View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF21583_low_4 (Length: 532)

Name: NF21583_low_4
Description: NF21583
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF21583_low_4
NF21583_low_4
[»] chr7 (41 HSPs)
chr7 (156-515)||(22858571-22858930)
chr7 (1-162)||(22858279-22858440)
chr7 (258-515)||(22831285-22831542)
chr7 (262-488)||(22889550-22889776)
chr7 (262-510)||(22805567-22805815)
chr7 (262-490)||(22876174-22876402)
chr7 (262-488)||(22898521-22898747)
chr7 (262-515)||(22809902-22810155)
chr7 (257-515)||(22842417-22842681)
chr7 (262-487)||(22815285-22815510)
chr7 (257-488)||(22840305-22840542)
chr7 (257-514)||(22880817-22881080)
chr7 (262-510)||(22894202-22894450)
chr7 (12-162)||(22809461-22809611)
chr7 (1-162)||(22880411-22880569)
chr7 (1-162)||(22889112-22889270)
chr7 (1-162)||(22814847-22815005)
chr7 (1-162)||(22830851-22831009)
chr7 (250-348)||(22885838-22885934)
chr7 (156-250)||(22889401-22889495)
chr7 (1-162)||(22875742-22875894)
chr7 (1-162)||(22839872-22840030)
chr7 (12-162)||(22893773-22893911)
chr7 (156-250)||(22815136-22815230)
chr7 (156-250)||(22831140-22831234)
chr7 (157-250)||(22805419-22805512)
chr7 (5-162)||(22805138-22805283)
chr7 (255-451)||(22913919-22914115)
chr7 (18-89)||(22826139-22826210)
chr7 (19-89)||(22898153-22898223)
chr7 (157-250)||(22840162-22840255)
chr7 (39-89)||(22913555-22913605)
chr7 (157-250)||(22876026-22876119)
chr7 (157-250)||(22898373-22898466)
chr7 (159-250)||(22842264-22842355)
chr7 (65-162)||(22885445-22885539)
chr7 (156-250)||(22880673-22880767)
chr7 (446-490)||(22873588-22873632)
chr7 (98-162)||(22913494-22913558)
chr7 (414-445)||(22885937-22885968)
chr7 (157-219)||(22894054-22894116)
[»] chr1 (3 HSPs)
chr1 (262-490)||(21150228-21150456)
chr1 (1-162)||(21150736-21150894)
chr1 (156-250)||(21150511-21150605)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 356; Significance: 0; HSPs: 41)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 156 - 515
Target Start/End: Original strand, 22858571 - 22858930
Alignment:
Q  156 ctcaacagcaaacacatggttgctagtgtttccaatgttggaatcgttaaagggaccaaggtattggtttggaagtgaatctggtagcccttttgatatt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22858571 ctcaacagcaaacacatggttgctagtgtttccaatgttggaatcgttaaagggaccaaggtattggtttggaagtgaatctggtagcccttttgatatt 22858670  T
Q  256 cagattttatggcaaataaaaaagtagttgagaaagaagacacagtttcactagaagtgtttttgaaaactataggatttggatagaaagcatgtgcagt 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22858671 cagattttatggcaaataaaaaagtagttgagaaagaagacacagtttcactagaagtgtttttgaaaactataggatttggatagaaagcatgtgctgt 22858770  T
Q  356 atcttgcccgatatcattggtgagtcttagtaagccagttgaagttaactcagcaataccatcaagatataaatgtgatgattggaatcctttatagatg 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22858771 atcttgcccgatatcattggtgagtcttagtaagccagttgaagttaactcagcaataccatcaagatataaatgtgatgattggaatcctttatagatg 22858870  T
Q  456 aaaccgttgtcttcacttgctaccaatgtaacaagcaaacataacataaagacaaacttg 515  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22858871 aaaccgttgtcttcacttgctaccaatgtaacaagcaaacataacataaagacaaacttg 22858930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 22858440 - 22858279
Alignment:
Q  1 tatccctttctagtggatatcctatgcaggtatggatagaatatgatggagtgaagaaaaatattgatgttacattagctccaattaattttggttgtaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22858440 tatccctttctagtggatatcctatgcaggtatggatagaatatgatggagtgaagaaaaatattgatgttacattagctccaattaattttggttgtaa 22858341  T
Q  101 tgttgttaaaccagcacgacctttgttatcattcacgaaagatctttctccaattctcaaca 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22858340 tgttgttaaaccagcacgacctttgttatcattcacgaaagatctttctccaattctcaaca 22858279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 258 - 515
Target Start/End: Original strand, 22831285 - 22831542
Alignment:
Q  258 gattttatggcaaataaaaaagtagttgagaaagaagacacagtttcactagaagtgtttttgaaaactataggatttggatagaaagcatgtgcagtat 357  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| || || | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||    
T  22831285 gattttatggtaaatacaaaagtagttgagaaagatgacacacttgcattcgaagtgtttttaaaaactatatgatttggatagaaagcatatgctgtat 22831384  T
Q  358 cttgcccgatatcattggtgagtcttagtaagccagttgaagttaactcagcaataccatcaagatataaatgtgatgattggaatcctttatagatgaa 457  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  22831385 ctggcccggtatcattggtgagtcttagtaagccatctgaagttaactcagcaataccatcaagatataaatgtgatgattggaaaccattatagatgaa 22831484  T
Q  458 accgttgtcttcacttgctaccaatgtaacaagcaaacataacataaagacaaacttg 515  Q
    || | |||||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||| |||| ||||    
T  22831485 actgctgtcttcacttgctacaaatgtaacaagaaaaaacaacataaacacaagcttg 22831542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 262 - 488
Target Start/End: Original strand, 22889550 - 22889776
Alignment:
Q  262 ttatggcaaataaaaaagtagttgagaaagaagacacagtttcactagaagtgtttttgaaaactataggatttggatagaaagcatgtgcagtatcttg 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |  | |||      
T  22889550 ttatggcaaataaaaaagtagttgagaaagaagacacgctttcactggaagtgtttttgaaaactattggatttggatagaaaccatgtcctttgtctct 22889649  T
Q  362 cccgatatcattggtgagtcttagtaagccagttgaagttaactcagcaataccatcaagatataaatgtgatgattggaatcctttatagatgaaaccg 461  Q
      |  |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |    
T  22889650 ttctgtatcattggtgagttttagtaagccatttgtagttaactcagcaataccatcaagatataaatgtgatgattggaatccattatatatgaaactg 22889749  T
Q  462 ttgtcttcacttgctaccaatgtaaca 488  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||    
T  22889750 ttgtcttcacttgcaaccaatgtaaca 22889776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 262 - 510
Target Start/End: Original strand, 22805567 - 22805815
Alignment:
Q  262 ttatggcaaataaaaaagtagttgagaaagaagacacagtttcactagaagtgtttttgaaaactataggatttggatagaaagcatgtgcagtatcttg 361  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |  |  ||||    
T  22805567 ttatggcaaatacaaaagtagttgagaaagaagacacactttcactggaagtgtttttgaaaactattggatttggatagaaagcatgacctattacttg 22805666  T
Q  362 cccgatatcattggtgagtcttagtaagccagttgaagttaactcagcaataccatcaagatataaatgtgatgattggaatcctttatagatgaaaccg 461  Q
      |  ||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  22805667 ttctgtatcattggtgagtcttagtatgccatctgaggttaactcagcaaaaccatcaagatataaatgtgatgattggaatccattatagatgaaactg 22805766  T
Q  462 ttgtcttcacttgctaccaatgtaacaagcaaacataacataaagacaa 510  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| | ||| | |||||||| ||||    
T  22805767 ttatcttcacttgctactaatgtaacatgaaaaaacaacataaacacaa 22805815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 262 - 490
Target Start/End: Original strand, 22876174 - 22876402
Alignment:
Q  262 ttatggcaaataaaaaagtagttgagaaagaagacacagtttcactagaagtgtttttgaaaactataggatttggatagaaagcatgtgcagtatcttg 361  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  | || |     
T  22876174 ttatggcaaatacaaaagtagttgagaaagaagacacacttccattggaagtgtttttgaaaactataggatttggatagaaaccatgtcctttttcata 22876273  T
Q  362 cccgatatcattggtgagtcttagtaagccagttgaagttaactcagcaataccatcaagatataaatgtgatgattggaatcctttatagatgaaaccg 461  Q
      |  |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  22876274 ttctgtatcattggtgagttttagtaagccatttgaggttaactcagcaataccatcaagatataaatttgatgattggaatccattatagatgaaactg 22876373  T
Q  462 ttgtcttcacttgctaccaatgtaacaag 490  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||    
T  22876374 ttttcttcacttgctaccaatgtaacaag 22876402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 262 - 488
Target Start/End: Original strand, 22898521 - 22898747
Alignment:
Q  262 ttatggcaaataaaaaagtagttgagaaagaagacacagtttcactagaagtgtttttgaaaactataggatttggatagaaagcatgtgcagtatcttg 361  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| || || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||    
T  22898521 ttatggcaaacacaaaagtagttgagaaagaagaaacacttccattagaagtgttcttgaaaactataggatttggatagaaagcatgtgctttttcttg 22898620  T
Q  362 cccgatatcattggtgagtcttagtaagccagttgaagttaactcagcaataccatcaagatataaatgtgatgattggaatcctttatagatgaaaccg 461  Q
    |  | |||||||||||||||| ||||||||| | || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |    
T  22898621 cttggtatcattggtgagtctaagtaagccattggaggttaaattagcaataccatcaagatataaatgtgatgattggaaaccattatagatgaaactg 22898720  T
Q  462 ttgtcttcacttgctaccaatgtaaca 488  Q
    || |||| |||||||||||||||||||    
T  22898721 ttatctttacttgctaccaatgtaaca 22898747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 262 - 515
Target Start/End: Original strand, 22809902 - 22810155
Alignment:
Q  262 ttatggcaaataaaaaagtagttgagaaagaagacacagtttcactagaagtgtttttgaaaactataggatttggatagaaagcatgtgcagtatcttg 361  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  | || ||    
T  22809902 ttatggcaaatacaaaagtagttgagaaagaagatacactttcactgatagtgtttttgaaaactacaggatttggatagaaagcatgtcctttttcatg 22810001  T
Q  362 cccgatatcattggtgagtcttagtaagccagttgaagttaactcagcaataccatcaagatataaatgtgatgattggaatcctttatagatgaaaccg 461  Q
      |  ||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |    
T  22810002 ttctgtatcattggtgagtcttagtaagccatctggggttaactcagcaataccatcaagatataaatgtgatgattggaaaccattatagatgaaactg 22810101  T
Q  462 ttgtcttcacttgctaccaatgtaacaagcaaacataacataaagacaaacttg 515  Q
    || |||| ||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||| |||| ||||    
T  22810102 ttatctttacttgctactaatgtaacaagaaaaaacaacataaacacaagcttg 22810155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 257 - 515
Target Start/End: Original strand, 22842417 - 22842681
Alignment:
Q  257 agattttatggcaaataaaaaagtagttgagaaagaagacacagtttcactagaagtgtttttgaaaactataggatttggatagaaagcatgtgcagta 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||  |  |     
T  22842417 agattttatggcaaataaaaaagtagttgagaaagaagacacactttcactagaagtgtttttgaaaactattggttttggatataaagcatgacctttg 22842516  T
Q  357 tcttgcccgatatcattggtgagtcttagtaagccagttgaagttaactcagcaataccatcaagatataaatgtgatgattggaatcct------ttat 450  Q
    | |||     ||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||      ||||    
T  22842517 tattgttttgtatcattggtgagtcttggtaagccacctgaggttaactcagcaataccatcaagatacaaatgaaatgattggaatcctctattattat 22842616  T
Q  451 agatgaaaccgttgtcttcacttgctaccaatgtaacaagcaaacataacataaagacaaacttg 515  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| ||||    
T  22842617 agatgaaactgttgtcttcacttgctaccaatgtaacaagaaaaaacaacataaacacaagcttg 22842681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 262 - 487
Target Start/End: Original strand, 22815285 - 22815510
Alignment:
Q  262 ttatggcaaataaaaaagtagttgagaaagaagacacagtttcactagaagtgtttttgaaaactataggatttggatagaaagcatgtgcagtatcttg 361  Q
    |||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |  ||      
T  22815285 ttattgcaaacacaaaagtagttgagaaagaagacacactttcattggaagtgtttttgaaaactataggatttggatagaaagcatatcctttggctct 22815384  T
Q  362 cccgatatcattggtgagtcttagtaagccagttgaagttaactcagcaataccatcaagatataaatgtgatgattggaatcctttatagatgaaaccg 461  Q
      |  |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |    
T  22815385 ttctgtatcattggtgagttttagtaagccatttgaggttaactcagcaataccatcaagatttaaatgtgatgattggaatccattatatatgaaactg 22815484  T
Q  462 ttgtcttcacttgctaccaatgtaac 487  Q
    |||||| |||||||||||||||||||    
T  22815485 ttgtctacacttgctaccaatgtaac 22815510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 257 - 488
Target Start/End: Original strand, 22840305 - 22840542
Alignment:
Q  257 agattttatggcaaataaaaaagtagttgagaaagaagacacagtttcactagaagtgtttttgaaaactataggatttggatagaaagcatgtgcagta 356  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| || | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  |     
T  22840305 agattttatggaaaatacaaaagtagttgagaaagaagaaacacttccgctggaagtgtttttgaaaactataggatttggatagaaagcttgtcctttt 22840404  T
Q  357 tcttgcccgatatcattggtgagtcttagtaagccagttgaagttaactcagcaataccatcaagatataaatgtgatgattggaatcc------tttat 450  Q
    |||||     ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||      |||||    
T  22840405 tcttgttttgtatcattggtgagtcttagtaagccagttgaggctaactcagcggtaccatcaagatataaatttgatgattggaatccattatatttat 22840504  T
Q  451 agatgaaaccgttgtcttcacttgctaccaatgtaaca 488  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  22840505 agatgaaactgttgtctatacttgctaccaatgtaaca 22840542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 257 - 514
Target Start/End: Original strand, 22880817 - 22881080
Alignment:
Q  257 agattttatggcaaataaaaaagtagttgagaaagaagacacagtttcactagaagtgtttttgaaaactataggatttggatagaaagcatgtgcagta 356  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |     
T  22880817 agatttgatggcaaatacaaaagtagttgagaaagaatacacactttcattggaagtgtttttgaaaactataggatttggatagaaagcatatcctttg 22880916  T
Q  357 tcttgcccgatatcattggtgagtcttagtaagccagttgaagttaactcagcaataccatcaagatataaatgtgatgattggaatcc------tttat 450  Q
     ||    |  | |||||||||||||||||||||||| ||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||      |||||    
T  22880917 gctctttctgtgtcattggtgagtcttagtaagccatttgagtttaccttagcaataccatcaagatataaatgtgatgaatggaatccattgtatttat 22881016  T
Q  451 agatgaaaccgttgtcttcacttgctaccaatgtaacaagcaaacataacataaagacaaactt 514  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||    
T  22881017 agatgaaactgttttcttcacttgctatcaatgtaacaagaaaaaacaacataaacacaaactt 22881080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 262 - 510
Target Start/End: Original strand, 22894202 - 22894450
Alignment:
Q  262 ttatggcaaataaaaaagtagttgagaaagaagacacagtttcactagaagtgtttttgaaaactataggatttggatagaaagcatgtgcagtatcttg 361  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| || || | |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||    
T  22894202 ttatggcaaatacaaaagtagttgagaatgaagaaacacttccattggaagtgttcttcaaaactatagggtttggatagaaagcatgtgctttttcttg 22894301  T
Q  362 cccgatatcattggtgagtcttagtaagccagttgaagttaactcagcaataccatcaagatataaatgtgatgattggaatcctttatagatgaaaccg 461  Q
       | | |||||||||||||||||||||||| | || ||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  | |||||||||||||      
T  22894302 tttggtgtcattggtgagtcttagtaagccattggaggttaaattagcaataccatcaagatacaaatgagatgattggaaatcattatagatgaaactt 22894401  T
Q  462 ttgtcttcacttgctaccaatgtaacaagcaaacataacataaagacaa 510  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||    
T  22894402 ttgtcttcacttggtaccaatgtaacaagaaaaaacaacataaacacaa 22894450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 12 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 22809611 - 22809461
Alignment:
Q  12 agtggatatcctatgcaggtatggatagaatatgatggagtgaagaaaaatattgatgttacattagctccaattaattttggttgtaatgttgttaaac 111  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |  |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  22809611 agtggctatcctatgcatgtatggattgaatatgatggtgaaaagaaaaagattgatgctactttagctccaattaatgttggttttaatgttgttaaac 22809512  T
Q  112 cagcacgacctttgttatcattcacgaaagatctttctccaattctcaaca 162  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  22809511 caacacgacctttgttatcattcaccaaagatctttctccaattcttaaca 22809461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 22880569 - 22880411
Alignment:
Q  1 tatccctttctagtggatatcctatgcaggtatggatagaatatgatggagtgaagaaaaatattgatgttacattagctccaattaattttggttgtaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | |||||| |||    
T  22880569 tatccctttccagtggatatcccatgcaggtatggattgactatgatggagtgaagaaaaagattgaggttacattagctccgattagtgttggttttaa 22880470  T
Q  101 tgttgttaaaccagcacgacctttgttatcattcacgaaagatctttctccaattctcaaca 162  Q
       |  ||||||| |||||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  22880469 ---taataaaccaacacgacatttgttgtcattgaccaaagatctttctccaattctcaaca 22880411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 22889270 - 22889112
Alignment:
Q  1 tatccctttctagtggatatcctatgcaggtatggatagaatatgatggagtgaagaaaaatattgatgttacattagctccaattaattttggttgtaa 100  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| | | |||||  ||     
T  22889270 tatccctttccagtggataccctatgcaggtatggattgaatatgatggagtgaagaaaaagattgatgttactttagcaccaatgagtgttggtgcta- 22889172  T
Q  101 tgttgttaaaccagcacgacctttgttatcattcacgaaagatctttctccaattctcaaca 162  Q
       |  ||||||| ||| ||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||    
T  22889171 --gtaataaaccaacacaacctttgttatcattgaccaaagatctttcttcaattctcaaca 22889112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 22815005 - 22814847
Alignment:
Q  1 tatccctttctagtggatatcctatgcaggtatggatagaatatgatggagtgaagaaaaatattgatgttacattagctccaattaattttggttgtaa 100  Q
    |||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | | |||||  ||     
T  22815005 tatccctttccaatggatttcctatacaggtatggattgactatgatggagtgaagaaaaagattgatgttactttagctccaatgagtgttggtgcta- 22814907  T
Q  101 tgttgttaaaccagcacgacctttgttatcattcacgaaagatctttctccaattctcaaca 162  Q
       |  ||||||| ||| ||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||    
T  22814906 --gtaataaaccaacacaacctttgttatcattgaccaaagatctttcttcaattctcaaca 22814847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 22831009 - 22830851
Alignment:
Q  1 tatccctttctagtggatatcctatgcaggtatggatagaatatgatggagtgaagaaaaatattgatgttacattagctccaattaattttggttgtaa 100  Q
    |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| | |||||| ||     
T  22831009 tatcccttaccagtggacatcctatgcaggtatggattgaatatgatggagtgaagaaaaagattgatgttaccttagctccagttagtgttggtttta- 22830911  T
Q  101 tgttgttaaaccagcacgacctttgttatcattcacgaaagatctttctccaattctcaaca 162  Q
       |  ||||||| ||| |||   ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  22830910 --gtcataaaccaacacaaccgacgttatcattgaccaaagatctttccccaattctcaaca 22830851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 250 - 348
Target Start/End: Original strand, 22885838 - 22885934
Alignment:
Q  250 gatattcagattttatggcaaataaaaaagtagttgagaaagaagacacagtttcactagaagtgtttttgaaaactataggatttggatagaaagcat 348  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22885838 gatattaagattttatagcaaataaagaattagttgagaaagaagacacactttcact--gagtgtttttgaaaactataggatttggatagaaagcat 22885934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 156 - 250
Target Start/End: Original strand, 22889401 - 22889495
Alignment:
Q  156 ctcaacagcaaacacatggttgctagtgtttccaatgttggaatcgttaaagggaccaaggtattggtttggaagtgaatctggtagcccttttg 250  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  22889401 ctcaacaccaaaaacatggttgctactgtttccactgttggaatcgttaaagagaccaaggtattgacttggtagtgaatctggtagcccttttg 22889495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 22875894 - 22875742
Alignment:
Q  1 tatccctttctagtggatatcctatgcaggtatggatagaatatgatggagtgaagaaaaatattgatgttacattagctccaattaattttggttgtaa 100  Q
    |||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||  |   || | ||||    
T  22875894 tatcccttttcagtggatatcccatgcaggtatggattgactatgatggagtgaaaaaaaagattgatgttactttagctccaataga---tgctagtaa 22875798  T
Q  101 tgttgttaaaccagcacgacctttgttatcattcacgaaagatctttctccaattctcaaca 162  Q
          ||||||| ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  22875797 ------taaaccaacacaacctttgttatcattgaccaaagatctttctccaattctcaaca 22875742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 22840030 - 22839872
Alignment:
Q  1 tatccctttctagtggatatcctatgcaggtatggatagaatatgatggagtgaagaaaaatattgatgttacattagctccaattaattttggttgtaa 100  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| | |||||| ||     
T  22840030 tatccctctccagtggatatcctatgcaagtatggattgaatatgatagagtgaagaaaaagattgatgttaccttagctccatttagtgttggtttta- 22839932  T
Q  101 tgttgttaaaccagcacgacctttgttatcattcacgaaagatctttctccaattctcaaca 162  Q
       |  ||||||| ||| |||   ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  22839931 --gtcataaaccaacacaaccgacgttatcattgaccaaagatctttccccaattctcaaca 22839872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 22893911 - 22893773
Alignment:
Q  12 agtggatatcctatgcaggtatggatagaatatgatggagtgaagaaaaatattgatgttacattagctccaattaattttggttgtaatgttgttaaac 111  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||| ||||||||||| |||||||||||            ||||||||||||||    
T  22893911 agtggctatcctatgcaggtatggattgaatatgatggtgaaaagaaaaagattgatgttactttagctccaat------------taatgttgttaaac 22893824  T
Q  112 cagcacgacctttgttatcattcacgaaagatctttctccaattctcaaca 162  Q
    ||  || ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  22893823 caaaacaacctttgttatcattgaccaaagatctttctccaattcttaaca 22893773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 156 - 250
Target Start/End: Original strand, 22815136 - 22815230
Alignment:
Q  156 ctcaacagcaaacacatggttgctagtgtttccaatgttggaatcgttaaagggaccaaggtattggtttggaagtgaatctggtagcccttttg 250  Q
    ||||||| |||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||||||    
T  22815136 ctcaacaccaaaaacatggttgttactgtttccattgttggaatcgttaaagagaccaaggtattgacttggtagtgaatttggtagcccttttg 22815230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 156 - 250
Target Start/End: Original strand, 22831140 - 22831234
Alignment:
Q  156 ctcaacagcaaacacatggttgctagtgtttccaatgttggaatcgttaaagggaccaaggtattggtttggaagtgaatctggtagcccttttg 250  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  22831140 ctcaacaccaaaaacatggttgctactgtttccaatgttggagtagttaaagagaccaaagtattgatttggtagtgaatttggtagcccttttg 22831234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 157 - 250
Target Start/End: Original strand, 22805419 - 22805512
Alignment:
Q  157 tcaacagcaaacacatggttgctagtgtttccaatgttggaatcgttaaagggaccaaggtattggtttggaagtgaatctggtagcccttttg 250  Q
    |||||| |||| |||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  22805419 tcaacaccaaaaacatggttgccactgtttccattgttggaatcattaaagagaccaaggtattgatttggtagtgaatttggtagcccttttg 22805512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 5 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 22805283 - 22805138
Alignment:
Q  5 cctttctagtggatatcctatgcaggtatggatagaatatgatggagtgaagaaaaatattgatgttacattagctccaattaattttggttgtaatgtt 104  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |            | |||||    
T  22805283 cctttccagtggaaatcctatacaggtatggattgattatgatggagtgaagaaaaagattgatgttactttagctccagt------------ttatgtt 22805196  T
Q  105 gttaaaccagcacgacctttgttatcattcacgaaagatctttctccaattctcaaca 162  Q
    ||||||||| || |||||| ||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||    
T  22805195 gttaaaccaacaggaccttcgttatcaatgaccaaagatctttctccaattcttaaca 22805138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 255 - 451
Target Start/End: Original strand, 22913919 - 22914115
Alignment:
Q  255 tcagattttatggcaaataaaaaagtagttgagaaagaagacacagtttcactagaagtgtttttgaaaactataggatttggatagaaagcatgtgcag 354  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||| |   ||||      || |||||||||||||| |||||||||||||||||  |      
T  22913919 tcagattttatggcaaaaacaaaagtagtagagaaagaagatacattactactacttccattgttgaaaactatagggtttggatagaaagcatgaccct 22914018  T
Q  355 tatcttgcccgatatcattggtgagtcttagtaagccagttgaagttaactcagcaataccatcaagatataaatgtgatgattggaatcctttata 451  Q
    | | ||| |    ||||||||| | ||||||||| ||| |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||    
T  22914019 tttgttgtcttgaatcattggttaatcttagtaaaccatttgaggttaattcagcaacaccatcaagatataaatgtgatgatttgaaaccattata 22914115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 18 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 22826210 - 22826139
Alignment:
Q  18 tatcctatgcaggtatggatagaatatgatggagtgaagaaaaatattgatgttacattagctccaattaat 89  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |  || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  22826210 tatcctatgcaggtatggatagaatatgatggtgaaaataaaaagattgatgttactttagctccaattaat 22826139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 22898223 - 22898153
Alignment:
Q  19 atcctatgcaggtatggatagaatatgatggagtgaagaaaaatattgatgttacattagctccaattaat 89  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  22898223 atcctatgcaggtatggattgaatatgatggtgaaaagaaaaagattgatgttactttagctccaattaat 22898153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 157 - 250
Target Start/End: Original strand, 22840162 - 22840255
Alignment:
Q  157 tcaacagcaaacacatggttgctagtgtttccaatgttggaatcgttaaagggaccaaggtattggtttggaagtgaatctggtagcccttttg 250  Q
    |||||| |||| |||||||||| |  ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||||||    
T  22840162 tcaacaccaaaaacatggttgccaccgtttccaatgttggattggttaaagagaccaaggtattgacttggtagtgaatttggtagcccttttg 22840255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 22913605 - 22913555
Alignment:
Q  39 gaatatgatggagtgaagaaaaatattgatgttacattagctccaattaat 89  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  22913605 gaatatgatggagtgaagaaaaagattgatgttactttagctccaattaat 22913555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 250
Target Start/End: Original strand, 22876026 - 22876119
Alignment:
Q  157 tcaacagcaaacacatggttgctagtgtttccaatgttggaatcgttaaagggaccaaggtattggtttggaagtgaatctggtagcccttttg 250  Q
    |||||| |||| |||||||||||| |||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||   ||| ||||| | ||||||||||||||    
T  22876026 tcaacaccaaaaacatggttgctactgtttccattgtttgaattgttaaagagaccaaggtattgacgtggtagtgagtttggtagcccttttg 22876119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 250
Target Start/End: Original strand, 22898373 - 22898466
Alignment:
Q  157 tcaacagcaaacacatggttgctagtgtttccaatgttggaatcgttaaagggaccaaggtattggtttggaagtgaatctggtagcccttttg 250  Q
    |||||| |||| |||||||||||| | |||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||  || | ||||||| ||||||||||||||    
T  22898373 tcaacaccaaaaacatggttgctactatttccattgttggatttgttaaagagaccaaggtattgactttgtagtgaatttggtagcccttttg 22898466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 250
Target Start/End: Original strand, 22842264 - 22842355
Alignment:
Q  159 aacagcaaacacatggttgctagtgtttccaatgttggaatcgttaaagggaccaaggtattggtttggaagtgaatctggtagcccttttg 250  Q
    |||| |||| |||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||   ||| ||||||| |||| |||||||||    
T  22842264 aacaccaaaaacatggttgctactatttccattgttggaattgttaaagagaccaaggtattgacctggtagtgaatttggttgcccttttg 22842355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 22885539 - 22885445
Alignment:
Q  65 tgatgttacattagctccaattaattttggttgtaatgttgttaaaccagcacgacctttgttatcattcacgaaagatctttctccaattctcaaca 162  Q
    ||||||||| ||||||||||||| | |||||| ||    || ||||||| ||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||    
T  22885539 tgatgttactttagctccaattagtgttggtttta---gtgataaaccaacacaacctttgttatcattgaccaaagatctttctccaatactcaaca 22885445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 156 - 250
Target Start/End: Original strand, 22880673 - 22880767
Alignment:
Q  156 ctcaacagcaaacacatggttgctagtgtttccaatgttggaatcgttaaagggaccaaggtattggtttggaagtgaatctggtagcccttttg 250  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||  || |||| ||||||||||||   |||| || |||| ||||||||||||||    
T  22880673 ctcaacagcaaaaacatggttgctaatgtttccagtgttgaaagtgtcaaagagaccaaggtatttacttggtagcgaatttggtagcccttttg 22880767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 446 - 490
Target Start/End: Original strand, 22873588 - 22873632
Alignment:
Q  446 tttatagatgaaaccgttgtcttcacttgctaccaatgtaacaag 490  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22873588 tttatagatgaaactgttgtcttcacttgctactaatgtaacaag 22873632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 98 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 22913558 - 22913494
Alignment:
Q  98 taatgttgttaaaccagcacgacctttgttatcattcacgaaagatctttctccaattctcaaca 162  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||| ||||    
T  22913558 taatgttgttaaaccaaaacaacctttgttatcattgaacaaagatctttcttcaattcttaaca 22913494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 414 - 445
Target Start/End: Original strand, 22885937 - 22885968
Alignment:
Q  414 ccatcaagatataaatgtgatgattggaatcc 445  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22885937 ccatcaagatataaatgtgatgattggaatcc 22885968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 157 - 219
Target Start/End: Original strand, 22894054 - 22894116
Alignment:
Q  157 tcaacagcaaacacatggttgctagtgtttccaatgttggaatcgttaaagggaccaaggtat 219  Q
    |||||| |||| || ||||||||||  |||||| |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  22894054 tcaacaccaaaaacgtggttgctaggatttccattgttggaatcgtcaaagagaccaaggtat 22894116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 129; Significance: 2e-66; HSPs: 3)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 262 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 21150456 - 21150228
Alignment:
Q  262 ttatggcaaataaaaaagtagttgagaaagaagacacagtttcactagaagtgtttttgaaaactataggatttggatagaaagcatgtgcagtatcttg 361  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |  | || ||    
T  21150456 ttatggcaaatacaaaagtagttgaaaaagaaaacacactttcgccggaagtgttttcgaaaactataggatttggatagaaagcatgccctatttcatg 21150357  T
Q  362 cccgatatcattggtgagtcttagtaagccagttgaagttaactcagcaataccatcaagatataaatgtgatgattggaatcctttatagatgaaaccg 461  Q
      |  ||||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  21150356 atctgtatcactagtgagtcttagtaagccatttgaggttaactcagcaataccatcaagatataaatgtgatgattggaatccattatagatgaaactg 21150257  T
Q  462 ttgtcttcacttgctaccaatgtaacaag 490  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||    
T  21150256 ttatcttcacttgctaccaatgtaacaag 21150228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Original strand, 21150736 - 21150894
Alignment:
Q  1 tatccctttctagtggatatcctatgcaggtatggatagaatatgatggagtgaagaaaaatattgatgttacattagctccaattaattttggttgtaa 100  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |  ||||| || ||| ||||||| ||||||||||||| | |||||| |||    
T  21150736 tatcccttttcagtggatatcctatgcatgtatggattgaatatgatggtgaaaagaagaagattaatgttactttagctccaattagtgttggttttaa 21150835  T
Q  101 tgttgttaaaccagcacgacctttgttatcattcacgaaagatctttctccaattctcaaca 162  Q
       |   ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||    
T  21150836 ---taaaaaaccagcaagacctttgttatcattgaccaaagatctttctccagttctcaaca 21150894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 156 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 21150605 - 21150511
Alignment:
Q  156 ctcaacagcaaacacatggttgctagtgtttccaatgttggaatcgttaaagggaccaaggtattggtttggaagtgaatctggtagcccttttg 250  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||| ||||||| ||||||| ||||||    
T  21150605 ctcaacaccaaaaacatggttgctactgtttccattgttggaattgttaaagagaccaaggtattgtgttggtagtgaatttggtagctcttttg 21150511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University