View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF21397_high_21 (Length: 305)

Name: NF21397_high_21
Description: NF21397
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF21397_high_21
NF21397_high_21
[»] chr6 (15 HSPs)
chr6 (18-294)||(8315445-8315720)
chr6 (38-294)||(27552072-27552326)
chr6 (38-294)||(17886810-17887061)
chr6 (18-235)||(8319984-8320199)
chr6 (38-235)||(17096236-17096431)
chr6 (38-235)||(17895685-17895881)
chr6 (38-235)||(14531749-14531945)
chr6 (21-235)||(17779914-17780128)
chr6 (46-236)||(27574708-27574885)
chr6 (131-294)||(17163566-17163730)
chr6 (80-196)||(6440865-6440979)
chr6 (227-290)||(8855275-8855339)
chr6 (130-168)||(7888212-7888250)
chr6 (228-261)||(3597592-3597625)
chr6 (131-172)||(17159659-17159700)
[»] chr3 (16 HSPs)
chr3 (18-290)||(21850144-21850417)
chr3 (18-237)||(21847107-21847327)
chr3 (80-294)||(54167344-54167560)
chr3 (38-235)||(9697586-9697783)
chr3 (38-235)||(11004365-11004560)
chr3 (38-236)||(43547722-43547920)
chr3 (38-235)||(9105275-9105470)
chr3 (80-236)||(54171924-54172082)
chr3 (156-294)||(43554233-43554371)
chr3 (38-157)||(43554645-43554764)
chr3 (80-235)||(39399127-39399279)
chr3 (52-174)||(755889-756012)
chr3 (227-292)||(53353126-53353191)
chr3 (80-188)||(38175790-38175896)
chr3 (227-258)||(1299044-1299075)
chr3 (130-163)||(755824-755857)
[»] chr7 (12 HSPs)
chr7 (18-294)||(27761338-27761613)
chr7 (18-235)||(22901154-22901371)
chr7 (80-294)||(7940083-7940299)
chr7 (20-229)||(47419521-47419729)
chr7 (18-235)||(27756846-27757062)
chr7 (38-235)||(7466485-7466669)
chr7 (38-236)||(35705633-35705830)
chr7 (80-235)||(7944636-7944793)
chr7 (42-166)||(733632-733756)
chr7 (61-294)||(13828087-13828321)
chr7 (212-261)||(22580901-22580948)
chr7 (124-205)||(37355589-37355670)
[»] chr2 (10 HSPs)
chr2 (18-294)||(8055333-8055607)
chr2 (80-294)||(36674992-36675208)
chr2 (38-235)||(12999426-12999622)
chr2 (18-235)||(8050839-8051054)
chr2 (80-236)||(36670502-36670660)
chr2 (18-235)||(6463379-6463583)
chr2 (124-294)||(35950486-35950654)
chr2 (71-235)||(13270980-13271131)
chr2 (80-235)||(41093824-41093976)
chr2 (80-168)||(34590280-34590366)
[»] chr5 (22 HSPs)
chr5 (38-294)||(26336767-26337023)
chr5 (80-294)||(12023230-12023446)
chr5 (80-294)||(7099374-7099590)
chr5 (80-294)||(16798610-16798826)
chr5 (18-235)||(30695293-30695509)
chr5 (21-294)||(40367555-40367816)
chr5 (38-235)||(32485947-32486143)
chr5 (38-235)||(19502307-19502504)
chr5 (80-294)||(37681977-37682182)
chr5 (80-235)||(12018731-12018888)
chr5 (80-235)||(7103943-7104100)
chr5 (80-235)||(16794108-16794265)
chr5 (38-235)||(36632314-36632497)
chr5 (48-235)||(43384945-43385138)
chr5 (124-294)||(10277145-10277313)
chr5 (91-235)||(40371750-40371892)
chr5 (52-186)||(20830304-20830437)
chr5 (80-235)||(37658732-37658878)
chr5 (124-235)||(10274546-10274655)
chr5 (111-186)||(20808675-20808749)
chr5 (21-69)||(40371693-40371742)
chr5 (227-262)||(26454406-26454441)
[»] chr4 (19 HSPs)
chr4 (18-236)||(31670089-31670306)
chr4 (38-294)||(8892582-8892837)
chr4 (80-294)||(44151499-44151715)
chr4 (38-294)||(50627904-50628146)
chr4 (38-236)||(53722006-53722202)
chr4 (38-235)||(10317025-10317220)
chr4 (38-235)||(27186142-27186341)
chr4 (80-235)||(3770842-3770999)
chr4 (80-235)||(44147023-44147180)
chr4 (38-228)||(43683636-43683813)
chr4 (80-294)||(31359093-31359303)
chr4 (38-137)||(35842843-35842942)
chr4 (80-235)||(41884925-41885076)
chr4 (80-236)||(49274517-49274669)
chr4 (138-235)||(31354678-31354772)
chr4 (51-200)||(53785880-53786028)
chr4 (130-171)||(45976222-45976263)
chr4 (156-207)||(35842797-35842847)
chr4 (227-255)||(1834087-1834115)
[»] scaffold0440 (2 HSPs)
scaffold0440 (80-294)||(2921-3137)
scaffold0440 (80-294)||(7447-7662)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (80-294)||(44865-45081)
scaffold0044 (80-235)||(49445-49602)
[»] chr8 (18 HSPs)
chr8 (80-294)||(197684-197900)
chr8 (80-294)||(312521-312737)
chr8 (21-235)||(28644562-28644775)
chr8 (18-294)||(30405761-30406019)
chr8 (38-235)||(33071918-33072113)
chr8 (38-235)||(42234656-42234851)
chr8 (80-294)||(43807485-43807699)
chr8 (18-235)||(30410270-30410486)
chr8 (80-236)||(202202-202360)
chr8 (80-236)||(317039-317197)
chr8 (133-294)||(41949743-41949902)
chr8 (38-235)||(38757003-38757186)
chr8 (80-235)||(43812044-43812199)
chr8 (222-294)||(1291265-1291337)
chr8 (137-235)||(41945339-41945434)
chr8 (55-294)||(27435169-27435397)
chr8 (228-294)||(17782356-17782422)
chr8 (247-294)||(31473324-31473371)
[»] chr1 (7 HSPs)
chr1 (38-294)||(43591783-43592037)
chr1 (18-294)||(26315954-26316216)
chr1 (18-235)||(39793831-39794046)
chr1 (21-235)||(16588422-16588635)
chr1 (18-235)||(26311522-26311725)
chr1 (80-236)||(10504435-10504588)
chr1 (227-290)||(30647310-30647373)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (131-233)||(60201-60302)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 15)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 18 - 294
Target Start/End: Original strand, 8315445 - 8315720
Alignment:
Q  18 tctttattgattctacattcaaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctagatc 117  Q
    ||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8315445 tctttattgattctacatatgaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatc 8315544  T
Q  118 ttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgtgattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttg 217  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8315545 ttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgtgattaaccactgattgtgattatcact-aaactaaacttg 8315643  T
Q  218 aattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaaacttctgagcttgatga 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8315644 aattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaaacttctgagcttgatga 8315720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 38 - 294
Target Start/End: Original strand, 27552072 - 27552326
Alignment:
Q  38 aaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaaca 137  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  27552072 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacgtttaaca 27552171  T
Q  138 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgtgattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacatc 237  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27552172 aacctgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa-atgtgattaaccactgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaacatc 27552269  T
Q  238 ctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaaacttctgagcttgatga 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27552270 ctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaagcttctgagcttgatga 27552326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 38 - 294
Target Start/End: Original strand, 17886810 - 17887061
Alignment:
Q  38 aaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaaca 137  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17886810 aaaaaatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagctgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgctaacctctaaca 17886909  T
Q  138 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgtgattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacatc 237  Q
    |||||       |||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17886910 aacttt------actttataacaaactaaaacaaaat-gtgattaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacatc 17887002  T
Q  238 ctcccttaattcaagtttc--cacttccttcattccaatcaaacttctgagcttgatga 294  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17887003 ctcccttaattcaagtttccacacttccttcattccaatcaagcttctgagcttgatga 17887061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Original strand, 8319984 - 8320199
Alignment:
Q  18 tctttattgattctacattcaaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctagatc 117  Q
    ||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8319984 tctttattgattctacataagaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagtttcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatc 8320083  T
Q  118 ttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgtgattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttg 217  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8320084 ttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacata-ttgtgattaaccactgattgtgattatcact-aaactaaacttg 8320181  T
Q  218 aattaaaacaaactaaca 235  Q
    ||||||||||||||||||    
T  8320182 aattaaaacaaactaaca 8320199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Original strand, 17096236 - 17096431
Alignment:
Q  38 aaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaaca 137  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17096236 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactatagatcttatctgctaacctctaaca 17096335  T
Q  138 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgtgattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17096336 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa-atgtgattaatcactgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 17096431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Original strand, 17895685 - 17895881
Alignment:
Q  38 aaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaaca 137  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  17895685 aaaaaatacaaaggaggtagcttatatacaatgcctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaattctagatcttatttgctaacctctaaca 17895784  T
Q  138 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgtgattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 235  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17895785 aacttgtaacaaacttcagaacaaactaaaataaa-atgtgattaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 17895881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Original strand, 14531749 - 14531945
Alignment:
Q  38 aaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaaca 137  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14531749 aaaatatacaaaggtggtagagtatatacaatgtctagctaagttgcttcaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgctaacctctaaca 14531848  T
Q  138 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgtgattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 235  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14531849 aacctgtaacaaacttcataacgaactaaaacaaa-atgtgattaatcattgattgtgattataactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 14531945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 21 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 17780128 - 17779914
Alignment:
Q  21 ttattgattctacattc-aaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctagatctt 119  Q
    ||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  17780128 ttattgattctacatacgaaaatgtacaaaggagatagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaaatctt 17780029  T
Q  120 atctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgtgattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaa 219  Q
    |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17780028 atctactagcctctaacaaacttttaacaaacttcataacaaactaaaacaaa-atgtgattaatctctgattgtgattatcact-aaactaaacttgaa 17779931  T
Q  220 tt-aaaacaaactaaca 235  Q
    || ||||||||||||||    
T  17779930 ttcaaaacaaactaaca 17779914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 46 - 236
Target Start/End: Original strand, 27574708 - 27574885
Alignment:
Q  46 caaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaacaaacttgta 145  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||           ||    
T  27574708 caaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactttagatcttatctgctaacctc-----------ta 27574796  T
Q  146 acaaacttcataacaaactaaaacaaacttgtgattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27574797 acaaacttcataacaaactaaaacaaa-atgtgattaaccactgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 27574885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 131 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 17163730 - 17163566
Alignment:
Q  131 tctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgtgattaacca-ctgattgtgattatcactaaaactaaacttgaatta--aaaca 227  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| || || || ||   ||| ||||||||  ||||||||||||||  ||  |    
T  17163730 tctaaccaacttgtaacaaacttcaaaacaaactaaaacaaagt-gtgatcaatcaactaatcacgatcatcactaat-ctaaacttgaattatcaacta 17163633  T
Q  228 aactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaaacttctgagcttgatga 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  17163632 aactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcataccaatcaagcttctgagcttgatga 17163566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 80 - 196
Target Start/End: Original strand, 6440865 - 6440979
Alignment:
Q  80 gttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgtga 179  Q
    ||||||||||| |||| | | ||||||||| ||| | |||||  ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || | ||  |||||    
T  6440865 gttgcttgaagtacaagctaagtaacaaacccta-accttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaaattcataacaaactgaatctaa-atgtga 6440962  T
Q  180 ttaaccactgattgtga 196  Q
    ||||||||| |||||||    
T  6440963 ttaaccactaattgtga 6440979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 227 - 290
Target Start/End: Original strand, 8855275 - 8855339
Alignment:
Q  227 aaactaacatcctcccttaattcaagttt-ccacttccttcattccaatcaaacttctgagcttg 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||  | |  |||||||||||| ||||||||||||    
T  8855275 aaactaacatcctcccttaattcaagttttccaacttcaccattccaatcaagcttctgagcttg 8855339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 130 - 168
Target Start/End: Original strand, 7888212 - 7888250
Alignment:
Q  130 ctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaa 168  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7888212 ctctaacaaagttgtaacaaacttcaaaacaaactaaaa 7888250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 228 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 3597625 - 3597592
Alignment:
Q  228 aactaacatcctcccttaattcaagtttccactt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3597625 aactaacatcctcccttaattcaagtttcaactt 3597592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 17159700 - 17159659
Alignment:
Q  131 tctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa 172  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  17159700 tctaaccaacttgtaacaaacgtcaaaacaaactaaaacaaa 17159659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 223; Significance: 1e-123; HSPs: 16)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 18 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 21850417 - 21850144
Alignment:
Q  18 tctttattgattctacattcaaaa-tatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctagat 116  Q
    ||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21850417 tctttattgattctatatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagat 21850318  T
Q  117 cttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgtgattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaactt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21850317 cttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaac-tgtgattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaactt 21850219  T
Q  217 gaatt-aaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaaacttctgagcttg 290  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  21850218 gaattaaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaataaagcttctgagcttg 21850144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 18 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 21847327 - 21847107
Alignment:
Q  18 tctttattgattctacattcaaaa-tatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctagat 116  Q
    ||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21847327 tctttattgattctatatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagat 21847228  T
Q  117 cttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgtgattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaactt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21847227 cttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaac-tgtgattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaactt 21847129  T
Q  217 gaatt-aaaacaaactaacatc 237  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  21847128 gaattaaaaacaaactaacatc 21847107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 80 - 294
Target Start/End: Original strand, 54167344 - 54167560
Alignment:
Q  80 gttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctagatc--ttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 177  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||   |  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54167344 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacacccttatttggtaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 54167443  T
Q  178 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaa 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54167444 gattaaccactgattgtgattatcactgaaactaaacttgaattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaa 54167543  T
Q  278 acttctgagcttgatga 294  Q
    |||||||||||||||||    
T  54167544 acttctgagcttgatga 54167560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 9697783 - 9697586
Alignment:
Q  38 aaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaaca 137  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9697783 aaaatatacaaaggaggcagcttatatacaatgtctagctaagtttcttgaagcacaagcaatgttacaaactctagatcttatttgctaacctctaaca 9697684  T
Q  138 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgtgattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9697683 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaaacaaaatgtgattaatcactaattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 9697586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Original strand, 11004365 - 11004560
Alignment:
Q  38 aaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaaca 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11004365 aaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaggttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctagatcttatttgctaacctctaaca 11004464  T
Q  138 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgtgattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 235  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11004465 aacttgtaacaatcttcataacaagctaaaacaaa-atgtgattattcactgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 11004560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 38 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 43547920 - 43547722
Alignment:
Q  38 aaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaaca 137  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  43547920 aaaatatacaaaggagatagcttatatacaatgtcttgctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgttaacctctaaca 43547821  T
Q  138 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgtgattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43547820 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaaacaaaatgtaattaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaagctaacat 43547722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 9105470 - 9105275
Alignment:
Q  38 aaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaaca 137  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  9105470 aaaatatacaaaggaggtagctcatatacaatgtctagttaggttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgttaacctctaaca 9105371  T
Q  138 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgtgattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 235  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9105370 aacttgtaacatacttcataacaaactaaagcaaa-atgtgattaatcattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 9105275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 80 - 236
Target Start/End: Original strand, 54171924 - 54172082
Alignment:
Q  80 gttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctag--atcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 177  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||   | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54171924 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 54172023  T
Q  178 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54172024 gattaaccactgattgtgattatcactgaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 54172082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 156 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 43554371 - 43554233
Alignment:
Q  156 taacaaactaaaacaaacttgtgattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagttt 255  Q
    |||||||||||||  ||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  43554371 taacaaactaaaaacaaaatgtgactaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacatctccccttaattcaagttt 43554272  T
Q  256 ccacttccttcattccaatcaaacttctgagcttgatga 294  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  43554271 ccacttccttcattcaaatcaagcttctgagcttgatga 43554233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 38 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 43554764 - 43554645
Alignment:
Q  38 aaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaaca 137  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  43554764 aaaatatacaaaagaggtagctcatatacaatgtcttactaagttgcttgaaacagaagcaatgtaataaactctagatcttatttgttaacctctaaca 43554665  T
Q  138 aacttgtaacaaacttcata 157  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  43554664 aacttgtaacaaacttcata 43554645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 80 - 235
Target Start/End: Original strand, 39399127 - 39399279
Alignment:
Q  80 gttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgtga 179  Q
    ||||||||||| |||| | | ||||||||| ||| | |||||  ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || | || | ||||    
T  39399127 gttgcttgaagtacaagctaagtaacaaacccta-accttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaaattcataacaaactgaatctaaat-gtga 39399224  T
Q  180 ttaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 235  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39399225 ttaaccactaattgtgattatcactaaa-ctaaacttgaattaaaacaaactaaca 39399279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 52 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 756012 - 755889
Alignment:
Q  52 aggtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctaga-tcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaa 150  Q
    ||||||||||||||||   ||||| || || ||||||||||||| ||||||||||||| |||   | ||||  | ||  |||||||||||||||||||||    
T  756012 aggtagcttatatacaccatctagttaggtagcttgaagcacaagcaatgtaacaaaccctaaccttttattagttacactctaacaaacttgtaacaaa 755913  T
Q  151 cttcataacaaactaaaacaaact 174  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  755912 cttcaaaacaaactaaaacaaact 755889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 227 - 292
Target Start/End: Original strand, 53353126 - 53353191
Alignment:
Q  227 aaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaaacttctgagcttgat 292  Q
    |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  53353126 aaactagcatcctctcttaatttaagtttccacttccttcatgccaatcaagcttctgagcttgat 53353191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 80 - 188
Target Start/End: Original strand, 38175790 - 38175896
Alignment:
Q  80 gttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgtga 179  Q
    ||||||||||| |||| | | ||||||||| ||| |||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||  |||||    
T  38175790 gttgcttgaagtacaagctaagtaacaaacccta-atcttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaaattcataacaaactgaaactaa-atgtga 38175887  T
Q  180 ttaaccact 188  Q
    |||||||||    
T  38175888 ttaaccact 38175896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 227 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 1299075 - 1299044
Alignment:
Q  227 aaactaacatcctcccttaattcaagtttcca 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1299075 aaactaacatcctcccttaattcaagtttcca 1299044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 755857 - 755824
Alignment:
Q  130 ctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaac 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  755857 ctctaacaaacttgtaacaaacttcaaaacaaac 755824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 218; Significance: 1e-120; HSPs: 12)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 18 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 27761613 - 27761338
Alignment:
Q  18 tctttattgattctacat-tcaaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctagat 116  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27761613 tctttattgattctacatataaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagat 27761514  T
Q  117 cttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgtgattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaactt 216  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27761513 cttatctacaaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaga-atgtgattaaccactgattgtgattatcact-aaactaaactt 27761416  T
Q  217 gaattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaaacttctgagcttgatga 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27761415 gaattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaagcttctgagcttgatga 27761338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22901371 - 22901154
Alignment:
Q  18 tctttattgattctacattcaaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctagatc 117  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22901371 tctttattgattctacatacaaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatc 22901272  T
Q  118 ttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgtgattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22901271 ttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgtgattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttt 22901172  T
Q  218 aattaaaacaaactaaca 235  Q
    ||||||||||||||||||    
T  22901171 aattaaaacaaactaaca 22901154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 80 - 294
Target Start/End: Original strand, 7940083 - 7940299
Alignment:
Q  80 gttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctag--atcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 177  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||   | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7940083 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 7940182  T
Q  178 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaa 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7940183 gattaaccactgattgtgattatcactgaaactaaacttgaattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaa 7940282  T
Q  278 acttctgagcttgatga 294  Q
     ||||||||||||||||    
T  7940283 gcttctgagcttgatga 7940299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 20 - 229
Target Start/End: Original strand, 47419521 - 47419729
Alignment:
Q  20 tttattgattctacattc-aaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctagatct 118  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  47419521 tttattgattctacatacgaaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaaacacaaacaatgtaacaaactctagatat 47419620  T
Q  119 tatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgtgattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttga 218  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47419621 tatctgctaacctctaagaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa-atgtgattaaccactgattgtgattatcact-aaactaaacttga 47419718  T
Q  219 attaaaacaaa 229  Q
    |||||||||||    
T  47419719 attaaaacaaa 47419729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 27757062 - 27756846
Alignment:
Q  18 tctttattgattctacat-tcaaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctagat 116  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27757062 tctttattgattctacatataaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagat 27756963  T
Q  117 cttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgtgattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaactt 216  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27756962 cttatctacaaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaga-atgcgattaaccactgattgtgattatcact-aaactaaactt 27756865  T
Q  217 gaattaaaacaaactaaca 235  Q
    |||||||||||||||||||    
T  27756864 gaattaaaacaaactaaca 27756846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Original strand, 7466485 - 7466669
Alignment:
Q  38 aaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaaca 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7466485 aaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctagatcttatttgctaacctctaaca 7466584  T
Q  138 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgtgattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 235  Q
    ||||||            |||||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7466585 aacttg------------taacaaactaaaacaaa-atgtgattaatcattgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 7466669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 38 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 35705830 - 35705633
Alignment:
Q  38 aaaatatacaaagga-ggtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaac 136  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35705830 aaaatatacaaagaaaggtagcttatatacaatgtctagctg-gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgctaacctctaac 35705732  T
Q  137 aaacttgtaacaaacttcat-aacaaactaaaacaaacttgtgattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 235  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35705731 aaacttgtaacaaactccataaacaaactaaaacaaa-atgtgattaatcactgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 35705634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 80 - 235
Target Start/End: Original strand, 7944636 - 7944793
Alignment:
Q  80 gttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctag--atcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 177  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||   | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7944636 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 7944735  T
Q  178 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7944736 gattaaccactgattgtgattatcactgaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 7944793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 42 - 166
Target Start/End: Original strand, 733632 - 733756
Alignment:
Q  42 tatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaacaaact 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  733632 tatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgctcgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgctaacctctaacaaaat 733731  T
Q  142 tgtaacaaacttcataacaaactaa 166  Q
    ||||||||| |||||||||||||||    
T  733732 tgtaacaaatttcataacaaactaa 733756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 61 - 294
Target Start/End: Original strand, 13828087 - 13828321
Alignment:
Q  61 atatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataaca 160  Q
    ||||||| | ||||| || || ||||||||||||| |||||||||| || |||  | ||||  | ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13828087 atatacactatctagttaggtagcttgaagcacaagcaatgtaacagaccctaactattattagatacactctaacaaacttgtaacaaacttcagaaca 13828186  T
Q  161 aactaaaacaaacttgtgattaacca-ctgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaa-aacaa-actaacatcctcccttaattcaagtttcc 257  Q
    ||| |||  ||| | ||||||||||| || |   |||||||||||||   |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13828187 aacaaaatgaaaat-gtgattaaccaactaaacatgattatcactaagg-taaacttgaattaacaactagactaacatcctcccttaattcaagtttcc 13828284  T
Q  258 acttccttcattccaatcaaacttctgagcttgatga 294  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13828285 acttccttcatgccaatcaaacttctgagcttgatga 13828321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 212 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 22580948 - 22580901
Alignment:
Q  212 aacttgaattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccactt 261  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22580948 aacttgaattaa--caaactaacatcctcccttaattcaagtttccactt 22580901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 37355670 - 37355589
Alignment:
Q  124 gctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgtgattaaccactgattgtgattatcacta 205  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||   | |||||||||||| | ||||||||||||||    
T  37355670 gctaatctctaagaaacttgtaacaactttcataacaaactaaagcaataatatgattaaccactaagtgtgattatcacta 37355589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 10)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 18 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 8055607 - 8055333
Alignment:
Q  18 tctttattgattctacattcaaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctagatc 117  Q
    ||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8055607 tctttattgattctacatatgaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatc 8055508  T
Q  118 ttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgtgattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttg 217  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8055507 ttatctactaacctctaacaaacttgcaacaaacttcataacaaactaaaataga-atgtgattaaccactgattgtgattatcact-aaactaaacttg 8055410  T
Q  218 aattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaaacttctgagcttgatga 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8055409 aattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaagcttctgagcttgatga 8055333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 80 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 36675208 - 36674992
Alignment:
Q  80 gttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctag--atcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 177  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||   | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36675208 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 36675109  T
Q  178 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaa 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36675108 gattaaccactgattgtgattatcactgaaactaaacttgaattaaaacaaactaacatcctcccgtaattcaagtttccacttccttcattccaatcaa 36675009  T
Q  278 acttctgagcttgatga 294  Q
     ||||||||||||||||    
T  36675008 gcttctgagcttgatga 36674992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Original strand, 12999426 - 12999622
Alignment:
Q  38 aaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaaca 137  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12999426 aaaatatacaaaggagatagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaagtaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaaca 12999525  T
Q  138 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgtgattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12999526 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa-atgtgattaaccactgattgttattatcactaaaactaaacttaaattaaaacaaactaaca 12999622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 8051054 - 8050839
Alignment:
Q  18 tctttattgattctacattcaaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctagatc 117  Q
    ||||||||||||||||||   |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8051054 tctttattgattctacatatgaaatgtacaaaggaggcagcttatatacaatatctagctaggttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatc 8050955  T
Q  118 ttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgtgattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttg 217  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8050954 ttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaataga-atgtgattaaccactgattgtgattatcact-aaactaaacttg 8050857  T
Q  218 aattaaaacaaactaaca 235  Q
    ||||||||||||||||||    
T  8050856 aattaaaacaaactaaca 8050839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 80 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 36670660 - 36670502
Alignment:
Q  80 gttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctag--atcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 177  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||   | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36670660 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 36670561  T
Q  178 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36670560 gattaaccactgattgtgattatcactgaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 36670502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Original strand, 6463379 - 6463583
Alignment:
Q  18 tctttattgattctacattc-aaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctagat 116  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6463379 tctttattgattctacatactaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaggttgcttgaagcacaaataatgtaacaaactctagat 6463478  T
Q  117 cttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgtgattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaactt 216  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||            |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6463479 cttatctactaacctctaacaaacttg------------taacaaactaaaacaaa-atgtgattaaccactgattgtgattatcact-aaactaaactt 6463564  T
Q  217 gaattaaaacaaactaaca 235  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  6463565 gaattaagacaaactaaca 6463583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 124 - 294
Target Start/End: Original strand, 35950486 - 35950654
Alignment:
Q  124 gctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgtgattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaa 223  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || | || | ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35950486 gctaatctctaactaacttgtaacaaaattcataacaaactgaacctaaat-gtgattaaccactaattgtgattatcactaaa-ctaaacttgaattaa 35950583  T
Q  224 aacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaaacttctgagcttgatga 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  35950584 aacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaagcttctaagcttgatga 35950654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 71 - 235
Target Start/End: Original strand, 13270980 - 13271131
Alignment:
Q  71 tctagctaagttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaaca 170  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||            |||||||||||||| |    
T  13270980 tctagctaagttgcttgaagcaaaaacaatgtaacaaactttagatcttatttactaacctctaacaaactt------------ataacaaactaaaata 13271067  T
Q  171 aacttgtgattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 235  Q
    ||  ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13271068 aa-gtgtaattaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 13271131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 80 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 41093976 - 41093824
Alignment:
Q  80 gttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgtga 179  Q
    ||||||||||| |||| | | ||||||||| ||| | |||||  ||||| ||||||| || |||||||||| ||||||||||||| || | || |  |||    
T  41093976 gttgcttgaagtacaagctaagtaacaaacccta-accttatgagctaatctctaactaatttgtaacaaaattcataacaaactgaatctaaata-tga 41093879  T
Q  180 ttaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 235  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  41093878 ttaatcactaattgtgattatcact-aaactaaatttgaattaaaacaaaccaaca 41093824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 80 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 34590366 - 34590280
Alignment:
Q  80 gttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaa 168  Q
    ||||||| |||||||| | || |||||||| |||  ||| || |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34590366 gttgcttaaagcacaagctatataacaaaccctaactct-atatgctaatctctaacaaacttgtaacaaa-ttcataacaaactaaaa 34590280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 22)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 38 - 294
Target Start/End: Original strand, 26336767 - 26337023
Alignment:
Q  38 aaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaaca 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26336767 aaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagttaagttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctagatcttatttgctaacctctaaca 26336866  T
Q  138 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgtgattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacatc 237  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||  ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26336867 aacatgtaacaaacatcataacaaactaaaaacaaaatgtgattaatcaccgattgtgattatcactaaaattaaacttgaattaaaacaaactaacatc 26336966  T
Q  238 ctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaaacttctgagcttgatga 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26336967 ctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaagcttctgagcttgatga 26337023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 80 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 12023446 - 12023230
Alignment:
Q  80 gttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctag--atcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 177  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||   | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12023446 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 12023347  T
Q  178 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaa 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12023346 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaa 12023247  T
Q  278 acttctgagcttgatga 294  Q
     ||||||||||||||||    
T  12023246 gcttctgagcttgatga 12023230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 80 - 294
Target Start/End: Original strand, 7099374 - 7099590
Alignment:
Q  80 gttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctag--atcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 177  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||   | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7099374 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 7099473  T
Q  178 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaa 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7099474 gattaaccactgattgtgattatcactgaaactaaacttgaattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaa 7099573  T
Q  278 acttctgagcttgatga 294  Q
     ||||||||||||||||    
T  7099574 gcttctgagcttgatga 7099590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 80 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 16798826 - 16798610
Alignment:
Q  80 gttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctag--atcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 177  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||   | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16798826 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 16798727  T
Q  178 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaa 277  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16798726 gattaaccacttattgtgattatcactgaaactaaacttgaattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaa 16798627  T
Q  278 acttctgagcttgatga 294  Q
     ||||||||||||||||    
T  16798626 gcttctgagcttgatga 16798610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 30695509 - 30695293
Alignment:
Q  18 tctttattgattctacattc-aaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctagat 116  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30695509 tctttattgattctacatacgaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagat 30695410  T
Q  117 cttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgtgattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaactt 216  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30695409 cttatatactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa-atgtgattaaccactgattgtgattatcact-aaactaaactt 30695312  T
Q  217 gaattaaaacaaactaaca 235  Q
    |||||||||||||||||||    
T  30695311 gaattaaaacaaactaaca 30695293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 21 - 294
Target Start/End: Original strand, 40367555 - 40367816
Alignment:
Q  21 ttattgattctacat-tcaaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagtt-gcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctagatct 118  Q
    ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40367555 ttattgattctacatatgaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctaaccaagtttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatct 40367654  T
Q  119 tatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgtgattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttga 218  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||            |||||||| | |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40367655 tatctactagcctctaacaaacttgtaacaaact------------aaaacaaaat-gtgattaatctctgattgtgattatcactaaa-ctaaacttga 40367740  T
Q  219 attaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaaacttctgagcttgatga 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40367741 attaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaagcttctgagcttgatga 40367816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Original strand, 32485947 - 32486143
Alignment:
Q  38 aaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaaca 137  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32485947 aaaatatataaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaaggaggttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgctaacctctaaca 32486046  T
Q  138 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgtgattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32486047 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa-atgtgattaatcattgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 32486143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 19502504 - 19502307
Alignment:
Q  38 aaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaaca 137  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  19502504 aaaatatataaaggaggtagcttatatacaatgtttagctaagttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctatatcttattttctaacctctaaca 19502405  T
Q  138 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgtga-ttaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19502404 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa-atgtgatttaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttaaattaaaacaaactaaca 19502307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 80 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 37682182 - 37681977
Alignment:
Q  80 gttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctag--atcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 177  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||   | ||||| ||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||    
T  37682182 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaactt-----------cataacaaactaaaacaaacttgt 37682094  T
Q  178 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaa 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37682093 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaa 37681994  T
Q  278 acttctgagcttgatga 294  Q
     ||||||||||||||||    
T  37681993 gcttctgagcttgatga 37681977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 80 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 12018888 - 12018731
Alignment:
Q  80 gttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctag--atcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 177  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||   | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12018888 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 12018789  T
Q  178 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12018788 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 12018731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 80 - 235
Target Start/End: Original strand, 7103943 - 7104100
Alignment:
Q  80 gttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctag--atcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 177  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||   | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7103943 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 7104042  T
Q  178 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7104043 gattaaccactgattgtgattatcactgaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 7104100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 80 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16794265 - 16794108
Alignment:
Q  80 gttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctag--atcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 177  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||   | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16794265 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 16794166  T
Q  178 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 235  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16794165 gattaaccacttattgtgattatcactgaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 16794108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 36632497 - 36632314
Alignment:
Q  38 aaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaaca 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36632497 aaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgctaacctctaaca 36632398  T
Q  138 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgtgattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 235  Q
    |||||||||||            ||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36632397 aacttgtaaca------------aactaaaacaaa-gtgtgattattcactgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 36632314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 48 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 43385138 - 43384945
Alignment:
Q  48 aaggaggtagctt-atatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaacaaacttgtaa 146  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  43385138 aaggaggtagctttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaaccctagattttatttgctaacttctaacaaacttgtaa 43385039  T
Q  147 caaacttcataacaaactaaaa-caaacttgtgattaaccactgattgtgattatcacta----aaactaaacttgaatt--aaaacaaactaaca 235  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||| ||||||||||||    ||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  43385038 caaacttcataacaaactaaaagcaaa--tgtgattaaccactaattatgattatcactaaactaaactaaacttgaattaaaaaacaaactaaca 43384945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 124 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 10277313 - 10277145
Alignment:
Q  124 gctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgtgattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaa 223  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || | || | ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10277313 gctaatctctaactaacttgtaacaaaattcataacaaactgaatctaaat-gtgattaaccactaattgtgattatcactaaa-ctaaacttgaattaa 10277216  T
Q  224 aacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaaacttctgagcttgatga 294  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10277215 aacaaactaacatcctctcttaattcgagtttccacttccttcattccaatcaagcttctgagcttgatga 10277145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 91 - 235
Target Start/End: Original strand, 40371750 - 40371892
Alignment:
Q  91 cacaaacaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgtgattaaccactga 190  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||    
T  40371750 cacaaacaatgtaataaactctagatcttatctactagcctctaacaaacttgtaacaatcttcataacaaactaaaacaaa-atgtgattaatctctga 40371848  T
Q  191 ttgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 235  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40371849 ttgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 40371892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 52 - 186
Target Start/End: Original strand, 20830304 - 20830437
Alignment:
Q  52 aggtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaac 151  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20830304 aggtagcttatatacaatgtctagttaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaacacttgatcttatttgctaatctctaacaaacttgtaacaaac 20830403  T
Q  152 ttcataacaaactaaaacaaacttgtgattaacca 186  Q
    ||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||    
T  20830404 ttcataacaaactgaaactaa-atgtgattaacca 20830437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 80 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 37658878 - 37658732
Alignment:
Q  80 gttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctag--atcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 177  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||   | ||||| ||||||||||||||||||||           |||||||| |||||||||||||||    
T  37658878 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaactt-----------cataacaagctaaaacaaacttgt 37658790  T
Q  178 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 235  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37658789 gattaaccactgattatgattatgactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 37658732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 124 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 10274655 - 10274546
Alignment:
Q  124 gctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgtgattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaa 223  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || | || | ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10274655 gctaatctctaactaacttgtaacaaaattcataacaaactgaatctaaat-gtgattaaccattaattgtgattatcactaaa-ctaaacttgaattaa 10274558  T
Q  224 aacaaactaaca 235  Q
    ||||||||||||    
T  10274557 aacaaactaaca 10274546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 111 - 186
Target Start/End: Original strand, 20808675 - 20808749
Alignment:
Q  111 ctagatcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgtgattaacca 186  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||    
T  20808675 ctagatcttatttgttaacctctaacaaacttgtaactaacttcataacaaactgaaactaa-atgtgattaacca 20808749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 69
Target Start/End: Original strand, 40371693 - 40371742
Alignment:
Q  21 ttattgattctacat-tcaaaatatacaaaggaggtagcttatatacaat 69  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40371693 ttattgattctacatatgaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaat 40371742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 227 - 262
Target Start/End: Original strand, 26454406 - 26454441
Alignment:
Q  227 aaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttc 262  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26454406 aaactaacttcctcccttaattcaagtttccacttc 26454441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 19)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 18 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 31670306 - 31670089
Alignment:
Q  18 tctttattgattctacattcaaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctagatc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  31670306 tctttattgattctacattcaaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcagaagcaatgtaacaaactctagatc 31670207  T
Q  118 ttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgtgattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31670206 ttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaac-tgtgattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttg 31670108  T
Q  218 aattaaaacaaactaacat 236  Q
    |||||||||||||||||||    
T  31670107 aattaaaacaaactaacat 31670089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 38 - 294
Target Start/End: Original strand, 8892582 - 8892837
Alignment:
Q  38 aaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaaca 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  8892582 aaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagttaagttgcttgaagcacaagcgatgtaacaaactctatatcttatttgctaatctctaaca 8892681  T
Q  138 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgtgattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacatc 237  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8892682 aatttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa-atgtgattaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacatc 8892780  T
Q  238 ctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaaacttctgagcttgatga 294  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  8892781 ctcccttaattcaaatttccacttccttcattccaatcaaccttttgagcttgatga 8892837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 80 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 44151715 - 44151499
Alignment:
Q  80 gttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctag--atcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 177  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||   | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44151715 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 44151616  T
Q  178 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaa 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44151615 gattaaccactgattgtgattatcactgaaactaaacttgaattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaa 44151516  T
Q  278 acttctgagcttgatga 294  Q
     ||||||||||||||||    
T  44151515 gcttctgagcttgatga 44151499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 38 - 294
Target Start/End: Original strand, 50627904 - 50628146
Alignment:
Q  38 aaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaaca 137  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  50627904 aaaatatataaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagtacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgctaacctctaaca 50628003  T
Q  138 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgtgattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacatc 237  Q
    ||||||||||||||    ||| |||  ||||       |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  50628004 aacttgtaacaaac----taaaaaa--aaaa-------gtgattaatcactgattgtgatta-cactaaaactaatcttgaattaaaacaaactaacatc 50628089  T
Q  238 ctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaaacttctgagcttgatga 294  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  50628090 ctcccttaattcaagtttccactgccttcattccaatcaagcttctgagcttgatga 50628146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 38 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 53722202 - 53722006
Alignment:
Q  38 aaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaaca 137  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  53722202 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatatagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctgctagcctctaaca 53722103  T
Q  138 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgtgattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53722102 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa-atgtgattaaccactgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 53722006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Original strand, 10317025 - 10317220
Alignment:
Q  38 aaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaaca 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10317025 aaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagttaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgctaacctctaaca 10317124  T
Q  138 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgtgattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10317125 aacttgtaacaaacttcataacaaactacaacaaa-gtgtgattaatcactgattgtgattataact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 10317220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 27186341 - 27186142
Alignment:
Q  38 aaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaaca 137  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27186341 aaaatatacaaaggaggcagcttatatacaatgtctagctaagtttcttgaagcacaagcaatgttacaaactctagatcttatttgctaacctctaaca 27186242  T
Q  138 aacttgtaacaaacttcataac-aaactaaaaca-aacttgtgattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 235  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27186241 aacttgtaacaaacttcataacaaaactaaaaaacaaaatgtgattaatcactaattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 27186142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 80 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 3770999 - 3770842
Alignment:
Q  80 gttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctag--atcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 177  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||   | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3770999 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 3770900  T
Q  178 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3770899 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 3770842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 80 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 44147180 - 44147023
Alignment:
Q  80 gttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctag--atcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 177  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||   | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44147180 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 44147081  T
Q  178 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44147080 gattaaccactgattgtgattatcactgaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 44147023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 38 - 228
Target Start/End: Original strand, 43683636 - 43683813
Alignment:
Q  38 aaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaaca 137  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||         
T  43683636 aaaatatacaaaggatgtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctatatcttatttgctaacctc----- 43683730  T
Q  138 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgtgattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaa 228  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43683731 ------taacaaacttcataacaaactaaaacaaa-gtgtgattaatcactgattgtgattatcactaaaa-taaacttgaattaaaacaa 43683813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 80 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 31359303 - 31359093
Alignment:
Q  80 gttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgtga 179  Q
    ||||||||||| |||| | | ||||||||| ||| | |||||  ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| || | || | ||||    
T  31359303 gttgcttgaagtacaagctaagtaacaaacccta-accttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaaattcatagcaaactgaatctaaat-gtga 31359206  T
Q  180 ttaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaaac 279  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31359205 ttaaccactaattgtgattatcattaaa-ctaaacttgaattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaagc 31359107  T
Q  280 ttctgagcttgatga 294  Q
     ||||||||||||||    
T  31359106 -tctgagcttgatga 31359093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 38 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 35842942 - 35842843
Alignment:
Q  38 aaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaaca 137  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35842942 aaaatatacaaaggaggtagtttatatacaatgtctaactaagttgcttgaagcacaagcattgtaacaaactctagatcttatttgctaacctctaaca 35842843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 80 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 41885076 - 41884925
Alignment:
Q  80 gttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgtga 179  Q
    ||||||||||| |||| | | ||||||||| ||| |||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || | || | ||||    
T  41885076 gttgcttgaagtacaagctaagtaacaaacccta-atcttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaa-ttcataacaaactgaatctaaat-gtga 41884980  T
Q  180 ttaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 235  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41884979 ttaaccactaattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaaccaaca 41884925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 80 - 236
Target Start/End: Original strand, 49274517 - 49274669
Alignment:
Q  80 gttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgtga 179  Q
    ||||||||||| |||| | | ||||||||| ||| | |||||  ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || | || | ||||    
T  49274517 gttgcttgaagtacaagctaagtaacaaacccta-accttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaa-ttcataacaaactgaatctaaat-gtga 49274613  T
Q  180 ttaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 236  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  49274614 ttaaccactaattatgatcatcactaaa-ctaaacttgaattaaaacaaactaacat 49274669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 138 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 31354772 - 31354678
Alignment:
Q  138 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgtgattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 235  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || || | || | ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  31354772 aacttgtaacaaaattcataacaa-ctgaatctaaat-gtgattaaccactaattgtaattatcactaaa-ctaaacttaaattaaaacaaactaaca 31354678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 53786028 - 53785880
Alignment:
Q  51 gaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaa 150  Q
    |||||||||||||||| |   |||| || |||||||||||||||| | ||||||||||| |||  | | ||  ||||   ||||||||||||||||||||    
T  53786028 gaggtagcttatatactagaactagttaggttgcttgaagcacaagctatgtaacaaaccctaactat-ataagctagtttctaacaaacttgtaacaaa 53785930  T
Q  151 cttcataacaaactaaaacaa-acttgtgattaaccactgattgtgattat 200  Q
     ||| |||||||| ||||||  |  |||||||||||||||| |||||||||    
T  53785929 -ttcttaacaaacaaaaacactaaatgtgattaaccactgagtgtgattat 53785880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 130 - 171
Target Start/End: Original strand, 45976222 - 45976263
Alignment:
Q  130 ctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaa 171  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45976222 ctctaaaaaacttgtaacaaacttcaaaacaaactaaaacaa 45976263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 156 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 35842847 - 35842797
Alignment:
Q  156 taacaaactaaaacaaacttgtgattaaccactgattgtgattatcactaaa 207  Q
    ||||| ||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35842847 taacatactaaaacaaagt-gtgattaatcactgattgtgattatcactaaa 35842797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 227 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 1834115 - 1834087
Alignment:
Q  227 aaactaacatcctcccttaattcaagttt 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1834115 aaactaacatcctcccttaattcaagttt 1834087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0440 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 2)
Name: scaffold0440
Description:

Target: scaffold0440; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 80 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 3137 - 2921
Alignment:
Q  80 gttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctag--atcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 177  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||   | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3137 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 3038  T
Q  178 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaa 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3037 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaa 2938  T
Q  278 acttctgagcttgatga 294  Q
    |||||||||||||||||    
T  2937 acttctgagcttgatga 2921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0440; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 80 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 7662 - 7447
Alignment:
Q  80 gttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctag--atcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 177  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||   | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7662 gttgcttgaaacacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa-ttgt 7564  T
Q  178 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaa 277  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7563 gattaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaa 7464  T
Q  278 acttctgagcttgatga 294  Q
    |||||||||||||||||    
T  7463 acttctgagcttgatga 7447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 80 - 294
Target Start/End: Original strand, 44865 - 45081
Alignment:
Q  80 gttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctag--atcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 177  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||   | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44865 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 44964  T
Q  178 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaa 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44965 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaa 45064  T
Q  278 acttctgagcttgatga 294  Q
    |||||||||||||||||    
T  45065 acttctgagcttgatga 45081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 80 - 235
Target Start/End: Original strand, 49445 - 49602
Alignment:
Q  80 gttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctag--atcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 177  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||   | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49445 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 49544  T
Q  178 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49545 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 49602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 18)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 80 - 294
Target Start/End: Original strand, 197684 - 197900
Alignment:
Q  80 gttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctag--atcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 177  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||   | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  197684 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 197783  T
Q  178 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaa 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  197784 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaa 197883  T
Q  278 acttctgagcttgatga 294  Q
    |||||||||||||||||    
T  197884 acttctgagcttgatga 197900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 80 - 294
Target Start/End: Original strand, 312521 - 312737
Alignment:
Q  80 gttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctag--atcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 177  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||   | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  312521 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 312620  T
Q  178 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaa 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  312621 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaa 312720  T
Q  278 acttctgagcttgatga 294  Q
    |||||||||||||||||    
T  312721 acttctgagcttgatga 312737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 21 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 28644775 - 28644562
Alignment:
Q  21 ttattgattctacattcaaaa-tatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctagatctt 119  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28644775 ttattgattctacatgcaaaaatatacaaaggaggtagcttatatacactgtctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatctt 28644676  T
Q  120 atctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgtgattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaa 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28644675 atctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa-atgtgattaaccactgattgtgattatcact-aaactaaacttgaa 28644578  T
Q  220 ttaaaacaaactaaca 235  Q
    ||||||||||||||||    
T  28644577 ttaaaacaaactaaca 28644562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 18 - 294
Target Start/End: Original strand, 30405761 - 30406019
Alignment:
Q  18 tctttattgattctacat-tcaaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctagat 116  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||    
T  30405761 tctttattgattctacatataaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaggttgcttgaagtacaagcaatgtaacaaattctagat 30405860  T
Q  117 cttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgtgattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaactt 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                  || ||||||||||||| |||||||||||    
T  30405861 cttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaaca------------------gaatgtgattatcact-aaactaaactt 30405941  T
Q  217 gaattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaaacttctgagcttgatga 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30405942 gaattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaagcttctgagcttgatga 30406019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 33072113 - 33071918
Alignment:
Q  38 aaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaaca 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  33072113 aaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgctaacctccaaca 33072014  T
Q  138 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgtgattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33072013 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaagaaa-gtgtgattaatcactgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 33071918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Original strand, 42234656 - 42234851
Alignment:
Q  38 aaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaaca 137  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42234656 aaaatatacaaagaaggtagtttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgctaacctctaaca 42234755  T
Q  138 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgtgattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42234756 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa-gtgtgattaatcactgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 42234851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 80 - 294
Target Start/End: Original strand, 43807485 - 43807699
Alignment:
Q  80 gttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctag--atcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 177  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||   | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||    
T  43807485 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacagaat-gt 43807583  T
Q  178 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaa 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43807584 gattaaccactgattgtgattatcactaaa-ctaaacttgaattaaaacaagctaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaa 43807682  T
Q  278 acttctgagcttgatga 294  Q
     ||||||||||||||||    
T  43807683 gcttctgagcttgatga 43807699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Original strand, 30410270 - 30410486
Alignment:
Q  18 tctttattgattctacat-tcaaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctagat 116  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||    
T  30410270 tctttattgattctacatataaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaggttgcttgaagtacaagcaatgtaacaaaatctagat 30410369  T
Q  117 cttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgtgattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaactt 216  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30410370 cttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaattaaaacaga-atgtgattaaccactgattgtgattatcact-aaactaaactt 30410467  T
Q  217 gaattaaaacaaactaaca 235  Q
    |||||||||||||||||||    
T  30410468 gaattaaaacaaactaaca 30410486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 80 - 236
Target Start/End: Original strand, 202202 - 202360
Alignment:
Q  80 gttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctag--atcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 177  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||   | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  202202 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 202301  T
Q  178 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  202302 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 202360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 80 - 236
Target Start/End: Original strand, 317039 - 317197
Alignment:
Q  80 gttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctag--atcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 177  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||   | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  317039 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 317138  T
Q  178 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  317139 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 317197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 133 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 41949902 - 41949743
Alignment:
Q  133 taacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgtgattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaacta 232  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||    
T  41949902 taaccaacttgtaacaaacttcaaaacaaactaaaacagagt-gtgattaatcactgattgtgattatcactaaa-ctaagcttgaattaaaagaaacta 41949805  T
Q  233 acatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaaacttctgagcttgatga 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  41949804 acatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattcaaatcaagcttctgagcttgatga 41949743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 38757186 - 38757003
Alignment:
Q  38 aaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaaca 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38757186 aaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatatctggctaggttgcttgaatcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaaca 38757087  T
Q  138 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgtgattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 235  Q
    |||||||||||            |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38757086 aacttgtaaca------------aactaaaacaga-atgtgattaaccactgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 38757003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 80 - 235
Target Start/End: Original strand, 43812044 - 43812199
Alignment:
Q  80 gttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctag--atcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 177  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||   | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  43812044 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaga-atgt 43812142  T
Q  178 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43812143 gattaaccactgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaagctaaca 43812199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 222 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 1291337 - 1291265
Alignment:
Q  222 aaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaaacttctgagcttgatga 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  1291337 aaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaagcttctgagtttgatga 1291265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 137 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 41945434 - 41945339
Alignment:
Q  137 aaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgtgattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 235  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41945434 aaacttgtaaccaacttg-taacaaactaaaacaaagt-gtgattaatcattgattgtgattatcactaaa-ctaaacttgaattaaaacaaactaaca 41945339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 55 - 294
Target Start/End: Original strand, 27435169 - 27435397
Alignment:
Q  55 tagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaa-actt 153  Q
    ||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||| | ||||||||||| |||  ||| || |||||| |      ||||||||||||| |  |    
T  27435169 tagcttatatacaatatctacttaggttgcttgaagcacaagctatgtaacaaaccctaactct-atgtgctaatc------aaacttgtaacaataact 27435261  T
Q  154 cataacaaactaaaacaaacttgtgattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagt 253  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||| | || ||||||||||  || |||||| |||||||     |||||  ||||| ||||||||||||    
T  27435262 cataacaaactaaaacaataatgtgattaaccactaagtgagattatcact--aagtaaactagaattaa---ctactaaattcctctcttaattcaagt 27435356  T
Q  254 ttccacttccttcattccaatcaaacttctgagcttgatga 294  Q
    || |||||| ||||| |||||||||||  | ||||||||||    
T  27435357 tttcacttctttcatgccaatcaaactctttagcttgatga 27435397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 228 - 294
Target Start/End: Original strand, 17782356 - 17782422
Alignment:
Q  228 aactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaaacttctgagcttgatga 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  17782356 aactaacatcctcccttaattcaagtttccactttcaccataccaatcaagcttcttagcttgatga 17782422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 247 - 294
Target Start/End: Original strand, 31473324 - 31473371
Alignment:
Q  247 ttcaagtttccacttccttcattccaatcaaacttctgagcttgatga 294  Q
    ||||||||||||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||    
T  31473324 ttcaagtttccacttccttcatggcagtcaaacttcttagcttgatga 31473371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 7)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 38 - 294
Target Start/End: Original strand, 43591783 - 43592037
Alignment:
Q  38 aaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaaca 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  43591783 aaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagccaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagattttatttgctaacctctaaca 43591882  T
Q  138 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgtgattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacatc 237  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43591883 atattgtaacaaacttcataacaaactaaaataaa-gtgcgattaatcactgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaacatc 43591980  T
Q  238 ctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaaacttctgagcttgatga 294  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  43591981 ctcccttaattcaagtttctacttccttcattccaatcaagcttttgagcttgatga 43592037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 18 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 26316216 - 26315954
Alignment:
Q  18 tctttattgattctacattcaaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctagatc 117  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26316216 tctttattgattctgcatacaaaatatacaaaggaagtagcttatatacaatatctagctaggttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatc 26316117  T
Q  118 ttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgtgattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttg 217  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||            |||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26316116 ttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaact------------aaaacagaat-gtgattaaccactgattgtgattatcactaaa-ctaaacttg 26316031  T
Q  218 aattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaaacttctgagcttgatga 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26316030 aattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaagcttctgagcttgatga 26315954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 39794046 - 39793831
Alignment:
Q  18 tctttattgattctacattcaaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctagatc 117  Q
    ||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39794046 tctttattgattctacatatgaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatc 39793947  T
Q  118 ttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgtgattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttg 217  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39793946 ttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaga-atgagattaaccactgattgtgattatcact-aaactaaacttg 39793849  T
Q  218 aattaaaacaaactaaca 235  Q
    ||||||||||||||||||    
T  39793848 aattaaaacaaactaaca 39793831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 21 - 235
Target Start/End: Original strand, 16588422 - 16588635
Alignment:
Q  21 ttattgattctacattcaaaa-tatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctagatctt 119  Q
    ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16588422 ttattgattctccatacaaaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttaaaacacaagcaatgtaacaaactctagatctt 16588521  T
Q  120 atctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgtgattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaa 219  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16588522 atatgataacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa-atgtgattaaccacttattgtgattatcact-aaactaaacttgaa 16588619  T
Q  220 ttaaaacaaactaaca 235  Q
    ||||||||||||||||    
T  16588620 ttaaaacaaactaaca 16588635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 26311725 - 26311522
Alignment:
Q  18 tctttattgattctacattcaaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctagatc 117  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26311725 tctttattgattctgcatacaaaatatacaaaggaagtagcttatatacaatatctagctaggttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatc 26311626  T
Q  118 ttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgtgattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttg 217  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||            |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26311625 ttatctactaacctctaacaaacttgtaaca------------aactaaaacaga-atgtgattaaccactgattgtgattatcact-aaactaaacttg 26311540  T
Q  218 aattaaaacaaactaaca 235  Q
    ||||||||||||||||||    
T  26311539 aattaaaacaaactaaca 26311522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 80 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 10504588 - 10504435
Alignment:
Q  80 gttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgtga 179  Q
    ||||||||||| |||| | | ||||||||| ||| | |||||  ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || | || | ||||    
T  10504588 gttgcttgaagtacaagctaagtaacaaacccta-accttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaaattcataacaaactgaatctaaat-gtga 10504491  T
Q  180 ttaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 236  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10504490 ttaatcactaattgtgattatcactaaa-ctaaacttgaattaaaacaaactaacat 10504435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 227 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 30647373 - 30647310
Alignment:
Q  227 aaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaaacttctgagcttg 290  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||   ||| |||||||| ||||| ||||||    
T  30647373 aaactaacatcctcccttaaatcaagtttccaattctaccatgccaatcaagcttctaagcttg 30647310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 233
Target Start/End: Original strand, 60201 - 60302
Alignment:
Q  131 tctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgtgattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaac 230  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||   |  ||||||||| |||| |||||||||||  |  ||| | |||||||||||||||||||    
T  60201 tctaacaaactggtaacaaaatttataacaaactaaaaattaaatgtgattaatcactaattgtgattatatcacaaagt-aacttgaattaaaacaaac 60299  T
Q  231 taa 233  Q
    |||    
T  60300 taa 60302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University