View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF21562_low_23 (Length: 378)

Name: NF21562_low_23
Description: NF21562
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF21562_low_23
NF21562_low_23
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (17-378)||(9677-10039)
[»] chr7 (91 HSPs)
chr7 (17-378)||(18164534-18164896)
chr7 (17-378)||(9510873-9511234)
chr7 (17-378)||(12703270-12703631)
chr7 (17-378)||(40523222-40523584)
chr7 (17-378)||(49051254-49051615)
chr7 (17-378)||(60537-60900)
chr7 (17-378)||(18175987-18176349)
chr7 (17-378)||(18182659-18183021)
chr7 (17-378)||(14330669-14331031)
chr7 (17-378)||(14337253-14337615)
chr7 (17-378)||(11366079-11366445)
chr7 (17-378)||(14655277-14655640)
chr7 (17-378)||(44786335-44786698)
chr7 (17-378)||(44792976-44793339)
chr7 (17-378)||(15162681-15163044)
chr7 (17-378)||(16407155-16407518)
chr7 (17-378)||(15156030-15156393)
chr7 (18-378)||(13684344-13684706)
chr7 (177-378)||(20703011-20703213)
chr7 (177-378)||(32767558-32767760)
chr7 (177-378)||(13690975-13691177)
chr7 (177-378)||(13569759-13569977)
chr7 (250-378)||(9409813-9409942)
chr7 (250-378)||(20205-20333)
chr7 (250-378)||(6017283-6017412)
chr7 (295-378)||(15021990-15022073)
chr7 (295-378)||(21543-21626)
chr7 (295-378)||(8202236-8202319)
chr7 (259-378)||(11232402-11232521)
chr7 (259-378)||(11239089-11239208)
chr7 (252-378)||(7536051-7536177)
chr7 (177-378)||(4318566-4318781)
chr7 (250-378)||(18531113-18531241)
chr7 (259-378)||(1347376-1347495)
chr7 (252-378)||(11262202-11262323)
chr7 (252-378)||(14953071-14953192)
chr7 (252-378)||(14959037-14959158)
chr7 (252-378)||(26419873-26419994)
chr7 (252-378)||(44408448-44408569)
chr7 (250-378)||(32740-32874)
chr7 (250-378)||(71108-71242)
chr7 (250-378)||(75217-75351)
chr7 (250-378)||(12705000-12705134)
chr7 (252-378)||(11548377-11548498)
chr7 (252-378)||(11554973-11555094)
chr7 (252-378)||(12692369-12692490)
chr7 (250-378)||(16907576-16907711)
chr7 (295-378)||(8705865-8705949)
chr7 (295-378)||(10869308-10869392)
chr7 (295-378)||(10875388-10875472)
chr7 (295-378)||(18585452-18585536)
chr7 (250-378)||(12718299-12718433)
chr7 (250-378)||(16113872-16114006)
chr7 (250-378)||(16117025-16117159)
chr7 (295-378)||(18553684-18553768)
chr7 (295-378)||(23520115-23520199)
chr7 (250-378)||(12723210-12723344)
chr7 (250-378)||(18279034-18279168)
chr7 (250-378)||(18282997-18283131)
chr7 (250-378)||(12714494-12714629)
chr7 (17-87)||(18531419-18531489)
chr7 (250-378)||(26292027-26292162)
chr7 (17-106)||(10875684-10875773)
chr7 (17-72)||(11262518-11262573)
chr7 (17-72)||(14959353-14959408)
chr7 (17-72)||(20702852-20702907)
chr7 (17-104)||(23519815-23519902)
chr7 (17-72)||(25039071-25039126)
chr7 (17-72)||(26420189-26420244)
chr7 (17-72)||(32767864-32767919)
chr7 (17-72)||(44408198-44408253)
chr7 (251-378)||(18425315-18425448)
chr7 (264-378)||(18556861-18556973)
chr7 (17-106)||(10869604-10869693)
chr7 (18-87)||(13691252-13691321)
chr7 (17-72)||(4318406-4318461)
chr7 (17-72)||(12692685-12692740)
chr7 (17-72)||(14953387-14953442)
chr7 (295-348)||(8719312-8719365)
chr7 (177-244)||(14148584-14148654)
chr7 (264-378)||(2530496-2530607)
chr7 (179-244)||(7536199-7536267)
chr7 (17-79)||(13570077-13570139)
chr7 (252-290)||(14148524-14148562)
chr7 (17-79)||(15022312-15022374)
chr7 (264-378)||(15083801-15083912)
chr7 (17-79)||(18553393-18553455)
chr7 (17-79)||(18585161-18585223)
chr7 (264-359)||(9593250-9593345)
chr7 (43-79)||(19985-20021)
chr7 (177-241)||(9409964-9410028)
[»] chr4 (88 HSPs)
chr4 (17-378)||(23954030-23954392)
chr4 (17-378)||(23960692-23961054)
chr4 (17-378)||(19780151-19780512)
chr4 (17-378)||(15362014-15362377)
chr4 (17-378)||(22194501-22194864)
chr4 (17-378)||(16231703-16232066)
chr4 (17-378)||(36884596-36884959)
chr4 (17-378)||(4771979-4772341)
chr4 (17-378)||(15148339-15148700)
chr4 (17-378)||(8048357-8048719)
chr4 (17-378)||(15383355-15383716)
chr4 (17-378)||(14298689-14299052)
chr4 (17-378)||(14305313-14305676)
chr4 (17-378)||(8054970-8055332)
chr4 (17-378)||(12474901-12475264)
chr4 (17-378)||(14268319-14268678)
chr4 (17-378)||(18024289-18024652)
chr4 (17-378)||(18071050-18071413)
chr4 (17-378)||(18295507-18295870)
chr4 (22-378)||(12481531-12481889)
chr4 (17-378)||(20115024-20115387)
chr4 (18-378)||(6873238-6873601)
chr4 (17-378)||(386193-386554)
chr4 (177-378)||(40478031-40478233)
chr4 (180-378)||(51493843-51494040)
chr4 (177-378)||(26284928-26285132)
chr4 (177-378)||(23081455-23081673)
chr4 (177-378)||(16956672-16956890)
chr4 (177-378)||(19942175-19942393)
chr4 (177-378)||(27709612-27709830)
chr4 (177-287)||(40471449-40471560)
chr4 (250-378)||(9272267-9272395)
chr4 (250-378)||(53433242-53433371)
chr4 (295-378)||(8384695-8384778)
chr4 (295-378)||(8391350-8391433)
chr4 (295-378)||(14073691-14073774)
chr4 (295-378)||(15256469-15256552)
chr4 (17-378)||(15321955-15322331)
chr4 (295-378)||(17090140-17090223)
chr4 (295-378)||(29041061-29041144)
chr4 (252-378)||(35170494-35170621)
chr4 (250-378)||(4561675-4561800)
chr4 (250-378)||(5757280-5757405)
chr4 (295-378)||(17808274-17808357)
chr4 (250-378)||(14757763-14757900)
chr4 (252-375)||(7901283-7901406)
chr4 (263-378)||(35613806-35613921)
chr4 (250-359)||(20682038-20682147)
chr4 (252-378)||(12521950-12522076)
chr4 (281-378)||(40453802-40453899)
chr4 (252-356)||(41385856-41385959)
chr4 (250-378)||(9556161-9556295)
chr4 (250-378)||(17809905-17810039)
chr4 (250-378)||(33742011-33742145)
chr4 (295-378)||(12300050-12300134)
chr4 (295-378)||(12349726-12349810)
chr4 (295-378)||(55795319-55795403)
chr4 (252-378)||(14678837-14678957)
chr4 (252-378)||(23838307-23838428)
chr4 (19-244)||(30235041-30235267)
chr4 (252-378)||(14685045-14685165)
chr4 (251-378)||(15224672-15224805)
chr4 (17-106)||(17962186-17962275)
chr4 (295-378)||(17962486-17962570)
chr4 (17-72)||(26284769-26284824)
chr4 (17-72)||(40471664-40471719)
chr4 (17-72)||(40478337-40478392)
chr4 (17-72)||(51493679-51493734)
chr4 (17-243)||(7901032-7901260)
chr4 (17-72)||(12522274-12522329)
chr4 (17-72)||(14679152-14679207)
chr4 (17-72)||(14685360-14685415)
chr4 (17-72)||(23838623-23838678)
chr4 (17-72)||(35614129-35614184)
chr4 (17-72)||(41385606-41385661)
chr4 (177-243)||(9272125-9272191)
chr4 (17-106)||(12299759-12299848)
chr4 (17-106)||(12349435-12349524)
chr4 (264-378)||(45938039-45938149)
chr4 (17-73)||(55795647-55795703)
chr4 (17-60)||(9271965-9272008)
chr4 (264-378)||(12487316-12487427)
chr4 (264-356)||(19757706-19757798)
chr4 (264-356)||(19782008-19782100)
chr4 (264-378)||(27533630-27533742)
chr4 (17-54)||(35170836-35170873)
chr4 (177-244)||(12522098-12522168)
chr4 (177-244)||(35613953-35614023)
[»] chr2 (68 HSPs)
chr2 (17-378)||(22320847-22321209)
chr2 (17-378)||(22327000-22327362)
chr2 (17-378)||(27617180-27617541)
chr2 (17-378)||(26877429-26877790)
chr2 (17-378)||(29233412-29233774)
chr2 (17-378)||(29346711-29347073)
chr2 (17-378)||(24913825-24914189)
chr2 (17-378)||(1842965-1843328)
chr2 (17-378)||(27599146-27599509)
chr2 (17-378)||(23170920-23171283)
chr2 (17-378)||(23582177-23582540)
chr2 (17-378)||(16928238-16928601)
chr2 (17-378)||(16996932-16997295)
chr2 (17-378)||(17003565-17003928)
chr2 (17-378)||(10873420-10873784)
chr2 (17-368)||(10866263-10866617)
chr2 (180-378)||(12828954-12829153)
chr2 (19-378)||(37318143-37318518)
chr2 (177-378)||(13970390-13970608)
chr2 (177-378)||(24714579-24714797)
chr2 (177-378)||(41610650-41610868)
chr2 (177-378)||(45057446-45057664)
chr2 (177-378)||(41604753-41604971)
chr2 (250-378)||(24872519-24872648)
chr2 (250-378)||(24880404-24880533)
chr2 (250-378)||(30971091-30971220)
chr2 (295-378)||(9340144-9340227)
chr2 (295-378)||(9488778-9488861)
chr2 (295-378)||(9608039-9608122)
chr2 (295-378)||(16922393-16922476)
chr2 (295-378)||(19490086-19490169)
chr2 (295-378)||(27215927-27216010)
chr2 (295-378)||(28432074-28432157)
chr2 (295-378)||(13306751-13306834)
chr2 (295-378)||(16985805-16985888)
chr2 (271-378)||(10866055-10866162)
chr2 (252-378)||(11677315-11677441)
chr2 (252-378)||(24641075-24641201)
chr2 (252-366)||(21147404-21147518)
chr2 (252-378)||(24502984-24503105)
chr2 (250-378)||(10101994-10102128)
chr2 (250-378)||(12901857-12901991)
chr2 (250-378)||(24628820-24628954)
chr2 (250-378)||(24648986-24649120)
chr2 (250-378)||(27379773-27379907)
chr2 (250-378)||(27383819-27383953)
chr2 (250-378)||(27601423-27601557)
chr2 (295-378)||(27369172-27369256)
chr2 (295-378)||(44381353-44381437)
chr2 (17-106)||(44381053-44381142)
chr2 (295-378)||(27375682-27375766)
chr2 (295-378)||(44388023-44388107)
chr2 (17-106)||(44387723-44387812)
chr2 (319-378)||(27195591-27195650)
chr2 (17-72)||(21147150-21147205)
chr2 (17-72)||(12829260-12829315)
chr2 (17-72)||(21139132-21139187)
chr2 (17-72)||(24640821-24640876)
chr2 (177-244)||(24640983-24641053)
chr2 (17-104)||(19489785-19489872)
chr2 (264-378)||(19928607-19928717)
chr2 (17-72)||(24503300-24503355)
chr2 (17-72)||(27197075-27197130)
chr2 (177-243)||(19645989-19646055)
chr2 (264-378)||(30345381-30345492)
chr2 (17-106)||(27369458-27369547)
chr2 (17-106)||(27375968-27376057)
chr2 (177-244)||(27196900-27196970)
[»] chr8 (45 HSPs)
chr8 (17-378)||(17669431-17669793)
chr8 (17-378)||(17676083-17676445)
chr8 (17-378)||(21915431-21915792)
chr8 (17-378)||(5534300-5534662)
chr8 (17-378)||(22083713-22084076)
chr8 (17-378)||(20013724-20014086)
chr8 (17-378)||(20019801-20020163)
chr8 (17-378)||(8354624-8354989)
chr8 (17-378)||(22124389-22124753)
chr8 (17-378)||(22115581-22115945)
chr8 (17-378)||(19111108-19111471)
chr8 (17-378)||(19117399-19117762)
chr8 (17-378)||(19496271-19496635)
chr8 (17-378)||(22047827-22048191)
chr8 (40-378)||(19498319-19498660)
chr8 (17-378)||(22123246-22123609)
chr8 (18-378)||(18854817-18855180)
chr8 (18-378)||(18865212-18865575)
chr8 (177-378)||(16883193-16883395)
chr8 (177-378)||(29122969-29123171)
chr8 (177-378)||(23845783-23846001)
chr8 (177-378)||(20023949-20024167)
chr8 (177-378)||(3216130-3216345)
chr8 (250-378)||(26935288-26935417)
chr8 (295-378)||(28454632-28454715)
chr8 (252-378)||(19905364-19905490)
chr8 (252-378)||(20527323-20527444)
chr8 (250-378)||(22111562-22111696)
chr8 (250-378)||(43251442-43251576)
chr8 (250-378)||(19278628-19278762)
chr8 (250-378)||(21972922-21973056)
chr8 (250-378)||(21977013-21977147)
chr8 (295-378)||(18065200-18065285)
chr8 (17-72)||(16883033-16883088)
chr8 (17-72)||(20527639-20527694)
chr8 (17-72)||(29123275-29123330)
chr8 (264-378)||(15531779-15531890)
chr8 (264-378)||(24445611-24445722)
chr8 (17-79)||(28454942-28455004)
chr8 (177-244)||(19905512-19905582)
chr8 (17-72)||(19905687-19905742)
chr8 (264-378)||(23847120-23847230)
chr8 (264-378)||(15538338-15538449)
chr8 (264-359)||(16231581-16231676)
chr8 (17-106)||(18065487-18065576)
[»] chr5 (86 HSPs)
chr5 (17-378)||(27663650-27664012)
chr5 (17-378)||(34294413-34294775)
chr5 (17-372)||(24472108-24472464)
chr5 (17-378)||(17706791-17707152)
chr5 (17-378)||(41098083-41098445)
chr5 (17-378)||(27670290-27670651)
chr5 (17-378)||(41769125-41769487)
chr5 (17-378)||(41775699-41776061)
chr5 (18-378)||(23609785-23610146)
chr5 (18-378)||(23841181-23841542)
chr5 (17-378)||(22264827-22265190)
chr5 (17-378)||(23584021-23584385)
chr5 (17-378)||(27608622-27608984)
chr5 (17-378)||(27615228-27615590)
chr5 (17-378)||(19991765-19992128)
chr5 (17-378)||(22062742-22063105)
chr5 (17-378)||(41294295-41294657)
chr5 (17-378)||(37286641-37287004)
chr5 (17-378)||(37293344-37293707)
chr5 (17-378)||(22328024-22328386)
chr5 (17-378)||(40707004-40707367)
chr5 (17-378)||(40713646-40714009)
chr5 (17-378)||(15001539-15001903)
chr5 (17-378)||(33725740-33726104)
chr5 (17-378)||(37543922-37544286)
chr5 (17-378)||(23249821-23250185)
chr5 (17-378)||(27516634-27516997)
chr5 (17-378)||(27523271-27523634)
chr5 (30-378)||(22341476-22341825)
chr5 (17-378)||(14994896-14995260)
chr5 (17-378)||(18038528-18038891)
chr5 (17-378)||(1692297-1692660)
chr5 (17-378)||(27687189-27687552)
chr5 (17-378)||(22132880-22133243)
chr5 (177-378)||(17283950-17284152)
chr5 (177-378)||(25406307-25406509)
chr5 (17-378)||(22139572-22139935)
chr5 (177-378)||(29471379-29471582)
chr5 (177-378)||(29477974-29478177)
chr5 (181-378)||(22587978-22588176)
chr5 (19-375)||(24020154-24020525)
chr5 (177-378)||(19768215-19768433)
chr5 (177-378)||(19774811-19775029)
chr5 (250-378)||(22343364-22343493)
chr5 (250-378)||(22352764-22352893)
chr5 (295-378)||(16354706-16354789)
chr5 (295-378)||(16361365-16361448)
chr5 (295-378)||(34564699-34564782)
chr5 (295-378)||(34571354-34571437)
chr5 (250-378)||(22326038-22326167)
chr5 (295-378)||(25106645-25106728)
chr5 (295-378)||(25165738-25165821)
chr5 (252-378)||(14359931-14360057)
chr5 (295-378)||(22410751-22410834)
chr5 (252-378)||(15442068-15442194)
chr5 (252-378)||(24554408-24554529)
chr5 (252-378)||(21295374-21295495)
chr5 (250-378)||(15237176-15237310)
chr5 (250-378)||(19473059-19473193)
chr5 (250-378)||(20295478-20295612)
chr5 (252-378)||(25534862-25534983)
chr5 (295-378)||(20775749-20775833)
chr5 (295-378)||(21667958-21668042)
chr5 (295-378)||(22258633-22258717)
chr5 (252-375)||(23337402-23337525)
chr5 (295-378)||(29316288-29316372)
chr5 (17-72)||(21295124-21295179)
chr5 (17-72)||(22588284-22588339)
chr5 (17-72)||(24554724-24554779)
chr5 (17-72)||(25535178-25535233)
chr5 (17-72)||(29471220-29471275)
chr5 (17-72)||(29477815-29477870)
chr5 (251-378)||(10752821-10752954)
chr5 (17-71)||(17284257-17284311)
chr5 (17-79)||(22258333-22258395)
chr5 (264-378)||(40723977-40724091)
chr5 (17-72)||(23337149-23337204)
chr5 (17-79)||(15441815-15441877)
chr5 (17-79)||(22410459-22410521)
chr5 (264-378)||(33409118-33409229)
chr5 (17-106)||(21667667-21667756)
chr5 (17-106)||(29316574-29316663)
chr5 (177-244)||(15441976-15442046)
chr5 (17-73)||(20776077-20776133)
chr5 (17-69)||(25406618-25406670)
chr5 (177-244)||(14359839-14359909)
[»] chr3 (135 HSPs)
chr3 (17-378)||(31422413-31422775)
chr3 (17-378)||(37615276-37615637)
chr3 (17-378)||(26794255-26794617)
chr3 (17-378)||(26788665-26789027)
chr3 (17-378)||(5106744-5107106)
chr3 (17-378)||(16758431-16758793)
chr3 (17-378)||(6598602-6598964)
chr3 (17-378)||(6605282-6605644)
chr3 (17-378)||(53380211-53380573)
chr3 (17-378)||(53386863-53387225)
chr3 (17-378)||(10153595-10153957)
chr3 (17-378)||(16623915-16624277)
chr3 (23-378)||(16747705-16748061)
chr3 (17-378)||(26889339-26889701)
chr3 (17-378)||(10846143-10846506)
chr3 (17-378)||(5221288-5221650)
chr3 (17-378)||(417883-418246)
chr3 (17-378)||(20057263-20057627)
chr3 (17-378)||(10910781-10911145)
chr3 (17-378)||(13250602-13250965)
chr3 (17-378)||(13257248-13257611)
chr3 (17-378)||(14673060-14673423)
chr3 (17-378)||(20063901-20064265)
chr3 (17-378)||(10003519-10003883)
chr3 (17-378)||(10010166-10010530)
chr3 (17-378)||(10904109-10904473)
chr3 (17-378)||(3690502-3690865)
chr3 (18-378)||(16489531-16489887)
chr3 (17-378)||(22643177-22643553)
chr3 (177-378)||(23704787-23704989)
chr3 (177-378)||(23723243-23723445)
chr3 (177-378)||(23741699-23741901)
chr3 (177-378)||(41201817-41202019)
chr3 (177-378)||(15692297-15692499)
chr3 (177-378)||(15726951-15727153)
chr3 (19-378)||(15991966-15992339)
chr3 (158-378)||(10236396-10236630)
chr3 (177-378)||(15825533-15825747)
chr3 (19-378)||(17710454-17710829)
chr3 (177-378)||(19808895-19809111)
chr3 (177-378)||(13316209-13316422)
chr3 (177-378)||(1145572-1145790)
chr3 (177-378)||(8721176-8721394)
chr3 (177-378)||(9073063-9073281)
chr3 (177-378)||(15343625-15343843)
chr3 (177-378)||(410771-410989)
chr3 (177-378)||(15350269-15350487)
chr3 (177-378)||(15397924-15398142)
chr3 (177-378)||(15404515-15404733)
chr3 (17-378)||(4710168-4710544)
chr3 (250-378)||(15367040-15367168)
chr3 (177-378)||(15360558-15360776)
chr3 (180-378)||(13320842-13321053)
chr3 (250-378)||(12891271-12891400)
chr3 (250-378)||(17253168-17253297)
chr3 (177-378)||(15337300-15337518)
chr3 (250-378)||(30777335-30777464)
chr3 (252-378)||(5150078-5150204)
chr3 (295-378)||(16633713-16633796)
chr3 (295-378)||(16640323-16640406)
chr3 (295-378)||(43160988-43161071)
chr3 (295-378)||(43167225-43167308)
chr3 (295-378)||(1333221-1333304)
chr3 (295-378)||(48423230-48423313)
chr3 (252-378)||(7985573-7985699)
chr3 (295-378)||(15584872-15584955)
chr3 (295-378)||(15591530-15591613)
chr3 (252-378)||(41092456-41092582)
chr3 (295-378)||(48430008-48430091)
chr3 (252-373)||(28351277-28351398)
chr3 (252-378)||(10325719-10325844)
chr3 (252-378)||(16333039-16333165)
chr3 (252-378)||(20722875-20722996)
chr3 (252-378)||(24187651-24187772)
chr3 (252-378)||(55148852-55148973)
chr3 (250-378)||(7109330-7109464)
chr3 (250-378)||(7113265-7113399)
chr3 (250-378)||(11069702-11069836)
chr3 (250-378)||(11165870-11166004)
chr3 (250-378)||(22321298-22321432)
chr3 (250-378)||(22336353-22336487)
chr3 (250-378)||(27409985-27410119)
chr3 (250-378)||(55022499-55022633)
chr3 (298-378)||(6608343-6608424)
chr3 (252-359)||(839135-839242)
chr3 (295-378)||(5201097-5201181)
chr3 (295-378)||(5426864-5426948)
chr3 (295-378)||(12482299-12482383)
chr3 (250-378)||(4107740-4107874)
chr3 (250-378)||(4111592-4111726)
chr3 (250-378)||(14498959-14499093)
chr3 (250-378)||(15617008-15617142)
chr3 (250-378)||(28949356-28949490)
chr3 (250-378)||(30065582-30065716)
chr3 (251-378)||(4589289-4589413)
chr3 (251-378)||(16750684-16750817)
chr3 (17-106)||(5426563-5426652)
chr3 (295-378)||(5420457-5420541)
chr3 (264-378)||(11300871-11300986)
chr3 (251-358)||(19775242-19775358)
chr3 (17-72)||(839436-839491)
chr3 (17-72)||(15692138-15692193)
chr3 (17-72)||(20723191-20723246)
chr3 (17-72)||(24187967-24188022)
chr3 (17-72)||(41201658-41201713)
chr3 (177-243)||(30777245-30777311)
chr3 (264-378)||(38814274-38814385)
chr3 (17-106)||(5420165-5420254)
chr3 (17-73)||(15584580-15584636)
chr3 (17-73)||(15591238-15591294)
chr3 (17-72)||(5149828-5149883)
chr3 (177-244)||(5149989-5150056)
chr3 (17-72)||(7985897-7985951)
chr3 (17-72)||(15726792-15726847)
chr3 (17-72)||(55149168-55149223)
chr3 (17-79)||(15360876-15360938)
chr3 (177-243)||(15366950-15367016)
chr3 (17-79)||(15397762-15397824)
chr3 (17-79)||(15404353-15404415)
chr3 (17-71)||(23704629-23704683)
chr3 (17-71)||(23723085-23723139)
chr3 (17-71)||(23741541-23741595)
chr3 (177-243)||(41092367-41092433)
chr3 (17-106)||(12482585-12482674)
chr3 (177-244)||(7985721-7985791)
chr3 (19-79)||(13321155-13321215)
chr3 (177-244)||(16333187-16333257)
chr3 (19-87)||(19809204-19809272)
chr3 (17-72)||(16333363-16333418)
chr3 (17-106)||(5201380-5201469)
chr3 (20-77)||(15337619-15337676)
chr3 (19-79)||(10236256-10236316)
chr3 (177-244)||(10325867-10325937)
chr3 (319-378)||(11854358-11854417)
chr3 (19-79)||(15825847-15825907)
[»] chr1 (60 HSPs)
chr1 (17-378)||(20215789-20216150)
chr1 (17-378)||(44844744-44845107)
chr1 (17-378)||(51328539-51328902)
chr1 (17-378)||(51335173-51335536)
chr1 (17-378)||(47659096-47659462)
chr1 (17-378)||(16345635-16345998)
chr1 (17-378)||(41348711-41349075)
chr1 (17-378)||(16352283-16352647)
chr1 (17-378)||(41356148-41356512)
chr1 (17-378)||(41478438-41478801)
chr1 (17-378)||(18599966-18600329)
chr1 (181-378)||(21828596-21828793)
chr1 (181-347)||(21844140-21844306)
chr1 (177-378)||(21807221-21807439)
chr1 (177-378)||(21835233-21835451)
chr1 (177-378)||(33386244-33386462)
chr1 (177-378)||(33392889-33393107)
chr1 (250-378)||(50887864-50887993)
chr1 (295-378)||(43078301-43078384)
chr1 (295-378)||(46157482-46157565)
chr1 (252-378)||(19111276-19111402)
chr1 (252-378)||(19104619-19104745)
chr1 (250-378)||(8305009-8305138)
chr1 (252-378)||(20525328-20525454)
chr1 (252-378)||(23763085-23763206)
chr1 (250-378)||(1010354-1010488)
chr1 (250-378)||(21406986-21407120)
chr1 (250-378)||(52639172-52639306)
chr1 (252-356)||(21437686-21437789)
chr1 (295-378)||(18626436-18626520)
chr1 (295-378)||(27898811-27898895)
chr1 (295-378)||(43063428-43063512)
chr1 (295-378)||(44755975-44756059)
chr1 (295-378)||(49334442-49334526)
chr1 (296-378)||(33384940-33385023)
chr1 (251-378)||(39244237-39244370)
chr1 (251-378)||(39247792-39247925)
chr1 (250-378)||(16375798-16375933)
chr1 (251-358)||(41388337-41388453)
chr1 (17-72)||(23763401-23763456)
chr1 (17-79)||(19111593-19111655)
chr1 (264-378)||(46975357-46975468)
chr1 (17-78)||(19063704-19063765)
chr1 (17-104)||(18626135-18626222)
chr1 (17-72)||(21828904-21828959)
chr1 (17-79)||(19104936-19104998)
chr1 (259-378)||(20229333-20229458)
chr1 (17-106)||(27898520-27898609)
chr1 (17-106)||(43063137-43063226)
chr1 (17-106)||(44756261-44756350)
chr1 (17-106)||(49334728-49334817)
chr1 (177-244)||(19104767-19104837)
chr1 (17-72)||(20525076-20525131)
chr1 (17-72)||(21437984-21438039)
chr1 (17-60)||(21844429-21844472)
chr1 (264-378)||(1925519-1925630)
chr1 (264-378)||(20924533-20924644)
chr1 (17-106)||(33394003-33394092)
chr1 (19-79)||(8305319-8305379)
chr1 (177-244)||(19111424-19111494)
[»] scaffold0044 (4 HSPs)
scaffold0044 (17-378)||(30409-30772)
scaffold0044 (17-378)||(72759-73121)
scaffold0044 (177-378)||(7943-8145)
scaffold0044 (17-71)||(8250-8304)
[»] scaffold0028 (10 HSPs)
scaffold0028 (17-378)||(67392-67753)
scaffold0028 (158-378)||(6873-7107)
scaffold0028 (158-378)||(13398-13632)
scaffold0028 (177-378)||(22926-23140)
scaffold0028 (18-378)||(56913-57288)
scaffold0028 (17-378)||(41406-41782)
scaffold0028 (250-378)||(59060-59194)
scaffold0028 (19-79)||(7187-7247)
scaffold0028 (19-79)||(13712-13772)
scaffold0028 (19-79)||(23240-23300)
[»] chr6 (103 HSPs)
chr6 (17-378)||(6980543-6980904)
chr6 (17-378)||(12762585-12762947)
chr6 (17-378)||(20649654-20650014)
chr6 (18-378)||(30597109-30597462)
chr6 (17-378)||(8797074-8797436)
chr6 (17-378)||(20060532-20060895)
chr6 (17-378)||(2869996-2870359)
chr6 (17-378)||(2876611-2876974)
chr6 (17-378)||(4233359-4233722)
chr6 (17-378)||(20801640-20802002)
chr6 (17-378)||(27327917-27328280)
chr6 (17-378)||(27388657-27389020)
chr6 (17-378)||(30694245-30694608)
chr6 (19-377)||(26130351-26130711)
chr6 (17-378)||(27430144-27430507)
chr6 (17-378)||(28287238-28287602)
chr6 (17-378)||(28258314-28258678)
chr6 (17-378)||(28264938-28265302)
chr6 (17-378)||(28337063-28337427)
chr6 (17-378)||(28343687-28344051)
chr6 (20-299)||(14059480-14059761)
chr6 (19-378)||(25110708-25111084)
chr6 (19-378)||(25117311-25117687)
chr6 (19-378)||(3708345-3708720)
chr6 (250-378)||(24291156-24291284)
chr6 (250-378)||(31317196-31317324)
chr6 (250-378)||(4167791-4167920)
chr6 (250-378)||(24315184-24315312)
chr6 (250-378)||(4208471-4208600)
chr6 (17-378)||(1544904-1545280)
chr6 (177-378)||(17037355-17037570)
chr6 (17-378)||(1538805-1539181)
chr6 (250-378)||(34832522-34832652)
chr6 (295-378)||(8228749-8228832)
chr6 (295-378)||(18930938-18931021)
chr6 (177-359)||(25595374-25595571)
chr6 (295-378)||(29587841-29587924)
chr6 (295-378)||(29593982-29594065)
chr6 (252-378)||(19808394-19808520)
chr6 (252-378)||(22758718-22758844)
chr6 (252-378)||(25928163-25928289)
chr6 (295-378)||(30638291-30638374)
chr6 (250-378)||(14098496-14098624)
chr6 (17-144)||(18194385-18194513)
chr6 (247-378)||(20176809-20176941)
chr6 (252-378)||(34370086-34370212)
chr6 (298-378)||(28314436-28314516)
chr6 (247-378)||(5834591-5834723)
chr6 (247-378)||(22159050-22159182)
chr6 (298-378)||(27185575-27185655)
chr6 (298-378)||(27207411-27207491)
chr6 (298-378)||(27241737-27241817)
chr6 (298-378)||(27263585-27263665)
chr6 (252-378)||(34298734-34298855)
chr6 (250-378)||(8243464-8243598)
chr6 (250-378)||(11566493-11566627)
chr6 (250-378)||(12619183-12619317)
chr6 (250-378)||(19870221-19870355)
chr6 (250-378)||(23394699-23394833)
chr6 (264-378)||(16759899-16760011)
chr6 (295-378)||(17017074-17017158)
chr6 (295-378)||(32565394-32565478)
chr6 (250-378)||(23989551-23989685)
chr6 (251-378)||(16624009-16624142)
chr6 (295-378)||(16552172-16552256)
chr6 (295-378)||(16576697-16576781)
chr6 (295-378)||(16618599-16618683)
chr6 (295-378)||(16628728-16628812)
chr6 (250-378)||(22862577-22862711)
chr6 (251-378)||(1644165-1644298)
chr6 (17-72)||(16372049-16372104)
chr6 (17-72)||(17031061-17031116)
chr6 (17-68)||(17037196-17037247)
chr6 (17-72)||(25928487-25928542)
chr6 (17-72)||(34298484-34298539)
chr6 (250-304)||(18917775-18917829)
chr6 (251-378)||(31478326-31478459)
chr6 (17-72)||(22759043-22759098)
chr6 (17-72)||(34369834-34369889)
chr6 (319-378)||(14471868-14471924)
chr6 (17-106)||(17016783-17016872)
chr6 (17-106)||(32565103-32565192)
chr6 (19-87)||(4168101-4168169)
chr6 (19-87)||(4208781-4208849)
chr6 (177-244)||(16371873-16371943)
chr6 (177-244)||(25928311-25928381)
chr6 (177-244)||(34369994-34370064)
chr6 (181-244)||(4167943-4168006)
chr6 (181-244)||(4208623-4208686)
chr6 (181-244)||(14098644-14098707)
chr6 (17-72)||(22331630-22331685)
chr6 (177-243)||(24291072-24291132)
chr6 (177-243)||(24315100-24315160)
chr6 (177-243)||(31317112-31317172)
chr6 (17-106)||(16551881-16551970)
chr6 (17-106)||(16576983-16577072)
chr6 (17-106)||(16618308-16618397)
chr6 (17-106)||(16628437-16628526)
chr6 (264-359)||(16741111-16741206)
chr6 (17-54)||(19808735-19808772)
chr6 (177-244)||(19808542-19808612)
chr6 (177-244)||(22758866-22758936)
chr6 (19-79)||(34832838-34832898)
[»] scaffold0052 (5 HSPs)
scaffold0052 (17-378)||(913-1277)
scaffold0052 (295-378)||(10220-10303)
scaffold0052 (295-378)||(56642-56725)
scaffold0052 (17-79)||(10542-10604)
scaffold0052 (17-79)||(56964-57026)
[»] scaffold0061 (2 HSPs)
scaffold0061 (17-378)||(59321-59684)
scaffold0061 (250-378)||(67642-67776)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (17-378)||(138949-139312)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (17-378)||(56856-57219)
[»] scaffold0029 (5 HSPs)
scaffold0029 (17-378)||(105739-106109)
scaffold0029 (17-378)||(125974-126343)
scaffold0029 (251-378)||(80172-80305)
scaffold0029 (250-304)||(61951-62005)
scaffold0029 (250-304)||(65867-65921)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (17-377)||(37925-38287)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (17-377)||(76525-76887)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (177-378)||(306980-307182)
scaffold0005 (17-72)||(307286-307341)
[»] scaffold0109 (3 HSPs)
scaffold0109 (17-378)||(26509-26887)
scaffold0109 (177-378)||(43183-43397)
scaffold0109 (264-378)||(36330-36442)
[»] scaffold0431 (2 HSPs)
scaffold0431 (158-378)||(12313-12547)
scaffold0431 (19-79)||(12627-12687)
[»] scaffold0572 (1 HSPs)
scaffold0572 (158-378)||(9721-9955)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (177-378)||(73863-74081)
[»] scaffold0004 (3 HSPs)
scaffold0004 (177-378)||(78083-78297)
scaffold0004 (252-378)||(60878-60999)
scaffold0004 (17-72)||(58279-58334)
[»] scaffold0744 (2 HSPs)
scaffold0744 (250-378)||(3782-3910)
scaffold0744 (187-243)||(3702-3758)
[»] scaffold0089 (2 HSPs)
scaffold0089 (177-378)||(19599-19815)
scaffold0089 (17-72)||(19438-19493)
[»] scaffold0140 (1 HSPs)
scaffold0140 (295-378)||(38565-38648)
[»] scaffold0525 (1 HSPs)
scaffold0525 (250-378)||(4214-4344)
[»] scaffold0780 (2 HSPs)
scaffold0780 (177-359)||(3-198)
scaffold0780 (19-73)||(303-357)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (19-378)||(14856-15230)
[»] scaffold0055 (1 HSPs)
scaffold0055 (295-378)||(25231-25314)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (250-378)||(8963-9091)
[»] scaffold0560 (2 HSPs)
scaffold0560 (250-369)||(5907-6026)
scaffold0560 (17-87)||(5659-5729)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (298-378)||(32473-32553)
[»] scaffold0013 (2 HSPs)
scaffold0013 (252-378)||(9207-9332)
scaffold0013 (177-244)||(9354-9424)
[»] scaffold0242 (2 HSPs)
scaffold0242 (252-378)||(19449-19570)
scaffold0242 (252-378)||(25623-25744)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (252-378)||(241931-242052)
scaffold0010 (17-72)||(242247-242302)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (250-378)||(81-215)
[»] scaffold0372 (1 HSPs)
scaffold0372 (250-378)||(5440-5574)
[»] scaffold0349 (1 HSPs)
scaffold0349 (250-378)||(12053-12187)
[»] scaffold0553 (2 HSPs)
scaffold0553 (295-378)||(8659-8743)
scaffold0553 (17-106)||(8945-9034)
[»] scaffold0133 (2 HSPs)
scaffold0133 (295-378)||(22074-22158)
scaffold0133 (17-106)||(22360-22449)
[»] scaffold0126 (2 HSPs)
scaffold0126 (295-378)||(4230-4314)
scaffold0126 (17-106)||(3939-4028)
[»] scaffold0259 (2 HSPs)
scaffold0259 (252-378)||(10043-10169)
scaffold0259 (177-244)||(10191-10261)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (252-358)||(2699-2804)
[»] scaffold0233 (2 HSPs)
scaffold0233 (252-359)||(14651-14758)
scaffold0233 (17-72)||(14401-14456)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (17-72)||(30068-30123)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (251-378)||(80871-80995)
[»] scaffold0256 (1 HSPs)
scaffold0256 (252-356)||(25087-25190)
[»] scaffold0697 (1 HSPs)
scaffold0697 (252-340)||(6522-6610)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (20-56)||(109188-109224)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (264-378)||(9311-9421)
[»] scaffold0229 (1 HSPs)
scaffold0229 (264-378)||(11891-12002)
[»] scaffold0157 (1 HSPs)
scaffold0157 (264-378)||(33050-33161)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (264-378)||(9793-9904)
[»] scaffold0051 (2 HSPs)
scaffold0051 (17-67)||(36903-36952)
scaffold0051 (264-378)||(30774-30885)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (264-378)||(189767-189878)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (264-359)||(173197-173292)


Alignment Details
Target: scaffold0155 (Bit Score: 327; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Original strand, 9677 - 10039
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  9677 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtttaagttatattaatattaattgaatatga 9776  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgctttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttat 215  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9777 actattgtattgtatattcatgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgctttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttat 9876  T
Q  216 gctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcata 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9877 gctgcttccgttatttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcata 9976  T
Q  316 tgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9977 tgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 10039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 327; Significance: 0; HSPs: 91)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Original strand, 18164534 - 18164896
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  18164534 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtttaagttatattaatattaattgaatatga 18164633  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgctttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttat 215  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18164634 actattgtattgtatattcatgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgctttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttat 18164733  T
Q  216 gctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcata 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18164734 gctgcttccgttatttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcata 18164833  T
Q  316 tgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18164834 tgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 18164896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Original strand, 9510873 - 9511234
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  9510873 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtttaagttatattaatattaattgaatatga 9510972  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgctttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttat 215  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9510973 actattgtattgtatattcatgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgctttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttat 9511072  T
Q  216 gctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcata 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9511073 gctgcttccgttatttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagt-gattacgatgttttgttcata 9511171  T
Q  316 tgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9511172 tgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 9511234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Original strand, 12703270 - 12703631
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  12703270 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtttaagttatattaatattaattgaatatga 12703369  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgctttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttat 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12703370 actattgtattgtatattcatgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgctttgatataatgatatcatcctgttatgtgacctgtttat 12703469  T
Q  216 gctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcata 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12703470 gctgcttccgttatttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagt-gattacgatgttttgttcata 12703568  T
Q  316 tgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12703569 tgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 12703631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Original strand, 40523222 - 40523584
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  40523222 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtttaagttatattaatattaattgaatatga 40523321  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgctttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttat 215  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40523322 actattgtattgtatactcatgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgctttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttat 40523421  T
Q  216 gctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcata 315  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40523422 gctgcttccgttacttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcata 40523521  T
Q  316 tgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40523522 tgtgtccatgcagagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 40523584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 49051615 - 49051254
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  49051615 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtttaagttatattaataataattgaatatga 49051516  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgctttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttat 215  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49051515 actattgtattgtatattcatgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgctttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttat 49051416  T
Q  216 gctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcata 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  49051415 gctgcttccgttatttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagt-gattacgatgttttgttcata 49051317  T
Q  316 tgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  49051316 tgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcct 49051254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Original strand, 60537 - 60900
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |  || ||    
T  60537 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagcgatgttgtttaatgcagactgtagagttgtttaagttatattaatattaattggttaaga 60636  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttta 214  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  60637 actattgtattgtatattcatgcaaaatgagaagatgtgataataatgcaatttatgtgctattgatataatgatatcatcttgatatgtgacttgttta 60736  T
Q  215 tgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcat 314  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  60737 tgctgcttccgttgtttaactaagtgcataagtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgttttgttcat 60836  T
Q  315 atgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  60837 atgtgtccatgcatagcatatcattgagctttgtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcct 60900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 18176349 - 18175987
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||||    
T  18176349 ttgattaagagtgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagtctgtagagttgtttaagttatgttgatattaattgaatatga 18176250  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttta 214  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18176249 actaatgtattgtatattcatgcaagatatgaaggtttgataatgatgcaa-ttatgtgcaattgatataatgatatcatcttgttatgtgacttgttta 18176151  T
Q  215 tgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcat 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  18176150 tgctgcttccgttatttaactaagtgcataagtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcat 18176051  T
Q  315 atgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  18176050 aagtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttgtcct 18175987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 18183021 - 18182659
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||||    
T  18183021 ttgattaagagtgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagtctgtagagttgtttaagttatgttgatattaattgaatatga 18182922  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttta 214  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18182921 actaatgtattgtatattcatgcaagatatgaaggtttgataatgatgcaa-ttatgtgctattgatataatgatatcatcttgttatgtgacttgttta 18182823  T
Q  215 tgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcat 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  18182822 tgctgcttccgttatttaactaagtgcataagtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttattcat 18182723  T
Q  315 atgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  18182722 aagtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttgtcct 18182659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 14331031 - 14330669
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgt-taagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||| || ||||| ||  ||||||| || ||| ||||    
T  14331031 ttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgagacctagtgatgttgttaaatgcagtccgtagagtagtctaagtcatgataatattgattgaacatga 14330932  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttta 214  Q
      || |||| ||||||||  ||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14330931 gttaatgtaatgtatatttatgcaagatatgaagagttgataatgatacaatttatgtgctattgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttta 14330832  T
Q  215 tgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcat 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14330831 tgctgcttccgttatttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagctccaagttattggatgcatattgataagt-gattacgatgttttgttcat 14330733  T
Q  315 atgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14330732 atgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 14330669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 14337615 - 14337253
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgt-taagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||| || ||||| ||  ||||||| || ||| ||||    
T  14337615 ttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgagacctagtgatgttgttaaatgcagtccgtagagtagtctaagtcatgataatattgattgaacatga 14337516  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttta 214  Q
      || |||| ||||||||  ||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14337515 gttaatgtaatgtatatttatgcaagatatgaagagttgataatgatacaatttatgtgctattgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttta 14337416  T
Q  215 tgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcat 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14337415 tgctgcttccgttatttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagctccaagttattggatgcatattgataagt-gattacgatgttttgttcat 14337317  T
Q  315 atgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14337316 atgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 14337253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 11366445 - 11366079
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgt-taagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||  |||||||| || |||||||| | | ||||    
T  11366445 ttgatcaagagtgaacccccaactggtaataagacctaatgatgacgtttaatgcagtctgtagagttggctaagttatgttgatattaattggacatga 11366346  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgtt-atgtgacctgttt 213  Q
    |||| ||||||||||  || ||||||||| |||    |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  11366345 actaatgtattgtattctcatgcaagatacgaaagcttgataatgatgcaatttatgtgctattgatataatgatatcatctcgtttatgtgacctgttt 11366246  T
Q  214 atgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgtttt---gt 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||   ||    
T  11366245 atgctgcttccgttatttaactaagtgcataagtatatgatgaagtt-agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgtttttgtgt 11366147  T
Q  311 tcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11366146 tcataagtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaataataggagctttgtcct 11366079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Original strand, 14655277 - 14655640
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||||    
T  14655277 ttgatcaagagtgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagttatattgatattaattgaatatga 14655376  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttta 214  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  14655377 actaatgtattgtatattcatgcaagatatgaaggtttgataataatgcaatttatgtgctattgatataatgatatcatcttgatatgtgacttgttta 14655476  T
Q  215 tgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttga-taagtcgattacgatgttttgttca 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||| |||||||||      
T  14655477 tgctgcttccgttatttaactaagtgcataagtatatgataaggtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttttgttgt 14655575  T
Q  314 tatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  14655576 taagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgattactaggagctttgtcct 14655640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Original strand, 44786335 - 44786698
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgt-taagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||    
T  44786335 ttgatcaagagtgaacccctagctggtaatgagacctagtgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtctaggttatattgatattaattgaatatga 44786434  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttta 214  Q
    | || ||||| |||||||| ||||||||| |||| | ||||||| || ||| ||| ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  44786435 attaatgtatcgtatattcatgcaagatatgaaggtttgataataatgcaatttacgtgctattgatataataatatcatcttgatatgtgacttgttta 44786534  T
Q  215 tgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttga-taagtcgattacgatgttttgttca 313  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||||||      
T  44786535 tgctgcttccgttgtttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgttgattacg-tgttttgttgt 44786633  T
Q  314 tatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44786634 taagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcct 44786698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Original strand, 44792976 - 44793339
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgt-taagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||    
T  44792976 ttgatcaagagtgaacccctagctggtaatgagacctagtgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtctaggttatattgatattaattgaatatga 44793075  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttta 214  Q
    | || ||||| |||||||| ||||||||| |||| | ||||||| || ||| ||| ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  44793076 attaatgtatcgtatattcatgcaagatatgaaggtttgataataatgcaatttacgtgctattgatataataatatcatcttgatatgtgacttgttta 44793175  T
Q  215 tgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttga-taagtcgattacgatgttttgttca 313  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||||||      
T  44793176 tgctgcttccgttgtttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgttgattacg-tgttttgttgt 44793274  T
Q  314 tatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44793275 taagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcct 44793339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Original strand, 15162681 - 15163044
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||| | ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||  | | ||||    
T  15162681 ttgatcaagagcgaacccctagttggtattaagacctaatgatgacgtttaatgcagtctgtagagttgtttaagttatgttgatattaaatggacatga 15162780  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgtt-atgtgacctgttt 213  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||| |  |   | ||||  ||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  15162781 actaatgtattgtatattcatgcaagatatgaaggt-tgatattcctgatatttataagctattgatataatgatatcattttgtttatgtgacctgttt 15162879  T
Q  214 atgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgtttt-gttc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  15162880 atgctgcttccgttatttaactaagtgcataagtttgtgatgaagtt-agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgtttttgttc 15162978  T
Q  313 atatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15162979 ataagtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaataataggagctttgtcct 15163044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Original strand, 16407155 - 16407518
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||| | ||||||| || || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||  | | ||||    
T  16407155 ttgatcaagagcgaacccctagttggtattaagacctaatgttgacgtttaatgcagtctgtagagttgtttaagttatgttgatattaaatggacatga 16407254  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgctt-tgatataatgatatcatcttgtt-atgtgacctgttt 213  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||| |  |   | ||||  |||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16407255 actaatgtattgtatattcatgcaagatacgaaggt-tgatattcctgatatttataagctaatgacataatgatatcatcttgtttatgtgacctgttt 16407353  T
Q  214 atgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttg-ttc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||    
T  16407354 atgctgcttccgttatttaactaagtgcataagtttatgatgaagtt-agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgtttttattc 16407452  T
Q  313 atatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16407453 ataagtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaataataggagctttgtcct 16407518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Original strand, 15156030 - 15156393
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    ||||||||||| |||||| ||  ||||| | ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||  | | ||||    
T  15156030 ttgatcaagagcgaacccgtagttggtattaagacctaatgatgacgtttaatgcagtctgtagagttgtttaagttatgttgatattaaatggacatga 15156129  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgtt-atgtgacctgttt 213  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||| |  |   | ||||  | | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  15156130 actaatgtattgtatattcatgcaagatatgaaggt-tgatattcctgatatttataagttattgatataatgatatcattttgtttatgtgacctgttt 15156228  T
Q  214 atgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgtttt-gttc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  15156229 atgctgcttccgttatttaactaagtgcataagtttgtgatgaagtt-agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgtttttgttc 15156327  T
Q  313 atatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  15156328 ataagtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccatgaataatagaagctttgtcct 15156393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 18 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 13684706 - 13684344
Alignment:
Q  18 tgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatgaa 116  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||| | ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||  | | |||||    
T  13684706 tgatcaagagcgaacccctagttggtattaagacctaatgatgacgtttaatgcagtctgtagagttgtttaagttatgttgatattaaatggacatgaa 13684607  T
Q  117 ctattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgtt-atgtgacctgttta 214  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||| | |||| | ||||| |  |   | ||||  ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  13684606 ctaatgtattgtatattcatgcaagaaatgaaggt-tgatattcctgatatttataagctattgatataatgatatcattttgtttatgtgacctgttta 13684508  T
Q  215 tgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgtttt-gttca 313  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  13684507 tgttgcttccgttatttaactaagtgcataagtttatgatgaagtt-agctccaatttaatggatgcatgttgatatgttgattacgatgtttttgttca 13684409  T
Q  314 tatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13684408 caagtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaataataggagctttgtcct 13684344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 177 - 378
Target Start/End: Original strand, 20703011 - 20703213
Alignment:
Q  177 ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcata-ggtatatgatgaagtttagctccaaattatt 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20703011 ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacttgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcatatggtatatgatgaagtttagctccaaattatt 20703110  T
Q  276 ggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgt 375  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  20703111 ggatgcatgttgatatgttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgt 20703210  T
Q  376 cct 378  Q
    |||    
T  20703211 cct 20703213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 177 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 32767760 - 32767558
Alignment:
Q  177 ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcata-ggtatatgatgaagtttagctccaaattatt 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32767760 ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacttgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcatatggtatatgatgaagtttagctccaaattatt 32767661  T
Q  276 ggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgt 375  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  32767660 ggatgcatgttgatatgttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagttttgt 32767561  T
Q  376 cct 378  Q
    |||    
T  32767560 cct 32767558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 177 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 13691177 - 13690975
Alignment:
Q  177 ttgatataatgatatcatcttgtt-atgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattatt 275  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| ||| |    
T  13691177 ttgatataatgatatcattttgtttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcataagtttatgatgaagtt-agctccaatttaat 13691079  T
Q  276 ggatgcatgttgataagtcgattacgatgtttt-gttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttg 374  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13691078 ggatgcatgttgatatgttgattacgatgtttttgttcataagtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaataataggagctttg 13690979  T
Q  375 tcct 378  Q
    ||||    
T  13690978 tcct 13690975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 177 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 13569977 - 13569759
Alignment:
Q  177 ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcatagg---------tatatgatgaa--------gt 259  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||||| |          |||||||||||        ||    
T  13569977 ttgatataatgatatcatcctgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatatatttatatatgatgaaatgatgacgt 13569878  T
Q  260 ttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacga 359  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13569877 ttagctccaaatttttggatgcatgtcgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgtatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgt 13569778  T
Q  360 atattaggagctttgtcct 378  Q
     ||||||||||||||||||    
T  13569777 ttattaggagctttgtcct 13569759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 250 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 9409942 - 9409813
Alignment:
Q  250 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgca-tagcatctcattgagcttagt 348  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  9409942 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcattagcatttcattgagcttagt 9409843  T
Q  349 cctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9409842 cttcaccacgattattaggagctttgtcct 9409813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 250 - 378
Target Start/End: Original strand, 20205 - 20333
Alignment:
Q  250 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgca-tagcatctcattgagcttagt 348  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  20205 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagt 20303  T
Q  349 cctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20304 cctcaccacgattattaggagctttgtcct 20333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 250 - 378
Target Start/End: Original strand, 6017283 - 6017412
Alignment:
Q  250 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgca-tagcatctcattgagcttagt 348  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  6017283 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagt 6017381  T
Q  349 cctcaccacga-atattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  6017382 cctcaccacgatttattaggagctttgtcct 6017412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 295 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 15022073 - 15021990
Alignment:
Q  295 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15022073 gattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcct 15021990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 295 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 21626 - 21543
Alignment:
Q  295 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21626 gattatgatgttttgttcatctgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcct 21543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 295 - 378
Target Start/End: Original strand, 8202236 - 8202319
Alignment:
Q  295 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8202236 gattatgatgttttgttcatctgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcct 8202319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 259 - 378
Target Start/End: Original strand, 11232402 - 11232521
Alignment:
Q  259 tttagctccaaattattggatgcatgttgataa-gtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccac 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11232402 tttagctccaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccac 11232500  T
Q  358 gaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |  ||||||||||||||||||    
T  11232501 gtttattaggagctttgtcct 11232521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 259 - 378
Target Start/End: Original strand, 11239089 - 11239208
Alignment:
Q  259 tttagctccaaattattggatgcatgttgataa-gtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccac 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11239089 tttagctccaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccac 11239187  T
Q  358 gaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |  ||||||||||||||||||    
T  11239188 gtttattaggagctttgtcct 11239208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 252 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 7536177 - 7536051
Alignment:
Q  252 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcc 350  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||| || |||||| ||| | || ||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  7536177 gatgacgtttagctccaaattattggatgcttattgatatgttgattacggtgatttgttgataagagttcatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 7536079  T
Q  351 tcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7536078 tcaccacgattattaggagctttgtcct 7536051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 177 - 378
Target Start/End: Original strand, 4318566 - 4318781
Alignment:
Q  177 ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcatag--------------gtatatgatgaagttta 262  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||| |||| | ||||||||||||||||||||               | ||| ||||| |||||    
T  4318566 ttgatataatgatatcatcctgttatgtgacttgactatgatgctactgttatttaactaagtgcataatgtctatatgtgaagaataagatgacgttta 4318665  T
Q  263 gctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 361  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||| | || ||||||  || | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  4318666 gctccaaattattggatgcatattgatatgatgattatggtgatttgttgttaagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgatt 4318764  T
Q  362 attaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||||||||    
T  4318765 attaggagctttgtcct 4318781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 250 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 18531241 - 18531113
Alignment:
Q  250 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagt 348  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||| || ||||||| || |||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  18531241 atgatgacgtttagctccaaattattggatgctcattgatatgttgattacggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagt 18531143  T
Q  349 cctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18531142 tctcaccacgattattaggagctttgtcct 18531113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 259 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 1347495 - 1347376
Alignment:
Q  259 tttagctccaaattattggatgcatgttgataa-gtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccac 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||| |||||||||  || | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1347495 tttagctccaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttttgttgttaagagttcatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccac 1347397  T
Q  358 gaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |  ||||||||||||||||||    
T  1347396 gtttattaggagctttgtcct 1347376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 252 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 11262323 - 11262202
Alignment:
Q  252 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgca-tagcatctcattgagcttagtcc 350  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  11262323 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacgatgttttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 11262226  T
Q  351 tcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||| ||    |||||||||||||||    
T  11262225 tcaccatga----taggagctttgtcct 11262202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 252 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 14953192 - 14953071
Alignment:
Q  252 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgca-tagcatctcattgagcttagtcc 350  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  14953192 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacgatgttttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 14953095  T
Q  351 tcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||| ||    |||||||||||||||    
T  14953094 tcaccatga----taggagctttgtcct 14953071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 252 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 14959158 - 14959037
Alignment:
Q  252 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgca-tagcatctcattgagcttagtcc 350  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  14959158 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacgatgttttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 14959061  T
Q  351 tcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||| ||    |||||||||||||||    
T  14959060 tcaccatga----taggagctttgtcct 14959037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 252 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 26419994 - 26419873
Alignment:
Q  252 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgca-tagcatctcattgagcttagtcc 350  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  26419994 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacgatgttttgttgata-gcgtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 26419897  T
Q  351 tcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||| ||    |||||||||||||||    
T  26419896 tcaccatga----taggagctttgtcct 26419873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 252 - 378
Target Start/End: Original strand, 44408448 - 44408569
Alignment:
Q  252 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgca-tagcatctcattgagcttagtcc 350  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  44408448 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacgatgttttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 44408545  T
Q  351 tcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||| ||    |||||||||||||||    
T  44408546 tcaccatga----taggagctttgtcct 44408569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 250 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 32874 - 32740
Alignment:
Q  250 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 340  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  32874 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 32775  T
Q  341 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  32774 agctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcct 32740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 250 - 378
Target Start/End: Original strand, 71108 - 71242
Alignment:
Q  250 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 340  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  71108 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 71207  T
Q  341 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  71208 agctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcct 71242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 250 - 378
Target Start/End: Original strand, 75217 - 75351
Alignment:
Q  250 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 340  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  75217 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 75316  T
Q  341 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  75317 agctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcct 75351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 250 - 378
Target Start/End: Original strand, 12705000 - 12705134
Alignment:
Q  250 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 340  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  12705000 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 12705099  T
Q  341 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  12705100 agctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcct 12705134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 252 - 378
Target Start/End: Original strand, 11548377 - 11548498
Alignment:
Q  252 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgca-tagcatctcattgagcttagtcc 350  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  11548377 gatgacgtttagctccaaattgttggatgcatattgatatgaagattacgatgttttgttgata-gagtccatgcagtagcat-tcattgagcttagtcc 11548474  T
Q  351 tcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||| ||    |||||||||||||||    
T  11548475 tcaccatga----taggagctttgtcct 11548498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 252 - 378
Target Start/End: Original strand, 11554973 - 11555094
Alignment:
Q  252 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgca-tagcatctcattgagcttagtcc 350  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  11554973 gatgacgtttagctccaaattgttggatgcatattgatatgaagattacgatgttttgttgata-gagtccatgcagtagcat-tcattgagcttagtcc 11555070  T
Q  351 tcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||| ||    |||||||||||||||    
T  11555071 tcaccatga----taggagctttgtcct 11555094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 252 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 12692490 - 12692369
Alignment:
Q  252 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgca-tagcatctcattgagcttagtcc 350  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||| ||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  12692490 gatgacgtctagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacgatgatttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 12692393  T
Q  351 tcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||    |||||||||||||||    
T  12692392 tcaccacga----taggagctttgtcct 12692369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 250 - 378
Target Start/End: Original strand, 16907576 - 16907711
Alignment:
Q  250 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 340  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  16907576 atgatgatgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 16907675  T
Q  341 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  16907676 agctttgtcctcaccacg--ttttaggagctttgtcct 16907711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 295 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 8705949 - 8705865
Alignment:
Q  295 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacg-aatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  8705949 gattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcct 8705865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 295 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 10869392 - 10869308
Alignment:
Q  295 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacg-aatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  10869392 gattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcct 10869308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 295 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 10875472 - 10875388
Alignment:
Q  295 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacg-aatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  10875472 gattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcct 10875388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 295 - 378
Target Start/End: Original strand, 18585452 - 18585536
Alignment:
Q  295 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacg-aatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  18585452 gattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcct 18585536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 250 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 12718433 - 12718299
Alignment:
Q  250 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacga---------tgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 340  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||         |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  12718433 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 12718334  T
Q  341 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    || || ||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  12718333 agttttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcct 12718299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 250 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 16114006 - 16113872
Alignment:
Q  250 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 340  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  16114006 atgatgacgtttagctccaagttattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 16113907  T
Q  341 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  16113906 agctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcct 16113872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 250 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 16117159 - 16117025
Alignment:
Q  250 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 340  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  16117159 atgatgacgtttagctccaagttattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 16117060  T
Q  341 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  16117059 agctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcct 16117025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 295 - 378
Target Start/End: Original strand, 18553684 - 18553768
Alignment:
Q  295 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacg-aatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||||||||  || | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  18553684 gattacgatgttttgttgttaagagtacatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcct 18553768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 295 - 378
Target Start/End: Original strand, 23520115 - 23520199
Alignment:
Q  295 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacg-aatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||    
T  23520115 gattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggatctttgtcct 23520199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 250 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 12723344 - 12723210
Alignment:
Q  250 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 340  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  12723344 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgctgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 12723245  T
Q  341 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||| |||||||||| |   |||||||||||||||||    
T  12723244 agctttgtcctcaccatg---attaggagctttgtcct 12723210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 250 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 18279168 - 18279034
Alignment:
Q  250 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 340  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  18279168 atgatgacgtttaactccaaattattgaatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 18279069  T
Q  341 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  18279068 agctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcct 18279034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 250 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 18283131 - 18282997
Alignment:
Q  250 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 340  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  18283131 atgatgacgtttaactccaaattattgaatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 18283032  T
Q  341 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  18283031 agctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcct 18282997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 250 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 12714629 - 12714494
Alignment:
Q  250 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacga---------tgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 340  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||         |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  12714629 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 12714530  T
Q  341 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||| ||||||  ||||  | ||||||||||||||||    
T  12714529 agctttgtcctccgcacg--ttttaggagctttgtcct 12714494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 18531489 - 18531419
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt 87  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||||    
T  18531489 ttgatcatgagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatgacgtttaatgcagtctgtaaagttgtt 18531419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 250 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 26292162 - 26292027
Alignment:
Q  250 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagt---------cgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 340  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||          ||||||||||| |||||  || | ||| ||||||||||| ||||||    
T  26292162 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacgatgtcttgttgttaagagtcaatgcatagcatttcattg 26292063  T
Q  341 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  26292062 agctttgtcctcaccacg--ttttaggagctttgtcct 26292027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 17 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 10875773 - 10875684
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgttaagttattttaatattaat 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||  |||||||||||| ||||| || | ||||| ||| || ||||||||    
T  10875773 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgaaacctaaggataacgtttaatgcagtctgtaaagctattaagatatgttgatattaat 10875684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 11262573 - 11262518
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgca 72  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  11262573 ttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatgacgtttaatgca 11262518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 14959408 - 14959353
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgca 72  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  14959408 ttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatgacgtttaatgca 14959353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 72
Target Start/End: Original strand, 20702852 - 20702907
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgca 72  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  20702852 ttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatgacgtttaatgca 20702907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 104
Target Start/End: Original strand, 23519815 - 23519902
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgttaagttattttaatatta 104  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||  |||||||||||| ||||| || | ||||| ||| || ||||||    
T  23519815 ttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgataacgtttaatgcagtctgtaaagctattaagatatgttgatatta 23519902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 72
Target Start/End: Original strand, 25039071 - 25039126
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgca 72  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  25039071 ttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatgacgtttaatgca 25039126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 26420244 - 26420189
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgca 72  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  26420244 ttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatgacgtttaatgca 26420189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 32767919 - 32767864
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgca 72  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  32767919 ttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatgacgtttaatgca 32767864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 72
Target Start/End: Original strand, 44408198 - 44408253
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgca 72  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  44408198 ttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatgacgtttaatgca 44408253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 251 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 18425448 - 18425315
Alignment:
Q  251 tgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttt---------tgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattga 341  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| || |||||||||| ||         ||||  || | ||||||||||||||| |||||||    
T  18425448 tgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgataatatgttgattacgatgattatggtgtcttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattga 18425349  T
Q  342 gcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||| ||||||||||||    ||||||||||||||||    
T  18425348 gctttgtcctcaccacg---tttaggagctttgtcct 18425315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 264 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 18556973 - 18556861
Alignment:
Q  264 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 361  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||||| ||||| |||||||||||  |  | |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||       
T  18556973 ctccaaattattggatgtatatgtgataagttgattaagatgttttgttgtttagcgtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccacg--- 18556878  T
Q  362 attaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||||||||    
T  18556877 attaggagctttgtcct 18556861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 10869693 - 10869604
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgttaagttattttaatattaat 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||  |||||||||||| ||||| || | ||||| ||| || ||||||||    
T  10869693 ttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgaaacttaatgataacgtttaatgcagtctgtaaagctattaagatatgttgatattaat 10869604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 13691321 - 13691252
Alignment:
Q  18 tgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt 87  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||| | ||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  13691321 tgatcaagagcgaacccctagttggtattaagacctaatgatgacgtttaatgcagtctgtagagttgtt 13691252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 72
Target Start/End: Original strand, 4318406 - 4318461
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgca 72  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  4318406 ttgatcaagagtgaatccctaattggtaatgagacctattgatgatgtttaatgca 4318461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 12692740 - 12692685
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgca 72  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  12692740 ttgatcaagagtgaatccctaattggtaatgaaacctaatgatgacgtttaatgca 12692685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 14953442 - 14953387
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgca 72  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||  ||||||||||    
T  14953442 ttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatgatgtttaatgca 14953387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 295 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 8719365 - 8719312
Alignment:
Q  295 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagt 348  Q
    |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8719365 gattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagt 8719312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 14148654 - 14148584
Alignment:
Q  177 ttgatataatgatatcatc---ttgttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcata 244  Q
    |||||||||||||||||||   ||||| |||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  14148654 ttgatataatgatatcatcctgttgttgtgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcata 14148584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 264 - 378
Target Start/End: Original strand, 2530496 - 2530607
Alignment:
Q  264 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 361  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||||||||| | ||| ||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||       
T  2530496 ctccaaattattggatgtataagtgataagtcgattaaggtgtcttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccacg--- 2530590  T
Q  362 attaggagctttgtcct 378  Q
     ||||||||||||||||    
T  2530591 tttaggagctttgtcct 2530607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 179 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 7536267 - 7536199
Alignment:
Q  179 gatataatgatatcatc---ttgttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcata 244  Q
    |||||||||||||||||   ||||| |||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  7536267 gatataatgatatcatcatgttgttgtgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcata 7536199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 13570139 - 13570077
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgta 79  Q
    ||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||| ||||| |||| ||||||| |||||    
T  13570139 ttgatcaagagtgaatccctaattgataataagacctaatgatgacgttaaatgcagtctgta 13570077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 252 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 14148562 - 14148524
Alignment:
Q  252 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgata 290  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14148562 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgata 14148524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 15022374 - 15022312
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgta 79  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||  |||||||||||| |||||    
T  15022374 ttgatccagagtgaacccctaattggtaatgaaaccttatgataacgtttaatgcagtctgta 15022312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 264 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 15083912 - 15083801
Alignment:
Q  264 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 361  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||| ||||| | ||| ||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||       
T  15083912 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaaggtgtcttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccacg--- 15083818  T
Q  362 attaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||||||||    
T  15083817 attaggagctttgtcct 15083801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 79
Target Start/End: Original strand, 18553393 - 18553455
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgta 79  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||  |||||||||||| |||||    
T  18553393 ttgatcaggagtgaacccctaattggtaatgaaaccttatgataacgtttaatgcagtctgta 18553455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 79
Target Start/End: Original strand, 18585161 - 18585223
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgta 79  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||  |||||||||||| |||||    
T  18585161 ttgatcaggagtgaacccctaattggtaatgaaaccttatgataacgtttaatgcagtctgta 18585223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 9593345 - 9593250
Alignment:
Q  264 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacga 359  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||| ||||| ||||||||||| ||| | |||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  9593345 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaagatgttttgttgata-gagtccatgcattagcata-cattgagctttgtcctcaccacga 9593250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 43 - 79
Target Start/End: Original strand, 19985 - 20021
Alignment:
Q  43 taatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgta 79  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  19985 taatgagacctagtgatgacgtttaatgcagtctgta 20021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 177 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 9410028 - 9409964
Alignment:
Q  177 ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgc 241  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||| ||  | ||||||| | |||||||||||||||||    
T  9410028 ttgatataatgatatcatactgctatgtgacatgactgtgctgctgctgttatttaactaagtgc 9409964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 327; Significance: 0; HSPs: 88)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 23954392 - 23954030
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  23954392 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtttaagttatattaatattaattgaatatga 23954293  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgctttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttat 215  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23954292 actattgtattgtatattcatgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgctttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttat 23954193  T
Q  216 gctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcata 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23954192 gctgcttccgttatttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcata 23954093  T
Q  316 tgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23954092 tgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 23954030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 23961054 - 23960692
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  23961054 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtttaagttatattaatattaattgaatatga 23960955  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgctttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttat 215  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23960954 actattgtattgtatattcatgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgctttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttat 23960855  T
Q  216 gctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcata 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23960854 gctgcttccgttatttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcata 23960755  T
Q  316 tgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23960754 tgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 23960692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Original strand, 19780151 - 19780512
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  19780151 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtttaagttatattaatattaattgaatatga 19780250  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgctttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttat 215  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19780251 actattgtattgtatattcatgcaagataggaagatgtgataatgatacaaattatgtgctttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttat 19780350  T
Q  216 gctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcata 315  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19780351 gctgcttccgttattt-actaagtgcataattatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcata 19780449  T
Q  316 tgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19780450 tgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 19780512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 15362377 - 15362014
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||| ||    
T  15362377 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgttgtttaatgcagactgtagagttgtttaagttatattaatattaattggataaga 15362278  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttta 214  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  15362277 actattgtattgtatattcatgcaaaatgagaagatgtgataataatgcaatttatgtgctattgatataatgatatcatcttgatatgtgacttgttta 15362178  T
Q  215 tgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcat 314  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15362177 tgctgcttccgttgtttaactaagtgcataagtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgttttgttcat 15362078  T
Q  315 atgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15362077 atgtgtccatgcatagcatatcattgagctttgtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcct 15362014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 22194864 - 22194501
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||| ||    
T  22194864 ttgatcaagagtgaacccctagctggtaatgagacctagggatgttgtttaatgcagactgtagagttgtttaagttatattaatattaattggataaga 22194765  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttta 214  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  22194764 actattgtattgtatattcatgcaaaatgagaagatgtgataataatgcaatttatgtgctattgatataatgatatcatcttgatatgtgacttgttta 22194665  T
Q  215 tgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcat 314  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22194664 tgctgcttccgttgtttaactaagtgcataagtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgttttgttcat 22194565  T
Q  315 atgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22194564 atgtgtccatgcatagcatatcattgagctttgtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcct 22194501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Original strand, 16231703 - 16232066
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||| ||    
T  16231703 ttgatcaagagtaaacccctatctggtaatgagacctagtgatgttgtttaatacagactgtagagttgtttaagttatattaatattaattggataaga 16231802  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttta 214  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  16231803 actattgtattgtatattcatgcaaaatgagaagatgtgataataatgcaatttatgtgctattgatataatgatatcatcttgatatgtgacttgttta 16231902  T
Q  215 tgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcat 314  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16231903 tgctgcttccgttgtttaactaagtgcataagtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgttttgttcat 16232002  T
Q  315 atgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16232003 atgtgtccatgcatagcatatcattgagctttgtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcct 16232066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Original strand, 36884596 - 36884959
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |  || ||    
T  36884596 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgttgtttaatgcagactgtagagttgtttaagttatatcaatattaattggttaaga 36884695  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttta 214  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  36884696 actattgtattgtatattcatgcaaaatgagaagatgtgataataatgcaatttatgtgctattgatataatgatatcatcttgatatgtgacttgttta 36884795  T
Q  215 tgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcat 314  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36884796 tgctgcttccgttgtttaactaagtgcataagtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgttttgttcat 36884895  T
Q  315 atgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  36884896 atgtgtccatgcatagcatatcattgagctttgtcctcaccacgaaaattaggagcgttgtcct 36884959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 4772341 - 4771979
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgt-taagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||| || ||||| ||  ||||||| || ||| ||||    
T  4772341 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgttgttaaatgcaatctgtagagtagtctaagtcatgataatattgattgaacatga 4772242  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttta 214  Q
     ||| |||| ||||||||  ||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4772241 gctaatgtaatgtatatttatgcaagatatgaagagttgataatgatacaatttatgtgctattgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttta 4772142  T
Q  215 tgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcat 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4772141 tgctgcttccgttatttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagt-gattacgatgttttgttcat 4772043  T
Q  315 atgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4772042 atgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 4771979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 15148700 - 15148339
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgttaagttattttaatattaatcgaatatgaa 116  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||    
T  15148700 ttgatcaagagtgaacccctaattggtattgagacctattgatgaagtttaatgcagtcggtagagttgttaagttatattgatattaattgaacatgaa 15148601  T
Q  117 ctattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttat 215  Q
    ||| ||||||||||| || ||||||||| |||| | ||||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  15148600 ctaatgtattgtataatcatgcaagatatgaaggt-tgataataatgcaatttatgtgctattgatataatgatatcatcttgatatgtgacttgtttat 15148502  T
Q  216 gctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcata 315  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15148501 gctgcttccgttgtttaactaagtgcataagtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgttttgttcata 15148402  T
Q  316 tgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15148401 tgtgtccatgcatagcatatcattgagctttgtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcct 15148339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Original strand, 8048357 - 8048719
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgt-taagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| || ||||| ||  ||||||| || ||| ||||    
T  8048357 ttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgagacctagtgatgttgttaaatgcagtctgtagagtagtctaagtcatgataatattgattgaacatga 8048456  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttta 214  Q
      || |||| ||||||||  ||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8048457 gttaatgtaatgtatatttatgcaagatatgaagagttgataatgatacaatttatgtgctattgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttta 8048556  T
Q  215 tgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcat 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8048557 tgctgcttccgttatttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagctccaagttattggatgcatgttgataagt-gattacgatgttttgttcat 8048655  T
Q  315 atgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8048656 atgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagccttgtcct 8048719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Original strand, 15383355 - 15383716
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||| ||    
T  15383355 ttgatcaagagtgaacccctatctggtaatgagacctagtgatgttgtt-aatacagactgtagagttgtttaagttatattaatattaattggataaga 15383453  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttta 214  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  15383454 actattgtattgtatattcatgcaaaatgagaagatgtgataataatgcaatttatgtgctattgatataatgatatcatcttgatatgtgacttgttta 15383553  T
Q  215 tgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcat 314  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||  |    
T  15383554 tgctgcttccgttgtttaactaagtgcataagtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatacgttgattacg-tgttttgttgtt 15383652  T
Q  315 atgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15383653 atgtgtccatgcatagcatatcattgagctttgtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcct 15383716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Original strand, 14298689 - 14299052
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||| | | ||||    
T  14298689 ttgatctagagtgaacccctaactagtaataagacctaatgatgacgtttaatgcagtctgtagagttgtttaagttatgttgatattaattggacatga 14298788  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgtt-atgtgacctgttt 213  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| ||| |  |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  14298789 actaatgtattgtatattcatgcaagatatgaaaacttgataatgatgcaatttatgtgctattgatataatgatatcatctcgtttatgtgacctgttt 14298888  T
Q  214 atgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttca 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  14298889 atgctgcttccgttatttaactaagtgcataagtatatgatgaagtt-agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttca 14298987  T
Q  314 tatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14298988 taagtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcgccacgaatattaggagctttgtcct 14299052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Original strand, 14305313 - 14305676
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||| | | ||||    
T  14305313 ttgatctagagtgaacccctaactagtaataagacctaatgatgacgtttaatgcagtctgtagagttgtttaagttatgttgatattaattggacatga 14305412  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgtt-atgtgacctgttt 213  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| ||| |  |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  14305413 actaatgtattgtatattcatgcaagatatgaaaacttgataatgatgcaatttatgtgctattgatataatgatatcatctcgtttatgtgacctgttt 14305512  T
Q  214 atgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttca 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  14305513 atgctgcttccgttatttaactaagtgcataagtatatgatgaagtt-agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttca 14305611  T
Q  314 tatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14305612 taagtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcgccacgaatattaggagctttgtcct 14305676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Original strand, 8054970 - 8055332
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgt-taagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| || ||||| ||  ||||||| || ||| ||||    
T  8054970 ttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgagacctagtgatgttgttaaatgcagtctgtagagtagtctaagtcatgataatattgattgaacatga 8055069  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttta 214  Q
      || |||| ||||||||  ||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8055070 gttaatgtaatgtatatttatgcaagatatgaagagttgataatgatacaatttatgtgttattgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttta 8055169  T
Q  215 tgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcat 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8055170 tgctgcttccgttatttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagctccaagttattggatgcatgttgataagt-gattacgatgttttgttcat 8055268  T
Q  315 atgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8055269 atgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagccttgtcct 8055332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 12475264 - 12474901
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |  || ||    
T  12475264 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagttatattaatattaattggttaaga 12475165  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttta 214  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||| | ||||||| || ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  12475164 actattgtattgtatattcatgcaaaatgagaaggtttgataataatgcaatttatgtgctattgatataataatatcatcttgatatgtgacttgttta 12475065  T
Q  215 tgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttga-taagtcgattacgatgttttgttca 313  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||||||      
T  12475064 tgctgcttccgttgtttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgttgattacg-tgttttgttgt 12474966  T
Q  314 tatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12474965 taagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcct 12474901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Original strand, 14268319 - 14268678
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||| ||||    
T  14268319 ttgattaagagtgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgttaaatgcagtctgtagagttgtttaagttatgttgatattaattgaacatga 14268418  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttta 214  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||  || ||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  14268419 actaatgtattgtatattcatgcaagatatgaagtt-tgataatgatgtaa-ttaagtgctattggtataatgatatcat-ttgttatgtgacttgttta 14268515  T
Q  215 tgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcat 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  14268516 tgctgcttccgttatttaactaagtgcataagtatatgatgaagtt-agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcat 14268614  T
Q  315 atgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14268615 aagtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcct 14268678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Original strand, 18024289 - 18024652
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||||    
T  18024289 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagagatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagttatattgatattaattgaatatga 18024388  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttta 214  Q
    | || |||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||| || ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  18024389 attaatgtattgtatattcatgcaagatatgaaggtttgataataatgcaatttatgtgctattgatataataatatcatcttgatatgtgacttgttta 18024488  T
Q  215 tgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttga-taagtcgattacgatgttttgttca 313  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||||||      
T  18024489 tgctgcttccgttgtttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgttgattacg-tgttttgttgt 18024587  T
Q  314 tatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    || | |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18024588 taagagtccatacatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcct 18024652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 18071413 - 18071050
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||  | ||    
T  18071413 ttgatcaagagtgaacccctaattggtattgagacctagtggtgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagttatattgatattaattgagcaaga 18071314  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttta 214  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  18071313 actaatgtattgtatattcatgcaagatatgaagatttgataataatgcaatttatgtgctattgatataatgatatcatcttgatatgtgacttgttta 18071214  T
Q  215 tgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttga-taagtcgattacgatgttttgttca 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||| |||||||||||    
T  18071213 tgctgcttccgttatttaactaagtgcatatgtttatgataaggtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttttgttca 18071115  T
Q  314 tatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18071114 taagtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcct 18071050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 18295870 - 18295507
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgttaag-ttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || |||| || |||||||| ||||||||    
T  18295870 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaggttatattgatattaattgaatatga 18295771  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttta 214  Q
    | || |||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||| || ||| ||||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  18295770 attaatgtattgtatattcatgcaagatatgaaggtttgataataatgcaatttatgtgctattgatataataataccatcttgatatgtgacttgttta 18295671  T
Q  215 tgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttga-taagtcgattacgatgttttgttca 313  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||||||      
T  18295670 tgctgcttccgttgtttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgttgattacg-tgttttgttgt 18295572  T
Q  314 tatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18295571 taagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcct 18295507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 22 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 12481889 - 12481531
Alignment:
Q  22 caagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgt-taagttattttaatattaatcgaatatgaactat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |  || |||||||    
T  12481889 caagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtntaagttatattaatattaattggttaagaactat 12481790  T
Q  121 tgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttatgctg 219  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||||| | ||||||| || ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  12481789 tgtattgtatattcatgcaaaatgagaaggtttgataataatgcaatttatgtgctattgatataataatatcatcttgatatgtgacttgtttatgctg 12481690  T
Q  220 cttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttga-taagtcgattacgatgttttgttcatatgt 318  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||||||  || |     
T  12481689 cttccgttgtttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaaga 12481591  T
Q  319 gtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12481590 gtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcct 12481531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 20115387 - 20115024
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||| | ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||  | | ||||    
T  20115387 ttgatcaagagcgaacccctagttggtattaagacctaatgatgacgtttaatgcagtctgtagagttgtttaagttatgttgatattaaatggacatga 20115288  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgtt-atgtgacctgttt 213  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| |  |   | ||||  ||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  20115287 actaatgtattgtatattcgtgcaagatacgaaggt-tgatattcctgatatttataagctgttgatataatgatatcattttgtttatgtgacctgttt 20115189  T
Q  214 atgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgtttt-gttc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  20115188 atgctgcttccgttatttaactaagtgcataagtttatgatgaagtt-agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgtttttgttc 20115090  T
Q  313 atatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  20115089 ataagtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaataataggagttttgtcct 20115024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 18 - 378
Target Start/End: Original strand, 6873238 - 6873601
Alignment:
Q  18 tgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagt-tgttaagttattttaatattaatcgaatatgaa 116  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| |  ||||| ||  | |||||  || ||   |||||| ||| |||||    
T  6873238 tgatcaagagggaacccctaattggtaatgaaacctagtgatgacgtttaatgtaatctgtaaagccttttaagacatgttgtcattaattgaacatgaa 6873337  T
Q  117 ctattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttat 215  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||| |||  | | || ||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6873338 ctaatgtattgtatattcatgcaagatatgaaagtttaattatgatgcaaatgatttgctattgatataatgatatcatcttgttatgtgacttgtttat 6873437  T
Q  216 gctgcttccgttatttaactaagtgcata-ggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcat 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||  |    
T  6873438 gctgcttccgttatttaactaagtgcatatggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgttttgttgtt 6873537  T
Q  315 atgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  6873538 aagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcct 6873601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Original strand, 386193 - 386554
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgttaagttattttaatattaatcgaatatgaa 116  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||  ||||| ||   |||||  || ||    ||||| ||  ||||     
T  386193 ttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatgacgtttaatgcaatctgtaaagcctttaagacatgttgtcgttaattgagcatgat 386292  T
Q  117 ctattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttat 215  Q
     || ||||||||| | || || |||||| |||  | | || ||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  386293 -taatgtattgtacaatcatgtaagatatgaaagt-taattatgatgcaaatgatttgctattgatataatgatatcatcttgttatgtgacttgtttat 386390  T
Q  216 gctgcttccgttatttaactaagtgcata-ggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcat 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||  |    
T  386391 gctgcttccgttatttaactaagtgcatatggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgttttgttgtt 386490  T
Q  315 atgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  386491 aagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcct 386554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 177 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 40478233 - 40478031
Alignment:
Q  177 ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcata-ggtatatgatgaagtttagctccaaattatt 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40478233 ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacttgtttatgttgcttccgttatttaactaagtgcatatggtatatgatgaagtttagctccaaattatt 40478134  T
Q  276 ggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgt 375  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  40478133 ggatgcatgttgatatgttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgt 40478034  T
Q  376 cct 378  Q
    |||    
T  40478033 cct 40478031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 180 - 378
Target Start/End: Original strand, 51493843 - 51494040
Alignment:
Q  180 atataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcata-ggtatatgatgaagtttagctccaaattattgga 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51493843 atataatgatatcatcttgttatgtgacttgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcatatggtatatgatgaagtttagctccaaattattgga 51493942  T
Q  279 tgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||  |||||| ||  |||||| |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  51493943 tgca--ttgatatgtttattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcct 51494040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 177 - 378
Target Start/End: Original strand, 26284928 - 26285132
Alignment:
Q  177 ttgatataatgatatcatcttgttat-gtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcata-ggtatatgatgaagtttagctccaaattat 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26284928 ttgatataatgatatcatcttgttattgtgacttgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcatatggtatatgatgaagtctagctccaaattat 26285027  T
Q  275 tggatgcatgttgataagtcga-ttacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagcttt 373  Q
    |||||||||||||||| || || ||||| |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  26285028 tggatgcatgttgatatgttgaattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagcctt 26285127  T
Q  374 gtcct 378  Q
    |||||    
T  26285128 gtcct 26285132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 177 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 23081673 - 23081455
Alignment:
Q  177 ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcatagg---------tatatgatgaa--------gt 259  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||||| |          |||||||||||        ||    
T  23081673 ttgatataatgatatcatcctgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatgtatttatatatgatgaaatgatgacgt 23081574  T
Q  260 ttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacga 359  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23081573 ttagctccaaattgttggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgt 23081474  T
Q  360 atattaggagctttgtcct 378  Q
     ||||||||||||||||||    
T  23081473 ttattaggagctttgtcct 23081455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 177 - 378
Target Start/End: Original strand, 16956672 - 16956890
Alignment:
Q  177 ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcatagg---------tatatgatgaa--------gt 259  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||||| |          |||||||||||        ||    
T  16956672 ttgatataatgatatcatcctgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatatatttatatatgatgaaatgatgacgt 16956771  T
Q  260 ttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacga 359  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16956772 ttagctccaaattgttggatgcatgttgatatgttgattacgatgttatgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgt 16956871  T
Q  360 atattaggagctttgtcct 378  Q
     ||||||||||||||||||    
T  16956872 ttattaggagctttgtcct 16956890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 177 - 378
Target Start/End: Original strand, 19942175 - 19942393
Alignment:
Q  177 ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcatagg---------tatatgatgaa--------gt 259  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||||| |          |||||||||||        ||    
T  19942175 ttgatataatgatatcatcctgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatgtatttatatatgatgaaatgatgacgt 19942274  T
Q  260 ttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacga 359  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19942275 ttagctccaaattgttggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgt 19942374  T
Q  360 atattaggagctttgtcct 378  Q
     ||||| ||||||||||||    
T  19942375 ttattatgagctttgtcct 19942393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 177 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 27709830 - 27709612
Alignment:
Q  177 ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcatagg---------tatatgatgaa--------gt 259  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | | ||||||||||||||||||| |          |||||||||||        ||    
T  27709830 ttgatataatgatatcatcctgttatgtgacttgattatgctgttgctgttatttaactaagtgcattgtatgtatttatatatgatgaaatgatgacgt 27709731  T
Q  260 ttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacga 359  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27709730 ttagctccaaattgttggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgt 27709631  T
Q  360 atattaggagctttgtcct 378  Q
     ||||||||||||||||||    
T  27709630 ttattaggagctttgtcct 27709612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 177 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 40471560 - 40471449
Alignment:
Q  177 ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcata-ggtatatgatgaagtttagctccaaattatt 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40471560 ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacttgtttatgttgcttccgttatttaactaagtgcatatggtatatgatgaagtttagctccaaattatt 40471461  T
Q  276 ggatgcatgttg 287  Q
    ||||||||||||    
T  40471460 ggatgcatgttg 40471449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 250 - 378
Target Start/End: Original strand, 9272267 - 9272395
Alignment:
Q  250 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 349  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||| || |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9272267 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgaatacggtgatttgttcataagagtccatgcatagcatttcattgagcttagtc 9272366  T
Q  350 ctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9272367 ctcaccacgattattaggagctttgtcct 9272395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 250 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 53433371 - 53433242
Alignment:
Q  250 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgca-tagcatctcattgagcttagt 348  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  53433371 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagt 53433273  T
Q  349 cctcaccacga-atattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  53433272 cctcaccacgatttattaggagctttgtcct 53433242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 295 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 8384778 - 8384695
Alignment:
Q  295 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8384778 gattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcct 8384695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 295 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 8391433 - 8391350
Alignment:
Q  295 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8391433 gattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcct 8391350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 295 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 14073774 - 14073691
Alignment:
Q  295 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14073774 gattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcct 14073691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 295 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 15256552 - 15256469
Alignment:
Q  295 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15256552 gattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcct 15256469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Original strand, 15321955 - 15322331
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagt-tgttaagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||  ||||| ||  | |||||  || ||   |||||| ||  ||||    
T  15321955 ttgatcaatagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatgacgtttaatgcaatctgtaaagccttttaagacatgttgtcattaattgagcatga 15322054  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttta 214  Q
      || ||||||||| | || || |||||| |||  | | || ||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||    
T  15322055 t-taatgtattgtacaatcatgtaagatatgaaagtttaattatgatgcaaatgatttgctattgatataatgatatcatcctgttatgtgacttgatta 15322153  T
Q  215 tgctgcttccgttatttaactaagtgcat--------------aggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttga-taagtcgatta 299  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||              | | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||    
T  15322154 tgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgattatgtgtaatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgatgatta 15322253  T
Q  300 cgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    || |||||| ||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||    
T  15322254 cg-tgttttattgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgtttattacgagctttgtcct 15322331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 295 - 378
Target Start/End: Original strand, 17090140 - 17090223
Alignment:
Q  295 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17090140 gattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcct 17090223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 295 - 378
Target Start/End: Original strand, 29041061 - 29041144
Alignment:
Q  295 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29041061 gattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcct 29041144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 252 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 35170621 - 35170494
Alignment:
Q  252 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcc 350  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||| || |||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  35170621 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacggtgatttgttgataagagtccatgcattagcatttcattgagcttagtcc 35170522  T
Q  351 tcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35170521 tcaccacgattattaggagctttgtcct 35170494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 250 - 378
Target Start/End: Original strand, 4561675 - 4561800
Alignment:
Q  250 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 349  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  4561675 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtc 4561774  T
Q  350 ctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||   |||||||||||||||||    
T  4561775 ctcaccacg---attaggagctttgtcct 4561800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 250 - 378
Target Start/End: Original strand, 5757280 - 5757405
Alignment:
Q  250 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 349  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  5757280 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtc 5757379  T
Q  350 ctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||   |||||||||||||||||    
T  5757380 ctcaccacg---attaggagctttgtcct 5757405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 295 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 17808357 - 17808274
Alignment:
Q  295 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17808357 gattatgatgttttgttcatctgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcct 17808274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 250 - 378
Target Start/End: Original strand, 14757763 - 14757900
Alignment:
Q  250 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 340  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  14757763 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattg 14757862  T
Q  341 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14757863 agcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcct 14757900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 252 - 375
Target Start/End: Original strand, 7901283 - 7901406
Alignment:
Q  252 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataa-gtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcc 350  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7901283 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgattatgatgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcc 7901381  T
Q  351 tcaccacgaatattaggagctttgt 375  Q
    ||||||||  |||||||||||||||    
T  7901382 tcaccacgtttattaggagctttgt 7901406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 263 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 35613921 - 35613806
Alignment:
Q  263 gctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 361  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||| ||| | ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  35613921 gctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacgatgttttgttgataagagtccatgtattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgatt 35613823  T
Q  362 attaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||||||||    
T  35613822 attaggagctttgtcct 35613806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 250 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 20682147 - 20682038
Alignment:
Q  250 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgca-tagcatctcattgagcttagt 348  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| || |||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  20682147 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagt 20682049  T
Q  349 cctcaccacga 359  Q
    |||||||||||    
T  20682048 cctcaccacga 20682038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 252 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 12522076 - 12521950
Alignment:
Q  252 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcc 350  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||| || |||||| ||| | |||||||||| ||||| |||||||||| |||||    
T  12522076 gatgacgtttggctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagctcagtcc 12521978  T
Q  351 tcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12521977 tcaccacgattattaggagctttgtcct 12521950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 281 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 40453899 - 40453802
Alignment:
Q  281 catgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||| || ||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  40453899 catgttgatatgttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcct 40453802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 252 - 356
Target Start/End: Original strand, 41385856 - 41385959
Alignment:
Q  252 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgca-tagcatctcattgagcttagtcc 350  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  41385856 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacgatgttttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 41385953  T
Q  351 tcacca 356  Q
    ||||||    
T  41385954 tcacca 41385959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 250 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 9556295 - 9556161
Alignment:
Q  250 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 340  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  9556295 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 9556196  T
Q  341 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  9556195 agctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcct 9556161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 250 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 17810039 - 17809905
Alignment:
Q  250 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 340  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  17810039 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 17809940  T
Q  341 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  17809939 agctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcct 17809905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 250 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 33742145 - 33742011
Alignment:
Q  250 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 340  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  33742145 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 33742046  T
Q  341 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  33742045 agctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcct 33742011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 295 - 378
Target Start/End: Original strand, 12300050 - 12300134
Alignment:
Q  295 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacg-aatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  12300050 gattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcct 12300134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 295 - 378
Target Start/End: Original strand, 12349726 - 12349810
Alignment:
Q  295 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacg-aatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  12349726 gattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcct 12349810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 295 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 55795403 - 55795319
Alignment:
Q  295 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacg-aatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  55795403 gattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcct 55795319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 252 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 14678957 - 14678837
Alignment:
Q  252 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcc 350  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||  ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  14678957 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacgatgttttgtg-ata-gagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 14678861  T
Q  351 tcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||| ||    |||||||||||||||    
T  14678860 tcaccatga----taggagctttgtcct 14678837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 252 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 23838428 - 23838307
Alignment:
Q  252 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgca-tagcatctcattgagcttagtcc 350  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||| |||||||| ||| | ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  23838428 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacgacgttttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgaacttagtcc 23838331  T
Q  351 tcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||| ||    |||||||||||||||    
T  23838330 tcaccatga----taggagctttgtcct 23838307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 244
Target Start/End: Original strand, 30235041 - 30235267
Alignment:
Q  19 gatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatgaac 117  Q
    |||||||||||||||||    ||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||| || |||| ||| ||| || |||||||| ||  ||||      
T  30235041 gatcaagagtgaacccccttatggtaatgagacctaatgacgacgtttaatgcagtctgtaaagctgtttaagatatgttgatattaattgagcatgat- 30235139  T
Q  118 tattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttatg 216  Q
    || ||||||||| | |  || |||||| |||  | | || ||||| ||| | || |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||  ||||    
T  30235140 taatgtattgtacaattatgtaagatatgaaagtttaattatgatgcaattgatttgctattgatataatgatatcattatgttatgtgacttgactatg 30235239  T
Q  217 ctgcttccgttatttaactaagtgcata 244  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  30235240 ctgctgctgttatttaactaagtgcata 30235267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 252 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 14685165 - 14685045
Alignment:
Q  252 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcc 350  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| |  ||||||||||||||||  ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  14685165 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatattaatatgatgattacgatgttttgtg-ata-gagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 14685069  T
Q  351 tcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||| ||    |||||||||||||||    
T  14685068 tcaccatga----taggagctttgtcct 14685045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 15224805 - 15224672
Alignment:
Q  251 tgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattga 341  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| |||||||    
T  15224805 tgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgataatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattga 15224706  T
Q  342 gcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||| ||||||||||||    ||||||||||||||||    
T  15224705 gctttgtcctcaccacg---tttaggagctttgtcct 15224672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 17 - 106
Target Start/End: Original strand, 17962186 - 17962275
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgttaagttattttaatattaat 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||  |||||||||||| ||||| || | ||||| ||| || ||||||||    
T  17962186 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgaaaccttatgataacgtttaatgcagtctgtaaagctattaagatatgttgatattaat 17962275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 295 - 378
Target Start/End: Original strand, 17962486 - 17962570
Alignment:
Q  295 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacg-aatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||| |||||||||||  || |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  17962486 gattaagatgttttgttgttaagaatccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcct 17962570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 72
Target Start/End: Original strand, 26284769 - 26284824
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgca 72  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  26284769 ttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatgacgtttaatgca 26284824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 40471719 - 40471664
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgca 72  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  40471719 ttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatgacgtttaatgca 40471664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 40478392 - 40478337
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgca 72  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  40478392 ttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatgacgtttaatgca 40478337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 72
Target Start/End: Original strand, 51493679 - 51493734
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgca 72  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  51493679 ttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatgacgtttaatgca 51493734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 17 - 243
Target Start/End: Original strand, 7901032 - 7901260
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgttaagttattttaatattaatcgaatatgaa 116  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||  || |||||||  ||||| ||   |||||  || ||   |||||| ||  ||||     
T  7901032 ttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatgaagtctaatgcaatctgtaaagcctttaagacatgttgtcattaattgagcatgat 7901131  T
Q  117 ctattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttta- 214  Q
     |||||||||||| | | ||| ||| || |||| | | || ||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||     
T  7901132 -tattgtattgtacaattgtgtaaggtatgaagtt-taattatgatgcaaataatttgctattgatataatgatatcatcatgttatgtgacttgattat 7901229  T
Q  215 --tgctgcttccgttatttaactaagtgcat 243  Q
      ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  7901230 gctgctgctgctgttatttaactaagtgcat 7901260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 12522329 - 12522274
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgca 72  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  12522329 ttgatcaagagtgaacccctagttggtaatgagacctaatgatgatgtttaatgca 12522274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 14679207 - 14679152
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgca 72  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| || ||||||||    
T  14679207 ttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatgacgattaatgca 14679152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 14685415 - 14685360
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgca 72  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| || ||||||||    
T  14685415 ttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatgacgattaatgca 14685360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 23838678 - 23838623
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgca 72  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  23838678 ttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatgacatttaatgca 23838623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 35614184 - 35614129
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgca 72  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  35614184 ttgatcaagagtgaacccctagttggtaatgagacctaatgatgatgtttaatgca 35614129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 72
Target Start/End: Original strand, 41385606 - 41385661
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgca 72  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  41385606 ttgatcaagagtgaacccctgattggtaatgaaacctaatgatgacgtttaatgca 41385661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 177 - 243
Target Start/End: Original strand, 9272125 - 9272191
Alignment:
Q  177 ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcat 243  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||| ||  ||||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  9272125 ttgatataatgaaatcatcctgttatgtgacttgactatgctgctgctgttgtttaactaagtgcat 9272191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 106
Target Start/End: Original strand, 12299759 - 12299848
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgttaagttattttaatattaat 106  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||  ||||  |||||||||||| ||||| || | ||||| ||| || ||||||||    
T  12299759 ttgatcaagagtgaacccctatttggtaatgaaaccttatgataacgtttaatgcagtctgtaaagctattaagatatgttgatattaat 12299848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 106
Target Start/End: Original strand, 12349435 - 12349524
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgttaagttattttaatattaat 106  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||  |||||||||||| ||||| || | ||||| ||| || ||||||||    
T  12349435 ttgatcaggagtgaacccctaattggtaatgaaaccttatgataacgtttaatgcagtctgtaaagctattaagatatgttgatattaat 12349524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 45938149 - 45938039
Alignment:
Q  264 ctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgca-tagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaata 362  Q
    ||||||||||||||||| |   |||||||| ||||| |||||||||||  || | ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |   |    
T  45938149 ctccaaattattggatgtaatgtgataagttgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccatg---a 45938055  T
Q  363 ttaggagctttgtcct 378  Q
    ||||||||||||||||    
T  45938054 ttaggagctttgtcct 45938039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 55795703 - 55795647
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcag 73  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||  ||||||||||||    
T  55795703 ttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacccaatgataacgtttaatgcag 55795647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 17 - 60
Target Start/End: Original strand, 9271965 - 9272008
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 60  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||    
T  9271965 ttgatcaagagtgaacctctaattggtaatgaaacctagtgatg 9272008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 264 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 12487427 - 12487316
Alignment:
Q  264 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 361  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||| ||||| | ||| ||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||       
T  12487427 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaaggtgtcttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccacg--- 12487333  T
Q  362 attaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||||||||    
T  12487332 attaggagctttgtcct 12487316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 264 - 356
Target Start/End: Original strand, 19757706 - 19757798
Alignment:
Q  264 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgca-tagcatctcattgagcttagtcctcacca 356  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||||| ||||| |||||||||||  || | ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  19757706 ctccaaattattggatgtatatgtgataagttgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcacca 19757798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 264 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 19782100 - 19782008
Alignment:
Q  264 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcacca 356  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||||| ||||| |||||||||||  || | |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  19782100 ctccaaattattggatgtatatgtgataagttgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcacca 19782008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 264 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 27533742 - 27533630
Alignment:
Q  264 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 361  Q
    ||||||||||||||||| ||   ||||| || ||||||| || |||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||       
T  27533742 ctccaaattattggatgtataagtgatacgttgattacggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccacg--- 27533647  T
Q  362 attaggagctttgtcct 378  Q
     ||||||||||||||||    
T  27533646 tttaggagctttgtcct 27533630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 35170873 - 35170836
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagaccta 54  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  35170873 ttgatcaagagtgaatccctaattggtaatgagaccta 35170836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 177 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 12522168 - 12522098
Alignment:
Q  177 ttgatataatgatatcatc---ttgttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcata 244  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||| || ||  |||| |||| | ||||||||||||||||||||    
T  12522168 ttgatataatgatatcatcctgttgttatgttacttgactatgatgctgctgttatttaactaagtgcata 12522098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 177 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 35614023 - 35613953
Alignment:
Q  177 ttgatataatgatatcatc---ttgttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcata 244  Q
    |||||||||||||||||||   ||||| |||||| ||  |||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  35614023 ttgatataatgatatcatcctgttgttgtgtgacttgactatgctgctgatgttatttaactaagtgcata 35613953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 327; Significance: 0; HSPs: 68)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Original strand, 22320847 - 22321209
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  22320847 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtttaagttatattaatattaattgaatatga 22320946  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgctttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttat 215  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22320947 actattgtattgtatattcatgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgctttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttat 22321046  T
Q  216 gctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcata 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22321047 gctgcttccgttatttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcata 22321146  T
Q  316 tgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22321147 tgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 22321209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Original strand, 22327000 - 22327362
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  22327000 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtttaagttatattaatattaattgaatatga 22327099  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgctttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttat 215  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22327100 actattgtattgtatattcatgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgctttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttat 22327199  T
Q  216 gctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcata 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22327200 gctgcttccgttatttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcata 22327299  T
Q  316 tgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22327300 tgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 22327362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 27617541 - 27617180
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  27617541 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtttaagttatattaataataattgaatatga 27617442  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgctttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttat 215  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27617441 actattgtattgtatattcatgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgctttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttat 27617342  T
Q  216 gctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcata 315  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27617341 gttgcttccgttatttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagt-gattacgatgttttgttcata 27617243  T
Q  316 tgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27617242 tgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcct 27617180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Original strand, 26877429 - 26877790
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  26877429 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtttaagttatattaatattaattgaatatga 26877528  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgctttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttat 215  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26877529 actattgtattgtatattcatgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgctttgatataatgacatcatcttgttatgtgacctgtttat 26877628  T
Q  216 gctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcata 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  26877629 gctgcttccgttatttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagt-gattacgttgttttgttcata 26877727  T
Q  316 tgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26877728 tgtgtccatgcatagcatatcattgagtttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcct 26877790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 29233774 - 29233412
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttg-ttaagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||| ||||    
T  29233774 ttgatcaagggtgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagtctgtagagttggttaagttatgttgatattaattgaacatga 29233675  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttta 214  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||| || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29233674 actagtgtattgtatattcatgcaagatatgaaggtttgataataatgcaatttatgtgctattgatataatgatatcatcttgttatgtgacttgttta 29233575  T
Q  215 tgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcat 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  29233574 tgctgcttccgttatttaactaagtgcataagtatatgatgaagtt-agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcat 29233476  T
Q  315 atgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  29233475 aagtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccgcgattattaggagctttgtcct 29233412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 29347073 - 29346711
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttg-ttaagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||| ||||    
T  29347073 ttgatcaagggtgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagtctgtagagttggttaagttatgttgatattaattgaacatga 29346974  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttta 214  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||| || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29346973 actagtgtattgtatattcatgcaagatatgaaggtttgataataatgcaatttatgtgctattgatataatgatatcatcttgttatgtgacttgttta 29346874  T
Q  215 tgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcat 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  29346873 tgctgcttccgttatttaactaagtgcataagtatatgatgaagtt-agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcat 29346775  T
Q  315 atgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  29346774 aagtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccgcgattattaggagctttgtcct 29346711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Original strand, 24913825 - 24914189
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||| || |||||||| ||| ||||    
T  24913825 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgttaaatgcagtctgtagagttgtttaagatatgttgatattaattgaacatga 24913924  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttta 214  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| |||  | |||| ||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24913925 actaatgtattgtatattcatgcaagatatgaaagtttgattatgatgcaattgatgtgctattgatataatgatatcatcttgttatgtgacttgttta 24914024  T
Q  215 tgctgcttccgttatttaactaagtgcata-ggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttca 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  24914025 tgctgcttccgttatttaactaagtgcatatggtatacgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttca 24914124  T
Q  314 tatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||    
T  24914125 taagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgatgattaggagttttgtcct 24914189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 1843328 - 1842965
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||| | | ||||    
T  1843328 ttgatctagagtgaacccctaactagtaataagacctaatgataacgtttaatgcagtctgtagagttgtttaagttatgttgatattaattggacatga 1843229  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgtt-atgtgacctgttt 213  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| ||| |  |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  1843228 actaatgtattgtatattcatgcaagatatgaaaacttgataatgatgcaatttatgtgctattgatataatgatatcatctcgtttatgtgacctgttt 1843129  T
Q  214 atgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttca 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  1843128 atgctgcttccgttatttaactaagtgcataaatatatgatgaagtt-agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttca 1843030  T
Q  314 tatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1843029 taagtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcgccacgaatattaggagctttgtcct 1842965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 27599509 - 27599146
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||| | | ||||    
T  27599509 ttgatctagagtgaacccctaactagtaataagacctaatgatgacgtttaatgcagtctgtagagttgtttaagttatgttgatattaattggacatga 27599410  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgtt-atgtgacctgttt 213  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| |||    |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||    
T  27599409 actaatgtattgtatattcatgcaagatatgaaagcttgataatgatgcaatttatgtgctattgatataatgatatcaactcgtttatgtgacctgttt 27599310  T
Q  214 atgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttca 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  27599309 atgctgcttccgttatttaactaagtgcataagtatatgatgaagtt-agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttca 27599211  T
Q  314 tatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27599210 taagtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccatgaatattaggagctttgtcct 27599146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 23171283 - 23170920
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||| ||||    
T  23171283 ttgatcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagtctgtagagttgtttaagttatgttgatattaattgaacatga 23171184  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttta 214  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||    
T  23171183 actaatgtattgtatattcatgcaagatatgaaggtttgataatgatgcaatttataagctattgatataatgatatcattttgttatgtgagttgttta 23171084  T
Q  215 tgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcat 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||    
T  23171083 tgctgcttctgttatttaactaagtgcataagtatatgatgaagtttagctccaaattactggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgtccat 23170984  T
Q  315 atgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23170983 aagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcct 23170920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 23582540 - 23582177
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||| ||||    
T  23582540 ttgatcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagtctgtagagttgtttaagttatgttgatattaattgaacatga 23582441  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttta 214  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||    
T  23582440 actaatgtattgtatattcatgcaagatatgaaggtttgataatgatgcaatttataagctattgatataatgatatcattttgttatgtgagttgttta 23582341  T
Q  215 tgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcat 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||    
T  23582340 tgctgcttctgttatttaactaagtgcataagtatatgatgaagtttagctccaaattactggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgtccat 23582241  T
Q  315 atgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23582240 aagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcct 23582177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 16928601 - 16928238
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgt-taagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||    
T  16928601 ttgatcaagagtgaacccctagctggtaatgagacctagtgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtctaggttatattgatattaattgaatatga 16928502  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttta 214  Q
    | || ||||| |||||||| ||||||||| |||| | ||||||| || ||| ||| ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  16928501 attaatgtatcgtatattcatgcaagatatgaaggtttgataataatgcaatttacgtgctattgatataataatatcatcttgatatgtgacttgttta 16928402  T
Q  215 tgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttga-taagtcgattacgatgttttgttca 313  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||||||      
T  16928401 tgctgcttccgttgtttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgttgattacg-tgttttgttgt 16928303  T
Q  314 tatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16928302 taagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcct 16928238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 16997295 - 16996932
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgt-taagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||    
T  16997295 ttgatcaagagtgaacccctagctggtaatgagacctagtgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtctaggttatattgatattaattgaatatga 16997196  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttta 214  Q
    | || ||||| |||||||| ||||||||| |||| | ||||||| || ||| ||| ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  16997195 attaatgtatcgtatattcatgcaagatatgaaggtttgataataatgcaatttacgtgctattgatataataatatcatcttgatatgtgacttgttta 16997096  T
Q  215 tgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttga-taagtcgattacgatgttttgttca 313  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||||||      
T  16997095 tgctgcttccgttgtttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgttgattacg-tgttttgttgt 16996997  T
Q  314 tatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16996996 taagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcct 16996932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 17003928 - 17003565
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgt-taagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||    
T  17003928 ttgatcaagagtgaacccctagctggtaatgagacctagtgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtctaggttatattgatattaattgaatatga 17003829  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttta 214  Q
    | || ||||| |||||||| ||||||||| |||| | ||||||| || ||| ||| ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  17003828 attaatgtatcgtatattcatgcaagatatgaaggtttgataataatgcaatttacgtgctattgatataataatatcatcttgatatgtgacttgttta 17003729  T
Q  215 tgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttga-taagtcgattacgatgttttgttca 313  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||||||      
T  17003728 tgctgcttccgttgtttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgttgattacg-tgttttgttgt 17003630  T
Q  314 tatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17003629 taagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcct 17003565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 10873784 - 10873420
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttg-ttaagt-tattttaatattaatcgaatatg 114  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||| |||||  ||| || |||||||| || ||||    
T  10873784 ttgatcaagagtgaacccctaattggcattgagacctagtgatgatgtttactgcagcctgtagagttgcttaagactatattgatattaattgagtatg 10873685  T
Q  115 aactattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttt 213  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  10873684 aactaatgtattgtatattcatgcaagatatgaaggtttgataataatgcaatttatgtgctattgatataatgatatcatcttgctgtgtgacttgttt 10873585  T
Q  214 atgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttga-taagtcgattacgatgttttgttc 312  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||| |||| |||||    
T  10873584 atgctgcttctgttatttaactaagtgcatatgtatatgataatgtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttctgttc 10873486  T
Q  313 atatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10873485 ataagtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcct 10873420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 17 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 10866617 - 10866263
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttg-ttaagt-tattttaatattaatcgaatatg 114  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||| |||||  ||| || |||||||| || ||||    
T  10866617 ttgatcaagagtgaacccctaattggcattgagacctagtgatgatgtttactgcagcctgtagagttgcttaagactatattgatattaattgagtatg 10866518  T
Q  115 aactattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttt 213  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  10866517 aactaatgtattgtatattcatgcaagatatgaaggtttgataataatgcaatttatgtgctattgatataatgatatcatcttgctgtgtgacttgttt 10866418  T
Q  214 atgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttga-taagtcgattacgatgttttgttc 312  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||| |||| |||||    
T  10866417 atgctgcttctgttatttaactaagtgcatatgtatatgataatgtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttctgttc 10866319  T
Q  313 atatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattagga 368  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10866318 ataagtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattagga 10866263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 180 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 12829153 - 12828954
Alignment:
Q  180 atataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcata-ggtatatgatgaagtttagctccaaattattgga 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12829153 atataatgatatcatcttgttatgtgacttgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcatatggtatatgatgaagtttagctccaaattattgga 12829054  T
Q  279 tgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  12829053 tgcatgttgatatgttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagttttgtcct 12828954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 19 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 37318518 - 37318143
Alignment:
Q  19 gatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatgaac 117  Q
    |||||||||||||||||    || |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| || |||| ||| ||| || |||||||| || |||||      
T  37318518 gatcaagagtgaacccccttatgataatgagacctaatgatgacgtttaatgcagtctgtaaagctgtttaagatatgttgatattaattgagtatgat- 37318420  T
Q  118 tattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttatg 216  Q
    || ||||||||| | |  || |||||| |||  | | || ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  37318419 taatgtattgtacaattatgtaagatatgaaagtttaattatgatacaattgatgtgctattgatataatgatatcatcctgttatgtgacttgattatg 37318320  T
Q  217 ctgcttccgttatttaactaagtgcatag-gtatat--------------gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacg 301  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||              ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  37318319 ctgctgctgttatttaactaagtgcatagtgtatatatacatgatgaaacgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacg 37318220  T
Q  302 atgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
     || ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37318219 gtgatttgtgcatatgagtccatgcatagcatttcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcct 37318143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 177 - 378
Target Start/End: Original strand, 13970390 - 13970608
Alignment:
Q  177 ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcatagg---------tatatgatgaa--------gt 259  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||||| |          |||||||||||        ||    
T  13970390 ttgatataatgatatcatcctgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatgtatttatatatgatgaaatgatgacgt 13970489  T
Q  260 ttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacga 359  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13970490 ttagctccaaattgttggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgt 13970589  T
Q  360 atattaggagctttgtcct 378  Q
     ||||||||||||||||||    
T  13970590 ttattaggagctttgtcct 13970608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 177 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 24714797 - 24714579
Alignment:
Q  177 ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcatagg---------tatatgatgaa--------gt 259  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||||| |          |||||||||||        ||    
T  24714797 ttgatataatgatatcatcctgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatgtatttatatatgatgaaatgatgacgt 24714698  T
Q  260 ttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacga 359  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24714697 ttagctccaaattgttggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgt 24714598  T
Q  360 atattaggagctttgtcct 378  Q
     ||||||||||||||||||    
T  24714597 ttattaggagctttgtcct 24714579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 177 - 378
Target Start/End: Original strand, 41610650 - 41610868
Alignment:
Q  177 ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcatagg---------tatatgatgaa--------gt 259  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||||| |          |||||||||||        ||    
T  41610650 ttgatataatgatatcatcctgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatatatttatatatgatgaaatgatgacgt 41610749  T
Q  260 ttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacga 359  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  41610750 ttagctccaaattgttggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcataacatctcattgagcttagtcctcaccacgt 41610849  T
Q  360 atattaggagctttgtcct 378  Q
     ||||||||||||||||||    
T  41610850 ttattaggagctttgtcct 41610868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 177 - 378
Target Start/End: Original strand, 45057446 - 45057664
Alignment:
Q  177 ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcatagg---------tatatgatgaa--------gt 259  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||||| |          |||||||||||        ||    
T  45057446 ttgatataatgatatcatcctgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatgtatttatatatgatgaaatgatgacgt 45057545  T
Q  260 ttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacga 359  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  45057546 ttagctccaaattgttggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagattccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgt 45057645  T
Q  360 atattaggagctttgtcct 378  Q
     ||||||||||||||||||    
T  45057646 ttattaggagctttgtcct 45057664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 177 - 378
Target Start/End: Original strand, 41604753 - 41604971
Alignment:
Q  177 ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcatagg---------tatatgatgaa--------gt 259  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||| ||||| |          |||||||||||        ||    
T  41604753 ttgatataatgatatcatcctgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaactgcattgtatatatttatatatgatgaaatgatgacgt 41604852  T
Q  260 ttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacga 359  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  41604853 ttagctccaaattgttggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcataacatctcattgagcttagtcctcaccacgt 41604952  T
Q  360 atattaggagctttgtcct 378  Q
     ||||||||||||||||||    
T  41604953 ttattaggagctttgtcct 41604971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 250 - 378
Target Start/End: Original strand, 24872519 - 24872648
Alignment:
Q  250 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgca-tagcatctcattgagcttagt 348  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  24872519 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacaatgatttgttcataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagt 24872617  T
Q  349 cctcaccacga-atattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  24872618 cctcaccacgatttattaggagctttgtcct 24872648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 250 - 378
Target Start/End: Original strand, 24880404 - 24880533
Alignment:
Q  250 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgca-tagcatctcattgagcttagt 348  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  24880404 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacaatgatttgttcataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagt 24880502  T
Q  349 cctcaccacga-atattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  24880503 cctcaccacgatttattaggagctttgtcct 24880533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 250 - 378
Target Start/End: Original strand, 30971091 - 30971220
Alignment:
Q  250 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgca-tagcatctcattgagcttagt 348  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  30971091 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagt 30971189  T
Q  349 cctcaccacga-atattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  30971190 cctcaccacgatttattaggagctttgtcct 30971220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 295 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 9340227 - 9340144
Alignment:
Q  295 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9340227 gattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcct 9340144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 295 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 9488861 - 9488778
Alignment:
Q  295 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9488861 gattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcct 9488778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 295 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 9608122 - 9608039
Alignment:
Q  295 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9608122 gattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcct 9608039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 295 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 16922476 - 16922393
Alignment:
Q  295 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16922476 gattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcct 16922393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 295 - 378
Target Start/End: Original strand, 19490086 - 19490169
Alignment:
Q  295 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19490086 gattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcct 19490169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 295 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 27216010 - 27215927
Alignment:
Q  295 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27216010 gattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcct 27215927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 295 - 378
Target Start/End: Original strand, 28432074 - 28432157
Alignment:
Q  295 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28432074 gattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcct 28432157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 295 - 378
Target Start/End: Original strand, 13306751 - 13306834
Alignment:
Q  295 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13306751 gattatgatgttctgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcct 13306834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 295 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 16985888 - 16985805
Alignment:
Q  295 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16985888 gattatgatgttctgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcct 16985805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 271 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 10866162 - 10866055
Alignment:
Q  271 ttattggatgcatgttgataa-gtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggag 369  Q
    ||||||||||||||||||| | |  ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10866162 ttattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttctgttcataagtgtccatgcataacatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggag 10866064  T
Q  370 ctttgtcct 378  Q
    |||||||||    
T  10866063 ctttgtcct 10866055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 252 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 11677441 - 11677315
Alignment:
Q  252 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcc 350  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |  | |||| ||| |||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  11677441 gatgacgtttagctccaaattattggatgcacattgatatgatggttacaatgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 11677343  T
Q  351 tcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11677342 tcaccacgattattaggagctttgtcct 11677315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 252 - 378
Target Start/End: Original strand, 24641075 - 24641201
Alignment:
Q  252 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcc 350  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||| || ||||||| || |||||| ||| | || ||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  24641075 gatgacgtttagctccaaattattggatgtttattgatatgttgattacggtgatttgttgataagagtgcatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 24641173  T
Q  351 tcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24641174 tcaccacgattattaggagctttgtcct 24641201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 252 - 366
Target Start/End: Original strand, 21147404 - 21147518
Alignment:
Q  252 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgca-tagcatctcattgagcttagtcc 350  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||| || |||||| ||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  21147404 gatgacgtttagctccaaattattggatgcttattgatatgttgattacggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 21147502  T
Q  351 tcaccacgaatattag 366  Q
    ||||||||| ||||||    
T  21147503 tcaccacgattattag 21147518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 252 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 24503105 - 24502984
Alignment:
Q  252 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgca-tagcatctcattgagcttagtcc 350  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    ||||||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  24503105 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatataatgattacgatgttttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 24503008  T
Q  351 tcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||    |||||||||||||||    
T  24503007 tcaccacga----taggagctttgtcct 24502984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 250 - 378
Target Start/End: Original strand, 10101994 - 10102128
Alignment:
Q  250 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 340  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  10101994 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 10102093  T
Q  341 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  10102094 agctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcct 10102128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 250 - 378
Target Start/End: Original strand, 12901857 - 12901991
Alignment:
Q  250 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 340  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  12901857 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 12901956  T
Q  341 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  12901957 agctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcct 12901991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 250 - 378
Target Start/End: Original strand, 24628820 - 24628954
Alignment:
Q  250 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 340  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  24628820 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 24628919  T
Q  341 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  24628920 agctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcct 24628954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 250 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 24649120 - 24648986
Alignment:
Q  250 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 340  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  24649120 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 24649021  T
Q  341 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  24649020 agctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcct 24648986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 250 - 378
Target Start/End: Original strand, 27379773 - 27379907
Alignment:
Q  250 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 340  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  27379773 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 27379872  T
Q  341 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  27379873 agctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcct 27379907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 250 - 378
Target Start/End: Original strand, 27383819 - 27383953
Alignment:
Q  250 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 340  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  27383819 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 27383918  T
Q  341 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  27383919 agctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcct 27383953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 250 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 27601557 - 27601423
Alignment:
Q  250 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 340  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  27601557 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 27601458  T
Q  341 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  27601457 agctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcct 27601423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 295 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 27369256 - 27369172
Alignment:
Q  295 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacg-aatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  27369256 gattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcct 27369172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 295 - 378
Target Start/End: Original strand, 44381353 - 44381437
Alignment:
Q  295 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacg-aatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  44381353 gattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcct 44381437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 106
Target Start/End: Original strand, 44381053 - 44381142
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgttaagttattttaatattaat 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||| ||||| || | ||||| ||| || ||||||||    
T  44381053 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgaaacctaatgataacgtttaatgcagtctgtaaagctattaagatatgttgatattaat 44381142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 295 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 27375766 - 27375682
Alignment:
Q  295 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacg-aatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||    
T  27375766 gattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctaaccacgttttattaggagctttgtcct 27375682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 295 - 378
Target Start/End: Original strand, 44388023 - 44388107
Alignment:
Q  295 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacg-aatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||||||||  || | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  44388023 gattacgatgttttgttgttaagagtccatgcataacatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcct 44388107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 17 - 106
Target Start/End: Original strand, 44387723 - 44387812
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgttaagttattttaatattaat 106  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||  |||||||||||| ||||| || | ||||| ||| || ||||||||    
T  44387723 ttgatcaagagtgaacccctaactagtaatgaaacctaatgataacgtttaatgcagtctgtaaagctattaagatatgttgatattaat 44387812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 319 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 27195650 - 27195591
Alignment:
Q  319 gtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27195650 gtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcct 27195591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 72
Target Start/End: Original strand, 21147150 - 21147205
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgca 72  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  21147150 ttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatgacgtttaatgca 21147205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 12829315 - 12829260
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgca 72  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||| |||||||||||    
T  12829315 ttgatcaagagtgaacccctaattggtaattaaacctaatgatgacgtttaatgca 12829260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 72
Target Start/End: Original strand, 21139132 - 21139187
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgca 72  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  21139132 ttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatgacatttaatgca 21139187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 72
Target Start/End: Original strand, 24640821 - 24640876
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgca 72  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  24640821 ttgatcaagagtgaacccctagttggtaatgaaacctaatgatgacgtttaatgca 24640876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 244
Target Start/End: Original strand, 24640983 - 24641053
Alignment:
Q  177 ttgatataatgatatcatc---ttgttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcata 244  Q
    |||||||| ||||||||||   ||||| |||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  24640983 ttgatatattgatatcatcctgttgttgtgtgacctgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcata 24641053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 17 - 104
Target Start/End: Original strand, 19489785 - 19489872
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgttaagttattttaatatta 104  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||  |||| ||||||| ||||| || | || |||||| || ||||||    
T  19489785 ttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaaccttatgataacgttcaatgcagtctgtaaagctattgagttatgttgatatta 19489872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 264 - 378
Target Start/End: Original strand, 19928607 - 19928717
Alignment:
Q  264 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgca-tagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 361  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||||| ||||| |||||||||||  || | ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| ||      
T  19928607 ctccaaattattggatgtatatgtgataagttgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccatga-- 19928702  T
Q  362 attaggagctttgtcct 378  Q
      |||||||||||||||    
T  19928703 --taggagctttgtcct 19928717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 17 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 24503355 - 24503300
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgca 72  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  24503355 ttgatcaggagcgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatgacgtttaatgca 24503300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 17 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 27197130 - 27197075
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgca 72  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |  ||||||||||    
T  27197130 ttgatcaagagtgaatccctaattggtaatgagacctaatgacgatgtttaatgca 27197075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 243
Target Start/End: Original strand, 19645989 - 19646055
Alignment:
Q  177 ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcat 243  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  | | || || | |||||||||||||||||||    
T  19645989 ttgatataatgatatcatcctgttatgtgacttgactgtactactgctgttatttaactaagtgcat 19646055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 264 - 378
Target Start/End: Original strand, 30345381 - 30345492
Alignment:
Q  264 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 361  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||| ||||| | ||| ||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||       
T  30345381 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaaggtgtcttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccacg--- 30345475  T
Q  362 attaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||||||||    
T  30345476 attaggagctttgtcct 30345492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 27369547 - 27369458
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgttaagttattttaatattaat 106  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||  ||||  |||||||||||| ||||| || | ||||| ||| || ||||||||    
T  27369547 ttgatcaggagtgaacccctagttggtaatgaaaccttatgataacgtttaatgcagtctgtaaagctattaagatatgttgatattaat 27369458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 27376057 - 27375968
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgttaagttattttaatattaat 106  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||  ||||  |||||||||||| ||||| || | ||||| ||| || ||||||||    
T  27376057 ttgatcaggagtgaacccctagttggtaatgaaaccttatgataacgtttaatgcagtctgtaaagctattaagatatgttgatattaat 27375968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 177 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 27196970 - 27196900
Alignment:
Q  177 ttgatataatgatatcatc---ttgttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcata 244  Q
    |||||||||||||||||||   ||||| |||||| ||  ||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  27196970 ttgatataatgatatcatcctgttgttgtgtgacttgactatgctgctgctattatttaactaagtgcata 27196900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 323; Significance: 0; HSPs: 45)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Original strand, 17669431 - 17669793
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  17669431 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtttaagttatattaatattaattgaatatga 17669530  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgctttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttat 215  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17669531 actattgtattgtatactcatgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgctttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttat 17669630  T
Q  216 gctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcata 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17669631 gctgcttccgttatttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcata 17669730  T
Q  316 tgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17669731 tgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 17669793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Original strand, 17676083 - 17676445
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  17676083 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtttaagttatattaatattaattgaatatga 17676182  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgctttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttat 215  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17676183 actattgtattgtatactcatgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgctttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttat 17676282  T
Q  216 gctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcata 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17676283 gctgcttccgttatttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcata 17676382  T
Q  316 tgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17676383 tgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagttttgtcct 17676445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Original strand, 21915431 - 21915792
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  21915431 ttgatcaagagtgaacccccaactgataatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtttaagttatattaatattaattgaatatga 21915530  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgctttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttat 215  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21915531 actattgtattgtatattcatgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgctttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttat 21915630  T
Q  216 gctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcata 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21915631 gctgcttccgttatttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagt-gattacgatgttttgttcata 21915729  T
Q  316 tgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21915730 tgtgtccatgcatagcataccattgagcttagtcctcaccatgaatattaggagctttgtcct 21915792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Original strand, 5534300 - 5534662
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  5534300 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctaatgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtttaagttatattaatattaattgaatatga 5534399  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgctttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttat 215  Q
    |||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5534400 actatcatattgtatattcatgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgctttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctatttat 5534499  T
Q  216 gctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcata 315  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  5534500 gctgcttccgttattaaactaagtgcataattatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatattttgttcata 5534599  T
Q  316 tgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5534600 tgtgtccatgcatagcatatcattgaacttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 5534662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 22084076 - 22083713
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||| ||    
T  22084076 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgttgtttaatgcagactgtagagttgtttaagttatattaatattaattggataaga 22083977  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttta 214  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  22083976 actatggtattgtatattcatgcaaaatgagaagatgtgataataatgcaatttatgtgctattgatataatgatatcatcttgatatgtgacttgttta 22083877  T
Q  215 tgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcat 314  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22083876 tgctgcttccgttgtttaactaagtgcataagtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgttttgttcat 22083777  T
Q  315 atgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22083776 atgtgtccatgcatagcatatcattgagctttgtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcct 22083713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Original strand, 20013724 - 20014086
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgt-taagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||| || ||||| ||  ||||||| || ||| ||||    
T  20013724 ttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgagacctagtgatgttgttaaatgcagtccgtagagtagtctaagtcatgataatattgattgaacatga 20013823  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttta 214  Q
      || |||| ||||||||  ||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20013824 gttaatgtaatgtatatttatgcaagatatgaagagttgataatgatacaatttatgtgctattgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttta 20013923  T
Q  215 tgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcat 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20013924 tgctgcttccgttatttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagctccaagttattggatgcatgttgataagt-gattacgatgttttgttcat 20014022  T
Q  315 atgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20014023 atgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 20014086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Original strand, 20019801 - 20020163
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgt-taagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||| || ||||| ||  ||||||| || ||| ||||    
T  20019801 ttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgagacctagtgatgttgttaaatgcagtccgtagagtagtctaagtcatgataatattgattgaacatga 20019900  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttta 214  Q
      || |||| ||||||||  ||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20019901 gttaatgtaatgtatatttatgcaagatatgaagagttgataatgatacaatttatgtgctattgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttta 20020000  T
Q  215 tgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcat 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20020001 tgctgcttccgttatttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagctccaagttattggatgcatgttgataagt-gattacgatgttttgttcat 20020099  T
Q  315 atgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20020100 atgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 20020163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Original strand, 8354624 - 8354989
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgttaag-ttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||| |||     
T  8354624 ttgatcaagagtgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagtctgtagagttgtttaggttatgttaatattaattgaacatgg 8354723  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaatt-atgtgct-ttgatataatgatatcatcttg-ttatgtgacctgtt 212  Q
    ||||  | ||||||||||| ||||||||| |||| | |||||| ||| ||| || ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  8354724 actaaggcattgtatattcatgcaagatatgaaggtttgataaagatgcaattttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtt 8354823  T
Q  213 tatgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttc 312  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||    
T  8354824 tatgctgctttcgttatttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttc 8354923  T
Q  313 atatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8354924 ataagtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcct 8354989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Original strand, 22124389 - 22124753
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||| ||||    
T  22124389 ttgattaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagtctgtagagttgtttaagttatgttgatattaattgaagatga 22124488  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttta 214  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  22124489 actaatgtattgtatattcatgcaagatatgaaggtttgataatgatgcaatttataagctattgatataatgatatcattttgttatgtgacttgttta 22124588  T
Q  215 tgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg-ttttgttca 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||    
T  22124589 tgctgcttccgttatttaactaagtgcataagtatatgatgaagtttagctccaaattactggatgcatgttgatatgttgattacgatgtttttgtcca 22124688  T
Q  314 tatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  22124689 taagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagatttgtcct 22124753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Original strand, 22115581 - 22115945
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||| ||||    
T  22115581 ttgatcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagtctgtagagttgtttaagttatgttgatattaattgaacatga 22115680  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttta 214  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  22115681 actaatgtattgtatattcatgcaagatatgaaggtttgataatgatgcaatttataagctattgatataatgatatcattttgttatgtgacttgttta 22115780  T
Q  215 tgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg-ttttgttca 313  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||    
T  22115781 tgctgcttcccttatttaactaagtgcataagtatatgattaagtttagctccaaattactggatgcatgttgatatgttgattacgatgtttttgtcca 22115880  T
Q  314 tatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22115881 taagagtccatgcatagcatctcattgagcttggtcctcaccacgattattaggagctttgtcct 22115945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 19111471 - 19111108
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgt-taagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||    
T  19111471 ttgatcaagagtgaacccctagctggtaatgagacctagtgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtctaggttatattgatattaattgaatatga 19111372  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttta 214  Q
    | || ||||| |||||||| ||||||||| |||| | ||||||| || ||| ||| ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  19111371 attaatgtatcgtatattcatgcaagatatgaaggtttgataataatgcaatttacgtgctattgatataataatatcatcttgatatgtgacttgttta 19111272  T
Q  215 tgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttga-taagtcgattacgatgttttgttca 313  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||||||      
T  19111271 tgctgcttccgttgtttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgttgattacg-tgttttgttgt 19111173  T
Q  314 tatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19111172 taagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcct 19111108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 19117762 - 19117399
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgt-taagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||    
T  19117762 ttgatcaagagtgaacccctagctggtaatgagacctagtgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtctaggttatattgatattaattgaatatga 19117663  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttta 214  Q
    | || ||||| |||||||| ||||||||| |||| | ||||||| || ||| ||| ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  19117662 attaatgtatcgtatattcatgcaagatatgaaggtttgataataatgcaatttacgtgctattgatataataatatcatcttgatatgtgacttgttta 19117563  T
Q  215 tgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttga-taagtcgattacgatgttttgttca 313  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||||||      
T  19117562 tgctgcttccgttgtttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgttgattacg-tgttttgttgt 19117464  T
Q  314 tatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19117463 taagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcct 19117399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 19496635 - 19496271
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagt-tattttaatattaatcgaatatg 114  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||| |||  ||| || |||||||| || ||||    
T  19496635 ttgatcaagagtgaacccctaattggtattgagacctagtgatgatgtttactgcagcctgtagagttgtttaagactatattgatattaattgagtatg 19496536  T
Q  115 aactattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgctt-tgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttt 213  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||| || ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  19496535 aactaatgtattgtatattcatgcaagatatgaaggtttgataataatgcaatttatgtgctaatgatataatgatatcatcttgctgtgtgacttgttt 19496436  T
Q  214 atgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttga-taagtcgattacgatgttttgttc 312  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| || |  ||||||| ||||||||||    
T  19496435 atgctgcttctgttatttaactaagtgcatatgtatatgataaggtttagcttcaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttttgttc 19496337  T
Q  313 atatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19496336 ataagtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 19496271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 22048191 - 22047827
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagt-tattttaatattaatcgaatatg 114  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||| |||  ||| || |||||||| || ||||    
T  22048191 ttgatcaagagtgaacccctaattggcattgaggcctagtgatgatgtttactgcagcctgtagagttgtttaagactatattgatattaattgagtatg 22048092  T
Q  115 aactattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttt 213  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  22048091 aactaatgtattgtatattcatgcaagatatgaaggtttgataataatgcaatttatgtgctattgatataatgatatcatcttgctgtgtgacttgttt 22047992  T
Q  214 atgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttga-taagtcgattacgatgttttgttc 312  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||| |||| |||||    
T  22047991 atgctgcttctgttatttaactaagtgcatatgtatatgataatgtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttctgttc 22047893  T
Q  313 atatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22047892 ataagtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 22047827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 40 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 19498660 - 19498319
Alignment:
Q  40 tggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagt-tattttaatattaatcgaatatgaactattgtattgtatattcgtg 137  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||| |||  ||| || |||||||| || ||||||||| |||||||||||||| ||    
T  19498660 tggtattgagacctagtgatgatgtttactgcagcctgtagagttgtttaagactatattgatattaattgagtatgaactaatgtattgtatattcatg 19498561  T
Q  138 caagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgctt-tgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaacta 236  Q
    ||||||| |||| | ||||||| || ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19498560 caagatatgaaggtttgataataatgcaatttatgtgctaatgatataatgatatcatcttgctgtgtgacttgtttatgctgcttctgttatttaacta 19498461  T
Q  237 agtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttga-taagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatct 335  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| || |  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  19498460 agtgcatatgtatatgataaggtttagcttcaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttttgttcataagtgtccatgcatagcatat 19498362  T
Q  336 cattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19498361 cattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 19498319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Original strand, 22123246 - 22123609
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||| | ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||  | | ||||    
T  22123246 ttgatcaagagcgaacccctagttggtattaagacctaatgatgacgtttaatgcagtctgtagagttgtttaagttatgttgatattaaatggacatga 22123345  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgtt-atgtgacctgttt 213  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||| |  |   | ||||  ||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  22123346 actaatgtattgtatattcatgcaagatatgaaggt-tgatattcctgatatttataagctattgatataatgatatcattttgtttatgtgacctgttt 22123444  T
Q  214 atgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgtttt-gttc 312  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  22123445 atgctgctcccgttatttaactaagtgcataagtttatgatgaagtt-agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgtttttgttc 22123543  T
Q  313 atatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22123544 ataagtgtccatgcatagcatctcattgagctcagtcctcaccacgaataataggagctttgtcct 22123609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 18 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 18855180 - 18854817
Alignment:
Q  18 tgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagt-tgttaagttattttaatattaatcgaatatgaa 116  Q
    ||||| |||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| |  ||||| ||  | |||||  || ||   |||||| ||| |||||    
T  18855180 tgatcgagagggaacccctaattggtaatgaaacctagtgatgacgtttaatgtaatctgtaaagccttttaagacatgttgtcattaattgaacatgaa 18855081  T
Q  117 ctattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttat 215  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||| |||  | | || |||||  |||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18855080 ctaatgtattgtatattcatgcaagatatgaaagtttaattatgatgaaaatgatttgctattgatataatgatatcatcttgttatgtgacttgtttat 18854981  T
Q  216 gctgcttccgttatttaactaagtgcata-ggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcat 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||  |    
T  18854980 gctgcttccgttatttaactaagtgcatatggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgttttgttgtt 18854881  T
Q  315 atgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  18854880 aagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcct 18854817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 18 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 18865575 - 18865212
Alignment:
Q  18 tgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagt-tgttaagttattttaatattaatcgaatatgaa 116  Q
    ||||| |||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| |  ||||| ||  | |||||  || ||   |||||| ||| |||||    
T  18865575 tgatcgagagggaacccctaattggtaatgaaacctagtgatgacgtttaatgtaatctgtaaagccttttaagacatgttgtcattaattgaacatgaa 18865476  T
Q  117 ctattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttat 215  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||| |||  | | || ||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18865475 ctaatgtattgtatattcatgcaagatatgaaagtttaattatgatgcaaatgatttgctattgatataatgatatcatcttgttatgtgacttgtttat 18865376  T
Q  216 gctgcttccgttatttaactaagtgcata-ggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcat 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||  |    
T  18865375 gctgcttccgttatttaactaagtgcatatggtatatgatcaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgttttgttgtt 18865276  T
Q  315 atgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  18865275 aagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcct 18865212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 177 - 378
Target Start/End: Original strand, 16883193 - 16883395
Alignment:
Q  177 ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcata-ggtatatgatgaagtttagctccaaattatt 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16883193 ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacttgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcatatggtatatgatgaagtttagctccaaattatt 16883292  T
Q  276 ggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgt 375  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  16883293 ggatgcatgttgatatgttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgt 16883392  T
Q  376 cct 378  Q
    |||    
T  16883393 cct 16883395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 177 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 29123171 - 29122969
Alignment:
Q  177 ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcata-ggtatatgatgaagtttagctccaaattatt 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29123171 ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacttgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcatatggtatatgataaagtttagctccaaattatt 29123072  T
Q  276 ggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgt 375  Q
    ||||||||||||||| || ||||||  |||||||||  || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  29123071 ggatgcatgttgatatgttgattacagtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacatttattaggagctttgt 29122972  T
Q  376 cct 378  Q
    |||    
T  29122971 cct 29122969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 177 - 378
Target Start/End: Original strand, 23845783 - 23846001
Alignment:
Q  177 ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcatagg---------tatatgatgaa--------gt 259  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||||| |          |||||||||||        ||    
T  23845783 ttgatataatgatatcatcctgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatatatttatatatgatgaaatgatgacgt 23845882  T
Q  260 ttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacga 359  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23845883 ttagctccaaattgttggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgt 23845982  T
Q  360 atattaggagctttgtcct 378  Q
     ||||||||||||||||||    
T  23845983 ttattaggagctttgtcct 23846001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 177 - 378
Target Start/End: Original strand, 20023949 - 20024167
Alignment:
Q  177 ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcatagg---------tatatgatgaa--------gt 259  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||||| |          |||||||||||        ||    
T  20023949 ttgatataatgatatcatcctgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatgtatttatatatgatgaaatgatgacgt 20024048  T
Q  260 ttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacga 359  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20024049 ttagctccaagttgttggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgt 20024148  T
Q  360 atattaggagctttgtcct 378  Q
     ||||||||| ||||||||    
T  20024149 ttattaggagttttgtcct 20024167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 177 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 3216345 - 3216130
Alignment:
Q  177 ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcatagg-----tatatgatgaa--------gtttag 263  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||       |||||||||||        ||||||    
T  3216345 ttgatataatgatatcatcctgttatgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaaatgatgacgtttag 3216246  T
Q  264 ctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgca-tagcatctcattgagcttagtcctcaccacga-at 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  || |||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  |    
T  3216245 ctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacagtgatttgttcataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattt 3216147  T
Q  362 attaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||||||||    
T  3216146 attaggagctttgtcct 3216130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 250 - 378
Target Start/End: Original strand, 26935288 - 26935417
Alignment:
Q  250 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgca-tagcatctcattgagcttagt 348  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  26935288 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagt 26935386  T
Q  349 cctcaccacga-atattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  26935387 cctcaccacgatttattaggagctttgtcct 26935417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 295 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 28454715 - 28454632
Alignment:
Q  295 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28454715 gattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcct 28454632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 252 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 19905490 - 19905364
Alignment:
Q  252 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcc 350  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||| || |||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  19905490 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 19905392  T
Q  351 tcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19905391 tcaccacgattattaggagctttgtcct 19905364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 252 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 20527444 - 20527323
Alignment:
Q  252 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgca-tagcatctcattgagcttagtcc 350  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  20527444 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacgatgttttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 20527347  T
Q  351 tcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||| ||    |||||||||||||||    
T  20527346 tcaccatga----taggagctttgtcct 20527323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 250 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 22111696 - 22111562
Alignment:
Q  250 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 340  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  22111696 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 22111597  T
Q  341 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  22111596 agctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcct 22111562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 250 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 43251576 - 43251442
Alignment:
Q  250 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 340  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  43251576 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 43251477  T
Q  341 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  43251476 agctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcct 43251442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 250 - 378
Target Start/End: Original strand, 19278628 - 19278762
Alignment:
Q  250 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 340  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  19278628 atgatgacgtttagctccaaattattgaatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 19278727  T
Q  341 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  19278728 agctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcct 19278762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 250 - 378
Target Start/End: Original strand, 21972922 - 21973056
Alignment:
Q  250 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 340  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  21972922 atgatgatgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattgcgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 21973021  T
Q  341 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  21973022 agctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcct 21973056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 250 - 378
Target Start/End: Original strand, 21977013 - 21977147
Alignment:
Q  250 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 340  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  21977013 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattgcgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 21977112  T
Q  341 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    || || ||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  21977113 agttttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcct 21977147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 295 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 18065285 - 18065200
Alignment:
Q  295 gattacgatgttttgttcat-atgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacg-aatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||||||||||||| | || | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  18065285 gattacgatgttttggttattaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcct 18065200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 72
Target Start/End: Original strand, 16883033 - 16883088
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgca 72  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  16883033 ttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatgacgtttaatgca 16883088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 20527694 - 20527639
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgca 72  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  20527694 ttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatgacgtttaatgca 20527639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 29123330 - 29123275
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgca 72  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  29123330 ttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatgacgtttaatgca 29123275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 264 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 15531890 - 15531779
Alignment:
Q  264 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 361  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||||| ||||| |||||||||||  || | |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||       
T  15531890 ctccaaattattggatgtatatgtgataagttgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccacg--- 15531796  T
Q  362 attaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||||||||    
T  15531795 attaggagctttgtcct 15531779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 378
Target Start/End: Original strand, 24445611 - 24445722
Alignment:
Q  264 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 361  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||| | ||||| |||||||||||  || | |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||       
T  24445611 ctccaaattattggatgtatatgtgataaattgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccacg--- 24445705  T
Q  362 attaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||||||||    
T  24445706 attaggagctttgtcct 24445722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 28455004 - 28454942
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgta 79  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||  |||||||||||| |||||    
T  28455004 ttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaaccttatgataacgtttaatgcagtctgta 28454942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 19905582 - 19905512
Alignment:
Q  177 ttgatataatgatatcatc---ttgttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcata 244  Q
    |||||||||||||||||||   ||||| |||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  19905582 ttgatataatgatatcatcctgttgttgtgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcata 19905512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 17 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 19905742 - 19905687
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgca 72  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |  ||||||||||    
T  19905742 ttgatcaagagtgaatccctaattggtaatgagacctaatgacgatgtttaatgca 19905687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 264 - 378
Target Start/End: Original strand, 23847120 - 23847230
Alignment:
Q  264 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgca-tagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 361  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||||| ||||| |||||||||||  || | ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| ||      
T  23847120 ctccaaattattggatgtatatgtgataagttgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccatga-- 23847215  T
Q  362 attaggagctttgtcct 378  Q
      |||||||||||||||    
T  23847216 --taggagctttgtcct 23847230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 264 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 15538449 - 15538338
Alignment:
Q  264 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 361  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||||| ||||| ||| |||||||  || | |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||        
T  15538449 ctccaaattattggatgtatatgtgataagttgattaagatattttgttgtta-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccac---a 15538355  T
Q  362 attaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||||||||    
T  15538354 attaggagctttgtcct 15538338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 359
Target Start/End: Original strand, 16231581 - 16231676
Alignment:
Q  264 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacga 359  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||| ||||| ||||||||||| ||| | |||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  16231581 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaagatgttttgttgata-gagtccatgcattagcata-cattgagctttgtcctcaccacga 16231676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 18065576 - 18065487
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgttaagttattttaatattaat 106  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||  |||||||||||| ||| | || | ||||| ||| || ||||||||    
T  18065576 ttgatcaggagtgaacccctaattggtaatgaaaccttatgataacgtttaatgcagtctgaaaagctattaagatatgttgatattaat 18065487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 323; Significance: 0; HSPs: 86)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Original strand, 27663650 - 27664012
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  27663650 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcatttaatgcagactgtagagttgtttaagttatattaatattaattgaatatga 27663749  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgctttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttat 215  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27663750 actattgtattgtatattcatgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgctttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttat 27663849  T
Q  216 gctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcata 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27663850 gctgcttccgttatttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcata 27663949  T
Q  316 tgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27663950 tgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 27664012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Original strand, 34294413 - 34294775
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  34294413 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtttaagttatattaatattaattgaatatga 34294512  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgctttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttat 215  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34294513 actattgtattgtatattcatgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgctttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttat 34294612  T
Q  216 gctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcata 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34294613 gctgcttccgttatttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagctccaaattattggatacatgttgataagttgattacgatgttttgttcata 34294712  T
Q  316 tgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34294713 tgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 34294775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 372
Target Start/End: Original strand, 24472108 - 24472464
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  24472108 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtttaagttatattaatattaattgaatatga 24472207  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgctttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttat 215  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24472208 actattgtattgtatattcatgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgctttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttat 24472307  T
Q  216 gctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcata 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24472308 gctgcttccgttatttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcata 24472407  T
Q  316 tgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctt 372  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24472408 tgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctt 24472464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Original strand, 17706791 - 17707152
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtta-agttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  17706791 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtttgagttatattaatattaattgaatatga 17706890  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgctttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttat 215  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17706891 actattgtattgtatattcatgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgctttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttat 17706990  T
Q  216 gctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcata 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17706991 gctgcttccgttatttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagt-gattacgatgttttgttcata 17707089  T
Q  316 tgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17707090 tgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 17707152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Original strand, 41098083 - 41098445
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  41098083 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtttaagttatattaatattaattgaatatga 41098182  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgctttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttat 215  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41098183 actattgtattgtatattcatgcaagataagaagatgtgatgatgatacaaattatgtgccttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttat 41098282  T
Q  216 gctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcata 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41098283 gctgcttccgttatttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcata 41098382  T
Q  316 tgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41098383 tgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 41098445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Original strand, 27670290 - 27670651
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  27670290 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtttaagttatattaatattaattgaatatga 27670389  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgctttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttat 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27670390 actattgtattgtatattcatgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatatgctttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttat 27670489  T
Q  216 gctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcata 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27670490 gctgcttccgttatttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagctccaagttattggatgcatgttgataagt-gattacgatgttttgttcata 27670588  T
Q  316 tgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27670589 tgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 27670651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 41769487 - 41769125
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  41769487 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacatagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtttaagttatattaatattaattgaatatga 41769388  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgctttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttat 215  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41769387 actattgtattgtatattcatgcaagataagaaaatgtgataatgatacaaattatgtgctttgatataatgatatcaccttgttatgtgacctgtttat 41769288  T
Q  216 gctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcata 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41769287 gctgcttccgttatttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcata 41769188  T
Q  316 tgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41769187 tgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 41769125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 41776061 - 41775699
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  41776061 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacatagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtttaagttatattaatattaattgaatatga 41775962  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgctttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttat 215  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41775961 actattgtattgtatattcatgcaagataagaaaatgtgataatgatacaaattatgtgctttgatataatgatatcaccttgttatgtgacctgtttat 41775862  T
Q  216 gctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcata 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41775861 gctgcttccgttatttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcata 41775762  T
Q  316 tgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41775761 tgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 41775699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 18 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 23610146 - 23609785
Alignment:
Q  18 tgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatgaa 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  23610146 tgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtttaagttatattaatattaattgaatatgaa 23610047  T
Q  117 ctattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgctttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttatg 216  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23610046 ctgttgtattgtatattcatgcaagataagaagatgtgataaagatacaaatcaggtgctttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttatg 23609947  T
Q  217 ctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatat 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23609946 ctgcttccgttatttaactaagtgcataagtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcatat 23609847  T
Q  317 gtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23609846 gtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 23609785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 18 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 23841542 - 23841181
Alignment:
Q  18 tgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatgaa 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  23841542 tgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtttaagttatattaatattaattgaatatgaa 23841443  T
Q  117 ctattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgctttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttatg 216  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23841442 ctgttgtattgtatattcatgcaagataagaagatgtgataaagatacaaatcaggtgctttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttatg 23841343  T
Q  217 ctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatat 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23841342 ctgcttccgttatttaactaagtgcataagtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcatat 23841243  T
Q  317 gtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23841242 gtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 23841181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 22265190 - 22264827
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  22265190 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtttaagttatattagtattaattgaatatga 22265091  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgctttgatataatga-tatcatcttgttatgtgacctgttta 214  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22265090 actattgtattgtatattcatgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgctttgatataatgaatatcatcttgttatgtgacctgttta 22264991  T
Q  215 tgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcat 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  22264990 tgctgcttccgttatttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgactacgatgttttgttcat 22264891  T
Q  315 atgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22264890 atgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 22264827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 23584385 - 23584021
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||||| |||| ||  |||||||||| ||| ||||    
T  23584385 ttgatcaagagtgatcccctaactggtaatgagacctagtgatgtggttagatgcagtctgtagagttgtttaagtcatgataatattaattgaacatga 23584286  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataa-gaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttt 213  Q
     ||| |||| |||||| |  |||||| | | |||||| || | ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23584285 gctaatgtaatgtataattatgcaaggttatgaagatttgtttatgatacaatttatgtgctattgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttt 23584186  T
Q  214 atgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttca 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23584185 atgctgcttccgttatttaactaagtgcataagtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgttttgttca 23584086  T
Q  314 tatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23584085 tatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 23584021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 27608984 - 27608622
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgt-taagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| || ||||| ||  ||||||| || ||| ||||    
T  27608984 ttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgagacctagtgatgttgttaaatgcagtctgtagagtagtctaagtcatgataatattgattgaacatga 27608885  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttta 214  Q
      || |||| ||||||||  ||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27608884 gttaatgtaatgtatatttatgcaagatatgaagagttgataatgatacaatttatgtgctattgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttta 27608785  T
Q  215 tgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcat 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27608784 tgctgcttccgttatttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagctccaagttattggatgcatgttgataagt-gattacgatgttttgttcat 27608686  T
Q  315 atgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27608685 atgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 27608622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 27615590 - 27615228
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgt-taagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| || ||||| ||  ||||||| || ||| ||||    
T  27615590 ttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgagacctagtgatgttgttaaatgcagtctgtagagtagtctaagtcatgataatattgattgaacatga 27615491  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttta 214  Q
      || |||| ||||||||  ||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27615490 gttaatgtaatgtatatttatgcaagatatgaagagttgataatgatacaatttatgtgctattgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttta 27615391  T
Q  215 tgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcat 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27615390 tgctgcttccgttatttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagctccaagttattggatgcatgttgataagt-gattacgatgttttgttcat 27615292  T
Q  315 atgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27615291 atgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 27615228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 19992128 - 19991765
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||| | | ||||    
T  19992128 ttgatctagagtgaacccctaactagtaataagacctaatgatgacgtttaatgcagtctgtagagttgtttaagttatgttgatattaattggacatga 19992029  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgtt-atgtgacctgttt 213  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| |||    |||||||||| ||| |||| |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  19992028 actaatgtattgtatattcatgcaagatatgaaagcttgataatgatgcaatttatatgctattgatataatgatatcatctcgtttatgtgacctgttt 19991929  T
Q  214 atgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttca 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  19991928 atgctgcttccgttatttaactaagtgcataagtatatgatgaagtt-agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttca 19991830  T
Q  314 tatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19991829 taagtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcgccacgaatattaggagctttgtcct 19991765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Original strand, 22062742 - 22063105
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||||    
T  22062742 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagttatattgatattaattgaatatga 22062841  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttta 214  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||| || ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  22062842 actaatgtattgtatattcatgcaagatatgaaggtttgataataatgcaatttatgtgctattgatataataatatcatcttgatatgtgacttgttta 22062941  T
Q  215 tgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttga-taagtcgattacgatgttttgttca 313  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||||||      
T  22062942 tgctgcttccgttgtttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgttgattacg-tgttttgttgt 22063040  T
Q  314 tatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22063041 taagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcct 22063105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Original strand, 41294295 - 41294657
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||| ||||    
T  41294295 ttgatcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagtctgtagagttgtttaagttatgttgatattaattgaacatga 41294394  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttta 214  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  41294395 actaatgtattgtatattcatgcaagatatgaaggtttgataatgatgcaatttataagctattgatataatgatatcattttgttatgtgacttgttta 41294494  T
Q  215 tgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcat 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| | |||    
T  41294495 tgctgcttccgttatttaactaagtgcataagtatatgatgaagtttagctccaaattactggatgcatgttgatatgttgattacgatgtttt-tccat 41294593  T
Q  315 atgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41294594 aagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcct 41294657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Original strand, 37286641 - 37287004
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| |||| |||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| || |||||||| | | ||||    
T  37286641 ttgatcaagagcgaacccctaattggtattgaggcctaatgatgacgtttaatgcagtctgtatagttgtttaagttatgttgatattaattggacatga 37286740  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgtt-atgtgacctgttt 213  Q
    |||| |||||| ||||||| ||||||||| |||  | |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  37286741 actaatgtattatatattcatgcaagatatgaaagtttgataatgatgcaatttatgtgctattgatataataatatcatctcgtttatgtgacctgttt 37286840  T
Q  214 atgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttca 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  37286841 atgctgcttccgttatttaactaagtgcataagtatatgatgaagtt-agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttca 37286939  T
Q  314 tatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37286940 taagtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 37287004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Original strand, 37293344 - 37293707
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| |||| |||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| || |||||||| | | ||||    
T  37293344 ttgatcaagagcgaacccctaattggtattgaggcctaatgatgacgtttaatgcagtctgtatagttgtttaagttatgttgatattaattggacatga 37293443  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgtt-atgtgacctgttt 213  Q
    |||| |||||| ||||||| ||||||||| |||  | |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  37293444 actaatgtattatatattcatgcaagatatgaaagtttgataatgatgcaatttatgtgctattgatataataatatcatctcgtttatgtgacctgttt 37293543  T
Q  214 atgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttca 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  37293544 atgctgcttccgttatttaactaagtgcataagtatatgatgaagtt-agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttca 37293642  T
Q  314 tatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37293643 taagtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 37293707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Original strand, 22328024 - 22328386
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    |||||| |||||||||||||||||  |||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||  ||| | | ||||    
T  22328024 ttgatctagagtgaacccctaactactaataagacctaatgatgacgtttaatgcagtctgtagagttgtttaagttatgttgatac-aattggacatga 22328122  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgtt-atgtgacctgttt 213  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| |||    |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  22328123 actaatgtattgtatattcatgcaagatatgaaagcttgataatgatgcaatttatgtgctattgatataatgatatcatctcgtttatgtgacctgttt 22328222  T
Q  214 atgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttca 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  22328223 atgctgcttccgttatttaactaagtgcataagtatatgatgaagtt-agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttca 22328321  T
Q  314 tatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22328322 taagtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 22328386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 40707367 - 40707004
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgttaag-ttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || |||| || |||||||| ||||||||    
T  40707367 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaggttatattgatattaattgaatatga 40707268  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttta 214  Q
    | || |||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||| || ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  40707267 attaatgtattgtatattcatgcaagatatgaaggtttgataataatgcaatttatgtgctattgatataataatatcatcttgatatgtgacttgttta 40707168  T
Q  215 tgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttga-taagtcgattacgatgttttgttca 313  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||||||      
T  40707167 tgctgcttccgttgtttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgttgattacg-tgttttgttgt 40707069  T
Q  314 tatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40707068 taagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcct 40707004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 40714009 - 40713646
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgttaag-ttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || |||| || |||||||| ||||||||    
T  40714009 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaggttatattgatattaattgaatatga 40713910  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttta 214  Q
    | || |||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||| || ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  40713909 attaatgtattgtatattcatgcaagatatgaaggtttgataataatgcaatttatgtgctattgatataataatatcatcttgatatgtgacttgttta 40713810  T
Q  215 tgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttga-taagtcgattacgatgttttgttca 313  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||||||      
T  40713809 tgctgcttccgttgtttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgttgattacg-tgttttgttgt 40713711  T
Q  314 tatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40713710 taagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcct 40713646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Original strand, 15001539 - 15001903
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||  | | ||||    
T  15001539 ttgatcaagagtgaacccctagttggtattaagacctaatgatgacgtttaatgcagtctgtagagttgtttaagttatgttgatattaaatggacatga 15001638  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgtt-atgtgacctgttt 213  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| | | |  |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  15001639 actaatgtattgtatattcatgcaagatatggaaacttgataatgatgcaatttatgtgctattgatataatgatatcattttgtttatgtgacctgttt 15001738  T
Q  214 atgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgtttt-gttc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  15001739 atgctgcttccgttatttaactaagtgcataagtttatgatgaagtt-agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgtttttgttc 15001837  T
Q  313 atatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15001838 ataagtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaataataggagctttgtcct 15001903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 33726104 - 33725740
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||  | | ||||    
T  33726104 ttgatcaagagtgaacccctaagcggtgttgagacctagtggagacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagttatgttgatattaaatggacatga 33726005  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgtt-atgtgacctgttt 213  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||| ||| |  ||||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  33726004 actaatgtattgtacattcatgcaagatatgaaaacttgataatgatgtaatttatgtgctattgatataatgatatcattttgtttatgtgatctgttt 33725905  T
Q  214 atgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttca 313  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33725904 atgctgcttccgttgtttaactaagtgcataagtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgttttgttca 33725805  T
Q  314 tatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33725804 tatgtgtccatgcatagcataacattgagctttgtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcct 33725740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 37544286 - 37543922
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagt-tattttaatattaatcgaatatg 114  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||  ||| || |||||||| || ||||    
T  37544286 ttgatcaagagtgaacccctaattggtattgagacctagtgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagactatattgatattaattgagtatg 37544187  T
Q  115 aactattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttt 213  Q
    | ||| |||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  37544186 atctaatgtattgtatattcatgcaagatacgaaggtttgataataatgcaatttatgtgctattgatataatgatatcatcttgctgtgtgacttgttt 37544087  T
Q  214 atgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttga-taagtcgattacgatgttttgttc 312  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||| ||||||||||    
T  37544086 atgctgcttctgttatttaactaagtgcatatgtatatgataaggtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttttgttc 37543988  T
Q  313 atatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37543987 ataagtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 37543922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 23250185 - 23249821
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    ||||||||||| |||||||    || |||| ||||||| ||||| |||| |||||||  |||||||| ||| |||| ||  | ||||| || ||| ||||    
T  23250185 ttgatcaagagcgaacccccttatgataataagacctaatgatgacgttaaatgcagtttgtagagtagtttaagtcatgatgatattgattgaacatga 23250086  T
Q  116 actattgtattgtatat--tcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtt 212  Q
     ||| |||| |||||||  |  ||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23250085 gctaatgtaatgtatatatttatgcaagatatgaagagttgataatgatacaatttatgtgctattgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtt 23249986  T
Q  213 tatgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23249985 tatgctgcttccgttatttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagt-gattacgatgttttgttc 23249887  T
Q  313 atatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23249886 atatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 23249821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 27516997 - 27516634
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgttaag-ttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || |||| || |||||||| ||||||||    
T  27516997 ttgatctagagtgaacccctaactggtaatgagatctagtgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaggttatattgatattaattgaatatga 27516898  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttta 214  Q
      || |||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||| || ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  27516897 gttaatgtattgtatattcatgcaagatatgaaggtttgataataatgcaatttatgtgctattgatataataatatcatcttgatatgtgacttgttta 27516798  T
Q  215 tgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttga-taagtcgattacgatgttttgttca 313  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||||||      
T  27516797 tgctgcttccgttgtttaactaagtgcataagtatatgatagagtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgttgattacg-tgttttgttgt 27516699  T
Q  314 tatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27516698 taagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcct 27516634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 27523634 - 27523271
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgttaag-ttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || |||| || |||||||| ||||||||    
T  27523634 ttgatctagagtgaacccctaactggtaatgagatctagtgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaggttatattgatattaattgaatatga 27523535  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttta 214  Q
      || |||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||| || ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  27523534 gttaatgtattgtatattcatgcaagatatgaaggtttgataataatgcaatttatgtgctattgatataataatatcatcttgatatgtgacttgttta 27523435  T
Q  215 tgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttga-taagtcgattacgatgttttgttca 313  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||||||      
T  27523434 tgctgcttccgttgtttaactaagtgcataagtatatgatagagtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgttgattacg-tgttttgttgt 27523336  T
Q  314 tatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27523335 taagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcct 27523271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 30 - 378
Target Start/End: Original strand, 22341476 - 22341825
Alignment:
Q  30 aacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatgaactattgtattgt 128  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||||| || |||  ||| | | |||||||| ||||||||    
T  22341476 aacccctaactagtaataagacctaatgatgacgtttaatgcagtatgtagagttgtttaagttatgttgatac-aattggacatgaactaatgtattgt 22341574  T
Q  129 atattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgtt-atgtgacctgtttatgctgcttccgt 226  Q
    |||||| ||||||||| |||    |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22341575 atattcatgcaagatatgaaagcttgataatgatgcaatttatgtgctattgatataatgatatcatctcgtttatgtgacctgtttatgctgcttccgt 22341674  T
Q  227 tatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgc 326  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  22341675 tatttaactaagtgcataagtatatgatgaagtt-agctccaaattatttgatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgcccatgc 22341773  T
Q  327 atagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22341774 atagcatctcattgagcatagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 22341825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Original strand, 14994896 - 14995260
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||| | ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||  | | ||||    
T  14994896 ttgatcaaaagtgaacccctagttggtattaagacctaatgatgacgtttaatgcagtctgtagagttgtttaagttatgttgatattaaatggacatga 14994995  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgtt-atgtgacctgttt 213  Q
    |||| | |||||||||||| ||||||||| | | |  |||||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  14994996 actaatctattgtatattcatgcaagatatggaaacttgataatgatgcaatttatgtgctattgatattatgatatcattttgtttatgtgacctgttt 14995095  T
Q  214 atgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgtttt-gttc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  14995096 atgctgcttccgttatttaactaagtgcataagtttatgatgatgtt-agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgtttttgttc 14995194  T
Q  313 atatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14995195 ataagtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaataataggagctttgtcct 14995260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Original strand, 18038528 - 18038891
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||| | ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||  | | ||||    
T  18038528 ttgatcaagagcgaacccctagttggtattaagacctaatgatgacgtttaatgcagtctgtagagttgtttaagttatgttgatattaaatggacatga 18038627  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgtt-atgtgacctgttt 213  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||| |  |   | ||||  ||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  18038628 actaatgtattgtatattcatgcaagatatgaaggt-tgatattcctgatatttataagctattgatataatgatatcattttgtttatgtgacctgttt 18038726  T
Q  214 atgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgtttt-gttc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  18038727 atgctgcttccgttatttaactaagtgcataagtttatgatgaagtt-agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgtttttgttc 18038825  T
Q  313 atatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18038826 ataagtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaataataggagctttgtcct 18038891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Original strand, 1692297 - 1692660
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||| | ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||  | | ||||    
T  1692297 ttgatcaagagcgaacccctagttggtattaagacctaatgatgacgtttaatgcagtctgtagagttgtttaagttatgttgatattaaatggacatga 1692396  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgtt-atgtgacctgttt 213  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||| | |||| | ||||| |  |   | ||||  ||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  1692397 actaatgtattgtatattcatgcaagaaatgaaggt-tgatattcctgatatttataagctattgatataatgatatcattttgtttatgtgacctgttt 1692495  T
Q  214 atgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgtttt-gttc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  1692496 atgctgcttccgttatttaactaagtgcataagtttatgatgaagtt-agctccaatttaatggatgcatgttgatatgttgattacgatgtttttgttc 1692594  T
Q  313 atatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1692595 ataagtgtccatgcatagcatcttattgagcttagtcctcaccacgaataataggagctttgtcct 1692660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Original strand, 27687189 - 27687552
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||| | ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||  | | ||||    
T  27687189 ttgatcaagagcgaacccctagttggtattaagacctaatgatgacgtttaatgcagtctgtagagttgtttaagttatgttgatattaaatggacatga 27687288  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgtt-atgtgacctgttt 213  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||| | |||| | ||||| |  |   | ||||  ||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  27687289 actaatgtattgtatattcatgcaagaaatgaaggt-tgatattcctgatatttataagctattgatataatgatattattttgtttatgtgacctgttt 27687387  T
Q  214 atgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgtttt-gttc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  27687388 atgctgcttccgttatttaactaagtgcataagtttatgatgaagtt-agctccaatttaatggatgcgtgttgatatgttgattacgatgtttttgttc 27687486  T
Q  313 atatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27687487 ataagtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaataataggagctttgtcct 27687552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 22133243 - 22132880
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagt-tgttaagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||  ||||| ||  | |||||  || ||   |||||| ||  ||||    
T  22133243 ttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatgacgtttaatgcaatctgtaaagccttttaagacatgttgtcattaattgagcatga 22133144  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttta 214  Q
      || ||||||||| | || || |||||| |||  | | || ||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22133143 t-taatgtattgtacaatcatgtaagatatgaaagtttaattatgatgcaaatgatttgctattgatataatgatatcatcttgttatgtgacttgttta 22133045  T
Q  215 tgctgcttccgttatttaactaagtgcata-ggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttca 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||      
T  22133044 tgctgcttccgttatttaactaagtgcatatggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatattgattacggtgttttgttgt 22132945  T
Q  314 tatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  22132944 taagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcct 22132880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 177 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 17284152 - 17283950
Alignment:
Q  177 ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcata-ggtatatgatgaagtttagctccaaattatt 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17284152 ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacttgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcatatggtatatgatgaagtttagctccaaattatt 17284053  T
Q  276 ggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgt 375  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||  || | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  17284052 ggatgcatgttgatatgttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgtatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgt 17283953  T
Q  376 cct 378  Q
    |||    
T  17283952 cct 17283950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 177 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 25406509 - 25406307
Alignment:
Q  177 ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcata-ggtatatgatgaagtttagctccaaattatt 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25406509 ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacttgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcatgtggtatatgatgaagtttagctccaaattatt 25406410  T
Q  276 ggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgt 375  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  25406409 ggatgcatgttgatatgttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgt 25406310  T
Q  376 cct 378  Q
    |||    
T  25406309 cct 25406307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 22139935 - 22139572
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagt-tgttaagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||  ||||| ||  | |||||  |  ||   |||||| ||  ||||    
T  22139935 ttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatgacgtttaatgcaatctgtaaagccttttaagacacgttgtcattaattgagcatga 22139836  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttta 214  Q
      || ||||||||| | || || |||||| |||  | | || ||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22139835 t-taatgtattgtacaatcatgtaagatatgaaagtttaattatgatgcaaatgatttgctattgatataatgatatcatcttgttatgtgacttgttta 22139737  T
Q  215 tgctgcttccgttatttaactaagtgcata-ggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttca 313  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||      
T  22139736 tgctgattccgttatttaactaagtgcatatggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgttttgttgt 22139637  T
Q  314 tatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    || | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  22139636 taagagtctatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcct 22139572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 177 - 378
Target Start/End: Original strand, 29471379 - 29471582
Alignment:
Q  177 ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcata-ggtatatgatgaagtttagctccaaattatt 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29471379 ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacttgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcatatggtatatgatgaagtttagctccaaattatt 29471478  T
Q  276 ggatgcatgttgataagtcg-attacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttg 374  Q
    ||||||||||||||| || | |||||| |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  29471479 ggatgcatgttgatatgttgaattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttg 29471578  T
Q  375 tcct 378  Q
    ||||    
T  29471579 tcct 29471582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 177 - 378
Target Start/End: Original strand, 29477974 - 29478177
Alignment:
Q  177 ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcata-ggtatatgatgaagtttagctccaaattatt 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29477974 ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacttgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcatatggtatatgatgaagtttagctccaaattatt 29478073  T
Q  276 ggatgcatgttgataagtcg-attacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttg 374  Q
    ||||||||||||||| || | |||||| |||||||||  || | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  29478074 ggatgcatgttgatatgttgaattacggtgttttgttgttaagagtccatgcataacatatcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttg 29478173  T
Q  375 tcct 378  Q
    ||||    
T  29478174 tcct 29478177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 181 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 22588176 - 22587978
Alignment:
Q  181 tataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcata-ggtatatgatgaagtttagctccaaattattggat 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22588176 tataatgatatcatcttgttatgtgacttgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcatatggtatatgatgaagtttatctccaaattattggat 22588077  T
Q  280 gcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  22588076 gcatgttgatatgttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccatgtttattaggagctttgtcct 22587978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 19 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 24020525 - 24020154
Alignment:
Q  19 gatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttg-ttaagttattttaatattaatcgaatatgaac 117  Q
    |||||||||||||||||    || |||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||| ||||| ||||| ||| ||  ||||||| ||||||| |     
T  24020525 gatcaagagtgaacccccttatgttaatgagacctaatgatgacgtttaatgctgcctgtaaagttgtttaagatatgttggtattaattgaatatg-at 24020427  T
Q  118 tattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttatg 216  Q
    || |||||| |  | |  || |||||| |||  | | |  ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  24020426 taatgtattttgcaattatgtaagatatgaaagtttaactatgatacaattgatgtgctattgatataatgatatcatcctgttatgtgacttgtttatg 24020327  T
Q  217 ctgcttccgttatttaactaagtgcatag------gtatatgatgaa--------gtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacga 302  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||       |||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  24020326 ctgctgctgttatttaactaagtgcatagtgtactttatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacga 24020227  T
Q  303 tgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgt 375  Q
    || |||||||||| |  |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24020226 tgatttgttcataagaatccatgcataacatttcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgt 24020154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 177 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 19768433 - 19768215
Alignment:
Q  177 ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcatagg---------tatatgatgaa--------gt 259  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||||| |          |||||||||||        ||    
T  19768433 ttgatataatgatatcatcctgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatgtatttatatatgatgaaatgatgacgt 19768334  T
Q  260 ttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacga 359  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  19768333 ttagctccaaattgttggatgcatgatgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctccgcacga 19768234  T
Q  360 atattaggagctttgtcct 378  Q
     ||||||||||||||||||    
T  19768233 ttattaggagctttgtcct 19768215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 177 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 19775029 - 19774811
Alignment:
Q  177 ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcatagg---------tatatgatgaa--------gt 259  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||||| |          |||||||||||        ||    
T  19775029 ttgatataatgatatcatcctgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatgtatttatatatgatgaaatgatgacgt 19774930  T
Q  260 ttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacga 359  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  19774929 ttagctccaaattgttggatgcatgatgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtcttcaccacgt 19774830  T
Q  360 atattaggagctttgtcct 378  Q
     ||||||||||||||||||    
T  19774829 ttattaggagctttgtcct 19774811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 250 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 22343493 - 22343364
Alignment:
Q  250 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 349  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22343493 atgatgacgtttagctccaaattattagatgcatgttgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcatagcatttcattgagcttagtc 22343394  T
Q  350 ctcaccacga-atattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  22343393 ctcaccacgatttattaggagctttgtcct 22343364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 250 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 22352893 - 22352764
Alignment:
Q  250 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 349  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22352893 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcatagcatttcattgagcttagtc 22352794  T
Q  350 ctcaccacga-atattaggagctttgtcct 378  Q
     |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  22352793 ttcaccacgatttattaggagctttgtcct 22352764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 295 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 16354789 - 16354706
Alignment:
Q  295 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16354789 gattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcct 16354706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 295 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 16361448 - 16361365
Alignment:
Q  295 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16361448 gattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcct 16361365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 295 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 34564782 - 34564699
Alignment:
Q  295 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34564782 gattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcct 34564699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 295 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 34571437 - 34571354
Alignment:
Q  295 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34571437 gattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcct 34571354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 250 - 378
Target Start/End: Original strand, 22326038 - 22326167
Alignment:
Q  250 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgca-tagcatctcattgagcttagt 348  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| || |||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  22326038 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagt 22326136  T
Q  349 cctcaccacga-atattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  22326137 cctcaccacgatttattaggagctttgtcct 22326167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 295 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 25106728 - 25106645
Alignment:
Q  295 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25106728 gattatgatgttttgttcatctgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcct 25106645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 295 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 25165821 - 25165738
Alignment:
Q  295 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25165821 gattatgatgttttgttcatctgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcct 25165738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 252 - 378
Target Start/End: Original strand, 14359931 - 14360057
Alignment:
Q  252 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcc 350  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||| |  ||||||| || |||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  14359931 gatgacgtttagctccaaactattggatgcatattgatatgatgattacggtggtttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 14360029  T
Q  351 tcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14360030 tcaccacgattattaggagctttgtcct 14360057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 295 - 378
Target Start/End: Original strand, 22410751 - 22410834
Alignment:
Q  295 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22410751 gattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 22410834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 252 - 378
Target Start/End: Original strand, 15442068 - 15442194
Alignment:
Q  252 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcc 350  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||  ||  ||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  15442068 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacagtgaattgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 15442166  T
Q  351 tcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15442167 tcaccacgattattaggagctttgtcct 15442194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 252 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 24554529 - 24554408
Alignment:
Q  252 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgca-tagcatctcattgagcttagtcc 350  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  24554529 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacgatgttttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 24554432  T
Q  351 tcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||    |||||||||||||||    
T  24554431 tcaccacga----taggagctttgtcct 24554408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 252 - 378
Target Start/End: Original strand, 21295374 - 21295495
Alignment:
Q  252 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgca-tagcatctcattgagcttagtcc 350  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  21295374 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacgatgttttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 21295471  T
Q  351 tcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||| ||    |||||||||||||||    
T  21295472 tcaccatga----taggagctttgtcct 21295495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 250 - 378
Target Start/End: Original strand, 15237176 - 15237310
Alignment:
Q  250 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 340  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  15237176 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 15237275  T
Q  341 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  15237276 agctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcct 15237310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 250 - 378
Target Start/End: Original strand, 19473059 - 19473193
Alignment:
Q  250 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 340  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  19473059 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 19473158  T
Q  341 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  19473159 agctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcct 19473193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 250 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 20295612 - 20295478
Alignment:
Q  250 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 340  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  20295612 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 20295513  T
Q  341 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  20295512 agctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcct 20295478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 252 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 25534983 - 25534862
Alignment:
Q  252 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgca-tagcatctcattgagcttagtcc 350  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  25534983 gatgacgtttaactccaaattattggatgcatattgatatgatgattacgatgttttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 25534886  T
Q  351 tcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||| ||    |||||||||||||||    
T  25534885 tcaccatga----taggagctttgtcct 25534862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 295 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 20775833 - 20775749
Alignment:
Q  295 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacg-aatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  20775833 gattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcct 20775749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 295 - 378
Target Start/End: Original strand, 21667958 - 21668042
Alignment:
Q  295 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacg-aatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  21667958 gattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcct 21668042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 295 - 378
Target Start/End: Original strand, 22258633 - 22258717
Alignment:
Q  295 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacg-aatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  22258633 gattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcct 22258717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 252 - 375
Target Start/End: Original strand, 23337402 - 23337525
Alignment:
Q  252 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgca-tagcatctcattgagcttagtcc 350  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||  || |||||| ||| | ||||||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  23337402 gatgacgtttggctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacagtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagctcagtcc 23337500  T
Q  351 tcaccacgaatattaggagctttgt 375  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||    
T  23337501 tcaccgcgattattaggagctttgt 23337525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 295 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 29316372 - 29316288
Alignment:
Q  295 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacg-aatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  29316372 gattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcct 29316288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 72
Target Start/End: Original strand, 21295124 - 21295179
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgca 72  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  21295124 ttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatgacgtttaatgca 21295179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 22588339 - 22588284
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgca 72  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  22588339 ttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatgacgtttaatgca 22588284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 24554779 - 24554724
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgca 72  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  24554779 ttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatgacgtttaatgca 24554724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 25535233 - 25535178
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgca 72  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  25535233 ttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatgacgtttaatgca 25535178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 72
Target Start/End: Original strand, 29471220 - 29471275
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgca 72  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  29471220 ttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatgacgtttaatgca 29471275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 72
Target Start/End: Original strand, 29477815 - 29477870
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgca 72  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  29477815 ttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatgacgtttaatgca 29477870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 251 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 10752954 - 10752821
Alignment:
Q  251 tgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattga 341  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||| ||| ||||||     
T  10752954 tgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgataatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcataacatttcattgg 10752855  T
Q  342 gcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||| ||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  10752854 gctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcct 10752821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 17284311 - 17284257
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgc 71  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  17284311 ttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatgacgtttaatgc 17284257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 79
Target Start/End: Original strand, 22258333 - 22258395
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgta 79  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||| |||||    
T  22258333 ttgatcaagagtgaatccctaactggtaatgaaacctaatgataacgtttaatgcagtctgta 22258395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 264 - 378
Target Start/End: Original strand, 40723977 - 40724091
Alignment:
Q  264 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 361  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||| ||||| | ||| ||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |    
T  40723977 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaaggtgtcttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcttcaccacgatt 40724074  T
Q  362 attaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||||||||    
T  40724075 attaggagctttgtcct 40724091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 72
Target Start/End: Original strand, 23337149 - 23337204
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgca 72  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  23337149 ttgatcaagagtgaacccctagttggtaatgagacctaatgatgatgtttaatgca 23337204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 79
Target Start/End: Original strand, 15441815 - 15441877
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgta 79  Q
    ||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  15441815 ttgatcaagagtgaatccctttatggtaatgagacctaatgatgacgtttaatgcagtctgta 15441877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 79
Target Start/End: Original strand, 22410459 - 22410521
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgta 79  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||||  |||||||||||| |||||    
T  22410459 ttgatcaagagtgaacccgtaattggtaatgagaccttatgataacgtttaatgcagtctgta 22410521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 33409229 - 33409118
Alignment:
Q  264 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 361  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||||| ||| | |||||||||||  || | |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||       
T  33409229 ctccaaattattggatgtatatgtgataagttgatcaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccacg--- 33409135  T
Q  362 attaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||||||||    
T  33409134 attaggagctttgtcct 33409118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 106
Target Start/End: Original strand, 21667667 - 21667756
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgttaagttattttaatattaat 106  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||  |||||||||||| ||||| || | ||||| ||| || ||||||||    
T  21667667 ttgatcaggagtgaacccctaattggtaatgaaaccttatgataacgtttaatgcagtctgtaaagctattaagatatgttgatattaat 21667756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 29316663 - 29316574
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgttaagttattttaatattaat 106  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||  |||||||||||| ||||| || | ||||| ||| || ||||||||    
T  29316663 ttgatcaggagtgaacccctaattggtaatgaaaccttatgataacgtttaatgcagtctgtaaagctattaagatatgttgatattaat 29316574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 244
Target Start/End: Original strand, 15441976 - 15442046
Alignment:
Q  177 ttgatataatgatatcatc---ttgttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcata 244  Q
    |||||||||||||||||||   ||||| |||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  15441976 ttgatataatgatatcatcctgttgttgtgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcata 15442046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 20776133 - 20776077
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcag 73  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||  ||||||||||||    
T  20776133 ttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgcaacctaatgataacgtttaatgcag 20776077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 25406670 - 25406618
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaat 69  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||||||||    
T  25406670 ttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacttaatgatgacgtttaat 25406618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 177 - 244
Target Start/End: Original strand, 14359839 - 14359909
Alignment:
Q  177 ttgatataatgatatcatc---ttgttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcata 244  Q
    |||||||||||||||||||   ||||| |||||| ||  |||| |||| | ||||||||||||||||||||    
T  14359839 ttgatataatgatatcatcctgttgttgtgtgacttgactatgttgctgctgttatttaactaagtgcata 14359909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 319; Significance: 1e-180; HSPs: 135)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Original strand, 31422413 - 31422775
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  31422413 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtttaagttatattaatattaattgaatatga 31422512  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgctttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttat 215  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31422513 actattgtattgtatattcatgcaagataagaagatgtgataatgatacaaatgatgtgccttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttat 31422612  T
Q  216 gctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcata 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31422613 gctgcttccgttatttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcata 31422712  T
Q  316 tgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31422713 tgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 31422775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 37615637 - 37615276
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  37615637 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtttaagttatattaatattaattgaatatga 37615538  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgctttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttat 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37615537 actattgtattgtatattcatgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgctt-gatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttat 37615439  T
Q  216 gctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcata 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37615438 gctgcttccgttatttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcata 37615339  T
Q  316 tgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37615338 tgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 37615276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Original strand, 26794255 - 26794617
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  26794255 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtttaagttatattaatattaattgaatatga 26794354  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgctttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttat 215  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26794355 actattgtattgtatattcatgcaagataagaaaatgtgataatgatacaaattatgtgctttgatataatgatatcatcttgttatgtgaccggtttat 26794454  T
Q  216 gctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcata 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  26794455 gctgcttccgttatttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcatt 26794554  T
Q  316 tgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26794555 tgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 26794617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Original strand, 26788665 - 26789027
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  26788665 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtttaagttatattaatattaattgaatatga 26788764  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgctttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttat 215  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26788765 actattgtattgtatattcatgcaagataagaaaatgtgataatgatacaaattatgtgctttgatataatgatatcatcttgttatgtgaccggtttat 26788864  T
Q  216 gctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcata 315  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26788865 gctgcttctgttatttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcata 26788964  T
Q  316 tgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26788965 tgtgtccatgcatagcatattattgagcttagttctcaccacgtatattaggagctttgtcct 26789027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Original strand, 5106744 - 5107106
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||    
T  5106744 ttgatcaagagtgaacccctaactggtagtgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtttaagttatattaatatcaattgaatatga 5106843  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgctttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttat 215  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5106844 actattatattgtatattcatgcaagataagaagatgtgttaatgatacaagttatgtgctttgatataatgatatcatcttgttatgtgacttgtttat 5106943  T
Q  216 gctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcata 315  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5106944 gctgctttcgttatttaactaagtgcatatgtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcata 5107043  T
Q  316 tgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5107044 tgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcacaacgaatattaggagctttgtcct 5107106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Original strand, 16758431 - 16758793
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgttaa-gttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||    
T  16758431 ttgattaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgccgtttaacgcagactgtagagttgttaaagttatattaatatcaattgaatatga 16758530  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgctttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttat 215  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16758531 actattgtattgtatattcatgcaagataagaagatgtgttaatgatacaaattatgtgctttgatataatgatatcatcttgttatgtgacttgtttat 16758630  T
Q  216 gctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcata 315  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  16758631 gctgctttcgttatttaactaagtgcataagtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattaggttgttttgttcata 16758730  T
Q  316 tgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
     |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16758731 cgtgttcatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 16758793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 6598964 - 6598602
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||    
T  6598964 ttgattaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgttaaatgcagactgtaaagttgtttaagttatattaatatcaattgaatatga 6598865  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgctttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttat 215  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6598864 actattgtattgtatattcatgcaagataagaagatgtgttaatgatacaaattatgtactttgatataatgatatcatcttgttatgtgacttgtttat 6598765  T
Q  216 gctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcata 315  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||     
T  6598764 gctgctttcgttatttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgtttcgttcatg 6598665  T
Q  316 tgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6598664 tgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 6598602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 6605644 - 6605282
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||    
T  6605644 ttgattaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgttaaatgcagactgtaaagttgtttaagttatattaatatcaattgaatatga 6605545  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgctttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttat 215  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6605544 actattgtattgtatattcatgcaagataagaagatgtgttaatgatacaaattatgtactttgatataatgatatcatcttgttatgtgacttgtttat 6605445  T
Q  216 gctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcata 315  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||     
T  6605444 gctgctttcgttatttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgtttcgttcatg 6605345  T
Q  316 tgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6605344 tgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 6605282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Original strand, 53380211 - 53380573
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  53380211 ttgatcaagagtgaaccc-taacttataatgagacctataaatgtcatttaatgcagactgtagagttgtttaagtcatattaatattaattgaatatga 53380309  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgcttt-gatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttta 214  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53380310 actattgaattgtatattcatgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgcttttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttta 53380409  T
Q  215 tgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcat 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  53380410 tgctgcttccgttatttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcat 53380509  T
Q  315 atgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53380510 atgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 53380573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Original strand, 53386863 - 53387225
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  53386863 ttgatcaagagtgaaccc-taacttataatgagacctataaatgtcatttaatgcagactgtagagttgtttaagtcatattaatattaattgaatatga 53386961  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgcttt-gatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttta 214  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53386962 actattgaattgtatattcatgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgcttttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttta 53387061  T
Q  215 tgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcat 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  53387062 tgctgcttccgttatttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcat 53387161  T
Q  315 atgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53387162 atgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 53387225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Original strand, 10153595 - 10153957
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||    
T  10153595 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcatttaatgcagactgtagagttgtttaagttatattaatatcaattgaatatga 10153694  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgctttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttat 215  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  10153695 actattatattgtatattcatgcaagataagaagatgtgttaatgatgcaaattatgtgttttgatataatgatatcatcttgttatgtgacttgtttac 10153794  T
Q  216 gctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcata 315  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10153795 gctgcttttgttatttaactaagtgcataagtataagatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgttttgttcata 10153894  T
Q  316 tgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10153895 tgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccatgaatattaggagctttgtcct 10153957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Original strand, 16623915 - 16624277
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgt-taagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||    
T  16623915 ttgaccaagagtgaacccctaattggtattgagacctagtggtgacgtttaatgcagcctgtagagttgtctaagttatattaatattgattgaataaga 16624014  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgctttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttat 215  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16624015 actattgtattgtatattcatgcaaaataagaagatgtgataatgatgcaaattatgtgctttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttat 16624114  T
Q  216 gctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcata 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  16624115 gctgcttccgttatttaactaagtgcataagtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgttttgttcatg 16624214  T
Q  316 tgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16624215 tgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcct 16624277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 23 - 378
Target Start/End: Original strand, 16747705 - 16748061
Alignment:
Q  23 aagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgttaa-gttattttaatattaatcgaatatgaactatt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  16747705 aagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgctgtttaacgcagattgtagagttgttaaagttatattaatatcaattgaatatgaactatt 16747804  T
Q  122 gtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgctttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttatgctgct 221  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16747805 gtattgtatattcatgcaagataagaagatgtgttaatgatacaaattatgtgctttgatataatgatatcatcttgttatgtgacttgtttatgctgct 16747904  T
Q  222 tccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtc 321  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||    
T  16747905 ttcgttatttaactaagtgcataagtatatgatgaagtttagctctaaattattggatgcatgttgataagtcgattaggctgttttgttcatacgtgtc 16748004  T
Q  322 catgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16748005 catgcatagcatatcattgagtttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 16748061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 26889701 - 26889339
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |  || ||    
T  26889701 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgttgtttaatgcagactgtagagttgtttaagttatattaatattaattggttaaga 26889602  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttta 214  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26889601 actattgtattgtatattcatgcaaaatgagaagatgtgataataatgcaatttatgtgctattgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgctta 26889502  T
Q  215 tgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcat 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26889501 tgctgcttccgttatttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagt-gattacgatgttttgttcat 26889403  T
Q  315 atgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26889402 atgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcct 26889339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Original strand, 10846143 - 10846506
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||  |||||||||| ||| ||||    
T  10846143 ttgatcaagagtgaacccctaactagtaatgagacctagtgatgtcgttaaatgcagtctgtagagttgtttaagtcatgataatattaattgaacatga 10846242  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttta 214  Q
     ||| |||| | || |||  ||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10846243 gctaatgtaatatacatttatgcaagatatgaagaattgataatgatacaatttatgtgctattgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttta 10846342  T
Q  215 tgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcat 314  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  10846343 tgctgctttcgttatttaactaagtgcataagtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatattgataagtttattacaatgttttgttcat 10846442  T
Q  315 atgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10846443 atgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 10846506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 5221650 - 5221288
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttg-ttaagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||| ||||    
T  5221650 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgttaaatgcagtctgtagagttggttaagttatgttgatattaattgaacatga 5221551  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttta 214  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| |||  | ||| ||| || | | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5221550 actaatgtattgtatattcatgcaagatatgaaagtttgaaaataatgccatttatgtgctattgatataatgatatcatcttgttatgtgacttgttta 5221451  T
Q  215 tgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcat 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  5221450 tgctgcttccgttatttaactaagtgcataagtatatgatgaagttaa-ctccaaattattggacacatgttgttatgttgattacgatgttttgttcat 5221352  T
Q  315 atgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5221351 aagtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcct 5221288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 418246 - 417883
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |  || ||    
T  418246 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagttatattaatattaattggttaaga 418147  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttta 214  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||| | ||||||| || ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  418146 actattgtattgtatattcatgcaaaatgagaaggtttgataataatgcaatttatgtgctattgatataataatatcatcttgatatgtgacttgttta 418047  T
Q  215 tgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttga-taagtcgattacgatgttttgttca 313  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||||||      
T  418046 tgctgcttccgttgtttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgttgattacg-tgttttgttgt 417948  T
Q  314 tatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  417947 taagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcct 417883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Original strand, 20057263 - 20057627
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt--aagttattttaatattaatcgaatatg 114  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  || |||| || |||||||| ||  |||    
T  20057263 ttgatcaggagtgaacccctaattggtattgagacctagtgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgttttaaattatattgatattaattgagcatg 20057362  T
Q  115 aactattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttt 213  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  20057363 aactaatgtattgtatattcatgcaagatatgaaggtttgataataatgcaatttatgtgctattgatataatgatatcatcttgatatgtgacttgttt 20057462  T
Q  214 atgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttga-taagtcgattacgatgttttgttc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||| ||||||||||    
T  20057463 atgctgcttccgttatttaactaagtgcatatgtatatgataaggtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttttgttc 20057561  T
Q  313 atatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20057562 ataagtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 20057627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 10911145 - 10910781
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||  | | ||||    
T  10911145 ttgatcaagagtgaacccctaattggtgttgagacctagtggagacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagttatgttgatattaaatggacatga 10911046  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgtt-atgtgacctgttt 213  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||| ||| |  ||||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  10911045 actaatgtattgtacattcatgcaagatatgaaaacttgataatgatgtaatttatgtgctattgatataatgatatcattttgtttatgtgatctgttt 10910946  T
Q  214 atgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttca 313  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10910945 atgctgcttccgttgtttaactaagtgcataagtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgttttgttca 10910846  T
Q  314 tatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10910845 tatgtgtccatgcatagcataacattgagctttgtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcct 10910781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 13250965 - 13250602
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgttaag-ttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || |||| || |||||||| ||||||||    
T  13250965 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaggttatattgatattaattgaatatga 13250866  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttta 214  Q
      || |||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||| || ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  13250865 gttaatgtattgtatattcatgcaagatatgaaggtttgataataatgcaatttatgtgctattgatataataatatcatcttgatatgtgacttgttta 13250766  T
Q  215 tgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttga-taagtcgattacgatgttttgttca 313  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||||||      
T  13250765 tgctgcttccgttgtttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgttgattacg-tgttttgttgt 13250667  T
Q  314 tatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13250666 taagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcct 13250602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 13257611 - 13257248
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgttaag-ttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || |||| || |||||||| ||||||||    
T  13257611 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaggttatattgatattaattgaatatga 13257512  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttta 214  Q
      || |||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||| || ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  13257511 gttaatgtattgtatattcatgcaagatatgaaggtttgataataatgcaatttatgtgctattgatataataatatcatcttgatatgtgacttgttta 13257412  T
Q  215 tgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttga-taagtcgattacgatgttttgttca 313  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||||||      
T  13257411 tgctgcttccgttgtttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgttgattacg-tgttttgttgt 13257313  T
Q  314 tatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13257312 taagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcct 13257248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Original strand, 14673060 - 14673423
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||||    
T  14673060 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagagatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagttatattgatattaattgaatatga 14673159  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttta 214  Q
    | || |||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||| || ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  14673160 attaatgtattgtatattcatgcaagatatgaaggtttgataataatgcaatttatgtgctattgatataataatatcatcttgatatgtgacttgttta 14673259  T
Q  215 tgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttga-taagtcgattacgatgttttgttca 313  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||||||      
T  14673260 tgctgcttccgttgtttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgttgattacg-tgttttgttgt 14673358  T
Q  314 tatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    || | |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14673359 taagagtccatacatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcct 14673423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Original strand, 20063901 - 20064265
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt--aagttattttaatattaatcgaatatg 114  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  || |||| || |||||||| ||  |||    
T  20063901 ttgatcaggagtgaacccctaattggtattgagacctagtgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgttttaaattatattgatattaattgagcatg 20064000  T
Q  115 aactattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttt 213  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  20064001 aactaatgtattgtatattcatgcaagatatgaaggtttgataataatgcaatttatgtgctattgatataatgatatcatcttgatatgtgacttgttt 20064100  T
Q  214 atgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttga-taagtcgattacgatgttttgttc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||| ||||||||||    
T  20064101 atgctgcttccgttatttaactaagtgcatatgtatatgataaggtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttttgttc 20064199  T
Q  313 atatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20064200 ataagtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatatgaggagctttgtcct 20064265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 10003883 - 10003519
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||  | | ||||    
T  10003883 ttgatcaagagtgaacccctaagtggtgttgagacctagtggagacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagttatgttgatattaaatggacatga 10003784  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgtt-atgtgacctgttt 213  Q
    ||||  |||||||| |||| ||||||||| ||| |  ||||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  10003783 actaaggtattgtacattcatgcaagatatgaaaacttgataatgatgtaatttatgtgctattgatataatgatatcattttgtttatgtgatctgttt 10003684  T
Q  214 atgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttca 313  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10003683 atgctgcttccgttgtttaactaagtgcataagtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgttttgttca 10003584  T
Q  314 tatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10003583 tatgtgtccatgcatagcataacattgagctttgtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcct 10003519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 10010530 - 10010166
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||  | | ||||    
T  10010530 ttgatcaagagtgaacccctaagtggtgttgagacctagtggagacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagttatgttgatattaaatggacatga 10010431  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgtt-atgtgacctgttt 213  Q
    ||||  |||||||| |||| ||||||||| ||| |  ||||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  10010430 actaaggtattgtacattcatgcaagatatgaaaacttgataatgatgtaatttatgtgctattgatataatgatatcattttgtttatgtgatctgttt 10010331  T
Q  214 atgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttca 313  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10010330 atgctgcttccgttgtttaactaagtgcataagtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgttttgttca 10010231  T
Q  314 tatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10010230 tatgtgtccatgcatagcataacattgagctttgtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcct 10010166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 10904473 - 10904109
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||  | | ||||    
T  10904473 ttgatcatgagtgaacccctaattggtgttgagacctagtggagacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagttatgttgatattaaatggacatga 10904374  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgtt-atgtgacctgttt 213  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||| ||| |  ||||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  10904373 actaatgtattgtacattcatgcaagatatgaaaacttgataatgatgtaatttatgtgctattgatataatgatatcattttgtttatgtgatctgttt 10904274  T
Q  214 atgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttca 313  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10904273 atgctgcttccgttgtttaactaagtgcataagtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgttttgttca 10904174  T
Q  314 tatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10904173 tatgtgtccatgcatagcataacattgagctttgtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcct 10904109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 3690865 - 3690502
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || ||||| || ||  | ||    
T  3690865 ttgatcaagagtgaacccctaattgggattgagacctagtgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagttatattgatattcattgagcaaga 3690766  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttta 214  Q
    |||| |||||||||||| | ||||||||| |||| | ||||||  || ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||    
T  3690765 actaatgtattgtatatgcatgcaagatatgaaggtttgataaaaatgcaatttatgtgctattgatataatgatatcatcttgatatgagatttgttta 3690666  T
Q  215 tgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttga-taagtcgattacgatgttttgttca 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||| |||||||||||    
T  3690665 tgctgcttccgttatttaactaagtgcatatgtatatgataaggtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttttgttca 3690567  T
Q  314 tatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3690566 taagtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcct 3690502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 18 - 378
Target Start/End: Original strand, 16489531 - 16489887
Alignment:
Q  18 tgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatgaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||  | | |||||    
T  16489531 tgatcaagagtgaacccctagttggtattaagacctaatgatgacgtttaatgcagtctgtagagttgtttaagttatgttgatattaaatggacatgaa 16489630  T
Q  117 ctattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgtt-atgtgacctgttta 214  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| |  ||  |  |||  | | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16489631 ctaatgtattgtatattcgtgcaagatatgaaggt-tgatattcctaatatatataagttgttgatataatgatatcattttgtttatgtgacctgttta 16489729  T
Q  215 tgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcat 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  ||||    
T  16489730 tgctgcttccgttatttaactaagtgcataagtttatgatgaagtt-agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgtttttgtcat 16489828  T
Q  315 atgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    | ||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16489829 aagtgtccatgcatagcatctcat-----ttagtcctcaccacgaataataggagctttgtcct 16489887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Original strand, 22643177 - 22643553
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgttaagttattttaatattaatcgaatatgaa 116  Q
    |||||| | |||||||||||   ||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| ||| |||||    
T  22643177 ttgatcgatagtgaacccctgcttggtattgagacctaatgatgacgttaaatgcagtctgtagagttgttaagatatgttgatattaattgaacatgaa 22643276  T
Q  117 ctattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttat 215  Q
    ||| ||||||||||| |  ||||||||| | |  | |||| || || ||| | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||    
T  22643277 ctaatgtattgtataattatgcaagatatgcaagtttgattataatgcaattgatgtgctattgatataatgatatcatcctgttatgtgatttgtttat 22643376  T
Q  216 gctgcttccgttatttaactaagtgcatag-gtatatga------tgaagt-------ttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacg 301  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||      |||| |       ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  22643377 gctgcttctgttatttaactaagtgcatattgtatatgagtatgatgaaatgatgaagttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacg 22643476  T
Q  302 atgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22643477 atgttttgttcatacgagtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcct 22643553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 177 - 378
Target Start/End: Original strand, 23704787 - 23704989
Alignment:
Q  177 ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcata-ggtatatgatgaagtttagctccaaattatt 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23704787 ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacttgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcatatggtatatgatgaagtttagctccaaattatt 23704886  T
Q  276 ggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgt 375  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  23704887 ggatgcatgttgatatgttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgt 23704986  T
Q  376 cct 378  Q
    |||    
T  23704987 cct 23704989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 177 - 378
Target Start/End: Original strand, 23723243 - 23723445
Alignment:
Q  177 ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcata-ggtatatgatgaagtttagctccaaattatt 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23723243 ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacttgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcatatggtatatgatgaagtttagctccaaattatt 23723342  T
Q  276 ggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgt 375  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  23723343 ggatgcatgttgatatgttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgt 23723442  T
Q  376 cct 378  Q
    |||    
T  23723443 cct 23723445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 177 - 378
Target Start/End: Original strand, 23741699 - 23741901
Alignment:
Q  177 ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcata-ggtatatgatgaagtttagctccaaattatt 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23741699 ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacttgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcatatggtatatgatgaagtttagctccaaattatt 23741798  T
Q  276 ggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgt 375  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  23741799 ggatgcatgttgatatgttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgt 23741898  T
Q  376 cct 378  Q
    |||    
T  23741899 cct 23741901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 177 - 378
Target Start/End: Original strand, 41201817 - 41202019
Alignment:
Q  177 ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcata-ggtatatgatgaagtttagctccaaattatt 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41201817 ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacttgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcatatggtatatgatgaagtttagctccaaattatt 41201916  T
Q  276 ggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgt 375  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  41201917 ggatgcatgttgatatgttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgt 41202016  T
Q  376 cct 378  Q
    |||    
T  41202017 cct 41202019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 177 - 378
Target Start/End: Original strand, 15692297 - 15692499
Alignment:
Q  177 ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcata-ggtatatgatgaagtttagctccaaattatt 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15692297 ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacttgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcatatggtatatgatgaagtttagctccaaattatt 15692396  T
Q  276 ggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgt 375  Q
    | ||||||||||| | || ||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  15692397 gtatgcatgttgacatgttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgt 15692496  T
Q  376 cct 378  Q
    |||    
T  15692497 cct 15692499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 177 - 378
Target Start/End: Original strand, 15726951 - 15727153
Alignment:
Q  177 ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcata-ggtatatgatgaagtttagctccaaattatt 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15726951 ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacttgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcatatggtatatgatgaagtttagctccaaattatt 15727050  T
Q  276 ggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgt 375  Q
    | ||||||||||| | || ||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  15727051 gtatgcatgttgacatgttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgt 15727150  T
Q  376 cct 378  Q
    |||    
T  15727151 cct 15727153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 19 - 378
Target Start/End: Original strand, 15991966 - 15992339
Alignment:
Q  19 gatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatgaac 117  Q
    |||||||||||||||||    || |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| || |||| ||| ||| || |||||||| || |||||      
T  15991966 gatcaagagtgaacccccttatgataatgagacctaatgatgacgtttaatgcagtctgtaaagctgtttaagatatgttgatattaattgagtatgat- 15992064  T
Q  118 tattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttatg 216  Q
    || ||||||||  | |  || |||||| |||| | | |  ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  15992065 taatgtattgtgcaattatgtaagatatgaaggtttaactatgatacaattgatgtgctattgatataatgatatcatcctgttatgtgacttgtttatg 15992164  T
Q  217 ctgcttccgttatttaactaagtgcatagg-----tatatgatgaa--------gtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgat 303  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||      |||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |    
T  15992165 ctgctgctgttatttaactaagtgcatagtgtatttatatgatgaactgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggt 15992264  T
Q  304 gttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    | |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15992265 gatttgttcataagagtccatgcatagcatttcattgagtttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcct 15992339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 158 - 378
Target Start/End: Original strand, 10236396 - 10236630
Alignment:
Q  158 atgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcatagg-----tatat 251  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |      |||||    
T  10236396 atgatacaattgatgtgctattgatataatgatatcatcctgttatgtgacttgtttatgctgctgctgttatttaactaagtgcatggtgtatttatat 10236495  T
Q  252 gatgaa--------gtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagc 343  Q
    ||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||    
T  10236496 gatgaactgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcatagcatttcattgagc 10236595  T
Q  344 ttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10236596 ttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcct 10236630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 177 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 15825747 - 15825533
Alignment:
Q  177 ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcatagg-----tatatgatgaa--------gtttag 263  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||      |||||||||||        ||||||    
T  15825747 ttgatataatgatatcatcctgttatgtgacttgtttatgctgctgctgttatttaactaagtgcatagtgtatttatatgatgaaatgatgacgtttag 15825648  T
Q  264 ctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatat 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15825647 ctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcatagcatttcattgagcttagtcctcaccacgattat 15825548  T
Q  364 taggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||||||    
T  15825547 taggagctttgtcct 15825533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 19 - 378
Target Start/End: Original strand, 17710454 - 17710829
Alignment:
Q  19 gatcaagagtgaa-cccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatgaa 116  Q
    ||||||||||||| ||||| | || |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||| || |||||||| || |||||     
T  17710454 gatcaagagtgaaacccctta-tgataatgagacctattgatgacgtttaatgcagtctgtaaagttgtttaagatatgttgatattaattgagtatgat 17710552  T
Q  117 ctattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgctt-tgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttat 215  Q
     || ||||| ||| | |  || |||||| |||  | | || ||||||||| | |||||||  | |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  17710553 -taatgtatggtacaattatgtaagatatgaaagtttaattatgatacaattgatgtgctaataatataatgatatcatcctgttatgtgacctgattat 17710651  T
Q  216 gctgcttccgttatttaactaagtgcatag-gtatat--------------gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattac 300  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||              |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  17710652 gctgctgctgttatttaactaagtgcatagtgtatatatacatgatgaaatgatgacatttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattac 17710751  T
Q  301 gatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    | || |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17710752 ggtgatttgttcatatgagtccatgcatagcattccattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcct 17710829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 177 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 19809111 - 19808895
Alignment:
Q  177 ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcatag---------gtat------atgatgaagttt 261  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| | |||||| |||||||||||||          ||||      ||||| ||||||    
T  19809111 ttgatataatgatatcatcatgttatgtgacttgattatgctgctgctgttattgaactaagtgcatattgtatatgagtatgatgaaatgataaagttt 19809012  T
Q  262 agctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 361  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  19809011 agctccaaattattgaatgcatgttgatatgtcgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatttcattgagcttagtcctcaccacgatt 19808912  T
Q  362 attaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||||||||    
T  19808911 attaggagctttgtcct 19808895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 177 - 378
Target Start/End: Original strand, 13316209 - 13316422
Alignment:
Q  177 ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatat-------------gatgaagtttag 263  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| |||| || |||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||             ||||| ||||||    
T  13316209 ttgatataatgatattatcctgttatatgacttgattatgctgctgctgttatttgactaagtgcat-ggtatatttatacgatgaatgatgacgtttag 13316307  T
Q  264 ctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatat 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13316308 ctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatttcattgagcttagtcctcaccacgattat 13316407  T
Q  364 taggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||||||    
T  13316408 taggagctttgtcct 13316422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 177 - 378
Target Start/End: Original strand, 1145572 - 1145790
Alignment:
Q  177 ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcatagg---------tatatgatgaa--------gt 259  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||||| |          |||||||||||        ||    
T  1145572 ttgatataatgatatcatcctgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatgtatttatatatgatgaaatgatgacgt 1145671  T
Q  260 ttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacga 359  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  1145672 ttagctccaaattgttggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgt 1145771  T
Q  360 atattaggagctttgtcct 378  Q
     ||||||||||||||||||    
T  1145772 ttattaggagctttgtcct 1145790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 177 - 378
Target Start/End: Original strand, 8721176 - 8721394
Alignment:
Q  177 ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcatagg---------tatatgatgaa--------gt 259  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||||| |          |||||||||||        ||    
T  8721176 ttgatataatgatatcatcctgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatgtatttatatatgatgaaatgatgacgt 8721275  T
Q  260 ttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacga 359  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8721276 ttagctccaaattgttggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgt 8721375  T
Q  360 atattaggagctttgtcct 378  Q
     ||||||||||||||||||    
T  8721376 ttattaggagctttgtcct 8721394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 177 - 378
Target Start/End: Original strand, 9073063 - 9073281
Alignment:
Q  177 ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcatagg---------tatatgatgaa--------gt 259  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||||| |          |||||||||||        ||    
T  9073063 ttgatataatgatatcatcctgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatgtatttatatatgatgaaatgatgacgt 9073162  T
Q  260 ttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacga 359  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  9073163 ttagctccaaattgttggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgt 9073262  T
Q  360 atattaggagctttgtcct 378  Q
     ||||||||||||||||||    
T  9073263 ttattaggagctttgtcct 9073281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 177 - 378
Target Start/End: Original strand, 15343625 - 15343843
Alignment:
Q  177 ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcatagg---------tatatgatgaa--------gt 259  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||||| |          |||||||||||        ||    
T  15343625 ttgatataatgatatcatcctgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatgtatttatatatgatgaaatgatgacgt 15343724  T
Q  260 ttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacga 359  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15343725 ttagctccaaattgttggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgt 15343824  T
Q  360 atattaggagctttgtcct 378  Q
     ||||||||||||||||||    
T  15343825 ttattaggagctttgtcct 15343843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 177 - 378
Target Start/End: Original strand, 410771 - 410989
Alignment:
Q  177 ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcatagg---------tatatgatgaa--------gt 259  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||||| |          |||||||||||        ||    
T  410771 ttgatataatgatatcatcctgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatgtatttatatatgatgaaatgatgacgt 410870  T
Q  260 ttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacga 359  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  410871 ttagctccaagttgttggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgt 410970  T
Q  360 atattaggagctttgtcct 378  Q
     ||||||||||||||||||    
T  410971 ttattaggagctttgtcct 410989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 177 - 378
Target Start/End: Original strand, 15350269 - 15350487
Alignment:
Q  177 ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcatagg---------tatatgatgaa--------gt 259  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||||| |          |||||||||||        ||    
T  15350269 ttgatataatgatatcatcctgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatgtatttatatatgatgaaatgatgacgt 15350368  T
Q  260 ttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacga 359  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15350369 ttagctccaaattgttggatgcatgttgatatgttgattacgatgtttttttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgt 15350468  T
Q  360 atattaggagctttgtcct 378  Q
     ||||||||||||||||||    
T  15350469 ttattaggagctttgtcct 15350487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 177 - 378
Target Start/End: Original strand, 15397924 - 15398142
Alignment:
Q  177 ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcatagg---------tatatgatgaa--------gt 259  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||||| |          |||||||||||        ||    
T  15397924 ttgatataatgatatcatcctgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatatatttatatatgatgaaatgatgacgt 15398023  T
Q  260 ttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacga 359  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15398024 ttagctccaaattgttggatgcatgtcgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgt 15398123  T
Q  360 atattaggagctttgtcct 378  Q
     ||||||||||||||||||    
T  15398124 ttattaggagctttgtcct 15398142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 177 - 378
Target Start/End: Original strand, 15404515 - 15404733
Alignment:
Q  177 ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcatagg---------tatatgatgaa--------gt 259  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||||| |          |||||||||||        ||    
T  15404515 ttgatataatgatatcatcctgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatatatttatatatgatgaaatgatgacgt 15404614  T
Q  260 ttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacga 359  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15404615 ttagctccaaatttttggatgcatgtcgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgt 15404714  T
Q  360 atattaggagctttgtcct 378  Q
     ||||||||||||||||||    
T  15404715 ttattaggagctttgtcct 15404733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 4710544 - 4710168
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    ||||||||||| |||||||    || |||| ||||||| ||||| |||||||||||  ||||| || |||| ||| ||| || ||||| ||||| |||||    
T  4710544 ttgatcaagagcgaacccccttatgataataagacctaatgatgacgtttaatgcaatctgtaaagctgtttaagatatgttgatattgatcgactatga 4710445  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttta 214  Q
      || ||||||||| |||  || |||||| |||  | | || |||||| || | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||    
T  4710444 t-taatgtattgtacatttatgtaagatatgaaagtttaattatgatataattgatgtgctattgatataatgatatcatcctgttatgtgacttgatta 4710346  T
Q  215 tgctgcttccgttatttaactaagtgcatagg---------tatatgatgaa--------gtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgat 297  Q
    |||| ||   ||||||||||||||||||| |          |||||||||||        ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||    
T  4710345 tgctact---gttatttaactaagtgcattgtatatatttatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattgttggatgcatgttgatatgttgat 4710249  T
Q  298 tacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  4710248 tacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatttcattgagcttagtcttcaccacgtttattaggagctttgtcct 4710168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 250 - 378
Target Start/End: Original strand, 15367040 - 15367168
Alignment:
Q  250 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 349  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15367040 atgatgacgtttagctccaaattgtaggatgcatgttgatatgttgattacgattttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 15367139  T
Q  350 ctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  15367140 ctcaccacgtttattaggagctttgtcct 15367168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 177 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 15360776 - 15360558
Alignment:
Q  177 ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcatagg---------tatatgatgaa--------gt 259  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||||| |          |||||||||||        ||    
T  15360776 ttgatataatgatatcatcctgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatatatttatatatgatgaaatgatgacgt 15360677  T
Q  260 ttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacga 359  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||    
T  15360676 ttagctccaaattgttggatgcatgtcgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagctttgtcctccgcacga 15360577  T
Q  360 atattaggagctttgtcct 378  Q
     | ||||||||||||||||    
T  15360576 tttttaggagctttgtcct 15360558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 180 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 13321053 - 13320842
Alignment:
Q  180 atataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcatagg-----tatatgatgaa--------gtttagctc 266  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||       |||||||||||        |||||||||    
T  13321053 atatattgatatcatcctgttatgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaaatgatgacgtttagctc 13320954  T
Q  267 caaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgca-tagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatatta 365  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13320953 caaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattatta 13320855  T
Q  366 ggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||||    
T  13320854 ggagctttgtcct 13320842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 250 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 12891400 - 12891271
Alignment:
Q  250 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgca-tagcatctcattgagcttagt 348  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  12891400 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagt 12891302  T
Q  349 cctcaccacga-atattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  12891301 cctcaccacgatttattaggagctttgtcct 12891271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 250 - 378
Target Start/End: Original strand, 17253168 - 17253297
Alignment:
Q  250 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgca-tagcatctcattgagcttagt 348  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  17253168 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagt 17253266  T
Q  349 cctcaccacga-atattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  17253267 cctcaccacgatttattaggagctttgtcct 17253297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 177 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 15337518 - 15337300
Alignment:
Q  177 ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcatagg---------tatatgatgaagt-------- 259  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| || | ||||||||||||||||||| |          ||||||||||| |            
T  15337518 ttgatataatgatatcatcctgttatgtgacttgattatgctactgctgttatttaactaagtgcattgtatatatttatatatgatgaaatgatgacat 15337419  T
Q  260 ttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacga 359  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||    
T  15337418 ttagctccaaattgttggatgcatgtcgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagctttgtcctccgcacga 15337319  T
Q  360 atattaggagctttgtcct 378  Q
     | ||||||| ||||||||    
T  15337318 tttttaggagttttgtcct 15337300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 250 - 378
Target Start/End: Original strand, 30777335 - 30777464
Alignment:
Q  250 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcga-ttacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagt 348  Q
    ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30777335 atgatgacgtttagctccaagttgttggatgcatgttgatatgttgaattacgatgttttgttcatgagagtccatgcatagcatttcattgagcttagt 30777434  T
Q  349 cctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  30777435 cctcaccacgtttattagaagctttgtcct 30777464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 252 - 378
Target Start/End: Original strand, 5150078 - 5150204
Alignment:
Q  252 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataa-gtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcc 350  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5150078 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgacgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcc 5150176  T
Q  351 tcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  5150177 tcaccacgtttattaggagctttgtcct 5150204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 295 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 16633796 - 16633713
Alignment:
Q  295 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16633796 gattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcct 16633713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 295 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 16640406 - 16640323
Alignment:
Q  295 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16640406 gattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcct 16640323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 295 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 43161071 - 43160988
Alignment:
Q  295 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43161071 gattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcct 43160988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 295 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 43167308 - 43167225
Alignment:
Q  295 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43167308 gattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcct 43167225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 295 - 378
Target Start/End: Original strand, 1333221 - 1333304
Alignment:
Q  295 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1333221 gattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcataacattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcct 1333304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 295 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 48423313 - 48423230
Alignment:
Q  295 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  48423313 gattatgatgttttgttcatctgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcct 48423230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 252 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 7985699 - 7985573
Alignment:
Q  252 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcc 350  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||| ||  ||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  7985699 gatgacgtttagctccaaattattgggtgcatgttgatatgatgattacggtgaattgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 7985601  T
Q  351 tcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7985600 tcaccacgattattaggagctttgtcct 7985573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 295 - 378
Target Start/End: Original strand, 15584872 - 15584955
Alignment:
Q  295 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15584872 gattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 15584955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 295 - 378
Target Start/End: Original strand, 15591530 - 15591613
Alignment:
Q  295 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15591530 gattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 15591613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 252 - 378
Target Start/End: Original strand, 41092456 - 41092582
Alignment:
Q  252 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataa-gtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcc 350  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41092456 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcc 41092554  T
Q  351 tcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||||    
T  41092555 tcaccacgtttattaggagccttgtcct 41092582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 295 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 48430091 - 48430008
Alignment:
Q  295 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  48430091 gattatgatgttttgttcatctgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacggaaattaggagctttgtcct 48430008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 252 - 373
Target Start/End: Original strand, 28351277 - 28351398
Alignment:
Q  252 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcc 350  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||| ||  ||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  28351277 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacggtgaattgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 28351375  T
Q  351 tcaccacgaatattaggagcttt 373  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  28351376 tcaccacgattattaggagcttt 28351398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 252 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 10325844 - 10325719
Alignment:
Q  252 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcc 350  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |  ||||||||| ||||||| ||| | || ||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  10325844 gatgacgtttagctccaaattattggatgcttattgatatgatgattacgattttttgttgata-gagttcatgcattagcat-tcattgagtttagtcc 10325747  T
Q  351 tcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10325746 tcaccacgattattaggagctttgtcct 10325719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 252 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 16333165 - 16333039
Alignment:
Q  252 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgca-tagcatctcattgagcttagtcc 350  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||| ||  ||||| ||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  16333165 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacggtgaattgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 16333067  T
Q  351 tcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  16333066 tcaccacgattatcaggagttttgtcct 16333039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 252 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 20722996 - 20722875
Alignment:
Q  252 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgca-tagcatctcattgagcttagtcc 350  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  20722996 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacgatgttttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 20722899  T
Q  351 tcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||| ||    |||||||||||||||    
T  20722898 tcaccatga----taggagctttgtcct 20722875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 252 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 24187772 - 24187651
Alignment:
Q  252 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgca-tagcatctcattgagcttagtcc 350  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  24187772 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacgatgttttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 24187675  T
Q  351 tcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||| ||    |||||||||||||||    
T  24187674 tcaccatga----taggagctttgtcct 24187651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 252 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 55148973 - 55148852
Alignment:
Q  252 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgca-tagcatctcattgagcttagtcc 350  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  55148973 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacgatgttttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 55148876  T
Q  351 tcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||| ||    |||||||||||||||    
T  55148875 tcaccatga----taggagctttgtcct 55148852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 250 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 7109464 - 7109330
Alignment:
Q  250 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 340  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  7109464 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 7109365  T
Q  341 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  7109364 agctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcct 7109330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 250 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 7113399 - 7113265
Alignment:
Q  250 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 340  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  7113399 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 7113300  T
Q  341 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  7113299 agctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcct 7113265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 250 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 11069836 - 11069702
Alignment:
Q  250 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 340  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  11069836 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 11069737  T
Q  341 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  11069736 agctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcct 11069702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 250 - 378
Target Start/End: Original strand, 11165870 - 11166004
Alignment:
Q  250 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 340  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  11165870 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 11165969  T
Q  341 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  11165970 agctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcct 11166004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 250 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 22321432 - 22321298
Alignment:
Q  250 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 340  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  22321432 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 22321333  T
Q  341 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  22321332 agctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcct 22321298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 250 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 22336487 - 22336353
Alignment:
Q  250 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 340  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  22336487 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 22336388  T
Q  341 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  22336387 agctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcct 22336353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 250 - 378
Target Start/End: Original strand, 27409985 - 27410119
Alignment:
Q  250 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 340  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  27409985 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 27410084  T
Q  341 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  27410085 agctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcct 27410119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 250 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 55022633 - 55022499
Alignment:
Q  250 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 340  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  55022633 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 55022534  T
Q  341 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  55022533 agctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcct 55022499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 298 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 6608424 - 6608343
Alignment:
Q  298 tacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacg-aatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||||||||||||   | | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6608424 tacgatgttttgttataaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaatattaggagctttgtcct 6608343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 252 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 839242 - 839135
Alignment:
Q  252 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgca-tagcatctcattgagcttagtcc 350  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |  ||||||| || |||||| ||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  839242 gatgacgtttagctccaaattattggatgcacattgatatgatgattacggtgatttgttgataagagtccatgcattagca-ctcattgagcttagtcc 839144  T
Q  351 tcaccacga 359  Q
    |||||||||    
T  839143 tcaccacga 839135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 295 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 5201181 - 5201097
Alignment:
Q  295 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacg-aatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  5201181 gattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcct 5201097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 295 - 378
Target Start/End: Original strand, 5426864 - 5426948
Alignment:
Q  295 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacg-aatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  5426864 gattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcct 5426948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 295 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 12482383 - 12482299
Alignment:
Q  295 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacg-aatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  12482383 gattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcct 12482299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 250 - 378
Target Start/End: Original strand, 4107740 - 4107874
Alignment:
Q  250 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 340  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  4107740 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatattgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 4107839  T
Q  341 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  4107840 agctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcct 4107874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 250 - 378
Target Start/End: Original strand, 4111592 - 4111726
Alignment:
Q  250 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 340  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  4111592 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatattgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 4111691  T
Q  341 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  4111692 agctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcct 4111726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 250 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 14499093 - 14498959
Alignment:
Q  250 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 340  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  14499093 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattatgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 14498994  T
Q  341 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  14498993 agctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcct 14498959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 250 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 15617142 - 15617008
Alignment:
Q  250 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 340  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  15617142 atgatgacatttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 15617043  T
Q  341 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  15617042 agctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcct 15617008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 250 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 28949490 - 28949356
Alignment:
Q  250 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacga---------tgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 340  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||         |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  28949490 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 28949391  T
Q  341 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||| |||||||||| |   |||||||||||||||||    
T  28949390 agctttgtcctcaccatg---attaggagctttgtcct 28949356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 250 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 30065716 - 30065582
Alignment:
Q  250 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacga---------tgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 340  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||         ||| |||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  30065716 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgtcttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 30065617  T
Q  341 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  30065616 agctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcct 30065582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 251 - 378
Target Start/End: Original strand, 4589289 - 4589413
Alignment:
Q  251 tgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacga-tgttttgttcatatgtgtccatgca-tagcatctcattgagcttagt 348  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |  || ||||| ||||||||| ||| | ||||||||| |||||| ||||||||||| ||    
T  4589289 tgatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgaatacgattgttttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgt 4589386  T
Q  349 cctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||| |||||   |||||||||||||||||    
T  4589387 cctccccacg---attaggagctttgtcct 4589413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 378
Target Start/End: Original strand, 16750684 - 16750817
Alignment:
Q  251 tgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattga 341  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| |||||||    
T  16750684 tgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgataatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattga 16750783  T
Q  342 gcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||| ||||||||||||    ||||||||||||||||    
T  16750784 gctttgtcctcaccacg---tttaggagctttgtcct 16750817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 17 - 106
Target Start/End: Original strand, 5426563 - 5426652
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgttaagttattttaatattaat 106  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||  |||||||||||| ||||| || | ||||| ||| || ||||||||    
T  5426563 ttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgataacgtttaatgcagtctgtaaagctattaagatatgttgatattaat 5426652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 295 - 378
Target Start/End: Original strand, 5420457 - 5420541
Alignment:
Q  295 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccac-gaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||||||||  || | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||    
T  5420457 gattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatatcatatcattgagcttagtcctcaccacattttattaggagctttgtcct 5420541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 264 - 378
Target Start/End: Original strand, 11300871 - 11300986
Alignment:
Q  264 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 361  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||| ||||| | ||| ||||| ||| | |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| |    
T  11300871 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaaggtgtcttgttgataagagtccatgcattagcat-tcactgagcttagtcctcaccacgatt 11300969  T
Q  362 attaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||| ||||||||    
T  11300970 attaggagttttgtcct 11300986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 251 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 19775358 - 19775242
Alignment:
Q  251 tgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattga 341  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| |||||||    
T  19775358 tgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgataatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattga 19775259  T
Q  342 gcttagtcctcaccacg 358  Q
    |||| ||||||||||||    
T  19775258 gctttgtcctcaccacg 19775242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 839491 - 839436
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgca 72  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  839491 ttgatcaagagtgaacccctaagtggtaatgagaccttatgatgacgtttaatgca 839436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 72
Target Start/End: Original strand, 15692138 - 15692193
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgca 72  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  15692138 ttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatgacgtttaatgca 15692193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 20723246 - 20723191
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgca 72  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  20723246 ttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatgacgtttaatgca 20723191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 24188022 - 24187967
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgca 72  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  24188022 ttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatgacgtttaatgca 24187967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 72
Target Start/End: Original strand, 41201658 - 41201713
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgca 72  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  41201658 ttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatgacgtttaatgca 41201713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 177 - 243
Target Start/End: Original strand, 30777245 - 30777311
Alignment:
Q  177 ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcat 243  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| || | |||||||||| ||||||||    
T  30777245 ttgatataatgatatcatcctgttatgtgacttgattatgcttctgctgttatttaaccaagtgcat 30777311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 264 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 38814385 - 38814274
Alignment:
Q  264 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 361  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||||| ||||| |||||||||||  || | |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||       
T  38814385 ctccaaattattggatgtatatgtgataagttgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccacg--- 38814291  T
Q  362 attaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||||||||    
T  38814290 attaggagctttgtcct 38814274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 106
Target Start/End: Original strand, 5420165 - 5420254
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgttaagttattttaatattaat 106  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||  |||||||||||| ||||| || | ||||| ||| || ||||||||    
T  5420165 ttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacataatgataacgtttaatgcagtctgtaaagctattaagatatgttgatattaat 5420254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 17 - 73
Target Start/End: Original strand, 15584580 - 15584636
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcag 73  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||  ||||||||||||    
T  15584580 ttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgagaccttatgataacgtttaatgcag 15584636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 17 - 73
Target Start/End: Original strand, 15591238 - 15591294
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcag 73  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||  ||||||||||||    
T  15591238 ttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgagaccttatgataacgtttaatgcag 15591294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 72
Target Start/End: Original strand, 5149828 - 5149883
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgca 72  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||||||||    
T  5149828 ttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacataatgatgacgtttaatgca 5149883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 244
Target Start/End: Original strand, 5149989 - 5150056
Alignment:
Q  177 ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcata 244  Q
    ||||||||||||||||||| | || |||||| |  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  5149989 ttgatataatgatatcatcctattgtgtgacttaattatgctgctgctgttatttaactaagtgcata 5150056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 7985951 - 7985897
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgca 72  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  7985951 ttgatcaagagtgaacccctta-tggtaatgagacctaatgatgacgtttaatgca 7985897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 72
Target Start/End: Original strand, 15726792 - 15726847
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgca 72  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||| |||||||||||    
T  15726792 ttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaattatgacgtttaatgca 15726847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 55149223 - 55149168
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgca 72  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||    
T  55149223 ttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatgacgtgtaatgca 55149168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 15360938 - 15360876
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgta 79  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||| ||||||| ||||| |||| ||||||| |||||    
T  15360938 ttgatcaagagtgaacccctaattgataataagacctaatgatgacgttaaatgcagtctgta 15360876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 177 - 243
Target Start/End: Original strand, 15366950 - 15367016
Alignment:
Q  177 ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcat 243  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||| || | | |||||||||||||||||||    
T  15366950 ttgatttaatgatatcatcctgttatgtgacttgattatgatgttgctgttatttaactaagtgcat 15367016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 79
Target Start/End: Original strand, 15397762 - 15397824
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgta 79  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||| ||||||| ||||| |||| ||||||| |||||    
T  15397762 ttgatcaagagtgaacccctaattgataataagacctaatgatgacgttaaatgcagtctgta 15397824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 79
Target Start/End: Original strand, 15404353 - 15404415
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgta 79  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||| ||||||| ||||| |||| ||||||| |||||    
T  15404353 ttgatcaagagtgaacccctaattgataataagacctaatgatgacgttaaatgcagtctgta 15404415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 71
Target Start/End: Original strand, 23704629 - 23704683
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgc 71  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  23704629 ttgatcaagagtgaacccctaattagtaatgaaacctaatgatgacgtttaatgc 23704683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 71
Target Start/End: Original strand, 23723085 - 23723139
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgc 71  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  23723085 ttgatcaagagtgaacccctaattagtaatgaaacctaatgatgacgtttaatgc 23723139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 71
Target Start/End: Original strand, 23741541 - 23741595
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgc 71  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  23741541 ttgatcaagagtgaacccctaattagtaatgaaacctaatgatgacgtttaatgc 23741595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 177 - 243
Target Start/End: Original strand, 41092367 - 41092433
Alignment:
Q  177 ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcat 243  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||| || || |||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  41092367 ttgatataatgatagcattctgttatgtaacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcat 41092433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 12482674 - 12482585
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgttaagttattttaatattaat 106  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||  |||||||||||| ||||| || | ||||| ||| || ||||||||    
T  12482674 ttgatcaggagtgaacccctaattggtaatgaaaccttatgataacgtttaatgcagtctgtaaagctattaagatatgttgatattaat 12482585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 7985791 - 7985721
Alignment:
Q  177 ttgatataatgatatcatc---ttgttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcata 244  Q
    |||||||||||||||||||   ||||| |||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  7985791 ttgatataatgatatcatcctgttgttgtgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcata 7985721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 13321215 - 13321155
Alignment:
Q  19 gatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgta 79  Q
    |||||||||||||||||    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  13321215 gatcaagagtgaacccccttatggtaatgagacctaatgatgacgtttaatgcagtctgta 13321155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 16333257 - 16333187
Alignment:
Q  177 ttgatataatgatatcatc---ttgttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcata 244  Q
    |||||||||||||||||||   ||||| |||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  16333257 ttgatataatgatatcatcctgttgttgtgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcata 16333187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 19809272 - 19809204
Alignment:
Q  19 gatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt 87  Q
    ||||||||||||||||||   || |||||||||||| ||||| |||| ||||||| |||||||| ||||    
T  19809272 gatcaagagtgaacccctttatgataatgagacctaatgatgacgttaaatgcagtctgtagagctgtt 19809204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 17 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 16333418 - 16333363
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgca 72  Q
    ||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  16333418 ttgatcaagagtgaatccctttatggtaatgagacctaatgatgacgtttaatgca 16333363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 5201469 - 5201380
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgttaagttattttaatattaat 106  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||  ||||||| |||| ||||| || | ||||| ||| || ||||||||    
T  5201469 ttgatcaggagtgaacccctaattggtaatgaaaccttatgataacgtttaaagcagtctgtaaagctattaagatatgttgatattaat 5201380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 15337676 - 15337619
Alignment:
Q  20 atcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactg 77  Q
    ||||||||||||||||||| || |||| ||||||| ||||| |||| ||||||| |||    
T  15337676 atcaagagtgaacccctaattgataataagacctaatgatgacgttaaatgcagtctg 15337619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 79
Target Start/End: Original strand, 10236256 - 10236316
Alignment:
Q  19 gatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgta 79  Q
    |||||||||||||||||    || |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  10236256 gatcaagagtgaacccccttatgataatgagacctaatgatgacgtttaatgcagtctgta 10236316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 177 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 10325937 - 10325867
Alignment:
Q  177 ttgatataatgatatcatc---ttgttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcata 244  Q
    |||||||||||||||||||   ||||| |||||| ||  ||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  10325937 ttgatataatgatatcatcctgttgttgtgtgacttgactatgctgctgctattatttaactaagtgcata 10325867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 319 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 11854417 - 11854358
Alignment:
Q  319 gtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||    
T  11854417 gtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgacgattagcagctttatcct 11854358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 15825907 - 15825847
Alignment:
Q  19 gatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgta 79  Q
    |||||||||||||||||    || |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  15825907 gatcaagagtgaacccccttatgataatgagacctaatgatgacgtttaatgcagtctgta 15825847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 319; Significance: 1e-180; HSPs: 60)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Original strand, 20215789 - 20216150
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  20215789 ttgatcaagagtgaacccccaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtttaagttatattaatattaattgaatatga 20215888  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgctttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttat 215  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20215889 actattgtattgtatattcatgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgctttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttat 20215988  T
Q  216 gctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcata 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20215989 gctgcttccgttatttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagt-gattacgatgttttgttcata 20216087  T
Q  316 tgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20216088 tgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 20216150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Original strand, 44844744 - 44845107
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||| ||    
T  44844744 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgttgtttaatgcagactgtagagttgtttaagttatattaatattaattggataaga 44844843  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttta 214  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  44844844 actattgtattgtatattcatgcaaaatgagaagatgtgataataatgcaatttatgtgctattgatataatgatatcatcttgatatgtgacttgttta 44844943  T
Q  215 tgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcat 314  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44844944 tgctgcttccgttgtttaactaagtgcataagtctatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgttttgttcat 44845043  T
Q  315 atgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44845044 atgtgtccgtgcatagcatatcattgagctttgtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcct 44845107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Original strand, 51328539 - 51328902
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgttaag-ttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || |||| || |||||||| ||||||||    
T  51328539 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaggttatattgatattaattgaatatga 51328638  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttta 214  Q
    | || |||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||| || ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  51328639 attaatgtattgtatattcatgcaagatatgaaggtttgataataatgcaatttatgtgctattgatataataatatcatcttgatatgtgacttgttta 51328738  T
Q  215 tgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttga-taagtcgattacgatgttttgttca 313  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||||||      
T  51328739 tgctgcttccgttgtttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgttgattacg-tgttttgttgt 51328837  T
Q  314 tatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  51328838 taagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcct 51328902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Original strand, 51335173 - 51335536
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgttaag-ttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || |||| || |||||||| ||||||||    
T  51335173 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaggttatattgatattaattgaatatga 51335272  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttta 214  Q
    | || |||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||| || ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  51335273 attaatgtattgtatattcatgcaagatatgaaggtttgataataatgcaatttatgtgctattgatataataatatcatcttgatatgtgacttgttta 51335372  T
Q  215 tgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttga-taagtcgattacgatgttttgttca 313  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||||||      
T  51335373 tgctgcttccgttgtttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgttgattacg-tgttttgttgt 51335471  T
Q  314 tatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  51335472 taagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcct 51335536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 47659462 - 47659096
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt--aagt-tattttaatattaatcgaatat 113  Q
    |||||||||||||||||||||| | | | |||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||  |||  ||| || |||||||| || |||    
T  47659462 ttgatcaagagtgaacccctaattagcattgagacctagtgatgatgtttactgcagcctgtagagttgtttaaagactatattgatattaattgagtat 47659363  T
Q  114 gaactattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgtt-atgtgacctgt 211  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||  ||| |  |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  47659362 gaactaatgtattgtatattcatgcaagatgtgaaaacttgataatgatgcaatttatgtgctattgatataatgatatcattttgtttatgtgatctgt 47659263  T
Q  212 ttatgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgtt 311  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  47659262 ttatgctgcttccgttgtttaactaagtgcataagtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgttttgtt 47659163  T
Q  312 catatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  47659162 catatgtgtccatgcatagcataacattgagctttgtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcct 47659096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Original strand, 16345635 - 16345998
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || ||||| || ||  | ||    
T  16345635 ttgatcaagagtgaacccctaattggtattgagacctagtgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagttatattgatattcattgagcaaga 16345734  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttta 214  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||| || ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| ||  ||||||    
T  16345735 actaatgtattgtatattcatgcaagatatgaaggtttgataataatgcaatttatgtgctattgatataaagatatcatcttgatatgagatttgttta 16345834  T
Q  215 tgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttga-taagtcgattacgatgttttgttca 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||| |||||||||||    
T  16345835 tgctgcttccgttatttaactaagtgcatatgtatatgataaggtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttttgttca 16345933  T
Q  314 tatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16345934 taagtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcct 16345998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Original strand, 41348711 - 41349075
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagt-tattttaatattaatcgaatatg 114  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||| |||  ||| || |||||||| || ||||    
T  41348711 ttgatcaagagtgaacccctaattggtattgagacctagtgatgatgtttactgcagcctgtagagttgtttaagactatattgatattaattgagtatg 41348810  T
Q  115 aactattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgctt-tgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttt 213  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||| || ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  41348811 aactaatgtattgtatattcatgcaagatatgaaggtttgataataatgcaatttatgtgctaatgatataatgatatcatcttgctgtgtgacttgttt 41348910  T
Q  214 atgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttga-taagtcgattacgatgttttgttc 312  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||| ||||||||||    
T  41348911 atgctgcttctgttatttaactaagtgcatatgtatatgataaggtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttttgttc 41349009  T
Q  313 atatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41349010 ataagtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 41349075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Original strand, 16352283 - 16352647
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || ||||| || ||  | ||    
T  16352283 ttgatcaagagtgaacccctaattggtattgagacctagtgatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagttatattgatattcattgagcaaga 16352382  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttta 214  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||| || ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| ||  ||||||    
T  16352383 actaatgtattgtatattcatgcaagatatgaaggtttgataataatgcaatttatgtgctattgatataaagatatcatcttgatatgagatttgttta 16352482  T
Q  215 tgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttga-taagtcgattacgatgttttgttca 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||| |||||||||||    
T  16352483 tgctgcttccgttatttaactaagtgcatatgtatatgataaggtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttttgttca 16352581  T
Q  314 tatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatatt-aggagctttgtcct 378  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  16352582 taagtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaaggagctttgtcct 16352647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Original strand, 41356148 - 41356512
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagt-tattttaatattaatcgaatatg 114  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||| |||  ||| || |||||||| || ||||    
T  41356148 ttgatcaagagtgaacccctaattggtattgagacctagtgatgatgtttactgcagcctgtagagttgtttaagactatattgatattaattgagtatg 41356247  T
Q  115 aactattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgctt-tgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttt 213  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||| || ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  41356248 aactaatgtattgtatattcatgcaagatatgaaggtttgataataatgcaatttatgtgctaatgatataatgatatcatcttgctgtgtgacttgttt 41356347  T
Q  214 atgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttga-taagtcgattacgatgttttgttc 312  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| || |  ||||||| ||||||||||    
T  41356348 atgctgcttctgttatttaactaagtgcatatgtatatgataaggtttagcttcaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttttgttc 41356446  T
Q  313 atatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41356447 ataagtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 41356512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Original strand, 41478438 - 41478801
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||  ||| ||||    
T  41478438 ttgatcaagagtgaacccctagttggtattaagacctaatgatgacgtttaatgcagtctgtagagttgtttaagttatgttgatattaaatgaacatga 41478537  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgtt-atgtgacctgttt 213  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||| |  |   | ||||  ||| |||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  41478538 actaatgtattgtatattcatgcaagatacgaaggt-tgatattcctgatatttataagctattgataaaatgatatcaccttgtttatgtgatctgttt 41478636  T
Q  214 atgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgtttt-gttc 312  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  41478637 atgctgctttcgttatttaactaagtgcataagtttatgatgaagtt-agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgtttttgttc 41478735  T
Q  313 atatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41478736 ataagtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaataataggagctttgtcct 41478801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Original strand, 18599966 - 18600329
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    ||||||||||| ||||||| |  ||||| | ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||  | | ||||    
T  18599966 ttgatcaagagcgaacccccagttggtattaagacctaatgatgacgtttaatgcagtctgtagagttgtttaagttatgttgatattaaatggacatga 18600065  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgtt-atgtgacctgttt 213  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||| | |||| | ||||| |  |   | ||||  ||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  18600066 actaatgtattgtatattcatgcaagaaatgaaggt-tgatattcctgatatttataagctattgatataatgatatcattttgtttatgtgatctgttt 18600164  T
Q  214 atgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgtttt-gttc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  18600165 atgctgcttccgttatttaactaagtgcataagtttatgatgaagtt-agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgtttttgttc 18600263  T
Q  313 atatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18600264 ataagtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaataataggagctttgtcct 18600329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 181 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 21828793 - 21828596
Alignment:
Q  181 tataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatg 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21828793 tataatgatatcatcttgttatgtgacttgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcatatgtatatgatgaattttagctccaaattattggatg 21828694  T
Q  281 catgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||| || |||||||  ||||||||  || | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  21828693 catgttgatatgttgattacggcgttttgttgttaagagtccatgcataacatatcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcct 21828596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 181 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 21844306 - 21844140
Alignment:
Q  181 tataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatg 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21844306 tataatgatatcatcttgttatgtgacttgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcatatgtatatgatgaagtttagctccaaattattggatg 21844207  T
Q  281 catgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttag 347  Q
    |||||||||| || |||||||  ||||||||  || | ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21844206 catgttgatatgttgattacggcgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttag 21844140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 177 - 378
Target Start/End: Original strand, 21807221 - 21807439
Alignment:
Q  177 ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcatagg---------tatatgatgaa--------gt 259  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||||| |          |||||||||||        ||    
T  21807221 ttgatataatgatatcatcctgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatgtatttatatatgatgaaatgatgatgt 21807320  T
Q  260 ttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacga 359  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21807321 ttagctccaaattgttggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgt 21807420  T
Q  360 atattaggagctttgtcct 378  Q
     ||||||||||||||||||    
T  21807421 ttattaggagctttgtcct 21807439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 177 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 21835451 - 21835233
Alignment:
Q  177 ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcatagg---------tatatgatgaa--------gt 259  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||||| |          |||||||||||        ||    
T  21835451 ttgatataatgatatcatcctgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatgtatttatatatgatgaaatgatgatgt 21835352  T
Q  260 ttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacga 359  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21835351 ttagctccaaattgttggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgt 21835252  T
Q  360 atattaggagctttgtcct 378  Q
     ||||||||||||||||||    
T  21835251 ttattaggagctttgtcct 21835233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 177 - 378
Target Start/End: Original strand, 33386244 - 33386462
Alignment:
Q  177 ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcatagg---------tatatgatgaa--------gt 259  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||||| |          |||||||||||        ||    
T  33386244 ttgatataatgatatcatcctgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatgtatttatatatgatgaaatgatgacgt 33386343  T
Q  260 ttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacga 359  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  33386344 ttagctccaaattgttggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgt 33386443  T
Q  360 atattaggagctttgtcct 378  Q
     ||||||||||||||||||    
T  33386444 ttattaggagctttgtcct 33386462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 177 - 378
Target Start/End: Original strand, 33392889 - 33393107
Alignment:
Q  177 ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcatagg---------tatatgatgaa--------gt 259  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||||| |          |||||||||||        ||    
T  33392889 ttgatataatgatatcatcctgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatgtatttatatatgatgaaatgatgacgt 33392988  T
Q  260 ttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacga 359  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  33392989 ttagctccaaattgttggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgt 33393088  T
Q  360 atattaggagctttgtcct 378  Q
     ||||||||||||||||||    
T  33393089 ttattaggagctttgtcct 33393107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 250 - 378
Target Start/End: Original strand, 50887864 - 50887993
Alignment:
Q  250 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgca-tagcatctcattgagcttagt 348  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  50887864 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagt 50887962  T
Q  349 cctcaccacga-atattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  50887963 cctcaccacgatttattaggagctttgtcct 50887993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 295 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 43078384 - 43078301
Alignment:
Q  295 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43078384 gattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcct 43078301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 295 - 378
Target Start/End: Original strand, 46157482 - 46157565
Alignment:
Q  295 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  46157482 gattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcct 46157565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 252 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 19111402 - 19111276
Alignment:
Q  252 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcc 350  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||| || |||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  19111402 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 19111304  T
Q  351 tcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19111303 tcaccacgattattaggagctttgtcct 19111276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 252 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 19104745 - 19104619
Alignment:
Q  252 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgca-tagcatctcattgagcttagtcc 350  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||| || |||||| ||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  19104745 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 19104647  T
Q  351 tcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  19104646 tcaccacggttattaggagctttgtcct 19104619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 250 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 8305138 - 8305009
Alignment:
Q  250 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgca-tagcatctcattgagcttagt 348  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| || |||||| ||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  8305138 atgatgacgtttaggtccaaattattggatgcatattgatatgttgattacggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagt 8305040  T
Q  349 cctcaccacga-atattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  8305039 cctcaccacgatttattaggagctttgtcct 8305009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 252 - 378
Target Start/End: Original strand, 20525328 - 20525454
Alignment:
Q  252 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcc 350  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||   |||||||||  ||   |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  20525328 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattattgtgttttgttgttaatagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 20525426  T
Q  351 tcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20525427 tcaccacgattattaggagctttgtcct 20525454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 252 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 23763206 - 23763085
Alignment:
Q  252 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgca-tagcatctcattgagcttagtcc 350  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  23763206 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacgatgttttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 23763109  T
Q  351 tcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||| ||    |||||||||||||||    
T  23763108 tcaccatga----taggagctttgtcct 23763085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 250 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 1010488 - 1010354
Alignment:
Q  250 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 340  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  1010488 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 1010389  T
Q  341 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  1010388 agctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcct 1010354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 250 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 21407120 - 21406986
Alignment:
Q  250 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 340  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  21407120 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 21407021  T
Q  341 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  21407020 agctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcct 21406986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 250 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 52639306 - 52639172
Alignment:
Q  250 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 340  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  52639306 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 52639207  T
Q  341 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  52639206 agctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcct 52639172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 252 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 21437789 - 21437686
Alignment:
Q  252 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgca-tagcatctcattgagcttagtcc 350  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||| ||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  21437789 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacgatgatttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 21437692  T
Q  351 tcacca 356  Q
    ||||||    
T  21437691 tcacca 21437686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 295 - 378
Target Start/End: Original strand, 18626436 - 18626520
Alignment:
Q  295 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacg-aatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  18626436 gattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcct 18626520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 295 - 378
Target Start/End: Original strand, 27898811 - 27898895
Alignment:
Q  295 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacg-aatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  27898811 gattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcct 27898895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 295 - 378
Target Start/End: Original strand, 43063428 - 43063512
Alignment:
Q  295 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacg-aatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  43063428 gattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcct 43063512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 295 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 44756059 - 44755975
Alignment:
Q  295 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacg-aatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  44756059 gattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcct 44755975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 295 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 49334526 - 49334442
Alignment:
Q  295 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacg-aatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  49334526 gattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcct 49334442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 296 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 33385023 - 33384940
Alignment:
Q  296 attacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacg-aatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||||||||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  33385023 attacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcct 33384940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 251 - 378
Target Start/End: Original strand, 39244237 - 39244370
Alignment:
Q  251 tgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattga 341  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| |||||||    
T  39244237 tgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgataatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattga 39244336  T
Q  342 gcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||| ||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  39244337 gctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcct 39244370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 251 - 378
Target Start/End: Original strand, 39247792 - 39247925
Alignment:
Q  251 tgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattga 341  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| |||||||    
T  39247792 tgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgataatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattga 39247891  T
Q  342 gcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||| ||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  39247892 gctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcct 39247925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 250 - 378
Target Start/End: Original strand, 16375798 - 16375933
Alignment:
Q  250 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacga---------tgttttgttcatatgtgtccatgcatagc-atctcatt 339  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||         |||||||||  || | ||||||||||||| || |||||    
T  16375798 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagctatttcatt 16375897  T
Q  340 gagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  16375898 gagctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcct 16375933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 251 - 358
Target Start/End: Original strand, 41388337 - 41388453
Alignment:
Q  251 tgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattga 341  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| |||||||    
T  41388337 tgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgataatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattga 41388436  T
Q  342 gcttagtcctcaccacg 358  Q
    |||| ||||||||||||    
T  41388437 gctttgtcctcaccacg 41388453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 23763456 - 23763401
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgca 72  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  23763456 ttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatgacgtttaatgca 23763401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 19111655 - 19111593
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgta 79  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||  ||||||||||| |||||    
T  19111655 ttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgagacctaataatgatgtttaatgcagtctgta 19111593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 264 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 46975468 - 46975357
Alignment:
Q  264 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 361  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||||| ||||| |||||||||||  || | |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||       
T  46975468 ctccaaattattggatgtatatgtgataagttgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccacg--- 46975374  T
Q  362 attaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||||||||    
T  46975373 attaggagctttgtcct 46975357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 19063765 - 19063704
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgt 78  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||  ||||||||||| ||||    
T  19063765 ttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgagacctaataatgatgtttaatgcagtctgt 19063704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 104
Target Start/End: Original strand, 18626135 - 18626222
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgttaagttattttaatatta 104  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||  ||||||| |||  ||||| || | ||||||||| || ||||||    
T  18626135 ttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgataacgtttaaagcaatctgtaaagctattaagttatgttgatatta 18626222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 21828959 - 21828904
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgca 72  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||  ||||||||||    
T  21828959 ttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatgatgtttaatgca 21828904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 19104998 - 19104936
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgta 79  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | |||  ||||||||||| |||||    
T  19104998 ttgatcaaaagtgaacccctaattggtaatgagacctaataatgatgtttaatgcagtctgta 19104936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 378
Target Start/End: Original strand, 20229333 - 20229458
Alignment:
Q  259 tttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||         |||||||  || | |||||||| |||||| ||||||||||| |||    
T  20229333 tttagctccaaattattggatgcatgataatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcttagcatttcattgagctttgtc 20229432  T
Q  350 ctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||    ||||||||||||||||    
T  20229433 ctcaccacg---tttaggagctttgtcct 20229458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 106
Target Start/End: Original strand, 27898520 - 27898609
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgttaagttattttaatattaat 106  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||  |||||||||||| ||||| || | ||||| ||| || ||||||||    
T  27898520 ttgatcaggagtgaacccctaattggtaatgaaaccttatgataacgtttaatgcagtctgtaaagctattaagatatgttgatattaat 27898609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 106
Target Start/End: Original strand, 43063137 - 43063226
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgttaagttattttaatattaat 106  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||  |||||||||||| ||||| || | ||||| ||| || ||||||||    
T  43063137 ttgatcaggagtgaacccctaattggtaatgaaaccttatgataacgtttaatgcagtctgtaaagctattaagatatgttgatattaat 43063226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 44756350 - 44756261
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgttaagttattttaatattaat 106  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||  |||||||||||| ||||| || | ||||| ||| || ||||||||    
T  44756350 ttgatcaggagtgaacccctaattggtaatgaaaccttatgataacgtttaatgcagtctgtaaagctattaagatatgttgatattaat 44756261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 49334817 - 49334728
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgttaagttattttaatattaat 106  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||  |||||||||||| ||||| || | ||||| ||| || ||||||||    
T  49334817 ttgatcaggagtgaacccctaattggtaatgaaaccttatgataacgtttaatgcagtctgtaaagctattaagatatgttgatattaat 49334728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 19104837 - 19104767
Alignment:
Q  177 ttgatataatgatatcatc---ttgttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcata 244  Q
    |||||||||||||||||||   ||||| |||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  19104837 ttgatataatgatatcatcatgttgttgtgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcata 19104767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 17 - 72
Target Start/End: Original strand, 20525076 - 20525131
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgca 72  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  20525076 ttgatcaaaagtgaatccctaattggtaatgagacctaatgatgatgtttaatgca 20525131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 17 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 21438039 - 21437984
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgca 72  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||  ||||||||||    
T  21438039 ttgatcaagagtgaacccctatttggtaatgaaacctaatgatgaagtttaatgca 21437984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 17 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 21844472 - 21844429
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 60  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  21844472 ttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatg 21844429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 264 - 378
Target Start/End: Original strand, 1925519 - 1925630
Alignment:
Q  264 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 361  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||| ||||| | ||| ||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||       
T  1925519 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaaggtgtcttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccacg--- 1925613  T
Q  362 attaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||||||||    
T  1925614 attaggagctttgtcct 1925630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 264 - 378
Target Start/End: Original strand, 20924533 - 20924644
Alignment:
Q  264 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 361  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||| ||||| | ||| ||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||       
T  20924533 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaaggtgtcttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccacg--- 20924627  T
Q  362 attaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||||||||    
T  20924628 attaggagctttgtcct 20924644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 33394092 - 33394003
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgttaagttattttaatattaat 106  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||  ||||  |||||||||||| ||||| || | ||||| ||| || ||||||||    
T  33394092 ttgatcaggagtgaacccctagttggtaatgaaaccttatgataacgtttaatgcagtctgtaaagctattaagatatgttgatattaat 33394003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 8305379 - 8305319
Alignment:
Q  19 gatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgta 79  Q
    |||||||||||||||||     |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  8305379 gatcaagagtgaacccccttaaggtaatgagacctaatgatgacgtttaatgcagtctgta 8305319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 177 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 19111494 - 19111424
Alignment:
Q  177 ttgatataatgatatcatc---ttgttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcata 244  Q
    ||||||||| |||||||||   ||||| |||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  19111494 ttgatataacgatatcatcctgttgttgtgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcata 19111424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 312; Significance: 1e-176; HSPs: 4)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 30772 - 30409
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  30772 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtttaagttatattaatattaattgaatatga 30673  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgctttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttat 215  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30672 actattgtattgtatactcatgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgctttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttat 30573  T
Q  216 gctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctcc-aaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcat 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  30572 gctgcttccgttatttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagctccaaaattattggatgcatgttgataagttgatcacgatgttttgttcat 30473  T
Q  315 atgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30472 atgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 30409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Original strand, 72759 - 73121
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  72759 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagattgtagagttgtttaagttatattaatatcaatcgaatatga 72858  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgctttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttat 215  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  72859 actattgtattgtatattcatgcaagataagaaaatgtgataatgatacaaattatgtgctttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttat 72958  T
Q  216 gctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcata 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  72959 gctgcttccgttatttaactaagtgcataatcatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcata 73058  T
Q  316 tgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  73059 tgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 73121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 177 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 8145 - 7943
Alignment:
Q  177 ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcata-ggtatatgatgaagtttagctccaaattatt 275  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8145 ttgatataattatatcatcttgttatgtgacttgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcatatggtatatgatgaagtttagctccaaattatt 8046  T
Q  276 ggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgt 375  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  8045 ggatgcatgttgatatgttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgt 7946  T
Q  376 cct 378  Q
    |||    
T  7945 cct 7943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 8304 - 8250
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgc 71  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||  ||||||||||    
T  8304 ttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgataacgtttaatgc 8250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 311; Significance: 1e-175; HSPs: 10)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 67753 - 67392
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  67753 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtttaagttatattaatattaactgaatatga 67654  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgctttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttat 215  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  67653 actattgtattgtatattcatgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgctttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttat 67554  T
Q  216 gctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcata 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  67553 gctgcttccgttatttaactaagtgcataattatatgacgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttg-tcata 67455  T
Q  316 tgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  67454 tgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 67392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 158 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 7107 - 6873
Alignment:
Q  158 atgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcatagg-----tatat 251  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||      |||||    
T  7107 atgatacaattgatgtgctattgatataatgatatcatcttgttatgtgacttgtttatgctgctgctgttatttaactaagtgcatagtgtatttatat 7008  T
Q  252 gatgaa--------gtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagc 343  Q
    ||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||    
T  7007 gatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcataacatttcattgagc 6908  T
Q  344 ttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6907 ttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcct 6873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 158 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 13632 - 13398
Alignment:
Q  158 atgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcatagg-----tatat 251  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||      |||||    
T  13632 atgatacaattgatgtgctattgatataatgatatcatcctgttatgtgacttgtttatgctgctgctgttatttaactaagtgcatagtgtatttatat 13533  T
Q  252 gatgaa--------gtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagc 343  Q
    ||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||    
T  13532 gatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcatagcatttcattgagc 13433  T
Q  344 ttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13432 ttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcct 13398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 177 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 23140 - 22926
Alignment:
Q  177 ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcatagg-----tatatgatgaa--------gtttag 263  Q
    ||||||||||| |||| || ||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||      |||||||||||        ||||||    
T  23140 ttgatataatgttatcctcctgttatgtgacttgtttatgctgctgctgttatttaactaagtgcatagtgtatttatatgatgaaatgatgacgtttag 23041  T
Q  264 ctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatat 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23040 ctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgatttgtccataagagtccatgcatagcatttcattgagcttagtcctcaccacgattat 22941  T
Q  364 taggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||||||    
T  22940 taggagctttgtcct 22926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 57288 - 56913
Alignment:
Q  18 tgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagt-tgttaagttattttaatattaatcgaatatgaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||  ||||| ||  | |||||  || ||   |||||| ||  ||||     
T  57288 tgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatgacgtttaatgcaatctgtaaagccttttaagacatgttgtcattaattgagcatgat 57189  T
Q  117 ctattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttat 215  Q
     || ||||||||| | || || |||||| |||  | | || ||||| ||||| || |||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||||    
T  57188 -taatgtattgtacaatcatgtaagatatgaaagtttaattatgatgcaaatgatttgctattgatacaatgatatcatcctgttatgtgacttgattat 57090  T
Q  216 gctgcttccgttatttaactaagtgcatag--------------gtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataa-gtcgattac 300  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||               | ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||    
T  57089 gctgctgctgttatttaactaagtgcataatgattatgtgtaacgaataagatgacgtttaactccaaattattggatgcatgttgattacgatgattac 56990  T
Q  301 gatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    | |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  56989 g-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcct 56913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 41782 - 41406
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagt-tgttaagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||  ||||| ||  | |||||  || ||   |||||| ||  ||||    
T  41782 ttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatgacgtttaatgcaatctgtaaagccttttaagacatgttgtcattaattgagcatga 41683  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttta 214  Q
      || ||||||||| | || || |||||| |||  | | || ||||| ||||| || |||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||    
T  41682 t-taatgtattgtacaatcatgtaagatatgaaagtttaattatgatgcaaatgatttgctattgatacaatgatatcatcctgttatgtgacttgatta 41584  T
Q  215 tgctgcttccgttatttaactaagtgcatag--------------gtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtc-gatta 299  Q
    || |||| | ||||||||||||||||||||               | ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||   |||||    
T  41583 tgttgctgctgttatttaactaagtgcataatgattatgtgtaacgaataagatgacgtttaactccaaattattggatgcatgttgattaggatgatta 41484  T
Q  300 cgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    || |||||||||  |  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  41483 cg-tgttttgttgtttagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcct 41406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 250 - 378
Target Start/End: Original strand, 59060 - 59194
Alignment:
Q  250 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacga---------tgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 340  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||         |||||||||  || | ||||||||||||| | ||||||    
T  59060 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcttttcattg 59159  T
Q  341 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  59160 agctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcct 59194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #8
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 7247 - 7187
Alignment:
Q  19 gatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgta 79  Q
    |||||||||||||||||    || |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  7247 gatcaagagtgaacccccttatgataatgagacctaatgatgacgtttaatgcagtctgta 7187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #9
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 13772 - 13712
Alignment:
Q  19 gatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgta 79  Q
    |||||||||||||||||    || |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  13772 gatcaagagtgaacccccttatgataatgagacctaatgatgacgtttaatgcagtctgta 13712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #10
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 23300 - 23240
Alignment:
Q  19 gatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgta 79  Q
    |||||||||||||||||    || |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  23300 gatcaagagtgaacccccttatgataatgagacctaatgatgacgtttaatgcagtctgta 23240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 311; Significance: 1e-175; HSPs: 103)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 6980904 - 6980543
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  6980904 ttgatcgagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgttgtttaatgcagactgtagagttgtttaagttatattaatattaattgaatatga 6980805  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgctttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttat 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6980804 actattgtattgtatattcatgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgctttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctatttat 6980705  T
Q  216 gctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcata 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6980704 gctgcttccgttatttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagt-gattacgatgttttgttcata 6980606  T
Q  316 tgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6980605 tgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 6980543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 12762947 - 12762585
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  12762947 ttgattaagagtgaacccctagctggtaatgagacctggtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtttaagttatattaatattaattgaatatga 12762848  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgctttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttat 215  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12762847 actattgtattgtatattcatgcaagataaggagatgtgataatgatacaaattatgtgctttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttat 12762748  T
Q  216 gctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcata 315  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12762747 gctgcttctgttatttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgttttgttcata 12762648  T
Q  316 tgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12762647 tgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcct 12762585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Original strand, 20649654 - 20650014
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgt-taagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  20649654 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtctaagttatattaatattaattgaatatga 20649753  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgctttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttat 215  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20649754 actattgcattgtatattcatgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgctt-gatataacgatatcatcttgttatgtgacctgtttat 20649852  T
Q  216 gctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcata 315  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20649853 gctgcttccattatttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagt-gattacgatgttttgttcata 20649951  T
Q  316 tgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20649952 tgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagttttgtcct 20650014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 18 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 30597462 - 30597109
Alignment:
Q  18 tgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatgaa 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  30597462 tgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtttaagttatattaatattaattgaatatgaa 30597363  T
Q  117 ctattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgctttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttatg 216  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30597362 ctgttgtattgtatattcatgcaagataagaagatgtgataaagatacaaattatgtgctttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttatg 30597263  T
Q  217 ctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatat 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||        |    
T  30597262 ctgcttccgttatttaactaagtgcataagtatatgatgaagttaagctccaaattattggatgcatgtcgataagttgattacgatgttt--------t 30597171  T
Q  317 gtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30597170 gtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 30597109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 8797436 - 8797074
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||    
T  8797436 ttgatcaagagtgaacctctaattggtaatgagacctagaaacgtcgttaaatgcagactgtagagttgtttaagttatattaatatcaatggaatatga 8797337  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgctttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttat 215  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  8797336 actattatattgtatattcatgcaagataagaagatgtgttaatgatgcaaattatgtgctttgatataatgatatcatcttgttatatgatttgtttat 8797237  T
Q  216 gctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcata 315  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8797236 gctgctttcgttatttaactaagtgcataagtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgttttgttcata 8797137  T
Q  316 tgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8797136 tgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 8797074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 20060895 - 20060532
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||| ||    
T  20060895 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgttgtttaatgcagactgtagagttgtttaagttatattaatattaattggataaga 20060796  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttta 214  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  20060795 actattgtattgtatattcatgcaaaatgagaagatgtgataataatgcaatttatgtgctattgatataatgatatcatcttgatatgtgacttgttta 20060696  T
Q  215 tgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcat 314  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20060695 tgctgcttccgttgtttaactaagtgcataagtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgttttgttcat 20060596  T
Q  315 atgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20060595 atgtgtccatgcatagcatatcattgagctttgtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcct 20060532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Original strand, 2869996 - 2870359
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||  |||||||||| ||| ||||    
T  2869996 ttgatcaagagtgaacccctaactagtaatgagacctagtgatgtcgttaaatgcagtctgtagagttgtttaagtcatgataatattaattgaacatga 2870095  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttta 214  Q
     ||| |||| |||| |||  ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2870096 gctaatgtaatgtacatttatgcaagatatgaagatttgataatgatacaatttatgtgctattgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttta 2870195  T
Q  215 tgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcat 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2870196 tgctgcttccgttatttaactaagtgcataagtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatattgataagttgattacgatgttttgttcat 2870295  T
Q  315 atgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2870296 atgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 2870359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Original strand, 2876611 - 2876974
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||  |||||||||| ||| ||||    
T  2876611 ttgatcaagagtgaacccctaactagtaatgagacctagtgatgtcgttaaatgcagtctgtagagttgtttaagtcatgataatattaattgaacatga 2876710  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttta 214  Q
     ||| |||| |||| |||  ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2876711 gctaatgtaatgtacatttatgcaagatatgaagatttgataatgatacaatttatgtgctattgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttta 2876810  T
Q  215 tgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcat 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2876811 tgctgcttccgttatttaactaagtgcataagtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatattgataagttgattacgatgttttgttcat 2876910  T
Q  315 atgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2876911 atgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 2876974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Original strand, 4233359 - 4233722
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||  |||||||||| ||| ||||    
T  4233359 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgttgttaaatgcagtctgtagagttgtttaagtcatgataatattaattgaacatga 4233458  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgctt-tgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttta 214  Q
      || |||| ||||||||  ||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4233459 gttaatgtaatgtatatttatgcaagatatgaagatttgataatgatacaatttatgtgctagtgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttta 4233558  T
Q  215 tgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcat 314  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4233559 tgctgcttccgttgtttaactaagtgcataagtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcat 4233658  T
Q  315 atgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4233659 atgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacaaatattaggagctttgtcct 4233722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 20802002 - 20801640
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||||    
T  20802002 ttgatcaagagtgaacccctaattggtattgagacctagtggtgacgtttaatgcagcctgtagagttgttcaagttatattgatattaattgaatatga 20801903  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttta 214  Q
    | || |||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||| || ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20801902 attaatgtattgtatattcatgcaagatatgaaggtttgataataatgcaatttatgtgccattgatataatgatatcatcttgttatgtgacttgttta 20801803  T
Q  215 tgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcat 314  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||    
T  20801802 tgctgctttcgttatttaactaagtgcataagtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagt-gattacgaagttttgtccat 20801704  T
Q  315 atgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20801703 atgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcct 20801640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Original strand, 27327917 - 27328280
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| || |||||||| ||| ||||    
T  27327917 ttgaccaagagtgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagtctgtagacttgtttaagttatgttgatattaattgaacatga 27328016  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttta 214  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||| ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27328017 actaatgtattgtatattcatgcaagatatgaaggtttgataatgatgcaatttgtgtgctattgatataatgatatcatcttgttatgtgacttgttta 27328116  T
Q  215 tgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcat 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  27328117 tgctgcttccgttatttaactaagtgcataagtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgctgattacgatgttttgttcat 27328216  T
Q  315 atgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  27328217 aagtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagttttgtcct 27328280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Original strand, 27388657 - 27389020
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| || |||||||| ||| ||||    
T  27388657 ttgaccaagagtgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagtctgtagacttgtttaagttatgttgatattaattgaacatga 27388756  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttta 214  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||| ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27388757 actaatgtattgtatattcatgcaagatatgaaggtttgataatgatgcaatttgtgtgctattgatataatgatatcatcttgttatgtgacttgttta 27388856  T
Q  215 tgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcat 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  27388857 tgctgcttccgttatttaactaagtgcataagtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgctgattacgatgttttgttcat 27388956  T
Q  315 atgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  27388957 aagtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagttttgtcct 27389020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 30694608 - 30694245
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||| | | ||||    
T  30694608 ttgatctagggtgaacccctaactagtaataagatctaatgatgacgtttaatgcagtctgtagagttgtttaagttatgttgatattaattggacatga 30694509  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgtt-atgtgacctgttt 213  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| |||    |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  30694508 actaatgtattgtatattcatgcaagatatgaaagcttgataatgatgcaatttatgtgctattgatataatgatatcatctcgtttatgtgacctgttt 30694409  T
Q  214 atgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttca 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  30694408 atgctgcttccgttatttaactaagtgcataagtatatgatgaagtt-agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgactacgatgttttgttca 30694310  T
Q  314 tatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30694309 taagtgtccatgcatagaatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 30694245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 19 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 26130711 - 26130351
Alignment:
Q  19 gatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatgaac 117  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| | | ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||| | | ||||||    
T  26130711 gatcaagagcgaacccctaattggcattaagacctaatgatgacgtttaatgcagtctgtagagttgtttaagttatgttgatattaattggacatgaac 26130612  T
Q  118 tattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgtt-atgtgacctgtttat 215  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| |||    |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  26130611 taatgtattgtatattcatgcaagatatgaaagcttgataatgatgcaatttatgtgctattgatataataatatcatctcgtttatgtgacctgtttat 26130512  T
Q  216 gctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcata 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  26130511 gctgcttccgttatttaactaagtgtataagtatatgatgaagtt-agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcata 26130413  T
Q  316 tgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcc 377  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26130412 agtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcc 26130351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Original strand, 27430144 - 27430507
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||  | ||    
T  27430144 ttgatcaagagtgaacccctaattggtattgagacctagtggtgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagttatattgatattaattgagcaaga 27430243  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttta 214  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  27430244 actaatgtattgtatattcatgcaagatatgaagatttgataataatgcaatttatgtgctattgatataatgatatcatcttgatatgtgacttgttta 27430343  T
Q  215 tgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttga-taagtcgattacgatgttttgttca 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||| |||||||||||    
T  27430344 tgctgcttccgttatttaactaagtgcatatgtttatgataaggtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttttgttca 27430442  T
Q  314 tatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27430443 taagtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcct 27430507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 28287602 - 28287238
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||  | ||||||||| ||  | ||    
T  28287602 ttgatcaagagtgaacccctagttggtaatgaaacctaaagatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagttacataaatattaattgagcaaga 28287503  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttta 214  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||   | ||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  28287502 actattatattgtatattcatgcaagatatgaagggttaataataatgcaatttatgtgctattgatataatgatatcatcttgatatgtgacttgttta 28287403  T
Q  215 tgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgca-tgttga-taagtcgattacgatgttttgttc 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||||| || |  ||||||| ||||||||||    
T  28287402 tgctgcttccgttatttaactaagtgcatatgtatatgataaggtttagctccaaattattggacgcattgttgattacgatgattacg-tgttttgttc 28287304  T
Q  313 atatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28287303 ataagtgtccatgcattacatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 28287238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Original strand, 28258314 - 28258678
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||  | ||||||||| ||  | ||    
T  28258314 ttgatcaagagtgaacccctagttggtaatgaaacctaaagatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagttacataaatattaattgagcaaga 28258413  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttta 214  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||   | ||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  28258414 actattatattgtatattcatgcaagatatgaagggttaataataatgcaatttatgtgctattgatataatgatatcatcttgatatgtgacttgttta 28258513  T
Q  215 tgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgca-tgttga-taagtcgattacgatgttttgttc 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||||| || |  ||||||| ||||||||||    
T  28258514 tgctgcttccgttatttaactaagtgcatatgtatatgataaggtttagctccaaattattggacgcattgttgattacgatgattacg-tgttttgttc 28258612  T
Q  313 atatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28258613 ataagtgtccatgcattacatatcattgagcttagtcttcaccacgaatattaggagctttgtcct 28258678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Original strand, 28264938 - 28265302
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||  | ||||||||| ||  | ||    
T  28264938 ttgatcaagagtgaacccctagttggtaatgaaacctaaagatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagttacataaatattaattgagcaaga 28265037  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttta 214  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||   | ||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  28265038 actattatattgtatattcatgcaagatatgaagggttaataataatgcaatttatgtgctattgatataatgatatcatcttgatatgtgacttgttta 28265137  T
Q  215 tgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgca-tgttga-taagtcgattacgatgttttgttc 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||||| || |  ||||||| ||||||||||    
T  28265138 tgctgcttccgttatttaactaagtgcatatgtatatgataaggtttagctccaaattattggacgcattgttgattacgatgattacg-tgttttgttc 28265236  T
Q  313 atatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28265237 ataagtgtccatgcattacatatcattgagcttagtcttcaccacgaatattaggagctttgtcct 28265302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Original strand, 28337063 - 28337427
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||  | ||||||||| ||  | ||    
T  28337063 ttgatcaagagtgaacccctagttggtaatgaaacctaaagatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagttacataaatattaattgagcaaga 28337162  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttta 214  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||   | ||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  28337163 actattatattgtatattcatgcaagatatgaagggttaataataatgcaatttatgtgctattgatataatgatatcatcttgatatgtgacttgttta 28337262  T
Q  215 tgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgca-tgttga-taagtcgattacgatgttttgttc 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||||| || |  ||||||| ||||||||||    
T  28337263 tgctgcttccgttatttaactaagtgcatatgtatatgataaggtttagctccaaattattggacgcattgttgattacgatgattacg-tgttttgttc 28337361  T
Q  313 atatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28337362 ataagtgtccatgcattacatatcattgagcttagtcttcaccacgaatattaggagctttgtcct 28337427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Original strand, 28343687 - 28344051
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||  | ||||||||| ||  | ||    
T  28343687 ttgatcaagagtgaacccctagttggtaatgaaacctaaagatgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagttacataaatattaattgagcaaga 28343786  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttta 214  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||   | ||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  28343787 actattatattgtatattcatgcaagatatgaagggttaataataatgcaatttatgtgctattgatataatgatatcatcttgatatgtgacttgttta 28343886  T
Q  215 tgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgca-tgttga-taagtcgattacgatgttttgttc 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||||| || |  ||||||| ||||||||||    
T  28343887 tgctgcttccgttatttaactaagtgcatatgtatatgataaggtttagctccaaattattggacgcattgttgattacgatgattacg-tgttttgttc 28343985  T
Q  313 atatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28343986 ataagtgtccatgcattacatatcattgagcttagtcttcaccacgaatattaggagctttgtcct 28344051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 20 - 299
Target Start/End: Original strand, 14059480 - 14059761
Alignment:
Q  20 atcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtta-agttattttaatattaatcgaatatgaact 118  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| | | ||| ||||| |||||||  ||   |  |||||||||| ||| |||| ||    
T  14059480 atcaagagtgaaccgctaactggtattgagacctagtgatgttgttaagtacagtctgtatagttgtttgagccctgataatattaattgaacatgagct 14059579  T
Q  119 attgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttatgc 217  Q
    | |||| || |||||  ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  14059580 aatgtaatgaatatttatgcaagatatgaagatttgataatgatacaatttatgtgctattgatataatgatatcatcttgttatgtgacttgcttatgc 14059679  T
Q  218 tgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgatta 299  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  14059680 tgctttcgttatttaactaagtgcataagtatatggtaaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgatta 14059761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 19 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 25111084 - 25110708
Alignment:
Q  19 gatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatgaac 117  Q
    |||||||||||||||||    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| || |||| ||| ||| || |||||||| ||| ||||||    
T  25111084 gatcaagagtgaaccccattatggtaatgagacctaatgatgacgtttaatgcagtctgtaaagctgtttaagatatgttgatattaattgaacatgaac 25110985  T
Q  118 tattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgctt-tgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttatg 216  Q
    || ||||||||| | |  ||||||||| |||  | | || ||||| ||| |  ||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||    
T  25110984 taatgtattgtacaattatgcaagatatgaaagtttaattatgatgcaattgttgtgctaatgatataatgacatcatcctgttatgtgacttatttatg 25110885  T
Q  217 ctgcttccgttatttaactaagtgcatag---------gtat------atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacg 301  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||          ||||      |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||    
T  25110884 ctgctgccgttatttaactaagtgcatattgtatatgagtatgatgaaatgatgaagtttagctccaaattattagatgcatgttgatatgatgattacg 25110785  T
Q  302 atgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25110784 atgttttgttcataagagtccatgcatagcatttcattaagtttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcct 25110708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 19 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 25117687 - 25117311
Alignment:
Q  19 gatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatgaac 117  Q
    |||||||||||||||||    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| || |||| ||| ||| || |||||||| ||| ||||||    
T  25117687 gatcaagagtgaaccccattatggtaatgagacctaatgatgacgtttaatgcagtctgtaaagctgtttaagatatgttgatattaattgaacatgaac 25117588  T
Q  118 tattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgctt-tgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttatg 216  Q
    || ||||||||| | |  ||||||||| |||  | | || ||||| ||| |  ||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||    
T  25117587 taatgtattgtacaattatgcaagatatgaaagtttaattatgatgcaattgttgtgctaatgatataatgacatcatcctgttatgtgacttatttatg 25117488  T
Q  217 ctgcttccgttatttaactaagtgcatag---------gtat------atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacg 301  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||          ||||      |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||    
T  25117487 ctgctgccgttatttaactaagtgcatattgtatatgagtatgatgaaatgatgaagtttagctccaaattattagatgcatgttgatatgatgattacg 25117388  T
Q  302 atgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25117387 atgttttgttcataagagtccatgcatagcatttcattaagtttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcct 25117311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 19 - 378
Target Start/End: Original strand, 3708345 - 3708720
Alignment:
Q  19 gatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatgaac 117  Q
    |||||||||||||||||    ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||| || |||| ||| ||| || |||||||| || |||||      
T  3708345 gatcaagagtgaacccccttatggtaatgagacctaatgatgacgtttactgcagtctgtaaagctgtttaagatatgttgatattaattgagtatgat- 3708443  T
Q  118 tattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttatg 216  Q
    || ||||||||| | |  || |||||| |||  | | || |||||| || | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  3708444 taatgtattgtacaattatgtaagatatgaaagtttaattatgatataactgatgtgctattgatataatgatatcatcctgttatgtgacttgattatg 3708543  T
Q  217 ctgcttccgttatttaactaagtgcatag---------gtat------atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacg 301  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||          ||||      ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||    
T  3708544 ctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtatatgtgtatgatgaaatgatgatgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgttgattacg 3708643  T
Q  302 atgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
     || |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3708644 gtgatttgttcataagagtccatgcatagcatttcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcct 3708720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 250 - 378
Target Start/End: Original strand, 24291156 - 24291284
Alignment:
Q  250 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 349  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24291156 atgatgatgtttagctccaaattgttggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 24291255  T
Q  350 ctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  24291256 ctcaccacgtttattaggagctttgtcct 24291284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 250 - 378
Target Start/End: Original strand, 31317196 - 31317324
Alignment:
Q  250 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 349  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31317196 atgatgatgtttagctccaaattgttggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 31317295  T
Q  350 ctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  31317296 ctcaccacgtttattaggagctttgtcct 31317324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 250 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 4167920 - 4167791
Alignment:
Q  250 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgca-tagcatctcattgagcttagt 348  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  4167920 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcattagcatttcattgagcttagt 4167821  T
Q  349 cctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4167820 cctcaccacgattattaggagctttgtcct 4167791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 250 - 378
Target Start/End: Original strand, 24315184 - 24315312
Alignment:
Q  250 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 349  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24315184 atgatgatgtttagctccaaattgttggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcataacatctcattgagcttagtc 24315283  T
Q  350 ctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  24315284 ctcaccacgtttattaggagctttgtcct 24315312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 250 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 4208600 - 4208471
Alignment:
Q  250 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgca-tagcatctcattgagcttagt 348  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  4208600 atgatgacgtttagctccaaattattagatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcattagcatttcattgagcttagt 4208501  T
Q  349 cctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4208500 cctcaccacgattattaggagctttgtcct 4208471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Original strand, 1544904 - 1545280
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagt-tgttaagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||  ||||| ||  | |||||  || ||   |||||| ||  ||||    
T  1544904 ttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatgacgtttaatgcaatctgtaaagccttttaagacatgttgtcattaattgagcatga 1545003  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttta 214  Q
      || ||||||||| | || || |||||| |||  | | || ||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||    
T  1545004 t-taatgtattgtacaatcatgtaagatatgaaagtttaattatgatgcaaatgatttgctattgatataatgatatcatcctgttatgtgacttgatta 1545102  T
Q  215 tgctgcttccgttatttaactaagtgcatag--------------gtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataa-gtcgatta 299  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||               | ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||    
T  1545103 tgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgattatgtgtaatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgatgatta 1545202  T
Q  300 cgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    || |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  1545203 cg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcct 1545280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 177 - 378
Target Start/End: Original strand, 17037355 - 17037570
Alignment:
Q  177 ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcatagg-----tatatgatgaa---------gttta 262  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||||||       | |||||||||         |||||    
T  17037355 ttgatataatgatatcatcctgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatgtatgatgaaaaagatgacgttta 17037454  T
Q  263 gctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaata 362  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| |  ||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||    
T  17037455 gctccaaattattggatgcacattgatatgatgattacggtgttttgttgataagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacaatta 17037554  T
Q  363 ttaggagctttgtcct 378  Q
    ||||||||||||||||    
T  17037555 ttaggagctttgtcct 17037570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Original strand, 1538805 - 1539181
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagt-tgttaagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||  ||||| ||  | |||||  || ||   |||||| ||  ||||    
T  1538805 ttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatgacgtttaatgcaatctgtaaagccttttaagacatgttgtcattaattgagcatga 1538904  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttta 214  Q
      || ||||||||| | || || |||||| |||  | | || ||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||    
T  1538905 t-taatgtattgtacaatcatgtaagatatgaaagtttaattatgatgcaaatgatttgctattgatataatgatatcatcctgttatgtgacttgatta 1539003  T
Q  215 tgctgcttccgttatttaactaagtgcatag--------------gtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataa-gtcgatta 299  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||               | ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||    
T  1539004 tgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgataatgtgtaatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgatgatta 1539103  T
Q  300 cgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    || |||||||||  || | ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  1539104 cg-tgttttgttgttaagagtccaggcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcct 1539181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 250 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 34832652 - 34832522
Alignment:
Q  250 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgca-tagcatctcattgagcttagt 348  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||| | ||||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  34832652 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcattagcatttcattaagcttagt 34832553  T
Q  349 cctcaccacga-atattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  34832552 cctcaccacgatttattaggagctttgtcct 34832522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 295 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 8228832 - 8228749
Alignment:
Q  295 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8228832 gattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcct 8228749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 295 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 18931021 - 18930938
Alignment:
Q  295 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18931021 gattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcct 18930938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 177 - 359
Target Start/End: Original strand, 25595374 - 25595571
Alignment:
Q  177 ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcatagg-------tatatgatgaa--------gttt 261  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||         |||||||||||        ||||    
T  25595374 ttgatataatgatatcatcctgttatgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgcctatatatatgatgaaatgatgacgttt 25595473  T
Q  262 agctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgca-tagcatctcattgagcttagtcctcaccacga 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25595474 agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacga 25595571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 295 - 378
Target Start/End: Original strand, 29587841 - 29587924
Alignment:
Q  295 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29587841 gattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcct 29587924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 295 - 378
Target Start/End: Original strand, 29593982 - 29594065
Alignment:
Q  295 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29593982 gattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcct 29594065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 252 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 19808520 - 19808394
Alignment:
Q  252 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcc 350  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||| || |||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  19808520 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 19808422  T
Q  351 tcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19808421 tcaccacgattattaggagctttgtcct 19808394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 252 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 22758844 - 22758718
Alignment:
Q  252 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcc 350  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||| || |||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  22758844 gatgacgtttagctccaaattattggatgcttattgatatgttgattacggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 22758746  T
Q  351 tcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22758745 tcaccacgattattaggagctttgtcct 22758718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 252 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 25928289 - 25928163
Alignment:
Q  252 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcc 350  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||| || |||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  25928289 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 25928191  T
Q  351 tcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25928190 tcaccacgattattaggagctttgtcct 25928163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 295 - 378
Target Start/End: Original strand, 30638291 - 30638374
Alignment:
Q  295 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30638291 gattatgatgttttgttcatctgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcct 30638374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 250 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 14098624 - 14098496
Alignment:
Q  250 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataa-gtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagt 348  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14098624 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgattacggtgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagt 14098526  T
Q  349 cctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||||||    
T  14098525 cctcaccacgtttattaagagctttgtcct 14098496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 144
Target Start/End: Original strand, 18194385 - 18194513
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagag-ttgttaagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| || ||| ||||| || |||||||| ||| ||||    
T  18194385 ttgattaagagtgaacccctaattggtattgagacctaatgatgacgtttaatgcagtctgtagagttttttaggttatgttgatattaattgaacatga 18194484  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagata 144  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||    
T  18194485 actaatgtattgtatattcatgcaagata 18194513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 247 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 20176941 - 20176809
Alignment:
Q  247 tatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgtttt-gttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagctt 345  Q
    |||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||| |||||| |||  || | |||||||||||||||||||||||||||    
T  20176941 tatatgatgacggttatctccaaattattggatgcacgttgatgtgttgattacggtgtttttgttgttaagagtccatgcatagcatctcattgagctt 20176842  T
Q  346 agtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||||||||| || | ||||||||||||||||    
T  20176841 agtcctcaccaagatttttaggagctttgtcct 20176809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 252 - 378
Target Start/End: Original strand, 34370086 - 34370212
Alignment:
Q  252 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcc 350  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |  ||||||| || |||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  34370086 gatgacgtttagcttcaaattattggatgcatattgatatgatgattacggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 34370184  T
Q  351 tcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34370185 tcaccacgattattaggagctttgtcct 34370212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 298 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 28314516 - 28314436
Alignment:
Q  298 tacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||||||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28314516 tacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 28314436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 247 - 378
Target Start/End: Original strand, 5834591 - 5834723
Alignment:
Q  247 tatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgtttt-gttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagctt 345  Q
    |||||||||| | ||| |||||||||||||||||||  |||||  || ||||||| |||||| |||  || | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  5834591 tatatgatgacggttatctccaaattattggatgcactttgatgtgttgattacggtgtttttgttgttaagagtccatgcatagtatctcattgagctt 5834690  T
Q  346 agtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||||||||| || | ||||||||||||||||    
T  5834691 agtcctcaccatgatttttaggagctttgtcct 5834723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 247 - 378
Target Start/End: Original strand, 22159050 - 22159182
Alignment:
Q  247 tatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgtttt-gttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagctt 345  Q
    |||||||||| | ||| |||||||||||||||||||  |||||  || ||||||| |||||| |||  || | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  22159050 tatatgatgacggttaactccaaattattggatgcacattgatgtgttgattacggtgtttttgttgttaagagtccatgcatagaatctcattgagctt 22159149  T
Q  346 agtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||||||||| || | ||||||||||||||||    
T  22159150 agtcctcaccaagatttttaggagctttgtcct 22159182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 298 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 27185655 - 27185575
Alignment:
Q  298 tacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||||||||||||  |  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27185655 tacgatgttttgttgttgagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 27185575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 298 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 27207491 - 27207411
Alignment:
Q  298 tacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||||||||||||  |  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27207491 tacgatgttttgttgttgagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 27207411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 298 - 378
Target Start/End: Original strand, 27241737 - 27241817
Alignment:
Q  298 tacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||||||||||||  |  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27241737 tacgatgttttgttgttgagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 27241817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 298 - 378
Target Start/End: Original strand, 27263585 - 27263665
Alignment:
Q  298 tacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||||||||||||  |  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27263585 tacgatgttttgttgttgagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 27263665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 252 - 378
Target Start/End: Original strand, 34298734 - 34298855
Alignment:
Q  252 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgca-tagcatctcattgagcttagtcc 350  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  34298734 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacgatgttttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 34298831  T
Q  351 tcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||| ||    |||||||||||||||    
T  34298832 tcaccatga----taggagctttgtcct 34298855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 250 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 8243598 - 8243464
Alignment:
Q  250 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 340  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  8243598 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 8243499  T
Q  341 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  8243498 agctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcct 8243464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 250 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 11566627 - 11566493
Alignment:
Q  250 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 340  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  11566627 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 11566528  T
Q  341 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  11566527 agctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcct 11566493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 250 - 378
Target Start/End: Original strand, 12619183 - 12619317
Alignment:
Q  250 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 340  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  12619183 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 12619282  T
Q  341 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  12619283 agctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcct 12619317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 250 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 19870355 - 19870221
Alignment:
Q  250 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacga---------tgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 340  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||         |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  19870355 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattatggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 19870256  T
Q  341 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  19870255 agctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcct 19870221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 250 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 23394833 - 23394699
Alignment:
Q  250 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 340  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  23394833 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 23394734  T
Q  341 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  23394733 agctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcct 23394699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 264 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 16760011 - 16759899
Alignment:
Q  264 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaata 362  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||| ||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||   |    
T  16760011 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg---a 16759915  T
Q  363 ttaggagctttgtcct 378  Q
    ||||||||||||||||    
T  16759914 ttaggagctttgtcct 16759899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 295 - 378
Target Start/End: Original strand, 17017074 - 17017158
Alignment:
Q  295 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacg-aatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  17017074 gattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcct 17017158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 295 - 378
Target Start/End: Original strand, 32565394 - 32565478
Alignment:
Q  295 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacg-aatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  32565394 gattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcct 32565478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 250 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 23989685 - 23989551
Alignment:
Q  250 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacga---------tgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 340  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||         || ||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  23989685 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtggtttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 23989586  T
Q  341 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  23989585 agctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcct 23989551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 251 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 16624142 - 16624009
Alignment:
Q  251 tgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattga 341  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| |||||||    
T  16624142 tgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgataatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattga 16624043  T
Q  342 gcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||| ||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  16624042 gctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcct 16624009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 295 - 378
Target Start/End: Original strand, 16552172 - 16552256
Alignment:
Q  295 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacg-aatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||| ||||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  16552172 gattacaatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcct 16552256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 295 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 16576781 - 16576697
Alignment:
Q  295 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacg-aatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||| ||||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  16576781 gattacaatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcct 16576697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 295 - 378
Target Start/End: Original strand, 16618599 - 16618683
Alignment:
Q  295 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacg-aatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||| ||||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  16618599 gattacaatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcct 16618683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 295 - 378
Target Start/End: Original strand, 16628728 - 16628812
Alignment:
Q  295 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacg-aatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||| ||||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  16628728 gattacaatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcct 16628812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 250 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 22862711 - 22862577
Alignment:
Q  250 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacga---------tgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 340  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||         |||||||||  || | ||||||||||| ||| ||||||    
T  22862711 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcataacatttcattg 22862612  T
Q  341 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    || || ||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  22862611 agttttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcct 22862577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 1644298 - 1644165
Alignment:
Q  251 tgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattga 341  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| |||||||    
T  1644298 tgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgataatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattga 1644199  T
Q  342 gcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||| ||||||||||||    ||||||||||||||||    
T  1644198 gctttgtcctcaccacg---tttaggagctttgtcct 1644165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 16372104 - 16372049
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgca 72  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  16372104 ttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgagacctaatgatgatgtttaatgca 16372049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 17031116 - 17031061
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgca 72  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  17031116 ttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatgacgtttaatgca 17031061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 68
Target Start/End: Original strand, 17037196 - 17037247
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaa 68  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  17037196 ttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgagacctaatgatgacgtttaa 17037247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 25928542 - 25928487
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgca 72  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  25928542 ttgatcaagagtgaaaccctaaatggtaatgagacctaatgatgacgtttaatgca 25928487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 72
Target Start/End: Original strand, 34298484 - 34298539
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgca 72  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  34298484 ttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatgacgtttaatgca 34298539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 250 - 304
Target Start/End: Original strand, 18917775 - 18917829
Alignment:
Q  250 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg 304  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||    
T  18917775 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatg 18917829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 251 - 378
Target Start/End: Original strand, 31478326 - 31478459
Alignment:
Q  251 tgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattga 341  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| |||||||    
T  31478326 tgatgacgtttagcttcaaattattggatgcatgataatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattga 31478425  T
Q  342 gcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||| ||||||||||||    ||||||||||||||||    
T  31478426 gctttgtcctcaccacg---tttaggagctttgtcct 31478459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 22759098 - 22759043
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgca 72  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  22759098 ttgatcaagagtgaaaccctaattggtaatgaaacctaatgatgacgtttaatgca 22759043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 72
Target Start/End: Original strand, 34369834 - 34369889
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgca 72  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  34369834 ttgatcaagagtgaatccctaattggtaatgagacctaatgatgatgtttaatgca 34369889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 319 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 14471924 - 14471868
Alignment:
Q  319 gtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    ||||||||||||||||    
T  14471924 gtccatgcatagcatatcattgagctttgtcctcaccacg---tttaggagctttgtcct 14471868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 106
Target Start/End: Original strand, 17016783 - 17016872
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgttaagttattttaatattaat 106  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||  ||||  |||||||||||| ||||| || | ||||| ||| || ||||||||    
T  17016783 ttgatcaagagtgaacccctatttggtaatgaaaccttatgataacgtttaatgcagtctgtaaagctattaagatatgttgatattaat 17016872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 106
Target Start/End: Original strand, 32565103 - 32565192
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgttaagttattttaatattaat 106  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||  |||||||||||| ||||| || | ||||| ||| || ||||||||    
T  32565103 ttgatcaggagtgaacccctaattggtaatgaaaccttatgataacgtttaatgcagtctgtaaagctattaagatatgttgatattaat 32565192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 4168169 - 4168101
Alignment:
Q  19 gatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt 87  Q
    |||||||||||||||||    ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| |||||||| ||||    
T  4168169 gatcaagagtgaacccccttatggtaatgagacctaatgatgacgttaaatgcagtctgtagagctgtt 4168101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 4208849 - 4208781
Alignment:
Q  19 gatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt 87  Q
    |||||||||||||||||    ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| |||||||| ||||    
T  4208849 gatcaagagtgaacccccttatggtaatgagacctaatgatgacgttaaatgcagtctgtagagctgtt 4208781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 16371943 - 16371873
Alignment:
Q  177 ttgatataatgatatcatc---ttgttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcata 244  Q
    |||||||||||||||||||   ||||| |||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  16371943 ttgatataatgatatcatcctgttgttgtgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcata 16371873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 25928381 - 25928311
Alignment:
Q  177 ttgatataatgatatcatc---ttgttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcata 244  Q
    |||||||||||||||||||   ||||| |||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  25928381 ttgatataatgatatcatcctgttgttgtgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcata 25928311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 244
Target Start/End: Original strand, 34369994 - 34370064
Alignment:
Q  177 ttgatataatgatatcatc---ttgttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcata 244  Q
    |||||||||||||||||||   ||||| |||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  34369994 ttgatataatgatatcatcctgttgttgtgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcata 34370064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 181 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 4168006 - 4167943
Alignment:
Q  181 tataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcata 244  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| ||  | ||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  4168006 tataatgatatcatactgttatgtgacttgactgtgctgctgctgttatttaactaagtgcata 4167943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 181 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 4208686 - 4208623
Alignment:
Q  181 tataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcata 244  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| ||  | ||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  4208686 tataatgatatcatactgttatgtgacttgactgtgctgctgctgttatttaactaagtgcata 4208623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 181 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 14098707 - 14098644
Alignment:
Q  181 tataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcata 244  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| ||  | ||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  14098707 tataatgatatcatactgttatgtgacttgactgtgctgctgctgttatttaactaagtgcata 14098644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 17 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 22331685 - 22331630
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgca 72  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |  ||||||||||    
T  22331685 ttgatcaagagtgaatccctaattggtaatgagacctaatgacgatgtttaatgca 22331630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 243
Target Start/End: Original strand, 24291072 - 24291132
Alignment:
Q  177 ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcat 243  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||      |||||||||||||||||||    
T  24291072 ttgatataatgatatcatcctgttatgtgacttgattatgct------gttatttaactaagtgcat 24291132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 243
Target Start/End: Original strand, 24315100 - 24315160
Alignment:
Q  177 ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcat 243  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||      |||||||||||||||||||    
T  24315100 ttgatataatgatatcatcctgttatgtgacttgattatgct------gttatttaactaagtgcat 24315160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 243
Target Start/End: Original strand, 31317112 - 31317172
Alignment:
Q  177 ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcat 243  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||      |||||||||||||||||||    
T  31317112 ttgatataatgatatcatcctgttatgtgacttgattatgct------gttatttaactaagtgcat 31317172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 106
Target Start/End: Original strand, 16551881 - 16551970
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgttaagttattttaatattaat 106  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||| || |  ||||  |||||||||||| ||||| || | ||||| ||| || ||||||||    
T  16551881 ttgatcaggagtgaacccctaattggtaatgaaactttatgataacgtttaatgcagtctgtaaagctattaagatatgttgatattaat 16551970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 16577072 - 16576983
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgttaagttattttaatattaat 106  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||| || |  ||||  |||||||||||| ||||| || | ||||| ||| || ||||||||    
T  16577072 ttgatcaggagtgaacccctaattggtaatgaaactttatgataacgtttaatgcagtctgtaaagctattaagatatgttgatattaat 16576983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 106
Target Start/End: Original strand, 16618308 - 16618397
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgttaagttattttaatattaat 106  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||| || |  ||||  |||||||||||| ||||| || | ||||| ||| || ||||||||    
T  16618308 ttgatcaggagtgaacccctaattggtaatgaaactttatgataacgtttaatgcagtctgtaaagctattaagatatgttgatattaat 16618397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 106
Target Start/End: Original strand, 16628437 - 16628526
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgttaagttattttaatattaat 106  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||| || |  ||||  |||||||||||| ||||| || | ||||| ||| || ||||||||    
T  16628437 ttgatcaggagtgaacccctaattggtaatgaaactttatgataacgtttaatgcagtctgtaaagctattaagatatgttgatattaat 16628526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 16741206 - 16741111
Alignment:
Q  264 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacga 359  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||| ||||| ||||||||||| ||| | |||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  16741206 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaagatgttttgttgata-gagtccatgcattagcata-cattgagctttgtcctcaccacga 16741111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 19808772 - 19808735
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagaccta 54  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  19808772 ttgatcaagagtgaatccctaattggtaatgagaccta 19808735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 177 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 19808612 - 19808542
Alignment:
Q  177 ttgatataatgatatcatc---ttgttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcata 244  Q
    |||||||||||||||||||   ||||| |||||| ||  |||| |||| | ||||||||||||||||||||    
T  19808612 ttgatataatgatatcatcctattgttgtgtgacttgactatgttgctgctgttatttaactaagtgcata 19808542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 177 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 22758936 - 22758866
Alignment:
Q  177 ttgatataatgatatcatc---ttgttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcata 244  Q
    |||||||| ||||||||||   ||||| |||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  22758936 ttgatatattgatatcatcctgttgttgtgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcata 22758866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 34832898 - 34832838
Alignment:
Q  19 gatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgta 79  Q
    |||||||||||||||||    || |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  34832898 gatcaagagtgaacccccttatgataatgagacctaatgatgacgtttaatgcagtctgta 34832838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0052 (Bit Score: 250; Significance: 1e-139; HSPs: 5)
Name: scaffold0052
Description:

Target: scaffold0052; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Original strand, 913 - 1277
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttg--ttaagttattttaatattaatcgaatatg 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||   ||||| ||| || |||||||| ||| |||    
T  913 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctggtgatgtcgttaaatgcagtctgtagagtttgtttaagatatgttgatattaattgaacatg 1012  T
Q  115 aactattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttt 213  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| | |||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  1013 aactaatgtattgtatattcatgcaagatatgaaggtttgattatgatgcaatttatgtgctattgatataatgacatcatcttgttatgtgacttgttt 1112  T
Q  214 atgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttca 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  1113 atgctgcttccgttatttaactaagtgcataagtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttca 1212  T
Q  314 tatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1213 taagtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcct 1277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0052; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 295 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 10303 - 10220
Alignment:
Q  295 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10303 gattatgatgttttgttcatctgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcct 10220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0052; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 295 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 56725 - 56642
Alignment:
Q  295 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  56725 gattatgatgttttgttcatctgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagttttgtcct 56642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0052; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 10604 - 10542
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgta 79  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||  |||||||||||| |||||    
T  10604 ttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaaccttatgataacgtttaatgcagtctgta 10542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0052; HSP #5
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 57026 - 56964
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgta 79  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||  |||||||||||| |||||    
T  57026 ttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaaccttatgataacgtttaatgcagtctgta 56964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 248; Significance: 1e-137; HSPs: 2)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Original strand, 59321 - 59684
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |  || ||    
T  59321 ttgattaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgttgttgtttaatgcagactgtagagttgtttaagttatattaatattaattggttaaga 59420  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttta 214  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||    
T  59421 actattgtattgtatattcatgcaaaatgagaagatgtgataataatgcaatttatgtgctattgatataaagatatcatcttgatatgtgacttgttta 59520  T
Q  215 tgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcat 314  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  59521 tgctgcttccgttgtttaactaagtgcataagtatatgatgaagtttaactccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgttttgttcct 59620  T
Q  315 atgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  59621 atgtgtccatgcatagcatatcattgagctttgtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcct 59684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 250 - 378
Target Start/End: Original strand, 67642 - 67776
Alignment:
Q  250 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 340  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  67642 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 67741  T
Q  341 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  67742 agctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcct 67776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 248; Significance: 1e-137; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 139312 - 138949
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |  || ||    
T  139312 ttgattaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgttgttgtttaatgcagactgtagagttgtttaagttatattaatattaattggttaaga 139213  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttta 214  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||    
T  139212 actattgtattgtatattcatgcaaaatgagaagatgtgataataatgcaatttatgtgctattgatataaagatatcatcttgatatgtgacttgttta 139113  T
Q  215 tgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcat 314  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  139112 tgctgcttccgttgtttaactaagtgcataagtatatgatgaagtttaactccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgttttgttcct 139013  T
Q  315 atgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  139012 atgtgtccatgcatagcatatcattgagctttgtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcct 138949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 57219 - 56856
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||  | ||    
T  57219 ttgatcaagagtgaacccctaattggtattgagacctagtggtgacgtttaatgcagcctgtagagttgtttaagttatattgatattaattgagcaaga 57120  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttta 214  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  57119 actaatgtattgtatattcatgcaagatatgaagatttgataataatgcaatttatgtgctattgatataatgatatcatcttgatatgtgacttgttta 57020  T
Q  215 tgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttga-taagtcgattacgatgttttgttca 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||| |||||||||||    
T  57019 tgctgcttccgttatttaactaagtgcatatgtttatgataaggtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttttgttca 56921  T
Q  314 tatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  56920 taagtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcct 56856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 5)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Original strand, 105739 - 106109
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||| ||||    
T  105739 ttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgagacttaatgatgacgttaaatgcagtctgtagagttgtttaagatatgttaatattaattgaacatga 105838  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttta 214  Q
    |||| ||||||||||| |  ||||||||| |||  | |||| ||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||    
T  105839 actaatgtattgtataattatgcaagatatgaaagtttgattatgatccaattgatgtgctattgatataatgatatcatcctgttttgtgacttgttta 105938  T
Q  215 tgctgcttccgttatttaactaagtgcata-ggta------tatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttt 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  105939 tgctgcttccgttatttaactaagtgcatattgtatatgagtatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttt 106038  T
Q  308 tgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  106039 tgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 106109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Original strand, 125974 - 126343
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||| || |||||||| ||| ||||    
T  125974 ttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgagacttaatgatgacgttaaatgcagtctgtagagttgtttaagatatgttgatattaattgaacatga 126073  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttta 214  Q
    |||| ||||||||||| |  ||||||||| |||  | |||| ||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||    
T  126074 actaatgtattgtataattatgcaagatatgaaagtttgattatgatccaattgatgtgctattgatataatgatatcatcctgttttgtgacttgttta 126173  T
Q  215 tgctgcttccgttatttaactaagtgcata-ggta------tatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttt 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  126174 tgctgcttccgttatttaactaagtgcatattgtatatgagtatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttt 126273  T
Q  308 tgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||    
T  126274 tgttcataagagaccatgcatagcatctcattgagcttagtccttaccac-attattaggagctttgtcct 126343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 80305 - 80172
Alignment:
Q  251 tgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattga 341  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| |||||||    
T  80305 tgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgataatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattga 80206  T
Q  342 gcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||| ||||||||||||    ||||||||||||||||    
T  80205 gctttgtcctcaccacg---tttaggagctttgtcct 80172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 250 - 304
Target Start/End: Original strand, 61951 - 62005
Alignment:
Q  250 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg 304  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||    
T  61951 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatg 62005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #5
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 250 - 304
Target Start/End: Original strand, 65867 - 65921
Alignment:
Q  250 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg 304  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||    
T  65867 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatg 65921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 181; Significance: 1e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 17 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 38287 - 37925
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagt-tattttaatattaatcgaatatg 114  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||  ||||| ||||| | ||||||||||| |||  ||| || |||||||| || ||||    
T  38287 ttgatcaagagtgaacccctaattggcattgagacctagtgatgatgtttactgcagccagtagagttgtttaagactatattgatattaattgagtatg 38188  T
Q  115 aactattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttt 213  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||     
T  38187 aactaatgtattgtatattcatgcaagatatgaaggtttgataataatgcaatttatgtgctattgatataatgatatcatcttgctgtgtgacttgtt- 38089  T
Q  214 atgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataa-gtcgattacgatgttttgttc 312  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||| |||| |||||    
T  38088 atgctgcttctgttatttaactaagtgcatatgtatatgataatgtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttctgttc 37990  T
Q  313 atatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcc 377  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37989 ataagtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcc 37925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 181; Significance: 1e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 17 - 377
Target Start/End: Original strand, 76525 - 76887
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagt-tattttaatattaatcgaatatg 114  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||  ||||| ||||| | ||||||||||| |||  ||| || |||||||| || ||||    
T  76525 ttgatcaagagtgaacccctaattggcattgagacctagtgatgatgtttactgcagccagtagagttgtttaagactatattgatattaattgagtatg 76624  T
Q  115 aactattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttt 213  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||     
T  76625 aactaatgtattgtatattcatgcaagatatgaaggtttgataataatgcaatttatgtgctattgatataatgatatcatcttgctgtgtgacttgtt- 76723  T
Q  214 atgctgcttccgttatttaactaagtgcataggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataa-gtcgattacgatgttttgttc 312  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||| |||| |||||    
T  76724 atgctgcttctgttatttaactaagtgcatatgtatatgataatgtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttctgttc 76822  T
Q  313 atatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcc 377  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  76823 ataagtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcc 76887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 151; Significance: 8e-80; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 177 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 307182 - 306980
Alignment:
Q  177 ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcata-ggtatatgatgaagtttagctccaaattatt 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  307182 ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacttgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcatatggtatatgatgaagtttagctccaaattatt 307083  T
Q  276 ggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgt 375  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  307082 ggatgcatgttgatatgttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgt 306983  T
Q  376 cct 378  Q
    |||    
T  306982 cct 306980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 17 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 307341 - 307286
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgca 72  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| || |  ||||| |||||||||||    
T  307341 ttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacttgatgatgacgtttaatgca 307286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 143; Significance: 5e-75; HSPs: 3)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 26887 - 26509
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatga 115  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||||||||| || ||||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||| || |||||||| ||| | ||    
T  26887 ttgatccagagtgaacccctatttggtaatgagacttaatgatgacgttaaatgcagtctgtagagttgtttaagatatattgatattaattgaacacga 26788  T
Q  116 actattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgttta 214  Q
    |||| ||||||||||| |  ||||||||| ||   | |||| ||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  26787 actaatgtattgtataattatgcaagatatgacagtttgattatgatgcaattgatgtgctattgatataatgatatcatcctgttatgtgacttgttta 26688  T
Q  215 tgctgcttccgttatttaactaagtgcata-----ggtatatgatgaa---------gtttagctccaaattattggatgcatgttg-ataagtcgatta 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  || ||    
T  26687 tgctgcttccgttatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgaatatgatgacta 26588  T
Q  300 cgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  26587 cgatgttttgttcataagattccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgatttttaggagctttgtcct 26509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 177 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 43397 - 43183
Alignment:
Q  177 ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgca-taggtatat------------gatgaagtttag 263  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||| | |||||||||||||||||| || || |||            ||||| ||||||    
T  43397 ttgatataatgatatcatcctgttatgtgacttgactatgctgctactgttatttaactaagtgcaatatgtctatacatgatgaaatgatgacgtttag 43298  T
Q  264 ctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgca-tagcatctcattgagcttagtcctcaccacga-at 361  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||| ||  ||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  |    
T  43297 ctccaaattattggaagcatgttgatatgttgatcacggtg-attgttcataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattt 43200  T
Q  362 attaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||||||||    
T  43199 attaggagctttgtcct 43183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 264 - 378
Target Start/End: Original strand, 36330 - 36442
Alignment:
Q  264 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 361  Q
    ||||||||||||||||| ||   ||||| || ||||||| || |||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||       
T  36330 ctccaaattattggatgtataagtgatatgttgattacggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccacg--- 36425  T
Q  362 attaggagctttgtcct 378  Q
     ||||||||||||||||    
T  36426 tttaggagctttgtcct 36442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 158 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 12547 - 12313
Alignment:
Q  158 atgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcatagg-----tatat 251  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||      |||||    
T  12547 atgatacaaatgatgtgctattgatataatgatatcatcctgttatgtgacttgtttatgctgctgctgttatttaactaagtgcatagtgtatttatat 12448  T
Q  252 gatgaa--------gtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagc 343  Q
    ||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||    
T  12447 gatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcatagcatttcattgagc 12348  T
Q  344 ttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12347 ttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcct 12313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 12687 - 12627
Alignment:
Q  19 gatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgta 79  Q
    |||||||||||||||||    || |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  12687 gatcaagagtgaacccccttatgataatgagacctaatgatgacgtttaatgcagtctgta 12627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0572 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0572
Description:

Target: scaffold0572; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 158 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 9955 - 9721
Alignment:
Q  158 atgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcatagg-----tatat 251  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||      |||||    
T  9955 atgatacaattgatgtgctattgatataatgatatcatcctgctacgtgacttgtttatgctgctgctgttatttaacttagtgcatagtgtatttatat 9856  T
Q  252 gatgaa--------gtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagc 343  Q
    ||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||    
T  9855 gatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcataacatttcattgagc 9756  T
Q  344 ttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9755 ttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcct 9721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 177 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 74081 - 73863
Alignment:
Q  177 ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcatagg---------tatatgatgaa--------gt 259  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||||| |          |||||||||||        ||    
T  74081 ttgatataatgatatcatcctgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatgtatttatatatgatgaaatgatgacgt 73982  T
Q  260 ttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacga 359  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  73981 ttagctccaaattgttggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgt 73882  T
Q  360 atattaggagctttgtcct 378  Q
     ||||||||||||||||||    
T  73881 ttattaggagctttgtcct 73863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 3)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 177 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 78297 - 78083
Alignment:
Q  177 ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcatag-gtat------------atgatgaagtttag 263  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||   ||||||||||||||||||||  ||||            ||||||| ||||||    
T  78297 ttgatataatgatatcatcctgttatgtgacttgattatgctgctgttgttatttaactaagtgcatattgtattcatacgatgaaatgatgacgtttag 78198  T
Q  264 ctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatat 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  78197 ctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcatagcatttcattgagcttagtcctcaccacgattat 78098  T
Q  364 taggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||||||    
T  78097 taggagctttgtcct 78083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 252 - 378
Target Start/End: Original strand, 60878 - 60999
Alignment:
Q  252 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgca-tagcatctcattgagcttagtcc 350  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  60878 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacgatgttttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 60975  T
Q  351 tcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||| ||    |||||||||||||||    
T  60976 tcaccatga----taggagctttgtcct 60999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 72
Target Start/End: Original strand, 58279 - 58334
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgca 72  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  58279 ttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatgacgtttaatgca 58334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0744 (Bit Score: 89; Significance: 8e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0744
Description:

Target: scaffold0744; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 250 - 378
Target Start/End: Original strand, 3782 - 3910
Alignment:
Q  250 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 349  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3782 atgatgacgtttagctccaaattgttggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatttcattgagcttagtc 3881  T
Q  350 ctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||||||   ||||||||||||||||||    
T  3882 ctcaccacatttattaggagctttgtcct 3910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0744; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 187 - 243
Target Start/End: Original strand, 3702 - 3758
Alignment:
Q  187 gatatcatcttgttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcat 243  Q
    ||||||||| || |||||||| || |||||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  3702 gatatcatcctgctatgtgacttgattatgctgctgctgttgtttaactaagtgcat 3758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 89; Significance: 8e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 177 - 378
Target Start/End: Original strand, 19599 - 19815
Alignment:
Q  177 ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcatagg-----tatatgatgaa---------gttta 262  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||||||       |||||||||||         |||||    
T  19599 ttgatataatgatatcatcctgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataagatgacgttta 19698  T
Q  263 gctccaaattattggatgcatgttga-taagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  19699 gctccaaattattggatgcatgttgaatacgatgattacggtgttgtgttgatatgagtccatgcatagcatttcattgagcttagtcctcaccacgatt 19798  T
Q  362 attaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||| ||||    
T  19799 attaggagctttatcct 19815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 72
Target Start/End: Original strand, 19438 - 19493
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgca 72  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  19438 ttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatgacgtttaatgca 19493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 76; Significance: 5e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 295 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 38648 - 38565
Alignment:
Q  295 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38648 gattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 38565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0525
Description:

Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 250 - 378
Target Start/End: Original strand, 4214 - 4344
Alignment:
Q  250 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttga-taagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagt 348  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4214 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgaatacgatgattacggtgttttgttgataagagtccatgcatagcatatcattgagcttagt 4313  T
Q  349 cctcaccacga-atattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  4314 cctcaccacgattttttaggagctttgtcct 4344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0780 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0780
Description:

Target: scaffold0780; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 177 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 198 - 3
Alignment:
Q  177 ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcatagg-----tatatgatgaa--------gtttag 263  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||  |||| |||| | ||||||||||||||||||||       |||||||||||        ||||||    
T  198 ttgatataatgatatcattctgttatgtgacttgactatgttgctgctgttatttaactaagtgcatattgtttttatatgatgaaatgatgacgtttag 99  T
Q  264 ctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgca-tagcatctcattgagcttagtcctcaccacga 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  98 ctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacga 3  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0780; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 357 - 303
Alignment:
Q  19 gatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcag 73  Q
    |||||||||||||||||    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  357 gatcaagagtgaacccccttatggtaatgagacctaatgatgacgtttaatgcag 303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 378
Target Start/End: Original strand, 14856 - 15230
Alignment:
Q  19 gatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt-aagttattttaatattaatcgaatatgaac 117  Q
    |||||||||||||||||    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| || |||| ||| ||| || |||||||| ||  | ||      
T  14856 gatcaagagtgaacccccttatggtaatgagacctaatgatgacgtttaatgcagtctgtaaagctgtttaagatatgttgatattaattgagcaagat- 14954  T
Q  118 tattgtattgtatattcgtgcaagataagaagatgtgataatgatacaaattatgtgct-ttgatataatgatatcatcttgttatgtgacctgtttatg 216  Q
    ||  |||||||| | |  || |||||| ||| || | || ||||| ||| | || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||    
T  14955 taaagtattgtacaattatgtaagatatgaaaatttaattatgatgcaattgatttgctattgatataatgatatcatcctgttatgtgacttgactatg 15054  T
Q  217 ctgcttccgttatttaactaagtgcatagg-----tatatgatgaa--------gtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgat 303  Q
     |||| | |||||||||||| |||||||       |||||||||||        |||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| | |    
T  15055 ttgctgctgttatttaactatgtgcataatgtctatatatgatgaaatgatgatgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgttgattatggt 15154  T
Q  304 gttttgttcatatgtgtccatgca-tagcatctcattgagcttagtcctcaccacga-atattaggagctttgtcct 378  Q
    | |||||||||| | || |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  15155 gatttgttcataagagttcatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgatttattaggagctttgtcct 15230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0055 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0055
Description:

Target: scaffold0055; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 295 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 25314 - 25231
Alignment:
Q  295 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25314 gattatgatgttttgttcatctgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcct 25231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 250 - 378
Target Start/End: Original strand, 8963 - 9091
Alignment:
Q  250 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagt 348  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||| || ||||||| || |||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  8963 atgatgacgtttagctccaaattattggatgctcattgatatgttgattacggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagt 9061  T
Q  349 cctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9062 cctcaccacgattattaggagctttgtcct 9091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0560 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0560
Description:

Target: scaffold0560; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 250 - 369
Target Start/End: Original strand, 5907 - 6026
Alignment:
Q  250 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgca-tagcatctcattgagcttagt 348  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||| || ||||||| || |||||| ||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  5907 atgatgacgtttagctccaaattattggatgctcattgatatgttgattacggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagt 6005  T
Q  349 cctcaccacgaatattaggag 369  Q
    ||||||||||| |||||||||    
T  6006 cctcaccacgattattaggag 6026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0560; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 87
Target Start/End: Original strand, 5659 - 5729
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgtt 87  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||||    
T  5659 ttgatcatgagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatgacgtttaatgcagtctgtaaagttgtt 5729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 298 - 378
Target Start/End: Original strand, 32473 - 32553
Alignment:
Q  298 tacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||||||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32473 tacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagttttgtcct 32553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 252 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 9332 - 9207
Alignment:
Q  252 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcc 350  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| ||||| | |||||| |  ||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  9332 gatgacgtttagatccaaattattagatgcttattgatatgatgattacgatgttttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 9235  T
Q  351 tcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||    
T  9234 tcaccacgattaataggagctttgtcct 9207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 9424 - 9354
Alignment:
Q  177 ttgatataatgatatcatc---ttgttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcata 244  Q
    |||||||||||||||||||   ||||| |||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  9424 ttgatataatgatatcatcctgttgttgtgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcata 9354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0242 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0242
Description:

Target: scaffold0242; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 252 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 19570 - 19449
Alignment:
Q  252 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgca-tagcatctcattgagcttagtcc 350  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  19570 gatgatgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacgatgttttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 19473  T
Q  351 tcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||| ||    |||||||||||||||    
T  19472 tcaccatga----taggagctttgtcct 19449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0242; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 252 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 25744 - 25623
Alignment:
Q  252 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgca-tagcatctcattgagcttagtcc 350  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  25744 gatgatgtttagctccaaattattggatgcattttgatatgatgattacgatgttttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 25647  T
Q  351 tcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||| ||    |||||||||||||||    
T  25646 tcaccatga----taggagctttgtcct 25623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 252 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 242052 - 241931
Alignment:
Q  252 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgca-tagcatctcattgagcttagtcc 350  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  242052 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacgatgttttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 241955  T
Q  351 tcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||| ||    |||||||||||||||    
T  241954 tcaccatga----taggagctttgtcct 241931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 242302 - 242247
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgca 72  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  242302 ttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatgacgtttaatgca 242247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 250 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 215 - 81
Alignment:
Q  250 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 340  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  215 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 116  T
Q  341 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  115 agctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcct 81  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0372 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0372
Description:

Target: scaffold0372; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 250 - 378
Target Start/End: Original strand, 5440 - 5574
Alignment:
Q  250 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 340  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  5440 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 5539  T
Q  341 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  5540 agctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcct 5574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 250 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 12187 - 12053
Alignment:
Q  250 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 340  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  12187 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 12088  T
Q  341 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  12087 agctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcct 12053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0553 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0553
Description:

Target: scaffold0553; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 295 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 8743 - 8659
Alignment:
Q  295 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacg-aatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  8743 gattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcct 8659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0553; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 9034 - 8945
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgttaagttattttaatattaat 106  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||  |||||||||||| ||||| || | ||||| ||| || ||||||||    
T  9034 ttgatcaggagtgaacccctaattggtaatgaaaccttatgataacgtttaatgcagtctgtaaagctattaagatatgttgatattaat 8945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 295 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 22158 - 22074
Alignment:
Q  295 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacg-aatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  22158 gattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcct 22074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 22449 - 22360
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgttaagttattttaatattaat 106  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||  ||||  |||||||||||| ||||| || | ||||| ||| || ||||||||    
T  22449 ttgatcaagagtgaacccctatttggtaatgaaaccttatgataacgtttaatgcagtctgtaaagctattaagatatgttgatattaat 22360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 295 - 378
Target Start/End: Original strand, 4230 - 4314
Alignment:
Q  295 gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacg-aatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  4230 gattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcct 4314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 106
Target Start/End: Original strand, 3939 - 4028
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgcagactgtagagttgttaagttattttaatattaat 106  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||  |||||||||||| ||||| || | ||||| ||| || ||||||||    
T  3939 ttgatcaggagtgaacccctaattggtaatgaaaccttatgataacgtttaatgcagtctgtaaagctattaagatatgttgatattaat 4028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 252 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 10169 - 10043
Alignment:
Q  252 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgca-tagcatctcattgagcttagtcc 350  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||| ||  ||||| ||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||||     
T  10169 gatgacgtttatctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacggtgaattgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtct 10071  T
Q  351 tcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||| |||| ||||| ||||||||||||    
T  10070 tcacgacgattattacgagctttgtcct 10043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 177 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 10261 - 10191
Alignment:
Q  177 ttgatataatgatatcatc---ttgttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcata 244  Q
    |||||||||||||||||||   ||||| |||||| ||  ||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  10261 ttgatataatgatatcatcctgttgttgtgtgacttgactatgctgctgctcttatttaactaagtgcata 10191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 252 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 2804 - 2699
Alignment:
Q  252 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgca-tagcatctcattgagcttagtcc 350  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||| |  ||||||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  2804 gatgacgtttggctccaaattattggatgcatatcgatatgatgattacgatgttttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 2707  T
Q  351 tcaccacg 358  Q
    ||||||||    
T  2706 tcaccacg 2699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0233 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0233
Description:

Target: scaffold0233; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 252 - 359
Target Start/End: Original strand, 14651 - 14758
Alignment:
Q  252 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgca-tagcatctcattgagcttagtcc 350  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |  ||||||| || |||||| ||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  14651 gatgacgtttagctccaaattattggatgcacattgatatgatgattacggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 14749  T
Q  351 tcaccacga 359  Q
    | |||||||    
T  14750 ttaccacga 14758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0233; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 72
Target Start/End: Original strand, 14401 - 14456
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgca 72  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  14401 ttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgagacctaatgatgacgtttaatgca 14456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 72
Target Start/End: Original strand, 30068 - 30123
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgtttaatgca 72  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  30068 ttgatcaagagtgaacccctaaatggtaatgagacctaatgatgacgtttaatgca 30123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 251 - 378
Target Start/End: Original strand, 80871 - 80995
Alignment:
Q  251 tgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacga-tgttttgttcatatgtgtccatgca-tagcatctcattgagcttagt 348  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |  || ||||| ||||||||| ||| | ||||||||| |||||| ||||||||||| ||    
T  80871 tgatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgaatacgattgttttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgt 80968  T
Q  349 cctcaccacgaatattaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||| |   |||||||||||||||||    
T  80969 cctcaccatg---attaggagctttgtcct 80995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 252 - 356
Target Start/End: Original strand, 25087 - 25190
Alignment:
Q  252 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgca-tagcatctcattgagcttagtcc 350  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |  |||||| |||||||||| ||| | ||||||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  25087 gatgacgtttagctccaaattattggatgcacattgatatgatgattacaatgttttgttgata-gagtccatgcattagcgt-tcattgagcttagtcc 25184  T
Q  351 tcacca 356  Q
    ||||||    
T  25185 tcacca 25190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0697 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0697
Description:

Target: scaffold0697; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 252 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 6610 - 6522
Alignment:
Q  252 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgca-tagcatctcattg 340  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||| |||||||| ||| | ||||||||| |||||| ||||||    
T  6610 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacgacgttttgttgata-gagtccatgcattagcatttcattg 6522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 20 - 56
Target Start/End: Original strand, 109188 - 109224
Alignment:
Q  20 atcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagt 56  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  109188 atcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagt 109224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 264 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 9421 - 9311
Alignment:
Q  264 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 361  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||||| ||||| |||||||||||  || | |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||      
T  9421 ctccaaattattggatgtatatgtgataagttgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccatga-- 9326  T
Q  362 attaggagctttgtcct 378  Q
      |||||||||||||||    
T  9325 --taggagctttgtcct 9311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0229 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0229
Description:

Target: scaffold0229; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 264 - 378
Target Start/End: Original strand, 11891 - 12002
Alignment:
Q  264 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 361  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||| ||||| | ||| ||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||       
T  11891 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaaggtgtcttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccacg--- 11985  T
Q  362 attaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||||||||    
T  11986 attaggagctttgtcct 12002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 264 - 378
Target Start/End: Original strand, 33050 - 33161
Alignment:
Q  264 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 361  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||| ||||| | ||| ||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||       
T  33050 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaaggtgtcttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccacg--- 33144  T
Q  362 attaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||||||||    
T  33145 attaggagctttgtcct 33161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 264 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 9904 - 9793
Alignment:
Q  264 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 361  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||| ||||| |||||||||||  || | |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| |       
T  9904 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccatg--- 9810  T
Q  362 attaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||||||||    
T  9809 attaggagctttgtcct 9793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 36952 - 36903
Alignment:
Q  17 ttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtcgttta 67  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||    
T  36952 ttgatcaagagtgaacccctaa-tggtaatgagacctaaagatgacgttta 36903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 30885 - 30774
Alignment:
Q  264 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 361  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||||||||| | ||| ||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||  ||    
T  30885 ctccaaattattggatgtataagtgataagtcgattaaggtgtcttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccac--at 30790  T
Q  362 attaggagctttgtcct 378  Q
     ||||||||||||||||    
T  30789 -ttaggagctttgtcct 30774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 264 - 378
Target Start/End: Original strand, 189767 - 189878
Alignment:
Q  264 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaat 361  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||| ||||| | ||| ||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||       
T  189767 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaaggtgtcttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccacg--- 189861  T
Q  362 attaggagctttgtcct 378  Q
    |||||||||||||||||    
T  189862 attaggagctttgtcct 189878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 173292 - 173197
Alignment:
Q  264 ctccaaattattggatgcatgt-tgataagtcgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacga 359  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||| ||||| ||||||||||| ||| | |||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  173292 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaagatgttttgttgata-gagtccatgcattagcata-cattgagctttgtcctcaccacga 173197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University