View Alignment
This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF21408_high_22 (Length: 292)
Name: NF21408_high_22
Description: NF21408
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF21408_high_22 |
 | |
|
| [»] scaffold0014 (3 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0167 (1 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold1284 (1 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold1270 (1 HSPs) |
| | |
|
Alignment Details
Target: scaffold0014 (Bit Score: 238; Significance: 1e-132; HSPs: 3)
Name: scaffold0014
Description:
Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 14 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 173480 - 173235
Alignment:
| Q |
14 |
agggagaagacgtagacatggctctggatcaagaagctctagataccatattaatactgaaaatatgtttattatatcatattatgtggtgagagtgtac |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
173480 |
agggagaagacgtagacatggctctggatcaagaagctctagataccatattagaactgaaaatatgtttattatatcatattatgtggtgagagtgtac |
173381 |
T |
|
| Q |
114 |
atttatataggtaagagtctcctagttaacccctaattaataaggaagattaatcaatacaatcaatacaatggctagtggagttgaaactaaatagtca |
213 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
173380 |
atttatataggtaagagtctcctagttaacccctaattaataaggaagattaatcaatacaatcaatacaatggctagtggagttgaaactaaatagtca |
173281 |
T |
|
| Q |
214 |
caacttttcaatatctccactaagtacttgattaattattctaaca |
259 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
173280 |
caacttttcaatatctccactaagtacttgattaattattctaaca |
173235 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 25 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 143663 - 143429
Alignment:
| Q |
25 |
gtagacatggctctggatcaagaagctctagataccatattaatactgaaaatatgtttattatatcatattatgtggtgagagtgtacatttatatagg |
124 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
143663 |
gtagacatggctttggatcaagaagctctagataccatattagaactgaaaatatgtttattatgtcatattatgtggtgagagtgtacatttatatagg |
143564 |
T |
|
| Q |
125 |
taagagtctcctagttaacccctaattaataaggaagattaatcaatacaatcaatacaatggctagtggagttgaaactaaatagtcacaacttttcaa |
224 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
143563 |
taggagtctcctagttaacccctaattaataaggaagattaatcaatacaatcaatacaatgactagtggagttaaaactaaatagtaacaacttttcaa |
143464 |
T |
|
| Q |
225 |
tatctccactaagtacttgattaattattctaaca |
259 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
143463 |
tatctccactaagtacttgattaattattctaaca |
143429 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0014; HSP #3
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 69 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 164116 - 163933
Alignment:
| Q |
69 |
actgaaaatatgtttattatatcatattatgtggtgagagtgtacatttatataggtaagagtctcctagttaacccctaattaataaggaagattaatc |
168 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
164116 |
actgaaaatatgtttattatgtcatattatgtggtgagagtgtacatttatataggtaggagtctcctagttaacccctaattaataaggaagatcaatc |
164017 |
T |
|
| Q |
169 |
aatacaatcaatacaatggctagtggagttgaaactaaatagtcacaacttttcaatatctccactaagtac--ttgattaattattctaaca |
259 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
164016 |
aata---------caatgactagtggagttaaaactaaatagtcacaacttttcaatatctccactaagtacttttgattaataattctaaca |
163933 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5 (Bit Score: 238; Significance: 1e-132; HSPs: 10)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 14 - 259
Target Start/End: Original strand, 36679285 - 36679530
Alignment:
| Q |
14 |
agggagaagacgtagacatggctctggatcaagaagctctagataccatattaatactgaaaatatgtttattatatcatattatgtggtgagagtgtac |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36679285 |
agggagaagacgtagacatggctctggatcaagaagctctagataccatattagaactgaaaatatgtttattatatcatattatgtggtgagagtgtac |
36679384 |
T |
|
| Q |
114 |
atttatataggtaagagtctcctagttaacccctaattaataaggaagattaatcaatacaatcaatacaatggctagtggagttgaaactaaatagtca |
213 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36679385 |
atttatataggtaagagtctcctagttaacccctaattaataaggaagattaatcaatacaatcaatacaatggctagtggagttgaaactaaatagtca |
36679484 |
T |
|
| Q |
214 |
caacttttcaatatctccactaagtacttgattaattattctaaca |
259 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36679485 |
caacttttcaatatctccactaagtacttgattaattattctaaca |
36679530 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 14 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 36662493 - 36662248
Alignment:
| Q |
14 |
agggagaagacgtagacatggctctggatcaagaagctctagataccatattaatactgaaaatatgtttattatatcatattatgtggtgagagtgtac |
113 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36662493 |
agggagaagacgtagacatggctctggatcaagaagctctagataccataatagaactgaaaatatgtttattatatcatattatgtggtgagagtgtac |
36662394 |
T |
|
| Q |
114 |
atttatataggtaagagtctcctagttaacccctaattaataaggaagattaatcaatacaatcaatacaatggctagtggagttgaaactaaatagtca |
213 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36662393 |
atttatataggtaagagtctcctagttaacccctaattaataaggaagattaatcaatacaatcaatacaatgactagtggagttgaaactaaatagtca |
36662294 |
T |
|
| Q |
214 |
caacttttcaatatctccactaagtacttgattaattattctaaca |
259 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36662293 |
gaacttttcaatatctccactaagtacttgattaattattctaaca |
36662248 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 69 - 259
Target Start/End: Original strand, 36674496 - 36674686
Alignment:
| Q |
69 |
actgaaaatatgtttattatatcatattatgtggtgagagtgtacatttatataggtaagagtctcctagttaacccctaattaataaggaagattaatc |
168 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36674496 |
actgaaaatatgtttattatatcatattatgtggtgagagtgtacatttatataggtaagagtctcctagttaacccctaattaataaggaagattaatc |
36674595 |
T |
|
| Q |
169 |
aatacaatcaatacaatggctagtggagttgaaactaaatagtcacaacttttcaatatctccactaagtacttgattaattattctaaca |
259 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36674596 |
aatacaatcaatacaatggctagtggagttgaaactaaatagtcacaacttttcaatatctccactaagtacttgattaattattctaaca |
36674686 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 43560129 - 43559896
Alignment:
| Q |
27 |
agacatggctctggatcaagaagctctagataccatattaatactgaaaatatgtttattatatcatattatgtggtgagagtgtacatttatataggta |
126 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43560129 |
agacatggctctggatcaagaagctctagataccatattagaactgaaaatatgtttattatatcatattatgcggtgagaatgtacatttatataggta |
43560030 |
T |
|
| Q |
127 |
agagtctcctagttaacccctaattaataaggaagattaatcaatacaatcaatacaatggctagtggagttgaaactaaatagtcacaa-cttttcaat |
225 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
43560029 |
ggagtctcctagttaacccctaattaataaggaagattaatcaacacaatcaatacaatgactagtggagttaaaactaaatagtcacaatcttttcaat |
43559930 |
T |
|
| Q |
226 |
atctccactaagtacttgattaattattctaaca |
259 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43559929 |
atctccacgaagtacttgattaattattctaaca |
43559896 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 69 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 36667279 - 36667089
Alignment:
| Q |
69 |
actgaaaatatgtttattatatcatattatgtggtgagagtgtacatttatataggtaagagtctcctagttaacccctaattaataaggaagattaatc |
168 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36667279 |
actgaaaatatgtttattatatcatattatgtggtgagagtgtacatttatataggtaagagtctcctagttaacccctaattaataaggaagattaatc |
36667180 |
T |
|
| Q |
169 |
aatacaatcaatacaatggctagtggagttgaaactaaatagtcacaacttttcaatatctccactaagtacttgattaattattctaaca |
259 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36667179 |
aatacaatcaatacaatggctagtggagttgaaactaaatagtcagaacttttcaatatctccactaagtacttgattaattattctaaca |
36667089 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 69 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 43564719 - 43564528
Alignment:
| Q |
69 |
actgaaaatatgtttattatatcatattatgtggtgagagtgtacatttatataggtaagagtctcctagttaacccctaattaataaggaagattaatc |
168 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43564719 |
actgaaaatatgtttattatatcatattatgtggtgagaatgtacatttatataggtaggagtctcctagttaacccctaattaataaggaagattaatc |
43564620 |
T |
|
| Q |
169 |
aatacaatcaatacaatggctagtggagttgaaactaaatagtcacaa-cttttcaatatctccactaagtacttgattaattattctaaca |
259 |
Q |
| |
|
|| |||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43564619 |
aacacaaccaacacaatgactagtggagttaaaactaaatagtcacaatcttttcaatatcgccactaagtacttgattaattattctaaca |
43564528 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 38 - 259
Target Start/End: Original strand, 23204100 - 23204312
Alignment:
| Q |
38 |
tggatcaagaagctctagataccatattaatactgaaaatatgtttattatatcatattatgtggtgagagtgtacatttatataggtaagagtctccta |
137 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23204100 |
tggatcaagaagctctagatatcatattagaactgaaaatatgtttattatattatattatatggtgagaatgtacatttatataggtaagagtctccta |
23204199 |
T |
|
| Q |
138 |
gttaacccctaattaataaggaagattaatcaatacaatcaatacaatggctagtggagttgaaactaaatagtcacaacttttcaatatctccactaag |
237 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |
|
|
| T |
23204200 |
gctaacccctaattaataaggaagatt---------aatcaatacaatgactagcggagttaaaactaaatagtcacaacttttcaatatttccactacg |
23204290 |
T |
|
| Q |
238 |
tacttgattaattattctaaca |
259 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
23204291 |
tacttaattaattattctaaca |
23204312 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 69 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 27378938 - 27378775
Alignment:
| Q |
69 |
actgaaaatatgtttattatatcatattatgtggtgagagtgtacatttatata--ggtaagagtctcctagttaacccctaattaataaggaagattaa |
166 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||| || ||| ||| ||||||| ||| ||| || | |||||||||| |
|
|
| T |
27378938 |
actgaaaatatgttcattatattgtattatgtgggcagaatgtacagttatatataggccggagcctcttagttaatccccaatcaacagggaagattaa |
27378839 |
T |
|
| Q |
167 |
tcaatacaatcaatacaatggctagtggagttgaaactaaatagtcacaacttttcaatatctc |
230 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||| || || | |||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27378838 |
tcaatacaatcaatataataaatatgaaagataaaactaaacagtcacaacttttcaatatctc |
27378775 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 133 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 4478563 - 4478475
Alignment:
| Q |
133 |
tcctagttaacccctaattaataaggaagattaatcaatacaatcaatacaatggctagtggagttgaaactaaatagtcacaacttttcaatatctc |
230 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4478563 |
tcctagttaatccccaattaatagggaagattaatcaatacaataaa---------tagtgaagataaaactaaacagtcacaacttttcaatatctc |
4478475 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 64 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 4478616 - 4478567
Alignment:
| Q |
64 |
ttaatactgaaaatatgtttattatatcatattatgtggtgagagtgtac |
113 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| |
|
|
| T |
4478616 |
ttaagactgaaaatatgtttattacatcatattatgtggggagaatgtac |
4478567 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1 (Bit Score: 238; Significance: 1e-132; HSPs: 15)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 14 - 259
Target Start/End: Original strand, 52609332 - 52609577
Alignment:
| Q |
14 |
agggagaagacgtagacatggctctggatcaagaagctctagataccatattaatactgaaaatatgtttattatatcatattatgtggtgagagtgtac |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
52609332 |
agggagaagacgtagacatggctctggatcaagaagctctagataccatattagaactgaaaatatgtttattatatcatattatgtggtgagagtgtac |
52609431 |
T |
|
| Q |
114 |
atttatataggtaagagtctcctagttaacccctaattaataaggaagattaatcaatacaatcaatacaatggctagtggagttgaaactaaatagtca |
213 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
52609432 |
atttatataggtaagagtctcctagttaacccctaattaataaggaagattaatcaatacaatcaatacaatggctagtggagttgaaactaaatagtca |
52609531 |
T |
|
| Q |
214 |
caacttttcaatatctccactaagtacttgattaattattctaaca |
259 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
52609532 |
caacttttcaatatctccactaagtacttgattaattattctaaca |
52609577 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 25 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 29886898 - 29886664
Alignment:
| Q |
25 |
gtagacatggctctggatcaagaagctctagataccatattaatactgaaaatatgtttattatatcatattatgtggtgagagtgtacatttatatagg |
124 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29886898 |
gtagacatggctctggatcaagaagctctagataccatattagaactgaaaatatgtttattatatcatattatgtggtgagagtgtacatttatatagg |
29886799 |
T |
|
| Q |
125 |
taagagtctcctagttaacccctaattaataaggaagattaatcaatacaatcaatacaatggctagtggagttgaaactaaatagtcacaacttttcaa |
224 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29886798 |
taggagtctcctagttaacccctaattaataaggaagattaatcaacacaatcaatacaatgactagtggagttaaaactaaatagtcacaacttttcat |
29886699 |
T |
|
| Q |
225 |
tatctccactaagtacttgattaattattctaaca |
259 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |
|
|
| T |
29886698 |
tatctccactaagtacttgattgattattataaca |
29886664 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 69 - 260
Target Start/End: Original strand, 20154423 - 20154614
Alignment:
| Q |
69 |
actgaaaatatgtttattatatcatattatgtggtgagagtgtacatttatataggtaagagtctcctagttaacccctaattaataaggaagattaatc |
168 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20154423 |
actgaaaatatgtttattatatcatattatgtggtgagagtgtacatttatataggtaagagtctcctagttaacccctaattaataaggaagattaatc |
20154522 |
T |
|
| Q |
169 |
aatacaatcaatacaatggctagtggagttgaaactaaatagtcacaacttttcaatatctccactaagtacttgattaattattctaacat |
260 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20154523 |
aatacaatcaatacaatggctagtggagttgaaactaaatagtcacaacttttcaatatctccactaagtacttgattaattattctaacat |
20154614 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 69 - 259
Target Start/End: Original strand, 52604576 - 52604766
Alignment:
| Q |
69 |
actgaaaatatgtttattatatcatattatgtggtgagagtgtacatttatataggtaagagtctcctagttaacccctaattaataaggaagattaatc |
168 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
52604576 |
actgaaaatatgtttattatatcatattatgtggtgagagtgtacatttatataggtaagagtctcctagttaacccctaattaataaggaagattaatc |
52604675 |
T |
|
| Q |
169 |
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259 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
52604676 |
aatacaatcaatacaatggctagtggagttgaaactaaatagtcacaacttttcaatatctccactaagtacttgattaattattctaaca |
52604766 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 69 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 20203669 - 20203479
Alignment:
| Q |
69 |
actgaaaatatgtttattatatcatattatgtggtgagagtgtacatttatataggtaagagtctcctagttaacccctaattaataaggaagattaatc |
168 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20203669 |
actgaaaatatgtttattatatcatattatgtggtgagagtgtatatttatataggtaggagtctcctagttaacccctaattaataaggaagattaatc |
20203570 |
T |
|
| Q |
169 |
aatacaatcaatacaatggctagtggagttgaaactaaatagtcacaacttttcaatatctccactaagtacttgattaattattctaaca |
259 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20203569 |
aatacaatcaatacaatgactagtggagttaaaactaaatagtcacaacttttcaatatctccactaagtacttgattaattattctaaca |
20203479 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 69 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 29891585 - 29891404
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| Q |
69 |
actgaaaatatgtttattatatcatattatgtggtgagagtgtacatttatataggtaagagtctcctagttaacccctaattaataaggaagattaatc |
168 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29891585 |
actgaaaatatgttcattatatcatattatgtggtgagagtgtacatttatataggtaggagtctcctagttaacccctaattaataaggaagattaatc |
29891486 |
T |
|
| Q |
169 |
aatacaatcaatacaatggctagtggagttgaaactaaatagtcacaacttttcaatatctccactaagtacttgattaattattctaaca |
259 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29891485 |
aata---------caatgactagtggagttaaaactaaatagtcacaacttttcaatatctccaccaagtacttgattaattattctaaca |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 57 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 52887636 - 52887444
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57 |
taccatattaatactgaaaatatgtttattatatcatattatgtggtgagagtgtacatttatataggtaagagtctcctagttaacccctaattaataa |
156 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
52887636 |
taccatattagaactgaaaatatgtttattatctcatattatgtggtgagagtgtacatttatat-ggtaggagtctcctagttaacccctaattaataa |
52887538 |
T |
|
| Q |
157 |
ggaagattaatcaatacaatcaatacaatggctagtggagttgaaactaaatagtcacaacttttcaatatctccactaagtacttgattaattattcta |
256 |
Q |
| |
|
| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
52887537 |
gaaagatt---------aatcaatacaatgactagtggagttaaaactaaatagtcacaacttttcaatatctccacaaagtacttgattaattattcta |
52887447 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 69 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 52890822 - 52890659
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| Q |
69 |
actgaaaatatgtttattatatcatattatgtggtgagagtgtacatttatataggtaagagtctcctagttaacccctaattaataaggaagattaatc |
168 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
52890822 |
actgaaaatatgtttattatatcatattatgtggtgagagt----------------aggagtctcctagttaacccctaattaataaggaagattaatc |
52890739 |
T |
|
| Q |
169 |
aatacaatcaatacaatggctagtggagttgaaactaaatagtcacaacttttcaatatctccactaagtacttgattaattattctaa |
257 |
Q |
| |
|
|||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
52890738 |
aatacaatga---------ctagtggagttaaaactaaatagtcacaacttttcaatatctccactaagtatttgattaattattctaa |
52890659 |
T |
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Back To:
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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 64 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 19807398 - 19807286
Alignment:
| Q |
64 |
ttaatactgaaaatatgtttattatatcatattatgtggtgagagtgtacatttatataggtaagagtctcctagttaacccctaattaataaggaagat |
163 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||||| || |||||||| ||||||| |
|
|
| T |
19807398 |
ttaagactgaaaatatgtttattatattatattatgtggggagaatgtacatttatataggcaggagcctcctagttaatcctcaattaatagggaagat |
19807299 |
T |
|
| Q |
164 |
taatcaatacaat |
176 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
| T |
19807298 |
taatcaatacaat |
19807286 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 69 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 8901024 - 8900938
Alignment:
| Q |
69 |
actgaaaatatgtttattatatcatattatgtggtgagagtgtacatttatataggtaagagtctcctagttaacccctaattaata |
155 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
8901024 |
actgaaattatgtttattatgtcgtattatgtaaggagaatgtacatttatataggtaggagtctcctagttaactcctaattaata |
8900938 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 69 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 14635265 - 14635152
Alignment:
| Q |
69 |
actgaaaatatgtttattatatcatattatgtggtg-agagtgtacatttatataggtaagagtctcctagttaacccctaattaataaggaagattaat |
167 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| ||| | |||||||| || | ||| |||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
14635265 |
actgaaaacatgtttactattttatattatgagggggagaatgtacatttatataggcaggggtctcctagttaatccccaattaatagggaagattaat |
14635166 |
T |
|
| Q |
168 |
caatacaatcaata |
181 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| |
|
|
| T |
14635165 |
caatacaataaata |
14635152 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 8900767 - 8900730
Alignment:
| Q |
193 |
ggagttgaaactaaatagtcacaacttttcaatatctc |
230 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8900767 |
ggagttcaaactaaatagtcacaacttttcaatatctc |
8900730 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 69 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 19932974 - 19932936
Alignment:
| Q |
69 |
actgaaaatatgtttattatatcatattatgtggtgaga |
107 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |
|
|
| T |
19932974 |
actgaaaatatgtttattatatcttattatgtggggaga |
19932936 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 93 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 19932755 - 19932694
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| Q |
93 |
tattatgtggtgagagtgtacatttatataggtaagagtctcctagttaacccctaattaat |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| ||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| ||| ||||||| |
|
|
| T |
19932755 |
tattatgtggggagaatgttcatttatacaggcaggagtctcctagttaatccccaattaat |
19932694 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 174 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 19932696 - 19932640
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| Q |
174 |
aatcaatacaatggctagtggagttgaaactaaatagtcacaacttttcaatatctc |
230 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
19932696 |
aatcaatacaataaatagtggagataaaactaaacagtcacaacttttcagtatctc |
19932640 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 17)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 14 - 260
Target Start/End: Original strand, 48513754 - 48514000
Alignment:
| Q |
14 |
agggagaagacgtagacatggctctggatcaagaagctctagataccatattaatactgaaaatatgtttattatatcatattatgtggtgagagtgtac |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48513754 |
agggagaagacgtagacatggctctggatcaagaagctctagataccatattagaactgaaaatatgtttattatatcatattatgtggtgagagtgtac |
48513853 |
T |
|
| Q |
114 |
atttatataggtaagagtctcctagttaacccctaattaataaggaagattaatcaatacaatcaatacaatggctagtggagttgaaactaaatagtca |
213 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48513854 |
atttatataggtaagagtctcctagttaacccctaattaataaggaagattaatcaatacaatcaatacaatggctagtggagttgaaactaaatagtca |
48513953 |
T |
|
| Q |
214 |
caacttttcaatatctccactaagtacttgattaattattctaacat |
260 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48513954 |
caacttttcaatatctccattaagtacttgattaattattctaacat |
48514000 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 30 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 42104979 - 42104750
Alignment:
| Q |
30 |
catggctctggatcaagaagctctagataccatattaatactgaaaatatgtttattatatcatattatgtggtgagagtgtacatttatataggtaaga |
129 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
42104979 |
catggctctggatcaagaagctctagataccatattagaactgaaaatatgtttattatatcatattatgtggtgagagtgtacatttatataggtagga |
42104880 |
T |
|
| Q |
130 |
gtctcctagttaacccctaattaataaggaagattaatcaatacaatcaatacaatggctagtggagttgaaactaaatagtcacaacttttcaatatct |
229 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42104879 |
gtctcctagttaacccctaattaataaggaagattaatcaatacaatcaataaaatgactagtggagttaaaactaaatagtcacaacttttcaatatct |
42104780 |
T |
|
| Q |
230 |
ccactaagtacttgattaattattctaaca |
259 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42104779 |
ccactaagtacttgattaattattctaaca |
42104750 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 25 - 259
Target Start/End: Original strand, 48728219 - 48728453
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| Q |
25 |
gtagacatggctctggatcaagaagctctagataccatattaatactgaaaatatgtttattatatcatattatgtggtgagagtgtacatttatatagg |
124 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
48728219 |
gtagacatggctctggatcaagaagctctagataccatattagaactgaaaataagtttattatatcatattatgtggtgagaatgtacatttatatagg |
48728318 |
T |
|
| Q |
125 |
taagagtctcctagttaacccctaattaataaggaagattaatcaatacaatcaatacaatggctagtggagttgaaactaaatagtcacaacttttcaa |
224 |
Q |
| |
|
|| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48728319 |
taggagcctcctagttaacccttaattaataaggaagattaatcaatacaatcaatacaatgactagtggagttaaaactaaatagtcacaacttttcaa |
48728418 |
T |
|
| Q |
225 |
tatctccactaagtacttgattaattattctaaca |
259 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48728419 |
tatctccactaagtacttgattaattattctaaca |
48728453 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 69 - 259
Target Start/End: Original strand, 48508965 - 48509155
Alignment:
| Q |
69 |
actgaaaatatgtttattatatcatattatgtggtgagagtgtacatttatataggtaagagtctcctagttaacccctaattaataaggaagattaatc |
168 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48508965 |
actgaaaatatgtttattatatcatattatgtggtgagagtgtacatttatataagtaagagtctcctagttaacccctaattaataaggaagattaatc |
48509064 |
T |
|
| Q |
169 |
aatacaatcaatacaatggctagtggagttgaaactaaatagtcacaacttttcaatatctccactaagtacttgattaattattctaaca |
259 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48509065 |
aatacaatcaatacaatggctagtggagttgaaactaaatagtcacaacttttcaatatctccactaagtacttgattaattattctaaca |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 69 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 42109930 - 42109740
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| Q |
69 |
actgaaaatatgtttattatatcatattatgtggtgagagtgtacatttatataggtaagagtctcctagttaacccctaattaataaggaagattaatc |
168 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42109930 |
actgaaaatatgtttattatatcatattatgtggtgagagtgtacatttatataggtaggagtctcctagttaacccctaattaataaggaagattaatc |
42109831 |
T |
|
| Q |
169 |
aatacaatcaatacaatggctagtggagttgaaactaaatagtcacaacttttcaatatctccactaagtacttgattaattattctaaca |
259 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42109830 |
aatacaatcaatacaatgactagtggagttaaaactaaatagtcacaacttttcaatatctccactaagtacttgattaattattctaaca |
42109740 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 25 - 226
Target Start/End: Original strand, 3718570 - 3718771
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| Q |
25 |
gtagacatggctctggatcaagaagctctagataccatattaatactgaaaatatgtttattatatcatattatgtggtgagagtgtacatttatatagg |
124 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3718570 |
gtagacatggctctggatcaagaagctctagatactatattagaactgaaaatatgtttattatatcatattatgtggtgagagtgtacatttatatagg |
3718669 |
T |
|
| Q |
125 |
taagagtctcctagttaacccctaattaataaggaagattaatcaatacaatcaatacaatggctagtggagttgaaactaaatagtcacaacttttcaa |
224 |
Q |
| |
|
|| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3718670 |
taggagtctcctaattaacccttaattaataaggaagattaatcaatacaatcaatacaatgaccagtgaagttaaaactaaatagtcacaacttttcaa |
3718769 |
T |
|
| Q |
225 |
ta |
226 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
3718770 |
ta |
3718771 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 69 - 259
Target Start/End: Original strand, 3713893 - 3714074
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69 |
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168 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3713893 |
actgaaaatatgtttattatatcatattatgtggtgagagtgtacatttatataggtaggagtctcctagttaacccctaattaataaggaagatt---- |
3713988 |
T |
|
| Q |
169 |
aatacaatcaatacaatggctagtggagttgaaactaaatagtcacaacttttcaatatctccactaagtacttgattaattattctaaca |
259 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3713989 |
-----aatcaatacaatgactagtggagttaaaactaaatagtcacaacttttcaatatctccactaagtacttgattaattattctaaca |
3714074 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 69 - 259
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69 |
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Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
48723400 |
actgaaaataagtttattatatcatattatgtggtgagagtgtacatttatataggtaggagtctcctagttaacccctaattaataaggtagatt---- |
48723495 |
T |
|
| Q |
169 |
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259 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
48723496 |
-----aatcaatacaatgactagtggagttaaaactaaatagtcacaacttttcaatatctccactaagtacttgattaaattattctaaca |
48723582 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 49 - 230
Target Start/End: Original strand, 37981045 - 37981226
Alignment:
| Q |
49 |
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148 |
Q |
| |
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||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||| |
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|
| T |
37981045 |
gctctggataccatcttaagactgaaaatatgtttatcatatcaaattatgtggggagaatgtacatttatatgggtaggagtttcctagttaatcccta |
37981144 |
T |
|
| Q |
149 |
attaataaggaagattaatcaatacaatcaatacaatggctagtggagttgaaactaaatagtcacaacttttcaatatctc |
230 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37981145 |
attaataaggaagattaatcaatacaaccaatacaataaatagtgaagttaaaactaaatagtcacaacttttcaatatctc |
37981226 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 49 - 230
Target Start/End: Original strand, 45187614 - 45187796
Alignment:
| Q |
49 |
gctctagataccatattaatactgaaaatatgtttatt-atatcatattatgtggtgagagtgtacatttatataggtaagagtctcctagttaacccct |
147 |
Q |
| |
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||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
45187614 |
gctctggataccatcttaagactgaaaatatgttttttcatatcaaattatgtggggagaatgtacatttatatgggtaggagtctcctagttaatccct |
45187713 |
T |
|
| Q |
148 |
aattaataaggaagattaatcaatacaatcaatacaatggctagtggagttgaaactaaatagtcacaacttttcaatatctc |
230 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
45187714 |
aattaataaggaagattaatcaatacaatcaatacaataaatagtgaagttaaaactaaatagtcacaacttttgaatatctc |
45187796 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 64 - 230
Target Start/End: Original strand, 45182071 - 45182238
Alignment:
| Q |
64 |
ttaatactgaaaatatgtttatt-atatcatattatgtggtgagagtgtacatttatataggtaagagtctcctagttaacccctaattaataaggaaga |
162 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||| || |||||| ||||||| | |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45182071 |
ttaagactgaaaatatgttttttcatatcaaattatgtagggagaatgtacatttatatgggtaggagtctcctagttaatccctaattaataaggaaga |
45182170 |
T |
|
| Q |
163 |
ttaatcaatacaatcaatacaatggctagtggagttgaaactaaatagtcacaacttttcaatatctc |
230 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45182171 |
ttaatcaatacaatcaatacaataaatagtgaagttaaaactaaatagtcacaacttttcaatatctc |
45182238 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 64 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 993559 - 993393
Alignment:
| Q |
64 |
ttaatactgaaaatatgtttattatatcatattatgtggtgagagtgtacatttatataggtaagagtctcctagttaacccctaattaataaggaagat |
163 |
Q |
| |
|
|||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| |
|
|
| T |
993559 |
ttaagactggaaatatgtttattatgtcatattatgtggggagaatgtacatttatataggcaggagtctcctagttaatccccaattaatagggaagat |
993460 |
T |
|
| Q |
164 |
taatcaatacaatcaatacaatggctagtggagttgaaactaaatagtcacaacttttcaatatctc |
230 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
993459 |
taatcaatacaatcaatacaataaatagtgaagataaaactaaacagtcacaacttttcaatatctc |
993393 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 69 - 230
Target Start/End: Original strand, 42356927 - 42357079
Alignment:
| Q |
69 |
actgaaaatatgtttattatatcatattatgtggtgagagtgtacatttatataggtaagagtctcctagttaacccctaattaataaggaagattaatc |
168 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| |||| |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42356927 |
actgaaaatatgtttatcatatcaaattatgtggggagaatgtatatttatatgggttggagtctcctagttaatccctaattaataaggaagattaatc |
42357026 |
T |
|
| Q |
169 |
aatacaatcaatacaatggctagtggagttgaaactaaatagtcacaacttttcaatatctc |
230 |
Q |
| |
|
|||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42357027 |
aatacaataaa---------tagtgaagttaaaactaaatagtcacaacttttcaatatctc |
42357079 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 55 - 230
Target Start/End: Original strand, 42360525 - 42360691
Alignment:
| Q |
55 |
gataccatattaatactgaaaatatgtttattatatcatattatgtggtgagagtgtacatttatataggtaagagtctcctagttaacccctaattaat |
154 |
Q |
| |
|
||||| || |||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |||| || | |||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
42360525 |
gatactatcttaagactaaaaatatgtttatcatatcaaattatgtggggagaatgtacatttatatgggtaggaatatcctagttaatccctaattaat |
42360624 |
T |
|
| Q |
155 |
aaggaagattaatcaatacaatcaatacaatggctagtggagttgaaactaaatagtcacaacttttcaatatctc |
230 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42360625 |
aagtaagattaatcaatacaataaa---------tagtgaagttaaaactaaacagtcacaacttttcaatatctc |
42360691 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 188 - 259
Target Start/End: Original strand, 48728481 - 48728552
Alignment:
| Q |
188 |
ctagtggagttgaaactaaatagtcacaacttttcaatatctccactaagtacttgattaattattctaaca |
259 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48728481 |
ctagtggagttaaaactaaatagtcacaacttttcaatatctccactaagtacttgattaattattctaaca |
48728552 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 188 - 259
Target Start/End: Original strand, 48728580 - 48728651
Alignment:
| Q |
188 |
ctagtggagttgaaactaaatagtcacaacttttcaatatctccactaagtacttgattaattattctaaca |
259 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48728580 |
ctagtggagttaaaactaaatagtcacaacttttcaatatctccactaagtacttgattaattattctaaca |
48728651 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 56 - 230
Target Start/End: Original strand, 40124128 - 40124293
Alignment:
| Q |
56 |
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154 |
Q |
| |
|
||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| | |||| ||||||||||| | |||||||||| |||| ||| |||| || |
|
|
| T |
40124128 |
ataccatcttaagactgaaaatatgtttattatcacatattatgaggggagaaatgtaaatttatataggcaggagtctcctatttaatccccaatt-at |
40124226 |
T |
|
| Q |
155 |
aaggaagattaatcaatacaatcaatacaatggctagtggagttgaaactaaatagtcacaacttttcaatatctc |
230 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40124227 |
agggaagattaatcaatacaataaa---------tagtgaagataaaactaaacagtcacaacttttcaatatctc |
40124293 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 11)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 14 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 12504687 - 12504442
Alignment:
| Q |
14 |
agggagaagacgtagacatggctctggatcaagaagctctagataccatattaatactgaaaatatgtttattatatcatattatgtggtgagagtgtac |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
12504687 |
agggagaagacgtagacatggctctggatcaagaagctctagataccatattagaactgaaaatatgtttattatatcatattatatggtgagagtgtac |
12504588 |
T |
|
| Q |
114 |
atttatataggtaagagtctcctagttaacccctaattaataaggaagattaatcaatacaatcaatacaatggctagtggagttgaaactaaatagtca |
213 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12504587 |
atttatataggtaagagtctcctagttaacccctaattaataaggaagattaatcaatacaatcaatacaatggctagtggagttgaaactaaatagtca |
12504488 |
T |
|
| Q |
214 |
caacttttcaatatctccactaagtacttgattaattattctaaca |
259 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12504487 |
caacttttcaatatctccactaagtacttgattaattattctaaca |
12504442 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 14 - 259
Target Start/End: Original strand, 14681239 - 14681484
Alignment:
| Q |
14 |
agggagaagacgtagacatggctctggatcaagaagctctagataccatattaatactgaaaatatgtttattatatcatattatgtggtgagagtgtac |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14681239 |
agggagaagacgtagacatggctctggatcaagaagctctagataccatattagaactgaaaatatgtttattatatcatattatgtggtgagagtgtac |
14681338 |
T |
|
| Q |
114 |
atttatataggtaagagtctcctagttaacccctaattaataaggaagattaatcaatacaatcaatacaatggctagtggagttgaaactaaatagtca |
213 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14681339 |
atttatataggtaagagtctcctagttaacccctaattaataaggaagattaatcaatacaatcaatacaatggccagtggagttgaaactaaatagtca |
14681438 |
T |
|
| Q |
214 |
caacttttcaatatctccactaagtacttgattaattattctaaca |
259 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14681439 |
gaacttttcaatatctccactaagtacttgattaattattctaaca |
14681484 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 69 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 12509476 - 12509286
Alignment:
| Q |
69 |
actgaaaatatgtttattatatcatattatgtggtgagagtgtacatttatataggtaagagtctcctagttaacccctaattaataaggaagattaatc |
168 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12509476 |
actgaaaatatgtttattatatcatattatgtggtgagagtgtacatttatataggtaagagtctcctagttaacccctaattaataaggaagattaatc |
12509377 |
T |
|
| Q |
169 |
aatacaatcaatacaatggctagtggagttgaaactaaatagtcacaacttttcaatatctccactaagtacttgattaattattctaaca |
259 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12509376 |
aatacaatcaatacaatggctagtggagttgaaactaaatagtcacaacttttcaatatctccactaagtacttgattaattattctaaca |
12509286 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 69 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 35753536 - 35753345
Alignment:
| Q |
69 |
actgaaaatatgtttattatatcatattatgtggtgagagtgtacatttatataggtaagagtctcctagttaacccctaattaataaggaagattaatc |
168 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35753536 |
actgaaaatatgtttattatatcatattatgtggtgagagtgtacatttatataggtaagagtctcctagttaacccctaattaataaggaagattaatc |
35753437 |
T |
|
| Q |
169 |
aatacaatcaatacaatggctagtggagttgaaactaaatagtcacaacttttcaatatctccactaagtacttgattaattattctaacat |
260 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35753436 |
aatacaatcaatacaatggctagtggagttgaaactaaatagtcagaacttttcaatatctccactaagtacttgattaattattctaacat |
35753345 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 69 - 259
Target Start/End: Original strand, 14676450 - 14676640
Alignment:
| Q |
69 |
actgaaaatatgtttattatatcatattatgtggtgagagtgtacatttatataggtaagagtctcctagttaacccctaattaataaggaagattaatc |
168 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14676450 |
actgaaaatatgtttattatatcatattatgtggtgagagtgtacatttatataggtaagagtctcctagttaacccctaattaataaggaagattaatc |
14676549 |
T |
|
| Q |
169 |
aatacaatcaatacaatggctagtggagttgaaactaaatagtcacaacttttcaatatctccactaagtacttgattaattattctaaca |
259 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14676550 |
aatacaatcaatacaatggccagtggagttgaaactaaatagtcagaacttttcaatatctccactaagtacttgattaattattctaaca |
14676640 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 93 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 39591892 - 39591726
Alignment:
| Q |
93 |
tattatgtggtgagagtgtacatttatataggtaagagtctcctagttaacccctaattaataaggaagattaatcaatacaatcaatacaatggctagt |
192 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
39591892 |
tattatgcggtgagagtgtacatttatataggtaggagtctcctagttaacccctaattaataaggaagattaatcaatacaatcaatacaatgactagt |
39591793 |
T |
|
| Q |
193 |
ggagttgaaactaaatagtcacaacttttcaatatctccactaagtacttgattaattattctaaca |
259 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39591792 |
ggagttaaaactaaatagttacaacttttcaatatctccactaagtacttgattaattattctaaca |
39591726 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 64 - 230
Target Start/End: Original strand, 4132360 - 4132518
Alignment:
| Q |
64 |
ttaatactgaaaatatgtttattatatcatattatgtggtg-agagtgtacatttatataggtaagagtctcctagttaacccctaattaataaggaaga |
162 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4132360 |
ttaagactgaaaatatgtttatcatatcatattatgtgggggagaatgtacatttatatgggtgggagtctcctagttaatccctaattaataaggaaga |
4132459 |
T |
|
| Q |
163 |
ttaatcaatacaatcaatacaatggctagtggagttgaaactaaatagtcacaacttttcaatatctc |
230 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4132460 |
ttaatcaatacaataaa---------tagtgaagttaaaactaaatagtcacaacttttcaatatctc |
4132518 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 64 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 26775706 - 26775589
Alignment:
| Q |
64 |
ttaatactgaaaatatgtttattatatcatattatgtggtgagagtgtacatttatataggtaagagtctcctagttaacccctaattaataaggaagat |
163 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
26775706 |
ttaagactgaaaatatgtttattatatcatattatgcggggagaatgtacatttatataggtaggactctcctagttaatccctaattaataaagaagat |
26775607 |
T |
|
| Q |
164 |
taatcaatacaatcaata |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
26775606 |
taatcaatacaataaata |
26775589 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 177 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 39587449 - 39587367
Alignment:
| Q |
177 |
caatacaatggctagtggagttgaaactaaatagtcacaacttttcaatatctccactaagtacttgattaattattctaaca |
259 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39587449 |
caatacaatgactagtggagttaaaactaaatagtcacaacttttcaatatctccactaagtacttgattaattattctaaca |
39587367 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 71 - 152
Target Start/End: Original strand, 32667563 - 32667645
Alignment:
| Q |
71 |
tgaaaatatgtttattatatcatattatgtggtg-agagtgtacatttatataggtaagagtctcctagttaacccctaatta |
152 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||||| |
|
|
| T |
32667563 |
tgaaaatatgttaatcatatcatattatgtgggggagaatgtacatttatatgggtaggagtctcctagttgatccctaatta |
32667645 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 230
Target Start/End: Original strand, 32663056 - 32663097
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| Q |
189 |
tagtggagttgaaactaaatagtcacaacttttcaatatctc |
230 |
Q |
| |
|
||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32663056 |
tagtgaagttaaaactaaatagttacaacttttcaatatctc |
32663097 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 10)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 14 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 20793417 - 20793171
Alignment:
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14 |
agggagaagacgtagacatggctctggatcaagaagctctagataccatattaatactgaaaatatgtttattatatcatattatgtggtgagagtgtac |
113 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20793417 |
agggagaagacgtagacatggctctggatcaagaagctctagataccatattagaactgaaaatatgtttattatatcatattatgtggtgagagtgtac |
20793318 |
T |
|
| Q |
114 |
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213 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20793317 |
atttatataggtaagagtctcctagttaacccctaattaataaggaagattattcaatacaatcaatacaatggctagtggagttgaaactaaatagtcg |
20793218 |
T |
|
| Q |
214 |
caacttttcaatatctccactaagtacttgattaattattctaacat |
260 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20793217 |
caacttttcaatatctccactaagtacttgattaattattctaacat |
20793171 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 14 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 44197864 - 44197619
Alignment:
| Q |
14 |
agggagaagacgtagacatggctctggatcaagaagctctagataccatattaatactgaaaatatgtttattatatcatattatgtggtgagagtgtac |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44197864 |
agggagaagacgtagacatggctctggatcaagaagctctagataccatattagaactgaaaatatgtttattatatcatattatgtggtgagagtgtac |
44197765 |
T |
|
| Q |
114 |
atttatataggtaagagtctcctagttaacccctaattaataaggaagattaatcaatacaatcaatacaatggctagtggagttgaaactaaatagtca |
213 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44197764 |
atttatataggtaagagtctcctagttaacccctaattaataaggaagattaatcaatacaatcaatacaatggccagtggagttgaaactaaatagtca |
44197665 |
T |
|
| Q |
214 |
caacttttcaatatctccactaagtacttgattaattattctaaca |
259 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44197664 |
gaacttttcaatatctccactaagtacttgattaattattctaaca |
44197619 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 69 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 44202651 - 44202461
Alignment:
| Q |
69 |
actgaaaatatgtttattatatcatattatgtggtgagagtgtacatttatataggtaagagtctcctagttaacccctaattaataaggaagattaatc |
168 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44202651 |
actgaaaatatgtttattatatcatattatgtggtgagagtgtacatttatataggtaagagtctcctagttaacccctaattaataaggaagattaatc |
44202552 |
T |
|
| Q |
169 |
aatacaatcaatacaatggctagtggagttgaaactaaatagtcacaacttttcaatatctccactaagtacttgattaattattctaaca |
259 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44202551 |
aatacaatcaatacaatggccagtggagttgaaactaaatagtcagaacttttcaatatctccactaagtacttgattaattattctaaca |
44202461 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 62 - 259
Target Start/End: Original strand, 1067864 - 1068061
Alignment:
| Q |
62 |
tattaatactgaaaatatgtttattatatcatattatgtggtgagagtgtacatttatataggtaagagtctcctagttaacccctaattaataaggaag |
161 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1067864 |
tattaaaactgaaaatatgtttattatttcatattatgtggtgagagtgtacatttatataggtaagagtctcctagttaacccctaattaataaggaag |
1067963 |
T |
|
| Q |
162 |
attaatcaatacaatcaatacaatggctagtggagttgaaactaaatagtcacaacttttcaatatctccactaagtacttgattaattattctaaca |
259 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1067964 |
attaatcaatacaatcaatacaatggccagtggagttgaaactaaatagtcagaacttttcaatatctccactaagtacttgattaattattctaaca |
1068061 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 69 - 259
Target Start/End: Original strand, 18898815 - 18899005
Alignment:
| Q |
69 |
actgaaaatatgtttattatatcatattatgtggtgagagtgtacatttatataggtaagagtctcctagttaacccctaattaataaggaagattaatc |
168 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18898815 |
actgaaaatatgtttattatatcatattatgtggtgagagtgtacatttatataggtaggagtcttctagttaacccctaattaataaggaagattaatc |
18898914 |
T |
|
| Q |
169 |
aatacaatcaatacaatggctagtggagttgaaactaaatagtcacaacttttcaatatctccactaagtacttgattaattattctaaca |
259 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
18898915 |
aatacaatcaatacaatgactagtggagttaaaactaaacagtcacaacttttcaatatctccactaagtacttgatcaattattctaaca |
18899005 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 69 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 40444381 - 40444205
Alignment:
| Q |
69 |
actgaaaatatgtttattatatcatattatgtggtgagagtgtacatttatataggtaagagtctcctagttaacccctaattaataaggaagattaatc |
168 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40444381 |
actgaaaatatgtttattatatgatattatgtagtgagagtgtacatttatataggtaggagtctcctagttaacccctaattaataaggaagattaatc |
40444282 |
T |
|
| Q |
169 |
aatacaatcaatacaatggctagtggagttgaaactaaatagtcacaacttttcaatatctccactaagtacttgatt |
246 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40444281 |
aatacaatcaatacaatgactagtggagttaaaactaaatagtcacaac-tttcaatatctccactaagtacttgatt |
40444205 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 72 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 2355061 - 2354909
Alignment:
| Q |
72 |
gaaaatatgtttattatatcatattatgtggtgagagtgtacatttatataggtaagagtctcctagttaacccctaattaataaggaagattaatcaat |
171 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
2355061 |
gaaattatgtttatcatatcaaattatgtgaggagaatgtacatttatatgggtaggagtctcctagttaatccctaattaataaggaagattaatcaat |
2354962 |
T |
|
| Q |
172 |
acaatcaatacaatggctagtggagttgaaactaaatagtcacaacttttcaatat |
227 |
Q |
| |
|
||| |||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2354961 |
aca---aatacaataaatagtgaagttaaaactaaatagtcacaacttttcaatat |
2354909 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 64 - 230
Target Start/End: Original strand, 8475766 - 8475933
Alignment:
| Q |
64 |
ttaatactgaaaatatgttt-attatatcatattatgtggtgagagtgtacatttatataggtaagagtctcctagttaacccctaattaataaggaaga |
162 |
Q |
| |
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|||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||| |||| | |||||||||||||| | |||||| | |||||| ||| || ||||| |||||| |
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|
| T |
8475766 |
ttaagactgaaattatgttttattatttcatattatatggggagaatttacatttatataggcaggagtcttccagttaatccccaaataatagggaaga |
8475865 |
T |
|
| Q |
163 |
ttaatcaatacaatcaatacaatggctagtggagttgaaactaaatagtcacaacttttcaatatctc |
230 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||| |||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
8475866 |
ttaatcaatacaatcaatacaataaatagtgaagataaaactaaacagtcacaacttttcaacatctc |
8475933 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 76 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 27414824 - 27414679
Alignment:
| Q |
76 |
atatgtttattatatcatattatgtggtgagagtgtacatttatataggtaagagtctcctagttaacccctaattaataaggaagattaatcaatacaa |
175 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| || |||| | |||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27414824 |
atatgtttatcatatcaaatcatgttgggagaatgtacatttatatgggtaggagtctcttagttaatccctaattaataaggaagattaatcaatacaa |
27414725 |
T |
|
| Q |
176 |
tcaatacaatggctagtggagttgaaactaaatagtcacaacttttcaatatctc |
230 |
Q |
| |
|
| || ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27414724 |
taaa---------tagtgaagttaaaactaaatagtgacaacttttcaatatctc |
27414679 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 177 - 259
Target Start/End: Original strand, 43901125 - 43901206
Alignment:
| Q |
177 |
caatacaatggctagtggagttgaaactaaatagtcacaacttttcaatatctccactaagtacttgattaattattctaaca |
259 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
43901125 |
caatacaatgactagtggagttaaaactaaatagtcacaacttttcaatatctccactaagtactt-attaaatattctaaca |
43901206 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 4)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 14 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 29651741 - 29651496
Alignment:
| Q |
14 |
agggagaagacgtagacatggctctggatcaagaagctctagataccatattaatactgaaaatatgtttattatatcatattatgtggtgagagtgtac |
113 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29651741 |
agggagaagacgtagacatggctctggatcaagaagctct-gataccatattagaactgaaaatatgtttattatatcatattatgtggtgagagtgtac |
29651643 |
T |
|
| Q |
114 |
atttatataggtaagagtctcctagttaacccctaattaataaggaagattaatcaatacaatcaatacaatggctagtggagttgaaactaaatagtca |
213 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29651642 |
atttatataggtaagagtctcctagttaacccctaattaataaggaagattaatcaatacaatcaatacaatggctagtggagttgaaactaaatagtca |
29651543 |
T |
|
| Q |
214 |
caacttttcaatatctccactaagtacttgattaattattctaacat |
260 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29651542 |
caacttttcaatatctccactaagtacttgattaattattctaacat |
29651496 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 69 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 29656531 - 29656341
Alignment:
| Q |
69 |
actgaaaatatgtttattatatcatattatgtggtgagagtgtacatttatataggtaagagtctcctagttaacccctaattaataaggaagattaatc |
168 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29656531 |
actgaaaatatgtttattatatcatattatgtggtgagagtgtacatttatataggtaagagtctcctagttaacccctaattaataaggaagattaatc |
29656432 |
T |
|
| Q |
169 |
aatacaatcaatacaatggctagtggagttgaaactaaatagtcacaacttttcaatatctccactaagtacttgattaattattctaaca |
259 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29656431 |
aatacaatcaatacaatggctagtggagttgaaactaaatagtcacaacttttcaatatctccactaagtacttgattaattattctaaca |
29656341 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 93 - 256
Target Start/End: Original strand, 26846592 - 26846755
Alignment:
| Q |
93 |
tattatgtggtgagagtgtacatttatataggtaagagtctcctagttaacccctaattaataaggaagattaatcaatacaatcaatacaatggctagt |
192 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || |
|
|
| T |
26846592 |
tattatgtggtgagaatgtacatttatataggtaggagtcttctagttaacccctaattaataaggaagattaatcaatacaatgaatacaatgattggt |
26846691 |
T |
|
| Q |
193 |
ggagttgaaactaaatagtcacaacttttcaatatctccactaagtacttgattaattattcta |
256 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26846692 |
ggagttaaaactaaatagtcacaacttttcaatatctccactaagtacttgattaattattcta |
26846755 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 224 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 34077644 - 34077606
Alignment:
| Q |
224 |
atatctccactaagtacttgattaattattctaacatca |
262 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34077644 |
atatctccactaagtacttgattaattattctaacatca |
34077606 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 13)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 25 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 46073296 - 46073062
Alignment:
| Q |
25 |
gtagacatggctctggatcaagaagctctagataccatattaatactgaaaatatgtttattatatcatattatgtggtgagagtgtacatttatatagg |
124 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46073296 |
gtagacatggctctggatcaagaagctctagataccatattagaactgaaaatatgtttattatatcatattatgtggtgagagtgtacatttatatagg |
46073197 |
T |
|
| Q |
125 |
taagagtctcctagttaacccctaattaataaggaagattaatcaatacaatcaatacaatggctagtggagttgaaactaaatagtcacaacttttcaa |
224 |
Q |
| |
|
|| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46073196 |
taggagtctcctggttaacccctaattaataaggaagattaatcaattcaatcaatacaatgactagtggagttaaaactaaatagtcacaacttttcaa |
46073097 |
T |
|
| Q |
225 |
tatctccactaagtacttgattaattattctaaca |
259 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
46073096 |
tatctccactaagtacttgattaattattctaaca |
46073062 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 25 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 55488588 - 55488353
Alignment:
| Q |
25 |
gtagacatggctctggatcaagaagctctagataccatattaatactgaaaatatgtttattatatcatattatgtggtgagagtgtacatttatatagg |
124 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
55488588 |
gtagacatggctctagatcaagaagctctagataccatattagaactgaaaatatgtttattatatcatattatgtggtgagagtgtacatttatatagg |
55488489 |
T |
|
| Q |
125 |
taagagtctcctagttaacccctaattaataaggaagattaatcaatacaatcaatacaatggctagtggagttgaaactaaatagtcacaacttttcaa |
224 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
55488488 |
taggagtctcctagttaacccataattaataagaaagattaatcaatacaatcaatacaatgactagtggagttaaaactaaatagtcacaacttttcaa |
55488389 |
T |
|
| Q |
225 |
tatctccactaagtacttgattaattattctaacat |
260 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
55488388 |
tatctccactaagtacttgattaattattctaacat |
55488353 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 69 - 259
Target Start/End: Original strand, 38323224 - 38323414
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| Q |
69 |
actgaaaatatgtttattatatcatattatgtggtgagagtgtacatttatataggtaagagtctcctagttaacccctaattaataaggaagattaatc |
168 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
38323224 |
actgaaaatatgtttattatatcatattatgtggtgagagtgtacatttatataggtaagagtctcctagttaacccctaattaataaggaagattaatc |
38323323 |
T |
|
| Q |
169 |
aatacaatcaatacaatggctagtggagttgaaactaaatagtcacaacttttcaatatctccactaagtacttgattaattattctaaca |
259 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38323324 |
aatacaatcaatacaatggctagtggagttgaaactaaatagtcacaacttttcaatatctccactaagtacttgattaattattctaaca |
38323414 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 69 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 46077841 - 46077651
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| Q |
69 |
actgaaaatatgtttattatatcatattatgtggtgagagtgtacatttatataggtaagagtctcctagttaacccctaattaataaggaagattaatc |
168 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
46077841 |
actgaaaatatgtttattatatcatattatgtggtgagagtgtacatttatataggtaggagtctcctagttaacccctaattaataaggaagattaatc |
46077742 |
T |
|
| Q |
169 |
aatacaatcaatacaatggctagtggagttgaaactaaatagtcacaacttttcaatatctccactaagtacttgattaattattctaaca |
259 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
46077741 |
aataatatcaatacaatgactagtggagttaaaactaaatagtcacaacttttcaatatctccactaactacttgattaattattataaca |
46077651 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 69 - 259
Target Start/End: Original strand, 33822958 - 33823146
Alignment:
| Q |
69 |
actgaaaatatgtttattatatcatattatgtggtgagagtgtacatttatataggtaagagtctcctagttaacccctaattaataaggaagattaatc |
168 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33822958 |
actgaaaatat--ttattatatcatattatgtgatgagagtgtacatttatataggtaggagtcttctagttaacccctaattaataaggaagattaatc |
33823055 |
T |
|
| Q |
169 |
aatacaatcaatacaatggctagtggagttgaaactaaatagtcacaacttttcaatatctccactaagtacttgattaattattctaaca |
259 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33823056 |
aatacaatcaatacaatgactagtggagttaaaactaaatagtcacaacttttcaatatctctactaagtacttgattaattattctaaca |
33823146 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 69 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 55493357 - 55493177
Alignment:
| Q |
69 |
actgaaaatatgtttattatatcatattatgtggtgagagtgtacatttatataggtaagagtctcctagttaacccctaattaataaggaagattaatc |
168 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
55493357 |
actgaaaatatgtttattatatcatattatgtggtgagagtgtacattt-tataggtaggagtctcctagttaacccctaattaataaggaagattaatc |
55493259 |
T |
|
| Q |
169 |
aatacaatcaatacaatggctagtggagttgaaactaaatagtcacaacttttcaatatctccactaagtacttgattaattattctaaca |
259 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
55493258 |
aata---------caatgactagtggagttaaaactaaatagtcacaacttttcaatatctccactaagtacttgattaattattctaaca |
55493177 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 104 - 260
Target Start/End: Original strand, 44742700 - 44742856
Alignment:
| Q |
104 |
gagagtgtacatttatataggtaagagtctcctagttaacccctaattaataaggaagattaatcaatacaatcaatacaatggctagtggagttgaaac |
203 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
44742700 |
gagaatgtacattcatataggtaggagtctcctagttaactcctaattaataaggaagattaatcaacacaatcaatacaatgactagtggagttaaaac |
44742799 |
T |
|
| Q |
204 |
taaatagtcacaacttttcaatatctccactaagtacttgattaattattctaacat |
260 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44742800 |
taaatagtcacaactttccaatatctccactaagtacttgattaattattctaacat |
44742856 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 64 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 36501223 - 36501057
Alignment:
| Q |
64 |
ttaatactgaaaatatgtttattatatcatattatgtggtgagagtgtacatttatataggtaagagtctcctagttaacccctaattaataaggaagat |
163 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||| | || ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36501223 |
ttaagactgaaaatatgtttctcatatcaaattatgtggggtgaatgtacatttatatgggtaggagtctcctagttaacccctaattaataaggaagac |
36501124 |
T |
|
| Q |
164 |
taatcaatacaatcaatacaatggctagtggagttgaaactaaatagtcacaacttttcaatatctc |
230 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
36501123 |
taatcaatacaatcaatacaataaatagtgaagttgaaactaaatagtcacaactttccaatatctc |
36501057 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 49 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 36497619 - 36497438
Alignment:
| Q |
49 |
gctctagataccatattaatactgaaaatatgtttattatatcatattatgtggtgagagtgtacatttatataggtaagagtctcctagttaaccccta |
148 |
Q |
| |
|
||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||| | || ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36497619 |
gctctggataccatcttaagactgaaaatatgtttctcatatcaaattatgtggggtgaatgtacatttatatgggtaggagtctcctagttaaccccta |
36497520 |
T |
|
| Q |
149 |
attaataaggaagattaatcaatacaatcaatacaatggctagtggagttgaaactaaatagtcacaacttttcaatatctc |
230 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
36497519 |
attaataaggaagactaatcaatccaatcaatacaataaatagtgaagttagaactaaatagtcacaactttccaatatctc |
36497438 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 87
Target Start/End: Original strand, 38328013 - 38328086
Alignment:
| Q |
14 |
agggagaagacgtagacatggctctggatcaagaagctctagataccatattaatactgaaaatatgtttatta |
87 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38328013 |
agggagaagacgtagacatggctctggatcaagaagctctagataccatattagaactgaaaatatgtttatta |
38328086 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 69 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 38328166 - 38328106
Alignment:
| Q |
69 |
actgaaaatatgtttattatatcatattatgtggtgagagtgtacatttatataggtaaga |
129 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38328166 |
actgaaaatatgtttattatatcatattatgtggtgagagtgtacatttatataggtaaga |
38328106 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 69 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 11901969 - 11901855
Alignment:
| Q |
69 |
actgaaaatatgtttattatatcatattatgtggtgagagtgtaca--tttatataggtaagagtctcctagttaacccctaattaataaggaagattaa |
166 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||| || ||||| || ||| | |||| | |||||||| | ||| ||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
11901969 |
actgaaaatatgttcattatattatgttatgagggcagaatatacagttatatataggcaggagcctcctagttaatccccaatcaatagggaagattaa |
11901870 |
T |
|
| Q |
167 |
tcaatacaatcaata |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| |
|
|
| T |
11901869 |
tcaatacaataaata |
11901855 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 260
Target Start/End: Original strand, 33826390 - 33826425
Alignment:
| Q |
225 |
tatctccactaagtacttgattaattattctaacat |
260 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33826390 |
tatctccactaagtacttgattaattattctaacat |
33826425 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0167 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0167
Description:
Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 69 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 31931 - 31745
Alignment:
| Q |
69 |
actgaaaatatgtttattatatcatattatgtggtgagagtgtacatttatataggtaagagtctcctagttaacccctaattaataaggaagattaatc |
168 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31931 |
actgaaaatatgtttattatatcatattatgttgtgagagtgtacatttatataggtaggagtctgctagttaacccctaattaataaggaagattaatc |
31832 |
T |
|
| Q |
169 |
aatacaatcaatacaatggctagtggagttgaaactaaatagtcacaacttttcaatatctccactaagtacttgattaattattct |
255 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31831 |
aatacaatcaatacaatgactagtggagttaaaactaaatagtcacaacttttcaatatctccactaagtacttgattaattattct |
31745 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4 (Bit Score: 160; Significance: 3e-85; HSPs: 6)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 69 - 259
Target Start/End: Original strand, 56135113 - 56135304
Alignment:
| Q |
69 |
actgaaaatatgtttattatatcatattatgtggtgagagtgtacatttatataggtaagagtctcctagttaacccctaattaataaggaagattaatc |
168 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
56135113 |
actgaaaatatgtttattatatcatattatgtggtgagaatgtacatttatataggtaggagtctcctagttaaccccttattaataaggaagattaatc |
56135212 |
T |
|
| Q |
169 |
aatacaatcaatacaatggctagtggagttgaaactaaatagtcacaa-cttttcaatatctccactaagtacttgattaattattctaaca |
259 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
56135213 |
aacacaatcaatacaatgactagtggagttaaaactaaatagtcacaatcttttcaatatctccactaagtacttgattaattattctaaca |
56135304 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 49 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 37073870 - 37073689
Alignment:
| Q |
49 |
gctctagataccatattaatactgaaaatatgtttattatatcatattatgtggtgagagtgtacatttatataggtaagagtctcctagttaaccccta |
148 |
Q |
| |
|
||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
37073870 |
gctctggataccatcttaagactgaaaatatgtttatcatatcaaattatgtggggaaaatgtacatttatatgggtgggagtctcctagttaatcccta |
37073771 |
T |
|
| Q |
149 |
attaataaggaagattaatcaatacaatcaatacaatggctagtggagttgaaactaaatagtcacaacttttcaatatctc |
230 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37073770 |
attaataaggaagattaatcaatacaatcaatacaataaatattgaagttaaaactaaatagtcacaacttttcaatatctc |
37073689 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 70 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 37077408 - 37077257
Alignment:
| Q |
70 |
ctgaaaatatgtttattatatcatattatgtggtgagagtgtacatttatataggtaagagtctcctagttaacccctaattaataaggaagattaatca |
169 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37077408 |
ctgaaaatatgtttatcatatcaaattatgtggggagaatgtacatttatatgggtaggagtctcctagttaatccctaattaataaggaagattaatca |
37077309 |
T |
|
| Q |
170 |
atacaatcaatacaatggctagtggagttgaaactaaatagtcacaacttttcaatatctc |
230 |
Q |
| |
|
||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37077308 |
atacaataaa---------tagtgaagttaaaactaaatagtcacaacttttcaatatctc |
37077257 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 64 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 28830564 - 28830403
Alignment:
| Q |
64 |
ttaatactgaaaatatgtttattatatcatattatgtggtgagagtgtacatttatataggtaagagtctcctagttaacccctaattaataaggaagat |
163 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28830564 |
ttaagactgaaaatatgtt-----tatcatattatgtggggagaatgtacatttatatgggtagaagtctcctagttaatccctaattaataaggaagat |
28830470 |
T |
|
| Q |
164 |
taatcaatacaatcaatacaatggctagtggagttgaaactaaatagtcacaacttttcaatatctc |
230 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28830469 |
caatcaatacgatcaatacaataaatattgaagttaaaactaaatagtcacaacttttcaatatctc |
28830403 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 55 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 26549515 - 26549389
Alignment:
| Q |
55 |
gataccatattaatactgaaaatatgtttattatatcatattatgtggtgagagtgtacatttatataggtaagagtctcctagttaacccctaattaat |
154 |
Q |
| |
|
|||| ||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
26549515 |
gatatcatcttaagactgaaaatatgtttgttatatcatattatatggggagaatgttaatttatatgggtaggagtctcctagttaatccctaattaat |
26549416 |
T |
|
| Q |
155 |
aaggaagattaatcaatacaatcaata |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
26549415 |
aaggaagattaatcaatacaataaata |
26549389 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 129
Target Start/End: Original strand, 46240552 - 46240610
Alignment:
| Q |
71 |
tgaaaatatgtttattatatcatattatgtggtgagagtgtacatttatataggtaaga |
129 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
46240552 |
tgaaaatatgtttaatataccatattatgtgaggagaatgtacatttatataggaaaga |
46240610 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1284 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold1284
Description:
Target: scaffold1284; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 27 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 73 - 1
Alignment:
| Q |
27 |
agacatggctctggatcaagaagctctagataccatattaatactgaaaatatgtttattatatcatattatg |
99 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
73 |
agacatggctctggatcaagaagctctagataccatattagaactgaaaatatgtttattatatcatattatg |
1 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1270 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold1270
Description:
Target: scaffold1270; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 183 - 259
Target Start/End: Original strand, 1 - 77
Alignment:
| Q |
183 |
aatggctagtggagttgaaactaaatagtcacaacttttcaatatctccactaagtacttgattaattattctaaca |
259 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
1 |
aatgactagtggagttaaaactaaatagtcacaacttttcaatatctccactaactacttgattaattattataaca |
77 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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