View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF21517_low_5 (Length: 390)

Name: NF21517_low_5
Description: NF21517
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF21517_low_5
NF21517_low_5
[»] scaffold0288 (1 HSPs)
scaffold0288 (16-372)||(3537-3893)
[»] chr6 (32 HSPs)
chr6 (60-372)||(4266984-4267296)
chr6 (64-372)||(4469809-4470117)
chr6 (61-372)||(4461126-4461437)
chr6 (64-369)||(4585642-4585947)
chr6 (61-372)||(4480696-4481007)
chr6 (64-372)||(4592237-4592545)
chr6 (61-372)||(4601792-4602103)
chr6 (61-372)||(4514939-4515250)
chr6 (61-372)||(4563714-4564025)
chr6 (61-372)||(4617025-4617336)
chr6 (16-372)||(4625909-4626265)
chr6 (61-372)||(4505860-4506171)
chr6 (61-372)||(4613536-4613847)
chr6 (60-372)||(4256429-4256742)
chr6 (179-372)||(4457715-4457908)
chr6 (60-372)||(4622144-4622456)
chr6 (61-372)||(4516324-4516635)
chr6 (64-369)||(4570978-4571283)
chr6 (61-372)||(4557128-4557439)
chr6 (61-372)||(4560509-4560820)
chr6 (60-372)||(4259972-4260284)
chr6 (61-372)||(4574311-4574622)
chr6 (60-366)||(3171743-3172049)
chr6 (64-372)||(4490173-4490481)
chr6 (61-372)||(4492958-4493269)
chr6 (64-372)||(4504215-4504523)
chr6 (61-372)||(4579435-4579746)
chr6 (60-265)||(4299671-4299870)
chr6 (62-372)||(4598175-4598485)
chr6 (77-332)||(4568072-4568330)
chr6 (62-164)||(4392052-4392154)
chr6 (61-123)||(4606958-4607020)
[»] chr5 (2 HSPs)
chr5 (60-372)||(24103001-24103313)
chr5 (61-366)||(27999923-28000228)
[»] chr8 (3 HSPs)
chr8 (61-366)||(1674229-1674534)
chr8 (61-372)||(20863661-20863972)
chr8 (61-372)||(16686085-16686396)
[»] chr7 (1 HSPs)
chr7 (55-372)||(3086417-3086734)
[»] chr3 (1 HSPs)
chr3 (61-372)||(1281117-1281428)
[»] scaffold0477 (1 HSPs)
scaffold0477 (59-372)||(4504-4817)
[»] scaffold0475 (1 HSPs)
scaffold0475 (212-372)||(3502-3662)


Alignment Details
Target: scaffold0288 (Bit Score: 333; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0288
Description:

Target: scaffold0288; HSP #1
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 3893 - 3537
Alignment:
Q  16 atcaagaggatatcgatgaatacacaaccacattttaagttaacattgtttaagcaaaacctccttaataactttgtccaggttcatgtatgaacgacca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3893 atcaagaggatatcgatgaatacacaaccacattttaagttaacattgtttaagcaaaacctccttaataactttgtccaggttcatgtatgaacgacca 3794  T
Q  116 cctggtctagtgttctcctctgccttcttctttaactcgacggccttttgcctcatcttctttcctttctctcccaccatcaattcattgactagcttct 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3793 cctggtctagtgttctcctctgccttcttctttaactccacggccttttgcctcatcttctttcctttctctcccaccgtcaattcattgactagcttct 3694  T
Q  216 ccacctcatctctcttcacatctctatcgatttcaagtccaatctcccattcgttgcaaataattctacagtttgttggctgatcaccaaagaatggcca 315  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3693 ccacctcatctctcttcacatccatatcgatttcaagtccaatctcccattcgttgcaaataaatctacagtttgttggctgatcaccaaagaatggcca 3594  T
Q  316 acaaagcattggcactccagcgcatatgctttcagtggttgaattccatccacaatg 372  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3593 acaaagcattggtactccagcgcatatgctttcagtggttgaattccatccacaatg 3537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 32)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 60 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 4267296 - 4266984
Alignment:
Q  60 attgtttaagcaaaacctccttaataactttgtccaggttcatgtatgaacgaccacctggtctagtgttctcctctgccttcttctttaactcgacggc 159  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||| | | |    
T  4267296 attgtttaagcatgacctccttaataactttgtccaagttcatgtatgaaaaaccaccaggtcttgtgttctcttctgccttcctcttcaactccaagac 4267197  T
Q  160 cttttgcctcatcttctttcctttctctcccaccatcaattcattgactagcttctccacctcatctctcttcacatctctatcgatttcaagtccaatc 259  Q
     |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||    
T  4267196 attttgcttcatcatatttcctttctctcccaccatcaattcattgactaacttctcgacgtcatctctcttcacatttgtattgatttcgagtccaatc 4267097  T
Q  260 tcccattcgttgcaaataattctacagtttgttggctgatcaccaaagaatggccaacaaagcattggcactccagcgcatatgctttcagtggttgaat 359  Q
    |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4267096 tcccattcatagcaaataaatctacagtttgttggctgatcaccaaagaatggccaacacaacattggcactccagcacatatgctttcagtggttgaat 4266997  T
Q  360 tccatccacaatg 372  Q
    ||||||| |||||    
T  4266996 tccatccgcaatg 4266984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 64 - 372
Target Start/End: Original strand, 4469809 - 4470117
Alignment:
Q  64 tttaagcaaaacctccttaataactttgtccaggttcatgtatgaacgaccacctggtctagtgttctcctctgccttcttctttaactcgacggccttt 163  Q
    ||||||||| || |||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||| || ||||| || | ||||||  |||||||||| ||||| | |  ||||    
T  4469809 tttaagcaagacatccttaatgactttgtccaagttcttgtatgaaacacctccaggtctggtatcctcctccaccttcttcttgaactccatgatcttt 4469908  T
Q  164 tgcctcatcttctttcctttctctcccaccatcaattcattgactagcttctccacctcatctctcttcacatctctatcgatttcaagtccaatctccc 263  Q
    | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4469909 tccctcatcttctttccattctctccaaccatcaattcattgactagcttctccacctcatctctcttcacatctttatcgatttcaagtccaatctccc 4470008  T
Q  264 attcgttgcaaataattctacagtttgttggctgatcaccaaagaatggccaacaaagcattggcactccagcgcatatgctttcagtggttgaattcca 363  Q
    |||| |||||||||| |||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4470009 attcattgcaaataaatctacaatttgctagctgatcaccaaagaatggccaacacaacattggcactccagcgcatatgctttcagtggttgagttcca 4470108  T
Q  364 tccacaatg 372  Q
    ||| |||||    
T  4470109 tccgcaatg 4470117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 61 - 372
Target Start/End: Original strand, 4461126 - 4461437
Alignment:
Q  61 ttgtttaagcaaaacctccttaataactttgtccaggttcatgtatgaacgaccacctggtctagtgttctcctctgccttcttctttaactcgacggcc 160  Q
    |||||||||||| || |||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||| || ||||| || | ||||||  |||||||||| || || | | ||    
T  4461126 ttgtttaagcaagacatccttaatgactttgtccaagttcttgtatgaaacacctccaggtctggtatcctcctccaccttcttcttgaattccatgacc 4461225  T
Q  161 ttttgcctcatcttctttcctttctctcccaccatcaattcattgactagcttctccacctcatctctcttcacatctctatcgatttcaagtccaatct 260  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4461226 ttttgcctcatcttctttccaatctctccaaccatcaattcgttgaccaacttctccacctcatccctcttcacatctttatcgatttcaagtccaatct 4461325  T
Q  261 cccattcgttgcaaataattctacagtttgttggctgatcaccaaagaatggccaacaaagcattggcactccagcgcatatgctttcagtggttgaatt 360  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4461326 cccatttgttgcaaataaatctacagtttgctggctgatcaccaaagaatggccaacacaacatcggcactccagcacatatgctttcagtggttgaatt 4461425  T
Q  361 ccatccacaatg 372  Q
    ||||||||||||    
T  4461426 ccatccacaatg 4461437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 64 - 369
Target Start/End: Original strand, 4585642 - 4585947
Alignment:
Q  64 tttaagcaaaacctccttaataactttgtccaggttcatgtatgaacgaccacctggtctagtgttctcctctgccttcttctttaactcgacggccttt 163  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||| ||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||  ||||||    
T  4585642 tttaagcaaaacctccttaatcactttttccaagtttatgtatgaacaacctccaggtctcgtgtcctcctccgccttcttcttcaactcgattgccttt 4585741  T
Q  164 tgcctcatcttctttcctttctctcccaccatcaattcattgactagcttctccacctcatctctcttcacatctctatcgatttcaagtccaatctccc 263  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||   | || | ||| |  ||||||||||    
T  4585742 tgcctcatcttctttccattctctcccaccatcaattcattgaccaacttctccacctcctctctcttcacattggtgtcaacttccatcccaatctccc 4585841  T
Q  264 attcgttgcaaataattctacagtttgttggctgatcaccaaagaatggccaacaaagcattggcactccagcgcatatgctttcagtggttgaattcca 363  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  4585842 attcattgcaaataattctacagtttgttggctgatcagcaatgaatggccaacacaacattggcactccagcacatatgctttcagtggttgagttcca 4585941  T
Q  364 tccaca 369  Q
    ||||||    
T  4585942 tccaca 4585947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 61 - 372
Target Start/End: Original strand, 4480696 - 4481007
Alignment:
Q  61 ttgtttaagcaaaacctccttaataactttgtccaggttcatgtatgaacgaccacctggtctagtgttctcctctgccttcttctttaactcgacggcc 160  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||| | ||||    
T  4480696 ttgtttaagcaagacctccttaatcactttgtccaagttcatgtatgaacaaccaccaggtcttgtgtcctcctctgccatcttcttcaactccatggcc 4480795  T
Q  161 ttttgcctcatcttctttcctttctctcccaccatcaattcattgactagcttctccacctcatctctcttcacatctctatcgatttcaagtccaatct 260  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||| || |||||||||||||   |||||||||| ||||||||||    
T  4480796 ttttgcttcatcttctttcctttctctcccaccaacaattcattgattaacctctccacatcttctctcttcacattggtatcgatttcgagtccaatct 4480895  T
Q  261 cccattcgttgcaaataattctacagtttgttggctgatcaccaaagaatggccaacaaagcattggcactccagcgcatatgctttcagtggttgaatt 360  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||||  |||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||    
T  4480896 cccattcattgcaaataattctacggttaggtggctgatcggcaaagaatggccaacacaacattggcactccagcacatacactttcagtggttgagtt 4480995  T
Q  361 ccatccacaatg 372  Q
    |||||| |||||    
T  4480996 ccatccgcaatg 4481007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 64 - 372
Target Start/End: Original strand, 4592237 - 4592545
Alignment:
Q  64 tttaagcaaaacctccttaataactttgtccaggttcatgtatgaacgaccacctggtctagtgttctcctctgccttcttctttaactcgacggccttt 163  Q
    ||||||||| |||||||| || | |||||||| |||||| ||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||    
T  4592237 tttaagcaacacctccttgatcaatttgtccaagttcatatatgaacaacctccaggtctcgtgttctcctctgccttcttcttcaactcgattgccttt 4592336  T
Q  164 tgcctcatcttctttcctttctctcccaccatcaattcattgactagcttctccacctcatctctcttcacatctctatcgatttcaagtccaatctccc 263  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||| ||||   |||| ||||| |  ||||||||||    
T  4592337 ttcctcatcttctttcctttctctcccaccatcaattcattgataagtttctccacctcctctctctttacattcgtatcaatttccatcccaatctccc 4592436  T
Q  264 attcgttgcaaataattctacagtttgttggctgatcaccaaagaatggccaacaaagcattggcactccagcgcatatgctttcagtggttgaattcca 363  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| | |||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  4592437 attcattgtaaataagtctacagtttgttggctgatcactaaagaatggccaacacaacattggaattccagcacatatactttcagtggttgagttcca 4592536  T
Q  364 tccacaatg 372  Q
    |||||||||    
T  4592537 tccacaatg 4592545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 61 - 372
Target Start/End: Original strand, 4601792 - 4602103
Alignment:
Q  61 ttgtttaagcaaaacctccttaataactttgtccaggttcatgtatgaacgaccacctggtctagtgttctcctctgccttcttctttaactcgacggcc 160  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||| | ||||    
T  4601792 ttgtttaagcaacacctccttaataactttgtccaggttcttgtatgaacaaccacctagtctagtgctctcctttgccatcttcttcaactccatggcc 4601891  T
Q  161 ttttgcctcatcttctttcctttctctcccaccatcaattcattgactagcttctccacctcatctctcttcacatctctatcgatttcaagtccaatct 260  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||  | |||| ||||||||  |||||| ||| ||| ||||||||||||| | |||||||||| |  |||||||    
T  4601892 ttttgcctcatcttcttgcctttatctccggctatcacttcattgatcagcttcgccaactcctctctcttcacatttgtatcgatttccataccaatct 4601991  T
Q  261 cccattcgttgcaaataattctacagtttgttggctgatcaccaaagaatggccaacaaagcattggcactccagcgcatatgctttcagtggttgaatt 360  Q
    ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||  |||| || |||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  4601992 cccattcattacaaataaatctacagtttgttggctgatcggcaaaaaaaggccaacacaacatcggcactccagcacatatgctttcagtggttgagtt 4602091  T
Q  361 ccatccacaatg 372  Q
    ||||||||||||    
T  4602092 ccatccacaatg 4602103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 61 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 4515250 - 4514939
Alignment:
Q  61 ttgtttaagcaaaacctccttaataactttgtccaggttcatgtatgaacgaccacctggtctagtgttctcctctgccttcttctttaactcgacggcc 160  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||||||| ||||| |||||||   || ||  ||||||||| ||| ||||||||||| || ||||| |   ||    
T  4515250 ttgtttaagcaacacctccttgatcactttgtccaagttcaagtatgaagacccgccaagtctagtgtcctcgtctgccttctttttcaactccataacc 4515151  T
Q  161 ttttgcctcatcttctttcctttctctcccaccatcaattcattgactagcttctccacctcatctctcttcacatctctatcgatttcaagtccaatct 260  Q
    |||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||   |||||||||| |  |||||||    
T  4515150 tttttcctcattttatttcctttctctcccaccatcaattcattgacaagcttttcaacctcctctctcttcacattcatatcgatttcgatcccaatct 4515051  T
Q  261 cccattcgttgcaaataattctacagtttgttggctgatcaccaaagaatggccaacaaagcattggcactccagcgcatatgctttcagtggttgaatt 360  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  4515050 cccattcattgcaaataaatctacagtttgttggttgatcaccaaagaattgccaacaaagcattggcactccagcgcatatgctctcagtggttgagtt 4514951  T
Q  361 ccatccacaatg 372  Q
    |||||| |||||    
T  4514950 ccatccgcaatg 4514939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 61 - 372
Target Start/End: Original strand, 4563714 - 4564025
Alignment:
Q  61 ttgtttaagcaaaacctccttaataactttgtccaggttcatgtatgaacgaccacctggtctagtgttctcctctgccttcttctttaactcgacggcc 160  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| ||| || | ||| ||||| |||||  | |||||||| ||||| |  |||    
T  4563714 ttgtttaagcaaaacctccttgatcactttgtccaagttcatgtatgaacaacctccagctctcgtgttttcctccactttcttcttcaactcaattgcc 4563813  T
Q  161 ttttgcctcatcttctttcctttctctcccaccatcaattcattgactagcttctccacctcatctctcttcacatctctatcgatttcaagtccaatct 260  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||   |||||||||| |  |||||||    
T  4563814 ttttgccgcatcttctttcctttctctcctgacatcaattcattgacaagtttctccacctcttctctctttacattcgtatcgatttccatcccaatct 4563913  T
Q  261 cccattcgttgcaaataattctacagtttgttggctgatcaccaaagaatggccaacaaagcattggcactccagcgcatatgctttcagtggttgaatt 360  Q
    ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  4563914 cccattcattgtaaataagtctacagtttgttggctgatcaccaaagaatggccaacacaacattggaactccagcacatatgctttcagtggttgagtt 4564013  T
Q  361 ccatccacaatg 372  Q
    |||||| |||||    
T  4564014 ccatccgcaatg 4564025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 61 - 372
Target Start/End: Original strand, 4617025 - 4617336
Alignment:
Q  61 ttgtttaagcaaaacctccttaataactttgtccaggttcatgtatgaacgaccacctggtctagtgttctcctctgccttcttctttaactcgacggcc 160  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||    
T  4617025 ttgtttaagcaacacatccttaataactttgttcaagttcatgtatgaacaaccacctggtctagtgttctcctctgccttcttcttcaactccatggcc 4617124  T
Q  161 ttttgcctcatcttctttcctttctctcccaccatcaattcattgactagcttctccacctcatctctcttcacatctctatcgatttcaagtccaatct 260  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||  | |||| ||||||||  |||||  ||| ||| |||||||||||||   |||||||||| |  |||||||    
T  4617125 ttttgcttcattttctttcctttatctccggctatcacttcattgatcagctttgccaactcctctctcttcacattcgtatcgatttccataccaatct 4617224  T
Q  261 cccattcgttgcaaataattctacagtttgttggctgatcaccaaagaatggccaacaaagcattggcactccagcgcatatgctttcagtggttgaatt 360  Q
    ||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||| ||  |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4617225 cccattcattacaaataaatctacagtctgttggctggtcggcaaaaaatggccaacacaacattggcactccagcgcatatactttcagtggttgaatt 4617324  T
Q  361 ccatccacaatg 372  Q
    |||||| |||||    
T  4617325 ccatccgcaatg 4617336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 16 - 372
Target Start/End: Original strand, 4625909 - 4626265
Alignment:
Q  16 atcaagaggatatcgatgaatacacaaccacattttaagttaacattgtttaagcaaaacctccttaataactttgtccaggttcatgtatgaacgacca 115  Q
    |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| || || ||||| | ||| ||||  ||||||||||||| ||||    
T  4625909 atcaagaggggattgatgaatacacaaccacattttaatctaatattgtttaagcaagacatcattaatcagtttatccatattcatgtatgaacaacca 4626008  T
Q  116 cctggtctagtgttctcctctgccttcttctttaactcgacggccttttgcctcatcttctttcctttctctcccaccatcaattcattgactagcttct 215  Q
    || || ||| |||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||| ||||||  || ||||    
T  4626009 ccgggactaatgttctcctctgccttcttcttcaactccatggccttttgcctcatcttctttccgttatctcctgccatcaatgcattgatcagtttct 4626108  T
Q  216 ccacctcatctctcttcacatctctatcgatttcaagtccaatctcccattcgttgcaaataattctacagtttgttggctgatcaccaaagaatggcca 315  Q
    | ||| | || ||||||||||    ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||   ||||||    
T  4626109 ctaccccctccctcttcacattagcatcgatttccattccaatctcccattcattgcaaatatatctacaatttgttggctgatcagcaaaatttggcca 4626208  T
Q  316 acaaagcattggcactccagcgcatatgctttcagtggttgaattccatccacaatg 372  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  4626209 acacagcattggaactccagcgcatatgctttcaatggttgagttccatccacaatg 4626265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 61 - 372
Target Start/End: Original strand, 4505860 - 4506171
Alignment:
Q  61 ttgtttaagcaaaacctccttaataactttgtccaggttcatgtatgaacgaccacctggtctagtgttctcctctgccttcttctttaactcgacggcc 160  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| ||||| || | ||||| |||| |||| || ||||| | | ||    
T  4505860 ttgtttaagcaacacctccttaataactttgtccaagttcatgaatgaacaaccaccaggtcttgtatcctcctttgccctctttttcaactccatgacc 4505959  T
Q  161 ttttgcctcatcttctttcctttctctcccaccatcaattcattgactagcttctccacctcatctctcttcacatctctatcgatttcaagtccaatct 260  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||| ||| |||||||| || |  ||||| |||||||   |||| ||||| | ||||||||    
T  4505960 tttttcctcatcttgtttcctttctctccaaccataatttcatcgaccagcttctctacattttctctattcacattagtatcaatttcgattccaatct 4506059  T
Q  261 cccattcgttgcaaataattctacagtttgttggctgatcaccaaagaatggccaacaaagcattggcactccagcgcatatgctttcagtggttgaatt 360  Q
    || |||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4506060 ccaattcattgcaaataaatctacagtttgttggttgatcaccaaagaacggccaacacagcattggcactccagcgcatatgctttcagtggttgagtt 4506159  T
Q  361 ccatccacaatg 372  Q
    |||||| |||||    
T  4506160 ccatccgcaatg 4506171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 61 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 4613847 - 4613536
Alignment:
Q  61 ttgtttaagcaaaacctccttaataactttgtccaggttcatgtatgaacgaccacctggtctagtgttctcctctgccttcttctttaactcgacggcc 160  Q
    |||||| ||||  ||||| || || |||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| |  |||    
T  4613847 ttgtttcagcagcacctcattgatcactttgtccaagttcatatatgaacaacctcctggtctcgtgtcctcctctgccttcttcttcaactcaattgcc 4613748  T
Q  161 ttttgcctcatcttctttcctttctctcccaccatcaattcattgactagcttctccacctcatctctcttcacatctctatcgatttcaagtccaatct 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||   | || ||||| |  ||||| |    
T  4613747 ttttgcctcattttctttcctttctctcccaccatcaattcattgaccagcttctctacctcatctctcttcacattggtgtcaatttccatcccaattt 4613648  T
Q  261 cccattcgttgcaaataattctacagtttgttggctgatcaccaaagaatggccaacaaagcattggcactccagcgcatatgctttcagtggttgaatt 360  Q
    ||||||| ||||| |||  ||| ||||||| |||||||||  | || ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  4613647 cccattcattgcatatatatctgcagtttgctggctgatccgcgaaaaatggccaacacaacattggcactccagcacatatgctttcagtggttgagtt 4613548  T
Q  361 ccatccacaatg 372  Q
    ||||||||||||    
T  4613547 ccatccacaatg 4613536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 60 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 4256742 - 4256429
Alignment:
Q  60 attgtttaagcaaaacctccttaataactttgtccaggttcatgtatgaacgaccacctggtctagtgttctcctctgccttcttctttaactcgacggc 159  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||| |||| || ||||||| ||||| ||||||||| || || | | |    
T  4256742 attgtttaagcatgacctccttaataactttgtccaagttcatcaatgaatgaccagctgggctggtgttcttctctgtcttcttcttcaattccatgac 4256643  T
Q  160 cttttgcctcatcttctttcctttctctcccaccatcaattcattgactagcttctccacctcatctctcttcacatctctatcgatttcaagtccaatc 259  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||| |||||||    
T  4256642 cttttgcctcatcttctttcctttttctcccgacatcaattcattgatcagattctccacctcatctctcttcacattagtattgatttcaattccaatc 4256543  T
Q  260 tcccattcgttgcaaataattctacagtttgttgg-ctgatcaccaaagaatggccaacaaagcattggcactccagcgcatatgctttcagtggttgaa 358  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| | |||||| ||||| || || ||||||||| |||||||     
T  4256542 tcccattcgctacaaataaatctacagtttgttggtctgatcagcaaaaaatggccaacacaacattggaactccggcacaaatgctttcaatggttgag 4256443  T
Q  359 ttccatccacaatg 372  Q
    |||||||| |||||    
T  4256442 ttccatcctcaatg 4256429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 179 - 372
Target Start/End: Original strand, 4457715 - 4457908
Alignment:
Q  179 cctttctctcccaccatcaattcattgactagcttctccacctcatctctcttcacatctctatcgatttcaagtccaatctcccattcgttgcaaataa 278  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |  |||||||| ||||| ||||||||||    
T  4457715 cctttttctcccaccatcaattcattgactaacttctccacctcatctctcttcacatttgtatcgatttccatcccaatctctcattcattgcaaataa 4457814  T
Q  279 ttctacagtttgttggctgatcaccaaagaatggccaacaaagcattggcactccagcgcatatgctttcagtggttgaattccatccacaatg 372  Q
     ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  4457815 atctacaacttgttggcttatcaccaaagaatggccaacgcagcattggcactccagcgcatatgctttcagtggttgagtttcatccacaatg 4457908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 60 - 372
Target Start/End: Original strand, 4622144 - 4622456
Alignment:
Q  60 attgtttaagcaaaacctccttaataactttgtccaggttcatgtatgaacgaccacctggtctagtgttctcctctgccttcttctttaactcgacggc 159  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||| || || ||  |||| |||||||||| ||| ||||| | |||    
T  4622144 attgtttaagcatgacctccttaataactttgtccaagttgttgtatgaacaaccaccagggctggtcgtctcatctgccttctccttcaactccatggc 4622243  T
Q  160 cttttgcctcatcttctttcctttctctcccaccatcaattcattgactagcttctccacctcatctctcttcacatctctatcgatttcaagtccaatc 259  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||  || |||  |||||| ||||| |||||||   ||| |||||| | |||||||    
T  4622244 cttttgtctcatcttctttcctttatctcccgacatcaattcattgatcagattcgacacctcctctcttttcacattagtattgatttcgattccaatc 4622343  T
Q  260 tcccattcgttgcaaataattctacagtttgttggctgatcaccaaagaatggccaacaaagcattggcactccagcgcatatgctttcagtggttgaat 359  Q
    ||||||   ||||| |||  |||||||||||||||||||||| | || ||||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  4622344 tcccatgaattgcagatatatctacagtttgttggctgatcagcgaaaaatggccaacacagcattgaaactccagcacatatgctttcggtggttgaat 4622443  T
Q  360 tccatccacaatg 372  Q
    |||||||||||||    
T  4622444 tccatccacaatg 4622456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 61 - 372
Target Start/End: Original strand, 4516324 - 4516635
Alignment:
Q  61 ttgtttaagcaaaacctccttaataactttgtccaggttcatgtatgaacgaccacctggtctagtgttctcctctgccttcttctttaactcgacggcc 160  Q
    |||||| ||||  ||||||||||| ||||| |||| |||||  ||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || || | ||||    
T  4516324 ttgtttgagcagcacctccttaatcactttttccaagttcacatatgaacaaccacctggtcttgtgtcctcctctgccttcttcttcaattccatggcc 4516423  T
Q  161 ttttgcctcatcttctttcctttctctcccaccatcaattcattgactagcttctccacctcatctctcttcacatctctatcgatttcaagtccaatct 260  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||   |||| |||||   ||||||||    
T  4516424 ttttgcctcatcttctttcctttatctcccaccattaattcattgatcagcttctccacctcctctctcttcacattggtatcaatttctgctccaatct 4516523  T
Q  261 cccattcgttgcaaataattctacagtttgttggctgatcaccaaagaatggccaacaaagcattggcactccagcgcatatgctttcagtggttgaatt 360  Q
    ||||||| |||||||||  ||| || ||||||||||| ||| |||| || |||||||| | |||||| ||||| || || ||||||||  | || || ||    
T  4516524 cccattcattgcaaatatatctgcaatttgttggctgctcagcaaaaaaaggccaacacaacattggtactccggcacagatgctttccattgtggagtt 4516623  T
Q  361 ccatccacaatg 372  Q
    ||||||||||||    
T  4516624 ccatccacaatg 4516635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 64 - 369
Target Start/End: Original strand, 4570978 - 4571283
Alignment:
Q  64 tttaagcaaaacctccttaataactttgtccaggttcatgtatgaacgaccacctggtctagtgttctcctctgccttcttctttaactcgacggccttt 163  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| | ||| |     |||    
T  4570978 tttaagcaaaacctccttaatcactttttccaagttcatgtatgaacaaccaccaggtctcgtgtcctcctccgccttcttcttcatctccattatattt 4571077  T
Q  164 tgcctcatcttctttcctttctctcccaccatcaattcattgactagcttctccacctcatctctcttcacatctctatcgatttcaagtccaatctccc 263  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||   |||||||||| | |||||||||||    
T  4571078 ttcctcatcttctttcctttatctcccaccatcaattcattgaccaaattctccacctcatttctcttcacattagtatcgatttcgattccaatctccc 4571177  T
Q  264 attcgttgcaaataattctacagtttgttggctgatcaccaaagaatggccaacaaagcattggcactccagcgcatatgctttcagtggttgaattcca 363  Q
    ||   ||||| |||  ||||||||||| |||||||||| |||| |||||| |||| | |||||| |||||||   |||||||||| || ||||| |||||    
T  4571178 atgtattgcagatatatctacagtttgctggctgatcagcaaaaaatggctaacacaacattggaactccagtagatatgctttcggtcgttgagttcca 4571277  T
Q  364 tccaca 369  Q
    ||||||    
T  4571278 tccaca 4571283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 61 - 372
Target Start/End: Original strand, 4557128 - 4557439
Alignment:
Q  61 ttgtttaagcaaaacctccttaataactttgtccaggttcatgtatgaacgaccacctggtctagtgttctcctctgccttcttctttaactcgacggcc 160  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||| |||||| |||| | ||| |    |    
T  4557128 ttgtttaagcaaaacctccttaatcactttttccaaattcatgtatgaacaaccaccaggtctcgtgtcctcctccgccttcgtcttcatctcaattatc 4557227  T
Q  161 ttttgcctcatcttctttcctttctctcccaccatcaattcattgactagcttctccacctcatctctcttcacatctctatcgatttcaagtccaatct 260  Q
    |||| || |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||   | || ||||| |  |||||||    
T  4557228 tttttccacatcttctttcctttctccccctccatcaattcattgaccaaattctctacctcatctctcttcacattggtgtcaatttccatgccaatct 4557327  T
Q  261 cccattcgttgcaaataattctacagtttgttggctgatcaccaaagaatggccaacaaagcattggcactccagcgcatatgctttcagtggttgaatt 360  Q
    |||||   |||||||||  ||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| | |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| ||    
T  4557328 cccatgtattgcaaatatatctgcagtttgctggctgatcagcaaaaaatggccaacacaacattggaactccagcagatatgctttcagtggttgagtt 4557427  T
Q  361 ccatccacaatg 372  Q
    ||||||||||||    
T  4557428 ccatccacaatg 4557439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 61 - 372
Target Start/End: Original strand, 4560509 - 4560820
Alignment:
Q  61 ttgtttaagcaaaacctccttaataactttgtccaggttcatgtatgaacgaccacctggtctagtgttctcctctgccttcttctttaactcgacggcc 160  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||| || ||||| |||| | |||| ||||| ||||| | ||| | ||||    
T  4560509 ttgtttaagcaacacctccttaatcactttctccaagttcatgtatgaacaacctccaggtctcgtgtacacctccgcctttttcttcagctccatggcc 4560608  T
Q  161 ttttgcctcatcttctttcctttctctcccaccatcaattcattgactagcttctccacctcatctctcttcacatctctatcgatttcaagtccaatct 260  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||    ||||||||||||||| || |||||||| || || ||||| |||| | |||| |||||   ||||||||    
T  4560609 ttttgcctcatcttctttcctttatctcaggacatcaattcattgaccagtttctccacgtcctccctctttacatttgtatcaatttcgtttccaatct 4560708  T
Q  261 cccattcgttgcaaataattctacagtttgttggctgatcaccaaagaatggccaacaaagcattggcactccagcgcatatgctttcagtggttgaatt 360  Q
     |||||| |||||||||  ||| ||||||| |||||||||  |||| ||||||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  4560709 tccattcattgcaaatatatcttcagtttgctggctgatctgcaaaaaatggccaacacaacattggaactccagcacatatgctttcagtggttgagtt 4560808  T
Q  361 ccatccacaatg 372  Q
    |||||| |||||    
T  4560809 ccatccgcaatg 4560820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 60 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 4260284 - 4259972
Alignment:
Q  60 attgtttaagcaaaacctccttaataactttgtccaggttcatgtatgaacgaccacctggtctagtgttctcctctgccttcttctttaactcgacggc 159  Q
    ||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||  ||||  ||| || |||||||||||||||||| |||| ||||| | | |    
T  4260284 attgtttgagcatgacctgcttaataactttgtccaagttcatcaatgaataaccagatggactggtgttctcctctgccttcctcttcaactccatgac 4260185  T
Q  160 cttttgcctcatcttctttcctttctctcccaccatcaattcattgactagcttctccacctcatctctcttcacatctctatcgatttcaagtccaatc 259  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||   ||| | ||||||||  |||||| ||||||||||||| |||||||   |||  ||||||| |||||||    
T  4260184 cttttgcctcatcttctttccttcttctcctgacataatttcattgatcagcttcgccacctcatctcttttcacattagtattaatttcaattccaatc 4260085  T
Q  260 tcccattcgttgcaaataattctacagtttgttggctgatcaccaaagaatggccaacaaagcattggcactccagcgcatatgctttcagtggttgaat 359  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | |||||| ||| | || || ||||||||| ||||||| |    
T  4260084 tcccattcgttacaaataaatctacagtttgttggctgatcagcaaaaaatggccaacacaacattggaacttcggcacaaatgctttcaatggttgagt 4259985  T
Q  360 tccatccacaatg 372  Q
    ||||||| |||||    
T  4259984 tccatccgcaatg 4259972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 61 - 372
Target Start/End: Original strand, 4574311 - 4574622
Alignment:
Q  61 ttgtttaagcaaaacctccttaataactttgtccaggttcatgtatgaacgaccacctggtctagtgttctcctctgccttcttctttaactcgacggcc 160  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||  ||||||||| ||| || ||||| |||| | ||||  |||||||||| | ||| | |||     
T  4574311 ttgtttaagcaacacctccttaatcactttctccaagtttgtgtatgaacaacctccaggtctcgtgtccacctccaccttcttcttcagctcaatggct 4574410  T
Q  161 ttttgcctcatcttctttcctttctctcccaccatcaattcattgactagcttctccacctcatctctcttcacatctctatcgatttcaagtccaatct 260  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||   ||||||||||   ||||||||    
T  4574411 ttttgcctcatcttctttcctttatctccggacatcaattcattgaccagtttctccacctcctccctctttacattagtatcgatttcctttccaatct 4574510  T
Q  261 cccattcgttgcaaataattctacagtttgttggctgatcaccaaagaatggccaacaaagcattggcactccagcgcatatgctttcagtggttgaatt 360  Q
    ||||||| |||||||||  ||| ||||||| |||||||||   ||| ||||||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  4574511 cccattcattgcaaatatatctgcagtttgctggctgatccgaaaaaaatggccaacataacattggaactccagcacatatgctttcagtggttgagtt 4574610  T
Q  361 ccatccacaatg 372  Q
    |||||| |||||    
T  4574611 ccatccgcaatg 4574622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 60 - 366
Target Start/End: Original strand, 3171743 - 3172049
Alignment:
Q  60 attgtttaagcaaaacctccttaataactttgtccaggttcatgtatgaacgaccacctggtctagtgttctcctctgccttcttctttaactcgacggc 159  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||   ||| || | |||||||||||||||||| ||||| | |||    
T  3171743 attgtttaagcaagacctccttaatcactttatccaagttcatgtatgaacaaccaccaaatcttgtatcctcctctgccttcttcttcaactccatggc 3171842  T
Q  160 cttttgcctcatcttctttcctttctctcccaccatcaattcattgactagcttctccacctcatctctcttcacatctctatcgatttcaagtccaatc 259  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||| |||||  ||||||| ||||   |||| ||||| |  ||||||    
T  3171843 cctttgcctcatcttctttcctttctctcccaccatcaattcgttgatcagtttctctacctcccctctctttacattggtatcaatttccatcccaatc 3171942  T
Q  260 tcccattcgttgcaaataattctacagtttgttggctgatcaccaaagaatggccaacaaagcattggcactccagcgcatatgctttcagtggttgaat 359  Q
    | |||||| | |||||||||||||| ||| | ||| |||||| |||| ||||||| ||| | |||||||| |||||| ||||  ||||| |||||||| |    
T  3171943 ttccattcttggcaaataattctactgttaggtggttgatcagcaaaaaatggcctacacaacattggcattccagcacatacactttccgtggttgagt 3172042  T
Q  360 tccatcc 366  Q
    |||||||    
T  3172043 tccatcc 3172049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 64 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 4490481 - 4490173
Alignment:
Q  64 tttaagcaaaacctccttaataactttgtccaggttcatgtatgaacgaccacctggtctagtgttctcctctgccttcttctttaactcgacggccttt 163  Q
    ||||||||  || |||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||  |||| |||| |||| ||||||||||||| |||||    ||||||    
T  4490481 tttaagcatgacatccttaatcactttgtccaagttcatgtatgaactaccaccgagtctcgtgtcctccgctgccttcttcttcaactccgtcgccttt 4490382  T
Q  164 tgcctcatcttctttcctttctctcccaccatcaattcattgactagcttctccacctcatctctcttcacatctctatcgatttcaagtccaatctccc 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||| |||||||| ||||   |||| ||||  |  ||||||||||    
T  4490381 tgcctcatcttctttcctttctctcccaccatcaattcattgatcagtttctctacctcttctctctttacattggtatcaattttcatcccaatctccc 4490282  T
Q  264 attcgttgcaaataattctacagtttgttggctgatcaccaaagaatggccaacaaagcattggcactccagcgcatatgctttcagtggttgaattcca 363  Q
    |||| | |||||||||||||| | |   ||| |||||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| || ||  || |||| |||||    
T  4490281 attcttcgcaaataattctactgctaagtggttgatcagcaaaaaatggccaacacaacattggcactccagcacatatactctccatgattgagttcca 4490182  T
Q  364 tccacaatg 372  Q
    |||||||||    
T  4490181 tccacaatg 4490173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 61 - 372
Target Start/End: Original strand, 4492958 - 4493269
Alignment:
Q  61 ttgtttaagcaaaacctccttaataactttgtccaggttcatgtatgaacgaccacctggtctagtgttctcctctgccttcttctttaactcgacggcc 160  Q
    |||||||||||| || ||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||| |||   |||| ||||||||||||||| || |||||   |||     
T  4492958 ttgtttaagcaagacatccttgatcactttgtccaagttcatgtatgaacaaccaccaggtactgtgtcctcctctgccttctttttcaactccgtggct 4493057  T
Q  161 ttttgcctcatcttctttcctttctctcccaccatcaattcattgactagcttctccacctcatctctcttcacatctctatcgatttcaagtccaatct 260  Q
    |||  ||||||||| |||||||||||||| ||||| |  |||||||| || |||||||| |  ||||| || ||||  ||||||||||| | ||||||||    
T  4493058 tttctcctcatcttgtttcctttctctccaaccataatctcattgaccagattctccacattttctctattaacattcctatcgatttctactccaatct 4493157  T
Q  261 cccattcgttgcaaataattctacagtttgttggctgatcaccaaagaatggccaacaaagcattggcactccagcgcatatgctttcagtggttgaatt 360  Q
    || |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||||||||| || |||||| |||  || ||||| ||    
T  4493158 ccaattcattgcaaatcaatctacagtttgttggctgatcactaaagaaaggccaacacaacattggcactccggcacatatgtttttggtagttgagtt 4493257  T
Q  361 ccatccacaatg 372  Q
    ||||||||||||    
T  4493258 ccatccacaatg 4493269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 64 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 4504523 - 4504215
Alignment:
Q  64 tttaagcaaaacctccttaataactttgtccaggttcatgtatgaacgaccacctggtctagtgttctcctctgccttcttctttaactcgacggccttt 163  Q
    ||||||||| || |||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||  |||| |||| |||||||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  4504523 tttaagcaagacgtccttaatcactttgtccaagttcatgtatgaacaaccaccaagtcttgtgtcctcctctgccttcttcttcaactccatggccttt 4504424  T
Q  164 tgcctcatcttctttcctttctctcccaccatcaattcattgactagcttctccacctcatctctcttcacatctctatcgatttcaagtccaatctccc 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || ||||| ||||| |||||||  ||||    ||| || |  |  ||||||||||    
T  4504423 tgcctcatcttctttcctttctctcccaccatcaattcattaataagtttctctacctcttctctctgtacattggcatcaatcttcatcccaatctccc 4504324  T
Q  264 attcgttgcaaataattctacagtttgttggctgatcaccaaagaatggccaacaaagcattggcactccagcgcatatgctttcagtggttgaattcca 363  Q
    |||| | |||||||||  | |  ||   ||||||||||  ||| ||||||||||| | ||||||||||||||| || |  |||||||||||||| |||||    
T  4504323 attcttcgcaaataatgttgctattaagtggctgatcagaaaaaaatggccaacacaacattggcactccagcacaaacactttcagtggttgagttcca 4504224  T
Q  364 tccacaatg 372  Q
    |||||||||    
T  4504223 tccacaatg 4504215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 61 - 372
Target Start/End: Original strand, 4579435 - 4579746
Alignment:
Q  61 ttgtttaagcaaaacctccttaataactttgtccaggttcatgtatgaacgaccacctggtctagtgttctcctctgccttcttctttaactcgacggcc 160  Q
    |||||| || || ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||  || || ||||| |||| ||||||  |||||||||| ||||| |  |||    
T  4579435 ttgtttgagtaacacctccttaatcactttctccaagttcatgtatgaacagcctccaggtctcgtgtcctcctccaccttcttcttcaactcaattgcc 4579534  T
Q  161 ttttgcctcatcttctttcctttctctcccaccatcaattcattgactagcttctccacctcatctctcttcacatctctatcgatttcaagtccaatct 260  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||   | |||||||||| |||||| |    
T  4579535 ttttgcctcatcttctttgctttctctcccaccatcaattcattaaccagcttctccacctcctctctcttcacattagtgtcgatttcaattccaattt 4579634  T
Q  261 cccattcgttgcaaataattctacagtttgttggctgatcaccaaagaatggccaacaaagcattggcactccagcgcatatgctttcagtggttgaatt 360  Q
     ||||   ||||| | |  ||| ||| ||  ||| |||||| | || ||||||||||| | |||||| ||||||||  |||||||||||||| |||| ||    
T  4579635 tccatgtattgcataaatatctgcagcttactgggtgatcagcgaaaaatggccaacacaacattggaactccagcagatatgctttcagtgattgagtt 4579734  T
Q  361 ccatccacaatg 372  Q
    |||||| |||||    
T  4579735 ccatccgcaatg 4579746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 60 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 4299870 - 4299671
Alignment:
Q  60 attgtttaagcaaaacctccttaataactttgtccaggttcatgtatgaacgaccacctggtctagtgttctcctctgccttcttctttaactcgacggc 159  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||      |||||    ||    
T  4299870 attgtttaagcagaacctccttaataactttgtccaagttcatgtacgaacaaccacctggattagtgttctcctctgccttc------aactcccttgc 4299777  T
Q  160 cttttgcctcatcttctttcctttctctcccaccatcaattcattgactagcttctccacctcatctctcttcacatctctatcgatttcaagtccaatc 259  Q
    |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||||| |||||| | |||||||||| | |||||||    
T  4299776 cttttgtctcatcttatctcctttctctcccaccatcaattcattgatcagcttttccacctcctctctcctcacatttgtatcgatttcgattccaatc 4299677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 62 - 372
Target Start/End: Original strand, 4598175 - 4598485
Alignment:
Q  62 tgtttaagcaaaacctccttaataactttgtccaggttcatgtatgaacgaccacctggtctagtgttctcctctgccttcttctttaactcgacggcct 161  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||| || | |||||||||||||| ||| ||  |||| || | |||||| |||||| |||| || || |  | ||    
T  4598175 tgtttaagaaacacctccttaatcactttctctaagttcatgtatgaacaacctccaagtctcgtttcctcctccgccttcatcttcaaatcaattgtct 4598274  T
Q  162 tttgcctcatcttctttcctttctctcccaccatcaattcattgactagcttctccacctcatctctcttcacatctctatcgatttcaagtccaatctc 261  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||   | || ||||  | |||||||||    
T  4598275 tttgcctcattttctttcctttatctcccgacatcaattcgttgaccagcttctccacctcctctctcttcacattagtttcaattttgattccaatctc 4598374  T
Q  262 ccattcgttgcaaataattctacagtttgttggctgatcaccaaagaatggccaacaaagcattggcactccagcgcatatgctttcagtggttgaattc 361  Q
    |||||| |||||||||  ||| ||||| | | |||||||  | || || || ||||| | |||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||    
T  4598375 ccattcattgcaaatatatctgcagttggcttgctgatccgcgaaaaagggacaacacaacattggcactccggcacatatactttcagtggttgagttc 4598474  T
Q  362 catccacaatg 372  Q
    ||||| |||||    
T  4598475 catccgcaatg 4598485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 77 - 332
Target Start/End: Original strand, 4568072 - 4568330
Alignment:
Q  77 tccttaataactttgtccaggttcatgtatgaacgaccacctggtctagtgttctcctctgccttcttcttt---aactcgacggccttttgcctcatct 173  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||  | |||| ||||| |||| || |||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||||||    
T  4568072 tccttaatcactttgtccaagttcatgtatgaagaatcaccaggtcttgtgtccttctctgccttcttcttcttcaactccacggccttttgcctcatct 4568171  T
Q  174 tctttcctttctctcccaccatcaattcattgactagcttctccacctcatctctcttcacatctctatcgatttcaagtccaatctcccattcgttgca 273  Q
    | |||||||||| ||||||||| |||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||| | ||| |||||| | |  || ||    
T  4568172 tttttcctttctgtcccaccattaattcattcatcagcttctccacctcctctctcttcacatttgtatcaatttcgattccgatctccaacttattaca 4568271  T
Q  274 aataattctacagtttgttggctgatcaccaaagaatggccaacaaagcattggcactc 332  Q
    ||||  ||| |||| ||||||||| |||  ||| || |||||||| | |||||| ||||    
T  4568272 aatatatctgcagtatgttggctgctcagaaaaaaaaggccaacataacattggtactc 4568330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 4392154 - 4392052
Alignment:
Q  62 tgtttaagcaaaacctccttaataactttgtccaggttcatgtatgaacgaccacctggtctagtgttctcctctgccttcttctttaactcgacggcct 161  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | |||||||| ||||||| |||||  |||||| ||||  |||| ||||| |||||||||||| |||||||  ||||    
T  4392154 tgtttaagcaagacctccttaatcagtttgtccaagttcatgaatgaagaaccaccaggtcatgtgtcctcctttgccttcttcttcaactcgatcgcct 4392055  T
Q  162 ttt 164  Q
    |||    
T  4392054 ttt 4392052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 61 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 4607020 - 4606958
Alignment:
Q  61 ttgtttaagcaaaacctccttaataactttgtccaggttcatgtatgaacgaccacctggtct 123  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||  ||||||||||||    
T  4607020 ttgtttaagcaaaaccttcttaatcactttttccaagttcatgtatgaaaaaccacctggtct 4606958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 2)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 60 - 372
Target Start/End: Original strand, 24103001 - 24103313
Alignment:
Q  60 attgtttaagcaaaacctccttaataactttgtccaggttcatgtatgaacgaccacctggtctagtgttctcctctgccttcttctttaactcgacggc 159  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| | ||| |||||||| |||||||||||||| ||||| | | |    
T  24103001 attgtttaagcatgacctccttaataactttgtccaagttcatgtatgaaaaaccaccagatcttgtgttctcttctgccttcttcttgaactccaagac 24103100  T
Q  160 cttttgcctcatcttctttcctttctctcccaccatcaattcattgactagcttctccacctcatctctcttcacatctctatcgatttcaagtccaatc 259  Q
    ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||    
T  24103101 cttttgcttcatcgtctttccgttctctcccaccatcaattcattgactaacttctcgacgtcatctctcttcacatttgtatcgatttcgagtccaatc 24103200  T
Q  260 tcccattcgttgcaaataattctacagtttgttggctgatcaccaaagaatggccaacaaagcattggcactccagcgcatatgctttcagtggttgaat 359  Q
    |||||||| | |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  24103201 tcccattcatagcaaataaatctacagtttgttggttgatcaccaaagaatggccaacacaacattggcactccagcacatatgctttcagtggttgagt 24103300  T
Q  360 tccatccacaatg 372  Q
    ||||||| |||||    
T  24103301 tccatccgcaatg 24103313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 61 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 28000228 - 27999923
Alignment:
Q  61 ttgtttaagcaaaacctccttaataactttgtccaggttcatgtatgaacgaccacctggtctagtgttctcctctgccttcttctttaactcgacggcc 160  Q
    |||||||| ||| || |||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||    
T  28000228 ttgtttaaacaacacttccttaatcactttgtccaagttcatgtatgaacaaccacctggtctagtgttctcctctgcctttttcttcaactccatggcc 28000129  T
Q  161 ttttgcctcatcttctttcctttctctcccaccatcaattcattgactagcttctccacctcatctctcttcacatctctatcgatttcaagtccaatct 260  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  || ||| |||||||||   |||| ||||| |  |||||||    
T  28000128 ttttgcctcatcttttttccattctctcccaccatcaattcattgataagcttctccaaatcctctatcttcacattcatatcaatttccataccaatct 28000029  T
Q  261 cccattcgttgcaaataattctacagtttgttggctgatcaccaaagaatggccaacaaagcattggcactccagcgcatatgctttcagtggttgaatt 360  Q
     |||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  28000028 tccattcattacaaataaatctacagtttgttggctgatcagcaaaaaatgaccaacacaacattggcactccagcgcatatgctttcggtggttgagtt 27999929  T
Q  361 ccatcc 366  Q
    ||||||    
T  27999928 ccatcc 27999923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 174; Significance: 2e-93; HSPs: 3)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 61 - 366
Target Start/End: Original strand, 1674229 - 1674534
Alignment:
Q  61 ttgtttaagcaaaacctccttaataactttgtccaggttcatgtatgaacgaccacctggtctagtgttctcctctgccttcttctttaactcgacggcc 160  Q
    |||||||||||| || |||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || | ||||    
T  1674229 ttgtttaagcaacacttccttaatcactttgtccaagttcatgtatgaacaaccacctggtctagtgttctcctctgccttcttcttcaattccatggcc 1674328  T
Q  161 ttttgcctcatcttctttcctttctctcccaccatcaattcattgactagcttctccacctcatctctcttcacatctctatcgatttcaagtccaatct 260  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||   | |||||||||||||   |||| ||||| |  |||||||    
T  1674329 ttttgcctcatcttttttccattctctcccaccatcaattcattgataagcttctccaaaccctctctcttcacattcgtatcaatttccataccaatct 1674428  T
Q  261 cccattcgttgcaaataattctacagtttgttggctgatcaccaaagaatggccaacaaagcattggcactccagcgcatatgctttcagtggttgaatt 360  Q
     |||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1674429 tccattcattacaaataaatctacagtttgttggctgatcagcaaaaaatggccaacacaacattggcactccagcgcatatgctttcagtggttgagtt 1674528  T
Q  361 ccatcc 366  Q
    ||||||    
T  1674529 ccatcc 1674534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 61 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 20863972 - 20863661
Alignment:
Q  61 ttgtttaagcaaaacctccttaataactttgtccaggttcatgtatgaacgaccacctggtctagtgttctcctctgccttcttctttaactcgacggcc 160  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||  | ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||    | |    
T  20863972 ttgtttaagcaacacctccttaatcactttgtccaagttcatatatgaaccaccttccggtcttgtgtcctcctctgccttcttcttcaactcatttgtc 20863873  T
Q  161 ttttgcctcatcttctttcctttctctcccaccatcaattcattgactagcttctccacctcatctctcttcacatctctatcgatttcaagtccaatct 260  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||||   | || ||||| |  |||||||    
T  20863872 ttttgcctcatcctccttcctttctctcccaccatcaattcatttaccagcatctccacctcctctctcttgacattggtgtcaatttcgatcccaatct 20863773  T
Q  261 cccattcgttgcaaataattctacagtttgttggctgatcaccaaagaatggccaacaaagcattggcactccagcgcatatgctttcagtggttgaatt 360  Q
    |||||| |||||||||   ||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||| || | ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||    
T  20863772 cccatttgttgcaaatgtatctgcagtttgtcggctgatcagcaaaaaatggccagcacaacattggcactccagcacatatgctctcaatggttgagtt 20863673  T
Q  361 ccatccacaatg 372  Q
    ||||||||||||    
T  20863672 ccatccacaatg 20863661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 61 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 16686396 - 16686085
Alignment:
Q  61 ttgtttaagcaaaacctccttaataactttgtccaggttcatgtatgaacgaccacctggtctagtgttctcctctgccttcttctttaactcgacggcc 160  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||||| | ||  || ||  ||||| | |  |  || |    |    
T  16686396 ttgtttaagcaaaacctccataatcactttttccaagttcatgtatgaacaaccaccaggtctcgggtcttcgtccaccttcatttgcagttcaattatc 16686297  T
Q  161 ttttgcctcatcttctttcctttctctcccaccatcaattcattgactagcttctccacctcatctctcttcacatctctatcgatttcaagtccaatct 260  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||   | || ||||| |  |||||||    
T  16686296 tttttcctcatcttctttcctttctctcccaccatcaattcattgaccaatttctccacctcatctctcttcacattggtgtcaatttccatgccaatct 16686197  T
Q  261 cccattcgttgcaaataattctacagtttgttggctgatcaccaaagaatggccaacaaagcattggcactccagcgcatatgctttcagtggttgaatt 360  Q
    ||||||| |||||||||  ||| || |||| |||||||||| |||| ||||||||||| | |||||| ||||||||  |||| |||||||||||||| ||    
T  16686196 cccattcattgcaaatatatctgcattttgctggctgatcagcaaaaaatggccaacacaacattggaactccagcatatatactttcagtggttgagtt 16686097  T
Q  361 ccatccacaatg 372  Q
    ||||||||||||    
T  16686096 ccatccacaatg 16686085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 1)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 55 - 372
Target Start/End: Original strand, 3086417 - 3086734
Alignment:
Q  55 ttaacattgtttaagcaaaacctccttaataactttgtccaggttcatgtatgaacgaccacctggtctagtgttctcctctgccttcttctttaactcg 154  Q
    |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    || |||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  3086417 ttaatattttttaagcaagacctccttaataactttgtccaagttcatgtatgaacaaccaccgatactggtgttctcttctgctttcttctttaactct 3086516  T
Q  155 acggccttttgcctcatcttctttcctttctctcccaccatcaattcattgactagcttctccacctcatctctcttcacatctctatcgatttcaagtc 254  Q
     || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||   |||||||||||| ||    
T  3086517 gcgacattttgcctcatcttctttcctttatctcccaccatcaattcattgatcagcttctcgacctcctctctcttcacattagtatcgatttcaattc 3086616  T
Q  255 caatctcccattcgttgcaaataattctacagtttgttggctgatcaccaaagaatggccaacaaagcattggcactccagcgcatatgctttcagtggt 354  Q
    |||||||||||   ||||| |||  |||||||||| |||| ||||| ||| | ||||||||||| | |||||||||||||||   || |||||||   ||    
T  3086617 caatctcccatatattgcagatatatctacagtttattggttgatctccataaaatggccaacacaacattggcactccagcaagtacgctttcaaccgt 3086716  T
Q  355 tgaattccatccacaatg 372  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  3086717 tgagttccatccacaatg 3086734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 1)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 61 - 372
Target Start/End: Original strand, 1281117 - 1281428
Alignment:
Q  61 ttgtttaagcaaaacctccttaataactttgtccaggttcatgtatgaacgaccacctggtctagtgttctcctctgccttcttctttaactcgacggcc 160  Q
    |||||||||||| |  |||||||| |||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||  |||||| || || | ||||    
T  1281117 ttgtttaagcaacatttccttaatcactttgtcgaagttcatgtatgaacaaccacccggtctagtgttctcctccgccgccttcttcaattccatggcc 1281216  T
Q  161 ttttgcctcatcttctttcctttctctcccaccatcaattcattgactagcttctccacctcatctctcttcacatctctatcgatttcaagtccaatct 260  Q
    ||||  ||||| ||||||||||  || ||  | |||||||||||||  | |||  ||||||| ||||||||||||| | |||||||||| |  |||||||    
T  1281217 ttttctctcatattctttccttcatccccggctatcaattcattgatcaacttagccacctcctctctcttcacatttgtatcgatttccataccaatct 1281316  T
Q  261 cccattcgttgcaaataattctacagtttgttggctgatcaccaaagaatggccaacaaagcattggcactccagcgcatatgctttcagtggttgaatt 360  Q
     |||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  1281317 tccattcattacaaataaatctacagtctgttggctgatcagcaaaaaatggccaacacaacattggcactccagcacatatgctttcagtggttgagtt 1281416  T
Q  361 ccatccacaatg 372  Q
    |||||| |||||    
T  1281417 ccatccgcaatg 1281428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0477 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0477
Description:

Target: scaffold0477; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 59 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 4817 - 4504
Alignment:
Q  59 cattgtttaagcaaaacctccttaataactttgtccaggttcatgtatgaacgaccacctggtctagtgttctcctctgccttcttctttaactcgacgg 158  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||| |  || ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||    
T  4817 cattgtttaagcatgacctccttaatcactttgtccaagttcatgtatgaacagccaccagaactggtgttctcctctgccttcttcttcaactccatgg 4718  T
Q  159 ccttttgcctcatcttctttcctttctctcccaccatcaattcattgactagcttctccacctcatctctcttcacatctctatcgatttcaagtccaat 258  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||  |  |||   ||||  |||||||||||||   |||| ||||| |  ||| |    
T  4717 ccttttgcctcatcttcattcctttatctcccgacatcaattcattgatcatattcgttaccttctctctcttcacattagtatcaatttccataccagt 4618  T
Q  259 ctcccattcgttgcaaataattctacagtttgttggctgatcaccaaagaatggccaacaaagcattggcactccagcgcatatgctttcagtggttgaa 358  Q
    |||||||   | | | |||   | | ||||||||||||||||  | || ||||||||||| | ||||||||||||  | |||||||||||| |||||||     
T  4617 ctcccatatatgggagatataccgatagtttgttggctgatcggcgaaaaatggccaacacaacattggcactcctacacatatgctttcaatggttgag 4518  T
Q  359 ttccatccacaatg 372  Q
    |||||||| |||||    
T  4517 ttccatccgcaatg 4504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0475 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0475
Description:

Target: scaffold0475; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 212 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 3662 - 3502
Alignment:
Q  212 ttctccacctcatctctcttcacatctctatcgatttcaagtccaatctcccattcgttgcaaataattctacagtttgttggctgatcaccaaagaatg 311  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    ||| ||||||  ||||||||||||||| || |||||   ||||||||||||||  || ||    || ||||    
T  3662 ttctccacctcctctctcttcacattggaatctatttcacttccaatctcccattcattccaaatgcatctacagtttgttgagtgttcggggaaaaatg 3563  T
Q  312 gccaacaaagcattggcactccagcgcatatgctttcagtggttgaattccatccacaatg 372  Q
    ||||||  |||||||| |||||||  || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  3562 gccaacgcagcattggaactccagaacaaatgctttcaatggttgagttccatccacaatg 3502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University