View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF21525_high_9 (Length: 376)

Name: NF21525_high_9
Description: NF21525
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF21525_high_9
NF21525_high_9
[»] chr6 (26 HSPs)
chr6 (111-363)||(25175563-25175815)
chr6 (111-363)||(27653983-27654235)
chr6 (111-363)||(16825752-16826006)
chr6 (24-352)||(23153458-23153787)
chr6 (26-359)||(14626045-14626377)
chr6 (20-359)||(1650016-1650352)
chr6 (99-352)||(1657748-1657999)
chr6 (99-363)||(35009439-35009702)
chr6 (99-352)||(15862484-15862734)
chr6 (24-94)||(23148266-23148336)
chr6 (99-295)||(29665941-29666137)
chr6 (99-184)||(27751603-27751688)
chr6 (22-57)||(23995247-23995282)
chr6 (24-57)||(18002394-18002427)
chr6 (24-57)||(26090059-26090092)
chr6 (115-199)||(29605612-29605696)
chr6 (26-57)||(4991396-4991427)
chr6 (24-55)||(15742119-15742150)
chr6 (22-57)||(27751742-27751777)
chr6 (22-57)||(32276656-32276691)
chr6 (23-57)||(1657659-1657693)
chr6 (23-57)||(15862789-15862823)
chr6 (24-57)||(18823282-18823315)
chr6 (24-57)||(18839137-18839170)
chr6 (25-57)||(19983192-19983224)
chr6 (25-57)||(35015057-35015089)
[»] chr5 (33 HSPs)
chr5 (111-363)||(25426628-25426880)
chr5 (111-363)||(12374-12626)
chr5 (111-363)||(22366481-22366733)
chr5 (136-363)||(18778017-18778244)
chr5 (111-363)||(19499899-19500151)
chr5 (111-363)||(21073595-21073847)
chr5 (22-363)||(23506965-23507305)
chr5 (136-363)||(43443420-43443647)
chr5 (24-363)||(27182470-27182810)
chr5 (136-363)||(4200010-4200237)
chr5 (136-363)||(27009841-27010068)
chr5 (22-363)||(22053750-22054096)
chr5 (22-363)||(18530985-18531330)
chr5 (99-352)||(34939289-34939540)
chr5 (111-311)||(29188284-29188483)
chr5 (99-246)||(20623085-20623232)
chr5 (99-246)||(21233528-21233675)
chr5 (101-245)||(25900408-25900552)
chr5 (99-246)||(16536313-16536460)
chr5 (99-246)||(37052860-37053007)
chr5 (20-57)||(20623286-20623323)
chr5 (20-57)||(21233437-21233474)
chr5 (20-57)||(25900315-25900352)
chr5 (20-57)||(37053061-37053098)
chr5 (23-57)||(16105967-16106001)
chr5 (20-57)||(16536514-16536551)
chr5 (319-359)||(29190482-29190522)
chr5 (22-57)||(108725-108760)
chr5 (24-57)||(9730277-9730310)
chr5 (322-363)||(17471803-17471844)
chr5 (20-57)||(21651018-21651055)
chr5 (115-199)||(29918127-29918212)
chr5 (106-195)||(32950862-32950951)
[»] chr2 (31 HSPs)
chr2 (111-363)||(19886661-19886913)
chr2 (22-358)||(462743-463078)
chr2 (22-363)||(8891242-8891584)
chr2 (22-363)||(36982361-36982704)
chr2 (25-363)||(20627238-20627576)
chr2 (25-363)||(19794629-19794967)
chr2 (99-363)||(17396653-17396916)
chr2 (25-363)||(43642881-43643220)
chr2 (22-363)||(24341306-24341652)
chr2 (149-363)||(7507894-7508107)
chr2 (99-363)||(25265390-25265653)
chr2 (22-121)||(22863169-22863270)
chr2 (99-246)||(19689401-19689548)
chr2 (99-246)||(23820187-23820334)
chr2 (99-246)||(14906440-14906587)
chr2 (99-246)||(20015127-20015274)
chr2 (20-57)||(9652791-9652828)
chr2 (20-57)||(14906349-14906386)
chr2 (20-57)||(23820388-23820425)
chr2 (20-57)||(17396562-17396599)
chr2 (20-57)||(19689310-19689347)
chr2 (20-57)||(20015328-20015365)
chr2 (25-57)||(22284278-22284310)
chr2 (26-57)||(25213372-25213403)
chr2 (116-197)||(68156-68238)
chr2 (24-57)||(7507756-7507789)
chr2 (20-57)||(12641554-12641591)
chr2 (24-57)||(28031133-28031166)
chr2 (24-91)||(31146072-31146138)
chr2 (24-57)||(33128372-33128405)
chr2 (25-57)||(22275045-22275077)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (22-361)||(3505-3843)
scaffold0266 (22-363)||(1124-1465)
[»] chr4 (30 HSPs)
chr4 (111-363)||(47357654-47357906)
chr4 (22-363)||(13246430-13246772)
chr4 (25-363)||(54118168-54118507)
chr4 (136-363)||(10644219-10644446)
chr4 (22-263)||(121989-122229)
chr4 (99-355)||(13048221-13048477)
chr4 (22-363)||(15675006-15675352)
chr4 (22-295)||(10104167-10104445)
chr4 (99-363)||(26680201-26680463)
chr4 (126-363)||(31115629-31115865)
chr4 (22-162)||(33240900-33241046)
chr4 (99-246)||(10488678-10488825)
chr4 (99-246)||(16327926-16328073)
chr4 (267-363)||(111395-111491)
chr4 (22-131)||(31132545-31132660)
chr4 (115-197)||(40885570-40885652)
chr4 (20-57)||(16609008-16609045)
chr4 (20-57)||(26680517-26680554)
chr4 (22-57)||(15135904-15135939)
chr4 (22-57)||(15272208-15272243)
chr4 (23-57)||(14952085-14952119)
chr4 (20-57)||(16327835-16327872)
chr4 (319-363)||(10104450-10104494)
chr4 (17-56)||(22738577-22738616)
chr4 (116-197)||(15044992-15045074)
chr4 (22-56)||(55376491-55376525)
chr4 (24-57)||(8045272-8045305)
chr4 (24-57)||(16523146-16523179)
chr4 (18-55)||(18248527-18248564)
chr4 (17-57)||(8378493-8378533)
[»] chr3 (51 HSPs)
chr3 (23-363)||(14842485-14842824)
chr3 (111-363)||(55316219-55316471)
chr3 (22-363)||(2049810-2050150)
chr3 (22-363)||(12030070-12030410)
chr3 (111-363)||(41270075-41270327)
chr3 (20-352)||(13838905-13839237)
chr3 (136-363)||(16821139-16821366)
chr3 (99-363)||(13975722-13975985)
chr3 (62-363)||(15858986-15859287)
chr3 (99-363)||(45860805-45861068)
chr3 (89-364)||(51158008-51158282)
chr3 (99-363)||(13954890-13955153)
chr3 (106-363)||(15936634-15936890)
chr3 (25-363)||(16744041-16744377)
chr3 (106-360)||(15938476-15938729)
chr3 (20-359)||(15614838-15615174)
chr3 (99-363)||(17912483-17912744)
chr3 (22-145)||(19260746-19260869)
chr3 (25-162)||(19231981-19232121)
chr3 (99-246)||(2449238-2449385)
chr3 (20-57)||(2449147-2449184)
chr3 (20-57)||(23492696-23492733)
chr3 (20-57)||(38168237-38168274)
chr3 (115-199)||(4145814-4145898)
chr3 (22-57)||(16261777-16261812)
chr3 (22-57)||(17912395-17912430)
chr3 (22-57)||(53771365-53771400)
chr3 (18-195)||(54651625-54651803)
chr3 (20-57)||(13954799-13954836)
chr3 (322-363)||(15468555-15468596)
chr3 (24-57)||(16933868-16933901)
chr3 (20-57)||(30153265-30153302)
chr3 (20-57)||(33342204-33342241)
chr3 (20-57)||(45861122-45861159)
chr3 (250-363)||(47984650-47984763)
chr3 (250-363)||(47993937-47994050)
chr3 (250-363)||(48003224-48003337)
chr3 (250-363)||(48012510-48012623)
chr3 (25-57)||(17955884-17955916)
chr3 (22-57)||(11986077-11986112)
chr3 (22-57)||(14285289-14285324)
chr3 (25-60)||(15857163-15857198)
chr3 (22-57)||(51961028-51961063)
chr3 (106-195)||(11986173-11986262)
chr3 (115-156)||(14080715-14080756)
chr3 (24-57)||(19947026-19947059)
chr3 (322-363)||(22275209-22275250)
chr3 (25-57)||(2844514-2844546)
chr3 (25-57)||(3992873-3992905)
chr3 (25-57)||(54038024-54038056)
chr3 (25-57)||(55513193-55513225)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (22-363)||(5987-6326)
[»] chr1 (19 HSPs)
chr1 (22-363)||(20931345-20931685)
chr1 (25-363)||(41394222-41394559)
chr1 (22-363)||(20913037-20913370)
chr1 (136-363)||(18601143-18601370)
chr1 (111-363)||(5072388-5072640)
chr1 (24-363)||(20893550-20893889)
chr1 (22-363)||(37844371-37844714)
chr1 (22-363)||(20445679-20446022)
chr1 (22-363)||(20531444-20531786)
chr1 (149-363)||(22227809-22228022)
chr1 (149-363)||(22232506-22232719)
chr1 (136-359)||(2116258-2116481)
chr1 (20-297)||(45051489-45051763)
chr1 (99-246)||(51452608-51452755)
chr1 (20-57)||(51452809-51452846)
chr1 (26-57)||(15861327-15861358)
chr1 (25-57)||(21860334-21860366)
chr1 (25-57)||(44034871-44034903)
chr1 (319-359)||(45051446-45051486)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (23-363)||(880-1218)
[»] scaffold0023 (3 HSPs)
scaffold0023 (24-363)||(48598-48936)
scaffold0023 (136-363)||(36093-36320)
scaffold0023 (24-57)||(61121-61154)
[»] chr8 (32 HSPs)
chr8 (22-364)||(16193640-16193980)
chr8 (111-363)||(30120722-30120974)
chr8 (22-363)||(43373389-43373731)
chr8 (173-363)||(222753-222943)
chr8 (173-363)||(736376-736566)
chr8 (173-363)||(860271-860461)
chr8 (111-363)||(16674392-16674644)
chr8 (22-352)||(24928713-24929043)
chr8 (136-363)||(21844597-21844824)
chr8 (136-363)||(21851990-21852217)
chr8 (25-363)||(16404900-16405235)
chr8 (111-359)||(6774258-6774505)
chr8 (111-359)||(24548986-24549233)
chr8 (99-363)||(22907214-22907476)
chr8 (99-352)||(17345581-17345832)
chr8 (99-246)||(5238203-5238350)
chr8 (99-246)||(24661248-24661395)
chr8 (99-246)||(43685662-43685809)
chr8 (173-235)||(691908-691970)
chr8 (20-57)||(5238404-5238441)
chr8 (20-57)||(22907123-22907160)
chr8 (20-57)||(24385647-24385684)
chr8 (20-57)||(24661157-24661194)
chr8 (20-57)||(43685863-43685900)
chr8 (25-57)||(24716762-24716794)
chr8 (24-57)||(2545265-2545298)
chr8 (24-57)||(3431175-3431208)
chr8 (24-57)||(22886654-22886687)
chr8 (25-57)||(274766-274798)
chr8 (25-57)||(641051-641083)
chr8 (25-57)||(826857-826889)
chr8 (116-156)||(38533855-38533895)
[»] chr7 (40 HSPs)
chr7 (111-363)||(10989410-10989661)
chr7 (136-363)||(2437457-2437684)
chr7 (20-361)||(16211768-16212108)
chr7 (26-363)||(3059966-3060302)
chr7 (22-363)||(13036935-13037277)
chr7 (22-363)||(36052667-36053006)
chr7 (136-363)||(13911049-13911277)
chr7 (22-358)||(11580658-11580997)
chr7 (136-363)||(13572676-13572903)
chr7 (106-363)||(18253842-18254098)
chr7 (99-357)||(25292338-25292595)
chr7 (99-363)||(47481031-47481294)
chr7 (136-363)||(16478987-16479213)
chr7 (99-363)||(7293017-7293279)
chr7 (100-363)||(13321014-13321278)
chr7 (99-246)||(11516343-11516490)
chr7 (99-246)||(15441564-15441711)
chr7 (99-246)||(30262129-30262276)
chr7 (27-220)||(295893-296087)
chr7 (20-57)||(7293333-7293370)
chr7 (20-57)||(11516544-11516581)
chr7 (20-57)||(14113898-14113935)
chr7 (20-57)||(15441473-15441510)
chr7 (20-57)||(30262038-30262075)
chr7 (22-131)||(36024372-36024488)
chr7 (22-57)||(2029244-2029279)
chr7 (22-94)||(15709428-15709504)
chr7 (22-57)||(42056185-42056220)
chr7 (20-56)||(25292247-25292283)
chr7 (22-57)||(3049905-3049940)
chr7 (17-56)||(10000279-10000318)
chr7 (22-57)||(13321334-13321369)
chr7 (22-57)||(25124450-25124485)
chr7 (22-57)||(47480941-47480976)
chr7 (116-197)||(13377693-13377775)
chr7 (24-57)||(371417-371450)
chr7 (20-57)||(14423549-14423585)
chr7 (25-57)||(126738-126770)
chr7 (29-57)||(15516765-15516793)
chr7 (25-57)||(32493946-32493978)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (22-363)||(8878-9218)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (22-363)||(12115-12453)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (22-352)||(171916-172245)
scaffold0001 (22-352)||(177619-177948)
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (20-363)||(26335-26678)
scaffold0162 (99-246)||(8180-8327)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (136-363)||(42997-43224)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (35-363)||(4996-5324)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (22-359)||(41733-42069)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (22-352)||(247363-247694)
scaffold0012 (20-57)||(34070-34107)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (22-363)||(128092-128431)
scaffold0008 (136-363)||(31700-31928)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (25-363)||(36837-37176)
[»] scaffold0195 (2 HSPs)
scaffold0195 (28-363)||(19206-19543)
scaffold0195 (99-363)||(21290-21553)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (22-357)||(272031-272365)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (24-363)||(123086-123427)
[»] scaffold0772 (2 HSPs)
scaffold0772 (106-339)||(5552-5785)
scaffold0772 (20-57)||(5846-5883)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (136-363)||(35-262)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (167-363)||(64584-64780)
scaffold0026 (106-363)||(107747-108003)
scaffold0026 (114-156)||(89863-89905)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (106-363)||(48187-48443)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (22-245)||(51105-51328)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (136-363)||(21141-21367)
scaffold0139 (136-363)||(14086-14312)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (73-363)||(148721-149012)
scaffold0025 (22-363)||(8849-9195)
scaffold0025 (22-120)||(146843-146941)
[»] scaffold0028 (3 HSPs)
scaffold0028 (22-245)||(89375-89600)
scaffold0028 (22-150)||(107705-107835)
scaffold0028 (26-57)||(130880-130911)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (149-363)||(5254-5466)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (149-363)||(3722-3936)
[»] scaffold0215 (4 HSPs)
scaffold0215 (136-359)||(9374-9596)
scaffold0215 (136-359)||(16272-16494)
scaffold0215 (17-57)||(9257-9297)
scaffold0215 (17-57)||(16155-16195)
[»] scaffold1711 (1 HSPs)
scaffold1711 (111-257)||(1304-1450)
[»] scaffold1542 (1 HSPs)
scaffold1542 (99-363)||(534-797)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (99-363)||(34460-34724)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (99-363)||(37066-37328)
scaffold0078 (20-57)||(36975-37012)
[»] scaffold0125 (2 HSPs)
scaffold0125 (99-363)||(41648-41911)
scaffold0125 (24-65)||(41957-41998)
[»] scaffold1560 (1 HSPs)
scaffold1560 (257-363)||(9-115)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (110-359)||(2966-3215)
[»] scaffold0132 (2 HSPs)
scaffold0132 (99-232)||(13636-13769)
scaffold0132 (22-57)||(13824-13859)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (257-363)||(48514-48620)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (136-265)||(13350-13478)
[»] scaffold0141 (4 HSPs)
scaffold0141 (99-246)||(26911-27058)
scaffold0141 (106-246)||(22656-22796)
scaffold0141 (20-57)||(22857-22894)
scaffold0141 (20-57)||(27112-27149)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (99-246)||(1582-1729)
scaffold0124 (20-57)||(1491-1528)
[»] scaffold0622 (1 HSPs)
scaffold0622 (267-363)||(9382-9478)
[»] scaffold0361 (2 HSPs)
scaffold0361 (99-192)||(3360-3453)
scaffold0361 (307-361)||(3210-3264)
[»] scaffold0597 (1 HSPs)
scaffold0597 (20-57)||(873-910)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (20-57)||(9877-9914)
[»] scaffold0032 (2 HSPs)
scaffold0032 (20-57)||(108070-108107)
scaffold0032 (22-57)||(55904-55939)
[»] scaffold0706 (1 HSPs)
scaffold0706 (22-57)||(6440-6475)
[»] scaffold0251 (1 HSPs)
scaffold0251 (22-57)||(13282-13317)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (106-262)||(56106-56262)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (22-57)||(57389-57424)
scaffold0058 (115-156)||(70307-70348)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (22-68)||(18015-18061)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (20-57)||(193392-193429)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (21-57)||(17300-17336)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (25-57)||(80187-80219)
[»] scaffold0516 (1 HSPs)
scaffold0516 (17-56)||(12036-12075)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (115-197)||(8174-8257)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (22-57)||(34305-34340)
[»] scaffold0066 (2 HSPs)
scaffold0066 (22-57)||(45338-45373)
scaffold0066 (149-195)||(45198-45244)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (22-57)||(12415-12450)
[»] scaffold0467 (1 HSPs)
scaffold0467 (18-195)||(10249-10427)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (23-57)||(17207-17241)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (116-197)||(2317-2399)
[»] scaffold0160 (1 HSPs)
scaffold0160 (22-56)||(339-373)
[»] scaffold0158 (1 HSPs)
scaffold0158 (22-56)||(25532-25566)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (24-57)||(5475-5508)
[»] scaffold0303 (1 HSPs)
scaffold0303 (24-57)||(4345-4378)
[»] scaffold0173 (1 HSPs)
scaffold0173 (24-57)||(5549-5582)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 26)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 111 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 25175815 - 25175563
Alignment:
Q  111 tgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 210  Q
    |||||||||||| |||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25175815 tgctaaattcgtgctcttgctgtgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 25175716  T
Q  211 gataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25175715 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 25175616  T
Q  311 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25175615 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 25175563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 111 - 363
Target Start/End: Original strand, 27653983 - 27654235
Alignment:
Q  111 tgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 210  Q
    |||||||||||| |||   || || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27653983 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgcttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 27654082  T
Q  211 gataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27654083 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttccaatgatgttatgaatgttatttga 27654182  T
Q  311 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27654183 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattaatgatg 27654235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 111 - 363
Target Start/End: Original strand, 16825752 - 16826006
Alignment:
Q  111 tgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgta--taattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaa 208  Q
    |||||||||||| |||   || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16825752 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtaattaattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaa 16825851  T
Q  209 atgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttattt 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16825852 atgataagttatgaagattgtgctaaattggtggatttctcctaatttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatct 16825951  T
Q  309 gatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  16825952 gatattatgattgatgaataattgctttgttatgcatattcatggattgatgatg 16826006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 24 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 23153787 - 23153458
Alignment:
Q  24 ctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcg 121  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||| |||||||||    
T  23153787 ctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgtttctaaattcg 23153688  T
Q  122 tactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatg 221  Q
    | |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||    
T  23153687 tgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtg 23153588  T
Q  222 aagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattg 321  Q
    || |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||   |||||| |||||||||||||| |||| |||||  ||||| ||||| || || |||    
T  23153587 aaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatattatggctgttaattgatgttgtggttg 23153489  T
Q  322 atgaataattgcttgggtatgcatattcatg 352  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||||||||||    
T  23153488 atgaatcattacttgggtatacatattcatg 23153458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 26 - 359
Target Start/End: Original strand, 14626045 - 14626377
Alignment:
Q  26 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtact 125  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||| |||  ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  14626045 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatcttcactttacaaattctcaaatgttgtttgaattgtgattatggataattattgctaaattcgtgct 14626144  T
Q  126 ccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaaga 225  Q
    |   || || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  14626145 cttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaa 14626244  T
Q  226 ttgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatga 325  Q
    |||||   ||  |||||| || | |||||||||||||||  |||| | ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||| || |  |||||||    
T  14626245 ttgtgtgcaattggtgaa-ttatgctaagttgttgttaacttgagatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatga 14626343  T
Q  326 ataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 359  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14626344 atcattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 14626377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 20 - 359
Target Start/End: Original strand, 1650016 - 1650352
Alignment:
Q  20 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatt-atggatgattgttgctaaat 118  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |  |||||  ||||||||||||  | | || ||| |  |||  ||||| ||    
T  1650016 tcatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatg-taattttgca--ttttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagat 1650112  T
Q  119 tcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagtt 218  Q
    |||| |||  ||| || ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  1650113 tcgtgctcttactgtgatgttacgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaagaatgataagtt 1650212  T
Q  219 atgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatga 318  Q
     |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||| | |||||| |||| | ||||||||| |||| |||||||||   ||||||||||| || |      
T  1650213 gtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttatggttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttgatgttgttg 1650311  T
Q  319 ttgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 359  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1650312 ttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaattgat 1650352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 99 - 352
Target Start/End: Original strand, 1657748 - 1657999
Alignment:
Q  99 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||     
T  1657748 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttggatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaa 1657847  T
Q  199 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 298  Q
     |||| |||||||  |||||||||| |||||||| ||  | || |||| | ||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||  |||||||||     
T  1657848 ttatgtaaaaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattt-tgctaagttattgtgaat-tgagttatgattcttgttcagttgatgttatt 1657945  T
Q  299 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 352  Q
      ||||| ||||| || |  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  1657946 gttgttaattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatg 1657999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 99 - 363
Target Start/End: Original strand, 35009439 - 35009702
Alignment:
Q  99 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  35009439 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttaagtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 35009538  T
Q  199 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 298  Q
     |||| |||||||  ||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||| ||||||||| |  |  | || ||  | ||||||| ||||||| |     
T  35009539 ttatgtaaaaatgtgaagttttgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgtt 35009637  T
Q  299 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 363  Q
      ||||| ||||| || |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35009638 gttgttaattgatgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 35009702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 99 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 15862734 - 15862484
Alignment:
Q  99 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 198  Q
    |||||| |||||| |||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||     
T  15862734 atggataattgttactaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaa 15862635  T
Q  199 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 298  Q
     |||| | |||||  |||||||||| |||||||| ||  | || |||| | ||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||| | | |||||||     
T  15862634 ttatgtataaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattt-tgctaagttattgtgaat-tgagttatgattcttgttc-atttatgttatt 15862538  T
Q  299 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 352  Q
      || || ||||| || |  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  15862537 gctgataattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatg 15862484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 24 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 23148336 - 23148266
Alignment:
Q  24 ctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttt 94  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23148336 ctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttt 23148266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 29666137 - 29665941
Alignment:
Q  99 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatg-ttca 197  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| ||| | || || |||||| ||  |||| ||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  29666137 atggataattgttgttaaattcgtgctctagctgtgatgttattttcttatgtatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattacatgtttca 29666038  T
Q  198 ta-tatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgtt 295  Q
     | |||||| |||||  |||||||||| ||||| || ||  ||||||||| | ||||||||||||| |  |||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  29666037 aagtatgcataaatgtcaagttatgaa-attgtactcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaaatgagatatgattcatgttcaattgatgtt 29665941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 27751688 - 27751603
Alignment:
Q  99 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtga 184  Q
    |||||| | ||| ||||||||||| ||| || | || |||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||    
T  27751688 atggataaatgtagctaaattcgtgctctaattgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgacaattgtatgattgttggtga 27751603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 23995282 - 23995247
Alignment:
Q  22 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23995282 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 23995247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 24 - 57
Target Start/End: Original strand, 18002394 - 18002427
Alignment:
Q  24 ctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18002394 ctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 18002427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 24 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 26090092 - 26090059
Alignment:
Q  24 ctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26090092 ctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 26090059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 29605696 - 29605612
Alignment:
Q  115 aaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcata 199  Q
    |||||||| ||| || |||| || |||||||| |||||||||||  || || ||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  29605696 aaattcgtgctctaattatggtgatatgtttgaatgcatgaattagtgataattgaattgttgttggtgaaattacatgttcata 29605612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 26 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 4991427 - 4991396
Alignment:
Q  26 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4991427 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 4991396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 24 - 55
Target Start/End: Original strand, 15742119 - 15742150
Alignment:
Q  24 ctaaggtaagggggttagtctttatcataatc 55  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15742119 ctaaggtaagggggttagtctttatcataatc 15742150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 22 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 27751777 - 27751742
Alignment:
Q  22 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27751777 atctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 27751742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 22 - 57
Target Start/End: Original strand, 32276656 - 32276691
Alignment:
Q  22 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32276656 atctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 32276691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 57
Target Start/End: Original strand, 1657659 - 1657693
Alignment:
Q  23 tctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1657659 tctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 1657693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 15862823 - 15862789
Alignment:
Q  23 tctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15862823 tctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 15862789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 57
Target Start/End: Original strand, 18823282 - 18823315
Alignment:
Q  24 ctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18823282 ctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 18823315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 57
Target Start/End: Original strand, 18839137 - 18839170
Alignment:
Q  24 ctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18839137 ctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 18839170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 57
Target Start/End: Original strand, 19983192 - 19983224
Alignment:
Q  25 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19983192 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 19983224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 57
Target Start/End: Original strand, 35015057 - 35015089
Alignment:
Q  25 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35015057 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 35015089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 33)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 111 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 25426880 - 25426628
Alignment:
Q  111 tgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 210  Q
    |||||||||||| |||   || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25426880 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 25426781  T
Q  211 gataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25426780 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 25426681  T
Q  311 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25426680 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 25426628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 111 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 12626 - 12374
Alignment:
Q  111 tgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 210  Q
    |||||||||||| |||   || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12626 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 12527  T
Q  211 gataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12526 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 12427  T
Q  311 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12426 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 12374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 111 - 363
Target Start/End: Original strand, 22366481 - 22366733
Alignment:
Q  111 tgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 210  Q
    |||||||||||| |||   || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22366481 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 22366580  T
Q  211 gataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22366581 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 22366680  T
Q  311 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22366681 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 22366733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 136 - 363
Target Start/End: Original strand, 18778017 - 18778244
Alignment:
Q  136 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18778017 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 18778116  T
Q  236 agggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 335  Q
      |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18778117 ttggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatattatttgatattatgattgatgaataattgctt 18778216  T
Q  336 gggtatgcatattcatggattgatgatg 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18778217 gggtatgcatattcatggattgatgatg 18778244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 111 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 19500151 - 19499899
Alignment:
Q  111 tgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 210  Q
    |||||||||||| |||   || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19500151 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 19500052  T
Q  211 gataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19500051 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 19499952  T
Q  311 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 363  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19499951 tattatgattgattaataattgctttggtatgcatattcatggattgatgatg 19499899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 111 - 363
Target Start/End: Original strand, 21073595 - 21073847
Alignment:
Q  111 tgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 210  Q
    |||||||||||| |||   || || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21073595 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatggatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 21073694  T
Q  211 gataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21073695 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttcttctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatcaatgttatttga 21073794  T
Q  311 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21073795 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 21073847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 22 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 23507305 - 23506965
Alignment:
Q  22 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcg 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  23507305 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatctccattttgtaagatttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcg 23507206  T
Q  122 tactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatg 221  Q
    | |||||  | || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  23507205 tgctccatttgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtg 23507106  T
Q  222 aagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattg 321  Q
    || |||||||| ||  ||||||||| | |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || |||    
T  23507105 aaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttg 23507007  T
Q  322 atgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23507006 atgaataattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 23506965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 136 - 363
Target Start/End: Original strand, 43443420 - 43443647
Alignment:
Q  136 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  43443420 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaa 43443519  T
Q  236 agggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 335  Q
      ||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43443520 ttggtgaatttcttctaagttgttgttgatttgagatgtgagtcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 43443619  T
Q  336 gggtatgcatattcatggattgatgatg 363  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  43443620 gggtttgcatattcatggattgatgatg 43443647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 24 - 363
Target Start/End: Original strand, 27182470 - 27182810
Alignment:
Q  24 ctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcg 121  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||     
T  27182470 ctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattca 27182569  T
Q  122 tactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatg 221  Q
    | |||||||| || || |||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||    
T  27182570 tgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaactgatgataattgtatgattgttgatgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtg 27182669  T
Q  222 aagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattg 321  Q
    || |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||   |||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || |||    
T  27182670 aaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttg 27182768  T
Q  322 atgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 363  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  27182769 atgaatcattgcttgagtatgcatattcatgaattgatgatg 27182810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 136 - 363
Target Start/End: Original strand, 4200010 - 4200237
Alignment:
Q  136 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  4200010 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgctaaa 4200109  T
Q  236 agggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 335  Q
      |||||||||||| || ||||||||| || |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4200110 ttggtgaatttctcttatgttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaatgattgctt 4200209  T
Q  336 gggtatgcatattcatggattgatgatg 363  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  4200210 gggtttgcatattcatgggttgatgatg 4200237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 136 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 27010068 - 27009841
Alignment:
Q  136 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| | |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  27010068 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgagtgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtactcaa 27009969  T
Q  236 agggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 335  Q
      |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27009968 ttggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattaatgaataattgctt 27009869  T
Q  336 gggtatgcatattcatggattgatgatg 363  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  27009868 gggtttgcatattcatggattgttgatg 27009841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 22 - 363
Target Start/End: Original strand, 22053750 - 22054096
Alignment:
Q  22 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcat----tttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgcta 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    |||| || ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| ||||||||||    
T  22053750 atctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttgaaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgcta 22053849  T
Q  116 aattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataa 215  Q
    ||||||| |||||||| || || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  ||    
T  22053850 aattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgtatgaattgatgatagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaa 22053949  T
Q  216 gttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatatta 315  Q
    ||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| |  |||| | |||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||| ||     
T  22053950 gttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttg 22054048  T
Q  316 tgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 363  Q
    |  ||||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  22054049 ttgttgatgaatcattgcttgggtctacatattcatgaattgatgatg 22054096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 22 - 363
Target Start/End: Original strand, 18530985 - 18531330
Alignment:
Q  22 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatc---atcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaat-tttgattat-ggatgattgttgctaa 116  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||| || || |||| |||||||||||    
T  18530985 atctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcgtcatcatcattttgcaatttttcaaatgtggtatgaatgtttcataattggataattgttgctaa 18531084  T
Q  117 attcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataag 216  Q
    |||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  |||    
T  18531085 attcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaag 18531184  T
Q  217 ttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattat 316  Q
    || |||| |||||| | ||  ||||||||| | ||||||||||||| |  |||| | |||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||| || |    
T  18531185 ttgtgaaaattgtgttcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgt 18531283  T
Q  317 gattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 363  Q
      ||||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  18531284 tgttgatgaatcattgctcgggtatacatattcatgaattgatgatg 18531330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 99 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 34939540 - 34939289
Alignment:
Q  99 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 198  Q
    |||||| | ||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||     
T  34939540 atggataactgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaa 34939441  T
Q  199 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 298  Q
     |||| |||||||  |||||||||| |||||||| ||  | || |||| | ||||||  |||| ||| |||||| |||||||||||||  |||||||||     
T  34939440 ttatgtaaaaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattt-tgctaagtcattgtgaat-tgagttatgattcttgttcagttgatgttatt 34939343  T
Q  299 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 352  Q
      ||||| ||||| || |  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  34939342 gctgttaattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatg 34939289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 111 - 311
Target Start/End: Original strand, 29188284 - 29188483
Alignment:
Q  111 tgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 210  Q
    ||||| |||||| |||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  29188284 tgctagattcgtgctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 29188383  T
Q  211 gataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 310  Q
    |||||||| |||| || ||||| ||  ||||||||| | ||||||| |||||||| |||| | ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||    
T  29188384 gataagttgtgaaaatggtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattga 29188482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 99 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 20623232 - 20623085
Alignment:
Q  99 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  20623232 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 20623133  T
Q  199 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaattt 246  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  20623132 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 20623085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 99 - 246
Target Start/End: Original strand, 21233528 - 21233675
Alignment:
Q  99 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  21233528 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 21233627  T
Q  199 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaattt 246  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  21233628 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 21233675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 101 - 245
Target Start/End: Original strand, 25900408 - 25900552
Alignment:
Q  101 ggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatat 200  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||| |||||   ||    
T  25900408 ggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggttaaattatatgtttgaat 25900507  T
Q  201 atgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatt 245  Q
    |||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || ||||||    
T  25900508 atgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatt 25900552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 99 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 16536460 - 16536313
Alignment:
Q  99 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||       
T  16536460 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaatttataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 16536361  T
Q  199 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaattt 246  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  16536360 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 16536313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 99 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 37053007 - 37052860
Alignment:
Q  99 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||       
T  37053007 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 37052908  T
Q  199 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaattt 246  Q
    |||||   |||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  37052907 atatgtggaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 37052860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 20623323 - 20623286
Alignment:
Q  20 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20623323 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 20623286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 57
Target Start/End: Original strand, 21233437 - 21233474
Alignment:
Q  20 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21233437 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 21233474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 57
Target Start/End: Original strand, 25900315 - 25900352
Alignment:
Q  20 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25900315 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 25900352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 37053098 - 37053061
Alignment:
Q  20 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37053098 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 37053061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 16106001 - 16105967
Alignment:
Q  23 tctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16106001 tctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 16105967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 20 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 16536551 - 16536514
Alignment:
Q  20 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16536551 tcatctaagataagggggttagtctttatcataatcat 16536514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 319 - 359
Target Start/End: Original strand, 29190482 - 29190522
Alignment:
Q  319 ttgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 359  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29190482 ttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 29190522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 22 - 57
Target Start/End: Original strand, 108725 - 108760
Alignment:
Q  22 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  108725 atctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 108760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 57
Target Start/End: Original strand, 9730277 - 9730310
Alignment:
Q  24 ctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9730277 ctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 9730310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 322 - 363
Target Start/End: Original strand, 17471803 - 17471844
Alignment:
Q  322 atgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 363  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  17471803 atgaatcattgcttgggtacgcatattcatgaattgatgatg 17471844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 21651055 - 21651018
Alignment:
Q  20 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  21651055 tcatctaaggtaagggggttaatatttatcataatcat 21651018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 29918212 - 29918127
Alignment:
Q  115 aaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcata 199  Q
    |||||||| |||||| |||| || |||||||| || |||||| |||||| || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  29918212 aaattcgtgctccaattatgatgatatgtttgaatacatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcata 29918127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 32950951 - 32950862
Alignment:
Q  106 attgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 195  Q
    ||||||| ||||||||| ||| |||| || |||||| || || || |||| |||||| || |||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  32950951 attgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgtatgatttgatgataattgtatgattgtggttgaaattacatgtt 32950862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 31)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 111 - 363
Target Start/End: Original strand, 19886661 - 19886913
Alignment:
Q  111 tgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 210  Q
    |||||||||||| |||   || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19886661 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 19886760  T
Q  211 gataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19886761 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 19886860  T
Q  311 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19886861 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 19886913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 22 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 463078 - 462743
Alignment:
Q  22 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcg 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  463078 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcg 462979  T
Q  122 tactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatg 221  Q
    | |||||||| || || ||| |||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  462978 tgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtg 462879  T
Q  222 aagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattg 321  Q
    || |||||| | ||  ||||||||| | ||||||||||||||   |||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| |  ||||||    
T  462878 aaaattgtgttcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgtcgtgattg 462780  T
Q  322 atgaataattgcttgggtatgcatattcatggattga 358  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  462779 atgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattga 462743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 22 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 8891584 - 8891242
Alignment:
Q  22 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatt 119  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||    
T  8891584 atctaaggtaaaggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaatt 8891485  T
Q  120 cgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagtta 219  Q
    ||| |||||||| || |  |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| | | ||||||||||||     
T  8891484 cgtgctccaactgtgataatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggcgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttg 8891385  T
Q  220 tgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgat 319  Q
    |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||   |||||| |||||||||||||| ||||||||||  | ||| ||||| || || |    
T  8891384 tgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctattaattgatgttgtggt 8891286  T
Q  320 tgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 363  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  8891285 tgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 8891242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 22 - 363
Target Start/End: Original strand, 36982361 - 36982704
Alignment:
Q  22 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcatttt-gtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||    
T  36982361 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcatttttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaat 36982460  T
Q  119 tcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagtt 218  Q
    |||| |||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| || |||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  36982461 tcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtattcatgaattgatgataattgtaagattgctggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagtt 36982560  T
Q  219 atgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatga 318  Q
     |||| |||||||| ||  ||||||||| | | ||||||||||| |  |||||| |||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||| || |      
T  36982561 gtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgccaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttgttg 36982659  T
Q  319 ttgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 363  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36982660 ttgatgaatcattgtttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 36982704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 25 - 363
Target Start/End: Original strand, 20627238 - 20627576
Alignment:
Q  25 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaa-ttttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgta 123  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||     
T  20627238 taaggtaacggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaaattttcaaatattgtatgaattatgattatggataattgttgttaaattcgtg 20627337  T
Q  124 ctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaa 223  Q
    |||||||| || || |||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||    
T  20627338 ctccaactgtgatgatatgtttgtatgcacgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtccaaatatgtaaaaatgataacttgtgaa 20627437  T
Q  224 gattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgat 323  Q
     |||||||| ||  ||||||||| |  ||||||||||||||| |||| | | |||||||||||| |||| |||||  ||||| ||| | || || |||||    
T  20627438 aattgtgctcaattggtgaattt-tgttaagttgttgttaatttgagatttaattcttgttcaattgattttatggttgttaattggtgttgtggttgat 20627536  T
Q  324 gaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 363  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  20627537 gaatcattgcttgggtatggatattcatgaattgaggatg 20627576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 25 - 363
Target Start/End: Original strand, 19794629 - 19794967
Alignment:
Q  25 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 122  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||   || |||||| ||||| | |||||||||    
T  19794629 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcattattttgtaaattt-caaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgtcgttaaattcgt 19794727  T
Q  123 actccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatga 222  Q
     |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| |||    
T  19794728 gctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 19794827  T
Q  223 agattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattga 322  Q
    | |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||| |||||||||    |||| ||||| ||||  ||||    
T  19794828 aaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagttatgattcttgttcaattgatgttatttccgttaattgatgttatagttga 19794926  T
Q  323 tgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 363  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19794927 tgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 19794967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 99 - 363
Target Start/End: Original strand, 17396653 - 17396916
Alignment:
Q  99 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||| |||||||||||||| || |  |||||| |||||||||||||||||||||| |     
T  17396653 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaa 17396751  T
Q  199 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 298  Q
    ||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  17396752 ataagtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatg 17396851  T
Q  299 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 363  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  17396852 aatgttatttgatattatgattaatggataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatg 17396916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 25 - 363
Target Start/End: Original strand, 43642881 - 43643220
Alignment:
Q  25 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 122  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||| ||    
T  43642881 taagggaaggaggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaatttttgcatagtggataattgttgctaaatttgt 43642980  T
Q  123 actccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatga 222  Q
     |||||| | || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||| |||||| |||    
T  43642981 gctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgttaagttgtga 43643080  T
Q  223 agattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattga 322  Q
    | |||||||| ||  ||||||||| | || ||||||| ||||| |||| | |||||||||||||| ||||| |||   ||||| ||||| || |  ||||    
T  43643081 aaattgtgctcaattggtgaattt-ttcttagttgttattaatttgagatatgattcttgttcaattgatgctattgctgttaattgatgttgtagttga 43643179  T
Q  323 tgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 363  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43643180 tgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 43643220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 22 - 363
Target Start/End: Original strand, 24341306 - 24341652
Alignment:
Q  22 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcat----tttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgcta 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    |||| || ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| ||||||||||    
T  24341306 atctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttgcaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgcta 24341405  T
Q  116 aattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataa 215  Q
    ||||| | || ||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||  ||    
T  24341406 aattcatgcttcaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattatatgttcaattatgtaaaaatgtgaa 24341505  T
Q  216 gttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatatta 315  Q
    ||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| |  |||| | |||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||| ||     
T  24341506 gttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttc 24341604  T
Q  316 tgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 363  Q
       ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  24341605 ctgttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatg 24341652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 149 - 363
Target Start/End: Original strand, 7507894 - 7508107
Alignment:
Q  149 tgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttct 248  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||| | ||  |||||||||      
T  7507894 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttatgaaaattgtgttcaattggtgaattt-g 7507992  T
Q  249 cctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttg-ttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatat 347  Q
     |||||||||||||||| |||| | |||||| || || || |||||||||   ||||||||||| || |  ||||||||| | |||||||||||||||||    
T  7507993 gctaagttgttgttaat-tgagatatgattcatgttttaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatat 7508091  T
Q  348 tcatggattgatgatg 363  Q
    ||||||||||||||||    
T  7508092 tcatggattgatgatg 7508107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 99 - 363
Target Start/End: Original strand, 25265390 - 25265653
Alignment:
Q  99 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  25265390 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 25265489  T
Q  199 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 298  Q
     |||| |||||||  ||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||| ||||||||| |  |  | || ||  | ||||||| ||||||| |     
T  25265490 ttatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgtt 25265588  T
Q  299 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 363  Q
      ||||| ||||| || |  || |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25265589 gttgttaattgatgttgttgtttatgaatcatggcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 25265653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 22 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 22863270 - 22863169
Alignment:
Q  22 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttt--gattatggatgattgttgctaaatt 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||    
T  22863270 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaattgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaatt 22863171  T
Q  120 cg 121  Q
    ||    
T  22863170 cg 22863169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 99 - 246
Target Start/End: Original strand, 19689401 - 19689548
Alignment:
Q  99 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  19689401 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 19689500  T
Q  199 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaattt 246  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  19689501 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 19689548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 99 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 23820334 - 23820187
Alignment:
Q  99 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  23820334 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 23820235  T
Q  199 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaattt 246  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  23820234 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 23820187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 99 - 246
Target Start/End: Original strand, 14906440 - 14906587
Alignment:
Q  99 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||       
T  14906440 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 14906539  T
Q  199 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaattt 246  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  14906540 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 14906587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 99 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 20015274 - 20015127
Alignment:
Q  99 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||  || |||| | ||||||||| ||||||||||||       
T  20015274 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgcatgcatgaattgataataattgtgtgattgttggttaaattacatgtttga 20015175  T
Q  199 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaattt 246  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  20015174 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 20015127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 57
Target Start/End: Original strand, 9652791 - 9652828
Alignment:
Q  20 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9652791 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 9652828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 57
Target Start/End: Original strand, 14906349 - 14906386
Alignment:
Q  20 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14906349 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 14906386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 23820425 - 23820388
Alignment:
Q  20 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23820425 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 23820388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 20 - 57
Target Start/End: Original strand, 17396562 - 17396599
Alignment:
Q  20 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17396562 tcatctaaggtaagggggttagtctttaccataatcat 17396599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 20 - 57
Target Start/End: Original strand, 19689310 - 19689347
Alignment:
Q  20 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19689310 tcatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 19689347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 20 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 20015365 - 20015328
Alignment:
Q  20 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20015365 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcatgatcat 20015328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 22284310 - 22284278
Alignment:
Q  25 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22284310 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 22284278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 26 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 25213403 - 25213372
Alignment:
Q  26 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25213403 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 25213372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 116 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 68238 - 68156
Alignment:
Q  116 aattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 197  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||| || || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  68238 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttca 68156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 57
Target Start/End: Original strand, 7507756 - 7507789
Alignment:
Q  24 ctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7507756 ctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 7507789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 57
Target Start/End: Original strand, 12641554 - 12641591
Alignment:
Q  20 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  12641554 tcatctaaggtaagggggttagttattatcataatcat 12641591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 57
Target Start/End: Original strand, 28031133 - 28031166
Alignment:
Q  24 ctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28031133 ctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 28031166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 91
Target Start/End: Original strand, 31146072 - 31146138
Alignment:
Q  24 ctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaa-tgttgtatgaat 91  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||||||| |  || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  31146072 ctaaggtaagggggttagaattcatcataatcatctt--ttgtgtaaattttcaaattgttgtatgaat 31146138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 33128405 - 33128372
Alignment:
Q  24 ctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33128405 ctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 33128372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 22275077 - 22275045
Alignment:
Q  25 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22275077 taaggtaagggggttagcctttatcataatcat 22275045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 22 - 361
Target Start/End: Original strand, 3505 - 3843
Alignment:
Q  22 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcg 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  3505 atctaaggtaagggggttagtctttgtcataatcatcttcattttgtaaattttcaaaagttgtatgaattttgattatagataattgttgctaaattcg 3604  T
Q  122 tactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatg 221  Q
    | |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  3605 tgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtg 3704  T
Q  222 aagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattg 321  Q
    || |||||||| ||  ||| ||||| | |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| || ||||||    
T  3705 aaaattgtgctcaattggtaaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttgtgattg 3803  T
Q  322 atgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatga 361  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3804 aggaataattgcttgggtatgcatattgatggattgatga 3843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 22 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 1465 - 1124
Alignment:
Q  22 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgt-aaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  1465 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaatttttcttatggataattgttgctaaattc 1366  T
Q  121 gtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttat 220  Q
    || |||||||| || || |||||| ||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  1365 gtgctccaactttgatgatatgttagtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgt 1266  T
Q  221 gaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgatt 320  Q
    ||| |||||||| ||  ||||||||| | |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||| || ||    
T  1265 gaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatattgtggtt 1167  T
Q  321 gatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 363  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  1166 gatgaataattgcttgggtgtgcatattcatgaattgatgatg 1124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 30)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 111 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 47357906 - 47357654
Alignment:
Q  111 tgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 210  Q
    |||||||||||| |||   || || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47357906 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatggattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 47357807  T
Q  211 gataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47357806 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 47357707  T
Q  311 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 363  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47357706 tattatgattgatgaataattgattgggtatgtatattcatggattgatgatg 47357654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 22 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 13246772 - 13246430
Alignment:
Q  22 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttt--gattatggatgattgttgctaaatt 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||| ||||||    
T  13246772 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgttaaatt 13246673  T
Q  120 cgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagtta 219  Q
    ||| || ||||| || || |||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||||||||||     
T  13246672 cgtgctacaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattaatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttg 13246573  T
Q  220 tgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgat 319  Q
    |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||   |||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || |    
T  13246572 tgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggt 13246474  T
Q  320 tgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 363  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  13246473 tgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 13246430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 25 - 363
Target Start/End: Original strand, 54118168 - 54118507
Alignment:
Q  25 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 122  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||    
T  54118168 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcattattttgtgaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgt 54118267  T
Q  123 actccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatga 222  Q
     |||||| | || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | || ||||||||| |||    
T  54118268 gctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaattgataagttgtga 54118367  T
Q  223 agattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattga 322  Q
    | |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||   | |||| |||||||||||||| |||||||||   ||||| ||||| || || ||||    
T  54118368 aaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagatttagttatgattcttgttcaattgatgttatagttgttaattgatgttgtggttga 54118466  T
Q  323 tgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 363  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  54118467 tgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 54118507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 136 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 10644446 - 10644219
Alignment:
Q  136 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  10644446 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaa 10644347  T
Q  236 agggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 335  Q
      ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10644346 ttggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 10644247  T
Q  336 gggtatgcatattcatggattgatgatg 363  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  10644246 gggtttgcatattcatggattgatgatg 10644219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 22 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 122229 - 121989
Alignment:
Q  22 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcg 121  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |    
T  122229 atctaaggtaaggggattagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaatttg 122130  T
Q  122 tactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatg 221  Q
    | |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  122129 tgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtg 122030  T
Q  222 aagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgtta 263  Q
    || |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||    
T  122029 aaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgtta 121989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 99 - 355
Target Start/End: Original strand, 13048221 - 13048477
Alignment:
Q  99 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 198  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||||||||    || ||||||||||||||||| |||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||| |     
T  13048221 atggataattgttgctaaattcatgctccaacttcaatgatatgtttgtatgcatgatttgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaa 13048320  T
Q  199 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 298  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||| | |||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  13048321 atatgtaaaaaggataagttatgaatattgtgctcaattgatgaatttctcctaagttgttgttagtttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatg 13048420  T
Q  299 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggat 355  Q
    ||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13048421 aatgttattagataatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggat 13048477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 22 - 363
Target Start/End: Original strand, 15675006 - 15675352
Alignment:
Q  22 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcat----tttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgcta 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    |||| || ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| ||||||||||    
T  15675006 atctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttgcaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgcta 15675105  T
Q  116 aattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataa 215  Q
    ||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  ||    
T  15675106 aattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaa 15675205  T
Q  216 gttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatatta 315  Q
    ||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| |  |||| | |||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||| ||     
T  15675206 gttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttg 15675304  T
Q  316 tgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 363  Q
    |  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  15675305 ttgttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatg 15675352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 22 - 295
Target Start/End: Original strand, 10104167 - 10104445
Alignment:
Q  22 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcat----tttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgcta 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    |||  || ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| ||||||||||    
T  10104167 atctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttacaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgcta 10104266  T
Q  116 aattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataa 215  Q
    ||| ||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  ||    
T  10104267 aatccgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaa 10104366  T
Q  216 gttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgtt 295  Q
    ||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| |  |||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  10104367 gttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgtt 10104445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 99 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 26680463 - 26680201
Alignment:
Q  99 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  26680463 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 26680364  T
Q  199 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 298  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| ||||||| |||  | |||||||  |  | ||||| ||| |  |||| | |||||||||| ||| ||||||| |     
T  26680363 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatagatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgtt 26680266  T
Q  299 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 363  Q
     ||| || | ||| || |  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26680265 gatgctaatagatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatggattgatgatg 26680201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 126 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 31115865 - 31115629
Alignment:
Q  126 ccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaaga 225  Q
    |||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||   |||| |||||||  ||||| |||| |    
T  31115865 ccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttccattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaa 31115766  T
Q  226 ttgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatga 325  Q
    || |||| ||  ||||||||| ||||||||||||||| |  |||| | |||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||| || |  |||||||    
T  31115765 ttatgctcaattggtgaattt-tcctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttgttgttgatga 31115667  T
Q  326 ataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 363  Q
    || ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  31115666 atcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatg 31115629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 22 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 33241046 - 33240900
Alignment:
Q  22 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcat----tttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgcta 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    |||| || ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| ||||||||||    
T  33241046 atctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttgcaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgcta 33240947  T
Q  116 aattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatg 162  Q
    ||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||    
T  33240946 aattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatg 33240900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 99 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 10488825 - 10488678
Alignment:
Q  99 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||       
T  10488825 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 10488726  T
Q  199 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaattt 246  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  10488725 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 10488678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 99 - 246
Target Start/End: Original strand, 16327926 - 16328073
Alignment:
Q  99 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||       
T  16327926 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 16328025  T
Q  199 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaattt 246  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  16328026 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 16328073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 267 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 111491 - 111395
Alignment:
Q  267 tgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 363  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  111491 tgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 111395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 22 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 31132660 - 31132545
Alignment:
Q  22 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcat----tttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgcta 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    |||| || ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| ||||||||||    
T  31132660 atctaaggtaagggggttagtcttcatcataattatcatcatcatttttgcaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgcta 31132561  T
Q  116 aattcgtactccaact 131  Q
    ||||||| ||||||||    
T  31132560 aattcgtgctccaact 31132545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 115 - 197
Target Start/End: Original strand, 40885570 - 40885652
Alignment:
Q  115 aaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 197  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| || || ||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  40885570 aaattcgtactccaactgtggtgctatgtttgtatgcatgaattggtgataattgaatgtttgttggtgaaattacatgttca 40885652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 57
Target Start/End: Original strand, 16609008 - 16609045
Alignment:
Q  20 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16609008 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 16609045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 26680554 - 26680517
Alignment:
Q  20 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26680554 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 26680517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 57
Target Start/End: Original strand, 15135904 - 15135939
Alignment:
Q  22 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15135904 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 15135939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 57
Target Start/End: Original strand, 15272208 - 15272243
Alignment:
Q  22 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15272208 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 15272243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 14952119 - 14952085
Alignment:
Q  23 tctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14952119 tctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 14952085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 20 - 57
Target Start/End: Original strand, 16327835 - 16327872
Alignment:
Q  20 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16327835 tcatataaggtaagggggttagtctttatcataatcat 16327872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 319 - 363
Target Start/End: Original strand, 10104450 - 10104494
Alignment:
Q  319 ttgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 363  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  10104450 ttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatg 10104494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 17 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 22738616 - 22738577
Alignment:
Q  17 acatcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatca 56  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  22738616 acatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatca 22738577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 116 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 15045074 - 15044992
Alignment:
Q  116 aattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 197  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||| || || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  15045074 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttca 15044992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 56
Target Start/End: Original strand, 55376491 - 55376525
Alignment:
Q  22 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatca 56  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  55376491 atctaaggtaagggggttagtcttcatcataatca 55376525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 8045305 - 8045272
Alignment:
Q  24 ctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8045305 ctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 8045272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 16523179 - 16523146
Alignment:
Q  24 ctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16523179 ctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 16523146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 18248564 - 18248527
Alignment:
Q  18 catcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatc 55  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  18248564 catcatctaaggtaagggggttagttattatcataatc 18248527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 8378533 - 8378493
Alignment:
Q  17 acatcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  8378533 acatcatctaaggtaaggggattagttattatcataatcat 8378493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 51)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 23 - 363
Target Start/End: Original strand, 14842485 - 14842824
Alignment:
Q  23 tctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgt 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14842485 tctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttcactttgcaaattctcaaatgttgtatgaattgtgattatggataattgttgctaaattcgt 14842584  T
Q  123 actccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatga 222  Q
     |||||||| || || |||||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  14842585 gctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgaagataattgtatgattgttggtgaaattgcatgttcaaatgtgtaaaaatgataagttatga 14842684  T
Q  223 agattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattga 322  Q
    | |||||||| ||  ||||||||| | |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  14842685 aaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttatgattga 14842783  T
Q  323 tgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 363  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14842784 tgaataattgattgggtttgcatattcatggattgatgatg 14842824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 111 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 55316471 - 55316219
Alignment:
Q  111 tgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 210  Q
    |||||||||||| |||   || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55316471 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 55316372  T
Q  211 gataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 310  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55316371 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 55316272  T
Q  311 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 363  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  55316271 taatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 55316219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 22 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 2050150 - 2049810
Alignment:
Q  22 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcg 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  2050150 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatcaattttgcttatggataattgttgctaaattcg 2050051  T
Q  122 tactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatg 221  Q
    | |||||||| ||  | ||||||||||||| |||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| || ||    
T  2050050 tgctccaactgtgacgatatgtttgtatgcctgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaacatgataacttgtg 2049951  T
Q  222 aagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattg 321  Q
    || |||||||| ||  ||||||||| | |||||||||||||||| |||| | ||||| |||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| || || |||    
T  2049950 aaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgatttttgttcaattgatgctatggttgttaattgatgttgtggttg 2049852  T
Q  322 atgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 363  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2049851 atgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 2049810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 22 - 363
Target Start/End: Original strand, 12030070 - 12030410
Alignment:
Q  22 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcg 121  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  12030070 atctaaggtaagggggttaatcattatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgacttttgcttatggataattgttgctaaattcg 12030169  T
Q  122 tactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatg 221  Q
    | |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||    
T  12030170 tgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaagtgataagttgtg 12030269  T
Q  222 aagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattg 321  Q
    ||  ||||||| ||  ||||||||| | ||||||| |||||||| |||  | |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| ||||| |||    
T  12030270 aaagttgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgatatttgattcttgttcaattgatgctatggttgttaattgatgttatggttg 12030368  T
Q  322 atgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 363  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12030369 atgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 12030410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 111 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 41270327 - 41270075
Alignment:
Q  111 tgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 210  Q
    |||||||||||| |||   || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41270327 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtggaattacatgttcatatatgcaaaaat 41270228  T
Q  211 gataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 310  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41270227 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 41270128  T
Q  311 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 363  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41270127 taatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 41270075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 20 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 13839237 - 13838905
Alignment:
Q  20 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgt-aaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaat 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  13839237 tcatctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatgaataattgttgctaaat 13839138  T
Q  119 tcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagtt 218  Q
    |||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| | | ||||||||||||    
T  13839137 tcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagtt 13839038  T
Q  219 atgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatga 318  Q
     |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||| |||    |||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || ||     
T  13839037 gtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtgg 13838939  T
Q  319 ttgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 352  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  13838938 ttgatgaatcattgtttgggtatgcatattcatg 13838905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 136 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 16821366 - 16821139
Alignment:
Q  136 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 235  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||||  |||||||||||    
T  16821366 tgttatgtttgtatgcataaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagctatgagtattgtgctaaa 16821267  T
Q  236 agggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 335  Q
      ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16821266 ttggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 16821167  T
Q  336 gggtatgcatattcatggattgatgatg 363  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||    
T  16821166 gggtttgcatattcatggattaatgatg 16821139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 99 - 363
Target Start/End: Original strand, 13975722 - 13975985
Alignment:
Q  99 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||| |||||||||||||| || |  |||||| |||||||||| ||||||||||| |     
T  13975722 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaa 13975820  T
Q  199 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 298  Q
    ||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  13975821 ataagtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatg 13975920  T
Q  299 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 363  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  13975921 aatgttatttgataatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatg 13975985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 62 - 363
Target Start/End: Original strand, 15858986 - 15859287
Alignment:
Q  62 attttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattg 159  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  15858986 attttgtaaattt-caattgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattg 15859084  T
Q  160 atgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgtt 259  Q
    ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||    
T  15859085 atgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgtt 15859183  T
Q  260 gttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 359  Q
    ||| |  |||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15859184 gttgaattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 15859283  T
Q  360 gatg 363  Q
    ||||    
T  15859284 gatg 15859287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 99 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 45861068 - 45860805
Alignment:
Q  99 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||| |||||||||||||| || |  |||||| |||||||||| ||||||||||| |     
T  45861068 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaa 45860970  T
Q  199 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 298  Q
    ||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  45860969 ataagtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatg 45860870  T
Q  299 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 363  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  45860869 aatgttatttgataatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatg 45860805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 89 - 364
Target Start/End: Original strand, 51158008 - 51158282
Alignment:
Q  89 aattttgattatggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaatt 188  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||    
T  51158008 aattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatt 51158107  T
Q  189 acatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaa 288  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||     
T  51158108 acatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaat 51158206  T
Q  289 tgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgt 364  Q
    ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  51158207 tgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatgt 51158282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 99 - 363
Target Start/End: Original strand, 13954890 - 13955153
Alignment:
Q  99 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||| |||||||||||||| || |  |||||| |||||||||| ||||||||||| |     
T  13954890 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaa 13954988  T
Q  199 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 298  Q
    ||| | ||||||||| ||||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  13954989 ataagtaaaaatgatcagttatgaatattgtgctcaattgatgaatttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatg 13955088  T
Q  299 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 363  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  13955089 aatgttatttgataatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatg 13955153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 106 - 363
Target Start/End: Original strand, 15936634 - 15936890
Alignment:
Q  106 attgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgca 205  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| |  || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| || || |    
T  15936634 attgttactaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgta 15936733  T
Q  206 aaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgtta 305  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| |  ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  15936734 aaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgtta 15936832  T
Q  306 tttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 363  Q
     ||||| || |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  15936833 attgatgttgtgattgatgaataattgcctgagtatgcatattcatggattgatgatg 15936890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 25 - 363
Target Start/End: Original strand, 16744041 - 16744377
Alignment:
Q  25 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtac 124  Q
    |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  16744041 taaggtaacgaggttagtctttaccataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgttaaattcgtgc 16744140  T
Q  125 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 224  Q
    ||||||| || || ||||||||||| |||||||||||  ||  ||||| ||||||||| ||||||||| || | ||||| |||||||| ||||||||||     
T  16744141 tccaactttgatgatatgtttgtatccatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaa 16744240  T
Q  225 attgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 324  Q
    ||||||| ||| || |||||||  |  | ||| | ||| |  |||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || |  || || |  ||||||    
T  16744241 attgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttatagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataaatgttgtagttgatg 16744338  T
Q  325 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 363  Q
    ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  16744339 aatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatg 16744377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 106 - 360
Target Start/End: Original strand, 15938476 - 15938729
Alignment:
Q  106 attgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgca 205  Q
    |||||| |||||| ||| |||||||| |  || ||||||||||  |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| || || |    
T  15938476 attgttactaaatacgtgctccaactgtaatgatatgtttgtaatcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgta 15938575  T
Q  206 aaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgtta 305  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| |  ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  15938576 aaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgtta 15938674  T
Q  306 tttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatg 360  Q
     ||||| || |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  15938675 attgatgttgtgattgatgaataattgcctgagtatgcatattcatggattgatg 15938729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 20 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 15615174 - 15614838
Alignment:
Q  20 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatt-atggatgattgttgctaaat 118  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |  |||||  ||||||||||||  | | || ||| |  |||  ||||| ||    
T  15615174 tcatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatg-taattttgca--ttttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagat 15615078  T
Q  119 tcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagtt 218  Q
    | || |||  ||| || |||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  15615077 ttgtgctcttactgtggtgttatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaggattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagtt 15614978  T
Q  219 atgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatga 318  Q
     |||| || ||||| ||  ||||||||| | ||||||| |||||||| || | | ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||| || |      
T  15614977 gtgaatatggtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgggatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtag 15614879  T
Q  319 ttgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 359  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15614878 ttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 15614838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 99 - 363
Target Start/End: Original strand, 17912483 - 17912744
Alignment:
Q  99 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| |     
T  17912483 atggataattgttgctaaattcgtgctccaact-tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaa 17912581  T
Q  199 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 298  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| ||||||| |||  | ||||||  |  || ||||| ||| |  |||| | |||||| |||||||  ||||||||     
T  17912582 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaattgatgaatt--tgatatgttgtagttgaattgagctatgattcatgttcaatcgatgttatt 17912679  T
Q  299 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 363  Q
      ||||| ||||| || |  ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17912680 gttgttaattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 17912744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 22 - 145
Target Start/End: Original strand, 19260746 - 19260869
Alignment:
Q  22 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcg 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  19260746 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaagttttcaaatgttgtatgaattttttttatggataattgttgctaaattcg 19260845  T
Q  122 tactccaactatgttgttatgttt 145  Q
    | ||| || |||| || |||||||    
T  19260846 tgctctaattatgatgatatgttt 19260869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 25 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 19232121 - 19231981
Alignment:
Q  25 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgt-aaattttcaaatgttgtatgaatttt--gattatggatgattgttgctaaattcg 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||||    
T  19232121 taaggtaagggggttagtctttatcttaatcatcatcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcg 19232022  T
Q  122 tactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatg 162  Q
    | |||||||| || || ||||||| ||| ||||||||||||    
T  19232021 tgctccaactgtgatgatatgtttatattcatgaattgatg 19231981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 99 - 246
Target Start/End: Original strand, 2449238 - 2449385
Alignment:
Q  99 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||       
T  2449238 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 2449337  T
Q  199 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaattt 246  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  2449338 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 2449385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 57
Target Start/End: Original strand, 2449147 - 2449184
Alignment:
Q  20 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2449147 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 2449184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 23492733 - 23492696
Alignment:
Q  20 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23492733 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 23492696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 38168274 - 38168237
Alignment:
Q  20 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38168274 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 38168237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 115 - 199
Target Start/End: Original strand, 4145814 - 4145898
Alignment:
Q  115 aaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcata 199  Q
    ||||||||||||||| |||| || |||||||| || ||||||||| || || ||| ||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  4145814 aaattcgtactccaattatggtgatatgtttgaatacatgaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattacatgttcata 4145898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 16261812 - 16261777
Alignment:
Q  22 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16261812 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 16261777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 57
Target Start/End: Original strand, 17912395 - 17912430
Alignment:
Q  22 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17912395 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 17912430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 53771400 - 53771365
Alignment:
Q  22 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53771400 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 53771365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 54651803 - 54651625
Alignment:
Q  18 catcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatt-atggatgattgttgctaa 116  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||| ||| |  | ||||  ||||||||||||  | | || ||| || |||||||||||    
T  54651803 catcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaa 54651704  T
Q  117 attcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 195  Q
    |||||| |||   || || || ||| ||  | |||||||||||||| || |||||| |||||  |||||||| ||||||    
T  54651703 attcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgtgagtgaaattgcatgtt 54651625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 20 - 57
Target Start/End: Original strand, 13954799 - 13954836
Alignment:
Q  20 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13954799 tcatctaaggtaagggggttagtctttaccataatcat 13954836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 322 - 363
Target Start/End: Original strand, 15468555 - 15468596
Alignment:
Q  322 atgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 363  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15468555 atgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 15468596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 24 - 57
Target Start/End: Original strand, 16933868 - 16933901
Alignment:
Q  24 ctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16933868 ctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 16933901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 20 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 30153302 - 30153265
Alignment:
Q  20 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30153302 tcatctaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 30153265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 20 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 33342241 - 33342204
Alignment:
Q  20 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33342241 tcatctaaggtaagagggttagtctttatcataatcat 33342204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 20 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 45861159 - 45861122
Alignment:
Q  20 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45861159 tcatctaaggtaagggggttagtctttaccataatcat 45861122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 250 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 47984763 - 47984650
Alignment:
Q  250 ctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattc 349  Q
    |||||||||||||    |||| |||||||| ||||||| ||||||| |   ||||| ||||| || |  ||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  47984763 ctaagttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattc 47984664  T
Q  350 atggattgatgatg 363  Q
    ||| ||||||||||    
T  47984663 atgaattgatgatg 47984650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 250 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 47994050 - 47993937
Alignment:
Q  250 ctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattc 349  Q
    |||||||||||||    |||| |||||||| ||||||| ||||||| |   ||||| ||||| || |  ||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  47994050 ctaagttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgattttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattc 47993951  T
Q  350 atggattgatgatg 363  Q
    ||| ||||||||||    
T  47993950 atgaattgatgatg 47993937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 250 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 48003337 - 48003224
Alignment:
Q  250 ctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattc 349  Q
    |||||||||||||    |||| |||||||| ||||||| ||||||| |   ||||| ||||| || |  ||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  48003337 ctaagttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattc 48003238  T
Q  350 atggattgatgatg 363  Q
    ||| ||||||||||    
T  48003237 atgaattgatgatg 48003224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 250 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 48012623 - 48012510
Alignment:
Q  250 ctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattc 349  Q
    |||||||||||||    |||| |||||||| ||||||| ||||||| |   ||||| ||||| || |  ||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  48012623 ctaagttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgattttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattc 48012524  T
Q  350 atggattgatgatg 363  Q
    ||| ||||||||||    
T  48012523 atgaattgatgatg 48012510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 57
Target Start/End: Original strand, 17955884 - 17955916
Alignment:
Q  25 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17955884 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 17955916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 22 - 57
Target Start/End: Original strand, 11986077 - 11986112
Alignment:
Q  22 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11986077 atctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 11986112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 22 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 14285324 - 14285289
Alignment:
Q  22 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14285324 atctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 14285289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 25 - 60
Target Start/End: Original strand, 15857163 - 15857198
Alignment:
Q  25 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcat 60  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15857163 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcat 15857198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 22 - 57
Target Start/End: Original strand, 51961028 - 51961063
Alignment:
Q  22 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  51961028 atctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 51961063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 195
Target Start/End: Original strand, 11986173 - 11986262
Alignment:
Q  106 attgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 195  Q
    ||||||| ||||||||| ||| |||| || |||||| || || ||||||| || ||| || |||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  11986173 attgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgcatgatttaatgataattgtatgattgtggttgaaattacatgtt 11986262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 14080756 - 14080715
Alignment:
Q  115 aaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa 156  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  14080756 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 14080715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 19947059 - 19947026
Alignment:
Q  24 ctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19947059 ctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 19947026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 322 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 22275250 - 22275209
Alignment:
Q  322 atgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 363  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  22275250 atgaatcattgcttaggtatgcatattcatgaattgatgatg 22275209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 2844546 - 2844514
Alignment:
Q  25 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2844546 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 2844514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 3992905 - 3992873
Alignment:
Q  25 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3992905 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 3992873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 57
Target Start/End: Original strand, 54038024 - 54038056
Alignment:
Q  25 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  54038024 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 54038056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 55513225 - 55513193
Alignment:
Q  25 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  55513225 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 55513193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 22 - 363
Target Start/End: Original strand, 5987 - 6326
Alignment:
Q  22 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcg 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5987 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcattttcactttgcaaattctcaaatgttgtatgaattgtgattatggataattgttgctaaattcg 6086  T
Q  122 tactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatg 221  Q
    | |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |     
T  6087 tgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgta 6186  T
Q  222 aagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattg 321  Q
    || |||||||| ||  ||||||||| | |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||  | |||||||||    
T  6187 aaaattgtgctgaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaat-tgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttttgttatgattg 6284  T
Q  322 atgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6285 atgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 6326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 19)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 22 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 20931685 - 20931345
Alignment:
Q  22 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcg 121  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  20931685 atctaaggtaagggggttagcctttatcataatcatcctcattttgcaaattttcaattgttgtatgaagtttgcttatggataattgttgctaaattcg 20931586  T
Q  122 tactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatg 221  Q
    | |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20931585 tgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcatatatgtaaaaatgataagttatg 20931486  T
Q  222 aagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattg 321  Q
    || |||||||||||  ||||||||| | |||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || |||    
T  20931485 aaaattgtgctaaattggtgaattt-tgctaaattgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttg 20931387  T
Q  322 atgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 363  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  20931386 atgaataatttcttgggtatgcatattcatgaattaatgatg 20931345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 25 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 41394559 - 41394222
Alignment:
Q  25 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtac 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41394559 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 41394460  T
Q  125 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 224  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||     
T  41394459 tccaactatgatgatatgtttgtatgcataaattgatgataattgtatgattgttggtgaagttacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 41394360  T
Q  225 attgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 324  Q
    |||||||| ||  ||||||||| | ||||||| ||||||   |||| | ||||||||| |||| |||||||||   ||||||||||| || |  ||||||    
T  41394359 attgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttatgttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatg 41394261  T
Q  325 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 363  Q
    ||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41394260 aatcactgattgggtatgcatattcatggattgatgatg 41394222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 22 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 20913370 - 20913037
Alignment:
Q  22 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcg 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||    
T  20913370 atctaaggtaagggggttagtctttatcgtaatcatcctcattttgcaaattttcaattgttgtatgaattttgcttacggataattgttgctaaattcg 20913271  T
Q  122 tactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatg 221  Q
    | |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20913270 tgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcatatatgtaaaaatgataagttatg 20913171  T
Q  222 aagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattg 321  Q
    || |||||||| ||  ||||||||| | | |||||||||||||       | |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || |||    
T  20913170 aaaattgtgctcaattggtgaattt-tgcaaagttgttgttaa-------tttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatcttgtggttg 20913079  T
Q  322 atgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20913078 atgaataattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 20913037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 136 - 363
Target Start/End: Original strand, 18601143 - 18601370
Alignment:
Q  136 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  18601143 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaa 18601242  T
Q  236 agggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 335  Q
      |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  18601243 ttggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgataatatgattaatgaataattgctt 18601342  T
Q  336 gggtatgcatattcatggattgatgatg 363  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  18601343 gggtttgcatattcatggattgatgatg 18601370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 111 - 363
Target Start/End: Original strand, 5072388 - 5072640
Alignment:
Q  111 tgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 210  Q
    |||||||||||| |||   || || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5072388 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttatatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 5072487  T
Q  211 gataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 310  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5072488 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 5072587  T
Q  311 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 363  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5072588 taatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 5072640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 24 - 363
Target Start/End: Original strand, 20893550 - 20893889
Alignment:
Q  24 ctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcg 121  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||     
T  20893550 ctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgtaa-ttttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattct 20893648  T
Q  122 tactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatg 221  Q
    | |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||    
T  20893649 tgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttgttgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtg 20893748  T
Q  222 aagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattg 321  Q
    || |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||   ||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || |||    
T  20893749 aaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgatttatgattcttgttcaattgatgttatgactgttaattgatgttgtggttg 20893847  T
Q  322 atgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 363  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  20893848 atgaatcattgtttgggtatgcatattcataaattgatgatg 20893889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 22 - 363
Target Start/End: Original strand, 37844371 - 37844714
Alignment:
Q  22 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttt--gattatggatgattgttgctaaatt 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||    
T  37844371 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaatt 37844470  T
Q  120 cgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagtta 219  Q
    | | ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  || | | |||||||||  ||    
T  37844471 catgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaatgataaaata 37844570  T
Q  220 -tgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatga 318  Q
     |||| |||||||| ||    ||||||| | ||||||||||||||   |||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || ||     
T  37844571 gtgaaaattgtgctcaattaatgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtgg 37844669  T
Q  319 ttgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 363  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  37844670 ttgatgagtcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 37844714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 22 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 20446022 - 20445679
Alignment:
Q  22 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgt-aaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaat 118  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||    
T  20446022 atctaaggtaagggagttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaat 20445923  T
Q  119 tcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagtt 218  Q
    |||| |||||| | || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  || | | |||||||||||     
T  20445922 tcgtgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaatgataagtg 20445823  T
Q  219 atgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatga 318  Q
     |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| |  || ||| ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||| || |      
T  20445822 gtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgtgttatgattcttgatcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtag 20445724  T
Q  319 ttgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 363  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  20445723 ttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 20445679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 22 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 20531786 - 20531444
Alignment:
Q  22 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatt 119  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||    
T  20531786 atctaaggtaaggaaattagtctttatcataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaatt 20531687  T
Q  120 cgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagtta 219  Q
    ||| |||||| | || |  |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  || | | |||||||||||      
T  20531686 cgtgctccaaatgtgataatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaatgataagtgg 20531587  T
Q  220 tgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgat 319  Q
    |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| |  || ||| ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||| || |  |    
T  20531586 tgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgtgttatgattcttgatcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtagt 20531488  T
Q  320 tgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 363  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  20531487 tgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 20531444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 149 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 22228022 - 22227809
Alignment:
Q  149 tgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttct 248  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||   ||  | ||||||| |    
T  22228022 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgtccaattgttgaattt-t 22227924  T
Q  249 cctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatatt 348  Q
     |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22227923 gctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatatt 22227824  T
Q  349 catggattgatgatg 363  Q
    |||||||||||||||    
T  22227823 catggattgatgatg 22227809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 149 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 22232719 - 22232506
Alignment:
Q  149 tgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttct 248  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||   ||  | ||||||| |    
T  22232719 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgtccaattgttgaattt-t 22232621  T
Q  249 cctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatatt 348  Q
     |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22232620 gctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatatt 22232521  T
Q  349 catggattgatgatg 363  Q
    |||||||||||||||    
T  22232520 catggattgatgatg 22232506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 136 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 2116481 - 2116258
Alignment:
Q  136 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| || ||||| ||    
T  2116481 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgctcaa 2116382  T
Q  236 agggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtga-gttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgct 334  Q
      ||||||||| | ||||||| |||||||| |||  || ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||| || |  ||||||||| ||||||    
T  2116381 ttggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgatattttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgct 2116283  T
Q  335 tgggtatgcatattcatggattgat 359  Q
    |||||||||||||||||| ||||||    
T  2116282 tgggtatgcatattcatgaattgat 2116258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 45051763 - 45051489
Alignment:
Q  20 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatt-atggatgattgttgctaaat 118  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |  |||||  ||||||||||||  | | || ||| |  |||  ||||| ||    
T  45051763 tcatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatg-tgattttgca--ttttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagat 45051667  T
Q  119 tcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagtt 218  Q
    ||||  ||  ||| || ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  45051666 tcgtgttcttactgtgatgttacgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagtt 45051567  T
Q  219 atgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttat 297  Q
     |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||| | |||||| |||| | ||||||||| |||| |||||||||    
T  45051566 gtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttatggttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttat 45051489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 99 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 51452755 - 51452608
Alignment:
Q  99 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  51452755 atggataattgttgctaaattcgtgcttcaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 51452656  T
Q  199 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaattt 246  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  51452655 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 51452608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 20 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 51452846 - 51452809
Alignment:
Q  20 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  51452846 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcttaatcat 51452809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 26 - 57
Target Start/End: Original strand, 15861327 - 15861358
Alignment:
Q  26 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15861327 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 15861358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 21860366 - 21860334
Alignment:
Q  25 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21860366 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 21860334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 57
Target Start/End: Original strand, 44034871 - 44034903
Alignment:
Q  25 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44034871 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 44034903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 319 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 45051486 - 45051446
Alignment:
Q  319 ttgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 359  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45051486 ttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaattgat 45051446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 23 - 363
Target Start/End: Original strand, 880 - 1218
Alignment:
Q  23 tctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgt 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  880 tctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttcactttacaaattctcaaatgttgtatgaattgtgattatggataattgttgctaaattcgt 979  T
Q  123 actccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatga 222  Q
     |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||    
T  980 gctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtga 1079  T
Q  223 agattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattga 322  Q
    | |||||||| ||  | ||||||| | |||||||||||||||| |||| | | |||||||||||| |||||||||| |||||| || || ||||||||||    
T  1080 aaattgtgctcaattgatgaattt-tgctaagttgttgttaat-tgagattttattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattga 1177  T
Q  323 tgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1178 tgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 1218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 3)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 24 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 48936 - 48598
Alignment:
Q  24 ctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgta 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  48936 ctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtg 48837  T
Q  124 ctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaa 223  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||    
T  48836 ctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaaaaaatgataagttgtgaa 48737  T
Q  224 gattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgat 323  Q
     |||||||| |   ||||||||| | ||||||||||| ||   |||||| |||||||||||||| ||||||||||  | ||| ||||| || || |||||    
T  48736 aattgtgctcagttggtgaattt-tgctaagttgttgctagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctattaattgatgttgtggttgat 48638  T
Q  324 gaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 363  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  48637 gaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 48598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 136 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 36320 - 36093
Alignment:
Q  136 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 235  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36320 tgttatgtttgtatgtatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatattcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 36221  T
Q  236 agggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 335  Q
      |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36220 ttggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcatgttcaatagatgttatgaatgttatttgataatatgattgatgaataattgctt 36121  T
Q  336 gggtatgcatattcatggattgatgatg 363  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  36120 gggtttgcatattcatggattgatgatg 36093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 57
Target Start/End: Original strand, 61121 - 61154
Alignment:
Q  24 ctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  61121 ctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 61154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 32)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 22 - 364
Target Start/End: Original strand, 16193640 - 16193980
Alignment:
Q  22 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcg 121  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16193640 atctaaggtaagggg-ttagtctttatcataatcatcatcatttggtaaattttcaaatattgtatgaattttgcttatggatgattgttgctaaattcg 16193738  T
Q  122 tactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatg 221  Q
    | ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  16193739 tgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggggaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtg 16193838  T
Q  222 aagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattg 321  Q
    || |||||||| ||  ||||||||| | | || ||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || |||    
T  16193839 aaaattgtgctcaattggtgaattt-tgccaaattgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttg 16193937  T
Q  322 atgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgt 364  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  16193938 atgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatgt 16193980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 111 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 30120974 - 30120722
Alignment:
Q  111 tgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 210  Q
    |||||||||||| |||   || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30120974 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatttatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 30120875  T
Q  211 gataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 310  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30120874 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttga 30120775  T
Q  311 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  30120774 tattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatcgattgatgatg 30120722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 22 - 363
Target Start/End: Original strand, 43373389 - 43373731
Alignment:
Q  22 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatt 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||   || |||||| |||  |||||||||    
T  43373389 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaatttttgtataatggataattaatgctaaatt 43373488  T
Q  120 cgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagtta 219  Q
    ||| |||||||| || || || ||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  43373489 cgtgctccaactgtgatgatacgtttgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttg 43373588  T
Q  220 tgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgat 319  Q
    |||| |||||||| ||  ||||||||| | |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| || || |    
T  43373589 tgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgctatggttgttaattgatgttgtggt 43373687  T
Q  320 tgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43373688 tgatgaataattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 43373731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 173 - 363
Target Start/End: Original strand, 222753 - 222943
Alignment:
Q  173 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagtt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  222753 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagtt 222852  T
Q  273 gtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  222853 gtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 222943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 173 - 363
Target Start/End: Original strand, 736376 - 736566
Alignment:
Q  173 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagtt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  736376 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagtt 736475  T
Q  273 gtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  736476 gtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 736566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 173 - 363
Target Start/End: Original strand, 860271 - 860461
Alignment:
Q  173 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagtt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  860271 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagtt 860370  T
Q  273 gtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  860371 gtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 860461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 111 - 363
Target Start/End: Original strand, 16674392 - 16674644
Alignment:
Q  111 tgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 210  Q
    |||||||||||| |||   || || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16674392 tgctaaattcgtgctctttctgtgatgttatgtttttatgcatgaatttatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 16674491  T
Q  211 gataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 310  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16674492 gataagttatgaatattgtgcttaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 16674591  T
Q  311 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 363  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  16674592 taatatgattaatgaataattgcttgagtttgcatattcatggattgatgatg 16674644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 22 - 352
Target Start/End: Original strand, 24928713 - 24929043
Alignment:
Q  22 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgt-aaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattc 120  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24928713 atctaaggtaatggggttagtctttatcataatcatcgtcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggataattgttgctaaattc 24928812  T
Q  121 gtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttat 220  Q
    || |||||||| || |  |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| |    
T  24928813 gtgctccaactgtgattatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgt 24928912  T
Q  221 gaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgatt 320  Q
    ||| |||||||| ||  ||||||||||  ||||||||| |||    |||||| ||  |||||||||| ||| ||||||  ||||| ||||| || |||||    
T  24928913 gaaaattgtgctcaattggtgaatttc-gctaagttgtggttggattgagttatgtctcttgttcaattgaggttatggttgttaattgatgttgtgatt 24929011  T
Q  321 gatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 352  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24929012 gatgaatcattgcttgggtatgcatattcatg 24929043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 136 - 363
Target Start/End: Original strand, 21844597 - 21844824
Alignment:
Q  136 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  21844597 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaa 21844696  T
Q  236 agggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 335  Q
      |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21844697 ttggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatttttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 21844796  T
Q  336 gggtatgcatattcatggattgatgatg 363  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  21844797 gggtttgcatattcattgattgttgatg 21844824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 136 - 363
Target Start/End: Original strand, 21851990 - 21852217
Alignment:
Q  136 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  21851990 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattaaatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaa 21852089  T
Q  236 agggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 335  Q
      |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21852090 ttggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 21852189  T
Q  336 gggtatgcatattcatggattgatgatg 363  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  21852190 gggtttgcatattcattgattgttgatg 21852217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 25 - 363
Target Start/End: Original strand, 16404900 - 16405235
Alignment:
Q  25 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 122  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||| |||||||||||||    
T  16404900 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcattattt-gtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcatgatggataattattgctaaattcgt 16404998  T
Q  123 actccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatga 222  Q
     |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||| |||||| |||    
T  16404999 gctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgttaagttgtga 16405098  T
Q  223 agattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattga 322  Q
    | |||||||| ||  ||||||||| | ||||   ||||||||  |||  | |||||||||||||| |||||||||   ||||| ||||| || |  ||||    
T  16405099 aaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaa---gttgttaaattgacatatgattcttgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttttagttga 16405194  T
Q  323 tgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 363  Q
    ||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  16405195 tgaatcactgcttgggtatgcaaattcatgaattgatgatg 16405235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 111 - 359
Target Start/End: Original strand, 6774258 - 6774505
Alignment:
Q  111 tgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 210  Q
    ||||| |||||| |||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  6774258 tgctagattcgtgctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 6774357  T
Q  211 gataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 310  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||| |||||||| |||| | ||||||||| |||| |||||||||   ||||||||||    
T  6774358 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttga 6774456  T
Q  311 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 359  Q
    | || |  ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6774457 tgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaattgat 6774505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 111 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 24549233 - 24548986
Alignment:
Q  111 tgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 210  Q
    ||||| |||||| |||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  24549233 tgctagattcgtgctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 24549134  T
Q  211 gataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 310  Q
    |||||||| |||| || ||||| ||  ||||||||| | ||||||| |||||||| || | | ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||    
T  24549133 gataagttgtgaaaatggtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgggatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattga 24549035  T
Q  311 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 359  Q
    | || |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24549034 tgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 24548986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 99 - 363
Target Start/End: Original strand, 22907214 - 22907476
Alignment:
Q  99 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  22907214 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 22907313  T
Q  199 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 298  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||  |  | ||||| ||| |  |||| | |||||||||| ||| ||||||| |     
T  22907314 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgtt 22907411  T
Q  299 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 363  Q
     ||| || | ||| || |  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22907412 gatgctaatagatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatggattgatgatg 22907476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 99 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 17345832 - 17345581
Alignment:
Q  99 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 198  Q
    |||||| |||||||| |||||||| ||| |||| || |||||||||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||     
T  17345832 atggataattgttgcgaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttatatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaa 17345733  T
Q  199 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 298  Q
     |||| |||||||  |||||||||| |||||||| ||  | || |||| | ||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||  |||| ||||     
T  17345732 ttatgtaaaaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattt-tgctaagttattgtgaat-tgagttatgattcttgttcagttgatattatt 17345635  T
Q  299 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 352  Q
      ||||| ||||| || |  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  17345634 gttgttaattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatg 17345581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 99 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 5238350 - 5238203
Alignment:
Q  99 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  5238350 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 5238251  T
Q  199 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaattt 246  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  5238250 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 5238203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 99 - 246
Target Start/End: Original strand, 24661248 - 24661395
Alignment:
Q  99 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  24661248 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 24661347  T
Q  199 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaattt 246  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  24661348 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 24661395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 99 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 43685809 - 43685662
Alignment:
Q  99 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  43685809 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 43685710  T
Q  199 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaattt 246  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  43685709 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 43685662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 173 - 235
Target Start/End: Original strand, 691908 - 691970
Alignment:
Q  173 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  691908 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 691970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 5238441 - 5238404
Alignment:
Q  20 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5238441 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 5238404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 57
Target Start/End: Original strand, 22907123 - 22907160
Alignment:
Q  20 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22907123 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 22907160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 57
Target Start/End: Original strand, 24385647 - 24385684
Alignment:
Q  20 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24385647 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 24385684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 57
Target Start/End: Original strand, 24661157 - 24661194
Alignment:
Q  20 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24661157 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 24661194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 43685900 - 43685863
Alignment:
Q  20 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43685900 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 43685863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 57
Target Start/End: Original strand, 24716762 - 24716794
Alignment:
Q  25 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24716762 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 24716794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 2545298 - 2545265
Alignment:
Q  24 ctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2545298 ctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 2545265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 57
Target Start/End: Original strand, 3431175 - 3431208
Alignment:
Q  24 ctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3431175 ctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 3431208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 22886687 - 22886654
Alignment:
Q  24 ctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22886687 ctaaggtaagggggttagtcttaatcataatcat 22886654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 274798 - 274766
Alignment:
Q  25 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  274798 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 274766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 57
Target Start/End: Original strand, 641051 - 641083
Alignment:
Q  25 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  641051 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 641083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 57
Target Start/End: Original strand, 826857 - 826889
Alignment:
Q  25 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  826857 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 826889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 116 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 38533895 - 38533855
Alignment:
Q  116 aattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa 156  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||    
T  38533895 aattcgtactccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaa 38533855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 40)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 111 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 10989661 - 10989410
Alignment:
Q  111 tgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 210  Q
    |||||||||||| |||   || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10989661 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 10989562  T
Q  211 gataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 310  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10989561 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttg-taatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 10989463  T
Q  311 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10989462 tattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 10989410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 136 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 2437684 - 2437457
Alignment:
Q  136 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  2437684 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgttcaa 2437585  T
Q  236 agggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 335  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2437584 ttggtgaatttttcctaagttgttgttaatatgagatttgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 2437485  T
Q  336 gggtatgcatattcatggattgatgatg 363  Q
    | || |||||||||||||||||||||||    
T  2437484 gagtttgcatattcatggattgatgatg 2437457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 20 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 16212108 - 16211768
Alignment:
Q  20 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatt 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  16212108 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaattttgcttatggacaattgttgctaaatt 16212009  T
Q  120 cgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagtta 219  Q
    ||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  16212008 cgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgtttgtgaaattgcatgttcaaatatgtaaaaatgataagttg 16211909  T
Q  220 tgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgat 319  Q
    |||| |||||||| ||  ||||||||| | |||||||||||||||| |||| | ||||||||||| || ||||||||||  ||||| ||||| || || |    
T  16211908 tgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttaaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggt 16211810  T
Q  320 tgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatga 361  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  16211809 tgatgattcattgcttgggtatgcatattcatgaattaatga 16211768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 26 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 3060302 - 3059966
Alignment:
Q  26 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtact 125  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  3060302 aaggtaagggggtaagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttatatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgct 3060203  T
Q  126 ccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaaga 225  Q
    |||||| || |  ||| ||||||||||| |||||||| || |||||  | |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||| |    
T  3060202 ccaactgtgataatatatttgtatgcattaattgatgataattgtaatactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataaattgtgaaaa 3060103  T
Q  226 ttgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatga 325  Q
    || |||| ||| ||||||||| |  |||||||||||||   |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  3060102 ttatgctcaaatggtgaattt-tgttaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatgactgttaattgatgttgtggttgatga 3060004  T
Q  326 ataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 363  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  3060003 atcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 3059966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 22 - 363
Target Start/End: Original strand, 13036935 - 13037277
Alignment:
Q  22 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatt 119  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||    
T  13036935 atctaaggtaagggggttagtcttcaccataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaatt 13037034  T
Q  120 cgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagtta 219  Q
    ||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||| | | ||||||||||||     
T  13037035 cgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttgatgaaattgcatgttcaaataggaacaaatgataagttg 13037134  T
Q  220 tgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgat 319  Q
    |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||   |||||| |||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||| || || |    
T  13037135 tgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattaatgttatgaatattaattgatgttgtggt 13037233  T
Q  320 tgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 363  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  13037234 tgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 13037277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 22 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 36053006 - 36052667
Alignment:
Q  22 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatt 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||    
T  36053006 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaatttttgtataatggataattgttgctaaatt 36052907  T
Q  120 cgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagtta 219  Q
      |||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| || || ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  36052906 tatactccaactgtgatgatacgtttgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttggtaaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttg 36052807  T
Q  220 tgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgat 319  Q
    |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||   ||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||| ||  ||||| ||||| || || |    
T  36052806 tgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaa---gttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttgtggttgttaattgatgttgtggt 36052711  T
Q  320 tgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36052710 tgatgaataattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 36052667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 136 - 363
Target Start/End: Original strand, 13911049 - 13911277
Alignment:
Q  136 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||    
T  13911049 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttaattgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgctcaa 13911148  T
Q  236 agggtgaatttctcct-aagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgct 334  Q
      |||||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13911149 ttggtgaatttctcctaaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataatttct 13911248  T
Q  335 tgggtatgcatattcatggattgatgatg 363  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13911249 tgggtttgcatattcatggattgatgatg 13911277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 22 - 358
Target Start/End: Original strand, 11580658 - 11580997
Alignment:
Q  22 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcatttt-gtaaattttcaaatgttgtatgaattttg---attatggatgattgttgctaaa 117  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    || |||||| ||| ||||||||    
T  11580658 atctaaggtaaggggattagtctttatcataatcatcatcatttttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttttgcataatggataattattgctaaa 11580757  T
Q  118 ttcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagt 217  Q
    ||||| |||||||| || |  |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||    
T  11580758 ttcgtgctccaactgtgataatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagt 11580857  T
Q  218 tatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatg 317  Q
    | |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||   |||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || ||    
T  11580858 tgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtg 11580956  T
Q  318 attgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattga 358  Q
     ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  11580957 gttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattga 11580997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 136 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 13572903 - 13572676
Alignment:
Q  136 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||| | |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  13572903 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtgtgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaa 13572804  T
Q  236 agggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 335  Q
      |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13572803 ttggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattaatgaataattgctt 13572704  T
Q  336 gggtatgcatattcatggattgatgatg 363  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  13572703 gggtttgcatattcatggattgttgatg 13572676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 106 - 363
Target Start/End: Original strand, 18253842 - 18254098
Alignment:
Q  106 attgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgca 205  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| |  || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| || || |    
T  18253842 attgttactaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgta 18253941  T
Q  206 aaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgtta 305  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  18253942 aaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgtta 18254040  T
Q  306 tttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 363  Q
     ||||| || |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  18254041 attgatgttgtgattgatgaataattgcctgagtatgcatattcatggattgatgatg 18254098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 99 - 357
Target Start/End: Original strand, 25292338 - 25292595
Alignment:
Q  99 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 198  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||||||| || || |||||||||||| |||||||| || |  |||||| |||||||||||||||||||||| |     
T  25292338 atggataattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgtatgaattgttgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaa 25292437  T
Q  199 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 298  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||| |||||||| ||  |||||||| |||||| ||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  25292438 atatgtaaaaaggataagctatgaatattgtgctcaattggtgaatt-ctcctaggttgtcgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatg 25292536  T
Q  299 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattg 357  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25292537 aatgttatttgatattatgactaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattg 25292595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 99 - 363
Target Start/End: Original strand, 47481031 - 47481294
Alignment:
Q  99 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| |||||||||||||||||     
T  47481031 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaa 47481130  T
Q  199 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 298  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| |||||| | ||  ||||||||| | ||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||| |||||||||     
T  47481131 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgttcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagttatgattcttgttcaattgatgttatc 47481229  T
Q  299 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 363  Q
      | ||| ||||| || |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47481230 gctcttaattgatgtttttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 47481294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 136 - 363
Target Start/End: Original strand, 16478987 - 16479213
Alignment:
Q  136 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||    
T  16478987 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaa 16479086  T
Q  236 agggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 335  Q
      ||||||||| |  |||||| || ||||| |||| | ||||||||| |||| |||||||||   ||||||||||| || |  ||||||||| | |||||    
T  16479087 ttggtgaattt-tgttaagttatttttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactgctt 16479185  T
Q  336 gggtatgcatattcatggattgatgatg 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16479186 gggtatgcatattcatggattgatgatg 16479213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 99 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 7293279 - 7293017
Alignment:
Q  99 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  7293279 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattaataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 7293180  T
Q  199 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 298  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||  |  | ||||||||| |  |||| | |||||||||| ||| ||||||| |     
T  7293179 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgttgttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgtt 7293082  T
Q  299 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 363  Q
     ||| || | ||| || |  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7293081 gatgctaatagatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatggattgatgatg 7293017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 100 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 13321278 - 13321014
Alignment:
Q  100 tggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatg-ttcat 198  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||||     
T  13321278 tggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtttcaa 13321179  T
Q  199 a-tatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttg-ttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgtta 296  Q
    | |||| | |||||  |||||||||| |||||||| ||  ||||||||| | |||||||| ||||| |  |||| | |||||| ||||||| ||||||||    
T  13321178 agtatgtataaatgtcaagttatgaa-attgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgattgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgtta 13321081  T
Q  297 tgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 363  Q
    |   ||||| ||||| || |  ||||||||| ||  ||||||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  13321080 ttgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtttgcacattcatgaattgatgatg 13321014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 99 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 11516490 - 11516343
Alignment:
Q  99 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  11516490 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 11516391  T
Q  199 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaattt 246  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  11516390 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 11516343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 99 - 246
Target Start/End: Original strand, 15441564 - 15441711
Alignment:
Q  99 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  15441564 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 15441663  T
Q  199 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaattt 246  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  15441664 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 15441711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 99 - 246
Target Start/End: Original strand, 30262129 - 30262276
Alignment:
Q  99 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  30262129 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 30262228  T
Q  199 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaattt 246  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  30262229 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 30262276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 27 - 220
Target Start/End: Original strand, 295893 - 296087
Alignment:
Q  27 aggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaa-ttttg-attatggatgattgttgctaaattcgtac 124  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||||||| |  |||||||||  ||||||||| ||||| || ||| || |||||||||||||||||      
T  295893 aggtaagggggtttgtcttcaacataattctcatcatttt-tgcattttcaaactttgtatgaaattttgcataatgaataattgttgctaaattcgtgt 295991  T
Q  125 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttat 220  Q
    || || |  | |||||||||||| ||||||||| |||| || |  ||| ||||||||||||||| |||||| |  |||| |||||||| |||||||    
T  295992 tctaattgaggtgttatgtttgtgtgcatgaatcgatgataatgttatgattgttggtgaaatttcatgttgaattatgtaaaaatgagaagttat 296087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 7293370 - 7293333
Alignment:
Q  20 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7293370 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 7293333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 11516581 - 11516544
Alignment:
Q  20 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11516581 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 11516544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 57
Target Start/End: Original strand, 14113898 - 14113935
Alignment:
Q  20 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14113898 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 14113935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 57
Target Start/End: Original strand, 15441473 - 15441510
Alignment:
Q  20 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15441473 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 15441510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 57
Target Start/End: Original strand, 30262038 - 30262075
Alignment:
Q  20 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30262038 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 30262075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 22 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 36024488 - 36024372
Alignment:
Q  22 atctaaggtaaggggg-ttagtctttatcataatcatcatca----ttttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgct 114  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    ||||  || ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| |||||| ||    
T  36024488 atctaaggtaaggggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttacaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgtttct 36024389  T
Q  115 aaattcgtactccaact 131  Q
    |||||||| ||||||||    
T  36024388 aaattcgtgctccaact 36024372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 2029279 - 2029244
Alignment:
Q  22 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2029279 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 2029244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 15709504 - 15709428
Alignment:
Q  22 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatc----attttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttt 94  Q
    |||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||    |||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  15709504 atctaaggtaagaggattagtcttcatcataatcatcatcatcaattttgcaatttttcaaatgtggtatgaatttt 15709428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 57
Target Start/End: Original strand, 42056185 - 42056220
Alignment:
Q  22 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42056185 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 42056220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 56
Target Start/End: Original strand, 25292247 - 25292283
Alignment:
Q  20 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatca 56  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25292247 tcatctaagataagggggttagtctttatcataatca 25292283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 22 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 3049940 - 3049905
Alignment:
Q  22 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3049940 atctaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 3049905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 17 - 56
Target Start/End: Original strand, 10000279 - 10000318
Alignment:
Q  17 acatcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatca 56  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  10000279 acatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatca 10000318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 22 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 13321369 - 13321334
Alignment:
Q  22 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13321369 atctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 13321334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 22 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 25124485 - 25124450
Alignment:
Q  22 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25124485 atctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 25124450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 22 - 57
Target Start/End: Original strand, 47480941 - 47480976
Alignment:
Q  22 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  47480941 atctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 47480976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 116 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 13377775 - 13377693
Alignment:
Q  116 aattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 197  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||| || || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  13377775 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttca 13377693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 371450 - 371417
Alignment:
Q  24 ctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  371450 ctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 371417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 57
Target Start/End: Original strand, 14423549 - 14423585
Alignment:
Q  20 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14423549 tcatctaaggtaagggggttagtc-ttatcataatcat 14423585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 126770 - 126738
Alignment:
Q  25 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  126770 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 126738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 57
Target Start/End: Original strand, 15516765 - 15516793
Alignment:
Q  29 gtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15516765 gtaagggggttagtctttatcataatcat 15516793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 57
Target Start/End: Original strand, 32493946 - 32493978
Alignment:
Q  25 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32493946 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 32493978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 22 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 9218 - 8878
Alignment:
Q  22 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcg 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  9218 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttcattttgcaaattttcaaaagttgtacgaattttgcttatggaaaattgttgctaaattcg 9119  T
Q  122 tactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatg 221  Q
    | |||||  | || |||||||||||||||||||||| |||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| |||||| ||    
T  9118 tgctccatttgtgatgttatgtttgtatgcatgaatcgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgttaagttgtg 9019  T
Q  222 aagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattg 321  Q
    || |||||||| ||  ||||||||| |  ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| || ||||||    
T  9018 aaaattgtgctcaattggtgaattt-tgttaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttgtgattg 8920  T
Q  322 atgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8919 atgaataattgcttgggtatgcatattcatgtattgatgatg 8878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 183; Significance: 7e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 22 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 12453 - 12115
Alignment:
Q  22 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaa-ttttgattatggatgattgttgctaaattc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12453 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttaattttgtaacttt-caaatgctgtatgaaattttgattatggataattgttgctaaattc 12355  T
Q  121 gtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttat 220  Q
    || ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| |||||||| | || || |||||||||||||| |    
T  12354 gtgctctaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaaatacatgtttaaatgtgtaaaaatgataagttgt 12255  T
Q  221 gaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgatt 320  Q
    ||| |||||||||||  ||||||||| |  |||||||||| |||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  12254 gaaaattgtgctaaattggtgaattt-tgttaagttgttg-taat-tgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttatgatt 12158  T
Q  321 gatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 363  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12157 catgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 12115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 175; Significance: 4e-94; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 22 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 172245 - 171916
Alignment:
Q  22 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcg 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||    
T  172245 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtataaattttgattatggataactgttgctaaatacg 172146  T
Q  122 tactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatg 221  Q
    | |||||||| || || |||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||    
T  172145 tgctccaactgtgatgatatgtttgtatggatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtg 172046  T
Q  222 aagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattg 321  Q
    || |||||||||||  ||||||||| | ||||||||| ||| |  ||||||  ||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || |||    
T  172045 aaaattgtgctaaattggtgaattt-tgctaagttgtggttgaattgagttacgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttg 171947  T
Q  322 atgaataattgcttgggtatgcatattcatg 352  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  171946 atgaatcattgcttaggtatgcatattcatg 171916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 22 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 177948 - 177619
Alignment:
Q  22 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcg 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||    
T  177948 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtataaattttgattatggataactgttgctaaatacg 177849  T
Q  122 tactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatg 221  Q
    | |||||||| || || |||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||    
T  177848 tgctccaactgtgatgatatgtttgtatggatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtg 177749  T
Q  222 aagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattg 321  Q
    || |||||||||||  ||||||||| | ||||||||| ||| |  ||||||  ||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || |||    
T  177748 aaaattgtgctaaattggtgaattt-tgctaagttgtggttgaattgagttacgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttg 177650  T
Q  322 atgaataattgcttgggtatgcatattcatg 352  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  177649 atgaatcattgcttaggtatgcatattcatg 177619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 173; Significance: 6e-93; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 20 - 363
Target Start/End: Original strand, 26335 - 26678
Alignment:
Q  20 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaa-ttttgattatggatgattgttgctaaat 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| || |||||||||||||    
T  26335 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatgatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttcataatgtataattgttgctaaat 26434  T
Q  119 tcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagtt 218  Q
    |||| |||||||| || || ||||||||||||| |||||||||| || |||||  ||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  26435 tcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcgtgaattgatgataattgtaagattattggtgaaagtacatgttcaaatatgtaaaaatgataagtt 26534  T
Q  219 atgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatga 318  Q
     |||| ||||| || ||  ||||||||| | ||||||||||||||   |||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || |||    
T  26535 gtgaaaattgttctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagaatgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtga 26633  T
Q  319 ttgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 363  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||    
T  26634 ttgatgaatcattgcttgggtatgcatattgatgaattgaggatg 26678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 99 - 246
Target Start/End: Original strand, 8180 - 8327
Alignment:
Q  99 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||||| |||||     
T  8180 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattggtgataattgtatgattgttggtgaaattacaggttcaa 8279  T
Q  199 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaattt 246  Q
     |||| |||||||  ||||| |||| |||||||| ||  |||||||||    
T  8280 ttatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt 8327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 136 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 43224 - 42997
Alignment:
Q  136 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 235  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43224 tgttatgtttctatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgaagattgtgctaaa 43125  T
Q  236 agggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 335  Q
      |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43124 ttggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcgtgttcaagtgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 43025  T
Q  336 gggtatgcatattcatggattgatgatg 363  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  43024 gggtttgcatattcatggattgatgatg 42997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 170; Significance: 4e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 35 - 363
Target Start/End: Original strand, 4996 - 5324
Alignment:
Q  35 gggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg-attatggatgattgttgctaaattcgtactccaactat 133  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  4996 gggttagtctttatcataatcattatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttcataatggataattgttgctaaattcgtactccaactgt 5095  T
Q  134 gttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgcta 233  Q
    |  | ||||||||||||| |||||||||| || |||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||     
T  5096 gacgatatgtttgtatgcgtgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaagtacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctc 5195  T
Q  234 aaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgc 333  Q
    ||  ||||||||| | | ||||||||||||   |||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || |||||||||||| |||||    
T  5196 aattggtgaattt-tgcaaagttgttgttagaatgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtgattgatgaatcattgc 5294  T
Q  334 ttgggtatgcatattcatggattgatgatg 363  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  5295 ttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 5324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 170; Significance: 4e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 22 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 42069 - 41733
Alignment:
Q  22 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcg 121  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  42069 atctaaggtaagggggttggtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcg 41970  T
Q  122 tactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatg 221  Q
    | |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || ||||   |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| || ||    
T  41969 tgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtcatattgttggtgaaattacatgctcaaatatgtaaaaatgataatttgtg 41870  T
Q  222 aagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattg 321  Q
    || |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||   |||||| |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||| | || |   ||    
T  41869 aaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgctatggctgttaattgttgttgtagatg 41771  T
Q  322 atgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 359  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  41770 atgaatcattggttgggtatgcatattcatgaattgat 41733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 170; Significance: 4e-91; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 22 - 352
Target Start/End: Original strand, 247363 - 247694
Alignment:
Q  22 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttt--gattatggatgattgttgctaaatt 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||    
T  247363 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaatt 247462  T
Q  120 cgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagtta 219  Q
    ||| |||||||| |  || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||  ||||||||| |||||||| ||| | | ||||||||||||     
T  247463 cgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgagggtgaaatttcatgttcaaataggaacaaatgataagttg 247562  T
Q  220 tgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgat 319  Q
    |||| |||||||| ||  ||| ||||| | ||||||||||||||   |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || |    
T  247563 tgaaaattgtgctcaattggtaaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatgactgttaattgatgttgtggt 247661  T
Q  320 tgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 352  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  247662 tgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatg 247694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 20 - 57
Target Start/End: Original strand, 34070 - 34107
Alignment:
Q  20 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34070 tcatctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 34107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 170; Significance: 4e-91; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 22 - 363
Target Start/End: Original strand, 128092 - 128431
Alignment:
Q  22 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcg 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  128092 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttcattttgcaaattttcaaaagttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcg 128191  T
Q  122 tactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatg 221  Q
    | || ||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| || || |||  || |||||| ||    
T  128192 tgcttcaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaaggtgttaagttgtg 128291  T
Q  222 aagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattg 321  Q
    || |||||||| ||  || |||||| |  || |||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||| || ||||||    
T  128292 aaaattgtgctcaattggcgaattt-tgttaggttgttgttaat-tgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaatggatgttgtgattg 128389  T
Q  322 atgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 363  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  128390 atgaataattgattgggtatgcatattcatgaattgatgatg 128431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 136 - 363
Target Start/End: Original strand, 31700 - 31928
Alignment:
Q  136 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 235  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||    
T  31700 tgttatgtttgaatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatattcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgctcaa 31799  T
Q  236 agggtgaatttctcct-aagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgct 334  Q
      |||||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31800 ttggtgaatttctcctaaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttaatattatgattgatgaataattgct 31899  T
Q  335 tgggtatgcatattcatggattgatgatg 363  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  31900 tgggtttgcatattcatggattaatgatg 31928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 166; Significance: 9e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 25 - 363
Target Start/End: Original strand, 36837 - 37176
Alignment:
Q  25 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||| |||||||||    
T  36837 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgttaaattcgt 36936  T
Q  123 actccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatga 222  Q
     |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||   ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||    
T  36937 gctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagcttgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtga 37036  T
Q  223 agattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattga 322  Q
    | |||||||||||  ||||||||| | ||||||||| |||    |||||| ||| |||||||||| ||| ||||||  ||||| ||||| || || ||||    
T  37037 aaattgtgctaaattggtgaattt-tgctaagttgtggttggattgagttatgaatcttgttcaattgacgttatggctgttaattgatgttgtggttga 37135  T
Q  323 tgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 363  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37136 tgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 37176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 2)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 28 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 19543 - 19206
Alignment:
Q  28 ggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcatttt-gtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgtac 124  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||||| |    
T  19543 ggtaagggggttagtcttcatcataatcatcataatttttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgc 19444  T
Q  125 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 224  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||     
T  19443 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 19344  T
Q  225 attgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 324  Q
    |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| |  |||||| |||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||| || |  ||||||    
T  19343 attgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatg 19245  T
Q  325 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 363  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19244 aatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 19206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 99 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 21553 - 21290
Alignment:
Q  99 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||     
T  21553 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaa 21454  T
Q  199 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 298  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| |  |||||| |||||| ||||||| |||||||||     
T  21453 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttatt 21355  T
Q  299 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 363  Q
      ||||| ||||| || |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21354 gctgttaattgatgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 21290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 160; Significance: 3e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 22 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 272365 - 272031
Alignment:
Q  22 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcg 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | | ||||||||| ||    
T  272365 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatattgtataaattttgattatggataaatattgctaaatacg 272266  T
Q  122 tactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatg 221  Q
    |||||||||| |  || |||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||    
T  272265 tactccaactgtaatgatatgtttgtatgaatgaattgatgataattgtatgattgatggagaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtg 272166  T
Q  222 aagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattg 321  Q
    || |||||||||||  ||||||||| | ||||||||| |||    |||||| |||||||||||||| || ||||||   ||||| ||||| || || |||    
T  272165 aaaattgtgctaaattggtgaattt-tgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattggtgttatagctgttaattgatgttgtggttg 272067  T
Q  322 atgaataattgcttgggtatgcatattcatggattg 357  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  272066 atgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattg 272031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 156; Significance: 8e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 24 - 363
Target Start/End: Original strand, 123086 - 123427
Alignment:
Q  24 ctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcatttt-gtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattc 120  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||    
T  123086 ctaaggtaagggggttagtcttcaccataatcatcataatttttgtaaatttgcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattc 123185  T
Q  121 gtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttat 220  Q
    || |||||| | || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| |    
T  123186 gtgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgt 123285  T
Q  221 gaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgatt 320  Q
    ||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||   | |||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||    
T  123286 gaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattaagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggtt 123384  T
Q  321 gatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 363  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  123385 gatgaataatggcttgggtatgcatattcatgaattgaagatg 123427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 2)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 106 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 5785 - 5552
Alignment:
Q  106 attgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgca 205  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| |    
T  5785 attgttgctaaattcgtgctccaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgta 5686  T
Q  206 aaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgtta 305  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5685 aaaatgataagtcatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgtta 5586  T
Q  306 tttgatattatgattgatgaataattgcttgggt 339  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  5585 tttgataatatgattaatgaataattgcttgggt 5552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 20 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 5883 - 5846
Alignment:
Q  20 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5883 tcatctaaggtaagggggttagtctttaccataatcat 5846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 136 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 262 - 35
Alignment:
Q  136 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| | |||||||| ||    
T  262 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgtatattgtgctcaa 163  T
Q  236 agggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 335  Q
      |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  162 ttggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattaatgaataattgctt 63  T
Q  336 gggtatgcatattcatggattgatgatg 363  Q
    |||| |||||||||||| |||| |||||    
T  62 gggtttgcatattcatgaattgttgatg 35  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 141; Significance: 8e-74; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 167 - 363
Target Start/End: Original strand, 64584 - 64780
Alignment:
Q  167 ttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatg 266  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||     
T  64584 ttgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatt 64683  T
Q  267 tgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 363  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  64684 tgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatg 64780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 106 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 108003 - 107747
Alignment:
Q  106 attgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgca 205  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| |  || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  108003 attgttactaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgca 107904  T
Q  206 aaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgtta 305  Q
    ||||||||||||| | || |||||||| ||  ||||||||| |  ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  107903 aaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgtta 107805  T
Q  306 tttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 363  Q
     ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  107804 attgatgttgtgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 107747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 156
Target Start/End: Original strand, 89863 - 89905
Alignment:
Q  114 taaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa 156  Q
    ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  89863 taaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 89905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 138; Significance: 5e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 106 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 48443 - 48187
Alignment:
Q  106 attgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgca 205  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |  || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| || || |    
T  48443 attgttgctaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgta 48344  T
Q  206 aaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgtta 305  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| |  ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||  ||||||    
T  48343 aaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgttaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatagatgtta 48245  T
Q  306 tttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 363  Q
     ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  48244 attgatgttgtgattgatgaataattgcctgggtatgcatattcatggattgatgatg 48187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 136; Significance: 7e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 22 - 245
Target Start/End: Original strand, 51105 - 51328
Alignment:
Q  22 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcg 121  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  51105 atcttaggtaaggagattagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcg 51204  T
Q  122 tactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatg 221  Q
    | |||||||| || || ||| |||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||    
T  51205 tgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaataggtaaaaatgataagttgtg 51304  T
Q  222 aagattgtgctaaaagggtgaatt 245  Q
    || |||||||| ||  ||||||||    
T  51305 aaaattgtgctcaattggtgaatt 51328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 136 - 363
Target Start/End: Original strand, 21141 - 21367
Alignment:
Q  136 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 235  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||| || || ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  21141 tgttatgtttgtatccattaattgatgataattatatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaagattgagctcaa 21240  T
Q  236 agggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 335  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21241 ttggtgaattt-tcctaagttgttgttaatttgagattggattcttgttcaattgatgttatgaatgttatttgatgttatgattgatgaataattgctt 21339  T
Q  336 gggtatgcatattcatggattgatgatg 363  Q
    | || |||||||||||||||| ||||||    
T  21340 gagtttgcatattcatggattaatgatg 21367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 136 - 363
Target Start/End: Original strand, 14086 - 14312
Alignment:
Q  136 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 235  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || || ||| |||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14086 tgttatgtctgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttagtgaaattacatgttgaaatatgtaaaaatgataagttatgaagattgtgctcaa 14185  T
Q  236 agggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 335  Q
      ||||||||| ||||||||||||| |||| |||| |  ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14186 ttggtgaattt-tcctaagttgttgataatttgagattggattcttgttcaattaatgttatgaatgttgtttgatgttatgattgatgaataattgctt 14284  T
Q  336 gggtatgcatattcatggattgatgatg 363  Q
    | || |||||||||||||||||||||||    
T  14285 gagtttgcatattcatggattgatgatg 14312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 73 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 149012 - 148721
Alignment:
Q  73 tttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgt 170  Q
    ||||||||||||||||||||||   || || ||| ||||||| |||||| || |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  149012 tttcaaatgttgtatgaatttttgcataattgataattgttgttaaatttgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgt 148913  T
Q  171 ataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgag 270  Q
    |  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  148912 aagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgag 148814  T
Q  271 ttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 363  Q
     | |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||  || || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  148813 atttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgaagttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgtatattcatgaattgatgatg 148721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 22 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 9195 - 8849
Alignment:
Q  22 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcat----tttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgcta 115  Q
    |||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||    |||| || ||||||||||| ||||| |||||   ||  ||||| ||||||||||    
T  9195 atctaaggtaagtgtgttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttgcaatttttcaaatgtggtatgtatttttcataattggataattgttgcta 9096  T
Q  116 aattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataa 215  Q
    ||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  ||    
T  9095 aattcgtgctccatctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaa 8996  T
Q  216 gttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatatta 315  Q
    ||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| |  |||| | |||||  ||||||| |||||||||   | ||| ||||| ||     
T  8995 gttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattaatgttcaattgatgttattgctattaattgatgttg 8897  T
Q  316 tgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 363  Q
    |  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  8896 ttgttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatg 8849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 22 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 146941 - 146843
Alignment:
Q  22 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  146941 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttcctaaattc 146843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 3)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 22 - 245
Target Start/End: Original strand, 89375 - 89600
Alignment:
Q  22 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatt 119  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   || |||||| ||||||||||||||    
T  89375 atctaaggtaagggggttagtcttcatcatgatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttctatgaatttttgcataatggataattgttgctaaatt 89474  T
Q  120 cgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagtta 219  Q
    ||| |||||||| || || ||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | |||| |||||||     
T  89475 cgtgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaattataagttg 89574  T
Q  220 tgaagattgtgctaaaagggtgaatt 245  Q
    |||| |||||||| ||  ||||||||    
T  89575 tgaaaattgtgctcaattggtgaatt 89600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 22 - 150
Target Start/End: Original strand, 107705 - 107835
Alignment:
Q  22 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttt--gattatggatgattgttgctaaatt 119  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||| ||||||||||    
T  107705 atctaaggtaagggggttagtcttcatcatgatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataatttttgctaaatt 107804  T
Q  120 cgtactccaactatgttgttatgtttgtatg 150  Q
    ||| |||||||| || || ||| ||||||||    
T  107805 cgtgctccaactgtgatgatatatttgtatg 107835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 26 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 130911 - 130880
Alignment:
Q  26 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  130911 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 130880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 149 - 363
Target Start/End: Original strand, 5254 - 5466
Alignment:
Q  149 tgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttct 248  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||  ||||||||| |    
T  5254 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattggtgaattt-t 5352  T
Q  249 cctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatatt 348  Q
     || ||||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  5353 gctgagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttgtgattaatgaataattgcttgggt-tgcatatt 5451  T
Q  349 catggattgatgatg 363  Q
    |||||||||||||||    
T  5452 catggattgatgatg 5466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 116; Significance: 6e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 149 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 3936 - 3722
Alignment:
Q  149 tgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaa-tgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttc 247  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| | ||||||   ||  |||||||||     
T  3936 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaaatgataagttatggaaattgtgtccaattggtgaattt- 3838  T
Q  248 tcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatat 347  Q
    | |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  3837 tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttatgattgatgaataattacttgggtttgcatat 3738  T
Q  348 tcatggattgatgatg 363  Q
    ||||||||||||||||    
T  3737 tcatggattgatgatg 3722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 4)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 136 - 359
Target Start/End: Original strand, 9374 - 9596
Alignment:
Q  136 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| || ||||| ||    
T  9374 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgctcaa 9473  T
Q  236 agggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 335  Q
      ||||||||| | ||||||| |||||||| |||| | ||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||| || |  ||||||||| |||||||    
T  9474 ttggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaaatgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgctt 9572  T
Q  336 gggtatgcatattcatggattgat 359  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  9573 gggtatgcatattcatgaattgat 9596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 136 - 359
Target Start/End: Original strand, 16272 - 16494
Alignment:
Q  136 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| || ||||| ||    
T  16272 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgctcaa 16371  T
Q  236 agggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 335  Q
      ||||||||| | ||||||| |||||||| |||| | ||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||| || |  ||||||||| |||||||    
T  16372 ttggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaaatgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgctt 16470  T
Q  336 gggtatgcatattcatggattgat 359  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  16471 gggtatgcatattcatgaattgat 16494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 57
Target Start/End: Original strand, 9257 - 9297
Alignment:
Q  17 acatcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  9257 acatcatctaaggtaagggggttagttattatcacaatcat 9297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 57
Target Start/End: Original strand, 16155 - 16195
Alignment:
Q  17 acatcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  16155 acatcatctaaggtaagggggttagttattatcacaatcat 16195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1711 (Bit Score: 103; Significance: 4e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold1711
Description:

Target: scaffold1711; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 111 - 257
Target Start/End: Original strand, 1304 - 1450
Alignment:
Q  111 tgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 210  Q
    |||||||||||| |||   || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1304 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 1403  T
Q  211 gataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttg 257  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  1404 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttg 1450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1542 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold1542
Description:

Target: scaffold1542; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 99 - 363
Target Start/End: Original strand, 534 - 797
Alignment:
Q  99 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  534 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 633  T
Q  199 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 298  Q
    ||| | | ||||||| |||| |||| ||||| || ||  ||||||||| | |||||||  |||||   | |||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  634 ataggaacaaatgatgagttgtgaaaattgtactcaattggtgaattt-tgctaagttactgttagattaagttatgattcttgtttaattgatgttatg 732  T
Q  299 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 363  Q
      || || ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  733 gctgctaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcaggaattgaggatg 797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 99 - 363
Target Start/End: Original strand, 34460 - 34724
Alignment:
Q  99 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 198  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  34460 atggataattattgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 34559  T
Q  199 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttg-ttcaaatgatgttat 297  Q
     | || ||||||   ||||| |||| ||||| || ||  ||||||||| | ||||||||||||| |  |||| | |||||| || || || |||||||||    
T  34560 ttgtgtaaaaatatgaagttgtgaaaattgttctcaataggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttttaattgatgttat 34658  T
Q  298 gaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 363  Q
       ||||||||||| || |  ||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34659 tgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactacttgggtatgcatattcatggattgatgatg 34724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 99 - 363
Target Start/End: Original strand, 37066 - 37328
Alignment:
Q  99 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||       
T  37066 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 37165  T
Q  199 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 298  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||  |  | ||||| |||    |||| | |||||||||| ||| ||||||| |     
T  37166 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttggattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgtt 37263  T
Q  299 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 363  Q
     ||| || | ||| || |  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37264 gatgctaatagatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatggattgatgatg 37328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 57
Target Start/End: Original strand, 36975 - 37012
Alignment:
Q  20 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36975 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 37012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 99 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 41911 - 41648
Alignment:
Q  99 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 198  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  41911 atggataattgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 41812  T
Q  199 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 298  Q
     |||| |||||||  ||||| |||| |||||| | ||  ||||||||| | ||| ||||||||| |  |  | || ||  | ||||||| ||||||| |     
T  41811 ttatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgttcaattggtgaattt-tgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgtt 41713  T
Q  299 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 363  Q
      |||||  |||| || |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41712 gttgttaaatgatgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 41648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 41998 - 41957
Alignment:
Q  24 ctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattt 65  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||    
T  41998 ctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatgttcattt 41957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1560 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold1560
Description:

Target: scaffold1560; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 257 - 363
Target Start/End: Original strand, 9 - 115
Alignment:
Q  257 gttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggatt 356  Q
    ||||||||| |||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9 gttgttaatttgatatttgattcttgttcaaatgatattatgaatgttaattgatgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggatt 108  T
Q  357 gatgatg 363  Q
    |||||||    
T  109 gatgatg 115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 110 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 3215 - 2966
Alignment:
Q  110 ttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaa 209  Q
    ||||||||||||| |||   || || |||||||||||||| |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||    
T  3215 ttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatccatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaa 3116  T
Q  210 tgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttg-ttcaaatgatgttatgaatgttattt 308  Q
    ||  ||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| |  |||| | |||||| || || || |||||||||   ||||||||    
T  3115 tgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttttaattgatgttattgttgttattt 3017  T
Q  309 gatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 359  Q
    ||| || |  ||||||||| | |||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  3016 gatgttgttgttgatgaatcactgcttgtgtatgcatattcatgaattgat 2966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 74; Significance: 7e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 99 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 13769 - 13636
Alignment:
Q  99 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  13769 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 13670  T
Q  199 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgct 232  Q
     |||| |||||||  ||||| |||| ||||||||    
T  13669 ttatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgct 13636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 22 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 13859 - 13824
Alignment:
Q  22 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13859 atctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 13824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 257 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 48620 - 48514
Alignment:
Q  257 gttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggatt 356  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48620 gttgttaatttgagatttgattcttgttcacttgatgttatggatgttaattgatgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggatt 48521  T
Q  357 gatgatg 363  Q
    |||||||    
T  48520 gatgatg 48514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 136 - 265
Target Start/End: Original strand, 13350 - 13478
Alignment:
Q  136 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| || ||||| ||    
T  13350 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgctcaa 13449  T
Q  236 agggtgaatttctcctaagttgttgttaat 265  Q
      ||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  13450 ttggtgaattt-tgctaagttattgttaat 13478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 4)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 99 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 27058 - 26911
Alignment:
Q  99 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||       
T  27058 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 26959  T
Q  199 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaattt 246  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  26958 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 26911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 106 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 22796 - 22656
Alignment:
Q  106 attgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgca 205  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||   |||||      
T  22796 attgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtg 22697  T
Q  206 aaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaattt 246  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  22696 aaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 22656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 22894 - 22857
Alignment:
Q  20 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22894 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 22857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 27149 - 27112
Alignment:
Q  20 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27149 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 27112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 99 - 246
Target Start/End: Original strand, 1582 - 1729
Alignment:
Q  99 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||       
T  1582 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 1681  T
Q  199 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaattt 246  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  1682 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 1729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 57
Target Start/End: Original strand, 1491 - 1528
Alignment:
Q  20 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1491 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 1528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 267 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 9478 - 9382
Alignment:
Q  267 tgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 363  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9478 tgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 9382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0361
Description:

Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 99 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 3453 - 3360
Alignment:
Q  99 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacat 192  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||| | || || ||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||||||||||    
T  3453 atggataattgatgctaaattcgtgctctagctgtgatgttaagtttgtatgcatgaattaatgatatttgtatgattgttggtgaaattacat 3360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 307 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 3264 - 3210
Alignment:
Q  307 ttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatga 361  Q
    ||||| || |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  3264 ttgatgttgtgattgatgaatcattgtttgggtaggcatattcatgaattgatga 3210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0597
Description:

Target: scaffold0597; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 57
Target Start/End: Original strand, 873 - 910
Alignment:
Q  20 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  873 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 57
Target Start/End: Original strand, 9877 - 9914
Alignment:
Q  20 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9877 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 9914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 57
Target Start/End: Original strand, 108070 - 108107
Alignment:
Q  20 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  108070 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 108107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 55939 - 55904
Alignment:
Q  22 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55939 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 55904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0706
Description:

Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 57
Target Start/End: Original strand, 6440 - 6475
Alignment:
Q  22 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6440 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 6475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 57
Target Start/End: Original strand, 13282 - 13317
Alignment:
Q  22 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13282 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 13317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 262
Target Start/End: Original strand, 56106 - 56262
Alignment:
Q  106 attgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatg--ttcatatatg 203  Q
    ||||||| ||||||||| ||| |||| || |||||| || || ||||||| |||||| || |||||| ||||| | ||||||||||||  || |  ||||    
T  56106 attgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgcatgatttgatgataattgtatgattgtggctgaaattacatgttttaaagtatg 56205  T
Q  204 caaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgtt 262  Q
     | |||||  |||||||||| |||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||    
T  56206 tataaatgtcaagttatgaa-attgtgctcaaatggtgaattt-tgctaagttgttgtt 56262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 57
Target Start/End: Original strand, 57389 - 57424
Alignment:
Q  22 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  57389 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 115 - 156
Target Start/End: Original strand, 70307 - 70348
Alignment:
Q  115 aaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa 156  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  70307 aaattcgtactccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 70348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 18061 - 18015
Alignment:
Q  22 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgt 68  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  18061 atctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcataattattttgt 18015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 20 - 57
Target Start/End: Original strand, 193392 - 193429
Alignment:
Q  20 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  193392 tcatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 193429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 57
Target Start/End: Original strand, 17300 - 17336
Alignment:
Q  21 catctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17300 catctaaggtaagcgggttagtctttatcataatcat 17336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 80219 - 80187
Alignment:
Q  25 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  80219 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 80187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0516 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0516
Description:

Target: scaffold0516; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 17 - 56
Target Start/End: Original strand, 12036 - 12075
Alignment:
Q  17 acatcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatca 56  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  12036 acatcatctaaggtaagggggttagttattatcataatca 12075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 115 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 8257 - 8174
Alignment:
Q  115 aaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatg-aattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 197  Q
    |||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||| |||||||| || ||| ||  ||||||||||| || ||||||||    
T  8257 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaatttgcatgttca 8174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 22 - 57
Target Start/End: Original strand, 34305 - 34340
Alignment:
Q  22 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34305 atctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 34340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 22 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 45373 - 45338
Alignment:
Q  22 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45373 atctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 45338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 149 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 45244 - 45198
Alignment:
Q  149 tgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 195  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  45244 tgcatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattacatgtt 45198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 22 - 57
Target Start/End: Original strand, 12415 - 12450
Alignment:
Q  22 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12415 atctaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 12450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 195
Target Start/End: Original strand, 10249 - 10427
Alignment:
Q  18 catcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatt-atggatgattgttgctaa 116  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||  ||| ||| |  ||||||  ||||||||||||  | | || ||| || |||||||||||    
T  10249 catcatctaaggtaagggggtttgtcttcttcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaa 10348  T
Q  117 attcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 195  Q
    |||||| |||   || || || ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  10349 attcgtgctcttgctgtgatgatattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 10427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 57
Target Start/End: Original strand, 17207 - 17241
Alignment:
Q  23 tctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17207 tctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 17241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 116 - 197
Target Start/End: Original strand, 2317 - 2399
Alignment:
Q  116 aattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 197  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||| || || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  2317 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttca 2399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 373 - 339
Alignment:
Q  22 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatca 56  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  373 atctaaggtaagggggttagtcttcatcataatca 339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 25566 - 25532
Alignment:
Q  22 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatca 56  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25566 atctaaggtaagggggttagtcttcatcataatca 25532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 57
Target Start/End: Original strand, 5475 - 5508
Alignment:
Q  24 ctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5475 ctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 5508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0303 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0303
Description:

Target: scaffold0303; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 57
Target Start/End: Original strand, 4345 - 4378
Alignment:
Q  24 ctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4345 ctaaggtaagggggttagactttatcataatcat 4378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0173 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0173
Description:

Target: scaffold0173; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 5582 - 5549
Alignment:
Q  24 ctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5582 ctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 5549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University