View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF2140_low_4 (Length: 571)

Name: NF2140_low_4
Description: NF2140
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF2140_low_4
NF2140_low_4
[»] chr7 (78 HSPs)
chr7 (20-559)||(44985573-44986124)
chr7 (270-552)||(37195921-37196217)
chr7 (418-559)||(17885332-17885474)
chr7 (269-552)||(16866043-16866351)
chr7 (269-552)||(7779882-7780190)
chr7 (269-552)||(24753050-24753345)
chr7 (418-559)||(37182142-37182284)
chr7 (417-552)||(38139875-38140012)
chr7 (269-552)||(21702533-21702841)
chr7 (420-552)||(30650505-30650638)
chr7 (420-552)||(45885851-45885984)
chr7 (420-559)||(44734443-44734583)
chr7 (418-559)||(41741533-41741675)
chr7 (421-552)||(45379980-45380113)
chr7 (417-552)||(17851728-17851864)
chr7 (417-552)||(18125311-18125447)
chr7 (420-559)||(39316862-39317002)
chr7 (417-552)||(44794110-44794246)
chr7 (417-552)||(35074343-35074480)
chr7 (421-544)||(25905510-25905634)
chr7 (425-551)||(25980008-25980135)
chr7 (418-559)||(39456098-39456239)
chr7 (417-551)||(41103528-41103666)
chr7 (455-559)||(43507300-43507404)
chr7 (426-559)||(37579130-37579263)
chr7 (417-559)||(12980244-12980387)
chr7 (417-523)||(44658532-44658639)
chr7 (420-521)||(16811635-16811737)
chr7 (417-552)||(45708948-45709081)
chr7 (417-559)||(2630656-2630799)
chr7 (417-548)||(27850409-27850540)
chr7 (269-552)||(38152776-38153068)
chr7 (422-548)||(3920417-3920543)
chr7 (417-559)||(18825955-18826097)
chr7 (435-559)||(16078881-16079005)
chr7 (269-392)||(10072524-10072648)
chr7 (422-559)||(5376953-5377090)
chr7 (417-552)||(46127266-46127398)
chr7 (423-495)||(3227035-3227108)
chr7 (486-559)||(3227696-3227769)
chr7 (269-392)||(39317053-39317177)
chr7 (417-559)||(24425249-24425390)
chr7 (482-558)||(10072357-10072434)
chr7 (428-544)||(26622834-26622950)
chr7 (272-384)||(12980444-12980556)
chr7 (435-537)||(26004573-26004675)
chr7 (269-384)||(38139703-38139818)
chr7 (417-559)||(23328477-23328620)
chr7 (269-384)||(17885532-17885647)
chr7 (420-552)||(25782993-25783125)
chr7 (269-378)||(35074543-35074652)
chr7 (269-392)||(45885676-45885800)
chr7 (486-559)||(26004673-26004746)
chr7 (276-392)||(44658385-44658502)
chr7 (269-384)||(27850243-27850352)
chr7 (269-392)||(37182332-37182456)
chr7 (269-392)||(41741361-41741485)
chr7 (269-384)||(44734270-44734383)
chr7 (269-344)||(26004397-26004472)
chr7 (269-384)||(30650698-30650813)
chr7 (271-384)||(5377152-5377265)
chr7 (420-457)||(10072436-10072473)
chr7 (269-378)||(17851925-17852034)
chr7 (461-548)||(5916194-5916280)
chr7 (269-384)||(25905695-25905810)
chr7 (269-344)||(37218112-37218187)
chr7 (350-384)||(45380174-45380208)
chr7 (269-346)||(24425473-24425550)
chr7 (280-381)||(37579331-37579432)
chr7 (272-336)||(3774185-3774249)
chr7 (421-457)||(43507415-43507451)
chr7 (488-559)||(41946731-41946802)
chr7 (269-384)||(43507512-43507627)
chr7 (269-384)||(44785169-44785284)
chr7 (417-457)||(3274762-3274802)
chr7 (269-337)||(23533527-23533595)
chr7 (296-384)||(39455953-39456041)
chr7 (320-384)||(42908003-42908067)
[»] chr5 (59 HSPs)
chr5 (269-559)||(17853205-17853518)
chr5 (269-559)||(13401916-13402229)
chr5 (277-542)||(6092449-6092728)
chr5 (418-559)||(3564813-3564954)
chr5 (269-559)||(4582981-4583296)
chr5 (418-559)||(35311685-35311826)
chr5 (271-565)||(20973410-20973718)
chr5 (418-559)||(28045517-28045660)
chr5 (418-559)||(1218619-1218759)
chr5 (417-552)||(4920695-4920831)
chr5 (417-552)||(42987563-42987699)
chr5 (269-552)||(40517675-40517983)
chr5 (417-552)||(5908772-5908908)
chr5 (418-559)||(12834659-12834802)
chr5 (418-559)||(12866636-12866779)
chr5 (417-552)||(22694985-22695121)
chr5 (269-559)||(15890069-15890383)
chr5 (417-559)||(27088436-27088577)
chr5 (418-559)||(29246036-29246178)
chr5 (417-552)||(30996466-30996601)
chr5 (420-559)||(6156005-6156145)
chr5 (417-551)||(6369566-6369701)
chr5 (421-559)||(27302823-27302959)
chr5 (417-559)||(35194073-35194215)
chr5 (417-559)||(3573087-3573229)
chr5 (435-559)||(2985010-2985134)
chr5 (417-559)||(12447244-12447386)
chr5 (417-559)||(30115346-30115488)
chr5 (421-559)||(8453462-8453598)
chr5 (435-559)||(2412828-2412952)
chr5 (419-559)||(33862270-33862409)
chr5 (269-392)||(33727913-33728037)
chr5 (269-392)||(5908600-5908724)
chr5 (272-392)||(29245866-29245987)
chr5 (476-552)||(10126977-10127053)
chr5 (269-392)||(6155832-6155956)
chr5 (269-384)||(4920888-4921003)
chr5 (417-551)||(18206888-18207024)
chr5 (420-548)||(38006556-38006684)
chr5 (269-392)||(10127127-10127251)
chr5 (277-384)||(16311213-16311320)
chr5 (269-384)||(18207080-18207195)
chr5 (272-370)||(22694817-22694915)
chr5 (469-550)||(42717769-42717849)
chr5 (272-384)||(24207746-24207857)
chr5 (278-370)||(42717551-42717643)
chr5 (269-332)||(12447482-12447545)
chr5 (272-367)||(1218804-1218899)
chr5 (273-384)||(12834490-12834601)
chr5 (269-344)||(35311915-35311990)
chr5 (269-371)||(30996671-30996772)
chr5 (289-383)||(33420279-33420373)
chr5 (502-559)||(15564517-15564574)
chr5 (269-392)||(2412638-2412762)
chr5 (269-317)||(27088285-27088333)
chr5 (274-384)||(12866468-12866578)
chr5 (291-384)||(38972984-38973077)
chr5 (272-392)||(39422399-39422520)
chr5 (421-480)||(15564577-15564637)
[»] chr2 (41 HSPs)
chr2 (269-559)||(37106562-37106870)
chr2 (418-559)||(12193911-12194053)
chr2 (417-552)||(13705444-13705580)
chr2 (269-552)||(10920515-10920816)
chr2 (417-559)||(45256686-45256829)
chr2 (268-559)||(18106028-18106316)
chr2 (418-551)||(7314732-7314866)
chr2 (417-552)||(24414215-24414351)
chr2 (417-552)||(37999353-37999489)
chr2 (269-552)||(10208342-10208649)
chr2 (417-552)||(13830606-13830742)
chr2 (417-552)||(42798071-42798208)
chr2 (417-552)||(8916020-8916156)
chr2 (417-559)||(36128189-36128333)
chr2 (417-552)||(45115428-45115564)
chr2 (269-552)||(30846815-30847124)
chr2 (417-552)||(9632256-9632392)
chr2 (454-559)||(37472850-37472955)
chr2 (417-559)||(44746192-44746335)
chr2 (417-559)||(31942269-31942411)
chr2 (420-559)||(14540649-14540784)
chr2 (418-552)||(6027973-6028108)
chr2 (269-384)||(12341663-12341778)
chr2 (269-392)||(9632440-9632564)
chr2 (417-559)||(19104924-19105066)
chr2 (440-559)||(16226833-16226952)
chr2 (293-380)||(7314583-7314670)
chr2 (269-382)||(12193737-12193851)
chr2 (272-392)||(37472673-37472794)
chr2 (272-384)||(24414046-24414158)
chr2 (272-384)||(44746023-44746135)
chr2 (277-371)||(13830811-13830905)
chr2 (269-378)||(36128017-36128126)
chr2 (273-384)||(8915853-8915963)
chr2 (489-552)||(16105488-16105551)
chr2 (277-384)||(31942104-31942211)
chr2 (269-335)||(42797912-42797978)
chr2 (269-346)||(6027812-6027889)
chr2 (502-559)||(37319805-37319862)
chr2 (320-392)||(45256877-45256950)
chr2 (467-511)||(17598816-17598859)
[»] chr3 (63 HSPs)
chr3 (269-559)||(6738316-6738620)
chr3 (269-551)||(20086879-20087174)
chr3 (271-559)||(22535754-22536067)
chr3 (269-559)||(48390728-48391042)
chr3 (423-551)||(23580698-23580826)
chr3 (417-552)||(39728540-39728676)
chr3 (417-550)||(17146233-17146367)
chr3 (418-559)||(29842170-29842312)
chr3 (423-559)||(10823782-10823919)
chr3 (417-552)||(44172495-44172631)
chr3 (417-552)||(44179195-44179331)
chr3 (417-552)||(49025550-49025686)
chr3 (418-559)||(34025816-34025958)
chr3 (418-559)||(43582440-43582582)
chr3 (269-552)||(52572478-52572786)
chr3 (417-552)||(44106875-44107011)
chr3 (417-552)||(44252616-44252752)
chr3 (417-552)||(44953518-44953654)
chr3 (417-552)||(49579933-49580069)
chr3 (418-559)||(34154280-34154418)
chr3 (269-552)||(39655184-39655492)
chr3 (269-552)||(29284205-29284513)
chr3 (417-553)||(44639143-44639279)
chr3 (417-552)||(52198023-52198160)
chr3 (417-559)||(30682684-30682826)
chr3 (269-559)||(4015955-4016269)
chr3 (269-552)||(7469689-7469997)
chr3 (269-559)||(4557216-4557530)
chr3 (423-512)||(23154153-23154242)
chr3 (458-565)||(48306661-48306768)
chr3 (431-552)||(23547069-23547191)
chr3 (417-548)||(42758248-42758379)
chr3 (420-559)||(34119521-34119658)
chr3 (421-559)||(53631767-53631905)
chr3 (271-384)||(34026016-34026129)
chr3 (417-559)||(19111598-19111739)
chr3 (421-559)||(31126882-31127020)
chr3 (421-552)||(41937089-41937220)
chr3 (417-548)||(54317018-54317149)
chr3 (421-559)||(830872-831010)
chr3 (269-384)||(49580126-49580241)
chr3 (269-338)||(12369102-12369171)
chr3 (271-392)||(23153978-23154099)
chr3 (272-392)||(48305555-48305676)
chr3 (269-392)||(19111787-19111911)
chr3 (397-474)||(23910306-23910385)
chr3 (269-344)||(29858486-29858561)
chr3 (269-384)||(44953346-44953461)
chr3 (269-392)||(44252800-44252924)
chr3 (445-559)||(14208264-14208377)
chr3 (269-384)||(42758436-42758551)
chr3 (269-371)||(44639349-44639451)
chr3 (269-362)||(10823613-10823706)
chr3 (296-392)||(34119709-34119806)
chr3 (273-361)||(31126746-31126834)
chr3 (269-384)||(39728733-39728848)
chr3 (269-323)||(30682943-30682997)
chr3 (269-362)||(23546859-23546952)
chr3 (319-384)||(34154476-34154541)
chr3 (417-453)||(48305724-48305760)
chr3 (309-384)||(52198217-52198292)
chr3 (269-337)||(31271210-31271278)
chr3 (269-333)||(53632017-53632081)
[»] chr1 (65 HSPs)
chr1 (269-559)||(5180908-5181217)
chr1 (269-559)||(18353991-18354306)
chr1 (418-559)||(17092043-17092185)
chr1 (269-544)||(24710736-24711025)
chr1 (269-559)||(40087375-40087689)
chr1 (418-559)||(50426739-50426881)
chr1 (269-559)||(17134810-17135125)
chr1 (269-551)||(24236672-24236979)
chr1 (418-559)||(34060103-34060245)
chr1 (418-559)||(42707914-42708056)
chr1 (418-559)||(45866269-45866411)
chr1 (269-552)||(36187131-36187439)
chr1 (423-552)||(42439759-42439889)
chr1 (271-559)||(19572425-19572737)
chr1 (417-552)||(29936286-29936422)
chr1 (418-559)||(23966735-23966878)
chr1 (269-559)||(39616166-39616471)
chr1 (417-552)||(49250856-49250992)
chr1 (417-552)||(51421728-51421864)
chr1 (422-559)||(3628073-3628213)
chr1 (417-552)||(34610943-34611079)
chr1 (417-552)||(20774502-20774639)
chr1 (417-552)||(28297803-28297940)
chr1 (425-545)||(16408823-16408940)
chr1 (386-559)||(35936869-35937042)
chr1 (462-551)||(13020559-13020648)
chr1 (269-392)||(23968633-23968757)
chr1 (417-559)||(44615558-44615701)
chr1 (417-559)||(44792868-44793011)
chr1 (417-559)||(29871368-29871510)
chr1 (417-559)||(49741090-49741232)
chr1 (424-559)||(16433254-16433386)
chr1 (417-559)||(9982973-9983115)
chr1 (417-559)||(12494874-12495016)
chr1 (269-548)||(34673193-34673496)
chr1 (269-480)||(13390355-13390574)
chr1 (461-565)||(44632264-44632367)
chr1 (268-365)||(34059058-34059155)
chr1 (269-392)||(45866097-45866220)
chr1 (417-480)||(23490854-23490918)
chr1 (269-392)||(34611127-34611251)
chr1 (269-392)||(49250684-49250808)
chr1 (269-392)||(51421912-51422036)
chr1 (269-368)||(28298025-28298124)
chr1 (272-392)||(44615389-44615510)
chr1 (272-392)||(44793059-44793180)
chr1 (273-384)||(42707752-42707863)
chr1 (269-344)||(49740937-49741012)
chr1 (269-346)||(16433090-16433167)
chr1 (269-362)||(20774651-20774744)
chr1 (269-392)||(23490682-23490806)
chr1 (269-344)||(3627908-3627983)
chr1 (516-559)||(13390312-13390355)
chr1 (269-344)||(38106308-38106383)
chr1 (269-384)||(42439581-42439696)
chr1 (272-334)||(25154778-25154840)
chr1 (270-384)||(29871198-29871311)
chr1 (269-389)||(12495067-12495188)
chr1 (422-512)||(2514678-2514769)
chr1 (269-392)||(16408996-16409119)
chr1 (449-512)||(38733902-38733965)
chr1 (269-344)||(29936525-29936600)
chr1 (269-315)||(9982801-9982847)
chr1 (494-544)||(23493497-23493547)
chr1 (329-392)||(33293502-33293566)
[»] chr8 (45 HSPs)
chr8 (269-552)||(27932282-27932591)
chr8 (418-559)||(45235927-45236069)
chr8 (417-552)||(2075917-2076053)
chr8 (417-552)||(24870107-24870242)
chr8 (417-559)||(28977197-28977340)
chr8 (418-559)||(17220579-17220721)
chr8 (418-559)||(29108906-29109048)
chr8 (296-552)||(4230668-4230938)
chr8 (418-559)||(11255092-11255230)
chr8 (423-559)||(1063369-1063506)
chr8 (269-551)||(24927819-24928126)
chr8 (269-552)||(32302929-32303238)
chr8 (423-542)||(34776945-34777065)
chr8 (446-559)||(39445680-39445793)
chr8 (433-559)||(1012480-1012606)
chr8 (420-559)||(24568802-24568940)
chr8 (417-559)||(34139310-34139453)
chr8 (435-553)||(43113727-43113845)
chr8 (482-552)||(40248496-40248566)
chr8 (458-559)||(35215367-35215467)
chr8 (443-559)||(34021341-34021456)
chr8 (417-559)||(17469118-17469260)
chr8 (445-559)||(29089573-29089685)
chr8 (417-552)||(20399461-20399597)
chr8 (269-384)||(2075745-2075860)
chr8 (306-392)||(39445524-39445611)
chr8 (269-384)||(27777109-27777224)
chr8 (269-384)||(43113537-43113652)
chr8 (486-552)||(31325134-31325199)
chr8 (272-392)||(5858566-5858687)
chr8 (269-362)||(34777144-34777237)
chr8 (269-392)||(37960873-37960997)
chr8 (277-392)||(40248290-40248406)
chr8 (269-392)||(1063560-1063690)
chr8 (269-344)||(17469345-17469420)
chr8 (269-346)||(36131840-36131917)
chr8 (420-457)||(40248457-40248494)
chr8 (272-380)||(29108736-29108844)
chr8 (269-384)||(20399654-20399769)
chr8 (269-386)||(1012678-1012795)
chr8 (269-382)||(24569002-24569114)
chr8 (277-317)||(34139581-34139621)
chr8 (269-392)||(17220765-17220891)
chr8 (417-541)||(14186205-14186325)
chr8 (420-559)||(36132003-36132141)
[»] chr4 (70 HSPs)
chr4 (418-559)||(39046821-39046962)
chr4 (418-559)||(31752324-31752466)
chr4 (418-559)||(42774629-42774771)
chr4 (418-559)||(48459349-48459491)
chr4 (417-552)||(47550437-47550573)
chr4 (422-559)||(47239474-47239612)
chr4 (417-552)||(32585363-32585500)
chr4 (417-552)||(43893103-43893239)
chr4 (272-552)||(7608845-7609150)
chr4 (269-553)||(21423735-21424044)
chr4 (269-552)||(11122781-11123089)
chr4 (417-552)||(5902698-5902834)
chr4 (356-559)||(4766333-4766540)
chr4 (417-552)||(31918642-31918779)
chr4 (269-552)||(11027947-11028256)
chr4 (417-552)||(6382356-6382493)
chr4 (417-552)||(44317409-44317546)
chr4 (435-559)||(425692-425816)
chr4 (417-559)||(19534324-19534466)
chr4 (421-559)||(42299659-42299797)
chr4 (417-559)||(1724394-1724536)
chr4 (464-547)||(15987372-15987455)
chr4 (417-559)||(26564700-26564842)
chr4 (269-559)||(37348992-37349295)
chr4 (417-522)||(55826707-55826814)
chr4 (417-559)||(6482119-6482262)
chr4 (417-559)||(7985205-7985348)
chr4 (436-548)||(28695245-28695357)
chr4 (435-559)||(37107280-37107404)
chr4 (269-392)||(31752515-31752639)
chr4 (482-559)||(53906431-53906508)
chr4 (428-559)||(32596279-32596410)
chr4 (435-552)||(12825563-12825680)
chr4 (443-559)||(39188384-39188499)
chr4 (269-384)||(1724182-1724296)
chr4 (269-384)||(48459549-48459664)
chr4 (272-392)||(6481950-6482071)
chr4 (458-559)||(9230152-9230255)
chr4 (269-392)||(15987174-15987298)
chr4 (417-522)||(13015335-13015446)
chr4 (417-559)||(13770539-13770681)
chr4 (269-344)||(53906250-53906325)
chr4 (269-370)||(43893309-43893410)
chr4 (269-378)||(44317609-44317718)
chr4 (269-378)||(55826535-55826644)
chr4 (269-384)||(7334109-7334224)
chr4 (269-384)||(47550265-47550380)
chr4 (269-378)||(31918470-31918579)
chr4 (271-344)||(32585591-32585664)
chr4 (269-333)||(26564950-26565014)
chr4 (269-344)||(5902532-5902607)
chr4 (269-384)||(6382184-6382299)
chr4 (269-380)||(19882968-19883079)
chr4 (417-547)||(39375160-39375289)
chr4 (271-392)||(21956728-21956850)
chr4 (269-323)||(47239316-47239370)
chr4 (271-316)||(44887680-44887725)
chr4 (421-457)||(53906393-53906429)
chr4 (269-384)||(42299856-42299971)
chr4 (517-559)||(13015557-13015599)
chr4 (458-548)||(29755456-29755545)
chr4 (269-335)||(36919240-36919306)
chr4 (269-346)||(3909014-3909091)
chr4 (269-302)||(13015218-13015251)
chr4 (308-392)||(25941197-25941282)
chr4 (269-318)||(46058280-46058329)
chr4 (269-346)||(50375833-50375909)
chr4 (320-384)||(1866512-1866576)
chr4 (296-384)||(39375346-39375434)
chr4 (340-380)||(47239368-47239408)
[»] chr6 (43 HSPs)
chr6 (269-552)||(10187991-10188292)
chr6 (269-559)||(27534546-27534861)
chr6 (417-552)||(32853713-32853849)
chr6 (417-552)||(2367195-2367331)
chr6 (417-552)||(10142601-10142737)
chr6 (417-559)||(14032419-14032561)
chr6 (417-550)||(24225569-24225703)
chr6 (417-552)||(12141254-12141390)
chr6 (273-552)||(5863298-5863602)
chr6 (417-529)||(27738664-27738777)
chr6 (417-552)||(3484006-3484142)
chr6 (417-559)||(12309441-12309577)
chr6 (417-559)||(14505949-14506091)
chr6 (428-559)||(24602950-24603081)
chr6 (421-559)||(14254821-14254959)
chr6 (417-559)||(12678177-12678318)
chr6 (433-559)||(30816120-30816246)
chr6 (417-509)||(32053000-32053093)
chr6 (482-559)||(32532426-32532503)
chr6 (459-559)||(14410959-14411058)
chr6 (461-559)||(7394015-7394112)
chr6 (458-559)||(14245110-14245210)
chr6 (269-392)||(30986306-30986430)
chr6 (417-525)||(11762342-11762450)
chr6 (269-384)||(2367388-2367503)
chr6 (272-384)||(32853906-32854018)
chr6 (269-378)||(31496502-31496611)
chr6 (269-378)||(31501888-31501997)
chr6 (490-551)||(32052927-32052988)
chr6 (269-392)||(15498377-15498501)
chr6 (269-384)||(10142429-10142544)
chr6 (418-457)||(32532505-32532544)
chr6 (269-378)||(3483834-3483943)
chr6 (305-392)||(9442483-9442570)
chr6 (269-384)||(12141447-12141562)
chr6 (269-344)||(14506176-14506251)
chr6 (277-384)||(27738834-27738941)
chr6 (269-354)||(8320719-8320803)
chr6 (269-368)||(12309656-12309755)
chr6 (269-368)||(24225782-24225881)
chr6 (269-380)||(29341322-29341433)
chr6 (306-392)||(30816313-30816398)
chr6 (269-392)||(32532593-32532717)
[»] scaffold0189 (1 HSPs)
scaffold0189 (421-559)||(4119-4259)
[»] scaffold0519 (1 HSPs)
scaffold0519 (418-559)||(10163-10301)
[»] scaffold0294 (1 HSPs)
scaffold0294 (421-559)||(14638-14776)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (417-552)||(197410-197545)
[»] scaffold0036 (2 HSPs)
scaffold0036 (421-559)||(33256-33394)
scaffold0036 (269-370)||(33475-33576)
[»] scaffold0027 (1 HSPs)
scaffold0027 (417-559)||(6269-6411)
[»] scaffold0095 (1 HSPs)
scaffold0095 (458-559)||(32655-32755)
[»] scaffold0014 (2 HSPs)
scaffold0014 (488-559)||(14299-14370)
scaffold0014 (272-392)||(14098-14218)
[»] scaffold0022 (2 HSPs)
scaffold0022 (435-552)||(90467-90584)
scaffold0022 (269-362)||(90675-90769)
[»] scaffold0135 (1 HSPs)
scaffold0135 (458-559)||(36018-36121)
[»] scaffold1630 (1 HSPs)
scaffold1630 (499-552)||(1492-1545)
[»] scaffold0097 (1 HSPs)
scaffold0097 (417-559)||(33446-33592)
[»] scaffold0902 (1 HSPs)
scaffold0902 (470-559)||(748-836)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 384; Significance: 0; HSPs: 78)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 384; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 559
Target Start/End: Original strand, 44985573 - 44986124
Alignment:
Q  20 tgttcttgatgaatatccagcatagttgactcgctcactcagaggcaacttgaacaccgcgcacttactagtagaaggtggtggtggtagtctagcctga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44985573 tgttcttgatgaatatccagcatagttgactcgctcactcagaggcaacttgaacaccgcgcacttactagtagaaggtggtggtggtagtatagcctga 44985672  T
Q  120 agttgaatataaacgattttacctttgcccttttcagttcctccacttgccgctgctctgtctccactaatttcctcggcgcccaacgagcctagtttac 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44985673 agttgaatataaacgattttacctttgcccttttcagttcctccacttgccgctgctctgtctccactaatttcctcggcgcccaacgagcctagtttac 44985772  T
Q  220 tctttactgttttttgagggtggtttactctatggtctata-------tgttacgaaggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaacc 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||       |||||   |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  44985773 tctttactgttttttgagggtggtttactctataatctatactttacttgttatttaggcattgcaacaaaactcatactcgcggttacccatccgaacc 44985872  T
Q  313 aaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggtttttcccgatttcaaacacgggtaacggatatatagatacccac 412  Q
    |||  |||||| |||||||||  || |||||||| | ||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  44985873 aaatctaatttgacggattttctccgttttgattgggtttgggtatggatatgggttttctccgatttcaaacacgggtaacgggtatataaatacccac 44985972  T
Q  413 tctga------acccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtatgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgata 506  Q
    || ||      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  44985973 tccgaactcatacccgtcccaaatgtaaaaaatta-tttatgttgatatgtatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgata 44986071  T
Q  507 tttaaatgatcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44986072 tttaaaggatcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 44986124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 270 - 552
Target Start/End: Original strand, 37195921 - 37196217
Alignment:
Q  270 ggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggtt 369  Q
    |||||| ||||||||  |||||||| |||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||| ||  |||||||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  37195921 ggcatgacaacaaaatccatacccgtggttatccgcccaaaccaaactcaatttgacggattttccctgttttgattaggtttgggtatgggtatggatt 37196020  T
Q  370 tttcccgatttcaaa-cacgggtaacggatatatagatacccactctgaa------------cccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatg 456  Q
    || |||||||||||| ||| ||||| || ||||||| ||||||| | |||            ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37196021 ttccccgatttcaaaacacaggtaatgggtatatagctacccaccccgaatccatacccaaacccgtcataaatgtaaaaaattactttatgttgatatg 37196120  T
Q  457 t-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtga 552  Q
    | ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37196121 ttatgttattttgtttgataactgtcatgttaataaaaactaccattgatatataaaagatcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtga 37196217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 418 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 17885474 - 17885332
Alignment:
Q  418 acccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgat 516  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  17885474 acccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattgtcatgtcaataaaaactaccattgatatttaaaggat 17885375  T
Q  517 caactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  17885374 caactaaatcattccatctatcaaatgttaaagtgaacatatt 17885332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 269 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 16866351 - 16866043
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||  ||||| |||| |||| ||| |||||| | | ||||| |||||||||||||    
T  16866351 aggcatggcaacaaaactcatatccgtggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttggttatgggtatgggt 16866252  T
Q  369 ttttcccgatttcaaa-cacgggta-----------acggatatatagatacccactctgaaccc------------gtcccaaatgtaaaaaattactt 444  Q
    ||| |||||| ||||| ||||||||           |||| ||||||| ||||||| | ||||||            |||||||||||||||||||||||    
T  16866251 tttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgagtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaattactt 16866152  T
Q  445 tatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaactaaatcattccgtctaacaaatg 543  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  16866151 tatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgccatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgattaactaaatcattttgtctaacaaatg 16866052  T
Q  544 ttaaagtga 552  Q
    | |||||||    
T  16866051 tgaaagtga 16866043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 269 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 7780190 - 7779882
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||| |||||| | | ||||| |||||||||||||    
T  7780190 aggcatggcaacaaaacccatacccgtggttacccatccgaaccaaactcaatttgacggattttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggt 7780091  T
Q  369 ttttcccgatttcaaa-cacgggta----acggata-------tatagatacccactctgaacc------------cgtcccaaatgtaaaaaattactt 444  Q
    ||| |||||| ||||| ||||||||    |||||||       ||||| ||||||| | |||||            ||||||||||||||||| ||| ||    
T  7780090 tttccccgatctcaaaacacgggtatgggacggataatgggtatataggtacccaccccgaacctatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaatttattt 7779991  T
Q  445 tatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaactaaatcattccgtctaacaaatg 543  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  7779990 tatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatg 7779891  T
Q  544 ttaaagtga 552  Q
    | |||||||    
T  7779890 tgaaagtga 7779882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 269 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 24753345 - 24753050
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||  |||||||||| | ||||| |||||||||  || |||||| | | |||||||||||||||||||    
T  24753345 aggcatggcaacaaaacccatacccgtggttacccgtccgaaccaaattcaatttgacggattttctccgttttgactgggtttggatatgggtatgggt 24753246  T
Q  369 ttttcccgatttcaaac------------acgggtaacggatatatagatacccactctgaa-cccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatat 455  Q
    ||| |||||| |||||             ||||||||||| ||||||| ||||||  |  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24753245 ttt-cccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaattattttatgttgatat 24753147  T
Q  456 gt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtga 552  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||    
T  24753146 gttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaa-gatcaactaaattattttgtctaacaaatgtgaaagtga 24753050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 418 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 37182284 - 37182142
Alignment:
Q  418 acccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgat 516  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  37182284 acccgtcccaaatgtaaaaaattatcttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggat 37182185  T
Q  517 caactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37182184 caactaaatcattgtgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 37182142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 417 - 552
Target Start/End: Original strand, 38139875 - 38140012
Alignment:
Q  417 aacccgtcccaaatgtaaaaaa-ttactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatg 514  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  38139875 aacccgtctcaaatgtaaaaaaattattttatattgatatgtcatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaagg 38139974  T
Q  515 atcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtga 552  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38139975 atcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtga 38140012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 269 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 21702841 - 21702533
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||| ||||| || ||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||| | | ||||| |||| ||||||||    
T  21702841 aggcatggcaacaaaacccatatccgtggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacggatttttcccgttttgactgggtttgggtatgagtatgggt 21702742  T
Q  369 ttttcccgatttc-aaacacgggta-----------acggatatatagatacccactctgaaccc------------gtcccaaatgtaaaaaattactt 444  Q
    ||| |||||| || |||||||||||           |||| ||||||| ||||||| | ||||||            ||||||||||||||||| |||||    
T  21702741 tttccccgatctcgaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccataccccaacccgtcccaaatgtaaaaaactactt 21702642  T
Q  445 tatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaactaaatcattccgtctaacaaatg 543  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  21702641 tatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccatttatatttaaaggatcaactaaataattttgtctaacaaatg 21702542  T
Q  544 ttaaagtga 552  Q
    | |||||||    
T  21702541 tgaaagtga 21702533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 420 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 30650638 - 30650505
Alignment:
Q  420 ccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatca 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  30650638 ccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgccatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatca 30650539  T
Q  519 actaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtga 552  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  30650538 actaaatcattttgtctaacaaatgtgaaagtga 30650505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 420 - 552
Target Start/End: Original strand, 45885851 - 45885984
Alignment:
Q  420 ccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatca 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45885851 ccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgccatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatca 45885950  T
Q  519 actaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtga 552  Q
    ||| |||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  45885951 acttaatcattttgtctaacaaatgtgaaagtga 45885984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 420 - 559
Target Start/End: Original strand, 44734443 - 44734583
Alignment:
Q  420 ccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatca 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  44734443 ccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtcatgttattttatttgataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttgaaggatca 44734542  T
Q  519 actaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
    | ||||||||| |||||||||||| |||||| || ||||||    
T  44734543 attaaatcattacgtctaacaaatattaaagcgagcatatt 44734583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 418 - 559
Target Start/End: Original strand, 41741533 - 41741675
Alignment:
Q  418 acccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgat 516  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||  |||    
T  41741533 acccgtcccaaatgtaaaaaattactttatactgatatgtcatgttattttgtttgataattatcatgttaataaaaactaccattgatatttaacggat 41741632  T
Q  517 caactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41741633 caattaaatcattacgtctaacaaatgttaaagtgagcatatt 41741675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 421 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 45380113 - 45379980
Alignment:
Q  421 cgtcccaaatgtaaaaaa-ttactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatca 518  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  45380113 cgtcccaaatgtaaaaaaattactttatgttgacatgtcatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatca 45380014  T
Q  519 actaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtga 552  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  45380013 actaaatcagttcgtctaacaaatgttaaagtga 45379980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 417 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 17851864 - 17851728
Alignment:
Q  417 aacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatga 515  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17851864 aacccatcccaaatgtaaaaaactactttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaagga 17851765  T
Q  516 tcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtga 552  Q
    ||||||||||||||   ||||| |||||| |||||||    
T  17851764 tcaactaaatcattttatctaataaatgtgaaagtga 17851728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 417 - 552
Target Start/End: Original strand, 18125311 - 18125447
Alignment:
Q  417 aacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatga 515  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  |    
T  18125311 aacccgtcccaaatgtaaaaaactactttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaagaa 18125410  T
Q  516 tcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtga 552  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||    
T  18125411 tcaactaaataattttgtctaacaaatgtgaaagtga 18125447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 420 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 39317002 - 39316862
Alignment:
Q  420 ccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatca 518  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| || ||||     
T  39317002 ccgtctcaaatgtaaaaaattattttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttgaaggatcg 39316903  T
Q  519 actaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39316902 attaaatcattacgtctaacaaatgttaaagtgagcatatt 39316862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 417 - 552
Target Start/End: Original strand, 44794110 - 44794246
Alignment:
Q  417 aacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatga 515  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||    
T  44794110 aacctgtcccaaatgtaaaaaattattttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttactaaaaactaccattgatacttaaatga 44794209  T
Q  516 tcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtga 552  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  44794210 tcaactaaatcattttgtctaacaaatgtgaaagtga 44794246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 417 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 35074480 - 35074343
Alignment:
Q  417 aacccgtcccaaatgtaaaaaat-tactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatg 514  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  35074480 aacccgtcccaaatgtaaaaaaactactttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaagg 35074381  T
Q  515 atcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtga 552  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||    
T  35074380 atcaactaaataattttgtctaacaaatgtgaaagtga 35074343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 421 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 25905634 - 25905510
Alignment:
Q  421 cgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaa 519  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  25905634 cgtcccaaatgtaaaaaattattttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaa 25905535  T
Q  520 ctaaatcattccgtctaacaaatgt 544  Q
    |||||| |||  |||||||||||||    
T  25905534 ctaaataattttgtctaacaaatgt 25905510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 425 - 551
Target Start/End: Original strand, 25980008 - 25980135
Alignment:
Q  425 ccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaactaa 523  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||| ||| || |||    
T  25980008 ccaaatgtaaaaaattattttatgttgaaatgtcatgttattttgtttgataattatcatgttaataaaaacttacattgatatttaaaggattaaataa 25980107  T
Q  524 atcattccgtctaacaaatgttaaagtg 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25980108 atcattccgtctaacaaatgttaaagtg 25980135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 418 - 559
Target Start/End: Original strand, 39456098 - 39456239
Alignment:
Q  418 acccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgat 516  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| || ||||||||||  || |||    
T  39456098 acccgtcccaaatgtaaaaa-ttactttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattgccatggtaataaaaattaccattgatattggaaggat 39456196  T
Q  517 caactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39456197 caattaaatcattacgtctaacaaatgttaaagtgagcatatt 39456239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 417 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 41103666 - 41103528
Alignment:
Q  417 aacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtat-gttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgat---atttaaa 512  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||   |||||||    
T  41103666 aacccgtcctaaatgtaaaaaattattttatgttgatatctcttgttattttgtttgataattgtcatgttaatacaaattaccattgatgatatttaaa 41103567  T
Q  513 tgatcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtg 551  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41103566 ggatcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtg 41103528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 455 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 43507404 - 43507300
Alignment:
Q  455 tgtatgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaac 554  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  43507404 tgtatgttattttgtttgataattgtcatattaataaaaactaccattgatatttaaaagatcaactaaatcattccgtctaacaaattttaaagtgagc 43507305  T
Q  555 atatt 559  Q
    |||||    
T  43507304 atatt 43507300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 426 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 37579263 - 37579130
Alignment:
Q  426 caaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaactaaa 524  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37579263 caaatgcagaaaattactttatgttgctatgccatgttattttgtttgataattgtcatgtta-taaaaattatcattgatatttaaatgagcaactaaa 37579165  T
Q  525 tcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  37579164 tcaatccatctaacaaatgttaaagtgagcatatt 37579130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 417 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 12980387 - 12980244
Alignment:
Q  417 aacccgtcccaaatgtaaaaaat-tactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatg 514  Q
    ||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  12980387 aacccgtcccaaatgcaaaaaaaatattttatgttgatatgccatgttattttgtttgataattttcgtgtta-taaaaactatcattgatatttaaagg 12980289  T
Q  515 atcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
    | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12980288 agcaactaaatcaatcggtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 12980244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 417 - 523
Target Start/End: Original strand, 44658532 - 44658639
Alignment:
Q  417 aacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatga 515  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  44658532 aacccgtaccaaatgtaaaaaaatattttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaagga 44658631  T
Q  516 tcaactaa 523  Q
    ||||||||    
T  44658632 tcaactaa 44658639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 420 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 16811737 - 16811635
Alignment:
Q  420 ccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatca 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  16811737 ccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatattatgttattttgtttgataattgccatgttaataaaaactaccattgatatttaaaagatca 16811638  T
Q  519 act 521  Q
    |||    
T  16811637 act 16811635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 417 - 552
Target Start/End: Original strand, 45708948 - 45709081
Alignment:
Q  417 aacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatga 515  Q
    ||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  45708948 aacccgtccaaaatgtaaaa---tactttatgttgatatgttatattattttgtttgataattgtcatattaataaaaattaccattgatatttaaagga 45709044  T
Q  516 tcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtga 552  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  45709045 tcaactaaatcattttgtctaacaaatgtgaaagtga 45709081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 417 - 559
Target Start/End: Original strand, 2630656 - 2630799
Alignment:
Q  417 aacccgtcccaaatgtaaaaaat-tactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatg 514  Q
    |||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||   | || |||||||||| ||||||||||||||||    
T  2630656 aacccgtcccgaatgcaaaaaaactactttatgttgatatgccatgttattttgtttgataattgccgtatt-ataaaaactaccattgatatttaaatg 2630754  T
Q  515 atcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
    | ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2630755 agcaactaaatcaatcggtctatcaaatgttaaagtgaacatatt 2630799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 417 - 548
Target Start/End: Original strand, 27850409 - 27850540
Alignment:
Q  417 aacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatga 515  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||    
T  27850409 aacccgtcccgaatgtagaaaattactttacgatgatatgtcatgttattttgtttgataattgtcgtgtta-taaaaactttcattgatatttaaagga 27850507  T
Q  516 tcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaa 548  Q
     ||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  27850508 gcaactaaatcaatcgatctaacaaatgttaaa 27850540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 269 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 38153068 - 38152776
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    ||||||||||||||||   |||||| |||||| || ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||| | | ||||| |||||||||||||    
T  38153068 aggcatggcaacaaaaactatacccacggttacccgcccgaaccaaactcaatttgacgga-ttttcccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggt 38152970  T
Q  369 ttttcccgatttcaaa------------cacgggtaacggatatatagatacccac------------tctgaacccgtcccaaatgtaaaaaattactt 444  Q
    ||| ||||||||||||             |||| |||||| ||||||| |||||||             || ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  38152969 tttccccgatttcaaaacatgggtatggaacggataacggctatataggtacccaccccgaacccatacctaaacccgtcccaaatgtaaaaaattattt 38152870  T
Q  445 tatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaactaaatcattccgtctaacaaatg 543  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||               |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38152869 tatgttgatatgtcatgttattttgtttgataatt---------------actaccattgatatctaaaggatcaactaaatcattccgtctaacaaatg 38152785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 422 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 3920543 - 3920417
Alignment:
Q  422 gtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaac 520  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  3920543 gtcccgaatgtagaaaattattttatgttgatatgccatgttattttgtttgataattgccatgtta-taaaaactaccattgatatttaaaggaacaac 3920445  T
Q  521 taaatcattccgtctaacaaatgttaaa 548  Q
    ||||| | || |||||||||||||||||    
T  3920444 taaatgaatcggtctaacaaatgttaaa 3920417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 417 - 559
Target Start/End: Original strand, 18825955 - 18826097
Alignment:
Q  417 aacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatga 515  Q
    ||||| ||||||||  | ||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||| |||| ||    
T  18825955 aacccatcccaaatacagaaaattattttacgttgatatgccatgttattttgtttgataattgtcgtgtta-taaaaactaccattgatatataaaaga 18826053  T
Q  516 tcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
     ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18826054 acaactaaatcaatcggtctaacaaatgttaaagtgagcatatt 18826097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 435 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 16079005 - 16078881
Alignment:
Q  435 aaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaactaaatcattccgt 533  Q
    |||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| | |||||||||||| ||  |||||||||| || ||    
T  16079005 aaaattactttacgttgatatgccatgttattttgtttgataattgtcgtgtta-taaaaactacccttgatatttaaaggagaaactaaatcaatcggt 16078907  T
Q  534 ctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
    |||| |||||||||||||||||||||    
T  16078906 ctaaaaaatgttaaagtgaacatatt 16078881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 269 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 10072648 - 10072524
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||  ||||| |||| |||| ||| |||||| | | ||||| |||||||||||||    
T  10072648 aggcatggcaacaaaacccatacccgcggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggt 10072549  T
Q  369 ttttcccgatttc-aaacacgggta 392  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||    
T  10072548 tttccccgatttcaaaacacgggta 10072524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 422 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 5377090 - 5376953
Alignment:
Q  422 gtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaac 520  Q
    ||||| |||| | ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| || ||||||||||| || ||||    
T  5377090 gtcccgaatgcagaaaattactttatgttgatatatcatgtaattttgtttgataattgtcgtgtta-taaaaactaccaatgatatttaaaggagcaac 5376992  T
Q  521 taaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
    ||||||| || || |||||||||||||| ||| ||||||    
T  5376991 taaatcaatcggtttaacaaatgttaaaatgagcatatt 5376953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 417 - 552
Target Start/End: Original strand, 46127266 - 46127398
Alignment:
Q  417 aacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatga 515  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| ||||||   |||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||| ||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  46127266 aacccgtcccaaatgcagaaaattattttatg---atatgtcatgttattttgtttgatcattgtcgtgtta-taataactaccattgatatttaaagga 46127361  T
Q  516 tcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtga 552  Q
     ||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  46127362 acaactaaatcaatcggtctaacaaatgttaaagtga 46127398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 423 - 495
Target Start/End: Original strand, 3227035 - 3227108
Alignment:
Q  423 tcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaac 495  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3227035 tcccaaatgtaaaaaattattttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaac 3227108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 486 - 559
Target Start/End: Original strand, 3227696 - 3227769
Alignment:
Q  486 taataaaaactatcattgatatttaaatgatcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  3227696 taataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattccgtctaacaaatgttgaagtgagcatatt 3227769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 269 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 39317177 - 39317053
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| |||| ||| |||||| | | |||||||||| ||||| ||    
T  39317177 aggcatggcaacaaaattcatactcgcggttatccgcccgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttggatatgagtatgagt 39317078  T
Q  369 ttttcccgatttc-aaacacgggta 392  Q
    ||| | ||||||| |||||||||||    
T  39317077 tttcctcgatttcaaaacacgggta 39317053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 417 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 24425390 - 24425249
Alignment:
Q  417 aacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatga 515  Q
    ||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |  ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||    
T  24425390 aacccgttccaaatgcataaaattactatatgttgatatgccatgttattctgtttgataattatcgtgtta-taaaaactaccattgatatttaaagga 24425292  T
Q  516 tcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
     ||| |||||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24425291 -caaataaatcaaccggtctaacaaatgttaaagtgagcatatt 24425249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 482 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 10072434 - 10072357
Alignment:
Q  482 atgttaataaaaa-ctatcattgatatttaaatgatcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatat 558  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  10072434 atgttaataaaaaactaccattgataattaaatgatcaactaaatcattccgcctaacaaatgttaaagtgagcatat 10072357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 428 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 26622950 - 26622834
Alignment:
Q  428 aatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaactaaatc 526  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| || ||| ||||||    
T  26622950 aatgcaaaaaattattttatgttgatatgccatgttattttgtttgataattgttgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaaggagcaattaaatc 26622852  T
Q  527 attccgtctaacaaatgt 544  Q
    | |  ||| |||||||||    
T  26622851 aattggtcaaacaaatgt 26622834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 272 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 12980556 - 12980444
Alignment:
Q  272 catggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggtttt 371  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| || |  |||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| | | ||||| ||||||| | ||||||    
T  12980556 catggcaacaaaactcatacccgtggttacccgctagaaccaaactcaatttaacgggttttccccattttgactgggtttgggtatgggttttggtttt 12980457  T
Q  372 tcccgatttcaaa 384  Q
     ||||||||||||    
T  12980456 ccccgatttcaaa 12980444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 435 - 537
Target Start/End: Original strand, 26004573 - 26004675
Alignment:
Q  435 aaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaactaaatcattccgt 533  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| || ||    
T  26004573 aaaattactttatgttgatatgccatgttattttgtttgataattgtcttctta-taaaaactatcattgatatttaaaggagcgactaaatcaatcggt 26004671  T
Q  534 ctaa 537  Q
    ||||    
T  26004672 ctaa 26004675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 269 - 384
Target Start/End: Original strand, 38139703 - 38139818
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    ||||||||||| ||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||  ||||| | ||||||| ||| |||||| | | |||||||||||||||||||    
T  38139703 aggcatggcaagaaaacccatatccgcggttacccgcccgaaccaaacccaatttgatggattttccccgttttgactgggtttggatatgggtatgggt 38139802  T
Q  369 ttttcccgatttcaaa 384  Q
    ||| ||| ||||||||    
T  38139803 tttccccaatttcaaa 38139818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 417 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 23328620 - 23328477
Alignment:
Q  417 aacccgtcccaaatgtaaaaaattacttt-atgttgatatgtat-gttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatg 514  Q
    |||||||||| |||| | ||||||| ||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||  || || |||||| ||||||||||||||||| |    
T  23328620 aacccgtcccgaatggagaaaattatttttatgttgacatgtcttgttattttgtttgataattgtcgtgcta-taaaaattatcattgatatttaaagg 23328522  T
Q  515 atcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
    |  |||||||||| || |||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  23328521 aataactaaatcaatcggtctaataaatgctaaagtgagcatatt 23328477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 269 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 17885647 - 17885532
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |  ||||||||||||  ||||| |||| |||| ||| |||||| | | |||| ||||||||||||||    
T  17885647 aggcatggcaacaaaacccatacccgtggttacctgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgaatatgggtatgggt 17885548  T
Q  369 ttttcccgatttcaaa 384  Q
    ||| |||||||| |||    
T  17885547 tttccccgattttaaa 17885532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 420 - 552
Target Start/End: Original strand, 25782993 - 25783125
Alignment:
Q  420 ccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatca 518  Q
    ||||||| |||| | |||||||||||||||| |||| | || |||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||  ||||||||| || ||    
T  25782993 ccgtcccgaatgcagaaaattactttatgttaatatctcatattattttgtttgataattgcagtgtta-taaaaactatcatcaatatttaaaggagca 25783091  T
Q  519 actaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtga 552  Q
    ||||||||| || || ||| |||| |||||||||    
T  25783092 actaaatcaatcggtataataaatattaaagtga 25783125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 269 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 35074652 - 35074543
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||  ||||  |||| |||| ||| |||||| | | ||||| |||||||||||||    
T  35074652 aggcatggcaacaaaacccatacccgtggttacccgcccgaaccaaacccaattagacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggt 35074553  T
Q  369 ttttcccgat 378  Q
    ||| ||||||    
T  35074552 tttccccgat 35074543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 269 - 392
Target Start/End: Original strand, 45885676 - 45885800
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || | ||||||||||  |||||||||| ||||  || |||||| | | ||||| |||||||||| ||    
T  45885676 aggcatggcaacaaaacccatacccgtggttacccgctcgaaccaaacccaatttaacgggttttctccgttttgactgggtttgggtatgggtatgagt 45885775  T
Q  369 ttttcccgatttc-aaacacgggta 392  Q
    ||| |||||| || |||||||||||    
T  45885776 tttccccgatctcaaaacacgggta 45885800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 486 - 559
Target Start/End: Original strand, 26004673 - 26004746
Alignment:
Q  486 taataaaaactatcattgatatttaaatgatcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  26004673 taataaaaactaccattgatatttaaaggagcgactaaatcaatcggtctaacaaatgttaaaatgagcatatt 26004746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 276 - 392
Target Start/End: Original strand, 44658385 - 44658502
Alignment:
Q  276 gcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggtttttccc 375  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||   ||||| |||| |||| | | |||||| | | ||||| |||||||||| |||||||||    
T  44658385 gcaacaaaacccatacccgcggttacctgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttcctcgttttgactgggtttgggtatgggtatgagtttttccc 44658484  T
Q  376 gatttc-aaacacgggta 392  Q
    |||||| |||||||||||    
T  44658485 gatttcaaaacacgggta 44658502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 269 - 384
Target Start/End: Original strand, 27850243 - 27850352
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||  ||||| |||| |||| ||| ||||||      |||| | |||||||||||    
T  27850243 aggcatggcaacaaaactcatatccgtggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacggtttttccccgttttga------ttgggtttgggtatgggt 27850336  T
Q  369 ttttcccgatttcaaa 384  Q
    ||| ||||||||||||    
T  27850337 tttccccgatttcaaa 27850352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 269 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 37182456 - 37182332
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    |||| |||||||||||| |||| ||||||||| || |||||| |||||| ||||| |||| |||| ||| |||||| | | ||||| |||| ||||||||    
T  37182456 aggcgtggcaacaaaacccatatccgcggttacccgcccgaatcaaactcaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgagtatgggt 37182357  T
Q  369 ttttcccgatttc-aaacacgggta 392  Q
    |||  |||| ||| |||||||||||    
T  37182356 tttctccgaattcaaaacacgggta 37182332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 269 - 392
Target Start/End: Original strand, 41741361 - 41741485
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    ||||||||||||||||| ||||   ||||||| || ||||||||||||  ||||| | |  |||| |||||||| | | ||||||| |||| ||||||||    
T  41741361 aggcatggcaacaaaacccatatttgcggttacccgcccgaaccaaacccaatttgatgagttttccccatttttactggatttgggtatgagtatgggt 41741460  T
Q  369 ttttcccgatttc-aaacacgggta 392  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||    
T  41741461 tttccccgatttcaaaacacgggta 41741485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 269 - 384
Target Start/End: Original strand, 44734270 - 44734383
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||  ||||| |||| ||||  || |||||| | | |||||  ||| ||||| ||    
T  44734270 aggcatggcaacaaaactcatactcgcggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacgggtttt--cccttttgactgggtttgggaatgtgtatgtgt 44734367  T
Q  369 ttttcccgatttcaaa 384  Q
    ||||| ||||||||||    
T  44734368 ttttctcgatttcaaa 44734383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 269 - 344
Target Start/End: Original strand, 26004397 - 26004472
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttga 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||  ||||| | || |||||||| ||||||    
T  26004397 aggcatggcaacaaaactcatacccgtggttacccgcccgaaccaaacacaatttgatgggtttttcccgttttga 26004472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 269 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 30650813 - 30650698
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||  ||||| |||| |||| ||| |||||| | | ||| | |||||||||| ||    
T  30650813 aggcatgtcaacaaaactcatacccgtggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttaggtatgggtatgagt 30650714  T
Q  369 ttttcccgatttcaaa 384  Q
    ||| ||| || |||||    
T  30650713 tttccccaatctcaaa 30650698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 271 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 5377265 - 5377152
Alignment:
Q  271 gcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggttt 370  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||| ||||| | | | ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |  |||  |||| || |||||||    
T  5377265 gcatgacaataaaattcatacccgtggttacctatctgaaccaaatctaatttaacggatttttcccgttttgattggggttgagtatgagtttgggttt 5377166  T
Q  371 ttcccgatttcaaa 384  Q
    | ||||||||||||    
T  5377165 tccccgatttcaaa 5377152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 420 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 10072473 - 10072436
Alignment:
Q  420 ccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt 457  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10072473 ccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt 10072436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 269 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 17852034 - 17851925
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | ||||| || ||||||||||||  ||||| | |||||||  || |||||| | | ||||| |||||||||||||    
T  17852034 aggcatggcaacaaaacccatacttgtggttacccgcccgaaccaaacccaatttgatggattttctccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggt 17851935  T
Q  369 ttttcccgat 378  Q
    ||| ||||||    
T  17851934 tttccccgat 17851925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 461 - 548
Target Start/End: Original strand, 5916194 - 5916280
Alignment:
Q  461 ttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaa 548  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | ||||||| |||||||||||||| ||  || | ||||| || |||||||||||||||||    
T  5916194 ttattttgtttgataattgctgtgtta-tcaaaactaccattgatatttaaaggagtaaatcaatcaatcggtctaacaaatgttaaa 5916280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 269 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 25905810 - 25905695
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || | ||||| ||||  ||||| || | |||| ||| |||||| | | ||||| |||||||||||||    
T  25905810 aggcatggcaacaaaacccatacccgtggttacccgctcgaactaaacccaatttgacaggttttcccctttttgactgggtttgggtatgggtatgggt 25905711  T
Q  369 ttttcccgatttcaaa 384  Q
    ||| ||| || |||||    
T  25905710 tttccccaatctcaaa 25905695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 269 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 37218187 - 37218112
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttga 344  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||| ||||| | || |||| ||| ||||||    
T  37218187 aggcatgacaacaaaactcataccagcggatacccacccgaaccaaactcaatttgatgggttttccccgttttga 37218112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 350 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 45380208 - 45380174
Alignment:
Q  350 tttggatatgggtatgggtttttcccgatttcaaa 384  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45380208 tttggatatgggtatgggtttttcccgatttcaaa 45380174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 269 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 24425550 - 24425473
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgatt 346  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||| |  ||||||||||||  ||||| |||||||||  || ||||||||    
T  24425550 aggcatggcaacaaaactcatacacgtggttaccagcccgaaccaaacccaatttgacggattttctccgttttgatt 24425473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 280 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 37579432 - 37579331
Alignment:
Q  280 caaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggtttttcccgatt 379  Q
    |||||| ||||| || ||||| || ||||||||||||  ||||  |||| |||| ||| |||||| ||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||    
T  37579432 caaaacccatacgcgtggttacccgcccgaaccaaacccaattagacgggttttccccgttttgactaggtttgggtatgggtttggatttttcccgatt 37579333  T
Q  380 tc 381  Q
    ||    
T  37579332 tc 37579331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 272 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 3774249 - 3774185
Alignment:
Q  272 catggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcc 336  Q
    |||||||||| ||| |||| |||||| || ||||||||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  3774249 catggcaacagaacccatatccgcgggtaaccacccgaaccaaacctaatttgatggatttttcc 3774185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 421 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 43507451 - 43507415
Alignment:
Q  421 cgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt 457  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43507451 cgtcccaaatgtaaaaaattattttatgttgatatgt 43507415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 488 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 41946802 - 41946731
Alignment:
Q  488 ataaaaactatcattgatatttaaatgatcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
    ||||||| | ||| ||| |||||||||| |||| |||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||    
T  41946802 ataaaaattgtcaatgaaatttaaatgagcaaccaaattattcagtcaaaaaaatgttaaagtgaacatatt 41946731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 269 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 43507627 - 43507512
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    ||||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||  | |||||||||  ||||| | || |||| ||| |||||| | | ||||| |||  ||||||||    
T  43507627 aggcatggcaataaaattcatatccgcggttacccgtctgaaccaaacccaatttgatgggttttccccgttttgactgggtttgggtataagtatgggt 43507528  T
Q  369 ttttcccgatttcaaa 384  Q
    ||| ||||||||||||    
T  43507527 tttccccgatttcaaa 43507512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 269 - 384
Target Start/End: Original strand, 44785169 - 44785284
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    |||||||||||||||| ||||||  | ||||| || |||||| |||||  ||||| |||  |||| ||| |||||| ||  ||||| |||||||||||||    
T  44785169 aggcatggcaacaaaattcatacatgtggttacccgcccgaatcaaacccaatttgacgagttttccccgttttgactaagtttgggtatgggtatgggt 44785268  T
Q  369 ttttcccgatttcaaa 384  Q
    |||  ||||| |||||    
T  44785269 tttctccgatctcaaa 44785284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 417 - 457
Target Start/End: Original strand, 3274762 - 3274802
Alignment:
Q  417 aacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt 457  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  3274762 aacccgtcccgaatgtagaaaattacattatgttgatatgt 3274802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 269 - 337
Target Start/End: Original strand, 23533527 - 23533595
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttccc 337  Q
    ||||||| ||||||||  ||||||||||| || || ||||||||||||  ||||| |||| ||||||||    
T  23533527 aggcatgacaacaaaatccatacccgcgggtaccctcccgaaccaaacccaatttgacgggtttttccc 23533595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 296 - 384
Target Start/End: Original strand, 39455953 - 39456041
Alignment:
Q  296 ggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggtttttcccgatttcaaa 384  Q
    ||||| || ||||||||||||  ||||| |||  |||| ||| |||||| | | ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  39455953 ggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacgagttttccccgttttgactgggtttgggtatggatatgggttttccccgatttcaaa 39456041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 320 - 384
Target Start/End: Original strand, 42908003 - 42908067
Alignment:
Q  320 atttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggtttttcccgatttcaaa 384  Q
    |||| |||| ||||||||| ||||||| | ||||| |||| || |||||||| ||||||||||||    
T  42908003 atttgacggttttttcccaatttgattgggtttgggtatgagtttgggttttccccgatttcaaa 42908067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 167; Significance: 4e-89; HSPs: 59)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 269 - 559
Target Start/End: Original strand, 17853205 - 17853518
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |||| |||| ||| |||||||| | ||||| ||||| |||||||    
T  17853205 aggcatggcaacaaaacgcatacccgcggttacccacctgaaccaaacctaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatggatatgggt 17853304  T
Q  369 ttttcccgatttcaaacacgggta-----------acggatatatagatacccactctgaaccc------------gtcccaaatgtaaaaaattacttt 445  Q
    ||| ||||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||| ||||||            ||||||||||||||||||||||||    
T  17853305 tttccccgatttcaaacacgggtatgggacgggtaacggatatatagatacccactccgaacccatacccatacccgtcccaaatgtaaaaaattacttt 17853404  T
Q  446 atgttgatatgtatgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaactaaatcattccgtctaacaaatgtt 545  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17853405 atgttgatatgtatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattccgtctaacaaatgtt 17853504  T
Q  546 aaagtgaacatatt 559  Q
    ||||||||||||||    
T  17853505 aaagtgaacatatt 17853518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 269 - 559
Target Start/End: Original strand, 13401916 - 13402229
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||  ||||| |||||||||| || |||||| ||| ||||| |||||||||| ||    
T  13401916 aggcatggcaacaaaacccatacccgcggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacggattttttccgttttgactaggtttgggtatgggtatgagt 13402015  T
Q  369 ttttcccgattt-caaacacgggta-----------acggatatatagatacccactctgaaccc-----------gtcccaaatgtaaaaaattacttt 445  Q
    |||||||||||| ||||||||||||           |||| ||| ||| ||||||||| ||||||           ||||||||||||||||||||||||    
T  13402016 ttttcccgattttcaaacacgggtatggaacgggtaacgggtatttaggtacccactccgaacccaaccgatacccgtcccaaatgtaaaaaattacttt 13402115  T
Q  446 atgttgatatgtatgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaactaaatcattccgtctaacaaatgtt 545  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13402116 atgttgatatgtatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactactattgatatttaaaggatcaactaaatcatttcgtctaacaaatgtt 13402215  T
Q  546 aaagtgaacatatt 559  Q
    ||| ||| ||||||    
T  13402216 aaaatgagcatatt 13402229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 277 - 542
Target Start/End: Original strand, 6092449 - 6092728
Alignment:
Q  277 caacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggtttttcccg 376  Q
    |||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||| | |||||||||| |||| ||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  6092449 caacaaaactcataccctaggttacccgcccgaaccaaattcaatttaacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtatgggtttttcccg 6092548  T
Q  377 atttcaaa-cacgggtaacggatatatagatacccactctgaaccc------------gtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgtt 462  Q
    || ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| | ||||||            |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6092549 atctcaaaacacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaatccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgttatgtt 6092648  T
Q  463 attttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaactaaatcattccgtctaacaaat 542  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  6092649 attttgtttgataattgcaatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaat 6092728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 418 - 559
Target Start/End: Original strand, 3564813 - 3564954
Alignment:
Q  418 acccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtatgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatc 517  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3564813 acccgttccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatc 3564912  T
Q  518 aactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3564913 aactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgagcatatt 3564954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 269 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 4583296 - 4582981
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||| || ||||||||||||  ||||| |||| |||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  4583296 aggcatggcaacaaaactcatatccacggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttggatatgggtatgggt 4583197  T
Q  369 ttttcccgatttcaaa------------cacgggtaacggatatatagatacccactctgaaccc------------gtcccaaatgtaaaaaattactt 444  Q
    ||| ||||||||||||             ||||||||||| ||||||| | ||||| |  |||||            |||||||||||||||||||||||    
T  4583196 tttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggttcccaccccaaacccatacccatacccgtcccaaatgtaaaaaattactt 4583097  T
Q  445 tatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaactaaatcattccgtctaacaaatg 543  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4583096 tatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattccgtctatcaaatg 4582997  T
Q  544 ttaaagtgaacatatt 559  Q
    ||||||||| ||||||    
T  4582996 ttaaagtgagcatatt 4582981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 418 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 35311826 - 35311685
Alignment:
Q  418 acccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtatgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatc 517  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  35311826 acccgtcccaaatgtaaaaaattattttatgttgatatgtatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatc 35311727  T
Q  518 aactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35311726 aactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgagcatatt 35311685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 271 - 565
Target Start/End: Original strand, 20973410 - 20973718
Alignment:
Q  271 gcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggttt 370  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||  | | | |||| |||| ||| |||||| | | ||||| |||||||||||||||    
T  20973410 gcatggcaacaaaacccatacccgcggttacccgcccgaaccaaacccattctgacgggttttccccgttttgactgggtttggttatgggtatgggttt 20973509  T
Q  371 ttcccgattt-caaacacgggta-----------acggatatatagatacccactctgaacccgt-cccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt 457  Q
    | |||||||| ||||||||||||           |||| ||||||| ||||||| | |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20973510 tccccgattttcaaacacgggtatgggatgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt 20973609  T
Q  458 -atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacat 556  Q
     ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |    
T  20973610 catggtattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatgtaaagtatcaactaaatcattccgtctaaaaaatattaaagtgagcgt 20973709  T
Q  557 attcttcga 565  Q
    ||| |||||    
T  20973710 attgttcga 20973718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 418 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 28045660 - 28045517
Alignment:
Q  418 acccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaa-taaaaactatcattgatatttaaatga 515  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  28045660 acccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtcatgttattttgttttataattgttatgttaaataaaaactatcattgatatttaaagga 28045561  T
Q  516 tcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28045560 tcaactaaatcattacgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 28045517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 418 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 1218759 - 1218619
Alignment:
Q  418 acccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtatgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatc 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  1218759 acccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatttgtatgttattttgtttgataattgtcatgttaa-aaaaactaccattgatatttaaaggatc 1218661  T
Q  518 aactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1218660 aactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgagcatatt 1218619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 417 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 4920831 - 4920695
Alignment:
Q  417 aacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatga 515  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4920831 aacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaatga 4920732  T
Q  516 tcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtga 552  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  4920731 tcaactaaatcattttgtctaacaaatgtgaaagtga 4920695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 417 - 552
Target Start/End: Original strand, 42987563 - 42987699
Alignment:
Q  417 aacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatga 515  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42987563 aacccgtcccaaatgtaaaaaattattttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaagga 42987662  T
Q  516 tcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtga 552  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  42987663 tcaactaaatcattttgtctaacaaatgtgaaagtga 42987699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 269 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 40517983 - 40517675
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||| | | ||||| |||||||||||||    
T  40517983 aggcatggcaacaaaacccatacccgtggttacccgcctgaaccaaattcaatttgacggatttttcccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggt 40517884  T
Q  369 ttttcccgatttcaaa-cacgggta-----------acggatatatagatacccactctgaaccc------------gtcccaaatgtaaaaaattactt 444  Q
    ||| ||||||  |||| ||||||||           |||| ||||||| ||||||| | ||||||            |||||||| ||||||||||| ||    
T  40517883 tttccccgatcccaaaacacgggtatgggatgggtaacgggtatatagttacccaccccgaacccatactcaaacccgtcccaaaggtaaaaaattattt 40517784  T
Q  445 tatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaactaaatcattccgtctaacaaatg 543  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  40517783 tatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatg 40517684  T
Q  544 ttaaagtga 552  Q
    | |||||||    
T  40517683 tgaaagtga 40517675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 417 - 552
Target Start/End: Original strand, 5908772 - 5908908
Alignment:
Q  417 aacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatga 515  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  5908772 aacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaagga 5908871  T
Q  516 tcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtga 552  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||    
T  5908872 tcaactaaataattttgtctaacaaatgtgaaagtga 5908908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 418 - 559
Target Start/End: Original strand, 12834659 - 12834802
Alignment:
Q  418 acccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt--atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatga 515  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  12834659 acccgtcccaaatgtaaaaaattaatttatgttgatatgtctatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttgaatga 12834758  T
Q  516 tcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
    |||| |||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12834759 tcaattaaatcgttacgtctaacaaatgttaaagtgagcatatt 12834802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 418 - 559
Target Start/End: Original strand, 12866636 - 12866779
Alignment:
Q  418 acccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt--atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatga 515  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  12866636 acccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtctatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttgaatga 12866735  T
Q  516 tcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
    |||| |||||  || |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12866736 tcaattaaattgttacgtctaacaaatgttaaagtgagcatatt 12866779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 417 - 552
Target Start/End: Original strand, 22694985 - 22695121
Alignment:
Q  417 aacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgta-tgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatga 515  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  22694985 aacccgtcccaaatgtaaaaaattattttatgttgatatgtaatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaagga 22695084  T
Q  516 tcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtga 552  Q
    ||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  22695085 tcaactatatcattttgtctaacaaatgtgaaagtga 22695121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 269 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 15890383 - 15890069
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||   ||||| |||| |||||||| |||||| ||| ||||| |||| ||||||||    
T  15890383 aggcatgacaacaaaacccatactcgcggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggtttttcccgttttgactaggtttggctatgtgtatgggt 15890284  T
Q  369 ttttcccgatttcaaac------------acgggtaacggatatatagatacccactctga-----------acccgtcccaaatgtaaaaaattacttt 445  Q
    |||  |||||||||||             ||||||||||| ||||||| ||||||| |  |           ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15890283 tttctccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccacccgaacccatacccatacccgtcccaaatgtaaaaaattacttt 15890184  T
Q  446 atgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaactaaatcattccgtctaacaaatgt 544  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||| || |||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  15890183 atgttgatatgtcatgttattttatttgataattgtcatattaatgaaaactaccattgatatttgaaggatcaattaaataattacgtctaacaaatgt 15890084  T
Q  545 taaagtgaacatatt 559  Q
    |||||||||||||||    
T  15890083 taaagtgaacatatt 15890069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 417 - 559
Target Start/End: Original strand, 27088436 - 27088577
Alignment:
Q  417 aacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtatgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgat 516  Q
    |||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||     
T  27088436 aacccgtctcgaatgtagaaaattattttatgttgatatgtatgttattttgtttgataattgttatgtt-ataaaaactatcattgatatttaaaggag 27088534  T
Q  517 caactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  27088535 caactaaatcaatcggtctaacaaatgttaaagtaagcatatt 27088577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 418 - 559
Target Start/End: Original strand, 29246036 - 29246178
Alignment:
Q  418 acccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgat 516  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||   ||    
T  29246036 acccatcccaaatgtaaaaaattattttatgttggtatgtcatgttattttgtttgataattgttatgttaataaacactaccattgatatttaatgaat 29246135  T
Q  517 caactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29246136 caattaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgagcatatt 29246178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 417 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 30996601 - 30996466
Alignment:
Q  417 aacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatga 515  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| ||    
T  30996601 aacccgtcccaaatgtaaaaaattactttaagttgatatgccatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccgttgatatttaaagga 30996502  T
Q  516 tcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtga 552  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30996501 tcaaataaatcattccgtctaac-aatgttaaagtga 30996466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 420 - 559
Target Start/End: Original strand, 6156005 - 6156145
Alignment:
Q  420 ccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatca 518  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||| || ||    
T  6156005 ccgtcacaaatgttgaaaattactttatgtttatatgacatgttattttgtttgataattgtcatggtaataaaaaatatcattgatatttaaaggagca 6156104  T
Q  519 actaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6156105 aataaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgagcatatt 6156145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 417 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 6369701 - 6369566
Alignment:
Q  417 aacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgta-tgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatga 515  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| | ||||| |||||| ||    
T  6369701 aacccgtccaaaatgtaaaaaattactttatgttgatgcgtcgtgttattttgtttgataattatcatgttaatgaaaactaccgttgatgtttaaaaga 6369602  T
Q  516 tcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtg 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6369601 tcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtg 6369566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 421 - 559
Target Start/End: Original strand, 27302823 - 27302959
Alignment:
Q  421 cgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaa 519  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||   ||   |||||||||||||| ||||||    
T  27302823 cgtcccaaacgtaaaaaattactttatgttaatatgtcatgttattttgtttgataattgtcatgttactacgtac---cattgatatttaaaggatcaa 27302919  T
Q  520 ctaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  27302920 ctaaatcattccatctaacaaatgttaaagtgatcatatt 27302959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 417 - 559
Target Start/End: Original strand, 35194073 - 35194215
Alignment:
Q  417 aacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatg-tatgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatga 515  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||||  |    
T  35194073 aacccgtcccgaatgtagaaaattactttatgttaatatgctatgttattttgtttgataattgctgtgtta-taaaaactaccattgatatttaaagaa 35194171  T
Q  516 tcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
    | |||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  35194172 taaactaaatcaattggtctaaaaaatgttaaagtgaacatatt 35194215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 417 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 3573229 - 3573087
Alignment:
Q  417 aacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatga 515  Q
    ||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||| ||| ||    
T  3573229 aacccctcccgaatgtagaaaattattttatgttgatatgtcatgttattctgtttgataattgtcgtgtta-taaaaactaccattgatattcaaagga 3573131  T
Q  516 tcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
     ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3573130 gcaactaaatcaatcggtctaacaaatgttaaagtgagcatatt 3573087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 435 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 2985134 - 2985010
Alignment:
Q  435 aaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaactaaatcattccgt 533  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||    
T  2985134 aaaattattttatattgatatgtcatgttattttatttgataattgttgtgtta-taaaaactatcattgatatttaaaggagcaactaaatcaatcggt 2985036  T
Q  534 ctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||    
T  2985035 ctaacaaatattaaagtgagcatatt 2985010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 417 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 12447386 - 12447244
Alignment:
Q  417 aacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatga 515  Q
    |||||||||||||| || |||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||    
T  12447386 aacccgtcccaaatatagaaaactactttatgttaatatgtcatgttattttgtttgataattgtcgtgtta-taaaaactaccattgatatttaaagga 12447288  T
Q  516 tcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
     ||  ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| |||||    
T  12447287 gcagttaaatcaatcgatctaacaaatgttaaagtgaatatatt 12447244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 417 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 30115488 - 30115346
Alignment:
Q  417 aacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatg-tatgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatga 515  Q
    |||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||| | |||| ||||||||| ||    
T  30115488 aacccgtcccgaatgcataaaattattttatgttgatatgctatgttattttgtttgataattgccgtgtta-taaaaaccaccatttatatttaaagga 30115390  T
Q  516 tcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
     ||||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30115389 gcaactaaatcgatcagtctaacaaatgttaaagtgagcatatt 30115346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 421 - 559
Target Start/End: Original strand, 8453462 - 8453598
Alignment:
Q  421 cgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtatgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaac 520  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||| |||||||| |||||| |||||| || |||||||||||||| ||  |||    
T  8453462 cgtcccaaatgtagaaaattagtttatgttaatatgtc-gttattttgtttaataattgtcatgtta-taaaaattaccattgatatttaaaggagtaac 8453559  T
Q  521 taaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||    
T  8453560 taaatcattcggtcaaacaaatgttaaaatgagcatatt 8453598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 435 - 559
Target Start/End: Original strand, 2412828 - 2412952
Alignment:
Q  435 aaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaactaaatcattccgt 533  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||  ||||||||||||| || ||||||||| | || ||    
T  2412828 aaaattactttatattgatatgtcatgttattttgtttgataattgttgtgtca-taaaaactacaattgatatttaaaggagcaactaaattaatcggt 2412926  T
Q  534 ctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||    
T  2412927 ctaacaaatattaaagtgagcatatt 2412952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 419 - 559
Target Start/End: Original strand, 33862270 - 33862409
Alignment:
Q  419 cccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatc 517  Q
    |||||||| |||| | |||| || ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||  |||||||||||||||| |    
T  33862270 cccgtcccgaatgcagaaaactattttatgttgatatgccatgttattttgtttgataattgtcatgttg-taaaaactacgattgatatttaaatgacc 33862368  T
Q  518 aactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
    |||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  33862369 aactaaatcaat-gggctaacaaatgttaaagtgaacatatt 33862409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 269 - 392
Target Start/End: Original strand, 33727913 - 33728037
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||  ||||| ||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||| |    
T  33727913 aggcatggcaacaaaacccatacccgtggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacggattttccccgttttgattgggtttggatatgggtatggat 33728012  T
Q  369 ttttcccgatttc-aaacacgggta 392  Q
    ||| |||||| || |||||||||||    
T  33728013 tttccccgatctcaaaacacgggta 33728037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 269 - 392
Target Start/End: Original strand, 5908600 - 5908724
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||| |||| |||| |||||||||||| | ||||| |||||||||| ||    
T  5908600 aggcatggcaacaaaatccatacccgtggttatccgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccattttgattgggtttgggtatgggtatgagt 5908699  T
Q  369 ttttcccgatttc-aaacacgggta 392  Q
    ||| |||||| || |||||||||||    
T  5908700 tttccccgatctcgaaacacgggta 5908724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 272 - 392
Target Start/End: Original strand, 29245866 - 29245987
Alignment:
Q  272 catggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggtttt 371  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| |||| |||| ||| |||||| ||| ||||| |||||||||| |||||    
T  29245866 catgacaacaaaacccatacccgcggttacccgcccgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgactaggtttgggtatgggtatgagtttt 29245965  T
Q  372 tcccgatttc-aaacacgggta 392  Q
      |||||||| |||||||||||    
T  29245966 ctccgatttcaaaacacgggta 29245987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 476 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 10127053 - 10126977
Alignment:
Q  476 attgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtga 552  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  10127053 attgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaagatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtgaaagtga 10126977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 269 - 392
Target Start/End: Original strand, 6155832 - 6155956
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||   |||||||||| ||||   | |||||| | | ||||| |||| || |||||    
T  6155832 aggcatggcaacaaaactcatacctgcggttatccacccgtaccaaatcaaatttaacgggttttcttcgttttgactgggtttgggtatgtgtttgggt 6155931  T
Q  369 ttttcccgatttc-aaacacgggta 392  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||    
T  6155932 tttccccgatttcaaaacacgggta 6155956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 269 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 4921003 - 4920888
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||  ||||| |||| ||||  || |||||| | | ||||| |||||||||||||    
T  4921003 aggcatggcaacaaaacccatacccgtggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttctccgttttgactgggtttggttatgggtatgggt 4920904  T
Q  369 ttttcccgatttcaaa 384  Q
    ||| |||||| |||||    
T  4920903 tttccccgatctcaaa 4920888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 417 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 18207024 - 18206888
Alignment:
Q  417 aacccgtcccaaatgtaaaaaattactt-tatgttgatatgt-atgttattttgtttgataatt-gttatgttaataaaaactatcattgatatttaaat 513  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||| |   ||||| |||||||||  | |||||||||||     
T  18207024 aacccgtcccgaatgtagaaaattacttctatgttgatatgccatgttattttgtttaataatttgccgtgtta-taaaaactactaatgatatttaaag 18206926  T
Q  514 gatcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtg 551  Q
    || ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  18206925 gagcaactaaatcaatcggtctaacaaatattaaagtg 18206888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 420 - 548
Target Start/End: Original strand, 38006556 - 38006684
Alignment:
Q  420 ccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatca 518  Q
    ||||||| |||||  ||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||  | ||| ||||||| | |||||||||||||| || ||    
T  38006556 ccgtcccgaatgttgaaaattaatttatgttaatatgtcatgttattttgtttgataatagtcgtatta-taaaaaccaccattgatatttaaaggagca 38006654  T
Q  519 actaaatcattccgtctaacaaatgttaaa 548  Q
    ||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  38006655 actaaatcaattggtctaacaattgttaaa 38006684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 269 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 10127251 - 10127127
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    ||||||| ||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||   ||||| |||| |||| ||| |||||| | | ||||| |||||||||||||    
T  10127251 aggcatgacaacaaaatccatacccgtggttatccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggt 10127152  T
Q  369 ttttcccgatttc-aaacacgggta 392  Q
    ||| |||||| || |||||||||||    
T  10127151 tttccccgatctcaaaacacgggta 10127127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 277 - 384
Target Start/End: Original strand, 16311213 - 16311320
Alignment:
Q  277 caacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggtttttcccg 376  Q
    |||||||||||||| |||||| || || || ||||||||| |||||| |||| ||||||||  ||||||| | |||||||||| || || |||||| |||    
T  16311213 caacaaaactcatatccgcgggtacccgcctgaaccaaacctaatttgacggttttttcccgctttgattgggtttggatatgagtttgagttttttccg 16311312  T
Q  377 atttcaaa 384  Q
    ||||||||    
T  16311313 atttcaaa 16311320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 269 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 18207195 - 18207080
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||  ||||| |||  |||||||| |||||| | | |||||  ||| || |||||    
T  18207195 aggcatggcaacaaaactcatacccgtggttacccacccaaaccaaacccaatttgacgtgtttttcccgttttgactgggtttgggcatgagtttgggt 18207096  T
Q  369 ttttcccgatttcaaa 384  Q
    ||| | ||||||||||    
T  18207095 tttcctcgatttcaaa 18207080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 272 - 370
Target Start/End: Original strand, 22694817 - 22694915
Alignment:
Q  272 catggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggttt 370  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||  ||||| ||||| ||||||| |||| | | | ||||| |||||||||||||||    
T  22694817 catggcaacaaaacccatacccgtggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacggaattttcccgttttaactgggtttgggtatgggtatgggttt 22694915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 469 - 550
Target Start/End: Original strand, 42717769 - 42717849
Alignment:
Q  469 tttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagt 550  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  42717769 tttgataattgtcgtgtta-taaaaactatcattgatatttaaaggagaaactaaatcaaccggtctaacaaatgttaaagt 42717849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 272 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 24207857 - 24207746
Alignment:
Q  272 catggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggtttt 371  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||||| | ||| || ||||||||||  |||||||   ||||| ||||||| || |||||    
T  24207857 catggcaacaaaatccatacccgcgggtacccacccgaaccaaactaagtttgac-gatttttcccgctttgattgagtttgggtatgggtttgagtttt 24207759  T
Q  372 tcccgatttcaaa 384  Q
     ||||||||||||    
T  24207758 ccccgatttcaaa 24207746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 278 - 370
Target Start/End: Original strand, 42717551 - 42717643
Alignment:
Q  278 aacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggttt 370  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||  |||||||||||  ||||| |||| |||||||| |||||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  42717551 aacaaaactcatacctgtggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggtttttcccgttttgactggatttgggtatgggtatgggttt 42717643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 269 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 12447545 - 12447482
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggattt 332  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  12447545 aggcatggcaacaaaacccatacccgtggttacccacccgaaccaaacccaatttgacggattt 12447482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 272 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 1218899 - 1218804
Alignment:
Q  272 catggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatggg 367  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||   ||||| |||  ||||| ||||||||| | | ||||| ||||||||||||    
T  1218899 catggcaacaaaacccatacccgcggttacccgctcgaaccaaatccaatttgacgagttttttccattttgactgggtttgggtatgggtatggg 1218804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 273 - 384
Target Start/End: Original strand, 12834490 - 12834601
Alignment:
Q  273 atggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggttttt 372  Q
    |||| |||||||| |||||  | ||||| ||  |||||||||||| ||||| |||| |||| |||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||     
T  12834490 atggtaacaaaacccatacatgtggttacccgtccgaaccaaactcaatttgacgggttttccccattttgactgggtttgggtatgggtatgggttttc 12834589  T
Q  373 cccgatttcaaa 384  Q
     || ||||||||    
T  12834590 tccaatttcaaa 12834601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 269 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 35311990 - 35311915
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttga 344  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||  ||||| |||||||||| || ||||||    
T  35311990 aggcatgacaataaaactcatatccgcggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacggattttttccgttttga 35311915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 269 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 30996772 - 30996671
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    ||||||||||||||||| |||| |  |||||||||  |||||||||||  ||||| ||||| ||||||| |||||| | | ||||| |||| ||||||||    
T  30996772 aggcatggcaacaaaacccatatctacggttatccgtccgaaccaaacccaatttgacgga-ttttcccgttttgactgggtttgggtatgagtatgggt 30996674  T
Q  369 ttt 371  Q
    |||    
T  30996673 ttt 30996671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 289 - 383
Target Start/End: Original strand, 33420279 - 33420373
Alignment:
Q  289 tacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggtttttcccgatttcaa 383  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||| || ||| |||| | ||||||||||||||| | ||||  |||| || ||| ||||||| ||||||||    
T  33420279 tacccgtggttatccatccgaaccaaacctattttgacgggtatttcccattttgattgggtttgagtatgagtttggatttttcctgatttcaa 33420373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 502 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 15564574 - 15564517
Alignment:
Q  502 tgatatttaaatgatcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||| |||||||| |||||||    
T  15564574 tgatatttaaatgagcaactaaatcatccactctaacaaatattaaagtgtacatatt 15564517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 269 - 392
Target Start/End: Original strand, 2412638 - 2412762
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    ||||||||||| |||| ||||| |||  |||||||| | ||  |||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||   ||||| ||||||| ||  |    
T  2412638 aggcatggcaaaaaaattcataaccgttgttatccatctgagtcaaattcaatttgacggattttccccattttgattgagtttgggtatgggtttgaat 2412737  T
Q  369 ttttcccgatttc-aaacacgggta 392  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||    
T  2412738 ttttcccaatttcaaaacacgggta 2412762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 269 - 317
Target Start/End: Original strand, 27088285 - 27088333
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaact 317  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  27088285 aggcatggcaacaaaatccatacccgtgattatccacccgaaccaaact 27088333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 274 - 384
Target Start/End: Original strand, 12866468 - 12866578
Alignment:
Q  274 tggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggtttttc 373  Q
    |||||||||||| |||||  | ||||| ||  ||||||||||   ||||| |||| |||| |||||||||| | | ||||| |||||||||| |||||      
T  12866468 tggcaacaaaacccatacatgtggttacccgtccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccattttgactgggtttgggtatgggtatgagttttct 12866567  T
Q  374 ccgatttcaaa 384  Q
    |||||||||||    
T  12866568 ccgatttcaaa 12866578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 291 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 38973077 - 38972984
Alignment:
Q  291 cccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggtttttcccgatttcaaa 384  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||| | ||| || | |||| ||| |||||| | | ||| | |||| || |||||||||||||||||||||    
T  38973077 cccgcgggtatccaccccaaccaaactcattttgacaggttttccccgttttgactgggtttaggtatgagtttgggtttttcccgatttcaaa 38972984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 272 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 39422520 - 39422399
Alignment:
Q  272 catggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggtttt 371  Q
    |||||||||||| |||||||| | || || || ||||||||| ||  || || || | |||| |||  ||||||| | |||||||||| || ||||||||    
T  39422520 catggcaacaaagctcatacctgtgggtaaccgcccgaaccacacccaaattgacaggttttccccgctttgattgggtttggatatgagtttgggtttt 39422421  T
Q  372 tcccgatttc-aaacacgggta 392  Q
    || ||||||| |||||||||||    
T  39422420 tctcgatttcaaaacacgggta 39422399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 421 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 15564637 - 15564577
Alignment:
Q  421 cgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgt 480  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  15564637 cgtcccgaatgtagaaaattactttacattgatatgtcatgttattttttttgaaaattgt 15564577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 145; Significance: 5e-76; HSPs: 41)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 269 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 37106870 - 37106562
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||  ||||| |||| |||| ||| |||||| |   ||||| |||||||||||||    
T  37106870 aggcatgacaacaaaactcatactcgcggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgactgagtttgggtatgggtatgggt 37106771  T
Q  369 ttttcccgatttcaaac------------acgggtaacggatatatagatacccactctgaaccc------gtcccaaatgtaaaaaattactttatgtt 450  Q
    ||| ||||||||||||             ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||      |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37106770 tttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccactccgaacccatacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgtt 37106671  T
Q  451 gatatgtatgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagt 550  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37106670 gatatatatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagt 37106571  T
Q  551 gaacatatt 559  Q
    || ||||||    
T  37106570 gagcatatt 37106562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 418 - 559
Target Start/End: Original strand, 12193911 - 12194053
Alignment:
Q  418 acccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgat 516  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  12193911 acccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattatcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggat 12194010  T
Q  517 caactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12194011 caactacatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 12194053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 417 - 552
Target Start/End: Original strand, 13705444 - 13705580
Alignment:
Q  417 aacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatga 515  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  13705444 aacccgtcccaaatgtgaaaaattactttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaagga 13705543  T
Q  516 tcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtga 552  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13705544 tcaactaaatcattccgtataacaaatgttaaagtga 13705580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 269 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 10920816 - 10920515
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||   ||||| |  | |||| ||| |||||| | | ||||| ||||||||||| |    
T  10920816 aggcatggcaacaaaacccatacccgtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgataggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatggat 10920717  T
Q  369 ttttcccgatttcaaa-cacgggta----acggatatatagatacccactctgaaccc------------gtcccaaatgtaaaaaattactttatgttg 451  Q
    |||| ||||| ||||| |||| |||    |||||||||||| || |||| | ||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10920716 tttttccgatctcaaaacacgagtatgggacggatatataggtatccaccccgaacccatacccaaatccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttg 10920617  T
Q  452 atatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagt 550  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  10920616 atatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtgaaagt 10920517  T
Q  551 ga 552  Q
    ||    
T  10920516 ga 10920515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 417 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 45256829 - 45256686
Alignment:
Q  417 aacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtat-gttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatga 515  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  45256829 aacccgtcccaaatgtaaaaaattactttattttgatatgtcttgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaattaccattgatatttaaagga 45256730  T
Q  516 tcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45256729 tcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacgtatt 45256686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 268 - 559
Target Start/End: Original strand, 18106028 - 18106316
Alignment:
Q  268 aaggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaattta-acggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgg 366  Q
    |||||||| ||||||||||||||   | ||||| || |||||| |||||| |||||  ||||||||| ||| |||||| | | |||||||||||||||||    
T  18106028 aaggcatgacaacaaaactcatatatgtggttacccgcccgaatcaaactcaattttgacggattttccccgttttgactgggtttggatatgggtatgg 18106127  T
Q  367 gtttttcccgatttcaaacacgggtaacggatatatagatacccactct-gaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttat 464  Q
    ||||| |||||| ||||| ||     |||| ||||||| ||||||  |  ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||  | |||||||    
T  18106128 gttttccccgatctcaaa-ac-----acgggtatataggtacccatacccgaacctgttccaaatgtaaaaaattattttatgttgatacattatgttat 18106221  T
Q  465 tttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  18106222 tttgtttgataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaattaaatcattttgtctaacaaatgtgaaagtgaacttatt 18106316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 418 - 551
Target Start/End: Original strand, 7314732 - 7314866
Alignment:
Q  418 acccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgat 516  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7314732 acccgtcccaaatgtaaaaaattattttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataaatatcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggat 7314831  T
Q  517 caactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtg 551  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7314832 caactaaatcattccgtctatcaaatgttaaagtg 7314866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 417 - 552
Target Start/End: Original strand, 24414215 - 24414351
Alignment:
Q  417 aacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatga 515  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24414215 aacccgtcccaaatgtaaaaaactactttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaatga 24414314  T
Q  516 tcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtga 552  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||    
T  24414315 tcaactaaataattttgtctaacaaatgtgaaagtga 24414351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 417 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 37999489 - 37999353
Alignment:
Q  417 aacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatga 515  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  |    
T  37999489 aacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaagaa 37999390  T
Q  516 tcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtga 552  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  37999389 tcaactaaatcattttgtctaacaaatgtgaaagtga 37999353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 269 - 552
Target Start/End: Original strand, 10208342 - 10208649
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||| ||| |||||| | | ||||| |||||||||||||    
T  10208342 aggcatggcaacaaaactcatacccgtgattatccgcccgaaccaaagttaatttgacgg-ttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggt 10208440  T
Q  369 ttttcccgat-ttcaaacacgggta-----------acggatatatagatacccactctgaaccc------------gtcccaaatgtaaaaaattactt 444  Q
    ||| ||| || || |||||||||||           | |||||||||| |||| || | ||||||            |||||||||||||||||||||||    
T  10208441 tttccccaatcttaaaacacgggtatgggacgggtaatggatatataggtacctaccccgaacccatactcaaaccagtcccaaatgtaaaaaattactt 10208540  T
Q  445 tatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaactaaatcattccgtctaacaaatg 543  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  10208541 tatgttaatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtcttacaaatg 10208640  T
Q  544 ttaaagtga 552  Q
    | |||||||    
T  10208641 tgaaagtga 10208649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 417 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 13830742 - 13830606
Alignment:
Q  417 aacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatga 515  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  13830742 aacctgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgtaaataaaaactaccattgatatttaaagga 13830643  T
Q  516 tcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtga 552  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  13830642 tcaactaaatcattttgtctaacaaatgtgaaagtga 13830606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 417 - 552
Target Start/End: Original strand, 42798071 - 42798208
Alignment:
Q  417 aacccgtcccaaatgtaaaaaa-ttactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatg 514  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  42798071 aacctgtcccaaatgtaaaaaaattactttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaagg 42798170  T
Q  515 atcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtga 552  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  42798171 atcaactaaatcattttgtctaacaaatgtgaaagtga 42798208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 417 - 552
Target Start/End: Original strand, 8916020 - 8916156
Alignment:
Q  417 aacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatga 515  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  8916020 aacccgtcccaaatgtaaaaaattattttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaagga 8916119  T
Q  516 tcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtga 552  Q
    | |||||||| |||  ||||||||||||| |||||||    
T  8916120 ttaactaaattattttgtctaacaaatgtgaaagtga 8916156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 417 - 559
Target Start/End: Original strand, 36128189 - 36128333
Alignment:
Q  417 aacccgtcccaaatgtaaaaaat-tactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatg 514  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  36128189 aacccgtcccaaatgtaaaaaaactactttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaagg 36128288  T
Q  515 atcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  36128289 atcaactaaataattttgtctaacaaatgtgaaagtgaacttatt 36128333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 417 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 45115564 - 45115428
Alignment:
Q  417 aacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatga 515  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  45115564 aacccatcccaaatgtaaaaaattacattatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaagga 45115465  T
Q  516 tcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtga 552  Q
    |||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  45115464 tcaattaaatcattttgtctaataaatgttaaagtga 45115428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 269 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 30847124 - 30846815
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||  ||||| |||| |||| ||| |||||| | | ||||| |||||||||||||    
T  30847124 aggcatggcaacaaaacccatacccgtggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggt 30847025  T
Q  369 ttttcccgatttc-aaacacgggta-----------acggatatatagatacccactctgaaccc------------gtcccaaatgtaaaaaat-tact 443  Q
    ||| |||||| || |||||||||||           |||| ||||||| ||||||| | ||||||            ||||||| |||||||||  ||||    
T  30847024 tttccccgatctcgaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaattgtaaaaaaactact 30846925  T
Q  444 ttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaactaaatcattccgtctaacaaat 542  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||    
T  30846924 ttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaataattttgtctaacaaat 30846825  T
Q  543 gttaaagtga 552  Q
    || |||||||    
T  30846824 gtgaaagtga 30846815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 417 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 9632392 - 9632256
Alignment:
Q  417 aacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatga 515  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  9632392 aacccgtcccaaatgtaaaaaactactttatgttgatatgttatgttatttttttttataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaagga 9632293  T
Q  516 tcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtga 552  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||    
T  9632292 tcaactaaataattttgtctaacaaatgtgaaagtga 9632256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 454 - 559
Target Start/End: Original strand, 37472850 - 37472955
Alignment:
Q  454 atgtatgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaa 553  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  37472850 atgtatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattctgtctaacaaatgttaaagtgag 37472949  T
Q  554 catatt 559  Q
    ||||||    
T  37472950 catatt 37472955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 417 - 559
Target Start/End: Original strand, 44746192 - 44746335
Alignment:
Q  417 aacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatga 515  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||  |||||||||| |||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  44746192 aacccgtcccaaatgtagaaaatcactttatcttgatatgccatgttattttatttgatcattgtaatggttataaaaactatcattgatatttaaagga 44746291  T
Q  516 tcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
     ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  44746292 gcaaataaattattccgtctaacaaatgttagagtgagcatatt 44746335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 417 - 559
Target Start/End: Original strand, 31942269 - 31942411
Alignment:
Q  417 aacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatga 515  Q
    |||| ||| |||||| | |||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||    
T  31942269 aacctgtcacaaatgcagaaaactactttatgctgatatgccatgttattttgtttgataattgtcgtgtta-taaaaactaccattgatatttaaagga 31942367  T
Q  516 tcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
     ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31942368 gcaactaaatcagtcggtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 31942411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 420 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 14540784 - 14540649
Alignment:
Q  420 ccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatca 518  Q
    ||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||     |||||||||| || ||    
T  14540784 ccgtcccgaacgtagaaaattactttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattgtcgtgtt-ataaaaacta----cgatatttaaaggagca 14540690  T
Q  519 actaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14540689 actaaatcaatcagtctaacaaatgttaaagtgagcatatt 14540649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 418 - 552
Target Start/End: Original strand, 6027973 - 6028108
Alignment:
Q  418 acccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgat 516  Q
    ||||||||  |||| | |||| || |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||| ||     
T  6027973 acccgtcctgaatgcagaaaagtattttatgttgataagccatgttattttgtttgataattgtcgtgttataaaaaactatcattgatatttaaaggag 6028072  T
Q  517 caactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtga 552  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  6028073 caactaaatcaattggtctaacaaatgttaaagtga 6028108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 269 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 12341778 - 12341663
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||| |||| |||| ||| |||||| |   ||||| |||||||||||||    
T  12341778 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgactgagtttgggtatgggtatgggt 12341679  T
Q  369 ttttcccgatttcaaa 384  Q
    ||| ||||||||||||    
T  12341678 tttccccgatttcaaa 12341663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 269 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 9632564 - 9632440
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| | | ||||  |||||||||||||    
T  9632564 aggcatggcaacaaaacccatacccgtggttacccgcccgaaccaaactcaatttgacgggtttttcccgttttgaatgggtttgagtatgggtatgggt 9632465  T
Q  369 ttttcccgatttc-aaacacgggta 392  Q
    ||| |||||| || |||||||||||    
T  9632464 tttccccgatctcgaaacacgggta 9632440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 417 - 559
Target Start/End: Original strand, 19104924 - 19105066
Alignment:
Q  417 aacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatga 515  Q
    |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||   ||||| |||||||||  || |||||||||| ||    
T  19104924 aacccgtcccgaatgcagaaaattactttatgttgacgtgtcatgttattttgtttaataattgccgtgtta-taaaaactactatcgatatttaaaaga 19105022  T
Q  516 tcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
     ||||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19105023 gcaactaaatcgatcggtctaacaaatgttaaagtgagcatatt 19105066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 440 - 559
Target Start/End: Original strand, 16226833 - 16226952
Alignment:
Q  440 tactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaactaaatcattccgtctaac 538  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||||     
T  16226833 tacttcatgttgatttgtcatgttattttatttgataattgtcgtgtta-taaaaactaccattgatatttaaattagcaactaaatcaattggtctaag 16226931  T
Q  539 aaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
    ||||||||||||||| |||||    
T  16226932 aaatgttaaagtgaatatatt 16226952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 293 - 380
Target Start/End: Original strand, 7314583 - 7314670
Alignment:
Q  293 cgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggtttttcccgattt 380  Q
    |||||||| || ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| |||||| | | |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7314583 cgcggttaaccgcccgaaccaaactcaatttgacggattttccccgttttgactgggtttggatatgggtatgggttttccccgattt 7314670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 269 - 382
Target Start/End: Original strand, 12193737 - 12193851
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcg-gttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatggg 367  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||| ||||||  ||||| |||| ||||||| ||||||| | | ||||| |||| ||||| |    
T  12193737 aggcatggcaacaaaaaccatacccgcgcgttacccacccgagccaaacccaatttgacgggtttttccgattttgactgggtttgggtatgagtatgtg 12193836  T
Q  368 tttttcccgatttca 382  Q
    |||||||||||||||    
T  12193837 tttttcccgatttca 12193851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 272 - 392
Target Start/End: Original strand, 37472673 - 37472794
Alignment:
Q  272 catggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggtttt 371  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||| |||| |||| ||| |||||| | | ||||| |||| |||||| ||||    
T  37472673 catggtaacaaaacccatacccgcagttacccgcccgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgagtatggatttt 37472772  T
Q  372 tcccgatttc-aaacacgggta 392  Q
     ||||||||| |||||||||||    
T  37472773 ccccgatttcaaaacacgggta 37472794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 272 - 384
Target Start/End: Original strand, 24414046 - 24414158
Alignment:
Q  272 catggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggtttt 371  Q
    |||||||||||||| |||||| | ||||| || ||||||||||||  ||||| |||| |||| ||| |||||||| | ||||| ||||||||| ||||||    
T  24414046 catggcaacaaaacccatacctgtggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtatcggtttt 24414145  T
Q  372 tcccgatttcaaa 384  Q
     |||||| |||||    
T  24414146 ccccgatctcaaa 24414158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 272 - 384
Target Start/End: Original strand, 44746023 - 44746135
Alignment:
Q  272 catggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggtttt 371  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||  ||||| |||| |||| ||| ||||||||   ||||| ||||| | ||||||||    
T  44746023 catggcaacaaaactcatatccacggttacccacccgtaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgattgagtttgggtatggatttgggtttt 44746122  T
Q  372 tcccgatttcaaa 384  Q
     ||||||||||||    
T  44746123 ccccgatttcaaa 44746135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 277 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 13830905 - 13830811
Alignment:
Q  277 caacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggtttt 371  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||  ||||| |||| |||| |||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||    
T  13830905 caacaaaacccatacccgtggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccattttgactgggtttgggtatgggtatgggtttt 13830811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 269 - 378
Target Start/End: Original strand, 36128017 - 36128126
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||  |  ||||||||||| |||||| ||||||||| ||| |||||| | | ||||| |||||||||| |     
T  36128017 aggcatggcaacaaaacccatacccgtggttactcgtccgaaccaaacctaatttgacggattttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgtgg 36128116  T
Q  369 ttttcccgat 378  Q
    ||| ||||||    
T  36128117 tttccccgat 36128126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 273 - 384
Target Start/End: Original strand, 8915853 - 8915963
Alignment:
Q  273 atggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggttttt 372  Q
    ||||||||||||| |||||| | |||||||| ||| || |||| | ||||| ||||||||||||| |||||| |   |||||||||||||||||| ||||    
T  8915853 atggcaacaaaacccatacctgtggttatccgcccaaatcaaattcaatttgacggatttttcccgttttgactgagtttggatatgggtatggg-tttt 8915951  T
Q  373 cccgatttcaaa 384  Q
    | |||| |||||    
T  8915952 ctcgatctcaaa 8915963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 489 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 16105551 - 16105488
Alignment:
Q  489 taaaaactatcattgatatttaaatgatcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtga 552  Q
    |||||| || ||||||||||| |  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  16105551 taaaaattaccattgatatttcacagatcaactaaatcattatgtctaacaaatgttaaagtga 16105488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 277 - 384
Target Start/End: Original strand, 31942104 - 31942211
Alignment:
Q  277 caacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggtttttcccg 376  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| || ||| ||||||||| ||||| | || ||||||||  ||||| | | ||||||||||||| |||||| | | ||    
T  31942104 caacaaaacccatacccgtggttacccgcccaaaccaaactcaatttgatgggtttttcccgctttgactgggtttggatatgggtttgggttatcctcg 31942203  T
Q  377 atttcaaa 384  Q
    ||||||||    
T  31942204 atttcaaa 31942211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 269 - 335
Target Start/End: Original strand, 42797912 - 42797978
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttc 335  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||  |||||| |||| ||||||    
T  42797912 aggcatggcaacaaaacccatacccgtggttacccgcccgaaccaaatctaatttgacgggtttttc 42797978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 269 - 346
Target Start/End: Original strand, 6027812 - 6027889
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgatt 346  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||  ||||| |||| |||| ||| ||||||||    
T  6027812 aggcatgacaacaaaacccatactcgtggttatccgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgatt 6027889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 502 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 37319862 - 37319805
Alignment:
Q  502 tgatatttaaatgatcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
    |||||||||||  | ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37319862 tgatatttaaagtagcaactaaatcaatcggtctaacaaatgttaaaatgaacatatt 37319805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 320 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 45256950 - 45256877
Alignment:
Q  320 atttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggtttttcccgatttc-aaacacgggta 392  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| | | | |||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  45256950 atttaatggatttttcccgttttgactgggtgtggatatgagtatgagttttccccgatttcaaaacacgggta 45256877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 467 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 17598859 - 17598816
Alignment:
Q  467 tgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaa 511  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  17598859 tgtttgataattgtcatgtta-taaaaacaatcattgatatttaa 17598816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 124; Significance: 2e-63; HSPs: 63)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 269 - 559
Target Start/End: Original strand, 6738316 - 6738620
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||  ||||| || | |||||||| |||||| | | ||||| |||||||||||||    
T  6738316 aggcatggcaataaaacccatacccgcggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacaggtttttcccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggt 6738415  T
Q  369 ttttcccgatttcaaa-cacgggtaacggatatatagatacccactctgaa------------cccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatat 455  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| |  ||            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6738416 tttccccgatttcaaaacacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaatccatactcatacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatat 6738515  T
Q  456 gt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaac 554  Q
    || ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||  || |||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||| |    
T  6738516 gtcatgttattttgtttgataattgccatgttaataaaaactaccattgatattggaaggatcaattaaatcattatgtctaacagatgttaaagtgagc 6738615  T
Q  555 atatt 559  Q
    |||||    
T  6738616 atatt 6738620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 269 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 20087174 - 20086879
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    ||||||||||||||||  |||||| ||||||| |  |  ||||||||   ||||| |||||||||  || |||||| | | |||||||||||||||||||    
T  20087174 aggcatggcaacaaaatccataccagcggttacctgctggaaccaaatccaatttgacggattttctccgttttgactgggtttggatatgggtatgggt 20087075  T
Q  369 ttttcccgatttcaaa-cacgggtaacggatatatagatacccactctgaaccc-----------gtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatg 456  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||| | ||||||           |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20087074 tttccccgatttcaaaacacgggtaatgggtatataggtacccaccccgaaccctactcatacccgtcccaaatgtaaaaaattattttatgttgatatg 20086975  T
Q  457 t-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtg 551  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20086974 tcatgttattttgcttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattccatctaacaaatgttaaagtg 20086879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 271 - 559
Target Start/End: Original strand, 22535754 - 22536067
Alignment:
Q  271 gcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggttt 370  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | || |||| ||| |||||| | | ||||| |||||||||| ||||    
T  22535754 gcatggcaacaaaacccatacccgcggttatccgcccgaaccaaactcaatttgatgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgagttt 22535853  T
Q  371 ttcccgatttcaaac------------acgggtaacggatatatagatacccactctgaaccc------------gtcccaaatgtaaaaaattacttta 446  Q
    | ||| ||||||||             ||||||||||| |||| ||  |||||| | ||||||            |||| ||||||||||||||| ||||    
T  22535854 tccccaatttcaaaacacggatatgggacgggtaacgggtatacaggcacccaccccgaacccatacacatactcgtcctaaatgtaaaaaattatttta 22535953  T
Q  447 tgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaactaaatcattccgtctaacaaatgtt 545  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22535954 tgttgatatgtcatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattctgtctaacaaatgtt 22536053  T
Q  546 aaagtgaacatatt 559  Q
    ||||||| ||||||    
T  22536054 aaagtgagcatatt 22536067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 269 - 559
Target Start/End: Original strand, 48390728 - 48391042
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||   |||||||||   ||||| ||||||||| ||| |||||| | | ||||| |||||||||||||    
T  48390728 aggcatggcaacaaaacccatacccgcggttacccgttcgaaccaaatccaatttgacggattttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggt 48390827  T
Q  369 ttttcccgatttcaaac------------acgggtaacggatatatagatacccactctgaaccc------------gtcccaaatgtaaaaaattactt 444  Q
    ||| ||||||||||||             |||||||||||  |||||| ||||||  ||||||||            ||||| || ||||||||||||||    
T  48390828 tttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggaatataggtacccatcctgaacccatacccatacccgtcccgaacgtaaaaaattactt 48390927  T
Q  445 tatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaactaaatcattccgtctaacaaatg 543  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48390928 tatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattgtcatgttaa-aaaaactaccattgatatttaaaagatcaactaaatcattccgtctaacaaatg 48391026  T
Q  544 ttaaagtgaacatatt 559  Q
    || |||||||||||||    
T  48391027 ttgaagtgaacatatt 48391042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 423 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 23580826 - 23580698
Alignment:
Q  423 tcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtatgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaacta 522  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  23580826 tcccaaatgtaaaaaattattttatgttgatatgtatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactactattgatatttaaaggatcaacta 23580727  T
Q  523 aatcattccgtctaacaaatgttaaagtg 551  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23580726 aatcattccgtataacaaatgttaaagtg 23580698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 417 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 39728676 - 39728540
Alignment:
Q  417 aacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgta-tgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatga 515  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  39728676 aacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgttattttgtttgataattgttctgttaataaaaactatcattgatatttaaaaga 39728577  T
Q  516 tcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtga 552  Q
    | ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  39728576 ttaactaaatcattttgtctaacaaatgtgaaagtga 39728540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 417 - 550
Target Start/End: Original strand, 17146233 - 17146367
Alignment:
Q  417 aacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatga 515  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17146233 aacccttcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaagga 17146332  T
Q  516 tcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagt 550  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  17146333 tcaactaaatcattttgtctaacaaatgtgaaagt 17146367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 418 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 29842312 - 29842170
Alignment:
Q  418 acccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgat 516  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  29842312 acccgtctcaaatgtaaaaaattactttatgttgatttgtcatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggat 29842213  T
Q  517 caactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  29842212 caactaaatcatttcgtctaacaaatgttgaagtgagcatatt 29842170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 423 - 559
Target Start/End: Original strand, 10823782 - 10823919
Alignment:
Q  423 tcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaact 521  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  10823782 tcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaact 10823881  T
Q  522 aaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  10823882 aaatcattttgtctaacaaatgtgaaagtgaacttatt 10823919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 417 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 44172631 - 44172495
Alignment:
Q  417 aacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatga 515  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| ||    
T  44172631 aacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccactgatatttaaagga 44172532  T
Q  516 tcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtga 552  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  44172531 tcaactaaatcattttgtctaacaaatgtgaaagtga 44172495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 417 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 44179331 - 44179195
Alignment:
Q  417 aacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatga 515  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| ||    
T  44179331 aacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccactgatatttaaagga 44179232  T
Q  516 tcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtga 552  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  44179231 tcaactaaatcattttgtctaacaaatgtgaaagtga 44179195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 417 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 49025686 - 49025550
Alignment:
Q  417 aacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatga 515  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  49025686 aacccgtcccaaatgtaaaaaattactttgtgttgatatgttatgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactaccattgatatttaaagga 49025587  T
Q  516 tcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtga 552  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||    
T  49025586 tcaactaaatcattttgtctaataaatgtgaaagtga 49025550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 418 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 34025958 - 34025816
Alignment:
Q  418 acccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgat 516  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| |||    
T  34025958 acccgtcccaaatgtaaaaaattattttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaattaccattgatatttaaaggat 34025859  T
Q  517 caactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||    
T  34025858 caactaaatcattccatctatcaaatgttaaagggagcatatt 34025816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 418 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 43582582 - 43582440
Alignment:
Q  418 acccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgat 516  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| |||||||||||||  |||    
T  43582582 acccgtcccaaatgtaaaaaattactttatattgatatgtcatgttattttgtttgataattatcatgtaaataaaaactaccattgatatttaacggat 43582483  T
Q  517 caactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43582482 caactaaatcattacgtctaacaaatgttaaagtgagcatatt 43582440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 269 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 52572786 - 52572478
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| || | |||| |||||||||| | | ||||| |||||||||| ||    
T  52572786 aggcatggcaacaaaacccatacccgtggttatccgcccgaaccaaactcaatttgacaggttttccccattttgactgggtttgggtatgggtatgagt 52572687  T
Q  369 ttttcccgatttcaaac------------acgggtaacggatatatagatacccactctgaa------------cccgtcccaaatgtaaaaaattactt 444  Q
    ||| | |||| |||||             ||||||||||| |||||||  |||||| | |||            ||||||||||||||||||||||||||    
T  52572686 tttcctcgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatatagggacccaccccgaatccatactcaagcccgtcccaaatgtaaaaaattactt 52572587  T
Q  445 tatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaactaaatcattccgtctaacaaatg 543  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||    
T  52572586 tatgttaatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaagtatcaactaaatcattttgtctaacaaatg 52572487  T
Q  544 ttaaagtga 552  Q
    | |||||||    
T  52572486 tgaaagtga 52572478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 417 - 552
Target Start/End: Original strand, 44106875 - 44107011
Alignment:
Q  417 aacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatga 515  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  44106875 aacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttaatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaagga 44106974  T
Q  516 tcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtga 552  Q
    ||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||    
T  44106975 tcaactaaatcattttgtcttacaaatgtgaaagtga 44107011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 417 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 44252752 - 44252616
Alignment:
Q  417 aacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatga 515  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  44252752 aacccgtcccaaatataaaaaactactttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaagga 44252653  T
Q  516 tcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtga 552  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||    
T  44252652 tcaactaaataattttgtctaacaaatgtgaaagtga 44252616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 417 - 552
Target Start/End: Original strand, 44953518 - 44953654
Alignment:
Q  417 aacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatga 515  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  44953518 aacccgtcccaaatgtaaaaaactactttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaagga 44953617  T
Q  516 tcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtga 552  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||    
T  44953618 tcaactaaataattttgtctaacaaatgtgaaagtga 44953654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 417 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 49580069 - 49579933
Alignment:
Q  417 aacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatga 515  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  49580069 aacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatattgatatgttatgttattttgtttgatgattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaagga 49579970  T
Q  516 tcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtga 552  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  49579969 tcaactaaatcattttgtctaacaaatgtgaaagtga 49579933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 418 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 34154418 - 34154280
Alignment:
Q  418 acccgtcccaaatgtaaaaaa-ttactttatgttgatatgtatgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgat 516  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  34154418 acccgtcccaaatgtaaaaaaattactttatgttgatatgt----tattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggat 34154323  T
Q  517 caactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34154322 caactaaatcattatgtctaacaaatattaaagtgaacatatt 34154280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 269 - 552
Target Start/End: Original strand, 39655184 - 39655492
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||  ||||| |||| |||| ||| |||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  39655184 aggcatggcaacaaaacccatacccgtggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtatgggt 39655283  T
Q  369 ttttcccgatttcaaa------------cacgggtaacggatatatagatacccactctgaaccc------------gtcccaaatgtaaaaaattactt 444  Q
    ||| |||||| |||||             ||||||||| | ||||||| ||||||| |  |||||            ||| ||||||||||||| |||||    
T  39655284 tttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacaggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacccgtctcaaatgtaaaaaactactt 39655383  T
Q  445 tatgttgatatg-tatgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaactaaatcattccgtctaacaaatg 543  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||   |||||||||||    
T  39655384 tatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaataattttctctaacaaatg 39655483  T
Q  544 ttaaagtga 552  Q
    | |||||||    
T  39655484 tgaaagtga 39655492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 269 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 29284513 - 29284205
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||  ||||| |||| ||||  || |||||| | | ||||| |||||||||||||    
T  29284513 aggcatggcaacaaaactcatacccgtggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttctccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggt 29284414  T
Q  369 ttttcccgatttc-aaacacggg-----------taacggatatatagatacccactctgaaccc------------gtcccaaatgtaaaaaattactt 444  Q
    |||||||||| || |||||||||           |||||| ||||||| ||||||  | ||||||            |||||| |||||||||| |||||    
T  29284413 ttttcccgatctcgaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccagcccgaacccatacccaaacccgtcccagatgtaaaaaactactt 29284314  T
Q  445 tatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaactaaatcattccgtctaacaaatg 543  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| |||  || |||||||||    
T  29284313 tatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattaatatttaaaagatcaactaaataattttgtttaacaaatg 29284214  T
Q  544 ttaaagtga 552  Q
    | |||||||    
T  29284213 tgaaagtga 29284205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 417 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 44639279 - 44639143
Alignment:
Q  417 aacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatga 515  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  44639279 aacccgttccaaatgtaaaaaattattttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaagga 44639180  T
Q  516 tcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaa 553  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||    
T  44639179 tcaactaaatcatt-tatctaacaaatgtgaaagtgaa 44639143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 417 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 52198160 - 52198023
Alignment:
Q  417 aacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatg-tatgtt-attttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatg 514  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  52198160 aacccgttccaaatgtaaaaaattactttacgttgatatgctatgtttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaagg 52198061  T
Q  515 atcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtga 552  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  52198060 atcaactaaatcattttgtctaacaaatgtgaaagtga 52198023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 417 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 30682826 - 30682684
Alignment:
Q  417 aacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatga 515  Q
    |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  30682826 aacccgtcctgaatgtagaaaattactttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataatggtcatgtta-taaaaactatcattgatatttaaagga 30682728  T
Q  516 tcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
     ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  30682727 gcaattaaatcattcgttctaacaaatgttaaagtgaacatatt 30682684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 269 - 559
Target Start/End: Original strand, 4015955 - 4016269
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||| ||||| ||||||| |||||    
T  4015955 aggcatggcaacaaaacccatacccgtggttacccacccgaacgaaactcaatttgacgggtttttcccgttttgactaggtttgggtatgggtttgggt 4016054  T
Q  369 ttttcccgatttcaaa------------cacgggtaacggatatatagatacccactctgaacc------------cgtcccaaatgtaaaaaattactt 444  Q
    ||| ||||||||||||             |||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||            |||||| |||| | |||| ||| |    
T  4016055 tttccccgatttcaaaacatgggtatgggacggataacgggtatataggtacccactccgaacccatacccaaactcgtcccgaatgcagaaaactacct 4016154  T
Q  445 tatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaactaaatcattccgtctaacaaatg 543  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||  || |||||||||| || ||||||||| | || ||||||||||||    
T  4016155 tatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattgatgtgtt-ataaaaactactatcgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatg 4016253  T
Q  544 ttaaagtgaacatatt 559  Q
    ||||||||||||||||    
T  4016254 ttaaagtgaacatatt 4016269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 269 - 552
Target Start/End: Original strand, 7469689 - 7469997
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||  ||||| |||| |||| ||| |||||| | | ||||| |||||||||||||    
T  7469689 aggcatggcaacaaaacccatacccgtggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggt 7469788  T
Q  369 ttttcccgatttc-aaacacgggta-----------acggatatatagatacccactctgaaccc------------gtcccaaatgtaaaaaattactt 444  Q
    ||| || ||| || |||||||||||           |||| ||||||| ||||||| | ||||||            ||||||||||||||| | |||||    
T  7469789 tttccctgatctcgaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatacacaaacccgtcccaaatgtaaaacactactt 7469888  T
Q  445 tatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaactaaatcattccgtctaacaaatg 543  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  7469889 tatgtggatatgttatgttattttgtttgataattgtcatcttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaataattttgtctaacaaatg 7469988  T
Q  544 ttaaagtga 552  Q
    | |||||||    
T  7469989 tgaaagtga 7469997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 269 - 559
Target Start/End: Original strand, 4557216 - 4557530
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||  ||||| |||| |||||||| |||||| | | ||||| ||||||| |||||    
T  4557216 aggcatgacaacaaaactcatacccgtggttacccacccgaacaaaacccaatttgacgggtttttcccgttttgactgggtttgggtatgggtttgggt 4557315  T
Q  369 ttttcccgatttcaaac------------acgggtaacggatatatagatacccactctgaacccgt------------cccaaatgtaaaaaattactt 444  Q
    ||| |||| |||||||             ||||||||||  ||||||| ||||||| | |||||| |            ||| |||| | ||||||||||    
T  4557316 tttccccgttttcaaaacatgggtatgggacgggtaacgagtatataggtacccaccccgaacccatacccaaatctatcccgaatgcagaaaattactt 4557415  T
Q  445 tatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaactaaatcattccgtctaacaaatg 543  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||  ||||||||||||| || ||||||||| | || ||||||||||||    
T  4557416 tatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattgatgtgtta-taaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatg 4557514  T
Q  544 ttaaagtgaacatatt 559  Q
    ||||||||||||||||    
T  4557515 ttaaagtgaacatatt 4557530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 423 - 512
Target Start/End: Original strand, 23154153 - 23154242
Alignment:
Q  423 tcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtatgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaa 512  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  23154153 tcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccgttgatatttaaa 23154242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 458 - 565
Target Start/End: Original strand, 48306661 - 48306768
Alignment:
Q  458 atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacata 557  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||    
T  48306661 atgttaatttgtttgataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaagtatcaactaaatcattccgtctaacaaatattaaagtgagcgta 48306760  T
Q  558 ttcttcga 565  Q
    || |||||    
T  48306761 ttgttcga 48306768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 431 - 552
Target Start/End: Original strand, 23547069 - 23547191
Alignment:
Q  431 gtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaactaaatcatt 529  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| |||    
T  23547069 gtaaaaaactactttatgttaatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactagcatttatatttaaaggatcaactaaataatt 23547168  T
Q  530 ccgtctaacaaatgttaaagtga 552  Q
      || |||||||||| |||||||    
T  23547169 ttgtttaacaaatgtgaaagtga 23547191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 417 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 42758379 - 42758248
Alignment:
Q  417 aacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatga 515  Q
    |||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  42758379 aacccgtcccgaacgaagaaaattactttatgttgatatgccatgttattttgtttgataattgccatgtta-taaaaactatcattgatatttaaagga 42758281  T
Q  516 tcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaa 548  Q
     ||| |||||||  | |||||||||||||||||    
T  42758280 gcaattaaatcaaccggtctaacaaatgttaaa 42758248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 420 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 34119658 - 34119521
Alignment:
Q  420 ccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtatgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaa 519  Q
    |||||||||||| | |||| |||||| ||||||||||    ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||| |||||| |||    
T  34119658 ccgtcccaaatgcagaaaactactttgtgttgatatgcca-ttattttgtttgataattgtcgtgtta-taaaaactaacattgatattgaaatgagcaa 34119561  T
Q  520 ctaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34119560 ctaaatcaatcggtctaacaaatgttaaagtgagcatatt 34119521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 421 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 53631905 - 53631767
Alignment:
Q  421 cgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaa 519  Q
    |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||| |||||||||||||| || |||    
T  53631905 cgtcccgaatctagaaaattactttatgttgatatgccatgttattttgtttgataattgccgtgtta-taaaaactaccattgatatttaaaggagcaa 53631807  T
Q  520 ctaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
    |||||||  || |||||||||||| |||||||| ||||||    
T  53631806 ctaaatcgatcggtctaacaaatgataaagtgagcatatt 53631767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 271 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 34026129 - 34026016
Alignment:
Q  271 gcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggttt 370  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||   ||||| |||| |||||||| |||||| | | |||||||||||||||||||||    
T  34026129 gcatggcaacaaaacccatacccgcggttaccctcccgaaccaaaaccaatttgacggttttttcccgttttgactgggtttggatatgggtatgggttt 34026030  T
Q  371 ttcccgatttcaaa 384  Q
    | ||||||||||||    
T  34026029 tccccgatttcaaa 34026016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 417 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 19111739 - 19111598
Alignment:
Q  417 aacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatga 515  Q
    ||||||| | ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||    
T  19111739 aacccgtacaaaatgtagaaaattactttatgtt-atatgtcatgttattttgtttgataattttcgtgtta-taaaaactaccattgatatttaaagga 19111642  T
Q  516 tcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
      |||||||||| |  || |||||||||||||||||| ||||||    
T  19111641 gtaactaaatcaattggtataacaaatgttaaagtgatcatatt 19111598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 421 - 559
Target Start/End: Original strand, 31126882 - 31127020
Alignment:
Q  421 cgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaa 519  Q
    ||||||||||| | |||| ||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||| |||||||||| ||| || |||    
T  31126882 cgtcccaaatgcagaaaactacattgtgttgatatgccatgttattttgtttgataattgtcgtatta-taaaaactaacattgatattgaaaggagcaa 31126980  T
Q  520 ctaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31126981 ctaaatcaatcagtctaacaaatgttaaagtgagcatatt 31127020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 421 - 552
Target Start/End: Original strand, 41937089 - 41937220
Alignment:
Q  421 cgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaa 519  Q
    |||| |||||| | |||| |||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||| |||||||||| |||||| |||    
T  41937089 cgtctcaaatgcagaaaactactttgtgttgacatgtcatattattttgtttgataattgtcgtgtta-taaagactaacattgatattgaaatgaacaa 41937187  T
Q  520 ctaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtga 552  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  41937188 ctaaatcaatcggtctaacaaatgttaaagtga 41937220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 417 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 54317149 - 54317018
Alignment:
Q  417 aacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatg-tatgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatga 515  Q
    ||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||  ||||||||||||| ||    
T  54317149 aacccgtcccaaacgaagaaaattactttatgttgatatgccatgttattttgtttgataattgccgtgtt-ataaaaactactattgatatttaaagga 54317051  T
Q  516 tcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaa 548  Q
     |||||||||||    |||||||||||||||||    
T  54317050 gcaactaaatcaacatgtctaacaaatgttaaa 54317018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 421 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 831010 - 830872
Alignment:
Q  421 cgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatg-tatgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaa 519  Q
    |||||| |||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||   | || |||||||||||||||||||||| || ||  ||    
T  831010 cgtcccgaatgcagaaaattactttatgttaatatgctatgttattttgtttgataattgccgtctt-ataaaaactatcattgatattttaaggagaaa 830912  T
Q  520 ctaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
    |||||||| |  |||||| ||||||||| |||| ||||||    
T  830911 ctaaatcaattggtctaaaaaatgttaacgtgagcatatt 830872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 269 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 49580241 - 49580126
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||   ||||| |||| |||| ||| |||||| | | ||||| |||||||||||||    
T  49580241 aggcatgacaacaaaacccatacccgtggttatccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggt 49580142  T
Q  369 ttttcccgatttcaaa 384  Q
    ||| |||||| |||||    
T  49580141 tttccccgatctcaaa 49580126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 269 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 12369171 - 12369102
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttccca 338  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  12369171 aggcatggcaacaaaacccatacccgtggttattcacccgaaccaaactcaatttgacggattttcccca 12369102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 271 - 392
Target Start/End: Original strand, 23153978 - 23154099
Alignment:
Q  271 gcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggttt 370  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||||||| || || ||||||| |  ||||| |||| |||||||| |||| | |   ||||| |||||||||||||||    
T  23153978 gcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgccggaaccaaccccaatttgacgggtttttcccgttttaactgagtttgggtatgggtatgggttt 23154077  T
Q  371 ttcccgatttcaaacacgggta 392  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  23154078 tccccgatttcaaacacgggta 23154099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 272 - 392
Target Start/End: Original strand, 48305555 - 48305676
Alignment:
Q  272 catggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggtttt 371  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||  ||| | |||| |||| |||||||||| | | ||||| |||||||||| |||||    
T  48305555 catgacaacaaaatccatacccgcggttacccacccgaaccaaacccaatctgacgggttttccccattttgactgggtttggttatgggtatgagtttt 48305654  T
Q  372 tcccgatttc-aaacacgggta 392  Q
     ||| ||||| |||||||||||    
T  48305655 ccccaatttcaaaacacgggta 48305676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 269 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 19111911 - 19111787
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| |||||  ||||  |||||||   ||||| ||||||||||||| |||||||| | ||||| |||| || || ||    
T  19111911 aggcatgacaacaaaactcatatccgtggttactcacctaaaccaaatccaatttgacggatttttccctttttgattgggtttgggtatgagtttgagt 19111812  T
Q  369 ttttcccgatttc-aaacacgggta 392  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    
T  19111811 ttttcccgatttcaaaacacgggta 19111787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 397 - 474
Target Start/End: Original strand, 23910306 - 23910385
Alignment:
Q  397 atatatagatacccactc-tgaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgat 474  Q
    |||||||||| ||||| | | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23910306 atatatagatccccacacctaaacccgtcccgaatgtagaaaattactttatgttgatatgtcatgttattttgtttgat 23910385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 269 - 344
Target Start/End: Original strand, 29858486 - 29858561
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttga 344  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||    
T  29858486 aggcatggcaacaaaacccatacccgtggttacccgcccgaaccaaacccaatttaacggattttccccgttttga 29858561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 269 - 384
Target Start/End: Original strand, 44953346 - 44953461
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| || | ||||||||||  ||||| |||| |||| ||| |||||| | | ||||| | |||||||||||    
T  44953346 aggcatggcaacaaaattcatacccgtggttacccgctcgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtttgggtatgggt 44953445  T
Q  369 ttttcccgatttcaaa 384  Q
    ||| |||||| |||||    
T  44953446 tttccccgatctcaaa 44953461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 269 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 44252924 - 44252800
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||  ||||| |||||  ||||| |||| |||| ||| |||||| | | ||||| |||||||||||||    
T  44252924 aggcatggcaacaaaatccatacccgtggttacccgtccgaatcaaaccaaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggt 44252825  T
Q  369 ttttcccgatttc-aaacacgggta 392  Q
    ||| |||||| || |||||||||||    
T  44252824 tttccccgatctcgaaacacgggta 44252800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 445 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 14208377 - 14208264
Alignment:
Q  445 tatgttgatatg-tatgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaactaaatcattccgtctaacaaatg 543  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| | ||||||||||||||| || |||| ||||||||| ||| |  |||||    
T  14208377 tatgttgatatactatgttatttggtttgataattgtcatgtta-taaaaa-tgtcattgatatttaaaggagcaacaaaatcattcagtcaaggaaatg 14208280  T
Q  544 ttaaagtgaacatatt 559  Q
    ||||| |||| |||||    
T  14208279 ttaaaatgaaaatatt 14208264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 269 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 42758551 - 42758436
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||  ||||| ||||||||| ||| |||| | | | ||||| |||| || |||||    
T  42758551 aggcatggcaacaaaacccatacccgtggttacccgcccgatccaaacccaatttgacggattttccccgttttaactgggtttgggtatgagtttgggt 42758452  T
Q  369 ttttcccgatttcaaa 384  Q
    ||  ||||||||||||    
T  42758451 ttcccccgatttcaaa 42758436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 269 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 44639451 - 44639349
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||  |||||| ||||  ||||| || | |||| |||||||||| | | ||||| |||||||||||||    
T  44639451 aggcatggcaacaaaactcatatccgtggttacccgtccgaacgaaacccaatttgactggttttccccattttgactgggtttgggtatgggtatgggt 44639352  T
Q  369 ttt 371  Q
    |||    
T  44639351 ttt 44639349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 269 - 362
Target Start/End: Original strand, 10823613 - 10823706
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggt 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||| ||||||| | ||||| |||  ||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||    
T  10823613 aggcatggcaacaaaactcatacccgtcgttacccgcccaaaccaaattcaatttgacgagttttttccattttgactaggtttgggtatgggt 10823706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 296 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 34119806 - 34119709
Alignment:
Q  296 ggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggtttttcccga-tttcaaacacgggta 392  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||| |||| |||| |||||||||||| | ||||| |||| || || ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  34119806 ggttaaccacccgaaccaaatctaatttgacgggttttccccattttgattgggtttgggtatgagtttgagtttttcccgattttaaaacacgggta 34119709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 273 - 361
Target Start/End: Original strand, 31126746 - 31126834
Alignment:
Q  273 atggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatggg 361  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||| || | || |||| ||| |||||||| | ||||| ||||||    
T  31126746 atggcaacaaaacccatacacgtggttaaccacccgaaccaaacttaaattgatgggttttccccgttttgatttggtttgggtatggg 31126834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 269 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 39728848 - 39728733
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||  ||||||||||   ||||| ||||||||| ||| |||||| | | ||||| |||| |||| |||    
T  39728848 aggcatggcaacaaaacccatacccgtggttacccgtccgaaccaaatccaatttgacggattttccccgttttgactgggtttgggtatgagtataggt 39728749  T
Q  369 ttttcccgatttcaaa 384  Q
    ||| | |||| |||||    
T  39728748 tttcctcgatctcaaa 39728733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 269 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 30682997 - 30682943
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaattt 323  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  30682997 aggcatgacaacaaaactcatacccgcagttattcactcgaatcaaacttaattt 30682943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 269 - 362
Target Start/End: Original strand, 23546859 - 23546952
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggt 362  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |  |||||||||  |||||||||| |||| ||| |||||| | | ||||| |||||||    
T  23546859 aggcatggcaacaaaacccatacccgtggttacccgcatgaaccaaacccaatttaacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggt 23546952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 319 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 34154541 - 34154476
Alignment:
Q  319 aatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggtttttcccgatttcaaa 384  Q
    ||||| ||||||||| ||| |||||| | | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  34154541 aatttgacggattttccccgttttgactgggtttggatatgggtatgtgttttccccgatttcaaa 34154476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 417 - 453
Target Start/End: Original strand, 48305724 - 48305760
Alignment:
Q  417 aacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgat 453  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  48305724 aacccgttccaaatgtaaaaaattactttatgttgat 48305760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 309 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 52198292 - 52198217
Alignment:
Q  309 aaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggtttttcccgatttcaaa 384  Q
    |||||||| |||||| |||| ||||| |  |||||| | | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  52198292 aaccaaacctaatttgacgggttttttctgttttgactgggtttgggtatgggtatgggtttttcccgatctcaaa 52198217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 269 - 337
Target Start/End: Original strand, 31271210 - 31271278
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttccc 337  Q
    |||||||||||| |||| | ||||||||| || ||  ||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  31271210 aggcatggcaaccaaacccgtacccgcgggtacccgtccgaatcaaactcaatttgacggatttttccc 31271278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 269 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 53632081 - 53632017
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttt 333  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||  |   ||||||||||||||||| |||| ||||    
T  53632081 aggcatggcaataaaactcatacccgtggttactcgttcgaaccaaacttaatttgacgggtttt 53632017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 122; Significance: 3e-62; HSPs: 65)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 269 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 5181217 - 5180908
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| | ||||| |||| |||| |||||||||| | | ||| | |||||||||||||    
T  5181217 aggcatggcaacaaaacccatacccgcggttacccgcccgaaccaaattcaatttgacgggttttccccattttgactgggtttaggtatgggtatgggt 5181118  T
Q  369 ttttcccgatttcaaac------------acgggtaacggatatatagatacccactctgaaccc------gtcccaaatgtaaaaaattactttatgtt 450  Q
    ||| ||||||||||||             ||||||||||| |||||||  |||||| |  |||||      || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  5181117 tttccccgatttcaaaatacgggtatgggacgggtaacgggtatataggcacccaccccaaacccatacccgttccaaatgtaaaaaattattttatgtt 5181018  T
Q  451 gatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaag 549  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  5181017 gatatgtcatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcatttcgtctaacaaattttaaag 5180918  T
Q  550 tgaacatatt 559  Q
    ||| ||||||    
T  5180917 tgagcatatt 5180908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 269 - 559
Target Start/End: Original strand, 18353991 - 18354306
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| ||| || ||||||||||| | ||||| |||| |||||||| |||||| | |||||| ||||||||||||||    
T  18353991 aggcatggcaacaaaacccgtacccgcgattacccgcccgaaccaaattcaatttgacgggtttttcccgttttgactggatttgaatatgggtatgggt 18354090  T
Q  369 ttttcccgatttcaaac------------acgggtaacggatatatagatacccactctgaacc------------cgtcccaaatgtaaaaaattactt 444  Q
    ||| ||||||||||||             ||||||||||| ||||||  | ||||| | |||||            ||||||||||||||||||||| ||    
T  18354091 tttccccgatttcaaaacatgggtatgggacgggtaacgggtatataagttcccaccccgaaccgatacccatactcgtcccaaatgtaaaaaattattt 18354190  T
Q  445 tatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaactaaatcattccgtctaacaaatg 543  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18354191 tatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaagatcaactaaatcattccgtctatcaaatg 18354290  T
Q  544 ttaaagtgaacatatt 559  Q
    ||||||||||||||||    
T  18354291 ttaaagtgaacatatt 18354306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 418 - 559
Target Start/End: Original strand, 17092043 - 17092185
Alignment:
Q  418 acccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgat 516  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17092043 acccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggat 17092142  T
Q  517 caactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  17092143 caactaaatcattccatctaataaatgttaaagtgaacatatt 17092185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 269 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 24711025 - 24710736
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    ||||||| ||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||| | ||||| |||| |||| ||| |||||| | | |||||||||| ||||||||    
T  24711025 aggcatgacaacaaaacccacacccgtgattatccacccgaaccaaattcaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttggatatgagtatgggt 24710926  T
Q  369 ttttcccgatttcaaac------------acgggtaacggatatatagatacccactctgaa-cccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatat 455  Q
    ||| |||||| |||||             ||||||||||| ||||||| ||||||  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24710925 tttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccatactcaaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatac 24710826  T
Q  456 gt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaactaaatcattccgtctaacaaatgt 544  Q
     | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  24710825 attatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgt 24710736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 269 - 559
Target Start/End: Original strand, 40087375 - 40087689
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| | ||||| ||||||||| ||| |||||| |   ||||| |||||||||| ||    
T  40087375 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccgtctgaaccaaattcaatttgacggattttccccgttttgactgagtttgggtatgggtatgagt 40087474  T
Q  369 ttttcccgatttcaaacacgggt-----------aacggatatatagatacccactctgaac------------ccgtcccaaatgtaaaaaattacttt 445  Q
    ||| |||||||  |||||| |||           |||||  |||||| ||||||| | ||||            ||||||||||||||||||||||||||    
T  40087475 tttccccgattcaaaacacaggtatgggatgagtaacgggaatataggtacccaccccgaactcatactcatacccgtcccaaatgtaaaaaattacttt 40087574  T
Q  446 atgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaactaaatcattccgtctaacaaatgt 544  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40087575 atgttgatatatcatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattccgtctaacaaatgt 40087674  T
Q  545 taaagtgaacatatt 559  Q
    |||||||| ||||||    
T  40087675 taaagtgagcatatt 40087689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 418 - 559
Target Start/End: Original strand, 50426739 - 50426881
Alignment:
Q  418 acccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgat 516  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  50426739 acccgtcccaaatgtaaaaatttactttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggat 50426838  T
Q  517 caactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  50426839 caactaaatcattccgtcttacaaatgttaaagtgagcatatt 50426881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 269 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 17135125 - 17134810
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||  ||||| |||||||||  |  |||||| | | ||||| | |||||||||||    
T  17135125 aggcatggcaacaaaacccatacccgcggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacggattttctctgttttgactgggtttgggtgtgggtatgggt 17135026  T
Q  369 ttttcccgatttcaaac------------acgggtaacggatatatagatacccactctgaaccc------------gtcccaaatgtaaaaaattactt 444  Q
    ||| ||||||||||||             ||||||||||| ||||||| ||||  | | ||||||            |||||| ||||||||||||||||    
T  17135025 tttccccgatttcaaaacacgggtatgagacgggtaacgggtatataggtaccatccccgaacccatacccatactcgtcccatatgtaaaaaattactt 17134926  T
Q  445 tatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaactaaatcattccgtctaacaaatg 543  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17134925 tatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcatttcgtctaacaaatg 17134826  T
Q  544 ttaaagtgaacatatt 559  Q
    ||||||||||||||||    
T  17134825 ttaaagtgaacatatt 17134810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 269 - 551
Target Start/End: Original strand, 24236672 - 24236979
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| | | ||| | |||||||||||||    
T  24236672 aggcatggcaacaaaactcatacccatggttacccgcccgaaccaaactcaatttgacgggtttttcccgttttgactgggtttaggtatgggtatgggt 24236771  T
Q  369 ttttcccgatttcaaa-cacgggta-----------acggatatatagatacccactctgaaccc------------gtcccaaatgtaaaaaattactt 444  Q
    ||| |||||| ||||| ||||||||           |||| ||||||| ||||||| | ||||||            |||||||||||||||||||| ||    
T  24236772 tttccccgatctcaaaacacgggtatggaacggggaacgggtatataggtacccaccccgaacccatactcaaacccgtcccaaatgtaaaaaattattt 24236871  T
Q  445 tatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaactaaatcattccgtctaacaaatg 543  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  24236872 tatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatg 24236971  T
Q  544 ttaaagtg 551  Q
    | ||||||    
T  24236972 tgaaagtg 24236979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 418 - 559
Target Start/End: Original strand, 34060103 - 34060245
Alignment:
Q  418 acccgtcccaaatgtaaaa-aattactttatgttgatatgtatgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgat 516  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||| |||    
T  34060103 acccgtcccaattgtaaaaaaattactttatgttgatatgtatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaacaaccattgatatttaaaggat 34060202  T
Q  517 caactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34060203 caactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgagcatatt 34060245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 418 - 559
Target Start/End: Original strand, 42707914 - 42708056
Alignment:
Q  418 acccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgat 516  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  42707914 acccgtcccaaatgtaaaaaattattttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggat 42708013  T
Q  517 caactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  42708014 caactaaatcattccgtctaacagatgttaaagtgagcatatt 42708056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 418 - 559
Target Start/End: Original strand, 45866269 - 45866411
Alignment:
Q  418 acccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgat 516  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  45866269 acccatcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattatcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggat 45866368  T
Q  517 caactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45866369 caactaaatcattctgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 45866411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 269 - 552
Target Start/End: Original strand, 36187131 - 36187439
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  |||| || ||||||||||||| |||||  ||| |||| ||| |||||| | | ||||| |||||||||||||    
T  36187131 aggcatggcaacaaaacccatacccgtcgttacccgcccgaaccaaactcaatttggcgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggt 36187230  T
Q  369 ttttcccgatttcaaac------------acgggtaacggatatatagatacccactctgaaccc------------gtcccaaatgtaaaaaattactt 444  Q
    ||| |||||| |||||             ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||            |||||||||||||||| ||| ||    
T  36187231 tttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccctgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaagttattt 36187330  T
Q  445 tatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaactaaatcattccgtctaacaaatg 543  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  36187331 tatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaatgatcaactaaatcattttgtctaacaaatg 36187430  T
Q  544 ttaaagtga 552  Q
    | |||||||    
T  36187431 tgaaagtga 36187439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 423 - 552
Target Start/End: Original strand, 42439759 - 42439889
Alignment:
Q  423 tcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaact 521  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42439759 tcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaact 42439858  T
Q  522 aaatcattccgtctaacaaatgttaaagtga 552  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  42439859 aaatcattttgtctaacaaatgttaaagtga 42439889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 271 - 559
Target Start/End: Original strand, 19572425 - 19572737
Alignment:
Q  271 gcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggttt 370  Q
    ||||||||||||||| |||||  | ||||| || |||||||||||| |||||| |||| |||| |||||||||| | | ||||| |||||||||||||||    
T  19572425 gcatggcaacaaaacccatacttgtggttacccgcccgaaccaaacctaatttgacgggttttccccattttgactgggtttgggtatgggtatgggttt 19572524  T
Q  371 ttcccgatttcaaa-cacgggta-----------acggatatatagatacccactctgaaccc------------gtcccaaatgtaaaaaattacttta 446  Q
    |||||||||||||| ||||||||           |||| ||||||| ||||||| | ||||||            |||||||||||||||||||| ||||    
T  19572525 ttcccgatttcaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatactcatacccgtcccaaatgtaaaaaattatttta 19572624  T
Q  447 tgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaactaaatcattccgtctaacaaatgtt 545  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| || || |||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  19572625 tgttgatatgtcatgttattttgtttgataattgccatgttaataaaaactaccattgata-ttgaaggatcaattaaatcattacgtctaacaaatgtt 19572723  T
Q  546 aaagtgaacatatt 559  Q
    ||||||| ||||||    
T  19572724 aaagtgagcatatt 19572737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 417 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 29936422 - 29936286
Alignment:
Q  417 aacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgta-tgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatga 515  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  29936422 aacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtaatgttatttttttttataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaagga 29936323  T
Q  516 tcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtga 552  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  29936322 tcaactaaatcattttgtctaacaaatgtgaaagtga 29936286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 418 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 23966878 - 23966735
Alignment:
Q  418 acccgtcccaaatgtaaaaaa-ttactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatga 515  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||  |    
T  23966878 acccgtcccaaatgtaaaaaaattactttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgtttataaaaactactattgatatttaaagta 23966779  T
Q  516 tcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  23966778 tcaactaaatcattccatctaacaaatgttaaagtgagcatatt 23966735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 269 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 39616471 - 39616166
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcataccc-gcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatggg 367  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| ||||| |||  |||| ||| |||||| |   ||||| |||| |||||||    
T  39616471 aggcatgacaacaaaactcataccccgcggttacccgcccgaaccaaactcaatttgacgagttttccccgttttgactgagtttgggtatgagtatggg 39616372  T
Q  368 tttttcccgatttcaaa-cacgggtaacgga-----------tatatagatacccactctga-acccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgata 454  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||||  |||           |||||||  |||||  |  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39616371 ttttcccctatttcaaaacacgggtataggacgggtaacaagtatataggcacccatacccatacccgtcccaaatgtaaaaaattattttatgttgata 39616272  T
Q  455 tgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaa 553  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  39616271 tgtcatgttattttgtttgctaattatcatgttaataaaaattaccattgatatttaaatgatcagttaaatcattccgtctaacagatgttaaagtgag 39616172  T
Q  554 catatt 559  Q
    ||||||    
T  39616171 catatt 39616166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 417 - 552
Target Start/End: Original strand, 49250856 - 49250992
Alignment:
Q  417 aacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatga 515  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  49250856 aacccgtcccaaatgtaaaaaactactttatgttgatatgttatgctattttgtttgataattgtcatgttgataaaaactatcattgatatttaaaaga 49250955  T
Q  516 tcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtga 552  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||    
T  49250956 tcaactaaattattttgtctaacaaatgtgaaagtga 49250992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 417 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 51421864 - 51421728
Alignment:
Q  417 aacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatga 515  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||    
T  51421864 aacccgtcccaaatgtaaaaaattactctatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgccatgttaataaaaactaccattgctatttaaagga 51421765  T
Q  516 tcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtga 552  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  51421764 tcaactaaatcattttgtctaacaaatgtgaaagtga 51421728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 422 - 559
Target Start/End: Original strand, 3628073 - 3628213
Alignment:
Q  422 gtcccaaatgtaaaaaa--ttactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatca 518  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||||||  |||||    
T  3628073 gtcccaaatgtaaaaaaaattactttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattatcatgttaataaaaactaccattaatatttaacggatca 3628172  T
Q  519 actaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3628173 actaaatcattacgtctaacaaatgttaaagtgagcatatt 3628213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 417 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 34611079 - 34610943
Alignment:
Q  417 aacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatga 515  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  34611079 aacccgtcccaaatgtaaaatactactttatgttgatatgttatattattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaaga 34610980  T
Q  516 tcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtga 552  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||    
T  34610979 tcaactaaataattttgtctaacaaatgtgaaagtga 34610943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 417 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 20774639 - 20774502
Alignment:
Q  417 aacccgtcccaaatgtaaaaaat-tactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatg 514  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| |    
T  20774639 aacccgtcccaaatgtaaaaaaactactttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaacttttattgatatttaaagg 20774540  T
Q  515 atcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtga 552  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||    
T  20774539 atcaactaaataattttgtctaacaaatgtgaaagtga 20774502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 417 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 28297940 - 28297803
Alignment:
Q  417 aacccgtcccaaatgtaaaaaat-tactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatg 514  Q
    ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  28297940 aacccgtcccaaatgtaaaaaaactattttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaagg 28297841  T
Q  515 atcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtga 552  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||    
T  28297840 atcaactaaattattttgtctaacaaatgtgaaagtga 28297803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 425 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 16408940 - 16408823
Alignment:
Q  425 ccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaactaa 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  16408940 ccaaatgtaaaaaattactttatgt----atgtcatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaa 16408845  T
Q  524 atcattccgtctaacaaatgtt 545  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  16408844 atcattccgtctaacaaatgtt 16408823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 386 - 559
Target Start/End: Original strand, 35936869 - 35937042
Alignment:
Q  386 acgggtaacggatatatagatacccactctgaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatg 484  Q
    |||| |||||| ||||||| ||||||| |  ||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    ||    
T  35936869 acggataacgggtatataggtacccaccccaaacccgtcatgaatgtagaaaattactttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataatttccgtg 35936968  T
Q  485 ttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
    || | |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35936969 tt-acaaaaactaccattgatatttaaaggagcaactaaatcaattggtctaacaaatgttaaagtgagcatatt 35937042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 462 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 13020648 - 13020559
Alignment:
Q  462 tattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtg 551  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13020648 tattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaagtatcaactaaatcattccgtctaacaaatattaaagtg 13020559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 269 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 23968757 - 23968633
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  23968757 aggcatggcaacaaaacccatacccgcggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacggattttccccattttgattgggtttgggtatgggtatgggt 23968658  T
Q  369 ttttcccgatttc-aaacacgggta 392  Q
    ||| |||| |||| |||||||||||    
T  23968657 tttccccggtttcaaaacacgggta 23968633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 417 - 559
Target Start/End: Original strand, 44615558 - 44615701
Alignment:
Q  417 aacccgtcccaaatgtaaaaaat-tactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatg 514  Q
    ||||||||||||||  ||||||  |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||| |    
T  44615558 aacccgtcccaaatccaaaaaaactactttatcttgatatgccatgttattttgtttgataattgtcgtgtta-taaaaactattattgatatttaaagg 44615656  T
Q  515 atcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
    |  |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44615657 agaaactaaatcaatcggtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 44615701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 417 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 44793011 - 44792868
Alignment:
Q  417 aacccgtcccaaatgtaaaaaat-tactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatg 514  Q
    ||||||||||||||  ||||||  |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||| |    
T  44793011 aacccgtcccaaatccaaaaaaactactttatcttgatatgccatgttattttgtttgataattgtcgtgtta-taaaaactattattgatatttaaagg 44792913  T
Q  515 atcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
    |  |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44792912 agaaactaaatcaatcggtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 44792868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 417 - 559
Target Start/End: Original strand, 29871368 - 29871510
Alignment:
Q  417 aacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatga 515  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||| |||||||||||||| ||    
T  29871368 aacccgtcccgaatgtagaaaattattttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattcccatgtta-taaaaactaccattgatatttaaagga 29871466  T
Q  516 tcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
     |||||| |||| || ||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  29871467 gcaactacatcaatcggtctaacaaatattaaaatgagcatatt 29871510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 417 - 559
Target Start/End: Original strand, 49741090 - 49741232
Alignment:
Q  417 aacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatga 515  Q
    |||||||||| |||| | |||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||  ||||||||||||| ||    
T  49741090 aacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgttatgttattttgtttgataattgatgtgtta-taaaaactactattgatatttaaagga 49741188  T
Q  516 tcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
     ||||||||| | || || |||||||||||||||||||||||||    
T  49741189 gcaactaaataaatcggtttaacaaatgttaaagtgaacatatt 49741232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 424 - 559
Target Start/End: Original strand, 16433254 - 16433386
Alignment:
Q  424 cccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaacta 522  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     | |||||||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  16433254 cccaaatgcagaaaattactttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattgt----attataaaaactaccattgatatttaaaggagcaacta 16433349  T
Q  523 aatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
    ||||| |  ||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  16433350 aatcaattggtctaacaaatattaaagtgagcatatt 16433386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 417 - 559
Target Start/End: Original strand, 9982973 - 9983115
Alignment:
Q  417 aacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatga 515  Q
    ||||| |||| |||| | |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| | |||||| | ||||||| |||||||||| ||| ||    
T  9982973 aacccatcccgaatgcagaaaattactttatgttaatatatcatgttattttgtttgataattctcatgtta-tcaaaactaccattgatattcaaagga 9983071  T
Q  516 tcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
     ||||||||| | || ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9983072 gcaactaaattaatcggtctaacaaatgttaaagtgagcatatt 9983115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 417 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 12495016 - 12494874
Alignment:
Q  417 aacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatga 515  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||  |||||||||||||| |||||||   ||||| ||||||||| || ||||||||||| ||    
T  12495016 aacccgtcccaaatgtagaaaactactatatgttgacatgacatgttattttgttttataattggcgtgtta-taaaaactaccactgatatttaaagga 12494918  T
Q  516 tcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
     |||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12494917 gcaactaaatttatcggtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 12494874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 269 - 548
Target Start/End: Original strand, 34673193 - 34673496
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | | ||| || ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| | | | ||||| ||||||| |||||    
T  34673193 aggcatgacaacaaaactcataccagtgattacccgcccgaaccaaacccaatttaacggattttccccattttaactgggtttgggtatgggtttgggt 34673292  T
Q  369 ttttcccgatttcaaa-cacgggta-----------acggatatatagatacccactctgaacccgt-cccaaa--tgt---------aaaaaattactt 444  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||           |||| ||||||| ||||||| | |||||| | ||||||  |||         | |||| |||||    
T  34673293 ttttcccaatttcaaaacacgggtatgagactggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaacctgttccgaacgaagaaaactactt 34673392  T
Q  445 tatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaactaaatcattccgtctaacaaatg 543  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||  | ||||||||||||    
T  34673393 tatgttgatatgccatgttattttgtttgataattgccgtgtta-taaaaactaccattgatatttaaaggagcaactaaatcaaccggtctaacaaatg 34673491  T
Q  544 ttaaa 548  Q
    |||||    
T  34673492 ttaaa 34673496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 269 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 13390574 - 13390355
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||||||||||||  ||||| |||| |||  ||| |||||| | | ||||| ||||||||||  |    
T  13390574 aggcatggcaacaaaacccatacccacggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacgggtttc-cccgttttgactgggtttgggtatgggtatgaat 13390476  T
Q  369 ttttcccgatttcaaa-cacgggtaacggatatatagatacccactctgaac------------ccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatat 455  Q
    ||| |||||||||||| |||     |||| ||||||| ||||||| | ||||            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13390475 tttccccgatttcaaaacac-----acgggtatataggtacccaccccgaactcatacccatacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatat 13390381  T
Q  456 gt-atgttattttgtttgataattgt 480  Q
    || |||||||||||||||||||||||    
T  13390380 gtcatgttattttgtttgataattgt 13390355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 461 - 565
Target Start/End: Original strand, 44632264 - 44632367
Alignment:
Q  461 ttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatattc 560  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||     
T  44632264 ttattttgtttgacaattgtcgtgtta-taaaaactatcattgatatttaaaggagcaactaaatcaataggtctaacaaatgttaaagtgatcatattg 44632362  T
Q  561 ttcga 565  Q
    |||||    
T  44632363 ttcga 44632367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 268 - 365
Target Start/End: Original strand, 34059058 - 34059155
Alignment:
Q  268 aaggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatg 365  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||| | ||||| |||| || ||||| |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  34059058 aaggcatggcaacaaaacccatacccacggttatccgtccgaaccaaattcaatttgacgggttattcccgttttgactagatttgggtatgggtatg 34059155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 269 - 392
Target Start/End: Original strand, 45866097 - 45866220
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||| ||| || |||| ||||  || |||||| ||| ||||| |||||||||||||    
T  45866097 aggcatggcaacaaaacccatactcgcggttacccgcccgagccaaacctaaattgacgggttttctcc-ttttgactaggtttgggtatgggtatgggt 45866195  T
Q  369 ttttcccgatttc-aaacacgggta 392  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||    
T  45866196 tttccccgatttcaaaacacgggta 45866220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 417 - 480
Target Start/End: Original strand, 23490854 - 23490918
Alignment:
Q  417 aacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatg-tatgttattttgtttgataattgt 480  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23490854 aacccgtcccaaatgtaaaaaactaatttatgtggatatgttatgttattttgtttgataattgt 23490918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 269 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 34611251 - 34611127
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    ||||||| ||||||||  |||||||| ||||| || || ||||||||   ||||| |||| |||| ||| ||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  34611251 aggcatgacaacaaaatccatacccgtggttacccgcctgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgattgaatttgggtatgggtatgggt 34611152  T
Q  369 ttttcccgatttc-aaacacgggta 392  Q
    |||||||||| || |||||||||||    
T  34611151 ttttcccgatctcaaaacacgggta 34611127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 269 - 392
Target Start/End: Original strand, 49250684 - 49250808
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||| |||| ||||  || |||||| | | ||||| |||||||||| ||    
T  49250684 aggcatgacaacaaaattcatacccgtggttatccgcccgaaccaaattcaatttgacgggttttctccgttttgactgggtttgggtatgggtatgagt 49250783  T
Q  369 ttttcccgatttc-aaacacgggta 392  Q
    ||| |||||| || |||||||||||    
T  49250784 tttccccgatctcaaaacacgggta 49250808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 269 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 51422036 - 51421912
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    ||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| || ||||||||||||  ||||| | || |||| |||||||||| | | ||||| |||||||||||||    
T  51422036 aggcatggcaataaaatccatatccgtggttacccgcccgaaccaaacccaatttgatgggttttccccattttgactgggtttgggtatgggtatgggt 51421937  T
Q  369 ttttcccgatttc-aaacacgggta 392  Q
    |||||||||| || |||||||||||    
T  51421936 ttttcccgatctcaaaacacgggta 51421912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 269 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 28298124 - 28298025
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||   ||||| |||| |||| ||  |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  28298124 aggcatgtcaacaaaactcatatccgtggttacccacccgaaccaaatccaatttgacgggttttccctgttttgattggatttgggtatgggtatgggt 28298025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 272 - 392
Target Start/End: Original strand, 44615389 - 44615510
Alignment:
Q  272 catggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggtttt 371  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||  |||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| | | ||||| |||| || ||||||||    
T  44615389 catggcaacaaaacccatacccgtggttacccacccagaccaaactcaatttgacgggtttttcccgttttgactgggtttgggtatgagtttgggtttt 44615488  T
Q  372 tcccgattt-caaacacgggta 392  Q
     || |||||  |||||||||||    
T  44615489 ccctgatttaaaaacacgggta 44615510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 272 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 44793180 - 44793059
Alignment:
Q  272 catggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggtttt 371  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||  |||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| | | ||||| |||| || ||||||||    
T  44793180 catggcaacaaaacccatacccgtggttacccacccagaccaaactcaatttgacgggtttttcccgttttgactgggtttgggtatgagtttgggtttt 44793081  T
Q  372 tcccgattt-caaacacgggta 392  Q
     || |||||  |||||||||||    
T  44793080 ccctgatttaaaaacacgggta 44793059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 273 - 384
Target Start/End: Original strand, 42707752 - 42707863
Alignment:
Q  273 atggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggttttt 372  Q
    ||||||||||||| ||||  || ||||||||  || ||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| | | ||||| |||| ||||| |||||     
T  42707752 atggcaacaaaacccataatcgtggttatccgtccaaactaaatttaatttgacggatttttcccattttgactgggtttgggtatgagtatgagttttc 42707851  T
Q  373 cccgatttcaaa 384  Q
     |||||||||||    
T  42707852 tccgatttcaaa 42707863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 269 - 344
Target Start/End: Original strand, 49740937 - 49741012
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttga 344  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  49740937 aggcatggcaacaaaatccatacccgtggttatccacttgaaccaaactcaatttgacggattttcccctttttga 49741012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 269 - 346
Target Start/End: Original strand, 16433090 - 16433167
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgatt 346  Q
    ||||||||||| |||||  ||| ||| ||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  16433090 aggcatggcaataaaacctatatccgtggttacccatccgaaccaaactcaatttgacggattttccccattttgatt 16433167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 269 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 20774744 - 20774651
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggt 362  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||||||||||  ||||| ||||||||| ||| |||||| | | ||||| |||||||    
T  20774744 aggcatggcaacaaaacccatactcgtggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacggattttccccgttttgactgggtttgggtatgggt 20774651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 269 - 392
Target Start/End: Original strand, 23490682 - 23490806
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |   |||| || |||||||||||   ||||| |||| |||||||  |||||| | | ||||| |||||||||||||    
T  23490682 aggcatggcaacaaaacccatactcatagttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggtttttcctgttttgactgggtttgggtatgggtatgggt 23490781  T
Q  369 ttttcccgatttc-aaacacgggta 392  Q
    ||| |||||| || |||||||||||    
T  23490782 tttccccgatctcgaaacacgggta 23490806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 269 - 344
Target Start/End: Original strand, 3627908 - 3627983
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttga 344  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||||| | |  |||||||| ||||||    
T  3627908 aggcatgacaacaaaactcatacacgcggttacccgcccgaaccaaactcaatttgatgagtttttcccgttttga 3627983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 516 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 13390355 - 13390312
Alignment:
Q  516 tcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13390355 tcaactaaatcatttcgtctaacaaatgttaaagtgagcatatt 13390312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 269 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 38106383 - 38106308
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttga 344  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||| |||||||||||  ||||| | ||||||| ||||||||||    
T  38106383 aggcatggcaacaaaactcatactcatggttacccatccgaaccaaacacaatttgatggattttccccattttga 38106308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 269 - 384
Target Start/End: Original strand, 42439581 - 42439696
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    ||||||||||||||||  ||||  || |||||||| ||||||||||||| ||||| ||  |||||| ||||||||| |   ||||| ||||||||||  |    
T  42439581 aggcatggcaacaaaatccatattcgtggttatccgcccgaaccaaactcaatttgacaaattttttccattttgactgagtttgggtatgggtatgaat 42439680  T
Q  369 ttttcccgatttcaaa 384  Q
    |||| ||||| |||||    
T  42439681 tttttccgatctcaaa 42439696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 272 - 334
Target Start/End: Original strand, 25154778 - 25154840
Alignment:
Q  272 catggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggattttt 334  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||    
T  25154778 catgacaacaaaactcatacacgcgggtatccacctgaatcaaacccaatttaacggattttt 25154840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 270 - 384
Target Start/End: Original strand, 29871198 - 29871311
Alignment:
Q  270 ggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggtt 369  Q
    |||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||| ||||| |||| |||| | | |||||| ||  ||||| |||| || ||||||    
T  29871198 ggcatgacaacaaaactcatactcgtggttatccatccg-accaaactcaatttgacgggttttcctcgttttgactaagtttgggtatgagtttgggtt 29871296  T
Q  370 tttcccgatttcaaa 384  Q
    ||  |||||||||||    
T  29871297 ttctccgatttcaaa 29871311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 269 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 12495188 - 12495067
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    ||||||| |||||||| ||||||  | ||||| ||||| ||||||||   ||||| ||||||||| |||| ||||| | | ||| | ||||||| | |||    
T  12495188 aggcatgacaacaaaattcatacatgtggttacccacctgaaccaaatccaatttgacggattttccccactttgactgggtttcggtatgggttttggt 12495089  T
Q  369 ttttcccgatttc-aaacacgg 389  Q
    ||||||||||||| ||||||||    
T  12495088 ttttcccgatttcaaaacacgg 12495067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 422 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 2514769 - 2514678
Alignment:
Q  422 gtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgat-atgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaa 512  Q
    ||||| |||| | ||||||| ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  2514769 gtcccgaatgcataaaattattttatgttgaacatgtcatgttattttgtttgataattgccgtgt-aataaaaactaccattgatatttaaa 2514678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 269 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 16409119 - 16408996
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| | |||||| || | |||| |||||  ||||| |||| |||| ||| |||||| | | ||||| |||||||||||||    
T  16409119 aggcatgacaacaaaacccatacacacggttaccc-ctcgaatcaaacccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggt 16409021  T
Q  369 ttttcccgatttc-aaacacgggta 392  Q
    ||| ||| ||||| |||||||||||    
T  16409020 tttccccaatttcaaaacacgggta 16408996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 449 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 38733965 - 38733902
Alignment:
Q  449 ttgatatg-tatgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaa 512  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||    
T  38733965 ttgatatgctatgttatttggtttgataattgtcatgtt-ataaaaattgtcattgatatttaaa 38733902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 269 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 29936600 - 29936525
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttga 344  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||  ||||| |||| |||| ||| ||||||    
T  29936600 aggcatgacaacaaaacccatacccgtggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttga 29936525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 269 - 315
Target Start/End: Original strand, 9982801 - 9982847
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaa 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||    
T  9982801 aggcatggcaacaaaactcatacccgtggttactctcccgaaccaaa 9982847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 494 - 544
Target Start/End: Original strand, 23493497 - 23493547
Alignment:
Q  494 actatcattgatatttaaatgatcaactaaatcattccgtctaacaaatgt 544  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  23493497 actaccattgatatttaaaggatcaactaaataattttgtctaacaaatgt 23493547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 329 - 392
Target Start/End: Original strand, 33293502 - 33293566
Alignment:
Q  329 atttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggtttttcccgatttc-aaacacgggta 392  Q
    |||||| || |||||||| | ||||| |||| || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33293502 attttttccgttttgattgggtttgggtatgagtttgggtttttcccgatttcaaaacacgggta 33293566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 115; Significance: 4e-58; HSPs: 45)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 269 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 27932591 - 27932282
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcgg-ttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatggg 367  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||  ||||| |||| |||| ||| |||||| | | ||||| ||||||||||||    
T  27932591 aggcatgacaacaaaactcatacccgcgggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatggg 27932492  T
Q  368 tttttcccgatttcaaa-cacgggta-----------acggatatatagatacccactctgaaccc------------gtcccaaatgtaaaaaattact 443  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||           |||| ||||||| ||||||| | ||||||            |||||||||||||||||||| |    
T  27932491 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgagtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatactcatatccgtcccaaatgtaaaaaattatt 27932392  T
Q  444 ttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaactaaatcattccgtctaacaaat 542  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  27932391 ttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaattaaatcattacgtctaacaaat 27932292  T
Q  543 gttaaagtga 552  Q
    ||||||||||    
T  27932291 gttaaagtga 27932282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 418 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 45236069 - 45235927
Alignment:
Q  418 acccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgat 516  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  45236069 acccgtcccaaatgtaaaaaattaatttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattatcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggat 45235970  T
Q  517 caactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45235969 caactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 45235927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 417 - 552
Target Start/End: Original strand, 2075917 - 2076053
Alignment:
Q  417 aacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatga 515  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  2075917 aacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaagga 2076016  T
Q  516 tcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtga 552  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  2076017 tcaactaaatcattttgtctaacaaatgtgaaagtga 2076053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 417 - 552
Target Start/End: Original strand, 24870107 - 24870242
Alignment:
Q  417 aacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatga 515  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  24870107 aacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtcatgttaatttgtttgataattgtcatgttaataaaa-ctaccattgatatttaaagga 24870205  T
Q  516 tcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtga 552  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24870206 tcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtga 24870242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 417 - 559
Target Start/End: Original strand, 28977197 - 28977340
Alignment:
Q  417 aacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatga 515  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28977197 aacccgtcccaaatgtaaaaaactactttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaatga 28977296  T
Q  516 tcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  28977297 tcaactaaataattttgtctaacaaatgtgaaagtgaacttatt 28977340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 418 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 17220721 - 17220579
Alignment:
Q  418 acccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgat 516  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| || |||    
T  17220721 acccgtcccaaatgtaaaagattactttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttgaaggat 17220622  T
Q  517 caactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17220621 caattaaatcattacgtctaacaaatgttaaagtgagcatatt 17220579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 418 - 559
Target Start/End: Original strand, 29108906 - 29109048
Alignment:
Q  418 acccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgat 516  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| || |||    
T  29108906 acccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtcatattattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttgaaggat 29109005  T
Q  517 caactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29109006 caattaaatcattacgtctaacaaatgttaaagtgagcatatt 29109048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 296 - 552
Target Start/End: Original strand, 4230668 - 4230938
Alignment:
Q  296 ggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggtttttcccgatttcaaac---------- 385  Q
    ||||| || ||||||||||||  ||||| |||| |||| |||||||||| | | ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||               
T  4230668 ggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccattttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacaggtatg 4230767  T
Q  386 --acgggtaacggatatatagatacccactctgaa-cccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgtt 481  Q
      ||| ||||||| ||||||| ||||||  |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||     
T  4230768 ggacgagtaacgggtatataggtacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatacattatgttattttgtttgataattgtc 4230867  T
Q  482 atgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtga 552  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  4230868 atgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtga 4230938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 418 - 559
Target Start/End: Original strand, 11255092 - 11255230
Alignment:
Q  418 acccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtatgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatc 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |   |  ||||||| ||||    
T  11255092 acccgtcccaaatgtaaaaaattactttgtgttgatatgtatgttattttgtttgataattgtcatattaataaaaactacc---gtcatttaaaggatc 11255188  T
Q  518 aactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11255189 aactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 11255230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 423 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 1063506 - 1063369
Alignment:
Q  423 tcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtat-gttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaact 521  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  1063506 tcccaagtgtaaaaaattactttatgttgatatgtcttgttattttgtttgataattgtcatgttgataaaaattaccattgatatttaaacgatcaact 1063407  T
Q  522 aaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1063406 aaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacgtatt 1063369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 269 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 24928126 - 24927819
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||  ||||| |||| |||| ||| |||||| | | ||||| |||||||||||||    
T  24928126 aggcatggcaacaaaacccatacccgcggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggt 24928027  T
Q  369 ttttcccgatttc-aaacacgggta-----------acggatatatagatacccactctgaaccc------------gtcccaaatgtaaaaaattactt 444  Q
    ||| || ||| || |||||||||||           |||| ||||||| ||||||| | ||||||            ||||||||||||||||| |||||    
T  24928026 tttccctgatctcgaaacacgggtatgagacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaactactt 24927927  T
Q  445 tatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaactaaatcattccgtctaacaaatg 543  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  24927926 tatgtggatatgttatgttattttgtttgataattgtcatcttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaataattttgtctaacaaatg 24927827  T
Q  544 ttaaagtg 551  Q
    | ||||||    
T  24927826 tgaaagtg 24927819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 269 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 32303238 - 32302929
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||| |||||  ||||| |||| |||| ||| |||||| | | ||||| |||||||||||||    
T  32303238 aggcatggcaacaaaacccatacccgtggttacccgcccgaaacaaacccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggt 32303139  T
Q  369 ttttcccgatttc-aaacacgggta-----------acggatatatagatacccactctgaaccc------------gtcccaaatgtaaaaaat-tact 443  Q
    ||| |||||| || |||||||||||           |||| ||||||| ||||||| | ||||||            |||||||||||||||||  || |    
T  32303138 tttccccgatctcgaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaaactatt 32303039  T
Q  444 ttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaactaaatcattccgtctaacaaat 542  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||    
T  32303038 ttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaataattttgtctaacaaat 32302939  T
Q  543 gttaaagtga 552  Q
    || |||||||    
T  32302938 gtgaaagtga 32302929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 423 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 34777065 - 34776945
Alignment:
Q  423 tcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaact 521  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  34777065 tcccaaatgtaaaaaattattttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgcaatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaact 34776966  T
Q  522 aaatcattccgtctaacaaat 542  Q
    ||||||||  |||||||||||    
T  34776965 aaatcattttgtctaacaaat 34776945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 446 - 559
Target Start/End: Original strand, 39445680 - 39445793
Alignment:
Q  446 atgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaactaaatcattccgtctaacaaatgt 544  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39445680 atgtagatatgtcatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatattt-aatgatcaattaaatcattccgtctaacaaatgt 39445778  T
Q  545 taaagtgaacatatt 559  Q
    |||||||| ||||||    
T  39445779 taaagtgagcatatt 39445793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 433 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 1012606 - 1012480
Alignment:
Q  433 aaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaactaaatcattcc 531  Q
    |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| || |||||||||||||| || ||||||||||| ||     
T  1012606 aaaaaactactttatgttgatatgccatgttattttgtttgataattgctgtgtta-taaaaagtaccattgatatttaaaggagcaactaaatcaatcg 1012508  T
Q  532 gtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1012507 gtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 1012480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 420 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 24568940 - 24568802
Alignment:
Q  420 ccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtatgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaa 519  Q
    ||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||  ||||||||||||| || |||    
T  24568940 ccgtcccgaatggagaaaactactttatgttgatatgtcagttattttgtttgataattgatgtgtta-taaaaactactattgatatttaaaggagcaa 24568842  T
Q  520 ctaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
    |||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24568841 ctaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 24568802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 417 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 34139453 - 34139310
Alignment:
Q  417 aacccgtcccaaatgtaaaaaa-ttactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatg 514  Q
    |||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||| |    
T  34139453 aacccgtcccgaatgcaaaaaaattactttatgttgatagaccatgttattttgtttgataattgtcgtgtta-taaaaactaccattgatatttaaagg 34139355  T
Q  515 atcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
    |  ||  |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34139354 agtaaacaaatcaatcggtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 34139310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 435 - 553
Target Start/End: Original strand, 43113727 - 43113845
Alignment:
Q  435 aaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaactaaatcattccgt 533  Q
    |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||    
T  43113727 aaaactacttcatgttgatatgttatgttattttgttagataattgtcgtgtta-taaaaactatcattgatatttgaaggagcaactaaatcaatcggt 43113825  T
Q  534 ctaacaaatgttaaagtgaa 553  Q
     |||||||||||||||||||    
T  43113826 ataacaaatgttaaagtgaa 43113845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 482 - 552
Target Start/End: Original strand, 40248496 - 40248566
Alignment:
Q  482 atgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtga 552  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40248496 atgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattcagtctaacaaatgttaaagtga 40248566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 458 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 35215467 - 35215367
Alignment:
Q  458 atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacata 557  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| | |||||||||||  || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  35215467 atgttattttgtttgataattgtcgtgtta-taaaaactacccttgatatttaatggagcaactaaatcaatcggtctaacaaatgttaaagtgaacata 35215369  T
Q  558 tt 559  Q
    ||    
T  35215368 tt 35215367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 443 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 34021456 - 34021341
Alignment:
Q  443 tttatgttgatatgtatgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaactaaatcattccgtctaacaaat 542  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||  ||||||||||||| || |||| |||||| |   ||||||||||    
T  34021456 tttatgttgatatgtatgttattttgtttgataattgtcat-tatataaaaactactattgatatttaaaggagcaacgaaatcaattaatctaacaaat 34021358  T
Q  543 gttaaagtgaacatatt 559  Q
    |||||||||| ||||||    
T  34021357 gttaaagtgagcatatt 34021341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 417 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 17469260 - 17469118
Alignment:
Q  417 aacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatga 515  Q
    |||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||   ||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  17469260 aacccgtcccaactgcagaaaactactttatgttgatatgccatgttattttgtttgataattgccttgtta-taaaagctaccattgatatttaaagga 17469162  T
Q  516 tcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
      |||||||||| |  |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  17469161 gaaactaaatcaatgggtctaaaaaattttaaagtgaacatatt 17469118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 445 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 29089685 - 29089573
Alignment:
Q  445 tatgttgatatgtatgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaactaaatcattccgtctaacaaatgt 544  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| || |||||||||||||||||||||| || ||||||||| | |  ||||||||||| |    
T  29089685 tatgttggtatgtatgttattttgtttgataattattgtgtt-attaaaactatcattgatatttaaaggagcaactaaattaatgggtctaacaaat-t 29089588  T
Q  545 taaagtgaacatatt 559  Q
    |||||| ||||||||    
T  29089587 taaagtaaacatatt 29089573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 417 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 20399597 - 20399461
Alignment:
Q  417 aacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttg-ataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatg 514  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||   |||||||||| |||  ||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||| |    
T  20399597 aacccgtcccgaatgcaaaaaattattttatgttgatataccatgttattttttttatataattgtcgtgtta-taaaaactagcattgatatttaaagg 20399499  T
Q  515 atcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtga 552  Q
    | |||| |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  20399498 accaaccaaatcaatcggtctaacaaatgttaaagtga 20399461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 269 - 384
Target Start/End: Original strand, 2075745 - 2075860
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||| || || |||||||||  ||||| |||||||||  || |||||| | | ||||| |||||||||||||    
T  2075745 aggcatggcaacaaaactcatatccgtggttacccgcctgaaccaaacccaatttgacggattttctccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggt 2075844  T
Q  369 ttttcccgatttcaaa 384  Q
    |||||||||| |||||    
T  2075845 ttttcccgatctcaaa 2075860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 306 - 392
Target Start/End: Original strand, 39445524 - 39445611
Alignment:
Q  306 ccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggtttttcccgatttc-aaacacgggta 392  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||| ||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39445524 ccgaaccaaactcaatttgacggattttccccgttttgactaggtttgggtatgggtatgggtttttcccgatttcaaaacacgggta 39445611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 269 - 384
Target Start/End: Original strand, 27777109 - 27777224
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| | || | | |||||||||||||||||| |||| ||||  || |||||| | | ||||| |||| || || ||    
T  27777109 aggcatgacaacaaaactcatacccgcaggtacctatccgaaccaaacttaatttgacgggttttctccgttttgactgggtttgggtatgtgtttgagt 27777208  T
Q  369 ttttcccgatttcaaa 384  Q
    ||||||||||||||||    
T  27777209 ttttcccgatttcaaa 27777224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 269 - 384
Target Start/End: Original strand, 43113537 - 43113652
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| |||| ||   ||||| | | ||||  |||| |  |||||    
T  43113537 aggcatggcaataaaactcatacccgtggttacccacccgaaccaaacccaatttaacgggttttccctgctttgactgggtttgcgtatgagattgggt 43113636  T
Q  369 ttttcccgatttcaaa 384  Q
    ||||||||||||||||    
T  43113637 ttttcccgatttcaaa 43113652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 486 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 31325199 - 31325134
Alignment:
Q  486 taataaaaactatcattgatatttaaatgatcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtga 552  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  31325199 taataaaaactaccattgatatttaaa-gatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtgaaagtga 31325134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 272 - 392
Target Start/End: Original strand, 5858566 - 5858687
Alignment:
Q  272 catggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggtttt 371  Q
    |||||||||||||  |||||| | ||||| | ||||||||||||   ||||| |||| |||| ||| |||||||| | ||||| ||||||| ||||||||    
T  5858566 catggcaacaaaatccatacctgtggttacctacccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggtttt 5858665  T
Q  372 tcccgattt-caaacacgggta 392  Q
    |||||||||  |||||||||||    
T  5858666 tcccgatttaaaaacacgggta 5858687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 269 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 34777237 - 34777144
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggt 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||| ||  |||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||| | | ||||| |||||||    
T  34777237 aggcatggcaacaaaactcatacccgtgattacccgtccgaaccaaacccaatttaacgggtttttcccgttttgactgggtttgggtatgggt 34777144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 269 - 392
Target Start/End: Original strand, 37960873 - 37960997
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||  |||| ||||||||||| ||| |||||| | || |||||||| |||||| ||| ||||| |||| || |||||    
T  37960873 aggcatgacatcaaaactcatatccgtagttacccacccgaaccgaacctaatttgatgggtttttcccgttttgactaggtttgggtatgagtttgggt 37960972  T
Q  369 ttttcccgattt-caaacacgggta 392  Q
    ||| ||||||||  |||||||||||    
T  37960973 tttccccgatttaaaaacacgggta 37960997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 277 - 392
Target Start/End: Original strand, 40248290 - 40248406
Alignment:
Q  277 caacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggtttttcccg 376  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  | || |||||||||  ||||| |||| |||||||| |||||| | | ||||| |||||||||  ||||| ||||    
T  40248290 caacaaaacccatacccgcggttactcgcctgaaccaaacccaatttgacgggtttttcccgttttgactgggtttgggtatgggtatatgttttccccg 40248389  T
Q  377 atttc-aaacacgggta 392  Q
    ||||| |||||||||||    
T  40248390 atttcaaaacacgggta 40248406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 269 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 1063690 - 1063560
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggat------atgggt 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||   |||| |||| |||| ||| |||||| | | | ||| |      ||||||    
T  1063690 aggcatggcaacaaaactcatacccgtggttacccgcccgaaccaaacccgatttgacgggttttccccgttttgactgggtgtgggtgtgggtatgggt 1063591  T
Q  363 atgggtttttcccgatttc-aaacacgggta 392  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1063590 atgggtttttcccgatttcaaaacacgggta 1063560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 269 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 17469420 - 17469345
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttga 344  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||  ||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  17469420 aggcatggcaacaaaacccatacccgtagttacccacccgaaccaaacccaatttgacggattttccccgttttga 17469345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 269 - 346
Target Start/End: Original strand, 36131840 - 36131917
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgatt 346  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||||| | |||||||| || ||||||||    
T  36131840 aggcatgacaacaaaattcatatccgtggttacccacccgaaccaaacctaatttgatggattttttccgttttgatt 36131917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 420 - 457
Target Start/End: Original strand, 40248457 - 40248494
Alignment:
Q  420 ccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt 457  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40248457 ccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt 40248494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 272 - 380
Target Start/End: Original strand, 29108736 - 29108844
Alignment:
Q  272 catggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggtttt 371  Q
    ||||||| |||||| |||| | |||||||  |  |||||||||||  ||||| |||| |||| ||| |||||| | | ||||| ||||||||||||||||    
T  29108736 catggcagcaaaacccataactgcggttactcgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggtttt 29108835  T
Q  372 tcccgattt 380  Q
    |||||||||    
T  29108836 tcccgattt 29108844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 269 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 20399769 - 20399654
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| ||||| || | ||||||||||  ||||| |||  |||| ||| |||||| | | ||||| ||||||| |||||    
T  20399769 aggcatggcaacaaaaccaatacccgtggttacccgctcgaaccaaacccaatttgacgagttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtttgggt 20399670  T
Q  369 ttttcccgatttcaaa 384  Q
    |||  |||||||||||    
T  20399669 tttctccgatttcaaa 20399654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 269 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 1012795 - 1012678
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||| ||||| ||||||||| |||||  ||||| |||| |||| | | ||||||||   ||||| |||| || |||||    
T  1012795 aggcatggcaataaaatccatacccgtggttacccacccgaatcaaacccaatttgacgggttttcctcgttttgattgagtttgggtatgagtttgggt 1012696  T
Q  369 ttttcccgatttcaaaca 386  Q
    ||| |||||||| |||||    
T  1012695 tttccccgatttaaaaca 1012678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 269 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 24569114 - 24569002
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    ||||||| ||||||||| |||||  | | ||||| | ||||||||||| |||||| |||| |||| ||| ||| |||| | ||| | ||||||||||| |    
T  24569114 aggcatgacaacaaaacacatacatgtgattatctatccgaaccaaacctaatttgacgggttttccccgttt-gattgggtttaggtatgggtatggat 24569016  T
Q  369 ttttcccgatttca 382  Q
    ||||||||||||||    
T  24569015 ttttcccgatttca 24569002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 277 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 34139621 - 34139581
Alignment:
Q  277 caacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaact 317  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  34139621 caacaaaactcatacccgtggttatccgcccgaaccaaact 34139581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 269 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 17220891 - 17220765
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcg--gttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgg 366  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||||  |||| || | |||||||||   ||||| |||| |||| |||||||||| |   ||||| |||||||||||    
T  17220891 aggcatgacaacaaaacctatacccgcgcggttacccgcacgaaccaaatccaatttgacgggttttccccattttgactgagtttgggtatgggtatgg 17220792  T
Q  367 gtttttcccgatttc-aaacacgggta 392  Q
     |||| ||||||||| |||||||||||    
T  17220791 attttccccgatttcaaaacacgggta 17220765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 417 - 541
Target Start/End: Complemental strand, 14186325 - 14186205
Alignment:
Q  417 aacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatga 515  Q
    |||||||||  |||||| ||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||  ||  ||||     |||||| |||||||||||||| ||    
T  14186325 aacccgtcctgaatgtagaaaattaatttatgttaatatgccatgttattttgtttgataacagtcgtgtt-----aaactaccattgatatttaaagga 14186231  T
Q  516 tcaactaaatcattccgtctaacaaa 541  Q
      |||||||||| |  ||||||||||    
T  14186230 gtaactaaatcaattggtctaacaaa 14186205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 420 - 559
Target Start/End: Original strand, 36132003 - 36132141
Alignment:
Q  420 ccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatca 518  Q
    ||||||| |||| | ||| ||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||   |||| ||||||| || |||| | |||||||  | ||    
T  36132003 ccgtcccgaatgcagaaagttattttatgtt-atatgtcatgttattttgtttgataattgccgtgtt-ataaaaattaccattaaaatttaaagaagca 36132100  T
Q  519 actaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
    | ||||| | || ||| ||||||||||||| ||| ||||||    
T  36132101 attaaattaatcggtcaaacaaatgttaaaatgagcatatt 36132141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 114; Significance: 2e-57; HSPs: 70)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 418 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 39046962 - 39046821
Alignment:
Q  418 acccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtatgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatc 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| |||     
T  39046962 acccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccgttgatatttaaaggatt 39046863  T
Q  518 aactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  39046862 aactaaatcattccgtctaacaaatgttaaaatgagcatatt 39046821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 418 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 31752466 - 31752324
Alignment:
Q  418 acccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgat 516  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  31752466 acccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaacaatgatatttaaaagat 31752367  T
Q  517 caactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  31752366 caactaaatcattccgtctatcaaatgttaaagtgagcatatt 31752324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 418 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 42774771 - 42774629
Alignment:
Q  418 acccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgat 516  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  42774771 acccgtccaaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggat 42774672  T
Q  517 caactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  42774671 caactaaatcattccttctaacaaatgttaaaatgaacatatt 42774629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 418 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 48459491 - 48459349
Alignment:
Q  418 acccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgat 516  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  48459491 acccatcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggat 48459392  T
Q  517 caactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
    |||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  48459391 caactaaatcattttgtctaaaaaatgttaaagtgagcatatt 48459349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 417 - 552
Target Start/End: Original strand, 47550437 - 47550573
Alignment:
Q  417 aacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatga 515  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  47550437 aacccgtcccaaatgtaaaaaattattttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaagga 47550536  T
Q  516 tcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtga 552  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  47550537 tcaactaaatcattttgtctaacaaatgtgaaagtga 47550573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 422 - 559
Target Start/End: Original strand, 47239474 - 47239612
Alignment:
Q  422 gtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaac 520  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  47239474 gtcccaaatgtaaaaaattattttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaac 47239573  T
Q  521 taaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
    ||||||||| | | || ||||||||||||||| ||||||    
T  47239574 taaatcatttcatttatcaaatgttaaagtgagcatatt 47239612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 417 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 32585500 - 32585363
Alignment:
Q  417 aacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtat-gttattttgtttgataattgttatgttaataaaaacta-tcattgatatttaaatg 514  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  32585500 aacccgtcccaaatgtaaaaacttactttatgtttatatgtcttgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaatcattgatatttaaagg 32585401  T
Q  515 atcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtga 552  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32585400 atcaactaaatcattccgtctaacaattgttaaagtga 32585363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 417 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 43893239 - 43893103
Alignment:
Q  417 aacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatga 515  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  43893239 aacccgtcccaaatgtaaaaaactactttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaagga 43893140  T
Q  516 tcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtga 552  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||    
T  43893139 tcaactaaattattttgtctaacaaatgtgaaagtga 43893103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 272 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 7609150 - 7608845
Alignment:
Q  272 catggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggtttt 371  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||| ||||  ||||| |||| |||| ||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||||    
T  7609150 catggcaacaaaacccatactcgtggttacccacccgaactaaacccaatttgacgggttttccccgttttgactggatttgggtatgggtatgggtttt 7609051  T
Q  372 tcccgatttc-aaacacgggta-----------acggatatatagatacccactctgaaccc------------gtcccaaatgtaaaaaattactttat 447  Q
     |||||| || |||||||||||           |||| ||||||| ||||||| | ||||||            ||||||||||||||||| |||| |||    
T  7609050 ccccgatctcgaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaactactctat 7608951  T
Q  448 gttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaactaaatcattccgtctaacaaatgtta 546  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||| |    
T  7608950 gttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactgtcattgatatttaaaggatcaactaaataattttgtctaacaaatgtga 7608851  T
Q  547 aagtga 552  Q
    ||||||    
T  7608850 aagtga 7608845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 269 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 21424044 - 21423735
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||   ||||| ||||||||||||| |||||| | | ||||| |||||||||||||    
T  21424044 aggcatggcaataaaactcatacccgtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacggatttttcccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggt 21423945  T
Q  369 ttttcccgatttc-aaacacggg-----------taacggatatatagatacccactctgaaccc------------gtcccaaatgtaaaaaattactt 444  Q
    ||| ||| || || |||||||||           |||||| ||||||| ||||||| |  |||||            ||||||||||||||||| |||||    
T  21423944 tttccccaatctcgaaacacgggtatgagacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacacaaacccgtcccaaatgtaaaaaactactt 21423845  T
Q  445 tatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaactaaatcattccgtctaacaaatg 543  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  21423844 tatgttgatatgttatattattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaataattttgtctaacaaatg 21423745  T
Q  544 ttaaagtgaa 553  Q
    | ||||||||    
T  21423744 tgaaagtgaa 21423735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 269 - 552
Target Start/End: Original strand, 11122781 - 11123089
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| |||||||||| || |||||| |   ||||| |||||||||||||    
T  11122781 aggcatggcaacaaaactcatacccgtggttacccgcccgaaccaaactcaatttgacggattttttccgttttgactgagtttgggtatgggtatgggt 11122880  T
Q  369 ttttcccgatttc-aaacacgggta-----------acggatatatagatacccactctgaaccc------------gtcccaaatgtaaaaaattactt 444  Q
    |||  ||||| || |||||||||||           |||| ||||||| ||||||| | ||||||            ||||||||||||||||| |||||    
T  11122881 tttctccgatctcgaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatactcaaacccgtcccaaatgtaaaaaactactt 11122980  T
Q  445 tatgttgatatgtat-gttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaactaaatcattccgtctaacaaatg 543  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  11122981 tatgttgatatgttttgttattttgttttataattgtcatgttaataaaaagtaccattgatatttaaaggatcaactaaataattttgtctaacaaatg 11123080  T
Q  544 ttaaagtga 552  Q
    | |||||||    
T  11123081 tgaaagtga 11123089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 417 - 552
Target Start/End: Original strand, 5902698 - 5902834
Alignment:
Q  417 aacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatga 515  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  5902698 aacccgtcccaaatgtaaaaaactactttatgttgatatgttatcttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaagga 5902797  T
Q  516 tcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtga 552  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||    
T  5902798 tcaactaaataattttgtctaacaaatgtgaaagtga 5902834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 356 - 559
Target Start/End: Original strand, 4766333 - 4766540
Alignment:
Q  356 tatgggtatgggtttttcccgatttcaaa-cacgggtaacggatatatagatacccactctga-----acccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgt 449  Q
    ||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| |  |     ||||||||||||||||||    ||||||||||    
T  4766333 tatgggtataggttttccccgaattcaaaacacgggtaacagatatataggtacccacccaaactcatacccgtcccaaatgtaaa----tactttatgt 4766428  T
Q  450 tgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaa-actatcattgatatttaaatgatcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaa 547  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  4766429 tgatatgttatgttattttatttgataattgtcatgttaataaaaaactatcattgatatttaaaggataaactaaatcattacctctaacaaatgttaa 4766528  T
Q  548 agtgaacatatt 559  Q
    ||| ||||||||    
T  4766529 agtaaacatatt 4766540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 417 - 552
Target Start/End: Original strand, 31918642 - 31918779
Alignment:
Q  417 aacccgtcccaaatgtaaaaaat-tactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatg 514  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  31918642 aacccgtcccaaatgtaaaaaaactactttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaagg 31918741  T
Q  515 atcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtga 552  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||    
T  31918742 atcaactaaataattttgtctaacaaatgtgaaagtga 31918779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 269 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 11028256 - 11027947
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||  ||||| |||| ||||  || |||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  11028256 aggcatggcaacaaaacccatacacgtggttacccacccgaaccaaacccaatttgacgggttttctccgttttgactggatttgggtatgggtatgggt 11028157  T
Q  369 ttttcccgatttcaaac------------acgggtaacggatatatagatacccactctgaaccc------------gtcccaaatgtaaaaaa-ttact 443  Q
    ||| |||||| |||||             ||||||||||| ||||||| ||||||| | |||| |            ||||||||||||||||| |||||    
T  11028156 tttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacccaaacctgtcccaaatgtaaaaaaattact 11028057  T
Q  444 ttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaactaaatcattccgtctaacaaat 542  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  11028056 ttatattgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactactatttatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaat 11027957  T
Q  543 gttaaagtga 552  Q
    || |||||||    
T  11027956 gtgaaagtga 11027947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 417 - 552
Target Start/End: Original strand, 6382356 - 6382493
Alignment:
Q  417 aacccgtcccaaatgtaaaaaat-tactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatg 514  Q
    ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  6382356 aacccgtcccaaatgtaaaaaaactattttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaagg 6382455  T
Q  515 atcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtga 552  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||    
T  6382456 atcaactaaataattttgtctaacaaatgtgaaagtga 6382493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 417 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 44317546 - 44317409
Alignment:
Q  417 aacccgtcccaaatgtaaaaaat-tactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatg 514  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| |    
T  44317546 aacccgtcccaaatgtaaaaaaactactttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactacgattgatatttaaagg 44317447  T
Q  515 atcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtga 552  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||    
T  44317446 atcaactaaataattttgtctaacaaatgtgaaagtga 44317409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 435 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 425816 - 425692
Alignment:
Q  435 aaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaactaaatcattccgt 533  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || ||    
T  425816 aaaattactttatgttgatatgccatgttattttgtttgataattgtcatgtta-taaaaactaccattgatatttaaaagaacaactaaatcaatcggt 425718  T
Q  534 ctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||    
T  425717 ctaacaaatcttaaagtgaacatatt 425692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 417 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 19534466 - 19534324
Alignment:
Q  417 aacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatga 515  Q
    |||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||| |||| ||    
T  19534466 aacccgtcacgaatgtagaaaattattttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattgtcgtgtta-taaaaactaccattgatatctaaagga 19534368  T
Q  516 tcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
     ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19534367 gcaactaaatcaatcggtctaacaaatgttaaagtgagcatatt 19534324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 421 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 42299797 - 42299659
Alignment:
Q  421 cgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaa 519  Q
    |||||||||| |||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||   ||||||||||||||| |||    
T  42299797 cgtcccaaatataaaaagt-actttatgttgatatgccatgttattttgtttgataattgtcttgttaataaaaactactgttgatatttaaatgagcaa 42299699  T
Q  520 ctaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
    ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  42299698 ctaaatcatcctctctaacaaatgttaaagtgaacatatt 42299659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 417 - 559
Target Start/End: Original strand, 1724394 - 1724536
Alignment:
Q  417 aacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatga 515  Q
    |||||||||| |||| | |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||  ||||||||||||| ||    
T  1724394 aacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttgatatgtcatgttattttgttagataattgatgtgtta-taaaaactactattgatatttaaagga 1724492  T
Q  516 tcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
     ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1724493 gcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 1724536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 464 - 547
Target Start/End: Original strand, 15987372 - 15987455
Alignment:
Q  464 ttttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaa 547  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15987372 ttttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaa 15987455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 417 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 26564842 - 26564700
Alignment:
Q  417 aacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatga 515  Q
    ||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||   ||||| |||||||||||||||||||||||  ||    
T  26564842 aacccgtcccaaatgcagaaaactactttatgttgatatgtcatgttagtttgtttgataactgccgtgtta-taaaaactatcattgatatttaacgga 26564744  T
Q  516 tcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
     ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26564743 acaactaaatcaatcggtcaaacaaatgttaaagtgaacatatt 26564700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 269 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 37349295 - 37348992
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||  ||||| || | |||| ||| |||||| | | ||||| |||| || || ||    
T  37349295 aggcatggcaacaaaacccatacccgtggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacaggttttccccgttttgactgggtttgggtatgagtttgagt 37349196  T
Q  369 ttttcccgatttcaaa-cacgggtaacggatatatagatacccactctgaaccc------------gtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatat 455  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||| || |||| ||||||||            ||||| |||| | ||||||| |||||||||||||    
T  37349195 tttccccgatttcaaaacacgggtaatgggtatataggtatccaccctgaacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaattattttatgttgatat 37349096  T
Q  456 gt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaac 554  Q
    |  ||||||||||||||||||||| |   |||| ||||||||| | |||||||||||| || ||||||||| | || ||||||||||| ||||||||| |    
T  37349095 gccatgttattttgtttgataattctcgcgtta-taaaaactaccgttgatatttaaaggagcaactaaattaatcggtctaacaaatcttaaagtgagc 37348997  T
Q  555 atatt 559  Q
    |||||    
T  37348996 atatt 37348992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 417 - 522
Target Start/End: Original strand, 55826707 - 55826814
Alignment:
Q  417 aacccgtcccaaatgtaaaaaat-tactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatg 514  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  55826707 aacccgtcccaaatgtaaaaaaactactttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcacgttaataaaaactaccattgatatttaaagg 55826806  T
Q  515 atcaacta 522  Q
    ||||||||    
T  55826807 atcaacta 55826814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 417 - 559
Target Start/End: Original strand, 6482119 - 6482262
Alignment:
Q  417 aacccgtcccaaatgtaaaaaat-tactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatg 514  Q
    ||||||||||||||| ||||||  || ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||| |    
T  6482119 aacccgtcccaaatgcaaaaaaactaatttatattgatatgccatgttattttgtttgataattgtcgtgtta-taaaaactaacattgatatttaaagg 6482217  T
Q  515 atcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
    |  |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6482218 agaaactaaatcaatcggtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 6482262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 417 - 559
Target Start/End: Original strand, 7985205 - 7985348
Alignment:
Q  417 aacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatga 515  Q
    |||||||||| |||| | |||| || |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||| | |||||||||||||||    
T  7985205 aacccgtcccgaatgcagaaaagtattttatgttgataagtcatgttattttgtttgataattgtcgtgttataaaaaactaccgttgatatttaaatga 7985304  T
Q  516 tcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
     ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  7985305 gcaactaaatcaattggtctaacaaatgttaaagtgaaaatatt 7985348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 436 - 548
Target Start/End: Original strand, 28695245 - 28695357
Alignment:
Q  436 aaattactttatgttgatatgta-tgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaactaaatcattccgtc 534  Q
    ||||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| | |||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||     
T  28695245 aaattgctttatgttgatatgcaatgttattttatttgataattgtcacgtta-taaaaactatcattaatatttaaaggagcaactaaatcattcggtt 28695343  T
Q  535 taacaaatgttaaa 548  Q
    ||||||||||||||    
T  28695344 taacaaatgttaaa 28695357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 435 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 37107404 - 37107280
Alignment:
Q  435 aaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaactaaatcattccgt 533  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||| ||||||||  | ||||||||||| || ||    
T  37107404 aaaattactttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattgccatgtta-taaaaactaccattggtatttaaagaagcaactaaatcaatcggt 37107306  T
Q  534 ctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
    || |||||| ||||| ||| ||||||    
T  37107305 ctgacaaatattaaaatgagcatatt 37107280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 269 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 31752639 - 31752515
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||   ||||| |||| ||||| || |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  31752639 aggcatgacaacaaaacccatacccgcggttacccgcccgaatcaaatccaatttgacgggtttttaccgttttgattgggtttggatatgggtatgggt 31752540  T
Q  369 ttttcccgatttc-aaacacgggta 392  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||    
T  31752539 tttccccgatttcaaaacacgggta 31752515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 482 - 559
Target Start/End: Original strand, 53906431 - 53906508
Alignment:
Q  482 atgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  53906431 atgttaataaaaactactattgatatttaatggatcaactaaatcattccttctaacaaatgttaaagtgaacgtatt 53906508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 428 - 559
Target Start/End: Original strand, 32596279 - 32596410
Alignment:
Q  428 aatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaactaaatc 526  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||   |||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| |||||| || || ||||||||||    
T  32596279 aatgtagaaaattattttatgttgatataccatgtcatttggtttgataattgtcatgtta-taaaaactagcattaatatttgaaggaacaactaaatc 32596377  T
Q  527 attccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
    |||  ||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  32596378 attaagtctaacaaattttaaagtgagcatatt 32596410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 435 - 552
Target Start/End: Original strand, 12825563 - 12825680
Alignment:
Q  435 aaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaactaaatcattccgt 533  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||| |  ||    
T  12825563 aaaattactttatgttgatatatcatgttattttgtttgataattatcgtgtta-taaaaactaaaattgatatttaaaggagcaactaaatcaattggt 12825661  T
Q  534 ctaacaaatgttaaagtga 552  Q
    |||| |||| |||||||||    
T  12825662 ctaataaatattaaagtga 12825680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 443 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 39188499 - 39188384
Alignment:
Q  443 tttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaactaaatcattccgtctaacaaa 541  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||  ||||||| |||| |||||||||  |  |||||||||| ||  |||||||||    
T  39188499 tttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataactgtcgtgttaa--aaaactaccatttatatttaaagaaaaaactaaatcaatcgttctaacaaa 39188402  T
Q  542 tgttaaagtgaacatatt 559  Q
    ||||||||||||||||||    
T  39188401 tgttaaagtgaacatatt 39188384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 269 - 384
Target Start/End: Original strand, 1724182 - 1724296
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| ||||| || |  |||||||  ||||| | | ||||| ||||||| |||||    
T  1724182 aggcatggtaacaaaactcatacccgtgtttacccacccgaaccaaactcaatttgac-gtgttttccccgtttgactgggtttgggtatgggtttgggt 1724280  T
Q  369 ttttcccgatttcaaa 384  Q
    ||||||||||||||||    
T  1724281 ttttcccgatttcaaa 1724296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 269 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 48459664 - 48459549
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||  ||||| |||||  ||||| | || ||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||    
T  48459664 aggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaatcaaaccaaatttgatgggtttttcccattttgattggatttgagtatggatatgggt 48459565  T
Q  369 ttttcccgatttcaaa 384  Q
    ||| ||||||||||||    
T  48459564 tttccccgatttcaaa 48459549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 272 - 392
Target Start/End: Original strand, 6481950 - 6482071
Alignment:
Q  272 catggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggtttt 371  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||  |  |||||||| | ||||| ||||||| ||||||||    
T  6481950 catggcaacaaaacctatacccgtggttatccacccgaatcaaactcaatttgacggattttctctgttttgattgggtttgggtatgggtttgggtttt 6482049  T
Q  372 tcccgattt-caaacacgggta 392  Q
     ||| ||||  |||||||||||    
T  6482050 ccccaatttaaaaacacgggta 6482071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 458 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 9230255 - 9230152
Alignment:
Q  458 atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgat--caactaaatcattccgtctaacaaatgtt-aaagtgaac 554  Q
    ||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||   ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  9230255 atgttattttgtttgataactgtcgtgtta-taaaaactaccattgatatttaaaggaaagcaactaaatcaatcggtctaacaaatgttaaaagtgaac 9230157  T
Q  555 atatt 559  Q
    |||||    
T  9230156 atatt 9230152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 269 - 392
Target Start/End: Original strand, 15987174 - 15987298
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    ||||||||||||||||| || |  |||||||| |||||||||||||||  ||||| |||| ||||  ||||||||||| | ||||| |||||||||| ||    
T  15987174 aggcatggcaacaaaacccacattcgcggttacccacccgaaccaaacccaatttgacgggttttctccattttgattgggtttgggtatgggtatgagt 15987273  T
Q  369 ttttcccga-tttcaaacacgggta 392  Q
    ||| || || ||| |||||||||||    
T  15987274 tttcccagattttaaaacacgggta 15987298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 417 - 522
Target Start/End: Original strand, 13015335 - 13015446
Alignment:
Q  417 aacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgt-----taataaaaactatcattgatattta 510  Q
    |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || |     | |||||||||| ||||||||||||    
T  13015335 aacccgtctcgaatgtaaaaaattattttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattttcattttcatgttataaaaactaccattgatattta 13015434  T
Q  511 aatgatcaacta 522  Q
    || || ||||||    
T  13015435 aaggagcaacta 13015446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 417 - 559
Target Start/End: Original strand, 13770539 - 13770681
Alignment:
Q  417 aacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatga 515  Q
    |||||||||| |||| | |||| || |||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||    ||||| ||||||| | |||| |||||| || ||    
T  13770539 aacccgtcccgaatgcataaaactattttatgttaataagccatgttattttgtttgataattaccgtgtta-taaaaacgaccattaatatttgaagga 13770637  T
Q  516 tcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
     ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13770638 gcaactaaatcaatcggtcaaacaaatgttaaagtgaacatatt 13770681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 269 - 344
Target Start/End: Original strand, 53906250 - 53906325
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttga 344  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||| |||| |||||||| ||||||    
T  53906250 aggcatggcaacaaaacccatacccacggttatccgcccgaaccaaacccaatttgacgggtttttcccgttttga 53906325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 269 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 43893410 - 43893309
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||  ||||| |||| |||| ||| |||||| | | ||||| |||||||||||||    
T  43893410 aggcatggcaacaaaacccatacccgtggttacccgcccgagccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggt 43893311  T
Q  369 tt 370  Q
    ||    
T  43893310 tt 43893309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 269 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 44317718 - 44317609
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| |||||  | |||||| |||||  ||||| ||||||||| ||| |||||| | | ||||| |||||||||||||    
T  44317718 aggcaaggcaacaaaacccatacccgtggttactcgcccgaatcaaacccaatttgacggattttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggt 44317619  T
Q  369 ttttcccgat 378  Q
    ||| ||||||    
T  44317618 tttccccgat 44317609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 269 - 378
Target Start/End: Original strand, 55826535 - 55826644
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||  ||||||||||   ||||| ||||||||| ||  |||||| | | |||||||||| ||||||||    
T  55826535 aggcatggcaacaaaacccatacccgtggttacccgtccgaaccaaatccaatttgacggattttccctgttttgactgggtttggatatgagtatgggt 55826634  T
Q  369 ttttcccgat 378  Q
    ||| ||||||    
T  55826635 tttccccgat 55826644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 269 - 384
Target Start/End: Original strand, 7334109 - 7334224
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||| ||||| || ||||||||| |||||| |||| ||||||||  ||||| | | ||||| ||||| | ||| |    
T  7334109 aggcatggcaacaaaacccatacttgcgggtatccgcctgaaccaaacctaatttgacgggtttttcccgctttgactgggtttgggtatggatttggat 7334208  T
Q  369 ttttcccgatttcaaa 384  Q
    ||| ||||||||||||    
T  7334209 tttccccgatttcaaa 7334224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 269 - 384
Target Start/End: Original strand, 47550265 - 47550380
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    |||||||| |||||||| |||||  | ||||| || ||||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||| | | ||||| ||| |||||| ||    
T  47550265 aggcatggaaacaaaacccatacatgtggttacccgcccgaaccaaactcaatttggcggattttccccattttgactgggtttgggtataggtatgagt 47550364  T
Q  369 ttttcccgatttcaaa 384  Q
    ||| |||||| |||||    
T  47550365 tttccccgatctcaaa 47550380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 269 - 378
Target Start/End: Original strand, 31918470 - 31918579
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||| ||||| |  ||||||||||||  ||||| |||| |||| ||| |||||| | | ||||| |||| ||||||||    
T  31918470 aggcatggcaacaaaacccatatccgtggttacctgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgagtatgggt 31918569  T
Q  369 ttttcccgat 378  Q
    ||| ||||||    
T  31918570 tttccccgat 31918579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 271 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 32585664 - 32585591
Alignment:
Q  271 gcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttga 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||| || | |||| ||| ||||||    
T  32585664 gcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccgcccaaaccaaacccaatttgaccggttttcccctttttga 32585591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 269 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 26565014 - 26564950
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttt 333  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||   ||||| |||||||||    
T  26565014 aggcatggcaacaaaacccatacccgtggttacccacccgaaccaaatccaatttgacggatttt 26564950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 269 - 344
Target Start/End: Original strand, 5902532 - 5902607
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttga 344  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| |||| |||| ||| ||||||    
T  5902532 aggcatggcaacaaaacctatacccgtggttacccgcccgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttga 5902607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 269 - 384
Target Start/End: Original strand, 6382184 - 6382299
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||| |||||  ||||| |||| |||| |||  ||||| | | ||||| |||||||||||||    
T  6382184 aggcatggcaataaaacccatacccgtggttacccgcccgaatcaaacccaatttgacgggttttccccgctttgactgggtttgggtatgggtatgggt 6382283  T
Q  369 ttttcccgatttcaaa 384  Q
    |||  ||||| |||||    
T  6382284 tttctccgatctcaaa 6382299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 269 - 380
Target Start/End: Original strand, 19882968 - 19883079
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||  || || ||||||||||||  ||||| |||| ||||||||  ||||||| | ||||  |||| || |||||    
T  19882968 aggcatggcaacaaaacccatactcgcgaatacccgcccgaaccaaacccaatttgacgggtttttcccgctttgattgggtttgagtatgagtttgggt 19883067  T
Q  369 ttttcccgattt 380  Q
    ||| ||||||||    
T  19883068 tttccccgattt 19883079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 417 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 39375289 - 39375160
Alignment:
Q  417 aacccgtcccaaatgtaaaaaa-ttactttatgttgatatgtatgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatga 515  Q
    |||||||||||| || |||||| |||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||   |||| |||||||||| || | ||||||||| ||    
T  39375289 aacccgtcccaattgcaaaaaaattactttacgttgatgtc-atgttattttgtttgataattgccgtgtt-ataaaaactaccactaatatttaaagga 39375192  T
Q  516 tcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaa 547  Q
     ||||||||| | ||  || ||||||||||||    
T  39375191 acaactaaataaatcaatcgaacaaatgttaa 39375160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 271 - 392
Target Start/End: Original strand, 21956728 - 21956850
Alignment:
Q  271 gcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggttt 370  Q
    ||||| ||||||||| ||||||  ||| || || |||||||||||   ||||| || | ||||||||||||| ||| ||||||| |||| || |||||||    
T  21956728 gcatgacaacaaaacccataccaacgggtacccgcccgaaccaaatcaaatttgacaggtttttcccattttaattggatttgggtatgagtttgggttt 21956827  T
Q  371 ttcccga-tttcaaacacgggta 392  Q
    || |||| ||| |||||||||||    
T  21956828 tttccgattttaaaacacgggta 21956850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 269 - 323
Target Start/End: Original strand, 47239316 - 47239370
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaattt 323  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||| |||||    
T  47239316 aggcatggcaacaaaactcatactcgcggttatccgtccaaaccaaactcaattt 47239370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 271 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 44887725 - 44887680
Alignment:
Q  271 gcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaac 316  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  44887725 gcatgacaacaaaactcatacccacggttatccgcccgaaccaaac 44887680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 421 - 457
Target Start/End: Original strand, 53906393 - 53906429
Alignment:
Q  421 cgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt 457  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  53906393 cgtcccaaatgtaaaaaattacttcatgttgatatgt 53906429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 269 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 42299971 - 42299856
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    ||||||| |||||||| |||||   ||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||| ||||| ||  ||||| |   ||| | ||||||||||| |    
T  42299971 aggcatgacaacaaaattcatatatgcggttacccatccgaaccaaactcaatttgacgggttttttccggtttgactgagtttaggtatgggtatggat 42299872  T
Q  369 ttttcccgatttcaaa 384  Q
    ||| ||||||||||||    
T  42299871 tttccccgatttcaaa 42299856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 517 - 559
Target Start/End: Original strand, 13015557 - 13015599
Alignment:
Q  517 caactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  13015557 caactaaattattcggtctaacagatgttaaagtgaacatatt 13015599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 458 - 548
Target Start/End: Original strand, 29755456 - 29755545
Alignment:
Q  458 atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaa 548  Q
    |||||||||||||||||||||    ||||| |||| |||| ||||||||||||||  |  |||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  29755456 atgttattttgtttgataattaccgtgtta-taaacactaccattgatatttaaagaagtaactaaatcaatcgatctaacaaatgttaaa 29755545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 269 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 36919306 - 36919240
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttc 335  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||  || |||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  36919306 aggcatgacaacaaaactcatactcgcgggtacgcatccgaaccaaactcaatttgacgggtttttc 36919240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 269 - 346
Target Start/End: Original strand, 3909014 - 3909091
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgatt 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||| | |   |||| | ||||||| ||||||||||||    
T  3909014 aggcatggcaacaaaactcatacccacggttacctgcccgaacccaccccgatttgatggattttccccattttgatt 3909091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 269 - 302
Target Start/End: Original strand, 13015218 - 13015251
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatc 302  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13015218 aggcacggcaacaaaactcatacccgcggttatc 13015251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 308 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 25941282 - 25941197
Alignment:
Q  308 gaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggtttttcccgatttc-aaacacgggta 392  Q
    |||| ||||| ||||||| || |||| |||| ||||||| | |||||  ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25941282 gaactaaactcaatttaatgggttttccccactttgatttggtttgggcatgtgtttgggtttttcccgatttcaaaacacgggta 25941197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 269 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 46058329 - 46058280
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaactt 318  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  46058329 aggcatgccaacaaaactcgtacccacatttatccacccgaaccaaactt 46058280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 269 - 346
Target Start/End: Original strand, 50375833 - 50375909
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgatt 346  Q
    ||||||| ||||||||| |||| |||||| || || ||||||||||||| ||||  |||||||||||||  |||||||    
T  50375833 aggcatgacaacaaaac-cataaccgcgggtaaccgcccgaaccaaactcaattcgacggatttttcccgctttgatt 50375909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 320 - 384
Target Start/End: Original strand, 1866512 - 1866576
Alignment:
Q  320 atttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggtttttcccgatttcaaa 384  Q
    |||| ||||||||| |||  ||||| ||| | ||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1866512 atttgacggattttccccgatttgactaggtctgggtatgagtatgggtttttcccgatttcaaa 1866576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 296 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 39375434 - 39375346
Alignment:
Q  296 ggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggtttttcccgatttcaaa 384  Q
    ||||| || ||||||||||| | ||||| |||| ||||||| ||||||| |   |||||||||| || ||| |||| ||||||||||||    
T  39375434 ggttacccgcccgaaccaaattcaatttgacgggtttttcctattttgactgagtttggatatgagtttggcttttccccgatttcaaa 39375346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 340 - 380
Target Start/End: Original strand, 47239368 - 47239408
Alignment:
Q  340 tttgattagatttggatatgggtatgggtttttcccgattt 380  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  47239368 tttgattggatttggatatgggtatggattttttccgattt 47239408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 108; Significance: 6e-54; HSPs: 43)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 269 - 552
Target Start/End: Original strand, 10187991 - 10188292
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||  ||||| |||| |||| ||| |||||| | | ||||| |||||||||||||    
T  10187991 aggcatggcaacaaaacccatacccgtggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggt 10188090  T
Q  369 ttttcccgatttcaaa-cacgggta----acggatatatagatacccactctgaacccgt------------cccaaatgtaaaaaattactttatgttg 451  Q
    ||| |||||| ||||| ||||||||    |||| ||||||| ||||||| | |||||| |            |||||||||||||||||| |||||||||    
T  10188091 tttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaacccatcccaaatgtaaaaaattattttatgttg 10188190  T
Q  452 atatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagt 550  Q
    |||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  10188191 atatattatgttattttgttcgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtgaaagt 10188290  T
Q  551 ga 552  Q
    ||    
T  10188291 ga 10188292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 269 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 27534861 - 27534546
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||  |||||||||||| ||||| |||| |||| ||| |||||||| | ||||| |||||||||| ||    
T  27534861 aggcatggcaacaaaacccatacccgtggttaaccgtccgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtatgagt 27534762  T
Q  369 ttttcccgatttc-aaacacgggta-----------acggatatatagatacccactctgaa------------cccgtcccaaatgtaaaaaattactt 444  Q
    ||| |||||| || |||||||||||           |||| ||||||| ||||||| | |||            |||||||||||||||||||| |||||    
T  27534761 tttccccgatctcgaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaatccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaactactt 27534662  T
Q  445 tatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaactaaatcattccgtctaacaaatg 543  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  27534661 tatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaagaatcaactaaataattttgtctaacaaatg 27534562  T
Q  544 ttaaagtgaacatatt 559  Q
    | ||||||||| ||||    
T  27534561 tgaaagtgaacttatt 27534546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 417 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 32853849 - 32853713
Alignment:
Q  417 aacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatga 515  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32853849 aacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgccatgttaataaaaactaccattgatatttaaatga 32853750  T
Q  516 tcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtga 552  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  32853749 tcaactaaatcattttgtctaacaaatgtgaaagtga 32853713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 417 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 2367331 - 2367195
Alignment:
Q  417 aacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatga 515  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  2367331 aacccgtcccaaatggaaaaaattactttatgtggatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaagga 2367232  T
Q  516 tcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtga 552  Q
    | ||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  2367231 taaactaaatcattttgtctaacaaatgttaaagtga 2367195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 417 - 552
Target Start/End: Original strand, 10142601 - 10142737
Alignment:
Q  417 aacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatga 515  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  10142601 aacctgtcccaaatgtaaaaaattattttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaagga 10142700  T
Q  516 tcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtga 552  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  10142701 tcaactaaatcattttgtctaacaaatgtgaaagtga 10142737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 417 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 14032561 - 14032419
Alignment:
Q  417 aacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatga 515  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  14032561 aacccgtcccaaatgcataaaattactttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattgttgtgtta-taaaaactatcattgatatttaaagga 14032463  T
Q  516 tcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
     ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14032462 gcaactaaatcaatcggtctaacaaatgttaaagtgagcatatt 14032419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 417 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 24225703 - 24225569
Alignment:
Q  417 aacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatga 515  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  24225703 aacccgtcccaaatgtaaaaaattattttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaagga 24225604  T
Q  516 tcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagt 550  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||||| |||||    
T  24225603 tcaactaaataattttgtctaacaaatgtgaaagt 24225569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 417 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 12141390 - 12141254
Alignment:
Q  417 aacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatga 515  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  12141390 aacccgtcccaaatgtaaaaaattattttatgttgatacgttatgttattttgtttgataattgtcatcttaataaaaactaacattgatatttaaagga 12141291  T
Q  516 tcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtga 552  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  12141290 tcaactaaatcattttgtctaacaaatgtgaaagtga 12141254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 273 - 552
Target Start/End: Original strand, 5863298 - 5863602
Alignment:
Q  273 atggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggttttt 372  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| |  ||||||||||||  ||||| |||| |||| ||| |||||| | | ||||| ||||||||||||||||     
T  5863298 atggcaacaaaacccatacccgtggttacctgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttc 5863397  T
Q  373 cccgatttcaaac------------acgggtaacggatatatagatacccactctgaaccc------------gtcccaaatgtaaaaaattactttatg 448  Q
    ||||||||||||             ||||||||||| |||||||||||||||   ||||||            ||||||||||||||||| || ||||||    
T  5863398 cccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatatagatacccacctcgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaaatattttatg 5863497  T
Q  449 ttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaa 547  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||| ||    
T  5863498 ttgatatgttatgttattttgtttgataattatcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaaaaaatgtgaa 5863597  T
Q  548 agtga 552  Q
    |||||    
T  5863598 agtga 5863602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 417 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 27738777 - 27738664
Alignment:
Q  417 aacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatga 515  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  27738777 aacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgttatgttattttgtatgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaagga 27738678  T
Q  516 tcaactaaatcatt 529  Q
     |||||||||||||    
T  27738677 gcaactaaatcatt 27738664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 417 - 552
Target Start/End: Original strand, 3484006 - 3484142
Alignment:
Q  417 aacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatga 515  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  3484006 aacccgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgttattttgtttcataattgtcatcttaataaaaactaccattgatatttaaagga 3484105  T
Q  516 tcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtga 552  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||    
T  3484106 tcaactaaataattttgtctaacaaatgtgaaagtga 3484142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 417 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 12309577 - 12309441
Alignment:
Q  417 aacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatga 515  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||       ||||||||||||||||||| |     
T  12309577 aacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattgtcatatt-------actatcattgatatttaaaggg 12309485  T
Q  516 tcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
     ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12309484 gcaattaaatcatttcgtctaacaaatgttaaagtaaacatatt 12309441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 417 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 14506091 - 14505949
Alignment:
Q  417 aacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatga 515  Q
    ||||||||||||||| | |||| |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||| ||| ||    
T  14506091 aacccgtcccaaatgcagaaaactactttgtgttgatatgtcacgttattttgtttgataattgtcgtgtta-taaaaactaacattgatattgaaagga 14505993  T
Q  516 tcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
     ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14505992 gcaactaaatcaatcagtctaacaaatgttaaagtgagcatatt 14505949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 428 - 559
Target Start/End: Original strand, 24602950 - 24603081
Alignment:
Q  428 aatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaactaaatc 526  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  24602950 aatgtagaaaattactttatgttgatgtgccatgttattttgtttgataattgacgtgtta-taaaaactaccattgatatttaaaggaacaactaaatc 24603048  T
Q  527 attccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
    | || ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24603049 aatcggtctaacaaatgttaaagtgagcatatt 24603081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 421 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 14254959 - 14254821
Alignment:
Q  421 cgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaa 519  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| || | |    
T  14254959 cgtcccaaatgcaaataataactttatgttgatatgtcatgttattttgtttgaaatttgatgtgtta-taaaaactatcattgatatttaaaggagcga 14254861  T
Q  520 ctaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
     |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  14254860 ttaaatcattcggtctaataaatgttaaagtcaacatatt 14254821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 417 - 559
Target Start/End: Original strand, 12678177 - 12678318
Alignment:
Q  417 aacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatga 515  Q
    |||||||||| |||  | ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||    
T  12678177 aacccgtcccgaattgagaaaattattttatattgatatgtcatgttattttgtttgataattgtcgtgtta-taaaaattatcattgatatttaaagga 12678275  T
Q  516 tcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
     ||||||||||| || |||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  12678276 gcaactaaatcaatcggtctaataaa-gttaaagtgagcatatt 12678318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 433 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 30816246 - 30816120
Alignment:
Q  433 aaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaactaaatcattcc 531  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||   ||||| ||||||||| |||||| ||||||| || || |||||||| ||     
T  30816246 aaaaaactactttatgttgatatgtgatgttattttgttggataattgccgtgtta-taaaaactaccattgacatttaaaggagcacctaaatcaatcg 30816148  T
Q  532 gtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||    
T  30816147 gtctaacaaatgttaaagtgtacatatt 30816120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 417 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 32053093 - 32053000
Alignment:
Q  417 aacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatattt 509  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  || ||||||||    
T  32053093 aacccgtccaaaatgtaaaaaaatactttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattatcatgttaataaaaacttacaatgatattt 32053000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 482 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 32532503 - 32532426
Alignment:
Q  482 atgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32532503 atgttaataaaaactaccaatgatatttaaaggaccaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgagcatatt 32532426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 459 - 559
Target Start/End: Original strand, 14410959 - 14411058
Alignment:
Q  459 tgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatat 558  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||    
T  14410959 tgttattttgtttgataattgtcgtgtta-taaaaaccatcattgatatttaaaggagaaactaaatcaatcggtctaacaaatgttaaagtgagcatat 14411057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 461 - 559
Target Start/End: Original strand, 7394015 - 7394112
Alignment:
Q  461 ttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
    ||||||||||||||||||    ||||| ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7394015 ttattttgtttgataattaccgtgtta-taaaaactaacattgatatttaaaggaacaactaaatcaatcggtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 7394112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 458 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 14245210 - 14245110
Alignment:
Q  458 atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacata 557  Q
    |||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||| |||| ||||||||| || | |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  14245210 atgttattttgtttgaaaattgtcgtgtta-taaaaactaccattaatatttaaaggagcgactaaatcattcggtctaataaatgttaaagtgaacata 14245112  T
Q  558 tt 559  Q
    ||    
T  14245111 tt 14245110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 269 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 30986430 - 30986306
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| |||| |||| ||| |||||| |   ||||| |||||||||||||    
T  30986430 aggcatggcaacaaaacccatacccgtggttacccgcccgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgactgagtttgggtatgggtatgggt 30986331  T
Q  369 ttttcccgatttc-aaacacgggta 392  Q
    ||| |||||| || |||||||||||    
T  30986330 tttccccgatctcaaaacacgggta 30986306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 417 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 11762450 - 11762342
Alignment:
Q  417 aacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatg-tatgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatga 515  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||  |||| |||||||||| |||||||||||| | ||    
T  11762450 aacccatcccaaatgtagaaaattactttatgttgatatgccatgttattttgttatataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttatagga 11762352  T
Q  516 tcaactaaat 525  Q
     |||||||||    
T  11762351 gcaactaaat 11762342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 269 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 2367503 - 2367388
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||  |||||||||||  ||||| | || |||||||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||    
T  2367503 aggcatggcaacaaaacccatatccgtggttacccgtccgaaccaaacccaatttgatgggtttttcccgttttgactaggtttgggtatgggtatgggt 2367404  T
Q  369 ttttcccgatttcaaa 384  Q
    ||| |||||| |||||    
T  2367403 tttccccgatctcaaa 2367388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 272 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 32854018 - 32853906
Alignment:
Q  272 catggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggtttt 371  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||  ||||| |||| ||||  || |||||| | | ||||| ||||||||||||||||    
T  32854018 catggcaacaaaacccatacccgtggttatccgaccgaaccaaacccaatttgacgggttttctccgttttgactgggtttggttatgggtatgggtttt 32853919  T
Q  372 tcccgatttcaaa 384  Q
     |||||| |||||    
T  32853918 ccccgatctcaaa 32853906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 269 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 31496611 - 31496502
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||  || ||||||||| ||||| |||| |||| ||| |||||| | | ||||| |||||||||| ||    
T  31496611 aggcatggcaacaaaacccatacccgtggttacccgtccaaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgagt 31496512  T
Q  369 ttttcccgat 378  Q
    ||| ||||||    
T  31496511 tttccccgat 31496502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 269 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 31501997 - 31501888
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||  || ||||||||| ||||| |||| |||| ||| |||||| | | ||||| |||||||||| ||    
T  31501997 aggcatggcaacaaaacccatacccgtggttacccgtccaaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgagt 31501898  T
Q  369 ttttcccgat 378  Q
    ||| ||||||    
T  31501897 tttccccgat 31501888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 490 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 32052988 - 32052927
Alignment:
Q  490 aaaaactatcattgatatttaaatgatcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtg 551  Q
    |||||||  |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32052988 aaaaacttacattgatatttaaaggattaaataaatcattccgtctaacaaatgttaaagtg 32052927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 269 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 15498501 - 15498377
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    |||||| |||||||||  ||||| | ||||||||| |||||| |||||  |||||||||| ||||  || |||||| | | ||||| ||||| |||||||    
T  15498501 aggcattgcaacaaaatccatactcacggttatccgcccgaatcaaacccaatttaacgggttttctccgttttgaatgggtttgggtatggatatgggt 15498402  T
Q  369 ttttcccgatttc-aaacacgggta 392  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||    
T  15498401 tttccccgatttcaaaacacgggta 15498377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 269 - 384
Target Start/End: Original strand, 10142429 - 10142544
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | |||||||| | ||||||||||| |||||  ||| |||| | | |||||| | | ||||| |||||||||||||    
T  10142429 aggcatggcaacaaaacccatacttgtggttatccgctcgaaccaaactcaatttggcgggttttcctcgttttgactgggtttgggtatgggtatgggt 10142528  T
Q  369 ttttcccgatttcaaa 384  Q
    ||| |||||| |||||    
T  10142529 tttccccgatctcaaa 10142544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 418 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 32532544 - 32532505
Alignment:
Q  418 acccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt 457  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32532544 acccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt 32532505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 269 - 378
Target Start/End: Original strand, 3483834 - 3483943
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |  ||||| || ||||||||||||  ||||| |||| |||| ||| |||||| | | ||||| |||| ||||||||    
T  3483834 aggcatggcaacaaaacccatactcatggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgtgtatgggt 3483933  T
Q  369 ttttcccgat 378  Q
    ||| ||||||    
T  3483934 tttccccgat 3483943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 305 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 9442570 - 9442483
Alignment:
Q  305 cccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggtttttcccgatttc-aaacacgggta 392  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| |||| ||| |||||| | | ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  9442570 cccgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgactgg-tttgggtatgggtatgggattttcccgatttcaaaacacgggta 9442483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 269 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 12141562 - 12141447
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    ||||||||||||||||| ||||||   ||||| || ||||||||||| | ||||| |||| |||| ||| |||||| | | ||||| || ||||||||||    
T  12141562 aggcatggcaacaaaacccatacctatggttacccgcccgaaccaaattcaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtacgggtatgggt 12141463  T
Q  369 ttttcccgatttcaaa 384  Q
    ||| ||| || |||||    
T  12141462 tttccccaatctcaaa 12141447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 269 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 14506251 - 14506176
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttga 344  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||| ||||| |||| |||| ||||||||||    
T  14506251 aggcatgacaataaaactcatacccgtggttaaccatccgaacgaaactcaatttgacgggttttccccattttga 14506176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 277 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 27738941 - 27738834
Alignment:
Q  277 caacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggtttttcccg 376  Q
    ||||||| | ||||| |||||||| |  ||||||||||| | ||||| | || |||||||| |||||| | | ||| | |||||||||||||||| ||||    
T  27738941 caacaaaccccatactcgcggttacctgcccgaaccaaattcaatttgatgggtttttcccgttttgactgggtttaggtatgggtatgggttttccccg 27738842  T
Q  377 atttcaaa 384  Q
    ||||||||    
T  27738841 atttcaaa 27738834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 269 - 354
Target Start/End: Original strand, 8320719 - 8320803
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttgg 354  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||| |||||| |||||||| ||||||||| |||  ||||| ||| |||||    
T  8320719 aggcatggcaaccaaactcatacccgcgg-tacacacccaaaccaatcttaatttgacggattttccccgctttgactaggtttgg 8320803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 269 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 12309755 - 12309656
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||||||||| || ||||||||| ||  ||||| |||  |||| |||||||||| | | ||||| | |||||||||||    
T  12309755 aggcatgacaacaaaccccatacccgcggttacccgcccgaaccagacccaatttgacgagttttccccattttgactgggtttgggtttgggtatgggt 12309656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 269 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 24225881 - 24225782
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  ||||| ||  |||||||||| | ||||| || | |||| ||| |||||||| | ||||| | |||||||||||    
T  24225881 aggcatgacaacaaaactcatacccatggttacccgtccgaaccaaattcaatttgacaggttttccccgttttgattgggtttgggtttgggtatgggt 24225782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 269 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 29341433 - 29341322
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||| ||  | | |||| |||||| ||||| | |  ||||  || |||||||| | |||||||||| || |||||    
T  29341433 aggcatggcaacaaaacccatatccgcgggtactcgctcgaatcaaactcaatttgatgagttttctccgttttgattgggtttggatatgagtttgggt 29341334  T
Q  369 ttttcccgattt 380  Q
    ||||||||||||    
T  29341333 ttttcccgattt 29341322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 306 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 30816398 - 30816313
Alignment:
Q  306 ccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggtttttcccgatttcaaacacgggta 392  Q
    |||||||||||  ||||| | ||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||| || | ||||||| |||| |||||||||||    
T  30816398 ccgaaccaaacccaatttgatggattttccccgttttgattgggtttggatatgggtttgag-ttttccccattttaaacacgggta 30816313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 269 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 32532717 - 32532593
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    ||||||| ||||||||  |||| | |||||||||| ||| || ||||   ||||| |||| ||||| || |||| ||| | ||||  |||| ||||||||    
T  32532717 aggcatgacaacaaaatccatatctgcggttatccgcccaaatcaaatccaatttgacgggttttttccgttttcattgggtttgagtatgagtatgggt 32532618  T
Q  369 ttttcccgatttc-aaacacgggta 392  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||    
T  32532617 tttccccgatttcaaaacacgggta 32532593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0189 (Bit Score: 105; Significance: 4e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0189
Description:

Target: scaffold0189; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 421 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 4259 - 4119
Alignment:
Q  421 cgtcccaaatgtaaaaaat-tactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatca 518  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  4259 cgtcccaaatgtaaaaaaaatactttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggagca 4160  T
Q  519 actaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4159 actaaatcattccatctaacaaatgttaaagtgaacatatt 4119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0519 (Bit Score: 100; Significance: 3e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0519
Description:

Target: scaffold0519; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 418 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 10301 - 10163
Alignment:
Q  418 acccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtatgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatc 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |   |  ||||||| ||||    
T  10301 acccgtcccaaatgtaaaaaattactttgtgttgatatgtatgttattttgtttgataattgtcatattaataaaaactacc---gtcatttaaaggatc 10205  T
Q  518 aactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10204 aactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 10163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0294 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0294
Description:

Target: scaffold0294; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 421 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 14776 - 14638
Alignment:
Q  421 cgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatg-tatgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaa 519  Q
    ||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || ||||  ||||||||| |||||||||||||| || |||    
T  14776 cgtcccaaatgtagaaaattatttaatgttgatatgatatattattttgtttgataattattgtgttg-taaaaactaccattgatatttaaaggagcaa 14678  T
Q  520 ctaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||| ||||||    
T  14677 ctaaatcaatcggtttaacaaatgttaaagtgagcatatt 14638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 65; Significance: 3e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 417 - 552
Target Start/End: Original strand, 197410 - 197545
Alignment:
Q  417 aacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatga 515  Q
    |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||    
T  197410 aacccgtcccgaatgcagaaaattactttatgttgatatgccatgttattttgtttgataattaccttgtta-taaaaactaccattgatatttaaagga 197508  T
Q  516 tcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtga 552  Q
     ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  197509 gcaactaaatcaatcggtctaacaaatattaaagtga 197545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 60; Significance: 3e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 421 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 33394 - 33256
Alignment:
Q  421 cgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaa 519  Q
    |||||| |||| | |||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||| || |||    
T  33394 cgtcccgaatgcagaaaactactttatgttgacatgccatgttattttgtttggtaattgttgtgtta-taaaaactacgattgatatttaaaggaacaa 33296  T
Q  520 ctaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
    |||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  33295 ctaaatcaatcggtctaacaattgttaaagtaaacatatt 33256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 269 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 33576 - 33475
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggt 368  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||| ||||| ||||| |||| ||||| ||||| |||| |||| ||| |||||||  | ||||| | |||||||||||    
T  33576 aggcatggcaacaaaacctatatccgtggttacccacctgaactaaactcaatttgacgggttttacccgttttgatcgggtttgggtttgggtatgggt 33477  T
Q  369 tt 370  Q
    ||    
T  33476 tt 33475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 60; Significance: 3e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 417 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 6411 - 6269
Alignment:
Q  417 aacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatga 515  Q
    |||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||  || || |||||| || |||||| ||||||| ||    
T  6411 aacccgtctcaaatgcagaaagttactttatgttgatatgccatgttattttgtttgatagttgtcgtgcta-taaaaattaccattgaaatttaaagga 6313  T
Q  516 tcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
     ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  6312 gcaactaaatcaatcgatctaacaaatgttaaagtgaacatatt 6269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095 (Bit Score: 54; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0095
Description:

Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 458 - 559
Target Start/End: Original strand, 32655 - 32755
Alignment:
Q  458 atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacata 557  Q
    |||| ||||||  ||||||| || ||| |||||||||||| || |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32655 atgtgattttgagtgataatggtcatggtaataaaaactaccagtgatatttaa-tgatcaattaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgagcata 32753  T
Q  558 tt 559  Q
    ||    
T  32754 tt 32755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 48; Significance: 4e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 488 - 559
Target Start/End: Original strand, 14299 - 14370
Alignment:
Q  488 ataaaaactatcattgatatttaaatgatcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14299 ataaaaactaccattgatatttaaaggaacaattaaatcaatcggtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 14370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 272 - 392
Target Start/End: Original strand, 14098 - 14218
Alignment:
Q  272 catggcaacaaaactcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggtatgggtttt 371  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||  ||||| |||| |||||||| ||||| || | ||||| |||| || || |||||    
T  14098 catgacaacaaaactcatactcgtggttacccacccaaaccaaacccaatttgacgggtttttcccgttttgtttgggtttgggtatgagtttgagtttt 14197  T
Q  372 tcccgatttcaaacacgggta 392  Q
     |||||||| |||||||||||    
T  14198 ccccgatttaaaacacgggta 14218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 435 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 90584 - 90467
Alignment:
Q  435 aaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaactaaatcattccgt 533  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||| | | |||||||||||||| || ||| ||||||| || ||    
T  90584 aaaattattttatgttgatatgccatgttattttgtttaataattgatgtgttattaaaa-caaccattgatatttaaaggagcaaataaatcaatcggt 90486  T
Q  534 ctaacaaatgttaaagtga 552  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  90485 ctaacaaatattaaagtga 90467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 269 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 90769 - 90675
Alignment:
Q  269 aggcatggcaacaaaa-ctcatacccgcggttatccacccgaaccaaacttaatttaacggatttttcccattttgattagatttggatatgggt 362  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||| ||||| || ||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||| |||||| | | ||||| |||||||    
T  90769 aggcatggcaaaaaaaactcatacccgtggttacccgcccgaactaaactcaatttgacggattttccccgttttgactgggtttgggtatgggt 90675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0135 (Bit Score: 46; Significance: 6e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0135
Description:

Target: scaffold0135; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 458 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 36121 - 36018
Alignment:
Q  458 atgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgat--caactaaatcattccgtctaacaaatgtt-aaagtgaac 554  Q
    ||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||   ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  36121 atgttattttgtttgataactgtcgtgtta-taaaaactaccattgatatttaaaggaaagcaactaaatcaatcggtctaacaaatgttaaaagtgaac 36023  T
Q  555 atatt 559  Q
    |||||    
T  36022 atatt 36018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1630 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1630
Description:

Target: scaffold1630; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 499 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 1545 - 1492
Alignment:
Q  499 cattgatatttaaatgatcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtga 552  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  1545 cattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtgaaagtga 1492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0097 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0097
Description:

Target: scaffold0097; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 417 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 33592 - 33446
Alignment:
Q  417 aacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattt---tg-tttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaa 511  Q
    |||||||| |||||| | |||| ||||||||| |||||||  |||||||||   || |||||||||| |  ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  33592 aacccgtcacaaatgcagaaaactactttatgatgatatgccatgttatttatttgatttgataattttcgtgtta-taaaaactaccattgatatttaa 33494  T
Q  512 atgatcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
    |  | ||| ||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||    
T  33493 agaagcaattaaatcagtcggtgtaacaaatattaaagtgaacatatt 33446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0902 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0902
Description:

Target: scaffold0902; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 470 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 836 - 748
Alignment:
Q  470 ttgataattgttatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgatcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 559  Q
    |||||| |||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||||  | |||| |||||||||  || || |||||||| ||||||||||||    
T  836 ttgatatttgtcatgtta-taaaacctaccattgatatttaaagtagcaaccaaatcattcgatcaaagaaatgttatagtgaacatatt 748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University