View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF21610_low_5 (Length: 251)

Name: NF21610_low_5
Description: NF21610
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF21610_low_5
NF21610_low_5
[»] chr5 (30 HSPs)
chr5 (1-251)||(25426630-25426880)
chr5 (1-251)||(12376-12626)
chr5 (1-251)||(19499901-19500151)
chr5 (1-251)||(22366481-22366731)
chr5 (1-248)||(18777995-18778242)
chr5 (1-251)||(21073595-21073845)
chr5 (1-248)||(43443398-43443645)
chr5 (1-251)||(4199985-4200235)
chr5 (5-247)||(27009847-27010089)
chr5 (1-251)||(23506967-23507216)
chr5 (1-251)||(27182559-27182808)
chr5 (51-251)||(29188284-29188483)
chr5 (1-251)||(22053845-22054094)
chr5 (1-251)||(18531079-18531328)
chr5 (10-251)||(34939289-34939528)
chr5 (116-251)||(20623085-20623220)
chr5 (116-251)||(21233540-21233675)
chr5 (117-251)||(25900418-25900552)
chr5 (116-251)||(16536313-16536448)
chr5 (116-251)||(37052860-37052995)
chr5 (167-251)||(7425492-7425576)
chr5 (167-251)||(10777974-10778058)
chr5 (167-251)||(11212069-11212153)
chr5 (167-251)||(23514729-23514813)
chr5 (167-251)||(35791102-35791186)
chr5 (167-248)||(17471595-17471676)
chr5 (167-248)||(32950862-32950943)
chr5 (167-251)||(1219524-1219608)
chr5 (3-43)||(29190482-29190522)
chr5 (163-247)||(26559815-26559900)
[»] chr2 (21 HSPs)
chr2 (1-251)||(19886661-19886911)
chr2 (5-251)||(17396665-17396910)
chr2 (4-251)||(462743-462989)
chr2 (1-248)||(19794719-19794965)
chr2 (4-251)||(8891247-8891493)
chr2 (1-251)||(36982453-36982702)
chr2 (4-248)||(20627328-20627571)
chr2 (1-251)||(7507856-7508105)
chr2 (1-231)||(43642989-43643218)
chr2 (1-232)||(24341420-24341650)
chr2 (1-251)||(25265402-25265651)
chr2 (116-251)||(19689413-19689548)
chr2 (116-251)||(23820187-23820322)
chr2 (116-251)||(14906452-14906587)
chr2 (116-251)||(20015127-20015262)
chr2 (167-251)||(8944014-8944098)
chr2 (167-251)||(12728560-12728644)
chr2 (167-251)||(23778049-23778133)
chr2 (167-251)||(34824643-34824727)
chr2 (167-251)||(12635872-12635956)
chr2 (167-250)||(3798608-3798691)
[»] chr6 (19 HSPs)
chr6 (1-251)||(25175565-25175815)
chr6 (1-251)||(27653983-27654233)
chr6 (1-251)||(16825752-16826004)
chr6 (3-251)||(14626130-14626377)
chr6 (3-251)||(1650105-1650352)
chr6 (10-249)||(23153458-23153696)
chr6 (10-251)||(1657760-1657999)
chr6 (1-251)||(35009451-35009700)
chr6 (10-249)||(15862484-15862720)
chr6 (67-248)||(29665941-29666122)
chr6 (178-250)||(27751603-27751675)
chr6 (167-251)||(1556173-1556257)
chr6 (167-251)||(16232060-16232144)
chr6 (163-247)||(19854317-19854402)
chr6 (167-251)||(18086827-18086911)
chr6 (167-251)||(19610186-19610270)
chr6 (167-250)||(23977937-23978020)
chr6 (200-248)||(22251573-22251621)
chr6 (163-223)||(29605612-29605672)
[»] chr4 (23 HSPs)
chr4 (1-251)||(47357656-47357906)
chr4 (1-247)||(10644221-10644467)
chr4 (7-223)||(13048261-13048477)
chr4 (4-232)||(13246435-13246662)
chr4 (1-251)||(54118256-54118505)
chr4 (1-251)||(15675101-15675350)
chr4 (1-232)||(31115631-31115861)
chr4 (99-251)||(121989-122140)
chr4 (67-251)||(10104262-10104445)
chr4 (1-251)||(26680203-26680451)
chr4 (116-251)||(10488678-10488813)
chr4 (116-251)||(16327938-16328073)
chr4 (4-96)||(111400-111492)
chr4 (67-232)||(40885585-40885749)
chr4 (167-251)||(18169138-18169222)
chr4 (167-251)||(19020654-19020738)
chr4 (200-251)||(33240900-33240951)
chr4 (167-251)||(7132069-7132153)
chr4 (167-250)||(15287250-15287333)
chr4 (167-250)||(15294359-15294442)
chr4 (1-43)||(10104450-10104492)
chr4 (163-247)||(18238157-18238242)
chr4 (167-248)||(22738437-22738518)
[»] chr7 (26 HSPs)
chr7 (1-251)||(10989412-10989661)
chr7 (1-251)||(2437459-2437709)
chr7 (1-251)||(13911024-13911275)
chr7 (5-247)||(13572682-13572924)
chr7 (1-249)||(18253849-18254096)
chr7 (5-251)||(25292350-25292595)
chr7 (1-251)||(47481043-47481292)
chr7 (1-245)||(16478968-16479211)
chr7 (4-251)||(11580751-11580997)
chr7 (4-251)||(13037026-13037272)
chr7 (1-251)||(16211768-16212017)
chr7 (1-232)||(36052669-36052896)
chr7 (4-251)||(3059971-3060217)
chr7 (1-251)||(13321016-13321267)
chr7 (1-251)||(7293019-7293267)
chr7 (116-251)||(11516343-11516478)
chr7 (116-251)||(15441576-15441711)
chr7 (116-251)||(30262141-30262276)
chr7 (167-251)||(15950795-15950879)
chr7 (167-251)||(18980025-18980109)
chr7 (165-251)||(48622670-48622756)
chr7 (142-251)||(295978-296087)
chr7 (167-251)||(15760118-15760202)
chr7 (167-251)||(15927736-15927820)
chr7 (167-250)||(13758538-13758621)
chr7 (163-247)||(28722272-28722357)
[»] chr8 (24 HSPs)
chr8 (1-251)||(30120724-30120974)
chr8 (1-251)||(16674392-16674642)
chr8 (5-247)||(21844576-21844818)
chr8 (5-247)||(21851969-21852211)
chr8 (1-189)||(222753-222941)
chr8 (1-189)||(736376-736564)
chr8 (1-189)||(860271-860459)
chr8 (1-251)||(43373480-43373729)
chr8 (3-251)||(6774258-6774505)
chr8 (3-251)||(24548986-24549233)
chr8 (4-251)||(16193728-16193974)
chr8 (10-251)||(24928803-24929043)
chr8 (1-251)||(16404987-16405233)
chr8 (10-247)||(17345581-17345816)
chr8 (1-251)||(22907226-22907474)
chr8 (127-189)||(691908-691970)
chr8 (116-251)||(5238203-5238338)
chr8 (116-251)||(24661260-24661395)
chr8 (116-251)||(43685662-43685797)
chr8 (167-251)||(22006262-22006346)
chr8 (167-251)||(13720932-13721016)
chr8 (167-251)||(16195399-16195483)
chr8 (167-250)||(16873056-16873139)
chr8 (167-251)||(13662269-13662353)
[»] chr3 (36 HSPs)
chr3 (1-251)||(55316221-55316471)
chr3 (1-251)||(41270077-41270327)
chr3 (1-247)||(16821141-16821387)
chr3 (1-251)||(14842573-14842822)
chr3 (5-251)||(13975734-13975979)
chr3 (5-251)||(45860811-45861056)
chr3 (1-249)||(15936641-15936888)
chr3 (4-251)||(51158030-51158276)
chr3 (1-251)||(15859036-15859285)
chr3 (5-251)||(13954902-13955147)
chr3 (2-249)||(15938483-15938729)
chr3 (1-251)||(12030159-12030408)
chr3 (1-251)||(2049812-2050061)
chr3 (3-251)||(15614838-15615085)
chr3 (10-251)||(13838905-13839145)
chr3 (1-251)||(17912495-17912742)
chr3 (116-251)||(2449250-2449385)
chr3 (1-248)||(16744130-16744375)
chr3 (167-251)||(12902094-12902178)
chr3 (167-251)||(54651625-54651709)
chr3 (167-251)||(5228481-5228565)
chr3 (167-251)||(12264796-12264880)
chr3 (167-251)||(25058907-25058991)
chr3 (167-251)||(49232604-49232688)
chr3 (1-112)||(47984652-47984763)
chr3 (1-112)||(47993939-47994050)
chr3 (1-112)||(48003226-48003337)
chr3 (1-112)||(48012512-48012623)
chr3 (167-248)||(11986181-11986262)
chr3 (163-247)||(41661727-41661812)
chr3 (167-251)||(15468344-15468428)
chr3 (167-251)||(18911161-18911245)
chr3 (167-251)||(22275377-22275461)
chr3 (1-40)||(15468555-15468594)
chr3 (163-247)||(31412333-31412418)
chr3 (200-248)||(18897051-18897099)
[»] chr1 (18 HSPs)
chr1 (1-251)||(5072388-5072638)
chr1 (1-251)||(18601118-18601368)
chr1 (1-251)||(22227811-22228060)
chr1 (1-251)||(22232508-22232757)
chr1 (1-251)||(20931347-20931596)
chr1 (1-251)||(20913039-20913281)
chr1 (3-251)||(2116258-2116506)
chr1 (1-251)||(20893638-20893887)
chr1 (1-251)||(41394224-41394473)
chr1 (4-251)||(20445684-20445930)
chr1 (4-251)||(20531449-20531695)
chr1 (65-251)||(45051489-45051674)
chr1 (4-251)||(37844462-37844709)
chr1 (116-251)||(51452608-51452743)
chr1 (167-251)||(46523557-46523641)
chr1 (167-250)||(17148735-17148818)
chr1 (167-248)||(18059765-18059846)
chr1 (3-43)||(45051446-45051486)
[»] scaffold0023 (4 HSPs)
scaffold0023 (1-251)||(36095-36345)
scaffold0023 (1-251)||(48600-48849)
scaffold0023 (212-251)||(169912-169951)
scaffold0023 (167-251)||(154011-154095)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (1-247)||(42999-43245)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (1-251)||(31675-31926)
scaffold0008 (1-251)||(128181-128429)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (5-247)||(41-283)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (5-247)||(64527-64774)
scaffold0026 (1-249)||(107749-107996)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (1-251)||(21116-21365)
scaffold0139 (1-243)||(14069-14310)
[»] scaffold0772 (1 HSPs)
scaffold0772 (23-251)||(5552-5780)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (1-251)||(3594-3843)
scaffold0266 (1-251)||(1126-1375)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (1-251)||(12117-12364)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (1-248)||(5219-5464)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (1-251)||(6076-6324)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (1-251)||(968-1216)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (1-251)||(48189-48438)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (3-247)||(9353-9596)
scaffold0215 (3-247)||(16251-16494)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (1-251)||(3724-3974)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (1-251)||(8880-9129)
[»] scaffold1711 (1 HSPs)
scaffold1711 (105-251)||(1304-1450)
[»] scaffold0025 (2 HSPs)
scaffold0025 (1-232)||(148723-148953)
scaffold0025 (1-251)||(8851-9100)
[»] scaffold0195 (2 HSPs)
scaffold0195 (1-251)||(19208-19457)
scaffold0195 (1-251)||(21292-21541)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (4-251)||(123176-123422)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (1-248)||(36928-37174)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (4-251)||(5073-5319)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (10-251)||(247454-247694)
scaffold0012 (167-251)||(34162-34246)
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (4-251)||(26427-26673)
scaffold0162 (116-251)||(8192-8327)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (3-251)||(2966-3214)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (10-251)||(171916-172156)
scaffold0001 (10-251)||(177619-177859)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (3-251)||(41733-41980)
[»] scaffold1542 (1 HSPs)
scaffold1542 (12-251)||(546-784)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (1-251)||(34472-34722)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (5-232)||(272031-272257)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (95-251)||(13325-13480)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (1-248)||(41650-41896)
[»] scaffold1560 (1 HSPs)
scaffold1560 (1-105)||(9-113)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (1-105)||(48516-48620)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (4-251)||(13511-13757)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (1-251)||(37078-37326)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (117-251)||(51194-51328)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (117-251)||(89466-89600)
[»] scaffold0361 (2 HSPs)
scaffold0361 (170-251)||(3360-3441)
scaffold0361 (1-55)||(3210-3264)
[»] scaffold0622 (1 HSPs)
scaffold0622 (1-96)||(9384-9479)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (116-251)||(22656-22791)
scaffold0141 (116-251)||(26911-27046)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (116-251)||(1594-1729)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (167-248)||(56114-56195)
[»] scaffold0066 (2 HSPs)
scaffold0066 (167-248)||(45198-45279)
scaffold0066 (167-248)||(54584-54665)
[»] scaffold0467 (1 HSPs)
scaffold0467 (167-251)||(10343-10427)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (167-251)||(39814-39898)
[»] scaffold1666 (1 HSPs)
scaffold1666 (167-250)||(1-84)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (165-247)||(8174-8257)
[»] scaffold0892 (1 HSPs)
scaffold0892 (165-251)||(3579-3665)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (165-251)||(54040-54126)
[»] scaffold0406 (1 HSPs)
scaffold0406 (163-247)||(14198-14283)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (163-247)||(108171-108256)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (167-251)||(1579-1663)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (167-251)||(2560-2644)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 247; Significance: 1e-137; HSPs: 30)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Original strand, 25426630 - 25426880
Alignment:
Q  1 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25426630 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 25426729  T
Q  101 acaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25426730 acaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac 25426829  T
Q  201 atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25426830 atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 25426880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Original strand, 12376 - 12626
Alignment:
Q  1 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12376 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 12475  T
Q  101 acaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12476 acaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcacttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac 12575  T
Q  201 atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12576 atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 12626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Original strand, 19499901 - 19500151
Alignment:
Q  1 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19499901 tcatcaatccatgaatatgcataccaaagcaattattaatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 19500000  T
Q  101 acaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19500001 acaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac 19500100  T
Q  201 atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19500101 atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 19500151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 22366731 - 22366481
Alignment:
Q  1 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22366731 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacaactcaaatta 22366632  T
Q  101 acaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22366631 acaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac 22366532  T
Q  201 atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22366531 atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 22366481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 18778242 - 18777995
Alignment:
Q  1 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18778242 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataatattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 18778143  T
Q  101 acaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18778142 acaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac 18778043  T
Q  201 atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattta 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18778042 atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattta 18777995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 21073845 - 21073595
Alignment:
Q  1 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21073845 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattgataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 21073746  T
Q  101 acaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21073745 acaacaacttagaagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac 21073646  T
Q  201 atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21073645 atccattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 21073595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 43443645 - 43443398
Alignment:
Q  1 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |    
T  43443645 tcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagactcacatctcaaatca 43443546  T
Q  101 acaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43443545 acaacaacttagaagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaac 43443446  T
Q  201 atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattta 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43443445 atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattta 43443398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 4200235 - 4199985
Alignment:
Q  1 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 100  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |    
T  4200235 tcatcaacccatgaatatgcaaacccaagcaatcattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatca 4200136  T
Q  101 acaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac 200  Q
    |||||||| || ||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4200135 acaacaacataagagaaattcaccaatttagcataatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaac 4200036  T
Q  201 atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4200035 atcaattcatgcatacaaacataacatcacaacaagagcacgaatttagca 4199985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 5 - 247
Target Start/End: Original strand, 27009847 - 27010089
Alignment:
Q  5 caatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaa 104  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  27009847 caatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacaa 27009946  T
Q  105 caacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatca 204  Q
    ||||||||||||||||||||  || || ||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| | ||||||  | |||||    
T  27009947 caacttaggagaaattcaccaattgagtacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacactcatacaatcatcatca 27010046  T
Q  205 attcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27010047 attcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 27010089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Original strand, 23506967 - 23507216
Alignment:
Q  1 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  23506967 tcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaatta 23507066  T
Q  101 acaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac 200  Q
    |||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |    
T  23507067 acaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatc 23507165  T
Q  201 atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||    ||||||||||||||||    
T  23507166 atcaattcatgcatacaaacatatcatcacaaatggagcacgaatttagca 23507216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 27182808 - 27182559
Alignment:
Q  1 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||    
T  27182808 tcatcaattcatgaatatgcatactcaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatcta 27182709  T
Q  101 acaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac 200  Q
    |||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| || |    
T  27182708 acaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcatcaacaatcatacaattatc 27182610  T
Q  201 atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||   ||||| ||||||||||    
T  27182609 atcagttcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcatgaatttagca 27182559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 51 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 29188483 - 29188284
Alignment:
Q  51 atcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttat 150  Q
    ||||| |||||  |||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||| ||||||| | |||||||||  || ||||| || |||| |||||||    
T  29188483 atcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaacaataacttagca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttat 29188385  T
Q  151 catttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagc 250  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  29188384 catttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagtaagagcacgaatctagc 29188285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 22054094 - 22053845
Alignment:
Q  1 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 100  Q
    |||||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| | ||||| | |    
T  22054094 tcatcaattcatgaatatgtagacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaattca 22053995  T
Q  101 acaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac 200  Q
    |||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  22053994 acaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactatc 22053896  T
Q  201 atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||    
T  22053895 atcaattcatacatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagca 22053845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 18531328 - 18531079
Alignment:
Q  1 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 100  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| |||||| |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| | ||||| | |    
T  18531328 tcatcaattcatgaatatgtatacccgagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaattca 18531229  T
Q  101 acaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac 200  Q
    |||||||||||| | |||||||||  || | |||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| || |    
T  18531228 acaacaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatc 18531130  T
Q  201 atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||    
T  18531129 atcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagca 18531079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 251
Target Start/End: Original strand, 34939289 - 34939528
Alignment:
Q  10 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 109  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || ||||| |||||   |||||||||  ||||||||||||| ||||||| || ||||  |||    
T  34939289 catgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaactgaacaagaatcataactcaa-ttcacaatgact 34939387  T
Q  110 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 209  Q
    ||| | |||| || |  || |||||||| ||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  34939388 tagca-aaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca 34939486  T
Q  210 tgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  34939487 tgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagca 34939528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 116 - 251
Target Start/End: Original strand, 20623085 - 20623220
Alignment:
Q  116 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 215  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  20623085 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 20623184  T
Q  216 caaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
T  20623185 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 20623220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 116 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 21233675 - 21233540
Alignment:
Q  116 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 215  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  21233675 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 21233576  T
Q  216 caaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
T  21233575 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 21233540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 117 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 25900552 - 25900418
Alignment:
Q  117 aattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatac 216  Q
    |||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   ||||| |||||| ||||||||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  25900552 aattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatataatttaaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatac 25900453  T
Q  217 aaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    ||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
T  25900452 aaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 25900418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 116 - 251
Target Start/End: Original strand, 16536313 - 16536448
Alignment:
Q  116 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 215  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  || ||||||||||||    
T  16536313 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattataaattcatgcata 16536412  T
Q  216 caaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
T  16536413 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 16536448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 116 - 251
Target Start/End: Original strand, 37052860 - 37052995
Alignment:
Q  116 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 215  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| ||||||   |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  37052860 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcatttccacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 37052959  T
Q  216 caaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
T  37052960 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 37052995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 167 - 251
Target Start/End: Original strand, 7425492 - 7425576
Alignment:
Q  167 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| |  | |||| ||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7425492 aacatgtaatttcacccacaaacataccataaccatcgattcatgcacaagaaaataacatcacagcaagagcacgaatttagca 7425576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 167 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 10778058 - 10777974
Alignment:
Q  167 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| |  | |||||||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10778058 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagca 10777974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 167 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 11212153 - 11212069
Alignment:
Q  167 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| |  | |||||||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11212153 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagca 11212069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 167 - 251
Target Start/End: Original strand, 23514729 - 23514813
Alignment:
Q  167 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| |  | |||||||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23514729 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagca 23514813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 167 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 35791186 - 35791102
Alignment:
Q  167 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||||||||||||  ||||  |||| |  | |||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35791186 aacatgtaatttcactcacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacatcacagcaagagcacgaatttagca 35791102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 167 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 17471676 - 17471595
Alignment:
Q  167 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattta 248  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| |  | |||||||||||||| |  || ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17471676 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaattta 17471595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 167 - 248
Target Start/End: Original strand, 32950862 - 32950943
Alignment:
Q  167 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattta 248  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||||| || |||||| |||| || || || ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  32950862 aacatgtaatttcaaccacaatcatacaattatcatcaaatcatacacacgaaaataacatcacagttagagcacgaattta 32950943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 1219608 - 1219524
Alignment:
Q  167 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| |  | |||||||| ||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1219608 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattaatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagca 1219524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 29190522 - 29190482
Alignment:
Q  3 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaa 43  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29190522 atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaa 29190482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 163 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 26559900 - 26559815
Alignment:
Q  163 tatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaatt-catgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 247  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  || ||| || || ||||| |||| || ||||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  26559900 tatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatataatcatagcaagagcacgaattt 26559815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 243; Significance: 1e-135; HSPs: 21)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 19886911 - 19886661
Alignment:
Q  1 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19886911 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 19886812  T
Q  101 acaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19886811 acaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcacttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac 19886712  T
Q  201 atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19886711 atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 19886661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 17396910 - 17396665
Alignment:
Q  5 caatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaa 104  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  |    
T  17396910 caatccatgaatatgcaaacccaagcaattatccattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaatga 17396811  T
Q  105 caacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatca 204  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||||| ||||||  | || ||    
T  17396810 caacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacttatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcaaca 17396711  T
Q  205 attcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
T  17396710 attcatgcatac-aacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 17396665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 4 - 251
Target Start/End: Original strand, 462743 - 462989
Alignment:
Q  4 tcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaaca 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||    
T  462743 tcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacgacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaaca 462842  T
Q  104 acaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatc 203  Q
    ||||||||| | |||||||||  || | |||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||    
T  462843 acaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatc 462941  T
Q  204 aattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||   ||||||||||||||||    
T  462942 aattcatgcatacaaatatatcatcacagttggagcacgaatttagca 462989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 19794965 - 19794719
Alignment:
Q  1 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||| ||||    ||||||||| |||||||||||||| ||||||| | |    
T  19794965 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactataacatcaattaacggaaataacatcaattgaacaagaatcataactcaattca 19794866  T
Q  101 acaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac 200  Q
    |||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||      
T  19794865 acaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatt 19794767  T
Q  201 atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattta 248  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||    
T  19794766 atcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattta 19794719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 4 - 251
Target Start/End: Original strand, 8891247 - 8891493
Alignment:
Q  4 tcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaaca 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||| |  |||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||    
T  8891247 tcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaatagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaaca 8891346  T
Q  104 acaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatc 203  Q
    ||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| || ||||    
T  8891347 acaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcgccaacaatcatacaattatcatc 8891445  T
Q  204 aattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||   ||||||||||||||||    
T  8891446 aattcatgcatacaaacatattatcacagttggagcacgaatttagca 8891493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 36982702 - 36982453
Alignment:
Q  1 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| ||||||| | |    
T  36982702 tcatcaattcatgaatatgcatacccaaacaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacaggaatcataactcaattca 36982603  T
Q  101 acaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac 200  Q
    |||||||||| | | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||| || |    
T  36982602 acaacaacttggca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccagcaatcttacaattatc 36982504  T
Q  201 atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||    
T  36982503 atcaattcatgaatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagca 36982453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 4 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 20627571 - 20627328
Alignment:
Q  4 tcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaaca 103  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || || | ||| |||||  ||||| |||| |||||||||||| | | ||||||||||||    
T  20627571 tcaattcatgaatatccatacccaagcaatgattcatcaaccacaacaccaattaacaaccataaaatcaattgaacaagaattaaatctcaaattaaca 20627472  T
Q  104 acaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatc 203  Q
    ||||||||  | |||||||||  || |||||||| |||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| || ||||    
T  20627471 acaacttaaca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaagttatcatttttacatatttggacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatc 20627373  T
Q  204 aattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattta 248  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||    
T  20627372 aattcgtgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattta 20627328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 7508105 - 7507856
Alignment:
Q  1 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaa-caagaatcacaactcaaatt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || |||||||||||   ||||||||| || || || |||||| | ||||| ||    
T  7508105 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattaaaacatgaatcatatctcaa-tt 7508007  T
Q  100 aacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaa 199  Q
    |||||||||||||   |||||||||  || | |||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||     
T  7508006 aacaacaacttagcc-aaattcaccaattgaacacaattttcataacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 7507908  T
Q  200 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||||||||||| |  || ||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  7507907 catcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagca 7507856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 43643218 - 43642989
Alignment:
Q  1 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || ||||| |||||   ||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  43643218 tcatcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaactacaacatcaattaacagcaatagcatcaattgaacaagaatcatatctcaaatta 43643119  T
Q  101 acaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac 200  Q
    | ||||||| || | |||||||||  || |||||||| |||| |||||| ||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |    
T  43643118 ataacaactaagaa-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttaacatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatc 43643020  T
Q  201 atcaattcatgcatacaaacataacatcaca 231  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43643019 atcaattcatgcatacaaacatatcatcaca 43642989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 24341650 - 24341420
Alignment:
Q  1 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 100  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||    || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| | ||||| | |    
T  24341650 tcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaggaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaattca 24341551  T
Q  101 acaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac 200  Q
    |||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||| || |    
T  24341550 acaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatataatttcaccaacaatcatacaattatc 24341452  T
Q  201 atcaattcatgcatacaaacataacatcacag 232  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24341451 atcaattcatgcatacaaacatatcatcacag 24341420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 25265651 - 25265402
Alignment:
Q  1 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| ||  | || ||||| |||||   | ||||||| ||||||| |  || || |  || | |    
T  25265651 tcatcaattcatgaatatgcatacccaagccatgattcataaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataattca 25265552  T
Q  101 acaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac 200  Q
    |||||||| ||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| || |    
T  25265551 acaacaacatagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatc 25265453  T
Q  201 atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  25265452 atcaattcatgcatacaaacataacatcaaagttagagcacgaatttagca 25265402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 116 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 19689548 - 19689413
Alignment:
Q  116 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 215  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  19689548 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 19689449  T
Q  216 caaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
T  19689448 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 19689413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 116 - 251
Target Start/End: Original strand, 23820187 - 23820322
Alignment:
Q  116 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 215  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  23820187 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 23820286  T
Q  216 caaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
T  23820287 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 23820322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 116 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 14906587 - 14906452
Alignment:
Q  116 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 215  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  14906587 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 14906488  T
Q  216 caaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
T  14906487 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 14906452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 116 - 251
Target Start/End: Original strand, 20015127 - 20015262
Alignment:
Q  116 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 215  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| | |||| ||  ||||||||||||||     
T  20015127 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcacacaattattatcaattcatgcatg 20015226  T
Q  216 caaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
T  20015227 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 20015262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 167 - 251
Target Start/End: Original strand, 8944014 - 8944098
Alignment:
Q  167 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| |  | |||||||||||||| |  || ||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  8944014 aacatgtaatttcacccacaaatataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagca 8944098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 167 - 251
Target Start/End: Original strand, 12728560 - 12728644
Alignment:
Q  167 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| |  | |||||||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12728560 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagca 12728644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 167 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 23778133 - 23778049
Alignment:
Q  167 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||||||||||| | ||||  |||| |  | ||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23778133 aacatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcatgcataagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagca 23778049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 167 - 251
Target Start/End: Original strand, 34824643 - 34824727
Alignment:
Q  167 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| |  | |||||||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34824643 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagca 34824727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 12635956 - 12635872
Alignment:
Q  167 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| |  | |||||||||||||| |  || ||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  12635956 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagca 12635872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 167 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 3798691 - 3798608
Alignment:
Q  167 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagc 250  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| |  | |||||||||||||| |  || ||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  3798691 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaagagcacgaatttagc 3798608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 19)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Original strand, 25175565 - 25175815
Alignment:
Q  1 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25175565 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 25175664  T
Q  101 acaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25175665 acaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac 25175764  T
Q  201 atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25175765 atcaattcatgcatacaaacataacaacacagcaagagcacgaatttagca 25175815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 27654233 - 27653983
Alignment:
Q  1 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27654233 tcattaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcattggaacaagaatcacaactcaaatta 27654134  T
Q  101 acaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27654133 acaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac 27654034  T
Q  201 atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27654033 atcaattcatgcatacaagcataacatcacagcaagagcacgaatttagca 27653983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 16826004 - 16825752
Alignment:
Q  1 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16826004 tcatcaatccatgaatatgcataacaaagcaattattcatcaatcataatatcagataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 16825905  T
Q  101 acaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatta--tacaacta 198  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  16825904 acaacaaattaggagaaatccaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattaattacaacta 16825805  T
Q  199 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16825804 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 16825752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 3 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 14626377 - 14626130
Alignment:
Q  3 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaac 102  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||  |||||||||| |||| ||||||||| | ||||| |||||    
T  14626377 atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaagttaac 14626278  T
Q  103 aacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacat 202  Q
    |||||||||| | || ||||||  ||   |||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||    
T  14626277 aacaacttagcataa-ttcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat 14626179  T
Q  203 caattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14626178 caattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 14626130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 1650352 - 1650105
Alignment:
Q  3 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaac 102  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || |||||||||||   ||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||    
T  1650352 atcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaac 1650253  T
Q  103 aacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacat 202  Q
     | ||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||    
T  1650252 cataacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcattcttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat 1650154  T
Q  203 caattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  1650153 caattcatgcatacaaacgtaacatcacagtaagagcacgaatctagca 1650105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 249
Target Start/End: Original strand, 23153458 - 23153696
Alignment:
Q  10 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 109  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| || || ||||| |||||  ||||| |||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  23153458 catgaatatgtatacccaagtaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataatatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaact 23153557  T
Q  110 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 209  Q
    ||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  23153558 tagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca 23153656  T
Q  210 tgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttag 249  Q
    |||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||    
T  23153657 tgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttag 23153696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 1657999 - 1657760
Alignment:
Q  10 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 109  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || ||||| |||||   |||||||||  ||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    
T  1657999 catgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaactgaacaagaatcataactcaa-ttcacaataact 1657901  T
Q  110 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 209  Q
    ||| | |||| || |  || |||||||| ||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  1657900 tagca-aaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca 1657802  T
Q  210 tgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  1657801 tgcatccaaacataacatcacagttagagcacgaatttagca 1657760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 35009700 - 35009451
Alignment:
Q  1 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||   | ||||||| ||||||| |  || || |  || | |    
T  35009700 tcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataattca 35009601  T
Q  101 acaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac 200  Q
    |||||||| ||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| || |    
T  35009600 acaacaacatagca-aaattcaccaattgagcacaattttcaaaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatc 35009502  T
Q  201 atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  35009501 atcaattcatgcatacaaacttaacatcacagttagagcacgaatttagca 35009451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 10 - 249
Target Start/End: Original strand, 15862484 - 15862720
Alignment:
Q  10 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 109  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || ||||| || ||   ||||||| | | |||||||||||| ||||||| || |||| ||||    
T  15862484 catgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattatcagcaataacataaat-gaacaagaatcataactcaa-ttcacaataact 15862581  T
Q  110 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 209  Q
    ||| | |||| || |  || |||||||| ||||||||||  ||||| | ||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  15862582 tagca-aaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttatacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca 15862680  T
Q  210 tgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttag 249  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  15862681 tgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttag 15862720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 67 - 248
Target Start/End: Original strand, 29665941 - 29666122
Alignment:
Q  67 aacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcata-tat 165  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | ||||  | ||||||||||||| | |||||||||  || || ||||| ||||||||||  ||||| |||||| | |    
T  29665941 aacatcaattgaacatgaatcatatctcatttcaacaacaacttagca-aaattcaccaattgagtacaat-ttcataacttgacatttatgcatacttt 29666038  T
Q  166 gaa-catgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattta 248  Q
    ||| |||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||| ||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29666039 gaaacatgtaatttcacccacaatcatacaattatcatcaattcatacataagaaaataacatcacagctagagcacgaattta 29666122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 178 - 250
Target Start/End: Original strand, 27751603 - 27751675
Alignment:
Q  178 tcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagc 250  Q
    ||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  27751603 tcaccaacaatcatacaattgtcatcaattcatgcatacaaacataacatcacaattagagcacgaatttagc 27751675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 167 - 251
Target Start/End: Original strand, 1556173 - 1556257
Alignment:
Q  167 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| |  | |||||||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1556173 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagca 1556257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 167 - 251
Target Start/End: Original strand, 16232060 - 16232144
Alignment:
Q  167 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| |  | |||||||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16232060 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagca 16232144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 247
Target Start/End: Original strand, 19854317 - 19854402
Alignment:
Q  163 tatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaatt-catgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 247  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  || ||| || |||||||| |||| |  |||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  19854317 tatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgtactcaaacataacatcataacaagagcacgaattt 19854402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 18086911 - 18086827
Alignment:
Q  167 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| |  | |||||||||||||| |  || ||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  18086911 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagca 18086827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 251
Target Start/End: Original strand, 19610186 - 19610270
Alignment:
Q  167 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| |  | |||| ||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19610186 aacatgtaatttcacccacaaacataccataaccatcgattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagca 19610270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 167 - 250
Target Start/End: Original strand, 23977937 - 23978020
Alignment:
Q  167 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagc 250  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| |  | |||||||||||||| |  || ||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  23977937 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaagagcacgaatttagc 23978020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 22251621 - 22251573
Alignment:
Q  200 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattta 248  Q
    |||||||||||||| |  || ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22251621 catcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaattta 22251573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 223
Target Start/End: Original strand, 29605612 - 29605672
Alignment:
Q  163 tatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacata 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||  || ||| || ||  ||||||||||| ||||||||    
T  29605612 tatgaacatgtaatttcaccaacaacaattcaattatcactaattcatgcattcaaacata 29605672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 23)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Original strand, 47357656 - 47357906
Alignment:
Q  1 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47357656 tcatcaatccatgaatatacatacccaatcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 47357755  T
Q  101 acaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47357756 acaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac 47357855  T
Q  201 atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47357856 atcaatccatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 47357906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Original strand, 10644221 - 10644467
Alignment:
Q  1 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |    
T  10644221 tcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatca 10644320  T
Q  101 acaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| || |    
T  10644321 acaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaattatc 10644420  T
Q  201 atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10644421 atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 10644467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 7 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 13048477 - 13048261
Alignment:
Q  7 atccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaaca 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  13048477 atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatctaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaactaacaaca 13048378  T
Q  107 acttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaat 206  Q
    |||||||||||||||| |  || |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||     
T  13048377 acttaggagaaattcatcaattgagcacaatattcataacttatcctttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaaa 13048278  T
Q  207 tcatgcatacaaacata 223  Q
    |||||||||||||||||    
T  13048277 tcatgcatacaaacata 13048261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 4 - 232
Target Start/End: Original strand, 13246435 - 13246662
Alignment:
Q  4 tcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaaca 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||    
T  13246435 tcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaaca 13246534  T
Q  104 acaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatc 203  Q
    ||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||     
T  13246535 acaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatt 13246633  T
Q  204 aattcatgcatacaaacataacatcacag 232  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13246634 aattcatgcatacaaacatatcatcacag 13246662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 54118505 - 54118256
Alignment:
Q  1 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||   ||||||||| |||||||||||||| |||| ||  ||    
T  54118505 tcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaactataacatcaattgaacaagaatcataactaaatcta 54118406  T
Q  101 acaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac 200  Q
    |||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| ||||||||| || | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |    
T  54118405 acaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcaattgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatc 54118307  T
Q  201 atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||    ||||||||||||||||    
T  54118306 atcaattcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacgaatttagca 54118256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 15675350 - 15675101
Alignment:
Q  1 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 100  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| | ||||| | |    
T  15675350 tcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaattca 15675251  T
Q  101 acaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac 200  Q
    |||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| || |    
T  15675250 acaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatc 15675152  T
Q  201 atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||    
T  15675151 atcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagca 15675101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 31115631 - 31115861
Alignment:
Q  1 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 100  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| | ||||| | |    
T  31115631 tcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaattca 31115730  T
Q  101 acaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||  || |||| ||| |||| |||||  ||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| |||||| || |    
T  31115731 acaacaacttagga-aaattcaccaattgagcataattttcacaacttcacatttttacataatggaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatc 31115829  T
Q  201 atcaattcatgcatacaaacataacatcacag 232  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31115830 atcaattcatgcatacaaacatatcatcacag 31115861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 99 - 251
Target Start/End: Original strand, 121989 - 122140
Alignment:
Q  99 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 198  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  121989 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta 122087  T
Q  199 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||| |||||||||    
T  122088 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacaaatttagca 122140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 67 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 10104445 - 10104262
Alignment:
Q  67 aacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatg 166  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | ||||| | ||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  ||    
T  10104445 aacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattg 10104347  T
Q  167 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||| ||||||||    
T  10104346 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacggatttagca 10104262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Original strand, 26680203 - 26680451
Alignment:
Q  1 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  | || ||| | || |||  | ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | |    
T  26680203 tcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattca 26680302  T
Q  101 acaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac 200  Q
    || ||||| |  |  ||||||| |  ||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||      
T  26680303 actacaacat--gtcaaattcatctattttgcacaattttcataacttttcatttttacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattatt 26680400  T
Q  201 atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
T  26680401 atcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 26680451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 116 - 251
Target Start/End: Original strand, 10488678 - 10488813
Alignment:
Q  116 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 215  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  10488678 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 10488777  T
Q  216 caaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
T  10488778 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 10488813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 116 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 16328073 - 16327938
Alignment:
Q  116 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 215  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  16328073 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 16327974  T
Q  216 caaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
T  16327973 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 16327938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 96
Target Start/End: Original strand, 111400 - 111492
Alignment:
Q  4 tcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaa 96  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  111400 tcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcataactcaa 111492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 67 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 40885749 - 40885585
Alignment:
Q  67 aacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcata-tat 165  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | ||||| | ||||| ||||||| | || ||||||  || |||| ||| ||||||||||  ||||| | |||| | |    
T  40885749 aacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaataacttagca-aagttcaccaattgagcataat-ttcataacttgacatttatacatacttt 40885652  T
Q  166 gaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacag 232  Q
    ||||||||||||||||||||||  || ||| || || ||||||||||||||||||||| || |||||    
T  40885651 gaacatgtaatttcaccaacaaacattcaattatcaccaattcatgcatacaaacatagcaccacag 40885585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 167 - 251
Target Start/End: Original strand, 18169138 - 18169222
Alignment:
Q  167 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| |  | |||||||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18169138 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagca 18169222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 167 - 251
Target Start/End: Original strand, 19020654 - 19020738
Alignment:
Q  167 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| |  | |||||||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19020654 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagca 19020738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 200 - 251
Target Start/End: Original strand, 33240900 - 33240951
Alignment:
Q  200 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||    
T  33240900 catcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagca 33240951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 7132153 - 7132069
Alignment:
Q  167 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| |  | |||||||||||||| |  || ||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  7132153 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagca 7132069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 167 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 15287333 - 15287250
Alignment:
Q  167 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagc 250  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| |  | |||| ||||||||| |  || ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15287333 aacatgtaatttcacccacaaacataccataaccatcgattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagc 15287250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 167 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 15294442 - 15294359
Alignment:
Q  167 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagc 250  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| |  | |||| ||||||||| |  || ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15294442 aacatgtaatttcacccacaaacataccataaccatcgattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagc 15294359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 10104492 - 10104450
Alignment:
Q  1 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaa 43  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  10104492 tcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaa 10104450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 163 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 18238242 - 18238157
Alignment:
Q  163 tatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaat-tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 247  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  || ||| || || |||| ||||| || |||||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  18238242 tatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatatcatgtattcaaacatatcatcataacaagagcacgaattt 18238157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 167 - 248
Target Start/End: Original strand, 22738437 - 22738518
Alignment:
Q  167 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattta 248  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| |  | |||||||||||||| |  || ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  22738437 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagaacacgaattta 22738518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 26)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Original strand, 10989412 - 10989661
Alignment:
Q  1 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10989412 tcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 10989511  T
Q  101 acaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac 200  Q
     |||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10989512 -caacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaac 10989610  T
Q  201 atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10989611 atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 10989661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Original strand, 2437459 - 2437709
Alignment:
Q  1 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||    
T  2437459 tcatcaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcaaatctcatatta 2437558  T
Q  101 acaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2437559 acaacaacttaggaaaaattcaccaattgaacacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaac 2437658  T
Q  201 atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2437659 atcaattcatgcatacaaacataacatcacaacaagagcacgaatttagca 2437709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 13911275 - 13911024
Alignment:
Q  1 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |    
T  13911275 tcatcaatccatgaatatgcaaacccaagaaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatca 13911176  T
Q  101 acaacaactt-aggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaa 199  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  || |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  13911175 acaacaactttaggagaaattcaccaattgagcataatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattaa 13911076  T
Q  200 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13911075 catcaattcatgcatacaaacataacatcacaacaagagcacgaatttagca 13911024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 5 - 247
Target Start/End: Original strand, 13572682 - 13572924
Alignment:
Q  5 caatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaa 104  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  13572682 caatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacaa 13572781  T
Q  105 caacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatca 204  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| | ||||  | |||||    
T  13572782 caacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcacacaatcatcatca 13572881  T
Q  205 attcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13572882 attcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 13572924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 18254096 - 18253849
Alignment:
Q  1 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  18254096 tcatcaatccatgaatatgcatactcaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaatta 18253997  T
Q  101 acaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac 200  Q
    |||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||| || |    
T  18253996 acaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatc 18253898  T
Q  201 atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttag 249  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||   ||||||||||||||    
T  18253897 atcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttag 18253849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 25292595 - 25292350
Alignment:
Q  5 caatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaa 104  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |    
T  25292595 caatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattagtcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacga 25292496  T
Q  105 caacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatca 204  Q
    |||| |||||| ||||||||  || |||||||| |||||| |||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||  | || ||    
T  25292495 caacctaggag-aattcaccaattgagcacaatattcatagcttatcctttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcaaca 25292397  T
Q  205 attcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| ||   |||||| |||||||||    
T  25292396 attcatacatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagca 25292350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 47481292 - 47481043
Alignment:
Q  1 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| ||| |   ||||||||| |||||||||||||| ||||||| | |    
T  47481292 tcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaaaaacatcaattaagagcgataacatcaattgaacaagaatcataactcaattca 47481193  T
Q  101 acaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac 200  Q
    |||||||||||| | |||||||||  || | |||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| || |    
T  47481192 acaacaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaattatc 47481094  T
Q  201 atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  47481093 atcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagca 47481043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 16479211 - 16478968
Alignment:
Q  1 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || |||||||||||   ||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||    
T  16479211 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaatta 16479112  T
Q  101 acaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac 200  Q
    | || ||||||  | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |    
T  16479111 aaaataacttaaca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatc 16479013  T
Q  201 atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  16479012 atcaattcatgcatacaaacataacatcgcagtaagagcacgaat 16478968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 4 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 11580997 - 11580751
Alignment:
Q  4 tcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaaca 103  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||    
T  11580997 tcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaaca 11580898  T
Q  104 acaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatc 203  Q
    ||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||    
T  11580897 acaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatc 11580799  T
Q  204 aattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||   ||||||||||||||||    
T  11580798 aattcatgcatacaaacatattatcacagttggagcacgaatttagca 11580751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 4 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 13037272 - 13037026
Alignment:
Q  4 tcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaaca 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||  |||||    
T  13037272 tcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaatattcataacattaattgaacaagaatcataactcaatctaaca 13037173  T
Q  104 acaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatc 203  Q
    ||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||| || ||||    
T  13037172 acaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgcaatttcatcaacaatcatacaattatcatc 13037074  T
Q  204 aattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||    
T  13037073 aattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagca 13037026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Original strand, 16211768 - 16212017
Alignment:
Q  1 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 100  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| || ||||||||||| | |||||||||    
T  16211768 tcattaattcatgaatatgcatacccaagcaatgaatcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatttaacaagaatcaaatctcaaatta 16211867  T
Q  101 acaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac 200  Q
    |||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||  ||||| || |    
T  16211868 acaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgcaatttcacaaacaatcttacaattatc 16211966  T
Q  201 atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||    
T  16211967 atcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagca 16212017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 36052669 - 36052896
Alignment:
Q  1 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||  || ||||||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  36052669 tcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccacaacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaatta 36052768  T
Q  101 acaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac 200  Q
    |||||   |||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| || || |    
T  36052769 acaac---ttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaattttaccaacaatcatataattatc 36052864  T
Q  201 atcaattcatgcatacaaacataacatcacag 232  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  36052865 atcaattcatgcatacaaacgtatcatcacag 36052896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 4 - 251
Target Start/End: Original strand, 3059971 - 3060217
Alignment:
Q  4 tcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaaca 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||    
T  3059971 tcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagtcataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaaca 3060070  T
Q  104 acaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatc 203  Q
    ||||||||  | |||||||||  || |||| ||| |||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||| || ||||    
T  3060071 acaacttaaca-aaattcaccatttgagcataattttcacaatttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacagtattacaattatcatc 3060169  T
Q  204 aattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||| ||||||||||| |||  |||||||   ||||||||||||||||    
T  3060170 aattaatgcatacaaatatattatcacagttggagcacgaatttagca 3060217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Original strand, 13321016 - 13321267
Alignment:
Q  1 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 100  Q
    |||||||| ||||||| |||| |||||||  || |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| | ||||| | |    
T  13321016 tcatcaattcatgaatgtgcaaacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaattca 13321115  T
Q  101 acaa-caacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcata-tatgaa-catgtaatttcaccaacaattatacaact 197  Q
    |||| |||||||| | |||||||||  || |||||||| ||||||||||  ||||| | |||| | |||| |||||||||||||||||||| |||||| |    
T  13321116 acaatcaacttagca-aaattcaccaattgagcacaat-ttcataacttgacatttatacatactttgaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt 13321213  T
Q  198 aacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  13321214 atcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagca 13321267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Original strand, 7293019 - 7293267
Alignment:
Q  1 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  | || ||| | || |||  | ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | |    
T  7293019 tcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattca 7293118  T
Q  101 acaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac 200  Q
    |||||||| |  |  ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||      
T  7293119 acaacaacat--gtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattatt 7293216  T
Q  201 atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
T  7293217 attaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 7293267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 116 - 251
Target Start/End: Original strand, 11516343 - 11516478
Alignment:
Q  116 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 215  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  11516343 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 11516442  T
Q  216 caaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
T  11516443 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 11516478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 116 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 15441711 - 15441576
Alignment:
Q  116 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 215  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  15441711 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 15441612  T
Q  216 caaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
T  15441611 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 15441576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 116 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 30262276 - 30262141
Alignment:
Q  116 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 215  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  30262276 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 30262177  T
Q  216 caaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
T  30262176 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 30262141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 167 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 15950879 - 15950795
Alignment:
Q  167 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| |  | |||||||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15950879 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagca 15950795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 167 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 18980109 - 18980025
Alignment:
Q  167 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| |  | |||||||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18980109 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagca 18980025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 165 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 48622756 - 48622670
Alignment:
Q  165 tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||||||||||||||| ||||  |||| |  | |||||||||||||| |  || ||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  48622756 tgaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatatcatcacagtaagagcacgaatttagca 48622670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 296087 - 295978
Alignment:
Q  142 ataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcac 241  Q
    ||||||| |||||||| ||||  | |||||| ||||||||||||||| |||  | || |||| ||||||||| |||||||||||| | ||   ||| |||    
T  296087 ataacttctcatttttacataattcaacatgaaatttcaccaacaatcataacattatcatcgattcatgcacacaaacataacacctcaattagaacac 295988  T
Q  242 gaatttagca 251  Q
    ||||||||||    
T  295987 gaatttagca 295978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 15760202 - 15760118
Alignment:
Q  167 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||  |  | |||||||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15760202 aacatgtaatttcacccacaaacatatcataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagca 15760118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 251
Target Start/End: Original strand, 15927736 - 15927820
Alignment:
Q  167 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| |  | |||||||||||||| |  || ||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  15927736 aacatgtaatttcacccacaagcataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagca 15927820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 167 - 250
Target Start/End: Original strand, 13758538 - 13758621
Alignment:
Q  167 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagc 250  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| |  | |||||||||||||| |  || ||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  13758538 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaagagcacgaatttagc 13758621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 163 - 247
Target Start/End: Original strand, 28722272 - 28722357
Alignment:
Q  163 tatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaatt-catgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 247  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  || ||| || || ||||| ||||||| |||||||| ||||| | | |||||||||||||    
T  28722272 tatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataactagagcacgaattt 28722357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 24)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Original strand, 30120724 - 30120974
Alignment:
Q  1 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||    
T  30120724 tcatcaatcgatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatta 30120823  T
Q  101 acaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30120824 acaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaac 30120923  T
Q  201 atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30120924 ataaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 30120974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 16674642 - 16674392
Alignment:
Q  1 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||    
T  16674642 tcatcaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaactta 16674543  T
Q  101 acaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16674542 acaacaacttaggagaaattcaccaattaagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaac 16674443  T
Q  201 atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16674442 ataaattcatgcataaaaacataacatcacagaaagagcacgaatttagca 16674392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 5 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 21844818 - 21844576
Alignment:
Q  5 caatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaa 104  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  21844818 caatcaatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaaaaatcacatctcaaattaacaa 21844719  T
Q  105 caacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatca 204  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||    
T  21844718 caacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatca 21844619  T
Q  205 attcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21844618 attcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 21844576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 5 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 21852211 - 21851969
Alignment:
Q  5 caatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaa 104  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21852211 caatcaatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacatctcaaattaacaa 21852112  T
Q  105 caacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatca 204  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||| ||||||  | |||||    
T  21852111 caacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatttaatttcaccaacaatcatacaatcatcatca 21852012  T
Q  205 attcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21852011 attcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 21851969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 222941 - 222753
Alignment:
Q  1 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  222941 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 222842  T
Q  101 acaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  222841 acaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt 222753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 736564 - 736376
Alignment:
Q  1 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  736564 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 736465  T
Q  101 acaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  736464 acaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt 736376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 860459 - 860271
Alignment:
Q  1 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  860459 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 860360  T
Q  101 acaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  860359 acaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt 860271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 43373729 - 43373480
Alignment:
Q  1 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||  |||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  43373729 tcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccatagcatcaattgaacaagaatcaaatctcaaatta 43373630  T
Q  101 acaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac 200  Q
    |||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || || |    
T  43373629 acaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatataattatc 43373531  T
Q  201 atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||   ||||||||||||||||    
T  43373530 atcaattcatgcatacaaacgtatcatcacagttggagcacgaatttagca 43373480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 3 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 6774505 - 6774258
Alignment:
Q  3 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaac 102  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || |||||||||||   ||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||    
T  6774505 atcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaac 6774406  T
Q  103 aacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacat 202  Q
    || ||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||    
T  6774405 aataacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat 6774307  T
Q  203 caattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  6774306 caattcatgcatacaaacataacatcacagtaagagcacgaatctagca 6774258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 3 - 251
Target Start/End: Original strand, 24548986 - 24549233
Alignment:
Q  3 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaac 102  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||  |||||||||| |||| ||||||||| | | |||||||||    
T  24548986 atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaatcccaaattaac 24549085  T
Q  103 aacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacat 202  Q
    || ||||||| | |||||||||  || ||||| || |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||    
T  24549086 aataacttagca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat 24549184  T
Q  203 caattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  24549185 caattcatgcatacaaacataacatcacagtaagagcacgaatctagca 24549233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 4 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 16193974 - 16193728
Alignment:
Q  4 tcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaaca 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||    
T  16193974 tcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaaca 16193875  T
Q  104 acaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatc 203  Q
    |||| || | | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| || ||||    
T  16193874 acaatttggca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttccccaacaatcatacaattatcatc 16193776  T
Q  204 aattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
T  16193775 aattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttagca 16193728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 10 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 24929043 - 24928803
Alignment:
Q  10 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||  |||||| ||| ||||||||||  || |||||||   ||| ||||||    
T  24929043 catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacaacatcaattaacaaccataacctcaattgaacaagagacataactcaatccaaccacaact 24928944  T
Q  110 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 209  Q
    |||  ||||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  24928943 tagc-gaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca 24928845  T
Q  210 tgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    ||||||||||||||  |||||||   ||||||||||||||||    
T  24928844 tgcatacaaacatataatcacagttggagcacgaatttagca 24928803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 16405233 - 16404987
Alignment:
Q  1 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 100  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||| |||||||||||||| |  |||| |||    
T  16405233 tcatcaattcatgaatttgcatacccaagcagtgattcatcaactaaaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacaagaatcatatgtcaattta 16405134  T
Q  101 acaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac 200  Q
    |||||   |||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||| ||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |    
T  16405133 acaac---ttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttaacatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatc 16405038  T
Q  201 atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||    
T  16405037 atcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagca 16404987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 247
Target Start/End: Original strand, 17345581 - 17345816
Alignment:
Q  10 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 109  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || ||||| |||||   |||| ||||  ||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    
T  17345581 catgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataatatcaactgaacaagaatcataactcaa-ttcacaataact 17345679  T
Q  110 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 209  Q
    ||| | |||| || |  || |||||||| ||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  17345680 tagca-aaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca 17345778  T
Q  210 tgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 247  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  17345779 tgcatataaacataacatcacagttagagcacgaattt 17345816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 22907474 - 22907226
Alignment:
Q  1 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  | || ||| | || |||  | ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | |    
T  22907474 tcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattca 22907375  T
Q  101 acaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac 200  Q
    || ||||| |  |  ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||      
T  22907374 actacaacat--gtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattatt 22907277  T
Q  201 atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
T  22907276 atcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 22907226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 127 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 691970 - 691908
Alignment:
Q  127 tttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  691970 tttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt 691908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 116 - 251
Target Start/End: Original strand, 5238203 - 5238338
Alignment:
Q  116 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 215  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  5238203 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 5238302  T
Q  216 caaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
T  5238303 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 5238338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 116 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 24661395 - 24661260
Alignment:
Q  116 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 215  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  24661395 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 24661296  T
Q  216 caaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
T  24661295 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 24661260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 116 - 251
Target Start/End: Original strand, 43685662 - 43685797
Alignment:
Q  116 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 215  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  43685662 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 43685761  T
Q  216 caaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
T  43685762 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 43685797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 167 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 22006346 - 22006262
Alignment:
Q  167 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| |  | |||||||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22006346 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagca 22006262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 13721016 - 13720932
Alignment:
Q  167 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| |  | |||||||||||||| |  || ||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  13721016 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagca 13720932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 251
Target Start/End: Original strand, 16195399 - 16195483
Alignment:
Q  167 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| |  | |||||||||||||| |  |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  16195399 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaacatagcatcacagcacgagaacgaatttagca 16195483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 167 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 16873139 - 16873056
Alignment:
Q  167 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagc 250  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| |  | |||||||||||||| |  || ||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  16873139 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaagagcacgaatttagc 16873056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 167 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 13662353 - 13662269
Alignment:
Q  167 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| |  | |||  ||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13662353 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatncattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagca 13662269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 36)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Original strand, 55316221 - 55316471
Alignment:
Q  1 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||    
T  55316221 tcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaactta 55316320  T
Q  101 acaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  55316321 acaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaac 55316420  T
Q  201 atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55316421 atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 55316471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Original strand, 41270077 - 41270327
Alignment:
Q  1 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||    
T  41270077 tcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaactta 41270176  T
Q  101 acaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  41270177 acaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaattccaccaacaatcatacaactaac 41270276  T
Q  201 atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41270277 atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 41270327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Original strand, 16821141 - 16821387
Alignment:
Q  1 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 100  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |    
T  16821141 tcattaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatca 16821240  T
Q  101 acaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |    
T  16821241 acaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcatagcttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatc 16821340  T
Q  201 atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 247  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16821341 atcaatttatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacggattt 16821387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 14842822 - 14842573
Alignment:
Q  1 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  14842822 tcatcaatccatgaatatgcaaacccaatcaattattcatcaatcataacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaatta 14842723  T
Q  101 acaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac 200  Q
    |||||||||||| | |||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||| |||||| || |    
T  14842722 acaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcataacttatcatttttacacatttgaacatgcaatttcaccaacaatcatacaattatc 14842624  T
Q  201 atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||    
T  14842623 ttcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagca 14842573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 13975979 - 13975734
Alignment:
Q  5 caatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaa 104  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  |    
T  13975979 caatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaatga 13975880  T
Q  105 caacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatca 204  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||  | || ||    
T  13975879 caacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacttatttaaacatgtaattccaccaacaatcatacaatcatcaaca 13975780  T
Q  205 attcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
T  13975779 attcatgcatac-aacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 13975734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Original strand, 45860811 - 45861056
Alignment:
Q  5 caatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaa 104  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  |    
T  45860811 caatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaatga 45860910  T
Q  105 caacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatca 204  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||  | || ||    
T  45860911 caacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacttatttaaacatgtaattccaccaacaatcatacaatcatcaaca 45861010  T
Q  205 attcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
T  45861011 attcatgcatac-aacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 45861056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 15936888 - 15936641
Alignment:
Q  1 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  15936888 tcatcaatccatgaatatgcatactcaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaatta 15936789  T
Q  101 acaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac 200  Q
    |||||||||||  | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||| || |    
T  15936788 acaacaacttatca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatc 15936690  T
Q  201 atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttag 249  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||   ||||||||||||||    
T  15936689 atcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttag 15936641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 4 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 51158276 - 51158030
Alignment:
Q  4 tcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaaca 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||    
T  51158276 tcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaaca 51158177  T
Q  104 acaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatc 203  Q
    ||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||    
T  51158176 acaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatc 51158078  T
Q  204 aattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||    
T  51158077 aattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagca 51158030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 15859285 - 15859036
Alignment:
Q  1 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||| | |    
T  15859285 tcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaattca 15859186  T
Q  101 acaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac 200  Q
    |||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |    
T  15859185 acaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatc 15859087  T
Q  201 atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||    
T  15859086 atcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagca 15859036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 13955147 - 13954902
Alignment:
Q  5 caatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaa 104  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  |    
T  13955147 caatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaatga 13955048  T
Q  105 caacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatca 204  Q
    |||||||||||||||||| |  || |||||||| ||||||||| ||||||||| | ||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||  | || ||    
T  13955047 caacttaggagaaattcatcaattgagcacaatattcataactgatcatttttacttatttaaacatgtaattccaccaacaatcatacaatcatcaaca 13954948  T
Q  205 attcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
T  13954947 attcatgcatac-aacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 13954902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 2 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 15938729 - 15938483
Alignment:
Q  2 catcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||    
T  15938729 catcaatccatgaatatgcatactcaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaa 15938630  T
Q  102 caacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaaca 201  Q
    ||||||||||  | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||    
T  15938629 caacaacttatca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca 15938531  T
Q  202 tcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttag 249  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||| ||||   ||||||| ||||||    
T  15938530 tcaattcatgattacaaacatatcattacagttggagcacgtatttag 15938483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 12030408 - 12030159
Alignment:
Q  1 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||  |||| ||||| |||||||||||||| |  ||||||||    
T  12030408 tcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccataacatcaattaacaaccatagcatcaattgaacaagaatcaaatatcaaatta 12030309  T
Q  101 acaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac 200  Q
    |||| ||||||| | |||||||||  || |||||||  |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| || |    
T  12030308 acaataacttagca-aaattcaccaattgagcacaactttcacaacttatcacttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatc 12030210  T
Q  201 atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||    
T  12030209 atcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagca 12030159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Original strand, 2049812 - 2050061
Alignment:
Q  1 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||| ||||| |||||||| ||||| | |||||||||    
T  2049812 tcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccatagcatcaattgaacaaaaatcaaatctcaaatta 2049911  T
Q  101 acaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac 200  Q
    |||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| || ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| || |    
T  2049912 acaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaagttatcatgtttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatc 2050010  T
Q  201 atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    ||||||||| ||||||||||||| | ||||||   ||||||||||||||||    
T  2050011 atcaattcaggcatacaaacatatcgtcacagttggagcacgaatttagca 2050061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 3 - 251
Target Start/End: Original strand, 15614838 - 15615085
Alignment:
Q  3 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaac 102  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||  |||||||||| |||| ||||||||| | | |||||||||    
T  15614838 atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaatcccaaattaac 15614937  T
Q  103 aacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacat 202  Q
    || ||||||| | |||||||||  || ||||| || |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||    
T  15614938 aataacttagca-aaattcaccaattgagcaccatattcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcctacaattatcat 15615036  T
Q  203 caattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||| |||||    
T  15615037 caattcatgcatacaaatataacaccacagtaagagcacaaatctagca 15615085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 251
Target Start/End: Original strand, 13838905 - 13839145
Alignment:
Q  10 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 109  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||   ||| ||||||    
T  13838905 catgaatatgcatacccaaacaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatccaaccacaact 13839004  T
Q  110 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 209  Q
    ||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||    
T  13839005 tagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaattca 13839103  T
Q  210 tgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||    
T  13839104 tgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagca 13839145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 17912742 - 17912495
Alignment:
Q  1 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||  ||||||| |||||| | ||||| | |    
T  17912742 tcatcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcgattgaacatgaatcatagctcaattca 17912643  T
Q  101 acaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac 200  Q
    || ||||| ||  |  |||||| |  ||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| || |    
T  17912642 actacaacatatca--aattcatcaattttgcacaattttcataacttttcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatc 17912545  T
Q  201 atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
T  17912544 atcaattcatgcatacaaacatatcatca-agttggagcacgaatttagca 17912495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 116 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 2449385 - 2449250
Alignment:
Q  116 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 215  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  2449385 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 2449286  T
Q  216 caaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
T  2449285 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 2449250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 16744375 - 16744130
Alignment:
Q  1 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 100  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  | || ||  | || |||  | ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | |    
T  16744375 tcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatttattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattca 16744276  T
Q  101 acaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac 200  Q
    || | ||| |  |  ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||| | || ||||||||| ||||||||| |||||  ||      
T  16744275 actataacat--gtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcatttttacatatttaaaaatgtaatttaaccaacaatcatacacttatt 16744178  T
Q  201 atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattta 248  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||   |||||||||||||    
T  16744177 atcaattcatggatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattta 16744130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 12902178 - 12902094
Alignment:
Q  167 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| |  | |||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12902178 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacatcacagcaagagcacgaatttagca 12902094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 251
Target Start/End: Original strand, 54651625 - 54651709
Alignment:
Q  167 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||| ||||||||  ||||| |||||| || |||||||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  54651625 aacatgcaatttcactcacaatcatacaattatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagca 54651709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 167 - 251
Target Start/End: Original strand, 5228481 - 5228565
Alignment:
Q  167 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| |  | |||||||||||||| |   | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5228481 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaaggaaataacatcacagcaagagcacgaatttagca 5228565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 167 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 12264880 - 12264796
Alignment:
Q  167 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| |  | |||||||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12264880 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagca 12264796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 167 - 251
Target Start/End: Original strand, 25058907 - 25058991
Alignment:
Q  167 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| |  | |||||||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25058907 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagca 25058991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 167 - 251
Target Start/End: Original strand, 49232604 - 49232688
Alignment:
Q  167 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| |  | |||||||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  49232604 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagca 49232688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 47984652 - 47984763
Alignment:
Q  1 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||  | || ||||| |||||   | ||||||| ||||||| |||||||| |||||   |    
T  47984652 tcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatcacatctcaatcca 47984751  T
Q  101 acaacaacttag 112  Q
    ||||||||||||    
T  47984752 acaacaacttag 47984763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 47993939 - 47994050
Alignment:
Q  1 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||  | || ||||| |||||   | ||||||| ||||||| |||||||| |||||   |    
T  47993939 tcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaaaatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatcacatctcaatcca 47994038  T
Q  101 acaacaacttag 112  Q
    ||||||||||||    
T  47994039 acaacaacttag 47994050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 48003226 - 48003337
Alignment:
Q  1 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||  | || ||||| |||||   | ||||||| ||||||| |||||||| |||||   |    
T  48003226 tcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatcacatctcaatcca 48003325  T
Q  101 acaacaacttag 112  Q
    ||||||||||||    
T  48003326 acaacaacttag 48003337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 48012512 - 48012623
Alignment:
Q  1 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||  | || ||||| |||||   | ||||||| ||||||| |||||||| |||||   |    
T  48012512 tcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaaaatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatcacatctcaatcca 48012611  T
Q  101 acaacaacttag 112  Q
    ||||||||||||    
T  48012612 acaacaacttag 48012623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 167 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 11986262 - 11986181
Alignment:
Q  167 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattta 248  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||||| || ||| || ||||||| || || ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  11986262 aacatgtaatttcaaccacaatcatacaattatcattaaatcatgcacacgaaaataacatcacagttagagcacgaattta 11986181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 247
Target Start/End: Original strand, 41661727 - 41661812
Alignment:
Q  163 tatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattc-atgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 247  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  || ||| || ||||| ||| ||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  41661727 tatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcatttccatgtattcaaacatatcatcatagcaagagcacgaattt 41661812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 15468428 - 15468344
Alignment:
Q  167 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| |  | |||||||||||||| |  || ||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  15468428 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcatagcaagagcacgaatttagca 15468344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 251
Target Start/End: Original strand, 18911161 - 18911245
Alignment:
Q  167 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| |  | |||||||||||||| |  || ||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  18911161 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagca 18911245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 251
Target Start/End: Original strand, 22275377 - 22275461
Alignment:
Q  167 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| |  | |||||||||||||| |  || ||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  22275377 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatggcatcacagcaagagcacgaatttagca 22275461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Complemental strand, 15468594 - 15468555
Alignment:
Q  1 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcat 40  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15468594 tcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcat 15468555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 163 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 31412418 - 31412333
Alignment:
Q  163 tatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaatt-catgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 247  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  || ||| || || ||||| |||| || |||||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  31412418 tatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcatcataacaagagcacgaattt 31412333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 18897099 - 18897051
Alignment:
Q  200 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattta 248  Q
    |||||||||||||| |  || ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18897099 catcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaattta 18897051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 18)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 5072638 - 5072388
Alignment:
Q  1 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||    
T  5072638 tcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaactta 5072539  T
Q  101 acaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5072538 acaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaac 5072439  T
Q  201 atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5072438 atcaattcatgcatataaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 5072388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 18601368 - 18601118
Alignment:
Q  1 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||    
T  18601368 tcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaactta 18601269  T
Q  101 acaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18601268 acaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaac 18601169  T
Q  201 atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18601168 atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcatgaatttagca 18601118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Original strand, 22227811 - 22228060
Alignment:
Q  1 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  22227811 tcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaatta 22227910  T
Q  101 acaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac 200  Q
    |||||||||||| | ||||||| |  ||   |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| || |    
T  22227911 acaacaacttagca-aaattcaacaattggacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaattatc 22228009  T
Q  201 atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    ||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22228010 atcaattcatgcacaagaaaataacatcacagcaagagcacgaatttagca 22228060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Original strand, 22232508 - 22232757
Alignment:
Q  1 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  22232508 tcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaatta 22232607  T
Q  101 acaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac 200  Q
    |||||||||||| | ||||||| |  ||   |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| || |    
T  22232608 acaacaacttagca-aaattcaacaattggacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaattatc 22232706  T
Q  201 atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    ||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22232707 atcaattcatgcacaagaaaataacatcacagcaagagcacgaatttagca 22232757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Original strand, 20931347 - 20931596
Alignment:
Q  1 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 100  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  20931347 tcattaattcatgaatatgcatacccaagaaattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaatta 20931446  T
Q  101 acaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac 200  Q
    ||||||| |||| | |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |    
T  20931447 acaacaatttagca-aaattcaccaatttagcacaattttcataacttatcatttttacatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatc 20931545  T
Q  201 atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||    
T  20931546 atcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagca 20931596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Original strand, 20913039 - 20913281
Alignment:
Q  1 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||       |||||    
T  20913039 tcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaagatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatca-------aatta 20913131  T
Q  101 acaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac 200  Q
    |||||||||| | | |||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |    
T  20913132 acaacaactttgca-aaattcaccaattgagcacaattttcataacttatcatttttacatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatc 20913230  T
Q  201 atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||    
T  20913231 atcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagca 20913281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 3 - 251
Target Start/End: Original strand, 2116258 - 2116506
Alignment:
Q  3 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaac-tcaaattaa 101  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||  |||||||||| |||| ||||||||| ||  |||||||||    
T  2116258 atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaaatatcaaattaa 2116357  T
Q  102 caacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaaca 201  Q
    ||| ||||||| | |||||||||  || ||||| || |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||    
T  2116358 caataacttagca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca 2116456  T
Q  202 tcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  2116457 tcaattcatgcatacaaacataacatcacagtaaaagcacgaatctagca 2116506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 20893887 - 20893638
Alignment:
Q  1 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 100  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||  ||    
T  20893887 tcatcaatttatgaatatgcatacccaaacaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagtcataacatcaattgaacaagaatcataaatcaatcta 20893788  T
Q  101 acaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac 200  Q
    |||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| || |    
T  20893787 acaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaacaacaatcatacaattatc 20893689  T
Q  201 atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||| ||||||||||    
T  20893688 atcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcaagaatttagca 20893638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Original strand, 41394224 - 41394473
Alignment:
Q  1 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||  | || |||||||||||   ||||||||| |||| ||||||||| | |||||  ||    
T  41394224 tcatcaatccatgaatatgcatacccaatcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaacata 41394323  T
Q  101 acaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac 200  Q
    |||| ||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| || |    
T  41394324 acaataacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaacttcaccaacaatcatacaattatc 41394422  T
Q  201 atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
T  41394423 atcaatttatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttagca 41394473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 4 - 251
Target Start/End: Original strand, 20445684 - 20445930
Alignment:
Q  4 tcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaaca 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||  |||||||||| |||| ||||||||| ||| ||| | ||||    
T  20445684 tcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacagccataacatcaattgatcaagaatcataacacaattcaaca 20445783  T
Q  104 acaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatc 203  Q
    ||||||||| | |||||||||  || |||||||| ||||  ||||||||||| | | ||  |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||    
T  20445784 acaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcaccacttatcatttgttcctacttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatc 20445882  T
Q  204 aattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||    ||||||||||||||||    
T  20445883 aattcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacgaatttagca 20445930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 4 - 251
Target Start/End: Original strand, 20531449 - 20531695
Alignment:
Q  4 tcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaaca 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||  |||||||||| |||| ||||||||| ||| ||| | ||||    
T  20531449 tcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacagccataacatcaattgatcaagaatcataacacaattcaaca 20531548  T
Q  104 acaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatc 203  Q
    ||||||||| | |||||||||  || |||||||| ||||  ||||||||||| | | ||  |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||    
T  20531549 acaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcaccacttatcatttgttcctacttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatc 20531647  T
Q  204 aattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||    ||||||||||||||||    
T  20531648 aattcatgcatacaaacatattatcacatttggagcacgaatttagca 20531695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 65 - 251
Target Start/End: Original strand, 45051489 - 45051674
Alignment:
Q  65 ataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatata 164  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||| | ||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| |||||     
T  45051489 ataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaaccataacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatt 45051587  T
Q  165 tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||    
T  45051588 tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacgtaacatcacagtaagaacacgaatctagca 45051674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 4 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 37844709 - 37844462
Alignment:
Q  4 tcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaaca 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||    
T  37844709 tcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgactcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaaca 37844610  T
Q  104 acaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttca-taacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacat 202  Q
    ||||||||| | |||||||    || |||||||| |||| ||  ||||||||| | | ||  |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||    
T  37844609 acaacttagca-aaattcattaattgagcacaattttcactattttatcatttgttcctacttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat 37844511  T
Q  203 caattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||| ||||||||||    
T  37844510 caattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcatgaatttagca 37844462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 116 - 251
Target Start/End: Original strand, 51452608 - 51452743
Alignment:
Q  116 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 215  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  51452608 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 51452707  T
Q  216 caaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||||| ||||| ||    |||||||||||||||    
T  51452708 caaacatatcatcaaagttgaagcacgaatttagca 51452743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 251
Target Start/End: Original strand, 46523557 - 46523641
Alignment:
Q  167 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||  |  |||||||||||||||| |  || ||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  46523557 aacatgtaatttcacccacaaacataacataaacatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagca 46523641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 167 - 250
Target Start/End: Original strand, 17148735 - 17148818
Alignment:
Q  167 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagc 250  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| |  | |||||||||||||| |  || ||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  17148735 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaagagcacgaatttagc 17148818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 167 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 18059846 - 18059765
Alignment:
Q  167 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattta 248  Q
    |||||||||||||||| | ||  |||| |  | |||||||||||||| |  || ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18059846 aacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaattta 18059765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 43
Target Start/End: Original strand, 45051446 - 45051486
Alignment:
Q  3 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaa 43  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  45051446 atcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaa 45051486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 4)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Original strand, 36095 - 36345
Alignment:
Q  1 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||    
T  36095 tcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcatattatcaaataacattcataacatctattgaacatgaatcacatctcaaatta 36194  T
Q  101 acaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36195 acaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaatatgtaatttcaccaacaatcatacaactaac 36294  T
Q  201 atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  36295 atcaattcatacatacaaacataacatcactacaagagcacgaatttagca 36345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Original strand, 48600 - 48849
Alignment:
Q  1 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||| |  |||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||    
T  48600 tcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaatagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatcta 48699  T
Q  101 acaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac 200  Q
     ||||||||||| | |||||||||   | |||||||| |||| |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |    
T  48700 gcaacaacttagca-aaattcaccaactgagcacaattttcacaacttatcattttttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatc 48798  T
Q  201 atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||    
T  48799 atcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagca 48849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 212 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 169951 - 169912
Alignment:
Q  212 catacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  169951 catacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 169912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 154095 - 154011
Alignment:
Q  167 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    ||||||||| |||||| ||||  |||| |  | |||||||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  154095 aacatgtaacttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagca 154011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Original strand, 42999 - 43245
Alignment:
Q  1 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||    
T  42999 tcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcacttgaacacgaatcacatctcaaatta 43098  T
Q  101 acaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |    
T  43099 acaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatc 43198  T
Q  201 atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 247  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43199 atcaattcatgcatagaaacataacatcccagcaagagcacgaattt 43245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 176; Significance: 6e-95; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 31926 - 31675
Alignment:
Q  1 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 100  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |    
T  31926 tcattaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatattaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatca 31827  T
Q  101 acaacaactt-aggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaa 199  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  || |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31826 acaacaactttaggagaaattcaccaattgagcataatattcataacttatcatttttgcatatatgaatatgtaatttcaccaacaatcatacaactaa 31727  T
Q  200 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  31726 catcaattcatgcattcaaacataacatcaccacaagagcacgaatttagca 31675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 128429 - 128181
Alignment:
Q  1 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||    
T  128429 tcatcaattcatgaatatgcatacccaatcaattattcatcaatcacaacatccattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctc-aatta 128331  T
Q  101 acaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac 200  Q
    |||||||| ||  | |||||| ||  || |||||||| |||| |||||| ||  ||| || || ||||||||||||||||||||||||  ||||| || |    
T  128330 acaacaacctaaca-aaattcgccaattgagcacaattttcacaacttaacacctttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatc 128232  T
Q  201 atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||||||||    
T  128231 atcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgaagcacgaatttagca 128181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 175; Significance: 3e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 5 - 247
Target Start/End: Original strand, 41 - 283
Alignment:
Q  5 caatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaa 104  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  41 caattcatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacaa 140  T
Q  105 caacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatca 204  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||||| | ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||    
T  141 caacttaggagaaattcaccaattgagcacaatatacataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatca 240  T
Q  205 attcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  241 attcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 164; Significance: 9e-88; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 5 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 64774 - 64527
Alignment:
Q  5 caatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaa 104  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  64774 caatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacaa 64675  T
Q  105 caacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatc- 203  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||     
T  64674 caacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatca 64575  T
Q  204 ----aattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 247  Q
        |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  64574 atataattcatgcatataaacataacatcacagcaagagcacgaattt 64527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 107749 - 107996
Alignment:
Q  1 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  107749 tcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaatta 107848  T
Q  101 acaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac 200  Q
    |||||||||||  | |||||||||  || |||||||| || | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| || |    
T  107849 acaacaacttatca-aaattcaccaattgagcacaatttttacaacttatcatttttgcacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatc 107947  T
Q  201 atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttag 249  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||   ||||||||||||||    
T  107948 atcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttag 107996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 21365 - 21116
Alignment:
Q  1 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 100  Q
    |||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||||    
T  21365 tcattaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcatcaatcataacatcaaataacattcataacatcaattgaacaagaatccaatctcaaatta 21266  T
Q  101 acaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||  || ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| || || |    
T  21265 acaacaacttagga-aaattcaccaattgagctcaatcttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatataattatc 21167  T
Q  201 atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21166 atcaattaatggatacaaacataacatcacaacaagagcacgaatttagca 21116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 14310 - 14069
Alignment:
Q  1 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | |||||||||||||  | |||||||||    
T  14310 tcatcaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcatcaatcataacatcaaacaacattcataacattaattgaacaagaatccaatctcaaatta 14211  T
Q  101 acaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac 200  Q
     ||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||| ||| || || |    
T  14210 tcaacaacttagga-aaattcaccaattgagcacaatcttcataacttatcatttttacatatttcaacatgtaatttcactaacaatcatataattatc 14112  T
Q  201 atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacga 243  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14111 atcaattcatgcatacagacataacatcacagcaagagcacga 14069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 149; Significance: 8e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 23 - 251
Target Start/End: Original strand, 5552 - 5780
Alignment:
Q  23 acccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattca 122  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5552 acccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattca 5651  T
Q  123 cccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacat 222  Q
    ||  || |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  5652 ccaattgagcacaatattcatgacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacat 5751  T
Q  223 aacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    ||||||| ||   ||||||||||||||||    
T  5752 aacatcaaagttggagcacgaatttagca 5780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 3843 - 3594
Alignment:
Q  1 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  3843 tcatcaatccatcaatatgcatacccaagcaattattcctcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaatta 3744  T
Q  101 acaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac 200  Q
    |||||||||||| | ||||| |||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |    
T  3743 acaacaacttagca-aaatttaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatc 3645  T
Q  201 atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||    
T  3644 atcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagca 3594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Original strand, 1126 - 1375
Alignment:
Q  1 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  1126 tcatcaattcatgaatatgcacacccaagcaattattcatcaaccacaatatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaatta 1225  T
Q  101 acaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac 200  Q
    |||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||      
T  1226 acaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatt 1324  T
Q  201 atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
T  1325 atcaattcatgcatactaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 1375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 136; Significance: 5e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Original strand, 12117 - 12364
Alignment:
Q  1 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||| |      
T  12117 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatgaatcataacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaatt-- 12214  T
Q  101 acaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac 200  Q
    |||||||||||  | |||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||| || || | |||||||| ||||||||||||| |||||| || |    
T  12215 acaacaacttaaca-aaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttaaacatgtattttcaccaacaatcatacaattatc 12313  T
Q  201 atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  12314 atcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttagagcacgaatttagca 12364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 136; Significance: 5e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 5464 - 5219
Alignment:
Q  1 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  5464 tcatcaatccatgaatatgca-acccaagcaattattcattaatcacaacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaatta 5366  T
Q  101 acaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac 200  Q
    ||||||||| || | |||||||||  || | |||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |    
T  5365 acaacaactcagca-aaattcaccaattgaacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatc 5267  T
Q  201 atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattta 248  Q
    ||||||||||||| |  || ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5266 atcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaattta 5219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 6324 - 6076
Alignment:
Q  1 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||| |||    
T  6324 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacaaaaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaa-tta 6226  T
Q  101 acaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac 200  Q
    |||||||||||| | |||||||||  || |||||||| || | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |    
T  6225 acaacaacttagca-aaattcaccaattcagcacaatttttacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatc 6127  T
Q  201 atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||    
T  6126 atcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagca 6076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 1216 - 968
Alignment:
Q  1 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||| |||||||||||| | | ||||| |||    
T  1216 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaataaaatctcaa-tta 1118  T
Q  101 acaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac 200  Q
    |||||||||||| | ||||||| |  || |||||||| |||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |    
T  1117 acaacaacttagca-aaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatc 1019  T
Q  201 atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||    
T  1018 atcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagca 968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Original strand, 48189 - 48438
Alignment:
Q  1 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  48189 tcatcaatccatgaatatgcatacccaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatctataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaatta 48288  T
Q  101 acaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac 200  Q
    |||||||||||  | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||| || |    
T  48289 acaacaacttaaca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatc 48387  T
Q  201 atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||   ||||||||||||||||    
T  48388 atcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagca 48438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 3 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 9596 - 9353
Alignment:
Q  3 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaac 102  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  9596 atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcatttgagcaagaatcaaatctcaaattaac 9497  T
Q  103 aacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacat 202  Q
    || ||||||| | |||||||||  || ||||| || |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||    
T  9496 aataacttagca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat 9398  T
Q  203 caattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9397 caattcatgcatacaaacataacatcacagcaaaagcacgaattt 9353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 3 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 16494 - 16251
Alignment:
Q  3 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaac 102  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  16494 atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcatttgagcaagaatcaaatctcaaattaac 16395  T
Q  103 aacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacat 202  Q
    || ||||||| | |||||||||  || ||||| || |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||    
T  16394 aataacttagca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat 16296  T
Q  203 caattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16295 caattcatgcatacaaacataacatcacagcaaaagcacgaattt 16251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Original strand, 3724 - 3974
Alignment:
Q  1 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  3724 tcatcaatccatgaatatgcaaacccaagtaattattcatcaatcataacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaatta 3823  T
Q  101 acaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatca-tttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaa 199  Q
    |||||||||||| | |||||||||  ||   |||||| | |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||     
T  3824 acaacaacttagca-aaattcaccaattggacacaatttccataacttatcattttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 3922  T
Q  200 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||||||||||| |  || ||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  3923 catcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagca 3974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 131; Significance: 5e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Original strand, 8880 - 9129
Alignment:
Q  1 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  8880 tcatcaatacatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaatta 8979  T
Q  101 acaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac 200  Q
    |||||||||||  | |||||||||  || |||||||| |||| |||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||| || |    
T  8980 acaacaacttaaca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttaacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatc 9078  T
Q  201 atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||    
T  9079 atcgattcatgcatacaaacataacatcacaaatggagcacgaatttagca 9129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1711 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold1711
Description:

Target: scaffold1711; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 105 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 1450 - 1304
Alignment:
Q  105 caacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatca 204  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1450 caacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatca 1351  T
Q  205 attcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1350 attcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 1304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 148723 - 148953
Alignment:
Q  1 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 100  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || ||  |||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  148723 tcatcaattcatgaatatacatacccaagcaatgattcatcaaccacaacttcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaatta 148822  T
Q  101 acaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac 200  Q
    |||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| || |    
T  148823 acaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatc 148921  T
Q  201 atcaattcatgcatacaaacataacatcacag 232  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  148922 atcaattcatgcatacaaacatatcatcacag 148953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Original strand, 8851 - 9100
Alignment:
Q  1 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 100  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||  | || ||||| ||| |   ||||||||| |||||||  ||||| | ||||| | |    
T  8851 tcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaatagcaataacatcaattgaacattaatcatatctcaattca 8950  T
Q  101 acaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac 200  Q
    |||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| || |    
T  8951 acaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatc 9049  T
Q  201 atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||    
T  9050 atcaattcatgcatacaaacatatcatcacagatggagcacgaatttagca 9100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 119; Significance: 7e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Original strand, 19208 - 19457
Alignment:
Q  1 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| ||||||| | |    
T  19208 tcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacaggaatcataactcaattca 19307  T
Q  101 acaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac 200  Q
    |||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| || |    
T  19308 acaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatc 19406  T
Q  201 atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||    
T  19407 atcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagca 19457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Original strand, 21292 - 21541
Alignment:
Q  1 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| ||||||| | |    
T  21292 tcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacaggaatcataactcaattca 21391  T
Q  101 acaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac 200  Q
    |||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| || |    
T  21392 acaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatc 21490  T
Q  201 atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||    
T  21491 atcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagca 21541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 4 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 123422 - 123176
Alignment:
Q  4 tcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaaca 103  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||| ||  |||||    
T  123422 tcaattcatgaatatgcatacccaagccattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcataacttaatctaaca 123323  T
Q  104 acaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatc 203  Q
    ||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||    
T  123322 acaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatc 123224  T
Q  204 aattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||    ||||||||||||||||    
T  123223 aattcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacgaatttagca 123176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 37174 - 36928
Alignment:
Q  1 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||| ||| |||||||||| ||| |||||||   |    
T  37174 tcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacgtcaattgaacaagattcataactcaatcca 37075  T
Q  101 acaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac 200  Q
    || ||||||||| | |||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||   ||||| || |    
T  37074 accacaacttagca-aaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaagcttacaattatc 36976  T
Q  201 atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattta 248  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||    
T  36975 atcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattta 36928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 108; Significance: 2e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 4 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 5319 - 5073
Alignment:
Q  4 tcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaaca 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||   |||||    
T  5319 tcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcattctaaca 5220  T
Q  104 acaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatc 203  Q
    ||||||| | | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||| || ||||    
T  5219 acaactttgca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtactttcaccaacaatcttacaattatcatc 5121  T
Q  204 aattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||| ||||||||||||| | ||||||   ||| ||||||||||||    
T  5120 aattcacgcatacaaacatatcgtcacagttggagtacgaatttagca 5073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 247694 - 247454
Alignment:
Q  10 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  247694 catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagtcataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaact 247595  T
Q  110 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 209  Q
    ||| | ||||| |||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||| |||||||||  |||| |||||| || ||||||||||    
T  247594 tagca-aaatttaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgaaatttcaccctcaatcatacaattatcatcaattca 247496  T
Q  210 tgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||||||||||| ||| ||||   ||||||||||||||||    
T  247495 tgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagca 247454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 34246 - 34162
Alignment:
Q  167 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| |  | |||||||||||||| |  || ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  34246 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttagca 34162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 104; Significance: 6e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 4 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 26673 - 26427
Alignment:
Q  4 tcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaaca 103  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||   |||||    
T  26673 tcaattcatcaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcattctaaca 26574  T
Q  104 acaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatc 203  Q
    ||||||||| | |||||||||  || || ||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||  ||||| || ||||    
T  26573 acaacttagca-aaattcaccaattgagaacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtactttcaccaataatcttacaattatcatc 26475  T
Q  204 aattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
T  26474 aattcacgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 26427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 116 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 8327 - 8192
Alignment:
Q  116 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 215  Q
    |||||||||  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||    
T  8327 aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacctgtaatttcaccaacaatcatacaattatcaccaattcatgcata 8228  T
Q  216 caaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  8227 caaacataacatcacagttagagcacgaatttagca 8192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 102; Significance: 9e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 3 - 251
Target Start/End: Original strand, 2966 - 3214
Alignment:
Q  3 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaa-caagaatcacaactcaaattaa 101  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||| | |||||||||  | || |||||||||||   ||||||||| || || || |||||| | ||||| | ||    
T  2966 atcaattcatgaatatgcatacacaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattaaaacatgaatcatatctcaattcaa 3065  T
Q  102 caacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaaca 201  Q
    ||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||    
T  3066 caacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca 3164  T
Q  202 tcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3165 tcaattcatggatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 3214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 102; Significance: 9e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 10 - 251
Target Start/End: Original strand, 171916 - 172156
Alignment:
Q  10 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 109  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||  ||||||| | ||| ||||||    
T  171916 catgaatatgcatacctaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcgtaactcaattcaaccacaact 172015  T
Q  110 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 209  Q
    ||| | |||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||    
T  172016 tagca-aaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaattca 172114  T
Q  210 tgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    | |||||||||||| ||||||||   ||||||| ||||||||    
T  172115 tccatacaaacatatcatcacagttggagcacgtatttagca 172156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 10 - 251
Target Start/End: Original strand, 177619 - 177859
Alignment:
Q  10 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 109  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||  ||||||| | ||| ||||||    
T  177619 catgaatatgcatacctaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcgtaactcaattcaaccacaact 177718  T
Q  110 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 209  Q
    ||| | |||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||    
T  177719 tagca-aaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaattca 177817  T
Q  210 tgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    | |||||||||||| ||||||||   ||||||| ||||||||    
T  177818 tccatacaaacatatcatcacagttggagcacgtatttagca 177859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 97; Significance: 9e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 3 - 251
Target Start/End: Original strand, 41733 - 41980
Alignment:
Q  3 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaac 102  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||   | || | ||| |||||  |||| ||||| |||||||||||||| |||||||  ||||    
T  41733 atcaattcatgaatatgcatacccaaccaatgattcatcatctacaacaacaattaacagccatagcatcaattgaacaagaatcataactcaatctaac 41832  T
Q  103 aacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacat 202  Q
    |||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| || ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||   |||| || |||    
T  41833 aacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaaattatcatttttacatatttgagcatgtaatttcaccaacaatatgacaattatcat 41931  T
Q  203 caattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||    
T  41932 caattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagca 41980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1542 (Bit Score: 92; Significance: 9e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold1542
Description:

Target: scaffold1542; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 784 - 546
Alignment:
Q  12 tgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaactta 111  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| || ||  |||||||||| || ||||||||||| |||| ||  |||||  ||||||    
T  784 tgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattagcagccataacatcaattaaacaagaatcataacttaatctaacagtaactta 685  T
Q  112 ggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatg 211  Q
    | | |||||||||  || || ||||| |||| |||| ||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||    
T  684 gca-aaattcaccaattgagtacaattttcacaactcatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatg 586  T
Q  212 catacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||    
T  585 catacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagca 546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 92; Significance: 9e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 34722 - 34472
Alignment:
Q  1 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaa-caagaatcacaactcaaatt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||  | || |||||||||||   ||||||||| || || || |||||| | ||||| |     
T  34722 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagtagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattaaaacatgaatcatatctcaattc 34623  T
Q  100 aacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaa 199  Q
    ||||||||||||| | |||||||||  || || ||||| |||| |||||   |||||| || |  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||     
T  34622 aacaacaacttagca-aaattcacctattgagaacaattttcacaacttcatatttttacacaattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 34524  T
Q  200 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  34523 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagca 34472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 5 - 232
Target Start/End: Original strand, 272031 - 272257
Alignment:
Q  5 caatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaa 104  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||   |||||| || |||||||||||||| |||||||   ||| |    
T  272031 caattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagctataacaccaattgaacaagaatcataactcaatccaacca 272130  T
Q  105 caacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatca 204  Q
    |||||||| | |||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||| | | ||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||| || |||||    
T  272131 caacttagca-aaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttctccatcaatcatacaattatcatca 272229  T
Q  205 attcatgcatacaaacataacatcacag 232  Q
    |||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  272230 attcattcatacaaacatatcattacag 272257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 95 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 13480 - 13325
Alignment:
Q  95 aaattaacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattataca 194  Q
    |||||||||| ||||||| | |||||||||  || ||||| || |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13480 aaattaacaataacttagca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcataca 13382  T
Q  195 actaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||    
T  13381 attatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacactaagagcacgaatctagca 13325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 41650 - 41896
Alignment:
Q  1 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||  |||||   | ||||||| ||||||| |  || || |  || | |    
T  41650 tcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcatttaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataattca 41749  T
Q  101 acaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac 200  Q
    |||||||| ||| | |||||||||  || | |||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| || |    
T  41750 acaacaacatagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatc 41848  T
Q  201 atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattta 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  41849 atcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaattta 41896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1560 (Bit Score: 77; Significance: 8e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold1560
Description:

Target: scaffold1560; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 113 - 9
Alignment:
Q  1 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||    
T  113 tcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacattcataatatcatttgaacaagaatcaaatatcaaatta 14  T
Q  101 acaac 105  Q
    |||||    
T  13 acaac 9  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Original strand, 48516 - 48620
Alignment:
Q  1 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||| | |||||||||    
T  48516 tcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacatccataacatcaagtgaacaagaatcaaatctcaaatta 48615  T
Q  101 acaac 105  Q
    |||||    
T  48616 acaac 48620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 251
Target Start/End: Original strand, 13511 - 13757
Alignment:
Q  4 tcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaaca 103  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||  | || ||||| |||||   | ||||||| ||||||| |  || || |  || | ||||    
T  13511 tcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaaca 13610  T
Q  104 acaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatc 203  Q
    ||||| ||| | ||||||| |  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||    
T  13611 acaacatagca-aaattcatcaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatc 13709  T
Q  204 aattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  13710 aattcatgcatacaaacataacatcaaagttagagcacgaatttagca 13757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 37326 - 37078
Alignment:
Q  1 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  | || ||| | || |||  | ||||||| ||| |||||||||| | |||||   |    
T  37326 tcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatcca 37227  T
Q  101 acaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac 200  Q
    || ||||| |  |  ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||      
T  37226 actacaacat--gtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattatt 37129  T
Q  201 atcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
T  37128 atcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 37078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 117 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 51328 - 51194
Alignment:
Q  117 aattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatac 216  Q
    ||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||    
T  51328 aattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatac 51229  T
Q  217 aaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    ||| ||| ||||||||   ||||||||||||||||    
T  51228 aaatatatcatcacagttggagcacgaatttagca 51194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 117 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 89600 - 89466
Alignment:
Q  117 aattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatac 216  Q
    ||||||||  || |||||||| |||| ||||||| |||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  89600 aattcaccaattgagcacaattttcacaacttataatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatac 89501  T
Q  217 aaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    ||| ||| ||||||||   ||||||||||||||||    
T  89500 aaatatatcatcacagttggagcacgaatttagca 89466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0361
Description:

Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 170 - 251
Target Start/End: Original strand, 3360 - 3441
Alignment:
Q  170 atgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3360 atgtaatttcaccaacaatcatacaaatatcattaattcatgcatacaaacttaacatcacagctagagcacgaatttagca 3441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Original strand, 3210 - 3264
Alignment:
Q  1 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaa 55  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| || |||||    
T  3210 tcatcaattcatgaatatgcctacccaaacaatgattcatcaatcacaacatcaa 3264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 96
Target Start/End: Original strand, 9384 - 9479
Alignment:
Q  1 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaa 96  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  9384 tcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaa 9479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 116 - 251
Target Start/End: Original strand, 22656 - 22791
Alignment:
Q  116 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 215  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  22656 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 22755  T
Q  216 caaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
T  22756 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 22791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 116 - 251
Target Start/End: Original strand, 26911 - 27046
Alignment:
Q  116 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 215  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  26911 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 27010  T
Q  216 caaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
T  27011 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 27046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 116 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 1729 - 1594
Alignment:
Q  116 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 215  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  1729 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 1630  T
Q  216 caaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
T  1629 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 1594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 56195 - 56114
Alignment:
Q  167 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattta 248  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||||| || |||||| ||||||| || || ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  56195 aacatgtaatttcagccacaatcatacaattatcatcaaatcatgcacacgaaaataacatcacagttagagcacgaattta 56114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 248
Target Start/End: Original strand, 45198 - 45279
Alignment:
Q  167 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattta 248  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||| |  || ||| ||||||| |||| |||||||||||    
T  45198 aacatgtaatttcacccacaatcatacaattatcatcaattcatgcacatcaaaatagcatcacaacaagggcacgaattta 45279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 167 - 248
Target Start/End: Original strand, 54584 - 54665
Alignment:
Q  167 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattta 248  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||| |  || ||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  54584 aacatgcaatttcacccacaatcatacaattatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaaggacacgaattta 54665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 167 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 10427 - 10343
Alignment:
Q  167 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| |  | |||||||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10427 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatatcatcacagcaagagcacgaatttagca 10343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 251
Target Start/End: Original strand, 39814 - 39898
Alignment:
Q  167 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| |  | |||||||||||||| |  || |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  39814 aacatgtaatttcacccacaaaaataccataatcatcaattcatgcacaggaaaatagaatcacagcaagagcacgaatttagca 39898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1666 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1666
Description:

Target: scaffold1666; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 167 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 84 - 1
Alignment:
Q  167 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagc 250  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| |  | |||||||||||||| |  || ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  84 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcctcacagcaagagcacgaatttagc 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 165 - 247
Target Start/End: Original strand, 8174 - 8257
Alignment:
Q  165 tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaatt-catgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 247  Q
    |||||||| || |||||||||||  || ||| || |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||    
T  8174 tgaacatgcaaattcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattt 8257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0892 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0892
Description:

Target: scaffold0892; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 251
Target Start/End: Original strand, 3579 - 3665
Alignment:
Q  165 tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||| |  | |||||||||||| | |  || | |||||||||| |||||||| |||||||||    
T  3579 tgaacatgtaatttcacccacaatcataccataatcatcaattcatggacaagaaaacaacatcacagtaagagcactaatttagca 3665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 251
Target Start/End: Original strand, 54040 - 54126
Alignment:
Q  165 tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||||||||||||||| ||||  |||| |  | |||||||||||||| |  || | | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  54040 tgaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaacagcatcacagtaagagcacgaatttagca 54126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0406 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0406
Description:

Target: scaffold0406; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 163 - 247
Target Start/End: Original strand, 14198 - 14283
Alignment:
Q  163 tatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaatt-catgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 247  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| || ||| || || ||||| |||| |  |||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  14198 tatgaacatgcaatttcaccagcaataattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacataacatcataacaagagcacgaattt 14283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 163 - 247
Target Start/End: Original strand, 108171 - 108256
Alignment:
Q  163 tatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaatt-catgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 247  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  || ||| || || ||||| |||| |  |||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  108171 tatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacataacatcataacaagagcacgaattt 108256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 167 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 1663 - 1579
Alignment:
Q  167 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| |  | |||||||||||||| |  || ||| |||||||||||| |||||| |||||||    
T  1663 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagtgcacgattttagca 1579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 167 - 251
Target Start/End: Original strand, 2560 - 2644
Alignment:
Q  167 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 251  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| |  | |||||||||||||| |  || ||| |||||| ||||||||||||||| ||||    
T  2560 aacatgtaatttcacccacaaacataccataagcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacggcaagagcacgaattgagca 2644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University