View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF21516_low_11 (Length: 381)

Name: NF21516_low_11
Description: NF21516
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF21516_low_11
NF21516_low_11
[»] chr8 (34 HSPs)
chr8 (18-197)||(10284549-10284728)
chr8 (20-193)||(12831052-12831225)
chr8 (20-193)||(504043-504216)
chr8 (20-193)||(23122519-23122692)
chr8 (20-193)||(34012218-34012391)
chr8 (20-175)||(44507027-44507182)
chr8 (22-193)||(14547929-14548100)
chr8 (20-194)||(40423864-40424038)
chr8 (20-193)||(15197338-15197511)
chr8 (20-197)||(37038484-37038661)
chr8 (20-196)||(5957835-5958011)
chr8 (34-202)||(8841345-8841513)
chr8 (18-198)||(15048098-15048278)
chr8 (20-160)||(1179895-1180035)
chr8 (18-198)||(43414498-43414678)
chr8 (20-197)||(4854781-4854958)
chr8 (18-193)||(30479396-30479571)
chr8 (18-155)||(10621047-10621184)
chr8 (18-199)||(15258845-15259026)
chr8 (59-175)||(9122229-9122345)
chr8 (18-194)||(16056322-16056498)
chr8 (18-193)||(24307715-24307890)
chr8 (18-193)||(34307219-34307394)
chr8 (18-159)||(16383380-16383521)
chr8 (67-200)||(42354503-42354636)
chr8 (18-184)||(14055523-14055689)
chr8 (20-166)||(42221520-42221666)
chr8 (20-198)||(20074869-20075029)
chr8 (87-197)||(40467772-40467882)
chr8 (18-195)||(17443828-17444005)
chr8 (18-197)||(32032728-32032906)
chr8 (111-197)||(32707921-32708007)
chr8 (111-175)||(42710234-42710298)
chr8 (18-74)||(24307632-24307688)
[»] chr3 (44 HSPs)
chr3 (268-376)||(29555247-29555355)
chr3 (20-200)||(30801648-30801828)
chr3 (19-166)||(52629304-52629451)
chr3 (20-193)||(53982016-53982189)
chr3 (20-198)||(8076398-8076576)
chr3 (18-198)||(33118767-33118948)
chr3 (20-193)||(33644205-33644378)
chr3 (20-193)||(54868817-54868990)
chr3 (20-193)||(17470410-17470583)
chr3 (20-200)||(35536631-35536811)
chr3 (18-200)||(20764830-20765012)
chr3 (20-193)||(49607419-49607592)
chr3 (20-163)||(31456694-31456837)
chr3 (18-200)||(41189679-41189861)
chr3 (18-200)||(26141445-26141629)
chr3 (18-199)||(51419276-51419457)
chr3 (18-197)||(11347840-11348019)
chr3 (18-200)||(26754698-26754880)
chr3 (20-197)||(14623757-14623934)
chr3 (20-193)||(36707350-36707519)
chr3 (20-193)||(48587023-48587186)
chr3 (20-197)||(8956767-8956944)
chr3 (18-199)||(45058469-45058649)
chr3 (198-269)||(29555212-29555283)
chr3 (17-199)||(42823113-42823295)
chr3 (20-197)||(35965700-35965869)
chr3 (20-175)||(9563004-9563159)
chr3 (35-200)||(13897970-13898135)
chr3 (20-200)||(24699870-24700049)
chr3 (20-118)||(27714888-27714986)
chr3 (18-200)||(47531868-47532050)
chr3 (20-91)||(11095377-11095448)
chr3 (18-141)||(48375680-48375803)
chr3 (23-165)||(39670019-39670161)
chr3 (56-200)||(1758374-1758515)
chr3 (18-131)||(11907374-11907487)
chr3 (45-166)||(36331278-36331399)
chr3 (22-197)||(35093592-35093767)
chr3 (20-141)||(41080714-41080833)
chr3 (35-94)||(43745766-43745825)
chr3 (133-193)||(11095289-11095349)
chr3 (101-166)||(21746137-21746202)
chr3 (111-200)||(43746435-43746524)
chr3 (35-131)||(45320390-45320486)
[»] chr2 (38 HSPs)
chr2 (20-184)||(33436031-33436195)
chr2 (20-193)||(10249304-10249477)
chr2 (20-193)||(13438348-13438521)
chr2 (20-193)||(32505570-32505743)
chr2 (20-166)||(30915468-30915614)
chr2 (20-197)||(20700820-20700997)
chr2 (20-193)||(28863460-28863633)
chr2 (20-175)||(9058485-9058640)
chr2 (20-193)||(17473025-17473198)
chr2 (20-193)||(19930742-19930915)
chr2 (20-193)||(40701483-40701656)
chr2 (20-193)||(7465657-7465830)
chr2 (20-166)||(4060690-4060836)
chr2 (18-198)||(40613819-40613999)
chr2 (18-197)||(36168839-36169018)
chr2 (20-193)||(28381577-28381750)
chr2 (18-198)||(42257196-42257376)
chr2 (18-200)||(38732357-38732539)
chr2 (20-175)||(38882751-38882908)
chr2 (18-143)||(26891476-26891601)
chr2 (18-198)||(2533127-2533306)
chr2 (20-124)||(5574479-5574583)
chr2 (18-197)||(43490124-43490303)
chr2 (20-175)||(27864709-27864851)
chr2 (18-197)||(38273061-38273239)
chr2 (32-200)||(2997402-2997570)
chr2 (18-158)||(17819961-17820101)
chr2 (46-200)||(41758616-41758772)
chr2 (21-199)||(3439985-3440163)
chr2 (20-200)||(33436216-33436386)
chr2 (100-196)||(44152012-44152108)
chr2 (45-198)||(13365383-13365536)
chr2 (20-155)||(41575142-41575278)
chr2 (18-166)||(45097684-45097832)
chr2 (58-197)||(3737986-3738125)
chr2 (101-198)||(17823874-17823971)
chr2 (69-197)||(3034901-3035029)
chr2 (109-184)||(2329352-2329431)
[»] chr1 (34 HSPs)
chr1 (20-193)||(9474798-9474971)
chr1 (20-175)||(2581920-2582075)
chr1 (18-197)||(32813250-32813429)
chr1 (20-193)||(27564657-27564830)
chr1 (20-193)||(41758810-41758983)
chr1 (20-197)||(51898601-51898778)
chr1 (20-184)||(50630463-50630627)
chr1 (20-166)||(3000324-3000470)
chr1 (20-193)||(48716204-48716377)
chr1 (20-175)||(38632261-38632416)
chr1 (20-166)||(38595159-38595305)
chr1 (20-193)||(47452242-47452415)
chr1 (20-175)||(43137-43292)
chr1 (18-200)||(45044475-45044657)
chr1 (18-199)||(5958916-5959097)
chr1 (41-164)||(13414787-13414910)
chr1 (20-193)||(37649203-37649376)
chr1 (18-195)||(49811447-49811624)
chr1 (20-175)||(8346327-8346483)
chr1 (20-148)||(44548343-44548471)
chr1 (18-197)||(44453982-44454165)
chr1 (35-200)||(11152293-11152458)
chr1 (18-197)||(50590918-50591097)
chr1 (18-199)||(47748446-47748626)
chr1 (20-193)||(26274437-26274607)
chr1 (18-175)||(7740736-7740893)
chr1 (20-195)||(23597011-23597186)
chr1 (18-197)||(37926356-37926535)
chr1 (18-197)||(6260873-6261052)
chr1 (18-197)||(41608411-41608590)
chr1 (56-197)||(44332289-44332430)
chr1 (20-166)||(3302482-3302628)
chr1 (42-199)||(26440761-26440908)
chr1 (87-195)||(34339968-34340075)
[»] scaffold0110 (1 HSPs)
scaffold0110 (18-199)||(8779-8960)
[»] chr4 (36 HSPs)
chr4 (20-193)||(6034049-6034222)
chr4 (20-193)||(48182971-48183144)
chr4 (18-199)||(31910195-31910376)
chr4 (20-166)||(480396-480542)
chr4 (20-198)||(50052345-50052523)
chr4 (20-193)||(24995029-24995202)
chr4 (20-193)||(41236352-41236525)
chr4 (20-200)||(29239891-29240071)
chr4 (20-166)||(11511411-11511557)
chr4 (20-166)||(42044316-42044462)
chr4 (20-175)||(54473473-54473628)
chr4 (20-198)||(50526088-50526266)
chr4 (53-197)||(41823920-41824064)
chr4 (20-155)||(29234205-29234340)
chr4 (18-195)||(40574782-40574959)
chr4 (18-200)||(19670631-19670813)
chr4 (18-196)||(48647645-48647823)
chr4 (20-199)||(3481659-3481828)
chr4 (20-175)||(23608240-23608395)
chr4 (18-197)||(50813810-50813989)
chr4 (18-197)||(55475194-55475373)
chr4 (18-200)||(47986211-47986392)
chr4 (32-200)||(17983658-17983826)
chr4 (19-141)||(53352540-53352661)
chr4 (20-195)||(29977890-29978065)
chr4 (18-199)||(28480184-28480365)
chr4 (18-199)||(28481059-28481240)
chr4 (18-199)||(28481934-28482115)
chr4 (18-198)||(29547876-29548056)
chr4 (42-194)||(47104571-47104723)
chr4 (18-198)||(32766961-32767141)
chr4 (18-149)||(8343129-8343260)
chr4 (18-203)||(18924407-18924592)
chr4 (45-200)||(29589655-29589810)
chr4 (111-194)||(56300086-56300169)
chr4 (18-198)||(44536663-44536842)
[»] chr7 (40 HSPs)
chr7 (20-166)||(38267045-38267191)
chr7 (20-193)||(8080305-8080478)
chr7 (18-198)||(21234404-21234584)
chr7 (20-171)||(35137538-35137689)
chr7 (18-197)||(46033719-46033898)
chr7 (20-166)||(38837222-38837368)
chr7 (20-193)||(4999436-4999609)
chr7 (20-193)||(19329847-19330020)
chr7 (20-184)||(19436118-19436282)
chr7 (20-166)||(40957712-40957858)
chr7 (20-159)||(3784000-3784139)
chr7 (20-174)||(32951434-32951588)
chr7 (18-200)||(35522879-35523061)
chr7 (20-175)||(7389394-7389548)
chr7 (18-200)||(8238215-8238398)
chr7 (20-166)||(3694372-3694518)
chr7 (18-197)||(26296647-26296826)
chr7 (18-197)||(38044200-38044379)
chr7 (20-193)||(11044193-11044356)
chr7 (44-196)||(16374743-16374895)
chr7 (20-124)||(36361904-36362008)
chr7 (20-193)||(36362031-36362192)
chr7 (18-197)||(22343364-22343543)
chr7 (46-197)||(41423713-41423864)
chr7 (20-193)||(3434567-3434730)
chr7 (18-148)||(36208176-36208306)
chr7 (18-195)||(41915744-41915921)
chr7 (49-199)||(27744225-27744375)
chr7 (18-198)||(31735887-31736060)
chr7 (20-197)||(35468773-35468950)
chr7 (56-196)||(2318160-2318302)
chr7 (18-200)||(32564341-32564523)
chr7 (18-200)||(40846028-40846210)
chr7 (18-195)||(7727909-7728086)
chr7 (18-175)||(18207183-18207339)
chr7 (18-195)||(39255844-39256020)
chr7 (18-107)||(46374810-46374899)
chr7 (133-198)||(46374741-46374806)
chr7 (58-196)||(32045880-32046018)
chr7 (133-193)||(36361847-36361907)
[»] chr5 (29 HSPs)
chr5 (20-193)||(33149560-33149733)
chr5 (20-193)||(2740279-2740452)
chr5 (20-193)||(18520806-18520979)
chr5 (20-193)||(35785204-35785377)
chr5 (18-195)||(35943812-35943989)
chr5 (20-184)||(36732873-36733037)
chr5 (22-184)||(13811659-13811821)
chr5 (20-193)||(14831819-14831992)
chr5 (20-193)||(40145412-40145585)
chr5 (18-197)||(15409528-15409707)
chr5 (18-198)||(31008991-31009171)
chr5 (18-196)||(6679701-6679879)
chr5 (18-150)||(28177778-28177910)
chr5 (18-199)||(26720519-26720700)
chr5 (18-199)||(26990268-26990449)
chr5 (87-199)||(2177436-2177548)
chr5 (18-199)||(3921181-3921362)
chr5 (18-198)||(2252085-2252265)
chr5 (20-200)||(6259916-6260096)
chr5 (42-198)||(20073433-20073589)
chr5 (20-142)||(42414275-42414397)
chr5 (20-163)||(36875564-36875698)
chr5 (36-196)||(33825243-33825403)
chr5 (18-198)||(39688814-39688994)
chr5 (59-197)||(21370048-21370186)
chr5 (20-195)||(9603818-9603993)
chr5 (23-106)||(41470425-41470508)
chr5 (63-125)||(31132392-31132454)
chr5 (35-120)||(16327921-16328006)
[»] chr6 (22 HSPs)
chr6 (22-193)||(32869685-32869856)
chr6 (20-175)||(22880598-22880753)
chr6 (20-193)||(17598559-17598732)
chr6 (20-193)||(11427621-11427796)
chr6 (18-197)||(31976251-31976430)
chr6 (20-166)||(23128076-23128222)
chr6 (20-193)||(15832582-15832755)
chr6 (20-158)||(6209422-6209560)
chr6 (20-200)||(31952945-31953125)
chr6 (20-193)||(29857832-29858005)
chr6 (27-164)||(31109351-31109488)
chr6 (18-198)||(30341277-30341457)
chr6 (18-197)||(15989960-15990139)
chr6 (18-200)||(15507939-15508121)
chr6 (18-197)||(31110679-31110856)
chr6 (22-182)||(946383-946543)
chr6 (45-197)||(4231578-4231730)
chr6 (20-175)||(28536428-28536581)
chr6 (19-147)||(9379680-9379808)
chr6 (59-184)||(30870058-30870183)
chr6 (20-137)||(12732487-12732604)
chr6 (152-197)||(22421997-22422042)
[»] scaffold0321 (1 HSPs)
scaffold0321 (18-166)||(10058-10206)
[»] scaffold1268 (1 HSPs)
scaffold1268 (20-196)||(848-1024)
[»] scaffold1267 (1 HSPs)
scaffold1267 (20-196)||(848-1024)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (20-193)||(4034-4207)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (45-196)||(152528-152679)
[»] scaffold0316 (1 HSPs)
scaffold0316 (45-124)||(17084-17163)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 128; Significance: 4e-66; HSPs: 34)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 18 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 10284728 - 10284549
Alignment:
Q  18 ttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctct 117  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  10284728 ttatgatacatagacacccttaagtgacaatacactctttgacacccacacaaaaatttgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctct 10284629  T
Q  118 ttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcc 197  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  10284628 ttcctttcatcttctctcttcctagtgcatggggtgtacaaggttgtataagaataaaaggtgtctatgtaacattttcc 10284549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 20 - 193
Target Start/End: Original strand, 12831052 - 12831225
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  12831052 atgatacatagacacccttaggtgacaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttt 12831151  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatt 193  Q
     ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||| ||||    
T  12831152 tctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgagaataaatggtgtctatgtatcatt 12831225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 20 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 504216 - 504043
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||    
T  504216 atgatacatagacacccttaggtggcaatacaccttttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacacattctcttt 504117  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatt 193  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||| ||||    
T  504116 tctctcatcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgagaataaagggtgtctatgtatcatt 504043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 20 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 23122692 - 23122519
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||    
T  23122692 atgatacatagacacccttaagtggcaatacaccttttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcataagcacactttctcttt 23122593  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatt 193  Q
     ||||| | ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||| ||||    
T  23122592 tctctcctgttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgagaataaagggtgtctatgtatcatt 23122519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 20 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 34012391 - 34012218
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | |||||||||    
T  34012391 atgatacatagacacccttaggtggtaatacaccctttgacacccacacaaaaatttgacacgtagtcacgtggatcccgcacaagcacactttctcttt 34012292  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatt 193  Q
     ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||  ||||||| ||| ||||    
T  34012291 tctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtacgagaataaagggtgtctatgtatcatt 34012218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 20 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 44507182 - 44507027
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  ||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||    
T  44507182 atgatacatagacacccttaggtggtaatacactctttaacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgtacaagcatactttctcttt 44507083  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaa 175  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  44507082 tctctcatcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgagaataaa 44507027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 22 - 193
Target Start/End: Original strand, 14547929 - 14548100
Alignment:
Q  22 gatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctctttcc 121  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| |    
T  14547929 gatacatagacacccttaggtggcaatacaccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttttc 14548028  T
Q  122 tctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatt 193  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||  ||||||| ||| ||||    
T  14548029 tctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaaggatgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 14548100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 20 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 40424038 - 40423864
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  40424038 atgatacatagatacccttaggtggcaatacaccctttgacatccacacaaaaatctgacacgtagtcatgtggaccccgcacaagcacactttctcttt 40423939  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattt 194  Q
     ||||| ||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||| |||||    
T  40423938 tctctcctcttctctcttcctaatacatgaggtgtacaagggtgtatgggaataaaaggtgtctatgtatcattt 40423864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 20 - 193
Target Start/End: Original strand, 15197338 - 15197511
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  15197338 atgatacatagacactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttt 15197437  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatt 193  Q
     ||||| ||||  ||||||| |||||||| | |||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||| ||||    
T  15197438 tctctcctcttttctcttccaaatgcatgaggtgtacaagggtgtatgggaataaaaagtgtctatgtatcatt 15197511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 20 - 197
Target Start/End: Original strand, 37038484 - 37038661
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||||| | | ||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| | ||||| |||    
T  37038484 atgatacatagacatctttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggatcccgcacaagcacactttctattt 37038583  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcc 197  Q
    |||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||  |||| || ||||||||||||    
T  37038584 cctctcctcttctctcttcctagtgcatggggtgtacaagggtgtatagaaataaagggtgtttatgtaacattttcc 37038661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 20 - 196
Target Start/End: Original strand, 5957835 - 5958011
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||||| |  |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| || | |||||||||    
T  5957835 atgatacatagacattcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggatcccgcacaatcacactttctcttt 5957934  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttc 196  Q
    |||||| ||||| ||||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||  |||| || |||||||||||    
T  5957935 cctctcctcttctctcttcctagtgcatgaggtgtacaagggtgtatgagaataaagggtgtttatgtaacattttc 5958011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 34 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 8841513 - 8841345
Alignment:
Q  34 cccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctctttcctctcatcttccc 133  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| ||||| |    
T  8841513 cccttaggtggcagtacaccctttgacacccacacaaaaatctaacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctctttcctctcctcttctc 8841414  T
Q  134 tcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcctttga 202  Q
    | |||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||    
T  8841413 ttttcctagtgcatggggtgtacaagagtgtatgagaataaatggtgtctatgtaacattttccattga 8841345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 15048278 - 15048098
Alignment:
Q  18 ttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctct 117  Q
    |||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||| |||||| |||||||||| | |||||||    
T  15048278 ttatgatacatagacatccttaggtggcaatacaccctttgacacc-acacaaaaatctgacacgtagccacatggaccccgcacaagcacactttctct 15048180  T
Q  118 ttcc-tctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcct 198  Q
    ||   |||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||  ||||||||||||    
T  15048179 ttttatctcctcttctctcttcctaatgtatgggatgtacaagggtgtatcggaataaagggtgtctatataacattttcct 15048098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 20 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 1180035 - 1179895
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||   |||||||||| | |||||||||    
T  1180035 atgatacatagacacccttaggtggtaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcatgtggattccgcacaagcacactttctcttt 1179936  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagg 160  Q
     ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  1179935 tctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagg 1179895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 18 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 43414678 - 43414498
Alignment:
Q  18 ttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctct 117  Q
    |||||||||||||| | |||||  || ||| ||||||||||||||||||| |||||| | |||||| ||||| |||| | |||||||||| | |||||||    
T  43414678 ttatgatacatagacatccttagatggcaacacaccctttgacacccacacaaaaatctaacacgtggtcacatggatcccgcacaagcacactttctct 43414579  T
Q  118 ttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcct 198  Q
    || ||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||   ||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  43414578 tttctctcctcttctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatggcaataaagggtgtctatgtaacattttcct 43414498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 20 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 4854958 - 4854781
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| | || | ||| ||||||  ||||||||| | |||||||||    
T  4854958 atgatacatagacatccttaggtggcaatacaccctttaacacctacataaaaatctgatatgtggccacatggaccctgcacaagcacactttctcttt 4854859  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcc 197  Q
     ||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  4854858 tctctcctcttctctcttactaatgtatgggatgtacaagggtatatgagaataaagagtgtctatgtaacattttcc 4854781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 30479571 - 30479396
Alignment:
Q  18 ttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctct 117  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || |  |  ||||||||||||||| | | |||||||    
T  30479571 ttatgatacataaacacccttaggtggcaatacaccctttgacatccacataaaaatctgacatgtggctatatggacctcgcacaagtacactttctct 30479472  T
Q  118 ttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatt 193  Q
    ||| |||  ||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||||||||    
T  30479471 ttcttcttctcttctctcttcctaatacatgaggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacatt 30479396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 10621184 - 10621047
Alignment:
Q  18 ttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctct 117  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| | || | |||||||||| | |||||||    
T  10621184 ttatgatacatagacatccttaggtggtaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagccacatcgatcccgcacaagcacactttctct 10621085  T
Q  118 ttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgta 155  Q
    || ||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  10621084 tttctctcctcttctctcttcctaatatatgggatgta 10621047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 15259026 - 15258845
Alignment:
Q  18 ttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctct 117  Q
    |||||||||||||| || ||||  || ||||||| || | |||| |||||||||||| ||||| || ||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  15259026 ttatgatacatagatactcttagatggcaatacatccctggacatccacataaaaatctgacatgtggtcacgtggaccctgcacaagcacattttctct 15258927  T
Q  118 ttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcctt 199  Q
    |||||||| ||||| |||||||||    || ||||||||||  ||||||   ||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  15258926 ttcctctcctcttctctcttcctagaatataggatgtacaaaagtgtatggaaataaagggtgtctatgtaacattttcctt 15258845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 59 - 175
Target Start/End: Original strand, 9122229 - 9122345
Alignment:
Q  59 acacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaa 158  Q
    ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| | |||||||||| | ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  9122229 acacccacacaaaaatctgacatgtagtcacgtggatcccgcacaagcacactttctcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaa 9122328  T
Q  159 gggtgtataagaataaa 175  Q
    | ||||||  |||||||    
T  9122329 gagtgtatgggaataaa 9122345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 16056498 - 16056322
Alignment:
Q  18 ttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctct 117  Q
    |||||||||||| | | ||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||||| || | ||  |||||| |||||||| | | |||||||    
T  16056498 ttatgatacataaacatccttatgtgacaatacatcccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcacaagtacactttctct 16056399  T
Q  118 ttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattt 194  Q
    ||| |||  ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| |||||||||    
T  16056398 ttcttcttctcttctctcttcctaatacatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattt 16056322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 18 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 24307890 - 24307715
Alignment:
Q  18 ttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctct 117  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||| || |||||||||||| |||||| ||| | || | ||  |||||| |||||||| | | |||||||    
T  24307890 ttatgatacataaacacccttaggtggcaatacatcccttgacacccacacaaaaatctgatatgtggccatatggaccccgcacaagtacactttctct 24307791  T
Q  118 ttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatt 193  Q
    ||| |||  ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||||||||    
T  24307790 ttcttcttctcttctctcttcctaatacatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacatt 24307715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 18 - 193
Target Start/End: Original strand, 34307219 - 34307394
Alignment:
Q  18 ttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctct 117  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| || | ||  || ||| |||||||| | | |||||||    
T  34307219 ttatgatacataaacacccttaggtggcaatacaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggacatatgaaccccgcacaagtacactttctct 34307318  T
Q  118 ttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatt 193  Q
    ||| |||  ||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||||||||    
T  34307319 ttcttcttctcttctctcttcctaatatatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacatt 34307394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 18 - 159
Target Start/End: Original strand, 16383380 - 16383521
Alignment:
Q  18 ttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctct 117  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| || | ||  |||||| |||||||| | | |||||||    
T  16383380 ttatgatacataaacacccttaggtggcaatacaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcacaagtacactttctct 16383479  T
Q  118 ttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaag 159  Q
    ||| |||  ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  16383480 ttcttcttctcttctctcttcctaatacatggggtgtacaag 16383521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 67 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 42354636 - 42354503
Alignment:
Q  67 ataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtat 166  Q
    |||||||| ||||||||  ||| ||||| ||| || ||||| | |||||||||| |||  ||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  42354636 ataaaaatctgacacgtgttcatgtggatctcacataagcacactttctctttcatcttctcttctctcttcctagtgcatggggtgtagaagggtgtat 42354537  T
Q  167 aagaataaaatgtgtctacgtaacattttccttt 200  Q
     ||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  42354536 gagaataaatggtgtctatgtaacattttccttt 42354503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 18 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 14055689 - 14055523
Alignment:
Q  18 ttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctc-gcacaagcatattttctc 116  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||||||||| | |||||| ||||| |||||| | ||| ||||||||||||||| |  |||||||  | ||| ||    
T  14055689 ttatgatacattgacacccttaggtgacaatacactccttgacatccacacaaaaatcttacatgtagtcacgtggacccctacacaagc-cactttttc 14055591  T
Q  117 tttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtcta 184  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||||| ||| | | ||||| ||||||| ||||||||  |||||||    
T  14055590 tttcctctgatcttctctcttcttaatgaatgaggtatacaaaggtgtatgagaataaatagtgtcta 14055523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 20 - 166
Target Start/End: Original strand, 42221520 - 42221666
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||| | | ||||| |||||||||||  | | |||||||||| |||||| ||||||||| |||  |||||| |  ||||||| | |||||||||    
T  42221520 atgatacatatacatccttaggtgacaatacattcctggacacccacacaaaaatctgacacgtaatcatatggaccccatacaagcacactttctcttt 42221619  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtat 166  Q
    | |||||||||| ||||||| |||  || || |||||||||||||||    
T  42221620 catctcatcttctctcttccaaatatatagggtgtacaagggtgtat 42221666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 20075029 - 20074869
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||||| | ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||        ||||||||||  ||||||||| | |||||||||    
T  20075029 atgatacatagacatccttaggtggcaatacactctttgacacccacataaaaatgtga--------cacgtggaccctgcacaagcacactttctcttt 20074938  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcct 198  Q
    |||||  ||||| ||||||||| | ||||           ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20074937 cctcttctcttctctcttcctagttcatg----------aggtgtatgagaataaaatgtgtctatgtaacattttcct 20074869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 197
Target Start/End: Original strand, 40467772 - 40467882
Alignment:
Q  87 cacgtggacctcgcacaagcatattttctctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacg 186  Q
    ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| |  ||||| |||||||   | |||  | |||||| ||||||| |    
T  40467772 cacgtggacttcgcacaagcacactttctctttcctctcatcttctctcttcctagtctatggggtgtacaaaaatttatggggataaaaggtgtctatg 40467871  T
Q  187 taacattttcc 197  Q
    |||||||||||    
T  40467872 taacattttcc 40467882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 18 - 195
Target Start/End: Original strand, 17443828 - 17444005
Alignment:
Q  18 ttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctct 117  Q
    |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||   || |||| |||| |||||| ||||| ||||||| ||||||| | |||||  | | |||||||    
T  17443828 ttatgatacatagacaaccttaggtgacaatacacttcttaacactcacacaaaaatctgacatgtagtcatgtggaccccacacaaagacactttctct 17443927  T
Q  118 ttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatttt 195  Q
    ||| |||  ||||| ||||||| | |||||| | ||||||||| |||||    |||||  ||||||| ||||||||||    
T  17443928 ttcatcttctcttctctcttcccagtgcatgagttgtacaaggatgtattcttataaagggtgtctatgtaacatttt 17444005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 197
Target Start/End: Original strand, 32032728 - 32032906
Alignment:
Q  18 ttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctct 117  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||| |||| |||| ||||| |||||| ||||| || | ||  |||| |  ||||||| | | |||||||    
T  32032728 ttatgatacataaacacccttaggtggcaatacatcctt-gacatccacacaaaaatctgacatgtggccatatggatcctgcacaagtacactttctct 32032826  T
Q  118 ttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcc 197  Q
    |||  ||  ||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  32032827 ttctccttctcttctctcttcctaatacatgaggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcc 32032906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 111 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 32708007 - 32707921
Alignment:
Q  111 tttctctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcc 197  Q
    |||||||||| |||  ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  32708007 tttctctttcttcttctcttctctcttcctaatacatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcc 32707921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 111 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 42710298 - 42710234
Alignment:
Q  111 tttctctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaa 175  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  42710298 tttctcttttctctcctcttctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaa 42710234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 18 - 74
Target Start/End: Original strand, 24307632 - 24307688
Alignment:
Q  18 ttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaat 74  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||| || |||||||||||| ||||||    
T  24307632 ttatgatacataaacacccttaggtggcaatacatccattgacacccacacaaaaat 24307688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 44)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 268 - 376
Target Start/End: Original strand, 29555247 - 29555355
Alignment:
Q  268 ttggtatttggacaacacgatacggttctattgtatttggtgaaaagctaattgatttggtgtggcttgggtcagttttttgtttgtctctcattgcgtc 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29555247 ttggtatttggacaacacgatacggttctattgtatttggtgaaaagctaattgatttggtgtggcttgggtcagttttttgtttgtctctcattgcgtc 29555346  T
Q  368 tctcctttg 376  Q
    |||||||||    
T  29555347 tctcctttg 29555355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 20 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 30801828 - 30801648
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||  |||||| | |||||||| |||||||||||    
T  30801828 atgatacatagacacccttaggtgataatacaccctttgatacccacacaaaaatatgacatgtagtcatatggaccccacacaagcacattttctcttt 30801729  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttccttt 200  Q
    |||||||||||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  30801728 cctctcatcttctctcttcctagtacatggggtgtacaagggtgtatgagaataaaaggtgtctatgtaacattttccttt 30801648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 166
Target Start/End: Original strand, 52629304 - 52629451
Alignment:
Q  19 tatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctctt 118  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| | ||||||||    
T  52629304 tatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgtacaagcacactttctctt 52629403  T
Q  119 tcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtat 166  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52629404 ttctctcatcttctctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtat 52629451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 20 - 193
Target Start/End: Original strand, 53982016 - 53982189
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  53982016 atgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttt 53982115  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatt 193  Q
     ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||  ||||||| ||| ||||    
T  53982116 tctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaaggttgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 53982189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 20 - 198
Target Start/End: Original strand, 8076398 - 8076576
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||| | ||||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  8076398 atgatacataaacacccttaggtggcagtacaccctttgacacccacacaaaaatctaacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttt 8076497  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcct 198  Q
    |||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||||  |||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  8076498 cctctcctcttctctcttcctagtgcatggggtgtacaaaagtgtatgagaataaatggtgtctatgtaacattttcct 8076576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 33118948 - 33118767
Alignment:
Q  18 ttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctct 117  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | || || || | |||||||    
T  33118948 ttatgatacatagacacccttaggtgacaatacaccctttgacacccacacaaaaatttgacacgtagtcacgtggatccctcagaaacacactttctct 33118849  T
Q  118 ttcctctcat-cttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcct 198  Q
    |||||||| | |||| |||| |||| |||||||| |||||||||||||||   ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  33118848 ttcctctcctccttctctctccctagtgcatggggtgtacaagggtgtatggaaataaagggtgtctacgtaacattttcct 33118767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 20 - 193
Target Start/End: Original strand, 33644205 - 33644378
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  33644205 atgatacatagacacccttgggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttt 33644304  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatt 193  Q
     ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||||  ||||||| ||| ||||    
T  33644305 tctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtataagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 33644378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 20 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 54868990 - 54868817
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| || | |||||||||    
T  54868990 atgatacatagacacccttaggtggcaatacaccttttgacacccacacaaaaatctgacacgtagttacgtggaccccgcacaatcacactttctcttt 54868891  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatt 193  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||   ||||||| ||||||| ||| ||||    
T  54868890 tctctcatcttctctcttcctaatgcatagggtgtacaagggtgtatggaaataaaaggtgtctatgtatcatt 54868817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 20 - 193
Target Start/End: Original strand, 17470410 - 17470583
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||||| ||| ||| ||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||    
T  17470410 atgatacatagacacctttaggtggcaatacaccttttaacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccacacaagcacactttctcttt 17470509  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatt 193  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||  ||||||| ||| ||||    
T  17470510 tctctcatcttctctcttcctaatgcatgggatgtacaaatatgtatgagaataaatggtgtctatgtatcatt 17470583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 20 - 200
Target Start/End: Original strand, 35536631 - 35536811
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||||| | ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||  |||||||| | || ||||||    
T  35536631 atgatacatagacatccttatgtggcaatacaccatttgacacccacataaaaatgtgacacgtggtcatgtggaccttacacaagcacacttcctcttt 35536730  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttccttt 200  Q
    | |||  ||||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  35536731 catcttctcttctctcttcctagtgcatggggtgtagaagggtgtatgagaataaatggtgtctatgtaacattttccttt 35536811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 18 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 20765012 - 20764830
Alignment:
Q  18 ttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctct 117  Q
    |||||| ||||||| | ||||| |||  ||||||| |||| ||||||||| |||||| |||||||| | ||| |||||| || ||||||| | |||||||    
T  20765012 ttatgagacatagacatccttaggtggtaatacactctttaacacccacacaaaaatctgacacgtggccacatggaccccgtacaagcacactttctct 20764913  T
Q  118 ttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttccttt 200  Q
    || ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  20764912 tttctctcatcttctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgagaataaatggtgtctatgtaacattttccttt 20764830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 20 - 193
Target Start/End: Original strand, 49607419 - 49607592
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | | |||||||| | |||||||||    
T  49607419 atgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggatcccacacaagcacactttctcttt 49607518  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatt 193  Q
     ||||| ||||  ||||||||||||||||   |||||||||||||||  |||||||  ||||||| ||| ||||    
T  49607519 tctctcctcttttctcttcctaatgcatgacgtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 49607592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 163
Target Start/End: Original strand, 31456694 - 31456837
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||||| |||| || | | ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  31456694 atgatacatagacacccataggcggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcatgtggaccccgcacaagcacactttctcttt 31456793  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtg 163  Q
     ||||| ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31456794 tctctcctcttttctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtg 31456837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 41189861 - 41189679
Alignment:
Q  18 ttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctct 117  Q
    |||||||||||| | | ||||| ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||| | |||||||    
T  41189861 ttatgatacatatacatccttaggtggcaatacatcatttgacacccacataaaaatttgacacgtggccacatggaccccgcacaagcacactttctct 41189762  T
Q  118 ttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttccttt 200  Q
    || ||||| |||||  ||||||||||| ||||  |||||||| ||||||   ||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  41189761 tttctctcctcttctttcttcctaatgtatggagtgtacaagagtgtatggaaataaagggtgtctatgtaacattttccttt 41189679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 26141629 - 26141445
Alignment:
Q  18 ttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctct 117  Q
    |||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| ||||| |||||| | |||||||| | |||||||    
T  26141629 ttatgatacatagacatccttaggtggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatctgacacgtggtcacatggaccccacacaagcacactttctct 26141530  T
Q  118 ttcctctcatcttc--cctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttccttt 200  Q
    || ||||| |||||   |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||   ||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  26141529 tttctctcctcttctttctcttcctaatgtatggggtgtacaagagtgtatggaaataaagggtgtctatgtaacattttccttt 26141445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 51419457 - 51419276
Alignment:
Q  18 ttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctct 117  Q
    |||||||||||||| | |||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |||||||| | ||| | |||| |||||||||| | |||||||    
T  51419457 ttatgatacatagacatccttagatgacaatacatcctttaacacccacacaaaaatctgacacgtggccacatagaccccgcacaagcacactttctct 51419358  T
Q  118 ttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcctt 199  Q
    || ||||| | ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||   ||||||| |||| || ||||||||||||||    
T  51419357 tttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatggaaataaaaggtgtttatgtaacattttcctt 51419276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 11348019 - 11347840
Alignment:
Q  18 ttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctct 117  Q
    |||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||||||| | ||| ||||||  ||| ||||| | |||||||    
T  11348019 ttatgatacatagacatccttaggtgacaatacatcctttgacatccacacaaaaatctgacacgtggccacatggaccctgcataagcacactttctct 11347920  T
Q  118 ttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcc 197  Q
    || ||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||  |||||||  ||||||| ||| ||||||||    
T  11347919 tttctctcctcttctctcttcctaatgtatggggtgtataagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtaccattttcc 11347840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 200
Target Start/End: Original strand, 26754698 - 26754880
Alignment:
Q  18 ttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctct 117  Q
    ||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||||    
T  26754698 ttatgattcatagacacccttaggtggcaatacacccttggacatccacacaaaaatctgacatgtggtcacatggaccccgcacaagcacattttctct 26754797  T
Q  118 ttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttccttt 200  Q
    |||||||| ||||| |||||||||    || || ||||||| |||||||   ||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  26754798 ttcctctcctcttctctcttcctagaatatagggtgtacaaaggtgtatggaaataaagagtgtctatgtaacattttccttt 26754880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 14623934 - 14623757
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||||| | ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||| |||||||| | |||||||||    
T  14623934 atgatacatagacatccttaggtggcaatacaccccttgacacccacataaaaatctgacatgtgttcatgtggacctcacacaagcacactttctcttt 14623835  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcc 197  Q
    | |||  ||||| ||||| ||| |||||| | |||| |||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  14623834 catcttctcttctctctttctagtgcatgaggtgtagaaggatgtatgagaataaatggtgtctatgtaacattttcc 14623757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 36707519 - 36707350
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||||| | |||    ||| | |||||||||    
T  36707519 atgatacatagatacccttaggtgacaatacaccctttgacatccacacaaaaatctgacacgtagttacgtggatcccgc----gcacactttctcttt 36707424  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatt 193  Q
     ||||| ||||| |||||||||||||||| | ||||||||  |||||  |||||||| ||||||| ||| ||||    
T  36707423 tctctcctcttctctcttcctaatgcatgaggtgtacaagaatgtatgggaataaaaggtgtctatgtatcatt 36707350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 20 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 48587186 - 48587023
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| | | ||||||||     
T  48587186 atgatacatagatacccttaggtggcaatacaccctttgacacctacataaaaatctgacacgtagtcacgtggatcccgcacaagtacactttctctt- 48587088  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatt 193  Q
             ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||| ||| ||||    
T  48587087 ---------ttctctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtatatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 48587023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 20 - 197
Target Start/End: Original strand, 8956767 - 8956944
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||||| | ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||||  |||||||| | || ||||||    
T  8956767 atgatacatagacatccttatgtggcaatacatcctttgacacccacataaaaatgtgacacgtgttcatgtggaccttacacaagcacacttcctcttt 8956866  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcc 197  Q
    | |||  ||||| ||||||||| ||||  || |||| |||||||||| ||||||||   |||||| ||||||||||||    
T  8956867 catcttctcttctctcttcctagtgcacagggtgtagaagggtgtatgagaataaatgctgtctatgtaacattttcc 8956944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 18 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 45058649 - 45058469
Alignment:
Q  18 ttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctct 117  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||   ||  |||||| |||||||| ||| |||||||    
T  45058649 ttatgatacataaacacccttaggtggcaatacaccctt-gacacccacataaaaatctgacatgtgaccatatggaccccgcacaagtatactttctct 45058551  T
Q  118 ttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcctt 199  Q
    ||| |||  ||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||   | ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  45058550 ttcttcttctcttctctcttcctaatacatggggtgtacaatggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcctt 45058469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 198 - 269
Target Start/End: Original strand, 29555212 - 29555283
Alignment:
Q  198 tttgatggatagtctcatttattgggtttgttctcttggtatttggacaacacgatactgttctattgtatt 269  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29555212 tttgatggatagtttcatttattgggtttgttctcttggtatttggacaacacgatacggttctattgtatt 29555283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 17 - 199
Target Start/End: Original strand, 42823113 - 42823295
Alignment:
Q  17 attatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctc 116  Q
    ||||||||||||| | ||| ||| |||  ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || ||||  |||||| |||| ||| ||| ||||||    
T  42823113 attatgatacataaacaccattatgtggtaatacaccccttgacacccacaaaaaaatttgacatgtggtcatatggaccccgcataagtatactttctc 42823212  T
Q  117 tttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcctt 199  Q
    |||| | |  ||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  42823213 tttcttattctcttctctcttcctaatacatgaggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcctt 42823295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 20 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 35965869 - 35965700
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||| | | |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||        ||| |  ||||||||| | |||||||||    
T  35965869 atgatacatatacatccttaagtgataatacatcctttgacacccacataaaaatctgacacgt--------ggatcctgcacaagcacactttctcttt 35965778  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcc 197  Q
    |||||| ||||  || ||| |||| |||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  35965777 cctctcctcttttcttttcttaattcatgaggtgtacaagggtgtatgagaataaaaggtgtctatgtaacattttcc 35965700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 20 - 175
Target Start/End: Original strand, 9563004 - 9563159
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||| | ||| |||  |||||||||| ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||| || | ||||||| |    
T  9563004 atgatacataaacaccattagatgacaatacaacctttgacatccatataaaaatctgacacgtagtcacgtggatcctgcacaaacacactttctctct 9563103  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaa 175  Q
     ||||| ||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||||  |||||||    
T  9563104 tctctcctcttctctcttcctaatgcatgagttgtacaaaggtgtatgggaataaa 9563159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 35 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 13898135 - 13897970
Alignment:
Q  35 ccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctctttcctctcatcttccct 134  Q
    ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||||| |||||||| | |||||||||| |||  ||||| ||    
T  13898135 ccttaggtggcaatacaccccttgacacccacataaaaatctgacacgtgttcatgtggacctcacacaagcacactttctctttcatcttctcttctct 13898036  T
Q  135 cttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttccttt 200  Q
    || |||| || ||||| |||| ||  |||||| ||||||||  |||||||  ||||||||| ||||    
T  13898035 ctccctagtgtatggggtgtagaaaagtgtatgagaataaatggtgtctatctaacatttttcttt 13897970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 20 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 24700049 - 24699870
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||||| | |||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||  | |||| || | |||||||||    
T  24700049 atgatacatagacatccttagttggcaatacaccttttgacacccacataaaaatctggcacgtggccacgtggaccctgtacaaacacactttctcttt 24699950  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttccttt 200  Q
    |||||| ||||| ||||||||| |  ||| | |||| || | ||||| |||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  24699949 cctctcctcttctctcttcctagtttatgaggtgtataa-gatgtatgagaataaaagatgtctatgtaacattttccttt 24699870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 20 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 27714986 - 27714888
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctctt 118  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||    
T  27714986 atgatacatagacacctttaggtggtaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcatgtggaccccgcacaagcacactttctctt 27714888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 18 - 200
Target Start/End: Original strand, 47531868 - 47532050
Alignment:
Q  18 ttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctct 117  Q
    |||||||||||||| | |||||  || ||||||||| ||| ||| ||||| || ||| |||||||| | ||  || ||| |||||||||| | |||||||    
T  47531868 ttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccttttaacatccacacaagaatctgacacgtggccatatgaaccccgcacaagcacactttctct 47531967  T
Q  118 ttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttccttt 200  Q
    || ||||| | ||| |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||  |||| || |||||||||||||||    
T  47531968 tttctctcctattctctcttcctaatgtatggaatgtacaagtgtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttccttt 47532050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 20 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 11095448 - 11095377
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgt 91  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  11095448 atgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgt 11095377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 18 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 48375803 - 48375680
Alignment:
Q  18 ttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctct 117  Q
    ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |  | | ||| | |||||| ||||  || ||||| |||||| |||||||||| |||||||||    
T  48375803 ttatgattcatagacacccttaggtgacaatacacccctgaaaatccatacaaaaatctgacgtgtggtcacatggaccccgcacaagcacattttctct 48375704  T
Q  118 ttcctctcatcttccctcttccta 141  Q
    |||||||| ||||| |||||||||    
T  48375703 ttcctctcctcttctctcttccta 48375680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 23 - 165
Target Start/End: Original strand, 39670019 - 39670161
Alignment:
Q  23 atacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctctttcct 122  Q
    ||||||||| | ||||| ||| ||||| | || |||||| | | |||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||| ||| | || |||||| ||    
T  39670019 atacatagacatccttatgtggcaatatatcccttgacatctatataaaaatttgacacgtgatcatgtggacctcgtacacgcacacttcctcttttct 39670118  T
Q  123 ctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgta 165  Q
    ||| ||||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||    
T  39670119 ctcctcttctctcttcttaatgtatgagatgtacaagggtgta 39670161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 56 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 1758515 - 1758374
Alignment:
Q  56 ttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgta 155  Q
    |||||||||||| |||||| |||||  | || ||||||||  | ||||| || |||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  1758515 ttgacacccacacaaaaatctgacatatggttacgtggactccacacaaacacattttctctttcatctcctcttctctcttcctaatgcatggg-tgta 1758417  T
Q  156 caagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttccttt 200  Q
    ||| |||||||  |||||||  |||| || |||||||||| ||||    
T  1758416 caaaggtgtat--gaataaacagtgtttatgtaacatttttcttt 1758374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 131
Target Start/End: Original strand, 11907374 - 11907487
Alignment:
Q  18 ttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctct 117  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | |  |||| |||| |||||| ||||| || ||||  |||||| |||||||||| |||||||||    
T  11907374 ttatgatacatagacacccttaggtgacaatacacacctgaacactcacacaaaaatctgacatgtggtcatatggaccccgcacaagcacattttctct 11907473  T
Q  118 ttcctctcatcttc 131  Q
    || ||||| |||||    
T  11907474 tttctctcctcttc 11907487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 45 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 36331399 - 36331278
Alignment:
Q  45 caatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctctttcctctcatcttccctcttcctaatg 144  Q
    |||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||| || | ||  |||||| |||||||| | | |||||||||| |||  ||||| |||||||||||     
T  36331399 caatgcaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcacaagtacactttctctttcttcttctcttctctcttcctaata 36331300  T
Q  145 catgggatgtacaagggtgtat 166  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  36331299 catggggtgtacaagggtgtat 36331278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 197
Target Start/End: Original strand, 35093592 - 35093767
Alignment:
Q  22 gatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctctttcc 121  Q
    |||||||||| | | ||| ||||||||||| | ||||||| ||||  |||||| ||||| || |||| ||| ||  |  ||||||| | |||||||| |     
T  35093592 gatacatagacaactttaggtgacaatacaacatttgacatccacgcaaaaatctgacatgtggtcatgtgaactccatacaagcacactttctcttgca 35093691  T
Q  122 tctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcc 197  Q
    |||  | ||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||   |||||| ||||||||||||    
T  35093692 tctttttttctctcttcctagtgcatgagatgtacaaaggtgtatgagaataaatgatgtctaggtaacattttcc 35093767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 141
Target Start/End: Original strand, 41080714 - 41080833
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||||| | ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||  |||||| ||| | || |||| ||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  41080714 atgatacatagacatcctta-gtagcaaaacaccctttgacacccacgcaaaaatctgatatgtggtcatgtggacc-cacacaagcacattttctcttt 41080811  T
Q  120 cctctcatcttccctcttccta 141  Q
    | |||| ||||| |||||||||    
T  41080812 catctcctcttctctcttccta 41080833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 94
Target Start/End: Original strand, 43745766 - 43745825
Alignment:
Q  35 ccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtgga 94  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  43745766 ccttaagtggcaatacactctttgacatccacgtaaaaatttgacacgtcatcacgtgga 43745825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 11095349 - 11095289
Alignment:
Q  133 ctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatt 193  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||| ||||    
T  11095349 ctcttcctaatgcatcgggtgtacaagggtgtatgagaataaagggtgtctatgtatcatt 11095289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 101 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 21746202 - 21746137
Alignment:
Q  101 acaagcatattttctctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtat 166  Q
    ||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||||| |||  ||| | |||||||||||||||    
T  21746202 acaagcacactttctctttcatctcatcttctctcttccaaatatatgaggtgtacaagggtgtat 21746137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 200
Target Start/End: Original strand, 43746435 - 43746524
Alignment:
Q  111 tttctctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttccttt 200  Q
    |||||||||| |||| |||||  |||||||| |||||| | ||||||||||||||| | || |||  |||| || |||||||||| ||||    
T  43746435 tttctctttcatctcctcttctttcttcctagtgcatgaggtgtacaagggtgtatgacaacaaagggtgtttatgtaacatttttcttt 43746524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 131
Target Start/End: Original strand, 45320390 - 45320486
Alignment:
Q  35 ccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctctttcctctcatcttc 131  Q
    |||||||||||||||||| | || |||| |||| |||||| ||| ||||||| | |||||| || |||||  | ||||||| |||| |||| |||||    
T  45320390 ccttaagtgacaatacactcattaacactcacacaaaaatctgatacgtagttatgtggacttcacacaaatacattttctttttcatctcctcttc 45320486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 38)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 20 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 33436195 - 33436031
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  33436195 atgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctaacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttt 33436096  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtcta 184  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  33436095 cctctcatcttctctcttcctaatgcatgaggtgtacaagggtgtatgagaataaaaggtgtcta 33436031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 20 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 10249477 - 10249304
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  10249477 atgatacatagacacccttaggtgacaatacaccttttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttt 10249378  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatt 193  Q
     ||||| ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||| ||||    
T  10249377 tctctcctcttttctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgagaataaagggtgtctatgtatcatt 10249304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 20 - 193
Target Start/End: Original strand, 13438348 - 13438521
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  13438348 atgatacatagacacccttaggtgacaatacatcctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttt 13438447  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatt 193  Q
     ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||  ||||||| ||| ||||    
T  13438448 tctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaaggatgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 13438521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 20 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 32505743 - 32505570
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| |||    
T  32505743 atgatacatagacacccttaggtgacaatacaccttttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctattt 32505644  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatt 193  Q
     ||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||| ||||    
T  32505643 tctctcctcttctctcttcttaatgcatggggtgtacaagggtgtatgagaataaagagtgtctatgtatcatt 32505570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 20 - 166
Target Start/End: Original strand, 30915468 - 30915614
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| | |||||||||    
T  30915468 atgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacccccacataaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgtacaagcacactttctcttt 30915567  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtat 166  Q
     ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  30915568 tctctcatcttctctcttcctaatacatggggtgtacaagggtgtat 30915614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 20 - 197
Target Start/End: Original strand, 20700820 - 20700997
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||    
T  20700820 atgatacatagacatccttatgtggcaatacaccctttgactcctacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcataagcacactttctcttt 20700919  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcc 197  Q
    |||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||  |||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  20700920 cctctcctcttctctcttcctagtgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtaacattttcc 20700997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 20 - 193
Target Start/End: Original strand, 28863460 - 28863633
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  28863460 atgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttt 28863559  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatt 193  Q
      |||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||  ||||||| ||| ||||    
T  28863560 tatctcctcttctctcttcctaatgcatgaggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 28863633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 20 - 175
Target Start/End: Original strand, 9058485 - 9058640
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  9058485 atgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcatgtggaccccgcacaagcacactttctcttt 9058584  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaa 175  Q
     ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||    
T  9058585 tctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagagtgtatgggaataaa 9058640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 20 - 193
Target Start/End: Original strand, 17473025 - 17473198
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| | |||||||||    
T  17473025 atgatacatagacacccttagatggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggatcccgcacaagcacactttctcttt 17473124  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatt 193  Q
     ||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||  ||||||| ||| ||||    
T  17473125 tctctcctcttctctcttcctaatgcatgaggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 17473198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 20 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 19930915 - 19930742
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| || | |||||||||    
T  19930915 atgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacatccacacaaaaatctgacacgtagtcatgtggaccccgcacaaacacactttctcttt 19930816  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatt 193  Q
     ||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||| ||||    
T  19930815 tctctcctcttctctcttcctaatgcatgaggtgtacaagggtgtatgggaataaaaggtgtctatgtatcatt 19930742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 20 - 193
Target Start/End: Original strand, 40701483 - 40701656
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| || | |||||||||    
T  40701483 atgatacatagacacccttaggtggcaatacaccttttgacacccacacaaaaatctgacacgtagttacgtggaccccgcacaatcacactttctcttt 40701582  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatt 193  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||   ||||||| ||||||| ||| ||||    
T  40701583 tctctcatcttctctcttcctaatgcatcgggtgtacaagggtgtatggaaataaaaggtgtctatgtatcatt 40701656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 20 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 7465830 - 7465657
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||    
T  7465830 atgatacatagacacccttagatggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccacacaagcacactttctcttt 7465731  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatt 193  Q
      |||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||  ||||||| ||| ||||    
T  7465730 tatctcttcttctctcttcctaatgcatgaggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 7465657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 166
Target Start/End: Original strand, 4060690 - 4060836
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||||| | |||| ||||| | ||||| |||    
T  4060690 atgatacatagacacccttaggtgacaatacaccttttgacatccacacaaaaatctgacacgtagttacgtggatcccgcataagcacactttcttttt 4060789  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtat 166  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4060790 tctctcatcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtat 4060836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 40613999 - 40613819
Alignment:
Q  18 ttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctct 117  Q
    |||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| |||||| |||||||||| | |||||||    
T  40613999 ttatgatacatagacatccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtggccacatggaccccgcacaagcacactttctct 40613900  T
Q  118 ttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcct 198  Q
    || ||||| | |||  ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  40613899 tttctctcctattctttcttcataatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtaacattttcct 40613819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 197
Target Start/End: Original strand, 36168839 - 36169018
Alignment:
Q  18 ttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctct 117  Q
    |||||||||||||| | |||||  |||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||| |||||||    
T  36168839 ttatgatacatagacatccttagatgacaatacatcctttaactcccacacaaaaatttgacacgtggccacatggaccccgcacaagcatactttctct 36168938  T
Q  118 ttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcc 197  Q
    || ||||| | ||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||  |||| || ||||||||||||    
T  36168939 tttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagagtgtatgagaataaagggtgtttatgtaacattttcc 36169018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 20 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 28381750 - 28381577
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| || |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||  |||||||||| | |||||||||    
T  28381750 atgatacatagacacccttaggtggcaatacacctttcgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacatggactccgcacaagcacactttctcttt 28381651  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatt 193  Q
     ||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||||||| |||||  |||||||  ||||||| ||| ||||    
T  28381650 tctctcatcttctctcttcctaatatatggggtgtacaaggatgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 28381577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 18 - 198
Target Start/End: Original strand, 42257196 - 42257376
Alignment:
Q  18 ttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctct 117  Q
    |||||||||||||| | | ||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||| |||||||||| | |||||||    
T  42257196 ttatgatacatagacatctttaggtggcaatacatcatttgacacccacataaaaatctgacacgtggccacatggaccccgcacaagcacactttctct 42257295  T
Q  118 ttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcct 198  Q
    || ||||| |||||  ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||||  ||||||| |||| ||||||||    
T  42257296 tttctctcctcttctttcttcctaatgtatggggtgtacaagagtgtatagaaataaagggtgtctatgtaatattttcct 42257376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 200
Target Start/End: Original strand, 38732357 - 38732539
Alignment:
Q  18 ttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctct 117  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||||| || ||||  |||||| |||||||| | | |||||||    
T  38732357 ttatgatacataaacacccttatgtgacaatacatcccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggtcatatggaccccgcacaagtacactttctct 38732456  T
Q  118 ttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttccttt 200  Q
    ||| |||  ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||   | ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  38732457 ttcttcttctcttctctcttcctaatacatgagatgtacaaggatgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttccttt 38732539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 38882908 - 38882751
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctc---gcacaagcatattttctc 116  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |   ||||||||  | ||||||    
T  38882908 atgatacatagacacccttaggtggcaata-accctttgacatccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggacccccccgcacaagcgcactttctc 38882810  T
Q  117 tttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaa 175  Q
    ||| |||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  38882809 ttttctcttatcttatctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaa 38882751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 18 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 26891601 - 26891476
Alignment:
Q  18 ttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctct 117  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||| | |||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  26891601 ttatgatacatagccacccttaggtggcaatacacccctagacacccacacaaaaatctgacatgtggtcacgtggacctcgaacaagcacattttctct 26891502  T
Q  118 ttcctctcatcttccctcttcctaat 143  Q
    |||||||  ||||| |||||||||||    
T  26891501 ttcctcttctcttctctcttcctaat 26891476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 198
Target Start/End: Original strand, 2533127 - 2533306
Alignment:
Q  18 ttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctct 117  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||| | |||| |||||||||| | ||| |||    
T  2533127 ttatgatacatagacatccttaagtggcaatacatcctttgacacc-acacaaaaatctgacacgtagccacatagaccccgcacaagcacactttttct 2533225  T
Q  118 ttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcct 198  Q
    ||  |||| ||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||  |||||||  |||| ||  ||||||||||||    
T  2533226 tttatctcctcttctctcttcccaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtatatataacattttcct 2533306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 5574583 - 5574479
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| | |||||||||    
T  5574583 atgatacatagacactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacataaaaatctgacacgtagtcacgtggatcccgcacaagcacactttctcttt 5574484  T
Q  120 cctct 124  Q
     ||||    
T  5574483 tctct 5574479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 197
Target Start/End: Original strand, 43490124 - 43490303
Alignment:
Q  18 ttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctct 117  Q
    |||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| || | ||  |||||| |||||||| | | ||| |||    
T  43490124 ttatgatacataaacacccttaggtgacaatacaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcacaagtacactttatct 43490223  T
Q  118 ttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcc 197  Q
    ||| |||  ||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  43490224 ttcttcttctcttctctcttcctaatacatagggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcc 43490303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 20 - 175
Target Start/End: Original strand, 27864709 - 27864851
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||||| | |||||||||    
T  27864709 atgatacatagacacccttatgtggcaatacaccctttgacatccacacaaaaatctgacacgtaatcacgtggaccccgcaaaagcacactttctcttt 27864808  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaa 175  Q
                 ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27864809 -------------ctcttcctaatacatgggatgtacaagggtgtatgagaataaa 27864851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 38273239 - 38273061
Alignment:
Q  18 ttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctct 117  Q
    |||||||||||||| |  ||||  || ||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||| ||||| |||| | |||||||    
T  38273239 ttatgatacatagacattcttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatctgacacgtagccacatggaccccgcactagcacactttctct 38273140  T
Q  118 ttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcc 197  Q
    || ||||| | ||| |||||||||||| ||||| ||||||| | ||||| ||||||||  |||| || |||| |||||||    
T  38273139 tttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaa-gatgtatgagaataaatggtgtttatgtaatattttcc 38273061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 32 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 2997570 - 2997402
Alignment:
Q  32 aacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctctttcctctcatcttc 131  Q
    |||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| || | ||  |||||| |||||||| | | |||||||||| |||  |||||    
T  2997570 aacccttaggtggcaatacaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcacaagtacactttctctttcttcttctcttc 2997471  T
Q  132 cctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttccttt 200  Q
     ||||||||||| |||| | |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  2997470 tctcttcctaatacatgaggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaagtgtctatgtaacatttcccttt 2997402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 18 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 17820101 - 17819961
Alignment:
Q  18 ttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctct 117  Q
    |||||||||||||| | |  || ||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| || || ||||||||| | ||||| || |||||||||    
T  17820101 ttatgatacatagacaactataggtggcaatacaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggttacgtggaccccacacaaacacattttctct 17820002  T
Q  118 ttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaa 158  Q
    ||| |||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||    
T  17820001 ttcatctcctcttctctcttcctaatgcatgaggtgtacaa 17819961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 46 - 200
Target Start/End: Original strand, 41758616 - 41758772
Alignment:
Q  46 aatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaa--gcatattttctctttcctctcatcttccctcttcctaat 143  Q
    |||| ||| ||||||||| | |||||||| |||||||||| ||| |  | |||||| ||  ||| |||||||||||  |||| ||||| |||||||||||    
T  41758616 aatataccttttgacacctatataaaaatctgacacgtagccacataaatctcgcataaacgcacattttctcttttatctcctcttctctcttcctaat 41758715  T
Q  144 gcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttccttt 200  Q
      ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  41758716 atatggggtgtacaaggatgtatgagaataaaatgtgtctatgtaacatttttcttt 41758772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 21 - 199
Target Start/End: Original strand, 3439985 - 3440163
Alignment:
Q  21 tgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctctttc 120  Q
    |||||| |||| ||||||| ||| |||||||| | | |||||||||| |||||| | ||| ||  | ||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  3439985 tgatacgtagacacccttaggtggcaatacactcctggacacccacacaaaaatctaacatgtgattacgtggaccccgcacaagcacattttctctttc 3440084  T
Q  121 ctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcctt 199  Q
    ||||| ||||| ||||| |||    || || ||||||| |||||||   ||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  3440085 ctctcctcttctctctttctagaatatagggtgtacaaaggtgtatggaaataaagggtgtctatgtaacattttcctt 3440163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 20 - 200
Target Start/End: Original strand, 33436216 - 33436386
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||||| | |||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||   || |||||| | ||||||||| | |||||||||    
T  33436216 atgatacatagacatccttagatggcaatacaccttttgacacccacataaaaatctgacacgtgaccatgtggactttgcacaagcacactttctcttt 33436315  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttccttt 200  Q
    ||| || ||||| ||||||||| | |||| |          |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  33436316 cctatcctcttctctcttcctagttcatgag----------gtgtatgagaataaaaggtgtctatgtaacattttccttt 33436386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 100 - 196
Target Start/End: Original strand, 44152012 - 44152108
Alignment:
Q  100 cacaagcatattttctctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttc 196  Q
    |||||||| | |||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||| |||| || |||||||||||    
T  44152012 cacaagcacactttctctttcatctcctcttctctcttcctaatgcatgagatatacaagggtgtatgcgaataaaaggtgtttatgtaacattttc 44152108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 45 - 198
Target Start/End: Original strand, 13365383 - 13365536
Alignment:
Q  45 caatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctctttcctctcatcttccctcttcctaatg 144  Q
    ||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||| ||   ||  |||||| |||||||| | | |||||||||| |||  ||||| |||||||||||     
T  13365383 caatataccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtgaccatatggaccccgcacaagtacactttctctttcttcttctcttctctcttcctaata 13365482  T
Q  145 catgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcct 198  Q
    |||||| |||||||||||| ||   | ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  13365483 catggggtgtacaagggtgaatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcct 13365536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Original strand, 41575142 - 41575278
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctc-gcacaagcatattttctctt 118  Q
    |||||||||||| | |||||  ||  ||||||||||||||||  |||| |||||||||||| || |||| ||||||| |  |||||||| | ||||||||    
T  41575142 atgatacatagacatccttagatggtaatacaccctttgacattcacacaaaaatttgacatgtggtcatgtggacccctacacaagcacactttctctt 41575241  T
Q  119 tcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgta 155  Q
    || |||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  41575242 tcatctcctcttctctcgtcctaatgcatgagatgta 41575278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 45097832 - 45097684
Alignment:
Q  18 ttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctct 117  Q
    |||||||||||| | | ||||| ||| ||||||| || |||||||||| | |||||| ||||| || | ||  |||||| |||||||| | | |||||||    
T  45097832 ttatgatacataaacatccttaggtggcaatacatcccttgacacccatacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcacaagtacactttctct 45097733  T
Q  118 ttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtat 166  Q
    ||| |||  ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  45097732 ttcttcttctcttctctcttcctaatacatcggatgtacaagagtgtat 45097684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 58 - 197
Target Start/End: Original strand, 3737986 - 3738125
Alignment:
Q  58 gacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtaca 157  Q
    |||||||||| |||||| ||||| || |||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||  ||||||||    || || ||||||    
T  3737986 gacacccacacaaaaatctgacatgtggtcatgtggaccccgcacaagcacattttctttttcctctcctcttctttcttcctagaatatagggtgtaca 3738085  T
Q  158 agggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcc 197  Q
    | ||||||| | |||| |  ||||||| ||||||||||||    
T  3738086 aaggtgtatgaaaatatagggtgtctatgtaacattttcc 3738125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 101 - 198
Target Start/End: Original strand, 17823874 - 17823971
Alignment:
Q  101 acaagcatattttctctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcct 198  Q
    ||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||||| |||  ||||| |||||||||||||||   ||||||   |||||| |||||||||||||    
T  17823874 acaagcacactttctctttcatctcatcttctctcttccaaatatatggggtgtacaagggtgtatgtaaataaaggatgtctatgtaacattttcct 17823971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 69 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 3035029 - 3034901
Alignment:
Q  69 aaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataa 168  Q
    |||||| ||||| || ||||  |||||| |||||||| ||| |||||||||| |||  ||||| ||||||||||| |||| | ||||| | |||||||      
T  3035029 aaaaatctgacatgtggtcatatggaccccgcacaagtatactttctctttcttcttctcttctctcttcctaatacatgaggtgtaccaaggtgtatgc 3034930  T
Q  169 gaataaaatgtgtctacgtaacattttcc 197  Q
     | ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  3034929 aattaaaaggtgtctatgtaacattttcc 3034901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 109 - 184
Target Start/End: Original strand, 2329352 - 2329431
Alignment:
Q  109 attttctctttcctctcatcttccctcttcc---ta-atgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtcta 184  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||   || ||  |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  2329352 attttctctttcctctcctcttctctcttcccgatagatatatgggatgtacaagggtgaataagaataaaaagtgtcta 2329431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 106; Significance: 6e-53; HSPs: 34)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 20 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 9474971 - 9474798
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || | |||||||||    
T  9474971 atgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacactttctcttt 9474872  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatt 193  Q
     ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||| ||||    
T  9474871 tctctcctcttctctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtatgagaataaagagtgtctatgtatcatt 9474798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 20 - 175
Target Start/End: Original strand, 2581920 - 2582075
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| |||    
T  2581920 atgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttcttttt 2582019  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaa 175  Q
     ||||| ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||||    
T  2582020 tctctcctcttctctcttcctaatacatgaggtgtacaagggtgtattagaataaa 2582075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 18 - 197
Target Start/End: Original strand, 32813250 - 32813429
Alignment:
Q  18 ttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctct 117  Q
    |||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||| | |||||||    
T  32813250 ttatgatacatagacatccttaggtggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatctgacacgtggtcacatggaccccgcacaagcacactttctct 32813349  T
Q  118 ttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcc 197  Q
    || ||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  32813350 tttctctcctcttctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtaacattttcc 32813429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 20 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 27564830 - 27564657
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||||| | ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  27564830 atgatacatagacatccttaggtggcaatacaccttttgacacccacacaaaaatctgacacgtaatcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttt 27564731  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatt 193  Q
     ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||  ||||||| ||| ||||    
T  27564730 tctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 27564657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 20 - 193
Target Start/End: Original strand, 41758810 - 41758983
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| || | |||||||||    
T  41758810 atgatacatagacaccattaaatggcaatacaccctttgacaaccacacaaaaatctgacacgtagtcacatggaccccgcacaaacacactttctcttt 41758909  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatt 193  Q
     ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||| ||||    
T  41758910 tctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgagaataaagggtgtctatgtatcatt 41758983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 20 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 51898778 - 51898601
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||||| | | ||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| | ||||| |||    
T  51898778 atgatacatagacatctttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggatcccgcacaagcacactttctattt 51898679  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcc 197  Q
    |||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||  |||| || ||||||||||||    
T  51898678 cctctcctcttctctcttcctagtgcatggggtgtacaagggtgtatagaaataaagggtgtttatgtaacattttcc 51898601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 20 - 184
Target Start/End: Original strand, 50630463 - 50630627
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  50630463 atgatacatagatacccttaggtggcaatacatcctttgttacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttt 50630562  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtcta 184  Q
     ||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||  |||||||    
T  50630563 tctctcctcttctctcttcctaatgcatagggtgtacaagggtgtatgagaataaatggtgtcta 50630627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 20 - 166
Target Start/End: Original strand, 3000324 - 3000470
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| | |||||||||    
T  3000324 atgatacataaacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgtacaagcacactttctcttt 3000423  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtat 166  Q
     ||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  3000424 tctctcatcttctctcttcctaatatatggggtgtacaagggtgtat 3000470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 20 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 48716377 - 48716204
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| |||||    
T  48716377 atgatacatagacacccttaggtggcaatacaccatttgacatccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttatcttt 48716278  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatt 193  Q
     || || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||  ||||||| ||| ||||    
T  48716277 tctttcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 48716204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 20 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 38632416 - 38632261
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| |||||    
T  38632416 atgatacatagacacccttaggtggcaatacaccttttaacatccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttttcttt 38632317  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaa 175  Q
     ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  38632316 tctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaa 38632261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 166
Target Start/End: Original strand, 38595159 - 38595305
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||| | ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| | |||||||||    
T  38595159 atgatacataaacacctttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgtacaagcacactttctcttt 38595258  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtat 166  Q
     ||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  38595259 tctctcatcttctctcttcctaatatatggggtgtacaagggtgtat 38595305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 20 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 47452415 - 47452242
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| | |||||||||| | |||||||||    
T  47452415 atgatacatagacacccttaggtggtaatacaccctttgacacccacacaaaaatctaacacgtagtcacgtggatcccgcacaagcacactttctcttt 47452316  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatt 193  Q
     ||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||  |||||||  ||||||| ||| ||||    
T  47452315 tctctcctcttctctcttcctattgcatggggtgtacaaggatgtatgggaataaagagtgtctatgtatcatt 47452242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 175
Target Start/End: Original strand, 43137 - 43292
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||||| |  |||| | ||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||    
T  43137 atgatacatagacagtcttaggagacaatacatcctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggactccgcacaagcacactttctcttt 43236  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaa 175  Q
     ||||| || || ||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  43237 tctctcctcctctctctttctaatgcatggggtgtacaagagtgtataagaataaa 43292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 45044657 - 45044475
Alignment:
Q  18 ttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctct 117  Q
    |||||||||||| |   ||||| ||| ||||||||| ||||||||||| | |||||| ||||| |||| ||| |||||| ||||||| || |||||||||    
T  45044657 ttatgatacatacatttccttaggtggcaatacaccatttgacacccatacaaaaatctgacatgtagccacatggaccccgcacaaacacattttctct 45044558  T
Q  118 ttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttccttt 200  Q
    || ||||  ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  45044557 tttctcttctcttctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgagaataaatgatgtctacgtaacattttccttt 45044475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 5959097 - 5958916
Alignment:
Q  18 ttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctct 117  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||| ||||| || ||||  |||||| |||||||| | | |||||||    
T  5959097 ttatgatacataaacacccttaagtggcaatacacctcttgacacccacacaaaaatctgacatgtggtcatatggaccccgcacaagtacactttctct 5958998  T
Q  118 ttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcctt 199  Q
    ||| |||  ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||   | ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5958997 ttcttcttctcttctctcttcctaatacatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaatgtgtctatgtaacattttcctt 5958916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 41 - 164
Target Start/End: Original strand, 13414787 - 13414910
Alignment:
Q  41 gtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctctttcctctcatcttccctcttcct 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  13414787 gtgacaatacaccctttgacacccacacaaaaatctaacacgtagtcacgtggaccccacacaagcacattttctcttttctatcatcttctctcttcct 13414886  T
Q  141 aatgcatgggatgtacaagggtgt 164  Q
    |||||||||  ||||| |||||||    
T  13414887 aatgcatggagtgtactagggtgt 13414910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 193
Target Start/End: Original strand, 37649203 - 37649376
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||||| | | ||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |   |||||||||| | |||| ||||    
T  37649203 atgatacatagacatctttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacgtggtcacgtgaattccgcacaagcacactttcccttt 37649302  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatt 193  Q
     ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||  ||||||| ||| ||||    
T  37649303 tctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 37649376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 49811624 - 49811447
Alignment:
Q  18 ttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctct 117  Q
    |||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||  | |||  |||||||||| | |||||||    
T  49811624 ttatgatagatagacatccttaggtgacaatacaccatttgacatccacacaaaaatctgacacgtagccatatagactccgcacaagcacactttctct 49811525  T
Q  118 ttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatttt 195  Q
    || ||||| ||||| |||||||||||| ||| | || |||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  49811524 tttctctcctcttctctcttcctaatgtatgtggtgcacaagggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatttt 49811447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 8346483 - 8346327
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||||  ||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||    
T  8346483 atgatacatagtcacctttaggtggcaatacaccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccctgcacaagcacactttctcttt 8346384  T
Q  120 cctctcatc-ttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaa 175  Q
     ||||| || ||  |||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||    
T  8346383 tctctcctctttttctcttcctaatgcatggagtgtacaaaggtgtatgagaataaa 8346327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 44548471 - 44548343
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||||| | | ||| ||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  44548471 atgatacatagacatctttaggtggcaatacaccatttgatacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttt 44548372  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatg 148  Q
     ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  44548371 tctctcttcttctctcttcctaatgcatg 44548343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 18 - 197
Target Start/End: Original strand, 44453982 - 44454165
Alignment:
Q  18 ttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctct 117  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |  |||| ||||||| |||||| ||||| || || ||||||| | | |||||||| | ||| |||    
T  44453982 ttatgatacatagacacctttaagtggcaatacatctcttgatacccacacaaaaatctgacatgtggttacgtggatcccacacaagcacactttttct 44454081  T
Q  118 ttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggat----gtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcc 197  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |    ||| |||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||    
T  44454082 ttcctctcatcttctctcttcctaatgcatggggtcagagtataagggtgtataagaataaatggtgtttatgtaacattttcc 44454165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 35 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 11152458 - 11152293
Alignment:
Q  35 ccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctctttcctctcatcttccct 134  Q
    ||||| ||| |||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||| || |||| ||||||||||   ||||| ||||||||| ||||| ||    
T  11152458 ccttaggtggcaatacacccttcgacatccacacaaaaatctgacacgtagtcatgtagaccccgcacaagcacgctttctttttcctctcctcttctct 11152359  T
Q  135 cttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttccttt 200  Q
    ||||| | |||||||| |||| |||| ||||| ||||||||  |||||||  ||||||||||||||    
T  11152358 cttcccagtgcatggggtgtagaaggatgtatgagaataaatggtgtctatataacattttccttt 11152293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 50591097 - 50590918
Alignment:
Q  18 ttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctct 117  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| || | ||  |||||| |||||||| | | |||||||    
T  50591097 ttatgatacataaacacccttaggtggcaatacaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcacaagtacactttctct 50590998  T
Q  118 ttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcc 197  Q
    ||| |||  ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||   | ||||| || |||| ||||||||||||    
T  50590997 ttcttcttctcttctctcttcctaatacatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtatctatgtaacattttcc 50590918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 199
Target Start/End: Original strand, 47748446 - 47748626
Alignment:
Q  18 ttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctct 117  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || | ||  |||| | |||||||| ||| |||||||    
T  47748446 ttatgatacataaatacccttaggtggcaatacaccctt-gacacccatataaaaatctgacatgtggccatatggatcccgcacaagtatactttctct 47748544  T
Q  118 ttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcctt 199  Q
    ||| |||  ||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||   | ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  47748545 ttcttcttctcttctctcttcctaatacatggggtgtacaagagtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcctt 47748626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 20 - 193
Target Start/End: Original strand, 26274437 - 26274607
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| ||||||| | ||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||| |  ||||||| | | ||| |||||    
T  26274437 atgatacatagacacccttatgtggcaatacatcatttgacatccacagaaaaatctgacacatagtcacgtggatcctgcacaagtacactttttcttt 26274536  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatt 193  Q
     |||   ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||  ||||||| ||| ||||    
T  26274537 tctc---tcttctctcttcctaatgcatgagatgcacaagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 26274607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 18 - 175
Target Start/End: Original strand, 7740736 - 7740893
Alignment:
Q  18 ttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctct 117  Q
    ||||||||||| || | ||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||| |||||||| |  | ||||||| | |||||  ||||||||| |    
T  7740736 ttatgatacattgacaaccttatgtgacaatacatccattgacacctacataaaaatatgacacgtggctatgtggaccccacacaaatatattttcttt 7740835  T
Q  118 ttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaa 175  Q
    ||| |||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||| | ||||  ||||||||    
T  7740836 ttcatctcctcttctctcttcctgttgcatgggatgtacaaagatgtacgagaataaa 7740893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 20 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 23597186 - 23597011
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||||| | | ||| ||| |||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||| |||||| || | ||| |||||    
T  23597186 atgatacatagacatcattaggtggcaatacactctttgatacccacataaaaatctgacacgtggccacgttgaccttgcacaaacacactttatcttt 23597087  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatttt 195  Q
     ||||| | ||| || |||||| | |||| | ||| ||||| ||||| |||||||||  |||||| ||||||||||    
T  23597086 tctctcctattctctattcctagttcatgaggtgtccaaggatgtatgagaataaaaaatgtctatgtaacatttt 23597011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 18 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 37926535 - 37926356
Alignment:
Q  18 ttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctct 117  Q
    |||||||||||||| | | ||| ||| ||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||| | ||| |||| | || ||||| | | |||||||    
T  37926535 ttatgatacatagatatctttaggtggcaatacatcttttaacacccacataaaaatctgacacgtggccacatggatcccgtacaagtacactttctct 37926436  T
Q  118 ttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcc 197  Q
    || ||||  ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||  |||||||  |||||||  ||| |||||||    
T  37926435 tttctcttctcttctctcttcctaatgtatggggtgtacaaggatgtatgtgaataaatggtgtctatataatattttcc 37926356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 18 - 197
Target Start/End: Original strand, 6260873 - 6261052
Alignment:
Q  18 ttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctct 117  Q
    |||||||| ||||| | ||||| |||  ||||||||| |  |||||||||||||||| | ||| || |||||||||||| |||| ||||| ||||||| |    
T  6260873 ttatgatagatagatatccttaggtggtaatacacccctgaacacccacataaaaatctaacatgtggtcacgtggaccccgcataagcacattttctat 6260972  T
Q  118 ttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcc 197  Q
    ||| |||| ||||| ||||| ||| |  || || ||||||| ||||||| | ||||||  |||| || ||||||||||||    
T  6260973 ttcttctcctcttctctctttctagtatatagggtgtacaaaggtgtatgaaaataaatggtgtgtatgtaacattttcc 6261052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 18 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 41608590 - 41608411
Alignment:
Q  18 ttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctct 117  Q
    |||||||||||| | | ||||| ||| |||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||| || | ||  |||||| || ||||| | | |||||||    
T  41608590 ttatgatacataaacatccttaggtggcaatacaccccttgacactcacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgtacaagtacactttctct 41608491  T
Q  118 ttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcc 197  Q
    ||| |||  ||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||   | ||||| |||| || ||||||||||||    
T  41608490 ttcttcttctcttctctcttcctaatacatagggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtttatgtaacattttcc 41608411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 56 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 44332430 - 44332289
Alignment:
Q  56 ttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgta 155  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || | |   |||||| |||||||| ||| |||||||||| |||  ||||| ||||||||||| ||| |  ||||    
T  44332430 ttgacacccacataaaaatctgacatgtggccctatggaccccgcacaagtatactttctctttcttcttctcttctctcttcctaatacatagagtgta 44332331  T
Q  156 caagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcc 197  Q
    |||||||||||   | ||||| || |||| ||||||||||||    
T  44332330 caagggtgtatgcaattaaaaggtatctatgtaacattttcc 44332289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 20 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 3302628 - 3302482
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||| | | ||||| ||||||||| |  | | |||||||||| |||||| ||||||||| |||  |||||| |  ||||||| | ||||| |||    
T  3302628 atgatacatatacatccttaggtgacaatatattcctggacacccacacaaaaatctgacacgtaatcatatggaccccatacaagcacactttcttttt 3302529  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtat 166  Q
    | |||||||||| ||||||| |||  || || |||||||||||||||    
T  3302528 catctcatcttctctcttccaaatatatagggtgtacaagggtgtat 3302482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 42 - 199
Target Start/End: Original strand, 26440761 - 26440908
Alignment:
Q  42 tgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctctttcctctcatcttccctcttccta 141  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| | ||| |||| | |||| ||||| | ||||||||          ||| |||||| ||    
T  26440761 tgacaatacaccctttaacacccacacaaaaatctgacacgtggccacatggatcccgcataagcacactttctctt----------ttctctcttcgta 26440850  T
Q  142 atgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcctt 199  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||   ||| || ||||||||||||||    
T  26440851 atgtatggaatgtacaagggtgtataggaataaaggatgtttatgtaacattttcctt 26440908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 87 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 34340075 - 34339968
Alignment:
Q  87 cacgtggacctcgcacaagcatattttctctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacg 186  Q
    ||||||||||||| | ||||| | ||||| ||| ||||  ||||| ||||||| | ||||| || |||||||| |||| | | ||||||| ||||||| |    
T  34340075 cacgtggacctcgtataagcacagtttcttttttctcttctcttctctcttccaagtgcatagggtgtacaagagtgt-tgaaaataaaaggtgtctatg 34339977  T
Q  187 taacatttt 195  Q
    |||||||||    
T  34339976 taacatttt 34339968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0110 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0110
Description:

Target: scaffold0110; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 18 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 8960 - 8779
Alignment:
Q  18 ttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctct 117  Q
    |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||  ||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| | |||||||||    
T  8960 ttatgatatatagacatccttaagtgacaatacactatttgacatctacacaaaaatttgacacatagtcacgtggaccccacacaagtacattttctct 8861  T
Q  118 ttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcctt 199  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  8860 ttcctcccatcttctctcttcctaatatatggggtgtacaagggtgtataagaataaaaggtgtctatgtaacattttcctt 8779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 36)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 20 - 193
Target Start/End: Original strand, 6034049 - 6034222
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| | |||||||||| | |||||||||    
T  6034049 atgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacatgtagtcacgtggatcccgcacaagcacactttctcttt 6034148  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatt 193  Q
     ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  6034149 tctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgagaataaaaggtgtctatgtatcatt 6034222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 20 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 48183144 - 48182971
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  48183144 atgatacatagacacccttacgtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttt 48183045  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatt 193  Q
     ||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||| ||||    
T  48183044 tctctcctcttctctcttcttaatgcatggggtgtacaagggtgtatgagaataaagggtgtctatgtatcatt 48182971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 18 - 199
Target Start/End: Original strand, 31910195 - 31910376
Alignment:
Q  18 ttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctct 117  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||| ||| |||||| |||||||||| | |||||||    
T  31910195 ttatgatacatagacatccttaggtgacaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagccacatggaccccgcacaagcacactttctct 31910294  T
Q  118 ttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcctt 199  Q
    || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  31910295 tttctctcatcttctctcttcctaatgtatgggatgtacaagagtgtatgggaataaatggtgtctatgtaacattttcctt 31910376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 20 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 480542 - 480396
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| | |||||||||    
T  480542 atgatacatagacacccttaggtgacaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgtacaagcacactttctcttt 480443  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtat 166  Q
     ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  480442 tctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaaaggtgtat 480396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 20 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 50052523 - 50052345
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  50052523 atgatacatagacatccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttt 50052424  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcct 198  Q
    |||||| ||||| ||||||||| |||||  | ||||||| |||||||  |||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  50052423 cctctcctcttctctcttcctagtgcataaggtgtacaaaggtgtatgggaataaagggtgtctatgtaacattttcct 50052345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 20 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 24995202 - 24995029
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||| || || |||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  24995202 atgatatatggacacccttagatggcaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacattttctcttt 24995103  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatt 193  Q
     ||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||  ||||||| ||| ||||    
T  24995102 tctctcctcttctctcttcttaatgcatggggtgtacaatggtgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 24995029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 20 - 193
Target Start/End: Original strand, 41236352 - 41236525
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  41236352 atgatacatagacacccttaggtggcaatacaccttttgacatccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttt 41236451  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatt 193  Q
     ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||  ||||||| ||| ||||    
T  41236452 tctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 41236525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 20 - 200
Target Start/End: Original strand, 29239891 - 29240071
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||    
T  29239891 atgatacatagacacccttaggtggcaatacaccatttgacatccacacaaaaatctaacacgtagtcacgtggaccccacacaagcacactttctcttt 29239990  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttccttt 200  Q
    |||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||  |||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  29239991 cctctcctcttctctcttcctagtgcatggggtgtacaagagtgtatgggaataaagggtgtctatgtaacattttccttt 29240071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 20 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 11511557 - 11511411
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  11511557 atgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacataaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttt 11511458  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtat 166  Q
     ||||  ||||| |||||| ||||||||| | |||||||||||||||    
T  11511457 tctcttctcttctctcttcttaatgcatgaggtgtacaagggtgtat 11511411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 20 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 42044462 - 42044316
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  42044462 atgatacatagacacccttaggtggcaatacatccttgtacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttt 42044363  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtat 166  Q
     ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42044362 tctctcctcttctctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtat 42044316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 20 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 54473628 - 54473473
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| |||||    
T  54473628 atgatacatagacacccttaggtgacaatacaccatttgacacccacacaaaaatctaacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttatcttt 54473529  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaa 175  Q
     ||||| ||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||  |||||||    
T  54473528 tctctcctcttctctcttcctaatacatggagtgtacaagggtgtatgggaataaa 54473473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 50526266 - 50526088
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||||| | | ||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||   ||||||||||   ||||| |||    
T  50526266 atgatacatagacatctttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtggtcacgtggattccgcacaagcacgctttctattt 50526167  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcct 198  Q
    |||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||  |||| || |||||||||||||    
T  50526166 cctctcctcttctctcttcctagtgcatggggtgtacaagggtgtatagaaataaagggtgtttatgtaacattttcct 50526088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 53 - 197
Target Start/End: Original strand, 41823920 - 41824064
Alignment:
Q  53 cctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggat 152  Q
    ||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| | ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| | |    
T  41823920 cctttaacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacatggaccccgcacaagcacactttctcttttctctcttcttctctcttcctaatgcatgaggt 41824019  T
Q  153 gtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcc 197  Q
    |||||| ||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  41824020 gtacaaaggtgtatgagaataaatggtgtctatgtaacattttcc 41824064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 29234340 - 29234205
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||| |||  || |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  29234340 atgatacatagacacccttagatggcaatacaccctttgataccttcacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttt 29234241  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgta 155  Q
     ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  29234240 tctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgta 29234205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 195
Target Start/End: Original strand, 40574782 - 40574959
Alignment:
Q  18 ttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctct 117  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |  || |||| | || ||||||| | |||||||    
T  40574782 ttatgatacatagacatccttaggtggtaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgctgctacatggatcccgaacaagcacactttctct 40574881  T
Q  118 ttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatttt 195  Q
    || ||||| ||||| |||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||    
T  40574882 tttctctcctcttctctcttcctaatatatggggtgtacaagggtgtatgagaataaaaggtgtctatctaacatttt 40574959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 18 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 19670813 - 19670631
Alignment:
Q  18 ttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctct 117  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||| || | ||  |||||| |||||||| | | |||||||    
T  19670813 ttatgatacataaacacccttaggtggcaatacaccccttgacactcacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcacaagtacactttctct 19670714  T
Q  118 ttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttccttt 200  Q
    ||| |||  ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  19670713 ttcttcttctcttctctcttcctaatacatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttccttt 19670631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 18 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 48647823 - 48647645
Alignment:
Q  18 ttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctct 117  Q
    |||||| ||||| | | ||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||  |||||||||| | |||||||    
T  48647823 ttatgacacataaacatccttaggtaacaatacacctcttaacacccacataaaaatctaacacgtggtcacgtggactccgcacaagcacaatttctct 48647724  T
Q  118 ttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttc 196  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||| | ||||||| ||||||   |||||| |||||||||||    
T  48647723 ttcctctcctcttctctcttcctagtgcatagaatgtacaaagatgtataaaaataaatgatgtctatgtaacattttc 48647645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 199
Target Start/End: Original strand, 3481659 - 3481828
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||||| ||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | |||||||| | |||||||||    
T  3481659 atgatacatagacacctttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccacacaagcacactttctcttt 3481758  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcctt 199  Q
    |||| ||||||| ||||| ||| |||||          ||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  3481759 cctcccatcttctctctttctagtgcat----------agggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttcctt 3481828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 175
Target Start/End: Original strand, 23608240 - 23608395
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||| ||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||  | |||||||| | |||||||||    
T  23608240 atgatatatagacacccttagatgacaatacaccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtgaactccacacaagcacactttctcttt 23608339  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaa 175  Q
      |||| ||||| |||||||||||||||| | |||||| || |||||  |||||||    
T  23608340 tatctcctcttctctcttcctaatgcatgaggtgtacagggatgtatgggaataaa 23608395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 50813989 - 50813810
Alignment:
Q  18 ttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctct 117  Q
    |||||||||||| | || |||| |||  ||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| || ||||  || ||| |||||||| | | |||||||    
T  50813989 ttatgatacataaacactcttaggtggtaatacaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggtcatatgaaccccgcacaagtacactttctct 50813890  T
Q  118 ttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcc 197  Q
    ||| |||  ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  50813889 ttcttcttctcttctctcttcctaatacatgagatgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcc 50813810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 197
Target Start/End: Original strand, 55475194 - 55475373
Alignment:
Q  18 ttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctct 117  Q
    |||||||||||| | | ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || | ||  ||||||  ||| ||| | | |||||||    
T  55475194 ttatgatacataaacatccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccctgcataagtacactttctct 55475293  T
Q  118 ttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcc 197  Q
    ||| |||  ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  55475294 ttcttcttctcttctctcttcctaatacatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcc 55475373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 200
Target Start/End: Original strand, 47986211 - 47986392
Alignment:
Q  18 ttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctct 117  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||| || |||||| ||||| |||||| ||||| || | ||  |||||| |||||||| | | |||||||    
T  47986211 ttatgatacataaacacccttaggtggcaatacatcccttgacatccacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcacaagtacactttctct 47986310  T
Q  118 ttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttccttt 200  Q
    ||| | |  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  47986311 ttcttattctcttctctcttcctaatacatgggatgtacaagggtgtat-gcaattaaaggtgtctatgtaacattttccttt 47986392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 32 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 17983826 - 17983658
Alignment:
Q  32 aacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctctttcctctcatcttc 131  Q
    |||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| || | ||  |||||| |||||||| | | |||||||||| |||  |||||    
T  17983826 aacccttaggtggcaatacaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcacaagtacactttctctttcttcttctcttc 17983727  T
Q  132 cctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttccttt 200  Q
     ||||||||||| |||| | |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  17983726 tctcttcctaatacatgaggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaagtgtctatgtaacatttcccttt 17983658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 53352661 - 53352540
Alignment:
Q  19 tatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctctt 118  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||  |||| ||||| ||| |||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  53352661 tatgatacatagacacccttaggtg-caatacattctttaacacctacacaaaaatctgacacgtagttaagtggaccccgcacaagcatactttctctt 53352563  T
Q  119 tcctctcatcttccctcttccta 141  Q
    | ||||| ||||| |||||||||    
T  53352562 ttctctcctcttctctcttccta 53352540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 20 - 195
Target Start/End: Original strand, 29977890 - 29978065
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||| | | || || ||| |||||||||| || ||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||| | |||||||| | |||||||||    
T  29977890 atgatacatacagaaccataggtggcaatacaccccttaacacccacacaaaaatctgacacgtagtcatatggaccccacacaagcacactttctcttt 29977989  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatttt 195  Q
    | |||  ||||  ||||  |||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||    
T  29977990 catcttctcttttctctcactaatgtatggggtgtacaagtgtgtataggaataaaagatatctatgtaacatttt 29978065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 18 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 28480365 - 28480184
Alignment:
Q  18 ttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctct 117  Q
    |||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||   || |||| |||| |||||| ||||| ||||||| ||||||| | ||||| || | ||||||     
T  28480365 ttataatacatagacaaccttaggtgacaatacacttcttaacactcacacaaaaatctgacatgtagtcatgtggaccccacacaaacacactttctcc 28480266  T
Q  118 ttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcctt 199  Q
    ||| |||| ||||| ||||||||| |||||| | ||||||||| |||||    |||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  28480265 ttcatctcctcttctctcttcctagtgcatgagttgtacaaggatgtattcttataaagggtgtctatgtaacattttcctt 28480184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 18 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 28481240 - 28481059
Alignment:
Q  18 ttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctct 117  Q
    |||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||   || |||| |||| |||||| ||||| ||||||| ||||||| | ||||| || | ||||||     
T  28481240 ttataatacatagacaaccttaggtgacaatacacttcttaacactcacacaaaaatctgacatgtagtcatgtggaccccacacaaacacactttctcc 28481141  T
Q  118 ttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcctt 199  Q
    ||| |||| ||||| ||||||||| |||||| | ||||||||| |||||    |||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  28481140 ttcatctcctcttctctcttcctagtgcatgagttgtacaaggatgtattcttataaagggtgtctatgtaacattttcctt 28481059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 18 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 28482115 - 28481934
Alignment:
Q  18 ttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctct 117  Q
    |||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||   || |||| |||| |||||| ||||| ||||||| ||||||| | ||||| || | ||||||     
T  28482115 ttataatacatagacaaccttaggtgacaatacacttcttaacactcacacaaaaatctgacatgtagtcatgtggaccccacacaaacacactttctcc 28482016  T
Q  118 ttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcctt 199  Q
    ||| |||| ||||| ||||||||| |||||| | ||||||||| |||||    |||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  28482015 ttcatctcctcttctctcttcctagtgcatgagttgtacaaggatgtattcttataaagggtgtctatgtaacattttcctt 28481934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 18 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 29548056 - 29547876
Alignment:
Q  18 ttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctct 117  Q
    |||||||||||| | | ||||| ||| ||||||| || |||||||||||| |||||| ||||| || | ||  |||| | |||| ||| | | ||| |||    
T  29548056 ttatgatacataaacatccttaggtggcaatacatcccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggccatatggatcccgcataagtacactttttct 29547957  T
Q  118 ttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcct 198  Q
    ||| |||  ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  29547956 ttcttcttctcttctctcttcctaatacatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcct 29547876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 42 - 194
Target Start/End: Original strand, 47104571 - 47104723
Alignment:
Q  42 tgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctctttcctctcatcttccctcttccta 141  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| ||    | |||| | ||||| || | |||||||||| |||| ||||| |||||| ||    
T  47104571 tgacaatacactctctgacacccacacaaaaatttgacacgtggttttattgaccccacacaaacacactttctctttcatctcctcttctctcttctta 47104670  T
Q  142 atgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattt 194  Q
    ||||||| | ||||| ||  ||||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  47104671 atgcatgaggtgtactagaatgtacgagaataaaaagtgtctacgtaacattt 47104723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 198
Target Start/End: Original strand, 32766961 - 32767141
Alignment:
Q  18 ttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctct 117  Q
    |||||||||||| | || |||| ||| |||||||||| |||||||||| | |||||| ||||| || | ||  ||||||  ||||||| | | |||||||    
T  32766961 ttatgatacataaacactcttaggtggcaatacaccccttgacacccatacaaaaatctgacatgtggccatatggaccctgcacaagtacactttctct 32767060  T
Q  118 ttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcct 198  Q
    ||| |||  || || ||||| ||||| ||| |  |||||||||||||||   | ||||||||||||| |||||||||||||    
T  32767061 ttcttcttctcctctctctttctaatacatagagtgtacaagggtgtatgcaattaaaatgtgtctatgtaacattttcct 32767141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 8343260 - 8343129
Alignment:
Q  18 ttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctct 117  Q
    |||||||||||| | | ||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| || | ||  |||||| |||| ||| ||| |||||||    
T  8343260 ttatgatacataaacatccttaggtggcaatacatcctttgacacctacataaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcataagtatactttctct 8343161  T
Q  118 ttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgg 149  Q
    ||| |||  ||||| ||||||||||| |||||    
T  8343160 ttcttcttctcttctctcttcctaatacatgg 8343129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 18 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 18924592 - 18924407
Alignment:
Q  18 ttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctct 117  Q
    ||||||| |||| | ||||||| ||| |||||||||| |||| | ||||| |||||| ||||| || |  |  || ||  |||||||| | | |||||||    
T  18924592 ttatgatccataaatacccttaggtggcaatacaccccttgatatccacacaaaaatctgacatgtggcaatatgaactccgcacaagtacactttctct 18924493  T
Q  118 ttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcctttgat 203  Q
    ||| |||  ||||| ||||||||||| |||| | |||| ||||||||||   | ||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  18924492 ttcttcttctcttctctcttcctaatacatgaggtgtaaaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcctttgat 18924407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 45 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 29589810 - 29589655
Alignment:
Q  45 caatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctctttcctctcatcttccctcttcctaatg 144  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||| ||| | || | ||  |||||| | |||||| | | |||||||||| |||  ||||| |||||||||||     
T  29589810 caatacaccccttgacacccacacaaaaatctgatatgtggccatatggaccccacacaagtacactttctctttcttcttctcttctctcttcctaata 29589711  T
Q  145 catgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttccttt 200  Q
    |||| | |||||||| ||||||   | ||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  29589710 catgaggtgtacaagagtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaatattttccttt 29589655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 56300169 - 56300086
Alignment:
Q  111 tttctctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattt 194  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||  ||||| ||||||||   ||||||||||||||||    
T  56300169 tttctctttcctctcctcttctctctttctaatgtatgagatgtacaagattgtatgagaataaagaatgtctacgtaacattt 56300086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 18 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 44536842 - 44536663
Alignment:
Q  18 ttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctct 117  Q
    |||||||||||| | ||  ||| ||| |||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||| || ||||  | |||| | || ||| | | |||||||    
T  44536842 ttatgatacataaacacttttaggtggcaatacaccctt-gacatccacacaaaaatctgacatgtggtcatatagaccccacataagtacactttctct 44536744  T
Q  118 ttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcct 198  Q
    ||| |||  ||||| ||||||||||| ||| || ||||||||  |||||   | ||||||||||||| |||||||||||||    
T  44536743 ttcttcttctcttctctcttcctaatacatagggtgtacaagaatgtatgcaattaaaatgtgtctatgtaacattttcct 44536663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 99; Significance: 9e-49; HSPs: 40)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 20 - 166
Target Start/End: Original strand, 38267045 - 38267191
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  38267045 atgatacatagacacccttatgtgacaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttt 38267144  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtat 166  Q
     ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  38267145 tctctcctcttctctcttcctaatgcatgggatgtacgaaggtgtat 38267191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 20 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 8080478 - 8080305
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  8080478 atgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacctacataaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttt 8080379  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatt 193  Q
     ||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||  |||||||  ||||||| ||| ||||    
T  8080378 tctctcctcttctctcttcctattgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 8080305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 18 - 198
Target Start/End: Original strand, 21234404 - 21234584
Alignment:
Q  18 ttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctct 117  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| || ||| |||||||||| |||||||||    
T  21234404 ttatgatacatagacatccttaggtgacaatacaccctttgacactcacacaaaaatttgacacgtagccacatgtaccccgcacaagcacattttctct 21234503  T
Q  118 ttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcct 198  Q
    | |||||| | | | |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  21234504 tacctctcctttcctctcttcctaatgtatggggtgtacaatggtgtatgagaataaaaggtgtctatgtaacattttcct 21234584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 20 - 171
Target Start/End: Original strand, 35137538 - 35137689
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| || | |||||||||    
T  35137538 atgataaatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctaacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacactttctcttt 35137637  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaa 171  Q
     ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35137638 tctctcctcttctctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtatgagaa 35137689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 18 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 46033898 - 46033719
Alignment:
Q  18 ttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctct 117  Q
    |||||||||||||| |  |||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||  ||||||||||||||||||||    
T  46033898 ttatgatacatagatattcttaggtggcaatacaccctttaacacccacataaaaatctgacacgtggtcacatgaactccgcacaagcatattttctct 46033799  T
Q  118 ttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcc 197  Q
    || ||||| ||||| || ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  46033798 tttctctcctcttctctattcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgagaataaatggtgtctatgtaacattttcc 46033719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 20 - 166
Target Start/End: Original strand, 38837222 - 38837368
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||  ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  38837222 atgatacatagacacccttaggtggcaatacacccttgtacacctacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttt 38837321  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtat 166  Q
     ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38837322 tctctcctcttctctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtat 38837368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 20 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 4999609 - 4999436
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||||| |||||||  || ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| || | |||||||||    
T  4999609 atgatacatagacacccttagatggcaatacaccttttgacacccacacaaaaatctgatacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacactttctcttt 4999510  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatt 193  Q
      |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  4999509 tatctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgagaataaaaggtgtctatgtatcatt 4999436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 20 - 193
Target Start/End: Original strand, 19329847 - 19330020
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||||| | ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  19329847 atgatacatagacatccttaggtggcaatacaccttttgacacccacacaaaaatctgacacgtaatcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttt 19329946  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatt 193  Q
     ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||  ||||||| ||| ||||    
T  19329947 tctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 19330020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 20 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 19436282 - 19436118
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | |||| ||||| | |||||||||    
T  19436282 atgatacatagacatccttaggtgacaatacaccttttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggatcccgcataagcacactttctcttt 19436183  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtcta 184  Q
     ||||  ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||    
T  19436182 tctcttctcttttctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgagaataaatggtgtcta 19436118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 166
Target Start/End: Original strand, 40957712 - 40957858
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||||| || |||| ||| |||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||| | |||||||||    
T  40957712 atgatacatagacactcttaggtggcaatacactctttgatacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggatcccgtacaagcacactttctcttt 40957811  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtat 166  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40957812 tctctcatcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtat 40957858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 159
Target Start/End: Original strand, 3784000 - 3784139
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| | |||||||||    
T  3784000 atgatacatagacacccttaggtggcaatacatcttttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggatcccgcacaagcacactttctcttt 3784099  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaag 159  Q
     ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  3784100 tctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaag 3784139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 32951588 - 32951434
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||||| || ||||  |||||||||| ||||| ||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  32951588 atgatacatagacactcttagatgacaatacatcctttaacatccacacaaaaatctaacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttt 32951489  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataa 174  Q
     ||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  32951488 tctctcctcttctctcttcctaatacatggggtgtacaagggtgtatgagaataa 32951434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 200
Target Start/End: Original strand, 35522879 - 35523061
Alignment:
Q  18 ttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctct 117  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||| |||||||| | ||  |||| | |||||||||| | |||||||    
T  35522879 ttatgatacatagacatccttaagtggcaatacaccatttaacacccacacaaaaatctgacacgtggccatatggatcccgcacaagcacactttctct 35522978  T
Q  118 ttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttccttt 200  Q
    || ||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||  |||| || |||||||||||||||    
T  35522979 tttctctcttcttctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtttatgtaacattttccttt 35523061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 20 - 175
Target Start/End: Original strand, 7389394 - 7389548
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  7389394 atgatacatagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttt 7389493  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaa 175  Q
     ||||| |  || ||||||||||| |||||| ||||| |||||||||  |||||||    
T  7389494 tctctcctactctctcttcctaatacatggggtgtac-agggtgtatgggaataaa 7389548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 200
Target Start/End: Original strand, 8238215 - 8238398
Alignment:
Q  18 ttatgatacatagaaaccct-taagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctc 116  Q
    |||||||||||| | ||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||  |||||| |||||||| | | ||||||    
T  8238215 ttatgatacataaacaccctgtaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacatgtagtcatatggaccccgcacaagtacactttctc 8238314  T
Q  117 tttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttccttt 200  Q
    |||| |||  ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||   | ||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  8238315 tttcttcttctcttctctcttcctaatacatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggcgtctatgtaacattttccttt 8238398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 20 - 166
Target Start/End: Original strand, 3694372 - 3694518
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||| ||| | ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||| | |||||||||    
T  3694372 atgatatatacacacccttaggtgacaatacaccttttaacacccacacaaaaatctgacacgtagtcatgtggatcccgcacaagcacactttctcttt 3694471  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtat 166  Q
     ||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  3694472 tctctcctcttctctcttcccaatgcatggggtgtacaagagtgtat 3694518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 197
Target Start/End: Original strand, 26296647 - 26296826
Alignment:
Q  18 ttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctct 117  Q
    |||||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||| |||| | ||  |||||| |||||||||  |||||||||    
T  26296647 ttatgatacatagacatccttaggtgacaatataccctttaacatccacataaaaatctgatacgtggccatatggaccccgcacaagcgcattttctct 26296746  T
Q  118 ttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcc 197  Q
    || ||||| ||||| |||||| ||||| ||| | |||||||||||||||   |||| |  ||||||||||||||||||||    
T  26296747 tttctctcctcttctctcttcttaatgtatgaggtgtacaagggtgtatggaaatatatggtgtctacgtaacattttcc 26296826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 197
Target Start/End: Original strand, 38044200 - 38044379
Alignment:
Q  18 ttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctct 117  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||| |||| ||  |||||| |||||||| | | |||||||    
T  38044200 ttatgatacataaacacccttaggtggcaatacaccccttgacatccacacaaaaatctgacatgtagccatatggaccccgcacaagtacactttctct 38044299  T
Q  118 ttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcc 197  Q
    ||| |||  ||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  38044300 ttcttcttctcttttctcttcctaatacatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcc 38044379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 20 - 193
Target Start/End: Original strand, 11044193 - 11044356
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||           ||||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||||||    
T  11044193 atgatacatagacacccttaggtggcaatacatcctttgacacccc----------tgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagtacactttctcttt 11044282  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatt 193  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||||| | ||||||  ||||||| ||| ||||    
T  11044283 cctctcatcttctctcttcctaatgcatgaggtgtacaaaggtgtatgaaaataaagagtgtctatgtatcatt 11044356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 44 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 16374895 - 16374743
Alignment:
Q  44 acaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctctttcctctcatcttccctcttcctaat 143  Q
    |||||||| || |||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||| |  ||||||||| |||| | ||| |||||||||||    
T  16374895 acaatacatcccttgacatccacacaaaaatctgacacgtggtcacgtggatctcacacaagcacacattctctttcatctctttttctctcttcctaat 16374796  T
Q  144 gcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttc 196  Q
    | ||||  ||||||| ||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  16374795 gtatggagtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttc 16374743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 20 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 36362008 - 36361904
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||    
T  36362008 atgatacatagacacccttaggtggcaatacatcctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccacacaagcacactttctcttt 36361909  T
Q  120 cctct 124  Q
     ||||    
T  36361908 tctct 36361904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 20 - 193
Target Start/End: Original strand, 36362031 - 36362192
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  |||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||    
T  36362031 atgatacatagacacccttaggtggtaatacatcctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccacacaagcacactttctcttt 36362130  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatt 193  Q
                 ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||| ||||    
T  36362131 ------------tctcttcctaatacatgggatgtacaagggtgtatgagaataaagggtgtctatgtatcatt 36362192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 197
Target Start/End: Original strand, 22343364 - 22343543
Alignment:
Q  18 ttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctct 117  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| ||   ||  |||||| |||||||| | | |||||||    
T  22343364 ttatgatacataaacacccttaggtggcaatacaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtgaccatatggaccccgcacaagtacactttctct 22343463  T
Q  118 ttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcc 197  Q
    ||| |||  ||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  22343464 ttcttcttctcttctctcttcctaatacatgaggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcc 22343543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 46 - 197
Target Start/End: Original strand, 41423713 - 41423864
Alignment:
Q  46 aatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctctttcctctcatcttccctcttcctaatgc 145  Q
    ||||||||  |||||||  ||| |||||| ||||| || ||||||| || | || |||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||    
T  41423713 aatacacctcttgacacttacacaaaaatctgacatgtggtcacgtagatcccgtacaagcatattttctctttcatctcctcttctctcttcctagtgc 41423812  T
Q  146 atgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcc 197  Q
    ||||| ||||||| ||||||| ||||||||  |||| || ||||||||||||    
T  41423813 atggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtttatgtaacattttcc 41423864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 20 - 193
Target Start/End: Original strand, 3434567 - 3434730
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| | |||||||||| | ||||||||     
T  3434567 atgatacatagacatccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaaactgacacgtagtcacgtggatcccgcacaagcacactttctctt- 3434665  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatt 193  Q
             ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||  ||||||| ||| ||||    
T  3434666 ---------ttctctcttcctaatgcatggggtgtacaaggctgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 3434730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 148
Target Start/End: Original strand, 36208176 - 36208306
Alignment:
Q  18 ttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctct 117  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||  ||||||  | |||||||||||| |||||  ||||| || ||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  36208176 ttatgatacatagacacccttaggtggtaatacattcattgacacccacacaaaaagctgacatgtggtcacgtggaccctgcacaagcacattttctct 36208275  T
Q  118 ttcctctcatcttccctcttcctaatgcatg 148  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  36208276 ttcctctcctcttctctcttcctagtgcatg 36208306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 195
Target Start/End: Original strand, 41915744 - 41915921
Alignment:
Q  18 ttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctct 117  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||| || | ||  |||||| |||||||| | | |||||||    
T  41915744 ttatgatacataaacacccttaggtggcaatacaccccttgacacctacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcacaagtacactttctct 41915843  T
Q  118 ttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatttt 195  Q
    ||| |||  ||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||||||||||    
T  41915844 ttcttcttctcttctctcttcctaatatatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacatttt 41915921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 49 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 27744375 - 27744225
Alignment:
Q  49 acaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatg 148  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| ||||| || | |||||||| | | || ||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  27744375 acaccctttgatacccacacaaaaatctgacatgtggccacgtggatccctcataagcacattttctctatcctctcctcttctctcttcctagtgcatg 27744276  T
Q  149 ggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcctt 199  Q
    |||||||||||| | |||  |||||||  |||| ||  |||||||||||||    
T  27744275 ggatgtacaaggatatatgggaataaatggtgtttatataacattttcctt 27744225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 18 - 198
Target Start/End: Original strand, 31735887 - 31736060
Alignment:
Q  18 ttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctct 117  Q
    |||||||||||||| | ||||| ||| |||||||| |||| ||||||||| |||       ||||| | ||| |||| | |||||||||| | |||||||    
T  31735887 ttatgatacatagacatccttaggtggcaatacactctttaacacccacacaaa-------cacgtggccacatggatcccgcacaagcacactttctct 31735979  T
Q  118 ttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcct 198  Q
    || ||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||| || ||||  ||||||||||||    
T  31735980 tttctctcctcttctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaaaggtatctatctaacattttcct 31736060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 20 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 35468950 - 35468773
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||||| | |||||  || ||||||| | |||||||||||||||||||| | | | ||   || |||||||  |||||| || | |||||||||    
T  35468950 atgatacatagacatccttagatggcaatacatcatttgacacccacataaaaatctaatatgtgaccatgtggaccctgcacaaacacactttctcttt 35468851  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcc 197  Q
    ||| || ||||| ||||||||| | |||| |||||| |||| ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||||    
T  35468850 cctatcctcttctctcttcctagttcatgagatgtataaggatgtatgagaataaaaggtgtatatgtaacattttcc 35468773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 56 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 2318302 - 2318160
Alignment:
Q  56 ttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctctttcctctcatcttccctct-tc-ctaatgcatgggatg 153  Q
    |||||||||||| |||||| ||||  || ||||||||||||   || ||||||| |||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||||  ||    
T  2318302 ttgacacccacacaaaaatctgacgtgtggtcacgtggacccgacataagcatactttctctttcatctcatcttctctctctctctaatgcatggagtg 2318203  T
Q  154 tacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttc 196  Q
    ||||| |||||||   |||||| |||||||| |||||||||||    
T  2318202 tacaaaggtgtatggaaataaagtgtgtctatgtaacattttc 2318160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 32564523 - 32564341
Alignment:
Q  18 ttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctct 117  Q
    |||||||||||| | |  |||| ||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| || |  |  |||||| |||||||  | | |||||||    
T  32564523 ttatgatacataaacattcttaggtggcaatacaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggctatatggaccccgcacaaatacactttctct 32564424  T
Q  118 ttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttccttt 200  Q
    ||| |||  ||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||   | |||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  32564423 ttcttcttctcttctctcttcctaatacatgaggtgtacaagggtgtatgcaattaaaatatgtctatgtaacatcttccttt 32564341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 40846210 - 40846028
Alignment:
Q  18 ttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctct 117  Q
    |||||||||||| | | ||||| ||| |||||||||| |||||| ||||| |||||| | ||| ||||| |  |||||| |||||||  | | |||||||    
T  40846210 ttatgatacataaacatccttaggtggcaatacaccccttgacatccacacaaaaatctaacatgtagttatatggaccccgcacaaatacactttctct 40846111  T
Q  118 ttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttccttt 200  Q
    ||| |||  ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||||   | ||||| || |||| |||||||||||||||    
T  40846110 ttcttcttctcttctctcttcctaaaagatgagatgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtatctatgtaacattttccttt 40846028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 195
Target Start/End: Original strand, 7727909 - 7728086
Alignment:
Q  18 ttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctct 117  Q
    |||||||||||| | ||||||| |||  ||||||||  ||||||  ||||||||||| ||||| || ||||  |||||| |||||||| | | ||||| |    
T  7727909 ttatgatacataaacacccttaggtggtaatacacctcttgacattcacataaaaatctgacatgtggtcatatggaccccgcacaagtacactttctgt 7728008  T
Q  118 ttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatttt 195  Q
    ||| |||  ||||| |||||||||||  ||||| ||||||||| |||||   | ||||| ||||||| ||||||||||    
T  7728009 ttcttcttctcttctctcttcctaatatatggggtgtacaaggatgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacatttt 7728086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 175
Target Start/End: Original strand, 18207183 - 18207339
Alignment:
Q  18 ttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctct 117  Q
    |||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||  |||||||||| | |||||| | |||||| | |||||| ||| | |||||||| | |||||||    
T  18207183 ttatgatacatagacaaccttaggtggcaatacacctcttgacacccatacaaaaatctaacacgtgg-cacgtgaaccccacacaagcacactttctct 18207281  T
Q  118 ttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaa 175  Q
    ||| |||| ||||| ||||||||| || || |  ||||||||||||||| | ||||||    
T  18207282 ttcatctcctcttctctcttcctagtggatagagtgtacaagggtgtatgataataaa 18207339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 39256020 - 39255844
Alignment:
Q  18 ttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctct 117  Q
    |||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||  |||| ||||| | |||||| |||||||| | |||||||||  | |||||| | | |||||||    
T  39256020 ttatgatacatagacaaccttaggtggcaatacaccacttgatacccatacaaaaatctgacacgt-ggcacgtggactccacacaagaacactttctct 39255922  T
Q  118 ttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatttt 195  Q
    ||| |||| ||||| |||||||   || || | |||||||||||||||| | ||||||  ||||||| ||||||||||    
T  39255921 ttcatctcctcttctctcttcccggtggatagaatgtacaagggtgtatgataataaagggtgtctatgtaacatttt 39255844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 18 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 46374899 - 46374810
Alignment:
Q  18 ttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagca 107  Q
    |||||||||||||| | ||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| | ||| |||||| ||||||||||    
T  46374899 ttatgatacatagacatccttaggtggcaacacaccctttaacacccacacaaaaatctgacacgtggccacatggaccccgcacaagca 46374810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 46374806 - 46374741
Alignment:
Q  133 ctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcct 198  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  46374806 ctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtaacattttcct 46374741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 58 - 196
Target Start/End: Original strand, 32045880 - 32046018
Alignment:
Q  58 gacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtaca 157  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  ||  | |||| |  || |||||| ||||| |||| |||||||||| ||||| | |||  ||| ||||||||    
T  32045880 gacacccacataaaaatctgacacgtaaccatatagaccccatactagcatactttctttttcatctcatcttctctctttcaaatatatgagatgtaca 32045979  T
Q  158 agggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttc 196  Q
    |||||||||   ||||||   |||||| |||||||||||    
T  32045980 agggtgtatgtaaataaagaatgtctatgtaacattttc 32046018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 36361907 - 36361847
Alignment:
Q  133 ctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatt 193  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||| ||||    
T  36361907 ctcttcctaatacatggaatgtacaagggtgtatgagaataaagggtgtctatgtatcatt 36361847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 29)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 20 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 33149733 - 33149560
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | |||||||||    
T  33149733 atgatacatagacacccttaggtggtaatacaccctttgacacccacacaaaaatttgacacgtagtcacgtggatcccgcacaagcacactttctcttt 33149634  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatt 193  Q
     ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||  ||||||| ||| ||||    
T  33149633 tctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtacgagaataaagggtgtctatgtatcatt 33149560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 20 - 193
Target Start/End: Original strand, 2740279 - 2740452
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| | |||||||||    
T  2740279 atgatacatagacatccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggatcccgcacaagcacactttctcttt 2740378  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatt 193  Q
     |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||| ||| ||||    
T  2740379 tctctccccttctctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 2740452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 20 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 18520979 - 18520806
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  18520979 atgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttt 18520880  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatt 193  Q
      |||| ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||  ||||||| ||| ||||    
T  18520879 tatctcctcttctctcttcctaatgcatgaggtgtacaagggtgtatgaaaataaagggtgtctatgtatcatt 18520806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 20 - 193
Target Start/End: Original strand, 35785204 - 35785377
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||| || | |||||||||    
T  35785204 atgatacatagacacccttaggtggcaatacaccttttgacacccacacaaaaatctgacacgtagttacgtggatcccgcacaatcacactttctcttt 35785303  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatt 193  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||| ||||||| ||| ||||    
T  35785304 tctctcatcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatggaaataaaaggtgtctatgtatcatt 35785377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 35943989 - 35943812
Alignment:
Q  18 ttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctct 117  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| | | |||||||| | |||||||    
T  35943989 ttatgatacatagacacccttaggtggcaatacatcatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagttacgtggatcccacacaagcacactttctct 35943890  T
Q  118 ttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatttt 195  Q
    |||||||| ||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||    
T  35943889 ttcctctcctcttttctcttcctagtgcatggggtgtacaagggtgtatggaaataaaatgtgtctatgtaacatttt 35943812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 20 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 36733037 - 36732873
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  36733037 atgatacatagacacccttaggtagcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttt 36732938  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtcta 184  Q
     ||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||  |||||||    
T  36732937 tctctcctcttctctcttcctaatgcatgaggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtcta 36732873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 22 - 184
Target Start/End: Original strand, 13811659 - 13811821
Alignment:
Q  22 gatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctctttcc 121  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||  |    
T  13811659 gatacatagacacccttaggtggcaatacatcatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttctc 13811758  T
Q  122 tctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtcta 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||  |||||||    
T  13811759 tctcctcttctctcttcctaatgcatgggatgtacaaggatgtatgggaataaatggtgtcta 13811821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 20 - 193
Target Start/End: Original strand, 14831819 - 14831992
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| | ||||| |||    
T  14831819 atgatacatagacactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacataaaaatctgacacgtagtcacgtggatcccgcacaagcacactttcttttt 14831918  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatt 193  Q
      |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||  ||||||| ||| ||||    
T  14831919 tttctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaaggatgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 14831992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 20 - 193
Target Start/End: Original strand, 40145412 - 40145585
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  40145412 atgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttaacatccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttt 40145511  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatt 193  Q
     ||||| ||||| |||||||||||||| | | ||||||||||| ||| ||||||||  ||||||| ||| ||||    
T  40145512 tctctcctcttctctcttcctaatgcacgaggtgtacaagggtatatgagaataaagggtgtctatgtatcatt 40145585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 18 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 15409707 - 15409528
Alignment:
Q  18 ttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctct 117  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||| |||||||||| | | |||||    
T  15409707 ttatgatacatagacatccttaggtgacaatacattctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagccacatggaccccgcacaagcacactctctct 15409608  T
Q  118 ttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcc 197  Q
    || ||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||  |||| || ||||||||||||    
T  15409607 tttctctcctcttctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgcgaataaagggtgtttatgtaacattttcc 15409528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 198
Target Start/End: Original strand, 31008991 - 31009171
Alignment:
Q  18 ttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctct 117  Q
    |||||||||||| | | ||||| |||||||||||  |||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| | ||||| |    
T  31008991 ttatgatacataaacatccttaggtgacaatacattcttccacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggatcccgcacaagcacactttctat 31009090  T
Q  118 ttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcct 198  Q
    |||||||  ||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  31009091 ttcctcttctcttctctcttcctagtgcatggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttcct 31009171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 196
Target Start/End: Original strand, 6679701 - 6679879
Alignment:
Q  18 ttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctct 117  Q
    |||||||||||||| | | ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||| || |||||||||    
T  6679701 ttatgatacatagacatctttaggtggcaatacaccttttgacacccacacaaaaatctgacacgtggtcacatggaccccgcacaaacacattttctct 6679800  T
Q  118 ttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttc 196  Q
    || ||||| ||||| |||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||   |||||| |||||||||||    
T  6679801 tttctctcctcttctctcttcctaatgtatagggtgtacaagggtgtatgacaataaatgatgtctatgtaacattttc 6679879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 18 - 150
Target Start/End: Original strand, 28177778 - 28177910
Alignment:
Q  18 ttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctct 117  Q
    |||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||| || | |||||||    
T  28177778 ttatgatacatagacatccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtggtcacatggaccccgcacaaacacactttctct 28177877  T
Q  118 ttcctctcatcttccctcttcctaatgcatggg 150  Q
    || ||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  28177878 tttctctcctcttccctcttcctaatgtatggg 28177910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 199
Target Start/End: Original strand, 26720519 - 26720700
Alignment:
Q  18 ttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctct 117  Q
    |||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||||| | ||| |||| | |||||||||| | |||||||    
T  26720519 ttatgatacatagacatccttaggtggcaatacaccctttaacacctacaaaaaaatctgacacgtggccacatggatcccgcacaagcacactttctct 26720618  T
Q  118 ttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcctt 199  Q
    || ||||  ||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||   ||||||  |||||||||||||    
T  26720619 tttctcttctcttctctcttcctaatgtatggggtgtactagggtgtatgagaataaatgatgtctatataacattttcctt 26720700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 199
Target Start/End: Original strand, 26990268 - 26990449
Alignment:
Q  18 ttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctct 117  Q
    |||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||||| | ||| |||| | |||||||||| | |||||||    
T  26990268 ttatgatacatagacatccttaggtggcaatacaccctttaacacctacaaaaaaatctgacacgtggccacatggatcccgcacaagcacactttctct 26990367  T
Q  118 ttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcctt 199  Q
    || ||||  ||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||   ||||||  |||||||||||||    
T  26990368 tttctcttctcttctctcttcctaatgtatggggtgtactagggtgtatgagaataaatgatgtctatataacattttcctt 26990449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 87 - 199
Target Start/End: Original strand, 2177436 - 2177548
Alignment:
Q  87 cacgtggacctcgcacaagcatattttctctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacg 186  Q
    |||||||| | | |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |    
T  2177436 cacgtggatcccacacaagcacattttctctttcctctcctcttctctcttcctagtgcattggatgtacaagggtgtatgagaataaaatgtgtctctg 2177535  T
Q  187 taacattttcctt 199  Q
    |||||||||||||    
T  2177536 taacattttcctt 2177548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 18 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 3921362 - 3921181
Alignment:
Q  18 ttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctct 117  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| || | ||  |||||| |||||||| | | |||||||    
T  3921362 ttatgatacataaacacccttaggtggcaatacaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcacaagtacactttctct 3921263  T
Q  118 ttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcctt 199  Q
    ||| |||  ||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  3921262 ttcttcttctcttctctcttcctaatatatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcctt 3921181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 2252265 - 2252085
Alignment:
Q  18 ttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctct 117  Q
    |||||||||||| | | ||||| ||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| || | ||  |||||| |||||||| | | |||||||    
T  2252265 ttatgatacataaacatccttaggtggcaatacaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcacaagtacactttctct 2252166  T
Q  118 ttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcct 198  Q
    ||| |||  ||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  2252165 ttcttcttctcttctctcttcctaatatatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcct 2252085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 20 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 6260096 - 6259916
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||| | | || || ||||||||||||||||| ||||||||  |||||| | |||| | ||||| |||||||| || ||||| | |||||||||    
T  6260096 atgatacatacacaaccataggtgacaatacaccctttaacacccacgcaaaaatctaacacatggtcacatggacctcacagaagcacactttctcttt 6259997  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttccttt 200  Q
    | |||| ||||| ||||  |||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||   | |||| |||||||||||||||    
T  6259996 catctcctcttctctctcactaatgtatgggatgtacaagtgtgtataggaataaaggatatctatgtaacattttccttt 6259916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 42 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 20073589 - 20073433
Alignment:
Q  42 tgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctctttcctctcatcttccctcttccta 141  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||   ||||||||||  ||||||||| | ||||| ||||||||| ||||| |||||||||    
T  20073589 tgacaatacaccctttgacactcacataaaaatcttgcacgtgaccacgtggaccctgcacaagcacactttctatttcctctcctcttctctcttccta 20073490  T
Q  142 atgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcct 198  Q
     | |||| ||| ||||| ||||||| |||||||||  ||||||  ||||||||||||    
T  20073489 gttcatgagatttacaaaggtgtatgagaataaaaaatgtctatctaacattttcct 20073433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 20 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 42414397 - 42414275
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||||| |||  || ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||| |||||    
T  42414397 atgatacatagacaccagtaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcatgtggaccccgcacaagcacactttatcttt 42414298  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaa 142  Q
     || || ||||| ||||||||||    
T  42414297 tctttcctcttctctcttcctaa 42414275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 20 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 36875698 - 36875564
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||         ||||||||||| | |||||||||| | |||||||||    
T  36875698 atgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaat---------agtcacgtggatcccgcacaagcacactttctcttt 36875608  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtg 163  Q
      |||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  36875607 tttctcctcttctctcttcctaatacatggggtgtacaagggtg 36875564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 36 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 33825403 - 33825243
Alignment:
Q  36 cttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctctttcctctcatcttccctc 135  Q
    |||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||| ||||  |||||||| | |||||||||  |||  ||||| |||    
T  33825403 cttaggtggcaatacactccttgacacccacataaaaatctgacacgtgttcatgtgaaccttacacaagcacactttctcttttatcttctcttctctc 33825304  T
Q  136 ttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttc 196  Q
    |||||| |||||||| |||| |||| ||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||    
T  33825303 ttcctagtgcatggggtgtagaaggctgtatgagaataaatggtgtcaatgtaacattttc 33825243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 39688994 - 39688814
Alignment:
Q  18 ttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctct 117  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||| ||| | || ||||  || ||| |||| ||| | | |||||||    
T  39688994 ttatgatacataaacacccttaagtggcaatacatcccttgacacccacacaaaaatctgatatgtggtcatatgaaccccgcataagtacactttctct 39688895  T
Q  118 ttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcct 198  Q
    ||| |||  ||||| ||||||||||| ||| || ||||||| |||||||   | ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  39688894 ttcttcttttcttctctcttcctaatacatagggtgtacaaaggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcct 39688814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 59 - 197
Target Start/End: Original strand, 21370048 - 21370186
Alignment:
Q  59 acacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaa 158  Q
    ||||||||  |||||| ||||| || |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||||||| |  ||  |||||||||    
T  21370048 acacccactcaaaaatctgacatgtggtcacgtggaccccgcacaaacacattttctctttcctctcatcttctttcttcctagtatataagatgtacaa 21370147  T
Q  159 gggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcc 197  Q
     ||||||| | ||||||  |||| || ||||||||||||    
T  21370148 aggtgtatgaaaataaagggtgtttatgtaacattttcc 21370186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 20 - 195
Target Start/End: Original strand, 9603818 - 9603993
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||| | | ||||| |||| ||||||| | || ||||| ||| |||||| |||||| | ||||  |||||| |  |||| || | |||||||||    
T  9603818 atgatacatatacatccttaggtgataatacactcattcacacctacacaaaaatctgacacatggtcatatggaccccatacaatcacactttctcttt 9603917  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatttt 195  Q
    | | || ||||| |||||| || ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  9603918 catttcgtcttctctcttcttagtgcttgggatgtacaaaggtgtatgagaataaatggtgtctacgtaacatttt 9603993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 41470508 - 41470425
Alignment:
Q  23 atacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagc 106  Q
    ||||||||| ||| ||| ||| ||||||| ||||| | |  || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41470508 atacatagacacctttaggtggcaatacatcctttaaaattcatataaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagc 41470425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 125
Target Start/End: Original strand, 31132392 - 31132454
Alignment:
Q  63 ccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctctttcctctc 125  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||||    
T  31132392 ccacacaaaaatctgacaagtagtcacgtggaccccgcacaagcatactttttcttttctctc 31132454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 120
Target Start/End: Original strand, 16327921 - 16328006
Alignment:
Q  35 ccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctctttc 120  Q
    ||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||| ||||| |||||||| | ||| ||||||    
T  16327921 ccttaggtggcaatacatccattgacacccacataaaaatctgacacgtgttcatgtgcacctcacacaagcacactttttctttc 16328006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 96; Significance: 5e-47; HSPs: 22)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 22 - 193
Target Start/End: Original strand, 32869685 - 32869856
Alignment:
Q  22 gatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctctttcc 121  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| |    
T  32869685 gatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttttc 32869784  T
Q  122 tctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatt 193  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||  ||||||| ||| ||||    
T  32869785 tctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaaggatgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 32869856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 20 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 22880753 - 22880598
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  22880753 atgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaattctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttt 22880654  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaa 175  Q
     ||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  22880653 tctctcctcttctctcttcctaatacatggggtgtacaagggtgtatgggaataaa 22880598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 20 - 193
Target Start/End: Original strand, 17598559 - 17598732
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  17598559 atgatacatagacacccttaggtggcaatacatcttttgacacccacacaaaaatctgacacgttgtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttt 17598658  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatt 193  Q
     ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||| ||||||| ||| ||||    
T  17598659 tctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatggaaataaaaggtgtctatgtatcatt 17598732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 20 - 193
Target Start/End: Original strand, 11427621 - 11427796
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaaccct--taagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctct 117  Q
    |||||||||||| |||||  || ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| | |||||||    
T  11427621 atgatacatagacaccctcttaggtggcaatacatcctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggatcccgcacaagcacactttctct 11427720  T
Q  118 ttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatt 193  Q
    || ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||| ||||    
T  11427721 tttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgagaataaagggtgtctatgtatcatt 11427796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 18 - 197
Target Start/End: Original strand, 31976251 - 31976430
Alignment:
Q  18 ttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctct 117  Q
    |||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||||| ||||| || ||| |||||||||| | |||||||    
T  31976251 ttatgatacatagacatccttaggtggcaatataccctttaacacccacacaaaaatctgacacgtggtcacatgaaccccgcacaagcacactttctct 31976350  T
Q  118 ttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcc 197  Q
    || ||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  31976351 tttctctcctcttctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgagaataaatggtgtctatgtaacattttcc 31976430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 23128222 - 23128076
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||| ||||| ||| ||| |||| |||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | | |||||||| | |||||||||    
T  23128222 atgatatatagacacctttatgtgataatacatcctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggatcccacacaagcacactttctcttt 23128123  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtat 166  Q
     ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23128122 tctctcctcttttctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtat 23128076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 20 - 193
Target Start/End: Original strand, 15832582 - 15832755
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||||| ||| ||| ||||||||| | | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||  | |||||||||||    
T  15832582 atgatacatagacacctttaggtgacaataaatcatttgacacccacacaaaaatttgacacgtagtcacgtggatcctgcacaaatacattttctcttt 15832681  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatt 193  Q
      |||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||  ||||||||||| ||||    
T  15832682 tttctcctcttctatcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtattggaataaagggtgtctacgtatcatt 15832755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 20 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 6209560 - 6209422
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||  |||||||| |||| |||||| || |||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||    
T  6209560 atgatacatagacacccttaggtggcaatacactatttgacactcacacaaaaatctgtcacgtagtcacgtggaccccgcactagcacactttctcttt 6209461  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaa 158  Q
     ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6209460 tctctcctcttctctcttcctaatgcatgggatgtacaa 6209422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 20 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 31953125 - 31952945
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||| ||||| | ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||| ||||| || | |||||||||    
T  31953125 atgatagatagacatccttaggtggcaatacaccccttgacacccacataaaaatctgacatgtgttcatgtggacctcacacaaacacactttctcttt 31953026  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttccttt 200  Q
    | |||  ||||| ||||||||| |||||||| |||| |||| ||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  31953025 catcttctcttctctcttcctagtgcatggggtgtagaaggatgtatgagaataaatggtgtctatgtaacattttccttt 31952945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 193
Target Start/End: Original strand, 29857832 - 29858005
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||||| ||| |||  || ||||||||| ||| ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| | |||| ||||| | |||||||||    
T  29857832 atgatacatagacacctttagatggcaatacaccttttaacacccacacaaaaatctgacacgtagttacgtggatcccgcataagcacactttctcttt 29857931  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatt 193  Q
     ||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||  ||||||| ||| ||||    
T  29857932 tctcttctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatt 29858005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 27 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 31109488 - 31109351
Alignment:
Q  27 atagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctctttcctctca 126  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||| ||| | | ||||||||| |||||     
T  31109488 atagacacccttaggtggcaatacaccctttgacatccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtagaccccgcaaaagtacactttctcttttctctcc 31109389  T
Q  127 tcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgt 164  Q
    ||||  |||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  31109388 tcttttctcttcctaatgcatggggtatacaagggtgt 31109351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 30341457 - 30341277
Alignment:
Q  18 ttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctct 117  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| || | ||  |||||| |||||||| | | |||||||    
T  30341457 ttatgatacataaacacccttaggtggcaatacaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcacaagtacactttctct 30341358  T
Q  118 ttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcct 198  Q
    ||| |||  ||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  30341357 ttcttcttctcttctctcttcctaatatatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcct 30341277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 15990139 - 15989960
Alignment:
Q  18 ttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctct 117  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| || | ||  |||||| |||||||| | | |||||||    
T  15990139 ttatgatacataaacacccttaggtggcaatacaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcacaagtacactttctct 15990040  T
Q  118 ttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcc 197  Q
    ||| |||  ||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  15990039 ttcttcttctcttctctcttcctaatatatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcc 15989960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 18 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 15508121 - 15507939
Alignment:
Q  18 ttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctct 117  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| || | ||  |||||| |||||||| | | |||||||    
T  15508121 ttatgatacataaacacccttaggtggcaatacaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcacaagtacactttctct 15508022  T
Q  118 ttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttccttt 200  Q
    ||| |||  ||||| |||||||||||  ||||| ||||||||| |||||   | ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  15508021 ttcttcttctcttctctcttcctaatatatggggtgtacaaggatgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttccttt 15507939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 31110856 - 31110679
Alignment:
Q  18 ttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctct 117  Q
    |||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||  ||| ||||||  ||||||||| | |||||||    
T  31110856 ttatgatacatagacatccttaggtggcaatacaccctttgacactcaca--aaaatctgacacgtaaccacatggaccctgcacaagcacactttctct 31110759  T
Q  118 ttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcc 197  Q
    || ||||  ||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||   ||||||   |||||| ||||||||||||    
T  31110758 tttctctactcttctctcttcctaatgtatggggtgtacaaaggtgtatggaaataaaggatgtctatgtaacattttcc 31110679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 22 - 182
Target Start/End: Original strand, 946383 - 946543
Alignment:
Q  22 gatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctctttcc 121  Q
    |||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||| ||  |||||| |||||| |||||||||  | | ||| | |||| | ||||||||| |    
T  946383 gatacatagacatccttaggtgataatacaccctttgacacctacccaaaaatctgacacctagtcacgtaaatcccgctctagcacactttctcttttc 946482  T
Q  122 tctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtc 182  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||| | ||||||| |||||    
T  946483 tctcctcttctctcttcctaatgcatgagatgtacaagaatgtatgacaataaaaagtgtc 946543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 45 - 197
Target Start/End: Original strand, 4231578 - 4231730
Alignment:
Q  45 caatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctctttcctctcatcttccctcttcctaatg 144  Q
    |||||||||| ||| |||||||| |||||| |||||||| | ||  |||||| |||||||| | | |||||||||| |||  ||||| |||||||||||     
T  4231578 caatacaccccttgccacccacacaaaaatctgacacgtggccatatggaccccgcacaagtacactttctctttcttcttctcttctctcttcctaata 4231677  T
Q  145 catgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcc 197  Q
    |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  4231678 catggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcc 4231730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 20 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 28536581 - 28536428
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||| | | ||||| ||| ||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||  |||| ||||||| | |||||||| | |||||||||    
T  28536581 atgatacataaacatccttaggtggcaatacaacccttgacacccacacaaaaatctgacacg--gtcatgtggaccccacacaagcacactttctcttt 28536484  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaa 175  Q
      |||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  28536483 tatcttctcttccctcttcctactgcatggggtgtacaagggtgtatgaaaataaa 28536428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 9379808 - 9379680
Alignment:
Q  19 tatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctctt 118  Q
    ||||||||||||| | |||||  |||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||| | || ||||| ||| ||||| || ||||||||||    
T  9379808 tatgatacatagacatccttagatgacaatacatcccttgacacccatacaaaaatttgacacgtggccatgtggatctcacacaaacacattttctctt 9379709  T
Q  119 tcctctcatcttccctcttcctaatgcat 147  Q
    || |||  ||||  |||||||||||||||    
T  9379708 tcatcttctcttttctcttcctaatgcat 9379680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 59 - 184
Target Start/End: Original strand, 30870058 - 30870183
Alignment:
Q  59 acacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaa 158  Q
    ||||||| |||||||| | ||| || ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |  || || |||||||    
T  30870058 acacccatataaaaatctaacatgtggtcacatggaccccgcacaagcacattttctctttcctctcctcttctctctttctagtatatagggtgtacaa 30870157  T
Q  159 gggtgtataagaataaaatgtgtcta 184  Q
     ||||||| | ||||||  |||||||    
T  30870158 aggtgtatgaaaataaagggtgtcta 30870183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 137
Target Start/End: Original strand, 12732487 - 12732604
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||||| |  |||||||| ||||| |  | |||||||||||| |||||| |||||||| |  | ||||| | | || ||||| |||||||||||    
T  12732487 atgatacatagacattcttaagtggcaatataatcattgacacccacacaaaaatctgacacgtggctatgtggatcccacataagcacattttctcttt 12732586  T
Q  120 cctctcatcttccctctt 137  Q
    | |||| ||||| |||||    
T  12732587 catctcctcttctctctt 12732604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 152 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 22422042 - 22421997
Alignment:
Q  152 tgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcc 197  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  22422042 tgtacaagggtgtatgagaataaatggtgtctatgtaacattttcc 22421997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0321 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0321
Description:

Target: scaffold0321; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 18 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 10206 - 10058
Alignment:
Q  18 ttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctct 117  Q
    |||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| | |||||||    
T  10206 ttatgatacatagacacctttaggtggcaatacatcctttgacatccacataaaaatctgacacgtagtcacgtggaccgcgtacaagcacactttctct 10107  T
Q  118 ttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtat 166  Q
    || ||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  10106 tttctctcctcttctctcttcctaatgcatagggtgtacaagggtgtat 10058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1268 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold1268
Description:

Target: scaffold1268; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 20 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 1024 - 848
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||||| | | ||| ||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||||||||||| | | |||||||||| | |||||||||    
T  1024 atgatacatagacatctttaggtggcaatacaccctttaacatccacacaaaaaactgacacgtagtcacgtgaatcccgcacaagcacactttctcttt 925  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttc 196  Q
    |||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||  |||||||  |||| || |||||||||||    
T  924 cctctcctcttctctcttcctagtgcatggggtgtacaagagtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttc 848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1267 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold1267
Description:

Target: scaffold1267; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 20 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 1024 - 848
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||||| | | ||| ||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||||||||||| | | |||||||||| | |||||||||    
T  1024 atgatacatagacatctttaggtggcaatacaccctttaacatccacacaaaaaactgacacgtagtcacgtgaatcccgcacaagcacactttctcttt 925  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttc 196  Q
    |||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||  |||||||  |||| || |||||||||||    
T  924 cctctcctcttctctcttcctagtgcatggggtgtacaagagtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttc 848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 193
Target Start/End: Original strand, 4034 - 4207
Alignment:
Q  20 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 119  Q
    |||||||||||| ||| |||  || ||||||||| ||| ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| | |||| ||||| | |||||||||    
T  4034 atgatacatagacacctttagatggcaatacaccttttaacacccacacaaaaatctgacacgtagttacgtggatcccgcataagcacactttctcttt 4133  T
Q  120 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatt 193  Q
     ||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||  ||||||| ||| ||||    
T  4134 tctcttctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatt 4207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 45 - 196
Target Start/End: Original strand, 152528 - 152679
Alignment:
Q  45 caatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctctttcctctcatcttccctcttcctaatg 144  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| || ||||  |||| | |||||||  | | |||||||||| |||  ||||| ||||| |||||     
T  152528 caatacaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggtcatatggatcccgcacaaatacactttctctttcttcttctcttctctctttctaata 152627  T
Q  145 catgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttc 196  Q
    ||||||||||||||||||||||   | ||||| ||||||| |||||||||||    
T  152628 catgggatgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttc 152679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0316 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0316
Description:

Target: scaffold0316; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 45 - 124
Target Start/End: Original strand, 17084 - 17163
Alignment:
Q  45 caatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctctttcctct 124  Q
    ||||||| || | |||| ||||| |||||| ||||| || ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  17084 caatacatccctcgacatccacacaaaaatctgacatgtggtcacatggaccccgcacaagcacattttctctttcctct 17163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University