View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF21416_low_11 (Length: 301)

Name: NF21416_low_11
Description: NF21416
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF21416_low_11
NF21416_low_11
[»] chr2 (29 HSPs)
chr2 (15-301)||(4412881-4413167)
chr2 (15-301)||(41867723-41868009)
chr2 (17-301)||(9685232-9685516)
chr2 (16-301)||(17344644-17344929)
chr2 (16-285)||(18744770-18745039)
chr2 (17-271)||(19161600-19161854)
chr2 (17-289)||(23484755-23485026)
chr2 (16-301)||(28225006-28225291)
chr2 (20-300)||(20142560-20142825)
chr2 (16-301)||(27502368-27502652)
chr2 (16-301)||(44686422-44686709)
chr2 (26-301)||(5532426-5532700)
chr2 (17-301)||(3825732-3826017)
chr2 (55-301)||(2888522-2888764)
chr2 (184-301)||(34814803-34814919)
chr2 (16-205)||(9674946-9675135)
chr2 (17-147)||(13146951-13147081)
chr2 (18-263)||(16351657-16351904)
chr2 (190-301)||(13147087-13147201)
chr2 (18-140)||(10579597-10579719)
chr2 (55-256)||(44720374-44720573)
chr2 (182-300)||(29808082-29808199)
chr2 (170-255)||(5679330-5679415)
chr2 (71-297)||(33612417-33612644)
chr2 (91-301)||(7760737-7760946)
chr2 (181-251)||(1296031-1296101)
chr2 (193-263)||(3968402-3968472)
chr2 (144-288)||(2886563-2886703)
chr2 (208-301)||(11921218-11921311)
[»] chr7 (35 HSPs)
chr7 (22-301)||(19277299-19277578)
chr7 (18-301)||(4501265-4501547)
chr7 (19-301)||(982955-983237)
chr7 (15-269)||(3676677-3676932)
chr7 (71-300)||(21326709-21326938)
chr7 (20-301)||(24527595-24527877)
chr7 (16-301)||(28517103-28517388)
chr7 (17-288)||(45613659-45613930)
chr7 (17-301)||(5825279-5825561)
chr7 (32-301)||(43856880-43857149)
chr7 (54-301)||(27521477-27521722)
chr7 (99-301)||(22197992-22198194)
chr7 (99-301)||(22239627-22239829)
chr7 (97-301)||(32584607-32584811)
chr7 (166-301)||(30216024-30216159)
chr7 (18-301)||(47679131-47679414)
chr7 (37-301)||(10905124-10905373)
chr7 (137-263)||(25186873-25186999)
chr7 (182-301)||(42295166-42295285)
chr7 (159-301)||(9281091-9281232)
chr7 (159-301)||(9292062-9292203)
chr7 (196-301)||(40726476-40726581)
chr7 (107-301)||(34772788-34772979)
chr7 (228-288)||(48539200-48539260)
chr7 (70-294)||(38839337-38839563)
chr7 (180-301)||(2904371-2904492)
chr7 (102-226)||(33202368-33202491)
chr7 (158-240)||(1249653-1249735)
chr7 (22-123)||(38596639-38596740)
chr7 (230-301)||(6634993-6635064)
chr7 (193-285)||(34067855-34067946)
chr7 (115-255)||(43383221-43383361)
chr7 (247-287)||(45424755-45424795)
chr7 (193-268)||(7637505-7637579)
chr7 (189-250)||(26770454-26770515)
[»] chr1 (29 HSPs)
chr1 (17-301)||(28040944-28041228)
chr1 (16-288)||(19035466-19035738)
chr1 (16-301)||(29169610-29169894)
chr1 (40-301)||(45659487-45659749)
chr1 (18-301)||(34644572-34644855)
chr1 (69-301)||(20259667-20259898)
chr1 (15-301)||(22346901-22347169)
chr1 (18-301)||(4861807-4862090)
chr1 (17-301)||(2898708-2898976)
chr1 (133-282)||(31737256-31737405)
chr1 (22-301)||(42919866-42920144)
chr1 (41-301)||(25375674-25375934)
chr1 (100-301)||(2764485-2764686)
chr1 (20-297)||(37932038-37932314)
chr1 (189-301)||(21473009-21473121)
chr1 (41-255)||(50161258-50161472)
chr1 (20-261)||(37200028-37200267)
chr1 (212-301)||(38731615-38731704)
chr1 (158-301)||(16500040-16500183)
chr1 (20-137)||(38731750-38731867)
chr1 (181-297)||(50314605-50314721)
chr1 (169-255)||(23043929-23044015)
chr1 (34-101)||(22375471-22375538)
chr1 (193-250)||(35387653-35387710)
chr1 (193-269)||(36486924-36487000)
chr1 (229-301)||(24177540-24177612)
chr1 (193-288)||(15584894-15584988)
chr1 (16-113)||(35387133-35387230)
chr1 (228-301)||(43831604-43831677)
[»] chr3 (32 HSPs)
chr3 (18-301)||(53785715-53785998)
chr3 (16-301)||(44198773-44199058)
chr3 (18-301)||(52741329-52741613)
chr3 (18-301)||(39583047-39583330)
chr3 (19-301)||(49017969-49018251)
chr3 (22-301)||(13582516-13582796)
chr3 (16-301)||(7900864-7901143)
chr3 (51-301)||(37132851-37133100)
chr3 (66-301)||(54508251-54508485)
chr3 (61-301)||(7501872-7502113)
chr3 (18-294)||(38146069-38146349)
chr3 (160-301)||(26772764-26772905)
chr3 (18-301)||(37992338-37992621)
chr3 (66-297)||(5338653-5338888)
chr3 (18-156)||(29861948-29862086)
chr3 (142-301)||(3443254-3443413)
chr3 (65-298)||(46940634-46940868)
chr3 (193-301)||(26856755-26856863)
chr3 (201-301)||(32546801-32546901)
chr3 (143-301)||(25325035-25325195)
chr3 (109-301)||(51234622-51234801)
chr3 (159-287)||(4473081-4473209)
chr3 (207-269)||(38670887-38670949)
chr3 (155-301)||(38978754-38978900)
chr3 (212-270)||(52411903-52411961)
chr3 (100-259)||(35236249-35236413)
chr3 (18-149)||(52411720-52411851)
chr3 (208-301)||(21552674-21552766)
chr3 (20-297)||(43123155-43123431)
chr3 (135-301)||(3376675-3376842)
chr3 (191-241)||(45676778-45676828)
chr3 (179-263)||(13772493-13772577)
[»] chr4 (38 HSPs)
chr4 (15-284)||(30940554-30940822)
chr4 (16-269)||(50000741-50000995)
chr4 (16-287)||(31847107-31847378)
chr4 (15-301)||(12918187-12918473)
chr4 (17-301)||(53170519-53170791)
chr4 (51-301)||(53619592-53619842)
chr4 (18-297)||(132395-132676)
chr4 (18-301)||(26521494-26521777)
chr4 (18-300)||(25504302-25504582)
chr4 (16-270)||(16957579-16957827)
chr4 (19-301)||(56461926-56462207)
chr4 (22-294)||(12053426-12053696)
chr4 (41-282)||(55933303-55933544)
chr4 (15-179)||(3330078-3330242)
chr4 (135-301)||(50462881-50463047)
chr4 (159-301)||(600651-600793)
chr4 (90-301)||(34107583-34107797)
chr4 (18-147)||(25706669-25706798)
chr4 (183-263)||(23255748-23255828)
chr4 (215-301)||(50483211-50483297)
chr4 (129-269)||(45385990-45386130)
chr4 (158-301)||(48656868-48657012)
chr4 (18-269)||(6865631-6865889)
chr4 (85-233)||(1041386-1041533)
chr4 (219-301)||(7536590-7536672)
chr4 (34-122)||(18534585-18534673)
chr4 (55-146)||(38535441-38535532)
chr4 (125-301)||(46391240-46391415)
chr4 (228-301)||(3330002-3330075)
chr4 (191-287)||(46440880-46440976)
chr4 (199-256)||(34536931-34536988)
chr4 (70-107)||(53098606-53098643)
chr4 (45-149)||(9815706-9815809)
chr4 (238-294)||(38535607-38535663)
chr4 (177-269)||(43849325-43849417)
chr4 (199-300)||(28739912-28740014)
chr4 (88-149)||(54927614-54927675)
chr4 (207-263)||(45760841-45760897)
[»] chr8 (29 HSPs)
chr8 (17-301)||(24125034-24125318)
chr8 (18-280)||(500254-500516)
chr8 (16-288)||(39434686-39434958)
chr8 (16-301)||(35739803-35740087)
chr8 (18-298)||(25021632-25021912)
chr8 (35-238)||(37517163-37517366)
chr8 (68-301)||(3187975-3188208)
chr8 (74-301)||(38815300-38815517)
chr8 (128-301)||(6592581-6592753)
chr8 (182-296)||(8882339-8882452)
chr8 (70-261)||(8619860-8620045)
chr8 (208-300)||(6618291-6618383)
chr8 (20-269)||(42921947-42922196)
chr8 (180-298)||(28196201-28196319)
chr8 (71-288)||(10189562-10189779)
chr8 (28-147)||(11611076-11611195)
chr8 (158-298)||(36004131-36004271)
chr8 (18-269)||(8115849-8116100)
chr8 (230-301)||(37514227-37514298)
chr8 (179-269)||(4073573-4073663)
chr8 (182-240)||(22589336-22589394)
chr8 (18-146)||(39671005-39671132)
chr8 (50-146)||(40839713-40839808)
chr8 (118-301)||(4699876-4700057)
chr8 (199-300)||(39671170-39671272)
chr8 (117-173)||(8882802-8882858)
chr8 (137-226)||(6792257-6792345)
chr8 (184-300)||(166166-166282)
chr8 (184-240)||(40839627-40839683)
[»] chr5 (31 HSPs)
chr5 (25-301)||(32269622-32269898)
chr5 (16-301)||(35310454-35310739)
chr5 (16-301)||(27336699-27336984)
chr5 (21-301)||(33691877-33692156)
chr5 (16-301)||(13166726-13167011)
chr5 (16-288)||(26212398-26212671)
chr5 (16-261)||(15291842-15292087)
chr5 (74-301)||(14423688-14423912)
chr5 (17-301)||(43129540-43129823)
chr5 (16-278)||(3113981-3114241)
chr5 (30-301)||(34335343-34335614)
chr5 (19-226)||(433373-433580)
chr5 (158-301)||(37873596-37873739)
chr5 (71-300)||(35455963-35456192)
chr5 (18-204)||(38446267-38446455)
chr5 (20-147)||(9841146-9841274)
chr5 (159-301)||(42921703-42921845)
chr5 (177-301)||(25663009-25663133)
chr5 (125-301)||(8100558-8100734)
chr5 (125-301)||(43115383-43115558)
chr5 (125-253)||(32230432-32230560)
chr5 (99-254)||(8858969-8859124)
chr5 (179-301)||(38875644-38875766)
chr5 (126-255)||(9829280-9829407)
chr5 (223-269)||(430640-430686)
chr5 (232-301)||(22188687-22188756)
chr5 (228-300)||(14723272-14723344)
chr5 (68-147)||(27355584-27355663)
chr5 (192-295)||(7716193-7716294)
chr5 (199-282)||(14436525-14436605)
chr5 (193-297)||(13307366-13307470)
[»] scaffold1768 (1 HSPs)
scaffold1768 (18-301)||(2-285)
[»] chr6 (21 HSPs)
chr6 (20-301)||(45489-45778)
chr6 (19-301)||(4206415-4206697)
chr6 (18-301)||(34304502-34304785)
chr6 (41-301)||(33220552-33220812)
chr6 (54-301)||(959586-959833)
chr6 (18-220)||(32115776-32115978)
chr6 (18-249)||(357535-357766)
chr6 (16-254)||(12401384-12401622)
chr6 (20-301)||(29337903-29338180)
chr6 (97-301)||(17249202-17249406)
chr6 (54-270)||(28543412-28543628)
chr6 (76-285)||(34415458-34415667)
chr6 (197-301)||(4165919-4166023)
chr6 (158-262)||(34168913-34169017)
chr6 (116-269)||(28008903-28009059)
chr6 (18-210)||(20693419-20693610)
chr6 (175-301)||(28625936-28626063)
chr6 (92-287)||(34554169-34554364)
chr6 (92-296)||(24016348-24016551)
chr6 (182-285)||(3714939-3715042)
chr6 (189-269)||(6225110-6225190)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (16-301)||(33256-33541)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (98-301)||(6340-6542)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (138-301)||(103112-103274)
[»] scaffold0186 (2 HSPs)
scaffold0186 (124-301)||(10366-10547)
scaffold0186 (20-112)||(19916-20008)
[»] scaffold0224 (1 HSPs)
scaffold0224 (22-301)||(18187-18465)
[»] scaffold0110 (1 HSPs)
scaffold0110 (37-279)||(47376-47618)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (99-285)||(49433-49622)
[»] scaffold0470 (1 HSPs)
scaffold0470 (208-300)||(7609-7701)
[»] scaffold0119 (1 HSPs)
scaffold0119 (134-250)||(16191-16307)
[»] scaffold0493 (1 HSPs)
scaffold0493 (91-293)||(8407-8609)
[»] scaffold0514 (1 HSPs)
scaffold0514 (137-226)||(4278-4366)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 29)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 15 - 301
Target Start/End: Original strand, 4412881 - 4413167
Alignment:
Q  15 acctgtgaacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgta 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4412881 acctgtgaacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgta 4412980  T
Q  115 gacttgactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatg 214  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4412981 gacttgactggggtttcaccacttgtgggattaagtgtcagaccttttaccgtaggacaggcaaccctaaaagctgtgtcaagcaaagtggccaaacatg 4413080  T
Q  215 agaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttgaccttc 301  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4413081 agaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacactttcggtttcctagcaccagagattgttgaccttc 4413167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 15 - 301
Target Start/End: Original strand, 41867723 - 41868009
Alignment:
Q  15 acctgtgaacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgta 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41867723 acctgtgaacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacagatgggtaggtggaaaacatgcttgtgta 41867822  T
Q  115 gacttgactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatg 214  Q
    |||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41867823 gacttgactgagatttcacgacttgtgggattaggtgtcggaccttttatcgtaggacaggcagccttaaaagctgcgtcaagcaaagtggtcaaacatg 41867922  T
Q  215 agaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttgaccttc 301  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||  |||||||||||    
T  41867923 agaaagcatgttctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacactttcgggttcctagcaccagaggctgttgaccttc 41868009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 17 - 301
Target Start/End: Original strand, 9685232 - 9685516
Alignment:
Q  17 ctgtgaacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtaga 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |  ||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9685232 ctgtgaacttcctgactgacccactagatagaaggtcaacactcaggcctgcaaacattatggtgtgcatatgggtaggtggaaaacatgattgtgtaga 9685331  T
Q  117 cttgactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgag 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||     
T  9685332 cttgactggggtttcaccacttgtgggattaggtgtcagaccttttaccgtaggataggcagccctaaaatccgcgtcaagcaaagtggccaaacatgaa 9685431  T
Q  217 aaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttgaccttc 301  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||  ||| |||||||    
T  9685432 aaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacacttttgattttctagcactagaggctgtggaccttc 9685516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 16 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 17344929 - 17344644
Alignment:
Q  16 cctgtgaacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtag 115  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  17344929 cctgtgaactttctgactgacccgctagaaagaagatcaacactcaggcatgcggatgttatggtgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtag 17344830  T
Q  116 acttgactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatga 215  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||    
T  17344829 acttgactggggtttcacaacttgtgggattaggtgtcagaccttttaccgtaggaaagccagtccttaaagctgcgtcaagtaaggtggccaaacacga 17344730  T
Q  216 gaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttgaccttc 301  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  17344729 gaaaacgtgttttcacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacactttcagtttcctagcaccataggctgttgaccttc 17344644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 16 - 285
Target Start/End: Original strand, 18744770 - 18745039
Alignment:
Q  16 cctgtgaacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtag 115  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  18744770 cctgtgaatttcctgactgacccgctagaaagaatatcaacactcaggcctgcgggtgttatggtgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtag 18744869  T
Q  116 acttgactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatga 215  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||  ||| | |||||| ||||| ||||||||  | ||||||||||| ||    
T  18744870 acttgactggggtttcaccacttgtgggattaggtgtcaggccatttaccgtaacacaggaagcccttaaagcagcgtcaagttaggtggccaaacacga 18744969  T
Q  216 gaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcacca 285  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  18744970 gaaagcgtgttctgacaatcaacatacttttataccatttgcttttgacattttcgattttctagcacca 18745039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 17 - 271
Target Start/End: Original strand, 19161600 - 19161854
Alignment:
Q  17 ctgtgaacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtaga 116  Q
    |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  19161600 ctgtgaacgtcctaactgacccattagatagaagatcaacactcaggcatgcggatgttatgatgtaaggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtaga 19161699  T
Q  117 cttgactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgag 216  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||  ||||||||  || |||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||     
T  19161700 cttgaatagggtttcaccacttgtgagattagatgtcaggccttttatggtaggacatacatccctaaaatctgcgtcaagaaaagtgggcaaacatgaa 19161799  T
Q  217 aaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcg 271  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19161800 aaagcgtgttctgacaatcaacatgtttttataccatttgcttttgacactttcg 19161854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 289
Target Start/End: Original strand, 23484755 - 23485026
Alignment:
Q  17 ctgtgaacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtaga 116  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| || |||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  23484755 ctgtgaacttcctgattgacctactatatagaagatcaacactcaagcatgcatatgttatgatgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtaga 23484854  T
Q  117 cttgactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgag 216  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||    
T  23484855 cttgattggggtttcaccacttgtgggattaagtgtcgggcctttaacggtgggacaactagccctaaaagctacgtcaaacaaagtggccaaatatgag 23484954  T
Q  217 aaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagaga 289  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||  |||||||||||||||||    
T  23484955 aaagcatgttctgacaatcaacatgcttttataccatttgtttttgacac-ttctgtttcctagcaccagaga 23485026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 16 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 28225291 - 28225006
Alignment:
Q  16 cctgtgaacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtag 115  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |    
T  28225291 cctgtgaactttctgacttacccactagatagaatatcgacacttaggcctacggatgttatggtgtacggatgggttggaggaaaacatgcatgtgtgg 28225192  T
Q  116 acttgactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatga 215  Q
    |||||| | ||||||||| ||||||||| ||||| ||  |  ||||||| ||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  28225191 acttgaatggggtttcactacttgtgggcttaggagttagggcttttacggtaggacaaacaactttaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaatatga 28225092  T
Q  216 gaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttgaccttc 301  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||  ||||| ||||||||||||    
T  28225091 gaaagcgtattctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacactttcggcttcctagcttcagaggttgttgaccttc 28225006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 20 - 300
Target Start/End: Original strand, 20142560 - 20142825
Alignment:
Q  20 tgaacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtagactt 119  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20142560 tgaacttcctgactgacccagtagatagaagatcaacactcaaacctgcagacattatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtagactt 20142659  T
Q  120 gactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaa 219  Q
    || | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||            
T  20142660 gattggggcttcaccacttgtgggattaggtgtcgtaccttttaccgtaggacaggcagctctaaaagcttcgtcaagcaaagtggccaaac-------- 20142751  T
Q  220 gcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttgacctt 300  Q
           ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||| |||||| || || |||||||||||    
T  20142752 -------atgacaatcaacatgcttttataccattttcttttgacacttttggttttctagcatcaaaggttgttgacctt 20142825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 16 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 27502652 - 27502368
Alignment:
Q  16 cctgtgaacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtag 115  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |    
T  27502652 cctgtgaactttctgactgacccactagatgcaagatcgacacttaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggttggaggaaaacatgcatgtgtgg 27502553  T
Q  116 acttgactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatga 215  Q
    || ||| | ||||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||  ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27502552 acctgaatggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcagagcttttacgataggacaa-taaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggtcaaacatga 27502454  T
Q  216 gaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttgaccttc 301  Q
    |||| ||||||  ||||| |||||||||||||||| |||   |||||| |||||||| ||||||||| || | | |||||||||||    
T  27502453 gaaaacgtgttccgacaaacaacatgcttttatacaattgctttttgacactttcgacttcctagcatcatatactgttgaccttc 27502368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 16 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 44686709 - 44686422
Alignment:
Q  16 cctgtgaacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtag 115  Q
    |||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||  | ||  |||||||||| ||||| |    
T  44686709 cctgtgaactttgtgactgatctactagatagaagattgacacttaggcctgcggatgttatggtgtacaaatgttt-ggacgaaaacatgcatgtgtgg 44686611  T
Q  116 acttgactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatga 215  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||  |||||||  ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  44686610 acttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggggcttttacgataggacagacagtcctaaaagctg-gtcaagcaatgtggccaaacatga 44686512  T
Q  216 gaaagcgtgttatga----caatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttgaccttc 301  Q
    ||||||||||| |||    |||||||||||||||||||   || |||||||| |||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  44686511 gaaagcgtgttctgacaatcaatcaacatgcttttatattgttcgcttttgacactttcggcttcctagcatcagagtttgttgaccttc 44686422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 26 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 5532700 - 5532426
Alignment:
Q  26 tcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtagacttgactag 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||   | | |||| |||||||| ||||| |||  |||||| | ||||||||| |||||  |||| ||  |    
T  5532700 tcctgactgacccactagatagaagatcgacatcgaagtctgcagatgttatagtgtatggactggtaggagaaaaacatgcatgtgtgaacttaaccgg 5532601  T
Q  126 ggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgt 225  Q
     |||||||||||  | |||||||| |||||   |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  5532600 agtttcaccactcataggattaggggtcggggattttacggtaggacatgcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggtcaaacatgagaaaacgtgt 5532501  T
Q  226 tatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttgaccttc 301  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| |  |||||||||||| || ||||||| ||||    
T  5532500 tgtgacaatcaacatgcttttatactatttacttttgacactttag-cttcctagcaccataggttgttgagcttc 5532426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 3826017 - 3825732
Alignment:
Q  17 ctgtgaacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtaga 116  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  | | || || |||||||| |||||||  ||| ||||| | ||||||||| ||||| ||    
T  3826017 ctgtgaactttctgactgacccactagatagaagatcgacctttatgcttgtggatgttaaggtgtacaaatgagtaggagaaaaacatgcatgtgtgga 3825918  T
Q  117 cttgactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgag 216  Q
    ||||| |  ||||||||| |||||||||||||| ||| |  ||||||| ||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  3825917 cttgattgaggtttcaccccttgtgggattaggggtcaggacttttacggtatgacagagagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggtcaaacatgaa 3825818  T
Q  217 aaagcgtgtt-atgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttgaccttc 301  Q
    ||||  | ||  |||||||| ||||| ||||||  |||||||||  || |||||| ||||||||||| || || ||||||||||||    
T  3825817 aaagttttttcctgacaatctacatgtttttatttcatttgcttcagacactttcaatttcctagcatcaaaggttgttgaccttc 3825732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 55 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 2888764 - 2888522
Alignment:
Q  55 acactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtagacttgactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcg 154  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||| |||  ||||||| | || |||||||| ||||| ||||| ||| |  |||| |||||| | |||||||| ||||    
T  2888764 acacttaggtctgcagatgttatggtatacatatgggtaagaggtaaacatgcatgtgtggacttaactggaatttcgccacttataggattaggggtcg 2888665  T
Q  155 gaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatt 254  Q
    ||    |||  ||||  ||| || ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  2888664 ga----ttatggtagtgcaaacaaccctaaaagttgcgtctagcaaagtggacaaacatgagaaaacgtgttctgacaatcaacatgtttttataccatt 2888569  T
Q  255 tgcttttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttgaccttc 301  Q
     | || ||| ||||| |  |||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  2888568 cgtttatgacacttttggcttcctaacacaagaggttgttgaccttc 2888522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 184 - 301
Target Start/End: Original strand, 34814803 - 34814919
Alignment:
Q  184 aaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcac 283  Q
    |||||| ||||||  ||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||  |||||| |||    
T  34814803 aaagcttcgtcaaataaagtgatcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaatatgcttttataccatttgctttcgacactttcg-gttcctaacac 34814901  T
Q  284 cagagattgttgaccttc 301  Q
    |||||| |||||||||||    
T  34814902 cagagactgttgaccttc 34814919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 16 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 9675135 - 9674946
Alignment:
Q  16 cctgtgaacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtag 115  Q
    ||||||||||| ||||| |||| | || ||| |||||| ||||| || | ||| ||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||| |      
T  9675135 cctgtgaactttctgaccgaccgattaaataaaagatcgacacttagacatgcagatgttatgatgtacgaatgagtaggaggaaaacatgcatgtatga 9675036  T
Q  116 acttgactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgg 205  Q
    |||||| | |||||||||||||  ||||||||||  || |||||||||  |||||||||  ||||||||||  |||||||| ||||||||    
T  9675035 acttgattggggtttcaccactcatgggattagggatcagaccttttatggtaggacaaatagccctaaaatatgcgtcaaacaaagtgg 9674946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 147
Target Start/End: Original strand, 13146951 - 13147081
Alignment:
Q  17 ctgtgaacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtaga 116  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| | |||| ||  |||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |  |||||  |    
T  13146951 ctgtgaacttcctgattaacccactagatagaagatcgacatttaggcatgtagatgttatggtgtacgcatgggtaggaagaaaacacggatgtgtgaa 13147050  T
Q  117 cttgactagggtttcaccacttgtgggatta 147  Q
    |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  13147051 cttgactgtggtttcaccacttatgggatta 13147081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 16351657 - 16351904
Alignment:
Q  18 tgtgaacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtagac 117  Q
    |||||||||  ||||||||  |||| |||||||||||||||| ||  |||   |||||||||| |||| |||||| ||  || ||||||| |||||||||    
T  16351657 tgtgaactttttgactgacttactatatagaagatcaacacttagatctgtaaatgttatggtatacgaatgggttggaagacaacatgcatgtgtagac 16351756  T
Q  118 ttgactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtag---gacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatg 214  Q
    ||||| || ||||||||| |||||| |||| ||||||||   |||||  |||   ||||  ||  |||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  16351757 ttgac-agagtttcaccatttgtggaattatgtgtcggagtatttacgataggtagacagacaatcctaaaagttgtgtcaagcaaagtggtcaaacatg 16351855  T
Q  215 agaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttga 263  Q
    |||||  ||||| | |||||||||||  |||||||   |||||||||||    
T  16351856 agaaaatgtgttctcacaatcaacataattttatattgtttgcttttga 16351904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 190 - 301
Target Start/End: Original strand, 13147087 - 13147201
Alignment:
Q  190 gcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttatgacaatcaacat---gcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccag 286  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||     |||||||||||||| |||||| ||||| | ||| ||| ||||||    
T  13147087 gcgtcaagaaaagtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcagcatatactttttataccatttgattttgacacttttggttttctaacaccag 13147186  T
Q  287 agattgttgaccttc 301  Q
    |||||||||||||||    
T  13147187 agattgttgaccttc 13147201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 18 - 140
Target Start/End: Original strand, 10579597 - 10579719
Alignment:
Q  18 tgtgaacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtagac 117  Q
    |||||||||| || |||||| || |||| ||||||| ||||| |||||  |  |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| | ||| |||    
T  10579597 tgtgaacttcttgtctgacctaccagatggaagatcgacacttaggccaacaaatgttatggtgtacgagtgggtaggaggaaaacatgcatttgtggac 10579696  T
Q  118 ttgactagggtttcaccacttgt 140  Q
    |||||| ||||||||||||||||    
T  10579697 ttgactggggtttcaccacttgt 10579719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 55 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 44720573 - 44720374
Alignment:
Q  55 acactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtagacttgactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcg 154  Q
    ||||| ||| ||||||||||| || |||||| |||| ||||  ||||| |||  |||||| | |||| |  |||||||||  ||||||||||||| |||     
T  44720573 acacttaggtctgcggatgttttgatgtacgaatggataggatgaaaatatg--tgtgtaaaattgattgaggtttcaccgtttgtgggattaggggtca 44720476  T
Q  155 gaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatt 254  Q
    |   ||||||  ||| ||| ||| | |||||||| |||||||| ||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  44720475 gcaattttacgttagaacatgcaacgctaaaagccgcgtcaagtaagatggccaaacatgaaaaaacgtgttatgacaatcaacatgtttttataccgtt 44720376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 182 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 29808199 - 29808082
Alignment:
Q  182 taaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagc 281  Q
    |||||| ||| ||||| |||||  |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| | | | |  ||||||||||    
T  29808199 taaaagttgcctcaagtaaagtcaccaaacatgagacagcgtgttataacaatcaacatg-ttttataccatttgcttttcacattatttatttcctagc 29808101  T
Q  282 accagagattgttgacctt 300  Q
    | | ||| |||||||||||    
T  29808100 atcggaggttgttgacctt 29808082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 170 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 5679415 - 5679330
Alignment:
Q  170 gacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccattt 255  Q
    ||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||| |||| |||||||||    
T  5679415 gacaagcggccctcaaagctgtttcaagcaaagtggccaaacatgagaaaacatgttaagataatcaacatcctttcataccattt 5679330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 71 - 297
Target Start/End: Original strand, 33612417 - 33612644
Alignment:
Q  71 atgttatggtgtacggatg-ggtaggtggaaaacatgcttgtgtagacttgactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtag 169  Q
    ||||||||||||||| | | |||||  ||||| ||||| | | |||||||||||  ||||||||| ||||||||| || | |||    || |||  ||||    
T  33612417 atgttatggtgtacgaaggtggtagaaggaaagcatgcatatatagacttgactgaggtttcaccgcttgtgggagtaagggtctaggctattatggtag 33612516  T
Q  170 gacaagcagccctaaaagctgcgt-caagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactt 268  Q
    |||| ||| ||||||||||  ||| |||||||| |||  |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||  ||||| ||||    
T  33612517 gacatgcaaccctaaaagccacgtgcaagcaaaatggt-aaacatgagaaaacgtgttttgacaatcaacatgattttatacaatttgtatttgacactt 33612615  T
Q  269 tcgatttcctagcaccagagattgttgac 297  Q
    | |  |||||| |||| ||| ||||||||    
T  33612616 ttggcttcctaacaccggaggttgttgac 33612644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 301
Target Start/End: Original strand, 7760737 - 7760946
Alignment:
Q  91 gtaggtggaaaacatgcttgtgtagacttgactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctg 190  Q
    ||||| ||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |   |    ||||||  || ||||||||| |||| ||||  |    
T  7760737 gtaggaggaaaacatacatgtgtgaacttgactagggtttcaccacttgtgggattatgaaccaagacttttatggtgggacaagcaaccctcaaagtcg 7760836  T
Q  191 cgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagagat 290  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| | | |||||| ||||  |||  ||| |||||| || || || || | ||| ||| |||||||| |    
T  7760837 cgtcaagtaaagtggccaatcatgagaaaacgtgatctaacaatc-acatattttcttacgatttgcattagacacctttggttttctatcaccagaggt 7760935  T
Q  291 tgttgaccttc 301  Q
    |||||||||||    
T  7760936 tgttgaccttc 7760946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 181 - 251
Target Start/End: Original strand, 1296031 - 1296101
Alignment:
Q  181 ctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttatacc 251  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||   |||| ||||||| |||||| |||||||||    
T  1296031 ctaaaagctgcgtcaaacaaaatggccaaacatgagaaaatatgttctgacaataaacatgtttttatacc 1296101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 263
Target Start/End: Original strand, 3968402 - 3968472
Alignment:
Q  193 tcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttga 263  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||| | |||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  3968402 tcaagcaaagtggtcaaatatgagaaaacatgttttgacaatcaatatgcttttatacaatttgcgtttga 3968472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 144 - 288
Target Start/End: Original strand, 2886563 - 2886703
Alignment:
Q  144 attaggtgtcggacc-ttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttatgacaatcaacatgc 242  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||| || ||||| |||| || ||| ||||| ||||| || |||||     ||| ||||| ||||||||||||||     
T  2886563 attaggtgtcggacaattttacggtaggtcacgcagctctaatagttgcatcaagtaaagtagcgaaaca-----aagtgtgttctgacaatcaacatgt 2886657  T
Q  243 ttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagag 288  Q
    ||||||| |||||| |||||| | ||||| ||||| |||| |||||    
T  2886658 ttttatatcatttgtttttgatattttcggtttccaagcatcagag 2886703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 208 - 301
Target Start/End: Original strand, 11921218 - 11921311
Alignment:
Q  208 aaacatgagaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttgaccttc 301  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||| |||| |||| | |||||| |||| || | | || ||| |||||||||||    
T  11921218 aaacattagaaaacgtgttctgacaatcaacatatttttataccgtttgttttttatactttcaattttctggtatcatagactgttgaccttc 11921311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 35)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 22 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 19277578 - 19277299
Alignment:
Q  22 aacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtagacttga 121  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19277578 aacttcctgactgacgcactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtctacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtagacttga 19277479  T
Q  122 ctagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagc 221  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19277478 ctggggtttcaccacttgtcggattaggtttcagaccttttgccgtaggacaggcagtcctaaaagctgcgtcaagcaaagtagccaaacatgagaaagc 19277379  T
Q  222 gtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttgaccttc 301  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19277378 gtgttctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacactttcggtttcctagcaccagaggttgttgaccttc 19277299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 18 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 4501547 - 4501265
Alignment:
Q  18 tgtgaacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtagac 117  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  4501547 tgtgaacttcctgaatgacccactagatagaagataaacactcaggccagcggatgttatggtgtacggataggtaggaggaaaacatgcatgtgtagac 4501448  T
Q  118 ttgactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgaga 217  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4501447 ttgactggggtttcaccacttgtgggattaggtgtcgggccttttaccgtaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaaacaaagtggccaaacatgaga 4501348  T
Q  218 aagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttgaccttc 301  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  4501347 aagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatataatttgcttttgacacttt-ggttttctagcaccagaggttgttgaccttc 4501265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 19 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 983237 - 982955
Alignment:
Q  19 gtgaacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtagact 118  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  983237 gtgaacttcctaactgacccactagatagaagatcaacactcaggcatccggaagttatgatgtacgaatgagtaggtgaaaaacatgcttgtgtagact 983138  T
Q  119 tgactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaa 218  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  983137 tgactagggtttaaccacttgtgggattaggtgtgggaccttttattgtaggacaggcagccataaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaa 983038  T
Q  219 agcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttgaccttc 301  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  983037 atcgtgttctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgatactttcggttttctagcaccagaggttgttggccttc 982955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 15 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 3676932 - 3676677
Alignment:
Q  15 acctgtgaacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgta 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3676932 acctgtgaacttcctgactgacccaatagatagaaaatcaacactcaggcttgtagatgttatggtgtagggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgta 3676833  T
Q  115 gacttgactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaag-cagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacat 213  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3676832 gacttgactggggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggtccttttaccgtaggacaggccagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggtcaaacat 3676733  T
Q  214 gagaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagacttt 269  Q
     |||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3676732 cagaaagcgtgttcttactatcaatatgcttttataccatttgcttttgacacttt 3676677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 71 - 300
Target Start/End: Original strand, 21326709 - 21326938
Alignment:
Q  71 atgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtagacttgactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtagg 170  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21326709 atgttatggtgtacagatgggtaggtggaaaacatacttgtgtagatttgattggagtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtagg 21326808  T
Q  171 acaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttc 270  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21326809 acaaacagccctaaaagccgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacactttc 21326908  T
Q  271 gatttcctagcaccagagattgttgacctt 300  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  21326909 gatttcctagcaccagaggctgttgacctt 21326938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 20 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 24527877 - 24527595
Alignment:
Q  20 tgaacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatggg-taggtggaaaacatgcttgtgtagact 118  Q
    |||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  24527877 tgaacttcctaactggcccactaggtcgaagatcaacactcaggtctgcgaatgtcatggtgtacggatgggataggtggaaaacatgtttgtgtagact 24527778  T
Q  119 tgactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaa 218  Q
    |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| |||||||  |||||||||||    
T  24527777 tgactagggtctcatcatttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaggcagccctaaaagcagtgtcaagtaaagtgggaaaacatgagaa 24527678  T
Q  219 agcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttgaccttc 301  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||   ||||||||||    
T  24527677 aacgtgttctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacactttcagtttcctagcacgagaggcggttgaccttc 24527595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 16 - 301
Target Start/End: Original strand, 28517103 - 28517388
Alignment:
Q  16 cctgtgaacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtag 115  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||| |    
T  28517103 cctgtgaactttctgactgacccactagatagaagatcgacacttaggcctgcaaatgttatggtgtacggatgggttggaggaaaacatgtatgtgtgg 28517202  T
Q  116 acttgactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatga 215  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||  ||||||| ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28517203 acttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtgggggcttttacagtaggacagacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatga 28517302  T
Q  216 gaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttgaccttc 301  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  28517303 gaaagcgtgtttagacaatcaacatgtttttataccatttgcttttgacacttttgacttcctagcatcagagacagttgaccttc 28517388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 17 - 288
Target Start/End: Original strand, 45613659 - 45613930
Alignment:
Q  17 ctgtgaacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtaga 116  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  45613659 ctgtgaacttcctgactgacccgctagaaagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatgatgtacgaatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtaga 45613758  T
Q  117 cttgactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgag 216  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||  || ||||||||| ||||||||| || ||| ||||||| | |    
T  45613759 cttgactggggtttcaccacttgtaggattaggtgtcgggcctttttccgtaggacagacaaccctaaaagttgcgtcaagtaaggtgaccaaacacggg 45613858  T
Q  217 aaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagag 288  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  45613859 aaagtgtgttctgacaatcaacatgtttttataccatttgattttgacactttcggtttccaagcaccagag 45613930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 5825561 - 5825279
Alignment:
Q  17 ctgtgaacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtaga 116  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||| ||    
T  5825561 ctgtgaactttctgattgacccactagatagaagatcgacacataggcctgcggatgttatggtgtacgaatgggttggaggaaaacatgcatgtgtgga 5825462  T
Q  117 cttgactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgag 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||   ||||||| | |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||     
T  5825461 cttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcgaggcttttacggcaggacaggaagccctaaaagctgcatcaagcaaagtg--caaacatgac 5825364  T
Q  217 aaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttgaccttc 301  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||   |||||||||||||| ||||||||||||    
T  5825363 aatgcgtgttatgacaatcaacatgtttttataccatttacttttgacactttcggcatcctagcaccagaggttgttgaccttc 5825279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 32 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 43857149 - 43856880
Alignment:
Q  32 ctgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtagacttgactagggtttc 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | || || ||||||||  |||||||    
T  43857149 ctgacccactagatagaagatcaacacttaggcctgcagatgttatggtgtacggatgggtaggagaaaaacatacatgcgtggacttgacgggggtttc 43857050  T
Q  132 accacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttatgac 231  Q
    |||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||  || |  |||||| |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||    
T  43857049 accacttgtgggattaggggtcggggcttttacagtaggacagacaacattaaaagatgcgtcaatcaaagtggctagacatgagaaagcgtgttttgac 43856950  T
Q  232 aatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttgaccttc 301  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||| | ||| | ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  43856949 aatcaacatgcgtttatacaatttgcttttgacatttttggtttcctaacaccagaggttgttgaccttc 43856880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 54 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 27521722 - 27521477
Alignment:
Q  54 aacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtagacttgactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtc 153  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| | |||||||   |||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||||    
T  27521722 aacactcaggtctgcggatgttattgtctacggatgggtaggagaaaaacata--tgtgtagacttgactgagatttcaccatttgtgggattaggtgtc 27521625  T
Q  154 ggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccat 253  Q
    || |||||||| |||||||| ||| || |||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||    
T  27521624 gggccttttacggtaggacatgcacccttaaaagttgcgttaaacaaagtggtcaaacatgagaaaacgtgttctgacaatcaacatgcatttatacaat 27521525  T
Q  254 ttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttgaccttc 301  Q
    || ||||||| ||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  27521524 ttacttttgacacttttggtttcctagcatcagaggttgttgaccttc 27521477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 99 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 22198194 - 22197992
Alignment:
Q  99 aaaacatgcttgtgtagacttgactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagc 198  Q
    ||||||||| |||||||| |||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  22198194 aaaacatgcatgtgtagatttgattggggtttcgccacttgtgcgattaggtgtcgggccttttatggtaggacgcgcagccctaaaagcggcgtcaagc 22198095  T
Q  199 aaagtggccaaacatgagaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttgacc 298  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  22198094 aaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttccaacaatcaacatgtttttataccatttgcttttgtcactttcggtttcctagcatcagaggttgttgacc 22197995  T
Q  299 ttc 301  Q
    |||    
T  22197994 ttc 22197992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 99 - 301
Target Start/End: Original strand, 22239627 - 22239829
Alignment:
Q  99 aaaacatgcttgtgtagacttgactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagc 198  Q
    ||||||||| |||||||| |||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  22239627 aaaacatgcatgtgtagatttgattggggtttcgccacttgtgcgattaggtgtcgggccttttatggtaggacgcgcagccctaaaagcggcgtcaagc 22239726  T
Q  199 aaagtggccaaacatgagaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttgacc 298  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  22239727 aaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttccaacaatcaacatgtttttataccatttgcttttgtcactttcggtttcctagcatcagaggttgttgacc 22239826  T
Q  299 ttc 301  Q
    |||    
T  22239827 ttc 22239829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 97 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 32584811 - 32584607
Alignment:
Q  97 ggaaaacatgcttgtgtagacttgactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaa 196  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||   |||||| |||||||| ||| ||||||||  ||| ||||    
T  32584811 ggaaaacatgcatgtgtggacttgactcgggtttcacctcttgtgggattaggggtcggggattttacggtaggacatgcaaccctaaaaattgcatcaa 32584712  T
Q  197 gcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttga 296  Q
     |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||| |||||||    
T  32584711 acaaagtggtcaaacatgagaaaacgtgttctgacaatcaagatgcttttacaccatttgcttttgacactttatgtttcctagcaccagaggttgttga 32584612  T
Q  297 ccttc 301  Q
    |||||    
T  32584611 ccttc 32584607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 166 - 301
Target Start/End: Original strand, 30216024 - 30216159
Alignment:
Q  166 gtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgaga 265  Q
    |||| ||||||| || |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  30216024 gtagaacaagcatccttaaaagctgcgtcaagcaaaatggtcaaatatgagaaagcgtgttttgacaatcaacatgtttttataccatttgcttttgaca 30216123  T
Q  266 ctttcgatttcctagcaccagagattgttgaccttc 301  Q
    |||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  30216124 ctttcggtttcctagcatcagagtttgttgatcttc 30216159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 47679414 - 47679131
Alignment:
Q  18 tgtgaacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtagac 117  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||  | | | || |||| |||| || || ||||||||| ||||||||| | ||| |||||    
T  47679414 tgtgaactttctgactgacgcactagatagaagatcgacactttgacttacgaatgtaatggcgtgcgaatgggtaggaggaaaacatacatgtctagac 47679315  T
Q  118 ttgactagggtttcaccacttgt-gggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| || |   |||||||   ||||| || | | ||||||| |||||| ||||||||| | ||| |||||    
T  47679314 ttgactagggtttcaccacttgtgggggttaggggtagcggcttttacaaaaggacgagtatctctaaaagttgcgtc-agcaaagtgacaaaatatgag 47679216  T
Q  217 aaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttgaccttc 301  Q
    |||| ||||| | |||||||| || ||||||||| |||||| ||||| | ||||| |||||||||| || || ||||||||||||    
T  47679215 aaagtgtgttctcacaatcaatatacttttatactatttgcgtttgacattttcggtttcctagcatcacaggttgttgaccttc 47679131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 37 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 10905373 - 10905124
Alignment:
Q  37 ccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtagacttgact-agggtttcacca 135  Q
    |||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||  |||||||| ||| ||||||||    
T  10905373 ccactagatataagatcgacacttaggcctgcagatgtt--ggtgtacggatggataggaggaaaacatgcatgtgtgaacttgactgaggttttcacca 10905276  T
Q  136 cttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttatgacaatc 235  Q
    ||||| |||||| | ||  |  ||||||              ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||| ||    
T  10905275 cttgttggattaagagttaggacttttat-------------gccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaatatgagaaaaagtgttctgacactc 10905189  T
Q  236 aacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttgaccttc 301  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||  |||||||||||    
T  10905188 aacatgc-tttataccatttgcttttgacacttttggttgcctagcaccagagtatgttgaccttc 10905124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 137 - 263
Target Start/End: Original strand, 25186873 - 25186999
Alignment:
Q  137 ttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttatgacaatca 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||| || |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||  || |||||    
T  25186873 ttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacataaaaccctaaaagttgtgtcaagtaaagtggtctaacatgagaaagcgtgttccgataatca 25186972  T
Q  237 acatgcttttataccatttgcttttga 263  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  25186973 acatgtttttctaccatttgcttttga 25186999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 182 - 301
Target Start/End: Original strand, 42295166 - 42295285
Alignment:
Q  182 taaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagc 281  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||| |    
T  42295166 taaaagcggcgtcaagcaaaatggccaaacataagaaagcttcttctgacaatcaacatgtttttataccatttgttttttatactttcggtttcctaac 42295265  T
Q  282 accagagattgttgaccttc 301  Q
    ||||| | ||||||||||||    
T  42295266 accaggggttgttgaccttc 42295285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 159 - 301
Target Start/End: Original strand, 9281091 - 9281232
Alignment:
Q  159 ttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgct 258  Q
    |||||| ||||||||  || ||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||      
T  9281091 ttttacagtaggacagacaaccctaaaagctgcatcaagcaaactagc-aaacatgagaaagcgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgga 9281189  T
Q  259 tttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttgaccttc 301  Q
    ||||| | |||    ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  9281190 tttgacattttttgcttcctagcaccagatgttgttgaccttc 9281232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 159 - 301
Target Start/End: Original strand, 9292062 - 9292203
Alignment:
Q  159 ttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgct 258  Q
    |||||| ||||||||  || ||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||      
T  9292062 ttttacagtaggacagacaaccctaaaagctgcatcaagcaaactagc-aaacatgagaaagcgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgga 9292160  T
Q  259 tttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttgaccttc 301  Q
    ||||| | |||    ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  9292161 tttgacattttttgcttcctagcaccagatgttgttgaccttc 9292203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 196 - 301
Target Start/End: Original strand, 40726476 - 40726581
Alignment:
Q  196 agcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttg 295  Q
    |||||||||||||||||| | |||  ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||  ||| ||||| ||||| ||||||    
T  40726476 agcaaagtggccaaacataataaaatgtgttctgacaatcaacatgtttttataccatttgtttttgacactttcggcttcatagcatcagaggttgttg 40726575  T
Q  296 accttc 301  Q
    ||||||    
T  40726576 accttc 40726581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 107 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 34772979 - 34772788
Alignment:
Q  107 cttgtgtagacttgactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggc 206  Q
    ||||||||||||||| |  ||||| | || ||||||||||| |||| || | |||||| ||| || | ||||| ||||||| ||  |||| |||||| ||    
T  34772979 cttgtgtagacttgattgaggttttatcatttgtgggattatgtgttgggctttttacggtatgataggcagctctaaaagttg--tcaatcaaagtagc 34772882  T
Q  207 caaacatgagaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttgaccttc 301  Q
    |||| ||||||||| |||||  |||||| || ||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| |  |||| ||||||||||||    
T  34772881 caaatatgagaaagtgtgttcggacaattaatatgtttttataccatttgcttttgaaactttcaatttcttag-attagaggttgttgaccttc 34772788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 228 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 48539260 - 48539200
Alignment:
Q  228 tgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagag 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||    
T  48539260 tgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacactttcggttttctagcaccagag 48539200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 70 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 38839563 - 38839337
Alignment:
Q  70 gatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtagacttgactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtag 169  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | | ||||||||| ||||| |||||||||  | ||||| || |||||||||| || ||||   ||||||| | ||    
T  38839563 gatgttatggtgtacggatgtgtaagag-aaaacatgcatgtgtggacttgactgagatttcatca-ttgtgggatttggggtcgtgtcttttacggaag 38839466  T
Q  170 gacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttatgacaatcaacatgc----ttttataccatttgcttttgaga 265  Q
     |||  || | ||||||| ||||| ||  ||| | | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    |||||||  |||||||||||| |    
T  38839465 aacagacaactctaaaagttgcgtaaaataaaatcgtcaaacatgagaaagcatgttatgtcaatcaacatgcatgtttttatataatttgcttttgaca 38839366  T
Q  266 ctttcgatttcctagcaccagagattgtt 294  Q
    |||| || |||||| ||| |||| |||||    
T  38839365 cttttgacttcctaacacgagaggttgtt 38839337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 180 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 2904492 - 2904371
Alignment:
Q  180 cctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttccta 279  Q
    |||||||| | ||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||| |||||| || ||| |  || |  ||||||    
T  2904492 cctaaaagttacgtcaagcaaaatagtcaaacatgagaaagcatgttccgacaatcaacatgattttatatcatttgtttgtgacatgtttggcttccta 2904393  T
Q  280 gcaccagagattgttgaccttc 301  Q
    |||| |||| ||||||||||||    
T  2904392 gcactagaggttgttgaccttc 2904371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 226
Target Start/End: Original strand, 33202368 - 33202491
Alignment:
Q  102 acatgcttgtgtagacttgactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaa 201  Q
    |||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||  ||||||| |||||| |   ||||||  ||| |||||| | | ||    
T  33202368 acatgcatgtgtggacttgact-gggtttcaccgcttgtgggattaggggttggggcttttacagtaggatagaaagccctggaagttgcgtccaactaa 33202466  T
Q  202 gtggccaaacatgagaaagcgtgtt 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||    
T  33202467 gtggccaaacatgagaacgcgtgtt 33202491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 158 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 1249735 - 1249653
Alignment:
Q  158 cttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttatgacaatcaacat 240  Q
    ||||||| |||||| |  ||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  1249735 cttttacggtaggatagacagccctaaaacctgcgtcaaataaagtggtcaaacatgagaaagcgtgttttgataatccacat 1249653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 38596740 - 38596639
Alignment:
Q  22 aacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtagacttga 121  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||| | || || ||||||||||||||||||||| ||||  | |||| |||| ||| | |||||||    
T  38596740 aacttcctgaccgacccactaaataaaagatcgacacttaagcatgtggatgttatggtgtacggatgtgtagaagaaaaatatgcatgtatggacttga 38596641  T
Q  122 ct 123  Q
    ||    
T  38596640 ct 38596639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 230 - 301
Target Start/End: Original strand, 6634993 - 6635064
Alignment:
Q  230 acaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttgaccttc 301  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||||||||||| | |||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||    
T  6634993 acaatcaacatatttttatatcatttgcttttgacagtttcgattttttagcatcagaggttgttgaccttc 6635064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 285
Target Start/End: Original strand, 34067855 - 34067946
Alignment:
Q  193 tcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcacca 285  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  || ||| |||||||  ||||| ||||| | |||||||| ||||    
T  34067855 tcaagccaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttttgacaatcaacat-tttctatgccatttgtatttgacacttttggtttcctagtacca 34067946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 43383361 - 43383221
Alignment:
Q  115 gacttgactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatg 214  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||  |  ||||  |||| ||  | ||||| |||||||  |||||  | ||||  ||||||||||| ||||    
T  43383361 gacttgactggggtttccccacttgtgggattgagaatcggggctttaactatgggacaggcagcccacaaagccacttcaaataaagtggccaaccatg 43383262  T
Q  215 agaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccattt 255  Q
    ||||||| ||||    |||||||||||||||||| ||||||    
T  43383261 agaaagcatgttccagcaatcaacatgcttttatgccattt 43383221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 247 - 287
Target Start/End: Original strand, 45424755 - 45424795
Alignment:
Q  247 ataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccaga 287  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  45424755 ataccatttgcttttgaaactttcgacttcctagcaccaga 45424795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 193 - 268
Target Start/End: Original strand, 7637505 - 7637579
Alignment:
Q  193 tcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactt 268  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| ||| | |||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  7637505 tcaagcaaagtggtcaa-catgagaaagtgtgctctgacgatcaataagcttttataccatttgcgtttgacactt 7637579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 26770515 - 26770454
Alignment:
Q  189 tgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttatac 250  Q
    ||||||||  |||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  26770515 tgcgtcaaataaagtggtaaaacatgagaaaacgtgttctgacaatctatatgcttttatac 26770454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 29)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 17 - 301
Target Start/End: Original strand, 28040944 - 28041228
Alignment:
Q  17 ctgtgaacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtaga 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28040944 ctgtgaacttcctgactaacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcagatgttatggtgtacagatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtaga 28041043  T
Q  117 cttgactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgag 216  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| | ||||||| |||||||||||||||||||    
T  28041044 cttgactggggtttcactacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggataggcagctctaaaatccgcgtcaaacaaagtggccaaacatgag 28041143  T
Q  217 aaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttgaccttc 301  Q
    |||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||    
T  28041144 aaagtgtgttctgacaatcaacaggtttttataccatttgcttttgacactttcggtttcctagcaccagaggcggttgaccttc 28041228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 16 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 19035738 - 19035466
Alignment:
Q  16 cctgtgaacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtag 115  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19035738 cctgtgaacttcctgaccgacccactagataaaagatcaacactcaggtatgtggacgttttggtgtacggatgggtaggtggaacacatgcttgtgtag 19035639  T
Q  116 acttgactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatga 215  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19035638 acttgactgggatttcaccagttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtagggcaggcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatga 19035539  T
Q  216 gaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagag 288  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  19035538 gaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttataccatttacttttgacacttacggtttcctagcaccagag 19035466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 16 - 301
Target Start/End: Original strand, 29169610 - 29169894
Alignment:
Q  16 cctgtgaacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtag 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||    
T  29169610 cctgtgaacttcctgactgacccgctagaaagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggataggtaggaggaaaacatgcatgtgtag 29169709  T
Q  116 acttgactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatga 215  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||| || |||||| || ||||||||||| ||    
T  29169710 acttgactggggtttcaccactt-tgggattaggtgtcgggccttttaccgtaggacagacagcccttaaagttgtgtcaagtaaggtggccaaacacga 29169808  T
Q  216 gaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttgaccttc 301  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  29169809 gaaaacgtgttctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacactttcggtttcctagcaccagaggttgttaaccttc 29169894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 40 - 301
Target Start/End: Original strand, 45659487 - 45659749
Alignment:
Q  40 ctagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtagacttgactagggtttcaccacttg 139  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||    
T  45659487 ctagaaagaagatcaacactcaggcatgcacatgttatagtgtacagatgggtaggaggaaaacatgcatgcgtagacttgactggggtttcaccacttg 45659586  T
Q  140 tgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccc-taaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttatgacaatcaac 238  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  45659587 tgggattaggtatcgggccttttaccgtaggacatgcagcccttaaaagctgcgtcaagtaaggtggccaaacacgagaaagcgtgttctgacaatcaac 45659686  T
Q  239 atgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttgaccttc 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  45659687 atgcttttataccatttgcttttgacactttcgatttcctatcaccagaggctgttgaccttc 45659749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 18 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 34644855 - 34644572
Alignment:
Q  18 tgtgaacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtagac 117  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||| ||||| |||    
T  34644855 tgtgaactttctgactgacccactagatagaagatcgacacttaggtatgcggatgttatggtgtatggatgggctggaggaaaacatgcatgtgtggac 34644756  T
Q  118 ttgactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgaga 217  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34644755 ttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggggcttttacggtaggacaagcaaccctaaaagttgcgtcaaacaaagtggccaaacatgaga 34644656  T
Q  218 aagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttgaccttc 301  Q
    ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  34644655 aagcgtgttctgacaacctacatgcttttataccatttgtttttgacactttcggcttcctagcatcagaggttgttgaccttc 34644572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 69 - 301
Target Start/End: Original strand, 20259667 - 20259898
Alignment:
Q  69 ggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtagacttgactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgta 168  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  20259667 ggatgttatggtgtacagatgggtagg-gaaaaacatgcatgtgtagacatgactagggttttaccgcttgtgggattaggtgtcagaccttttaccgga 20259765  T
Q  169 ggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactt 268  Q
      ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  | |||| ||||    
T  20259766 aaacaggtagccctaaaagctacgtcaagcaaagtggttaaaaatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgtttttataccatttattgttgacactt 20259865  T
Q  269 tcgatttcctagcaccagagattgttgaccttc 301  Q
    ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  20259866 tcggtttcttagcaccagaggttgttgaccttc 20259898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 15 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 22347169 - 22346901
Alignment:
Q  15 acctgtgaacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgta 114  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||                |||||||||||| ||||    
T  22347169 acctgtgaactttctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcagacgttatggtg----------------gaaaacatgcttctgta 22347086  T
Q  115 gacttgactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatg 214  Q
    ||||||| | | |||||||||||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||| || || |||||| |  ||||||||||||||||||| |||    
T  22347085 gacttgattggtgtttcaccacttgtgg-attagatttcggactttttaccgtaggacaaacaacc-taaaagttatgtcaagcaaagtggccaaatatg 22346988  T
Q  215 agaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttgaccttc 301  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  22346987 agaaagcgtgttctgacaatcaacatgcgtttataccttttgcttttgacactttcggtttcctagtagcagaggttgttgaccttc 22346901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 18 - 301
Target Start/End: Original strand, 4861807 - 4862090
Alignment:
Q  18 tgtgaacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtagac 117  Q
    |||||||||| ||| ||| | | || |||||||||| |||||   |||| | |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||     
T  4861807 tgtgaacttcttgattgatctattaaatagaagatcgacacttcagcctacagatgttatggtgtacggatgggtaggagaaaaacatgcatgtgtggat 4861906  T
Q  118 ttgactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgaga 217  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||| |||    | ||||  ||||||||  ||||| |||||| ||||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  4861907 ttgactggtgtttcaccacttgttggattaggggtcttgacatttatggtaggacagacagccttaaaagttgcgtcaagtaaaatggtcaaacatgaga 4862006  T
Q  218 aagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttgaccttc 301  Q
    |||||| || |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||    
T  4862007 aagcgtcttctgacaagcaacatacttttatacaatttgcttttgacactttcgatttcctaacaccaaaagttgttgaccttc 4862090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 17 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 2898976 - 2898708
Alignment:
Q  17 ctgtgaacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtaga 116  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||||     |||| | ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||      || ||||    
T  2898976 ctgtgaactttttgactgacctactagata-----tcaatattcaggtctgcggatgtcatggtgtacggatgggtatgaggaaaac------gtttaga 2898888  T
Q  117 cttgactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgag 216  Q
    ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||        | ||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2898887 cttgatttgggtttcaccacttgtgtgattaggtgtcgggccttttac--------atgcaaccctaaaagatgcatcaagcaaagtggccaaacatgag 2898796  T
Q  217 aaag----cgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttgaccttc 301  Q
    ||||    |||||| |||||||||| | | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2898795 aaagtgagcgtgttctgacaatcaata-gtttttataccatttgcttttgatactttcggtttcctagcaccagaggttgttgaccttc 2898708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 133 - 282
Target Start/End: Original strand, 31737256 - 31737405
Alignment:
Q  133 ccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttatgaca 232  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| || || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | | || |||||    
T  31737256 ccacttgtgagattaggtgtcagaccttttacggtaagataaacggccctaaaagcggcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaaacatattctgaca 31737355  T
Q  233 atcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagca 282  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||    
T  31737356 atcaacatgcttttataccatttgtttttgacactttcgattttctagca 31737405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 22 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 42920144 - 42919866
Alignment:
Q  22 aacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtagacttga 121  Q
    |||||| |||| || |||||| ||| |||||||||| | |||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||  |||||| | |||||    
T  42920144 aacttcatgaccgatccactaaataaaagatcaacatttaggcttgcagatgttaaggtgtacagatgggtaggaggaaaacatatttgtgtgggcttga 42920045  T
Q  122 ctagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagc 221  Q
     |  | |||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||   |||||||| || ||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||| |    
T  42920044 ttgagatttcactactcgtgggattacgggtcggagcttttatgataggacaaacaaccctaaaagttgcatcaaacaaagcggccaaacatgagaaa-c 42919946  T
Q  222 gtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttgaccttc 301  Q
    ||||| | |||||||||||| ||||||  ||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||  |||||||||| ||||||    
T  42919945 gtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgcttttgacacttttgatttccaagcagtagagattgttaaccttc 42919866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 41 - 301
Target Start/End: Original strand, 25375674 - 25375934
Alignment:
Q  41 tagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtagacttgactagggtttcaccacttgt 140  Q
    ||||||||||||  ||||| ||| |||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||  | || || ||||| |||||||||| ||| ||    
T  25375674 tagatagaagattgacacttaggtctgcagatgttatggtatacggatgggtagaaggaaaacatgcaagcgtggatttgaccagggtttcactactcgt 25375773  T
Q  141 gggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttatgacaatcaacat 240  Q
     |||||||| ||| || ||||||| ||||||||  || | | ||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||| | || ||||||||    
T  25375774 cggattaggggtcagagcttttacggtaggacagacaactccaaaagttgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgacaaaacatgttcttaccatcaacat 25375873  T
Q  241 gcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttgaccttc 301  Q
    | |||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||| ||||  ||||||||| |||||    
T  25375874 gtttttataccatttgctattgacacttttggcttcctatcaccgaagattgttggccttc 25375934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 100 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 2764686 - 2764485
Alignment:
Q  100 aaacatgcttgtgtagacttgactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagca 199  Q
    |||||||| |||||  |||||| |  |||||||||||||||||| ||||| || ||  ||||||  |||||| | |||| |||||||| || ||||  ||    
T  2764686 aaacatgcatgtgtgaacttgattgaggtttcaccacttgtgggtttaggggttggtgcttttatggtaggataggcagtcctaaaagttgtgtcagaca 2764587  T
Q  200 aagtggccaaacatgagaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttgacct 299  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||   ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  2764586 aagtggtcaaacatgagaaaacgtgttccgacaatcaacatgcttttatgccattttcttttgacactttcagcttcctagcatcagaggttgttgacct 2764487  T
Q  300 tc 301  Q
    ||    
T  2764486 tc 2764485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 20 - 297
Target Start/End: Original strand, 37932038 - 37932314
Alignment:
Q  20 tgaacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtagactt 119  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| |||||  ||||  ||| ||||||||||| || || |||||    
T  37932038 tgaactttctgaccgacccattagatagaaaatcgacacttaggcctgcggatgttatgatgtacatatggacaggaggaaaacatgcatgcgtggactt 37932137  T
Q  120 gactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaa 219  Q
    || |  |||||||||||||||||||||||| | |    ||||||| ||| ||||  |||||||||||| || |||||||||| ||| |||| | ||||||    
T  37932138 gattgaggtttcaccacttgtgggattaggggccaaggcttttacagtaagacagacagccctaaaagttgtgtcaagcaaaatggtcaaatacgagaaa 37932237  T
Q  220 gcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttgac 297  Q
    | ||||| ||||||||||| || ||||| |  |||   |||| | |||||||  |||||||||||||||  |||||||    
T  37932238 g-gtgttctgacaatcaacgtgtttttacattattatttttttacactttcggcttcctagcaccagaggatgttgac 37932314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 189 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 21473121 - 21473009
Alignment:
Q  189 tgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagag 288  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  21473121 tgcgtcaagtaaaatggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgtttttataccatttgcttttgacacttgcagtttcctagcaccagag 21473022  T
Q  289 attgttgaccttc 301  Q
      |||||||||||    
T  21473021 gctgttgaccttc 21473009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 41 - 255
Target Start/End: Original strand, 50161258 - 50161472
Alignment:
Q  41 tagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtagacttgactagggtttcaccacttgt 140  Q
    ||||||||||||||||||   || |||   |||||||||||||||| |||||| | | ||||||||| ||||| ||||| ||     |||||||||| ||    
T  50161258 tagatagaagatcaacacatgggtctgtatatgttatggtgtacggttgggtaagagaaaaacatgcatgtgtggacttaaccgatatttcaccactcgt 50161357  T
Q  141 gggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttatgacaatcaacat 240  Q
    || |||||| |  |   ||||||| ||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  50161358 ggaattaggggctgagacttttacggtaggacagacaaccctaaaagttgcgtcaagcaaagtggacaaacatgagaaagcgtgttctcacaatcaacat 50161457  T
Q  241 gcttttataccattt 255  Q
    ||||||||| |||||    
T  50161458 gcttttatatcattt 50161472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 20 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 37200267 - 37200028
Alignment:
Q  20 tgaacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtagactt 119  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||| | |  ||   ||||||||| ||||  ||||||| | ||||||||||| ||||| |||||    
T  37200267 tgaactttctgtctgacccactagatagaagattgacacttaagtttgaa-atgttatggggtaccaatgggtaagaggaaaacatgcatgtgt-gactt 37200170  T
Q  120 gactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaa 219  Q
    ||||   ||||||||||| ||||||||| |   |||| |||||||  ||||||| |||||| |||||| | ||||||| ||||||| ||||||| |||||    
T  37200169 gactgatgtttcaccactcgtgggattaaggaccggagcttttacaataggacatgcagccataaaagttacgtcaagtaaagtggtcaaacataagaaa 37200070  T
Q  220 gcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgctttt 261  Q
    || |||  | |||||||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  37200069 gcatgtgctaacaatcaatatgtttttataccatttgttttt 37200028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 212 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 38731704 - 38731615
Alignment:
Q  212 atgagaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttgaccttc 301  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| |  ||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  38731704 atgagaaagcgtgttctgacaatcaacatacttttatacaatttgcttttgaaacttttggcttcttagcaccagaggttgttaaccttc 38731615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 158 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 16500183 - 16500040
Alignment:
Q  158 cttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgc 257  Q
    ||||||| ||||||||  ||  |||||||| ||||||| | |||||||||||| || ||||| | |||| | ||||| ||||||| ||||||| ||||||    
T  16500183 cttttacggtaggacagacaatcctaaaagttgcgtcacgtaaagtggccaaatataagaaaacatgttctaacaattaacatgcctttatactatttgc 16500084  T
Q  258 ttttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttgaccttc 301  Q
    |||||| ||||| || |||||||||  ||||  |||||||||||    
T  16500083 ttttgacacttttgacttcctagcattagaggctgttgaccttc 16500040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 20 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 38731867 - 38731750
Alignment:
Q  20 tgaacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtagactt 119  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | | |  | ||| ||| ||||||||| |||||||||||| |||||| ||||   ||| || ||    
T  38731867 tgaacttccttactgacccactagatagaagatcgatagttaaacttgcagatattatggtgtgcggatgggtaggaggaaaatatgcaaatgtggattt 38731768  T
Q  120 gactagggtttcaccact 137  Q
    ||||||||||||||||||    
T  38731767 gactagggtttcaccact 38731750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 181 - 297
Target Start/End: Original strand, 50314605 - 50314721
Alignment:
Q  181 ctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctag 280  Q
    |||| |||||| | ||||||||||| ||||||||| ||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||  ||||||||     
T  50314605 ctaagagctgcataaagcaaagtggtcaaacatgacaaaacttgttctcacaatcaacatgcttttataccatttacttttgacattttttatttcctaa 50314704  T
Q  281 caccagagattgttgac 297  Q
    ||| |||  ||||||||    
T  50314705 cacaagatgttgttgac 50314721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 23044015 - 23043929
Alignment:
Q  169 ggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccattt 255  Q
    |||||| || |||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |  ||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  23044015 ggacaaacaaccctcaaagctgcatcaagcaaagtggccaaatatgagaaaacaagtactcacaatcaacatgcttttataccattt 23043929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 101
Target Start/End: Original strand, 22375471 - 22375538
Alignment:
Q  34 gacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaa 101  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  22375471 gacccacgagatagaagatcgacacttaggcctgcgaatgttatggtgtacgaattggtaggaggaaa 22375538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 250
Target Start/End: Original strand, 35387653 - 35387710
Alignment:
Q  193 tcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttatac 250  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  35387653 tcaagcaaagtggccaaacatgaaaaagtgtgttctgacgatcaacaagcttttatac 35387710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 193 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 36487000 - 36486924
Alignment:
Q  193 tcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagacttt 269  Q
    ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||  |||||||  |||||||||||| |||||    
T  36487000 tcaagtaaagtggtcaaatatgagaaagcgtgttttgacaatcaatatctttttatataatttgcttttgacacttt 36486924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 229 - 301
Target Start/End: Original strand, 24177540 - 24177612
Alignment:
Q  229 gacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttgaccttc 301  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||| |||||  |||| ||||||    
T  24177540 gacaatcaacatatttttataccatttgtttttgacagtttcggtttcctagcatcagaggctgtttaccttc 24177612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 193 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 15584988 - 15584894
Alignment:
Q  193 tcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagag 288  Q
    ||||||||||||  |||||||  |||| ||| || |||||||||||||| || |||||||||||| ||||| | ||| || |||||||||| ||||    
T  15584988 tcaagcaaagtgatcaaacattggaaaacgtattctgacaatcaacatgtttctataccatttgcgtttgacatttttga-ttcctagcactagag 15584894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 113
Target Start/End: Original strand, 35387133 - 35387230
Alignment:
Q  16 cctgtgaacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgt 113  Q
    |||||||||||||| || ||| ||||| |||||||||| ||| | | || ||| ||||||||| ||||| |||| ||| | || |||||||| |||||    
T  35387133 cctgtgaacttcctcacagactcactaaatagaagatctacagttaagcatgcagatgttatgatgtacagatgtgtaagaggtaaacatgcatgtgt 35387230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 228 - 301
Target Start/End: Original strand, 43831604 - 43831677
Alignment:
Q  228 tgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttgaccttc 301  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||| ||||| |   || ||| ||||||||||||||||||||    
T  43831604 tgacaatcaacatgtttttataccattgacttgtgacacttttgtcctcttagaaccagagattgttgaccttc 43831677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 32)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 18 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 53785998 - 53785715
Alignment:
Q  18 tgtgaacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtagac 117  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  53785998 tgtgaacttcctaactgacccgctagaaataagatcaacactcaggcatgcggatgttttggtgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagac 53785899  T
Q  118 ttgactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgaga 217  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| ||||    
T  53785898 ttgactggggtttcaccactagtgggattaggtgtcgggccttttaccgtaggataggcagcccttaaagccgcgtcaagtaaggtggccaaacacgaga 53785799  T
Q  218 aagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttgaccttc 301  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  53785798 aagcgtgttctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacactttcggtttcctagcaccagaggttgttgaccttc 53785715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 16 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 44199058 - 44198773
Alignment:
Q  16 cctgtgaacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtag 115  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  |||||||||| ||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  44199058 cctgtgaacttcgtgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcttgtggacattatggtgtatggatgagtaggtggaaaacatgttagtgtag 44198959  T
Q  116 acttgactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatga 215  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  44198958 acttgactggggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggtcaggcagctctaaaagttgcgtcaagcaaagtggccaaacatga 44198859  T
Q  216 gaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttgaccttc 301  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||| |||  |||||||||||    
T  44198858 gaaagcgtgttctgagaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacactttcggtttcttaacacccgaggctgttgaccttc 44198773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 18 - 301
Target Start/End: Original strand, 52741329 - 52741613
Alignment:
Q  18 tgtgaacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtagac 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52741329 tgtgaacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcagacttgcagatgttgtggtatacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtagac 52741428  T
Q  118 ttgactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccct-aaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgag 216  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| || |||||||||||    
T  52741429 ttgactgaggtttcaccacttgtgggattagatgtaggaccttttattgtaggacaggcagccctaaaaagctgagtcaaacaaattgaccaaacatgag 52741528  T
Q  217 aaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttgaccttc 301  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  52741529 aaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacacttttggtttcctagcaccagaggttgttgaccttc 52741613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 18 - 301
Target Start/End: Original strand, 39583047 - 39583330
Alignment:
Q  18 tgtgaacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtagac 117  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||    
T  39583047 tgtgaactttctgattgacccactagatagaagatcgacacttaggcatgcggatgttatagtgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgcgtggac 39583146  T
Q  118 ttgactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgaga 217  Q
    ||||||  ||||| |||||||||||||||| | ||||| || ||||  |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39583147 ttgacttaggttttaccacttgtgggattaagggtcgggccatttatggtaggataggcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgaga 39583246  T
Q  218 aagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttgaccttc 301  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| || ||||||| |||||||||| || || ||||||||||||    
T  39583247 aagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatatcatttgttttcgacactttcggtttcctagcatcataggttgttgaccttc 39583330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 19 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 49018251 - 49017969
Alignment:
Q  19 gtgaacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtagact 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| |||||| |||    
T  49018251 gtgaacttcctgactgacccactagatagaagattaacactcaggcatgcagatgttatggtgtacggattggtacgaggaaaacatgcatgtgtaaact 49018152  T
Q  119 tgactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaa 218  Q
    ||||| | |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||| |||| | ||| || ||||||| |||||||||||||    
T  49018151 tgactggagtttcaccacttgtggaattaggtgtcgagccttttacggtaggacaagcaaccctgaaagttacgtaaaacaaagtgaccaaacatgagaa 49018052  T
Q  219 agcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttgaccttc 301  Q
    || ||||| | |||||||||||| |||||||||||||  |||| | ||||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||    
T  49018051 agtgtgttctaacaatcaacatgtttttataccattttttttttacactttcggtttcctagcacccgaggttgttgatcttc 49017969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 22 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 13582796 - 13582516
Alignment:
Q  22 aacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttat--ggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtagactt 119  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||| |||  |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  13582796 aacttcctgactgatccattagatagaagatcaacactctggcttacggatgctatatggtgtatggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagactt 13582697  T
Q  120 gactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaa 219  Q
    |||   ||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||    
T  13582696 gaccgaggtttcaacacttgtgggattaggtgtcaggccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaatcaaagtgatcaaacataagaaa 13582597  T
Q  220 gcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttgaccttc 301  Q
    | ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||   |||||||||||||    
T  13582596 gtgtgttctgacaatcaacgtgtttttataccatttg-tttttacacttttgatttcctagcaccaacaattgttgaccttc 13582516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 16 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 7901143 - 7900864
Alignment:
Q  16 cctgtgaacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtag 115  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |      |   |||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||| ||||| |    
T  7901143 cctgtgaactttctgactgactcactagatagaagatcaacaccc------gtatatgttatggtgtatagatgtgtaggaggaaaacatgcatgtgtgg 7901050  T
Q  116 acttgactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatga 215  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||| |||||||    | |||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||    
T  7901049 acttgactggggtttcaccacttgtgggattaggggttgggtcttttacggtaggacggatatccctaaaaactgcgtcaagcaaaatagccgaacatga 7900950  T
Q  216 gaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttgaccttc 301  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  7900949 gaaagcgttttctgacaatcaacatgcttttataccatttgtttttgacactttcggcttcctagcatcagaggttgttgaccttc 7900864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 51 - 301
Target Start/End: Original strand, 37132851 - 37133100
Alignment:
Q  51 atcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtagacttgactagggtttcaccacttgtgggattaggt 150  Q
    ||||||||| || | || |||| |||||||||||||||| ||||    ||||||||| ||||||||| ||| |  ||||| ||||| |||||||||| ||    
T  37132851 atcaacactaagacatgtggatattatggtgtacggatgtgtagaaa-aaaacatgcatgtgtagacatgattgaggttttaccacctgtgggattaagt 37132949  T
Q  151 gtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttatac 250  Q
    ||| ||||||||| || || |||  |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  37132950 gtcagaccttttatcggagaacagacagccctaaaagctacgtcaagcaaagtggttaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgtttttatac 37133049  T
Q  251 catttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttgaccttc 301  Q
    |||||| |||| | ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  37133050 catttgttttttacactttcggtttcttagcaccagaggttgttgaccttc 37133100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 66 - 301
Target Start/End: Original strand, 54508251 - 54508485
Alignment:
Q  66 tgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtagacttgactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttacc 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| |||||  |||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| |   ||||||     
T  54508251 tgcggatgttatggtgtacggatgggtagaag-aaaacatgcatgtgtgtacttgattggggtttcaccacttgttggattaggtgtcaggatttttaca 54508349  T
Q  166 gtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaag-cgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgag 264  Q
     || ||||||||||| |||| | |||||||| |||| |||| ||||||||||||  | |||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||     
T  54508350 ataagacaagcagccataaa-gttgcgtcaaacaaaatggctaaacatgagaaaaacttgttctgacaattaacatgtttttatatcatttgcttttgac 54508448  T
Q  265 actttcgatttcctagcaccagagattgttgaccttc 301  Q
    | ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  54508449 atttttgattttctagcaccagaggttgttgaccttc 54508485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 61 - 301
Target Start/End: Original strand, 7501872 - 7502113
Alignment:
Q  61 aggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtagacttgactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggacctt 160  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||  |||| ||||| | |     
T  7501872 aggcctgcagatgttatggtatacggattggtagaaggaaaacatgcatgtgtagacttaaccagggtttcaccactcgtgggtctaggggtcgggc-tg 7501970  T
Q  161 ttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgc-gtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttatgacaatcaacatgctttt-ataccatttgct 258  Q
    ||||  ||||||||||  || |||||| |   |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  7501971 ttacgataggacaagctaccgtaaaagtttttgtcaagtaaagtggtcaaacatgagaaagcgtgttcgaacaatcaacatgttttttataccattttct 7502070  T
Q  259 tttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttgaccttc 301  Q
    ||||| | ||| | |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7502071 tttgacatttttggtttcctagcaccagaggttgttgaccttc 7502113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 38146349 - 38146069
Alignment:
Q  18 tgtgaacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacgg-------atgggtaggtggaaaacatgcttg 110  Q
    ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||   |||||||| |||||         ||| || || |||||| |||| ||    
T  38146349 tgtgaactttctcactgaccaactagatagaagatcgacacttaggcctg---atgttatgatgtacattgtatatatgagtcggaggaaaatatgcatg 38146253  T
Q  111 tgtagacttgactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaa 210  Q
    ||  ||||||  | ||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| |  |||||||| |||||||||||||| || |||| |||||||| ||||    
T  38146252 tgaggacttgcatggggtttcacgacttgtgggattaggggtcggagctttgagggtaggacatgcagccctaaaagcggcatcaatcaaagtggtcaaa 38146153  T
Q  211 catgagaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagagattgtt 294  Q
    |  |||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||    
T  38146152 cgcgagacaacgtgttttgacaatcaacatgtttttataccatttacatttgacacttttgacttcctagcaccagaggttgtt 38146069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 160 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 26772905 - 26772764
Alignment:
Q  160 tttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgctt 259  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26772905 tttacagtaggacatgcatccctaaaagttgtgtcaagcaaagtggccaaacatcagaaaacgtgttctgacaatcaacatgcttttataccatttgctt 26772806  T
Q  260 ttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttgaccttc 301  Q
    |||| ||||| |  ||||||||| |||||   ||||||||||    
T  26772805 ttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttc 26772764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 18 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 37992621 - 37992338
Alignment:
Q  18 tgtgaacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtagac 117  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||  ||||| ||| |||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||    
T  37992621 tgtgaactttctcactgacccacttgatagaagatggacacttaggtctgtagatgttatgatgtacggatgggtaggaggaaaacatgtgtgtgtggac 37992522  T
Q  118 ttgactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgaga 217  Q
    ||||   |||||||| ||||  || ||||||  ||||    |||||| ||||||||   ||||||  ||| || ||||| ||||||| |||||||||||     
T  37992521 ttgatcggggtttcatcactcatgagattagaggtcgagatttttacggtaggacatatagccctgcaagttgtgtcaaacaaagtgaccaaacatgagg 37992422  T
Q  218 aagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttgaccttc 301  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||   ||| |  ||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  37992421 aagcatgttctgacaatcaacatgattttatatcatttacttttgatggttttggcttcatagcactagaggttgttgaccttc 37992338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 66 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 5338888 - 5338653
Alignment:
Q  66 tgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtagacttgactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcg-gaccttttac 164  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||  | ||||||||| | ||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||  |   || |||||||    
T  5338888 tgcggatgttacggtgtatgaatgggtagaagaaaaacatgcatctgtggacttgatttgggttacaccacttgtgggattagggatttagagcttttac 5338789  T
Q  165 cgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgtta---tgacaatcaacatgcttttataccatttgctttt 261  Q
     ||||||||   |||||||| || |||||||| |||| | |||||||||||||||| | |||    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5338788 ggtaggacagaaagccctaagagttgcgtcaaacaaaattgccaaacatgagaaagtgcgttgcgttgacagtcaacatgcttttatacaatttgctttt 5338689  T
Q  262 gagactttcgatttcctagcaccagagattgttgac 297  Q
    || |||||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  5338688 gacactttcggcttcctagcactagagattgttgac 5338653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 29862086 - 29861948
Alignment:
Q  18 tgtgaacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtagac 117  Q
    |||||||||| || ||| |||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||    
T  29862086 tgtgaacttcttgtctggcccactagatagaagatcgacacttaggcatgcagatgttatggtgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtgaac 29861987  T
Q  118 ttgactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcgga 156  Q
    |||||| |||||| | |||||||  ||||||| ||||||    
T  29861986 ttgactggggtttaaacacttgttagattaggggtcgga 29861948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 142 - 301
Target Start/End: Original strand, 3443254 - 3443413
Alignment:
Q  142 ggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttatgacaatcaacatg 241  Q
    |||||||||||| |  |||||||  |||||||   || |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || | ||||||||||||    
T  3443254 ggattaggtgtcaggacttttacgataggacagagagtcctaaaagttgcgtcaagcaaaatggccaaacatgaaaaagtgtattctaacaatcaacatg 3443353  T
Q  242 cttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttgaccttc 301  Q
    |||||||||||||| || |||| ||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  3443354 cttttataccattttctgttgacactttcagtttcctagcactagaggttgttgaccttc 3443413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 65 - 298
Target Start/End: Original strand, 46940634 - 46940868
Alignment:
Q  65 ctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaa-catgcttgtgtagacttgactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggacctttta 163  Q
    |||| |||||||||||||| |||| | |||| | |||| ||||  |||||  ||||||||  |||||||  ||| ||||||||||| ||||    |||||    
T  46940634 ctgcagatgttatggtgtatggatagataggagcaaaaacatgtatgtgtgaacttgactgaggtttcattactcgtgggattaggggtcgaggatttta 46940733  T
Q  164 ccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttga 263  Q
      ||||||||  || | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  46940734 tggtaggacagacaactctaaaagatgcgtcaagcaaagtggccaaacattagaaaacatgttccgacaatcaacatgcttttataccatttgtttttga 46940833  T
Q  264 gactttcgatttcctagcaccagagattgttgacc 298  Q
     ||||| ||  ||||||||||| ||| | ||||||    
T  46940834 cacttttgacgtcctagcaccatagactattgacc 46940868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 193 - 301
Target Start/End: Original strand, 26856755 - 26856863
Alignment:
Q  193 tcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagagattg 292  Q
    ||||| ||| ||| |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||    
T  26856755 tcaagtaaaatggtcaaatatgataaagcgtgttgtgacaatcaacatgcttttataccatctgcttttgacgctttcgatttcctagcactagagactg 26856854  T
Q  293 ttgaccttc 301  Q
    |||||||||    
T  26856855 ttgaccttc 26856863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 201 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 32546901 - 32546801
Alignment:
Q  201 agtggccaaacatgagaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttgacctt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  32546901 agtggccaaacatgagaaagcgtgttcggacaatcaacatacttttataccatttgcttttgacactttcagtttcctagcaccaaaggctgttgacctt 32546802  T
Q  301 c 301  Q
    |    
T  32546801 c 32546801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 143 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 25325195 - 25325035
Alignment:
Q  143 gattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttatgacaatcaacat-- 240  Q
    ||||||| || || |||||||  |||||||| | ||  ||||||| |||||||||||||||| | |||||| | ||| ||| || || ||||||||||      
T  25325195 gattaggggttgggccttttatggtaggacatgtagttctaaaagttgcgtcaagcaaagtgacaaaacattataaaacgtattttggcaatcaacatat 25325096  T
Q  241 gcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttgaccttc 301  Q
    | ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25325095 gtttttataccatttgctttcaacactttcgatttcctagcaccatagattgttgaccttc 25325035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 109 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 51234801 - 51234622
Alignment:
Q  109 tgtgtagacttgactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggcca 208  Q
    ||||| ||||||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||   |||||||  |||||||| || |||||||| |||||||||                
T  51234801 tgtgtggacttgattaaggtttcaccacttgtgggtttaggggtcgagacttttacgataggacaaacaaccctaaaaactgcgtcaa------------ 51234714  T
Q  209 aacatgagaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttgaccttc 301  Q
     |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||    
T  51234713 -acatgaaaaagcatgttatgacaaccaacatgcttttataccatttatttttgacactttcgactttctagcatcagaggttgttgaccttc 51234622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 159 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 4473209 - 4473081
Alignment:
Q  159 ttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgct 258  Q
    |||||| ||||||||   |||| |||||  |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| | || ||||| ||| |||||||| ||||| |    
T  4473209 ttttacggtaggacagagagccttaaaaattgcgtcaagcaaagtgtcaaaacatgaaaaagcgtgttctaaccatcaatatgtttttatactatttgtt 4473110  T
Q  259 tttgagactttcgatttcctagcaccaga 287  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  4473109 tttgacactttcggcttcctagcaccaga 4473081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 207 - 269
Target Start/End: Original strand, 38670887 - 38670949
Alignment:
Q  207 caaacatgagaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagacttt 269  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  38670887 caaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgtttttgacacttt 38670949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 301
Target Start/End: Original strand, 38978754 - 38978900
Alignment:
Q  155 gaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatt 254  Q
    |||||||||| |||||| |  || ||||||||| || |||||||||| |||  | ||||| |||| ||| || |||||||||| ||| |||||||| |||    
T  38978754 gaccttttacggtaggaaatacaaccctaaaagttgtgtcaagcaaattggttagacatgtgaaaacgtattttgacaatcaatatgtttttatactatt 38978853  T
Q  255 tgcttttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttgaccttc 301  Q
    || |||||| ||||| | |||||||||||| |||   ||||||||||    
T  38978854 tgtttttgacacttttggtttcctagcacctgaggccgttgaccttc 38978900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 270
Target Start/End: Original strand, 52411903 - 52411961
Alignment:
Q  212 atgagaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttc 270  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  52411903 atgagagagcgtgttctgacaatcaacatgcttttattccatttgcttttgacactttc 52411961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 100 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 35236413 - 35236249
Alignment:
Q  100 aaacatgcttgtgtagacttgactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagca 199  Q
    |||||||| ||||| ||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||  |||  |||||||  |||||| | | ||| ||||||| ||||||||| |    
T  35236413 aaacatgcatgtgtggacttgattgaggtttcaccacctgtgggattagggatcgagccttttatggtaggataggtagctctaaaagttgcgtcaagta 35236314  T
Q  200 aagtggccaaacatgagaaagc-----gtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgctt 259  Q
    || || |||||| | ||||| |      ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  35236313 aaatgaccaaacttaagaaaacatgttatgttatgacaatcaaaatacttttataccatttgctt 35236249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 149
Target Start/End: Original strand, 52411720 - 52411851
Alignment:
Q  18 tgtgaacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtagac 117  Q
    |||||||||  | ||||||||||||||||||||||  || || |||||||| ||||||||| ||| || ||||  ||| ||||||| | | | ||| |||    
T  52411720 tgtgaactttttaactgacccactagatagaagattgacgcttaggcctgcagatgttatgatgtccgaatggacaggaggaaaacttacatatgtggac 52411819  T
Q  118 ttgactagggtttcaccacttgtgggattagg 149  Q
    | ||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  52411820 tcgactgaggttttaccacttgtgggattagg 52411851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 208 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 21552766 - 21552674
Alignment:
Q  208 aaacatgagaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttgaccttc 301  Q
    ||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| | ||||  |||||||||| |||||| |||||||||||    
T  21552766 aaacatgggaaaatgtattatgacaatcaacatgcttt-ataccatttatttttgacattttcagtttcctagcatcagagactgttgaccttc 21552674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 43123431 - 43123155
Alignment:
Q  20 tgaacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtagactt 119  Q
    |||||||| || ||||||||| |||| ||||| | ||||| |||||  |  |||||||||||||||| |||| ||    ||||||  | ||||| |||||    
T  43123431 tgaacttcttgtctgacccacaagatggaagaccgacacttaggccaacaaatgttatggtgtacgggtgggcagaacaaaaacaaacatgtgtggactt 43123332  T
Q  120 gactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaa 219  Q
     | | |||||||||| |||||||||||  |  |  || |||| || || ||||| ||| || | ||||  || |||||||||||| | |||||||| |||    
T  43123331 aattggggtttcacctcttgtgggattgaggattagagcttt-acggtgggacatgcaaccatcaaagtcgcatcaagcaaagtgtctaaacatgataaa 43123233  T
Q  220 gcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttgac 297  Q
    |  |||| |||||||||||||| | |||||| |||| |  |||| ||||| ||||| ||||||||| || ||||||||    
T  43123232 ggatgttctgacaatcaacatgttgttatactatttacgattgacacttttgattttctagcaccatagtttgttgac 43123155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 301
Target Start/End: Original strand, 3376675 - 3376842
Alignment:
Q  135 acttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttatgacaat 234  Q
    |||||| |||||||| |||| | ||||||| |||||| | |||  | ||||| |||||||||| ||| |||  |||||||| ||| | | || | |||||    
T  3376675 acttgtaggattaggggtcgcaacttttacggtaggatatgcattcttaaaaactgcgtcaagaaaaatggttaaacatgataaaacatattctcacaat 3376774  T
Q  235 caacatgcttt-tataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttgaccttc 301  Q
    ||||||  ||| || |||||||||||||||   ||| | ||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  3376775 caacatattttatagaccatttgcttttgacttttttggtttcctagcactagaggttgttgaccttc 3376842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 241
Target Start/End: Original strand, 45676778 - 45676828
Alignment:
Q  191 cgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttatgacaatcaacatg 241  Q
    |||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  45676778 cgtcaagcaaagtgaccaagcataagaaaacgtgttctgacaatcaacatg 45676828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 179 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 13772577 - 13772493
Alignment:
Q  179 ccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttga 263  Q
    |||| |||||||| ||||||||||    ||||||||||||| ||||||    |||||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  13772577 ccctcaaagctgcttcaagcaaagccatcaaacatgagaaaacgtgttccatcaatcaacacacttttataccatttgcgtttga 13772493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 38)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 15 - 284
Target Start/End: Original strand, 30940554 - 30940822
Alignment:
Q  15 acctgtgaacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgta 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30940554 acctgtgaacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactaaggcctacgaatgttatggtgtacgaatgggtaggtggaaaacatgcttgtgta 30940653  T
Q  115 gacttgactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatg 214  Q
    |||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||||||  || ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  30940654 gacttgactgaggtttcgccacttgtgggattaagtgtcaaaccttttaccataggacagacaaccctaaaagttgcgtcaagtaaagtggtcaaacatg 30940753  T
Q  215 agaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcacc 284  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30940754 agaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacca-ttgcttttgacactttcgatttcctagcacc 30940822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 16 - 269
Target Start/End: Original strand, 50000741 - 50000995
Alignment:
Q  16 cctgtgaacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtag 115  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |    
T  50000741 cctgtgaactttctgactgacccactagatagaagatcgacacttaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggttggaggaaaacatgcatgtgtgg 50000840  T
Q  116 acttgactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatga 215  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| | ||| || ||  ||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  50000841 acttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtaggacagacagctctaaaagctgcgtcaagcaaagtggtcaaacatga 50000940  T
Q  216 gaaagcgtgttatgacaatcaacatgctttt-ataccatttgcttttgagacttt 269  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||    
T  50000941 gaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttaatacaatttgcttttgacacttt 50000995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 16 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 31847378 - 31847107
Alignment:
Q  16 cctgtgaacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtag 115  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||| | || ||||||||||| ||||| |    
T  31847378 cctgtgaactttctgactgacccactagataaaagattgacacttaggcctgcagatattatggtgtacagatggattggaggaaaacatgcatgtgtgg 31847279  T
Q  116 acttgactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatga 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31847278 acttgactagggtttcaccacttgtgggtttaggggtgggggcttttacagtaggacaggcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggtcaaacatga 31847179  T
Q  216 gaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccaga 287  Q
    |||| | |||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| |  ||||||||| ||||    
T  31847178 gaaaccatgttctgacagtcaacatgtttttttaccatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcaga 31847107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 15 - 301
Target Start/End: Original strand, 12918187 - 12918473
Alignment:
Q  15 acctgtgaacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgta 114  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||     
T  12918187 acctgtgaactttctaactgacccactagatagaagatcgacacttaggcctgtggatgtcatggtgtatggatgggtaagaggaaaacatgcatgtgtg 12918286  T
Q  115 gacttgactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatg 214  Q
     | |||||| | |||||| |||||||||||||| |  ||||  ||||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||     
T  12918287 tagttgactggagtttcatcacttgtgggattaagattcggggcttttacggtaggacaaacaaccctaaaagttgcgtcaaacaaagtggtcaaacata 12918386  T
Q  215 agaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttgaccttc 301  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12918387 agaaatcgtgttctgacaatcaacacacttttatactatttacttttgacactttcgacttcctagcatcagagattgttgaccttc 12918473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 17 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 53170791 - 53170519
Alignment:
Q  17 ctgtgaacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtaga 116  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53170791 ctgtgaacttcctgactgacctactagatagaagatcaacacttaggcatgcagacgttatggt------atgggtaggtggaaaacatgcttgtgtaga 53170698  T
Q  117 cttgactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgag 216  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  | || | | ||||| ||||||||||||    
T  53170697 cttgactggggtttcaccactcgtgggattaggtgtcggaccttttacagtatgacaggcagccctaaaagtcgtgttaggtaaagtagccaaacatgag 53170598  T
Q  217 aaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttgaccttc 301  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||       |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||    
T  53170597 aaagcgtgttctgacagtcaacatgctt------gatttgcttttgacactttcggtttgctagcaccagaggctgttgaccttc 53170519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 51 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 53619842 - 53619592
Alignment:
Q  51 atcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtagacttgactagggtttcaccacttgtgggattaggt 150  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||      
T  53619842 atcaacacttaggcctgcatatgttatggtgtacggatgagttggaggaaaacatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttagag 53619743  T
Q  151 gtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttatac 250  Q
    || ||  ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  53619742 gtgggggcttttacagtaggacaggcaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaaacgtgttctgacaatcaacatgcttttatac 53619643  T
Q  251 catttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttgaccttc 301  Q
    |||||| |||||| ||||| || ||||||||| |||||   ||||||||||    
T  53619642 catttgtttttgacacttttgacttcctagcatcagaggcagttgaccttc 53619592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 18 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 132676 - 132395
Alignment:
Q  18 tgtgaacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtagac 117  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||  ||| ||| ||||||||||||||| |||  ||||| |||||| |||| |||||  ||    
T  132676 tgtgaacttcttgactggtccactagatagaagatcgacacttcggcatgcagatgttatggtgtacagatacgtaggaggaaaatatgcatgtgtgaac 132577  T
Q  118 ttgactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgt--aggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatga 215  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  132576 ttgactggggtttcaccacttgttggattaggggtcgggacttttacggtgtaggacaggcagccctaaaagctgcgtcaagcaaaatggcaaaacatga 132477  T
Q  216 gaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttgac 297  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||  | ||||||||||||||    
T  132476 gaaatcgtgttctgacaatcaacatgcttttataccatttgttttttacactttcggtttcctaatatcagagattgttgac 132395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 18 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 26521777 - 26521494
Alignment:
Q  18 tgtgaacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtagac 117  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | | |||| || | |||||||||||| || ||||||| ||||||||||| ||| | |||    
T  26521777 tgtgagctttctgactgacccactagatagaagatcgacatttaagcctacgaaggttatggtgtacagacgggtaggaggaaaacatgcatgtatggac 26521678  T
Q  118 ttgactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgaga 217  Q
    |||||| | |||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| |    
T  26521677 ttgactggagtttcatcacttgtgggattaggggtcagaccttttatggtaggacaaacaaccctaaaagttgcgtcaaacaaagtggctaaacatgaaa 26521578  T
Q  218 aagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttgaccttc 301  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  | ||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  26521577 aaacgtgttatgacaatcaacatgcttttatatcatatgctttcaacacttttggtttcctagcaccagaggctgttgaccttc 26521494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 18 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 25504582 - 25504302
Alignment:
Q  18 tgtgaacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtagac 117  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||    
T  25504582 tgtgaacttcttgatagacccactagatagaagtttaacactcagacatgcggatgttatggtgtacggatgggtaggagaaaaacatgcatgtatagac 25504483  T
Q  118 ttgactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgaga 217  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||| |||| ||| |||| |||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||    
T  25504482 ttgactgaggtttcaccacttgtgggattaggcgtcaggccttttacggtatgacaggcaaccct-aaagttgcatcaagcaaa-tggtcaaacatgaga 25504385  T
Q  218 aagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttgacctt 300  Q
    || |||||| | |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| | ||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  25504384 aaacgtgttctaacaatcgacatgtttttataccgtttgcttttgacatttttggtttcctagcactagagactgttgacctt 25504302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 16 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 16957827 - 16957579
Alignment:
Q  16 cctgtgaacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtag 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  16957827 cctgtgaacttcctgactgacccgctagataaaagatcaacacttaggcctgcagatgttatggtgtacggatgggtaggtgtaaaacatgcatgtgtgg 16957728  T
Q  116 acttgactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatga 215  Q
    |||||||  |||    ||||||||| |||||||| ||||| ||| |||| |||||| | |||| |||||||| |||||  |||||| || ||||||||||    
T  16957727 acttgac--ggg----accacttgttggattaggggtcgggcctcttacagtaggataggcagtcctaaaagttgcgtagagcaaaatgaccaaacatga 16957634  T
Q  216 gaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttc 270  Q
    ||||| ||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  16957633 gaaagtgtgctctgataatcaacatgcttatataccatttgcttttgacactttc 16957579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 19 - 301
Target Start/End: Original strand, 56461926 - 56462207
Alignment:
Q  19 gtgaacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtagact 118  Q
    ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| | || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  56461926 gtgaaattcctggctgatccactagatagaagatcgacacttaagcatgcgaatgttatggtgtacggatgagtaggtggaaaacatgcatgtgtggact 56462025  T
Q  119 tgactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaa 218  Q
    |||||  |||||||||| |||| |||||||| ||||   ||||||| || | | |  |  ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||    
T  56462026 tgactgaggtttcaccatttgttggattaggggtcgagacttttacggttgtatagaccaccctaaaagttgcgtcaaacaaagtgg-caaacatgataa 56462124  T
Q  219 agcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttgaccttc 301  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| || ||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  56462125 agcgtgttctgacaatcaacatgtttttataccatttgttttagacacttttggtttcctagcaccagaggttgttgaccttc 56462207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 22 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 12053696 - 12053426
Alignment:
Q  22 aacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtagacttga 121  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||  || |||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| ||| | |    
T  12053696 aacttcctgactgatccactagatagaagatcgagactttggtctgcagatgttatgttgtacagatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtggacatta 12053597  T
Q  122 ctagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagc 221  Q
     | ||||||||||| | || ||||| || ||||   ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |    
T  12053596 ttggggtttcaccattagttggattgggggtcga--cttttacagtaggacaaacagctctaaaagctgcgtcaaacaaagttgtcaaacatgagaaatc 12053499  T
Q  222 gtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagagattgtt 294  Q
    ||||| | |||||||| | | ||||||| |||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  12053498 gtgttctaacaatcaaaacgtttttatatcatttgctttcgactctttcaatttcctagcaccagagactgtt 12053426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 41 - 282
Target Start/End: Original strand, 55933303 - 55933544
Alignment:
Q  41 tagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtagacttgactagggtttcaccacttgt 140  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| | || ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  ||| |  | || ||  |||||||||| |||||    
T  55933303 tagatagaagatcgacacttaggtccgcagatgttatggtctacggatgggttggaggaaaacatgaatgtctgaatttaaccggggtttcaccccttgt 55933402  T
Q  141 gggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttatgacaatcaacat 240  Q
    ||| ||| | ||| |  ||||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| | |||||||||||    
T  55933403 gggtttaagggtcagggcttttacggtaggacagtcagccctaaaagttgcgtcaaacaaagtggccaaacatgagaaagtttgttctaacaatcaacat 55933502  T
Q  241 gcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagca 282  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  55933503 gcttttataccatttgcttttgacactttcgacttcctagca 55933544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 15 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 3330242 - 3330078
Alignment:
Q  15 acctgtgaacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgta 114  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| | || ||||||| ||| |||||     
T  3330242 acctgtgaactttctgactgacccactagatagaagatcaacacttaggcatgcagatgttatggtgtacggatggattggaggaaaacgtgcatgtgtg 3330143  T
Q  115 gacttgactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagc 179  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||  ||||||| |||||||| |||||    
T  3330142 gacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtgggggcttttacggtaggacaggcagc 3330078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 135 - 301
Target Start/End: Original strand, 50462881 - 50463047
Alignment:
Q  135 acttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttatgacaat 234  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||| ||| ||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||| || ||  ||||||    
T  50462881 acttgttggattaggtgtcggtacttctacggtaggacagacagccttaaaagttgcgtcaagcaagatgaccaaacatgagaaagtgtcttccgacaat 50462980  T
Q  235 caacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttgaccttc 301  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  50462981 caacatgctttcataccatttgcttttgacacttttgatttccttacaccagagactgttgaccttc 50463047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 159 - 301
Target Start/End: Original strand, 600651 - 600793
Alignment:
Q  159 ttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgct 258  Q
    |||||| ||||||||  || ||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  600651 ttttactgtaggacagacaaccctaaaagttatgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaaacgtgttctaacaattaacatgcttttataccatttgct 600750  T
Q  259 tttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttgaccttc 301  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  600751 tttgtcactttcggtttcctaacaccagaggttgttgaccttc 600793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 90 - 301
Target Start/End: Original strand, 34107583 - 34107797
Alignment:
Q  90 ggtaggtggaaaacatgcttgtgtagacttgactagggtttcaccacttg-tgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagc 188  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||| ||||   ||||||||||| ||  || |||||||||||||| || ||||||||  |||  ||  |||||||      
T  34107583 ggtaggtggaaaatatgcttggatagatttgaacggggtttcaccattttatgagattaggtgtcggatctcttaccgtataacagacaatcctaaaaat 34107682  T
Q  189 tgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttat--gacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccag 286  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||  |  || |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34107683 tgcgtcaaacgaagtggccaaacatgagaaaacgtgtgttcagataatcaacatgtttttataccatttgtttttgacactttcgatttcctagcaccag 34107782  T
Q  287 agattgttgaccttc 301  Q
    ||  |||||||||||    
T  34107783 aggctgttgaccttc 34107797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 25706798 - 25706669
Alignment:
Q  18 tgtgaacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtagac 117  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| || |||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||||| |||    
T  25706798 tgtgaactttctgactgacccactagatagaagatcgacacttaagcctacgtatgttatggtgtacagatgggtaggagaaaaacatgcatgtgtggac 25706699  T
Q  118 ttgactagggtttcaccacttgtgggatta 147  Q
    |||| | ||||||||| || ||| ||||||    
T  25706698 ttgatttgggtttcactacctgtcggatta 25706669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 183 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 23255828 - 23255748
Alignment:
Q  183 aaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttga 263  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23255828 aaaagttgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaattaacatgcttttataccatttgtttttga 23255748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 215 - 301
Target Start/End: Original strand, 50483211 - 50483297
Alignment:
Q  215 agaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttgaccttc 301  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  50483211 agaaagcgtcttctgacaatcaacatgattttataccatttgctttcgacactttcggtttcctagcaccagaggttgttgaccttc 50483297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 129 - 269
Target Start/End: Original strand, 45385990 - 45386130
Alignment:
Q  129 ttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttat 228  Q
    |||||||||||||||||||||   || | ||||| | |||||||| ||| |||||||||||  |||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |    
T  45385990 ttcaccacttgtgggattagggcccgaaacttttgcggtaggacatgcaaccctaaaagctaagtcaaggaaagtggtcaaacataagaaagcgtgttct 45386089  T
Q  229 gacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagacttt 269  Q
    |||||||||  |  ||||||||||||| | ||||| |||||    
T  45386090 gacaatcaatttctttttataccatttacatttgaaacttt 45386130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 158 - 301
Target Start/End: Original strand, 48656868 - 48657012
Alignment:
Q  158 cttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgc 257  Q
    ||||||| ||| ||||  |||||||||||| | | ||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||     
T  48656868 cttttacagtatgacagacagccctaaaagtttcatcaagtaaaatggacaaacatgagaaagtgtgttatgtcaatcaaaatgtttttataccatttgt 48656967  T
Q  258 ttttgagactttcgatttcctagc-accagagattgttgaccttc 301  Q
    |||||| |||||||| ||| |||| |  |||| ||||||||||||    
T  48656968 ttttgacactttcgacttcttagcgattagaggttgttgaccttc 48657012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 18 - 269
Target Start/End: Original strand, 6865631 - 6865889
Alignment:
Q  18 tgtgaacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtagac 117  Q
    ||||||||| || ||||| | | ||||||||||||  ||||| |||  ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||  |     
T  6865631 tgtgaactttctaactgatctattagatagaagattgacacttaggtatgcggatgttatgatgtacgtatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtgtat 6865730  T
Q  118 ttgactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacat---- 213  Q
    ||  |  | ||||||||| ||||| || ||   ||||   ||||||| |||| |||| ||||| |||||||| ||   | ||||||| ||||||||        
T  6865731 ttatcgggagtttcaccatttgtgagactaaaggtcgtggcttttacggtagaacaaacagccataaaagctacgattaacaaagtgtccaaacatgaaa 6865830  T
Q  214 ---gagaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagacttt 269  Q
       |||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  6865831 cacgagaaaacgtgttctgactatcaacatgcttttatatcatttgcttttgacacttt 6865889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 85 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 1041533 - 1041386
Alignment:
Q  85 ggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtagacttgactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggacctttt-accgtaggacaagcagcccta 183  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | ||| |||  ||||   |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||| | |||    
T  1041533 ggatgggtaggaggaaaacatgcatatgtggac--gacttaagtttcaccacttatgggattaggtgtcagacctttttatggtaggacaagcaactcta 1041436  T
Q  184 aaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttatgacaa 233  Q
    |||| || ||||| || ||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||    
T  1041435 aaagttgtgtcaaacatagtggtcaaacataagaaagtgtgttctgacaa 1041386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 219 - 301
Target Start/End: Original strand, 7536590 - 7536672
Alignment:
Q  219 agcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttgaccttc 301  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| | ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7536590 agcgtgttttgacaatcaacatgtttttatacaatttgtttttgacaatttcagtttcctagcaccagaggttgttgaccttc 7536672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 34 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 18534673 - 18534585
Alignment:
Q  34 gacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtagacttgac 122  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  18534673 gacccactagattgaagatcgacacttaggcctacaaatgttatggtatacggatgggtagaaggaaaacatgcatgtgtggacttgac 18534585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 55 - 146
Target Start/End: Original strand, 38535441 - 38535532
Alignment:
Q  55 acactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtagacttgactagggtttcaccacttgtgggatt 146  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| |||  || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38535441 acacttaggtctgtggatgttattgtggacggatgggtaggaggaaaatatgtgtgagcagacttgactagggtttcactacttgtgggatt 38535532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 301
Target Start/End: Original strand, 46391240 - 46391415
Alignment:
Q  125 gggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtg 224  Q
    |||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||| |||||| | |  | |||||||||| |||| | ||||| ||  ||||| |||||| | ||    
T  46391240 gggtttcaccacttgtaggattagaggtcggatcttttacggtaggatatgttgacctaaaagctacgtcgaacaaagcggttaaacacgagaaaacatg 46391339  T
Q  225 ttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttgaccttc 301  Q
    || | |||  ||||||| |||||||||| |||||| | | | ||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||    
T  46391340 ttctcacagccaacatgtttttatacca-ttgcttgtaacattttcgatttcctatcagtagaggttgttgaccttc 46391415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 228 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 3330075 - 3330002
Alignment:
Q  228 tgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttgaccttc 301  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |  ||||||||| |||||   ||||||||||    
T  3330075 tgacaatcaacatgcttttatactatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttc 3330002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 191 - 287
Target Start/End: Original strand, 46440880 - 46440976
Alignment:
Q  191 cgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccaga 287  Q
    |||||| |||||||| ||||||| | |||| ||||| | ||||| |||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||    
T  46440880 cgtcaaacaaagtggtcaaacataaaaaagtgtgttctaacaattaacacgtttttatatcatttgcttttgacactttcggcttcctagcatcaga 46440976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 256
Target Start/End: Original strand, 34536931 - 34536988
Alignment:
Q  199 aaagtggccaaacatgagaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttg 256  Q
    |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  34536931 aaagtgaccaaacatgaaaaaacgtgttatgacaatcaacatatttttatactatttg 34536988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 70 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 53098643 - 53098606
Alignment:
Q  70 gatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgc 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  53098643 gatgttatggtgtacggatgggtaggaggaaaacatgc 53098606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 149
Target Start/End: Original strand, 9815706 - 9815809
Alignment:
Q  45 tagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtagacttgactagggtttcaccacttgtggga 144  Q
    ||||||||||||| | ||  |||| |||| |||||||||| ||| |||||| |||||||| || |||||| ||||||   ||||||| ||||| ||||||    
T  9815706 tagaagatcaacatttagatctgcagatgctatggtgtacagataggtaggaggaaaacaagcatgtgta-acttgatcggggtttcgccactagtggga 9815804  T
Q  145 ttagg 149  Q
    |||||    
T  9815805 ttagg 9815809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Original strand, 38535607 - 38535663
Alignment:
Q  238 catgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagagattgtt 294  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||    
T  38535607 catgctcttataccatttgcatttgacacttttgacttcctagcaccagaggttgtt 38535663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 269
Target Start/End: Original strand, 43849325 - 43849417
Alignment:
Q  177 agccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagacttt 269  Q
    |||||| ||||| || | |||||  ||||||||||| |||||||||||||  || || |||||||||||||||| |||||  ||||| |||||    
T  43849325 agccctcaaagccgctttaagcagtgtggccaaacacgagaaagcgtgttcagataaccaacatgcttttatactatttgtgtttgacacttt 43849417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 199 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 28740014 - 28739912
Alignment:
Q  199 aaagtggccaaacatgagaaagcgtgttatgacaatcaacatgc-ttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttgac 297  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||||| ||||| | ||||||  |||||||||||||   ||||| |||||||| |||||| ||||| |  ||||||||    
T  28740014 aaagtggccaaacacgagaaattgtgttgtgacagttaacatgtgttttataccatttatgtttgacactttcgacttcctaacaccacaagttgttgac 28739915  T
Q  298 ctt 300  Q
    |||    
T  28739914 ctt 28739912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 54927675 - 54927614
Alignment:
Q  88 tgggtaggtggaaaacatgcttgtgtagacttgactagggtttcaccacttgtgggattagg 149  Q
    |||||||| || |||||||| ||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||    
T  54927675 tgggtaggagggaaacatgcatgtgtggacttgattggggtttccccacttgtgggtttagg 54927614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 207 - 263
Target Start/End: Original strand, 45760841 - 45760897
Alignment:
Q  207 caaacatgagaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttga 263  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| | ||||| |||||    
T  45760841 caaagatgagaaagcgtgttttgacaatcaacatatttttatatcttttgcatttga 45760897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 29)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 17 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 24125318 - 24125034
Alignment:
Q  17 ctgtgaacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtaga 116  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| || |||||||  |||||||||| ||||||||    
T  24125318 ctgtcaacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcatatgttatggtctactgacgggtaggaagaaaacatgcatgtgtaga 24125219  T
Q  117 cttgactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgag 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  24125218 cttgactggggtttcaccacttgtgggattatgcgtcgtgccttttacggtgggacaagcagccctaaaagctgcatcaagcaaaatggccaaacatgag 24125119  T
Q  217 aaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttgaccttc 301  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  24125118 aaagcgtgctctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacaattttgatttcctagcaccagaggttgttggccttc 24125034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 18 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 500516 - 500254
Alignment:
Q  18 tgtgaacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtagac 117  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  500516 tgtgaacttcctgatttacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatgttgtatggatgggtagaaggaaaacatgcatgtgtagac 500417  T
Q  118 ttgactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgaga 217  Q
    |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  500416 ttgagtgaggtttcaccacttgtgggattaggtgtcgggccttttacggtaggaccgacagccctaaaagttgcgtcaagcaaagtggccaaacatgaga 500317  T
Q  218 aagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctag 280  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||    
T  500316 aaacgtgttctgacaatcaacatgcttttataccatttacttttgacattttcggtttcctag 500254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 16 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 39434958 - 39434686
Alignment:
Q  16 cctgtgaacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtag 115  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||      
T  39434958 cctgtgaactttctgactgacccactagatagaagatcgacacttaggtctgtcgatgttatggtgtacggatgggttggaggaaaacatgcatgtgtgt 39434859  T
Q  116 acttgactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatga 215  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || |   ||||||| |||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39434858 acttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtggaggcttttacagtaggacaggaagctctaaaagttgcgtcaagcaaagtggccaaacatga 39434759  T
Q  216 gaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagag 288  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||| |||||    
T  39434758 gaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttataccatttgtttttgacacttttgacttcctagcatcagag 39434686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 16 - 301
Target Start/End: Original strand, 35739803 - 35740087
Alignment:
Q  16 cctgtgaacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtag 115  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  35739803 cctgtgaactttctgactgacccatttggtagaagatcaacacttaggcatgcagatgttatggtgtatgaatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtgg 35739902  T
Q  116 acttgactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatga 215  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||  || ||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  35739903 acttgactggggtttcaccactagtgggattaag-gtcgggccttttacggtaggacagacatccctaaaagttgtgttaagcaaagtggccaaacatga 35740001  T
Q  216 gaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttgaccttc 301  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35740002 gaaagcgggttctgacaatcaacatgtttttatacaattagcttttgacactttcagtttcctagcaccagagattgttgaccttc 35740087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 18 - 298
Target Start/End: Original strand, 25021632 - 25021912
Alignment:
Q  18 tgtgaacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtagac 117  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  25021632 tgtgaacttcttgtctgacccactagatagaagatcgtcacttaggcctgcagatgttatggtgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtggac 25021731  T
Q  118 ttgactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgaga 217  Q
    |||||  | ||||||||||||||||||||||| ||||    |||||| ||| ||||  |||||||||||| || ||||||||||||||  ||| ||||||    
T  25021732 ttgaccggagtttcaccacttgtgggattaggggtcgatgtttttacagtatgacatacagccctaaaagttgtgtcaagcaaagtggtgaaatatgaga 25021831  T
Q  218 aagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttgacc 298  Q
    ||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||| |  ||||||||||||||| |||||||||    
T  25021832 aagtgtgttctcacaatcaacatgtttttataccattttcttttgacatttttggcttcctagcaccagaggttgttgacc 25021912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 35 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 37517366 - 37517163
Alignment:
Q  35 acccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtagacttgactagggtttcacc 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||    
T  37517366 acccactagatagaagatcaacactcatgcctgcaaatgtgatggtgtacggatgggtaggtggaaaatatgtttgtgtagacttgactggggtttcgcc 37517267  T
Q  135 acttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttatgacaat 234  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||    
T  37517266 acttgttggattaggcgtaggaccttttaccgtaggacagacagctctaaaagctgcatcaagcaaagtggccaaacatgagaaagggtgttccgacaat 37517167  T
Q  235 caac 238  Q
    ||||    
T  37517166 caac 37517163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 68 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 3188208 - 3187975
Alignment:
Q  68 cggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtagacttgactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgt 167  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||| ||||| | ||||  | ||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||| ||    
T  3188208 cggatgttatggtgtacggatggattggaggaaaacatgcatgtgtggccttgtgtggggtttcaccacttgtgggtttagg-gtcggggcttttacggt 3188110  T
Q  168 aggacaagcagcc-ctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagac 266  Q
    |||||| | |||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3188109 aggacaggaagcctctaaaagttgcatcaagcaaagtggcaaaacatgaggaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgaaac 3188010  T
Q  267 tttcgatttcctagcaccagagattgttgaccttc 301  Q
    |||||  ||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  3188009 tttcggcttcctagcatcagaggttgttaaccttc 3187975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 74 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 38815517 - 38815300
Alignment:
Q  74 ttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtagacttgactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggaca 173  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |          ||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||  ||||||||    
T  38815517 ttatggtgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtgg----------ggtatcaccacttgtgggattaggggtcggggcttttatggtaggaca 38815428  T
Q  174 agcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgat 273  Q
      |||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||       
T  38815427 gacagccctaaaagccacgccaaacaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacactttccgc 38815328  T
Q  274 ttcctagcaccagagattgttgaccttc 301  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||    
T  38815327 ttcctagcaccagagggtgttgaccttc 38815300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 128 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 6592753 - 6592581
Alignment:
Q  128 tttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgtta 227  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| |  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  6592753 tttcaccgtttgtgggattaggtgtcgg-ccttttacgataggatagacagtcgtaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttc 6592655  T
Q  228 tgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttgaccttc 301  Q
    | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  6592654 tcacaatcaacatgattttaaaccatttgcttttgacactttcagtttcctagctccagaggttgttgaccttc 6592581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 182 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 8882452 - 8882339
Alignment:
Q  182 taaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagc 281  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||||  ||| |||||    
T  8882452 taaaacctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaatatgcttttaaaccatttgtttttga-actttcagttttctagc 8882354  T
Q  282 accagagattgttga 296  Q
    ||||||| |||||||    
T  8882353 accagaggttgttga 8882339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 70 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 8620045 - 8619860
Alignment:
Q  70 gatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtagacttgactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtag 169  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | ||||||      |||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||   |||||||  |||    
T  8620045 gatgttatggtgtacgaatgggtaagaggaaaa------tgtgtgaacttgactggggtttcaccacttgtgggattagagatcgtgacttttacgatag 8619952  T
Q  170 gacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgctttt 261  Q
     |||  |||||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  8619951 aacagacagccctaaaagttgcgtcaagtaaaatggtcaaacatgaaaaagcgtattttgacaatcaacgtgcttttataccatttgttttt 8619860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 208 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 6618383 - 6618291
Alignment:
Q  208 aaacatgagaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttgacctt 300  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6618383 aaacatgagaaagcgtgttctcacaatcaacatgattttaaaccatttgcttttgacactttcagtttcctagctccagagattgttgacctt 6618291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 20 - 269
Target Start/End: Original strand, 42921947 - 42922196
Alignment:
Q  20 tgaacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtagactt 119  Q
    |||||||| ||||| || ||||| |||||||||  ||||| | |  ||  ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  | ||||| |||||    
T  42921947 tgaacttcttgacttactcactatatagaagattgacacttacgtatgtagatgttatggtgtacagatgggtaggaggaaaacaaacatgtgtggactt 42922046  T
Q  120 gactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaa 219  Q
    |||| | |||||| ||   ||| |||||   ||| || ||||||  ||| |||| |||||| |||||| |||||||| |||| ||| ||||  |||||||    
T  42922047 gactggagtttcatcaaacgtgagattaatggtcagagcttttatggtaagacatgcagccataaaagttgcgtcaaacaaaatggtcaaatttgagaaa 42922146  T
Q  220 gcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagacttt 269  Q
     |||||| |||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||| |||||    
T  42922147 acgtgttttgacaatcaaaatgcttttaaatcatttgcctttgacacttt 42922196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 180 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 28196319 - 28196201
Alignment:
Q  180 cctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttccta 279  Q
    ||||||| |||| ||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |  ||||||    
T  28196319 cctaaaaactgcatcaagtaaagcggctaaacatgagaaagtgtgttatgataataaacatgtttttataccatttgtttttgacacttttgtcttccta 28196220  T
Q  280 gcaccagagattgttgacc 298  Q
    |||||| || |||||||||    
T  28196219 gcaccataggttgttgacc 28196201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 71 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 10189779 - 10189562
Alignment:
Q  71 atgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtagacttgactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtagg 170  Q
    |||||||| | ||||||| |||||| ||||||||||  ||||| ||||||| | || ||||||| |||||| ||||||| ||     ||||||  |||||    
T  10189779 atgttatgttttacggattggtaggaggaaaacatgtatgtgtggacttgattgggatttcaccgcttgtgagattaggggttaaggcttttatggtagg 10189680  T
Q  171 acaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttc 270  Q
    |||  ||  |||||||| |||| |||  ||||| | |||||| |||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| | |||     
T  10189679 acatacattcctaaaagttgcgccaattaaagtagtcaaacaagagaaagcatgttctgacaatcaacatgtttttatatcatttgcatttgacattttt 10189580  T
Q  271 gatttcctagcaccagag 288  Q
    |  |||||||||| ||||    
T  10189579 ggcttcctagcactagag 10189562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 28 - 147
Target Start/End: Original strand, 11611076 - 11611195
Alignment:
Q  28 ctgactgacccactagatagaagatcaacactca-ggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtagacttgactagg 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | ||| | || ||||  ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||  ||    
T  11611076 ctgactgacccactagatagaagattgaaacttaaggtctgcaaatgttatggtgtatgaatgggtagg-ggaaaacatgcatgtgtggacttcacaggg 11611174  T
Q  127 gtttcaccacttgtgggatta 147  Q
    ||||||||||| |||||||||    
T  11611175 gtttcaccactcgtgggatta 11611195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 158 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 36004271 - 36004131
Alignment:
Q  158 cttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgc 257  Q
    ||||||| || || ||||||| ||  |||| || || ||| |||||||| ||| |||| |||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  36004271 cttttacggtggggcaagcagtccctaaagttgggtaaagtaaagtggctaaatatgacaaagtgcgttatgacaatcaacatgtttttataccatttac 36004172  T
Q  258 ttttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttgacc 298  Q
     ||||| | ||| || |||||| |||||||| |||||||||    
T  36004171 atttgacatttttgacttcctatcaccagaggttgttgacc 36004131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 8116100 - 8115849
Alignment:
Q  18 tgtgaacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtagac 117  Q
    |||||||||| ||| |||| ||||| |  ||||||| ||||  | ||| |||| ||||| |||||||| ||||||| | | ||||||||| | |||  ||    
T  8116100 tgtgaacttcttgattgactcactaaacggaagatcgacacatatgccagcgggtgttacggtgtacgaatgggtaagagaaaaacatgcatttgtgaac 8116001  T
Q  118 ttgactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgaga 217  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||   |||     |||| | |||| |||||||| |||||||| |  ||||| || ||||| ||||| | |||    
T  8116000 ttgactaaggtttcaccacttgtaggattaatggtcatgattttttcggtagaacaagcagtcctaaaagttatgtcaatcagagtggtcaaacgtaaga 8115901  T
Q  218 aagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagacttt 269  Q
    || | |||| | | |||||| || |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  8115900 aatcttgttctaataatcaatatacttttataccatttgcatttgacacttt 8115849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 230 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 37514298 - 37514227
Alignment:
Q  230 acaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttgaccttc 301  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  37514298 acaatcaacatgcgtttatactatttgcttttgacactttcaatttcctagcgccagaggctgttgaccttc 37514227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 179 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 4073663 - 4073573
Alignment:
Q  179 ccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagacttt 269  Q
    ||||||||| ||| |||| |||||||| |||||| |||||| |||||| |  ||||||||||| |||||||| |||||| ||||| |||||    
T  4073663 ccctaaaagttgcatcaaacaaagtggtcaaacaagagaaaacgtgttttaccaatcaacatgattttatacaatttgcatttgacacttt 4073573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 182 - 240
Target Start/End: Original strand, 22589336 - 22589394
Alignment:
Q  182 taaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttatgacaatcaacat 240  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  22589336 taaaagctgcgtcaagcaaaatggctgaacatgagaaagcgtgttctgacaaccaacat 22589394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 18 - 146
Target Start/End: Original strand, 39671005 - 39671132
Alignment:
Q  18 tgtgaacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtagac 117  Q
    |||||| || || ||||||||||||||||  ||||| ||| | ||| |||||||||||| |||||   |||||||||| | |||| |||| ||||| |||    
T  39671005 tgtgaaatttctaactgacccactagatattagatcgacatttaggtctgcggatgttacggtgtctagatgggtaggagaaaaatatgcatgtgtggac 39671104  T
Q  118 ttgactagggtttcaccacttgtgggatt 146  Q
    |||||| | ||||||||| ||||| ||||    
T  39671105 ttgact-gagtttcaccatttgtgagatt 39671132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 50 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 40839808 - 40839713
Alignment:
Q  50 gatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtagacttgactagggtttcaccacttgtgggatt 146  Q
    |||||||||| ||||  ||  ||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||    
T  40839808 gatcaacacttaggctagcatatgttctggtatacgggtgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattggagtttc-ccacttgtgggatt 40839713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 118 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 4700057 - 4699876
Alignment:
Q  118 ttgactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgaga 217  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||| |  |||   |||||||  | ||| |  || |||| |||| || ||||||||||||||||||||||||      
T  4700057 ttgactggggtttcaccacttgtgggtttaaggatcgcggcttttacaatcggatagacaaccctcaaagttgtgtcaagcaaagtggccaaacatga-t 4699959  T
Q  218 aagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttgaccttc 301  Q
    ||||||||| | ||||| |||||| ||||| |||||||| | || | ||||| |  ||| |||||||||||  |||||||||||    
T  4699958 aagcgtgttctcacaattaacatgtttttacaccatttg-tgttaacacttttggcttcatagcaccagaggctgttgaccttc 4699876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 199 - 300
Target Start/End: Original strand, 39671170 - 39671272
Alignment:
Q  199 aaagtggccaaacatgagaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccattt-gcttttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttgac 297  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||   |||| | | |||||  ||||||||||||||| ||||| ||    
T  39671170 aaagtggccaaaccagagaaagcgtgttttgacaattaacatgtttttatacaatttatttttttacattttcggcttcctagcaccagaggttgttaac 39671269  T
Q  298 ctt 300  Q
    |||    
T  39671270 ctt 39671272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 8882858 - 8882802
Alignment:
Q  117 cttgactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggaca 173  Q
    ||||||||  |||||||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  8882858 cttgactaaagtttcaccacttatgagattaggtgttggatcttttaccgtaggaca 8882802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 6792345 - 6792257
Alignment:
Q  137 ttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgtt 226  Q
    ||||| ||||||||||||| || ||||| || ||| |  ||| | |||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  6792345 ttgtgagattaggtgtcgg-ccatttacggttggatagacagtcgtaaaagctacgtcaaacagagtggccaaacatgagaaaacgtgtt 6792257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 184 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 166282 - 166166
Alignment:
Q  184 aaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcac 283  Q
    ||||| || |||| ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||  |||||  ||| |||| |||| | ||||| | ||| |  ||||||||||    
T  166282 aaagccgcttcaaacaaagtgtccaatcatgagaaagcgtgttctgacaacaaacatattttcatactatttacgtttgaaatttttggcttcctagcac 166183  T
Q  284 cagagattgttgacctt 300  Q
    || |||  |||||||||    
T  166182 catagaccgttgacctt 166166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 184 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 40839683 - 40839627
Alignment:
Q  184 aaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttatgacaatcaacat 240  Q
    ||||| || |||||||||||| | | |||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  40839683 aaagccgcttcaagcaaagtgccaacacataagaaatcgtgttatgacaatcaacat 40839627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 181; Significance: 8e-98; HSPs: 31)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 25 - 301
Target Start/End: Original strand, 32269622 - 32269898
Alignment:
Q  25 ttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtagacttgacta 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||     
T  32269622 ttcctaactgacccactagatagaagatcaacactcaaatctgcagatgttatggtgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgactg 32269721  T
Q  125 gggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtg 224  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||  |||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||    
T  32269722 gggtttcaccacttctggaattaggtgtcgggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaagctgcatcaaccaaagtggtcaaacatgagaaagtgtg 32269821  T
Q  225 ttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttgaccttc 301  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  32269822 ttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgatttcctagcactagaggttgttgaccttc 32269898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 16 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 35310739 - 35310454
Alignment:
Q  16 cctgtgaacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtag 115  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |    
T  35310739 cctgtgaacttcctaactgacccactagatagaagatcaacacttaggcttgcggatgttatgatgtacggatgggttggaggaaaacatgcatgtgtgg 35310640  T
Q  116 acttgactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatga 215  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||| ||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  35310639 acttgattggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggggcttttacggtaggacagacaaccctaaaagatgcgtcaagcaaagtggccaaacatga 35310540  T
Q  216 gaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttgaccttc 301  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||| ||| |||||  |||| ||||||    
T  35310539 gaaagcatgttctgacaatcaacatgcttttataccatctgcttttgacactttcggcttcctggcatcagaggctgttaaccttc 35310454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 16 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 27336984 - 27336699
Alignment:
Q  16 cctgtgaacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtag 115  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |    
T  27336984 cctgtgaactttctgactgacccactagatagaagatcgacacttaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggttggaggaaaacatgcatgtgtgg 27336885  T
Q  116 acttgactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatga 215  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||  |||||||  |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  27336884 acttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtgggggcttttacaataggacagacagccctaaaagttgcgtcaagcaaagtggtcaaacatga 27336785  T
Q  216 gaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttgaccttc 301  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  |  ||||||||| |||||   ||||||||||    
T  27336784 gaaatcgtgttctgacaatcaacatacttttataccatttgcttttgacacttgtggcttcctagcatcagaggcagttgaccttc 27336699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 21 - 301
Target Start/End: Original strand, 33691877 - 33692156
Alignment:
Q  21 gaacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtagacttg 120  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||    
T  33691877 gaactttctgactgaccc-ctagatagaagatcgacacttaagcctgcaaatgttatggtgtacggatgggttggaggaaaacatgcatgtgtggacttg 33691975  T
Q  121 actagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaag 220  Q
    |||  |||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  33691976 actgaggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggggcttttacggtaggacaggcaggcctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgacaaaa 33692075  T
Q  221 cgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttgaccttc 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  ||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  33692076 cgtgttatgacaatcaacatgcttttgtaccatttgcttttgacactttcggcttcttagcatcagagactgttgaccttc 33692156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 16 - 301
Target Start/End: Original strand, 13166726 - 13167011
Alignment:
Q  16 cctgtgaacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtag 115  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| |    
T  13166726 cctgtgaactttctgactgacccactagatagaagatcgacacttaagcatgcggatgttatggtctacggatgggttggaggaaaacatgcatgtgtgg 13166825  T
Q  116 acttgactagggtttcaccacttgtgggatt-aggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatg 214  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  || | | ||  |  ||||||| || |||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  13166826 acttgact-gggtttcaccacttgtggattttatgggttagggcttttacggtgggacagacaaccctaaaatctgcgtcaagcaaagtggctaaacatg 13166924  T
Q  215 agaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttgaccttc 301  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||| |||||||||||    
T  13166925 agaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacactttcggcttcctagcatcagagactgttgaccttc 13167011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 16 - 288
Target Start/End: Original strand, 26212398 - 26212671
Alignment:
Q  16 cctgtgaacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaaca-tgcttgtgta 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| | ||| ||||||    
T  26212398 cctgtgaacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcatgcagatgtgatggtgtacgggtggctaggtggaaaaaaatgcatgtgta 26212497  T
Q  115 gacttgactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatg 214  Q
    || |||||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||   ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26212498 gatttgactggggtttcatcacttgtgagattaggtgttggaccttttatcgttggaatggcagttctaaaagttgcgtcaagcaaagtggccaaacatg 26212597  T
Q  215 agaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagag 288  Q
    ||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| |||| |  |||||  |||| |||||||||||    
T  26212598 agaaagcgtattctgacgatcaacatgcttttataccatttgttttttaccctttcagtttcttagcaccagag 26212671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 15291842 - 15292087
Alignment:
Q  16 cctgtgaacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtag 115  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||    
T  15291842 cctgtgaacttcccaactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcgaatgttatggtgtacggctgggtaggaggaaaacatgtttgtgtag 15291941  T
Q  116 acttgactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatga 215  Q
    |||||| |  ||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| | ||| ||||  || |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  15291942 acttgaatgaggtttcaccacttgttggattaagtgtcgggccttttgcggtatgacagacaaccctaaaagtggcgtcaaacaaagtggccaaacatga 15292041  T
Q  216 gaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgctttt 261  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  15292042 gaaaacgtgttctgacaatcaacatgtttttatacaatttgttttt 15292087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 74 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 14423912 - 14423688
Alignment:
Q  74 ttatggtgtacggatgggt-aggtggaaaacatgcttgtgtagacttgactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggac 172  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14423912 ttatggtgtacggatggtttaggtggaaaatatgcttgtgaagacttgattggggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggacctttaaccgtaggac 14423813  T
Q  173 aagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcga 272  Q
    | ||| ||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||      
T  14423812 aggcaaccctaaaaaatgcgtcaagcaaagtgaccgaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacactttc-- 14423715  T
Q  273 tttcctagcaccagagattgttgaccttc 301  Q
      |||||||| |||||  |||||||||||    
T  14423714 --tcctagcatcagaggctgttgaccttc 14423688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 17 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 43129823 - 43129540
Alignment:
Q  17 ctgtgaacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtaga 116  Q
    |||||||||| || ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||| |||||  |    
T  43129823 ctgtgaactttcttactgatctactagatagaagatcgacacttaggcatgcagatgttatgatgtacggatggataggaggaaaa-atgcatgtgtgaa 43129725  T
Q  117 cttgactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgag 216  Q
     |||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| || |||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43129724 attgactggggtttcaccacttgttggattaggggtcggaacttttacggttggacattcagtcctaaaagatgcgtcaagcaaagtggtcaaacatgag 43129625  T
Q  217 aaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttgaccttc 301  Q
    ||| |||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||  || |||||||||    
T  43129624 aaaacgtgttctgacaatcaacatgtttttctaccatttgcttttgacattttcggtttcctaacaccagatgtttttgaccttc 43129540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 16 - 278
Target Start/End: Original strand, 3113981 - 3114241
Alignment:
Q  16 cctgtgaacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtag 115  Q
    ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||||  ||||||| | ||||| ||  | | |||||    
T  3113981 cctgtgaacttgccgactg-cccactagatagaagatcaacacttagtcatgcagatgttatggtgtacaaatgggtaagaggaaa-cactcatttgtag 3114078  T
Q  116 acttgactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatga 215  Q
    ||||||| ||  ||||||||||  |||||||||| |||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  3114079 acttgaccagtatttcaccactcatgggattaggggtcggggcttttacggtaggacaggcagccctaaaagttgcatcaaacaaagtggccaaacatga 3114178  T
Q  216 gaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcct 278  Q
    |||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||    
T  3114179 gaaagcatgttctgacagtcaacatgtttttataccatttgtttttgacacttttggtttcct 3114241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 30 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 34335614 - 34335343
Alignment:
Q  30 gactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtagacttgactagggtt 129  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||  ||||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||| ||||| || || ||| |||||    
T  34335614 gactgacccactagatagaagatcgacacttaggcttgcatatgttatggtgtacaaatgagtaggaggaaaacatgcatgtgtggaattcactggggtt 34335515  T
Q  130 tcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttatg 229  Q
      | ||||||| |||||| | |||  | ||||||| |||||| |  || ||||||||||   ||||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||    
T  34335514 ctatcacttgtaggattaagggtcaaagcttttactgtaggatagacaaccctaaaagccatgtcaagcaaaagggccaaacatgagaaagcgtgtcctg 34335415  T
Q  230 acaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttgaccttc 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||  ||||||||  |||||||||||    
T  34335414 acaatcaacatgcttttataccatttgtttttgacactttcgactttctgacaccagaggctgttgaccttc 34335343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 433580 - 433373
Alignment:
Q  19 gtgaacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtagact 118  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| |||| ||||| ||||    
T  433580 gtgaactttctgactggcccactaaatagaagatccacacttaggcatgcggatgttatggtgtacagatgggttggaggaaaatatgcatgtgtggact 433481  T
Q  119 tgactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaa 218  Q
    ||||  |||||||||||| |||||| ||| | || ||  ||||||| |||||| |  || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  433480 tgaccggggtttcaccacctgtgggtttaagggtaggggcttttacggtaggatagacaaccttaaaagctgtgtcaagcaaagtggccaaacatgagaa 433381  T
Q  219 agcgtgtt 226  Q
    ||||||||    
T  433380 agcgtgtt 433373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 158 - 301
Target Start/End: Original strand, 37873596 - 37873739
Alignment:
Q  158 cttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgc 257  Q
    ||||||| ||||||||  |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37873596 cttttacggtaggacagacagctctaaaagttgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgtttttataccatttgc 37873695  T
Q  258 ttttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttgaccttc 301  Q
    |||||| ||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37873696 ttttgacacttttggcttcctagcaccagaggttgttgaccttc 37873739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 71 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 35456192 - 35455963
Alignment:
Q  71 atgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtagacttgactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtagg 170  Q
    |||||||||||||| |||||||||| || ||| |||| ||||| ||||||||  ||||||  ||||| || |||||||| ||| | |||||||| |||||    
T  35456192 atgttatggtgtacagatgggtaggaggtaaatatgcatgtgtggacttgaccggggttttgccactcgtaggattaggggtccggccttttacggtagg 35456093  T
Q  171 acaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttc 270  Q
      | | ||||| ||||| || || ||| ||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||     
T  35456092 gtaggtagcccaaaaagttgtgttaagtaaaatggtcaaacatgagaaagcgtgttctaacaatcaacatgcttttataccttttgcttttgacaatttt 35455993  T
Q  271 gatttcctagcaccagagattgttgacctt 300  Q
    |  |||||||||||||||  ||||||||||    
T  35455992 ggcttcctagcaccagaggatgttgacctt 35455963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 38446455 - 38446267
Alignment:
Q  18 tgtgaacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtagac 117  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||| |||    
T  38446455 tgtgaattttctgactgaccctctagatagaatatcgacacttaggcatgcaaatgttatggtgtacggatgggttggagtaaaacatgcatgtgtggac 38446356  T
Q  118 ttgactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccct--aaaagctgcgtcaagcaaagtg 204  Q
    ||||||  |||||||||||||||||| ||||| || ||  ||||||| ||| |||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  38446355 ttgactgaggtttcaccacttgtgggtttaggagttggggcttttacggtatgacatgcatccctaaaaaagctgcgtcaagcaaagtg 38446267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 20 - 147
Target Start/End: Original strand, 9841146 - 9841274
Alignment:
Q  20 tgaacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtac-ggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtagact 118  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||  | ||||||||| |||||| |||    
T  9841146 tgaacttcctgacttacctactagatagaagatcgacacttaggcctgcggatgttatggtgtgcgggatgggtagaagaaaaacatgcgtgtgtaaact 9841245  T
Q  119 tgactagggtttcaccacttgtgggatta 147  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9841246 tgagtagggtttcaccacttgtgggatta 9841274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 159 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 42921845 - 42921703
Alignment:
Q  159 ttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgct 258  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||| || ||| ||| |  |||| |||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42921845 ttttaccgtaagacaggcagccctaaaaactacgttaagtatggtggtcaaacacgagaaaacgtgttctgacaatcaacatgcttttataccatttgct 42921746  T
Q  259 tttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttgaccttc 301  Q
    | ||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||    
T  42921745 tatgacactttcggtttcctagcaccagaggttgttggccttc 42921703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 177 - 301
Target Start/End: Original strand, 25663009 - 25663133
Alignment:
Q  177 agccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttc 276  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||   |||    
T  25663009 agccctaaaagctgcatcaaacaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgataatcaacatgtttttataccatttgcttttgacactttcagcttc 25663108  T
Q  277 ctagcaccagagattgttgaccttc 301  Q
    |||||| ||||  ||||||| ||||    
T  25663109 ctagcatcagaagttgttgatcttc 25663133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 125 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 8100734 - 8100558
Alignment:
Q  125 gggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||  |||| |  |||||||| ||| ||||||| ||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  8100734 gggtttcaccacttgtgggattaagagtcgggactttaatagtaggacatgcatccctaaacgctgcatcaagtaaaatggtcaaacatgagaaaacgtg 8100635  T
Q  225 ttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttgaccttc 301  Q
    || |||||||  |||||||||||||||||||| || ||| |||||| | |||||  ||| |||| ||||||||||||    
T  8100634 ttgtgacaatttacatgcttttataccatttgtttgtgacactttcaacttccttccactagaggttgttgaccttc 8100558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 125 - 301
Target Start/End: Original strand, 43115383 - 43115558
Alignment:
Q  125 gggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtg 224  Q
    |||||||||||||  |||||||||  |||||  ||||||| |||||| |  |||||||||||| ||||| ||  |||| || |||| |||||||||||||    
T  43115383 gggtttcaccactcatgggattagaggtcggggcttttacggtaggatagacagccctaaaagttgcgtaaat-aaagcggtcaaatatgagaaagcgtg 43115481  T
Q  225 ttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttgaccttc 301  Q
    || |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||  || ||| || |||||||||||||||||||||    
T  43115482 ttttgacaatcaacatgctttcatagcatttgcttttgacacttctgacttcgtaacaccagagattgttgaccttc 43115558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 125 - 253
Target Start/End: Original strand, 32230432 - 32230560
Alignment:
Q  125 gggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtg 224  Q
    |||||||| || ||||| ||||||| ||| || ||||||| ||| |||||| |||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||    
T  32230432 gggtttcatcagttgtgagattaggggtcagaacttttacggtaagacaagtagctttaaaagttgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaaatgtg 32230531  T
Q  225 ttatgacaatcaacatgcttttataccat 253  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||    
T  32230532 ttctgacaatcaacaagcttttataccat 32230560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 99 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 8859124 - 8858969
Alignment:
Q  99 aaaacatgcttgtgtagacttgactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagc 198  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||  |||||||  |||| || |||||||   |  | ||||||| || ||||||||| |||  ||| |||||||||||    
T  8859124 aaaacatgcatgtgtggacttgactgaggtttcattacttctgagattagggaccatagcttttacggtgggacaagcaacccacaaaactgcgtcaagc 8859025  T
Q  199 aaagtggccaaacatgagaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatt 254  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  8859024 aaagtagtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgtttttatatcatt 8858969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 179 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 38875766 - 38875644
Alignment:
Q  179 ccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcct 278  Q
    |||||||| |||| |||| ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||   |||||    
T  38875766 ccctaaaaactgcatcaaacaaagcgaccaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacatgtttttgtaccatttgtttttgacactttcagcttcct 38875667  T
Q  279 agcaccagagattgttgaccttc 301  Q
    ||||||||||  || ||||||||    
T  38875666 agcaccagaggctgctgaccttc 38875644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 126 - 255
Target Start/End: Original strand, 9829280 - 9829407
Alignment:
Q  126 ggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgt 225  Q
    |||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||  ||| || |   ||||||||||| ||||| |||||||||||| || ||||| |||  ||||    
T  9829280 ggtttcaccacttgtaagattaggagtcggatcttttatagtaagatagatagccctaaaagttgcgt-aagcaaagtggctaa-catgataaaatgtgt 9829377  T
Q  226 tatgacaatcaacatgcttttataccattt 255  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9829378 tttgacaatcaacatgcttttataccattt 9829407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 223 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 430686 - 430640
Alignment:
Q  223 tgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagacttt 269  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  430686 tgttctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacacttt 430640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 232 - 301
Target Start/End: Original strand, 22188687 - 22188756
Alignment:
Q  232 aatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttgaccttc 301  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||||  |||||||||||  |||||||||||    
T  22188687 aatcaacatgattttatactatttgtttttgacactttcgattttttagcaccagaggctgttgaccttc 22188756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 228 - 300
Target Start/End: Original strand, 14723272 - 14723344
Alignment:
Q  228 tgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttgacctt 300  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||| | ||||| | |||  ||||| ||||| |||||||||||    
T  14723272 tgacaatcaacatgcttttatatcatttgttttttacacttttggttttttagcatcagaggttgttgacctt 14723344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 68 - 147
Target Start/End: Original strand, 27355584 - 27355663
Alignment:
Q  68 cggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtagacttgactagggtttcaccacttgtgggatta 147  Q
    |||| ||||||||||||   | |||||| ||||||||||  ||||| || |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  27355584 cggacgttatggtgtacatgtcggtaggaggaaaacatggatgtgttgaattgaatggggtttcaccacttgtgggatta 27355663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 7716294 - 7716193
Alignment:
Q  192 gtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgc-ttttgagactttcgatttcctagcaccagagat 290  Q
    |||||||||||||| ||||||  |||   ||| |||||||| |||| ||| || |||||||||||| |||||| ||||| | ||| |||||||||||| |    
T  7716294 gtcaagcaaagtggtcaaacaaaaga---cgtattatgacattcaatatgtttctataccatttgcgttttgacacttttggttttctagcaccagaggt 7716198  T
Q  291 tgttg 295  Q
    |||||    
T  7716197 tgttg 7716193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 199 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 14436605 - 14436525
Alignment:
Q  199 aaagtggccaaacatgagaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagca 282  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| |   |||||||||| ||||||| |||||| |||||| || || || |||||||||    
T  14436605 aaagtggccaaacatgaaaaaacgtgttct---aatcaacatgtttttatatcatttgtttttgacacctttgacttcctagca 14436525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 13307470 - 13307366
Alignment:
Q  193 tcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagagattg 292  Q
    ||||| ||| ||| |||||||||||||| || || | || ||||||||| ||||||||| ||||| || || ||||| ||  |||||| |  ||||||||    
T  13307470 tcaagtaaaatggtcaaacatgagaaagtgtattcttactatcaacatgtttttataccttttgcgttcgacacttttgacatcctagaattagagattg 13307371  T
Q  293 ttgac 297  Q
    |||||    
T  13307370 ttgac 13307366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1768 (Bit Score: 180; Significance: 3e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold1768
Description:

Target: scaffold1768; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 18 - 301
Target Start/End: Original strand, 2 - 285
Alignment:
Q  18 tgtgaacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtagac 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  2 tgtgaacttcctgactgacccactagatagatgatcaacacgcaggcccgcggatgttatgatgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtatagac 101  T
Q  118 ttgactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgaga 217  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  102 ttgactggggtttcaccacttgtgggattaagtgtcgggccttttactgtaggacaggcagccctaaaaactgcgtcaagcaaagtggccaaacatgaga 201  T
Q  218 aagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttgaccttc 301  Q
     || | |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| | ||| |||| |||| || ||||||||||||    
T  202 cagtgggttatgaccatcaacatgcttttataccatttgtgtttgacacttttggttttctagtaccaaaggttgttgaccttc 285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 180; Significance: 3e-97; HSPs: 21)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 20 - 301
Target Start/End: Original strand, 45489 - 45778
Alignment:
Q  20 tgaacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtagactt 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45489 tgaactttctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcagatgtgatggtgtacggatgggtagatggaaaacatgcttgtgtagactt 45588  T
Q  120 gact-------agg-gtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaac 211  Q
    |||        ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||    
T  45589 gacagcttgacaggtgtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaggcagctctaaaagctgcatcaagcaaagtgatcaaac 45688  T
Q  212 atgagaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttgaccttc 301  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||    
T  45689 atgagaaaacgtgttctgacaatcaacatgcttttattccatttgtttttgacactttcggtttcttagcaccagaggctgttgaccttc 45778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 19 - 301
Target Start/End: Original strand, 4206415 - 4206697
Alignment:
Q  19 gtgaacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtagact 118  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  4206415 gtgaacttcttgattgacccactagataaaagatcaacactcaagcctgcggatgttatggtgtacaaatgggttggaggaaaacatgcatgtgtagact 4206514  T
Q  119 tgactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaa 218  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| |||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4206515 tgactggggtttcaccacttgtgggattaggcatcagaccttttacggtaggacatgcagccttaaaagtggcgtcaagcaaagtggctaaacatgagaa 4206614  T
Q  219 agcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttgaccttc 301  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4206615 agcgtgttctgacaatgaacatgcttttatatcatttgcttttgacactttcgggttcctagcaccagaggttgttgaccttc 4206697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 34304785 - 34304502
Alignment:
Q  18 tgtgaacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtagac 117  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||    
T  34304785 tgtgaactttctgactgacccactagatagaagatcgacacttaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggctggaggaaaacatgcatgtgtggac 34304686  T
Q  118 ttgactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgaga 217  Q
    |||| | ||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||| || |||||   ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  34304685 ttgattggggtttcaccacttgtgggtttaggagtcggggcttttacggttggacagctagccctaaaagctgcgtcaagcaaaataaccaaacatgaga 34304586  T
Q  218 aagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttgaccttc 301  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||| ||||   |||||||||||    
T  34304585 aagcgtgttctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacactttgggcttcctagcatcagatgatgttgaccttc 34304502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 41 - 301
Target Start/End: Original strand, 33220552 - 33220812
Alignment:
Q  41 tagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtagacttgactagggtttcaccacttgt 140  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| || || ||||||||||| |||||  | |||||| ||||||||||||||||    
T  33220552 tagatagaagattgacactcaggcctgcagatgttatgatgtacggatgagttggaggaaaacatgcatgtgtgaatttgactggggtttcaccacttgt 33220651  T
Q  141 gggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttatgacaatcaacat 240  Q
    ||| ||||| |||||  ||||||| ||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  33220652 gggtttaggggtcggggcttttacggtaggacagacagctctaaaagctgcatcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgtgttgacaatcaacat 33220751  T
Q  241 gcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttgaccttc 301  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  33220752 gcttttataccatttgcttttgacactttcggcttcctagcatccgaggttgttgaccttc 33220812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 54 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 959833 - 959586
Alignment:
Q  54 aacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtagacttgactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtc 153  Q
    ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |   |||||||||||| ||||||||||||||    
T  959833 aacactcaggcatgcggatgttacagtgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtggacttgattgaagtttcaccacttatgggattaggtgtc 959734  T
Q  154 ggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccat 253  Q
    || |||||||| ||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||| || ||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  959733 gggccttttacggtaggacaaacaaccctaaaagttgtgtcaagcaaagtggctaaccatgagaaaacgtgttctgacaatcaacatgtctttataccat 959634  T
Q  254 ttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttgaccttc 301  Q
    ||| |||||| | ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  959633 ttgtttttgacattttcggtttcctagcaccagaggttgttgaccttc 959586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 18 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 32115978 - 32115776
Alignment:
Q  18 tgtgaacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtagac 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  32115978 tgtgaacttcctgactgacctactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacagatgagtaggaggaaaacatgcatgtgtagac 32115879  T
Q  118 ttgactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgaga 217  Q
    |||||  |||||||| ||||| |||||||||||||||| | ||||||  ||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32115878 ttgaccggggtttcatcacttatgggattaggtgtcgggcattttacgttaggacatgcagccttaaaagttgcgtcaaacaaagtggccaaacatgaga 32115779  T
Q  218 aag 220  Q
    |||    
T  32115778 aag 32115776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 18 - 249
Target Start/End: Original strand, 357535 - 357766
Alignment:
Q  18 tgtgaacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtagac 117  Q
    |||||||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||  ||| |||||||||||||| |||||||| || | ||||||||| ||||| |||    
T  357535 tgtgaactttttgactgacacactagatagaagatcgacacttaggtatgcagatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaacatgcatgtgtggac 357634  T
Q  118 ttgactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgaga 217  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  357635 ttgactggagtttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttttacggtaggacaggcagccctaaaagcttcgtcaagcaaagtggccaaacatgaga 357734  T
Q  218 aagcgtgttatgacaatcaacatgcttttata 249  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  357735 aagcgtgttctgacaatgaacatgcttttata 357766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 16 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 12401622 - 12401384
Alignment:
Q  16 cctgtgaacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtag 115  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| | | ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  12401622 cctgtgaacttcctgactgacctactagatagcagatcaagacttaagtctgcaaatgttatggtgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtag 12401523  T
Q  116 acttgactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatga 215  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||| |  || |  ||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |    
T  12401522 acttgattggggtttcaccacttatgggattatggttcagggcttttatggtaggacaagcagcactaaaagttgcgtcaaacaaagtggccaaacataa 12401423  T
Q  216 gaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatt 254  Q
    || |||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||    
T  12401422 gatagcgtgttttgctaatcaacatgcttatataccatt 12401384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 20 - 301
Target Start/End: Original strand, 29337903 - 29338180
Alignment:
Q  20 tgaacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtagactt 119  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  29337903 tgaacttctggattgacccactagatagaagttcgacacttaggcctgcagatgttatggtgtgcagatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtggactt 29338002  T
Q  120 gactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaa 219  Q
    ||    ||||| |||||| |    |||||  |||||  ||||||| ||||||||| ||  | |||||| || |||||||||||  |||||||||||||||    
T  29338003 gatcgaggttttaccactcg----attagtggtcggggcttttacggtaggacaaacaatcataaaagatgtgtcaagcaaagctgccaaacatgagaaa 29338098  T
Q  220 gcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttgaccttc 301  Q
     |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29338099 acgtgttctaacaatcaacatgctcttataccatttgcttttgacacttctgacttcctagcaccagagatcgttgaccttc 29338180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 97 - 301
Target Start/End: Original strand, 17249202 - 17249406
Alignment:
Q  97 ggaaaacatgcttgtgtagacttgactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaa 196  Q
    |||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| || || || ||  ||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||    
T  17249202 ggaaaatatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccatttgtgggtttcggagtgggcgcttttacggtaggacaaacaaccctaaaagttgcgtcaa 17249301  T
Q  197 gcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttga 296  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||| |||||   |||||    
T  17249302 acaaagtggccaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttga 17249401  T
Q  297 ccttc 301  Q
    |||||    
T  17249402 ccttc 17249406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 54 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 28543628 - 28543412
Alignment:
Q  54 aacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtagacttgactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtc 153  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||| || ||||||  |||||||||||||||||||||||  |||    
T  28543628 aacactcaggcatgcagatgttatgatgtacagatggataggaggaaaacatgcatgtgtggatttgactgaggtttcaccacttgtgggattagaggtc 28543529  T
Q  154 ggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccat 253  Q
     |  ||||||| ||| |||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||  ||||| |||||| ||    
T  28543528 aggacttttacggtaagacaggcagccttaaaagtcgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaatcgtgttttgaaaatcactatgctcttatactat 28543429  T
Q  254 ttgcttttgagactttc 270  Q
    ||| |||||| ||||||    
T  28543428 ttgattttgacactttc 28543412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 76 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 34415667 - 34415458
Alignment:
Q  76 atggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtagacttgactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaag 175  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||| | | |||  |||||| | ||||||||||||  || |||||||| ||| |  ||||||| |||||| | |    
T  34415667 atggtgtatggatgggtaggaggaaaacatacatttgtgaacttgattggggtttcaccacacgttggattaggggtcaggacttttacggtaggatagg 34415568  T
Q  176 cagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgattt 275  Q
    || || || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| | |||    
T  34415567 catccttacaagctgcgtcaagcaaaatggcgaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacatgcttttatgccatttgtttttgacactttaggttt 34415468  T
Q  276 cctagcacca 285  Q
    |||| |||||    
T  34415467 cctaacacca 34415458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 197 - 301
Target Start/End: Original strand, 4165919 - 4166023
Alignment:
Q  197 gcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttga 296  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  4165919 gcaaagtggctaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatatcatttgcttttgacactttcgggttcctagcaccagaggttgttga 4166018  T
Q  297 ccttc 301  Q
    |||||    
T  4166019 ccttc 4166023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 158 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 34169017 - 34168913
Alignment:
Q  158 cttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgc 257  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34169017 cttttaccgtaggacatgcaaccctaaaatttgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcatgtttggacaagcaacatgcttttataccatttgc 34168918  T
Q  258 ttttg 262  Q
    |||||    
T  34168917 ttttg 34168913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 116 - 269
Target Start/End: Original strand, 28008903 - 28009059
Alignment:
Q  116 acttgactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatga 215  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||  ||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||    
T  28008903 acttgactggagtttcaccactcgtgggattaggggtcggggcttttacggtaggacatgcaaccctaaaagctacgtcaagcaaagcggtcaaacatga 28009002  T
Q  216 gaaagcgtgttatgacaatc---aacatgcttttataccatttgcttttgagacttt 269  Q
    |||||| |||| | ||||||   || ||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  28009003 gaaagcttgttctaacaatcaagaatatggttttataccatttgcttttgacacttt 28009059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 20693419 - 20693610
Alignment:
Q  18 tgtgaacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtagac 117  Q
    |||||||||  ||| ||||| |||||||| |||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | |||  ||    
T  20693419 tgtgaactttttgattgaccaactagataaaagatccacacttaggcctgcagatattatggtgtacagatgggtaggaggaaaacatgc-tatgtgaac 20693517  T
Q  118 ttgactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaa 210  Q
    ||||  |||||||||||||| ||||||||||  ||| || ||||||| |||| |||  | |||||||| | ||| |||| |||||||||||||    
T  20693518 ttgatcagggtttcaccactcgtgggattagaggtctgagcttttacagtagaacatacggccctaaaggttgcatcaaacaaagtggccaaa 20693610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 175 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 28626063 - 28625936
Alignment:
Q  175 gcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttatgacaatcaaca-tgcttttataccatttgcttttgagactttcgat 273  Q
    |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||| |  |||||||||||||| |||| | |||||| ||    
T  28626063 gcagcccttaaagctgcgtcaagtaaggtggctaaacacgagaaaacgtgttctgacaatcaacattttttttataccatttgttttttacactttcaat 28625964  T
Q  274 ttcctagcaccagagattgttgaccttc 301  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  28625963 ttcctagcaccagaggttgttgagcttc 28625936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 92 - 287
Target Start/End: Original strand, 34554169 - 34554364
Alignment:
Q  92 taggtggaaaacatgcttgtgtagacttgactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgc 191  Q
    |||| |||||||| || | ||| || |||| | ||||||||||| |||||||||||||  || |  ||||||  ||||| ||  || | ||||||| |||    
T  34554169 taggaggaaaacaagcatatgtggatttgattggggtttcaccaattgtgggattagggatcagggcttttaaagtaggtcagacaacactaaaagttgc 34554268  T
Q  192 gtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccaga 287  Q
    ||||||||||  | ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||| ||||||| || ||||  ||||||||||||||    
T  34554269 gtcaagcaaaacgaccaaacatgagaaagcgtgttctgataatcaagatgtttttataccatttacttttgacacattcggcttcctagcaccaga 34554364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 92 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 24016551 - 24016348
Alignment:
Q  92 taggtggaaaacatgcttgtgtagacttgactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgc 191  Q
    |||| ||||||||||| |||||  | |||||  | ||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||   | || |||  || || |||||| |||    
T  24016551 taggaggaaaacatgcatgtgtgaatttgaccggagtttccccacttgtgggattaggagtcggggctttttgggaag-acagacaaccgtaaaagttgc 24016453  T
Q  192 gtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagagatt 291  Q
     ||||| ||| | | ||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||||||||| |||| | ||| | |||||||||||||||  ||    
T  24016452 atcaagtaaaatagtcaaacatgagaaagcttgttctcacaatcaacatgtttttataccatttgctattgatagttttggtttcctagcaccagatgtt 24016353  T
Q  292 gttga 296  Q
    |||||    
T  24016352 gttga 24016348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 182 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 3715042 - 3714939
Alignment:
Q  182 taaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagc 281  Q
    |||||| || ||||| |||| |||  |||||||||||| |||||| | ||||| |||||| ||||||| ||| || |||||| ||||| || ||| ||||    
T  3715042 taaaagttgtgtcaaacaaaatggttaaacatgagaaaacgtgttctcacaattaacatgtttttatatcatctgtttttgacacttttgacttcttagc 3714943  T
Q  282 acca 285  Q
    ||||    
T  3714942 acca 3714939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 189 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 6225190 - 6225110
Alignment:
Q  189 tgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagacttt 269  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||||||||   |||| ||||||||||||||||| |||  ||||||  ||||| |||||    
T  6225190 tgcgtcaaataaagtggtcaaacatgagaaattttgttgtgacaatcaacatgcttatatgtcatttgtgtttgacacttt 6225110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 153; Significance: 4e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 16 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 33541 - 33256
Alignment:
Q  16 cctgtgaacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacat--gcttgtgt 113  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||     
T  33541 cctgtgaacttcttgactg-cctactagatagaagatcaacactcaggcatgcggatgttatggtgtacggatgggtaggaggaaaacatatgcatgtgc 33443  T
Q  114 agacttgactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacat 213  Q
    | |||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| || |||| |  || |||||||||||||| ||||||    
T  33442 aaacttgattggggtttcaccacttatgggattaggtgtcgggccttttacggtaggacaggcaaccttaaa-gtggcatcaagcaaagtggctaaacat 33344  T
Q  214 gagaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttgaccttc 301  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  33343 gagaaagcgtgttctgacaatcaacatgtttttataccatttacttttgacattttcggtttcctaacaccagaggttgttgaccttc 33256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 148; Significance: 4e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 98 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 6542 - 6340
Alignment:
Q  98 gaaaacatgcttgtgtagacttgactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaag 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  6542 gaaaacatgcttgtgtagacttgactggggtttcaccacttgtgggattagg-gtcggaccttttaccgtaggacagacagccctaaaagttgcgtcaag 6444  T
Q  198 caaagtggccaaacatgagaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttgac 297  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||  |||||||    
T  6443 taaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttctataccatttgcttttgacactttcagtttcctagcaccagaggctgttgac 6344  T
Q  298 cttc 301  Q
    ||||    
T  6343 cttc 6340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 104; Significance: 7e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 138 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 103274 - 103112
Alignment:
Q  138 tgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttatgacaatcaa 237  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  103274 tgtgggataaggtgtcgggccttttaccgtaggacaggcagccctcaaagctgcgtcaagtaagatggccaaacacgagaaagcgtgtc-tgacaatcaa 103176  T
Q  238 catgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttgaccttc 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  103175 catgcttttataccatttgcttttgacactttcggtttcctagcaccagaggctgttgaccttc 103112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0186 (Bit Score: 89; Significance: 6e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0186
Description:

Target: scaffold0186; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 124 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 10547 - 10366
Alignment:
Q  124 agggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgt 223  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || ||  ||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||    
T  10547 agggtttcaccactcgtgggattaggggttggggcttttacagttggacaagcagccctaaaagttgcgtcaagtaaaatggccaaacatgataatgcgt 10448  T
Q  224 gttatga----caatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttgaccttc 301  Q
    ||| |||    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |  ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10447 gttctgacaatcaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacacttgtggcttcctagcaccagaggttgttgaccttc 10366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0186; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 20 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 20008 - 19916
Alignment:
Q  20 tgaacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtg 112  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| || ||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  20008 tgaacttcttaactgacccactagatagaagatgaacacttagacctgtagatgttatggtgtacggataggtaggaggaaaacatgcatgtg 19916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0224 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0224
Description:

Target: scaffold0224; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 22 - 301
Target Start/End: Original strand, 18187 - 18465
Alignment:
Q  22 aacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtagacttga 121  Q
    |||||| |||| || |||||| ||| |||||||||| | |||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||  |||||| | |||||    
T  18187 aacttcatgaccgatccactaaataaaagatcaacatttaggcttgcagatgttaaggtgtacagatgggtaggaggaaaacatatttgtgtgggcttga 18286  T
Q  122 ctagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagc 221  Q
     |  | |||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||   |||||||| || ||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||| |    
T  18287 ttgagatttcactactcgtgggattacgggtcggagcttttatgataggacaaacaaccctaaaagttgcatcaaacaaagcggccaaacatgagaaa-c 18385  T
Q  222 gtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttgaccttc 301  Q
    ||||| | |||||||||||| ||||||  ||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||  |||||||||| ||||||    
T  18386 gtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgcttttgacacttttgatttccaagcagtagagattgttaaccttc 18465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0110 (Bit Score: 79; Significance: 6e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0110
Description:

Target: scaffold0110; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 37 - 279
Target Start/End: Original strand, 47376 - 47618
Alignment:
Q  37 ccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtagacttgactagggtttcaccac 136  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||  |||  ||||||||||||||  ||| ||| | | |||| ||||  |||| ||||||| | ||||||||||||    
T  47376 ccactaaatagaagatcaacacttagggatgcaaatgttatggtgtacaaatgagtatgagaaaaaaatgcaagtgtggacttgattggggtttcaccac 47475  T
Q  137 ttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttatgacaatca 236  Q
    |||||||||||||  | |   ||||||| |||||||||  |  |||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||| ||||| | |    
T  47476 ttgtgggattagggattgagacttttacggtaggacaaataaacctaaaagttgcgtcaagtaaaatggccaaacatgagaaaatgtgttctgacagtta 47575  T
Q  237 acatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttccta 279  Q
    ||||  ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  47576 acatatttttataccatttgcttttaacactttcgatttccta 47618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 99 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 49622 - 49433
Alignment:
Q  99 aaaacatgcttgtgtagacttgactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggac----cttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtc 194  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| | | ||||||| ||||||||||||||| ||||| |    ||||| | |   |||||||||||||||||| ||| ||    
T  49622 aaaacatgcatgtgtggacttgatt-gagtttcactacttgtgggattaggggtcggtcagagcttttgcagctagacaagcagccctaaaagttgcatc 49524  T
Q  195 aagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcacca 285  Q
    || |||||||| ||||  ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || |||||    
T  49523 aaacaaagtggtcaaatgtgagaaatcgtgttctgacaatcaacgtgcttttataccatttgcttttgacactttcgacttcttaacacca 49433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0470 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0470
Description:

Target: scaffold0470; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 208 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 7701 - 7609
Alignment:
Q  208 aaacatgagaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagagattgttgacctt 300  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7701 aaacatgagaaagcgtgttctcacaatcaacatgattttaaaccatttgcttttgacactttcagtttcctagctccagagattgttgacctt 7609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0119 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0119
Description:

Target: scaffold0119; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 134 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 16307 - 16191
Alignment:
Q  134 cacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttatgacaa 233  Q
    ||||||| ||||||||  ||||| ||||||  ||||||||  || | |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||    
T  16307 cacttgttggattagggatcggaacttttatagtaggacagacaacgctaaaagctgcgtcaaacaaaatggccaaacatgagaaaacatgttctgacaa 16208  T
Q  234 tcaacatgcttttatac 250  Q
    | |||||| ||||||||    
T  16207 taaacatgtttttatac 16191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0493 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0493
Description:

Target: scaffold0493; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 91 - 293
Target Start/End: Original strand, 8407 - 8609
Alignment:
Q  91 gtaggtggaaaacatgcttgtgtagacttgactagggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctg 190  Q
    ||||| || |||||||| ||| | |||| |||| ||||||| |||||||| |||||  | | |||  |||| || || ||||||||| || | |||||||    
T  8407 gtaggagggaaacatgcatgtttggactggactggggtttccccacttgtaggattgagagacggggctttcactgtgggacaagcaaccttcaaagctg 8506  T
Q  191 cgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttatgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgagactttcgatttcctagcaccagagat 290  Q
    | |||| |||  |||   ||||||||||| | |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||| | ||||||||||| |||| |    
T  8507 cttcaaacaatttggttgaacatgagaaaacatgttctgacaatcaacatgtttttataccatttgcgtttaacacttttggtttcctagcactagaggt 8606  T
Q  291 tgt 293  Q
    |||    
T  8607 tgt 8609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0514 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0514
Description:

Target: scaffold0514; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 226
Target Start/End: Original strand, 4278 - 4366
Alignment:
Q  137 ttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgtt 226  Q
    ||||| ||||||||||||| || ||||| || ||| |  ||| | |||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  4278 ttgtgagattaggtgtcgg-ccatttacggttggatagacagtcgtaaaagctacgtcaaacagagtggccaaacatgagaaaacgtgtt 4366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University