View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF21527_low_32 (Length: 296)

Name: NF21527_low_32
Description: NF21527
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF21527_low_32
NF21527_low_32
[»] chr6 (12 HSPs)
chr6 (19-268)||(23895639-23895888)
chr6 (19-268)||(18420467-18420716)
chr6 (105-268)||(14102308-14102472)
chr6 (44-268)||(22066235-22066457)
chr6 (44-268)||(23884434-23884656)
chr6 (44-268)||(17512246-17512467)
chr6 (131-269)||(11421473-11421611)
chr6 (105-269)||(23110241-23110405)
chr6 (125-268)||(10259802-10259945)
chr6 (110-269)||(12173427-12173586)
chr6 (144-255)||(24564649-24564759)
chr6 (113-232)||(12415071-12415190)
[»] chr4 (14 HSPs)
chr4 (19-268)||(37059002-37059251)
chr4 (22-268)||(26812427-26812673)
chr4 (22-268)||(26821894-26822140)
chr4 (19-268)||(15842921-15843170)
chr4 (19-268)||(3242310-3242559)
chr4 (19-268)||(54689936-54690185)
chr4 (19-268)||(54699367-54699616)
chr4 (22-268)||(3917985-3918231)
chr4 (44-268)||(20884472-20884694)
chr4 (113-257)||(23622926-23623070)
chr4 (44-263)||(11482257-11482474)
chr4 (44-268)||(50516521-50516742)
chr4 (113-169)||(16489961-16490018)
chr4 (105-249)||(18125454-18125595)
[»] chr7 (14 HSPs)
chr7 (19-268)||(15174456-15174705)
chr7 (19-268)||(7592922-7593171)
chr7 (44-268)||(11634353-11634574)
chr7 (44-268)||(14634801-14635023)
chr7 (44-268)||(14644501-14644723)
chr7 (44-268)||(9736888-9737110)
chr7 (44-268)||(33292200-33292422)
chr7 (110-268)||(32818003-32818160)
chr7 (48-268)||(15947396-15947614)
chr7 (112-268)||(19352612-19352768)
chr7 (150-254)||(13874433-13874536)
chr7 (167-268)||(48710030-48710131)
chr7 (110-269)||(4306580-4306738)
chr7 (44-172)||(48711400-48711526)
[»] chr5 (24 HSPs)
chr5 (19-268)||(22489101-22489350)
chr5 (19-268)||(30454224-30454473)
chr5 (19-268)||(30459282-30459531)
chr5 (19-267)||(30444853-30445101)
chr5 (19-268)||(4635861-4636110)
chr5 (19-268)||(24412744-24412993)
chr5 (19-268)||(24422193-24422442)
chr5 (19-268)||(18568954-18569204)
chr5 (44-268)||(13815396-13815617)
chr5 (110-259)||(22118134-22118284)
chr5 (44-268)||(24244066-24244287)
chr5 (44-268)||(24290690-24290911)
chr5 (44-268)||(42732600-42732818)
chr5 (44-268)||(11223318-11223539)
chr5 (44-268)||(33955523-33955745)
chr5 (113-257)||(5600587-5600731)
chr5 (113-257)||(5610233-5610377)
chr5 (113-257)||(31150669-31150813)
chr5 (44-268)||(20035941-20036163)
chr5 (151-268)||(26652667-26652783)
chr5 (151-268)||(26924252-26924368)
chr5 (44-268)||(20834373-20834595)
chr5 (153-268)||(22448353-22448467)
chr5 (210-268)||(37514882-37514940)
[»] chr2 (12 HSPs)
chr2 (19-268)||(31710489-31710738)
chr2 (19-268)||(24022765-24023014)
chr2 (19-268)||(14273122-14273369)
chr2 (44-268)||(35877458-35877680)
chr2 (44-268)||(35884947-35885169)
chr2 (44-268)||(36724660-36724882)
chr2 (113-257)||(1800500-1800644)
chr2 (113-257)||(22632409-22632553)
chr2 (44-268)||(3396865-3397087)
chr2 (113-257)||(1791006-1791146)
chr2 (125-268)||(18578707-18578850)
chr2 (210-266)||(16446670-16446726)
[»] chr8 (24 HSPs)
chr8 (19-268)||(20713985-20714234)
chr8 (19-268)||(7789101-7789350)
chr8 (44-268)||(18143452-18143673)
chr8 (44-268)||(25037049-25037270)
chr8 (44-268)||(25051086-25051307)
chr8 (44-268)||(18232870-18233091)
chr8 (44-268)||(18242321-18242542)
chr8 (44-268)||(18883183-18883404)
chr8 (44-267)||(18251772-18251992)
chr8 (44-268)||(31575434-31575652)
chr8 (44-268)||(4843745-4843968)
chr8 (44-268)||(42712201-42712423)
chr8 (44-268)||(20044760-20044982)
chr8 (44-268)||(20030121-20030343)
chr8 (44-268)||(12925296-12925518)
chr8 (44-268)||(12767573-12767797)
chr8 (103-268)||(15833950-15834115)
chr8 (104-268)||(24096098-24096262)
chr8 (150-262)||(24634015-24634126)
chr8 (150-268)||(12915506-12915623)
chr8 (150-268)||(33592157-33592274)
chr8 (150-268)||(33601796-33601913)
chr8 (150-266)||(42896174-42896289)
chr8 (226-268)||(20714417-20714459)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (19-268)||(30846-31095)
scaffold0040 (20-268)||(9963-10206)
[»] chr3 (21 HSPs)
chr3 (19-268)||(28367676-28367925)
chr3 (19-268)||(28375494-28375743)
chr3 (19-268)||(28383316-28383565)
chr3 (19-268)||(24794569-24794818)
chr3 (19-268)||(28351743-28351992)
chr3 (19-269)||(38529199-38529449)
chr3 (28-268)||(4951520-4951758)
chr3 (44-268)||(5385632-5385854)
chr3 (44-268)||(46305597-46305818)
chr3 (113-257)||(17529895-17530039)
chr3 (113-257)||(54624662-54624806)
chr3 (44-268)||(23486983-23487207)
chr3 (103-268)||(13328301-13328465)
chr3 (105-207)||(7784091-7784194)
chr3 (113-257)||(32877877-32878021)
chr3 (113-257)||(48978677-48978817)
chr3 (113-257)||(48988217-48988357)
chr3 (116-268)||(19388773-19388928)
chr3 (105-249)||(4361558-4361699)
chr3 (214-268)||(7784012-7784066)
chr3 (210-254)||(24285493-24285537)
[»] scaffold0482 (1 HSPs)
scaffold0482 (19-268)||(3449-3698)
[»] scaffold0028 (2 HSPs)
scaffold0028 (19-268)||(94454-94703)
scaffold0028 (19-268)||(103895-104144)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (19-268)||(408244-408493)
[»] chr1 (10 HSPs)
chr1 (20-245)||(15810030-15810251)
chr1 (103-268)||(5378447-5378613)
chr1 (103-268)||(40999058-40999224)
chr1 (110-268)||(26906269-26906427)
chr1 (103-268)||(14272041-14272205)
chr1 (103-268)||(14281907-14282071)
chr1 (114-268)||(21633591-21633744)
chr1 (103-268)||(3470960-3471124)
chr1 (150-267)||(21919455-21919571)
chr1 (125-253)||(30676810-30676938)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (44-268)||(256901-257122)
[»] scaffold0233 (1 HSPs)
scaffold0233 (19-103)||(26309-26393)
[»] scaffold0206 (1 HSPs)
scaffold0206 (44-268)||(2051-2273)
[»] scaffold0269 (1 HSPs)
scaffold0269 (113-257)||(14848-14992)
[»] scaffold0247 (1 HSPs)
scaffold0247 (113-246)||(24600-24733)
[»] scaffold0021 (3 HSPs)
scaffold0021 (103-252)||(124047-124195)
scaffold0021 (114-246)||(99991-100123)
scaffold0021 (44-171)||(143111-143237)
[»] scaffold0334 (1 HSPs)
scaffold0334 (158-268)||(12571-12680)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (150-268)||(2284-2401)
[»] scaffold0223 (1 HSPs)
scaffold0223 (117-266)||(27078-27231)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 218; Significance: 1e-120; HSPs: 12)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 19 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 23895888 - 23895639
Alignment:
Q  19 catacaaagtgtgttgtatttcttaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagcattgtagaa 118  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  23895888 catacaaagtgtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataa 23895789  T
Q  119 gcctgctgaggttgataatacaggtgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaactatagtg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23895788 gcctgctgaggttgataatacaggtgtaacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtg 23895689  T
Q  219 gataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaac 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23895688 gataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaac 23895639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 19 - 268
Target Start/End: Original strand, 18420467 - 18420716
Alignment:
Q  19 catacaaagtgtgttgtatttcttaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagcattgtagaa 118  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||    
T  18420467 catacaaagtgtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagtttggagatagaaaattccaacctttcttttgctattgtgcaaagaattgtataa 18420566  T
Q  119 gcctgctgaggttgataatacaggtgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaactatagtg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18420567 gcctgctgaggttgataatacaggtgtaacggactgatctggtgtgatcaagatttgttagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtg 18420666  T
Q  219 gataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaac 268  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  18420667 tataatctcacacgaggtgtcgggactggaagtagccgggttttgtgaac 18420716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 105 - 268
Target Start/End: Original strand, 14102308 - 14102472
Alignment:
Q  105 aaagcattgtagaagcctgctgaggttgataatacagg-tgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagc 203  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||| |||||    
T  14102308 aaagaattgtagaagtctgctgaggttaataatacagggtgtaacaggctgatctgttgtgatcaagaccttacagtgctagtcaaaagtttctgttagc 14102407  T
Q  204 aagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaac 268  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14102408 aagacaactatagtggataatctcacaagaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaac 14102472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 44 - 268
Target Start/End: Original strand, 22066235 - 22066457
Alignment:
Q  44 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagcattgtagaagcctgctgaggttgataatacag 141  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||| ||| |  |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22066235 aagtctattgggcttaatagttt-gagataggaaaagttccaacctttcttgtgcgaaag--caaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacag 22066331  T
Q  142 gtgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggg 241  Q
      || || ||||||| | |||||||||||| ||| ||||| | || |||||||||||  | |  | | |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22066332 tggttacggactgatctagtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttctaccaact-gcatactatagtggataatctcacacgaagtgtggg 22066430  T
Q  242 gactgaaagtagccgggtttggtgaac 268  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||    
T  22066431 gactggaagtagccgggtttggtgaac 22066457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 44 - 268
Target Start/End: Original strand, 23884434 - 23884656
Alignment:
Q  44 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagcattgtagaagcctgctgaggttgataatacag 141  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||||||| ||| |  |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23884434 aagtctattgggcttaatagttt-gagataggaagagttccaacctttcttgtgcgaaag--caaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacag 23884530  T
Q  142 gtgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggg 241  Q
      || || ||||||| |||||||||||||| ||| ||||| | || |||||||||||  | |  | | ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  23884531 tggttacggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttctaccaac-tgcatactatagtggacaatctcacacgaagtgtggg 23884629  T
Q  242 gactgaaagtagccgggtttggtgaac 268  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||    
T  23884630 gactggaagtagccgggtttggtgaac 23884656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 44 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 17512467 - 17512246
Alignment:
Q  44 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagcattgtagaagcctgctgaggttgataatacag 141  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||  |||  ||   ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17512467 aagtctattgggcttaatagtttt-agataggaaaagttccaacctttctcgtgc--gtaaacaaagaattgtagaagcctgctaaggttgataatacag 17512371  T
Q  142 gtgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggg 241  Q
    | || |||||||||| | ||||||||||||  || ||||| | || |||||||||||  | |  | | ||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  17512370 g-gttacagactgatctagtgtgatcaagactttatagtgttggttagaagtttctaccaact-gtatactatagtggataatctcacaagaagtgtggg 17512273  T
Q  242 gactgaaagtagccgggtttggtgaac 268  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  17512272 gactgaaagtagccgagtttggtgaac 17512246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 131 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 11421611 - 11421473
Alignment:
Q  131 tgataataca-ggtgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaactatagtggataatctcac 229  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| | ||| || || | |||||||||||||||||||    
T  11421611 tgataatacatggtgtaacagactgatctggtgtgatcaagatcttatagtgttagtcagaattttttgttaacatgata-ctatagtggataatctcac 11421513  T
Q  230 acgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaact 269  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||    
T  11421512 acgaggtgtggggactggaagtagccggatttgatgaact 11421473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 105 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 23110405 - 23110241
Alignment:
Q  105 aaagcattgtagaagcctgctgaggttgataatacagg-tgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagc 203  Q
    |||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||  || ||||| ||||| || |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| |||||    
T  23110405 aaagaattttagaagcctgttgatgttgataatattgggtgtaatagacttatctggtgtgatcaagaacatatagtgctagtcagaagtttctgttagc 23110306  T
Q  204 aagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaact 269  Q
      ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| || ||| |||||||    
T  23110305 c-gaatactatagtggataatctaacacggggtgtggggactggaagtagctggttttcgtgaact 23110241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 125 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 10259945 - 10259802
Alignment:
Q  125 tgaggttgataatacagg-tgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaactatagtggataa 223  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||| ||    
T  10259945 tgaggtttataatacagggtgtaacggactgatctggtgtgatcaagaatttatagtgctagtcagaagtttctcttagc-aggatactatagtggagaa 10259847  T
Q  224 tctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaac 268  Q
    || ||||||| ||||| |||||| ||||||| || ||||||||||    
T  10259846 tcccacacgaagtgtgaggactggaagtagctggatttggtgaac 10259802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 110 - 269
Target Start/End: Original strand, 12173427 - 12173586
Alignment:
Q  110 attgtagaagcctgctgaggttgataatacagg-tgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaa 208  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||  |||||| | ||||  |||||| ||||||||||||||  || | |||||||||| |||||||| |||||| ||     
T  12173427 attgtagaagcctactaaggtttattttacaggatttaacgaactgatctggtgtgatcaagaatttatggtgctagtcataagtttctgttagcatgat 12173526  T
Q  209 aactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaact 269  Q
    | |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12173527 a-ctatagtggataatcttacacaaggtgtggggactgaaagtagccgagtttggtgaact 12173586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 24564759 - 24564649
Alignment:
Q  144 gtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgggga 243  Q
    |||||||| |||| || ||||||||||| | | ||||| || ||||||||||||| |||   ||| | ||||||||| ||||||| |||| |||||| ||    
T  24564759 gtaacagattgatctgatgtgatcaagaacatatagtgttattcagaagtttctagtagtt-gaatattatagtggacaatctcatacgaagtgtggaga 24564661  T
Q  244 ctgaaagtagcc 255  Q
    ||||||||||||    
T  24564660 ctgaaagtagcc 24564649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 113 - 232
Target Start/End: Original strand, 12415071 - 12415190
Alignment:
Q  113 gtagaagcctgctgaggttgataatacag-gtgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttct-attagcaagaaaa 210  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||  | || |||||||| | |||||||||| || ||  || | |    
T  12415071 gtagaagcctgctatggttaataatacagagtgtaacggactgatctggtgtgatcaacttattatagtgctattaagaagtttctgataag--aggata 12415168  T
Q  211 ctatagtggataatctcacacg 232  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  12415169 ctataatggataatctcacacg 12415190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 218; Significance: 1e-120; HSPs: 14)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 19 - 268
Target Start/End: Original strand, 37059002 - 37059251
Alignment:
Q  19 catacaaagtgtgttgtatttcttaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagcattgtagaa 118  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  37059002 catacaaagtgtgttgtatttctcaaagtctattgagcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataa 37059101  T
Q  119 gcctgctgaggttgataatacaggtgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaactatagtg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37059102 gcctgctgaggttgataatacaggtgtaacggactgatctggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtg 37059201  T
Q  219 gataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaac 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37059202 gataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaac 37059251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 22 - 268
Target Start/End: Original strand, 26812427 - 26812673
Alignment:
Q  22 acaaagtgtgttgtatttcttaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagcattgtagaagcc 121  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  26812427 acaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcc 26812526  T
Q  122 tgctgaggttgataatacaggtgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaactatagtggat 221  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26812527 tgctgaggttgataatacaggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggat 26812626  T
Q  222 aatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaac 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26812627 aatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaac 26812673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 22 - 268
Target Start/End: Original strand, 26821894 - 26822140
Alignment:
Q  22 acaaagtgtgttgtatttcttaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagcattgtagaagcc 121  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  26821894 acaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcc 26821993  T
Q  122 tgctgaggttgataatacaggtgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaactatagtggat 221  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26821994 tgctgaggttgataatacaggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggat 26822093  T
Q  222 aatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaac 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26822094 aatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaac 26822140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 19 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 15843170 - 15842921
Alignment:
Q  19 catacaaagtgtgttgtatttcttaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagcattgtagaa 118  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15843170 catacaaagtgtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaatttcaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtagaa 15843071  T
Q  119 gcctgctgaggttgataatacaggtgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaactatagtg 218  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  15843070 gcctgcttaggttgataatacaggtgtaacagactgatctgatgtgatcaagatcttatagtgctagtcagaagtttctgttagcaagacaactatagtg 15842971  T
Q  219 gataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaac 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  15842970 gataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgagtttggtgaac 15842921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 19 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 3242559 - 3242310
Alignment:
Q  19 catacaaagtgtgttgtatttcttaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagcattgtagaa 118  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  3242559 catacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataa 3242460  T
Q  119 gcctgctgaggttgataatacaggtgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaactatagtg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||  || || ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3242459 gcctgctgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtg 3242360  T
Q  219 gataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaac 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3242359 gataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaac 3242310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 19 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 54690185 - 54689936
Alignment:
Q  19 catacaaagtgtgttgtatttcttaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagcattgtagaa 118  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  54690185 catacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataa 54690086  T
Q  119 gcctgctgaggttgataatacaggtgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaactatagtg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||  || || ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  54690085 gcctgctgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtg 54689986  T
Q  219 gataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaac 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  54689985 gataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaac 54689936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 19 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 54699616 - 54699367
Alignment:
Q  19 catacaaagtgtgttgtatttcttaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagcattgtagaa 118  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  54699616 catacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataa 54699517  T
Q  119 gcctgctgaggttgataatacaggtgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaactatagtg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||  || || ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  54699516 gcctgctgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtg 54699417  T
Q  219 gataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaac 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  54699416 gataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaac 54699367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 22 - 268
Target Start/End: Original strand, 3917985 - 3918231
Alignment:
Q  22 acaaagtgtgttgtatttcttaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagcattgtagaagcc 121  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  3917985 acaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagaaagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcc 3918084  T
Q  122 tgctgaggttgataatacaggtgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaactatagtggat 221  Q
    ||||||||||||||||||||  || || ||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3918085 tgctgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtaatgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggat 3918184  T
Q  222 aatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaac 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3918185 aatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaac 3918231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 44 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 20884694 - 20884472
Alignment:
Q  44 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagcattgtagaagcctgctgaggttgataatacag 141  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||||||| ||| |  |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20884694 aagtctattgggcttaatagttt-gagataggaagagttccaacctttcttgtgcgaaag--caaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacag 20884598  T
Q  142 gtgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggg 241  Q
      || || ||||||| |||||||||||| | ||| ||||| | || |||||||||||  | |  | | |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20884597 tggttacggactgatctggtgtgatcaaaaccttatagtgttggttagaagtttctaccaac-tgcatactatagtggataatctcacacgaagtgtggg 20884499  T
Q  242 gactgaaagtagccgggtttggtgaac 268  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  20884498 gactggaagtagccgggtttggggaac 20884472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 113 - 257
Target Start/End: Original strand, 23622926 - 23623070
Alignment:
Q  113 gtagaagcctgctgaggttgataatacag-gtgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaac 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||  |||| || | ||    
T  23622926 gtagaagcctgctgaggttgataatacagagtgtaacagactgatctggtgtgatcaacatattatagtgctattcagaagtttctgatagc-aggatac 23623024  T
Q  212 tatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgg 257  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||||    
T  23623025 tatagtggataatctcacacgtagtgtggggactggacgtagccgg 23623070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 44 - 263
Target Start/End: Original strand, 11482257 - 11482474
Alignment:
Q  44 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagcattgtagaagcctgctgaggttgataatacag 141  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||||||| ||| |  |  ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11482257 aagtctattcggcttaatagttt-gagataggaagagttccaacctttcttgtgcgaaag--caaagaattgtagaagccggctgaggttgataatacag 11482353  T
Q  142 gtgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggg 241  Q
    | || || ||||||||||||||||| |||| ||| ||||| | || |||||||||||  | |  | | |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11482354 gggttacggactgatatggtgtgataaagaccttatagtgttggttagaagtttctaccaac-tgtatactatagtggataatctcacacgaagtgtggg 11482452  T
Q  242 gactgaaagtagccgggtttgg 263  Q
    ||||  ||||||||||||||||    
T  11482453 gactagaagtagccgggtttgg 11482474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 44 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 50516742 - 50516521
Alignment:
Q  44 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa-ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagcattgtagaagcctgctgaggttgataatacagg 142  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||  || |  |  ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |    
T  50516742 aagtctattgggcttaatagttt-gagataggaaagttccaacctttcttgagcgaaag--caaagaattgtaacagcctgctgaggttgataatacaag 50516646  T
Q  143 tgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgggg 242  Q
     || || ||||||| |||||||||||||| ||| ||||| | || |||| ||||||  | |  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  50516645 ggttacggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaaatttctaccaacg-gaatactatagtggataatctcacacgaagtgtgggg 50516547  T
Q  243 actgaaagtagccgggtttggtgaac 268  Q
    |||| |||||| ||||||||| ||||    
T  50516546 actggaagtagtcgggtttggggaac 50516521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 113 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 16490018 - 16489961
Alignment:
Q  113 gtagaagcctgctgaggttgataatacag-gtgtaacagactgatatggtgtgatcaa 169  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16490018 gtagaagtctgctgaggttgataatactgagtgtaacagactgatatggtgtgatcaa 16489961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 18125595 - 18125454
Alignment:
Q  105 aaagcattgtagaagcctgctgaggttgataatac-aggtgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagc 203  Q
    |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || |||||||||    ||  | |||| || |||||||| | |||||    
T  18125595 aaagaattgaagaagtctgctgaggttgataatacaaggtgtaacagaatgatctgttgtgatcaa---ttttcaatgctggtaagaagtttttgttagc 18125499  T
Q  204 aagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaa 249  Q
     || | |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  18125498 -aggatactataatggataatctcacacgaggtgtggagaccgaaa 18125454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 14)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 19 - 268
Target Start/End: Original strand, 15174456 - 15174705
Alignment:
Q  19 catacaaagtgtgttgtatttcttaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagcattgtagaa 118  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||    
T  15174456 catacaaagtgtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattatataa 15174555  T
Q  119 gcctgctgaggttgataatacaggtgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaactatagtg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  15174556 gcctgctgaggttgataatacaggtgtaacggactgatctggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttttgttagcaagaaaactatagtg 15174655  T
Q  219 gataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaac 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15174656 gataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaac 15174705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 19 - 268
Target Start/End: Original strand, 7592922 - 7593171
Alignment:
Q  19 catacaaagtgtgttgtatttcttaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagcattgtagaa 118  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  7592922 catacaaagtgtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataa 7593021  T
Q  119 gcctgctgaggttgataatacaggtgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaactatagtg 218  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  7593022 gcctgatgaggttgataatacaggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactataatg 7593121  T
Q  219 gataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaac 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  7593122 gataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccaggtttggtgaac 7593171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 44 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 11634574 - 11634353
Alignment:
Q  44 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagcattgt-agaagcctgctgaggttgataatacagg 142  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  11634574 aagtctattgggctgaatagttt-gagatagaaaattccaacctttcttttgcta--gtgcaaagaattgtaagaagcctgctgaggttgataatacaga 11634478  T
Q  143 tgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgggg 242  Q
     || ||| ||||||  |||||||||||||  || ||||| | || ||||||||||   | |  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11634477 ggttacaaactgatcgggtgtgatcaagacgttatagtgttggttagaagtttctgccaac-tgaatactatagtggataatctcacacgaagtgtgggg 11634379  T
Q  243 actgaaagtagccgggtttggtgaac 268  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||    
T  11634378 actggaagtagccggatttggtgaac 11634353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 44 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 14635023 - 14634801
Alignment:
Q  44 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagcattgtagaagcctgctgaggttgataatacag 141  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||| ||| |  |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14635023 aagtctattgggcttaatagttt-gagataggaaaagttccaacctttcttgtgcgaaag--caaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacag 14634927  T
Q  142 gtgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggg 241  Q
      || || ||||||| |||||||||||||| ||| ||||| | || |||||||||||  |||  | | |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14634926 tggttacggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttctaccagc-tgcatactatagtggataatctcacacgaagtgtggg 14634828  T
Q  242 gactgaaagtagccgggtttggtgaac 268  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||    
T  14634827 gactggaagtagccgggtttggtgaac 14634801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 44 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 14644723 - 14644501
Alignment:
Q  44 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagcattgtagaagcctgctgaggttgataatacag 141  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||| ||| |  |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14644723 aagtctattgggcttaatagttt-gagataggaaaagttccaacctttcttgtgcgaaag--caaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacag 14644627  T
Q  142 gtgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggg 241  Q
      || || ||||||| |||||||||||||| ||| ||||| | || |||||||||||  | |  | | |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14644626 tggttacggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttctaccaac-tgcatactatagtggataatctcacacgaagtgtggg 14644528  T
Q  242 gactgaaagtagccgggtttggtgaac 268  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||    
T  14644527 gactggaagtagccgggtttggtgaac 14644501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 44 - 268
Target Start/End: Original strand, 9736888 - 9737110
Alignment:
Q  44 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagcattgtagaagcctgctgaggttgataatacag 141  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||| ||| |  |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9736888 aagtctattgggcttaatagttt-gagataggaaaagttccaacctttcttgtgcgaaag--caaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacag 9736984  T
Q  142 gtgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggg 241  Q
    | |  |||||||||| |||||||||||||  ||| ||||| | || |||||||||||  | |  ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  9736985 gggctacagactgatctggtgtgatcaaggccttatagtgttggttagaagtttctacaaac-tgaatactataatggataatctcacacgaagtgtggg 9737083  T
Q  242 gactgaaagtagccgggtttggtgaac 268  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  9737084 gactggaagtagccgggtttagtgaac 9737110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 44 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 33292422 - 33292200
Alignment:
Q  44 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagcattgtagaagcctgctgaggttgataatacag 141  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||   |||||||||||||| ||| |  |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33292422 aagtctattgggctcaatagttt-gagataggaagagttccaacctttcttgtgcgaaag--caaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacag 33292326  T
Q  142 gtgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggg 241  Q
      || || ||||||| |||||||||||||| ||| ||||| | || |||||||||||  | |  | | |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33292325 tggttacggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttctaccaac-tgcatactatagtggataatctcacacgaagtgtggg 33292227  T
Q  242 gactgaaagtagccgggtttggtgaac 268  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||    
T  33292226 gactggaagtagccgggtttggtgaac 33292200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 110 - 268
Target Start/End: Original strand, 32818003 - 32818160
Alignment:
Q  110 attgtagaagcctgctgaggttgataatacaggtgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaa 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| | || |||||||||||  | |  |||     
T  32818003 attgtagaagcctgcggaggttgataatacaggggttacagactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttctaccaac-tgaat 32818101  T
Q  210 actatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaac 268  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  32818102 actatagtggataatctcacacgaagtgtggggaccggaagtagccgggtttggtgaac 32818160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 48 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 15947614 - 15947396
Alignment:
Q  48 ctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagcattgtagaagcctgctgaggttgataatacaggtgt 145  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||||||| ||| |  |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  15947614 ctattgggcttaatagttt-gagataggaagagttccaacctttcttgtgcgaaag--caaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacagtggt 15947518  T
Q  146 aacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggact 245  Q
     || ||||||| |||||||||||||| ||| ||||| | || |||||||||||  | |  | | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  15947517 tacggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttctaccaac-tgcatactatagtggataatctcacacgaagtgtggtgact 15947419  T
Q  246 gaaagtagccgggtttggtgaac 268  Q
    | |||||||||||||||||||||    
T  15947418 ggaagtagccgggtttggtgaac 15947396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 112 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 19352768 - 19352612
Alignment:
Q  112 tgtagaagcctgctgaggttgataatacagg-tgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaa 210  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||  ||| ||||||||||| ||  || |||| | |||||||||||||| |||||| || |     
T  19352768 tgtagaagcctgatgaggttcataatacagggtgtaacggaaagatctggtgtgatcaggaatttatagtacaagtcagaagtttctgttagcaggaga- 19352670  T
Q  211 ctatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaac 268  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||  ||||||||||    
T  19352669 ctatagtggataatctcacacgaagtgtgaggactggaagtagccgaatttggtgaac 19352612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 150 - 254
Target Start/End: Original strand, 13874433 - 13874536
Alignment:
Q  150 gactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaa 249  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| ||||| | || |||||||||||  | |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  13874433 gactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttctaccaact-gaaaactatagtggataatctcacacgaagtgtggggactggaa 13874531  T
Q  250 gtagc 254  Q
    |||||    
T  13874532 gtagc 13874536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 167 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 48710131 - 48710030
Alignment:
Q  167 caagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgt-ggggactgaaagtagccgggtttggtg 265  Q
    ||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  48710131 caagaccttatagtgctagttagaagtttctactagct-gaatactatagtggataatctcacacgaagtgtgggggactggaagtatccgagtttggtg 48710033  T
Q  266 aac 268  Q
    |||    
T  48710032 aac 48710030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 110 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 4306738 - 4306580
Alignment:
Q  110 attgtagaagcctgctgaggttgataatacag-gtgtaa-cagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaaga 207  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| |||||||||||| | |   |||||||| ||| ||||||||  |||   |     
T  4306738 attgtagaagtctgctgaggttgataatacagagtgtaatcggactgatctggtgtgatcaacaac--atagtgctattcataagtttctgatag-ttgg 4306642  T
Q  208 aaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaact 269  Q
    | |||||||| || |||||||| ||| ||||||| |||| ||||||| || |||||||||||    
T  4306641 atactatagtagaaaatctcactcgaagtgtgggaactggaagtagctggctttggtgaact 4306580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 44 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 48711526 - 48711400
Alignment:
Q  44 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa-ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagcattgtagaagcctgctgaggttgataatacagg 142  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||| ||  |  |  ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| |    
T  48711526 aagtctattgtgcttaatagttt-gagatagaaaagttttaacctttcttgtgtgaaag--caaagaattatagaagcctgttgaggttgataatacatg 48711430  T
Q  143 tgtaacagactgatatggtgtgatcaagat 172  Q
    |||  |  ||||||||||||||||||||||    
T  48711429 tgttccgaactgatatggtgtgatcaagat 48711400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 24)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 19 - 268
Target Start/End: Original strand, 22489101 - 22489350
Alignment:
Q  19 catacaaagtgtgttgtatttcttaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagcattgtagaa 118  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22489101 catacaaagtgtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtagaa 22489200  T
Q  119 gcctgctgaggttgataatacaggtgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaactatagtg 218  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  22489201 gtctgctgaggttgataatacaggtgtaacggactgatctggtgtgatcaagatcttatagtgctagtcataagtttctgttagcaagacaactatagtg 22489300  T
Q  219 gataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaac 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22489301 gataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaac 22489350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 19 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 30454473 - 30454224
Alignment:
Q  19 catacaaagtgtgttgtatttcttaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagcattgtagaa 118  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  30454473 catacaaagtgtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataa 30454374  T
Q  119 gcctgctgaggttgataatacaggtgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaactatagtg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30454373 gcctgctgaggttgataatacaggtgttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtg 30454274  T
Q  219 gataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaac 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30454273 gataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaac 30454224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 19 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 30459531 - 30459282
Alignment:
Q  19 catacaaagtgtgttgtatttcttaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagcattgtagaa 118  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  30459531 catacaaagtgtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataa 30459432  T
Q  119 gcctgctgaggttgataatacaggtgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaactatagtg 218  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30459431 gcctgccgaggttgataatacaggtgttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtg 30459332  T
Q  219 gataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaac 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30459331 gataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaac 30459282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 19 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 30445101 - 30444853
Alignment:
Q  19 catacaaagtgtgttgtatttcttaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagcattgtagaa 118  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  30445101 catacaaagtgtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataa 30445002  T
Q  119 gcctgctgaggttgataatacaggtgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaactatagtg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30445001 gcctgctgaggttgataatacaggtgttatggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtg 30444902  T
Q  219 gataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaa 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30444901 gataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaa 30444853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 19 - 268
Target Start/End: Original strand, 4635861 - 4636110
Alignment:
Q  19 catacaaagtgtgttgtatttcttaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagcattgtagaa 118  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4635861 catacaaagtgtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacatttcttttgctagtgtgcaaagaattgtagaa 4635960  T
Q  119 gcctgctgaggttgataatacaggtgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaactatagtg 218  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  4635961 gcctgctgaggttgataaaacaggtgtaacggactgatatggtgtgatcaagatcttatagtgctggtcagaagtttctgttagcaagacaactatagtg 4636060  T
Q  219 gataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaac 268  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4636061 gataatctcacgtgaggtgtggggactgaaaatagccgggtttggtgaac 4636110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 19 - 268
Target Start/End: Original strand, 24412744 - 24412993
Alignment:
Q  19 catacaaagtgtgttgtatttcttaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagcattgtagaa 118  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  24412744 catacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataa 24412843  T
Q  119 gcctgctgaggttgataatacaggtgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaactatagtg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24412844 gcctgctgaggttgataatacagaggttacagactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtg 24412943  T
Q  219 gataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaac 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  24412944 gataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccggatttggtgaac 24412993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 19 - 268
Target Start/End: Original strand, 24422193 - 24422442
Alignment:
Q  19 catacaaagtgtgttgtatttcttaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagcattgtagaa 118  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  24422193 catacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataa 24422292  T
Q  119 gcctgctgaggttgataatacaggtgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaactatagtg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||  || || ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24422293 gcctgctgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtg 24422392  T
Q  219 gataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaac 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  24422393 gataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccggatttggtgaac 24422442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 19 - 268
Target Start/End: Original strand, 18568954 - 18569204
Alignment:
Q  19 catacaaagtgtgttgtatttcttaaagtctattgggcttaatagtttt-gagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagcattgtaga 117  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  18568954 catacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagtttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtata 18569053  T
Q  118 agcctgctgaggttgataatacaggtgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaactatagt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || || ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18569054 agcctgctgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagt 18569153  T
Q  218 ggataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaac 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18569154 ggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaac 18569204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 44 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 13815617 - 13815396
Alignment:
Q  44 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagcattgta-gaagcctgctgaggttgataatacagg 142  Q
    |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| |    
T  13815617 aagtttattgggcttaatagttta-agatagaaaattccaacctttcttttgctagtg--caaagaattgtaagaagcctgttgaggttgataatacaag 13815521  T
Q  143 tgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgggg 242  Q
     || ||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||| | || |||||||||||  | |  ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  13815520 ggttacagaatgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttctaccaac-tgaatactatagtggataatctcacatgaagtgtgggg 13815422  T
Q  243 actgaaagtagccgggtttggtgaac 268  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||    
T  13815421 actggaagtagccggatttggtgaac 13815396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 110 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 22118284 - 22118134
Alignment:
Q  110 attgtagaagcctgctgaggttgataatacagg-tgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaa 208  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||| |||||||||     
T  22118284 attgtagaagcatgctgatgttgataatacaggatgtaacagactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttattcagaagtttctgttagcaagac 22118185  T
Q  209 aactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggt 259  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  22118184 aactataatggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagtcgggt 22118134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 44 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 24244287 - 24244066
Alignment:
Q  44 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagcattgt-agaagcctgctgaggttgataatacagg 142  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||     
T  24244287 aagtctattgggctgaatagttt-gagatagaaaattccaacctttcttttgcta--gtgcaaagaattgtaagaatcctgctgaggttgataatacaga 24244191  T
Q  143 tgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgggg 242  Q
     || ||| ||||||  |||||||||||||  |||||||| |  | ||||||||||   | |  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24244190 ggttacaaactgatcgggtgtgatcaagacgttgtagtgttgattagaagtttctgccaac-tgaatactatagtggataatctcacacgaagtgtgggg 24244092  T
Q  243 actgaaagtagccgggtttggtgaac 268  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||    
T  24244091 actggaagtagccggatttggtgaac 24244066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 44 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 24290911 - 24290690
Alignment:
Q  44 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagcattgt-agaagcctgctgaggttgataatacagg 142  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||     
T  24290911 aagtctattgggctgaatagttt-gagatagaaaattccaacctttcttttgcta--gtgcaaagaattgtaagaatcctgctgaggttgataatacaga 24290815  T
Q  143 tgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgggg 242  Q
     || ||| ||||||  |||||||||||||  |||||||| |  | ||||||||||   | |  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24290814 ggttacaaactgatcgggtgtgatcaagacgttgtagtgttgattagaagtttctgccaac-tgaatactatagtggataatctcacacgaagtgtgggg 24290716  T
Q  243 actgaaagtagccgggtttggtgaac 268  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||    
T  24290715 actggaagtagccggatttggtgaac 24290690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 44 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 42732818 - 42732600
Alignment:
Q  44 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa-ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagcattgtagaagcctgctgaggttgataatacagg 142  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||| ||    ||  ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42732818 aagtctattgggcttaatagttt-gagatagaagagtttcaacctttcttgtg----tgatcaa-gaattgtagaagcctgttgaggttgataatacagg 42732725  T
Q  143 tgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgggg 242  Q
     ||    ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42732724 ggttctggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgctagttagaagtttctactagct-gaatactatagtggataatctcacacgaagtgtgggg 42732626  T
Q  243 actgaaagtagccgggtttggtgaac 268  Q
    |||| |||||||||||||||||||||    
T  42732625 actggaagtagccgggtttggtgaac 42732600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 44 - 268
Target Start/End: Original strand, 11223318 - 11223539
Alignment:
Q  44 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagcattgtagaagcctgctgaggttgataatacag 141  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||||||| ||| |  |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11223318 aagtctattgggcttaatagttt-gagataggaagagttccaacctttcttgtgcgaaag--caaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacag 11223414  T
Q  142 gtgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggg 241  Q
    | || |||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| | || |||||||||||  |    | | |||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  11223415 gggttacagactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttctacca--ctgtatactataatggataatctcacacgaagtgtggg 11223512  T
Q  242 gactgaaagtagccgggtttggtgaac 268  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  11223513 gactggaagtagccgagtttggtgaac 11223539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 44 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 33955745 - 33955523
Alignment:
Q  44 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagcattgtagaagcctgctgaggttgataatacag 141  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||||||| ||| |  |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33955745 aagtctattgggcttaatagttt-gagataggaagagttccaacctttcttgtgcgaaag--caaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacag 33955649  T
Q  142 gtgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggg 241  Q
      || ||  |||||| |||||||||||||| ||| ||||| | || |||||||||||  | |  | | |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33955648 tggttacgtactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttctaccaact-gcatactatagtggataatctcacacgaagtgtggg 33955550  T
Q  242 gactgaaagtagccgggtttggtgaac 268  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||    
T  33955549 gactggaagtagccgggtttggtgaac 33955523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 113 - 257
Target Start/End: Original strand, 5600587 - 5600731
Alignment:
Q  113 gtagaagcctgctgaggttgataatacag-gtgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaac 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||  ||||| || | |    
T  5600587 gtagaagcctgctgaggttgataatacagagtgtaacggactgatctggtgtgatcaacatattatagtgctattcagaagtttctgatagcaggata-c 5600685  T
Q  212 tatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgg 257  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||    
T  5600686 tatagtggataatctcacacgtggtgtggggactggacgtagccgg 5600731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 113 - 257
Target Start/End: Original strand, 5610233 - 5610377
Alignment:
Q  113 gtagaagcctgctgaggttgataatacag-gtgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaac 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||  ||||| || | |    
T  5610233 gtagaagcctgctgaggttgataatacagagtgtaacggactgatctggtgtgatcaacatattatagtgctattcagaagtttctgatagcaggata-c 5610331  T
Q  212 tatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgg 257  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||    
T  5610332 tatagtggataatctcacacgtggtgtggggactggacgtagccgg 5610377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 113 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 31150813 - 31150669
Alignment:
Q  113 gtagaagcctgctgaggttgataatacag-gtgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaac 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||  ||||| || | |    
T  31150813 gtagaagcctgctgaggttgataatacagagtgtaacggactgatctggtgtgatcaacatattatagtgctattcagaagtttctgatagcaggata-c 31150715  T
Q  212 tatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgg 257  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||||    
T  31150714 tatagtggataatctcacacgtagtgtggggactggacgtagccgg 31150669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 44 - 268
Target Start/End: Original strand, 20035941 - 20036163
Alignment:
Q  44 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagcattgtagaagcctgctgaggttgataatacag 141  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   ||||||||||| || ||| |  |  ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  20035941 aagtctattgggcttaatagttt-gagataggaagagttccaaccttttttgtgcgaaag--caaagaattgtagaagcctgctaaggttgataatatag 20036037  T
Q  142 gtgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggg 241  Q
      || |  ||||||| |||||||||||||| ||| ||||| | || |||||||||||  | |  | | ||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  20036038 tggttatggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttctaccaact-gtatactatagtggataatctcacatgatgtgtggg 20036136  T
Q  242 gactgaaagtagccgggtttggtgaac 268  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||    
T  20036137 gactggaagtagccgggtttggtgaac 20036163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 151 - 268
Target Start/End: Original strand, 26652667 - 26652783
Alignment:
Q  151 actgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaag 250  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||    
T  26652667 actgatatggtgtgatcaagacctaatagtgctagttagaagtttctattagct-gaatactatagtggattatctcacacgaagtgtggggactggaag 26652765  T
Q  251 tagccgggtttggtgaac 268  Q
    ||| | ||||||||||||    
T  26652766 tagtcaggtttggtgaac 26652783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 151 - 268
Target Start/End: Original strand, 26924252 - 26924368
Alignment:
Q  151 actgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaag 250  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||    
T  26924252 actgatatggtgtgatcaagacctaatagtgctagttagaagtttctattagct-gaatactatagtggattatctcacacgaagtgtggggactggaag 26924350  T
Q  251 tagccgggtttggtgaac 268  Q
    ||| | ||||||||||||    
T  26924351 tagtcaggtttggtgaac 26924368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 44 - 268
Target Start/End: Original strand, 20834373 - 20834595
Alignment:
Q  44 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagcattgtagaagcctgctgaggttgataatacag 141  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||| ||   |||||||||||||| ||| |  |  ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  20834373 aagtctattgggcttaatagttt-gacataggaagagttccaacctttcttgtgcgaaag--caaagaattggagaagcctgctgaggttgattatacag 20834469  T
Q  142 gtgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggg 241  Q
      || ||  |||||| |||| ||||||||| ||| ||||| | || |||||||||||  | |  | | |||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  20834470 tggttacgaactgatctggtatgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttctaccaact-gcatactatagtggataatctcacacggagtgtggg 20834568  T
Q  242 gactgaaagtagccgggtttggtgaac 268  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||    
T  20834569 gactggaagtagccgggtttggtgaac 20834595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 153 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 22448467 - 22448353
Alignment:
Q  153 tgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaagta 252  Q
    |||| |||||||||||||| ||| ||||| | || |||||||||||  | |  | | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  22448467 tgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttctaccaact-gtatactatagtggataatctcacacgaagtgtggggactggaagta 22448369  T
Q  253 gccgggtttggtgaac 268  Q
    ||||| || |||||||    
T  22448368 gccggattgggtgaac 22448353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 210 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 37514940 - 37514882
Alignment:
Q  210 actatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaac 268  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| |||| |||||    
T  37514940 actatagtggataatctcacacaaggtgtggggactagaagtagccggctttgatgaac 37514882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 12)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 19 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 31710738 - 31710489
Alignment:
Q  19 catacaaagtgtgttgtatttcttaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagcattgtagaa 118  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31710738 catacaaagtgtgttgtatttctcaaagtctattgggcttactagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtagaa 31710639  T
Q  119 gcctgctgaggttgataatacaggtgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaactatagtg 218  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  31710638 gtctgctgaggttgataatacaggtgtaacggactgatctggtgtgatcaagatcttatagtgctagtcagaagtttctgttagcaagacaactatagtg 31710539  T
Q  219 gataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaac 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31710538 gataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaac 31710489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 19 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 24023014 - 24022765
Alignment:
Q  19 catacaaagtgtgttgtatttcttaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagcattgtagaa 118  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24023014 catacaaagtgtgttgtatttctcaaagtctattggggttaatagttttgagatagaaaatttcaaccttccttttgctagtgtgcaaagaattgtagaa 24022915  T
Q  119 gcctgctgaggttgataatacaggtgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaactatagtg 218  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  24022914 gcctgttgaggttgataatacaggtgtaacggactgatctggtgtgatcaagatcttatagtgctagtcagaagtttctgttagcaagacaactatagtg 24022815  T
Q  219 gataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaac 268  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||    
T  24022814 gataatctcacacgaggtgtgggaattggaagtagccgggtttggtgaac 24022765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 19 - 268
Target Start/End: Original strand, 14273122 - 14273369
Alignment:
Q  19 catacaaagtgtgttgtatttcttaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagcattgtagaa 118  Q
    |||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14273122 catacaaagtgtattgtatttctcaa-gtctattgggcttaatagttta-agatagaaaattccaacatttcttttgctagtgtgcaaagaattgtagaa 14273219  T
Q  119 gcctgctgaggttgataatacaggtgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaactatagtg 218  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  14273220 gcctgctgaggttgataatataggtgtaacagactgatatggtgtgattaagatcttatagtgctagtcagaagtttctgttagcaagacaactatagtg 14273319  T
Q  219 gataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaac 268  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14273320 gataatctcacacgaggtgtggagactgaaagtagccgggtttggtgaac 14273369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 44 - 268
Target Start/End: Original strand, 35877458 - 35877680
Alignment:
Q  44 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagcattgtagaagcctgctgaggttgataatacag 141  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||||||| ||| |  |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35877458 aagtctattgggcttaatagttt-gagataggaagagttccaacctttcttgtgcgaaag--caaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacag 35877554  T
Q  142 gtgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggg 241  Q
      || ||  |||||| |||||||||||||| ||| ||||| | || |||||||||||  | |  | | |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35877555 tggttacgaactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttctaccaact-gcatactatagtggataatctcacacgaagtgtggg 35877653  T
Q  242 gactgaaagtagccgggtttggtgaac 268  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||    
T  35877654 gactggaagtagccgggtttggtgaac 35877680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 44 - 268
Target Start/End: Original strand, 35884947 - 35885169
Alignment:
Q  44 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagcattgtagaagcctgctgaggttgataatacag 141  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||||||| ||| |  |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35884947 aagtctattgggcttaatagttt-gagataggaagagttccaacctttcttgtgcgaaag--caaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacag 35885043  T
Q  142 gtgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggg 241  Q
      || ||  |||||| |||||||||||||| ||| ||||| | || |||||||||||  | |  | | |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35885044 tggttacgaactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttctaccaact-gcatactatagtggataatctcacacgaagtgtggg 35885142  T
Q  242 gactgaaagtagccgggtttggtgaac 268  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||    
T  35885143 gactggaagtagccgggtttggtgaac 35885169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 44 - 268
Target Start/End: Original strand, 36724660 - 36724882
Alignment:
Q  44 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagcattgtagaagcctgctgaggttgataatacag 141  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||||||| ||| |  |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36724660 aagtctattgggcttaatagttt-gagataggaagagttccaacctttcttgtgcgaaag--caaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacag 36724756  T
Q  142 gtgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggg 241  Q
      || ||  |||||| |||||||||||||| ||| ||||| | || |||||||||||  | |  | | |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36724757 tggttacgaactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttctaccaact-gcatactatagtggataatctcacacgaagtgtggg 36724855  T
Q  242 gactgaaagtagccgggtttggtgaac 268  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||    
T  36724856 gactggaagtagccgggtttggtgaac 36724882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 113 - 257
Target Start/End: Original strand, 1800500 - 1800644
Alignment:
Q  113 gtagaagcctgctgaggttgataatacag-gtgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaac 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||  |||| || | ||    
T  1800500 gtagaagcctgctgaggttgataatacagagtgtaacggactgatctggtgtgatcaacatattatagtgctattcagaagtttctgatagc-aggatac 1800598  T
Q  212 tatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgg 257  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||||    
T  1800599 tatagtggataatctcacacgtagtgtggggactggacgtagccgg 1800644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 113 - 257
Target Start/End: Original strand, 22632409 - 22632553
Alignment:
Q  113 gtagaagcctgctgaggttgataatacag-gtgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaac 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||  |||| || | ||    
T  22632409 gtagaagcctgctgaggttgataatacagagtgtaacggactgatctggtgtgatcaacatattatagtgttagtcagaagtttctgatagc-aggatac 22632507  T
Q  212 tatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgg 257  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||||    
T  22632508 tatagtggataatctcacacgtagtgtggggactggacgtagccgg 22632553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 44 - 268
Target Start/End: Original strand, 3396865 - 3397087
Alignment:
Q  44 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagcattgtagaagcctgctgaggttgataatacag 141  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||||||| ||| |  |  ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||     
T  3396865 aagtctattgggcttaatagttt-gagataggaagagttccaacctttcttgtgcgaaag--caaagaattttagaagtctgctgaggttgataatacaa 3396961  T
Q  142 gtgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggg 241  Q
      || || ||||||| |||||||||||||| ||| ||||| | || |||||||||||  | |  | | |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3396962 tggttacggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttctaccaact-gtatactatagtggataatctcacacgaagtgtggg 3397060  T
Q  242 gactgaaagtagccgggtttggtgaac 268  Q
    ||||  ||||||| |||||||||||||    
T  3397061 gactagaagtagctgggtttggtgaac 3397087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 113 - 257
Target Start/End: Original strand, 1791006 - 1791146
Alignment:
Q  113 gtagaagcctgctgaggttgataatacag-gtgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaac 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||      | | | ||    
T  1791006 gtagaagcctgctgaggttgataatacagagtgtaacggactgatctggtgtgatcaacatattatagtgctattcagaagtttct-----gatggatac 1791100  T
Q  212 tatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgg 257  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||||    
T  1791101 tatagtggataatctcacacgtagtgtggggactggacgtagccgg 1791146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 125 - 268
Target Start/End: Original strand, 18578707 - 18578850
Alignment:
Q  125 tgaggttgataatacagg-tgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaactatagtggataa 223  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| || | |||||| ||||||| ||| |||| ||||||| |||||||| |||| | || |  ||  ||| ||||    
T  18578707 tgaggttgataatacagggtgtaacagattggtctggtgttatcaagaacttatagtcctagtcaaaagtttctgttaggaggatat-tactgtgaataa 18578805  T
Q  224 tctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaac 268  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  18578806 tctcacacaaggtgtggggactgaaagtagtcgggtttgatgaac 18578850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 210 - 266
Target Start/End: Original strand, 16446670 - 16446726
Alignment:
Q  210 actatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtga 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  16446670 actatagtggataatctcacacgaaatgtggggactgaaagtagtcggatttagtga 16446726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 24)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 19 - 268
Target Start/End: Original strand, 20713985 - 20714234
Alignment:
Q  19 catacaaagtgtgttgtatttcttaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagcattgtagaa 118  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20713985 cataaaaagtgtgttgtatttctcaaagtatattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtagaa 20714084  T
Q  119 gcctgctgaggttgataatacaggtgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaactatagtg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||    
T  20714085 gcctgctgaggttgataatacaggtgtaacagactgatctggtgtgatcaagatcttatagtgctagtcagaagtttctgttagcaagacaactataatg 20714184  T
Q  219 gataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaac 268  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20714185 gataatgtcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaac 20714234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 19 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 7789350 - 7789101
Alignment:
Q  19 catacaaagtgtgttgtatttcttaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagcattgtagaa 118  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  7789350 catacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataa 7789251  T
Q  119 gcctgctgaggttgataatacaggtgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaactatagtg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  7789250 gcctgctgaggttgataatacagaggttacagactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagacaactatagtg 7789151  T
Q  219 gataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaac 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7789150 gataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaac 7789101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 44 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 18143673 - 18143452
Alignment:
Q  44 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagcattgta-gaagcctgctgaggttgataatacagg 142  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| |    
T  18143673 aagtctattgggcttaatagttt-gagatagaaaattccaacctttcttttgctagtg--caaagaattgtaagaagcctactgaggttgataatacaag 18143577  T
Q  143 tgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgg 240  Q
     || |||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| | || ||||||||   ||| |||  |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18143576 ggttacagactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagttt---ttaccaactgaatgctatagtggataatctcacacgaagtgtgg 18143480  T
Q  241 ggactgaaagtagccgggtttggtgaac 268  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  18143479 ggactggaagtagccggatttggtgaac 18143452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 44 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 25037270 - 25037049
Alignment:
Q  44 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagcattgta-gaagcctgctgaggttgataatacagg 142  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  25037270 aagtatattgggcttaatagttt-gagatagaaaattccaacctttcttttgctagtg--caaagaattgtaagaagcctgctgaggttgataatacaga 25037174  T
Q  143 tgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgggg 242  Q
     || |||||||||| ||||||||||||||  || ||||| | || |||||||||||  | |  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25037173 ggttacagactgatctggtgtgatcaagactttatagtgttggttagaagtttctaccaac-tgaatactatagtggataatctcacacgaagtgtgggg 25037075  T
Q  243 actgaaagtagccgggtttggtgaac 268  Q
    |||| |||||||| | || |||||||    
T  25037074 actggaagtagccagattgggtgaac 25037049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 44 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 25051307 - 25051086
Alignment:
Q  44 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagcattgta-gaagcctgctgaggttgataatacagg 142  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  25051307 aagtatattgggcttaatagttt-gagatagaaaattccaacctttcttttgctagtg--caaagaattgtaagaagcctgctgaggttgataatacaga 25051211  T
Q  143 tgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgggg 242  Q
     || |||||||||| ||||||||||||||  || ||||| | || |||||||||||  | |  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25051210 ggttacagactgatctggtgtgatcaagacattatagtgttggttagaagtttctaccaac-tgaatactatagtggataatctcacacgaagtgtgggg 25051112  T
Q  243 actgaaagtagccgggtttggtgaac 268  Q
    |||| |||||||| | || |||||||    
T  25051111 actggaagtagccagattgggtgaac 25051086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 44 - 268
Target Start/End: Original strand, 18232870 - 18233091
Alignment:
Q  44 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagcattgt-agaagcctgctgaggttgataatacagg 142  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||     
T  18232870 aagtctattgggctgaatagttt-gagatagaaaattccaacctttcttttgcta--gtgcaaagaattgtaagaatcctgctgaggttgataatacaga 18232966  T
Q  143 tgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgggg 242  Q
     || ||| ||||||  |||||||||||||  |||||||| |  | ||||||||||   | |  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18232967 ggttacaaactgatcgggtgtgatcaagacgttgtagtgttgattagaagtttctgccaac-tgaatactatagtggataatctcacacgaagtgtgggg 18233065  T
Q  243 actgaaagtagccgggtttggtgaac 268  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||    
T  18233066 actggaagtagccggatttggtgaac 18233091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 44 - 268
Target Start/End: Original strand, 18242321 - 18242542
Alignment:
Q  44 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagcattgt-agaagcctgctgaggttgataatacagg 142  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||     
T  18242321 aagtctattgggctgaatagttt-gagatagaaaattccaacctttcttttgcta--gtgcaaagaattgtaagaatcctgctgaggttgataatacaga 18242417  T
Q  143 tgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgggg 242  Q
     || ||| ||||||  |||||||||||||  |||||||| |  | ||||||||||   | |  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18242418 ggttacaaactgatcgggtgtgatcaagacgttgtagtgttgattagaagtttctgccaac-tgaatactatagtggataatctcacacgaagtgtgggg 18242516  T
Q  243 actgaaagtagccgggtttggtgaac 268  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||    
T  18242517 actggaagtagccggatttggtgaac 18242542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 44 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 18883404 - 18883183
Alignment:
Q  44 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagcattgt-agaagcctgctgaggttgataatacagg 142  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  18883404 aagtctattgggctgaatagttt-gagatagaaaattccaacctttcttttgcta--gtgcaaagaattgtaagaagcctgctgaggttgataatacaga 18883308  T
Q  143 tgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgggg 242  Q
     |  ||  |||||| ||||||||||||||  || ||||| | || |||| ||||||  | |  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18883307 gggtacgaactgatctggtgtgatcaagactttatagtgttggttagaattttctaccaac-tgaatactatagtggataatctcacacgaagtgtgggg 18883209  T
Q  243 actgaaagtagccgggtttggtgaac 268  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||    
T  18883208 actggaagtagccggatttggtgaac 18883183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 44 - 267
Target Start/End: Original strand, 18251772 - 18251992
Alignment:
Q  44 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagcattgt-agaagcctgctgaggttgataatacagg 142  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||     
T  18251772 aagtctattgggctgaatagttt-gagatagaaaattccaacctttcttttgcta--gtgcaaagaattgtaagaatcctgctgaggttgataatacaga 18251868  T
Q  143 tgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgggg 242  Q
     || ||| ||||||  |||||||||||||  || ||||| | || ||||||||||   | |  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18251869 ggttacaaactgatcgggtgtgatcaagacgttatagtgttggttagaagtttctgccaac-tgaatactatagtggataatctcacacgaagtgtgggg 18251967  T
Q  243 actgaaagtagccgggtttggtgaa 267  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  18251968 actggaagtagccggatttggtgaa 18251992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 44 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 31575652 - 31575434
Alignment:
Q  44 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa-ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagcattgtagaagcctgctgaggttgataatacagg 142  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||    ||  ||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31575652 aagtctattgggcttaatagttt-gagatagaagagttccaacctttcttgtg----tgatcaa-gaattgtagaagcttgctgaggttgataatacagg 31575559  T
Q  143 tgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgggg 242  Q
     ||    ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31575558 ggttctggactgatttggtgtgatcaagaccttatagtgctagttagaagtttctactagct-gaatactatagtggataatctcacacgaagtgtgggg 31575460  T
Q  243 actgaaagtagccgggtttggtgaac 268  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||    
T  31575459 actggaagtagccggatttggtgaac 31575434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 44 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 4843968 - 4843745
Alignment:
Q  44 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagcattgt-agaagcctgctgaggttgata--ataca 140  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||  |||||    
T  4843968 aagtctattggccttaatagttt-gagatagaaaattccaacctttcttttgcta--gtgcaaagaattgtaagaagcctgatgaggttgataatataca 4843872  T
Q  141 ggtgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgg 240  Q
     | || |||||||||| |||||||||||||| ||| ||||  | || |||| ||||||  | |  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4843871 agggttacagactgatctggtgtgatcaagaccttatagtcttggttagaaatttctaccaac-tgaatactatagtggataatctcacacgaagtgtgg 4843773  T
Q  241 ggactgaaagtagccgggtttggtgaac 268  Q
    |||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  4843772 ggactggaagtagccggatttagtgaac 4843745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 44 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 42712423 - 42712201
Alignment:
Q  44 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagcattgtagaagcctgctgaggttgataatacag 141  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||||||| ||| |  |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42712423 aagtctattgggcttaatagttt-gagataggaagagttccaacctttcttgtgcgaaag--caaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacag 42712327  T
Q  142 gtgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggg 241  Q
      || || ||||||| |||||||||||||| ||| ||||| | || |||||||||||  | |  | | |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42712326 tggttacggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttctaccaac-tgcatactatagtggataatctcacacgaagtgtggg 42712228  T
Q  242 gactgaaagtagccgggtttggtgaac 268  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||    
T  42712227 gactggaagtagccgggtttggtgaac 42712201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 44 - 268
Target Start/End: Original strand, 20044760 - 20044982
Alignment:
Q  44 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagcattgtagaagcctgctgaggttgataatacag 141  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||||||| ||| |  |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20044760 aagtctattgggcttaatagttt-gagataggaagagttccaacctttcttgtgcgaaag--caaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacag 20044856  T
Q  142 gtgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggg 241  Q
    | || || ||||||| |||||||||||||| ||| ||||| | || |||||||||||  | |  | | ||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  20044857 gggttacggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttctaccaac-tgtatactatcgtggataatctcacacgaagtgtggg 20044955  T
Q  242 gactgaaagtagccgggtttggtgaac 268  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||    
T  20044956 gactggatgtagccgggtttggtgaac 20044982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 44 - 268
Target Start/End: Original strand, 20030121 - 20030343
Alignment:
Q  44 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagcattgtagaagcctgctgaggttgataatacag 141  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||||||| ||| |  |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20030121 aagtctatttggcttaatagttt-gagataggaagagttccaacctttcttgtgcgaaag--caaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacag 20030217  T
Q  142 gtgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggg 241  Q
    |  | || ||||||| |||||||||||||| ||| ||||| | || |||||||| ||  | |  | | |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20030218 ggattacggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttataccaact-gtatactatagtggataatctcacacgaagtgtggg 20030316  T
Q  242 gactgaaagtagccgggtttggtgaac 268  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||    
T  20030317 gactggaagtagccgggtttggtgaac 20030343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 44 - 268
Target Start/End: Original strand, 12925296 - 12925518
Alignment:
Q  44 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagcattgtagaagcctgctgaggttgataatacag 141  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||||||| ||| |     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12925296 aagtctattgggcttaatagttt-gagataggaagagttccaacctttcttgtgcgaaaa--caaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacag 12925392  T
Q  142 gtgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggg 241  Q
      || || ||||||| |||||||||||||| ||| ||||| | || |||||||||||  | |  | | |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12925393 tggttacggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttctaccaac-tgcatactatagtggataatctcacacgaagtgtggg 12925491  T
Q  242 gactgaaagtagccgggtttggtgaac 268  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  12925492 gactggaagtagtcgggtttcgtgaac 12925518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 44 - 268
Target Start/End: Original strand, 12767573 - 12767797
Alignment:
Q  44 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagcattgtagaagcctgctgaggttgataatacag 141  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||   |||||||||||||| ||| |  |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12767573 aagtctattgagcttaatagttt-gagataggaagagttccaacctttcttgtgcgaaag--caaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacag 12767669  T
Q  142 gtgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggg 241  Q
    | || || ||||||| |||||||||||||| ||| ||||| | || |||||||||||  | |  ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  12767670 gggttacggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttctaccaac-tgaatactatagtggataatctcacacgaaatgtggg 12767768  T
Q  242 gac--tgaaagtagccgggtttggtgaac 268  Q
    |||  || ||||| ||||| |||||||||    
T  12767769 gactgtggaagtaaccgggattggtgaac 12767797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 103 - 268
Target Start/End: Original strand, 15833950 - 15834115
Alignment:
Q  103 gcaaagcattgtagaagcctgctgaggttgataatacaggt-gtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctatta 201  Q
    |||||| ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||  |||||  ||| || |||| || |||||| ||| ||||||||||||||||||||  |||    
T  15833950 gcaaagaattgtagaaacctactgatgttgataatacagggagtaacgaacttatctggtatggtcaagaacttatagtgctagtcagaagtttcagtta 15834049  T
Q  202 gcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaac 268  Q
    ||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15834050 gcatgata-ctataatggataatctcacacgaggtgtgtggactgaaagtagccggatttggtgaac 15834115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 104 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 24096262 - 24096098
Alignment:
Q  104 caaagcattgtagaagcctgctgaggttgataatacaggtgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagc 203  Q
    ||||| |||| |||||  || |||||||||||||||| |   ||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| | |||||    
T  24096262 caaagaattgaagaagtttgttgaggttgataatacaaggaaaatggactgatatggtgtaatcaagaacttgtagtgctagtcaaaagtttatgttagc 24096163  T
Q  204 aagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgt-ggggactgaaagtagccgggtttggtgaac 268  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| || |||||||||||    
T  24096162 aag-atactatagtggataatctcacacgaggtgtgggggactggaagtagtcgagtttggtgaac 24096098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 150 - 262
Target Start/End: Original strand, 24634015 - 24634126
Alignment:
Q  150 gactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaa 249  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||    
T  24634015 gactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgctagttagaagtttctactagct-gaatactatagtggataatatcacacgaagtgtggggactggaa 24634113  T
Q  250 gtagccgggtttg 262  Q
    |||| ||||||||    
T  24634114 gtagtcgggtttg 24634126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 150 - 268
Target Start/End: Original strand, 12915506 - 12915623
Alignment:
Q  150 gactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaa 249  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| ||||| | || |||||||||||  | |  | | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  12915506 gactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttctaccaact-gcatactatagtggataatctcacacgaagtgtggggactggaa 12915604  T
Q  250 gtagccgggtttggtgaac 268  Q
    |||||||||||||||||||    
T  12915605 gtagccgggtttggtgaac 12915623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 150 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 33592274 - 33592157
Alignment:
Q  150 gactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaa 249  Q
    ||||||| | |||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||| | | |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  33592274 gactgatctagtgtgatcaagaccttatagtgttggtcagaagtttctgtcaact-gaaaactatagtggataatctcacacgaagtgtggggactggaa 33592176  T
Q  250 gtagccgggtttggtgaac 268  Q
    |||||||| || |||||||    
T  33592175 gtagccggattgggtgaac 33592157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 150 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 33601913 - 33601796
Alignment:
Q  150 gactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaa 249  Q
    ||||||| | |||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||| | | |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  33601913 gactgatctagtgtgatcaagaccttatagtgttggtcagaagtttctgtcaact-gaaaactatagtggataatctcacacgaagtgtggggactggaa 33601815  T
Q  250 gtagccgggtttggtgaac 268  Q
    |||||||| || |||||||    
T  33601814 gtagccggattgggtgaac 33601796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 150 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 42896289 - 42896174
Alignment:
Q  150 gactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaa 249  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| ||||| | || |||||||||||| | |  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||    
T  42896289 gactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttctatcaact-gaaatctatagtggataatctcacacgaagtgtggagactggaa 42896191  T
Q  250 gtagccgggtttggtga 266  Q
    |||||||| || |||||    
T  42896190 gtagccggattgggtga 42896174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 226 - 268
Target Start/End: Original strand, 20714417 - 20714459
Alignment:
Q  226 tcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaac 268  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20714417 tcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaac 20714459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 19 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 31095 - 30846
Alignment:
Q  19 catacaaagtgtgttgtatttcttaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagcattgtagaa 118  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  31095 catacaaagtgtgttgtatgtctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataa 30996  T
Q  119 gcctgctgaggttgataatacaggtgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaactatagtg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30995 gcctgctgaggttgataatacaggtgttactgactgatctggtgtgatcaaaatattgtagtgttagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtg 30896  T
Q  219 gataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaac 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30895 gataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaac 30846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 20 - 268
Target Start/End: Original strand, 9963 - 10206
Alignment:
Q  20 atacaaagtgtgttgtatttcttaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagcattgtagaag 119  Q
    ||||||||||||||||| |||| || |||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||  ||||| ||||||||||    
T  9963 atacaaagtgtgttgtaattctcaa-gtctattatgcttaatagttt-gagatagaaaattctaacatttatttttctagtg--caaagaattgtagaag 10058  T
Q  120 cctgctgaggttgataatacaggtgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaactatagtgg 219  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  10059 cctattgaggttgataatacaggtgtaacagactgatctggtgtgatctagaccttatagtgctagtcagaagtttctgttagcaagacaactatagtgg 10158  T
Q  220 ataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaac 268  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||| |||||||||||    
T  10159 ataatctcacacggggtgtggggactggaa-tagccgtgtttggtgaac 10206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 21)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 19 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 28367925 - 28367676
Alignment:
Q  19 catacaaagtgtgttgtatttcttaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagcattgtagaa 118  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  28367925 catacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataa 28367826  T
Q  119 gcctgctgaggttgataatacaggtgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaactatagtg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||  || || ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28367825 gcctgctgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtg 28367726  T
Q  219 gataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaac 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28367725 gataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaac 28367676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 19 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 28375743 - 28375494
Alignment:
Q  19 catacaaagtgtgttgtatttcttaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagcattgtagaa 118  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  28375743 catacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataa 28375644  T
Q  119 gcctgctgaggttgataatacaggtgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaactatagtg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||  || || ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28375643 gcctgctgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtg 28375544  T
Q  219 gataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaac 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28375543 gataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaac 28375494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 19 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 28383565 - 28383316
Alignment:
Q  19 catacaaagtgtgttgtatttcttaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagcattgtagaa 118  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  28383565 catacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataa 28383466  T
Q  119 gcctgctgaggttgataatacaggtgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaactatagtg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||  || || ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28383465 gcctgctgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtg 28383366  T
Q  219 gataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaac 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28383365 gataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaac 28383316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 19 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 24794818 - 24794569
Alignment:
Q  19 catacaaagtgtgttgtatttcttaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagcattgtagaa 118  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  24794818 catacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataa 24794719  T
Q  119 gcctgctgaggttgataatacaggtgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaactatagtg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||  || || ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24794718 gcctgctgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtg 24794619  T
Q  219 gataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaac 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24794618 gataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaac 24794569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 19 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 28351992 - 28351743
Alignment:
Q  19 catacaaagtgtgttgtatttcttaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagcattgtagaa 118  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  28351992 catacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataa 28351893  T
Q  119 gcctgctgaggttgataatacaggtgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaactatagtg 218  Q
    ||||||| |||||||||||||||  || || ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28351892 gcctgctaaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtg 28351793  T
Q  219 gataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaac 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28351792 gataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaac 28351743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 19 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 38529449 - 38529199
Alignment:
Q  19 catacaaagtgtgttgtatttcttaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagcattgtagaa 118  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38529449 catacaaagtgtgttgtaattctcaaagtctattgggcttaatcgttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtagaa 38529350  T
Q  119 gcctgctgaggttgataatacaggtgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaactatagtg 218  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  38529349 gcctactgaggttgataatacaagtgtaacagactcatctggtgtgatcaagatcttatagtgctagtcagaaatttctgttagcaagacaactatagtg 38529250  T
Q  219 gataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaact 269  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  38529249 gataatctcacacgaggtgtgggcactggaagtagccgggtttggtgaact 38529199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 28 - 268
Target Start/End: Original strand, 4951520 - 4951758
Alignment:
Q  28 tgtgttgtatttcttaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagcattgtagaagcctgctga 127  Q
    |||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| |||    
T  4951520 tgtgttgtatttctcat-gtctatttggcttaatagttt-gagatagaaaatttcaacctttcttttgctagtgtgtaaagaattgtagaaggctgttga 4951617  T
Q  128 ggttgataatacaggtgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaactatagtggataatctc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||    
T  4951618 ggttgataatacaggtgtaacagactgatctggtgtgaccaataccttgtagtgctagtcagaaatttctgttagcaagacaaatatagtggataatctc 4951717  T
Q  228 acacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaac 268  Q
    |||||||||||| |||||  |||||| || |||||||||||    
T  4951718 acacgaggtgtgaggacttgaagtagtcgagtttggtgaac 4951758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 44 - 268
Target Start/End: Original strand, 5385632 - 5385854
Alignment:
Q  44 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagcattgtagaagcctgctgaggttgataatacag 141  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||||||| ||| |  |  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5385632 aagtctattgggcttaatagttt-gagataggaagagttccaacctttcttgtgcgaaag--caaagaattgtagaagcctgctgaggttgatgatacag 5385728  T
Q  142 gtgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggg 241  Q
      || ||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||| | || |||||||||||| |||  | | |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5385729 tggttacatactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttctatcagct-gtatactatagtggataatctcacacgaagtgtggg 5385827  T
Q  242 gactgaaagtagccgggtttggtgaac 268  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||    
T  5385828 gactggaagtagccgggtttggtgaac 5385854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 44 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 46305818 - 46305597
Alignment:
Q  44 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagcattgtagaagcctgctgaggttgataatacag 141  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||||||| ||| |  |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46305818 aagtctattgggcttaatagttt-gagataggaagagttccaacctttcttgtgcgaaag--caaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacag 46305722  T
Q  142 gtgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggg 241  Q
      || |||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| | || |||||||||||  | |  | | |||| |||||||||||||| |||| |||||||    
T  46305721 tggttacagactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttctaccaac-tgtatactaaagtggataatctca-acgaagtgtggg 46305624  T
Q  242 gactgaaagtagccgggtttggtgaac 268  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||    
T  46305623 gactggaagtagccgggtttgatgaac 46305597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 113 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 17530039 - 17529895
Alignment:
Q  113 gtagaagcctgctgaggttgataatacag-gtgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaac 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||  ||||| || | |    
T  17530039 gtagaagcctgctgaggttgataatacagagtgtaacggactgatctggtgtgatcaacatattatagtgctattcagaagtttctgatagcaggata-c 17529941  T
Q  212 tatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgg 257  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||||    
T  17529940 tatagtggataatctcacacgtagtgtggggactggacgtagccgg 17529895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 113 - 257
Target Start/End: Original strand, 54624662 - 54624806
Alignment:
Q  113 gtagaagcctgctgaggttgataatacag-gtgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaac 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| || || |||||||| ||||||||||||  |||| || | ||    
T  54624662 gtagaagcctgctgaggttgataatacagagtgtaacagactgatctggtatgatcaacatattatagtgctattcagaagtttctgatagc-aggatac 54624760  T
Q  212 tatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgg 257  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||||    
T  54624761 tatagtggataatctcacacgtagtgtggggactggacgtagccgg 54624806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 44 - 268
Target Start/End: Original strand, 23486983 - 23487207
Alignment:
Q  44 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagcattgtagaagcctgctgaggttgataatacag 141  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||| ||||||| ||| |  |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23486983 aagtctattgggcttaatagttt-gagataggaagagttccaagctttcttgtgcaaaag--caaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacaa 23487079  T
Q  142 gtgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggg 241  Q
    | || |||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| | || |||||||||||  | |  ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  23487080 gggttacagactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttctaccaac-tgaatactatagtggataatctcacacgaaatgtggg 23487178  T
Q  242 gac--tgaaagtagccgggtttggtgaac 268  Q
    |||  || ||||| ||||| |||||||||    
T  23487179 gactgtggaagtaaccgggattggtgaac 23487207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 103 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 13328465 - 13328301
Alignment:
Q  103 gcaaagcattgtagaagcctgctgaggttgataatacaggtgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattag 202  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | || || ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| | || |||||||||||  |     
T  13328465 gcaaagaattgtagaagcttgctgaggttgataatacaagggttacggactgatctggtgtgatcaagacctaatagtgttggttagaagtttctaccaa 13328366  T
Q  203 caagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaac 268  Q
    |  | | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  13328365 ct-gtatactatagtggataatctcacacgaagtgtggggactggaagtagtcgggtttggtgaac 13328301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 105 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 7784194 - 7784091
Alignment:
Q  105 aaagcattgtagaagcctgctgaggttgataatacagg-tgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagc 203  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||| |||||||| |||||    
T  7784194 aaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacagggtgtaacagactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttagtcataagtttctgttagc 7784095  T
Q  204 aaga 207  Q
    ||||    
T  7784094 aaga 7784091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 113 - 257
Target Start/End: Original strand, 32877877 - 32878021
Alignment:
Q  113 gtagaagcctgctgaggttgataatacag-gtgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaac 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |  || ||||| || |||||||||| |  ||||| || | |    
T  32877877 gtagaagcctgctgaggttgataatacagagtgtaacagactgatctggtgtgatcaacaaattatagtgttattcagaagtttatgatagcatgata-c 32877975  T
Q  212 tatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgg 257  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||||    
T  32877976 tatagtggataatctcacacgtagtgtggggactggacgtagccgg 32878021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 113 - 257
Target Start/End: Original strand, 48978677 - 48978817
Alignment:
Q  113 gtagaagcctgctgaggttgataatacag-gtgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaac 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||      | | | ||    
T  48978677 gtagaagcctgctgaggttgataatacagagtgtaacggactgatctggtgtgatcaacatattatagtgctattcagaagtttct-----gatggatac 48978771  T
Q  212 tatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgg 257  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||||    
T  48978772 tatagtggataatctcacacgtagtgtggggactggacgtagccgg 48978817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 113 - 257
Target Start/End: Original strand, 48988217 - 48988357
Alignment:
Q  113 gtagaagcctgctgaggttgataatacag-gtgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaac 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||      | | | ||    
T  48988217 gtagaagcctgctgaggttgataatacagagtgtaacggactgatctggtgtgatcaacatattatagtgctattcagaagtttct-----gatggatac 48988311  T
Q  212 tatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgg 257  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||||    
T  48988312 tatagtggataatctcacacgtagtgtggggactggacgtagccgg 48988357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 116 - 268
Target Start/End: Original strand, 19388773 - 19388928
Alignment:
Q  116 gaagcctgctgaggttgataatacag-gtgtaa-cagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttct-at-tagcaagaaaac 211  Q
    |||||||||||||| | ||||||||  ||| || |||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||| |||||||||| | || ||||  ||| ||    
T  19388773 gaagcctgctgaggataataatacatagtgcaatcagactgatatggtgtcatcaacaacttatagtgctattcagaagtttatgatatagct-gaatac 19388871  T
Q  212 tatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaac 268  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||  ||||||||||    
T  19388872 tatagtcgataatctcacacgaagtgtggggacttgaagtagccgattttggtgaac 19388928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 4361699 - 4361558
Alignment:
Q  105 aaagcattgtagaagcctgctgaggttgataatac-aggtgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagc 203  Q
    |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || |||||||||    ||  | |||| || |||||||| | |||||    
T  4361699 aaagaattgaagaagtctgctgaggttgataatacaaggtgtaacagaatgatctgttgtgatcaa---ttttcaatgctggtaagaagtttttgttagc 4361603  T
Q  204 aagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaa 249  Q
     || | |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  4361602 -aggatactataatggataatctcacacgaggtgtggagaccgaaa 4361558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 214 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 7784066 - 7784012
Alignment:
Q  214 tagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaac 268  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||| | ||||||||||||    
T  7784066 tagtggataatctcacatgtggtgtgggaactggaagtagtcaggtttggtgaac 7784012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 210 - 254
Target Start/End: Original strand, 24285493 - 24285537
Alignment:
Q  210 actatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagc 254  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||| || |||||||    
T  24285493 actatagtggataatctcacacgaagtgtagggagtggaagtagc 24285537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0482 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0482
Description:

Target: scaffold0482; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 19 - 268
Target Start/End: Original strand, 3449 - 3698
Alignment:
Q  19 catacaaagtgtgttgtatttcttaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagcattgtagaa 118  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  3449 catacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataa 3548  T
Q  119 gcctgctgaggttgataatacaggtgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaactatagtg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  3549 gcctgctgaggttgataatacagaggttacagactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagacaactatagtg 3648  T
Q  219 gataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaac 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3649 gataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaac 3698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 2)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 19 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 94703 - 94454
Alignment:
Q  19 catacaaagtgtgttgtatttcttaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagcattgtagaa 118  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  94703 catacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataa 94604  T
Q  119 gcctgctgaggttgataatacaggtgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaactatagtg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||  || || ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  94603 gcctgctgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtg 94504  T
Q  219 gataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaac 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  94503 gataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttagtgaac 94454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 19 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 104144 - 103895
Alignment:
Q  19 catacaaagtgtgttgtatttcttaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagcattgtagaa 118  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  104144 catacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataa 104045  T
Q  119 gcctgctgaggttgataatacaggtgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaactatagtg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||  || || ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  104044 gcctgctgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtg 103945  T
Q  219 gataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaac 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  103944 gataatctcacacgaggtgtggggactggaattagccgggtttggtgaac 103895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 19 - 268
Target Start/End: Original strand, 408244 - 408493
Alignment:
Q  19 catacaaagtgtgttgtatttcttaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagcattgtagaa 118  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  408244 catacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataa 408343  T
Q  119 gcctgctgaggttgataatacaggtgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaactatagtg 218  Q
    |||||  |||||||||||||||||||| || |||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  408344 gcctgaagaggttgataatacaggtgttacggactaatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtg 408443  T
Q  219 gataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaac 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  408444 gataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagacgggtttggtgaac 408493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 119; Significance: 8e-61; HSPs: 10)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 20 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 15810251 - 15810030
Alignment:
Q  20 atacaaagtgtgttgtatttcttaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagcattgtagaag 119  Q
    ||||||||||||||||| |||| || || | ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||| ||||||||||    
T  15810251 atacaaagtgtgttgtaattctcaa-gtatgttgagcttaatagttt-gagatagaaaattccaacctttcttttgctggtt--caaagaattgtagaag 15810156  T
Q  120 cctgctgaggttgataatacaggtgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaactatagtgg 219  Q
    | ||| || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||| ||||| || ||||||||    
T  15810155 catgccgaagttgataatacaggtgtaacggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgctactcagaagtttctgttaccaagataattatagtgg 15810056  T
Q  220 ataatctcacacgaggtgtggggact 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  15810055 ataatctcacacgaggtgtggggact 15810030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 103 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 5378613 - 5378447
Alignment:
Q  103 gcaaagcattgtagaagcctgctgaggttgataatacagg-tgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctatta 201  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| |||    
T  5378613 gcaaagaattgtagaagtctgctgaggtttataatatagggtgtaacagactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgctagttagaagtttctgtta 5378514  T
Q  202 gcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaac 268  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5378513 gcaagacaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaac 5378447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 103 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 40999224 - 40999058
Alignment:
Q  103 gcaaagcattgtagaagcctgctgaggttgataataca-ggtgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctatta 201  Q
    |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||| |||||||  |||    
T  40999224 gcaaagaattgtagaagtctgttgaggttgataatacatggtgtaacaaactgatctggtgtgatcaaaaccttatagtgctagtcataagtttccgtta 40999125  T
Q  202 gcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaac 268  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  40999124 gcaagacaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagttgtcgggtttggtgaac 40999058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 110 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 26906427 - 26906269
Alignment:
Q  110 attgtagaagcctgctgaggttgataatacag-gtgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaa 208  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| |    
T  26906427 attgtaaaagtctgctgaggttgataatacagagtgtaacagactgatctggtgtgaccaagaacttatagtgctagtcagaagtttctgttaacaag-a 26906329  T
Q  209 aactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaac 268  Q
     | |||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||    
T  26906328 tattataatggataatctcacacgaggtatggggactagaagtagcctggtttggtgaac 26906269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 103 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 14272205 - 14272041
Alignment:
Q  103 gcaaagcattgtagaagcctgctgaggttgataatacaggtgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattag 202  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || || ||||||| |||||||||||||| ||| ||||| | || |||||||||||  |     
T  14272205 gcaaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacagtggttacggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgtttgttagaagtttctaccaa 14272106  T
Q  203 caagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaac 268  Q
    |  | | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14272105 c-tgcatactatagtggataatctcacacgaagtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaac 14272041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 103 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 14282071 - 14281907
Alignment:
Q  103 gcaaagcattgtagaagcctgctgaggttgataatacaggtgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattag 202  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || || ||||||| |||||||||||||| ||| ||||| | || |||||||||||  |     
T  14282071 gcaaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacagtggttacggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgtttgttagaagtttctaccaa 14281972  T
Q  203 caagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaac 268  Q
    |  | | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14281971 c-tgcatactatagtggataatctcacacgaagtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaac 14281907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 114 - 268
Target Start/End: Original strand, 21633591 - 21633744
Alignment:
Q  114 tagaagcctgctgaggttgataatacaggtgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaacta 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||  | ||||||| |||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||||| |||  |||| ||||    
T  21633591 tagaagcctgctgaggttgataatacagttgttccggactgatctggtgtgaccaagaccttataatgctagtcagaagtttctactag-tagaatacta 21633689  T
Q  214 tagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaac 268  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  21633690 tagtggataatctcacaaaaagtgtggggactagacgtagccgggtttggtgaac 21633744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 103 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 3471124 - 3470960
Alignment:
Q  103 gcaaagcattgtagaagcctgctgaggttgataatacaggtgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattag 202  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || || ||||||| |||||||||||||| ||| || || | || |||||||||   ||     
T  3471124 gcaaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacagtggttacggactgatctggtgtgatcaagaccttataatgttggttagaagtttc---tac 3471028  T
Q  203 caa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaac 268  Q
    |||  | | |||| |||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||    
T  3471027 caattgtatactacagtggataatctcacatgaagtgtgggggctggaagtaaccgggtttggtgaac 3470960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 150 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 21919571 - 21919455
Alignment:
Q  150 gactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaa 249  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| ||||| | || |||||||||||  | |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  21919571 gactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttctaccaact-gaaaactatagtggataatctcacacgaagtgtggggactggaa 21919473  T
Q  250 gtagccgggtttggtgaa 267  Q
    |||||||| || ||||||    
T  21919472 gtagccggattgggtgaa 21919455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 125 - 253
Target Start/End: Original strand, 30676810 - 30676938
Alignment:
Q  125 tgaggttgataatacag-gtgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaactatagtggataa 223  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| | | |||||||| ||| ||||||||  ||||  ||| | | || |||||||    
T  30676810 tgagattgataatacagagtgtaacagactgatcttgtgtgatcaagaacatatagtgctattcataagtttcttatagc-tgaatattgtaatggataa 30676908  T
Q  224 tctcacacgaggtgtggggactgaaagtag 253  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30676909 tctcacacgaagtgtggggactgaaagtag 30676938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 44 - 268
Target Start/End: Original strand, 256901 - 257122
Alignment:
Q  44 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagcattgt-agaagcctgctgaggttgataatacagg 142  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||     
T  256901 aagtctattgggctgaatagttt-gagatagaaaattccaacctttcttttgcta--gtgcaaagaattgtaagaagcttgctgaggttgataatacaga 256997  T
Q  143 tgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgggg 242  Q
     || ||  |||||| ||||||||||||||  || ||||| | || |||||||||||  | |  ||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  256998 ggttacgaactgatctggtgtgatcaagactttatagtgttggttagaagtttctaccaac-tgaatactatagtggataatttcacacgaagtgtgggg 257096  T
Q  243 actgaaagtagccgggtttggtgaac 268  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||    
T  257097 actggaagtagccggatttggtgaac 257122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0233 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0233
Description:

Target: scaffold0233; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 19 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 26393 - 26309
Alignment:
Q  19 catacaaagtgtgttgtatttcttaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26393 catacaaagtgtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtg 26309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0206 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0206
Description:

Target: scaffold0206; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 44 - 268
Target Start/End: Original strand, 2051 - 2273
Alignment:
Q  44 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagcattgtagaagcctgctgaggttgataatacag 141  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||||||| ||| |  |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2051 aagtctatttggcttaatagttt-gagataggaagagttccaacctttcttgtgcgaaag--caaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacag 2147  T
Q  142 gtgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggg 241  Q
    |  | || ||||||| |||||||||||||| ||| ||||| | || |||||||| ||  | |  | | |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2148 ggattacggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttataccaact-gtatactatagtggataatctcacacgaagtgtggg 2246  T
Q  242 gactgaaagtagccgggtttggtgaac 268  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||    
T  2247 gactggaagtagccgggtttggtgaac 2273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 113 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 14992 - 14848
Alignment:
Q  113 gtagaagcctgctgaggttgataatacag-gtgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaac 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||  |||| || | ||    
T  14992 gtagaagcctgctgaggttgataatacagagtgtaacagactgatctggtgtgatcaacatattatagtgctattcagaagtttctgatagc-aggatac 14894  T
Q  212 tatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgg 257  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||||    
T  14893 tatagtggataatctcacacgtagtgtggggactggacgtagccgg 14848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 113 - 246
Target Start/End: Original strand, 24600 - 24733
Alignment:
Q  113 gtagaagcctgctgaggttgataatacag-gtgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaac 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||  |||| || | ||    
T  24600 gtagaagcctgctgaggttgataatacagagtgtaacggactgatctggtgtgatcaacatattatagtgctattcagaagtttctgatagc-aggatac 24698  T
Q  212 tatagtggataatctcacacgaggtgtggggactg 246  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  24699 tatagtggataatctcacacgtagtgtggggactg 24733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 3)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 103 - 252
Target Start/End: Original strand, 124047 - 124195
Alignment:
Q  103 gcaaagcattgtagaagcctgctgaggttgataatacaggtgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattag 202  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || || ||||||| |||||||||||||| ||| ||||| | || |||||||||||  |     
T  124047 gcaaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacagtggttacggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttctaccaa 124146  T
Q  203 caagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaagta 252  Q
    |  | | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  124147 c-tgcatactatagtggataatctcacacgaagtgtggggactggaagta 124195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 114 - 246
Target Start/End: Original strand, 99991 - 100123
Alignment:
Q  114 tagaagcctgctgaggttgataatacag-gtgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaact 212  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||  |||| || | |||    
T  99991 tagaagcttgttgaggttgataatacagagtgtaacagactgatttggtgtgatcaacatattatagtgctattcagaagtttctgatagc-aggatact 100089  T
Q  213 atagtggataatctcacacgaggtgtggggactg 246  Q
    ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  100090 ataatggataatctcacacgtagtgtggggactg 100123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 44 - 171
Target Start/End: Original strand, 143111 - 143237
Alignment:
Q  44 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagcattgtagaagcctgctgaggttgataatacag 141  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||||||| ||| |  |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  143111 aagtctattgggcttaatagttt-gagataggaagagttccaacctttcttgtgcgaaag--caaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacag 143207  T
Q  142 gtgtaacagactgatatggtgtgatcaaga 171  Q
      || || ||||||| ||||||||||||||    
T  143208 tggttacggactgatctggtgtgatcaaga 143237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0334
Description:

Target: scaffold0334; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 158 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 12680 - 12571
Alignment:
Q  158 tggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgg 257  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| | || |||||||||||  | | | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  12680 tggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttctaccaacta-aaaactatagtggataatctcacacgaagtgtagggactggaagtagccgg 12582  T
Q  258 gtttggtgaac 268  Q
     || |||||||    
T  12581 attgggtgaac 12571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 150 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 2401 - 2284
Alignment:
Q  150 gactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaa 249  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| ||||| | || |||||||||||  | |  | | ||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||    
T  2401 gactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttctaccaact-gtatactatagtggataatctcacaagaagtgtggggactagaa 2303  T
Q  250 gtagccgggtttggtgaac 268  Q
    |||||||| || |||||||    
T  2302 gtagccggattgggtgaac 2284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0223 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0223
Description:

Target: scaffold0223; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 117 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 27231 - 27078
Alignment:
Q  117 aagcctgctgaggttgataatacag-gtgtaacagactgatatggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctattagcaagaaaactata 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |||| | |||||||||||| | | ||||| || | ||||||||||  |||   || | |||||    
T  27231 aagcctgctgaggttgataatacagagtgtaacgaattgatctagtgtgatcaagaacatatagtgttattaagaagtttctgatagttggata-ctata 27133  T
Q  216 gtggat----aatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtga 266  Q
    ||||||    |||||||||||| || ||||||||| |||||||||  ||||||||    
T  27132 gtggatggataatctcacacgaagtatggggactggaagtagccgactttggtga 27078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University