View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF21601_low_15 (Length: 344)

Name: NF21601_low_15
Description: NF21601
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF21601_low_15
NF21601_low_15
[»] chr6 (17 HSPs)
chr6 (1-328)||(11126785-11127111)
chr6 (1-331)||(25456101-25456430)
chr6 (1-322)||(24409021-24409342)
chr6 (1-322)||(14968276-14968598)
chr6 (9-331)||(12981361-12981684)
chr6 (1-332)||(28108841-28109177)
chr6 (1-331)||(23379991-23380325)
chr6 (1-299)||(22300758-22301059)
chr6 (138-320)||(12745581-12745762)
chr6 (22-318)||(21633068-21633362)
chr6 (103-293)||(32111836-32112025)
chr6 (235-314)||(7836896-7836976)
chr6 (11-123)||(22959657-22959769)
chr6 (11-123)||(23828623-23828735)
chr6 (138-185)||(7836819-7836866)
chr6 (8-110)||(12745461-12745564)
chr6 (3-43)||(23895458-23895498)
[»] scaffold0083 (1 HSPs)
scaffold0083 (1-316)||(27946-28259)
[»] chr8 (12 HSPs)
chr8 (1-332)||(17929720-17930054)
chr8 (1-331)||(12584962-12585295)
chr8 (1-320)||(38249547-38249870)
chr8 (1-331)||(8910351-8910684)
chr8 (16-331)||(23944995-23945313)
chr8 (1-331)||(33878415-33878747)
chr8 (1-331)||(22175068-22175401)
chr8 (3-320)||(23645771-23646090)
chr8 (1-322)||(25592685-25593011)
chr8 (23-331)||(22223506-22223813)
chr8 (23-331)||(22229848-22230155)
chr8 (128-322)||(31983729-31983923)
[»] chr7 (8 HSPs)
chr7 (1-332)||(20595392-20595722)
chr7 (1-331)||(45288315-45288648)
chr7 (1-322)||(22255945-22256270)
chr7 (9-322)||(4544430-4544746)
chr7 (17-327)||(9274215-9274525)
chr7 (88-314)||(13810598-13810825)
chr7 (22-181)||(16222745-16222904)
chr7 (247-322)||(26137226-26137301)
[»] chr2 (11 HSPs)
chr2 (1-331)||(45455790-45456123)
chr2 (1-331)||(1504494-1504827)
chr2 (1-331)||(9186520-9186852)
chr2 (1-320)||(25872693-25873016)
chr2 (29-322)||(24237075-24237369)
chr2 (1-331)||(31428614-31428947)
chr2 (29-322)||(25957548-25957844)
chr2 (1-331)||(13972990-13973323)
chr2 (22-328)||(11058542-11058850)
chr2 (1-99)||(16788842-16788939)
chr2 (8-98)||(30151195-30151285)
[»] chr4 (16 HSPs)
chr4 (18-332)||(33411138-33411451)
chr4 (1-298)||(15162891-15163188)
chr4 (1-322)||(27678151-27678476)
chr4 (1-331)||(39500373-39500708)
chr4 (9-331)||(56197527-56197852)
chr4 (9-322)||(3798981-3799298)
chr4 (22-333)||(53894984-53895293)
chr4 (128-322)||(19861472-19861666)
chr4 (1-331)||(49637675-49638006)
chr4 (156-331)||(15430943-15431116)
chr4 (156-331)||(15437557-15437730)
chr4 (139-314)||(26061004-26061179)
chr4 (9-110)||(19826273-19826375)
chr4 (229-331)||(19826421-19826524)
chr4 (1-82)||(15432436-15432515)
chr4 (243-293)||(22090970-22091020)
[»] chr3 (24 HSPs)
chr3 (1-332)||(7832282-7832614)
chr3 (1-331)||(10883506-10883839)
chr3 (1-311)||(55032834-55033148)
chr3 (1-331)||(47053456-47053784)
chr3 (1-331)||(2777505-2777838)
chr3 (100-331)||(15196374-15196604)
chr3 (1-322)||(28329388-28329712)
chr3 (1-320)||(24127556-24127877)
chr3 (22-332)||(9157024-9157332)
chr3 (1-327)||(19302544-19302871)
chr3 (129-322)||(36533884-36534077)
chr3 (14-320)||(10961931-10962244)
chr3 (14-320)||(10965440-10965753)
chr3 (1-278)||(13558426-13558705)
chr3 (137-314)||(22994786-22994963)
chr3 (128-293)||(30159230-30159394)
chr3 (197-319)||(3839478-3839602)
chr3 (1-188)||(22026250-22026442)
chr3 (96-234)||(12541300-12541436)
chr3 (28-331)||(11635637-11635934)
chr3 (88-314)||(18541392-18541620)
chr3 (1-51)||(15196616-15196666)
chr3 (1-43)||(11757993-11758035)
chr3 (210-238)||(17140631-17140659)
[»] chr5 (10 HSPs)
chr5 (1-332)||(2837866-2838199)
chr5 (14-322)||(34134060-34134375)
chr5 (53-331)||(22938232-22938513)
chr5 (22-331)||(19688270-19688578)
chr5 (103-322)||(2455586-2455805)
chr5 (22-327)||(26550320-26550627)
chr5 (22-325)||(28563505-28563810)
chr5 (128-285)||(30763599-30763756)
chr5 (1-110)||(21333763-21333873)
chr5 (22-85)||(35382068-35382131)
[»] chr1 (5 HSPs)
chr1 (9-293)||(22454531-22454815)
chr1 (1-322)||(45940111-45940436)
chr1 (8-331)||(21019543-21019869)
chr1 (22-328)||(49718338-49718646)
chr1 (1-299)||(13640218-13640519)
[»] scaffold0048 (3 HSPs)
scaffold0048 (14-322)||(27771-28086)
scaffold0048 (1-183)||(23561-23741)
scaffold0048 (214-322)||(23739-23850)
[»] scaffold0270 (1 HSPs)
scaffold0270 (1-331)||(1241-1574)
[»] scaffold0321 (1 HSPs)
scaffold0321 (1-320)||(4035-4359)
[»] scaffold0214 (2 HSPs)
scaffold0214 (1-331)||(12176-12507)
scaffold0214 (1-331)||(26192-26523)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (1-320)||(28076-28392)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (1-328)||(754-1084)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (103-322)||(9307-9526)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (1-322)||(96113-96422)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (22-331)||(99364-99670)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (128-322)||(226087-226281)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (138-314)||(49513-49689)
[»] scaffold1785 (1 HSPs)
scaffold1785 (128-249)||(468-587)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (128-249)||(63078-63197)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 265; Significance: 1e-148; HSPs: 17)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 11127111 - 11126785
Alignment:
Q  1 tgaaaacgggacaaaacattgaaaatctgagtaacttcaaacttgattgtctcaattgttacaagtaatatctagtacccttacaagaattgttgttcca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11127111 tgaaaacgggacaaaacattgaaaatctgagtaacttcaaactcgattgtctcaattgttacaagtaatctctagtacccttacaagaattgttgttcca 11127012  T
Q  101 aaggtgaatgttggattcaatttatgttttaactttcgtaggagtgcctaactaaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatcccacggccttca 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||    
T  11127011 aaggtgaatgttggattgaatttatgttttaacttccgtaggagtgcctaactcaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatccca---ccttca 11126915  T
Q  201 tctaagctccgttataaccctgaaagacctcaaagtgt--attgacattgattttgattgacatttagaaacttttcaagtgtatggtaaaatgtggatt 298  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11126914 tctaagccccgttataaccctgaaagaccacaaagtgtgcattgacattgattttgattgacgtttagaaacttttcaagtgtatggtaatatgtggatt 11126815  T
Q  299 gcatgtcgactgtgtgtgaaccctattcat 328  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11126814 gcatgtcgattgtgtgtgaaccctattcat 11126785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Original strand, 25456101 - 25456430
Alignment:
Q  1 tgaaaacgggacaaaacattgaaaatctgagtaacttcaaacttgattgtctcaattgttacaagtaatatctagtacccttacaagaattgttgttcca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||| ||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25456101 tgaaaacgggacaaaacattgaaaatatgagtaactttaaactcaattgtcccaattgttataaataatctctagtacccttacaagaattgttgttcca 25456200  T
Q  101 aaggtgaatgttggattcaatttatgttttaactttcgtaggagtgcctaact-aaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatcccacggccttc 199  Q
    |||||||||| |||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||||    
T  25456201 aaggtgaatgatggattaaatttgtgctttaacttccgtaggagtgcctaactcaaaattttatgtagcctacttatccaaatattatccca---ccttc 25456297  T
Q  200 atctaagctccgttataaccctgaaagacctcaaagtgt--attgacattgattttgattgacatttagaaacttttcaagtgtatggtaaaatgtggat 297  Q
    | |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||    
T  25456298 acctaagccccgttataaccctttaagacctcaaagtgtgcattgacattgattttgattgacgtttagaaacttttcaagcgtatggtaatatgtagat 25456397  T
Q  298 tgcatgtcgactgtgtgtgaaccctattcatatt 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25456398 tgcatgtcgactgtgtgtgaaccct-ttcatatt 25456430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Original strand, 24409021 - 24409342
Alignment:
Q  1 tgaaaacgggacaaaacattgaaaatctgagtaacttcaaacttgattgtctcaattgttacaagtaatatctagtacccttacaagaattgttgttcca 100  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| | |||||||||||||||  |||||| ||||||||  || |||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24409021 tgaaaaagggacaagacattgaaaaaccgagtaacttcaaactcaattgtcccaattgttttaaataatctctagtacccttgcaagaattgttgttcca 24409120  T
Q  101 aa-ggtgaatgttggattcaatttatgttttaactttcgtaggagtgcctaactaaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatcccacggccttc 199  Q
    || |||||||| |||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||    
T  24409121 aaaggtgaatgatggattgaatttgtgctttaacttccgtaggagtgcctaactcaaattttgtgtagcctacttatccaaataatatccca---ccttc 24409217  T
Q  200 atctaagctccgttataaccctgaaagacctcaaagtgt--attgacattgattttgattgacatttagaaacttttcaagtgtatggtaaaatgtggat 297  Q
    | |||||| || |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||  ||    
T  24409218 acctaagccccattataacccttaaagacctcaaagtgtgcattgacatggattttgattgacgtttagaaacttttcaagcatatggtaatatgtaaat 24409317  T
Q  298 tgcatgtcgactgtgtgtgaaccct 322  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  24409318 ttcatgtcgactgtgtgtgaaccct 24409342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Original strand, 14968276 - 14968598
Alignment:
Q  1 tgaaaacgggacaaaacattgaaaatctgagtaacttcaaacttgattgtctcaattgttacaagtaatatctagtacccttacaagaattgttgttcca 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||| |||||||||| | |||| ||||||||||||    
T  14968276 tgaaaaagggacaaaacattgaaaattcgagtaacttcaaactcgattgtcccaattgttataaataatctctagtacccgtgcaagtattgttgttcca 14968375  T
Q  101 aaggtgaatgttggattcaatttatgttttaactttcgtaggagtgcctaact-aaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatcccacggccttc 199  Q
    |||||||||| |  ||| ||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||    
T  14968376 aaggtgaatgatatattgaatttgtgctttaacttttgtaggagtgcctaactcaaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatcgca---ccttc 14968472  T
Q  200 atctaagctccgttataaccctgaaagacctcaaagtgt--attgacattgattttgattgacatttagaaacttttcaagtgtatggtaaaatgtgga- 296  Q
    | |||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||     
T  14968473 acctaagccccgttataaccatttaagacctcaaagtgtgcattgacattgattttgattgacgtttagaaacttttcaagcgtatgataatatgtagac 14968572  T
Q  297 ttgcatgtcgactgtgtgtgaaccct 322  Q
     |||||||||||||||||||||||||    
T  14968573 ctgcatgtcgactgtgtgtgaaccct 14968598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 9 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 12981684 - 12981361
Alignment:
Q  9 ggacaaaacattgaaaatctgagtaacttcaaacttgattgtctcaattgttacaagtaatatctagtacccttacaagaattgttgttccaaaggtgaa 108  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12981684 ggacaaaatattgaaaatccaagtaacttcaaactcgattgtcccaattgttacaaataatctctagttcccttacaagaattgttgttccaaaggtgaa 12981585  T
Q  109 tgttggattcaatttatgttttaactttcgtaggagtgcctaact-aaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatcccacggccttcatctaagc 207  Q
    |  |||| | ||||| || |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||   |||||| ||||||    
T  12981584 taatggaatgaatttgtgctttaactttcgtaggaatgcctaactcaaaattttgtatagcctacttatcgaaatattatccca---ccttcacctaagc 12981488  T
Q  208 tccgttataaccctgaaagacctcaaagtgt--attgacattgattttgattgacatttagaaacttttcaagtgtatggtaaaatgtgga-ttgcatgt 304  Q
     |||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||    
T  12981487 cccgttataacccttcaagacctcaaagtgtgcattgacattgattttgattgatgtttagaaacttttcaagcgtatggtaatatgtagatttgcatgt 12981388  T
Q  305 cgactgtgtgtgaaccctattcatatt 331  Q
     || || |||||||||||  |||||||    
T  12981387 tgattgagtgtgaacccttatcatatt 12981361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 28109177 - 28108841
Alignment:
Q  1 tgaaaacgggacaaaacattgaaaatctgagtaacttcaaacttgattgtctcaattgttacaagtaatatctagtacccttacaagaattgttgttcca 100  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28109177 tgaaaaagggacaaaatattgaaaatccgagtaacttcaaactcgattgtcccaattgtaacaaataatctctagtacccttacaagaattg-tgttcca 28109079  T
Q  101 aaggtgaatgttggattcaatttatgttttaactttcgtaggagtgcctaac-taaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatcccacggccttc 199  Q
    |||||||||| |||||| ||||| || |||||||| || | |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||    
T  28109078 aaggtgaatgatggattgaatttgtgctttaacttccgcatgagttcctaacacaaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatccca---ccttc 28108982  T
Q  200 atctaagctccgttataaccctgaaagacctcaaagtg-------tattgacattgattttgattgacatttagaaacttttcaagtgtatggtaaaatg 292  Q
    |  ||||| || ||||||||||  ||||||||||||||       |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  28108981 acttaagccccattataaccctttaagacctcaaagtgtgcattatattaacattgattttgattgacgtttagaaacttttcaagcgtatggtaatatg 28108882  T
Q  293 t-ggattgcatgtcgactgtgtgtgaaccctattcatattt 332  Q
    | |  ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  28108881 tagtcttgcatgtcaactgtgtgtgaaacctattcatattt 28108841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 23380325 - 23379991
Alignment:
Q  1 tgaaaacgggacaaaacattgaaaatctgagtaacttcaaacttgattgtctcaattgttacaagtaatatctagtacccttacaagaattgttgttcc- 99  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||| ||||||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||| || |     
T  23380325 tgaaaaagggacaaaacattgaaaaaccgagtaacttcaagctcgattgtcccaattgttataaataatctctagtacccttgcaagaattgttttttcc 23380226  T
Q  100 -aaaggtgaatgt----tggattcaatttatgtt-ttaactttcgtaggagtgcctaactaaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatcccacg 193  Q
     |||||||||||     || ||| ||||| |||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  23380225 aaaaggtgaatgaacgatgaattgaattt-tgtgcttaacttccgtaggagtgcctaactcaaattttgtgtagcctacttatccaaataatatcccaca 23380127  T
Q  194 gccttcatctaagctccgttataaccctgaaagacctcaaagtgt--attgacattgattttgattgacatttagaaacttttcaagtgtatggtaaaat 291  Q
        ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||    
T  23380126 a---tcacctaagccccgttataacccttaaagacctcaaagtgtgcattgacattgattttgattgacgtttagaaacttttcaagcttatggtaatat 23380030  T
Q  292 gtggattgcatgtcgactgtgtgtgaaccctattcatatt 331  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23380029 gtagattacatgtcgactgtgtgtgaaccct-ttcatatt 23379991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Original strand, 22300758 - 22301059
Alignment:
Q  1 tgaaaacgggacaaaacattgaaaatctgagtaacttcaaacttgattgtctcaattgttacaagtaatatctagtacccttacaagaattgttgttcca 100  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22300758 tgaaaaagggacaagacattgaaaaaccgagtaacttcaaactcgattgtcccaattattataaataatctctagtacccttgcaagaattgttgttcca 22300857  T
Q  101 aagg----tgaatgttggattcaatttatgttttaactttcgtaggagtgcctaactaaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatcccacggcc 196  Q
    || |    |||||| |  ||| |||||     ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||    
T  22300858 aaaggtgatgaatgatatattgaattttgcgcttaacttccgtaggaatgcctaactcaaattttatgtagcctacttatccaaatattatccca---cc 22300954  T
Q  197 ttcatctaagctccgttataaccctgaaagacctcaaagtgt--attgacattgattttgattgacatttagaaacttttcaagtgtatggtaaaatgtg 294  Q
    ||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||| ||||     
T  22300955 ttcacataagctctgttataaccctaaaagacctcaaagtgtgcattgacattgattttgattgacgtttagaaactttttaagcttatggtaatatgta 22301054  T
Q  295 gattg 299  Q
    |||||    
T  22301055 gattg 22301059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 138 - 320
Target Start/End: Original strand, 12745581 - 12745762
Alignment:
Q  138 gtaggagtgcctaactaaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatcccacggccttcatctaagctccgttataaccctgaaagacctcaaagtg 237  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  12745581 gtaggaatgcctaactcaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatcccac---cttcacctaagccccgttataaccctttaagacctcaaagtg 12745677  T
Q  238 t--attgacattgattttgattgacatttagaaacttttcaagtgtatggtaaaatgtggattgcatgtcgactgtgtgtgaacc 320  Q
    |  |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  12745678 tgcattgacattgattttgattgacgtttagaaatttttcaagtgtatggtaatatgtagattgcatgtcgactgtgtgttaacc 12745762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 22 - 318
Target Start/End: Original strand, 21633068 - 21633362
Alignment:
Q  22 aaaatctgagtaacttcaaacttgattgtctcaattgttacaagtaatatctagtacccttacaagaattgttgttccaaagg-tgaatgttggattcaa 120  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||| | || ||||||| |||| ||||||||| ||||||   |||||||| |||||| ||||||  ||||| ||    
T  21633068 aaaatctgagtaatttcaaactcgattgtcccgatagttacaaataatctctagtacctttacaa---ttgttgtttcaaagggtgaatgagggatttaa 21633164  T
Q  121 tttatgttttaactttcgtaggagtgcctaactaaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatcccacggccttcatctaagctccgttataaccc 220  Q
    | | || ||||| || ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   | || |  |||||  |||||||||||    
T  21633165 tctttgctttaatttccgtaggagttcctaactcaaatttcgtgtagcctacttatccaaatattatccca---catttacataagcctcgttataaccc 21633261  T
Q  221 tgaaagacctcaaa--gtgtattgacattgattttgattgacatttagaaacttttcaagtgtatggtaaaatgtgga-ttgcatgtcgactgtgtgtga 317  Q
    | ||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || | ||  | ||||||||||||||||||    
T  21633262 ttaaagacctcaaagtgtgtaatgacaatgattttgattgacgtttagaaacttttcaagtgtatggtaatatatagacctacatgtcgactgtgtgtga 21633361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 103 - 293
Target Start/End: Original strand, 32111836 - 32112025
Alignment:
Q  103 ggtgaatgttggattcaatttatgttttaactttcgtaggagtgcctaactaaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatcccacggccttcatc 202  Q
    ||||||||  ||||| |||  ||| ||||| || |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||   |||| | |    
T  32111836 ggtgaatgagggattgaatccatgctttaatttccgtaggagtgtctaactcaaattttgtatagcctacttatctaaataatatccca---cctttacc 32111932  T
Q  203 taagctccgttataaccctgaaagacctcaaa--gtgtattgacattgattttgattgacatttagaaacttttcaagtgtatggtaaaatgt 293  Q
    ||||| || |||||||| | ||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  32111933 taagccccattataacctttaaagacctcaaagtgtgtaatgacgttgattttgattgacgtttagaaacttttcaagcgtatgataatatgt 32112025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 235 - 314
Target Start/End: Original strand, 7836896 - 7836976
Alignment:
Q  235 gtgtattgacattgattttgattgacatttagaaacttttcaagtgtatggtaaaatgtgga-ttgcatgtcgactgtgtg 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||| || ||||||||||||| ||||    
T  7836896 gtgtattgacattgattttgattgacgtttagaaacttttcaagcatatggtaatatgtagacttgcatgtcgactttgtg 7836976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 123
Target Start/End: Original strand, 22959657 - 22959769
Alignment:
Q  11 acaaaacattgaaaatctgagtaacttcaaacttgattgtctcaattgttacaagtaatatctagtacccttacaagaattgttgttccaaaggtgaatg 110  Q
    |||||||||| ||||   ||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||| | ||||||| | | | ||||||||||||| ||||||||||||    
T  22959657 acaaaacattaaaaaatcgagtaacttcaaactcgattgccccaatttttacaagtattctctagtatcttcaaaagaattgttgtttcaaaggtgaatg 22959756  T
Q  111 ttggattcaattt 123  Q
     |||||| |||||    
T  22959757 atggattgaattt 22959769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 23828735 - 23828623
Alignment:
Q  11 acaaaacattgaaaatctgagtaacttcaaacttgattgtctcaattgttacaagtaatatctagtacccttacaagaattgttgttccaaaggtgaatg 110  Q
    |||||||||| ||||   ||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||| | ||||||| | | | ||||||||||||| ||||||||||||    
T  23828735 acaaaacattaaaaaatcgagtaacttcaaactcgattgccccaatttttacaagtattctctagtatcttcaaaagaattgttgtttcaaaggtgaatg 23828636  T
Q  111 ttggattcaattt 123  Q
     |||||| |||||    
T  23828635 atggattgaattt 23828623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 185
Target Start/End: Original strand, 7836819 - 7836866
Alignment:
Q  138 gtaggagtgcctaactaaaattttgtgtagcctacttatccaaatatt 185  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7836819 gtaggagtgcctaactcaaattttgtgtagcctagttatccaaatatt 7836866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 110
Target Start/End: Original strand, 12745461 - 12745564
Alignment:
Q  8 gggacaaaacattgaaaatctgagtaacttcaaacttgattgtctcaattgttacaagtaatatctagtacccttacaagaattgttgttcc-aaaggtg 106  Q
    ||||||| |||||||||| | || |||||||||||| |||| |  ||||||||| || |||| ||| |||| ||| |||||||||||||||| |||||||    
T  12745461 gggacaagacattgaaaaaccgattaacttcaaactcgattcttccaattgttataaataatctctggtactcttgcaagaattgttgttccaaaaggtg 12745560  T
Q  107 aatg 110  Q
    ||||    
T  12745561 aatg 12745564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 3 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 23895498 - 23895458
Alignment:
Q  3 aaaacgggacaaaacattgaaaatctgagtaacttcaaact 43  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  23895498 aaaaggggacaaaacattcaaaatccgagtaacttcaaact 23895458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 27946 - 28259
Alignment:
Q  1 tgaaaacgggacaaaacattgaaaatctgagtaacttcaaacttgattgtctcaattgttacaagtaatatctagtacccttacaagaattgttgttcca 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27946 tgaaaatgggacaaaacattgaaaatccgagtaacttcaaactcgattgtcccaattgttacaaataatctctagtacccttacaagaattgttgttcca 28045  T
Q  101 aaggtgaatgttggattcaatttatgttttaactttcgtaggagtgcctaactaaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatcccacggccttca 200  Q
    |||||||||| |||||| || || || ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||    
T  28046 aaggtgaatgatggattgaa-ttgtgctttaactttcgtaggagtgtctaactcaaattttgtgtagcctacttattcaaatattatccca---ccttca 28141  T
Q  201 tctaagctccgttataaccctgaaagacctcaaagtgt--attgacattgattttgattgacatttagaaacttttcaagtgtatggtaaaatgtggatt 298  Q
     |||||| || |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||    
T  28142 cctaagccccattataacccttaaagacctcaaagtgtgaattgacattgattttgattgacgtttagaaacttttcaagcttatggtaatatgtagatt 28241  T
Q  299 gcatgtcgactgtgtgtg 316  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  28242 gcatgtcgactatgtgtg 28259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 184; Significance: 2e-99; HSPs: 12)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Original strand, 17929720 - 17930054
Alignment:
Q  1 tgaaaacgggacaaaacattgaaaatctgagtaacttcaaacttgattgtctcaattgttacaagtaata---tctagtacccttacaagaattgttgtt 97  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| ||||||||||||  || |   |||||||||||||||||||||||||||    
T  17929720 tgaaaaagggacaaaacattgaaaatccgagtaacttcaagctcgattgtcccaattgttacaaaaaaaaatctctagtacccttacaagaattgttgtt 17929819  T
Q  98 ccaaaggtgaatgttggattcaatttatgttttaactttc-gtaggagtgcctaact-aaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatcccacggc 195  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||| |||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||       
T  17929820 ccaaaggtgaatgatggattgaatttatgctttaaaattccgtaggagtgcctaactcaaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatctcac--- 17929916  T
Q  196 cttcatctaagctccgttataaccctgaaagacctcaaagtgt--attgacattgattttgattgacatttagaaacttttcaagtgtatggtaaaatgt 293  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  17929917 cttcacctaagccccgttataaccctttaagacctcaaagtgtgcattgacattgattttgattgacgtttagaaacttttcaagcgtatggtaatatgt 17930016  T
Q  294 ggattgcatgtcgactgtgtgtgaaccctattcatattt 332  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  17930017 agattgcatgtcgactgtctgtgaaccct-ttcatattt 17930054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Original strand, 12584962 - 12585295
Alignment:
Q  1 tgaaaacgggacaaaacattgaaaatctgagtaacttcaaacttgattgtctcaattgttacaagtaatatctagtacccttacaagaattgttgttcca 100  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  12584962 tgaaaaagggacaagacattgaaaaaccgagtaacttcaaacttgattgtcccaattgttataaataatctctagtacccttgcaagaattgttattcca 12585061  T
Q  101 aagg-----tgaatgttggattcaatttatgtt-ttaactttcgtaggagtgcctaactaaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatcccacgg 194  Q
    || |     |||||| |||||| ||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  12585062 aaaggtgaatgaatgatggattgaattt-tgtgcttaactttcgtaggaatgcctaactcaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatcccac-- 12585158  T
Q  195 ccttcatctaagctccgttataaccctgaaagacctcaaagtgt--attgacattgattttgattgacatttagaaacttttcaagtgtatggtaaaatg 292  Q
     ||||| |||||| |||||||||||||  || ||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| |||    
T  12585159 -cttcacctaagccccgttataaccctttaatacctcaaagtgtgcatcgacattgattttgattgacgtttagaaacttttcaagcgtaaggtaatatg 12585257  T
Q  293 tggattgcatgtcgactgtgtgtgaaccctattcatatt 331  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12585258 tagattgcatgtcgactgtgtgtgaaccct-ttcatatt 12585295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 38249870 - 38249547
Alignment:
Q  1 tgaaaacgggacaaaacattgaaaatctgagtaacttcaaacttgattgtctcaattgttacaagtaatatctagtacccttacaagaattgttgttcca 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||  |  ||| ||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  38249870 tgaaaaagggacaaaacattgaaaatccgagtaacttaaaactcgattgtcccaattgttatgaaaaatctctagtacctttacgagaattgttgttcca 38249771  T
Q  101 aagg-----tgaatgttggattcaatttatgttttaactttcgtaggagtgcctaactaaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatcccacggc 195  Q
    || |     |||||| |||  | | ||| || ||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  38249770 aaaggtgaatgaatgatggtgtgattttgtgctttaatttccgtaggaatgcctaactcaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatcccac--- 38249674  T
Q  196 cttcatctaagctccgttataaccctgaaagacctcaaagtgt--attgacattgattttgattgacatttagaaacttttcaagtgtatggtaaaatgt 293  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  38249673 cttcacctaagccccgttataaccctgaaagacatcaaagtgtgcattgacattgattttgattgacgtttagaaacttttcaagcgtatggtaatatgt 38249574  T
Q  294 ggattgcatgtcgactgtgtgtgaacc 320  Q
     ||||||||||||||||||||||||||    
T  38249573 agattgcatgtcgactgtgtgtgaacc 38249547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Original strand, 8910351 - 8910684
Alignment:
Q  1 tgaaaacgggacaaaacattgaaaatctgagtaacttcaaacttgattgtctcaattgttacaagtaatatctagtacccttacaagaattgttgttcca 100  Q
    |||||| ||||||  |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8910351 tgaaaaagggacatgacattgaaaaaccgagtaacttcaaactcgattgtcccaattattataaataatctctagtacccttgcaagaattgttgttcca 8910450  T
Q  101 aagg-----tgaatgttggattcaatttatgtt-ttaactttcgtaggagtgcctaactaaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatcccacgg 194  Q
    || |     |||||| |||||| ||||| |||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||      
T  8910451 aaaggtgaatgaatgatggattgaattt-tgtgcttaacttccgtaggaatgcctaactcaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatcacac-- 8910547  T
Q  195 ccttcatctaagctccgttataaccctgaaagacctcaaagtgt--attgacattgattttgattgacatttagaaacttttcaagtgtatggtaaaatg 292  Q
     ||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||     
T  8910548 -cttcacctaagccccgttataaccctttaagacctcaaagtgtgcattgacattgattttgattgacgtttagaaacttttcaagcgtatggtaatata 8910646  T
Q  293 tggattgcatgtcgactgtgtgtgaaccctattcatatt 331  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8910647 tagaatgcatgtcgactgtgtgtgaaccct-ttcatatt 8910684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 16 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 23945313 - 23944995
Alignment:
Q  16 acattgaaaatctgagtaacttcaaacttgattgtctcaattgttacaagtaatatctagtacccttacaagaattgttgttccaaa-ggtgaa----tg 110  Q
    |||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    ||    
T  23945313 acattgaaaaaccgagtaactttaaactcgattgtcccaattgttataaataatctctagtacccttgcaagaattgttgttccaaaaggtgaaagaatg 23945214  T
Q  111 ttggattcaatttatgtt-ttaactttcgtaggagtgcctaactaaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatcccacggccttcatctaagctc 209  Q
     |||||| ||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||  |    
T  23945213 atggattgaattt-tgtgcttaactttcgtaggaatgcctaactcaaattttgtgtaacctacttatccaaatattatcccac---cttcacctaagtcc 23945118  T
Q  210 cgttataaccctgaaagacctcaaagtgt--attgacattgattttgattgacatttagaaacttttcaagtgtatggtaaaatgtggattgcatgtcga 307  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  23945117 cgttataaccctttaagacctcaaagtgtgcattgacattgattttgattgacgtttagaaacttttcaagcgtatggtaatatgtagattgcatgtcga 23945018  T
Q  308 ctgtgtgtgaaccctattcatatt 331  Q
    || |||||||||||| ||||||||    
T  23945017 ctctgtgtgaaccct-ttcatatt 23944995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 33878747 - 33878415
Alignment:
Q  1 tgaaaacgggacaaaacattgaaaatctgagtaacttcaaacttgattgtctcaattgttacaagtaatatctagtacccttacaagaattgttgttcca 100  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33878747 tgaaaaagggacaagacattgaaaaaccgagtaacttcaaactcgattgtcccaattgttatagataatctctagtacccttgcaagaattgttgttcca 33878648  T
Q  101 aagg-----tgaatgttggattcaatttatgtt-ttaactttcgtaggagtgcctaactaaaattttgtgtagcctacttatccaaatat-tatcccacg 193  Q
    || |     |||| | |||||| ||||| |||  ||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||     
T  33878647 aaaggggaatgaacgatggattgaattt-tgtgcttaacttccgtagg--tgcctaactcaaattttgtgtagcctacttatccaaataaatatcccac- 33878552  T
Q  194 gccttcatctaagctccgttataaccctgaaagacctcaaagtgt--attgacattgattttgattgacatttagaaacttttcaagtgtatggtaaaat 291  Q
      ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  33878551 --cttcacctaagccccgttataacccttaaagacctcaaagtgtgcattgacattgattttgattgatgtttagaaacttttcaagcgtatggtaatat 33878454  T
Q  292 gtggattgcatgtcgactgtgtgtgaaccctattcatatt 331  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33878453 gtagattgcatgtcgactgtgtgtgaaccct-ttcatatt 33878415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 22175401 - 22175068
Alignment:
Q  1 tgaaaacgggacaaaacattgaaaatctgagtaacttcaaacttgattgtctcaattgttacaagtaatatctagtacccttacaagaattgttgttcca 100  Q
    |||||| |||||||||| |||||||   ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  22175401 tgaaaaagggacaaaacgttgaaaaatcgagtaacttcaaactcgattgtcccaattgttataaataatctctaggacccttgcaagaattgttgttcca 22175302  T
Q  101 aagg-----tgaatgttggattcaatttatgttttaactttcgtaggagtgcctaactaaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatcccacggc 195  Q
    || |     |||||| || ||| ||||| | | ||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||       
T  22175301 aaaggtgaatgaatgatgaattgaatttttttcttaacttccgtaggaatgcctaactcaaatattgtgtagcctacttatcgaaatattgtcccac--- 22175205  T
Q  196 cttcatctaagctccgttataaccctgaaagacctcaaagtgt--attgacattgattttgattgacatttagaaacttttcaagtgtatggtaaaatgt 293  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||  || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||||    
T  22175204 cttcacctaagccccgttataaccctttaaaacctcaaagtgtgcattgacattgattttgattgacgtttagaaacttttcaagcgtgtggtaatatgt 22175105  T
Q  294 ggattgcatgtcgactgtgtgtgaaccctattcatatt 331  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  22175104 agattgcatgtcgattgtgtgtgaaccct-ttcatatt 22175068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 3 - 320
Target Start/End: Original strand, 23645771 - 23646090
Alignment:
Q  3 aaaacgggacaaaacattgaaaatctgagtaacttcaaacttgattgtctcaattgttacaagtaatatctagtacccttacaagaattgttgttccaaa 102  Q
    |||| ||||||| |||||||||| |  |||||||| ||||| ||||||| |||  |||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23645771 aaaaagggacaagacattgaaaaaccaagtaactttaaactcgattgtcccaa--gttataaataatctctagtacccttgcaagaattgttgttccaaa 23645868  T
Q  103 gg-----tgaatgttggattcaatttatgtt-ttaactttcgtaggagtgcctaactaaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatcccacggcc 196  Q
    ||     |||||| |||||| ||||| |||  ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  23645869 gggtgaatgaatgatggattgaattt-tgtgcttaacttccgtaggaatgcctaactcaaattttgtatagcctacttatccaaatattatcccac---c 23645964  T
Q  197 ttcatctaagctccgttataaccctgaaagacctcaaagtgt--attgacattgattttgattgacatttagaaacttttcaagtgtatggtaaaatgtg 294  Q
    |||| |||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||     
T  23645965 ttcacctaagccccgttacaaccctttaagacctcaaagtgtgcattgacattgattttgattgacgtttagaaactttttaagcgtatggtaatatgta 23646064  T
Q  295 gattgcatgtcgactgtgtgtgaacc 320  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  23646065 gattgcatgtcaactgtgtgtgaacc 23646090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 25593011 - 25592685
Alignment:
Q  1 tgaaaacgggacaaaacattgaaaatctgagtaacttcaaacttgattgtctcaattgttacaagtaatatctagtacccttacaagaattgtt-gttcc 99  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |  |||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  25593011 tgaaaaagggacaagacattgaaaaaccgagtaacttcaaactcgattgtcccggttgttataaataatctctagtacccttgcaagaattgtttgttcc 25592912  T
Q  100 aa-aggtgaatgt----tggattcaatttatgtt-ttaactttcgtaggagtgcctaactaaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatcccacg 193  Q
    || |||||||||     |||||| ||||| |||  ||||||| |||| || |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  25592911 aataggtgaatgaatgatggattgaattt-tgtgcttaacttccgtatgaatgccaaactcaaattttgtgtagcctacttatccaaatat-atcccac- 25592815  T
Q  194 gccttcatctaagctccgttataaccctgaaagacctcaaagtgt--attgaca-ttgattttgattgacatttagaaacttttcaagtgtatggtaaaa 290  Q
      ||||| |||||| | |||||||||||  |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |    
T  25592814 --cttcacctaagccctgttataaccctttaagacctcaaagtgtgcattgacaattgattttgattgacgtttagaaacttttcaagcttatggtaata 25592717  T
Q  291 tgtggattgcatgtcgactgtgtgtgaaccct 322  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25592716 tgtagattgcatgtcgactgtgtgtaaaccct 25592685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 23 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 22223813 - 22223506
Alignment:
Q  23 aaatctgagtaacttcaaacttgattgtctcaattgttacaagtaatatctagtacccttacaagaattgttgttccaaagg-tgaatgttggattcaat 121  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||||||| |||| ||||||| || | ||||||| | ||   |  ||||||||| |||||| ||||||  ||||| |||    
T  22223813 aaatccgagtaatttcaaactcgattgtcccaatagttacaaatattctctagtaactttt--accattgttgtttcaaagggtgaatgagggattgaat 22223716  T
Q  122 ttatgttttaactttcgtaggagtgcctaactaaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatcccacggccttcatctaagctccgttataaccct 221  Q
     | || ||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||   ||| | |||||| |||||||||||||    
T  22223715 ctttgctttaattttcgaaggagtccctaactcaaattttgtgtagcctacttattcaaatattatctcac---ctttacctaagccccgttataaccct 22223619  T
Q  222 gaaagacctcaaagtgtat--tgacattgattttgattgacatttagaaacttttcaagtgtatggtaaaatgtgga-ttgcatgtcgactgtgtgtgaa 318  Q
     |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  |||| || |||||||||||||    
T  22223618 taaagacctcaaagtgtgtaatgacattgattttgattgacgtttagaaacttttcaagcgtatggtaatatgtagacctgcacgtagactgtgtgtgaa 22223519  T
Q  319 ccctattcatatt 331  Q
    ||||  |||||||    
T  22223518 cccttatcatatt 22223506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 23 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 22230155 - 22229848
Alignment:
Q  23 aaatctgagtaacttcaaacttgattgtctcaattgttacaagtaatatctagtacccttacaagaattgttgttccaaagg-tgaatgttggattcaat 121  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||||||| |||| ||||||| || | ||||||| | ||   |  ||||||||| |||||| ||||||  ||||| |||    
T  22230155 aaatccgagtaatttcaaactcgattgtcccaatagttacaaatattctctagtaactttt--accattgttgtttcaaagggtgaatgagggattgaat 22230058  T
Q  122 ttatgttttaactttcgtaggagtgcctaactaaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatcccacggccttcatctaagctccgttataaccct 221  Q
     | || ||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||   ||| | |||||| |||||||||||||    
T  22230057 ctttgctttaattttcgaaggagtccctaactcaaattttgtgtagcctacttattcaaatattatctcac---ctttacctaagccccgttataaccct 22229961  T
Q  222 gaaagacctcaaagtgtat--tgacattgattttgattgacatttagaaacttttcaagtgtatggtaaaatgtgga-ttgcatgtcgactgtgtgtgaa 318  Q
     |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  |||| || |||||||||||||    
T  22229960 taaagacctcaaagtgtgtaatgacattgattttgattgacgtttagaaacttttcaagcgtatggtaatatgtagacctgcacgtagactgtgtgtgaa 22229861  T
Q  319 ccctattcatatt 331  Q
    ||||  |||||||    
T  22229860 cccttatcatatt 22229848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 128 - 322
Target Start/End: Original strand, 31983729 - 31983923
Alignment:
Q  128 tttaactttcgtaggagtgcctaactaaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatcccacggccttcatctaagctccgttataaccctgaaaga 227  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||   ||| | |||| | ||||||||||||| |||||    
T  31983729 tttaattttcctaggagtgcctaactcaaattttgtgtagtctacttatccaaataatatcatac---ctttacctaaaccccgttataacccttaaaga 31983825  T
Q  228 cctcaaa--gtgtattgacattgattttgattgacatttagaaacttttcaagtgtatggtaaaatgtgga-ttgcatgtcgactgtgtgtgaaccct 322  Q
    |||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||| |||| ||    |||||||||||||||||||||||    
T  31983826 cctcaaaatgtgtaatgacattgattttgattgacgtttagaaacttttcaagcatattgtaatatgtagaccaacatgtcgactgtgtgtgaaccct 31983923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 8)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Original strand, 20595392 - 20595722
Alignment:
Q  1 tgaaaacgggacaaaacattgaaaatctgagtaacttcaaacttgattgtctcaattgttacaagtaatatctagtacccttacaagaattgttgttcca 100  Q
    |||||| || |||| |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20595392 tgaaaaaggtacaagacattgaaaacccgagtaacttcaaactcgattgtcccaattattagaaataatctctagtacccttgcaagaattgttgttcca 20595491  T
Q  101 aaggtgaatgttggattcaatttatgttttaactttcgtaggagtgcctaactaaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatcccacggccttca 200  Q
    |||||||||| |||||  ||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||    
T  20595492 aaggtgaatgatggatcaaatttgtgctttaacttttgtaggagtgcctaactcaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatccca---ccttca 20595588  T
Q  201 tctaagctccgttataaccctgaaagacctcaaagtgt--attgac-attgattttgattgacatttagaaacttttcaagtgtatggtaaaatgtggat 297  Q
     |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||| |||    
T  20595589 cctaagccccgttataaccctttaagacctcaaagtgtgcattgacaattgattttgattgacgtttagaaacttttcaagcttatggtaatatgtagat 20595688  T
Q  298 tgcatgtcgactgtgtgtgaaccctattcatattt 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20595689 tgcatgtcgactgtgtgtgaaccct-ttcatattt 20595722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 45288648 - 45288315
Alignment:
Q  1 tgaaaacgggacaaaacattgaaaatctgagtaacttcaaacttgattgtctcaattgttacaagtaatatctagtacccttacaagaattgttgttcca 100  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||| ||| | ||||||| ||||||||| || |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  45288648 tgaaaaagggacaagacattgaaaaaccgagtaactttaaattcgattgtcccaattgttataaataatctctagtactcttgcaagaattgttgttcca 45288549  T
Q  101 aagg-----tgaatgttggattcaatttatgtt-ttaactttcgtaggagtgcctaactaaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatcccacgg 194  Q
    || |     |||||| || ||| ||||| |||  ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  45288548 aaaggtgaatgaatgatgaattgaattt-tgtgcttaacttccgtaggaatgcctaactcaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatcccac-- 45288452  T
Q  195 ccttcatctaagctccgttataaccctgaaagacctcaaagtgt--attgacattgattttgattgacatttagaaacttttcaagtgtatggtaaaatg 292  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  45288451 -cttcacctaagctccgttataaccctttaagacctcaaagtgtgcattgacattgattttgattgacgtttagaaacttttcaagcgtatggtaatatg 45288353  T
Q  293 tggattgcatgtcgactgtgtgtgaaccctattcatatt 331  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  45288352 tagattgcatgtcgattgtgtgtgaaccct-ttcatatt 45288315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Original strand, 22255945 - 22256270
Alignment:
Q  1 tgaaaacgggacaaaacattgaaaatctgagtaacttcaaacttgattgtctcaattgttacaagtaatatctagtacccttacaagaattgttgttcca 100  Q
    |||||| ||||||||  |||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||| ||||||| | || |||||||||||||||||    
T  22255945 tgaaaaagggacaaagaattgaaaaaccgagtaacttcaaactcgattgtcccaattgttataaataatctctagtatctttgcaagaattgttgttcca 22256044  T
Q  101 aagg-----tgaatgttggattcaatttatgt-tttaactttcgtaggagtgcctaactaaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatcccacgg 194  Q
    || |     |||||| || ||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |    
T  22256045 aaaggtgaatgaatgatgaattgaattt-tgtgtttaactttcgtaggagtgcctaactcaaattttgtgtagcctacttatccaaataatatccctcag 22256143  T
Q  195 ccttcatctaagctccgttataaccctgaaagacctcaaagtgt--attgacattgattttgattgacatttagaaacttttcaagtgtatggtaaaatg 292  Q
       ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||    
T  22256144 ---tcacctaagccccgttataacccttaaagacctcaaagtgtgcattgacattgattttgattgacgtttagaaacttttcaagcttatggtaatatg 22256240  T
Q  293 tggattgcatgtcgactgtgtgtgaaccct 322  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22256241 tagattgcatgtcgactgtgtgtgaaccct 22256270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 9 - 322
Target Start/End: Original strand, 4544430 - 4544746
Alignment:
Q  9 ggacaaaacattgaaaatctgagtaacttcaaacttgattgtctcaattgttacaagtaatatctagtacccttacaagaattgttgttccaaagg---- 104  Q
    |||||| |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |  |||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |        
T  4544430 ggacaagacattgaaaaaccgagtaacttcaaactcgattgtcccggttgttataaataatctctagtacccttgcaagaattgttgttccaaaaggtga 4544529  T
Q  105 -tgaatgttggattcaatttatgtt-ttaactttcgtaggagtgcctaactaaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatcccacggccttcatc 202  Q
     |||||| |||||| ||||| |||  ||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||   ||||| |    
T  4544530 atgaatgatggattgaattt-tgtgcttaacttccataggaatgcctaactcaaattttgtgtagcctatttatccaaatat-atctcac---cttcacc 4544624  T
Q  203 taagctccgttataaccctgaaagacctcaaagtgt--attgacattgattttgattgacatttagaaacttttcaagtgtatggtaaaatgtggattgc 300  Q
    ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||    
T  4544625 taagccccgttataaccctttaagacctcaaagtgtgcattgacattgattttgattgacgtttagaaacttttcaagcttatggtaatatgtagattgc 4544724  T
Q  301 atgtcgactgtgtgtgaaccct 322  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  4544725 atgtcgactgtgtgtgaaccct 4544746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 17 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 9274525 - 9274215
Alignment:
Q  17 cattgaaaatctgagtaacttcaaacttgattgtctcaattgttacaagtaatatctagtacccttacaagaattgttgttccaaaggtgaatgttggat 116  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||  |||||||||| | |||||||||  || |||  ||| ||||||||||| | | |  ||||    
T  9274525 cattgaaaatccgagtaactttaaactcgattgtcccaacagttacaagtattctctagtacctatagaagttttgatgttccaaaggggcaaga-ggat 9274427  T
Q  117 tcaatttatgtt--ttaactttcgtaggagtgcctaactaaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatcccacggccttcatctaagctccgtta 214  Q
    | ||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||  |||| |    
T  9274426 tgaattt-tgttctttaactttcgtatgagtgcctaactcaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatccca---ccttcacctaagacccgtga 9274331  T
Q  215 taaccctgaaagacctcaaa--gtgtattgacattgattttgattgacatttagaaacttttcaagtgtatggtaaaatgtgga-ttgcatgtcgactgt 311  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||    
T  9274330 taaccctgaaagacctcaaagtgtgtagtgatattgattttgattgatgtttagaaactcttcaagcgtatggtaatatgtagacctgcatgtcgactgt 9274231  T
Q  312 gtgtgaaccctattca 327  Q
    ||||||| ||||||||    
T  9274230 gtgtgaatcctattca 9274215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 88 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 13810825 - 13810598
Alignment:
Q  88 aattgttgttccaaagg-tgaatgttggattcaatttatgttttaactttcgtaggagtgcctaactaaaattttgtgtagcctacttatccaaatatta 186  Q
    |||||||||| |||||| ||||||  ||||| ||||  || ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13810825 aattgttgtttcaaagggtgaatgagggattgaattcgtgctttaatttccgtaggagtgcctaactcaaattttgtgtagcctacttatccaaatatta 13810726  T
Q  187 tcccacggccttcatctaagctccgttataaccctgaaagacctcaaagtgtat--tgacattgattttgattgacatttagaaacttttcaagtgtatg 284  Q
    ||||||   ||| | |||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  13810725 tcccac---ctttacctaagacacgttataaccctgaaagacctcaaagtgtgtaatgacattgattttgattgacgtttagagacttttcaagagtatg 13810629  T
Q  285 gtaaaatgtgga-ttgcatgtcgactgtgtg 314  Q
    |||| |||| || ||| ||||||||||||||    
T  13810628 gtaatatgtagacttgtatgtcgactgtgtg 13810598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 22 - 181
Target Start/End: Original strand, 16222745 - 16222904
Alignment:
Q  22 aaaatctgagtaacttcaaacttgattgtctcaatt-gttacaagtaatatctagtacccttacaagaattgttgttccaaag-gtgaatgttggattca 119  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||| |||   ||||||| || | ||||||||| ||||||  |||||| || ||| | |||||||| ||||| |    
T  16222745 aaaatctgagtaactttaaactcgattgtcccaacaagttacaaatattctctagtacctttacaa--attgttatttcaaggtgtgaatgtgggattga 16222842  T
Q  120 atttatgttttaactttcgtaggagtgcctaactaaaattttgtgtagcctacttatccaaa 181  Q
    ||  ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16222843 atccatgctttaacttccgtaggagtgcctaactcaaattttgtgtagcctacttatccaaa 16222904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 247 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 26137301 - 26137226
Alignment:
Q  247 tgattttgattgacatttagaaacttttcaagtgtatggtaaaatgtggattgcatgtcgactgtgtgtgaaccct 322  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  26137301 tgattttgattgacgtttagaaacctttcaagcttatggtaatatgtagattgcatgtcgtctgtgtgtgaaccct 26137226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 11)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Original strand, 45455790 - 45456123
Alignment:
Q  1 tgaaaacgggacaaaacattgaaaatctgagtaacttcaaacttgattgtctcaattgttacaagtaatatctagtacccttacaagaattgttgttcca 100  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| || || |||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45455790 tgaaaaagggacaagacattgaaaaaccgagtaacttcaaacttgattgtcccaattgctataaataatctctagtacccttgcaagaattgttgttcca 45455889  T
Q  101 aagg-----tgaatgttggattcaatttatgtt-ttaactttcgtaggagtgcctaactaaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatcccacgg 194  Q
    || |     |||||| |||||| ||||| |||  |||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  45455890 aaaggtgaatgaatgatggattgaattt-tgtgcttaattttcgtaggaatgcctaactcaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatcccac-- 45455986  T
Q  195 ccttcatctaagctccgttataaccctgaaagacctcaaagtgt--attgacattgattttgattgacatttagaaacttttcaagtgtatggtaaaatg 292  Q
     ||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||    
T  45455987 -cttcacctaagccccgttataaccctttaagacctcaaagtgtgcattgacattgattttgattgacgtttagaaacttttcaagcttatggtaatatg 45456085  T
Q  293 tggattgcatgtcgactgtgtgtgaaccctattcatatt 331  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45456086 tagattgtatgtcgactgtgtgtgaaccct-ttcatatt 45456123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 1504827 - 1504494
Alignment:
Q  1 tgaaaacgggacaaaacattgaaaatctgagtaacttcaaacttgattgtctcaattgttacaagtaatatctagtacccttacaagaattgttgttcca 100  Q
    |||||| ||||||  |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| | ||||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1504827 tgaaaaagggacatgacattgaaaaaccgagtaacttcaaactcgattgtcccgattgttataaataatttctagtacccttgcaagaattgttgttcca 1504728  T
Q  101 aagg-----tgaatgttggattcaatttatgtt-ttaactttcgtaggagtgcctaactaaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatcccacgg 194  Q
    || |     |||||| |||||| ||||| |||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||      
T  1504727 aaaggtgaatgaatgatggattgaattt-tgtgcttaacttccgtaggaatgcctaactcaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatctcac-- 1504631  T
Q  195 ccttcatctaagctccgttataaccctgaaagacctcaaagtgt--attgacattgattttgattgacatttagaaacttttcaagtgtatggtaaaatg 292  Q
     ||||| |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  1504630 -cttcacctaagccccgttataaccgttaaagacctcaaagtgtgcattgacattgattttgattgacgtttagaaacttttcaagcgtatggtaatatg 1504532  T
Q  293 tggattgcatgtcgactgtgtgtgaaccctattcatatt 331  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1504531 tagattgcatgtcgactgtgtgtgaaccct-ttcatatt 1504494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 9186852 - 9186520
Alignment:
Q  1 tgaaaacgggacaaaacattgaaaatctgagtaacttcaaacttgattgtctcaattgttacaagtaatatctagtacccttacaagaattgttgttcca 100  Q
    |||||| ||||||| | |||||||| | ||||||||| ||||  ||||||| ||||||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9186852 tgaaaaagggacaagatattgaaaaaccgagtaactttaaacacgattgtcccaattgttataaataatctctagtacccttgcaagaattgttgttcca 9186753  T
Q  101 aagg-----tgaatgttggattcaatttatgtt-ttaactttcgtaggagtgcctaactaaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatcccacgg 194  Q
    || |     |||||| || ||| ||||| |||  ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  9186752 aaaggtgaatgaatgatgaattgaattt-tgtgcttaacttccgtaggaatgcctaactcaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatccc---g 9186657  T
Q  195 ccttcatctaagctccgttataaccctgaaagacctcaaag-tgtattgacattgattttgattgacatttagaaacttttcaagtgtatggtaaaatgt 293  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  9186656 ccttcacctaagccccgttataacccttaaagacctcaaagctgcattgacattgattttgattgacgtttagaaactttccaagcgtatggtaatatgt 9186557  T
Q  294 ggattgcatgtcgactgtgtgtgaaccctattcatatt 331  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9186556 agattgcatgtcgactgtgtgtgaaccct-ttcatatt 9186520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Original strand, 25872693 - 25873016
Alignment:
Q  1 tgaaaacgggacaaaacattgaaaatctgagtaacttcaaacttgattgtctcaattgttacaagtaatatctagtacccttacaagaattgttgttcca 100  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| | ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25872693 tgaaaaagggacaagacattgaaaaaccgagtaacattaaactcgattgtcccaattgttataaataatctctagtacccttgcaagaattgttgttcca 25872792  T
Q  101 aagg-----tgaatgttggattcaatttatgtt-ttaactttcgtaggagtgcctaactaaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatcccacgg 194  Q
    || |     |||||| |||||| ||||| |||  ||||||| |||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  25872793 aaaggtgaatgaatgatggattgaattt-tgtgcttaacttccgtatgaatgcctaactcaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatcccac-- 25872889  T
Q  195 ccttcatctaagctccgttataaccctgaaagacctcaaagtgt--attgacattgattttgattgacatttagaaacttttcaagtgtatggtaaaatg 292  Q
     ||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||    
T  25872890 -cttcacctaagccccgttataaccctttaagacctcaaaatgtgcattgacattgattttgattgacgtttagaaacttttcaagcttatggtaatatg 25872988  T
Q  293 tggattgcatgtcgactgtgtgtgaacc 320  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25872989 tggattgcatgtcgattgtgtgtgaacc 25873016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 29 - 322
Target Start/End: Original strand, 24237075 - 24237369
Alignment:
Q  29 gagtaacttcaaacttgattgtctcaattgttacaagtaatatctagtacccttacaagaattgttgttc-caaaggtgaatgttggattcaatttatgt 127  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |   ||| ||||||| |||| || |||||||| ||  |||||||||||| |||||| || || ||     
T  24237075 gagtaacttcatactcgattgtcccaattgttagataaaatctctagtatccttgcatgaattgtttttttcaaaggtgaatgatggattgaaattgtgc 24237174  T
Q  128 tttaactttcgtaggagtgcctaactaaaattttgtgtagcctacttatccaaatat-tatcccacggccttcatctaagctccgttataaccctgaaag 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||   ||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  24237175 tttaactttcgtaggagtgcctaactcaaattttgtgtagcctacttatccaaataaatatcccac---cttcacctaagccccgttataacccttaaag 24237271  T
Q  227 acctcaaagtgt--attgacattgattttgattgacatttagaaacttttcaagtgtatggtaaaatgtggattgcatgtcgactgtgtgtgaaccct 322  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24237272 acctcaaagtgtgcattgacattgattttgattgacgtttagaaacttttcaagcttatggtaatatgtagattgcatgtcgactgtgtgtgaaccct 24237369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 31428947 - 31428614
Alignment:
Q  1 tgaaaacgggacaaaacattgaaaatctgagtaacttcaaacttgattgtctcaattgttacaagtaatatctagtacccttacaagaattgttgttcc- 99  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||     
T  31428947 tgaaaaagggacaaaacattgaaaaaccgagtaacttcaaactcgattgtcccaattattataaataatctctagtacccttgcaagaattgttgttcct 31428848  T
Q  100 aaaggtgaatgt----tggattcaatttatgtt-ttaactttcgtaggagtgcctaactaaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatcccacgg 194  Q
    |||||||||||     |||||| | ||| |||  ||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      
T  31428847 aaaggtgaatgaatgatggattgatttt-tgtgcttaacttccgtagaaatgcctaactcaaattttgtgtagcctacttatccaaatattattccac-- 31428751  T
Q  195 ccttcatctaagctccgttataaccctgaaagacctcaaagtgt--attgacattgattttgattgacatttagaaacttttcaagtgtatggtaaaatg 292  Q
     ||||| |||||| | |||||||||||  |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  31428750 -cttcacctaagccctgttataaccctttaagacctcaaagtgtgcattgatattgattttgattgatgtttagaaacttttcaagcgtatggtaatatg 31428652  T
Q  293 tggattgcatgtcgactgtgtgtgaaccctattcatatt 331  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31428651 tagattgcatgtcgactgtgtgtgaaccct-ttcatatt 31428614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 29 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 25957844 - 25957548
Alignment:
Q  29 gagtaacttcaaacttgattgtctcaattgttacaagtaatatctagtacccttacaagaattgttgtt-ccaaaggtgaatgttggattcaatttatgt 127  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |   ||| ||||||| |||| || |||||||| || ||||||||||||| |||||| || || ||     
T  25957844 gagtaacttcatactcgattgtcccaattgttagataaaatctctagtatccttgcacgaattgttttttccaaaggtgaatgatggattgaaattgtgc 25957745  T
Q  128 tttaactttcgtaggagtgcctaactaaaattttgtgtagcctacttatccaaatat---tatcccacggccttcatctaagctccgttataaccctgaa 224  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||   ||||| |||||| ||||||||||||| ||    
T  25957744 tttaactttcgtaggagtgcccaactcaaattttgtgtagcctacttatccaaataaatatatcccac---cttcacctaagccccgttataacccttaa 25957648  T
Q  225 agacctcaaagtgt--attgacattgattttgattgacatttagaaacttttcaagtgtatggtaaaatgtggattgcatgtcgactgtgtgtgaaccct 322  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25957647 agacctcaaagtgtgcattgacattgattttgattgacgtttagaaacttttccagcttatggtaatatgtagattgcatgtcgactgtgtgtgaaccct 25957548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 13973323 - 13972990
Alignment:
Q  1 tgaaaacgggacaaaacattgaaaatctgagtaacttcaaacttgattgtctcaattgttacaagtaatatctagtacccttacaagaattgttgttcca 100  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| |  |||||||||||||| |||||||  |||||||| || |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  13973323 tgaaaaagggacaagacattgaaaaaccaagtaacttcaaactcgattgtccaaattgttataaataatctctagcacccttgcaagaattgttgttcca 13973224  T
Q  101 aagg-----tgaatgttggattcaatttatgtt-ttaactttcgtaggagtgcctaactaaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatcccacgg 194  Q
    || |     |||||| |||||| ||| | |||  ||||||| |||| || || |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||      
T  13973223 aaaggtgaatgaatgatggattgaatat-tgtgcttaacttccgtatgaatgtctaactcaaattttttgtagcctacttatccaaatattatcccac-- 13973127  T
Q  195 ccttcatctaagctccgttataaccctgaaagacctcaaagtgt--attgacattgattttgattgacatttagaaacttttcaagtgtatggtaaaatg 292  Q
     ||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  13973126 -cttcacctaagccccgttataaccctttaagacctcaaagtgtgaactgacattgattttgattgacgtttagaaacttttcaagcgtatggtaatatg 13973028  T
Q  293 tggattgcatgtcgactgtgtgtgaaccctattcatatt 331  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  13973027 tagattgcatgtcgactgtgtgggaaccct-ttcatatt 13972990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 22 - 328
Target Start/End: Original strand, 11058542 - 11058850
Alignment:
Q  22 aaaatctgagtaacttcaaacttgattgtctcaatt-gttacaagtaatatctagtacccttacaagaattgttgttccaaaggtgaatgttggattcaa 120  Q
    ||||| ||||||| || ||||| ||||||| |||   ||||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||| || ||| ||||||||  ||||| ||    
T  11058542 aaaatttgagtaaatttaaactcgattgtcccaacaagttacaaataatctctagtacctttacaa--attgttatttcaagggtgaatgagggattgaa 11058639  T
Q  121 tttatgttttaactttcgtaggagt--gcctaact-aaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatcccacggccttcatctaagctccgttataa 217  Q
    |  ||  |||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||| |||||||||    
T  11058640 tccattctttaacttccgtaggagttggcctaactcaaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatccca---ccttcacctaagccccgttataa 11058736  T
Q  218 ccctgaaagacctcaaagtgt--attgacattgattttgattgacatttagaaacttttcaagtgtatggtaaaatgtgga-ttgcatgtcgactgtgtg 314  Q
    |||| |||||||| |||||||  ||||| ||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||||| |    
T  11058737 cccttaaagaccttaaagtgtgcattgatattgatttttattgacgtttagaaatttttcaagcgtatggtaatatgtagatttgcatgtcgactgtgag 11058836  T
Q  315 tgaaccctattcat 328  Q
    ||||||||||||||    
T  11058837 tgaaccctattcat 11058850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 16788939 - 16788842
Alignment:
Q  1 tgaaaacgggacaaaacattgaaaatctgagtaacttcaaacttgattgtctcaattgttacaagtaatatctagtacccttacaagaattgttgttcc 99  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| | || |||||||||||| ||||||| ||||| ||| || |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  16788939 tgaaaatgggacaaaatattgaaaaaccgaataacttcaaactcgattgtcccaattattataaataatctctagta-ccttgcaagaattgttgttcc 16788842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 98
Target Start/End: Original strand, 30151195 - 30151285
Alignment:
Q  8 gggacaaaacattgaaaatctgagtaacttcaaacttgattgtctcaattgttacaagtaatatctagtacccttacaagaattgttgttc 98  Q
    ||||||||||||||||||    ||||||||||| || |||||| |||||| ||  || |||| ||||||| |||| |||||||||||||||    
T  30151195 gggacaaaacattgaaaaatcaagtaacttcaagctcgattgtttcaattattttaaataatctctagtatccttgcaagaattgttgttc 30151285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 161; Significance: 8e-86; HSPs: 16)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 18 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 33411451 - 33411138
Alignment:
Q  18 attgaaaatctgagtaacttcaaacttgattgtctcaattgttacaagtaatatctagtacccttacaagaattgttgttccaaaggtgaatgttggatt 117  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||| || |||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33411451 attgaaaaattgagttacttcaaactcgatggtcccaattgttataaataacctctagtacccttgcaataattgttgttccaaaggtgaatgatggatt 33411352  T
Q  118 caatttatgttttaactttcgtaggagtgcctaact-aaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatcccacggccttcatctaagctccgttata 216  Q
     ||||| || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||| || ||| |    
T  33411351 gaatttgtgctttaacttccgtaggagtgtctaactcaaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatccca---ccttcacctaagccccattaaa 33411255  T
Q  217 accctgaaagacctcaaagtgt--attgacattgattttgattgacatttagaaacttttcaagtgtatggtaaaatgtggattgcatgtcgactgtgtg 314  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  33411254 acccttaaagacctcaaagtgtgcattgacattgattttgatcgacgtttagaaacttttcaagcttatggtaatatgtagattgcatgtcgactgtgtg 33411155  T
Q  315 tgaaccctattcatattt 332  Q
    |||||||| |||||||||    
T  33411154 tgaaccct-ttcatattt 33411138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 298
Target Start/End: Original strand, 15162891 - 15163188
Alignment:
Q  1 tgaaaacgggacaaaacattgaaaatctgagtaacttcaaacttgattgtctcaattgttacaagtaatatctagtacccttacaagaattgttgttcca 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | |||| |||||||||||||    
T  15162891 tgaaaaggggacaaaacattgaaaatccgagtaacttcaaactcgattgtcccaattgttacaagtattatctagtaccttcacaataattgttgttcca 15162990  T
Q  101 aaggtgaatgttggattcaa-tttatgttttaactttcgtaggagtgcctaactaaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatcccacggccttc 199  Q
    |||||||||| |||||| || ||| || ||| |||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||    
T  15162991 aaggtgaatgatggattgaattttgtgctttcacttccgtatgagtgcttaactcaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatctca---ccttc 15163087  T
Q  200 atctaagctccgttataaccctgaaagacctcaaagtgt--attgacattgattttgattgacatttagaaacttttcaagtgtatggtaaaatgtggat 297  Q
      |||||| | |||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||    
T  15163088 gcctaagcccagttataaccctgaaagtcctcaaagtgtgaaatgacattgattttgattgacgtttagaaacttttcaagcgtatggtaatatgtagat 15163187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 27678476 - 27678151
Alignment:
Q  1 tgaaaacgggacaaaacattgaaaatctgagtaacttcaaacttgattgtctcaattgttacaagtaatatctagtacccttacaagaattgttgttcca 100  Q
    |||||| ||||||  |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27678476 tgaaaaagggacacgacattgaaaaaccgagtaacttcaaactcgattgtcccaattgttataaataatctctagtacccttgcaagaattgttgttcca 27678377  T
Q  101 aagg-----tgaatgttggattcaattt-atgttttaactttcgtaggagtgcctaactaaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatcccacgg 194  Q
    || |     |||||| |||||| ||||| ||| || ||||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||      
T  27678376 aaaggtgaatgaatgatggattgaattttatgctt-aacttccgtaggattgcctaactcaaattttatgtagcctacttatccaaatattatttcac-- 27678280  T
Q  195 ccttcatctaagctccgttataaccctgaaagacctcaaagtgt--attgacattgattttgattgacatttagaaacttttcaagtgtatggtaaaatg 292  Q
     ||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||    
T  27678279 -cttcacctaagcccccttataacccttaaagacctcaaagtgtgcattgacattgattttgattgacgtttagaaacttttcaagcttatggtaatatg 27678181  T
Q  293 tggattgcatgtcgactgtgtgtgaaccct 322  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27678180 tagattgcatgtcgactgtgtgtgaaccct 27678151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Original strand, 39500373 - 39500708
Alignment:
Q  1 tgaaaacgggacaaaacattgaaaatctgagtaacttcaaacttgattgtctcaattgttacaagtaatatctagtacccttacaagaattgttgttcca 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||| ||||||||  || |||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39500373 tgaaaaagggacaaaacattgaaaaaccgagtaacttcaagctcgattgtcccaattgttttaaataatctctagtacccttgcaagaattgttgttcca 39500472  T
Q  101 aagg-----tgaatgttggattcaatttatgtt-ttaactttcgtaggagtgcctaactaaaattttgtgtagcctacttatccaaatat-tatcccacg 193  Q
    || |     |||||| |||||| ||||| |||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||     
T  39500473 aaaggtgaatgaatgatggattgaattt-tgtgcttaacttccgtaggaatgcctaactcaaattttgtgtagcctacttatccaaataaatatcccac- 39500570  T
Q  194 gccttcatctaagctccgttataaccctgaaagacctcaaagtgt--attgacattgattttgattgacatttagaaacttttcaagtgtatggtaaaat 291  Q
      ||||| |||||| | ||||||||||| || |||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  39500571 --cttcacctaagcccagttataacccttaatgacctcaaagtgtgcattgacattgattttgattgaagtttagaaacttttcaagcgtatggtaatat 39500668  T
Q  292 gtggattgcatgtcgactgtgtgtgaaccctattcatatt 331  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  39500669 gtagattgcatgtcgattgtgtgtgaacccttttcatatt 39500708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 9 - 331
Target Start/End: Original strand, 56197527 - 56197852
Alignment:
Q  9 ggacaaaacattgaaaatctgagtaacttcaaacttgattgtctcaattgttacaagtaatatctagtacccttacaagaattgttgttccaaagg---- 104  Q
    |||||| | |||||||| | ||||||||||||||| |||||||  |||||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |        
T  56197527 ggacaagatattgaaaaaccgagtaacttcaaactcgattgtcctaattgttataaataatctctagtacccttgcaagaattgttgttccaaaaggtga 56197626  T
Q  105 -tgaatgttggattcaatttatgtt-ttaactttcgtaggagtgcctaactaaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatcccacggccttcatc 202  Q
     |||||| |||||| ||||| |||  |||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||| |    
T  56197627 atgaatgatggattgaattt-tgtgcttaacttctgtaggaatgcctaactcaaattttgtgtaacctacttatccaaatattatcccac---cttcacc 56197722  T
Q  203 taagctccgttataaccctgaaagacctcaaagtgt--attgacattgattttgattgacatttagaaacttttcaagtgtatggtaaaatgtggattgc 300  Q
    ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||    
T  56197723 taagccccgttataacctttaaagacctcaaagtgtgcattgacattgattttgattgacgtttagaaacttttcaagcatatggtaatatgtagattgc 56197822  T
Q  301 atgtcgactgtgtgtgaaccctattcatatt 331  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  56197823 atgtcgactgtgtgtgaaccct-ttcatatt 56197852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 9 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 3799298 - 3798981
Alignment:
Q  9 ggacaaaacattgaaaatctgagtaacttcaaacttgattgtctcaattgttacaagtaatatctagtacccttacaagaattgttgttccaaagg---- 104  Q
    |||||| |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| |        
T  3799298 ggacaagacattgaaaaaccgagtaacttcaaactcgattgtcccaattgttataaataatctctagtacccttgcaagaatggttgttccaaaaggtga 3799199  T
Q  105 -tgaatgttggattcaatttatgttttaactttcgtaggagtgcctaactaaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatcccacggccttcatct 203  Q
     |||||| |||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||   |||||| ||    
T  3799198 atgaatgatggattgaatttgtgctttaacttccgtaggagtgcctaactcaaattttgtgtaccctacttatccaaataatatctca---ccttcacct 3799102  T
Q  204 aagctccgttataaccctgaaagacctcaaagtgt--attgacattgattttgattgacatttagaaacttttcaagtgtatggtaaaatgtggattgca 301  Q
    |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||| ||| |||| ||||| |    
T  3799101 aagtcccgttataacccttaaagacctcaaagtgtgcattgacattgattttgattgacgtttagaaacttttcaagcttatgataatatgtagattgta 3799002  T
Q  302 tgtcgactgtgtgtgaaccct 322  Q
    |||| | ||||||||||||||    
T  3799001 tgtccattgtgtgtgaaccct 3798981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 22 - 333
Target Start/End: Original strand, 53894984 - 53895293
Alignment:
Q  22 aaaatctgagtaacttcaaacttgattgtctcaattgttacaagtaatatctagtacccttacaagaattgttgttccaaagg-tgaatgttggattcaa 120  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||| | || ||||||| |||| ||||||||| ||||||   |||||||| |||||| || |||  ||||| ||    
T  53894984 aaaatctgagtaatttcaaactcgattgtcccgatagttacaaataatctctagtacctttacaa---ttgttgtttcaaagggtggatgagggatttaa 53895080  T
Q  121 tttatgttttaactttcgtaggagtgcctaactaaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatcccacggccttcatctaagctccgttataaccc 220  Q
    | | || ||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||| | |||||| ||||||||||||    
T  53895081 tctttgctttaattttcgtaggagttccttactcaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatctca---cctttacctaagccccgttataaccc 53895177  T
Q  221 tgaaagacctcaaa--gtgtattgacattgattttgattgacatttagaaacttttcaagtgtatggtaaaatgtgga-ttgcatgtcgactgtgtgtga 317  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  53895178 tgaaagacctcaaagtgtgtaatgacattgattttgattaacgtttagaaactcttcaagcgtatggtaatatgtagacctgcatgtcgactgtgtgtga 53895277  T
Q  318 accctattcatatttg 333  Q
    |||||  |||||||||    
T  53895278 acccttatcatatttg 53895293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 128 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 19861666 - 19861472
Alignment:
Q  128 tttaactttcgtaggagtgcctaact-aaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatcccacggccttcatctaagctccgttataaccctgaaag 226  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  19861666 tttaattttcataggagtgcctaactcaaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatcccac---cttcacctaagccccgttataacccttaaag 19861570  T
Q  227 acctcaaagtgt--attgacattgattttgattgacatttagaaacttttcaagtgtatggtaaaatgtggattgcatgtcgactgtgtgtgaaccct 322  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  19861569 acctcaaagtgtgcattgacattgattttgattgacatttaaaaacttttcaagcatatggtaatatgtagaatgcatgtcgactgtgtgtgaaccct 19861472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 49638006 - 49637675
Alignment:
Q  1 tgaaaacgggacaaaacattgaaaatctgagtaacttcaaacttgattgtctcaa-ttgttacaagtaatatctagtacccttacaagaattgttgttcc 99  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||  ||||| ||||||| ||| ||||||  | | || ||||||||| || |||||||||| |||||    
T  49638006 tgaaaaagggacataacattgaaaatccgagtatcta-aaactcgattgtcccaaattgttaagaatgatctctagtacctttgcaagaattgt-gttcc 49637909  T
Q  100 aaa-ggtgaatg-----ttggattcaatttatgttttaactttcgtaggagtgcctaactaaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatcccacg 193  Q
    ||| ||||||||     |||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||        
T  49637908 aaaaggtgaatgaataattgg-ttcaatttgtgttttaacttatgtaggagtgcctaactcaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatcca--- 49637813  T
Q  194 gccttcatctaagctccgttataaccctgaaagacctcaaagtgt--attgacattgattttgattgacatttagaaacttttcaagtgtatggtaaaat 291  Q
     |||||| |||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||| ||    
T  49637812 -ccttcacctaagccccgttgttacccttaaagacctcaaagtgtgcattgacattgattttgattgacgtatagaaactcttcaagcgtatggtaatat 49637714  T
Q  292 gtggattgcatgtcgactgtgtgtgaaccctattcatatt 331  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  49637713 gtagattgtatgtcgactgtgtgtgaaccct-ttcatatt 49637675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 156 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 15431116 - 15430943
Alignment:
Q  156 aattttgtgtagcctacttatccaaatattatcccacggccttcatctaagctccgttataaccctgaaagacctcaaagtgt--attgacattgatttt 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||| || |||||| |||  ||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  15431116 aattttgtgtagcctacttatccaaatattatcccac---cttcacctaagccccattataatcctttaagacctcaaaatgtgcattgacattgatttt 15431020  T
Q  254 gattgacatttagaaacttttcaagtgtatggtaaaatgtggattgcatgtcgactgtgtgtgaaccctattcatatt 331  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15431019 gattgacgtttagaaacttttcaagcgtatggtaatatgtaggttgcatgtcgactgtgtgtgaaccct-ttcatatt 15430943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 156 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 15437730 - 15437557
Alignment:
Q  156 aattttgtgtagcctacttatccaaatattatcccacggccttcatctaagctccgttataaccctgaaagacctcaaagtgt--attgacattgatttt 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||| || |||||| |||  ||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  15437730 aattttgtgtagcctacttatccaaatattatcccac---cttcacctaagccccattataatcctttaagacctcaaaatgtgcattgacattgatttt 15437634  T
Q  254 gattgacatttagaaacttttcaagtgtatggtaaaatgtggattgcatgtcgactgtgtgtgaaccctattcatatt 331  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15437633 gattgacgtttagaaacttttcaagcgtatggtaatatgtaggttgcatgtcgactgtgtgtgaaccct-ttcatatt 15437557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 139 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 26061179 - 26061004
Alignment:
Q  139 taggagtgcctaactaaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatcccacggccttcatctaagctccgttataaccctgaaagacctcaaagtgt 238  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||   ||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26061179 taggagtgcctaactcaaattttatgtagtctacttatccaaataatatcacac---ctttacctaagccccgttataacccttaaagacctcaaagtgt 26061083  T
Q  239 at--tgacattgattttgattgacatttagaaacttttcaagtgtatggtaaaatgtgga-ttgcatgtcgactgtgtg 314  Q
     |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| |||| ||  | |||||||||||||||    
T  26061082 gtaatgacattgattttgattgacgtttagaaacttttcaagcgcatggtaatatgtagacctacatgtcgactgtgtg 26061004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 110
Target Start/End: Original strand, 19826273 - 19826375
Alignment:
Q  9 ggacaaaacattgaaaatctgagtaacttcaaacttgattgtctcaattgttacaagtaatatctagtacccttacaagaattgttgttcc-aaaggtga 107  Q
    |||||| |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  19826273 ggacaagacattgaaaacccgagtaacttcaaactcgattgtcccaaatgttataaataatctctagtaccctttcaagaattgttgttccaaaaggtga 19826372  T
Q  108 atg 110  Q
    |||    
T  19826373 atg 19826375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 229 - 331
Target Start/End: Original strand, 19826421 - 19826524
Alignment:
Q  229 ctcaaagtgt--attgacattgattttgattgacatttagaaacttttcaagtgtatggtaaaatgtggattgcatgtcgactgtgtgtgaaccctattc 326  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  19826421 ctcaaagtgtgcattgacattgattttgattgacgtttagaaatttttcaagcttatagtaatatgtagattgcatgtcaactgtgtgtgaaccct-ttc 19826519  T
Q  327 atatt 331  Q
    |||||    
T  19826520 atatt 19826524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 15432515 - 15432436
Alignment:
Q  1 tgaaaacgggacaaaacattgaaaatctgagtaacttcaaacttgattgtctcaattgttacaagtaatatctagtaccctt 82  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||  |||||||  || |||||||||||||||||    
T  15432515 tgaaaaagggacaagacattgaaaaaccgagtaacttcaaactcgattatccaaattgtt--aaataatatctagtaccctt 15432436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 243 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 22091020 - 22090970
Alignment:
Q  243 acattgattttgattgacatttagaaacttttcaagtgtatggtaaaatgt 293  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  22091020 acatggattttgatcgatatttagaaaattttcaagtgtatggtaatatgt 22090970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 160; Significance: 3e-85; HSPs: 24)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Original strand, 7832282 - 7832614
Alignment:
Q  1 tgaaaacgggacaaaa-cattgaaaatctgagtaacttcaaacttgattgtctcaattgttacaagtaatatctagtacccttacaagaattgttgttcc 99  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||| | ||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  7832282 tgaaaaagggacaaaaacattgaaaatccgagtaacttcaaactcgattgtcccaatgattacaagtattctctagtaccttcacaagtattgttgttcc 7832381  T
Q  100 aaaggtgaatgttggattcaatttatg-ttttaactttcgtaggagtgcctaact-aaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatcccacggcct 197  Q
    ||||||| ||| |||||| ||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  7832382 aaaggtgcatgatggattgaatttgtgctttaaacttccgtaggagtgcctaactcaaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatccca---cct 7832478  T
Q  198 tcatctaagctccgttataaccctgaaagacctcaaagtgt--attgacattgattttgattgacatttagaaacttttcaagtgtatggtaaaatgtgg 295  Q
    | | |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||| |    
T  7832479 ttacctaagccccgttataaccctttaagacctcaaagtgtgcattgacattgattttgattgacgtttagaaacttttcaagcgtatggtagtatgtag 7832578  T
Q  296 attgcatgtcgactgtgtgtgaaccctattcatattt 332  Q
    ||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  7832579 attgcatatcgactaagtgtgaaccct-ttcatattt 7832614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Original strand, 10883506 - 10883839
Alignment:
Q  1 tgaaaacgggacaaaacattgaaaatctgagtaacttcaaacttgattgtctcaattgttacaagtaatatctagtacccttacaagaattgttgttcca 100  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10883506 tgaaaaagggacaagacattgaaaaaccgagtaactttaaactcgattgtcccaattgttataaataatctctagtacccttgcaagaattgttgttcca 10883605  T
Q  101 aagg-----tgaatgttggattcaatttatgtt-ttaactttcgtaggagtgcctaactaaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatcccacgg 194  Q
    || |     |||||| || ||| ||||| |||  |||| || ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  10883606 aaaggtgaatgaatgatgaattgaattt-tgtgcttaaattccgtaggaatgcctaactcaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatcccat-- 10883702  T
Q  195 ccttcatctaagctccgttataaccctgaaagacctcaaagtgt--attgacattgattttgattgacatttagaaacttttcaagtgtatggtaaaatg 292  Q
     ||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  10883703 -cttcacctaagccccgttataaccctttaagacctcaaagtgtgcattgacattgattttgattgacgtttagaaacttttcaagcgtatggtaatatg 10883801  T
Q  293 tggattgcatgtcgactgtgtgtgaaccctattcatatt 331  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  10883802 tagattgcatgtcgattgtgtgtgaaccct-ttcatatt 10883839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 55033148 - 55032834
Alignment:
Q  1 tgaaaacgggacaaaacattgaaaatctgagtaacttcaaacttgattgtctcaattgttacaagtaatatctagtacccttacaagaattgttgttcca 100  Q
    |||||| ||||||  |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  55033148 tgaaaaagggacatgacattgaaaaaccgagtaacttcaaactcgattgtcccaattgttataaataatctctagtacccttgcaagaattgttgttcca 55033049  T
Q  101 aa-ggtgaat----gttggattcaatttatgtt-ttaactttcgtaggagtgcctaactaaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatcccacgg 194  Q
    || |||||||    | |||||| ||||| |||  ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||      
T  55033048 aaaggtgaattaatgatggattgaattt-tgtgcttaacttccgtaggaatgcctaactcaaattttgtgtagcctacttatcgaaatattatcccac-- 55032952  T
Q  195 ccttcatctaagctccgttataaccctgaaagacctcaaagtgt--attgacattgattttgattgacatttagaaacttttcaagtgtatggtaaaatg 292  Q
     ||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  55032951 -cttcacctaagccccgttataaccctttaagacctcaaagtgtgcattgacattgattttgattgacgtttagaaacttttcaagcgtatggtaatatg 55032853  T
Q  293 tggattgcatgtcgactgt 311  Q
    | |||||||| ||||||||    
T  55032852 tagattgcatatcgactgt 55032834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Original strand, 47053456 - 47053784
Alignment:
Q  1 tgaaaacgggacaaaacattgaaaatctgagtaacttcaaacttgattgtctcaattgttacaagtaatatctagtacccttacaagaattgttgttcca 100  Q
    |||||| |||||||  ||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  47053456 tgaaaaggggacaagtcattgaaaaaccgagtaactt-aaactcgattgtcccaattgttataaataatctctagtacccttgcaagaattgttgttcca 47053554  T
Q  101 aa-ggtgaatgttggattcaatttatgtt-ttaactttcgtaggagtgcctaactaaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatcccacggcctt 198  Q
    || |||||||| |||||| ||||| |||  ||||||| ||||  | ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||    
T  47053555 aaaggtgaatgatggattgaattt-tgtgcttaacttccgtatcaatgcctaactcaaattttgtgtagcctacttattcaaatattatcccac---ctt 47053650  T
Q  199 catctaagctccgttataaccctgaaagacctcaaagtgt--attgacattgattttgattgacatttagaaacttttcaagtgtatggtaaaatgtgga 296  Q
    || |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||| |||| ||    
T  47053651 cacctaagccccgttataaccctttaagacctcaaagtgtgcattaacattgattttgattgacgtttagcaacttttaaagcgtatggtaatatgtaga 47053750  T
Q  297 ttgcatgtcgactgtgtgtgaaccctattcatatt 331  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  47053751 ttgcatgtcgactatgtgtgaaccct-ttcatatt 47053784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Original strand, 2777505 - 2777838
Alignment:
Q  1 tgaaaacgggacaaaacattgaaaatctgagtaacttcaaacttgattgtctcaattgttacaagtaatatctagtacccttacaagaattgttgttcca 100  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| | ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2777505 tgaaaaagggacaagacattgaaaaaccgagtaacattaaactcgattgtcccaattgttataaataatctctagtacccttgcaagaattgttgttcca 2777604  T
Q  101 aa-ggtgaat----gttggattcaatttatgtt-ttaactttcgtaggagtgcctaactaaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatcccacgg 194  Q
    || |||||||    | || ||| ||||| |||  ||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  2777605 aaaggtgaataaatgatgaattgaattt-tgtacttaacttccgtaggagtgcctacttcaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatcccac-- 2777701  T
Q  195 ccttcatctaagctccgttataaccctgaaagacctcaaagtgt--attgacattgattttgattgacatttagaaacttttcaagtgtatggtaaaatg 292  Q
     ||||| |||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||| |||    
T  2777702 -cttcacctaagccccgttataaccctttaagacatcaaagtgtgcattgacattgattttgattgacgtctagaaacttttcaagcttatggtaatatg 2777800  T
Q  293 tggattgcatgtcgactgtgtgtgaaccctattcatatt 331  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2777801 tagattgcatgtcgactgtgtgtgaaccct-ttcatatt 2777838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 100 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 15196604 - 15196374
Alignment:
Q  100 aaaggtgaatgttggattcaatttatgttttaactttcgtaggagtgcctaact-aaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatcccacggcctt 198  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  15196604 aaaggtgaatgatggattgaatttatgttttaacttccgtaggagtgcctaactcaaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatcccac---ctt 15196508  T
Q  199 catctaagctccgttataaccctgaaagacctcaaagtgt--attgacattgattttgattgacatttagaaacttttcaagtgtatggtaaaatgtgga 296  Q
    || |||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||  |    
T  15196507 cacctaagccccgttataaccattaaagacatcaaagtgtgcattgacattgattttgattgacgtttagaaacttttcaagcatatggtaatatgtaaa 15196408  T
Q  297 ttgcatgtcgactgtgtgtgaaccctattcatatt 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15196407 ttgcatgtcgactgtgtgtgaaccct-ttcatatt 15196374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Original strand, 28329388 - 28329712
Alignment:
Q  1 tgaaaacgggacaaaacattgaaaatctgagtaacttcaaacttgattgtctcaattgttacaagtaatatctagtacccttacaagaattgttgttcca 100  Q
    |||||| ||||||||  |||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  28329388 tgaaaaagggacaaagaattgaaaaaccgagtaacttcaaactcgattgtcccaattgttataaataatctctagtatccttgcaagagttgttgttcca 28329487  T
Q  101 aagg-----tgaatgttggattcaatttatgt-tttaactttcgtaggagtgcctaactaaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatcccacgg 194  Q
    || |     |||||| |||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||       
T  28329488 aaaggtgaatgaatgatggattgaattt-tgtgtttaacttccgtaggagtgcctaactcaaattttgtgtagcctacttatccaaatat-atcccaa-- 28329583  T
Q  195 ccttcatctaagctccgttataaccctgaaagacctcaaagtgt--attgacattgattttgattgacatttagaaacttttcaagtgtatggtaaaatg 292  Q
     ||||| |||||| || ||||||||||  |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||| |||    
T  28329584 -cttcacctaagccccattataaccctttaagacctcaaggtgtgcattgacattgattttgattgatgtttagaaacttttcaagcttatggtaatatg 28329682  T
Q  293 tggattgcatgtcgactgtgtgtgaaccct 322  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28329683 tagattgcatgtcgactgtgtgtgaaccct 28329712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Original strand, 24127556 - 24127877
Alignment:
Q  1 tgaaaacgggacaaaacattgaaaatctgagtaacttcaaacttgattgtctcaattgttacaagtaatatctagtacccttacaagaattgttgttcca 100  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |  |||||| || |||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  24127556 tgaaaaagggacaagacattgaaaaaccgagtaacttcaaactcgattgtcccggttgttataaataatctctagtatccttgcaa-aattgttgttcca 24127654  T
Q  101 aagg-----tgaatgttggattcaatttatgtt-ttaactttcgtaggagtgcctaactaaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatcccacgg 194  Q
    || |     |||||| |||||| ||||| |||  |||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||      
T  24127655 aaaggtgattgaatgatggattgaattt-tgtgcttaacttctgtaggaatgcctaactcaaattttgtgtagcctacttatccaaatat-atcccac-- 24127750  T
Q  195 ccttcatctaagctccgttataaccctgaaagacctcaaagtgt--attgacattgattttgattgacatttagaaacttttcaagtgtatggtaaaatg 292  Q
     ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||    
T  24127751 -cttcacctaagccccgttataacccttaaagacctcaaagtgtgcattgacattgattttgattgacgtttagaaacttttcaagcttatggtaatatg 24127849  T
Q  293 tggattgcatgtcgactgtgtgtgaacc 320  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||    
T  24127850 tagattgcatgtcgactgtgtgtgaacc 24127877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 22 - 332
Target Start/End: Original strand, 9157024 - 9157332
Alignment:
Q  22 aaaatctgagtaacttcaaacttgattgtctcaatt-gttacaagtaatatctagtacccttacaagaattgttgttccaaaggt-gaatgttggattca 119  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||| |||   ||||||| |||| ||||||||| ||||||  || |||||| ||| | | |||||| ||||| |    
T  9157024 aaaatctgagtaactttaaactcgattgtcccaacaagttacaaataatctctagtacctttacaa--atggttgtttcaaggtttgaatgtgggattga 9157121  T
Q  120 atttatgttttaactttcgtaggagtgcctaactaaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatcccacggccttcatctaagctccgttataacc 219  Q
    || | || ||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| | |||||| |||||||||||    
T  9157122 atctttgctttaatttatgtaggagtgcctaactcaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatccc---gcctttacctaagccccgttataacc 9157218  T
Q  220 ctgaaagacctcaaagtgtat--tgacattgattttgattgacatttagaaacttttcaagtgtatggtaaaatgtggattgcatgtcgactgtgtgtga 317  Q
    || |||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  9157219 cttaaagacatcaaagtgtgtaatgacattgattttgattgacatttagaaatttttcaagcgtatggtaatatgtagattgcatgtcgactgtgtgtga 9157318  T
Q  318 accctattcatattt 332  Q
    ||||| |||||||||    
T  9157319 accct-ttcatattt 9157332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 19302871 - 19302544
Alignment:
Q  1 tgaaaacgggacaaaacattgaaaatctgagtaacttcaaacttgattgtctcaattgttacaagtaatatctagtacccttacaagaattgttgttcca 100  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||  |||||||||| | ||||||||| |||||||  ||| |||||||    
T  19302871 tgaaaaagggacaaatcattgaaaatccgagtaactttaaactcgattgtcccaacagttacaagtattctctagtacctttacaagttttgatgttcca 19302772  T
Q  101 aaggtgaatgttggattcaattta-tgttttaactttcgtaggagtgcctaactaaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatcccacggccttc 199  Q
    |||| | | |  ||||| |||||  || |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||    
T  19302771 aagggggaagagggattgaattttgtgctttaacttccgtaggaatgcctaactcaaattttgtgtagcctacttattcaaatattatccca---ccttc 19302675  T
Q  200 atctaagctccgttataaccctgaaagacctcaaa--gtgtattgacattgattttgattgacatttagaaacttttcaagtgtatggtaaaatgtgga- 296  Q
    | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||| ||||| |||||||||| |||||||| | ||||||| ||| |||| |||| ||     
T  19302674 acctaagccccgttataaccttgaaagacctcaaagtgtgtagtgatattgactttgattgacgtttagaaaatcttcaagtctatcgtaatatgtagac 19302575  T
Q  297 ttgcatgtcgactgtgtgtgaaccctattca 327  Q
     |||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  19302574 ctgcatgtcgattgtgtgtgaaacctattca 19302544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 129 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 36534077 - 36533884
Alignment:
Q  129 ttaactttcgtaggagtgcctaact-aaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatcccacggccttcatctaagctccgttataaccctgaaaga 227  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||| |||||| |||||||||||||  ||||    
T  36534077 ttaacttccgtaggaatgcctaactcaaaattttgtgtagcctgcttatccaaatattatcccac---cttcacctaagccccgttataaccctttaaga 36533981  T
Q  228 cctcaaagtgt--attgacattgattttgattgacatttagaaacttttcaagtgtatggtaaaatgtggattgcatgtcgactgtgtgtgaaccct 322  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36533980 cctcaaagtgtgcattgacattgattttgattgacgtttagaaactttttaagtgtatggtaatatgtagattgcatgtcgactgtgtgtgaaccct 36533884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 320
Target Start/End: Original strand, 10961931 - 10962244
Alignment:
Q  14 aaacattgaaaa-tctgagtaacttcaaacttgattgtctcaatt-gttacaagtaatatctagtacccttacaagaattgttgttccaaagg-----tg 106  Q
    |||||||||||| ||||||||| | |||||| ||||||| ||||  ||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |     ||    
T  10961931 aaacattgaaaaatctgagtaattccaaactcgattgtcccaataagttacaaataatctctagtacccttgcaagaattgttgttccaaaaggtgaatg 10962030  T
Q  107 aatgttggattcaatttatgtt-ttaactttcgtaggagtgcctaactaaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatcccacggccttcatctaa 205  Q
    |||| |||||| ||||| |||  ||||||| |||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||| ||||    
T  10962031 aatgatggattgaattt-tgtgcttaacttccgtatgaatgcctaactcaaattttgtgtagcctacttatccaaatattattcca---ccttcacctaa 10962126  T
Q  206 gctccgttataaccctgaaagacctcaaa--gtgtattgacattgattttgattgacatttagaaacttttcaagtgtatggtaaaatgtgga-ttgcat 302  Q
    || ||||||||| |||  |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||  |||||    
T  10962127 gccccgttataatcctttaagacctcaaagtgtgtaatgacattgattttgattgacgtttagaaacttttcaagcgtatgataatatgtagacctgcat 10962226  T
Q  303 gtcgactgtgtgtgaacc 320  Q
    || || ||||||||||||    
T  10962227 gttgattgtgtgtgaacc 10962244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 320
Target Start/End: Original strand, 10965440 - 10965753
Alignment:
Q  14 aaacattgaaaa-tctgagtaacttcaaacttgattgtctcaatt-gttacaagtaatatctagtacccttacaagaattgttgttccaaagg-----tg 106  Q
    |||||||||||| ||||||||| | |||||| ||||||| ||||  ||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |     ||    
T  10965440 aaacattgaaaaatctgagtaattccaaactcgattgtcccaataagttacaaataatctctagtacccttgcaagaattgttgttccaaaaggtgaatg 10965539  T
Q  107 aatgttggattcaatttatgtt-ttaactttcgtaggagtgcctaactaaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatcccacggccttcatctaa 205  Q
    |||| |||||| ||||| |||  ||||||| |||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||| ||||    
T  10965540 aatgatggattgaattt-tgtgcttaacttccgtatgaatgcctaactcaaattttgtgtagcctacttatccaaatattattcca---ccttcacctaa 10965635  T
Q  206 gctccgttataaccctgaaagacctcaaa--gtgtattgacattgattttgattgacatttagaaacttttcaagtgtatggtaaaatgtgga-ttgcat 302  Q
    || ||||||||| |||  |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||  |||||    
T  10965636 gccccgttataatcctttaagacctcaaagtgtgtaatgacattgattttgattgacgtttagaaacttttcaagcgtatgataatatgtagacctgcat 10965735  T
Q  303 gtcgactgtgtgtgaacc 320  Q
    || || ||||||||||||    
T  10965736 gttgattgtgtgtgaacc 10965753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Original strand, 13558426 - 13558705
Alignment:
Q  1 tgaaaacgggacaaaacattgaaaatctgagtaacttcaaacttgattgtctcaattgttacaagtaatatctagtacccttacaagaattgttgttcca 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||| ||||||||  || |||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  13558426 tgaaaaagggacaaaacattgaaaaaccgagtaacttcaagctcgattgtcccaattgttttaaataatctctagtatccttgcaa-aattgttgttcca 13558524  T
Q  101 aagg-----tgaatgttggattcaatttatgtt-ttaactttcgtaggagtgcctaactaaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatcccacgg 194  Q
    || |     |||||| |||||| ||||| |||  |||||||  |||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||       
T  13558525 aaaggtgattgaatgatggattgaattt-tgtgcttaacttctgtaggaatgtctaactcaaattttgtgtagcctacttatccaaata-tatccca--- 13558619  T
Q  195 ccttcatctaagctccgttataaccctgaaagacctcaaagtgt--attgacattgattttgattgacatttagaaacttttcaag 278  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13558620 ccttcacctaagccccgttataacccttaaagacctcaaagtgtgcattgacattgattttgattgacgtttagaaacttttcaag 13558705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 137 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 22994963 - 22994786
Alignment:
Q  137 cgtaggagtgcctaactaaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatcccacggccttcatctaagctccgttataaccctgaaagacctcaaa-- 234  Q
    |||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||      
T  22994963 cgtaggagtgccgacctcaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatccca---cctttacctaagccccgttataaccctaaaagacctcaaagt 22994867  T
Q  235 gtgtattgacattgattttgattgacatttagaaacttttcaagtgtatggtaaaatgtgga-ttgcatgtcgactgtgtg 314  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| |||| || ||| ||| ||||||||||    
T  22994866 gtgtaatgacattggttttgattggcatttagaaacttttcaagcgtttggtaatatgtagacttgaatggcgactgtgtg 22994786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 128 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 30159394 - 30159230
Alignment:
Q  128 tttaactttcgtaggagtgcctaactaaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatcccacggccttcatctaagctccgttataaccctgaaaga 227  Q
    ||||| || ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||| | |||| |  ||||||||||||||||||    
T  30159394 tttaatttccgtaggaatgcctaactcaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatctcac---cttaacctaaacctcgttataaccctgaaaga 30159298  T
Q  228 cctcaaagtgtat--tgacattgattttgattgacatttagaaacttttcaagtgtatggtaaaatgt 293  Q
    ||||||||||| |  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  30159297 cctcaaagtgtgtaatgatattgattttgattgacgtttagaaacttttcaagcgtatggtaatatgt 30159230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 197 - 319
Target Start/End: Original strand, 3839478 - 3839602
Alignment:
Q  197 ttcatctaagctccgttataaccctgaaagacctcaaagtgt--attgacattgattttgattgacatttagaaacttttcaagtgtatggtaaaatgtg 294  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||     
T  3839478 ttcacctaagctccgttataactctttaagacctcaaagtgttcattgacattgattttgattgacgtttagaaacttttcaagcgtatggtaatatgta 3839577  T
Q  295 gattgcatgtcgactgtgtgtgaac 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  3839578 gattgcatgtcgactgtgtgtgaac 3839602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 22026250 - 22026442
Alignment:
Q  1 tgaaaacgggacaaaacattgaaaatctgagtaacttcaaacttgattgtctcaattgttacaagtaatatctagtacccttacaagaattgttgttcca 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||| ||||||||| || |||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||    
T  22026250 tgaaaaagggacaaaacattgaaaaaccgagtaacttcaagctcgattgtcccaattgttataaataatctctggtatccttgcaagaattgttgttcca 22026349  T
Q  101 aagg-----tgaatgttggattcaatttatgt-tttaactttcgtaggagtgcctaactaaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatc 188  Q
    || |     |||||| |||||| ||||| |||  ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22026350 aaaggtgaatgaatgatggattgaattt-tgtgcttaacttccgtaggaatgcctaactcaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatc 22026442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 96 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 12541436 - 12541300
Alignment:
Q  96 ttccaaaggtgaatgttggattcaatttatgttttaactttcgtaggagtgcctaactaaaattttgtgtagcctacttatccaaat-attatcccacgg 194  Q
    ||||||||||||||| |||||| || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||       
T  12541436 ttccaaaggtgaatgatggattgaaattgtgctttaactttcgtaggagtgcctaactcaaattttgtgtagcctacttatccaaataaatatccca--- 12541340  T
Q  195 ccttcatctaagctccgttataaccctgaaagacctcaaa 234  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  12541339 ccttcacctaagccccgttataacccttaaagacctcaaa 12541300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 28 - 331
Target Start/End: Original strand, 11635637 - 11635934
Alignment:
Q  28 tgagtaacttcaaacttgattgtctcaatt-gttacaagtaatatctagtacccttacaagaattgttgttccaaagg-tgaatgttggattcaatttat 125  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| ||| | ||||||| || | ||||||||| ||||||  ||||||||| ||| || ||||||  ||||| |||  ||    
T  11635637 tgagtaactttaaactcgattgtcccaactagttacaaatattctctagtacctttacaa--attgttgtttcaaggggtgaatgagggattgaatccat 11635734  T
Q  126 gttttaactttcgtaggagtgcctaactaaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatcccacggccttcatctaagctccgttataaccctgaaa 225  Q
    | ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||      ||||||||||| |||||||    ||| | ||||||  ||||||||| || |||    
T  11635735 gatttaatttccgtaggagtgcctaactcaaattttgtgta------ttatccaaataatatcccat---ctttacctaagcctcgttataactcttaaa 11635825  T
Q  226 gacctcaaagtgtat--tgacattgattttgattgacatttagaaacttttcaagtgtatggtaaaatgtgga-ttgcatgtcgactgtgtgtgaaccct 322  Q
     |||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||| || || ||||||||||||||    
T  11635826 tacctcaaagtgtgtaatgacattgattttgattgacgtttagaaacttttcaagcgtatggtaatatgtagacttgcacgttgattgtgtgtgaaccct 11635925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 88 - 314
Target Start/End: Original strand, 18541392 - 18541620
Alignment:
Q  88 aattgttgttccaaaggtgaatgttgg-attcaatttatgttttaactttcgtaggagtgcctaactaaaattttgtgtagcctacttatccaaatatta 186  Q
    |||||||||| ||| ||||||||  || ||| ||| | ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  18541392 aattgttgtttcaagggtgaatgaggggattgaatctgtgtttaaaatttcgtaggagtgcataacttaaattttgtgcagccaacttatccaaatatta 18541491  T
Q  187 tcccacggccttcatctaagctccgttataa-ccctgaaagacctcaaagtg--tattgacattgattttgattgacatttagaaacttttcaagtgtat 283  Q
    |||||    ||| | |||||| || |||||| |||  |||||||| ||||||  || |||||| || ||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  18541492 tccca---gctttacctaagccccattataaccccaaaaagaccttaaagtgtctaatgacatggactttgattaacatttagaaaattttcaagtgtat 18541588  T
Q  284 ggtaaaatgtgga-ttgcatgtcgactgtgtg 314  Q
    ||||| |||| ||  |||||||||||||||||    
T  18541589 ggtaatatgtagacctgcatgtcgactgtgtg 18541620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 15196666 - 15196616
Alignment:
Q  1 tgaaaacgggacaaaacattgaaaatctgagtaacttcaaacttgattgtc 51  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  15196666 tgaaaaagggacaaaacattgaaaatccgagtaacttcaaactagattgtc 15196616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Original strand, 11757993 - 11758035
Alignment:
Q  1 tgaaaacgggacaaaacattgaaaatctgagtaacttcaaact 43  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11757993 tgaaaaagggacaaaacattgaaaatccgagtaacttcaaact 11758035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 210 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 17140659 - 17140631
Alignment:
Q  210 cgttataaccctgaaagacctcaaagtgt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17140659 cgttataaccctgaaagacctcaaagtgt 17140631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 156; Significance: 8e-83; HSPs: 10)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 2838199 - 2837866
Alignment:
Q  1 tgaaaacgggacaaaacattgaaaatctgagtaacttcaaacttgattgtctcaattgttacaagtaatatctagtacccttacaagaattgttgttcca 100  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||| | ||| | ||| ||||||||  ||||||||||    
T  2838199 tgaaaaagggacaaaacattaaaaatttgagtaactttaaacttgattgtcccaacagttacaagtattctctggcacctttacaagaggtgttgttcca 2838100  T
Q  101 aaggtgaatgttggattcaa-tttatgttttaactttcgtaggagtgcctaact-aaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatcccacggcctt 198  Q
    |||||||||| |||||| || ||| || |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||    
T  2838099 aaggtgaatgatggattgaattttgtgctttaacttccgtaggagtgcataactcaaaattttgtgtagcctacttaacaaaatattatccca---cctt 2838003  T
Q  199 catctaagctccgttataaccctgaaagacctcaaagtg--tattgacattgattttgattgacatttagaaacttttcaagtgtatggtaaaatgtgga 296  Q
    || |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| |||||||||| |||| ||    
T  2838002 cacctaagccccgttataacccttaaagatctcaaagtggacattgacattgattttgattgacgtttataaatttttcaaatgtatggtaatatgtaga 2837903  T
Q  297 -ttgcatgtcgactgtgtgtgaaccctattcatattt 332  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2837902 cttgcatgtcgactgtgtgtgaaccctattcatattt 2837866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 14 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 34134375 - 34134060
Alignment:
Q  14 aaacattgaaaatctgagtaacttcaaacttgattgtctcaattgttacaagtaatatctagtacccttacaagaattgttgttccaaagg-----tgaa 108  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||  |||||||| || |||| |||||||||||| || |||||||||||||||| |     ||||    
T  34134375 aaacattgaaaaaccgagtaacttcaagcttgattgtcctaattgttataaataatctctagtacccttgcatgaattgttgttccaaaaggtgaatgaa 34134276  T
Q  109 tgttggattcaatttatgt--tttaactttcgtaggagtgcctaactaaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatcccacggccttcatctaag 206  Q
    || |||||| || || ||   || ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||    
T  34134275 tgatggattgaaattttgcgcttaaactttcgtaggaatgcctaactcaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatccca---ccttcacctaag 34134179  T
Q  207 ctccgttataaccctgaaagacctcaaagtgt--attgac-attgattttgattgacatttagaaacttttcaagtgtatggtaaaatgtggattgcatg 303  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  34134178 ccccgttataacccttaaagacctcaaagtgtgcattgacaaatgattttgattgacgtttagaaacctttcaagcttatggtaatatgtagattgcatg 34134079  T
Q  304 tcgactgtgtgtgaaccct 322  Q
    |||||||||||||||||||    
T  34134078 tcgactgtgtgtgaaccct 34134060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 53 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 22938513 - 22938232
Alignment:
Q  53 caattgttacaagtaatatctagtacccttacaagaattgttgttccaaagg-----tgaatgttggattcaatttatgtt-ttaactttcgtaggagtg 146  Q
    ||||||||| || |||  |||||||||||| || |||||||||||||||| |     |||||| |||||| ||||| |||  ||||||| ||||||  ||    
T  22938513 caattgttataaataaactctagtacccttgcatgaattgttgttccaaaaggtgaatgaatgatggattgaattt-tgtgcttaacttccgtagggatg 22938415  T
Q  147 cctaactaaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatcccacggccttcatctaagctccgttataaccctgaaagacctcaaagtgt--attgac 244  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||| ||| |||||| ||  |||||||||||||||  ||||||    
T  22938414 cctaactcaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatcccac---cttcacctaagccccgctataactctttaagacctcaaagtgtgcattgac 22938318  T
Q  245 attgattttgattgacatttagaaacttttcaagtgtatggtaaaatgtggattgcatgtcgactgtgtgtgaaccctattcatatt 331  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  22938317 attgattttgattgacgtttagaaacttttcaagcgtatggtaatatgtagattgcatgtcgactatgtgtgaaccct-ttcatatt 22938232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 22 - 331
Target Start/End: Original strand, 19688270 - 19688578
Alignment:
Q  22 aaaatctgagtaacttcaaacttgattgtctcaattgttacaagtaatatctagtacccttacaagaattgttgttccaaag-gtgaatgttggattcaa 120  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||  ||  ||||||| |||  ||||||||  ||||||  ||||||||| ||| | |||||||| ||||| ||    
T  19688270 aaaatctgagtaactttaaactcgattgtcctaaaagttacaaataagctctagtacttttacaa--attgttgtttcaaggtgtgaatgtgggattgaa 19688367  T
Q  121 tttatgttttaactttcgtaggagtgcctaactaaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatcccacggccttcatctaagctccgttataaccc 220  Q
    | | || ||||| ||   ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||| | |||||| ||||||||||||    
T  19688368 tctttgctttaatttctataggagtgcctaactcaaattttgtgtagcttacttatccaaatattatccca---cctttacctaagccccgttataaccc 19688464  T
Q  221 tgaaagacctcaaa--gtgtattgacattgattttgattgacatttagaaacttttcaagtgtatggtaaaatgtgga-ttgcatgtcgactgtgtgtga 317  Q
    | ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| |||| || ||||| ||||| || ||||||    
T  19688465 ttaaagacctcaaagtgtgtaatgacattgattttgattgacgtttagaaatttttcaagcgtatggtaatatgtagacttgcacgtcgattgagtgtga 19688564  T
Q  318 accctattcatatt 331  Q
    |||||  |||||||    
T  19688565 acccttgtcatatt 19688578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 103 - 322
Target Start/End: Original strand, 2455586 - 2455805
Alignment:
Q  103 ggtgaatgttggattcaatttatgttttaactttcgtaggagtgcctaactaaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatcccacggccttcatc 202  Q
    ||||||||  ||||| |||  ||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||   ||| | |    
T  2455586 ggtgaatgagggattgaatccatgctttaattttcgtatgagtgcctaactcaaattttgtgtagcctatttatccaaataatatcacac---ctttacc 2455682  T
Q  203 taagctccgttataaccctgaaagacctcaaagtgtat--tgacattgattttgattgacatttagaaacttttcaagtgtatggtaaaatgtgga-ttg 299  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||   |    
T  2455683 taagctccgttataacccttaaagacctcaaagtgtgtaatgacattgattttgattgacgtttagaaacttttcaagcgtatggtaatatgtagaccag 2455782  T
Q  300 catgtcgactgtgtgtgaaccct 322  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  2455783 catgtcgactgtgtgtgaaccct 2455805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 22 - 327
Target Start/End: Original strand, 26550320 - 26550627
Alignment:
Q  22 aaaatctgagtaacttcaaacttgattgtctcaatt-gttacaagtaatatctagtacccttacaagaattgttgttccaaagg-tgaatgttggattca 119  Q
    ||||| |||||||||| ||||| |||||||  ||   ||||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||| || ||| || ||||||  ||||| |    
T  26550320 aaaatttgagtaactttaaactcgattgtcctaacaagttacaaataatctctagtacctttacaa--attgttatttcaaggggtgaatgagggattga 26550417  T
Q  120 atttatgttttaactttcgtaggagt-gcctaact-aaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatcccacggccttcatctaagctccgttataa 217  Q
    ||  ||  |||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||| |||||||||    
T  26550418 atccattctttaacttccgtaggaattgcctaactcaaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatccca---ccttcacctaagccccgttataa 26550514  T
Q  218 ccctgaaagacctcaaagtgt--attgacattgattttgattgacatttagaaacttttcaagtgtatggtaaaatgtgga-ttgcatgtcgactgtgtg 314  Q
    |||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||||| || |    
T  26550515 cccttaaagacctcaaagtgtgcattgatattgatttttattgacgtttagaaatttttcaagcgtatggtaatatgtagatttgcatgtcgactatgag 26550614  T
Q  315 tgaaccctattca 327  Q
    |||||||||||||    
T  26550615 tgaaccctattca 26550627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 22 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 28563810 - 28563505
Alignment:
Q  22 aaaatctgagtaacttcaaacttgattgtctcaatt-gttacaagtaatatctagtacccttacaagaattgttgttccaaagg-tgaatgttggattca 119  Q
    ||||| |||||||||| ||||| ||||||| |||   ||||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||| || ||| || ||||||   |||| |    
T  28563810 aaaatttgagtaactttaaactcgattgtcccaacaagttacaaataatctctagtacctttacaa--attgttatttcaaggggtgaatgagtgattga 28563713  T
Q  120 atttatgttttaactttcgtaggagt-gcctaact-aaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatcccacggccttcatctaagctccgttataa 217  Q
    ||  ||  |||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||| |||||||||    
T  28563712 atccattctttaacttccgtaggaattgcctaactcaaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatccca---ccttcacctaagccccgttataa 28563616  T
Q  218 ccctgaaagacctcaaagtgt--attgacattgattttgattgacatttagaaacttttcaagtgtatggtaaaatgtgga-ttgcatgtcgactgtgtg 314  Q
    |||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||||| || |    
T  28563615 cccttaaagacctcaaagtgtgcattgatattgatttttattgacgtttagaaatttttcaagcgtatggtaatatgtagatttgcatgtcgactatgag 28563516  T
Q  315 tgaaccctatt 325  Q
    |||||||||||    
T  28563515 tgaaccctatt 28563505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 128 - 285
Target Start/End: Original strand, 30763599 - 30763756
Alignment:
Q  128 tttaactttcgtaggagtgcctaactaaaattttgtgtagcctacttatccaaatatta-tcccacggccttcatctaagctccgttataaccctgaaag 226  Q
    ||||| || ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   ||| | |||| | ||||||||||||||||||    
T  30763599 tttaatttccgtaggaatgcctaactcaaattttgtgtagcctacttatccaaatattaatctcac---ctttacctaaaccccgttataaccctgaaag 30763695  T
Q  227 acctcaaagtgtat--tgacattgattttgattgacatttagaaacttttcaagtgtatgg 285  Q
    |||||||||||| |  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  30763696 acctcaaagtgtgtaatgatattgattttgattgacgtttagaaacttttcaagcgtatgg 30763756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 21333873 - 21333763
Alignment:
Q  1 tgaaaacgggacaaaacattgaaaatctgagtaacttcaaacttgattgtctcaattgttacaagtaatatctagtacccttacaagaattgttgttcc- 99  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||  |||||||| || |||| | |||||||||| ||||||||||||||||     
T  21333873 tgaaaaagggacaagacattgaaaaaccgagtaactttaaactcgattgtcctaattgttataaataatctatagtacccttgcaagaattgttgttcca 21333774  T
Q  100 aaaggtgaatg 110  Q
    |||||||||||    
T  21333773 aaaggtgaatg 21333763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 35382131 - 35382068
Alignment:
Q  22 aaaatctgagtaacttcaaacttgattgtctcaattgttacaagtaatatctagtacccttaca 85  Q
    ||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  35382131 aaaatttgagtaatttcaaactcgattgtcccaattgttacaaataatctctagtacctttaca 35382068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 151; Significance: 7e-80; HSPs: 5)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 9 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 22454815 - 22454531
Alignment:
Q  9 ggacaaaacattgaaaatctgagtaacttcaaacttgattgtctcaattgttacaagtaatatctagtacccttacaagaattgttgttccaaaggtgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22454815 ggacaaaacattgaaaatccgagtaacttcaaattcgattgtcccaattgtttcaaataatctctagtacccttacaagaattgttgttccaaaggtgaa 22454716  T
Q  109 tgttggattcaatttatgttttaactttcgtaggagtgcctaact-aaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatcccacggccttcatctaagc 207  Q
    || |||| | ||||| || ||||||||   ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||   |||||| ||||||    
T  22454715 tgatggaatgaatttgtgctttaacttcgataggaatgcctaactcaaaattttgtgtagcctatttatccaagtattatccca---ccttcacctaagc 22454619  T
Q  208 tccgttataaccctgaaagacctcaaagtgt--attgacattgattttgattgacatttagaaacttttcaagtgtatggtaaaatgt 293  Q
     |||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  22454618 cccgttataaccctttaagacctcaaagtgtgcattgacattgattttgattgatgtttagaaacttttcaagcgtatggtaatatgt 22454531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Original strand, 45940111 - 45940436
Alignment:
Q  1 tgaaaacgggacaaaacattgaaaatctgagtaacttcaaacttgattgtctcaattgttacaagtaatatctagtacccttacaagaattgttgttcca 100  Q
    |||||| ||||||  |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |  |||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45940111 tgaaaaagggacaggacattgaaaaaccgagtaacttcaaactcgattgtcccggttgttataaataatctctagtacccttgcaagaattgttgttcca 45940210  T
Q  101 aagg-----tgaatgttggattcaatttatgtt-ttaactttcgtaggagtgcctaactaaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatcccacgg 194  Q
    || |     |||||| |||||| | ||| |||  ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||       
T  45940211 aaaggtgaatgaatgatggattgagttt-tgtgcttaactttcgtaggaatgcctaactcaaattttgtgtagcctacttattcaaatattatccca--- 45940306  T
Q  195 ccttcatctaagctccgttataaccctgaaagacctcaaagtgt--attgacattgattttgattgacatttagaaacttttcaagtgtatggtaaaatg 292  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||| |||    
T  45940307 ccttcacctaagccccgttataacccttaaagacctcaaagtgtgcattgacattgattttgattgacgtttaaaaacttttcaagcttatggtaatatg 45940406  T
Q  293 tggattgcatgtcgactgtgtgtgaaccct 322  Q
    | |||| ||||||||||||||| |||||||    
T  45940407 tagattacatgtcgactgtgtgcgaaccct 45940436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 8 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 21019869 - 21019543
Alignment:
Q  8 gggacaaaacattgaaaatctgagtaacttcaaacttgattgtctcaattgttacaagtaatatctagtacccttacaagaattgttgttccaaagg--- 104  Q
    ||||||| |||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| || |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |       
T  21019869 gggacaagacattgaaaaaccgagtaacttaaaactcgattgtcccaattgttataaataatctctagtacccttgcaataattgttgttccaaaaggtg 21019770  T
Q  105 --tgaatgttggattcaatttatgtt-ttaactttcgtaggagtgcctaactaaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatcccacggccttcat 201  Q
      |||||| |||||| | ||| |||  ||||||| |||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||     
T  21019769 aatgaatgatggattgagttt-tgtgcttaacttccgtaagaatgcctaactcaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatcccac---cttcac 21019674  T
Q  202 ctaagctccgttataaccctgaaagacctcaaagtgta--ttgacattgattttgattgacatttagaaacttttcaagtgtatggtaaaatgtggattg 299  Q
    |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||    
T  21019673 ctaagccccgttataaccattaaagacctcaaagtgtacattgacattgattttgattgacgtttagaaacttttcaagcatatggtaatatgtagattg 21019574  T
Q  300 catgtcgactgtgtgtgaaccctattcatatt 331  Q
    |||||||| |||| || |||||| ||||||||    
T  21019573 catgtcgattgtgcgtaaaccct-ttcatatt 21019543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 22 - 328
Target Start/End: Original strand, 49718338 - 49718646
Alignment:
Q  22 aaaatctgagtaacttcaaacttgattgtctcaatt-gttacaagtaatatctagtacccttacaagaattgttgttccaaagg-tgaatgttggattca 119  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||   ||||||| || | ||||||||| ||||||  ||||||||| ||| || ||||||  ||||| |    
T  49718338 aaaatcttagtaactttaaactcgattgtcccaacaagttacaaatattctctagtacctttacaa--attgttgtttcaaggggtgaatgagggattga 49718435  T
Q  120 attta-tgttttaactttcgtaggagtgcctaact-aaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatcccacggccttcatctaagctccgttataa 217  Q
    ||||  || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||| |||||||||    
T  49718436 attttgtgctttaacttccgtaggagtgcctaactcaaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatcccac---cttcacctaagccccgttataa 49718532  T
Q  218 ccctgaaagacctcaaagtgt--attgacattgattttgattgacatttagaaacttttcaagtgtatggtaaaatgtgga-ttgcatgtcgactgtgtg 314  Q
    ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| ||||||    
T  49718533 ccctttaagacctcaaagtgtgcattgacattgattttgattgacgtttagaaatttttcaagcgtatggtaatatgtagatttgcatgtcgattgtgtg 49718632  T
Q  315 tgaaccctattcat 328  Q
    ||||||||||||||    
T  49718633 tgaaccctattcat 49718646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 13640519 - 13640218
Alignment:
Q  1 tgaaaacgggacaaaacattgaaaatctgagtaacttcaaacttgattgtctcaattgttacaagtaatatctagtacccttacaagaattgttgttcca 100  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13640519 tgaaaaagggacaagacattgaaaaaccgagtaacttcaaactcgattgtcccaattattataaataatctctagtacccttgcaagaattgttgttcca 13640420  T
Q  101 aagg----tgaatgttggattcaatttatgttttaactttcgtaggagtgcctaactaaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatcccacggcc 196  Q
    || |    |||||| |  ||| |||||     ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||    
T  13640419 aaaggtgatgaatgatatattgaattttgcgcttaacttccgtaggaatgcctaactcaaattttatgtagcctacttatccaaatattatccca---cc 13640323  T
Q  197 ttcatctaagctccgttataaccctgaaagacctcaaagtgt--attgacattgattttgattgacatttagaaacttttcaagtgtatggtaaaatgtg 294  Q
    ||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||| ||||     
T  13640322 ttcacataagctctgttataaccctaaaagacctcaaagtgtgcattgacattgattttgattgacgtttagaaactttttaagcttatggtaatatgta 13640223  T
Q  295 gattg 299  Q
    |||||    
T  13640222 gattg 13640218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0048 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 3)
Name: scaffold0048
Description:

Target: scaffold0048; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 14 - 322
Target Start/End: Original strand, 27771 - 28086
Alignment:
Q  14 aaacattgaaaatctgagtaacttcaaacttgattgtctcaattgttacaagtaatatctagtacccttacaagaattgttgttccaaagg-----tgaa 108  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||  |||||||| || |||| |||||||||||| || |||||||||||||||| |     ||||    
T  27771 aaacattgaaaaaccgagtaacttcaagcttgattgtcctaattgttataaataatctctagtacccttgcatgaattgttgttccaaaaggtgaatgaa 27870  T
Q  109 tgttggattcaatttatgt--tttaactttcgtaggagtgcctaactaaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatcccacggccttcatctaag 206  Q
    || |||||| || || ||   || ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||    
T  27871 tgatggattgaaattttgcgcttaaactttcgtaggaatgcctaactcaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatccca---ccttcacctaag 27967  T
Q  207 ctccgttataaccctgaaagacctcaaagtgt--attgac-attgattttgattgacatttagaaacttttcaagtgtatggtaaaatgtggattgcatg 303  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  27968 ccccgttataacccttaaagacctcaaagtgtgcattgacaaatgattttgattgacgtttagaaacctttcaagcttatggtaatatgtagattgcatg 28067  T
Q  304 tcgactgtgtgtgaaccct 322  Q
    |||||||||||||||||||    
T  28068 tcgactgtgtgtgaaccct 28086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0048; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Original strand, 23561 - 23741
Alignment:
Q  1 tgaaaacgggacaaaacattgaaaatctgagtaacttcaaacttgattgtctcaattgttacaagtaatatctagtacccttacaagaattgttgttcca 100  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||| | ||||||||||| |||  |||||| ||||||||| |   ||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  23561 tgaaaaagggacaagacattaaaaacccgagtaacttcatactctattgtcccaattgttagata-aatctctagtatccttgcaagaattgtttttcca 23659  T
Q  101 aaggtgaatgttggattcaatttatgttttaactttcgtaggagtgcctaactaaaattttgtgtagcctacttatccaaata 183  Q
    |||||||||| |||||| |  || || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23660 aaggtgaatgatggattgatattctgctttaactttcgtaggagtgtctaactcaaatttt-tgtagcctacttatccaaata 23741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0048; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 214 - 322
Target Start/End: Original strand, 23739 - 23850
Alignment:
Q  214 ataaccctgaaagacctcaaagtgt--attgaca-ttgattttgattgacatttagaaacttttcaagtgtatggtaaaatgtggattgcatgtcgactg 310  Q
    ||||||||  |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  23739 ataacccttcaagacctcaaagtgtgcattgacaattgattttgattgacgtttagaaacttttcaagcttatggtaatatgtagattgcatgtcgactg 23838  T
Q  311 tgtgtgaaccct 322  Q
    ||||||||||||    
T  23839 tgtgtgaaccct 23850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 1574 - 1241
Alignment:
Q  1 tgaaaacgggacaaaacattgaaaatctgagtaacttcaaacttgattgtctcaattgttacaagtaatatctagtacccttacaagaattgttgttcca 100  Q
    |||||| || |||| |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  1574 tgaaaaaggaacaagacattgaaaaaccgagtaacttcaaactcgattgtcccaattgttataaataatctctagtacccttgcaaggattgttgttcca 1475  T
Q  101 aagg-----tgaatgttggattcaatttatgtt-ttaactttcgtaggagtgcctaactaaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatcccacgg 194  Q
    || |     |||||| || ||| ||||| |||  ||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  1474 aaaggtgaatgaatgatgaattgaattt-tgtgcttaacttccgtaggaatgcctaactcgaattttgtgtagcctacttatccaaatattatcccac-- 1378  T
Q  195 ccttcatctaagctccgttataaccctgaaagacctcaaagtgt--attgacattgattttgattgacatttagaaacttttcaagtgtatggtaaaatg 292  Q
     ||||| |||||| || |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||| |||    
T  1377 -cttcacctaagcccctttataaccttttaagacctcaatgtgtgcattgacattgattttgattgatgtttagaaacttttcaagcttatggtaatatg 1279  T
Q  293 tggattgcatgtcgactgtgtgtgaaccctattcatatt 331  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  1278 tagattgcatgtcgactgtgtgtgaaacct-ttcatatt 1241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0321 (Bit Score: 128; Significance: 4e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0321
Description:

Target: scaffold0321; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 4359 - 4035
Alignment:
Q  1 tgaaaacgggacaaaacattgaaaatctgagtaacttcaaacttgattgtctcaattgttacaagtaatatctagtacccttacaagaattgttgttcca 100  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||   ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| || |||| |||||||||  | | |||||| ||||||||    
T  4359 tgaaaaagggacaagacattaaaaaatcgagtaacttcaaactcgattgtcccaactgttataaataatctctagtacctctgcgagaatttttgttcca 4260  T
Q  101 aa-ggtgaatgt-----tggattcaattt-atgttttaactttcgtaggagtgcctaactaaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatcccacg 193  Q
    || ||||||||      |||||| ||||| ||| || ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  4259 aaaggtgaatgaatgaatggattgaattttatgctt-aacttccgtaggaatgcctaactcaaattttgtgtagcctacttatccaaataatatcccac- 4162  T
Q  194 gccttcatctaagctccgttataaccctgaaagacctcaaagtgt--attgacattgattttgattgacatttagaaacttttcaagtgtatggtaaaat 291  Q
      ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||    
T  4161 --cttcacctaagccccgttataacccttaaagacctcaaagtgtgcattgacattgattttgattgacgtttagaaacttttcaagcttatggtaatat 4064  T
Q  292 gtggattgcatgtcgactgtgtgtgaacc 320  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  4063 gtagattgcatgtcgactgtgtttgaacc 4035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0214 (Bit Score: 126; Significance: 6e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0214
Description:

Target: scaffold0214; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Original strand, 12176 - 12507
Alignment:
Q  1 tgaaaacgggacaaaacattgaaaatctgagtaacttcaaacttgattgtctcaa-ttgttacaagtaatatctagtacccttacaagaattgttgttcc 99  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||| ||| ||||||  | | || ||||||||| || |||||||||| |||||    
T  12176 tgaaaaagggacataacattgaaaatctgagtatcta-aaactcgattgtcccaaattgttaagaatgatctctagtacctttgcaagaattgt-gttcc 12273  T
Q  100 aaa-ggtgaatgt----tggattcaatttatgttttaactttcgtaggagtgcctaactaaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatcccacgg 194  Q
    ||| ||||||||     ||| ||||| || |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||         
T  12274 aaaaggtgaatgaataatgggttcaaattgtgttttaacttctgtaggagtgcctaactcaaattttgtgtagcctacttattcaaatattctcca---- 12369  T
Q  195 ccttcatctaagctccgttataaccctgaaagacctcaaagtgt--attgacattgattttgattgacatttagaaacttttcaagtgtatggtaaaatg 292  Q
    |||| | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  12370 ccttaacctaagccccgttataaccttgaaagacctcaaagtgtgcattgacattgattttgattgacgtttagaaacttttcaagcgtatggtaatatg 12469  T
Q  293 tggattgcatgtcgactgtgtgtgaaccctattcatatt 331  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12470 tagattgtatgtcgactgtgtgtgaaccct-ttcatatt 12507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0214; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Original strand, 26192 - 26523
Alignment:
Q  1 tgaaaacgggacaaaacattgaaaatctgagtaacttcaaacttgattgtctcaa-ttgttacaagtaatatctagtacccttacaagaattgttgttcc 99  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||  ||||| ||||||| ||| ||||||  | | || ||||||||| || |||||||||| |||||    
T  26192 tgaaaaagggacataacattgaaaatccgagtatcta-aaactcgattgtcccaaattgttaagaatgatctctagtacctttgcaagaattgt-gttcc 26289  T
Q  100 aaa-ggtgaatgt----tggattcaatttatgttttaactttcgtaggagtgcctaactaaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatcccacgg 194  Q
    ||| ||||||||     ||| ||||| || |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||         
T  26290 aaaaggtgaatgaataatgggttcaaattgtgttttaacttctgtaggagtgcctaactcaaattttgtgtagcctacttattcaaatattctcca---- 26385  T
Q  195 ccttcatctaagctccgttataaccctgaaagacctcaaagtgt--attgacattgattttgattgacatttagaaacttttcaagtgtatggtaaaatg 292  Q
    |||| | |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  26386 ccttaacctaagccccgttataaccataaaagacctcaaagtgtgcattgacattgattttgattgacgtttagaaacttttcaagcgtatggtaatatg 26485  T
Q  293 tggattgcatgtcgactgtgtgtgaaccctattcatatt 331  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26486 tagattgtatgtcgactgtgtgtgaaccct-ttcatatt 26523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Original strand, 28076 - 28392
Alignment:
Q  1 tgaaaacgggacaaaacattgaaaatctgagtaacttcaaacttgattgtctcaattgttacaagtaatatctagtacccttacaagaattgttgttcca 100  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||| | ||||||||||| |||  ||| || ||||||||| |   ||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  28076 tgaaaaagggacaagacattaaaaacccgagtaacttcatactctattatcccaattgttagataaaatctctagtatccttgcaagaattgtttttcca 28175  T
Q  101 aaggtgaatgttggattcaatttatgttttaactttcgtaggagtgcctaactaaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatcccacggccttca 200  Q
    |||||||||| |||||| |  || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||   |||| ||   ||||||    
T  28176 aaggtgaatgatggattgagattgtgctttaactttcgtaggagtgcctaactcaaattttttgtagcctacttatccaaa---tatctca---ccttca 28269  T
Q  201 tctaagctccgttataaccctgaaagacctcaaagtgt--attgac-attgattttgattgacatttagaaacttttcaagtgtatggtaaaatgtggat 297  Q
     || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| || | |||    
T  28270 ccttagccccgttataacccttaaagacctcaaagtgtgcattgacaattgattttgattgacgtttagaaacttttcaagcttatggtaatatctagat 28369  T
Q  298 tgcatgtcgactgtgtgtgaacc 320  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  28370 tgcatgtcgattgtgtgtgaacc 28392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 121; Significance: 6e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 1084 - 754
Alignment:
Q  1 tgaaaacgggacaaaacattgaaaatctgagtaacttcaaacttgattgtctcaattgttacaagtaa-tatctagtacccttacaagaattgttgttcc 99  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||  || | |||||||||||| |||||||||||| |||    
T  1084 tgaaaaagggacaagacattgaaaagccgagtaacttcaaactcgattgtcccaattcttataaaaaaatctctagtacccttgcaagaattgttggtcc 985  T
Q  100 aaagg-----tgaatgttggattcaatttatgtt-ttaactttcgtaggagtgcctaactaaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatcccacg 193  Q
    ||| |     |||||| |||||| |||| ||||  || |||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||     
T  984 aaaaggtgaatgaatgatggattgaatt-atgtgctttactaccgtaggaatgcctaactcaaattttgtgtagcctacttatccaaatattattgcac- 887  T
Q  194 gccttcatctaagctccgttataaccctgaaagacctcaaagtgt--attgacattgattttgattgacatttagaaacttttcaagtgtatggtaaaat 291  Q
      ||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  886 --cttcacctaagccccgttataaccctttaagacctcaaagtgtgcattgacattgattttgattgatgtttagaaacttttcaagcgtatggtaatat 789  T
Q  292 gtggattgcatgtcgactgtgtgtgaaccctattcat 328  Q
    ||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  788 gtaaattgcatgtcgactg--tgtgaaccctattcat 754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 103 - 322
Target Start/End: Original strand, 9307 - 9526
Alignment:
Q  103 ggtgaatgttggattcaatttatgttttaactttcgtaggagtgcctaactaaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatcccacggccttcatc 202  Q
    ||||||||  ||||| |||  ||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| | |    
T  9307 ggtgaatgagggattgaatccatgctttaattttcgtaggcgtgcctaactcaaattttgtgtagcctacttatccaaataatatccca---cctttacc 9403  T
Q  203 taagctccgttataaccctgaaagacctcaaa--gtgtattgacattgattttgattgacatttagaaacttttcaagtgtatggtaaaatgtgga-ttg 299  Q
    ||||| || |||||||||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| |||| ||   |    
T  9404 taagccccattataacccttaaagacctcaaagtgtgtaatgacattgattttgattgacgtttagaaacttttcaagcgcatggtaatatgtagaccag 9503  T
Q  300 catgtcgactgtgtgtgaaccct 322  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  9504 catgtcgactgtgtgtgaaccct 9526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 94; Significance: 8e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 96422 - 96113
Alignment:
Q  1 tgaaaacgggacaaaacattgaaaatctgagtaacttcaaacttgattgtctcaattgttacaagtaatatctagtacccttacaagaattgttgttcca 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||| ||||||||  ||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  96422 tgaaaaagggacaaaacattgaaaatccgagtaatttaaaactcgattgtcccaattgttg-aataaatctctagtacccttgcaagaattgttgttcca 96324  T
Q  101 aa-ggtgaatgttggat----tcaatttatgt-tttaactttcgtaggagtgcctaactaaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatcccacgg 194  Q
    || ||||||||  ||||    | || || ||| |||||||| ||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  96323 aaaggtgaatgaaggatgaattgaaattttgtgtttaacttccgtaggaatgcctaactcaattgttgtgtagcctacttatccaaatattatccca--- 96227  T
Q  195 ccttcatctaagctccgttataaccctgaaagacctcaaagtgtattgacattgattttgattgacatttagaaacttttcaagtgtatggtaaaatgtg 294  Q
    |||||| |||||  |||||||||||||  |||||||||| |||              |  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||     
T  96226 ccttcacctaagtcccgttataaccctttaagacctcaatgtg--------------tgcattgacgtttagaaacttttcaagcgtatggtaatatgta 96141  T
Q  295 gattgcatgtcgactgtgtgtgaaccct 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  96140 gattgcatgtcgactgtgtgtgaaccct 96113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 22 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 99670 - 99364
Alignment:
Q  22 aaaatctgagtaacttcaaacttgattgtctcaattgttacaagtaatatctagtacccttacaagaattgttgttccaaa-ggtgaatgttggattcaa 120  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||  ||||||| |  | |||||||||  ||| |   |||||||| |||| ||||||||  ||||| ||    
T  99670 aaaatctgagtaaattcaaactcgattgtcccaacagttacaaatgttctctagtacctgtacca---ttgttgtttcaaaaggtgaatgagggattaaa 99574  T
Q  121 tttatgttttaactttcgtaggagtgcctaactaaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatcccacggccttcatctaagctccgttataaccc 220  Q
    |  ||||||||| ||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| | |||||| | ||||||||||    
T  99573 tccatgttttaatttctgtaggagtgtctaactcaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatcccac---ctttacctaagc-ctgttataaccc 99478  T
Q  221 tgaaagacctcaaagtgtat--tgacattgattttgattgacatttagaaacttttcaagtgtatggtaaaatgtgga-ttgcatgtcgactgtgtgtga 317  Q
    | |||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||||| || || || ||||||    
T  99477 ttaaagacctcaaagtgtgtaatgacattaattttgattaacgtttacaaacttttcaagtgtatggtaatatgtagatttgcacgttgattgagtgtga 99378  T
Q  318 accctattcatatt 331  Q
    |||||  |||||||    
T  99377 acccttatcatatt 99364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 128 - 322
Target Start/End: Original strand, 226087 - 226281
Alignment:
Q  128 tttaactttcgtaggagtgcctaactaaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatcccacggccttcatctaagctccgttataaccctgaaaga 227  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||   ||| | |||| | ||||||||||||| |||||    
T  226087 tttaattttcctaggagtgcctaactcaaattttgtgtagtctacttatccaaataatatcatac---ctttacctaaaccccgttataacccttaaaga 226183  T
Q  228 cctcaaa--gtgtattgacattgattttgattgacatttagaaacttttcaagtgtatggtaaaatgtgga-ttgcatgtcgactgtgtgtgaaccct 322  Q
    |||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||| |||| ||    |||||||||||||||||||||||    
T  226184 cctcaaaatgtgtaatgacattgattttgattgacgtttagaaacttttcaagcatattgtaatatgtagaccaacatgtcgactgtgtgtgaaccct 226281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 138 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 49689 - 49513
Alignment:
Q  138 gtaggagtgcctaactaaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatcccacggccttcatctaagctccgttataaccctgaaagacct---caaa 234  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||| | |||| ||||||||||||||| ||||||||    ||     
T  49689 gtaggaatgcctaactcaaattttgtgtagcttacttatccaaatattatccca---cctttacctaaactccgttataaccct-aaagacctttaaaat 49594  T
Q  235 gtgtattgacattgattttgattgacatttagaaacttttcaagtgtatggtaaaatgtgga-ttgcatgtcgactgtgtg 314  Q
    ||||  ||||||  | |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||    
T  49593 gtgtgatgacatgtactttgattgacgtctagaaacttttcaagcgtatggtaatatgtagacttgcacgtcgactgtgtg 49513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1785 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1785
Description:

Target: scaffold1785; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 249
Target Start/End: Original strand, 468 - 587
Alignment:
Q  128 tttaactttcgtaggagtgcctaactaaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatcccacggccttcatctaagctccgttataaccctgaaaga 227  Q
    |||||||| ||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||| || | | ||||||||| |||  ||||    
T  468 tttaacttccgtagaaatgcctaactcaaatgttgtgtagcctacttatccaaatattattcca---ccttcacctgatccccgttataa-cctttaaga 563  T
Q  228 cctcaaagtgt--attgacattga 249  Q
    |||||||||||  |||||||||||    
T  564 cctcaaagtgtgcattgacattga 587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 249
Target Start/End: Original strand, 63078 - 63197
Alignment:
Q  128 tttaactttcgtaggagtgcctaactaaaattttgtgtagcctacttatccaaatattatcccacggccttcatctaagctccgttataaccctgaaaga 227  Q
    |||||||| ||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||| || | | ||||||||| |||  ||||    
T  63078 tttaacttccgtagaaatgcctaactcaaatgttgtgtagcctacttatccaaatattattcca---ccttcacctgatccccgttataa-cctttaaga 63173  T
Q  228 cctcaaagtgt--attgacattga 249  Q
    |||||||||||  |||||||||||    
T  63174 cctcaaagtgtgcattgacattga 63197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University