View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF21638_low_5 (Length: 229)

Name: NF21638_low_5
Description: NF21638
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF21638_low_5
NF21638_low_5
[»] chr2 (57 HSPs)
chr2 (3-212)||(32214869-32215078)
chr2 (3-212)||(6726000-6726209)
chr2 (3-212)||(21155008-21155217)
chr2 (3-212)||(18808948-18809157)
chr2 (3-212)||(23709480-23709689)
chr2 (3-212)||(23711961-23712170)
chr2 (3-212)||(39682318-39682527)
chr2 (3-212)||(571402-571611)
chr2 (3-212)||(23130867-23131076)
chr2 (3-212)||(23133334-23133543)
chr2 (3-212)||(26505384-26505593)
chr2 (3-212)||(26507862-26508071)
chr2 (3-212)||(34402470-34402679)
chr2 (6-212)||(24367782-24367988)
chr2 (3-212)||(24898143-24898353)
chr2 (3-212)||(24900626-24900836)
chr2 (3-212)||(24903103-24903313)
chr2 (3-212)||(24905580-24905790)
chr2 (3-212)||(24908055-24908265)
chr2 (3-212)||(23135595-23135804)
chr2 (3-212)||(32039446-32039655)
chr2 (3-212)||(28577104-28577313)
chr2 (3-212)||(22105417-22105627)
chr2 (3-212)||(45029802-45030011)
chr2 (3-176)||(43137304-43137477)
chr2 (3-177)||(24529511-24529686)
chr2 (3-212)||(38967379-38967588)
chr2 (83-212)||(24642802-24642933)
chr2 (3-160)||(23060521-23060679)
chr2 (3-160)||(23076450-23076608)
chr2 (3-160)||(22337123-22337281)
chr2 (3-160)||(22731189-22731347)
chr2 (3-160)||(22738135-22738292)
chr2 (13-175)||(19671848-19672010)
chr2 (3-160)||(298769-298928)
chr2 (11-160)||(23654341-23654491)
chr2 (3-160)||(23285873-23286027)
chr2 (121-190)||(22173799-22173868)
chr2 (3-76)||(24643034-24643107)
chr2 (10-175)||(23708558-23708725)
chr2 (11-96)||(38134-38219)
chr2 (3-160)||(23660031-23660188)
chr2 (160-212)||(20261381-20261433)
chr2 (69-160)||(7688-7779)
chr2 (3-123)||(25616193-25616314)
chr2 (9-116)||(28405990-28406099)
chr2 (90-166)||(22459511-22459587)
chr2 (137-177)||(29601478-29601518)
chr2 (14-143)||(23103369-23103497)
chr2 (161-207)||(10684718-10684764)
chr2 (3-56)||(23040249-23040302)
chr2 (3-156)||(7679593-7679745)
chr2 (76-177)||(23791357-23791458)
chr2 (3-71)||(8946665-8946734)
chr2 (14-147)||(32451896-32452031)
chr2 (10-48)||(18786971-18787009)
chr2 (76-177)||(20520130-20520230)
[»] chr8 (64 HSPs)
chr8 (3-212)||(16413264-16413473)
chr8 (3-212)||(14409392-14409601)
chr8 (3-212)||(1484407-1484616)
chr8 (3-212)||(5853240-5853449)
chr8 (3-212)||(15203179-15203388)
chr8 (3-212)||(20403232-20403441)
chr8 (3-212)||(22001758-22001967)
chr8 (3-212)||(20046143-20046352)
chr8 (3-212)||(4483286-4483494)
chr8 (3-212)||(4542321-4542530)
chr8 (3-212)||(19896270-19896483)
chr8 (3-207)||(14823779-14823982)
chr8 (3-177)||(41598193-41598367)
chr8 (3-212)||(45290642-45290852)
chr8 (11-212)||(15070571-15070774)
chr8 (3-212)||(19936951-19937163)
chr8 (3-177)||(26223924-26224098)
chr8 (14-175)||(19801367-19801527)
chr8 (3-190)||(25484245-25484425)
chr8 (3-175)||(18818348-18818522)
chr8 (3-160)||(16092297-16092455)
chr8 (3-148)||(7372786-7372932)
chr8 (111-212)||(24485992-24486093)
chr8 (3-160)||(6759266-6759421)
chr8 (3-160)||(20536216-20536374)
chr8 (3-161)||(23406387-23406548)
chr8 (3-160)||(28648999-28649157)
chr8 (3-143)||(21923900-21924041)
chr8 (121-210)||(32810054-32810143)
chr8 (11-145)||(21918969-21919105)
chr8 (7-140)||(26219726-26219858)
chr8 (3-160)||(22875073-22875230)
chr8 (3-140)||(26225268-26225404)
chr8 (3-160)||(22626744-22626901)
chr8 (13-166)||(17612059-17612213)
chr8 (3-160)||(18879191-18879344)
chr8 (71-177)||(13508022-13508129)
chr8 (13-177)||(13597554-13597720)
chr8 (14-177)||(20498581-20498746)
chr8 (11-145)||(31971273-31971407)
chr8 (4-116)||(21285606-21285719)
chr8 (3-160)||(23648561-23648719)
chr8 (3-123)||(18678094-18678215)
chr8 (14-96)||(45131017-45131098)
chr8 (3-123)||(32121740-32121861)
chr8 (3-48)||(6520376-6520421)
chr8 (3-48)||(38855319-38855364)
chr8 (76-177)||(37116431-37116532)
chr8 (14-96)||(16199664-16199746)
chr8 (14-94)||(21389473-21389552)
chr8 (14-94)||(21396003-21396082)
chr8 (14-94)||(21778799-21778878)
chr8 (14-94)||(21790496-21790575)
chr8 (161-212)||(1326991-1327042)
chr8 (10-48)||(983474-983512)
chr8 (76-177)||(17266930-17267031)
chr8 (10-48)||(23760912-23760950)
chr8 (161-207)||(35026849-35026895)
chr8 (14-109)||(5866280-5866376)
chr8 (11-48)||(17140932-17140969)
chr8 (11-48)||(21491011-21491048)
chr8 (76-160)||(17439461-17439544)
chr8 (9-56)||(21673718-21673766)
chr8 (9-56)||(26355757-26355805)
[»] chr6 (57 HSPs)
chr6 (3-212)||(34963378-34963587)
chr6 (3-212)||(30676658-30676867)
chr6 (3-212)||(12742322-12742531)
chr6 (3-212)||(19005051-19005260)
chr6 (3-212)||(22782232-22782441)
chr6 (3-212)||(24422552-24422761)
chr6 (3-212)||(33861799-33862008)
chr6 (3-212)||(33864283-33864492)
chr6 (3-212)||(8055034-8055243)
chr6 (3-212)||(18334540-18334749)
chr6 (3-212)||(19858867-19859076)
chr6 (3-212)||(2291128-2291337)
chr6 (2-212)||(25688506-25688716)
chr6 (3-212)||(1540859-1541068)
chr6 (3-212)||(25656634-25656843)
chr6 (3-212)||(26924588-26924797)
chr6 (3-214)||(1595554-1595765)
chr6 (3-190)||(25754814-25755001)
chr6 (3-190)||(20556864-20557049)
chr6 (14-177)||(18456735-18456898)
chr6 (3-172)||(16448514-16448684)
chr6 (3-176)||(3852001-3852174)
chr6 (14-147)||(18461895-18462028)
chr6 (3-160)||(25629310-25629468)
chr6 (3-143)||(17287768-17287909)
chr6 (3-177)||(19847932-19848108)
chr6 (9-160)||(20360915-20361067)
chr6 (3-157)||(29060548-29060703)
chr6 (3-160)||(18409782-18409940)
chr6 (10-160)||(25644335-25644487)
chr6 (11-160)||(16496260-16496410)
chr6 (3-160)||(19303496-19303653)
chr6 (3-160)||(20593781-20593939)
chr6 (3-175)||(22780166-22780340)
chr6 (3-97)||(20638301-20638396)
chr6 (14-160)||(18821801-18821946)
chr6 (3-160)||(20076708-20076862)
chr6 (69-177)||(8227448-8227557)
chr6 (160-212)||(12942363-12942415)
chr6 (10-175)||(20109153-20109322)
chr6 (3-56)||(25714425-25714478)
chr6 (161-212)||(15875469-15875520)
chr6 (161-212)||(28289283-28289334)
chr6 (3-107)||(23992435-23992540)
chr6 (3-48)||(27333286-27333331)
chr6 (3-48)||(27394026-27394071)
chr6 (165-212)||(18913994-18914041)
chr6 (165-212)||(18937252-18937299)
chr6 (14-160)||(35245605-35245749)
chr6 (10-48)||(9098582-9098620)
chr6 (3-48)||(19862982-19863027)
chr6 (3-48)||(19873124-19873169)
chr6 (125-177)||(23076862-23076915)
chr6 (9-56)||(19652209-19652257)
chr6 (14-156)||(23019425-23019567)
chr6 (12-48)||(28496539-28496575)
chr6 (12-48)||(29808950-29808986)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (3-212)||(10778-10987)
[»] scaffold0023 (5 HSPs)
scaffold0023 (3-212)||(17388-17597)
scaffold0023 (3-212)||(94416-94625)
scaffold0023 (3-157)||(44459-44614)
scaffold0023 (9-156)||(100388-100534)
scaffold0023 (11-48)||(119891-119928)
[»] chr4 (64 HSPs)
chr4 (3-212)||(3515012-3515221)
chr4 (3-212)||(19618120-19618329)
chr4 (3-212)||(18215222-18215431)
chr4 (3-212)||(15118300-15118509)
chr4 (3-212)||(52312515-52312724)
chr4 (6-212)||(14970655-14970861)
chr4 (3-212)||(12255-12464)
chr4 (3-212)||(19242704-19242914)
chr4 (3-212)||(44615293-44615502)
chr4 (3-207)||(44773040-44773244)
chr4 (3-212)||(15355272-15355482)
chr4 (3-212)||(1837457-1837666)
chr4 (3-212)||(18239367-18239576)
chr4 (3-212)||(50222287-50222496)
chr4 (3-190)||(51463838-51464025)
chr4 (3-190)||(23803235-23803422)
chr4 (3-177)||(44102219-44102393)
chr4 (3-190)||(12610955-12611135)
chr4 (3-212)||(7641140-7641339)
chr4 (3-166)||(44928873-44929037)
chr4 (14-177)||(21815568-21815731)
chr4 (3-172)||(20149834-20150004)
chr4 (13-177)||(15367708-15367873)
chr4 (13-177)||(15402721-15402886)
chr4 (13-177)||(15371220-15371385)
chr4 (13-177)||(15373501-15373666)
chr4 (13-177)||(15370036-15370200)
chr4 (13-174)||(16223550-16223712)
chr4 (3-175)||(7798782-7798956)
chr4 (11-160)||(12902773-12902923)
chr4 (3-160)||(22636443-22636601)
chr4 (3-160)||(7088885-7089043)
chr4 (3-140)||(54798729-54798867)
chr4 (3-116)||(14280321-14280434)
chr4 (2-160)||(16377478-16377635)
chr4 (3-160)||(14038656-14038814)
chr4 (14-171)||(22353852-22354010)
chr4 (3-160)||(7893711-7893869)
chr4 (3-107)||(52873375-52873480)
chr4 (3-160)||(44052837-44052995)
chr4 (3-140)||(8574844-8574980)
chr4 (3-160)||(16270191-16270348)
chr4 (3-158)||(16239927-16240082)
chr4 (14-177)||(13788-13953)
chr4 (3-160)||(6899899-6900056)
chr4 (11-160)||(23374314-23374464)
chr4 (10-177)||(52243131-52243302)
chr4 (10-175)||(43198492-43198661)
chr4 (160-212)||(15534343-15534395)
chr4 (161-212)||(14048740-14048791)
chr4 (161-212)||(36038033-36038084)
chr4 (11-80)||(3096309-3096379)
chr4 (14-96)||(14053321-14053403)
chr4 (69-158)||(15464888-15464977)
chr4 (161-212)||(15497019-15497070)
chr4 (161-212)||(49547722-49547773)
chr4 (3-56)||(39706347-39706401)
chr4 (162-212)||(52873126-52873176)
chr4 (161-212)||(19857607-19857658)
chr4 (14-147)||(6190481-6190616)
chr4 (9-48)||(12774021-12774060)
chr4 (10-48)||(12288278-12288316)
chr4 (11-48)||(15551833-15551870)
chr4 (125-177)||(53082089-53082142)
[»] chr1 (44 HSPs)
chr1 (3-212)||(21840772-21840981)
chr1 (3-212)||(23593682-23593892)
chr1 (3-212)||(13988871-13989080)
chr1 (3-212)||(21923239-21923448)
chr1 (3-212)||(21475035-21475244)
chr1 (3-212)||(29776693-29776902)
chr1 (3-212)||(16361922-16362132)
chr1 (3-212)||(29298142-29298350)
chr1 (3-212)||(31612318-31612527)
chr1 (3-212)||(16275311-16275521)
chr1 (3-212)||(22123015-22123225)
chr1 (3-177)||(21346966-21347141)
chr1 (3-212)||(15859956-15860166)
chr1 (3-177)||(21342101-21342276)
chr1 (3-177)||(21707172-21707346)
chr1 (3-177)||(21711714-21711888)
chr1 (3-177)||(13212844-13213019)
chr1 (3-172)||(40389159-40389329)
chr1 (14-190)||(45574812-45574989)
chr1 (3-177)||(433017-433190)
chr1 (3-160)||(22532277-22532435)
chr1 (11-160)||(27250684-27250834)
chr1 (3-160)||(50210168-50210326)
chr1 (3-160)||(34509788-34509946)
chr1 (3-160)||(22468651-22468809)
chr1 (14-177)||(21896193-21896358)
chr1 (11-160)||(21026696-21026846)
chr1 (14-174)||(21861510-21861672)
chr1 (10-166)||(16758664-16758822)
chr1 (3-158)||(20135195-20135351)
chr1 (11-94)||(20847175-20847259)
chr1 (14-177)||(35261018-35261180)
chr1 (3-56)||(20454613-20454666)
chr1 (10-175)||(33681022-33681188)
chr1 (161-212)||(43543214-43543265)
chr1 (9-120)||(21754059-21754170)
chr1 (71-160)||(22354527-22354616)
chr1 (3-48)||(21714550-21714595)
chr1 (9-56)||(20248293-20248341)
chr1 (76-177)||(41049973-41050073)
chr1 (10-56)||(52928029-52928076)
chr1 (11-48)||(20918620-20918657)
chr1 (9-116)||(22921868-22921976)
chr1 (126-177)||(16368224-16368276)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (7-212)||(4703-4908)
[»] chr3 (78 HSPs)
chr3 (3-212)||(12567565-12567774)
chr3 (3-212)||(13544030-13544239)
chr3 (3-212)||(9707555-9707764)
chr3 (3-212)||(16454229-16454438)
chr3 (3-212)||(17463183-17463392)
chr3 (3-212)||(45606855-45607064)
chr3 (3-212)||(7781295-7781504)
chr3 (3-212)||(8899099-8899308)
chr3 (3-212)||(34159331-34159540)
chr3 (3-212)||(55476496-55476705)
chr3 (3-212)||(13151738-13151948)
chr3 (3-212)||(13154203-13154413)
chr3 (6-212)||(38961839-38962045)
chr3 (3-212)||(6469082-6469291)
chr3 (3-212)||(10247671-10247880)
chr3 (3-212)||(16282759-16282968)
chr3 (3-212)||(28848559-28848768)
chr3 (3-212)||(41123895-41124101)
chr3 (3-201)||(17446614-17446811)
chr3 (6-190)||(50242830-50243014)
chr3 (3-177)||(17672631-17672805)
chr3 (3-177)||(29172565-29172740)
chr3 (3-212)||(8499523-8499734)
chr3 (3-177)||(12119707-12119882)
chr3 (3-212)||(15412434-15412645)
chr3 (14-177)||(53070636-53070799)
chr3 (14-190)||(43550448-43550625)
chr3 (3-129)||(15977520-15977646)
chr3 (3-212)||(27165255-27165466)
chr3 (2-175)||(43840939-43841114)
chr3 (3-160)||(40213676-40213833)
chr3 (3-212)||(53301452-53301664)
chr3 (10-175)||(26686902-26687069)
chr3 (3-160)||(14972862-14973020)
chr3 (3-160)||(17487864-17488022)
chr3 (3-160)||(17499346-17499504)
chr3 (3-109)||(55500947-55501053)
chr3 (3-140)||(36166603-36166739)
chr3 (9-160)||(14576788-14576939)
chr3 (13-176)||(42386428-42386593)
chr3 (3-160)||(13442282-13442440)
chr3 (3-160)||(23083316-23083474)
chr3 (3-160)||(25476340-25476498)
chr3 (8-140)||(21618459-21618590)
chr3 (3-145)||(20698405-20698548)
chr3 (3-94)||(44494814-44494905)
chr3 (3-160)||(18438542-18438700)
chr3 (9-141)||(14572603-14572735)
chr3 (3-94)||(10556990-10557081)
chr3 (11-145)||(12399225-12399360)
chr3 (3-160)||(24153164-24153321)
chr3 (3-160)||(11424718-11424872)
chr3 (3-94)||(17737241-17737335)
chr3 (13-177)||(24340660-24340826)
chr3 (14-175)||(52523666-52523831)
chr3 (114-177)||(17248224-17248287)
chr3 (13-177)||(23274705-23274871)
chr3 (69-177)||(37642202-37642311)
chr3 (69-166)||(22147474-22147571)
chr3 (76-175)||(2051138-2051238)
chr3 (161-212)||(54520985-54521036)
chr3 (163-212)||(29544790-29544839)
chr3 (3-123)||(46822273-46822394)
chr3 (168-212)||(12305315-12305359)
chr3 (3-50)||(45577948-45577995)
chr3 (9-175)||(16097342-16097509)
chr3 (3-48)||(28194698-28194743)
chr3 (3-109)||(12511065-12511172)
chr3 (161-212)||(15977696-15977747)
chr3 (10-123)||(30029855-30029968)
chr3 (10-156)||(15470939-15471085)
chr3 (9-48)||(12174327-12174366)
chr3 (9-48)||(32307691-32307730)
chr3 (11-48)||(13210395-13210432)
chr3 (3-48)||(14234495-14234540)
chr3 (3-48)||(15878119-15878164)
chr3 (9-175)||(16103794-16103960)
chr3 (3-56)||(23077537-23077590)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (3-212)||(11293-11503)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (3-212)||(12197-12406)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (3-212)||(20752-20961)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (3-212)||(37826-38035)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (3-212)||(501089-501298)
scaffold0001 (3-177)||(85562-85737)
scaffold0001 (9-48)||(160698-160737)
[»] chr7 (76 HSPs)
chr7 (3-212)||(456326-456535)
chr7 (3-212)||(11393235-11393444)
chr7 (3-212)||(15376661-15376870)
chr7 (3-212)||(16232525-16232734)
chr7 (3-212)||(20385071-20385280)
chr7 (3-212)||(21189543-21189752)
chr7 (3-212)||(32125496-32125705)
chr7 (3-212)||(41522922-41523131)
chr7 (3-212)||(41525384-41525593)
chr7 (3-212)||(14949070-14949279)
chr7 (3-212)||(18640277-18640486)
chr7 (3-212)||(24702243-24702452)
chr7 (3-212)||(27216865-27217074)
chr7 (3-210)||(11972501-11972708)
chr7 (3-212)||(16213689-16213898)
chr7 (3-212)||(16410064-16410273)
chr7 (3-212)||(18430717-18430926)
chr7 (3-212)||(24704693-24704899)
chr7 (3-177)||(44116514-44116688)
chr7 (3-176)||(3386338-3386511)
chr7 (14-190)||(13647344-13647521)
chr7 (3-212)||(13869351-13869562)
chr7 (3-147)||(24275176-24275320)
chr7 (3-177)||(17061898-17062072)
chr7 (53-207)||(26355936-26356090)
chr7 (53-207)||(26358388-26358542)
chr7 (3-177)||(38898359-38898534)
chr7 (3-175)||(20110561-20110723)
chr7 (14-177)||(12756654-12756817)
chr7 (3-160)||(3564319-3564477)
chr7 (3-124)||(13831378-13831499)
chr7 (3-117)||(48273397-48273512)
chr7 (3-160)||(12698839-12698998)
chr7 (11-166)||(26212012-26212168)
chr7 (10-177)||(2280056-2280225)
chr7 (3-160)||(9509197-9509355)
chr7 (3-160)||(18456368-18456525)
chr7 (3-160)||(38227489-38227646)
chr7 (110-212)||(15081895-15081999)
chr7 (11-109)||(10589055-10589154)
chr7 (143-212)||(13841157-13841226)
chr7 (3-116)||(22072921-22073036)
chr7 (10-160)||(15143993-15144143)
chr7 (69-177)||(19486681-19486790)
chr7 (160-212)||(11303409-11303461)
chr7 (149-212)||(18627717-18627780)
chr7 (11-99)||(16386263-16386353)
chr7 (161-212)||(16108637-16108688)
chr7 (14-177)||(16495421-16495581)
chr7 (161-212)||(23664901-23664952)
chr7 (17-175)||(12255730-12255892)
chr7 (82-166)||(15116568-15116651)
chr7 (161-212)||(14270010-14270061)
chr7 (161-207)||(29796771-29796817)
chr7 (161-207)||(29800590-29800636)
chr7 (3-56)||(47831815-47831869)
chr7 (3-48)||(67753-67798)
chr7 (10-177)||(1867932-1868101)
chr7 (82-166)||(15113031-15113114)
chr7 (161-212)||(8468803-8468854)
chr7 (3-97)||(14932752-14932847)
chr7 (3-97)||(15356187-15356282)
chr7 (3-97)||(15360301-15360396)
chr7 (14-145)||(40443410-40443541)
chr7 (125-177)||(15008436-15008489)
chr7 (125-177)||(20220127-20220180)
chr7 (11-109)||(34200802-34200901)
chr7 (9-56)||(44014192-44014240)
chr7 (9-48)||(811199-811238)
chr7 (9-48)||(18005660-18005699)
chr7 (3-58)||(26356096-26356151)
chr7 (3-58)||(26358548-26358603)
chr7 (3-48)||(18154909-18154954)
chr7 (3-48)||(19649557-19649602)
chr7 (3-48)||(28505366-28505411)
chr7 (11-109)||(11996033-11996132)
[»] chr5 (57 HSPs)
chr5 (3-212)||(264716-264925)
chr5 (3-212)||(32027398-32027607)
chr5 (3-212)||(42245313-42245522)
chr5 (3-212)||(39363389-39363598)
chr5 (3-212)||(10732888-10733097)
chr5 (3-212)||(20909017-20909226)
chr5 (3-212)||(29345985-29346194)
chr5 (3-212)||(29348458-29348667)
chr5 (3-212)||(29350931-29351140)
chr5 (3-212)||(39245141-39245350)
chr5 (3-212)||(29329939-29330145)
chr5 (3-212)||(20917900-20918105)
chr5 (3-177)||(36154766-36154937)
chr5 (10-177)||(20901991-20902159)
chr5 (3-177)||(2154596-2154771)
chr5 (3-212)||(38619439-38619650)
chr5 (3-175)||(11581184-11581356)
chr5 (3-212)||(23064516-23064727)
chr5 (3-172)||(18319021-18319191)
chr5 (3-177)||(31061073-31061248)
chr5 (3-177)||(10775659-10775833)
chr5 (3-172)||(24067112-24067282)
chr5 (3-160)||(25421540-25421698)
chr5 (3-160)||(23390451-23390609)
chr5 (3-160)||(9077960-9078118)
chr5 (3-160)||(24529228-24529386)
chr5 (15-160)||(25431414-25431560)
chr5 (3-160)||(1096475-1096633)
chr5 (11-160)||(21729019-21729169)
chr5 (11-160)||(21808344-21808494)
chr5 (3-160)||(8286797-8286956)
chr5 (3-140)||(22412192-22412329)
chr5 (3-160)||(24493577-24493734)
chr5 (3-94)||(21997555-21997647)
chr5 (14-160)||(22144068-22144215)
chr5 (11-160)||(22075035-22075185)
chr5 (3-160)||(13025319-13025476)
chr5 (3-160)||(13095503-13095660)
chr5 (76-177)||(40725935-40726037)
chr5 (161-212)||(9776521-9776572)
chr5 (5-93)||(18418590-18418678)
chr5 (53-140)||(20766095-20766181)
chr5 (3-123)||(17517193-17517314)
chr5 (3-48)||(21329565-21329610)
chr5 (14-173)||(22178161-22178323)
chr5 (14-95)||(21292991-21293071)
chr5 (161-212)||(37804851-37804902)
chr5 (9-175)||(21565556-21565723)
chr5 (14-143)||(37723922-37724050)
chr5 (3-50)||(20806852-20806899)
chr5 (9-48)||(22959600-22959639)
chr5 (3-41)||(21502231-21502269)
chr5 (11-48)||(19660903-19660940)
chr5 (3-48)||(26704079-26704124)
chr5 (3-48)||(26973812-26973857)
chr5 (70-166)||(18356389-18356485)
chr5 (14-109)||(20026945-20027043)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (3-212)||(9247-9456)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (3-212)||(13952-14161)
[»] scaffold0028 (5 HSPs)
scaffold0028 (3-212)||(136685-136894)
scaffold0028 (3-212)||(139154-139363)
scaffold0028 (3-212)||(144092-144301)
scaffold0028 (3-212)||(134216-134425)
scaffold0028 (3-212)||(141623-141832)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (3-210)||(13397-13604)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (3-212)||(40405-40614)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (3-190)||(82077-82264)
scaffold0037 (10-175)||(22610-22776)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (3-177)||(158433-158607)
scaffold0003 (10-160)||(339905-340053)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (3-190)||(111-298)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (3-177)||(4302-4476)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (3-177)||(16789-16963)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (12-177)||(29946-30111)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (3-190)||(1250-1438)
[»] scaffold0145 (3 HSPs)
scaffold0145 (3-177)||(9754-9929)
scaffold0145 (3-160)||(32950-33107)
scaffold0145 (3-160)||(38769-38926)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (3-190)||(12069-12250)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (3-177)||(4219-4393)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (14-177)||(79267-79430)
scaffold0056 (3-160)||(17170-17330)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (14-177)||(20363-20524)
scaffold0031 (3-160)||(128759-128916)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (6-177)||(2111-2283)
scaffold0247 (71-177)||(17964-18071)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (3-177)||(161072-161247)
scaffold0007 (77-177)||(164573-164674)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (3-160)||(22891-23048)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (3-212)||(38604-38815)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (3-160)||(26020-26178)
scaffold0122 (3-140)||(44682-44820)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (3-166)||(51921-52085)
scaffold0011 (11-145)||(167948-168083)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (3-160)||(13219-13377)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (4-160)||(39486-39642)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (4-160)||(75170-75326)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (11-145)||(1018-1153)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (3-160)||(3141-3299)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (3-160)||(3106-3263)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (3-160)||(16555-16713)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (3-160)||(1859-2017)
[»] scaffold0228 (3 HSPs)
scaffold0228 (9-160)||(4522-4673)
scaffold0228 (9-160)||(12104-12255)
scaffold0228 (9-160)||(22056-22207)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (3-140)||(116435-116571)
scaffold0022 (161-212)||(53820-53873)
scaffold0022 (126-177)||(78453-78505)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (3-160)||(6076-6237)
[»] scaffold0046 (4 HSPs)
scaffold0046 (3-109)||(28422-28529)
scaffold0046 (11-109)||(11308-11407)
scaffold0046 (11-48)||(2013-2050)
scaffold0046 (11-48)||(4568-4605)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (3-160)||(3478-3636)
scaffold0292 (3-160)||(351-508)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (10-177)||(27686-27855)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (3-175)||(8472-8642)
[»] scaffold0120 (4 HSPs)
scaffold0120 (3-160)||(32913-33069)
scaffold0120 (3-160)||(45936-46092)
scaffold0120 (3-159)||(16121-16278)
scaffold0120 (3-57)||(17388-17442)
[»] scaffold0695 (1 HSPs)
scaffold0695 (121-212)||(6070-6161)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (10-175)||(8481-8650)
scaffold0621 (9-48)||(6549-6588)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (3-143)||(8487-8628)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (59-160)||(3485-3586)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (13-160)||(24257-24406)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (2-160)||(25903-26061)
scaffold0026 (3-160)||(39866-40023)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (11-160)||(4865-5015)
[»] scaffold0357 (2 HSPs)
scaffold0357 (10-177)||(16037-16206)
scaffold0357 (14-177)||(13147-13313)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (82-155)||(13092-13165)
[»] scaffold0175 (3 HSPs)
scaffold0175 (59-175)||(13157-13274)
scaffold0175 (2-50)||(280-328)
scaffold0175 (11-109)||(34139-34238)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (14-145)||(1971-2103)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (13-177)||(11482-11648)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (11-85)||(4728-4803)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (13-177)||(38193-38359)
[»] scaffold0235 (1 HSPs)
scaffold0235 (11-96)||(11462-11548)
[»] scaffold0503 (2 HSPs)
scaffold0503 (104-177)||(12039-12112)
scaffold0503 (14-74)||(11982-12042)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (69-177)||(53486-53595)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (69-177)||(225482-225590)
[»] scaffold1427 (1 HSPs)
scaffold1427 (161-212)||(1591-1642)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (16-145)||(4545-4675)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (76-177)||(7996-8098)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (11-96)||(13513-13598)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (3-160)||(39921-40078)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (11-160)||(10381-10528)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (75-160)||(27911-27996)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (11-145)||(32083-32216)
[»] scaffold0422 (1 HSPs)
scaffold0422 (161-212)||(3186-3237)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (14-177)||(1011-1171)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (14-177)||(12587-12751)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (11-96)||(15483-15568)
scaffold0114 (167-212)||(27958-28003)
[»] scaffold0021 (3 HSPs)
scaffold0021 (3-56)||(121774-121827)
scaffold0021 (14-143)||(174785-174913)
scaffold0021 (84-160)||(124675-124751)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (3-109)||(15669-15776)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (3-56)||(1093-1147)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (3-56)||(6619-6673)
scaffold0333 (3-56)||(13999-14053)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (59-145)||(6675-6761)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (3-56)||(15836-15890)
scaffold0020 (3-48)||(178902-178947)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (4-56)||(1091-1144)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (14-177)||(6220-6386)
[»] scaffold0395 (2 HSPs)
scaffold0395 (71-160)||(918-1006)
scaffold0395 (3-56)||(4893-4946)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (3-48)||(6191-6236)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (9-175)||(45732-45899)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (13-160)||(20928-21077)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (14-177)||(60652-60818)
scaffold0010 (9-156)||(129919-130066)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (10-175)||(10481-10647)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (76-177)||(97089-97190)
scaffold0006 (76-177)||(106367-106468)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (9-156)||(143-290)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (3-48)||(23847-23892)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (9-120)||(32112-32224)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (3-48)||(36458-36503)
[»] scaffold0106 (2 HSPs)
scaffold0106 (3-48)||(15306-15351)
scaffold0106 (14-74)||(7285-7347)
[»] scaffold0123 (2 HSPs)
scaffold0123 (10-177)||(25121-25289)
scaffold0123 (125-177)||(667-720)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (10-116)||(10542-10649)
[»] scaffold0556 (1 HSPs)
scaffold0556 (69-156)||(8090-8176)
[»] scaffold0513 (1 HSPs)
scaffold0513 (161-212)||(10835-10886)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (9-48)||(2713-2752)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (3-97)||(29562-29657)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (9-48)||(19278-19317)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (161-212)||(36014-36065)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (14-94)||(1051-1132)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (87-176)||(18176-18265)
[»] scaffold0210 (2 HSPs)
scaffold0210 (3-48)||(21871-21916)
scaffold0210 (3-48)||(29763-29808)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (3-48)||(69798-69843)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (9-56)||(12780-12828)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (14-94)||(16301-16380)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 57)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 32215078 - 32214869
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
32215078 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 32214979  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
32214978 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcat 32214879  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
32214878 atatacatat 32214869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Original strand, 6726000 - 6726209
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
6726000 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgtaagt 6726099  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
6726100 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcat 6726199  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
6726200 atatacatat 6726209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 21155217 - 21155008
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
21155217 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagt 21155118  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
21155117 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcat 21155018  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
21155017 atatacatat 21155008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Original strand, 18808948 - 18809157
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
18808948 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 18809047  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
18809048 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcat 18809147  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
18809148 atatacatat 18809157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 23709689 - 23709480
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
23709689 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 23709590  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
23709589 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcat 23709490  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
23709489 atatacatat 23709480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 23712170 - 23711961
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
23712170 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 23712071  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
23712070 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcat 23711971  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
23711970 atatacatat 23711961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Original strand, 39682318 - 39682527
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
39682318 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 39682417  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
39682418 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcat 39682517  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
39682518 atatacatat 39682527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Original strand, 571402 - 571611
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
571402 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 571501  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
571502 caacaacgtctcaattgttcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcat 571601  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
571602 atatacatat 571611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Original strand, 23130867 - 23131076
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
23130867 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 23130966  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
23130967 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcat 23131066  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
23131067 atatacatat 23131076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Original strand, 23133334 - 23133543
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
23133334 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 23133433  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
23133434 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcat 23133533  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
23133534 atatacatat 23133543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Original strand, 26505384 - 26505593
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||    
26505384 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaaatgcaagt 26505483  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
26505484 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcat 26505583  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
26505584 atatacatat 26505593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Original strand, 26507862 - 26508071
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||    
26507862 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaaatgcaagt 26507961  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
26507962 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcat 26508061  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
26508062 atatacatat 26508071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 34402679 - 34402470
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
34402679 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 34402580  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
34402579 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcat 34402480  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
34402479 atatacatat 34402470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 6 - 212
Target Start/End: Original strand, 24367782 - 24367988
Alignment:
6 ttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaa 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
24367782 ttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 24367881  T
106 caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcatata 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
24367882 caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataaccaacatcttaaaacatcatata 24367981  T
206 tacatat 212  Q
    |||||||    
24367982 tacatat 24367988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 24898353 - 24898143
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttt-gttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaag 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
24898353 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 24898254  T
102 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatca 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
24898253 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca 24898154  T
202 tatatacatat 212  Q
    |||||||||||    
24898153 tatatacatat 24898143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 24900836 - 24900626
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttt-gttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaag 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
24900836 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 24900737  T
102 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatca 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
24900736 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca 24900637  T
202 tatatacatat 212  Q
    |||||||||||    
24900636 tatatacatat 24900626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 24903313 - 24903103
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttt-gttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaag 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
24903313 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 24903214  T
102 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatca 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
24903213 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca 24903114  T
202 tatatacatat 212  Q
    |||||||||||    
24903113 tatatacatat 24903103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 24905790 - 24905580
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttt-gttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaag 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
24905790 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 24905691  T
102 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatca 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
24905690 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca 24905591  T
202 tatatacatat 212  Q
    |||||||||||    
24905590 tatatacatat 24905580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 24908265 - 24908055
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttt-gttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaag 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
24908265 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 24908166  T
102 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatca 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
24908165 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca 24908066  T
202 tatatacatat 212  Q
    |||||||||||    
24908065 tatatacatat 24908055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Original strand, 23135595 - 23135804
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
23135595 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 23135694  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||    
23135695 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattacatcacagtataacaacatcaaatgataatcagcatcttaaaacatcat 23135794  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
23135795 atatacatat 23135804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 32039655 - 32039446
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
32039655 atcttaatcaacttagaccggctcatgcagcttagttaaataacaacagtaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 32039556  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
32039555 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaatcataatcaacatcttaaaacatcat 32039456  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
32039455 atatacatat 32039446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Original strand, 28577104 - 28577313
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||     
28577104 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacgcaacagtatacaaaaacagcatgatataataatatcaaatgcaagc 28577203  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
28577204 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcat 28577303  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
28577304 atatacatat 28577313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Original strand, 22105417 - 22105627
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaag 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||    
22105417 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 22105516  T
102 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatca 201  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
22105517 tcaacaacttctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaattataatcaacatcttaaaacatca 22105616  T
202 tatatacatat 212  Q
    |||||||||||    
22105617 tatatacatat 22105627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 45030011 - 45029802
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||    
45030011 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacacaacaatatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagt 45029912  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||| |||||    
45029911 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacatttatatcacaatataacaacatgaaataataatcatcatcttaaaacatcat 45029812  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
45029811 atatacatat 45029802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 3 - 176
Target Start/End: Original strand, 43137304 - 43137477
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||    
43137304 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagtaatatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagt 43137403  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaa 176  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
43137404 caacaacgtctcaattgttcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacatcatcaaa 43137477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 3 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 24529686 - 24529511
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
24529686 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcatagttaaataacaacaacaacacatcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaagtgcaagt 24529587  T
103 caacaacgtctcaatta-ttcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 177  Q
     |||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
24529586 taacaacgtctcaattatttcatatataattcaaataatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaat 24529511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Original strand, 38967379 - 38967588
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | ||||| || |||||||||| ||||||| ||||||||||||| || ||||    
38967379 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacatcgacacaacaatatacaaaaatagcatgaaataataatatcaaatgcaagt 38967478  T
103 caa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatca 201  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||    
38967479 caatcaacatctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatat-acaacatcaaataataatcaacatcttaagacatca 38967577  T
202 tatatacatat 212  Q
    |||||||||||    
38967578 tatatacatat 38967588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 83 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 24642933 - 24642802
Alignment:
83 taataatatcaattgtaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaa 182  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||    
24642933 taataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaatcataa 24642834  T
183 tcaacatc--ttaaaaaatcatatatacatat 212  Q
    ||||||||   | ||| |||||||||||||||    
24642833 tcaacatcaacttaaacatcatatatacatat 24642802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 3 - 160
Target Start/End: Original strand, 23060521 - 23060679
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaag 101  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
23060521 atcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaag 23060620  T
102 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 160  Q
    |||||||| ||| || |||| |  |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||    
23060621 tcaacaacatcttaaatattaaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcaca 23060679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 3 - 160
Target Start/End: Original strand, 23076450 - 23076608
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaag 101  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
23076450 atcttcatccacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaag 23076549  T
102 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 160  Q
    |||||||  ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||    
23076550 tcaacaatatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcaca 23076608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 160
Target Start/End: Original strand, 22337123 - 22337281
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaag 101  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||    
22337123 atcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggctgtatataaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 22337222  T
102 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 160  Q
     ||||||| |||||| ||| ||   |||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
22337223 acaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcaca 22337281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 3 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 22731347 - 22731189
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaag 101  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
22731347 atcttcatcaagttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaat 22731248  T
102 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 160  Q
    ||| |||| | | || |||||| ||||  ||||||||||||| |||  |||||||||||    
22731247 tcatcaacatattaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcaca 22731189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 22738292 - 22738135
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
22738292 atcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacattaaataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaatt 22738193  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 160  Q
    || |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||||| |||  |||||||||||    
22738192 catcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcaca 22738135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 175
Target Start/End: Original strand, 19671848 - 19672010
Alignment:
13 acttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaa-caacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaacaacg 110  Q
    |||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||| || ||||| || |||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |  | |||| ||||||     
19671848 acttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaaca 19671946  T
111 tctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaa 175  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
19671947 tctcaat-attcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataacaacatcaa 19672010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 298928 - 298769
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataac-aacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||    
298928 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgcaa 298829  T
101 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 160  Q
     |||||||| ||| || |||||| |||    |||||||||||||| |  |||||||||||    
298828 ttcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcaca 298769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 23654491 - 23654341
Alignment:
11 caacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaacaac 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || || ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||| ||||    
23654491 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacagcataggcagcatacaaatacatcatgacataataatatcaattgcaattcatcaac 23654392  T
110 gtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 160  Q
     ||| || ||||||  ||| | |||||||||||||| |  |||||||||||    
23654391 atcttaaatattcaagtattactcaagtaatgcataaaacattatatcaca 23654341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 160
Target Start/End: Original strand, 23285873 - 23286027
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaag 101  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| ||     
23285873 atcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaaca----gacataataatatcaattgcaat 23285968  T
102 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 160  Q
    ||| |||| ||| || |||||| || |  ||||||||||||||| |  |||||||||||    
23285969 tcatcaacatcttaaatattcaaatgttcttcaagtaatgcataaaacattatatcaca 23286027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 121 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 22173868 - 22173799
Alignment:
121 tcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatc 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
22173868 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaatcataatcaacatc 22173799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 3 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 24643107 - 24643034
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagc 76  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
24643107 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacatcagtatacaaaaacagc 24643034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 23708725 - 23708558
Alignment:
10 tcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataaca-acaacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaaca 107  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| | | ||||| | ||||||| | |||||| ||||| |||| ||||||||||| || ||| |     
23708725 tcaacttagaccgactcaagcagcttagttaaataacagatagcaacataggcagtatgc-aaaacaacatgatataacaatatcaattgcaaatcatcg 23708627  T
108 acgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaa 175  Q
    || ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
23708626 acatctcaaacattcaaatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 23708558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 38219 - 38134
Alignment:
11 caacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 96  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
38219 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 38134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 3 - 160
Target Start/End: Original strand, 23660031 - 23660188
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaag 101  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||| ||||| || |||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| || ||     
23660031 atcttcatcaacttagaccgactcatgtatcttagttaaacaacaacagcaacataggcagtatacgaaa-caggatgacataataatatcaaatgcaaa 23660129  T
102 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 160  Q
    |||||||| ||| || ||||||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
23660130 tcaacaacatcttaaatattcaatcataactcaagtaatgcgtataacattatatcaca 23660188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 160 - 212
Target Start/End: Original strand, 20261381 - 20261433
Alignment:
160 aatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcatatatacatat 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
20261381 aatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatat 20261433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 69 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 7779 - 7688
Alignment:
69 aaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 160  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||| || |||||| |||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
7779 aaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaaacattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcaca 7688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 3 - 123
Target Start/End: Original strand, 25616193 - 25616314
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaag 101  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| | || || | ||||  ||||  ||||||| ||||||| ||||||||||| ||     
25616193 atcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaattacaatagcagcataggcagattacatcaacagcaagacataaaaatatcaattgcaat 25616292  T
102 tcaacaacgtctcaattattca 123  Q
    |||||||| ||| || ||||||    
25616293 tcaacaacatcttaaatattca 25616314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 116
Target Start/End: Original strand, 28405990 - 28406099
Alignment:
9 atcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataac-aacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaac 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| | ||||||| ||||| || ||||| |||| |||||| | || || |||||    
28405990 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaac 28406089  T
107 aacgtctcaa 116  Q
    ||| ||||||    
28406090 aacatctcaa 28406099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 90 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 22459587 - 22459511
Alignment:
90 atcaattgtaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa 166  Q
    ||||| || |||||| |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
22459587 atcaaatgaaagtcatcaacatctcaaatattcacatataactcaagtaatgtatatacaattatatcacattataa 22459511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Original strand, 29601478 - 29601518
Alignment:
137 taatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
29601478 taatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 29601518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 14 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 23103497 - 23103369
Alignment:
14 cttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaacaacgtc 112  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||| | |||||||||  |||||||||||||| || ||||||| |  || ||| |||| ||    
23103497 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataaaaacagcaacataggcagtatac--aaacagcatgacatgattatatcaaattcaattcatcaacatc 23103400  T
113 tcaattattcacatataattcaagtaatgca 143  Q
    ||||| |||||   ||||||||||| |||||    
23103399 tcaatcattcattcataattcaagtcatgca 23103369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 10684764 - 10684718
Alignment:
161 atataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcatatata 207  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
10684764 atataacaacatcaaatggtaattaacatcttaaaacatcatatata 10684718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 23040302 - 23040249
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaaca 56  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
23040302 atcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 23040249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 156
Target Start/End: Original strand, 7679593 - 7679745
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataac-aacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaa 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||||| |||||    
7679593 atcttaatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcaa-tgtaa 7679690  T
101 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 156  Q
    |||| |||| ||  ||  | ||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||    
7679691 gtcatcaacatcataaaca-tcaaacataattcatgtaatgtatatataattatat 7679745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 76 - 177
Target Start/End: Original strand, 23791357 - 23791458
Alignment:
76 catgacataataatatcaattgtaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaata-taacaacatca 174  Q
    ||||| |||| |||||||| || || |||||||| ||||||  ||| | |||||||||| |||||||||||| | |||||||||| || |||||||||||    
23791357 catgatataaaaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacatt-atatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatca 23791455  T
175 aat 177  Q
    |||    
23791456 aat 23791458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 71
Target Start/End: Original strand, 8946665 - 8946734
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaa 71  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| | ||||| | |||||||||||||    
8946665 atcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttagataacaatagcaacataggcagtatacaaaa 8946734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 32452031 - 32451896
Alignment:
14 cttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaa-caacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaacaa-cg 110  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||| | ||| || ||||| || ||| || |||||| |||||||||||| |||||||| || ||| |||||| |     
32452031 cttagaccgactcatgcagcttggttaaacatcaaacagcaacataggcagcattcaaaaatagcatgacataacaatatcaa-tgcaagccaacaatca 32451933  T
111 tctcaattattcacatataattcaagtaatgcatata 147  Q
    |||||||||||||  || | |||||||||||| ||||    
32451932 tctcaattattcatttaaacttcaagtaatgcgtata 32451896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 18787009 - 18786971
Alignment:
10 tcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaa 48  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
18787009 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 18786971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 20520230 - 20520130
Alignment:
76 catgacataataatatcaattgtaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaata-taacaacatca 174  Q
    ||||| |||| ||||||||| | || |||||||| ||||||  || || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || |||| ||||||    
20520230 catgatataacaatatcaat-gcaaatcaacaacatctcaaacat-catatataattcaagtaatgcatatacaaatatatcacattattaacgacatca 20520133  T
175 aat 177  Q
    |||    
20520132 aat 20520130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 64)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 16413473 - 16413264
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
16413473 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 16413374  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
16413373 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcat 16413274  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
16413273 atatacatat 16413264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 14409601 - 14409392
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
14409601 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 14409502  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
14409501 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcat 14409402  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
14409401 atatacatat 14409392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Original strand, 1484407 - 1484616
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
1484407 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 1484506  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
1484507 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcat 1484606  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
1484607 atatacatat 1484616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 5853449 - 5853240
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
5853449 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 5853350  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
5853349 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcat 5853250  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
5853249 atatacatat 5853240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 15203388 - 15203179
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
15203388 atcttaatcaacttagagcgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgtaagt 15203289  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
15203288 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcat 15203189  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
15203188 atatacatat 15203179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Original strand, 20403232 - 20403441
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
20403232 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 20403331  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
20403332 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcat 20403431  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
20403432 atatacatat 20403441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Original strand, 22001758 - 22001967
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
22001758 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 22001857  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
22001858 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcat 22001957  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
22001958 atatacatat 22001967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 20046352 - 20046143
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||    
20046352 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagt 20046253  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
20046252 caacaacgtctcaattatttacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcat 20046153  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
20046152 atatacatat 20046143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Original strand, 4483286 - 4483494
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
4483286 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaa-taacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 4483384  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
4483385 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcat 4483484  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
4483485 atatacatat 4483494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 4542530 - 4542321
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
4542530 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacaagatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 4542431  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
4542430 caacaacgtctcaattattcacatatagttcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcat 4542331  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
4542330 atatacatat 4542321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Original strand, 19896270 - 19896483
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataa---taatatcaattgta 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||   ||||||||| || |    
19896270 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacggtatacaaaaacagcatgacataataataatatcaaatgca 19896369  T
100 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaa-a 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |    
19896370 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaaata 19896469  T
199 tcatatatacatat 212  Q
    ||||||||||||||    
19896470 tcatatatacatat 19896483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 3 - 207
Target Start/End: Original strand, 14823779 - 14823982
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||| |   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
14823779 atcttaatcaatttagacc-actcatgcagcaaagttaaataacaacaacaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 14823877  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||    
14823878 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacattaaataataatcaacatcttaaaacatcat 14823977  T
203 atata 207  Q
    |||||    
14823978 atata 14823982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 3 - 177
Target Start/End: Original strand, 41598193 - 41598367
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
41598193 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttgaataacaacagcaacacagtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 41598292  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
41598293 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaat 41598367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 45290852 - 45290642
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
45290852 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgtaagc 45290753  T
103 caa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatca 201  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||    
45290752 caatcaacgtctcaattattcacatataattcaattaatgcagatacaattatatcacagtataacaacgtcaaataataatcaacatcttaaaacatca 45290653  T
202 tatatacatat 212  Q
    |||||||||||    
45290652 tatatacatat 45290642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 212
Target Start/End: Original strand, 15070571 - 15070774
Alignment:
11 caacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaa-caac 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||    
15070571 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacagtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaatcaac 15070670  T
110 gtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcatatatac 208  Q
    |||||||||||||||| |||||  || | ||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
15070671 gtctcaattattcacagataatctaattgatgcatatacaattatatctgaatataaacaacatcaaatgataatcaacatcttaaaacatcataaatac 15070770  T
209 atat 212  Q
    ||||    
15070771 atat 15070774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 19937163 - 19936951
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||    
19937163 atcttaatcaacttggaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataagatcaaatgcaagt 19937064  T
103 caa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatc--ttaaaaaat 199  Q
    ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| ||    
19937063 caatcaacgtctcaattactcacaaataattcaatcaatgcacatacagttatatcacaatataacaacatcaaatgataatcaacatcaacttaaacat 19936964  T
200 catatatacatat 212  Q
    |||||||||||||    
19936963 catatatacatat 19936951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 3 - 177
Target Start/End: Original strand, 26223924 - 26224098
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||| |||  ||||||||||||| ||| | |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||    
26223924 atcttaatcaacttagatcgacccatgcagcttaattaaataacaacagcaataaagcaatatacaaaaatagcatgacataataatatcaaatgcaagt 26224023  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 177  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
26224024 caacaacatctcaattattcacatataatttaattaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaat 26224098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 19801527 - 19801367
Alignment:
14 cttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaacaacgtct 113  Q
    ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
19801527 cttagaccggctcatgcagcttagttaaataacaatagcaacacaacagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaacgcaagtcaacaacgtct 19801429  T
114 caattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaa 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
19801428 caattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattataacacaatataacaacatcaa 19801367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 3 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 25484425 - 25484245
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| ||| |||||||||||||| | |       ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |    
25484425 atcttaatcaacttagaccaactcgtgcagcttagttaaataacaacagcta-------gtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaaat 25484333  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatc 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
25484332 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataataacatcaaatcataatcaacatc 25484245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 18818522 - 18818348
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaag 101  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
18818522 atcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaag 18818423  T
102 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa-caacatcaa 175  Q
    |||||| | ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||| |||| |||||||||    
18818422 tcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacaacataatcaacatcaa 18818348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 16092455 - 16092297
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaag 101  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
16092455 atcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 16092356  T
102 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 160  Q
    |||||||| |||||| ||| ||   |||||| ||||||||| ||||  |||||||||||    
16092355 tcaacaacatctcaaatatacattcataatttaagtaatgcgtataacattatatcaca 16092297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 3 - 148
Target Start/End: Original strand, 7372786 - 7372932
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaag 101  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
7372786 atcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaag 7372885  T
102 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatat 148  Q
    |||||| | ||| || ||||||  |||| |||||||||||| |||||    
7372886 tcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcttatat 7372932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 111 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 24486093 - 24485992
Alignment:
111 tctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcatatatacat 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||||||||||    
24486093 tctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttagaacatcatatatacat 24485994  T
211 at 212  Q
    ||    
24485993 at 24485992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 3 - 160
Target Start/End: Original strand, 6759266 - 6759421
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaag 101  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||    
6759266 atcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaag 6759365  T
102 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 160  Q
    ||||||   |||||||||| |||  ||||||||| |||||| ||||  |||||||||||    
6759366 tcaaca---tctcaattatacactcataattcaattaatgcgtataacattatatcaca 6759421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 160
Target Start/End: Original strand, 20536216 - 20536374
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaag 101  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
20536216 atcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagaaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaat 20536315  T
102 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 160  Q
    ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||||| |||  |||||||||||    
20536316 tcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcaca 20536374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 161
Target Start/End: Original strand, 23406387 - 23406548
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaag 101  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
23406387 atcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaag 23406486  T
102 tcaac--aacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaa 161  Q
    |||||  | | ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||    
23406487 tcaacatatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacaa 23406548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 28649157 - 28648999
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaag 101  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||    
28649157 atcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaaagcaacataggcagtatacgaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 28649058  T
102 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 160  Q
    |||||||| ||| |||||| ||   |||||||||||||||  ||||  |||||||||||    
28649057 tcaacaacatcttaattatacattcataattcaagtaatgtgtataacattatatcaca 28648999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 21924041 - 21923900
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaag 101  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| || |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||    
21924041 atcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtctacaaaaacaacatgacatgataatatcaattgcaag 21923942  T
102 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgca 143  Q
    |||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||    
21923941 tcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgca 21923900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 121 - 210
Target Start/End: Original strand, 32810054 - 32810143
Alignment:
121 tcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcatatatacat 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
32810054 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatacat 32810143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 21919105 - 21918969
Alignment:
11 caacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaacaac 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
21919105 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcaacaac 21919006  T
110 gtctcaattattcacat-ataattcaagtaatgcata 145  Q
     ||| || |||||| || ||  |||||||||||||||    
21919005 atcttaaatattcaaataattcttcaagtaatgcata 21918969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 140
Target Start/End: Original strand, 26219726 - 26219858
Alignment:
7 taatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaac 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | |||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| || ||||||||    
26219726 taatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacagcagtatac-aaaatagtatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 26219824  T
107 aacgtctcaattattcacatataattcaagtaat 140  Q
    ||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||    
26219825 aacatctcaaatatacattcataattcaagtaat 26219858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 160
Target Start/End: Original strand, 22875073 - 22875230
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaag 101  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||| || || |||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| || |||    
22875073 atcttcatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaatagcagcagcaacacaggcagtatacaaaa-caacatgacataataatatcaaatgcaag 22875171  T
102 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 160  Q
    |||||||| |||||| ||| ||   |||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
22875172 tcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcaca 22875230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 3 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 26225404 - 26225268
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | ||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |  ||||    
26225404 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaacaatatac-aaaacagtatgacataataatatcaaatacaagt 26225306  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaat 140  Q
    ||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||    
26225305 caacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat 26225268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 160
Target Start/End: Original strand, 22626744 - 22626901
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaag 101  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |  ||     
22626744 atcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacaacatgacataataatatcaaatacaaa 22626842  T
102 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 160  Q
    |||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||  ||||  |||||||||||    
22626843 tcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgtgtataacattatatcaca 22626901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 17612213 - 17612059
Alignment:
13 acttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaa-caacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaacaacg 110  Q
    |||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||| |||||||| || |||||| ||||| || ||||| |||||||||||    |||||| ||||||     
17612213 acttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcaacaacataggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatcgcacgtaagtaaacaaca 17612115  T
111 tctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa 166  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
17612114 tctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataa 17612059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 3 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 18879344 - 18879191
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaag 101  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||     |||||||||||||||||| ||     
18879344 atcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaaca-----acataataatatcaattgcaat 18879250  T
102 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 160  Q
    ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||||  |||  |||||||||||    
18879249 tcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgctcataacattatatcaca 18879191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 71 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 13508129 - 13508022
Alignment:
71 aacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaa 169  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |  | |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||    
13508129 aacatcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaacatctcaaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaa 13508030  T
170 catcaaat 177  Q
    ||||||||    
13508029 catcaaat 13508022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 13597720 - 13597554
Alignment:
13 acttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaa-caacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaacaacg 110  Q
    |||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||| || ||||| | |||| || ||||| || ||||| ||||||||||| |  | |||| ||||||     
13597720 acttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataagcagaatgcaaaa-catcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaaca 13597622  T
111 tctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaaat 177  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||    
13597621 tcccaaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaat 13597554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Original strand, 20498581 - 20498746
Alignment:
14 cttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaa-caacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaacaacgt 111  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  ||||| || ||||| || ||||||  ||||  ||||||| |||| |||||||| || |||||| |||| |    
20498581 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgtaaaat-agcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 20498679  T
112 ctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaaat 177  Q
    |||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||    
20498680 ctcaaacattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaat 20498746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 145
Target Start/End: Original strand, 31971273 - 31971407
Alignment:
11 caacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaacaac 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  || ||| ||||    
31971273 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacaacatgacataataatatcaattccaattcatcaac 31971371  T
110 gtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 145  Q
     ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
31971372 atcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 31971407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 116
Target Start/End: Original strand, 21285606 - 21285719
Alignment:
4 tcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataac-aacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaag 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | |||||| ||||| |||| |||||||| || ||     
21285606 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttgttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaaa 21285704  T
102 tcaacaacgtctcaa 116  Q
    |||||||| ||||||    
21285705 tcaacaacatctcaa 21285719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 3 - 160
Target Start/End: Original strand, 23648561 - 23648719
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaag 101  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| | ||||| | ||||  ||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||     
23648561 atcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaattaacaatagcaacataggcagattacaacaacaacatgacataataatatcatttgcaat 23648660  T
102 tcaacaacgtctcaattattcacatataa-ttcaagtaatgcatatataattatatcaca 160  Q
     ||||||| ||| || |||||| ||| || ||||||||||||| | |  |||||||||||    
23648661 acaacaacatcttaaatattca-ataaaacttcaagtaatgcacacaacattatatcaca 23648719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 3 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 18678215 - 18678094
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaag 101  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | || || | ||||  ||||  ||||||| ||||||| ||||||||||| ||     
18678215 atcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagattacatcaacagcaagacataaaaatatcaattgcaat 18678116  T
102 tcaacaacgtctcaattattca 123  Q
    |||||||| ||| || ||||||    
18678115 tcaacaacatcttaaatattca 18678094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 45131098 - 45131017
Alignment:
14 cttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 96  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| | |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||    
45131098 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtaaac--aaacagcatgacataataatatcaatt 45131017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 3 - 123
Target Start/End: Original strand, 32121740 - 32121861
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaag 101  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| | || || | ||||  ||||  ||||||| ||||||| ||||||||||| ||     
32121740 atcttaatcaacttagaatgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagattacatcaacagcaagacataaaaatatcaattgcaat 32121839  T
102 tcaacaacgtctcaattattca 123  Q
    |||||||| ||| || ||||||    
32121840 tcaacaacatcttaaatattca 32121861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 48
Target Start/End: Original strand, 6520376 - 6520421
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaa 48  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
6520376 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 6520421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 38855364 - 38855319
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaa 48  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
38855364 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 38855319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 76 - 177
Target Start/End: Original strand, 37116431 - 37116532
Alignment:
76 catgacataataatatcaattgtaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaata-taacaacatca 174  Q
    ||||| |||| |||||||| || || |||||||| ||||||  || || |||||||||| |||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||    
37116431 catgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacat-catatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatca 37116529  T
175 aat 177  Q
    |||    
37116530 aat 37116532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 16199746 - 16199664
Alignment:
14 cttagaccgactcatgcaactttgttaaataac-aacaacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 96  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||| || |||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||    
16199746 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtattc--aaacaacatgacataataatatcaatt 16199664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 21389552 - 21389473
Alignment:
14 cttagaccgactcatgcaactttgttaaataac-aacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 94  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| | | |||||||   |||||||||||||||| |||||||    
21389552 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggtagtatac---aacagcatgacataattatatcaa 21389473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 21396082 - 21396003
Alignment:
14 cttagaccgactcatgcaactttgttaaataac-aacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 94  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||   |||||||||| ||||| |||||||    
21396082 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatac---aacagcatgagataattatatcaa 21396003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 21778878 - 21778799
Alignment:
14 cttagaccgactcatgcaactttgttaaataac-aacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 94  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| | | |||||||   |||||||||||||||| |||||||    
21778878 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggtagtatac---aacagcatgacataattatatcaa 21778799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 21790575 - 21790496
Alignment:
14 cttagaccgactcatgcaactttgttaaataac-aacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 94  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||   |||||||||| ||||| |||||||    
21790575 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatac---aacagcatgagataattatatcaa 21790496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 161 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 1327042 - 1326991
Alignment:
161 atataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcatatatacatat 212  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||| |||||||||||    
1327042 atataacaacatcaaataataatcaacatctcaaaacatcgtatatacatat 1326991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 983512 - 983474
Alignment:
10 tcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaa 48  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
983512 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 983474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 17267031 - 17266930
Alignment:
76 catgacataataatatcaattgtaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaata-taacaacatca 174  Q
    ||||| |||| |||||||| || || |||||||| ||||||  || || |||||||||  |||||||||||| | |||||||||| || |||||||||||    
17267031 catgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacat-catatataattcttgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatca 17266933  T
175 aat 177  Q
    |||    
17266932 aat 17266930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 23760950 - 23760912
Alignment:
10 tcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaa 48  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
23760950 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 23760912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 35026895 - 35026849
Alignment:
161 atataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcatatata 207  Q
    ||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||    
35026895 atataacaatatcaaacgataatcaacatcttaaaacatcatatata 35026849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 14 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 5866376 - 5866280
Alignment:
14 cttagaccgactcatgcaactttgttaaataac-aacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaacaac 109  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||| | ||||||| | ||| || ||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||    
5866376 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaac 5866280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 48
Target Start/End: Original strand, 17140932 - 17140969
Alignment:
11 caacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaa 48  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
17140932 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 17140969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 48
Target Start/End: Original strand, 21491011 - 21491048
Alignment:
11 caacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaa 48  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
21491011 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 21491048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 76 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 17439544 - 17439461
Alignment:
76 catgacataataatatcaattgtaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 160  Q
    ||||| |||| |||||||| || || |||||||| ||||||  || || |||||||||| |||||||||||| || |||||||||    
17439544 catgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacat-catatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcaca 17439461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 56
Target Start/End: Original strand, 21673718 - 21673766
Alignment:
9 atcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataac-aacaacaaca 56  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| ||||||||||    
21673718 atcaacttagaccgactcatgcatcatagttaaataacaaacaacaaca 21673766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 26355805 - 26355757
Alignment:
9 atcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataac-aacaacaaca 56  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||    
26355805 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaaca 26355757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 57)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Original strand, 34963378 - 34963587
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
34963378 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 34963477  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
34963478 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcat 34963577  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
34963578 atatacatat 34963587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 30676867 - 30676658
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||    
30676867 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgatataataatatcaaatgcaagt 30676768  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
30676767 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcat 30676668  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
30676667 atatacatat 30676658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Original strand, 12742322 - 12742531
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
12742322 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 12742421  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
12742422 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcat 12742521  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
12742522 atatacatat 12742531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Original strand, 19005051 - 19005260
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
19005051 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 19005150  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
19005151 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcat 19005250  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
19005251 atatacatat 19005260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Original strand, 22782232 - 22782441
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
22782232 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 22782331  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
22782332 caacaacgtctcaattattcacacataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaatcataatcaacatcttaaaacatcat 22782431  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
22782432 atatacatat 22782441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Original strand, 24422552 - 24422761
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
24422552 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 24422651  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
24422652 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcat 24422751  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
24422752 atatacatat 24422761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Original strand, 33861799 - 33862008
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
33861799 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 33861898  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
33861899 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcat 33861998  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
33861999 atatacatat 33862008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Original strand, 33864283 - 33864492
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
33864283 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 33864382  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
33864383 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcat 33864482  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
33864483 atatacatat 33864492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Original strand, 8055034 - 8055243
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
8055034 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaaaagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 8055133  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
8055134 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcat 8055233  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
8055234 atatacatat 8055243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 18334749 - 18334540
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
18334749 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 18334650  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
18334649 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcat 18334550  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
18334549 atatacatat 18334540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 19859076 - 19858867
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
19859076 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 19858977  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||    
19858976 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataacaatcaacatcttaaaacatcat 19858877  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
19858876 atatacatat 19858867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 2291337 - 2291128
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||    
2291337 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagt 2291238  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
2291237 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcat 2291138  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
2291137 atatacatat 2291128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 2 - 212
Target Start/End: Original strand, 25688506 - 25688716
Alignment:
2 tatcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaag 101  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
25688506 tatcttaatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaactgcaag 25688605  T
102 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatca 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
25688606 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatacatatataatcatatcacaatataacaacaccaaatggtaatcaacatcttaaaacatca 25688705  T
202 tatatacatat 212  Q
    | |||||||||    
25688706 tttatacatat 25688716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 1541068 - 1540859
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||    
1541068 atcttaatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagtatgacataataatatcaaatgcaagt 1540969  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
1540968 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattacatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcat 1540869  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
1540868 atatacatat 1540859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Original strand, 25656634 - 25656843
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
25656634 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacatagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 25656733  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
25656734 taataacgtctcaattattcacatataattcaactaatacatatataattatatcacaatataaaaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatctt 25656833  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
25656834 atatacatat 25656843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 26924797 - 26924588
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
26924797 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaatagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 26924698  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
26924697 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcat 26924598  T
203 atatacatat 212  Q
    || |||||||    
26924597 atgtacatat 26924588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 3 - 214
Target Start/End: Original strand, 1595554 - 1595765
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || |    
1595554 atcttaatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataacagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaatt 1595653  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
1595654 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatggatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcat 1595753  T
203 atatacatattg 214  Q
    ||||||||||||    
1595754 atatacatattg 1595765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 3 - 190
Target Start/End: Original strand, 25754814 - 25755001
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |    
25754814 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaaat 25754913  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatc 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
25754914 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatcataatcaacatc 25755001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 3 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 20557049 - 20556864
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||    
20557049 atcttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatggcataataatatcaaatgcaagt 20556950  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatc 190  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
20556949 caacaacgtctcaat--ttcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaatcataatcaacatc 20556864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Original strand, 18456735 - 18456898
Alignment:
14 cttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaacaacgtct 113  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
18456735 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaatagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtct 18456834  T
114 caattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
18456835 caattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaat 18456898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 3 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 16448684 - 16448514
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
16448684 atcttaatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 16448585  T
103 caa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacat 172  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
16448584 caatcaacgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataacaacat 16448514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 3 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 3852174 - 3852001
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||    
3852174 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagtttaataacaacagcaacacaatagtatacaaaaacagcatgacatgataatataaaatgcaagt 3852075  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaa 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
3852074 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacatcatcaaa 3852001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 147
Target Start/End: Original strand, 18461895 - 18462028
Alignment:
14 cttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaacaacgtct 113  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
18461895 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaatagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtct 18461994  T
114 caattattcacatataattcaagtaatgcatata 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
18461995 caattattcacatataattcaagtaatgcatata 18462028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 25629468 - 25629310
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaag 101  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||    
25629468 atcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaattacaacaggaacacatgcagtatacgaaaacagcatgacataacaatatcaaatgcaag 25629369  T
102 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 160  Q
    |||||||| |||||||||| ||   |||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
25629368 tcaacaacatctcaattatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcaca 25629310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 17287909 - 17287768
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagc-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaag 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
17287909 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggtagtatacaaacacagcatgacataataatatcaattgcaag 17287810  T
102 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgca 143  Q
    |||||| | ||| || ||||||  |||| |||||||||||||    
17287809 tcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgca 17287768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 19848108 - 19847932
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaag 101  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | || || || |||  ||||  |||||||  |||||| ||||||||||| ||     
19848108 atcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagattacatcaacagcaacacataaaaatatcaattgcaat 19848009  T
102 tcaacaacgtctcaattatt-cacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 177  Q
    |||||||  ||| || |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
19848008 tcaacaatatcttaaatatttcacatataattcaaataatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaat 19847932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 20361067 - 20360915
Alignment:
9 atcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaaca 107  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||    
20361067 atcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagcatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatca 20360968  T
108 acgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 160  Q
    || ||| || |||||| ||||  |||||||||||||||||  |||||||||||    
20360967 acatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcatataacattatatcaca 20360915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 3 - 157
Target Start/End: Original strand, 29060548 - 29060703
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaag 101  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||    
29060548 atcttcatcagcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaag 29060647  T
102 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatc 157  Q
    |||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| |||  ||||||||    
29060648 tcaacaacatctcaagtatacattcataattcaagtaatgcacataacattatatc 29060703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 18409940 - 18409782
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaag 101  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || |||    
18409940 atcttcatcaacttagaccgactcatgcagctcagttaaataacaacagcaacacaggcagtatacgaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaag 18409841  T
102 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 160  Q
    |||||||| ||||||| || ||   ||||||||| |||| ||||||  |||||||||||    
18409840 tcaacaacatctcaatcatccattcataattcaaataatacatataacattatatcaca 18409782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 160
Target Start/End: Original strand, 25644335 - 25644487
Alignment:
10 tcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataaca-acaacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaaca 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||| || |||||| |||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||| ||    
25644335 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcgtgatataacaatatcaaatgtaagtcatca 25644434  T
108 acgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 160  Q
    || ||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
25644435 acatctcaaacattcatatataattcaagtaatgcgtatacaattatatcaca 25644487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 11 - 160
Target Start/End: Original strand, 16496260 - 16496410
Alignment:
11 caacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaacaac 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
16496260 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaattgcaattcaacaac 16496359  T
110 gtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 160  Q
     ||| || |||||| |||    |||||||||||||| |  |||||||||||    
16496360 atcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaatattatatcaca 16496410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 3 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 19303653 - 19303496
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaag 101  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || |||    
19303653 atcttcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacacaggaagtatac-aaaacaacatgacataataatatcaaatgcaag 19303555  T
102 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 160  Q
    |||||||| |||||||||| ||   ||| ||||||||||| | |||  |||||||||||    
19303554 tcaacaacatctcaattatacattcatatttcaagtaatgtacataacattatatcaca 19303496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 3 - 160
Target Start/End: Original strand, 20593781 - 20593939
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaag 101  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||    
20593781 atcttcatcaacttagaccgaatcatgcagctcagttaaataaaaacagcaacacatgcagtatacgaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 20593880  T
102 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 160  Q
    |||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
20593881 tcaacaacatctcaattatacaatcataaatcaagtaatgcgtataacaatatatcaca 20593939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 3 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 22780340 - 22780166
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaag 101  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
22780340 atcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacaaaaacataggcaatatacaaaaacagcttgacataataatatcaattgcaag 22780241  T
102 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa-caacatcaa 175  Q
    |||||| | ||| || ||||||  |||| |||||||||||||   |  |||||||||||| |||| |||||||||    
22780240 tcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacgcaacattatatcacaacataatcaacatcaa 22780166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 20638396 - 20638301
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattg 97  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
20638396 atcttcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattg 20638301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 18821946 - 18821801
Alignment:
14 cttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaacaa-cgtc 112  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  | ||| |||||| | ||    
18821946 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgccataacaatatcaa-cgcaagccaacaatcatc 18821848  T
113 tcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 160  Q
    |||||||||||  || | |||||||||||| ||||  |||||||||||    
18821847 tcaattattcatttaaacttcaagtaatgcgtata-cattatatcaca 18821801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 3 - 160
Target Start/End: Original strand, 20076708 - 20076862
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaag 101  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| | |||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||     
20076708 atcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtaaac-aaaacagcatgacataataatatcaaatgcaaa 20076806  T
102 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 160  Q
    ||||||   ||| ||  |||||  |||| |||||||||||| ||||  |||||||||||    
20076807 tcaaca---tcttaaaaattcaattatacttcaagtaatgcgtataacattatatcaca 20076862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 69 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 8227557 - 8227448
Alignment:
69 aaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aac 167  Q
    |||||| ||||| |||||||||||    |||||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||    
8227557 aaaacatcatgatataataatatcgcacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaac 8227458  T
168 aacatcaaat 177  Q
    ||||||||||    
8227457 aacatcaaat 8227448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 160 - 212
Target Start/End: Original strand, 12942363 - 12942415
Alignment:
160 aatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcatatatacatat 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
12942363 aatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatat 12942415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 175
Target Start/End: Original strand, 20109153 - 20109322
Alignment:
10 tcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaa-caacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaaca 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||| || ||||| || |||||| ||||| || ||| | |||| |||||||| || |||||| ||    
20109153 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-caacataatataacaatatcaaatgcaagtcatca 20109251  T
108 acgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatata--attatatcacaatat-aacaacatcaa 175  Q
    || |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||| ||| |||||||||||    
20109252 acatctcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaatattatatcacattataaacaacatcaa 20109322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 3 - 56
Target Start/End: Original strand, 25714425 - 25714478
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaaca 56  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
25714425 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 25714478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 161 - 212
Target Start/End: Original strand, 15875469 - 15875520
Alignment:
161 atataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcatatatacatat 212  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
15875469 atataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatacatat 15875520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 161 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 28289334 - 28289283
Alignment:
161 atataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcatatatacatat 212  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
28289334 atataacgacatcaaatggtaattaacatcttaaaacatcatatatacatat 28289283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 107
Target Start/End: Original strand, 23992435 - 23992540
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaag 101  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||| | || || | ||||  ||||  ||||||| ||||||| ||||||||||| ||     
23992435 atcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagctaaataacaatagcagcataggcagattacatcaacagcaagacataaaaatatcaattgcaat 23992534  T
102 tcaaca 107  Q
    ||||||    
23992535 tcaaca 23992540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 27333331 - 27333286
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaa 48  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
27333331 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 27333286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 27394071 - 27394026
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaa 48  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
27394071 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 27394026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 212
Target Start/End: Original strand, 18913994 - 18914041
Alignment:
165 aacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcatatatacatat 212  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
18913994 aacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatacatat 18914041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 212
Target Start/End: Original strand, 18937252 - 18937299
Alignment:
165 aacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcatatatacatat 212  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
18937252 aacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatacatat 18937299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 14 - 160
Target Start/End: Original strand, 35245605 - 35245749
Alignment:
14 cttagaccgactcatgcaactttgttaaataac-aacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaacaacgt 111  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||| ||||| | |||||||||   |||| |||||||||||||||||||||  || ||| |||| |    
35245605 cttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaaacaccaacataggcagtatac---aacaacatgacataataatatcaatttcaattcatcaacat 35245701  T
112 ctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 160  Q
    || |  ||| || ||||  ||||||||||||||| || |||||||||||    
35245702 cttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcaca 35245749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 9098620 - 9098582
Alignment:
10 tcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaa 48  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
9098620 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 9098582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 48
Target Start/End: Original strand, 19862982 - 19863027
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaa 48  Q
    ||||| |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
19862982 atcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaa 19863027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 48
Target Start/End: Original strand, 19873124 - 19873169
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaa 48  Q
    ||||| |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
19873124 atcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaa 19873169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 125 - 177
Target Start/End: Original strand, 23076862 - 23076915
Alignment:
125 atataattcaagtaatgcatatataattatatcacaata-taacaacatcaaat 177  Q
    |||||||||| |||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||    
23076862 atataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaat 23076915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 56
Target Start/End: Original strand, 19652209 - 19652257
Alignment:
9 atcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataac-aacaacaaca 56  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||    
19652209 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaaca 19652257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 156
Target Start/End: Original strand, 23019425 - 23019567
Alignment:
14 cttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaa-caacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaacaacgt 111  Q
    |||||||||||| ||||| ||| |||||  ||||| || ||||| | ||||||| ||||| || ||||| |||| |||||||| || ||||||||||| |    
23019425 cttagaccgacttatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataagcagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaatgcaagtcaacaacat 23019523  T
112 ctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 156  Q
    |||||  | ||| | |||||||| |||||| ||||| ||||||||    
23019524 ctcaaaca-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatat 23019567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 28496575 - 28496539
Alignment:
12 aacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaa 48  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
28496575 aacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 28496539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 29808986 - 29808950
Alignment:
12 aacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaa 48  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
29808986 aacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 29808950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 178; Significance: 4e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Original strand, 10778 - 10987
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||    
10778 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagt 10877  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
10878 caacaacgtctcaattattcacatataatttaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcat 10977  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
10978 atatacatat 10987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 178; Significance: 4e-96; HSPs: 5)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 17597 - 17388
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
17597 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 17498  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
17497 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacagtataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcat 17398  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
17397 atatacatat 17388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Original strand, 94416 - 94625
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
94416 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 94515  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
94516 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcat 94615  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
94616 atatacatat 94625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 157
Target Start/End: Original strand, 44459 - 44614
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaa-acagcatgacataataatatcaattgtaag 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||    
44459 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 44558  T
102 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatc 157  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
44559 tcaacaacatctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatagaattatatc 44614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 156
Target Start/End: Original strand, 100388 - 100534
Alignment:
9 atcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataac-aacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaac 106  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||| | ||||||| | ||| || ||||| ||||||||||| | || || |||||    
100388 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataataatatcgaatgcaaatcaac 100486  T
107 aacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 156  Q
    ||| |||||| |||| ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
100487 aacatctcaaatattaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 100534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 48
Target Start/End: Original strand, 119891 - 119928
Alignment:
11 caacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaa 48  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
119891 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 119928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 178; Significance: 4e-96; HSPs: 64)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Original strand, 3515012 - 3515221
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||    
3515012 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaaaaacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcaagacataataatatcaaatgcaagt 3515111  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
3515112 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcat 3515211  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
3515212 atatacatat 3515221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 19618329 - 19618120
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||    
19618329 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagt 19618230  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
19618229 caacaacgtctcaattattcacctataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcat 19618130  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
19618129 atatacatat 19618120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 18215431 - 18215222
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
18215431 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 18215332  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
18215331 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaatcataatcaacatcttaaaacatcat 18215232  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
18215231 atatacatat 18215222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 15118509 - 15118300
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
15118509 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 15118410  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
15118409 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcat 15118310  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
15118309 atatacatat 15118300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Original strand, 52312515 - 52312724
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
52312515 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 52312614  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
52312615 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcat 52312714  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
52312715 atatacatat 52312724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 6 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 14970861 - 14970655
Alignment:
6 ttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaa 105  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
14970861 ttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaaacagcaatatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 14970762  T
106 caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcatata 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
14970761 caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatacatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatata 14970662  T
206 tacatat 212  Q
    |||||||    
14970661 tacatat 14970655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 12464 - 12255
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
12464 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 12365  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||    
12364 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatccaataataatcaacatcttaaaacatcat 12265  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
12264 atatacatat 12255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Original strand, 19242704 - 19242914
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
19242704 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 19242803  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatca 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||    
19242804 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataaacaactccaaatggtaatcaacatcttaaaacatca 19242903  T
202 tatatacatat 212  Q
    |||||||||||    
19242904 tatatacatat 19242914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Original strand, 44615293 - 44615502
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||    
44615293 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 44615392  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
44615393 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcat 44615492  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
44615493 atatacatat 44615502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 3 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 44773244 - 44773040
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
44773244 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 44773145  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
44773144 caacaacgtctcaattattcacaaataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaatatcat 44773045  T
203 atata 207  Q
    |||||    
44773044 atata 44773040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 15355482 - 15355272
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
15355482 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 15355383  T
103 caa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatca 201  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
15355382 caatcaacgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca 15355283  T
202 tatatacatat 212  Q
    |||||||||||    
15355282 tatatacatat 15355272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 1837666 - 1837457
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||    
1837666 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataataccaaatgcaagt 1837567  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
1837566 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacgattatatcacattataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcat 1837467  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
1837466 atatacatat 1837457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 18239576 - 18239367
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
18239576 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcagcacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 18239477  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
18239476 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattacatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcat 18239377  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
18239376 atatacatat 18239367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 50222496 - 50222287
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
50222496 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacattatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 50222397  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||    
50222396 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaatatcaaataataatcaacatcttaaaacatcat 50222297  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
50222296 atatacatat 50222287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 3 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 51464025 - 51463838
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |    
51464025 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaaat 51463926  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatc 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
51463925 caacaacgtctcaattattcacatataattcaaataatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatcataatcaacatc 51463838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 3 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 23803422 - 23803235
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |    
23803422 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaaat 23803323  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatc 190  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
23803322 caacaacgtctaaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacataaaatcataatcaacatc 23803235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 3 - 177
Target Start/End: Original strand, 44102219 - 44102393
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
44102219 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaataacacagtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 44102318  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 177  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
44102319 aaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacatcatcaaat 44102393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 3 - 190
Target Start/End: Original strand, 12610955 - 12611135
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||       ||||||||||||||||||||||||||||| || || |    
12610955 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-------acaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaaat 12611047  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatc 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
12611048 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatcataatcaacatc 12611135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 7641339 - 7641140
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||          |||||| ||||||||||||||||||| || ||||    
7641339 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca----------aaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagt 7641250  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
7641249 caacaacgtctcaattatttacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaatatcat 7641150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 44929037 - 44928873
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaag 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||    
44929037 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacagcatgacataataatgtcaaatgcaag 44928938  T
102 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa 166  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
44928937 tcaataacatctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa 44928873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 21815731 - 21815568
Alignment:
14 cttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaacaacgtct 113  Q
    ||||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||    
21815731 cttagaccgactcgtgcagcttagttaaataacgacagcaacacaactgtatacaaaaacagcatgacataataatataaaatgcaagtcaacaacgtct 21815632  T
114 caattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
21815631 caattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcataatataacaacatcaaat 21815568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 3 - 172
Target Start/End: Original strand, 20149834 - 20150004
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
20149834 atcttaatcaacttagactgactcatgcaacttgataaaataacaacagcgacacatcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 20149933  T
103 caa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacat 172  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
20149934 caatcatcgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataacaacat 20150004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 13 - 177
Target Start/End: Original strand, 15367708 - 15367873
Alignment:
13 acttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaa-caacgt 111  Q
    |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
15367708 acttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaatcaacgt 15367807  T
112 ctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 177  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
15367808 ctcaattattcacatataattcaactaacgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaat 15367873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 13 - 177
Target Start/End: Original strand, 15402721 - 15402886
Alignment:
13 acttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaa-caacgt 111  Q
    |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
15402721 acttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaatcaacgt 15402820  T
112 ctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 177  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
15402821 ctcaattattcacatataattcaactaacgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaat 15402886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 177
Target Start/End: Original strand, 15371220 - 15371385
Alignment:
13 acttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaa-caacgt 111  Q
    |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||    
15371220 acttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaatcaatgt 15371319  T
112 ctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 177  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
15371320 ctcaattattcacatataattcaactaacgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaat 15371385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 177
Target Start/End: Original strand, 15373501 - 15373666
Alignment:
13 acttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaa-caacgt 111  Q
    |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||    
15373501 acttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaatcaatgt 15373600  T
112 ctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 177  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
15373601 ctcaattattcacatataattcaactaacgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaat 15373666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 177
Target Start/End: Original strand, 15370036 - 15370200
Alignment:
13 acttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaa-caacgt 111  Q
    |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
15370036 acttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaatcaacgt 15370135  T
112 ctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 177  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
15370136 ctcaattattcacatataattcaact-acgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaat 15370200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 174
Target Start/End: Original strand, 16223550 - 16223712
Alignment:
13 acttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaa-caacgt 111  Q
    |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| ||||||    
16223550 acttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatctaatgcaagtcaatcaacgt 16223649  T
112 ctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatca 174  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
16223650 ctcaattattcacatataattcaactaacccatatacaattatatcacaatataacaacatca 16223712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 175
Target Start/End: Original strand, 7798782 - 7798956
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaag 101  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
7798782 atcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaag 7798881  T
102 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa-caacatcaa 175  Q
    ||| |||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  ||| |||||||| |||| |||||||||    
7798882 tcatcaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattgtatcacaacataatcaacatcaa 7798956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 11 - 160
Target Start/End: Original strand, 12902773 - 12902923
Alignment:
11 caacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaacaac 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
12902773 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaattcatcaac 12902872  T
110 gtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 160  Q
     ||| || |||||| |||| |||||||||||||||| |  |||||||||||    
12902873 atcttaaatattcaaatattattcaagtaatgcataaaacattatatcaca 12902923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 160
Target Start/End: Original strand, 22636443 - 22636601
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaag 101  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
22636443 atcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacatagacagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaat 22636542  T
102 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 160  Q
    ||| |||| ||| || |||||| ||||  |||||||||||||||||  |||||||||||    
22636543 tcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcatataacattatatcaca 22636601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 3 - 160
Target Start/End: Original strand, 7088885 - 7089043
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaag 101  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
7088885 atcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaat 7088984  T
102 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 160  Q
    ||| |||| ||| |  |||||| |||| |||||||||||||||| |  |||||||||||    
7088985 tcatcaacatcttacatattcaaatattattcaagtaatgcataaaacattatatcaca 7089043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 3 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 54798867 - 54798729
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaag 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
54798867 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttgaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 54798768  T
102 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaat 140  Q
    |||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||    
54798767 tcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat 54798729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 3 - 116
Target Start/End: Original strand, 14280321 - 14280434
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||    
14280321 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagt 14280420  T
103 caacaacgtctcaa 116  Q
    ||||||| ||||||    
14280421 caacaacatctcaa 14280434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 2 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 16377635 - 16377478
Alignment:
2 tatcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaa 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||| || ||    
16377635 tatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaa--cagcatgacataataatatcaaatgcaa 16377538  T
101 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 160  Q
    ||||||||| |||||||||| ||   |||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
16377537 gtcaacaacatctcaattatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcaca 16377478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 160
Target Start/End: Original strand, 14038656 - 14038814
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaag 101  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || |||    
14038656 atcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacatgcagtatacaaaaacaacatggcataataatatcaaatgcaag 14038755  T
102 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 160  Q
    |||||||| |||||||||| ||   ||| ||||||||||||| |||  |||||||||||    
14038756 tcaacaacatctcaattatacattcatatttcaagtaatgcacataacattatatcaca 14038814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 171
Target Start/End: Original strand, 22353852 - 22354010
Alignment:
14 cttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaacaacgtc 112  Q
    |||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| || || || |||  |  |  |||| |||||||||| ||||||||||  || |||||||||||    
22353852 cttagaccgactcatgcagcttaggtaaataacaacagcagcataggcagattgtagcaacaacatgacataacaatatcaattacaattcaacaacgtc 22353951  T
113 tcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaaca 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
22353952 tcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaaca 22354010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 160
Target Start/End: Original strand, 7893711 - 7893869
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaag 101  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
7893711 atcttcatcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaag 7893810  T
102 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 160  Q
    |||||| | ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  ||||| |||||    
7893811 tcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataccattatttcaca 7893869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 52873480 - 52873375
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaag 101  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
52873480 atcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaag 52873381  T
102 tcaaca 107  Q
    ||||||    
52873380 tcaaca 52873375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 3 - 160
Target Start/End: Original strand, 44052837 - 44052995
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaag 101  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
44052837 atcttcatcaacttaggccgactcatgcagctcagttaaataacaacatcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaat 44052936  T
102 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 160  Q
    ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||||  |||  |||||||||||    
44052937 tcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgctcataacattatatcaca 44052995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 8574980 - 8574844
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| |    
8574980 atcttaattaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaacagtatac-aaaacaacatgacataataatatcaaatgtaatt 8574882  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaat 140  Q
    ||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||    
8574881 caacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat 8574844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 16270348 - 16270191
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaag 101  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||| | ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||    
16270348 atcttcatcaagttagaccgactcatgcagcttaattaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaatgcaag 16270250  T
102 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 160  Q
    | |||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||    
16270249 ttaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcaca 16270191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 3 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 16240082 - 16239927
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaag 101  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| | ||| | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||    
16240082 atcttcatcaacttagaccaactcatgcaacttaattaaataacaatagcaaaataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaatgcaag 16239984  T
102 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatca 158  Q
    |||||||| ||| || ||||||  |||| || |||||||||| |||  |||||||||    
16239983 tcaacaacatcttaaatattcaattatactttaagtaatgcaaataacattatatca 16239927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 13953 - 13788
Alignment:
14 cttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaa-caacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaacaacgt 111  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||  ||||| || ||||| || |||||| ||||| || ||||| |||| |||||||| || |||||| |||| |    
13953 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 13855  T
112 ctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaaat 177  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||    
13854 ctcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaat 13788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 3 - 160
Target Start/End: Original strand, 6899899 - 6900056
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaag 101  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| | ||||||||| |||||| |||  |||||||||||||| || |||    
6899899 atcttcatcaacttagaccgactcatgcatcttagttaaataacaatagcaacataggcagtatac-aaaacaacatagcataataatatcaaatgcaag 6899997  T
102 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 160  Q
    |||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||| | |||  |||||||||||    
6899998 tcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgtacataacattatatcaca 6900056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 23374464 - 23374314
Alignment:
11 caacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaacaac 109  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| || ||||||||    
23374464 caacttagaacgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgcaattcaacaac 23374365  T
110 gtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 160  Q
     ||| || |||||| |||    |||||||||||||| |  |||||||||||    
23374364 atcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcaca 23374314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 52243302 - 52243131
Alignment:
10 tcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaa-caacaacacag-cagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaattgtaagtcaa 105  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||| || |||||| ||||  |||  ||||| |||| |||||||| || || ||||    
52243302 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaat-cagttcatgatataacaatatcaaatgaaattcaa 52243204  T
106 caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaaat 177  Q
    |||| ||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||    
52243203 caacatctcaaacattcatatataatccaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaat 52243131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 10 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 43198661 - 43198492
Alignment:
10 tcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaa-caacaacacag-cagtatacaaaaacag-catgacataataatatcaattgtaagtcaac 106  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||| || || ||| |||||  |  ||||| ||||  ||||||| || |||||| |    
43198661 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacaatatgcaaaacaattcatgatataaccatatcaaatgcaagtcatc 43198562  T
107 aacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaa 175  Q
    ||  |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
43198561 aatatctcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 43198492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 160 - 212
Target Start/End: Original strand, 15534343 - 15534395
Alignment:
160 aatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcatatatacatat 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
15534343 aatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatat 15534395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 161 - 212
Target Start/End: Original strand, 14048740 - 14048791
Alignment:
161 atataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcatatatacatat 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
14048740 atataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatat 14048791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 161 - 212
Target Start/End: Original strand, 36038033 - 36038084
Alignment:
161 atataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcatatatacatat 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
36038033 atataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatat 36038084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 80
Target Start/End: Original strand, 3096309 - 3096379
Alignment:
11 caacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatga 80  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||    
3096309 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatga 3096379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 14 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 14053403 - 14053321
Alignment:
14 cttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaa-caacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 96  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
14053403 cttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaaacaacagcatagacagtatacaaa--cagcatgacataataatatcaatt 14053321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 69 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 15464977 - 15464888
Alignment:
69 aaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatca 158  Q
    |||| ||||||| |||| |||||||| || || |||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
15464977 aaaatagcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacattcatatataattcaagtattgcatatacaattatatca 15464888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 161 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 15497070 - 15497019
Alignment:
161 atataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcatatatacatat 212  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
15497070 atataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatacatat 15497019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 161 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 49547773 - 49547722
Alignment:
161 atataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcatatatacatat 212  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
49547773 atataacaacatcaaatgataatcaacatcttaaaacatcatagatacatat 49547722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 39706401 - 39706347
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataac-aacaacaaca 56  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
39706401 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaaca 39706347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 162 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 52873176 - 52873126
Alignment:
162 tataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcatatatacatat 212  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
52873176 tataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatacatat 52873126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 212
Target Start/End: Original strand, 19857607 - 19857658
Alignment:
161 atataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcatatatacatat 212  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
19857607 atataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatatatat 19857658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 147
Target Start/End: Original strand, 6190481 - 6190616
Alignment:
14 cttagaccgactcatgcaactttgttaaataac-aacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaacaa-cg 110  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||| | | |||| ||||| | |||| || |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||  ||||| |     
6190481 cttagaccgactcatgcagcttagttaaacatcaaacagcaacataggcagcattcaaaaatagcatgacataacaatatcaa-tgtaagcgaacaatca 6190579  T
111 tctcaattattcacatataattcaagtaatgcatata 147  Q
    |||||||||||||  || | |||||||||||| ||||    
6190580 tctcaattattcatttaaacttcaagtaatgcgtata 6190616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 48
Target Start/End: Original strand, 12774021 - 12774060
Alignment:
9 atcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaa 48  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
12774021 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 12774060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 12288316 - 12288278
Alignment:
10 tcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaa 48  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
12288316 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 12288278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 48
Target Start/End: Original strand, 15551833 - 15551870
Alignment:
11 caacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaa 48  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
15551833 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 15551870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 125 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 53082142 - 53082089
Alignment:
125 atataattcaagtaatgcatatataattatatcacaata-taacaacatcaaat 177  Q
    |||||||||| |||||||||||| | |||||||||| || ||||||||||||||    
53082142 atataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaat 53082089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 178; Significance: 4e-96; HSPs: 44)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Original strand, 21840772 - 21840981
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||    
21840772 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagt 21840871  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
21840872 caacaacgtctcaattattcacatataatttaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcat 21840971  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
21840972 atatacatat 21840981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 23593892 - 23593682
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
23593892 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 23593793  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatca 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
23593792 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataaacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatca 23593693  T
202 tatatacatat 212  Q
    |||||||||||    
23593692 tatatacatat 23593682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Original strand, 13988871 - 13989080
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
13988871 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 13988970  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
13988971 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcat 13989070  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
13989071 atatacatat 13989080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 21923448 - 21923239
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
21923448 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 21923349  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
21923348 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcat 21923249  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
21923248 atatacatat 21923239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 21475244 - 21475035
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
21475244 atcttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 21475145  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
21475144 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcat 21475045  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
21475044 atatacatat 21475035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Original strand, 29776693 - 29776902
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || ||||    
29776693 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaataacatgacataataatatcaaatgcaagt 29776792  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
29776793 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcat 29776892  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
29776893 atatacatat 29776902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Original strand, 16361922 - 16362132
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||    
16361922 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacgacagcaacacaacagtatataaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagt 16362021  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatca 201  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
16362022 caacaacgtctcaattattcacaaataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataaacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatca 16362121  T
202 tatatacatat 212  Q
    |||||||||||    
16362122 tatatacatat 16362132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Original strand, 29298142 - 29298350
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||    
29298142 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatga-ataataatatcaaatgcaagt 29298240  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
29298241 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataataacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcat 29298340  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
29298341 atatacatat 29298350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Original strand, 31612318 - 31612527
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
31612318 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaatagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 31612417  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||    
31612418 caacaacatctcagttattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaatatcttaaaacatcat 31612517  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
31612518 atatacatat 31612527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 16275521 - 16275311
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
16275521 atcttaatcaacttagaccgactcatacaacttagttaaataacaacaacgacatagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagt 16275422  T
103 caa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatca 201  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||| ||||    
16275421 caatcaacgtctcaattattcacataaaattcaattaatgcatataccattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaatatcttgaaacatca 16275322  T
202 tatatacatat 212  Q
    |||||||||||    
16275321 tatatacatat 16275311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 22123225 - 22123015
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaa-caacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaag 101  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||    
22123225 atcttaatctacttagaccgactcatgcagcttagttaaatagcaaacagcaacacaacagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaaatgcaag 22123126  T
102 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatca 201  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||    
22123125 tcaacaatgtctcaattattcacatttaattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaatatcttaaaacatca 22123026  T
202 tatatacatat 212  Q
    |||||||||||    
22123025 tatatacatat 22123015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 3 - 177
Target Start/End: Original strand, 21346966 - 21347141
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||    
21346966 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaaagacacagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagt 21347065  T
103 caa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 177  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
21347066 caatcaacgtctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaat 21347141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 15860166 - 15859956
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || || ||||    
15860166 atcttaatcaacttggaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacagcagtatacaaaaacaacatgacataataatattaaatgcaagt 15860067  T
103 caa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatca 201  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||    
15860066 caatcaacgtcttaattactcacaaataattcaatcaatgcacatacaattatatcacaatataacaacatcagatggtaatcaacatcttaagacatca 15859967  T
202 tatatacatat 212  Q
    |||||||||||    
15859966 tatatacatat 15859956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 3 - 177
Target Start/End: Original strand, 21342101 - 21342276
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||    
21342101 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaaagacacagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagt 21342200  T
103 caa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 177  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
21342201 caatcaacgtctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattacatcacaatataacaacatcaaat 21342276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 3 - 177
Target Start/End: Original strand, 21707172 - 21707346
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||    
21707172 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacacaatagtatacaaaaaaagcatgacagaataatatcaaatgcaagt 21707271  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
21707272 caacaacgtctcaattattcacatataaatcatgtaatgcctatacaattatatcacaatataacatcatcaaat 21707346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 3 - 177
Target Start/End: Original strand, 21711714 - 21711888
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||    
21711714 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacacaatagtatacaaaaaaagcatgacagaataatatcaaatgcaagt 21711813  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
21711814 caacaacgtctcaattattcacatataaatcatgtaatgcctatacaattatatcacaatataacatcatcaaat 21711888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 13213019 - 13212844
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | || || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||    
13213019 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacgcaacagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagt 13212920  T
103 caa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 177  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
13212919 caatcaacgtctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaat 13212844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 172
Target Start/End: Original strand, 40389159 - 40389329
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
40389159 atcttaatcaacctagactgactcatgcaacttggttaaataacaacagcgacacatcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 40389258  T
103 caa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacat 172  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
40389259 caatcatcgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataacaacat 40389329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 45574989 - 45574812
Alignment:
14 cttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaacaacgtc 112  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||    
45574989 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatgacataataataccaaatgcaagtcaacaacgtc 45574890  T
113 tcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatc 190  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
45574889 tcaattattaacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataagaacatcaaatcataatcaacatc 45574812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 3 - 177
Target Start/End: Original strand, 433017 - 433190
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||| ||  |||||||||||||||| || |||||||||||||||| || ||||    
433017 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacggcaaca-cag-gcagtatacaaaaacatcaagacataataatatcaaatgcaagt 433114  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaaat 177  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
433115 caacaacatctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataaacaacatcaaat 433190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 160
Target Start/End: Original strand, 22532277 - 22532435
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaag 101  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||     
22532277 atcttcatcaacttagaccaactcatgcaatttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatccattgcaat 22532376  T
102 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 160  Q
    |||||||| ||| || ||||||   ||||||||||||||||| |||  |||||||||||    
22532377 tcaacaacatcttaaatattcattcataattcaagtaatgcacataacattatatcaca 22532435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 27250834 - 27250684
Alignment:
11 caacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaacaac 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||    
27250834 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaac 27250735  T
110 gtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 160  Q
     ||| || |||||| |||| |||||||||||||||| |  |||||||||||    
27250734 atcttaaatattcaaatattattcaagtaatgcataaaacattatatcaca 27250684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 50210326 - 50210168
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaag 101  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||    
50210326 atcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaag 50210227  T
102 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 160  Q
    |||||||| |||||| ||| ||   |||||||||||||||| | ||  |||||||||||    
50210226 tcaacaacatctcaagtatacattcataattcaagtaatgcgtttaacattatatcaca 50210168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 160
Target Start/End: Original strand, 34509788 - 34509946
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaag 101  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||    
34509788 atcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataatgatatcaaatgcaag 34509887  T
102 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 160  Q
    |||||||| ||| |||||| ||   |||  ||||||||||| ||||  |||||||||||    
34509888 tcaacaacatcttaattatacattcatatctcaagtaatgcttataacattatatcaca 34509946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 22468809 - 22468651
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaag 101  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||||| | ||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||     
22468809 atcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaataacaatagcaacataggcagattacaacaacagcatgacatcataatatcaattgcaat 22468710  T
102 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 160  Q
    |||||||| ||| |||||||||   |||  |||||||||||| |||  |||||||||||    
22468709 tcaacaacatcttaattattcaataatatctcaagtaatgcacataacattatatcaca 22468651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 21896358 - 21896193
Alignment:
14 cttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaa-caacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaacaacgt 111  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  ||||| || ||||| || |||||||||||| |||||||| |||| |||||||| || |||||| |||| |    
21896358 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 21896260  T
112 ctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaaat 177  Q
    |||||  ||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||    
21896259 ctcaaacattcatatataattcatgtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaat 21896193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 160
Target Start/End: Original strand, 21026696 - 21026846
Alignment:
11 caacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaacaac 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| | | ||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||| || ||||||||    
21026696 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaatataggcagtatacaaaatcagcatgacgtaaatatatcaattgcaattcaacaac 21026795  T
110 gtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 160  Q
     ||| || |||||| |||    |||||||||||||| |  |||||||||||    
21026796 atcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcaca 21026846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 21861672 - 21861510
Alignment:
14 cttagaccgactcatgcaactttgttaaataac-aacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaacaacgt 111  Q
    |||||||||||||||||| ||| | |||  ||| |||| ||||| | ||||||| | |||||||||||| |||| |||||||| || |||||| |||| |    
21861672 cttagaccgactcatgcagcttagctaataaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 21861574  T
112 ctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatca 174  Q
    |||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||    
21861573 ctcaaacattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatca 21861510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 10 - 166
Target Start/End: Original strand, 16758664 - 16758822
Alignment:
10 tcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaa-caacaacacag-cagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaattgtaagtcaa 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| || |||||| ||||  |||  ||||| |||| |||||||| |  ||  |||    
16758664 tcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaac-cagttcatgatataacaatatcaaatacaatacaa 16758762  T
106 caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa 166  Q
    |||| || |||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
16758763 caacatcacaac-attcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataa 16758822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 3 - 158
Target Start/End: Original strand, 20135195 - 20135351
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaag 101  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| | || || | ||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||  || ||     
20135195 atcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaacaacaatagcagcataggcagattacaacaacatcatgacataataatatcatgtgcaat 20135294  T
102 tcaacaacgtctcaattattcacatataa-ttcaagtaatgcatatataattatatca 158  Q
    |||||||| ||| || |||||| ||| || ||||||||||||||| |  |||||||||    
20135295 tcaacaacatcttaagtattca-ataaaacttcaagtaatgcatacaacattatatca 20135351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 20847259 - 20847175
Alignment:
11 caacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 94  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| | |||||| |||||| |||||||||||||  |||||||    
20847259 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtacacaaaatcagcatgacataaatatatcaa 20847175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 35261180 - 35261018
Alignment:
14 cttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaa-caacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaacaacgt 111  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||  ||||| || ||||| || |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| || || ||||||   |    
35261180 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-cagcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaaca---t 35261085  T
112 ctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaata-taacaacatcaaat 177  Q
    |||||  ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||||||    
35261084 ctcaaacattcatacataattcaagtaatgcatatacaattacatcacattattaacaacatcaaat 35261018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 3 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 20454666 - 20454613
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaaca 56  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
20454666 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 20454613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 175
Target Start/End: Original strand, 33681022 - 33681188
Alignment:
10 tcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataac-aacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaaca 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | || |||||  ||    
33681022 tcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcgtca 33681120  T
108 acgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaa 175  Q
    || |||||| || ||| | |||||||| |||||| ||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||    
33681121 acatctcaaata-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaa 33681188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 161 - 212
Target Start/End: Original strand, 43543214 - 43543265
Alignment:
161 atataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcatatatacatat 212  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
43543214 atataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatacatat 43543265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 120
Target Start/End: Original strand, 21754059 - 21754170
Alignment:
9 atcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataac-aacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaac 106  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||||| || || |||||    
21754059 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcaaatgcaa-tcaac 21754156  T
107 aacgtctcaattat 120  Q
    ||| ||||||||||    
21754157 aacatctcaattat 21754170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 22354616 - 22354527
Alignment:
71 aacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 160  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
22354616 aacagcatgacataaaaatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 22354527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 48
Target Start/End: Original strand, 21714550 - 21714595
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaa 48  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
21714550 atcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaa 21714595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 56
Target Start/End: Original strand, 20248293 - 20248341
Alignment:
9 atcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataac-aacaacaaca 56  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||    
20248293 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaaaaacaaacaacaaca 20248341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 76 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 41050073 - 41049973
Alignment:
76 catgacataataatatcaattgtaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaata-taacaacatca 174  Q
    ||||| |||| |||||||| || || |||||||| ||||||    ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||| |||    
41050073 catgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaca--tcatatataattcaagtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacgtca 41049976  T
175 aat 177  Q
    |||    
41049975 aat 41049973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 52928076 - 52928029
Alignment:
10 tcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataac-aacaacaaca 56  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
52928076 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaaca 52928029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 48
Target Start/End: Original strand, 20918620 - 20918657
Alignment:
11 caacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaa 48  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
20918620 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 20918657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 9 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 22921976 - 22921868
Alignment:
9 atcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataac-aacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaac 106  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | || || |||||    
22921976 atcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaac 22921878  T
107 aacgtctcaa 116  Q
    ||| ||||||    
22921877 aacatctcaa 22921868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 126 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 16368276 - 16368224
Alignment:
126 tataattcaagtaatgcatatataattatatcacaata-taacaacatcaaat 177  Q
    ||||||||| |||||||||||| | |||||||||| || ||||||||||||||    
16368276 tataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaat 16368224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 174; Significance: 9e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 7 - 212
Target Start/End: Original strand, 4703 - 4908
Alignment:
7 taatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaac 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||    
4703 taatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 4802  T
107 aacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcatatat 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
4803 aacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacaacatatat 4902  T
207 acatat 212  Q
    ||||||    
4903 acatat 4908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 174; Significance: 9e-94; HSPs: 78)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Original strand, 12567565 - 12567774
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||    
12567565 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcaatatacaaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagt 12567664  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
12567665 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatgataatcaacatcttaaaacatcat 12567764  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
12567765 atatacatat 12567774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Original strand, 13544030 - 13544239
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||    
13544030 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcaatatacaaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagt 13544129  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
13544130 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatgataatcaacatcttaaaacatcat 13544229  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
13544230 atatacatat 13544239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 9707764 - 9707555
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||    
9707764 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatacaagt 9707665  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
9707664 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcat 9707565  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
9707564 atatacatat 9707555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 16454438 - 16454229
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
16454438 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 16454339  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
16454338 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcat 16454239  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
16454238 atatacatat 16454229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Original strand, 17463183 - 17463392
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
17463183 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 17463282  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
17463283 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcat 17463382  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
17463383 atatacatat 17463392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 45607064 - 45606855
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
45607064 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 45606965  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
45606964 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcat 45606865  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
45606864 atatacatat 45606855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 7781504 - 7781295
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |    
7781504 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaaat 7781405  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
7781404 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcat 7781305  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
7781304 atatacatat 7781295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Original strand, 8899099 - 8899308
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
8899099 atcttaatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 8899198  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
8899199 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaatcataatcaacatcttaaaacatcat 8899298  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
8899299 atatacatat 8899308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Original strand, 34159331 - 34159540
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
34159331 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 34159430  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
34159431 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcat 34159530  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
34159531 atatacatat 34159540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Original strand, 55476496 - 55476705
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
55476496 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 55476595  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
55476596 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcat 55476695  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
55476696 atatacatat 55476705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 13151948 - 13151738
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttt-gttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaag 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
13151948 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 13151849  T
102 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatca 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
13151848 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca 13151749  T
202 tatatacatat 212  Q
    |||||||||||    
13151748 tatatacatat 13151738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 13154413 - 13154203
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttt-gttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaag 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
13154413 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 13154314  T
102 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatca 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
13154313 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca 13154214  T
202 tatatacatat 212  Q
    |||||||||||    
13154213 tatatacatat 13154203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 6 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 38962045 - 38961839
Alignment:
6 ttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaa 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
38962045 ttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 38961946  T
106 caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcatata 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
38961945 caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataaccaacatcttaaaacatcatata 38961846  T
206 tacatat 212  Q
    |||||||    
38961845 tacatat 38961839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 6469291 - 6469082
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
6469291 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 6469192  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
6469191 caacaacgtctcaattagtcacatataattgaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcat 6469092  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
6469091 atatacatat 6469082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 10247880 - 10247671
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
10247880 atcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataacaacagcagcacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 10247781  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
10247780 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcat 10247681  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
10247680 atatacatat 10247671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 16282968 - 16282759
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  | || ||||    
16282968 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatattgaatgcaagt 16282869  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
16282868 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcat 16282769  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
16282768 atatacatat 16282759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 28848768 - 28848559
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
28848768 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 28848669  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
28848668 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattacatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcat 28848569  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
28848568 atatacatat 28848559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Original strand, 41123895 - 41124101
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
41123895 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca---acaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 41123991  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
41123992 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcat 41124091  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
41124092 atatacatat 41124101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 3 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 17446811 - 17446614
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
17446811 atcttaatcaacttagac-gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 17446713  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatca 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
17446712 caacaacgtctcaattattcacatatcattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca 17446614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 6 - 190
Target Start/End: Original strand, 50242830 - 50243014
Alignment:
6 ttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaa 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || ||||    
50242830 ttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagtagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaaatcaa 50242929  T
106 caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatc 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
50242930 caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatcataatcaacatc 50243014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 3 - 177
Target Start/End: Original strand, 17672631 - 17672805
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |    
17672631 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacatagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaaat 17672730  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
17672731 caacaacgtctcaattattcacatataattcaaataatgcatatataattatatcacaatataacatcatcaaat 17672805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 3 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 29172740 - 29172565
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
29172740 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 29172641  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaata-taacaacatcaaat 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||    
29172640 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatactatcaacatcaaat 29172565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Original strand, 8499523 - 8499734
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||    
8499523 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacagtagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagt 8499622  T
103 caa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatc 200  Q
    ||| ||| |||||||||||||||| |||||  || ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
8499623 caatcaatgtctcaattattcacagataatctaattaatgcatatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgataatcaacatcttaaaacatc 8499722  T
201 atatatacatat 212  Q
    ||||||||||||    
8499723 atatatacatat 8499734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 3 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 12119882 - 12119707
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
12119882 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttgttaaataacaacagcgacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 12119783  T
103 caa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 177  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
12119782 caatcaacgtctcaattattcacagataatctaattaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaat 12119707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Original strand, 15412434 - 15412645
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
15412434 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacagtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 15412533  T
103 caa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatc 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||  || | ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||    
15412534 caatcaacgtctcaattattcacagataatctaattgatgcatatacaattatatcccaatataaacaacatcaaatgataatcaacatcttaaaacttc 15412633  T
201 atatatacatat 212  Q
    ||||||||||||    
15412634 atatatacatat 15412645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 53070799 - 53070636
Alignment:
14 cttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaacaacgtct 113  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| || |||||||||||||||| || |||||||||||||||    
53070799 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataacagtatacaaaaacaacaagacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtct 53070700  T
114 caattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
53070699 caattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatctaacaacatcaaat 53070636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 43550625 - 43550448
Alignment:
14 cttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaacaacgtc 112  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||| ||||| | ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
43550625 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataatgacagcaacatatgcagtatgcaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtc 43550526  T
113 tcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatc 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
43550525 tcaattattcacatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacaatataacaacatcaaatcataatcaacatc 43550448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 129
Target Start/End: Original strand, 15977520 - 15977646
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||    
15977520 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaatagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagt 15977619  T
103 caacaacgtctcaattattcacatata 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
15977620 caacaacgtctcaattattcacatata 15977646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Original strand, 27165255 - 27165466
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaa-caacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||| | || |||||| ||||| || ||||| |||  |||||||| || ||    
27165255 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaatatagacagtatgcaaaa-caacatgatataccaatatcaaatgcaa 27165353  T
101 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa-caacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaat 199  Q
    |||| |||  |||||| |||||| |||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
27165354 gtcatcaatatctcaaatattcatatataatttaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacat 27165453  T
200 catatatacatat 212  Q
    |||||||||||||    
27165454 catatatacatat 27165466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 175
Target Start/End: Original strand, 43840939 - 43841114
Alignment:
2 tatcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaa 100  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
43840939 tatcttcatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacatagacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaa 43841038  T
101 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa-caacatcaa 175  Q
    ||||||| | ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||| |||| |||||||||    
43841039 gtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacaacataatcaacatcaa 43841114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 3 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 40213833 - 40213676
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||||    
40213833 atcttaatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacatcaacacagcagtatacataaacatcatgacataataatatcaaatgcaagt 40213734  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 160  Q
    ||||||| |||||||||| ||   ||||| |||||||||| ||||  |||||||||||    
40213733 caacaacatctcaattatacattcataatccaagtaatgcgtataacattatatcaca 40213676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 53301664 - 53301452
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaa-caacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || ||||| || |||||| ||||| || ||||| |||| |||||||| || ||    
53301664 atcttaatcaacttagaccgactcatacaacttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaatgcaa 53301566  T
101 gtcaa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa-caacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaa 198  Q
    ||||  |||  |||||| |||||| |||||||||||||| | | |||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |    
53301565 gtcattcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattacgtatacaattatatcacaatataaacaacataaaatggtaatcaacatcttaaaaca 53301466  T
199 tcatatatacatat 212  Q
    ||||||||||||||    
53301465 tcatatatacatat 53301452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 10 - 175
Target Start/End: Original strand, 26686902 - 26687069
Alignment:
10 tcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaacaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
26686902 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacat 26687001  T
109 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa-caacatcaa 175  Q
    | ||| || |||||   |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||| |||| |||||||||    
26687002 catcttaaatattccattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacaacataatcaacatcaa 26687069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 160
Target Start/End: Original strand, 14972862 - 14973020
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaag 101  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||     
14972862 atcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaaa 14972961  T
102 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 160  Q
    |||||||| |||||  ||| ||   |||||||||||||||||||||  |||||||||||    
14972962 tcaacaacatctcatatatacattcataattcaagtaatgcatataacattatatcaca 14973020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 3 - 160
Target Start/End: Original strand, 17487864 - 17488022
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaag 101  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
17487864 atcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaaatagacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaat 17487963  T
102 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 160  Q
    ||| |||| ||| || |||||| ||||  |||||||||||||||||  |||||||||||    
17487964 tcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcatataacattatatcaca 17488022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 3 - 160
Target Start/End: Original strand, 17499346 - 17499504
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaag 101  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
17499346 atcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaaatagacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaat 17499445  T
102 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 160  Q
    ||| |||| ||| || |||||| ||||  |||||||||||||||||  |||||||||||    
17499446 tcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcatataacattatatcaca 17499504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 3 - 109
Target Start/End: Original strand, 55500947 - 55501053
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
55500947 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 55501046  T
103 caacaac 109  Q
    |||||||    
55501047 caacaac 55501053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 3 - 140
Target Start/End: Original strand, 36166603 - 36166739
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||    
36166603 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacagcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 36166701  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaat 140  Q
    ||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||    
36166702 caacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat 36166739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 14576939 - 14576788
Alignment:
9 atcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaaca 107  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
14576939 atcaacttagaccgactcattcaacttagttaaataacaacagcaacatagacagtata-aacaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaaca 14576841  T
108 acgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 160  Q
    || ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
14576840 acatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 14576788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 176
Target Start/End: Original strand, 42386428 - 42386593
Alignment:
13 acttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaacaacgt 111  Q
    |||||||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |    
42386428 acttagaccgactcatgcagtttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataacaatatcaaatgcaagtcaacaacat 42386527  T
112 ctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa-caacatcaaa 176  Q
    ||||| ||||||   |||||||||| ||||||||||  |||||||||||  |||| ||||||||||    
42386528 ctcaaatattcattcataattcaagcaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaaa 42386593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 160
Target Start/End: Original strand, 13442282 - 13442440
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaag 101  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||     
13442282 atcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacggcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaat 13442381  T
102 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 160  Q
    ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||||| |||  |||||||||||    
13442382 tcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcaca 13442440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 23083474 - 23083316
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaag 101  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
23083474 atcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaattgcaag 23083375  T
102 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 160  Q
    |||||||| ||| || ||||||  | || ||| ||||||||| |||  |||||||||||    
23083374 tcaacaacatcttaaatattcaattttacttctagtaatgcacataacattatatcaca 23083316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 25476498 - 25476340
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagc-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaag 101  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
25476498 atcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaaaaacaacagcaacacaggtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 25476399  T
102 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 160  Q
    |||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||  |||  |||||||||||    
25476398 tcaacaacatctcaagtatacattcataattcaagtaatgcgcataacattatatcaca 25476340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 140
Target Start/End: Original strand, 21618459 - 21618590
Alignment:
8 aatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaaca 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
21618459 aatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaacagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 21618557  T
108 acgtctcaattattcacatataattcaagtaat 140  Q
    || |||||| ||| ||   ||||||||||||||    
21618558 acatctcaaatatacattcataattcaagtaat 21618590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 20698548 - 20698405
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaag 101  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||     
20698548 atcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacgtaataatatcaattgcaat 20698449  T
102 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 145  Q
    ||| |||| ||| |  |||||| ||||  |||||||||||||||    
20698448 tcatcaacatcttatatattcaaatattcttcaagtaatgcata 20698405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 94
Target Start/End: Original strand, 44494814 - 44494905
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 94  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
44494814 atcttaatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacagcagtatacaaaaacagcataacataataatatcaa 44494905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 160
Target Start/End: Original strand, 18438542 - 18438700
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaag 101  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||    
18438542 atcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgatataataatatcaaatgcaag 18438641  T
102 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 160  Q
    |||||||| |||   |||| ||   |||  ||||||||||||||||  |||||||||||    
18438642 tcaacaacatcttttttatacattcatatctcaagtaatgcatataacattatatcaca 18438700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 141
Target Start/End: Original strand, 14572603 - 14572735
Alignment:
9 atcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaaca 107  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
14572603 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacatagacagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaattgagagtcaaca 14572701  T
108 acgtctcaattattcacatataattcaagtaatg 141  Q
    || ||| || ||||||  |||| ||||| |||||    
14572702 acatcttaaatattcaattatacttcaaataatg 14572735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 94
Target Start/End: Original strand, 10556990 - 10557081
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 94  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
10556990 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacatcagcatacaaaaacggcatgacataataatatcaa 10557081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 145
Target Start/End: Original strand, 12399225 - 12399360
Alignment:
11 caacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaacaac 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || ||||||||    
12399225 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaaatgcaattcaacaac 12399324  T
110 gtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 145  Q
     ||| || |||||| |||    ||||||||||||||    
12399325 atcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcata 12399360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 24153321 - 24153164
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagc-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaag 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | | ||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||    
24153321 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacgatagcaacataggtagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaatgcaag 24153223  T
102 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 160  Q
    |||||||| ||| || ||||||  |||| ||||| ||||||| |||  || ||||||||    
24153222 tcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaaataatgcacataacataatatcaca 24153164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 3 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 11424872 - 11424718
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaag 101  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | ||     
11424872 atcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataacaatatcaatagcaaa 11424774  T
102 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 160  Q
    ||||||   |||||||||| ||   |||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
11424773 tcaaca---tctcaattatgcattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcaca 11424718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 3 - 94
Target Start/End: Original strand, 17737241 - 17737335
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagta---tacaaaaacagcatgacataataatatcaa 94  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| ||   ||||| ||||||||||||||||||||||||    
17737241 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcaatatactacaacaacagcatgacataataatatcaa 17737335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 24340826 - 24340660
Alignment:
13 acttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaa-caacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaacaacg 110  Q
    |||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||| || ||||| | ||||||| || || || ||||| ||||||||||| |  | |||| ||||||     
24340826 acttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacatatgcagtatgcacaa-catcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaaca 24340728  T
111 tctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaaat 177  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||    
24340727 tctcaaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaat 24340660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 52523831 - 52523666
Alignment:
14 cttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaa-caacaacacag-cagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaattgtaagtcaacaac 109  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| || |||||| ||||| |||  ||||| |||| |||||| | || || ||||||||    
52523831 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaa-cagttcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaac 52523733  T
110 gtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaa 175  Q
     ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
52523732 atctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 52523666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 114 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 17248287 - 17248224
Alignment:
114 caattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 177  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
17248287 caattattcacatataattcaaataatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaat 17248224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 177
Target Start/End: Original strand, 23274705 - 23274871
Alignment:
13 acttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaa-caacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaacaacg 110  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| || ||||| || |||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |  | |||| ||||||     
23274705 acttagactgactcatgcaacttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaaca 23274803  T
111 tctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaaat 177  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||    
23274804 tctcaaatattcacatataattcaagtaaagaatatacaattacatcacattataaacaacatcaaat 23274871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 69 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 37642311 - 37642202
Alignment:
69 aaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aac 167  Q
    |||||| ||||| |||||||||||    |||||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||    
37642311 aaaacatcatgatataataatatcgcacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaac 37642212  T
168 aacatcaaat 177  Q
    ||||||||||    
37642211 aacatcaaat 37642202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 69 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 22147571 - 22147474
Alignment:
69 aaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa 166  Q
    |||||| ||||| |||||||||||    |||||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
22147571 aaaacatcatgatataataatatcgcacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataa 22147474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 76 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 2051238 - 2051138
Alignment:
76 catgacataataatatcaattgtaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatca 174  Q
    ||||| |||| |||||||| || || |||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||    
2051238 catgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatca 2051139  T
175 a 175  Q
    |    
2051138 a 2051138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 161 - 212
Target Start/End: Original strand, 54520985 - 54521036
Alignment:
161 atataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcatatatacatat 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
54520985 atataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatat 54521036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 163 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 29544839 - 29544790
Alignment:
163 ataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcatatatacatat 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
29544839 ataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatat 29544790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 3 - 123
Target Start/End: Original strand, 46822273 - 46822394
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaag 101  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | || || | ||||  ||||  |||| || ||||||| ||||||||||| ||     
46822273 atcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagattacatcaacaacaagacataaaaatatcaattgcaat 46822372  T
102 tcaacaacgtctcaattattca 123  Q
    |||||||| ||| || ||||||    
46822373 tcaacaacatcttaaatattca 46822394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 212
Target Start/End: Original strand, 12305315 - 12305359
Alignment:
168 aacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcatatatacatat 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
12305315 aacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatat 12305359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 45577995 - 45577948
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaaca 50  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
45577995 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaca 45577948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 175
Target Start/End: Original strand, 16097342 - 16097509
Alignment:
9 atcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataac-aacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaac 106  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| | ||| ||| | ||| || ||| | |||| |||||| | || |||||| |    
16097342 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcaatatgc-aaatcatcatcatataacaatatcgaatgcaagtcatc 16097440  T
107 aacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaa 175  Q
    ||| |||||| || ||| | |||||||| |||||| ||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||    
16097441 aacatctcaaata-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaa 16097509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 48
Target Start/End: Original strand, 28194698 - 28194743
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaa 48  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
28194698 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 28194743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 109
Target Start/End: Original strand, 12511065 - 12511172
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaag 101  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| | || || | ||||  ||||  |||| || ||||||| ||||||||||| ||     
12511065 atcttaatcaacttagaatgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagattacatcaacaacaagacataaaaatatcaattgcaat 12511164  T
102 tcaacaac 109  Q
    ||||||||    
12511165 tcaacaac 12511172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 212
Target Start/End: Original strand, 15977696 - 15977747
Alignment:
161 atataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcatatatacatat 212  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
15977696 atataacaacatcaaataataaccaacatcttaaaacatcatatatacatat 15977747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 10 - 123
Target Start/End: Original strand, 30029855 - 30029968
Alignment:
10 tcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaacaa 108  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| | || || || |||  ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| || || ||||    
30029855 tcaacttagactgactcatgcaacttagtttaataacaatagcagcatagacagattacaacaacagcatgacataagaatatcatttgcaattc-acaa 30029953  T
109 cgtctcaattattca 123  Q
    ||||| || ||||||    
30029954 cgtcttaaatattca 30029968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 156
Target Start/End: Original strand, 15470939 - 15471085
Alignment:
10 tcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataaca-acaacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaaca 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | || |||||| ||    
15470939 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatca 15471037  T
108 acgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 156  Q
    || ||||||  | ||| | |||||||| |||||| ||||| ||||||||    
15471038 acatctcaaaca-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatat 15471085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 12174366 - 12174327
Alignment:
9 atcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaa 48  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
12174366 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 12174327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 48
Target Start/End: Original strand, 32307691 - 32307730
Alignment:
9 atcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaa 48  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
32307691 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 32307730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 13210432 - 13210395
Alignment:
11 caacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaa 48  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
13210432 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 13210395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 48
Target Start/End: Original strand, 14234495 - 14234540
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaa 48  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||    
14234495 atcttaatcaacttagactgattcatgcagcttagttaaataacaa 14234540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 15878164 - 15878119
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaa 48  Q
    ||||| |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
15878164 atcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaa 15878119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 9 - 175
Target Start/End: Original strand, 16103794 - 16103960
Alignment:
9 atcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataac-aacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaac 106  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||| ||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | || || |||||    
16103794 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacgaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaac 16103891  T
107 aacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaa 175  Q
    ||| |||||| || ||| | ||||||||  ||||| ||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||    
16103892 aacatctcaaata-tcaaacataattcatttaatgtatataaaattatataacattataaacaacatcaa 16103960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 23077590 - 23077537
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaaca 56  Q
    |||||||||| |||| |  |||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
23077590 atcttaatcatcttatatagactcatgcaacttggttaaataacaacagcaaca 23077537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 171; Significance: 6e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Original strand, 11293 - 11503
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
11293 atcttaatcaaattagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 11392  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatc-a 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |    
11393 caacaacgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaaaatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaa 11492  T
202 tatatacatat 212  Q
    |||||||||||    
11493 tatatacatat 11503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 170; Significance: 2e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 12406 - 12197
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||    
12406 atcttaatcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagaatacaaaaacagcatgacaaaataatatcaaatgcaagt 12307  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
12306 caacaacgtctcaattattcacatttaattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcat 12207  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
12206 atatacatat 12197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 170; Significance: 2e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Original strand, 20752 - 20961
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
20752 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 20851  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
20852 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcat 20951  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
20952 atatacatat 20961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 170; Significance: 2e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Original strand, 37826 - 38035
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
37826 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 37925  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
37926 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcat 38025  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
38026 atatacatat 38035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 170; Significance: 2e-91; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Original strand, 501089 - 501298
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||    
501089 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcaatatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagt 501188  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||    
501189 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatagtaatcaacatcttaaaacattat 501288  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
501289 atatacatat 501298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 85737 - 85562
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
85737 atcttaatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 85638  T
103 caa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 177  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
85637 caatcaacgtctgaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaat 85562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 48
Target Start/End: Original strand, 160698 - 160737
Alignment:
9 atcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaa 48  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
160698 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 160737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 170; Significance: 2e-91; HSPs: 76)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Original strand, 456326 - 456535
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
456326 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 456425  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
456426 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcat 456525  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
456526 atatacatat 456535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 11393444 - 11393235
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
11393444 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 11393345  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
11393344 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcat 11393245  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
11393244 atatacatat 11393235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 15376870 - 15376661
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
15376870 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 15376771  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
15376770 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcat 15376671  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
15376670 atatacatat 15376661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Original strand, 16232525 - 16232734
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
16232525 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 16232624  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
16232625 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcat 16232724  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
16232725 atatacatat 16232734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 20385280 - 20385071
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
20385280 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 20385181  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
20385180 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcat 20385081  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
20385080 atatacatat 20385071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 21189752 - 21189543
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
21189752 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 21189653  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
21189652 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcat 21189553  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
21189552 atatacatat 21189543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Original strand, 32125496 - 32125705
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
32125496 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 32125595  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
32125596 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcat 32125695  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
32125696 atatacatat 32125705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Original strand, 41522922 - 41523131
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
41522922 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 41523021  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
41523022 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcat 41523121  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
41523122 atatacatat 41523131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Original strand, 41525384 - 41525593
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
41525384 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 41525483  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
41525484 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcat 41525583  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
41525584 atatacatat 41525593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 14949279 - 14949070
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
14949279 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 14949180  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
14949179 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcat 14949080  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
14949079 atatacatat 14949070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Original strand, 18640277 - 18640486
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
18640277 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 18640376  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||    
18640377 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacataaaataataatcaacatcttaaaacatcat 18640476  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
18640477 atatacatat 18640486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Original strand, 24702243 - 24702452
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||    
24702243 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagt 24702342  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
24702343 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcat 24702442  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
24702443 atatacatat 24702452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Original strand, 27216865 - 27217074
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
27216865 atcttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 27216964  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
27216965 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcat 27217064  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
27217065 atatacatat 27217074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 3 - 210
Target Start/End: Original strand, 11972501 - 11972708
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
11972501 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 11972600  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||    
11972601 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaatatcttaaaacatcat 11972700  T
203 atatacat 210  Q
    ||||||||    
11972701 atatacat 11972708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Original strand, 16213689 - 16213898
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||    
16213689 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatccaagt 16213788  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
16213789 caacaacgtcttaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaacataacaacatcaaatggtaatcaacatatgaaaacatcat 16213888  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
16213889 atatacatat 16213898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Original strand, 16410064 - 16410273
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
16410064 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 16410163  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
16410164 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatacatatacaattatatcatagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcat 16410263  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
16410264 atatacatat 16410273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Original strand, 18430717 - 18430926
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||    
18430717 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatataaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagt 18430816  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
18430817 caacaacatctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcat 18430916  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
18430917 atatacatat 18430926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Original strand, 24704693 - 24704899
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    |||||||||||||||| || ||||    
24704693 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacaa---gacataataatatcaaatgcaagt 24704789  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
24704790 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcat 24704889  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
24704890 atatacatat 24704899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 3 - 177
Target Start/End: Original strand, 44116514 - 44116688
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||    
44116514 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagt 44116613  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
44116614 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagcaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaat 44116688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 3 - 176
Target Start/End: Original strand, 3386338 - 3386511
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||    
3386338 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaatagtatacaaaaacagcatgacatgataatatcaaatgcaagt 3386437  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaa 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
3386438 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatacatatacaattatatcacaatataacatcatcaaa 3386511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 190
Target Start/End: Original strand, 13647344 - 13647521
Alignment:
14 cttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaacaacgtc 112  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
13647344 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtc 13647443  T
113 tcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatc 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
13647444 tcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaatcataatcaacatc 13647521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Original strand, 13869351 - 13869562
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
13869351 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacagtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 13869450  T
103 caa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatc 200  Q
    ||| |||||||||||||||||| | |||||  || | ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
13869451 caatcaacgtctcaattattcaaagataatctaattgatgcatatacaattatatcccaatataaacaacatcaaatgataatcaacatcttaaaacatc 13869550  T
201 atatatacatat 212  Q
    ||||||||||||    
13869551 atatatacatat 13869562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 3 - 147
Target Start/End: Original strand, 24275176 - 24275320
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
24275176 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 24275275  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatata 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
24275276 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatata 24275320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 17062072 - 17061898
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaa-caacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaag 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||    
17062072 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaactcagcagtatacaaaat-agcatgacataataatatcaaatgcaag 17061974  T
102 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 177  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
17061973 tcagcaacgtctcaattattaacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaat 17061898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 53 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 26356090 - 26355936
Alignment:
53 aacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataatt 152  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
26356090 aacacaacagtatacaaaaacagcataacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaatt 26355991  T
153 atatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcatatata 207  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||    
26355990 atatcacaatataacaacattaaataataatcaacatcttaaaacatcatatata 26355936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 53 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 26358542 - 26358388
Alignment:
53 aacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataatt 152  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
26358542 aacacaacagtatacaaaaacagcataacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaatt 26358443  T
153 atatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcatatata 207  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||    
26358442 atatcacaatataacaacattaaataataatcaacatcttaaaacatcatatata 26358388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 38898534 - 38898359
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
38898534 atcttaatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacgacacagcagtatataaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 38898435  T
103 caa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 177  Q
    ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||    
38898434 caatcaacatctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcacagtataacaacgtcaaat 38898359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 3 - 175
Target Start/End: Original strand, 20110561 - 20110723
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |          |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
20110561 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagc----------tatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 20110650  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaa 175  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
20110651 caataacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaa 20110723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 12756817 - 12756654
Alignment:
14 cttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaacaacgtct 113  Q
    |||||||||||||  |||  || |||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||    
12756817 cttagaccgactcgagcagtttagttaaataacaacagcaacacaacaatatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtaaacaacgtct 12756718  T
114 caattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 177  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
12756717 caattattcacataaaattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaat 12756654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 3564477 - 3564319
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaag 101  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
3564477 atcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgtaag 3564378  T
102 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 160  Q
    |||||||| |||||||||| ||   |||||||||||||||| ||||  |||| ||||||    
3564377 tcaacaacatctcaattatacattcataattcaagtaatgcgtataacattagatcaca 3564319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 3 - 124
Target Start/End: Original strand, 13831378 - 13831499
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| || || ||||    
13831378 atcttaatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacacggtagtatacaaaaacaacatgacataataatataaaatgcaagt 13831477  T
103 caacaacgtctcaattattcac 124  Q
    ||||||||||||||||||||||    
13831478 caacaacgtctcaattattcac 13831499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 117
Target Start/End: Original strand, 48273397 - 48273512
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaag 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
48273397 atcttaatcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 48273496  T
102 tcaacaacgtctcaat 117  Q
    |||||||| |||||||    
48273497 tcaacaacatctcaat 48273512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 3 - 160
Target Start/End: Original strand, 12698839 - 12698998
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaa-acagcatgacataataatatcaattgtaa 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
12698839 atcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaacacagcatgacataataatatcaattgcaa 12698938  T
101 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 160  Q
     ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||||| |||  |||||||||||    
12698939 ttcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcaca 12698998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 166
Target Start/End: Original strand, 26212012 - 26212168
Alignment:
11 caacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaacaac 109  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
26212012 caacttagaccgactcatacaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaattgcaattcaacaac 26212111  T
110 gtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa 166  Q
     ||| || |||||| |||    |||||||||||||| |  ||||||||||| |||||    
26212112 atcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcacattataa 26212168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 10 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 2280225 - 2280056
Alignment:
10 tcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaa-caacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaaca 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||| |||||||| || |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| || || ||||||    
2280225 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatgcaaaa-cagcatgatataataatatcaaatgcaaatcaaca 2280127  T
108 acgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaaat 177  Q
    || |||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||    
2280126 acatctcaaatattcatatataattcaaataatacatataaaattatatcacattataaacaacatcaaat 2280056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 3 - 160
Target Start/End: Original strand, 9509197 - 9509355
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaag 101  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||     
9509197 atcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagtaacataggcagtatacaataacagcatgacataataatatcaattgcaat 9509296  T
102 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 160  Q
    ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||||| |||  | |||||||||    
9509297 tcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacactatatcaca 9509355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 3 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 18456525 - 18456368
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaag 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | | ||||| || |||||||||||| || ||||||||||||||||||| || |||    
18456525 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacgatagcaacataggcagtatacaaaa-caacatgacataataatatcaaatgcaag 18456427  T
102 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 160  Q
    |||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||    
18456426 tcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcaca 18456368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 160
Target Start/End: Original strand, 38227489 - 38227646
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaag 101  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||    
38227489 atcttcatctacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaatgcaag 38227587  T
102 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 160  Q
    |||||||| ||| || ||||||  |||| ||||| ||||| | |||| |||||||||||    
38227588 tcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaattaatgtacatatcattatatcaca 38227646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 110 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 15081999 - 15081895
Alignment:
110 gtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatc--ttaaaaaatcatatata 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||   | ||| ||||||||||    
15081999 gtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaatcataatcaacatcaacttaaacatcatatata 15081900  T
208 catat 212  Q
    |||||    
15081899 catat 15081895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 109
Target Start/End: Original strand, 10589055 - 10589154
Alignment:
11 caacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaacaac 109  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||||    
10589055 caacttagatcgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacatatgcagtatacaaaaacaacatgacataatcatatcaattgcaattcaacaac 10589154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 143 - 212
Target Start/End: Original strand, 13841157 - 13841226
Alignment:
143 atatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcatatatacatat 212  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
13841157 atatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatacatat 13841226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 3 - 116
Target Start/End: Original strand, 22072921 - 22073036
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataac-aacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaa 100  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||| |||||||||| | ||| ||| ||||| |||||||| |||| |||||||| |||||    
22072921 atcttaatcaacttagactgacccatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcactatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaa 22073020  T
101 gtcaacaacgtctcaa 116  Q
    ||||||||| ||||||    
22073021 gtcaacaacatctcaa 22073036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 10 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 15144143 - 15143993
Alignment:
10 tcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaacaac 109  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||   |||||| ||| ||||||| || || |||||||||| || ||| |||||||    
15144143 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacatctcagtatgcaataacagcaagatatcataatatcaaatgcaagccaacaac 15144044  T
110 gtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 160  Q
     |||||| ||| ||   |||||| ||||||||| ||||  || ||||||||    
15144043 atctcaagtatacattcataatttaagtaatgcgtataacatcatatcaca 15143993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 69 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 19486790 - 19486681
Alignment:
69 aaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aac 167  Q
    |||||| ||||| |||||||||||    |||||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||    
19486790 aaaacatcatgatataataatatcgcacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagttatgcatatacaattatatcacattataaac 19486691  T
168 aacatcaaat 177  Q
    ||||||||||    
19486690 aacatcaaat 19486681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 160 - 212
Target Start/End: Original strand, 11303409 - 11303461
Alignment:
160 aatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcatatatacatat 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
11303409 aatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatat 11303461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 149 - 212
Target Start/End: Original strand, 18627717 - 18627780
Alignment:
149 aattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcatatatacatat 212  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
18627717 aattatatcacaatataacaagatcaaatactaatcaacatcttaaaacatcatatatacatat 18627780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 16386353 - 16386263
Alignment:
11 caacttagaccgactcatgcaactttgttaaataac-aacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgta 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||    
16386353 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacgacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgta 16386263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 161 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 16108688 - 16108637
Alignment:
161 atataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcatatatacatat 212  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
16108688 atataacaacatcaaacggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatat 16108637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Original strand, 16495421 - 16495581
Alignment:
14 cttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaa-caacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaacaacgt 111  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| || |||||| ||||  || ||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||      
16495421 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaac-catcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaac-- 16495517  T
112 ctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 177  Q
     |||||||| || |  ||| ||| |||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||    
16495518 -tcaattat-cagacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataacaacatcaaat 16495581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 161 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 23664952 - 23664901
Alignment:
161 atataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcatatatacatat 212  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
23664952 atataacaacatcaaatggtaattaacatcttaaaacatcatatatacatat 23664901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 12255892 - 12255730
Alignment:
17 agaccgactcatgcaactttgttaaataacaa-caacaacacag-cagtatacaaaaacag-catgacataataatatcaattgtaagtcaacaacgtct 113  Q
    |||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| || |||||| ||||   |  ||||| |||| |||||||| || || || ||||| |||    
12255892 agacagactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatagtcagtatgcaaatcaattcatgatataacaatatcaaatgaaattctacaacatct 12255793  T
114 caattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaa 175  Q
    |||  ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
12255792 caaacattcatatataattcaagtaatacatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 12255730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 166
Target Start/End: Original strand, 15116568 - 15116651
Alignment:
82 ataataatatcaattgtaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa 166  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||| |||||    
15116568 ataacaatatcaattgcaagtcatcaacatctcaat-attcacatataactcaagtaatatatatacaattatatcacattataa 15116651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 161 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 14270061 - 14270010
Alignment:
161 atataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcatatatacatat 212  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
14270061 atataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatacatat 14270010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 207
Target Start/End: Original strand, 29796771 - 29796817
Alignment:
161 atataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcatatata 207  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
29796771 atataacaacatcaaatggtaattaacatcttaaaacatcatatata 29796817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 207
Target Start/End: Original strand, 29800590 - 29800636
Alignment:
161 atataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcatatata 207  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
29800590 atataacaacatcaaatggtaattaacatcttaaaacatcatatata 29800636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 56
Target Start/End: Original strand, 47831815 - 47831869
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataac-aacaacaaca 56  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
47831815 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaaca 47831869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 48
Target Start/End: Original strand, 67753 - 67798
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaa 48  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
67753 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 67798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 1868101 - 1867932
Alignment:
10 tcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataac-aacaacaacacag-cagtatacaaaaacagc--atgacataataatatcaattgtaagtcaa 105  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||| |||||||||| || ||||||| |||| ||||  |||| |||| ||||||||| | || | ||    
1868101 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaactaacaacaacataggcagtatataaaa-cagctcatgatataacaatatcaat-gcaaatgaa 1868004  T
106 caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaata-taacaacatcaaat 177  Q
    |||| ||||||  || || |||||||||| |||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||    
1868003 caacatctcaaacat-catatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaat 1867932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 82 - 166
Target Start/End: Original strand, 15113031 - 15113114
Alignment:
82 ataataatatcaattgtaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa 166  Q
    |||| |||||||| || |||||| |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||| |||||    
15113031 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaat-attcacatataactcaagtaatatatatacaattatatcacattataa 15113114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 212
Target Start/End: Original strand, 8468803 - 8468854
Alignment:
161 atataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcatatatacatat 212  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
8468803 atataacaacatcaaataataatcaacatcataaaacatcatatatacatat 8468854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 14932847 - 14932752
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattg 97  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| |  | || | | ||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
14932847 atcttaatcaacttagactgactcatgcgacttagttaaataacaatagtagcataggtagattacaacaatagcatgacataataatatcaattg 14932752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 15356282 - 15356187
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattg 97  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| |  | || | | ||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
15356282 atcttaatcaacttagactgactcatgcgacttagttaaataacaatagtagcataggtagattacaacaatagcatgacataataatatcaattg 15356187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 15360396 - 15360301
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattg 97  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| |  | || | | ||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
15360396 atcttaatcaacttagactgactcatgcgacttagttaaataacaatagtagcataggtagattacaacaatagcatgacataataatatcaattg 15360301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 14 - 145
Target Start/End: Original strand, 40443410 - 40443541
Alignment:
14 cttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaa-caacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaacaacgt 111  Q
    ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| || ||||| | |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||  || ||| |||| |    
40443410 cttagaccgactcgtgcagcttagttaaataacaaacagcaacatacgcagtaaacaaa--cagcatgacataataatatcaatttcaattcatcaacat 40443507  T
112 ctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 145  Q
    || |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
40443508 cttaggtatacaaatattcttcaagtaatgcata 40443541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 15008489 - 15008436
Alignment:
125 atataattcaagtaatgcatatataattatatcacaata-taacaacatcaaat 177  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||    
15008489 atataattcaagtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaat 15008436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 20220180 - 20220127
Alignment:
125 atataattcaagtaatgcatatataattatatcacaata-taacaacatcaaat 177  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||    
20220180 atataattcatgtaatgcatatacaattatatcacattattaacaacatcaaat 20220127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 109
Target Start/End: Original strand, 34200802 - 34200901
Alignment:
11 caacttagaccgactcatgcaactttgttaaataac-aacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaacaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||| | ||||||| | ||| || ||||| ||||||||||| | ||||| |||||||    
34200802 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaa 34200900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 56
Target Start/End: Original strand, 44014192 - 44014240
Alignment:
9 atcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataac-aacaacaaca 56  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
44014192 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaaca 44014240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 811238 - 811199
Alignment:
9 atcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaa 48  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
811238 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 811199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 48
Target Start/End: Original strand, 18005660 - 18005699
Alignment:
9 atcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaa 48  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
18005660 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 18005699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 3 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 26356151 - 26356096
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacaca 58  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||| |   ||||||||||||||||||||||    
26356151 atcttaatcaatttagactgactcatgcagcaaagttaaataacaacaacaacaca 26356096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 3 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 26358603 - 26358548
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacaca 58  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||| |   ||||||||||||||||||||||    
26358603 atcttaatcaatttagactgactcatgcagcaaagttaaataacaacaacaacaca 26358548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 18154954 - 18154909
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaa 48  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
18154954 atcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaa 18154909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 19649602 - 19649557
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaa 48  Q
    ||||| |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
19649602 atcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaa 19649557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 28505411 - 28505366
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaa 48  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
28505411 atcttcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 28505366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 11996132 - 11996033
Alignment:
11 caacttagaccgactcatgcaactttgttaaataac-aacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaacaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| ||||||||||  | ||||| |||||||    
11996132 caacttagaccgactcatgcatcttagttaattaacaaacaacaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatattgaatgtaaatcaacaa 11996034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 170; Significance: 2e-91; HSPs: 57)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 264925 - 264716
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
264925 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 264826  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
264825 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcat 264726  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
264725 atatacatat 264716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Original strand, 32027398 - 32027607
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||    
32027398 atcttaatcaacttagaccgactcatacaacttagttaaataacaacaacaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatccaagt 32027497  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
32027498 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcat 32027597  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
32027598 atatacatat 32027607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 42245522 - 42245313
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
42245522 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 42245423  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
42245422 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcat 42245323  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
42245322 atatacatat 42245313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Original strand, 39363389 - 39363598
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
39363389 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 39363488  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
39363489 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcat 39363588  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
39363589 atatacatat 39363598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 10733097 - 10732888
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
10733097 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 10732998  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
10732997 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaccgtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcat 10732898  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
10732897 atatacatat 10732888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Original strand, 20909017 - 20909226
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
20909017 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaaagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 20909116  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
20909117 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcat 20909216  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
20909217 atatacatat 20909226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Original strand, 29345985 - 29346194
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
29345985 atcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataacaacagcatcacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 29346084  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
29346085 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcat 29346184  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
29346185 atatacatat 29346194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Original strand, 29348458 - 29348667
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
29348458 atcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataagaacagcatcacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 29348557  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
29348558 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcat 29348657  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
29348658 atatacatat 29348667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Original strand, 29350931 - 29351140
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
29350931 atcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataagaacagcatcacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 29351030  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
29351031 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcat 29351130  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
29351131 atatacatat 29351140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Original strand, 39245141 - 39245350
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
39245141 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 39245240  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
39245241 caataacgtcccaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattacatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcat 39245340  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
39245341 atatacatat 39245350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Original strand, 29329939 - 29330145
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||    
29329939 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagt 29330038  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||| | |||||||||| |||||    
29330039 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaa---taataatcatcttaaaacatcat 29330135  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
29330136 atatacatat 29330145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 20918105 - 20917900
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    ||||    
20918105 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacaaaataatataaa----aagt 20918010  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
20918009 caacaacgtctcaattattcacatctaattcaagtaaagcatatataattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcat 20917910  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
20917909 atatacatat 20917900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 3 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 36154937 - 36154766
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
36154937 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaaca---cagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 36154841  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
36154840 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacatcatcaaat 36154766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 10 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 20902159 - 20901991
Alignment:
10 tcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaacaac 109  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
20902159 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaagtgcaagtcaacaac 20902060  T
110 gtctcaatta-ttcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 177  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
20902059 gtctcaattatttcacatataattcaaataatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaat 20901991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 3 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 2154771 - 2154596
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
2154771 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaactgcaagt 2154672  T
103 caacaacgtctcaatta-ttcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 177  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
2154671 caacaacgtctcaattatttcacatataattcaaataatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaat 2154596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Original strand, 38619439 - 38619650
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
38619439 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacgacacagtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 38619538  T
103 caa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatc 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||  || | ||||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
38619539 caatcaacgtctcaattattcacagataatctaattgatgcatatacaattatattccaatataaacaacatcaaatgataatcaacatcttaaaacatc 38619638  T
201 atatatacatat 212  Q
    ||||||||||||    
38619639 atatatacatat 38619650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 3 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 11581356 - 11581184
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||    
11581356 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagt 11581257  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaa 175  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
11581256 caataacgtctcaattattcacgtataattcaagtaatgtatatacaattatatcacaatataacaacatcaa 11581184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Original strand, 23064516 - 23064727
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||    
23064516 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacgacacagtagtatacaaaaacagcatgacctaataatatcaaatgcaagt 23064615  T
103 caa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatc 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||  || | ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||     
23064616 caatcaacgtctcaattattcacagataatctaattgatgcatatacaattatatcccaatataaacaacatcaaatgataatcaacatcttaaaacata 23064715  T
201 atatatacatat 212  Q
    ||||||||||||    
23064716 atatatacatat 23064727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 3 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 18319191 - 18319021
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
18319191 atcttaatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 18319092  T
103 caa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacat 172  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
18319091 caatcaacgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataacaacat 18319021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 3 - 177
Target Start/End: Original strand, 31061073 - 31061248
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
31061073 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaaaacagtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 31061172  T
103 caa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 177  Q
    ||| |||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
31061173 caatcaacgtatcaattattcacaaataatttaattaatgcatataaaattatatcacaatataacaacatcaaat 31061248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 10775833 - 10775659
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| || ||||    
10775833 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacgacagcgacacagcagtatataaaaccagcatgacataataatatcaaatgcaagt 10775734  T
103 caa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 177  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
10775733 caatcaacgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatat-acaacatcaaat 10775659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 3 - 172
Target Start/End: Original strand, 24067112 - 24067282
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||    
24067112 atcttaatcaacttagaccgaccaatgcagcttggttaaataacaacagcgacacaacagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagt 24067211  T
103 caa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacat 172  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
24067212 caatcatcgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataacaacat 24067282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 160
Target Start/End: Original strand, 25421540 - 25421698
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaag 101  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
25421540 atcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaag 25421639  T
102 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 160  Q
    |||||| | ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||    
25421640 tcaacagcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcaca 25421698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 23390609 - 23390451
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaag 101  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||     
23390609 atcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacatagacagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaat 23390510  T
102 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 160  Q
    ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||||| |||  |||||||||||    
23390509 tcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcaca 23390451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 160
Target Start/End: Original strand, 9077960 - 9078118
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaag 101  Q
    ||||| |||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||    
9077960 atcttcatcaacttagactgacccatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacagcatgacataataatatcaagtgcaag 9078059  T
102 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 160  Q
    |||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
9078060 tcaacaacatctcaattatacattcataactcaagtaatgcgtataacattatatcaca 9078118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 160
Target Start/End: Original strand, 24529228 - 24529386
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaag 101  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || |||    
24529228 atcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataatgatatcaaatgcaag 24529327  T
102 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 160  Q
    |||||||| ||| |||||| ||   |||  ||||||||||| ||||  |||||||||||    
24529328 tcaacaacatcttaattatacattcatatctcaagtaatgcttataacattatatcaca 24529386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 160
Target Start/End: Original strand, 25431414 - 25431560
Alignment:
15 ttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaacaacgtct 113  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
25431414 ttagaccgactcatgcatcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatct 25431513  T
114 caattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 160  Q
     || | ||||  |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||    
25431514 taaatgttcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcaca 25431560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 3 - 160
Target Start/End: Original strand, 1096475 - 1096633
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaag 101  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| || ||     
1096475 atcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggtagtatgcaaaaacaacataacataataatatcaaatgcaaa 1096574  T
102 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 160  Q
    |||||||| |||||  ||| ||   |||||||||||||||||||||  |||||||||||    
1096575 tcaacaacatctcacatatacattcataattcaagtaatgcatataacattatatcaca 1096633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 11 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 21729169 - 21729019
Alignment:
11 caacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaacaac 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
21729169 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaattgcaattcaacaac 21729070  T
110 gtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 160  Q
     ||| || |||||| |||    |||||||||||||| |  |||||||||||    
21729069 atcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaatattatatcaca 21729019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 11 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 21808494 - 21808344
Alignment:
11 caacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaacaac 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
21808494 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaattgcaattcaacaac 21808395  T
110 gtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 160  Q
     ||| || |||||| |||    |||||||||||||| |  |||||||||||    
21808394 atcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcaca 21808344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 8286956 - 8286797
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacaca-gcagtatac-aaaaacagcatgacataataatatcaattgtaa 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
8286956 atcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaa 8286857  T
101 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 160  Q
     ||| |||| ||| || || ||| | ||  ||||||||||||| |||  |||||||||||    
8286856 ttcatcaacatcttaaataatcaaacattcttcaagtaatgcacataacattatatcaca 8286797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 140
Target Start/End: Original strand, 22412192 - 22412329
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaag 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| | ||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||    
22412192 atcttaatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacgataacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaatgcaag 22412290  T
102 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaat 140  Q
    |||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||    
22412291 tcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat 22412329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 160
Target Start/End: Original strand, 24493577 - 24493734
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaag 101  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| | ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||    
24493577 atcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaagtaacaatagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaatgcaag 24493675  T
102 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 160  Q
    |||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||| ||||| |||  |||||||||||    
24493676 tcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtgatgcacataacattatatcaca 24493734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 3 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 21997647 - 21997555
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 94  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
21997647 atcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 21997555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 160
Target Start/End: Original strand, 22144068 - 22144215
Alignment:
14 cttagaccgactcatgcaactttgttaaataaca-acaacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaacaacgt 111  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||| | | ||||| | |||||| ||||| |||| ||||||||||| || |||||||| |    
22144068 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacagacatcaacataggtagtatgc-aaaacaacatgatataacaatatcaattgcaaatcaacaacat 22144166  T
112 ctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 160  Q
    |||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
22144167 ctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 22144215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 160
Target Start/End: Original strand, 22075035 - 22075185
Alignment:
11 caacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagca-gtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaacaac 109  Q
    |||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||| || | |||||||||| || |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
22075035 caacttagaccgactcattcagcttagttaaataacaacagcaacataggaagtatacaaaatcaacatgacataataatatcaattgcaattcaacaac 22075134  T
110 gtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 160  Q
     ||| || |||||| |||    |||||||||||||| |  |||||||||||    
22075135 atcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcaca 22075185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 3 - 160
Target Start/End: Original strand, 13025319 - 13025476
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaag 101  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| | ||||| || |||||||||||| |||||||||||| | ||||||| || |||    
13025319 atcttcatcaacttagaccgactcatgcagcatagttaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacatattgatatcaaatgcaag 13025417  T
102 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 160  Q
    |||||||| ||| || ||||||  |||| ||||| ||||| | |||  |||||||||||    
13025418 tcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaaataatgtacataacattatatcaca 13025476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 3 - 160
Target Start/End: Original strand, 13095503 - 13095660
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaag 101  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| | ||||| || |||||||||||| |||||||||||| | ||||||| || |||    
13095503 atcttcatcaacttagaccgactcatgcagcatagttaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacatattgatatcaaatgcaag 13095601  T
102 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 160  Q
    |||||||| ||| || ||||||  |||| ||||| ||||| | |||  |||||||||||    
13095602 tcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaaataatgtacataacattatatcaca 13095660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 76 - 177
Target Start/End: Original strand, 40725935 - 40726037
Alignment:
76 catgacataataatatcaattgtaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatca 174  Q
    ||||| |||||||||||    |||||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||    
40725935 catgatataataatatcgcacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatca 40726034  T
175 aat 177  Q
    |||    
40726035 aat 40726037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 161 - 212
Target Start/End: Original strand, 9776521 - 9776572
Alignment:
161 atataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcatatatacatat 212  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
9776521 atataacaacatcaaatggtaattaacatcttaaaacatcatatatacatat 9776572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 5 - 93
Target Start/End: Original strand, 18418590 - 18418678
Alignment:
5 cttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgtt-aaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 93  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
18418590 cttaatcaacttagactgactcgtgcaacttagttaaaataacaacatcaacataggcagtatac--aaacagcatgacataataatatca 18418678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 53 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 20766181 - 20766095
Alignment:
53 aacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaat 140  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||    
20766181 aacacaacagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat 20766095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 17517314 - 17517193
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaag 101  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| | || || | ||||  ||||  ||||||| ||||||| ||||||||| | ||     
17517314 atcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagtttaataacaatagcagcataggcagattacatcaacagcaagacataaaaatatcaatcgcaat 17517215  T
102 tcaacaacgtctcaattattca 123  Q
    |||||||| ||| || ||||||    
17517214 tcaacaacatcttaaatattca 17517193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 21329610 - 21329565
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaa 48  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
21329610 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 21329565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 22178323 - 22178161
Alignment:
14 cttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaa-caacaacacag-cagtatacaaaaacagc--atgacataataatatcaattgtaagtcaacaac 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||| || ||||||| |||| ||||  |||| || | |||||||| || || ||||||||    
22178323 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatataaaa-cagctcatgatatgacaatatcaaatgcaaatcaacaac 22178225  T
110 gtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaata-taacaacatc 173  Q
     ||||||  || || |||||||||| |||||||||||| | |||||||||| || ||||||||||    
22178224 atctcaaacat-catatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatc 22178161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 21293071 - 21292991
Alignment:
14 cttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaat 95  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||||| | |||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||    
21293071 cttagaccgattcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtaaac--aaacagtatgacataataatatcaat 21292991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 37804902 - 37804851
Alignment:
161 atataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcatatatacatat 212  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||    
37804902 atataacaacatcaaattctaattaacatcttaaaacatcatatatacatat 37804851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 175
Target Start/End: Original strand, 21565556 - 21565723
Alignment:
9 atcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataac-aacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaac 106  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| || | ||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | || |||||| |    
21565556 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtat-ccaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatc 21565654  T
107 aacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaa 175  Q
    ||| | |||| || ||| | |||||||| |||||| ||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||    
21565655 aacatttcaaata-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaa 21565723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 143
Target Start/End: Original strand, 37723922 - 37724050
Alignment:
14 cttagaccgactcatgcaactttgttaaataaca-acaacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaacaacgt 111  Q
    ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||| || ||||||||||   ||||||||||| || ||||||| |  || ||| |||| |    
37723922 cttagactgactcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcagtatacaa---cagcatgacatgattatatcaaattaaattcatcaacat 37724018  T
112 ctcaattattcacatataattcaagtaatgca 143  Q
    |||||| |||||   |||||||||||||||||    
37724019 ctcaatcattcattcataattcaagtaatgca 37724050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 3 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 20806899 - 20806852
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaaca 50  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||||    
20806899 atcttaatcaacatagaccgactcatgcagcttaattaaataacaaca 20806852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 22959639 - 22959600
Alignment:
9 atcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaa 48  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
22959639 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 22959600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 41
Target Start/End: Complemental strand, 21502269 - 21502231
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaa 41  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
21502269 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaa 21502231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 19660940 - 19660903
Alignment:
11 caacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaa 48  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
19660940 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 19660903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 48
Target Start/End: Original strand, 26704079 - 26704124
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaa 48  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
26704079 atcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaa 26704124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 48
Target Start/End: Original strand, 26973812 - 26973857
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaa 48  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
26973812 atcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaa 26973857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 70 - 166
Target Start/End: Original strand, 18356389 - 18356485
Alignment:
70 aaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa 166  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  || |||||||| |||  | |||||| ||||   | |||||||||||| |  ||||||||||| |||||    
18356389 aaacagcatgatataataatatcaatttcaattcaacaacatcttgaatattcaaatatttcttaagtaatgcataaaacattatatcacattataa 18356485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 20027043 - 20026945
Alignment:
14 cttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaa-caacaacacag-cagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaattgtaagtcaacaac 109  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||| || |||||| ||||| |||  ||||| ||||||||||||| || || ||||||||    
20027043 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatccaaaa-cagttcatgatataataatatcaaatgcaattcaacaac 20026945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 166; Significance: 5e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Original strand, 9247 - 9456
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||    
9247 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatataaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagt 9346  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
9347 caacaacgtctcaattattcacatataatttaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaa 9446  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
9447 atatacatat 9456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 166; Significance: 5e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Original strand, 13952 - 14161
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
13952 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagataaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 14051  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
14052 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcat 14151  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
14152 atatacatat 14161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 162; Significance: 1e-86; HSPs: 5)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Original strand, 136685 - 136894
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||    
136685 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 136784  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
136785 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcat 136884  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
136885 atatacatat 136894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Original strand, 139154 - 139363
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||    
139154 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 139253  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
139254 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcat 139353  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
139354 atatacatat 139363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Original strand, 144092 - 144301
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||    
144092 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 144191  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
144192 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcat 144291  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
144292 atatacatat 144301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Original strand, 134216 - 134425
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||    
134216 atcttaatcaacatagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 134315  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
134316 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcat 134415  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
134416 atatacatat 134425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Original strand, 141623 - 141832
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||    
141623 atcttaatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 141722  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
141723 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcat 141822  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
141823 atatacatat 141832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 160; Significance: 2e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 3 - 210
Target Start/End: Original strand, 13397 - 13604
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
13397 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 13496  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
13497 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattacatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcat 13596  T
203 atatacat 210  Q
    ||||||||    
13597 atatacat 13604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Original strand, 40405 - 40614
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||    
40405 atcttaatcaacttagaccgactcgtgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacaggatgacataataatatcaaatgcaagt 40504  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||    
40505 caacaacgtctcaattattcacataaaattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacttcat 40604  T
203 atatacatat 212  Q
    ||||||||||    
40605 atatacatat 40614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 148; Significance: 3e-78; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 3 - 190
Target Start/End: Original strand, 82077 - 82264
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |    
82077 atcttaatcaacttagaccgactcatgaagcttagttaaataacaacagcaacacagtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaaat 82176  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatc 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
82177 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatcataatcaacatc 82264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 22776 - 22610
Alignment:
10 tcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataac-aacaacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaaca 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| | ||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | || |||||| ||    
22776 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcgacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatca 22678  T
108 acgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaa 175  Q
    || |||||| || ||| | |||||||| |||||| ||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||    
22677 acatctcaaata-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaa 22610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 3 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 158607 - 158433
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
158607 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 158508  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
158507 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaat 158433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 340053 - 339905
Alignment:
10 tcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaacaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||    
340053 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-acaacaacataggcagtatac-aaaacaacatgacataataatatcaaat-caagtcaacaa 339957  T
109 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 160  Q
    | |||||| ||| ||   |||||||||||||||  ||||  |||||||||||    
339956 catctcaagtatacattcataattcaagtaatgtgtataacattatatcaca 339905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 3 - 190
Target Start/End: Original strand, 111 - 298
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || |    
111 atcttaatcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaatagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaaat 210  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatc 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
211 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatcataatcaacatc 298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 139; Significance: 7e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 3 - 177
Target Start/End: Original strand, 4302 - 4476
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |    
4302 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagtagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaaat 4401  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 177  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
4402 caacaacgtctcaattaatcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacatcatcaaat 4476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 3 - 177
Target Start/End: Original strand, 16789 - 16963
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||    
16789 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagtagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagt 16888  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 177  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
16889 caacaacgtctcaattatttacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacatcatcaaat 16963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 134; Significance: 7e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 12 - 177
Target Start/End: Original strand, 29946 - 30111
Alignment:
12 aacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaacaacgt 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
29946 aacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaagtgtaagtcaacaacgt 30045  T
112 ctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 177  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
30046 ctcaattattcacatataattcaaataattcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaat 30111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 3 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 1438 - 1250
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
1438 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaacaataacacatgagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 1339  T
103 caa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatc 190  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
1338 caatcatcgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaatcataatcaacatc 1250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 3)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 3 - 177
Target Start/End: Original strand, 9754 - 9929
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||    
9754 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaagtgcaagt 9853  T
103 caacaacgtctcaatta-ttcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 177  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
9854 caacaacgtctcaattatttcacatataattcaaataatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaat 9929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 160
Target Start/End: Original strand, 32950 - 33107
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaag 101  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||| | ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||    
32950 atcttcatcaagttagaccgactcatgcagcttaattaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaatgcaag 33048  T
102 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 160  Q
    | |||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||    
33049 ttaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcaca 33107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 3 - 160
Target Start/End: Original strand, 38769 - 38926
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaag 101  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||| | ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||     
38769 atcttcatcaacttagaccgagtcatgcagcttaattaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaatgcaaa 38867  T
102 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 160  Q
    | |||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||    
38868 taaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcaca 38926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 129; Significance: 6e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 3 - 190
Target Start/End: Original strand, 12069 - 12250
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||      || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||    
12069 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaa------cagcaacacagcagtatactaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 12162  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatc 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
12163 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaatcataatcaacatc 12250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 124; Significance: 6e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 3 - 177
Target Start/End: Original strand, 4219 - 4393
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||    
4219 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacgacagcgacacagcagtatacaaaaccagcatgacataataatatcaaatgcaagt 4318  T
103 caa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 177  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
4319 caatcaacgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatat-acaacatcaaat 4393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 79430 - 79267
Alignment:
14 cttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaacaacgtct 113  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||    
79430 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacgacagtatataaaaacagcatgacataataatttcaaatgcaagtcaacaacgtct 79331  T
114 caattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
79330 caattattcacatataattcaagtaatgcatatacaagtatatcacaatataacaacatcaaat 79267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 17330 - 17170
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaa--cagcatgacataataatatcaattgta 99  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || |    
17330 atcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 17231  T
100 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 160  Q
    |||||||||| |||||| ||| ||   |||||||||||||||| | ||  |||||||||||    
17230 agtcaacaacatctcaagtatacattcataattcaagtaatgcgtttaacattatatcaca 17170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 20524 - 20363
Alignment:
14 cttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaacaacgtct 113  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
20524 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacatcagtatacaaaa-caacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtct 20426  T
114 caattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
20425 caattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-aacatcaaat 20363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 160
Target Start/End: Original strand, 128759 - 128916
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | ||||| |  |  | | ||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
128759 atcttaatcaaattagaccaactcatgcaacttagttaaataacaaaagcaacaaaaaaaaaaaaaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 128858  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 160  Q
    ||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||| | |||  |||||||||||    
128859 caacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgtacataacattatatcaca 128916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 113; Significance: 2e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 6 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 2283 - 2111
Alignment:
6 ttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaa 105  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||    
2283 ttaatcaacttagaccgactcttgcagcttagttaaataacaacagcgacacaacagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 2184  T
106 -caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 177  Q
      ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
2183 ttaacgtctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaat 2111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 71 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 18071 - 17964
Alignment:
71 aacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaa 169  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |  | |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||    
18071 aacatcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaacatctcaaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaa 17972  T
170 catcaaat 177  Q
    ||||||||    
17971 catcaaat 17964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 108; Significance: 2e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 3 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 161247 - 161072
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| || ||||    
161247 atcttaaccaacttagaccgactcatgcagcttagttaaatatcaacagcgacacagcagtatacaaaaacataatgacataataatatcaaatgcaagt 161148  T
103 caa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 177  Q
    ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
161147 caatcaacatctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataacaatatcaaat 161072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 77 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 164674 - 164573
Alignment:
77 atgacataataatatcaattgtaagtcaa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaa 175  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
164674 atgacataataatatcaaatgcaagtcaatcaacatctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaa 164575  T
176 at 177  Q
    ||    
164574 at 164573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 3 - 160
Target Start/End: Original strand, 22891 - 23048
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
22891 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaccagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 22990  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 160  Q
    ||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||    
22991 caacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcaca 23048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 97; Significance: 8e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 38815 - 38604
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaa-caacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| || ||||| || |||||| ||||| || ||||| |||| |||||||| || ||    
38815 atcttaatcaacttagacctactcatgcaccttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaatgcaa 38717  T
101 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa-caacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaat 199  Q
    |||| |||  |||||| |||| | |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
38716 gtcatcaatatctcaaatatttatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacat 38617  T
200 catatatacatat 212  Q
    |||||||||||||    
38616 catatatacatat 38604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 87; Significance: 7e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 26178 - 26020
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaag 101  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
26178 atcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgtaat 26079  T
102 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 160  Q
    ||||||||||||||| ||| ||   |||||||||||||||| | ||  |||||||||||    
26078 tcaacaacgtctcaagtatacattcataattcaagtaatgcgtttaacattatatcaca 26020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 3 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 44820 - 44682
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaag 101  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
44820 atcttaatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 44721  T
102 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaat 140  Q
    |||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||    
44720 tcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat 44682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Original strand, 51921 - 52085
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaag 101  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
51921 atcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcaatatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaag 52020  T
102 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa 166  Q
    |||||| | ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||    
52021 tcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacaacataa 52085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 168083 - 167948
Alignment:
11 caacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaacaac 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||| ||||    
168083 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaac 167984  T
110 gtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 145  Q
     ||| || |||||| |||| ||||||||||||||||    
167983 atcttaaatattcaaatattattcaagtaatgcata 167948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 3 - 160
Target Start/End: Original strand, 13219 - 13377
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaag 101  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
13219 atcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaat 13318  T
102 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 160  Q
    ||| |||| ||| || |||||| ||||  |||||||||||||||||  |||||||||||    
13319 tcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcatataacattatatcaca 13377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 82; Significance: 7e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 160
Target Start/End: Original strand, 39486 - 39642
Alignment:
4 tcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||    
39486 tcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaatgcaagt 39584  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 160  Q
    ||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| |||  |||||||||||    
39585 caacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacataacattatatcaca 39642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 82; Significance: 7e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 75326 - 75170
Alignment:
4 tcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||    
75326 tcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaatgcaagt 75228  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 160  Q
    ||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| |||  |||||||||||    
75227 caacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacataacattatatcaca 75170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 1153 - 1018
Alignment:
11 caacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaacaac 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||| ||||    
1153 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaac 1054  T
110 gtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 145  Q
     ||| || |||||| |||| ||||||||||||||||    
1053 atcttaaatattcaaatattattcaagtaatgcata 1018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 79; Significance: 4e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 3299 - 3141
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaag 101  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||     
3299 atcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgatataataatatcaaatgtaat 3200  T
102 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 160  Q
    |||||||| |||||| ||| ||   |||||||||||||||| | ||  |||||||||||    
3199 tcaacaacatctcaagtatacattcataattcaagtaatgcgtttaacattatatcaca 3141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 79; Significance: 4e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 3263 - 3106
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaag 101  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||| || ||||||||||||||||||| || |||    
3263 atcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-caacatgacataataatatcaaatgcaag 3165  T
102 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 160  Q
    |||||||| |||||| ||| ||   |||||||||||||||||||||  |||||||||||    
3164 tcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcatataacattatatcaca 3106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 79; Significance: 4e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 16713 - 16555
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaag 101  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||    
16713 atcttcatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacgaaaacagcatgacataataatatcaaatggaag 16614  T
102 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 160  Q
    |||||| | |||||| ||| ||   |||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
16613 tcaacagcatctcaagtatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcaca 16555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 79; Significance: 4e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 160
Target Start/End: Original strand, 1859 - 2017
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaag 101  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||     
1859 atcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacatagacagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaat 1958  T
102 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 160  Q
    ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||||| |||  |||||||||||    
1959 tcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcaca 2017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 77; Significance: 7e-36; HSPs: 3)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 160
Target Start/End: Original strand, 4522 - 4673
Alignment:
9 atcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaaca 107  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
4522 atcaacttagaccgactcatgcg-cttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatataaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 4620  T
108 acgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 160  Q
    || |||||| ||| ||   |||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
4621 acatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcaca 4673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 160
Target Start/End: Original strand, 12104 - 12255
Alignment:
9 atcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaaca 107  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
12104 atcaacttagaccgactcatgcg-cttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatataaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 12202  T
108 acgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 160  Q
    || |||||| ||| ||   |||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
12203 acatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcaca 12255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 160
Target Start/End: Original strand, 22056 - 22207
Alignment:
9 atcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaaca 107  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
22056 atcaacttagaccgactcatgcg-cttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatataaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 22154  T
108 acgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 160  Q
    || |||||| ||| ||   |||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
22155 acatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcaca 22207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 74; Significance: 4e-34; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 140
Target Start/End: Original strand, 116435 - 116571
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||    
116435 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaacagtatac-aaaacagcatgacataatcatatcaaatgcaagt 116533  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaat 140  Q
    ||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||    
116534 caacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat 116571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 53873 - 53820
Alignment:
161 atataacaacatcaaatggtaatcaacatct--taaaaaatcatatatacatat 212  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||||||    
53873 atataacaacatcaaatgataatcaacatctacttaaacatcatatatacatat 53820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 126 - 177
Target Start/End: Original strand, 78453 - 78505
Alignment:
126 tataattcaagtaatgcatatataattatatcacaata-taacaacatcaaat 177  Q
    ||||||||| |||||||||||| | |||||||||| || ||||||||||||||    
78453 tataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaat 78505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 6237 - 6076
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaaca-ca---gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgt 98  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||   | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
6237 atcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacaacataggtagtatacaaaaacagcatgacatgataatatcaattgc 6138  T
99 aagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 160  Q
    || ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||||| |||  |||||||||||    
6137 aattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcaca 6076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 4)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 109
Target Start/End: Original strand, 28422 - 28529
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaag 101  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||     
28422 atcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaat 28521  T
102 tcaacaac 109  Q
    ||||||||    
28522 tcaacaac 28529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 109
Target Start/End: Original strand, 11308 - 11407
Alignment:
11 caacttagaccgactcatgcaactttgttaaataac-aacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaacaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||| | ||||||| | ||| || ||||| ||||||||||| | ||||| |||||||    
11308 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaa 11406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 48
Target Start/End: Original strand, 2013 - 2050
Alignment:
11 caacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaa 48  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
2013 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 2050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 48
Target Start/End: Original strand, 4568 - 4605
Alignment:
11 caacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaa 48  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
4568 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 4605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 3 - 160
Target Start/End: Original strand, 3478 - 3636
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaag 101  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| | | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
3478 atcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataactaaagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaat 3577  T
102 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 160  Q
    ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||||| |||  |||||||||||    
3578 tcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcaaataacattatatcaca 3636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 160
Target Start/End: Original strand, 351 - 508
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaag 101  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| || ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||    
351 atctttatcgacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaataacataggcagtatacaaaat-agcatgacgtaataatatcaattggaag 449  T
102 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 160  Q
    |||||||| ||| || |||||   |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||    
450 tcaacaacatcttaaatattcgattatacttcaagtaatgcacataacattatatcaca 508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 10 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 27855 - 27686
Alignment:
10 tcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaa-caacaacacagc-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaaca 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||| |||||||| ||  ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||    
27855 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggtagtatgcaaaa-cagcatgatataacaatatcaaatgtaaatcaaca 27757  T
108 acgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa-caacatcaaat 177  Q
    || ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||    
27756 acatctcaaacattcacatataattctagtaatgcatatacaattatatcacattataaccaacatcaaat 27686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 3 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 8642 - 8472
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagt 102  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||     ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
8642 atcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacagcaacatag--gcagtat-caaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagt 8546  T
103 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa-caacatcaa 175  Q
    ||||| | ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||| |||| |||||||||    
8545 caacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacaacataatcaacatcaa 8472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 4)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 3 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 33069 - 32913
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaag 101  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||     
33069 atcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaacagcaacacaggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaattgcaat 32971  T
102 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 160  Q
    |||||||| ||| || ||||||  |||| ||| |||||||||||||  |||||| ||||    
32970 tcaacaacatcttaaatattca-ttatacttcgagtaatgcatataacattataacaca 32913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 3 - 160
Target Start/End: Original strand, 45936 - 46092
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaag 101  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||     
45936 atcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaacagcaacacaggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaattgcaat 46034  T
102 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 160  Q
    |||||||| ||| || ||||||  |||| ||| |||||||||||||  |||||| ||||    
46035 tcaacaacatcttaaatattca-ttatacttcgagtaatgcatataacattataacaca 46092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 159
Target Start/End: Original strand, 16121 - 16278
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaag 101  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || || |||||||||| || |||    
16121 atcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacagcaagatatcataatatcaaatgcaag 16220  T
102 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcac 159  Q
     ||||| | |||||| ||| ||   |||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
16221 ccaacatcatctcaagtatacattcataactcaagtaatgcatataacattatatcac 16278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 17442 - 17388
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacac 57  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||    
17442 atcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacac 17388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0695 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0695
Description:

Target: scaffold0695; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 121 - 212
Target Start/End: Original strand, 6070 - 6161
Alignment:
121 tcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcatatatacatat 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
6070 tcacatataattcaagtaatgcatatgcaattaaatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatacatat 6161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 10 - 175
Target Start/End: Original strand, 8481 - 8650
Alignment:
10 tcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaa-caacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaaca 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| || |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| || |||||| ||    
8481 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaa-cagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatca 8579  T
108 acgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatata--attatatcacaatat-aacaacatcaa 175  Q
    || |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||| ||| |||||||||||    
8580 acatctcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaatattatatcacattataaacaacatcaa 8650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 48
Target Start/End: Original strand, 6549 - 6588
Alignment:
9 atcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaa 48  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
6549 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 6588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 3 - 143
Target Start/End: Original strand, 8487 - 8628
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagc-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaag 101  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
8487 atcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagcaacataggtagtatacaaaaacagtatgacataataatatcaattgcaag 8586  T
102 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgca 143  Q
    |||||||| ||| ||  |||||  | || |||||||||||||    
8587 tcaacaacatcttaaacattcaagtgtacttcaagtaatgca 8628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 59 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 3586 - 3485
Alignment:
59 gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatca 158  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||  |||||||||    
3586 gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattatacactcataattcaagtaatgcgtataacattatatca 3487  T
159 ca 160  Q
    ||    
3486 ca 3485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 24406 - 24257
Alignment:
13 acttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaa-acagcatgacataataatatcaattgtaagtcaacaacg 110  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||     
24406 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaacacagcatgacataaaaatatcaattgcaattcatcaaca 24307  T
111 tctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 160  Q
    ||| || |||||| ||||  ||||||||||||| |||  |||||||||||    
24306 tcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcaca 24257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 2 - 160
Target Start/End: Original strand, 25903 - 26061
Alignment:
2 tatcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaa 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| | ||||| || ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| || ||    
25903 tatcttcatcaacttagaccgactcatgaagcttagttaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaat-atcatgacataataatatcaaatgcaa 26001  T
101 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 160  Q
    || |||||| |||||| ||||||  |||| |||||||||||||| ||  |||||||||||    
26002 gtaaacaacatctcaaatattcaattatacttcaagtaatgcatttaacattatatcaca 26061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 3 - 160
Target Start/End: Original strand, 39866 - 40023
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaag 101  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||||||| | ||||| || ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| || |||    
39866 atcttcatcaacttagaccaactcatgaagcttagttaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaat-atcatgacataataatatcaaatgcaag 39964  T
102 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 160  Q
    | |||||| |||||| ||||||  |||| |||||||||||||| ||  |||||||||||    
39965 taaacaacatctcaaatattcaattatacttcaagtaatgcatttaacattatatcaca 40023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 160
Target Start/End: Original strand, 4865 - 5015
Alignment:
11 caacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaacaac 109  Q
    |||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || ||||||||    
4865 caacttagaccgactcatgcagattagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaaatgcaattcaacaac 4964  T
110 gtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 160  Q
     ||| || |||||| |||    |||||||||||||| |  |||||||||||    
4965 atcttaagtattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcaca 5015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 16206 - 16037
Alignment:
10 tcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaa-caacaacacagc-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaaca 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||| |||||||| ||  ||||| ||||| || ||||| |||| |||||||| ||||| ||||||    
16206 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggtagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaatgtaaatcaaca 16108  T
108 acgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa-caacatcaaat 177  Q
    || ||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||    
16107 acatctcaaacattcttatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaccaacatcaaat 16037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Original strand, 13147 - 13313
Alignment:
14 cttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaa-caacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaacaacgt 111  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||  ||||| |||||||| || |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| || || |||||||| |    
13147 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatgcaaaa-cagcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacat 13245  T
112 ctcaatt-attcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa-caacatcaaat 177  Q
    || ||   ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||    
13246 ctgaaaccattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaccaacatcaaat 13313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 62; Significance: 6e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 82 - 155
Target Start/End: Original strand, 13092 - 13165
Alignment:
82 ataataatatcaattgtaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattata 155  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
13092 ataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattgaagtaatgcatatataattata 13165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 62; Significance: 6e-27; HSPs: 3)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 59 - 175
Target Start/End: Original strand, 13157 - 13274
Alignment:
59 gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatca 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  |||||||||    
13157 gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatca 13256  T
159 caatataa-caacatcaa 175  Q
    ||| |||| |||||||||    
13257 caacataatcaacatcaa 13274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 50
Target Start/End: Original strand, 280 - 328
Alignment:
2 tatcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaaca 50  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||    
280 tatcttcatcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaataacaaca 328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 109
Target Start/End: Original strand, 34139 - 34238
Alignment:
11 caacttagaccgactcatgcaactttgttaaataac-aacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaacaa 108  Q
    |||||||||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||  || ||||| ||||||||||| | ||||| |||||||    
34139 caacttagaccgactcatacagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatac-aacccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaa 34237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 145
Target Start/End: Original strand, 1971 - 2103
Alignment:
14 cttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaacaacgtc 112  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | ||| || |||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| || |||||||| ||    
1971 cttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaacagcgacataggcagtatacaaaatcaacatgacataatgatatcaattgcaattcaacaacatc 2070  T
113 tcaattattcacatataattcaagtaatgcata 145  Q
    | || |||||| | || ||||||||||||||||    
2071 ttaaatattcaaacattattcaagtaatgcata 2103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 177
Target Start/End: Original strand, 11482 - 11648
Alignment:
13 acttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaa-caacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaacaacg 110  Q
    |||||||  |||||||||| ||| ||||| |||||| || ||||| || |||||| ||||| || ||||| |||||||||||    |||||| ||||||     
11482 acttagattgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatcgcacgtaagtaaacaaca 11580  T
111 tctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaaat 177  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||    
11581 tctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaat 11648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Original strand, 4728 - 4803
Alignment:
11 caacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataa 85  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
4728 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataa 4803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 38359 - 38193
Alignment:
13 acttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaa-caacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaacaacg 110  Q
    |||||||  |||||||||| ||| ||||| |||||| || ||||| || |||||| ||||| || ||||| |||||||||||    |||||| ||||||     
38359 acttagattgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatcgcacgtaagtaaacaaca 38261  T
111 tctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaaat 177  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||    
38260 tctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaat 38193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 55; Significance: 9e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 11548 - 11462
Alignment:
11 caacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 96  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
11548 caacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggtagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 11462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 104 - 177
Target Start/End: Original strand, 12039 - 12112
Alignment:
104 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 177  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
12039 aacaacgcctcaattattcacatataattcaagcaatgcatatacaattatatcacaatataacagtatcaaat 12112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 74
Target Start/End: Original strand, 11982 - 12042
Alignment:
14 cttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaaca 74  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||    
11982 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtataccaaaaca 12042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 69 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 53595 - 53486
Alignment:
69 aaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aac 167  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||| || |||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||    
53595 aaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaac 53496  T
168 aacatcaaat 177  Q
    ||||||||||    
53495 aacatcaaat 53486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 69 - 177
Target Start/End: Original strand, 225482 - 225590
Alignment:
69 aaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aac 167  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| || || |||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||    
225482 aaaacagcgtgatataataatatcaaatgcaa-tcaacaacatctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaac 225580  T
168 aacatcaaat 177  Q
    ||||||||||    
225581 aacatcaaat 225590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1427 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold1427
Description:

Target: scaffold1427; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 161 - 212
Target Start/End: Original strand, 1591 - 1642
Alignment:
161 atataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcatatatacatat 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
1591 atataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcatatatacatat 1642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 16 - 145
Target Start/End: Original strand, 4545 - 4675
Alignment:
16 tagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaacaacgtctc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||||||| ||| | ||||| || || |||||||||| | ||| |||||||| |||     
4545 tagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacagcataggcagtatgcaacagcagcaagatatcataatatcaaatataattcaacaacatctt 4644  T
115 aattattcacatataattcaagtaatgcata 145  Q
    || ||||||  |||| |||||||||||||||    
4645 aaatattcatttatacttcaagtaatgcata 4675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 76 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 8098 - 7996
Alignment:
76 catgacataataatatcaattgtaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatca 174  Q
    ||||| ||||||||||||| || || |||||||| ||| ||  ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||    
8098 catgatataataatatcaaatgaaattcaacaacatcttaaacattcatatataattcaagtaatgtatataaaattatatcacattataaacaacatca 7999  T
175 aat 177  Q
    |||    
7998 aat 7996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 96
Target Start/End: Original strand, 13513 - 13598
Alignment:
11 caacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 96  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||    
13513 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacaacatgacatgataatatcaatt 13598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 3 - 160
Target Start/End: Original strand, 39921 - 40078
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaag 101  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||||| | ||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || | |    
39921 atcttcatcaacttagaccaactcatgcagcttaattaaataacaatagcaacataggcagtatac-aaaacaacatgacataataatatcaaatgcatg 40019  T
102 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 160  Q
    |||| ||| ||| || ||||    |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||    
40020 tcaataacatcttaaatatttgattatacttcaagtaatgcacataacattatatcaca 40078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 10528 - 10381
Alignment:
11 caacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaa-caacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaacaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||| | | ||||| |||||| || ||||| || ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  || |||||||    
10528 caacttagaccgactcatgcagcatagttaattaacaaacagcaacataggcagtatacaa---cagcatgacataataatatcaatttcaattcaacaa 10432  T
109 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 160  Q
    | ||| || ||| || ||||  ||||||||||||||| || |||||||||||    
10431 catcttaagtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcaca 10381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 75 - 160
Target Start/End: Original strand, 27911 - 27996
Alignment:
75 gcatgacataataatatcaattgtaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 160  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||| ||   |||||||||||||||||||||  |||||||||||    
27911 gcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcatataacattatatcaca 27996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 145
Target Start/End: Original strand, 32083 - 32216
Alignment:
11 caacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaacaac 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| | |||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||  || ||| ||||    
32083 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtaaac--aaacaacatgacataataatatcaatttcaattcatcaac 32180  T
110 gtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 145  Q
     ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
32181 atcttaggtatacaaatattcttcaagtaatgcata 32216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0422
Description:

Target: scaffold0422; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 161 - 212
Target Start/End: Original strand, 3186 - 3237
Alignment:
161 atataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcatatatacatat 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
3186 atataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatctacatat 3237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 1171 - 1011
Alignment:
14 cttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaa-caacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaacaacgt 111  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| || |||||| ||||  || ||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||      
1171 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaac-catcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaac-- 1075  T
112 ctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 177  Q
     |||||||| || |  ||| ||| |||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||    
1074 -tcaattat-cagacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataacaacatcaaat 1011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Original strand, 12587 - 12751
Alignment:
14 cttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaa-caacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaacaacgt 111  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||||  ||||| || ||||| || |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| || |||||| |||| |    
12587 cttagaccgactcatgtagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-cagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 12685  T
112 ctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaaat 177  Q
    ||||| || | | ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||    
12686 ctcaaatacttatatataattc-agtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaat 12751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 15568 - 15483
Alignment:
11 caacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 96  Q
    |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
15568 caacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaagagcaacataggcagtatac-aaaacaacatgacataataatatcaatt 15483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 167 - 212
Target Start/End: Original strand, 27958 - 28003
Alignment:
167 caacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcatatatacatat 212  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
27958 caacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatacatat 28003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 3)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 3 - 56
Target Start/End: Original strand, 121774 - 121827
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaaca 56  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
121774 atcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaaca 121827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 14 - 143
Target Start/End: Original strand, 174785 - 174913
Alignment:
14 cttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaa-caacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaacaacgt 111  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||| || ||||||||||   ||||||||||| || ||||||| |  || |||||||| |    
174785 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatacaa---cagcatgacatgattatatcaaattcaattcaacaacat 174881  T
112 ctcaattattcacatataattcaagtaatgca 143  Q
    |||||| |||||   |||||||||||||||||    
174882 ctcaatcattcattcataattcaagtaatgca 174913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 160
Target Start/End: Original strand, 124675 - 124751
Alignment:
84 aataatatcaattgtaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 160  Q
    |||||||||||||| || ||| |||||| | || |||||| ||||  |||||||||||||||||  |||||||||||    
124675 aataatatcaattgcaattcatcaacgttttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcatataacattatatcaca 124751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 109
Target Start/End: Original strand, 15669 - 15776
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataac-aacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||| ||||| | ||||||||| ||| || ||||| ||||||||||| | |||||    
15669 atcttaatcaacttagaccgactcgtgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatac-aaaccatcatgatataataatatcgaatgtaa 15767  T
101 gtcaacaac 109  Q
     ||||||||    
15768 atcaacaac 15776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 1147 - 1093
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataac-aacaacaaca 56  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
1147 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaaca 1093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 56
Target Start/End: Original strand, 6619 - 6673
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataac-aacaacaaca 56  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
6619 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaaca 6673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 56
Target Start/End: Original strand, 13999 - 14053
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataac-aacaacaaca 56  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
13999 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaaca 14053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 59 - 145
Target Start/End: Original strand, 6675 - 6761
Alignment:
59 gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 145  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| | || |||||||| ||| || |||||| | || ||||||||||||||||    
6675 gcagtatacaaaatcaacatgacataatgatatcaatagcaattcaacaacatcttaaatattcaaacattattcaagtaatgcata 6761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 15890 - 15836
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataac-aacaacaaca 56  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
15890 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaaca 15836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 48
Target Start/End: Original strand, 178902 - 178947
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaa 48  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
178902 atcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaa 178947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 56
Target Start/End: Original strand, 1091 - 1144
Alignment:
4 tcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataac-aacaacaaca 56  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
1091 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaaca 1144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 6386 - 6220
Alignment:
14 cttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaa-caacaacacag-cagtatacaaaaacagc--atgacataataatatcaattgtaagtcaacaac 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  ||||| || ||||| || ||||||| |||| ||||  |||| || | |||||||| || || ||||||||    
6386 cttagaccgactcatgcaacttagttaatgaacaaacagcaacataggcagtatataaaa-cagctcatgatatgacaatatcaaatgcaaatcaacaac 6288  T
110 gtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaat-ataacaacatcaaat 177  Q
     ||||||  || || |||||||||| |||||||||||| | |||||||||| | |||||||||||||||    
6287 atctcaaacat-catatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattaataacaacatcaaat 6220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 1006 - 918
Alignment:
71 aacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 160  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||  |||||| ||||||   ||||||||||||||||| |||  |||||||||||    
1006 aacagcatggcataataatatcaat-gcaagtcaacaaaatctcaaatattcaatcataattcaagtaatgcacataacattatatcaca 918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 4946 - 4893
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaaca 56  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
4946 atcttcatcaacttagaccaactcatgcaacttagttaaataacaacagcaaca 4893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 6236 - 6191
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaa 48  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
6236 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 6191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 45899 - 45732
Alignment:
9 atcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataac-aacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaac 106  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||  || | | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||||||| |    
45899 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagaaaaataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgtaagtcatc 45801  T
107 aacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaa 175  Q
    ||| ||||||||| ||| | |||||||| || ||| ||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||    
45800 aacatctcaatta-tcaaacataattcatgtgatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaa 45732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 160
Target Start/End: Original strand, 20928 - 21077
Alignment:
13 acttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaa-caacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaacaacg 110  Q
    ||||||||||||||||  | ||| ||||| |||||| || ||||| || || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||     
20928 acttagaccgactcataaagcttagttaattaacaatcagcaacataggcaatatgcaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaattcaacaaca 21027  T
111 tctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 160  Q
    ||| |  |||||| || |  | ||||||||||||| |  |||||||||||    
21028 tcttatatattcaaatgttctacaagtaatgcataaaacattatatcaca 21077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 60818 - 60652
Alignment:
14 cttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaa-caacaacacag-cagtatacaaaaacagc--atgacataataatatcaattgtaagtcaacaac 109  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||||  ||||| || ||||| || |||||||||||| ||||  |||| |||  ||||||||| | || ||||||||    
60818 cttaaaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagctcatgatataccaatatcaat-gcaaatcaacaac 60721  T
110 gtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca-atataacaacatcaaat 177  Q
     ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |  ||||||||||||||    
60720 atctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaaatatatcacataattaacaacatcaaat 60652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 156
Target Start/End: Original strand, 129919 - 130066
Alignment:
9 atcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataaca-acaacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaac 106  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | || |||||| |    
129919 atcaacttagaccgactcatgcatcttagttaaataacacacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatc 130017  T
107 aacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 156  Q
    ||| |||||| || ||| | |||||||| |||||| ||||| ||||||||    
130018 aacatctcaaata-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatat 130066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 10647 - 10481
Alignment:
10 tcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataac-aacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaaca 107  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| |||| ||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | || |||||| ||    
10647 tcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatca 10549  T
108 acgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaa 175  Q
    || |||||| || ||| | |||||||| |||||| ||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||    
10548 acatctcaaata-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaa 10481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 76 - 177
Target Start/End: Original strand, 97089 - 97190
Alignment:
76 catgacataataatatcaattgtaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaata-taacaacatca 174  Q
    ||||| |||| |||||||| || || |||||||| ||||||  || || |||||||||| |||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||    
97089 catgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacat-catatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatca 97187  T
175 aat 177  Q
    |||    
97188 aat 97190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 76 - 177
Target Start/End: Original strand, 106367 - 106468
Alignment:
76 catgacataataatatcaattgtaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaata-taacaacatca 174  Q
    ||||| |||| |||||||| || || |||||||| ||||||  || || |||||||||| |||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||    
106367 catgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacat-catatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatca 106465  T
175 aat 177  Q
    |||    
106466 aat 106468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 156
Target Start/End: Original strand, 143 - 290
Alignment:
9 atcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataac-aacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaac 106  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | || || |||||    
143 atcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaac 241  T
107 aacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 156  Q
    ||| |||||| || ||| | |||||||| |||||| ||||| ||||||||    
242 aacatctcaaata-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatat 290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 48
Target Start/End: Original strand, 23847 - 23892
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaa 48  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
23847 atcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaa 23892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 120
Target Start/End: Original strand, 32112 - 32224
Alignment:
9 atcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataac-aacaacaaca-cagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaac 106  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||  || ||||| ||||| || ||||| |||| |||||| | ||||| ||| |    
32112 atcatcttagaccgactcatgcagcttagataaataacaaacaacaacataagtagtatgcaaaatcatcatgatataacaatatcgaatgtaa-tcatc 32210  T
107 aacgtctcaattat 120  Q
    ||||||||||||||    
32211 aacgtctcaattat 32224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 48
Target Start/End: Original strand, 36458 - 36503
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaa 48  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
36458 atcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaa 36503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 15351 - 15306
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaa 48  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
15351 atcttaatcaacgtagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 15306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 74
Target Start/End: Original strand, 7285 - 7347
Alignment:
14 cttagaccgactcatgcaactttgttaaataac-aacaacaacaca-gcagtatacaaaaaca 74  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||||| ||||    
7285 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaacaaca 7347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 177
Target Start/End: Original strand, 25121 - 25289
Alignment:
10 tcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaa-caacaacacag-cagtatacaaaaacagc--atgacataataatatcaattgtaagtcaa 105  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||| || ||||| || ||||||| |||| ||||  |||| ||||  |||||||| | || ||||    
25121 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaa-cagctcatgatataacgatatcaat-gcaaatcaa 25218  T
106 caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 177  Q
    |||| ||||||  || || |||||||||| |||||| ||||| || ||||||||| ||| ||||||||||||    
25219 caacatctcaaacat-catatataattcatgtaatgtatatacaaatatatcacattattacaacatcaaat 25289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 125 - 177
Target Start/End: Original strand, 667 - 720
Alignment:
125 atataattcaagtaatgcatatataattatatcacaata-taacaacatcaaat 177  Q
    |||||||||| |||||||||||| | |||||||||| || ||||||||||||||    
667 atataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaat 720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 116
Target Start/End: Original strand, 10542 - 10649
Alignment:
10 tcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataac-aacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaaca 107  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | || |||||| ||    
10542 tcaacttagaccgactcatgcagcttttttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatca 10640  T
108 acgtctcaa 116  Q
    || ||||||    
10641 acatctcaa 10649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 69 - 156
Target Start/End: Original strand, 8090 - 8176
Alignment:
69 aaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 156  Q
    |||||||||||| |||| |||||||| || ||||||||||| ||||||  | ||| | |||||||| |||||| ||||| ||||||||    
8090 aaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaaca-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatat 8176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0513
Description:

Target: scaffold0513; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 161 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 10886 - 10835
Alignment:
161 atataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcatatatacatat 212  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||| |||||| |||||||||||||||    
10886 atataacaacatcaaataatactcaacattttaaaacatcatatatacatat 10835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 2752 - 2713
Alignment:
9 atcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaa 48  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
2752 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 2713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 3 - 97
Target Start/End: Original strand, 29562 - 29657
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattg 97  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||| |  | || | | ||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
29562 atcttaatcaacttagactgactcatgtgacttagttaaataacaatagtagcataggtagattacaataatagcatgacataataatatcaattg 29657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 48
Target Start/End: Original strand, 19278 - 19317
Alignment:
9 atcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaa 48  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
19278 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 19317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 161 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 36065 - 36014
Alignment:
161 atataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcatatatacatat 212  Q
    |||||| |||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
36065 atataagaacatcaaaaaataatcaacatcttaaaacatcatatatacatat 36014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 94
Target Start/End: Original strand, 1051 - 1132
Alignment:
14 cttagaccgactcatgcaactttgttaaataac-aacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 94  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||| | ||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||    
1051 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaacagcatgatataacaatatcaa 1132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 18265 - 18176
Alignment:
87 aatatcaattgtaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaat-ataacaacatcaaa 176  Q
    |||||||| || || |||||||| ||||||  || || |||||||||| |||||||||||| | |||||||||| | ||||||||||||||    
18265 aatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacat-catatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattaataacaacatcaaa 18176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 21916 - 21871
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaa 48  Q
    |||||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||    
21916 atcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttaaataacaa 21871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 29808 - 29763
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaa 48  Q
    |||||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||    
29808 atcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttaaataacaa 29763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 48
Target Start/End: Original strand, 69798 - 69843
Alignment:
3 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataacaa 48  Q
    ||||| |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
69798 atcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaa 69843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 56
Target Start/End: Original strand, 12780 - 12828
Alignment:
9 atcaacttagaccgactcatgcaactttgttaaataac-aacaacaaca 56  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||    
12780 atcaacttagaccgactcatgcagcttagctaaataacaaacaacaaca 12828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 94
Target Start/End: Original strand, 16301 - 16380
Alignment:
14 cttagaccgactcatgcaactttgttaaataa-caacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 94  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||  |||| ||||| | |||||||||   |||||||||||||||| |||||||    
16301 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataagaaacagcaacataggcagtatac---aacagcatgacataattatatcaa 16380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University