View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF2153_high_6 (Length: 347)

Name: NF2153_high_6
Description: NF2153
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF2153_high_6
NF2153_high_6
[»] chr4 (14 HSPs)
chr4 (1-347)||(51337723-51338069)
chr4 (1-347)||(28143124-28143478)
chr4 (1-344)||(14191989-14192343)
chr4 (64-253)||(13957504-13957690)
chr4 (64-210)||(10142441-10142585)
chr4 (64-253)||(51758731-51758918)
chr4 (64-188)||(25201629-25201751)
chr4 (64-253)||(42511377-42511560)
chr4 (72-253)||(20151950-20152128)
chr4 (264-347)||(52459097-52459180)
chr4 (264-347)||(52460354-52460437)
chr4 (309-347)||(21320093-21320131)
chr4 (309-346)||(10142225-10142262)
chr4 (264-347)||(10373311-10373395)
[»] chr3 (8 HSPs)
chr3 (1-347)||(23044573-23044919)
chr3 (1-347)||(31884633-31884979)
chr3 (1-344)||(6024429-6024785)
chr3 (65-253)||(47185232-47185417)
chr3 (64-149)||(44879802-44879887)
chr3 (264-347)||(1698500-1698583)
chr3 (264-347)||(12893131-12893215)
chr3 (83-151)||(46948097-46948165)
[»] chr2 (17 HSPs)
chr2 (1-347)||(29303248-29303593)
chr2 (1-347)||(19678100-19678454)
chr2 (1-347)||(7880036-7880382)
chr2 (1-325)||(45277179-45277503)
chr2 (1-347)||(90008-90352)
chr2 (1-344)||(18780848-18781202)
chr2 (1-344)||(2565696-2566024)
chr2 (1-173)||(6271283-6271455)
chr2 (64-249)||(25621709-25621891)
chr2 (64-253)||(14904291-14904477)
chr2 (66-136)||(6883603-6883673)
chr2 (85-253)||(38422321-38422486)
chr2 (309-347)||(19091168-19091206)
chr2 (66-246)||(43672676-43672854)
chr2 (264-343)||(30386938-30387017)
chr2 (308-347)||(11199269-11199308)
chr2 (191-253)||(6883542-6883603)
[»] chr1 (12 HSPs)
chr1 (1-347)||(36296774-36297120)
chr1 (1-347)||(42722309-42722655)
chr1 (1-347)||(28945488-28945842)
chr1 (1-344)||(26221759-26222113)
chr1 (64-231)||(12028035-12028198)
chr1 (64-183)||(48646247-48646364)
chr1 (73-251)||(5208437-5208612)
chr1 (65-195)||(35501334-35501461)
chr1 (64-253)||(47397161-47397352)
chr1 (64-155)||(49228381-49228472)
chr1 (264-345)||(5509795-5509876)
chr1 (264-325)||(47397466-47397528)
[»] chr7 (14 HSPs)
chr7 (1-347)||(8069652-8070000)
chr7 (1-347)||(48636774-48637120)
chr7 (1-347)||(6189080-6189426)
chr7 (1-347)||(48238531-48238876)
chr7 (1-347)||(19311619-19311963)
chr7 (1-238)||(6195596-6195833)
chr7 (14-260)||(23305479-23305725)
chr7 (67-253)||(43178641-43178820)
chr7 (64-231)||(24441697-24441862)
chr7 (65-253)||(39038303-39038485)
chr7 (64-149)||(8113540-8113625)
chr7 (308-343)||(39038875-39038910)
chr7 (268-347)||(28460185-28460266)
chr7 (264-347)||(45446009-45446091)
[»] chr5 (6 HSPs)
chr5 (1-347)||(7850386-7850732)
chr5 (1-347)||(38491118-38491464)
chr5 (1-347)||(14651417-14651760)
chr5 (64-249)||(43171057-43171239)
chr5 (64-253)||(5120565-5120752)
chr5 (308-347)||(29789626-29789665)
[»] chr8 (13 HSPs)
chr8 (1-347)||(28509332-28509678)
chr8 (1-325)||(6927234-6927558)
chr8 (1-293)||(28516593-28516885)
chr8 (1-346)||(11994391-11994734)
chr8 (1-344)||(2878881-2879237)
chr8 (64-253)||(11648148-11648332)
chr8 (167-263)||(24683137-24683232)
chr8 (64-180)||(602166-602280)
chr8 (264-325)||(24682741-24682802)
chr8 (64-149)||(960719-960804)
chr8 (121-188)||(35824208-35824273)
chr8 (157-247)||(9381943-9382032)
chr8 (267-330)||(32073358-32073422)
[»] chr6 (6 HSPs)
chr6 (1-347)||(33516303-33516649)
chr6 (1-347)||(14677810-14678154)
chr6 (67-253)||(11680511-11680694)
chr6 (64-253)||(1830948-1831131)
chr6 (71-155)||(4064983-4065067)
chr6 (70-131)||(1831140-1831201)
[»] scaffold0743 (2 HSPs)
scaffold0743 (1-206)||(2485-2690)
scaffold0743 (211-347)||(3190-3326)
[»] scaffold0385 (1 HSPs)
scaffold0385 (81-188)||(910-1015)
[»] scaffold1266 (1 HSPs)
scaffold1266 (264-347)||(1394-1477)
[»] scaffold0263 (1 HSPs)
scaffold0263 (264-347)||(18539-18622)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (264-347)||(98290-98373)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 298; Significance: 1e-167; HSPs: 14)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 51338069 - 51337723
Alignment:
Q  1 attttagcacctaaatagtagacactgaatttttgaaatctaatgatagtaaaaccnnnnnnntaaaagtatatcaacacgtaattaattaaattttaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51338069 attttagcacctaaatagtagacacttaatttttgacatctaatgatagtaaaaccaaaaaaataaaagtatatcaacacgtaattaattaaattttaga 51337970  T
Q  101 catttggatacaaaattctccaatgctaaacacataacaacaataatacttgataaacaaaattcgtgttaaactttttagagtaatctaagatacaata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  51337969 catttggatacaaaattctccaatgctaaacacataacaacaataatacttgataaacaaaattagtgttaaattttttagagtaatctaagatacaata 51337870  T
Q  201 actcatttgttatactacaaataaatcattcatctttttatatgctataagtaccaagtttatattactatattgatataattaatttattttggatact 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51337869 actcatttgttatactacaaataaatcattcatctttttatatgctataagtaccaagtttatattactatattgatataattaatttattttggatact 51337770  T
Q  301 ttcaaggcaagattaagattaatttgtctagtaggcccattttcaac 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  51337769 ttcaaggcaagattaagattaatttctccggtaggcccattttcaac 51337723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 28143124 - 28143478
Alignment:
Q  1 attttagcacctaaatagtagacactgaatttttgaaatctaatgatagtaaaaccnnnnnnntaaaagtatatcaacacgtaattaattaaattttaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28143124 attttagcacctaaatagtaggcactgaatttttgacatctaatgatagtaaaaccaaaaaaataaaagtatatcaacacgtaatcaattaaattttaga 28143223  T
Q  101 catttggatacaaaattctccaatgctaaacacataacaacaataatacttgataaacaaaattcgtgttaaactttttagagtaatctaagatacaata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28143224 catttggatacaaaattctccaatgctaaacacataacaacaataatacttgataaacaaaattagtgttaaattttttagagtaatctaagatacaata 28143323  T
Q  201 actcatttgttatactacaaataaatca--------ttcatctttttatatgctataagtaccaagtttatattactatattgatataattaatttattt 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28143324 actcatttgttatactacaaataaatcattcatcttttcatctttttatatgctataagtatcaagtttatattactatattgatataattaatttattt 28143423  T
Q  293 tggatactttcaaggcaagattaagattaatttgtctagtaggcccattttcaac 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  28143424 tggatactttcaaggcaagattaagattaatttctctagtagatccattttcaac 28143478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 14191989 - 14192343
Alignment:
Q  1 attttagcacctaaatagtagacactgaatttttgaaatctaatgatagtaaaaccnnnnnnntaaaagtatat----caacacgtaattaattaaattt 96  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||       |||| ||||||    |||||||| |||||||||||||    
T  14191989 attttagcacttaaatagtagacactgaatttttgacatctaatgatagtaaaaccaaaaaaataaaggtatatatatcaacacgtcattaattaaattt 14192088  T
Q  97 tagacatttggatacaaaattctccaatgctaaacacataacaacaataatacttgataaacaaaa--ttcgtgttaaactttttagagtaatctaagat 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  |   ||||| |  |||||||||||||||||||    
T  14192089 tagacatttggatacaaaattctccaatgttaaactcataacaacaataatacttgataaaaaaaaaatcactgttagaaattttagagtaatctaagat 14192188  T
Q  195 acaataactcatttgt-----tatactacaaataaatcattcatctttttatatgctataagtaccaagtttatattactatattgatataattaattta 289  Q
    ||||||||||||||||     |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14192189 acaataactcatttgtaattgtatactacaaataaatcactcttctttttatatgctacaagtaccaagtttttattactatattgatataattaattta 14192288  T
Q  290 ttttggatactttcaaggcaagattaagattaatttgtctagtaggcccattttc 344  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14192289 ttttggatactttaaaggcaagattaagattaatttttctagtaggcccattttc 14192343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 64 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 13957690 - 13957504
Alignment:
Q  64 taaaagtatatcaacacgtaattaattaaattttagacatttggatacaaaattctccaatgctaaacacataacaacaataatacttgataaacaaaat 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||  |||||||    
T  13957690 taaaagtatatcaacacgtaattaactaaattttaaacttttggatgcaaaattcttcaatgttaaactcataacaatgataatacatgat--acaaaat 13957593  T
Q  164 tcgtgttaaactttttagagtaatctaagatacaataactcatttgttatactacaaataaatcattcatctttttatatgctataagta 253  Q
    | |||||| | ||||||||  ||||  |||||||| || ||||||| ||||||| || || ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13957592 tagtgttagagtttttagataaatcatagatacaagaagtcatttg-tatactagaagtacatcattcctctttttatatgctataagta 13957504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 64 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 10142585 - 10142441
Alignment:
Q  64 taaaagtatatcaacacgtaattaattaaattttagacatttggatacaaaattctccaatgctaaacacataacaacaataatacttgataaacaaaat 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| || ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||  |||||||    
T  10142585 taaaagtatatcaacacgtaattaactaaattttaaacttttgaatgcaaaattctccaatgttaaactaataacaacaataatacatgat--acaaaat 10142488  T
Q  164 tcgtgttaaactttttagagtaatctaagatacaataactcatttgt 210  Q
    | |||||| |||||||| || ||||  |||||||  ||||| |||||    
T  10142487 tagtgttagactttttaaaggaatcatagatacatgaactcctttgt 10142441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 64 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 51758918 - 51758731
Alignment:
Q  64 taaaagtatatcaacacgtaattaattaaattttagacatttggatacaaaattctccaatgctaaa-cacataacaacaataatacttgataaacaaaa 162  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| || |||||||  |||| ||  ||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||  |||||    
T  51758918 taaaaatatatcaacatgtaattaattaaaatttaaacttttggatggaaaagtcggcaatgttaaaactcataacaacaataatacatgata--caaaa 51758821  T
Q  163 ttcgtgttaaactttttagagtaatctaagatacaataactcatttgttatactacaaataaatcattcatctttttatatgctataagta 253  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| | ||  || || |||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  51758820 ttagtgttagactttttagagtaatctaagatacaagaactcctttgtt-tgcttgaagtacatcattccgctttttatatgatataagta 51758731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 64 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 25201751 - 25201629
Alignment:
Q  64 taaaagtatatcaacacgtaattaattaaattttagacatttggatacaaaattctccaatgctaaacacataacaacaataatacttgataaacaaaat 163  Q
    |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||    
T  25201751 taaaagtacatcatcacgtaagtaattaaattttaaacttttagatacaaaattcttcaatgttaaactcataacaacaataatatttgat--acaaaat 25201654  T
Q  164 tcgtgttaaactttttagagtaatc 188  Q
    | |||||| ||||||||||| ||||    
T  25201653 tagtgttagactttttagagaaatc 25201629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 64 - 253
Target Start/End: Original strand, 42511377 - 42511560
Alignment:
Q  64 taaaagtatatcaacacgtaattaattaaattttagacatttggatacaaaattctccaatgctaaacacataacaacaataatacttgataaacaaaat 163  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||  || ||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||    
T  42511377 taaaagtatatcagcacgtaattaactaaattttaaactcttagatgcaaa-ttctccaatgttaaactcataacaacaataatacatgat--acaaaat 42511473  T
Q  164 tcgtgttaaactttttagagtaatctaagatacaataactcatttgttatactacaaataaatcattcatctttttatatgctataagta 253  Q
    | |||||  ||||||||||  ||||  ||| |||| ||||| |||| ||||||| || || ||||||| |||||||||||| || |||||    
T  42511474 tagtgtt--actttttagaagaatcatagacacaagaactcttttg-tatactagaagtacatcattcctctttttatatgttagaagta 42511560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 72 - 253
Target Start/End: Original strand, 20151950 - 20152128
Alignment:
Q  72 tatcaacacgtaattaattaaattttagacatttggatacaaaattctccaatgctaaacacataacaacaataatacttgataaacaaaattcgtgtta 171  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| | || |||   | |||||||||||  ||||| ||||||||||| |||| ||||||  |||||    |||||    
T  20151950 tatcaacacttaattaattaaattttagcctttcggacgtagaattctccaatattaaacccataacaacaacaatagttgata--caaaaccaatgtta 20152047  T
Q  172 aactttttagagtaatctaagatacaataactcatttgttatactacaaataaatcattcatctttttatatgctataagta 253  Q
    |||||||||||| |||  || || ||| ||||| |||  ||   ||||| || |||||||||||||||||||| || |||||    
T  20152048 aactttttagaggaataaaaaatgcaagaactccttt-ataagttacaagtatatcattcatctttttatatgttacaagta 20152128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 264 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 52459180 - 52459097
Alignment:
Q  264 attactatattgatataattaatttattttggatactttcaagg-caagattaagattaatttgtctagtaggcccattttcaac 347  Q
    |||||| ||||||||||||| |||| |||||||  |||| || | |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  52459180 attactgtattgatataatttattt-ttttggaatctttgaaagacaagattaaggttaatttctctggtaggcccattttcaac 52459097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 264 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 52460437 - 52460354
Alignment:
Q  264 attactatattgatataattaatttattttggatactttcaagg-caagattaagattaatttgtctagtaggcccattttcaac 347  Q
    |||||| ||||||||||||| |||| |||||||  |||| || | |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  52460437 attactgtattgatataatttattt-ttttggaatctttgaaagacaagattaaggttaatttctctggtaggcccattttcaac 52460354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 309 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 21320131 - 21320093
Alignment:
Q  309 aagattaagattaatttgtctagtaggcccattttcaac 347  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  21320131 aagattaagattaatttatctagtaagcccattttcaac 21320093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 309 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 10142262 - 10142225
Alignment:
Q  309 aagattaagattaatttgtctagtaggcccattttcaa 346  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  10142262 aagattaagattaatttctctagtagacccattttcaa 10142225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 347
Target Start/End: Original strand, 10373311 - 10373395
Alignment:
Q  264 attactatattgatataattaatttattttggatactttcaagg-caagattaagattaatttgtctagtaggcccattttcaac 347  Q
    |||| |||| |||||||||| | || |||||||  |||| || | ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  10373311 attattataatgatataatttaatttttttggaagctttaaatgacaagattaaaattaatttttctagtaggtccattttcaac 10373395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 298; Significance: 1e-167; HSPs: 8)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 23044573 - 23044919
Alignment:
Q  1 attttagcacctaaatagtagacactgaatttttgaaatctaatgatagtaaaaccnnnnnnntaaaagtatatcaacacgtaattaattaaattttaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23044573 attttagcacctaaatagtagacacttaatttttgacatctaatgataataaaaccaaaaaaataaaagtatatcaacacgtaattaattaaattttaga 23044672  T
Q  101 catttggatacaaaattctccaatgctaaacacataacaacaataatacttgataaacaaaattcgtgttaaactttttagagtaatctaagatacaata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23044673 catttggatacaaaattctccaatgctaaacacataacaacaataatacttgataaacaaaattagtgttaaattttttagagtaatctaagatacaata 23044772  T
Q  201 actcatttgttatactacaaataaatcattcatctttttatatgctataagtaccaagtttatattactatattgatataattaatttattttggatact 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23044773 actcatttgttatactacaaataaatcattcatctttttatatgctataagtaccaagtttatattactatattgatataattaatttattttggatact 23044872  T
Q  301 ttcaaggcaagattaagattaatttgtctagtaggcccattttcaac 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  23044873 ttcaaggcaagattaagattaatttctccagtaggcccattttcaac 23044919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 31884633 - 31884979
Alignment:
Q  1 attttagcacctaaatagtagacactgaatttttgaaatctaatgatagtaaaaccnnnnnnntaaaagtatatcaacacgtaattaattaaattttaga 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31884633 attttagcacctaaatagtcgacactgaatttttgacatctaatgatagtaaaaccaaaaaaataaaagtatatcaacacgtaattaattaaattttaga 31884732  T
Q  101 catttggatacaaaattctccaatgctaaacacataacaacaataatacttgataaacaaaattcgtgttaaactttttagagtaatctaagatacaata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31884733 catttggatacaaaattctccaatgctaaacacataacaacaataatacttgataaacaaaattagtgttaaattttttagagtaatctaagatacaata 31884832  T
Q  201 actcatttgttatactacaaataaatcattcatctttttatatgctataagtaccaagtttatattactatattgatataattaatttattttggatact 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31884833 actcatttgttatactacaaataaatcatccatctttttatatgctataagtaccaagtttatattactatattgatataattaatttattttagatact 31884932  T
Q  301 ttcaaggcaagattaagattaatttgtctagtaggcccattttcaac 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  31884933 ttcaaggcaagattaagattaatttctctagtatgcccattttcaac 31884979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 6024429 - 6024785
Alignment:
Q  1 attttagcacctaaatagtagacactgaatttttgaaatctaatgatagtaaaaccnnnnnnntaaaagtatat----caacacgtaattaattaaattt 96  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||       |||||||||||    |||||||| |||||||||||||    
T  6024429 attttagcacttaaatagtagacactgaatttttgacatctaatgatagtaaaaccaaaaaaataaaagtatatatatcaacacgtcattaattaaattt 6024528  T
Q  97 tagacatttggatacaaaattctccaatgctaaacacataacaacaataatacttgata----aacaaaattcgtgttaaactttttagagtaatctaag 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    || |||||   ||||| | ||||||||||||||||||    
T  6024529 tagacatttggatacaaaattctccaatgttaaactcataacaacaataatacttgatataaaaaaaaaatcactgttagaatttttagagtaatctaag 6024628  T
Q  193 atacaataactcatttgt-----tatactacaaataaatcattcatctttttatatgctataagtaccaagtttatattactatattgatataattaatt 287  Q
    ||||||||||||||||||     |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6024629 atacaataactcatttgtaattgtatactacaaataaatcactcttctttttatatgctacaagtaccaagtttatattactatattgatataattaatt 6024728  T
Q  288 tattttggatactttcaaggcaagattaagattaatttgtctagtaggcccattttc 344  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6024729 tattttggatactttaaaagcaagattaagattaatttttctagtaggcccattttc 6024785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 65 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 47185417 - 47185232
Alignment:
Q  65 aaaagtatatcaacacgtaattaattaaattttagacatttggatacaaaattctccaatgctaaacacataacaacaataatacttgataaacaaaatt 164  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||  ||||||||    
T  47185417 aaaagtatatcaacaagtaattaactaaattttaaacatttggatgcaaaattctccaatgttaaactcataacaacaataattcatgat--acaaaatt 47185320  T
Q  165 cgtgttaaactttttagagtaatctaagatacaataactcatttgttatactacaaataaatcattcatctttttatatgctataagta 253  Q
     |||||| ||||||||||| ||||  |||||||| ||||| |||| || | || || || ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  47185319 agtgttagactttttagaggaatcatagatacaagaactcttttg-tacattataagtacatcatttctctttttatatgctataagta 47185232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 44879887 - 44879802
Alignment:
Q  64 taaaagtatatcaacacgtaattaattaaattttagacatttggatacaaaattctccaatgctaaacacataacaacaataatac 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | | | ||| | ||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||    
T  44879887 taaaagtatatcaacacgtaattaactaaattttaatcttctagatgccaaattctccaatattaaactcataacaataataatac 44879802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 264 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 1698583 - 1698500
Alignment:
Q  264 attactatattgatataattaatttattttggatactttcaagg-caagattaagattaatttgtctagtaggcccattttcaac 347  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | |||||  ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||    
T  1698583 attactatattgatataatttattt-tcttggaatctttcaaagacaagattaagattaatttatctagtaaacctattttcaac 1698500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 264 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 12893215 - 12893131
Alignment:
Q  264 attactatattgatataattaatttattttgga-tactttcaaggcaagattaagattaatttgtctagtaggcccattttcaac 347  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||||| || ||  |||  |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  12893215 attactatgttgatataatttattttttttggaatatttgaaagataagattaaaattaatttctctagtaggtccattttcaac 12893131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 83 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 46948165 - 46948097
Alignment:
Q  83 aattaattaaattttagacatttggatacaaaattctccaatgctaaacacataacaacaataatactt 151  Q
    ||||||||||||||| | | ||||||| || |||| ||||||   |||| |||||||||||||||||||    
T  46948165 aattaattaaattttggtcttttggatgcagaattatccaatatcaaactcataacaacaataatactt 46948097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 294; Significance: 1e-165; HSPs: 17)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 29303593 - 29303248
Alignment:
Q  1 attttagcacctaaatagtagacactgaatttttgaaatctaatgatagtaaaaccnnnnnnntaaaagtatatcaacacgtaattaattaaattttaga 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29303593 attttaacacctaaatagtagacactgaatttt-gagatctaatgatagtaaaaccaaaaaaataaaagtatatcaacacgtaattaattaaattttaga 29303495  T
Q  101 catttggatacaaaattctccaatgctaaacacataacaacaataatacttgataaacaaaattcgtgttaaactttttagagtaatctaagatacaata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29303494 catttggatacaaaattctccaattctaaacacataacaacaataatacttgataaacaaaattagtgttaaattttttagagtaatctaagatacaata 29303395  T
Q  201 actcatttgttatactacaaataaatcattcatctttttatatgctataagtaccaagtttatattactatattgatataattaatttattttggatact 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29303394 actcatttgttatactacaaataaatcattcatctttttatatgctataagtaccaagtttatattactatattgatataattaatttattttggatact 29303295  T
Q  301 ttcaaggcaagattaagattaatttgtctagtaggcccattttcaac 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29303294 ttcaaggcaagattaagattaatttctctagtaggcccattttcaac 29303248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 19678454 - 19678100
Alignment:
Q  1 attttagcacctaaatagtagacactgaatttttgaaatctaatgatagtaaaaccnnnnnnntaaaagtatatcaacacgtaattaattaaattttaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19678454 attttagcacctaaatagtagacactgaatttttgacatctaatgatagtaaaatcaaaaaaataaaagtatatcaacacgtaattaattaaattttaga 19678355  T
Q  101 catttggatacaaaattctccaatgctaaacacataacaacaataatacttgataaacaaaattcgtgttaaactttttagagtaatctaagatacaata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19678354 catttggatacaaaattctccaatgctaaacacataacaacaataatacttgataaacaaaattagtgttaaattttttagagtaatctaagatacaata 19678255  T
Q  201 actcatttgttatactacaaataaatcattcatc--------tttttatatgctataagtaccaagtttatattactatattgatataattaatttattt 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19678254 actcatttgttatactacaaataaatcattcatcttttcatctttttatatgctataagtaccaagtttatattactatattgatataattaatttattt 19678155  T
Q  293 tggatactttcaaggcaagattaagattaatttgtctagtaggcccattttcaac 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  19678154 tggatactttcaaggcaagattaagattaatttctctagtagacccattttcaac 19678100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 7880036 - 7880382
Alignment:
Q  1 attttagcacctaaatagtagacactgaatttttgaaatctaatgatagtaaaaccnnnnnnntaaaagtatatcaacacgtaattaattaaattttaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |       |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7880036 attttagcacctaaatagtagacactgaatttttgacatctaatgatagtaaaatcaaaaaaataaaagtatatcaacacgtaattagttaaattttaga 7880135  T
Q  101 catttggatacaaaattctccaatgctaaacacataacaacaataatacttgataaacaaaattcgtgttaaactttttagagtaatctaagatacaata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  7880136 catttggatacaaaattctccaatgctaaacacacaacaacaataatacttgataaacaaaattagtgttaaatgttttagagtaatctaagatacaata 7880235  T
Q  201 actcatttgttatactacaaataaatcattcatctttttatatgctataagtaccaagtttatattactatattgatataattaatttattttggatact 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7880236 actcatttgttatactacagataaatcattcatctttttataggctataagtaccaagtttatattactatattgatataattaatttattttgaatact 7880335  T
Q  301 ttcaaggcaagattaagattaatttgtctagtaggcccattttcaac 347  Q
    || |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7880336 tttaaggaaagattaagattaatttctctagtaggcccattttcaac 7880382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 45277179 - 45277503
Alignment:
Q  1 attttagcacctaaatagtagacactgaatttttgaaatctaatgatagtaaaaccnnnnnnntaaaagtatatcaacacgtaattaattaaattttaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45277179 attttagcacctaaatagtagacactgaatttttgacatctaatgatagtaaaatcaaaaaaataaaagtatatcaacacgtaattaattaaattttaga 45277278  T
Q  101 catttggatacaaaattctccaatgctaaacacataacaacaataatacttgataaacaaaattcgtgttaaactttttagagtaatctaagatacaata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  45277279 catttggatacaaaattctccaatgctaaacacacaacaacaataatacttgataaacaaaattagtgttaaatgttttagagtaatctaagatacaata 45277378  T
Q  201 actcatttgttatactacaaataaatcattcatctttttatatgctataagtaccaagtttatattactatattgatataattaatttattttggatact 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45277379 actcatttgttatactacaaataaatcattcatctttttataggctataagtaccaagtttatattactatattgatataattaatttattttgaatact 45277478  T
Q  301 ttcaaggcaagattaagattaattt 325  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  45277479 ttcaaggaaagattaagattaattt 45277503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 90008 - 90352
Alignment:
Q  1 attttagcacctaaatagtagacactgaatttttgaaatctaatgatagtaaaaccnnnnnnntaaaagtatatcaacacgtaattaattaaattttaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  90008 attttagcacctaaatagtagacagtgaatttgtgacatctaatgatagtaaaaccaaaaaaataaaagtatatcaacacgtaattaattaaattttaga 90107  T
Q  101 catttggatacaaaattctccaatgctaaacacataacaacaataatacttgataaacaaaattcgtgttaaactttttagagtaatctaagatacaata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  90108 catttggatacaaaattctccaattttaaacccataacaacaataatacttgataaaaaaaaat-gtgttaaattttttagagtaatctaagatacaata 90206  T
Q  201 actcatttgttatactacaaataaatcattcatctttttatatgctataagtaccaagtttatattactatattgatataattaatttattttggatact 300  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  90207 actcatttgt-atactacaaataaatcattcctctttttatatgctacaagtaccaagtttatattactatattgatataattaatttattttggatact 90305  T
Q  301 ttcaaggcaagattaagattaatttgtctagtaggcccattttcaac 347  Q
    || ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  90306 ttaaaggcaatattaagattaatttttctaataggcccattttcaac 90352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 18780848 - 18781202
Alignment:
Q  1 attttagcacctaaatagtagacactgaatttttgaaatctaatgatagtaaaaccnnnnnnntaaaagtatat----caacacgtaattaattaaattt 96  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||       |||| ||||||    |||||||| |||||||||||||    
T  18780848 attttagcacttaaatattagacactgaatttttgacatctaatgatagtaaaaccaaaaaaataaaggtatatatatcaacacgtcattaattaaattt 18780947  T
Q  97 tagacatttggatacaaaattctccaatgctaaacacataacaacaataatacttgataaacaaaa--ttcgtgttaaactttttagagtaatctaagat 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  |   ||||| |  |||||||||||||||||||    
T  18780948 tagacatttggatacaaaattctccaatgttaaactcataacaacaataatacttgataaaaaaaaaatcactgttagaaattttagagtaatctaagat 18781047  T
Q  195 acaataactcatttgt-----tatactacaaataaatcattcatctttttatatgctataagtaccaagtttatattactatattgatataattaattta 289  Q
    ||||||||||||||||     |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18781048 acaataactcatttgtaattgtatactacaaataaatcactcttctttttatatgctacaagtaccaagtttatattactatattgatataattaattta 18781147  T
Q  290 ttttggatactttcaaggcaagattaagattaatttgtctagtaggcccattttc 344  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18781148 ttttggatactttaaaggcaagattaagattaatttttctagtaggcccattttc 18781202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 2566024 - 2565696
Alignment:
Q  1 attttagcacctaaatagtagacactgaatttttgaaatctaatgatagtaaaaccnnnnnnntaaaagtatat----caacacgtaattaattaaattt 96  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||       |||| ||||||    |||||||| |||||||||||||    
T  2566024 attttagcacttaaataatagacactgaatttttgacatctaatgatagtaaaaccaaaaaaataaaggtatatatatcaacacgtcattaattaaattt 2565925  T
Q  97 tagacatttggatacaaaattctccaatgctaaacacataacaacaataatacttgataaacaaaa--ttcgtgttaaactttttagagtaatctaagat 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  |   ||||| | |||||||||||||||         
T  2565924 tagacatttggatacaaaattctccaatgttaaactcataacaacaataatacttgataaaaaaaaaatcactgttagaatttttagagtaatct----- 2565830  T
Q  195 acaataactcatttgttatactacaaataaatcattcatctttttatatgctataagtaccaagtttatattactatattgatataattaatttattttg 294  Q
                    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2565829 ----------------tatactacaaataaatcactcttctttttatatgctacaagtaccaagtttatattactatattgatataattaatttattttg 2565746  T
Q  295 gatactttcaaggcaagattaagattaatttgtctagtaggcccattttc 344  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2565745 gatactttaaaggcaaaattaagattaatttttctagtaggcccattttc 2565696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Original strand, 6271283 - 6271455
Alignment:
Q  1 attttagcacctaaatagtagacactgaatttttgaaatctaatgatagtaaaaccnnnnnnntaaaagtatatcaacacgtaattaattaaattttaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6271283 attttagcacctaaatagtagacacttaatttttgacatctaatgataataaaaccaaaaaaataaaagtatatcaacacgtaattaattaaattttaga 6271382  T
Q  101 catttggatacaaaattctccaatgctaaacacataacaacaataatacttgataaacaaaattcgtgttaaa 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6271383 catttggatacaaaattctccaatgctaaacacataacaacaataatacttgataaacaaaattagtgttaaa 6271455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 64 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 25621891 - 25621709
Alignment:
Q  64 taaaagtatatcaacacgtaattaattaaattttagacatttggatacaaaattctccaatgctaaacacataacaacaataatacttgataaacaaaat 163  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||    
T  25621891 taaaaatatatcaacacgtaattagttaaattttaaacttttggaagcaaaattctccaatgttaaactcataacaacaataatacatgat--acaaaat 25621794  T
Q  164 tcgtgttaaactttttagagtaatctaagatacaataactcatttgttatactacaaataaatcattcatctttttatatgctata 249  Q
    | |||||| || |||||||| ||||  | ||||||||||||||||| ||||||  || || ||||||| ||||||| |||| ||||    
T  25621793 tagtgttagaccttttagaggaatcataaatacaataactcatttg-tatactggaagtacatcattcctctttttctatgatata 25621709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 64 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 14904477 - 14904291
Alignment:
Q  64 taaaagtatatcaacacgtaattaattaaattttagacatttggatacaaaattctccaatgctaaacacataacaacaataatacttgataaacaaaat 163  Q
    |||||||||  |||||  ||||||| ||||||||| || |||| || ||||||| ||||||| ||| | | ||||||||||||||| ||||  |||||||    
T  14904477 taaaagtatgccaacatataattaactaaattttaaacttttgaatgcaaaattatccaatgttaacctcctaacaacaataatacatgat--acaaaat 14904380  T
Q  164 tcgtgttaaactttttagagtaatctaagatacaataactcatttgttatactacaaataaatcattcatctttttatatgctataagta 253  Q
    |  ||||| | ||||||||  ||||  ||| ||||||||||||||  ||||||| || || |||| || |||||||||||| ||||||||    
T  14904379 tattgttagattttttagaagaatcatagaaacaataactcattt-atatactataagtatatcactcctctttttatatgttataagta 14904291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 6883673 - 6883603
Alignment:
Q  66 aaagtatatcaacacgtaattaattaaattttagacatttggatacaaaattctccaatgctaaacacata 136  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  6883673 aaagtatatcaacacataattaattaaattttaaatttttggatagaaaattctccaatgttaaactcata 6883603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 253
Target Start/End: Original strand, 38422321 - 38422486
Alignment:
Q  85 ttaattaaattttagacatttggatacaaaattctccaatgctaaacacataacaacaataatacttgataaacaaaattcgtgttaaactttttagagt 184  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| || | |||||||||   |||| |||||||| |||| ||||||||  ||||||   |||||| ||||||||||      
T  38422321 ttaattaaattttagccttttggatgcagacttctccaatatcaaacccataacaataatattacttgat--acaaaaccagtgttagactttttagaag 38422418  T
Q  185 aatctaagatacaataactcatttgttatactacaaataaatcattcatctttttatatgctataagta 253  Q
    |||| ||||||| | ||||| |||  |||  ||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  38422419 aatcaaagatactagaactccttt-atatgttacaagtacatcattcctctttttatatgctacaagta 38422486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 309 - 347
Target Start/End: Original strand, 19091168 - 19091206
Alignment:
Q  309 aagattaagattaatttgtctagtaggcccattttcaac 347  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19091168 aagattaagattaatttctctagtaggcccattttcaac 19091206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 66 - 246
Target Start/End: Original strand, 43672676 - 43672854
Alignment:
Q  66 aaagtatatcaacacgtaattaattaaattttagacatttggatacaaaattctccaatgct-aaacacataacaacaataatacttgataaacaaaatt 164  Q
    |||| |||||||||| || ||||||||||||||    |||||||| | |  ||||||||  | |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||     
T  43672676 aaagaatatcaacacttatttaattaaattttaactttttggatatagacctctccaatatttaaacccataacatcaataatacttgat--acaaaatc 43672773  T
Q  165 cgtgttaaactttttagagtaatctaagatacaataactcatttgttatactacaaataaatcattcatctttttatatgct 246  Q
     || ||| ||||||||||| |||| |||||||  |||||| |||  |||  ||||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  43672774 agtattagactttttagaggaatcaaagataccgtaactccttt-atatgttacaagtacatcattcctctttttatatgct 43672854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 264 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 30387017 - 30386938
Alignment:
Q  264 attactatattgatataattaatttattttggatactttcaagg-caagattaagattaatttgtctagtaggcccatttt 343  Q
    |||||||||||||||||||| | || |||||||  |||| || | |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  30387017 attactatattgatataatttaatt-ttttggaacctttaaaagacaagattaagattaatttatctagtaagcccatttt 30386938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 308 - 347
Target Start/End: Original strand, 11199269 - 11199308
Alignment:
Q  308 caagattaagattaatttgtctagtaggcccattttcaac 347  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  11199269 caagattaagattaatttctctagtatgcccattttcaac 11199308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 6883603 - 6883542
Alignment:
Q  191 agatacaataactcatttgttatactacaaataaatcattcatctttttatatgctataagta 253  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| || || ||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  6883603 agatacaagaactcatttgt-atactaaaagtacatcattcctctttttatatgctacaagta 6883542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 294; Significance: 1e-165; HSPs: 12)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 36297120 - 36296774
Alignment:
Q  1 attttagcacctaaatagtagacactgaatttttgaaatctaatgatagtaaaaccnnnnnnntaaaagtatatcaacacgtaattaattaaattttaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36297120 attttagcacctaaatagtagacacttaatttttgacatctaatgatagtaaaaccaaaaaaataaaagtatatcaacacgtaattaattaaattttaga 36297021  T
Q  101 catttggatacaaaattctccaatgctaaacacataacaacaataatacttgataaacaaaattcgtgttaaactttttagagtaatctaagatacaata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36297020 catttggatacaaaattctccaatgctaaacacataacaacaataatacttgataaacaaaattagtgttaaattttttagagtaatctaagatacaata 36296921  T
Q  201 actcatttgttatactacaaataaatcattcatctttttatatgctataagtaccaagtttatattactatattgatataattaatttattttggatact 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36296920 actcatttgttatactacaaataaatcattcatctttttatatgctataagtaccaagtttatattactatattgatataattaatttattttggatact 36296821  T
Q  301 ttcaaggcaagattaagattaatttgtctagtaggcccattttcaac 347  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  36296820 ttcaaggaaagattaagattaatttcttcagtaggcccattttcaac 36296774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 42722655 - 42722309
Alignment:
Q  1 attttagcacctaaatagtagacactgaatttttgaaatctaatgatagtaaaaccnnnnnnntaaaagtatatcaacacgtaattaattaaattttaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42722655 attttagcacctaaatagtagacacttaatttttgacatctaatgataggaaaaccaaaaaaataaaagtatatcaacacgtaattaattaaattttaga 42722556  T
Q  101 catttggatacaaaattctccaatgctaaacacataacaacaataatacttgataaacaaaattcgtgttaaactttttagagtaatctaagatacaata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  42722555 catttggatacaaaattctccaatgctaaacacataacaacaataatacttgataaacaaaattagtgttaaattttttagagtaatctaagatacaata 42722456  T
Q  201 actcatttgttatactacaaataaatcattcatctttttatatgctataagtaccaagtttatattactatattgatataattaatttattttggatact 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42722455 actcatttgttatactacaaataaatcattcatctttttatatgctataagtaccaagtttatattactatattgatataattaatttattttggatact 42722356  T
Q  301 ttcaaggcaagattaagattaatttgtctagtaggcccattttcaac 347  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  42722355 ttcaaggaaagattaagattaatttcttcagtaggcccattttcaac 42722309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 28945488 - 28945842
Alignment:
Q  1 attttagcacctaaatagtagacactgaatttttgaaatctaatgatagtaaaaccnnnnnnntaaaagtatatcaacacgtaattaattaaattttaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28945488 attttagcacctaaatagtaggcactgaatttttgacatctaatgatagtaaaaccaaaaaaataaaagtatatcaacacgtaattaattaaattttaga 28945587  T
Q  101 catttggatacaaaattctccaatgctaaacacataacaacaataatacttgataaacaaaattcgtgttaaactttttagagtaatctaagatacaata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28945588 catttggatacaaaattctccaatgctaaacacataacaacaataatacttgataaacaaaattagtgttaaattttttagagtaatctaagatacaata 28945687  T
Q  201 actcatttgttatactacaaataaatca--------ttcatctttttatatgctataagtaccaagtttatattactatattgatataattaatttattt 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28945688 actcatttgttatactacaaataaatcattcatcttttcatctttttatatgctataagtaccaagtttatattactatattgatataattaatttattt 28945787  T
Q  293 tggatactttcaaggcaagattaagattaatttgtctagtaggcccattttcaac 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  28945788 tggatactttcaaggcaagattaagattaatttctctagtagatccattttcaac 28945842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 26222113 - 26221759
Alignment:
Q  1 attttagcacctaaatagtagacactgaatttttgaaatctaatgatagtaaaaccnnnnnnntaaaag-----tatatcaacacgtaattaattaaatt 95  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||         ||||     ||||||||||||| ||||||||||||    
T  26222113 attttagcacttaaataatagacactgaattttttacatctaatgatagtaaaaccaaaaaaaataaaggtatatatatcaacacgtcattaattaaatt 26222014  T
Q  96 ttagacatttggatacaaaattctccaatgctaaacacataacaacaataatacttgataaacaaaa--ttcgtgttaaactttttagagtaatctaaga 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||  |   ||||| | |||||||||||||||||||    
T  26222013 ttagacatttggatacaaaattctccaatgttaaactcataaaaacaataatacttgataaaaaaaaaatcactgttagaatttttagagtaatctaaga 26221914  T
Q  194 tacaataactcatttgt-----tatactacaaataaatcattcatctttttatatgctataagtaccaagtttatattactatattgatataattaattt 288  Q
    |||||||||||||||||     |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26221913 tacaataactcatttgtaattgtatactacaaataaatcactcttctttttatatgctacaagtaccaagtttatattactatattgatataattaattt 26221814  T
Q  289 attttggatactttcaaggcaagattaagattaatttgtctagtaggcccattttc 344  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  26221813 attttggatactttaaaagcaagattaagattaattt-tgtagtaggtccattttc 26221759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 64 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 12028198 - 12028035
Alignment:
Q  64 taaaagtatatcaacacgtaattaattaaattttagacatttggatacaaaattctccaatgctaaacacataacaacaataatacttgataaacaaaat 163  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||    
T  12028198 taaaagtatatcaaaacgtaattaactaaattttaaacttttggatgcaaaattctccaatgttaaactcataacaacaataatacatgat--acaaaat 12028101  T
Q  164 tcgtgttaaactttttagagtaatctaagatacaataactcatttgttatactacaaataaatcattc 231  Q
    | |||||| || |||||||| ||||  |||||||| ||||| |||| ||||| | ||||| |||||||    
T  12028100 tagtgttagac-ttttagaggaatcatagatacaagaactcctttg-tatacaagaaatacatcattc 12028035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 64 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 48646364 - 48646247
Alignment:
Q  64 taaaagtatatcaacacgtaattaattaaattttagacatttggatacaaaattctccaatgctaaacacataacaacaataatacttgataaacaaaat 163  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||  | |||||    
T  48646364 taaaagtatatcaacacgcaattaattaaattttaaacatttagatgcaaaattcttcaatgttaaactcataacaacaataatacatgat--ataaaat 48646267  T
Q  164 tcgtgttaaactttttagag 183  Q
    | |||||| | |||||||||    
T  48646266 tagtgttagaatttttagag 48646247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 251
Target Start/End: Original strand, 5208437 - 5208612
Alignment:
Q  73 atcaacacgtaattaattaaattttagacatttggatacaaaattctccaatgctaaacacataacaacaataatacttgataaacaaaattcgtgttaa 172  Q
    |||||||  ||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||| || || |||||||||| |||||  |||||  ||||||| ||||||     
T  5208437 atcaacatataattaactaaattttaaacttttggatgcaaaattctacaatgttagacccataacaacagtaatatatgata--caaaattagtgttag 5208534  T
Q  173 actttttagagtaatctaagatacaataactcatttgttatactacaaataaatcattcatctttttatatgctataag 251  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||| |||||||| | ||||||| || |  |||||||  ||||||||||| ||||||    
T  5208535 actttttagagaaatcatagatacaagaactcattcg-tatactagaagtgcatcattctgctttttatatgttataag 5208612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 65 - 195
Target Start/End: Original strand, 35501334 - 35501461
Alignment:
Q  65 aaaagtatatcaacacgtaattaattaaattttagacatttggatacaaaattctccaatgctaaacacataacaacaataatacttgataaacaaaatt 164  Q
    |||||||||||||| | || ||||||||||||||| | |||| |||||  ||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||     
T  35501334 aaaagtatatcaactcttagttaattaaattttaggcttttgtatacatcattctccaatgttaaacccataacaattataatacttgataaa-aaaat- 35501431  T
Q  165 cgtgttaaactttttagagtaatctaagata 195  Q
     |||||| ||||||| ||| |||| ||||||    
T  35501432 -gtgttagactttttcgagaaatcaaagata 35501461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 64 - 253
Target Start/End: Original strand, 47397161 - 47397352
Alignment:
Q  64 taaaagtatatcaacacgtaattaattaaattttagacatttggatacaaaattctcc-----aatgctaaacacataacaacaataatacttgataaac 158  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |  |||||||   |||||||||     |||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||  ||    
T  47397161 taaaagtatatcaacatataattaattaaattttaaatttttggatggtaaattctccaatataatgttaaactcataacaacaaaaatacatgat--ac 47397258  T
Q  159 aaaattcgtgttaaactttttagagtaatctaagatacaataactcatttgttatactacaaataaatcattcatctttttatatgctataagta 253  Q
    |||||| || ||| ||||||||||| ||||  | |||||||||||| |||  ||| ||| ||  | ||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  47397259 aaaattagttttacactttttagaggaatcataaatacaataactccttt-atatgctagaaggacatcattcctctctttatatgctataagta 47397352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 64 - 155
Target Start/End: Original strand, 49228381 - 49228472
Alignment:
Q  64 taaaagtatatcaacacgtaattaattaaattttagacatttggatacaaaattctccaatgctaaacacataacaacaataatacttgata 155  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| || ||||  |  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  49228381 taaaagtatataaacacgcaattaattacattttaaacttttgattgaaaaattctccaatgttaaactcataacaacaataatacgtgata 49228472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 264 - 345
Target Start/End: Original strand, 5509795 - 5509876
Alignment:
Q  264 attactatattgatataattaatttattttggatactttcaagg-caagattaagattaatttgtctagtaggcccattttca 345  Q
    |||||||||||||||||||| |  | |||||||  |||| || | |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  5509795 attactatattgatataatttaaat-ttttggaatctttgaaagacaagattaagattaatttatctagtaggcacattttca 5509876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 264 - 325
Target Start/End: Original strand, 47397466 - 47397528
Alignment:
Q  264 attactatattgatataattaatttattttggatacttt-caaggcaagattaagattaattt 325  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  47397466 attactatattgatataatttattttttttggaacctttgaaagacaagattaagattaattt 47397528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 293; Significance: 1e-164; HSPs: 14)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 8070000 - 8069652
Alignment:
Q  1 attttagcacctaaatagtagacactgaatttttgaaatctaatgatagtaaaaccnnnnnnntaaaagtatatcaacacgtaattaattaaattttaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8070000 attttagcacctaaatagtagacactgaatttttgacatctaatgatagtaaaaccaaaaaaataaaagtatatcaacacgtaattaattaaattttaga 8069901  T
Q  101 catttggatacaaaattctccaatgctaaacacataacaacaataatacttgataaacaaaattcgtgttaaactttttagagtaatctaagatacaata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  8069900 catttggatacaaaattctccaatgctaaacacataacaacaataatacttgataaacaaaattagtgttaaattgtttagagtaatctaagatacaata 8069801  T
Q  201 actcattt--gttatactacaaataaatcattcatctttttatatgctataagtaccaagtttatattactatattgatataattaatttattttggata 298  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8069800 actcatttttgttatactacaaataaatcattcatctttttatatgctataagtaccaagtttatattactatattgatataattaatttattttggatg 8069701  T
Q  299 ctttcaaggcaagattaagattaatttgtctagtaggcccattttcaac 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8069700 ctttcaaggcaagattaagattaatttctctagtaggcccattttcaac 8069652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 48637120 - 48636774
Alignment:
Q  1 attttagcacctaaatagtagacactgaatttttgaaatctaatgatagtaaaaccnnnnnnntaaaagtatatcaacacgtaattaattaaattttaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48637120 attttagcacctaaatagtagacacttaatttttgacatctaatgataggaaaaccaaaaaaataaaagtatatcaacacgtaattaattaaattttaga 48637021  T
Q  101 catttggatacaaaattctccaatgctaaacacataacaacaataatacttgataaacaaaattcgtgttaaactttttagagtaatctaagatacaata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  48637020 catttggatacaaaattctccaatgctaaacacataacaacaataatacttgataaacaaaattagtgttaaattttttagagtaatctaagatacaata 48636921  T
Q  201 actcatttgttatactacaaataaatcattcatctttttatatgctataagtaccaagtttatattactatattgatataattaatttattttggatact 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48636920 actcatttgttatactacaaataaatcattcatctttttatatgctataagtaccaagtttatattactatattgatataattaatttattttggatact 48636821  T
Q  301 ttcaaggcaagattaagattaatttgtctagtaggcccattttcaac 347  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  48636820 ttcaaggaaagattaagattaatttcttcagtaggcccattttcaac 48636774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 6189080 - 6189426
Alignment:
Q  1 attttagcacctaaatagtagacactgaatttttgaaatctaatgatagtaaaaccnnnnnnntaaaagtatatcaacacgtaattaattaaattttaga 100  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6189080 attttagcacctaaataatcgacactgaatttttgacatctaatgatagtaaaaccaaaaaaataaaagtatatcaacacgtaattaattaaattttata 6189179  T
Q  101 catttggatacaaaattctccaatgctaaacacataacaacaataatacttgataaacaaaattcgtgttaaactttttagagtaatctaagatacaata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6189180 catttggatacaaaattctccaatgctaaacacataacaacaataatacttgataaacaaaattagtgttaaattttttagagtaatctaagatacaata 6189279  T
Q  201 actcatttgttatactacaaataaatcattcatctttttatatgctataagtaccaagtttatattactatattgatataattaatttattttggatact 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6189280 actcatttgttatactacaaataaatcattcatctttttatatgctataagtaccaagtttatattattatattgatataattaatttattttagatact 6189379  T
Q  301 ttcaaggcaagattaagattaatttgtctagtaggcccattttcaac 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  6189380 ttcaaggcaagattaagattaatttctctagtatgcccattttcaac 6189426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 48238876 - 48238531
Alignment:
Q  1 attttagcacctaaatagtagacactgaatttttgaaatctaatgatagtaaaaccnnnnnnntaaaagtatatcaacacgtaattaattaaattttaga 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48238876 attttagcacctaaatagttgacactgaatttttgacatctaatgatagtaaaaccaaaaaaataaaagtatatcaacacgtaattaattaaattttaga 48238777  T
Q  101 catttggatacaaaattctccaatgctaaacacataacaacaataatacttgataaacaaaattcgtgttaaactttttagagtaatctaagatacaata 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  48238776 catttgaatacaaaattctccaatgttaa-cacataacaacaataatacttgataaacaaaattagtgttaaattttttagagtaatctaagatacaata 48238678  T
Q  201 actcatttgttatactacaaataaatcattcatctttttatatgctataagtaccaagtttatattactatattgatataattaatttattttggatact 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48238677 actcatttgttatactacaaataaatcattcatctttttatatgctataagtaccaagtttatattactatattgatataattaatttattttggatact 48238578  T
Q  301 ttcaaggcaagattaagattaatttgtctagtaggcccattttcaac 347  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  48238577 ttcaaggcaagattaagatttatttctctagtaggcccattttcaac 48238531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 19311619 - 19311963
Alignment:
Q  1 attttagcacctaaatagtagacactgaatttttgaaatctaatgatagtaaaaccnnnnnnntaaaagtatatcaacacgtaattaattaaattttaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19311619 attttagcacctaaatagtagacagtgaatttgtgacatctaatgatagtaaaaccaaaaaaataaaagtatatcaacacgtaattaattaaattttaga 19311718  T
Q  101 catttggatacaaaattctccaatgctaaacacataacaacaataatacttgataaacaaaattcgtgttaaactttttagagtaatctaagatacaata 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19311719 cattttgatacaaaattctccaatgttaaacccataacaacaataatacttgataaaaaaaaat-gtgttaaaatttttagagtaatctaagatacaata 19311817  T
Q  201 actcatttgttatactacaaataaatcattcatctttttatatgctataagtaccaagtttatattactatattgatataattaatttattttggatact 300  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19311818 actcatttgt-agactacaaataaatcattcctcttcttatatgctacaagtaccaagtttatattactatattgatataattaatttattttagatact 19311916  T
Q  301 ttcaaggcaagattaagattaatttgtctagtaggcccattttcaac 347  Q
    || ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  19311917 ttaaaggcaatattaagattaatttttctaataggcccattttcaac 19311963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 6195596 - 6195833
Alignment:
Q  1 attttagcacctaaatagtagacactgaatttttgaaatctaatgatagtaaaaccnnnnnnntaaaagtatatcaacacgtaattaattaaattttaga 100  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6195596 attttagcacctaaataatcgacactgaatttttgacatctaatgatagtaaaaccaaaaaaataaaagtatatcaacacgtaattaattaaattttaaa 6195695  T
Q  101 catttggatacaaaattctccaatgctaaacacataacaacaataatacttgataaacaaaattcgtgttaaactttttagagtaatctaagatacaata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6195696 catttggatacaaaattctccaatgctaaacacataacaacaataatacttgataaacaaaattagtgttaaattttttagagtaatctaagatacaata 6195795  T
Q  201 actcatttgttatactacaaataaatcattcatctttt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6195796 actcatttgttatactacaaataaatcattcatctttt 6195833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 23305725 - 23305479
Alignment:
Q  14 aatagtagacactgaatttttgaaatctaatgatagtaaaaccnnnnnnn-taaaagtatatcaacacgtaattaattaaattttagacatttggataca 112  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||| |||        ||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  23305725 aatagtagacactgaaattttgaaacctaagaatagtaacaccaaaaaaaataaaagtatgttaacacgtagttaaataaattttagacttttggataca 23305626  T
Q  113 aaattctccaatgctaaacacataacaacaataatacttgataaacaaaattcgtgttaaactttttagagtaatctaagatacaataactcatttgtta 212  Q
    ||||| ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||  | | |||||    |||| ||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||| ||    
T  23305625 aaattatccaatgttaaacccataactacaataatacttgcgatagaaaatcaaggttagacttttttgaggaatctaagatacgagaactcatttg-ta 23305527  T
Q  213 tactacaaataaatcattcatctttttatatgctataagtaccaagtt 260  Q
    | ||| || || || |||| |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  23305526 tgctagaagtagattattcctcttttaatatgctacaagtaccaagtt 23305479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 67 - 253
Target Start/End: Original strand, 43178641 - 43178820
Alignment:
Q  67 aagtatatcaacacgtaattaattaaattttagacatttggatacaaaattctccaatgctaaacacataacaacaataatacttgataaacaaaattcg 166  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||   ||||||   ||| |||||||| |    
T  43178641 aagtatatcaacacgtaattaattaaattttaaacttttggataaaaaaatctccaatgttaaactcataacaa---taatac---atatacaaaattag 43178734  T
Q  167 tgttaaactttttagagtaatctaagatacaataactcatttgttatactacaaataaatcattcatctttttatatgctataagta 253  Q
    ||||| ||||||||||| ||||  | |||||| ||||| |||| ||| ||| || || ||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  43178735 tgttagactttttagaggaatcacaaatacaagaactcctttg-tatgctagaagtacatcatttctctttttatatgatataagta 43178820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 64 - 231
Target Start/End: Original strand, 24441697 - 24441862
Alignment:
Q  64 taaaagtatatcaacacgtaattaattaaattttagacatttggatacaaaattctccaatg-ctaaacacataacaacaataatacttgataaacaaaa 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||||| |||||  ||||| || |||||||||||||| ||||  ||||||    
T  24441697 taaaagtatatcaacacgtaattaaataaattttaaacttttggatgcaaaattcttcaatgtttaaactcaaaacaacaataatacatgat--acaaaa 24441794  T
Q  163 ttcgtgttaaactttttagagtaatctaagatacaataactcatttgttatactacaaataaatcattc 231  Q
    ||  ||||||||||||||||| ||||  ||| |||| ||||| |||| ||||||| || || |||||||    
T  24441795 ttattgttaaactttttagaggaatcatagacacaagaactcctttg-tatactagaagtatatcattc 24441862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 65 - 253
Target Start/End: Original strand, 39038303 - 39038485
Alignment:
Q  65 aaaagtatatcaacacgtaattaattaaattttagacatttggatacaaaattctccaatgctaaacacataacaacaataatacttgataaacaaaatt 164  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  |||  || |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  39038303 aaaaatatatcaacacgtaattaattaaattttaaacttttggatggaaa--tc-ccaatgttaaactcataacaacaataatacatgat--acaaaatt 39038397  T
Q  165 cgtgttaaactttttagagtaatctaagatacaataactcatttgttatactacaaataaatcattcatctttttatatgctataagta 253  Q
     |||||| ||||||||||| ||||  | ||| || ||||| |||| ||| ||| || || ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  39038398 agtgttagactttttagaggaatcgtatatagaaaaactcctttg-tatgctagaagtacatcattcctctttttatatgttataagta 39038485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 64 - 149
Target Start/End: Original strand, 8113540 - 8113625
Alignment:
Q  64 taaaagtatatcaacacgtaattaattaaattttagacatttggatacaaaattctccaatgctaaacacataacaacaataatac 149  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  8113540 taaaagtatatcaacatataattaactaaattttaaacttttggatgcaaaattctccaatgttaaactcataacaacaataatac 8113625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 308 - 343
Target Start/End: Original strand, 39038875 - 39038910
Alignment:
Q  308 caagattaagattaatttgtctagtaggcccatttt 343  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39038875 caagattaagattaatttatctagtaggcccatttt 39038910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 268 - 347
Target Start/End: Original strand, 28460185 - 28460266
Alignment:
Q  268 ctatattgatataatt-aatttattttggatactttcaagg-caagattaagattaatttgtctagtaggcccattttcaac 347  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||  |||| || | ||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  28460185 ctatattgatataatttaattttttttggaacctttaaaagacaatattaaaattaatttttctagtaagcccattttcaac 28460266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 347
Target Start/End: Original strand, 45446009 - 45446091
Alignment:
Q  264 attactatattgatataattaatttattttggatacttt-caaggcaagattaagattaatttgtctagtaggcccattttcaac 347  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| |||||||  ||||  |||  |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  45446009 attactatattgatataatt--ttttttttggaacctttgaaagaaaagattaaaattaatttctctagtaggccaattttcaac 45446091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 290; Significance: 1e-163; HSPs: 6)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 7850732 - 7850386
Alignment:
Q  1 attttagcacctaaatagtagacactgaatttttgaaatctaatgatagtaaaaccnnnnnnntaaaagtatatcaacacgtaattaattaaattttaga 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7850732 attttagcacctaaataatagacactgaatttttgacatctaatgatagtaaaaccaaaaaaataaaagtatatcaacacgtaattaattaaattttaga 7850633  T
Q  101 catttggatacaaaattctccaatgctaaacacataacaacaataatacttgataaacaaaattcgtgttaaactttttagagtaatctaagatacaata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7850632 catttggatacaaaattctccaatgctaaacacataacaacaataatacttgataaacaaaattagtgttaaattttttagagtaatctaagatacaata 7850533  T
Q  201 actcatttgttatactacaaataaatcattcatctttttatatgctataagtaccaagtttatattactatattgatataattaatttattttggatact 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7850532 actcatttgttatactacaaataaatcattcatctttttatatgctataagtaccaagtctatattactatattgatataattaatgtattttggatact 7850433  T
Q  301 ttcaaggcaagattaagattaatttgtctagtaggcccattttcaac 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||    
T  7850432 ttcaaggcaagattaagattaatttctccagtaggtccattttcaac 7850386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 38491464 - 38491118
Alignment:
Q  1 attttagcacctaaatagtagacactgaatttttgaaatctaatgatagtaaaaccnnnnnnntaaaagtatatcaacacgtaattaattaaattttaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38491464 attttagcacctaaatagtagacactgaatttttgacatctaatgataataaaatcaaaaaaataaaagtatatcaacacgtaattaattaaattttaga 38491365  T
Q  101 catttggatacaaaattctccaatgctaaacacataacaacaataatacttgataaacaaaattcgtgttaaactttttagagtaatctaagatacaata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  38491364 catttggatacaaaattctccaatgctaaacacacaacaacaataatacttgataaacaaaattagtgttaaatgttttagagtaatctaagatacaata 38491265  T
Q  201 actcatttgttatactacaaataaatcattcatctttttatatgctataagtaccaagtttatattactatattgatataattaatttattttggatact 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38491264 actcatttgttatactacaaataaatcattcatctttttataggctataagtaccaagtttatattactatattgatataattaatttattttgaatact 38491165  T
Q  301 ttcaaggcaagattaagattaatttgtctagtaggcccattttcaac 347  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38491164 ttcaaggaaagattaagattaatttatctagtaggcccattttcaac 38491118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 14651417 - 14651760
Alignment:
Q  1 attttagcacctaaatagtagacactgaatttttgaaatctaatgatagtaaaaccnnnnnnntaaaagtatatcaacacgtaattaattaaattttaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14651417 attttagcacctaaatagtagacagtgaatttgtgacatctaatgatagtaaaaccaaaaaaataaaagtatatcaacacgtaattaattaaattttaga 14651516  T
Q  101 catttggatacaaaattctccaatgctaaacacataacaacaataatacttgataaacaaaattcgtgttaaactttttagagtaatctaagatacaata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14651517 catttggatacaaaattctccaattttaaacccataacaacaataatacttgataaaaaaaat--gtgttaaattttttagagtaatctaagatacaata 14651614  T
Q  201 actcatttgttatactacaaataaatcattcatctttttatatgctataagtaccaagtttatattactatattgatataattaatttattttggatact 300  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14651615 actcatttgt-atactacaaataaatcattcctctttttatatgctacaagtaccaagtttatattactatattgatataattaatttattttggatact 14651713  T
Q  301 ttcaaggcaagattaagattaatttgtctagtaggcccattttcaac 347  Q
    || ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  14651714 ttaaaggcaatattaagattaatttttctaataggcccattttcaac 14651760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 64 - 249
Target Start/End: Original strand, 43171057 - 43171239
Alignment:
Q  64 taaaagtatatcaacacgtaattaattaaattttagacatttggatacaaaattctccaatgctaaacacataacaacaataatacttgataaacaaaat 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||| |||||||| | ||  |||||||    
T  43171057 taaaagtatatcaacacgtaattaactaaattttaaacttttggatgcaaaattctccaatgttaaactcgtaacaaaaataatacataat--acaaaat 43171154  T
Q  164 tcgtgttaaactttttagagtaatctaagatacaataactcatttgttatactacaaataaatcattcatctttttatatgctata 249  Q
    | |||||| ||||| ||||| ||||  | |||||| ||||| |||| || |||| || || ||||||| | |||||||||| ||||    
T  43171155 tagtgttagactttgtagaggaatcataaatacaagaactcctttg-tacactagaagtacatcattcctttttttatatgttata 43171239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 64 - 253
Target Start/End: Original strand, 5120565 - 5120752
Alignment:
Q  64 taaaagtatatcaacacgtaattaattaaattttagacatttggatacaaaattctccaatgctaaacacataacaacaataatacttgataaacaaaat 163  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||  |||||||||||||| ||  |  |||||||||||||||| |||||  ||||||    
T  5120565 taaaagtatatcaatacgtaattaattaaattttaaacttttggatgaaaaattctccaatgtta--cttataacaacaataatacatgata--caaaat 5120660  T
Q  164 tcgtgttaaactttttagagtaatctaagatacaataact---catttgttatactacaaataaatcattcatctttttatatgctataagta 253  Q
    | |||||| | |||||| || ||||  |||||||| ||||   ||||||| || ||| || || | ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  5120661 tagtgttagagtttttaaaggaatcatagatacaagaactgatcatttgt-atgctagaagtacaccattcctctttttatatgatataagta 5120752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 308 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 29789665 - 29789626
Alignment:
Q  308 caagattaagattaatttgtctagtaggcccattttcaac 347  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  29789665 caagattaagattaatttctctagtagacccattttcaac 29789626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 286; Significance: 1e-160; HSPs: 13)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 28509678 - 28509332
Alignment:
Q  1 attttagcacctaaatagtagacactgaatttttgaaatctaatgatagtaaaaccnnnnnnntaaaagtatatcaacacgtaattaattaaattttaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28509678 attttagcacctaaatagtagacactgaatttttgacatctaatgatagtaaaatcaaaaaaataaaagtatatcaacacgtaattaattaaattttaga 28509579  T
Q  101 catttggatacaaaattctccaatgctaaacacataacaacaataatacttgataaacaaaattcgtgttaaactttttagagtaatctaagatacaata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  28509578 catttggatacaaaattctccaatgctaaacacacaacaacaataatacttgataaacaaaattagtgttaaatgttttagagtaatctaagatacaata 28509479  T
Q  201 actcatttgttatactacaaataaatcattcatctttttatatgctataagtaccaagtttatattactatattgatataattaatttattttggatact 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28509478 actcatttgttatactacaaataaatcattcatctttttataggctataagtaccaagtttatattactatattgatataattaatttattttgaatact 28509379  T
Q  301 ttcaaggcaagattaagattaatttgtctagtaggcccattttcaac 347  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28509378 ttcaaggaaagattaagattaatttttctagtaggcccattttcaac 28509332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 6927234 - 6927558
Alignment:
Q  1 attttagcacctaaatagtagacactgaatttttgaaatctaatgatagtaaaaccnnnnnnntaaaagtatatcaacacgtaattaattaaattttaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6927234 attttagcacctaaatagtagacactgaatttttgacatctaatgatagtaaaatcaaaaaaataaaagtatatcaacacgtaattaattaaattttaga 6927333  T
Q  101 catttggatacaaaattctccaatgctaaacacataacaacaataatacttgataaacaaaattcgtgttaaactttttagagtaatctaagatacaata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  6927334 catttggatacaaaattctccaatgctaaacacacaacaacaataatacttgataaacaaaattagtgttaaatgttttagagtaatctaagatacaata 6927433  T
Q  201 actcatttgttatactacaaataaatcattcatctttttatatgctataagtaccaagtttatattactatattgatataattaatttattttggatact 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6927434 actcatttgttatactacaaataaatcattcatctttttataggctataagtaccaagtttatattactatattgatataattaatttattttggatact 6927533  T
Q  301 ttcaaggcaagattaagattaattt 325  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  6927534 ttcaaggaaagattaagattaattt 6927558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 28516885 - 28516593
Alignment:
Q  1 attttagcacctaaatagtagacactgaatttttgaaatctaatgatagtaaaaccnnnnnnntaaaagtatatcaacacgtaattaattaaattttaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28516885 attttagcacctaaatagtagacactgaatttttgacatctaatgatagtaaaatcaaaaaaataaaagtatatcaacacgtaattaattaaattttaga 28516786  T
Q  101 catttggatacaaaattctccaatgctaaacacataacaacaataatacttgataaacaaaattcgtgttaaactttttagagtaatctaagatacaata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  28516785 catttggatacaaaattctccaatgctaaacacacaacaacaataatacttgataaacaaaattagtgttaaatgttttagagtaatctaagatacaata 28516686  T
Q  201 actcatttgttatactacaaataaatcattcatctttttatatgctataagtaccaagtttatattactatattgatataattaatttatttt 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28516685 actcatttgttatactacaaataaatcattcatctttttataggctataagtaccaagtttatattactatattgatataattaatttatttt 28516593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 346
Target Start/End: Original strand, 11994391 - 11994734
Alignment:
Q  1 attttagcacctaaatagtagacactgaatttttgaaatctaatgatagtaaaaccnnnnnnntaaaagtatatcaacacgtaattaattaaattttaga 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11994391 attttagtacctaaatagtagacagtgaatttgggacatctaatgatagtaaaaccaaaaaaataaaagtatatcaacacgtaattaattaaattttaga 11994490  T
Q  101 catttggatacaaaattctccaatgctaaacacataacaacaataatacttgataaacaaaattcgtgttaaactttttagagtaatctaagatacaata 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11994491 cattttgatacaaaattctccaatgttaaacccataacaacaataatacttgataaaaaaaaat-gtgttaaaatttttagagtaatctaagatacaata 11994589  T
Q  201 actcatttgttatactacaaataaatcattcatctttttatatgctataagtaccaagtttatattactatattgatataattaatttattttggatact 300  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11994590 actcatttgt-atactacaaataaatcattcctcttcttatatgctacaagtaccaagtttatattactatattgatataattaaattattttggatact 11994688  T
Q  301 ttcaaggcaagattaagattaatttgtctagtaggcccattttcaa 346  Q
    || ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  11994689 ttaaaggcaatattaagattaatttttctaataggcccattttcaa 11994734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 2878881 - 2879237
Alignment:
Q  1 attttagcacctaaatagtagacactgaatttttgaaatctaatgatagtaaaaccnnnnnnntaaaagtatat----caacacgtaattaattaaattt 96  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||       || | ||||||    |||||||| |||||||||||||    
T  2878881 attttagcacttaaatagtagacactgaatttttgacatctaatgatagtaaaaccaaaaaaatagaggtatatatatcaacacgtcattaattaaattt 2878980  T
Q  97 tagacatttggatacaaaattctccaatgctaaacacataacaacaataatacttgataaacaaaa----ttcgtgttaaactttttagagtaatctaag 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    |   ||||| | ||||||||| ||||||||    
T  2878981 tagacatttggatacaaaattctccaatattaaactcataacaacaataatacttgataaaaaaaaaaaatcactgttagaatttttagagaaatctaag 2879080  T
Q  193 atacaataactcatttgt-----tatactacaaataaatcattcatctttttatatgctataagtaccaagtttatattactatattgatataattaatt 287  Q
    ||||||||||||||||||     |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2879081 atacaataactcatttgtaattgtatactacaaataaatcactcttctttttatatgctacaagtaccaagtttatattactatattgatataattaatt 2879180  T
Q  288 tattttggatactttcaaggcaagattaagattaatttgtctagtaggcccattttc 344  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2879181 tattttggatactttaaaggcaagattaagattaatttttctagtaggcccattttc 2879237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 64 - 253
Target Start/End: Original strand, 11648148 - 11648332
Alignment:
Q  64 taaaagtatatcaacacgtaattaattaaattttagacatttggatacaaaattctccaatgctaaacacataacaacaataatacttgataaacaaaat 163  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||  ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||  || ||||  |||||||    
T  11648148 taaaagtatatcaacacataattaattaaattttaaacttttggatgaaaaatactccaatgttaaactcataacaacaata--acatgat--acaaaat 11648243  T
Q  164 tcgtgttaaactttttagagtaatctaagatacaataactcatttgttatactacaaataaatcattcatctttttatatgctataagta 253  Q
    | |||||  ||| ||||||| ||||  |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  11648244 tagtgtttgactctttagaggaatcatagatacaataactcctttg-tatgctagaaatacatcattcctctttttataaactataagta 11648332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 167 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 24683232 - 24683137
Alignment:
Q  167 tgttaaactttttagagtaatctaagatacaataactcatttgttatactacaaataaatcattcatctttttatatgctataagtaccaagtttat 263  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  24683232 tgttagactttttagagtaatctaagatacaagaactcatttg-tatgctacaagtaaatcattcctctttttatatgctacaaataccaagtttat 24683137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 64 - 180
Target Start/End: Original strand, 602166 - 602280
Alignment:
Q  64 taaaagtatatcaacacgtaattaattaaattttagacatttggatacaaaattctccaatgctaaacacataacaacaataatacttgataaacaaaat 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||| ||  | |||||||    
T  602166 taaaagtatatcaacacgtaattaattaaattttaaacttttggatggaaaattctaaaatgttaaactcataacaacaataatacatg--acacaaaat 602263  T
Q  164 tcgtgttaaacttttta 180  Q
    | |||||| ||||||||    
T  602264 tagtgttagacttttta 602280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 264 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 24682802 - 24682741
Alignment:
Q  264 attactatattgatataattaatttattttggatactttcaaggcaagattaagattaattt 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  24682802 attactatattgatataattaatttatttttgatactttaaagacaagattaagattaattt 24682741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 64 - 149
Target Start/End: Original strand, 960719 - 960804
Alignment:
Q  64 taaaagtatatcaacacgtaattaattaaattttagacatttggatacaaaattctccaatgctaaacacataacaacaataatac 149  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || ||| ||| |||||||||| |||| ||||| ||| ||||||| |||||    
T  960719 taaaaatatatcaacacgtaattaattaaaatttaaactttttgatgcaaaattctctaatgttaaactcatcacaacaagaatac 960804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 121 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 35824273 - 35824208
Alignment:
Q  121 caatgctaaacacataacaacaataatacttgataaacaaaattcgtgttaaactttttagagtaatc 188  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  35824273 caatgttaaactcataacaacaataatacatgata--caaaattagtgttaaactttttagaggaatc 35824208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 157 - 247
Target Start/End: Original strand, 9381943 - 9382032
Alignment:
Q  157 acaaaattcgtgttaaactttttagagtaatctaagatacaataactcatttgttatactacaaataaatcattcatctttttatatgcta 247  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| ||||  |||||||| ||||| |||| |||| || || || ||||||| | |||||||||||||    
T  9381943 acaaaattagtgttagactttttagaggaatcatagatacaagaactcttttg-tatattagaagtacatcattcttatttttatatgcta 9382032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 267 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 32073422 - 32073358
Alignment:
Q  267 actatattgatataattaatttattttggatactttcaa-ggcaagattaagattaatttgtcta 330  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||| || | |||||||||||||||||| ||||    
T  32073422 actatgttgatataatttatttattttggaacctttgaacgacaagattaagattaatttctcta 32073358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 286; Significance: 1e-160; HSPs: 6)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 33516303 - 33516649
Alignment:
Q  1 attttagcacctaaatagtagacactgaatttttgaaatctaatgatagtaaaaccnnnnnnntaaaagtatatcaacacgtaattaattaaattttaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33516303 attttagcacctaaatagtagacactgaatttttgacatctaatgatagtaaaatcaaaaaaataaaagtatatcaacacgtaattaattaaattttaga 33516402  T
Q  101 catttggatacaaaattctccaatgctaaacacataacaacaataatacttgataaacaaaattcgtgttaaactttttagagtaatctaagatacaata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  33516403 catttggatacaaaattctccaatgctaaacacacaacaacaataatacttgataaacaaaattagtgttaaatgttttagagtaatctaagatacaata 33516502  T
Q  201 actcatttgttatactacaaataaatcattcatctttttatatgctataagtaccaagtttatattactatattgatataattaatttattttggatact 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33516503 actcatttgttatactacagataaatcattcatctttttataggctataagtaccaagtttatattactatattgatataattaatttattttggatact 33516602  T
Q  301 ttcaaggcaagattaagattaatttgtctagtaggcccattttcaac 347  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33516603 ttcaaggaaagattaagattaatttctctagtaggcccattttcaac 33516649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 14678154 - 14677810
Alignment:
Q  1 attttagcacctaaatagtagacactgaatttttgaaatctaatgatagtaaaaccnnnnnnntaaaagtatatcaacacgtaattaattaaattttaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||||||||||||       || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14678154 attttagcacctaaatagtaggcagtgaatttgtgacatctaatgatagtaaaaccaaaaaaatataagtatatcaatacgtaattaattaaattttaga 14678055  T
Q  101 catttggatacaaaattctccaatgctaaacacataacaacaataatacttgataaacaaaattcgtgttaaactttttagagtaatctaagatacaata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  14678054 catttggatacaaaattctccaatgttaaacccataacaacaataatacttgataaaaaaaaat-gtgttagaatttttagagtaatctaagatacaata 14677956  T
Q  201 actcatttgttatactacaaataaatcattcatctttttatatgctataagtaccaagtttatattactatattgatataattaatttattttggatact 300  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  14677955 actcatttgt-atactacaaataaatcattcctctttttatatgctacaagtacaaagtttatattactatattgatataattaatttatttatgatact 14677857  T
Q  301 ttcaaggcaagattaagattaatttgtctagtaggcccattttcaac 347  Q
    || ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  14677856 ttaaaggcaatattaagattaatttttctaataggcccattttcaac 14677810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 67 - 253
Target Start/End: Original strand, 11680511 - 11680694
Alignment:
Q  67 aagtatatcaacacgtaattaattaaattttagacatttggatacaaaattctccaatgctaaacacataacaacaataatacttgataaacaaaattcg 166  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |  ||| ||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||      
T  11680511 aagtatatcaacacgtaattaactaaattttaaagttttagatgcaaaattctccaatgttaaactcctaacaacaataatacttgat--acaaaattat 11680608  T
Q  167 tgttaaactttttagagtaatctaagatacaataactcatttgttatactacaaataaatcattcatctttttatatgctataagta 253  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||| ||| | | ||||||   |  ||||||| || || ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  11680609 tgttagacttttttgaggaatcttagacagagtaactc-cataatatactagaagtacatcattactctttttatatgctataagta 11680694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 64 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 1831131 - 1830948
Alignment:
Q  64 taaaagtatatcaacacgtaattaattaaattttagacatttggatacaaaattctccaatgctaaacacataacaacaataatacttgataaacaaaat 163  Q
    ||||| |||||||| ||||||||  | |||||||| || |||||||  |||||||||||||| |||||   | | ||||||||||| ||||  |||||||    
T  1831131 taaaaatatatcaatacgtaatttctaaaattttaaacttttggatggaaaattctccaatgttaaac---ttataacaataatacatgat--acaaaat 1831037  T
Q  164 tcgtgttaaactttttagagtaatctaagatacaataactcatttgttatactacaaataaatcattcatctttttatatgctataagta 253  Q
    | || ||| |||||||||||||||| |  |||||| | ||| |||| ||| ||| || |  |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1831036 tagttttagactttttagagtaatcaataatacaagagctcctttg-tatgctagaagtgcatcattcatctttttatatgttataagta 1830948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 71 - 155
Target Start/End: Original strand, 4064983 - 4065067
Alignment:
Q  71 atatcaacacgtaattaattaaattttagacatttggatacaaaattctccaatgctaaacacataacaacaataatacttgata 155  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||  ||||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  4064983 atatcaacacttaattaattaaattttagccttttggatgcataattctccaatattaaacccatagcaacaattatacttgata 4065067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 1831201 - 1831140
Alignment:
Q  70 tatatcaacacgtaattaattaaattttagacatttggatacaaaattctccaatgctaaac 131  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||| || |||||||  |||||||||||||| |||||    
T  1831201 tatataaacatgtaattaattatattttaaacttttggatcgaaaattctccaatgttaaac 1831140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0743 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 2)
Name: scaffold0743
Description:

Target: scaffold0743; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 2485 - 2690
Alignment:
Q  1 attttagcacctaaatagtagacactgaatttttgaaatctaatgatagtaaaaccnnnnnnntaaaagtatatcaacacgtaattaattaaattttaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||       ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2485 attttagcacctaaatagtagacactgaatttttgatatctaatgatagtaaaaccaaaaaaataaaagtatatcaacacataattaattaaattttaga 2584  T
Q  101 catttggatacaaaattctccaatgctaaacacataacaacaataatacttgataaacaaaattcgtgttaaactttttagagtaatctaagatacaata 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2585 catttggatacaaaattatccaatgttaaacacataacaacaataatacttcataaacaaaatttgtgttaaattttttagagtaatctaagatacaata 2684  T
Q  201 actcat 206  Q
    ||||||    
T  2685 actcat 2690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0743; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 211 - 347
Target Start/End: Original strand, 3190 - 3326
Alignment:
Q  211 tatactacaaataaatcattcatctttttatatgctataagtaccaagtttatattactatattgatataattaatttattttggatactttcaaggcaa 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3190 tatactacaaataaatcattcatctttttatatgctataagtaccaagtttatattactatattgatataattaatttattttggatactttcaaggcaa 3289  T
Q  311 gattaagattaatttgtctagtaggcccattttcaac 347  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  3290 gattaagtttaatttctctagtaggccaattttcaac 3326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0385 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0385
Description:

Target: scaffold0385; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 81 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 1015 - 910
Alignment:
Q  81 gtaattaattaaattttagacatttggatacaaaattctccaatgctaaacacataacaacaataatacttgataaacaaaattcgtgttaaacttttta 180  Q
    |||||||| ||||| ||| ||  |||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||| ||||||||    
T  1015 gtaattaactaaatattaaactattggatgcaaaattcaccaatgttaaactcataacaacaataatacatgat--acaaaattagtgttagacttttta 918  T
Q  181 gagtaatc 188  Q
    ||| ||||    
T  917 gaggaatc 910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1266 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1266
Description:

Target: scaffold1266; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 1477 - 1394
Alignment:
Q  264 attactatattgatataattaatttattttggatactttcaagg-caagattaagattaatttgtctagtaggcccattttcaac 347  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||  |||| || | | ||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||    
T  1477 attacaatattgatataatttatt-attttggaatctttgaaagactagattaagattaagttttctagtaggctcattttcaac 1394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0263 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0263
Description:

Target: scaffold0263; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 347
Target Start/End: Original strand, 18539 - 18622
Alignment:
Q  264 attactatattgatataattaatttattttggatactttcaagg-caagattaagattaatttgtctagtaggcccattttcaac 347  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| |||||||  |||| || | | ||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||    
T  18539 attacaatattgatataatttattt-ttttggaatctttgaaagactagattaagattaagttttctagtaggctcattttcaac 18622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 347
Target Start/End: Original strand, 98290 - 98373
Alignment:
Q  264 attactatattgatataattaatttattttggatactttcaagg-caagattaagattaatttgtctagtaggcccattttcaac 347  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| |||||||  |||| || | |||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||    
T  98290 attaatatattgatataatttattt-ttttggaatctttgaaagacaagattaagattaatttctctagcatgctcattttcaac 98373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University