggtttgtacactttgtactttgtcaactct 15851065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 166 - 277
Target Start/End: Original strand, 16493245 - 16493356
Alignment:
Q  166 gagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttc 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   ||||||| ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||    
T  16493245 gagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttc 16493344  T
Q  266 atttcttcgttc 277  Q
    | ||||||||||    
T  16493345 aattcttcgttc 16493356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 30 - 209
Target Start/End: Original strand, 15833281 - 15833459
Alignment:
Q  30 ttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggca 129  Q
    |||||||  ||||| | ||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||  || |  |||||||  ||||| ||  |||||||||| ||||||||||||    
T  15833281 ttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatcaattcctat--tgaaggaaca-tttctgcaggca 15833377  T
Q  130 gagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtacttcgtcaactct 209  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  15833378 gagctgtttttcttgtcttgtagcgtagacaaaaatagagtagtggaggtagtggttgtacactttgtactttgtcaactct 15833459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 30 - 206
Target Start/End: Original strand, 51340886 - 51341063
Alignment:
Q  30 ttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggca 129  Q
    |||||||  ||||| | ||| |||||||||||||| ||| || || ||||  || |  ||||||| |||||| ||  |||||||||| ||||||| ||||    
T  51340886 ttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggttgttgtactatgaaggatcacgttcaaatccattcctattctgaaggaaca-tttctgcgggca 51340984  T
Q  130 gagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt-gtacttcgtcaac 206  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  51340985 gagctgtttttcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtactttgtcaac 51341063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 103 - 209
Target Start/End: Original strand, 17021975 - 17022082
Alignment:
Q  103 atcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttg-tcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtacttc 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||  | |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  17021975 atcttgaaggaaca-tttctgcaggcagagctgtttatcttgtcttgtagcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacactttgtacttt 17022073  T
Q  201 gtcaactct 209  Q
    |||||||||    
T  17022074 gtcaactct 17022082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 51 - 209
Target Start/End: Original strand, 22151142 - 22151301
Alignment:
Q  51 tttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgt 149  Q
    |||||||||||||| ||| ||| | ||||  || |  ||||||| |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  22151142 tttgcctgatttggatgttgtcttatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaaagaaca-tttctgcaggcagagctgtttttcttgtcttgt 22151240  T
Q  150 agcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtacttcgtcaactct 209  Q
    ||||| ||||  | |||| | ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||    
T  22151241 agcgtagacacaagcagaatcgtggaggtagtggttgtacgctttgtactttgtcaactct 22151301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 45861856 - 45861693
Alignment:
Q  30 ttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggca 129  Q
    |||||||  ||||| | ||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| ||  |||||||||| ||||||||||||    
T  45861856 ttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggttgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctattctgaaggaaca-tttctgcaggca 45861758  T
Q  130 gagctgttgtctt-gtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||| | || |||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  45861757 gagctgttttttttgtcttgtagcgtagacataaacatagtagtggaggtagtggtcgtacactt 45861693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 28 - 193
Target Start/End: Original strand, 2561061 - 2561226
Alignment:
Q  28 ctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcagg 127  Q
    |||||||||  ||||| | ||| |||||||||| ||| | | ||||| ||||| || |  |||||||||||||||||  ||||||||||   | ||||||    
T  2561061 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaatgatcaatttcaaattcattcccattgtgaaggaacatcgt-tgcagg 2561159  T
Q  128 cagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
     ||||||||| | |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2561160 tagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 2561226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 30 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 12752904 - 12752727
Alignment:
Q  30 ttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggca 129  Q
    |||||||  ||||| | ||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||| || |  ||||||  |||||| ||  |||||||||| ||| ||||||||    
T  12752904 ttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggttgttgtcctatgaatgatcacgttcaaagccattcctattctgaaggaacatttt-tgcaggca 12752806  T
Q  130 gagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtacttcgtcaac 206  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  12752805 gagctgtttttcttgtcttgtagcgtagacataaacagagttgtggagatagtggtcgtacactttgtactttgtcaac 12752727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 30 - 209
Target Start/End: Original strand, 13148141 - 13148321
Alignment:
Q  30 ttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggca 129  Q
    |||||||  ||||| | ||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| |    
T  13148141 ttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaacaa-ttctgcaggta 13148239  T
Q  130 gagctg-ttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtacttcgtcaactct 209  Q
    |||||| || |||||||||||| ||| |||     || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  13148240 gagctgtttttcttgtcttgtatcgtagacgcacgcatagtcgtggaggtagtggttgtacactttgtactttgtcaactct 13148321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 28 - 174
Target Start/End: Original strand, 49990134 - 49990280
Alignment:
Q  28 ctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcagg 127  Q
    |||||||||  ||||| | ||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  49990134 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaac-atttctgcagg 49990232  T
Q  128 cagagctg-ttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtgg 174  Q
    || ||||| || |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||    
T  49990233 caaagctgtttttcttgtcttgtagcgtagacataagcagagtagtgg 49990280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 88 - 193
Target Start/End: Original strand, 40799807 - 40799912
Alignment:
Q  88 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 186  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||||| | | |||||||||||||||| | ||| |||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40799807 ttcaaatgcattcccattgtgaaggaacattgt-tgcaggcagagctgtttttcttatcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttg 40799905  T
Q  187 tacactt 193  Q
    |||||||    
T  40799906 tacactt 40799912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 29 - 193
Target Start/End: Original strand, 5213452 - 5213615
Alignment:
Q  29 tttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggc 128  Q
    ||||||||  ||||| | |||||||||||||| ||| | | |||||  |||| || |  ||||||| |||||||||   ||||||||| | | |||| ||    
T  5213452 tttgatcaatcaccaatgatcctttgcctgatatggctattgtcctaagaatgatcaatttcaaatgcattcccattgagaaggaacattgt-tgcacgc 5213550  T
Q  129 agagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5213551 agagctgtttttcttgtcttgtagcatagacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 5213615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 88 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 24775760 - 24775655
Alignment:
Q  88 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 186  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||   | |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  24775760 ttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatcgt-tgcaggcagagctgttttacttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggatgtagtggttg 24775662  T
Q  187 tacactt 193  Q
    |||||||    
T  24775661 tacactt 24775655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 88 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 47405647 - 47405542
Alignment:
Q  88 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 186  Q
    ||||||| |||||| ||  ||||||||||  || |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  47405647 ttcaaatgcattcctattgtgaaggaacatctt-tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacatagtagtggaggtagtggttg 47405549  T
Q  187 tacactt 193  Q
    |||||||    
T  47405548 tacactt 47405542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 25398448 - 25398376
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25398448 tgcaggcagagctgtttttattgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 25398376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 88 - 193
Target Start/End: Original strand, 2784998 - 2785102
Alignment:
Q  88 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 186  Q
    ||||||| |||||||||   ||||||||| | | |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  2784998 ttcaaatgcattcccattgagaaggaacattct-tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaa-atcagagtagtggaggtagtggttg 2785095  T
Q  187 tacactt 193  Q
    |||||||    
T  2785096 tacactt 2785102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 88 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 11909250 - 11909145
Alignment:
Q  88 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 186  Q
    ||||||| |||||| ||  ||| |||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| | | ||||  |||| |||||||||||||||||| |    
T  11909250 ttcaaatccattcctattctgagggaaca-tttctgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtaacatagacataaacaaagtagtggaggtagtggtcg 11909152  T
Q  187 tacactt 193  Q
    |||||||    
T  11909151 tacactt 11909145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 139 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 12726405 - 12726351
Alignment:
Q  139 tcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    ||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12726405 tcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 12726351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 139 - 193
Target Start/End: Original strand, 47207690 - 47207744
Alignment:
Q  139 tcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    ||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47207690 tcttgtcttgtagcaaagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 47207744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 139 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 53056902 - 53056848
Alignment:
Q  139 tcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    ||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53056902 tcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 53056848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 21605844 - 21605775
Alignment:
Q  125 aggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21605844 aggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 21605775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 30054410 - 30054341
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgtctt-gtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtaca 190  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||   ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30054410 tgcaggcagagctgttatctttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagttagtggttgtaca 30054341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 1728208 - 1728136
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  1728208 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtgcagatagtggttgtacactt 1728136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Original strand, 6090698 - 6090770
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||| ||||||||| | ||||||||| |||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6090698 tgcaggaagagctgtttttcttgtcttgcagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 6090770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 21636863 - 21636791
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    ||||||||||| |||| | |||||||||||||   ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21636863 tgcaggcagagttgttttgcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacactt 21636791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Original strand, 22140730 - 22140802
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    ||||||||||||| || | |||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22140730 tgcaggcagagctatttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttatacactt 22140802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 193
Target Start/End: Original strand, 11868253 - 11868307
Alignment:
Q  139 tcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||| |||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11868253 tcttgttttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 11868307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 193
Target Start/End: Original strand, 14955361 - 14955465
Alignment:
Q  88 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 186  Q
    ||||||| |||||||||   ||||||||| | | ||||||||||||| || | |||||||||||||   || || |||||||||||||||||||||||||    
T  14955361 ttcaaatgcattcccattgagaaggaacattgt-tgcaggcagagctatttttcttgtcttgtagcagagataa-aacagagtagtggaggtagtggttg 14955458  T
Q  187 tacactt 193  Q
    |||||||    
T  14955459 tacactt 14955465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 18121797 - 18121743
Alignment:
Q  139 tcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    ||||||||||||||   |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18121797 tcttgtcttgtagcagagacaaacacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 18121743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 18142927 - 18142873
Alignment:
Q  139 tcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    ||||||||||||||   |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18142927 tcttgtcttgtagcagagacaaacacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 18142873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 193
Target Start/End: Original strand, 28582039 - 28582144
Alignment:
Q  88 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 186  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||   | |||||||||||||||| | ||||| ||||| |   ||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  28582039 ttcaaatccattcccattgtgaaggaacatcgt-tgcaggcagagctgtttttcttgttttgtaccagagacaaaaactgagtagtggaggtagtggttg 28582137  T
Q  187 tacactt 193  Q
    |||||||    
T  28582138 tacactt 28582144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 193
Target Start/End: Original strand, 29855393 - 29855447
Alignment:
Q  139 tcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    ||||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29855393 tcttgtcttgtagcagagataaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 29855447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 193
Target Start/End: Original strand, 33583163 - 33583267
Alignment:
Q  88 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 186  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||||| | | |||||||| ||||||| | |||||||||||||   ||||| || |||||| |||||||||||||||    
T  33583163 ttcaaatgcattcccattgtgaaggaacattgt-tgcaggcatagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaa-aatagagtattggaggtagtggttg 33583260  T
Q  187 tacactt 193  Q
    |||||||    
T  33583261 tacactt 33583267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 156 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 12389030 - 12388993
Alignment:
Q  156 gacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12389030 gacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 12388993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 156 - 193
Target Start/End: Original strand, 16032526 - 16032563
Alignment:
Q  156 gacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16032526 gacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 16032563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 164 - 277
Target Start/End: Original strand, 16487098 - 16487211
Alignment:
Q  164 cagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctt 263  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |  ||||||||| || |||   ||||||  ||||||| | | || ||  |||||||||||||||||    
T  16487098 cagagtagtggaggtactggttgaacacttgtagtgtgtcaactctattgacgagagacaagagctcagtggtatccatatatccgttgatacctccctt 16487197  T
Q  264 tcatttcttcgttc 277  Q
    ||| ||||| ||||    
T  16487198 tcaattctttgttc 16487211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 16658811 - 16658739
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  16658811 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacacaaactaagtagtggaggtagtggttgtacactt 16658739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Original strand, 20646120 - 20646192
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||| ||||| | |||||||||||||   ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20646120 tgcaggcagaactgttattcttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacactt 20646192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 38177836 - 38177764
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    ||||||||||| |||| | |||||||||||||   | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38177836 tgcaggcagagttgtttttcttgtcttgtagcagagtcaaaaatagagtagtggaggtagtggttgtacactt 38177764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 46796560 - 46796488
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||||   ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  46796560 tgcaggcatagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacaaagtagtggagatagtggttgtacactt 46796488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 49642955 - 49642883
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  49642955 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactt 49642883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 49666598 - 49666526
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  49666598 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacagaatcagagtagtggagatagtggttgtacactt 49666526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 142 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 49553661 - 49553610
Alignment:
Q  142 tgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||   ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  49553661 tgtcttgtagcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtggttgtacactt 49553610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 193
Target Start/End: Original strand, 11223548 - 11223601
Alignment:
Q  139 tcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    ||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11223548 tcttgtcttgtagcagagacaa-aacagagtagtggagatagtggttgtacactt 11223601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 88 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 20627657 - 20627552
Alignment:
Q  88 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 186  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||   | ||||||||||| |||| | ||| |||||||||   || || |||| ||||||||||||||||||||    
T  20627657 ttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatcgt-tgcaggcagagttgtttttcttatcttgtagcagagataaaaacaaagtagtggaggtagtggttg 20627559  T
Q  187 tacactt 193  Q
    |||||||    
T  20627558 tacactt 20627552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 190
Target Start/End: Original strand, 37412571 - 37412640
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtaca 190  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||| |  ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37412571 tgcaggcatagctgttttacttgtcttgtagtgaagacagaaacagagtagtggagatagtggttgtaca 37412640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 46350038 - 46349965
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgtctt-gtcttgtagcgtggacaa-gaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||||||| | || ||||||||||   ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  46350038 tgcaggcagagctgttttttttgtcttgtagcagagacaaagaacatagtagtggaggcagtggttgtacactt 46349965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #169
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 9700229 - 9700157
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    ||||||||||| |||| | |||||||||||||   ||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  9700229 tgcaggcagagatgttattcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtgcagatagtggttatacactt 9700157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #170
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 166 - 198
Target Start/End: Original strand, 16880026 - 16880058
Alignment:
Q  166 gagtagtggaggtagtggttgtacacttgtact 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16880026 gagtagtggaggtagtggttgtacaattgtact 16880058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #171
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Original strand, 31303352 - 31303424
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||   ||||  ||| ||||||||||| |||| |||||||||||    
T  31303352 tgcaggcagagctgttatccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagttgttgtacactt 31303424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 124)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 1367682 - 1367932
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  1367682 tcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 1367781  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 225  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  1367782 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 1367880  T
Q  226 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1367881 tactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 1367932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 20 - 277
Target Start/End: Original strand, 18441243 - 18441499
Alignment:
Q  20 ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatt 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18441243 ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaaca-tt 18441341  T
Q  120 tctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcag 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||    
T  18441342 tctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataacgaag 18441441  T
Q  220 gacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18441442 gacaagtacccagtgctttccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 18441499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 15888576 - 15888326
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  15888576 tcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 15888477  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 225  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  15888476 ggcaaagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 15888378  T
Q  226 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    | ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15888377 tgctcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 15888326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 21770190 - 21769940
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  21770190 tcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 21770091  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 225  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  21770090 ggcatagttgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 21769992  T
Q  226 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21769991 tactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 21769940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 29 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 19986058 - 19985810
Alignment:
Q  29 tttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggc 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  19986058 tttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattatcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgcaggc 19985959  T
Q  129 agagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtac 228  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |      
T  19985958 atagttgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgt 19985859  T
Q  229 tcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19985858 tcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 19985810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 9171038 - 9171288
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  9171038 tcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtccttttaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 9171137  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 225  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  9171138 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtagac-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 9171236  T
Q  226 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9171237 tactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 9171288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 31116759 - 31116508
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  31116759 tcctttgatcattcaccagtaatcctttgcttgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 31116660  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 225  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||     
T  31116659 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgctaacgaaggacaaa 31116560  T
Q  226 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31116559 tacttagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 31116508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 40055008 - 40054750
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  40055008 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcctatcttgaaggaac-at 40054910  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtac-ttcgtcaactctgttaacgc 217  Q
    || ||||||||  | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |     
T  40054909 ttatgcaggcatggttgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttttgtcaactctgttaaaga 40054810  T
Q  218 aggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  40054809 aggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcaaatcttcgttc 40054750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 20 - 277
Target Start/End: Original strand, 18419162 - 18419418
Alignment:
Q  20 ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatt 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18419162 ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaaca-tt 18419260  T
Q  120 tctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcag 219  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||    
T  18419261 tctgcaggaagagctgttgttttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctaataacgaag 18419360  T
Q  220 gacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18419361 gacaagtacccagtgctttccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 18419418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 589265 - 589515
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  589265 tcctttgatcaatcaccagtgatccttttcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 589364  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 225  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  589365 ggcctagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 589463  T
Q  226 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  589464 tactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 589515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 9170237 - 9170487
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  9170237 tcctttgatcattcaccagtaatcntttgcctgatttgggtgtagtccttttaagaattagcttnaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 9170336  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 225  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  9170337 ggcatagctgttgtnttgtcttgtagcgtagac-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 9170435  T
Q  226 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9170436 tactcantgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 9170487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 14745917 - 14745666
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||    
T  14745917 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtactcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagggcacaaattctgca 14745818  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 225  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||     
T  14745817 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttgtattttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 14745718  T
Q  226 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    | ||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14745717 tgctcagtgctatccatatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 14745666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 9159782 - 9160032
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  9159782 tcctttgatcattcaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtccttttaagaattagctttaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 9159881  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 225  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  9159882 ggcatagctgttgttttgtcttgtagcgtagac-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 9159980  T
Q  226 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9159981 tactcaatgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 9160032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Original strand, 30049564 - 30049822
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  30049564 gttgagttcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaatgaaca-t 30049662  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgc 217  Q
    |||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  30049663 ttctgcaggcatggctgtttttcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacga 30049762  T
Q  218 aggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |||||||||||| |||  ||| |||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  30049763 aggacaagtacttagttttctccaaatgactgttgatgtctccctttcaattcttcgttc 30049822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 44280549 - 44280799
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||    
T  44280549 tcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccactttgaaggcacaaattctgca 44280648  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 225  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  44280649 gacatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 44280747  T
Q  226 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    | ||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  44280748 tgctcagcgctgtccaaatgaccgttgataccttcctttcaattcttcgttc 44280799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 3165787 - 3166037
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||    
T  3165787 tcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccactttgaaggcacaaattctgca 3165886  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 225  Q
    | || | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  3165887 gacatacctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 3165985  T
Q  226 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    | ||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  3165986 tgctcagcgctgtccaaatgaccgttgataccttcctttcaattcttcgttc 3166037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 20491059 - 20491309
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||    
T  20491059 tcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattctcatcttgaaggcacaaattttgca 20491158  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 225  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  20491159 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtgattgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 20491257  T
Q  226 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    | ||||| | | | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  20491258 tgctcagcgttgtccaaatgaccgttgataccttcctttcaattcttcgttc 20491309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 19 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 26209802 - 26209547
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  || | ||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  26209802 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaaca-t 26209704  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || | |    
T  26209703 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaatagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaatgaa 26209605  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgtt 276  Q
    ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26209604 ggacaagcacccagtgcttttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgtt 26209547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 5685570 - 5685822
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  5685570 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtacaacttctgca 5685669  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  5685670 ggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 5685769  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5685770 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 5685822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 9433315 - 9433567
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  9433315 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtacaacttctgca 9433414  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  9433415 ggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 9433514  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9433515 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 9433567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 3476594 - 3476338
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  3476594 gttgagttcctttgatcatccaccattaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctgtgaaggattaacttcaaattcattcctatcttgaaggaaca-t 3476496  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |  | |    
T  3476495 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcagagaa 3476397  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||||||| || ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| | | ||||||||    
T  3476396 ggacaagcacccagtgcttttcaaatgaacgttggtacctcccttttaatccttcgttc 3476338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 541136 - 541388
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  541136 tcctttgatcatccactagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtacaacttctgca 541235  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  541236 ggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 541335  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  541336 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 541388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 9443911 - 9444163
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  9443911 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtacaacttctgca 9444010  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  9444011 ggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaacacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 9444110  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9444111 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 9444163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 20989704 - 20989956
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  20989704 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgcagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaaggtacaaattctgca 20989803  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  20989804 ggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 20989903  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
     | ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20989904 atgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 20989956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 30 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 21003253 - 21003005
Alignment:
Q  30 ttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggca 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||    
T  21003253 ttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaaggtagaaattctgcaggca 21003154  T
Q  130 gagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtac 228  Q
      ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   ||||||| |    
T  21003153 tggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagtgc 21003054  T
Q  229 tcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21003053 tcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 21003005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 6867472 - 6867222
Alignment:
Q  28 ctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcagg 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  6867472 ctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtacaaattctgcagg 6867373  T
Q  128 cagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagt 226  Q
    ||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||||    
T  6867372 catggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagt 6867273  T
Q  227 actcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
     ||||||||| | || ||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  6867272 gctcagtgctatccatatatccgttgataccttcctttcaattcttcgttc 6867222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 6878104 - 6877854
Alignment:
Q  28 ctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcagg 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||    
T  6878104 ctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccaacttgaatgtacaaattctgcagg 6878005  T
Q  128 cagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagt 226  Q
    ||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||||    
T  6878004 catggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagt 6877905  T
Q  227 actcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
     ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6877904 gctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 6877854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Original strand, 29590039 - 29590295
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||  || | ||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  29590039 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcatatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaaca-t 29590137  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || | |    
T  29590138 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtgaaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaatgaa 29590236  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||||||| || ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| | | ||||||||    
T  29590237 ggacaagcacccagtgcttttcaaatgaacgttggtacctcccttttaatccttcgttc 29590295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 276
Target Start/End: Original strand, 15216363 - 15216618
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||   || | ||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  15216363 gttgagttcctttgatcattcaccagtaatctattgcctgatttgggtgtagtcctatgacagatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaaca-t 15216461  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || | |    
T  15216462 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgcagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttttactttgtcaactct-tcaaagaa 15216560  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgtt 276  Q
    ||||||| || |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15216561 ggacaagcacccagtgcttctcaaatggccgttgatacctccctttcaattcttcgtt 15216618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 467830 - 467578
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  467830 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 467731  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  467730 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 467631  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  467630 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 467578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 11096106 - 11096358
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  11096106 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 11096205  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  11096206 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 11096305  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11096306 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 11096358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 24930852 - 24930600
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  24930852 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtacaaattctgca 24930753  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||   ||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  24930752 ggcatgactgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 24930653  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24930652 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 24930600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 26653574 - 26653322
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  26653574 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgaacaaattctgca 26653475  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  26653474 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 26653375  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26653374 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 26653322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 26699903 - 26699651
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  26699903 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgaacaaattctgca 26699804  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  26699803 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 26699704  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26699703 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 26699651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 37344251 - 37344503
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  37344251 tcctttgattatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcttttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtacaaattctgca 37344350  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   | |||    
T  37344351 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagaggcaa 37344450  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37344451 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 37344503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 19 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 12734420 - 12734165
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||  || | ||||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  12734420 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatctcttgcctgatttaggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaatttattcctatcttgaaggaaca-t 12734322  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |  | |    
T  12734321 ttctgcaggcagagttgttgtcttgtcttatagcgtagacaaaaacagagtaatggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcagagaa 12734223  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgtt 276  Q
    ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  12734222 ggacaagcacccagtgcttttcaaatgaccgttgatacctccctttaaattcttcgtt 12734165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 455048 - 454796
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  455048 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 454949  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  454948 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 454849  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  454848 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattctttgttc 454796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 2705861 - 2705609
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  2705861 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 2705762  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  | |||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  2705761 ggcatggttgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 2705662  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2705661 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 2705609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 4222661 - 4222913
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  4222661 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 4222760  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  4222761 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 4222860  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4222861 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 4222913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 8617437 - 8617689
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  8617437 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 8617536  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  8617537 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 8617636  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8617637 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 8617689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 8628000 - 8628252
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  8628000 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 8628099  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  8628100 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 8628199  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8628200 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 8628252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 17950367 - 17950115
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  17950367 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 17950268  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  17950267 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 17950168  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17950167 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 17950115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Original strand, 13682367 - 13682623
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  13682367 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatattttgcctgatttgggtgtagtcttgtgaaggattaacttcaaattcattcccattttgaaggaaca-t 13682465  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |  | |    
T  13682466 ttctgcaggaatagctgttgttttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcagagaa 13682564  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||||||| || ||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||    
T  13682565 ggacaagcacccagtgattttcaaatgaacgttggtacctcccttttaattcttcgttc 13682623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 2716465 - 2716213
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||  | |||| |||||||    
T  2716465 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattctcatcttgagtgtacaaattctgca 2716366  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||   |||||    
T  2716365 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttttcaactctattaacgagagacaa 2716266  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2716265 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 2716213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 4212062 - 4212314
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||  | |||| |||||||    
T  4212062 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcatttccatcttgagtgtacaaattctgca 4212161  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  4212162 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 4212261  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4212262 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 4212314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 17960973 - 17960721
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  17960973 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 17960874  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  17960873 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcatagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 17960774  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17960773 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 17960721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 48710740 - 48710488
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  48710740 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 48710641  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  48710640 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 48710541  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  48710540 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 48710488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 87 - 277
Target Start/End: Original strand, 8933634 - 8933823
Alignment:
Q  87 cttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 186  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8933634 cttcaaattcattcctatcttgaaggaacaatt-ctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttg 8933732  T
Q  187 tacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  8933733 tacacttgtactttgtcaactctgataaagaaggacaagcacccagtgcttttcaaatgaccgttgatacctcccttttaattcttcgttc 8933823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 87 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 38593921 - 38593732
Alignment:
Q  87 cttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  38593921 cttcaaattcattcccatcttgaaggaaca-tttctgcaggcatgactgttatcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtgaaggtagtggttg 38593823  T
Q  187 tacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  38593822 tacacttgtactttgtcaactctgttaaagaaggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcaaatcttcgttc 38593732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 166933 - 167185
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  166933 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttaggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 167032  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  167033 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 167132  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  167133 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 167185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 177525 - 177777
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  177525 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttaggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 177624  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  177625 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 177724  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  177725 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 177777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 9085335 - 9085586
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  9085335 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaa-ttctgca 9085433  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  9085434 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 9085533  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9085534 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 9085586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 9095049 - 9095300
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  9095049 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaa-ttctgca 9095147  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  9095148 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 9095247  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9095248 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 9095300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 11005236 - 11005488
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  11005236 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 11005335  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  11005336 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 11005435  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||| | | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11005436 gtgctcagtgttatccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttc 11005488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 8002314 - 8002061
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaag-gaacaatttctgc 124  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||    
T  8002314 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgc 8002215  T
Q  125 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 223  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   ||||    
T  8002214 aggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagaca 8002115  T
Q  224 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||| ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8002114 agtgctcagtgctttccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttc 8002061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 8012959 - 8012706
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaag-gaacaatttctgc 124  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||    
T  8012959 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgc 8012860  T
Q  125 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 223  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   ||||    
T  8012859 aggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagaca 8012760  T
Q  224 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||| ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8012759 agtgctcagtgctttccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttc 8012706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 22089174 - 22089426
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  22089174 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 22089273  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||   |||| || |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  22089274 ggcatgactgtcgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 22089373  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||   ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22089374 gtgctcagtgctatccatatattcgttgatacctccctttcaattcttcgttc 22089426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 22099789 - 22100041
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  22099789 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 22099888  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  | ||| || |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  22099889 ggcatggttgtcgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 22099988  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||   ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22099989 gtgctcagtgctatccatatattcgttgatacctccctttcaattcttcgttc 22100041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 26390345 - 26390093
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  26390345 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgaattgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 26390246  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  26390245 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 26390146  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  26390145 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattctttgttc 26390093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 26400987 - 26400735
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  26400987 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgaattgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 26400888  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  26400887 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 26400788  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  26400787 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattctttgttc 26400735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 40042357 - 40042106
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||  | |||||| |||||    
T  40042357 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattccttcccatcttgagtgtacaatt-ctgca 40042259  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  40042258 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 40042159  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40042158 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 40042106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 40052906 - 40052655
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||  | |||||| |||||    
T  40052906 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattccttcccatcttgagtgtacaatt-ctgca 40052808  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  40052807 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 40052708  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40052707 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 40052655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 1987591 - 1987844
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaag-gaacaatttctgc 124  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||    
T  1987591 tcctttgattatccaccagtgatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgc 1987690  T
Q  125 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 223  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   ||||    
T  1987691 aggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagaca 1987790  T
Q  224 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1987791 agagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 1987844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 1998212 - 1998465
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaag-gaacaatttctgc 124  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||    
T  1998212 tcctttgattatccaccagtgatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgc 1998311  T
Q  125 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 223  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   ||||    
T  1998312 aggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagaca 1998411  T
Q  224 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1998412 agagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 1998465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 42865878 - 42866131
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaag-gaacaatttctgc 124  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||    
T  42865878 tcctttgattatccaccagtgatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaacttctgc 42865977  T
Q  125 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 223  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   ||||    
T  42865978 aggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagaca 42866077  T
Q  224 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||| ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42866078 agtgctcagtgctttccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttc 42866131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 42876504 - 42876757
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaag-gaacaatttctgc 124  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||    
T  42876504 tcctttgattatccaccagtgatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaacttctgc 42876603  T
Q  125 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 223  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   ||||    
T  42876604 aggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagaca 42876703  T
Q  224 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||| ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42876704 agtgctcagtgctttccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttc 42876757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 24734804 - 24735056
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  24734804 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 24734903  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||| |   |||||    
T  24734904 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacatttgtactttgtcaactctaataatgagagacaa 24735003  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  24735004 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattctttgttc 24735056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 24744751 - 24745003
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  24744751 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 24744850  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||| |   |||||    
T  24744851 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacatttgtactttgtcaactctaataatgagagacaa 24744950  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  24744951 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattctttgttc 24745003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 26 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 26294278 - 26294067
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  26294278 tcctttgattatacaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 26294179  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  26294178 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 26294079  T
Q  225 gtactcagtgct 236  Q
    || |||||||||    
T  26294078 gtgctcagtgct 26294067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 19 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 24882674 - 24882443
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  || | ||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  24882674 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaa- 24882576  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    ||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |      
T  24882575 ttctgcaggcagagctgttaacttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgttgaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-ttaatgag 24882477  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttg 252  Q
    ||||||| || || |||| ||||||||| |||||    
T  24882476 ggacaagcacccattgcttttcaaatgaacgttg 24882443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 131 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 6044354 - 6044208
Alignment:
Q  131 agctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtactc 230  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  6044354 agctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataacgaaggacaagtaccc 6044255  T
Q  231 agtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6044254 agtgcctttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 6044208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 19 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 38403462 - 38403331
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  38403462 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaac-at 38403364  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtag 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38403363 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtag 38403331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 133 - 277
Target Start/End: Original strand, 48382304 - 48382449
Alignment:
Q  133 ctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaa-cagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtactca 231  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||| || ||    
T  48382304 ctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaaacagagtagtggaggtagcggttgtacacttgtactttgtcaactctgataaagaaggacaagcaccca 48382403  T
Q  232 gtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  48382404 gtgcttttcaaatgaccgttgatacatcccttttaattcttcgttc 48382449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 51 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 8999155 - 8998998
Alignment:
Q  51 tttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgta 150  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  8999155 tttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaaca-tttctgcaggcagagctgttatattgtcttgta 8999057  T
Q  151 gcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactct 209  Q
    |||| ||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8999056 gcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 8998998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 51 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 11087265 - 11087110
Alignment:
Q  51 tttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgta 150  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11087265 tttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttaaaggaaca-tttatgcaggcagagctgttatcttgtcttgta 11087167  T
Q  151 gcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaact 207  Q
    | || ||||  | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11087166 gtgtagacacaagcagagtcatggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaact 11087110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 30 - 189
Target Start/End: Original strand, 602636 - 602796
Alignment:
Q  30 ttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggca 129  Q
    |||||||  ||||| | |||||||||||||||||| | ||||||| |||| ||||   ||||||| |||||  |  |||| |||||| ||||||||||||    
T  602636 ttgatcaagcaccaatgatcctttgcctgatttggatatagtcctatgaagaattgatttcaaatccattctgaatttgagggaaca-tttctgcaggca 602734  T
Q  130 gagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaa-gaacagagtagtggaggtagtggttgtac 189  Q
    |||||||| | |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  602735 gagctgtttttcttgtcctgtagcgtagacaaagaacagagtagtggaggaagtggttgtac 602796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 79
Target Start/End: Original strand, 48382236 - 48382296
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaa 79  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  48382236 gttgagttcctttgatcatccactagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaa 48382296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 51 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 13174827 - 13174668
Alignment:
Q  51 tttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgt 149  Q
    ||||||||||||||  || ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||| ||| ||||||| | ||||||||||    
T  13174827 tttgcctgatttggaagttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaagtaaca-tttctgcatgcaaagctgtttttcttgtcttgt 13174729  T
Q  150 agcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtacttcgtcaactct 209  Q
    || || || |  | |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  13174728 agtgtagagacaatcagagtcgtggaggtagtggttgtacactttgtactttgtcaactct 13174668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 30944518 - 30944446
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30944518 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 30944446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 88 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 16112112 - 16112007
Alignment:
Q  88 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 186  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||   | |||||||||||||||| || ||||||||||||   ||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  16112112 ttcaaatgcattcccattatgaaggaacatcgt-tgcaggcagagctgttttccttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttg 16112014  T
Q  187 tacactt 193  Q
    |||||||    
T  16112013 tacactt 16112007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 88 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 33691940 - 33691835
Alignment:
Q  88 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 186  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||   | |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  33691940 ttcaaatccattcccattgtgaaggaacatcgt-tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggtta 33691842  T
Q  187 tacactt 193  Q
    |||||||    
T  33691841 tacactt 33691835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 88 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 48237130 - 48237025
Alignment:
Q  88 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 186  Q
    ||||||| |||||| ||  ||||||||||  || |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  48237130 ttcaaatgcattcctattgtgaaggaacatctt-tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacaaagtagtggaggtagtggttg 48237032  T
Q  187 tacactt 193  Q
    |||||||    
T  48237031 tacactt 48237025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 125 - 193
Target Start/End: Original strand, 4821440 - 4821509
Alignment:
Q  125 aggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4821440 aggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 4821509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 21283568 - 21283496
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21283568 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagtagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 21283496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Original strand, 27871681 - 27871753
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27871681 tgcaggtagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 27871753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Original strand, 44467027 - 44467099
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44467027 tgcaggcatagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 44467099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 88 - 193
Target Start/End: Original strand, 9069492 - 9069597
Alignment:
Q  88 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 186  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||   | ||||||||||| |||| | |||||||||||||   ||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  9069492 ttcaaatccattcccattgtgaaggaacatcat-tgcaggcagagatgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaactgagtagtggaggtagtggttg 9069590  T
Q  187 tacactt 193  Q
    |||||||    
T  9069591 tacactt 9069597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 88 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 30945584 - 30945479
Alignment:
Q  88 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 186  Q
    ||||||| |||||||||  ||| |||||| | | |||||||| ||||||| | |||||||||||||   ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  30945584 ttcaaatgcattcccattctgagggaacattgt-tgcaggcatagctgtttttcttgtcttgtagctgagacaaaaacaaagtagtggaggtagtggttg 30945486  T
Q  187 tacactt 193  Q
    |||||||    
T  30945485 tacactt 30945479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Original strand, 1292993 - 1293065
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1292993 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagaagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 1293065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Original strand, 4494540 - 4494612
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4494540 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaagagagtagtggaggtagcggttgtacactt 4494612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 88 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 28622584 - 28622481
Alignment:
Q  88 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 186  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||   | |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  28622584 ttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatcgt-tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagaagtagaggtagtggttg 28622486  T
Q  187 tacac 191  Q
    |||||    
T  28622485 tacac 28622481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 35952883 - 35952811
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35952883 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagtagagacaaaaacagagtaatggaggtagtggttgtacactt 35952811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 193
Target Start/End: Original strand, 21692236 - 21692322
Alignment:
Q  107 tgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| |||| | |||||||||||||   ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21692236 tgaaggaacaatgt-tgcaggcagagatgttatacttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacactt 21692322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 88 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 23280187 - 23280081
Alignment:
Q  88 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaa-cagagtagtggaggtagtggtt 185  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||  || |||||||| ||||||| | |||||||||||||   ||||| || ||||||||||||| ||||||||    
T  23280187 ttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatctt-tgcaggcatagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaaacagagtagtggagatagtggtt 23280089  T
Q  186 gtacactt 193  Q
    ||||||||    
T  23280088 gtacactt 23280081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 193
Target Start/End: Original strand, 8182911 - 8182965
Alignment:
Q  139 tcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    ||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8182911 tcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 8182965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 193
Target Start/End: Original strand, 24788122 - 24788176
Alignment:
Q  139 tcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||||    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24788122 tcttgtcttgtagtagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 24788176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 193
Target Start/End: Original strand, 28409020 - 28409074
Alignment:
Q  139 tcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||||    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28409020 tcttgtcttgtagtagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 28409074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 122 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 4412157 - 4412088
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtaca 190  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4412157 tgcaggcagagctgttttccttgtcttgtagtagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtaca 4412088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 156 - 193
Target Start/End: Original strand, 14426545 - 14426582
Alignment:
Q  156 gacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14426545 gacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 14426582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 156 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 22578181 - 22578144
Alignment:
Q  156 gacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22578181 gacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 22578144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 140 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 24794891 - 24794838
Alignment:
Q  140 cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||||   ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24794891 cttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacactt 24794838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Original strand, 331608 - 331680
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||   ||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  331608 tgcaggcagagctgttatccttgtcttgtagcagagacacaaactgtgtagtggaggtagtggttgtacactt 331680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 2265713 - 2265642
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||||   ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2265713 tgcaggcatagctgtttttcttgtcttgtagcaaagacaa-aacagagcagtggaggtagtggttgtacactt 2265642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 9709997 - 9709925
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  9709997 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagcagtggatgtagtggttttacactt 9709925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 19711208 - 19711136
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||    ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  19711208 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagtagagacaaaaacagagtagtggaaatagtggttgtacactt 19711136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 38593967 - 38593935
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcct 51  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38593967 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcct 38593935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 41842468 - 41842396
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  41842468 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtgcaggtagtggttgtacactt 41842396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 48806074 - 48806002
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||| ||||||||||| | |||||||||||||   ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  48806074 tgcatgcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaatcagagtagtggaagtagtggttgtacactt 48806002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 162 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 19237197 - 19237166
Alignment:
Q  162 aacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19237197 aacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 19237166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 107 - 193
Target Start/End: Original strand, 21695350 - 21695436
Alignment:
Q  107 tgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  21695350 tgaaggaacaatgt-tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagttgaggtactggttgtacactt 21695436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 88 - 193
Target Start/End: Original strand, 14193044 - 14193149
Alignment:
Q  88 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 186  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||   | |||||| ||||||||| | |||||||| || |   ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  14193044 ttcaaatccattcccattgtgaaggaacatggt-tgcaggaagagctgtttttcttgtcttttaacagagacaaaaacagagtagtagaggtagtggttg 14193142  T
Q  187 tacactt 193  Q
    |||||||    
T  14193143 tacactt 14193149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 162 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 13894152 - 13894123
Alignment:
Q  162 aacagagtagtggaggtagtggttgtacac 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13894152 aacagagtagtggaggtagtggttgtacac 13894123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 193
Target Start/End: Original strand, 14425445 - 14425482
Alignment:
Q  156 gacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14425445 gacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 14425482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 19339402 - 19339373
Alignment:
Q  164 cagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19339402 cagagtagtggaggtagtggttgtacactt 19339373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 32264895 - 32264842
Alignment:
Q  139 tcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacact 192  Q
    ||||||||||||||   ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  32264895 tcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagcagtggaggtactggttgtacact 32264842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 2913803 - 2913731
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    ||||||||||| |||| || ||||||||||||   ||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2913803 tgcaggcagagttgttatccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactt 2913731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 162 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 7488059 - 7488023
Alignment:
Q  162 aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtact 198  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  7488059 aacagagtagtggagatagtggttgtacagttgtact 7488023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 12174535 - 12174464
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  12174535 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaa-aacagagtactaaaggtagtggttgtacactt 12174464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 13138090 - 13138018
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||   ||||  ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  13138090 tgcaggcagagctgttatccttgtcttgtagcagagacataaactgagtaatggagatagtggttgtacactt 13138018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 166 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 13172502 - 13172470
Alignment:
Q  166 gagtagtggaggtagtggttgtacacttgtact 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13172502 gagtagtggaggtagtggttgtacaattgtact 13172470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 16316752 - 16316680
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||| ||||||| ||| |||||||||||||   ||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16316752 tgcaggaagagctgctgttcttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactt 16316680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 29935553 - 29935481
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||  |||  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  29935553 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacacaaactaagtagtggagatagtggttgtacactt 29935481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 141 - 193
Target Start/End: Original strand, 33605668 - 33605720
Alignment:
Q  141 ttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    ||||||||||||   ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  33605668 ttgtcttgtagcagagacaaaaacatagtagtgaaggtagtggttgtacactt 33605720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 122 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 48063015 - 48062947
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtac 189  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  48063015 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacagaaacagagtaatggagatagtggttgtac 48062947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 118)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 18382121 - 18381864
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18382121 gttgagttcctttgatcatccactagtaatcctttgcctgatttggatgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaaca-t 18382023  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  18382022 ttctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaa 18381923  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18381922 ggacaagtactcagggctctccaaatgactgttgatacctccctttcaattcttcgttc 18381864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 20441535 - 20441277
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  20441535 gttgaattcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaa 20441436  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  20441435 ttctgtaggcatagttgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaa 20441336  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||| || ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20441335 ggaaaaatactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 20441277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 7689669 - 7689418
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  7689669 tcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcacatcttgaaggcacaaattctgca 7689570  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 225  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  7689569 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 7689471  T
Q  226 t-actcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    | |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7689470 taactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 7689418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 19 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 20195910 - 20195667
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20195910 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgaagtcctttgaaggatcaacttcaaattcattcccatcttgatggaacaat 20195811  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |    
T  20195810 t-ctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataacgaa 20195712  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctt 263  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20195711 ggacaagtacctagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctt 20195667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 4250775 - 4250525
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  4250775 tcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 4250676  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 225  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  4250675 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 4250577  T
Q  226 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    | ||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  4250576 tgctcagcgctatccaaatgaccgttgataccttcctttcaattcttcgttc 4250525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 39194304 - 39194054
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  39194304 tcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaggaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 39194205  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 225  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||      
T  39194204 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaga 39194106  T
Q  226 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39194105 tactcagtgctatccaaataaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 39194054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Original strand, 39586958 - 39587216
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  39586958 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgagtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaaca-t 39587056  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgc 217  Q
    |||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  39587057 ttctgcaggcatggctgtttttcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacga 39587156  T
Q  218 aggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  39587157 aggacaagtacttagtgttctccaaatgaccgttgatgtctccctttcaattcttcgttc 39587216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 9050705 - 9050447
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  9050705 gttgaattcctttgatcatccaccagtaattctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaaaaatagcttcaaattcattaccatcttgaaggaac-at 9050607  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtac-ttcgtcaactctgttaacgc 217  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| |     
T  9050606 ttctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttttgtcaactttgttaaaga 9050507  T
Q  218 aggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  9050506 atgacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttaatacctccctttcaaatcttcgttc 9050447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Original strand, 47195250 - 47195508
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  47195250 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatccttcgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattaacttcaaattcattcccatcttgaaggaaca-t 47195348  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgc 217  Q
    |||||||||||   ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  47195349 ttctgcaggcatgactgtttttcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacga 47195448  T
Q  218 aggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  47195449 aggacaagtacttagttttctccaaatgaccgttgatgtctccctttcaattcttcgttc 47195508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 14388343 - 14388086
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  || | ||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  14388343 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaaca-t 14388245  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |    
T  14388244 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataaagaa 14388145  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  14388144 ggacaagcacccagtgcttttcaaatgaccgttgatacctcccttttaattcttcgttc 14388086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 20 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 11195283 - 11195027
Alignment:
Q  20 ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatt 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11195283 ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcttgatttgagtgtagtcctttgaaggatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaaca-tt 11195185  T
Q  120 tctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcag 219  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |     
T  11195184 tctgcaggcaaagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtaatggttgtacacttgtactttgtcaactctgataacgaaa 11195085  T
Q  220 gacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11195084 gacaagtacccagtgctttccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 11195027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 5973760 - 5974011
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  5973760 tcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 5973859  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 225  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  5973860 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggcagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 5973958  T
Q  226 tactcagtgctcttc-aaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    | ||||| | | | | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  5973959 tgctcagcgttgtccaaaatgaccgttgataccttcctttcaattcttcgttc 5974011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 154499 - 154249
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||    
T  154499 tcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccactttgaaggcacaaattctgca 154400  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 225  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  154399 gacatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttatacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 154301  T
Q  226 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    | ||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  154300 tgctcagcgctgtccaaatgaccgttgataccttcctttcaattcttcgttc 154249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 35012918 - 35013169
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  35012918 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaaggtacaaattctgca 35013017  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 225  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   ||||||    
T  35013018 ggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaag 35013117  T
Q  226 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    | ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35013118 tgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 35013169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 19 - 275
Target Start/End: Original strand, 675436 - 675690
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  || | |||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  675436 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcccattttgaaggaaca-t 675534  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || | |    
T  675535 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaagcagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaatgaa 675633  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgt 275  Q
    ||||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  675634 ggacaagcaccgagtgcttttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgt 675690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 23580538 - 23580286
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  23580538 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaaggtacaaattctgca 23580439  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  23580438 ggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 23580339  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23580338 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 23580286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 148424 - 148174
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||    
T  148424 tcctttgatcattcaccagtaattctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccactttgaaggcacaaattctgca 148325  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 225  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  148324 gacatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtgattgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 148226  T
Q  226 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    | ||||| ||| | ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||    
T  148225 tgctcagcgctgtccaaatgaccgttgatactttcctttcaattcttcgttc 148174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Original strand, 17957229 - 17957487
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17957229 gttgagttcctttgatcttccaccagtaattctttgcctgatatgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaac-at 17957327  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtac-ttcgtcaactctgttaacgc 217  Q
    |||||||||||  | |||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||| |     
T  17957328 ttctgcaggcatggttgttttcttgtcttgtagtgtagacaaaaacagagtaatggaggtagtggttgtacacttgtacttttgtaaactctgataaaga 17957427  T
Q  218 aggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  17957428 aggacaaatactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcaaatcttcgttc 17957487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 20 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 41132831 - 41132577
Alignment:
Q  20 ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatt 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  || | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  41132831 ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcccattttgaaggaacagtt 41132732  T
Q  120 tctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcag 219  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || | ||    
T  41132731 -ctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtagaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaaagaag 41132634  T
Q  220 gacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgtt 276  Q
    |||||  || || |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41132633 gacaaacacccaatgcttttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgtt 41132577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 18311189 - 18310932
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||  || | ||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  18311189 gttgagtttctttgatcattcaccagtaatcttttgcttgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaaca-t 18311091  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |    
T  18311090 ttctgcaggtagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataaagaa 18310991  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| | ||||||||    
T  18310990 ggacaagcacccagtgcttttcaaatgaccgttgatatcttcctttcaatccttcgttc 18310932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 19187833 - 19188086
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  19187833 tcctttgattatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagagtaagcttcaaattcattcccatcttgaacgtacaacttctgca 19187932  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  19187933 ggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 19188032  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaa-atgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | ||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19188033 gtgctcagtgctatccaatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 19188086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 4167254 - 4167506
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  4167254 tcctttgattatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtacaaattctgca 4167353  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  ||| |||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  4167354 ggcatggctattgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 4167453  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4167454 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 4167506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 4177910 - 4178162
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||    
T  4177910 tcctttgattatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtacaaattttgca 4178009  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  4178010 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 4178109  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4178110 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 4178162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 12730542 - 12730794
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  12730542 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 12730641  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  12730642 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 12730741  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12730742 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 12730794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 12741135 - 12741387
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  12741135 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 12741234  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  12741235 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 12741334  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12741335 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 12741387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 12898195 - 12897943
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  12898195 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 12898096  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  12898095 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 12897996  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12897995 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 12897943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 5639922 - 5639670
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  5639922 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatacgcttcaaattcattcccatcttgaacgtacaaattctgca 5639823  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  | |||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  5639822 ggcatggttgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 5639723  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5639722 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 5639670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 5650479 - 5650227
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  5650479 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatacgcttcaaattcattcccatcttgaacgtacaaattctgca 5650380  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  | |||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  5650379 ggcatggttgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 5650280  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5650279 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 5650227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 21877762 - 21878014
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  21877762 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 21877861  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  21877862 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 21877961  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| |  | ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21877962 gtgctcagtgctatctatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 21878014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 21895197 - 21895449
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  21895197 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 21895296  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  21895297 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 21895396  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21895397 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 21895449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 33084557 - 33084809
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  33084557 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtacaaattctgca 33084656  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||| | |||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  33084657 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcatagacagaaaatagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 33084756  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33084757 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 33084809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 10997996 - 10997744
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  10997996 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 10997897  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  10997896 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 10997797  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10997796 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 10997744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 12614528 - 12614276
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  12614528 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 12614429  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  12614428 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 12614329  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12614328 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttc 12614276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 21863656 - 21863908
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  21863656 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaaaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 21863755  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  21863756 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtaaacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 21863855  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21863856 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 21863908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 19178954 - 19179207
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  19178954 tcctttgattatccaccagtaatcatttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagagtaagcttcaaattcattcccatcttgaacgtacaacttctgca 19179053  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||   |||||    
T  19179054 ggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactatattaacgagagacaa 19179153  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaa-atgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || || |||||| | ||| ||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  19179154 gtgcttagtgctatccaatatatccgttgataactccctttcaattcttcgttc 19179207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 7507297 - 7507549
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  7507297 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 7507396  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  7507397 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 7507496  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  7507497 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattctttgttc 7507549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 7517894 - 7518146
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  7517894 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 7517993  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  7517994 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 7518093  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  7518094 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattctttgttc 7518146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 12623993 - 12623741
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  12623993 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 12623894  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||    
T  12623893 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 12623794  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||| | | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12623793 gtgctcagtgatatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 12623741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 51629399 - 51629147
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  51629399 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 51629300  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  51629299 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 51629200  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  51629199 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattctttgttc 51629147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 51656660 - 51656408
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  51656660 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 51656561  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  51656560 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 51656461  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  51656460 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattctttgttc 51656408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 2538531 - 2538782
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||   |||||    
T  2538531 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaaaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaaa-ctgca 2538629  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  2538630 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 2538729  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2538730 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 2538782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 3171617 - 3171870
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaag-gaacaatttctgc 124  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||    
T  3171617 tcctttgattatccaccagtgatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaacttctgc 3171716  T
Q  125 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 223  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   ||||    
T  3171717 aggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagaca 3171816  T
Q  224 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||| ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3171817 agtgctcagtgctttccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttc 3171870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 3182219 - 3182472
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaag-gaacaatttctgc 124  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||    
T  3182219 tcctttgattatccaccagtgatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaacttctgc 3182318  T
Q  125 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 223  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   ||||    
T  3182319 aggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagaca 3182418  T
Q  224 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||| ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3182419 agtgctcagtgctttccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttc 3182472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 5833213 - 5833466
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaag-gaacaatttctgc 124  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||    
T  5833213 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgc 5833312  T
Q  125 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 223  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   ||||    
T  5833313 aggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagaca 5833412  T
Q  224 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||| ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5833413 agtgctcagtgctttccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttc 5833466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 5843815 - 5844068
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaag-gaacaatttctgc 124  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||    
T  5843815 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgc 5843914  T
Q  125 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 223  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   ||||    
T  5843915 aggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagaca 5844014  T
Q  224 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||| ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5844015 agtgctcagtgctttccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttc 5844068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 35401377 - 35401124
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttga-aggaacaatttctgc 124  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||    
T  35401377 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgc 35401278  T
Q  125 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 223  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   ||||    
T  35401277 aggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagaca 35401178  T
Q  224 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||| ||||||| | | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35401177 agtgctcagtgttatccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttc 35401124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 35404604 - 35404351
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttga-aggaacaatttctgc 124  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||    
T  35404604 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgc 35404505  T
Q  125 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 223  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   ||||    
T  35404504 aggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagaca 35404405  T
Q  224 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||| ||||||| | | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35404404 agtgctcagtgttatccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttc 35404351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 35648903 - 35648650
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttga-aggaacaatttctgc 124  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||    
T  35648903 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgc 35648804  T
Q  125 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 223  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   ||||    
T  35648803 aggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagaca 35648704  T
Q  224 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||| ||||||| | | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35648703 agtgctcagtgttatccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttc 35648650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 35638251 - 35637998
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttga-aggaacaatttctgc 124  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||    
T  35638251 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgc 35638152  T
Q  125 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 223  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   ||||    
T  35638151 aggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagaca 35638052  T
Q  224 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||| ||||||| | | || ||  | |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35638051 agtgctcagtgttatccatatatctgttgatacctccctttcagttcttcgttc 35637998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 38095071 - 38095324
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttga-aggaacaatttctgc 124  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||    
T  38095071 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggatcaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgc 38095170  T
Q  125 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 223  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   ||||    
T  38095171 aggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagaca 38095270  T
Q  224 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
     || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38095271 ggtgctcagtgctttccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttc 38095324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 38105696 - 38105949
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttga-aggaacaatttctgc 124  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||    
T  38105696 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggatcaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgc 38105795  T
Q  125 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 223  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   ||||    
T  38105796 aggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagaca 38105895  T
Q  224 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
     || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38105896 ggtgctcagtgctttccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttc 38105949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 47608143 - 47607890
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaag-gaacaatttctgc 124  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||    
T  47608143 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgc 47608044  T
Q  125 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 223  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   ||||    
T  47608043 aggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaaagagagaca 47607944  T
Q  224 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||| ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  47607943 agtgctcagtgctttccatatatccgttgatacctccctttcaattcatcgttc 47607890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 47618751 - 47618498
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaag-gaacaatttctgc 124  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||    
T  47618751 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgc 47618652  T
Q  125 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 223  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   ||||    
T  47618651 aggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaaagagagaca 47618552  T
Q  224 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||| ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  47618551 agtgctcagtgctttccatatatccgttgatacctccctttcaattcatcgttc 47618498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 36236641 - 36236390
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||| ||||||||||||  | |||| |||||||    
T  36236641 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaatttcaaattccttcccatcttgagtgtacaa-ttctgca 36236543  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  36236542 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 36236443  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |  || |||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36236442 gagcttagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 36236390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 36247188 - 36246937
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||| ||||||||||||  | |||| |||||||    
T  36247188 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaatttcaaattccttcccatcttgagtgtacaa-ttctgca 36247090  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  36247089 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 36246990  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |  || |||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36246989 gagcttagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 36246937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 19 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 46181096 - 46180865
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  || | ||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  46181096 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaa- 46180998  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || |      
T  46180997 ttctgcaggcagagctgttaacttgtcttgtagcgaagacacactcagggtcgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaatgag 46180899  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttg 252  Q
    ||||||| || ||||||| ||||||||| |||||    
T  46180898 ggacaagcacccagtgcttttcaaatgaacgttg 46180865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Original strand, 20798929 - 20799118
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  |  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20798929 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatagaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaat 20799028  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactct 209  Q
    | ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20799029 t-ctgcaggcagagctgttattttgtcttgtagcgaggacatgctcagggtcgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 20799118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 133 - 276
Target Start/End: Original strand, 12946818 - 12946961
Alignment:
Q  133 ctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtactcag 232  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| || |||||||    
T  12946818 ctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataacgaaggataaatactcag 12946917  T
Q  233 tgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgtt 276  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12946918 tgcttttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgtt 12946961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 19 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 22610191 - 22609960
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||  || |  |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22610191 gttgagttcctttgatcatccatcagtaatcttttgcctgatttgagtgtagtcctataaaggatcaaattcaaattcattcctatcttgaaggaacaat 22610092  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    | ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || |      
T  22610091 t-ctgcaggcagagctgttatattgtcttgtagcgaggacatgctcagggtcgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaatgag 22609994  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttg 252  Q
    | ||||| |||||||||| ||||||||| |||||    
T  22609993 gtacaagcactcagtgcttttcaaatgagcgttg 22609960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 19 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 45070870 - 45070630
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||  || | ||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  45070870 gttgagttcctttgatcattcaccactaatcttttgcctgatttggatgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaa- 45070772  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    ||| || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| | || | |    
T  45070771 ttctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggaggtagtggttgtacatttgtaatttgtcaactct-tcaatgaa 45070673  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccc 261  Q
    ||||| | || ||||||| ||||||||| |||||  |||||||    
T  45070672 ggacaggcacccagtgcttttcaaatgaacgttggcacctccc 45070630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 20884099 - 20883910
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||  || | ||||||||||||||| |||||||||||| ||     
T  20884099 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatctgttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaagaa- 20884001  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactct 209  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||    ||| || |||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20884000 ttctgctggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagctaatggttgtacacttgtactttgtcaactct 20883910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Original strand, 23926923 - 23927112
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||  || |  ||||||| |||||| ||||||||||||| ||    
T  23926923 gttgagttcctttgatcatccactagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctataaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaac-at 23927021  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactct 209  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23927022 ttctgtaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacatactcagggtcgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 23927112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 51 - 252
Target Start/End: Original strand, 5929600 - 5929799
Alignment:
Q  51 tttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgta 150  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5929600 tttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaaca-tttctgcaggcagagctggtgtcttgtcttgta 5929698  T
Q  151 gcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgt 250  Q
    |||| ||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||   |||||||| || ||||||| ||||||||| |||    
T  5929699 gcgtagacacaatcagagtcgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaataaaggacaagcacccagtgcttttcaaatgaacgt 5929797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 27 - 252
Target Start/End: Original strand, 28474100 - 28474323
Alignment:
Q  27 cctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcag 126  Q
    |||||||||||  |||| | ||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||    
T  28474100 cctttgatcatttaccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttaaaggaaca-tttctgcag 28474198  T
Q  127 gcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagt 226  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||  | |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||  ||||||||     
T  28474199 gcagagctgttatcttgtcttgtagcgcagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacaattgtactttgtcaactct-tcaacaaaggacaagc 28474297  T
Q  227 actcagtgctcttcaaatgaccgttg 252  Q
    || ||||||| ||||||||| |||||    
T  28474298 acccagtgcttttcaaatgaacgttg 28474323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 55 - 252
Target Start/End: Original strand, 44200912 - 44201108
Alignment:
Q  55 cctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgt 154  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||| || |||| ||||||||||||||||    
T  44200912 cctgatttggatgttgtcctatgaaagatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaaca-tttctgcaggcaaagttgttatcttgtcttgtagcgt 44201010  T
Q  155 ggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttg 252  Q
     ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | || | |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||    
T  44201011 agacacaaacagagtcgtggaggtagtggttgtacactttgtactttgtcaactct-tcaatgaaggacaagcactcagtgcttttcaaatgaacgttg 44201108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 51 - 252
Target Start/End: Original strand, 19037903 - 19038103
Alignment:
Q  51 tttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgt 149  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| | || ||| |  ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  19037903 tttgcctgatttggatgttgtcctataaagaatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaaca-tttctgcaggcagagctgtttttcttgtcttgt 19038001  T
Q  150 agcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccg 249  Q
    ||||  ||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |  | |||||||| || ||||||| ||||||||| ||    
T  19038002 agcgcagacacaatcagagtcgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcagtgaaggacaagcacccagtgcttttcaaatgaacg 19038100  T
Q  250 ttg 252  Q
    |||    
T  19038101 ttg 19038103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 30 - 209
Target Start/End: Original strand, 17370917 - 17371097
Alignment:
Q  30 ttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggca 129  Q
    |||||||  ||||| | ||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  17370917 ttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggttgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcatgaaggaaca-tttctgcaggca 17371015  T
Q  130 gagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt-gtacttcgtcaactct 209  Q
    ||||| || | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  17371016 gagctatttttcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtactttgtcaactct 17371097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 51 - 209
Target Start/End: Original strand, 28379892 - 28380049
Alignment:
Q  51 tttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgta 150  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| ||||  || |  |||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28379892 tttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatcaattcctatcttgaaggaaca-tttctgcaggcagagctgttatcttgtcttgta 28379990  T
Q  151 gcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactct 209  Q
    |||| ||||  |  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28379991 gcgtagacacaattagagtcgtggaggtactggttgtacacttgtactttgtcaactct 28380049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 51 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 52350869 - 52350670
Alignment:
Q  51 tttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgta 150  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| | |||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  52350869 tttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctaacttgaagggaca-tttctgcaggcagagctattatcttgtcttgta 52350771  T
Q  151 gcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgt 250  Q
    |||| ||||  | |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | || | |||||||| || ||||||| ||||| ||| |||    
T  52350770 gcgtagacacaagcagagttgtggaggtagtggttgtacaattgtactttgtcaactct-tcaatgaaggacaagcacccagtgcttttcaagtgaacgt 52350672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 30 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 19170539 - 19170360
Alignment:
Q  30 ttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggca 129  Q
    |||||||  ||||| | ||| ||||| |||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  19170539 ttgatcaatcaccaatgatcttttgcttgatttggttgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaacgaaca-tttctgcaggca 19170441  T
Q  130 gagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtacttcgtcaactc 208  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  19170440 gagctgtttttcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacactttgtactttgtcaactc 19170360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 51 - 209
Target Start/End: Original strand, 20251671 - 20251828
Alignment:
Q  51 tttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgta 150  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  20251671 tttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaaca-tttctgcaggcagagctgttatcttgttttgta 20251769  T
Q  151 gcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactct 209  Q
    || | ||||  | |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  20251770 gcatagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacccttgcactttgtcaactct 20251828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 30 - 209
Target Start/End: Original strand, 22655352 - 22655532
Alignment:
Q  30 ttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggca 129  Q
    |||||||  ||||| | ||| |||||||||||||| ||| |||||  |||  || |  ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  22655352 ttgatcagtcaccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctaagaaggatcacattcaaatccattcctatcttgaaggaaca-tttctgcaggca 22655450  T
Q  130 gagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtacttcgtcaactct 209  Q
    || ||||| | ||||||||||||||| ||||  | |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  22655451 gaactgtttttcttgtcttgtagcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacactttgtactttgtcaactct 22655532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 51 - 209
Target Start/End: Original strand, 22019232 - 22019391
Alignment:
Q  51 tttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttg-tcttgtcttgt 149  Q
    ||||||||||||||  || ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  22019232 tttgcctgatttggaagttgtcctatgaaggatcatgttcaaatccattcctatcttgaaggaaca-tttctgcaggaagagctgtttatcttgtcttgt 22019330  T
Q  150 agcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtacttcgtcaactct 209  Q
    ||||| ||||  | |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  22019331 agcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacactttgtactttgtcaactct 22019391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 88 - 209
Target Start/End: Original strand, 22642828 - 22642950
Alignment:
Q  88 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttg-tcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 186  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||| ||||  | |||||| ||||||||||||||||    
T  22642828 ttcaaatccattcctatcttgaaggaaca-tttctgcaggcagaactgtttatcttgtcttgtaccgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttg 22642926  T
Q  187 tacac-ttgtacttcgtcaactct 209  Q
    ||||| |||||||| |||||||||    
T  22642927 tacactttgtactttgtcaactct 22642950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 141 - 252
Target Start/End: Original strand, 23064935 - 23065045
Alignment:
Q  141 ttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtactcagtgctcttc 240  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || | |||||||| || ||||||| |||    
T  23064935 ttgtcttgtagcgtagacacaaacagagtcgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaatgaaggacaagcacccagtgcttttc 23065033  T
Q  241 aaatgaccgttg 252  Q
    |||||| |||||    
T  23065034 aaatgaacgttg 23065045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 30 - 190
Target Start/End: Original strand, 21543904 - 21544064
Alignment:
Q  30 ttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggca 129  Q
    |||||||  ||||| | ||| |||||||||||||| ||| ||||| | || ||| |  ||||||| |||||| | |||||||||||| ||||| ||||||    
T  21543904 ttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctataaagaatcatgttcaaatccattcctaacttgaaggaaca-tttctacaggca 21544002  T
Q  130 gagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtaca 190  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||| |||||    
T  21544003 gagctgtttttcttgtcttgtagcgtagacaaaagcaaagtagtggaggtagtggtcgtaca 21544064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Original strand, 1900311 - 1900383
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1900311 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 1900383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 50 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 25448751 - 25448608
Alignment:
Q  50 ctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttg 148  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||||||||  ||||||||||   | |||||||| ||||||| | |||||||||    
T  25448751 ctttgcctgatatggttgttgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatcgt-tgcaggcaaagctgtttttcttgtcttg 25448653  T
Q  149 tagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    ||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25448652 tagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 25448608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Original strand, 36134156 - 36134228
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36134156 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 36134228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 88 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 22464956 - 22464851
Alignment:
Q  88 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 186  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||  || |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| || ||||||||||||||||||| ||    
T  22464956 ttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatctt-tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtggatg 22464858  T
Q  187 tacactt 193  Q
    |||||||    
T  22464857 tacactt 22464851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Original strand, 21702780 - 21702852
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21702780 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 21702852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 51 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 26548441 - 26548282
Alignment:
Q  51 tttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttg-tcttgtcttgt 149  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| |||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||  || ||||||||    
T  26548441 tttgcctgatttggatgctgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaaagaaca-tttatgcagacagagctgtttatcctgtcttgt 26548343  T
Q  150 agcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtacttcgtcaactct 209  Q
    ||||| ||||    ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  26548342 agcgtagacagaggcagtgtcgtggaggtagtggttgtacactttgtactttgtcaactct 26548282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Original strand, 35040132 - 35040204
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    ||||||||||||| || | |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35040132 tgcaggcagagctttttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 35040204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 22600366 - 22600224
Alignment:
Q  51 tttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgt 149  Q
    |||||||||| ||| | | ||||| ||||| || |  ||||||| |||||||||  ||||||||||   | ||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  22600366 tttgcctgatatggttattgtcctatgaatgatcaatttcaaatccattcccattgtgaaggaacatcat-tgcaggcagagttgtttttcttgtcttgt 22600268  T
Q  150 agcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||   ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22600267 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 22600224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 88 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 2327587 - 2327482
Alignment:
Q  88 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 186  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||   | |||| ||||||||||| | |||||||||||||   ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  2327587 ttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatcgt-tgcaagcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaccagagtagtggaggtagtggttg 2327489  T
Q  187 tacactt 193  Q
    |||||||    
T  2327488 tacactt 2327482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 139 - 193
Target Start/End: Original strand, 22153841 - 22153895
Alignment:
Q  139 tcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    ||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22153841 tcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 22153895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 88 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 32786084 - 32785979
Alignment:
Q  88 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 186  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||  || |||| ||||||||||| | |||||||| |||||  ||||| |||| |||||||||| |||||||||    
T  32786084 ttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatctt-tgcaagcagagctgtttttcttgtcttttagcggagacaaaaacatagtagtggagatagtggttg 32785986  T
Q  187 tacactt 193  Q
    |||||||    
T  32785985 tacactt 32785979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 7745209 - 7745132
Alignment:
Q  117 atttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    ||||||||||||| ||||||| | |||||| |||||||  | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7745209 atttctgcaggcaaagctgtttttcttgtcatgtagcgaaggcaatagcagagtagtggaggtagtggttgtacactt 7745132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Original strand, 19215578 - 19215650
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  19215578 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtgcagatagtggttgtacactt 19215650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 21135274 - 21135202
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||   ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  21135274 tgcaggcagagctgttatccttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggatttagtggttgtacactt 21135202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 22427471 - 22427399
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||||   ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22427471 tgcaggcaaagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacaaagtagtggaggtagtggttgtacactt 22427399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Original strand, 30572163 - 30572235
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30572163 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagaaacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 30572235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Original strand, 46088955 - 46089027
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||||||| || |||||| |||||   ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  46088955 tgcaggcagagctgttatccttgtctagtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 46089027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 123 - 193
Target Start/End: Original strand, 37642215 - 37642286
Alignment:
Q  123 gcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||||||||   ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37642215 gcaggcatagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacactt 37642286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 39201104 - 39201034
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||||||| | |||| |||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39201104 tgcaggcagagctgtttt-ttgtgttgtagcagaaacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 39201034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 193
Target Start/End: Original strand, 2266962 - 2267127
Alignment:
Q  28 ctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcagg 127  Q
    |||||||||  ||||| | ||| |||||||||| ||| | | ||||| ||||| || |  ||||||| |||| ||||  ||||||||||  || |||||     
T  2266962 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaatgatcaatttcaaatgcatttccattgtgaaggaacatctt-tgcaga 2267060  T
Q  128 cagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    || ||||||| | ||||||||||||    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2267061 caaagctgtttttcttgtcttgtagtagagacaaaaacatagtagtggaggtagtggttgtacactt 2267127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 193
Target Start/End: Original strand, 2268515 - 2268569
Alignment:
Q  139 tcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    ||||||||||||||   ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2268515 tcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtcgaggtagtggttgtacactt 2268569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 193
Target Start/End: Original strand, 10757354 - 10757459
Alignment:
Q  88 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 186  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||  ||| |||||||| || |||||||||    
T  10757354 ttcaaattcattccaagtatgaaggaacaatg-ctgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtgaagatagtggttg 10757452  T
Q  187 tacactt 193  Q
    |||||||    
T  10757453 tacactt 10757459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 21121178 - 21121108
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 191  Q
    ||||| |||||||||| || ||||||||||||   ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21121178 tgcagacagagctgttatccttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacac 21121108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 24028816 - 24028751
Alignment:
Q  105 cttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagta 170  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  24028816 cttgaaggaaca-tttctgcaggcagagctatttttcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagta 24028751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 14263566 - 14263493
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaa-cagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||||||||   ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14263566 tgcaggaagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 14263493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 190
Target Start/End: Original strand, 2834562 - 2834725
Alignment:
Q  28 ctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcagg 127  Q
    |||||||||  ||||| | ||| |||||||||| ||| | | ||||| ||||| || |  ||||||| |||||||||  ||||| ||||   | |||||     
T  2834562 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaatgatcaatttcaaatgcattcccattgtgaagtaacatcgt-tgcaga 2834660  T
Q  128 cagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaa-gaacagagtagtggaggtagtggttgtaca 190  Q
    |||||||||| | |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2834661 cagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaagaacagagtagtggaggcagtggttgtaca 2834725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 16235410 - 16235338
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  16235410 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaaaggagtagtggaggtagttgttgtacactt 16235338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Original strand, 23024754 - 23024826
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||| ||||||||||| | |||||||||||||   ||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  23024754 tgcatgcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtgcagatagtggttgtacactt 23024826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Original strand, 29215763 - 29215835
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||||||   ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  29215763 tgcaggcagagctgtttttcttgccttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagctagtgattgtacactt 29215835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 33256465 - 33256393
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33256465 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactt 33256393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 33276637 - 33276565
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33276637 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactt 33276565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 48570345 - 48570273
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||| ||||||| | |||||| ||||||   ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48570345 tgcaggcatagctgtttttcttgtcctgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 48570273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 162 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 21191938 - 21191907
Alignment:
Q  162 aacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21191938 aacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 21191907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 159 - 198
Target Start/End: Original strand, 23054370 - 23054409
Alignment:
Q  159 aagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtact 198  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  23054370 aagaacagagtagtgaaggtagtggttgtacaattgtact 23054409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 193
Target Start/End: Original strand, 35401777 - 35401847
Alignment:
Q  125 aggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaa-cagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||    
T  35401777 aggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaaacatagtagtggaggtagtggttgtacactt 35401847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 44821641 - 44821587
Alignment:
Q  139 tcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    ||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  44821641 tcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtagttgtacactt 44821587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 21205017 - 21204965
Alignment:
Q  140 cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||||   ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21205017 cttgtcttgtagcacagacaa-aacagagtagtggaagtagtggttgtacactt 21204965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 23036676 - 23036569
Alignment:
Q  88 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctg-ttgtcttgtcttgtagcgtggac--aagaacagagtagtggaggtagtggt 184  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||   | |||||||||||||| || ||||||||||||||   |||  || |||| ||||| ||||||||||||    
T  23036676 ttcaaatccattcccattgtgaaggaacatcat-tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaaaacaaagtagaggaggtagtggt 23036578  T
Q  185 tgtacactt 193  Q
    |||||||||    
T  23036577 tgtacactt 23036569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 34255630 - 34255561
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtaca 190  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||   |||||   |||||||||||| ||||||||||||||    
T  34255630 tgcaggcagagctgttatccttgtcttgtagcagagacaaactcagagtagtggaagtagtggttgtaca 34255561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 188
Target Start/End: Original strand, 38282500 - 38282600
Alignment:
Q  88 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 186  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||||| | | |||| |||||||| || | ||| |||||||||   ||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  38282500 ttcaaatccattcccattgtgaaggaacattgt-tgcaagcagagctatttttcttatcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttg 38282598  T
Q  187 ta 188  Q
    ||    
T  38282599 ta 38282600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Original strand, 1577833 - 1577905
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||||| | || ||||||||||||   ||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1577833 tgcaggcagagctggtatccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactt 1577905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Original strand, 10250952 - 10251024
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    ||||||||||| |||| | ||||||||||||    ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  10250952 tgcaggcagagatgtttttcttgtcttgtagtagagacaaaaacagagtagtggagataatggttgtacactt 10251024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 2)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 33117 - 32860
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  33117 gttgagttcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttaggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaa 33018  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  33017 ttctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaa 32919  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |||||| ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||    
T  32918 ggacaaatactcagtgctatccaaatgatcgttgatacctccctttcaattattcgttc 32860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 40661 - 40409
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  40661 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 40562  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  40561 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 40462  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40461 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 40409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 2)
Name: scaffold0407
Description:

Target: scaffold0407; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 20 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 12328 - 12072
Alignment:
Q  20 ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatt 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12328 ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatt 12229  T
Q  120 tctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcag 219  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||    
T  12228 -ctgcaggcggagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataacgaag 12130  T
Q  220 gacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12129 gacaagtacccagtgcttttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 12072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 87 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 16092 - 15903
Alignment:
Q  87 cttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  16092 cttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatt-ctgcaggcggagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtgtaggtagtggttg 15994  T
Q  187 tacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||||||||||||| ||||||| |  ||  | | ||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15993 tacacttgtactttgtcaacttttatattgaatgacaagtatccattgcttttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 15903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0267
Description:

Target: scaffold0267; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 29 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 6423 - 6175
Alignment:
Q  29 tttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggc 128  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || |||||||    
T  6423 tttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatctttaaggcacaaattttgcaggc 6324  T
Q  129 agagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtac 228  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| |||    
T  6323 atagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaattctgttaacgaaggacaaatac 6224  T
Q  229 tcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6223 tcagtgcttttcatatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 6175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 3)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 54330 - 54080
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  54330 tcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 54231  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 225  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  54230 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagcatggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgcaggacaaa 54132  T
Q  226 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    | ||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  54131 tgctcagcgctgtccaaatgaccgttgataccttcctttcaattcttcgttc 54080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 14632 - 14884
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  14632 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaaggtacaaattctgca 14731  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  14732 ggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaagcagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 14831  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14832 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 14884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 5746 - 5674
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||||||||   ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5746 tgcaggtagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacatagtagtggaggtagtggttgtacactt 5674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0497 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0497
Description:

Target: scaffold0497; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 10501 - 10244
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  10501 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattcccatcttaaaggaaca-t 10403  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |    
T  10402 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaagcagagtagtggaggtagtggttgtacatttgtactttgtcaactctgataacgaa 10303  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10302 ggacaagtacccagtgcttttcaaacgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 10244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 27 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 7092 - 6842
Alignment:
Q  27 cctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcag 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  7092 cctttgatcatccaccagtaatcctttgcctggtttgggtgtagtcctttaaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgcag 6993  T
Q  127 gcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagt 226  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |    
T  6992 gcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaat 6893  T
Q  227 actcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
     || |||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6892 gcttagtgctatccatatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 6842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0272 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0272
Description:

Target: scaffold0272; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 19 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 13821 - 13565
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13821 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaaggaataat 13722  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |    
T  13721 ta-tgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacatagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgaa 13623  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgtt 276  Q
    |||||| |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  13622 ggacaaatactcagtgcttctgaaatgaccgttgatacctccctttcgattcttcgtt 13565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 183; Significance: 5e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 39 - 273
Target Start/End: Original strand, 1 - 235
Alignment:
Q  39 caccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttg 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||    
T  1 caccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaatttattcccatcttgaaggcacaaattctgcaggcatagctgttg 100  T
Q  139 tcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtactcagtgctct 238  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |    
T  101 tcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatactcagtgctat 200  T
Q  239 tcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttc 273  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  201 ccaaatgaccgttgataccttcctttcaattcttc 235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 183; Significance: 5e-99; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Original strand, 5338 - 5595
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5338 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaaca-t 5436  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |    
T  5437 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtagttgtacacttgtactttgtcaactctgataacgaa 5536  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  5537 ggacaattacccagtgcttttcaaccgaccgttgatatctccctttcaattcttcgttc 5595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 183 - 277
Target Start/End: Original strand, 12896 - 12990
Alignment:
Q  183 gttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||| |||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  12896 gttgtacacttgtactttgtcaactctgataacgaaggacaattacccagtgcttttcaaccgaccgttgatatctccctttcaattcttcgttc 12990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391 (Bit Score: 180; Significance: 3e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0391
Description:

Target: scaffold0391; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 2425 - 2175
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||    
T  2425 tcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgattttggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaaatctgca 2326  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 225  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||     
T  2325 agcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtattttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 2227  T
Q  226 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  2226 tactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctcccttttaattcttcgttc 2175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 180; Significance: 3e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 36949 - 36691
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  36949 gttgagttcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaaca-t 36851  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgc 217  Q
    |||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||     
T  36850 ttctgcaggcatggctgtttttcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgttaactctgttaacga 36751  T
Q  218 aggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  36750 aggacaagtacttagttttctccaaatgaccgttgatgtctccctttcaattcttcgttc 36691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 3)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 56995 - 56738
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  56995 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaaca-t 56897  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| |    
T  56896 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaaatctgataacgaa 56797  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||| || | | | ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  56796 ggaaaatttccccgtgcttttcaaacgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 56738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 88 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 548 - 464
Alignment:
Q  88 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagt 172  Q
    ||||||| |||||| ||  ||| |||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  548 ttcaaatccattcctattctgagggaaca-tttctgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcgtagacataaacagagtagt 464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 117 - 193
Target Start/End: Original strand, 32447 - 32524
Alignment:
Q  117 atttctgcaggcagagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||| |||||||| ||||||| || ||||||||||||   ||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32447 atttttgcaggcaaagctgttatccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactt 32524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747 (Bit Score: 176; Significance: 7e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0747
Description:

Target: scaffold0747; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 2848 - 3098
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||    
T  2848 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtactcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagggcacaaattctgca 2947  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 225  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  2948 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa-aacagagtagtggaggtattggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 3046  T
Q  226 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    | || || ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3047 tgctaagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcacttcttcgttc 3098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 176; Significance: 7e-95; HSPs: 2)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 42727 - 42477
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  42727 tcctttgatcattcaccaataatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaggaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 42628  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 225  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||     
T  42627 ggcatagctgatgtcttgtcttgtagcgaggacaa-aacagagtagtggaggtagtcgttgtacacttgtacgttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 42529  T
Q  226 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42528 tactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 42477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 31180 - 31432
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  31180 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 31279  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  31280 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 31379  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |  ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  31380 gagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattctttgttc 31432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 176; Significance: 7e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 52313 - 52058
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  52313 tcctttgatcattcatcagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaac-atttatgca 52215  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagc----gtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtac-ttcgtcaactctgttaacgcagg 220  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||    || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | |||    
T  52214 ggcagagctgttatcttgtcttgcagcgtaggtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttttgtcaactctgttaaagaagg 52115  T
Q  221 acaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  52114 acaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 52058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 163; Significance: 4e-87; HSPs: 4)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Original strand, 175367 - 175624
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  175367 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggatcagcttcaaattcattcccatcttgaaggaaca-t 175465  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    |||||||  || ||||||||||||||| |||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | | |    
T  175466 ttctgcaaacaaagctgttgtcttgtcctgtagcgtagacataaatagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgatgaagaa 175565  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  175566 ggacaagtatccaatgcttttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 175624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 165 - 277
Target Start/End: Original strand, 180424 - 180536
Alignment:
Q  165 agagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctcccttt 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | | ||||||||||  || |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  180424 agagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgatgaagaaggacaagtatccaatgcttttcaaatgaccgttgatacctcccttt 180523  T
Q  265 catttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||||    
T  180524 caattcttcgttc 180536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 27 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 40551 - 40369
Alignment:
Q  27 cctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcag 126  Q
    |||||||||||  |||| | ||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  40551 cctttgatcatttaccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaaca-tttctgcag 40453  T
Q  127 gcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactct 209  Q
    ||| ||||||| | ||||||||||||||  ||||  | |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  40452 gcaaagctgttatacttgtcttgtagcgaagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacaattgtactttgtcaactct 40369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #4
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 27 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 59097 - 58915
Alignment:
Q  27 cctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcag 126  Q
    |||||||||||  |||| | ||| |||||||||||||| ||| ||| | ||||  || |  ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  59097 cctttgatcatttaccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcttatgaaggatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaaca-tttctgcag 58999  T
Q  127 gcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactct 209  Q
    ||||||||||| | ||||||| |||| |   |||  | |||| | |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||    
T  58998 gcagagctgttatacttgtctcgtagtgcaaacacaagcagattcgtggaggtagtgattgtacaattgtactttgtcaactct 58915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Original strand, 35580 - 35836
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  35580 gttgagttcctttgatcatccaccattaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctgtgaaggattaacttcaaattcattcctatcttgaaggaaca-t 35678  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || | |    
T  35679 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaaagaa 35777  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||||||| || ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| | | ||||||||    
T  35778 ggacaagcacccagtgcttttcaaatgaacgttggtacctcccttttaatccttcgttc 35836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 20 - 228
Target Start/End: Original strand, 40546 - 40753
Alignment:
Q  20 ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatt 119  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  40546 ttgagttcctttgatcatccaccaataatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaaca-tt 40644  T
Q  120 tctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcag 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||    
T  40645 tctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataacgaag 40744  T
Q  220 gacaagtac 228  Q
    |||||||||    
T  40745 gacaagtac 40753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0410
Description:

Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 19 - 276
Target Start/End: Original strand, 15772 - 16027
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||  || | |||| ||||||||||  ||||||||||||| |    
T  15772 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcttgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttctaattcattcctttcttgaaggaaca-t 15870  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | || | |    
T  15871 ttctgcaggcagagatgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtaccttgtcaactct-tcaatgaa 15969  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgtt 276  Q
    ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15970 ggacaagcacccagtgcttttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgtt 16027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 7050 - 6798
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  7050 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtacaacttctgca 6951  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  6950 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 6851  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6850 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 6798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 148; Significance: 4e-78; HSPs: 4)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Original strand, 140847 - 141104
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtccttt-gaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaa 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  || | ||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  140847 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtccttttgaaggatcaacttcaaactcattcccatcttgaaggaaca- 140945  T
Q  118 tttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgc 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| | | || |     
T  140946 tttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtaaact-tttcaatga 141044  T
Q  218 aggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |||||||  || ||||||| || ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  141045 aggacaaacacccagtgctttttaaatgactgttgatacctcccttttaattcttcgttc 141104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Original strand, 127689 - 127945
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| |||||||||||||| |    
T  127689 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcgtttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaaca-t 127787  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | || | |    
T  127788 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttgtacttagtcaaatct-tcaatgaa 127886  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||||||| | || |||||||    
T  127887 ggacaagcacccagtgctttttaaatgaccgttgatacctcccttttaattattcgttc 127945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #3
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 27 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 7856 - 7632
Alignment:
Q  27 cctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcag 126  Q
    |||||||||||  |||| | ||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||  || |  |||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||    
T  7856 cctttgatcatttaccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaagcatcaagttcaaattcattcatatcttgaatgaaca-tttctgcag 7758  T
Q  127 gcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaag 225  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||  ||||    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||  |||| |||    
T  7757 gcagagctgttatacttgtcttgtagcgcagacacactcagagtcgtggaggtagtggttgtacaattgtactttgtcaactct-tcaacaaaggataag 7659  T
Q  226 tactcagtgctcttcaaatgaccgttg 252  Q
     || ||||||| ||||||||| |||||    
T  7658 cacccagtgcttttcaaatgaacgttg 7632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 215641 - 215569
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  215641 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacgaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 215569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0481 (Bit Score: 138; Significance: 4e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0481
Description:

Target: scaffold0481; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 13038 - 12795
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  13038 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttggttgtagtcctttgaagtatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaac-at 12940  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    || | || ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || |      
T  12939 tttttcatgcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaaagag 12841  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctcccttt 264  Q
    ||||||| || ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  12840 ggacaagcacccagtgcttttcaaatgaacgttggtacctcccttt 12795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0386 (Bit Score: 129; Significance: 8e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0386
Description:

Target: scaffold0386; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 12404 - 12656
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgca 125  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  12404 tcctttgattatccaccagtgattctttgcctgatttaggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 12503  T
Q  126 ggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaa 224  Q
    ||||  |||||||| ||||||||||| || |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  12504 ggcatggctgttgttttgtcttgtagagtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaa 12603  T
Q  225 gtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||| | || ||  |||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  12604 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttaaattcttcgttc 12656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0739 (Bit Score: 126; Significance: 5e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0739
Description:

Target: scaffold0739; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Original strand, 2037 - 2280
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||   || | ||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  2037 gttgagttcctttgatcattcaccattaatcttttgcctaatttgggtgtagtcctgtgacggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaaca-t 2135  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || | |    
T  2136 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgcagacaaaaatagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaaagaa 2234  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctcccttt 264  Q
    ||| | | || ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  2235 ggaaaggcacccagtgcttttcaaatgaacgttggtacctcccttt 2280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 26 - 265
Target Start/End: Original strand, 19290 - 19538
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtccttt-gaataatt-agcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctg 123  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |    
T  19290 tcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtccttttgaggaatttaacttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattcgg 19389  T
Q  124 c----aggcaga-gctgttgtcttgtcttgtagcgtgg--acaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacg 216  Q
         ||||| | | ||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  19390 tgtcgaggcataaggtgttgtcttgtcttgtagcgttggaacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaatg 19489  T
Q  217 caggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttc 265  Q
     ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  19490 aaggacaaatactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttc 19538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 25 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 17153 - 16912
Alignment:
Q  25 ttcctttgatcatccaccagt-aatcctttgcctgatttgggtgtag-tcctttgaataattagcttcaaa--ttcattcccatctt-gaaggaacaatt 119  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||  |||||||||||||| ||||| |||| |    
T  17153 ttcctttgatcattcaccagttaatcctttgcctgatttgggtgtaggtcctttgaggaattaacttcaaaatttcattcccatctttgaaggcacaaat 17054  T
Q  120 tc---tgc-aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgt-ggacaagaacagagtagtggaggtagt-ggttgtac-acttgtacttcgtcaactctgtt 212  Q
    ||   | | ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  17053 tcgtgtacgaggcataggtgttgtcttgtcttgtagcgttggacaaaaacagagtagtggaggtagtgggttgtactacttgtactttgtcaactctgtt 16954  T
Q  213 --aacgcaggacaagtactcagtgctctt-caaatgaccgtt 251  Q
      |||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||    
T  16953 aaaacgaaggacaaatactcagtgctattccaaatgaccgtt 16912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0105 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 3)
Name: scaffold0105
Description:

Target: scaffold0105; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Original strand, 8009 - 8262
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttga-aggaacaatttctgc 124  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||    
T  8009 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgc 8108  T
Q  125 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 223  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   | ||    
T  8109 aggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagaggca 8208  T
Q  224 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||| ||||||| | | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8209 agtgctcagtgttatccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttc 8262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0105; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 26 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 37166 - 36913
Alignment:
Q  26 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttga-aggaacaatttctgc 124  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||    
T  37166 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgc 37067  T
Q  125 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggaca 223  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   | ||    
T  37066 aggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagaggca 36967  T
Q  224 agtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||| ||||||| | | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36966 agtgctcagtgttatccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttc 36913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0105; HSP #3
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 41 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 47785 - 47547
Alignment:
Q  41 ccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttga-aggaacaatttctgcaggcagagctgttgt 139  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||   | |||| |||||||||||  ||||||||    
T  47785 ccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgcaggcatggctgttgt 47686  T
Q  140 cttgtcttgtagcgtggaca-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtactcagtgctct 238  Q
     |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   | ||||| ||||||| | |    
T  47685 tttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagaggcaagtgctcagtgttat 47586  T
Q  239 tcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
     || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47585 ccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttc 47547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0627 (Bit Score: 119; Significance: 8e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0627
Description:

Target: scaffold0627; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 119 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 8177 - 8019
Alignment:
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  8177 ttctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaa 8078  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |||||| ||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8077 ggacaaatactcagagctaaccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 8019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0163 (Bit Score: 116; Significance: 5e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0163
Description:

Target: scaffold0163; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Original strand, 29517 - 29707
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcct-ttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaa 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  || | ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29517 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctattgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaa 29616  T
Q  118 tttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactct 209  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29617 -ttctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 29707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 114; Significance: 7e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Original strand, 689 - 932
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||  || | ||||||| ||||||| |||||||||||||||     
T  689 gttgagtacctttgatcatccaccagtaatcttttgcttgatttggatgtagtcctatgaaggatcaacttcaaaatcattcctatcttgaaggaacaa- 787  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    |||| |||||||||||| | ||||||||||||| || |||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || | |    
T  788 ttctacaggcagagctgctatcttgtcttgtagtgtagacacgctcagagttgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaatgaa 886  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctcccttt 264  Q
    ||||||| || ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  887 ggacaagcacacagtgcttttcaaatgaacgttgacacctcccttt 932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Original strand, 5069 - 5312
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||  || | ||||||| ||||||| |||||||||||||||     
T  5069 gttgagtacctttgatcatccaccagtaatcttttgcttgatttggatgtagtcctatgaaggatcaacttcaaaatcattcctatcttgaaggaacaa- 5167  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    |||| |||||||||||| | ||||||||||||| || |||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || | |    
T  5168 ttctacaggcagagctgctatcttgtcttgtagtgtagacacgctcagagttgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaatgaa 5266  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctcccttt 264  Q
    ||||||| || ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  5267 ggacaagcacacagtgcttttcaaatgaacgttgacacctcccttt 5312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073 (Bit Score: 111; Significance: 5e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0073
Description:

Target: scaffold0073; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Original strand, 58344 - 58533
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||  || | ||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  58344 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttaggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaa- 58442  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactct 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||     || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  58443 ttctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacacttagggtcgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 58533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0752 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0752
Description:

Target: scaffold0752; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Original strand, 1863 - 2106
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||||  || | ||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  1863 gttgagttcctttgatcatctaccagtaatcttttgcctgatttggatatagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaa- 1961  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgca 218  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    ||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | || | |    
T  1962 ttctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggaggtagtggttgtacatttgtactttgtcaactct-tcaatgaa 2060  T
Q  219 ggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctcccttt 264  Q
    ||||| | || ||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||    
T  2061 ggacaggcacccagtgcttttcaaatgaacgttggcacctcccttt 2106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0752; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Original strand, 1248 - 1437
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||||  || | ||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  1248 gttgagttcctttgatcatctaccagtaatcttttgcctgatttggatatagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaa- 1346  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactct 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    ||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  1347 ttctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggaggtagtggttgtacatttgtactttgtcaactct 1437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0201 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0201
Description:

Target: scaffold0201; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 108 - 277
Target Start/End: Original strand, 7362 - 7530
Alignment:
Q  108 gaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaact 207  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7362 gaaggaaca-tttatgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgcagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaact 7460  T
Q  208 ctgttaacgcaggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||| ||| | |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  7461 ctgataaagaaggacaagcacccagtgcttttcaaatgaccgttgatacctccctttcaatttttcgttc 7530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0201; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 196
Target Start/End: Original strand, 19137 - 19174
Alignment:
Q  159 aagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgta 196  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  19137 aagaacagagtagtcgaggtagtggttgtacaattgta 19174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 104; Significance: 7e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 29010 - 28820
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  || | ||||||||||||||| ||||| |||||||||     
T  29010 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccaatcttaaaggaacaa- 28912  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggagg-tagtggttgtacacttgtacttcgtcaactct 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    ||| || || |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28911 ttctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtagaggatagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 28820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1477 (Bit Score: 99; Significance: 7e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold1477
Description:

Target: scaffold1477; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 139 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 1755 - 1617
Alignment:
Q  139 tcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtactcagtgctct 238  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| | ||||||||||||||||| |||    
T  1755 tcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctaataatgaaggacaagtactcagtgttct 1656  T
Q  239 tcaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  1655 tcaaatgaccgttgatacctcccttttaattcttcgttc 1617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0547 (Bit Score: 99; Significance: 7e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0547
Description:

Target: scaffold0547; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Original strand, 761 - 950
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||  || | ||||||||||||||| ||||||  |||||||     
T  761 gttgagttcctttgatcatccaccattaatcttttgcctgatttggatgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgtgggaacaa- 859  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactct 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  860 ttctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcaaggacacactcagggtcgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 91; Significance: 4e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 59504 - 59316
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||  || | ||||||||||||||| |||||||||| ||||     
T  59504 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctaatttaggtgtagtcctatgaaggatgaacttcaaattcattcctatcttgaagg-acaa- 59407  T
Q  119 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactct 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||    ||| || |||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  59406 ttctgcaggcagagctgttatcttgtcctgtagcgaggacacactcagggtcgtggagataatggttgtacacttgtactttgtcaactct 59316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 88 - 199
Target Start/End: Original strand, 143031 - 143142
Alignment:
Q  88 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgtcttgt-cttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 186  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||   | |||||||||||||||| | || | |||||||| | ||||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  143031 ttcaaatccattcccattgtgaaggaacatcgt-tgcaggcagagctgttttttttttcttgtagcatagacaaaaactaagtagtggaggtagtggttg 143129  T
Q  187 tacacttgtactt 199  Q
    |||||||||||||    
T  143130 tacacttgtactt 143142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 162 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 35230 - 35115
Alignment:
Q  162 aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccc 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||  |||||    
T  35230 aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaagtacttagttttctccaaatgaccgttgatgtctccc 35131  T
Q  262 tttcatttcttcgttc 277  Q
    ||||| ||||||||||    
T  35130 tttcaattcttcgttc 35115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 51 - 252
Target Start/End: Original strand, 61119 - 61318
Alignment:
Q  51 tttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgta 150  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  61119 tttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctttcttgaaggaaca-tttctgcaggcagagctgttatcttgtcttgta 61217  T
Q  151 gcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgt 250  Q
    |||| ||||  | |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | || | |||||||| || ||||||| ||| ||||| |||    
T  61218 gcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacaattgtactttgtcaactct-tcaatgaaggacaagcacccagtgcttttctaatgaacgt 61316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Original strand, 212321 - 212393
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  212321 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcatagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 212393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280 (Bit Score: 77; Significance: 9e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0280
Description:

Target: scaffold0280; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 27 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 18044 - 17861
Alignment:
Q  27 cctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcag 126  Q
    ||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  18044 cctttgatcattcaccattgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcatgttcaaatccattcctatcttgaaggaaca-tttctgcag 17946  T
Q  127 gcagagctgttg-tcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtacttcgtcaactct 209  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||| ||||  | |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  17945 gcagagctgtttatcttgtcttgtagcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacactttgtactttgtcaactct 17861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 2874 - 2802
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2874 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 2802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 30 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 20611 - 20432
Alignment:
Q  30 ttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggca 129  Q
    |||||||  ||||| | ||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| |||||||||||   |||||| ||||||    
T  20611 ttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggac--atttctacaggca 20514  T
Q  130 gagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtacttcgtcaactct 209  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  20513 gagctgtttttcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactttgtactttgtcaactct 20432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0655 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0655
Description:

Target: scaffold0655; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 51 - 206
Target Start/End: Original strand, 5014 - 5170
Alignment:
Q  51 tttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctg-ttgtcttgtcttgt 149  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| |||| ||| |  ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  5014 tttgcctgatttggatgttgtcctatgaagaatcatgttcaaatccattcctatcttgaaggaac-atttctgcaggcagagctgtttttcttgtcttgt 5112  T
Q  150 agcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtacttcgtcaac 206  Q
    ||||| ||||    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  5113 agcgtagacacacgcagagtcgtggaggtagtggttgtacactttgtactttgtcaac 5170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 38211 - 38120
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  || | ||||||||||||||| ||||||||    
T  38211 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaa 38120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 62; Significance: 8e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 30 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 6757 - 6577
Alignment:
Q  30 ttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggca 129  Q
    |||||||  ||||| | ||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| ||  |||||||||| ||||||||||||    
T  6757 ttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctattctgaaggaaca-tttctgcaggca 6659  T
Q  130 gagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt-gtacttcgtcaactct 209  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| || || | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  6658 gagctgtttttcttgtcttgtagcgtagaaaaaagcggagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtactttgtcaactct 6577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 51 - 209
Target Start/End: Original strand, 61629 - 61788
Alignment:
Q  51 tttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttg-tcttgtcttgt 149  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||  |||||||||||    
T  61629 tttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttt-tgtaggcagagctgtttatcttgtcttgt 61727  T
Q  150 agcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtacttcgtcaactct 209  Q
    ||||| ||||  | |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  61728 agcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacactttgtactttgtcaactct 61788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0422
Description:

Target: scaffold0422; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 88 - 209
Target Start/End: Original strand, 11695 - 11816
Alignment:
Q  88 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 186  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  11695 ttcaaatccattcctatcttgaaggatcaatt-ctgcaggcagagctgtttttcttatcttgtagcgtagacaa-aacagagtagtggaggtagtggttt 11792  T
Q  187 tacac-ttgtacttcgtcaactct 209  Q
    ||||| |||||||| |||||||||    
T  11793 tacactttgtactttgtcaactct 11816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0544 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0544
Description:

Target: scaffold0544; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 10005 - 9907
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaa 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| ||||  || | ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10005 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttagatgcagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaa 9907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0570 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0570
Description:

Target: scaffold0570; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 51 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 1886 - 1727
Alignment:
Q  51 tttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgt 149  Q
    ||||||||||||||  || ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| |||||||||||||| ||| |  ||||||||||||| | ||||||||||    
T  1886 tttgcctgatttggaagttgtcctatgaaggatcatgttcaaatccattcctatcttgaaggaacattttttt-aggcagagctgtttttcttgtcttgt 1788  T
Q  150 agcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt-gtacttcgtcaactct 209  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  1787 agcgtagacaaaagcagagtagtggaggtagtggttgtaaacttcgtactttgtcaactct 1727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 51 - 193
Target Start/End: Original strand, 7181 - 7324
Alignment:
Q  51 tttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgt 149  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  7181 tttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaact-tttctgcaggcagagctgtttttcttgtcttgt 7279  T
Q  150 agcgtggacaagaa-cagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  7280 agcgtagacaaaaaacagagaagtggaggtagtggtcgtacactt 7324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 30 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 38319 - 38157
Alignment:
Q  30 ttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggca 129  Q
    |||||||  ||||| | ||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| || |||| |||||| ||||||||||||    
T  38319 ttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggttgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctattttgatggaaca-tttctgcaggca 38221  T
Q  130 gagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||| | ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38220 gagctgtttttcttgtcttgtagcatagacaa-aacagagtagtggaggtagtggtcgtacactt 38157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1321 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold1321
Description:

Target: scaffold1321; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 30 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 1170 - 990
Alignment:
Q  30 ttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggca 129  Q
    |||||||  ||||| | ||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| ||  |||||||||| ||||||||||||    
T  1170 ttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacattcaaatccattcctattatgaaggaaca-tttctgcaggca 1072  T
Q  130 gagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt-gtacttcgtcaactct 209  Q
    || ||||| | |||||||||||| || ||||  | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  1071 gaactgtttttcttgtcttgtagagtagacataagcatagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtactttgtcaactct 990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1263 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold1263
Description:

Target: scaffold1263; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 30 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 1363 - 1183
Alignment:
Q  30 ttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggca 129  Q
    |||||||  ||||| | ||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| ||  |||||||||| ||||||||||||    
T  1363 ttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacattcaaatccattcctattatgaaggaaca-tttctgcaggca 1265  T
Q  130 gagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt-gtacttcgtcaactct 209  Q
    || ||||| | |||||||||||| || ||||  | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  1264 gaactgtttttcttgtcttgtagagtagacataagcatagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtactttgtcaactct 1183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0477 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0477
Description:

Target: scaffold0477; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 165 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 6278 - 6166
Alignment:
Q  165 agagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctcccttt 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   ||||||| |  |||||| | || ||  ||||||||||||||||||    
T  6278 agagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgcagagtgctttccatatatccgttgatacctcccttt 6179  T
Q  265 catttcttcgttc 277  Q
    || ||||||||||    
T  6178 caattcttcgttc 6166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 30 - 205
Target Start/End: Original strand, 16831 - 17007
Alignment:
Q  30 ttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggca 129  Q
    |||||||  ||||| | ||| ||||| |||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| ||  |||||||||| ||| ||||||||    
T  16831 ttgatcaatcaccaatgatcttttgcttgatttggttgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctattctgaaggaaca-tttatgcaggca 16929  T
Q  130 gagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt-gtacttcgtcaa 205  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  16930 gagctgtttttcttgtcttgtagcgtagacataaatagagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtactttgtcaa 17007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 117 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 165095 - 165018
Alignment:
Q  117 atttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  165095 atttctgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcgtagacataaacagagtagtggaggtagtggtcgtacactt 165018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 51 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 4110 - 3967
Alignment:
Q  51 tttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgt 149  Q
    |||||||||||||| ||| ||| | ||||  || |  ||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||||||| | ||||||||||    
T  4110 tttgcctgatttggatgttgtcttatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaact-tttctgcaggtagagctgtttttcttgtcttgt 4012  T
Q  150 agcgtggac-aagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    ||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  4011 agcgtagacgaaaaacagagaagtggaggtagtggtcgtacactt 3967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0906 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0906
Description:

Target: scaffold0906; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 4568 - 4468
Alignment:
Q  165 agagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctcccttt 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   ||||||| ||||||||| | || ||  ||||||  ||||||||||    
T  4568 agagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttggaacctcccttt 4469  T
Q  265 c 265  Q
    |    
T  4468 c 4468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0443
Description:

Target: scaffold0443; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 1218 - 1116
Alignment:
Q  51 tttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgta 150  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  1218 tttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaaca-tttctgcagacagagctgttatcttgtcttgta 1120  T
Q  151 gcgt 154  Q
    ||||    
T  1119 gcgt 1116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 88 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 15799 - 15694
Alignment:
Q  88 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 186  Q
    ||||||| |||||| ||  ||| |||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||| |    
T  15799 ttcaaatccattcctattctgagggaaca-tttctgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcgtagacataaacagagtagtggagatagtggtcg 15701  T
Q  187 tacactt 193  Q
    |||||||    
T  15700 tacactt 15694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Original strand, 7348 - 7420
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7348 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagggacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacactt 7420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 164 - 264
Target Start/End: Original strand, 22050 - 22149
Alignment:
Q  164 cagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctt 263  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||  |||||||| || ||||||| ||||||||| |||||| |||| ||||    
T  22050 cagagttgtggaggtagtggttgtacaattgtactttgtcaactct-tcaacaaaggacaagcacccagtgcttttcaaatgaacgttgacaccttcctt 22148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0471 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0471
Description:

Target: scaffold0471; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Original strand, 3271 - 3343
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3271 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagcagtggaggtagtggttgtacactt 3343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 17909 - 17837
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17909 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 17837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Original strand, 9122 - 9194
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  9122 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcatagacaaaaacacagtagtggagatagtggttgtacactt 9194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 27573 - 27501
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27573 tgcaggcagagctgtttttcttatcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 27501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 67
Target Start/End: Original strand, 16553 - 16601
Alignment:
Q  19 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtg 67  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  16553 gttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctaatttgggtg 16601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 25809 - 25737
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctg-ttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25809 tgcaggcagagctgcttttcttgtcttgtagtagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 25737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 139 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 34930 - 34876
Alignment:
Q  139 tcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    ||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34930 tcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 34876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0185 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0185
Description:

Target: scaffold0185; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 209
Target Start/End: Original strand, 9281 - 9352
Alignment:
Q  139 tcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtacttcgtcaactct 209  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  9281 tcttgtcttgtagcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacactttgtactttgtcaactct 9352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1331 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1331
Description:

Target: scaffold1331; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 88 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 1876 - 1771
Alignment:
Q  88 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 186  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||||| | | |||||||| ||||||| | |||||||||||||   ||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  1876 ttcaaatgcattcccattgtgaaggaacattgt-tgcaggcatagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagcagtgaaggtagtggttg 1778  T
Q  187 tacactt 193  Q
    |||||||    
T  1777 tacactt 1771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0859 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0859
Description:

Target: scaffold0859; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 122 - 188
Target Start/End: Original strand, 2951 - 3016
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgta 188  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||  |||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  2951 tgcaggcagagctgtttt-ttgtcttgtagcagggacaaaaatagagtagtggaggtagtggttgta 3016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0479 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0479
Description:

Target: scaffold0479; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 139 - 193
Target Start/End: Original strand, 9954 - 10008
Alignment:
Q  139 tcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    ||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9954 tcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 10008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 15884 - 15811
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt--cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||||||| |  |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15884 tgcaggcagagctgttttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 15811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 25544 - 25471
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt--cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||||||| |  |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25544 tgcaggcagagctgttttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 25471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 88 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 1974 - 1869
Alignment:
Q  88 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 186  Q
    ||||||| |||||| ||  ||| |||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| | | ||||  |||| |||||||||||||||||| |    
T  1974 ttcaaatccattcctattctgagggaaca-tttctgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtaacatagacataaacaaagtagtggaggtagtggtcg 1876  T
Q  187 tacactt 193  Q
    |||||||    
T  1875 tacactt 1869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0774 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0774
Description:

Target: scaffold0774; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 6426 - 6346
Alignment:
Q  171 gtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgcaggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttg 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || |  ||||||| || ||||||| ||||||||| |||||    
T  6426 gtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaatgagggacaagcacccagtgcttttcaaatgaacgttg 6346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 162 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 415 - 379
Alignment:
Q  162 aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtact 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  415 aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtact 379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0337 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0337
Description:

Target: scaffold0337; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Original strand, 14615 - 14687
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14615 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacactt 14687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0227 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0227
Description:

Target: scaffold0227; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 122 - 189
Target Start/End: Original strand, 22643 - 22711
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtac 189  Q
    ||||||||| |||||| | |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22643 tgcaggcagtgctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 22711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 3)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Original strand, 18998 - 19070
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||||||||   ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18998 tgcaggcagagctgtttttcttttcttgtagcagagacaaaaactgagtagtggaggtagtggttgtacactt 19070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 22275 - 22203
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  22275 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtactggagatagtggttgtacactt 22203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 125 - 193
Target Start/End: Original strand, 9530 - 9599
Alignment:
Q  125 aggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9530 aggcagagctgtttttcttgtcttgtagtagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 9599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Original strand, 1627 - 1699
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| ||||   ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1627 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttctagcagagacaaaaacaaagtagtggaggtagtggttgtacactt 1699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 21115 - 21043
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21115 tgcaggcaaagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 21043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 162 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 31887 - 31851
Alignment:
Q  162 aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtact 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31887 aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtact 31851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 3)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Original strand, 211365 - 211437
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  211365 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtagttgtatactt 211437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 162 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 244387 - 244356
Alignment:
Q  162 aacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  244387 aacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 244356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 377703 - 377630
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttg 194  Q
    ||||||||||| |||| || ||||||||||||   ||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  377703 tgcaggcagagttgttatccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttg 377630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 90199 - 90127
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  90199 tgcaggcaaagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtaggggttgtacactt 90127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 88 - 193
Target Start/End: Original strand, 7639 - 7742
Alignment:
Q  88 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttg 186  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||   | |||||||||||||||| | |||||||||||||   |||||  || |||||||||||||||||||||    
T  7639 ttcaaatccattcccattgtgaaggaacatcgt-tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaa--actgagtagtggaggtagtggttg 7735  T
Q  187 tacactt 193  Q
    |||||||    
T  7736 tacactt 7742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 36901 - 36847
Alignment:
Q  139 tcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    ||||||||||||||   ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36901 tcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtagaggtagtggttgtacactt 36847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 193
Target Start/End: Original strand, 42104 - 42158
Alignment:
Q  139 tcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    ||||||||||||||   ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42104 tcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtagaggtagtggttgtacactt 42158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 99331 - 99277
Alignment:
Q  139 tcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    ||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  99331 tcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 99277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 193
Target Start/End: Original strand, 37387 - 37441
Alignment:
Q  139 tcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    ||||||||||||||   ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37387 tcttgtcttgtagcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtggttgtacactt 37441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 193
Target Start/End: Original strand, 135447 - 135501
Alignment:
Q  139 tcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    ||||||||||||||   ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  135447 tcttgtcttgtagcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtggttgtacactt 135501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1359 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold1359
Description:

Target: scaffold1359; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 156 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 764 - 727
Alignment:
Q  156 gacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  764 gacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1359; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 1864 - 1827
Alignment:
Q  156 gacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1864 gacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 1827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0414 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0414
Description:

Target: scaffold0414; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 240 - 277
Target Start/End: Original strand, 2550 - 2587
Alignment:
Q  240 caaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2550 caaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 2587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0178 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0178
Description:

Target: scaffold0178; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 240 - 277
Target Start/End: Original strand, 27001 - 27038
Alignment:
Q  240 caaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27001 caaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 27038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0607 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0607
Description:

Target: scaffold0607; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 191
Target Start/End: Original strand, 5991 - 6043
Alignment:
Q  139 tcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 191  Q
    ||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5991 tcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacac 6043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0567 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0567
Description:

Target: scaffold0567; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Original strand, 9873 - 9945
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||||||| || |||| |||||||   || || |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9873 tgcaggcagagctgttttccttgttttgtagcagagataaaaacagagtagtgcaggtagtggttgtacactt 9945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0473 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0473
Description:

Target: scaffold0473; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 2815 - 2763
Alignment:
Q  141 ttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    ||||||||||||   ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2815 ttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagttagtggttgtacactt 2763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 964 - 893
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    ||||| |||||||||| || ||||||||||||   ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  964 tgcagacagagctgttatccttgtcttgtagcagagacaa-aacagagtagtggaagtagtggttgtacactt 893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Original strand, 9923 - 9995
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||||   ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9923 tgcaggcatagctgttatccttgtcttgtagcagcgacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacactt 9995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0065
Description:

Target: scaffold0065; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Original strand, 1657 - 1729
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  1657 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacacaaactaagtagtggaggtagtggttgtacactt 1729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 78510 - 78438
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    ||||||||||| |||| | |||||||||||||   ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  78510 tgcaggcagagttgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacatagtagtgtaggtagtggttgtacactt 78438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Original strand, 60770 - 60842
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||||||| | | ||||||||||    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  60770 tgcaggcagagctgtttttcatgtcttgtagaagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 60842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 122 - 188
Target Start/End: Original strand, 84362 - 84429
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgta 188  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  84362 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagtagagacaaaaactgagtagtggaggtagtggttgta 84429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1204 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1204
Description:

Target: scaffold1204; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 243 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 2424 - 2390
Alignment:
Q  243 atgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2424 atgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 2390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0861 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0861
Description:

Target: scaffold0861; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 5073 - 5019
Alignment:
Q  139 tcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  5073 tcttgtcttgtagcagggacaaaaacatggtaatggaggtagtggttgtacactt 5019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0226 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0226
Description:

Target: scaffold0226; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 19208 - 19175
Alignment:
Q  244 tgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttc 277  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19208 tgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc 19175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 87741 - 87672
Alignment:
Q  125 aggcagagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||| |||| || ||||||||||||   ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  87741 aggcagagttgttatcattgtcttgtagcagagacagaaacagagtagtggaagtagtggttgtacactt 87672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 166 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 980 - 948
Alignment:
Q  166 gagtagtggaggtagtggttgtacacttgtact 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  980 gagtagtggaggtagtggttgtacaattgtact 948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0439
Description:

Target: scaffold0439; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 6884 - 6812
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||| ||||||||||| | ||||| |||||||   ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6884 tgcatgcagagctgtttttcttgtgttgtagcagagacaaaaatagagtactggaggtagtggttgtacactt 6812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0364 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0364
Description:

Target: scaffold0364; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 166 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 10506 - 10474
Alignment:
Q  166 gagtagtggaggtagtggttgtacacttgtact 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10506 gagtagtggaggtagtggttgtacaattgtact 10474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 126 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 10248 - 10180
Alignment:
Q  126 ggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||    ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10248 ggcagagctgtttttcttgtcttgtagaagagacacaaacagagtagtggaggtagtggtcgtacactt 10180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 126 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 14912 - 14844
Alignment:
Q  126 ggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||    ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14912 ggcagagctgtttttcttgtcttgtagaagagacacaaacagagtagtggaggtagtggtcgtacactt 14844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 5469 - 5397
Alignment:
Q  122 tgcaggcagagctgttgtc-ttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 193  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||||   |||||   |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5469 tgcaggcagagctgttatccttttcttgtagcagagacaaactcagagtagtggaagtagtggttgtacactt 5397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 162 - 198
Target Start/End: Original strand, 144913 - 144949
Alignment:
Q  162 aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtact 198  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  144913 aacagagtagtggaggtagtggatgtacaattgtact 144949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University