View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF21585_high_10 (Length: 504)

Name: NF21585_high_10
Description: NF21585
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF21585_high_10
NF21585_high_10
[»] chr7 (79 HSPs)
chr7 (24-485)||(22698820-22699281)
chr7 (153-343)||(42798622-42798809)
chr7 (154-338)||(42805478-42805661)
chr7 (154-339)||(2541018-2541201)
chr7 (153-338)||(43557425-43557610)
chr7 (154-342)||(47716413-47716600)
chr7 (153-338)||(21172009-21172189)
chr7 (154-338)||(32758215-32758394)
chr7 (151-287)||(46354145-46354281)
chr7 (154-341)||(48735119-48735302)
chr7 (169-337)||(11617589-11617754)
chr7 (154-336)||(35334818-35334995)
chr7 (169-338)||(19426890-19427055)
chr7 (161-339)||(10693072-10693245)
chr7 (155-293)||(5180199-5180337)
chr7 (158-328)||(14732831-14732999)
chr7 (367-485)||(22688114-22688232)
chr7 (153-328)||(47077865-47078035)
chr7 (162-338)||(27629596-27629769)
chr7 (183-338)||(42391100-42391250)
chr7 (174-343)||(33871905-33872070)
chr7 (176-314)||(14099030-14099165)
chr7 (176-314)||(14409047-14409182)
chr7 (160-338)||(40463837-40464011)
chr7 (201-338)||(7879639-7879773)
chr7 (154-338)||(34626208-34626388)
chr7 (163-287)||(23419724-23419845)
chr7 (189-337)||(29907408-29907552)
chr7 (175-275)||(7644931-7645031)
chr7 (154-287)||(42476827-42476956)
chr7 (198-284)||(35203437-35203523)
chr7 (163-337)||(3469176-3469350)
chr7 (176-316)||(19266426-19266563)
chr7 (191-338)||(38262196-38262340)
chr7 (154-254)||(42495917-42496016)
chr7 (154-276)||(12473258-12473380)
chr7 (153-338)||(13805056-13805235)
chr7 (175-326)||(39123865-39124018)
chr7 (163-292)||(48123529-48123655)
chr7 (186-329)||(18747472-18747613)
chr7 (155-254)||(18326989-18327087)
chr7 (160-278)||(1423967-1424085)
chr7 (154-328)||(2662946-2663112)
chr7 (204-334)||(21566439-21566567)
chr7 (163-287)||(28362195-28362316)
chr7 (154-316)||(28078154-28078312)
chr7 (176-329)||(16341254-16341405)
chr7 (154-242)||(7193039-7193127)
chr7 (176-287)||(19265791-19265899)
chr7 (197-338)||(31591109-31591245)
chr7 (159-245)||(7794596-7794682)
chr7 (155-287)||(8148995-8149126)
chr7 (199-336)||(18512455-18512588)
chr7 (183-337)||(11741778-11741927)
chr7 (176-323)||(42101899-42102044)
chr7 (177-274)||(6736867-6736963)
chr7 (256-328)||(36267827-36267897)
chr7 (154-246)||(21447544-21447636)
chr7 (179-338)||(32233135-32233290)
chr7 (212-309)||(1408469-1408563)
chr7 (191-339)||(23231550-23231693)
chr7 (219-330)||(38604546-38604654)
chr7 (243-313)||(33500556-33500625)
chr7 (72-156)||(22688250-22688333)
chr7 (176-244)||(44123712-44123780)
chr7 (157-262)||(25198679-25198788)
chr7 (256-338)||(27889316-27889395)
chr7 (157-208)||(29140487-29140538)
chr7 (204-274)||(15108458-15108527)
chr7 (157-226)||(31533641-31533710)
chr7 (256-338)||(45018923-45019006)
chr7 (162-254)||(5814433-5814525)
chr7 (231-338)||(35787269-35787372)
chr7 (236-327)||(13792161-13792250)
chr7 (215-329)||(27697452-27697565)
chr7 (297-338)||(36602541-36602582)
chr7 (204-269)||(43852047-43852111)
chr7 (230-325)||(21139761-21139852)
chr7 (170-210)||(28685259-28685299)
[»] chr5 (56 HSPs)
chr5 (154-338)||(38879535-38879718)
chr5 (157-316)||(27328709-27328867)
chr5 (157-338)||(4619104-4619284)
chr5 (157-338)||(43334159-43334339)
chr5 (154-338)||(24448844-24449025)
chr5 (154-338)||(41014273-41014453)
chr5 (153-338)||(8169984-8170164)
chr5 (154-338)||(35710267-35710446)
chr5 (187-338)||(32703411-32703557)
chr5 (154-276)||(22187239-22187361)
chr5 (153-339)||(1565384-1565567)
chr5 (154-265)||(37024626-37024735)
chr5 (154-316)||(22600408-22600567)
chr5 (209-340)||(13801765-13801895)
chr5 (154-260)||(23974735-23974840)
chr5 (169-337)||(12006329-12006496)
chr5 (157-327)||(22861680-22861844)
chr5 (183-338)||(1405170-1405322)
chr5 (203-329)||(43574609-43574732)
chr5 (176-338)||(28516433-28516593)
chr5 (192-328)||(42924840-42924977)
chr5 (175-325)||(19142956-19143102)
chr5 (155-315)||(2838733-2838890)
chr5 (163-329)||(39301087-39301249)
chr5 (176-329)||(208936-209086)
chr5 (184-334)||(1850624-1850770)
chr5 (231-340)||(16880645-16880751)
chr5 (219-337)||(20135623-20135740)
chr5 (160-340)||(30006285-30006462)
chr5 (195-254)||(22025538-22025597)
chr5 (159-274)||(31299591-31299705)
chr5 (215-331)||(7368413-7368524)
chr5 (220-338)||(29334415-29334531)
chr5 (231-326)||(7097772-7097863)
chr5 (246-341)||(34154811-34154903)
chr5 (183-338)||(3771324-3771474)
chr5 (185-287)||(22907915-22908014)
chr5 (183-274)||(34074623-34074714)
chr5 (172-226)||(17419886-17419940)
chr5 (176-273)||(24903758-24903855)
chr5 (260-338)||(16957374-16957449)
chr5 (163-226)||(39079875-39079937)
chr5 (153-210)||(19438702-19438759)
chr5 (204-273)||(41425952-41426021)
chr5 (266-338)||(25622524-25622595)
chr5 (290-338)||(32354214-32354262)
chr5 (183-254)||(10634227-10634298)
chr5 (218-340)||(12575658-12575779)
chr5 (178-316)||(24323727-24323862)
chr5 (178-316)||(24360351-24360486)
chr5 (177-271)||(31694172-31694266)
chr5 (180-222)||(9794472-9794514)
chr5 (175-237)||(18698586-18698648)
chr5 (175-216)||(31362454-31362495)
chr5 (242-274)||(9794439-9794471)
chr5 (290-338)||(16028624-16028672)
[»] chr2 (69 HSPs)
chr2 (155-338)||(10543653-10543835)
chr2 (154-340)||(14530272-14530457)
chr2 (155-338)||(24200623-24200805)
chr2 (153-338)||(8455316-8455498)
chr2 (156-338)||(11514392-11514570)
chr2 (154-338)||(21779261-21779440)
chr2 (157-338)||(25249738-25249915)
chr2 (151-287)||(12023969-12024102)
chr2 (154-338)||(9671134-9671314)
chr2 (152-281)||(7214486-7214615)
chr2 (171-338)||(17667973-17668137)
chr2 (154-340)||(23397720-23397901)
chr2 (156-338)||(19977714-19977893)
chr2 (154-338)||(5840982-5841165)
chr2 (155-344)||(14544018-14544207)
chr2 (154-338)||(25079717-25079899)
chr2 (191-338)||(10546153-10546298)
chr2 (156-338)||(17896215-17896395)
chr2 (160-338)||(27573581-27573755)
chr2 (171-338)||(17623535-17623699)
chr2 (154-307)||(22371011-22371158)
chr2 (189-326)||(19614981-19615116)
chr2 (191-338)||(14444720-14444863)
chr2 (154-272)||(17705449-17705567)
chr2 (155-316)||(32781310-32781467)
chr2 (178-326)||(31158451-31158598)
chr2 (175-340)||(40416869-40417031)
chr2 (176-316)||(21377095-21377232)
chr2 (169-338)||(39914306-39914472)
chr2 (178-274)||(5450263-5450360)
chr2 (154-328)||(26684630-26684803)
chr2 (177-322)||(99281-99421)
chr2 (176-290)||(23145745-23145857)
chr2 (176-290)||(23557535-23557647)
chr2 (176-316)||(33795261-33795398)
chr2 (164-328)||(24859998-24860157)
chr2 (185-328)||(25641487-25641626)
chr2 (163-329)||(4516360-4516522)
chr2 (220-338)||(40762234-40762349)
chr2 (176-275)||(29419945-29420048)
chr2 (216-338)||(36871509-36871626)
chr2 (155-249)||(17472926-17473020)
chr2 (176-274)||(44521434-44521532)
chr2 (175-338)||(44643497-44643658)
chr2 (185-326)||(31821355-31821491)
chr2 (172-255)||(44604826-44604908)
chr2 (235-338)||(25632544-25632644)
chr2 (177-287)||(45235867-45235976)
chr2 (183-274)||(17380298-17380388)
chr2 (177-338)||(4795730-4795890)
chr2 (194-274)||(2003597-2003678)
chr2 (254-331)||(23488535-23488611)
chr2 (199-274)||(12315713-12315787)
chr2 (209-275)||(15296467-15296533)
chr2 (154-200)||(39189556-39189602)
chr2 (158-245)||(4852304-4852388)
chr2 (196-328)||(17471544-17471675)
chr2 (286-338)||(22371195-22371247)
chr2 (153-203)||(27466262-27466312)
chr2 (276-337)||(40579750-40579810)
chr2 (163-222)||(35017781-35017840)
chr2 (288-331)||(124921-124964)
chr2 (160-226)||(15896350-15896416)
chr2 (257-339)||(19185742-19185823)
chr2 (240-325)||(24890451-24890533)
chr2 (215-326)||(30826052-30826158)
chr2 (177-226)||(34752771-34752820)
chr2 (277-338)||(34766330-34766390)
chr2 (241-326)||(39499242-39499324)
[»] chr6 (48 HSPs)
chr6 (154-338)||(29355855-29356039)
chr6 (164-338)||(12221914-12222088)
chr6 (154-338)||(1346918-1347097)
chr6 (154-338)||(1354757-1354936)
chr6 (156-331)||(3815084-3815256)
chr6 (154-338)||(9161077-9161259)
chr6 (159-338)||(2166410-2166587)
chr6 (159-338)||(2178043-2178220)
chr6 (151-286)||(6024184-6024319)
chr6 (154-268)||(8409197-8409311)
chr6 (152-327)||(20400619-20400791)
chr6 (170-317)||(14553482-14553627)
chr6 (154-325)||(15866052-15866218)
chr6 (192-339)||(17432332-17432484)
chr6 (155-307)||(13905011-13905158)
chr6 (154-331)||(14975097-14975261)
chr6 (154-287)||(1941809-1941940)
chr6 (205-327)||(33138838-33138957)
chr6 (193-325)||(7947384-7947514)
chr6 (157-274)||(32728217-32728334)
chr6 (157-245)||(12063424-12063512)
chr6 (176-340)||(12889402-12889564)
chr6 (178-338)||(28007604-28007760)
chr6 (171-322)||(24097552-24097696)
chr6 (153-338)||(23930127-23930308)
chr6 (153-287)||(24734586-24734729)
chr6 (218-338)||(26097178-26097293)
chr6 (153-226)||(33922937-33923010)
chr6 (176-284)||(2755475-2755583)
chr6 (186-273)||(23240886-23240971)
chr6 (185-287)||(18277243-18277343)
chr6 (256-338)||(12885967-12886048)
chr6 (218-338)||(25557743-25557858)
chr6 (275-338)||(6808468-6808530)
chr6 (178-287)||(32068074-32068179)
chr6 (195-338)||(3116129-3116263)
chr6 (170-232)||(8417442-8417504)
chr6 (257-338)||(12892064-12892144)
chr6 (183-285)||(4136567-4136669)
chr6 (154-244)||(22967125-22967215)
chr6 (154-244)||(23821178-23821268)
chr6 (233-275)||(24751134-24751176)
chr6 (172-272)||(27855500-27855601)
chr6 (164-210)||(19649292-19649338)
chr6 (204-244)||(3564817-3564857)
chr6 (274-338)||(13267797-13267860)
chr6 (239-271)||(14341134-14341166)
chr6 (210-321)||(32579436-32579543)
[»] chr3 (77 HSPs)
chr3 (154-338)||(13628790-13628974)
chr3 (152-338)||(13730602-13730787)
chr3 (153-338)||(46421034-46421219)
chr3 (154-338)||(40272812-40272993)
chr3 (154-336)||(8247688-8247870)
chr3 (155-338)||(29366720-29366902)
chr3 (154-338)||(1217066-1217245)
chr3 (158-337)||(22122918-22123092)
chr3 (186-338)||(516417-516569)
chr3 (154-288)||(4495713-4495845)
chr3 (154-338)||(5173719-5173902)
chr3 (154-274)||(7696948-7697066)
chr3 (154-337)||(22609743-22609921)
chr3 (154-339)||(39203492-39203672)
chr3 (153-338)||(12914035-12914217)
chr3 (169-338)||(26869698-26869863)
chr3 (154-287)||(9607179-9607312)
chr3 (177-325)||(34420656-34420802)
chr3 (154-327)||(6411833-6412002)
chr3 (152-262)||(10870025-10870134)
chr3 (154-338)||(16735417-16735597)
chr3 (154-326)||(26573104-26573272)
chr3 (154-338)||(52926219-52926391)
chr3 (206-339)||(10795422-10795554)
chr3 (210-338)||(14986989-14987116)
chr3 (176-343)||(53996560-53996725)
chr3 (183-331)||(7942995-7943140)
chr3 (176-329)||(19731000-19731150)
chr3 (231-340)||(45786212-45786320)
chr3 (154-273)||(45620890-45621009)
chr3 (154-285)||(12525386-12525512)
chr3 (189-287)||(45139526-45139624)
chr3 (189-287)||(33926094-33926190)
chr3 (177-326)||(25944468-25944615)
chr3 (207-338)||(31592878-31593004)
chr3 (221-338)||(49013473-49013589)
chr3 (193-326)||(54374357-54374488)
chr3 (189-288)||(54032608-54032705)
chr3 (218-344)||(54484730-54484854)
chr3 (186-273)||(30928209-30928296)
chr3 (183-328)||(45948848-45948993)
chr3 (191-269)||(39212003-39212081)
chr3 (157-274)||(26782345-26782462)
chr3 (236-336)||(353351-353450)
chr3 (155-338)||(25517170-25517353)
chr3 (176-329)||(19751576-19751726)
chr3 (161-287)||(33235513-33235639)
chr3 (176-252)||(53062036-53062112)
chr3 (210-287)||(55401208-55401284)
chr3 (157-270)||(21874999-21875106)
chr3 (163-250)||(35417902-35417988)
chr3 (176-339)||(28904941-28905101)
chr3 (242-343)||(34771359-34771457)
chr3 (197-274)||(52428538-52428616)
chr3 (167-316)||(11461656-11461809)
chr3 (242-338)||(15797284-15797377)
chr3 (176-329)||(44403564-44403715)
chr3 (231-313)||(9276317-9276395)
chr3 (184-273)||(8410929-8411016)
chr3 (178-275)||(1121285-1121382)
chr3 (176-328)||(829452-829601)
chr3 (217-287)||(31904907-31904975)
chr3 (176-274)||(29106547-29106645)
chr3 (231-307)||(47624095-47624167)
chr3 (211-324)||(43114882-43114994)
chr3 (286-338)||(47624204-47624256)
chr3 (226-331)||(26292380-26292480)
chr3 (293-338)||(40390353-40390398)
chr3 (277-338)||(14266372-14266431)
chr3 (217-294)||(31672732-31672807)
chr3 (151-245)||(43956550-43956643)
chr3 (297-338)||(10484616-10484657)
chr3 (277-338)||(30452892-30452952)
chr3 (165-222)||(33075931-33075987)
chr3 (153-198)||(39430464-39430509)
chr3 (232-288)||(16130329-16130384)
chr3 (274-338)||(24851301-24851364)
[»] chr8 (60 HSPs)
chr8 (154-338)||(39460994-39461177)
chr8 (151-338)||(12670250-12670432)
chr8 (152-338)||(35261631-35261814)
chr8 (153-338)||(7136527-7136711)
chr8 (154-338)||(28817626-28817807)
chr8 (154-338)||(36720750-36720931)
chr8 (151-331)||(20284076-20284257)
chr8 (151-331)||(21070704-21070886)
chr8 (154-339)||(17823530-17823712)
chr8 (154-338)||(30454097-30454276)
chr8 (152-331)||(44530101-44530277)
chr8 (154-339)||(13160656-13160837)
chr8 (151-331)||(29521692-29521869)
chr8 (154-338)||(6760777-6760959)
chr8 (158-338)||(25250480-25250659)
chr8 (152-337)||(45071217-45071398)
chr8 (154-326)||(2626473-2626645)
chr8 (154-331)||(18164767-18164940)
chr8 (154-338)||(12625843-12626025)
chr8 (153-338)||(26954085-26954270)
chr8 (154-273)||(20869560-20869677)
chr8 (163-325)||(44781517-44781677)
chr8 (163-324)||(42083712-42083870)
chr8 (155-287)||(11748254-11748386)
chr8 (153-316)||(24245404-24245562)
chr8 (171-338)||(8897764-8897928)
chr8 (218-338)||(20869941-20870060)
chr8 (183-270)||(14018034-14018121)
chr8 (163-254)||(28407379-28407469)
chr8 (211-325)||(17250888-17251001)
chr8 (177-316)||(24365081-24365218)
chr8 (183-338)||(31457156-31457307)
chr8 (176-326)||(22598133-22598279)
chr8 (206-338)||(5135290-5135418)
chr8 (231-340)||(16225050-16225158)
chr8 (209-328)||(5689640-5689756)
chr8 (155-287)||(44742568-44742698)
chr8 (199-334)||(389642-389776)
chr8 (183-286)||(35105906-35106008)
chr8 (217-326)||(29877111-29877217)
chr8 (193-329)||(8483947-8484080)
chr8 (178-274)||(36918102-36918198)
chr8 (183-261)||(30962847-30962925)
chr8 (234-339)||(33866983-33867088)
chr8 (154-270)||(40604970-40605086)
chr8 (231-287)||(43942355-43942411)
chr8 (186-287)||(23000269-23000365)
chr8 (176-316)||(11000971-11001109)
chr8 (231-338)||(10857859-10857964)
chr8 (221-338)||(19729363-19729475)
chr8 (154-197)||(23286431-23286474)
chr8 (257-331)||(16013511-16013584)
chr8 (261-338)||(26102578-26102652)
chr8 (277-331)||(27507985-27508038)
chr8 (191-232)||(27635020-27635061)
chr8 (290-338)||(27468092-27468140)
chr8 (242-314)||(31454236-31454307)
chr8 (274-338)||(35107311-35107374)
chr8 (191-245)||(3377506-3377560)
chr8 (274-338)||(28407475-28407538)
[»] chr1 (85 HSPs)
chr1 (153-338)||(18944619-18944804)
chr1 (154-338)||(46247953-46248134)
chr1 (153-338)||(10668196-10668385)
chr1 (160-338)||(30395726-30395903)
chr1 (154-338)||(34725098-34725277)
chr1 (153-338)||(20004090-20004274)
chr1 (153-338)||(32632557-32632738)
chr1 (154-338)||(14617015-14617196)
chr1 (154-338)||(41319806-41319987)
chr1 (154-338)||(27201624-27201807)
chr1 (160-338)||(9939443-9939622)
chr1 (154-331)||(46991781-46991955)
chr1 (153-338)||(38478282-38478462)
chr1 (153-338)||(47214487-47214667)
chr1 (159-338)||(18741957-18742137)
chr1 (157-324)||(23768334-23768498)
chr1 (153-331)||(45812544-45812717)
chr1 (176-338)||(35117765-35117927)
chr1 (193-338)||(35005139-35005283)
chr1 (173-327)||(6925096-6925247)
chr1 (154-338)||(27474258-27474438)
chr1 (158-338)||(19414420-19414595)
chr1 (163-328)||(2435796-2435958)
chr1 (154-338)||(8197020-8197201)
chr1 (154-309)||(19932782-19932933)
chr1 (151-274)||(4430087-4430210)
chr1 (176-274)||(18724606-18724704)
chr1 (159-331)||(45402077-45402247)
chr1 (152-287)||(22930119-22930250)
chr1 (183-329)||(22327105-22327245)
chr1 (191-338)||(35253187-35253329)
chr1 (160-338)||(12126837-12127010)
chr1 (176-275)||(17470406-17470505)
chr1 (175-338)||(6983811-6983969)
chr1 (177-338)||(19701570-19701729)
chr1 (177-316)||(25468285-25468421)
chr1 (164-287)||(33222971-33223092)
chr1 (157-287)||(25290143-25290280)
chr1 (175-314)||(20036218-20036355)
chr1 (238-339)||(4349699-4349797)
chr1 (187-316)||(11596523-11596648)
chr1 (154-232)||(34714600-34714678)
chr1 (176-273)||(50760288-50760385)
chr1 (163-338)||(50811926-50812098)
chr1 (175-329)||(15511157-15511311)
chr1 (156-221)||(40424721-40424786)
chr1 (177-274)||(44485170-44485267)
chr1 (155-274)||(24564322-24564441)
chr1 (158-290)||(18335335-18335465)
chr1 (209-326)||(22324925-22325039)
chr1 (241-338)||(42304207-42304303)
chr1 (155-267)||(18335914-18336026)
chr1 (176-328)||(27136661-27136811)
chr1 (177-329)||(39214967-39215117)
chr1 (176-271)||(52910216-52910312)
chr1 (158-225)||(21006125-21006192)
chr1 (176-329)||(10378744-10378884)
chr1 (188-338)||(19974074-19974221)
chr1 (176-245)||(2435983-2436052)
chr1 (193-326)||(45264411-45264542)
chr1 (245-316)||(15505632-15505700)
chr1 (163-329)||(35019217-35019378)
chr1 (240-331)||(31442396-31442485)
chr1 (263-338)||(50606487-50606561)
chr1 (176-274)||(34679280-34679378)
chr1 (187-264)||(31272446-31272522)
chr1 (218-338)||(31382214-31382330)
chr1 (170-265)||(14987989-14988084)
chr1 (194-329)||(23371141-23371271)
chr1 (240-285)||(46859129-46859173)
chr1 (178-290)||(19656152-19656263)
chr1 (163-324)||(43207476-43207640)
chr1 (187-226)||(43768168-43768207)
chr1 (233-338)||(20999850-20999952)
chr1 (155-241)||(21723642-21723727)
chr1 (231-338)||(1517311-1517416)
chr1 (219-338)||(23796507-23796623)
chr1 (258-326)||(4249455-4249520)
chr1 (258-326)||(4249779-4249844)
chr1 (258-326)||(4250103-4250168)
chr1 (151-287)||(10163733-10163867)
chr1 (175-240)||(25554817-25554882)
chr1 (208-316)||(30682845-30682948)
chr1 (243-338)||(43768205-43768297)
chr1 (183-267)||(49722641-49722724)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (159-340)||(58936-59116)
[»] chr4 (92 HSPs)
chr4 (161-338)||(16408601-16408777)
chr4 (154-338)||(5648213-5648393)
chr4 (154-337)||(6430627-6430806)
chr4 (153-338)||(11054148-11054328)
chr4 (154-338)||(20224938-20225117)
chr4 (153-338)||(23501746-23501924)
chr4 (154-338)||(48598825-48599004)
chr4 (157-338)||(16911519-16911699)
chr4 (173-340)||(44363128-44363294)
chr4 (153-338)||(47528530-47528710)
chr4 (153-331)||(21646917-21647094)
chr4 (154-338)||(30639334-30639514)
chr4 (151-338)||(13256399-13256581)
chr4 (154-338)||(5306660-5306844)
chr4 (175-287)||(25343162-25343274)
chr4 (183-338)||(54175046-54175200)
chr4 (159-338)||(30352580-30352767)
chr4 (176-338)||(35567146-35567305)
chr4 (192-336)||(29207900-29208039)
chr4 (164-328)||(19027813-19027973)
chr4 (173-337)||(40915802-40915962)
chr4 (149-338)||(20405042-20405224)
chr4 (153-324)||(37494804-37494972)
chr4 (178-338)||(9832313-9832468)
chr4 (157-338)||(54730206-54730387)
chr4 (183-315)||(7385499-7385628)
chr4 (154-287)||(10660358-10660491)
chr4 (154-287)||(10874503-10874636)
chr4 (217-338)||(20639658-20639777)
chr4 (158-286)||(14590795-14590922)
chr4 (183-287)||(17043444-17043546)
chr4 (199-338)||(47443956-47444092)
chr4 (186-338)||(25463108-25463256)
chr4 (185-339)||(30690175-30690333)
chr4 (169-337)||(8473621-8473786)
chr4 (212-331)||(21489099-21489216)
chr4 (228-339)||(48327762-48327872)
chr4 (157-322)||(14983791-14983953)
chr4 (183-331)||(39077803-39077946)
chr4 (154-338)||(55766466-55766647)
chr4 (178-275)||(23580268-23580365)
chr4 (176-284)||(487187-487294)
chr4 (155-329)||(54966977-54967145)
chr4 (176-274)||(47441591-47441689)
chr4 (154-270)||(55830786-55830902)
chr4 (176-316)||(39029082-39029220)
chr4 (176-260)||(42164224-42164307)
chr4 (188-275)||(7038041-7038127)
chr4 (157-244)||(17315389-17315476)
chr4 (220-338)||(25629069-25629184)
chr4 (176-325)||(20908649-20908797)
chr4 (218-337)||(7909281-7909397)
chr4 (245-340)||(20225119-20225213)
chr4 (183-274)||(41018855-41018945)
chr4 (183-316)||(49938615-49938742)
chr4 (163-329)||(36589708-36589870)
chr4 (163-245)||(54640429-54640510)
chr4 (244-338)||(2813169-2813263)
chr4 (242-329)||(16494259-16494345)
chr4 (164-274)||(30496383-30496491)
chr4 (176-259)||(43035224-43035307)
chr4 (231-328)||(51865048-51865142)
chr4 (157-222)||(5313107-5313172)
chr4 (178-340)||(32478790-32478942)
chr4 (199-316)||(9037729-9037844)
chr4 (178-287)||(30581515-30581624)
chr4 (185-254)||(32629350-32629418)
chr4 (261-338)||(33836487-33836563)
chr4 (241-338)||(36816384-36816479)
chr4 (220-316)||(49796818-49796910)
chr4 (177-274)||(3580901-3580994)
chr4 (183-272)||(51420556-51420646)
chr4 (274-339)||(11394924-11394988)
chr4 (274-339)||(11404651-11404715)
chr4 (163-240)||(12257688-12257764)
chr4 (212-287)||(9987884-9987957)
chr4 (275-339)||(38755907-38755970)
chr4 (175-275)||(44357195-44357295)
chr4 (175-278)||(11579819-11579922)
chr4 (163-285)||(49938490-49938610)
chr4 (209-290)||(17079698-17079777)
chr4 (234-287)||(35894511-35894563)
chr4 (290-339)||(40553936-40553985)
chr4 (157-197)||(18969698-18969738)
chr4 (290-338)||(35532079-35532127)
chr4 (274-338)||(38786681-38786744)
chr4 (191-274)||(10380004-10380086)
chr4 (232-274)||(12711510-12711553)
chr4 (163-226)||(50856345-50856407)
chr4 (276-338)||(32484307-32484368)
chr4 (275-340)||(25388249-25388313)
chr4 (232-284)||(23914379-23914430)
[»] scaffold0168 (1 HSPs)
scaffold0168 (154-338)||(30533-30712)
[»] scaffold0187 (4 HSPs)
scaffold0187 (157-336)||(10052-10226)
scaffold0187 (157-336)||(20380-20554)
scaffold0187 (154-219)||(8899-8964)
scaffold0187 (154-219)||(19227-19292)
[»] scaffold0057 (4 HSPs)
scaffold0057 (154-338)||(24772-24948)
scaffold0057 (163-338)||(46794-46966)
scaffold0057 (213-338)||(43672-43793)
scaffold0057 (177-223)||(46995-47041)
[»] scaffold0258 (2 HSPs)
scaffold0258 (156-338)||(13024-13202)
scaffold0258 (155-197)||(17507-17549)
[»] scaffold0311 (1 HSPs)
scaffold0311 (170-331)||(10780-10938)
[»] scaffold1176 (1 HSPs)
scaffold1176 (162-340)||(1585-1758)
[»] scaffold0223 (1 HSPs)
scaffold0223 (161-339)||(11093-11265)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (158-286)||(226456-226583)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (159-287)||(4117-4245)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (170-290)||(35064-35184)
[»] scaffold0024 (1 HSPs)
scaffold0024 (154-226)||(83829-83901)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (162-338)||(72867-73034)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (209-338)||(48634-48758)
[»] scaffold0954 (1 HSPs)
scaffold0954 (191-339)||(3537-3680)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (153-244)||(8847-8935)
[»] scaffold0194 (1 HSPs)
scaffold0194 (155-226)||(24619-24690)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (169-244)||(43098-43173)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (183-290)||(32913-33019)
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (248-338)||(24133-24220)
[»] scaffold0167 (1 HSPs)
scaffold0167 (191-266)||(23590-23665)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 446; Significance: 0; HSPs: 79)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 446; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 22699281 - 22698820
Alignment:
Q  24 cctgtcagctgttcaaaaatctctacctctgaatttccaacaccacagaggcaatgctccttggcacaatcagtaattaatggtataactaatttgctct 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22699281 cctgtcagctgttcaaaaatctctacctctgaatttccaacaccacagaggcaatgctccttggcacaatcagtaattaatggtataactaatttgctct 22699182  T
Q  124 atgattaatttctcatctacatatgtcttagaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctgg 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  22699181 atgattaatttctcatctacatatgtcttagaggggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttatgggttcaagtcctgg 22699082  T
Q  224 aaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgc 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22699081 aaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccggaccctgtgtatgcgggagctatagtgc 22698982  T
Q  324 accgggttaccctttatatgtcttcgactgtctttattttctaagaacttatatcagatttgttttgaatgaaggaaccaatctattatgtgggatagga 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22698981 accgggttaccctttatatgtcttcgactgtctttattttctaagaacttatatcagatttgttttgaatgaaggaaccaatctattatgtgggatagga 22698882  T
Q  424 cttatgaccatgccatatgcagtaaaagaaggagggttgttgagccttacattactgctact 485  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22698881 cttatgaccatgccatatgcagtaaaagaaggagggttgttgagccttacattactgctact 22698820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 153 - 343
Target Start/End: Original strand, 42798622 - 42798809
Alignment:
Q  153 agaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggta 252  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  42798622 agaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcttggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggta 42798721  T
Q  253 agactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttaccctttatatg 343  Q
    || ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||    
T  42798722 aggctgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccc-tttcccggaccctgcatatgcgggagctatagtgcatcgggttgccctttttatg 42798809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 154 - 338
Target Start/End: Original strand, 42805478 - 42805661
Alignment:
Q  154 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 253  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  42805478 gaggggtaaccttggcgtaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaa 42805577  T
Q  254 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    | ||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||| |  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  42805578 ggctgtgtacaatacaccaataatggtgggaccc-cttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 42805661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 154 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 2541201 - 2541018
Alignment:
Q  154 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactg-aaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggta 252  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  2541201 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggta 2541102  T
Q  253 agactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttta 339  Q
    || |||||||| |||||||  ||||||||||||||  ||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  2541101 aggctgcgtactatacacc--aaatggtgggaccc-cttcccggtccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggtttcccttta 2541018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 153 - 338
Target Start/End: Original strand, 43557425 - 43557610
Alignment:
Q  153 agaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggta 252  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||    
T  43557425 agaggggtaaccttgccgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagagta 43557524  T
Q  253 agactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagc-tatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||| || ||| |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||    
T  43557525 aggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccc-cctcccggactctgcgtatgcgggagcttttagtgcaccgggttgcccttt 43557610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 154 - 342
Target Start/End: Original strand, 47716413 - 47716600
Alignment:
Q  154 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 253  Q
    |||||||||||||| | ||||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  47716413 gaggggtaaccttggcacaactggaaaagttgttgccatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaa 47716512  T
Q  254 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttaccctttatat 342  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||| |  |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  47716513 ggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccc-cttcccggaccccgcatatgcgggagctttggtgcaccgggttgccctttatat 47716600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 153 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 21172189 - 21172009
Alignment:
Q  153 agaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggta 252  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  |||||||||||    
T  21172189 agaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtaactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggta 21172092  T
Q  253 agactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    || ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  21172091 aggctgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccc-cttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 21172009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 154 - 338
Target Start/End: Original strand, 32758215 - 32758394
Alignment:
Q  154 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 253  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||    
T  32758215 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaa 32758312  T
Q  254 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    | ||| ||||||||||||  ||||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  32758313 ggctgtgtacaatacacc--aaatggtgggaccc-cttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 32758394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 151 - 287
Target Start/End: Original strand, 46354145 - 46354281
Alignment:
Q  151 ttagaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacaggg 250  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  46354145 ttagaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgattggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacaggg 46354244  T
Q  251 taagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccc 287  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  46354245 taaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccc 46354281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 154 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 48735302 - 48735119
Alignment:
Q  154 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcc-tggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggta 252  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||  |||||| ||||    
T  48735302 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtccttggaaacaacctcttgtgt--aaaacacggta 48735205  T
Q  253 agactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttaccctttata 341  Q
    || ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  48735204 aggctgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccc-cttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctttata 48735119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 169 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 11617754 - 11617589
Alignment:
Q  169 cgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatac 268  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11617754 cgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatac 11617655  T
Q  269 accaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttaccctt 337  Q
    |||  ||||||||||||||  |||| | |||||| |||||| ||| || |||||||||||||| |||||    
T  11617654 acc--aaatggtgggaccc-cttcctggaccctgcgtatgcaggacctttagtgcaccgggttgccctt 11617589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 154 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 35334995 - 35334818
Alignment:
Q  154 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 253  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  35334995 gagggataaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgagttcaagtcctggaaacagtctc--gtgtaaaaaacagggtaa 35334898  T
Q  254 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttaccct 336  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||  |||||| |||||| |||||| |||||| |||||||||||||| ||||    
T  35334897 gactgtgtacaatacacc--gaatggtgggaccc-cttcccggaccctgcgtatgcaggagctttagtgcaccgggtttccct 35334818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 169 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 19427055 - 19426890
Alignment:
Q  169 cgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatac 268  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19427055 cgcaactggtaaagttgttgtcatgtgaccgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaatagggtaagactgcgtacaatac 19426956  T
Q  269 accaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    |||  ||||||||||||||  ||| || ||||||  |||||| |||||  ||||||||||||| ||||||    
T  19426955 acc--aaatggtgggaccc--ttctcggaccctgcatatgcgagagcttcagtgcaccgggttgcccttt 19426890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 161 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 10693245 - 10693072
Alignment:
Q  161 aaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcg 260  Q
    ||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  |||| |||||||| |||||    
T  10693245 aaccttggcgcaactagtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaagagggtaaggctgcg 10693148  T
Q  261 tacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttta 339  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  10693147 tacaatacacc--aaatggtgggaccc-cttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcactgggttgcccttta 10693072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 155 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 5180337 - 5180199
Alignment:
Q  155 aggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaag 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  5180337 aggggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcaagggttcaacttctggaaacagcctcttgtgtcaaaaacagggtaag 5180238  T
Q  255 actgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcc 293  Q
    |||| |||||| |||||||||||| | |||||| |||||    
T  5180237 actgtgtacaacacaccaaaaatgattggacccctttcc 5180199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 158 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 14732999 - 14732831
Alignment:
Q  158 ggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagact 257  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || |||   |||||||||||||||||| ||    
T  14732999 ggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaagtcatgggttcaagtcctggaaacagcctcccatgtaaaaaacagggtaaggct 14732900  T
Q  258 gcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgg 328  Q
    |||| |||||||||||||||||||  || |  |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  14732899 gcgt-caatacaccaaaaatggtgaaactc-cttcccgaaccctgtttatgcgggagctttagtgcaccgg 14732831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 367 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 22688232 - 22688114
Alignment:
Q  367 agaacttatatcagatttgttttgaatgaaggaaccaatctattatgtgggataggacttatgaccatgccatatgcagtaaaagaaggagggttgttga 466  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22688232 agaacttatatcaattttgttttgaatgaaggaaccaatctactatgtgggataggacttatgactatgccatatgcagtaaaagaaggagggtttttga 22688133  T
Q  467 gccttacattactgctact 485  Q
    ||||| |||||||| ||||    
T  22688132 gccttgcattactgttact 22688114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 153 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 47078035 - 47077865
Alignment:
Q  153 agaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggta 252  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||  ||    
T  47078035 agaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaatagag--ta 47077938  T
Q  253 agactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgg 328  Q
    |   ||||||||||||||  ||||||||||||||| || ||| ||||||   |||||||||||| |||||||||||    
T  47077937 aagttgcgtacaatacac--aaaatggtgggacccctt-cccaaaccctacatatgcgggagctctagtgcaccgg 47077865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 162 - 338
Target Start/End: Original strand, 27629596 - 27629769
Alignment:
Q  162 accttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgt 261  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  27629596 accttggcgcaactggtaaagttgttgtcatttgaccgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgcgt 27629695  T
Q  262 acaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    | ||||||||  ||||||||||||||  ||||||  |||||  ||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||    
T  27629696 aaaatacacc--aaatggtgggaccc-cttcccgggccctgcatatgcggtagcttcagtgcaccgggttgcccttt 27629769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 183 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 42391250 - 42391100
Alignment:
Q  183 ttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgg 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  42391250 ttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcttcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc--aaatggtgg 42391155  T
Q  283 gacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    |||||  |||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  42391154 gaccc-cttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 42391100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 174 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 33872070 - 33871905
Alignment:
Q  174 ctggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaa 273  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||      
T  33872070 ctggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcgcgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgta-aaaacaggataaggctgcgtacaatacacc-- 33871974  T
Q  274 aaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttaccctttatatg 343  Q
    ||||||||||||||  |||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| || ||||||||    
T  33871973 aaatggtgggaccc-cttcccagaccctgtgtatgcgagagctttagtgcaccaggttgccttttatatg 33871905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 176 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 14099165 - 14099030
Alignment:
Q  176 ggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaa 275  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||    
T  14099165 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttgaagtcctggaaatagccttttgtgtaaaaaacaggttaagactgcgtacaatacacc--aa 14099068  T
Q  276 atggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggag 314  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||  |||||| ||||    
T  14099067 atggtgggaccc-cttcccgaaccctacgtatgcaggag 14099030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 176 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 14409182 - 14409047
Alignment:
Q  176 ggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaa 275  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||    
T  14409182 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttgaagtcctggaaatagccttttgtgtaaaaaacaggttaagactgcgtacaatacacc--aa 14409085  T
Q  276 atggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggag 314  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||  |||||| ||||    
T  14409084 atggtgggaccc-cttcccgaaccctacgtatgcaggag 14409047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 160 - 338
Target Start/End: Original strand, 40463837 - 40464011
Alignment:
Q  160 taaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgc 259  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||    
T  40463837 taaccttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatgtgactgtaaggtcacgggttcaagtcatagaaacagtctcttgtgt-aaaaactgggtaaggctgc 40463935  T
Q  260 gtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    ||| ||||||||  ||||||||||||||  ||| || |||||| |||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||    
T  40463936 gtataatacacc--aaatggtgggaccc-cttctcggaccctgcgtatgcgggagcttcagtgcaccgagttgcccttt 40464011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 201 - 338
Target Start/End: Original strand, 7879639 - 7879773
Alignment:
Q  201 aaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||| ||||    
T  7879639 aaggtcacgggttcaagtcctggaaacaatctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccc-cttcccggaccc 7879735  T
Q  301 tgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    || |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  7879736 tgcgtatgcgggagcttcagtgcaccgggttgcccttt 7879773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 154 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 34626388 - 34626208
Alignment:
Q  154 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 253  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||    
T  34626388 gaggggtaaccttagcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgattgaaaggccacagattcaagtcctggaaacagcctcctgtgt-aaaaacagggtaa 34626290  T
Q  254 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    | |||||| |||||||||  ||||||||||| ||  |||||| |||||| ||||||||||||| |||| || |||||| ||||||    
T  34626289 ggctgcgttcaatacacc--aaatggtgggatcc-cttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagttcatcgggttgcccttt 34626208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 163 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 23419845 - 23419724
Alignment:
Q  163 ccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgta 262  Q
    ||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23419845 ccttggcgcaac-ggtaaagttgctgtcatgtgactaaaaggtcacaggttcaagttctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgta 23419747  T
Q  263 caatacaccaaaaatggtgggaccc 287  Q
    |||||||||  ||||||||||||||    
T  23419746 caatacacc--aaatggtgggaccc 23419724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 189 - 337
Target Start/End: Original strand, 29907408 - 29907552
Alignment:
Q  189 tcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccct 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||     
T  29907408 tcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagcctcttgtgtaaaaaatagtgtaaggctgcgttcaatacacc-aaaatggtgggaccc- 29907505  T
Q  289 tttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttaccctt 337  Q
      ||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  29907506 catcccggaccc--tgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctt 29907552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 175 - 275
Target Start/End: Original strand, 7644931 - 7645031
Alignment:
Q  175 tggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaa 274  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  7644931 tggtaaatttgttgtaacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaagatagcgtacaatacaccaaa 7645030  T
Q  275 a 275  Q
    |    
T  7645031 a 7645031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 154 - 287
Target Start/End: Original strand, 42476827 - 42476956
Alignment:
Q  154 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 253  Q
    |||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||| |||||    
T  42476827 gaggggtaacattggcgtaactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacggattcaagttctggaaacagtctcttgtgt--aaaacaaggtaa 42476924  T
Q  254 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccc 287  Q
    | ||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  42476925 ggctgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccc 42476956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 198 - 284
Target Start/End: Original strand, 35203437 - 35203523
Alignment:
Q  198 tgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtggga 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35203437 tgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacattctcttgtgtaaaaaacaggataagactgcgtacaatataccaaaaatggtggga 35203523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 163 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 3469350 - 3469176
Alignment:
Q  163 ccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaa--aaaacagggtaagactgcg 260  Q
    ||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||| | ||||||||||||  ||||||||||| |  ||||    
T  3469350 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacagactcaagtcctagaaacattctcttgtgtaaaaaaaacagggtacggttgcg 3469252  T
Q  261 tacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttaccctt 337  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  ||||   |||||||||||||||||||| |||||| | ||||| |||||    
T  3469251 tacaatacaccaaaaatggcgggaccc-cttcctagaccctgtgtatgcgggagctttagtgcgctgggttgccctt 3469176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 176 - 316
Target Start/End: Original strand, 19266426 - 19266563
Alignment:
Q  176 ggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaa 275  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  19266426 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcgtgggttcaagtcctgaaaatagccacttgcgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc--aa 19266523  T
Q  276 atggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagct 316  Q
    || |||||| ||  |||||| |||||| |||||||||||||    
T  19266524 attgtgggatcc-cttcccggaccctgcgtatgcgggagct 19266563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 191 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 38262340 - 38262196
Alignment:
Q  191 atgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttt 290  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||   ||| |||||||||||  ||||| ||||||||  |    
T  38262340 atgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaatatggtaatgttgcatacaatacacc--aaatgatgggaccc-ct 38262244  T
Q  291 tcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  38262243 tcccgaacactgcgtatgcgggagctttagtgcaccggattgcccttt 38262196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 154 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 42496016 - 42495917
Alignment:
Q  154 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 253  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| | |||||||||||||    
T  42496016 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatatgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtat-aaaaacagggtaa 42495918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 154 - 276
Target Start/End: Original strand, 12473258 - 12473380
Alignment:
Q  154 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 253  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||| |  ||||||||| |||||||||||||    
T  12473258 gaggggtagccttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatgtatctgaaaggtcatgggttcaagtcctgcaaacaacctcttgtgtcaaaaacagggtaa 12473357  T
Q  254 gactgcgtacaatacaccaaaaa 276  Q
    |  ||||||||||||||||||||    
T  12473358 ggatgcgtacaatacaccaaaaa 12473380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 153 - 338
Target Start/End: Original strand, 13805056 - 13805235
Alignment:
Q  153 agaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggta 252  Q
    ||||||| | ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||    
T  13805056 agagggggagccttggcgcaa-tggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtaacgggttcaagtcctggaaatagcctctggtgtaaaaca-ggggta 13805153  T
Q  253 agactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    || ||| ||||||||||||  ||||||||||| ||  |||| | |||||| ||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||    
T  13805154 aggctgtgtacaatacacc--aaatggtggga-ccacttcctggaccctgcgtatgcgggagct-ttgtgcactgggctacccttt 13805235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 175 - 326
Target Start/End: Original strand, 39123865 - 39124018
Alignment:
Q  175 tggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggt----aagactgcgtacaatacac 270  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||    ||| ||||||| |||||||    
T  39123865 tggtaaagttgttgtcatgtgactgaaacgacacgggttcaagtcctagaaacggtctcttgtgt-aaaaacagggtagggaaggctgcgtaaaatacac 39123963  T
Q  271 caaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcacc 326  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||| ||||||| | |||||||    
T  39123964 caaaaatggtgggaccc-cttcccggaccctgcgtatgagggagctttggtgcacc 39124018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 163 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 48123655 - 48123529
Alignment:
Q  163 ccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgta 262  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| ||||| ||    
T  48123655 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttatcatgtgtctgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaataacagggtaaaactgcata 48123557  T
Q  263 caatacaccaaaaatggtgggacccttttc 292  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  48123556 caatacacc--aaatggtgggacccctttc 48123529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 186 - 329
Target Start/End: Original strand, 18747472 - 18747613
Alignment:
Q  186 ttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaa-cagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtggga 284  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || || |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||  || ||||||||    
T  18747472 ttgtcacgtgactgaaaggtcacgggatcaagtcttggaaacagccttttgtgtaaaaaagcagggtaaggctgcgtataatacacc--aattggtggga 18747569  T
Q  285 cccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccggg 329  Q
    |||  |||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  18747570 ccc-cttcctgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccggg 18747613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 155 - 254
Target Start/End: Original strand, 18326989 - 18327087
Alignment:
Q  155 aggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaag 254  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  18326989 aggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgacttgaaggtcacgggttcaagtcccggaaacagcctcttgtgt-aaaaacagggtaag 18327087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 160 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 1424085 - 1423967
Alignment:
Q  160 taaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgc 259  Q
    |||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||    
T  1424085 taactttggcgcaactggtaaagttgttgttatgtgactggaaggtcacggattcaaatcctggaaacagtctgttgtgtaaaaaacagggtaatgctgc 1423986  T
Q  260 gtacaatacaccaaaaatg 278  Q
     |||| |||||||| ||||    
T  1423985 atacactacaccaataatg 1423967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 154 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 2663112 - 2662946
Alignment:
Q  154 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 253  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |  ||||  ||||||||||||||||| || |||||||||  |||| |||||||    
T  2663112 gaggggtaaccttggcgcaactagtaaagttgttgttatgtgactgga--gtcataggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaatagggtaa 2663017  T
Q  254 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgg 328  Q
    | ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |  ||||||  |||||||||||| ||| |||||||    
T  2663016 ggctgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccctttt--cagaccctgcatatgcgggagctctagcgcaccgg 2662946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 204 - 334
Target Start/End: Original strand, 21566439 - 21566567
Alignment:
Q  204 gtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgt 303  Q
    ||||| |||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||     
T  21566439 gtcacaggttcaagtcttggaaaccgcctcttgtgtaaaaaacagaggaagactgcgtacaatacacc-aaaatggtaggaccc-cttcccgaaccctgc 21566536  T
Q  304 gtatgcgggagctatagtgcaccgggttacc 334  Q
     |||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  21566537 atatgcgggagctttagtgcaccgggctacc 21566567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 163 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 28362316 - 28362195
Alignment:
Q  163 ccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgta 262  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  28362316 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtggctgaaaggtcacaggttcaagtcctagaaactgcctcttgtgtaaaaaacttggtaaggctgcgta 28362218  T
Q  263 caatacaccaaaaatggtgggaccc 287  Q
    |||||||||  ||||||||||||||    
T  28362217 caatacacc--aaatggtgggaccc 28362195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 154 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 28078312 - 28078154
Alignment:
Q  154 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 253  Q
    ||||||||||| || ||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||  ||||||||||||||    
T  28078312 gaggggtaaccctggcgcaactcgtgaagttgttgtcatgtgactgtaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagtctcgtgt-aaaaaaacagggtaa 28078214  T
Q  254 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagct 316  Q
    |  ||| | |||||||||  ||||||||||||||  |||||||| ||||  |||||| |||||    
T  28078213 ggttgcatgcaatacacc--aaatggtgggaccc-cttcccgaatcctgcatatgcgagagct 28078154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 176 - 329
Target Start/End: Original strand, 16341254 - 16341405
Alignment:
Q  176 ggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaa 275  Q
    |||||| ||||| ||||||   ||||||||||||||||||||| || |||| || |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||    
T  16341254 ggtaaagttgttatcatgtatttgaaaggtcacgggttcaagttctagaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctacgtacaatacacc-aaa 16341352  T
Q  276 atggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccggg 329  Q
    |||||||| |||| |||||| |||     |||||||||||| | ||||||||||    
T  16341353 atggtggg-ccctcttcccggacctatcatatgcgggagctttggtgcaccggg 16341405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 154 - 242
Target Start/End: Original strand, 7193039 - 7193127
Alignment:
Q  154 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaa 242  Q
    |||||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||    
T  7193039 gaggggtaaccttggcgtaacttgtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctcgaaacaacctcttgtgtaaa 7193127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 176 - 287
Target Start/End: Original strand, 19265791 - 19265899
Alignment:
Q  176 ggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaa 275  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| | || | ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  19265791 ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcttggatacagccgcttgtgt-aaaaagagggtaaggctgcgtacaatacacc--aa 19265887  T
Q  276 atggtgggaccc 287  Q
    ||||||||||||    
T  19265888 atggtgggaccc 19265899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 197 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 31591245 - 31591109
Alignment:
Q  197 ctgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccga 296  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||  ||||||     
T  31591245 ctgaaaggtcacgagttcaagtcctggaaacaacctcttgtgt--aaaacagagtaaggctgcgtacaataca--ataaatggtgggaccc-cttcccgg 31591151  T
Q  297 accctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    ||| ||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  31591150 accttgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 31591109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 159 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 7794682 - 7794596
Alignment:
Q  159 gtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaa 245  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||    
T  7794682 gtaaccttagcgcaactggtaaagttgttgttatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttatgtaaaaaa 7794596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 155 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 8149126 - 8148995
Alignment:
Q  155 aggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtg-taaaaaacagggtaa 253  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||| |||    |||||||| ||||||| |||||||    
T  8149126 aggggtaaccttggcacaactggtaatgttgttgtcatgtgactgcaaagtcacgagttcaagtcctgaaaactacctcttgtgttaaaaaatagggtaa 8149027  T
Q  254 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccc 287  Q
    |  |||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  8149026 ggttgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccc 8148995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 199 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 18512588 - 18512455
Alignment:
Q  199 gaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaac 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||  |||||| ||    
T  18512588 gaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacatcttgtgta-aaaatagggtaaggctgcgtacaatacacc--gaatggtgggaccc-cttcccggac 18512493  T
Q  299 cctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttaccct 336  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||| ||||| ||||    
T  18512492 cctgcgtatgcgggagctttggtgcactgggttgccct 18512455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 183 - 337
Target Start/End: Original strand, 11741778 - 11741927
Alignment:
Q  183 ttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgg 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||  ||| ||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  11741778 ttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctgaaaacagcttctagtgt--aaaatagggtaaggctgcgtacaatacacc--aaatggtgg 11741873  T
Q  283 gacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttaccctt 337  Q
    || ||  |||||| |  |||   ||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  11741874 gatcc-cttcccggattctgcacatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctt 11741927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 176 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 42102044 - 42101899
Alignment:
Q  176 ggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaa 275  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| |||||||   |||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||| |||||||||| |||  | |||    
T  42102044 ggtaaagttgttgtcacgtgactggaaggtcaaaagttcaagtcctggaaacagcctcttccgtaaaaaacagggtaacactgcgtacagtac-tctaaa 42101946  T
Q  276 atggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgc 323  Q
     ||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||| |||| ||||||    
T  42101945 gtggtgggaccc-tttcccggaccctgcgtatccggcagctttagtgc 42101899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 177 - 274
Target Start/End: Original strand, 6736867 - 6736963
Alignment:
Q  177 gtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaa 274  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| |  ||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  6736867 gtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcacgggttcaagtcctcaaaacaacctcttgtat-aaaaacaaggtaagactgcatacaatacaccaaa 6736963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 256 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 36267897 - 36267827
Alignment:
Q  256 ctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgg 328  Q
    |||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36267897 ctgcgtacaatacaccaaa--tggttggacccatttcccgaaccctgtgtatgcgggagctttagtgcaccgg 36267827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 154 - 246
Target Start/End: Original strand, 21447544 - 21447636
Alignment:
Q  154 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaac 246  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| | || |||||||||| |||||||| || ||| || ||||||||||||||||    
T  21447544 gaggggtaaccttggcgcaactgataaatttgttgtcatgtaattggaaggtcacggattcaagtcttgaaaacagcctcttgtgtaaaaaac 21447636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 179 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 32233290 - 32233135
Alignment:
Q  179 aaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatg 278  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||| | ||||| | ||||||  |||||    
T  32233290 aaaattgttgtcacctgactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgta-aaaacagggtaaggcagcgtatattacacc--aaatg 32233194  T
Q  279 gtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    ||||||  |  ||||| |||||||  |||| |||||||  ||||||||||| | ||||||    
T  32233193 gtgggattc-cttcccaaaccctgcatatgagggagcttcagtgcaccgggctgcccttt 32233135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 212 - 309
Target Start/End: Original strand, 1408469 - 1408563
Alignment:
Q  212 ttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgc 309  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| |  ||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||    
T  1408469 ttcaagtcctggaaatagcctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgtgtacaatacagc--aaatggtgggaccc-cttcccggaccctgcgtatgc 1408563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 191 - 339
Target Start/End: Original strand, 23231550 - 23231693
Alignment:
Q  191 atgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttt 290  Q
    |||||||||||||||||| |  |  ||||||||||| || ||||||||||||| | | |||||| ||||||| |||||||| ||  || |||||||| ||    
T  23231550 atgtgactgaaaggtcacag--tagagtcctggaaagagcctcttgtgtaaaatataaggtaaggctgcgtataatacaccgaa--tgatgggacccctt 23231645  T
Q  291 tcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttta 339  Q
     ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| ||| |||||||    
T  23231646 -cccgaaccctgcgtatgcggcagctttagtgcaccgagtttcccttta 23231693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 219 - 330
Target Start/End: Original strand, 38604546 - 38604654
Alignment:
Q  219 cctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctat 318  Q
    |||||||| || ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||| |    
T  38604546 cctggaaacagcctcttgtgtaaaa-acagggtaaggctgcgtacaatacacc--aaatggtgagaccccttt-ccggaccctgcgtatgcgggagcttt 38604641  T
Q  319 -agtgcaccgggt 330  Q
     ||||||||||||    
T  38604642 aagtgcaccgggt 38604654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 243 - 313
Target Start/End: Original strand, 33500556 - 33500625
Alignment:
Q  243 aaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcggga 313  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||    
T  33500556 aaacagggtaagactgcgtactatacacaaaaaatggtgggaccc-cttcccggaccctgcgtatgcggga 33500625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 72 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 22688333 - 22688250
Alignment:
Q  72 aggcaatgctccttggcacaatcagtaattaatggtataactaatttgctctatgattaatttctcatctacatatgtcttagag 156  Q
    |||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||| | ||| ||||||||    
T  22688333 aggcaatgttcctttgcacgatcagtaattaatggtatgactaatttgttctataattaattt-tcatctgcttatatcttagag 22688250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 176 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 44123780 - 44123712
Alignment:
Q  176 ggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaa 244  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  44123780 ggtaaagttggtgtcatgtgactgaaagattacgggttcaagtactggaaacagcctcttgtgtaaaaa 44123712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 262
Target Start/End: Original strand, 25198679 - 25198788
Alignment:
Q  157 gggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttc---aagtcctggaaatagtctcttgtgt-aaaaaacagggta 252  Q
    ||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||| ||   ||||| |||||| ||||| |||||| |||||||| ||||    
T  25198679 gggtaaccttggcgtaactggtaaagttgttgtcatatgactgaaagatcatgggatcaaaaagtcttggaaacagtcttttgtgtaaaaaaacaaggta 25198778  T
Q  253 agactgcgta 262  Q
    |||| |||||    
T  25198779 agaccgcgta 25198788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 256 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 27889395 - 27889316
Alignment:
Q  256 ctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||| | || ||||||||| ||||||    
T  27889395 ctgcgtacaatacaccaaa--tggtgggacccctt-cccggaccctgcgtatgcgggagctttggtacaccgggttgcccttt 27889316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 157 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 29140538 - 29140487
Alignment:
Q  157 gggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcac 208  Q
    |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  29140538 gggtaatcttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtaactgaaaggtcac 29140487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 15108527 - 15108458
Alignment:
Q  204 gtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaa 274  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||| ||||    
T  15108527 gtcacgagttcaagtcctggaaacagtttcttgtgta-aaaacaaggtaaggctgtgtacaatacatcaaa 15108458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 157 - 226
Target Start/End: Original strand, 31533641 - 31533710
Alignment:
Q  157 gggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaa 226  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||||  ||||||||| ||||||    
T  31533641 gggtgaccttgacgcaactcgtaaaattgttatcatatgactaaatggtcacatgttcaagtcttggaaa 31533710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 256 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 45019006 - 45018923
Alignment:
Q  256 ctgcgtacaatacaccaaaaa--tggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||| |||| || |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||    
T  45019006 ctgcgtacaatataccaaaaaactggtggaacccctt-cccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccaggttgcccttt 45018923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 162 - 254
Target Start/End: Original strand, 5814433 - 5814525
Alignment:
Q  162 accttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaag 254  Q
    |||||| |||||  |||||| ||||||| |||||| || || |||||||||||||||  |||||| |  ||||| ||||||||| ||||||||    
T  5814433 accttggcgcaatcggtaaagttgttgttatgtgattggaaagtcacgggttcaagttttggaaagaacctcttatgtaaaaaatagggtaag 5814525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 35787372 - 35787269
Alignment:
Q  231 ctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggt 330  Q
    |||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||  |||||| |||||||  |||||| ||| || |||||||||||||  | ||||||||||    
T  35787372 ctcttgtgtaaaaa-catggtaaggttgcgtacaatacacc--aaatggcgggaccc-cttcccggaccttgcgtatgcgggagcttcaatgcaccgggt 35787277  T
Q  331 tacccttt 338  Q
    | ||||||    
T  35787276 tgcccttt 35787269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 236 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 13792250 - 13792161
Alignment:
Q  236 gtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccg 327  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||  |||||| |||||||  ||| ||||||||| |||||| |||||| | ||||||||    
T  13792250 gtgtaaaaaacttggtaagactgcatacaatacacc-caaatggcgggaccc-cttctcgaaccctgcgtatgctggagcttttgtgcaccg 13792161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 215 - 329
Target Start/End: Original strand, 27697452 - 27697565
Alignment:
Q  215 aagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtggg--acccttttcccgaaccctgtgtatgcggg 312  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| ||| ||| |||  ||||||||||| |||||||  ||||||| |||  |||||| |||||||||    
T  27697452 aagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaatcagggcaaggctgtgta--atacaccaaaa-tggtgggggaccctttccccagaccctgcgtatgcggg 27697548  T
Q  313 agctatagtgcaccggg 329  Q
    ||||  | |||||||||    
T  27697549 agcttaaatgcaccggg 27697565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 338
Target Start/End: Original strand, 36602541 - 36602582
Alignment:
Q  297 accctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  36602541 accctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 36602582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 269
Target Start/End: Original strand, 43852047 - 43852111
Alignment:
Q  204 gtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaataca 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |  ||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  43852047 gtcacgggttcaagtcctgaaaaaac-ctcttctgtaaaaaacagggtaaggctatgtacaataca 43852111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 230 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 21139852 - 21139761
Alignment:
Q  230 tctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcac 325  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||  ||  |||| |||||||||  ||||||||||| || ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||    
T  21139852 tctcttgtgtaaaaa-cagagtaaggttggatacagtacaccaaa--tggtgggacccctt-cccgaactctgtgtatgcggaagctttagtgcac 21139761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 170 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 28685299 - 28685259
Alignment:
Q  170 gcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgg 210  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28685299 gcaactgttaaagttgttgtcatgtgactgaaagatcacgg 28685259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 56)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 154 - 338
Target Start/End: Original strand, 38879535 - 38879718
Alignment:
Q  154 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 253  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||    
T  38879535 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtataaaaaacagggtaa 38879634  T
Q  254 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  38879635 ggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccc-cttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 38879718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 157 - 316
Target Start/End: Original strand, 27328709 - 27328867
Alignment:
Q  157 gggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagac 256  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27328709 gggtaaccttgacgcaattggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacagggtaaggc 27328808  T
Q  257 tgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagct 316  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  27328809 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccc-cttcccgaaccctgcgtatgcgggagct 27328867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 157 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 4619284 - 4619104
Alignment:
Q  157 gggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagac 256  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  4619284 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggc 4619185  T
Q  257 tgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||| |  |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  4619184 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccc-cttcccggaccccgcatatgcgagagctttagtgcaccgggttgcccttt 4619104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 157 - 338
Target Start/End: Original strand, 43334159 - 43334339
Alignment:
Q  157 gggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgt-aaaaaacagggtaaga 255  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||     
T  43334159 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcctgtgtaaaaaaacagggtaagg 43334258  T
Q  256 ctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  43334259 ctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccc-cttcccggaccctgcg-atgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 43334339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 154 - 338
Target Start/End: Original strand, 24448844 - 24449025
Alignment:
Q  154 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 253  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| |||||||    
T  24448844 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagccttttgtgtaaaaaatagggtaa 24448943  T
Q  254 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    | ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||| |||||| |||||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  24448944 ggctgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccc-cttcccggaccctgcgtatgcaggagctttagtgcaccgggttgcccttt 24449025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 154 - 338
Target Start/End: Original strand, 41014273 - 41014453
Alignment:
Q  154 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 253  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  41014273 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacagggtaa 41014371  T
Q  254 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    | ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||| | |||| |  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  41014372 ggctgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccc-cttcctggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 41014453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 153 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 8170164 - 8169984
Alignment:
Q  153 agaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggta 252  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||  |||||||||||    
T  8170164 agagggctaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgaccgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagccttttgtgt--aaaacagggta 8170067  T
Q  253 agactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    || ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||| |  ||||||||||||| ||||||    
T  8170066 aggctgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccc-cttcccggaccctgcatatgcgggagtttcagtgcaccgggttgcccttt 8169984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 154 - 338
Target Start/End: Original strand, 35710267 - 35710446
Alignment:
Q  154 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 253  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  |||| |||||||    
T  35710267 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtaactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaatagggtaa 35710364  T
Q  254 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    | |||||| |||||||||  ||||||||||||||  |||||| | | ||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  35710365 ggctgcgttcaatacacc--aaatggtgggaccc-cttcccggaacatgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 35710446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 187 - 338
Target Start/End: Original strand, 32703411 - 32703557
Alignment:
Q  187 tgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacc 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  32703411 tgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc--aaatggtgggacc 32703506  T
Q  287 cttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    |  |||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  32703507 c-cttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 32703557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 154 - 276
Target Start/End: Original strand, 22187239 - 22187361
Alignment:
Q  154 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 253  Q
    |||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||    
T  22187239 gaggggtaactttggcgcaactagtaaagttgttgtcatttgactgaaaggtcaccggtttaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacatgataa 22187338  T
Q  254 gactgcgtacaatacaccaaaaa 276  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  22187339 gactgcgtacaatacaccaaaaa 22187361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 153 - 339
Target Start/End: Original strand, 1565384 - 1565567
Alignment:
Q  153 agaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgt-aaaaaacagggt 251  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||| || ||||||||   |    
T  1565384 agaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcgcgggttcaagtcctggaaacaacctcttgagtaaaaaaacatatt 1565483  T
Q  252 aagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttta 339  Q
    ||| ||||||||||| ||||  |||||| |||||||  |||||| ||||||  |||| ||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  1565484 aaggctgcgtacaatgcacc--aaatggcgggaccc-cttcccggaccctgcatatgtgggagct-tagtgcaccgggttgcccttta 1565567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 154 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 37024735 - 37024626
Alignment:
Q  154 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 253  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||    
T  37024735 gaggggtaaccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaa 37024638  T
Q  254 gactgcgtacaa 265  Q
    | ||||||||||    
T  37024637 ggctgcgtacaa 37024626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 154 - 316
Target Start/End: Original strand, 22600408 - 22600567
Alignment:
Q  154 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 253  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| | | | |||||||||| |||||||||    
T  22600408 gaggggtaaccttgacgtaactggtaaagttgttatcatgtgactggaaggttacgggttcaagtcctggaaacaatattttgtgtaaaacacagggtaa 22600507  T
Q  254 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagct 316  Q
    | ||| ||||||||||||  ||||||||||| ||  |||||| | |||| |||||||||||||    
T  22600508 ggctgtgtacaatacacc--aaatggtgggatcc-cttcccggatcctgcgtatgcgggagct 22600567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 209 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 13801895 - 13801765
Alignment:
Q  209 gggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatg 308  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||| |  ||||    
T  13801895 gggttcaagtcctggaagcagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccc-cttcccggaccccgcatatg 13801797  T
Q  309 cgggagctatagtgcaccgggttaccctttat 340  Q
    || ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  13801796 cgagagctttagtgcaccgggttgccctttat 13801765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 154 - 260
Target Start/End: Original strand, 23974735 - 23974840
Alignment:
Q  154 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 253  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||    
T  23974735 gaggggtaaccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaagagggtaa 23974833  T
Q  254 gactgcg 260  Q
    | |||||    
T  23974834 ggctgcg 23974840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 169 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 12006496 - 12006329
Alignment:
Q  169 cgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacggg-ttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaata 267  Q
    |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |  ||||| ||||||||| |||||||| || | |||||||    
T  12006496 cgcaactgctcaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacggggttcaagtc-tggaaacaacctcttatgtaaaaaatagggtaaggctccatacaata 12006398  T
Q  268 caccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttaccctt 337  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||  ||||||  |||||||||||| |||||||||| ||| |||||    
T  12006397 caccaataatggtgggaccc-cttcccagaccctgcctatgcgggagctttagtgcaccgtgttgccctt 12006329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 157 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 22861844 - 22861680
Alignment:
Q  157 gggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagac 256  Q
    ||||||||||| | |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||| |    |||||||    
T  22861844 gggtaaccttggcacaactgataaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacggattcaagtcctagaagcagtctcttgtgtaaaacaa---gtaagac 22861748  T
Q  257 tgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccg 327  Q
    |||  |||||||| ||||  ||||||||||| || | |||||||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  22861747 tgctcacaatacatcaaa--tggtgggacccctt-ctcgaaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccg 22861680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 183 - 338
Target Start/End: Original strand, 1405170 - 1405322
Alignment:
Q  183 ttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgg 282  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |  ||||| | ||||||| || |||||  |||||||||||||||  |||||||||    
T  1405170 ttgttgtcatgtgactagaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttatataaaaaatagagtaagtttgcgtacaatacacc--aaatggtgg 1405267  T
Q  283 gacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    ||||| ||||| ||||||||  |||||||||||| |||| |||||| || ||||||    
T  1405268 gaccc-tttcctgaaccctgcatatgcgggagctctagtacaccggattgcccttt 1405322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 203 - 329
Target Start/End: Original strand, 43574609 - 43574732
Alignment:
Q  203 ggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctg 302  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  43574609 ggtcacgtgttcaagtcctggaaacaatctcttgtgtagaaaacagggtaaggctgcgtacaatatacc--aaatggtgggaccc-cttcccggaccctg 43574705  T
Q  303 tgtatgcgggagctatagtgcaccggg 329  Q
     ||||||||||||| ||| ||||||||    
T  43574706 cgtatgcgggagctttagagcaccggg 43574732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 176 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 28516593 - 28516433
Alignment:
Q  176 ggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaa 275  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||| || | |||||||||||||| | |||    
T  28516593 ggtaaagttgttgtcaggtggctgaaaggtcacgggttcaagtcttggaaacatcctcttgtgtaaaaaacaggctagggctgcgtacaatacatc-aaa 28516495  T
Q  276 atggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    ||||||||||||  |||||  |||||| | |||| |||||| ||||| ||| |||| ||||||    
T  28516494 atggtgggaccc-attcccagaccctgcgcatgcaggagctttagtggaccaggttgcccttt 28516433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 192 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 42924977 - 42924840
Alignment:
Q  192 tgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccctttt 291  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |   |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| | || ||     
T  42924977 tgtgactgaaaggtcacgagttcaagtcctgaaaacaacatcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgcgtacaatacaccaaaaatgatggaatcccttc 42924878  T
Q  292 cccga-accctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgg 328  Q
    || || |||||| |||||||| |||| |||||||||||    
T  42924877 ccagacaccctgcgtatgcggaagctttagtgcaccgg 42924840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 175 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 19143102 - 19142956
Alignment:
Q  175 tggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaa 274  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| | ||| ||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||  |    
T  19143102 tggtaaaattgttgtcacgtgactaaaatgccacaggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgta-aaaacagggtaaggctgcgtacagtacacc--a 19143006  T
Q  275 aatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcac 325  Q
    |||||||||||||  |||||| ||| || ||||||||||| | ||||||||    
T  19143005 aatggtgggaccc-cttcccggaccatgcgtatgcgggagatttagtgcac 19142956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 155 - 315
Target Start/End: Original strand, 2838733 - 2838890
Alignment:
Q  155 aggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactg-aaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 253  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||   |||| ||  |||||||| |||||||||||||    
T  2838733 aggggtaaccttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatgtgactgtaaaggtcacgaggtcaagtctcagaaacagcatcttgtgt-aaaaacagggtaa 2838831  T
Q  254 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagc 315  Q
    | ||||||||||||||||  ||||||||||| ||  ||| || |||||| ||||||||||||    
T  2838832 ggctgcgtacaatacacc--aaatggtgggatcc-cttctcggaccctgcgtatgcgggagc 2838890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 163 - 329
Target Start/End: Original strand, 39301087 - 39301249
Alignment:
Q  163 ccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgta 262  Q
    ||||| |||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || |  |||||||||| |||||||||||||  ||||||    
T  39301087 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgttactgaaaggtcacgggttcaagtcttgggaacaacctcttgtgtataaaacagggtaaggatgcgta 39301185  T
Q  263 caatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccggg 329  Q
     ||| ||||||||| ||||||||||  |||||| |||||  ||||| ||||| | ||||||||||||    
T  39301186 taatgcaccaaaaa-ggtgggaccc-cttcccggaccctccgtatgtgggag-tttagtgcaccggg 39301249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 176 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 209086 - 208936
Alignment:
Q  176 ggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaa 275  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||||| |||    
T  209086 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacaagttcaagtcctggcaacaacctcttgtgta-aaaacagggtaaggctgcattcaatacacc-aaa 208989  T
Q  276 atggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccggg 329  Q
    ||||||||||||  |||| | |||||| ||||||  ||||| ||||||||||||    
T  208988 atggtgggaccc-cttcctggaccctgggtatgcaagagctttagtgcaccggg 208936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 184 - 334
Target Start/End: Original strand, 1850624 - 1850770
Alignment:
Q  184 tgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtggg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||  ||||  ||||||||||||| |  ||||||||||    
T  1850624 tgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcccggaaataacctcttgtgt-aaaaacagaataagggtgcgtacaatacatc--aaatggtggg 1850720  T
Q  284 acccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacc 334  Q
    | ||  |||| | |||||| | |||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  1850721 a-ccacttcctggaccctgcggatgcggaagctttagtgcaccggattacc 1850770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 231 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 16880751 - 16880645
Alignment:
Q  231 ctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggt 330  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| || ||  |||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||||    
T  16880751 ctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc--aaatggtgtga-ccacttcccggaccatgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggt 16880655  T
Q  331 taccctttat 340  Q
    | ||||||||    
T  16880654 ttccctttat 16880645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 219 - 337
Target Start/End: Original strand, 20135623 - 20135740
Alignment:
Q  219 cctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctat 318  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||| |  ||||| ||||||      
T  20135623 cctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccc-cttcccggaccccgcatatgcaggagcttc 20135721  T
Q  319 agtgcaccgggttaccctt 337  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  20135722 agtgcaccgggttgccctt 20135740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 160 - 340
Target Start/End: Original strand, 30006285 - 30006462
Alignment:
Q  160 taaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgc 259  Q
    |||| ||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| | ||| |  ||||| | |||| ||||||||||| |||     
T  30006285 taacattggcgcaactgataaatttgttgtcatgtgactgaaaggtcatagattcaagtccggaaaacaacctcttatataaacaacagggtaaggctgt 30006384  T
Q  260 gtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttaccctttat 340  Q
    ||||| |||||   ||||||||||||||  ||||||   ||| |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  30006385 gtacattacac--taaatggtgggaccc-cttcccggggcctatgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccttttat 30006462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 195 - 254
Target Start/End: Original strand, 22025538 - 22025597
Alignment:
Q  195 gactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaag 254  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  22025538 gactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaag 22025597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 159 - 274
Target Start/End: Original strand, 31299591 - 31299705
Alignment:
Q  159 gtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactg 258  Q
    |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| |||| || ||||||| |  ||||||| |||| ||||    
T  31299591 gtaaccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgacttacaggtcactagttcaagtcctagaaacagcctcttgtat-taaaacagtgtaaaactg 31299689  T
Q  259 cgtacaatacaccaaa 274  Q
    ||||||||||| ||||    
T  31299690 cgtacaatacatcaaa 31299705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 215 - 331
Target Start/End: Original strand, 7368413 - 7368524
Alignment:
Q  215 aagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggag 314  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||  |||||| ||||||  |||| |||||    
T  7368413 aagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacacc--aattggtgggaccc-cttcccggaccctgcatatgtgggag 7368507  T
Q  315 ctatagtgcaccgggtt 331  Q
    || ||||||||||||||    
T  7368508 ctctagtgcaccgggtt 7368524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 220 - 338
Target Start/End: Original strand, 29334415 - 29334531
Alignment:
Q  220 ctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctata 319  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||| |||||| ||||| |||| || ||    
T  29334415 ctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacc-agaatggtgggaccc-attcccggaccctgcgtatgtgggatcttta 29334512  T
Q  320 gtgcaccgggttacccttt 338  Q
     ||||||||| | ||||||    
T  29334513 atgcaccgggctgcccttt 29334531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 231 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 7097863 - 7097772
Alignment:
Q  231 ctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcacc 326  Q
    |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||  ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  7097863 ctcttgtgtaaaaa-cagggtaaggttgcgtacaatacaccaaa--tggtgagacccctt-cccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcacc 7097772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 246 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 34154903 - 34154811
Alignment:
Q  246 cagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttaccctttata 341  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| || |||| ||||||  ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||    
T  34154903 cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaa--tggtgggacccctt-cccggaccctgcatatgcggtagctctagtgcaccgggttgccctttata 34154811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 183 - 338
Target Start/End: Original strand, 3771324 - 3771474
Alignment:
Q  183 ttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaa-cagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtg 281  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||| || ||| |||||   |||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||   |||||    
T  3771324 ttgttctcacgtgactgaaaggtcacaggtttaagtcatgtaaacagtct---gtgtaaaaaaacagggtaaggctgtgaacaatacaccaat--tggtg 3771418  T
Q  282 ggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    |||||| || |||| || ||||||||| ||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  3771419 ggacccctt-cccggactctgtgtatgtgggagctttagtgcaccgggctgcccttt 3771474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 185 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 22908014 - 22907915
Alignment:
Q  185 gttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtggga 284  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| || |||||||||| ||||||| |||||  ||| |||||||||||  |||||||||||    
T  22908014 gttgttatgtgactgaaaggtcaagggttcaagtccaagaaacagcctcttgtgta-aaaacagagtaaggttgcatacaatacacc--aaatggtggga 22907918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 183 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 34074714 - 34074623
Alignment:
Q  183 ttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaa 274  Q
    |||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||| |||| || |||||||||||||||||  |||||  ||||| ||||||||||||    
T  34074714 ttgttgtcacatgactgaaaggtcacaagttcaagtcctagaaacagcctcttgtgtaaaaaacacagtaaggttgcgttcaatacaccaaa 34074623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 172 - 226
Target Start/End: Original strand, 17419886 - 17419940
Alignment:
Q  172 aactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaa 226  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  17419886 aactggtaaaattgttgtaatgtgactgaaaggttacgagttcaagtcctggaaa 17419940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 24903855 - 24903758
Alignment:
Q  176 ggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaa 273  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| |||| |||  ||||||||| ||| || || |||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||    
T  24903855 ggtaaatttgttgtcacgtgactgaaaagtcatgggcacaagtcctgaaaacagccttttgtgtaaaaaatagggtaagattgtgtacaatccaccaa 24903758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 260 - 338
Target Start/End: Original strand, 16957374 - 16957449
Alignment:
Q  260 gtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  16957374 gtacaatacaccaaa--tggtgggacccctt-cccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 16957449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 39079937 - 39079875
Alignment:
Q  163 ccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaa 226  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39079937 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgacagaaaggtcacgggttcaagtcttggaaa 39079875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 153 - 210
Target Start/End: Original strand, 19438702 - 19438759
Alignment:
Q  153 agaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgg 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  19438702 agaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatatgactaaaagatcacgg 19438759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 204 - 273
Target Start/End: Original strand, 41425952 - 41426021
Alignment:
Q  204 gtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaa 273  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |   | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  41425952 gtcacgggttcaagttctggaaacaacttattgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaa 41426021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 266 - 338
Target Start/End: Original strand, 25622524 - 25622595
Alignment:
Q  266 tacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    |||||||| ||||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  25622524 tacaccaataatggtgggacccctt-cccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccggattgcccttt 25622595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 290 - 338
Target Start/End: Original strand, 32354214 - 32354262
Alignment:
Q  290 ttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  32354214 ttcccggaccctgtgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 32354262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 183 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 10634298 - 10634227
Alignment:
Q  183 ttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaag 254  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |  ||| |||| ||||| |||||||||    
T  10634298 ttgttgtcaagtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctagaaacaacctcgtgtgcaaaaatcagggtaag 10634227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 218 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 12575779 - 12575658
Alignment:
Q  218 tcctggaaatagtctcttgtgtaaa-aaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagct 316  Q
    ||||||||| || |||||| ||||| ||||||| |||   ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| | |||||| |||||| ||||||    
T  12575779 tcctggaaacagcctcttgcgtaaataaacaggctaaagttgcgtacaatacacc-aaaatggtgggaccc-cttcctggaccctgcgtatgcaggagct 12575682  T
Q  317 atagtgcaccgggttaccctttat 340  Q
     | |||||||||| | ||||||||    
T  12575681 ttggtgcaccgggctgccctttat 12575658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 178 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 24323862 - 24323727
Alignment:
Q  178 taaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaat 277  Q
    |||| ||||| || ||||||||||| ||||   |||||||| ||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||  ||||    
T  24323862 taaagttgttatcgtgtgactgaaatgtcaaatgttcaagttctggaaacaacctcttgtgtaaaagacagggtaagcttgcgtataatactcc--aaat 24323765  T
Q  278 ggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagct 316  Q
     |||||||||  |||||  ||||||| ||||||||||||    
T  24323764 agtgggaccc-cttcccagaccctgtatatgcgggagct 24323727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 178 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 24360486 - 24360351
Alignment:
Q  178 taaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaat 277  Q
    |||| ||||| || ||||||||||| ||||   |||||||| ||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||  ||||    
T  24360486 taaagttgttatcgtgtgactgaaatgtcaaatgttcaagttctggaaacaacctcttgtgtaaaagacagggtaagcttgcgtataatactcc--aaat 24360389  T
Q  278 ggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagct 316  Q
     |||||||||  |||||  ||||||| ||||||||||||    
T  24360388 agtgggaccc-cttcccagaccctgtatatgcgggagct 24360351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 31694266 - 31694172
Alignment:
Q  177 gtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacacc 271  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||| || ||| |||| || |||||||||| ||| |||  |||| |||||||||||    
T  31694266 gtaaagttgttgtcacgtgactgataggtcataggttcaagtcttgaaaaaagtcactcgtgtaaaaaataggctaaagctgcatacaatacacc 31694172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 180 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 9794514 - 9794472
Alignment:
Q  180 aaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctg 222  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  9794514 aaattgttgtcatgtgatcaaaaggtcacgggttcaagtcctg 9794472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 175 - 237
Target Start/End: Original strand, 18698586 - 18698648
Alignment:
Q  175 tggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgt 237  Q
    ||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||| ||| ||| || |||||||    
T  18698586 tggtaaaatggttgtcacgtgattgaacggtcacgggttcaagtactgaaaacagcctcttgt 18698648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 31362495 - 31362454
Alignment:
Q  175 tggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaa 216  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  31362495 tggtaaagttgttgtcatgtgattggaaggtcacgggttcaa 31362454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 242 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 9794471 - 9794439
Alignment:
Q  242 aaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaa 274  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9794471 aaaacagggtaagactgcatacaatacaccaaa 9794439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 16028672 - 16028624
Alignment:
Q  290 ttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    |||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  16028672 ttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 16028624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 128; Significance: 6e-66; HSPs: 69)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 155 - 338
Target Start/End: Original strand, 10543653 - 10543835
Alignment:
Q  155 aggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaag 254  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||    
T  10543653 aggggtaaccttggcgcaactgataaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacggcctcttgtgtaaaaaacagggtaag 10543752  T
Q  255 actgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  10543753 gctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccc-cttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 10543835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 154 - 340
Target Start/End: Original strand, 14530272 - 14530457
Alignment:
Q  154 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 253  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||    
T  14530272 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtataaaaaacagggtaa 14530371  T
Q  254 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttaccctttat 340  Q
    | || ||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  14530372 ggctacgtacaatacaccaataatggtgggaccc-cttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttat 14530457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 155 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 24200805 - 24200623
Alignment:
Q  155 aggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaag 254  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  24200805 aggggtaaccttgatgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaagtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaag 24200706  T
Q  255 actgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||| ||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  24200705 gctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaacc-cttcccggaccctgagtatgtgagagctttagtgcaccgggttgcccttt 24200623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 153 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 8455498 - 8455316
Alignment:
Q  153 agaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggta 252  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||    
T  8455498 agaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacacagggta 8455399  T
Q  253 agactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    || ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||| |||||| |||||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  8455398 aggctgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccc-cttcccggaccctgcgtatgccggagctttagtgcaccgggttgcccttt 8455316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 156 - 338
Target Start/End: Original strand, 11514392 - 11514570
Alignment:
Q  156 ggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaaga 255  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||  |||||     
T  11514392 ggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaactcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacaaagtaagg 11514491  T
Q  256 ctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  11514492 ctgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccc--ttcccagaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccggattgcccttt 11514570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 154 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 21779440 - 21779261
Alignment:
Q  154 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 253  Q
    |||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||  ||||||||||||    
T  21779440 gaggggtaaccttggcgcaactggtgaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggagacagcctcttgtgt--aaaacagggtaa 21779343  T
Q  254 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    |  |||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  21779342 ggttgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccc-cttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 21779261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 157 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 25249915 - 25249738
Alignment:
Q  157 gggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagac 256  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| | |||||||||||| |    
T  25249915 gggtaaccttggcgcaattggtaaagttgttgtcatgtgactgtaaggtcacgggttcaagtcatggaaacagtctcttgtgt-acaaacagggtaaggc 25249817  T
Q  257 tgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  25249816 tgcgtacaatacacc--aaatggtgggatcc-cttcccgaaccctgcgtatgcgtgagctttagtgcaccgggttgcccttt 25249738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 151 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 12024102 - 12023969
Alignment:
Q  151 ttagaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacaggg 250  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||    
T  12024102 ttagaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta-aaaacaggg 12024004  T
Q  251 taagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccc 287  Q
    |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  12024003 taaggctgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccc 12023969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 154 - 338
Target Start/End: Original strand, 9671134 - 9671314
Alignment:
Q  154 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgact-gaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggta 252  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||||||  |||||||||||    
T  9671134 gaggggtaaccttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatgtgactggaaatgtcacgggttcaaatcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggta 9671231  T
Q  253 agactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    || ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  9671232 aggctgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccc-cttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 9671314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 152 - 281
Target Start/End: Original strand, 7214486 - 7214615
Alignment:
Q  152 tagaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggt 251  Q
    |||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  7214486 tagaggggtaactttggcacaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcttggaaacagtctcttgtgtaaaatacagggt 7214585  T
Q  252 aagactgcgtacaatacaccaaaaatggtg 281  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  7214586 aaggctgcgtacaatacacaaaaaatggtg 7214615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 171 - 338
Target Start/End: Original strand, 17667973 - 17668137
Alignment:
Q  171 caactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacac 270  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  17667973 caactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaatcagggtaaggctgcgtacaatacac 17668072  T
Q  271 caaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    |  ||||||||| ||||  ||| ||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  17668073 c--aaatggtggaaccc-cttctcgaaccctgcgtatatgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 17668137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 154 - 340
Target Start/End: Original strand, 23397720 - 23397901
Alignment:
Q  154 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 253  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||  |||| |||||||    
T  23397720 gaggggtaaccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaatagggtaa 23397817  T
Q  254 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttaccctttat 340  Q
    | || |||||||||||||  ||||||||||||||  ||| || |||||   |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  23397818 ggctacgtacaatacacc--aaatggtgggaccc-cttctcggaccctacatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctttat 23397901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 156 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 19977893 - 19977714
Alignment:
Q  156 ggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaaga 255  Q
    |||||||||||| || ||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||| ||| ||||     
T  19977893 ggggtaaccttggcggaactggtgaagttgttgtcatgtgaccgaaaggtcacgggttcaagttctggaaacagcctcttttgtaaaaaataggataagg 19977794  T
Q  256 ctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
     |||||||||||||||  ||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  19977793 ttgcgtacaatacacc--aaatggtgggatcc-cttcccgaaccttgtgtatgcgggagctttagtgcaccagattacccttt 19977714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 154 - 338
Target Start/End: Original strand, 5840982 - 5841165
Alignment:
Q  154 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 253  Q
    ||||||||||||||  |||| || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||| |||||||    
T  5840982 gaggggtaaccttggtgcaaatgataaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagccttttgtgtaaaaaatagggtaa 5841081  T
Q  254 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    |  ||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||| |||| |  |||||||||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  5841082 ggatgcgtacaatacatcaataatggtgggaccc-cttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgagttgcccttt 5841165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 155 - 344
Target Start/End: Original strand, 14544018 - 14544207
Alignment:
Q  155 aggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgta-aaaaacagggtaa 253  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| || || ||||||| || |||||||||| |||||||||||||    
T  14544018 aggggtaaccttggcgcaattggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttacaggtccaggtactggaaacagcctcttgtgtagaaaaacagggtaa 14544117  T
Q  254 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttaccctttatatgt 344  Q
    |||||||| |||||  | ||||||||| ||||||  |||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||    
T  14544118 gactgcgtgcaataaccaaaaaatggtcggaccc-cttccgggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccaagttgccctttatatgt 14544207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 154 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 25079899 - 25079717
Alignment:
Q  154 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaa-aaaacagggta 252  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| |  ||||||||||| |||||| ||||    
T  25079899 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcttagaaacaacctcttgtgtaaaaaaacaaggta 25079800  T
Q  253 agactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    ||  |||||||||||||||   |||||||||||||  |||||| |||||| ||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  25079799 aggatgcgtacaatacacc--gaatggtgggaccc-cttcccggaccctgcgtatgcaagagctttagtgcaccgggttgcccttt 25079717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 191 - 338
Target Start/End: Original strand, 10546153 - 10546298
Alignment:
Q  191 atgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgt-aaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccctt 289  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||      
T  10546153 atgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacatcctcttgtataaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccc-c 10546249  T
Q  290 ttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  10546250 ttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 10546298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 156 - 338
Target Start/End: Original strand, 17896215 - 17896395
Alignment:
Q  156 ggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgt-aaaaaacagggtaag 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||| |  ||||||||| |||||| ||||||||    
T  17896215 ggggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgaccgaaaggtcacggattcaagtcctagaaacaacctcttgtgtaaaaaaatagggtaag 17896314  T
Q  255 actgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
     |||||||||||| |||  ||||||||||||||  ||| || |||||| ||||| ||||||| ||||||| || ||| ||||||    
T  17896315 gctgcgtacaatatacc--aaatggtgggaccc-cttctcggaccctgcgtatgtgggagctttagtgcatcgagttgcccttt 17896395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 160 - 338
Target Start/End: Original strand, 27573581 - 27573755
Alignment:
Q  160 taaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgc 259  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || || || ||||||||| | ||||| |||||| ||||    
T  27573581 taaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcattggttcaagtccgggcaacagcctcttgtgt-ataaacatggtaaggctgc 27573679  T
Q  260 gtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||| || |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  27573680 gtacaatacacc--aaatggt-ggaaccatttcccaaaccctgtgtatgtgggagctttagtgcatcgggttgcccttt 27573755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 171 - 338
Target Start/End: Original strand, 17623535 - 17623699
Alignment:
Q  171 caactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacac 270  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  17623535 caactggtaaagttgttgtcatgcgactggaaggtcacgggttcaagtcctcgaaacaacctcttgtgtaaaaatcagggtaaggctgcgtacaatacac 17623634  T
Q  271 caaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    |  ||||||||| ||||  |||||||| |||| ||||| || |||| |||||||| ||||| ||||||    
T  17623635 c--aaatggtggaaccc-cttcccgaatcctgcgtatgtggaagctttagtgcactgggttgcccttt 17623699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 154 - 307
Target Start/End: Original strand, 22371011 - 22371158
Alignment:
Q  154 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 253  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || ||| |||   |||||||||||||    
T  22371011 gaggggtaaccttggcccaactggtaaagttgttgtcatgtgactgggaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcgtgt---aaaaacagggtaa 22371107  T
Q  254 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtat 307  Q
    | ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  22371108 ggctgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccc-cttcccggaccctgtgtat 22371158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 189 - 326
Target Start/End: Original strand, 19614981 - 19615116
Alignment:
Q  189 tcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccct 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||  |||     
T  19614981 tcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtccttgaaacatcctcttgtataaaaaacagggtaagactgcgtacaatataccaataatagtggacccc- 19615079  T
Q  289 tttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcacc 326  Q
     ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  19615080 -ttcccgaaccctgcgtatgcaggagctttagtgcacc 19615116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 191 - 338
Target Start/End: Original strand, 14444720 - 14444863
Alignment:
Q  191 atgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttt 290  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||  ||||||||||||||  |    
T  14444720 atgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacagggtaaggctgtgtacgatacacc--aaatggtgggaccc-ct 14444815  T
Q  291 tcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||    
T  14444816 tcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccaggttgcccttt 14444863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 154 - 272
Target Start/End: Original strand, 17705449 - 17705567
Alignment:
Q  154 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 253  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||| ||||| ||||    
T  17705449 gaggggtaaccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactagaaggtcacgggttcaagtcctggaaaccgcctcttgtgtaaacaacagagtaa 17705548  T
Q  254 gactgcgtacaatacacca 272  Q
    | ||| |||||||||||||    
T  17705549 ggctgtgtacaatacacca 17705567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 155 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 32781467 - 32781310
Alignment:
Q  155 aggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaag 254  Q
    ||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||  ||||  ||||||||||||| |||||||||  ||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  32781467 agggggaaccttggcgcaa-tggtaaagttgttgcaatgttgctgaaaggtcacgagttcaagtctcggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaag 32781369  T
Q  255 actgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagct 316  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||    
T  32781368 actgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccc-cttcccagaccctgtgtatgcgggagct 32781310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 178 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 31158598 - 31158451
Alignment:
Q  178 taaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaat 277  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  31158598 taaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcaagggttaaagtcttcaaaacagcctcttgcgtaaaaaacagggtaagattgcatacaataaaccaaaaat 31158499  T
Q  278 ggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcacc 326  Q
    ||||||||||  |||||  |||||| ||||||||||||| |||| ||||    
T  31158498 ggtgggaccc-cttcccagaccctgcgtatgcgggagctttagtacacc 31158451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 175 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 40417031 - 40416869
Alignment:
Q  175 tggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaa 274  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||     
T  40417031 tggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcatggaaacaacctcttgtataaaaaacagggaaaggctgtgtacaatacaccaat 40416932  T
Q  275 aatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttaccctttat 340  Q
      || ||||||||||||   || |||||  |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  40416931 --tgatgggacccttttttgga-ccctgcatatgcgagagctttagtgcaccgggttgccctttat 40416869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 176 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 21377232 - 21377095
Alignment:
Q  176 ggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaa 275  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||| |  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||  ||    
T  21377232 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttacgagttcaagtcatagaaacatcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgggtacaatgcacc--aa 21377135  T
Q  276 atggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagct 316  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  21377134 atggtgggaccc-cttcccgaaccctgcgtatgtgggagct 21377095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 169 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 39914472 - 39914306
Alignment:
Q  169 cgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaa-aaaacagggtaagactgcgtacaata 267  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||    
T  39914472 cgcatctggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggatcaagtactggaaacaacctcttgtgtaaaaaaacagggtaaggatgtgtacaata 39914373  T
Q  268 caccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    ||||   ||||||||||||| ||  ||  |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  39914372 cacc--gaatggtgggacccctt--cctgaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcccttt 39914306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 178 - 274
Target Start/End: Original strand, 5450263 - 5450360
Alignment:
Q  178 taaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgt-aaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaa 274  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  5450263 taaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaattcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaaacatggtaaggctgcgtacaatacaccaaa 5450360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 154 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 26684803 - 26684630
Alignment:
Q  154 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatag-tctcttgtgt-aaaaaacagggt 251  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||| ||| ||  ||||||||| |||||| | |||    
T  26684803 gaggggtaactttagcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgattgaaaggtcaaaggtttaagtcctgaaaacagacctcttgtgtaaaaaaatatggt 26684704  T
Q  252 aagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgg 328  Q
    ||| |||||||||||| ||   ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  26684703 aaggctgcgtacaatatac--taaatggtggga-cctcttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttaatgcaccgg 26684630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 177 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 99421 - 99281
Alignment:
Q  177 gtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaa 276  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||  |||||||| || ||| |||||||||||||||||||      
T  99421 gtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagcctcttgt--aaaaaacatggcaaggctgcgtacaatacaccaaa-- 99326  T
Q  277 tggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtg 322  Q
    |||||| |||| ||  | || ||||||||||||||||||| |||||    
T  99325 tggtggaaccccttctcaga-ccctgtgtatgcgggagctttagtg 99281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 176 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 23145857 - 23145745
Alignment:
Q  176 ggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaa 275  Q
    |||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||| || ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||    
T  23145857 ggtaaagttgttgtagcgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcttgaaaacagactcttgtgtaaaaaacagtgtaaggctgcgtacaatacacc--aa 23145760  T
Q  276 atggtgggacccttt 290  Q
     ||||||||||||||    
T  23145759 ttggtgggacccttt 23145745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 176 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 23557647 - 23557535
Alignment:
Q  176 ggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaa 275  Q
    |||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||| || ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||    
T  23557647 ggtaaagttgttgtagcgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcttgaaaacagactcttgtgtaaaaaacagtgtaaggctgcgtacaatacacc--aa 23557550  T
Q  276 atggtgggacccttt 290  Q
     ||||||||||||||    
T  23557549 ttggtgggacccttt 23557535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 176 - 316
Target Start/End: Original strand, 33795261 - 33795398
Alignment:
Q  176 ggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtac-aatacaccaaa 274  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||       
T  33795261 ggtaaagttgttgtcacgtgattgaaaggtcacgggttcaagtcccggaaacaacctcttgggtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaaatacacc--- 33795357  T
Q  275 aatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagct 316  Q
     ||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||    
T  33795358 tatggtgggaccc-cttcccagaccctgtgtatgcgggagct 33795398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 164 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 24860157 - 24859998
Alignment:
Q  164 cttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtac 263  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||| |  |||| ||||||||| || |||| | ||||||||    
T  24860157 cttggcgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactggaaggttacgggtttaagccctggaaacaacctctggtgtaaaaa-catggtagg-ctgcgtac 24860060  T
Q  264 aatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgg 328  Q
    |||||||||||  |||| | |||| || | || |||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  24860059 aatacaccaaa--tggtagaacccctt-ctcggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgg 24859998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 185 - 328
Target Start/End: Original strand, 25641487 - 25641626
Alignment:
Q  185 gttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtggga 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||  ||||||||||||   |||||||||||||||  |||| ||||||    
T  25641487 gttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcattttgtgt-gaaaacagggtaaagttgcgtacaatacacc--aaattgtggga 25641583  T
Q  285 cccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgg 328  Q
    |||  |||||||| |||| ||||||| ||||| ||||| |||||    
T  25641584 ccc-cttcccgaatcctgcgtatgcgagagctttagtgaaccgg 25641626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 163 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 4516522 - 4516360
Alignment:
Q  163 ccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgta 262  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||| || |||| || |||||||||||||||||||| ||  |||||||    
T  4516522 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacatattcaagttctagaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggcaacgctgcgta 4516424  T
Q  263 caatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccggg 329  Q
    |||||||||  || |||||||||||  |||||| |||||| ||||| || |||| ||||| ||||||    
T  4516423 caatacacc--aattggtgggaccc-cttcccggaccctgcgtatgtggaagctttagtgtaccggg 4516360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 220 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 40762349 - 40762234
Alignment:
Q  220 ctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctata 319  Q
    ||||||| || |||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||  |||||||||||||| ||||| | |||||| ||||| ||||||| ||    
T  40762349 ctggaaacagcctcttgtgtaaaaaactgggtaaggctacgtacaatacacc--aaatggtgggaccc-tttcctggaccctgcgtatgtgggagcttta 40762253  T
Q  320 gtgcaccgggttacccttt 338  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  40762252 gtgcaccgggttgcccttt 40762234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 176 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 29420048 - 29419945
Alignment:
Q  176 ggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaaga----ctgcgtacaatacacc 271  Q
    |||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||    
T  29420048 ggtaaagttgttgtcacatgactgaaaggtcacgagttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaagtaaggctgcgtacaatacacc 29419949  T
Q  272 aaaa 275  Q
    ||||    
T  29419948 aaaa 29419945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 216 - 338
Target Start/End: Original strand, 36871509 - 36871626
Alignment:
Q  216 agtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagc 315  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || || ||  |||| ||||||||||||    
T  36871509 agtcctggaaacagcctcttgtgtgaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccccttcccgga--cctgcgtatgcgggagc 36871603  T
Q  316 tatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    | |||||||||||||| ||||||    
T  36871604 tttagtgcaccgggttgcccttt 36871626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 155 - 249
Target Start/End: Original strand, 17472926 - 17473020
Alignment:
Q  155 aggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagg 249  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||| || ||||||||||||||||    
T  17472926 aggggtaaccttgacgcaactaataaagttgttgtcaaatgattgaaaggtcacgggttcaggtcttagaaatagcctattgtgtaaaaaacagg 17473020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 176 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 44521532 - 44521434
Alignment:
Q  176 ggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaa 274  Q
    |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||| | |||||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||    
T  44521532 ggtaaagttgttatcacgtgactgaaaggtcacgcgttcaaatcttggaaacaatctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcatataatacaccaaa 44521434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 175 - 338
Target Start/End: Original strand, 44643497 - 44643658
Alignment:
Q  175 tggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgt-aaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaa 273  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| || |||||  || ||||||||| ||||| |||||||||||  |||      
T  44643497 tggtaaagttgtcatcatgtgactgaaaggtcacgtgttcaagttctagaaagagcctcttccgtaaaaaaacagagtaaggctgcgtacaatgtacc-- 44643594  T
Q  274 aaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    ||||||||||||||  |||||  |||||| ||||||||||||  |||||||||||| | ||||||    
T  44643595 aaatggtgggaccc-cttcccagaccctgcgtatgcgggagccttagtgcaccgggctgcccttt 44643658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 185 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 31821491 - 31821355
Alignment:
Q  185 gttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtggga 284  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| || |   ||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||  ||||| |||||    
T  31821491 gttgttatgtgactgaaaggtcacgagttcaagtcgtagaaacagccg--tgtgtaaaaaatagggtaaggttgtgtacaatacacc--aaatgatggga 31821396  T
Q  285 cccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcacc 326  Q
    ||| ||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||||    
T  31821395 ccccttt-ccgaaacctgtgtatgcgggagctttaatgcacc 31821355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 172 - 255
Target Start/End: Original strand, 44604826 - 44604908
Alignment:
Q  172 aactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaaga 255  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||||||    
T  44604826 aactgctaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacaggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgt-aaaaacagggtaaga 44604908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 235 - 338
Target Start/End: Original strand, 25632544 - 25632644
Alignment:
Q  235 tgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacc 334  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||  |  |||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  25632544 tgtgtaaaaaacaggataaggctgcgtacaatacacc--aaatggtgggattc-cttcccgaaccttacgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcc 25632640  T
Q  335 cttt 338  Q
    ||||    
T  25632641 cttt 25632644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 177 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 45235976 - 45235867
Alignment:
Q  177 gtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaa-aacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaa 275  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||| || |||||||| || |||  |||||||  |||    
T  45235976 gtaaagttgttctcatgtgactgaaagatcacgagttcaagtcctagaaacagtctcttctgtaaaataatagggtaaggctacgtgtaatacac--aaa 45235879  T
Q  276 atggtgggaccc 287  Q
    ||||||||||||    
T  45235878 atggtgggaccc 45235867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 183 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 17380388 - 17380298
Alignment:
Q  183 ttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaa 274  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||| | ||||||||||||  || || ||||||||||||    
T  17380388 ttgttgtcatgtgaccgaaaggtcacgggttcaagtcttggaaacaacctcttgtgt-ataaacagggtaaggttgtgtgcaatacaccaaa 17380298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 338
Target Start/End: Original strand, 4795730 - 4795890
Alignment:
Q  177 gtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaa-cagggtaagactgcgtacaatacaccaaaa 275  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| |||||  ||| ||||| || ||| || ||| || |||||||| || | | ||||||||| ||||||||| |||    
T  4795730 gtaaagttgttgtcacgtgactgaaaagtcacttgttgaagtcttgaaaacagcctcatgcgtaaaaaaacaagattagactgcgtgcaatacacc-aaa 4795828  T
Q  276 atggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| | |||| |||||||  ||||| ||||||    
T  4795829 atggtggga-ccttttcccggaccttgtgtatgccgaagctttagtgcagtgggttgcccttt 4795890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 194 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 2003678 - 2003597
Alignment:
Q  194 tgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgt-aaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaa 274  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||| || |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  2003678 tgactgaaaggtcacgggtacaagtcctggaaacagccccttgcgtaaaaaaacagggtaaggatgcgtacaatacaacaaa 2003597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 254 - 331
Target Start/End: Original strand, 23488535 - 23488611
Alignment:
Q  254 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggtt 331  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  23488535 gactgcgtgcaatacacaaaaaatggtgggaccc-cttcccggaccctgcgtatgcgagagctttagtgcaccgggtt 23488611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 199 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 12315787 - 12315713
Alignment:
Q  199 gaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaa 274  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12315787 gaaaggtcacgagttcaagtcatggaaacagcttcttat-taaaaaacagggtaagactgtgtacaatacaccaaa 12315713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 209 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 15296533 - 15296467
Alignment:
Q  209 gggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaa 275  Q
    |||||||||||| ||||| || || |||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  15296533 gggttcaagtcccggaaacagcctgttgtgtaaaatacagggtaaggctgcgtacaatataccaaaa 15296467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 154 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 39189602 - 39189556
Alignment:
Q  154 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactga 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39189602 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactga 39189556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 158 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 4852388 - 4852304
Alignment:
Q  158 ggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaa 245  Q
    ||||||||||  |||||||| |||   ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  4852388 ggtaaccttggtgcaactggcaaa---gttgtcatgtgaccgaaaagtcaggggttcaagtcctgcaaacagtctcttgtgaaaaaaa 4852304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 196 - 328
Target Start/End: Original strand, 17471544 - 17471675
Alignment:
Q  196 actgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaa-cagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttccc 294  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||   |||| || ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| |||||| || |||||  |||||    
T  17471544 actgaaatgtcacaggttcaagtctcagaaacagcctcttgtgtaaaaaaacaggataagactgcgtacaatatacc-aaaatgatgagaccc-cttccc 17471641  T
Q  295 gaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgg 328  Q
      ||||||  |||||||||| | |||||||||||    
T  17471642 tgaccctgcctatgcgggagttttagtgcaccgg 17471675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 286 - 338
Target Start/End: Original strand, 22371195 - 22371247
Alignment:
Q  286 ccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  22371195 ccttttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 22371247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 27466312 - 27466262
Alignment:
Q  153 agaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaag 203  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27466312 agaggcgtaacattggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaag 27466262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 276 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 40579810 - 40579750
Alignment:
Q  276 atggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttaccctt 337  Q
    |||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  40579810 atggtgggacccctt-cccggaccctgagtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctt 40579750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 222
Target Start/End: Original strand, 35017781 - 35017840
Alignment:
Q  163 ccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgact-gaaaggtcacgggttcaagtcctg 222  Q
    ||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  35017781 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgacttgaaaggtcacgggtttaagtcctg 35017840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 288 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 124964 - 124921
Alignment:
Q  288 ttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggtt 331  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  124964 ttttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggtt 124921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 160 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 15896416 - 15896350
Alignment:
Q  160 taaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaa 226  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| || || |||| | ||| ||||| ||||||    
T  15896416 taacgttgatgcaactggtaaaattgttgtcatgtgattggaatgtcaagagttgaagtcttggaaa 15896350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 257 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 19185823 - 19185742
Alignment:
Q  257 tgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttta 339  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| |||| || || | |||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||||||    
T  19185823 tgcgtacaatgcacaaaaaatggtggaacccctt-cctggaccctgcgtatgcgggagctttagtacatcgagttacccttta 19185742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 240 - 325
Target Start/End: Original strand, 24890451 - 24890533
Alignment:
Q  240 aaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcac 325  Q
    |||||||| |||||| |||| |||||||||||  || |||||||||||  |||||| |||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  24890451 aaaaaacaaggtaaggctgcatacaatacacc--aattggtgggaccc-cttcccggaccctgcgtatgcaggagctttagtgcac 24890533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 215 - 326
Target Start/End: Original strand, 30826052 - 30826158
Alignment:
Q  215 aagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggag 314  Q
    ||||| |||||| || ||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||  |||||| ||||||  |||  |||||   ||||||||||    
T  30826052 aagtcttggaaacagcctcttgtgtaaaaat-agggtaaggttgcgtacaatacaccaaa--tggtggaaccctt--cccagaccctacatatgcgggag 30826146  T
Q  315 ctatagtgcacc 326  Q
    || |||||||||    
T  30826147 ctttagtgcacc 30826158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 34752820 - 34752771
Alignment:
Q  177 gtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaa 226  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  34752820 gtaaacttgttatcatgtgactgaaaggtcacgaattcaagttctggaaa 34752771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 277 - 338
Target Start/End: Original strand, 34766330 - 34766390
Alignment:
Q  277 tggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    ||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  34766330 tggtgggacccctt-cccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaacgggtttcccttt 34766390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 241 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 39499324 - 39499242
Alignment:
Q  241 aaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtggga-cccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcacc 326  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  39499324 aaaaatagggtaaagctgcgtacaatacatcaaa--tggtgggatcccttttc--gaatcctgcgtatgcgggagctttagtgcacc 39499242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 48)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 154 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 29356039 - 29355855
Alignment:
Q  154 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaa-ttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggta 252  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  29356039 gaggggtaaccttggcacaactggtaaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaagaaacagggta 29355940  T
Q  253 agactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  29355939 aggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccc-cttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 29355855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 164 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 12222088 - 12221914
Alignment:
Q  164 cttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtac 263  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12222088 cttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcttggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtac 12221989  T
Q  264 aatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagc-tatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    |||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||    
T  12221988 aatacaccaataatggtgggaccc-cttcccggaccctgcgtatgcgggagcttttagtgcaccgggttgcccttt 12221914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 154 - 338
Target Start/End: Original strand, 1346918 - 1347097
Alignment:
Q  154 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 253  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||  ||||||||||||    
T  1346918 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagccacttgtgt--aaaacagggtaa 1347015  T
Q  254 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    | ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  1347016 ggctgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccc-cttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 1347097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 154 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 1354936 - 1354757
Alignment:
Q  154 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 253  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||    
T  1354936 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcactggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaa 1354839  T
Q  254 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    | ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  1354838 ggctgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccc-cttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 1354757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 156 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 3815256 - 3815084
Alignment:
Q  156 ggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaaga 255  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| | |||| ||    
T  3815256 ggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaatgtcacgggttcaagtcctggaaacagactattgtgtaaaaaatatggtacga 3815157  T
Q  256 ctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggtt 331  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||||    
T  3815156 ctgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccc-tttcccgaaccctacgtatgcggaagctttagtgcaccgggtt 3815084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 154 - 338
Target Start/End: Original strand, 9161077 - 9161259
Alignment:
Q  154 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 253  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||    
T  9161077 gaggggtaaccttgacgcaatcggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacagagtaa 9161175  T
Q  254 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    | |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||| || |||||| |||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||    
T  9161176 ggctgcgtacaatacatcaataatggtgggaccc-cttctcggaccctgcgtatgcggaagctttagtgcaccaggttgcccttt 9161259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 159 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 2166587 - 2166410
Alignment:
Q  159 gtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactg 258  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| ||||  ||    
T  2166587 gtaaccttg-cgcaactagtaaagttgttgttatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaatacaggataaggttg 2166489  T
Q  259 cgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||| | ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  2166488 cgtacaatacaccaataatggtgggaccc-cttcccggaccctatatattcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 2166410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 159 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 2178220 - 2178043
Alignment:
Q  159 gtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactg 258  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| ||||  ||    
T  2178220 gtaaccttg-cgcaactagtaaagttgttgttatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaatacaggataaggttg 2178122  T
Q  259 cgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||| | ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  2178121 cgtacaatacaccaataatggtgggaccc-cttcccggaccctatatattcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 2178043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 151 - 286
Target Start/End: Original strand, 6024184 - 6024319
Alignment:
Q  151 ttagaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacaggg 250  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| ||||| |||| |||| || ||||||||||||||||| ||    
T  6024184 ttagaggggtaattttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgattggaaggtcacggtttcaaatcctagaaacagcctcttgtgtaaaaaacatgg 6024283  T
Q  251 taagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacc 286  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  6024284 taagactgcgtacaatacaccaataatgatgggacc 6024319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 154 - 268
Target Start/End: Original strand, 8409197 - 8409311
Alignment:
Q  154 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 253  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  8409197 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtaatgtgactgaaaggtcacggattcaagtcctggaaactgcctcttgtgtaaaaaacagggtaa 8409296  T
Q  254 gactgcgtacaatac 268  Q
    | |||||||||||||    
T  8409297 ggctgcgtacaatac 8409311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 152 - 327
Target Start/End: Original strand, 20400619 - 20400791
Alignment:
Q  152 tagaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggt 251  Q
    ||||| |||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  20400619 tagagaggtaaccttggcgcaattggtatagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagttatggaaacaatctcttgtgtaaaaaacagggt 20400718  T
Q  252 aagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccg 327  Q
    ||||||||||||| |||||   |||| | ||||||||||| |||||||||  |||||| | | || ||||||||||    
T  20400719 aagactgcgtacagtacac--taaatagcgggaccctttt-ccgaaccctacgtatgcagaaactttagtgcaccg 20400791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 170 - 317
Target Start/End: Original strand, 14553482 - 14553627
Alignment:
Q  170 gcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaataca 269  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||    
T  14553482 gcaactggtaaagttgttgtcatgtgact-aaaggtcacaggttcaagtcctggaaatagcttcttgtgtaaaaaatagggtaaggctgtgtataataca 14553580  T
Q  270 ccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagcta 317  Q
    |||||| |||||||||||  |||    |||||||||||||||||||||    
T  14553581 ccaaaactggtgggaccc-cttcgtagaccctgtgtatgcgggagcta 14553627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 154 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 15866218 - 15866052
Alignment:
Q  154 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 253  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||  ||||||||||||||||    
T  15866218 gaggggtaaccttggcccaactggtaaagttgttggcatgtgattgaaaggtcatgggttcaattcctggaaacagcctcttaagtaaaaaacagggtaa 15866119  T
Q  254 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcac 325  Q
      ||||||  ||||||||  ||||||||||||||  |||||| |||||| || ||||||| |||||||||||    
T  15866118 agctgcgt--aatacacc--aaatggtgggaccc-cttcccggaccctgcgtttgcgggatctatagtgcac 15866052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 192 - 339
Target Start/End: Original strand, 17432332 - 17432484
Alignment:
Q  192 tgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaaga------ctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggac 285  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||       ||| ||||||||||| |||||||||| |||    
T  17432332 tgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacaacatcttgtgtaaaaaacagggtaagggtaaggctgtgtacaatacactaaaaatggtgagac 17432431  T
Q  286 ccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttta 339  Q
    | |||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  17432432 c-ttttcccggatcctgtgcatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttta 17432484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 155 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 13905158 - 13905011
Alignment:
Q  155 aggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaag 254  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    ||||||||||||||||||||||||    
T  13905158 agggggaaccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggctcaagtcctgaaaacgacctcttgtgtaaaaaacagggtaag 13905060  T
Q  255 actgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtat 307  Q
     |||| |||||| ||||  ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||    
T  13905059 gctgcatacaattcacc--aaatggt-ggaccc-tttcccgaaccctgcgtat 13905011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 154 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 14975261 - 14975097
Alignment:
Q  154 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 253  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||       
T  14975261 gagggataaccttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacggattcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacaagg--- 14975165  T
Q  254 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggtt 331  Q
             ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |  |||||||||| | ||||||||||||||    
T  14975164 ---------caatacaccaataatggtgggaccc-cttcccgaaccccgcatatgcgggagttttagtgcaccgggtt 14975097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 154 - 287
Target Start/End: Original strand, 1941809 - 1941940
Alignment:
Q  154 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 253  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||| || ||||| || ||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  1941809 gaggggtaaccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatctgactggaaggtcgcggattgaagtcatgtaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 1941908  T
Q  254 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccc 287  Q
    | ||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  1941909 ggctgcgtacaatacacc--gaatggtgggaccc 1941940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 205 - 327
Target Start/End: Original strand, 33138838 - 33138957
Alignment:
Q  205 tcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtg 304  Q
    |||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  33138838 tcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtataaaaaacagagtaaggccgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccctttt-ccggaccctgtg 33138934  T
Q  305 tatgcgggagctatagtgcaccg 327  Q
    ||||| | |||| ||||||||||    
T  33138935 tatgcagtagctttagtgcaccg 33138957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 193 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 7947514 - 7947384
Alignment:
Q  193 gtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttc 292  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |  ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||    
T  7947514 gtgactgaaaggtcaccggttcaactcctggaaacaacctcctgtgtaaaaaccagggtaaggctgcgtacaatacacc-aaaatggtggg-cccccttc 7947417  T
Q  293 ccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcac 325  Q
    ||| ||| || ||||| ||||||| ||||||||    
T  7947416 ccggaccttgcgtatgtgggagctttagtgcac 7947384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 157 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 32728334 - 32728217
Alignment:
Q  157 gggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagac 256  Q
    |||||||||||  | |||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  32728334 gggtaaccttggtggaacgagtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacagattcaagttttggaaacaacctcttatgtaaaaaacagggtaagac 32728235  T
Q  257 tgcgtacaatacaccaaa 274  Q
    || |||||||| ||||||    
T  32728234 tgtgtacaatataccaaa 32728217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 157 - 245
Target Start/End: Original strand, 12063424 - 12063512
Alignment:
Q  157 gggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaa 245  Q
    |||||||||||  ||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||    
T  12063424 gggtaaccttggtgcaactgataaagttgttatcatgagactgaaaggtcacgggttcaagtcctagaaatagcctcttgtataaaaaa 12063512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 176 - 340
Target Start/End: Original strand, 12889402 - 12889564
Alignment:
Q  176 ggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaa 275  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| || ||| || ||||||||| |||||||||| ||| |||| |||||||||||  ||    
T  12889402 ggtaaagttgttgtcacgtgagtgaaaggtcacaggttcaagtcttgaaaacagcctcttgtgttaaaaacagggcaaggctgcatacaatacacc-taa 12889500  T
Q  276 atggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttaccctttat 340  Q
    | | |||||||| ||| ||| ||||| ||| || ||||||| ||||||| |||| | ||||||||    
T  12889501 acgatgggaccccttt-ccggaccctctgtgtgtgggagctttagtgcatcgggctgccctttat 12889564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 178 - 338
Target Start/End: Original strand, 28007604 - 28007760
Alignment:
Q  178 taaaattgttgtcatgtgac-tgaaa-ggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaa 275  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||  ||    
T  28007604 taaagttgttgtcatgtgacatgaaaaggtcacgggttcaagtcctggaaagagcctcttgtgt--aaaacagggtcaggctgcgtacaatacacc--aa 28007699  T
Q  276 atggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    ||| ||||||||  ||||| || |||   ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||    
T  28007700 atgctgggaccc-cttccctaa-cctccatatgcggaagctctagtgcaccggattacccttt 28007760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 171 - 322
Target Start/End: Original strand, 24097552 - 24097696
Alignment:
Q  171 caactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacac 270  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||  || ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||    ||    
T  24097552 caactggtaaaattgatgtcatgttactgaaaggtcacgagtttaagtcctcgaaccagcctcttgtataaaaaacagggtaaggctgcttaca----ac 24097647  T
Q  271 caaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtg 322  Q
    |  ||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||| |||| |||||    
T  24097648 c--aaatggtgggaccc-cttcccggaccctgcgtatgcggaagctttagtg 24097696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 153 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 23930308 - 23930127
Alignment:
Q  153 agaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggtt-caagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggt 251  Q
    |||| |||||||||| |||||||  ||||  |||||||||||| || |||||||||| ||| |||||| |||||| |||||| ||||||||||||| | |    
T  23930308 agagaggtaaccttggcgcaactcataaagatgttgtcatgtgtctcaaaggtcacgagttccaagtcatggaaacagtctcatgtgtaaaaaacaagat 23930209  T
Q  252 aagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    |    |||||||||||||||  | ||||||||||||  ||| || ||||||  |||||||||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  23930208 a--gttgcgtacaatacacc--agatggtgggaccc-cttcacggaccctgcttatgcgggagctttagtgcaccgagttgcccttt 23930127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 153 - 287
Target Start/End: Original strand, 24734586 - 24734729
Alignment:
Q  153 agaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgt---------aaaa 243  Q
    |||| |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||| |||| |||| |  |||||||||         ||||    
T  24734586 agagaggtaacattggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcaaaagttcaaatccttgaaacaacctcttgtgtaaaaaaaaaaaaa 24734685  T
Q  244 aacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccc 287  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  24734686 aacagggtaaggttgcgtacaatacaacaaaaaaggtgggaccc 24734729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 218 - 338
Target Start/End: Original strand, 26097178 - 26097293
Alignment:
Q  218 tcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagcta 317  Q
    ||||||||| || |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||  |||||  |||||||  |||||| ||||||  ||||||||||||     
T  26097178 tcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacacc--aaatgaagggaccc-cttcccggaccctgcatatgcgggagctc 26097272  T
Q  318 tagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  26097273 tagtgcaccgggttgcccttt 26097293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 153 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 33923010 - 33922937
Alignment:
Q  153 agaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaa 226  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  33923010 agaggggtaaccttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatttgactgaaaagtcacaggttcaagtcctagaaa 33922937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 176 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 2755583 - 2755475
Alignment:
Q  176 ggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaa 275  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||| || ||| |  ||||| |   ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  2755583 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcgtaggttcaagtcttgcaaacatcctcttataccaaaaataggctaaggctgcgtacaatacaccaaaa 2755484  T
Q  276 atggtggga 284  Q
    |||||||||    
T  2755483 atggtggga 2755475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 186 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 23240971 - 23240886
Alignment:
Q  186 ttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaa 273  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  23240971 ttgtcacgtgactgaaaggtcacaggtgcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagtttgcgtacaatataccaa 23240886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 185 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 18277343 - 18277243
Alignment:
Q  185 gttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtggga 284  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||||| || |||||||||||||| |||||||||  || |||||  |||||  |||||||||||    
T  18277343 gttgtcctgtgactaaaaggtcacgggttcaaatcttggaaacagcctcttgtgtaaaaatcagggtaaggttgagtacagaacacc--aaatggtggga 18277246  T
Q  285 ccc 287  Q
    |||    
T  18277245 ccc 18277243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 256 - 338
Target Start/End: Original strand, 12885967 - 12886048
Alignment:
Q  256 ctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||  |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  12885967 ctgcgtacaatacacaaaaaatggtgggaccc-cttcccagaccctgcgtatgtgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 12886048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 218 - 338
Target Start/End: Original strand, 25557743 - 25557858
Alignment:
Q  218 tcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagcta 317  Q
    ||||||||| || |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||  |||||  || ||||  |||||| ||||||  ||||||||||||     
T  25557743 tcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacacc--aaatgaaggaaccc-cttcccggaccctgcatatgcgggagctc 25557837  T
Q  318 tagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  25557838 tagtgcaccgggttgcccttt 25557858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 275 - 338
Target Start/End: Original strand, 6808468 - 6808530
Alignment:
Q  275 aatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    ||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  6808468 aatggtgggacccctt-cccggaccctgtgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 6808530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 287
Target Start/End: Original strand, 32068074 - 32068179
Alignment:
Q  178 taaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaat 277  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||    ||||||||||||||||||| |||  |||  ||||||||||| |||||    
T  32068074 taaagttgttgtcacgtgaccgaaaggtcacatgttcaagtcttggaaac---ctcttgtgtaaaaaacaggataatgctgtttacaatacacc-aaaat 32068169  T
Q  278 ggtgggaccc 287  Q
    ||||||||||    
T  32068170 ggtgggaccc 32068179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 195 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 3116263 - 3116129
Alignment:
Q  195 gactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttccc 294  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |  ||||||| ||||||         ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| |    
T  3116263 gactgaaaggtcatgggttcaagtcatggaaacaacctcttgtataaaaat--------gactgcgcacaatacaccaaaaatggtgggaccc-cttctc 3116173  T
Q  295 gaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    | ||| || ||||||||||||| |||| |||||| || ||||||    
T  3116172 ggaccttgcgtatgcgggagctttagtacaccggattgcccttt 3116129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 170 - 232
Target Start/End: Original strand, 8417442 - 8417504
Alignment:
Q  170 gcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtct 232  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| |||||| |||||    
T  8417442 gcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaatgtcacgagttcaggtcatggaaacagtct 8417504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 257 - 338
Target Start/End: Original strand, 12892064 - 12892144
Alignment:
Q  257 tgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||| || |||| |||| |  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  12892064 tgcgtataatacaccaataatggtgggacccctt-cccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 12892144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 4136669 - 4136567
Alignment:
Q  183 ttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgg 282  Q
    |||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||||  ||| |   |||||||||||| ||||||||||  |||||| | ||||| |||| ||||||    
T  4136669 ttgttgccacgtgactaaaatgtcacgggttcaagtcctaaaaacaacatcttgtgtaaaatacagggtaaggttgcgtagagtacactaaaattggtgg 4136570  T
Q  283 gac 285  Q
    |||    
T  4136569 gac 4136567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 244
Target Start/End: Original strand, 22967125 - 22967215
Alignment:
Q  154 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaa 244  Q
    |||||||||||||  |||| ||| |||| || |||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||| |   |||||||||||||    
T  22967125 gaggggtaaccttcgcgcatctgataaagttattgtcatgtgactgtaaggtcactagttcaagtcatggaaacaacttcttgtgtaaaaa 22967215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 23821268 - 23821178
Alignment:
Q  154 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaa 244  Q
    |||||||||||||  |||| ||| |||| || |||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||| |   |||||||||||||    
T  23821268 gaggggtaaccttcgcgcatctgataaagttattgtcatgtgactgtaaggtcactagttcaagtcatggaaacaacttcttgtgtaaaaa 23821178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 24751176 - 24751134
Alignment:
Q  233 cttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaa 275  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24751176 cttgtgtaaaaaatagggtaagactgcgtacaatacactaaaa 24751134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 172 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 27855601 - 27855500
Alignment:
Q  172 aactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaa-aaaacagggtaagactgcgtacaatacac 270  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||| ||| || ||| |||||| | ||| ||  || ||||||| |||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  27855601 aactggtaaagtttttgtcatgtgactgaaatgtcgcgagtttaagtcccgaaaacagcttcctgtgtaaaaaaatagggtaaggctgcgtataatacac 27855502  T
Q  271 ca 272  Q
    ||    
T  27855501 ca 27855500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 164 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 19649338 - 19649292
Alignment:
Q  164 cttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgg 210  Q
    |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19649338 cttggcgcaactgataaagttgttgtcatgtgactgaaagatcacgg 19649292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 204 - 244
Target Start/End: Original strand, 3564817 - 3564857
Alignment:
Q  204 gtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaa 244  Q
    |||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  3564817 gtcacgagttcaagttctgaaaatagtctcttgtgtaaaaa 3564857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 274 - 338
Target Start/End: Original strand, 13267797 - 13267860
Alignment:
Q  274 aaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    |||||||||||||| || || | |||||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  13267797 aaatggtgggacccctt-cctggaccctgcgtatgcgggagcttcagtgcaccgggttgcccttt 13267860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 239 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 14341166 - 14341134
Alignment:
Q  239 taaaaaacagggtaagactgcgtacaatacacc 271  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14341166 taaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc 14341134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 210 - 321
Target Start/End: Original strand, 32579436 - 32579543
Alignment:
Q  210 ggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgc 309  Q
    ||||||||||||||||| || |||| || | ||||| | |||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||  |||||  ||||||  |||||    
T  32579436 ggttcaagtcctggaaacagcctctggtat-aaaaatacggtaagcctgcgtacaatacccc--aaatggtgggaccc-cttcccagaccctgcatatgc 32579531  T
Q  310 gggagctatagt 321  Q
    ||||||| ||||    
T  32579532 gggagctttagt 32579543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 77)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 154 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 13628974 - 13628790
Alignment:
Q  154 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaa-ttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggta 252  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  13628974 gaggggtaaccttggcacaactggtaaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaagaaacagggta 13628875  T
Q  253 agactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  13628874 aggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccc-cttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 13628790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 152 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 13730787 - 13730602
Alignment:
Q  152 tagaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggt 251  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  13730787 tagaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggt 13730688  T
Q  252 aagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    ||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||| |  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  13730687 aaggctgtgtacaatacaccaataatggtgggaccc-cttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 13730602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 153 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 46421219 - 46421034
Alignment:
Q  153 agaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggta 252  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  46421219 agaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgacttaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggta 46421120  T
Q  253 agactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctat-agtgcaccgggttacccttt 338  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||| | |||||||||| || ||||||    
T  46421119 aggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccc-cttcccggaccctgcgtatgcgggagctttaagtgcaccggtttgcccttt 46421034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 154 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 40272993 - 40272812
Alignment:
Q  154 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 253  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  40272993 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcatgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 40272894  T
Q  254 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    | ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  40272893 ggctgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccc-cttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 40272812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 154 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 8247870 - 8247688
Alignment:
Q  154 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 253  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  8247870 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaa 8247771  T
Q  254 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctat-agtgcaccgggttaccct 336  Q
    |  ||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||| |||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||    
T  8247770 ggttgcgtacaatacaccaataatggtgggactc-cttcccggaccctgcgtatgcgggagctttaagtgcactgggttgccct 8247688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 155 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 29366902 - 29366720
Alignment:
Q  155 aggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaag 254  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||    
T  29366902 aggggtaaccttggcgtaactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtataaaaaacagggtaag 29366803  T
Q  255 actgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  29366802 gctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccc-cttcccggaccctgcgtatgtgggagctttagtgcactgggttgcccttt 29366720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 154 - 338
Target Start/End: Original strand, 1217066 - 1217245
Alignment:
Q  154 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 253  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||    
T  1217066 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgtagtcatgtcactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaa 1217163  T
Q  254 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    | ||||||||||||||||  |||||| |||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  1217164 ggctgcgtacaatacacc--aaatggcgggaccc-cttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 1217245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 158 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 22123092 - 22122918
Alignment:
Q  158 ggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagact 257  Q
    |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||    
T  22123092 ggtaaccttggcgccactggtaaatttgttgtcatgtgactgaaaggtcgcgggttcaagtcctggaaacagtctcttgtgt--aaaacagggtaaggct 22122995  T
Q  258 gcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttaccctt 337  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||| ||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  22122994 gcgtacaatacacc--aaatggtgggaccc-cttcccggaccctgcatatgcgagagctctagtgcaccgggttgccctt 22122918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 186 - 338
Target Start/End: Original strand, 516417 - 516569
Alignment:
Q  186 ttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacacc-aaaaatggtggga 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||| ||||    
T  516417 ttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgcacaataaaccaaaaaatggcggga 516516  T
Q  285 cccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    ||| || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  516517 ccccttccccg-accctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 516569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 154 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 4495845 - 4495713
Alignment:
Q  154 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 253  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||    
T  4495845 gaggggtaaccttcgcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctgaaaatagcctattgtgtaaaaaacagggtaa 4495746  T
Q  254 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccct 288  Q
    | ||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  4495745 ggctgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccct 4495713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 154 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 5173902 - 5173719
Alignment:
Q  154 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaa-ttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggta 252  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||  |||    
T  5173902 gaggggtaaccttggcgcaactcgtaaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgta-aaaacaaagta 5173804  T
Q  253 agactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    ||  ||| | ||||||||||||||||||||| |||  |||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  5173803 aggttgcatgcaatacaccaaaaatggtggggccc-cttcccggaccttgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 5173719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 154 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 7697066 - 7696948
Alignment:
Q  154 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 253  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  7697066 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagtctcttgtgt--aaaacagggtaa 7696969  T
Q  254 gactgcgtacaatacaccaaa 274  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  7696968 ggctgcgtacaatacaccaaa 7696948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 154 - 337
Target Start/End: Original strand, 22609743 - 22609921
Alignment:
Q  154 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 253  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  22609743 gaggggtaaccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactgtaaggtaacgggttcaagtcttggaaacagcctcttgtgt-aaaaacagggtaa 22609840  T
Q  254 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttaccctt 337  Q
    | ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||| ||| || |||||||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  22609841 ggctgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccc-cttcccggaccttgcgtatgcgggagcttcagtgcaccgggttgccctt 22609921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 154 - 339
Target Start/End: Original strand, 39203492 - 39203672
Alignment:
Q  154 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 253  Q
    |||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || |||||||||  ||||||||||||    
T  39203492 gaggggtaaccttggcacaacttgtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtccttgaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaa 39203589  T
Q  254 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttta 339  Q
    |  |||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||| ||| ||  |||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  39203590 ggttgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccc-cttcccggaccttgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttta 39203672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 153 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 12914217 - 12914035
Alignment:
Q  153 agaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggta 252  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  12914217 agaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtaatgtgaccgaaaggtcacaagttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggta 12914118  T
Q  253 agactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    || | ||||||||||||||  |||||||| |||||  |||||  ||||||  ||||||||||||  | ||||||||||| ||||||    
T  12914117 aggcggcgtacaatacacc--aaatggtgagaccc-cttcccagaccctgcatatgcgggagcttcaatgcaccgggttgcccttt 12914035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 169 - 338
Target Start/End: Original strand, 26869698 - 26869863
Alignment:
Q  169 cgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatac 268  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  26869698 cgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagcctctggtgt-aaaaacagggtaaggctgcgtacaatac 26869796  T
Q  269 accaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    |||  ||||||||||||||  || ||| ||| || ||||||||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  26869797 acc--aaatggtgggaccc-cttgccggaccatgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgcccttt 26869863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 154 - 287
Target Start/End: Original strand, 9607179 - 9607312
Alignment:
Q  154 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 253  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||    
T  9607179 gaggggtaaccttggcgcaacttgtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatcggttcaagtcctggaaacagcctcttgcgtaaaaaacagggtaa 9607278  T
Q  254 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccc 287  Q
    | ||||||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  9607279 ggctgcgtagaatacaccaataatgttgggaccc 9607312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 177 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 34420802 - 34420656
Alignment:
Q  177 gtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaa 276  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  34420802 gtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtaccatacacc-aaaa 34420704  T
Q  277 tggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcac 325  Q
    |||||||||||  |||||| ||| || ||||| ||||||| ||||||||    
T  34420703 tggtgggaccc-cttcccggaccttgcgtatgtgggagctttagtgcac 34420656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 154 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 6412002 - 6411833
Alignment:
Q  154 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| || ||| || |||||||||| ||||||||||||    
T  6412002 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtaactgataggtcatgggttcaagtcttgtaaacagcctcttgtgta-aaaacagggtaa 6411904  T
Q  254 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccg 327  Q
    | ||||||||||||||||  ||||| ||||||||  |||||  ||| || ||||||||||||| ||||||||||    
T  6411903 ggctgcgtacaatacacc--aaatgatgggaccc-cttcccagaccttgcgtatgcgggagctttagtgcaccg 6411833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 152 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 10870134 - 10870025
Alignment:
Q  152 tagaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggt 251  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||    
T  10870134 tagaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta-aaaacagggt 10870036  T
Q  252 aagactgcgta 262  Q
    ||| |||||||    
T  10870035 aaggctgcgta 10870025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 154 - 338
Target Start/End: Original strand, 16735417 - 16735597
Alignment:
Q  154 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 253  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| || |||||||   |||||||||||||    
T  16735417 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgt-agaaaaacagggtaa 16735515  T
Q  254 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    | ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||| || ||| |||||||| ||||  ||||||| ||||| ||||||    
T  16735516 ggctgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccc-cttcccggacactgcgtatgcggtagcttcagtgcactgggttgcccttt 16735597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 154 - 326
Target Start/End: Original strand, 26573104 - 26573272
Alignment:
Q  154 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 253  Q
    |||||| | ||||| |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  26573104 gagggggacccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcctgtgtaaaaaacagggtaa 26573202  T
Q  254 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcacc 326  Q
    | ||||||||||||||||  || |||||||||||   ||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  26573203 ggctgcgtacaatacacc--aattggtgggaccc-catcccggaccctgcgtatgcgtgagctttagtgcacc 26573272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 154 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 52926391 - 52926219
Alignment:
Q  154 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 253  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||         ||||    
T  52926391 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta---------gtaa 52926301  T
Q  254 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    | ||||||||||||||||  |||||||||||| |  |||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  52926300 ggctgcgtacaatacacc--aaatggtgggacac-cttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagcgcaccgggttgcccttt 52926219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 206 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 10795554 - 10795422
Alignment:
Q  206 cacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgt 305  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | |||||| ||    
T  10795554 cacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaagacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccc-cttcctggaccctgcgt 10795456  T
Q  306 atgcgggagctatagtgcaccgggttacccttta 339  Q
    |||||||||||  |||||||| |||| |||||||    
T  10795455 atgcgggagcttcagtgcaccaggttgcccttta 10795422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 210 - 338
Target Start/End: Original strand, 14986989 - 14987116
Alignment:
Q  210 ggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgc 309  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||| ||  |||||    
T  14986989 ggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccc-attcccggaccttgcatatgc 14987087  T
Q  310 gggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  14987088 gggagctttagtgcaccgggtttcccttt 14987116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 176 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 53996725 - 53996560
Alignment:
Q  176 ggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaa 275  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||    
T  53996725 ggtaaatttgttgtcatttgactgaaaggtcacgtgttcaagtcgtggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcttacaatacacc-aaa 53996627  T
Q  276 atggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttaccctttatatg 343  Q
    ||||||||||||  |||||  || ||| ||||| ||||||| |||||||||||| | |||||| ||||    
T  53996626 atggtgggaccc-cttccctgacactgcgtatgtgggagctttagtgcaccgggctgccctttttatg 53996560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 183 - 331
Target Start/End: Original strand, 7942995 - 7943140
Alignment:
Q  183 ttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgg 282  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  7942995 ttgttgtcatgtgactggaaggtcacggattcaagtcctggaaacagcatcttgtctaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacatc--aaatggtgg 7943092  T
Q  283 gacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggtt 331  Q
    || || ||||| | ||| || ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  7943093 gatccctttccag-accatgcgtatgcgggagctttagtgcactgggtt 7943140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 176 - 329
Target Start/End: Original strand, 19731000 - 19731150
Alignment:
Q  176 ggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaa 275  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||   |    
T  19731000 ggtaaatttgttgtcacgtgattgaaaggtcacggatgcaagtcctggaaatagcctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggttgcgtacaatacacc--ta 19731097  T
Q  276 atggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccggg 329  Q
     ||||||||||| ||||||  || |||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  19731098 ttggtgggaccc-tttcccagactctgtgtatgcaggagctttagtgcaccggg 19731150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 231 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 45786320 - 45786212
Alignment:
Q  231 ctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggt 330  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| | |||| |||||| |||||||||||||    
T  45786320 ctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccc-cttcccggaccctgcgaatgctggagctttagtgcaccgggt 45786222  T
Q  331 taccctttat 340  Q
    | ||||||||    
T  45786221 tgccctttat 45786212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 154 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 45621009 - 45620890
Alignment:
Q  154 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaa-aaaacagggta 252  Q
    |||||| | ||||| |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  45621009 gagggggagccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagttctggaaacagcctcttgtgtaaaaaaacagggta 45620911  T
Q  253 agactgcgtacaatacaccaa 273  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  45620910 aggctgcgtacaatacaccaa 45620890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 154 - 285
Target Start/End: Original strand, 12525386 - 12525512
Alignment:
Q  154 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 253  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  12525386 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaa---gttgtcatatgactgaaaggtcacaggttcgagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaatcagggtaa 12525482  T
Q  254 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggac 285  Q
    | |||||   | ||||||||||||||||||||    
T  12525483 ggctgcg--aagtacaccaaaaatggtgggac 12525512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 189 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 45139624 - 45139526
Alignment:
Q  189 tcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccc 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |  ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  45139624 tcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagttttggaaacaacctcttgtgtaaaacacagggtaaggctgcatacaatacaccaaaaatggtgggaccc 45139526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 189 - 287
Target Start/End: Original strand, 33926094 - 33926190
Alignment:
Q  189 tcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccc 287  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||||||    
T  33926094 tcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaatagcctcttgtgt-aaaaacagggtaaggctgtgtacaatacacc-ataatggtgggaccc 33926190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 177 - 326
Target Start/End: Original strand, 25944468 - 25944615
Alignment:
Q  177 gtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaa 276  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||| ||| ||| ||| |||||||||||| ||||    
T  25944468 gtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaaccgcctctcgtgtaaaaaactgggcaaggctgagtacaatacacc-aaaa 25944566  T
Q  277 tggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcacc 326  Q
    |||||||||||  |||||  |||||| ||||| ||||||| ||| |||||    
T  25944567 tggtgggaccc-cttccctgaccctgcgtatgtgggagctttagcgcacc 25944615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 207 - 338
Target Start/End: Original strand, 31592878 - 31593004
Alignment:
Q  207 acgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgta 306  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| |  |||||| ||||||  ||    
T  31592878 acgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc--aaatggtgggactc-cttcccggaccctgcata 31592972  T
Q  307 tgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  31592973 tgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 31593004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 221 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 49013589 - 49013473
Alignment:
Q  221 tggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatag 320  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||| |  || ||||||||| |||    
T  49013589 tggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccc-cttcccggaccccgcatacgcgggagctttag 49013491  T
Q  321 tgcaccgggttacccttt 338  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  49013490 tgcaccgggttgcccttt 49013473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 193 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 54374488 - 54374357
Alignment:
Q  193 gtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttc 292  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||| |  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||    
T  54374488 gtgactgaaaggtcacaggttcaagtcttggaaacaacctcttgtgtaaaaaatagggtaaggctgcgtacaatccacc-aaaatggtgggaccc-cttc 54374391  T
Q  293 ccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcacc 326  Q
    ||| ||||||  |||||||||||| |||| ||||    
T  54374390 ccggaccctgcatatgcgggagctttagttcacc 54374357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 189 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 54032705 - 54032608
Alignment:
Q  189 tcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccct 288  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||   ||||||||||||||    
T  54032705 tcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc--gaatggtgggaccct 54032608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 218 - 344
Target Start/End: Original strand, 54484730 - 54484854
Alignment:
Q  218 tcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaa-cagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagct 316  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| || |||| |||||| |||||||||||||    
T  54484730 tcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaaa--tggtgggacccctt-cccggaccctgcgtatgcgggagct 54484826  T
Q  317 atagtgcaccgggttaccctttatatgt 344  Q
     |||||||||||||| |||||| |||||    
T  54484827 ttagtgcaccgggttgccctttttatgt 54484854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 186 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 30928296 - 30928209
Alignment:
Q  186 ttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaa 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||  || ||| ||||||||||    
T  30928296 ttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggttgtgtaaaatacaccaa 30928209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 183 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 45948993 - 45948848
Alignment:
Q  183 ttgttgtcatgtgactgaa---aggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatgg 279  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||  || |||    
T  45948993 ttgttttcatgtgactgaaggaaggtcacgggttcaattcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaatagggtaaggctgcatacaatacacc--aattgg 45948896  T
Q  280 tgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgg 328  Q
    ||||||||  ||| || |||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  45948895 tgggaccc-cttctcggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgg 45948848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 191 - 269
Target Start/End: Original strand, 39212003 - 39212081
Alignment:
Q  191 atgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaataca 269  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  39212003 atgtgactgaaatgtcacgggttcaagtcctggaaataacctcttgtgtaaataacaaggtaagactgcgtacaataca 39212081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 157 - 274
Target Start/End: Original strand, 26782345 - 26782462
Alignment:
Q  157 gggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagac 256  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| || ||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||||||||||| |||||||  |    
T  26782345 gggtaaccttgacgcaattggtaaagttattgtcatgcgattgaaaggtcacggattcaagtccttgaaacaatctcttgtgtaaaaaatagggtaatgc 26782444  T
Q  257 tgcgtacaatacaccaaa 274  Q
    ||  || |||||||||||    
T  26782445 tgtataaaatacaccaaa 26782462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 236 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 353450 - 353351
Alignment:
Q  236 gtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttaccc 335  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||| |  |||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  353450 gtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccc-cttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccc 353352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 155 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 25517353 - 25517170
Alignment:
Q  155 aggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagt--cctggaaatagtctcttgtgtaaaaaa-cagggt 251  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || | | |   |||||||| |  ||||||||||||||| || | |    
T  25517353 agggataaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacaggatgatgggacctggaaacatcctcttgtgtaaaaaaacaagat 25517254  T
Q  252 aagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    | | |||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||| | |||| |||||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  25517253 atggctgcgtacaatacac--aaaatggtgggacccctt-cccggatcctgcgtatgctggagctttagtgcaccgggttgcccttt 25517170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 176 - 329
Target Start/End: Original strand, 19751576 - 19751726
Alignment:
Q  176 ggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaa 275  Q
    |||||| || |||||| |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||   |    
T  19751576 ggtaaattttttgtcacgtgattgaaaggtcacggatgcaagtcctggaaatagcctcttgtgtaaaaatcaaggtaaggttgcgtacaatacacc--ta 19751673  T
Q  276 atggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccggg 329  Q
     ||||||||||| ||||||  ||  |||||||||  ||||| ||||||||||||    
T  19751674 ttggtgggaccc-tttcccagactttgtgtatgcatgagctttagtgcaccggg 19751726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 161 - 287
Target Start/End: Original strand, 33235513 - 33235639
Alignment:
Q  161 aaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgac-tgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaa-aacagggtaagactg 258  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  |||||| || || ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33235513 aaccttgatgcagctggtaaagttgttgtcatgtgacatgaaaggtcacaagttcaaatcgtgtaaagagcctcttgtgtaaaaaaacagggtaagactg 33235612  T
Q  259 cgtacaatacaccaaaaatggtgggaccc 287  Q
     |||||||||||   ||||||||||||||    
T  33235613 tgtacaatacac--taaatggtgggaccc 33235639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 176 - 252
Target Start/End: Original strand, 53062036 - 53062112
Alignment:
Q  176 ggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggta 252  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||    
T  53062036 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgtgttcaagtcctggaaacagcctcctgtgtcaaaaacagggta 53062112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 210 - 287
Target Start/End: Original strand, 55401208 - 55401284
Alignment:
Q  210 ggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccc 287  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  55401208 ggttcaagtcctgtaaacagcctcttgtgtaaaaaacaggttaagactgcgtataatacacc-aaaatggtgggaccc 55401284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 157 - 270
Target Start/End: Original strand, 21874999 - 21875106
Alignment:
Q  157 gggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtg-taaaaaacagggtaaga 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||       |||||||||| | ||||||| |  |||||||| ||||||| ||||||||     
T  21874999 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactg-------acgggttcaaattctggaaacaacctcttgtgttaaaaaagagggtaagg 21875091  T
Q  256 ctgcgtacaatacac 270  Q
    |||||||||||||||    
T  21875092 ctgcgtacaatacac 21875106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 163 - 250
Target Start/End: Original strand, 35417902 - 35417988
Alignment:
Q  163 ccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacaggg 250  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  35417902 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttatcatgtgactgagaggtcacgagttcaaatcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacaggg 35417988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 176 - 339
Target Start/End: Original strand, 28904941 - 28905101
Alignment:
Q  176 ggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaa-aacagggtaagactgcgtacaatacaccaaa 274  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| |||||  ||| |||||| || || |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  28904941 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaagtcacatgtttaagtccagggaacagtctcttgtgtaaaataacaaggtaagactgtgtacattacaccaaa 28905040  T
Q  275 aatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttta 339  Q
     |   |||||||| ||||||| |||||| ||| |||||| || ||||| | |||| | |||||||    
T  28905041 ta---tgggaccc-tttcccggaccctgcgtaagcgggaactttagtgtaacgggctgcccttta 28905101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 242 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 34771457 - 34771359
Alignment:
Q  242 aaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttaccctttata 341  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||| | |||||| ||    
T  34771457 aaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccc-cttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggctgcccttttta 34771361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 197 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 52428616 - 52428538
Alignment:
Q  197 ctgaaaggtcacgggttcaagtc-ctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaa 274  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||  || ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  52428616 ctgaaaggtcacgggtttaagtctctggaagcagcctcttgtgtaaaatacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaa 52428538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 167 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 11461809 - 11461656
Alignment:
Q  167 gacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaa---aaaacagggtaagactgcgtac 263  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||| || |||| |||| ||||||||||||| ||||||||   |||||| || |||| ||| |||    
T  11461809 gacgcaactggtaaagttgttgtcatatgacaggaaggttacaggtttaagttctggaaatagtcttttgtgtaaaaaaaaacaaggaaagattgcatac 11461710  T
Q  264 aatacacca--aaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagct 316  Q
    ||||||| |  |||||||| ||| |||||||||| || ||| ||||| |||||||    
T  11461709 aatacactagtaaaatggt-ggaaccttttcccggactctgcgtatgtgggagct 11461656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 242 - 338
Target Start/End: Original strand, 15797284 - 15797377
Alignment:
Q  242 aaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||| ||||||  |||| ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  15797284 aaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccc-cttcccggaccctgcatatgtgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 15797377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 176 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 44403715 - 44403564
Alignment:
Q  176 ggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaa 275  Q
    |||||| || |||||| ||| || ||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||| | ||||| |  |||    
T  44403715 ggtaaagttattgtcacgtggctaaaaggtcacaggttaaagtcctgggaatagcctcttgtgtaaaagacaaggtaaggctgcggagaatac-cacaaa 44403617  T
Q  276 atggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccggg 329  Q
    ||||||||||||  |||||| |||||  |||||| | |||| ||||||||||||    
T  44403616 atggtgggaccc-cttcccggaccctacgtatgctgaagctttagtgcaccggg 44403564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 231 - 313
Target Start/End: Original strand, 9276317 - 9276395
Alignment:
Q  231 ctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcggga 313  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  9276317 ctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc--aaatggt-ggaccc-tttcccggaccctgcgtatgcggga 9276395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 184 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 8411016 - 8410929
Alignment:
Q  184 tgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaa 273  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||  | |||  ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  8411016 tgttgtcatgggactgaaaggtcaccggttcaggtcctggaaactgcctc--gtgtaaaaaacagggtaaggctgctcacaatacaccaa 8410929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 178 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 1121382 - 1121285
Alignment:
Q  178 taaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaa 275  Q
    |||| ||||||||  ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| |   |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  1121382 taaatttgttgtccggtggctgaaaggtcacgtgtttaagtcctggaaacaacttcttgtgtaagaaataaggtgagactgcgtacaatacaccaaaa 1121285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 176 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 829601 - 829452
Alignment:
Q  176 ggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaa 275  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||||  | || |||||||| || |||| |  ||||||| |||| ||||  ||||   |||||||||||||||||||    
T  829601 ggtaaagttgttgtcacgtgattgaaagacc-cgagttcaagttctagaaacaacctcttgtctaaagaacatagtaaagttgcgtacaatacaccaaaa 829503  T
Q  276 atggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgg 328  Q
     ||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  829502 -tggtgggacccctt-cccgaaccctgcgtatgcaggagctttagtgcaccgg 829452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 217 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 31904975 - 31904907
Alignment:
Q  217 gtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccc 287  Q
    |||||||||| || || || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  31904975 gtcctggaaacagcctattatgtaaaaaacagggtatgactgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccc 31904907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 176 - 274
Target Start/End: Original strand, 29106547 - 29106645
Alignment:
Q  176 ggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaa 274  Q
    ||||||| |||||||||||| || |||| |||||||| |||||| || ||| |  ||||||||||||||| ||| ||||  | ||||||||||||||||    
T  29106547 ggtaaaaatgttgtcatgtggctcaaagatcacgggtacaagtcttgaaaacaacctcttgtgtaaaaaataggataaggttacgtacaatacaccaaa 29106645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 307
Target Start/End: Original strand, 47624095 - 47624167
Alignment:
Q  231 ctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtat 307  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  47624095 ctcttgtgtaaaa-acagggtaaggctgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccc-cttcccggaccctgtgtat 47624167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 211 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 43114994 - 43114882
Alignment:
Q  211 gttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaa-cagggtaaga-ctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatg 308  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||  |||||||||||||  |  || ||||| |||||    
T  43114994 gttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaaacagggtaagggctacctacaatacaccaaa--tggtgggacccttc-ctggacccctgcgtatg 43114898  T
Q  309 cgggagctatagtgca 324  Q
    |||||||| |||||||    
T  43114897 cgggagctttagtgca 43114882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 286 - 338
Target Start/End: Original strand, 47624204 - 47624256
Alignment:
Q  286 ccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  47624204 ccttttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 47624256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 226 - 331
Target Start/End: Original strand, 26292380 - 26292480
Alignment:
Q  226 atagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcac 325  Q
    |||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||  || ||||| || || |||||||||||  ||||||||| || ||||||||    
T  26292380 atagcctcttgtgtaaaa--cagggtaagaccgcgtacgatacaccaaa--tgatgggatccctt-cccgaaccctgcatatgcgggaactctagtgcac 26292474  T
Q  326 cgggtt 331  Q
    ||||||    
T  26292475 cgggtt 26292480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 293 - 338
Target Start/End: Original strand, 40390353 - 40390398
Alignment:
Q  293 ccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  40390353 ccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 40390398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 277 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 14266431 - 14266372
Alignment:
Q  277 tggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    |||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  14266431 tggtgggaccctt--cctgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcactgggttgcccttt 14266372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 217 - 294
Target Start/End: Original strand, 31672732 - 31672807
Alignment:
Q  217 gtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttccc 294  Q
    |||||||||| || || || ||||||||||| || |||| |||||||||||||||  |||||||||||| || |||||    
T  31672732 gtcctggaaacagcctattatgtaaaaaacaaggcaagagtgcgtacaatacacc--aaatggtgggactctcttccc 31672807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 151 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 43956643 - 43956550
Alignment:
Q  151 ttagaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaa 245  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| |||||| ||||||| |  ||||||||| |||  ||||||| || ||||||| || ||| |||||||||||    
T  43956643 ttagagggggaaccttggcgcaac-ggtaaagttgttgttacttgactgaaaagtccggggttcatgttctggaaacagcctcatgtgtaaaaaa 43956550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 10484657 - 10484616
Alignment:
Q  297 accctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  10484657 accctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 10484616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 277 - 338
Target Start/End: Original strand, 30452892 - 30452952
Alignment:
Q  277 tggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    ||||||||||| || |||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  30452892 tggtgggacccctt-cccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 30452952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 33075987 - 33075931
Alignment:
Q  165 ttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctg 222  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||| |||||    
T  33075987 ttgacgcaac-ggtaaaattgttgtcatgtgattgagaggtcacatgttcaaatcctg 33075931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 198
Target Start/End: Original strand, 39430464 - 39430509
Alignment:
Q  153 agaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgact 198  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  39430464 agaggggtaactttgacgcaactggtaaagttgctgtcatctgact 39430509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 232 - 288
Target Start/End: Original strand, 16130329 - 16130384
Alignment:
Q  232 tcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccct 288  Q
    |||| |||||||| |||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  16130329 tcttctgtaaaaagcaggataaggctgcgaacaatacacc-aaaatggtgggaccct 16130384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 274 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 24851364 - 24851301
Alignment:
Q  274 aaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    |||||||||||||| || |||| | ||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  24851364 aaatggtgggacccctt-cccggatcctgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 24851301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 121; Significance: 9e-62; HSPs: 60)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 154 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 39461177 - 39460994
Alignment:
Q  154 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 253  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  39461177 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgagactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagagtaa 39461078  T
Q  254 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  39461077 ggctgcgtacaatacaccaataatggtgagaccc-cttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 39460994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 151 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 12670432 - 12670250
Alignment:
Q  151 ttagaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacaggg 250  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  |||||||||    
T  12670432 ttagaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacaggg 12670335  T
Q  251 taagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12670334 taaggctgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccc-cttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttacccttt 12670250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 152 - 338
Target Start/End: Original strand, 35261631 - 35261814
Alignment:
Q  152 tagaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggt 251  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35261631 tagaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagccctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacagggt 35261730  T
Q  252 aagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    |||  |||||||||||||||  ||||||||||||||  |||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  35261731 aaggttgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccc-cttcctggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 35261814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 153 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 7136711 - 7136527
Alignment:
Q  153 agaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggta 252  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||    
T  7136711 agaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcatgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaccagggta 7136612  T
Q  253 agactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7136611 aggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccc-cttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttacccttt 7136527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 154 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 28817807 - 28817626
Alignment:
Q  154 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 253  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  28817807 gaggggtaaccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaa 28817708  T
Q  254 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    | ||||||||||||||||   |||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  28817707 ggctgcgtacaatacacc--caatggtgggaccc-cttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcccttt 28817626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 154 - 338
Target Start/End: Original strand, 36720750 - 36720931
Alignment:
Q  154 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 253  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  36720750 gaggggtaaccttggcgtaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaa 36720849  T
Q  254 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    | ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||    
T  36720850 ggctgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccc-cttcccggaccctgcgtatgcggaagctttagtgcacccggttgcccttt 36720931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 151 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 20284257 - 20284076
Alignment:
Q  151 ttagaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgt--aaaaaacag 248  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |  |||||| ||    
T  20284257 ttagagcggtaaccttgacgcaacgggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtataaaaaaaaaag 20284158  T
Q  249 ggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggtt 331  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  20284157 ggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccc-cttcccggaccctgcgtatgcgggagttttagtgcaccgggtt 20284076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 151 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 21070886 - 21070704
Alignment:
Q  151 ttagaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgt---aaaaaaca 247  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |   |||||| |    
T  21070886 ttagagcggtaaccttgacgcaacgggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtataaaaaaaaaaa 21070787  T
Q  248 gggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggtt 331  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  21070786 gggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccc-cttcccggaccctgcgtatgcgggagttttagtgcaccgggtt 21070704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 154 - 339
Target Start/End: Original strand, 17823530 - 17823712
Alignment:
Q  154 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 253  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| |||    
T  17823530 gaggggtaatcttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgaccgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaccaggataa 17823629  T
Q  254 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttta 339  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||  |||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||||| |||||||    
T  17823630 gactgcgtaaaatacacc--aaatggtggaaccc-cttcccgaaccctgcatatgcaggagctttagtgcaccgggttgcccttta 17823712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 154 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 30454276 - 30454097
Alignment:
Q  154 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 253  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  |||||| |||||    
T  30454276 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacaaggtaa 30454179  T
Q  254 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    | |||||||| |||||||  ||||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  30454178 ggctgcgtacgatacacc--aaatggtgggaccc-cttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 30454097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 152 - 331
Target Start/End: Original strand, 44530101 - 44530277
Alignment:
Q  152 tagaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggt 251  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  44530101 tagaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgctgtcatgtgactagaaggtcacgggttcaagtcttggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggt 44530200  T
Q  252 aagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggtt 331  Q
    ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44530201 aaggctgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccc-cttcctggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggtt 44530277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 154 - 339
Target Start/End: Original strand, 13160656 - 13160837
Alignment:
Q  154 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 253  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  13160656 gaggggtaacctcggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagcctcttgtgt-aaaaacagggtaa 13160754  T
Q  254 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttta 339  Q
    | ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||    
T  13160755 ggctgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccc-cttcccggaccctgcgtatgcgggagcttcagtgcgccgggttgcccttta 13160837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 151 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 29521869 - 29521692
Alignment:
Q  151 ttagaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacaggg 250  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  29521869 ttagaggggtaaccttggcgcaactgataaagttgttgtcgtgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtttaaaaaacaggg 29521770  T
Q  251 taagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggtt 331  Q
    |||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||   ||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29521769 taaggctgcgtacaatacacc--aaatggtgggaacc-catcccagaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggtt 29521692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 154 - 338
Target Start/End: Original strand, 6760777 - 6760959
Alignment:
Q  154 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 253  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  6760777 gaggggtaac-ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatatgactagaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaa 6760875  T
Q  254 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    | || ||||||||||||||| |||||||||||||  ||| || |||| |  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  6760876 ggcttcgtacaatacaccaataatggtgggaccc-cttctcggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 6760959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 158 - 338
Target Start/End: Original strand, 25250480 - 25250659
Alignment:
Q  158 ggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagact 257  Q
    |||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| || || |||||||||||| |||||| | ||    
T  25250480 ggtaaccttggcacaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacatgttcaagtcctggaaacagcctattgtgtaaaaaatagggtatggct 25250579  T
Q  258 gcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |  |||||||||| | |||||||||||||| ||||||    
T  25250580 gcgtacaatacaccaataatggtgggaccc-cttcccgaaccccgcatatgcgggagatttagtgcaccgggttgcccttt 25250659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 152 - 337
Target Start/End: Original strand, 45071217 - 45071398
Alignment:
Q  152 tagaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggt 251  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||||    
T  45071217 tagaggggtaaccttggcgatactggtaaagttgttgtcatgtgattgtaaggtcacgggttcaagttctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacagggt 45071315  T
Q  252 aagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttaccctt 337  Q
    ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||| ||| || |||||||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  45071316 aaggctgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccc-cttcccggaccttgcgtatgcgggagcttcagtgcaccgggttgccctt 45071398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 154 - 326
Target Start/End: Original strand, 2626473 - 2626645
Alignment:
Q  154 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgt---aaaaaacaggg 250  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||   |||||||||||    
T  2626473 gaggggtaaccttggcgcaattggtaaagttgttgtcatgtgaccgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaaaaacaggg 2626572  T
Q  251 taagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcacc 326  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||  |||||  ||||||  ||||||||||||  ||||||||    
T  2626573 taagactgcgtacaatacacc--aaatgatgggaccc-cttcccagaccctgcatatgcgggagcttcagtgcacc 2626645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 154 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 18164940 - 18164767
Alignment:
Q  154 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 253  Q
    ||||||||| |||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||    
T  18164940 gaggggtaatcttggcgcaaccggtgaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta-aaaacagggtaa 18164842  T
Q  254 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggtt 331  Q
    |  |||||||||||||||  ||| | || || || ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18164841 ggttgcgtacaatacacc--aaaggatgtga-ccatttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggtt 18164767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 154 - 338
Target Start/End: Original strand, 12625843 - 12626025
Alignment:
Q  154 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgt-aaaaaacagggta 252  Q
    ||||| |||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||   |||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||||    
T  12625843 gagggataacgttcacgcaactggtaaagttgttgtcgtgtgacttgtaggtcacgggctcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaaacagggta 12625942  T
Q  253 agactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||   ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  12625943 agactgcatacaatacacc--aaatggtgggaccc-cctcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 12626025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 153 - 338
Target Start/End: Original strand, 26954085 - 26954270
Alignment:
Q  153 agaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgt-aaaaaacagggt 251  Q
    ||||||||||| ||| || || ||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||    
T  26954085 agaggggtaactttggcgtaattggtaaagttgttgtcatgtgattagaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaaacagggt 26954184  T
Q  252 aagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||  |||  |  |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  26954185 aaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccc-cttcccagacctcgcatatgcgggagctttagtgcactgggttgcccttt 26954270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 154 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 20869677 - 20869560
Alignment:
Q  154 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 253  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||    
T  20869677 gagggataaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaa 20869580  T
Q  254 gactgcgtacaatacaccaa 273  Q
    | ||| ||||||||||||||    
T  20869579 ggctgtgtacaatacaccaa 20869560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 163 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 44781677 - 44781517
Alignment:
Q  163 ccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgta 262  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  44781677 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaagttcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaagacagggtaaggctgtgta 44781579  T
Q  263 caatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcac 325  Q
    |||||||||||||||| ||||||||   ||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  44781578 caatacaccaaaaatgttgggaccc-cgtcccagaccctgcgtatgcgggagctttagtgcac 44781517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 163 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 42083870 - 42083712
Alignment:
Q  163 ccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgta 262  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||  ||| ||| |||||||    
T  42083870 ccttggcgcaac-ggtaaaattgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagccttttgtgtaaaaaatggggcaaggctgcgta 42083772  T
Q  263 caatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgca 324  Q
    || || ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| |||||||    
T  42083771 cagtatacc-aaaatggtgggaccc-cttcccgaaccctgtgtacgtgggagctttagtgca 42083712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 155 - 287
Target Start/End: Original strand, 11748254 - 11748386
Alignment:
Q  155 aggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaag 254  Q
    ||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||| |||||||||    
T  11748254 aggggtaactttggtgcaactggtgaaattgttgtcatgtgactgaaatgtcacgggttcaagtcttggaaacagcctcttttgtaaaaagcagggtaag 11748353  T
Q  255 actgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccc 287  Q
    || |||||||||| || ||||||||| ||||||    
T  11748354 acagcgtacaatatacaaaaaatggtaggaccc 11748386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 153 - 316
Target Start/End: Original strand, 24245404 - 24245562
Alignment:
Q  153 agaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggta 252  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||    |||||||||    
T  24245404 agaggggtaaccttggggcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaa-cgtctcttatgt----aacagggta 24245498  T
Q  253 agactgcgtacaatacacc-aaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagct 316  Q
    ||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||  |||| | |||||| |||||||||||||    
T  24245499 agactacgtacaatgcaccaaaaaattgtgggaccc-cttcctggaccctgcgtatgcgggagct 24245562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 171 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 8897928 - 8897764
Alignment:
Q  171 caactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacac 270  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| |  | ||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  8897928 caactggtaaagttgttgtcatgtgacagcaaggtcacgggttgaagtcctggaaacaaccgcttgtgtaaaaaatagggtaaggctacgtacaatacac 8897829  T
Q  271 caaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    |  ||||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| || |||||| |||| ||||||    
T  8897828 c--aaatggtgggaccc-cttcccggaccctgcatatgcgggagctttactgcacccggttgcccttt 8897764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 218 - 338
Target Start/End: Original strand, 20869941 - 20870060
Alignment:
Q  218 tcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagcta 317  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| | |||| |  ||||||||||||     
T  20869941 tcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccc-cttccaggaccccgcatatgcgggagctt 20870039  T
Q  318 tagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  20870040 tagtgcaccgggttgcccttt 20870060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 183 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 14018121 - 14018034
Alignment:
Q  183 ttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacac 270  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14018121 ttgttgtcacgtgattgaaaggtcatgggttcaagtcttggaaacagtctcttgtgtaaaaaacagggtgagactgcgtacaatacac 14018034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 163 - 254
Target Start/End: Original strand, 28407379 - 28407469
Alignment:
Q  163 ccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaag 254  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  28407379 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacagggtaag 28407469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 211 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 17251001 - 17250888
Alignment:
Q  211 gttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcg 310  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||      
T  17251001 gttcaagtcctggaagcagcctcttgtgtaaaaaacaggttaaggcagcgtacaatacaccaataatggtgggaccc-tttcccgaaccctgcgtatgaa 17250903  T
Q  311 ggagctatagtgcac 325  Q
    |||||| ||||||||    
T  17250902 ggagctttagtgcac 17250888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 177 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 24365218 - 24365081
Alignment:
Q  177 gtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaa-cagggtaagactgcgtacaatacaccaaaa 275  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||    
T  24365218 gtaaagttgttgtcatgtgactaaaatgtcacgggttcaagccctagaaacagcctcttgtgtaaaaaatcagggtaaggctgcgaacaatacacc--aa 24365121  T
Q  276 atggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagct 316  Q
    ||||||||||||  |||||| |||||| ||||| |||||||    
T  24365120 atggtgggaccc-cttcccggaccctgcgtatgtgggagct 24365081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 183 - 338
Target Start/End: Original strand, 31457156 - 31457307
Alignment:
Q  183 ttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgg 282  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||| ||||| |||  ||| |||||||||||||| |  ||||||| |    
T  31457156 ttgttgtcatgtggctgaaaggtcacgggttcaagtcctgtaaacaacctcttgtgt-aaaaataggaaaaggctgcgtacaatacatc--aaatggtag 31457252  T
Q  283 gacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    |||||  ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  31457253 gaccc-cttcccaaaccctgcgtatgcgggagctctagtgcaccggattgcccttt 31457307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 176 - 326
Target Start/End: Original strand, 22598133 - 22598279
Alignment:
Q  176 ggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaa 275  Q
    |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||  ||    
T  22598133 ggtaaagttgttgtcacatgactgaaaggtcacgggttcaaatcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctatgtacaatacacc--aa 22598230  T
Q  276 atggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcacc 326  Q
     ||||| ||||| ||||||| ||| || |||||||||| || |||||||||    
T  22598231 ttggtgagaccc-tttcccggaccttgcgtatgcggga-ctttagtgcacc 22598279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 206 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 5135418 - 5135290
Alignment:
Q  206 cacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgt 305  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||  |||||| |||||| ||    
T  5135418 cacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaagagggtaaggctgtgtacaatacacc--aaatggtgggaccc-cttcccggaccctgcgt 5135322  T
Q  306 atgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    |||| |||||| | |||||||||| | ||||||    
T  5135321 atgcaggagct-ttgtgcaccgggctgcccttt 5135290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 231 - 340
Target Start/End: Original strand, 16225050 - 16225158
Alignment:
Q  231 ctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggt 330  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  |||||| |||| |  |||||||||||| |||||||||||||    
T  16225050 ctcttatgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaataatggtgggatcc-cttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggt 16225148  T
Q  331 taccctttat 340  Q
    |  |||||||    
T  16225149 tgtcctttat 16225158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 209 - 328
Target Start/End: Original strand, 5689640 - 5689756
Alignment:
Q  209 gggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatg 308  Q
    ||||||||||| || |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||  |||||||||| || |||||    
T  5689640 gggttcaagtcttgtaaatagcctcttgtgtaaaaagcagggtaaggctgcgtacaatacacc--aaatggtggaaccc-cttcccgaaccatgcgtatg 5689736  T
Q  309 cgggagctatagtgcaccgg 328  Q
     ||||||| |||||||||||    
T  5689737 tgggagctttagtgcaccgg 5689756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 155 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 44742698 - 44742568
Alignment:
Q  155 aggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaag 254  Q
    ||||| |||||||  ||||| |||||| ||||||||  |||| || ||||||| | |||||||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||    
T  44742698 agggggaaccttggtgcaac-ggtaaagttgttgtcgcgtgattgtaaggtcatgagttcaagttctggaaacaatctcctgtgtaaaaaacagggtaag 44742600  T
Q  255 actgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccc 287  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44742599 gctgcgtacaatacacc-aaaatggtgggaccc 44742568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 199 - 334
Target Start/End: Original strand, 389642 - 389776
Alignment:
Q  199 gaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgt--aaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccga 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||| ||||| || ||||| |     
T  389642 gaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaccctcttgtgtcaaaaaaacagggtaaggttgcgtacaatacacc--aaatgatgggatccctttcctg- 389738  T
Q  297 accctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacc 334  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  389739 accctgcgtatgcgagagctttagtgcaccggattacc 389776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 183 - 286
Target Start/End: Original strand, 35105906 - 35106008
Alignment:
Q  183 ttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgg 282  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||| | ||||||||    
T  35105906 ttgttgtcacgtggctgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaagagagtgtaaggctgcgtacaatacacc-agaatggtgg 35106004  T
Q  283 gacc 286  Q
    ||||    
T  35106005 gacc 35106008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 217 - 326
Target Start/End: Original strand, 29877111 - 29877217
Alignment:
Q  217 gtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagct 316  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||     
T  29877111 gtcctggaaacagccttttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccc-cttcccggaccctgcgtatgcgggagcg 29877207  T
Q  317 atagtgcacc 326  Q
     |||||||||    
T  29877208 ttagtgcacc 29877217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 193 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 8484080 - 8483947
Alignment:
Q  193 gtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttc 292  Q
    |||||| ||| |||| |||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  || |||||||||||   ||    
T  8484080 gtgacttaaatgtcatgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggcaaggctgcgtacaatacacc--aattggtgggaccc-catc 8483984  T
Q  293 ccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccggg 329  Q
    ||  |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||    
T  8483983 ccagaccctgcgtatgcgggagctttagggcaccggg 8483947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 178 - 274
Target Start/End: Original strand, 36918102 - 36918198
Alignment:
Q  178 taaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaa 274  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||||||  |||||||| ||||||| | | |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  36918102 taaaattgttgttatggaactgaaaggtcacatgttcaagttctggaaacaatttcttatgtaaaaaacagggtaaggctgtgtacaatacaccaaa 36918198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 183 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 30962925 - 30962847
Alignment:
Q  183 ttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgt 261  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  30962925 ttgttgtcatgtgattgaaaggtcacgacttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaatagggttaggctgcgt 30962847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 234 - 339
Target Start/End: Original strand, 33866983 - 33867088
Alignment:
Q  234 ttgtgtaaaaaa-cagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccctt-ttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggtt 331  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||  || ||| ||||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||    
T  33866983 ttgtgtaaaaaagcagggtaagactgcatacaatacataaaaaatggtg--acacttcttcccgaaccctgcgtatgcagaagctttagtgcaccgggtt 33867080  T
Q  332 acccttta 339  Q
     |||||||    
T  33867081 gcccttta 33867088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 154 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 40605086 - 40604970
Alignment:
Q  154 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 253  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| || | | | | ||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||  || |||    
T  40605086 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgattggatgattatgggttcaagtcatggaaacaatcttttgtgtaaaaaattggataa 40604987  T
Q  254 gactgcgtacaatacac 270  Q
    |  ||||||||||||||    
T  40604986 ggttgcgtacaatacac 40604970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 231 - 287
Target Start/End: Original strand, 43942355 - 43942411
Alignment:
Q  231 ctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccc 287  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43942355 ctcttatgtcaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccc 43942411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 186 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 23000365 - 23000269
Alignment:
Q  186 ttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggac 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||||  | | |||||||||||  ||||||||||||    
T  23000365 ttgtcatgtgactgaaaggtcacgggt--aagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacacggtaaggttccatacaatacacc--aaatggtgggac 23000271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 176 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 11001109 - 11000971
Alignment:
Q  176 ggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgt-aaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaa 274  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||| ||| |  ||  ||||| |||||||| | |||| ||| ||||||||||||  |    
T  11001109 ggtaaagttgttgtcatgtgattgaaaggtcgcgggttcaaattctgaaaacaacctactgtgtaaaaaaacaagataaggctgtgtacaatacacc--a 11001012  T
Q  275 aatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagct 316  Q
    |||||||||||||  | |||||||||||| ||||| ||||||    
T  11001011 aatggtgggaccc-ctacccgaaccctgtttatgcaggagct 11000971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 338
Target Start/End: Original strand, 10857859 - 10857964
Alignment:
Q  231 ctcttgtgtaaaaaa-cagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccggg 329  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||   ||||||||||  || || | ||| || ||||||||||||| ||||||||||||    
T  10857859 ctcttgtgtaaaaaaacagggtaaggctgcgcacaatacaccaat--tggtgggaccactt-cctggaccttgcgtatgcgggagctttagtgcaccggg 10857955  T
Q  330 ttacccttt 338  Q
    || ||||||    
T  10857956 ttgcccttt 10857964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 221 - 338
Target Start/End: Original strand, 19729363 - 19729475
Alignment:
Q  221 tggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatag 320  Q
    |||||| |||||||| |||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||  |||||| ||||||  ||| |||||||| |||    
T  19729363 tggaaacagtctcttatgtaaaa--cagggtaaggctgtgtacaatacacc--aaatggtgggaccc-cttcccggaccctgcatatacgggagctctag 19729457  T
Q  321 tgcaccgggttacccttt 338  Q
    ||||| || || ||||||    
T  19729458 tgcactggattgcccttt 19729475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 23286474 - 23286431
Alignment:
Q  154 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgac 197  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23286474 gaggggtaaccttgtcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgac 23286431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 257 - 331
Target Start/End: Original strand, 16013511 - 16013584
Alignment:
Q  257 tgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggtt 331  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||  ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  16013511 tgcgtacaatacactaaaaatggtgcgaccc-cttcccagaccctgcctatgcgggagctttagtgcaccgggtt 16013584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 261 - 338
Target Start/End: Original strand, 26102578 - 26102652
Alignment:
Q  261 tacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| || |||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  26102578 tacaatacaccaaa--tggtgggacccctt-cccggaccctgcttatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 26102652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 277 - 331
Target Start/End: Original strand, 27507985 - 27508038
Alignment:
Q  277 tggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggtt 331  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27507985 tggtgggacccctt-cccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggtt 27508038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 191 - 232
Target Start/End: Original strand, 27635020 - 27635061
Alignment:
Q  191 atgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtct 232  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27635020 atgtgactgaaatgtcacgggttcaagtcctggaaacagtct 27635061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 290 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 27468140 - 27468092
Alignment:
Q  290 ttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  27468140 ttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 27468092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 242 - 314
Target Start/End: Original strand, 31454236 - 31454307
Alignment:
Q  242 aaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggag 314  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||||||||  | ||||||| |||||||||||    
T  31454236 aaaacatggtaagactgcgtataatacacaaaaaatgatgagaccctttt-tcaaaccctgcgtatgcgggag 31454307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 274 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 35107374 - 35107311
Alignment:
Q  274 aaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    |||||||||||||| || |||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||    
T  35107374 aaatggtgggacccctt-cccggacgctgtgtatgcggaagctttagtgcaccgggttgcccttt 35107311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 191 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 3377560 - 3377506
Alignment:
Q  191 atgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaa 245  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||| || ||||||||| |||||||||||||||    
T  3377560 atgtgactcaaaggtcacgaattcaattcttggaaatagcctcttgtgtaaaaaa 3377506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 274 - 338
Target Start/End: Original strand, 28407475 - 28407538
Alignment:
Q  274 aaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||  ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  28407475 aaatggtgggacccctt-cccggaccctacgtatgcgggagctttactgcaccgggttgcccttt 28407538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 85)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 153 - 338
Target Start/End: Original strand, 18944619 - 18944804
Alignment:
Q  153 agaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggta 252  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  18944619 agaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaaggcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggta 18944718  T
Q  253 agactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagc-tatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||    
T  18944719 aggctgcgtacaatacaccaacaatggtgggaccc-cttcccggaccctgcgtatgcgggagcttttagtgcaccgggttgcccttt 18944804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 154 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 46248134 - 46247953
Alignment:
Q  154 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 253  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  46248134 gaggggtaaccttggctcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaatgtcacgggttcaagtcttggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaa 46248035  T
Q  254 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  46248034 gactgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccc-cttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgtaccgggttgcccttt 46247953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 153 - 338
Target Start/End: Original strand, 10668196 - 10668385
Alignment:
Q  153 agaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgt-----gactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaaca 247  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  10668196 agaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaaca 10668295  T
Q  248 gggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
     ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  10668296 aggtaaggttgcgtacaatacaccaataatggtgggaccc-cttcccggtccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 10668385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 160 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 30395903 - 30395726
Alignment:
Q  160 taaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgc 259  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30395903 taaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactttaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgc 30395804  T
Q  260 gtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||| |  |||||||||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  30395803 gtacaatacaccaataatggtgggaccc-cttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgagttgcccttt 30395726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 154 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 34725277 - 34725098
Alignment:
Q  154 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 253  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||    
T  34725277 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaa 34725180  T
Q  254 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    | |||||||||||||||   ||||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  34725179 ggctgcgtacaatacac--taaatggtgggaccc-cttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 34725098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 153 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 20004274 - 20004090
Alignment:
Q  153 agaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggta 252  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| ||||    
T  20004274 agaggggtaaccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctctcgtgtaaaaaacaaggta 20004175  T
Q  253 agactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||  |||| |  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  20004174 aggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccc-cttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 20004090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 153 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 32632738 - 32632557
Alignment:
Q  153 agaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggta 252  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||    
T  32632738 agaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatatgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta-aaaacagggta 32632640  T
Q  253 agactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    || ||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||| |||||||  ||||||||||||  |||||||| |||| ||||||    
T  32632639 aggctgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccc-cttcccaaaccctgcatatgcgggagcttgagtgcaccaggtttcccttt 32632557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 154 - 338
Target Start/End: Original strand, 14617015 - 14617196
Alignment:
Q  154 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 253  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| |||| |||||    
T  14617015 gaggggtaaccttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgagttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaataacaaggtaa 14617114  T
Q  254 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    |  |||||||||||||||  ||||||||||| ||  |||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14617115 ggttgcgtacaatacacc--aaatggtgggatcc-cttcccggaccctgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttacccttt 14617196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 154 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 41319987 - 41319806
Alignment:
Q  154 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 253  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41319987 gaggggtaaccttgacacaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 41319888  T
Q  254 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    | ||||||||||||||||  ||||| ||||||||  ||||||||||||   |||||||||| |  ||||||| ||||| ||||||    
T  41319887 ggctgcgtacaatacacc--aaatgatgggaccc-cttcccgaacccttcatatgcgggagtttcagtgcactgggttgcccttt 41319806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 154 - 338
Target Start/End: Original strand, 27201624 - 27201807
Alignment:
Q  154 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 253  Q
    |||||||||||||  || || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||    
T  27201624 gaggggtaaccttagcgtaaatggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtcagaaacagggtaa 27201723  T
Q  254 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| || ||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||    
T  27201724 ggctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccc-cttcccggaccttgcgtatgcgggagctttagtgcattgggttgcccttt 27201807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 160 - 338
Target Start/End: Original strand, 9939443 - 9939622
Alignment:
Q  160 taaccttgacgcaactggtaaaa-ttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactg 258  Q
    |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||| ||| ||||| ||||||  ||    
T  9939443 taaccttggcgcaaccggtaaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgagttcaagtcctggaaacaacctcttgtttaagaaacatggtaaggttg 9939542  T
Q  259 cgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||  ||| || |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9939543 cgtgcaatacaccaaaaatggtgggacccccttctcggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttacccttt 9939622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 154 - 331
Target Start/End: Original strand, 46991781 - 46991955
Alignment:
Q  154 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 253  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  46991781 gaggggtaaccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 46991880  T
Q  254 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggtt 331  Q
    | ||| ||||||||||||   |||||||||||||  |||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  46991881 ggctgtgtacaatacacc--gaatggtgggaccc-cttcccggaccctgcgtatgtgggagctttagtgcaccgggtt 46991955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 153 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 38478462 - 38478282
Alignment:
Q  153 agaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggta 252  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||  |||||||||||    
T  38478462 agaggggtaaccttggcgcaactagtaaacttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagcctcttgtgt--aaaacagggta 38478365  T
Q  253 agactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    || ||||||||||||||||  ||||||||| ||||  ||| || ||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  38478364 aggctgcgtacaatacacc--aaatggtggaaccc-cttctcggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 38478282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 153 - 338
Target Start/End: Original strand, 47214487 - 47214667
Alignment:
Q  153 agaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggta 252  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||    
T  47214487 agaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagtctcttgttt--aaaacagggta 47214584  T
Q  253 agactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    ||  |||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||  ||||||  |||||||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  47214585 aggttgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccc-cttcccagaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccagattacccttt 47214667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 159 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 18742137 - 18741957
Alignment:
Q  159 gtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcct-ggaaatagtctcttgtgt-aaaaaacagggtaagac 256  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || | ||||| ||||| |||| | ||||||||||||||| |    
T  18742137 gtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcaagggttcaaatcttgggaaacagtcttttgtataaaaaaacagggtaaggc 18742038  T
Q  257 tgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  18742037 tgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccc-cttcccagaccctgcgtatgcgagagctttagtgcaccgggtttcccttt 18741957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 157 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 23768498 - 23768334
Alignment:
Q  157 gggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagac 256  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| |    
T  23768498 gggtaacctcgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaaggtcacaggttcaagtcatggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggc 23768399  T
Q  257 tgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgca 324  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| |  |||||  |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  23768398 tgcgtacaatacacc--aaatggtgggacac-cttcccagaccctgcgtatgcgggagctttagtgca 23768334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 153 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 45812717 - 45812544
Alignment:
Q  153 agaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggta 252  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||| ||||||    
T  45812717 agaggggtaaccttggcgcaactgataaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctgaaaacagtctcttgtgt--aaaagagggta 45812620  T
Q  253 agactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggtt 331  Q
    || |||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  45812619 aggctgcatacaatacacc--aaatggtgggaccc-cttcccaaaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggtt 45812544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 176 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 35117927 - 35117765
Alignment:
Q  176 ggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaa 275  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  35117927 ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagcctcttgtgtaaaatacagggtaaggctgtgtacaatacaccaaaa 35117828  T
Q  276 atggtgggacccttttcccgaaccctgtgt-atgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    ||| ||||||||  |||||| |||||| || |||| |||||| |||||||||||| | ||||||    
T  35117827 atgatgggaccc-cttcccggaccctgcgtaatgcaggagctttagtgcaccgggcttcccttt 35117765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 193 - 338
Target Start/End: Original strand, 35005139 - 35005283
Alignment:
Q  193 gtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttc 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||| || |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  35005139 gtgactgaaaggtcacgggttcaagtcttgaaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaaaaatggtgggaccc-cttc 35005237  T
Q  293 ccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    ||| |||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||    
T  35005238 ccggaccctgcgtatgcgggcgctttagtgcaccgggttgcccttt 35005283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 173 - 327
Target Start/End: Original strand, 6925096 - 6925247
Alignment:
Q  173 actggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacacca 272  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||     
T  6925096 actggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagcctcttgtgtaaaaaatagggtaaggctgcggacaatacacc- 6925194  T
Q  273 aaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccg 327  Q
      |||||||||||||  ||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  6925195 -gaatggtgggaccc-cttcccggtccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccg 6925247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 154 - 338
Target Start/End: Original strand, 27474258 - 27474438
Alignment:
Q  154 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 253  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||    
T  27474258 gaggggtaaccttagctcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcttggaaacagtctcttgtgt-aaaaacagggcaa 27474356  T
Q  254 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
      |||||||||||||||    |||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  27474357 agctgcgtacaatacac--tgaatggtgggaccc-cttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccggattgcccttt 27474438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 158 - 338
Target Start/End: Original strand, 19414420 - 19414595
Alignment:
Q  158 ggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagact 257  Q
    |||||||||| || || ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||  |||||||| |||| ||    
T  19414420 ggtaaccttggcgtaattggtaaagttgttgtcatatgactgaaaggtcacgggttcaagtcctagaaagagcctcttatgt--aaaacaggttaaggct 19414517  T
Q  258 gcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  19414518 gcgtacaatacacc--aaatggtgggaccc-cttcccgtaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 19414595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 163 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 2435958 - 2435796
Alignment:
Q  163 ccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgta 262  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  2435958 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcctgtgtgaaaaatagggtaagcctgcgta 2435860  T
Q  263 caatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgg 328  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||  | ||||||||||| |||||||||||    
T  2435859 caatacacc-aaaatggtgggaccccttt-ccgtaccctccgcatgcgggagctttagtgcaccgg 2435796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 154 - 338
Target Start/End: Original strand, 8197020 - 8197201
Alignment:
Q  154 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 253  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  8197020 gaggggtaaccttggtgcaactggtcaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggtaattgcctcttgtgtaaaaaacatggtaa 8197119  T
Q  254 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    | || |||||| ||||||  ||||||| ||||||  ||| || |||||| |||||  |||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  8197120 ggctacgtacagtacacc--aaatggtaggaccc-cttctcggaccctgcgtatgttggagctttagtgtaccgggttgcccttt 8197201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 154 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 19932933 - 19932782
Alignment:
Q  154 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 253  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| | |  || ||||||||||||||||||||    
T  19932933 gaggggttaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagt--tggatacaacct-ttgtgtaaaaaacagggtaa 19932837  T
Q  254 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgc 309  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||    
T  19932836 ggctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccc-cttcccggaccctgcgtatgc 19932782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 151 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 4430210 - 4430087
Alignment:
Q  151 ttagaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacaggg 250  Q
    |||||||| ||| |||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  4430210 ttagagggttaatcttggcgcagctggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggtttaagtcttgaaaacagtatcttgtgtaaaaaacaggg 4430111  T
Q  251 taagactgcgtacaatacaccaaa 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  4430110 taagactgcgtacaatacaccaaa 4430087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 176 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 18724704 - 18724606
Alignment:
Q  176 ggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaa 274  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  18724704 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgtgtacaatacaccaaa 18724606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 159 - 331
Target Start/End: Original strand, 45402077 - 45402247
Alignment:
Q  159 gtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggt--aag-a 255  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||  |||      
T  45402077 gtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtga-tggaaggtaacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacagggttcaagtt 45402174  T
Q  256 ctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggtt 331  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45402175 ctgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccc-cttcccagaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggtt 45402247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 152 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 22930250 - 22930119
Alignment:
Q  152 tagaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggt 251  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||||| ||||||||||    
T  22930250 tagaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacagccttttgtgta-aaaacagggt 22930152  T
Q  252 aagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccc 287  Q
    |||  || | ||||||||||  ||||||||||||||    
T  22930151 aaggttgtg-acaatacacc--aaatggtgggaccc 22930119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 183 - 329
Target Start/End: Original strand, 22327105 - 22327245
Alignment:
Q  183 ttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgg 282  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||| |||| || |||| ||||||||||    
T  22327105 ttgttgtcatgtgactgaaaggtcgcgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgtgtacgatgcacc-aaaatggtgg 22327203  T
Q  283 gacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccggg 329  Q
    |      ||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  22327204 g-----gttcccgaactctgtgtatgcgggagctttggtgcaccggg 22327245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 191 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 35253329 - 35253187
Alignment:
Q  191 atgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttt 290  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |    
T  35253329 atgtgactgaaagatcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccc-ct 35253235  T
Q  291 tcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    ||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  35253234 tcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccggattgcccttt 35253187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 160 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 12127010 - 12126837
Alignment:
Q  160 taaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgc 259  Q
    |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||||| ||  ||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  12127010 taaccttggcgcaactcgtaaagttgttgtcatgtaattgaaaggtcacgggtttaagttctggaaacagcttcttgtgt--aaaacagggtaaggctgc 12126913  T
Q  260 gtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| |||||||| | ||| ||||||    
T  12126912 gtacaatacacc--aaattgtgggaccc-cttcccggaccctgcatatgcgggagctgtagtgcactgcgttgcccttt 12126837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 176 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 17470505 - 17470406
Alignment:
Q  176 ggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaa 275  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17470505 ggtaaagttgttgtcacgtgactgaatggtcatgggttcaagtcctagaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaaa 17470406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 175 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 6983969 - 6983811
Alignment:
Q  175 tggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaa 274  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||  || ||||||||||||||||  |||||||||||||||  |    
T  6983969 tggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagcctc--gtataaaaaacagggtaagtatgcgtacaatacacc--a 6983874  T
Q  275 aatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    ||||||||||||| ||| ||| |||||| ||| || |||||| | |||||||||| | ||||||    
T  6983873 aatggtgggaccccttt-ccggaccctgcgtaggcaggagctttggtgcaccgggctgcccttt 6983811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 177 - 338
Target Start/End: Original strand, 19701570 - 19701729
Alignment:
Q  177 gtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaa 276  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| || ||| || ||||||||||||||||  ||||||  || |||||||||||| ||||    
T  19701570 gtaaagttgttgtcgtgtgactgaaatgtcacgggtttaagtcatgaaaacagcctcttgtgtaaaaaacttggtaaggatgggtacaatacacc-aaaa 19701668  T
Q  277 tggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    ||||||| |||  |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  19701669 tggtggggccc-cttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccaggctacccttt 19701729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 177 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 25468421 - 25468285
Alignment:
Q  177 gtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaa 276  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||  |||    
T  25468421 gtaaagttgttgtcatgtgattgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaatcagggtaaggttgcgtacaatacacc--aaa 25468324  T
Q  277 tggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagct 316  Q
    |||| ||| ||| |||||  |||||| |||||||||||||    
T  25468323 tggttgga-cctcttcccagaccctgcgtatgcgggagct 25468285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 164 - 287
Target Start/End: Original strand, 33222971 - 33223092
Alignment:
Q  164 cttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtac 263  Q
    |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| || ||||||||| |||||||||| |||  |||||||    
T  33222971 cttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacggatttaagtcatggaaacagcctcttgtgt-aaaaacagggaaaggttgcgtac 33223069  T
Q  264 aatacaccaaaaatggtgggaccc 287  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
T  33223070 aatacacc-aaaatggtgggaccc 33223092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 157 - 287
Target Start/End: Original strand, 25290143 - 25290280
Alignment:
Q  157 gggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaa--atagtctcttgtgtaaaaaacagggtaag 254  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  | || ||||||||||||||||||||||||    
T  25290143 gggtaaccttggcgcaacaggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgtgttcaagtcttggaaacacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaag 25290242  T
Q  255 ac-----tgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccc 287  Q
     |     || ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  25290243 gcaaggttgtgtacaatacaccaaaaatgataggaccc 25290280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 175 - 314
Target Start/End: Original strand, 20036218 - 20036355
Alignment:
Q  175 tggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaa-aaacagggtaagactgcgtacaatacaccaa 273  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| | | ||||||||| ||||| |||||||||      
T  20036218 tggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaaactcttgtgtaaagagaaagggtaagattgcgttcaatacacc-- 20036315  T
Q  274 aaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggag 314  Q
    ||||||||| ||||  |||||| |||||| |||||| ||||    
T  20036316 aaatggtggaaccc-cttcccggaccctgcgtatgcaggag 20036355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 238 - 339
Target Start/End: Original strand, 4349699 - 4349797
Alignment:
Q  238 gtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttaccctt 337  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  4349699 gtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaa--tggtgggacccctt-cccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctt 4349795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 187 - 316
Target Start/End: Original strand, 11596523 - 11596648
Alignment:
Q  187 tgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacc 286  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |  ||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  11596523 tgtcatgtgactgaaatgtcacgggttcaagtcctagaaacaacctcttgtgt-aaaaacagggtaaggctgcgtataatacacc--aaatggtgggacc 11596619  T
Q  287 cttttcccgaaccctgtgtatgcgggagct 316  Q
    |  |||| | |||||| |||||||||||||    
T  11596620 c-cttcctggaccctgcgtatgcgggagct 11596648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 154 - 232
Target Start/End: Original strand, 34714600 - 34714678
Alignment:
Q  154 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtct 232  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  34714600 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgattgaaaggtcacgggttcaagtcatggaaacagtct 34714678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 176 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 50760385 - 50760288
Alignment:
Q  176 ggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaa 273  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||    
T  50760385 ggtaaagtagttgtcatgtgactgagaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtataaaactgggtaaggctgcgtataatacaccaa 50760288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 163 - 338
Target Start/End: Original strand, 50811926 - 50812098
Alignment:
Q  163 ccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgt-aaaaaacagggtaagactgcgt 261  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||  |||||    
T  50811926 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacggaatcatgtcctggaaacagcttcttgtgtaaaaaaacagggtaaggttgcgt 50812024  T
Q  262 acaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||  ||||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| ||| | ||||||    
T  50812025 acaatacacc-aaaatggtggacccc--ttcccgcgccctgcgtatgcgggagctttaatgcactgggctgcccttt 50812098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 175 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 15511311 - 15511157
Alignment:
Q  175 tggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcg--tacaatacacca 272  Q
    ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||   || ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||     
T  15511311 tggtaaagttgttgtaatgtggctgaaaggtcacatattgaagtcctggaaaccgcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcggatacaatacacc- 15511213  T
Q  273 aaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccggg 329  Q
    |||||||||| ||||  |||| | |||||| ||||| | ||||| ||||||||||||    
T  15511212 aaaatggtggtaccc-cttcctggaccctgcgtatgtgtgagctttagtgcaccggg 15511157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 156 - 221
Target Start/End: Original strand, 40424721 - 40424786
Alignment:
Q  156 ggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcct 221  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40424721 ggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggccacgggttcaagtcct 40424786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 177 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 44485267 - 44485170
Alignment:
Q  177 gtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaa 274  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| |  | ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  44485267 gtaaagttgttgtcatgtgattgaaaggtcacgggttatagtcctggaaacaaccacttgtgtaaaagacatggtaaggctgcgtacaatacaccaaa 44485170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 155 - 274
Target Start/End: Original strand, 24564322 - 24564441
Alignment:
Q  155 aggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaag 254  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||||| ||| |||| ||||| ||||||||| | | |||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  24564322 aggggtaaccttggcgcaaccagtaaagttgatgtcttgtgattgaaaggtcgcagattcaagtcttggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaag 24564421  T
Q  255 actgcgtacaatacaccaaa 274  Q
      |||||||||| |||||||    
T  24564422 ggtgcgtacaattcaccaaa 24564441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 158 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 18335465 - 18335335
Alignment:
Q  158 ggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagact 257  Q
    |||||||||| ||||| || |||| || |||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||   |    
T  18335465 ggtaaccttggcgcaagtgataaagtttttgtcatgtgtctgaaaggtcacaagttaaagtcctggaaacagtctcttgtttaaaaattagggtaaagtt 18335366  T
Q  258 gcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttt 290  Q
    |||||||||||| |  ||||| |||||||||||    
T  18335365 gcgtacaatacatc--aaatgatgggacccttt 18335335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 209 - 326
Target Start/End: Original strand, 22324925 - 22325039
Alignment:
Q  209 gggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatg 308  Q
    ||||||||||| |||||| || ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| ||   ||||| |||||| |||||    
T  22324925 gggttcaagtcttggaaacagcctcttgtgtaaaa-acagggtaaggctgcatacaatacaccaaaaatggt-ggagccccgtcccg-accctgcgtatg 22325021  T
Q  309 cgggagctatagtgcacc 326  Q
    |||||||| |||||||||    
T  22325022 cgggagctttagtgcacc 22325039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 241 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 42304303 - 42304207
Alignment:
Q  241 aaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  42304303 aaaaacagggtaaggttgcgtacaatacacaaaaaatggtgggaccc-cttcccggaccctgcgtatgtgggagctttagtgcaccggattgcccttt 42304207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 155 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 18336026 - 18335914
Alignment:
Q  155 aggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaag 254  Q
    |||||||| |||| ||||| || |||| |||||| |||||| ||||||||||||  |||||||| ||| ||||| ||| |||| |||| |||||||||||    
T  18336026 aggggtaatcttggcgcaagtgataaagttgttgccatgtgtctgaaaggtcacatgttcaagttctgaaaataatctattgtttaaagaacagggtaag 18335927  T
Q  255 actgcgtacaata 267  Q
     ||||||||||||    
T  18335926 gctgcgtacaata 18335914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 176 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 27136811 - 27136661
Alignment:
Q  176 ggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaa 275  Q
    |||||| ||||||||| |||| || |||| |||| |||||||| |||| || |  ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||    
T  27136811 ggtaaagttgttgtcacgtgattggaaggacacgagttcaagttctgggaacaacctcttgtgtaaaaaacatggtaaggttgcgtacaatacacc-aaa 27136713  T
Q  276 atggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgg 328  Q
    ||||||||||||  ||||   | | ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  27136712 atggtgggaccc-cttcctagatcatgtgtatgcgggagctccagtgcaccgg 27136661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 177 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 39215117 - 39214967
Alignment:
Q  177 gtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaa 276  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||||||| |  |||||||| ||||||| |  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  || ||||    
T  39215117 gtaaagttattgtcacgtgactaaaaggtcccaagttcaagtactggaaacaacctcttgtgtaaaaaactgggtaaggctgcgtacaatattcc-aaaa 39215019  T
Q  277 tggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccggg 329  Q
    ||||||| |||  ||||| ||||||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  39215018 tggtgggtccc-cttcccaaaccctgcgtatgtggaagctttagtgcaccggg 39214967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 176 - 271
Target Start/End: Original strand, 52910216 - 52910312
Alignment:
Q  176 ggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgt-aaaaaacagggtaagactgcgtacaatacacc 271  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| || |||||  || ||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  52910216 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaactcttggaaacagcctcttaggtaaaaaaacagggtaggactgtgtacaatacacc 52910312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 158 - 225
Target Start/End: Original strand, 21006125 - 21006192
Alignment:
Q  158 ggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaa 225  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  21006125 ggtaaccttgacgcaaccggtaaaattgttgtcatgcgactgaaaggtcaaaggttcaagtactggaa 21006192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 176 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 10378884 - 10378744
Alignment:
Q  176 ggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaa 275  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||         ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  10378884 ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggttacgggttcaagtcctggaaa---------gtg-agaaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc--aa 10378797  T
Q  276 atggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccggg 329  Q
    ||||||||||||  |||  | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  10378796 atggtgggaccc-cttcttggaccctgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 10378744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 188 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 19974221 - 19974074
Alignment:
Q  188 gtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccc 287  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || |||  |||| ||||| |||| |||  ||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  19974221 gtcacgtgactgaaagatcacgggttcaagtcttggaaacagcctcaagtgt-aaaaatagggcaaggttgcgtacaatacacc-aaaatgatgggaccc 19974124  T
Q  288 ttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
      |||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||    
T  19974123 -attcccggactctatgtatgcgggagctttagtgcacggggctgcccttt 19974074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 176 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 2436052 - 2435983
Alignment:
Q  176 ggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaa 245  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||    
T  2436052 ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcctgtgtaaaaaa 2435983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 193 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 45264542 - 45264411
Alignment:
Q  193 gtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttc 292  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||| ||||| ||| || ||||||||| |||||||||||||||  |||    
T  45264542 gtgattgaaaggtcacatgttcaagtcctggaaacaacctcttgtgcaaaaaacagagtaaggctgtgtgcaatacacc-aaaatggtgggaccc-cttc 45264445  T
Q  293 ccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcacc 326  Q
     |  ||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  45264444 tcagaccctgcatatgcgggagctttagtgcacc 45264411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 245 - 316
Target Start/End: Original strand, 15505632 - 15505700
Alignment:
Q  245 acagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagct 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  15505632 acagggtaagactgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccc-cttcccgaaccctgcgtatgcgggagct 15505700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 163 - 329
Target Start/End: Original strand, 35019217 - 35019378
Alignment:
Q  163 ccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgta 262  Q
    ||||| |||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||| ||| |  ||||||| |||||| |||  |||| |||| ||    
T  35019217 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcacatgactgaaaggtcacagattcaagtcctgtaaacaacctcttgtataaaaatcagtataaggctgcata 35019315  T
Q  263 caatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccggg 329  Q
    |||||||||  || |||||||||||   ||||  |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  35019316 caatacacc--aattggtgggaccc--ctcccagaccctgcgtatgcgagagctttagtgcaccggg 35019378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 240 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 31442485 - 31442396
Alignment:
Q  240 aaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggtt 331  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| || ||||||||| ||||||| | ||||||||||||    
T  31442485 aaaaaacagggtaaggatgcgtacaatacacc-aaaatggtgggaccc-cttcccggacactgtgtatgtgggagctttggtgcaccgggtt 31442396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 263 - 338
Target Start/End: Original strand, 50606487 - 50606561
Alignment:
Q  263 caatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  50606487 caatacaccaaaaatggtgggacccctt-cccggaccctgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 50606561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 176 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 34679378 - 34679280
Alignment:
Q  176 ggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaa 274  Q
    |||||| || |||||||||||||||||  ||||  |||| | |||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  34679378 ggtaaagttattgtcatgtgactgaaatatcacatgttccattcctagaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtactatacatcaaa 34679280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 31272522 - 31272446
Alignment:
Q  187 tgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtaca 264  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  31272522 tgtcacgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgta-aaaacatggtaaggctgcgtaca 31272446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 218 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 31382330 - 31382214
Alignment:
Q  218 tcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagcta 317  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||| | ||||||  ||||||||||||     
T  31382330 tcctggaaacagcctcttgtgtaaaaa-caggataaggctgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccc-cttcctggaccctgcatatgcgggagctt 31382235  T
Q  318 tagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    || || |||||||| ||||||    
T  31382234 tactgtaccgggttgcccttt 31382214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 14988084 - 14987989
Alignment:
Q  170 gcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaa 265  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||  || |||||  |||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  14988084 gcaactggtaaagttgttgtcatatgactagaaagtcacaagttcaagtcctgaaaacagtatcttatgtaaaatacaggataaggctgcgtacaa 14987989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 194 - 329
Target Start/End: Original strand, 23371141 - 23371271
Alignment:
Q  194 tgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcc 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||||| ||| |||  || |||||||||||||||  || |||||||| ||  |    
T  23371141 tgactgaaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagccacttgggtaaaaaac-gggcaaggttgtgtacaatacaccaaa--tgctgggacccctt--c 23371235  T
Q  294 cgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccggg 329  Q
    |  |||||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  23371236 cagaccctgcgtatgtggtagctttagtgcaccggg 23371271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 240 - 285
Target Start/End: Original strand, 46859129 - 46859173
Alignment:
Q  240 aaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggac 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  46859129 aaaaaacagggtaagactgcgtacaatacacc-aaaatggtgggac 46859173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 178 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 19656263 - 19656152
Alignment:
Q  178 taaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaat 277  Q
    |||| ||||||||  |||||| |||||||||  | ||||| | |||||| || ||||||||||||||||| |||||  ||  |||||||||||| |||||    
T  19656263 taaagttgttgtcgcgtgactcaaaggtcactagctcaaggcttggaaacagcctcttgtgtaaaaaacatggtaacgctatgtacaatacacc-aaaat 19656165  T
Q  278 ggtgggacccttt 290  Q
    ||| |||||||||    
T  19656164 ggtaggacccttt 19656152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 324
Target Start/End: Original strand, 43207476 - 43207640
Alignment:
Q  163 ccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaagg------tcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagac 256  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||||| ||      |||| |||| ||||| |||||| |  ||||| ||| ||||||||||||||||    
T  43207476 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcacgtgactgaatggacacactcacaggtttaagtcttggaaacaacctcttatgtgaaaaacagggtaagac 43207574  T
Q  257 tgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgca 324  Q
     || ||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||  ||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  43207575 ggcatacaatacacc-aaattggtggga-cctcttcccagaccctatgtatgcgagagctttagtgca 43207640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 187 - 226
Target Start/End: Original strand, 43768168 - 43768207
Alignment:
Q  187 tgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaa 226  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43768168 tgtcatgtcactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaa 43768207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 20999952 - 20999850
Alignment:
Q  233 cttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggtta 332  Q
    ||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||  || |||| ||| || || | |||||| ||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  20999952 cttgtgtaaaaaacaaggcaaggctgcgtacaatacaccaaa--tgatggggcccctt-ccggcaccctgcgtacgcgggagctttagtgcaccgggctg 20999856  T
Q  333 cccttt 338  Q
    ||||||    
T  20999855 cccttt 20999850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 241
Target Start/End: Original strand, 21723642 - 21723727
Alignment:
Q  155 aggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaa 241  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| ||  |||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  21723642 aggggtaaccttcgcacaactggtaaagttgttgtcatgtgactggatggttacaagttc-agtcctggaaacagcctcttgtgtaa 21723727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 231 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 1517416 - 1517311
Alignment:
Q  231 ctcttgtgt-aaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccggg 329  Q
    ||||||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||   ||||||||||| ||  | || ||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  1517416 ctcttgtgttaaaaaacatgataaggctgcgtacaatacaccaat--tggtgggaccccttctcaga-ccctgcgtatgcaggagctttagtgcaccggg 1517320  T
Q  330 ttacccttt 338  Q
    || ||||||    
T  1517319 ttgcccttt 1517311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 219 - 338
Target Start/End: Original strand, 23796507 - 23796623
Alignment:
Q  219 cctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctat 318  Q
    |||||||| || |||||||||||||| ||  |||||  |||||||||||||||  |||||||| |||||  |||||  ||||||  ||||| |||||| |    
T  23796507 cctggaaacagcctcttgtgtaaaaatcaatgtaaggttgcgtacaatacacc--aaatggtgagaccc-cttcccagaccctgcatatgctggagcttt 23796603  T
Q  319 agtgcaccgggttacccttt 338  Q
    ||||||||||| | ||||||    
T  23796604 agtgcaccgggctgcccttt 23796623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 258 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 4249520 - 4249455
Alignment:
Q  258 gcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcacc 326  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| || || |||||||| |||||||||||||||| || ||||||    
T  4249520 gcgtacaatacaccaaa--tggtgggatccctt-cccgaaccttgtgtatgcgggagctttaatgcacc 4249455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 258 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 4249844 - 4249779
Alignment:
Q  258 gcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcacc 326  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| || || |||||||| |||||||||||||||| || ||||||    
T  4249844 gcgtacaatacaccaaa--tggtgggatccctt-cccgaaccttgtgtatgcgggagctttaatgcacc 4249779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 258 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 4250168 - 4250103
Alignment:
Q  258 gcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcacc 326  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| || || |||||||| |||||||||||||||| || ||||||    
T  4250168 gcgtacaatacaccaaa--tggtgggatccctt-cccgaaccttgtgtatgcgggagctttaatgcacc 4250103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 287
Target Start/End: Original strand, 10163733 - 10163867
Alignment:
Q  151 ttagaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacaggg 250  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| |||| ||||||||||||| || ||| || ||  ||| |||| ||| ||| |  ||||| ||||||||| | |     
T  10163733 ttagaggggtaacattggcgcaactgataaagttgttgtcatgtggctaaaatgttacaagtttaagttctgaaaacaacctcttatgtaaaaaatatga 10163832  T
Q  251 taagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccc 287  Q
    ||||| ||  ||||||||| |  ||||||||||||||    
T  10163833 taagattgtatacaatacatc--aaatggtgggaccc 10163867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 25554882 - 25554817
Alignment:
Q  175 tggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgta 240  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||||| |||| ||| |||||||||||| |  ||||||||||    
T  25554882 tggtaaagttgttgtcacgtgactaaaaggccacgtgtttaagtcctggaaacaacctcttgtgta 25554817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 208 - 316
Target Start/End: Original strand, 30682845 - 30682948
Alignment:
Q  208 cgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtat 307  Q
    ||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||| || |||| |||||  | ||||||||||||||  |||||| ||| || ||||    
T  30682845 cgggttcaaatcctgaaaatagcctcttgtgt-aaaaacaaggtaagattgtgtac-ataca--acaaatggtgggaccc-cttcccggaccgtgcgtat 30682939  T
Q  308 gcgggagct 316  Q
    |||||||||    
T  30682940 gcgggagct 30682948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 243 - 338
Target Start/End: Original strand, 43768205 - 43768297
Alignment:
Q  243 aaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||  || |||||||||||  |||||  |||||| |||| |||||||| || ||||||||| | ||||||    
T  43768205 aaacagggtaaggctgcctacaatacacc--aattggtgggaccc-cttcccagaccctgcgtatacgggagctttaatgcaccgggctgcccttt 43768297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 183 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 49722724 - 49722641
Alignment:
Q  183 ttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaata 267  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| || ||| |  |||||||  ||| || ||||||||| |||||||||||    
T  49722724 ttgttgtcacgtgaatgaaaggtcacgggtttaagtcatgtaaacaacctcttgt-aaaataatagggtaagattgcgtacaata 49722641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 159 - 340
Target Start/End: Original strand, 58936 - 59116
Alignment:
Q  159 gtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactg 258  Q
    |||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  58936 gtaaccttggagcaactggtaaacttattgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtataaaaaacagggtaagactg 59035  T
Q  259 cgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttaccctttat 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||  || ||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  59036 cgtacaatacaccaaaaatggtgggaccc-cttcccagactctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccctttat 59116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 92)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 161 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 16408777 - 16408601
Alignment:
Q  161 aaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcg 260  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16408777 aaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcg 16408678  T
Q  261 tacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||  |||||| |||| |  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  16408677 tacaatacaccaataatggtggaaccc-cttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 16408601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 154 - 338
Target Start/End: Original strand, 5648213 - 5648393
Alignment:
Q  154 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 253  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  5648213 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacagggtaa 5648311  T
Q  254 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    | ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||    
T  5648312 ggctgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccc-cttcccggaccctgcgtatgcgggagcttcagtgcactgggttgcccttt 5648393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 154 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 6430806 - 6430627
Alignment:
Q  154 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 253  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||||    
T  6430806 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcatggaaacagcctcttgtgta-aaaacagggtaa 6430708  T
Q  254 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttaccctt 337  Q
    | ||||||||||||||||  ||||||||||| ||  |||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  6430707 ggctgcgtacaatacacc--aaatggtggga-ccacttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagcgcaccgggttgccctt 6430627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 153 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 11054328 - 11054148
Alignment:
Q  153 agaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggta 252  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||    
T  11054328 agaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagtctcttgtgt--aaaacagggta 11054231  T
Q  253 agactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| || ||||  |||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  11054230 agactgcgtacaatacacc--aaatggcggaaccc-cttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 11054148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 154 - 338
Target Start/End: Original strand, 20224938 - 20225117
Alignment:
Q  154 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 253  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  |||||||||  ||||||||||||    
T  20224938 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgt--aaaacagggtaa 20225035  T
Q  254 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    | ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  20225036 ggctgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccc-cttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 20225117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 153 - 338
Target Start/End: Original strand, 23501746 - 23501924
Alignment:
Q  153 agaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggta 252  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||      | || ||||||||||||||||||||||    
T  23501746 agaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtc------acagcctcttgtgtaaaaaacagggta 23501839  T
Q  253 agactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  23501840 aggttgcgtacaatacaccaataatggtgggaccc-cttcccggaccctgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 23501924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 154 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 48599004 - 48598825
Alignment:
Q  154 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 253  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||    
T  48599004 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaa 48598907  T
Q  254 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    | ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||| ||| ||  ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  48598906 ggctgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccc-cttcccggaccatgcatatgccggagctctagtgcaccgggttgcccttt 48598825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 157 - 338
Target Start/End: Original strand, 16911519 - 16911699
Alignment:
Q  157 gggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagac 256  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||| ||| ||||||||| |    
T  16911519 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgacttaaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagcctcttgtgtacaaatcagggtaaggc 16911618  T
Q  257 tgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||| ||| ||||||||| ||||  |||||||| ||||||    
T  16911619 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccc-cttcccggaccctgcgtacgcgggagctttagtttaccgggttgcccttt 16911699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 173 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 44363294 - 44363128
Alignment:
Q  173 actggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacacca 272  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||    
T  44363294 actggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgagttcaagtcctgaaaacagcctcgtgtgtaaaaaacagggtagggctgcgtacaacgcacca 44363195  T
Q  273 aaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttaccctttat 340  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  44363194 aaaatggtgggaccc-cttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttat 44363128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 153 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 47528710 - 47528530
Alignment:
Q  153 agaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggta 252  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||  |||||||||||    
T  47528710 agaggggtaaccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggta 47528613  T
Q  253 agactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    || ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||| ||||||  |||| ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  47528612 aggctgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccc-cttcccggaccctgaatatgtgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 47528530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 153 - 331
Target Start/End: Original strand, 21646917 - 21647094
Alignment:
Q  153 agaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggta 252  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||    
T  21646917 agagggataaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaatagggta 21647016  T
Q  253 agactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggtt 331  Q
    || |||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||  |||| |  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  21647017 aggctgcgtacaatataccaataatggtgggaccc-cttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggtt 21647094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 154 - 338
Target Start/End: Original strand, 30639334 - 30639514
Alignment:
Q  154 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 253  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  30639334 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcttgtgactgaaaggtcactggttcaagtcctggaaacagactcttgtgt-aaaaacagggtaa 30639432  T
Q  254 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    | ||||||||||||||||  |||||||| |||||  |||||| ||||||  |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  30639433 ggctgcgtacaatacacc--aaatggtgagaccc-cttcccggaccctgcatatgcgggagctttagtgcactgggttgcccttt 30639514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 151 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 13256581 - 13256399
Alignment:
Q  151 ttagaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacaggg 250  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    || ||||||||||||||||||||    
T  13256581 ttagaggggtaaccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcataggttcaagtcctgg----agcctcttgtgtaaaaaacaggg 13256486  T
Q  251 taagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||| |  | |||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  13256485 taaggctgcgtacaatacaccaataatagtgggaccc-cttcccgaaccccgcatctgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 13256399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 154 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 5306844 - 5306660
Alignment:
Q  154 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 253  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||    
T  5306844 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgatgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaatcagggtaa 5306746  T
Q  254 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatg----cgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    |  |||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||| |||||| |||||    |||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  5306745 ggttgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccc-cttcccggaccctgcgtatgtggacgggagctttaatgcaccgggttgcccttt 5306660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 175 - 287
Target Start/End: Original strand, 25343162 - 25343274
Alignment:
Q  175 tggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaa 274  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25343162 tggtaaagttgttgtcacgtgactgataggtcacaggttcaagttctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaa 25343261  T
Q  275 aatggtgggaccc 287  Q
    || ||| ||||||    
T  25343262 aagggttggaccc 25343274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 183 - 338
Target Start/End: Original strand, 54175046 - 54175200
Alignment:
Q  183 ttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctgg-aaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtg 281  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  54175046 ttgttgtcatgtgactgaaatgtcacggattcaagtcctggaaaacagcctcttgtgt-aaaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc-aaaatggtg 54175143  T
Q  282 ggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    |||||| || |||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  54175144 ggaccccttccccggaccctgcatatgcgggagctttagtgcaccgggctgcccttt 54175200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 159 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 30352767 - 30352580
Alignment:
Q  159 gtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaa-----aaaacagggtaa 253  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||     ||||||||||||    
T  30352767 gtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcaagtgaccgaaaggtcacgggttagagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaaaaaaacagggtaa 30352668  T
Q  254 g----actgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    |     ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  30352667 gtaaagctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccc-cttctcggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgtgttgcccttt 30352580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 176 - 338
Target Start/End: Original strand, 35567146 - 35567305
Alignment:
Q  176 ggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaa 275  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| || | |||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||  ||    
T  35567146 ggtaaagttgttgtcatgtaactgaaaggtcatgggttcaagtcttggaaacagccacttgtgtaaaaaacagggtaaggctgtgtacaacacacc--aa 35567243  T
Q  276 atggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  35567244 atggtgggaccc-cttcccgaaccctgcgtctgcgggagctttagtgcaccgggctgcccttt 35567305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 192 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 29208039 - 29207900
Alignment:
Q  192 tgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccctttt 291  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||    
T  29208039 tgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaattgcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccc-ctt 29207945  T
Q  292 cccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttaccct 336  Q
    |||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  29207944 cccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccct 29207900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 164 - 328
Target Start/End: Original strand, 19027813 - 19027973
Alignment:
Q  164 cttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtac 263  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19027813 cttgacgcaa-tggtagagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacatcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtac 19027911  T
Q  264 aatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgg 328  Q
    ||||||||  || ||||||||||| ||||| | || ||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  19027912 aatacacc--aattggtgggacccctttccag-actctgcgtatgtgggagctttagtgcaccgg 19027973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 173 - 337
Target Start/End: Original strand, 40915802 - 40915962
Alignment:
Q  173 actggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacacca 272  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||     
T  40915802 actggtaaagttgttgtcatgtgactataaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacc- 40915899  T
Q  273 aaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttaccctt 337  Q
     ||||||||||| ||  |||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||| || |||||    
T  40915900 -aaatggtgggagcc-cttcccggaccctgcgtatgcgggagcttcagtgcaccggattgccctt 40915962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 149 - 338
Target Start/End: Original strand, 20405042 - 20405224
Alignment:
Q  149 tcttagaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgt-aaaaaaca 247  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||       ||| |||| || ||||||||| ||||||||    
T  20405042 tcttggaggggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacggg-------cctagaaacagcctcttgtgtaaaaaaaca 20405134  T
Q  248 gggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||  |||||| |||| |  |||||||||||| |||||||  ||||| ||||||    
T  20405135 gggtaagattgcgtacaatacactaataatggtgggaccc-cttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcattgggttgcccttt 20405224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 153 - 324
Target Start/End: Original strand, 37494804 - 37494972
Alignment:
Q  153 agaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggta 252  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  37494804 agaggggtaaccttggtgcaactggtaaagttgttgccatgcgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggta 37494903  T
Q  253 agactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgca 324  Q
    ||  ||| ||||||| |||  |||||||||||||| ||| | | |||||| |||||| |||||| |||||||    
T  37494904 aggttgcatacaatatacc--aaatggtgggaccccttt-cgggaccctgcgtatgcaggagctttagtgca 37494972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 178 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 9832468 - 9832313
Alignment:
Q  178 taaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaat 277  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||    
T  9832468 taaaattgttgtgatctgactgaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc--aaat 9832373  T
Q  278 ggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||  ||||| ||| || |||||||||||||| ||||||    
T  9832372 ggtgggaccc-cttcccggaccctgcatatgcaggaactctagtgcaccgggttgcccttt 9832313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 157 - 338
Target Start/End: Original strand, 54730206 - 54730387
Alignment:
Q  157 gggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgt-aaaaaacagggtaaga 255  Q
    ||||||| ||| |||||  |||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| |||||| ||| ||||     
T  54730206 gggtaactttggcgcaatcggtaaagttgttgtcatgtgaccaaaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagcctcttgtgtaaaaaaataggataagg 54730305  T
Q  256 ctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    ||||||| |||||||||| |||| ||| ||||  |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  54730306 ctgcgtataatacaccaataatgatggaaccc-cttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgaattacccttt 54730387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 183 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 7385628 - 7385499
Alignment:
Q  183 ttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgg 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||  || || |||||||||  |||||||||    
T  7385628 ttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagccctggaaacagcctcatgtgtaaaaaatagggtaaggttgtgtgcaatacacc--aaatggtgg 7385531  T
Q  283 gacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagc 315  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  7385530 gaccc-tttcccggaccctgtgtatgcgggagc 7385499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 154 - 287
Target Start/End: Original strand, 10660358 - 10660491
Alignment:
Q  154 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 253  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |  ||||| ||||||||| ||||||     
T  10660358 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttacatgttcaagtcctggaaacaacctcttatgtaaaaaatagggtat 10660457  T
Q  254 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccc 287  Q
    | |||| ||||||||||||| ||||||| |||||    
T  10660458 ggctgcatacaatacaccaataatggtgagaccc 10660491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 154 - 287
Target Start/End: Original strand, 10874503 - 10874636
Alignment:
Q  154 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 253  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |  ||||| ||||||||| ||||||     
T  10874503 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttacatgttcaagtcctggaaacaacctcttatgtaaaaaatagggtat 10874602  T
Q  254 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccc 287  Q
    | |||| ||||||||||||| ||||||| |||||    
T  10874603 ggctgcatacaatacaccaataatggtgagaccc 10874636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 217 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 20639777 - 20639658
Alignment:
Q  217 gtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagct 316  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||||||    
T  20639777 gtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc-aaaatggtgggaccc-cttcccggaccctgcgtatgcgggagct 20639680  T
Q  317 atagtgcaccgggttacccttt 338  Q
     |||||||||||||| ||||||    
T  20639679 ttagtgcaccgggttgcccttt 20639658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 158 - 286
Target Start/End: Original strand, 14590795 - 14590922
Alignment:
Q  158 ggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgt-aaaaaacagggtaagac 256  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || ||||||| | ||||||||||||||| |    
T  14590795 ggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacggattcaagtcctagaaacagcctcttgtctaaaaaaacagggtaaggc 14590894  T
Q  257 tgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacc 286  Q
    ||| ||||||||| |  |||||||||||||    
T  14590895 tgcatacaatacatc--aaatggtgggacc 14590922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 183 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 17043546 - 17043444
Alignment:
Q  183 ttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgg 282  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  17043546 ttgttgtcaagtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaatacagggtaaggctgcgtacaatacacc--aaatggtgg 17043449  T
Q  283 gaccc 287  Q
    |||||    
T  17043448 gaccc 17043444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 199 - 338
Target Start/End: Original strand, 47443956 - 47444092
Alignment:
Q  199 gaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaac 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||| ||    
T  47443956 gaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgcgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccc-cttcccggac 47444052  T
Q  299 cctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    ||||  ||||| ||||||  ||||||| ||||| ||||||    
T  47444053 cctgcatatgcaggagcttcagtgcactgggttgcccttt 47444092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 186 - 338
Target Start/End: Original strand, 25463108 - 25463256
Alignment:
Q  186 ttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggac 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||| |||  ||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  25463108 ttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaactgggaaaggttgcgtacaacacacc--aaatggtgggac 25463205  T
Q  286 ccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    ||  |||||| ||||||  |||||||||||| | ||||||| || ||||||||    
T  25463206 cc-cttcccggaccctgcatatgcgggagct-ttgtgcaccaggctacccttt 25463256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 185 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 30690333 - 30690175
Alignment:
Q  185 gttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaa-------aaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaat 277  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||       ||||||||||||| |||| |||||||||||  || |    
T  30690333 gttgtcaagtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaaaagcctcttgtgtaaaaaataaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc--aatt 30690236  T
Q  278 ggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttta 339  Q
    ||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| || | |||||||    
T  30690235 ggtgggaccc-cttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccaggctgcccttta 30690175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 169 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 8473786 - 8473621
Alignment:
Q  169 cgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatac 268  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||  ||||||||||||||||||| || |||||||||    ||||||||||| |||| ||||||||    
T  8473786 cgcaactggtaaagttgttgtcatatgaccggaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--ttaacagggtaaggctgcatacaatac 8473689  T
Q  269 accaaaaatggtgggacccttttccc-gaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttaccctt 337  Q
    |||  |||||||||||||| || ||| || |||||  |||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  8473688 acc--aaatggtgggaccccttccccggacccctgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctt 8473621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 212 - 331
Target Start/End: Original strand, 21489099 - 21489216
Alignment:
Q  212 ttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgg 311  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  21489099 ttcaagtcctggaaacagcctcttgcgtaaaaaacagagtaagactgcgtacaatgcacc-aaaatggtgggaccc-cttcccgaaccctgcgtatgcgg 21489196  T
Q  312 gagctatagtgcaccgggtt 331  Q
    ||||| | |||||| |||||    
T  21489197 gagctttcgtgcactgggtt 21489216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 228 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 48327872 - 48327762
Alignment:
Q  228 agtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccg 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||    ||||||| || | ||||||||||    
T  48327872 agtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcatacaatacaccaataatggtggga-cctcttcccgaaccccacatatgcggaagttttagtgcaccg 48327774  T
Q  328 ggttacccttta 339  Q
    ||||||||||||    
T  48327773 ggttacccttta 48327762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 157 - 322
Target Start/End: Original strand, 14983791 - 14983953
Alignment:
Q  157 gggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagac 256  Q
    ||||||||||| |  |||||||||| |||||||||| ||| || |||||||||| |||||||| | |||| || ||||||||||||||| ||||||||      
T  14983791 gggtaaccttggcagaactggtaaagttgttgtcatatgattggaaggtcacggattcaagtctttgaaacagcctcttgtgtaaaaaatagggtaaggt 14983890  T
Q  257 tgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtg 322  Q
    ||| ||||||||||   ||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||| |||||    
T  14983891 tgcctacaatacac--taaatggtgggaccc-cttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtg 14983953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 183 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 39077946 - 39077803
Alignment:
Q  183 ttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgg 282  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  |||||||||  ||||||||||| ||||||  |||||     
T  39077946 ttgttgtcatgtgattgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggttgcgtacaatataccaaa--tggtga 39077851  T
Q  283 gacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggtt 331  Q
    |||   ||||| || |||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  39077850 gacatctttccgga-ccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggtt 39077803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 154 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 55766647 - 55766466
Alignment:
Q  154 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcac-gggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggta 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||  |||||| ||| ||||||||   ||||||||||    
T  55766647 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgaccggaaggtcacggggttcaagttttggaaacagtttcttgtgt-gtaaacagggta 55766549  T
Q  253 agactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    || |||||||||||||||    |||||||| ||||   ||||| ||| || ||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||    
T  55766548 aggctgcgtacaatacac--tgaatggtggaaccc-catcccggaccttgcgtatgcgagagctttagtgcaccgggatgcccttt 55766466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 178 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 23580365 - 23580268
Alignment:
Q  178 taaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaa 275  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  23580365 taaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagttctagaaagagcctcttgtgtaaaaaacaggggaagactgcgtaggatacaccaaaa 23580268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 176 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 487294 - 487187
Alignment:
Q  176 ggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaa 275  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||| | |||    
T  487294 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcttggaaacaacctcttgtgtataaaacaaggtaaagctgcgtacaataca-ctaaa 487196  T
Q  276 atggtggga 284  Q
    |||||||||    
T  487195 atggtggga 487187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 155 - 329
Target Start/End: Original strand, 54966977 - 54967145
Alignment:
Q  155 aggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaag 254  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  54966977 agggggaaccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacatgttcaagttctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaag 54967075  T
Q  255 actgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccggg 329  Q
      ||| ||||||| |||  ||||||||||||||  |||||| |||||   |||||||||||| | ||||||||||    
T  54967076 gttgc-tacaatatacc--aaatggtgggaccc-cttcccgtaccctacatatgcgggagct-ttgtgcaccggg 54967145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 176 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 47441689 - 47441591
Alignment:
Q  176 ggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaa 274  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  47441689 ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacaggttcaagtccaagaaacagtctcttttgtaaaaatcagggtaaggctgtgtacaatacaccaaa 47441591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 154 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 55830902 - 55830786
Alignment:
Q  154 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgg-gttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggta 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||   ||||||||||    
T  55830902 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgatcggaaggtcacggagttcaagttttggaaacagtctcttgtgt-gtaaacagggta 55830804  T
Q  253 agactgcgtacaatacac 270  Q
    |  |||||||||||||||    
T  55830803 atgctgcgtacaatacac 55830786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 176 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 39029220 - 39029082
Alignment:
Q  176 ggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaa 275  Q
    |||||| |||||||| ||||||| ||||||||  |||||||| | |||||| || |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||    
T  39029220 ggtaaagttgttgtcgtgtgactaaaaggtcataggttcaagccttggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgtgtacaataca-cgaaa 39029122  T
Q  276 atggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagct 316  Q
    |||||||||||  ||| ||| ||||||  ||||||||||||    
T  39029121 atggtgggaccacttt-ccggaccctgcatatgcgggagct 39029082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 176 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 42164307 - 42164224
Alignment:
Q  176 ggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcg 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  42164307 ggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcttggaaacaacctcttgtgta-aaaacagggtaaggctgcg 42164224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 188 - 275
Target Start/End: Original strand, 7038041 - 7038127
Alignment:
Q  188 gtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaa 275  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7038041 gtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctg-aaacagcttcttgtgtaaaaaatagggtaagacttcgtacaatacaccaaaa 7038127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 157 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 17315476 - 17315389
Alignment:
Q  157 gggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaa 244  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |  ||||||||||||||    
T  17315476 gggtaaccttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaattcctcgaaacaacctcttgtgtaaaaa 17315389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 220 - 338
Target Start/End: Original strand, 25629069 - 25629184
Alignment:
Q  220 ctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctata 319  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||  |||||| |||||   |||||||||||| ||    
T  25629069 ctggaaacagtctcttgtgtaaaaaatagggtaaggctgtgtacaatacacc--aaatggtgggaccc-cttcccggaccctacatatgcgggagcttta 25629165  T
Q  320 gtgcaccgggttacccttt 338  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  25629166 gtgcaccgggttgcccttt 25629184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 176 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 20908797 - 20908649
Alignment:
Q  176 ggtaaaattgttgtcatgtgactgaaag-gtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaa 274  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  || ||  ||||||||| |||||| |   |||| | ||||||| | |||||| |||||||||||||||||||    
T  20908797 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaatgttacatgttcaagtcatggaaacatcgtcttttctaaaaaagaaggtaaggctgcgtacaatacaccaaa 20908698  T
Q  275 aatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcac 325  Q
    | ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  20908697 a-tggtgggacccctt-cccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcac 20908649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 218 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 7909397 - 7909281
Alignment:
Q  218 tcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgc-gggagct 316  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||||    
T  7909397 tcctggaaacagtctcttgtgtaaaaa-cagggtaaggttgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccc-cttcccgaaccctgcgtatgcggggagct 7909302  T
Q  317 atagtgcaccgggttaccctt 337  Q
     ||||||| |||||| |||||    
T  7909301 ttagtgcatcgggttgccctt 7909281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 245 - 340
Target Start/End: Original strand, 20225119 - 20225213
Alignment:
Q  245 acagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttaccctttat 340  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||| |  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  20225119 acagggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccc-cttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttat 20225213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 183 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 41018945 - 41018855
Alignment:
Q  183 ttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaa 274  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||  |||||||| || ||||||||||||||||    
T  41018945 ttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgt-aaaattagggtaaggctacgtacaatacaccaaa 41018855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 183 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 49938742 - 49938615
Alignment:
Q  183 ttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgg 282  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| |||||||   | |||||||||||| ||||||||||    
T  49938742 ttgttgtcacgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta-aaaacggggtaag---gtgtacaatacacc-aaaatggtgg 49938648  T
Q  283 gacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagct 316  Q
    |||||  |||||  ||||||  ||||||||||||    
T  49938647 gaccc-cttcccataccctgcatatgcgggagct 49938615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 163 - 329
Target Start/End: Original strand, 36589708 - 36589870
Alignment:
Q  163 ccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgta 262  Q
    ||||| |||||| |||||| ||| |||||  ||||||||| ||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||  |||   |    
T  36589708 ccttggcgcaac-ggtaaagttgatgtcacatgactgaaacgtc-caggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacatggtaatgctgttga 36589805  T
Q  263 caatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccggg 329  Q
    || |||||| |||||||||||||||  |||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||    
T  36589806 cagtacacc-aaaatggtgggaccc-cttcctgaaccctatgtatgcgggagctttggtgcaccggg 36589870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 163 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 54640510 - 54640429
Alignment:
Q  163 ccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaa 245  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  54640510 ccttggcgcaac-ggtaaaattgttgtcacgtggctgaaaggtcacgggttcaagtcttggaaacagcctcttgtgtaaaaaa 54640429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 244 - 338
Target Start/End: Original strand, 2813169 - 2813263
Alignment:
Q  244 aacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctat-agtgcaccgggttacccttt 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||| | |||||||||| || ||||||    
T  2813169 aacagggtaagactgcgtacaatacatcaataatggtgggaccc-tttcccgaacgatgcgtatgcgggagctttaagtgcaccggattgcccttt 2813263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 242 - 329
Target Start/End: Original strand, 16494259 - 16494345
Alignment:
Q  242 aaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccggg 329  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||    
T  16494259 aaaacagggtaaagctgcatacaatacaccaaaaatggtgggaccc-tttcccagaccctgtgtatgcggaagctttagtgtaccggg 16494345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 164 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 30496491 - 30496383
Alignment:
Q  164 cttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtac 263  Q
    |||| ||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || |||||||||||| |   ||||||| |||| |||    
T  30496491 cttggcgcaactgtaaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgtgttcaagtcatggaaacagcctcttgtgtaaaca--cgggtaaggctgcatac 30496394  T
Q  264 aatacaccaaa 274  Q
    |||||||||||    
T  30496393 aatacaccaaa 30496383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 176 - 259
Target Start/End: Original strand, 43035224 - 43035307
Alignment:
Q  176 ggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgc 259  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  43035224 ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtccaggaaacaacctcttgtgtaagaaacacggtaaggctgc 43035307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 231 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 51865142 - 51865048
Alignment:
Q  231 ctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgg 328  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  51865142 ctcttgtgtaaaaaacatggtaaggctgcgtacaatacacc--aaatggtggggccc-cttcccggaccctgcgtatgcgggagctttattgcaccgg 51865048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 157 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 5313172 - 5313107
Alignment:
Q  157 gggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctg 222  Q
    ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  5313172 gggtaaccttggcgtaactggtaaagttgttgtcatgtgattgaaaggtcacgggttcaattcctg 5313107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 178 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 32478942 - 32478790
Alignment:
Q  178 taaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaat 277  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| |  |||| |||| |||||||||||||| |||     ||||||||  ||||    
T  32478942 taaagttgttgtcatgtgaccgagaggtcacaggttcaagtcctggaaacaacctctagtgt-aaaaacagggtaaggctg-----aatacacc--aaat 32478851  T
Q  278 ggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttaccctttat 340  Q
    ||||||||||  |||||| |||| | ||||||||||||| | |||||||||||  ||||||||    
T  32478850 ggtgggaccc-cttcccggacccagcgtatgcgggagct-ttgtgcaccgggtggccctttat 32478790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 199 - 316
Target Start/End: Original strand, 9037729 - 9037844
Alignment:
Q  199 gaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaac 298  Q
    ||||||||||  ||||||||| | |||||| ||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||   |||||| |||||| ||| ||||||    
T  9037729 gaaaggtcacatgttcaagtcatagaaataatctcttgtgcataaaatagggtaagactgcatacaatacacc--gaatggtaggaccccttttccgaac 9037826  T
Q  299 cctgtgtatgcgggagct 316  Q
     ||| |||||| ||||||    
T  9037827 actgcgtatgcaggagct 9037844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 178 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 30581624 - 30581515
Alignment:
Q  178 taaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaa-aaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaa 276  Q
    |||| |||||||||  | ||| |||||||| ||||||||||| |||||| |  ||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||| ||||    
T  30581624 taaagttgttgtcacatcactaaaaggtcaagggttcaagtcgtggaaacaacctcttgtgtaaaaaaacagggtaagggtgtgtacaatacacc-aaaa 30581526  T
Q  277 tggtgggaccc 287  Q
    |||||||||||    
T  30581525 tggtgggaccc 30581515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 32629418 - 32629350
Alignment:
Q  185 gttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaag 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||    
T  32629418 gttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaaatcctcgaaacagcctcttgt-aaaaaaacagggtaag 32629350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 261 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 33836563 - 33836487
Alignment:
Q  261 tacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  33836563 tacaatacaccaataatggtgggacccctt-cccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaacgggttgcccttt 33836487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 241 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 36816479 - 36816384
Alignment:
Q  241 aaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    |||||||||| | | ||||||||||||||||||||| |||||||| | || || | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  36816479 aaaaacagggcagggctgcgtacaatacaccaaaaa-ggtgggactcctt-cctggaccctgtgtatgcgggagctttagtgtaccgggttgcccttt 36816384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 220 - 316
Target Start/End: Original strand, 49796818 - 49796910
Alignment:
Q  220 ctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagct 316  Q
    ||||||| || ||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  49796818 ctggaaacagcctcttgtgttaaaa-catggtaaggctgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccc-cttcccgaaccctgcgtatgcgggagct 49796910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 3580994 - 3580901
Alignment:
Q  177 gtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaa 274  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||    |||||||||||||| || |||||| ||| || ||||||||||||    
T  3580994 gtaaagttgttgtcatgtgactgaaaagtcacgagttcaagt-ctggaaa---cctcttgtgtaaaaaccatggtaaggctgtgtgcaatacaccaaa 3580901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 183 - 272
Target Start/End: Original strand, 51420556 - 51420646
Alignment:
Q  183 ttgttgtcatgtgactgaaaggtcacggg-ttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacacca 272  Q
    ||||||||| |||||||||||||||   | |||||||| |||||| |  |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  51420556 ttgttgtcacgtgactgaaaggtcagttgattcaagtcatggaaacaacctcttgtgtagaaaacagggtaaggctgggtacaatacacca 51420646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 274 - 339
Target Start/End: Original strand, 11394924 - 11394988
Alignment:
Q  274 aaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttta 339  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  11394924 aaatggtgggacccctttccgga-ccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttta 11394988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 274 - 339
Target Start/End: Original strand, 11404651 - 11404715
Alignment:
Q  274 aaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttta 339  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  11404651 aaatggtgggacccctttccgga-ccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttta 11404715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 12257764 - 12257688
Alignment:
Q  163 ccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgta 240  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| |||| ||  |||||||||    
T  12257764 ccttgacgcaac-ggtaaagttgttgtcacgtgattgaaaggtcacgggttcaaatcctagaaacagcgtcttgtgta 12257688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 9987957 - 9987884
Alignment:
Q  212 ttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccc 287  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  9987957 ttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaacaatagggtaaggctgcatacaatacacc--aaatggtgggaccc 9987884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 38755970 - 38755907
Alignment:
Q  275 aatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttta 339  Q
    ||||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  38755970 aatggtgggacccctt-cccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttta 38755907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 275
Target Start/End: Original strand, 44357195 - 44357295
Alignment:
Q  175 tggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaa 274  Q
    ||||||| || |||| |||| |||||||||||| | ||||||||||| |||| |  || |||||||| ||| || |||||||  ||||||||||||||||    
T  44357195 tggtaaagttattgttatgtaactgaaaggtcatgagttcaagtcctagaaacaaccttttgtgtaataaatagagtaagacgacgtacaatacaccaaa 44357294  T
Q  275 a 275  Q
    |    
T  44357295 a 44357295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 175 - 278
Target Start/End: Original strand, 11579819 - 11579922
Alignment:
Q  175 tggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaa 274  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| | ||  |||| ||||| |||||| | ||| |||| |||||||||   ||| ||||| ||||||||||||||    
T  11579819 tggtaaagttgttgtcatgtgattgaaatggcataggtttaagtcttggaaacaatctattgtataaaaaacaatataaaactgcatacaatacaccaaa 11579918  T
Q  275 aatg 278  Q
    ||||    
T  11579919 aatg 11579922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 163 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 49938610 - 49938490
Alignment:
Q  163 ccttgacgcaactggtaaaa-ttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgt 261  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| |||||  ||  | |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  49938610 ccttggcgcaac-ggtaaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacagattcaagtcttggaagcagcgtattgtgt-aaaaacagggtaaggctgcgt 49938513  T
Q  262 acaatacaccaaaaatggtgggac 285  Q
     |||| || | |||||||||||||    
T  49938512 ccaattcatc-aaaatggtgggac 49938490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 209 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 17079777 - 17079698
Alignment:
Q  209 gggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttt 290  Q
    ||||||||||| |||||| | | ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| |   |||||||||||||||||    
T  17079777 gggttcaagtcttggaaacaatatcttgtgtataaaacagggtaaggctgcatacaatacgc--taaatggtgggacccttt 17079698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 234 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 35894563 - 35894511
Alignment:
Q  234 ttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccc 287  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35894563 ttgtgtaaaaaacacggtaagtgtgcgtacaatacacc-aaaatggtgggaccc 35894511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 40553985 - 40553936
Alignment:
Q  290 ttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttta 339  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  40553985 ttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttta 40553936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 157 - 197
Target Start/End: Original strand, 18969698 - 18969738
Alignment:
Q  157 gggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgac 197  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18969698 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgac 18969738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 290 - 338
Target Start/End: Original strand, 35532079 - 35532127
Alignment:
Q  290 ttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  35532079 ttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 35532127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 274 - 338
Target Start/End: Original strand, 38786681 - 38786744
Alignment:
Q  274 aaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    |||||||||||||| || |||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  38786681 aaatggtgggacccctt-cccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 38786744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 10380086 - 10380004
Alignment:
Q  191 atgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaa 274  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||  ||| |  |||||||||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  10380086 atgtgactgaaaggtcacttgttcaagtcctacaaacaacctcttgtgta-aaaataggataaaattgcgtacaatacaccaaa 10380004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 232 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 12711553 - 12711510
Alignment:
Q  232 tcttgtgtaaaaaac-agggtaagactgcgtacaatacaccaaa 274  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12711553 tcttgtgtaaaaaaatagggtaagactgcgtacaatacaccaaa 12711510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 50856407 - 50856345
Alignment:
Q  163 ccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaa 226  Q
    ||||| |||||| |||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  50856407 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcacatgattgaaaggtcacgggttcaagtcctagaaa 50856345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 276 - 338
Target Start/End: Original strand, 32484307 - 32484368
Alignment:
Q  276 atggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    |||||||||||| || |||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  32484307 atggtgggacccctt-cccggaccctgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 32484368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 275 - 340
Target Start/End: Original strand, 25388249 - 25388313
Alignment:
Q  275 aatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttaccctttat 340  Q
    ||||||||||||| || |||| |||||| ||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  25388249 aatggtgggacccctt-cccggaccctgcgtatgcatgagctttagtgcaccgggttgccctttat 25388313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 232 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 23914430 - 23914379
Alignment:
Q  232 tcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtggga 284  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  23914430 tcttgtgtaaaaat-agggtaagactgcatacaatacatcaaatatggtggga 23914379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168 (Bit Score: 103; Significance: 5e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0168
Description:

Target: scaffold0168; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 154 - 338
Target Start/End: Original strand, 30533 - 30712
Alignment:
Q  154 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 253  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||  |||||||||||     
T  30533 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcaccggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtag 30630  T
Q  254 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    | ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  30631 ggctgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccc-cttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 30712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0187 (Bit Score: 98; Significance: 5e-48; HSPs: 4)
Name: scaffold0187
Description:

Target: scaffold0187; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 157 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 10226 - 10052
Alignment:
Q  157 gggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagac 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||| |||||||    
T  10226 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagagtaagac 10129  T
Q  257 tgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttaccct 336  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||||||  |||||| ||||||  ||||| ||||||  ||||||||||||| ||||    
T  10128 tgcgtacaatacacc--aaatagtgggaccc-cttcccggaccctgcatatgcaggagctccagtgcaccgggttgccct 10052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0187; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 157 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 20554 - 20380
Alignment:
Q  157 gggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagac 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||| |||||||    
T  20554 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagagtaagac 20457  T
Q  257 tgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttaccct 336  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||||||  |||||| ||||||  ||||| ||||||  ||||||||||||| ||||    
T  20456 tgcgtacaatacacc--aaatagtgggaccc-cttcccggaccctgcatatgcaggagctccagtgcaccgggttgccct 20380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0187; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 219
Target Start/End: Original strand, 8899 - 8964
Alignment:
Q  154 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtc 219  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  8899 gaggggtaaccttggcgcaaccggtgaagttgttgtcatgtgactgaaatgtcacaggttcaagtc 8964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0187; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 219
Target Start/End: Original strand, 19227 - 19292
Alignment:
Q  154 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtc 219  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  19227 gaggggtaaccttggcgcaaccggtgaagttgttgtcatgtgactgaaatgtcacaggttcaagtc 19292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 4)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 154 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 24948 - 24772
Alignment:
Q  154 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 253  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     || || |||||||||||||||||||||||    
T  24948 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtc-----aacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaa 24854  T
Q  254 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    | |||||||||| |||||  ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | |||| ||||||    
T  24853 ggctgcgtacaacacacc--aaatggtgggaccc-cttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcagccggttgcccttt 24772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 163 - 338
Target Start/End: Original strand, 46794 - 46966
Alignment:
Q  163 ccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgta 262  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||  ||||||    
T  46794 ccttggcgcaattggtaaagttgttgtcatgtgactagaaggtcacgggttcaagtgctggaaacaacctcttgtgtaaaaaatagggtaaggttgcgta 46893  T
Q  263 caatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    |||||||||  ||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  46894 caatacacc--aaatggtgggaccc-cttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 46966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 213 - 338
Target Start/End: Original strand, 43672 - 43793
Alignment:
Q  213 tcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcggg 312  Q
    |||||| ||||||| ||  ||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| || ||||||  ||||||||    
T  43672 tcaagttctggaaacagcgtcttgtgtaaaa--caaggtaaggctgcgtacaatacaccaaa--tggtgggacccctttctcggaccctgcatatgcggg 43767  T
Q  313 agctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    |||| |||||||| | ||| ||||||    
T  43768 agctctagtgcactgagttgcccttt 43793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 47041 - 46995
Alignment:
Q  177 gtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctgg 223  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47041 gtaaagttgttgtcaggtgactgaaaggtcacgagttcaagtcctgg 46995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0258 (Bit Score: 88; Significance: 4e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0258
Description:

Target: scaffold0258; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 156 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 13202 - 13024
Alignment:
Q  156 ggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaaga 255  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| || ||||||| ||||||     
T  13202 ggggtaaccttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcaccggttcaagtcctggaaacagcctcttgcgt-aaaaacaaggtaagg 13104  T
Q  256 ctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||  |||||  |||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||    
T  13103 ctgcgtacaatacacc--gaatggtgggaccc-cttcccagaccctgcgtatgcgggggctttagtgcaccgggttgcccttt 13024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0258; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 155 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 17549 - 17507
Alignment:
Q  155 aggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgac 197  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  17549 aggggtaaccttaacgcaactgctaaagttgttgtcatgtgac 17507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0311 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0311
Description:

Target: scaffold0311; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 170 - 331
Target Start/End: Original strand, 10780 - 10938
Alignment:
Q  170 gcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaataca 269  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||| |  |||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||    
T  10780 gcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaaggtctgaaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtagggctgcgtccaataca 10879  T
Q  270 ccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggtt 331  Q
    ||  ||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  10880 cc--aaatggtgggaccc-cttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcactgggtt 10938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1176 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold1176
Description:

Target: scaffold1176; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 162 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 1758 - 1585
Alignment:
Q  162 accttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgt 261  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |  |||||||||  |||||||| |||| |||| |    
T  1758 accttgacgcaattggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctgaaaacaacctcttgtgt--aaaacaggataaggctgcat 1661  T
Q  262 acaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttaccctttat 340  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||  |||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||    
T  1660 acaatacacc--aaatgatgggaccc-cttcccggacccggcgtatgcgggagctttagtgcaccaggttgccttttat 1585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0223 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0223
Description:

Target: scaffold0223; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 161 - 339
Target Start/End: Original strand, 11093 - 11265
Alignment:
Q  161 aaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcg 260  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||  ||||| ||||     
T  11093 aaccttggcgcaactggtaaagttgttct-atgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacaaagtaaggctgct 11189  T
Q  261 tacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttta 339  Q
    |||||||||||  |||||||||||| |  |||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||    
T  11190 tacaatacacc--aaatggtgggacac-cttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttta 11265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 71; Significance: 6e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 158 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 226583 - 226456
Alignment:
Q  158 ggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgt-aaaaaacagggtaagac 256  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || ||||||| | ||||||||||||||| |    
T  226583 ggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacggattcaagtcctagaaacagcctcttgtctaaaaaaacagggtaaggc 226484  T
Q  257 tgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacc 286  Q
    ||| ||||||||| |  |||||||||||||    
T  226483 tgcatacaatacatc--aaatggtgggacc 226456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 159 - 287
Target Start/End: Original strand, 4117 - 4245
Alignment:
Q  159 gtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactg 258  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| ||||  ||    
T  4117 gtaaccttg-cgcaactagtaaagttgttgttatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaatacaggataaggttg 4215  T
Q  259 cgtacaatacaccaa-aaatggtgggaccc 287  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  4216 cgtacaatacaccaataattggtgggaccc 4245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 64; Significance: 9e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 170 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 35184 - 35064
Alignment:
Q  170 gcaactggtaaaattg-ttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgt-aaaaaacagggtaagactgcgtacaata 267  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||    
T  35184 gcaactggtaaagtttattgtcatgtgactgtaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagtctcttgtgtgtgaaaacagggtaaggctgcgtacaata 35085  T
Q  268 caccaaaaatggtgggacccttt 290  Q
    ||||  |||||||||||||||||    
T  35084 cacc--aaatggtgggacccttt 35064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0024
Description:

Target: scaffold0024; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 154 - 226
Target Start/End: Original strand, 83829 - 83901
Alignment:
Q  154 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaa 226  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  83829 gaggggtaaccttggcgcaactagtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcttggaaa 83901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 162 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 73034 - 72867
Alignment:
Q  162 accttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaata-gtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcg 260  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||        |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||     
T  73034 accttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgt-------gtcacgggttcaagtcctagaaacaagtctcttgtgtaaaaaacacggtaaggctgcc 72942  T
Q  261 tacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    |||||||||||  ||||||| | ||||  |||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||    
T  72941 tacaatacacc--aaatggtagtaccc-cttcccggaacctgcgtatgcgggagctttagtgcaccaggttgcccttt 72867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 209 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 48758 - 48634
Alignment:
Q  209 gggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatg 308  Q
    ||||||||||  |||||| || |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| || |||| ||||||  ||||    
T  48758 gggttcaagtggtggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaa--tggtgggacccctt-cccggaccctgcatatg 48664  T
Q  309 cgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  48663 cgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 48634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0954 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0954
Description:

Target: scaffold0954; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 191 - 339
Target Start/End: Original strand, 3537 - 3680
Alignment:
Q  191 atgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttt 290  Q
    |||||||||||||||||| |  |  ||||||||||| || ||||||||||||| | | |||||| ||||||| |||||||| ||  || |||||||| ||    
T  3537 atgtgactgaaaggtcacag--tagagtcctggaaagagcctcttgtgtaaaatataaggtaaggctgcgtataatacaccgaa--tgatgggacccctt 3632  T
Q  291 tcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttta 339  Q
     ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| ||| |||||||    
T  3633 -cccgaaccctgcgtatgcggcagctttagtgcaccgagtttcccttta 3680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 153 - 244
Target Start/End: Original strand, 8847 - 8935
Alignment:
Q  153 agaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaa 244  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |   |||||||||||||    
T  8847 agaggggtaaccttgacgc---tggtaaagttgttgtcatgtgactgtaaggtcacaggttcaattcctggaaacaacttcttgtgtaaaaa 8935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0194 (Bit Score: 44; Significance: 8e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0194
Description:

Target: scaffold0194; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 155 - 226
Target Start/End: Original strand, 24619 - 24690
Alignment:
Q  155 aggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaa 226  Q
    ||||||||||||| | ||| || |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24619 aggggtaaccttggcacaattgataaagttgttgtcaagtgactgtaaggtcacgggttcaagtcctggaaa 24690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 44; Significance: 8e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 169 - 244
Target Start/End: Original strand, 43098 - 43173
Alignment:
Q  169 cgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaa 244  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||| || ||||||||||||||    
T  43098 cgcaactggtaaagttattgtcatgtgattgaaaggtcacgagttcaggtcctagaaacagcctcttgtgtaaaaa 43173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 44; Significance: 8e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 183 - 290
Target Start/End: Original strand, 32913 - 33019
Alignment:
Q  183 ttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgg 282  Q
    |||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||  |||| |  ||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||| ||||||    
T  32913 ttgttgccacgtgacttaaaggtcatgggttcaagtccgcgaaaaaacctcttctgtaaaaaacagagtaagactgtatacaatacacc-aaattggtgg 33011  T
Q  283 gacccttt 290  Q
    ||||||||    
T  33012 gacccttt 33019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 248 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 24220 - 24133
Alignment:
Q  248 gggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 338  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| || |||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  24220 gggtaaggctgcgtacaatacaccaaa--tggtgggacccctt-cccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccggattgcccttt 24133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 191 - 266
Target Start/End: Original strand, 23590 - 23665
Alignment:
Q  191 atgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaat 266  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| || ||| |  ||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  23590 atgtgactgaaagggtacgggttcaagtcttgcaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtgaggctgcgtacaat 23665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University