View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF21582_low_8 (Length: 437)

Name: NF21582_low_8
Description: NF21582
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF21582_low_8
NF21582_low_8
[»] chr3 (18 HSPs)
chr3 (18-429)||(77112-77523)
chr3 (18-429)||(48248958-48249369)
chr3 (18-429)||(29949542-29949953)
chr3 (18-429)||(29998696-29999107)
chr3 (18-429)||(36815605-36816019)
chr3 (18-429)||(46991337-46991749)
chr3 (28-429)||(6504057-6504458)
chr3 (28-427)||(21954341-21954740)
chr3 (18-429)||(13745810-13746224)
chr3 (18-429)||(14400115-14400529)
chr3 (28-429)||(16446178-16446582)
chr3 (18-429)||(3950301-3950715)
chr3 (125-429)||(7839154-7839457)
chr3 (18-429)||(8159072-8159486)
chr3 (18-429)||(30945731-30946145)
chr3 (18-429)||(6742445-6742859)
chr3 (28-91)||(8118509-8118572)
chr3 (36-85)||(21543391-21543440)
[»] chr2 (28 HSPs)
chr2 (18-426)||(11691922-11692330)
chr2 (30-429)||(28347501-28347900)
chr2 (18-429)||(9655713-9656124)
chr2 (18-429)||(12906584-12906995)
chr2 (18-429)||(24604181-24604592)
chr2 (18-429)||(24940742-24941153)
chr2 (18-429)||(45476915-45477327)
chr2 (17-429)||(436870-437290)
chr2 (18-429)||(43948375-43948785)
chr2 (18-429)||(27274449-27274863)
chr2 (18-425)||(1097918-1098325)
chr2 (18-429)||(24751217-24751631)
chr2 (18-429)||(34919874-34920285)
chr2 (18-429)||(7264538-7264952)
chr2 (18-429)||(41007068-41007483)
chr2 (28-429)||(39795528-39795932)
chr2 (18-429)||(5348725-5349139)
chr2 (18-429)||(10622543-10622957)
chr2 (18-429)||(38947321-38947735)
chr2 (18-429)||(41561570-41561984)
chr2 (18-429)||(211530-211944)
chr2 (88-389)||(17996334-17996635)
chr2 (131-429)||(3801768-3802069)
chr2 (28-112)||(3797900-3797984)
chr2 (28-189)||(25618188-25618352)
chr2 (28-91)||(24683970-24684033)
chr2 (28-85)||(25855455-25855512)
chr2 (28-91)||(21536104-21536167)
[»] chr7 (13 HSPs)
chr7 (18-429)||(8401062-8401473)
chr7 (18-429)||(43826698-43827109)
chr7 (18-429)||(47062442-47062853)
chr7 (18-429)||(12116461-12116872)
chr7 (18-429)||(15067447-15067861)
chr7 (18-429)||(42500965-42501379)
chr7 (18-429)||(18106946-18107360)
chr7 (28-342)||(10707781-10708095)
chr7 (33-429)||(616853-617252)
chr7 (18-429)||(30788097-30788511)
chr7 (18-429)||(43622224-43622638)
chr7 (18-429)||(45764937-45765351)
chr7 (28-85)||(3762832-3762889)
[»] chr8 (16 HSPs)
chr8 (18-429)||(2145091-2145502)
chr8 (30-429)||(43371325-43371724)
chr8 (28-427)||(35964847-35965246)
chr8 (18-429)||(7169449-7169849)
chr8 (18-429)||(8421945-8422359)
chr8 (18-429)||(7341637-7342051)
chr8 (18-429)||(32430954-32431368)
chr8 (34-429)||(30303715-30304113)
chr8 (18-429)||(32376997-32377411)
chr8 (195-429)||(43686419-43686653)
chr8 (16-199)||(43683327-43683510)
chr8 (18-145)||(22585861-22585988)
chr8 (18-145)||(22581999-22582126)
chr8 (341-429)||(22581386-22581474)
chr8 (28-91)||(17317379-17317442)
chr8 (28-83)||(17340935-17340990)
[»] chr4 (16 HSPs)
chr4 (18-428)||(4978050-4978460)
chr4 (18-429)||(4769692-4770103)
chr4 (18-429)||(4977313-4977723)
chr4 (18-427)||(38462929-38463338)
chr4 (33-429)||(3405348-3405747)
chr4 (18-429)||(19071746-19072160)
chr4 (110-429)||(11503064-11503383)
chr4 (238-429)||(9891580-9891774)
chr4 (284-429)||(21472352-21472497)
chr4 (18-112)||(17238920-17239014)
chr4 (18-135)||(51643096-51643213)
chr4 (326-429)||(41024757-41024862)
chr4 (28-91)||(13896851-13896914)
chr4 (30-90)||(20970616-20970675)
chr4 (28-90)||(6183584-6183646)
chr4 (28-81)||(17497453-17497506)
[»] chr1 (23 HSPs)
chr1 (19-429)||(19497557-19497967)
chr1 (19-429)||(38691032-38691442)
chr1 (40-429)||(13175339-13175728)
chr1 (18-429)||(37016472-37016883)
chr1 (18-429)||(51663816-51664227)
chr1 (28-429)||(50115865-50116266)
chr1 (18-429)||(12648668-12649082)
chr1 (37-429)||(46974722-46975114)
chr1 (28-386)||(36074901-36075259)
chr1 (18-429)||(5079493-5079907)
chr1 (18-429)||(29354777-29355191)
chr1 (28-429)||(13630974-13631378)
chr1 (18-429)||(44467140-44467554)
chr1 (18-429)||(38774203-38774618)
chr1 (18-429)||(3946550-3946964)
chr1 (18-429)||(20351014-20351428)
chr1 (149-429)||(41455395-41455678)
chr1 (237-429)||(3984671-3984867)
chr1 (18-230)||(3991365-3991577)
chr1 (28-84)||(32105770-32105826)
chr1 (142-202)||(32105887-32105947)
chr1 (57-94)||(742428-742465)
chr1 (30-91)||(25232130-25232191)
[»] chr6 (7 HSPs)
chr6 (18-428)||(21357442-21357852)
chr6 (18-428)||(23961424-23961834)
chr6 (30-429)||(31147880-31148279)
chr6 (18-429)||(28357876-28358290)
chr6 (29-412)||(18607571-18607947)
chr6 (18-429)||(1610840-1611254)
chr6 (19-302)||(254501-254784)
[»] chr5 (15 HSPs)
chr5 (18-429)||(7799107-7799509)
chr5 (18-429)||(25895186-25895600)
chr5 (28-429)||(27865944-27866348)
chr5 (28-429)||(34079338-34079742)
chr5 (18-429)||(1036909-1037323)
chr5 (18-429)||(13566196-13566610)
chr5 (18-379)||(4198995-4199356)
chr5 (33-431)||(18536443-18536841)
chr5 (28-429)||(11031551-11031955)
chr5 (28-429)||(38858289-38858693)
chr5 (18-426)||(37818966-37819377)
chr5 (18-355)||(7020055-7020395)
chr5 (18-389)||(28884527-28884901)
chr5 (18-428)||(20287828-20288240)
chr5 (375-429)||(4202388-4202442)
[»] scaffold0341 (1 HSPs)
scaffold0341 (18-429)||(15446-15860)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (18-429)||(2439-2853)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (18-429)||(34367-34781)
[»] scaffold0201 (1 HSPs)
scaffold0201 (237-429)||(25254-25449)
[»] scaffold0219 (1 HSPs)
scaffold0219 (274-429)||(17627-17782)
[»] scaffold0542 (1 HSPs)
scaffold0542 (28-85)||(1169-1226)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (27-93)||(2100-2166)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 348; Significance: 0; HSPs: 18)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 429
Target Start/End: Original strand, 77112 - 77523
Alignment:
Q  18 gattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcat 117  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  77112 gattctaccctgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacggtatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcat 77211  T
Q  118 actttaggaaaggtgggaaatcactacaaacatcttggaactccactaatgcaattgcatataactcttgagtggacgattcaaccatagctttcaatgc 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  77212 actttaggaaaggtgggaaatcactacaagcatcttggaactccactaatgcatttacatataactcttgagtgggagattcaaccatagctttccatgc 77311  T
Q  218 cctcatgatcttcgtgacaacatcacgattactcacctctttcccatccttttttcccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaacattt 317  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  77312 cctcatgatcttcttgacaccatcacgattactcacctcttttccatccttttttcccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaacattt 77411  T
Q  318 gcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttctgggaaaacaattccaaccgctttcatcaaagacccatccctgtcggtaacaatcacctttg 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  77412 gcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataattttctggaaaaacaattccaaccgctttcatcaaagactcatccgtgtcggtaacaatcaccttag 77511  T
Q  418 gcatattcatct 429  Q
    ||||||||||||    
T  77512 gcatattcatct 77523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 18 - 429
Target Start/End: Original strand, 48248958 - 48249369
Alignment:
Q  18 gattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcat 117  Q
    ||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48248958 gattcgaccttgttcgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtatgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatggcat 48249057  T
Q  118 actttaggaaaggtgggaaatcactacaaacatcttggaactccactaatgcaattgcatataactcttgagtggacgattcaaccatagctttcaatgc 217  Q
    | |||  ||||  |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  48249058 aatttttgaaaattgggaaatcactacatgaatcttggaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggtgattcaaccatagctttccatgc 48249157  T
Q  218 cctcatgatcttcgtgacaacatcacgattactcacctctttcccatccttttttcccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaacattt 317  Q
    |||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  48249158 cctcattatcttcttgacaacatcgcgattactcacctctttcccatccttttttcccaaaggatatttacaatctaagacacacctttgtttaacattt 48249257  T
Q  318 gcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttctgggaaaacaattccaaccgctttcatcaaagacccatccctgtcggtaacaatcacctttg 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| |    
T  48249258 gcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttcgggaaaaacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccttgtcggtaacaatcaccttag 48249357  T
Q  418 gcatattcatct 429  Q
    ||||||||||||    
T  48249358 gcatattcatct 48249369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 18 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 29949953 - 29949542
Alignment:
Q  18 gattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcat 117  Q
    ||||| ||| |||||||||  || |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29949953 gattcaaccctgttggtggccctacaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcat 29949854  T
Q  118 actttaggaaaggtgggaaatcactacaaacatcttggaactccactaatgcaattgcatataactcttgagtggacgattcaaccatagctttcaatgc 217  Q
    | |||  |||| ||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  29949853 aatttttgaaaagtgggaaatcactacatgaatcttagaactccactaatgcatttgcatataactcttgagtgggcgattcaaccatagatttccatgc 29949754  T
Q  218 cctcatgatcttcgtgacaacatcacgattactcacctctttcccatccttttttcccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaacattt 317  Q
    |||||| |||||  | |||||||| |||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  29949753 cctcattatcttattcacaacatcgcgaggtttcacctctttcccatccttttttcccaaaggatatttacaatctaagacacacctttgtttaacattt 29949654  T
Q  318 gcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttctgggaaaacaattccaaccgctttcatcaaagacccatccctgtcggtaacaatcacctttg 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |    
T  29949653 gcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttcggggaaaacatttgcaacctctttcatcaaagacatatccctgtcggtcacaatcaccttag 29949554  T
Q  418 gcatattcatct 429  Q
    ||||||||||||    
T  29949553 gcatattcatct 29949542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 18 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 29999107 - 29998696
Alignment:
Q  18 gattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcat 117  Q
    ||||| ||| |||||||||  || |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29999107 gattcaaccctgttggtggccctacaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcat 29999008  T
Q  118 actttaggaaaggtgggaaatcactacaaacatcttggaactccactaatgcaattgcatataactcttgagtggacgattcaaccatagctttcaatgc 217  Q
    | |||  |||| ||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  29999007 aatttttgaaaagtgggaaatcactacatgaatcttagaactccactaatgcatttgcatataactcttgagtgggcgattcaaccatagatttccatgc 29998908  T
Q  218 cctcatgatcttcgtgacaacatcacgattactcacctctttcccatccttttttcccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaacattt 317  Q
    |||||| |||||  | |||||||| |||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  29998907 cctcattatcttattcacaacatcgcgaggtttcacctctttcccatccttttttcccaaaggatatttacaatctaagacacacctttgtttaacattt 29998808  T
Q  318 gcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttctgggaaaacaattccaaccgctttcatcaaagacccatccctgtcggtaacaatcacctttg 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |    
T  29998807 gcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttcggggaaaacatttgcaacctctttcatcaaagacatatccctgtcggtcacaatcaccttag 29998708  T
Q  418 gcatattcatct 429  Q
    ||||||||||||    
T  29998707 gcatattcatct 29998696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 18 - 429
Target Start/End: Original strand, 36815605 - 36816019
Alignment:
Q  18 gattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcat 117  Q
    ||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36815605 gattcgaccctgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatggcat 36815704  T
Q  118 actttaggaaaggtgggaaatcactacaaacatcttggaactccactaatgcaattgcatataactcttgagtggacgattcaaccatagctttcaatgc 217  Q
    | | ||  |||  |||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  36815705 aatctacaaaaattgggaaatcactacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgc 36815804  T
Q  218 cctcatgatcttcgtgacaacatcacgattactcacctctttcccatcctttttt---cccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaaca 314  Q
    | |||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  36815805 cttcattatcttcttgacaacatcgcgattgctcacctctttcccatcctttttaaaacccaaaggatatttacaatctaagacacacctttgtttaaca 36815904  T
Q  315 tttgcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttctgggaaaacaattccaaccgctttcatcaaagacccatccctgtcggtaacaatcacct 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  36815905 tttgcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttcgggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcacct 36816004  T
Q  415 ttggcatattcatct 429  Q
    | |||||||||||||    
T  36816005 taggcatattcatct 36816019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 18 - 429
Target Start/End: Original strand, 46991337 - 46991749
Alignment:
Q  18 gattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcat 117  Q
    ||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46991337 gattcgaccctgttcgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggcctgtccatgccctcacaattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcat 46991436  T
Q  118 actttagg-aaaggtgggaaatcactacaaacatcttggaactccactaatgcaattgcatataactcttgagtggacgattcaaccatagctttcaatg 216  Q
    | |||    |||  |||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  46991437 aatttttttaaaattgggaaatcactacatgaatcttggaactccattaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgattcaaccatagctttccatg 46991536  T
Q  217 ccctcatgatcttcgtgacaacatcacgattactcacctctttcccatccttttttcccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaacatt 316  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  46991537 ccctcattatcttcttgacaacatcgcgattactcacctctttcccatccttttttcctaaaggatatttacaatctaagacacacctttgtttaacatt 46991636  T
Q  317 tgcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttctgggaaaacaattccaaccgctttcatcaaagacccatccctgtcggtaacaatcaccttt 416  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| || ||| || |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||     
T  46991637 tgcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataattttcgggaaaaacatttgcaatcgttttcatcaaagacatatccatgtcggtaacaatcacctta 46991736  T
Q  417 ggcatattcatct 429  Q
    |||||||||||||    
T  46991737 ggcatattcatct 46991749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 28 - 429
Target Start/End: Original strand, 6504057 - 6504458
Alignment:
Q  28 tgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcatactttaggaa 127  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||    
T  6504057 tgttgttggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtatgtctatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatggcataattttttaa 6504156  T
Q  128 aggtgggaaatcactacaaacatcttggaactccactaatgcaattgcatataactcttgagtggacgattcaaccatagctttcaatgccctcatgatc 227  Q
    |  | |||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||  |||||| |||    
T  6504157 aattaggaaatcactacatgaatcttggaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgattcaaccatagatttccatttcctcattatc 6504256  T
Q  228 ttcgtgacaacatcacgattactcacctctttcccatccttttttcccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaacatttgcttgcacat 327  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6504257 ttcttgacaacatcgcgattactcacctctttcccatccttttttcccaaaggatatttacaatctgagacacacatttgtttaacatttgcttgcacat 6504356  T
Q  328 gaaagtaacaattcattgcataactttctgggaaaacaattccaaccgctttcatcaaagacccatccctgtcggtaacaatcacctttggcatattcat 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  6504357 gaaagtaacaattcattgcataactttcggggaaaccatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccgtgtcgttaacaatcaccttaggcatattcat 6504456  T
Q  428 ct 429  Q
    ||    
T  6504457 ct 6504458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 28 - 427
Target Start/End: Original strand, 21954341 - 21954740
Alignment:
Q  28 tgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcatactttaggaa 127  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||    
T  21954341 tgtttgtggtccttcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatggtataatttttgaa 21954440  T
Q  128 aggtgggaaatcactacaaacatcttggaactccactaatgcaattgcatataactcttgagtggacgattcaaccatagctttcaatgccctcatgatc 227  Q
    |  |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||     
T  21954441 aattgggaaatcactacatgaatcttggaactccactaatgcaattgcatataaatgttgagtgggcgattcaacaatagctttccatgctctcattatg 21954540  T
Q  228 ttcgtgacaacatcacgattactcacctctttcccatccttttttcccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaacatttgcttgcacat 327  Q
    ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | ||||||||||||||||||||||||    
T  21954541 ttcttgataacatcgcgattactcacctctttcccatccttttttcccaaaggatatttacaatctaagactctcttttgtttaacatttgcttgcacat 21954640  T
Q  328 gaaagtaacaattcattgcataactttctgggaaaacaattccaaccgctttcatcaaagacccatccctgtcggtaacaatcacctttggcatattcat 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||    
T  21954641 gaaagtaacaattcattgcataactttcggggaaaacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcgataacagtcaccttaggcaaattcat 21954740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 18 - 429
Target Start/End: Original strand, 13745810 - 13746224
Alignment:
Q  18 gattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcat 117  Q
    ||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13745810 gattcgaccctgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatggcat 13745909  T
Q  118 actttaggaaaggtgggaaatcactacaaacatcttggaactccactaatgcaattgcatataactcttgagtggacgattcaaccatagctttcaatgc 217  Q
    | | ||  |||  |||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  13745910 aatctacaaaaattgggaaatcactacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgc 13746009  T
Q  218 cctcatgatcttcgtgacaacatcacgattactcacctctttcccatcctttttt---cccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaaca 314  Q
    | |||| |||||| | || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  13746010 cttcattatcttcttcaccacatcgcgattgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaatccaagacacacctttgtttaaca 13746109  T
Q  315 tttgcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttctgggaaaacaattccaaccgctttcatcaaagacccatccctgtcggtaacaatcacct 414  Q
    || |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || ||||||  | ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  13746110 ttagcttgcacatgaaaataacaattcaatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcacct 13746209  T
Q  415 ttggcatattcatct 429  Q
    | |||||||||||||    
T  13746210 taggcatattcatct 13746224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 18 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 14400529 - 14400115
Alignment:
Q  18 gattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcat 117  Q
    ||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| | | | || |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14400529 gattcgaccctgttcgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctttctatgccctcataattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatggcat 14400430  T
Q  118 actttaggaaaggtgggaaatcactacaaacatcttggaactccactaatgcaattgcatataactcttgagtggacgattcaaccatagctttcaatgc 217  Q
    | |||   |||  |||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  14400429 aattttcaaaaattgggaaatcactacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggtgattcaaccatagctttccatgc 14400330  T
Q  218 cctcatgatcttcgtgacaacatcacgattactcacctctttcccatcctttttt---cccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaaca 314  Q
    | |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |    
T  14400329 cttcattatcttcttgacaacatcgcgattgctcacctatttcccatcctttttaaaacccaaaggatatttacaatctaagacacacctttgttttata 14400230  T
Q  315 tttgcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttctgggaaaacaattccaaccgctttcatcaaagacccatccctgtcggtaacaatcacct 414  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| |||    
T  14400229 tttgcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttctggaaaaacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcccct 14400130  T
Q  415 ttggcatattcatct 429  Q
    | |||||||||||||    
T  14400129 taggcatattcatct 14400115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 28 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 16446582 - 16446178
Alignment:
Q  28 tgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcatactttaggaa 127  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||    
T  16446582 tgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatggcataatctacaaa 16446483  T
Q  128 aggtgggaaatcactacaaacatcttggaactccactaatgcaattgcatataactcttgagtggacgattcaaccatagctttcaatgccctcatgatc 227  Q
    |  |||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||    
T  16446482 aattgggaaatcactacatgaatctttgaactccactaatgcatttgaatataactgttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccttcattatc 16446383  T
Q  228 ttcgtgacaacatcacgattactcacctctttcccatcctttttt---cccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaacatttgcttgca 324  Q
    ||| | || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  16446382 ttcttcaccacatcgcgattgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaatccaagacacacctttgtttaacattagcttgca 16446283  T
Q  325 catgaaagtaacaattcattgcataactttctgggaaaacaattccaaccgctttcatcaaagacccatccctgtcggtaacaatcacctttggcatatt 424  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| |  | |||||||| |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  16446282 catgaaaataacaattcattgcataactttccggaaaaatatgtgcaaccgctgtcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatatt 16446183  T
Q  425 catct 429  Q
    |||||    
T  16446182 catct 16446178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 18 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 3950715 - 3950301
Alignment:
Q  18 gattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcat 117  Q
    ||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3950715 gattcgaccttgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcat 3950616  T
Q  118 actttaggaaaggtgggaaatcactacaaacatcttggaactccactaatgcaattgcatataactcttgagtggacgattcaaccatagctttcaatgc 217  Q
    | | ||  |||  |||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||  |||||||||||||||||| ||||    
T  3950615 aatctacaaaaattgggaaatcactacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagctttccatgc 3950516  T
Q  218 cctcatgatcttcgtgacaacatcacgattactcacctctttcccatcctttttt---cccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaaca 314  Q
      |||| |||||| | || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||    
T  3950515 gttcattatcttcttcaccacatcccgattgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaaca 3950416  T
Q  315 tttgcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttctgggaaaacaattccaaccgctttcatcaaagacccatccctgtcggtaacaatcacct 414  Q
    || ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| || ||||||  | ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  3950415 ttagcttgcacatgaaaaaaacaattcaatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcacct 3950316  T
Q  415 ttggcatattcatct 429  Q
    | |||||||||||||    
T  3950315 taggcatattcatct 3950301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 125 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 7839457 - 7839154
Alignment:
Q  125 gaaaggtgggaaatcactacaaacatcttggaactccactaatgcaattgcatataactcttgagtggacgattcaaccatagctttcaatgccctcatg 224  Q
    |||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  7839457 gaaaagtgggaaatcactacatgaatcttggaactccactaatgcatttgcataaaactcttgactgggcgattcaaccatagctttccatgccctcatt 7839358  T
Q  225 atcttcgtgacaacatcacgattactcacctctttcccatccttttttcccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaacatttgcttgca 324  Q
    |||||  |||||||||| |||    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7839357 atcttattgacaacatcgcgaggtttcacctctttcctatccttttt-cccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaacatttgctagca 7839259  T
Q  325 catgaaagtaacaattcattgcataactttctgggaaaacaattccaaccgctttcatcaaagacccatccctgtcggtaacaatcacctttggcatatt 424  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| ||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  7839258 catgaaagtaacaattcattgcataactttcagggaaaacatttgcaaccgctttcatcacagacatatccctgtcggtcacaatcaccttaggcatatt 7839159  T
Q  425 catct 429  Q
    |||||    
T  7839158 catct 7839154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 18 - 429
Target Start/End: Original strand, 8159072 - 8159486
Alignment:
Q  18 gattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcat 117  Q
    ||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8159072 gattcgaccctgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcat 8159171  T
Q  118 actttaggaaaggtgggaaatcactacaaacatcttggaactccactaatgcaattgcatataactcttgagtggacgattcaaccatagctttcaatgc 217  Q
    | | ||  |||  || ||||||||||||   ||||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||  |||||||||||||||||| ||||    
T  8159172 aatctacaaaaattgagaaatcactacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagctttccatgc 8159271  T
Q  218 cctcatgatcttcgtgacaacatcacgattactcacctctttcccatcctttttt---cccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaaca 314  Q
      |||| |||||| | || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||    
T  8159272 gttcattatcttcttcaccacatcccgattgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaaca 8159371  T
Q  315 tttgcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttctgggaaaacaattccaaccgctttcatcaaagacccatccctgtcggtaacaatcacct 414  Q
    || ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| || ||||||  | ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  8159372 ttagcttgcacatgaaaaaaacaattcaatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcacct 8159471  T
Q  415 ttggcatattcatct 429  Q
    | |||||||||||||    
T  8159472 taggcatattcatct 8159486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 18 - 429
Target Start/End: Original strand, 30945731 - 30946145
Alignment:
Q  18 gattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcat 117  Q
    ||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30945731 gattcgaccctgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcat 30945830  T
Q  118 actttaggaaaggtgggaaatcactacaaacatcttggaactccactaatgcaattgcatataactcttgagtggacgattcaaccatagctttcaatgc 217  Q
    | | ||  |||  |||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||  |||||||||||||||||| ||||    
T  30945831 aatctacaaaaattgggaaatcactacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagctttccatgc 30945930  T
Q  218 cctcatgatcttcgtgacaacatcacgattactcacctctttcccatcctttttt---cccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaaca 314  Q
      |||| |||||| | || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||    
T  30945931 gttcattatcttcttcaccacatcccgattgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaaca 30946030  T
Q  315 tttgcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttctgggaaaacaattccaaccgctttcatcaaagacccatccctgtcggtaacaatcacct 414  Q
    || ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| || ||||||  | ||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||    
T  30946031 ttagcttgcacatgaaaaaaacaattcaatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccactttcatcaaagacatatccctatcggtaataatcacct 30946130  T
Q  415 ttggcatattcatct 429  Q
    | |||||||||||||    
T  30946131 taggcatattcatct 30946145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 18 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 6742859 - 6742445
Alignment:
Q  18 gattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcat 117  Q
    ||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  6742859 gattcgaccctgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaagatggtcatggcat 6742760  T
Q  118 actttaggaaaggtgggaaatcactacaaacatcttggaactccactaatgcaattgcatataactcttgagtggacgattcaaccatagctttcaatgc 217  Q
    | | ||  |||  |||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||| | |  ||||||||||||  |||| ||||    
T  6742759 aatctacaaaaattgggaaatcactacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattattgattaggagattcaaccataattttccatgc 6742660  T
Q  218 cctcatgatcttcgtgacaacatcacgattactcacctctttcccatcctttttt---cccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaaca 314  Q
      |||| |||||| | || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    |||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||    
T  6742659 gttcattatcttcttcaccacatcccgattgctcacctcgttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaaca 6742560  T
Q  315 tttgcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttctgggaaaacaattccaaccgctttcatcaaagacccatccctgtcggtaacaatcacct 414  Q
    || ||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||| || ||||||  | ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  6742559 ttagcttgcacatgaaaaaaacaatttaatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcacct 6742460  T
Q  415 ttggcatattcatct 429  Q
    | |||||||||||||    
T  6742459 taggcatattcatct 6742445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 8118572 - 8118509
Alignment:
Q  28 tgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctcctt 91  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| ||| | |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  8118572 tgttggtggtcctgcatccaagatgcaatacaaggtatgcccatgccctcactattttttcctt 8118509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 21543440 - 21543391
Alignment:
Q  36 gttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactatttt 85  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  21543440 gttctgcagccaagatgctagacacggtatgtgcatgccctcactatttt 21543391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 281; Significance: 1e-157; HSPs: 28)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 18 - 426
Target Start/End: Original strand, 11691922 - 11692330
Alignment:
Q  18 gattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcat 117  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11691922 gattctaccctgttggtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctaactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcat 11692021  T
Q  118 actttaggaaaggtgggaaatcactacaaacatcttggaactccactaatgcaattgcatataactcttgagtggacgattcaaccatagctttcaatgc 217  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||    
T  11692022 actttaggaaaagtgggaaatcactacaaacatcttggagctccactaatgcatttgcatataactcttgagtgggcgattcaaccataactttccatgc 11692121  T
Q  218 cctcatgatcttcgtgacaacatcacgattactcacctctttcccatccttttttcccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaacattt 317  Q
     ||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  11692122 tctcattatcttcttgacaacattgcgattactcacctctttcccatccttttttcccaaaggatatttataatctaatatgcacctatgtttaacattt 11692221  T
Q  318 gcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttctgggaaaacaattccaaccgctttcatcaaagacccatccctgtcggtaacaatcacctttg 417  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || ||||| ||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||| |    
T  11692222 tcttacacatgaaagtaacaattcattgcataactttcgggaaaaacatttgcaaccactttcatcaaagacatatccctgtcagtcacaatcaccttag 11692321  T
Q  418 gcatattca 426  Q
    |||||||||    
T  11692322 gcatattca 11692330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Original strand, 28347501 - 28347900
Alignment:
Q  30 ttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcatactttaggaaag 129  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||  ||||     
T  28347501 ttggtggtcctgcaaccaagatgcaagacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcaattcattcaaggtggtcatgacataatttttgaaaa 28347600  T
Q  130 gtgggaaatcactacaaacatcttggaactccactaatgcaattgcatataactcttgagtggacgattcaaccatagctttcaatgccctcatgatctt 229  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  28347601 gtgggaaatcactacatgaatcttggaactccactaattcatttgcatataactcttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccctcattatctt 28347700  T
Q  230 cgtgacaacatcacgattactcacctctttcccatccttttttcccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaacatttgcttgcacatga 329  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28347701 cttgacaacatcgcgattactcacctctttcccatccttttttcccaaaggatatttacaatctaagacgcacctttgtttaacatttgcttgcacatga 28347800  T
Q  330 aagtaacaattcattgcataactttctgggaaaacaattccaaccgctttcatcaaagacccatccctgtcggtaacaatcacctttggcatattcatct 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||||    
T  28347801 aagtaacaattcattgcataacttttggggaaaacattttcaaccgctttcatcaaagacatatccatgtcggtcacaatcaccttagacatattcatct 28347900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 18 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 9656124 - 9655713
Alignment:
Q  18 gattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcat 117  Q
    ||||| ||| |||||||||| || |||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9656124 gattcgaccctgttggtggtcctacaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtctttcacttcattcaaggtggtcatggcat 9656025  T
Q  118 actttaggaaaggtgggaaatcactacaaacatcttggaactccactaatgcaattgcatataactcttgagtggacgattcaaccatagctttcaatgc 217  Q
    | |||  |||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  9656024 aatttttgaaaagtgggaaatcactacatgaatcttggaactccactaatgcatttgcatataactcttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgc 9655925  T
Q  218 cctcatgatcttcgtgacaacatcacgattactcacctctttcccatccttttttcccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaacattt 317  Q
    | |||| |||||| |||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9655924 cgtcattatcttcttgacaacattgggattactcacttctttcccatccttttttcccaaaggatatttacaatctaagacgcacctttgtttaacattt 9655825  T
Q  318 gcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttctgggaaaacaattccaaccgctttcatcaaagacccatccctgtcggtaacaatcacctttg 417  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| |||||||||| ||||  |||||||||||| ||||||||||| |    
T  9655824 gcctgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttcggggaaaacatttgcaactgctttcatcatagacatatccctgtcggtcacaatcaccttag 9655725  T
Q  418 gcatattcatct 429  Q
    | ||||| ||||    
T  9655724 gtatattaatct 9655713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 18 - 429
Target Start/End: Original strand, 12906584 - 12906995
Alignment:
Q  18 gattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcat 117  Q
    ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12906584 gattcaaccctgttggtggtcctgcaaccaagatgcaacacatgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcat 12906683  T
Q  118 actttaggaaaggtgggaaatcactacaaacatcttggaactccactaatgcaattgcatataactcttgagtggacgattcaaccatagctttcaatgc 217  Q
    | ||| ||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  12906684 aattttggaaaagtgggaaatcactacatgaatcttggaactccaccaatgcatttgcatataactcttgagtaggcgattcaaccatagctttccatgc 12906783  T
Q  218 cctcatgatcttcgtgacaacatcacgattactcacctctttcccatccttttttcccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaacattt 317  Q
    |||||| |||||| | |||||||| |||    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||    
T  12906784 cctcattatcttcttcacaacatcgcgaggtttcacctctttcccatccttttttccgaaaggatatttacaatataagacgcacatttgtttaacattt 12906883  T
Q  318 gcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttctgggaaaacaattccaaccgctttcatcaaagacccatccctgtcggtaacaatcacctttg 417  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| | || ||||||||||||||||||||  ||| ||||| || | ||||||||| |    
T  12906884 gcttgcacatgaaagcaacaattcattgcataactttcgggaaaaatatttgcaaccgctttcatcaaagacatatcactgtcagtcataatcaccttag 12906983  T
Q  418 gcatattcatct 429  Q
    ||||||||||||    
T  12906984 gcatattcatct 12906995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 18 - 429
Target Start/End: Original strand, 24604181 - 24604592
Alignment:
Q  18 gattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcat 117  Q
    ||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24604181 gattcgaccctgttggtagtcctgcaaccaagatgcatcacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatggcat 24604280  T
Q  118 actttaggaaaggtgggaaatcactacaaacatcttggaactccactaatgcaattgcatataactcttgagtggacgattcaaccatagctttcaatgc 217  Q
    | ||| | |||| |||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||    
T  24604281 aattttgaaaag-tgggaaataactacatgaatcttggaactccactaatgcatttgcatataactcttgagtgggcgattcaatcatagctttgcatgc 24604379  T
Q  218 -cctcatgatcttcgtgacaacatcacgattactcacctctttcccatccttttttcccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaacatt 316  Q
     |||||| |||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  24604380 gcctcattatcttcttgagaacatcgcgattactcacctctttcccatccttttttcccaaaggatatttacaatctaagacgcacatttgtttaacatt 24604479  T
Q  317 tgcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttctgggaaaacaattccaaccgctttcatcaaagacccatccctgtcggtaacaatcaccttt 416  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||     
T  24604480 tgcttgcacattaaagtaacaattcattgcataactttcggggaaaacatttgcaaccgctttcatcaaagaaatatccctgtcggtcacaatcacctta 24604579  T
Q  417 ggcatattcatct 429  Q
    |||||||||||||    
T  24604580 ggcatattcatct 24604592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 18 - 429
Target Start/End: Original strand, 24940742 - 24941153
Alignment:
Q  18 gattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcat 117  Q
    ||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24940742 gattcgaccctgttggtagtcctgcaaccaagatgcatcacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatggcat 24940841  T
Q  118 actttaggaaaggtgggaaatcactacaaacatcttggaactccactaatgcaattgcatataactcttgagtggacgattcaaccatagctttcaatgc 217  Q
    | ||| | |||| |||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||    
T  24940842 aattttgaaaag-tgggaaataactacatgaatcttggaactccactaatgcatttgcatataactcttgagtgggcgattcaatcatagctttgcatgc 24940940  T
Q  218 -cctcatgatcttcgtgacaacatcacgattactcacctctttcccatccttttttcccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaacatt 316  Q
     |||||| |||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  24940941 gcctcattatcttcttgagaacatcgcgattactcacctctttcccatccttttttcccaaaggatatttacaatctaagacgcacatttgtttaacatt 24941040  T
Q  317 tgcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttctgggaaaacaattccaaccgctttcatcaaagacccatccctgtcggtaacaatcaccttt 416  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||     
T  24941041 tgcttgcacataaaagtaacaattcattgcataactttcggggaaaacatttgcaaccgctttcatcaaagaaatatccctgtcggtcacaatcacctta 24941140  T
Q  417 ggcatattcatct 429  Q
    |||||||||||||    
T  24941141 ggcatattcatct 24941153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 18 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 45477327 - 45476915
Alignment:
Q  18 gattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcat 117  Q
    ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45477327 gattcgaccctgttggtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctatccatgccctcgctattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcat 45477228  T
Q  118 actttaggaaaggtgggaaatcactacaaacatcttggaactccactaatgcaattgcatataactcttgagtggacgattcaaccatagctttcaatgc 217  Q
    | ||| ||||| ||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  45477227 aattttggaaaagtgagaaatcactacatgaatcttggaactccactaatgcatttgcatataactcttgagtgggcgattcaaccatagttttccatgc 45477128  T
Q  218 cctcatgatcttcgtgacaacatcacgattactcacctctttcccatcc-ttttttcccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaacatt 316  Q
    ||| || |||||| | ||||||||||||    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  45477127 ccttattatcttcttcacaacatcacgaggtttcacctctttcccatcctttttttcccaaaggatatttacaatctaagacgcacatttgtttaacatt 45477028  T
Q  317 tgcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttctgggaaaacaattccaaccgctttcatcaaagacccatccctgtcggtaacaatcaccttt 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| |||||||||  ||| ||||| || |||||||||||     
T  45477027 tgcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttcggggaaaacatttgcaaccgcttttatcaaagacatatcactgtcagtcacaatcacctta 45476928  T
Q  417 ggcatattcatct 429  Q
    |||||||||||||    
T  45476927 ggcatattcatct 45476915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 17 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 437290 - 436870
Alignment:
Q  17 agattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggca 116  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  437290 agattcaaccatgttggtggtcctgcaaccaagatgcaacacatgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatgaca 437191  T
Q  117 tactttaggaaaggtgggaaatcactacaaacatcttggaactccactaatgca--------attgcatataactcttgagtggacgattcaaccatagc 208  Q
    || |||  |||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  437190 taatttttgaaaagtgggaaatcactacatgaatcttggaactccactaatgcatttgcattattgcatataactcttgagtgggcgattcaaccatagc 437091  T
Q  209 tttcaatgccctcatgatcttcgtgacaacatcacgattactcacctctttcccatccttttttcccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgt 308  Q
    |||| |||||||||| |||||| | |||||||| |||    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  437090 tttccatgccctcattatcttcttcacaacatcgcgaggtttcacctctttcccatcattttttcctaaaggatatttacaacctaatacgcacctttgt 436991  T
Q  309 ttaacatttgcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttctgggaaaacaattccaaccgctttcatcaaagacccatccctgtcggtaacaa 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || ||||| ||||||| ||||||  ||||||||| || ||||    
T  436990 ttaacatttgcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttcggggaaaatatttgcaaccactttcataaaagacatatccctgtcagtcacaa 436891  T
Q  409 tcacctttggcatattcatct 429  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  436890 tcaccttaggcatattcatct 436870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 18 - 429
Target Start/End: Original strand, 43948375 - 43948785
Alignment:
Q  18 gattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcat 117  Q
    ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43948375 gattcgaccctgttggtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcat 43948474  T
Q  118 actttaggaaaggtgggaaatcactacaaacatcttggaactccactaatgcaattgcatataactcttgagtggacgattcaaccatagctttcaatgc 217  Q
    | ||| | |||| |||  |||||||| |   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||    
T  43948475 aattttgaaaag-tggagaatcactatatgaatcttggaactccactaatgcatttgcatataactcttgagtgggcgattcaaccataactttccatgc 43948573  T
Q  218 cctcatgatcttcgtgacaacatcacgattactcacctctttcccatccttttttcccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaacattt 317  Q
    || ||| |||||| | ||||||||  ||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  43948574 ccccattatcttcttcacaacatcgtgaggtttcacctctttcccatccttttttcccaaaggatatttacaatctaagacgcacatttgtttaacattt 43948673  T
Q  318 gcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttctgggaaaacaattccaaccgctttcatcaaagacccatccctgtcggtaacaatcacctttg 417  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||| |    
T  43948674 gcttgcacatgaaagtaagaattcattgcataactttcggggaaaacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatctctgtcggtcacaatcaccttag 43948773  T
Q  418 gcatattcatct 429  Q
    ||||||||||||    
T  43948774 gcatattcatct 43948785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 18 - 429
Target Start/End: Original strand, 27274449 - 27274863
Alignment:
Q  18 gattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcat 117  Q
    ||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27274449 gattcgaccctgttcgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatggcat 27274548  T
Q  118 actttaggaaaggtgggaaatcactacaaacatcttggaactccactaatgcaattgcatataactcttgagtggacgattcaaccatagctttcaatgc 217  Q
    | |||   |||  |||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  27274549 aattttcaaaaattgggaaatcactacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgc 27274648  T
Q  218 cctcatgatcttcgtgacaacatcacgattactcacctctttcccatcctttttt---cccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaaca 314  Q
    | |||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  27274649 cttcattatcttcttgacaacatcgcgattgctcacctctttcccatcctttttaaaacccaaaggatatttacaatctaagacacacctttgtttaaca 27274748  T
Q  315 tttgcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttctgggaaaacaattccaaccgctttcatcaaagacccatccctgtcggtaacaatcacct 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  | ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  27274749 tttgcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttcgggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcacct 27274848  T
Q  415 ttggcatattcatct 429  Q
    | |||||||||||||    
T  27274849 taggcatattcatct 27274863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 18 - 425
Target Start/End: Original strand, 1097918 - 1098325
Alignment:
Q  18 gattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcat 117  Q
    ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | | | ||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1097918 gattcgaccctgttggtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctatccatgccctaccaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacat 1098017  T
Q  118 actttaggaaaggtgggaaatcactacaaacatcttggaactccactaatgcaattgcatataactcttgagtggacgattcaaccatagctttcaatgc 217  Q
    | |||  ||||  |||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  1098018 aatttttgaaaattgggaaatcactacatgaatcttggaactccattaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgattcaaccatagttttccatgc 1098117  T
Q  218 cctcatgatcttcgtgacaacatcacgattactcacctctttcccatccttttttcccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaacattt 317  Q
    |||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  1098118 cctcattatcttcttgacaacatcgcgattgctcacctctttcccatccttttttcccaaaggatgtttacaatctaagacacacctttgtttaacattt 1098217  T
Q  318 gcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttctgggaaaacaattccaaccgctttcatcaaagacccatccctgtcggtaacaatcacctttg 417  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||| |    
T  1098218 gcttgcacatgaaagtaacgattcattgcataactttcggggaaaacatttgcaaccgctttcatcaaagacaattccctatcggtaacaatcaccttag 1098317  T
Q  418 gcatattc 425  Q
    ||||||||    
T  1098318 gcatattc 1098325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 18 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 24751631 - 24751217
Alignment:
Q  18 gattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcat 117  Q
    ||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24751631 gattcgaccctgttcgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatggcat 24751532  T
Q  118 actttaggaaaggtgggaaatcactacaaacatcttggaactccactaatgcaattgcatataactcttgagtggacgattcaaccatagctttcaatgc 217  Q
    | |||   |||  |||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  24751531 aattttcaaaaattgggaaatcactacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgc 24751432  T
Q  218 cctcatgatcttcgtgacaacatcacgattactcacctctttcccatcctttttt---cccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaaca 314  Q
    | |||| |||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  24751431 cttcattatcttcttgaaaacatcgcgattgctcacctctttcccatcctttttaaaacccaaaggatatttacaatctaagacacacctttgtttaaca 24751332  T
Q  315 tttgcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttctgggaaaacaattccaaccgctttcatcaaagacccatccctgtcggtaacaatcacct 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||  | ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  24751331 tttgcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttcggaaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcacct 24751232  T
Q  415 ttggcatattcatct 429  Q
    | |||||||||||||    
T  24751231 taggcatattcatct 24751217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 18 - 429
Target Start/End: Original strand, 34919874 - 34920285
Alignment:
Q  18 gattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcat 117  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || | | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||    
T  34919874 gattctaccctgttggtggtcctgcaaccaagatgcaacgcatggtctgtccatgctctcactattttctccttcacttcattcaatatggtcatgacat 34919973  T
Q  118 actttaggaaaggtgggaaatcactacaaacatcttggaactccactaatgcaattgcatataactcttgagtggacgattcaaccatagctttcaatgc 217  Q
    | ||| ||||| |||| |||||||| ||   ||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  34919974 aattttggaaaagtggaaaatcactgcatgaatcttggaactccactaatacatttgcatataacttttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgc 34920073  T
Q  218 cctcatgatcttcgtgacaacatcacgattactcacctctttcccatccttttttcccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaacattt 317  Q
    |||||| |||||| | |||||||| ||     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34920074 cctcattatcttcttcacaacatcgcgtggtttcacctctttcccatcctttttttccaaaggatatttacaatctaagacgcacctttgtttaacattt 34920173  T
Q  318 gcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttctgggaaaacaattccaaccgctttcatcaaagacccatccctgtcggtaacaatcacctttg 417  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || || |||||||||||||||||  ||||||||| || ||||||| | | |    
T  34920174 gcttgcacatgaaagtaataattcattgcataactttcggggaaaacatttgcatccgctttcatcaaagacatatccctgtcagtcacaatcatcatag 34920273  T
Q  418 gcatattcatct 429  Q
    ||||||||||||    
T  34920274 gcatattcatct 34920285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 18 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 7264952 - 7264538
Alignment:
Q  18 gattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcat 117  Q
    ||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7264952 gattcgaccttgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatggcat 7264853  T
Q  118 actttaggaaaggtgggaaatcactacaaacatcttggaactccactaatgcaattgcatataactcttgagtggacgattcaaccatagctttcaatgc 217  Q
    | | ||  |||  || ||||||||||||   ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  7264852 aatctacaaaaattgagaaatcactacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgc 7264753  T
Q  218 cctcatgatcttcgtgacaacatcacgattactcacctctttcccatcctttttt---cccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaaca 314  Q
    | |||| |||||| | || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  7264752 cttcattatcttcttcaccacatcgcgattgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaatctaagacacacctttgtttaaca 7264653  T
Q  315 tttgcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttctgggaaaacaattccaaccgctttcatcaaagacccatccctgtcggtaacaatcacct 414  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||  | ||||||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||    
T  7264652 ttagcttgcacatgaaagtaacaactcattgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcgataacaatcacct 7264553  T
Q  415 ttggcatattcatct 429  Q
    | |||||||||||||    
T  7264552 taggcatattcatct 7264538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 18 - 429
Target Start/End: Original strand, 41007068 - 41007483
Alignment:
Q  18 gattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcat 117  Q
    ||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  41007068 gattcaaccctgttggtgatcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtgattatggcat 41007167  T
Q  118 actttaggaaaggtgggaaatcactacaaacatcttggaactccactaatgcaattgcatataactcttgagtggacgattcaaccatagctttcaatgc 217  Q
    | |||  |||| |||||||| |||  ||   |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||     
T  41007168 aatttttgaaaagtgggaaaacacatcatgaatcttggaactccactaatgcatttacatataactcttgagtgggcgattcaaccatagtttttcatgt 41007267  T
Q  218 cctcatgatcttcgtgacaacatcacgattactcacctctttcccatccttttttcccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaacattt 317  Q
    |||||| |||||| | |||||||  ||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41007268 cctcattatcttcttcacaacattgcgatgtttcacctctttcccatccttttgtcccaaaggatatttacaatctaagacgcacctttgtttaacattt 41007367  T
Q  318 gcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttctgggaaaacaattccaaccgctttcatcaaagac----ccatccctgtcggtaacaatcacc 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| | || |||||||||||||||| |||      |||||||||||| |||||||||    
T  41007368 gcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataattttcgggaaaaatatttgcaaccgctttcatcaatgacatatatatccctgtcggtcacaatcacc 41007467  T
Q  414 tttggcatattcatct 429  Q
    || |||||||||||||    
T  41007468 ttaggcatattcatct 41007483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 28 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 39795932 - 39795528
Alignment:
Q  28 tgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcatactttaggaa 127  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||||||| | | ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||    
T  39795932 tgtttgtggtcctacaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgctctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatggcataatctacaaa 39795833  T
Q  128 aggtgggaaatcactacaaacatcttggaactccactaatgcaattgcatataactcttgagtggacgattcaaccatagctttcaatgccctcatgatc 227  Q
    |  |||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||    
T  39795832 aattgggaaatcactacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactattgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccttcattatc 39795733  T
Q  228 ttcgtgacaacatcacgattactcacctctttcccatcctttttt---cccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaacatttgcttgca 324  Q
    ||| | || ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||    |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  39795732 ttcttcaccacatcgcgattgctcacctctatcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaatccaagacacacctttgtttaacattagcttgca 39795633  T
Q  325 catgaaagtaacaattcattgcataactttctgggaaaacaattccaaccgctttcatcaaagacccatccctgtcggtaacaatcacctttggcatatt 424  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||||  | ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  39795632 catgaaaataacaattcattgcataacttcccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatatt 39795533  T
Q  425 catct 429  Q
    |||||    
T  39795532 catct 39795528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 18 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 5349139 - 5348725
Alignment:
Q  18 gattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcat 117  Q
    ||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5349139 gattcgaccctgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcat 5349040  T
Q  118 actttaggaaaggtgggaaatcactacaaacatcttggaactccactaatgcaattgcatataactcttgagtggacgattcaaccatagctttcaatgc 217  Q
    | | ||  |||  |||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||  |||||||||||||||||| ||||    
T  5349039 aatctacaaaaattgggaaatcactacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagctttccatgc 5348940  T
Q  218 cctcatgatcttcgtgacaacatcacgattactcacctctttcccatcctttttt---cccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaaca 314  Q
      |||| |||||| | || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||    
T  5348939 gttcattatcttcttcaccacatcccgattgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaaca 5348840  T
Q  315 tttgcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttctgggaaaacaattccaaccgctttcatcaaagacccatccctgtcggtaacaatcacct 414  Q
    || ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| || ||||||  | ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  5348839 ttagcttgcacatgaaaaaaacaattcaatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcacct 5348740  T
Q  415 ttggcatattcatct 429  Q
    | |||||||||||||    
T  5348739 taggcatattcatct 5348725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 18 - 429
Target Start/End: Original strand, 10622543 - 10622957
Alignment:
Q  18 gattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcat 117  Q
    ||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10622543 gattcgaccctgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcat 10622642  T
Q  118 actttaggaaaggtgggaaatcactacaaacatcttggaactccactaatgcaattgcatataactcttgagtggacgattcaaccatagctttcaatgc 217  Q
    | | ||  |||  |||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||  |||||||||||||||||| ||||    
T  10622643 aatctacaaaaattgggaaatcactacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagctttccatgc 10622742  T
Q  218 cctcatgatcttcgtgacaacatcacgattactcacctctttcccatcctttttt---cccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaaca 314  Q
      |||| |||||| | || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||    
T  10622743 gttcattatcttcttcaccacatcccgattgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaaca 10622842  T
Q  315 tttgcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttctgggaaaacaattccaaccgctttcatcaaagacccatccctgtcggtaacaatcacct 414  Q
    || ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| || ||||||  | ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  10622843 ttagcttgcacatgaaaaaaacaattcaatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcacct 10622942  T
Q  415 ttggcatattcatct 429  Q
    | |||||||||||||    
T  10622943 taggcatattcatct 10622957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 18 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 38947735 - 38947321
Alignment:
Q  18 gattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcat 117  Q
    ||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38947735 gattcgaccctgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtttgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtgttcatggcat 38947636  T
Q  118 actttaggaaaggtgggaaatcactacaaacatcttggaactccactaatgcaattgcatataactcttgagtggacgattcaaccatagctttcaatgc 217  Q
    | | ||  |||  |||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  38947635 aatctacaaaaattgggaaatcactacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgattgggcgattcaaccatagctttccatgc 38947536  T
Q  218 cctcatgatcttcgtgacaacatcacgattactcacctctttcccatcctttttt---cccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaaca 314  Q
      |||| |||||| | || ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||    |||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||    
T  38947535 gttcattatcttcttcaccacatcccgattgctcacccctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaaca 38947436  T
Q  315 tttgcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttctgggaaaacaattccaaccgctttcatcaaagacccatccctgtcggtaacaatcacct 414  Q
    || ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||  || ||||||  | ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  38947435 ttagcttgcacatgaaaaaaacaattcaatgcataacttttcggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcacct 38947336  T
Q  415 ttggcatattcatct 429  Q
    | |||||||||||||    
T  38947335 taggcatattcatct 38947321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 18 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 41561984 - 41561570
Alignment:
Q  18 gattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcat 117  Q
    ||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41561984 gattcgaccctgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcat 41561885  T
Q  118 actttaggaaaggtgggaaatcactacaaacatcttggaactccactaatgcaattgcatataactcttgagtggacgattcaaccatagctttcaatgc 217  Q
    | | ||  |||  |||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||  |||||||||||||||||| ||||    
T  41561884 aatctacaaaaattgggaaatcactacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagctttccatgc 41561785  T
Q  218 cctcatgatcttcgtgacaacatcacgattactcacctctttcccatcctttttt---cccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaaca 314  Q
      |||| |||||| | || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||    
T  41561784 gttcattatcttcttcaccacatcccgattgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaaca 41561685  T
Q  315 tttgcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttctgggaaaacaattccaaccgctttcatcaaagacccatccctgtcggtaacaatcacct 414  Q
    || ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| || ||||||  | ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  41561684 ttagcttgcacatgaaaaaaacaattcaatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcacct 41561585  T
Q  415 ttggcatattcatct 429  Q
    | |||||||||||||    
T  41561584 taggcatattcatct 41561570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 18 - 429
Target Start/End: Original strand, 211530 - 211944
Alignment:
Q  18 gattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcat 117  Q
    ||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  211530 gattcgaccctgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcat 211629  T
Q  118 actttaggaaaggtgggaaatcactacaaacatcttggaactccactaatgcaattgcatataactcttgagtggacgattcaaccatagctttcaatgc 217  Q
    | | ||  |||  |||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||  |||||||||||||||||| ||||    
T  211630 aatctacaaaaattgggaaatcactacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagctttccatgc 211729  T
Q  218 cctcatgatcttcgtgacaacatcacgattactcacctctttcccatcctttttt---cccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaaca 314  Q
      |||| |||||| | || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||    
T  211730 gttcattatcttcttcaccacatcccgattgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaaca 211829  T
Q  315 tttgcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttctgggaaaacaattccaaccgctttcatcaaagacccatccctgtcggtaacaatcacct 414  Q
    || ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| || ||||||  | ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  211830 ttagcttgcacatgaaaaaaacaattcaatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcacct 211929  T
Q  415 ttggcatattcatct 429  Q
    |  ||||||||||||    
T  211930 tatgcatattcatct 211944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 88 - 389
Target Start/End: Original strand, 17996334 - 17996635
Alignment:
Q  88 ccttcacttcattcaaggtggtcatggcatactttaggaaaggtgggaaatcactacaaacatcttggaactccactaatgcaattgcatataactcttg 187  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  17996334 ccttcacttcatccaaggtggtcatggcataggttaggaaaattgggaaatcactacaaacatcttggaactccaataatgcatttgcatataactcttg 17996433  T
Q  188 agtggacgattcaaccatagctttcaatgccctcatgatcttcgtgacaacatcacgattactcacctctttcccatccttttttcccaaaggatattta 287  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||| |||  ||| | |||||| | || ||||||| ||   ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  17996434 agtgggcgattcaacaatagttttccatgtgctcgttatcttcttcactacatcaccatgtttcacctccttcccattcttttttcccaaaggatatcta 17996533  T
Q  288 caatctaagatgcacctttgtttaacatttgcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttctgggaaaacaattccaaccgctttcatcaaag 387  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || ||||||| ||||| ||||    
T  17996534 cagtctaagatgcacctttgtttaacatttttttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttcagggagaacatttgcaaccgcattcataaaag 17996633  T
Q  388 ac 389  Q
    ||    
T  17996634 ac 17996635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 131 - 429
Target Start/End: Original strand, 3801768 - 3802069
Alignment:
Q  131 tgggaaatcactacaaacatcttggaactccactaatgcaattgcatataactcttgagtggacgattcaaccatagctttcaatgccctcatgatcttc 230  Q
    |||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||| ||||||    
T  3801768 tgggaaatcactacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgattcaaccatagatttccatgccttcattatcttc 3801867  T
Q  231 gtgacaacatcacgattactcacctctttcccatcctttttt---cccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaacatttgcttgcacat 327  Q
     | || || || ||||| |||||||||||| ||||||||||    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3801868 ttcaccacttcgcgattgctcacctctttctcatcctttttaaagcccaaaggatatttacaatctaagacacacctttgtttaacattagcttgcacat 3801967  T
Q  328 gaaagtaacaattcattgcataactttctgggaaaacaattccaaccgctttcatcaaagacccatccctgtcggtaacaatcacctttggcatattcat 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  | ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3801968 gaaagtaacaattcattgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcat 3802067  T
Q  428 ct 429  Q
    ||    
T  3802068 ct 3802069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 112
Target Start/End: Original strand, 3797900 - 3797984
Alignment:
Q  28 tgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcat 112  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3797900 tgtttgtggtcctgcaacctagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcat 3797984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 28 - 189
Target Start/End: Original strand, 25618188 - 25618352
Alignment:
Q  28 tgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaag---gtggtcatggcatactttag 124  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||| | | | ||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||    ||| ||  | ||||  ||||    
T  25618188 tgttggtggttatgcagccaagatgcaacacatggtctttccatgccctcactattttatccttaacaacattcaatacagtgctctcgacataggttag 25618287  T
Q  125 gaaaggtgggaaatcactacaaacatcttggaactccactaatgcaattgcatataactcttgag 189  Q
     ||   ||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  25618288 aaactttggaaaatcattacaaacattttggaactccactaatgcacttgcatataattcttgag 25618352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 24684033 - 24683970
Alignment:
Q  28 tgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctcctt 91  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||    
T  24684033 tgtttgtggttctgcaactaagatgcaagacacggtgtgtccatgccctcactattttttcctt 24683970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 28 - 85
Target Start/End: Original strand, 25855455 - 25855512
Alignment:
Q  28 tgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactatttt 85  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||| ||||| ||||||||||    
T  25855455 tgttggtggttctgcacccaagatgaaacacacggtctgtctatgccttcactatttt 25855512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 21536167 - 21536104
Alignment:
Q  28 tgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctcctt 91  Q
    |||||||||||||  | |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| || |||||    
T  21536167 tgttggtggttcttaacccaagatgcaacacacggaatgtccataccctcactatattttcctt 21536104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 280; Significance: 1e-156; HSPs: 13)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 18 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 8401473 - 8401062
Alignment:
Q  18 gattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcat 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  8401473 gattctaccatgttggtggttctgcaactaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctccttcatttcattcaaggtggtcatgacat 8401374  T
Q  118 actttaggaaaggtgggaaatcactacaaacatcttggaactccactaatgcaattgcatataactcttgagtggacgattcaaccatagctttcaatgc 217  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  8401373 actttaggaaaagtggaaaatcactacaaaaatcttggaactccactaatgcatttgcatataactcttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgc 8401274  T
Q  218 cctcatgatcttcgtgacaacatcacgattactcacctctttcccatccttttttcccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaacattt 317  Q
    |||||| |||||| ||||||||||   ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8401273 cctcattatcttcttgacaacatcgtcatgtttcacctctttcccatccttttttcccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaacattt 8401174  T
Q  318 gcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttctgggaaaacaattccaaccgctttcatcaaagacccatccctgtcggtaacaatcacctttg 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||  |||| || ||||||||||| |    
T  8401173 gcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataaattttggggaaaacattttcaaccgctttcatcaaagacatatcattgtcagtcacaatcaccttag 8401074  T
Q  418 gcatattcatct 429  Q
    |||| |||||||    
T  8401073 gcatcttcatct 8401062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 18 - 429
Target Start/End: Original strand, 43826698 - 43827109
Alignment:
Q  18 gattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcat 117  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| || | | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43826698 gattctaccctgttggtagttctacaaccaagatgcaacgcatggtctgtccatgccctcgctattttctccttcacttcattcaaggcggtcatggcat 43826797  T
Q  118 actttaggaaaggtgggaaatcactacaaacatcttggaactccactaatgcaattgcatataactcttgagtggacgattcaaccatagctttcaatgc 217  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||    
T  43826798 actttaggaaaagcgggaaatcactacaaacatcttggaactccactaatgcatttgcatataactcttgagtgggcgattcaaccataactttccatgc 43826897  T
Q  218 cctcatgatcttcgtgacaacatcacgattactcacctctttcccatccttttttcccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaacattt 317  Q
      |||| |||||| | ||| |||| |||    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43826898 attcattatcttcttcacaccatcgcgaggtttcacctctttcccatccttttttcccaaaagatatttacaatctaagatgcatctttgtttaacattt 43826997  T
Q  318 gcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttctgggaaaacaattccaaccgctttcatcaaagacccatccctgtcggtaacaatcacctttg 417  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||   || |||||||||||      
T  43826998 gcttgcacatgaaaataacaattcattgcataactttcggggaaaacatttccaaccgctttcatcaaagacatatccctgctagtgacaatcaccttaa 43827097  T
Q  418 gcatattcatct 429  Q
    ||||||||||||    
T  43827098 gcatattcatct 43827109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 18 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 47062853 - 47062442
Alignment:
Q  18 gattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcat 117  Q
    ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  47062853 gattcgaccctgttggtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtttgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatgacat 47062754  T
Q  118 actttaggaaaggtgggaaatcactacaaacatcttggaactccactaatgcaattgcatataactcttgagtggacgattcaaccatagctttcaatgc 217  Q
    | ||   |||| ||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |    
T  47062753 aattattgaaaagtgggaaatcactacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactcttgagtgggcgattcaaccatagctttccatac 47062654  T
Q  218 cctcatgatcttcgtgacaacatcacgattactcacctctttcccatccttttttcccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaacattt 317  Q
    |||||| ||||||   |||||||| |||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  47062653 cctcattatcttctccacaacatcgcgaggtttcacctctttcccatccttttttcccaaaggatatttacaatccaagacgcacctttgtttaacattt 47062554  T
Q  318 gcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttctgggaaaacaattccaaccgctttcatcaaagacccatccctgtcggtaacaatcacctttg 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| | |    
T  47062553 gcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttcggggaaaacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtcacaatcaccgtag 47062454  T
Q  418 gcatattcatct 429  Q
    ||||||||||||    
T  47062453 gcatattcatct 47062442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 18 - 429
Target Start/End: Original strand, 12116461 - 12116872
Alignment:
Q  18 gattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcat 117  Q
    ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12116461 gattctaccctgttagtggtcctgcaaccaagatgcagcacatggtctgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcat 12116560  T
Q  118 actttaggaaaggtgggaaatcactacaaacatcttggaactccactaatgcaattgcatataactcttgagtggacgattcaaccatagctttcaatgc 217  Q
    | | |  |||| |||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  12116561 aatgtttgaaaagtgggaaatcaccacatgaatcttggaactccactaatgcatttgcaaataactcttgagtgggcgattcaaccatagctttctatgc 12116660  T
Q  218 cctcatgatcttcgtgacaacatcacgattactcacctctttcccatccttttttcccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaacattt 317  Q
    |||||| |||||| | |||||||| |||    || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  12116661 cctcattatcttcttcacaacatcgcgacgtttcgcctctttcctatccttttttcccaaaggatatttacaatcgaagacgcacctttgtttaacattt 12116760  T
Q  318 gcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttctgggaaaacaattccaaccgctttcatcaaagacccatccctgtcggtaacaatcacctttg 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||| |||| || ||||||||||| |    
T  12116761 gcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttcggggaaaacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccatgtcagtcacaatcaccttag 12116860  T
Q  418 gcatattcatct 429  Q
    ||||||| ||||    
T  12116861 gcatatttatct 12116872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 18 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 15067861 - 15067447
Alignment:
Q  18 gattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcat 117  Q
    ||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15067861 gattcgaccctgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatggcat 15067762  T
Q  118 actttaggaaaggtgggaaatcactacaaacatcttggaactccactaatgcaattgcatataactcttgagtggacgattcaaccatagctttcaatgc 217  Q
    | | ||  |||  |||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  15067761 aatctaaaaaaattgggaaatcactacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgc 15067662  T
Q  218 cctcatgatcttcgtgacaacatcacgattactcacctctttcccatcctttttt---cccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaaca 314  Q
    | |||| |||||| | || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  15067661 cttcattatcttcttcaccacatcgcgattgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaatccaagacacacctttgtttaaca 15067562  T
Q  315 tttgcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttctgggaaaacaattccaaccgctttcatcaaagacccatccctgtcggtaacaatcacct 414  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||  | ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  15067561 ttagcttgcacatgaaaataacaattcattgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcacct 15067462  T
Q  415 ttggcatattcatct 429  Q
    | |||||||||||||    
T  15067461 taggcatattcatct 15067447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 18 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 42501379 - 42500965
Alignment:
Q  18 gattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcat 117  Q
    ||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42501379 gattcgaccatgtttgtggtcatgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatggtat 42501280  T
Q  118 actttaggaaaggtgggaaatcactacaaacatcttggaactccactaatgcaattgcatataactcttgagtggacgattcaaccatagctttcaatgc 217  Q
    | | ||  |||  |||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  42501279 aatctacaaaaattgggaaatcactacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgc 42501180  T
Q  218 cctcatgatcttcgtgacaacatcacgattactcacctctttcccatcctttttt---cccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaaca 314  Q
    | |||| |||||| | || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  42501179 cttcattatcttcttcaccacatcgcgattgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaatccaagacacacctttgtttaaca 42501080  T
Q  315 tttgcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttctgggaaaacaattccaaccgctttcatcaaagacccatccctgtcggtaacaatcacct 414  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||  | ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  42501079 ttagcttgcacatgaaaataacaattcattgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcacct 42500980  T
Q  415 ttggcatattcatct 429  Q
    | |||||||||||||    
T  42500979 taggcatattcatct 42500965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 18 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 18107360 - 18106946
Alignment:
Q  18 gattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcat 117  Q
    ||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18107360 gattcgaccctgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatggcat 18107261  T
Q  118 actttaggaaaggtgggaaatcactacaaacatcttggaactccactaatgcaattgcatataactcttgagtggacgattcaaccatagctttcaatgc 217  Q
    | | ||  |||  |||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  18107260 aatctacaaaaattgggaaatcactacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgc 18107161  T
Q  218 cctcatgatcttcgtgacaacatcacgattactcacctctttcccatccttttt---tcccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaaca 314  Q
    | |||| |||||| | || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    | |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  18107160 cttcattatcttcttcaccacatcgcgattgctcacctctttcccatcctttttaaagctcaaaggatatttacaatccaagacacacctttgtttaaca 18107061  T
Q  315 tttgcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttctgggaaaacaattccaaccgctttcatcaaagacccatccctgtcggtaacaatcacct 414  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||  | |||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  18107060 ttagcttgcacatgaaaataacaattcattgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcaccaaagacatatccctatcggtaacaatcacct 18106961  T
Q  415 ttggcatattcatct 429  Q
    | |||||||||||||    
T  18106960 taggcatattcatct 18106946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 28 - 342
Target Start/End: Original strand, 10707781 - 10708095
Alignment:
Q  28 tgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcatactttaggaa 127  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  10707781 tgttggtggtcctgcaacatagatgcaacgcatggtctgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcataattttggaa 10707880  T
Q  128 aggtgggaaatcactacaaacatcttggaactccactaatgcaattgcatataactcttgagtggacgattcaaccatagctttcaatgccctcatgatc 227  Q
    | ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||    
T  10707881 aagtgggaaatcactacatgaatcttggaactccactaatgcatttgcatataactcttgagtgggcgattcaaccatagcattccatgccttcattatc 10707980  T
Q  228 ttcgtgacaacatcacgattactcacctctttcccatccttttttcccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaacatttgcttgcacat 327  Q
    ||| | |||||||| |||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10707981 ttcttcacaacatcgcgaggtttcacctctttcccatccttttttcccaaaggatatttacaatctaagacgcacctttgtttaacattttcttgcacat 10708080  T
Q  328 gaaagtaacaattca 342  Q
    |||||||||||||||    
T  10708081 gaaagtaacaattca 10708095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 33 - 429
Target Start/End: Original strand, 616853 - 617252
Alignment:
Q  33 gtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcatactttaggaaaggtg 132  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||  ||    
T  616853 gtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatggcataatctacaaaaattg 616952  T
Q  133 ggaaatcactacaaacatcttggaactccactaatgcaattgcatataactcttgagtggacgattcaaccatagctttcaatgccctcatgatcttcgt 232  Q
    |||||||||||||   ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||||  |||| |||||| |    
T  616953 ggaaatcactacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttaagtgggcgattcaaccatagctttccatgcgttcattatcttctt 617052  T
Q  233 gacaacatcacgattactcacctctttcccatcctttttt---cccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaacatttgcttgcacatga 329  Q
     || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  617053 caccacatcccgattgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatga 617152  T
Q  330 aagtaacaattcattgcataactttctgggaaaacaattccaaccgctttcatcaaagacccatccctgtcggtaacaatcacctttggcatattcatct 429  Q
    || |||||||||| |||||||||||| || ||||||  | ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  617153 aaataacaattcaatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatct 617252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 18 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 30788511 - 30788097
Alignment:
Q  18 gattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcat 117  Q
    ||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30788511 gattcgaccctgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcat 30788412  T
Q  118 actttaggaaaggtgggaaatcactacaaacatcttggaactccactaatgcaattgcatataactcttgagtggacgattcaaccatagctttcaatgc 217  Q
    | | ||  |||  |||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||  |||||||||||||||||| ||||    
T  30788411 aatctacaaaaattgggaaatcactacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagctttccatgc 30788312  T
Q  218 cctcatgatcttcgtgacaacatcacgattactcacctctttcccatcctttttt---cccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaaca 314  Q
      |||| |||||| | || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||    
T  30788311 gttcattatcttcttcaccacatcccgattgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaaca 30788212  T
Q  315 tttgcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttctgggaaaacaattccaaccgctttcatcaaagacccatccctgtcggtaacaatcacct 414  Q
    || ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| || ||||||  | ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  30788211 ttagcttgcacatgaaaaaaacaattcaatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcacct 30788112  T
Q  415 ttggcatattcatct 429  Q
    | |||||||||||||    
T  30788111 taggcatattcatct 30788097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 18 - 429
Target Start/End: Original strand, 43622224 - 43622638
Alignment:
Q  18 gattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcat 117  Q
    ||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43622224 gattcgaccctgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcat 43622323  T
Q  118 actttaggaaaggtgggaaatcactacaaacatcttggaactccactaatgcaattgcatataactcttgagtggacgattcaaccatagctttcaatgc 217  Q
    | | ||  |||  |||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||  |||||||||||||||||| ||||    
T  43622324 aatctacaaaaattgggaaatcactacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagctttccatgc 43622423  T
Q  218 cctcatgatcttcgtgacaacatcacgattactcacctctttcccatcctttttt---cccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaaca 314  Q
      |||| |||||| | || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||    
T  43622424 gttcattatcttcttcaccacatcccgattgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaaca 43622523  T
Q  315 tttgcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttctgggaaaacaattccaaccgctttcatcaaagacccatccctgtcggtaacaatcacct 414  Q
    || ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| || ||||||  | ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  43622524 ttagcttgcacatgaaaaaaacaattcaatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcacct 43622623  T
Q  415 ttggcatattcatct 429  Q
    | |||||||||||||    
T  43622624 taggcatattcatct 43622638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 18 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 45765351 - 45764937
Alignment:
Q  18 gattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcat 117  Q
    ||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45765351 gattcgaccctgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcat 45765252  T
Q  118 actttaggaaaggtgggaaatcactacaaacatcttggaactccactaatgcaattgcatataactcttgagtggacgattcaaccatagctttcaatgc 217  Q
    | | ||  |||  |||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||  |||||||||||||||||| ||||    
T  45765251 aatctacaaaaattgggaaatcactacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagctttccatgc 45765152  T
Q  218 cctcatgatcttcgtgacaacatcacgattactcacctctttcccatcctttttt---cccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaaca 314  Q
      |||| |||||| | || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||    
T  45765151 gttcattatcttcttcaccacatcccgattgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaaca 45765052  T
Q  315 tttgcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttctgggaaaacaattccaaccgctttcatcaaagacccatccctgtcggtaacaatcacct 414  Q
    || ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| || |||| |  | ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  45765051 ttagcttgcacatgaaaaaaacaattcaatgcataactttccggaaaaatatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcacct 45764952  T
Q  415 ttggcatattcatct 429  Q
    | |||||||||||||    
T  45764951 taggcatattcatct 45764937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 3762889 - 3762832
Alignment:
Q  28 tgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactatttt 85  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||| | | || |||||||| |||||||||    
T  3762889 tgttggtggttctgcagccaagatgcaagacatggtctgaccatgcccccactatttt 3762832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 272; Significance: 1e-152; HSPs: 16)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 18 - 429
Target Start/End: Original strand, 2145091 - 2145502
Alignment:
Q  18 gattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcat 117  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  2145091 gattcgaccatgttggtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcactgcattcaaggtggtcatgacat 2145190  T
Q  118 actttaggaaaggtgggaaatcactacaaacatcttggaactccactaatgcaattgcatataactcttgagtggacgattcaaccatagctttcaatgc 217  Q
    | |||  |||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| || |    
T  2145191 aatttttgaaaagtgggaaatcactacatgaatcttggaactccactaatgcatttgcatataactcttaagtgggcaattcaaccatagctttccattc 2145290  T
Q  218 cctcatgatcttcgtgacaacatcacgattactcacctctttcccatccttttttcccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaacattt 317  Q
    |||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2145291 cctcattatcttcttgacaacatcgtgattactcacctctttcccatccttttttcccaaaggatatttacaatctaagacgcacctttgtttaacattt 2145390  T
Q  318 gcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttctgggaaaacaattccaaccgctttcatcaaagacccatccctgtcggtaacaatcacctttg 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||| |    
T  2145391 gcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttctgggaaaatatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccatgtcggtcacaatcaccttag 2145490  T
Q  418 gcatattcatct 429  Q
    ||||||||||||    
T  2145491 gcatattcatct 2145502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 43371724 - 43371325
Alignment:
Q  30 ttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcatactttaggaaag 129  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||| | | | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||     
T  43371724 ttggtggtcctgcaaccaagatgcatcacatggtctctccatgccctcacaattttttccttcacttcattcaaggtggtcatggcataatttttgaaaa 43371625  T
Q  130 gtgggaaatcactacaaacatcttggaactccactaatgcaattgcatataactcttgagtggacgattcaaccatagctttcaatgccctcatgatctt 229  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  43371624 gtgggaaatcactacatgaatcttggaactccactaatgcatttgcatataactcttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccctcattatctt 43371525  T
Q  230 cgtgacaacatcacgattactcacctctttcccatccttttttcccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaacatttgcttgcacatga 329  Q
    | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  43371524 cttgccaacatcgcgattactcacctctttcccatccttttttcccaaaggatatttacaatctaagacgcacctttgtttaacatttgcttgcacataa 43371425  T
Q  330 aagtaacaattcattgcataactttctgggaaaacaattccaaccgctttcatcaaagacccatccctgtcggtaacaatcacctttggcatattcatct 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| | |||||| ||||    
T  43371424 aagtaacaattcattgcataactttctgggaaaacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtcacaatcaccttagacatatttatct 43371325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 28 - 427
Target Start/End: Original strand, 35964847 - 35965246
Alignment:
Q  28 tgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcatactttaggaa 127  Q
    |||| ||||| ||| || |||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||  |||    
T  35964847 tgttcgtggtcctgaaatcaagatgcaacacatggtttgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtgatcatgacataatttttgaa 35964946  T
Q  128 aggtgggaaatcactacaaacatcttggaactccactaatgcaattgcatataactcttgagtggacgattcaaccatagctttcaatgccctcatgatc 227  Q
    |  ||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||    
T  35964947 aattggaaaatcactacatgaatcttggaactccactaatgcatttgcatataattgttgagtggacgattcaaccatagcttttcatgccctcattatc 35965046  T
Q  228 ttcgtgacaacatcacgattactcacctctttcccatccttttttcccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaacatttgcttgcacat 327  Q
    ||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35965047 ttcttgacagcatcgtgattactcacctctttcccatcctttttttccaaaagatatttacaatctaagacacacctttgtttaacatttgcttgcacat 35965146  T
Q  328 gaaagtaacaattcattgcataactttctgggaaaacaattccaaccgctttcatcaaagacccatccctgtcggtaacaatcacctttggcatattcat 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || ||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  35965147 gaaagtaacaattcattgcataactttcgggaaaaacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccttgtcagtaacaatcaccttaggcatattcat 35965246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 18 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 7169849 - 7169449
Alignment:
Q  18 gattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcat 117  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |        |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  7169849 gattctaccctgttggtggttctgcaaccaagatgcaacccaggt-------atgccctcactattttctccttcacttcttccaaggtggtcatggcat 7169757  T
Q  118 actttaggaaaggtgggaaatcactacaaacatcttggaactccactaatgcaattgcatataactcttgagtggacgattcaaccatagctttcaatgc 217  Q
    | |||| ||||  |||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||||   ||    
T  7169756 aatttaagaaaattgggaaatcattacatgtatcttggaactccactaatgcatttgcatataattattgagtgtgcgattcaaccatagctttccgagc 7169657  T
Q  218 cctcatgatcttcgtgacaacatcacgattactcacctctttcccatccttttttcccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaacattt 317  Q
    |||||| ||||     |||| ||| |||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  7169656 cctcattatctaa---acaatatcgcgaggtttcacctctttcccatccttttttcccaaaggatatttacaatctaagatgcacatt-gtttaacattt 7169561  T
Q  318 gcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttctgggaaaacaattccaaccgctttcatcaaagacccatccctgtcggtaacaatcacctttg 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||  |||| |||| || ||||||||||| |    
T  7169560 gcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttcggggaaaatatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccttgtcagtcacaatcaccttag 7169461  T
Q  418 gcatattcatct 429  Q
    ||||||||||||    
T  7169460 gcatattcatct 7169449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 18 - 429
Target Start/End: Original strand, 8421945 - 8422359
Alignment:
Q  18 gattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcat 117  Q
    ||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8421945 gattcgaccctgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcat 8422044  T
Q  118 actttaggaaaggtgggaaatcactacaaacatcttggaactccactaatgcaattgcatataactcttgagtggacgattcaaccatagctttcaatgc 217  Q
    | | ||  |||  |||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||  |||||||||||||||||| ||||    
T  8422045 aatctacaaaaattgggaaatcactacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagctttccatgc 8422144  T
Q  218 cctcatgatcttcgtgacaacatcacgattactcacctctttcccatcctttttt---cccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaaca 314  Q
      |||| |||||| | || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||    
T  8422145 gttcattatcttcttcaccacatcccgattgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaaca 8422244  T
Q  315 tttgcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttctgggaaaacaattccaaccgctttcatcaaagacccatccctgtcggtaacaatcacct 414  Q
    || ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  8422245 ttagcttgcacatgaaaaaaacaattcaatgcataactttctggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcacct 8422344  T
Q  415 ttggcatattcatct 429  Q
    | |||||||||||||    
T  8422345 taggcatattcatct 8422359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 18 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 7342051 - 7341637
Alignment:
Q  18 gattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcat 117  Q
    ||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7342051 gattcgaccttgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcat 7341952  T
Q  118 actttaggaaaggtgggaaatcactacaaacatcttggaactccactaatgcaattgcatataactcttgagtggacgattcaaccatagctttcaatgc 217  Q
    | | ||  |||  |||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||  |||||||||||||||||| ||||    
T  7341951 aatctacaaaaattgggaaatcactacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagctttccatgc 7341852  T
Q  218 cctcatgatcttcgtgacaacatcacgattactcacctctttcccatcctttttt---cccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaaca 314  Q
      |||| |||||| | || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||    
T  7341851 gttcattatcttcttcaccacatcccgattgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaaca 7341752  T
Q  315 tttgcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttctgggaaaacaattccaaccgctttcatcaaagacccatccctgtcggtaacaatcacct 414  Q
    || ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| || ||||||  | ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  7341751 ttagcttgcacatgaaaaaaacaattcaatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcacct 7341652  T
Q  415 ttggcatattcatct 429  Q
    | |||||||||||||    
T  7341651 taggcatattcatct 7341637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 18 - 429
Target Start/End: Original strand, 32430954 - 32431368
Alignment:
Q  18 gattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcat 117  Q
    ||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32430954 gattcgaccctgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcat 32431053  T
Q  118 actttaggaaaggtgggaaatcactacaaacatcttggaactccactaatgcaattgcatataactcttgagtggacgattcaaccatagctttcaatgc 217  Q
    | | ||  |||  |||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||  |||||||||||||||||| ||||    
T  32431054 aatctacaaaaattgggaaatcactacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagctttccatgc 32431153  T
Q  218 cctcatgatcttcgtgacaacatcacgattactcacctctttcccatcctttttt---cccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaaca 314  Q
      |||| |||||| | || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||    
T  32431154 gttcattatcttcttcaccacatcccgattgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaaca 32431253  T
Q  315 tttgcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttctgggaaaacaattccaaccgctttcatcaaagacccatccctgtcggtaacaatcacct 414  Q
    || ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| || ||||||  | ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  32431254 ttagcttgcacatgaaaaaaacaattcaatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcacct 32431353  T
Q  415 ttggcatattcatct 429  Q
    | |||||||||||||    
T  32431354 taggcatattcatct 32431368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 34 - 429
Target Start/End: Original strand, 30303715 - 30304113
Alignment:
Q  34 tggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcatactttaggaaaggtgg 133  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||  |||  |||    
T  30303715 tggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgg 30303814  T
Q  134 gaaatcactacaaacatcttggaactccactaatgcaattgcatataactcttgagtggacgattcaaccatagctttcaatgccctcatgatcttcgtg 233  Q
    ||||||||||||   ||||| ||||||||||||| || |||||||||| | |||| |||  |||||||||||| ||||| ||||  |||| |||||| |     
T  30303815 gaaatcactacatgaatctttgaactccactaatacatttgcatataattgttgattgggagattcaaccataactttccatgcgttcattatcttcttc 30303914  T
Q  234 acaacatcacgattactcacctctttcccatcctttttt---cccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaacatttgcttgcacatgaa 330  Q
    || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30303915 accacatcccgattgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaatccaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgaa 30304014  T
Q  331 agtaacaattcattgcataactttctgggaaaacaattccaaccgctttcatcaaagacccatccctgtcggtaacaatcacctttggcatattcatct 429  Q
    | |||||||||| |||||||||||| || ||||||  | ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30304015 aataacaattcaatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatct 30304113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 18 - 429
Target Start/End: Original strand, 32376997 - 32377411
Alignment:
Q  18 gattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcat 117  Q
    ||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32376997 gattcgaccctgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtttgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcat 32377096  T
Q  118 actttaggaaaggtgggaaatcactacaaacatcttggaactccactaatgcaattgcatataactcttgagtggacgattcaaccatagctttcaatgc 217  Q
    | | ||  |||  |||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||  |||||||||||||||||| ||||    
T  32377097 aatctacaaaaattgggaaatcactacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagctttccatgc 32377196  T
Q  218 cctcatgatcttcgtgacaacatcacgattactcacctctttcccatcctttttt---cccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaaca 314  Q
      |||| |||||| | || ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||    
T  32377197 gttcattatcttcttcaccacatcccgattgatcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaaca 32377296  T
Q  315 tttgcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttctgggaaaacaattccaaccgctttcatcaaagacccatccctgtcggtaacaatcacct 414  Q
    || ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| || ||||||  | ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  32377297 ttagcttgcacatgaaaaaaacaattcaatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcacct 32377396  T
Q  415 ttggcatattcatct 429  Q
    | |||||||||||||    
T  32377397 taggcatattcatct 32377411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 195 - 429
Target Start/End: Original strand, 43686419 - 43686653
Alignment:
Q  195 gattcaaccatagctttcaatgccctcatgatcttcgtgacaacatcacgattactcacctctttcccatccttttttcccaaaggatatttacaatcta 294  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||||| |||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43686419 gattcaaccatagctttccatgccctcattatcttcttcacaacatcgcgaggtttcacctctttcccatccttttttcccaaaggatatttacaatcta 43686518  T
Q  295 agatgcacctttgtttaacatttgcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttctgggaaaacaattccaaccgctttcatcaaagacccatc 394  Q
    ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||    
T  43686519 agacgcgcatttgtttaacatttgcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttcggggaaaacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatc 43686618  T
Q  395 cctgtcggtaacaatcacctttggcatattcatct 429  Q
    ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||    
T  43686619 cctgtcggtcacaatcaccttagtcatattcatct 43686653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 199
Target Start/End: Original strand, 43683327 - 43683510
Alignment:
Q  16 cagattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggc 115  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  43683327 cagattcgaccctgttggttgtcatgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatgac 43683426  T
Q  116 atactttaggaaaggtgggaaatcactacaaacatcttggaactccactaatgcaattgcatataactcttgagtggacgattc 199  Q
     || |||  |||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  43683427 ttaatttttgaaaagtgggaaatcactacatgaatcttggaactccactaatgcatttgcatataactcttaagtgggcgattc 43683510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 18 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 22585988 - 22585861
Alignment:
Q  18 gattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcat 117  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22585988 gattctaccctgttggtgattctgcaaccaagatgcaacacatggtatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtagtcatggcat 22585889  T
Q  118 actttaggaaaggtgggaaatcactaca 145  Q
    | |||||||||  |||||||||||||||    
T  22585888 aatttaggaaaattgggaaatcactaca 22585861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 18 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 22582126 - 22581999
Alignment:
Q  18 gattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcat 117  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22582126 gattctaccctgttggtgattctgcaaacaagatgcaacacatggtatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtagtcatggcat 22582027  T
Q  118 actttaggaaaggtgggaaatcactaca 145  Q
    | |||||||||  |||||||||||||||    
T  22582026 aatttaggaaaattgggaaatcactaca 22581999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 341 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 22581474 - 22581386
Alignment:
Q  341 cattgcataactttctgggaaaacaattccaaccgctttcatcaaagacccatccctgtcggtaacaatcacctttggcatattcatct 429  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  22581474 cattgcataactttcggggaaaacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcagtcacaatcacctttggcatattcatct 22581386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 28 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 17317442 - 17317379
Alignment:
Q  28 tgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctcctt 91  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17317442 tgttggtgattctgcacccaagatgcaacacacggtatgtccatgccctcactattttttcctt 17317379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 17340990 - 17340935
Alignment:
Q  28 tgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactatt 83  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  17340990 tgttggtggttctgcacccaagatacaacacacggtatgtccttgccctcactatt 17340935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 271; Significance: 1e-151; HSPs: 16)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 18 - 428
Target Start/End: Original strand, 4978050 - 4978460
Alignment:
Q  18 gattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcat 117  Q
    ||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4978050 gattcgaccctgctggtggtcctgcaaccaagatgcatcacatggtctgtccatgccctcaaaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgtcat 4978149  T
Q  118 actttaggaaaggtgggaaatcactacaaacatcttggaactccactaatgcaattgcatataactcttgagtggacgattcaaccatagctttcaatgc 217  Q
    | |||  |||| ||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  4978150 aatttttgaaaagtgggaaatcactacatgaatcttgaaactccactaatgcatttgcatataactcttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgc 4978249  T
Q  218 cctcatgatcttcgtgacaacatcacgattactcacctctttcccatccttttttcccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaacattt 317  Q
    |||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  4978250 cctcattatcttcttgacaacatcgcgattactcacctctttcccatccttttttcccaaaggatatttacaatctaagacgcacatttgtttaacattt 4978349  T
Q  318 gcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttctgggaaaacaattccaaccgctttcatcaaagacccatccctgtcggtaacaatcacctttg 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |    
T  4978350 gcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttcggggaaaacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtcacaatcaccttag 4978449  T
Q  418 gcatattcatc 428  Q
    |||||||||||    
T  4978450 gcatattcatc 4978460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 18 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 4770103 - 4769692
Alignment:
Q  18 gattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcat 117  Q
    ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4770103 gattcgaccttgttggtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtttgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatgacat 4770004  T
Q  118 actttaggaaaggtgggaaatcactacaaacatcttggaactccactaatgcaattgcatataactcttgagtggacgattcaaccatagctttcaatgc 217  Q
    | ||| ||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  4770003 aattttggaaaagtgggaaatcactacattaatcttggaactccactaatgcatttgcatataaatcttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgc 4769904  T
Q  218 cctcatgatcttcgtgacaacatcacgattactcacctctttcccatccttttttcccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaacattt 317  Q
    |||| | || ||| | |||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||    
T  4769903 cctcgttattttcttcacaacatcgcgatgtttcacctctttcccatcctttttttccaaaggatatttacaatctaagacacacatttgtttaatattt 4769804  T
Q  318 gcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttctgggaaaacaattccaaccgctttcatcaaagacccatccctgtcggtaacaatcacctttg 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||| |    
T  4769803 gcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttcggggaaaacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcagtcacaatcaccttag 4769704  T
Q  418 gcatattcatct 429  Q
    ||||||||||||    
T  4769703 gcatattcatct 4769692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 18 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 4977723 - 4977313
Alignment:
Q  18 gattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcat 117  Q
    ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||    
T  4977723 gattcgaccctgttggtggtcctgcaaccaagatgcatcacacagtctgtccatgccctcacaattttgtcattcacttcattcaaggtggtcatgacat 4977624  T
Q  118 actttaggaaaggtgggaaatcactacaaacatcttggaactccactaatgcaattgcatataactcttgagtggacgattcaaccatagctttcaatgc 217  Q
    | |||   ||| ||| ||||||||||||   || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  4977623 aattttttaaaagtgagaaatcactacatgaatattggaactccactaatgcatttgcatataactcttgagtggccgattcaaccatagctttccatgc 4977524  T
Q  218 cctcatgatcttcgtgacaacatcacgattactcacctctttcccatccttttttcccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaacattt 317  Q
    ||  || |||||| ||||||||||  | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4977523 cca-attatcttcttgacaacatcgtggtttctcacctctttcccatcattttttcccaaaggatatttacaatctaagacgcacctttgtttaacattt 4977425  T
Q  318 gcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttctgggaaaacaattccaaccgctttcatcaaagacccatccctgtcggtaacaatcacctttg 417  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |    
T  4977424 gcttgcacatgaaagtaataattcattgcataactttcgaggaaaacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtcacaatcaccttag 4977325  T
Q  418 gcatattcatct 429  Q
    ||||||||||||    
T  4977324 gcatattcatct 4977313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 18 - 427
Target Start/End: Original strand, 38462929 - 38463338
Alignment:
Q  18 gattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcat 117  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38462929 gattcgaccatgttgctggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcat 38463028  T
Q  118 actttaggaaaggtgggaaatcactacaaacatcttggaactccactaatgcaattgcatataactcttgagtggacgattcaaccatagctttcaatgc 217  Q
    | |||  |||| ||| ||||||||||||   || ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||  ||||    
T  38463029 aatttttgaaaagtgagaaatcactacatgaattttggaactccactgatgcatttgcatataactcttgagtgggcaattcgaccatagcttttcatgc 38463128  T
Q  218 cctcatgatcttcgtgacaacatcacgattactcacctctttcccatccttttttcccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaacattt 317  Q
    |||||| |||||| | |||||||| |||    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38463129 cctcattatcttcttcacaacatcgcgaggtttcacctctttcccatccctttttcccaaaggatatttaaaatctaagacgcacctttgtttaacattt 38463228  T
Q  318 gcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttctgggaaaacaattccaaccgctttcatcaaagacccatccctgtcggtaacaatcacctttg 417  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||| | || ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |    
T  38463229 gcttgcacatgaaaataacaattcattgtataacttttggggaaaatattttcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtcacaatcaccttag 38463328  T
Q  418 gcatattcat 427  Q
    ||||||||||    
T  38463329 gcatattcat 38463338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 33 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 3405747 - 3405348
Alignment:
Q  33 gtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcatactttaggaaaggtg 132  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| | ||  |||  ||    
T  3405747 gtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtagtcatgacataatctacaaaaattg 3405648  T
Q  133 ggaaatcactacaaacatcttggaactccactaatgcaattgcatataactcttgagtggacgattcaaccatagctttcaatgccctcatgatcttcgt 232  Q
    |||||||||||||   ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |    
T  3405647 ggaaatcactacatgaatctttgaactccactaatgcatttggatataactgtcgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccttcattatcttctt 3405548  T
Q  233 gacaacatcacgattactcacctctttcccatcctttttt---cccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaacatttgcttgcacatga 329  Q
     || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3405547 caccacatcgcgattgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaatccaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatga 3405448  T
Q  330 aagtaacaattcattgcataactttctgggaaaacaattccaaccgctttcatcaaagacccatccctgtcggtaacaatcacctttggcatattcatct 429  Q
    || ||||||||||||||||||||||| || ||||||  | ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3405447 aaataacaattcattgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatct 3405348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 18 - 429
Target Start/End: Original strand, 19071746 - 19072160
Alignment:
Q  18 gattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcat 117  Q
    ||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19071746 gattcgaccctgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcat 19071845  T
Q  118 actttaggaaaggtgggaaatcactacaaacatcttggaactccactaatgcaattgcatataactcttgagtggacgattcaaccatagctttcaatgc 217  Q
    | | ||  |||  |||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||  |||||||||||||||||| ||||    
T  19071846 aatctacaaaaattgggaaatcactacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagctttccatgc 19071945  T
Q  218 cctcatgatcttcgtgacaacatcacgattactcacctctttcccatcctttttt---cccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaaca 314  Q
      |||| |||||| | || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||    
T  19071946 gttcattatcttcttcaccacatcccgattgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaaca 19072045  T
Q  315 tttgcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttctgggaaaacaattccaaccgctttcatcaaagacccatccctgtcggtaacaatcacct 414  Q
    || ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| || ||||||  | ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  19072046 ttagcttgcacatgaaaaaaacaattcaatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcacct 19072145  T
Q  415 ttggcatattcatct 429  Q
    | |||||||||||||    
T  19072146 taggcatattcatct 19072160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 110 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 11503383 - 11503064
Alignment:
Q  110 catggcatactttaggaaaggtgggaaatcactacaaacatcttggaactccactaatgcaattgcatataactcttgagtggacgattcaaccatagct 209  Q
    ||||||||| |||  |||| |||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11503383 catggcataatttttgaaaagtgggaaatcgctacatgaatcttggaactccactaatgcattttcatataactcttgagtgggcgattcaaccatagct 11503284  T
Q  210 ttcaatgccctcatgatcttcgtgacaacatcacgattactcacctctttcccatccttttttcccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtt 309  Q
    ||| |||||||||| |||||| | ||||||||  ||    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11503283 ttccatgccctcattatcttcttcacaacatcgtgagatttcacctctttcccatcgttttttcccaaagaatatttacaatctaagatggacctttgtt 11503184  T
Q  310 taacatttgcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttctgggaaaacaattccaaccgctttcatcaaagacccatccctgtcggtaacaat 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || ||||| |||||||||| |||  |||| ||| ||| |||||    
T  11503183 taacatttgcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttcgggaaaaacatttgcaaccactttcatcaaggacatatccatgttggtcacaat 11503084  T
Q  410 cacctttggcatattcatct 429  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  11503083 caccttaggcatattcatct 11503064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 238 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 9891774 - 9891580
Alignment:
Q  238 catcacgattactcacctctttcccatcctttttt---cccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaacatttgcttgcacatgaaagta 334  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||    |||||| ||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  9891774 catcgcgattgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaagatatttacaatccaagacacgcctttgtttaacattagcttgcacatgaaaata 9891675  T
Q  335 acaattcattgcataactttctgggaaaacaattccaaccgctttcatcaaagacccatccctgtcggtaacaatcacctttggcatattcatct 429  Q
    ||||||||||||||||||||  || ||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9891674 acaattcattgcataacttttcggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacacatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatct 9891580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 284 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 21472497 - 21472352
Alignment:
Q  284 tttacaatctaagatgcacctttgtttaacatttgcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttctgggaaaacaattccaaccgctttcatc 383  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||     
T  21472497 tttacaatctaagacgcacctttgtttaacatttgcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttcggggaaaacatttgcaaccgctttcatt 21472398  T
Q  384 aaagacccatccctgtcggtaacaatcacctttggcatattcatct 429  Q
    ||||||  ||| |||||||| |||||| |||| | |||||| ||||    
T  21472397 aaagacatatctctgtcggtcacaatctccttagtcatatttatct 21472352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 112
Target Start/End: Original strand, 17238920 - 17239014
Alignment:
Q  18 gattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcat 112  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17238920 gattctaccctgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctccttcacttctttcaaggtggtcat 17239014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 135
Target Start/End: Original strand, 51643096 - 51643213
Alignment:
Q  18 gattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcat 117  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  51643096 gattctactctgttggtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctccttcatttcatttaaggtggtcatggcat 51643195  T
Q  118 actttaggaaaggtggga 135  Q
    | |||  |||| ||||||    
T  51643196 aatttttgaaaagtggga 51643213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 326 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 41024862 - 41024757
Alignment:
Q  326 atgaaagtaacaattcattgcataactttctgggaaaacaattccaaccgctttcatcaaagac--ccatccctgtcggtaacaatcacctttggcatat 423  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||  | ||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41024862 atgaaagtaacaattcattgcataacttttcggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatat 41024763  T
Q  424 tcatct 429  Q
    ||||||    
T  41024762 tcatct 41024757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 28 - 91
Target Start/End: Original strand, 13896851 - 13896914
Alignment:
Q  28 tgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctcctt 91  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||    
T  13896851 tgttggtggttctgcagccaagatgcaacacacggtatgtccatgccttcacaattttttcctt 13896914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 90
Target Start/End: Original strand, 20970616 - 20970675
Alignment:
Q  30 ttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctcct 90  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  20970616 ttggtggtcctgcacccaagatgcaacacaaggtatgtccatg-cctcactattttgtcct 20970675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 6183646 - 6183584
Alignment:
Q  28 tgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctcct 90  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||  | ||| |||||| |||||||||||||||    
T  6183646 tgttagtggttctgtaaccaagatgcaagacacagtttgttcatgccgtcactattttctcct 6183584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 17497506 - 17497453
Alignment:
Q  28 tgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcacta 81  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  17497506 tgttcgtggtcctgcacccaagatgtaacacaaggtatgtccatgccctcacta 17497453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 263; Significance: 1e-146; HSPs: 23)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 19 - 429
Target Start/End: Original strand, 19497557 - 19497967
Alignment:
Q  19 attctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcata 118  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19497557 attctaccctgttggtggttctgccaccaagatgcaacacatggtttgtccatgccctcactattttctccttcacttctttcaaggtggtcatggcata 19497656  T
Q  119 ctttaggaaaggtgggaaatcactacaaacatcttggaactccactaatgcaattgcatataactcttgagtggacgattcaaccatagctttcaatgcc 218  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||  |||||    
T  19497657 atttaggaaaagtgggaaatcactacatgcatctaggaactccactaatgcatttccatataactcttgagtgtgcgattcaaccataacttttcatgcc 19497756  T
Q  219 ctcatgatcttcgtgacaacatcacgattactcacctctttcccatccttttttcccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaacatttg 318  Q
    ||||| |||||| | |||||||| |||    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19497757 ctcattatcttcttcacaacatcgcgaggtttcacctcttttccatccttttttcccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaacatttg 19497856  T
Q  319 cttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttctgggaaaacaattccaaccgctttcatcaaagacccatccctgtcggtaacaatcacctttgg 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||   ||||||||| || ||||||||||| ||    
T  19497857 cttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttcggggaaaacatttgcaaccgctttcatcaaagatatatccctgtctgtcacaatcaccttagg 19497956  T
Q  419 catattcatct 429  Q
    |||||| ||||    
T  19497957 catatttatct 19497967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 19 - 429
Target Start/End: Original strand, 38691032 - 38691442
Alignment:
Q  19 attctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcata 118  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38691032 attctactctgttggtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttttccttcacttcattcaaggtggtcatgacata 38691131  T
Q  119 ctttaggaaaggtgggaaatcactacaaacatcttggaactccactaatgcaattgcatataactcttgagtggacgattcaaccatagctttcaatgcc 218  Q
     |||  |||| |||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  38691132 atttttgaaaagtgggaaatcactaaatgaatcttggaactccactaatgcatttgcaaataactcttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgcc 38691231  T
Q  219 ctcatgatcttcgtgacaacatcacgattactcacctctttcccatccttttttcccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaacatttg 318  Q
    ||||| |||||| | |||||||| |||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38691232 ctcattatcttcttcacaacatcgcgaggattcacgtctttcccatccttttttcccaaaggatatttacaatctaagacgcacctttgtttaacatttg 38691331  T
Q  319 cttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttctgggaaaacaattccaaccgctttcatcaaagacccatccctgtcggtaacaatcacctttgg 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||  ||    
T  38691332 cttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttcggggaaaacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtcacaatcacctcagg 38691431  T
Q  419 catattcatct 429  Q
    |||||| ||||    
T  38691432 catatttatct 38691442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 40 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 13175728 - 13175339
Alignment:
Q  40 tgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcatactttaggaaaggtgggaaatc 139  Q
    |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  13175728 tgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcattgcataattttggaaaagtgggaaatc 13175629  T
Q  140 actacaaacatcttggaactccactaatgcaattgcatataactcttgagtggacgattcaaccatagctttcaatgccctcatgatcttcgtgacaaca 239  Q
    ||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| | ||||||    
T  13175628 actacatgaatcttggaactccactaatgcatttgcatataactcttgagtggacgattcaaccatagttttccatgccctcattatcttcttcacaaca 13175529  T
Q  240 tcacgattactcacctctttcccatccttttttcccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaacatttgcttgcacatgaaagtaacaat 339  Q
    || |||    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13175528 tcgcgaggtttctcctctttcccatccttttttcccaaaggatatttacaatctaagacgtacctttgtttaacatttgcttgcacatgaaagtaacaat 13175429  T
Q  340 tcattgcataactttctgggaaaacaattccaaccgctttcatcaaagacccatccctgtcggtaacaatcacctttggcatattcatct 429  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||||||||||  ||||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||    
T  13175428 tcattgcataactttcggggaaaacatttacaaccactttcatcaaagacatatccctgtcagtcacagtcaccttaggcatattcatct 13175339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 18 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 37016883 - 37016472
Alignment:
Q  18 gattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcat 117  Q
    ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  37016883 gattcgaccctgttggtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctaacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacat 37016784  T
Q  118 actttaggaaaggtgggaaatcactacaaacatcttggaactccactaatgcaattgcatataactcttgagtggacgattcaaccatagctttcaatgc 217  Q
    | |||  ||||  ||| |||| ||| ||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  37016783 aatttttgaaaattggaaaattactgcatgaatcttggaactccactaatgcatttgcatataactgctgagtgggcgattcaaccatagctttccatgc 37016684  T
Q  218 cctcatgatcttcgtgacaacatcacgattactcacctctttcccatccttttttcccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaacattt 317  Q
    |||||| |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  37016683 cctcattatcttcttgacaacatcgcgattactcagctctttcccatccttttttcccaaaggatatttacaatctaagacacacctttgtttaacattt 37016584  T
Q  318 gcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttctgggaaaacaattccaaccgctttcatcaaagacccatccctgtcggtaacaatcacctttg 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||| |    
T  37016583 gcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttcggggaaaacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccatgttggtaacaatcaccttag 37016484  T
Q  418 gcatattcatct 429  Q
    ||||||||||||    
T  37016483 gcatattcatct 37016472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 18 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 51664227 - 51663816
Alignment:
Q  18 gattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcat 117  Q
    ||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| | | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51664227 gattcgaccctgttagtggtcctgcaaccaagatgcaacatatggtttgtccatgccttcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcat 51664128  T
Q  118 actttaggaaaggtgggaaatcactacaaacatcttggaactccactaatgcaattgcatataactcttgagtggacgattcaaccatagctttcaatgc 217  Q
    | |||  |||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  51664127 aatttttgaaaagtgggaaatcactacatgaatcttggaactccactaatgcatttgcatataactcttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgc 51664028  T
Q  218 cctcatgatcttcgtgacaacatcacgattactcacctctttcccatccttttttcccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaacattt 317  Q
    | |||| |||||| | ||| |||| | |    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  51664027 catcattatcttcttcacagcatcgctaggtttcacctctttcccatccttttttcccaaaggatatctacaatctaagacgcacatttgtttaacattt 51663928  T
Q  318 gcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttctgggaaaacaattccaaccgctttcatcaaagacccatccctgtcggtaacaatcacctttg 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||| |    
T  51663927 gcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttcggggaaaacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatcactgtcggtcacaatcaccttag 51663828  T
Q  418 gcatattcatct 429  Q
    ||||||||||||    
T  51663827 gcatattcatct 51663816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 28 - 429
Target Start/End: Original strand, 50115865 - 50116266
Alignment:
Q  28 tgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcatactttaggaa 127  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||  ||    
T  50115865 tgttagtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtatgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatataaaaa 50115964  T
Q  128 aggtgggaaatcactacaaacatcttggaactccactaatgcaattgcatataactcttgagtggacgattcaaccatagctttcaatgccctcatgatc 227  Q
    |  ||||||||||||| |   ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  50115965 aattgggaaatcactaaatgaatcttagaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccctcattatc 50116064  T
Q  228 ttcgtgacaacatcacgattactcacctctttcccatccttttttcccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaacatttgcttgcacat 327  Q
    ||| |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  50116065 ttcttgacaatatcgcgattactcacctatttcccatccttttttcccaaaggatatttacaatctaagacacacctttgtttaacatttgtttgcatat 50116164  T
Q  328 gaaagtaacaattcattgcataactttctgggaaaacaattccaaccgctttcatcaaagacccatccctgtcggtaacaatcacctttggcatattcat 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  50116165 gaaagtaacaattcattgcataactttcgggaaaaacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaagcatattcat 50116264  T
Q  428 ct 429  Q
    ||    
T  50116265 ct 50116266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 18 - 429
Target Start/End: Original strand, 12648668 - 12649082
Alignment:
Q  18 gattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcat 117  Q
    ||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12648668 gattcgaccctgttcgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcataattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatggcat 12648767  T
Q  118 actttaggaaaggtgggaaatcactacaaacatcttggaactccactaatgcaattgcatataactcttgagtggacgattcaaccatagctttcaatgc 217  Q
    | |||   |||  |||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  12648768 aattttcaaaaattgggaaatcactacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgc 12648867  T
Q  218 cctcatgatcttcgtgacaacatcacgattactcacctctttcccatcctttttt---cccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaaca 314  Q
    |||||| |||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  12648868 cctcattatcttcttgacaacatcgtgattgctcacctctttcccatcctttttaaaacccaaaggatatttacaatctaagacacacctttgtttaaca 12648967  T
Q  315 tttgcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttctgggaaaacaattccaaccgctttcatcaaagacccatccctgtcggtaacaatcacct 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  12648968 tttgcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttcgggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcacct 12649067  T
Q  415 ttggcatattcatct 429  Q
    | |||||||||||||    
T  12649068 taggcatattcatct 12649082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 37 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 46975114 - 46974722
Alignment:
Q  37 ttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcatactttaggaaaggtgggaa 136  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| |||||||    
T  46975114 ttctgcaaccaagatgcaacacatggtctatccatgccctcactattttcttcttcacttcattcaaggtggtcatggcataatttttgaaaagtgggaa 46975015  T
Q  137 atcactacaaacatcttggaactccactaatgcaattgcatataactcttgagtggacgattcaaccatagctttcaatgccctcatgatcttcgtgaca 236  Q
    |||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||||| ||||| |||||||| | |||||| | |||    
T  46975014 atcactacatgaatcttggaactccactaatgcatttgcaaataactcttgagtgggcgtttcaaccataactttccatgccctcgttatcttcttcaca 46974915  T
Q  237 acatcacgattactcacctctttcccatccttttttcccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaacatttgcttgcacatgaaagtaac 336  Q
    |||||  ||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46974914 acatcgtgaggtttcacctctttcccatccttttttcccaaaggatatttacaatctaagacgcacctttgtttaacatttgcttgcacatgaaagtaac 46974815  T
Q  337 aattcattgcataactttctgggaaaacaattccaaccgctttcatcaaagacccatccctgtcggtaacaatcacctttggcatattcatct 429  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| |||| || ||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  46974814 aattcattgcataacttccggggaaaacatttgcaaccactttaattaaagacatatccctgtcggtcacaatcaccttaggcatattcatct 46974722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 28 - 386
Target Start/End: Original strand, 36074901 - 36075259
Alignment:
Q  28 tgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcatactttaggaa 127  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  36074901 tgttggtggtcctgcaacatagatgcaacgcatggtctgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcataattttggaa 36075000  T
Q  128 aggtgggaaatcactacaaacatcttggaactccactaatgcaattgcatataactcttgagtggacgattcaaccatagctttcaatgccctcatgatc 227  Q
    | ||||||||| || |||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  36075001 aagtgggaaattaccacatgaatcttggaactccactaatgcatttgcatataactcttgagtgggcaattcaaccatagctttccatgccctcattatc 36075100  T
Q  228 ttcgtgacaacatcacgattactcacctctttcccatccttttttcccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaacatttgcttgcacat 327  Q
    ||| | |||||||| |||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  36075101 ttcttcacaacatcgcgaggtttcacctctttcccatccttttttcccaaaggatatttacaatctaagacgcacatttgtttaatatttgcttgcacat 36075200  T
Q  328 gaaagtaacaattcattgcataactttctgggaaaacaattccaaccgctttcatcaaa 386  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  36075201 gaaactaacaattcattgcataactttcggggaaaacatttgcaaccgctttcatcaaa 36075259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 18 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 5079907 - 5079493
Alignment:
Q  18 gattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcat 117  Q
    ||||| ||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||| | | |||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5079907 gattcgaccttgtttgtggtcctgcaacctagatgcaacacatggtctgtccatgccttcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatggcat 5079808  T
Q  118 actttaggaaaggtgggaaatcactacaaacatcttggaactccactaatgcaattgcatataactcttgagtggacgattcaaccatagctttcaatgc 217  Q
    | | ||  |||  |||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  5079807 aatctacaaaaattgggaaatcactacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgc 5079708  T
Q  218 cctcatgatcttcgtgacaacatcacgattactcacctctttcccatcctttttt---cccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaaca 314  Q
    | |||| |||||| | || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  5079707 cttcattatcttcttcaccacatcgcgattgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaatctaagacacacctttgtttaaca 5079608  T
Q  315 tttgcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttctgggaaaacaattccaaccgctttcatcaaagacccatccctgtcggtaacaatcacct 414  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  | ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  5079607 ttagcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcacct 5079508  T
Q  415 ttggcatattcatct 429  Q
    | |||||||||||||    
T  5079507 taggcatattcatct 5079493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 18 - 429
Target Start/End: Original strand, 29354777 - 29355191
Alignment:
Q  18 gattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcat 117  Q
    ||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29354777 gattcgaccctgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatggcat 29354876  T
Q  118 actttaggaaaggtgggaaatcactacaaacatcttggaactccactaatgcaattgcatataactcttgagtggacgattcaaccatagctttcaatgc 217  Q
    | | ||  |||  |||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  29354877 aatctacaaaaattgggaaatcactacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgc 29354976  T
Q  218 cctcatgatcttcgtgacaacatcacgattactcacctctttcccatcctttttt---cccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaaca 314  Q
    | |||| |||||| | || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  29354977 cttcattatcttcttcaccacatcgcgattgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaatccaagacacacctttgtttaaca 29355076  T
Q  315 tttgcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttctgggaaaacaattccaaccgctttcatcaaagacccatccctgtcggtaacaatcacct 414  Q
    || |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || ||||||  | ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  29355077 ttagcttgcacatgaaaataacaattcaatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcacct 29355176  T
Q  415 ttggcatattcatct 429  Q
    | |||||||||||||    
T  29355177 taggcatattcatct 29355191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 28 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 13631378 - 13630974
Alignment:
Q  28 tgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcatactttaggaa 127  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||    
T  13631378 tgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatggcataatctacaaa 13631279  T
Q  128 aggtgggaaatcactacaaacatcttggaactccactaatgcaattgcatataactcttgagtggacgattcaaccatagctttcaatgccctcatgatc 227  Q
    |  |||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||    
T  13631278 aattgggaaatcactacatgaatctttgaactccactaatgcatttgaatataactgttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccttcattatc 13631179  T
Q  228 ttcgtgacaacatcacgattactcacctctttcccatcctttttt---cccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaacatttgcttgca 324  Q
    ||| | || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  13631178 ttcttcaccacatcgcgattgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaatccaagacacacctttgtttaacattagcttgca 13631079  T
Q  325 catgaaagtaacaattcattgcataactttctgggaaaacaattccaaccgctttcatcaaagacccatccctgtcggtaacaatcacctttggcatatt 424  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| |  | |||||||| |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  13631078 catgaaaataacaattcattgcataactttccggaaaaatatgtgcaaccgctgtcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatatt 13630979  T
Q  425 catct 429  Q
    |||||    
T  13630978 catct 13630974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 18 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 44467554 - 44467140
Alignment:
Q  18 gattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcat 117  Q
    ||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44467554 gattcgaccctgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcat 44467455  T
Q  118 actttaggaaaggtgggaaatcactacaaacatcttggaactccactaatgcaattgcatataactcttgagtggacgattcaaccatagctttcaatgc 217  Q
    | | ||  |||  |||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||  |||||||||||||||||| ||||    
T  44467454 aatctacaaaaattgggaaatcactacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagctttccatgc 44467355  T
Q  218 cctcatgatcttcgtgacaacatcacgattactcacctctttcccatcctttttt---cccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaaca 314  Q
      |||| |||||| | || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||    
T  44467354 gttcattatcttcttcaccacatcccgattgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaaca 44467255  T
Q  315 tttgcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttctgggaaaacaattccaaccgctttcatcaaagacccatccctgtcggtaacaatcacct 414  Q
    || ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| || ||||||  | ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  44467254 ttagcttgcacatgaaaaaaacaattcaatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcacct 44467155  T
Q  415 ttggcatattcatct 429  Q
    | |||||||||||||    
T  44467154 taggcatattcatct 44467140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 18 - 429
Target Start/End: Original strand, 38774203 - 38774618
Alignment:
Q  18 gattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcat 117  Q
    ||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38774203 gattcgaccctgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcat 38774302  T
Q  118 actttaggaaaggtgggaaatcactacaaacatcttggaactccactaatgcaattgcatataactcttgagtggacgattcaaccatagctttcaatgc 217  Q
    | | ||  |||  |||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||  |||||||||||||||||| ||||    
T  38774303 aatctacaaaaattgggaaatcactacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagctttccatgc 38774402  T
Q  218 cctcatgatcttcgtgacaacatcacgattactcacctctttcccatccttttt---tcccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaaca 314  Q
      |||| |||||| | || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||    
T  38774403 gttcattatcttcttcaccacatcccgattgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaaca 38774502  T
Q  315 tttgcttgcacatg-aaagtaacaattcattgcataactttctgggaaaacaattccaaccgctttcatcaaagacccatccctgtcggtaacaatcacc 413  Q
    || ||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||| || ||||||  | ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  38774503 ttagcttgcacatgaaaaaaaacaattcaatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcacc 38774602  T
Q  414 tttggcatattcatct 429  Q
    || |||||||||||||    
T  38774603 ttaggcatattcatct 38774618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 18 - 429
Target Start/End: Original strand, 3946550 - 3946964
Alignment:
Q  18 gattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcat 117  Q
    ||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| | | |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3946550 gattcgaccctgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtctatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcat 3946649  T
Q  118 actttaggaaaggtgggaaatcactacaaacatcttggaactccactaatgcaattgcatataactcttgagtggacgattcaaccatagctttcaatgc 217  Q
    | | ||  |||  || ||||||||||||   ||||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||  |||||||||||||||||| ||||    
T  3946650 aatctacaaaaattgagaaatcactacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagctttccatgc 3946749  T
Q  218 cctcatgatcttcgtgacaacatcacgattactcacctctttcccatcctttttt---cccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaaca 314  Q
      |||| |||||| | || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    |||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||    
T  3946750 gttcattatcttcttcaccacatcccgattgctcacctctttcccgtcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaaca 3946849  T
Q  315 tttgcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttctgggaaaacaattccaaccgctttcatcaaagacccatccctgtcggtaacaatcacct 414  Q
    || ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| || ||||||  | ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  3946850 ttagcttgcacatgaaaaaaacaattcaatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcacct 3946949  T
Q  415 ttggcatattcatct 429  Q
    | |||||||||||||    
T  3946950 taggcatattcatct 3946964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 18 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 20351428 - 20351014
Alignment:
Q  18 gattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcat 117  Q
    ||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20351428 gattcgaccctgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaatacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcat 20351329  T
Q  118 actttaggaaaggtgggaaatcactacaaacatcttggaactccactaatgcaattgcatataactcttgagtggacgattcaaccatagctttcaatgc 217  Q
    | | ||  |||  |||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||  ||||||||||||| |||| ||||    
T  20351328 aatctacaaaaattgggaaatcactacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgc 20351229  T
Q  218 cctcatgatcttcgtgacaacatcacgattactcacctctttcccatcctttttt---cccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaaca 314  Q
      |||| || ||| | || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||    
T  20351228 gttcattatattcttcaccacatcccgattgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaaca 20351129  T
Q  315 tttgcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttctgggaaaacaattccaaccgctttcatcaaagacccatccctgtcggtaacaatcacct 414  Q
    || ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| || ||||||  | ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  20351128 ttagcttgcacatgaaaaaaacaattcaatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcacct 20351029  T
Q  415 ttggcatattcatct 429  Q
    | |||||||||||||    
T  20351028 taggcatattcatct 20351014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 149 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 41455678 - 41455395
Alignment:
Q  149 atcttggaactccactaatgcaattgcatataactcttgagtggacgattcaaccatagctttcaatgccctcatgatcttcgtgacaacatcacgatta 248  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||| ||||| |||||     
T  41455678 atctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttgaccacatcgcgattg 41455579  T
Q  249 ctcacctctttcccatcctttttt---cccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaacatttgcttgcacatgaaagtaacaattcattg 345  Q
    |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41455578 ctcacctctttcccatcctttttaaaacccaaaggatatttacaatctaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgaaagtaacaattcattg 41455479  T
Q  346 cataactttctgggaaaacaattccaaccgctttcatcaaagacccatccctgtcggtaacaatcacctttggcatattcatct 429  Q
    |||||||||  || ||||||  | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  41455478 cataacttttcggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggtatattcatct 41455395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 237 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 3984867 - 3984671
Alignment:
Q  237 acatcacgattactcacctctttcccatcctttttt---cccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaacatttgcttgcacatgaaagt 333  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||      
T  3984867 acatcccgattgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgaaaaa 3984768  T
Q  334 aacaattcattgcataactttctgggaaaacaattccaaccgctttcatcaaagacccatccctgtc-ggtaacaatcacctttggcatattcatct 429  Q
    ||||||||| |||||||||||| || ||||||  | ||||||||||||||||||||  |||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3984767 aacaattcaatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcgggtaacaatcaccttaggcatattcatct 3984671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 18 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 3991577 - 3991365
Alignment:
Q  18 gattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcat 117  Q
    ||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3991577 gattcgaccctgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcat 3991478  T
Q  118 actttaggaaaggtgggaaatcactacaaacatcttggaactccactaatgcaattgcatataactcttgagtggacgattcaaccatagctttcaatgc 217  Q
    | | ||  |||  |||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||  |||||||||||||||||| ||||    
T  3991477 aatctacaaaaattgggaaatcactacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagctttccatgc 3991378  T
Q  218 cctcatgatcttc 230  Q
      |||| ||||||    
T  3991377 gttcattatcttc 3991365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 84
Target Start/End: Original strand, 32105770 - 32105826
Alignment:
Q  28 tgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattt 84  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32105770 tgttggtggttctgtatccaagatgcaagacatgatatgtccatgccctcactattt 32105826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 202
Target Start/End: Original strand, 32105887 - 32105947
Alignment:
Q  142 tacaaacatcttggaactccactaatgcaattgcatataactcttgagtggacgattcaac 202  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||    
T  32105887 tacaaacatttttgaactccactaatgcaattgcatataattcttgtgtgggtgattcaac 32105947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 94
Target Start/End: Original strand, 742428 - 742465
Alignment:
Q  57 acacgatatgtccatgccctcactattttctccttcac 94  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  742428 acacgatatgtccatgtccttactattttctccttcac 742465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 25232191 - 25232130
Alignment:
Q  30 ttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctcctt 91  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||||| ||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||    
T  25232191 ttggtggttttgcagccaggatgcaagacacggtctgtccattccctcactattttatcctt 25232130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 7)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 18 - 428
Target Start/End: Original strand, 21357442 - 21357852
Alignment:
Q  18 gattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcat 117  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  21357442 gattctaccctgttggtggttctgcagccaagatgcaacacatggtatgtccatgccctcactattttctctttcacttctttcaaggtggtcatggcat 21357541  T
Q  118 actttaggaaaggtgggaaatcactacaaacatcttggaactccactaatgcaattgcatataactcttgagtggacgattcaaccatagctttcaatgc 217  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  21357542 aatttaggaaaagtgggaaatcactacatgcatcttggaactccactaatgcatttgcatataactcttgagtgtgcgattcaaccatagctttccatgc 21357641  T
Q  218 cctcatgatcttcgtgacaacatcacgattactcacctctttcccatccttttttcccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaacattt 317  Q
    |||||| |||||| | |||||||| |||    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21357642 cctcattatcttcttcacaacatcgcgaggtttcacctctttcccatccttttttcccgaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaacattt 21357741  T
Q  318 gcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttctgggaaaacaattccaaccgctttcatcaaagacccatccctgtcggtaacaatcacctttg 417  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||  |||  |||| || ||| ||||| | |    
T  21357742 tcttgcacatgaaagcaacaattcattgcataactttcggggaaaacatttgcgaccgctttcatcaaagacatatctttgtcagtcacagtcaccctag 21357841  T
Q  418 gcatattcatc 428  Q
    |||||||||||    
T  21357842 gcatattcatc 21357852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 18 - 428
Target Start/End: Original strand, 23961424 - 23961834
Alignment:
Q  18 gattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcat 117  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  23961424 gattctaccctgttggtggttctgcagccaagatgcaacacatggtatgtccatgccctcactattttctctttcacttctttcaaggtggtcatggcat 23961523  T
Q  118 actttaggaaaggtgggaaatcactacaaacatcttggaactccactaatgcaattgcatataactcttgagtggacgattcaaccatagctttcaatgc 217  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  23961524 aatttaggaaaagtgggaaatcactacatgcatcttggaactccactaatgcatttgcatataactcttgagtgtgcgattcaaccatagctttccatgc 23961623  T
Q  218 cctcatgatcttcgtgacaacatcacgattactcacctctttcccatccttttttcccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaacattt 317  Q
    |||||| |||||| | |||||||| |||    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23961624 cctcattatcttcttcacaacatcgcgaggtttcacctctttcccatccttttttcccgaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaacattt 23961723  T
Q  318 gcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttctgggaaaacaattccaaccgctttcatcaaagacccatccctgtcggtaacaatcacctttg 417  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||  |||  |||| || ||| ||||| | |    
T  23961724 tcttgcacatgaaagcaacaattcattgcataactttcggggaaaacatttgcgaccgctttcatcaaagacatatctttgtcagtcacagtcaccctag 23961823  T
Q  418 gcatattcatc 428  Q
    |||||||||||    
T  23961824 gcatattcatc 23961834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 31148279 - 31147880
Alignment:
Q  30 ttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcatactttaggaaag 129  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  ||||     
T  31148279 ttggtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacatattttttgaaaa 31148180  T
Q  130 gtgggaaatcactacaaacatcttggaactccactaatgcaattgcatataactcttgagtggacgattcaaccatagctttcaatgccctcatgatctt 229  Q
     ||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||    
T  31148179 ttggaaaatcactacatgaatcttggaactccactaatgcatttgcatataactgtcgagtgggcgattcaactatagctttccatgccctcaatatctt 31148080  T
Q  230 cgtgacaacatcacgattactcacctctttcccatccttttttcccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaacatttgcttgcacatga 329  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31148079 cttgacaacatcgcgattactcacctctttcccatccttttttcccaaaggatatttgcaatctaagacgcacctttgtttaacatttgcttgcacatca 31147980  T
Q  330 aagtaacaattcattgcataactttctgggaaaacaattccaaccgctttcatcaaagacccatccctgtcggtaacaatcacctttggcatattcatct 429  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31147979 aagtagcaattcattgcataactttcggggaaaacatttgcaaccactttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatct 31147880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 18 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 28358290 - 28357876
Alignment:
Q  18 gattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcat 117  Q
    ||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28358290 gattcgaccctgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacat 28358191  T
Q  118 actttaggaaaggtgggaaatcactacaaacatcttggaactccactaatgcaattgcatataactcttgagtggacgattcaaccatagctttcaatgc 217  Q
    | | ||  |||  |||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28358190 aatctacaaaaattgggaaatcactacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtggacgattcaaccatagctttccatgc 28358091  T
Q  218 cctcatgatcttcgtgacaacatcacgattactcacctctttcccatcctttttt---cccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaaca 314  Q
    | |||| |||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||    
T  28358090 cttcattatcttcttgaccacatcgcgattgctcacctctttcccatcctttttaaaacccaaaggatatttacaatctaagacacacctttgtttgaca 28357991  T
Q  315 tttgcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttctgggaaaacaattccaaccgctttcatcaaagacccatccctgtcggtaacaatcacct 414  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  | ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  28357990 ttagcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcacct 28357891  T
Q  415 ttggcatattcatct 429  Q
    | |||||||||||||    
T  28357890 taggcatattcatct 28357876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 29 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 18607947 - 18607571
Alignment:
Q  29 gttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcatactttaggaaa 128  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||    
T  18607947 gttggtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgttcatgccctcact-------ccttcacttcattcaaggtggtcatggcataatttttgaaa 18607855  T
Q  129 ggtgggaaatcactacaaacatcttggaactccactaatgcaattgcatataactcttgagtggacgattcaaccatagctttcaatgccctcatgatct 228  Q
     ||||||||||||||||   |||||  ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  18607854 agtgggaaatcactacatgaatcttctaactccactaatgcatttccatataactcttgattgggtgattcaaccatagctttccatgccctcattatct 18607755  T
Q  229 tcgtgacaacatcacgattactcacctctttcccatccttttttcccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaacatttgcttgcacatg 328  Q
    || | |||||||| |||    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  18607754 tcttcacaacatcgcgaggtttcacctctttcccatcattttttcccaaaggatatttacaatctaagacacatctttgtttaacatttgcttgcacatg 18607655  T
Q  329 aaagtaacaattcattgcataactttctgggaaaacaattccaaccgctttcatcaaagacccatccctgtcggtaacaatcac 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || ||||||||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||    
T  18607654 aaagtaacaattcattgcataactttcgggtaaaacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccatgtcggtcacaatcac 18607571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 18 - 429
Target Start/End: Original strand, 1610840 - 1611254
Alignment:
Q  18 gattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcat 117  Q
    ||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  1610840 gattcgaccctgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatgacat 1610939  T
Q  118 actttaggaaaggtgggaaatcactacaaacatcttggaactccactaatgcaattgcatataactcttgagtggacgattcaaccatagctttcaatgc 217  Q
    | | ||  |||  |||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||  |||||||||||||||||| ||||    
T  1610940 aatctacaaaaattgggaaatcactacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagctttccatgc 1611039  T
Q  218 cctcatgatcttcgtgacaacatcacgattactcacctctttcccatcctttttt---cccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaaca 314  Q
      |||| |||||| | || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||    
T  1611040 gttcattatcttcttcaccacatcccgattgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaaca 1611139  T
Q  315 tttgcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttctgggaaaacaattccaaccgctttcatcaaagacccatccctgtcggtaacaatcacct 414  Q
    || ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| || ||||||  | ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  1611140 ttagcttgcacatgaaaaaaacaattcaatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcacct 1611239  T
Q  415 ttggcatattcatct 429  Q
    | |||||||||||||    
T  1611240 taggcatattcatct 1611254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 19 - 302
Target Start/End: Original strand, 254501 - 254784
Alignment:
Q  19 attctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcata 118  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||||||| |||| |||||||||||| ||  ||| |||||||| |||||| ||    
T  254501 attctaccttgttggtggttctgcatccaagatgcaacacatagtctgtccatgctctcattattttctccttaacaacatccaaggtggccatggccta 254600  T
Q  119 ctttaggaaaggtgggaaatcactacaaacatcttggaactccactaatgcaattgcatataactcttgagtggacgattcaaccatagctttcaatgcc 218  Q
      |||  ||   ||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| || ||| ||| | |||| |||  |||||||| ||| ||| | ||||     
T  254601 ggttataaactttggaaaatcatgacaaacattttggaactccactaatgcactttcatttaatttttgaatgggtgattcaacaataacttcccatgct 254700  T
Q  219 ctcatgatcttcgtgacaacatcacgattactcacctctttcccatccttttttcccaaaggatatttacaatctaagatgcac 302  Q
    ||||| |||||| | || |||| || ||   ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||  ||||||||||||    
T  254701 ctcattatcttcttcactacattaccatgtttcatctctttcccatcctttattcctaaaggatatctacggtctaagatgcac 254784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 240; Significance: 1e-133; HSPs: 15)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 18 - 429
Target Start/End: Original strand, 7799107 - 7799509
Alignment:
Q  18 gattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcat 117  Q
    ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7799107 gattcgaccctgttggtggtcctgcaaccaagatgcatcacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcattgcat 7799206  T
Q  118 actttaggaaaggtgggaaatcactacaaacatcttggaactccactaatgcaattgcatataactcttgagtggacgattcaaccatagctttcaatgc 217  Q
    | |||  |||| ||| |||||||||||    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  7799207 aatttttgaaaagtgagaaatcactacttgaatcttggaactccactaatgcatttgcatataactcttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgc 7799306  T
Q  218 cctcatgatcttcgtgacaacatcacgattactcacctctttcccatccttttttcccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaacattt 317  Q
    ||||||||         ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7799307 cctcatga---------caacatcgcgattactcacctctttcccatccttttttcccaaaggatatttacaatctaagacgcacctttgtttaacattt 7799397  T
Q  318 gcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttctgggaaaacaattccaaccgctttcatcaaagacccatccctgtcggtaacaatcacctttg 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || | ||||||||| |||||  |||| ||||||| ||||||||||| |    
T  7799398 gcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttcggggaaaacatttgcatctgctttcatcgaagacatatccatgtcggtcacaatcaccttag 7799497  T
Q  418 gcatattcatct 429  Q
    ||||||||||||    
T  7799498 gcatattcatct 7799509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 18 - 429
Target Start/End: Original strand, 25895186 - 25895600
Alignment:
Q  18 gattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcat 117  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25895186 gattcgaccatgttcgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtagtcatggcat 25895285  T
Q  118 actttaggaaaggtgggaaatcactacaaacatcttggaactccactaatgcaattgcatataactcttgagtggacgattcaaccatagctttcaatgc 217  Q
    | |||   |||  |||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  25895286 aattttcaaaaattgggaaatcactacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataaatgttgagtggccgattcaaccatagctttccatgc 25895385  T
Q  218 cctcatgatcttcgtgacaacatcacgattactcacctctttcccatcctttttt---cccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaaca 314  Q
    | |||| |||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  25895386 cttcattatcttcttgacaacatcgcgattgctcgcctctttcccatcctttttaaaacccaaaggatatttacaatctaagacacacctttgtttaaca 25895485  T
Q  315 tttgcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttctgggaaaacaattccaaccgctttcatcaaagacccatccctgtcggtaacaatcacct 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  25895486 tttgcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttcgggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcacct 25895585  T
Q  415 ttggcatattcatct 429  Q
    | |||||||||||||    
T  25895586 taggcatattcatct 25895600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 28 - 429
Target Start/End: Original strand, 27865944 - 27866348
Alignment:
Q  28 tgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcatactttaggaa 127  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||    
T  27865944 tgtttgtggtcctgcaactaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatggcataatctacaaa 27866043  T
Q  128 aggtgggaaatcactacaaacatcttggaactccactaatgcaattgcatataactcttgagtggacgattcaaccatagctttcaatgccctcatgatc 227  Q
    |  |||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||    
T  27866044 aattgggaaatcactacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccttcattatc 27866143  T
Q  228 ttcgtgacaacatcacgattactcacctctttcccatcctttttt---cccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaacatttgcttgca 324  Q
    ||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  27866144 ttcttgaccacatcacgattgctcacctctttcccatcctttttaaaacccaaaggatatttacaatctaagacacacctttgtttaacatttgcttgca 27866243  T
Q  325 catgaaagtaacaattcattgcataactttctgggaaaacaattccaaccgctttcatcaaagacccatccctgtcggtaacaatcacctttggcatatt 424  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  | ||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  27866244 catgaaagtaacaattcattgcataactttcgggaaaaacatgtgcaatcgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatatt 27866343  T
Q  425 catct 429  Q
    |||||    
T  27866344 catct 27866348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 28 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 34079742 - 34079338
Alignment:
Q  28 tgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcatactttaggaa 127  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||    
T  34079742 tgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatggcataatctacaaa 34079643  T
Q  128 aggtgggaaatcactacaaacatcttggaactccactaatgcaattgcatataactcttgagtggacgattcaaccatagctttcaatgccctcatgatc 227  Q
    |  ||| |||||||||||   ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||    
T  34079642 aattggaaaatcactacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccttcattatc 34079543  T
Q  228 ttcgtgacaacatcacgattactcacctctttcccatcctttttt---cccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaacatttgcttgca 324  Q
    ||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  34079542 ttcttgaccacatcgcgattgctcacctctttcccatcctttttaaaacccaaaggatatttacaatctaagacacacctttgtttaacatttgcttgca 34079443  T
Q  325 catgaaagtaacaattcattgcataactttctgggaaaacaattccaaccgctttcatcaaagacccatccctgtcggtaacaatcacctttggcatatt 424  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  | ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  34079442 catgaaagtaacaattcattgcataactttcgggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatatt 34079343  T
Q  425 catct 429  Q
    |||||    
T  34079342 catct 34079338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 18 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 1037323 - 1036909
Alignment:
Q  18 gattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcat 117  Q
    ||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| | | | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1037323 gattcgaccctgttcgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctatccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatggcat 1037224  T
Q  118 actttaggaaaggtgggaaatcactacaaacatcttggaactccactaatgcaattgcatataactcttgagtggacgattcaaccatagctttcaatgc 217  Q
    | |||  ||||  |||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||  ||||    
T  1037223 aatttttgaaaattgggaaatcactacaggaatctttgaactccactaatgcatttgcatataacttttgagtgggtgattcaaccatagcttttcatgc 1037124  T
Q  218 cctcatgatcttcgtgacaacatcacgattactcacctctttcccatccttttt---tcccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaaca 314  Q
    |  ||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||    
T  1037123 ctacattatcttcttgacaacatcgcgattgctcacctctttcccatcctttttaaaacccaaaggatatttacaatctaagacacatctttgtttaaca 1037024  T
Q  315 tttgcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttctgggaaaacaattccaaccgctttcatcaaagacccatccctgtcggtaacaatcacct 414  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||| || ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  1037023 tttgcttgcacatgaaagtaactattcattgcataactttcgggaaaaacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcacct 1036924  T
Q  415 ttggcatattcatct 429  Q
    | |||||||||||||    
T  1036923 taggcatattcatct 1036909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 18 - 429
Target Start/End: Original strand, 13566196 - 13566610
Alignment:
Q  18 gattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcat 117  Q
    ||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13566196 gattcgaccctgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatggcat 13566295  T
Q  118 actttaggaaaggtgggaaatcactacaaacatcttggaactccactaatgcaattgcatataactcttgagtggacgattcaaccatagctttcaatgc 217  Q
    | | ||  |||  |||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  13566296 aatctacaaaaaatgggaaatcactacatgaatctttgaactccactaatgcattttcatataactgttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgc 13566395  T
Q  218 cctcatgatcttcgtgacaacatcacgattactcacctctttcccatccttttt---tcccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaaca 314  Q
    | |||| |||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||    
T  13566396 cttcattatcttcatgaccacatcgcgattgctcacctctttcccatcctttttaaaatccaaaggatatttacaatctaagacacacctttgtttgaca 13566495  T
Q  315 tttgcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttctgggaaaacaattccaaccgctttcatcaaagacccatccctgtcggtaacaatcacct 414  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  13566496 ttagcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcacct 13566595  T
Q  415 ttggcatattcatct 429  Q
    | |||||||||||||    
T  13566596 taggcatattcatct 13566610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 18 - 379
Target Start/End: Original strand, 4198995 - 4199356
Alignment:
Q  18 gattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcat 117  Q
    ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4198995 gattcgaccctgttggtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcat 4199094  T
Q  118 actttaggaaaggtgggaaatcactacaaacatcttggaactccactaatgcaattgcatataactcttgagtggacgattcaaccatagctttcaatgc 217  Q
    | |||   ||| ||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  4199095 aattttttaaaagtgagaaatcactacatgaatcttggaactccactaatgtatttgcatataactcttgaatggacaattcaaccatagctttccatgc 4199194  T
Q  218 cctcatgatcttcgtgacaacatcacgattactcacctctttcccatccttttttcccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaacattt 317  Q
     ||||| ||| || | |||||||| |||    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4199195 tctcattatcatcttcacaacatcgcgagatttcacctctttcccatcattttttcccaaaggatatttataatctaagacgcacctttgtttaacattt 4199294  T
Q  318 gcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttctgggaaaacaattccaaccgcttt 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  4199295 gcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttcggggaaaacatttgcaaccgcttt 4199356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 33 - 431
Target Start/End: Original strand, 18536443 - 18536841
Alignment:
Q  33 gtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcatactttaggaaaggtg 132  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  | || |||    
T  18536443 gtggtcctgcaaccaagatgcaacatatggtctgttcatgccctcactattttctccttcacttcattcaatgtggtcatggcataatttttggaaagtg 18536542  T
Q  133 ggaaatcactacaaacatcttggaactccactaatgcaattgcatataactcttgagtggacgattcaaccatagctttcaatgccctcatgatcttcgt 232  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |    
T  18536543 ggaaatcactacatgaatcttggaactccactaatacatttgcaaataactcttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccctcattatcttctt 18536642  T
Q  233 gacaacatcacgattactcacctctttcccatccttttttcccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaacatttgcttgcacatgaaag 332  Q
     |||||||| |      |||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||     
T  18536643 cacaacatcgcatggtttcacctcttttccataattttttcccaaacgatatttacaatctaagacgcacctttgtttaacttttacttgcacatgaaat 18536742  T
Q  333 taacaattcattgcataactttctgggaaaacaattccaaccgctttcatcaaagacccatccctgtcggtaacaatcacctttggcatattcatctct 431  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  18536743 taacaattcattgcataactttcggggaaaacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccttgtcggtcacaatcaccttaggcatattcatctct 18536841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 28 - 429
Target Start/End: Original strand, 11031551 - 11031955
Alignment:
Q  28 tgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcatactttaggaa 127  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||    
T  11031551 tgtttgtggtcctacaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttttccttcacttcattcaaggtggtcatggcataatctacaaa 11031650  T
Q  128 aggtgggaaatcactacaaacatcttggaactccactaatgcaattgcatataactcttgagtggacgattcaaccatagctttcaatgccctcatgatc 227  Q
    |  |||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| | |||| |||    
T  11031651 aattgggaaatcactacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgtcttcattatc 11031750  T
Q  228 ttcgtgacaacatcacgattactcacctctttcccatcctttttt---cccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaacatttgcttgca 324  Q
    ||| | || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  11031751 ttcttcaccacatcgcgattgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaatccaagacacacctttgtttaacattagcttgca 11031850  T
Q  325 catgaaagtaacaattcattgcataactttctgggaaaacaattccaaccgctttcatcaaagacccatccctgtcggtaacaatcacctttggcatatt 424  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||  | ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  11031851 catgaaaataacaattcattgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatatt 11031950  T
Q  425 catct 429  Q
    |||||    
T  11031951 catct 11031955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 28 - 429
Target Start/End: Original strand, 38858289 - 38858693
Alignment:
Q  28 tgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcatactttaggaa 127  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||  ||    
T  38858289 tgtttgtggtcctacaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatctacaaa 38858388  T
Q  128 aggtgggaaatcactacaaacatcttggaactccactaatgcaattgcatataactcttgagtggacgattcaaccatagctttcaatgccctcatgatc 227  Q
    |  |||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||| |||| |||    
T  38858389 aattgggaaatcactacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgattcaaccatagcttttcatgccttcattatc 38858488  T
Q  228 ttcgtgacaacatcacgattactcacctctttcccatcctttttt---cccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaacatttgcttgca 324  Q
    ||| | || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  38858489 ttcttcaccacatcgcgattgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaatccaagacacacctttgtttaacattagcttgca 38858588  T
Q  325 catgaaagtaacaattcattgcataactttctgggaaaacaattccaaccgctttcatcaaagacccatccctgtcggtaacaatcacctttggcatatt 424  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||  | ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  38858589 catgaaaataacaattcattgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatatt 38858688  T
Q  425 catct 429  Q
    |||||    
T  38858689 catct 38858693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 18 - 426
Target Start/End: Original strand, 37818966 - 37819377
Alignment:
Q  18 gattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcat 117  Q
    ||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37818966 gattcgaccctgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtgttcatggcat 37819065  T
Q  118 actttaggaaaggtgggaaatcactacaaacatcttggaactccactaatgcaattgcatataactcttgagtggacgattcaaccatagctttcaatgc 217  Q
    | | ||  |||  |||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  37819066 aatctacaaaaattgggaaatcactacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgt 37819165  T
Q  218 cctcatgatcttcgtgacaacatcacgattactcacctctttcccatcctttttt---cccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaaca 314  Q
    | |||| |||||  | || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    |||||| ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  37819166 cttcattatctttttcaccacatcgcgattgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaatgatatttacaatccaagacacacctttgtttaaca 37819265  T
Q  315 tttgcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttctgggaaaacaattccaaccgctttcatcaaagacccatccctgtcggtaacaatcacct 414  Q
    || |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || ||||||  | ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  37819266 ttagcttgcacatgaaaataacaattcaatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctctcggtaacaatcacct 37819365  T
Q  415 ttggcatattca 426  Q
    | ||||||||||    
T  37819366 taggcatattca 37819377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 18 - 355
Target Start/End: Original strand, 7020055 - 7020395
Alignment:
Q  18 gattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcat 117  Q
    ||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7020055 gattcgaccctgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcat 7020154  T
Q  118 actttaggaaaggtgggaaatcactacaaacatcttggaactccactaatgcaattgcatataactcttgagtggacgattcaaccatagctttcaatgc 217  Q
    | | ||   ||  |||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  7020155 aatctaccgaaattgggaaatcactacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataaccgttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgc 7020254  T
Q  218 cctcatgatcttcgtgacaacatcacgattactcacctctttcccatccttttt---tcccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaaca 314  Q
    | |||| |||||| | || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  7020255 cttcattatcttcttcaccacatcgcgattgctcacctctttcccatcctttttaaaacccaaaggatatttacaatctaagacacacctttgtttaaca 7020354  T
Q  315 tttgcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttc 355  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7020355 ttagcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttc 7020395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 18 - 389
Target Start/End: Original strand, 28884527 - 28884901
Alignment:
Q  18 gattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcat 117  Q
    ||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28884527 gattcgaccctgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatggcat 28884626  T
Q  118 actttaggaaaggtgggaaatcactacaaacatcttggaactccactaatgcaattgcatataactcttgagtggacgattcaaccatagctttcaatgc 217  Q
    | | ||  |||  |||||||||| ||||   ||||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  28884627 aatctacaaaaattgggaaatcaatacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgagtgggcgattcaaccatagttttccatgc 28884726  T
Q  218 cctcatgatcttcgtgacaacatcacgattactcacctctttcccatcctttttt---cccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaaca 314  Q
    | |||| |||||| | || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  28884727 cttcattatcttcttcaccacatcgcgattgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaatccaagacacacctttgtttaaca 28884826  T
Q  315 tttgcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttctgggaaaacaattccaaccgctttcatcaaagac 389  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  28884827 ttagcttgcacatgaaaataacaattcattgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagac 28884901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 18 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 20288240 - 20287828
Alignment:
Q  18 gattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcat 117  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||| | | | ||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||| | ||||||||    
T  20288240 gattctaccctattggtggttctgcaaccaagatataacacatggtttatccatgccctcactattttctccttaacaacatccaaggtagacatggcat 20288141  T
Q  118 actttaggaaaggtgggaaatcactacaaacatcttggaactccactaatgcaattgcatataactcttgagtgg--acgattcaaccatagctttcaat 215  Q
    |  ||||||||  ||| |||||| ||||||||| || |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||    |||||||  ||| ||| | |     
T  20288140 aggttaggaaaattggaaaatcattacaaacatttttgaactccactaatgcatttgaatataattcttgagtgggtgtgattcaataataacttaccac 20288041  T
Q  216 gccctcatgatcttcgtgacaacatcacgattactcacctctttcccatccttttttcccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaacat 315  Q
     | ||||| |||||| | || ||||||| ||   ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||   ||||||||    
T  20288040 actctcattatcttcttaactacatcaccatgtttcacctctttcccatccttttttgccataggatatctacagtctaagatgcacctgactttaacat 20287941  T
Q  316 ttgcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttctgggaaaacaattccaaccgctttcatcaaagacccatccctgtcggtaacaatcacctt 415  Q
    ||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||  ||| || |||||||||| |  |||| |||| || |||| ||||||    
T  20287940 ttttctgcacatgaaagtaacaattcattgcaaaactttctgggagaacatttgaaactgcattcatcaaagtcgtatccttgtcagtcacaaccacctt 20287841  T
Q  416 tggcatattcatc 428  Q
     || | |||||||    
T  20287840 aggaacattcatc 20287828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 375 - 429
Target Start/End: Original strand, 4202388 - 4202442
Alignment:
Q  375 gctttcatcaaagacccatccctgtcggtaacaatcacctttggcatattcatct 429  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  4202388 gctttcatcaaagacatatctctgtcggtcacaatcaccttaggcatattcatct 4202442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0341 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0341
Description:

Target: scaffold0341; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 18 - 429
Target Start/End: Original strand, 15446 - 15860
Alignment:
Q  18 gattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcat 117  Q
    ||||| ||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||| | | ||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||     
T  15446 gattcgaccctgtttgtggtcctgcaacctagatgcaacacatggtctgtccattccctcacaattttgtctttcacttcattcaaggtggtcatggcac 15545  T
Q  118 actttaggaaaggtgggaaatcactacaaacatcttggaactccactaatgcaattgcatataactcttgagtggacgattcaaccatagctttcaatgc 217  Q
    | | ||  |||  |||||||||||||||   ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  15546 aatctacaaaaattgggaaatcactacatgaatctttgaactccagtaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgc 15645  T
Q  218 cctcatgatcttcgtgacaacatcacgattactcacctctttcccatcctttttt---cccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaaca 314  Q
    | |||| |||||| | || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  15646 cttcattatcttcttcaccacatcgcgattgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaatgatatttacaatctaagacacacctttgtttaaca 15745  T
Q  315 tttgcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttctgggaaaacaattccaaccgctttcatcaaagacccatccctgtcggtaacaatcacct 414  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  | ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  15746 ttagcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcacct 15845  T
Q  415 ttggcatattcatct 429  Q
    | |||| ||||||||    
T  15846 taggcacattcatct 15860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 18 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 2853 - 2439
Alignment:
Q  18 gattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcat 117  Q
    ||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2853 gattcgaccctgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcat 2754  T
Q  118 actttaggaaaggtgggaaatcactacaaacatcttggaactccactaatgcaattgcatataactcttgagtggacgattcaaccatagctttcaatgc 217  Q
    | | ||  |||  |||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||  |||||||||||||||||| ||||    
T  2753 aatctacaaaaattgggaaatcactacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagctttccatgc 2654  T
Q  218 cctcatgatcttcgtgacaacatcacgattactcacctctttcccatcctttttt---cccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaaca 314  Q
      |||| |||||| | || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||    
T  2653 gttcattatcttcttcaccacatcccgattgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaaca 2554  T
Q  315 tttgcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttctgggaaaacaattccaaccgctttcatcaaagacccatccctgtcggtaacaatcacct 414  Q
    || ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| || ||||||  | ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  2553 ttagcttgcacatgaaaaaaacaattcaatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcacct 2454  T
Q  415 ttggcatattcatct 429  Q
    | |||||||||||||    
T  2453 taggcatattcatct 2439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 18 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 34781 - 34367
Alignment:
Q  18 gattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcat 117  Q
    ||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34781 gattcgaccctgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcat 34682  T
Q  118 actttaggaaaggtgggaaatcactacaaacatcttggaactccactaatgcaattgcatataactcttgagtggacgattcaaccatagctttcaatgc 217  Q
    | | ||  |||  |||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||  |||||||||||||||||| ||||    
T  34681 aatctacaaaaattgggaaatcactacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagctttccatgc 34582  T
Q  218 cctcatgatcttcgtgacaacatcacgattactcacctctttcccatcctttttt---cccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaaca 314  Q
      |||| |||||| | || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||    
T  34581 gttcattatcttcttcaccacatcccgattgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaaca 34482  T
Q  315 tttgcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttctgggaaaacaattccaaccgctttcatcaaagacccatccctgtcggtaacaatcacct 414  Q
    || ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| || ||||||  | ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  34481 ttagcttgcacatgaaaaaaacaattcaatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcacct 34382  T
Q  415 ttggcatattcatct 429  Q
    | |||||||||||||    
T  34381 taggcatattcatct 34367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0201 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0201
Description:

Target: scaffold0201; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 237 - 429
Target Start/End: Original strand, 25254 - 25449
Alignment:
Q  237 acatcacgattactcacctctttcccatcctttttt---cccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaacatttgcttgcacatgaaagt 333  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25254 acatcgcgattgctcacctctttcccatcctttttaaaacccaaaggatatttacaatctaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgaaagt 25353  T
Q  334 aacaattcattgcataactttctgggaaaacaattccaaccgctttcatcaaagacccatccctgtcggtaacaatcacctttggcatattcatct 429  Q
    |||||||||||||||||||||  || |||||| || ||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25354 aacaattcattgcataacttttaggaaaaacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatcaatgtaggtaacaatcaccttaggcatattcatct 25449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0219 (Bit Score: 96; Significance: 6e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0219
Description:

Target: scaffold0219; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 274 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 17782 - 17627
Alignment:
Q  274 ccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaacatttgcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttctgggaaaacaattccaac 373  Q
    ||||||| ||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||    
T  17782 ccaaagggtatttaatatctaagacgcacctttatttaacatttgcttgcacatgaaagtgacaattcattgcagaactttcggggaaaacatttgcaac 17683  T
Q  374 cgctttcatcaaagacccatccctgtcggtaacaatcacctttggcatattcatct 429  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  17682 cgctttcatcaaagacatatccctgtcggtcacaatcaccttatgcatattcatct 17627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0542 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0542
Description:

Target: scaffold0542; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 28 - 85
Target Start/End: Original strand, 1169 - 1226
Alignment:
Q  28 tgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactatttt 85  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| ||| | | |||||||||||||||||||||    
T  1169 tgttggtggttcggcagccaagatgcaagacatggtctgtccatgccctcactatttt 1226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 27 - 93
Target Start/End: Original strand, 2100 - 2166
Alignment:
Q  27 atgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacgatatgtccatgccctcactattttctccttca 93  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||| | | ||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  2100 atgttcgtggtcctgcacccaagatgtaacacaaggtctgtccataccctcactattttgtccttca 2166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University