View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF21506_high_9 (Length: 322)

Name: NF21506_high_9
Description: NF21506
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF21506_high_9
NF21506_high_9
[»] chr2 (34 HSPs)
chr2 (169-315)||(32766217-32766364)
chr2 (169-315)||(31091506-31091652)
chr2 (173-315)||(32764940-32765081)
chr2 (169-315)||(21733750-21733899)
chr2 (172-312)||(31090165-31090305)
chr2 (217-315)||(14704052-14704149)
chr2 (169-315)||(17330209-17330355)
chr2 (170-308)||(24459432-24459570)
chr2 (174-315)||(34037652-34037793)
chr2 (173-315)||(2910102-2910244)
chr2 (172-313)||(40000315-40000456)
chr2 (169-315)||(24458058-24458204)
chr2 (169-313)||(39016364-39016506)
chr2 (169-308)||(5914978-5915117)
chr2 (192-315)||(17466807-17466930)
chr2 (170-315)||(7073638-7073783)
chr2 (169-313)||(2911468-2911616)
chr2 (178-305)||(38853762-38853889)
chr2 (203-313)||(33161799-33161909)
chr2 (191-308)||(5914324-5914441)
chr2 (203-312)||(7412124-7412233)
chr2 (223-315)||(17466093-17466185)
chr2 (173-300)||(34582664-34582791)
chr2 (218-312)||(37607149-37607243)
chr2 (169-315)||(39015003-39015149)
chr2 (232-315)||(38984967-38985051)
chr2 (169-315)||(31814323-31814467)
chr2 (164-281)||(8420006-8420123)
chr2 (173-305)||(38854791-38854923)
chr2 (173-305)||(31443234-31443365)
chr2 (240-315)||(39999022-39999096)
chr2 (258-312)||(10728990-10729044)
chr2 (258-304)||(26586285-26586331)
chr2 (221-282)||(12746213-12746274)
[»] chr8 (22 HSPs)
chr8 (169-315)||(32898424-32898570)
chr8 (169-315)||(35177393-35177539)
chr8 (169-315)||(35178784-35178929)
chr8 (170-315)||(10407563-10407708)
chr8 (173-315)||(5738002-5738144)
chr8 (164-315)||(1952949-1953099)
chr8 (173-315)||(5965421-5965563)
chr8 (163-270)||(41753990-41754097)
chr8 (169-315)||(41754776-41754919)
chr8 (232-315)||(45476223-45476306)
chr8 (217-315)||(28619035-28619133)
chr8 (169-315)||(30134564-30134710)
chr8 (232-315)||(5736903-5736986)
chr8 (241-315)||(45476542-45476616)
chr8 (173-315)||(59554-59696)
chr8 (234-315)||(10406269-10406350)
chr8 (223-315)||(28524810-28524902)
chr8 (173-305)||(43539107-43539239)
chr8 (239-306)||(32565696-32565763)
chr8 (222-276)||(41121160-41121214)
chr8 (217-282)||(12637770-12637835)
chr8 (263-315)||(41122730-41122782)
[»] chr1 (31 HSPs)
chr1 (169-313)||(10332984-10333128)
chr1 (169-315)||(9339644-9339790)
chr1 (169-315)||(32665749-32665895)
chr1 (169-315)||(7945533-7945679)
chr1 (169-315)||(10333165-10333311)
chr1 (170-310)||(7944156-7944294)
chr1 (169-308)||(5782412-5782551)
chr1 (172-315)||(6612420-6612563)
chr1 (169-315)||(9341004-9341150)
chr1 (169-315)||(22856678-22856824)
chr1 (169-315)||(52440539-52440684)
chr1 (169-315)||(52439477-52439619)
chr1 (173-313)||(8975161-8975301)
chr1 (170-314)||(34088449-34088585)
chr1 (254-315)||(22857558-22857619)
chr1 (222-315)||(6613957-6614051)
chr1 (222-312)||(50107185-50107275)
chr1 (169-279)||(3117647-3117757)
chr1 (173-312)||(11060766-11060905)
chr1 (252-315)||(32664585-32664647)
chr1 (198-308)||(5783095-5783205)
chr1 (218-280)||(25037925-25037987)
chr1 (218-280)||(25043137-25043199)
chr1 (181-273)||(44019996-44020088)
chr1 (201-312)||(11829939-11830050)
chr1 (173-315)||(1407642-1407784)
chr1 (254-315)||(534518-534579)
chr1 (266-315)||(33342511-33342560)
chr1 (181-281)||(1001164-1001264)
chr1 (115-167)||(12173238-12173290)
chr1 (169-229)||(2923861-2923921)
[»] chr5 (34 HSPs)
chr5 (168-315)||(4592858-4593005)
chr5 (169-315)||(2464667-2464813)
chr5 (169-315)||(8074449-8074594)
chr5 (169-313)||(546017-546160)
chr5 (169-315)||(9538028-9538174)
chr5 (169-315)||(21069287-21069433)
chr5 (170-315)||(19182949-19183094)
chr5 (164-315)||(28591092-28591244)
chr5 (169-314)||(2466753-2466899)
chr5 (108-241)||(13651173-13651305)
chr5 (169-315)||(14891126-14891268)
chr5 (203-315)||(32641705-32641817)
chr5 (169-313)||(40612640-40612784)
chr5 (169-315)||(25590429-25590574)
chr5 (170-315)||(19186199-19186344)
chr5 (172-315)||(9537024-9537166)
chr5 (169-308)||(16611726-16611865)
chr5 (208-315)||(32640325-32640432)
chr5 (169-315)||(8075812-8075958)
chr5 (208-315)||(544685-544792)
chr5 (173-315)||(31947016-31947158)
chr5 (204-305)||(19271375-19271476)
chr5 (175-315)||(16978996-16979136)
chr5 (173-265)||(18400192-18400284)
chr5 (211-315)||(28589739-28589843)
chr5 (179-277)||(13483029-13483126)
chr5 (234-280)||(14881010-14881056)
chr5 (219-315)||(4594080-4594174)
chr5 (232-276)||(13483174-13483218)
chr5 (222-314)||(35538281-35538373)
chr5 (231-310)||(18004698-18004777)
chr5 (173-312)||(26327054-26327193)
chr5 (169-215)||(24900411-24900457)
chr5 (261-315)||(40611350-40611404)
[»] chr7 (42 HSPs)
chr7 (170-315)||(44333138-44333281)
chr7 (166-315)||(48646044-48646193)
chr7 (169-315)||(48777254-48777401)
chr7 (169-315)||(7258273-7258419)
chr7 (169-315)||(44334429-44334574)
chr7 (173-315)||(7259663-7259805)
chr7 (173-315)||(43457459-43457601)
chr7 (169-315)||(48788651-48788797)
chr7 (172-313)||(46286504-46286645)
chr7 (169-313)||(48647424-48647568)
chr7 (164-315)||(10899052-10899203)
chr7 (169-315)||(35727697-35727842)
chr7 (169-315)||(42477379-42477524)
chr7 (172-315)||(30924988-30925130)
chr7 (169-315)||(35729065-35729211)
chr7 (201-312)||(34888905-34889016)
chr7 (174-308)||(8375569-8375703)
chr7 (173-315)||(12223678-12223820)
chr7 (169-315)||(39708101-39708247)
chr7 (222-315)||(13578300-13578392)
chr7 (169-315)||(8048763-8048909)
chr7 (183-293)||(8374926-8375036)
chr7 (169-279)||(45583682-45583792)
chr7 (224-315)||(45584475-45584566)
chr7 (170-315)||(19433913-19434058)
chr7 (159-315)||(12220011-12220166)
chr7 (219-315)||(44529076-44529172)
chr7 (169-315)||(5930112-5930257)
chr7 (218-310)||(44530595-44530687)
chr7 (231-315)||(32793231-32793315)
chr7 (173-243)||(385662-385732)
chr7 (173-271)||(34704911-34705009)
chr7 (203-312)||(2677768-2677877)
chr7 (212-270)||(10894391-10894449)
chr7 (173-250)||(21062819-21062896)
chr7 (252-313)||(46287385-46287446)
chr7 (203-315)||(7509450-7509562)
chr7 (221-305)||(8879532-8879616)
chr7 (258-310)||(24287567-24287619)
chr7 (260-315)||(33060899-33060954)
chr7 (217-299)||(33607618-33607700)
chr7 (258-315)||(30917800-30917857)
[»] chr3 (35 HSPs)
chr3 (170-315)||(48572984-48573129)
chr3 (163-315)||(36278944-36279096)
chr3 (169-296)||(17700516-17700643)
chr3 (164-315)||(55388066-55388217)
chr3 (173-296)||(17701917-17702040)
chr3 (169-315)||(52316977-52317123)
chr3 (169-314)||(52318297-52318442)
chr3 (169-281)||(19114531-19114643)
chr3 (171-315)||(20464069-20464213)
chr3 (169-308)||(33428421-33428560)
chr3 (169-308)||(47118037-47118176)
chr3 (166-308)||(45600925-45601066)
chr3 (169-282)||(2592019-2592132)
chr3 (210-315)||(36280296-36280401)
chr3 (169-313)||(2591625-2591769)
chr3 (208-315)||(53959079-53959186)
chr3 (169-315)||(3671037-3671182)
chr3 (169-315)||(34263803-34263949)
chr3 (217-315)||(48574438-48574536)
chr3 (174-315)||(50753820-50753961)
chr3 (169-310)||(48808362-48808505)
chr3 (171-315)||(55389448-55389592)
chr3 (169-308)||(47075337-47075476)
chr3 (203-292)||(11773053-11773142)
chr3 (169-308)||(19115133-19115271)
chr3 (164-281)||(49261550-49261664)
chr3 (169-315)||(53957673-53957817)
chr3 (223-305)||(40205934-40206016)
chr3 (180-246)||(19331117-19331183)
chr3 (223-312)||(40206919-40207009)
chr3 (196-270)||(47427885-47427959)
chr3 (258-315)||(48809634-48809690)
chr3 (173-316)||(26652583-26652725)
chr3 (260-315)||(36827454-36827509)
chr3 (187-315)||(612230-612358)
[»] chr4 (25 HSPs)
chr4 (169-308)||(53771035-53771174)
chr4 (169-315)||(42278047-42278193)
chr4 (170-315)||(47878463-47878608)
chr4 (173-312)||(47874566-47874704)
chr4 (169-315)||(31844720-31844865)
chr4 (174-305)||(26172931-26173062)
chr4 (169-308)||(48740006-48740145)
chr4 (169-315)||(26170638-26170784)
chr4 (163-315)||(39868914-39869064)
chr4 (169-278)||(54574423-54574532)
chr4 (169-315)||(4703196-4703342)
chr4 (217-315)||(50694795-50694893)
chr4 (187-315)||(21623096-21623224)
chr4 (168-308)||(53770330-53770470)
chr4 (223-313)||(4701817-4701907)
chr4 (217-315)||(21621869-21621967)
chr4 (169-315)||(31844934-31845080)
chr4 (179-312)||(42391868-42392003)
chr4 (183-308)||(26685408-26685528)
chr4 (169-305)||(44158502-44158638)
chr4 (169-272)||(19051253-19051356)
chr4 (230-315)||(19050297-19050382)
chr4 (218-277)||(54574822-54574881)
chr4 (258-312)||(32244361-32244415)
chr4 (258-315)||(24753540-24753597)
[»] scaffold0039 (3 HSPs)
scaffold0039 (171-315)||(79073-79217)
scaffold0039 (169-315)||(79662-79808)
scaffold0039 (174-250)||(74357-74433)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (170-282)||(116054-116166)
[»] chr6 (9 HSPs)
chr6 (169-315)||(30747997-30748143)
chr6 (169-308)||(31218953-31219092)
chr6 (173-308)||(31219146-31219281)
chr6 (169-315)||(23507947-23508092)
chr6 (173-305)||(12676459-12676591)
chr6 (198-312)||(24621104-24621218)
chr6 (192-243)||(6468832-6468883)
chr6 (116-168)||(1947349-1947401)
chr6 (267-315)||(10855902-10855950)
[»] scaffold0767 (1 HSPs)
scaffold0767 (173-314)||(5601-5742)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 34)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 169 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 32766364 - 32766217
Alignment:
Q  169 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 268  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  32766364 gagcaaatagtcactttggtccctgactctgcacctcgttgtcacataggtccctgactcaggattaaatacaaataagtccctgactctgcacttccgt 32766265  T
Q  269 tatcactttagtccttgccgtt-aaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  32766264 tatcactttagtccttgacgttaaaaaaaatctgttaagtgatgatgt 32766217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 169 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 31091652 - 31091506
Alignment:
Q  169 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 268  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||| || | |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  31091652 gagcaaatagtcactttggtccctgactctgcaccttgctgtcacataggtccctgactcaggattaaatacaaataagtccctgactctgcacttccgt 31091553  T
Q  269 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    |||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31091552 tatcactttagtctctgacgttaaaaaaatatgttaagtgatgatgt 31091506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 173 - 315
Target Start/End: Original strand, 32764940 - 32765081
Alignment:
Q  173 aaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatc 272  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||| || |||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  32764940 aaatagtcactttagtccctgattctgcagctagttgtcatataggtctctgactcaggattaaatacaaataagtccctgactctgcacttccgttatc 32765039  T
Q  273 actttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    |||||| ||| || |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32765040 actttaatccctgacgttaaaaaa-tatgttaagtgatgatgt 32765081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 169 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 21733899 - 21733750
Alignment:
Q  169 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcat---gattaaatacaaataagtccctaactttgcacttc 265  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| || |  |||||||||||  ||||||||||||||   ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||    
T  21733899 gagcaaatagtcactctagtccctgactttgtacatcgttgtcacaaaggtccctgactcatcatgattaaatacaaataagtctctgactctgcacttc 21733800  T
Q  266 cgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    ||| |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21733799 cgtcatcactttagttgttgcagttaaaaaattctgttaagtgatgatgt 21733750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 172 - 312
Target Start/End: Original strand, 31090165 - 31090305
Alignment:
Q  172 caaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttat 271  Q
    |||||||||| |||||||||||| | |||| |||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  31090165 caaatagtcaatttagtccctgattctgcagctcgctgtcacataggtccttgactcaggattaaatataaataagtctctgactctgcacttccgttat 31090264  T
Q  272 cactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatga 312  Q
     | |||||||| || |||||||||| |||||||||||||||    
T  31090265 gattttagtccctgacgttaaaaaaatatgttaagtgatga 31090305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 217 - 315
Target Start/End: Original strand, 14704052 - 14704149
Alignment:
Q  217 ggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14704052 ggtccctgactcaggattaaatacaaataagtccctcactctgcacttccgttatcactttagtccctgacgttaaaaaa-tatgttaagtgatgatgt 14704149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 169 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 17330355 - 17330209
Alignment:
Q  169 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 268  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||| | |||| |||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||    
T  17330355 gagcaaatagtcgctttagtccttgattctgcagctcactgtcacataggtccctgactcaggattaaatacaaataagtctctgactctgcatttccgt 17330256  T
Q  269 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    |||||||||||||| || ||||||   ||| ||||||||||||||||    
T  17330255 tatcactttagtccatgacgttaagttattctgttaagtgatgatgt 17330209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 170 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 24459570 - 24459432
Alignment:
Q  170 agcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgtt 269  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||  ||||||||  ||    
T  24459570 agcaaagagtcactttggtccctgactctgcatctcgctgtcacataggtccctgaatcaggattaaatacaaataagtctctgaccctgcacttctatt 24459471  T
Q  270 atcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtg 308  Q
    ||||||||||||| || | |||||||| |||||||||||    
T  24459470 atcactttagtccctgacattaaaaaaatatgttaagtg 24459432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 174 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 34037793 - 34037652
Alignment:
Q  174 aatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatca 273  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||| || | ||||| |  ||||| | ||||| |||||||||||||||||||  | ||| |||||||| |||||||    
T  34037793 aatagtcactttagtccttgactctgcaccttgctgtcataaaggtccataactcaggattaaatacaaataagtctatgactctgcacttctgttatca 34037694  T
Q  274 ctttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    ||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34037693 ctttagttcccgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 34037652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 173 - 315
Target Start/End: Original strand, 2910102 - 2910244
Alignment:
Q  173 aaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatc 272  Q
    ||||| |||||||||||  ||| | |||| |||| |||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| || ||    
T  2910102 aaataatcactttagtctttgattttgcagctcgctgtcacatagatccctgactcgggattaaatacaaataagtctctgactctgcacttcctttgtc 2910201  T
Q  273 actttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    |||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  2910202 actttagtccctgacgttaaaaaaatctgttaagtgatgatgt 2910244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 172 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 40000456 - 40000315
Alignment:
Q  172 caaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttat 271  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| |||| |||| ||| |||| | ||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  40000456 caaattgtcactttggtccctgactctgcacctcgctgttacatagatccctgattgaggattaaatacaaataagtctctaaccctgcacttccgttat 40000357  T
Q  272 cactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgat 313  Q
    ||||||| ||| || |||||| ||| | ||||||||||||||    
T  40000356 cactttattccctgacgttaagaaaatctgttaagtgatgat 40000315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 169 - 315
Target Start/End: Original strand, 24458058 - 24458204
Alignment:
Q  169 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| | |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||  || ||| | ||||| |||    
T  24458058 gagcaaatagtcactttagtccctgattatgcagctcgctatcacataggtccctgactcaaaattaaatacaaataagtttctgactctacactttcgt 24458157  T
Q  269 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    |||||||||||||  |  |||||||||| | | ||||||||| ||||    
T  24458158 tatcactttagtctctaacgttaaaaaaatctattaagtgataatgt 24458204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 169 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 39016506 - 39016364
Alignment:
Q  169 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccct--gactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttcc 266  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | |||| |||| ||||||||   || ||  |||||| |||||||||||||||||||    ||| |||||||||    
T  39016506 gagcaaatagtcactttagtctctgattctgcagctcgctgtcacatacatctctctgactcaggattaaatacaaataagtc----actctgcacttcc 39016411  T
Q  267 gttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgat 313  Q
    |||||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||||||||    
T  39016410 gttatcactttagtctctgacgttaaaaaaatatgttaagtgatgat 39016364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 169 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 5915117 - 5914978
Alignment:
Q  169 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 268  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| | ||| || ||||  |||||||  |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  5915117 gagcaaatagtcactttagtccatgactctgcacctcgctttcaaataggtctttgactcagaattaaatacaaagaagtcactaactctgcacttccgt 5915018  T
Q  269 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtg 308  Q
    |||||| ||| |||  | ||||||| |||| |||||||||    
T  5915017 tatcaccttaatccccgacgttaaataattctgttaagtg 5914978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 192 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 17466930 - 17466807
Alignment:
Q  192 tgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgtta 291  Q
    ||||| |||| |||| ||||||||  | | |||||||| ||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||   | |||||    
T  17466930 tgactctgcacctcgctgtcacataagccgctgactcaggattaaatacaaagaagtctctgactctgcacttccgttatcactttagtctaagacgtta 17466831  T
Q  292 aaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    || |||| ||||||||||||||||    
T  17466830 aataattctgttaagtgatgatgt 17466807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 170 - 315
Target Start/End: Original strand, 7073638 - 7073783
Alignment:
Q  170 agcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgtt 269  Q
    ||||||||||||||||||||| | | | |||| ||   |||| ||| |||| |||| ||  ||||||||||||||||||| || | | ||||||||||||    
T  7073638 agcaaatagtcactttagtccttcattctgcagcttactgtcgcataggtctctgattcgggattaaatacaaataagtctctgattctgcacttccgtt 7073737  T
Q  270 atcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    ||||||||||||| || ||||||   ||| ||||||||||||||||    
T  7073738 atcactttagtccctgacgttaagttattctgttaagtgatgatgt 7073783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 169 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 2911616 - 2911468
Alignment:
Q  169 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 268  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||  | |||| |||| ||||||||  | || |||||||   ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||    
T  2911616 gagcaaatagtcactttggtctctggttctgcagctcgctgtcacataaggccatgactcaaagttaaatataaataagtctctgactttgcacttccgt 2911517  T
Q  269 tatcactt----tagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgat 313  Q
    ||||||||    |||||| || |||||||||| | ||||||||||||||    
T  2911516 tatcactttagttagtccctgacgttaaaaaaatctgttaagtgatgat 2911468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 178 - 305
Target Start/End: Original strand, 38853762 - 38853889
Alignment:
Q  178 gtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcacttt 277  Q
    |||||||| |||||||||| | ||  || |||||| |  |||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||||| |||    
T  38853762 gtcactttggtccctgactctacacttcattgtcataaaggtctctgactcaggattaaatacaaagtagtccctaaatgtgcacttccgttatcaattt 38853861  T
Q  278 agtccttgccgttaaaaaattatgttaa 305  Q
    ||||  || ||||||| |||||||||||    
T  38853862 agtcactgacgttaaataattatgttaa 38853889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 203 - 313
Target Start/End: Original strand, 33161799 - 33161909
Alignment:
Q  203 ctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgt 302  Q
    ||||||||||||  |||| ||| || | |||||||| |||| ||||| |  ||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||    
T  33161799 ctcgttgtcacaaaggtctctgccttaggattaaatgcaaagaagtctcagactatgtacttccgttatcactttagtccttgacgttaaataattttgt 33161898  T
Q  303 taagtgatgat 313  Q
    |||||||||||    
T  33161899 taagtgatgat 33161909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 191 - 308
Target Start/End: Original strand, 5914324 - 5914441
Alignment:
Q  191 ctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgtt 290  Q
    |||||| |||| |||||||| | || |||| ||||||||  |||||||||||| |||||  | |||||||||| ||||||||||||||| || || ||||    
T  5914324 ctgactttgcacctcgttgtgatataggtctctgactcacaattaaatacaaagaagtcagtgactttgcactcccgttatcactttagaccatgacgtt 5914423  T
Q  291 aaaaaattatgttaagtg 308  Q
    ||| |||| |||||||||    
T  5914424 aaataattctgttaagtg 5914441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 203 - 312
Target Start/End: Original strand, 7412124 - 7412233
Alignment:
Q  203 ctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgt 302  Q
    ||||||||||||| | || |||||||| ||||||||| ||| ||||| || |   ||||||||||||||||||||||||| |  | ||||| ||||||||    
T  7412124 ctcgttgtcacatagatctctgactcaagattaaatataaagaagtcactgatagtgcacttccgttatcactttagtccctaacattaaataattatgt 7412223  T
Q  303 taagtgatga 312  Q
    ||||||||||    
T  7412224 taagtgatga 7412233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 223 - 315
Target Start/End: Original strand, 17466093 - 17466185
Alignment:
Q  223 tgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    ||||||| ||||||||||||| |  || || ||| |||||||||||| |||||||||||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  17466093 tgactcaggattaaatacaaagatatctctgactctgcacttccgttttcactttagtccctgacgtgaaacaattatgttaagtgatgatgt 17466185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 173 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 34582791 - 34582664
Alignment:
Q  173 aaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatc 272  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| |||| || | ||| |||  ||||  ||||||  |||||||||||||  ||||||| | | |||||||||||||||    
T  34582791 aaatggtcacgttagtccctgactctgcaccttgctgttacaaaggtcattgactcgggattaaatacaaagtagtccctgaatgtgcacttccgttatc 34582692  T
Q  273 actttagtccttgccgttaaaaaattat 300  Q
    |||||||||| || ||||||| ||||||    
T  34582691 actttagtccctgacgttaaataattat 34582664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 218 - 312
Target Start/End: Original strand, 37607149 - 37607243
Alignment:
Q  218 gtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatga 312  Q
    |||||| ||||||||||||||||||   ||||| | | | ||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||| ||||||    
T  37607149 gtccctaactcatgattaaatacaaggtagtcctttaatgtgcacttccgttatcactttagtccctgacgttatataattatgttaactgatga 37607243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 315
Target Start/End: Original strand, 39015003 - 39015149
Alignment:
Q  169 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 268  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||| || ||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||| |||  | ||| ||||||| | |    
T  39015003 gagcaaataatcacttttgtccctgactctgcacctcgctgccacatagatccttgactcaggattaaatacaaatacgtctttgactctgcactttcat 39015102  T
Q  269 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    ||||| ||||||   |  |||||||||  | ||||||||||||||||    
T  39015103 tatcattttagtttctaacgttaaaaatatttgttaagtgatgatgt 39015149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 232 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 38985051 - 38984967
Alignment:
Q  232 attaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaa-aaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    |||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||  |  ||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  38985051 attaaatacaaagaagtccttgactctgcacttccgttatcactttagtcactaacgttaaataaattatgttaagtgttgatgt 38984967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 169 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 31814467 - 31814323
Alignment:
Q  169 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 268  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||| |||| |||| ||| | |  |||| ||||||||  |||||||| ||| ||||   | ||| |||||||||||    
T  31814467 gagcaaatagtcactttagtcatttactctgcacctcgctgttaaa--ggtctctgactcagaattaaatataaagaagtttttgactctgcacttccgt 31814370  T
Q  269 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    |||||||||||||| |  | ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  31814369 tatcactttagtccctagcattaaataattctgttaagtgatgatgt 31814323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 281
Target Start/End: Original strand, 8420006 - 8420123
Alignment:
Q  164 aaaaggagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcact 263  Q
    |||| ||| |||| |||||||| |||||||||| ||||| |||  ||||||   |||||||| ||| |||||||||||||  ||||||| | | ||||||    
T  8420006 aaaatgagtaaatggtcactttggtccctgactctgcatttcgcggtcacaaatgtccctgagtcaagattaaatacaaagtagtccctgaatgtgcact 8420105  T
Q  264 tccgttatcactttagtc 281  Q
    || ||||||| |||||||    
T  8420106 tctgttatcagtttagtc 8420123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 173 - 305
Target Start/End: Original strand, 38854791 - 38854923
Alignment:
Q  173 aaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatc 272  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | ||  ||||||||| |  ||||  ||||||| |||||||||||||  ||| ||||| | |||||||  ||||||    
T  38854791 aaatagtcactttggtccctgactctacacttcgttgtcataaaggtctttgactcaggattaaatacaaagtagttcctaaatgtgcacttatgttatc 38854890  T
Q  273 actttagtccttgccgttaaaaaattatgttaa 305  Q
    | |||||||  ||  |||||| |||||||||||    
T  38854891 aatttagtcactgaagttaaataattatgttaa 38854923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 173 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 31443365 - 31443234
Alignment:
Q  173 aaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatc 272  Q
    |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||   |||  ||||| || ||||||||||||  ||||||| |   |||||||  ||||||    
T  31443365 aaatggtcactttagtctctgactctgcatctcgttgtcacaaaagtcattgacttataattaaatacaaagtagtccctga-agtgcacttatgttatc 31443267  T
Q  273 actttagtccttgccgttaaaaaattatgttaa 305  Q
    | ||||||| ||| | ||||||| || ||||||    
T  31443266 agtttagtctttgactttaaaaacttttgttaa 31443234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 240 - 315
Target Start/End: Original strand, 39999022 - 39999096
Alignment:
Q  240 caaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    ||||||||||| | | |||||||| | |||||||||||| ||  || |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39999022 caaataagtccttgattttgcact-cggttatcactttaatctctgacgttaaaaaaatatgttaagtgatgatgt 39999096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 258 - 312
Target Start/End: Original strand, 10728990 - 10729044
Alignment:
Q  258 tgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatga 312  Q
    |||||||||||||||| ||||| || || ||||||||| ||||||||| ||||||    
T  10728990 tgcacttccgttatcagtttagcccctgacgttaaaaacttatgttaactgatga 10729044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 258 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 26586331 - 26586285
Alignment:
Q  258 tgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgtta 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||    
T  26586331 tgcacttccgttatcactttagtctctggcgttaaataattatgtta 26586285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 221 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 12746274 - 12746213
Alignment:
Q  221 cctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtcc 282  Q
    ||||||||| |||||||||||||  ||| ||| | | ||| |||||||||||||||||||||    
T  12746274 cctgactcaggattaaatacaaagtagttcctgaatgtgcccttccgttatcactttagtcc 12746213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 22)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 169 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 32898570 - 32898424
Alignment:
Q  169 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  32898570 gagcaaatagtcactttagtccctgactctgcaactcactgtcacataggtccctgacttaggattaaatacaaataagtccctgactctgcacttccgt 32898471  T
Q  269 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  32898470 tatcactttagtccctgacgttaaaaaaatctgttaagtgatgatgt 32898424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 169 - 315
Target Start/End: Original strand, 35177393 - 35177539
Alignment:
Q  169 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 268  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | | |||| |||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  35177393 gagcaaatagtcaatttagtccctaattctgcagctcgctgtcacataggtccctgactccggattaaatacaaataagtccctgactctgcacttccgt 35177492  T
Q  269 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    |||||||||||||| || |||||||| | | ||||||||||||||||    
T  35177493 tatcactttagtccctgacgttaaaataatctgttaagtgatgatgt 35177539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 169 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 35178929 - 35178784
Alignment:
Q  169 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 268  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | |||||||||||    
T  35178929 gagcaaatagtcactttggtccctgactctgcacatcgctgtcatattggtccctgactcaggattaaatacaaataagtccctgattctgcacttccgt 35178830  T
Q  269 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  35178829 tatcactttagtccctgacgttaaaaaa-tctgttaagtgatgatgt 35178784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 170 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 10407708 - 10407563
Alignment:
Q  170 agcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgtt 269  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | |||| |||  |||||||| ||||  ||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10407708 agcaaatagtcactttagtctctgattctgcagctcactgtcacataggtcattgacttaggattaaacacaaataagtccataactttgcacttccgtt 10407609  T
Q  270 atcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    ||||||||||| | || |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  10407608 atcactttagttcctgacgttaaaaaaatctgttaagtgatgatgt 10407563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 173 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 5738144 - 5738002
Alignment:
Q  173 aaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatc 272  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||   | ||| || ||||||||||||    
T  5738144 aaatggtcactttagttcctgactttgcatatcgttgtgacataggtccatgactcaagattaaatacaaagaagttattgactctgtacttccgttatc 5738045  T
Q  273 actttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    |||| |||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  5738044 acttcagtctttggcgttaaataattctgttaagtgatgatgt 5738002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 164 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 1953099 - 1952949
Alignment:
Q  164 aaaaggagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcact 263  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| || | || |||||| | ||||| |||||||||||||  | ||| || |||    
T  1953099 aaaaagagtaaatagtcactttagtccctgattctgcagctcgttgtcatatagatctctgact-aggattacatacaaataagtctatgactctgtact 1953001  T
Q  264 tccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||| || | ||||||||||||||||    
T  1953000 tccgttatcactttagtctctgacgttaaataaatctgttaagtgatgatgt 1952949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 173 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 5965563 - 5965421
Alignment:
Q  173 aaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatc 272  Q
    ||||||||| || |||| |||| | | || ||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||| |||||  | ||| |||||||||||||||    
T  5965563 aaatagtcatttcagtctctgattttacacctcgttgtcacaaatgtccctgactcaggattaaatacaaagaagtctttgactctgcacttccgttatc 5965464  T
Q  273 actttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    |||||||||  || |||||||  |||||||||||| |||||||    
T  5965463 actttagtctctgacgttaaatgattatgttaagtaatgatgt 5965421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 163 - 270
Target Start/End: Original strand, 41753990 - 41754097
Alignment:
Q  163 taaaaggagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcac 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| || | |||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| ||| | |||    
T  41753990 taaaaggagcaaatagtcactttagtccctggttctgcaccttgctgtcacataggtccctgactcaggattaaatataaacaagtccctgactctacac 41754089  T
Q  263 ttccgtta 270  Q
    || |||||    
T  41754090 tttcgtta 41754097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 169 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 41754919 - 41754776
Alignment:
Q  169 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 268  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| | |||| |||| |||||||| | || |||||||| ||||||||||||| |||| ||| ||| | |||||||||    
T  41754919 gagcaaatagtcactttaatcc-tgattctgcacctcgctgtcacatagatctctgactcaggattaaatacaaacaagttcctgactctacacttccgt 41754821  T
Q  269 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    ||| ||||||| || |||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  41754820 tattactttag-ccctgccgttaaaaaa-actgttaagtgatgatgt 41754776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 232 - 315
Target Start/End: Original strand, 45476223 - 45476306
Alignment:
Q  232 attaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    |||||||||||||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  45476223 attaaatacaaataagtctctgactctgcacttctgttatcactttagtctctcccgttaaaaaaatctgttaagtgatgatgt 45476306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 217 - 315
Target Start/End: Original strand, 28619035 - 28619133
Alignment:
Q  217 ggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || ||  | ||| ||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  28619035 ggtccctgacccatgattaaatacaaagaaatcattgactctgcactttcgttatcactttagtctcggccgttaaataattttgttaagtgatgatgt 28619133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 315
Target Start/End: Original strand, 30134564 - 30134710
Alignment:
Q  169 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 268  Q
    ||||||||| |||||||||||| | ||| |||| |||| |||||||  ||||||  ||||||||||||||||||| ||||   | ||| |||||||| ||    
T  30134564 gagcaaataatcactttagtccttaactctgcacctcgctgtcacaaaggtcccctactcatgattaaatacaaagaagtgtgtgactctgcacttctgt 30134663  T
Q  269 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    |||||||||| |   |  ||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  30134664 tatcactttaatatctaacgttatataattatgttaggtgatgatgt 30134710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 232 - 315
Target Start/End: Original strand, 5736903 - 5736986
Alignment:
Q  232 attaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    |||||||||||| || || |||||| | ||||| ||||||||||||||||| |  ||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  5736903 attaaatacaaagaaatctctaactctacactttcgttatcactttagtccctcacgttaaataattttgttaagtgatgatgt 5736986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 241 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 45476616 - 45476542
Alignment:
Q  241 aaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    ||||||||| || ||| ||||||||  ||||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45476616 aaataagtcgctgactctgcacttctcttatcactttagtctctgtcgttaaaaaaatatgttaagtgatgatgt 45476542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 173 - 315
Target Start/End: Original strand, 59554 - 59696
Alignment:
Q  173 aaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatc 272  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || |||| |||||| |  |||||||||||| ||| || ||||||  ||||||| | |  | |  || || |||    
T  59554 aaatagtcactttagtccctgactttacacctcgctgtcactttagtccctgactcaggataaactacaaaatagtccctgaatgggtagatctgtcatc 59653  T
Q  273 actttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    | |||||||||| |  |||||||||||||||||  ||||||||    
T  59654 agtttagtccttacaattaaaaaattatgttaaccgatgatgt 59696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 234 - 315
Target Start/End: Original strand, 10406269 - 10406350
Alignment:
Q  234 taaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    |||||| ||| ||||| || ||| ||||||||  ||||||||||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  10406269 taaataaaaacaagtctctgactctgcacttctattatcactttagtccctggtgttaaaaaaatctgttaagtgatgatgt 10406350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 223 - 315
Target Start/End: Original strand, 28524810 - 28524902
Alignment:
Q  223 tgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    ||||||| |||||||||||||  | ||| | | | |||||||||||||||| |||||||  || ||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  28524810 tgactcaggattaaatacaaagtaatccttgaatgtgcacttccgttatcattttagtctctgacgttaaataattttgttaactgatgatgt 28524902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 173 - 305
Target Start/End: Original strand, 43539107 - 43539239
Alignment:
Q  173 aaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatc 272  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| |||| |||| |||||| |  ||||| |||||| ||| || ||||||  ||||||| | | || |  || ||||||    
T  43539107 aaatagtcactttggtccctaactttgcacctcgctgtcactttagtccccgactcaggataaactacaaaatagtccctgaatgtgtatatctgttatc 43539206  T
Q  273 actttagtccttgccgttaaaaaattatgttaa 305  Q
    | |||| ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  43539207 agtttaatccttaccgttaaaaaattctgttaa 43539239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 239 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 32565763 - 32565696
Alignment:
Q  239 acaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaag 306  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||   ||||| ||||||||||||    
T  32565763 acaaagaagtcccaaattttgcactttcgttatcactttagtcattgatattaaataattatgttaag 32565696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 222 - 276
Target Start/End: Original strand, 41121160 - 41121214
Alignment:
Q  222 ctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactt 276  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||  |||||||||    
T  41121160 ctgactcatgattaaatacaaagaagtctctgactatgcacttctattatcactt 41121214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 217 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 12637835 - 12637770
Alignment:
Q  217 ggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtcc 282  Q
    ||||||| ||||| |||| ||||||||  ||| ||| | | |||||||||||||||||||||||||    
T  12637835 ggtccctaactcaggattgaatacaaagtagttcctgaatgtgcacttccgttatcactttagtcc 12637770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 263 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 41122782 - 41122730
Alignment:
Q  263 ttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    |||| |||||| ||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41122782 ttccattatcattttagtgtttgacgttaaataattatgttaagtgatgatgt 41122730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 31)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 169 - 313
Target Start/End: Original strand, 10332984 - 10333128
Alignment:
Q  169 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  10332984 gagcaaatagtcactttagtccctgactttgcacctcgttgtcacataggtccttgattcaggattaaatataaataagtcccttactctgcacttccgt 10333083  T
Q  269 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgat 313  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||    
T  10333084 tatcattttagtccttgacgttaaaaaaatctgttaagtgatgat 10333128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 169 - 315
Target Start/End: Original strand, 9339644 - 9339790
Alignment:
Q  169 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 268  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||    
T  9339644 gagcaaatagtccctttagtccctgattctgcagctcgttgttacataggtccctgactcaggattaaatacaaataaatccccgactctgcacttccgt 9339743  T
Q  269 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  9339744 tatcactttagtccctgacgttaaaaaaatctgttaagtgatgatgt 9339790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 169 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 32665895 - 32665749
Alignment:
Q  169 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||||    
T  32665895 gagcaaatagtcactttagtccctgattctgcagctcgctgtcacataggtctctgactcatgattaaatacaaataagtctttgactctgcacttccgt 32665796  T
Q  269 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  32665795 tatcactttagtccctggcgttacaaaaatctgttaagtgatgatgt 32665749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 169 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 7945679 - 7945533
Alignment:
Q  169 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 268  Q
    ||||||||| ||| ||| |||||||||| |||| |||| |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  7945679 gagcaaataatcattttggtccctgactctgcacctcgctgtcacataggttcctgactcaggattaaatacaaataagtctctgactatgcacttccgt 7945580  T
Q  269 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||||||||||    
T  7945579 tatcactttagtccctgacgttaaaaaaatatgctaagtgatgatgt 7945533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 169 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 10333311 - 10333165
Alignment:
Q  169 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 268  Q
    ||||||||||||||| || || |||| | |||| |||| ||| |||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  10333311 gagcaaatagtcactataatctctgattctgcagctcgctgttacataggtctctgactcaagattaaatacaaataagtctctgactctgcacttccgt 10333212  T
Q  269 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    |||||||||||||  |  |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  10333211 tatcactttagtctctagcgttaaaaaaatctgttaagtgatgatgt 10333165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 170 - 310
Target Start/End: Original strand, 7944156 - 7944294
Alignment:
Q  170 agcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgtt 269  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| | |||| |||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||    
T  7944156 agcaaatagtcact--agtccctgattttgcaactcgctgtcacataggtccctgactcaaaattaaatacaaataagtccttgactctgcactttcgtt 7944253  T
Q  270 atcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgat 310  Q
    |||| |||||||| |  |||||||||| |||||||||||||    
T  7944254 atcaatttagtccctaacgttaaaaaaatatgttaagtgat 7944294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 169 - 308
Target Start/End: Original strand, 5782412 - 5782551
Alignment:
Q  169 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 268  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| || | | ||||||||| |    
T  5782412 gagcaaattgtcattttagtccctgactctgcacctcgctgtcacataggtctctgactcatgattaaatacaaagaagtctctgattatgcacttccct 5782511  T
Q  269 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtg 308  Q
    |||||||||||||  || ||||||| |||| | |||||||    
T  5782512 tatcactttagtctctgacgttaaataattttattaagtg 5782551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 172 - 315
Target Start/End: Original strand, 6612420 - 6612563
Alignment:
Q  172 caaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttat 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| | |   ||| |||||||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||| ||||    
T  6612420 caaatagtcactttagtccctgactctgcacctcgctgttataaatgtctctgactcatgattaaatacaaacaagtctctgactctgcacttccattat 6612519  T
Q  272 cactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    ||||||| ||| || ||||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  6612520 cactttaatccctgacgttaaataattttgttaagtgattatgt 6612563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 169 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 9341150 - 9341004
Alignment:
Q  169 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 268  Q
    |||||||||||||||||  ||  | | | ||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||    
T  9341150 gagcaaatagtcactttgatcatttattctgcatctcactatcacataggtccctgactcaggattaaatacaaataagtctctgactttgcacttctgt 9341051  T
Q  269 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    |||||||||||||  || |||||||||| | | ||||||||||||||    
T  9341050 tatcactttagtctctgacgttaaaaaaatctattaagtgatgatgt 9341004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 169 - 315
Target Start/End: Original strand, 22856678 - 22856824
Alignment:
Q  169 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 268  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| |||| | |||||| |||  | | | ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  22856678 gagcaaatggtcactttagtcactgactctgcaccacgttgttacaaagattcttgactcaggattaaatacaaagaagtctctaactctgcacttccgt 22856777  T
Q  269 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    |||||||||||||   | ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  22856778 tatcactttagtctccgacgttaaataattatgttaagtgattatgt 22856824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 169 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 52440684 - 52440539
Alignment:
Q  169 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 268  Q
    ||||||||| |||| || ||| |||||| ||||  ||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| || ||| ||||||||| |    
T  52440684 gagcaaataatcacattggtctctgactttgcacatcgctgtcacataggtccctgagtcaggattaaatataaataagtctctgactctgcacttccat 52440585  T
Q  269 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  52440584 tatcactttagt-cttgacgttaaaaaaatgtgttaagtgatgatgt 52440539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 169 - 315
Target Start/End: Original strand, 52439477 - 52439619
Alignment:
Q  169 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 268  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||| |||||||| |||| ||| |||| ||||||||||| |||||||     || |||| ||||||    
T  52439477 gagcaaatagtcactttagcccctgattctgcagctcgctgtcacataggtctctggctcaggattaaatacagataagtc----tctctgcatttccgt 52439572  T
Q  269 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  52439573 tatcactttagtccctgacgttaaaaaaatctgttaagtgatgatgt 52439619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 173 - 313
Target Start/End: Original strand, 8975161 - 8975301
Alignment:
Q  173 aaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatc 272  Q
    |||| |||||||| |||||| ||| |||| || |||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||  ||||| | | | ||||||| |||||||    
T  8975161 aaatggtcactttggtccctaactttgcaccttgttgtcacaaaggtccctgactcaagattaaatataaagtagtccatgaatatgcactttcgttatc 8975260  T
Q  273 actttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgat 313  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||| |||||| |||||||    
T  8975261 actttagtctttggcgttaaataattttgttaattgatgat 8975301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 170 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 34088585 - 34088449
Alignment:
Q  170 agcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgtt 269  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||  ||||        ||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||  |    
T  34088585 agcaaattgtcactttagtccctgactctacatctcgctgtcacaaaggtc--------atgattaaatacaaagaagtctctgactctgcacttccact 34088494  T
Q  270 atcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatg 314  Q
    ||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  34088493 atcactttaatccttgacattaaataattatgttaagtgatgatg 34088449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 254 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 22857619 - 22857558
Alignment:
Q  254 actttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22857619 actttgcacttccgttatcactttagtccatgacgttaaataattatgttaagtgatgatgt 22857558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 222 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 6614051 - 6613957
Alignment:
Q  222 ctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtcct-tgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||||| ||||||| |||||||||  | ||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  6614051 ctgactcaggattaaatacaaataagtctctgactctgcacttcagttatcattttagtcctccgacgttaaataattttgttaagtgatgatgt 6613957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 222 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 50107275 - 50107185
Alignment:
Q  222 ctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatga 312  Q
    |||| ||| |||||||||||||  |||| || | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  50107275 ctgattcaggattaaatacaaaatagtctctgaatgtgcacttccgttatcactttagtccttggcgttaaataattatgttaactgatga 50107185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 279
Target Start/End: Original strand, 3117647 - 3117757
Alignment:
Q  169 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 268  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||| | ||  ||||| |||||  |||| |||||||| ||||||||||||| || || || ||| | |||||||||    
T  3117647 gagcaaatagtcattttagtccctaactcttcacatcgttatcacaaaggtctctgactcaagattaaatacaaagaaatctctgactctccacttccgt 3117746  T
Q  269 tatcactttag 279  Q
    |||||||||||    
T  3117747 tatcactttag 3117757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 173 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 11060905 - 11060766
Alignment:
Q  173 aaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatc 272  Q
    |||| ||||||||  ||| ||||| |||| |||| |||||||  ||||| |||||||  ||||||||||||  ||||||| | |  |||||| |||||||    
T  11060905 aaatggtcactttgatccttgactatgcacctcgctgtcacaaaggtccatgactcaaaattaaatacaaaatagtccctgaatgggcactttcgttatc 11060806  T
Q  273 actttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatga 312  Q
    ||||||||||  | ||||||| |||| |||||| ||||||    
T  11060805 actttagtccccgacgttaaataattctgttaactgatga 11060766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 252 - 315
Target Start/End: Original strand, 32664585 - 32664647
Alignment:
Q  252 taactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  32664585 taactctgcacttccgttatcactttagtccttgacgttaagaaaat-tgttaagtgatgatgt 32664647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 198 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 5783205 - 5783095
Alignment:
Q  198 tgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaat 297  Q
    |||| |||| |||||||| | |||  ||||||  |||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||  |  ||||||| |||    
T  5783205 tgcacctcgctgtcacatagatcctcgactcagaattaaatacaaagaagtccatgactctgcacttccgttatcactttagtcactagcgttaaataat 5783106  T
Q  298 tatgttaagtg 308  Q
    | |||||||||    
T  5783105 tctgttaagtg 5783095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 218 - 280
Target Start/End: Original strand, 25037925 - 25037987
Alignment:
Q  218 gtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagt 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| || |||| |||||||||||||||    
T  25037925 gtccctgactcatgattaaatacaaagaagtcactgactctggacttacgttatcactttagt 25037987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 218 - 280
Target Start/End: Original strand, 25043137 - 25043199
Alignment:
Q  218 gtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagt 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| || |||| |||||||||||||||    
T  25043137 gtccctgactcatgattaaatacaaagaagtcactgactctggacttacgttatcactttagt 25043199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 181 - 273
Target Start/End: Original strand, 44019996 - 44020088
Alignment:
Q  181 actttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatca 273  Q
    ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||   ||| |||||||| ||||||||| ||| ||||| || ||| ||||||| ||||||||    
T  44019996 actttggtccctgactttgcaactcgttgtcacaaaagtctctgactcaagattaaatataaagaagtctctgactctgcacttacgttatca 44020088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 201 - 312
Target Start/End: Original strand, 11829939 - 11830050
Alignment:
Q  201 atctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattat 300  Q
    ||||||||||||||  |||| || ||||| |||||||||||||| ||||| |   | |||| ||||||||| | ||||| | ||| ||||||||| ||||    
T  11829939 atctcgttgtcacaaaggtcactaactcaagattaaatacaaattagtccttgtatatgcatttccgttattagtttaggctttgacgttaaaaacttat 11830038  T
Q  301 gttaagtgatga 312  Q
    ||||| ||||||    
T  11830039 gttaactgatga 11830050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 173 - 315
Target Start/End: Original strand, 1407642 - 1407784
Alignment:
Q  173 aaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatc 272  Q
    ||||| |||||||  || |||||| |||| || |||||||||  ||||| ||||| |||| |||||| |||  |||  || | | |||||||  ||||||    
T  1407642 aaataatcactttcatctctgactctgcaccttgttgtcacaaaggtccatgacttatgactaaatataaagtagtttctgaatatgcacttatgttatc 1407741  T
Q  273 actttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    |||||||||| || ||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  1407742 actttagtccctgacgttaaataattttgttaactgatgatgt 1407784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 254 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 534579 - 534518
Alignment:
Q  254 actttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  534579 actttacacttctgttatcactttagtccctaccgttaaaaaaatctgttaagttatgatgt 534518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 266 - 315
Target Start/End: Original strand, 33342511 - 33342560
Alignment:
Q  266 cgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33342511 cgttatcactttagtctctgacgttaaataattatgttaagtgatgatgt 33342560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 281
Target Start/End: Original strand, 1001164 - 1001264
Alignment:
Q  181 actttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagt 280  Q
    |||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||  ||||| ||||||  |||||||||||||  |||| || | | |||||||| ||||||| ||||||    
T  1001164 actttagtccatgactttgcacctcgttgccacaaaggtccatgactcgggattaaatacaaagtagtctctgaatgtgcacttctgttatcagtttagt 1001263  T
Q  281 c 281  Q
    |    
T  1001264 c 1001264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 12173290 - 12173238
Alignment:
Q  115 attatggatcttggtaaccagtatcctcagggtaatggtttaggaaactaaaa 167  Q
    ||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12173290 attatgggtcttgttaaccagtgccctcagggtaatggttaaggaaactaaaa 12173238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 169 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 2923921 - 2923861
Alignment:
Q  169 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactca 229  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||| | |||||  |||||||||||||    
T  2923921 gagcaaatagtcactttagttcctaactttgcacctcgctatcacaaaggtccctgactca 2923861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 34)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 168 - 315
Target Start/End: Original strand, 4592858 - 4593005
Alignment:
Q  168 ggagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccg 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | || | |||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  4592858 ggagcaaatagtcactttagtccctgattatgtagctcgctgtcacataagtccctgactcaagattaaatacaaataagtccctgactctgcacttccg 4592957  T
Q  268 ttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  4592958 ttatcactttagtccctgacgttaaaaaaatctgttaagtgatgatgt 4593005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 169 - 315
Target Start/End: Original strand, 2464667 - 2464813
Alignment:
Q  169 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 268  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | |||| |||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  2464667 gagcaaatagtcactttagtcactgattctgcagctcgctgtcatataggtccatgactcatgattaaatacaaataagtccctaactctgcacttacgt 2464766  T
Q  269 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    |||||||||||||  || |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  2464767 tatcactttagtctctgacgttaaaaaaatttgttaagtgatgatgt 2464813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 169 - 315
Target Start/End: Original strand, 8074449 - 8074594
Alignment:
Q  169 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  8074449 gagcaaatagtcactttagtccctgattatgcagctcgctgtcacataagtccctgactcaggattaaatacaaataagtccctgactctgcacttccgt 8074548  T
Q  269 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    |||||||||||| | || |||||||||| |  |||||||||||||||    
T  8074549 tatcactttagttcctgacgttaaaaaa-tcggttaagtgatgatgt 8074594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 169 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 546160 - 546017
Alignment:
Q  169 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 268  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | |||| |||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||    
T  546160 gagcaaatagtcactttagtccc-gattttgcagctcgctgtcacataggtccctgactcaggattaaatacagataagtccttgactctgcacttccgt 546062  T
Q  269 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgat 313  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||    
T  546061 tatcactttagtccctgacgttaaaaaaatttgttaagtgatgat 546017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 169 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 9538174 - 9538028
Alignment:
Q  169 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 268  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || | | |||||||||||    
T  9538174 gagcaaatagtcactttggtccctgactctgcatctcgttgtcatataggtccctgactcaggattaaatacaaagaagtctctgattgtgcacttccgt 9538075  T
Q  269 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    ||||| |||||||  ||  |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  9538074 tatcattttagtctctgatgttaaataattatgttaagtgattatgt 9538028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 169 - 315
Target Start/End: Original strand, 21069287 - 21069433
Alignment:
Q  169 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 268  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||    
T  21069287 gagcaaatagtcactttagtctctgactctgcacctcgttgtcacagaggtctctgactcaggattaaatacaaataagtccttgactctgcacttctgt 21069386  T
Q  269 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    | |||||||| |   ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21069387 tttcactttaatatatgccgttaaaaaattttgttaagtgatgatgt 21069433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 170 - 315
Target Start/End: Original strand, 19182949 - 19183094
Alignment:
Q  170 agcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgtt 269  Q
    |||||||||| |||||||  | ||||| |||| |||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||||    
T  19182949 agcaaatagttactttagaacttgactttgcacctcgctgtcacataggtctctgactcaggattaaatacaaataagttcctgactctacacttccgtt 19183048  T
Q  270 atcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  19183049 atcactttagtccttgcgattaaaaaaatatgttaagtgatgatgt 19183094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 164 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 28591244 - 28591092
Alignment:
Q  164 aaaaggagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcact 263  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  28591244 aaaaagagcaaatagtcactttgatccctgactctgcacctcgctgtcacataggtccctgactcaggattaaatacaaataaatccctgactctgcact 28591145  T
Q  264 tccgttatcactttagtccttgccgtta-aaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    ||| |||||||||||||||  | ||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  28591144 tcctttatcactttagtccccgacgttacaaaaaatctgttaagtgatgatgt 28591092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 169 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 2466899 - 2466753
Alignment:
Q  169 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 268  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| |||| |||| | |||||| ||||  ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  2466899 gagcaaatagtcactttggtctctgactctgcacctcgctatcacataggtcattgattcaggattaaataaaaataagtccctaactctgcacttccgt 2466800  T
Q  269 tatcactttagtccttgccgtt-aaaaaattatgttaagtgatgatg 314  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||| | |||||||||||||||    
T  2466799 tatcactttagtccctgacgttaaaaaaaatctgttaagtgatgatg 2466753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 108 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 13651305 - 13651173
Alignment:
Q  108 tactagtattatggatcttggtaaccagtatcctcagggtaatggtttaggaaactaaaaggagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgt 207  Q
    |||||||||||||||||||  | || | | |||||| || ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| || |     
T  13651305 tactagtattatggatcttactgacgaatgtcctcatggcaatggttaaggaaactaaaatgagcaaatagtcactttagtccttgactgtgcacct-gc 13651207  T
Q  208 tgtcacatgggtccctgactcatgattaaataca 241  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  13651206 tgtcacataggtccctgactcaggattaaataca 13651173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 169 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 14891268 - 14891126
Alignment:
Q  169 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 268  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| |    ||||| || ||| | |||||||||    
T  14891268 gagcaaatagtcactttggtccctcactctgcacctcgctgtcacataggtctctgactcatgattaaatgc----aagtctctgactctacacttccgt 14891173  T
Q  269 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    |||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14891172 tatcactttagtctctgacgttaaaaaaatatgttaagtgatgatgt 14891126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 203 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 32641817 - 32641705
Alignment:
Q  203 ctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgt 302  Q
    ||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||    
T  32641817 ctcgttgtcacgtaggtcccttactcaagattaaatacaaataagttgctgactctgcacttccgttatcactttaatccctgacgttaaaaaaatatgt 32641718  T
Q  303 taagtgatgatgt 315  Q
    |||||||||||||    
T  32641717 taagtgatgatgt 32641705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 169 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 40612784 - 40612640
Alignment:
Q  169 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||  |||||| | ||||||||||||| ||||||||||| |||  | ||| ||| |||||||||||    
T  40612784 gagcaaatagtcactttagtccctgattttgcagctcactgtcacgtaggtccctgactcaggattaaatacagatattttcctgactctgcacttccgt 40612685  T
Q  269 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgat 313  Q
    |||||||||| | | || |||||||||| | ||||||||||||||    
T  40612684 tatcactttaattcctgacgttaaaaaaatctgttaagtgatgat 40612640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 169 - 315
Target Start/End: Original strand, 25590429 - 25590574
Alignment:
Q  169 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 268  Q
    |||||||||||||||||  |  |||||| |||| |||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| || | | |||||||| ||    
T  25590429 gagcaaatagtcactttgttttctgactctgcacctcgctgtcacataggtccctgactcg-gattaaatacaaataagtctctgattctgcacttctgt 25590527  T
Q  269 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    |||||||||| ||  || |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25590528 tatcactttaatctctgacgttaaaaaattttgttaagtgatgatgt 25590574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 170 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 19186344 - 19186199
Alignment:
Q  170 agcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgtt 269  Q
    |||||||||||| ||||||| |   || ||||||||   ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||||| || ||| | || |||||||    
T  19186344 agcaaatagtcattttagtctcatgctctgcatctcccagtcacataggtccctgacttaggattaaatacaaacaagtctctgactctacatttccgtt 19186245  T
Q  270 atcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    |||||||||||||||| |||||||| | | ||||||| ||||||||    
T  19186244 atcactttagtccttgtcgttaaaacaatctgttaagcgatgatgt 19186199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 172 - 315
Target Start/End: Original strand, 9537024 - 9537166
Alignment:
Q  172 caaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttat 271  Q
    ||||| || |||||||||||| ||| |||| |||| |||||||| |||| |||||| |  |||||||||||| |||||  | ||| ||||||||| ||||    
T  9537024 caaatggtgactttagtccctcactctgcacctcgctgtcacataggtctctgacttagaattaaatacaaagaagtca-tgactgtgcacttccattat 9537122  T
Q  272 cactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    ||||||||||  || ||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  9537123 cactttagtcactgacgttaaataattatggtaagtgatgatgt 9537166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 169 - 308
Target Start/End: Original strand, 16611726 - 16611865
Alignment:
Q  169 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 268  Q
    |||||||| ||||||||| | | ||||| | || |||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| ||| | || | | |||||||||||    
T  16611726 gagcaaatggtcactttaattcttgactctacacctcgctgtcacataggtctctgactcaggattaaatacaaagaagcctctgattatgcacttccgt 16611825  T
Q  269 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtg 308  Q
    |||||||||||||  || ||||||| |||| |||||||||    
T  16611826 tatcactttagtctctgacgttaaataattctgttaagtg 16611865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 208 - 315
Target Start/End: Original strand, 32640325 - 32640432
Alignment:
Q  208 tgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagt 307  Q
    |||||||| || || | ||||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||  || |||||||||| | ||||||||    
T  32640325 tgtcacataggaccataactcaggattaaatacaaataagtccctaactctaaacttctgttatcactttagtctctgacgttaaaaaaatttgttaagt 32640424  T
Q  308 gatgatgt 315  Q
    ||||||||    
T  32640425 gatgatgt 32640432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 169 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 8075958 - 8075812
Alignment:
Q  169 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 268  Q
    |||||||||||| |||| |||  ||||| |||| |||| ||| | || | ||||||| ||| ||||||||||||| ||||  || | | ||||||| |||    
T  8075958 gagcaaatagtcgctttggtcattgactctgcacctcgctgttagatagatccctgattcaagattaaatacaaaaaagtatctgattctgcactttcgt 8075859  T
Q  269 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    |||||||||||||| || |||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  8075858 tatcactttagtccctgacgtttaaaaaatctgttaagtgatgatgt 8075812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 208 - 315
Target Start/End: Original strand, 544685 - 544792
Alignment:
Q  208 tgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagt 307  Q
    ||||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| | ||||||   || | |||||||| ||||||||||    
T  544685 tgtcagataggtctctgactcaggattaaatacaaataagtcactgactctgcacttccgttataaatttagtttctgacattaaaaaaatatgttaagt 544784  T
Q  308 gatgatgt 315  Q
    ||| ||||    
T  544785 gattatgt 544792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 173 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 31947158 - 31947016
Alignment:
Q  173 aaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatc 272  Q
    ||||||||||||||||| |||| | ||||  | ||||||| || | | ||| ||| |  |||||||||||| |||||  | ||| |  ||||||||||||    
T  31947158 aaatagtcactttagtctctgattctgcactttgttgtcatatagattccttacttaaaattaaatacaaacaagtctatgactctagacttccgttatc 31947059  T
Q  273 actttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    |||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31947058 actttagtcactgctgttaaaaaaatatgttaagtgatgatgt 31947016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 204 - 305
Target Start/End: Original strand, 19271375 - 19271476
Alignment:
Q  204 tcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgtt 303  Q
    ||||||||||| | ||||| | |||||||||||||| |||  ||||| | | | |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||| |||||||    
T  19271375 tcgttgtcacaagtgtcccaggctcatgattaaatataaagtagtcctttaatgtgcacttccgttatcagtttagtccatgacgttaaaaatttatgtt 19271474  T
Q  304 aa 305  Q
    ||    
T  19271475 aa 19271476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 175 - 315
Target Start/End: Original strand, 16978996 - 16979136
Alignment:
Q  175 atagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcac 274  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| || | || ||||  ||||  |||||||  ||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||||     
T  16978996 atagtcactttagtccttgactttgcaccttgctgccacaaaggtcattgactcagaattaaatgcaaataagtccctaactctgtacttacgttatcat 16979095  T
Q  275 tttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    |||||||  |  ||||||   ||| ||||||||||||||||    
T  16979096 tttagtctctaacgttaagttattctgttaagtgatgatgt 16979136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 173 - 265
Target Start/End: Original strand, 18400192 - 18400284
Alignment:
Q  173 aaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttc 265  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||| || ||| ||||||||    
T  18400192 aaatggtcactttagtccctgactctgcacctcactgtcacataggtccttgactcaggattaaataaaaagaagtcactgactctgcacttc 18400284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 211 - 315
Target Start/End: Original strand, 28589739 - 28589843
Alignment:
Q  211 cacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgat 310  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |   | |||||| |||||||||| || |||||||  || |||||||||| | |||||||||||    
T  28589739 cacataggtccctgactcataattaaatacaaatacatttttgactttgtacttccgttaccattttagtctctgacgttaaaaaaatctgttaagtgat 28589838  T
Q  311 gatgt 315  Q
    |||||    
T  28589839 gatgt 28589843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 179 - 277
Target Start/End: Original strand, 13483029 - 13483126
Alignment:
Q  179 tcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcacttt 277  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||||   ||| || ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| || ||| ||||||| ||||||||||||    
T  13483029 tcactttagtccc-gactctgtatctcgcattcagataggttcctgactcatgattaaatataaagaagtctcttactctgcactttcgttatcacttt 13483126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 234 - 280
Target Start/End: Original strand, 14881010 - 14881056
Alignment:
Q  234 taaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagt 280  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  14881010 taaacacaaataagtccctgactctgcacttccgttatcactttagt 14881056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 219 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 4594174 - 4594080
Alignment:
Q  219 tccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||| ||||||||| ||||||| ||| ||| |  |||||||||  | ||||||||||||||||    
T  4594174 tccctgactcaggattaaatacaaataagt-catgactctgcacttccattatcac-ttaatcccttacgttaaaaagatctgttaagtgatgatgt 4594080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 232 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 13483218 - 13483174
Alignment:
Q  232 attaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactt 276  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  13483218 attaaatacaaacaagtctctgactttgcacttccgttatcactt 13483174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 222 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 35538373 - 35538281
Alignment:
Q  222 ctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatg 314  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||| | | | | ||||||||||||||||||||| |||||   |||||| |||| |||||| ||||||||    
T  35538373 ctgactcgtgattaaatacaaagtagttcttcaatgtgcacttccgttatcactttaatccttaatgttaaataattctgttaactgatgatg 35538281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 231 - 310
Target Start/End: Original strand, 18004698 - 18004777
Alignment:
Q  231 gattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgat 310  Q
    ||||||||||||| | |||  | ||| ||||||||||||||||||||||||  ||  |||||| | ||||||||||||||    
T  18004698 gattaaatacaaagaggtctatgactctgcacttccgttatcactttagtctctgatgttaaatagttatgttaagtgat 18004777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 173 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 26327193 - 26327054
Alignment:
Q  173 aaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatc 272  Q
    ||||||| | ||| ||| |||||| |||| |||||||||| | |||  ||||||||| ||||||||| |||  |  || |   | ||||||||||| |||    
T  26327193 aaatagttattttggtcactgactctgcacctcgttgtcataagggctcctgactcaggattaaatataaaataacccttggatgtgcacttccgtaatc 26327094  T
Q  273 actttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatga 312  Q
    | ||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||    
T  26327093 agtttagtccttgacgttaaaaatttctgttaactgatga 26327054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 169 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 24900457 - 24900411
Alignment:
Q  169 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacat 215  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  24900457 gagcaaatagtcactttggtccctgactctgcacctcgctgtcacat 24900411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 261 - 315
Target Start/End: Original strand, 40611350 - 40611404
Alignment:
Q  261 acttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    |||||| ||||||||||||||  || |||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  40611350 acttcccttatcactttagtctctgacgttaaaaaaatatgttaggtgatgatgt 40611404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 91; Significance: 4e-44; HSPs: 42)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 170 - 315
Target Start/End: Original strand, 44333138 - 44333281
Alignment:
Q  170 agcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgtt 269  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||    
T  44333138 agcaaatagtcactttggtccctgactctgcacctcgctgtcacataggtccctgactcatgattaaatacaaataagtctctgactctgcacttccgtt 44333237  T
Q  270 atcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    |||||  ||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  44333238 atcac--tagtccttgacgttaaaaaaatctgttaagtgatgatgt 44333281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 166 - 315
Target Start/End: Original strand, 48646044 - 48646193
Alignment:
Q  166 aaggagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttc 265  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  48646044 aaggagtaaatagtcactttggtccctgactatgcacctcgctgtcacataggtccctgactcaggattaaatacaaataagtccctgactctacacttc 48646143  T
Q  266 cgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    ||||||||||||||||  || |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  48646144 cgttatcactttagtctctgtcgttaaaaaaatatattaagtgatgatgt 48646193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 169 - 315
Target Start/End: Original strand, 48777254 - 48777401
Alignment:
Q  169 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 268  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | |||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  48777254 gagcaaatagtcactttagtctctgattctgcagctcgctgtcacataagtccctgactcatgattaaatacaaataattccctgactctgcacttccgt 48777353  T
Q  269 tatcactttagtccttgccg-ttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    |||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  48777354 tatcactttagtccatgacgtttaaaaaaatatgttaagtgatgatgt 48777401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 169 - 315
Target Start/End: Original strand, 7258273 - 7258419
Alignment:
Q  169 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 268  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| | || ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||||| ||    
T  7258273 gagcaaatagtcactttggtccctgactctacacctcgttgtcacataggtccctaactcaggattaaatacaaataagtctctgactctgcacttctgt 7258372  T
Q  269 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  7258373 tatcactttagtccctgacgttaaaaaaatctgttaagtgatgatgt 7258419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 169 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 44334574 - 44334429
Alignment:
Q  169 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 268  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |    
T  44334574 gagcaaatagtcactttagttcctgattctgcagctcgctgttacataggtccctgactcatgattaaatataaataagtccctgactctgcacttccat 44334475  T
Q  269 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    |||||||||||||| || | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  44334474 tatcactttagtccctgacattaaaaaa-tatgttaagtgatgatgt 44334429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 173 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 7259805 - 7259663
Alignment:
Q  173 aaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatc 272  Q
    |||||||||||||| || |||| | || | |||| ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||    
T  7259805 aaatagtcactttaatcgctgattttgtagctcgctgtcacatgggtctctgattcaggattaaatacaaataagtccctgactctacacttccgttatc 7259706  T
Q  273 actttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    |||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  7259705 actttagtccctgacgttaaaaaaatctgttaagtgatgatgt 7259663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 173 - 315
Target Start/End: Original strand, 43457459 - 43457601
Alignment:
Q  173 aaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatc 272  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||| |||| |||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  43457459 aaatagtcactttagtccctgattctgcagctcgctgtcgcataggtccctgactcaggattaaatacaaataagtccccgactctgcacttccgttatc 43457558  T
Q  273 actttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    |||||||| | || ||||||   ||| ||||||||||||||||    
T  43457559 actttagttcatgacgttaagttattctgttaagtgatgatgt 43457601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 169 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 48788797 - 48788651
Alignment:
Q  169 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 268  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||| |||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||    
T  48788797 gagcaaatagtcactttgatccttgactttgcacctcgctgtcacataggtccctgactcataattaaatataaataagtctctgactctgcacttccgt 48788698  T
Q  269 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    |||||||||||||  || |||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  48788697 tatcactttagtctctgacgttaaaaaaatttgttaggtgatgatgt 48788651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 172 - 313
Target Start/End: Original strand, 46286504 - 46286645
Alignment:
Q  172 caaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttat 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| | |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||||| |||||    
T  46286504 caaatagtcactttagtccctgactcttcatctcgctgttagaaaggtccctgactcaggattaaatacaaataagtctctgactctgcacttctgttat 46286603  T
Q  272 cactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgat 313  Q
    ||||||| ||  | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  46286604 cactttaatctctaccgttaaaaaaatatgttaagtgatgat 46286645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 169 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 48647568 - 48647424
Alignment:
Q  169 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 268  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | | || |||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||||  ||    
T  48647568 gagcaaatagtcactttagaccctgattctacagctcgctatcacataggtccctgactcaggattaaatacaaataagtctctcactctgcacttttgt 48647469  T
Q  269 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgat 313  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||    
T  48647468 tatcactttagtccctgacgttaaaaaaatctgttaagtgatgat 48647424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 164 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 10899203 - 10899052
Alignment:
Q  164 aaaaggagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcact 263  Q
    |||| ||| |||| || ||||| |||||||||| |||| |||| |||||||| | ||| |||| || ||||||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  10899203 aaaatgagtaaattgttactttggtccctgactctgcacctcgctgtcacatagatccttgacccaggattaaatacaaataagtctctgactctgcact 10899104  T
Q  264 tccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  10899103 tccgttatcactttagtccctgacgttaaaaaaatctgttaagtgatgatgt 10899052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 169 - 315
Target Start/End: Original strand, 35727697 - 35727842
Alignment:
Q  169 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 268  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||| |||| |||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||| ||||| |||||    
T  35727697 gagcaaacagtcactttgatccctgactctgcacctcgctgtcacataggtccctgactcaggattaaatataaataagtctctgactctgcacatccgt 35727796  T
Q  269 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    |||||||||||||| || |||||||||  | ||||||||||||||||    
T  35727797 tatcactttagtcc-tgacgttaaaaatctctgttaagtgatgatgt 35727842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 169 - 315
Target Start/End: Original strand, 42477379 - 42477524
Alignment:
Q  169 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 268  Q
    ||||||||| ||| ||| |||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  42477379 gagcaaataatcaatttggtccttgactctgcacctcgttgtcgcataggtctctgactcaggattaaatacaaataagt-cctgactctgcacttccgt 42477477  T
Q  269 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    ||||| |||| ||| || |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42477478 tatcattttaatccctgacgttaaaaaaatatgttaagtgatgatgt 42477524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 172 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 30925130 - 30924988
Alignment:
Q  172 caaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttat 271  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | |||| |||   ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  30925130 caaatagtcactttaatccctgattctgcagctcccagtcacataggtccttgactcaggattaaatacaaataagtctctgactatgcacttccgttat 30925031  T
Q  272 cactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
     |||||||||  || |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  30925030 tactttagtctctgacgttaaaaaa-tctgttaagtgatgatgt 30924988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 169 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 35729211 - 35729065
Alignment:
Q  169 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 268  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | |||| |||| |||||||| ||||| ||||| | ||||| ||||||||||||| || ||| ||||||||||     
T  35729211 gagcaaatagtcactttattccctgattttgcagctcgctgtcacataggtccttgacttaggattacatacaaataagtcactgactctgcacttccgc 35729112  T
Q  269 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    ||||||| |||||| || | ||||| || | ||||||||||||||||    
T  35729111 tatcactgtagtccctgacattaaataaatctgttaagtgatgatgt 35729065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 201 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 34889016 - 34888905
Alignment:
Q  201 atctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattat 300  Q
    |||||| |||||||  |||| || ||||||||||||||| ||| | |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||    
T  34889016 atctcgctgtcacaaaggtctctcactcatgattaaatataaagatgtccttaactctgcacttccgttatcactttagtccttgacgtttaataattat 34888917  T
Q  301 gttaagtgatga 312  Q
    ||||||||||||    
T  34888916 gttaagtgatga 34888905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 174 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 8375703 - 8375569
Alignment:
Q  174 aatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatca 273  Q
    ||||||||| |||||||||||||  ||| | |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||| ||||||||||||||||    
T  8375703 aatagtcacattagtccctgacttcgcaccgcactgtcacataggtccctgactcatgattaaatacaaagaagtttctgactctgcacttccgttatca 8375604  T
Q  274 ctttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtg 308  Q
     ||||||||  | ||||||| |||| |||||||||    
T  8375603 atttagtccgcgacgttaaataattttgttaagtg 8375569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 173 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 12223820 - 12223678
Alignment:
Q  173 aaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatc 272  Q
    |||| ||||||||||||||||||  ||||  ||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| ||| |||| |||||||||     
T  12223820 aaatggtcactttagtccctgacactgcacatcaatgtcacataggtccctgactcaggattaaatataaagaagtccctgactctgcagttccgttatt 12223721  T
Q  273 actttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    |||||||||  ||  |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  12223720 actttagtcactgatgttaaataattctgttaagtgatgatgt 12223678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 169 - 315
Target Start/End: Original strand, 39708101 - 39708247
Alignment:
Q  169 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 268  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||| || | ||||  ||||||  ||||| ||||||| |||| |||||||| ||||| |  |||||||||||||||    
T  39708101 gagcatatagtcactttagtctctgactctgtacctcgccgtcacaaaggtccatgactcaagattgaatacaaagaagtcaccgactttgcacttccgt 39708200  T
Q  269 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    |||||||||||||| ||  |||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  39708201 tatcactttagtccgtgatgttaaataattatgttatgtgataatgt 39708247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 222 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 13578392 - 13578300
Alignment:
Q  222 ctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13578392 ctgactcagaattaaatacaaataagtcactgactctgcacttccgttatcactttagtcc-tgacgttaaataattatgttaagtgatgatgt 13578300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 169 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 8048909 - 8048763
Alignment:
Q  169 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 268  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||| |||| |||| || ||||  |||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |  ||| |||||||||||    
T  8048909 gagcaaatagtcactttaccctctgactctgcacctcgctgacacaaaggtctctgactcaagattaaatacaaagaagtctccgactctgcacttccgt 8048810  T
Q  269 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    |||||||||| || ||  ||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  8048809 tatcactttaatctttaacgttaaataattctattaagtgatgatgt 8048763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 183 - 293
Target Start/End: Original strand, 8374926 - 8375036
Alignment:
Q  183 tttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtcc 282  Q
    |||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||| ||||||||  |||||||||||| ||||  || | ||||||||||||||||||||||||||     
T  8374926 tttagtccctgactctgcacctcgctgtcacataggtctctgactcagaattaaatacaaaaaagtttctgattttgcacttccgttatcactttagtct 8375025  T
Q  283 ttgccgttaaa 293  Q
    ||| |||||||    
T  8375026 ttgacgttaaa 8375036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 169 - 279
Target Start/End: Original strand, 45583682 - 45583792
Alignment:
Q  169 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||  ||| | |||||| |||||||||||||  |||||||||| |||||| ||| | | |||||||||||    
T  45583682 gagcaaatagtcactttagtccctgattctgcagttcgctatcacataggtccctgactcagaattaaatacagataagttcctgattctgcacttccgt 45583781  T
Q  269 tatcactttag 279  Q
    |||||||||||    
T  45583782 tatcactttag 45583792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 224 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 45584566 - 45584475
Alignment:
Q  224 gactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |  | ||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  45584566 gactcaggattaaatacaaataagccaatgactctgcacttccgttatcactttagtccctgacgttaaaaaaatctgttaagtgatgatgt 45584475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 170 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 19434058 - 19433913
Alignment:
Q  170 agcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgtt 269  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||  |||| |||| | | ||||||||| ||  ||||| |  |||  ||||||| |||    
T  19434058 agcaaattgtcactttagtccctaactctccatctcgttgtcacaaaggtctctgatttaggattaaatataaggaagtcaccgactccgcacttcagtt 19433959  T
Q  270 atcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    ||||||||||||  || ||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  19433958 atcactttagtctatggcgttaaataattctgttaagtgatgatgt 19433913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 159 - 315
Target Start/End: Original strand, 12220011 - 12220166
Alignment:
Q  159 aaactaaaaggagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaacttt 258  Q
    |||| |||| ||||||||  ||||||||||  ||  || |||| ||||||||||||  | | ||||||||| ||||||||| ||| ||||| || ||| |    
T  12220011 aaacaaaaatgagcaaatgatcactttagtgtctagctatgcacctcgttgtcacaaagattcctgactcaagattaaatagaaagaagtctctgactct 12220110  T
Q  259 gcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    ||||||| | |||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  12220111 gcacttctgatatcactttagt-cttgacgttaaataattttgttaagtgatgatgt 12220166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 219 - 315
Target Start/End: Original strand, 44529076 - 44529172
Alignment:
Q  219 tccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||   |||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  44529076 tccctgactcatgattaaatacaaataagtctccgactcaacacttctgttatcactttagtccctgacgttaaataattttgttaagcgatgatgt 44529172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 169 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 5930257 - 5930112
Alignment:
Q  169 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 268  Q
    |||||||| |||||||||||| || ||| ||||  ||| | |||||  ||||||| ||||| ||||||||||||  || |  | | || |||||||||||    
T  5930257 gagcaaatggtcactttagtctcttactttgcacttcgctatcacaaaggtccctaactcaggattaaatacaagaaattttcga-ctgtgcacttccgt 5930159  T
Q  269 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  5930158 tatcactttagtccctgccattaaataattctgttaagtgatgatgt 5930112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 218 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 44530687 - 44530595
Alignment:
Q  218 gtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgat 310  Q
    ||||| |||||| ||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||   ||| |||||||||||    
T  44530687 gtccccgactcaggattaaatataaataagtctctgactctgcacttccgttatcactttagtcattggcgttaagttattctgttaagtgat 44530595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 315
Target Start/End: Original strand, 32793231 - 32793315
Alignment:
Q  231 gattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    |||||||||||||||||||  | | | |||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  32793231 gattaaatacaaataagtcattgattctgcatttcggttatcactttagtctttggcgttaaataattatgttaactgatgatgt 32793315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 173 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 385732 - 385662
Alignment:
Q  173 aaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaa 243  Q
    |||| |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  385732 aaatggtcactttggtccttgactctgcatctcgttgtcacagaggtccctaactcatgattgaatacaaa 385662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 173 - 271
Target Start/End: Original strand, 34704911 - 34705009
Alignment:
Q  173 aaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttat 271  Q
    ||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||  || | |||||||| ||||||||||||| ||||| || ||| || |||| ||||||    
T  34704911 aaatagtcactttagtctccgactctgcacctcgttgtcacaaaggcctctgactcaggattaaatacaaagaagtctctgactgtgtactttcgttat 34705009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 2677877 - 2677768
Alignment:
Q  203 ctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgt 302  Q
    ||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||  | ||||||| | ||||||| |||||||| |||||||| |  ||||||||| ||  ||    
T  2677877 ctcgttgtcacaaaggtctatgactcatgattaaatacaaagtattccctaaatgtgcactttcgttatcagtttagtccctcgcgttaaaaactttagt 2677778  T
Q  303 taagtgatga 312  Q
    ||| ||||||    
T  2677777 taactgatga 2677768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 270
Target Start/End: Original strand, 10894391 - 10894449
Alignment:
Q  212 acatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgtta 270  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  10894391 acataggtccctgactcaagattaaatataaataagtctctaattctgcacttccgtta 10894449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 173 - 250
Target Start/End: Original strand, 21062819 - 21062896
Alignment:
Q  173 aaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtcc 250  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| |  ||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||    
T  21062819 aaatggtcactttagtccctgactttgcacctcgctgtcataaaggtccttgactcaggattaaatacatagaagtcc 21062896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 252 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 46287446 - 46287385
Alignment:
Q  252 taactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgat 313  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||| |||||||    
T  46287446 taactctgcatttccgttatcactttagtctttggcgttaaaaaaatttgttaaatgatgat 46287385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 7509562 - 7509450
Alignment:
Q  203 ctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgt 302  Q
    ||||||||||||  ||||  ||| ||||||||||||| ||| ||||| |  | | |||||||||||||| ||||||  || || ||||||| |||| |||    
T  7509562 ctcgttgtcacaaaggtctttgattcatgattaaatataaagaagtctcagattctgcacttccgttattactttaacccctgacgttaaataattttgt 7509463  T
Q  303 taagtgatgatgt 315  Q
    |||||||| ||||    
T  7509462 taagtgattatgt 7509450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 221 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 8879616 - 8879532
Alignment:
Q  221 cctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaa 305  Q
    ||||||||| |||||||||||||  ||| ||| | | |||| ||| |||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||||    
T  8879616 cctgactcaggattaaatacaaagtagttcctgaatgtgcatttctgttatcactttagtccctgacgttaaataattttgttaa 8879532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 258 - 310
Target Start/End: Original strand, 24287567 - 24287619
Alignment:
Q  258 tgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgat 310  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  24287567 tgcacttaagttatcactttagtccttgacgttaaataattatgttaattgat 24287619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 260 - 315
Target Start/End: Original strand, 33060899 - 33060954
Alignment:
Q  260 cacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    ||||||||||||||||||||||  || ||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  33060899 cacttccgttatcactttagtctctgacgttaaataattctgttaaatgatgatgt 33060954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 33607700 - 33607618
Alignment:
Q  217 ggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaatta 299  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||| ||||| || | | |||||||||||||||| ||||| || || ||||||| |||||    
T  33607700 ggtctctgattcaggattaaatacaaagaagtctctgattctgcacttccgttatcattttagaccctgacgttaaataatta 33607618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 258 - 315
Target Start/End: Original strand, 30917800 - 30917857
Alignment:
Q  258 tgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  30917800 tgcacttccattatcactttaatcctcgacgttaaataattatgctaactgatgatgt 30917857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 35)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 170 - 315
Target Start/End: Original strand, 48572984 - 48573129
Alignment:
Q  170 agcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgtt 269  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||    
T  48572984 agcaaatagtcactttggtccctgactctgcacctcgttatcacataggtccctgactcaggattaaatacaaataagcctctgactctgcacttccgtt 48573083  T
Q  270 atcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  48573084 atcactttagtccttgacgttaaaaaaatttgttaagcgatgatgt 48573129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 163 - 315
Target Start/End: Original strand, 36278944 - 36279096
Alignment:
Q  163 taaaaggagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcac 262  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| | | || ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||    
T  36278944 taaatggagcaaatagtcactttagtccctgattatacagctcgttgtcacataggtccctgattcaggattaaatacaaataagtctctgactctgcac 36279043  T
Q  263 ttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    ||||||||||| |||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||    
T  36279044 ttccgttatcattttagtccctgacgttaaaaaattcttttaagtgatgatgt 36279096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 169 - 296
Target Start/End: Original strand, 17700516 - 17700643
Alignment:
Q  169 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 268  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  17700516 gagcaaatagtcactttagtctttgactctgcacctcgttgtcacataggttcctgactcaggattaaatacaaataagtccctgactctgcacttccgt 17700615  T
Q  269 tatcactttagtccttgccgttaaaaaa 296  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||    
T  17700616 tatcactttagtccctgacgttaaaaaa 17700643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 164 - 315
Target Start/End: Original strand, 55388066 - 55388217
Alignment:
Q  164 aaaaggagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcact 263  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||||  || ||| ||||||    
T  55388066 aaaatgagcaaatagtcactttagtccctgattctgcagctcgctgtcatataggtctctgactcaggattaaatacaaataagttactgactctgcact 55388165  T
Q  264 tccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
     |||||||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  55388166 cccgttatcactttagtccctgacgttaaaaaaatttgttaagtgatgatgt 55388217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 173 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 17702040 - 17701917
Alignment:
Q  173 aaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatc 272  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||| |||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  17702040 aaatagtcactttagtctctgattctgcagctcgctgtcatataggtccctgactcaagattaaatacaaataagtccctgactctgcacttccgttatc 17701941  T
Q  273 actttagtccttgccgttaaaaaa 296  Q
    |||||||||| || ||||||||||    
T  17701940 actttagtccctgacgttaaaaaa 17701917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 169 - 315
Target Start/End: Original strand, 52316977 - 52317123
Alignment:
Q  169 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 268  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| | |||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||    
T  52316977 gagcaaataatcactttagtctctgattctgcagctcgctgtcatataggtctctgactcatgattaaatacaaataagtctttaactctgcacctccgt 52317076  T
Q  269 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  52317077 tatcattttagtccatgacgttaaaaaaatctgttaagtgatgatgt 52317123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 169 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 52318442 - 52318297
Alignment:
Q  169 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 268  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||  ||| |||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |     
T  52318442 gagcaaatagtcactttggtctctgactctgcacttcgctgtcacatagatccctgactcaggattaaatacaaataagtccctgactctgcacttctga 52318343  T
Q  269 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatg 314  Q
    ||| |||||||||| || |||||||||| | |||||||||||||||    
T  52318342 tattactttagtccctgacgttaaaaaaatctgttaagtgatgatg 52318297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 169 - 281
Target Start/End: Original strand, 19114531 - 19114643
Alignment:
Q  169 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 268  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  19114531 gagcaaatgatcactttagtccctgactctgcacttcgttgtcacagaggtccctgactcaagattaaatacaaagaagtcactaactttgcacttccgt 19114630  T
Q  269 tatcactttagtc 281  Q
    |||||||||||||    
T  19114631 tatcactttagtc 19114643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 171 - 315
Target Start/End: Original strand, 20464069 - 20464213
Alignment:
Q  171 gcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgtta 270  Q
    |||||| | |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||    
T  20464069 gcaaatggacactttagtccccgactctgcacctcgttgtcacaaaggtccctggctcatgattaaatacaaagaagtccctgactctgcacttctgtta 20464168  T
Q  271 tcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    ||||||||||||  | ||||||| || | ||||||||||||||||    
T  20464169 tcactttagtccacgacgttaaataactctgttaagtgatgatgt 20464213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 169 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 33428560 - 33428421
Alignment:
Q  169 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 268  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| |||||| | ||| |||| ||||||    
T  33428560 gagcaaatggtcactttcgtccctgactctgcacctcgttgtcacataggtccctgactcagaattaaatacaaagaagtccttgactctgcatttccgt 33428461  T
Q  269 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtg 308  Q
    | |||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||    
T  33428460 tgtcactttagtcctcagcgttaaataattatgttaagtg 33428421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 169 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 47118176 - 47118037
Alignment:
Q  169 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 268  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||  ||||| |||||| |||||||| |||| ||||| || ||| ||||||| |||    
T  47118176 gagcaaatggtcactttagtccctgactctgcacctcgttgtcatataagtccccgactcaggattaaatgcaaagaagtctctgactctgcactttcgt 47118077  T
Q  269 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtg 308  Q
    |||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||||    
T  47118076 tatcactttagtccctgacgttaaataattttgttaagtg 47118037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 166 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 45601066 - 45600925
Alignment:
Q  166 aaggagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttc 265  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||   |||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||    
T  45601066 aaggagcaaatcgtcactttagtccctgactctgtccctcgctgtcacataggtccctgattcaggattaaatacaaagaagt-cctgactctgcacttc 45600968  T
Q  266 cgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtg 308  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||| |||| |||||||||    
T  45600967 cgttatcactttagtccacgacgttaaataattctgttaagtg 45600925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 169 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 2592132 - 2592019
Alignment:
Q  169 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 268  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | |||| |||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    ||||||||    
T  2592132 gagcaaatagtcactttagtccctaattctgcagctcgctgtcacataggtccctgactcaggattaaatacaaataagtccctgactcaatacttccgt 2592033  T
Q  269 tatcactttagtcc 282  Q
    ||||||||||||||    
T  2592032 tatcactttagtcc 2592019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 210 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 36280401 - 36280296
Alignment:
Q  210 tcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtga 309  Q
    |||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||    
T  36280401 tcacataggtctctgactcaggattaaatataaataagtctctgactctgcacttccgttatcactttagtccctgacgttaaaaaaatatgttaagtga 36280302  T
Q  310 tgatgt 315  Q
    ||||||    
T  36280301 tgatgt 36280296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 169 - 313
Target Start/End: Original strand, 2591625 - 2591769
Alignment:
Q  169 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||| || | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||| |    
T  2591625 gagcaaatagtcactttagtccctgattctgcagcttgctgtcacataggtccctgactcaggattaaatacaaacaagtctctgactctgcacttccat 2591724  T
Q  269 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgat 313  Q
     ||||||||||||| ||  |||||   ||| ||||||||||||||    
T  2591725 gatcactttagtccctgatgttaagttattctgttaagtgatgat 2591769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 208 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 53959186 - 53959079
Alignment:
Q  208 tgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagt 307  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| | ||||||||    
T  53959186 tgtcacataggtctctgactcatgattaaatacaaataagttcatgactctgcacttccgttatcactttagtctctgacgttaaaaaaatttgttaagt 53959087  T
Q  308 gatgatgt 315  Q
    ||||||||    
T  53959086 gatgatgt 53959079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 169 - 315
Target Start/End: Original strand, 3671037 - 3671182
Alignment:
Q  169 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 268  Q
    ||||| |||||||||||| ||| ||||| |||| |||  | |||||  |||| ||||||||  ||||||||||||||||||  | ||| | |||||||||    
T  3671037 gagcatatagtcacttta-tccttgactttgcacctctctatcacaaaggtctctgactcagaattaaatacaaataagtctatgactctccacttccgt 3671135  T
Q  269 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3671136 tatcactttaatccctgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 3671182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 169 - 315
Target Start/End: Original strand, 34263803 - 34263949
Alignment:
Q  169 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 268  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||| |||||||  ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| || ||| | ||||||| |    
T  34263803 gagcaaatagtcactttggcccctgactctgcacctcgctgtcacagaggtccttgattcaggattaaatacaaataagtctctgactctacacttccat 34263902  T
Q  269 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    |||||||||| ||| || | |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  34263903 tatcactttaatccctgacattaaaaaaatatgttaagggatgatgt 34263949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 217 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 48574536 - 48574438
Alignment:
Q  217 ggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | | |||| |||||||||    
T  48574536 ggtccctgactcaggattaaatacaaataagtccctgactctgcactttcgttatcactttagtccttgacgttaaaaaaatcttttaaatgatgatgt 48574438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 174 - 315
Target Start/End: Original strand, 50753820 - 50753961
Alignment:
Q  174 aatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatca 273  Q
    |||||||||||||||||||  || |||| |||| |||||||| ||||||| | ||| ||||||||| ||| ||||  || ||| | |||||| |||||||    
T  50753820 aatagtcactttagtccctagctctgcacctcgctgtcacataggtccctaattcaggattaaatataaacaagtttctgactctacacttctgttatca 50753919  T
Q  274 ctttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    ||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  50753920 ctttagtccctgccgttaaaaaaatctgttaagtgatgatgt 50753961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 169 - 310
Target Start/End: Original strand, 48808362 - 48808505
Alignment:
Q  169 gagcaaatagtcacttta--gtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttcc 266  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||||| | |||| |||| ||| | || |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  48808362 gagcaaataatcactttatagtccctgattctgcagctcgctgttagataggtctctgactcaggattaaatacaaataagttcctaactctgcacttcc 48808461  T
Q  267 gttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgat 310  Q
    ||| ||||||||||||  |  ||||||||| |||||||||||||    
T  48808462 gttgtcactttagtcccggatgttaaaaaaatatgttaagtgat 48808505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 171 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 55389592 - 55389448
Alignment:
Q  171 gcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgtta 270  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||| |||||||| ||||  |||||||  ||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||    
T  55389592 gcaaatagtcactttggtccctaactctgcacctcgctgtcacataggtcattgactcaaaattaaatacaattaagtccctgactctacacttccgtta 55389493  T
Q  271 tcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    ||||||||||||    ||||| || | ||||||||||||||||||    
T  55389492 tcactttagtccccaacgttacaacaatatgttaagtgatgatgt 55389448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 169 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 47075476 - 47075337
Alignment:
Q  169 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 268  Q
    |||||||| ||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||| ||  |||| ||| | |||||||||    
T  47075476 gagcaaatggtcactttaatccttgactctgcacctcgttgtcacataggtccgtcactcaagattaaatacaaagaaacccctgactctacacttccgt 47075377  T
Q  269 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtg 308  Q
    |||||||||||||  || ||||||| |||| |||||||||    
T  47075376 tatcactttagtctctgacgttaaataattttgttaagtg 47075337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 203 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 11773142 - 11773053
Alignment:
Q  203 ctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaa 292  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  11773142 ctcgctgtcacataggtccctgactcaggattaaatacaaataagtctctgactctacacttccgttatcactttagtccctggcgttaa 11773053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 169 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 19115271 - 19115133
Alignment:
Q  169 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 268  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| |||| |||| |||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||| |||| | | ||| |||||||||||    
T  19115271 gagcaaatagtcactttagttcgtgactctgcacctcgatgtcacataggtccttcactcaggattaaatacaaagaagt-catgactctgcacttccgt 19115173  T
Q  269 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtg 308  Q
    | | |||||||||| |  ||||||| |||| |||||||||    
T  19115172 ttttactttagtccctaacgttaaataattctgttaagtg 19115133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 164 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 49261664 - 49261550
Alignment:
Q  164 aaaaggagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcact 263  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| | | |   ||  | |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||   ||||| |||||| |||| |    
T  49261664 aaaaagagcaaatagtcactttagtccataattccacacattgttgtcacataggtccctgactcaggattaaataca---aagtctctaactctgcatt 49261568  T
Q  264 tccgttatcactttagtc 281  Q
    ||||||||||||||||||    
T  49261567 tccgttatcactttagtc 49261550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 315
Target Start/End: Original strand, 53957673 - 53957817
Alignment:
Q  169 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 268  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| | |||| |||| ||| |||| ||| ||||||||| || ||||||||||||||||  | ||| ||||||||| |    
T  53957673 gagcaaatagtcactttagtacttgattctgcaactcgctgttacataggttcctgactcagga-taaatacaaataagtctatgactctgcacttccct 53957771  T
Q  269 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    || || |||  ||| || |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  53957772 taacaattt-ttccctgacgttaaaaaaatctgttaagtgatgatgt 53957817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 223 - 305
Target Start/End: Original strand, 40205934 - 40206016
Alignment:
Q  223 tgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaa 305  Q
    ||||||| ||||||| |||||  |||| || | | |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  40205934 tgactcacgattaaaaacaaagtagtctctgaatgtgcacttccgttatcagtttagtcattggcgttaaaaaattatgttaa 40206016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 246
Target Start/End: Original strand, 19331117 - 19331183
Alignment:
Q  180 cactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataa 246  Q
    |||||| || ||||||| |||| || | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19331117 cactttcgttcctgactctgcaccttgctgtcacataggtccctgactcaggattaaatacaaataa 19331183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 223 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 40207009 - 40206919
Alignment:
Q  223 tgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagt-ccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatga 312  Q
    |||||||||||||| || |||| ||||| | | | |||| ||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  40207009 tgactcatgattaagtataaattagtccttgaatgtgcatttccgttatcagtttagtcccttaacgttaaaaaattatgttaactgatga 40206919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 196 - 270
Target Start/End: Original strand, 47427885 - 47427959
Alignment:
Q  196 tgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgtta 270  Q
    |||||| |||| |||||||| ||||| |||||||  |||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||    
T  47427885 tgtgcacctcgctgtcacataggtccttgactcaaaattaaatacaaagaagtccctgactgtgcacttacgtta 47427959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 258 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 48809690 - 48809634
Alignment:
Q  258 tgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| | ||||||||||||||||    
T  48809690 tgcacttccgttatcactttagtccatgacg-taaaaaaatctgttaagtgatgatgt 48809634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 173 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 26652725 - 26652583
Alignment:
Q  173 aaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatc 272  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||| |  |||||||||| | ||| |||||||||  ||||| | | | || |  || ||||||    
T  26652725 aaatagtcacttgggtccctgactttgcatctcgctgtcactttagtccctgacttaggataaaatacaaaatagtccatgaatgtgtatctctgttatc 26652626  T
Q  273 actttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgtc 316  Q
    | |||||||||| | ||| ||||||| ||||||  |||||||||    
T  26652625 agtttagtccttactgtt-aaaaattctgttaatcgatgatgtc 26652583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 260 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 36827509 - 36827454
Alignment:
Q  260 cacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||  |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  36827509 cacttccgttatcactttagtctctgatgttaaataattttgttaagtgatgatgt 36827454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 187 - 315
Target Start/End: Original strand, 612230 - 612358
Alignment:
Q  187 gtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgc 286  Q
    |||||||||| |||| |||||||| |||  | |||  || |||  |||||||||||| |||||| | | | || ||||  |||||||||||||| | |      
T  612230 gtccctgactatgcacctcgttgttacaaagatcctcgattcaaaattaaatacaaagaagtccgtgaatgtgtacttatgttatcactttagttcctca 612329  T
Q  287 cgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  612330 cattaaataattatgttaagtgatgatgt 612358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 84; Significance: 7e-40; HSPs: 25)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 169 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 53771174 - 53771035
Alignment:
Q  169 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 268  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||| |||| ||| |||||||||||    
T  53771174 gagcaaatggtcactttagtccctgactctgcacctcgttgtcacataggtccctgactcagaattaaatacaaagaagcccctgactctgcacttccgt 53771075  T
Q  269 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtg 308  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||    
T  53771074 tatcactttagtcattgacgttaaataattctgttaagtg 53771035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 169 - 315
Target Start/End: Original strand, 42278047 - 42278193
Alignment:
Q  169 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 268  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | |||| || | |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  42278047 gagcaaatagtcactttagtccttgattctgcagcttgctgtcacataggtccctgactcgggattaaatacaaataagttcctgactctgcacttccgt 42278146  T
Q  269 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    |||||||||| ||| || |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  42278147 tatcactttaatccctgacgttaaaaaaatctgttaagtgatgatgt 42278193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 170 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 47878608 - 47878463
Alignment:
Q  170 agcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgtt 269  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||| ||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  47878608 agcaaatagtcactttgatccctgactctgcacctcgctgttacataggtccctgactctggattaaatacaaataagtccctgactctacacttccgtt 47878509  T
Q  270 atcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    ||||||||||||| || |||||| ||| | ||||||| ||||||||    
T  47878508 atcactttagtccatgacgttaataaaatctgttaagcgatgatgt 47878463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 173 - 312
Target Start/End: Original strand, 47874566 - 47874704
Alignment:
Q  173 aaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatc 272  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||| |||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||    
T  47874566 aaatagtcactttagtctctgattctgcagctcgctatcacataggtccctgactcaagattaaatacaaataagtccctgattctgcacttccgttatc 47874665  T
Q  273 actttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatga 312  Q
    |||||||||| ||  ||||||||| |||||||| ||||||    
T  47874666 actttagtcc-tgatgttaaaaaaatatgttaaatgatga 47874704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 169 - 315
Target Start/End: Original strand, 31844720 - 31844865
Alignment:
Q  169 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || |||| |||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| |    
T  31844720 gagcaaatagtcactttagtccctagctctgcacctcgctgtcacataggtccctgactcaggattaaatacaaacaagtccctaactctacacttccct 31844819  T
Q  269 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    ||||||||| |||  || |||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  31844820 tatcactttggtcactgtcgtttaaaaa-tctgttaagtgatgatgt 31844865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 174 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 26173062 - 26172931
Alignment:
Q  174 aatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatca 273  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||| ||   ||||| |  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||    
T  26173062 aatagtcactttagtccccaactatgcaccttactgtcagaaaggtccttgactcaagattaaatacaaataagtctctgactctgcacttccgttatca 26172963  T
Q  274 ctttagtccttgccgttaaaaaattatgttaa 305  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26172962 ctttagtccatgccgttaaaaaattatgttaa 26172931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 169 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 48740145 - 48740006
Alignment:
Q  169 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 268  Q
    |||||||| ||||||||||||| || || |||| ||| ||||||| | | |||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||    
T  48740145 gagcaaatggtcactttagtccatgtctctgcacctcattgtcacgtagatccctgactcataattaaatacaaagaagtccccaactctgcacttctgt 48740046  T
Q  269 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtg 308  Q
    |||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||||    
T  48740045 tatcactttagtccctgacgttaaataattctgttaagtg 48740006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 169 - 315
Target Start/End: Original strand, 26170638 - 26170784
Alignment:
Q  169 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 268  Q
    ||||||||||| | ||||||| |||||| |||| |||||||| |||   ||  |||||| | |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| |    
T  26170638 gagcaaatagttagtttagtctctgactttgcacctcgttgttacaaaagtatctgacttaagattaaatacaaataagttccttactctgcacttccat 26170737  T
Q  269 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26170738 tatcactttagtccatgctgttaaaaaattttgttaagtgatgatgt 26170784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 163 - 315
Target Start/End: Original strand, 39868914 - 39869064
Alignment:
Q  163 taaaaggagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcac 262  Q
    ||||| ||| |||| || ||||||||| |||||| |||| |||| ||| |||  |||||||||||||| |||||||||||| |||| |   ||| |||||    
T  39868914 taaaatgagtaaattgttactttagtctctgactctgcacctcgctgttacaaaggtccctgactcataattaaatacaaacaagttcg--actctgcac 39869011  T
Q  263 ttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39869012 ttccgttatcactttagtctctgacgttaaataattatgttaagtgatgatgt 39869064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 169 - 278
Target Start/End: Original strand, 54574423 - 54574532
Alignment:
Q  169 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 268  Q
    ||||||||||||| |||  | ||| ||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  54574423 gagcaaatagtcattttgcttcctcactctgcatctcgctgtcacataggtctctgactcaggattaaatacaaataagttcttaactctgcacttccgt 54574522  T
Q  269 tatcacttta 278  Q
    ||||||||||    
T  54574523 tatcacttta 54574532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 169 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 4703342 - 4703196
Alignment:
Q  169 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 268  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||| | ||||||| |||||||| ||||||| |||||  |||||||||||| |||||  | ||| | |||||||||    
T  4703342 gagcaaattgtcactttagttactgactctacatctcgctgtcacataggtccctaactcagaattaaatacaaagaagtctttgactgtacacttccgt 4703243  T
Q  269 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    |||||||||||||  || | ||||| |||| | ||||||||||||||    
T  4703242 tatcactttagtctctggcattaaataattctattaagtgatgatgt 4703196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 217 - 315
Target Start/End: Original strand, 50694795 - 50694893
Alignment:
Q  217 ggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    |||||||||||||  |||||||| ||||||||  || | | ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  50694795 ggtccctgactcaaaattaaatataaataagtttctgattctgcacttccgttatctctttagtccctgacgttaaaaaattctgttaagtgatgatgt 50694893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 187 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 21623224 - 21623096
Alignment:
Q  187 gtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgc 286  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||| |||||||||||||  ||||| | | | |||||||| ||||||||||||||||  |     
T  21623224 gtccttgactctgcatctcgttgtcacaatgttccctgattcaggattaaatacaaaatagtccttgaatgtgcacttctgttatcactttagtccccga 21623125  T
Q  287 cgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    ||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  21623124 cgttaaataattatgttaactaatgatgt 21623096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 168 - 308
Target Start/End: Original strand, 53770330 - 53770470
Alignment:
Q  168 ggagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccg 267  Q
    |||| |||| |||||||||||| |||||| |||| ||||   |||||| ||| |||||||||  |||||||||||| |||||  | ||| |||||||||     
T  53770330 ggagtaaatggtcactttagtctctgactctgcacctcgcattcacataggttcctgactcagaattaaatacaaagaagtctatgactctgcacttcca 53770429  T
Q  268 ttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtg 308  Q
    |||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||||    
T  53770430 ttatcactctagtctctgccgttaaataattctgttaagtg 53770470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 223 - 313
Target Start/End: Original strand, 4701817 - 4701907
Alignment:
Q  223 tgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgat 313  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||| ||  |||||| |||| ||||||||||||||    
T  4701817 tgacttatgattaaatacaaagaagtccccgactatgcacttccgctatcactttagtccctgatgttaaataattctgttaagtgatgat 4701907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 217 - 315
Target Start/End: Original strand, 21621869 - 21621967
Alignment:
Q  217 ggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  ||||  | | | ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  21621869 ggtccctgactcaggattaaatacaaaatagtcattgaatgtgcacttccgttatcactttagtccctgatgttaaataattatgttaactgatgatgt 21621967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 169 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 31845080 - 31844934
Alignment:
Q  169 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 268  Q
    ||||||||| ||||||||||   ||| | ||||||| ||||||| || |||  |||||||| ||||||||||||| || |     ||| | |||||||||    
T  31845080 gagcaaatactcactttagtttttgattttgcatcttgttgtcatataggtttctgactcaggattaaatacaaacaaattttagactctacacttccgt 31844981  T
Q  269 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31844980 tatcattttcgtccttgcagttaaaaaaatatgttaagtgatgatgt 31844934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 179 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 42392003 - 42391868
Alignment:
Q  179 tcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtcccta--actttgcacttccgttatcactt 276  Q
    ||||||||||| ||||||  ||| |||  |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  | | ||||||||| |||||| ||    
T  42392003 tcactttagtctctgactccgcacctcactgtcacataggtctctgactcatgattaaatacaaattagtccctaataatgtgcacttcctttatcagtt 42391904  T
Q  277 tagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatga 312  Q
    ||||||  | ||||||||| || | |||| ||||||    
T  42391903 tagtcccagacgttaaaaacttctattaactgatga 42391868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 183 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 26685528 - 26685408
Alignment:
Q  183 tttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtcc 282  Q
    |||||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||||| |||     ||||||||| | |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||     
T  26685528 tttagtccctgactctgcacctcgctgtcacataggtccctcact-----ttaaatacatagaagtccttgactatgcacttccgttatcactttagtct 26685434  T
Q  283 ttgccgttaaaaaattatgttaagtg 308  Q
     || | ||||| |||| |||||||||    
T  26685433 ctgacattaaataattctgttaagtg 26685408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 169 - 305
Target Start/End: Original strand, 44158502 - 44158638
Alignment:
Q  169 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 268  Q
    |||||||| |||| ||||| ||| |||| |||| |||||||| |||  ||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| |  ||||  ||    
T  44158502 gagcaaatggtcaatttagcccccgactctgcacctcgttgttacagaggttcctgactcaggattaaatacaaagaagtccctgactctatacttttgt 44158601  T
Q  269 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaa 305  Q
    ||| |||||| ||| |  ||||||| |||||||||||    
T  44158602 tattactttaatccctaacgttaaataattatgttaa 44158638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 169 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 19051356 - 19051253
Alignment:
Q  169 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 268  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||| ||||  |||| |||||||  ||||||||||||| ||||| || ||| | ||||| |||    
T  19051356 gagcaaatggtcactttagtccctgactctacacctcgttggcacaaaggtcactgactcgagattaaatacaaagaagtctctgactctacactttcgt 19051257  T
Q  269 tatc 272  Q
    ||||    
T  19051256 tatc 19051253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 230 - 315
Target Start/End: Original strand, 19050297 - 19050382
Alignment:
Q  230 tgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    |||||||||||||| ||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||   | ||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  19050297 tgattaaatacaaagaagtctcggactctgcacttccgttatcactttagtctccgacgttaaataattctattaagtgatgatgt 19050382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 218 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 54574881 - 54574822
Alignment:
Q  218 gtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcacttt 277  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||||||    
T  54574881 gtccttgactcaggattaaatacaaataaatctctaactctgcacttctgttatcacttt 54574822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 258 - 312
Target Start/End: Original strand, 32244361 - 32244415
Alignment:
Q  258 tgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatga 312  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  32244361 tgcacttccgttatcactttggtccataacgttaaataattatgttaagtgatga 32244415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 258 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 24753597 - 24753540
Alignment:
Q  258 tgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  24753597 tgcacttctgttatcactttagtcattcgcgttaaataattttgttaactgatgatgt 24753540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 3)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 171 - 315
Target Start/End: Original strand, 79073 - 79217
Alignment:
Q  171 gcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgtta 270  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| |||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||| |||| ||    
T  79073 gcaaatagtcaatttagttcctgactctgcacctcgctgtcacataggtccttgactcatgattaaataaaaagaagtccttgactttgcacctccgata 79172  T
Q  271 tcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  79173 tcactttagtctttgacgttaaataattttgttaagtgatgatgt 79217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 169 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 79808 - 79662
Alignment:
Q  169 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 268  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||  | ||| |||| |||  |    
T  79808 gagcaaatagtcactttaatccctgactcggcacctcgttgttacataagttcctgactcatgattaaatacaaagaagtctttgactctgcatttctat 79709  T
Q  269 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  79708 tatcattttagtctttgacgttaaataattttattaagtgatgatgt 79662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 174 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 74433 - 74357
Alignment:
Q  174 aatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtcc 250  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| |||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  74433 aatagtcagtttagtccctgactctgcaactcactgtcacataggtccctaactcatgattaaatacaaagaagtcc 74357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 170 - 282
Target Start/End: Original strand, 116054 - 116166
Alignment:
Q  170 agcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgtt 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | | |||| |||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  116054 agcaaatagtcactttagttcctcattctgcagctcgctgtcacataggtccctgactcaggattaaatacaaataagtccctgactatgcacttccgtt 116153  T
Q  270 atcactttagtcc 282  Q
    |||||||||||||    
T  116154 atcactttagtcc 116166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 9)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 169 - 315
Target Start/End: Original strand, 30747997 - 30748143
Alignment:
Q  169 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||||| || ||| | ||||| |||    
T  30747997 gagcaaatagtcactttagtccctgattctgcacctcgctgtcacataggtccctgacttaggattaaatacaaacaagtctctgactctacactttcgt 30748096  T
Q  269 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  30748097 tatcactttagtcgctgccgttaaaaaaaactattaagtgatgatgt 30748143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 169 - 308
Target Start/End: Original strand, 31218953 - 31219092
Alignment:
Q  169 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 268  Q
    |||||||| ||||||||| || |||||| |||| |||| |||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||    
T  31218953 gagcaaatggtcactttaatctctgactctgcacctcgctgtcacataggtccttaactcaggattaaatacaaagaagttcctgactctgcacttccgt 31219052  T
Q  269 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtg 308  Q
    |||||||||| ||| ||  |||||| |||| | |||||||    
T  31219053 tatcactttaatccctgatgttaaataattctcttaagtg 31219092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 173 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 31219281 - 31219146
Alignment:
Q  173 aaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatc 272  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||| ||||  | ||||| ||||||||||||| |||| ||| |||   |||||||||||||    
T  31219281 aaatggtcactttaatccctgactctgcacctcgctgtcacataggtcattaactcaggattaaatacaaagaagttcctgactcgacacttccgttatc 31219182  T
Q  273 actttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtg 308  Q
    |||||||||  || ||||||| |||| | |||||||    
T  31219181 actttagtctctgacgttaaataattctcttaagtg 31219146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 315
Target Start/End: Original strand, 23507947 - 23508092
Alignment:
Q  169 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 268  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || | || |||  |||||||| ||| ||||| ||| ||||||||||||| || ||  | ||||| ||||||| |    
T  23507947 gagcaaatagtcactttagtctctg-ctctacacctccctgtcacataggttcctgattcaggattaaatacaaacaaatctatgactttacacttcctt 23508045  T
Q  269 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    |||||||||||||| || |||||||   || ||||||||||| ||||    
T  23508046 tatcactttagtccctgtcgttaaatttttttgttaagtgataatgt 23508092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 173 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 12676591 - 12676459
Alignment:
Q  173 aaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatc 272  Q
    |||||||||||||  |  |||||| |||| ||||||||||||  |||| ||| |||| |||||||||||||  |||| |||| | |||||||  ||||||    
T  12676591 aaatagtcactttgatatctgactctgcacctcgttgtcacaatggtctctgtctcaggattaaatacaaagtagtctctaaatgtgcacttttgttatc 12676492  T
Q  273 actttagtccttgccgttaaaaaattatgttaa 305  Q
    | |||||||  || | ||||||| |||||||||    
T  12676491 agtttagtctctggcattaaaaatttatgttaa 12676459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 198 - 312
Target Start/End: Original strand, 24621104 - 24621218
Alignment:
Q  198 tgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaat 297  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||| ||||||||||||||||||||| || || |||| |  || |||||||||||| ||||||| ||| | ||||||| |    
T  24621104 tgcatctcgttatcataaaggtccttgactcatgattaaatacaaagaaatctctaaatgcgcgcttccgttatcagtttagtcattgacattaaaaact 24621203  T
Q  298 tatgttaagtgatga 312  Q
    | | |||| ||||||    
T  24621204 tctattaactgatga 24621218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 192 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 6468883 - 6468832
Alignment:
Q  192 tgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaa 243  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  6468883 tgactctgcatatcgctgtcacaaaggtccctgactcatgattaaatacaaa 6468832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 168
Target Start/End: Original strand, 1947349 - 1947401
Alignment:
Q  116 ttatggatcttggtaaccagtatcctcagggtaatggtttaggaaactaaaag 168  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  1947349 ttatgggtcttgttaaccagtgtcctcgggataatggttaaggaaactaaaag 1947401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 267 - 315
Target Start/End: Original strand, 10855902 - 10855950
Alignment:
Q  267 gttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 315  Q
    |||||| ||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  10855902 gttatcgctttagtccctgacgttaaataattatgttaagtgatcatgt 10855950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0767 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0767
Description:

Target: scaffold0767; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 173 - 314
Target Start/End: Original strand, 5601 - 5742
Alignment:
Q  173 aaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatc 272  Q
    |||| |||||||||||| || ||| |||| |||||||| |||   ||| ||||||||  |||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||    
T  5601 aaattgtcactttagtcactcactttgcacctcgttgtgacaaatgtctctgactcagaattaaatacaaagaagtccctgactctacacttccgttatc 5700  T
Q  273 actttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatg 314  Q
    |||||||||  || ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  5701 actttagtctctggcgttaaataattatgttatgtgatgatg 5742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University