View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF21647_high_10 (Length: 348)

Name: NF21647_high_10
Description: NF21647
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF21647_high_10
NF21647_high_10
[»] chr5 (12 HSPs)
chr5 (20-348)||(27413714-27414042)
chr5 (20-348)||(18362843-18363171)
chr5 (20-348)||(26200772-26201100)
chr5 (20-348)||(33940886-33941214)
chr5 (20-348)||(20949421-20949749)
chr5 (45-346)||(23375377-23375670)
chr5 (207-348)||(5601744-5601885)
chr5 (49-253)||(20037345-20037549)
chr5 (88-348)||(22456358-22456618)
chr5 (207-253)||(24299224-24299270)
chr5 (206-279)||(30453229-30453302)
chr5 (206-279)||(30458307-30458380)
[»] chr4 (7 HSPs)
chr4 (20-348)||(16254799-16255127)
chr4 (20-348)||(6693784-6694112)
chr4 (20-348)||(17150939-17151267)
chr4 (20-348)||(7844905-7845233)
chr4 (22-348)||(520362-520688)
chr4 (206-248)||(26813598-26813640)
chr4 (206-348)||(54698404-54698546)
[»] chr7 (13 HSPs)
chr7 (20-348)||(6536050-6536378)
chr7 (20-348)||(16140631-16140959)
chr7 (20-348)||(5389618-5389946)
chr7 (20-348)||(26305122-26305450)
chr7 (20-348)||(26361368-26361696)
chr7 (20-348)||(32099946-32100274)
chr7 (20-348)||(8502615-8502943)
chr7 (20-348)||(44898865-44899193)
chr7 (20-348)||(46498680-46499008)
chr7 (20-348)||(9543687-9544015)
chr7 (20-348)||(42596924-42597252)
chr7 (20-341)||(13283877-13284198)
chr7 (206-279)||(15175619-15175692)
[»] chr6 (9 HSPs)
chr6 (20-348)||(18161631-18161959)
chr6 (20-348)||(16899512-16899840)
chr6 (20-348)||(31359127-31359455)
chr6 (20-348)||(18710425-18710753)
chr6 (20-348)||(18704490-18704818)
chr6 (22-348)||(34766922-34767248)
chr6 (20-219)||(29561121-29561320)
chr6 (214-348)||(29542013-29542147)
chr6 (207-253)||(25895796-25895842)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (20-348)||(148274-148602)
[»] chr8 (5 HSPs)
chr8 (20-348)||(14892199-14892527)
chr8 (20-348)||(21211417-21211745)
chr8 (22-342)||(22832311-22832631)
chr8 (207-253)||(18234019-18234065)
chr8 (207-253)||(18243470-18243516)
[»] chr3 (5 HSPs)
chr3 (20-348)||(8974412-8974740)
chr3 (20-348)||(9538701-9539029)
chr3 (20-348)||(6423873-6424201)
chr3 (99-345)||(12387556-12387802)
chr3 (207-348)||(48979838-48979979)
[»] chr2 (6 HSPs)
chr2 (20-348)||(9512211-9512539)
chr2 (20-348)||(18652784-18653112)
chr2 (20-348)||(45015919-45016247)
chr2 (20-348)||(27168433-27168761)
chr2 (20-344)||(22903709-22904033)
chr2 (207-348)||(1792120-1792261)
[»] chr1 (3 HSPs)
chr1 (20-348)||(16156449-16156777)
chr1 (20-348)||(1987636-1987964)
chr1 (49-347)||(22959894-22960191)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (22-348)||(6017-6343)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (20-348)||(52979-53305)
[»] scaffold0313 (2 HSPs)
scaffold0313 (22-348)||(7335-7661)
scaffold0313 (22-348)||(11117-11443)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (45-346)||(16795-17088)
[»] scaffold0611 (1 HSPs)
scaffold0611 (22-231)||(1-210)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (149-348)||(91-290)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (185-348)||(20341-20504)
scaffold0141 (20-189)||(27670-27839)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (20-189)||(86973-87142)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (49-347)||(189004-189301)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (207-253)||(258158-258204)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (206-348)||(102918-103060)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 245; Significance: 1e-136; HSPs: 12)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 20 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 27414042 - 27413714
Alignment:
Q  20 acatcatcatcagctattgatgagatttgttgagatgctttcaaagcaagtgtttttaccttcttcactggtttatctccttgaagtacaacttcatgag 119  Q
    ||||| |||||||| | ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27414042 acatcttcatcagcaactgatggggtttgctgagatgctttcaaagcaagtgtttttaccttcttcactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgag 27413943  T
Q  120 ctcttagtgaaccaatgagatctttcaggttcatagattttaaatttttggcctgagtaattgttgtgaccatatgtcctcacacacttggaagacatct 219  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  27413942 ctcttagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtctccacacacttggaagacatct 27413843  T
Q  220 taatatttttctgattctatcatgagtggaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtt 319  Q
     | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27413842 cagtatttttctaattctatcatgagtagaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctggcatacatctcatcaatggtt 27413743  T
Q  320 tcattttcactcattttaaagacttcaaa 348  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27413742 tcattttcactcatttcaaagacttcaaa 27413714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 20 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 18363171 - 18362843
Alignment:
Q  20 acatcatcatcagctattgatgagatttgttgagatgctttcaaagcaagtgtttttaccttcttcactggtttatctccttgaagtacaacttcatgag 119  Q
    ||||| |||||||| | ||||| | |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18363171 acatcttcatcagcaactgatggggtttgctgagatgcttttaaggcaagtgtttttaccttcttcactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgag 18363072  T
Q  120 ctcttagtgaaccaatgagatctttcaggttcatagattttaaatttttggcctgagtaattgttgtgaccatatgtcctcacacacttggaagacatct 219  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  18363071 ctcttagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtctccacacacttggaagacatct 18362972  T
Q  220 taatatttttctgattctatcatgagtggaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtt 319  Q
     |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18362971 cagaatttttctaattctatcatgagtggaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatcttgcatacatctcatcaatggtt 18362872  T
Q  320 tcattttcactcattttaaagacttcaaa 348  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18362871 tcattttcactcatttcaaagacttcaaa 18362843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 20 - 348
Target Start/End: Original strand, 26200772 - 26201100
Alignment:
Q  20 acatcatcatcagctattgatgagatttgttgagatgctttcaaagcaagtgtttttaccttcttcactggtttatctccttgaagtacaacttcatgag 119  Q
    ||||| |||||||| | ||||| | |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26200772 acatcttcatcagcaactgatggggtttgctgagatgctttcaaggcaagtgttcttaccttcttcactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgag 26200871  T
Q  120 ctcttagtgaaccaatgagatctttcaggttcatagattttaaatttttggcctgagtaattgttgtgaccatatgtcctcacacacttggaagacatct 219  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||| |||  |||| |||||||||||||||    
T  26200872 ctcttagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtctccacatacttggaagacatct 26200971  T
Q  220 taatatttttctgattctatcatgagtggaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtt 319  Q
     |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26200972 cagaatttttctaattctatcatgagtggaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatcttgcatacatctcatcaatggtt 26201071  T
Q  320 tcattttcactcattttaaagacttcaaa 348  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26201072 tcattttcactcatttcaaagacttcaaa 26201100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 20 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 33941214 - 33940886
Alignment:
Q  20 acatcatcatcagctattgatgagatttgttgagatgctttcaaagcaagtgtttttaccttcttcactggtttatctccttgaagtacaacttcatgag 119  Q
    ||||| |||||||| | ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33941214 acatcttcatcagcaactgatgaggtttgctgagatgctttcaaggcaagtgttcttaccttctttactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgag 33941115  T
Q  120 ctcttagtgaaccaatgagatctttcaggttcatagattttaaatttttggcctgagtaattgttgtgaccatatgtcctcacacacttggaagacatct 219  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||| |||  |||| |||||||||||||||    
T  33941114 ctcttagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtctccacatacttggaagacatct 33941015  T
Q  220 taatatttttctgattctatcatgagtggaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtt 319  Q
     |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33941014 cagaatttttctaattctatcatgagtggaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatcttgcatacatctcatcaatggtt 33940915  T
Q  320 tcattttcactcattttaaagacttcaaa 348  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33940914 tcattttcactcatttcaaagacttcaaa 33940886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 20 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 20949749 - 20949421
Alignment:
Q  20 acatcatcatcagctattgatgagatttgttgagatgctttcaaagcaagtgtttttaccttcttcactggtttatctccttgaagtacaacttcatgag 119  Q
    |||||||| |||| || ||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20949749 acatcatcttcagttactgatgaggtttgctgagaggctttcaaggcaagtgactttaccttctttactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgag 20949650  T
Q  120 ctcttagtgaaccaatgagatctttcaggttcatagattttaaatttttggcctgagtaattgttgtgaccatatgtcctcacacacttggaagacatct 219  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||  ||||||||| |||  |||| |||||||||||||||    
T  20949649 ctctcagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagatttcaaatccttggcctgagtgattgcagtgaccataggtctccacatacttggaagacatct 20949550  T
Q  220 taatatttttctgattctatcatgagtggaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtt 319  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20949549 caatatttttctgattctctcatgagtggaatatgcttttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctggcatacatctcatcaatggtt 20949450  T
Q  320 tcattttcactcattttaaagacttcaaa 348  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20949449 tcattttcactcatttcaaagacttcaaa 20949421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 45 - 346
Target Start/End: Original strand, 23375377 - 23375670
Alignment:
Q  45 tttgttgagatgctttcaaagcaagtgtttttaccttcttcactggtttatctccttgaagtacaacttcatgagctcttagtgaaccaatgagatcttt 144  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  23375377 tttgttgagatgctttcaaggaaagtgattttacctttttcactggtttgtctttttgaagtacaacttcatgagctctcagtgaaccaatgagatcttc 23375476  T
Q  145 caggttcatagattttaaatttttggcctgagtaattgttgtgaccatatgtcctcacacacttggaagacatcttaatatttttctgattctatcatga 244  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||   ||||| |||  |||| |||||     ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  23375477 aaggttcatagattttaaatctttggcctgagtaa---ttgcatccataggtctccacatacttg-----catctcaatatttttctgattctttcatga 23375568  T
Q  245 gtggaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtttcattttcactcattttaaagactt 344  Q
    ||||||||| | |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||    
T  23375569 gtggaatatacttttcgaagagacctcatctcatttactattgtagtaaatctaaaatacatttcatcaatagtttcattctcactcatttcaaagactt 23375668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 207 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 5601885 - 5601744
Alignment:
Q  207 ttggaagacatcttaatatttttctgattctatcatgagtggaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacat 306  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||| || || || ||||| |  |||||||| ||||| | |||||||||||| |  || |||||||  |||||    
T  5601885 ttggaagacatcttagtatttttcttattctgtcgtgggtagaataagtttttccaagtgatcttagttcatttactatagatgtgaatctagagtacat 5601786  T
Q  307 ctcatcaatggtttcattttcactcattttaaagacttcaaa 348  Q
     ||||||||| |||||| |||| |||||| ||||| ||||||    
T  5601785 ttcatcaatgttttcatcttcaatcatttcaaagatttcaaa 5601744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 49 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 20037549 - 20037345
Alignment:
Q  49 ttgagatgctttcaaagcaagtgtttttaccttcttcactggtttatctccttgaagtacaacttcatgagctcttagtgaaccaatgagatctttcagg 148  Q
    |||||||||||| | |||||   ||||| |||| ||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||  |      
T  20037549 ttgagatgctttgagagcaatcatttttccctttttcaccggtttatcttcttggagtagaacttcatgagctctaagtgttccaatgagattttctaaa 20037450  T
Q  149 ttcatagattttaaatttttggcctgagtaattgttgtgaccatatgtcctcacacacttggaagacatcttaatatttttctgattctatcatgagtgg 248  Q
      ||  || |||| ||  ||||| ||||| |||||||| |||||| |||  |||    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  20037449 gccaaggaatttagatcgttggcttgagtgattgttgtaaccataggtctccacgtgtttgggagacatcttaatatttttctgattctgtcatgagggg 20037350  T
Q  249 aatat 253  Q
    |||||    
T  20037349 aatat 20037345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 88 - 348
Target Start/End: Original strand, 22456358 - 22456618
Alignment:
Q  88 tggtttatctccttgaagtacaacttcatgagctcttagtgaaccaatgagatctttcaggttcatagattttaaatttttggcctgagtaattgttgtg 187  Q
    |||||| ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||  |    ||  || ||||||| |||||| ||||| |||  |||     
T  22456358 tggtttgtcttcttgaagcaaaacttcatgagctcttagtgttccaatgagatcttctaaagccaaggaatttaaatctttggcttgagtgatttctgta 22456457  T
Q  188 accatatgtcctcacacacttggaagacatcttaatatttttctgattctatcatgagtggaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattg 287  Q
    |||||| |||  || | | | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||   ||||| |  || ||||  ||||||||| | |    
T  22456458 accataggtctccatatattaggaagacatcttaatatttttctgattctgtcatgaggagaatatatttttcccaatgacctcaactcatttactttag 22456557  T
Q  288 tagtaaatctagcatacatctcatcaatggtttcattttcactcattttaaagacttcaaa 348  Q
     |||||||||   |||||| ||||||||| |||| | |||| ||||||  |||| ||||||    
T  22456558 aagtaaatctgaaatacatttcatcaatgttttcctcttcattcatttcgaagatttcaaa 22456618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 253
Target Start/End: Original strand, 24299224 - 24299270
Alignment:
Q  207 ttggaagacatcttaatatttttctgattctatcatgagtggaatat 253  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  24299224 ttgggagacatcttaatatttttctgattctgtcatgaggggaatat 24299270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 206 - 279
Target Start/End: Original strand, 30453229 - 30453302
Alignment:
Q  206 cttggaagacatcttaatatttttctgattctatcatgagtggaatatgcctttccaagagatctcatttcatt 279  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||| ||| |  |||||||| ||||| | ||||||    
T  30453229 cttggaagacatcttaagatttttcttatccgatcatgagtggtataagtttttccaagtgatcttaattcatt 30453302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 206 - 279
Target Start/End: Original strand, 30458307 - 30458380
Alignment:
Q  206 cttggaagacatcttaatatttttctgattctatcatgagtggaatatgcctttccaagagatctcatttcatt 279  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||| ||| |  |||||||| ||||| | ||||||    
T  30458307 cttggaagacatcttaagatttttcttatccgatcatgagtggtataagtttttccaagtgatcttaattcatt 30458380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 7)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 20 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 16255127 - 16254799
Alignment:
Q  20 acatcatcatcagctattgatgagatttgttgagatgctttcaaagcaagtgtttttaccttcttcactggtttatctccttgaagtacaacttcatgag 119  Q
    |||||||||||||| | ||||||  |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16255127 acatcatcatcagcaactgatgaactttgctgagatgctttcaaggcaagtgtttttaccttcttcactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgag 16255028  T
Q  120 ctcttagtgaaccaatgagatctttcaggttcatagattttaaatttttggcctgagtaattgttgtgaccatatgtcctcacacacttggaagacatct 219  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||   ||||||||| |||  |||| |||||||||||||||    
T  16255027 ctctcagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctaagtaattacagtgaccataggtctccacatacttggaagacatct 16254928  T
Q  220 taatatttttctgattctatcatgagtggaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtt 319  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16254927 caatatttttctgattctatcatgagtagaatatgcctttccaagagatctcatatcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtt 16254828  T
Q  320 tcattttcactcattttaaagacttcaaa 348  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16254827 tcattttcactcatttcaaagacttcaaa 16254799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 20 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 6694112 - 6693784
Alignment:
Q  20 acatcatcatcagctattgatgagatttgttgagatgctttcaaagcaagtgtttttaccttcttcactggtttatctccttgaagtacaacttcatgag 119  Q
    ||||| |||||||| | ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6694112 acatcttcatcagcaactgatgaggtttgctgagatgctttcaaggcaagtgttcttaccttcttcactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgag 6694013  T
Q  120 ctcttagtgaaccaatgagatctttcaggttcatagattttaaatttttggcctgagtaattgttgtgaccatatgtcctcacacacttggaagacatct 219  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||| |||  |||| |||||||||||||||    
T  6694012 ctcttagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtctccacatacttggaagacatct 6693913  T
Q  220 taatatttttctgattctatcatgagtggaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtt 319  Q
     |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6693912 cagaatttttctaattctatcatgagtggaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatcttgcatacatctcatcaatggtt 6693813  T
Q  320 tcattttcactcattttaaagacttcaaa 348  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6693812 tcattttcactcatttcaaagacttcaaa 6693784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 20 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 17151267 - 17150939
Alignment:
Q  20 acatcatcatcagctattgatgagatttgttgagatgctttcaaagcaagtgtttttaccttcttcactggtttatctccttgaagtacaacttcatgag 119  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17151267 acatcatcatcagctactgatgaggtttgctgagatgctttcaaggcaagtgtttttaccttcttcactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgag 17151168  T
Q  120 ctcttagtgaaccaatgagatctttcaggttcatagattttaaatttttggcctgagtaattgttgtgaccatatgtcctcacacacttggaagacatct 219  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||   |||||||| |||  || |||||||||||||||||    
T  17151167 ctcttagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagattataaatctttggcctgagtaattgcattgaccataggtctccaaacacttggaagacatct 17151068  T
Q  220 taatatttttctgattctatcatgagtggaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtt 319  Q
    |||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17151067 taatatttttctaattcaaacatgagtagaatatgccttttcaagatatctcatttaatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtt 17150968  T
Q  320 tcattttcactcattttaaagacttcaaa 348  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17150967 tcattttcactcatttcaaagacttcaaa 17150939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 20 - 348
Target Start/End: Original strand, 7844905 - 7845233
Alignment:
Q  20 acatcatcatcagctattgatgagatttgttgagatgctttcaaagcaagtgtttttaccttcttcactggtttatctccttgaagtacaacttcatgag 119  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7844905 acatcatcatcagctactaatgagctttgttgagatgctttcaatgcaagtgtctttaccttcttcactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgag 7845004  T
Q  120 ctcttagtgaaccaatgagatctttcaggttcatagattttaaatttttggcctgagtaattgttgtgaccatatgtcctcacacacttggaagacatct 219  Q
    |||| | ||| |||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||  || |||||||||||||||||    
T  7845005 ctctcaatgagccaatgagatcttctagattcatagattttaaatctttggcctgagtaattgcagtgaccataggtctccatacacttggaagacatct 7845104  T
Q  220 taatatttttctgattctatcatgagtggaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtt 319  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7845105 taatatttttctgattctatcataagtagaataagcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtt 7845204  T
Q  320 tcattttcactcattttaaagacttcaaa 348  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  7845205 tcattttcactcatttcaaaaacttcaaa 7845233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 22 - 348
Target Start/End: Original strand, 520362 - 520688
Alignment:
Q  22 atcatcatcagctattgatgagatttgttgagatgctttcaaagcaagtgtttttaccttcttcactggtttatctccttgaagtacaacttcatgagct 121  Q
    |||||| |||| || ||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  520362 atcatcttcagttactgatgaggtttgctgagaggctttcaaggcaagtgactttaccttctttactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgagct 520461  T
Q  122 cttagtgaaccaatgagatctttcaggttcatagattttaaatttttggcctgagtaattgttgtgaccatatgtcctcacacacttggaagacatctta 221  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||  ||||||||| |||  |||| ||||||||||||||| |    
T  520462 ctcagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagatttcaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtctccacatacttggaagacatctca 520561  T
Q  222 atatttttctgattctatcatgagtggaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtttc 321  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  520562 atatttttctgattctctcatgagtggaatatgtttttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctggcatacatctcatcaatggtttc 520661  T
Q  322 attttcactcattttaaagacttcaaa 348  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||    
T  520662 attttcactcatttcaaagacttcaaa 520688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 206 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 26813640 - 26813598
Alignment:
Q  206 cttggaagacatcttaatatttttctgattctatcatgagtgg 248  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||    
T  26813640 cttggaagacatcttaaaatttttcttattcgatcatgagtgg 26813598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 206 - 348
Target Start/End: Original strand, 54698404 - 54698546
Alignment:
Q  206 cttggaagacatcttaatatttttctgattctatcatgagtggaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcataca 305  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||| ||| |  |||||||| ||||| | |||||| || || |  || ||||| |  ||||    
T  54698404 cttggaagacatcttaagatttttcttatccgatcatgagtggtataagtttttccaagtgatcttaattcattcacaatagatgtgaatctggagtaca 54698503  T
Q  306 tctcatcaatggtttcattttcactcattttaaagacttcaaa 348  Q
    | ||||||||| | |||| |||  |||||| ||||| ||||||    
T  54698504 tttcatcaatgttctcatcttcgttcatttcaaagatttcaaa 54698546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 13)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 20 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 6536378 - 6536050
Alignment:
Q  20 acatcatcatcagctattgatgagatttgttgagatgctttcaaagcaagtgtttttaccttcttcactggtttatctccttgaagtacaacttcatgag 119  Q
    ||||| |||||||| | ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6536378 acatcttcatcagcaactgatgaggtttgctgagatgctttcaaggcaagtgttcttaccttcttcactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgag 6536279  T
Q  120 ctcttagtgaaccaatgagatctttcaggttcatagattttaaatttttggcctgagtaattgttgtgaccatatgtcctcacacacttggaagacatct 219  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||| |||  |||| |||||||||||||||    
T  6536278 ctcttagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtctccacatacttggaagacatct 6536179  T
Q  220 taatatttttctgattctatcatgagtggaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtt 319  Q
     |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6536178 cagaatttttctaattctatcatgagtggaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatcttgcatacatctcatcaatggtt 6536079  T
Q  320 tcattttcactcattttaaagacttcaaa 348  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6536078 tcattttcactcatttcaaagacttcaaa 6536050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 20 - 348
Target Start/End: Original strand, 16140631 - 16140959
Alignment:
Q  20 acatcatcatcagctattgatgagatttgttgagatgctttcaaagcaagtgtttttaccttcttcactggtttatctccttgaagtacaacttcatgag 119  Q
    ||||| |||||||| | ||||| | |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16140631 acatcttcatcagcaactgatggggtttgctgagatgcttttaaggcaagtgtttttaccttcttcactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgag 16140730  T
Q  120 ctcttagtgaaccaatgagatctttcaggttcatagattttaaatttttggcctgagtaattgttgtgaccatatgtcctcacacacttggaagacatct 219  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  16140731 ctcttagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtctccacacacttggaagacatct 16140830  T
Q  220 taatatttttctgattctatcatgagtggaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtt 319  Q
     |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16140831 cagaatttttctaattctatcatgagtggaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatcttgcatacatctcatcaatggtt 16140930  T
Q  320 tcattttcactcattttaaagacttcaaa 348  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16140931 tcattttcactcatttcaaagacttcaaa 16140959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 20 - 348
Target Start/End: Original strand, 5389618 - 5389946
Alignment:
Q  20 acatcatcatcagctattgatgagatttgttgagatgctttcaaagcaagtgtttttaccttcttcactggtttatctccttgaagtacaacttcatgag 119  Q
    ||||| |||||||| | ||||| | |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5389618 acatcttcatcagcaactgatggggtttgctgagatgctttcaaggcaagtgttcttaccttcttcactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgag 5389717  T
Q  120 ctcttagtgaaccaatgagatctttcaggttcatagattttaaatttttggcctgagtaattgttgtgaccatatgtcctcacacacttggaagacatct 219  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||| |||  |||| |||||||||||||||    
T  5389718 ctcttagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtctccacatacttggaagacatct 5389817  T
Q  220 taatatttttctgattctatcatgagtggaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtt 319  Q
     |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5389818 cagaatttttctaattctatcatgagtggaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatcttgcatacatctcatcaatggtt 5389917  T
Q  320 tcattttcactcattttaaagacttcaaa 348  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5389918 tcattttcactcatttcaaagacttcaaa 5389946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 20 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 26305450 - 26305122
Alignment:
Q  20 acatcatcatcagctattgatgagatttgttgagatgctttcaaagcaagtgtttttaccttcttcactggtttatctccttgaagtacaacttcatgag 119  Q
    ||||| |||||||| | ||||| | |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26305450 acatcttcatcagcaactgatggggtttgctgagatgctttcaaggcaagtgttcttaccttcttcactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgag 26305351  T
Q  120 ctcttagtgaaccaatgagatctttcaggttcatagattttaaatttttggcctgagtaattgttgtgaccatatgtcctcacacacttggaagacatct 219  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||| |||  |||| |||||||||||||||    
T  26305350 ctcttagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtctccacatacttggaagacatct 26305251  T
Q  220 taatatttttctgattctatcatgagtggaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtt 319  Q
     |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26305250 cagaatttttctaattctatcatgagtggaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatcttgcatacatctcatcaatggtt 26305151  T
Q  320 tcattttcactcattttaaagacttcaaa 348  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26305150 tcattttcactcatttcaaagacttcaaa 26305122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 20 - 348
Target Start/End: Original strand, 26361368 - 26361696
Alignment:
Q  20 acatcatcatcagctattgatgagatttgttgagatgctttcaaagcaagtgtttttaccttcttcactggtttatctccttgaagtacaacttcatgag 119  Q
    ||||| |||||||| | ||||| | |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26361368 acatcttcatcagcaactgatggggtttgctgagatgctttcaaggcaagtgttcttaccttcttcactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgag 26361467  T
Q  120 ctcttagtgaaccaatgagatctttcaggttcatagattttaaatttttggcctgagtaattgttgtgaccatatgtcctcacacacttggaagacatct 219  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||| |||  |||| |||||||||||||||    
T  26361468 ctcttagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtctccacatacttggaagacatct 26361567  T
Q  220 taatatttttctgattctatcatgagtggaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtt 319  Q
     |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26361568 cagaatttttctaattctatcatgagtggaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatcttgcatacatctcatcaatggtt 26361667  T
Q  320 tcattttcactcattttaaagacttcaaa 348  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26361668 tcattttcactcatttcaaagacttcaaa 26361696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 20 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 32100274 - 32099946
Alignment:
Q  20 acatcatcatcagctattgatgagatttgttgagatgctttcaaagcaagtgtttttaccttcttcactggtttatctccttgaagtacaacttcatgag 119  Q
    ||||| |||||||| | ||||| | |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32100274 acatcttcatcagcaactgatggggtttgctgagatgctttcaaggcaagtgttcttaccttcttcactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgag 32100175  T
Q  120 ctcttagtgaaccaatgagatctttcaggttcatagattttaaatttttggcctgagtaattgttgtgaccatatgtcctcacacacttggaagacatct 219  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||| |||  |||| |||||||||||||||    
T  32100174 ctcttagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtctccacatacttggaagacatct 32100075  T
Q  220 taatatttttctgattctatcatgagtggaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtt 319  Q
     |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32100074 cagaatttttctaattctatcatgagtggaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatcttgcatacatctcatcaatggtt 32099975  T
Q  320 tcattttcactcattttaaagacttcaaa 348  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32099974 tcattttcactcatttcaaagacttcaaa 32099946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 20 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 8502943 - 8502615
Alignment:
Q  20 acatcatcatcagctattgatgagatttgttgagatgctttcaaagcaagtgtttttaccttcttcactggtttatctccttgaagtacaacttcatgag 119  Q
    ||||| |||||||| | ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8502943 acatcttcatcagcaactgatgaggtttgctgagatgctttcaaggcaagtgttcttaccttctttactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgag 8502844  T
Q  120 ctcttagtgaaccaatgagatctttcaggttcatagattttaaatttttggcctgagtaattgttgtgaccatatgtcctcacacacttggaagacatct 219  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||| |||  |||| |||||||||||||||    
T  8502843 ctcttagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtctccacatacttggaagacatct 8502744  T
Q  220 taatatttttctgattctatcatgagtggaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtt 319  Q
     |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  8502743 cagaatttttctaattctatcatgagtggaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatcttgcatacatttcatcaatggtt 8502644  T
Q  320 tcattttcactcattttaaagacttcaaa 348  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8502643 tcattttcactcatttcaaagacttcaaa 8502615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 20 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 44899193 - 44898865
Alignment:
Q  20 acatcatcatcagctattgatgagatttgttgagatgctttcaaagcaagtgtttttaccttcttcactggtttatctccttgaagtacaacttcatgag 119  Q
    ||||| |||||||| | ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44899193 acatcttcatcagcaactgatgaggtttgctgagatgctttcaaggcaagtgttcttaccttctttactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgag 44899094  T
Q  120 ctcttagtgaaccaatgagatctttcaggttcatagattttaaatttttggcctgagtaattgttgtgaccatatgtcctcacacacttggaagacatct 219  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||| |||  |||| |||||||||||||||    
T  44899093 ctcttagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtctccacatacttggaagacatct 44898994  T
Q  220 taatatttttctgattctatcatgagtggaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtt 319  Q
     |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44898993 cagaatttttctaattctatcatgagtggaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatcttgcatacatctcatcaatggtt 44898894  T
Q  320 tcattttcactcattttaaagacttcaaa 348  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  44898893 tcatttttactcatttcaaagacttcaaa 44898865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 20 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 46499008 - 46498680
Alignment:
Q  20 acatcatcatcagctattgatgagatttgttgagatgctttcaaagcaagtgtttttaccttcttcactggtttatctccttgaagtacaacttcatgag 119  Q
    ||||| |||||||| | |||||   |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  46499008 acatcttcatcagcaactgatggagtttgctgagatgcttttaaggcaagtgtttttaccttcttcactggtttgtctccttaaagtacaacttcatgag 46498909  T
Q  120 ctcttagtgaaccaatgagatctttcaggttcatagattttaaatttttggcctgagtaattgttgtgaccatatgtcctcacacacttggaagacatct 219  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  46498908 ctcttagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtctccacacacttggaagacatct 46498809  T
Q  220 taatatttttctgattctatcatgagtggaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtt 319  Q
     |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  46498808 cagaatttttctaattctatcatgagtggaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatcttgcatacatctcatcaatggtt 46498709  T
Q  320 tcattttcactcattttaaagacttcaaa 348  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  46498708 tcattttcactcatttcaaagacttcaaa 46498680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 20 - 348
Target Start/End: Original strand, 9543687 - 9544015
Alignment:
Q  20 acatcatcatcagctattgatgagatttgttgagatgctttcaaagcaagtgtttttaccttcttcactggtttatctccttgaagtacaacttcatgag 119  Q
    |||||||| |||||   ||||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9543687 acatcatcttcagcagctgatgagctttgctgagatgcttttaaggcaagtgtttttaccttcttcactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgag 9543786  T
Q  120 ctcttagtgaaccaatgagatctttcaggttcatagattttaaatttttggcctgagtaattgttgtgaccatatgtcctcacacacttggaagacatct 219  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||  ||||||||| |||  |||| |||||||||||||||    
T  9543787 ctctcagtgaaccaataagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctgggtgattgcagtgaccataggtctccacatacttggaagacatct 9543886  T
Q  220 taatatttttctgattctatcatgagtggaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtt 319  Q
    || ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9543887 tagtatttttctaattctatcatgagtagaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctggcatacatctcatcaatggtt 9543986  T
Q  320 tcattttcactcattttaaagacttcaaa 348  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  9543987 tcattttcactcatttcaaaaacttcaaa 9544015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 20 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 42597252 - 42596924
Alignment:
Q  20 acatcatcatcagctattgatgagatttgttgagatgctttcaaagcaagtgtttttaccttcttcactggtttatctccttgaagtacaacttcatgag 119  Q
    |||||||| |||| || ||||||| |||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42597252 acatcatcttcagttactgatgaggtttgttgagaggctttcaaggcaagtgactttaccttcttcactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgag 42597153  T
Q  120 ctcttagtgaaccaatgagatctttcaggttcatagattttaaatttttggcctgagtaattgttgtgaccatatgtcctcacacacttggaagacatct 219  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| ||| ||||  ||||||||| |||   ||| ||||||||| |||||    
T  42597152 ctctcagtgaacaaatgagatcttccaggttcatagatttcaaatctttggcctcagtgattgcagtgaccataggtctctacatacttggaaggcatct 42597053  T
Q  220 taatatttttctgattctatcatgagtggaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtt 319  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42597052 caatatttttctgattctctcatgagtggaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctggcatacatctcatcaatggtt 42596953  T
Q  320 tcattttcactcattttaaagacttcaaa 348  Q
    |||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  42596952 tcattcacactcatttcaaagacttcaaa 42596924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 20 - 341
Target Start/End: Original strand, 13283877 - 13284198
Alignment:
Q  20 acatcatcatcagctattgatgagatttgttgagatgctttcaaagcaagtgtttttaccttcttcactggtttatctccttgaagtacaacttcatgag 119  Q
    ||||||||||||| || ||||||  |||  ||||| |||||||| |||||||  ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13283877 acatcatcatcagttactgatgaagtttactgagaggctttcaaggcaagtgactttaccttctttactagtttgtctccttgaagtacaacttcatgag 13283976  T
Q  120 ctcttagtgaaccaatgagatctttcaggttcatagattttaaatttttggcctgagtaattgttgtgaccatatgtcctcacacacttggaagacatct 219  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||  ||||||||| |||  |||| ||||||||| |||||    
T  13283977 ctctaagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagatttcaaatctttggcctgagtgattgaagtgaccataggtctccacatacttggaaggcatct 13284076  T
Q  220 taatatttttctgattctatcatgagtggaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtt 319  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13284077 taatatttttctgattctctcatgagtggagtatgccttcccaagagatctcatttcatttactattgcagtaaatctggcatacatctcatcaatggtt 13284176  T
Q  320 tcattttcactcattttaaaga 341  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  13284177 tcattttcactcatttcaaaga 13284198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 206 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 15175692 - 15175619
Alignment:
Q  206 cttggaagacatcttaatatttttctgattctatcatgagtggaatatgcctttccaagagatctcatttcatt 279  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||| ||| |  |||||||| ||||| | ||||||    
T  15175692 cttggaagacatcttaagatttttcttatccgatcatgagtggtataagtttttccaagtgatcttaattcatt 15175619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 9)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 20 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 18161959 - 18161631
Alignment:
Q  20 acatcatcatcagctattgatgagatttgttgagatgctttcaaagcaagtgtttttaccttcttcactggtttatctccttgaagtacaacttcatgag 119  Q
    ||||| |||||||| | ||||| | |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18161959 acatcttcatcagcaactgatggggtttgctgagatgcttttaaggcaagtgtttttaccttcttcactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgag 18161860  T
Q  120 ctcttagtgaaccaatgagatctttcaggttcatagattttaaatttttggcctgagtaattgttgtgaccatatgtcctcacacacttggaagacatct 219  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  18161859 ctcttagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtctccacacacttggaagacatct 18161760  T
Q  220 taatatttttctgattctatcatgagtggaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtt 319  Q
     |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18161759 cagaatttttctaattctatcatgagtggaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatcttgcatacatctcatcaatggtt 18161660  T
Q  320 tcattttcactcattttaaagacttcaaa 348  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18161659 tcattttcactcatttcaaagacttcaaa 18161631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 20 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 16899840 - 16899512
Alignment:
Q  20 acatcatcatcagctattgatgagatttgttgagatgctttcaaagcaagtgtttttaccttcttcactggtttatctccttgaagtacaacttcatgag 119  Q
    ||||| |||||||| | ||||| | |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16899840 acatcttcatcagcaactgatggggtttgctgagatgcttttaaggcaagtgtttttaccttcttcactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgag 16899741  T
Q  120 ctcttagtgaaccaatgagatctttcaggttcatagattttaaatttttggcctgagtaattgttgtgaccatatgtcctcacacacttggaagacatct 219  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  16899740 ctcttagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtctccacacacttggaagacatct 16899641  T
Q  220 taatatttttctgattctatcatgagtggaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtt 319  Q
     |  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16899640 cagaatttttctaattctatcatgagttgaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatcttgcatacatctcatcaatggtt 16899541  T
Q  320 tcattttcactcattttaaagacttcaaa 348  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16899540 tcattttcactcatttcaaagacttcaaa 16899512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 20 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 31359455 - 31359127
Alignment:
Q  20 acatcatcatcagctattgatgagatttgttgagatgctttcaaagcaagtgtttttaccttcttcactggtttatctccttgaagtacaacttcatgag 119  Q
    ||||| |||||||| | ||||| | |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31359455 acatcttcatcagcaactgatggggtttgctgagatgctttcaaggcaagtgttcttaccttcttcactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgag 31359356  T
Q  120 ctcttagtgaaccaatgagatctttcaggttcatagattttaaatttttggcctgagtaattgttgtgaccatatgtcctcacacacttggaagacatct 219  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||| |||  |||| |||||||||||||||    
T  31359355 ctcttagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtctccacatacttggaagacatct 31359256  T
Q  220 taatatttttctgattctatcatgagtggaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtt 319  Q
     |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31359255 cagaatttttctaattctatcatgagtggaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatcttgcatacatctcatcaatggtt 31359156  T
Q  320 tcattttcactcattttaaagacttcaaa 348  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31359155 tcattttcactcatttcaaagacttcaaa 31359127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 20 - 348
Target Start/End: Original strand, 18710425 - 18710753
Alignment:
Q  20 acatcatcatcagctattgatgagatttgttgagatgctttcaaagcaagtgtttttaccttcttcactggtttatctccttgaagtacaacttcatgag 119  Q
    |||||||||||||||| | ||||| |||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||    
T  18710425 acatcatcatcagctacttatgaggtttgctgagaagctttcaaggcaagtgattttaccttcttcactgggttgtctccttgaagtacaactgcatgag 18710524  T
Q  120 ctcttagtgaaccaatgagatctttcaggttcatagattttaaatttttggcctgagtaattgttgtgaccatatgtcctcacacacttggaagacatct 219  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||  |||| |||||||||||||||    
T  18710525 ctctcagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctgagtaattgcagtgaccataggtctccacatacttggaagacatct 18710624  T
Q  220 taatatttttctgattctatcatgagtggaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtt 319  Q
    ||  || ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18710625 tagaatctttctgattctctcatgagtggaatattcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtt 18710724  T
Q  320 tcattttcactcattttaaagacttcaaa 348  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18710725 tcattttcactcatttcaaagacttcaaa 18710753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 20 - 348
Target Start/End: Original strand, 18704490 - 18704818
Alignment:
Q  20 acatcatcatcagctattgatgagatttgttgagatgctttcaaagcaagtgtttttaccttcttcactggtttatctccttgaagtacaacttcatgag 119  Q
    |||||||||||||||| | ||||| |||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||    
T  18704490 acatcatcatcagctacttatgaggtttgctgagaagctttcaaggcaagtgattttaccttcttcactgggttgtctccttgaagtacaactgcatgag 18704589  T
Q  120 ctcttagtgaaccaatgagatctttcaggttcatagattttaaatttttggcctgagtaattgttgtgaccatatgtcctcacacacttggaagacatct 219  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||  |||| |||||||||||||||    
T  18704590 ctctcagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctgagtaattgcagtgaccataggtctccacatacttggaagacatct 18704689  T
Q  220 taatatttttctgattctatcatgagtggaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtt 319  Q
    ||  || ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18704690 tagaatctttctgattctctcatgagtggaatattcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcataaatctcatcaatggtt 18704789  T
Q  320 tcattttcactcattttaaagacttcaaa 348  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18704790 tcattttcactcatttcaaagacttcaaa 18704818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 22 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 34767248 - 34766922
Alignment:
Q  22 atcatcatcagctattgatgagatttgttgagatgctttcaaagcaagtgtttttaccttcttcactggtttatctccttgaagtacaacttcatgagct 121  Q
    |||||| |||| || ||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34767248 atcatcttcagttactgatgaggtttgctgagaggctttcaaggcaagtgactttaccttctttactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgagct 34767149  T
Q  122 cttagtgaaccaatgagatctttcaggttcatagattttaaatttttggcctgagtaattgttgtgaccatatgtcctcacacacttggaagacatctta 221  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||  ||||||||| |||  |||| ||||||||||||||| |    
T  34767148 ctcagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagatttcaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtctccacatacttggaagacatctca 34767049  T
Q  222 atatttttctgattctatcatgagtggaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtttc 321  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34767048 atatttttctgattctctcatgagtggaatatgcttttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctggcatacatctcatcaatggtttc 34766949  T
Q  322 attttcactcattttaaagacttcaaa 348  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||    
T  34766948 attttcactcatttcaaagacttcaaa 34766922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 29561320 - 29561121
Alignment:
Q  20 acatcatcatcagctattgatgagatttgttgagatgctttcaaagcaagtgtttttaccttcttcactggtttatctccttgaagtacaacttcatgag 119  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29561320 acatcatcatcagctactgatgaggtttgctgagatgctttcaaagcaagtgtttttacattcttcactggtttatctccttgaagtacgacttcatgag 29561221  T
Q  120 ctcttagtgaaccaatgagatctttcaggttcatagattttaaatttttggcctgagtaattgttgtgaccatatgtcctcacacacttggaagacatct 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29561220 ctcttagtgaaccaatgagatctttcaggttcatagattttaaatctttggcctaagtaattgttgtgaccatatgtcctcacacacttgaaagacatct 29561121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 214 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 29542147 - 29542013
Alignment:
Q  214 acatcttaatatttttctgattctatcatgagtggaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatca 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29542147 acatcttaatatttttctgattctatcatgagtggaatatgcctttccaagagatttcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatca 29542048  T
Q  314 atggtttcattttcactcattttaaagacttcaaa 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29542047 atggtttcattttcactcattttaaagacttcaaa 29542013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 25895842 - 25895796
Alignment:
Q  207 ttggaagacatcttaatatttttctgattctatcatgagtggaatat 253  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  25895842 ttgggagacatcttaatatttttctgattctgtcatgaggggaatat 25895796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 233; Significance: 1e-129; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 20 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 148602 - 148274
Alignment:
Q  20 acatcatcatcagctattgatgagatttgttgagatgctttcaaagcaagtgtttttaccttcttcactggtttatctccttgaagtacaacttcatgag 119  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  148602 acatcatcatcagctactgatgagctttgctgagatgctttcaaggtaagtgtttttactttcttcactggtttgtctccttgaagtacaacgtcatgag 148503  T
Q  120 ctcttagtgaaccaatgagatctttcaggttcatagattttaaatttttggcctgagtaattgttgtgaccatatgtcctcacacacttggaagacatct 219  Q
    |||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  148502 ctctcagtgaaccaatgagatcctctaggttcatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtctccacacacttggaagacatct 148403  T
Q  220 taatatttttctgattctatcatgagtggaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtt 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  148402 taatatttttctgattctatcatgagtataatatgccttttcaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatagtt 148303  T
Q  320 tcattttcactcattttaaagacttcaaa 348  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  148302 tcattttcactcatttcaaagacttcaaa 148274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 233; Significance: 1e-129; HSPs: 5)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 20 - 348
Target Start/End: Original strand, 14892199 - 14892527
Alignment:
Q  20 acatcatcatcagctattgatgagatttgttgagatgctttcaaagcaagtgtttttaccttcttcactggtttatctccttgaagtacaacttcatgag 119  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14892199 acatcatcatcagctactgatgagctttgctgagatgctttcaaggcaagtgttttcaccttcttcactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgag 14892298  T
Q  120 ctcttagtgaaccaatgagatctttcaggttcatagattttaaatttttggcctgagtaattgttgtgaccatatgtcctcacacacttggaagacatct 219  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||  ||||||||| |||  |||| |||||||||||||||    
T  14892299 ctctcagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatcttctgcctgagtaattgcagtgaccataggtctccacatacttggaagacatct 14892398  T
Q  220 taatatttttctgattctatcatgagtggaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtt 319  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14892399 caatatttttctaattctatcatgagtagaatataccttttcaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatagtt 14892498  T
Q  320 tcattttcactcattttaaagacttcaaa 348  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14892499 tcattttcactcatttcaaagacttcaaa 14892527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 20 - 348
Target Start/End: Original strand, 21211417 - 21211745
Alignment:
Q  20 acatcatcatcagctattgatgagatttgttgagatgctttcaaagcaagtgtttttaccttcttcactggtttatctccttgaagtacaacttcatgag 119  Q
    ||||| |||||| | | ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21211417 acatcttcatcatcaactgatgaggtttgctgagatgctttcaaggcaagtgttcttaccttcttcactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgag 21211516  T
Q  120 ctcttagtgaaccaatgagatctttcaggttcatagattttaaatttttggcctgagtaattgttgtgaccatatgtcctcacacacttggaagacatct 219  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||| |||  |||| |||||||||||||||    
T  21211517 ctcttagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtctccacatacttggaagacatct 21211616  T
Q  220 taatatttttctgattctatcatgagtggaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtt 319  Q
     |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21211617 cagaatttttctaattctatcatgagtggaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatcttgcatacatctcatcaatggtt 21211716  T
Q  320 tcattttcactcattttaaagacttcaaa 348  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21211717 tcattttcactcatttcaaagacttcaaa 21211745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 22 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 22832631 - 22832311
Alignment:
Q  22 atcatcatcagctattgatgagatttgttgagatgctttcaaagcaagtgtttttaccttcttcactggtttatctccttgaagtacaacttcatgagct 121  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||    
T  22832631 atcatcatcagctactgatgaggtttgctgagaggctttcaaggcaagtgattttaccttcttcactggtttgtctccttgaagtactacttcaggagct 22832532  T
Q  122 cttagtgaaccaatgagatctttcaggttcatagattttaaatttttggcctgagtaattgttgtgaccatatgtcctcacacacttggaagacatctta 221  Q
    || |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||  ||||| ||| |||  |||| | |||||||||||||      
T  22832531 ctcagtgaaccaatgagatcttcaaggttcatagatttcaaatctttggcctgagtgattgcagtgacgataggtctccacataattggaagacatctcg 22832432  T
Q  222 atatttttctgattctatcatgagtggaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtttc 321  Q
      || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22832431 gaatctttccgattctttcatgagtggaatatgccttttcaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcataaatggtttc 22832332  T
Q  322 attttcactcattttaaagac 342  Q
    ||| |||||||||| ||||||    
T  22832331 attctcactcatttcaaagac 22832311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 18234065 - 18234019
Alignment:
Q  207 ttggaagacatcttaatatttttctgattctatcatgagtggaatat 253  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  18234065 ttgggagacatcttaatatttttctgattctgtcatgaggggaatat 18234019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 18243516 - 18243470
Alignment:
Q  207 ttggaagacatcttaatatttttctgattctatcatgagtggaatat 253  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  18243516 ttgggagacatcttaatatttttctgattctgtcatgaggggaatat 18243470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 233; Significance: 1e-129; HSPs: 5)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 20 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 8974740 - 8974412
Alignment:
Q  20 acatcatcatcagctattgatgagatttgttgagatgctttcaaagcaagtgtttttaccttcttcactggtttatctccttgaagtacaacttcatgag 119  Q
    ||||| |||||||| | ||||| | |||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8974740 acatcttcatcagcaactgatggggtttgctgagatgcttttaaggcaagtgtctttaccttcttcactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgag 8974641  T
Q  120 ctcttagtgaaccaatgagatctttcaggttcatagattttaaatttttggcctgagtaattgttgtgaccatatgtcctcacacacttggaagacatct 219  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  8974640 ctcttagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtctccacacacttggaagacatct 8974541  T
Q  220 taatatttttctgattctatcatgagtggaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtt 319  Q
     |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8974540 cagaatttttctaattctatcatgagtggaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatcttgcatacatctcatcaatggtt 8974441  T
Q  320 tcattttcactcattttaaagacttcaaa 348  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8974440 tcattttcactcatttcaaagacttcaaa 8974412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 20 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 9539029 - 9538701
Alignment:
Q  20 acatcatcatcagctattgatgagatttgttgagatgctttcaaagcaagtgtttttaccttcttcactggtttatctccttgaagtacaacttcatgag 119  Q
    ||||| |||||||| | ||||| | |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9539029 acatcttcatcagcaactgatggggtttgctgagatgctttcaaggcaagtgttcttaccttcttcactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgag 9538930  T
Q  120 ctcttagtgaaccaatgagatctttcaggttcatagattttaaatttttggcctgagtaattgttgtgaccatatgtcctcacacacttggaagacatct 219  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||| |||  |||| |||||||||||||||    
T  9538929 ctcttagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtctccacatacttggaagacatct 9538830  T
Q  220 taatatttttctgattctatcatgagtggaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtt 319  Q
     |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9538829 cagaatttttctaattctatcatgagtggaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatcttgcatacatctcatcaatggtt 9538730  T
Q  320 tcattttcactcattttaaagacttcaaa 348  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9538729 tcattttcactcatttcaaagacttcaaa 9538701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 20 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 6424201 - 6423873
Alignment:
Q  20 acatcatcatcagctattgatgagatttgttgagatgctttcaaagcaagtgtttttaccttcttcactggtttatctccttgaagtacaacttcatgag 119  Q
    ||||| |||||||| | ||||| | |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6424201 acatcttcatcagcaactgatggggtttgctgagatgctttcaaggcaagtgtttttaccttcttcactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgag 6424102  T
Q  120 ctcttagtgaaccaatgagatctttcaggttcatagattttaaatttttggcctgagtaattgttgtgaccatatgtcctcacacacttggaagacatct 219  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||    
T  6424101 ctcttagtgaaccaatgagatcttccaggtttatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtctccacacacttggaagacacct 6424002  T
Q  220 taatatttttctgattctatcatgagtggaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtt 319  Q
     | ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6424001 cagtatttttctaattctatcatgagtagaatatgcatttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctggcatacatctcatcaatggtt 6423902  T
Q  320 tcattttcactcattttaaagacttcaaa 348  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6423901 tcattttcactcatttcaaagacttcaaa 6423873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 99 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 12387802 - 12387556
Alignment:
Q  99 cttgaagtacaacttcatgagctcttagtgaaccaatgagatctttcaggttcatagattttaaatttttggcctgagtaattgttgtgaccatatgtcc 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| || ||||||| ||| ||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| |||     
T  12387802 cttgaagtacaacttcatgagctatcagtgaatcaatgagatcttccaagttcatatattgtaaatatttagcctgagtaattgcagtgaccataggtct 12387703  T
Q  199 tcacacacttggaagacatcttaatatttttctgattctatcatgagtggaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatcta 298  Q
    || || ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12387702 tcgcatacttggaaggcatctcaatatttttctgactctctcataagtggaatatgcctttccaaaagatcttatttcatttactattgtagtaaatcta 12387603  T
Q  299 gcatacatctcatcaatggtttcattttcactcattttaaagacttc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12387602 gcatacatctcatcaatggtttcattttcactcatttcaaagacttc 12387556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 207 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 48979979 - 48979838
Alignment:
Q  207 ttggaagacatcttaatatttttctgattctatcatgagtggaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacat 306  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||| || || || ||||| |  |||||||| ||||| | |||||||||||| |  || |||||||  |||||    
T  48979979 ttggaagacatcttagtatttttcttattctgtcgtgggtagaataagtttttccaagtgatcttagttcatttactatagatgtgaatctagagtacat 48979880  T
Q  307 ctcatcaatggtttcattttcactcattttaaagacttcaaa 348  Q
     ||||||||| |||||| |||| |||||| ||||| ||||||    
T  48979879 ttcatcaatgttttcatcttcaatcatttcaaagatttcaaa 48979838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 233; Significance: 1e-129; HSPs: 6)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 20 - 348
Target Start/End: Original strand, 9512211 - 9512539
Alignment:
Q  20 acatcatcatcagctattgatgagatttgttgagatgctttcaaagcaagtgtttttaccttcttcactggtttatctccttgaagtacaacttcatgag 119  Q
    ||||| |||||||| | ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9512211 acatcttcatcagcaactgatgaggtttgctgagatgctttcaaggcaagtgttcttaccttctttactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgag 9512310  T
Q  120 ctcttagtgaaccaatgagatctttcaggttcatagattttaaatttttggcctgagtaattgttgtgaccatatgtcctcacacacttggaagacatct 219  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||| |||  |||| |||||||||||||||    
T  9512311 ctcttagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtctccacatacttggaagacatct 9512410  T
Q  220 taatatttttctgattctatcatgagtggaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtt 319  Q
     |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9512411 cagaatttttctaattctatcatgagtggaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatcttgcatacatctcatcaatggtt 9512510  T
Q  320 tcattttcactcattttaaagacttcaaa 348  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9512511 tcattttcactcatttcaaagacttcaaa 9512539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 20 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 18653112 - 18652784
Alignment:
Q  20 acatcatcatcagctattgatgagatttgttgagatgctttcaaagcaagtgtttttaccttcttcactggtttatctccttgaagtacaacttcatgag 119  Q
    ||||| |||||||| | ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18653112 acatcttcatcagcaactgatgaggtttgctgagatgctttcaaggcaagtgttcttaccttctttactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgag 18653013  T
Q  120 ctcttagtgaaccaatgagatctttcaggttcatagattttaaatttttggcctgagtaattgttgtgaccatatgtcctcacacacttggaagacatct 219  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||| |||  |||| |||||||||||||||    
T  18653012 ctcttagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtctccacatacttggaagacatct 18652913  T
Q  220 taatatttttctgattctatcatgagtggaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtt 319  Q
     |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18652912 cagaatttttctaattctatcatgagtggaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatcttgcatacatctcatcaatggtt 18652813  T
Q  320 tcattttcactcattttaaagacttcaaa 348  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18652812 tcattttcactcatttcaaagacttcaaa 18652784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 20 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 45016247 - 45015919
Alignment:
Q  20 acatcatcatcagctattgatgagatttgttgagatgctttcaaagcaagtgtttttaccttcttcactggtttatctccttgaagtacaacttcatgag 119  Q
    |||||||||||||| | ||||||| ||   ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45016247 acatcatcatcagcaactgatgagcttgactgagatgcttttaaggcaagtgtttttaccttctttactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgag 45016148  T
Q  120 ctcttagtgaaccaatgagatctttcaggttcatagattttaaatttttggcctgagtaattgttgtgaccatatgtcctcacacacttggaagacatct 219  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||| |||  |||| |||||||||||||||    
T  45016147 ctcttagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtctccacatacttggaagacatct 45016048  T
Q  220 taatatttttctgattctatcatgagtggaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtt 319  Q
     | ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45016047 cagtatttttctaattctatcatgagtagaatatgcatttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtt 45015948  T
Q  320 tcattttcactcattttaaagacttcaaa 348  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45015947 tcattttcactcatttcaaagacttcaaa 45015919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 20 - 348
Target Start/End: Original strand, 27168433 - 27168761
Alignment:
Q  20 acatcatcatcagctattgatgagatttgttgagatgctttcaaagcaagtgtttttaccttcttcactggtttatctccttgaagtacaacttcatgag 119  Q
    |||||||| |||| || ||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27168433 acatcatcttcagttactgatgaggtttgctgagaggctttcaaggcaagtgactttactttctttactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgag 27168532  T
Q  120 ctcttagtgaaccaatgagatctttcaggttcatagattttaaatttttggcctgagtaattgttgtgaccatatgtcctcacacacttggaagacatct 219  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||  ||||||||| |||  |||| |||||||||||||||    
T  27168533 ctctcagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagatttcaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtctccacatacttggaagacatct 27168632  T
Q  220 taatatttttctgattctatcatgagtggaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtt 319  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27168633 caatatttttctgattctctcatgagtggaatatgcttttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctggcatacatctcatcaatggtt 27168732  T
Q  320 tcattttcactcattttaaagacttcaaa 348  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27168733 tcattttcactcatttcaaagacttcaaa 27168761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 20 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 22904033 - 22903709
Alignment:
Q  20 acatcatcatcagctattgatgagatttgttgagatgctttcaaagcaagtgtttttaccttcttcactggtttatctccttgaagtacaacttcatgag 119  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||| ||||| || |||||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22904033 acatcatcttcagctactgatgaggtttgctgagaggcttttaaggcaagtgactttaccttcttcattggtttgtctccttgaagtacaacttcatgag 22903934  T
Q  120 ctcttagtgaaccaatgagatctttcaggttcatagattttaaatttttggcctgagtaattgttgtgaccatatgtcctcacacacttggaagacatct 219  Q
    |||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||||||  || |||||| |||  |||| ||||||||| || ||    
T  22903933 ctctcagtgaaccaatgagatcttccaagttcatagatttcaaatctttggcctgagtaattgcagttaccataggtctccacatacttggaaggcaact 22903834  T
Q  220 taatatttttctgattctatcatgagtggaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtt 319  Q
     ||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22903833 caatatttttctgattatctcatgagtgaaatatgtctttccaagagatctcatttcatttactattgtaataaatctggcatacatctcatcaatggtt 22903734  T
Q  320 tcattttcactcattttaaagactt 344  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||    
T  22903733 tcattctcactcatttcaaagactt 22903709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 207 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 1792261 - 1792120
Alignment:
Q  207 ttggaagacatcttaatatttttctgattctatcatgagtggaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacat 306  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||| || || || ||||| |  |||||||| ||||| | |||||||||||| |  || |||||||  |||||    
T  1792261 ttggaagacatcttagtatttttcttattctgtcgtgggtagaataagtttttccaagtgatcttagttcatttactatagatgtgaatctagagtacat 1792162  T
Q  307 ctcatcaatggtttcattttcactcattttaaagacttcaaa 348  Q
     ||||||||| |||||| |||| |||||| ||||| ||||||    
T  1792161 ttcatcaatgttttcatcttcaatcatttcaaagatttcaaa 1792120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 3)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 20 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 16156777 - 16156449
Alignment:
Q  20 acatcatcatcagctattgatgagatttgttgagatgctttcaaagcaagtgtttttaccttcttcactggtttatctccttgaagtacaacttcatgag 119  Q
    ||||| |||||||| | ||||| | |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  16156777 acatcttcatcagcaactgatggggtttgctgagatgctttcaaagcaggtgtttttaccttcttcactggtttgtctcgttgaagtacaacttcatgag 16156678  T
Q  120 ctcttagtgaaccaatgagatctttcaggttcatagattttaaatttttggcctgagtaattgttgtgaccatatgtcctcacacacttggaagacatct 219  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||  ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  16156677 ctcttagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatcttttgcctgagtgattgcagtgaccataggtctccacacacttggaagacatct 16156578  T
Q  220 taatatttttctgattctatcatgagtggaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtt 319  Q
     | ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16156577 cagtatttttctaattttatcatgagtagaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctggcatacatctcatcaatggtt 16156478  T
Q  320 tcattttcactcattttaaagacttcaaa 348  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16156477 tcattttcactcatttcaaagacttcaaa 16156449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 20 - 348
Target Start/End: Original strand, 1987636 - 1987964
Alignment:
Q  20 acatcatcatcagctattgatgagatttgttgagatgctttcaaagcaagtgtttttaccttcttcactggtttatctccttgaagtacaacttcatgag 119  Q
    |||||||| |||| || |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1987636 acatcatcttcagttactgatgagatttgctgagaggctttcaaggcaagtgactttaccttctttactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgag 1987735  T
Q  120 ctcttagtgaaccaatgagatctttcaggttcatagattttaaatttttggcctgagtaattgttgtgaccatatgtcctcacacacttggaagacatct 219  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||| |||   ||||||||| |||  |||| ||||||||| |||||    
T  1987736 ctcttagtgaaccaatgagatcttccagattcatagatttcaaatctttggcctgagtgatttcagtgaccataggtctccacatacttggaagtcatct 1987835  T
Q  220 taatatttttctgattctatcatgagtggaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtt 319  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1987836 caatatttttctgattctctcatgagtggaatatgcttttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctggcatacatctcatcaatggtt 1987935  T
Q  320 tcattttcactcattttaaagacttcaaa 348  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1987936 tcattttcactcatttcaaagacttcaaa 1987964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 49 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 22960191 - 22959894
Alignment:
Q  49 ttgagatgctttcaaagcaagtgtttttaccttcttcactggtttatctccttgaagtacaacttcatgagctcttagtgaaccaatgagatctttcagg 148  Q
    |||||| ||||| || | ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||      
T  22960191 ttgagaagcttttaaggtaagtgattttaccttcctcactggtttatctccttaaagtataacttcatgagctcttagtgaacca-tgagttcttccaaa 22960093  T
Q  149 ttcatagattttaaatttttggcctgagtaattgttgtgaccatatgtcctcacacacttggaagacatcttaatatttttctgattctatcatgagtgg 248  Q
     ||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||| |||  || | ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||    
T  22960092 gtcaaagagtttaaatctttggcttgagtaattgcagtgaccataggtctccatatacttggaagacatcttagtatcttcctgattctatcatgagtgg 22959993  T
Q  249 aatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtttcattttcactcattttaaagacttcaa 347  Q
     |||| | || || ||| ||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  22959992 tatatactttgcccagatatctcatttcattcactattgttgtgaatctatcatacatttcatcaatggtttcattttcactcatttcaaagatttcaa 22959894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 223; Significance: 1e-123; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 22 - 348
Target Start/End: Original strand, 6017 - 6343
Alignment:
Q  22 atcatcatcagctattgatgagatttgttgagatgctttcaaagcaagtgtttttaccttcttcactggtttatctccttgaagtacaacttcatgagct 121  Q
    |||||| |||| || ||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6017 atcatcttcagttactgatgaggtttgctgagaggctttcaaggcaagtgactttaccttctttactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgagct 6116  T
Q  122 cttagtgaaccaatgagatctttcaggttcatagattttaaatttttggcctgagtaattgttgtgaccatatgtcctcacacacttggaagacatctta 221  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||  ||||||||| |||  |||| ||||||||||||||| |    
T  6117 ctcagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagatttcaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtctccacatacttggaagacatctca 6216  T
Q  222 atatttttctgattctatcatgagtggaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtttc 321  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6217 atatttttctgattctctcatgagtggaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctggcatacatctcatcaatggtttc 6316  T
Q  322 attttcactcattttaaagacttcaaa 348  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||    
T  6317 attttcactcatttcaaagacttcaaa 6343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 20 - 348
Target Start/End: Original strand, 52979 - 53305
Alignment:
Q  20 acatcatcatcagctattgatgagatttgttgagatgctttcaaagcaagtgtttttaccttcttcactggtttatctccttgaagtacaacttcatgag 119  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  52979 acatcatcatcagctactgatgagctttgatgagatgctttcaaggcaagtgttttcaccttcttcactagtttgtctccttgaagtataacttcatgag 53078  T
Q  120 ctcttagtgaaccaatgagatctttcaggttcatagattttaaatttttggcctgagtaattgttgtgaccatatgtcctcacacacttggaagacatct 219  Q
    |||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||  || | |||||||||||||||    
T  53079 ctctcagtgatccaatgagatcttcgaggttcatagattttaaatctttggcctgagtaattgcagtgaccataggtctccatatacttggaagacatct 53178  T
Q  220 taatatttttctgattctatcatgagtggaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtt 319  Q
       |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53179 --ctatttttctgattctatcatgagtagaatatgcctttccaagagatctcatatcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtt 53276  T
Q  320 tcattttcactcattttaaagacttcaaa 348  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  53277 tcattttcactcatttcaaagacttcaaa 53305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0313 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 2)
Name: scaffold0313
Description:

Target: scaffold0313; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 22 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 7661 - 7335
Alignment:
Q  22 atcatcatcagctattgatgagatttgttgagatgctttcaaagcaagtgtttttaccttcttcactggtttatctccttgaagtacaacttcatgagct 121  Q
    |||||| |||| || ||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7661 atcatcttcagttactgatgaggtttgctgagaggctttcaaggcaagtgactttaccttctttactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgagct 7562  T
Q  122 cttagtgaaccaatgagatctttcaggttcatagattttaaatttttggcctgagtaattgttgtgaccatatgtcctcacacacttggaagacatctta 221  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||  ||||||||| |||  |||| ||||||||||||||| |    
T  7561 ctcagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagatttcaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtctccacatacttggaagacatctca 7462  T
Q  222 atatttttctgattctatcatgagtggaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtttc 321  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7461 atatttttctgattctctcatgagtggaatatgcttttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctggcatacatctcatcaatggtttc 7362  T
Q  322 attttcactcattttaaagacttcaaa 348  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||    
T  7361 attttcactcatttcaaagacttcaaa 7335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0313; HSP #2
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 22 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 11443 - 11117
Alignment:
Q  22 atcatcatcagctattgatgagatttgttgagatgctttcaaagcaagtgtttttaccttcttcactggtttatctccttgaagtacaacttcatgagct 121  Q
    |||||| |||| || ||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11443 atcatcttcagttactgatgaggtttgctgagaggctttcaaggcaagtgactttaccttctttactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgagct 11344  T
Q  122 cttagtgaaccaatgagatctttcaggttcatagattttaaatttttggcctgagtaattgttgtgaccatatgtcctcacacacttggaagacatctta 221  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||  ||||||||| |||  |||| ||||||||||||||| |    
T  11343 ctcagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagatttcaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtctccacatacttggaagacatctca 11244  T
Q  222 atatttttctgattctatcatgagtggaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtttc 321  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11243 atatttttctgattctctcatgagtggaatatgcttttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctggcatacatctcatcaatggtttc 11144  T
Q  322 attttcactcattttaaagacttcaaa 348  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||    
T  11143 attttcactcatttcaaagacttcaaa 11117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 45 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 17088 - 16795
Alignment:
Q  45 tttgttgagatgctttcaaagcaagtgtttttaccttcttcactggtttatctccttgaagtacaacttcatgagctcttagtgaaccaatgagatcttt 144  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  17088 tttgttgagatgctttcaaggaaagtgattttacctttttcactggtttgtctttttgaagtacaacttcatgagctctcagtgaaccaatgagatcttc 16989  T
Q  145 caggttcatagattttaaatttttggcctgagtaattgttgtgaccatatgtcctcacacacttggaagacatcttaatatttttctgattctatcatga 244  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||   ||||| |||  |||| |||||     ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  16988 aaggttcatagattttaaatctttggcctgagtaa---ttgcatccataggtctccacatacttg-----catctcaatatttttctgattctttcatga 16897  T
Q  245 gtggaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtttcattttcactcattttaaagactt 344  Q
    ||||||||| | |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||    
T  16896 gtggaatatacttttcgaagagacctcatctcatttactattgtagtaaatctaaaatacatttcatcaatagtttcattctcactcatttcaaagactt 16797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0611 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0611
Description:

Target: scaffold0611; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 22 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 210 - 1
Alignment:
Q  22 atcatcatcagctattgatgagatttgttgagatgctttcaaagcaagtgtttttaccttcttcactggtttatctccttgaagtacaacttcatgagct 121  Q
    |||||||||||| | ||||||  |||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  210 atcatcatcagcaactgatgaactttgctgagatgctttcaaggaaagtgtttttaccttcttcactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgagct 111  T
Q  122 cttagtgaaccaatgagatctttcaggttcatagattttaaatttttggcctgagtaattgttgtgaccatatgtcctcacacacttggaagacatctta 221  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||||||| |||  || | ||||||||||||||| |    
T  110 ctcagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctaagtaattgcagtgaccataggtctccaaatacttggaagacatctca 11  T
Q  222 atatttttct 231  Q
    ||||||||||    
T  10 atatttttct 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 128; Significance: 4e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 149 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 290 - 91
Alignment:
Q  149 ttcatagattttaaatttttggcctgagtaattgttgtgaccatatgtcctcacacacttggaagacatcttaatatttttctgattctatcatgagtgg 248  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||  ||||||||| |||  |||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  290 ttcatagatttcaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtctccacatacttggaagacatctcattatttttcttattctttcatgagtgg 191  T
Q  249 aatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtttcattttcactcattttaaagacttcaaa 348  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  190 aatatgcttttctaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctttcatacatctcatcaatggtttcattttcactcatttcaaagacttcaaa 91  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 185 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 20504 - 20341
Alignment:
Q  185 gtgaccatatgtcctcacacacttggaagacatcttaatatttttctgattctatcatgagtggaatatgcctttccaagagatctcatttcatttacta 284  Q
    ||||||||| |||  ||||  ||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20504 gtgaccataggtctccacattcttggaagacatcttagaatctttctgattctctcatgagtggaatatgcctttccaagagatctcatttcatttacta 20405  T
Q  285 ttgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtttcattttcactcattttaaagacttcaaa 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  20404 ttgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtttcattttcactcatttcaaagagttcaaa 20341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 20 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 27839 - 27670
Alignment:
Q  20 acatcatcatcagctattgatgagatttgttgagatgctttcaaagcaagtgtttttaccttcttcactggtttatctccttgaagtacaacttcatgag 119  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  27839 acatcatcatcagctactgatgaggtttgctgagaagctttcaaggcaagtgattttaccttcttcactggtttgtctccttgaagtataacttcatgag 27740  T
Q  120 ctcttagtgaaccaatgagatctttcaggttcatagattttaaatttttggcctgagtaattgttgtgac 189  Q
    |||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||    
T  27739 ctctcaatgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatctttgatctgagtaattgtagtgac 27670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 20 - 189
Target Start/End: Original strand, 86973 - 87142
Alignment:
Q  20 acatcatcatcagctattgatgagatttgttgagatgctttcaaagcaagtgtttttaccttcttcactggtttatctccttgaagtacaacttcatgag 119  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  86973 acatcatcatcagctactgatgaggtttgctgagaagctttcaaggcaagtgattttaccttcttcactggtttgtctccttgaagtataacttcatgag 87072  T
Q  120 ctcttagtgaaccaatgagatctttcaggttcatagattttaaatttttggcctgagtaattgttgtgac 189  Q
    |||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||    
T  87073 ctctcaatgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatctttgatctgagtaattgtagtgac 87142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 99; Significance: 8e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 49 - 347
Target Start/End: Original strand, 189004 - 189301
Alignment:
Q  49 ttgagatgctttcaaagcaagtgtttttaccttcttcactggtttatctccttgaagtacaacttcatgagctcttagtgaaccaatgagatctttcagg 148  Q
    |||||| ||||| || ||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||      
T  189004 ttgagaagcttttaaggcaagtgattttacctttctcattggtttatctccttaaagtataacttcatgagctcttagtgaacca-tgagtacttccaaa 189102  T
Q  149 ttcatagattttaaatttttggcctgagtaattgttgtgaccatatgtcctcacacacttggaagacatcttaatatttttctgattctatcatgagtgg 248  Q
     ||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||| | |  ||   ||||||||||||||||| ||| || || |||||||||||||||     
T  189103 gtcaaagagtttaaatctttggcttgagtaattgcagtgaccataggcctccatgtacttggaagacatcttagtatcttcctaattctatcatgagtgc 189202  T
Q  249 aatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtttcattttcactcattttaaagacttcaa 347  Q
     |||| | || || ||| ||||||||||||| |||||||| || |||||| |||| || | |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  189203 tatatactttgcccagatatctcatttcattcactattgttgtgaatctatcatatattttatcaatggtttcattttcactcatttcaaagatttcaa 189301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 258204 - 258158
Alignment:
Q  207 ttggaagacatcttaatatttttctgattctatcatgagtggaatat 253  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  258204 ttgggagacatcttaatatttttctgattctgtcatgaggggaatat 258158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 206 - 348
Target Start/End: Original strand, 102918 - 103060
Alignment:
Q  206 cttggaagacatcttaatatttttctgattctatcatgagtggaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcataca 305  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||| ||| |  |||||||| ||||| | |||||| || || |  || ||||| |  ||||    
T  102918 cttggaagacatcttaagatttttcttatccgatcatgagtggtataagtttttccaagtgatcttaattcattcacaatagatgtgaatctggagtaca 103017  T
Q  306 tctcatcaatggtttcattttcactcattttaaagacttcaaa 348  Q
    | ||||||||| | |||| |||  |||||| ||||| ||||||    
T  103018 tttcatcaatgttctcatcttcgttcatttcaaagatttcaaa 103060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University