View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF21635_high_5 (Length: 607)

Name: NF21635_high_5
Description: NF21635
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF21635_high_5
NF21635_high_5
[»] chr4 (50 HSPs)
chr4 (73-593)||(25617938-25618435)
chr4 (15-459)||(32429034-32429487)
chr4 (15-459)||(34279254-34279695)
chr4 (13-345)||(18670838-18671178)
chr4 (15-316)||(54859062-54859361)
chr4 (40-345)||(3409464-3409781)
chr4 (15-316)||(47071408-47071710)
chr4 (15-316)||(14643630-14643934)
chr4 (15-130)||(18737162-18737277)
chr4 (15-306)||(30019743-30020054)
chr4 (15-299)||(35096028-35096330)
chr4 (14-243)||(34128218-34128442)
chr4 (15-299)||(35090915-35091217)
chr4 (15-130)||(18716489-18716604)
chr4 (274-450)||(54858987-54859163)
chr4 (274-420)||(14643585-14643731)
chr4 (274-420)||(47071609-47071755)
chr4 (255-459)||(3424114-3424318)
chr4 (213-345)||(18716696-18716828)
chr4 (213-345)||(18737369-18737501)
chr4 (274-460)||(35096246-35096432)
chr4 (274-459)||(35091133-35091318)
chr4 (274-420)||(30019695-30019833)
chr4 (15-193)||(3424725-3424904)
chr4 (274-420)||(22118925-22119071)
chr4 (148-316)||(22118849-22119026)
chr4 (274-380)||(3409488-3409594)
chr4 (215-299)||(18671107-18671191)
chr4 (405-459)||(3409329-3409383)
chr4 (274-380)||(18671048-18671154)
chr4 (214-299)||(3424215-3424300)
chr4 (192-316)||(34601929-34602047)
chr4 (215-299)||(18716757-18716841)
chr4 (364-459)||(34128122-34128218)
chr4 (43-99)||(34602065-34602121)
chr4 (397-460)||(34601824-34601887)
chr4 (350-417)||(34601887-34601954)
chr4 (215-299)||(3409451-3409535)
chr4 (215-299)||(18737430-18737514)
chr4 (215-261)||(47071668-47071714)
chr4 (381-420)||(3409388-3409427)
chr4 (381-420)||(18716865-18716904)
chr4 (381-420)||(18737538-18737577)
chr4 (511-549)||(42375114-42375152)
chr4 (511-549)||(53954714-53954752)
chr4 (215-261)||(54859058-54859104)
chr4 (422-459)||(22119093-22119130)
chr4 (423-460)||(30019637-30019674)
chr4 (422-459)||(47071777-47071814)
chr4 (511-548)||(51265442-51265479)
[»] chr1 (53 HSPs)
chr1 (17-460)||(43358755-43359206)
chr1 (15-420)||(10186362-10186783)
chr1 (26-349)||(21431533-21431865)
chr1 (13-320)||(1187826-1188134)
chr1 (17-316)||(19310826-19311132)
chr1 (15-247)||(44523985-44524226)
chr1 (15-324)||(16051206-16051512)
chr1 (15-299)||(28574297-28574599)
chr1 (15-299)||(28598309-28598611)
chr1 (15-130)||(35626172-35626287)
chr1 (258-420)||(10185891-10186053)
chr1 (274-459)||(16051403-16051588)
chr1 (15-122)||(17414633-17414740)
chr1 (274-420)||(19311031-19311177)
chr1 (15-124)||(3465473-3465582)
chr1 (15-124)||(3468067-3468176)
chr1 (15-123)||(13654335-13654445)
chr1 (274-420)||(13654527-13654673)
chr1 (274-420)||(1188029-1188175)
chr1 (274-459)||(28574515-28574700)
chr1 (151-299)||(3468215-3468370)
chr1 (274-459)||(28598527-28598712)
chr1 (274-469)||(3468286-3468481)
chr1 (163-316)||(13654468-13654628)
chr1 (274-380)||(21431561-21431667)
chr1 (213-403)||(35626336-35626525)
chr1 (276-420)||(35653093-35653237)
chr1 (333-422)||(44523928-44524017)
chr1 (192-282)||(35653172-35653262)
chr1 (215-312)||(10185907-10186004)
chr1 (250-320)||(1188219-1188289)
chr1 (215-299)||(3701367-3701451)
chr1 (13-57)||(29681588-29681632)
chr1 (13-57)||(48366213-48366257)
chr1 (403-458)||(17414304-17414359)
chr1 (403-457)||(35653036-35653090)
chr1 (156-193)||(17414583-17414620)
chr1 (403-459)||(1188333-1188389)
chr1 (382-417)||(17414365-17414400)
chr1 (274-356)||(3701369-3701451)
chr1 (511-549)||(9157306-9157344)
chr1 (274-316)||(44523975-44524017)
chr1 (511-549)||(48993913-48993951)
chr1 (307-420)||(1188217-1188330)
chr1 (511-548)||(17127561-17127598)
chr1 (511-548)||(29179701-29179738)
chr1 (511-548)||(46931994-46932031)
chr1 (511-548)||(48498412-48498449)
chr1 (511-548)||(48994021-48994058)
chr1 (512-549)||(49444909-49444946)
chr1 (405-461)||(3696109-3696165)
chr1 (239-299)||(3696233-3696293)
chr1 (520-548)||(4609100-4609128)
[»] chr3 (60 HSPs)
chr3 (13-460)||(49784494-49784950)
chr3 (15-420)||(29827429-29827826)
chr3 (15-299)||(5481390-5481692)
chr3 (15-299)||(6857957-6858259)
chr3 (15-299)||(10672840-10673142)
chr3 (15-299)||(8458311-8458614)
chr3 (15-299)||(5457913-5458216)
chr3 (15-299)||(6852854-6853156)
chr3 (15-299)||(8464750-8465052)
chr3 (15-299)||(10591197-10591499)
chr3 (15-299)||(10584760-10585062)
chr3 (15-299)||(31076304-31076606)
chr3 (15-299)||(33702501-33702804)
chr3 (15-299)||(10677953-10678257)
chr3 (15-299)||(31081409-31081711)
chr3 (15-124)||(4049807-4049916)
chr3 (15-121)||(1302343-1302449)
chr3 (15-121)||(33703299-33703405)
chr3 (13-122)||(3187551-3187660)
chr3 (15-123)||(4054941-4055049)
chr3 (15-118)||(20891059-20891162)
chr3 (13-121)||(18024246-18024354)
chr3 (274-459)||(5481289-5481474)
chr3 (274-459)||(4050026-4050211)
chr3 (274-459)||(4055160-4055345)
chr3 (274-459)||(8458530-8458715)
chr3 (274-459)||(10672739-10672924)
chr3 (274-459)||(10677852-10678037)
chr3 (274-460)||(6852752-6852938)
chr3 (274-460)||(8464968-8465154)
chr3 (274-460)||(10584658-10584844)
chr3 (151-299)||(4049955-4050110)
chr3 (274-459)||(6857856-6858041)
chr3 (274-459)||(31081308-31081493)
chr3 (381-457)||(20891474-20891550)
chr3 (274-460)||(1302044-1302230)
chr3 (274-460)||(33702399-33702585)
chr3 (151-299)||(1302146-1302301)
chr3 (151-299)||(4055089-4055244)
chr3 (274-455)||(10591100-10591281)
chr3 (274-459)||(31076201-31076388)
chr3 (274-345)||(5457926-5457997)
chr3 (215-322)||(20891281-20891402)
chr3 (381-459)||(269502-269580)
chr3 (274-316)||(18024091-18024133)
chr3 (151-193)||(33703447-33703489)
chr3 (381-460)||(5457816-5457890)
chr3 (408-459)||(18023914-18023965)
chr3 (215-274)||(20891354-20891413)
chr3 (159-193)||(20891182-20891216)
chr3 (405-457)||(18023324-18023376)
chr3 (274-333)||(20891281-20891340)
chr3 (511-549)||(1801442-1801480)
chr3 (511-549)||(39430009-39430047)
chr3 (215-272)||(18023468-18023525)
chr3 (160-193)||(18024195-18024228)
chr3 (520-549)||(33689172-33689201)
chr3 (511-548)||(41752961-41752998)
chr3 (520-549)||(47677359-47677388)
chr3 (423-459)||(29827849-29827885)
[»] chr5 (35 HSPs)
chr5 (15-420)||(35368682-35369095)
chr5 (15-345)||(2022964-2023301)
chr5 (274-459)||(13556105-13556290)
chr5 (15-299)||(39908958-39909260)
chr5 (15-299)||(9877441-9877743)
chr5 (15-299)||(9872326-9872628)
chr5 (15-124)||(13556400-13556509)
chr5 (15-299)||(39903845-39904147)
chr5 (50-316)||(43540668-43540928)
chr5 (151-316)||(13556189-13556361)
chr5 (274-420)||(43540623-43540768)
chr5 (274-459)||(9872225-9872410)
chr5 (274-459)||(9877340-9877525)
chr5 (15-121)||(4555653-4555759)
chr5 (274-459)||(39909176-39909361)
chr5 (274-459)||(39904063-39904248)
chr5 (381-454)||(24091794-24091867)
chr5 (215-299)||(2023230-2023314)
chr5 (172-345)||(43379556-43379731)
chr5 (274-380)||(2023171-2023277)
chr5 (15-69)||(43378437-43378491)
chr5 (37-89)||(25184114-25184166)
chr5 (408-459)||(4555967-4556018)
chr5 (274-356)||(43379601-43379683)
chr5 (412-459)||(2024420-2024467)
chr5 (156-193)||(4555772-4555809)
chr5 (511-549)||(2356375-2356413)
chr5 (511-549)||(2953294-2953332)
chr5 (511-549)||(16971248-16971286)
chr5 (511-549)||(32485653-32485691)
chr5 (511-548)||(291094-291131)
chr5 (520-549)||(3180065-3180094)
chr5 (511-548)||(19655155-19655192)
chr5 (520-549)||(26662404-26662433)
chr5 (520-549)||(26933999-26934028)
[»] chr2 (24 HSPs)
chr2 (15-460)||(716267-716716)
chr2 (15-305)||(42780184-42780481)
chr2 (15-294)||(30283357-30283645)
chr2 (15-299)||(14917284-14917586)
chr2 (15-299)||(45120386-45120689)
chr2 (15-190)||(16284437-16284614)
chr2 (15-299)||(17720428-17720730)
chr2 (144-354)||(20892197-20892413)
chr2 (274-459)||(45120605-45120790)
chr2 (274-459)||(14917183-14917368)
chr2 (274-417)||(42780391-42780534)
chr2 (274-460)||(30283250-30283436)
chr2 (381-459)||(39178924-39179002)
chr2 (274-459)||(17720327-17720512)
chr2 (381-459)||(17720000-17720078)
chr2 (372-420)||(20892157-20892205)
chr2 (511-549)||(14470588-14470626)
chr2 (304-345)||(39178847-39178888)
chr2 (422-459)||(42780559-42780596)
chr2 (467-511)||(29891880-29891924)
chr2 (515-550)||(24116028-24116063)
chr2 (511-549)||(45213904-45213942)
chr2 (511-548)||(16514421-16514458)
chr2 (511-547)||(6217222-6217258)
[»] chr6 (23 HSPs)
chr6 (13-420)||(21936467-21936886)
chr6 (13-459)||(21937568-21938028)
chr6 (15-459)||(20751881-20752322)
chr6 (15-299)||(21275773-21276075)
chr6 (15-356)||(24509703-24510061)
chr6 (154-353)||(24508708-24508914)
chr6 (15-121)||(2887490-2887596)
chr6 (15-121)||(2889212-2889318)
chr6 (274-458)||(11182989-11183173)
chr6 (15-121)||(24508926-24509032)
chr6 (274-459)||(21275991-21276176)
chr6 (15-122)||(11183263-11183370)
chr6 (274-356)||(24508764-24508846)
chr6 (335-420)||(12909533-12909618)
chr6 (335-420)||(12934640-12934725)
chr6 (213-320)||(11183068-11183175)
chr6 (215-320)||(24508682-24508787)
chr6 (274-376)||(24509918-24510022)
chr6 (403-457)||(12909621-12909675)
chr6 (403-457)||(12934728-12934782)
chr6 (422-459)||(21936408-21936445)
chr6 (511-542)||(24587464-24587495)
chr6 (511-549)||(24618597-24618635)
[»] chr8 (34 HSPs)
chr8 (13-302)||(10340866-10341163)
chr8 (15-316)||(18608535-18608832)
chr8 (17-316)||(43956735-43957051)
chr8 (15-299)||(34108229-34108533)
chr8 (15-299)||(14314813-14315115)
chr8 (15-299)||(14318517-14318819)
chr8 (15-299)||(26986891-26987193)
chr8 (274-461)||(43956649-43956836)
chr8 (15-124)||(26981971-26982080)
chr8 (15-123)||(18494272-18494380)
chr8 (15-356)||(25953019-25953363)
chr8 (274-420)||(18608491-18608636)
chr8 (274-459)||(34108449-34108634)
chr8 (274-459)||(14318416-14318601)
chr8 (274-459)||(18493978-18494163)
chr8 (274-459)||(26986790-26986975)
chr8 (274-459)||(26981676-26981861)
chr8 (16-87)||(18885065-18885136)
chr8 (45-300)||(1781869-1782118)
chr8 (151-299)||(18494079-18494233)
chr8 (274-459)||(14314712-14314897)
chr8 (151-299)||(26981777-26981932)
chr8 (274-420)||(1782036-1782179)
chr8 (274-345)||(10340882-10340953)
chr8 (512-549)||(34229637-34229674)
chr8 (412-461)||(10340696-10340745)
chr8 (419-456)||(18608435-18608472)
chr8 (215-304)||(25953012-25953101)
chr8 (511-549)||(5033265-5033303)
chr8 (511-549)||(33841587-33841625)
chr8 (511-548)||(5033158-5033195)
chr8 (511-548)||(10086754-10086791)
chr8 (511-548)||(33841695-33841732)
chr8 (511-548)||(35441073-35441110)
[»] scaffold0223 (2 HSPs)
scaffold0223 (15-299)||(1921-2223)
scaffold0223 (274-459)||(1820-2005)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (15-316)||(173358-173662)
scaffold0005 (274-420)||(173561-173707)
[»] chr7 (37 HSPs)
chr7 (15-284)||(5440217-5440492)
chr7 (15-284)||(5449227-5449502)
chr7 (15-299)||(12856789-12857091)
chr7 (15-247)||(4181357-4181585)
chr7 (15-124)||(14610364-14610473)
chr7 (15-299)||(26051021-26051323)
chr7 (15-299)||(26056134-26056436)
chr7 (15-299)||(26060380-26060682)
chr7 (15-299)||(26065493-26065795)
chr7 (15-121)||(12851674-12851780)
chr7 (274-459)||(12851894-12852079)
chr7 (274-459)||(12857007-12857192)
chr7 (274-459)||(26051239-26051424)
chr7 (274-459)||(26056352-26056537)
chr7 (274-459)||(26060598-26060783)
chr7 (274-459)||(26065711-26065896)
chr7 (13-122)||(37459938-37460047)
chr7 (15-110)||(11056625-11056720)
chr7 (15-300)||(35352221-35352495)
chr7 (151-299)||(12851823-12851978)
chr7 (192-299)||(14610524-14610631)
chr7 (274-345)||(14610547-14610618)
chr7 (274-343)||(5440217-5440286)
chr7 (274-343)||(5449227-5449296)
chr7 (403-459)||(2248853-2248909)
chr7 (13-57)||(5436692-5436736)
chr7 (367-411)||(37459771-37459815)
chr7 (290-461)||(35352119-35352290)
chr7 (154-262)||(37459802-37459917)
chr7 (405-459)||(4181276-4181330)
chr7 (274-316)||(4181347-4181389)
chr7 (511-549)||(11016973-11017011)
chr7 (511-548)||(11016866-11016903)
chr7 (511-548)||(34854799-34854836)
chr7 (511-548)||(41018332-41018369)
chr7 (511-548)||(45231954-45231991)
chr7 (377-417)||(14610650-14610690)
[»] scaffold0006 (3 HSPs)
scaffold0006 (15-123)||(144096-144206)
scaffold0006 (274-420)||(144288-144434)
scaffold0006 (163-316)||(144229-144389)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (515-548)||(27217-27250)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 357; Significance: 0; HSPs: 50)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 73 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 25618435 - 25617938
Alignment:
Q  73 tttagaataagagaatgagggagaattattttgttaatgcaacaaaattctggtttctgtttttgttgtagtctttcaaactaatgcccaaatgccaagc 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25618435 tttagaataagagaatgagggagaattattttgttaatgcaacaaaattttggtttatgtttttgttgtagtctttcaaactaatgcccaaatgccaagc 25618336  T
Q  173 atttatagtgcattatatgacatgagagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatata 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  25618335 atttatagtgcattatatgacatgagagaaaacacctctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcatccagttgcgaaaggttatgatcatata 25618236  T
Q  273 cacttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtc 372  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  25618235 cacttgaatcaatgttatggttcattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaagttcattaagaacccttttgtc 25618136  T
Q  373 aaaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattccaatattttggaaatcaccaacattatgttgaaacc 472  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                   
T  25618135 aaaggttacaatgtatatgaaaga-tctcatgaacagttacaactcttagttctaaagtgattccaatattttggaaatcaccaa--------------- 25618052  T
Q  473 agcatagtcatggttgccctcacgacagttgatacactaatgtcactaatgtcacccaactctatgtcacacaagtgggtagctacccactgtaggggca 572  Q
      |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||     | || ||| ||||||||||    
T  25618051 --catagtcatggttgccctcacgatcgttgatacactaatgtcatcaatgtcacccaactctatgtcacacaagt-----gttatccattgtaggggca 25617959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 15 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 32429487 - 32429034
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgagggagaattattttgttaatgcaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  32429487 tattttacagatttatggttccaacaattcactcatgcattaaagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgttgttaatccaa 32429388  T
Q  115 caaaattctggtttctgtttt-tgttgtagtctttcaaactaatgcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatgac-------atgagagaaaaca 206  Q
    ||||||||||       || | |||||| || | || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||    
T  32429387 caaaattctgtccaaaattgtgtgttgttgtgtgtccaactaatgcacaaatgccaagcatttatagtgcattatatgactcttcaaatgagagaaaaca 32429288  T
Q  207 ttcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggtttattaagcaccc 306  Q
      ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  32429287 cccctttgacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccctttgtcaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatgattcattaagcaccc 32429188  T
Q  307 ttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca-aaggttacaatgtatatgaatgattctcatga 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||| |   | |  |   | | || ||| ||||||||||||||||||  |||||    
T  32429187 ttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcattgtcatggttcattatctatcaataaataataatgttccaatgtatatgaatgatttccatga 32429088  T
Q  406 agagttacaactcttagttctaaagtgattccaatattttggaaatcaccaaca 459  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32429087 agagttacaactcttggttctaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 32429034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 15 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 34279695 - 34279254
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgagggagaattattttgttaatgcaa 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||    
T  34279695 tattttacagatttatggtttcaggaattcactcatgcattagagaattgatggttgatttagagtaagagaacgaggaagaattatgttgttaatgtaa 34279596  T
Q  115 caaaattctggtttctgtttttgttgtagtctttcaaactaatgcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatgac-------atgagagaaaacat 207  Q
    ||||||||  ||| |||| | |||          |||| |||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||     
T  34279595 caaaattcatgtt-ctgtgtgtgt----------caaattaatgctcaaatgtcgagcatttatagtgcattatatgacccttcacatgagagaaaacac 34279507  T
Q  208 tcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggtttattaagcaccct 307  Q
    || | |||||||||||||||||||| || ||| | |||||  || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |     
T  34279506 tcatttgacttgaatcaatgttatggttaattgaacacccttttaccaaaggttatgatcatatacacttaaatcaatgttaaggtttattaagcactca 34279407  T
Q  308 tttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtc-aaaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaa 406  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| |||||| |||| ||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  34279406 tttgccaaaggttataatcatatacacttgaatcaatgctaaggttcattaagcacccatttgtcaaaagattctaatgtatatgaatgattcccatgaa 34279307  T
Q  407 gagttacaactcttagttctaaagtgattccaatattttggaaatcaccaaca 459  Q
    || ||  |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34279306 gaattgaaacttttggttctaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 34279254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 13 - 345
Target Start/End: Original strand, 18670838 - 18671178
Alignment:
Q  13 aatattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgagggagaattattttgttaatgc 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18670838 aatattttacagatttatggttccaacaagtcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgttgttaatgc 18670937  T
Q  113 aacaaaattctggtttctgtttttgttgtagtct-ttcaaactaatgcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatg-------acatgagagaaaa 204  Q
    |||| ||||||||||||| || |  |||| || | | |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||       ||||||||||||     
T  18670938 aacataattctggtttctattgtctttgttgtgtgtccaaattaattcccaaatgccaagcatttatagtccattatatgacccttcacatgagagaaag 18671037  T
Q  205 cattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggtttattaagcac 304  Q
    ||  | | ||||||||||||||| |||| |||||||||| | |  || | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18671038 cacccatttgacttgaatcaatgctatggttcattaagccctcttttaccaaaggttatcttcatatacacttgaatcaatgttatggttcattaagcac 18671137  T
Q  305 ccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatg 345  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18671138 cattttgccaaaggttataaccatatacacttaaatcaatg 18671178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 15 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 54859361 - 54859062
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgagggagaattattttgttaatgcaa 114  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| || |||||||||  |    
T  54859361 tattttacggatttatggttccagcaattcactcgtgcattagagaattgatggatgatttagagcaagagaatgagggagaatcatgttgttaatgtga 54859262  T
Q  115 caaaattctggtttctgtttttgttgtagtctttcaaactaatgcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatgac-------atgagagaaaacat 207  Q
    ||||||||      |  |||| ||||| |||   |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||     
T  54859261 caaaattc------catttttggttgt-gtc---caaattaatgcccaaatatcaagcatttatagtgcattatatgacccttcacatgagagaaaacac 54859172  T
Q  208 tcc-tgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggtttattaagcaccc 306  Q
     || | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  54859171 cccctttgacttgaatcaatgttatggttcattaagcatccatttgccaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatgtttcattaagcaccc 54859072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 40 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 3409781 - 3409464
Alignment:
Q  40 aattcactcatgcattagagaattgat----ggatgatttagaataagagaatgagggagaa-ttattttgttaatgcaacaaaattctggtttctgttt 134  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||| |||||||||||||||||  |||| ||||||| | | ||||||| | |||  ||||     
T  3409781 aattcactcatgcattagagaattaatatatggatgatttagagtaagagaatgagggagatcttatgttgttaaagtatcaaaatttttgttcatgttg 3409682  T
Q  135 ttgttgtagtctttc-aaactaatgcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatgac-------atgagagaaaacattcctgtgacttgaatcaat 226  Q
    ||||| | || | || ||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||       ||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  3409681 ttgttct-gtgtgtctaaattaatgcccaaatgtcaaatatttatagtgcattatatgacccttcacatgagagaaaacactcctttgacttgaatcaat 3409583  T
Q  227 gttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataacc 326  Q
    | |||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  3409582 gctatgattcattaagcacccctttgccaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttcattaagtacccttttgccaaaggttataact 3409483  T
Q  327 atatacacttgaatcaatg 345  Q
    ||| ||| |||||||||||    
T  3409482 atacacatttgaatcaatg 3409464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 15 - 316
Target Start/End: Original strand, 47071408 - 47071710
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgagggagaattattttgttaatgcaa 114  Q
    ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  47071408 tattttacaaatttatggttcaaacaattcactcattcattagagaattgatagataatttagagtaagagaatgagggagaattatgttgttaatgtaa 47071507  T
Q  115 caaaattctggtttctgtttttgttgtagtctttcaaactaatgcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatgac-------------atgagaga 201  Q
    |||||||      |||||| |||||||       |||| |||||||||||||  || |||||||||| |||||||||||             ||||||||    
T  47071508 caaaatt------tctgttcttgttgtc------caaattaatgcccaaatgttaaacatttatagtacattatatgacccttcacatgaacatgagaga 47071595  T
Q  202 aaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggtttattaag 301  Q
    ||||| |  | |||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  47071596 aaacacttttttgacttgaatcaatgcaatggttcattaagcatccatttgccaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttcattaag 47071695  T
Q  302 cacccttttgccaaa 316  Q
    ||||| |||||||||    
T  47071696 cacccatttgccaaa 47071710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 14643934 - 14643630
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgagggagaattattttgttaatgcaa 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| ||||| ||| ||    
T  14643934 tattttagagatttatggttccagcaattcacctatacattagagaattgatggatgatttagagtaagagaattaggaagaattatgttgttgatgtaa 14643835  T
Q  115 caaaattctggtttctgtttttgttgtagtctttcaaactaatgcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatg-------acatgagagaaaacat 207  Q
    |||||||||  ||||||| ||  ||||  | | | ||| |||||| |||||  ||| ||||||||| ||||||||||       |||||| ||||||||     
T  14643834 caaaattcttttttctgtatt--ttgt--tatgttaaattaatgcacaaatatcaaacatttatagcgcattatatgacccttcacatgatagaaaacac 14643739  T
Q  208 tcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggtttattaagcaccct 307  Q
     | | ||||||||||||||| || | |||||||| ||| |  |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  14643738 ccatttgacttgaatcaatgctaaggttcattaaacactcctttgtcaaatgttatgatcatatacacttgaatcaatgttaaggttcattaagcaccct 14643639  T
Q  308 tttgccaaa 316  Q
    |||||||||    
T  14643638 tttgccaaa 14643630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 130
Target Start/End: Original strand, 18737162 - 18737277
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgagggagaattattttgttaatgcaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18737162 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgaattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgttgttaatgcaa 18737261  T
Q  115 caaaattctggtttct 130  Q
    |||||||||| |||||    
T  18737262 caaaattctgttttct 18737277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 30020054 - 30019743
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgagggagaattattttgttaatgcaa 114  Q
    ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||| ||||||||| ||    
T  30020054 tatttcacatatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 30019955  T
Q  115 caaaattctg-------gtttctgtttttgt-------tgtagtctttcaaactaatgcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatg-------ac 193  Q
    ||||||||||        | | |||| ||||       |||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||       ||    
T  30019954 caaaattctgtccaaaattgtgtgttgttgtgttgttctgttctctgtcaaactaatgcccaaatgccaaacatttatagtgcattatatgacccttcac 30019855  T
Q  194 atgagagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggt 293  Q
    |||||||||| ||  | | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||   |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||    
T  30019854 atgagagaaagcacccatttgacttgaatc-atgttatggttcattaagcacctttttgccaaaggttatgatcatacacacttgaatcaatgcaaaggt 30019756  T
Q  294 ttattaagcaccc 306  Q
    | |||||||||||    
T  30019755 tcattaagcaccc 30019743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 299
Target Start/End: Original strand, 35096028 - 35096330
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgagggagaattattttgttaatgcaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||| ||||||||| ||    
T  35096028 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 35096127  T
Q  115 caaaattctg----gtttctgt-------ttttgttgtagtctttcaaactaatgcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatg-------acatg 196  Q
    ||||||||||      || |||       | | ||| | || | |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||       |||||    
T  35096128 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 35096227  T
Q  197 agagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttta 296  Q
    ||||||| ||   || | |||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||| |    
T  35096228 agagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 35096327  T
Q  297 tta 299  Q
    |||    
T  35096328 tta 35096330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 34128442 - 34128218
Alignment:
Q  14 atattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgagggagaattattttgttaatgca 113  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  34128442 atattttacagatttatggtttcaacaattcactcatgcattagaaaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgatgttaatgca 34128343  T
Q  114 acaaaattctggtttctgtttttgttgtagtctttcaaactaatgcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatg-------acatgagagaaaaca 206  Q
    |||||||||| ||||||          |||  | ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||    
T  34128342 acaaaattcttgtttct----------tag--tgtcaaattaatggccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgacccttcacattagagaaaaca 34128255  T
Q  207 ttcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagc 243  Q
     || | |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  34128254 ctcatttgacttgaatcaatgttatagttcattaagc 34128218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 15 - 299
Target Start/End: Original strand, 35090915 - 35091217
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgagggagaattattttgttaatgcaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |  ||||||| ||||||||| ||    
T  35090915 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaattttgatgaattatgttgttaatgtaa 35091014  T
Q  115 caaaattctg----gtttctgt-------ttttgttgtagtctttcaaactaatgcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatg-------acatg 196  Q
    ||||||||||      || |||       | | ||| | |||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||       |||||    
T  35091015 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtatggtttttgtctcttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 35091114  T
Q  197 agagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttta 296  Q
    ||||||| ||   || | |||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||| |    
T  35091115 agagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 35091214  T
Q  297 tta 299  Q
    |||    
T  35091215 tta 35091217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 130
Target Start/End: Original strand, 18716489 - 18716604
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgagggagaattattttgttaatgcaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  18716489 tattttacagatttatggttccagcaattcactcttgtattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgggggagaattatgttgttaatgcaa 18716588  T
Q  115 caaaattctggtttct 130  Q
    |||||||||| |||||    
T  18716589 caaaattctgttttct 18716604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 274 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 54859163 - 54858987
Alignment:
Q  274 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 373  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||  | | ||||| ||| ||||||||| ||    
T  54859163 acttgaatcaatgttatggttcattaagcatccatttgccaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatgtttcattaagcacccttttgcca 54859064  T
Q  374 aaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattccaatattttggaaa 450  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| | || ||| ||||||||||| | |||||||||||    
T  54859063 aaggttccaatgtatatgaatgattccaatgaagagttacaatttttggttgtaaagtgattctattattttggaaa 54858987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 274 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 14643731 - 14643585
Alignment:
Q  274 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 373  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||| ||| | |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||| ||    
T  14643731 acttgaatcaatgctaaggttcattaaacactcctttgtcaaatgttatgatcatatacacttgaatcaatgttaaggttcattaagcacccttttgcca 14643632  T
Q  374 aaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactctt 420  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  14643631 aaggttccaatgtatatgaatgattcccatgaatagttacaactctt 14643585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 274 - 420
Target Start/End: Original strand, 47071609 - 47071755
Alignment:
Q  274 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 373  Q
    |||||||||||||  |||||| |||||||| || ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||  | ||||||| ||| |||| |||| ||    
T  47071609 acttgaatcaatgcaatggttcattaagcatccatttgccaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttcattaagcacccatttgcca 47071708  T
Q  374 aaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactctt 420  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  47071709 aaggttccaatgtatatgaatgattttcatgaagagttacaactctt 47071755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 255 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 3424318 - 3424114
Alignment:
Q  255 aaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttc 354  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||  | |||||    
T  3424318 aaaggttatgatcatatcgacttaaatcaatgttatggttcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatacacatttgaatcaatgtcatggttc 3424219  T
Q  355 atgaagaacccttttgtca-aaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattccaatattttggaaatca 453  Q
    || |   | |  |   | | || ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3424218 attatctatcaataaataataatgttccaatgtatatg-atggttctcatgaagagttacaacttttggttctaaagtgattccattattttggaaatca 3424120  T
Q  454 ccaaca 459  Q
    | ||||    
T  3424119 caaaca 3424114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 213 - 345
Target Start/End: Original strand, 18716696 - 18716828
Alignment:
Q  213 tgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgc 312  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||| | |  || | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||    
T  18716696 tgacttgaatcaatgatatggttcattaagctctcttttaccaaaagttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttcattaagcactatttggc 18716795  T
Q  313 caaatgttataaccatatacacttgaatcaatg 345  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18716796 caaaggttataaccatatacacttgaatcaatg 18716828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 213 - 345
Target Start/End: Original strand, 18737369 - 18737501
Alignment:
Q  213 tgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgc 312  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||| | |  || | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||    
T  18737369 tgacttgaatcaatgatatggttcattaagctctcttttaccaaaagttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttcattaagcacaatttagc 18737468  T
Q  313 caaatgttataaccatatacacttgaatcaatg 345  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  18737469 caaaggttataacaatatacacttgaatcaatg 18737501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 274 - 460
Target Start/End: Original strand, 35096246 - 35096432
Alignment:
Q  274 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 373  Q
    |||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||| |  ||   |           
T  35096246 acttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcattattaataataaataat 35096345  T
Q  374 aaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattccaatattttggaaatcaccaacat 460  Q
    || ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35096346 aatgttccaatgtatatgaatggttcccatgaagagttacaactttttgttctaaagtgattccattattttggaaatcaccaacat 35096432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 274 - 459
Target Start/End: Original strand, 35091133 - 35091318
Alignment:
Q  274 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 373  Q
    |||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||| |  ||   |           
T  35091133 acttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcattattaataataaataat 35091232  T
Q  374 aaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattccaatattttggaaatcaccaaca 459  Q
    || ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35091233 aatgttccaatgtatatgaatggttcccatgaagagttacaacttttggttctaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 35091318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 274 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 30019833 - 30019695
Alignment:
Q  274 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 373  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||       ||    
T  30019833 acttgaatca-tgttatggttcattaagcacctttttgccaaaggttatgatcatacacacttgaatcaatgcaaaggttcattaagcacc-------ca 30019742  T
Q  374 aaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactctt 420  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  30019741 aaggttccaatgtatatgaaagattcccatgaagagttacaactctt 30019695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 3424904 - 3424725
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgagggaga-attattttgttaatgca 113  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  |||| ||||||| | |    
T  3424904 tattttacagatttatgtttccagtaactcactcatgcattagagaattaatggatgatttagagtaagagaatgagggagatcttatgttgttaaagta 3424805  T
Q  114 acaaaattctggtttctgtttttgttgtagtctttc-aaactaatgcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatgac 193  Q
    |||||| | | |||  |||| ||||| | || | || ||| ||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||    
T  3424804 acaaaaattttgttcatgttgttgttct-gtttgtctaaattaatgcccaaatatcaaatatttatagtgcattatatgac 3424725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 274 - 420
Target Start/End: Original strand, 22118925 - 22119071
Alignment:
Q  274 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 373  Q
    |||||||| |||  ||||||| ||||||||||| |||||| || |||   | ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| |||| ||    
T  22118925 acttgaatgaataatatggttcattaagcacccctttgccgaaggttgcgatcatatacacttgaatcaatgctaaggttcattaagcacccatttgcca 22119024  T
Q  374 aaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactctt 420  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  22119025 aaggttccaatgtaaatgaatgattttcaggaagagttgcaactctt 22119071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 148 - 316
Target Start/End: Original strand, 22118849 - 22119026
Alignment:
Q  148 tcaaactaatgcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatgac-------atgagagaaaa--cattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcat 238  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||       |||||||||||  ||  ||| |||||||||| |||  |||| |||||    
T  22118849 tcaaattaatgcccaaatgtcaagcatttatagtatattatatgacccttcacatgagagaaaatacacccctttgacttgaatgaataatatggttcat 22118948  T
Q  239 taagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaa 316  Q
    |||||||||  ||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||||    
T  22118949 taagcacccctttgccgaaggttgcgatcatatacacttgaatcaatgctaaggttcattaagcacccatttgccaaa 22119026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 274 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 3409594 - 3409488
Alignment:
Q  274 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 373  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||  | ||||||| ||| ||||||||| ||    
T  3409594 acttgaatcaatgctatgattcattaagcacccctttgccaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttcattaagtacccttttgcca 3409495  T
Q  374 aaggtta 380  Q
    |||||||    
T  3409494 aaggtta 3409488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 215 - 299
Target Start/End: Original strand, 18671107 - 18671191
Alignment:
Q  215 acttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggtttatta 299  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||   |||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||    
T  18671107 acttgaatcaatgttatggttcattaagcaccattttgccaaaggttataaccatatacacttaaatcaatgtcatggttcatta 18671191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 405 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 3409383 - 3409329
Alignment:
Q  405 aagagttacaactcttagttctaaagtgattccaatattttggaaatcaccaaca 459  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3409383 aagagtaacaacttttagttctaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 3409329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 274 - 380
Target Start/End: Original strand, 18671048 - 18671154
Alignment:
Q  274 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 373  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||| | ||||| ||||| |||||   ||||||||||||||||||||  | ||||||| ||| ||| ||||| ||    
T  18671048 acttgaatcaatgctatggttcattaagccctcttttaccaaaggttatcttcatatacacttgaatcaatgttatggttcattaagcaccattttgcca 18671147  T
Q  374 aaggtta 380  Q
    |||||||    
T  18671148 aaggtta 18671154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 3424300 - 3424215
Alignment:
Q  214 gacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggtttatta 299  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||| | |||| ||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  3424300 gacttaaatcaatgttatggttcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatacacatttgaatcaatgtcatggttcatta 3424215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 34602047 - 34601929
Alignment:
Q  192 acatgagagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatg 291  Q
    |||||||| |||||| || | ||||||||||||||| |||  |||||||| || ||| |||  ||||||||||||||||||       ||||||||||||    
T  34602047 acatgagaaaaaacactcatttgacttgaatcaatgctatagttcattaaacatccatttgtcaaaggttatgatcatata------tatcaatgttatg 34601954  T
Q  292 gtttattaagcacccttttgccaaa 316  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||    
T  34601953 gttcattaagcacccctttgccaaa 34601929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 215 - 299
Target Start/End: Original strand, 18716757 - 18716841
Alignment:
Q  215 acttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggtttatta 299  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||    | || ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  18716757 acttgaatcaatgttatggttcattaagcactatttggccaaaggttataaccatatacacttgaatcaatgtcatggttcatta 18716841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 364 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 34128218 - 34128122
Alignment:
Q  364 ccttttgtcaaaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattcca-atattttggaaatcaccaaca 459  Q
    ||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||   |||||||||||| || |||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  34128218 ccttttgccaaaggttccaatatatatgaaagattctcacagagagttacaacttttggttctaaaatgattccataatttttggaaatcaccaaca 34128122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 43 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 34602121 - 34602065
Alignment:
Q  43 tcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgagggagaatt 99  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  34602121 tcactcatgcataagaaaattgatggatgatttagagtaaaagaatgagggagaatt 34602065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 34601887 - 34601824
Alignment:
Q  397 ttctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattccaatattttggaaatcaccaacat 460  Q
    ||||| |||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  34601887 ttctcgtgaaaagttacaacttttagttctaaaatgattccattattttagaaatcaccaacat 34601824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 350 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 34601954 - 34601887
Alignment:
Q  350 ggttcatgaagaacccttttgtcaaaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaact 417  Q
    ||||||| ||| |||| |||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34601954 ggttcattaagcacccctttgccaaagattcaaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaact 34601887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 215 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 3409535 - 3409451
Alignment:
Q  215 acttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggtttatta 299  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||| ||||||||| |  ||| ||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  3409535 acttgaatcaatgttatggttcattaagtacccttttgccaaaggttataactatacacatttgaatcaatgtcatggttcatta 3409451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 215 - 299
Target Start/End: Original strand, 18737430 - 18737514
Alignment:
Q  215 acttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggtttatta 299  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||    | || ||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  18737430 acttgaatcaatgttatggttcattaagcacaatttagccaaaggttataacaatatacacttgaatcaatgtcatggttcatta 18737514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 215 - 261
Target Start/End: Original strand, 47071668 - 47071714
Alignment:
Q  215 acttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggtt 261  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||    
T  47071668 acttgaatcaatgttatggttcattaagcacccatttgccaaaggtt 47071714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 381 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 3409427 - 3409388
Alignment:
Q  381 caatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactctt 420  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  3409427 caatgtatatgaatggttctcatgaagagttacaaatctt 3409388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 381 - 420
Target Start/End: Original strand, 18716865 - 18716904
Alignment:
Q  381 caatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactctt 420  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  18716865 caatgtatatgaatggttcccatgaagagttacaactctt 18716904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 381 - 420
Target Start/End: Original strand, 18737538 - 18737577
Alignment:
Q  381 caatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactctt 420  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  18737538 caatgtatatgaatggttcccatgaagagttacaactctt 18737577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 511 - 549
Target Start/End: Original strand, 42375114 - 42375152
Alignment:
Q  511 aatgtcactaatgtcacccaactctatgtcacacaagtg 549  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42375114 aatgtcaccaatgtcacccaactctatgtcacccaagtg 42375152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 511 - 549
Target Start/End: Original strand, 53954714 - 53954752
Alignment:
Q  511 aatgtcactaatgtcacccaactctatgtcacacaagtg 549  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  53954714 aatgtcaccaatgtcacccaactctatgtcacaaaagtg 53954752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 215 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 54859104 - 54859058
Alignment:
Q  215 acttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggtt 261  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||    
T  54859104 acttgaatcaatgttatgtttcattaagcacccttttgccaaaggtt 54859058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 422 - 459
Target Start/End: Original strand, 22119093 - 22119130
Alignment:
Q  422 gttctaaagtgattccaatattttggaaatcaccaaca 459  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  22119093 gttctaaagtgattccattattttgaaaatcaccaaca 22119130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 423 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 30019674 - 30019637
Alignment:
Q  423 ttctaaagtgattccaatattttggaaatcaccaacat 460  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  30019674 ttctaaagtgattccattattttagaaatcaccaacat 30019637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 422 - 459
Target Start/End: Original strand, 47071777 - 47071814
Alignment:
Q  422 gttctaaagtgattccaatattttggaaatcaccaaca 459  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47071777 gttgtaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 47071814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 511 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 51265479 - 51265442
Alignment:
Q  511 aatgtcactaatgtcacccaactctatgtcacacaagt 548  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  51265479 aatgtcaccaatgtcacccaactctatgtcacccaagt 51265442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 53)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 17 - 460
Target Start/End: Original strand, 43358755 - 43359206
Alignment:
Q  17 ttttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgagggagaattattttgttaatgcaaca 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  43358755 ttttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggataatttagagtaagagaatgagggagaattatgttgttaatgtaaca 43358854  T
Q  117 aaattctggtttctgtttt-tgttgtagtctttcaaactaatgcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatgac-------atgagagaaaacatt 208  Q
    |||||| |       || | ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||       |||||||||| || |    
T  43358855 aaattcagtccaaaattgtgtgttgtagtgtgtccaactaatgcccaaatgccaagcatttatagtgcattataggactcttcacatgagagaaagcact 43358954  T
Q  209 cctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggtttattaagcaccctt 308  Q
    | | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  43358955 catttgacttgaatcaatgctatgattcattaagcacccctttgccaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttcatt-agcaccctt 43359053  T
Q  309 ttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca-aaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaag 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||| |  || |  |   | | || ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43359054 ttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatatcatggttcattatcaatcaataaataataatgttccaatgtatatgaatgattctcatgaag 43359153  T
Q  408 agttacaactcttagttctaaagtgattccaatattttggaaatcaccaacat 460  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43359154 agttacaactcttggttctaaagtgattccattattttggaaatcaccaacat 43359206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 15 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 10186783 - 10186362
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgagggagaattattttgttaatgcaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||    
T  10186783 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgatggagaattatgttgttaatgtaa 10186684  T
Q  115 caaaattctggt-----ttctgtttttgttgtagt-ct---ttcaaactaatgcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatgac-------atgag 198  Q
    ||||||||||       || |||| || ||||  | ||   |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||       |||||    
T  10186683 caaaattctgtccaaaattatgttgttattgttcttctgtgttcaaattaatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattatatgacccttcacatgag 10186584  T
Q  199 agaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggtttatt 298  Q
    ||||| ||  | | ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  10186583 agaaagcacccatttgacttgaaccaatgctatggttcattaagcacccctttgtcaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgctatggttcatt 10186484  T
Q  299 aagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtcaaaggttacaatgtatatgaatgatt 398  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||  |||| |||| ||| |||| ||||  ||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  10186483 aagcacccttttgccaaaagttacaaccatataaacttcaatcaatgataaggctcattaagcacccctttgctaaaagtttcaatgtatatgaaagatt 10186384  T
Q  399 ctcatgaagagttacaactctt 420  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  10186383 cccatgaagagttacaactctt 10186362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 26 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 21431865 - 21431533
Alignment:
Q  26 tttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgagggagaattattttgttaatgcaacaaaattctgg 125  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  21431865 tttatggttccatcaattcactgatgcattagagaattgatggatgatttagattaagagaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattcttg 21431766  T
Q  126 tttctgtttt-tgttgtagtctttcaaactaatgcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatg-------acatgagagaaaaca-ttcctgtgac 216  Q
    ||  |||||| ||||||  ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||       |||||||||||| ||   ||| ||||    
T  21431765 ttcttgttttctgttgttctctgtccaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgacccttcacatgagagaaagcaccccctttgac 21431666  T
Q  217 ttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaa 316  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||| |||||||||    
T  21431665 ttaaatcaatgttatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatgatcatacacacttgaatcaatgttaaggttcatcaagcacccatttgccaaa 21431566  T
Q  317 tgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaa 349  Q
     |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  21431565 ggttataattatatacacttgaatcaatgcaaa 21431533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 13 - 320
Target Start/End: Original strand, 1187826 - 1188134
Alignment:
Q  13 aatattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgagggagaattattttgttaatgc 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||||     
T  1187826 aatattttacagatttatggttctaccaattcactcatgcattaaagaattgatggatgatttagagtaagagaatga-ggagatttatgttgttaatgt 1187924  T
Q  113 aacaaaattctggtttctgt-ttttgttgtagtctttcaaactaatgcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatg-------acatgagagaaaa 204  Q
    ||||||||||| | |||||| ||||||||     | ||||| ||||||||||||| |||||| ||||  || ||||||||       ||||||||| |||    
T  1187925 aacaaaattcttg-ttctgtgttttgttg-----tgtcaaattaatgcccaaatggcaagcacttattatggattatatgactctacacatgagagtaaa 1188018  T
Q  205 cattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggtttattaagcac 304  Q
    ||  ||| |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||| ||     
T  1188019 cacccctttgacttgaattaatgttatggttcattaaacacccatttgccaaaggttatgatcatatacacttgtatcaatgctaaggttcattaatcat 1188118  T
Q  305 ccttttgccaaatgtt 320  Q
    ||||||||||||||||    
T  1188119 ccttttgccaaatgtt 1188134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 17 - 316
Target Start/End: Original strand, 19310826 - 19311132
Alignment:
Q  17 ttttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgagggagaattattttgttaatgcaaca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  19310826 ttttacagatttatggttccagcaattcattcatgcattagagaattgatggatgatttatagtaagagaatgagggagaattatattgttaatgtaaca 19310925  T
Q  117 aaattctggtttctgtttttgttg-tagtctttcaaactaatgcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatg-------acatgagagaaaacatt 208  Q
    ||| ||| ||      || ||||| |  | | ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||       |||||||||||| ||      
T  19310926 aaactct-gtccaaaattatgttgcttttgtgtcaaattaatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattacatgacccttcacatgagagaaagcacc 19311024  T
Q  209 cctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggtttattaagcaccctt 308  Q
    ||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||| |    
T  19311025 cctttgacttgaatcaatgttatagttcattaagcacccttttaccaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgctaaggttcattatgcacccct 19311124  T
Q  309 ttgccaaa 316  Q
    ||||||||    
T  19311125 ttgccaaa 19311132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 15 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 44524226 - 44523985
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgagggagaattattttgttaatgcaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  44524226 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttaaagtaagagaatgatggagaattatgttgttaatgcaa 44524127  T
Q  115 caaaattctggtttctgtttttgttgtagtctttcaaactaatgcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatgac---------atgagagaaaac 205  Q
    ||| |||||| |     | | |||||| ||  |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||         ||||| ||||||    
T  44524126 caatattctgttcaaattgtgtgttgttgttgttcaaattaatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattatatgacccttcacatatgagggaaaac 44524027  T
Q  206 attcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcaccc 247  Q
    |  | | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44524026 acccatttgacttgaatcaatgttatggttcattaagcaccc 44523985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 324
Target Start/End: Original strand, 16051206 - 16051512
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgagggagaattattttgttaatgcaa 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||  ||||       ||||||| ||    
T  16051206 tattttacagatttatggtttcagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttaaagtaagaaaatgagtaagaaaatgagggttaatgtaa 16051305  T
Q  115 caaaattctggtttctgtttttgttgtagtctttcaaactaatgcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatgac-------atgagagaaaacat 207  Q
    |||||||||      |||| ||||||| |||   |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||       ||||| |||||||     
T  16051306 caaaattct------tgttcttgttgt-gtc---caaattaatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattatatgaccattcacatgagtgaaaacac 16051395  T
Q  208 tcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggtttattaagcaccct 307  Q
     | | ||||||||||||||| |||| |||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||     
T  16051396 ccttttgacttgaatcaatgatatggttcattaagcactcatttgccaaatgttatgatcatatacacttgaatcaatgctatggttcattaagtatcca 16051495  T
Q  308 tttgccaaatgttataa 324  Q
    ||| |||||||||||||    
T  16051496 tttaccaaatgttataa 16051512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 299
Target Start/End: Original strand, 28574297 - 28574599
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgagggagaattattttgttaatgcaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||| ||||||||| ||    
T  28574297 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 28574396  T
Q  115 caaaattctg----gtttctgt-------ttttgttgtagtctttcaaactaatgcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatg-------acatg 196  Q
    ||||||||||      || |||       | | ||| | || | |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||       |||||    
T  28574397 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 28574496  T
Q  197 agagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttta 296  Q
    ||||||||||    | | |||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||| |    
T  28574497 agagaaaacacctatttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 28574596  T
Q  297 tta 299  Q
    |||    
T  28574597 tta 28574599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 299
Target Start/End: Original strand, 28598309 - 28598611
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgagggagaattattttgttaatgcaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||| ||||||||| ||    
T  28598309 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 28598408  T
Q  115 caaaattctg----gtttctgt-------ttttgttgtagtctttcaaactaatgcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatg-------acatg 196  Q
    ||||||||||      || |||       | | ||| | || | |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||       |||||    
T  28598409 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 28598508  T
Q  197 agagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttta 296  Q
    ||||||||||    | | |||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||| |    
T  28598509 agagaaaacacctatttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 28598608  T
Q  297 tta 299  Q
    |||    
T  28598609 tta 28598611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 130
Target Start/End: Original strand, 35626172 - 35626287
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgagggagaattattttgttaatgcaa 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  35626172 tattttatagatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgttgttaatgtaa 35626271  T
Q  115 caaaattctggtttct 130  Q
    ||||||||||||||||    
T  35626272 caaaattctggtttct 35626287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 258 - 420
Target Start/End: Original strand, 10185891 - 10186053
Alignment:
Q  258 ggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatg 357  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||     
T  10185891 ggttatgatcatatatacttgaatcaatgatatggttcattaagcacctttttgccaaaggttataaccatatacacttgaatcaacgctaaggttcatt 10185990  T
Q  358 aagaacccttttgtcaaaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactctt 420  Q
    ||| |||| ||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  10185991 aagcacccatttgctaaaggtttcaatgtatatgaaagattcccataaagagttacaattctt 10186053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 274 - 459
Target Start/End: Original strand, 16051403 - 16051588
Alignment:
Q  274 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 373  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| | || |||  ||    
T  16051403 acttgaatcaatgatatggttcattaagcactcatttgccaaatgttatgatcatatacacttgaatcaatgctatggttcattaagtatccatttacca 16051502  T
Q  374 aaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattccaatattttggaaatcaccaaca 459  Q
    || |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  16051503 aatgttataatgtatatgaatgattcccataaagagttataacttttggttctaaagtgattccattattttagaaatcaccaaca 16051588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 17414740 - 17414633
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgagggagaattattttgttaatgcaa 114  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  17414740 tattttccagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgttgttaatgtaa 17414641  T
Q  115 caaaattc 122  Q
    ||||||||    
T  17414640 caaaattc 17414633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 274 - 420
Target Start/End: Original strand, 19311031 - 19311177
Alignment:
Q  274 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 373  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| | | |||| |||| ||    
T  19311031 acttgaatcaatgttatagttcattaagcacccttttaccaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgctaaggttcattatgcacccctttgcca 19311130  T
Q  374 aaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactctt 420  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  19311131 aaggttccaatgtatatgaaagattcccatgaagagttacaactctt 19311177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 124
Target Start/End: Original strand, 3465473 - 3465582
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgagggagaattattttgttaatgcaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||| ||||||||| ||    
T  3465473 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 3465572  T
Q  115 caaaattctg 124  Q
    ||||||||||    
T  3465573 caaaattctg 3465582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 124
Target Start/End: Original strand, 3468067 - 3468176
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgagggagaattattttgttaatgcaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||| ||||||||| ||    
T  3468067 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 3468166  T
Q  115 caaaattctg 124  Q
    ||||||||||    
T  3468167 caaaattctg 3468176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 123
Target Start/End: Original strand, 13654335 - 13654445
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgattt--agaataagagaatgagggagaattattttgttaatgc 112  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13654335 tattttacagatttatggtttcagcaattcactcatgcattagagaattaatggatgatttagagagcaagagaatgagggagaattatgttgttaatgc 13654434  T
Q  113 aacaaaattct 123  Q
    |||||||||||    
T  13654435 aacaaaattct 13654445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 274 - 420
Target Start/End: Original strand, 13654527 - 13654673
Alignment:
Q  274 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 373  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||| | |||| |||||||| |||||||||| |||||| ||| |||  |||| ||    
T  13654527 acttgaatcaatgttatggttcattaagtacccttttgccaagggttatgatcatacacacttgagtcaatgcaaaagttcattaagcacctatttgcca 13654626  T
Q  374 aaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactctt 420  Q
    |||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  13654627 aaggttccaatgtatatgaaagactctcatgaagagttacaactctt 13654673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 274 - 420
Target Start/End: Original strand, 1188029 - 1188175
Alignment:
Q  274 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 373  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||  | ||||||| ||    
T  1188029 acttgaattaatgttatggttcattaaacacccatttgccaaaggttatgatcatatacacttgtatcaatgctaaggttcattaatcatccttttgcca 1188128  T
Q  374 aaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactctt 420  Q
    || ||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||    
T  1188129 aatgttccaatgtatatgaaagattcccatgaatagttacaactctt 1188175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 274 - 459
Target Start/End: Original strand, 28574515 - 28574700
Alignment:
Q  274 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 373  Q
    |||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||| |  ||   |           
T  28574515 acttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcattattaataataaataat 28574614  T
Q  374 aaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattccaatattttggaaatcaccaaca 459  Q
    || ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28574615 aatgttccaatgtatatgaatggttcccatgaagagttacaacttttggttctaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 28574700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 151 - 299
Target Start/End: Original strand, 3468215 - 3468370
Alignment:
Q  151 aactaatgcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatgac-------atgagagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagc 243  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||       |||||||||| ||   || | |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3468215 aactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacatctttaacttgaatcaatgtcatgattcattaagc 3468314  T
Q  244 acccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggtttatta 299  Q
    ||||  |||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||| ||||    
T  3468315 acccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcatta 3468370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 274 - 459
Target Start/End: Original strand, 28598527 - 28598712
Alignment:
Q  274 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 373  Q
    |||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||| |  ||   |           
T  28598527 acttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcattattaataataaataat 28598626  T
Q  374 aaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattccaatattttggaaatcaccaaca 459  Q
    || ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28598627 aatgttccaatgtatatgaatggttcccatgaagagttacaacttttggttctaaattgattccattattttggaaatcaccaaca 28598712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 274 - 469
Target Start/End: Original strand, 3468286 - 3468481
Alignment:
Q  274 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 373  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||| |  ||   |           
T  3468286 acttgaatcaatgtcatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcattattaataataaataat 3468385  T
Q  374 aaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattccaatattttggaaatcaccaacattatgttgaa 469  Q
    || ||| ||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||| ||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3468386 aatgttccaatgtatatgaatggttcctatgaagaattacaacttttgattctaaaatgattccattattttggaaatcaccaacattattttgaa 3468481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 163 - 316
Target Start/End: Original strand, 13654468 - 13654628
Alignment:
Q  163 aatgccaagcatttatagtgcattatatgac-------atgagagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcga 255  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||       |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||| |    
T  13654468 aatgccaagtatttatagtgcattatatgacccttcacatgagagaaaacacccctttgacttgaatcaatgttatggttcattaagtacccttttgcca 13654567  T
Q  256 aaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaa 316  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||  |  ||| ||||||||||  |||||||||    
T  13654568 agggttatgatcatacacacttgagtcaatgcaaaagttcattaagcacctatttgccaaa 13654628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 274 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 21431667 - 21431561
Alignment:
Q  274 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 373  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||||||||||  ||||||||| ||| |||| |||| ||    
T  21431667 acttaaatcaatgttatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatgatcatacacacttgaatcaatgttaaggttcatcaagcacccatttgcca 21431568  T
Q  374 aaggtta 380  Q
    |||||||    
T  21431567 aaggtta 21431561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 213 - 403
Target Start/End: Original strand, 35626336 - 35626525
Alignment:
Q  213 tgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgc 312  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||| | |||||  |||| ||| |||||||| ||| || |||||||||||| || |||| |||||  ||| |||||     
T  35626336 tgacttgcatcaatgttatggttcatttaacacccttttgccaaaagttatgattatacactcttgaatcaatgctaaggttcattaaatacc-ttttgt 35626434  T
Q  313 caaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtcaaaggttacaatgtatatgaatgattctcat 403  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| | |||||| ||| |||  |||| ||||| ||  |||||||||||| |||| ||||    
T  35626435 caaaggttataatcatatacacttgaatcaaagcagaagttcattaagtacctatttgccaaagattctaatgtatatgaaagattttcat 35626525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 276 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 35653237 - 35653093
Alignment:
Q  276 ttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtcaaa 375  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||| | |||| |||| ||||| | |||||||||||||||| || | || |||| | ||| |||| |||  ||||    
T  35653237 ttgaatcaatgatatggttcattaagcactcctttgtcaaaggttatgatcatatacacttgaatcgatcctaaagttcgttaagcaccccttttccaaa 35653138  T
Q  376 ggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactctt 420  Q
    || | |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  35653137 ggctccaatatatatgaatgattcccatgaagtgttacaactctt 35653093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 333 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 44524017 - 44523928
Alignment:
Q  333 acttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtcaaaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactcttag 422  Q
    |||||||||||||  | ||||||| ||| |||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44524017 acttgaatcaatgttatggttcattaagcacccctttgacaaaggtttaaatgtatatgaatgattcccatgaagagttacaactcttag 44523928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 192 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 35653262 - 35653172
Alignment:
Q  192 acatgagagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatc 282  Q
    ||||||||||||||| || | ||| ||||||||||| |||| |||||||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35653262 acatgagagaaaacactcatttgaattgaatcaatgatatggttcattaagcactcctttgtcaaaggttatgatcatatacacttgaatc 35653172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 215 - 312
Target Start/End: Original strand, 10185907 - 10186004
Alignment:
Q  215 acttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgc 312  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||   |||| ||||||||| | |||||||||||||||||| | || |||| ||||||||||| |||||    
T  10185907 acttgaatcaatgatatggttcattaagcacctttttgccaaaggttataaccatatacacttgaatcaacgctaaggttcattaagcacccatttgc 10186004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 250 - 320
Target Start/End: Original strand, 1188219 - 1188289
Alignment:
Q  250 ttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgtt 320  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||    
T  1188219 ttgccaaaggttatgataatatacacttgtatcaatgttaagattcattaagcatccttttgccaaatgtt 1188289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 215 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 3701451 - 3701367
Alignment:
Q  215 acttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggtttatta 299  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||| | | || | ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  3701451 acttgaatcaatattatggttcattaagcatcaatttaccaaaggttgtgatcagatacacttgaatcaatgctatggttcatta 3701367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 57
Target Start/End: Original strand, 29681588 - 29681632
Alignment:
Q  13 aatattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattag 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29681588 aatattttacagatttatggttccagcaattcactaatgcattag 29681632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 48366257 - 48366213
Alignment:
Q  13 aatattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattag 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  48366257 aatattttacagatttatggttccagcaattcactaatgcattag 48366213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 403 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 17414359 - 17414304
Alignment:
Q  403 tgaagagttacaactcttagttctaaagtgattccaatattttggaaatcaccaac 458  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17414359 tgaagagttacaagttttggttctaaagtgattccattattttggaaatcaccaac 17414304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 403 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 35653090 - 35653036
Alignment:
Q  403 tgaagagttacaactcttagttctaaagtgattccaatattttggaaatcaccaa 457  Q
    ||||||||||||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35653090 tgaagagttacaacttttggttccaaagtgattccattattttggaaatcaccaa 35653036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 156 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 17414620 - 17414583
Alignment:
Q  156 atgcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatgac 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17414620 atgcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatgac 17414583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 403 - 459
Target Start/End: Original strand, 1188333 - 1188389
Alignment:
Q  403 tgaagagttacaactcttagttctaaagtgattccaatattttggaaatcaccaaca 459  Q
    |||| |||||||| | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1188333 tgaaaagttacaatttttggttctaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 1188389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 382 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 17414400 - 17414365
Alignment:
Q  382 aatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaact 417  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17414400 aatgtatatgaatgattctaatgaagagttacaact 17414365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 274 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 3701451 - 3701369
Alignment:
Q  274 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcat 356  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| |  ||| ||||| ||| | | || |||||||||||||||||| | |||||||    
T  3701451 acttgaatcaatattatggttcattaagcatcaatttaccaaaggttgtgatcagatacacttgaatcaatgctatggttcat 3701369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 511 - 549
Target Start/End: Complemental strand, 9157344 - 9157306
Alignment:
Q  511 aatgtcactaatgtcacccaactctatgtcacacaagtg 549  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9157344 aatgttaccaatgtcacccaactctatgtcacacaagtg 9157306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 274 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 44524017 - 44523975
Alignment:
Q  274 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaa 316  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  44524017 acttgaatcaatgttatggttcattaagcacccctttgacaaa 44523975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 511 - 549
Target Start/End: Complemental strand, 48993951 - 48993913
Alignment:
Q  511 aatgtcactaatgtcacccaactctatgtcacacaagtg 549  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  48993951 aatgtcaccaatgtcacccaactctatgtcacccaagtg 48993913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 307 - 420
Target Start/End: Original strand, 1188217 - 1188330
Alignment:
Q  307 ttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtcaaaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaa 406  Q
    |||||||||| ||||| |  ||||||||||| |||||||  ||| ||||| ||| | ||||||| |||| ||| ||||  ||| ||| |||||  ||||     
T  1188217 ttttgccaaaggttatgataatatacacttgtatcaatgttaagattcattaagcatccttttgccaaatgttccaattcatacgaaagattcctatgac 1188316  T
Q  407 gagttacaactctt 420  Q
    ||||||||||||||    
T  1188317 gagttacaactctt 1188330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 511 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 17127598 - 17127561
Alignment:
Q  511 aatgtcactaatgtcacccaactctatgtcacacaagt 548  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  17127598 aatgtcactaatgtcacctaactctatatcacacaagt 17127561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 511 - 548
Target Start/End: Original strand, 29179701 - 29179738
Alignment:
Q  511 aatgtcactaatgtcacccaactctatgtcacacaagt 548  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29179701 aatgtcaccaatgtcacccaactctatgtcacccaagt 29179738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 511 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 46932031 - 46931994
Alignment:
Q  511 aatgtcactaatgtcacccaactctatgtcacacaagt 548  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  46932031 aatgtcaccaatgtcacccaactctatgtcacccaagt 46931994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 511 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 48498449 - 48498412
Alignment:
Q  511 aatgtcactaatgtcacccaactctatgtcacacaagt 548  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  48498449 aatgtcacaaatgtcacccaactctatgtcacccaagt 48498412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 511 - 548
Target Start/End: Original strand, 48994021 - 48994058
Alignment:
Q  511 aatgtcactaatgtcacccaactctatgtcacacaagt 548  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  48994021 aatgtcaccaatgtcacccaactctatgtcacccaagt 48994058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 512 - 549
Target Start/End: Complemental strand, 49444946 - 49444909
Alignment:
Q  512 atgtcactaatgtcacccaactctatgtcacacaagtg 549  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  49444946 atgtcaccaatgtcacccaactctatgtcacccaagtg 49444909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 405 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 3696165 - 3696109
Alignment:
Q  405 aagagttacaactcttagttctaaagtgattccaatattttggaaatcaccaacatt 461  Q
    ||||||||||||| ||  ||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  3696165 aagagttacaacttttgattccaaagtgattccattattttagaaattaccaacatt 3696109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 239 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 3696293 - 3696233
Alignment:
Q  239 taagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggtttatta 299  Q
    |||||||| | |||| |||||||||||  ||||| |||||||||||| |||||||| ||||    
T  3696293 taagcacctatttgccaaaggttatgactatataaacttgaatcaatattatggttcatta 3696233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 520 - 548
Target Start/End: Original strand, 4609100 - 4609128
Alignment:
Q  520 aatgtcacccaactctatgtcacacaagt 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4609100 aatgtcacccaactctatgtcacacaagt 4609128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 60)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 13 - 460
Target Start/End: Original strand, 49784494 - 49784950
Alignment:
Q  13 aatattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgagggagaattattttgttaatgc 112  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  49784494 aatattttccagatttatggttccagcaattcactcatgaattagagaattgatagatgatttaaagtaaaagaatgagggggaattatgttgttaatgc 49784593  T
Q  113 aacaaaattctggtttctgtttt-tgttgtagtctttcaaactaatgcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatgac-------atgagagaaaa 204  Q
    ||||||||||||       || | |||||| || | || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||    
T  49784594 aacaaaattctgtccaaaattgtgtgttgttgtatgtccaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaaa 49784693  T
Q  205 cattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggtttattaagcac 304  Q
    || || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  49784694 cactcatttgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccatttgccaaagcttatgatcatatacacttgaatcaatgatatggtttattatgcac 49784793  T
Q  305 ccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca-aaggttacaatgtatatgaatgattctcat 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| |   | |  |   | | || ||| ||||||||||||||||||  |||    
T  49784794 ccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgtcatggttcattatctatcaataaataataatgttccaatgtatatgaatgatttccat 49784893  T
Q  404 gaagagttacaactcttagttctaaagtgattccaatattttggaaatcaccaacat 460  Q
    |||||||||||||| || ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  49784894 gaagagttacaacttttggttttaaagtgattctattattttggaaatcaccaacat 49784950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 15 - 420
Target Start/End: Original strand, 29827429 - 29827826
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgagggagaattattttgttaatgcaa 114  Q
    ||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  29827429 tattttacagatttat-----cagcaattcactcatgcattagagaattgatgaatgatttagagtaagagaatgagggagaattaggttattaatgcaa 29827523  T
Q  115 caaaattctggtttctgtttttgttgtagtctttcaaactaatgcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatgac------atgagagaaaacatt 208  Q
    ||||||||| |||| |||||||         | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||      |||| ||||||||      
T  29827524 caaaattcttgtttatgttttt---------tgtcaaactaatgcccaaatgccaagcatttataatgcattatatgactttcacatgatagaaaacacc 29827614  T
Q  209 cctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggtttattaagcaccctt 308  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| |||| |||||| |||| ||||||||||||||| || |||| ||||||||||  |    
T  29827615 cctttgacttgaatcaatgttatgattcattaagcaccattttgccaaagattatgaccatacacacttgaatcaatgctaaggttcattaagcaccaat 29827714  T
Q  309 ttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtcaaaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaaga 408  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||  |||| |||||||| |||| |||||||| ||||| |||| |||    
T  29827715 ttgtcaaatgttataatcatatacacttgaatcaatgcaaaggttcattaaacacctgtttgccaaaggttccaatctatatgaaagattcccatgcaga 29827814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 5481692 - 5481390
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgagggagaattattttgttaatgcaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||| ||    
T  5481692 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 5481593  T
Q  115 caaaattctg-----gtt-tctgt--ttttgttgtagtctt---tcaaactaatgcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatg-------acatg 196  Q
    ||||||||||     ||| | |||  || ||| ||  | ||   |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||       |||||    
T  5481592 caaaattctgtccaagttgtgtgtagttgtgtggtttttttatcttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 5481493  T
Q  197 agagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttta 296  Q
    ||||||| ||    | | |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||| |    
T  5481492 agagaaagcacctatttaacttgaatcaatgtcatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 5481393  T
Q  297 tta 299  Q
    |||    
T  5481392 tta 5481390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 6858259 - 6857957
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgagggagaattattttgttaatgcaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||| ||    
T  6858259 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 6858160  T
Q  115 caaaattctg----gtttctgt-------ttttgttgtagtctttcaaactaatgcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatg-------acatg 196  Q
    ||||||||||      || |||       | | ||| | || | || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||       |||||    
T  6858159 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatatccaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 6858060  T
Q  197 agagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttta 296  Q
    ||||||| ||   || | |||||||||||||  ||||||||| ||||||||  |||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||| |    
T  6858059 agagaaatcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcatcaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 6857960  T
Q  297 tta 299  Q
    |||    
T  6857959 tta 6857957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 10673142 - 10672840
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgagggagaattattttgttaatgcaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||| ||||||||| ||    
T  10673142 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 10673043  T
Q  115 caaaattctg----gtttctgt-------ttttgttgtagtctttcaaactaatgcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatg-------acatg 196  Q
    ||||||||||      || |||       | | ||| | || |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||       |||||    
T  10673042 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtattttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 10672943  T
Q  197 agagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttta 296  Q
    ||||||| ||   || | |||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||| |    
T  10672942 agagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 10672843  T
Q  297 tta 299  Q
    |||    
T  10672842 tta 10672840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 299
Target Start/End: Original strand, 8458311 - 8458614
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgagggagaattattttgttaatgcaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||| ||    
T  8458311 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 8458410  T
Q  115 caaaattctg----gtttctgt-------ttttgttgtagtctttcaaactaatgccc-aaatgccaagcatttatagtgcattatatg-------acat 195  Q
    ||||||||||      || |||       | | ||| | || | |  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||       ||||    
T  8458411 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgcccaaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacat 8458510  T
Q  196 gagagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttt 295  Q
    |||||||||||   || | |||||||||||||  |||||||||||| |||||  |||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||     
T  8458511 gagagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaaccacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgttatggttc 8458610  T
Q  296 atta 299  Q
    ||||    
T  8458611 atta 8458614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 5458216 - 5457913
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgagggagaattattttgttaatgcaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||| ||    
T  5458216 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 5458117  T
Q  115 caaaattctg-----gtt-tctgt--ttttgttgtagtctt----tcaaactaatgcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatg-------acat 195  Q
    ||||||||||     ||| | |||  || ||| ||  | ||    |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||       ||||    
T  5458116 caaaattctgtccaagttgtgtgtagttgtgtggttttttttatcttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacat 5458017  T
Q  196 gagagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttt 295  Q
    |||||||| ||    | | |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| || |||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||     
T  5458016 gagagaaagcacctatttaacttgaatcaatgtcatgattcattaagcacccttttgccaagggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttc 5457917  T
Q  296 atta 299  Q
    ||||    
T  5457916 atta 5457913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 6853156 - 6852854
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgagggagaattattttgttaatgcaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||| ||    
T  6853156 tattttacagatttatggttccagcaattcactcgtgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 6853057  T
Q  115 caaaattctg----gtttctgt-------ttttgttgtagtctttcaaactaatgcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatg-------acatg 196  Q
    ||||||||||      || |||       | | ||| | || | || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||       |||||    
T  6853056 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatatccaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 6852957  T
Q  197 agagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttta 296  Q
    ||||||| ||   || | |||||||||||||  ||||||||| ||||||||  |||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||| |    
T  6852956 agagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcatcaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 6852857  T
Q  297 tta 299  Q
    |||    
T  6852856 tta 6852854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 299
Target Start/End: Original strand, 8464750 - 8465052
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgagggagaattattttgttaatgcaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||| ||    
T  8464750 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 8464849  T
Q  115 caaaattctg----gtttctgt-------ttttgttgtagtctttcaaactaatgcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatg-------acatg 196  Q
    ||||||||||      || |||       | | ||| | || | |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||       |||||    
T  8464850 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 8464949  T
Q  197 agagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttta 296  Q
    ||||||| ||   || | |||||||||||||| |||||||||||||||||   |||| ||||||||| | |||||| |||||| ||||||| |||||| |    
T  8464950 agagaaagcacctctttaacttgaatcaatgtcatgattcattaagcaccattttgccaaaggttataaccatatatacttgagtcaatgtcatggttca 8465049  T
Q  297 tta 299  Q
    |||    
T  8465050 tta 8465052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 10591499 - 10591197
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgagggagaattattttgttaatgcaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||| ||||||||| ||    
T  10591499 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaggaattatgttgttaatgtaa 10591400  T
Q  115 caaaattctg----gtttctgt-------ttttgttgtagtctttcaaactaatgcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatg-------acatg 196  Q
    ||||||||||      || |||       | | ||| | || |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||       |||||    
T  10591399 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtattttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 10591300  T
Q  197 agagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttta 296  Q
    ||||||| ||   || | |||||||||||||  ||||||||||||||||||  || | ||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||| |    
T  10591299 agagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttaccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 10591200  T
Q  297 tta 299  Q
    |||    
T  10591199 tta 10591197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 15 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 10585062 - 10584760
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgagggagaattattttgttaatgcaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||| ||||||||| ||    
T  10585062 tattttacagatttatggttctagctattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaggaattatgttgttaatgtaa 10584963  T
Q  115 caaaattctg----gtttctgt-------ttttgttgtagtctttcaaactaatgcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatg-------acatg 196  Q
    ||||||||||      || |||       | | ||| | || |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||       |||||    
T  10584962 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtattttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 10584863  T
Q  197 agagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttta 296  Q
    ||||||||||   || | |||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||| ||||||||| | |||||| | |||||||||||| |||||| |    
T  10584862 agagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatatttgaatcaatgtcatggttca 10584763  T
Q  297 tta 299  Q
    |||    
T  10584762 tta 10584760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 15 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 31076606 - 31076304
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgagggagaattattttgttaatgcaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||| ||||||||| ||    
T  31076606 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 31076507  T
Q  115 caaaattctg----gtttctgt-------ttttgttgtagtctttcaaactaatgcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatg-------acatg 196  Q
    ||||||||||      || |||       | | ||| | || | |  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||       |||||    
T  31076506 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatgttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttataatgcattatatgactcttcacatg 31076407  T
Q  197 agagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttta 296  Q
    ||||||| ||   || | |||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||| |    
T  31076406 agagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 31076307  T
Q  297 tta 299  Q
    |||    
T  31076306 tta 31076304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 33702804 - 33702501
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgagggagaattattttgttaatgcaa 114  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||| ||||||||| ||    
T  33702804 tattttacatatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 33702705  T
Q  115 caaaattctg------gtttctgtttttg------ttgtagtctttcaaactaatgcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatg-------acat 195  Q
    ||||||||||       | | |||  |||      || | |||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||       ||||    
T  33702704 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggttttttgtctattcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacat 33702605  T
Q  196 gagagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttt 295  Q
    |||||||| ||   || | |||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||| ||||||||| | | |||| |||||||||||||| ||||||     
T  33702604 gagagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccttatatacttgaatcaatgtcatggttc 33702505  T
Q  296 atta 299  Q
    ||||    
T  33702504 atta 33702501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 10678257 - 10677953
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgagggagaattattttgttaatgcaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||| ||||||||| ||    
T  10678257 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 10678158  T
Q  115 caaaattctg----gtttctgt-------ttttgttgtagtctttcaaactaatgcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatg---------aca 194  Q
    ||||||||||      || |||       | | ||| | || |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||         |||    
T  10678157 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtattttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgtgactcttcaca 10678058  T
Q  195 tgagagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggtt 294  Q
    ||| ||||| ||    | | |||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  10678057 tgaaagaaagcacctttttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggtt 10677958  T
Q  295 tatta 299  Q
     ||||    
T  10677957 catta 10677953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 31081711 - 31081409
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgagggagaattattttgttaatgcaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||| ||||||||| ||    
T  31081711 tattttacagatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 31081612  T
Q  115 caaaattctg----gtttctgt-------ttttgttgtagtctttcaaactaatgcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatg-------acatg 196  Q
    ||||||||||      || |||       | | ||| | || | |  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||       |||||    
T  31081611 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatgttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttataatgcattatatgactcttcacatg 31081512  T
Q  197 agagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttta 296  Q
    ||||||| ||   || | |||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||| |    
T  31081511 agagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 31081412  T
Q  297 tta 299  Q
    |||    
T  31081411 tta 31081409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 124
Target Start/End: Original strand, 4049807 - 4049916
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgagggagaattattttgttaatgcaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||| ||||||||| ||    
T  4049807 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 4049906  T
Q  115 caaaattctg 124  Q
    ||||||||||    
T  4049907 caaaattctg 4049916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 1302449 - 1302343
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgagggagaattattttgttaatgcaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||| ||||||||| ||    
T  1302449 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 1302350  T
Q  115 caaaatt 121  Q
    |||||||    
T  1302349 caaaatt 1302343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 121
Target Start/End: Original strand, 33703299 - 33703405
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgagggagaattattttgttaatgcaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||| ||||||||| ||    
T  33703299 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 33703398  T
Q  115 caaaatt 121  Q
    |||||||    
T  33703399 caaaatt 33703405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 3187660 - 3187551
Alignment:
Q  13 aatattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgagggagaattattttgttaatgc 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  3187660 aatattttacagatttatggttcgagcaattcactcatgcattaaagaattgatagatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgttgttaatgt 3187561  T
Q  113 aacaaaattc 122  Q
     |||||||||    
T  3187560 cacaaaattc 3187551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 123
Target Start/End: Original strand, 4054941 - 4055049
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgagggagaattattttgttaatgcaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||| ||||||||| ||    
T  4054941 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattaaagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 4055040  T
Q  115 caaaattct 123  Q
    |||||||||    
T  4055041 caaaattct 4055049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 118
Target Start/End: Original strand, 20891059 - 20891162
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgagggagaattattttgttaatgcaa 114  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||    
T  20891059 tattttatagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagcgaatgagggagaattatgttgtttatgtaa 20891158  T
Q  115 caaa 118  Q
    ||||    
T  20891159 caaa 20891162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 18024354 - 18024246
Alignment:
Q  13 aatattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgagggagaattattttgttaatgc 112  Q
    |||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  18024354 aatattttacagatttattgttctaacaattcattcatgcattagagaattgatgaatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgttgttaatgt 18024255  T
Q  113 aacaaaatt 121  Q
    |||||||||    
T  18024254 aacaaaatt 18024246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 274 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 5481474 - 5481289
Alignment:
Q  274 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 373  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||| |  ||   |           
T  5481474 acttgaatcaatgtcatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcattattaataataaataat 5481375  T
Q  374 aaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattccaatattttggaaatcaccaaca 459  Q
    || ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5481374 aatgttccaatgtatatgaatggttcccatgaagagttacaacttttggttctaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 5481289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 274 - 459
Target Start/End: Original strand, 4050026 - 4050211
Alignment:
Q  274 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 373  Q
    |||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||| |  ||   |           
T  4050026 acttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcattattaataataaataat 4050125  T
Q  374 aaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattccaatattttggaaatcaccaaca 459  Q
    || ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4050126 aatgttccaatgtatatgaatggttcccatgaagagttacaacttttggttctaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 4050211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 274 - 459
Target Start/End: Original strand, 4055160 - 4055345
Alignment:
Q  274 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 373  Q
    |||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||| |  ||   |           
T  4055160 acttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcattattaataataaataat 4055259  T
Q  374 aaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattccaatattttggaaatcaccaaca 459  Q
    || ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4055260 aatgttccaatgtatatgaatggttcccatgaagagttacaacttttggttctaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 4055345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 274 - 459
Target Start/End: Original strand, 8458530 - 8458715
Alignment:
Q  274 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 373  Q
    |||||||||||||  ||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||| |  ||   |           
T  8458530 acttgaatcaatgccatgattcattaaccacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgttatggttcattattaataataaataat 8458629  T
Q  374 aaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattccaatattttggaaatcaccaaca 459  Q
    || ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8458630 aatgttccaatgtatatgaatggttcccatgaagagttacaacttttagttctaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 8458715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 274 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 10672924 - 10672739
Alignment:
Q  274 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 373  Q
    |||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||| |  ||   |           
T  10672924 acttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcattattaataataaataat 10672825  T
Q  374 aaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattccaatattttggaaatcaccaaca 459  Q
    || ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10672824 aatgttccaatgtatatgaatggttcccatgaagagttacaacttttggttctaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 10672739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 274 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 10678037 - 10677852
Alignment:
Q  274 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 373  Q
    |||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||| |  ||   |           
T  10678037 acttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcattattaataataaataat 10677938  T
Q  374 aaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattccaatattttggaaatcaccaaca 459  Q
    || ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10677937 aatgttccaatgtatatgaatggttcccatgaagagttacaacttttggttctaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 10677852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 274 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 6852938 - 6852752
Alignment:
Q  274 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 373  Q
    |||||||||||||  ||| || || |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||| |  ||   |           
T  6852938 acttgaatcaatgccatgattcatcaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcattattaataataaataat 6852839  T
Q  374 aaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattccaatattttggaaatcaccaacat 460  Q
    || ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6852838 aatgttccaatgtatatgaatggttcccatgaagagttacaacttttggttctaaagtgattccattattttggaaatcaccaacat 6852752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 274 - 460
Target Start/End: Original strand, 8464968 - 8465154
Alignment:
Q  274 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 373  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||  | ||||||| |  ||   |           
T  8464968 acttgaatcaatgtcatgattcattaagcaccattttgccaaaggttataaccatatatacttgagtcaatgtcatggttcattattaataataaataat 8465067  T
Q  374 aaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattccaatattttggaaatcaccaacat 460  Q
    || ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8465068 aatgttccaatgtatatgaatggttcccatgaagagttacaacttttggttctaaagtgattccattattttggaaatcaccaacat 8465154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 274 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 10584844 - 10584658
Alignment:
Q  274 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 373  Q
    |||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||  | ||||||| |  ||   |           
T  10584844 acttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatatttgaatcaatgtcatggttcattattaataataaataat 10584745  T
Q  374 aaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattccaatattttggaaatcaccaacat 460  Q
    || ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10584744 aatgttccaatgtatatgaatggttcccatgaagagttacaacttttggttctaaagtgattccattattttggaaatcaccaacat 10584658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 151 - 299
Target Start/End: Original strand, 4049955 - 4050110
Alignment:
Q  151 aactaatgcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatgac-------atgagagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagc 243  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||   || | |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  4049955 aactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagc 4050054  T
Q  244 acccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggtttatta 299  Q
    ||||  |||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||| ||||    
T  4050055 acccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcatta 4050110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 274 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 6858041 - 6857856
Alignment:
Q  274 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 373  Q
    |||||||||||||  ||| || || |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||| |  ||   |           
T  6858041 acttgaatcaatgccatgattcatcaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcattattaataataaataat 6857942  T
Q  374 aaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattccaatattttggaaatcaccaaca 459  Q
    || ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6857941 aatgttccaatgtatatgaatggttcccatgaagagttacaacttttggttctaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 6857856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 274 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 31081493 - 31081308
Alignment:
Q  274 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 373  Q
    |||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||| |  ||   |           
T  31081493 acttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcattattaataataaataat 31081394  T
Q  374 aaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattccaatattttggaaatcaccaaca 459  Q
    || ||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31081393 aatgttccaatgtatatgaatggttcccatgaagagtcacaacttttggttctaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 31081308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 381 - 457
Target Start/End: Original strand, 20891474 - 20891550
Alignment:
Q  381 caatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattccaatattttggaaatcaccaa 457  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20891474 caatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaacttttggttctaaagtgattccattattttggaaatcaccaa 20891550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 274 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 1302230 - 1302044
Alignment:
Q  274 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 373  Q
    |||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||| |  ||   |           
T  1302230 acttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcattattaataataaataat 1302131  T
Q  374 aaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattccaatattttggaaatcaccaacat 460  Q
    || ||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  1302130 aatgttccaatatatatgaatggttcccatgaagagttacaacttttggttctaaagtgattccattattttggaaattaccaacat 1302044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 274 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 33702585 - 33702399
Alignment:
Q  274 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 373  Q
    |||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||  | ||||||| |  ||   |           
T  33702585 acttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccttatatacttgaatcaatgtcatggttcattattaataataaataat 33702486  T
Q  374 aaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattccaatattttggaaatcaccaacat 460  Q
    || ||| | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33702485 aatgttcctatgtatatgaatggttcccatgaagagttacaacttttggttctaaagtgattccattattttggaaatcaccaacat 33702399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 151 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 1302301 - 1302146
Alignment:
Q  151 aactaatgcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatgac-------atgagagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagc 243  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||       |||||||||| ||   || | |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  1302301 aactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagc 1302202  T
Q  244 acccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggtttatta 299  Q
    ||||  |||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||| ||||    
T  1302201 acccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcatta 1302146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 151 - 299
Target Start/End: Original strand, 4055089 - 4055244
Alignment:
Q  151 aactaatgcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatgac-------atgagagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagc 243  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||       |||||||||| ||   || | |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  4055089 aactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagc 4055188  T
Q  244 acccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggtttatta 299  Q
    ||||  |||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||| ||||    
T  4055189 acccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcatta 4055244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 274 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 10591281 - 10591100
Alignment:
Q  274 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 373  Q
    |||||||||||||  ||| || ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||| |  ||   |           
T  10591281 acttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttaccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcattattaataataaataat 10591182  T
Q  374 aaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattccaatattttggaaatcacc 455  Q
    || ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10591181 aatgttccaatgtatatgaatggttcccatgaagagttacaacttttggttctaaagtgattccattattttggaaatcacc 10591100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 274 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 31076388 - 31076201
Alignment:
Q  274 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 373  Q
    |||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||| |  ||  |  |    |    
T  31076388 acttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcattattaatacaataaata 31076289  T
Q  374 a--aggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattccaatattttggaaatcaccaaca 459  Q
    |  | ||| ||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31076288 ataatgttccaatgtatatgaatggtttccatgaagagtcacaacttttggttctaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 31076201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 274 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 5457997 - 5457926
Alignment:
Q  274 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatg 345  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||    
T  5457997 acttgaatcaatgtcatgattcattaagcacccttttgccaagggttataaccatatatacttgaatcaatg 5457926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 215 - 322
Target Start/End: Original strand, 20891281 - 20891402
Alignment:
Q  215 acttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatac--------------acttgaatcaatgttatggtttattaa 300  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||              ||||||||||||| ||||||| |||||    
T  20891281 acttgaatcaatgatatggttcattaagcaaccatttgccaaaggttatgatcatatacatcagatttgttttacttgaatcaatgctatggttcattaa 20891380  T
Q  301 gcacccttttgccaaatgttat 322  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  20891381 gcacccttttgccaaaggttat 20891402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 381 - 459
Target Start/End: Original strand, 269502 - 269580
Alignment:
Q  381 caatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattccaatattttggaaatcaccaaca 459  Q
    |||| |||||||||| ||  ||| ||||| ||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  269502 caatatatatgaatggtttccataaagagctacaacttttgattctaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 269580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 274 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 18024133 - 18024091
Alignment:
Q  274 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaa 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18024133 acttgaatcaatgttatggtttattaaacacccttttgccaaa 18024091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 151 - 193
Target Start/End: Original strand, 33703447 - 33703489
Alignment:
Q  151 aactaatgcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatgac 193  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33703447 aactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgac 33703489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 381 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 5457890 - 5457816
Alignment:
Q  381 caatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattccaatattttggaaatcaccaacat 460  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||  |||||     |||||| |||||||||||||||||||||    
T  5457890 caatgtatatgaatggttcccatgaagagttacaacttttgattcta-----attccattattttggaaatcaccaacat 5457816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 408 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 18023965 - 18023914
Alignment:
Q  408 agttacaactcttagttctaaagtgattccaatattttggaaatcaccaaca 459  Q
    |||||||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18023965 agttacaacttttggttataaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 18023914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 215 - 274
Target Start/End: Original strand, 20891354 - 20891413
Alignment:
Q  215 acttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatataca 274  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||||||    
T  20891354 acttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatggtcatataca 20891413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 193
Target Start/End: Original strand, 20891182 - 20891216
Alignment:
Q  159 cccaaatgccaagcatttatagtgcattatatgac 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20891182 cccaaatgccaagcatttatagtgcattatatgac 20891216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 405 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 18023376 - 18023324
Alignment:
Q  405 aagagttacaactcttagttctaaagtgattccaatattttggaaatcaccaa 457  Q
    |||| |||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18023376 aagacttacaactttcaattctaaagtgattccattattttggaaatcaccaa 18023324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 274 - 333
Target Start/End: Original strand, 20891281 - 20891340
Alignment:
Q  274 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatataca 333  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||| ||||| | ||||||||    
T  20891281 acttgaatcaatgatatggttcattaagcaaccatttgccaaaggttatgatcatataca 20891340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 511 - 549
Target Start/End: Complemental strand, 1801480 - 1801442
Alignment:
Q  511 aatgtcactaatgtcacccaactctatgtcacacaagtg 549  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1801480 aatgtcaccaatgtcacccaactctatgtcacccaagtg 1801442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 511 - 549
Target Start/End: Original strand, 39430009 - 39430047
Alignment:
Q  511 aatgtcactaatgtcacccaactctatgtcacacaagtg 549  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  39430009 aatgtcactaatgtcacccaactttatgtcactcaagtg 39430047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 215 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 18023525 - 18023468
Alignment:
Q  215 acttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatata 272  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||  || | || |||||||| ||||||    
T  18023525 acttgaatcaatgatatgattcattaagcacccctttaccaacggttatgaccatata 18023468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 160 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 18024228 - 18024195
Alignment:
Q  160 ccaaatgccaagcatttatagtgcattatatgac 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18024228 ccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgac 18024195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 520 - 549
Target Start/End: Complemental strand, 33689201 - 33689172
Alignment:
Q  520 aatgtcacccaactctatgtcacacaagtg 549  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33689201 aatgtcacccaactctatgtcacacaagtg 33689172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 511 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 41752998 - 41752961
Alignment:
Q  511 aatgtcactaatgtcacccaactctatgtcacacaagt 548  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41752998 aatgtcaccaatgtcacccaactctatgtcacccaagt 41752961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 520 - 549
Target Start/End: Original strand, 47677359 - 47677388
Alignment:
Q  520 aatgtcacccaactctatgtcacacaagtg 549  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47677359 aatgtcacccaactctatgtcacacaagtg 47677388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 423 - 459
Target Start/End: Original strand, 29827849 - 29827885
Alignment:
Q  423 ttctaaagtgattccaatattttggaaatcaccaaca 459  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  29827849 ttctaaagtgattccattcttttggaaatcaccaaca 29827885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 35)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 15 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 35369095 - 35368682
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgagggagaattattttgttaatgcaa 114  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || || ||||||    
T  35369095 tattttacagatttatggttacaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgaggaagaattatgtttttgatgcaa 35368996  T
Q  115 caaaattctggtttctgtt-tttgttgtagtctttcaaactaatgcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatg-------acatgagagaaaaca 206  Q
    ||||||||| |||| |||| | |||||| || | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||    
T  35368995 caaaattcttgtttttgttgtgtgttgttgtgtgtcaaattaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgacttttcacatgagagaaaaca 35368896  T
Q  207 ttcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggtttattaagcaccc 306  Q
     || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||   ||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||     
T  35368895 ctcatttgacttgaatcaatgttatgattcattaaacacctttttatcaaatgttatgatcatatacacttgaatcaatgctaaggttcattaagcacct 35368796  T
Q  307 ttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtcaaaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaa 406  Q
     |||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| || | |||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||    
T  35368795 ctttgtcaaaggttataatcatatacacttaaatcaatgctaaggttcattaagcactcatttgccaaaggttccaatgtatatgaaagattctcataaa 35368696  T
Q  407 gagttacaactctt 420  Q
    ||||||||||||||    
T  35368695 gagttacaactctt 35368682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 15 - 345
Target Start/End: Original strand, 2022964 - 2023301
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgagggagaattattttgttaatgcaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||| ||    
T  2022964 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 2023063  T
Q  115 caaaattctggtttctgtttt-tgttgtagtctttcaaactaatgcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatgac-------atgagagaaaaca 206  Q
    ||||||||||       || | |||||| || | || |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||       |||||||||| ||    
T  2023064 caaaattctgtccaaaattatgtgttgttgtgtgtccaactaatgcccatatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagca 2023163  T
Q  207 ttcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggtttattaagcaccc 306  Q
      ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  2023164 c-cctttgacttgaatcaatgttatgattcattaaacacccatttgtcaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatgattcattaagcaccc 2023262  T
Q  307 ttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatg 345  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  2023263 ttttgccaaaggttataaccatacacacttgaatcaatg 2023301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 274 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 13556290 - 13556105
Alignment:
Q  274 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 373  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||  |||| ||    
T  13556290 acttgaatcaatgctatgattcattaagcacctttttgccaaaggttataatcatatacacttgaatcaatgcaaatgttcattaagcacctatttgcca 13556191  T
Q  374 aaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattccaatattttggaaatcaccaaca 459  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13556190 aaggttccaatgtatatgaaagattcccatgaagagttacaactcttggttttaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 13556105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 299
Target Start/End: Original strand, 39908958 - 39909260
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgagggagaattattttgttaatgcaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||| ||||||||| ||    
T  39908958 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 39909057  T
Q  115 caaaattctg------gtttctgtttttg-----ttgtagtctttcaaactaatgcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatg-------acatg 196  Q
    ||||||||||       | | |||  |||     || | || |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||       |||||    
T  39909058 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtgatttttgttttttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 39909157  T
Q  197 agagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttta 296  Q
    ||||||| ||    | | |||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||| |    
T  39909158 agagaaagcacctatttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 39909257  T
Q  297 tta 299  Q
    |||    
T  39909258 tta 39909260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 15 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 9877743 - 9877441
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgagggagaattattttgttaatgcaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||| ||||||||| ||    
T  9877743 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 9877644  T
Q  115 caaaattctg----gtttctgt-------ttttgttgtagtctttcaaactaatgcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatg-------acatg 196  Q
    ||||||||||      || |||       | | ||| | || | |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||       |||||    
T  9877643 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 9877544  T
Q  197 agagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttta 296  Q
    ||||||| ||    | | |||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||| |    
T  9877543 agagaaagcacctatttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 9877444  T
Q  297 tta 299  Q
    |||    
T  9877443 tta 9877441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 9872628 - 9872326
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgagggagaattattttgttaatgcaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   | |||||||| ||||||||| ||    
T  9872628 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaattgtgaagaattatgttgttaatgtaa 9872529  T
Q  115 caaaattctg----gtttctgt-------ttttgttgtagtctttcaaactaatgcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatg-------acatg 196  Q
    ||||||||||      || |||       | | ||| | || | |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||       |||||    
T  9872528 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 9872429  T
Q  197 agagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttta 296  Q
    ||||||| ||    | | |||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||| |    
T  9872428 agagaaagcacctatttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 9872329  T
Q  297 tta 299  Q
    |||    
T  9872328 tta 9872326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 13556509 - 13556400
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgagggagaattattttgttaatgcaa 114  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| ||    
T  13556509 tattttacatatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 13556410  T
Q  115 caaaattctg 124  Q
    |||| |||||    
T  13556409 caaacttctg 13556400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 299
Target Start/End: Original strand, 39903845 - 39904147
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgagggagaattattttgttaatgcaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||| ||||||||| ||    
T  39903845 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 39903944  T
Q  115 caaaattctggt----ttctgttt-------ttgttgtagtctttcaaactaatgcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatgac-------atg 196  Q
    ||||||||||      || ||| |       | ||| | || |||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||       |||    
T  39903945 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgttttttcaactaatgccaaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 39904044  T
Q  197 agagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttta 296  Q
    ||||||| ||    | | |||||||||||||  ||||||||||||||||    |||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||| |    
T  39904045 agagaaagcacctatttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcactattttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 39904144  T
Q  297 tta 299  Q
    |||    
T  39904145 tta 39904147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 50 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 43540928 - 43540668
Alignment:
Q  50 tgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgagggagaattattttgttaatgcaacaaaattctggtttctgtttttgttgtagtctttc 149  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||| |||||||||      ||| ||  |||| | |||   |    
T  43540928 tgcattagagaattgatagatgatttagagtaagagaatgatggagaactatgttgttaatgtaacaaaatt------tctattcatgttat-gtc---c 43540839  T
Q  150 aaactaatgcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatgac-------atgagagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaag 242  Q
    ||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||       ||||||||| ||  || | |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  43540838 aaattaatgcccagatgccaagtatttatagtgcattatatgacccttcacatgagagaacac--tcatttgacttgagtcaatgttatggttcattaag 43540741  T
Q  243 cacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaa 316  Q
    ||||   |||  |||||||||||||||||||||||||||||||  || | || ||||||||||| |||||||||    
T  43540740 cacctt-ttgtcaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatactaagattcattaagcacccctttgccaaa 43540668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 151 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 13556361 - 13556189
Alignment:
Q  151 aactaatgcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatgac-------atgagagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagc 243  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||       |||||||||| ||  | | ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13556361 aactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacccatttgacttgaatcaatgctatgattcattaagc 13556262  T
Q  244 acccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaa 316  Q
    |||   |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |  ||| ||||||||||  |||||||||    
T  13556261 acctttttgccaaaggttataatcatatacacttgaatcaatgcaaatgttcattaagcacctatttgccaaa 13556189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 274 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 43540768 - 43540623
Alignment:
Q  274 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 373  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||| |||| |||| ||    
T  43540768 acttgagtcaatgttatggttcattaagcacc-ttttgtcaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatactaagattcattaagcacccctttgcca 43540670  T
Q  374 aaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactctt 420  Q
    |||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  43540669 aaggttccaatgtatatgaataattaccatgaagagttacaactctt 43540623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 274 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 9872410 - 9872225
Alignment:
Q  274 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 373  Q
    |||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||| |  ||   |           
T  9872410 acttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcattattaataataaataat 9872311  T
Q  374 aaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattccaatattttggaaatcaccaaca 459  Q
    || ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9872310 aatgttccaatgtatatgaatggttcccatgaagagttacaacttttggttctaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 9872225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 274 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 9877525 - 9877340
Alignment:
Q  274 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 373  Q
    |||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||| |  ||   |           
T  9877525 acttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcattattaataataaataat 9877426  T
Q  374 aaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattccaatattttggaaatcaccaaca 459  Q
    || ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9877425 aatgttccaatgtatatgaatggttcccatgaagagttacaacttttggttctaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 9877340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 15 - 121
Target Start/End: Original strand, 4555653 - 4555759
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgagggagaattattttgttaatgcaa 114  Q
    ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||  | |||||||| ||||||||| ||    
T  4555653 tattttacagatttatggtaccaataattcactcatgcattagagaattaatggatgatttagagtaatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 4555752  T
Q  115 caaaatt 121  Q
    |||||||    
T  4555753 caaaatt 4555759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 274 - 459
Target Start/End: Original strand, 39909176 - 39909361
Alignment:
Q  274 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 373  Q
    |||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||| |  ||   |           
T  39909176 acttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcattattaataataaataat 39909275  T
Q  374 aaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattccaatattttggaaatcaccaaca 459  Q
    || ||| ||||||||||||||| ||  || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39909276 aatgttccaatgtatatgaatggtttacacgaagagttacaacttttggttctaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 39909361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 274 - 459
Target Start/End: Original strand, 39904063 - 39904248
Alignment:
Q  274 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 373  Q
    |||||||||||||  ||| || |||||||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||| |  ||   |           
T  39904063 acttgaatcaatgccatgattcattaagcactattttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcattattaataataaataat 39904162  T
Q  374 aaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattccaatattttggaaatcaccaaca 459  Q
    || ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  39904163 aatgttccaatgtatatgaatggttcccatgaagagttacaacttttggttctaaagtgattcaattattttggaaatcaccaaca 39904248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 381 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 24091867 - 24091794
Alignment:
Q  381 caatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattccaatattttggaaatcac 454  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  24091867 caatgtatatgaaagattctcataaagagttacaactcttggttctaaagtgattctattattttggaaatcac 24091794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 215 - 299
Target Start/End: Original strand, 2023230 - 2023314
Alignment:
Q  215 acttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggtttatta 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  2023230 acttgaatcaatgttatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatacacacttgaatcaatgtcatggttcatta 2023314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 172 - 345
Target Start/End: Original strand, 43379556 - 43379731
Alignment:
Q  172 catttatagtgcattatatgaca--tgagagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcat 269  Q
    ||||||||||||||||||||||   | | | |||||| || | | ||||||||||||||||||||||| ||||||| |  || | |||| ||||||||||    
T  43379556 catttatagtgcattatatgacccttcacataaaacactcattttacttgaatcaatgttatgattcactaagcactcttttaccaaagtttatgatcat 43379655  T
Q  270 atacacttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatg 345  Q
    ||||||||||||||||| || |||| ||||| || |  ||| ||||| ||||| | ||||||| ||| ||||||||    
T  43379656 atacacttgaatcaatgctacggttcattaaacatcactttaccaaaagttatgatcatatacgcttaaatcaatg 43379731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 274 - 380
Target Start/End: Original strand, 2023171 - 2023277
Alignment:
Q  274 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 373  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||| |||| ||||| | ||||||||||||||||||||  | | ||||| ||| ||||||||| ||    
T  2023171 acttgaatcaatgttatgattcattaaacacccatttgtcaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccttttgcca 2023270  T
Q  374 aaggtta 380  Q
    |||||||    
T  2023271 aaggtta 2023277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 15 - 69
Target Start/End: Original strand, 43378437 - 43378491
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatgga 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  43378437 tattttacagatttatggttccagcaattcactaatgcattaaagaattgatgga 43378491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 37 - 89
Target Start/End: Original strand, 25184114 - 25184166
Alignment:
Q  37 agcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatg 89  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25184114 agcaattcactaatacattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatg 25184166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 408 - 459
Target Start/End: Original strand, 4555967 - 4556018
Alignment:
Q  408 agttacaactcttagttctaaagtgattccaatattttggaaatcaccaaca 459  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4555967 agttacaacttttaattctaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 4556018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 274 - 356
Target Start/End: Original strand, 43379601 - 43379683
Alignment:
Q  274 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcat 356  Q
    |||||||||||||||||| || | ||||||| ||||| |||||  |||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  43379601 acttgaatcaatgttatgattcactaagcactcttttaccaaagtttatgatcatatacacttgaatcaatgctacggttcat 43379683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 412 - 459
Target Start/End: Original strand, 2024420 - 2024467
Alignment:
Q  412 acaactcttagttctaaagtgattccaatattttggaaatcaccaaca 459  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2024420 acaacttttggttctaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 2024467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 156 - 193
Target Start/End: Original strand, 4555772 - 4555809
Alignment:
Q  156 atgcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatgac 193  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4555772 atgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgac 4555809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 511 - 549
Target Start/End: Original strand, 2356375 - 2356413
Alignment:
Q  511 aatgtcactaatgtcacccaactctatgtcacacaagtg 549  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2356375 aatgtcaccaatgtcatccaactctatgtcacacaagtg 2356413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 511 - 549
Target Start/End: Original strand, 2953294 - 2953332
Alignment:
Q  511 aatgtcactaatgtcacccaactctatgtcacacaagtg 549  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2953294 aatgtcaccaatgtcacccaactctatgtcacccaagtg 2953332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 511 - 549
Target Start/End: Original strand, 16971248 - 16971286
Alignment:
Q  511 aatgtcactaatgtcacccaactctatgtcacacaagtg 549  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16971248 aatgtcaccaatgtcacccaactctatgtcacccaagtg 16971286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 511 - 549
Target Start/End: Original strand, 32485653 - 32485691
Alignment:
Q  511 aatgtcactaatgtcacccaactctatgtcacacaagtg 549  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32485653 aatgtcaccaatgtcacccaactctgtgtcacacaagtg 32485691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 511 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 291131 - 291094
Alignment:
Q  511 aatgtcactaatgtcacccaactctatgtcacacaagt 548  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  291131 aatgtcaccaatgtcacccaactctatgtcactcaagt 291094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 520 - 549
Target Start/End: Complemental strand, 3180094 - 3180065
Alignment:
Q  520 aatgtcacccaactctatgtcacacaagtg 549  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3180094 aatgtcacccaactctatgtcacacaagtg 3180065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 511 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 19655192 - 19655155
Alignment:
Q  511 aatgtcactaatgtcacccaactctatgtcacacaagt 548  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19655192 aatgtcaccaatgtcacccaactctatgtcacccaagt 19655155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 520 - 549
Target Start/End: Complemental strand, 26662433 - 26662404
Alignment:
Q  520 aatgtcacccaactctatgtcacacaagtg 549  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26662433 aatgtcacccaactctatgtcacacaagtg 26662404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 520 - 549
Target Start/End: Complemental strand, 26934028 - 26933999
Alignment:
Q  520 aatgtcacccaactctatgtcacacaagtg 549  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26934028 aatgtcacccaactctatgtcacacaagtg 26933999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 188; Significance: 1e-101; HSPs: 24)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 15 - 460
Target Start/End: Original strand, 716267 - 716716
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgagggagaattattttgttaatgcaa 114  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| | |     
T  716267 tattttacagatttagggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgaaggagaattatgttgttaaagaag 716366  T
Q  115 caaaattctggtttctgtttttgttgtagtctttcaaactaatgcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatgac-------atgagagaaaacat 207  Q
    ||||||||| |||| ||||||   ||| |||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||    
T  716367 caaaattcttgtttatgtttt--ctgttgtcagtcacactaatgcccaaatgccaaacatttatagtgcattatatgacctttcatatgagagaaaacat 716464  T
Q  208 tcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggtttattaagcaccct 307  Q
     ||| |||||||||||||||||| | | |||||| ||||   |||| |||||||||||||||| || |||||||||||| || | || |||||||||||     
T  716465 ccctttgacttgaatcaatgttacggtccattaaacacctttttgccaaaggttatgatcatacactcttgaatcaatgctaagcttcattaagcacccc 716564  T
Q  308 tttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtcaaaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaag 407  Q
    ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||  |||  | |||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||    
T  716565 tttaccaaaggttataatcatatacacttgaatcaatgcaaaggtttattaaacacctatttacctaaggttccaatgtatatgaaagattcacataaag 716664  T
Q  408 agttacaactcttagttctaaagtgattccaatattttggaaatcaccaacat 460  Q
    |||||||||| |||  |||||| |||||||| ||||||  |||||| ||||||    
T  716665 agttacaactttta-atctaaaatgattccattattttaaaaatcatcaacat 716716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 15 - 305
Target Start/End: Original strand, 42780184 - 42780481
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgagggagaattattttgttaatgcaa 114  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||| | || |||| ||    
T  42780184 tattttacaaatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatggtgaagaattatgtagt-aatgtaa 42780282  T
Q  115 caaaattctggtttctgtttt-tgttgtagtctttcaaactaatgcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatgac-------atgagagaaaaca 206  Q
    ||||||||||       || | |||||| || | || ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||       |||||||||||||    
T  42780283 caaaattctgtccaaaattgtgtgttgttgtgtgtccaactaatgcccaactgtcaatcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaaaca 42780382  T
Q  207 ttcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggtttattaagcacc 305  Q
      ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42780383 cccctttgacttgaatcaatgttatggttcattaagccaccatttgccaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttcattaagcacc 42780481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 30283645 - 30283357
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgagggagaattattttgttaatgcaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||| ||||||||| ||    
T  30283645 tattttacagatttatggttctagcaattcactcatgcattagagaattgattgatgatttagagtaagagaaggatggagaattatgttgttaatgtaa 30283546  T
Q  115 caaaattctg----gtttctgtttttgttgtagtctttcaaactaatgcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatg-------acatgagagaaa 203  Q
    ||||||||||      || || ||| ||||| || |||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||       |||||| |||||    
T  30283545 caaaattctgtccaaattgtg-tttagttgt-gtgttttcaactaatgcccaaatgccaaacatttatagtgcattatatgactcttcacatgaaagaaa 30283448  T
Q  204 acattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggtt 294  Q
    |||  ||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| |||| |||| | |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  30283447 acacccctttaacttgaatcaatattatggttcattaagcacccttttgccaaagattataaccatatatacttgaatcaatgtcatggtt 30283357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 14917586 - 14917284
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgagggagaattattttgttaatgcaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||| ||    
T  14917586 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 14917487  T
Q  115 caaaattctg-----gtt-tctgt-----ttttgttgtagtctttcaaactaatgcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatg-------acatg 196  Q
    ||||||||||     ||| | |||     | | ||| | || | |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||       |||||    
T  14917486 caaaattctgtccaagttgtgtgtagttgtgtggtttttgtatcttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 14917387  T
Q  197 agagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttta 296  Q
    ||||||||||    | | |||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||| |    
T  14917386 agagaaaacagctatttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 14917287  T
Q  297 tta 299  Q
    |||    
T  14917286 tta 14917284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 299
Target Start/End: Original strand, 45120386 - 45120689
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgagggagaattattttgttaatgcaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||| ||    
T  45120386 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattggagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 45120485  T
Q  115 caaaattctg------gtttctgtttttg------ttgtagtctttcaaactaatgcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatg-------acat 195  Q
    ||||||||||       | | |||  |||      || | || | || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||       ||||    
T  45120486 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggttttttgtatatccaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacat 45120585  T
Q  196 gagagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttt 295  Q
    |||||||| ||   || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||     
T  45120586 gagagaaagcacctctttaacttgaatcaatgtcatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttc 45120685  T
Q  296 atta 299  Q
    ||||    
T  45120686 atta 45120689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 190
Target Start/End: Original strand, 16284437 - 16284614
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgattt-agaataagagaatgagggagaattattttgttaatgca 113  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16284437 tattttactgatttatggtttcagcaattcactcatgcattagagagttgatgaatgattttagagtaagagaatgagggagaattatattgttaatgca 16284536  T
Q  114 acaaaattctggtttctgt-ttttgttgtagtctttcaaactaatgcccaaatgccaagcatttatagtgcattatat 190  Q
    |||||||||| |||||||| | || ||||  | | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16284537 acaaaattcttgtttctgtgtgtttttgttttgtgtcaaacaaatgcccaaataccaagcatttatagtgcattatat 16284614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 15 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 17720730 - 17720428
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgagggagaattattttgttaatgcaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||| ||||||||| ||    
T  17720730 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 17720631  T
Q  115 caaaattctg----gtttctgt-------ttttgttgtagtctttcaaactaatgcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatg-------acatg 196  Q
    ||||||||||      || |||       | | ||| | || | |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||       |||||    
T  17720630 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatcttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 17720531  T
Q  197 agagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttta 296  Q
    ||||||| ||   || | |||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||| ||||||||| | |||||| |||| ||||||||| |||||| |    
T  17720530 agagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttcaatcaatgtcatggttca 17720431  T
Q  297 tta 299  Q
    |||    
T  17720430 tta 17720428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 144 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 20892413 - 20892197
Alignment:
Q  144 tctttcaaactaatgcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatgac-------atgagagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattc 236  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||       | ||||||||||| || | ||| ||||||||||||| || |||    
T  20892413 tctttcaaactaatgcccaaatgtcaagtatttatagtgcattatatgactcttcacacgagagaaaacactcatttgatttgaatcaatgtt-tggttc 20892315  T
Q  237 attaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacactt 336  Q
    ||||||||||   |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |  ||||||||||| || | |||||||||||    
T  20892314 attaagcacctttttggcaaatgttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttcattaatcactcacttgccaaatgtcatgatcatatacactt 20892215  T
Q  337 gaatcaatgcaaaggttc 354  Q
    |||||||| |||| ||||    
T  20892214 gaatcaatacaaatgttc 20892197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 274 - 459
Target Start/End: Original strand, 45120605 - 45120790
Alignment:
Q  274 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 373  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||| |  ||   |           
T  45120605 acttgaatcaatgtcatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcattattaataataaataat 45120704  T
Q  374 aaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattccaatattttggaaatcaccaaca 459  Q
    || ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45120705 aatgtttcaatgtatatgaatggttcccatgaagagttacaacttttaattctaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 45120790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 274 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 14917368 - 14917183
Alignment:
Q  274 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 373  Q
    |||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||| |  ||   |           
T  14917368 acttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcattattaataataaataat 14917269  T
Q  374 aaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattccaatattttggaaatcaccaaca 459  Q
    || ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14917268 aatgttccaatgtatatgaatggttcccatgaagagttacaacttttggttctaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 14917183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 274 - 417
Target Start/End: Original strand, 42780391 - 42780534
Alignment:
Q  274 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 373  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||  | ||||||| ||| |||  ||||  |    
T  42780391 acttgaatcaatgttatggttcattaagccaccatttgccaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttcattaagcacctatttgcta 42780490  T
Q  374 aaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaact 417  Q
    || ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42780491 aaagttccaatgtatatgaaagattctcatgaagagttacaact 42780534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 274 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 30283436 - 30283250
Alignment:
Q  274 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 373  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||  |  ||   |           
T  30283436 acttgaatcaatattatggttcattaagcacccttttgccaaagattataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcagtatcaataataaataat 30283337  T
Q  374 aaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattccaatattttggaaatcaccaacat 460  Q
    || ||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30283336 aatgttccaatgtacatgaatggttcccatgaagagttacaacttttggttctaaaatgattccattattttggaaatcaccaacat 30283250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 381 - 459
Target Start/End: Original strand, 39178924 - 39179002
Alignment:
Q  381 caatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattccaatattttggaaatcaccaaca 459  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39178924 caatgtatatgaatggttcccatgaagagttacaacttttagttctaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 39179002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 274 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 17720512 - 17720327
Alignment:
Q  274 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 373  Q
    |||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||  | ||||||| |  ||   |           
T  17720512 acttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttcaatcaatgtcatggttcattattaataataaataat 17720413  T
Q  374 aaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattccaatattttggaaatcaccaaca 459  Q
    || ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  17720412 aatgttccaatgtatatgaatggttcccatgaagagttacaacttttggttctaaagtgattctattattttggaaatcaccaaca 17720327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 381 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 17720078 - 17720000
Alignment:
Q  381 caatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattccaatattttggaaatcaccaaca 459  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17720078 caatgtatatgaatagttcccatgaagagttacaacttttggttctaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 17720000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 372 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 20892205 - 20892157
Alignment:
Q  372 caaaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactctt 420  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20892205 caaatgttccaatgtatatgaatggttctcatgaagagttacaactctt 20892157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 511 - 549
Target Start/End: Complemental strand, 14470626 - 14470588
Alignment:
Q  511 aatgtcactaatgtcacccaactctatgtcacacaagtg 549  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14470626 aatgtcaccaatgtcacccaactctatgtcacacaagtg 14470588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 304 - 345
Target Start/End: Original strand, 39178847 - 39178888
Alignment:
Q  304 cccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatg 345  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  39178847 cccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatg 39178888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 422 - 459
Target Start/End: Original strand, 42780559 - 42780596
Alignment:
Q  422 gttctaaagtgattccaatattttggaaatcaccaaca 459  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42780559 gttctaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 42780596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 467 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 29891924 - 29891880
Alignment:
Q  467 gaaaccagcatagtcatggttgccctcacgacagttgatacacta 511  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  29891924 gaaaccagcatagtcatggttacccccacgaccgttgatacacta 29891880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 515 - 550
Target Start/End: Original strand, 24116028 - 24116063
Alignment:
Q  515 tcactaatgtcacccaactctatgtcacacaagtgg 550  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24116028 tcactaatggcacccaactctatgtcacacaagtgg 24116063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 511 - 549
Target Start/End: Original strand, 45213904 - 45213942
Alignment:
Q  511 aatgtcactaatgtcacccaactctatgtcacacaagtg 549  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45213904 aatgtcatcaatgtcacccaactctatgtcacacaagtg 45213942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 511 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 16514458 - 16514421
Alignment:
Q  511 aatgtcactaatgtcacccaactctatgtcacacaagt 548  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16514458 aatgtcaccaatgtcacccaactctatgtcacccaagt 16514421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 511 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 6217258 - 6217222
Alignment:
Q  511 aatgtcactaatgtcacccaactctatgtcacacaag 547  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6217258 aatgtcaccaatgtcacccaactctatgtcacccaag 6217222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 163; Significance: 9e-87; HSPs: 23)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 13 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 21936886 - 21936467
Alignment:
Q  13 aatattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgagggagaattattttgttaatgc 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||| |||||||||     
T  21936886 aatattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatagatgatttagagtatgagaatgatggagaattatgttgttaatgt 21936787  T
Q  113 aacaaaattctgg-------tttctgtttttgttgtagtctttcaaactaatgcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatgac-------atgag 198  Q
    |||||| ||| |        | | |||| ||||||| || ||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||       |||||    
T  21936786 aacaaagttcagtccaaaattgtgtgttgttgttgttgtgtt--aaactaatgcccaaatgttaagcatttatagtgcattatatgacccttcacatgag 21936689  T
Q  199 agaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggtttatt 298  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  || |||| | |    
T  21936688 agaaaacacccctttgacttgaatcaatgttatggtttattaagcacctttttgccaaaggttatgatcatatacacttgaataaattctaaggttcact 21936589  T
Q  299 aagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtcaaaggttacaatgtatatgaatgatt 398  Q
    || ||||| ||||||||| || || | |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||| ||||||||  ||||||||| || ||||    
T  21936588 aaacacccctttgccaaaggtcatgatcatataaacttgaatcaatgcaaaggttcattaagcacccatttgccaaaggttcaaatgtatataaaagatt 21936489  T
Q  399 ctcatgaagagttacaactctt 420  Q
      ||| ||||||||||||||||    
T  21936488 tccataaagagttacaactctt 21936467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 459
Target Start/End: Original strand, 21937568 - 21938028
Alignment:
Q  13 aatattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgagggagaattattttgttaatgc 112  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||     
T  21937568 aatattatacaaatttatggttccagcaattcactcatgcatttgagaattgatggatgttttagaataagagagtgatggaaaattatgttgttaatgt 21937667  T
Q  113 aacaaaattctgg-------tttctgtttttgttgtagtctt-tcaaactaatgcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatgac-------atga 197  Q
    | ||||||| ||        | | |||| ||||||| ||  | | ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||       ||||    
T  21937668 a-caaaattatgtccaaaattgtgtgttgttgttgttgttgtgttaaactaatgcccaaatgccaaacatttatagtgcgttatatgacccttcacatga 21937766  T
Q  198 gagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggtttat 297  Q
    ||||||| |  ||| |||||||||||||||| ||| |||||||| |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||    
T  21937767 gagaaaatacccctttgacttgaatcaatgtgatggttcattaaacacccttttgccaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgataaagttaat 21937866  T
Q  298 taagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtcaaaggttacaatgtatatgaatgat 397  Q
    ||| ||||| ||| ||||| || || | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||| ||||  ||| ||| ||||||||| |||  ||    
T  21937867 taaacaccccttttccaaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatgcaaatgttcattaaccacccctttgctaaatgttccaatgtatacgaaatat 21937966  T
Q  398 tctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattccaatattttggaaatcaccaaca 459  Q
    | |||||||||||||||  |  | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21937967 tttcatgaagagttacatattatggttctaaaatgattccattattttggaaatcaccaaca 21938028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 15 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 20752322 - 20751881
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgagggagaattattttgttaatgcaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||  | |||||||| ||||||||| ||    
T  20752322 tattttacagatttatggttccaacaattcactcatgcatcagagaattgatggatgacttatagtaagagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 20752223  T
Q  115 caaaattctggtttctgtttttgttgtagtctttcaaactaatgcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatgac-------atgagagaaaacat 207  Q
    |||||||||   |||      |||       | ||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||       |||||||||||||     
T  20752222 caaaattct---ttccaaaactgtg------tgtcaagttaatgcctaaatgccaagtatttatagtgcattagatgacctttcacatgagagaaaacac 20752132  T
Q  208 tcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggtttattaagcaccct 307  Q
    || | |||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||| ||||| |||||     
T  20752131 tcatttgacttgaatcaatgttatggttcattaagcaccattttgtcaaaggttatggccatatacacttgaatcaatgctaaggttcattaaacacccc 20752032  T
Q  308 tttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtcaaaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaag 407  Q
    |||| |||| |||||||  ||||||||||||| |||||| |||||| || ||| |||| ||||  |||||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  20752031 tttgtcaaaggttataataatatacacttgaaccaatgctaaggtttattaagcacccatttgctaaaggttataatgtatatgaaaggttctcatgaag 20751932  T
Q  408 agttacaactcttagttctaaagtgattccaatattttggaaatcaccaaca 459  Q
    |||||||||| || | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  20751931 agttacaact-tttgatctaaagtgaatccattattttggaaatcaccaaca 20751881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 299
Target Start/End: Original strand, 21275773 - 21276075
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgagggagaattattttgttaatgcaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||| ||||||||| ||    
T  21275773 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 21275872  T
Q  115 caaaattctg----gtttctgt-------ttttgttgtagtctttcaaactaatgcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatg-------acatg 196  Q
    ||||||||||      || |||       | | ||| | || | |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||       |||||    
T  21275873 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 21275972  T
Q  197 agagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttta 296  Q
    ||||||| ||   || | |||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||| |    
T  21275973 agagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 21276072  T
Q  297 tta 299  Q
    |||    
T  21276073 tta 21276075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 15 - 356
Target Start/End: Original strand, 24509703 - 24510061
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgagggagaattattttgttaatgcaa 114  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||| ||||||||| ||    
T  24509703 tattttacaaatttatggttccaacaattcactaatgcattagagaattgatggatgatttaaagtaaaagaatgatggagaattatgttgttaatgtaa 24509802  T
Q  115 caaaattctg-----gtttctgttt--ttgttgtagtc-tttcaaactaatgcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatg-------acatgaga 199  Q
    || |||| ||       || ||| |  ||||||| ||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||       ||||||||    
T  24509803 cataattttgtacaaaattatgtataattgttgttgtcgtgttaaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgaaccttcacatgaga 24509902  T
Q  200 gaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatg---atcatatacacttgaatcaatgttatggttta 296  Q
    |||||||  | | |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |  |||  ||| ||||||   ||||||||||||||||| ||||||| |||| |    
T  24509903 gaaaacacccatttgacttgaatcaatgttatggttcattaaacacacttttgtcaaatgttatgatcatcatatacacttgaattaatgttaaggttca 24510002  T
Q  297 ttaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcat 356  Q
    ||||  ||||||||| ||||  | || |  |||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  24510003 ttaa-tacccttttgtcaaagatcatgattatatacacttgaattaatgttaaggttcat 24510061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 154 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 24508914 - 24508708
Alignment:
Q  154 taatgcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatgac-------atgagagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacc 246  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||       |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24508914 taatgcccaaatgccaaacatttacagtacataatatgacccttctcatgagagaaaacacccctttgacttgaatcaatgttatggttcattaagcacc 24508815  T
Q  247 cacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgc 346  Q
    |  |||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| || |||| ||||| ||||| ||| ||||| || || | |||||||||||||||||||||    
T  24508814 cttttgccaaaggttatgatcttatacacttgaattaatgctaaggttcattaaacacccctttaccaaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatgc 24508715  T
Q  347 aaaggtt 353  Q
    |||||||    
T  24508714 aaaggtt 24508708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 121
Target Start/End: Original strand, 2887490 - 2887596
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgagggagaattattttgttaatgcaa 114  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||    
T  2887490 tattttacagatttatgattccagcaattcactcatgcattagagagttgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgttggtaatggaa 2887589  T
Q  115 caaaatt 121  Q
    |||||||    
T  2887590 caaaatt 2887596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 121
Target Start/End: Original strand, 2889212 - 2889318
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgagggagaattattttgttaatgcaa 114  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||    
T  2889212 tattttacagatttatgattccagcaattcactcatgcattagagagttgatgaatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgttggtaatggaa 2889311  T
Q  115 caaaatt 121  Q
    |||||||    
T  2889312 caaaatt 2889318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 274 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 11183173 - 11182989
Alignment:
Q  274 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 373  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| || || |||| |||| ||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||| ||| |||| |||| ||    
T  11183173 acttgaatcagtgttatggttcattaaacatccctttgtcaaaggttatgatcatatacacttgaatcaaggctaaggttcattaagtacccctttgcca 11183074  T
Q  374 aaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattccaatattttggaaatcaccaac 458  Q
    || ||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||  || |||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||    
T  11183073 aatgttccaatgtatatgaaagatttccatgaagagttacaacatttggttctaaattgattccattattttagaaatgaccaac 11182989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 15 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 24509032 - 24508926
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgagggagaattattttgttaatgcaa 114  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| ||||||||| ||    
T  24509032 tattttacaaatttatgattccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaaaagaatgatggagaattatgttgttaatgtaa 24508933  T
Q  115 caaaatt 121  Q
    || ||||    
T  24508932 cataatt 24508926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 274 - 459
Target Start/End: Original strand, 21275991 - 21276176
Alignment:
Q  274 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 373  Q
    |||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||| |  ||   |           
T  21275991 acttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcattattaataataaataat 21276090  T
Q  374 aaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattccaatattttggaaatcaccaaca 459  Q
    || ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21276091 aatgttccaatgtatatgaatggttcccatgaagagttacaacttttggttctaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 21276176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 15 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 11183370 - 11183263
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgagggagaattattttgttaatgcaa 114  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || ||| || ||    
T  11183370 tattttacaggtttatggtttcagcaatttactcatgcattagagaattgattgatgatttagagtaagagaatgagagagaattatgttattattgtaa 11183271  T
Q  115 caaaattc 122  Q
    ||||||||    
T  11183270 caaaattc 11183263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 274 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 24508846 - 24508764
Alignment:
Q  274 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcat 356  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  24508846 acttgaatcaatgttatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatgatcttatacacttgaattaatgctaaggttcat 24508764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 335 - 420
Target Start/End: Original strand, 12909533 - 12909618
Alignment:
Q  335 ttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtcaaaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactctt 420  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||  ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12909533 ttgaatcaatgctaaggttcattaaacacctttttgccaaaggttccaatgtatatgaatgattctcatgaaaagttacaactctt 12909618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 335 - 420
Target Start/End: Original strand, 12934640 - 12934725
Alignment:
Q  335 ttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtcaaaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactctt 420  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||  ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12934640 ttgaatcaatgctaaggttcattaaacacctttttgccaaaggttccaatgtatatgaatgattctcatgaaaagttacaactctt 12934725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 213 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 11183175 - 11183068
Alignment:
Q  213 tgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgc 312  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||| || ||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||| | || |||| |||||| |||| |||||    
T  11183175 tgacttgaatcagtgttatggttcattaaacatccctttgtcaaaggttatgatcatatacacttgaatcaaggctaaggttcattaagtacccctttgc 11183076  T
Q  313 caaatgtt 320  Q
    ||||||||    
T  11183075 caaatgtt 11183068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 215 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 24508787 - 24508682
Alignment:
Q  215 acttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgcca 314  Q
    |||||||| |||| || | |||||||| |||||  || | |||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||| ||| ||| |||    
T  24508787 acttgaattaatgctaaggttcattaaacacccctttaccaaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatgcaaaggtttattaagcgcccatttacca 24508688  T
Q  315 aatgtt 320  Q
    ||||||    
T  24508687 aatgtt 24508682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 274 - 376
Target Start/End: Original strand, 24509918 - 24510022
Alignment:
Q  274 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgtt---ataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttg 370  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||   || | ||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||  |||||||||    
T  24509918 acttgaatcaatgttatggttcattaaacacacttttgtcaaatgttatgatcatcatatacacttgaattaatgttaaggttcattaa-tacccttttg 24510016  T
Q  371 tcaaag 376  Q
    ||||||    
T  24510017 tcaaag 24510022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 403 - 457
Target Start/End: Original strand, 12909621 - 12909675
Alignment:
Q  403 tgaagagttacaactcttagttctaaagtgattccaatattttggaaatcaccaa 457  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  12909621 tgaagagttacaacttttggttctaaagtgattccattattttagaaatcaccaa 12909675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 403 - 457
Target Start/End: Original strand, 12934728 - 12934782
Alignment:
Q  403 tgaagagttacaactcttagttctaaagtgattccaatattttggaaatcaccaa 457  Q
    ||||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12934728 tgaagagttacaacttttggttctagagtgattccattattttggaaatcaccaa 12934782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 422 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 21936445 - 21936408
Alignment:
Q  422 gttctaaagtgattccaatattttggaaatcaccaaca 459  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21936445 gttctaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 21936408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 511 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 24587495 - 24587464
Alignment:
Q  511 aatgtcactaatgtcacccaactctatgtcac 542  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24587495 aatgtcactaatgtcacccaactctatgtcac 24587464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 511 - 549
Target Start/End: Complemental strand, 24618635 - 24618597
Alignment:
Q  511 aatgtcactaatgtcacccaactctatgtcacacaagtg 549  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24618635 aatgtcaccaatgtcacccaactctatgtcactcaagtg 24618597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 136; Significance: 1e-70; HSPs: 34)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 13 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 10341163 - 10340866
Alignment:
Q  13 aatattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgagggagaattattttgttaatgc 112  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10341163 aatattttacagatttatgattccagcaattcactcatgcattagagaatttatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgttgttaatgc 10341064  T
Q  113 aacaaaattctggtttctgtt-tttgttgtagtctttcaaactaatgcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatg-------acatgagagaaaa 204  Q
    ||||||||||||       || | |||| |  | | || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||       |||||||| |||     
T  10341063 aacaaaattctgtccaaaattgtatgtttttatatgtccaactaatgcccaaatgccaagcatttatggtgcattatatgactcttcacatgagaaaaag 10340964  T
Q  205 cattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggtttattaagc 302  Q
    ||   || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  10340963 cacctctttgacttgaatcaatgctatgattcattaagcacccttttgtcaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatgattcattaagc 10340866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 15 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 18608832 - 18608535
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgagggagaattattttgttaatgcaa 114  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  18608832 tattttacagatttatcgttccgtcaattaactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgttgttaatgtaa 18608733  T
Q  115 caaaattctggtttctgtttttgttgtagtctttcaaactaatgcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatg------acatgagagaaaacatt 208  Q
    ||||||||| |||||   || |||    | |   |||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||      |||||||||||||||      
T  18608732 caaaattcttgtttc---ttgtgt----gcc---caaattaatgcctaaatgccaaacatttgtagtgcattatatgaccttcacatgagagaaaacacc 18608643  T
Q  209 cctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggtttattaagcaccctt 308  Q
    ||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||| |    
T  18608642 cctttaacttgaatcaatgttatggttcattaagcacccctttgccaaaggttatgaacatatacacttgaatcactgctatggttcatcaagcacccct 18608543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 17 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 43957051 - 43956735
Alignment:
Q  17 ttttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgagggagaattattttgttaatgcaaca 116  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  43957051 ttttacaaatttatggtttcagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgatgaagaattatgttgttaatgcaaca 43956952  T
Q  117 aaattctg--------gtttct-gtt-tttgttgtagtctttcaaactaatgcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatg-------acatgaga 199  Q
    ||||| ||        || | | ||| | |||| | || | || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||       ||||||||    
T  43956951 aaattatgtccaaattgtgtgtagttgtgtgtttttgtatgtccaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgaga 43956852  T
Q  200 gaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggtttatta 299  Q
    |||| || || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| |  ||| ||||    
T  43956851 gaaagcactcatttgacttgaatcaatgctatgattcattaagcacctttttgccaaaggttataatcatatacatttgaatcaatgtaaatgttcatta 43956752  T
Q  300 agcacccttttgccaaa 316  Q
    ||||||  |||||||||    
T  43956751 agcacctatttgccaaa 43956735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 299
Target Start/End: Original strand, 34108229 - 34108533
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgagggagaattattttgttaatgcaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||| ||    
T  34108229 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 34108328  T
Q  115 caaaattctg-----gt---------ttctgtttttgttgtagtctttcaaactaatgcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatg-------ac 193  Q
    ||||||||||     ||         || |||  || |||||    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||       ||    
T  34108329 caaaattctgtccaagttgtgtgtagttgtgtggtttttgtatatattcaa-ctaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcac 34108427  T
Q  194 atgagagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggt 293  Q
    |||||||||| ||   || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||    
T  34108428 atgagagaaagcacctctttaacttgaatcaatgtcatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggt 34108527  T
Q  294 ttatta 299  Q
    | ||||    
T  34108528 tcatta 34108533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 14315115 - 14314813
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgagggagaattattttgttaatgcaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||| ||||||||| ||    
T  14315115 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 14315016  T
Q  115 caaaattctg----gtttctgt-------ttttgttgtagtctttcaaactaatgcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatg-------acatg 196  Q
    ||||||||||      || |||       | | ||| | |||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||       |||||    
T  14315015 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtctcttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 14314916  T
Q  197 agagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttta 296  Q
    ||||||||||    | | |||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||| |    
T  14314915 agagaaaacacctatttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 14314816  T
Q  297 tta 299  Q
    |||    
T  14314815 tta 14314813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 14318819 - 14318517
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgagggagaattattttgttaatgcaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||| ||||||||| ||    
T  14318819 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 14318720  T
Q  115 caaaattctg----gtttctgt-------ttttgttgtagtctttcaaactaatgcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatg-------acatg 196  Q
    ||||||||||      || |||       | | ||| | |||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||       |||||    
T  14318719 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtctcttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 14318620  T
Q  197 agagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttta 296  Q
    ||||||||||    | | |||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||| |    
T  14318619 agagaaaacacctatttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 14318520  T
Q  297 tta 299  Q
    |||    
T  14318519 tta 14318517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 26987193 - 26986891
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgagggagaattattttgttaatgcaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||| ||||||||| ||    
T  26987193 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 26987094  T
Q  115 caaaattctg----gtttctgt-------ttttgttgtagtctttcaaactaatgcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatg-------acatg 196  Q
    ||||||||||      || |||       | | ||| | || | |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||       |||||    
T  26987093 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 26986994  T
Q  197 agagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttta 296  Q
    ||||||| ||   || | |||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||| |    
T  26986993 agagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 26986894  T
Q  297 tta 299  Q
    |||    
T  26986893 tta 26986891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 274 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 43956836 - 43956649
Alignment:
Q  274 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 373  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||| |||  |||| ||    
T  43956836 acttgaatcaatgctatgattcattaagcacctttttgccaaaggttataatcatatacatttgaatcaatgtaaatgttcattaagcacctatttgcca 43956737  T
Q  374 aaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattccaatattttggaaatcaccaacatt 461  Q
    ||| || ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  43956736 aagattccaatgtatatgaaagatttccatgaagagttacaactcttgattctaaagtgattccattattttaaaaatcaccaacatt 43956649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 26982080 - 26981971
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgagggagaattattttgttaatgcaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||| ||||||||| ||    
T  26982080 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 26981981  T
Q  115 caaaattctg 124  Q
    ||||||||||    
T  26981980 caaaattctg 26981971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 18494380 - 18494272
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgagggagaattattttgttaatgcaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||| ||||||||| ||    
T  18494380 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 18494281  T
Q  115 caaaattct 123  Q
    |||||||||    
T  18494280 caaaattct 18494272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 25953363 - 25953019
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgagggagaattattttgttaatgcaa 114  Q
    |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||| ||    
T  25953363 tattgtacatatttatggttcaagcaattcactcatgcattagacaattgatggatgatttagagtatgagaatgatggagaattatgttgttaatgtaa 25953264  T
Q  115 caaaattctg-----gtttctgtttttgttgtagtctttcaaactaatgcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatg-------acatgagagaa 202  Q
    ||||||||||       || |||| || ||||  |  | |||| ||||        ||||| ||||||||||||||||||||       |||||||||||    
T  25953263 caaaattctgtccaaaattgtgttgttattgt--ttgtccaaattaat--------gccaaacatttatagtgcattatatgaccattcacatgagagaa 25953174  T
Q  203 aacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttg-cgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggtttattaag 301  Q
    ||||  | | |||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||  ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || |||    
T  25953173 aacacccatttgacttaaatcaattttatggttcattaagcatccttttgccaaaatgttatgatcatatacacttgaatcaatattaaggttcatcaag 25953074  T
Q  302 cacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcat 356  Q
    ||| |  ||||||||  | || |  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25953073 cactcaattgccaaagctcatgataatatacacttgaatcaatgcaagggttcat 25953019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 274 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 18608636 - 18608491
Alignment:
Q  274 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 373  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||| |||| |||| ||    
T  18608636 acttgaatcaatgttatggttcattaagcacccctttgccaaaggttatgaacatatacacttgaatcactgctatggttcatcaagcacccctttgcca 18608537  T
Q  374 aaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactctt 420  Q
    ||| |  |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18608536 aagatcccaat-tatatgaatgattcccatgaagagttacaactctt 18608491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 274 - 459
Target Start/End: Original strand, 34108449 - 34108634
Alignment:
Q  274 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 373  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||| |  ||   |           
T  34108449 acttgaatcaatgtcatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcattattaataataaataat 34108548  T
Q  374 aaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattccaatattttggaaatcaccaaca 459  Q
    || ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34108549 aatgttccaatgtatatgaatggttcccatgaagagttacaacttttggttctaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 34108634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 274 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 14318601 - 14318416
Alignment:
Q  274 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 373  Q
    |||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||| |  ||   |           
T  14318601 acttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcattattaataataaataat 14318502  T
Q  374 aaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattccaatattttggaaatcaccaaca 459  Q
    || ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14318501 aatgttccaatgtatatgaatggttcccatgaagagttacaacttttggttctaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 14318416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 274 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 18494163 - 18493978
Alignment:
Q  274 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 373  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||| |  ||   |           
T  18494163 acttgaatcaatgtcatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcattattaataataaataat 18494064  T
Q  374 aaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattccaatattttggaaatcaccaaca 459  Q
    || ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18494063 aatgttccaatgtatatgaatggttcccatgaagagttacaacttttggttctaaattgattccattattttggaaatcaccaaca 18493978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 274 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 26986975 - 26986790
Alignment:
Q  274 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 373  Q
    |||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||| |  ||   |           
T  26986975 acttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcattattaataataaataat 26986876  T
Q  374 aaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattccaatattttggaaatcaccaaca 459  Q
    || ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26986875 aatgttccaatgtatatgaatggttcccatgaagagttacaacttttggttctaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 26986790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 274 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 26981861 - 26981676
Alignment:
Q  274 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 373  Q
    |||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||  | ||||||| |  ||   |           
T  26981861 acttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccgtatatacttgaatcaatgtcatggttcattattaataataaataat 26981762  T
Q  374 aaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattccaatattttggaaatcaccaaca 459  Q
    || ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26981761 aatgttccaatgtatatgaatggttcccatgaagagttacaacttttggttctaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 26981676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 87
Target Start/End: Original strand, 18885065 - 18885136
Alignment:
Q  16 attttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaa 87  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  18885065 attttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgattgatgatttagagtaagagaa 18885136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 45 - 300
Target Start/End: Original strand, 1781869 - 1782118
Alignment:
Q  45 actcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgagggagaattattttgttaatgcaacaaaattctggtttctgtttttgttgtagt 144  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||  ||||      |||||| ||||    ||    
T  1781869 actcatgaattagagaattggtggatgattttgagtaagagaatgagggataattatgttgttaatgtaacggaatt------tctgttgttgt----gt 1781958  T
Q  145 ctttcaaactaatgcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatgac-------atgagagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattca 237  Q
    | | |||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||       ||||||||||| | |  | |||||||||||||||||||| ||||    
T  1781959 cctccaaattaatgtccaaatgtcaaacatttatagtgcagtatacgacctttcacatgagagaaaatactattttgacttgaatcaatgttatggttca 1782058  T
Q  238 ttaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggtttattaa 300  Q
    |||||||| || || | ||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1782059 ttaagcacgcattttctaaatgttat---catatacacttgaatcaatgttatggttcattaa 1782118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 151 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 18494233 - 18494079
Alignment:
Q  151 aactaatgcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatgac-------atgagagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagc 243  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||       |||||||||| ||  | | | |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18494233 aactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcac-cttttaacttgaatcaatgtcatgattcattaagc 18494135  T
Q  244 acccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggtttatta 299  Q
    ||||  |||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||| ||||    
T  18494134 acccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcatta 18494079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 274 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 14314897 - 14314712
Alignment:
Q  274 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 373  Q
    |||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||| |  ||   |           
T  14314897 acttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcattattaataataaataat 14314798  T
Q  374 aaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattccaatattttggaaatcaccaaca 459  Q
    || ||| ||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  14314797 aatgttccaatgtatacgaatggttcccattaagagttacaacttttggttctaaagtaattccattattttgaaaatcaccaaca 14314712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 151 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 26981932 - 26981777
Alignment:
Q  151 aactaatgcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatgac-------atgagagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagc 243  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||       |||||||||| ||   || | |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  26981932 aactaatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagc 26981833  T
Q  244 acccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggtttatta 299  Q
    ||||  |||| ||||||||| | | |||| |||||||||||||| |||||| ||||    
T  26981832 acccttttgccaaaggttataaccgtatatacttgaatcaatgtcatggttcatta 26981777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 274 - 420
Target Start/End: Original strand, 1782036 - 1782179
Alignment:
Q  274 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 373  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| | |||||||||   ||||||||||||||||||||  | ||||||| ||  ||   |||| ||    
T  1782036 acttgaatcaatgttatggttcattaagcacgcattttctaaatgttat---catatacacttgaatcaatgttatggttcattaatcactgatttgcca 1782132  T
Q  374 aaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactctt 420  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||| | | ||||||||||||||||    
T  1782133 aaggttccaatacatatgaatgattcacgtaaagagttacaactctt 1782179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 274 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 10340953 - 10340882
Alignment:
Q  274 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatg 345  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  10340953 acttgaatcaatgctatgattcattaagcacccttttgtcaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatg 10340882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 512 - 549
Target Start/End: Complemental strand, 34229674 - 34229637
Alignment:
Q  512 atgtcactaatgtcacccaactctatgtcacacaagtg 549  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34229674 atgtcactaatgtcacccaactctatgtcacacaagtg 34229637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 412 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 10340745 - 10340696
Alignment:
Q  412 acaactcttagttctaaagtgattccaatattttggaaatcaccaacatt 461  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  10340745 acaacttttggttctaaagtgattccattatttgggaaatcaccaacatt 10340696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 419 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 18608472 - 18608435
Alignment:
Q  419 ttagttctaaagtgattccaatattttggaaatcacca 456  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18608472 ttagttctaaagtgattccattattttggaaatcacca 18608435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 215 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 25953101 - 25953012
Alignment:
Q  215 acttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggtttattaagcac 304  Q
    |||||||||||| ||| | ||||| |||||| || |||| |||| | ||||| |||||||||||||||||||  | |||| |||||||||    
T  25953101 acttgaatcaatattaaggttcatcaagcactcaattgccaaagctcatgataatatacacttgaatcaatgcaagggttcattaagcac 25953012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 511 - 549
Target Start/End: Original strand, 5033265 - 5033303
Alignment:
Q  511 aatgtcactaatgtcacccaactctatgtcacacaagtg 549  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5033265 aatgtcaccaatgtcacccaactctatgtcacccaagtg 5033303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 511 - 549
Target Start/End: Complemental strand, 33841625 - 33841587
Alignment:
Q  511 aatgtcactaatgtcacccaactctatgtcacacaagtg 549  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33841625 aatgtcaccaatgtcacccaactctatgtcacccaagtg 33841587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 511 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 5033195 - 5033158
Alignment:
Q  511 aatgtcactaatgtcacccaactctatgtcacacaagt 548  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5033195 aatgtcaccaatgtcacccaactctatgtcacccaagt 5033158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 511 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 10086791 - 10086754
Alignment:
Q  511 aatgtcactaatgtcacccaactctatgtcacacaagt 548  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  10086791 aatgtcactaatgtcacccaattctatgtcacccaagt 10086754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 511 - 548
Target Start/End: Original strand, 33841695 - 33841732
Alignment:
Q  511 aatgtcactaatgtcacccaactctatgtcacacaagt 548  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33841695 aatgtcaccaatgtcacccaactctatgtcacccaagt 33841732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 511 - 548
Target Start/End: Original strand, 35441073 - 35441110
Alignment:
Q  511 aatgtcactaatgtcacccaactctatgtcacacaagt 548  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35441073 aatgtcaccaatgtcacccaactctatgtcacccaagt 35441110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0223 (Bit Score: 105; Significance: 4e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0223
Description:

Target: scaffold0223; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 2223 - 1921
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgagggagaattattttgttaatgcaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||| ||    
T  2223 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 2124  T
Q  115 caaaattctg-----gtt-tctgt-----ttttgttgtagtctttcaaactaatgcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatg-------acatg 196  Q
     |||||||||     ||| | |||     | | ||| | || | |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||       |||||    
T  2123 taaaattctgtccaagttgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 2024  T
Q  197 agagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttta 296  Q
    ||||||||||   || | |||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||| |    
T  2023 agagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 1924  T
Q  297 tta 299  Q
    |||    
T  1923 tta 1921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0223; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 274 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 2005 - 1820
Alignment:
Q  274 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 373  Q
    |||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||| |  ||   |           
T  2005 acttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcattattaataataaatagt 1906  T
Q  374 aaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattccaatattttggaaatcaccaaca 459  Q
    || ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  1905 aatgttccaatgtatatgaatggttcccatgaagagatacaacttttggttctaaagtgattccattattttgaaaatcaccaaca 1820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 105; Significance: 4e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 316
Target Start/End: Original strand, 173358 - 173662
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgagggagaattattttgttaatgcaa 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| ||||| ||| ||    
T  173358 tattttagagatttatggttccagcaattcacctatacattagagaattgatggatgatttagagtaagagaattaggaagaattatgttgttgatgtaa 173457  T
Q  115 caaaattctggtttctgtttttgttgtagtctttcaaactaatgcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatg-------acatgagagaaaacat 207  Q
    |||||||||  ||||||| ||  ||||  | | | ||| |||||| |||||  ||| ||||||||| ||||||||||       |||||| ||||||||     
T  173458 caaaattcttttttctgtatt--ttgt--tatgttaaattaatgcacaaatatcaaacatttatagcgcattatatgacccttcacatgatagaaaacac 173553  T
Q  208 tcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggtttattaagcaccct 307  Q
     | | ||||||||||||||| || | |||||||| ||| |  |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  173554 ccatttgacttgaatcaatgctaaggttcattaaacactcctttgtcaaatgttatgatcatatacacttgaatcaatgttaaggttcattaagcaccct 173653  T
Q  308 tttgccaaa 316  Q
    |||||||||    
T  173654 tttgccaaa 173662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 274 - 420
Target Start/End: Original strand, 173561 - 173707
Alignment:
Q  274 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 373  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||| ||| | |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||| ||    
T  173561 acttgaatcaatgctaaggttcattaaacactcctttgtcaaatgttatgatcatatacacttgaatcaatgttaaggttcattaagcacccttttgcca 173660  T
Q  374 aaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactctt 420  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  173661 aaggttccaatgtatatgaatgattcccatgaatagttacaactctt 173707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 100; Significance: 4e-49; HSPs: 37)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 5440492 - 5440217
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgagggagaattattttgttaatgcaa 114  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  5440492 tattttacagatgtatggttccagcaatttactcaagctttagagaattgatcgatgatttagagtaagggaatgagggagaattatgttgttaatgtaa 5440393  T
Q  115 -caaaattctggtttctgtttttgttgtagtctttcaaactaatgcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatg-------acatgagagaaaaca 206  Q
      |||||||| |||  |||| || |||| ||  | |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||    
T  5440392 taaaaattcttgttcttgttgtttttgt-gt-gtccaaattaaagcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatgacccttcacatgagagaaaaca 5440295  T
Q  207 ttcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaa 284  Q
      | | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  || | ||| ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  5440294 cccatttgacttgaatcaatgttatggttcattaatcacccctttcccaaaagttatgaccatatacacttaaatcaa 5440217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 5449502 - 5449227
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgagggagaattattttgttaatgcaa 114  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  5449502 tattttacagatgtatggttccagcaatttactcaagctttagagaattgatcgatgatttagagtaagggaatgagggagaattatgttgttaatgtaa 5449403  T
Q  115 -caaaattctggtttctgtttttgttgtagtctttcaaactaatgcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatg-------acatgagagaaaaca 206  Q
      |||||||| |||  |||| || |||| ||  | |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||    
T  5449402 taaaaattcttgttcttgttgtttttgt-gt-gtccaaattaaagcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatgacccttcacatgagagaaaaca 5449305  T
Q  207 ttcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaa 284  Q
      | | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  || | ||| ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  5449304 cccatttgacttgaatcaatgttatggttcattaatcacccctttcccaaaagttatgaccatatacacttaaatcaa 5449227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 299
Target Start/End: Original strand, 12856789 - 12857091
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgagggagaattattttgttaatgcaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||| ||||||||| ||    
T  12856789 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 12856888  T
Q  115 caaaattctg----gtttctgt-------ttttgttgtagtctttcaaactaatgcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatg-------acatg 196  Q
    ||||||||||      || |||       | | ||| | || | |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||       |||||    
T  12856889 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 12856988  T
Q  197 agagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttta 296  Q
    ||||||| ||   || | |||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||| |    
T  12856989 agagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 12857088  T
Q  297 tta 299  Q
    |||    
T  12857089 tta 12857091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 4181585 - 4181357
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgagggagaattattttgttaatgcaa 114  Q
    |||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4181585 tattttacgggtttatggttcgagcaat-cactcatgcattagagaattgatggatgatttagattaagagaatgagggagaattatgttgttaatgcaa 4181487  T
Q  115 caaaattctggtttctgtttttgttgtagtctttcaaactaatgcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatgac-------atgagagaaaacat 207  Q
    ||||||||| |||| |||          || | ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||       |||||||||||||     
T  4181486 caaaattctcgtttatgt----------gtgtgtcaaattaatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattatatgactcttcatatgagagaaaacac 4181397  T
Q  208 tcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcaccc 247  Q
       | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  4181396 cattttgacttgaatcaatgttaaggttcattaagcaccc 4181357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 15 - 124
Target Start/End: Original strand, 14610364 - 14610473
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgagggagaattattttgttaatgcaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| ||    
T  14610364 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 14610463  T
Q  115 caaaattctg 124  Q
    ||||||||||    
T  14610464 caaaattctg 14610473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 15 - 299
Target Start/End: Original strand, 26051021 - 26051323
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgagggagaattattttgttaatgcaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||| ||||||||| ||    
T  26051021 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 26051120  T
Q  115 caaaattctg----gtttctgt-------ttttgttgtagtctttcaaactaatgcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatg-------acatg 196  Q
    ||||||||||      || |||       | | ||| | || | |  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||       |||||    
T  26051121 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgcctaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 26051220  T
Q  197 agagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttta 296  Q
    ||||||| ||   || | |||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||| |    
T  26051221 agagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 26051320  T
Q  297 tta 299  Q
    |||    
T  26051321 tta 26051323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 15 - 299
Target Start/End: Original strand, 26056134 - 26056436
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgagggagaattattttgttaatgcaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||| ||||||||| ||    
T  26056134 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 26056233  T
Q  115 caaaattctg----gtttctgt-------ttttgttgtagtctttcaaactaatgcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatg-------acatg 196  Q
    ||||||||||      || |||       | | ||| | || | |  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||       |||||    
T  26056234 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgcctaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 26056333  T
Q  197 agagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttta 296  Q
    ||||||| ||   || | |||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||| |    
T  26056334 agagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 26056433  T
Q  297 tta 299  Q
    |||    
T  26056434 tta 26056436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 15 - 299
Target Start/End: Original strand, 26060380 - 26060682
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgagggagaattattttgttaatgcaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||| ||||||||| ||    
T  26060380 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 26060479  T
Q  115 caaaattctg----gtttctgt-------ttttgttgtagtctttcaaactaatgcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatg-------acatg 196  Q
    ||||||||||      || |||       | | ||| | || | |  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||       |||||    
T  26060480 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgcctaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 26060579  T
Q  197 agagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttta 296  Q
    ||||||| ||   || | |||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||| |    
T  26060580 agagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 26060679  T
Q  297 tta 299  Q
    |||    
T  26060680 tta 26060682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 15 - 299
Target Start/End: Original strand, 26065493 - 26065795
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgagggagaattattttgttaatgcaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||| ||||||||| ||    
T  26065493 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 26065592  T
Q  115 caaaattctg----gtttctgt-------ttttgttgtagtctttcaaactaatgcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatg-------acatg 196  Q
    ||||||||||      || |||       | | ||| | || | |  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||       |||||    
T  26065593 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgcctaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 26065692  T
Q  197 agagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttta 296  Q
    ||||||| ||   || | |||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||| |    
T  26065693 agagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 26065792  T
Q  297 tta 299  Q
    |||    
T  26065793 tta 26065795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 121
Target Start/End: Original strand, 12851674 - 12851780
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgagggagaattattttgttaatgcaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||| ||    
T  12851674 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 12851773  T
Q  115 caaaatt 121  Q
    |||||||    
T  12851774 caaaatt 12851780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 274 - 459
Target Start/End: Original strand, 12851894 - 12852079
Alignment:
Q  274 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 373  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||| |  ||   |           
T  12851894 acttgaatcaatgtcatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcattattaataataaataat 12851993  T
Q  374 aaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattccaatattttggaaatcaccaaca 459  Q
    || || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12851994 aatgtaacaatgtatatgaatggttcccatgaagagttacaacttttggttctaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 12852079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 274 - 459
Target Start/End: Original strand, 12857007 - 12857192
Alignment:
Q  274 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 373  Q
    |||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||| |  ||   |           
T  12857007 acttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcattattaataataaataat 12857106  T
Q  374 aaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattccaatattttggaaatcaccaaca 459  Q
    || ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12857107 aatgttccaatgtatatgaatggttcccatgaagagttacaacttttggttctaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 12857192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 274 - 459
Target Start/End: Original strand, 26051239 - 26051424
Alignment:
Q  274 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 373  Q
    |||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||| |  ||   |           
T  26051239 acttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcattattaataataaataat 26051338  T
Q  374 aaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattccaatattttggaaatcaccaaca 459  Q
    || ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26051339 aatgttccaatgtatatgaatggttcccatgaagagttacaacttttggttctaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 26051424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 274 - 459
Target Start/End: Original strand, 26056352 - 26056537
Alignment:
Q  274 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 373  Q
    |||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||| |  ||   |           
T  26056352 acttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcattatcaataataaataat 26056451  T
Q  374 aaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattccaatattttggaaatcaccaaca 459  Q
    || ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26056452 aatgttccaatgtatatgaatggttcccatgaagagttacaacttttggttctaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 26056537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 274 - 459
Target Start/End: Original strand, 26060598 - 26060783
Alignment:
Q  274 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 373  Q
    |||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||| |  ||   |           
T  26060598 acttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcattattaataataaataat 26060697  T
Q  374 aaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattccaatattttggaaatcaccaaca 459  Q
    || ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26060698 aatgttccaatgtatatgaatggttcccatgaagagttacaacttttggttctaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 26060783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 274 - 459
Target Start/End: Original strand, 26065711 - 26065896
Alignment:
Q  274 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 373  Q
    |||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||| |  ||   |           
T  26065711 acttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcattatcaataataaataat 26065810  T
Q  374 aaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattccaatattttggaaatcaccaaca 459  Q
    || ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26065811 aatgttccaatgtatatgaatggttcccatgaagagttacaacttttggttctaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 26065896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 37460047 - 37459938
Alignment:
Q  13 aatattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgagggagaattattttgttaatgc 112  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||     
T  37460047 aatattttacagatatatggtttcagcaattcgctaatgcatcagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgtgggagaattatgttgttcatgt 37459948  T
Q  113 aacaaaattc 122  Q
    |||| |||||    
T  37459947 aacataattc 37459938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 15 - 110
Target Start/End: Original strand, 11056625 - 11056720
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgagggagaattattttgttaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||   |||||||| ||||||||    
T  11056625 tattttacagatttatggttccaacaattcactcatgcattaaagaattgatggatgatttaaagtaagagaatgataaagaattatgttgttaat 11056720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 15 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 35352495 - 35352221
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgagggagaattattttgttaatgcaa 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||          ||||||||| |||||||||  |    
T  35352495 tattttatagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatggtttatagtaa----------gagaattatgttgttaatgtga 35352406  T
Q  115 caaaattctggtttctgtttttgttgtagtctttcaaactaatgcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatgac--------atgagagaaaaca 206  Q
    ||||||||| ||      || |||||| |||   |||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||        |||||||||||      
T  35352405 caaaattcttgt-----attgtgttgt-gtc---caaattaatgcccaaatgtcaagcatatatggtgcattatatgacccttcaaaatgagagaaaatg 35352315  T
Q  207 ttcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggtttattaa 300  Q
    |  || |||||||| |||| | | || ||||||||||||||| ||   |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  35352314 tctctttgacttgattcaacgatttggttcattaagcacccatttatcaaaggttatgattatatacacttgaatcaatgttatgattcattaa 35352221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 151 - 299
Target Start/End: Original strand, 12851823 - 12851978
Alignment:
Q  151 aactaatgcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatgac-------atgagagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagc 243  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||       |||||||||| ||    | | |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12851823 aactaatgcccaaatgtcaagtatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctatttaacttgaatcaatgtcatgattcattaagc 12851922  T
Q  244 acccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggtttatta 299  Q
    ||||  |||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||| ||||    
T  12851923 acccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcatta 12851978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 192 - 299
Target Start/End: Original strand, 14610524 - 14610631
Alignment:
Q  192 acatgagagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatg 291  Q
    |||||||||||| ||   || |||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||    
T  14610524 acatgagagaaagcacctctttgacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatg 14610623  T
Q  292 gtttatta 299  Q
    ||| ||||    
T  14610624 gttcatta 14610631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 274 - 345
Target Start/End: Original strand, 14610547 - 14610618
Alignment:
Q  274 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatg 345  Q
    |||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  14610547 acttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatg 14610618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 274 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 5440286 - 5440217
Alignment:
Q  274 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaa 343  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  5440286 acttgaatcaatgttatggttcattaatcacccctttcccaaaagttatgaccatatacacttaaatcaa 5440217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 274 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 5449296 - 5449227
Alignment:
Q  274 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaa 343  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  5449296 acttgaatcaatgttatggttcattaatcacccctttcccaaaagttatgaccatatacacttaaatcaa 5449227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 403 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 2248909 - 2248853
Alignment:
Q  403 tgaagagttacaactcttagttctaaagtgattccaatattttggaaatcaccaaca 459  Q
    ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  2248909 tgaagagttactacttttggttctaaagtgattccattattttagaaatcaccaaca 2248853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 5436736 - 5436692
Alignment:
Q  13 aatattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattag 57  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  5436736 aatattttacagatttatggttcaagcaattcactaatgcattag 5436692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 367 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 37459815 - 37459771
Alignment:
Q  367 tttgtcaaaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagtt 411  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37459815 tttgccaaaggttacaatgtatatgaatgattcccatgaagagtt 37459771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 290 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 35352290 - 35352119
Alignment:
Q  290 tggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtcaaaggttacaatgtata 389  Q
    ||||| ||||||||||| |||  |||| ||||| |  |||||||||||||||||||  | | ||||| ||  | || |||||||||| || |||| ||||    
T  35352290 tggttcattaagcacccatttatcaaaggttatgattatatacacttgaatcaatgttatgattcattaaatatccatttgtcaaagattccaatatata 35352191  T
Q  390 tgaatgattctcatgaagagttacaactcttagttctaaagtgattccaatattttggaaatcaccaacatt 461  Q
    | ||| |||||||| || |  || |||| ||  ||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  35352190 taaataattctcataaaaacctataacttttgattctaaagtaatttcattatttcggaaatcaccaacatt 35352119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 154 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 37459917 - 37459802
Alignment:
Q  154 taatgcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatg-------acatgagagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacc 246  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||       |||||||||||||||  | | ||| ||||||  |||||||| |||||||| |||     
T  37459917 taatgcccaaatgtcaagtatttatagtgcattatatgtccattcacatgagagaaaacacgcatttgatttgaattgatgttatggttcattaaacact 37459818  T
Q  247 cacttgcgaaaggtta 262  Q
    || |||| ||||||||    
T  37459817 catttgccaaaggtta 37459802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 405 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 4181330 - 4181276
Alignment:
Q  405 aagagttacaactcttagttctaaagtgattccaatattttggaaatcaccaaca 459  Q
    ||||||| ||||| ||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4181330 aagagttgcaacttttgattttaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 4181276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 274 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 4181389 - 4181347
Alignment:
Q  274 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaa 316  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||    
T  4181389 acttgaatcaatgttaaggttcattaagcacccctttgccaaa 4181347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 511 - 549
Target Start/End: Original strand, 11016973 - 11017011
Alignment:
Q  511 aatgtcactaatgtcacccaactctatgtcacacaagtg 549  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11016973 aatgtcaccaatgtcacccaactctatgtcacccaagtg 11017011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 511 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 11016903 - 11016866
Alignment:
Q  511 aatgtcactaatgtcacccaactctatgtcacacaagt 548  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11016903 aatgtcaccaatgtcacccaactctatgtcacccaagt 11016866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 511 - 548
Target Start/End: Original strand, 34854799 - 34854836
Alignment:
Q  511 aatgtcactaatgtcacccaactctatgtcacacaagt 548  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34854799 aatgtcaccaatgtcacccaactctatgtcacccaagt 34854836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 511 - 548
Target Start/End: Original strand, 41018332 - 41018369
Alignment:
Q  511 aatgtcactaatgtcacccaactctatgtcacacaagt 548  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41018332 aatgtcaccaatgtcacccaactctatgtcacccaagt 41018369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 511 - 548
Target Start/End: Original strand, 45231954 - 45231991
Alignment:
Q  511 aatgtcactaatgtcacccaactctatgtcacacaagt 548  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45231954 aatgtcaccaatgtcacccaactctatgtcacccaagt 45231991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 377 - 417
Target Start/End: Original strand, 14610650 - 14610690
Alignment:
Q  377 gttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaact 417  Q
    ||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  14610650 gttccaatgtatatgaatggttcccatgaagagttacaact 14610690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 80; Significance: 3e-37; HSPs: 3)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 123
Target Start/End: Original strand, 144096 - 144206
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgattt--agaataagagaatgagggagaattattttgttaatgc 112  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  144096 tattttacagatttatggtttcagcaattcactcatgcattagagaattaatggatgatttagagagcaagagaatgagggagaattatgttgttaatgc 144195  T
Q  113 aacaaaattct 123  Q
    |||||||||||    
T  144196 aacaaaattct 144206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 274 - 420
Target Start/End: Original strand, 144288 - 144434
Alignment:
Q  274 acttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatgaagaacccttttgtca 373  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||| | |||| |||||||| |||||||||| |||||| ||| |||  |||| ||    
T  144288 acttgaatcaatgttatggttcattaagtacccttttgccaagggttatgatcatacacacttgagtcaatgcaaaagttcattaagcacctatttgcca 144387  T
Q  374 aaggttacaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactctt 420  Q
    |||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  144388 aaggttccaatgtatatgaaagactctcatgaagagttacaactctt 144434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #3
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 163 - 316
Target Start/End: Original strand, 144229 - 144389
Alignment:
Q  163 aatgccaagcatttatagtgcattatatgac-------atgagagaaaacattcctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccacttgcga 255  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||       |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||| |    
T  144229 aatgccaagtatttatagtgcattatatgacccttcacatgagagaaaacacccctttgacttgaatcaatgttatggttcattaagtacccttttgcca 144328  T
Q  256 aaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggtttattaagcacccttttgccaaa 316  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||  |  ||| ||||||||||  |||||||||    
T  144329 agggttatgatcatacacacttgagtcaatgcaaaagttcattaagcacctatttgccaaa 144389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 27250 - 27217
Alignment:
Q  515 tcactaatgtcacccaactctatgtcacacaagt 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27250 tcactaatgtcacccaactctatgtcacccaagt 27217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University