View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF21555_low_1 (Length: 459)

Name: NF21555_low_1
Description: NF21555
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF21555_low_1
NF21555_low_1
[»] chr1 (68 HSPs)
chr1 (17-370)||(21053983-21054335)
chr1 (17-370)||(9987227-9987579)
chr1 (17-324)||(20622072-20622381)
chr1 (17-324)||(40282402-40282711)
chr1 (17-324)||(9036442-9036751)
chr1 (32-324)||(51765436-51765728)
chr1 (17-349)||(44203656-44203994)
chr1 (17-321)||(13316194-13316494)
chr1 (17-276)||(8550670-8550929)
chr1 (17-276)||(20762698-20762950)
chr1 (17-254)||(3189356-3189590)
chr1 (17-254)||(3198173-3198407)
chr1 (17-254)||(3207012-3207246)
chr1 (17-276)||(3156891-3157147)
chr1 (17-161)||(37168323-37168465)
chr1 (17-173)||(42297963-42298117)
chr1 (17-272)||(44455186-44455438)
chr1 (17-276)||(49918376-49918632)
chr1 (17-161)||(13549001-13549142)
chr1 (17-179)||(28220210-28220368)
chr1 (17-161)||(7482231-7482373)
chr1 (17-161)||(13547090-13547231)
chr1 (17-181)||(28265536-28265696)
chr1 (17-161)||(47255340-47255482)
chr1 (17-181)||(834149-834309)
chr1 (17-161)||(11348724-11348865)
chr1 (17-161)||(29136273-29136415)
chr1 (17-161)||(31925708-31925849)
chr1 (17-165)||(37033068-37033215)
chr1 (17-161)||(47115197-47115340)
chr1 (17-181)||(50169192-50169352)
chr1 (17-276)||(31659264-31659520)
chr1 (17-150)||(34603602-34603733)
chr1 (17-141)||(23555286-23555407)
chr1 (25-165)||(45644351-45644488)
chr1 (17-181)||(50167157-50167317)
chr1 (17-163)||(19754521-19754664)
chr1 (17-276)||(37503443-37503696)
chr1 (17-259)||(28223325-28223563)
chr1 (17-161)||(193637-193778)
chr1 (17-181)||(46064944-46065104)
chr1 (17-276)||(37559751-37560011)
chr1 (17-181)||(4552619-4552779)
chr1 (17-181)||(13659318-13659478)
chr1 (17-138)||(1833548-1833667)
chr1 (17-141)||(15820333-15820455)
chr1 (17-165)||(19752712-19752857)
chr1 (25-137)||(22079350-22079461)
chr1 (69-161)||(28242382-28242472)
chr1 (17-165)||(196904-197050)
chr1 (17-181)||(3847103-3847263)
chr1 (69-181)||(36683756-36683866)
chr1 (17-181)||(41360940-41361101)
chr1 (68-161)||(37876767-37876858)
chr1 (17-276)||(10925249-10925504)
chr1 (17-180)||(30476429-30476588)
chr1 (23-111)||(13938168-13938256)
chr1 (25-181)||(40122178-40122332)
chr1 (49-135)||(6808510-6808595)
chr1 (27-165)||(13137973-13138108)
chr1 (49-122)||(16455679-16455750)
chr1 (36-137)||(2926553-2926653)
chr1 (93-153)||(8871071-8871130)
chr1 (17-141)||(927996-928119)
chr1 (84-133)||(5459997-5460046)
chr1 (50-121)||(9109459-9109529)
chr1 (17-138)||(37282714-37282835)
chr1 (17-98)||(12318585-12318665)
[»] chr5 (54 HSPs)
chr5 (17-370)||(29720389-29720743)
chr5 (17-370)||(29722549-29722903)
chr5 (17-370)||(29750948-29751303)
chr5 (17-370)||(9789021-9789367)
chr5 (17-371)||(18441440-18441791)
chr5 (17-324)||(16409500-16409808)
chr5 (17-370)||(26177907-26178255)
chr5 (17-349)||(10593283-10593620)
chr5 (17-349)||(22536104-22536432)
chr5 (17-349)||(25078145-25078483)
chr5 (17-349)||(25136114-25136452)
chr5 (17-349)||(40380115-40380453)
chr5 (25-349)||(40382335-40382664)
chr5 (17-322)||(26170798-26171093)
chr5 (17-324)||(30182614-30182917)
chr5 (17-324)||(13343087-13343389)
chr5 (69-349)||(16544483-16544773)
chr5 (17-324)||(36073882-36074184)
chr5 (17-349)||(16546654-16546995)
chr5 (17-276)||(25412786-25413042)
chr5 (17-181)||(37439167-37439328)
chr5 (17-259)||(13239777-13240016)
chr5 (17-259)||(32636850-32637088)
chr5 (17-161)||(213491-213633)
chr5 (17-161)||(40147287-40147428)
chr5 (17-173)||(28278342-28278494)
chr5 (27-276)||(30682809-30683056)
chr5 (17-180)||(13488229-13488388)
chr5 (17-259)||(42428334-42428572)
chr5 (17-159)||(27637615-27637755)
chr5 (17-180)||(28750638-28750797)
chr5 (17-272)||(39468439-39468691)
chr5 (17-178)||(533795-533952)
chr5 (68-161)||(5058121-5058212)
chr5 (17-181)||(33831706-33831866)
chr5 (17-181)||(3075640-3075800)
chr5 (49-181)||(16452138-16452266)
chr5 (17-141)||(42426255-42426377)
chr5 (19-184)||(8565926-8566086)
chr5 (17-165)||(538051-538196)
chr5 (68-161)||(27015599-27015690)
chr5 (32-165)||(42309932-42310062)
chr5 (32-150)||(9049354-9049469)
chr5 (17-138)||(13695713-13695834)
chr5 (25-140)||(16640961-16641071)
chr5 (84-165)||(19806454-19806534)
chr5 (17-141)||(38747031-38747153)
chr5 (79-181)||(31183057-31183157)
chr5 (39-163)||(33906028-33906151)
chr5 (49-163)||(316820-316933)
chr5 (96-137)||(4160702-4160743)
chr5 (68-181)||(42926967-42927077)
chr5 (116-181)||(5887416-5887479)
chr5 (66-137)||(10700674-10700743)
[»] chr6 (47 HSPs)
chr6 (17-370)||(3072552-3072903)
chr6 (17-349)||(16653137-16653470)
chr6 (17-370)||(27647886-27648232)
chr6 (17-349)||(16554894-16555227)
chr6 (17-349)||(16578328-16578661)
chr6 (17-349)||(16616719-16617052)
chr6 (17-349)||(16631450-16631783)
chr6 (17-324)||(412126-412418)
chr6 (17-325)||(6097285-6097583)
chr6 (17-324)||(2171366-2171673)
chr6 (17-349)||(25421330-25421668)
chr6 (17-349)||(6027271-6027608)
chr6 (17-349)||(34167103-34167442)
chr6 (17-349)||(13153938-13154277)
chr6 (84-349)||(33341909-33342183)
chr6 (17-324)||(30834373-30834678)
chr6 (17-324)||(5413234-5413536)
chr6 (17-276)||(31404561-31404817)
chr6 (17-370)||(16452127-16452471)
chr6 (17-349)||(34164881-34165220)
chr6 (17-254)||(5406109-5406342)
chr6 (17-254)||(5410434-5410667)
chr6 (67-324)||(5408909-5409162)
chr6 (17-259)||(33160254-33160494)
chr6 (17-170)||(3808699-3808851)
chr6 (17-276)||(9182917-9183173)
chr6 (17-161)||(21588957-21589098)
chr6 (17-161)||(21593690-21593831)
chr6 (17-161)||(17763016-17763158)
chr6 (17-161)||(17758049-17758191)
chr6 (17-181)||(26954268-26954428)
chr6 (17-161)||(28137409-28137550)
chr6 (17-161)||(5043653-5043795)
chr6 (17-161)||(26830124-26830265)
chr6 (17-161)||(22424826-22424969)
chr6 (17-141)||(2972959-2973081)
chr6 (79-181)||(16569108-16569208)
chr6 (49-161)||(26800645-26800755)
chr6 (24-169)||(603081-603223)
chr6 (246-349)||(6136109-6136216)
chr6 (17-165)||(33211182-33211327)
chr6 (17-138)||(3038926-3039045)
chr6 (283-349)||(13159066-13159133)
chr6 (17-135)||(4045448-4045566)
chr6 (69-137)||(9572667-9572735)
chr6 (96-181)||(21356021-21356104)
chr6 (34-122)||(25073611-25073698)
[»] chr3 (74 HSPs)
chr3 (17-322)||(7779842-7780146)
chr3 (17-370)||(801116-801463)
chr3 (17-328)||(54635150-54635462)
chr3 (17-349)||(45283008-45283344)
chr3 (17-370)||(6716525-6716881)
chr3 (17-324)||(23199976-23200280)
chr3 (17-349)||(3617474-3617812)
chr3 (17-349)||(25637451-25637792)
chr3 (17-277)||(23197823-23198081)
chr3 (17-349)||(4600550-4600889)
chr3 (17-349)||(4598329-4598668)
chr3 (17-324)||(5257983-5258286)
chr3 (17-276)||(9636010-9636268)
chr3 (17-276)||(19683774-19684031)
chr3 (17-324)||(5260162-5260465)
chr3 (17-349)||(10211418-10211757)
chr3 (84-349)||(10209265-10209537)
chr3 (17-349)||(10056242-10056581)
chr3 (17-349)||(10058464-10058803)
chr3 (17-349)||(10060686-10061025)
chr3 (17-349)||(10062908-10063247)
chr3 (17-349)||(10065130-10065469)
chr3 (17-276)||(7764490-7764747)
chr3 (17-272)||(37408484-37408737)
chr3 (17-276)||(7762291-7762548)
chr3 (17-276)||(45095189-45095445)
chr3 (122-349)||(10067435-10067668)
chr3 (17-276)||(9581308-9581565)
chr3 (17-180)||(34491238-34491397)
chr3 (17-173)||(43401789-43401944)
chr3 (17-173)||(49199457-49199612)
chr3 (17-276)||(29810894-29811150)
chr3 (17-161)||(4569978-4570120)
chr3 (17-169)||(43403736-43403887)
chr3 (17-274)||(51398840-51399094)
chr3 (17-173)||(30236151-30236304)
chr3 (17-276)||(5236343-5236598)
chr3 (17-272)||(40735409-40735660)
chr3 (17-181)||(29196368-29196529)
chr3 (17-161)||(6095600-6095741)
chr3 (17-161)||(41819523-41819665)
chr3 (17-165)||(44331571-44331716)
chr3 (17-161)||(54593730-54593871)
chr3 (50-173)||(40913352-40913472)
chr3 (17-181)||(31314471-31314631)
chr3 (17-165)||(40734524-40734669)
chr3 (17-173)||(46173383-46173536)
chr3 (17-161)||(46860500-46860642)
chr3 (17-324)||(760873-761173)
chr3 (17-165)||(29813089-29813234)
chr3 (17-165)||(39153358-39153503)
chr3 (79-181)||(16499115-16499215)
chr3 (17-143)||(53921521-53921645)
chr3 (17-165)||(44700476-44700620)
chr3 (17-128)||(36018878-36018987)
chr3 (17-150)||(22835014-22835144)
chr3 (52-161)||(55301972-55302079)
chr3 (25-181)||(32744418-32744570)
chr3 (25-150)||(32891138-32891260)
chr3 (25-165)||(29682393-29682530)
chr3 (17-173)||(47304277-47304430)
chr3 (25-181)||(9666448-9666600)
chr3 (25-181)||(23391891-23392043)
chr3 (79-181)||(23410311-23410411)
chr3 (94-150)||(27305722-27305777)
chr3 (87-249)||(2074994-2075149)
chr3 (23-111)||(4055813-4055901)
chr3 (84-137)||(33191922-33191974)
chr3 (234-276)||(9634707-9634750)
chr3 (99-137)||(5433906-5433944)
chr3 (50-104)||(35138762-35138815)
chr3 (25-122)||(51352150-51352244)
chr3 (36-120)||(4075511-4075595)
chr3 (50-118)||(20937715-20937781)
[»] chr7 (70 HSPs)
chr7 (17-373)||(43503944-43504298)
chr7 (17-349)||(20343922-20344254)
chr7 (17-289)||(39731394-39731666)
chr7 (17-349)||(18388566-18388904)
chr7 (17-349)||(18392002-18392340)
chr7 (71-349)||(1560471-1560757)
chr7 (17-349)||(6594364-6594702)
chr7 (17-349)||(6592146-6592484)
chr7 (17-272)||(35853940-35854194)
chr7 (17-324)||(25766796-25767103)
chr7 (17-226)||(24789866-24790075)
chr7 (17-349)||(32060128-32060468)
chr7 (24-324)||(48408835-48409136)
chr7 (17-276)||(23555066-23555323)
chr7 (17-276)||(29991079-29991335)
chr7 (17-324)||(4178800-4179102)
chr7 (17-259)||(19502204-19502443)
chr7 (17-165)||(34310712-34310858)
chr7 (49-276)||(25615911-25616137)
chr7 (17-180)||(22269999-22270158)
chr7 (17-272)||(27347843-27348095)
chr7 (17-179)||(14069817-14069975)
chr7 (17-179)||(14379845-14380003)
chr7 (17-161)||(8359316-8359459)
chr7 (17-181)||(41317416-41317576)
chr7 (17-276)||(18126670-18126928)
chr7 (221-324)||(24790230-24790333)
chr7 (17-173)||(2390308-2390461)
chr7 (17-165)||(8153368-8153513)
chr7 (17-159)||(29608763-29608902)
chr7 (23-161)||(32358055-32358190)
chr7 (17-274)||(48489457-48489711)
chr7 (17-165)||(30024729-30024874)
chr7 (17-161)||(48599335-48599476)
chr7 (17-276)||(43864270-43864526)
chr7 (17-324)||(1113683-1113981)
chr7 (20-161)||(3259024-3259162)
chr7 (16-164)||(2759195-2759340)
chr7 (17-157)||(6431997-6432134)
chr7 (17-141)||(48491605-48491727)
chr7 (17-276)||(4586187-4586443)
chr7 (17-259)||(47676040-47676278)
chr7 (17-141)||(2360992-2361114)
chr7 (17-161)||(4508707-4508848)
chr7 (25-141)||(23565081-23565195)
chr7 (17-165)||(31732966-31733111)
chr7 (17-276)||(26417342-26417598)
chr7 (17-180)||(47673927-47674085)
chr7 (49-181)||(41648993-41649121)
chr7 (17-181)||(495965-496125)
chr7 (17-181)||(38671204-38671364)
chr7 (17-181)||(4253510-4253672)
chr7 (25-173)||(6359941-6360087)
chr7 (68-181)||(24525484-24525594)
chr7 (68-181)||(36146390-36146500)
chr7 (54-181)||(31518965-31519089)
chr7 (32-161)||(31105394-31105520)
chr7 (49-161)||(4510549-4510658)
chr7 (49-161)||(4512391-4512500)
chr7 (25-156)||(22328395-22328525)
chr7 (67-161)||(18396392-18396486)
chr7 (87-163)||(30814530-30814605)
chr7 (49-250)||(36574434-36574626)
chr7 (17-181)||(12097849-12098001)
chr7 (50-150)||(3904628-3904726)
chr7 (67-123)||(5116679-5116735)
chr7 (32-150)||(23344016-23344129)
chr7 (67-161)||(5513668-5513760)
chr7 (17-103)||(31518821-31518905)
chr7 (25-65)||(24525990-24526030)
[»] chr2 (48 HSPs)
chr2 (17-324)||(6266716-6267023)
chr2 (17-371)||(32289589-32289938)
chr2 (17-324)||(4484167-4484473)
chr2 (17-324)||(30833371-30833677)
chr2 (17-349)||(12647192-12647530)
chr2 (17-349)||(13655835-13656175)
chr2 (17-321)||(4502975-4503274)
chr2 (17-370)||(45099781-45100122)
chr2 (17-276)||(36987961-36988218)
chr2 (17-324)||(36205504-36205806)
chr2 (17-272)||(5723146-5723398)
chr2 (17-276)||(6594890-6595148)
chr2 (21-214)||(2334368-2334556)
chr2 (17-259)||(29867895-29868133)
chr2 (17-161)||(35446885-35447026)
chr2 (17-325)||(38312266-38312570)
chr2 (17-161)||(45726955-45727096)
chr2 (17-276)||(17057255-17057511)
chr2 (17-276)||(17085238-17085494)
chr2 (17-181)||(34139752-34139913)
chr2 (17-181)||(36773588-36773748)
chr2 (17-181)||(723726-723886)
chr2 (17-181)||(14633807-14633968)
chr2 (17-181)||(36317991-36318151)
chr2 (17-159)||(1631735-1631874)
chr2 (17-181)||(11067331-11067491)
chr2 (17-181)||(33162432-33162592)
chr2 (32-161)||(17490149-17490275)
chr2 (25-173)||(24398091-24398238)
chr2 (17-161)||(33648196-33648340)
chr2 (25-181)||(11151573-11151725)
chr2 (17-141)||(42362378-42362500)
chr2 (17-172)||(42288101-42288252)
chr2 (50-152)||(28671989-28672090)
chr2 (87-165)||(39284930-39285007)
chr2 (49-150)||(26353242-26353340)
chr2 (49-141)||(7451176-7451266)
chr2 (86-165)||(17450671-17450748)
chr2 (49-123)||(7815311-7815383)
chr2 (17-165)||(11690527-11690672)
chr2 (32-138)||(11049594-11049699)
chr2 (79-123)||(14202450-14202494)
chr2 (25-137)||(7597036-7597145)
chr2 (92-138)||(42412117-42412162)
chr2 (17-127)||(13121794-13121901)
chr2 (49-181)||(42019851-42019983)
chr2 (117-181)||(1345590-1345653)
chr2 (49-137)||(30218068-30218155)
[»] chr8 (57 HSPs)
chr8 (17-372)||(2627760-2628110)
chr8 (17-349)||(25689980-25690312)
chr8 (17-349)||(3439529-3439860)
chr8 (17-324)||(31218283-31218586)
chr8 (17-349)||(15290547-15290886)
chr8 (17-349)||(15470916-15471255)
chr8 (17-349)||(42575131-42575469)
chr8 (17-370)||(17982679-17983021)
chr8 (17-323)||(19945199-19945502)
chr8 (17-276)||(42498220-42498477)
chr8 (17-324)||(34254170-34254473)
chr8 (17-276)||(34256393-34256649)
chr8 (17-276)||(44303881-44304137)
chr8 (17-276)||(1746105-1746360)
chr8 (17-276)||(33352176-33352432)
chr8 (17-259)||(43036449-43036687)
chr8 (17-272)||(4731684-4731936)
chr8 (17-272)||(15212812-15213064)
chr8 (17-254)||(12702542-12702776)
chr8 (17-161)||(42434992-42435133)
chr8 (17-135)||(40328805-40328922)
chr8 (17-276)||(27811304-27811560)
chr8 (17-276)||(30143366-30143622)
chr8 (25-181)||(3303652-3303804)
chr8 (17-161)||(4283550-4283691)
chr8 (17-161)||(18655426-18655567)
chr8 (32-165)||(5689312-5689442)
chr8 (17-165)||(40221771-40221916)
chr8 (17-173)||(10930188-10930341)
chr8 (17-161)||(11384011-11384152)
chr8 (17-165)||(40321106-40321251)
chr8 (19-161)||(4162525-4162663)
chr8 (79-181)||(4743196-4743296)
chr8 (17-181)||(1345353-1345513)
chr8 (25-181)||(1292446-1292597)
chr8 (17-164)||(9765771-9765914)
chr8 (17-123)||(44353819-44353923)
chr8 (77-165)||(6599056-6599143)
chr8 (77-165)||(6674509-6674596)
chr8 (17-181)||(19491680-19491841)
chr8 (70-180)||(4733784-4733891)
chr8 (23-141)||(18141852-18141968)
chr8 (49-181)||(10015139-10015265)
chr8 (49-324)||(41366457-41366724)
chr8 (51-141)||(3073894-3073981)
chr8 (49-150)||(8153816-8153914)
chr8 (24-156)||(18106087-18106213)
chr8 (25-181)||(30291641-30291794)
chr8 (17-141)||(3772218-3772340)
chr8 (49-137)||(32902197-32902284)
chr8 (49-137)||(7597672-7597759)
chr8 (50-161)||(8965692-8965800)
chr8 (79-111)||(10929874-10929906)
chr8 (49-137)||(11712024-11712111)
chr8 (84-135)||(38863949-38864000)
chr8 (25-102)||(10240188-10240264)
chr8 (217-253)||(32902096-32902132)
[»] chr4 (68 HSPs)
chr4 (17-370)||(31495099-31495460)
chr4 (17-349)||(8395628-8395966)
chr4 (17-349)||(8393419-8393757)
chr4 (17-324)||(13992130-13992434)
chr4 (17-349)||(7124926-7125264)
chr4 (17-349)||(7122707-7123045)
chr4 (17-276)||(56178522-56178779)
chr4 (17-349)||(5136088-5136428)
chr4 (17-349)||(5138313-5138653)
chr4 (17-254)||(29999719-29999949)
chr4 (17-276)||(5369968-5370226)
chr4 (17-276)||(48143069-48143330)
chr4 (17-276)||(52095248-52095504)
chr4 (17-173)||(2209739-2209894)
chr4 (17-259)||(12743829-12744067)
chr4 (17-161)||(6655982-6656123)
chr4 (17-161)||(46703526-46703669)
chr4 (17-276)||(9927345-9927600)
chr4 (17-180)||(12745297-12745456)
chr4 (17-259)||(12739454-12739692)
chr4 (17-272)||(34570304-34570556)
chr4 (17-158)||(41964441-41964580)
chr4 (17-173)||(26364262-26364415)
chr4 (17-180)||(26175619-26175778)
chr4 (17-181)||(46147373-46147533)
chr4 (17-173)||(50262689-50262843)
chr4 (17-272)||(37740651-37740903)
chr4 (20-276)||(52082549-52082796)
chr4 (32-161)||(50673848-50673974)
chr4 (17-161)||(8648165-8648306)
chr4 (17-141)||(8665434-8665556)
chr4 (17-161)||(41639452-41639593)
chr4 (17-173)||(54883046-54883199)
chr4 (17-181)||(48893620-48893784)
chr4 (17-161)||(12073418-12073560)
chr4 (17-121)||(12744087-12744189)
chr4 (17-121)||(12745476-12745578)
chr4 (17-165)||(27416962-27417107)
chr4 (17-165)||(36463386-36463531)
chr4 (17-161)||(40632471-40632612)
chr4 (25-181)||(45687164-45687316)
chr4 (17-181)||(47038393-47038552)
chr4 (17-150)||(35662467-35662597)
chr4 (17-161)||(379406-379548)
chr4 (17-272)||(5429705-5429957)
chr4 (17-123)||(12747794-12747898)
chr4 (25-181)||(6542161-6542313)
chr4 (25-173)||(12119573-12119719)
chr4 (49-181)||(31474209-31474337)
chr4 (17-141)||(54199926-54200048)
chr4 (17-163)||(36994550-36994693)
chr4 (17-150)||(37229733-37229865)
chr4 (79-259)||(29254580-29254758)
chr4 (17-178)||(5871846-5872003)
chr4 (17-161)||(5207843-5207985)
chr4 (17-173)||(21688275-21688428)
chr4 (17-181)||(52467336-52467496)
chr4 (25-156)||(26699447-26699577)
chr4 (49-141)||(4588017-4588107)
chr4 (79-141)||(13009464-13009526)
chr4 (49-137)||(33989902-33989989)
chr4 (25-111)||(24969146-24969230)
chr4 (67-161)||(51337139-51337231)
chr4 (79-123)||(3913534-3913578)
chr4 (67-135)||(33089953-33090021)
chr4 (17-161)||(5349936-5350076)
chr4 (50-135)||(37754986-37755070)
chr4 (52-137)||(21703860-21703943)
[»] scaffold0491 (2 HSPs)
scaffold0491 (17-324)||(10998-11304)
scaffold0491 (17-279)||(8616-8878)
[»] scaffold0565 (1 HSPs)
scaffold0565 (17-349)||(2410-2748)
[»] scaffold0674 (1 HSPs)
scaffold0674 (17-331)||(3551-3870)
[»] scaffold0286 (1 HSPs)
scaffold0286 (17-324)||(11583-11895)
[»] scaffold0137 (1 HSPs)
scaffold0137 (17-349)||(6297-6637)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (17-324)||(434559-434863)
[»] scaffold1519 (1 HSPs)
scaffold1519 (17-278)||(942-1200)
[»] scaffold1808 (1 HSPs)
scaffold1808 (129-331)||(1-208)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (17-272)||(114628-114881)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (17-161)||(18004-18145)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (17-276)||(20301-20557)
[»] scaffold0466 (1 HSPs)
scaffold0466 (17-161)||(7353-7494)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (17-181)||(149079-149239)
[»] scaffold0236 (1 HSPs)
scaffold0236 (49-161)||(10547-10656)
[»] scaffold0219 (1 HSPs)
scaffold0219 (49-161)||(27442-27553)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (17-106)||(80338-80425)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (50-101)||(25112-25162)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 280; Significance: 1e-156; HSPs: 68)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 17 - 370
Target Start/End: Original strand, 21053983 - 21054335
Alignment:
Q  17 aattagggtt-gttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttca 115  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  21053983 aattagggtttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgcaacc--ttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtaca 21054080  T
Q  116 atctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgt 215  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21054081 aactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgt 21054180  T
Q  216 attgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcacatactttgtttggtggttaccactctcctttgctcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21054181 attgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcacacacttagtttggtggttaccactctcctttgctcc 21054280  T
Q  316 acacatcattattcttgtattggcgtggttcgatttgagatcggaattcacaaca 370  Q
    |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21054281 acacatcatatttcttgtattggtgtggttcgatttgagatcggaattcacaaca 21054335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 17 - 370
Target Start/End: Original strand, 9987227 - 9987579
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||   ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9987227 aattagggttgttcattgtgaacttgtctaatctaatttcttgcaacc--ttttgtatcccttttgcaagaactcattgatagtggattggagagtacaa 9987324  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtcttt-gttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgt 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9987325 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtcttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgt 9987424  T
Q  216 attgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcacatactttgtttggtggttaccactctcctttgctcc 315  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9987425 atagtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcacacactttgattggtggttaccactctcctttgctcc 9987524  T
Q  316 acacatcattattcttgtattggcgtggttcgatttgagatcggaattcacaaca 370  Q
    |||||||||  || | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9987525 acacatcatatttttcgtattggtgtggttcgatttgagatcggaattcacaaca 9987579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 17 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 20622381 - 20622072
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | |  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  20622381 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaa 20622282  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgta 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20622281 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgta 20622182  T
Q  217 ttgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttg--cacatactttgtttggtggttaccactctcctttgctc 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  20622181 ttgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcacacacactttgtttggtggttactactttcctttgctc 20622082  T
Q  315 cacacatcat 324  Q
    ||||||||||    
T  20622081 cacacatcat 20622072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 17 - 324
Target Start/End: Original strand, 40282402 - 40282711
Alignment:
Q  17 aattagggtt-gttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttca 115  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  40282402 aattagggttagttcattgtgaacttgtctaatctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtaca 40282499  T
Q  116 atctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgt 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40282500 atctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgt 40282599  T
Q  216 attgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttg--cacatactttg-tttggtggttaccactctcctttgc 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40282600 attgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcacacacactttgttttggtggttaccactctcctttgc 40282699  T
Q  313 tccacacatcat 324  Q
    ||||||||||||    
T  40282700 tccacacatcat 40282711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 17 - 324
Target Start/End: Original strand, 9036442 - 9036751
Alignment:
Q  17 aattagggtt-gttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttca 115  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||    
T  9036442 aattagggtttgttcattgtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattgaagagtaca 9036538  T
Q  116 atctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctcct--tttatcttgtgattgt 213  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  9036539 atctctcctcgagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtatttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgt 9036638  T
Q  214 gtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcac--atactttgtttggtggttaccactctcctttg 311  Q
    |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9036639 gctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttgttgcttgcacaaacactttgtttggtggttaccactctccttag 9036738  T
Q  312 ctccacacatcat 324  Q
    |||||||||||||    
T  9036739 ctccacacatcat 9036751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 32 - 324
Target Start/End: Original strand, 51765436 - 51765728
Alignment:
Q  32 ttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 131  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51765436 ttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccccttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 51765535  T
Q  132 aggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcac-t 230  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| || |||| |    
T  51765536 aggacaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtctttgttttcctcttccctctccttttatcttgtgcttgtggtttgtgcttttcactt 51765634  T
Q  231 tgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttgcacatactttgtttggtggttaccactctcctttgctccacacatcat 324  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  || ||  || |||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  51765635 tgtttcctagattagatctaggtgttgttattgttgattattgcttgcactcac-ttaattagtggttactactttcctttgctccacacatcat 51765728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 17 - 349
Target Start/End: Original strand, 44203656 - 44203994
Alignment:
Q  17 aattagggtt-gttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagtt 113  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||   | ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||     
T  44203656 aattagggtttgttcatagtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacc--tcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagta 44203752  T
Q  114 caatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtct-ttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattg 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44203753 caatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctccttgtatcttgtgattg 44203852  T
Q  213 -tgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcac---atactttgtttggtggttaccactctcct 308  Q
     ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||     
T  44203853 ttgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcacaataaactttgtttggtggttaccactctccg 44203952  T
Q  309 ttgctccacacatcattattc-ttgtattggcgtggttcgat 349  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  44203953 tcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgat 44203994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 17 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 13316494 - 13316194
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13316494 aattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccctttt-gtatctctttgg-aagaactcattgatagtggattggagagttcaa 13316397  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgta 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||  |||||||   ||||  |||||||||||| || || |||||      
T  13316396 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttagtgagtttgtttctctctt--ctctccttttatattttgcttgtggt 13316300  T
Q  217 ttgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttgcacatactttgtttggtggttaccactctcctttgctc 314  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||   |||||| ||  || |||| ||| ||||||||||    
T  13316299 ttgtgtttttcactttgattcctagattagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttg-ttattgattactactttcctttgctc 13316201  T
Q  315 cacacat 321  Q
    |||||||    
T  13316200 cacacat 13316194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 17 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 8550929 - 8550670
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    ||||||| |||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8550929 aattaggtttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaactcattt-gtatcccttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaa 8550832  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttct-tcttccctctccttttatcttgtgattgtg- 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| | ||||  ||||||||||| |||||     
T  8550831 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgttttctctctt-cttctctctttatcttgtgcttgtga 8550734  T
Q  215 tattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttg 276  Q
    | |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  8550733 ttttgtgtttttcactttgattcctagattagatctaggtgttgttattgttgattattgcttg 8550670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 17 - 276
Target Start/End: Original strand, 20762698 - 20762950
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20762698 aattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccctttt-gtatctcttc-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaa 20762795  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgt-gt 215  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||| |||||||   ||||  ||||||||||||||| || |||| ||    
T  20762796 tctctcctacagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatct-ttggtgtgtttgtttctctctt--ctctccttttatcttttgcttgtggt 20762892  T
Q  216 attgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttg 276  Q
     ||||| || ||||    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  20762893 tttgtgcttttcac----ttcctagattagatctaggtgctgttattgttgattattgcttg 20762950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Original strand, 3189356 - 3189590
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  || |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3189356 aattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcctgtaactctttt-gtatct-ttttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaa 3189453  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgt-gt 215  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||   ||||  ||||||||||||||| || |||| ||    
T  3189454 tctctcatccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgtttctctctt--ctctccttttatcttttgcttgtggt 3189550  T
Q  216 attgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtg 254  Q
     ||||| || |||| ||| || ||||||||||||||||||    
T  3189551 tttgtgcttttcactttgattactagattagatctaggtg 3189590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Original strand, 3198173 - 3198407
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  || |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3198173 aattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcctgtaactctttt-gtatct-ttttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaa 3198270  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgt-gt 215  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||   ||||  ||||||||||||||| || |||| ||    
T  3198271 tctctcatccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgtttctctctt--ctctccttttatcttttgcttgtggt 3198367  T
Q  216 attgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtg 254  Q
     ||||| || |||| ||| || ||||||||||||||||||    
T  3198368 tttgtgcttttcactttgattactagattagatctaggtg 3198407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Original strand, 3207012 - 3207246
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  || |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3207012 aattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcctgtaactctttt-gtatct-ttttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaa 3207109  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgt-gt 215  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||   ||||  ||||||||||||||| || |||| ||    
T  3207110 tctctcatccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgtttctctctt--ctctccttttatcttttgcttgtggt 3207206  T
Q  216 attgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtg 254  Q
     ||||| || |||| ||| || ||||||||||||||||||    
T  3207207 tttgtgcttttcactttgattactagattagatctaggtg 3207246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 17 - 276
Target Start/End: Original strand, 3156891 - 3157147
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3156891 aattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccattt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaa 3156988  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtg-t 215  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||    |||||  ||||| |||||||| || ||||| |    
T  3156989 tctctcccccatattaggtcaagtt-ggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttcctctcttc--tctccctttatcttttgcttgtggt 3157084  T
Q  216 attgtgtttctcactt-gtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttg 276  Q
     ||||| || |||||| | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  3157085 tttgtgcttttcactttgattcctagattagatctaggtgctgttattgttgattattgcttg 3157147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 17 - 161
Target Start/End: Original strand, 37168323 - 37168465
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37168323 aattagggttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaa 37168421  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaaca 161  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  37168422 tctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 37168465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 17 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 42298117 - 42297963
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||  |||||| |||||  || ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  42298117 aattagggttgttttttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcattt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattgaagagatcaa 42298020  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgt 173  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42298019 tctctcctccagagtaggtcatggttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgt 42297963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 272
Target Start/End: Original strand, 44455186 - 44455438
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44455186 aattagggttgttctttgtgaacttgttgaaactaatttcttgtaactcattt-gtatct-ttttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaa 44455283  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgt-gt 215  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||| ||||||| ||||  ||| |||   |||| | |||||||| || || | ||    
T  44455284 tctctcccccagattaggtcaagttt-gaccgaactgggtcaacgatct-ttggtgtgtttg--ttcctctcttctcttcctttatcttttgcttttggt 44455379  T
Q  216 attgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattg 272  Q
     |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  44455380 tttgtgtttttcactttgattcctagattagatctaggtgctgttattgttgattattg 44455438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 276
Target Start/End: Original strand, 49918376 - 49918632
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  49918376 aattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccattt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaa 49918473  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgta 216  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||| ||||||    |||||  |||||||||||||| || ||||| |    
T  49918474 tctctcccccaaattaggtcaagtt-ggaccgaactaggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttcctctcttc--tctccttttatcttttgcttgtgga 49918569  T
Q  217 tt-gtgtttctcactt-gtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttg 276  Q
    || ||| || ||| || | |||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||    
T  49918570 tttgtgcttttcattttgattcctagattagatataggtgctgttattgttgattattgcttg 49918632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 13549142 - 13549001
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||| ||| |||||||| |||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13549142 aattagggttgttctttgtgagcttgttaaacctaatttcatgtaacccattt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaa 13549045  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaaca 161  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  13549044 tctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 13549001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 28220368 - 28220210
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28220368 aattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccattt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaa 28220271  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgt 179  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  28220270 tctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgt 28220210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 17 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 7482373 - 7482231
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  7482373 aattagggttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtgaattggagagatcaa 7482275  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaaca 161  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||||||    
T  7482274 tctctccttcagagtaggtcaag-ttggaccgaactaggtgaaca 7482231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 17 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 13547231 - 13547090
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||  || ||| ||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13547231 aattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctattttcttgtaacccattt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaa 13547134  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaaca 161  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  13547133 tctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 13547090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 17 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 28265696 - 28265536
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  28265696 aattagggttgttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccattt-gtatctcttt-gtaagaactctttgatagtggattggagagatcaa 28265599  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttt 181  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  28265598 tctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 28265536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 17 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 47255482 - 47255340
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  47255482 aattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccattt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaa 47255385  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaaca 161  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||    
T  47255384 tctctcctccagagtaggtcattgttggaccgaactgggtgaaca 47255340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 834309 - 834149
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||| | ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  834309 aattagggttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccattt-gtatcccttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcta 834212  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttt 181  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  834211 tctctcccccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 834149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 161
Target Start/End: Original strand, 11348724 - 11348865
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11348724 aattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccattt-gtatctctttc-taagaactcattgatagtggattggagagatcaa 11348821  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaaca 161  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||    
T  11348822 tctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgagtgaaca 11348865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 161
Target Start/End: Original strand, 29136273 - 29136415
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||  || ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  29136273 aattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttggaacccattt-gtatttcttt-gtaagaactcattgatcgtggattggagagatcaa 29136370  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaaca 161  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  29136371 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaaca 29136415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 31925849 - 31925708
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||  || ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31925849 aattagggatgttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccattt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaa 31925752  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaaca 161  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||    
T  31925751 tctctcctctagagtaggtcaag-ttggaccgaactaggtgaaca 31925708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 37033215 - 37033068
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||  | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  37033215 aattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaatccattttgcatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagattaa 37033117  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatct 165  Q
    ||||| ||||| ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||    
T  37033116 tctcttctccatagtaggtcatggttggaccgaactgggtgaacaatct 37033068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 161
Target Start/End: Original strand, 47115197 - 47115340
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  47115197 aattagggttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaaaaacccattgatagtggattggagagatcaa 47115295  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaaca 161  Q
    ||||| |||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||    
T  47115296 tctctgctccagagtaggtcattgttggaccgaactgggtgaaca 47115340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 50169352 - 50169192
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  50169352 aattagggttgttctttgtgagcttgtcaaagctaatttcttgtaactcattt-gtatctcttt-gtaagtactcattgatagtggattgaagagatcaa 50169255  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttt 181  Q
    ||||||| | ||| ||||||||| |||||||||| ||| | |||||||| ||||||| |||||||    
T  50169254 tctctcccctagattaggtcaag-ttggaccgaactggatcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 50169192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 276
Target Start/End: Original strand, 31659264 - 31659520
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  31659264 aattagggctgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccattt-gtatctcttt-gtaagaacttattgatagtggattggagagatcaa 31659361  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgt-gt 215  Q
    |||||||  |||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||  | ||| ||||  ||||||||||||||| || || | ||    
T  31659362 tctctccctcagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtt--tattcctcttttctctccttttatcttttgcttatggt 31659457  T
Q  216 attgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttg 276  Q
     ||||| || | || ||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  31659458 tttgtgctttttactttgattcctagattagatcaaggtgttgttattgttgattattgcttg 31659520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 17 - 150
Target Start/End: Original strand, 34603602 - 34603733
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  34603602 aattagggttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccattttttatctcttt-gtaagaactcattgatggtggattgaagagatcaa 34603700  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaa 150  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34603701 tctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaa 34603733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 17 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 23555407 - 23555286
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  || |||||||||| |||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23555407 aattagggttgttctttgtgaacttgttgaaactaatttcttataactcattt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 23555310  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtt 141  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||    
T  23555309 tctctcc-ccatagtaggtcaagtt 23555286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 25 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 45644488 - 45644351
Alignment:
Q  25 ttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcct 124  Q
    |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||     
T  45644488 ttgttctttgtgagcttgtcaaagctaatttcttgcaactcattt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatatctccc 45644391  T
Q  125 ccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatct 165  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  45644390 ccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 45644351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 17 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 50167317 - 50167157
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  50167317 aattagggttgttatttgtgagcttgtcaaagctaatttcttgtaacccattt-gtatctcttt-gtaaaaactcattgatagtggattggagagatcaa 50167220  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttt 181  Q
    ||||||| ||||| ||| ||||| |||||||||| | ||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  50167219 tctctcccccagattagctcaag-ttggaccgaactaggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 50167157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 17 - 163
Target Start/End: Original strand, 19754521 - 19754664
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19754521 aattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaac-cgatttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaa 19754618  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaat 163  Q
    |||||||  |||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  19754619 tctctccctcagattaggtcaag-ttggaccgaagtgggtcaacaat 19754664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 17 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 37503696 - 37503443
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||||     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37503696 aattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaac----cttgtatctc-tttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaa 37503602  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattg-tgt 215  Q
    ||||||| ||||| || |||||| ||||| |||| | ||| |||||||| ||||||| ||||  ||| |||   |||||| |||||||| || |||  ||    
T  37503601 tctctcccccagattatgtcaag-ttggatcgaactaggtcaacaatct-ttggtgtgtttg--ttcctctcttctctccctttatcttttgcttgcggt 37503506  T
Q  216 attgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtg-ttttgttgattattgcttg 276  Q
     ||||| || |||| ||  ||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||    
T  37503505 tttgtgcttttcactttaattcctagattagatctaggtgttgatattgttgattattgcttg 37503443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 28223563 - 28223325
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    ||||| ||||| || || |||||||||  || ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28223563 aattatggttgatctttctgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccattt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaa 28223466  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtg-t 215  Q
    ||||||| ||| | ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||  | | |||   |||||| |||||||| || ||||| |    
T  28223465 tctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttg--tccctctcttctctccctttatcttttgcttgtgat 28223370  T
Q  216 attgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt 259  Q
     |||||||| |||| ||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  28223369 tttgtgtttttcactttgattactagattagatctaggtgttgtt 28223325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 161
Target Start/End: Original strand, 193637 - 193778
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| || | | |||||  || ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  193637 aattagggttgttctttattagcttgttgaagctaatttcttgtaactcattt-gtatctcttt-gtaataactcattgatagtggattggagagatcaa 193734  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaaca 161  Q
    ||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  193735 tctcttctccagagtatgtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 193778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 181
Target Start/End: Original strand, 46064944 - 46065104
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    ||||||| |||||| |||||| || ||  || ||||||||||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  46064944 aattaggtttgttctttgtgagctcgttgaagctaatttcttgtaactcatgt-gtatctcttt-gtaagaactcattcatagtggattggagagatcaa 46065041  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttt 181  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  46065042 tctctcccccagagtaggtcaag-ttggatcgaactgggtaaacaatct-ttggtgtgtttgttt 46065104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 17 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 37560011 - 37559751
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtc-aaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttca 115  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| |||    
T  37560011 aattagagttgttctttgtgaacttgttgaaagctaatttcttgtaacccattt-gtatctcttt-gtaagaactcgttgatagtgaattggagagatca 37559914  T
Q  116 atctctcctcc-agagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgt- 213  Q
    |||||||| || ||| ||||||||| |||||||||| | ||| |||||||| ||||||| ||||||    ||||| ||| || |||||||| || ||||     
T  37559913 atctctccccctagattaggtcaag-ttggaccgaacttggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttcctctcttctctc-ccctttatcttttgcttgtg 37559817  T
Q  214 gtattgtgtttctcac-ttgtttcctaga-ttagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttg 276  Q
    || ||||| || |||| ||| |||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  37559816 gttttgtgcttttcactttgattcctagatttagatctaggtgctgttattgttgattattgcttg 37559751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 4552779 - 4552619
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    ||||||| |||| | |||||| |||||  || ||||||||||||||| | ||| ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  4552779 aattaggtttgtcctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaaccccttt-gtatcccttt-gtaagaactcattgataatggattggagagatcaa 4552682  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttt 181  Q
    |||||||  |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  4552681 tctctccctcagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 4552619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 13659478 - 13659318
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||  |||| | |||||  || |||||||||||| || | |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13659478 aattagggttgttttttgtaagcttgttgaagctaatttcttgttacccattta-tatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaa 13659381  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttt 181  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  13659380 tctctcccccagagtaggttaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtatttgttt 13659318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 17 - 138
Target Start/End: Original strand, 1833548 - 1833667
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||||  | |  || |||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1833548 aattagggttgttctttgtgaatctattgaagctaaattcttgtaactcattt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaa 1833645  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaa 138  Q
    ||||||| ||||| ||||||||    
T  1833646 tctctccaccagattaggtcaa 1833667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 17 - 141
Target Start/End: Original strand, 15820333 - 15820455
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    ||||||| |||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| | ||    
T  15820333 aattaggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacacattt-gtatctctttt-taagaactcattgatagtgcattgaagagataaa 15820430  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtt 141  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  15820431 tctctcatccagagtaggtcaagtt 15820455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 17 - 165
Target Start/End: Original strand, 19752712 - 19752857
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||  || ||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  19752712 aattagggttgttctttgcgagcttgttgaagctaatttcttgtaac-cgatttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagaggattggagagatcaa 19752809  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatct 165  Q
    ||||||  ||| | ||||||||| |||||||||| | ||| ||||||||    
T  19752810 tctctctcccatattaggtcaag-ttggaccgaactaggtcaacaatct 19752857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 25 - 137
Target Start/End: Original strand, 22079350 - 22079461
Alignment:
Q  25 ttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcct 124  Q
    |||||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||    
T  22079350 ttgttctttgtgagcttgttaaagctaatttcttgtaac-cattttgtatctctttgtaaagaactcattgatattggattggagagatcaatttctcct 22079448  T
Q  125 ccagagtaggtca 137  Q
    ||| |||||||||    
T  22079449 ccaaagtaggtca 22079461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 69 - 161
Target Start/End: Original strand, 28242382 - 28242472
Alignment:
Q  69 ttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaaca 161  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||    
T  28242382 ttgtatctcttt-gtaagaactcatt-atagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccgaactgggtgaaca 28242472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 197050 - 196904
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||  ||  |||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  |    
T  197050 aattagggttgttctttgtgagcttgtttaagttaatttcttgtaactcattt-gtatcccttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagattta 196953  T
Q  117 tctct-cctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatct 165  Q
    ||||| || ||||| ||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||    
T  196952 tctctccccccagattaggtcaag-ttggaccgaactggatcaacaatct 196904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 3847263 - 3847103
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||||  || |||| || ||||||| | ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  3847263 aattagggttgttctttgtgagtttgtttaagctaaatttttgtaacccattt-gtatcccttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcca 3847166  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttt 181  Q
    ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| | ||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  3847165 tctcttccccagattaggtcaag-ttggaccgaacttggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 3847103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 69 - 181
Target Start/End: Original strand, 36683756 - 36683866
Alignment:
Q  69 ttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctctt 168  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| || || ||| |||||||    
T  36683756 ttgtaactcatttgtaagaactcattgatagtggattgtagaaatcaatctctcccccagagtaggtcaag-ttagaccgaactgagtaaac-atctctt 36683853  T
Q  169 ggtgtctttgttt 181  Q
    ||||| |||||||    
T  36683854 ggtgtgtttgttt 36683866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 181
Target Start/End: Original strand, 41360940 - 41361101
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    ||||||| |||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||| ||||    
T  41360940 aattaggtttgttctttgtgagcttgttgaaactaatttcttgtaacccattt-gtatctcttt-gtaagaactcgttgatagtggattaaagagatcaa 41361037  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttt 181  Q
    | ||||| ||| |||||||| |  |||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  41361038 tatctcccccatagtaggtc-atattggaccgaactaggtcaacaatatcttggtgtgtttgttt 41361101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 68 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 37876858 - 37876767
Alignment:
Q  68 tttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaaca 161  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  37876858 tttgtatctcttt-gtaataactcattgatagtggattgcagagatcaatctctcctccagagtacatcaag-ttgaaccgaactgggtgaaca 37876767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 17 - 276
Target Start/End: Original strand, 10925249 - 10925504
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaac---tcattgatagtggattggagagtt 113  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||    |||||||||||||||||||||  |    
T  10925249 aattatggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcattt-gtatctcttt-gtaagaagaattcattgatagtggattggagaaat 10925346  T
Q  114 caatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgt 213  Q
    |||||||||| | ||| ||||| ||| ||||| |||| ||||| |||||||| ||| ||| |||||||   ||||| |||    |||||||| || ||||    
T  10925347 caatctctcccctagattaggtaaag-ttggatcgaactgggtcaacaatct-ttgatgtgtttgttt--atcttctctc----tttatcttttgcttgt 10925438  T
Q  214 -gtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttg 276  Q
     || ||| |||| || | ||| || |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  10925439 ggttttgagtttttccctttgattactagattagatctaggtgttgttattgttgattattgcttg 10925504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 30476588 - 30476429
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| || |||||||||  ||  |||||| ||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||    
T  30476588 aattagggttgttctttatgaacttgttgaagataatttattgtaacccattt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatactggattggacagatcaa 30476491  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgtt 180  Q
    ||||| | ||| |  |||| ||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  30476490 tctctaccccatatgaggttaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgtt 30476429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 23 - 111
Target Start/End: Original strand, 13938168 - 13938256
Alignment:
Q  23 ggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaag-aactcattgatagtggattggagag 111  Q
    |||||||| | | |||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13938168 ggttgttcttggagaacttgtaaaatataatttcttgtaaccttttttgtatctc-tttgtaagaaactcattgatagtggattggagag 13938256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 25 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 40122332 - 40122178
Alignment:
Q  25 ttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgata--gtggattggagagttcaatctctc 122  Q
    |||||| |||||| |||||  || |||||||||| |||||| ||| ||||| |||| |||||||||| ||||||  ||||||| ||||| ||||||||||    
T  40122332 ttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttataactcattt-gtatcacttt-gtaagaactctttgatatagtggattagagagatcaatctctc 40122235  T
Q  123 ctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttt 181  Q
    | ||| | ||||||||| |||||||||| | ||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  40122234 ccccatattaggtcaag-ttggaccgaactaggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 40122178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 49 - 135
Target Start/End: Original strand, 6808510 - 6808595
Alignment:
Q  49 ctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggt 135  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||||    
T  6808510 ctaacttcttgtaactctttt-gtatctctttgtaaagaactcatttatagtggattggagagatcaatctcttcctcagagtaggt 6808595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 13138108 - 13137973
Alignment:
Q  27 gttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctcc 126  Q
    |||| |||||| |||||  || ||||||||||||||| | ||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||  |||||||||| |     
T  13138108 gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccattt-gcatctcttt-gtaagaacacattgatagtggattgaagagagcaatctctcccct 13138011  T
Q  127 agagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatct 165  Q
    |||||||||| |  |||||||||| ||||| ||||||||    
T  13138010 agagtaggtc-atattggaccgaactgggtcaacaatct 13137973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 122
Target Start/End: Original strand, 16455679 - 16455750
Alignment:
Q  49 ctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctc 122  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16455679 ctaatttcttgtaacccattt-gtatctctgt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctc 16455750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 36 - 137
Target Start/End: Original strand, 2926553 - 2926653
Alignment:
Q  36 gaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggt 135  Q
    |||||||| |||  |||||| ||||||| ||||||| ||||||||   | ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  2926553 gaacttgttaaagttaatttattgtaac-ctttttgcatctctttgaaacgaattcattggtagtggattggagagatcaatctcttctgcagagtaggt 2926651  T
Q  136 ca 137  Q
    ||    
T  2926652 ca 2926653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 93 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 8871130 - 8871071
Alignment:
Q  93 ttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattg 153  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||||    
T  8871130 ttgatagtggattggagagatcaatctctcccccatagtaggccaag-ttggaccgaattg 8871071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 17 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 928119 - 927996
Alignment:
Q  17 aattagggtt-gttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttca 115  Q
    |||||||||| |||| |||||| |||||  || ||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||  ||    
T  928119 aattagggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgg-atctcttt-gtaaaaactcattaatagtggattagagagacca 928022  T
Q  116 atctctcctccagagtaggtcaagtt 141  Q
    | |||| | |||  ||||||||||||    
T  928021 acctcttccccaaggtaggtcaagtt 927996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 84 - 133
Target Start/End: Original strand, 5459997 - 5460046
Alignment:
Q  84 aagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtag 133  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||    
T  5459997 aagaactcattgatagtagattggagagatcaatctctcatctagagtag 5460046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 9109529 - 9109459
Alignment:
Q  50 taatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctct 121  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||   |||||| | ||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  9109529 taatttcttgtaaccctttt-gtatctctttgtaaagaacacgttgatagtgtattggagagatcaatctct 9109459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 37282835 - 37282714
Alignment:
Q  17 aattagggtt-gttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttca 115  Q
    |||||||||| |||| |||||| |||||  || ||||||| | ||||| ||||| | ||||||||   |||||||||||  ||||||||||||||| | |    
T  37282835 aattagggtttgttccttgtgagcttgttgaagctaatttatggtaaccctttt-gcatctctttgtaaagaactcattagtagtggattggagagataa 37282737  T
Q  116 atctctcctccagagtaggtcaa 138  Q
    |||||||||   |||||||||||    
T  37282736 atctctcctttggagtaggtcaa 37282714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 12318665 - 12318585
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgata 98  Q
    ||||||| |||||||| | || |||||  || ||||||||||||||| | |||||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  12318665 aattaggtttgttcatggagagcttgttgaagctaatttcttgtaac-cattttgtatgtcttctttaagaactcattgata 12318585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 275; Significance: 1e-153; HSPs: 54)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 17 - 370
Target Start/End: Original strand, 29720389 - 29720743
Alignment:
Q  17 aattagggtt-gttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttca 115  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  29720389 aattagggttagttcattgtgaacttgtctaatctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtaca 29720486  T
Q  116 atctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgt 215  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29720487 atctctcctctagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgt 29720586  T
Q  216 attgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttg--cacatactttgtttggtggttaccactctcctttgct 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29720587 attgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgtacacacactttgtttggtggttaccactctcctttgct 29720686  T
Q  314 ccacacatcattattcttgtattggcgtggttcgatttgagatcggaattcacaaca 370  Q
    ||||||| |||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29720687 ccacacaacatatttcttgtattggtgtggttcgacttgagatcggaattcacaaca 29720743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 17 - 370
Target Start/End: Original strand, 29722549 - 29722903
Alignment:
Q  17 aattagggtt-gttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttca 115  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  29722549 aattagggttagttcattgtgaacttgtctaatctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtaca 29722646  T
Q  116 atctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgt 215  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29722647 atctctcctccagagtaggtcaaatttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgt 29722746  T
Q  216 attgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttg--cacatactttgtttggtggttaccactctcctttgct 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29722747 attgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgtacacacactttgtttggtggttaccactctactttgct 29722846  T
Q  314 ccacacatcattattcttgtattggcgtggttcgatttgagatcggaattcacaaca 370  Q
    ||||||| |||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29722847 ccacacaccatatttcttgtattggtgtggttcgacttgagatcggaattcacaaca 29722903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 17 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 29751303 - 29750948
Alignment:
Q  17 aattagggtt-gttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttca 115  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  29751303 aattagggtttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtaca 29751206  T
Q  116 atctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtc-tttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtg 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29751205 atctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtcttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtg 29751106  T
Q  215 tattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttg--cacatactttgtttggtggttaccactctcctttgc 312  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29751105 tactgtgtttctcacttgttttctagattatatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcacacacacattgtttggtggttaccactctcctttgc 29751006  T
Q  313 tccacacatcattattcttgtattggcgtggttcgatttgagatcggaattcacaaca 370  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  29751005 tccacacatcatatttcttgtattggtgtggttcgatttaagattggaattcacaaca 29750948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 17 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 9789367 - 9789021
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9789367 aattaaggttgttccttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttt-gtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 9789269  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctc-ttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgt 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  9789268 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtctttgttttcctcttccctctccgtttatcttgtgcttgtgt 9789169  T
Q  216 attgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcacatactttgtttggtggttaccactctcctttgctcc 315  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  9789168 attgtgtttttcacttctttcctagattagatctaggtgctgttttgttgatttttgcttgcacacactttg-ttggtggttactactttcctttgctcc 9789070  T
Q  316 acacatcattattcttgtattggcgtggttcgatttgagatcggaattcacaaca 370  Q
    |||||||||  |  ||||||||| |||||    ||||||||||||||||||||||    
T  9789069 acacatcatact--ttgtattggtgtggt----tttgagatcggaattcacaaca 9789021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 17 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 18441791 - 18441440
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18441791 aattagggttgttccttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttt-gtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 18441693  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctc-ttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgt 215  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  18441692 tctctcctctagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtctttgttttcctcttccctctccgtttatcttgtgcttgtgt 18441593  T
Q  216 attgtg----tttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcacatactttgtttggtggttaccactctcctttg 311  Q
    ||||||    ||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  18441592 attgtgtttttttttcacttctttcctagattagatctaggtgctgttttgttgattattgcttgcacacactttg-ttggtggttactactttcctttg 18441494  T
Q  312 ctccacacatcattattcttgtattggcgtggttcgatttgagatcggaattcacaacag 371  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||| |||||    |||||||||||||||||||||||    
T  18441493 ctccacacatc-ttact-ttgtattggtgtggt----tttgagatcggaattcacaacag 18441440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 17 - 324
Target Start/End: Original strand, 16409500 - 16409808
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16409500 aattagggttgttctttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttt-gtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 16409598  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctc-ttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgt 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16409599 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtctttgttttcctcttccctctccttttatcttgtgcttgtgt 16409698  T
Q  216 attgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttgcacatactttgtttggtggttaccactctcctttgct 313  Q
     || || || |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  |||||| || |||||||| ||| |||||||||    
T  16409699 tttatgcttttcactttgtttcctagattagatctaggtgttgttattgttgattattgcttgcacccactttg-ttagtggttactactttcctttgct 16409797  T
Q  314 ccacacatcat 324  Q
    |||||||||||    
T  16409798 ccacacatcat 16409808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 17 - 370
Target Start/End: Original strand, 26177907 - 26178255
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26177907 aattagggttgttctttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttt-gtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 26178005  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctc-ttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgt 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26178006 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtctttgttttcctcttccctctccttttatcttgtgcttgtgt 26178105  T
Q  216 attgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttgcacatactttgtttggtggttaccactctcctttgct 313  Q
     || || || |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||||||| |||||| || |||||||| ||| |||||||||    
T  26178106 tttatgcttttcactttgattcctagattagatctaggtgttgttatcattgattattgcttgcacacactttg-ttagtggttactactttcctttgct 26178204  T
Q  314 ccacacatcattattcttgtattggcgtggttcgatttgagatcggaattcacaaca 370  Q
    ||||||||| |  |||  ||||||| |||||    ||||||||||||||||||||||    
T  26178205 ccacacatcttacttc--gtattggtgtggt----tttgagatcggaattcacaaca 26178255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 17 - 349
Target Start/End: Original strand, 10593283 - 10593620
Alignment:
Q  17 aattagggtt-gttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcatt-gatagtggattggagagttc 114  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  10593283 aattagggtttgttcatagtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtac 10593379  T
Q  115 aatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctcct--tttatcttgtgattg 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  10593380 aatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtatttgttttctacttccctctccttgtttatcttgtgattg 10593479  T
Q  213 tgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcac---atactttgtttggtggttaccactctcctt 309  Q
    ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||| |    
T  10593480 tgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttgttgcttgcacaatacactttgtttggtggttaccactctccgt 10593579  T
Q  310 tgctccacacatcattattc-ttgtattggcgtggttcgat 349  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  10593580 cgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgat 10593620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 17 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 22536432 - 22536104
Alignment:
Q  17 aattagggtt-gttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttca 115  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||    
T  22536432 aattagggtttgttcattgtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggggagtaca 22536336  T
Q  116 atctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgt 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22536335 atctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgcttttgttttcttcttccctccccttttatcttgtgattgtgt 22536236  T
Q  216 attgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcacatactttg-tttggtggttaccactctcctttgctc 314  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||| | ||||    
T  22536235 tttgagtttctcacttgtttcctagattagatctaggt-gttttttgttgattgttgcttgcatacactttgctttggtggttaccgctctccgtcgctc 22536137  T
Q  315 cacacatcattattcttgtattggcgtggttcgat 349  Q
    ||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||    
T  22536136 cacacatcattct--ttgtattggtgtggttcgat 22536104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 17 - 349
Target Start/End: Original strand, 25078145 - 25078483
Alignment:
Q  17 aattagggtt-gttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagtt 113  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||   | ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||     
T  25078145 aattagggtttgttcatagtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacc--tcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagta 25078241  T
Q  114 caatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtct-ttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattg 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25078242 caatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctccttgtatcttgtgattg 25078341  T
Q  213 -tgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcac---atactttgtttggtggttaccactctcct 308  Q
     ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||   | |||||||| |||||||||||||||||     
T  25078342 ttgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcacaataaactttgttcggtggttaccactctccg 25078441  T
Q  309 ttgctccacacatcattattc-ttgtattggcgtggttcgat 349  Q
    | ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||    
T  25078442 tcgctccacacatcattcttctttgtattggtgtggttcgat 25078483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 17 - 349
Target Start/End: Original strand, 25136114 - 25136452
Alignment:
Q  17 aattagggtt-gttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagtt 113  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||   | ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||     
T  25136114 aattagggtttgttcatagtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacc--tcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagta 25136210  T
Q  114 caatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtct-ttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattg 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25136211 caatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctccttgtatcttgtgattg 25136310  T
Q  213 -tgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcac---atactttgtttggtggttaccactctcct 308  Q
     ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||   | |||||||| |||||||||||||||||     
T  25136311 ttgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcacaataaactttgttcggtggttaccactctccg 25136410  T
Q  309 ttgctccacacatcattattc-ttgtattggcgtggttcgat 349  Q
    | ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||    
T  25136411 tcgctccacacatcattcttctttgtattggtgtggttcgat 25136452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 17 - 349
Target Start/End: Original strand, 40380115 - 40380453
Alignment:
Q  17 aattagggtt-gttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagtt 113  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40380115 aattagggtttgttcatagtgaacttgtcaaa-ctaatttcttgtaacc--tcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtt 40380211  T
Q  114 caatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtct-ttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattg 212  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||    |||||||||||||||    
T  40380212 caaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctccttgtttatcttgtgattg 40380311  T
Q  213 -tgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcac---atactttgtttggtggttaccactctcct 308  Q
     ||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||     
T  40380312 ttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcacaataaactttgtttggtggttaccactctccg 40380411  T
Q  309 ttgctccacacatcattattc-ttgtattggcgtggttcgat 349  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  40380412 tcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgat 40380453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 25 - 349
Target Start/End: Original strand, 40382335 - 40382664
Alignment:
Q  25 ttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctc 122  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||   | ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  40382335 ttgttcatagtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacc--tcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaaactctc 40382431  T
Q  123 ctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtct-ttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattg-tgtattgt 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||    ||||||||||||||| ||  ||||    
T  40382432 ctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctccttgtttatcttgtgattgttgctttgt 40382531  T
Q  221 gtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcac---atactttgtttggtggttaccactctcctttgctccac 317  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||   |||||||    
T  40382532 gtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcacaataaactttgtttggtggttaccactctccgccgctccac 40382631  T
Q  318 acatcattattc-ttgtattggcgtggttcgat 349  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  40382632 acatcattattctttgtattggtgtggttcgat 40382664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 17 - 322
Target Start/End: Original strand, 26170798 - 26171093
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26170798 aattaggattgttctttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactct------------tttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 26170885  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctc-ttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgt 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26170886 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtctttgttttcctcttccctctccttttatcttgtgcttgtgt 26170985  T
Q  216 attgtgtttctca-cttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttgcacatactttgtttggtggttaccactctcctttgct 313  Q
     || || || |||  ||| ||||||||||||||||||||| |||| |  | |||||||||||||||| |||||| || ||| |||| ||| |||||||||    
T  26170986 tttatgcttttcattttgattcctagattagatctaggtgttgttatcatcgattattgcttgcacacactttg-ttagtgcttactactttcctttgct 26171084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 324
Target Start/End: Original strand, 30182614 - 30182917
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30182614 aattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttc-tatctctttgg-aagaactcattgatagtggattggagagttcaa 30182711  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgta 216  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| |||||||   ||||  |||||||||||||||||| ||||||     
T  30182712 tctctcctccagagtatgtcaagtttggaccgaactggatgaacaatct-ttggtgtgtttgtttctctctt--ctctccttttatcttgtgcttgtgtt 30182808  T
Q  217 ttgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttgcacatactttgtttggtggttaccactctcctttgctc 314  Q
    ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||   |||||| ||  ||||||| ||| ||||||||||    
T  30182809 ttgtgcttttcactttgtttcctagattagatctaggtgttgttattgttgattattgtttgcattcactttg-ttattggttactactttcctttgctc 30182907  T
Q  315 cacacatcat 324  Q
    ||||||||||    
T  30182908 cacacatcat 30182917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 17 - 324
Target Start/End: Original strand, 13343087 - 13343389
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13343087 aattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaa-tccttttgtatctctttg--aagaactcattgatagtggattggagagttcaa 13343183  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgta 216  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||   ||||  |||||||||||| || || |||||      
T  13343184 tctctcctccagagtaggtcatgtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttgatgtgtttgtttctctctt--ctctccttttatattttgcttgtggt 13343280  T
Q  217 ttgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttgcacatactttgtttggtggttaccactctcctttgctc 314  Q
    ||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||   |||||| ||  ||||||| ||| ||||||||||    
T  13343281 ttgtgcttttcactttgattcctagattagatctaggtgttgttattgttgattattgcttgcattcactttg-ttattggttactactttcctttgctc 13343379  T
Q  315 cacacatcat 324  Q
    ||||||||||    
T  13343380 cacacatcat 13343389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 69 - 349
Target Start/End: Original strand, 16544483 - 16544773
Alignment:
Q  69 ttgtatctcttttgtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctc 166  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  16544483 ttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctc 16544582  T
Q  167 ttggtgtct-ttgttttcttcttccctctcct---tttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttg 262  Q
    || |||| | ||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||   |  | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16544583 tttgtgtttattgttttcttcttccctctcctttgtttatcttgtgtttagttgctttgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttg 16544682  T
Q  263 ttgattattgcttgcac-ata--ctttgtttggtggttaccactctcctttgctccacacatcattattc-ttgtattggcgtggttcgat 349  Q
    ||| || |||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  16544683 ttgtttcttgcttgctcaataagctttgtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgat 16544773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 17 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 36074184 - 36073882
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36074184 aattagggttgttctttgcgaacttgtcaaagctaatttcttgtaactctttt-gtatctctttg--aagaactcattgatagtggattggagagttcaa 36074088  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgta 216  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| |||||||   ||||  |||||||||||| || || |||||      
T  36074087 tctctcctccaaagtaggtcaagtttggaccgaactggatgaacaatct-ttggtgtgtttgtttctctctt--ctctccttttatgttttgcttgtgat 36073991  T
Q  217 ttgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttgcacatactttgtttggtggttaccactctcctttgctc 314  Q
    ||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||   |||||| ||  ||||||  ||| ||||||||||    
T  36073990 ttgtgcttttcactttgattcctagattagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttg-ttattggttattactttcctttgctc 36073892  T
Q  315 cacacatcat 324  Q
    ||||||||||    
T  36073891 cacacatcat 36073882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 17 - 349
Target Start/End: Original strand, 16546654 - 16546995
Alignment:
Q  17 aattagggtt-gttcattgtgaac-ttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagt 112  Q
    |||||||||| |||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||   | ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16546654 aattagggtttgttcatagtgaacattgtcaag-ctaatttcttgtaacc--tcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagt 16546750  T
Q  113 tcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtct-ttgttttcttcttccctctcct---tttatcttgtg 208  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  16546751 acaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctcctttgtttatcttgtg 16546850  T
Q  209 attgtgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcac-ata--ctttgtttggtggttaccactct 305  Q
     ||   |  | |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||| | |||  |||||||||||||||| ||||||    
T  16546851 tttagttgctttgtttcacacttgtttcctagattggatttaggtggtgttttgttgtttcttgcttgctcaataagctttgtttggtggttatcactct 16546950  T
Q  306 cctttgctccacacatcattattc-ttgtattggcgtggttcgat 349  Q
    || | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  16546951 ccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgat 16546995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 276
Target Start/End: Original strand, 25412786 - 25413042
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25412786 aattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccctttt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaa 25412883  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgta 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||   ||||  ||||||||||||||| || |||||      
T  25412884 tctctcctccagagtaggtcaagtttggactgaactgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgtttctctctt--ctctccttttatcttttgcttgtggt 25412980  T
Q  217 ttgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttg 276  Q
    ||||| || || | ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||    
T  25412981 ttgtgcttttctctttgattcctagattagatataggtgctgttattgttgattattgcttg 25413042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 17 - 181
Target Start/End: Original strand, 37439167 - 37439328
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37439167 aattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagttaatttcttgtaactctttt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaa 37439264  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttt 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  37439265 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgttt 37439328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 13239777 - 13240016
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13239777 aattagggtttttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaactctttt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaa 13239874  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgt-gt 215  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||||| |||||||   ||||  ||||||||||||||| || |||| ||    
T  13239875 tctctcctccagagtaggtcaaatttggaccgaactgggtgaacaat-ttttggtgtgtttgtttctctctt--ctctccttttatcttttgcttgtggt 13239971  T
Q  216 attgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt 259  Q
     |||||||| |||| ||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  13239972 tttgtgtttttcactttgattactagattagatctaggtgttgtt 13240016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 32636850 - 32637088
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  32636850 aattatggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccattt-gtatctcttt-gtaagaactctttgatagtggattggagagatcaa 32636947  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtg-t 215  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||   ||||||  |||| ||||||||||| ||||| |    
T  32636948 tctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgtttctctcttcc--ctccctttatcttgtgcttgtgat 32637043  T
Q  216 attgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt 259  Q
     ||| |||| |||| ||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  32637044 tttgagtttttcactttgattactagattagatctaggtgttgtt 32637088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 17 - 161
Target Start/End: Original strand, 213491 - 213633
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  213491 aattagggttgttctttgtgagcttgttaaagctaatttcttgtaacccattt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaa 213588  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaaca 161  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  213589 tctctcctccatagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 213633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 161
Target Start/End: Original strand, 40147287 - 40147428
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| | |||| |||||  || ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40147287 aattagggttgttcttcgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcattt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaa 40147384  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaaca 161  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  40147385 tctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 40147428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 17 - 173
Target Start/End: Original strand, 28278342 - 28278494
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28278342 aattatggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccattt-gtatctcttt-gtaaaaactcattgatagtggattggagagatcaa 28278439  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgt 173  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  28278440 tctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaacaat-tcttggtgt 28278494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 27 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 30683056 - 30682809
Alignment:
Q  27 gttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaa--ctcattgatagtggattggagagttcaatctctcct 124  Q
    |||| ||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  30683056 gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaaccctttt-gtatttcttt-gtaagaatactcattgatagtggattggagagatcaatctctccc 30682959  T
Q  125 ccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtatt-gtgtt 223  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| ||||||| ||||||    |||||  |||||||||||||| || ||||| ||| ||| |    
T  30682958 ccagattaggtcaagtt-ggaccgaactgg-tcaacaatct-ttggtgtgtttgttcctctcttc--tctccttttatcttttgcttgtgaatttgtgct 30682864  T
Q  224 tctcactt-gtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttg 276  Q
    | |||||| | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  30682863 tttcactttgattcctagattagatctaggtgttgttattgttgattattgcttg 30682809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Original strand, 13488229 - 13488388
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13488229 aattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccattt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaa 13488326  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgtt 180  Q
    ||||||| | ||| ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| || |||||||||||    
T  13488327 tctctccccgagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaataatct-tttgtgtctttgtt 13488388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 42428572 - 42428334
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||||||  || ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42428572 aattatggtttttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccattt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaa 42428475  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtg-t 215  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||| ||||||  ||||||  |||||| |||||||| || ||||| |    
T  42428474 tctctcccccatattaggtcaagtt-ggaccgaactgggtcaacaatct-ttagtgtgtttgtt--cttcttttctctccctttatcttttgcttgtggt 42428379  T
Q  216 attgtgtttctcactt-gtttcctagattagatctaggtggtgtt 259  Q
     ||| | || |||||| | || |||||||||||||||||| ||||    
T  42428378 tttgagcttttcactttgattactagattagatctaggtgttgtt 42428334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 17 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 27637755 - 27637615
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| || ||| |||||  || ||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  27637755 aattagggttgttctttatgagcttgtttaaactaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaagaactcatt-atagtggattggagagatcaa 27637658  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaa 159  Q
    |||||||| ||||||||||||   |||||||||| ||||||||    
T  27637657 tctctcctgcagagtaggtcattgttggaccgaactgggtgaa 27637615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 28750797 - 28750638
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| || |||| ||||  ||  ||||||| |||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28750797 aattagggttgttctttatgaaattgttgaagttaatttcctgtaacccattt-gtatct-ttttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaa 28750700  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgtt 180  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||    
T  28750699 tctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaattgggtcaataatct-ttggtgtgtttgtt 28750638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 39468691 - 39468439
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  39468691 aattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccattt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattagagagatcaa 39468594  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgt-gt 215  Q
    ||||||| ||| | ||||| ||  |||||| ||| ||||| |||||||| || |||| ||||  ||| |||   |||||| ||||||||||| | || ||    
T  39468593 tctctcccccatattaggttaa-attggactgaactgggtcaacaatct-ttagtgtgtttg--ttcctctcttctctccctttatcttgtgctcgtggt 39468498  T
Q  216 attgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattg 272  Q
     ||||| || |||| ||| || |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  39468497 tttgtgcttttcactttgatttctagattagatctaggtgctgttattgttgattattg 39468439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 17 - 178
Target Start/End: Original strand, 533795 - 533952
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    ||||||||||| || |||||| |||||  || ||||||| ||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  533795 aattagggttggtctttgtgagcttgttgaagctaattttttgtaacccattt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggaaagatcaa 533892  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttg 178  Q
    ||||||| ||| | ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  533893 tctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtctttg 533952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 68 - 161
Target Start/End: Original strand, 5058121 - 5058212
Alignment:
Q  68 tttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaaca 161  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  5058121 tttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctctagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 5058212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 181
Target Start/End: Original strand, 33831706 - 33831866
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    ||||||| |||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  33831706 aattaggtttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccattt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattgaagagatcaa 33831803  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttt 181  Q
    ||||||| ||| | ||||||||| |||||| ||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  33831804 tctctcccccatattaggtcaag-ttggactgaactgggtcaacaatct-ttggtgtttttgttt 33831866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 17 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 3075800 - 3075640
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    ||||||| |||||| |||||| ||||   |||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||    
T  3075800 aattaggtttgttctttgtgagcttgctgaatctaatttcttgtaacccattt-gtatct-ttttgtaagaattcgttgatagtgaattggagagatcaa 3075703  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttt 181  Q
    |||||||  || ||||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||||| |||||||    
T  3075702 tctctccctcatagtaggtcaag-ttggaccaaattgggtgaac-atttcttggtgtgtttgttt 3075640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 49 - 181
Target Start/End: Original strand, 16452138 - 16452266
Alignment:
Q  49 ctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccg 148  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  16452138 ctaatttcttgtaacccattt-gtatctcttt-gtaagaactcattcatagtggattggagagataaatctctcccccagagtaggtcaag-ttggaccg 16452234  T
Q  149 aattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttt 181  Q
    || ||||| ||| || ||||||||| |||||||    
T  16452235 aactgggtaaac-atttcttggtgtgtttgttt 16452266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 17 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 42426377 - 42426255
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||  || ||||||||||| ||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42426377 aattagggttgttctttgtgaaattgttgaagctaatttcttgcaacccattt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaa 42426280  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtt 141  Q
    ||||||| || || |||||||||||    
T  42426279 tctctccccctgattaggtcaagtt 42426255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 8566086 - 8565926
Alignment:
Q  19 ttagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatc 118  Q
    ||||| |||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||| | ||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8566086 ttaggtttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccattt-gtatccctct-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatc 8565989  T
Q  119 tctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttct 184  Q
    ||||  ||||| ||||||||| |||||||||| | ||| |||||  ||||||||| ||||||||||    
T  8565988 tctcacccagattaggtcaag-ttggaccgaactaggtcaacaa--tcttggtgtgtttgttttct 8565926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 17 - 165
Target Start/End: Original strand, 538051 - 538196
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    ||||| ||||| || |||||| |||||  || ||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  538051 aattaaggttgctctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccattt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatagtagattggagagatcaa 538148  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatct 165  Q
    ||||||| ||| | ||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||    
T  538149 tctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactggatcaacaatct 538196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 68 - 161
Target Start/End: Original strand, 27015599 - 27015690
Alignment:
Q  68 tttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaaca 161  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  27015599 tttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattgtacagatcaatctctcctccaaaataggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 27015690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 32 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 42310062 - 42309932
Alignment:
Q  32 ttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 131  Q
    |||||| |||||  || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||| |||    
T  42310062 ttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactctttt-gtatctcttt-gtaagaacttattgatagtggattagcgagatcaatctctcccccatagt 42309965  T
Q  132 aggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatct 165  Q
    || | |||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  42309964 agattaagttt-gaccgaattggataaacaatct 42309932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 32 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 9049469 - 9049354
Alignment:
Q  32 ttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 131  Q
    |||||| |||||  || ||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||    
T  9049469 ttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaac-cattttgtatctcttt-gtaagaactcattgacagtggattggagagatcaatatctcccccaaagt 9049372  T
Q  132 aggtcaagtttggaccgaa 150  Q
    |||| ||| ||||||||||    
T  9049371 aggtgaag-ttggaccgaa 9049354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 13695834 - 13695713
Alignment:
Q  17 aattagggtt-gttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttca 115  Q
    |||||||||| |||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||   ||||||||||| |||||||||| ||||| | |    
T  13695834 aattagggtttgttctttgtgagcttgttaaagctaatttcttgtaaccctttt-gtatctctttgtaaagaactcattaatagtggattagagagatta 13695736  T
Q  116 atctctcctccagagtaggtcaa 138  Q
     ||||||||||| ||||||||||    
T  13695735 ttctctcctccatagtaggtcaa 13695713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 16641071 - 16640961
Alignment:
Q  25 ttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcct 124  Q
    |||||| |||||| |||||  || || ||||||  |||||||||| |||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16641071 ttgttctttgtgagcttgttgaagctgatttctgataactctttt-gtatctcttt-gtaagaact---tgatagtggattggagagatcaatctctcct 16640977  T
Q  125 ccagagtaggtcaagt 140  Q
    ||||||||||||||||    
T  16640976 ccagagtaggtcaagt 16640961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 84 - 165
Target Start/End: Original strand, 19806454 - 19806534
Alignment:
Q  84 aagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatct 165  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  19806454 aagaactccttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 19806534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 141
Target Start/End: Original strand, 38747031 - 38747153
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||| | ||| |||||||||| | || ||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  38747031 aattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccattt-gtatctctttggaaa-aactcattgatagaggattggagagatcaa 38747128  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtt 141  Q
    |||||||  ||||  ||||||||||    
T  38747129 tctctccctcagatcaggtcaagtt 38747153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 79 - 181
Target Start/End: Original strand, 31183057 - 31183157
Alignment:
Q  79 tttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttg 178  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| ||| | ||||||||| |||||||||| ||||| |||| ||| ||||||| ||||    
T  31183057 tttgtaagaactcattgatactggattggagagatctatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacattct-ttggtgtgtttg 31183154  T
Q  179 ttt 181  Q
    |||    
T  31183155 ttt 31183157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 39 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 33906151 - 33906028
Alignment:
Q  39 cttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaa 138  Q
    |||||| || |||| ||||||||| || ||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| | | ||||||||||||    
T  33906151 cttgtcgaagctaacttcttgtaa-tccttttgtatctctttgtaaagaactcattgatagtagattggaaagatcaatctcttccctagagtaggtcaa 33906053  T
Q  139 gtttggaccgaattgggtgaacaat 163  Q
      |||||||||  ||||| ||||||    
T  33906052 tgttggaccgagctgggtaaacaat 33906028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 49 - 163
Target Start/End: Original strand, 316820 - 316933
Alignment:
Q  49 ctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccg 148  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||||||| | |||||||||||   ||||||||    
T  316820 ctaatttcttgtaa-tccttttgtatctctttgtaaagaactcattgataatggatcggagggatcaatctctcccctagagtaggtcattgttggaccg 316918  T
Q  149 aattgggtgaacaat 163  Q
    || | ||| ||||||    
T  316919 aacttggtaaacaat 316933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 137
Target Start/End: Original strand, 4160702 - 4160743
Alignment:
Q  96 atagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtca 137  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4160702 atagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtca 4160743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 68 - 181
Target Start/End: Original strand, 42926967 - 42927077
Alignment:
Q  68 tttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctct 167  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||  | ||||||||   || ||||||||||| |||||||||| ||||| ||| || |||    
T  42926967 tttgtatctcttt-gtaagaactcattgacagtggattgaagaaataaatctctctctcatagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtaaac-atttct 42927063  T
Q  168 tggtgtctttgttt 181  Q
    |||||| |||||||    
T  42927064 tggtgtgtttgttt 42927077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 116 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 5887479 - 5887416
Alignment:
Q  116 atctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttt 181  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| | |||||||| ||||||| |||||||    
T  5887479 atctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaattggatcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 5887416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 66 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 10700743 - 10700674
Alignment:
Q  66 tttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtca 137  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||| | ||||||| ||  ||||||| ||| |||||||||    
T  10700743 tttttgtatctctttaaaaagaactcattgatagtgaagtggagagatc--tctctcccccatagtaggtca 10700674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 47)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 17 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 3072903 - 3072552
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3072903 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtgaattggagagttcaa 3072804  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgta 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  3072803 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcctcttccctctccttttatcttgtgcttgtgtt 3072704  T
Q  217 ttgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggt-gttttgttgattattgcttgcacatactttgtttggtggttaccactctcctttgctcc 315  Q
    || || || ||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| ||| |||||||||||    
T  3072703 ttatgcttttcacttgtttcctagattagatctatgtgctatttttgttgattattgcttgcacacactttg-ttagtggttactactttcctttgctcc 3072605  T
Q  316 acacatcattattcttgtattggcgtggttcgatttgagatcggaattcacaaca 370  Q
    |||||||||  |||  ||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||    
T  3072604 acacatcatatttc--gtattggtgtgacacgatttgagatcggaattcacaaca 3072552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 17 - 349
Target Start/End: Original strand, 16653137 - 16653470
Alignment:
Q  17 aattagggtt-gttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcatt-gatagtggattggagagttc 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  16653137 aattagggtttgttcattgtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtgc 16653233  T
Q  115 aatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctctt-ggtgtctttgttttcttcttccctctcctt--ttatcttgtgatt 211  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  16653234 aaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtatttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgatt 16653333  T
Q  212 gtgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcacatactttgtttggtggttaccactctcctttg 311  Q
    |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16653334 gtgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttgttgcttgcacacactttgtttggtggttaccactctccttgg 16653433  T
Q  312 ctccacacatcattattcttgtattggcgtggttcgat 349  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||    
T  16653434 ctccacacatcattatt-tagtattggtgtggttcgat 16653470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 17 - 370
Target Start/End: Original strand, 27647886 - 27648232
Alignment:
Q  17 aattagggtt-gttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttca 115  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  27647886 aattagggtttgttcattgtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtaca 27647982  T
Q  116 atctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgt 215  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||      ||||||    
T  27647983 aactctcctccagagtagatcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgcttttgttttcttcttccctctccttttatc------ttgtgt 27648076  T
Q  216 attgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttg--cacatactttgtttggtggttaccactctcctttgct 313  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27648077 attgagtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcacacacactttgttcggtggttaccactctcctttgct 27648176  T
Q  314 ccacacatcattattcttgtattggcgtggttcgattt--gagatcggaattcacaaca 370  Q
    |||||||||   ||||||||||||| |||||||||| |  | |||||||||||||||||    
T  27648177 ccacacatc---attcttgtattggtgtggttcgatctaggtgatcggaattcacaaca 27648232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 17 - 349
Target Start/End: Original strand, 16554894 - 16555227
Alignment:
Q  17 aattagggtt-gttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcatt-gatagtggattggagagttc 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  16554894 aattagggtttgttcattgtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtgc 16554990  T
Q  115 aatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctctt-ggtgtctttgttttcttcttccctctcctt--ttatcttgtgatt 211  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  16554991 aaactctcctccaaagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtatttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgatt 16555090  T
Q  212 gtgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcacatactttgtttggtggttaccactctcctttg 311  Q
    |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16555091 gtgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttgttgcttgcacacactttgtttggtggttaccactctccttgg 16555190  T
Q  312 ctccacacatcattattcttgtattggcgtggttcgat 349  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||    
T  16555191 ctccacacatcattatt-tagtattggtgtggttcgat 16555227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 17 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 16578661 - 16578328
Alignment:
Q  17 aattagggtt-gttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcatt-gatagtggattggagagttc 114  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  16578661 aattagggtttgctcattgtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtgc 16578565  T
Q  115 aatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctctt-ggtgtctttgttttcttcttccctctcctt--ttatcttgtgatt 211  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  16578564 aaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtatttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgatt 16578465  T
Q  212 gtgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcacatactttgtttggtggttaccactctcctttg 311  Q
    |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16578464 gtgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttgttgcttgcacacactttgtttggtggttaccactctccttgg 16578365  T
Q  312 ctccacacatcattattcttgtattggcgtggttcgat 349  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||    
T  16578364 ctccacacatcattatt-tagtattggtgtggttcgat 16578328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 17 - 349
Target Start/End: Original strand, 16616719 - 16617052
Alignment:
Q  17 aattagggtt-gttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcatt-gatagtggattggagagttc 114  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  16616719 aattagggtttgctcattgtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtgc 16616815  T
Q  115 aatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctctt-ggtgtctttgttttcttcttccctctcctt--ttatcttgtgatt 211  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  16616816 aaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtatttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgatt 16616915  T
Q  212 gtgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcacatactttgtttggtggttaccactctcctttg 311  Q
    |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16616916 gtgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttgttgcttgcacacactttgtttggtggttaccactctccttgg 16617015  T
Q  312 ctccacacatcattattcttgtattggcgtggttcgat 349  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||    
T  16617016 ctccacacatcattatt-tagtattggtgtggttcgat 16617052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 17 - 349
Target Start/End: Original strand, 16631450 - 16631783
Alignment:
Q  17 aattagggtt-gttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcatt-gatagtggattggagagttc 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  16631450 aattagggtttgttcattgtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtgc 16631546  T
Q  115 aatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctctt-ggtgtctttgttttcttcttccctctcctt--ttatcttgtgatt 211  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  16631547 aaactctcctccaaagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtatttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgatt 16631646  T
Q  212 gtgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcacatactttgtttggtggttaccactctcctttg 311  Q
    |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16631647 gtgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttgttgcttgcacacactttgtttggtggttaccactctccttgg 16631746  T
Q  312 ctccacacatcattattcttgtattggcgtggttcgat 349  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||    
T  16631747 ctccacacatcattatt-tagtattggtgtggttcgat 16631783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 17 - 324
Target Start/End: Original strand, 412126 - 412418
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  412126 aattagggttgttcattgtgaacttatcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattagagagttcaa 412225  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctctt-ggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgt 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  412226 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtatttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgcttgtgt 412325  T
Q  216 attgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcacatactttgtttggtggttaccactctcctttgctcc 315  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||                ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  412326 attgtgtttttcacttgttacctagattagatctaggtgctgtt----------------gcacacactttgtttggtggttactactttcctttgctcc 412409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 17 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 6097583 - 6097285
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6097583 aattaggattgttctttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttt------------gtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 6097496  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctc-ttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgt 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6097495 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtctttgttttcctcttccctctccttgtatcttgtgattgtgt 6097396  T
Q  216 attgtgtttct-cacttgtttcctagattagatctaggtggtg-ttttgttgattattgcttgcacatactttgtttggtggttaccactctcctttgct 313  Q
    ||||||||| | |||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||| || |||||||| ||| ||| |||||    
T  6097395 attgtgtttttccacttgttacctagattagatcaaggtgctgtttttgttgattatagcttgcacacactttg-ttagtggttactactttccgttgct 6097297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 17 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 2171673 - 2171366
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2171673 aattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttt--gtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 2171577  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgta 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||   ||||| ||| |||||||||||||| ||||||     
T  2171576 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtatttgtttatctcttctctc-ccttttatcttgtgcttgtgtt 2171478  T
Q  217 ttgtg---tttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttgcacatactttgtttggtggttaccactctcctttg 311  Q
    || ||   ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| ||| |||||||    
T  2171477 ttatgttttttttcactttgattcctagattagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcacacactttg-ttagtggttactactttcctttg 2171379  T
Q  312 ctccacacatcat 324  Q
    |||||||||||||    
T  2171378 ctccacacatcat 2171366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 17 - 349
Target Start/End: Original strand, 25421330 - 25421668
Alignment:
Q  17 aattagggtt-gttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagtt 113  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||   | ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||     
T  25421330 aattagggtttgttcatagtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacc--tcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagta 25421426  T
Q  114 caatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtct-ttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattg 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||    |||||||||||||||    
T  25421427 caatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctccttgtttatcttgtgattg 25421526  T
Q  213 -tgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcac---atactttgtttggtggttaccactctcct 308  Q
     ||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||   | |||||||| |||||||||||||||||     
T  25421527 ttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcacaataaactttgttcggtggttaccactctccg 25421626  T
Q  309 ttgctccacacatcattattc-ttgtattggcgtggttcgat 349  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  25421627 tcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgat 25421668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 17 - 349
Target Start/End: Original strand, 6027271 - 6027608
Alignment:
Q  17 aattagggtt-gttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagtt 113  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||   | ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||     
T  6027271 aattagggtttgttcatagtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacc--tcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagta 6027367  T
Q  114 caatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtct-ttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattg 212  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  6027368 caatctctcctccagagtatgtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctc-cattttatcttgtgattg 6027466  T
Q  213 -tgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcac---atactttgtttggtggttaccactctcct 308  Q
     ||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||   | || ||||| |||||||||| ||||||     
T  6027467 ttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcacaatacaccttgttaggtggttacccctctccg 6027566  T
Q  309 ttgctccacacatcattattc-ttgtattggcgtggttcgat 349  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  6027567 tcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgat 6027608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 349
Target Start/End: Original strand, 34167103 - 34167442
Alignment:
Q  17 aattagggtt-gttcattgtgaac-ttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagt 112  Q
    |||||||||| |||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||   | ||||||  ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  34167103 aattagggtttgttcatagtgaacattgtcaag-ctaatttcttgtaacc--tcttgtattccttttgtaaagaacttatttgatagtggattggagagt 34167199  T
Q  113 tcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtct-ttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgatt 211  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34167200 acaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctccttgtatcttgtgatt 34167299  T
Q  212 g-tgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgc---acatactttgtttggtggttaccactctcc 307  Q
    | ||  ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||   | ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  34167300 gttgctttgtgtttcacacttggttcctagatttgatctaggtggtgttttgttgttttttgcttgctcaatattttttgtttggtggttaccactctcc 34167399  T
Q  308 tttgctccacacatcattattc-ttgtattggcgtggttcgat 349  Q
     | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  34167400 gtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgat 34167442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 349
Target Start/End: Original strand, 13153938 - 13154277
Alignment:
Q  17 aattagggtt-gttcattgtgaac-ttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagt 112  Q
    |||||||||| |||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||   | ||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13153938 aattagggtttgttcatagtgaacattgtcaag-ctaatttcttgtaacc--tcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagt 13154034  T
Q  113 tcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtct-ttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgatt 211  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13154035 acaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctccttgtatcttgtgatt 13154134  T
Q  212 g-tgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcac-ata--ctttgtttggtggttaccactctcc 307  Q
    | ||  ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||| | |||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  13154135 gttgctttgtgtttcacacttggttcctagattcgatctaggtggtgtattgttgtttcttgcttgctcaataagctttgttaggtggttaccactctcc 13154234  T
Q  308 tttgctccacacatcattattc-ttgtattggcgtggttcgat 349  Q
     | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  13154235 gtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgat 13154277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 84 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 33342183 - 33341909
Alignment:
Q  84 aagaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtct-ttgttt 181  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| | ||||||    
T  33342183 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttt 33342084  T
Q  182 tcttcttccctctccttt---tatcttgtgattgtgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgca 278  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||| ||   |  | |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  33342083 tcttcttccctctcctttgtttatcttgtgtttagttgctttgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgca 33341984  T
Q  279 c-ata--ctttgtttggtggttaccactctcctttgctccacacatcattattc-ttgtattggcgtggttcgat 349  Q
    | |||  ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  33341983 caataagctttgtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgat 33341909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 17 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 30834678 - 30834373
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30834678 aattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccctttt-gtatctctttgg-aagaactcattgatagtggattggagagttcaa 30834581  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgta 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||   ||||  |||||||||||| || || |||||      
T  30834580 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaataatct-ttggtgtgtttgtttatctctt--ctctccttttatattttgcttgtggt 30834484  T
Q  217 ttgtg--tttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttgcacatactttgtttggtggttaccactctcctttgc 312  Q
    |||||  ||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||   |||||| ||  ||||||| | | ||||||||    
T  30834483 ttgtgtttttttcactttgattcatagattagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttg-ttattggttactattttcctttgc 30834385  T
Q  313 tccacacatcat 324  Q
    ||||||||||||    
T  30834384 tccacacatcat 30834373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 5413536 - 5413234
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5413536 aattagggttgttctttgcgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccctttt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaa 5413439  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgta 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||   ||||  ||||||||||||||| || |||||      
T  5413438 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaact-ggtgaacaatct-ttggtgtgtttgtttctctctt--ctctccttttatcttttgcttgtggt 5413343  T
Q  217 ttgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttgcacatactttgtttggtggttaccactctcctttgctc 314  Q
    ||||| || || | ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  |  ||||||  |  ||||||| ||| ||||||||||    
T  5413342 ttgtgcttttctctttgattcctagattagatctaggtgttgttattgttgattattgcttgtgctcactttg-atattggttactactttcctttgctc 5413244  T
Q  315 cacacatcat 324  Q
    ||||||||||    
T  5413243 cacacatcat 5413234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 31404817 - 31404561
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31404817 aattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccctttt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaa 31404720  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgta 216  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||   ||||  ||||||||||||||| || |||||      
T  31404719 tctctcctccagagtaggccaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgtttctctctt--ctctccttttatcttttgcttgtggt 31404623  T
Q  217 ttgtg-tttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttg 276  Q
    ||||| ||||    ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  31404622 ttgtgctttcctctttgattcctagattagatctaggtgctgttattgttgattattgcttg 31404561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 17 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 16452471 - 16452127
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||   ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16452471 aattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccctttca-tatctctttgg-aagaactcattgatagtggattggagagttcaa 16452374  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttat-cttgtgattgtgt 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||   ||||  ||||||||||||  || || |||||     
T  16452373 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgtttctctctt--ctctccttttatatttttgcttgtgg 16452277  T
Q  216 attgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttgcacatactttgtttggtggttaccactctcctttgct 313  Q
     ||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |   |||||| ||  ||||||| ||| |||||| ||    
T  16452276 tttgtgcttttcactttgattcctagattagatctaggtgatgttattgttgattattgcttgtattcactttg-ttattggttactactttcctttact 16452178  T
Q  314 ccacacatcattattcttgtattggcgtggttcgatttgagatcggaattcacaaca 370  Q
    |||||||||||  |||  ||||||| ||| |    ||||||||||||||||||||||    
T  16452177 ccacacatcatagttc--gtattggtgtgat----tttgagatcggaattcacaaca 16452127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 17 - 349
Target Start/End: Original strand, 34164881 - 34165220
Alignment:
Q  17 aattagggtt-gttcattgtgaac-ttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagt 112  Q
    |||||||||| |||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||   | ||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34164881 aattagggtttgttcatagtgaacattgtcaag-ctaatttcttgtaacc--tcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagt 34164977  T
Q  113 tcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtct-ttgttttcttcttccctctcct--tttatcttgtga 209  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||     
T  34164978 acaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgt 34165077  T
Q  210 ttgtgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcac-ata--ctttgtttggtggttaccactctc 306  Q
    ||   |  | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  34165078 ttagttgctttgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtg-tttgttgtttcttgcttgctcaataagcttggtttggtggttaccactctc 34165176  T
Q  307 ctttgctccacacatcattattc-ttgtattggcgtggttcgat 349  Q
    | | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  34165177 cgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgat 34165220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 5406342 - 5406109
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5406342 aattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccctttt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaa 5406245  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgta 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||   ||||  ||||||||||||||| || |||||      
T  5406244 tctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgtttctctctt--ctctccttttatcttttgtttgtggt 5406148  T
Q  217 ttgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtg 254  Q
    ||||| || || | ||| |||||||||||||||||||||    
T  5406147 ttgtgcttttctctttgattcctagattagatctaggtg 5406109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 5410667 - 5410434
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5410667 aattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccctttt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaa 5410570  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgta 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||   ||||  ||||||||||||||| || |||||      
T  5410569 tctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgtttctctctt--ctctccttttatcttttgtttgtggt 5410473  T
Q  217 ttgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtg 254  Q
    ||||| || || | ||| |||||||||||||||||||||    
T  5410472 ttgtgcttttctctttgattcctagattagatctaggtg 5410434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 67 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 5409162 - 5408909
Alignment:
Q  67 ttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctc 166  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||     
T  5409162 ttttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaact-ggtgaacaatct- 5409066  T
Q  167 ttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgtt 264  Q
    ||||||| |||||||   ||||  ||||||||||||||| || |||||  ||||| || || | ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  5409065 ttggtgtgtttgtttctctctt--ctctccttttatcttttgcttgtggtttgtgcttttctctttgattcctagattagatctaggtgttgttattgtt 5408968  T
Q  265 gattattgcttgcacatactttgtttggtggttaccactctcctttgctccacacatcat 324  Q
    ||||||||||||  |  ||||||  |  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  5408967 gattattgcttgtgctcactttg-atattggttactactttcctttgctccacacatcat 5408909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 33160494 - 33160254
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  33160494 aattagagttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaactctttt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatggtggattggagagatcaa 33160397  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgt-gt 215  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| |||||||   ||||| ||| | ||||||||| || |||| ||    
T  33160396 tctctcctccagagtatttcaagtttggaccaaactgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgtttctctcttctctc-ctttttatcttttgtttgtggt 33160299  T
Q  216 attgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt 259  Q
     ||||| || |||| ||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  33160298 tttgtgcttttcactttgattactagattagatctaggtgttgtt 33160254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 17 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 3808851 - 3808699
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3808851 aattagggttgttctttgtgagcttgttgaaactaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaa 3808753  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttgg 170  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||| | |||||||||||||||||    
T  3808752 tctctcctccagagtaggtcatgattggaccgaactaggtgaacaatctcttgg 3808699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 9183173 - 9182917
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||  || ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9183173 aattagggttgttctttgtgaatttgttgaagctaatttcttgtaacccattt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaa 9183076  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgt-gt 215  Q
    ||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||  | | |||   |||||| |||||||| || |||| ||    
T  9183075 tctctcctccagattatgtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttg--tccctctcttctctccctttatcttttgcttgtggt 9182980  T
Q  216 attgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttg 276  Q
     ||||  || |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  9182979 tttgtacttttcactttgattcctagattagatctaggtgttgttattgttgattattgcttg 9182917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 161
Target Start/End: Original strand, 21588957 - 21589098
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21588957 aattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccattt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaa 21589054  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaaca 161  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  21589055 tctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 21589098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 161
Target Start/End: Original strand, 21593690 - 21593831
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21593690 aattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccattt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaa 21593787  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaaca 161  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  21593788 tctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 21593831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 17 - 161
Target Start/End: Original strand, 17763016 - 17763158
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  17763016 aattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcattt-gtatct-ttttggaagaactcattgatagtggattggagtgatcaa 17763113  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaaca 161  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||    
T  17763114 tctctcctccagagtagatcaagtttggaccgaactaggtgaaca 17763158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 161
Target Start/End: Original strand, 17758049 - 17758191
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17758049 aattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccattt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaa 17758146  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaaca 161  Q
    |||| |||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||    
T  17758147 tctcccctctagagtagttcaagtttggaccgaactaggtgaaca 17758191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 26954428 - 26954268
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26954428 aattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatct-gtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaa 26954331  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttt 181  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| | ||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  26954330 tctctcccccaaagtaggtcaag-ttggaccgaactaggtcaacaatct-ttggtgactttgttt 26954268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 28137550 - 28137409
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||| | ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28137550 aattagggttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccattt-gtatttcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaa 28137453  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaaca 161  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  28137452 tctctcccccagagtaggtcaag-ttggaccgaattgtgtgaaca 28137409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 17 - 161
Target Start/End: Original strand, 5043653 - 5043795
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    ||||||| |||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  5043653 aattaggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcattt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatagtagattggagagatcaa 5043750  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaaca 161  Q
    ||||||||||| |||||||||   |||||||||| ||||||||||    
T  5043751 tctctcctccatagtaggtcattgttggaccgaactgggtgaaca 5043795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 17 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 26830265 - 26830124
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||||  || |||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26830265 aattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaa-tccatttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaa 26830168  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaaca 161  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  26830167 tctctcctccaaagtaggtcaagttt-gactgaactgggtgaaca 26830124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 22424969 - 22424826
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactc-tttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttca 115  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  22424969 aattagggttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttttgtatctcttt-gtaagaactcatt-atagtggattggagagatca 22424872  T
Q  116 atctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaaca 161  Q
    ||||||||| ||||||||||||   |||||||| | ||||||||||    
T  22424871 atctctccttcagagtaggtcattgttggaccgtactgggtgaaca 22424826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 2973081 - 2972959
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    ||||||| |||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2973081 aattaggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccattt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaa 2972984  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtt 141  Q
    ||||||||| |||||||||||||||    
T  2972983 tctctcctcaagagtaggtcaagtt 2972959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 79 - 181
Target Start/End: Original strand, 16569108 - 16569208
Alignment:
Q  79 tttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttg 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  16569108 tttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttg 16569205  T
Q  179 ttt 181  Q
    |||    
T  16569206 ttt 16569208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 49 - 161
Target Start/End: Original strand, 26800645 - 26800755
Alignment:
Q  49 ctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccg 148  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  26800645 ctaatttcttgtaactaattttgtatctcttt-gtaagaactcatt-atagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccg 26800742  T
Q  149 aattgggtgaaca 161  Q
    || ||| ||||||    
T  26800743 aactggatgaaca 26800755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 24 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 603223 - 603081
Alignment:
Q  24 gttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcc 123  Q
    ||||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  603223 gttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccattt-gtatctcttt-gtaagaactcgttgatagtggattggagaaatcaatctctcc 603126  T
Q  124 tccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttg 169  Q
     | ||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  603125 ccaagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatctcttg 603081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 246 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 6136216 - 6136109
Alignment:
Q  246 atctaggtggtgttttgttgattattgcttgcacat---actttgtttggtggttaccactctcctttgctccacacatcattattc-ttgtattggcgt 341  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  6136216 atctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcacaatacactttgtttggtggttaccactctccgttgctccacacatcattattctttgtattggtat 6136117  T
Q  342 ggttcgat 349  Q
    ||||||||    
T  6136116 ggttcgat 6136109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 17 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 33211327 - 33211182
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||   ||  |||||||||||| ||| ||| |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  33211327 aattatggttgttctttgtgagcttgatgaagttaatttcttgtagctcattt-gtatctcttt-gtaagaactcatttataatggattggagagatcaa 33211230  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatct 165  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  33211229 tctctcccccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 33211182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 3039045 - 3038926
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |  || ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| | ||    
T  3039045 aattagggttgttcattgtgagctttttgaagctaatttcttgtaacccattt-gtatctcttt-gtaagaactctttaatagtggattggagagattaa 3038948  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaa 138  Q
    ||||||| ||||| ||||||||    
T  3038947 tctctcccccagattaggtcaa 3038926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 283 - 349
Target Start/End: Original strand, 13159066 - 13159133
Alignment:
Q  283 ctttgtttggtggttaccactctcctttgctccacacatcattattc-ttgtattggcgtggttcgat 349  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  13159066 ctttgttaggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgat 13159133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 135
Target Start/End: Original strand, 4045448 - 4045566
Alignment:
Q  17 aattagggtt-gttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttca 115  Q
    |||||||||| |||| || ||| |||||  || |||||||||||||| || |||| |||||||||   || ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4045448 aattagggtttgttctttatgagcttgttgaagctaatttcttgtaa-tcattttatatctctttgtaaataactcattgatagtggattggagagatca 4045546  T
Q  116 atctctcctccagagtaggt 135  Q
    || ||| | ||| |||||||    
T  4045547 atttctaccccaaagtaggt 4045566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 69 - 137
Target Start/End: Original strand, 9572667 - 9572735
Alignment:
Q  69 ttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtca 137  Q
    ||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||  |||||||||||    
T  9572667 ttgtaactctttgttaagaacccattgatagtggattgcagagatcaatctctactttagagtaggtca 9572735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 21356104 - 21356021
Alignment:
Q  96 atagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttt 181  Q
    |||||||||||||||| |   ||||||||||||| |||||| |  |||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  21356104 atagtggattggagagctgc-tctctcctccagattaggtc-atattggaccgaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttgttt 21356021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 34 - 122
Target Start/End: Original strand, 25073611 - 25073698
Alignment:
Q  34 gtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctc 122  Q
    |||| ||||| ||| ||| ||| ||||||| ||||| |||||||| |   |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  25073611 gtgagcttgttaaagctattttattgtaaccctttt-gtatctctatgtaaagaactcattgatagtggattagagaaatcaatctctc 25073698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 74)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 17 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 7780146 - 7779842
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7780146 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaacc--ttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 7780049  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgta 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7780048 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccaaagtgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcctcttccctctccttttatcttgtgcttgtgta 7779949  T
Q  217 ttgtg-tttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtg-ttttgttgattattgcttgcacatactttgtttggtggttaccactctcctttgctc 314  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7779948 ttgtgttttttcacttgtttcctagattagatctaggtgctgtttttgttgattattgcttgcacacactttg-ttggtggttaccactctcctttgctc 7779850  T
Q  315 cacacatc 322  Q
    ||||||||    
T  7779849 cacacatc 7779842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 17 - 370
Target Start/End: Original strand, 801116 - 801463
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  801116 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagtacaa 801215  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgta 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||    
T  801216 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatc------ttgtgta 801309  T
Q  217 ttgtgtttct-cacttgtttcctagattagatctaggtg--gtgttttgttgattattgcttgcacatactttgtttggtggttaccactctcctttgct 313  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||| ||| |||||||||    
T  801310 ttgtgtttttccacttgtttcctagattagatctaggtgctgttttttgttgattattgcttgcacacacttt-attagtggttactactttcctttgct 801408  T
Q  314 ccacacatcattattcttgtattggcgtggttcgatttgagatcggaattcacaaca 370  Q
    |||||||||||  |||  ||||||| |||   || ||||||||||||||||||||||    
T  801409 ccacacatcatatttc--gtattggtgtgacacgttttgagatcggaattcacaaca 801463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 17 - 328
Target Start/End: Original strand, 54635150 - 54635462
Alignment:
Q  17 aattagggtt-gttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttca 115  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  54635150 aattagggtttgttcattgtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtaca 54635246  T
Q  116 atctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctctt-ggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtg 214  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54635247 aactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtg 54635346  T
Q  215 tattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttg--cacatactttgtttggtggttaccactctcctttgc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54635347 tattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcacacacactttgtttggtggttaccactctcctttgc 54635446  T
Q  313 tccacacatcattatt 328  Q
    ||||||||||||||||    
T  54635447 tccacacatcattatt 54635462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 17 - 349
Target Start/End: Original strand, 45283008 - 45283344
Alignment:
Q  17 aattagggtt-gttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctctttt---gtaagaactcatt-gatagtggattggagag 111  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||   ||||||||| |||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45283008 aattagggtttgttcatagtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacc--ttttgtatccctttttttgtaagaactcatttgatagtggattggagag 45283104  T
Q  112 ttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctcct--tttatcttgtga 209  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  45283105 tacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaatctcttggtgcttttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtga 45283204  T
Q  210 ttgtgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcac--atactttgtttggtggttaccactctcc 307  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||    
T  45283205 ttgtgtattgtgtttctcactagtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcacaaacactttgtttggtggttaccgctctcc 45283304  T
Q  308 tttgctccacacatcattattcttgtattggcgtggttcgat 349  Q
     | ||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||    
T  45283305 gtcgctccacacatcattct--ttgtattggtgtggttcgat 45283344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 17 - 370
Target Start/End: Original strand, 6716525 - 6716881
Alignment:
Q  17 aattagggtt-gttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttca 115  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  6716525 aattagggtttgttcattgtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtaca 6716621  T
Q  116 atctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctc-ttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgt- 213  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  6716622 aactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctccccttttatcttgtgattgta 6716721  T
Q  214 gtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgtttt-gttgattattgcttg--cacatactttgtttggtggttaccactctccttt 310  Q
     | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| || ||| ||    
T  6716722 tttttgagtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttggttgattattgcttgcacacacactttgtttggtggttaccgctttccgtt 6716821  T
Q  311 gctccacacatcattattcttgtattggcgtggttcgattt--gagatcggaattcacaaca 370  Q
    ||||||||||||| | |  ||| ||||| |||||||||| |  | |||||||||||||||||    
T  6716822 gctccacacatcactct--ttgcattggtgtggttcgatctaggtgatcggaattcacaaca 6716881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 17 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 23200280 - 23199976
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23200280 aattagagttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccctttt-gtatct-ttttgtaagaactcattgatagtgaattggagagttcaa 23200183  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgta 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||      
T  23200182 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttatgcttgtggt 23200084  T
Q  217 ttgtgtttctca-cttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcacatactttgtttggtggttaccactctcctttgctcc 315  Q
    |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||  |||||| ||  ||||||| ||| |||||||||||    
T  23200083 ttgtgtttttcattttgtttcctagattagatctaggtgttttattgttgattattgcttgcactcactttg-ttattggttactactttcctttgctcc 23199985  T
Q  316 acacatcat 324  Q
    ||| |||||    
T  23199984 acatatcat 23199976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 17 - 349
Target Start/End: Original strand, 3617474 - 3617812
Alignment:
Q  17 aattagggtt-gttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagtt 113  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||   | ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||     
T  3617474 aattagggtttgttcatagtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacc--tcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagta 3617570  T
Q  114 caatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtct-ttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattg 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3617571 caatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctccttgtatcttgtgattg 3617670  T
Q  213 -tgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcac---atactttgtttggtggttaccactctcct 308  Q
     ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||   | |||||||| |||||||||||||||||     
T  3617671 ttgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcacaataaactttgttcggtggttaccactctccg 3617770  T
Q  309 ttgctccacacatcattatt-cttgtattggcgtggttcgat 349  Q
    | ||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||    
T  3617771 tcgctccacacatcattcttatttgtattggtgtggttcgat 3617812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 17 - 349
Target Start/End: Original strand, 25637451 - 25637792
Alignment:
Q  17 aattagggtt-gttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagtt 113  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||   | ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||     
T  25637451 aattagggtttgttcatagtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacc--tcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagta 25637547  T
Q  114 caatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctc-ttggtgtctttgttttcttcttccctctcct--tttatcttgtgat 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  25637548 caatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgat 25637647  T
Q  211 tg--tgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcac---atactttgtttggtggttaccactct 305  Q
    ||  ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||   | |||||||| |||||||||||||||    
T  25637648 tgtttgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcctgcttgcacaatacactttgttaggtggttaccactct 25637747  T
Q  306 cctttgctccacacatcattattc-ttgtattggcgtggttcgat 349  Q
    || | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  25637748 ccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgat 25637792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 17 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 23198081 - 23197823
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23198081 aattagagttgttttttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccctttt-gtatct-ttttgtaagaactcattgatagtgaattggagagttcaa 23197984  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgta 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||      
T  23197983 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtctttgttttcctcttctctctccttttatcttgtgcttgtggt 23197885  T
Q  217 ttgtgtttctca-cttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgc 277  Q
    |||||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||    
T  23197884 ttgtgtttttcattttgtttcctagattagatctatgtgttttattgttgattattgcttgc 23197823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 17 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 4600889 - 4600550
Alignment:
Q  17 aattagggtt-gttcattgtgaac-ttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagt 112  Q
    |||||||||| |||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||   ||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4600889 aattagggtttgttcatagtgaacattgtcaag-ctaatttcttgtaacc--ttttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagt 4600793  T
Q  113 tcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtct-ttgttttcttcttccctctcct--tttatcttgtga 209  Q
     ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  4600792 acaaactctcctctagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtga 4600693  T
Q  210 ttgtgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcac-ata--ctttgtttggtggttaccactctc 306  Q
    ||||  ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || | |||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  4600692 ttgttgatt-tgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttgttgtttctggcttgctcaataagctttgtttggtggttaccactctc 4600594  T
Q  307 ctttgctccacacatcattattc-ttgtattggcgtggttcgat 349  Q
    | | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  4600593 cgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgat 4600550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 17 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 4598668 - 4598329
Alignment:
Q  17 aattagggtt-gttcattgtgaac-ttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagt 112  Q
    |||||||||| |||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||   | ||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4598668 aattagggtttgttcatagtgaacattgtcaag-ctaatttcttgtaacc--tcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagt 4598572  T
Q  113 tcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtct-ttgttttcttcttccctctcct--tttatcttgtga 209  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  4598571 acaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtga 4598472  T
Q  210 ttgtgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcac-ata--ctttgtttggtggttaccactctc 306  Q
    |||| |  | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  4598471 ttgt-tgctttgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttattgtttcttgcttgctcaataagctttgtttggtggttaccactctc 4598373  T
Q  307 ctttgctccacacatcattattc-ttgtattggcgtggttcgat 349  Q
    | | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  4598372 cgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgat 4598329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 17 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 5258286 - 5257983
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5258286 aattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccctttt-gtatctctttgg-aagaactcattgatagtggattggagagttcaa 5258189  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgta 216  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||   ||||  |||||||||||| || || |||||      
T  5258188 tctcttctccagagtaggtcaagtttggaccgaacttggtgaacaatct-ttggtgtgtttgtttctctctt--ctctccttttatattttgcttgtggt 5258092  T
Q  217 ttgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttgcacatactttgtttggtggttaccactctcctttgctc 314  Q
    ||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||   |||||| ||  ||||||| ||| ||||||||||    
T  5258091 ttgtgcttttcactttgattcctagattagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttg-ttattggttactactttcctttgctc 5257993  T
Q  315 cacacatcat 324  Q
    ||||||||||    
T  5257992 cacacatcat 5257983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 9636268 - 9636010
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9636268 aattagggttgttctttgtgaacttgtcaaaactaatttcttgtaaccctttt-gtatct-ttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 9636171  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgta 216  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||   ||| | ||| |||||||||||||| |||||      
T  9636170 tctctcctccaaagtaggtcaagtttgaaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtgtttgtttctctctgctctc-ccttttatcttgtgcttgtgat 9636072  T
Q  217 ttgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttg 276  Q
    || || || |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  9636071 ttatgcttttcactttgattcctagattagatctaggtgctgttattgttgattattgcttg 9636010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 17 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 19684031 - 19683774
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19684031 aattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccctttt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaa 19683934  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgt-gt 215  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||   ||||  ||||||||||||||| || |||| ||    
T  19683933 tctctcctccatagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgtttctctctt--ctctccttttatcttttgcttgtggt 19683837  T
Q  216 attgtgtttctcacttgt-ttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttg 276  Q
     |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  19683836 tttgtgtttttcacttttattcctagattagatctaggtgctgttattgttgattattgcttg 19683774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 17 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 5260465 - 5260162
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5260465 aattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccctttt-gtatctctttgg-aagaactcattgatagtggattggagagttcaa 5260368  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgta 216  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||   ||||  |||||||||||| || || |||||      
T  5260367 tctcttctccaaagtaggtcaagtttggaccgaacttggtgaacaatct-ttggtgtgtttgtttctctctt--ctctccttttatattttgcttgtggt 5260271  T
Q  217 ttgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttgcacatactttgtttggtggttaccactctcctttgctc 314  Q
    ||||| || |||| ||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||  ||||||| ||| ||||||||||    
T  5260270 ttgtgcttttcactttgattcctaaattagatctaggtgttgttattgttgattattgcttgcactcactttg-ttattggttactactttcctttgctc 5260172  T
Q  315 cacacatcat 324  Q
    ||||||||||    
T  5260171 cacacatcat 5260162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 17 - 349
Target Start/End: Original strand, 10211418 - 10211757
Alignment:
Q  17 aattagggtt-gttcattgtgaac-ttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagt 112  Q
    |||||||||| |||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||   | ||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10211418 aattagggtttgttcatagtgaacattgtcaag-ctaatttcttgtaacc--tcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagt 10211514  T
Q  113 tcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtct-ttgttttcttcttccctctcct--tttatcttgtga 209  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| | |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||    
T  10211515 acaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcatcttccctctccttgtttatcttgtga 10211614  T
Q  210 ttgtgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcac-ata--ctttgtttggtggttaccactctc 306  Q
    |||| |  | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| | |||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  10211615 ttgt-tgctttgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgctcaataagctttgattggtggttaccactctc 10211713  T
Q  307 ctttgctccacacatcattattct-tgtattggcgtggttcgat 349  Q
    | | |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  10211714 cgtcgctccacacatcattattctctgtattggtgtggttcgat 10211757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 84 - 349
Target Start/End: Original strand, 10209265 - 10209537
Alignment:
Q  84 aagaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtct-ttgttt 181  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| |||| | ||||||    
T  10209265 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccaaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttt 10209364  T
Q  182 tcttcttccctctcct--tttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcac 279  Q
    || |||||||||||||  |||||||||||||||| |  | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| |    
T  10209365 tcatcttccctctccttgtttatcttgtgattgt-tgctttgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgctc 10209463  T
Q  280 -ata--ctttgtttggtggttaccactctcctttgctccacacatcattattct-tgtattggcgtggttcgat 349  Q
     |||  ||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  10209464 aataagctttgattggtggttaccactctccgtcactccacacatcattattctctgtattggtgtggttcgat 10209537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 17 - 349
Target Start/End: Original strand, 10056242 - 10056581
Alignment:
Q  17 aattagggtt-gttcattgtgaac-ttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagt 112  Q
    |||||||||| |||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||   | ||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10056242 aattagggtttgttcatagtgaacattgtcaag-ctaatttcttgtaacc--tcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagt 10056338  T
Q  113 tcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtct-ttgttttcttcttccctctcct--tttatcttgtga 209  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||     
T  10056339 acaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgt 10056438  T
Q  210 ttgtgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcac-ata--ctttgtttggtggttaccactctc 306  Q
    ||   |  | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  10056439 ttagttgctttgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtg-tttgttgtttcttgcttgctcaataagcttggtttggtggttaccactctc 10056537  T
Q  307 ctttgctccacacatcattattc-ttgtattggcgtggttcgat 349  Q
    | | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  10056538 cgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgat 10056581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 17 - 349
Target Start/End: Original strand, 10058464 - 10058803
Alignment:
Q  17 aattagggtt-gttcattgtgaac-ttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagt 112  Q
    |||||||||| |||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||   | ||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10058464 aattagggtttgttcatagtgaacattgtcaag-ctaatttcttgtaacc--tcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagt 10058560  T
Q  113 tcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtct-ttgttttcttcttccctctcct--tttatcttgtga 209  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||     
T  10058561 acaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgt 10058660  T
Q  210 ttgtgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcac-ata--ctttgtttggtggttaccactctc 306  Q
    ||   |  | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  10058661 ttagttgctttgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtg-tttgttgtttcttgcttgctcaataagcttggtttggtggttaccactctc 10058759  T
Q  307 ctttgctccacacatcattattc-ttgtattggcgtggttcgat 349  Q
    | | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  10058760 cgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgat 10058803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 17 - 349
Target Start/End: Original strand, 10060686 - 10061025
Alignment:
Q  17 aattagggtt-gttcattgtgaac-ttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagt 112  Q
    |||||||||| |||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||   | ||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10060686 aattagggtttgttcatagtgaacattgtcaag-ctaatttcttgtaacc--tcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagt 10060782  T
Q  113 tcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtct-ttgttttcttcttccctctcct--tttatcttgtga 209  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||     
T  10060783 acaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgt 10060882  T
Q  210 ttgtgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcac-ata--ctttgtttggtggttaccactctc 306  Q
    ||   |  | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  10060883 ttagttgctttgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtg-tttgttgtttcttgcttgctcaataagcttggtttggtggttaccactctc 10060981  T
Q  307 ctttgctccacacatcattattc-ttgtattggcgtggttcgat 349  Q
    | | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  10060982 cgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgat 10061025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 17 - 349
Target Start/End: Original strand, 10062908 - 10063247
Alignment:
Q  17 aattagggtt-gttcattgtgaac-ttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagt 112  Q
    |||||||||| |||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||   | ||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10062908 aattagggtttgttcatagtgaacattgtcaag-ctaatttcttgtaacc--tcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagt 10063004  T
Q  113 tcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtct-ttgttttcttcttccctctcct--tttatcttgtga 209  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||     
T  10063005 acaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgt 10063104  T
Q  210 ttgtgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcac-ata--ctttgtttggtggttaccactctc 306  Q
    ||   |  | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  10063105 ttagttgctttgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtg-tttgttgtttcttgcttgctcaataagcttggtttggtggttaccactctc 10063203  T
Q  307 ctttgctccacacatcattattc-ttgtattggcgtggttcgat 349  Q
    | | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  10063204 cgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgat 10063247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 17 - 349
Target Start/End: Original strand, 10065130 - 10065469
Alignment:
Q  17 aattagggtt-gttcattgtgaac-ttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagt 112  Q
    |||||||||| |||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||   | ||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10065130 aattagggtttgttcatagtgaacattgtcaag-ctaatttcttgtaacc--tcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagt 10065226  T
Q  113 tcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtct-ttgttttcttcttccctctcct--tttatcttgtga 209  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||     
T  10065227 acaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgt 10065326  T
Q  210 ttgtgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcac-ata--ctttgtttggtggttaccactctc 306  Q
    ||   |  | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  10065327 ttagttgctttgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtg-tttgttgtttcttgcttgctcaataagcttggtttggtggttaccactctc 10065425  T
Q  307 ctttgctccacacatcattattc-ttgtattggcgtggttcgat 349  Q
    | | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  10065426 cgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgat 10065469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 17 - 276
Target Start/End: Original strand, 7764490 - 7764747
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  7764490 aattagggttgttctttgtgaacttgttaaagctaatttcttgtaactctttt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatgaa 7764587  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgt-gt 215  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||   ||||  ||||||||||||||| || |||| ||    
T  7764588 tctctcctccagagtaggtcaaatttagaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgtttctctctt--ctctccttttatcttttgtttgtggt 7764684  T
Q  216 attgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttg 276  Q
     ||||| || |||| ||| |||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  7764685 tttgtgcttttcactttgattccaagattagatctaggtgctgttattgttgattattgcttg 7764747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 17 - 272
Target Start/End: Original strand, 37408484 - 37408737
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  37408484 aattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccctttt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattgaagagatcaa 37408581  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtg-t 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||   ||||  ||||||||||||||| || ||||| |    
T  37408582 tctctcctccagagtaggtcaagtttggatcgaactgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgtttctctctt--ctctccttttatcttttgcttgtgat 37408678  T
Q  216 attgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattg 272  Q
     | ||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  37408679 ttagtgcttttcactttgattcctagattagatctaggtgctgttattgttgattattg 37408737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 17 - 276
Target Start/End: Original strand, 7762291 - 7762548
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7762291 aattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaactctttt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaa 7762388  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgt-gt 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || ||| |||||||   ||||  ||||||||||||||| || |||| ||    
T  7762389 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-atgatgtgtttgtttctctctt--ctctccttttatcttttgcttgtggt 7762485  T
Q  216 attgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttg 276  Q
     ||||| || |||| ||| |||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||    
T  7762486 tttgtgcttttcactttgattcctaaattagatctaggtgttgttattgttgattattacttg 7762548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 17 - 276
Target Start/End: Original strand, 45095189 - 45095445
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45095189 aattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccctttt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaa 45095286  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgta 216  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || |||||||   |||   ||||||||||||||| || |||||      
T  45095287 tctctcctctagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggcgtatttgttt--ctctattctctccttttatcttttgcttgtggt 45095383  T
Q  217 ttgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttg 276  Q
    ||||||||  | | ||| ||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||    
T  45095384 ttgtgttttactctttgattcatagattagatctatgtgctgttattgttgattattgcttg 45095445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 122 - 349
Target Start/End: Original strand, 10067435 - 10067668
Alignment:
Q  122 cctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtct-ttgttttcttcttccctctcctt--ttatcttgtgattgtgtatt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||   |  |    
T  10067435 cctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgtttagttgct 10067534  T
Q  219 gtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcaca-ta--ctttgtttggtggttaccactctcctttgctcc 315  Q
     |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| || |||||||| || ||  ||| ||||||||||||||||||||| | |||||    
T  10067535 ttgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttt-gttgtttcttgcttgctcaataagcttggtttggtggttaccactctccgtcgctcc 10067633  T
Q  316 acacatcattattc-ttgtattggcgtggttcgat 349  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  10067634 acacatcattattctttgtattggtgtggttcgat 10067668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 17 - 276
Target Start/End: Original strand, 9581308 - 9581565
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    ||||||| |||||| |||||| |||||  || |||||||||| |||| | ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9581308 aattaggtttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttttaacccattt-gtatcccttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaa 9581405  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgt-gt 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||   ||||  |||||| ||||| ||||| |||| ||    
T  9581406 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttgatgtgtttgtttctctctt--ctctccctttattttgtgcttgtggt 9581502  T
Q  216 attgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttg 276  Q
     ||||| || |||| ||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  9581503 tttgtgcttttcactttgattcatagattagatctaggtgctgttattgttgattattgcttg 9581565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Original strand, 34491238 - 34491397
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34491238 aattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcattt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaa 34491335  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgtt 180  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  34491336 tctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgtt 34491397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 17 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 43401944 - 43401789
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  43401944 aattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacgcattttttatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagaaattaa 43401846  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgt 173  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43401845 tctctcctccagagtaggtcatggttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgt 43401789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 17 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 49199612 - 49199457
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  49199612 aattaaggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagattaa 49199514  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgt 173  Q
    ||||||||||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  49199513 tctctcctccagactaggtcatggttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgt 49199457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 276
Target Start/End: Original strand, 29810894 - 29811150
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29810894 aattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccattt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaa 29810991  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgt-gt 215  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| ||  |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||  ||| |||   |||||| |||||||| || |||| ||    
T  29810992 tctctcccccagattaggtcaag-ttaaaccgaattgggtcaacaatct-ttggtgtgtttg--ttcatctcttctctccctttatcttttgcttgtggt 29811087  T
Q  216 attgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttg 276  Q
     ||| | || |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  29811088 tttgagcttttcactttgattcctagattagatctaggtgctgttattgttgattattgcttg 29811150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 161
Target Start/End: Original strand, 4569978 - 4570120
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |  || ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4569978 aattagggttgttcattgtgagcttattgaagctaatttcttgtaactcattt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaa 4570075  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaaca 161  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  4570076 tctctactccagagtaggtgaagtttggaccgaactgggtcaaca 4570120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 43403887 - 43403736
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    ||||||| |||||| |||||| |||||  || || |||||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  43403887 aattaggcttgttctttgtgagcttgttgaagctcatttcttgtaactcatgttttatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagattaa 43403789  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttg 169  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43403788 tctctcctccagagtaggtcatggttggaccgaactgggtgaacaatctcttg 43403736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 17 - 274
Target Start/End: Original strand, 51398840 - 51399094
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||  || ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  |    
T  51398840 aattagggttgttcttagtgaacttgttgaagctaatttcttgtaactcattt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagattta 51398937  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgt-gt 215  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| | ||| |||||||| ||||||| ||||  ||| |||   |||||| |||||||| || |||| ||    
T  51398938 tctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaacttggtcaacaatct-ttggtgtgtttg--ttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggt 51399033  T
Q  216 attgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgct 274  Q
     ||||  || |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  51399034 tttgtacttttcactttgattcctagattagatctaggtgctgttattgttgattattgct 51399094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 17 - 173
Target Start/End: Original strand, 30236151 - 30236304
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30236151 aattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaac-ctatttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaa 30236248  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgt 173  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| | ||| |||||| |||||||||    
T  30236249 tctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactaggtcaacaatttcttggtgt 30236304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 5236598 - 5236343
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  5236598 aattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccattt-gtatctcttt-gtaagaactcattgataatggattcgagagatcaa 5236501  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgta 216  Q
    ||| ||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||||| ||||||    |||||  |||||||||||||| || ||||| |    
T  5236500 tctttcc-ccagattaggtcaa-tttggaccaaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttcctctcttc--tctccttttatcttttgcttgtgga 5236406  T
Q  217 tt-gtgtttctcactt-gtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttg 276  Q
    || ||| || |||||| | ||||||||||||||||||| | | || |||||||||||||||||    
T  5236405 tttgtgcttttcactttgattcctagattagatctaggagctcttattgttgattattgcttg 5236343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 272
Target Start/End: Original strand, 40735409 - 40735660
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||  || ||||||| ||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40735409 aattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaac-cagtttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaa 40735506  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgta 216  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||| | |||||| ||||||| ||||  ||| |||   |||||| |||||||| || ||||| |    
T  40735507 tctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcagcaatct-ttggtgtatttg--ttcctctcttctctcc-tttatcttttgcttgtgga 40735601  T
Q  217 -ttgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattg 272  Q
     ||||| || |||| ||| |||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  40735602 tttgtgcttttcactttggttcctatattagatctaggtgctgttattgttgattattg 40735660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 17 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 29196529 - 29196368
Alignment:
Q  17 aattagggtt-gttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttca 115  Q
    |||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  29196529 aattagggtttgttctttgtgagcttgtcaaagctaatttcttggaacccattt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatca 29196432  T
Q  116 atctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttt 181  Q
    |||||||| ||| | ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  29196431 atctctcccccaaattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 29196368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 17 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 6095741 - 6095600
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| |  ||  |||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6095741 aattagggttgttctttgtaaacttcttgaagttaatttcttgtaacccattt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaa 6095644  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaaca 161  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||    
T  6095643 tctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgtgtgaaca 6095600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 17 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 41819665 - 41819523
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||  |||||| |||||| || ||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  ||||    
T  41819665 aattagggttgttttttgtgagcttgtctaagctaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaagaactcatt-atagtggattggagacatcaa 41819568  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaaca 161  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||| || ||||||||||    
T  41819567 tctctcctccagagtaggtcattgttggaccaaactgggtgaaca 41819523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 17 - 165
Target Start/End: Original strand, 44331571 - 44331716
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||  | ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  44331571 aattagggttgttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaagccattt-gtatctcttt-gtaagaacttattgatagtggattggagagatcaa 44331668  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatct 165  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  44331669 tctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 44331716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 17 - 161
Target Start/End: Original strand, 54593730 - 54593871
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||  || ||||||| ||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  54593730 aattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccattt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaa 54593827  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaaca 161  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||    
T  54593828 tctctcctccagagtatgtcaag-ttggaccaaactgggtgaaca 54593871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 50 - 173
Target Start/End: Original strand, 40913352 - 40913472
Alignment:
Q  50 taatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccga 149  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||    
T  40913352 taatttcttgtaactcattt-gtatctcttt-gtaagaactcatcgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccga 40913448  T
Q  150 attgggtgaacaatctcttggtgt 173  Q
    | ||||| ||||||||||||||||    
T  40913449 actgggtcaacaatctcttggtgt 40913472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 181
Target Start/End: Original strand, 31314471 - 31314631
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  31314471 aattagggttgttcattgtgatcttgttgaagctaatttcttgtaacccattt-gtatct-ttttgtaagaactctttgatagtggattggagagatcaa 31314568  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttt 181  Q
    | ||||| ||| | ||||||||| |||||||||| || || |||||||| ||||||| |||||||    
T  31314569 tatctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgagtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 31314631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 165
Target Start/End: Original strand, 40734524 - 40734669
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||| | ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40734524 aattagggttgttctttgtgagcttgttgaacctaatttcttgtaacacattt-gtatcccttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaa 40734621  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatct 165  Q
    ||||||| ||| | ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  40734622 tctctcccccaaattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 40734669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 173
Target Start/End: Original strand, 46173383 - 46173536
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  46173383 aattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccattt-gtatctcttt-gtaagaattcattgatagtggattggagagatcaa 46173480  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgt 173  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| | | | |||||| |||||||||    
T  46173481 tctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactagatcaacaatttcttggtgt 46173536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 161
Target Start/End: Original strand, 46860500 - 46860642
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    ||||||| |||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  46860500 aattaggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccattt-gtatctcttt-gtaataactcattgatagtggattggagagatcaa 46860597  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaaca 161  Q
    ||| |||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||    
T  46860598 tctttcctccagagtaggtcattgttggaccgaattggatgaaca 46860642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 17 - 324
Target Start/End: Original strand, 760873 - 761173
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||  ||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||| | ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  760873 aattaggtctgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccattt-gtatcccttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaa 760970  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgt-gt 215  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||   ||||| |||    |||||||| || |||| ||    
T  760971 tctctcccccagattaggtcaag-ttggactgaaatgggttaacaatct-ttggtgtgtttgtttctctcttctctc----tttatcttttgcttgtggt 761064  T
Q  216 attgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtg-ttttgttgattattgcttgcacatactttgtttggtggttaccactctcctttgct 313  Q
     ||| | || |||| ||| ||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||     |||||| ||  ||||||| ||| |||||||||    
T  761065 tttgagcttttcactttgattcctagattagatctaggtgctgctattgttg-ttattgcttgagttcactttgatt-ttggttactactttcctttgct 761162  T
Q  314 ccacacatcat 324  Q
    |||||||||||    
T  761163 ccacacatcat 761173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 165
Target Start/End: Original strand, 29813089 - 29813234
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||| | ||| | |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  29813089 aattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccattt-gcatctcttt-gtaagaactcatttatagtggattggagagatcaa 29813186  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatct 165  Q
    ||||||| ||||| | ||||| | |||||||||| ||||| ||||||||    
T  29813187 tctctcccccagatttggtcatg-ttggaccgaactgggtcaacaatct 29813234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 39153503 - 39153358
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  39153503 aattaggtttgttcattgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaactcattt-gtatcccttta-taagaactcattgatagtggattggagagaacaa 39153406  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatct 165  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||    
T  39153405 tctctcccccagattaggtcaag-ttggactgaactgggtcaacaatct 39153358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 79 - 181
Target Start/End: Original strand, 16499115 - 16499215
Alignment:
Q  79 tttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttg 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  16499115 tttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagagtaggttaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtatttg 16499212  T
Q  179 ttt 181  Q
    |||    
T  16499213 ttt 16499215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 17 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 53921645 - 53921521
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    ||||||| |||||  |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  53921645 aattaggtttgttgtttgtgagcttgttaaagctaatttcttgtaactcattt-gtatca-ttttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaa 53921548  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttg 143  Q
    ||||||| || |||||| |||||||||    
T  53921547 tctctcccccggagtagatcaagtttg 53921521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 17 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 44700620 - 44700476
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||||  || ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  44700620 aattagggttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac-ctatttgtatctcttt-gtaagaactctttgatagtggattggagagatcaa 44700523  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatct 165  Q
    ||||||| ||| | ||||||||| |||||||||| | ||| ||||||||    
T  44700522 tctctcc-ccacattaggtcaag-ttggaccgaactaggtcaacaatct 44700476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 128
Target Start/End: Original strand, 36018878 - 36018987
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||  ||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  36018878 aattagggttgttctttgtgagcttgttgaagttaatttcttgtaactcattttgtatctc-tttgtaagaactcatt-atagtggattggagaggtcaa 36018975  T
Q  117 tctctcctccag 128  Q
    ||||||| ||||    
T  36018976 tctctcccccag 36018987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 17 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 22835144 - 22835014
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    ||||||| |||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||| | ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22835144 aattaggtttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccattt-gtatcccttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaa 22835047  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaa 150  Q
    ||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||    
T  22835046 tctctccgccatattaggtcaag-ttggaccgaa 22835014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 52 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 55302079 - 55301972
Alignment:
Q  52 atttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaat 151  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||     
T  55302079 atttcttgtaac-ctatttgtatctcttt-gtaagaattcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccatagtaggtcattgttggaccgaac 55301982  T
Q  152 tgggtgaaca 161  Q
    | ||||||||    
T  55301981 ttggtgaaca 55301972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 25 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 32744570 - 32744418
Alignment:
Q  25 ttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcct 124  Q
    |||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| |||| | ||||| |||     
T  32744570 ttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaactcattt-gtatcacttt-gtaagaactctttgatagtggattgaagagataaatctatccc 32744473  T
Q  125 ccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttt 181  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  32744472 ccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 32744418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 25 - 150
Target Start/End: Original strand, 32891138 - 32891260
Alignment:
Q  25 ttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcct 124  Q
    |||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||     
T  32891138 ttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcattt-gtatctcttt-gtaagaactcgttgatagtggattggagagataaatctctccc 32891235  T
Q  125 ccagagtaggtcaagtttggaccgaa 150  Q
    || |||||||||| | ||||||||||    
T  32891236 ccggagtaggtcatg-ttggaccgaa 32891260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 25 - 165
Target Start/End: Original strand, 29682393 - 29682530
Alignment:
Q  25 ttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcct 124  Q
    |||||| |||||| |||||  || |||||||||||| || | ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  29682393 ttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtcacccattt-gtatcccttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccc 29682490  T
Q  125 ccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatct 165  Q
    | ||| ||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  29682491 ctagattagatcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 29682530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 173
Target Start/End: Original strand, 47304277 - 47304430
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||  ||  |||| ||||||||| | | | |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  47304277 aattatggttgttctttgtgagcttgttgaagttaatatcttgtaacccatct-gtatctcttc-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaa 47304374  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgt 173  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||||| | |||||||    
T  47304375 tctctccccaagattaggtcaagttt-gaccgaactgggtcaacaatttattggtgt 47304430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 9666600 - 9666448
Alignment:
Q  25 ttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcct 124  Q
    |||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||||| |||  || |||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| |  ||||||||     
T  9666600 ttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcattta-tacctcttt-gtaagaattctttgatagtggattggagagattgatctctccc 9666503  T
Q  125 ccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttt 181  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  9666502 ccagattaggtaaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 9666448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 25 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 23392043 - 23391891
Alignment:
Q  25 ttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcct 124  Q
    |||||| |||||| |||||  ||  |||||||||||||| | ||| ||||| |||| | |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||     
T  23392043 ttgttctttgtgagcttgtttaagataatttcttgtaacccattt-gtatcacttt-gcaagaactctttgatagtggattgtagagataaatctctccc 23391946  T
Q  125 ccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttt 181  Q
    ||| | ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  23391945 ccaaattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 23391891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 23410411 - 23410311
Alignment:
Q  79 tttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttg 178  Q
    ||||||||||||| | |||| |||||||||||| | ||||||||| ||| | ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  23410411 tttgtaagaactcttagataatggattggagagataaatctctcccccaaattaggtcaag-ttggaacgaattgggtcaacaatct-ttggtgtgtttg 23410314  T
Q  179 ttt 181  Q
    |||    
T  23410313 ttt 23410311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 94 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 27305777 - 27305722
Alignment:
Q  94 tgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaa 150  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  27305777 tgatagtggattggagagatcaatctctcctccaaagtaggtcaa-tttggaccgaa 27305722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 87 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 2075149 - 2074994
Alignment:
Q  87 aactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttc 186  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||| ||||| ||| || ||| ||||| ||| |||   ||    
T  2075149 aactaattgatagtggatttgagagatcaatctctccccgagagtaggtcaag-ttggatcgaactgggtaaac-atttctgggtgtgtttattt--ctc 2075054  T
Q  187 ttccctctccttttatcttgtgattgt-gtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatct 249  Q
    ||| |||    |||||||| || |||| || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  2075053 ttctctc----tttatcttttgcttgtggttttgtgtttttcacttgtttcctagattaaatct 2074994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 23 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 4055901 - 4055813
Alignment:
Q  23 ggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaag-aactcattgatagtggattggagag 111  Q
    |||||||| | | |||||||| |||  ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  4055901 ggttgttcttggagaacttgtaaaagttaatttcttgtaacctcttttgtatctc-tttgtaagaaactcattgatagtggattgaagag 4055813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 84 - 137
Target Start/End: Original strand, 33191922 - 33191974
Alignment:
Q  84 aagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtca 137  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||    
T  33191922 aagaactcattgatagtggattagagagatcaatctct-ctccagaggaggtca 33191974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 234 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 9634750 - 9634707
Alignment:
Q  234 ttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttg 276  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  9634750 ttcctagattagatctaggtgctgttattgttgattattgcttg 9634707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 5433944 - 5433906
Alignment:
Q  99 gtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtca 137  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  5433944 gtggattggagagatcaatctctcctccatagtaggtca 5433906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 50 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 35138815 - 35138762
Alignment:
Q  50 taatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggat 104  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  35138815 taatttcttgcaactctttt-gtatctctttgtaaagaactcattgatagtggat 35138762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 51352244 - 51352150
Alignment:
Q  25 ttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctc 122  Q
    ||||||||||||| ||| | |||  |||||||||||||  |  ||||||| || ||||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  51352244 ttgttcattgtgagctttttaaagttaatttcttgtaa--ccatttgtatttc-tttgtaataactcattgagagtggatttgagagatcaatctctc 51352150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 4075595 - 4075511
Alignment:
Q  36 gaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaa-ctcattgatagtggattggagagttcaatctc 120  Q
    |||||||| |||  ||||||||||||||   ||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  4075595 gaacttgtaaaagttaatttcttgtaacctcttttgtatcacttt-gtaagaaactctttgatagtggattggagagatcactctc 4075511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 50 - 118
Target Start/End: Original strand, 20937715 - 20937781
Alignment:
Q  50 taatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatc 118  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||   ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||    
T  20937715 taatttcttgtaaccctttt-gtatctctttgaaaagaactcattgata-tagattggagagatcaatc 20937781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 70)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 17 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 43504298 - 43503944
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43504298 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtgaattggagagttcaa 43504199  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgta 216  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  43504198 tctctcctccatagtaggtcaagtttggatcgaactgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcctcttccctctccttttatcttgtgcttgtgtt 43504099  T
Q  217 ttgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttg--cacatactttgtttggtggttaccactctcctttgct 313  Q
    || || || |||| ||| |||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43504098 ttatgcttttcactttgattcctagattagatctagctg--tttttgttgattattgcttgcacacacactttg-ttggtggttaccactctcctttgct 43504002  T
Q  314 ccacacatcattattcttgtattggcgtggttcgatttgagatcggaattcacaacagaa 373  Q
    |||||||||||  |||  ||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43504001 ccacacatcatatttc--gtattggtgtgacacgatttgagatcggaattcacaacagaa 43503944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 17 - 349
Target Start/End: Original strand, 20343922 - 20344254
Alignment:
Q  17 aattagggtt-gttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcatt-gatagtggattggagagttc 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  20343922 aattagggtttgttcattgtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtac 20344018  T
Q  115 aatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctctt-ggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20344019 aatctctcctccagagtaggtcaagtt-ggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgt 20344117  T
Q  214 gtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctagg---tggtgttttgttgattattgcttgcacatactttgtttggtggttaccactctccttt 310  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20344118 gttttgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtgctggttttttgtcgattgttgcttgcacacactttgtttggtggttaccactctccttt 20344217  T
Q  311 gctccacacatcattattcttgtattggcgtggttcgat 349  Q
    ||||||||||||||| |  ||| ||||| ||||||||||    
T  20344218 gctccacacatcattct--ttgcattggtgtggttcgat 20344254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 17 - 289
Target Start/End: Original strand, 39731394 - 39731666
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39731394 aattagggttgttctttgtgaacttgtcagatctaatttcttgtaactctttt-gtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 39731492  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgta 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||      
T  39731493 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtctttgttttcctcttccctctccttttatcttgtgcttgtggt 39731591  T
Q  217 ttgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttgcacatactttgtt 289  Q
    ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  39731592 ttgtgcttttcactttgtttcctagattagatctaggtgttgttattgttgattattgcttgcacccactttgtt 39731666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 17 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 18388904 - 18388566
Alignment:
Q  17 aattagggtt-gttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagtt 113  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||   | ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||     
T  18388904 aattagggtttgttcatagtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacc--tcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagta 18388808  T
Q  114 caatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtct-ttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattg 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  18388807 caatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctctttgtatcttgtgattg 18388708  T
Q  213 -tgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcac---atactttgtttggtggttaccactctcct 308  Q
     ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||   | |||||||| |||||||||||||||||     
T  18388707 ttgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcacaataaactttgttcggtggttaccactctccg 18388608  T
Q  309 ttgctccacacatcattattc-ttgtattggcgtggttcgat 349  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  18388607 tcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgat 18388566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 17 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 18392340 - 18392002
Alignment:
Q  17 aattagggtt-gttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagtt 113  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||   | ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||     
T  18392340 aattagggtttgttcatagtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacc--tcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagta 18392244  T
Q  114 caatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtct-ttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattg 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18392243 caatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctccttgtatcttgtgattg 18392144  T
Q  213 -tgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcac---atactttgtttggtggttaccactctcct 308  Q
     ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||   | |||||||| ||||||||||||||||      
T  18392143 ttgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcacaataaactttgttcggtggttaccactctctg 18392044  T
Q  309 ttgctccacacatcattattc-ttgtattggcgtggttcgat 349  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  18392043 tcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgat 18392002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 71 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 1560757 - 1560471
Alignment:
Q  71 gtatctcttttgtaagaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttg 169  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  1560757 gtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtaaccaatctcttg 1560658  T
Q  170 gtgtctttgttttcttcttccctctcct--tttatcttgtgattg-tgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttga 266  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  1560657 gtgtatttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgt 1560558  T
Q  267 ttattgcttgcac---atactttgtttggtggttaccactctcctttgctccacacatcattattc-ttgtattggcgtggttcgat 349  Q
    || ||||||||||   ||||| |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  1560557 ttcttgcttgcacaatatactctgttcggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgat 1560471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 17 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 6594702 - 6594364
Alignment:
Q  17 aattagggtt-gttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagtt 113  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||   | ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||     
T  6594702 aattagggtttgttcatagtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacc--tcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagta 6594606  T
Q  114 caatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtct-ttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattg 212  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||    |||||||||||||||    
T  6594605 caaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctccttgtttatcttgtgattg 6594506  T
Q  213 -tgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcac---atactttgtttggtggttaccactctcct 308  Q
     ||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||     
T  6594505 ttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcacaataaactttgtttggtggttaccactctccg 6594406  T
Q  309 ttgctccacacatcattattc-ttgtattggcgtggttcgat 349  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  6594405 tcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgat 6594364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 17 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 6592484 - 6592146
Alignment:
Q  17 aattagggtt-gttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagtt 113  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||   | ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||     
T  6592484 aattagggtttgttcatagtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacc--tcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagta 6592388  T
Q  114 caatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtct-ttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattg 212  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||    ||| |||||||||||    
T  6592387 caaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctccttgtttttcttgtgattg 6592288  T
Q  213 -tgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcac---atactttgtttggtggttaccactctcct 308  Q
     ||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||     
T  6592287 ttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcacaataaactttgtttggtggttaccactctccg 6592188  T
Q  309 ttgctccacacatcattattc-ttgtattggcgtggttcgat 349  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  6592187 tcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgat 6592146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 272
Target Start/End: Original strand, 35853940 - 35854194
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35853940 aattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccctttt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 35854037  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgta 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||   ||||| ||| |||||||||||||| ||||||     
T  35854038 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtgtttgtttctctcttctctc-ccttttatcttgtgcttgtgtt 35854136  T
Q  217 ttgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattg 272  Q
    || || || |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  35854137 ttatgcttttcactttgcttcctagattagatctaggtgctgttattgttgattattg 35854194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 25767103 - 25766796
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25767103 aattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccccttttgtatctcttttg-aagaactcattgatagtggattggagagttcaa 25767005  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatc-ttgtgattgtgt 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||   | ||| ||| ||||||||| || || |||||     
T  25767004 tctctcctccagagtaggtcaagtttagaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtgtttgtttctctattctctc-ccttttatctttttgcttgtga 25766906  T
Q  216 attgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttgcacatactttgtttggtggttaccactctcctttgct 313  Q
     |||||||| |||| ||| | ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |  |||||| ||  ||||||| ||| | |||||||    
T  25766905 tttgtgtttttcactttgatacctagattagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcgctcactttg-ttattggttactacttttctttgct 25766807  T
Q  314 ccacacatcat 324  Q
    |||||||||||    
T  25766806 ccacacatcat 25766796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 24789866 - 24790075
Alignment:
Q  17 aattagggtt-gttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttca 115  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |     
T  24789866 aattagggtttgttcattgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaca--ttttgtatcccttttgtaaaaactctttgatagtggattggagagtact 24789963  T
Q  116 atctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttg-ttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtg 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24789964 atctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtctttgtttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtg 24790063  T
Q  215 tattgtgtttct 226  Q
     |||||||||||    
T  24790064 cattgtgtttct 24790075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 17 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 32060468 - 32060128
Alignment:
Q  17 aattagggtt-gttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctc--ttttgtaa-gaactcatt-gatagtggattggagag 111  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||   | ||||||| |  |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  32060468 aattagggtttgttcatagtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacc--tcttgtatcccctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagag 32060372  T
Q  112 ttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtct-ttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgat 210  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||    |||||||||||||    
T  32060371 tacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaacttggtgaacaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctccttgtttatcttgtgat 32060272  T
Q  211 tg-tgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcac---atactttgtttggtggttaccactctc 306  Q
    || ||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||   | |||||||| ||||||||||||||||    
T  32060271 tgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcacaataaactttgttcggtggttaccactctc 32060172  T
Q  307 ctttgctccacacatcattattc-ttgtattggcgtggttcgat 349  Q
    | | ||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||    
T  32060171 cgtcgctccacacatcattattctttatattggtgtggttcgat 32060128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 24 - 324
Target Start/End: Original strand, 48408835 - 48409136
Alignment:
Q  24 gttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcc 123  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  48408835 gttgttctttgtaaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccccttttgtatctcttttgaaataactcattgatagtggattggagagtttaatctctcc 48408934  T
Q  124 tccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatc-ttgtgattgtgtattgtgt 222  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||   ||||| ||| ||||||||| || || |||||  |||||     
T  48408935 tccagagtatgtcaagtttagaccgaactgggtgaacaatttcttggtgtgtttgtttctctcttctctc-ccttttatctttttgcttgtgatttgtgc 48409033  T
Q  223 ttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttgcacatactttgtttggtggttaccactctcctttgctccacaca 320  Q
    || |||| ||| | ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||  ||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  48409034 ttttcactttgatacctagattagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcactcactttg-ttattggttactactttcctttgctccacaca 48409132  T
Q  321 tcat 324  Q
    ||||    
T  48409133 tcat 48409136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 17 - 276
Target Start/End: Original strand, 23555066 - 23555323
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23555066 aattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacactttt-gtacctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaa 23555163  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgt-gt 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||   ||||  ||||||||||||||| || |||| ||    
T  23555164 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttgatgtgtttgtttctctctt--ctctccttttatcttttgcttgtggt 23555260  T
Q  216 attgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttg 276  Q
    ||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  23555261 attgtgttttttactttgattcctagattagatctaggtgttgttattgttgattattgcttg 23555323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 17 - 276
Target Start/End: Original strand, 29991079 - 29991335
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29991079 aattagggttgttatttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccctttt-gtatctctttc-taataactcattgatagtggattggagagatcaa 29991176  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgta 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||   ||||  ||||||||||||||| || |||||      
T  29991177 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgtttctctctt--ctctccttttatcttttgcttgtggt 29991273  T
Q  217 ttgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttg 276  Q
    ||||| || || | ||| |||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||    
T  29991274 ttgtgcttttctctttgattcctatattagatctaggtgttgttattgttgattattacttg 29991335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 17 - 324
Target Start/End: Original strand, 4178800 - 4179102
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  4178800 aattagggttgttctttgtgaacttgggaaagctaatttcttgtaaccctttt-gtatctctttg--aagaactcattgatagtggattgaacagttcaa 4178896  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgta 216  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||| || | |||||||||||| ||||||| |||||||   ||||  |||||||||||| || || |||||      
T  4178897 tctctcctccagagcaggtcaagtttgaaccaaactaggtgaacaatct-ttggtgtgtttgtttctctctt--ctctccttttatattttgcttgtggt 4178993  T
Q  217 ttgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttgcacatactttgtttggtggttaccactctcctttgctc 314  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||   |||||| ||  ||||||| ||| ||||||||||    
T  4178994 ttgtgtttttcactttgattcctagattagatctaggtgctgttattgttgattattgcttacattcactttg-ttattggttactactttcctttgctc 4179092  T
Q  315 cacacatcat 324  Q
    ||||||||||    
T  4179093 cacacatcat 4179102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 19502204 - 19502443
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    ||||| |||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19502204 aattaaggttgttttttgtgagcttgtcaaagctaatttcttgtaactctttt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaa 19502301  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgt-gt 215  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||   ||||  |||||| ||||| ||||| |||| ||    
T  19502302 tctctcctccagagtaagtcaagtttggaacgaagtgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgtttctctctt--ctctccctttattttgtgcttgtggt 19502398  T
Q  216 attgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt 259  Q
     ||| |||| |||| ||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  19502399 tttgagtttttcactttgattactagattagatctaggtgttgtt 19502443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 17 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 34310858 - 34310712
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||  || ||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34310858 aattagggttgttctttgtgaaattgttgaagctaatttcttgtaacacattt-gtatct-ttttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaa 34310761  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatct 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34310760 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 34310712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 49 - 276
Target Start/End: Original strand, 25615911 - 25616137
Alignment:
Q  49 ctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccg 148  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25615911 ctaatttcttgtaacccattt-gtatca-ttttgtaagaactcattgatagtggattagagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccg 25616008  T
Q  149 aattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgt-gtattgtgtttctcactt-gtttcctagattaga 246  Q
    || |||| ||||||||| ||||||| |||||||   |||| | ||||  ||||||||||| |||| || ||||| || |||||| | |||||||||||||    
T  25616009 aactgggcgaacaatct-ttggtgtgtttgtttctctctt-cttctctctttatcttgtgcttgtggttttgtgcttttcacttcgattcctagattaga 25616106  T
Q  247 tctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttg 276  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  25616107 tctaggtgttgttattgttgattattgcttg 25616137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Original strand, 22269999 - 22270158
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  22269999 aattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccattt-gtatctcttt-gtaagaactgattgatagtggattggagagatcaa 22270096  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgtt 180  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  22270097 tctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaac-atctcttggtgtgtttgtt 22270158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 272
Target Start/End: Original strand, 27347843 - 27348095
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  27347843 aattaggattgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccattt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattgcagagatcaa 27347940  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgt-gt 215  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||  ||| |||   |||||  |||||||| || |||| ||    
T  27347941 tctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttg--ttcctctcttctctcactttatcttttgcttgtggt 27348036  T
Q  216 attgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattg 272  Q
     |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  27348037 tttgtgtttttcactttgattcctagattagatctaggtgctgttattgttgattattg 27348095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 14069975 - 14069817
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14069975 aattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccattt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaa 14069878  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgt 179  Q
    ||||||| | ||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  14069877 tctctccccaagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgt 14069817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 14380003 - 14379845
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14380003 aattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccattt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaa 14379906  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgt 179  Q
    ||||||| | ||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  14379905 tctctcccctagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgt 14379845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 8359459 - 8359316
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||| ||| |||||| |||||  || ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8359459 aattagggtttttctttgtgagcttgtttaaactaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaa 8359361  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaaca 161  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||    
T  8359360 tctctcctccagagtaggtcattgttggaccgaactgggtgaaca 8359316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 41317576 - 41317416
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41317576 aattagggttgttctttgtgagcttgtcaaagctaatttcttgtaa-tccatttgtatcccttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaa 41317479  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttt 181  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  41317478 tctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 41317416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 276
Target Start/End: Original strand, 18126670 - 18126928
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  18126670 aattagggttgttctttgtgaacttgttcaagctaatttcttgtaacccattt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggaggaatcaa 18126767  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgt-gt 215  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||  ||||| |||||||| ||||||| ||||||    | ||  |||||| |||||||| || |||| ||    
T  18126768 tctctcccccagactaggtcaagttt-gaccgacctgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttcctctattttctctccctttatcttttgcttgtggt 18126865  T
Q  216 attgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttg 276  Q
     ||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||    
T  18126866 tttgtgcttttcactttgattcctagattagatctaggtgttgttattcttgattattgcttg 18126928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 221 - 324
Target Start/End: Original strand, 24790230 - 24790333
Alignment:
Q  221 gtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcacatactttgtttggtggttaccactctcctttgctccacaca 320  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  24790230 gtttctcacctgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattacttgcacgcactttgtttggtggttaccactttccgttgctccacaca 24790329  T
Q  321 tcat 324  Q
    ||||    
T  24790330 tcat 24790333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 173
Target Start/End: Original strand, 2390308 - 2390461
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||| |||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  2390308 aattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccattt-gtatctcttt-gtaataactcatatatagtggattggagagatcaa 2390405  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgt 173  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||||||||||||    
T  2390406 tctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactaggtgaataatctcttggtgt 2390461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 165
Target Start/End: Original strand, 8153368 - 8153513
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8153368 aattagggttgttctttgtgagattgtcaaagctaatttcttgtaactcattt-gtatctcttt-gtaataactcattgatagtggattggagagatcaa 8153465  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatct 165  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||    
T  8153466 tctctcccccagattaggtcaag-ttggactgaactgggtcaacaatct 8153513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 17 - 159
Target Start/End: Original strand, 29608763 - 29608902
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  29608763 aattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcattt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagatatcaa 29608860  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaa 159  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||    
T  29608861 tcactcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgagtgaa 29608902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 23 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 32358190 - 32358055
Alignment:
Q  23 ggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctc 122  Q
    |||||| | |||||| |||||  || ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32358190 ggttgtgctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccattt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctc 32358093  T
Q  123 ctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaaca 161  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  32358092 ctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 32358055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 17 - 274
Target Start/End: Original strand, 48489457 - 48489711
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||  || ||||||||||||||| | ||| |||||||||| | || |||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  48489457 aattagggttgttctttgaaaacttgttgaagctaatttcttgtaacccattt-gtatctcttt-gcaataactcattcatagtggattggagagatcaa 48489554  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgt-gt 215  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||  ||| |||   ||| || |||||||| || |||| ||    
T  48489555 tctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtaaacaatct-ttggtgtgtttg--ttcctctcttctcgccctttatcttttgcttgtggt 48489650  T
Q  216 attgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgct 274  Q
     ||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  48489651 tttgtgcttttcactttgattcctagattagatctaggtgttgttattgttgattattgct 48489711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 17 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 30024874 - 30024729
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  30024874 aattagggttgttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccattt-gtatctcttt-gtaagaactctttgatagtggattggagagatcaa 30024777  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatct 165  Q
    || |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||    
T  30024776 tcactcccccagagtaggtcaag-ttggaccgaactggatcaacaatct 30024729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 17 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 48599476 - 48599335
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  48599476 aattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcattt-gtatctctttgg-aagagctcattgatagtggattggagagatcaa 48599379  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaaca 161  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  48599378 tctctcctccagagcagatcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 48599335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 17 - 276
Target Start/End: Original strand, 43864270 - 43864526
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  || |||||||| |||||| | ||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  43864270 aattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcctgtaacccattt-gtatctcttt-gtaaaaactaattgatagtggattggagagatcaa 43864367  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgt-gt 215  Q
    ||||||  ||||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||    |||||| ||||  ||| |||   |||||| |||||||| || |||| ||    
T  43864368 tctctctcccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaat-agatggtgtgtttg--ttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggt 43864463  T
Q  216 attgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttg 276  Q
     ||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  43864464 tttgtgcttttcactttgattcctagattagatctaggtgctgttattgttgattattgcttg 43864526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 17 - 324
Target Start/End: Original strand, 1113683 - 1113981
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||  || |||||||||| |||| | ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  1113683 aattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttataacccattt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatagtagattggagagatcaa 1113780  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgt-gt 215  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||| || |||||||| ||||||| |||| |||||     | ||||| |||||||| || |||| ||    
T  1113781 tctctcccccatattaggtcaagttt-gaccgaattgagtcaacaatct-ttggtgtgtttg-tttct-----cttctccctttatcttttgcttgtggt 1113872  T
Q  216 attgtgtttctca-cttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttgcacatactttgtttggtggttaccactctcctttgct 313  Q
     |||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||    |||||||  |  | ||||||||| |||||||||    
T  1113873 tttgtgtttttcattttgattcctagattagatctaggtgttattattgttg-ttattgcttgtgtttactttg-atattagttaccactttcctttgct 1113970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 161
Target Start/End: Original strand, 3259024 - 3259162
Alignment:
Q  20 tagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatct 119  Q
    ||||||||||| |||||| |||||  || ||||||| ||||||||| ||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3259024 tagggttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttattgtaactcattt-gtatctcttt-gtaaaaacccattgatagtggattggagagatcaatct 3259121  T
Q  120 ctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaaca 161  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  3259122 ctcctccagagtaggtcaag-ttgaaccgaactgggtgaaca 3259162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 2759340 - 2759195
Alignment:
Q  16 caattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttca 115  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  2759340 caattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaactcattta-tatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagatatca 2759243  T
Q  116 atctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatc 164  Q
    |||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| | ||| |||||||    
T  2759242 atctcttccccagattaggtcaag-ttggaccgaacttggtcaacaatc 2759195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 157
Target Start/End: Original strand, 6431997 - 6432134
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    ||||||| |||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  6431997 aattaggattgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccattt-gtatctcttt-gtaagaactcgttgatagtggattggagagatcaa 6432094  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtg 157  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  6432095 tctctccttcagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtg 6432134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 141
Target Start/End: Original strand, 48491605 - 48491727
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||| | ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  48491605 aattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccattt-gtatctcttt-gaaagaactcattgatagtggattggagagatcaa 48491702  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtt 141  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||    
T  48491703 tctctcccccagattaggtcaagtt 48491727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 276
Target Start/End: Original strand, 4586187 - 4586443
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||| ||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4586187 aattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaattttttgtaacccatttt-tatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaa 4586284  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgt-gt 215  Q
    ||||||| ||| | || |||||  |||||||||| |||||  ||||||| || |||| ||||  ||| |||   |||||| |||||||| || |||| ||    
T  4586285 tctctcccccatattatgtcaa-cttggaccgaactgggtcgacaatct-ttcgtgtgtttg--ttcctctcttctctccctttatcttttgtttgtggt 4586380  T
Q  216 attgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttg 276  Q
     ||||| || |||| ||| || |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  4586381 tttgtgcttttcactttgattactagattagatctaggtgttgttattgtttattattgcttg 4586443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 47676278 - 47676040
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||  || ||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  47676278 aattagggttgttctttgtgaatttgttgaagctaatttcttgtaacccattt-gtatctcttt-gtaagaactcaatgatagtggaatggagagatcaa 47676181  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtg-t 215  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| ||||||| ||||||    |||||  ||||| |||||||| || ||||| |    
T  47676180 tctctcccccatattaggtcaagtt-ggaccgaactggatcaacaatct-ttggtgtgtttgttcctctcttc--tctccatttatcttttgcttgtggt 47676085  T
Q  216 attgtgtttctcactt-gtttcctagattagatctaggtggtgtt 259  Q
     ||||| || |||||| | || |||||||||||||||||| ||||    
T  47676084 tttgtgcttttcactttgattactagattagatctaggtgttgtt 47676040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 2361114 - 2360992
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||    
T  2361114 aattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcattt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggatttgagatatcaa 2361017  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtt 141  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||    
T  2361016 tctctcccccagattaggtcaagtt 2360992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 4508848 - 4508707
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| |  || ||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  4508848 aattagggttgttctttgtgagcttattgaagctaatttcttgtaacccattt-gtatctcttt-gtaagaactcattgagagtggattggagagatcaa 4508751  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaaca 161  Q
    ||||| || |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  4508750 tctcttcttcagagtaggttaag-ttggaccgaactgggtgaaca 4508707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 25 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 23565195 - 23565081
Alignment:
Q  25 ttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcct 124  Q
    |||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||      
T  23565195 ttgttctttgtgagcttgttgaaactaatttcttgtaactctttt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctc 23565098  T
Q  125 ccagagtaggtcaagtt 141  Q
    | |||||||||||||||    
T  23565097 ctagagtaggtcaagtt 23565081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 31733111 - 31732966
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||   || ||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  31733111 aattagggttgttctttgtgagcttggtgaagctaatttcttgtaacccattt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatactggattggagagatcaa 31733014  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatct 165  Q
    ||||||| ||| | ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  31733013 tctctcccccaaattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 31732966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 276
Target Start/End: Original strand, 26417342 - 26417598
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||  ||  |||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  26417342 aattagggttgttctttgtgagcttgttgaagataatttcttgtaacccattt-gtatctcttt-gtaagaactcgttgatagtggattggagagatcaa 26417439  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgt-gt 215  Q
    ||||||| ||||  ||||||||  ||||||| || ||||| |||||| ||||||||| ||||  ||| |||   |||||| |||||||| || |||| ||    
T  26417440 tctctcc-ccaggttaggtcaa-attggaccaaactgggtcaacaatttcttggtgtgtttg--ttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggt 26417535  T
Q  216 attgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttg 276  Q
     ||| | || |||| ||| ||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  26417536 tttgagcttttcactttgattcatagattatatctaggtgctgttattgttgattattgcttg 26417598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 47674085 - 47673927
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  47674085 aattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccattt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaa 47673988  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgtt 180  Q
    ||||||| ||| | || |||||| |||||||||| ||  | |||||||| ||||||| ||||||    
T  47673987 tctctcc-ccatattaagtcaag-ttggaccgaactgaatcaacaatct-ttggtgtgtttgtt 47673927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 49 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 41649121 - 41648993
Alignment:
Q  49 ctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccg 148  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||    
T  41649121 ctaatttcttgtaacccattt-gtatcccttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccaaattaggtcaag-ttggaccg 41649025  T
Q  149 aattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttt 181  Q
    || ||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  41649024 aactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 41648993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 17 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 496125 - 495965
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    ||||||||| |||| |||||| |||||  || ||||||||||| ||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  496125 aattagggtagttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgcaacccattt-gtatctcttta-taagaactcattgatagtggattggagagatcaa 496028  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttt 181  Q
    ||||||| | | ||||||||||| |||||| |||  |||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  496027 tctctcccctatagtaggtcaag-ttggacagaaccgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 495965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 17 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 38671364 - 38671204
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||  || ||||||| ||||||| | ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||    
T  38671364 aattagggttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttattgtaacacattt-gtatcacttt-gtaagaactcattgatagtggattgaagagataaa 38671267  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttt 181  Q
    ||| ||| ||| | ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  38671266 tctatcccccaaaataggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 38671204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 4253672 - 4253510
Alignment:
Q  17 aattagggtt-gttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttca 115  Q
    |||||||||| |||| |||||| |||||  || |||||||| |||||| |||||  ||||||||| | ||||||||||||||| |||||| ||||| |||    
T  4253672 aattagggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcatgtaaccctttta-tatctctttggaaagaactcattgataatggattagagagatca 4253574  T
Q  116 atctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttt 181  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||| || ||||||||| |||||||    
T  4253573 atctctcccacagagtaggtcaa-tttggaccgaactaggtaaac-atttcttggtgtgtttgttt 4253510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 25 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 6360087 - 6359941
Alignment:
Q  25 ttgttcattg-tgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcc 123  Q
    |||||||||| ||| |||||  || ||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |    
T  6360087 ttgttcattggtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccattt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatagttgattggagagatcaatctcttc 6359990  T
Q  124 tccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgt 173  Q
     ||| | ||||||||| ||||| |||| ||||| |||||| |||||||||    
T  6359989 cccatattaggtcaag-ttggatcgaactgggtcaacaatttcttggtgt 6359941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 68 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 24525594 - 24525484
Alignment:
Q  68 tttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctct 167  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||| |||||| ||| ||||| || ||||| |    
T  24525594 tttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccaagattaggtcaag-ttggacggaactgggtcaataatct-t 24525498  T
Q  168 tggtgtctttgttt 181  Q
    |||||| |||||||    
T  24525497 tggtgtgtttgttt 24525484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 68 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 36146500 - 36146390
Alignment:
Q  68 tttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctct 167  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||| | ||| |||||||| |    
T  36146500 tttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggatttgagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactaggtcaacaatct-t 36146404  T
Q  168 tggtgtctttgttt 181  Q
    |||||| |||||||    
T  36146403 tggtgtgtttgttt 36146390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 54 - 181
Target Start/End: Original strand, 31518965 - 31519089
Alignment:
Q  54 ttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctc-ctccagagtaggtcaagtttggaccgaatt 152  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| |    
T  31518965 ttcttgtaactcattt-gtatctcttt-gtaagaactcattgacagtggattggagagatcaatctctctccccagagtaggtcaag-ttggaccgaact 31519061  T
Q  153 gggtgaacaatctcttggtgtctttgttt 181  Q
    || | ||| || ||||||||| |||||||    
T  31519062 ggataaac-atttcttggtgtgtttgttt 31519089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 32 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 31105520 - 31105394
Alignment:
Q  32 ttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 131  Q
    |||||| |||||  || ||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| | |||||    
T  31105520 ttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccattt-gtatct-ttttgtaagaactcattgatggtggattggagagataaatctctccccaagagt 31105423  T
Q  132 aggtcaagtttggaccgaattgggtgaaca 161  Q
    || ||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  31105422 agatcaag-ttggaccgaactgggtaaaca 31105394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 49 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 4510658 - 4510549
Alignment:
Q  49 ctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccg 148  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  4510658 ctaatttcttgtaacccattt-gtatctcttta-taagaactcattgatagtggattgaagaaatcaatctctcctgtagagtaggtcaag-ttggaccg 4510562  T
Q  149 aattgggtgaaca 161  Q
     | ||||||||||    
T  4510561 tactgggtgaaca 4510549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 49 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 4512500 - 4512391
Alignment:
Q  49 ctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccg 148  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  4512500 ctaatttcttgtaacccattt-gtatctcttta-taagaactcattgatagtggattgaagaaatcaatctctcctgtagagtaggtcaag-ttggaccg 4512404  T
Q  149 aattgggtgaaca 161  Q
     | ||||||||||    
T  4512403 tactgggtgaaca 4512391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 25 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 22328525 - 22328395
Alignment:
Q  25 ttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcct 124  Q
    |||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||||   | ||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||     
T  22328525 ttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactctttt-gtatctctttgcaaggaagtcattaatagtggatttgagagatcaatctctccc 22328427  T
Q  125 ccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggt 156  Q
    | |||||||||||   |||||||||| |||||    
T  22328426 ctagagtaggtcattgttggaccgaactgggt 22328395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 67 - 161
Target Start/End: Original strand, 18396392 - 18396486
Alignment:
Q  67 ttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaaca 161  Q
    ||||||||||||||   ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||| ||||| ||||    
T  18396392 ttttgtatctctttataaagaattcattgatagaggattggagagatcaatctctcctcaagagtaggtcaatggtggaccgaactgggtaaaca 18396486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 87 - 163
Target Start/End: Original strand, 30814530 - 30814605
Alignment:
Q  87 aactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaat 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  30814530 aactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaat 30814605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 49 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 36574626 - 36574434
Alignment:
Q  49 ctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccg 148  Q
    ||||||||||||||| |||||  |||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||| | |||||||||||| ||||||||     
T  36574626 ctaatttcttgtaaccctttta-tatctctttgtaaagaactcattgatagtggtttggagagatcaatccatcc-ctagagtaggtcaa-tttggacca 36574530  T
Q  149 aattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgt-gtattgtgtttctcacttgtttcctagattagat 247  Q
    || ||||| ||| || ||||| ||| |||||||  |||||| |||    |||||||| |  |||| || |||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  36574529 aactgggtaaac-atttcttgatgtgtttgttt--ttcttctctc----tttatctttttcttgtggttttgtgtttttcacttgattcctagattagat 36574437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 12098001 - 12097849
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  ||  |||||||||||||| | ||| ||||||||        ||||| ||| ||||||||||||||| | ||    
T  12098001 aattagggttgttcattgtgagcttgttgaagttaatttcttgtaacccattt-gtatctct--------aactctttg-tagtggattggagagatgaa 12097912  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttt 181  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| | ||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  12097911 tctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactaggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 12097849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 3904726 - 3904628
Alignment:
Q  50 taatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccga 149  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||   |||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||  ||||||||||||   |||||||||    
T  3904726 taatttcttgtaacactttt-gcatctctttgtaaagaactcattgatagtg-atcagagagatcaatctctccctcagagtaggtcattgttggaccga 3904629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 123
Target Start/End: Original strand, 5116679 - 5116735
Alignment:
Q  67 ttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcc 123  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  5116679 ttttgtatctctttgtaaagaactcattgatagtgaattggagagataaatctctcc 5116735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 150
Target Start/End: Original strand, 23344016 - 23344129
Alignment:
Q  32 ttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 131  Q
    |||||| |||||  || ||||||||||||||| ||||  |||| ||||| || |||||||||||||| | |||||||||  | ||||||||  |||||||    
T  23344016 ttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccttta-gtatatcttt-gtgagaactcattgataatagattggagaaattaatctctc--ccagagt 23344111  T
Q  132 aggtcaagtttggaccgaa 150  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  23344112 aggtcaag-ttggaccgaa 23344129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 67 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 5513760 - 5513668
Alignment:
Q  67 ttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaaca 161  Q
    |||| |||||||||   ||||||||||||| | || |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||    
T  5513760 ttttatatctctttgtaaagaactcattgacactgaattggagaat-caatctcacctccagagtaggtcaa-tttggactgaactgggtaaaca 5513668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 103
Target Start/End: Original strand, 31518821 - 31518905
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtgga 103  Q
    ||||||| |||||| |||||| ||| |  || ||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  31518821 aattaggtttgttctttgtgagcttattgaagctagtttcttgtaactcattt-gtatctcttt-gtaagaactcattgacagtgga 31518905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 25 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 24526030 - 24525990
Alignment:
Q  25 ttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactc 65  Q
    |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  24526030 ttgttctttgtgagcttgtcaaagctaatttcttgtaactc 24525990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 48)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 17 - 324
Target Start/End: Original strand, 6266716 - 6267023
Alignment:
Q  17 aattagggtt-gttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttca 115  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  6266716 aattagggtttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtaca 6266813  T
Q  116 atctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtcttt-gttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtg 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  6266814 atctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtcttttgttttcttcttccctctccgtttatcttgtgcttgtg 6266913  T
Q  215 tattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcacatactttgtttggtggttaccactctcctttgctc 314  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6266914 tattgtgtttttcacttctttcctagattagatctaggtgttgttttgttgatttttgcttacacacactttgtttggtggttaccactctcctttgctc 6267013  T
Q  315 cacacatcat 324  Q
    ||||||||||    
T  6267014 cacacatcat 6267023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 17 - 371
Target Start/End: Original strand, 32289589 - 32289938
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||    
T  32289589 aattagggttgttctttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttt-gtatctcttttgtaagaactcattgatagtaaattagagagatcaa 32289687  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctc-ttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgt 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32289688 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtccttgttttcctcttccctctccttttatcttgtgcttgtgt 32289787  T
Q  216 attgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttgcacatactttgtttggtggttaccactctcctttgct 313  Q
     || || || |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  |||||| || |||||||| ||| |||||||||    
T  32289788 tttatgcttttcactttgtttcctagattagatctaggtgttgttattgttgattattgcttgcacccactttg-ttagtggttactactttcctttgct 32289886  T
Q  314 ccacacatcattattcttgtattggcgtggttcgatttgagatcggaattcacaacag 371  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||| |||||    |||||||||||||||||||||||    
T  32289887 ccacacatc-ttact-ttgtattggtgtggt----tttgagatcggaattcacaacag 32289938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 17 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 4484473 - 4484167
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4484473 aattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccctttt-gtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 4484375  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgta 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||      
T  4484374 tctctcctccagagtaggtcaagtttggacagaactgggtgaacaatct-ttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgcttgtggt 4484276  T
Q  217 ttgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttgcacatactttgtttggtggttaccactctcctttgctc 314  Q
    || || || |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||  ||||||| ||| ||||||||||    
T  4484275 ttttgcttttcactttgtttcctagattagatctaggtgttgttattgttgattattgcttgcactcactttg-ttattggttactactttcctttgctc 4484177  T
Q  315 cacacatcat 324  Q
    ||||||||||    
T  4484176 cacacatcat 4484167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 17 - 324
Target Start/End: Original strand, 30833371 - 30833677
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30833371 aattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagttaatttcttgtaaccctttt-gtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 30833469  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgta 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||      
T  30833470 tctctcctccagagtaggtcaagtttggactgaactgggtgaacaatct-ttggtgtctttgttttcctcttccctctccttttatcttgtgcttgtggt 30833568  T
Q  217 ttgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttgcacatactttgtttggtggttaccactctcctttgctc 314  Q
    ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||  |  ||  ||||||| ||| ||||||||||    
T  30833569 ttgtgcttttcactttgtttcctagattagatctaggtgttgttattgttgattattgcttgcactcac-ataattaatggttactactttcctttgctc 30833667  T
Q  315 cacacatcat 324  Q
    ||||||||||    
T  30833668 cacacatcat 30833677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 17 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 12647530 - 12647192
Alignment:
Q  17 aattagggtt-gttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagtt 113  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||   | ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||     
T  12647530 aattagggtttgttcatagtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacc--tcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagta 12647434  T
Q  114 caatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtct-ttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattg 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12647433 caatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctccttgtatcttgtgattg 12647334  T
Q  213 -tgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcac---atactttgtttggtggttaccactctcct 308  Q
     ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||   | |||||||| |||||||||||||||||     
T  12647333 ttgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcacaataaactttgttcggtggttaccactctccg 12647234  T
Q  309 ttgctccacacatcattattc-ttgtattggcgtggttcgat 349  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  12647233 tcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgat 12647192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 17 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 13656175 - 13655835
Alignment:
Q  17 aattagggtt-gttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcatt-gatagtggattggagagttc 114  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||   | ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  13656175 aattagggtttgttcatagtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacc--tcttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtac 13656079  T
Q  115 aatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctc-ttggtgtct-ttgttttcttcttccctctcct--tttatcttgtgat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  13656078 aatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttggtgtttgttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgat 13655979  T
Q  211 tg-tgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcac---atactttgtttggtggttaccactctc 306  Q
    || ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||   ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  13655978 tgttgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcacaatatactctgttcggtggttaccactctc 13655879  T
Q  307 ctttgctccacacatcattattc-ttgtattggcgtggttcgat 349  Q
    | | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  13655878 cgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgat 13655835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 17 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 4503274 - 4502975
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4503274 aattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaactctttt-gtatctctttg--aagaactcattgatagtggattggagagttcaa 4503178  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgta 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||   ||||  |||||||||||||||||| ||||||     
T  4503177 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgtttctctctt--ctctccttttatcttgtgcttgtgtt 4503081  T
Q  217 ttgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttgcacatactttgtttggtggttaccactctcctttgctc 314  Q
    ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||   |||||| ||  ||||||| ||| |||||| |||    
T  4503080 ttgtgcttttcactttgtttcctagattagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttg-ttattggttactactttcctttactc 4502982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 17 - 370
Target Start/End: Original strand, 45099781 - 45100122
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45099781 aattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaactctttt-gtatctctttg--aagaactcattgatagtggattggagagttcaa 45099877  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgta 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||   ||||  |||||||||||| || || |||||      
T  45099878 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgtttctctctt--ctctccttttatattttgcttgtgat 45099974  T
Q  217 ttgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttgcacatactttgtttggtggttaccactctcctttgctc 314  Q
    ||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||     ||||||  |  ||||||| ||| ||||||||||    
T  45099975 ttgtgcttttcactttgattcctagattagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgtgttcactttg-atattggttactactttcctttgctc 45100073  T
Q  315 cacacatcattattcttgtattggcgtggttcgatttgagatcggaattcacaaca 370  Q
    |||||||||| ||||  ||||||| ||     ||||||||| ||||||||||||||    
T  45100074 cacacatcataattc--gtattggtgt-----gatttgagaccggaattcacaaca 45100122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 36988218 - 36987961
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36988218 aattagggttgttctatgtgagcttgtcaaaactaatttcttgtaactctttt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaa 36988121  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgt-gt 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||   ||||  ||||||||||||||| || |||| |     
T  36988120 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgtttctctctt--ctctccttttatcttttgcttgtggc 36988024  T
Q  216 attgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttg 276  Q
     ||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  36988023 tttgtgcttttcactttgattcctagattagatctaggtgttgttattgttgattattgcttg 36987961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 17 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 36205806 - 36205504
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  36205806 aattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaactctttt-gtatctctttg--aagaactcattgacagcggattggagagttcaa 36205710  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgta 216  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||   ||||  |||||||||||| || || |||||      
T  36205709 tctatcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgtttctctctt--ctctccttttatattttgcttgtggt 36205613  T
Q  217 ttgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttgcacatactttgtttggtggttaccactctcctttgctc 314  Q
    || || || |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||     |||||| ||  ||||||| ||| ||||||||||    
T  36205612 ttctgcttttcactttgattcctagattagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgtgttcactttg-ttattggttactactttcctttgctc 36205514  T
Q  315 cacacatcat 324  Q
    ||||||||||    
T  36205513 cacacatcat 36205504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 17 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 5723398 - 5723146
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5723398 aattaggcttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaac-ctttttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaa 5723301  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgta 216  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||   |||   ||||||||||||||| || |||||      
T  5723300 tctctcctctagagtaggttaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgttt--ctctattctctccttttatcttttgcttgtggt 5723204  T
Q  217 ttgtgtttctc-acttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattg 272  Q
    ||||| || ||   ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  5723203 ttgtgcttttctttttgattcctagattagatctaggtgttgttattgttgattattg 5723146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 17 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 6595148 - 6594890
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  6595148 aattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaaccctttt-gaatctcttt-gtaagaactcgttgatagtggattggagagatcaa 6595051  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgt-gt 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||||   ||||| ||| ||||||||||| || |||| ||    
T  6595050 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaatct-ttggtgtgtttgtttctctcttctctc-ccttttatcttttgcttgtggt 6594953  T
Q  216 attgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttg 276  Q
     ||||| || |||| ||| || |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||    
T  6594952 tttgtgcttttcactttgatttctagattagatctaggtgctgttattgttgattattacttg 6594890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 2334556 - 2334368
Alignment:
Q  21 agggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctc 120  Q
    |||||||||| ||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2334556 agggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttctagtaactctttt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctc 2334459  T
Q  121 tcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtg 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| |||||||   ||||  |||||| ||||||||||| |||||    
T  2334458 tcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggggaacaatct-ttggtgtgtttgtttctctctt--ctctccctttatcttgtgcttgtg 2334368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 29867895 - 29868133
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  29867895 aattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccattt-gtatctcttt-gtaagaactctttgatagtggattggagagatcaa 29867992  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgt-gt 215  Q
    ||||||| ||| | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||| ||| |||||||   ||||  |||||| ||||||||||| |||| ||    
T  29867993 tctctcccccaaattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaataatct-ttgatgtgtttgtttctctctt--ctctccgtttatcttgtgcttgtggt 29868088  T
Q  216 attgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt 259  Q
     ||| |||| |||| ||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  29868089 tttgagtttttcactttgattactagattagatctaggtgttgtt 29868133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 35447026 - 35446885
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  35447026 aattagggttgttctttgtgatcttgttgaatctaatttcttgtaacccattt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcac 35446929  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaaca 161  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  35446928 tctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 35446885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 325
Target Start/End: Original strand, 38312266 - 38312570
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38312266 aattagggttgttctttgtgaacttgttgaaactaatttcttgtaacccattt-gtatctcttt-gtaagatctcattgatagtggattggagagatcaa 38312363  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgt-gt 215  Q
    ||||||| ||||| || |||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||| ||| ||||  ||| |||   |||||| |||||||| || |||| ||    
T  38312364 tctctcccccagattatgtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttgatgtgtttg--ttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggt 38312459  T
Q  216 attgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttgcacatactttgtttggtggttaccactctcctttgct 313  Q
     ||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||     ||||||  |  ||||||| ||| |||||||||    
T  38312460 tttgtgcttttcactttgattcctagattagatctaggtgctgttattgttgattgttgcttgtgttcactttg-atattggttactactttcctttgct 38312558  T
Q  314 ccacacatcatt 325  Q
    ||||||||||||    
T  38312559 ccacacatcatt 38312570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 161
Target Start/End: Original strand, 45726955 - 45727096
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45726955 aattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaac-ctatttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaa 45727052  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaaca 161  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  45727053 tctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 45727096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 17057511 - 17057255
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| |||  | |||||  || ||||||| ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17057511 aattagggttgttctttgcaagcttgttgaagctaattttttgtaactcattt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaa 17057414  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgt-gt 215  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||  ||| |||   |||||| |||||||| || |||| ||    
T  17057413 tctctcccccagactaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttg--ttcctctcgtctctccctttatcttttgcttgtggt 17057318  T
Q  216 attgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttg 276  Q
     ||||| || |||| ||  ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  17057317 tttgtgcttttcactttaattcctagattagatctaggtgctgttattgttgattattgcttg 17057255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 17085494 - 17085238
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| |||  | |||||  || ||||||| ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17085494 aattagggttgttctttgcaagcttgttgaagctaattttttgtaactcattt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaa 17085397  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgt-gt 215  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||  ||| |||   |||||| |||||||| || |||| ||    
T  17085396 tctctcccccagactaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttg--ttcctctcgtctctccctttatcttttgcttgtggt 17085301  T
Q  216 attgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttg 276  Q
     ||||| || |||| ||  ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  17085300 tttgtgcttttcactttaattcctagattagatctaggtgctgttattgttgattattgcttg 17085238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 17 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 34139913 - 34139752
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||| | | | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34139913 aattagggttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatat-gtatcccttttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaa 34139815  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttt 181  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  34139814 tctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 34139752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 181
Target Start/End: Original strand, 36773588 - 36773748
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  36773588 aattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcattt-gtatctcttt-gtaagaactctttgatagtggattggagagatcaa 36773685  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttt 181  Q
    ||||||| ||||| || |||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  36773686 tctctcccccagattatgtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 36773748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 17 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 723886 - 723726
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    ||||||| |||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||| | ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  723886 aattaggtttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccattt-gtatcccttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaa 723789  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttt 181  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  723788 tctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 723726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 17 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 14633968 - 14633807
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    ||||||| |||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  14633968 aattaggattgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccattt-gtatcccttttgtaagaactcatagatagtggattggagagatcaa 14633870  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttt 181  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| || || |||||||| ||||||| |||||||    
T  14633869 tctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgagtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 14633807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 17 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 36318151 - 36317991
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||  || ||||||| ||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36318151 aattagggttgttctttgtgagcttgttgaaactaatttattgtaacccattt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaa 36318054  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttt 181  Q
    |||||||   ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  36318053 tctctcccttagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 36317991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 17 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 1631874 - 1631735
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    ||||||| |||||| |||||| |||||  || ||||| ||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  1631874 aattaggattgttctttgtgagcttgttgaagctaatatcttgtaacccattt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagaaatcaa 1631777  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaa 159  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||    
T  1631776 tctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgagtgaa 1631735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 181
Target Start/End: Original strand, 11067331 - 11067491
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||| ||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||    
T  11067331 aattagtgttgtactttgtgagcttgtcaaagctaatttcttgtaacccattt-gtatctcttt-gtaagaactcatttataatggattgaagagatcaa 11067428  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttt 181  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| | ||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  11067429 tctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactcggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 11067491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 33162592 - 33162432
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||| | ||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  33162592 aattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccattt-gtatctctct-gtaagaactcattgatagtggattagagagatcaa 33162495  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttt 181  Q
    ||||||| | ||| ||||||||| |||||||||| | ||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  33162494 tctctcccctagattaggtcaag-ttggaccgaactaggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 33162432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 32 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 17490275 - 17490149
Alignment:
Q  32 ttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 131  Q
    |||||| |||||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | |||||    
T  17490275 ttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactctttt-gtaactcttt-gtaagaactcattgatagtggattgtagagatcaatctctcccctagagt 17490178  T
Q  132 aggtcaagtttggaccgaattgggtgaaca 161  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  17490177 aggtcaa-tttggaccgaactgggtaaaca 17490149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 25 - 173
Target Start/End: Original strand, 24398091 - 24398238
Alignment:
Q  25 ttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcct 124  Q
    |||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||| ||||| ||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||     
T  24398091 ttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaaccctttt-gtatctctttgtaaagaactcattgataatggattggagagatcaatctctccc 24398189  T
Q  125 ccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgt 173  Q
    ||| |||||||||   |||||||||| ||| ||||||||  ||||||||    
T  24398190 ccatagtaggtcattgttggaccgaactggctgaacaattacttggtgt 24398238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 17 - 161
Target Start/End: Original strand, 33648196 - 33648340
Alignment:
Q  17 aattagggtt-gttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttca 115  Q
    |||||||||| |||| |||||| |||||  || |||||||| |||||| ||||| |||| |||||   |||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  33648196 aattagggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcctgtaaccctttt-gtatttctttgtaaagaactcattgatagcggattggagagatca 33648294  T
Q  116 atctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaaca 161  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||| ||||    
T  33648295 atctctcctccagagtaggtcattgttggaccgaactgggtaaaca 33648340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 25 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 11151725 - 11151573
Alignment:
Q  25 ttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcct 124  Q
    |||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||| | ||| ||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||||||     
T  11151725 ttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccattt-gtatcacttt-gtaagaactcttagatagtggattggagagatcaacctctccc 11151628  T
Q  125 ccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttt 181  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  11151627 ccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 11151573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 17 - 141
Target Start/End: Original strand, 42362378 - 42362500
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    ||||||| |||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||| | ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  42362378 aattaggtttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccattt-gtatcccttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcta 42362475  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtt 141  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||    
T  42362476 tctctcccccagattaggtcaagtt 42362500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 42288252 - 42288101
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||  || ||||||| ||||||| | ||| |||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  42288252 aattaaggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccattt-gtatttcttt-gtaagagctcattgataatggattggagagatcaa 42288155  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtg 172  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||| || ||| ||||||||    
T  42288154 tctctcc-ccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaataatttcttggtg 42288101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 50 - 152
Target Start/End: Original strand, 28671989 - 28672090
Alignment:
Q  50 taatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccga 149  Q
    ||||||||||| || | ||||||||||||||   ||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  28671989 taatttcttgttac-cgttttgtatctctttacaaagaactcactgacagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccga 28672087  T
Q  150 att 152  Q
    |||    
T  28672088 att 28672090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 87 - 165
Target Start/End: Original strand, 39284930 - 39285007
Alignment:
Q  87 aactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatct 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  39284930 aactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 39285007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 49 - 150
Target Start/End: Original strand, 26353242 - 26353340
Alignment:
Q  49 ctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccg 148  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||   ||||||||||||| ||||||||    
T  26353242 ctaatttcttgtaacactttt-gtatct-ttttgtaagtactcattgatagtggattggagagatcactctctcccttagagtaggtcaag-ttggaccg 26353338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 49 - 141
Target Start/End: Original strand, 7451176 - 7451266
Alignment:
Q  49 ctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtt 141  Q
    |||||||||||||| || ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||||||||    
T  7451176 ctaatttcttgtaattcattt-gtatctcttt-gtaataactcattgatagtggattgcagagatcaatctctcctctacagtaggtcaagtt 7451266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 86 - 165
Target Start/End: Original strand, 17450671 - 17450748
Alignment:
Q  86 gaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatct 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||    
T  17450671 gaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcc-acagagtaggtcaag-ttggaccgaactaggtgaacaatct 17450748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 49 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 7815383 - 7815311
Alignment:
Q  49 ctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcc 123  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||    
T  7815383 ctaatttcttgtaactctttt-gtatctcttt-gtaagaactcatttatagtggattggagagattaatctctcc 7815311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 165
Target Start/End: Original strand, 11690527 - 11690672
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    ||||||| |||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||| | ||| ||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||||| ||||    
T  11690527 aattaggtttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccattt-gtatcccttt-gtaagaaatcgttgatagtggattggagagatcaa 11690624  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatct 165  Q
     |||||| ||| | || |||||| |||||||||| ||| | ||||||||    
T  11690625 cctctcccccatattacgtcaag-ttggaccgaactggatcaacaatct 11690672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 138
Target Start/End: Original strand, 11049594 - 11049699
Alignment:
Q  32 ttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 131  Q
    |||||| |||||  || |||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||| || | |    
T  11049594 ttgtgagcttgttgaagctaatttcttataacccttttagtatctcttt-gtaagaactcattgatagtagattgaaaagatcaatctctccttcataat 11049692  T
Q  132 aggtcaa 138  Q
    |||||||    
T  11049693 aggtcaa 11049699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 14202494 - 14202450
Alignment:
Q  79 tttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcc 123  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  14202494 tttgtaagaactcattgatagtagattggagagatcaatctctcc 14202450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 7597145 - 7597036
Alignment:
Q  25 ttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgt-aagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcc 123  Q
    |||||| || |||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||  |||||| ||  |||||||    
T  7597145 ttgttccttatgaacttgtcgaaactaatttcttgtaagtc-ttttgtatct-ttttgtaaagaactcattgattgtagaacggagagatc--tctctcc 7597050  T
Q  124 tccagagtaggtca 137  Q
    | ||||||||||||    
T  7597049 ttcagagtaggtca 7597036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 138
Target Start/End: Original strand, 42412117 - 42412162
Alignment:
Q  92 attgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaa 138  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  42412117 attgatagtggattggagagatcaatctctcc-ccagagtaggtcaa 42412162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 17 - 127
Target Start/End: Original strand, 13121794 - 13121901
Alignment:
Q  17 aattagggtt-gttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttca 115  Q
    |||||||||| |||| |||||| |||||  ||  ||||||||||||||    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||  |||    
T  13121794 aattagggtttgttctttgtgagcttgttgaagataatttcttgtaacc---tttgtatctcttt-gtagaaactcattgatagtggattgaagaaatca 13121889  T
Q  116 atctctcctcca 127  Q
    ||||||||||||    
T  13121890 atctctcctcca 13121901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 49 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 42019983 - 42019851
Alignment:
Q  49 ctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaa---ctcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgga 145  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||   ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| | ||| ||||||| |   |||||    
T  42019983 ctaatttcttgtaactctttt-gtatctcttt-gtaaaaaaaactcattgatagtgaatttgagagatcaatctcttccccatagtaggttattgttgga 42019886  T
Q  146 ccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttt 181  Q
    || |||||| | |||| | ||||||||| |||||||    
T  42019885 ccaaattggataaacact-tcttggtgtgtttgttt 42019851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 117 - 181
Target Start/End: Original strand, 1345590 - 1345653
Alignment:
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttt 181  Q
    ||||||| |||||||||||| |  |||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  1345590 tctctcccccagagtaggtc-atattggaccgaactgggtcaacaatttcttggtgtgtttgttt 1345653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 49 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 30218155 - 30218068
Alignment:
Q  49 ctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtca 137  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||   || || ||||||||||||| ||| | || |||||| |||| |||||||| ||||    
T  30218155 ctaatttcttgtaac-cattttgtatctctttgtaaataattcattgatagtgggttgaaaagatcaatcactcccccagagtaagtca 30218068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 57)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 17 - 372
Target Start/End: Original strand, 2627760 - 2628110
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2627760 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgcaactctttttgtatctcttgtgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 2627859  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgta 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  2627860 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaataatctcttggtgtctttgttttcctcttccctctccttttatcttgtgcttgtgtt 2627959  T
Q  217 ttgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttga-ttattgcttgcacatactttgtttggtggttaccactctcctttgctc 314  Q
    || || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||  |||||| || |||||||| ||| ||||||||||    
T  2627960 ttatgcttttcacttgtttcctagattagatctaggtgttgttattgttgattttttgcttgcacccactttg-ttagtggttactactttcctttgctc 2628058  T
Q  315 cacacatcattattcttgtattggcgtggttcgatttgagatcggaattcacaacaga 372  Q
    |||||||| ||| | ||||||||| |||||    || |||||||||||||||||||||    
T  2628059 cacacatc-ttact-ttgtattggtgtggt----ttcgagatcggaattcacaacaga 2628110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 17 - 349
Target Start/End: Original strand, 25689980 - 25690312
Alignment:
Q  17 aattagggtt-gttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttca 115  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  25689980 aattagggtttgttcattgtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtaca 25690076  T
Q  116 atctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctctt-ggtgtct-ttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgt 213  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  25690077 aactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtttgttgttttcttcttccctccccttttatcttgtgagtgt 25690176  T
Q  214 gtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttg--cacatactttgtttggtggttaccactctcctttg 311  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25690177 gttttgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattcttgcttgcacacacactttgtttggtggttaccactctcctttg 25690276  T
Q  312 ctccacacatcattattcttgtattggcgtggttcgat 349  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||    
T  25690277 ctccacacatcattct--ttgtattggtgtggttcgat 25690312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 17 - 349
Target Start/End: Original strand, 3439529 - 3439860
Alignment:
Q  17 aattagggtt-gttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttca 115  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  3439529 aattagggtttgttcattatgaacttggcaag-ctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtaca 3439625  T
Q  116 atctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctctt-ggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtg 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3439626 atctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactggatgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtg 3439725  T
Q  215 tattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcacatactttgtttggtggttaccactctcctttgctc 314  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||||    
T  3439726 ttttgagtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattgttgcttgcacacactttgtttggtggttaccgctctccgtcgctc 3439825  T
Q  315 cacacatcattattcttgtattggcgtggttcgat 349  Q
    ||||||||||| || | ||||||| ||||||||||    
T  3439826 cacacatcatttttttagtattggtgtggttcgat 3439860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 17 - 324
Target Start/End: Original strand, 31218283 - 31218586
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31218283 aattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccctttt-gtatctctttgg-aagaactcattgatagtggattagagagttcaa 31218380  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgta 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||   ||||  |||||||||||||||||| || |||     
T  31218381 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgtttctctctt--ctctccttttatcttgtgcttatgtt 31218477  T
Q  217 ttgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttgcacatactttgtttggtggttaccactctcctttgctc 314  Q
    ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||   |||||| ||  ||||| | ||| ||||||||||    
T  31218478 ttgtgcttttcactttgtttcctagattagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttg-ttattggttgctactttcctttgctc 31218576  T
Q  315 cacacatcat 324  Q
    ||||||||||    
T  31218577 cacacatcat 31218586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 349
Target Start/End: Original strand, 15290547 - 15290886
Alignment:
Q  17 aattagggtt-gttcattgtgaac-ttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagt 112  Q
    |||||||||| |||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||   | ||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15290547 aattagggtttgttcatagtgaacattgtcaag-ctaatttcttgtaacc--tcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagt 15290643  T
Q  113 tcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtct-ttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgatt 211  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15290644 acaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgtccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctccttgtatcttgtgatt 15290743  T
Q  212 g-tgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcac-ata--ctttgtttggtggttaccactctcc 307  Q
    | ||  ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||| | |||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  15290744 gttgctttgtgtttcacacttggttcctagattcgatctaggtggtgtattgttgtttcttgcttgctcaataagctttgttaggtggttaccactctcc 15290843  T
Q  308 tttgctccacacatcattattc-ttgtattggcgtggttcgat 349  Q
     | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  15290844 gtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgat 15290886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 349
Target Start/End: Original strand, 15470916 - 15471255
Alignment:
Q  17 aattagggtt-gttcattgtgaac-ttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagt 112  Q
    |||||||||| |||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||   | ||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15470916 aattagggtttgttcatagtgaacattgtcaag-ctaatttcttgtaacc--tcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagt 15471012  T
Q  113 tcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtct-ttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgatt 211  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15471013 acaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgtccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctccttgtatcttgtgatt 15471112  T
Q  212 g-tgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcac-ata--ctttgtttggtggttaccactctcc 307  Q
    | ||  ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||| | |||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  15471113 gttgctttgtgtttcacacttggttcctagattcgatctaggtggtgtattgttgtttcttgcttgctcaataagctttgttaggtggttaccactctcc 15471212  T
Q  308 tttgctccacacatcattattc-ttgtattggcgtggttcgat 349  Q
     | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  15471213 gtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgat 15471255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 17 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 42575469 - 42575131
Alignment:
Q  17 aattaggg-ttgttcattgtgaac-ttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagt 112  Q
    |||||||| |||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||   | ||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42575469 aattagggattgttcatagtgaacattgtcaag-ctaatttcttgtaacc--tcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagt 42575373  T
Q  113 tcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtct-ttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgatt 211  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  42575372 acaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctccttgtatcttgtgttt 42575273  T
Q  212 gtgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcac-ata--ctttgtttggtggttaccactctcct 308  Q
    |  |  | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| | |||  |||||||||||||||||||||||||     
T  42575272 ggttgctttgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgctcaataagctttgtttggtggttaccactctccg 42575173  T
Q  309 ttgctccacacatcattat-tcttgtattggcgtggttcgat 349  Q
    | |||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||    
T  42575172 tcgctccacacatcattatagtttgtattggtgtggttcgat 42575131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 17 - 370
Target Start/End: Original strand, 17982679 - 17983021
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17982679 aattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagttaatttcttgtaaccctttt-gtatctctttgg-aagaactcattgatagtggattggagagttcaa 17982776  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgta 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||   ||||  |||||||||||| || || |||||      
T  17982777 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgtttctctctt--ctctccttttatattttgcttgtggt 17982873  T
Q  217 ttgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttgcacatactttgtttggtggttaccactctcctttgctc 314  Q
    ||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||     |||||| ||  ||||||| ||  ||||||||||    
T  17982874 ttgtgcttttcactttgattcctagattagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgtgttcactttg-ttattggttactacgttcctttgctc 17982972  T
Q  315 cacacatcattattcttgtattggcgtggttcgatttgagatcggaattcacaaca 370  Q
    ||||||||||  |  ||||||||| ||     ||||||||||||||||||||||||    
T  17982973 cacacatcatagt--ttgtattggtgt-----gatttgagatcggaattcacaaca 17983021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 17 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 19945502 - 19945199
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19945502 aattatggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccacttttgtatctctttgg-aagaactcattgatagtggattggagagttcaa 19945404  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgta 216  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||   ||||  |||||||||||| || || |||||      
T  19945403 tctctcctcgagagtaggtcaagtttgaaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgtttctctctt--ctctccttttatattttgcttgtggt 19945307  T
Q  217 ttgtgtttctcactt-gtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttgcacatactttgtttggtggttaccactctcctttgctc 314  Q
    ||||| || |||||| | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||   |||||| ||  ||||||| ||| ||||||||||    
T  19945306 ttgtgcttttcacttcgattcctagattagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttg-ttattggttactactttcctttgctc 19945208  T
Q  315 cacacatca 323  Q
    |||||||||    
T  19945207 cacacatca 19945199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 276
Target Start/End: Original strand, 42498220 - 42498477
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42498220 aattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaaccctttt-gtatttcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaa 42498317  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgt-gt 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| | ||||  ||||||||||||||| || |||| ||    
T  42498318 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgtttccctctt--ctctccttttatcttttgcttgtggt 42498414  T
Q  216 attgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttg 276  Q
     |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  42498415 tttgtgtttttcactttgattcctagattagatctaggtgttgttattgttaattattgcttg 42498477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 34254473 - 34254170
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  34254473 aattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagttaatttcttgtaaccctttt-gtatctcttt-gtaagaacttattgatagtggattggagagatcaa 34254376  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgta 216  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||   ||||  ||||||||||||||| || |||||      
T  34254375 tctctcctctagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgtttctctctt--ctctccttttatcttttgcttgtggt 34254279  T
Q  217 ttgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttgcacatactttgtttggtggttaccactctcctttgctc 314  Q
    ||||| || || | ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  |  ||||||  |  ||||||| ||| ||||||||||    
T  34254278 ttgtgcttttctctttgattcctagattagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgtgctcactttg-atattggttactactttcctttgctc 34254180  T
Q  315 cacacatcat 324  Q
    ||||||||||    
T  34254179 cacacatcat 34254170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 34256649 - 34256393
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34256649 aattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagttaatttcttgtaaccctttt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaa 34256552  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgta 216  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||   ||||  ||||||||||||||| || |||||      
T  34256551 tctctcctctagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgtttctctctt--ctctccttttatcttttgcttgtggt 34256455  T
Q  217 ttgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttg 276  Q
    ||||| || || | ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  34256454 ttgtgcttttctctttgattcctagattagatctaggtgctgttattgttgattattgcttg 34256393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 276
Target Start/End: Original strand, 44303881 - 44304137
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44303881 aattaaggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaa-tccttttgtatctctttt-taagaactcattgatagtggattggagagttcaa 44303978  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgta 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||| |||||||   ||||  ||||||||||||||| || |||||      
T  44303979 tctctcctccagagtaggtcaagtttggatcgaactaggtgaacaatct-ttggtgtgtttgtttctctctt--ctctccttttatcttttgcttgtggt 44304075  T
Q  217 ttgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttg 276  Q
    ||||| || |||| ||| || |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  44304076 ttgtgcttttcactttgatttctagattagatctaggtgttgttattgttgattattgcttg 44304137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 17 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 1746360 - 1746105
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1746360 aattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccctttt-gtatctctttg--aagaactcattgatagtggattggagagttcaa 1746264  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgta 216  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||   ||||  |||||||||||| || || |||||      
T  1746263 tctctcctccatagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatc-gttggtgtgtttgtttctctctt--ctctccttttatattttgcttgtggt 1746167  T
Q  217 ttgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttg 276  Q
    ||| | || | || ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  1746166 ttgcgcttttgactttgattcctagattagatctaggtgctgttattgttgattattgcttg 1746105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 276
Target Start/End: Original strand, 33352176 - 33352432
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33352176 aattagggttgttctttgtgaacttgttgaacctaatttcttgtaacccattt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaa 33352273  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgta 216  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||| ||| ||||  ||| |||    |||||||||||||| || ||||| |    
T  33352274 tctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttgatgtgtttg--ttcctctcttatctccttttatcttttgcttgtgga 33352369  T
Q  217 -ttgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttg 276  Q
     |||||||| |||| ||| || ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||    
T  33352370 tttgtgtttttcactttgatttctagattagatttaggtgttgttattgttgattattgcttg 33352432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 43036449 - 43036687
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  43036449 aattagggttgttctttgtgaacttgttgaaactaatttcttgtaattcattt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggatttgagagatcaa 43036546  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgt-gt 215  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||  ||| |||   |||||| |||||||| || |||| ||    
T  43036547 tctctcctccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttg--ttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggt 43036642  T
Q  216 attgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt 259  Q
     ||| | || |||| ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  43036643 tttgagcttttcactttggttactagattagatctaggtggtgtt 43036687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 272
Target Start/End: Original strand, 4731684 - 4731936
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    ||||||||||| || |||||| |||||  || ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  4731684 aattagggttgctctttgtgagcttgttgaacctaatttcttgtaacccattt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcga 4731781  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtg-t 215  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||    |||||  ||||| |||||||| || ||||| |    
T  4731782 tctctcccccagattcggtcaagtt-ggaccgaattgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttcctctcttc--tctccctttatcttttgcttgtggt 4731877  T
Q  216 attgtgtttctcactt-gtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattg 272  Q
     ||||| || |||||| | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  4731878 tttgtgcttttcactttgattcctagattagatctaggtgctgttattgttgattattg 4731936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 272
Target Start/End: Original strand, 15212812 - 15213064
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  15212812 aattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccattt-gtatctcttt-gtaagaactcattgataatggattggagagatcaa 15212909  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgt-gt 215  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||  ||| |||   |||||| |||||||| || |||| |     
T  15212910 tctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttg--ttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggc 15213005  T
Q  216 attgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattg 272  Q
     ||||| || |||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||    
T  15213006 tttgtgcttttcactttgattcctagattagatcaaggtgctgttattgttgattattg 15213064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 12702776 - 12702542
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  12702776 aattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaaccctttt-gtgtctcttt-gtaagaactcattgatattggattggagagatcaa 12702679  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgt-gt 215  Q
    ||||||| | ||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||| | |||||||   ||||  |||||| ||||||||||| |||| ||    
T  12702678 tctctcccctagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtatgtttgtttctctctt--ctctccctttatcttgtgcttgtggt 12702583  T
Q  216 attgtgtttctcactt--gtttcctagattagatctaggtg 254  Q
     |||||||| ||||||   ||| ||||||||||||||||||    
T  12702582 tttgtgtttttcactttgattttctagattagatctaggtg 12702542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 17 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 42435133 - 42434992
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  42435133 aattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccattt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagaaatcaa 42435036  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaaca 161  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  42435035 tctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 42434992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 135
Target Start/End: Original strand, 40328805 - 40328922
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    ||||||| |||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40328805 aattaggtttgttctttgtgagcttgtttaaactaatttcttgtaactcattttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaa 40328903  T
Q  117 tctctcctccagagtaggt 135  Q
    |||||||||||||||||||    
T  40328904 tctctcctccagagtaggt 40328922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 276
Target Start/End: Original strand, 27811304 - 27811560
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  27811304 aattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccattt-gtatctcttt-gtaagaacccattgatagtggattgaagagatcaa 27811401  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtg-t 215  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||  | ||||  ||||   |||||||| || ||||| |    
T  27811402 tctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgttttttcccctctt--ctcttgctttatcttttgcttgtgat 27811497  T
Q  216 attgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttg 276  Q
     ||||| || |||| ||| |||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  27811498 tttgtgcttttcactttgattcctaaattagatctaggtgttgttattgttgattattgcttg 27811560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 276
Target Start/End: Original strand, 30143366 - 30143622
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30143366 aattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccattt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaa 30143463  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgt-gt 215  Q
    ||||||| |||||  |||||||| ||| || ||| || || |||||||| ||||||| ||||  ||| |||   |||||| |||||||| || |||| ||    
T  30143464 tctctcccccagataaggtcaag-ttgaactgaactgagtcaacaatct-ttggtgtgtttg--ttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggt 30143559  T
Q  216 attgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttg 276  Q
     ||| | || |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  30143560 tttgagcttttcactttgattcctagattagatctaggtgttgttattgttgattattgcttg 30143622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 25 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 3303804 - 3303652
Alignment:
Q  25 ttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcct 124  Q
    |||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||     
T  3303804 ttgttctttgtgagcttgtttaacctaatttcttgtaactcattt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattgaagagatcaatctctccc 3303707  T
Q  125 ccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttt 181  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  3303706 ccacagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtaaacaatct-ttggtgtgtttgttt 3303652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 17 - 161
Target Start/End: Original strand, 4283550 - 4283691
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||  |||||| |||||  || ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4283550 aattagggttgttttttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccattt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaa 4283647  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaaca 161  Q
    |||| |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  4283648 tctcccctctagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 4283691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 17 - 161
Target Start/End: Original strand, 18655426 - 18655567
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  18655426 aattaaggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccattt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattagagagatcaa 18655523  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaaca 161  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  18655524 tctctcctccaaagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 18655567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 32 - 165
Target Start/End: Original strand, 5689312 - 5689442
Alignment:
Q  32 ttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 131  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  5689312 ttgtgagcttgtcaaagctaatttcttgtaacccattt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagatt 5689409  T
Q  132 aggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatct 165  Q
     ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  5689410 tggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 5689442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 165
Target Start/End: Original strand, 40221771 - 40221916
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  40221771 aattagggttgttctttgtgagcttgttgaaactaatttcttgtaacccattt-gtatctcttt-gtaagaactcgttgatagtggattggagagatcaa 40221868  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatct 165  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||| || |||||    
T  40221869 tctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaataatct 40221916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 10930341 - 10930188
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    ||||||||||| || |||||| || ||  || ||||||||||||||| | |||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  10930341 aattagggttgctctttgtgagctcgttgaagctaatttcttgtaacccattta-tatctcttt-gtaagaacacattgatagtggattggagagatcaa 10930244  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgt 173  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  10930243 tctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatttcttggtgt 10930188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 161
Target Start/End: Original strand, 11384011 - 11384152
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||||  || ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||  || |    
T  11384011 aattagggttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaactcattt-gtatctcttt-gtaagaacccattgatactggattggagacatcga 11384108  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaaca 161  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  11384109 tctctcctccagagtaggttaag-ttggaccgaactgggtgaaca 11384152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 165
Target Start/End: Original strand, 40321106 - 40321251
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  ||  |||||||||||||| | ||  |||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  40321106 aattagggttgttcattgtgagcttgttgaagttaatttcttgtaacccatta-gtatctcttt-gtaaaaactctttgatagtggattggagagatcaa 40321203  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatct 165  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  40321204 tctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 40321251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 161
Target Start/End: Original strand, 4162525 - 4162663
Alignment:
Q  19 ttagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatc 118  Q
    ||||| |||||| ||| ||||||||  || ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||    
T  4162525 ttaggtttgttctttgagaacttgttgaagctaatttcttgtaactcattt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatag-ggattggagatatcaatc 4162621  T
Q  119 tctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaaca 161  Q
    ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  4162622 tctccccaagagtaggtcaag-ttggaccgaattgggtaaaca 4162663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 79 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 4743296 - 4743196
Alignment:
Q  79 tttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttg 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  4743296 tttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccaaagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttg 4743199  T
Q  179 ttt 181  Q
    |||    
T  4743198 ttt 4743196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 17 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 1345513 - 1345353
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| ||||||  || |  || ||||||||||||||| | | | |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1345513 aattagggttgttctttgtgagtttattgaagctaatttcttgtaacccatat-gtatctcttt-gaaagaactcattgatagtggattgaagagttcaa 1345416  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttt 181  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || ||||||| | ||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  1345415 tctctcccccagagtaggtcaag-ttagaccgaactaggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 1345353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 25 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 1292597 - 1292446
Alignment:
Q  25 ttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcct 124  Q
    |||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  | |||||||||     
T  1292597 ttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcattt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggatttgagaaataaatctctcc- 1292501  T
Q  125 ccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttt 181  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||| || ||||||||| |||||||    
T  1292500 ccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggcaaac-atttcttggtgtgtttgttt 1292446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 17 - 164
Target Start/End: Original strand, 9765771 - 9765914
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |       
T  9765771 aattagggttgttctttgtgagcttggcaaagctaatttcttgtaacccattt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagct-gc 9765867  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatc 164  Q
    ||||||| ||||| |||||| |  |||||||||| ||||| |||||||    
T  9765868 tctctcccccagattaggtc-atattggaccgaactgggtcaacaatc 9765914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 123
Target Start/End: Original strand, 44353819 - 44353923
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | || ||||    
T  44353819 aattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacacattt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattgaaaagatcaa 44353916  T
Q  117 tctctcc 123  Q
    |||||||    
T  44353917 tctctcc 44353923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 77 - 165
Target Start/End: Original strand, 6599056 - 6599143
Alignment:
Q  77 cttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatct 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  6599056 cttttgtaagaactcattgatagtggattagagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 6599143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 77 - 165
Target Start/End: Original strand, 6674509 - 6674596
Alignment:
Q  77 cttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatct 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  6674509 cttttgtaagaactcattgatagtggattagagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 6674596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 19491841 - 19491680
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    ||||||| |||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||| ||||    
T  19491841 aattaggtttgttctttgtgagcttgttgaaactaatttcttgtaacccattt-gtatctcttt-gtaagaactcgttgatagtggattaaagagatcaa 19491744  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttt 181  Q
    | ||||| ||| |||||||| |  |||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  19491743 tatctcccccatagtaggtc-atattggaccgaactaggtcaacaatatcttggtgtgtttgttt 19491680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 70 - 180
Target Start/End: Original strand, 4733784 - 4733891
Alignment:
Q  70 tgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttg 169  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||| ||| |||    
T  4733784 tgtatctcttt-gtaagaattcattgatagtggattggagagatcgatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacagtct-ttg 4733880  T
Q  170 gtgtctttgtt 180  Q
    |||| ||||||    
T  4733881 gtgtgtttgtt 4733891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 23 - 141
Target Start/End: Original strand, 18141852 - 18141968
Alignment:
Q  23 ggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctc 122  Q
    |||||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||| | ||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18141852 ggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccattt-gtatcacttt-gtaagaactctttgatagtggattggagagatcaatctctc 18141949  T
Q  123 ctccagagtaggtcaagtt 141  Q
    | | ||| |||||||||||    
T  18141950 ccctagattaggtcaagtt 18141968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 49 - 181
Target Start/End: Original strand, 10015139 - 10015265
Alignment:
Q  49 ctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccg 148  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  10015139 ctaatttcttgtaactcattt-gtatctctttt--aggaactcattgatagtggattggagagataaatctct-ctccatagtaggtcaag-ttggaccg 10015233  T
Q  149 aattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttt 181  Q
    || ||||| ||  || ||||||||| |||||||    
T  10015234 aactgggt-aatcatttcttggtgtatttgttt 10015265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 49 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 41366724 - 41366457
Alignment:
Q  49 ctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccg 148  Q
    |||||||||| |||| || |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||    
T  41366724 ctaatttcttttaac-ctatttgtatcccttt-gtaagaactcatttatagtggattggagagatcaatctctcc-ctagattaggtcaag-ttggaccg 41366629  T
Q  149 aattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgt-gtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattaga 246  Q
    || ||||  |||||||| ||||||| |||  |||| ||||| |   || |||||||| || |||| || ||||| || |||| ||| |||||| ||||||    
T  41366628 aactgggacaacaatct-ttggtgtgttttgtttc-tcttctc---ccatttatcttttgtttgtggttttgtgcttttcactttgattcctatattaga 41366534  T
Q  247 tctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttgcacatactttgtttggtggttaccactctcctttgctccacacatcat 324  Q
    |||||||| |||| |||||| ||||||||||    |||||||  |  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  41366533 tctaggtgttgttattgttg-ttattgcttgtgtttactttg-atattggttactactttcctttgctccacacatcat 41366457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 51 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 3073981 - 3073894
Alignment:
Q  51 aatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtt 141  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  3073981 aatttcttgtaaca-tttttgtatctcttt-gtaagaactcattgataatggcttggagagatcaatctctcc-ccatagtaggtcaagtt 3073894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 49 - 150
Target Start/End: Original strand, 8153816 - 8153914
Alignment:
Q  49 ctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccg 148  Q
    |||| ||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||    
T  8153816 ctaaattcgtgtaactctttt-gtatatcttt-gtaagaactcattgatagttgattggagagatcaatctcttcctcagagtaggtcaag-ttggaccg 8153912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 24 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 18106213 - 18106087
Alignment:
Q  24 gttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcc 123  Q
    ||||||| ||| || |||||  || ||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  18106213 gttgttctttgcgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcattt-gtatct--tttgtaagaactcattgatagt-gtttggagagatcaatctctcc 18106118  T
Q  124 tccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggt 156  Q
     ||||| ||||||||| |||||||||| |||||    
T  18106117 -ccagaataggtcaag-ttggaccgaactgggt 18106087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 25 - 181
Target Start/End: Original strand, 30291641 - 30291794
Alignment:
Q  25 ttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctct-cc 123  Q
    |||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  30291641 ttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcattt-gtatcacttt-gtaagaattctttgatagtggattggagagatcaatctctccc 30291738  T
Q  124 tccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttt 181  Q
    |||||| || | |||| |||||||||| ||  | |||||||| ||||||| |||||||    
T  30291739 tccagattatgccaag-ttggaccgaactgaatcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 30291794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 141
Target Start/End: Original strand, 3772218 - 3772340
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    ||||||| |||||| |||||| ||| |  || ||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| ||||    
T  3772218 aattaggtttgttctttgtgagcttatttaagctaatttcttgtaactcattt-gtatatcttt-gtaagaatttattgatagtggattggagagatcaa 3772315  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtt 141  Q
    ||| ||   ||||||||||||||||    
T  3772316 tctatctctcagagtaggtcaagtt 3772340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 49 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 32902284 - 32902197
Alignment:
Q  49 ctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtca 137  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  32902284 ctaatttcttgtaact-tttttgtatctctttctaaagaattcattgatagtgaatttgagagatcaatctctccccctgagtaggtca 32902197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 49 - 137
Target Start/End: Original strand, 7597672 - 7597759
Alignment:
Q  49 ctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtca 137  Q
    |||||||||| ||| || ||||||||||||||   |||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  7597672 ctaatttcttataa-tccttttgtatctctttgtaaagaatgcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccatagtaggtca 7597759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 8965800 - 8965692
Alignment:
Q  50 taatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccga 149  Q
    ||||||||| |||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| | ||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||    
T  8965800 taatttcttataaccctttta-tatctcttt-gtaagaactcattgatagtgcatcggagagataaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccga 8965704  T
Q  150 attgggtgaaca 161  Q
    | ||||| ||||    
T  8965703 actgggtaaaca 8965692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 111
Target Start/End: Original strand, 10929874 - 10929906
Alignment:
Q  79 tttgtaagaactcattgatagtggattggagag 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10929874 tttgtaagaactcattgatagtggattggagag 10929906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 49 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 11712111 - 11712024
Alignment:
Q  49 ctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtca 137  Q
    ||||||||||| ||| |||||  |||||||||   || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  || |||||||||    
T  11712111 ctaatttcttgaaaccctttta-tatctctttgtaaataactcattgatagtggattgaagagatcaatctctccctcaaagtaggtca 11712024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 135
Target Start/End: Original strand, 38863949 - 38864000
Alignment:
Q  84 aagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggt 135  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| || |||||||    
T  38863949 aagaactcgttgatagtggattggagagatcaatctcccctgcatagtaggt 38864000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 102
Target Start/End: Original strand, 10240188 - 10240264
Alignment:
Q  25 ttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtgg 102  Q
    |||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||| | | ||| ||||||||   |||||||||||||||||||    
T  10240188 ttgttctttgtgagcttgttgaatctaatttcttgtaac-catgttggatctctttgtaaagaactcattgatagtgg 10240264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 217 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 32902132 - 32902096
Alignment:
Q  217 ttgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggt 253  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32902132 ttgtgtttttcacttggttcctagattagatctaggt 32902096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 68)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 17 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 31495460 - 31495099
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31495460 aattaggattgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagttgattggagagttcaa 31495361  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttt--------tatcttgtg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||        |||||||||    
T  31495360 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcctcttccctctccttttatccttttatcttgtg 31495261  T
Q  209 attgtgtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttg--cacatactttgtttggtggttaccactct 305  Q
     |||||| || || || |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||| ||||||| ||| |    
T  31495260 cttgtgttttatgcttttcactttgtttcctagattagatctaggtgctgttttgttgattattgcttgcacacacactttg-ttgatggttactacttt 31495162  T
Q  306 cctttgctccacacatcattattcttgtattggcgtggttcgatttgagatcggaattcacaaca 370  Q
    |||||||||||||||||||  |||  |||||||  ||   |||||||||||||||||||||||||    
T  31495161 cctttgctccacacatcatatttc--gtattggtatgacacgatttgagatcggaattcacaaca 31495099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 17 - 349
Target Start/End: Original strand, 8395628 - 8395966
Alignment:
Q  17 aattagggtt-gttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcatt-gatagtggattggagagttc 114  Q
    |||||||||| |||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  8395628 aattagggtttgttcatagtgaacatgtcaag-ctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtac 8395724  T
Q  115 aatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtct-ttgttttcttcttccctctcc-ttttatcttgtgattg 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  8395725 aatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctccattgtatcttgtgattg 8395824  T
Q  213 -tgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcac---atactttgtttggtggttaccactctcct 308  Q
     ||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||     
T  8395825 ttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgttttttgcttgcacaataaactttgtttggtggttaccactctccg 8395924  T
Q  309 ttgctccacacatcattattc-ttgtattggcgtggttcgat 349  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  8395925 tcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgat 8395966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 17 - 349
Target Start/End: Original strand, 8393419 - 8393757
Alignment:
Q  17 aattagggtt-gttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcatt-gatagtggattggagagttc 114  Q
    |||||||||| |||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  8393419 aattagggtttgttcatagtgaacatgtcaag-ctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtac 8393515  T
Q  115 aatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtct-ttgttttcttcttccctctcc-ttttatcttgtgattg 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  8393516 aatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctccattgtatcttgtgattg 8393615  T
Q  213 -tgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcac---atactttgtttggtggttaccactctcct 308  Q
     ||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||   | |||| |||||||||||||||||||||     
T  8393616 ttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcacaataaacttcgtttggtggttaccactctccg 8393715  T
Q  309 ttgctccacacatcattattc-ttgtattggcgtggttcgat 349  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  8393716 tcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgat 8393757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 17 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 13992434 - 13992130
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13992434 aattagggttgttctttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttt-gtatctctt--gtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 13992338  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatc-ttgtgattgtgt 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||   ||||| ||| ||||||||| || || |||||     
T  13992337 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaacaatct-ttggtgtgtttgtttctctcttctctc-ccttttatctttttgcttgtga 13992240  T
Q  216 attgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttgcacatactttgtttggtggttaccactctcctttgct 313  Q
     ||||| || |||| ||| | ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||  ||||||| ||| |||||||||    
T  13992239 tttgtgcttttcactttgatacctagattagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcactcactttg-ttattggttactactttcctttgct 13992141  T
Q  314 ccacacatcat 324  Q
    |||||||||||    
T  13992140 ccacacatcat 13992130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 349
Target Start/End: Original strand, 7124926 - 7125264
Alignment:
Q  17 aattagggtt-gttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagtt 113  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||     
T  7124926 aattagggtttgttcatagtgaacttgtcaaa-ctaatttcttgtaacc--tcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagta 7125022  T
Q  114 caatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtct-ttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattg 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    ||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||    |||||||||||||||    
T  7125023 caatctctcctccagagtaggtcaagcaaagaccgaactgggtgaacaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctccttgtttatcttgtgattg 7125122  T
Q  213 t-gtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcac---atactttgtttggtggttaccactctcct 308  Q
    | |  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||   | |||||||| |||||||||||||||||     
T  7125123 ttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcacaataaactttgttcggtggttaccactctccg 7125222  T
Q  309 ttgctccacacatcattattc-ttgtattggcgtggttcgat 349  Q
    | ||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||    
T  7125223 tcgctccacacatcattattctttatattggtgtggttcgat 7125264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 349
Target Start/End: Original strand, 7122707 - 7123045
Alignment:
Q  17 aattagggtt-gttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagtt 113  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||     
T  7122707 aattagggtttgttcatagtgaacttgtcaaa-ctaatttcttgtaacc--tcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagta 7122803  T
Q  114 caatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtct-ttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattg 212  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    ||||||| |||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||    |||||||||||||||    
T  7122804 caatctctcctccatagtaggtcaagcaaagaccgaactgggtgaacaatttctttgtgtttattgttttcttcttccctccttgtttatcttgtgattg 7122903  T
Q  213 t-gtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcac---atactttgtttggtggttaccactctcct 308  Q
    | |  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||   | |||||||| |||||||||||||||||     
T  7122904 ttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcacaataaactttgttcggtggttaccactctccg 7123003  T
Q  309 ttgctccacacatcattattc-ttgtattggcgtggttcgat 349  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  7123004 tcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgat 7123045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 17 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 56178779 - 56178522
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  56178779 aattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaaccctttt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaa 56178682  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgt-gt 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||   ||||  ||||||||||||||| || |||| ||    
T  56178681 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgtttctctctt--ctctccttttatcttttgcttgtggt 56178585  T
Q  216 attgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttg 276  Q
     ||||| || |||| ||  ||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  56178584 tttgtgcttttcactttcattcctagattagatctaggtgttgttattgtttattattgcttg 56178522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 17 - 349
Target Start/End: Original strand, 5136088 - 5136428
Alignment:
Q  17 aattagggtt-gttcattgtgaac-ttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagt 112  Q
    |||||||||| |||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||   | ||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5136088 aattagggtttgttcatagtgaacattgtcaag-ctaatttcttgtaacc--tcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagt 5136184  T
Q  113 tcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtct-ttgttttcttcttccctctcct--tttatcttgtg- 208  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||     
T  5136185 acaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgt 5136284  T
Q  209 attgtgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcac-ata--ctttgtttggtggttaccactct 305  Q
     |||  |  | |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||  | |||||||| | |||  |||||||||||||||||||||||    
T  5136285 tttggttgctttgtttcacacttggttcctagattagatcta-gtgatgttttgttgtctcttgcttgctcaataagctttgtttggtggttaccactct 5136383  T
Q  306 cctttgctccacacatcattattc-ttgtattggcgtggttcgat 349  Q
    || | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  5136384 ccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgat 5136428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 17 - 349
Target Start/End: Original strand, 5138313 - 5138653
Alignment:
Q  17 aattagggtt-gttcattgtgaac-ttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagt 112  Q
    |||||||||| |||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||   | ||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5138313 aattagggtttgttcatagtgaacattgtcaag-ctaatttcttgtaacc--tcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagt 5138409  T
Q  113 tcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtct-ttgttttcttcttccctctcct--tttatcttgtg- 208  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||     
T  5138410 acaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgt 5138509  T
Q  209 attgtgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcac-ata--ctttgtttggtggttaccactct 305  Q
     |||  |  | |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||  | |||||||| | |||  |||||||||||||||||||||||    
T  5138510 tttggttgctttgtttcacacttggttcctagattagatcta-gtgatgttttgttgtctcttgcttgctcaataagctttgtttggtggttaccactct 5138608  T
Q  306 cctttgctccacacatcattattc-ttgtattggcgtggttcgat 349  Q
    || | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  5138609 ccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgat 5138653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 29999949 - 29999719
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29999949 aattagggttgttctttgtgaacatgtcaaagctaatttcttgtaactctttt-gtatcttttttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaa 29999851  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgta 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     ||||||| |||||||   ||||  |||||||||| |||| || |||||      
T  29999850 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca-----ttggtgtgtttgtttctctctt--ctctccttttgtcttttgcttgtggt 29999758  T
Q  217 ttgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtg 254  Q
    |||||||| || | ||| |||||||||||||||||||||    
T  29999757 ttgtgtttttctctttgattcctagattagatctaggtg 29999719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 17 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 5370226 - 5369968
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaat-ctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttca 115  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| |||    
T  5370226 aattagggttgttctttgtgaacttgtcaaaagctaatttcttgtaaccctttt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggactagagagatca 5370129  T
Q  116 atctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgt-g 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||| |||||||   ||||  ||||||||||||||| || |||| |    
T  5370128 atctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaatct-ttgatgtgtttgtttatctctt--ctctccttttatcttttgcttgtgg 5370032  T
Q  215 tattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttg 276  Q
    | ||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  5370031 ttttgtgcttttcactttgattcctagattagatctaggtgctgttattgttgattattgcttg 5369968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 17 - 276
Target Start/End: Original strand, 48143069 - 48143330
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  48143069 aattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaaccctttt-gtatctcttca-taagaactcattgatagtggattggagagatcaa 48143166  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtg-t 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| |||||||   ||||  ||||||||||||||| || ||||| |    
T  48143167 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccaaactgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgtttctctctt--ctctccttttatcttttgcttgtgat 48143263  T
Q  216 attgtg----tttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttg 276  Q
     |||||    ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  48143264 tttgtgcttttttttcactttgattcctagattagatctaggtgttgttattgttgattattgcttg 48143330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 17 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 52095504 - 52095248
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| ||||    
T  52095504 aattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccattt-gtatctcttt-gtaagaaatctttgatagtggattggagagatcaa 52095407  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgt-gt 215  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| |||||||   ||||  ||||||||||||||| |  |||| ||    
T  52095406 tctctcctccagagtagg-caagtttggaccgaactgggtgaacaat-ttttggtgtgtttgtttctctctt--ctctccttttatcttttccttgtggt 52095311  T
Q  216 attgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttg 276  Q
     ||||| || || | |||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||    
T  52095310 tttgtgcttttctctttgactcctagattagatctaggtgttgttattgttgattattacttg 52095248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 17 - 173
Target Start/End: Original strand, 2209739 - 2209894
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||| ||| |||||| |||||  || ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  2209739 aattagggtttttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagattaa 2209837  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgt 173  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2209838 tctctcctccagagtaggtcatggttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgt 2209894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 12744067 - 12743829
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12744067 aattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccattt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaa 12743970  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgt-gt 215  Q
    ||||||| ||| | ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||  ||| |||    |||||||||||||| || |||| ||    
T  12743969 tctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttg--ttcctctcttttctccttttatcttttgcttgtagt 12743874  T
Q  216 attgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt 259  Q
     ||||| || |||| ||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  12743873 tttgtgcttttcactttgattactagattagatctaggtgttgtt 12743829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 161
Target Start/End: Original strand, 6655982 - 6656123
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6655982 aattaaggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaactcattt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaa 6656079  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaaca 161  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6656080 tctctcatccagagtaggtcaag-ttggaccgaattgggtgaaca 6656123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 161
Target Start/End: Original strand, 46703526 - 46703669
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  46703526 aattagggttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaagaactcatttatagtggattggagagatcaa 46703624  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaaca 161  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  46703625 tctctcctccagagtaggtcattgttggaccgaattgggtgaaca 46703669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 9927600 - 9927345
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9927600 aattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccattt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaa 9927503  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgta 216  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| || || |||||||| ||||||| ||||  ||| |||   |||||| |||||||| || ||||| |    
T  9927502 tctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgagtcaacaatct-ttggtgtgtttg--ttcctctattctctcc-tttatcttttgcttgtgga 9927408  T
Q  217 -ttgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttg 276  Q
     ||||| || |||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  9927407 tttgtgcttttcactttgattcctagattaaatctaggtgctgttattgttgattattgcttg 9927345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 12745456 - 12745297
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12745456 aattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccattt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaa 12745359  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgtt 180  Q
    ||||||| ||| | ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  12745358 tctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgtt 12745297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 12739692 - 12739454
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12739692 aattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccattt-gtatctattt-gtatgaactcattgatagtggattggagagatcaa 12739595  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtg-t 215  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||    |||||  |||||||||||||| || ||||| |    
T  12739594 tctctcccccagattaggtcaagtt-ggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttcctctcttc--tctccttttatcttttgcttgtggt 12739499  T
Q  216 attgtgtttctcactt-gtttcctagattagatctaggtggtgtt 259  Q
     ||||| || |||||| | || || ||||||||||||||| ||||    
T  12739498 tttgtgcttttcactttgattacttgattagatctaggtgttgtt 12739454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 34570556 - 34570304
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||| |  || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34570556 aattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccaatt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaa 34570459  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtg-t 215  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||    |||||  |||||||||||||| || ||||| |    
T  34570458 tctctcccccagattaggttaagtt-ggatcgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttcctctcttc--tctccttttatcttttgcttgtggt 34570363  T
Q  216 attgtgtttctcactt-gtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattg 272  Q
     ||||| || |||||| | ||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  34570362 tttgtgcttttcactttgattcttagattagatctaggtgttgttattgttgattattg 34570304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 17 - 158
Target Start/End: Original strand, 41964441 - 41964580
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||  || ||||||| ||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41964441 aattagggttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttattgtaacccattttgtatcccttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaa 41964539  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtga 158  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  41964540 tctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 41964580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 17 - 173
Target Start/End: Original strand, 26364262 - 26364415
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  26364262 aattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaactcattt-gtatctcttt-gtaagaactcattaatagtggattggagagatcaa 26364359  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgt 173  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| ||| ||| ||||| |||||| |||||||||    
T  26364360 tctctcccccagattaggtcaagttt-gactgaactgggtcaacaatttcttggtgt 26364415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 26175778 - 26175619
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26175778 aattagggttgttctttgtgagcttgttgaaactaatttcttgtaacccattt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaa 26175681  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgtt 180  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  26175680 tctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgtt 26175619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 46147533 - 46147373
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||    
T  46147533 aattagggttgttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcattt-gtatctcttt-gtaagaactctttgatagtggattggagacatcaa 46147436  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttt 181  Q
    ||||||| ||| | ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  46147435 tctctcccccaaattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 46147373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 50262843 - 50262689
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||    
T  50262843 aattacggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccattt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatagttgattggagatatcaa 50262746  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgt 173  Q
    ||| |||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  50262745 tctttcctccagagtaggtcattgttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgt 50262689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 272
Target Start/End: Original strand, 37740651 - 37740903
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37740651 aattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccattt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaa 37740748  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgt-gt 215  Q
    ||||||| ||||| | ||||||| |||||||||| || || |||||| | || |||| ||||  ||| |||   |||||| |||||||| || |||| ||    
T  37740749 tctctcccccagatttggtcaag-ttggaccgaactgtgtcaacaat-tttttgtgtgtttg--ttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggt 37740844  T
Q  216 attgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattg 272  Q
     ||||| || |||| ||| |||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  37740845 tttgtgcttttcactttgattcctacattagatctaggtgctgttattgttgattattg 37740903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 20 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 52082796 - 52082549
Alignment:
Q  20 tagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatct 119  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||| || |||||||||||       | ||| |||    
T  52082796 tagggttgttctttgtgaacttgtcaaaactaatttcttgtaacccattt-gtatctcttt-gtaagaaatctttgatagtgga-------gatcattct 52082706  T
Q  120 ctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgt-gtatt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||   ||||  ||||||||||||||| || |||| || ||    
T  52082705 ctcctccagagtaggtcaagtttagaccgatttgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgtttatctctt--ctctccttttatcttttgcttgtggtttt 52082609  T
Q  219 gtgtttctc-acttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttg 276  Q
     || || ||   ||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  52082608 atgcttttctttttgattcctagataagatctaggtgctgttattgttgattattgcttg 52082549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 32 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 50673974 - 50673848
Alignment:
Q  32 ttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 131  Q
    |||||| |||||  || ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  50673974 ttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcattt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagt 50673877  T
Q  132 aggtcaagtttggaccgaattgggtgaaca 161  Q
    |||||||| |||||||||| | ||||||||    
T  50673876 aggtcaag-ttggaccgaactaggtgaaca 50673848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 17 - 161
Target Start/End: Original strand, 8648165 - 8648306
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||  || |||||||||| |||| | ||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  8648165 aattagggttgttcattgtgagtttgttgaagctaatttcttataacccattt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatattggattggagagatcaa 8648262  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaaca 161  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||    
T  8648263 tctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccaaactgggtgaaca 8648306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 17 - 141
Target Start/End: Original strand, 8665434 - 8665556
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||  || ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8665434 aattagggttgttctttgagagcttgttgaagctaatttcttgtaacccattt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaa 8665531  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtt 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  8665532 tctctcctccagagtaggtcaagtt 8665556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 17 - 161
Target Start/End: Original strand, 41639452 - 41639593
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |  || ||||||||||||||| | ||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  41639452 aattagggttgttctttgtgaactttttgaagctaatttcttgtaacccattt-gtatctattt-gtaagaactcatcgatagtggattggagagatcaa 41639549  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaaca 161  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||    
T  41639550 tctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgagtgaaca 41639593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 17 - 173
Target Start/End: Original strand, 54883046 - 54883199
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||  |||||| |||||  || ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  54883046 aattagggttgttttttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccattt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagggatcaa 54883143  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgt 173  Q
    ||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  54883144 tctctcctccagattaagtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatttcttggtgt 54883199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 17 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 48893784 - 48893620
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgt----gaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagt 112  Q
    |||||||||||||||||||    || |||||  || ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||     
T  48893784 aattagggttgttcattgtttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcattt-gtatctcttt-gtaagaactctttgatagtggattggagaga 48893687  T
Q  113 tcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttt 181  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  48893686 tcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 48893620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 161
Target Start/End: Original strand, 12073418 - 12073560
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    ||||||| |||||| |||||| |||||  || ||||||| ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12073418 aattaggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaactcattt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaa 12073515  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaaca 161  Q
    |||||| ||||||||||||||   |||||||||| | ||||||||    
T  12073516 tctctcttccagagtaggtcattgttggaccgaactaggtgaaca 12073560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 12744189 - 12744087
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12744189 aattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccattt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaa 12744092  T
Q  117 tctct 121  Q
    |||||    
T  12744091 tctct 12744087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 12745578 - 12745476
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12745578 aattagggttgttctttgtgaacttgtcaaaactaatttcttgtaacccattt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaa 12745481  T
Q  117 tctct 121  Q
    |||||    
T  12745480 tctct 12745476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 27417107 - 27416962
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27417107 aattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccattt-gtatctcttt-gtaaaaactcattgatagtggattggagagatcaa 27417010  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatct 165  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| || || ||||||||    
T  27417009 tctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgagtcaacaatct 27416962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 36463531 - 36463386
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||  || ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  36463531 aattagggctgttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccattt-gtatctcttt-gtaagaactctttgacagtggattggagagatcaa 36463434  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatct 165  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  36463433 tctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 36463386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 161
Target Start/End: Original strand, 40632471 - 40632612
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40632471 aattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaac-ctatttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaa 40632568  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaaca 161  Q
    ||||||||| | |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  40632569 tctctcctctaaagtaagtcaag-ttggaccgaactgggtaaaca 40632612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 25 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 45687316 - 45687164
Alignment:
Q  25 ttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcct 124  Q
    |||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  45687316 ttgttctttgtgagcttgtcaaagctaatttcttataactcattt-gtatctattt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatctatctctcct 45687219  T
Q  125 ccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttt 181  Q
    ||| | || |||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  45687218 ccatattatgtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 45687164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 47038552 - 47038393
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||  || |||||||||||||| ||  |||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  47038552 aattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaa-tc-atttgtatct-gtttgtaaggactcattgatagtggattggagagatcaa 47038456  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttt 181  Q
    ||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  47038455 tctctcccccagagtaagtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 47038393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 17 - 150
Target Start/End: Original strand, 35662467 - 35662597
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| || |||  ||||  || ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35662467 aattagggttgttctttatgagtttgttgaagctaatttcttgtaactcattt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaa 35662564  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaa 150  Q
    | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  35662565 tatctcctcaagagtaggtcaag-ttggaccgaa 35662597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 161
Target Start/End: Original strand, 379406 - 379548
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    ||||||| |||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||| | ||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  379406 aattaggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccattt-gtatcgcttt-gtaagaactaattgatagtggattggagagatcaa 379503  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaaca 161  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||| ||| ||||||    
T  379504 tctctcctccagagtaggtcattgttggaccgaactggatgaaca 379548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 272
Target Start/End: Original strand, 5429705 - 5429957
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||| ||| | |||| |||||  || ||||||||||||||| | ||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5429705 aattagggttattcttcgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccattt-gtatctattt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaa 5429802  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgt-gt 215  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||| ||| ||| ||||  ||| |||   |||||| |||||||| |  |||| ||    
T  5429803 tctctcccccagattaggttaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttgatgtgtttg--ttcctctcttctctccctttatcttttacttgtggt 5429898  T
Q  216 attgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattg 272  Q
     ||| | || |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  5429899 tttgagcttttcactttgattcctagattagatctaggtgctgttattgttgattattg 5429957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 17 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 12747898 - 12747794
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12747898 aattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaac-ccatttgtatct-atttgtatgaactcattgatagtggattggagagatcaa 12747801  T
Q  117 tctctcc 123  Q
    |||||||    
T  12747800 tctctcc 12747794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 25 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 6542313 - 6542161
Alignment:
Q  25 ttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcct 124  Q
    |||||| |||||| |||||  || |||||||||||| |  ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  6542313 ttgttctttgtgagcttgttgaaactaatttcttgttagcctttt-gtatctcttt-gtaagaactcgttgatagtggattggagagatcaatctctccc 6542216  T
Q  125 ccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttt 181  Q
    |||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||| || ||||||||| |||||||    
T  6542215 ccagggtaggtcaag-ttggaccgaactgggtaaac-atttcttggtgtgtttgttt 6542161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 25 - 173
Target Start/End: Original strand, 12119573 - 12119719
Alignment:
Q  25 ttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcct 124  Q
    |||||| |||||||||| |  || ||||||||||||||| ||||| ||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||     
T  12119573 ttgttctttgtgaactttttgaagctaatttcttgtaaccctttt-gtatctctttgtaaagaactcatttatagtggattggagagatcaatctctcc- 12119670  T
Q  125 ccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgt 173  Q
    | |||||||||||   |||||||||| | |||||||||| |||||||||    
T  12119671 caagagtaggtcattgttggaccgaactaggtgaacaatttcttggtgt 12119719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 49 - 181
Target Start/End: Original strand, 31474209 - 31474337
Alignment:
Q  49 ctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccg 148  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  31474209 ctaatttcttgtaactcattt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatagttgattggagagataaatctctccaccagagtagatcaag-ttggaccg 31474305  T
Q  149 aattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttt 181  Q
    || ||||| ||| || ||||||||| |||||||    
T  31474306 aactgggtaaac-atatcttggtgtgtttgttt 31474337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 17 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 54200048 - 54199926
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||     
T  54200048 aattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccattt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatagtgaattagagagatcat 54199951  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtt 141  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||    
T  54199950 tctctcccccagattaggtcaagtt 54199926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 163
Target Start/End: Original strand, 36994550 - 36994693
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||| | ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36994550 aattaaggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccattt-gtatcccttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaa 36994647  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaat 163  Q
    ||||||| ||| | ||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  36994648 tctctcccccatattagatcaag-ttggaccgaactgggtcaacaat 36994693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 37229865 - 37229733
Alignment:
Q  17 aattagggt-tgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttca 115  Q
    ||||||||| ||||| |||||| ||||| ||| | ||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  37229865 aattagggtgtgttctttgtgagcttgttaaagcaaatttgttgtaaccctttttatatctcttt-gtaagaactcatttatagtggattggagagatca 37229767  T
Q  116 atctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaa 150  Q
    ||||||||  || ||||||||||| ||||||||||    
T  37229766 atctctccctcatagtaggtcaag-ttggaccgaa 37229733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 79 - 259
Target Start/End: Original strand, 29254580 - 29254758
Alignment:
Q  79 tttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttg 178  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| | ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  29254580 tttgtaagaactcgttgatagtggattggagagatcaatctctctcccaaattaggtcaagtt-ggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttg 29254677  T
Q  179 ttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtg-tattgtgtttctcactt-gtttcctagattagatctaggtggtgtt 259  Q
    ||  | |||   |||||| |||||||| || ||||| | |||||||| |||||| | || |||||||||||||||||| ||||    
T  29254678 tt--cctctattctctccatttatcttttgcttgtggttttgtgtttttcactttgattactagattagatctaggtgttgtt 29254758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 178
Target Start/End: Original strand, 5871846 - 5872003
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    ||||||| |||||| |||||| |||||  || | ||||||||||||| | |||| |||| |||| | |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||    
T  5871846 aattaggtttgttctttgtgagcttgtttaagcaaatttcttgtaacccatttt-tatcacttt-gcaagaactctttgatagtggattagagagatcaa 5871943  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttg 178  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  5871944 tctctcccccagattaggtcaagttt-gaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttg 5872003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 5207985 - 5207843
Alignment:
Q  17 aattagggtt-gttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctct-tttgtaagaactcattgatagtggattggagagttc 114  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||  || ||||||| ||| ||| |||   |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  5207985 aattagggtttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttattgcaaccctt---gtatatctatttgtaagaactcattgatagtggattggaaagatc 5207889  T
Q  115 aatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaaca 161  Q
    ||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  5207888 aatctctctcccagagtaggtcaa-tttggactgaattgggtaaaca 5207843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 173
Target Start/End: Original strand, 21688275 - 21688428
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||  || ||||||| ||||||||| ||| |||||||||  | ||||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  21688275 aattagggttgttctttgtgagcttgttgaaactaattttttgtaactcattt-gtatctcttcgg-aagaactcattgataatgaattggagagatcaa 21688372  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgt 173  Q
    || |||| | ||| ||||||||| || |||||||||| || |||||| |||||||||    
T  21688373 tccctcccctagattaggtcaag-ttagaccgaattgagtcaacaatttcttggtgt 21688428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 52467496 - 52467336
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    ||||||| |||||| |||||| |||||  || ||||| ||||||||| | ||| ||||| |||| |||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  52467496 aattaggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatatcttgtaacccattt-gtatcacttt-gtaataactttttgatagtggattggagagatcaa 52467399  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttt 181  Q
    ||||||| | ||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  52467398 tctctccccgagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 52467336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 25 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 26699577 - 26699447
Alignment:
Q  25 ttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcct 124  Q
    |||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||       
T  26699577 ttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactctttt-gtatctctttgtaaagaactcatttataatggattggagagatcaatctctatc 26699479  T
Q  125 ccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggt 156  Q
    |||||||||||||   |||||||||| |||||    
T  26699478 ccagagtaggtcattgttggaccgaactgggt 26699447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 49 - 141
Target Start/End: Original strand, 4588017 - 4588107
Alignment:
Q  49 ctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtt 141  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| | ||||| |||||    
T  4588017 ctaatttcttgtaaccctttt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagaacaatctctcccccataataggtgaagtt 4588107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 79 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 13009526 - 13009464
Alignment:
Q  79 tttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtt 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| | |||||||||||    
T  13009526 tttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcgatctctcctccaaattaggtcaagtt 13009464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 49 - 137
Target Start/End: Original strand, 33989902 - 33989989
Alignment:
Q  49 ctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtca 137  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||   || ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  33989902 ctaatttcttgtaa-tccttttgtatctctttgtaaataactcgttaatagtggattggagagatcaatctctccaccagagtaggtca 33989989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 111
Target Start/End: Original strand, 24969146 - 24969230
Alignment:
Q  25 ttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagag 111  Q
    |||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24969146 ttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcattt-gtatctcttt-gtaagaactaattgatagtggattggagag 24969230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 161
Target Start/End: Original strand, 51337139 - 51337231
Alignment:
Q  67 ttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaaca 161  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||  || | ||||||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  51337139 ttttgtatctctttt-taagaactcattgatagtgtattagagagatcaatctctcccacacattaggtcaag-ttggaccgaactgggtaaaca 51337231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 79 - 123
Target Start/End: Original strand, 3913534 - 3913578
Alignment:
Q  79 tttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcc 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3913534 tttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcc 3913578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 67 - 135
Target Start/End: Original strand, 33089953 - 33090021
Alignment:
Q  67 ttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggt 135  Q
    |||||||||||| |   |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  33089953 ttttgtatctctctgtaaagaactcattgatagtggattagagagatcaatctctcctctagagtaggt 33090021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 17 - 161
Target Start/End: Original strand, 5349936 - 5350076
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| || |||||| |||||| |||  |||||||||||||   |||||||| |||||| || |  |||||| ||      
T  5349936 aattaggtttgttctttgtgaacttgtcgaagctaattccttgtagctc-gtttgtatctctttgtaaagaactcgttgataatgaagcggagagatc-- 5350032  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaaca 161  Q
    ||||||| |||||||||||||   |||||| ||||||||| ||||    
T  5350033 tctctcc-ccagagtaggtcattgttggactgaattgggtaaaca 5350076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 50 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 37755070 - 37754986
Alignment:
Q  50 taatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggt 135  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||   || |||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  37755070 taatttcttgtaac-ctttttttatctctttctaaaaaactcattgataatggtttgaagagatcaatctctcccccatagtaggt 37754986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 52 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 21703943 - 21703860
Alignment:
Q  52 atttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaa-gaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtca 137  Q
    |||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||| ||| |||||||||    
T  21703943 atttcttgtacc-ctttttgtatct-ttttgtaaagaactcattgacagtggattggagatatcaatctatcc-ccatagtaggtca 21703860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 2)
Name: scaffold0491
Description:

Target: scaffold0491; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 17 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 11304 - 10998
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11304 aattagggttgttctttgtgaacttgtaaaatctaatttcttgtaaccctttt-gtatctcttttgtaagaactcgttgatagtggattggagagttcaa 11206  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgta 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||      
T  11205 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtctttgttttcctcttccctctccttttatcttgtgcttgtggt 11107  T
Q  217 ttgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttgcacatactttgtttggtggttaccactctcctttgctc 314  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  |||| | |   ||||||| ||| ||||||||||    
T  11106 ttgtgtttttcactttgtttcctagattagatctaggtgttgttattgttgattattgcttgcacccacttag-tcattggttactactttcctttgctc 11008  T
Q  315 cacacatcat 324  Q
    |||| |||||    
T  11007 cacatatcat 10998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 17 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 8878 - 8616
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8878 aattagggttgttctttgtgaacttataaaatctaatttcttgtaaccctttt-gtatctcttttgtaagaactcgttgatagtggattggagagttcaa 8780  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgta 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||      
T  8779 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtctttgttttcctcttccctcttcttttatcttgtgcttgtggt 8681  T
Q  217 ttgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttgcac 279  Q
    ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  8680 ttgtgcttttcactttgtttcctagattagatctaggtgttgttattgttgattattgcttgcac 8616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0565 (Bit Score: 181; Significance: 1e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0565
Description:

Target: scaffold0565; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 17 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 2748 - 2410
Alignment:
Q  17 aattagggtt-gttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagtt 113  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||   | ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||     
T  2748 aattagggtttgttcatagtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacc--tcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagta 2652  T
Q  114 caatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtct-ttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattg 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2651 caatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctttttgtgtttattgttttcttcttccctctccttgtatcttgtgattg 2552  T
Q  213 -tgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcac---atactttgtttggtggttaccactctcct 308  Q
     ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||     
T  2551 ttgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcacaataaactttgtttggtggttaccactctccg 2452  T
Q  309 ttgctccacacatcattattc-ttgtattggcgtggttcgat 349  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  2451 tcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgat 2410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0674 (Bit Score: 166; Significance: 1e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0674
Description:

Target: scaffold0674; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 17 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 3870 - 3551
Alignment:
Q  17 aattagggtt-gttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagtt 113  Q
    |||||||||| |||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||   | ||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3870 aattagggtttgttcatagtgaacatgtcaag-ctaatttcttgtaacc--tcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtt 3774  T
Q  114 caatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtct-ttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattg 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3773 caatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctccttgtatcttgtgattg 3674  T
Q  213 -tgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcac---atactttgtttggtggttaccactctcct 308  Q
     ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||   | |||||||| |||||||||||||||||     
T  3673 ttgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcacaataaactttgttcggtggttaccactctccg 3574  T
Q  309 ttgctccacacatcattattctt 331  Q
    | |||||||||||||||||||||    
T  3573 tcgctccacacatcattattctt 3551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0286 (Bit Score: 160; Significance: 4e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0286
Description:

Target: scaffold0286; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 17 - 324
Target Start/End: Original strand, 11583 - 11895
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11583 aattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaactcattt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 11680  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtg-- 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||   ||||| ||| |||||||||||||| |||||      
T  11681 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtatttgtttatctcttctctc-ccttttatcttgtgcttgtgtt 11779  T
Q  215 -tattgtgtttct--cac-ttgt-ttcctagattag-atctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttgcacatactttgtttggtggttaccactctcc 307  Q
     |||||| ||| |  ||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| ||| |||    
T  11780 ttattgttttttttccactttgtattcctagattagtatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcacacactttg-ttagtggttactactttcc 11878  T
Q  308 tttgctccacacatcat 324  Q
    |||||||||||||||||    
T  11879 tttgctccacacatcat 11895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0137 (Bit Score: 153; Significance: 6e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0137
Description:

Target: scaffold0137; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 349
Target Start/End: Original strand, 6297 - 6637
Alignment:
Q  17 aattagggtt-gttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgt-aagaactca-ttgatagtggattggagagtt 113  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||  |   ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  6297 aattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaagcc--cttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagta 6393  T
Q  114 caatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctcc---ttttatcttgtgat 210  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  6394 caaactctcctccagagtaggttaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgttattgttttcttcttccctctccttgttttatcttgtgat 6493  T
Q  211 tg-tgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcac---atactttgtttggtggttaccactctc 306  Q
    || ||  ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||    
T  6494 tgttgctttgtgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgtattgttgtttcttgcttgcacaataaactttgtttggtggttaccactctc 6593  T
Q  307 ctttgctccacacatcattattc-ttgtattggcgtggttcgat 349  Q
    | | |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  6594 cgtcgctccacatatcattattctttgtattggtgtggttcgat 6637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 150; Significance: 4e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 324
Target Start/End: Original strand, 434559 - 434863
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  434559 aattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccctttt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 434656  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgta 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| |||||||   ||||| ||| |||||||||||||| ||||||     
T  434657 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatat-ttggtgtgtttgtttctctcttctctc-ccttttatcttgtgcttgtgtt 434754  T
Q  217 ttgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttgcacatactttgtttggtggttaccactctcctttgctc 314  Q
    ||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| | | |||||   |  ||||||| ||| ||||||||||    
T  434755 ttgtgcttttcactttgattcctagattagatctaggtgctgttattgttgattattgattgaaaacacttt-aataatggttactactttcctttgctc 434853  T
Q  315 cacacatcat 324  Q
    ||||||||||    
T  434854 cacacatcat 434863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1519 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold1519
Description:

Target: scaffold1519; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 17 - 278
Target Start/End: Original strand, 942 - 1200
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  942 aattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccctttt-gtatctctttg--aacaactcattgatagtggattggagagttcaa 1038  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttct-tcttccctctccttttatcttgtgattgtgt 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||  ||||| ||||  ||||||||||||  | || |||||     
T  1039 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtgttttgtttctctctt--ctctccttttatactttgcttgtgg 1135  T
Q  216 attgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttgca 278  Q
     ||||| || |||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1136 tttgtgcttttcactttgatacctagattagatctaggtggtgttattgttgattattgcttgca 1200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1808 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold1808
Description:

Target: scaffold1808; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 129 - 331
Target Start/End: Original strand, 1 - 208
Alignment:
Q  129 agtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtct-ttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgt-gtattgtgtttct 226  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||     
T  1 agtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctccttgtatcttgtgattgttgctttgtgtttca 100  T
Q  227 cacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcac---atactttgtttggtggttaccactctcctttgctccacacatca 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||   | |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  101 cacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcacaataaactttgttaggtggttaccactctccgtcgctccacacatca 200  T
Q  324 ttattctt 331  Q
    ||||||||    
T  201 ttattctt 208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 108; Significance: 5e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 17 - 272
Target Start/End: Original strand, 114628 - 114881
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  114628 aattaaggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacgctttt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaa 114725  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattg-tgt 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||| |||||||  ||||||   ||||  ||||||||||||||| |  ||| |||    
T  114726 tctctcctccagagtaggttaagtttagaccgaactggatgaacaatct-ttggtgtgcttgtttctctctt--ctctccttttatctttttcttgttgt 114822  T
Q  216 attgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattg 272  Q
     ||||| || |||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||    
T  114823 tttgtgcttttcactttgattcctagattagatataggtgttgttattgttgattattg 114881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 18145 - 18004
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18145 aattagggttgttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcattt-gtatctcttt-gtaa-aactcattgatagtggattggagagatcaa 18049  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaaca 161  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  18048 tctctcctccagggtaggtcaagtttggatcgaactgggtgaaca 18004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 20557 - 20301
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    ||||||| |||||  ||||||||||||  || ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  20557 aattaggtttgttttttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccattt-gtatctcttt-gtaagaactctttgatattggattggagagatcaa 20460  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgt-gt 215  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||| | ||||||| ||||  ||| |||   |||||| |||||||| || |||| ||    
T  20459 tctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaat-ttttggtgtgtttg--ttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggt 20364  T
Q  216 attgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttg 276  Q
     |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  20363 tttgtgtttttcactttgattcctagattagatctaggtgctgttattgttaattattgcttg 20301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466 (Bit Score: 69; Significance: 9e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 161
Target Start/End: Original strand, 7353 - 7494
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  7353 aattaaggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccattt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggaaagatcaa 7450  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaaca 161  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  7451 tctctcctctagagtaggttaag-ttggaccgaactgggtgaaca 7494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 149239 - 149079
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaa 116  Q
    |||||||||||||  |||| | |||||  || |||||||||||| || | |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  149239 aattagggttgttttttgtaagcttgttgaagctaatttcttgttacccattta-tatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaa 149142  T
Q  117 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaattgggtgaacaatctcttggtgtctttgttt 181  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  149141 tctctcccccagagtaggttaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtatttgttt 149079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0236 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0236
Description:

Target: scaffold0236; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 49 - 161
Target Start/End: Original strand, 10547 - 10656
Alignment:
Q  49 ctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccg 148  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10547 ctaatttattgtaac-cattttgtatctcttt-gtaagaactcgttgatagtggattgaagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccg 10643  T
Q  149 aattgggtgaaca 161  Q
    || ||||| ||||    
T  10644 aactgggtaaaca 10656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0219 (Bit Score: 49; Significance: 7e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0219
Description:

Target: scaffold0219; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 49 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 27553 - 27442
Alignment:
Q  49 ctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccg 148  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||   || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||   ||||||||    
T  27553 ctaatttcttgtaactcattt-gtatctctttgtaaataacttattgatagtggattggagagatcaatctctcccccatagtaggtcattgttggaccg 27455  T
Q  149 aattgggtgaaca 161  Q
    |||| ||| ||||    
T  27454 aattaggtaaaca 27442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 17 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 80425 - 80338
Alignment:
Q  17 aattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattg 106  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||  || ||||||||||| ||| |  ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  80425 aattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgcaac-ccatttgtatct-ttttgtaagaactcatagatagtgaattg 80338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 101
Target Start/End: Original strand, 25112 - 25162
Alignment:
Q  50 taatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtg 101  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  25112 taatttcttgtaac-ctttttgtatctctttgtaaagaactcattgatagtg 25162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University