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 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF21408_low_14 (Length: 372)

Name: NF21408_low_14
Description: NF21408
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF21408_low_14
NF21408_low_14
[»] chr5 (10 HSPs)
chr5 (18-362)||(244778-245122)
chr5 (18-362)||(29949587-29949931)
chr5 (18-362)||(29951225-29951569)
chr5 (251-362)||(38936717-38936828)
chr5 (168-359)||(16780615-16780804)
chr5 (286-362)||(21352695-21352771)
chr5 (298-362)||(21352606-21352670)
chr5 (234-343)||(23660940-23661049)
chr5 (234-343)||(23797521-23797630)
chr5 (188-337)||(258977-259125)
[»] chr4 (17 HSPs)
chr4 (18-362)||(15017980-15018324)
chr4 (18-362)||(15019620-15019964)
chr4 (18-362)||(13518297-13518644)
chr4 (18-362)||(39488487-39488834)
chr4 (18-362)||(9398956-9399303)
chr4 (176-359)||(13517922-13518105)
chr4 (18-92)||(9166926-9167000)
chr4 (144-362)||(11098499-11098718)
chr4 (144-362)||(42872895-42873112)
chr4 (286-362)||(46690508-46690584)
chr4 (144-362)||(21377201-21377418)
chr4 (274-362)||(18281342-18281429)
chr4 (144-343)||(19457618-19457816)
chr4 (170-352)||(24663911-24664095)
chr4 (165-263)||(30874982-30875080)
chr4 (289-360)||(22473681-22473750)
chr4 (270-341)||(19455904-19455975)
[»] chr1 (12 HSPs)
chr1 (18-362)||(36233308-36233652)
chr1 (18-362)||(24157391-24157737)
chr1 (18-359)||(20189134-20189478)
chr1 (18-362)||(20190767-20191114)
chr1 (93-365)||(48462803-48463074)
chr1 (167-362)||(36233845-36234040)
chr1 (152-364)||(48463831-48464040)
chr1 (18-362)||(20759106-20759443)
chr1 (144-362)||(40553903-40554120)
chr1 (273-362)||(31390149-31390237)
chr1 (273-362)||(40554650-40554738)
chr1 (18-51)||(31390245-31390278)
[»] chr7 (9 HSPs)
chr7 (18-362)||(9647272-9647619)
chr7 (18-362)||(7842676-7843023)
chr7 (18-359)||(9595773-9596117)
chr7 (18-359)||(9646736-9647080)
chr7 (24-362)||(40998562-40998903)
chr7 (24-362)||(41000421-41000763)
chr7 (92-362)||(23446662-23446932)
chr7 (319-362)||(24790122-24790165)
chr7 (319-362)||(24790156-24790199)
[»] chr2 (10 HSPs)
chr2 (18-362)||(22300233-22300580)
chr2 (18-362)||(18535639-18535986)
chr2 (18-362)||(24806620-24806969)
chr2 (18-362)||(24808476-24808825)
chr2 (219-362)||(31974034-31974177)
chr2 (238-362)||(22299690-22299814)
chr2 (144-362)||(44793275-44793492)
chr2 (301-362)||(24806089-24806151)
chr2 (273-362)||(44792615-44792703)
chr2 (238-267)||(31973965-31973994)
[»] chr8 (8 HSPs)
chr8 (18-362)||(8366107-8366454)
chr8 (18-362)||(17278012-17278358)
chr8 (178-362)||(17277409-17277593)
chr8 (210-362)||(6778187-6778338)
chr8 (144-362)||(17857163-17857380)
chr8 (144-362)||(23016561-23016778)
chr8 (289-362)||(23016372-23016444)
chr8 (319-362)||(17277677-17277720)
[»] chr3 (11 HSPs)
chr3 (18-362)||(25531636-25531983)
chr3 (18-362)||(16346634-16346981)
chr3 (18-362)||(5554128-5554475)
chr3 (18-362)||(47418313-47418660)
chr3 (18-362)||(23460202-23460549)
chr3 (93-362)||(5553198-5553467)
chr3 (142-362)||(16022616-16022836)
chr3 (19-362)||(47566476-47566821)
chr3 (167-327)||(32570515-32570674)
chr3 (186-362)||(2683485-2683660)
chr3 (268-314)||(25532821-25532867)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (18-362)||(54856-55204)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (18-362)||(86583-86926)
scaffold0026 (259-362)||(643-746)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (18-362)||(241046-241393)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (18-362)||(420-769)
[»] scaffold0146 (1 HSPs)
scaffold0146 (191-362)||(31591-31762)
[»] scaffold0269 (2 HSPs)
scaffold0269 (18-229)||(1740-1954)
scaffold0269 (271-362)||(1962-2051)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (251-362)||(22399-22510)
[»] scaffold0021 (2 HSPs)
scaffold0021 (243-362)||(17657-17776)
scaffold0021 (243-362)||(27188-27307)
[»] scaffold0094 (1 HSPs)
scaffold0094 (144-362)||(13365-13582)
[»] scaffold0321 (1 HSPs)
scaffold0321 (144-362)||(5220-5437)
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (144-362)||(11265-11481)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (144-362)||(4225-4442)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (144-362)||(375180-375392)
[»] chr6 (2 HSPs)
chr6 (323-362)||(12037064-12037103)
chr6 (325-362)||(12037016-12037053)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (318-362)||(8902-8946)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 337; Significance: 0; HSPs: 10)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 362
Target Start/End: Original strand, 244778 - 245122
Alignment:
Q  18 atgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggctaattatttctagacgttacatttccacaaacacctttaattcttcagcttacacac 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  244778 atgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggctaattatttctagacgttacaattccacaaacacctttaattcttcagcttacacac 244877  T
Q  118 tttaaccacgttttcaacttacaactcattttacaccattaaatattccgaatttgatcttgagtcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagcttt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  244878 tttaaccacgttttcaacttacaactcattttacaccattaaatatttcgaatttgatcttgagtcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagcttt 244977  T
Q  218 ccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatatagccaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaaccc 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  244978 ccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatatagccaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaaccc 245077  T
Q  318 aaaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  245078 aaaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 245122  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 29949931 - 29949587
Alignment:
Q  18 atgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggctaattatttctagacgttacatttccacaaacacctttaattcttcagcttacacac 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29949931 atgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggctaattatttctagacgttacaattccacaaacacctttaattcttcagcttacacac 29949832  T
Q  118 tttaaccacgttttcaacttacaactcattttacaccattaaatattccgaatttgatcttgagtcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagcttt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29949831 tttaaccacgttttcaacttacaactcattttacaccattaaatattccgaatttgatcttgaatcaaatagatgaaatgtagagaatttcgtaagcttt 29949732  T
Q  218 ccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatatagccaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaaccc 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29949731 ccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatatagccaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaaccc 29949632  T
Q  318 aaaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29949631 aaaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 29949587  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 29951569 - 29951225
Alignment:
Q  18 atgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggctaattatttctagacgttacatttccacaaacacctttaattcttcagcttacacac 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29951569 atgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggctaattatttctagacgttacaattccacaaacacctttaattcttcagcttacacac 29951470  T
Q  118 tttaaccacgttttcaacttacaactcattttacaccattaaatattccgaatttgatcttgagtcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagcttt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29951469 tttaaccacgttttcaacttacaactcattttacaccattaaatattccgaatttgatcttgaatcaaatagatgaaatgtagagaatttcgtaagcttt 29951370  T
Q  218 ccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatatagccaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaaccc 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29951369 ccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatatagccaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaaccc 29951270  T
Q  318 aaaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29951269 aaaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 29951225  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 251 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 38936828 - 38936717
Alignment:
Q  251 cagagctccagatatagccaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttcttttattccacaatgac 350  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  38936828 cagagctccatatatagccaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaattttgaacccaaaattgatttggttcttttatttcacaatgac 38936729  T
Q  351 tttattattctt 362  Q
    ||||||||||||    
T  38936728 tttattattctt 38936717  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 168 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 16780804 - 16780615
Alignment:
Q  168 aatttgatcttgagtcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatatag 267  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||||| ||| || ||  |||| ||||||| || | ||||||| |||||| ||||||||||||  ||| |||||||    
T  16780804 aatttgttcttgagttaaacagacgaaatgcagataactttctaagatttccaaggactcaaagatcgcctcaatcggacatccagaattccggatatag 16780705  T
Q  268 ccaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttcttttattccacaatgactttattatt 359  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16780704 ccaaaacaagacaaacacatcatgaactacgaaaataaaacattgaa-ccaaaattaattcaattcttttatt-cacaatgactttattatt 16780615  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 286 - 362
Target Start/End: Original strand, 21352695 - 21352771
Alignment:
Q  286 atcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21352695 atcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaattaggttcttttattccataatgactttattattctt 21352771  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 298 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 21352670 - 21352606
Alignment:
Q  298 gaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 362  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21352670 gaaaataaaactttgaatccaaaattaattaggttcttttattccataatgactttattattctt 21352606  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 234 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 23661049 - 23660940
Alignment:
Q  234 cacctcaaacggacatccagagctccagatatagccaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttc 333  Q
    |||||||| |||||||||| | ||| ||||||  | |||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  23661049 cacctcaatcggacatccataactctagatatgacaaaaacaagacagtcatataatcacctacgaaaataatac-ttgaaaccaaaattaatttggttc 23660951  T
Q  334 -ttttattcca 343  Q
     ||||||||||    
T  23660950 attttattcca 23660940  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 234 - 343
Target Start/End: Original strand, 23797521 - 23797630
Alignment:
Q  234 cacctcaaacggacatccagagctccagatatagccaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttc 333  Q
    |||||||| |||||||||| | ||| ||||||  | |||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  23797521 cacctcaatcggacatccataactctagatatgacaaaaacaagacagtcatataatcacctacgaaaataatac-ttgaaaccaaaattaatttggttc 23797619  T
Q  334 -ttttattcca 343  Q
     ||||||||||    
T  23797620 attttattcca 23797630  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 259125 - 258977
Alignment:
Q  188 agatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatatagccaaaacaagacagacatat 287  Q
    ||||||| |||||| ||||   ||||||||||  ||| | ||| ||||| ||||  ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||  |      
T  259125 agatgaattgtagacaattctctaagctttccgtcgaatcaaatatcacgtcaattggacatctagagctcaagatatagccgaaacaagacagaggtga 259026  T
Q  288 catgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttctttt 337  Q
    ||| || ||| ||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||||    
T  259025 catcacttacaaaaataacacttcgaa-ccaaaactaatttggttctttt 258977  T

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Target: chr4 (Bit Score: 337; Significance: 0; HSPs: 17)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 362
Target Start/End: Original strand, 15017980 - 15018324
Alignment:
Q  18 atgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggctaattatttctagacgttacatttccacaaacacctttaattcttcagcttacacac 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15017980 atgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggctaattatttctagacgttacaattccacaaacacctttaattcttcagcttacacac 15018079  T
Q  118 tttaaccacgttttcaacttacaactcattttacaccattaaatattccgaatttgatcttgagtcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagcttt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15018080 tttaaccacgttttcaacttacaactcattttacaccattaaatatttcgaatttgatcttgagtcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagcttt 15018179  T
Q  218 ccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatatagccaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaaccc 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15018180 ccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatatagccaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaaccc 15018279  T
Q  318 aaaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15018280 aaaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 15018324  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 362
Target Start/End: Original strand, 15019620 - 15019964
Alignment:
Q  18 atgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggctaattatttctagacgttacatttccacaaacacctttaattcttcagcttacacac 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15019620 atgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggctaattatttctagacgttacaattccacaaacacctttaattcttcagcttacacac 15019719  T
Q  118 tttaaccacgttttcaacttacaactcattttacaccattaaatattccgaatttgatcttgagtcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagcttt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15019720 tttaaccacgttttcaacttacaactcattttacaccattaaatatttcgaatttgatcttgagtcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagcttt 15019819  T
Q  218 ccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatatagccaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaaccc 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15019820 ccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatatagccaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaaccc 15019919  T
Q  318 aaaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15019920 aaaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 15019964  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 18 - 362
Target Start/End: Original strand, 13518297 - 13518644
Alignment:
Q  18 atgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggctaattatttctagacgttacatttccacaaacacc---tttaattcttcagcttaca 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||| |||||    
T  13518297 atgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtaaaggctaattatttctagacgttacaattccacaaacaccacctttaattcttcagattaca 13518396  T
Q  115 cactttaaccacgttttcaacttacaactcattttacaccattaaatattccgaatttgatcttgagtcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagc 214  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13518397 caatttaaccacgttttcaacttacaactcattttaaaccattaaatattccgaatttgcacttgagtcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagt 13518496  T
Q  215 tttccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatatagccaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaa 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13518497 tttccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatatagccaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaa 13518596  T
Q  315 cccaaaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13518597 cccaaaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 13518644  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 18 - 362
Target Start/End: Original strand, 39488487 - 39488834
Alignment:
Q  18 atgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggctaattatttctagacgttacatttccacaaacacc---tttaattcttcagcttaca 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| || ||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  39488487 atgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaagacttattatttctagacgttacaatttcacaaacaccacctttaattcttcagcttaca 39488586  T
Q  115 cactttaaccacgttttcaacttacaactcattttacaccattaaatattccgaatttgatcttgagtcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagc 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  39488587 cactttaaccacgttttcaacttacaactcattttaaaccattaaatattctgagtttgctcttgagtcaaacagatgaattgtggagaatttcgtaagc 39488686  T
Q  215 tttccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatatagccaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaa 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39488687 tttccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatctagagctccagatatagccaaaataagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaa 39488786  T
Q  315 cccaaaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 362  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  39488787 cccaaaattaattaggttcttttattccataatgaatttattattctt 39488834  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 18 - 362
Target Start/End: Original strand, 9398956 - 9399303
Alignment:
Q  18 atgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggctaattatttctagacgttacatttccacaaacacc---tttaattcttcagcttaca 114  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||| |||    
T  9398956 atgagaaggttacatattcatttgcacatttatttgtgaaggcttattatgtctagacgttacaattccacaaacaccgcctttaattcttcagctaaca 9399055  T
Q  115 cactttaaccacgttttcaacttacaactcattttacaccattaaatattccgaatttgatcttgagtcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagc 214  Q
    |||||||||||||| |||  |||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9399056 cactttaaccacgtcttctgcttatatatcattctacaccattaaatattccgaatttgctcttgagtcaaacagacgaaatgtagagaatttcgtaagc 9399155  T
Q  215 tttccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatatagccaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaa 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9399156 tttccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccatatatagccaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaa 9399255  T
Q  315 cccaaaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9399256 cccaaaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 9399303  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 176 - 359
Target Start/End: Original strand, 13517922 - 13518105
Alignment:
Q  176 cttgagtcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatatagccaaaaca 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||| ||||||||||||    
T  13517922 cttgagtcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaacgaacatcggaagctccagacatagccaaaaca 13518021  T
Q  276 agacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttcttttattccacaatgactttattatt 359  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13518022 agacagacatatcatgatctacgaaaataaaactttgaacccaaagttaatttggttcttttattccacaataactttattatt 13518105  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 9167000 - 9166926
Alignment:
Q  18 atgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggctaattatttctagacgttacatttccacaaac 92  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9167000 atgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggctaattatttctagacgttacaattccacaaac 9166926  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 144 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 11098718 - 11098499
Alignment:
Q  144 cattttacaccattaaatattccgaatttgatcttgagtcaaacagatgaaatgtaga-gaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaa 242  Q
    ||||||||||||| | |||| |||| |||| |  |||||| |||| |||||||||||| |||||| |||  ||||||||||  | ||||||||||||||     
T  11098718 cattttacaccatgatatatgccgattttgcttatgagtccaacatatgaaatgtagatgaattt-gtaccctttccaacgcttcaaagatcacctcaat 11098620  T
Q  243 cggacatccagagctccagatatagccaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaa-tttggttcttttattc 341  Q
    ||||  |||||||||| ||||||    || |||||||||| | || ||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||| |||| |||||||||||    
T  11098619 cggagttccagagctctagatatgatgaatacaagacagatacataatgacctacgaaaataacaatttgaaccaaaaaataaatttgattcttttattc 11098520  T
Q  342 cacaatgactttattattctt 362  Q
    || ||||| ||||||||||||    
T  11098519 cataatgaatttattattctt 11098499  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 144 - 362
Target Start/End: Original strand, 42872895 - 42873112
Alignment:
Q  144 cattttacaccattaaatattccgaatttgatcttgagtcaaacagatgaaatgtaga-gaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaa 242  Q
    ||||||||||||| | |||| |||| |||| |  | |||| |||| |||||||||||| |||||| |||  ||||||||||  | ||||||||||||||     
T  42872895 cattttacaccatgatatatgccgattttgcttataagtccaacatatgaaatgtagatgaattt-gtaccctttccaacgcttcaaagatcacctcaat 42872993  T
Q  243 cggacatccagagctccagatatagccaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttcttttattcc 342  Q
    |||   |||||||||| ||||||    || |||||||| | | || ||||||||||||||||| | |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  42872994 cgggattccagagctctagatatgatgaatacaagacatatacataatgacctacgaaaataacaatttgaaccaaaaat-aatttgattcttttattcc 42873092  T
Q  343 acaatgactttattattctt 362  Q
    | ||||| ||||||||||||    
T  42873093 ataatgaatttattattctt 42873112  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 286 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 46690584 - 46690508
Alignment:
Q  286 atcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  46690584 atcatgacctacgaaaataaaactttaaatttaaaattaatttagttcttttattccacactgactttattattctt 46690508  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 144 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 21377418 - 21377201
Alignment:
Q  144 cattttacaccattaaatattccgaatttgatcttgagtcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaac 243  Q
    ||||||||||||| | |||| |||| |||| |  |||||| |||| ||||||||||||  |||| |||  ||||||| |   | |||||||||||||| |    
T  21377418 cattttacaccatgatatatgccgattttgcttctgagtccaacatatgaaatgtagatgattttgtaccctttccatcacttcaaagatcacctcaatc 21377319  T
Q  244 ggacatccagagctccagatatagccaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttcttttattcca 343  Q
     ||  | || ||||| ||||||    || | |||||||| | || ||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  21377318 agagttgcaaagctctagatatgatgaatataagacagatacataatgacctacgaaaataaaaatctgaaccaaaaat-aatttggttcttttattcca 21377220  T
Q  344 caatgactttattattctt 362  Q
     | ||||||||||||||||    
T  21377219 tattgactttattattctt 21377201  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 274 - 362
Target Start/End: Original strand, 18281342 - 18281429
Alignment:
Q  274 caagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 362  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||||||   |||||||| ||||| |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  18281342 caagacagatacataatgacctacgaaaataactatttgaaccaaaaat-aatttgattcttttattcgataatgactttattattctt 18281429  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 144 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 19457816 - 19457618
Alignment:
Q  144 cattttacaccattaaatattccgaatttgatcttgagtcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaac 243  Q
    ||||||||||||  ||||||   |||| ||||||| |||| |||| | ||||| |||  ||| |  |||| |||||||||  ||||||||||||| || |    
T  19457816 cattttacaccaagaaatatgttgaatctgatcttaagtctaacataggaaatttaggaaatattctaagttttccaacgcattaaagatcaccttaatc 19457717  T
Q  244 ggacatccagagctccagatatagccaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttc-ttttattcc 342  Q
     |||||  ||| ||| ||||||| | |||||||||||| ||||| ||  |  |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  19457716 agacattgagaactctagatataacaaaaacaagacagccatat-atcgcaaacgaaaataacactttgaacc-aaaattaatttggttcattttattcc 19457619  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 170 - 352
Target Start/End: Original strand, 24663911 - 24664095
Alignment:
Q  170 tttgatcttgagtcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatatagcc 269  Q
    |||||||||||  | || |||||||||| ||| || ||  ||||||||||||| | ||||||||  | |||| |||||||| | | ||| |||||| | |    
T  24663911 tttgatcttgaccccaaaagatgaaatgcagataaatttctaagctttccaacaaattaaagattgcatcaatcggacatcgacatctctagatatggac 24664010  T
Q  270 aaaacaagacagacatatcatgacc--tacgaaaat-aaaactttgaacccaaaattaatttggttcttttattccacaatgactt 352  Q
    ||||||||||||| |||| |||| |  |||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| ||| ||| ||||    
T  24664011 aaaacaagacagatatataatgatctatacgaatataaaaactttgaa-ccaaaaataatttggttctcttatgccataataactt 24664095  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 165 - 263
Target Start/End: Original strand, 30874982 - 30875080
Alignment:
Q  165 ccgaatttgatcttgagtcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagat 263  Q
    ||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||   |||  ||| ||||||||||| ||||||||||| | |||| |||||||||||||| ||||    
T  30874982 ccgaatttgatcttgagtttaaatgatgaaatgtagaattttttttaaactttccaacgaattaaagatcacgttaaacagacatccagagctcaagat 30875080  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 289 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 22473750 - 22473681
Alignment:
Q  289 atgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattc 360  Q
    |||||| |||||||||| | |||||||| ||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22473750 atgaccaacgaaaataacaatttgaaccaaaaa--aaattggttcttttattccataatgactttattattc 22473681  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 270 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 19455975 - 19455904
Alignment:
Q  270 aaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttc-ttttattc 341  Q
    ||||||| |||||||||| || |||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  19455975 aaaacaaaacagacatataatcacctacaaaaataacactt-gaaaccaaaattaatttggttcattttattc 19455904  T

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Target: chr1 (Bit Score: 333; Significance: 0; HSPs: 12)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 36233652 - 36233308
Alignment:
Q  18 atgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggctaattatttctagacgttacatttccacaaacacctttaattcttcagcttacacac 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36233652 atgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggctaattatttctagacgttacaattccacaaacacctttaattcttcagcttacacac 36233553  T
Q  118 tttaaccacgttttcaacttacaactcattttacaccattaaatattccgaatttgatcttgagtcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagcttt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36233552 tttaaccacgttttcaacttacaactcattttacaccattaaatatttcgaatttgatcttgagtcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagcttt 36233453  T
Q  218 ccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatatagccaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaaccc 317  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36233452 ccaacgagttaaagatcgcctcaaacggacatccagagctccagatatagccaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaaccc 36233353  T
Q  318 aaaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36233352 aaaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 36233308  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 18 - 362
Target Start/End: Original strand, 24157391 - 24157737
Alignment:
Q  18 atgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggctaattatttctagacgttacatttccacaaacacc---tttaattcttcagcttaca 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||| |||||||    
T  24157391 atgaggaggttacatattcatttgca-attgatttgtgaaggcttattatttctagacgttacaattccacaaacaccacctttaattcttccgcttaca 24157489  T
Q  115 cactttaaccacgttttcaacttacaactcattttacaccattaaatattccgaatttgatcttgagtcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagc 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24157490 cactttaaccacgttttcaacttacaactcattttaaaccattaaatattccgaattttctcttgagttaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagc 24157589  T
Q  215 tttccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatatagccaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaa 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24157590 tttccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatatagctaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaa 24157689  T
Q  315 cccaaaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 362  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24157690 cccaaaattaattaggttcttttattccataatgactttattattctt 24157737  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 18 - 359
Target Start/End: Original strand, 20189134 - 20189478
Alignment:
Q  18 atgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggctaattatttctagacgttacatttccacaaacacc---tttaattcttcagcttaca 114  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||| ||||||||    
T  20189134 atgaggaggttatatattcatttgcacattgatttgtgaaggcttattatttctagacgttacaattccacaaacaccacctttaattcttaagcttaca 20189233  T
Q  115 cactttaaccacgttttcaacttacaactcattttacaccattaaatattccgaatttgatcttgagtcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagc 214  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  20189234 cactttaactacgttttcaacttacaactcactttacaccattaaatattccgactttgctcttgagtcaaacagatgaaatgtagagaattttgtaaac 20189333  T
Q  215 tttccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatatagccaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaa 314  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20189334 tttccaacaagttgaagatcacctcaaacggacatccagaactccagatatagccaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaa 20189433  T
Q  315 cccaaaattaatttggttcttttattccacaatgactttattatt 359  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20189434 accaaaattaatttggttcttttattccacaatgactttattatt 20189478  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 18 - 362
Target Start/End: Original strand, 20190767 - 20191114
Alignment:
Q  18 atgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggctaattatttctagacgttacatttccacaaacacc---tttaattcttcagcttaca 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  20190767 atgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggcttattatttcaagacgttacaattccacaaacaccacctttaattcttcagcttaca 20190866  T
Q  115 cactttaaccacgttttcaacttacaactcattttacaccattaaatattccgaatttgatcttgagtcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagc 214  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  20190867 cactttcatcacgttttcaacttacaactcattttaaaacattaaatattccgaatttgctcttgagtcaaacagatgaaatgtagataatttagtaagc 20190966  T
Q  215 tttccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatatagccaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaa 314  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20190967 tttccaaagagttaaagatcacctcaaacggacatccaaagctccagatatagtcaaaacaagacagacatatcatgacatacgaaaataaaactttgaa 20191066  T
Q  315 cccaaaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 362  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  20191067 cccaaaattaattaggttcttttattctataatgactttattattctt 20191114  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 93 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 48463074 - 48462803
Alignment:
Q  93 acctttaattcttcagcttacacactttaaccacgttttcaacttacaactcattttacaccattaaatattccgaatttgatcttgagtcaaacagatg 192  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  48463074 acctttaattcttcagtttacacactttaaccacgttttcaacttacaactcattttaaaccattaaatattccgaatttgctcttgaatcaaatagatg 48462975  T
Q  193 aaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatatagccaaaacaagacagacatatcatga 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  48462974 aaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacatcaaacggatatccagagctccaaatatagccaaaacaagacatacatatcatga 48462875  T
Q  293 cctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattcttctc 365  Q
    ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||||    
T  48462874 cctacaaaaataaaactttgaatctaaaattaatttgattctttt-tttcgcaatgactttattattcttctc 48462803  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 167 - 362
Target Start/End: Original strand, 36233845 - 36234040
Alignment:
Q  167 gaatttgatcttgagtcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatata 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36233845 gaatttgatcttgagtcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcgcctcaaacggacatccagagctccagatata 36233944  T
Q  267 gccaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36233945 gccaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 36234040  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 152 - 364
Target Start/End: Original strand, 48463831 - 48464040
Alignment:
Q  152 accattaaatattccgaatttgatcttgagtcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatcc 251  Q
    ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48463831 accattaaaaattccgaatttg--cttgagtcaaacagatgaaatgtaaagaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatcc 48463928  T
Q  252 agagctccagatatagccaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttcttttattccacaatgact 351  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  48463929 agagctccagatatagccaaaacaagacagacatatcatgacctacaaaaataaaa-tttgaacccaaaattattttggttcttttattccacaataact 48464027  T
Q  352 ttattattcttct 364  Q
    |||||||| ||||    
T  48464028 ttattattattct 48464040  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 18 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 20759443 - 20759106
Alignment:
Q  18 atgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggctaattatttctagacgttacatttccacaaacacc---tttaattcttcagcttaca 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||  |||||| |||| |||||| |||||||||||||   ||||||| ||||||||| |    
T  20759443 atgaggatgttacatattcatttgcacattgattaatcaaggcttgttatttatagatgttacaattccacaaacaccatctttaatttttcagcttata 20759344  T
Q  115 cactttaaccacgttttcaacttacaactcattttacaccattaaatattccgaatttgatcttgagtcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagc 214  Q
    |||||||| ||  | |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||        ||||||||||||| |||| |    
T  20759343 cactttaatcatatcttcaacttacagttcattttacaccattaaatattccgaatttgctcttcagacaaa--------atgtagagaattttgtaaac 20759252  T
Q  215 tttccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatata--gccaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttg 312  Q
    ||||||  |||| |||||| ||||||  |||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20759251 tttccatagagtaaaagattacctcactcggacatccagaactccatatatatagccaaaacaagacatacatatcatgacctacgaaaataaaactttg 20759152  T
Q  313 aacccaaaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 362  Q
    || ||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||    
T  20759151 aa-ccaaaattaatttggttctt---tttcacaatgactttattattctt 20759106  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 144 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 40554120 - 40553903
Alignment:
Q  144 cattttacaccattaaatattccgaatttgatcttgagtcaaacagatgaaatgtaga-gaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaa 242  Q
    ||||||||||||| | |||| |||| |||| |  |||||| | || |||||||||||| |||||| |||  ||||||||||  | ||||||||||||||     
T  40554120 cattttacaccatgatatatgccgattttgcttctgagtccagcatatgaaatgtagatgaattt-gtaccctttccaacgcttcaaagatcacctcaat 40554022  T
Q  243 cggacatccagagctccagatatagccaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttcttttattcc 342  Q
    ||||  |||||||||| ||||||    || |||||||||| | || ||||||||||||||||| | |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  40554021 cggagttccagagctctagatatgatgaatacaagacagatacataatgacctacgaaaataacaatttgaaccaaaaat-aatttgattcttttattcc 40553923  T
Q  343 acaatgactttattattctt 362  Q
    | ||||| ||||||||||||    
T  40553922 ataatgaatttattattctt 40553903  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 273 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 31390237 - 31390149
Alignment:
Q  273 acaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 362  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||||| | |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  31390237 acaagacagatacataatgacctacgaaaataacaatttgaaccaaaaat-aatttgattcttttattccataatgaatttattattctt 31390149  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 273 - 362
Target Start/End: Original strand, 40554650 - 40554738
Alignment:
Q  273 acaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 362  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||||| | |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  40554650 acaagacagatacataatgacctacgaaaataacaatttgaaccaaaaat-aatttgattcttttattccataatgaatttattattctt 40554738  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 31390278 - 31390245
Alignment:
Q  18 atgaggaggttacatattcatttgcacattgatt 51  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31390278 atgagaaggttacatattcatttgcacattgatt 31390245  T

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Target: chr7 (Bit Score: 298; Significance: 1e-167; HSPs: 9)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 18 - 362
Target Start/End: Original strand, 9647272 - 9647619
Alignment:
Q  18 atgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggctaattatttctagacgttacatttccacaaacacct---ttaattcttcagcttaca 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||| |||||    
T  9647272 atgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtaaaggctgattatttctagacgttacaattccacaaacacctcctttaattcttcaggttaca 9647371  T
Q  115 cactttaaccacgttttcaacttacaactcattttacaccattaaatattccgaatttgatcttgagtcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagc 214  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  9647372 caatttaaccacgttttcaacttacaactcattttaaaccattaaatattccgaatttgcacttgagtcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagt 9647471  T
Q  215 tttccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatatagccaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaa 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9647472 tttccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatatagccaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaa 9647571  T
Q  315 cccaaaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9647572 cccaaaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 9647619  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 18 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 7843023 - 7842676
Alignment:
Q  18 atgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggctaattatttctagacgttacatttccacaaacacct---ttaattcttcagcttaca 114  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||| |||||||||    
T  7843023 atgaagaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggcttattatttctagacgttacaattccacaaacacctcctttaattctccagcttaca 7842924  T
Q  115 cactttaaccacgttttcaacttacaactcattttacaccattaaatattccgaatttgatcttgagtcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagc 214  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||    
T  7842923 cactttaaccacgttttctacttacaactcattttaaaccattaaatattccgaatttgcacttgagtcaaacggatgaattgtatagaatttcgtaagc 7842824  T
Q  215 tttccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatatagccaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaa 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7842823 tttccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctctagatataaccaaaacaaaacagacatatcttgacctacgaaaataaaactttgaa 7842724  T
Q  315 cccaaaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7842723 cccaaaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 7842676  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 18 - 359
Target Start/End: Original strand, 9595773 - 9596117
Alignment:
Q  18 atgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggctaattatttctagacgttacatttccacaaacacct---ttaattcttcagcttaca 114  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||| |||||||||    
T  9595773 atgaggtggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggcttattatttctagacgttacaattccacaaacacctcctttaattctccagcttaca 9595872  T
Q  115 cactttaaccacgttttcaacttacaactcattttacaccattaaatattccgaatttgatcttgagtcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagc 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9595873 cactttaaccacgttttcaacttacaactcattttaagccattaaatattccgaatttgcacttgagtcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagc 9595972  T
Q  215 tttccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatatagccaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaa 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9595973 tttccaacgagttaaagatcacctcaaacgaacatcgggagctccagacatagccaaaacaagacagacatatcatgatctacgaaaataaaactttgaa 9596072  T
Q  315 cccaaaattaatttggttcttttattccacaatgactttattatt 359  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9596073 cccaaagttaatttggttcttttattccacaataactttattatt 9596117  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 18 - 359
Target Start/End: Original strand, 9646736 - 9647080
Alignment:
Q  18 atgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggctaattatttctagacgttacatttccacaaacacct---ttaattcttcagcttaca 114  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  9646736 atgaggtggttacatattcatttggacattgatttgtgaaggcttattatttctagacgttacaattccacaaacacctcctttaattcttcagcttaca 9646835  T
Q  115 cactttaaccacgttttcaacttacaactcattttacaccattaaatattccgaatttgatcttgagtcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagc 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9646836 cactttaaccacgttttcaacttacaactcattttaagccattaaatattccgaatttgcacttgagtcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagc 9646935  T
Q  215 tttccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatatagccaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaa 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9646936 tttccaacgagttaaagatcacctcaaacgaacatcggaagctccagacatagccaaaacaagacagacatatcatgatctacgaaaataaaactttgaa 9647035  T
Q  315 cccaaaattaatttggttcttttattccacaatgactttattatt 359  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9647036 cccaaagttaatttggttcttttattccacaataactttattatt 9647080  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 24 - 362
Target Start/End: Original strand, 40998562 - 40998903
Alignment:
Q  24 aggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggctaattatttctagacgttacatttccacaaacacc---tttaattcttcagcttacacacttt 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||  |||||||||||| ||||| |||||||   ||||||||||||||| ||| |||||    
T  40998562 aggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggattattatggctagacgttacaattccataaacaccacctttaattcttcagctaacatacttt 40998661  T
Q  121 aaccacgttttcaacttacaactcattttacaccattaaatattccgaatttgatcttgagtcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttcca 220  Q
    |||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40998662 aaccacgtcttctacttacagctcattttgcaccattaaatattaagaatttgctcttgaatcaaacagatgaaatgtagagaattttgtaagctttcca 40998761  T
Q  221 acgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatatagccaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaa 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40998762 acgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatatagccaaaataagacagacatatcatgacctacgaaaataaaattttgaacccaaa 40998861  T
Q  321 attaatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40998862 attaatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 40998903  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 24 - 362
Target Start/End: Original strand, 41000421 - 41000763
Alignment:
Q  24 aggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggctaattatttctagacgttacatttccacaaacacc---tttaattcttcagcttacacacttt 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||  |||||||||||| ||||| |||||||   ||||||||||||||| ||| |||||    
T  41000421 aggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggattattatggctagacgttacaattccataaacaccacctttaattcttcagctaacatacttt 41000520  T
Q  121 aaccacgttttcaacttacaactcattttacaccattaaatattccgaatttgatcttgagtcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttcca 220  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41000521 aaccacgtcttctacttacaactcattttgcaccattaaatattaagaatttgctcttgaatcaaacagatgaaatgtagagaatttcgcaagctttcca 41000620  T
Q  221 acgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatatagccaaaacaagacagacatatcatgacctacg-aaaataaaactttgaacccaa 319  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  41000621 acgagttagagatcacctcaaacggacatccagagctccagatatagccaaaacaagaccgacatatcatgacctacgaaaaataaaattttgaacccaa 41000720  T
Q  320 aattaatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41000721 aattaatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 41000763  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 92 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 23446932 - 23446662
Alignment:
Q  92 cacctttaattcttcagcttacacactttaaccacgttttcaacttacaactcattttacaccattaaatattccgaatttgatcttgagtcaaacagat 191  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  23446932 cacctttaattcttcagctaacatactttaaccacgtcttctacttacagctcattctgcaccattaaatattccgaatttgctcttgactcaaacagat 23446833  T
Q  192 gaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatatagccaaaacaagacagacatatcatg 291  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23446832 gaaatgtagagaatttggtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatatagccaaaacaagacagacatatcatg 23446733  T
Q  292 acctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23446732 acctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 23446662  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 319 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 24790165 - 24790122
Alignment:
Q  319 aaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24790165 aaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 24790122  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 319 - 362
Target Start/End: Original strand, 24790156 - 24790199
Alignment:
Q  319 aaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24790156 aaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 24790199  T

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Target: chr2 (Bit Score: 294; Significance: 1e-165; HSPs: 10)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 18 - 362
Target Start/End: Original strand, 22300233 - 22300580
Alignment:
Q  18 atgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggctaattatttctagacgttacatttccacaaacacc---tttaattcttcagcttaca 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||| ||    
T  22300233 atgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggcttattatttctagacgttacaattccacaaacaccacctttaattcttcagcttgca 22300332  T
Q  115 cactttaaccacgttttcaacttacaactcattttacaccattaaatattccgaatttgatcttgagtcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagc 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22300333 cactttaaccacgttttcaacttacaactcattttaaaccattaaatattccgaatttgctcttgagtcaaacagatgaaatgtagagaattccgtaagc 22300432  T
Q  215 tttccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatatagccaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaa 314  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22300433 tttccaacaagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccggatatagcaaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaa 22300532  T
Q  315 cccaaaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22300533 cccaaaattaatttggttcttttattccacaatgaatttattattctt 22300580  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 18 - 362
Target Start/End: Original strand, 18535639 - 18535986
Alignment:
Q  18 atgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggctaattatttctagacgttacatttccacaaacacc---tttaattcttcagcttaca 114  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||    
T  18535639 atgagaaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaatgcttattatggctagacgttacatttccacaaacaccacctttaattcttcagctaaca 18535738  T
Q  115 cactttaaccacgttttcaacttacaactcattttacaccattaaatattccgaatttgatcttgagtcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagc 214  Q
     ||||||||||||| ||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18535739 tactttaaccacgtcttctacttacagctcattctgcaccattaaatattccgaatttgctcttgactcaaacagatgaaatgtagagaattttgtaagc 18535838  T
Q  215 tttccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatatagccaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaa 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18535839 tttccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatatagccaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataagactttgaa 18535938  T
Q  315 cccaaaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18535939 cccaaaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 18535986  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 18 - 362
Target Start/End: Original strand, 24806620 - 24806969
Alignment:
Q  18 atgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggctaattatttc-tagacgttacatttccacaaacacc---tttaattcttcagcttac 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  | ||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||| ||    
T  24806620 atgagaaggttacatattcatttgcacattgatttttgaaggcttattatggcctagacgttacaattccacaaacaccacctttaattcttcagctaac 24806719  T
Q  114 acactttaaccacgttttcaacttacaactcattttacaccattaaatattccgaatttgatcttgagtcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaag 213  Q
    | ||||||||||||| ||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24806720 atactttaaccacgtcttctacttacagctcattctgcaccattaaatattccgaatttgctcttggatcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaag 24806819  T
Q  214 ctttccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatatagccaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttga 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24806820 ctttccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatccggagctccagatatagccaaaacaagacagacatatcatgacctacaaaaataaaactttga 24806919  T
Q  314 acccaaaattaatttggttcttttattccacaatgac-tttattattctt 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24806920 acccaaaattaatttggttcttttattccacaatgacttttattattctt 24806969  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 18 - 362
Target Start/End: Original strand, 24808476 - 24808825
Alignment:
Q  18 atgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggctaattatttc-tagacgttacatttccacaaacacc---tttaattcttcagcttac 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  | ||| ||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||| ||    
T  24808476 atgagaaggttacatattcatttgcacattgatttttgaaggcttattatggcctagccgttacaattccacaaacaccacctttaattcttcagctaac 24808575  T
Q  114 acactttaaccacgttttcaacttacaactcattttacaccattaaatattccgaatttgatcttgagtcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaag 213  Q
    | ||||||||||||| ||| | ||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24808576 atactttaaccacgtcttctaattacagctcattctgaaccattaaatattccgaatttgctcttggatcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaag 24808675  T
Q  214 ctttccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatatagccaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttga 313  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24808676 ctttccaatgagttaaagatcacctgaaacggacatccggagctccagatatagccaaaacaagacagacatatcatgacctacaaaaataaaactttga 24808775  T
Q  314 acccaaaattaatttggttcttttattccacaatgactt-tattattctt 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24808776 acccaaaattaatttggttcttttattccacaatgacttctattattctt 24808825  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 219 - 362
Target Start/End: Original strand, 31974034 - 31974177
Alignment:
Q  219 caacgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatatagccaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaaccca 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31974034 caacgagttaaagatcacctcaaacggacatccagaactcccgatatagccaaaacaagacaaacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaaccca 31974133  T
Q  319 aaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 362  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31974134 aaattaattaggttcttttattccataatgactttattattctt 31974177  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 238 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 22299814 - 22299690
Alignment:
Q  238 tcaaacggacatccagagctccagatatagccaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttctttt 337  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22299814 tcaagcggacatccaaagctccagatataggcaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttctttt 22299715  T
Q  338 attccacaatgactttattattctt 362  Q
    |||||||||||| ||||||||||||    
T  22299714 attccacaatgaatttattattctt 22299690  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 144 - 362
Target Start/End: Original strand, 44793275 - 44793492
Alignment:
Q  144 cattttacaccattaaatattccgaatttgatcttgagtcaaacagatgaaatgtaga-gaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaa 242  Q
    ||||||||||||| | |||| |||| |||| |  |||||| |||| |||||||||||| |||||| |||  ||||||||||  | ||||||||||||||     
T  44793275 cattttacaccatgatatatgccgattttgcttctgagtccaacatatgaaatgtagatgaattt-gtaccctttccaacgcttcaaagatcacctcaat 44793373  T
Q  243 cggacatccagagctccagatatagccaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttcttttattcc 342  Q
    ||||  |||||||||| ||||||    || |||||||||| | || ||||||||||||||||| | |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  44793374 cggagttccagagctctagatatgatgaatacaagacagatacataatgacctacgaaaataacaatttgaaccaaaaat-aatttgattcttttattcc 44793472  T
Q  343 acaatgactttattattctt 362  Q
    | ||||| ||||||||||||    
T  44793473 ataatgaatttattattctt 44793492  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 301 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 24806151 - 24806089
Alignment:
Q  301 aataaaactttgaacccaaaattaatttggttcttttattccacaatgac-tttattattctt 362  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24806151 aataaaacattgaacccaaaattaaattggttcttttattccacaatgacttttattattctt 24806089  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 273 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 44792703 - 44792615
Alignment:
Q  273 acaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 362  Q
    |||||||||| | || ||||||||| ||||||| | |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  44792703 acaagacagatacataatgacctacaaaaataacaatttgaaccaaaaat-aatttgattcttttattccataatgaatttattattctt 44792615  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 238 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 31973994 - 31973965
Alignment:
Q  238 tcaaacggacatccagagctccagatatag 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31973994 tcaaacggacatccagagctccagatatag 31973965  T

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Target: chr8 (Bit Score: 290; Significance: 1e-163; HSPs: 8)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 18 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 8366454 - 8366107
Alignment:
Q  18 atgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggctaattatttctagacgttacatttccacaaacacc---tttaattcttcagcttaca 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  8366454 atgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggcttattatttctagacgttacaattccacaaacaccacctttaattcttcagcttaca 8366355  T
Q  115 cactttaaccacgttttcaacttacaactcattttacaccattaaatattccgaatttgatcttgagtcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagc 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||    
T  8366354 cactttaaccacgttttcaacttacaactcattttaaaccgttaaatattccgaatttgctcttgagtcaaatagataaaatgtagagaattccgtaagc 8366255  T
Q  215 tttccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatatagccaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaa 314  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8366254 tttcaaacgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccaaatatagccaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaa 8366155  T
Q  315 cccaaaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8366154 cccaaaattaatttggttcttttattccacaatgaatttattattctt 8366107  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 18 - 362
Target Start/End: Original strand, 17278012 - 17278358
Alignment:
Q  18 atgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggctaattatttctagacgttacatttccacaaacacc---tttaattcttcagcttaca 114  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||| |||    
T  17278012 atgagaaggttacatattcattttcacattgatttgtgaaggcttattatgtctagacgttacaattccacaaacaccacctttaattcttcagctaaca 17278111  T
Q  115 cactttaaccacgttttcaacttacaactcattttacaccattaaatattccgaatttgatcttgagtcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagc 214  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  17278112 cactttaaccacgtcttctacttatagctcattctacaccactaaatattccgaatttgcttttgagtcaaacagacgaaatgtagaaaatttcgtaagc 17278211  T
Q  215 tttccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatatagccaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaa 314  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |    
T  17278212 tttccaatgagttaaagatcacctcaaacggacatctagagctccagatatagccaaaacaagacagacatatcatgacttacgaaaat-aaactttgga 17278310  T
Q  315 cccaaaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17278311 cccaaaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 17278358  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 178 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 17277593 - 17277409
Alignment:
Q  178 tgagtcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatatagccaaaacaag 277  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17277593 tgagtcaaacagacgaaatgtagagaattccgtaagctttccaatgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatatagccaaaacaag 17277494  T
Q  278 acagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 362  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17277493 acatacatatcatgacctacaaaaataaaactttgaacccaaaattaatttgattcttttattccacaatgactttattattctt 17277409  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 210 - 362
Target Start/End: Original strand, 6778187 - 6778338
Alignment:
Q  210 taagctttccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatatagccaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaact 309  Q
    ||||||||| || || | ||||| |||||||  || | || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||    
T  6778187 taagctttctaaagactcaaagaacacctcactcgaatattcagagctccaaatatagccaaaacaagacagacatatcatgacatgtgtaaataaaact 6778286  T
Q  310 ttgaacccaaaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 362  Q
    | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6778287 tagaa-ccaaaattaattcggttcttttattccacaataactttattattctt 6778338  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 144 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 17857380 - 17857163
Alignment:
Q  144 cattttacaccattaaatattccgaatttgatcttgagtcaaacagatgaaatgtaga-gaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaa 242  Q
    ||||||||||||| | |||| |||| |||| |  |||||| |||| |||||||||||| |||||| |||  ||||||||||  | ||||||||||||||     
T  17857380 cattttacaccatgatatatgccgattttgcttctgagtccaacatatgaaatgtagatgaattt-gtaccctttccaacgcttcaaagatcacctcaat 17857282  T
Q  243 cggacatccagagctccagatatagccaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttcttttattcc 342  Q
    ||||  |||||||||| ||||||    || |||||||||| | || ||||||||||||||||| | |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  17857281 cggagttccagagctctagatatgatgaatacaagacagatacataatgacctacgaaaataacaatttgaaccaaaaat-aatttgattcttttattcc 17857183  T
Q  343 acaatgactttattattctt 362  Q
    | ||||| ||||||||||||    
T  17857182 ataatgaatttattattctt 17857163  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 144 - 362
Target Start/End: Original strand, 23016561 - 23016778
Alignment:
Q  144 cattttacaccattaaatattccgaatttgatcttgagtcaaacagatgaaatgtaga-gaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaa 242  Q
    ||||||||||||| | |||| |||| |||| |  |||||| |||| |||||||||||| |||||| |||  ||||||||||  | ||| ||||||||||     
T  23016561 cattttacaccatgatatatgccgattttgcttatgagtccaacatatgaaatgtagatgaattt-gtaccctttccaacgcttcaaatatcacctcaat 23016659  T
Q  243 cggacatccagagctccagatatagccaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttcttttattcc 342  Q
     |||  | |||| ||| ||||||    || |||||||||| | || ||||||||||||||||| | |||||| |||||| ||||||| || |||||||||    
T  23016660 tggagttgcagaactctagatatgatgaatacaagacagatacataatgacctacgaaaataacaatttgaa-ccaaaaataatttgatttttttattcc 23016758  T
Q  343 acaatgactttattattctt 362  Q
    | || ||||||| |||||||    
T  23016759 ataacgactttaatattctt 23016778  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 289 - 362
Target Start/End: Original strand, 23016372 - 23016444
Alignment:
Q  289 atgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 362  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  23016372 atgacctacgaaaataacaatttgaaccaaaaat-aatttgattcttttattccataatgactttaatattctt 23016444  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 319 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 17277720 - 17277677
Alignment:
Q  319 aaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17277720 aaattaatttggttcttttattccataatgactttattattctt 17277677  T

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Target: chr3 (Bit Score: 286; Significance: 1e-160; HSPs: 11)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 18 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 25531983 - 25531636
Alignment:
Q  18 atgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggctaattatttctagacgttacatttccacaaacacc---tttaattcttcagcttaca 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  25531983 atgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggcttattatttctagacgttacaattccacaaacaccacctttaattcttcagcttaca 25531884  T
Q  115 cactttaaccacgttttcaacttacaactcattttacaccattaaatattccgaatttgatcttgagtcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagc 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  25531883 cactttaaccacgttttcaacttacaactcattttaaaccattaaatattctgaatttgctcttaagtcaaacagatgaaatgtagagaattccataagc 25531784  T
Q  215 tttccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatatagccaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaa 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25531783 tttccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatatagtcaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaa 25531684  T
Q  315 cccaaaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 362  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  25531683 cccaaaattaatttggttctttttttctacaatgaatttattattctt 25531636  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 18 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 16346981 - 16346634
Alignment:
Q  18 atgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggctaattatttctagacgttacatttccacaaacacc---tttaattcttcagcttaca 114  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||    
T  16346981 atgagaaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaatgcttattatggctagacgttacatttccacaaacaccacctttaattcttcagctaaca 16346882  T
Q  115 cactttaaccacgttttcaacttacaactcattttacaccattaaatattccgaatttgatcttgagtcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagc 214  Q
     ||||||||||||| ||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16346881 tactttaaccacgtcttctacttacagctcattctgcaccattaaatattctgaatttgctcttgactcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagc 16346782  T
Q  215 tttccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatatagccaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaa 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16346781 tttccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatatagccaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataagactttgaa 16346682  T
Q  315 cccaaaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16346681 cccaaaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 16346634  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 18 - 362
Target Start/End: Original strand, 5554128 - 5554475
Alignment:
Q  18 atgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggctaattatttctagacgttacatttccacaaacacc---tttaattcttcagcttaca 114  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||| |||    
T  5554128 atgagaaggttacatattcatttacacattgatttgtgaaggcttattatggctagacgttacaattccacaaacaccacctttaattcttcagctaaca 5554227  T
Q  115 cactttaaccacgttttcaacttacaactcattttacaccattaaatattccgaatttgatcttgagtcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagc 214  Q
     ||||||||||||| ||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5554228 tactttaaccacgtcttctacttacagctcattctgcaccattaaatattccgaatttgctcttgaatcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagc 5554327  T
Q  215 tttccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatatagccaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaa 314  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5554328 tatccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatatagccaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaattttgaa 5554427  T
Q  315 cccaaaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5554428 cccaaaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 5554475  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 18 - 362
Target Start/End: Original strand, 47418313 - 47418660
Alignment:
Q  18 atgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggctaattatttctagacgttacatttccacaaacacc---tttaattcttcagcttaca 114  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||    
T  47418313 atgagaaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaatgcttattatggctagacgttacatttccacaaacaccacctttaattcttcagctaaca 47418412  T
Q  115 cactttaaccacgttttcaacttacaactcattttacaccattaaatattccgaatttgatcttgagtcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagc 214  Q
     ||||||||||||| ||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  47418413 tactttaaccacgtcttctacttacagctcattctgcaccattaaatattctgaatttgctcttgactcaaacagatgaaatgtagagaattttgtaagc 47418512  T
Q  215 tttccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatatagccaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaa 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  47418513 tttccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatatagccaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataagactttgaa 47418612  T
Q  315 cccaaaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47418613 cccaaaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 47418660  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 18 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 23460549 - 23460202
Alignment:
Q  18 atgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggctaattatttctagacgttacatttccacaaacacc---tttaattcttcagcttaca 114  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||| |||    
T  23460549 atgagaaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggcttattatggctagacgttacaattccacaaacaccacctttaattcttcagctaaca 23460450  T
Q  115 cactttaaccacgttttcaacttacaactcattttacaccattaaatattccgaatttgatcttgagtcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagc 214  Q
     ||||||||||||| ||| || |||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23460449 tactttaaccacgtcttctacctacagctcattctgcaccattaaatattccgaatttgctcttgaatcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagc 23460350  T
Q  215 tttccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatatagccaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaa 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23460349 tttccaacgagttaaagatcacctcaaacggatatccagagctccagatatagccaaaacaagacagacatataatgacctacgaaaataaaactttgaa 23460250  T
Q  315 cccaaaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23460249 cccaaaattaatttggttcttttattctacaatgactttattattctt 23460202  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 93 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 5553467 - 5553198
Alignment:
Q  93 acctttaattcttcagcttacacactttaaccacgttttcaacttacaactcattttacaccattaaatattccgaatttgatcttgagtcaaacagatg 192  Q
    ||||||||||||||| || ||| |||| |||||||| ||| ||||||| |||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||||    
T  5553467 acctttaattcttcaactaacatacttcaaccacgtcttctacttacagctcattctgcaccattaaatatttcgaatttgctcttgaattaaacagatg 5553368  T
Q  193 aaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatatagccaaaacaagacagacatatcatga 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5553367 aaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatatagccaaaacaagatagacatatcatga 5553268  T
Q  293 cctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 362  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5553267 cctacgaaaataaaattttgaacccaaaattaatttggttcttttatttcacaatgactttattattctt 5553198  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 142 - 362
Target Start/End: Original strand, 16022616 - 16022836
Alignment:
Q  142 ctcattttacaccattaaatattccgaatttgatcttgagtcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaa 241  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16022616 ctcattctacaccactaaatattccgaatttgatcttgagtcaaacagacgaaatgtagagaacttcgtaagctttccaacgagttaaagaccacctcaa 16022715  T
Q  242 acggacatccagagctccagatatagccaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttcttttattc 341  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16022716 acggacatccagagcttcagatatagccaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttggacccaaaattaatttggttcttttattc 16022815  T
Q  342 cacaatgactttattattctt 362  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  16022816 cacaatgactttattattctt 16022836  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 19 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 47566821 - 47566476
Alignment:
Q  19 tgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggctaattatttctagacgttacatttccacaaacacc---tttaattcttcagcttacac 115  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||||   |||||||||||| ||| |||    
T  47566821 tgagaaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaagcttattatttctagaaattacaattccacaaacaccacttttaattcttcaacttgcac 47566722  T
Q  116 actttaaccacgttttcaacttacaactcattttacaccattaaatattccgaatttgatcttgagtcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagct 215  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||  |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  47566721 actttaatcacgtcttcaacttacagctcattctacaccattaaatattttgaatttgctc--gagtcaaacagacgaaatgtaaagaattttgtaagct 47566624  T
Q  216 ttccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatatagccaaaacaagacagac--atatcatgacctacgaaaataaaactttga 313  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| ||| |    
T  47566623 ttccaacgaattaaagatcacctcaatcgaacatccatagctccagatatagccaagacaagacaaacatatatcatgatctacgaaaataaaa-tttta 47566525  T
Q  314 acccaaaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 362  Q
    |  ||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47566524 aatcaaaattaaatcaattcttttattccacaatgactttattattctt 47566476  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 167 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 32570674 - 32570515
Alignment:
Q  167 gaatttgatcttgagtcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatata 266  Q
    ||||||| ||| |||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    ||||||||| |||||||||||    
T  32570674 gaatttgctctcgagtcaaacatacaaaatgtagataattttgtaagctttccaacgaattaaagatcacctcaatataacatccagaactccagatata 32570575  T
Q  267 gccaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatt 327  Q
    |  ||||||| | |||||||| |||| |||||||||||| | || ||| ||||||||||||    
T  32570574 gtaaaaacaaaatagacatataatgatctacgaaaataacatttagaa-ccaaaattaatt 32570515  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 186 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 2683660 - 2683485
Alignment:
Q  186 acagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatatagccaaaacaagacagacat 285  Q
    ||||| ||||| |||| ||||| |||| | || |||||| ||||||||||  | || ||||||| || ||  | ||||||||  |||| |||||||||||    
T  2683660 acagacgaaatatagataattttgtaatcatttcaacgaattaaagatcatttgaatcggacattcaaagtcctagatatagataaaataagacagacat 2683561  T
Q  286 atcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 362  Q
     | |||| |||| ||||||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  2683560 gttatgatctacaaaaataacactttgaaca-aaaattaatttgatttttttattccaaaatgattttattattctt 2683485  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 268 - 314
Target Start/End: Original strand, 25532821 - 25532867
Alignment:
Q  268 ccaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaa 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25532821 ccaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaa 25532867  T

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Target: scaffold0025 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 18 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 55204 - 54856
Alignment:
Q  18 atgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggctaattatttctagacgttacatttccacaaacacc---tttaattcttcagcttaca 114  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||| |||    
T  55204 atgagaaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggcttattatggctagacgttacaattccacaaacaccacctttaattcttcagctaaca 55105  T
Q  115 cactttaaccacgttttcaacttacaactcattttacaccattaaatattccgaatttgatcttgagtcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagc 214  Q
     ||||||||||||| ||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  55104 tactttaaccacgtcttctacttacagctcattctgcaccattaaatattccgaatttgctcttgaatcaaacagatgaaatgtagagaattttgtaagc 55005  T
Q  215 tttccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatatagccaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaa 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  55004 tttccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatatagcgaaaacaagacagacatagcatgacctacgaaaataaaactttgaa 54905  T
Q  315 cccaaaattaatttggttcttttattccacaatgac-tttattattctt 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  54904 cccaaaattaatttggttcttttattccacaatgacttttattattctt 54856  T

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Target: scaffold0026 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 18 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 86926 - 86583
Alignment:
Q  18 atgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggctaattatttctagacgttacatttccacaaacacc---tttaattcttcagcttaca 114  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||     
T  86926 atgaggaggttacatattgattttcacattgatttgtgaaggcttattatttatagacgttacaattccacaaacaccacctttaattcttcagcttact 86827  T
Q  115 cactttaaccacgttttcaacttacaactcattttacaccattaaatattccgaatttgatcttgagtcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagc 214  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  86826 cactttaaccacgttttcagcttacaactcattttacaccattaaatattccgaatttgctcttgagtcaaacagatgaaatttagagaatttcgtaagc 86727  T
Q  215 tttccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatatagccaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaa 314  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||    ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  86726 tttcaaacgagttaaagatcacctcaaacggacatcaggagctccatatatagccaaaaca----agagatatcatgacctacaaaaataaaacattgaa 86631  T
Q  315 cccaaaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 362  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  86630 cccaaaattaatttggttcctttattccacaatgactttattattctt 86583  T

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Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 259 - 362
Target Start/End: Original strand, 643 - 746
Alignment:
Q  259 cagatatagccaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttcttttattccacaatgactttattat 358  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||    
T  643 cagatatagccaaaacaagatagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttgattcttttatttctcaatgactttattat 742  T
Q  359 tctt 362  Q
    ||||    
T  743 tctt 746  T

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Target: scaffold0013 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 18 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 241393 - 241046
Alignment:
Q  18 atgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggctaattatttctagacgttacatttccacaaacacc---tttaattcttcagcttaca 114  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||| |||    
T  241393 atgagaaggttatatattcatttgcacattgatttttgaaggcttattatgtctagacgttacaattccacaaacaccacctttaattcttcagctaaca 241294  T
Q  115 cactttaaccacgttttcaacttacaactcattttacaccattaaatattccgaatttgatcttgagtcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagc 214  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  241293 cactttaaccacgtcttctacttatagctcattctacaccactaaatattccgaatttgctcctgagtcaaaaagacgaaatgtagagaacttcgtaagc 241194  T
Q  215 tttccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatatagccaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaa 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  241193 tttccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagcttcagatatagccaaaacaagacagacatattatgacctacgaaaataaaactttaaa 241094  T
Q  315 cccaaaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  241093 cccaaaattaatttggttcttttattctgcaatgactttattattctt 241046  T

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Target: scaffold0018 (Bit Score: 228; Significance: 1e-126; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 18 - 362
Target Start/End: Original strand, 420 - 769
Alignment:
Q  18 atgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggctaattatttc-tagacgttacatttccacaaacacc---tttaattcttcagcttac 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  | ||| ||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||| ||    
T  420 atgagaaggttacatattcatttgcacattgatttttgaaggcttattatggcctagccgttacaattccacaaacaccacctttaattcttcagctaac 519  T
Q  114 acactttaaccacgttttcaacttacaactcattttacaccattaaatattccgaatttgatcttgagtcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaag 213  Q
    | ||||||||||||| ||| | ||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  520 atactttaaccacgtcttctaattacagctcattctgaaccattaaatattccgaatttgctcttggatcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaag 619  T
Q  214 ctttccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatatagccaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttga 313  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  620 ctttccaatgagttaaagatcacctgaaacggacatccggagctccagatatagccaaaacaagacagacatatcatgacctacaaaaataaaactttga 719  T
Q  314 acccaaaattaatttggttcttttattccacaatgactt-tattattctt 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  720 acccaaaattaatttggttcttttattccacaatgacttctattattctt 769  T

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Target: scaffold0146 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 191 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 31762 - 31591
Alignment:
Q  191 tgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatatagccaaaacaagacagacatatcat 290  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31762 tgaaatgtagagaattttgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatatagccaaaacaagacagacatatcat 31663  T
Q  291 gacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 362  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31662 gacctacgaaaataagactttgaacccaaaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 31591  T

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Target: scaffold0269 (Bit Score: 161; Significance: 9e-86; HSPs: 2)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 18 - 229
Target Start/End: Original strand, 1740 - 1954
Alignment:
Q  18 atgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggctaattatttctagacgttacatttccacaaacacc---tttaattcttcagcttaca 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||| |||||||    
T  1740 atgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaagcttattatttctagacgttacaattccacaaacaccacctttaattcttccgcttaca 1839  T
Q  115 cactttaaccacgttttcaacttacaactcattttacaccattaaatattccgaatttgatcttgagtcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagc 214  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||    
T  1840 cactttaaccacgttttcaaattacaactcattttaaaccattaaatattccgaatttgctcttgagtcagacagatgaaatgtagagaattccataagc 1939  T
Q  215 tttccaacgagttaa 229  Q
    |||||||||||||||    
T  1940 tttccaacgagttaa 1954  T

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Target: scaffold0269; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 271 - 362
Target Start/End: Original strand, 1962 - 2051
Alignment:
Q  271 aaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 362  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1962 aaacaagacaga--tatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttcttttattccacaatgacattattattctt 2051  T

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Target: scaffold0096 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 251 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 22510 - 22399
Alignment:
Q  251 cagagctccagatatagccaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttcttttattccacaatgac 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22510 cagagctccagatatagccaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttcttttattccacaatgac 22411  T
Q  351 tttattattctt 362  Q
    ||||||||||||    
T  22410 tttattattctt 22399  T

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Target: scaffold0021 (Bit Score: 108; Significance: 4e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 243 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 17776 - 17657
Alignment:
Q  243 cggacatccagagctccagatatagccaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttcttttattcc 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17776 cggacatccagagctccagatatagccaaaacaagacatacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttcttttattca 17677  T
Q  343 acaatgactttattattctt 362  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  17676 acactgactttattattctt 17657  T

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Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 243 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 27307 - 27188
Alignment:
Q  243 cggacatccagagctccagatatagccaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttcttttattcc 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27307 cggacatccagagctccagatatagccaaaacaagacatacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttcttttattca 27208  T
Q  343 acaatgactttattattctt 362  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  27207 acactgactttattattctt 27188  T

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Target: scaffold0094 (Bit Score: 64; Significance: 7e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0094
Description:

Target: scaffold0094; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 144 - 362
Target Start/End: Original strand, 13365 - 13582
Alignment:
Q  144 cattttacaccattaaatattccgaatttgatcttgagtcaaacagatgaaatgtaga-gaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaa 242  Q
    ||||||||||||| | |||| |||| |||| |  |||  | |||| |||||||||||| |||||| |||  ||||||||||  | ||||||||||||||     
T  13365 cattttacaccatgatatatgccgattttgcttctgaacccaacatatgaaatgtagatgaattt-gtaccctttccaacgcttcaaagatcacctcaat 13463  T
Q  243 cggacatccagagctccagatatagccaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttcttttattcc 342  Q
    ||||  |  ||||||| ||||||    || |||| ||||| | || ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13464 cggagttgtagagctctagatatgatgaatacaaaacagatacataatgacctacgaaaataaaaatttgaacccaaaat-aatttggttcttttattcc 13562  T
Q  343 acaatgactttattattctt 362  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  13563 ataatgactttattattctt 13582  T

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Target: scaffold0321 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0321
Description:

Target: scaffold0321; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 144 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 5437 - 5220
Alignment:
Q  144 cattttacaccattaaatattccgaatttgatcttgagtcaaacagatgaaatgtaga-gaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaa 242  Q
    ||||||||||||| | |||| |||| |||| |  |||||| |||| |||||||||||| |||||| |||  ||||||||||  | ||||||||||||||     
T  5437 cattttacaccatgatatatgccgattttgcttctgagtccaacatatgaaatgtagatgaattt-gtaccctttccaacgcttcaaagatcacctcaat 5339  T
Q  243 cggacatccagagctccagatatagccaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttcttttattcc 342  Q
    ||||  ||||||| || ||||||    || |||||||| | | || ||||||||||||||||| | |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  5338 cggagttccagagttctagatatgatgaatacaagacacatacataatgacctacgaaaataacaatttgaaccaaaaat-aatttgattcttttattcc 5240  T
Q  343 acaatgactttattattctt 362  Q
    | ||||| ||||||||||||    
T  5239 ataatgaatttattattctt 5220  T

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Target: scaffold0180 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 144 - 362
Target Start/End: Original strand, 11265 - 11481
Alignment:
Q  144 cattttacaccattaaatattccgaatttgatcttgagtcaaacagatgaaatgtaga-gaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaa 242  Q
    ||||||||||||| | |||| |||| |||| |  |||||| |||| |||||||||||| |||||| |||  ||||||||||  | ||||||||||||||     
T  11265 cattttacaccatgatatatgccgattttgcttctgagtccaacatatgaaatgtagatgaattt-gtaccctttccaacgcttcaaagatcacctcaat 11363  T
Q  243 cggacatccagagctccagatatagccaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttcttttattcc 342  Q
    ||||  | |||||||| ||||||    || |||||||||| | || ||||||||||||||||| | |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  11364 cggagttgcagagctctagatatgatgaatacaagacagatacataatgacctacgaaaataacaatttgaa-ccaaaaataatttgattcttttattcc 11462  T
Q  343 acaatgactttattattctt 362  Q
    | |||||||||| |||||||    
T  11463 a-aatgactttaatattctt 11481  T

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Target: scaffold0139 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 144 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 4442 - 4225
Alignment:
Q  144 cattttacaccattaaatattccgaatttgatcttgagtcaaacagatgaaatgtaga-gaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaa 242  Q
    ||||||||||||| | || | |||| |||| |  ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||  ||||| ||||  ||||||||||||||||     
T  4442 cattttacaccatgatatctgccgattttgcttctgagtcaaacatatgaaatgtagatgaattt-gtaccctttcgaacgctttaaagatcacctcaat 4344  T
Q  243 cggacatccagagctccagatatagccaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttcttttattcc 342  Q
    ||||  |  ||||||| | ||||    || |||| ||||| | || ||||||||||||||||| | |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  4343 cggagttgtagagctctaaatatgatgaatacaatacagatacataatgacctacgaaaataacaatttgaaccaaaaat-aatttgattcttttattcc 4245  T
Q  343 acaatgactttattattctt 362  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  4244 ataatgactttattattctt 4225  T

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Target: scaffold0002 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 144 - 362
Target Start/End: Original strand, 375180 - 375392
Alignment:
Q  144 cattttacaccattaaatattccgaatttgatcttgagtcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaac 243  Q
    ||||||||||||| | |||| |||| |||| |  |||||| |||| ||||||||||    |||| |||  ||||||||||  | |||||||||||||| |    
T  375180 cattttacaccatgatatatgccgattttgcttctgagtccaacatatgaaatgta----attt-gtaccctttccaacgcttcaaagatcacctcaatc 375274  T
Q  244 ggacatccagagctccagatatagccaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttcttttattcca 343  Q
     ||  |||||||||| ||||||    || |||||||||| | || ||||||||| ||||||| | |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||    
T  375275 agagttccagagctctagatatgaggaatacaagacagatacataatgacctacaaaaataacaatttgaaccaaaaat-aatttgattcttttattcca 375373  T
Q  344 caatgactttattattctt 362  Q
     ||||| ||||||||||||    
T  375374 taatgaatttattattctt 375392  T

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Target: chr6 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 2)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 323 - 362
Target Start/End: Original strand, 12037064 - 12037103
Alignment:
Q  323 taatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12037064 taatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 12037103  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 325 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 12037053 - 12037016
Alignment:
Q  325 atttggttcttttattccacaatgactttattattctt 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12037053 atttggttcttttattccacaatgactttattattctt 12037016  T

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Target: scaffold0359 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 318 - 362
Target Start/End: Original strand, 8902 - 8946
Alignment:
Q  318 aaaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 362  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8902 aaaattaacttggttcttatattccacaatgactttattattctt 8946  T

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