View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF21649_high_2 (Length: 439)

Name: NF21649_high_2
Description: NF21649
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF21649_high_2
NF21649_high_2
[»] chr6 (44 HSPs)
chr6 (9-414)||(27623520-27623927)
chr6 (9-415)||(27284175-27284581)
chr6 (9-397)||(13518007-13518395)
chr6 (9-415)||(8899512-8899918)
chr6 (9-415)||(27355924-27356330)
chr6 (9-415)||(34458321-34458725)
chr6 (9-415)||(33370244-33370650)
chr6 (9-399)||(16755815-16756206)
chr6 (9-398)||(4763759-4764148)
chr6 (9-398)||(28166490-28166880)
chr6 (9-415)||(29555537-29555943)
chr6 (9-397)||(27491130-27491518)
chr6 (9-399)||(27063477-27063866)
chr6 (9-415)||(22928694-22929102)
chr6 (9-415)||(26772442-26772847)
chr6 (9-415)||(26110224-26110629)
chr6 (9-397)||(16680136-16680525)
chr6 (9-415)||(4539571-4539978)
chr6 (9-404)||(30551813-30552208)
chr6 (9-399)||(26791811-26792201)
chr6 (9-391)||(29579018-29579399)
chr6 (9-398)||(29507412-29507803)
chr6 (9-415)||(28213433-28213840)
chr6 (9-415)||(27200165-27200571)
chr6 (9-415)||(27248662-27249068)
chr6 (9-398)||(4778876-4779266)
chr6 (9-415)||(4531267-4531673)
chr6 (9-391)||(13292764-13293140)
chr6 (9-376)||(16937838-16938204)
chr6 (9-399)||(14139213-14139597)
chr6 (9-399)||(27013728-27014111)
chr6 (9-399)||(26926763-26927137)
chr6 (9-398)||(27031019-27031405)
chr6 (9-313)||(26666471-26666774)
chr6 (9-399)||(27208899-27209285)
chr6 (9-399)||(27239943-27240329)
chr6 (9-399)||(24869705-24870089)
chr6 (9-398)||(27025141-27025526)
chr6 (9-398)||(24299573-24299957)
chr6 (9-398)||(15406346-15406731)
chr6 (9-398)||(15418133-15418518)
chr6 (23-377)||(20174566-20174930)
chr6 (23-377)||(22161061-22161425)
chr6 (318-415)||(23851450-23851547)
[»] chr3 (57 HSPs)
chr3 (9-415)||(32296574-32296981)
chr3 (9-398)||(5727940-5728330)
chr3 (9-398)||(47029415-47029805)
chr3 (9-398)||(5717030-5717420)
chr3 (9-398)||(5764038-5764428)
chr3 (9-398)||(10649033-10649422)
chr3 (9-415)||(29658877-29659283)
chr3 (9-399)||(8217593-8217985)
chr3 (9-404)||(4340585-4340980)
chr3 (9-415)||(29142663-29143072)
chr3 (9-376)||(31958364-31958733)
chr3 (9-415)||(4629730-4630135)
chr3 (9-399)||(5472949-5473338)
chr3 (9-415)||(21680646-21681051)
chr3 (9-376)||(5603222-5603591)
chr3 (9-376)||(24334157-24334526)
chr3 (9-415)||(28109860-28110271)
chr3 (9-398)||(51787984-51788373)
chr3 (9-398)||(4790542-4790932)
chr3 (9-415)||(18248683-18249089)
chr3 (9-398)||(4422880-4423269)
chr3 (9-415)||(16422128-16422534)
chr3 (9-399)||(10402110-10402499)
chr3 (9-399)||(22381490-22381879)
chr3 (9-415)||(28027236-28027640)
chr3 (9-415)||(20570755-20571161)
chr3 (9-399)||(17970775-17971163)
chr3 (9-398)||(18231155-18231544)
chr3 (9-415)||(48471872-48472282)
chr3 (9-398)||(5019675-5020063)
chr3 (9-404)||(17978859-17979255)
chr3 (9-391)||(18286264-18286645)
chr3 (9-391)||(18301565-18301946)
chr3 (9-399)||(20071994-20072386)
chr3 (9-404)||(5590270-5590665)
chr3 (10-415)||(16618399-16618808)
chr3 (9-376)||(28345155-28345521)
chr3 (9-399)||(22864757-22865145)
chr3 (9-399)||(22879816-22880204)
chr3 (9-398)||(11104270-11104660)
chr3 (9-399)||(6536652-6537042)
chr3 (9-399)||(7079183-7079578)
chr3 (9-398)||(18057222-18057614)
chr3 (9-398)||(31030154-31030536)
chr3 (9-391)||(6207869-6208247)
chr3 (9-397)||(18336591-18336973)
chr3 (9-415)||(19700431-19700849)
chr3 (9-391)||(4727602-4727978)
chr3 (9-392)||(32445122-32445496)
chr3 (9-398)||(15735009-15735393)
chr3 (9-391)||(35886733-35887111)
chr3 (9-398)||(4689613-4689996)
chr3 (9-399)||(5658095-5658482)
chr3 (9-398)||(8283367-8283767)
chr3 (9-260)||(15886650-15886895)
chr3 (289-399)||(15886894-15887006)
chr3 (313-398)||(8002522-8002607)
[»] chr5 (49 HSPs)
chr5 (9-403)||(3795539-3795934)
chr5 (9-398)||(30174471-30174861)
chr5 (9-397)||(33881133-33881521)
chr5 (9-397)||(18369298-18369686)
chr5 (9-391)||(11555367-11555748)
chr5 (9-415)||(33298522-33298932)
chr5 (9-399)||(37760987-37761378)
chr5 (9-415)||(22894405-22894810)
chr5 (9-398)||(41680710-41681100)
chr5 (9-415)||(28953546-28953952)
chr5 (9-392)||(43084270-43084653)
chr5 (9-384)||(18494534-18494908)
chr5 (9-415)||(37352410-37352816)
chr5 (9-399)||(28655247-28655638)
chr5 (9-390)||(30158048-30158429)
chr5 (9-398)||(40467319-40467708)
chr5 (9-415)||(32590042-32590447)
chr5 (9-404)||(6880303-6880699)
chr5 (9-397)||(8659238-8659625)
chr5 (9-399)||(9544473-9544864)
chr5 (9-399)||(37746088-37746484)
chr5 (9-398)||(13180559-13180944)
chr5 (9-397)||(11329644-11330034)
chr5 (9-397)||(24729977-24730365)
chr5 (9-391)||(23631982-23632366)
chr5 (9-415)||(9323466-9323871)
chr5 (9-398)||(13318594-13318982)
chr5 (9-404)||(33522382-33522778)
chr5 (9-399)||(13436440-13436836)
chr5 (9-415)||(2517054-2517461)
chr5 (9-415)||(12138165-12138570)
chr5 (9-415)||(31820176-31820580)
chr5 (9-399)||(15752624-15753008)
chr5 (9-399)||(37665252-37665642)
chr5 (9-399)||(30035431-30035820)
chr5 (9-398)||(34622524-34622914)
chr5 (9-399)||(18122182-18122572)
chr5 (9-399)||(5643805-5644193)
chr5 (9-415)||(26486385-26486780)
chr5 (9-399)||(31437469-31437852)
chr5 (9-415)||(25206266-25206679)
chr5 (9-415)||(25270422-25270835)
chr5 (9-399)||(22992890-22993272)
chr5 (9-399)||(15652526-15652914)
chr5 (9-392)||(23897886-23898263)
chr5 (9-399)||(33783492-33783877)
chr5 (9-392)||(24975861-24976238)
chr5 (9-399)||(24608250-24608636)
chr5 (9-398)||(30940642-30941025)
[»] scaffold0418 (1 HSPs)
scaffold0418 (9-399)||(12034-12423)
[»] chr4 (27 HSPs)
chr4 (9-398)||(20332288-20332678)
chr4 (9-415)||(39856630-39857034)
chr4 (9-398)||(40099502-40099892)
chr4 (9-398)||(27157178-27157569)
chr4 (9-398)||(24586227-24586617)
chr4 (9-397)||(14104554-14104941)
chr4 (9-415)||(18794483-18794889)
chr4 (9-397)||(30759775-30760161)
chr4 (9-397)||(33667669-33668055)
chr4 (9-399)||(54839400-54839789)
chr4 (9-399)||(14753360-14753749)
chr4 (9-399)||(5700549-5700939)
chr4 (9-399)||(34182830-34183218)
chr4 (9-404)||(21975708-21976103)
chr4 (9-415)||(1906245-1906656)
chr4 (9-415)||(5011870-5012277)
chr4 (9-404)||(31120376-31120772)
chr4 (9-399)||(36338392-36338774)
chr4 (9-399)||(24118672-24119061)
chr4 (9-415)||(15233809-15234219)
chr4 (9-415)||(15276495-15276904)
chr4 (10-415)||(15380105-15380510)
chr4 (9-391)||(6575879-6576253)
chr4 (9-391)||(1673877-1674260)
chr4 (9-398)||(17019062-17019447)
chr4 (9-318)||(36324183-36324484)
chr4 (9-398)||(14671026-14671412)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (9-415)||(3045-3453)
scaffold0159 (9-254)||(17949-18196)
[»] chr2 (41 HSPs)
chr2 (9-398)||(254508-254897)
chr2 (9-398)||(37945721-37946111)
chr2 (9-399)||(27809697-27810089)
chr2 (9-398)||(16167475-16167864)
chr2 (9-399)||(12592806-12593200)
chr2 (9-398)||(13930400-13930791)
chr2 (9-391)||(12661543-12661924)
chr2 (9-399)||(3788490-3788879)
chr2 (9-376)||(22921999-22922368)
chr2 (9-398)||(37931369-37931765)
chr2 (9-399)||(37383673-37384063)
chr2 (9-376)||(39896088-39896454)
chr2 (9-415)||(40239489-40239894)
chr2 (9-376)||(19410340-19410709)
chr2 (9-415)||(27782212-27782618)
chr2 (9-415)||(12710457-12710863)
chr2 (9-398)||(27122522-27122909)
chr2 (9-397)||(34867681-34868068)
chr2 (9-398)||(9343843-9344232)
chr2 (9-398)||(39045678-39046067)
chr2 (9-415)||(37679747-37680155)
chr2 (9-415)||(37695012-37695420)
chr2 (9-404)||(21697029-21697427)
chr2 (9-404)||(16823193-16823588)
chr2 (9-404)||(16897892-16898287)
chr2 (9-398)||(31882284-31882672)
chr2 (9-415)||(11629041-11629446)
chr2 (9-415)||(21671026-21671435)
chr2 (9-399)||(34160840-34161232)
chr2 (9-399)||(32055798-32056187)
chr2 (9-347)||(31868642-31868979)
chr2 (9-399)||(34297152-34297535)
chr2 (10-415)||(27396303-27396718)
chr2 (9-415)||(19450274-19450689)
chr2 (9-399)||(34268782-34269167)
chr2 (9-399)||(28888275-28888660)
chr2 (9-399)||(27428309-27428692)
chr2 (9-398)||(23122434-23122818)
chr2 (9-398)||(20843909-20844298)
chr2 (9-198)||(23116993-23117182)
chr2 (342-398)||(31887682-31887738)
[»] chr8 (24 HSPs)
chr8 (9-404)||(28355778-28356176)
chr8 (9-399)||(9360620-9361009)
chr8 (9-398)||(31360527-31360916)
chr8 (9-398)||(33248365-33248753)
chr8 (9-399)||(18796704-18797095)
chr8 (9-376)||(31483698-31484067)
chr8 (9-415)||(19680430-19680835)
chr8 (9-403)||(29835317-29835710)
chr8 (9-398)||(44566979-44567371)
chr8 (9-415)||(12086551-12086958)
chr8 (9-398)||(15773573-15773962)
chr8 (9-399)||(18715478-18715870)
chr8 (9-391)||(21341998-21342381)
chr8 (9-391)||(19910990-19911374)
chr8 (48-399)||(33264729-33265079)
chr8 (9-415)||(19202203-19202598)
chr8 (10-415)||(22074758-22075164)
chr8 (9-415)||(27602742-27603141)
chr8 (139-415)||(16260205-16260480)
chr8 (9-399)||(19655175-19655562)
chr8 (9-398)||(2131096-2131479)
chr8 (9-399)||(22138904-22139288)
chr8 (9-398)||(19694094-19694479)
chr8 (9-373)||(14569180-14569542)
[»] chr1 (11 HSPs)
chr1 (9-398)||(3647147-3647536)
chr1 (9-398)||(10968666-10969056)
chr1 (9-390)||(10951100-10951482)
chr1 (9-397)||(28591085-28591472)
chr1 (9-415)||(20334281-20334689)
chr1 (33-415)||(51644204-51644588)
chr1 (9-398)||(41787175-41787566)
chr1 (9-399)||(28155726-28156118)
chr1 (9-415)||(16201893-16202307)
chr1 (9-415)||(20466761-20467175)
chr1 (9-415)||(21891628-21892020)
[»] chr7 (32 HSPs)
chr7 (9-398)||(26678856-26679246)
chr7 (9-415)||(5141086-5141493)
chr7 (9-398)||(26663664-26664054)
chr7 (9-409)||(26441238-26441639)
chr7 (9-415)||(16745272-16745679)
chr7 (9-376)||(4138997-4139366)
chr7 (9-398)||(39206891-39207280)
chr7 (9-404)||(24586287-24586682)
chr7 (9-391)||(5164387-5164769)
chr7 (9-398)||(26518789-26519176)
chr7 (9-398)||(31558146-31558535)
chr7 (9-399)||(5154079-5154468)
chr7 (9-415)||(11446867-11447273)
chr7 (33-399)||(26509471-26509839)
chr7 (9-415)||(16047294-16047697)
chr7 (9-401)||(16443755-16444148)
chr7 (9-415)||(26268837-26269247)
chr7 (9-398)||(2160566-2160957)
chr7 (9-397)||(45393216-45393604)
chr7 (9-399)||(45737296-45737688)
chr7 (9-415)||(4205368-4205774)
chr7 (9-415)||(3451297-3451704)
chr7 (9-391)||(11418531-11418913)
chr7 (9-415)||(26313601-26314006)
chr7 (9-415)||(31084374-31084781)
chr7 (9-312)||(26595750-26596055)
chr7 (9-399)||(2779247-2779631)
chr7 (9-399)||(31129900-31130284)
chr7 (9-415)||(10847562-10847970)
chr7 (9-398)||(10910678-10911061)
chr7 (11-399)||(16512194-16512576)
chr7 (313-398)||(26531926-26532011)
[»] scaffold0547 (1 HSPs)
scaffold0547 (9-399)||(9508-9897)
[»] scaffold0792 (1 HSPs)
scaffold0792 (9-399)||(4469-4862)
[»] scaffold0322 (2 HSPs)
scaffold0322 (9-415)||(1639-2045)
scaffold0322 (9-415)||(12028-12445)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (9-398)||(18584-18975)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (9-399)||(8795-9184)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (9-415)||(15551-15964)
[»] scaffold0143 (2 HSPs)
scaffold0143 (9-399)||(9912-10301)
scaffold0143 (9-399)||(33295-33682)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (9-415)||(13931-14338)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (10-415)||(25097-25510)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (9-398)||(6065-6451)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (9-391)||(24772-25150)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (9-183)||(1-175)
[»] scaffold0288 (1 HSPs)
scaffold0288 (237-415)||(359-537)
[»] scaffold0241 (1 HSPs)
scaffold0241 (253-415)||(26243-26405)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (9-391)||(40495-40898)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 360; Significance: 0; HSPs: 44)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 414
Target Start/End: Original strand, 27623520 - 27623927
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27623520 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 27623619  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaag-aaaatgttttgtata 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27623620 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaatttttaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaaatgttttgtata 27623719  T
Q  208 tagctttgaaagtagaag-aaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 306  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27623720 tagctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 27623819  T
Q  307 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagcacagaaac 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | |||||| |||||||||||| |||||| |    
T  27623820 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagc 27623919  T
Q  407 ttctgatg 414  Q
    ||||||||    
T  27623920 ttctgatg 27623927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 415
Target Start/End: Original strand, 27284175 - 27284581
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27284175 accacagactatcctggggaagagcctgtttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 27284274  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27284275 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 27284374  T
Q  209 agctttgaaagtagaag-aaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 307  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  27284375 agctttgaaagtagaagaaaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 27284473  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagcacagaaact 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||    
T  27284474 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaagct 27284573  T
Q  408 tctgatga 415  Q
    || |||||    
T  27284574 tcagatga 27284581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 397
Target Start/End: Original strand, 13518007 - 13518395
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    |||||||||||||| || | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13518007 accacagactatcccggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 13518106  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13518107 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 13518206  T
Q  209 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 308  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13518207 agctttgaaagtggaaaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 13518306  T
Q  309 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaag 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  13518307 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaag 13518395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 415
Target Start/End: Original strand, 8899512 - 8899918
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8899512 accacagactatcctggaggagaacctgtttgtaacatatattgaaatagacatcaacataccctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 8899611  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaat-gttttgtata 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  8899612 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtata 8899711  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 307  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8899712 taactttgaaagtagaag-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 8899810  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagcacagaaact 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | |||||| |||||||||||| |||||| ||    
T  8899811 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagct 8899910  T
Q  408 tctgatga 415  Q
    || |||||    
T  8899911 tcagatga 8899918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 415
Target Start/End: Original strand, 27355924 - 27356330
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27355924 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 27356023  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27356024 ctcaggtttgcttttcaaaatagaccaaaggttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 27356123  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27356124 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 27356222  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagcacagaaact 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| | |||||| |||||||||||| |||||| ||    
T  27356223 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagct 27356322  T
Q  408 tctgatga 415  Q
    | ||||||    
T  27356323 tttgatga 27356330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 9 - 415
Target Start/End: Original strand, 34458321 - 34458725
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34458321 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 34458420  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34458421 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaaccattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 34458519  T
Q  209 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 308  Q
    ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34458520 agcttagaaaatagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 34458618  T
Q  309 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagcacagaaactt 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| | |||||| |||||||||||| |||||| |||    
T  34458619 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagctt 34458718  T
Q  409 ctgatga 415  Q
     ||||||    
T  34458719 ttgatga 34458725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 9 - 415
Target Start/End: Original strand, 33370244 - 33370650
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33370244 accacagactatcctggaggagagcctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 33370343  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 207  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  33370344 ctcaggttcgcttttcaaaatagacaaaaaaatttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaagagaaagaaaatgctttgtata 33370443  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 307  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33370444 tagctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 33370542  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagcacagaaact 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| | |||||| |||||||||||| |||||| ||    
T  33370543 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagct 33370642  T
Q  408 tctgatga 415  Q
    | ||||||    
T  33370643 tttgatga 33370650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 9 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 16756206 - 16755815
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16756206 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 16756107  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaat--gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtat 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16756106 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattgtcaaaatatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtat 16756007  T
Q  207 atagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  16756006 atagctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagcggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 16755908  T
Q  307 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagca 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  16755907 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagca 16755815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 9 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 4764148 - 4763759
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4764148 accacagactatcctgaaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 4764049  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  4764048 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtata 4763949  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 307  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  4763948 tagctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 4763850  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagc 398  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||| ||||||| |||||    
T  4763849 ttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagc 4763759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 9 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 28166880 - 28166490
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28166880 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 28166781  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa--tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtat 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||    
T  28166780 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaataaattgtat 28166681  T
Q  207 atagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  28166680 atagctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtatgagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 28166582  T
Q  307 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagc 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||| |||||    
T  28166581 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttggattcgcaagc 28166490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 9 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 29555943 - 29555537
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| |  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29555943 accacagactatcctggaggggaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 29555844  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 207  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29555843 ttcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagcttttaattttctaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 29555744  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 307  Q
    |||||||||||||| ||  |||| ||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  29555743 tagctttgaaagtaaaaagaaaacagagttt-cagacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgcgactccacggat 29555645  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagcacagaaact 407  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  29555644 ttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaact 29555545  T
Q  408 tctgatga 415  Q
    ||||||||    
T  29555544 tctgatga 29555537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 9 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 27491518 - 27491130
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27491518 accacagactatcctggaggagaacttgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 27491419  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27491418 ctcaggtttgcttttcaaaatagaccaaaggttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 27491319  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 307  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27491318 cagctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggat 27491220  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaag 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| | |||||| ||||||||||||    
T  27491219 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaag 27491130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 9 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 27063866 - 27063477
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27063866 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 27063767  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  27063766 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtata 27063667  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 307  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  27063666 tagctttgaaagtagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 27063569  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagca 399  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  27063568 ttacaaagcttggaaaatggtaattttattagttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcccagaaactttgaattcacaagca 27063477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 9 - 415
Target Start/End: Original strand, 22928694 - 22929102
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  22928694 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctattg 22928793  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagtttt-caattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt--gta 205  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  22928794 ctcaggtttgctttcaaaaatagacaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttttgta 22928893  T
Q  206 tatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgg 305  Q
     ||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||    
T  22928894 catagctttgaaagtagaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcataggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatgg 22928992  T
Q  306 attcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagcacagaaa 405  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||     
T  22928993 atttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcgcaagcacagaag 22929092  T
Q  406 cttctgatga 415  Q
    |||| |||||    
T  22929093 cttcagatga 22929102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 9 - 415
Target Start/End: Original strand, 26772442 - 26772847
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26772442 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacattcacataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttg 26772541  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 207  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26772542 ctcaggtttgtttttcaaaatagacaaaaagttttcaatcttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 26772641  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 307  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26772642 tagctttgaaagtagaagaaaa-tagaattt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggat 26772739  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagcacagaaact 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||  ||||| ||    
T  26772740 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcttagaaactttgaatccacaagtgcagaagct 26772839  T
Q  408 tctgatga 415  Q
    | ||||||    
T  26772840 tttgatga 26772847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 9 - 415
Target Start/End: Original strand, 26110224 - 26110629
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    |||||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26110224 accacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatatggaaatagacattaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 26110323  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 208  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26110324 ctcaggtttgcttttcaaaacagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 26110423  T
Q  209 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 308  Q
    ||||||||||||| ||  |||  |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  26110424 agctttgaaagtaaaaagaaagcagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 26110522  T
Q  309 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagcacagaaactt 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||  ||||| |||    
T  26110523 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcttagaaactttgaatccacaagtgcagaagctt 26110622  T
Q  409 ctgatga 415  Q
     ||||||    
T  26110623 ttgatga 26110629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 9 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 16680525 - 16680136
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16680525 accacagactatcctggaggagaacccgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgtcg 16680426  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaat-gttttgtata 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  16680425 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtata 16680326  T
Q  208 tagctttgaaagtagaag-aaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 306  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  16680325 taactttgaaagtagaagaaaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgacgtataagagtggtggtcagccgacggcgtgactccacgga 16680227  T
Q  307 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaag 397  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  16680226 ttttcaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaag 16680136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 9 - 415
Target Start/End: Original strand, 4539571 - 4539978
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    |||||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4539571 accacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacattaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaacgtaccctgttg 4539670  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 208  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4539671 ctcaggtttgcttttcaaaacagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 4539770  T
Q  209 agctttgaaagt-agaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 307  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4539771 agctttgaaagtaaaaagaaaaatagag-tttcaaacaacagcacaagctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggat 4539869  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagcacagaaac 406  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| | |||||| |||||||||||| |||||| |    
T  4539870 tcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagc 4539969  T
Q  407 ttctgatga 415  Q
    || ||||||    
T  4539970 ttttgatga 4539978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 9 - 404
Target Start/End: Original strand, 30551813 - 30552208
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30551813 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacattcacataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttg 30551912  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtata 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30551913 ctcgggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtata 30552012  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 307  Q
    |||||||||||||| ||  |||| |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30552013 tagctttgaaagtaaaaagaaaacagag-tttcaaacaaaagcacagtctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggat 30552111  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagcacagaa 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||    
T  30552112 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctgggaactttgaatccacaagtacagaa 30552208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 9 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 26792201 - 26791811
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||  | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26792201 accacagactatcctgaaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacattcacataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttg 26792102  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  26792101 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtata 26792002  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 307  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  26792001 tagctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcacaagctcaaattgacgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgattccacggat 26791903  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagca 399  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  26791902 ttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagca 26791811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 9 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 29579399 - 29579018
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||  | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29579399 accacagactatcctgaaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacattcacataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttg 29579300  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaatttt-caaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  29579299 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaatttttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaagatagaaggaaaatgatttgtata 29579200  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 307  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29579199 tagctttgaaaatagaagaaaa-tagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggat 29579102  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaatt 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  29579101 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaatt 29579018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 9 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 29507803 - 29507412
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29507803 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgttccatttgaatgtaccctgttg 29507704  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29507703 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaagagaaagaaaatgttttgtata 29507604  T
Q  208 tagctttgaaagtagaaga--aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgg 305  Q
    |||||||||||||| || |  |||  |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  29507603 tagctttgaaagtaaaaaaagaaagcagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgg 29507505  T
Q  306 attcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagc 398  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||| ||||||| |||||    
T  29507504 atttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagc 29507412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 9 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 28213840 - 28213433
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    |||||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28213840 accacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacattaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaacgtaccctgttg 28213741  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 207  Q
    |||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28213740 ctcaggcttgcttttcaaaacacacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 28213641  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 307  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28213640 cagctttgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaacagcacaagctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggat 28213542  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagcacagaaac 406  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| | |||||| |||||||||||| |||||| |    
T  28213541 tcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagc 28213442  T
Q  407 ttctgatga 415  Q
    || ||||||    
T  28213441 ttttgatga 28213433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 9 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 27200571 - 27200165
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27200571 accacagacta-cctggaggagaacctgcttgtaacatacattgaaatacacatcaacatactctcgttcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 27200473  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaa-aatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtat 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  27200472 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaagaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtac 27200373  T
Q  207 atagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 306  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  27200372 atagctttgaaagtagaag-aaaatagagtttt-aatcaaaagcacaagctcaaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 27200275  T
Q  307 ttcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagcacagaaa 405  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||||| ||||||     
T  27200274 ttcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcttagaaactttgaatccacaagtacagaag 27200175  T
Q  406 cttctgatga 415  Q
    ||| ||||||    
T  27200174 cttttgatga 27200165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 9 - 415
Target Start/End: Original strand, 27248662 - 27249068
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27248662 accacagacta-cctggaggagaacctgcttgtaacatacattgaaatacacatcaacatactctcgttcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 27248760  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaa-aatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtat 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  27248761 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaagaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtac 27248860  T
Q  207 atagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 306  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  27248861 atagctttgaaagtagaag-aaaatagagtttt-aatcaaaagcacaagctcaaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 27248958  T
Q  307 ttcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagcacagaaa 405  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||||| ||||||     
T  27248959 ttcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcttagaaactttgaatccacaagtacagaag 27249058  T
Q  406 cttctgatga 415  Q
    ||| ||||||    
T  27249059 cttttgatga 27249068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 9 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 4779266 - 4778876
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    |||||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4779266 accacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttg 4779168  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4779167 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttcgtata 4779068  T
Q  208 tagcttt-gaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 306  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  4779067 cagcttttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccggaggcgtgactccacgga 4778969  T
Q  307 ttcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagc 398  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  4778968 ttcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaagc 4778876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 9 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 4531673 - 4531267
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaa-atagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgtt 107  Q
    |||||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4531673 accacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaagatagacacccacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgtt 4531575  T
Q  108 gctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtat 206  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  4531574 gctcgggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatggaaagagaatgttttgtat 4531475  T
Q  207 atagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 306  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  4531474 acagctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtgatcagccgaaggcacgactccacgga 4531376  T
Q  307 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagcacagaaac 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||  ||||||||||| |||||| |    
T  4531375 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcccagaaacttcgaattcacaagtacagaagc 4531276  T
Q  407 ttctgatga 415  Q
    || ||||||    
T  4531275 ttttgatga 4531267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 9 - 391
Target Start/End: Original strand, 13292764 - 13293140
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13292764 accacagactatcctggaggagaacctgcttataacatatattgaaatagacaccaacacacgctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 13292863  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 208  Q
    ||||||||||||||||||||     ||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13292864 ctcaggtttgcttttcaaaa-----aaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 13292958  T
Q  209 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  13292959 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 13293057  T
Q  309 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaatt 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||||    
T  13293058 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacggtaatcattacatttcctagaaactttgaatt 13293140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 9 - 376
Target Start/End: Original strand, 16937838 - 16938204
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    |||||||| |||| ||| | ||| |||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16937838 accacagattatcttggaggagaacctgctggtaacatatattgaaatagacaccaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 16937937  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 207  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  16937938 ctcaggtttgcttttcaaaataaacaaaaagttttcagttttcaaaaatgtttgtttcaagcattgccattatcaaaatagaaggaaaataatttgtata 16938037  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 307  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||    
T  16938038 tagctttgaaaatagaagaaaa-tagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcggccgaaggcgtgactccacggat 16938135  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcc 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16938136 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcc 16938204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 9 - 399
Target Start/End: Original strand, 14139213 - 14139597
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    |||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  14139213 accaaagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtctcatttgaatgtaccatgttg 14139312  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 208  Q
    ||||||||||||||||||||     ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14139313 ctcaggtttgcttttcaaaa-----aaaactttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 14139407  T
Q  209 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 308  Q
    ||||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  14139408 agctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 14139506  T
Q  309 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagca 399  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||| ||||||| ||||||    
T  14139507 tacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagca 14139597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 9 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 27014111 - 27013728
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    |||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27014111 accaaagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattaaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtctcatttgaatgtaccctgttg 27014012  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 208  Q
    ||||||||||||||||||||      |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27014011 ctcaggtttgcttttcaaaa------aaactttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 27013918  T
Q  209 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 308  Q
    ||||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  27013917 agctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 27013819  T
Q  309 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagca 399  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||| ||||||| ||||||    
T  27013818 tacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagca 27013728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 9 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 26927137 - 26926763
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||      |||         |||||||||||||||||||||    
T  26927137 accacagactatcctagaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacata------ctc---------tcatttgaatgtaccctgttg 26927053  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||    
T  26927052 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaataaattgtata 26926953  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 307  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  26926952 tagctttgaaagtagaagaaaa-tagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 26926855  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagca 399  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  26926854 ttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagca 26926763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 9 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 27031405 - 27031019
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27031405 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttg 27031307  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt--gta 205  Q
    |||||||||||||||||||| |    |||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||  |||    
T  27031306 ctcaggtttgcttttcaaaaaa----aaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaatagaaggaaaatgttttttgta 27031211  T
Q  206 tatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgg 305  Q
     ||| ||||||||||| ||  |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  27031210 cataactttgaaagtaaaaagaaaacagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgg 27031112  T
Q  306 attcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagc 398  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  27031111 atttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaatacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcacaagc 27031019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 9 - 313
Target Start/End: Original strand, 26666471 - 26666774
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26666471 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacattcacataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttg 26666570  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 207  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26666571 ctcaggtttgtttttcaaaatagacaaaaagttttcaatcttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 26666670  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 307  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26666671 tagctttgaaagtagaag-aaaataga-atttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggat 26666768  T
Q  308 tcacaa 313  Q
    ||||||    
T  26666769 tcacaa 26666774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 9 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 27209285 - 27208899
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  27209285 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcacgtt-catttgaatgtaccctgttg 27209187  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa---tagaaagaaaatgtttt-g 203  Q
    |||| |||||||||||||||       ||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||   ||||| ||||||||||| |    
T  27209186 ctcaagtttgcttttcaaaa-------aactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaaaatagaaggaaaatgtttttg 27209094  T
Q  204 tatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccac 303  Q
    || ||| ||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  27209093 tacataactttgaaagtaaaaagaaaatagagttt-caaacaaaagcacacgctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccac 27208995  T
Q  304 ggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagca 399  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  27208994 ggatttacaaagcttggaaaatggtaattttatgggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagca 27208899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 9 - 399
Target Start/End: Original strand, 27239943 - 27240329
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  27239943 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcacgtt-catttgaatgtaccctgttg 27240041  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa---tagaaagaaaatgtttt-g 203  Q
    |||| |||||||||||||||       ||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||   ||||| ||||||||||| |    
T  27240042 ctcaagtttgcttttcaaaa-------aactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaaaatagaaggaaaatgtttttg 27240134  T
Q  204 tatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccac 303  Q
    || ||| ||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  27240135 tacataactttgaaagtaaaaagaaaatagagttt-caaacaaaagcacacgctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccac 27240233  T
Q  304 ggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagca 399  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  27240234 ggatttacaaagcttggaaaatggtaattttatgggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagca 27240329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 9 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 24870089 - 24869705
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | |||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  24870089 accacagactatcctggaggagaaactgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttg 24869991  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gta 205  Q
    ||||||||||||||||||||       ||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||    
T  24869990 ctcaggtttgcttttcaaaa-------aactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgta 24869898  T
Q  206 tatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgg 305  Q
     ||| ||||||||||| ||  ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  24869897 cataactttgaaagtaaaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgg 24869799  T
Q  306 attcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagca 399  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  24869798 atttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagca 24869705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 9 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 27025526 - 27025141
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  27025526 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactagctcatgcatgtctcgtttgaatgtaccctgttg 27025427  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt--gt 204  Q
    ||||||||||||||||||||       ||  |||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||||  ||    
T  27025426 ctcaggtttgcttttcaaaa-------aactttttcaattttcaagatgcttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgttttttgt 27025334  T
Q  205 atatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacg 304  Q
    | ||| ||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  27025333 acataactttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacg 27025235  T
Q  305 gattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagc 398  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  27025234 gatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcctagagactttgaattcgcaagc 27025141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 9 - 398
Target Start/End: Original strand, 24299573 - 24299957
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||     
T  24299573 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgcttatgcatgtt-catttgaatgtaccctgtta 24299671  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtat 206  Q
    ||||||||||||||||||||     ||||  |||||||||||||| ||||||||| | |||||| |||||||| |||| |||| | ||| ||||| |||     
T  24299672 ctcaggtttgcttttcaaaa-----aaaactttttcaattttcaagatgtttgttccgagcatttgtcattattaaaaaagaagggaaacgtttttgtac 24299766  T
Q  207 atagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 306  Q
    ||| |||||| |||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  24299767 ataactttgagagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 24299865  T
Q  307 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagc 398  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  24299866 tttacaaagcttggaaaatggtaattttatgggttggtgatacattgaacacaacaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagc 24299957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 9 - 398
Target Start/End: Original strand, 15406346 - 15406731
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  15406346 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatacgttgaaatagacaccaacatacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttg 15406444  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gta 205  Q
    ||||||||||||||||||||      ||   ||| |||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||    
T  15406445 ctcaggtttgcttttcaaaa------aactttttccaattttccagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgta 15406538  T
Q  206 tatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgg 305  Q
     ||| ||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  15406539 catatctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgg 15406637  T
Q  306 attcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagc 398  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||| | |||| ||||||| |||||    
T  15406638 atttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtgatacattgaacacagcaatcatgacatttcctaggaactttgaattcgcaagc 15406731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 9 - 398
Target Start/End: Original strand, 15418133 - 15418518
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  15418133 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatacgttgaaatagacaccaacatacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttg 15418231  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gta 205  Q
    ||||||||||||||||||||      ||   ||| |||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||    
T  15418232 ctcaggtttgcttttcaaaa------aactttttccaattttccagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgta 15418325  T
Q  206 tatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgg 305  Q
     ||| ||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  15418326 catatctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgg 15418424  T
Q  306 attcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagc 398  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||| | |||| ||||||| |||||    
T  15418425 atttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtgatacattgaacacagcaatcatgacatttcctaggaactttgaattcgcaagc 15418518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 23 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 20174930 - 20174566
Alignment:
Q  23 tggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttt 122  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||  |     |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  20174930 tggggaaaagcttgcttgtaacacatattgagatatacattgatgcgcactcgctcatgcatgtttcacttgaaagtaccttgttgctaaggtttgcttt 20174831  T
Q  123 tcaaaatagaca-aaaagttttcaat------tttcaaaatgtttgttt-caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatatagctt 213  Q
    |||||||||||| |||| || |  ||      ||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||    
T  20174830 tcaaaatagacagaaaacttcttgatatttttttttagaatgtttgttttcaagcattgtcatcatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtacataactt 20174731  T
Q  214 tgaaagta--gaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcac 311  Q
    || |||||  ||  ||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||    
T  20174730 tggaagtaaagagaaaaaatagagttt-caaacaaaagcacagactcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgggactccatggatttac 20174632  T
Q  312 aaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcct 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||| |||||||    
T  20174631 aaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgagcatggtaaacactatatttcct 20174566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 23 - 377
Target Start/End: Original strand, 22161061 - 22161425
Alignment:
Q  23 tggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttt 122  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||  |     |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  22161061 tggggaaaagcttgcttgtaacacatattgagatatacattgatgcgcactcgctcatgcatgtttcacttgaaagtaccttgttgctaaggtttgcttt 22161160  T
Q  123 tcaaaatagaca-aaaagttttcaat------tttcaaaatgtttgttt-caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatatagctt 213  Q
    |||||||||||| |||| || |  ||      ||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||    
T  22161161 tcaaaatagacagaaaacttcttgatatttttttttagaatgtttgttttcaagcattgtcatcatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtacataactt 22161260  T
Q  214 tgaaagta--gaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcac 311  Q
    || |||||  ||  ||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||    
T  22161261 tggaagtaaagagaaaaaatagagttt-caaacaaaagcacagactcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgggactccatggatttac 22161359  T
Q  312 aaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcct 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||| |||||||    
T  22161360 aaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgagcatggtaaacactatatttcct 22161425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 318 - 415
Target Start/End: Original strand, 23851450 - 23851547
Alignment:
Q  318 tggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagcacagaaacttctgatga 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  23851450 tggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcgcaagcacagaagcttcagatga 23851547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 352; Significance: 0; HSPs: 57)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 32296981 - 32296574
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32296981 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttg 32296882  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32296881 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 32296782  T
Q  209 agctttgaaagtagaaga-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 307  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32296781 agctttgaaagtagaagaaaaaatagaattttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcacgactccacggat 32296682  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagcacagaaact 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||    
T  32296681 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcgcagaaact 32296582  T
Q  408 tctgatga 415  Q
    ||||||||    
T  32296581 tctgatga 32296574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 5728330 - 5727940
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5728330 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 5728231  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5728230 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 5728131  T
Q  209 agctttgaaagtagaaga-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 307  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5728130 agctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 5728031  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagc 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  5728030 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 5727940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 47029805 - 47029415
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47029805 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 47029706  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47029705 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 47029606  T
Q  209 agctttgaaagtagaaga-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 307  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47029605 agctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 47029506  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagc 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  47029505 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 47029415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 5717420 - 5717030
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5717420 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 5717321  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5717320 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 5717221  T
Q  209 agctttgaaagtagaaga-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 307  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5717220 agctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 5717121  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagc 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  5717120 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaagc 5717030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 398
Target Start/End: Original strand, 5764038 - 5764428
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5764038 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 5764137  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5764138 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 5764237  T
Q  209 agctttgaaagtagaag-aaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 307  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5764238 agctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 5764337  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagc 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  5764338 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaagc 5764428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 10649422 - 10649033
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10649422 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 10649323  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaat-gttttgtata 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  10649322 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtata 10649223  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 307  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10649222 taactttgaaagtagaag-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 10649124  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagc 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||    
T  10649123 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacacttcctggaaactttgaattcgcaagc 10649033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 9 - 415
Target Start/End: Original strand, 29658877 - 29659283
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29658877 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 29658976  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29658977 ctcaggtttgcttttcaaaatagaccaaaggttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 29659076  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 307  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29659077 taactttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 29659175  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagcacagaaact 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| | |||||| |||||||||||| |||||| ||    
T  29659176 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagct 29659275  T
Q  408 tctgatga 415  Q
    | ||||||    
T  29659276 tttgatga 29659283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 9 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 8217985 - 8217593
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8217985 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 8217886  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa--tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gta 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  8217885 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaatgtttgtttcgagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgta 8217786  T
Q  206 tatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgg 305  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8217785 tataactttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgg 8217687  T
Q  306 attcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagca 399  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  8217686 atccacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctgaaaactttgaattcgcaagca 8217593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 9 - 404
Target Start/End: Original strand, 4340585 - 4340980
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4340585 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttg 4340684  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 207  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  4340685 ctcaggtttgcttttcaaaataaacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatggaaggaaaatgttttgtata 4340784  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 307  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4340785 tagctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggat 4340883  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagcacagaa 404  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||||| ||||||    
T  4340884 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcttagaaactttgaatccacaagtacagaa 4340980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 9 - 415
Target Start/End: Original strand, 29142663 - 29143072
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29142663 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccatgttg 29142762  T
Q  109 ctcaggtttgcttttc--aaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gta 205  Q
    |||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  29142763 ctcaggtttgttttttcaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgta 29142862  T
Q  206 tatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgg 305  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29142863 tatagctttgaaagtagaaaaaaaatggagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgg 29142962  T
Q  306 attcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagcacagaaa 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | |||||| |||||||||||| ||||||     
T  29142963 attcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaag 29143062  T
Q  406 cttctgatga 415  Q
    |||| |||||    
T  29143063 cttcagatga 29143072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 9 - 376
Target Start/End: Original strand, 31958364 - 31958733
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31958364 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaaggtaccctgttg 31958463  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31958464 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 31958563  T
Q  209 agctttgaaagtagaaga--aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 306  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  31958564 agctttgaaagtagaagaacaaaatagaattttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 31958663  T
Q  307 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcc 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31958664 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcc 31958733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 9 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 4630135 - 4629730
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4630135 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatgttgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttg 4630037  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtata 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  4630036 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtata 4629937  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 307  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4629936 taactttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 4629838  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagcacagaaact 407  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | |||||| |||||||||||| |||||| ||    
T  4629837 taacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagct 4629738  T
Q  408 tctgatga 415  Q
    || |||||    
T  4629737 tcagatga 4629730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 9 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 5473338 - 5472949
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5473338 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 5473239  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  5473238 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaa-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatggaaggaaaatgttttgtata 5473140  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 307  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5473139 tagctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 5473041  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagca 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||| ||||||| ||||||    
T  5473040 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagca 5472949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 9 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 21681051 - 21680646
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21681051 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatgttgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttg 21680953  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtata 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||    
T  21680952 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatggaaagaaaatatttttgtata 21680853  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 307  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21680852 taactttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 21680754  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagcacagaaact 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | |||||| |||||||||||| |||||| ||    
T  21680753 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagct 21680654  T
Q  408 tctgatga 415  Q
    || |||||    
T  21680653 tcagatga 21680646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 9 - 376
Target Start/End: Original strand, 5603222 - 5603591
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  5603222 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgttttatttgaaggtaccctgttg 5603321  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5603322 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 5603421  T
Q  209 agctttgaaagtagaaga--aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 306  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  5603422 agctttgaaagtagaagaacaaaatagaattttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 5603521  T
Q  307 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcc 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5603522 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcc 5603591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 9 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 24334526 - 24334157
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24334526 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaaggtaccctgttg 24334427  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24334426 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtgtat 24334327  T
Q  209 agctttgaaagtagaaga--aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 306  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  24334326 agctttgaaagtagaagaacaaaatagaattttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 24334227  T
Q  307 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcc 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24334226 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcc 24334157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 9 - 415
Target Start/End: Original strand, 28109860 - 28110271
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    |||||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28109860 accacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacaccaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 28109959  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaat----gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgt 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28109960 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaaaacgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgt 28110059  T
Q  205 atatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacg 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28110060 atatagctttgaaagtagaagaaaaatggagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagcccaaggcatgactccacg 28110159  T
Q  305 gattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacattt-cctggaaactctgaattcacaagcacaga 403  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   ||||| |||||||||||| |||||    
T  28110160 gattcataaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaaactttgaattcacaagtacaga 28110259  T
Q  404 aacttctgatga 415  Q
    | |||| |||||    
T  28110260 agcttcagatga 28110271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 9 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 51788373 - 51787984
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51788373 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacattaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 51788274  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 207  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  51788273 ctcaggtttgcttttcaaaataaacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatattttgtata 51788174  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 307  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51788173 tagctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 51788075  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagc 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||    
T  51788074 tcacaaagcttggaaaatggtaattttatcggttggtggtacattgaacacagcaatcattacacttcctggaaactttgaattcgcaagc 51787984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 9 - 398
Target Start/End: Original strand, 4790542 - 4790932
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4790542 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 4790641  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtata 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4790642 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtata 4790741  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  4790742 tagctttgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgaatccacggat 4790840  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagc 398  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  4790841 ttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacggtaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaagc 4790932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 9 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 18249089 - 18248683
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18249089 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 18248990  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18248989 ctcaggtttgcttttcaaaatagaccaaaggttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatg 18248890  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18248889 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttc-caaacaaaagcaaaggctcaacttgatgtataagagtgatggtcagccaaaggcatgactccacggat 18248791  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagcacagaaact 407  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| | |||||| |||||||||||| |||||| ||    
T  18248790 tcacaaagctcggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagct 18248691  T
Q  408 tctgatga 415  Q
    | ||||||    
T  18248690 tttgatga 18248683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 9 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 4423269 - 4422880
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4423269 accacagactatcctgaaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 4423170  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  4423169 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttatttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtata 4423070  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 307  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  4423069 tagctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaacttgatgtataaaagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 4422971  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagc 398  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  4422970 ttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 4422880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 9 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 16422534 - 16422128
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16422534 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 16422435  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagtttt-caattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt--gta 205  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  16422434 ctcaggtttgcttt-caaaatacacaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttttgta 16422336  T
Q  206 tatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgg 305  Q
     ||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  16422335 catagctttgaaagtagaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgg 16422237  T
Q  306 attcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagcacagaaa 405  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||     
T  16422236 atttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcc-ggaaactttgaattcgcaagcacagaag 16422138  T
Q  406 cttctgatga 415  Q
    |||| |||||    
T  16422137 cttcagatga 16422128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 9 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 10402499 - 10402110
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10402499 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 10402400  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10402399 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcgagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 10402300  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 307  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  10402299 tagctttgaaagtagaa-aaaaatagaatttt-aatcaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggtgtgactccacggat 10402202  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagca 399  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  10402201 ttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaagca 10402110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 9 - 399
Target Start/End: Original strand, 22381490 - 22381879
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |    
T  22381490 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtacactgtcg 22381588  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22381589 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 22381688  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  22381689 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 22381787  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagca 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  22381788 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagca 22381879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 9 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 28027640 - 28027236
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28027640 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatacattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 28027541  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||   ||||||||    
T  28027540 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaggaaaataaattgtatat 28027441  T
Q  209 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 308  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28027440 agctttgaaagtagaag-aaaatagaatttt-aaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcctgactccacggatt 28027343  T
Q  309 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagcacagaaactt 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||| |||||| |||||| |||    
T  28027342 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatccacaagtacagaagctt 28027243  T
Q  409 ctgatga 415  Q
     ||||||    
T  28027242 ttgatga 28027236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 9 - 415
Target Start/End: Original strand, 20570755 - 20571161
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20570755 accacagactatcctggaggagaacctgtttgtaacatatattgaaatagacaccaacatacacttgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttg 20570854  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 207  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  20570855 ctcaggtttgcttttcaaaataaacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttatttcaagcattgtcattatcaaaatggaaggaaaatgttttgtata 20570954  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 307  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20570955 tagctttgaaaatagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaacggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 20571053  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagcacagaaact 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| | |||||| |||||||||||| |||||| ||    
T  20571054 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagct 20571153  T
Q  408 tctgatga 415  Q
    | ||||||    
T  20571154 tttgatga 20571161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 9 - 399
Target Start/End: Original strand, 17970775 - 17971163
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17970775 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacgcatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 17970874  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||    
T  17970875 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaataaattgtatat 17970974  T
Q  209 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 308  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  17970975 agctttgaaaatagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 17971072  T
Q  309 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagca 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  17971073 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacgttgaacacagcaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagca 17971163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 9 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 18231544 - 18231155
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18231544 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacattcacataccctcgctcatgcatgtttcatttgactgtaccctgttg 18231445  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18231444 ctcgggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 18231345  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 307  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18231344 tagctttgaaagtagaaagaaaacagagtttt-aaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 18231246  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagc 398  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  18231245 tcgcaaatcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaagc 18231155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 9 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 48472282 - 48471872
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48472282 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 48472183  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaatttt-----caaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttg 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48472182 ctcaggtttgcttttcaaaatagacagaaagttttcaatttttaaaaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttg 48472083  T
Q  204 tatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccac 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||     
T  48472082 tatatagctttgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtatgagagtggtggtcagccgagggcgtgactccat 48471984  T
Q  304 ggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagcacaga 403  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||     
T  48471983 ggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacatcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtagg 48471884  T
Q  404 aacttctgatga 415  Q
    ||||| ||||||    
T  48471883 aacttttgatga 48471872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 9 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 5020063 - 5019675
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    |||||||||||||| || | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5020063 accacagactatcccggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 5019964  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  5019963 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgttcgtttcaggcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtata 5019864  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 307  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5019863 tagctttgaaagtagaagaaag-tagagtttt-aaacaaaagcacaagctcaaattgatgtgtaagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggat 5019766  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagc 398  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  5019765 ttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 5019675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 9 - 404
Target Start/End: Original strand, 17978859 - 17979255
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    |||||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  17978859 accacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacataccctcgctcatgcatatttcctttgaatgtaccctgttg 17978958  T
Q  109 ctcaggtttgctttt-caaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtat 206  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17978959 ctcaggtttgctttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtat 17979058  T
Q  207 atagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 306  Q
    ||||||||||||||| ||  |||| ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17979059 atagctttgaaagtaaaaagaaaacagagttt-caaacaaaagcacagtctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacgga 17979157  T
Q  307 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagcacagaa 404  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||    
T  17979158 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctgggaactttgaatccacaagtacagaa 17979255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 9 - 391
Target Start/End: Original strand, 18286264 - 18286645
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18286264 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttg 18286362  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa--tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtat 206  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18286363 ctcagatttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtat 18286462  T
Q  207 atagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 306  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  18286463 atagctttgaaagtagaagaaaa-tagagtttt-aatcaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 18286560  T
Q  307 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaatt 391  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||| ||||||    
T  18286561 tttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcccagaaactttgaatt 18286645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 9 - 391
Target Start/End: Original strand, 18301565 - 18301946
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18301565 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttg 18301663  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa--tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtat 206  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18301664 ctcagatttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtat 18301763  T
Q  207 atagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 306  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  18301764 atagctttgaaagtagaagaaaa-tagagtttt-aatcaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 18301861  T
Q  307 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaatt 391  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||| ||||||    
T  18301862 tttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcccagaaactttgaatt 18301946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 9 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 20072386 - 20071994
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20072386 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 20072287  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc----aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgt 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20072286 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgt 20072187  T
Q  205 atatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacg 304  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  20072186 atatagctttgaaagtagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagaggggtggtcagccgaaggtgtgactccacg 20072089  T
Q  305 gattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagca 399  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  20072088 gatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtgatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagca 20071994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 9 - 404
Target Start/End: Original strand, 5590270 - 5590665
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    |||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5590270 accatagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacctattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 5590369  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtata 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  5590370 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtaca 5590469  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 307  Q
    |||||||||||||| ||  |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  5590470 tagctttgaaagtaaaaagaaaacagag-tttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 5590568  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagcacagaa 404  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  || | |||||| |||||||||||| ||||||    
T  5590569 ttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacagctcttagaaactttgaattcacaagtacagaa 5590665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 10 - 415
Target Start/End: Original strand, 16618399 - 16618808
Alignment:
Q  10 ccacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgc 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16618399 ccacagactatcctggggaagagcctccttgtaacacatattgaaatagacatcgacatacgctcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgc 16618498  T
Q  110 tcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagtttt---caattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt---g 203  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |    
T  16618499 tcaggtttgcttt-caaaatggacaaaaactttttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaagatagaaagaaaatgtttttttg 16618597  T
Q  204 tatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccac 303  Q
    || ||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  16618598 tacatagctttgaaagtagaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccac 16618696  T
Q  304 ggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagcacaga 403  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  16618697 ggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacatttcctagaaactttgaattcgcaagcacaga 16618796  T
Q  404 aacttctgatga 415  Q
    | ||||||||||    
T  16618797 agcttctgatga 16618808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 9 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 28345521 - 28345155
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    |||||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28345521 accacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacaccaacataccctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 28345422  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaatttt-caaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  28345421 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaatttttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtata 28345322  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 307  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  28345321 tagctttgaaaatagaagaaaa-tagagtttt-aaacaaaagcataggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 28345224  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcc 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28345223 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcc 28345155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 9 - 399
Target Start/End: Original strand, 22864757 - 22865145
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||| ||||| | ||| || |||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22864757 accacagactaccctggaggagaacccgcttgtaacatatattgaaatagacattaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 22864856  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 208  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22864857 ctcaggtttgcttttcaaaacagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatac 22864956  T
Q  209 agctttgaaagtagaagaaa-aatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 307  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||   ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  22864957 agctttgaaagtagaagaaagcatag---tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtgatcagccgaaggcgtgactccacggat 22865053  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagca 399  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||| ||||||| ||||||    
T  22865054 ttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcccagaaactttgaattcgcaagca 22865145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 9 - 399
Target Start/End: Original strand, 22879816 - 22880204
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||| ||||| | ||| || |||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22879816 accacagactaccctggaggagaacccgcttgtaacatatattgaaatagacattaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 22879915  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 208  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22879916 ctcaggtttgcttttcaaaacagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatac 22880015  T
Q  209 agctttgaaagtagaagaaa-aatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 307  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||   ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  22880016 agctttgaaagtagaagaaagcatag---tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtgatcagccgaaggcgtgactccacggat 22880112  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagca 399  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||| ||||||| ||||||    
T  22880113 ttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcccagaaactttgaattcgcaagca 22880204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 9 - 398
Target Start/End: Original strand, 11104270 - 11104660
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11104270 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 11104369  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata- 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||   |||||||     
T  11104370 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaggaaaataaattgtatat 11104469  T
Q  208 -tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 306  Q
     |||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||    
T  11104470 ttagctttgaaagtaaaaagaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtagtcagccgaaggcgtggctccacgga 11104568  T
Q  307 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagc 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| |||| || |||||    
T  11104569 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacacttcctggaaactttgaactcgcaagc 11104660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 9 - 399
Target Start/End: Original strand, 6536652 - 6537042
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6536652 accacagactatccttgagaagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgcttcatttgaatgtaccctgttg 6536751  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 207  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6536752 ctcaggtttgcttttcaaaacagacaaaaagtttttaattttcaaaaatgtttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 6536851  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 307  Q
    |||||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  6536852 tagctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 6536950  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagca 399  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||| ||||||| ||||||    
T  6536951 ttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcccagaaactttgaattcgcaagca 6537042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 9 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 7079578 - 7079183
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7079578 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 7079479  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttc-aattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaa-aatagaaagaaaatgttttgtat 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7079478 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttttaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaagaatagaaagaaaatgttttgtat 7079379  T
Q  207 ata----gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactcca 302  Q
    |||    |||||||||||| ||  |||| ||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  7079378 atatatagctttgaaagtaaaaagaaaacagagttt-cagacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactcca 7079280  T
Q  303 cggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagca 399  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  7079279 cggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagca 7079183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 9 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 18057614 - 18057222
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18057614 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 18057515  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatc-aaaatagaaagaaaatg-ttttgta 205  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||    
T  18057514 ctcaggtttgctttcaaaaatagacaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaaatagaaggaaaatgtttttgta 18057415  T
Q  206 tatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgg 305  Q
     ||| ||||||||||| ||  |||  |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  18057414 cataactttgaaagtaaaaagaaagcagag-tttcaaacaaaagcacgggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgg 18057316  T
Q  306 attcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagc 398  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  18057315 atttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagc 18057222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 9 - 398
Target Start/End: Original strand, 31030154 - 31030536
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31030154 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatcttgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttg 31030252  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 208  Q
    ||||||||||||||||||||     ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31030253 ctcaggtttgcttttcaaaa-----aaaactttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 31030347  T
Q  209 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  31030348 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgacgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 31030446  T
Q  309 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagc 398  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||| ||||||| |||||    
T  31030447 tacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagc 31030536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 9 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 6208247 - 6207869
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6208247 accacagaccatcctggggaagagcctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttg 6208149  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgttttgtat 206  Q
    ||||||||||||||||||||      |||  |||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||    
T  6208148 ctcaggtttgcttttcaaaa------aaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcctttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgttttgtat 6208055  T
Q  207 atagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  6208054 atagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgacgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 6207955  T
Q  307 ttcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaatt 391  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||    
T  6207954 tttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcctagaaactttgaatt 6207869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 9 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 18336973 - 18336591
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    |||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18336973 accatagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttg 18336875  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 208  Q
    ||||||||||||||||||||     ||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18336874 ctcaggtttgcttttcaaaa-----aaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcattatcattatcataatagaaagaaaatgttttgtatat 18336780  T
Q  209 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  18336779 agctttgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaatcgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 18336681  T
Q  309 cacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaag 397  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||    
T  18336680 tacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaag 18336591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 9 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 19700849 - 19700431
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19700849 accacagactatcctggggaagaatctgctcgtaacacatattgaaatagacaccaacatacactcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttg 19700750  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaa--gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagca-ttgtcattatcaaaatagaaagaaaatg------- 198  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||           
T  19700749 ctcaggtttgc-tttcaaaatagacaaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcatttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttttt 19700651  T
Q  199 ----ttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggca 294  Q
        ||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  19700650 ttttttttgtacatagctttgaaagtaaaaagaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaggcttaacttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcg 19700552  T
Q  295 tgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcac 394  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |    
T  19700551 tgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgatacattgaacacagtaatcactacatttcctagaaactttgaattcgc 19700452  T
Q  395 aagcacagaaacttctgatga 415  Q
    || || || | ||||||||||    
T  19700451 aaacataggagcttctgatga 19700431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 9 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 4727978 - 4727602
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4727978 accacagaccatcctggggaagagcctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttg 4727880  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgttttgtat 206  Q
    ||||||||||||||||||||      |||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  4727879 ctcaggtttgcttttcaaaa------aaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaagaaaatgttttgtat 4727786  T
Q  207 atagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 306  Q
    ||||||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  4727785 atagctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 4727687  T
Q  307 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaatt 391  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||    
T  4727686 tttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatcacatttcctagaaactttgaatt 4727602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 9 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 32445496 - 32445122
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32445496 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttg 32445398  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 208  Q
    ||||||||||||||||||||       ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32445397 ctcaggtttgcttttcaaaa-------aactttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcattatcattatcaaaacagaaagaaaatgttttgtatat 32445305  T
Q  209 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 308  Q
    | ||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  32445304 aactttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 32445206  T
Q  309 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattc 392  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||| |||||||    
T  32445205 tacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcccagaaactttgaattc 32445122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 9 - 398
Target Start/End: Original strand, 15735009 - 15735393
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15735009 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttg 15735107  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gta 205  Q
    ||||||||||||||||||||     ||||  |||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||| |||| ||||| | ||||||||| |||    
T  15735108 ctcaggtttgcttttcaaaa-----aaaactttttcaattttcaagatgcttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaagggaaatgtttttgta 15735202  T
Q  206 tatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgg 305  Q
     ||| ||||||||||| ||||||   ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  15735203 cataactttgaaagtaaaagaaagc-agagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgg 15735300  T
Q  306 attcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagc 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  15735301 attcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagc 15735393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 9 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 35887111 - 35886733
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||     
T  35887111 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgtatgtt-cgtttgaatgtaccctgtta 35887013  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gta 205  Q
    | ||||||||||||||||||      |||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||    
T  35887012 cacaggtttgcttttcaaaa------aaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgta 35886919  T
Q  206 tatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgg 305  Q
     ||||||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  35886918 catagctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgg 35886820  T
Q  306 attcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaatt 391  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||    
T  35886819 atttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtgatacattgaacacagtaatcattacatttcctagaaactttgaatt 35886733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 9 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 4689996 - 4689613
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | |||  |||||||||||| |||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  4689996 accacagactatcctggaggagaatctgcttgtaacatatattgaaataggcaccaacatacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttg 4689898  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gta 205  Q
    ||||||||||||||||||||       ||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||    
T  4689897 ctcaggtttgcttttcaaaa-------aactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgta 4689805  T
Q  206 tatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgg 305  Q
     ||| ||| ||||||| ||||||   ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  4689804 cataacttagaaagtaaaagaaagc-agagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgg 4689707  T
Q  306 attcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagc 398  Q
    ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  4689706 atttacgaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacgcagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagc 4689613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 9 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 5658482 - 5658095
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||| | | ||| |||||||||||||    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  5658482 accacagactatccttgaggagaacctgcttgtaacatgcgttgaaatagacaccaacatacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttg 5658384  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gta 205  Q
    || |||||||||||||||||      |||  ||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||    
T  5658383 cttaggtttgcttttcaaaa------aaactttttcaatttttaagatgtttgtttcaagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgta 5658290  T
Q  206 tatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgat--gtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccac 303  Q
     ||| | ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  5658289 cataacgttgaaagtaaaaggaaaatagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaaatgatatgtataagagtggtggtcagccgaaggcctgactccac 5658191  T
Q  304 ggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagca 399  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  5658190 ggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacgttgaacacagcaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagca 5658095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 9 - 398
Target Start/End: Original strand, 8283367 - 8283767
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  8283367 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacgctcgctcatgcatgttttgtttgaatgtaccctgttg 8283466  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaag---------ttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagca-ttgtcatta-tcaaaatagaaagaaaat 197  Q
    |||||||||||||| ||||| | | |||||          |||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  8283467 ctcaggtttgctttccaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaactttttcaattttcaagatgcttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaat 8283566  T
Q  198 g-ttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatg 296  Q
    | ||||||| ||| ||||||||||| ||  |||   ||| |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  8283567 gtttttgtacataactttgaaagtaaaaagaaagcggag-tttcaaacaaaaacacatgctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtg 8283665  T
Q  297 actccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaa 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||    
T  8283666 actccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacatcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaa 8283765  T
Q  397 gc 398  Q
    ||    
T  8283766 gc 8283767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 9 - 260
Target Start/End: Original strand, 15886650 - 15886895
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    |||||||||||||| || | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  15886650 accacagactatccgggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacatacactcgctcatgcatg-ttcgtttgaatgtaccctgttg 15886748  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagca-ttgtcatta-tcaaaatagaaagaaaat-gttttgta 205  Q
    ||||||||||||||||||       ||||  |||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||| | ||||||||| |||| |  |||||||    
T  15886749 ctcaggtttgcttttcaa-------aaaactttttcaattttcaagatgtttgcttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaagtatttttgta 15886841  T
Q  206 tatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaa 260  Q
     ||| ||||||||||| ||  |||| |||| |||||||||||| || ||||||||    
T  15886842 cataactttgaaagtaaaaagaaaacagag-tttcaaacaaaaacacaggctcaa 15886895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 289 - 399
Target Start/End: Original strand, 15886894 - 15887006
Alignment:
Q  289 aaggcatgactccacggattc-acaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactct 386  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |    
T  15886894 aaggcgtgactccacggattttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaacttt 15886993  T
Q  387 gaattcacaagca 399  Q
    |||||| ||||||    
T  15886994 gaattcgcaagca 15887006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 313 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 8002607 - 8002522
Alignment:
Q  313 aagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagc 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||    
T  8002607 aagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacacttcctggaaactttgaattcgcaagc 8002522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 344; Significance: 0; HSPs: 49)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 3795934 - 3795539
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3795934 accacagactatcctggaggagaacctgcttataacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 3795835  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3795834 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 3795735  T
Q  209 agctttgaaagtagaaga-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 307  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3795734 agctttgaaagtagaagaaaaaatagaattttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 3795635  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagcacaga 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  3795634 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacaga 3795539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 30174861 - 30174471
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30174861 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 30174762  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30174761 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 30174662  T
Q  209 agctttgaaagtagaaga-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 307  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30174661 agctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 30174562  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagc 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  30174561 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 30174471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 33881521 - 33881133
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    |||||||||||||| || | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33881521 accacagactatcccggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 33881422  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33881421 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 33881322  T
Q  209 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 308  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33881321 agctttgaaagtggaaaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 33881222  T
Q  309 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaag 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  33881221 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaag 33881133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 397
Target Start/End: Original strand, 18369298 - 18369686
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18369298 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 18369397  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18369398 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattaccaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 18369497  T
Q  209 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18369498 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcgaaggttcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggatt 18369597  T
Q  309 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaag 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  18369598 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaag 18369686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 9 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 11555748 - 11555367
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11555748 accaccgactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 11555649  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11555648 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaagaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 11555549  T
Q  209 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  11555548 agctttgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 11555450  T
Q  309 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaatt 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||    
T  11555449 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcctagaaactttgaatt 11555367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 9 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 33298932 - 33298522
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33298932 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccatgttg 33298833  T
Q  109 ctcaggtttgcttttc--aaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gta 205  Q
    |||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33298832 ctcaggtttgttttttcaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgta 33298733  T
Q  206 tatagctttgaaagtagaagaaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacg 304  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33298732 tatagctttgaaagtagaaaaaaaaatggagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacg 33298633  T
Q  305 gattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagcacagaa 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | |||||| |||||||||||| ||||||    
T  33298632 gattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaa 33298533  T
Q  405 acttctgatga 415  Q
     |||| |||||    
T  33298532 gcttcagatga 33298522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 9 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 37761378 - 37760987
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37761378 accacagtctatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtgccctgttg 37761279  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaa-tagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtat 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37761278 ctcaggtttgcttttcaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtat 37761179  T
Q  207 atagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 306  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37761178 atagctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccgcgga 37761080  T
Q  307 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagca 399  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||| ||||||| ||||||    
T  37761079 tttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagca 37760987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 9 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 22894810 - 22894405
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22894810 accacagactatcctggggaagagtctgcttgtaacacatatcgaaatagacatcaacatacactcgcttatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttg 22894711  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaag-ttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 207  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  22894710 ctcaggtttgcttt-caaaatagacaaaaaccttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcatggtcattatcaaaatagaaagaaaatattttgtaca 22894612  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 307  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  22894611 tagctttgaaagtagaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 22894513  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagcacagaaact 407  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||    
T  22894512 ttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacatttcctagaaactttgaattcgcaagcacagaagct 22894413  T
Q  408 tctgatga 415  Q
    ||||||||    
T  22894412 tctgatga 22894405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 9 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 41681100 - 41680710
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41681100 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacataaattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttg 41681002  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaa-tagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtat 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  41681001 ctcaggtttgcttttcaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtat 41680902  T
Q  207 atagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  41680901 atagctttgaaagtagaagaaaaatggagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaagggcacgactccacgga 41680802  T
Q  307 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagc 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  41680801 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccattacatttcctagaaactttgaattcgcaagc 41680710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 9 - 415
Target Start/End: Original strand, 28953546 - 28953952
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28953546 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacataaattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttg 28953644  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaa-tagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtat 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28953645 ctcaggtttgcttttcaaaaatagacaaaaagttttcaattcccaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtat 28953744  T
Q  207 atagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 306  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28953745 atagctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 28953843  T
Q  307 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagcacagaaac 406  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||| |||||||||||| |||||| |    
T  28953844 tttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagctcttagaaactttgaattcacaagtacagaagc 28953943  T
Q  407 ttctgatga 415  Q
    ||| |||||    
T  28953944 ttcagatga 28953952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 9 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 43084653 - 43084270
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||||||||| || | |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43084653 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtagcatacattgaaatagacatcaacatactctcgttcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 43084554  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaat-gttttgtata 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  43084553 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaactttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtata 43084454  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 307  Q
    || |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43084453 taactttgaaaatagaag-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgcataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 43084355  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattc 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||    
T  43084354 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccgaaaactttgaattc 43084270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 9 - 384
Target Start/End: Original strand, 18494534 - 18494908
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18494534 accacagactatcctggaggagaacccgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 18494633  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |   ||||||||    
T  18494634 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaataggaagaaagtaaattgtatat 18494733  T
Q  209 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 308  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  18494734 agctttgaaagtagaag-aaaatggagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtatgagagtggtggtcggccgaaggcgtgactccacggatt 18494832  T
Q  309 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaact 384  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  18494833 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaact 18494908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 9 - 415
Target Start/End: Original strand, 37352410 - 37352816
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    |||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37352410 accacagattatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacattaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaacgtaccctgttg 37352509  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgttttgtata 207  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  37352510 ctcaggtttgcttttcaaaataaacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaaatggaaggaaaatgttttgtata 37352609  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 307  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37352610 tagctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggat 37352708  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagcacagaaact 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||| ||||| ||||||  ||||| ||    
T  37352709 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcccagaaactttgaatccacaagtgcagaagct 37352808  T
Q  408 tctgatga 415  Q
    | ||||||    
T  37352809 tttgatga 37352816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 9 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 28655638 - 28655247
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28655638 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 28655539  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaa--tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgta 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28655538 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaaaatgtttgtttcgagcattgtcattattaaaatagaaagaaaatgttttgta 28655439  T
Q  206 tatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgg 305  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  28655438 tatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtagtcagccgaaggcgtgactccacgg 28655341  T
Q  306 attcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagca 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  28655340 attcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaagca 28655247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 9 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 30158429 - 30158048
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30158429 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacattaacatattctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccccgttg 30158330  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30158329 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtata 30158230  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 307  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30158229 tagctttgaaagtagaagaaaggtagagtttt-aaacaaaagcacaagctcaaattgatgtgtaagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggat 30158131  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaat 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| |||||    
T  30158130 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcactacatttcttagaaactttgaat 30158048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 9 - 398
Target Start/End: Original strand, 40467319 - 40467708
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40467319 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 40467418  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  40467419 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattattaaaatggaaagaaaatgttttgtata 40467518  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 307  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  40467519 tagctttgaaagtagaaagaaaatagagtttt-aaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 40467617  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagc 398  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  40467618 ttataaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 40467708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 9 - 415
Target Start/End: Original strand, 32590042 - 32590447
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32590042 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 32590141  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32590142 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgttcgtttcaggcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgatttgtata 32590241  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 307  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||    
T  32590242 tagctttgaaagtagaag-aaagtagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtagtcggccaaaggcatgaccccacgaat 32590339  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagcacagaaact 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||||| |||||| ||    
T  32590340 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcttagaaactttgaatccacaagtacagaagct 32590439  T
Q  408 tctgatga 415  Q
    | ||||||    
T  32590440 tttgatga 32590447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 9 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 6880699 - 6880303
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    |||||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6880699 accacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacacacattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 6880600  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6880599 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaataggaagaaaatgttttgtata 6880500  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  6880499 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagtctt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 6880401  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacattt-cctggaaactctgaattcacaagcacagaa 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   ||||| |||||||||||| ||||||    
T  6880400 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaaactttgaattcacaagtacagaa 6880303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 9 - 397
Target Start/End: Original strand, 8659238 - 8659625
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8659238 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacattaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttg 8659337  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 207  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8659338 ctcaggtttgcttttcaaaataaacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtata 8659437  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 307  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8659438 tagctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaaacaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggat 8659536  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaag 397  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||    
T  8659537 tcacaaagcttggcgaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcc-cgaaactttgaattcacaag 8659625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 9 - 399
Target Start/End: Original strand, 9544473 - 9544864
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    |||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9544473 accaaagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 9544572  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc----aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgt 204  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9544573 ctcaggtttacttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgt 9544672  T
Q  205 atatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacg 304  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  9544673 atatagctttgaaagtagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacg 9544770  T
Q  305 gattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagca 399  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  9544771 gatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcct-gaaactttgaattcgcaagca 9544864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 9 - 399
Target Start/End: Original strand, 37746088 - 37746484
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacat----atactc--gctcatgcatgtttcatttgaatgtacc 102  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37746088 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacattaacattaacatactctcgctcatgcatgcttcatttgaatgtacc 37746187  T
Q  103 ctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37746188 ctgttgctcaggtttgcttttcaaaacagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt 37746287  T
Q  203 gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactcca 302  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  37746288 gtatatagctttgaaagtaaaaagaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactcca 37746387  T
Q  303 cggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagca 399  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||| ||||||| ||||||    
T  37746388 cggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcccagaaactttgaattcgcaagca 37746484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 9 - 398
Target Start/End: Original strand, 13180559 - 13180944
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13180559 accacagactatcctggaggggaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 13180658  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 208  Q
    ||||||||||||||||||||     ||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13180659 ctcaggtttgcttttcaaaa-----aaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 13180753  T
Q  209 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 308  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  13180754 agctttgaaagtagaagaaaaatggagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 13180853  T
Q  309 cacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagc 398  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  13180854 tacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 13180944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 9 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 11330034 - 11329644
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11330034 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 11329935  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||   |||||||    
T  11329934 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaatttttaaaaatgtttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaggaaaataaattgtata 11329835  T
Q  208 t--agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgg 305  Q
    |  ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  11329834 tttagctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttaaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtatgagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgg 11329736  T
Q  306 attcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaag 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  11329735 attcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaag 11329644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 9 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 24730365 - 24729977
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||  | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24730365 accacagactatcctgaaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacattcacataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttg 24730266  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa--tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtat 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24730265 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatattttgtat 24730166  T
Q  207 atagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 306  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  24730165 atagctttgaaagtagaagaaaa-tagaattt-caaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 24730068  T
Q  307 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaag 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  24730067 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaag 24729977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 9 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 23632366 - 23631982
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23632366 accacagactatcctggaggagaaccggcttataacacatattgaaatagacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 23632267  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaa-tagacaaaaag--ttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgta 205  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23632266 ctcaagtttgcttttcaaaaatagacaaaaagctttttcaattttcaagatgtttatttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgta 23632167  T
Q  206 tatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgg 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  23632166 tatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgcataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgg 23632068  T
Q  306 attcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaatt 391  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||||    
T  23632067 attcacgaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacggtaatcattacatttcctagaaactttgaatt 23631982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 9 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 9323871 - 9323466
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    |||||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9323871 accacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcgacatactctcgcttatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttg 9323772  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  9323771 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatat 9323672  T
Q  209 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 308  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  9323671 agctttgaaaatagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 9323574  T
Q  309 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacattt-cctggaaactctgaattcacaagcacagaaact 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   ||||| |||||||||||| |||||||||    
T  9323573 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaaactttgaattcacaagtacagaaact 9323474  T
Q  408 tctgatga 415  Q
    || |||||    
T  9323473 tcagatga 9323466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 9 - 398
Target Start/End: Original strand, 13318594 - 13318982
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    |||||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13318594 accacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacattaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 13318693  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 208  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13318694 ctcaggtttgcttttcaaaacagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 13318793  T
Q  209 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 308  Q
    ||||||||||||| ||  |||  |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  13318794 agctttgaaagtaaaaagaaagcagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 13318892  T
Q  309 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagc 398  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||| ||||||| |||||    
T  13318893 tacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcataacatttcccagaaactttgaattcgcaagc 13318982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 9 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 33522778 - 33522382
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33522778 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacattcacataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttg 33522679  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtata 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33522678 ctcgggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtata 33522579  T
Q  208 tagctttgaaagtagaaga-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 306  Q
    |||||||||||||| || | |||| |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33522578 tagctttgaaagtaaaaaagaaaacagag-tttcaaacaaaagcacagtctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacgga 33522480  T
Q  307 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagcacagaa 404  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||    
T  33522479 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctgggaactttgaatccacaagtacagaa 33522382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 9 - 399
Target Start/End: Original strand, 13436440 - 13436836
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13436440 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaatatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 13436539  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc----aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaag-aaaatgttttg 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13436540 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaaaatgtttgtttcaagcgttgccattatcaaaatagaaagaaaaatgttttg 13436639  T
Q  204 tatatagctttgaaagtagaag-aaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactcca 302  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  13436640 tatatagctttgaaagtagaagaaaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactcca 13436738  T
Q  303 cggattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagca 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  13436739 cggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaagca 13436836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 9 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 2517461 - 2517054
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2517461 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacacgttgaaatagacatcaacatactctcattcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttg 2517362  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa---tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgta 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2517361 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaaatgtttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgta 2517262  T
Q  206 tatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgg 305  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  2517261 tatagctttgaaagtagaagaaaa-tagaatct-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgagggcatgactccacgg 2517164  T
Q  306 attcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagcacagaaa 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| | |||||| |||||||||||| ||||||     
T  2517163 attcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaag 2517064  T
Q  406 cttctgatga 415  Q
    ||| ||||||    
T  2517063 cttttgatga 2517054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 9 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 12138570 - 12138165
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    |||||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12138570 accacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcgacatactctcgcttatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttg 12138471  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  12138470 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatat 12138371  T
Q  209 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 308  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  12138370 agctttgaaaatagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 12138273  T
Q  309 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacattt-cctggaaactctgaattcacaagcacagaaact 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   ||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  12138272 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaaactttgaattcataagtacagaaact 12138173  T
Q  408 tctgatga 415  Q
    || |||||    
T  12138172 tcagatga 12138165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 9 - 415
Target Start/End: Original strand, 31820176 - 31820580
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||  | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  31820176 accacagactatcctgaaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacattcacataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccttgttg 31820275  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  31820276 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatat 31820375  T
Q  209 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 308  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  31820376 agctttgaaaatagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 31820473  T
Q  309 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagcacagaaactt 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| | |||||| |||||||||||| |||||| |||    
T  31820474 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagctt 31820573  T
Q  409 ctgatga 415  Q
     ||||||    
T  31820574 ttgatga 31820580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 9 - 399
Target Start/End: Original strand, 15752624 - 15753008
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    |||||||| |||| ||| | ||| |||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15752624 accacagattatcttggaggagaacctgctggtaacatatattgaaatagacaccaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 15752723  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    ||||||||||||||||||||||    
T  15752724 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagtattgtcattatca----agaaagaaaatgttttgtatat 15752819  T
Q  209 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 308  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15752820 agctttgaaagtagaag-aaaataga-atttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggatt 15752917  T
Q  309 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagca 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  15752918 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgatacattgaacacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagca 15753008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 9 - 399
Target Start/End: Original strand, 37665252 - 37665642
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37665252 accacagactatcctggaggagaacctgtttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttg 37665350  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaa-tagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtat 206  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37665351 ctcaggtttgctttttaaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtat 37665450  T
Q  207 atagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 306  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  37665451 acagctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 37665549  T
Q  307 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagca 399  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||| | ||||||| ||||||    
T  37665550 tttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcccagaaattttgaattcgcaagca 37665642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 9 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 30035820 - 30035431
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    |||||||| |||| ||| | |||  ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30035820 accacagattatcttggaggagaatctgctggtaacatatattgaaatagacaccaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 30035721  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 207  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30035720 ctcaggtttgcttttcaaaataaacaaaaagttttcagttttcaaaaatgtttgtttcaagcattgccattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 30035621  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 307  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  30035620 tagctttgaaagtagaagaaaa-tagaatttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 30035523  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagca 399  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  30035522 ttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgatacattgaacacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagca 30035431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 9 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 34622914 - 34622524
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34622914 accacagactatccttgagaagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 34622815  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 207  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34622814 ctcaggtttgcttttcaaaacagacaaaaagtttttaattttcaaaaatgtttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 34622715  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 307  Q
    |||||||||||||| ||  |||  |||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  34622714 tagctttgaaagtaaaaagaaagcagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccggaggcgtgactccacggat 34622616  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagc 398  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  34622615 tcacaaaacttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaagc 34622524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 9 - 399
Target Start/End: Original strand, 18122182 - 18122572
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | |||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18122182 accacagactatcctggaggagaaactgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttg 18122280  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||    
T  18122281 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttctcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaataaattgtata 18122380  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 306  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  18122381 tagctttgaaagtagaaaaaaaaatagagtttt-aaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 18122479  T
Q  307 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagca 399  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||| ||||||| ||||||    
T  18122480 tttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagca 18122572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 9 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 5644193 - 5643805
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    |||||||| |||| ||| | ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5644193 accacagattatcttggaggagaacctgcttttaacatatattgaaatagacatcgacatactctcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttg 5644095  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5644094 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcgattttcaaaaatgtttgtttcaggcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtata 5643995  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 307  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  5643994 tagctttgaaagtaaaagaaaa-tagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 5643897  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagca 399  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| | |||| ||||||| ||||||    
T  5643896 tcacaaaacttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtgatcatgacatttcctaggaactttgaattcgcaagca 5643805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 9 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 26486780 - 26486385
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    |||||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26486780 accacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcgacatactctcgcttatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttg 26486681  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  26486680 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatat 26486581  T
Q  209 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 308  Q
    |||||||           ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  26486580 agctttg-----------aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 26486493  T
Q  309 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacattt-cctggaaactctgaattcacaagcacagaaact 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   ||||| |||||||||||| |||||||||    
T  26486492 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaaactttgaattcacaagtacagaaact 26486393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 9 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 31437852 - 31437469
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    |||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31437852 accaaagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtctcatttgaatgtaccctgttg 31437753  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 208  Q
    ||||||||||||||||||||      |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31437752 ctcaggtttgcttttcaaaa------aaactttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 31437659  T
Q  209 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 308  Q
    ||||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  31437658 agctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 31437560  T
Q  309 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagca 399  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||| ||||||| ||||||    
T  31437559 tacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagca 31437469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 9 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 25206679 - 25206266
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    |||||||  |||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25206679 accacagtttatcctagggaagaatttgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatacgctcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttg 25206580  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaag-----ttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt 202  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||      |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25206579 ttcaggtttgcttt-caaaatagacaaaaaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcatttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt 25206481  T
Q  203 --gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactc 300  Q
      ||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  25206480 ttgtacatagctttgaaagtaaaaagaaaatagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactc 25206382  T
Q  301 cacggattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagca 399  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||    
T  25206381 cacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcactacatttcctataaactctgaattcgcaaaca 25206282  T
Q  400 cagaaacttctgatga 415  Q
     || | ||||||||||    
T  25206281 taggagcttctgatga 25206266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 9 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 25270835 - 25270422
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    |||||||  |||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25270835 accacagtttatcctagggaagaatttgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatacgctcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttg 25270736  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaag-----ttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt 202  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||      |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25270735 ttcaggtttgcttt-caaaatagacaaaaaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcatttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt 25270637  T
Q  203 --gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactc 300  Q
      ||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  25270636 ttgtacatagctttgaaagtaaaaagaaaatagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactc 25270538  T
Q  301 cacggattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagca 399  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||    
T  25270537 cacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcactacatttcctataaactctgaattcgcaaaca 25270438  T
Q  400 cagaaacttctgatga 415  Q
     || | ||||||||||    
T  25270437 taggagcttctgatga 25270422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 9 - 399
Target Start/End: Original strand, 22992890 - 22993272
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22992890 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttg 22992988  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 208  Q
    ||||||||||||||||||||      |||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22992989 ctcaggtttgcttttcaaaa------aaactttttcaattttcaaaatgcttgtttcgagcatcatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 22993082  T
Q  209 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 308  Q
    ||||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  22993083 agctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 22993181  T
Q  309 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagca 399  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  22993182 tacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcgatacatttcctgaaaactttgaattcgcaagca 22993272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 9 - 399
Target Start/End: Original strand, 15652526 - 15652914
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15652526 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttg 15652624  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 208  Q
    |||||||||||||||    | | | ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15652625 ctcaggtttgcttttttttaaaaaaaaaactttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 15652724  T
Q  209 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 308  Q
    ||||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  15652725 agctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 15652823  T
Q  309 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagca 399  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  15652824 tacaaagcttggaaaatggtaattttattagttggtggtacattgaacacagcaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagca 15652914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 9 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 23898263 - 23897886
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23898263 accacagactatcctggagaagaatctgcttgcaacatatattgaaatagacaccaacatacactcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttg 23898164  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt----g 203  Q
    ||||||||||||||          |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    |    
T  23898163 ctcaggtttgcttt----------caaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcatttgtcattattaaaatagaaagaaaatgttttttttg 23898074  T
Q  204 tatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccac 303  Q
    || ||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  23898073 tacatagctttgaaagtaaaaagaaaatagagtttt-aaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccat 23897975  T
Q  304 ggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattc 392  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||    
T  23897974 gaatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattc 23897886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 9 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 33783877 - 33783492
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  33783877 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttg 33783779  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa--tagaaagaaaatgtttt-gt 204  Q
    ||| ||||||||||||||||       ||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||  ||||| ||||||||||| ||    
T  33783778 ctccggtttgcttttcaaaa-------aactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaaatagaaggaaaatgtttttgt 33783686  T
Q  205 atatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacg 304  Q
    | ||| ||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  33783685 acataactttgaaagtaaaaagaaaatagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacg 33783587  T
Q  305 gattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagca 399  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  33783586 gatttacaaagcttggaaaatggtaattttatgggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagca 33783492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 9 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 24976238 - 24975861
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    |||||| |||||||||| | ||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  24976238 accacatactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatgttgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatatttcgtttgaatgtaccctgttg 24976139  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gta 205  Q
    ||||||||||||||||||||        |  ||| |||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||    
T  24976138 ctcaggtttgcttttcaaaa--------acttttccaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgta 24976047  T
Q  206 tatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgg 305  Q
     ||| ||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  24976046 cataactttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacagactcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgg 24975948  T
Q  306 attcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattc 392  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||| |||||||    
T  24975947 atttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacaacaatcattacatttcctagaaactttgaattc 24975861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 9 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 24608636 - 24608250
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  24608636 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatgttgaaatagacaccaacacacacttgctcatgcatgttttgtttgaatgtaccctgttg 24608537  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagca-ttgtcatta-tcaaaatagaaagaaaatg-ttttgta 205  Q
    ||||||||||||||||||||       ||  |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||    
T  24608536 ctcaggtttgcttttcaaaa-------aactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgta 24608444  T
Q  206 tatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgg 305  Q
     ||| ||||||||||| ||  |||   ||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  24608443 cataactttgaaagtaaaaagaaagcggag-tttcaaacaaaagcacatgctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgg 24608345  T
Q  306 attcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagca 399  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  24608344 atttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacaacaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagca 24608250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 9 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 30941025 - 30940642
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  30941025 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaataggcaccaacatacactcgctcatgcatgtt-cttttgaatgtaccctgttg 30940927  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagca-ttgtcatta-tcaaaatagaaagaaaatg-ttttgta 205  Q
    ||||||||||||||||||||        |  |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||    
T  30940926 ctcaggtttgcttttcaaaa--------actttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgta 30940835  T
Q  206 tatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgg 305  Q
     ||| ||||||||||| ||  |||  |||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  30940834 cataactttgaaagtaaaaagaaagcaga-atttcaaacaaaagcacaggctcaaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgg 30940736  T
Q  306 attcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagc 398  Q
    ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  30940735 atttacgaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagc 30940642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 343; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 12423 - 12034
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12423 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 12324  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12323 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttatatat 12224  T
Q  209 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 308  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12223 agctttgaaagtagaag-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 12125  T
Q  309 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagca 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||    
T  12124 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcgcaagca 12034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 339; Significance: 0; HSPs: 27)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 398
Target Start/End: Original strand, 20332288 - 20332678
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20332288 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 20332387  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20332388 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatattttgtatat 20332487  T
Q  209 agctttgaaagtagaag-aaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 307  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20332488 agctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 20332587  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagc 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  20332588 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 20332678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 39857034 - 39856630
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39857034 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 39856935  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39856934 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 39856835  T
Q  209 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 308  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39856834 agctttgaaagtagaagaaaaa-agagtttt-aaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 39856737  T
Q  309 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagcacagaaactt 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | |||||| |||||||||||| |||||| |||    
T  39856736 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagctt 39856637  T
Q  409 ctgatga 415  Q
    | |||||    
T  39856636 cagatga 39856630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 398
Target Start/End: Original strand, 40099502 - 40099892
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40099502 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 40099601  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40099602 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 40099701  T
Q  209 agctttgaaagtagaag-aaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 307  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40099702 agctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagtaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 40099801  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagc 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  40099802 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 40099892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 398
Target Start/End: Original strand, 27157178 - 27157569
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27157178 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 27157277  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaat-gttttgtata 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  27157278 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtata 27157377  T
Q  208 tagctttgaaagtagaag-aaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 306  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27157378 tagctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 27157477  T
Q  307 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagc 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  27157478 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 27157569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 9 - 398
Target Start/End: Original strand, 24586227 - 24586617
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24586227 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctattg 24586326  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24586327 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcattgtccttatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 24586426  T
Q  209 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 308  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24586427 agctttgaaagtagaagaaaaatggagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 24586526  T
Q  309 cacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagc 398  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  24586527 cacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacatcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagc 24586617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 9 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 14104941 - 14104554
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14104941 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 14104842  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14104841 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattaccaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 14104742  T
Q  209 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 308  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14104741 agctttgaaagtagaaagaaaacagagtttt-aaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggatt 14104643  T
Q  309 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaag 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  14104642 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaag 14104554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 9 - 415
Target Start/End: Original strand, 18794483 - 18794889
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18794483 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacattaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttg 18794582  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaa-aatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 207  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  18794583 ctcaggtttgcttttcaaaataaacaaaaagttttcaattttcaagaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatggaaggaaaatgttttgtata 18794682  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 307  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18794683 tagctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 18794781  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagcacagaaact 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||  | |||||| |||||||||||| |||||| ||    
T  18794782 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacagtttttagaaactttgaattcacaagtacagaagct 18794881  T
Q  408 tctgatga 415  Q
    | ||||||    
T  18794882 tttgatga 18794889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 9 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 30760161 - 30759775
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30760161 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaaagtaccctgttg 30760062  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  30760061 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatat 30759962  T
Q  209 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 308  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  30759961 agctttgaaaatagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 30759864  T
Q  309 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaag 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  30759863 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaag 30759775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 9 - 397
Target Start/End: Original strand, 33667669 - 33668055
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33667669 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaaagtaccctgttg 33667768  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  33667769 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatat 33667868  T
Q  209 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 308  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  33667869 agctttgaaaatagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 33667966  T
Q  309 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaag 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  33667967 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaag 33668055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 9 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 54839789 - 54839400
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54839789 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 54839690  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 207  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  54839689 ctcaagtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtata 54839590  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 307  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  54839589 tagctttgaaagtagaagaaaa-tagagttt-caagcaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 54839492  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagca 399  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  54839491 ttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagca 54839400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 9 - 399
Target Start/End: Original strand, 14753360 - 14753749
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14753360 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttg 14753458  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa--tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtat 206  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14753459 ctcagatttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtat 14753558  T
Q  207 atagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 306  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  14753559 atagctttgaaagtagaagaaaa-tagagtttt-aatcaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 14753656  T
Q  307 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagca 399  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||| ||||||| ||||||    
T  14753657 tttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcccagaaactttgaattcgcaagca 14753749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 9 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 5700939 - 5700549
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5700939 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 5700840  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 207  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5700839 ctcaagtttgcttttcaaaatagacaaaaagtttttaattttcaaaaatgttcgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 5700740  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 307  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5700739 tagctttgaaagtagaag-aaaataga-atttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggat 5700642  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagca 399  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||   ||||| ||||||| ||||||    
T  5700641 tcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcccaaaaactttgaattcgcaagca 5700549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 9 - 399
Target Start/End: Original strand, 34182830 - 34183218
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    |||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34182830 accacagattatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttg 34182928  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34182929 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaa-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 34183027  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  34183028 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagcggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 34183126  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagca 399  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||| ||||||| ||||||    
T  34183127 ttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcccagaaactttgaattcgcaagca 34183218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 9 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 21976103 - 21975708
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    |||| |||||||||||| | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21976103 accatagactatcctggaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacattcacataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttg 21976004  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtata 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21976003 ctcgggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtata 21975904  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 307  Q
    |||||||||||||| ||  |||| |||| ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21975903 tagctttgaaagtaaaaagaaaacagag-tttcaaacaaaagcgcagtctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggat 21975805  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagcacagaa 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||    
T  21975804 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctgggaactttgaatccacaagtacagaa 21975708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 9 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 1906656 - 1906245
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1906656 accacagactatcctggggaagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttg 1906557  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaag--ttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgttt---- 201  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||        
T  1906556 ctcaggtttgcttt-caaaatagacaaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcatttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttcttt 1906458  T
Q  202 tgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactcc 301  Q
    |||| || |||||||||||||||  | | |||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  1906457 tgtacatggctttgaaagtagaaagatagtagagttt-caaacaaaagcacagactcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactcc 1906359  T
Q  302 acggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagcaca 401  Q
    || |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  1906358 acagatatacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcaca 1906259  T
Q  402 gaaacttctgatga 415  Q
      | ||||||||||    
T  1906258 tgagcttctgatga 1906245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 9 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 5012277 - 5011870
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  5012277 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcgacatactctcgcttatgcatgtttcgtttgaatgtgccctgttg 5012178  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| ||||||||    
T  5012177 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagtttttaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgccattatccaagtagaaagaaaatgatttgtata 5012078  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 307  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  5012077 tagctttgaaagtagaagaaaagtagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 5011979  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagcacagaaac 406  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||   ||||| |||||||||||| |||||| |    
T  5011978 tcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagc 5011879  T
Q  407 ttctgatga 415  Q
    ||| |||||    
T  5011878 ttcagatga 5011870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 9 - 404
Target Start/End: Original strand, 31120376 - 31120772
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31120376 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacattcacataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttg 31120475  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaa-tagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtat 206  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31120476 ctcgggtttgcttttcaaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtat 31120575  T
Q  207 atagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 306  Q
    ||||||||||||||| ||  |||| ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31120576 atagctttgaaagtaaaaagaaaacagagttt-caaacaaaagcacagtctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacgga 31120674  T
Q  307 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagcacagaa 404  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||  |||| |||||| ||||||    
T  31120675 ttcacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctgggaacttcgaatccacaagtacagaa 31120772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 9 - 399
Target Start/End: Original strand, 36338392 - 36338774
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36338392 accacagactatcctggaggagaacccgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttg 36338490  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 208  Q
    ||||||||||||||||||||      |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36338491 ctcaggtttgcttttcaaaa------aaactttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 36338584  T
Q  209 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  36338585 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 36338683  T
Q  309 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagca 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||| ||||||| ||||||    
T  36338684 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggcggtacattgaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagca 36338774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 9 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 24119061 - 24118672
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||| || |||||||||||| || || | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24119061 accacggactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatgttgaaatagacaccagcacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttg 24118963  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24118962 ctccggtttgcttttcaaaatagacaaaaagtttttaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 24118863  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 307  Q
    |||||||||||||| ||  |||| ||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  24118862 tagctttgaaagtaaaaagaaaacagagttt-cagacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 24118764  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagca 399  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||| ||||||| ||||||    
T  24118763 ttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcccagaaactttgaattcgcaagca 24118672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 9 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 15234219 - 15233809
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15234219 accacagactatcctggggaagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttg 15234120  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaag------ttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt 202  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||       ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||    
T  15234119 cccaggtttgcttt-caaaatagacaaaaaaaaaactttttcaagtttcaagatgtttgcttcaagcattgtcattatcaagataaaaagaaattttttt 15234021  T
Q  203 gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactcca 302  Q
    ||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| |    
T  15234020 gtacatagctttgaaagtagaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggttagccgaaggcgtgactcta 15233922  T
Q  303 cggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagcacag 402  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||     
T  15233921 cggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattggacatagtaaccactacatttcctataaactttgaattcgcaagcacaa 15233822  T
Q  403 aaacttctgatga 415  Q
    || ||| ||||||    
T  15233821 aagcttatgatga 15233809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 9 - 415
Target Start/End: Original strand, 15276495 - 15276904
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||| ||||| |||||| ||||| |||||    
T  15276495 accacagactatcctggggaagagcctgtttgtaacacatattgaaatagacatcgacatacgctcactcatgcacgtttcgtttgaacgtaccttgttg 15276594  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagtttt---caattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt--g 203  Q
    |||| |||| |||| ||||| ||||||||| ||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |    
T  15276595 ctcaagtttacttt-caaaacagacaaaaactttttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaagatagaaagaaaatgttttttg 15276693  T
Q  204 tatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccac 303  Q
    || |||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  15276694 tacatagctttgaaagtagagagaaaatagagttt-caaacaaaagcacaggctcgaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccac 15276792  T
Q  304 ggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagcacaga 403  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  15276793 ggatttacaaagcttggaaaatggcaattttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacatttcctagaaactttgaattcgcaagcacaga 15276892  T
Q  404 aacttctgatga 415  Q
    | ||||||||||    
T  15276893 agcttctgatga 15276904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 10 - 415
Target Start/End: Original strand, 15380105 - 15380510
Alignment:
Q  10 ccacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgc 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||    
T  15380105 ccacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaaaagacatcgacatacgctcgctcatgcacgtttcgtttgaatgtaccttgttgc 15380204  T
Q  110 tcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt--gtata 207  Q
    ||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| |    
T  15380205 tcaggcttgcttt-caaaacagacaaaaacttttttaatttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaagatagaaagaaaatgttttttgtaca 15380303  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 307  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  15380304 tagctttgaaagtagaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcacaggctcgaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 15380402  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagcacagaaact 407  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| || ||    
T  15380403 ttacaaagcttggaaaatggcaattttattggttggtggtacattgaacacgataaccactacatttccttgaaactttgaattcgcaagcacaaaagct 15380502  T
Q  408 tctgatga 415  Q
    || |||||    
T  15380503 tcggatga 15380510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 9 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 6576253 - 6575879
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6576253 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttg 6576155  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 208  Q
    |||||||||||||||||||       |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6576154 ctcaggtttgcttttcaaag------aaactttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 6576061  T
Q  209 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 308  Q
    ||||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  6576060 agctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 6575962  T
Q  309 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaatt 391  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||    
T  6575961 tacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatcacatttcctagaaactttgaatt 6575879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 9 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 1674260 - 1673877
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1674260 accacagactatcctagggaagaacctgcttgtaacacat--tgaaatagacatcaacacacactcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttg 1674163  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaag--ttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt--g 203  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  |    
T  1674162 ctcaagtttgcttt-caaaatagacaaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcatttgtcattatcaaaatagaaagaaaatattttttg 1674064  T
Q  204 tatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccac 303  Q
    || || |||||||||||||||  | | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||    
T  1674063 tacatggctttgaaagtagaaagatagtagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggagtgacaccac 1673965  T
Q  304 ggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaatt 391  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||    
T  1673964 ggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtatattgaacacagtaaccactacatttcctagaaactttgaatt 1673877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 9 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 17019447 - 17019062
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17019447 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttg 17019349  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtat 206  Q
    ||||||||||||||||||||      |||  ||||||||| |||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||     
T  17019348 ctcaggtttgcttttcaaaa------aaactttttcaattctcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaatagaaggaaaatgtttttgtac 17019255  T
Q  207 atagcttt-gaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgg 305  Q
    |||||||| ||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  17019254 atagcttttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcataggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgg 17019156  T
Q  306 attcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagc 398  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  17019155 atttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtgatacattgaacacagtaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagc 17019062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 9 - 318
Target Start/End: Original strand, 36324183 - 36324484
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36324183 accacagactatcctggaggagaacccgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttg 36324281  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 208  Q
    ||||||||||||||||||||      |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36324282 ctcaggtttgcttttcaaaa------aaactttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 36324375  T
Q  209 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  36324376 agctttgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 36324474  T
Q  309 cacaaagctt 318  Q
    ||||||||||    
T  36324475 cacaaagctt 36324484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 9 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 14671412 - 14671026
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14671412 accacagactatcctagaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttg 14671313  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtt-ttgta 205  Q
    ||||||||||||||||||||      |||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||    
T  14671312 ctcaggtttgcttttcaaaa------aaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgttcttgta 14671219  T
Q  206 tatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgg 305  Q
     ||| ||||||||||| ||  |||  ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  14671218 cataactttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacgggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacgg 14671120  T
Q  306 attcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagc 398  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  14671119 atttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcacaagc 14671026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 338; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 415
Target Start/End: Original strand, 3045 - 3453
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3045 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaaggtaccctgttg 3144  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3145 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagagaatgttttgtatat 3244  T
Q  209 agctttgaaagtagaaga--aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 306  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  3245 agctttgaaagtagaagaacaaaatagaattttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 3344  T
Q  307 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagcacagaaac 406  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  3345 tttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaac 3444  T
Q  407 ttctgatga 415  Q
    |||||||||    
T  3445 ttctgatga 3453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 9 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 18196 - 17949
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18196 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaaggtaccctgttg 18097  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18096 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagagaatgttttgtatat 17997  T
Q  209 agctttgaaagtagaaga--aaaatagagttttcaaacaaaagcaaag 254  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  17996 agctttgaaagtagaagaacaaaatagaattttcaaacaaaagcaaag 17949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 335; Significance: 0; HSPs: 41)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 398
Target Start/End: Original strand, 254508 - 254897
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  254508 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 254607  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  254608 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 254706  T
Q  209 agctttgaaagtagaagaaaa-atagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 307  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  254707 agctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 254806  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagc 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  254807 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 254897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 398
Target Start/End: Original strand, 37945721 - 37946111
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37945721 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactcttactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 37945820  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37945821 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 37945920  T
Q  209 agctttgaaagtagaag-aaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 307  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37945921 agctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 37946020  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagc 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  37946021 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtatattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 37946111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 27810089 - 27809697
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27810089 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaacctgttg 27809990  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27809989 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 27809890  T
Q  209 agctttgaaagtagaaga--aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 306  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27809889 agctttgaaagtagaagaaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 27809790  T
Q  307 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagca 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  27809789 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagca 27809697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 16167864 - 16167475
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16167864 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacataccctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 16167765  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaat-gttttgtata 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  16167764 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtata 16167665  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 307  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16167664 taactttgaaagtagaag-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 16167566  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagc 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  16167565 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 16167475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 12593200 - 12592806
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12593200 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 12593101  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa----tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgt 204  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12593100 ctcaggtttgctttccaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgt 12593001  T
Q  205 atatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacg 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12593000 atatagctttgaaagtagaagaaaaatggagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacg 12592901  T
Q  305 gattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagca 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  12592900 gattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagca 12592806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 9 - 398
Target Start/End: Original strand, 13930400 - 13930791
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||| ||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13930400 accacagactatcttggaggagaacctgctcgtaacacatattgaaatagacattaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 13930499  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtat 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13930500 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtat 13930599  T
Q  207 atagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13930600 atagctttgaaagtagaagaaaaatggagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcacgactccacgga 13930699  T
Q  307 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagc 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  13930700 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 13930791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 9 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 12661924 - 12661543
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12661924 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 12661825  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12661824 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 12661725  T
Q  209 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  12661724 agctttgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 12661626  T
Q  309 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaatt 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||    
T  12661625 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcctagaaactttgaatt 12661543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 9 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 3788879 - 3788490
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3788879 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatacattgaaatagacatcaacatactctcgttcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 3788780  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3788779 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 3788680  T
Q  209 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 308  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3788679 agctttgaaagtagaag-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccgcggatt 3788581  T
Q  309 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagca 399  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||| ||||||| ||||||    
T  3788580 tataaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagca 3788490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 9 - 376
Target Start/End: Original strand, 22921999 - 22922368
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22921999 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaaggtaccctgttg 22922098  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22922099 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 22922198  T
Q  209 agctttgaaagtagaaga--aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 306  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  22922199 agctttgaaagtagaagaacaaaatagaattttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 22922298  T
Q  307 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcc 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22922299 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcc 22922368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 9 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 37931765 - 37931369
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    |||||||||||||| || | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37931765 accacagactatcccggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacattaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttg 37931666  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 207  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37931665 ctcaggtttgcttttcaaaataaacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 37931566  T
Q  208 tagctttgaaagtagaag------aaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactcc 301  Q
    ||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37931565 tagctttgaaagtagaagaaaaaaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactcc 37931466  T
Q  302 acggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagc 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  37931465 acggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 37931369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 9 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 37384063 - 37383673
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37384063 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttggatgtaccctgttg 37383964  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37383963 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 37383864  T
Q  209 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  37383863 agctttgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccggaggcgtgactccacggatt 37383765  T
Q  309 cacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagca 399  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  37383764 cacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaagca 37383673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 9 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 39896454 - 39896088
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39896454 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 39896355  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39896354 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 39896255  T
Q  209 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  39896254 agctttgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccggaggcgtgactccacggatt 39896156  T
Q  309 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcc 376  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39896155 cacaaagctcggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcc 39896088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 9 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 40239894 - 40239489
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40239894 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatgttgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttg 40239796  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtata 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||    
T  40239795 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatggaaagaaaatatttttgtata 40239696  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 307  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40239695 taactttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 40239597  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagcacagaaact 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | |||||| |||||||||||| |||||| ||    
T  40239596 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagct 40239497  T
Q  408 tctgatga 415  Q
    || |||||    
T  40239496 tcagatga 40239489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 9 - 376
Target Start/End: Original strand, 19410340 - 19410709
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  19410340 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaaggtatcctgttg 19410439  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19410440 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtgtat 19410539  T
Q  209 agctttgaaagtagaaga--aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 306  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  19410540 agctttgaaagtagaagaacaaaatagaattttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 19410639  T
Q  307 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcc 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19410640 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcc 19410709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 9 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 27782618 - 27782212
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27782618 accacagactatcctggaggagaacctgtttgtaacatatattgaaatagacaccaacatacactcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttg 27782519  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 207  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  27782518 ctcaggtttgcttttcaaaataaacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatggaaggaaaatgttttgtata 27782419  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 307  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27782418 tagctttgaaaatagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaacggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 27782320  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagcacagaaact 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| | |||||| |||||||||||| |||||| ||    
T  27782319 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagct 27782220  T
Q  408 tctgatga 415  Q
    | ||||||    
T  27782219 tttgatga 27782212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 9 - 415
Target Start/End: Original strand, 12710457 - 12710863
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||  | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12710457 accacagactatcctgaaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacattcacataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttg 12710556  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa--tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtat 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12710557 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtat 12710656  T
Q  207 atagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 306  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12710657 atagctttgaaagtagaagaaaa-tagaattt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 12710754  T
Q  307 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagcacagaaac 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| |||||||||||| |||||| |    
T  12710755 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagc 12710854  T
Q  407 ttctgatga 415  Q
    ||| |||||    
T  12710855 ttcagatga 12710863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 9 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 27122909 - 27122522
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27122909 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 27122810  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 208  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27122809 ctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatat 27122710  T
Q  209 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 308  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  27122709 agctttgaaagtagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcaaaggctcaatttgatgtataagaggggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 27122612  T
Q  309 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagc 398  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||| ||||||| |||||    
T  27122611 tacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagc 27122522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 9 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 34868068 - 34867681
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34868068 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 34867969  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34867968 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtata 34867869  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 307  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  34867868 tagctttgaaaatagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactctacggat 34867771  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaag 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  34867770 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatttcatttcctggaaactttgaattcgcaag 34867681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 9 - 398
Target Start/End: Original strand, 9343843 - 9344232
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9343843 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 9343942  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 207  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  9343943 ctcaggtttgcttttcaaaatggacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattattaaaatggaaagaaaatgttttgtata 9344042  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 307  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  9344043 tagctttgaaagtagaaagaaaatagagtttt-aaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 9344141  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagc 398  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  9344142 ttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 9344232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 9 - 398
Target Start/End: Original strand, 39045678 - 39046067
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39045678 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 39045777  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  39045778 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagtattgtcattattaaaatggaaagaaaatgttttgtata 39045877  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 307  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  39045878 tagctttgaaagtagaaagaaaatagagtttt-aaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 39045976  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagc 398  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  39045977 ttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttagtggtacattgaacacagtaatcattacattttctggaaactttgaattcgcaagc 39046067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 9 - 415
Target Start/End: Original strand, 37679747 - 37680155
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37679747 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatacattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 37679846  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc--aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg-ttttgta 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37679847 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaaaatttcaattttcaaaaaatgtttgtttcaagcattgtctttatcaaaatagaaagaaaatgtttttgta 37679946  T
Q  206 tatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgg 305  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37679947 tatagctttgaaagtagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacgg 37680044  T
Q  306 attcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagcacagaa 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||||    
T  37680045 attcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcccgaaaactttgaattcacaagtacagaa 37680144  T
Q  405 acttctgatga 415  Q
     |||| |||||    
T  37680145 gcttcagatga 37680155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 9 - 415
Target Start/End: Original strand, 37695012 - 37695420
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37695012 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatacattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 37695111  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc--aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg-ttttgta 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37695112 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaaaatttcaattttcaaaaaatgtttgtttcaagcattgtctttatcaaaatagaaagaaaatgtttttgta 37695211  T
Q  206 tatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgg 305  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37695212 tatagctttgaaagtagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacgg 37695309  T
Q  306 attcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagcacagaa 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||||    
T  37695310 attcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcccgaaaactttgaattcacaagtacagaa 37695409  T
Q  405 acttctgatga 415  Q
     |||| |||||    
T  37695410 gcttcagatga 37695420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 9 - 404
Target Start/End: Original strand, 21697029 - 21697427
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  21697029 accacagactatcctggggaagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccttgttg 21697128  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaag--ttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt--g 203  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  21697129 ctcaggtttgcttt-caaaatagacaaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcatttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttttg 21697227  T
Q  204 tatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccac 303  Q
    || |||||||||||||||| |  | | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  21697228 tacatagctttgaaagtaggaagatagtagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccac 21697326  T
Q  304 ggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagcacaga 403  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  21697327 ggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacaga 21697426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 9 - 404
Target Start/End: Original strand, 16823193 - 16823588
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16823193 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacattcacataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttg 16823292  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtata 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16823293 ctcgggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtata 16823392  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 307  Q
    |||||||||||||| ||  |||| |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16823393 tagctttgaaagtaaaaagaaaacagag-tttcaaacaaaagcacagtctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggat 16823491  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagcacagaa 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||    
T  16823492 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctgggaactttgaatccacaagtacagaa 16823588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 9 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 16898287 - 16897892
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16898287 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacattcacataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttg 16898188  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtata 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16898187 ctcgggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtata 16898088  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 307  Q
    |||||||||||||| ||  |||| |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16898087 tagctttgaaagtaaaaagaaaacagag-tttcaaacaaaagcacagtctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggat 16897989  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagcacagaa 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||    
T  16897988 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctgggaactttgaatccacaagtacagaa 16897892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 9 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 31882672 - 31882284
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31882672 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacattaacatattctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccccgttg 31882573  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 207  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31882572 ctcaagtttgcttttcaaaatagaaaaaaagtttttaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgccattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 31882473  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 307  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  31882472 tagctttgaaagtagaagaaaa-tagaattt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 31882375  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagc 398  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  31882374 ttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgatacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 31882284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 9 - 415
Target Start/End: Original strand, 11629041 - 11629446
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11629041 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttg 11629139  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtat 206  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11629140 ctcaggtttgtttttcaaaatagacaaagagttttcaattttcaaaaatgtttatttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtat 11629239  T
Q  207 atagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 306  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  11629240 atagctttgaaaataaaagaaaa-tagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 11629337  T
Q  307 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagcacagaaac 406  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||| |||||||||||| |||||| |    
T  11629338 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagc 11629437  T
Q  407 ttctgatga 415  Q
    ||| |||||    
T  11629438 ttcagatga 11629446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 9 - 415
Target Start/End: Original strand, 21671026 - 21671435
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21671026 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatacattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 21671125  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagac-aaaaagttttcaattttc--aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg-ttttgt 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21671126 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaaaaatttcaattttcaaaaaatgtttgtttcaagcattgtctttatcaaaatagaaagaaaatgtttttgt 21671225  T
Q  205 atatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacg 304  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21671226 atatagctttgaaagtagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacg 21671323  T
Q  305 gattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagcacaga 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||| |||||    
T  21671324 gattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcccgaaaactttgaattcacaagtacaga 21671423  T
Q  404 aacttctgatga 415  Q
    | |||| |||||    
T  21671424 agcttcagatga 21671435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 9 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 34161232 - 34160840
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34161232 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtgacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 34161133  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa---tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgta 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34161132 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaaatgtttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgta 34161033  T
Q  206 tatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgg 305  Q
    |||||||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  34161032 tatagctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgg 34160934  T
Q  306 attcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagca 399  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||| ||||||| ||||||    
T  34160933 atttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcccagaaactttgaattcgcaagca 34160840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 9 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 32056187 - 32055798
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    |||||||| |||| ||| | ||| |||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32056187 accacagattatcttggaggagaacctgctggtaacatatattgaaatagacaccaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 32056088  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 207  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32056087 ctcaggtttgcttttcaaaataaacaaaaagttttcagttttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 32055988  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 307  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  32055987 tagctttgaaagtagaagaaaa-tagaatttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtagtcagccgaaggcgtgactccacggat 32055890  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagca 399  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  32055889 ttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgatacattgaacacagtaatcatgacatttcctggaaactttgaattcgcaagca 32055798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 31868642 - 31868979
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31868642 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacacactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 31868741  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  31868742 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtata 31868841  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 307  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  31868842 tagctttgaaagtagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 31868939  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 347  Q
    | |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31868940 ttacaatgcttgaaaaatggtaattttattggttggtggt 31868979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 9 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 34297535 - 34297152
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34297535 accacagactatcctggaggagaacccgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 34297436  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 208  Q
    ||||||||||||||||||||      |||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34297435 ctcaggtttgcttttcaaaa------aaactttttcaattttcgaaatgtttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 34297342  T
Q  209 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 308  Q
    ||||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  34297341 agctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagatt 34297243  T
Q  309 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagca 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||| ||||||| ||||||    
T  34297242 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagca 34297152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 10 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 27396718 - 27396303
Alignment:
Q  10 ccacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgc 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  27396718 ccacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcgacatacgctcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccttgttgc 27396619  T
Q  110 tcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaag----------ttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgt 199  Q
    | ||||||||||| |||||  ||||||||           |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  27396618 ttaggtttgcttt-caaaaaggacaaaaaactttttttttttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattataaagatagaaagaaaatgt 27396520  T
Q  200 ttt--gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatga 297  Q
    |||  ||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  27396519 tttttgtacatagctttgaaagtagaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtga 27396421  T
Q  298 ctccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaag 397  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||    
T  27396420 ctccacggatttacaaagcttggaaaatggcaattttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacatttcctagaaactttgaattcgcaag 27396321  T
Q  398 cacagaaacttctgatga 415  Q
    |||| || ||||||||||    
T  27396320 cacaaaagcttctgatga 27396303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 9 - 415
Target Start/End: Original strand, 19450274 - 19450689
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||  |||| |||||| ||||| |||||    
T  19450274 accacagactatcctggggaagagcctgcttataacacatattgaaatagacatcgacatacgctcactcatgcacatttcgtttgaacgtaccttgttg 19450373  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagtttt------caattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt 202  Q
    ||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||      |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19450374 ctcaggtttacttt-caaaacagacaaaaacttttttttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaagatagaaagaaaatgtttt 19450472  T
Q  203 -----gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatga 297  Q
         ||| ||| |||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||    
T  19450473 tttttgtacatacctttgaaagtagagagaaaatagagttt-caaacaaaagcacatgctcgaattgatgtataaaagtggtggtcagccgaaggcgtga 19450571  T
Q  298 ctccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaag 397  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||    
T  19450572 ttccacggatttacaaagcttggaaaatggcaattttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacatttcctagaaactttgaattcgcaag 19450671  T
Q  398 cacagaaacttctgatga 415  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  19450672 cacagaagcttctgatga 19450689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 9 - 399
Target Start/End: Original strand, 34268782 - 34269167
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||| | |||||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34268782 accacagactatcctagagaagaatctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacatacactcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttg 34268881  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gta 205  Q
    ||||||||||||||||||||       ||  ||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||    
T  34268882 ctcaggtttgcttttcaaaa-------aactttttcaatttttaagatgtttgtttcaagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgta 34268974  T
Q  206 tatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgg 305  Q
     ||| ||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  34268975 cataactttgaaagtaaaaagaaaatagagtttt-aaacaaaagcacatgctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgg 34269073  T
Q  306 attcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagca 399  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  34269074 atttacaaagcttggagaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacaacaatcatgacatttcctagaaactttgaattcacaagca 34269167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 9 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 28888660 - 28888275
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28888660 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttg 28888562  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gta 205  Q
    ||||||||||||||||||||      |||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||    
T  28888561 ctcaggtttgcttttcaaaa------aaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgta 28888468  T
Q  206 tatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgg 305  Q
     ||| ||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  28888467 cataactttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgcgactccacgg 28888369  T
Q  306 attcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagca 399  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  28888368 atttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagca 28888275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 9 - 399
Target Start/End: Original strand, 27428309 - 27428692
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  27428309 accacggactatcctgggggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacatacactcgctcatgcacgtt-cgtttgaatgtaccctgttg 27428407  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gta 205  Q
    ||||||||||||||||||||        |  ||| |||||||||| ||||||||||| | |||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| | |    
T  27428408 ctcaggtttgcttttcaaaa--------acttttgcaattttcaagatgtttgtttcgaacatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgca 27428499  T
Q  206 tatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgg 305  Q
     ||| ||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  27428500 cataactttgaaagtaaaaagaaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgg 27428598  T
Q  306 attcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagca 399  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||    
T  27428599 atttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaactcacaagca 27428692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 9 - 398
Target Start/End: Original strand, 23122434 - 23122818
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||||||||| || ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  23122434 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttg 23122532  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtat 206  Q
    ||||||||||||||||||||      |||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||     
T  23122533 ctcaggtttgcttttcaaaa------aaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaatagaaggaaaatgtttttgtac 23122626  T
Q  207 atagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 306  Q
    ||| ||||||||||| ||  |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  23122627 ataactttgaaagtaaaaagaaaacagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggtgtgactccacgga 23122725  T
Q  307 ttcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagc 398  Q
    ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  23122726 tttgcaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtgatacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagc 23122818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 9 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 20844298 - 20843909
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  20844298 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacgctcgctcatgcatgttttgtttgaatgtaccctgttg 20844199  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgttttgt-- 204  Q
    ||||||||||||||||||||     ||||  |||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| |      
T  20844198 ctcaggtttgcttttcaaaa-----aaaactttttcaattttcaagatgcttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgttttttga 20844104  T
Q  205 atatagcttt-gaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccac 303  Q
    | ||| |||| ||| ||| ||  ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||    
T  20844103 acataacttttgaaggtaaaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtgtccagccgaaggcgtgactccac 20844005  T
Q  304 ggattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagc 398  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||| ||||||| |||||    
T  20844004 ggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctaggaactttgaattcgcaagc 20843909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 9 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 23117182 - 23116993
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23117182 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 23117083  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg 198  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||   ||  ||||||||||||||| || || |||| | |||||||    
T  23117082 cccaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaatggtcaaaaacgttagttcaagcattgtcatgatgaagataggaggaaaatg 23116993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 398
Target Start/End: Original strand, 31887682 - 31887738
Alignment:
Q  342 ggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagc 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  31887682 ggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagc 31887738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 328; Significance: 0; HSPs: 24)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 404
Target Start/End: Original strand, 28355778 - 28356176
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28355778 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 28355877  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28355878 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 28355977  T
Q  209 agctttgaaagtagaag--aaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 306  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28355978 agctttgaaagtagaagaaaaaaatagaattttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 28356077  T
Q  307 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacattt-cctggaaactctgaattcacaagcacagaa 404  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   ||||| |||||||||||| ||||||    
T  28356078 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaaactttgaattcacaagtacagaa 28356176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 9361009 - 9360620
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9361009 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 9360910  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9360909 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 9360810  T
Q  209 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 308  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9360809 agctttgaaagtagaag-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 9360711  T
Q  309 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagca 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| |||| |||||| ||||||| ||||||    
T  9360710 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattggacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagca 9360620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 31360916 - 31360527
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31360916 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 31360817  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaat-gttttgtata 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  31360816 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtata 31360717  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 307  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31360716 taactttgaaagtagaag-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 31360618  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagc 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||    
T  31360617 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacacttcctggaaactttgaattcgcaagc 31360527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 9 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 33248753 - 33248365
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33248753 accacagactatcctggaggagaacctgcttataacatatattgaaatagacaccaacacacgctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 33248654  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33248653 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 33248554  T
Q  209 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  33248553 agctttgaaagtagaagaaaaatagagtttt-aaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 33248455  T
Q  309 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagc 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  33248454 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagc 33248365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 9 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 18797095 - 18796704
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18797095 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 18796996  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtata 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18796995 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtata 18796896  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  18796895 tagctttgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 18796797  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagca 399  Q
    | | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  18796796 ttataaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacggtaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaagca 18796704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 9 - 376
Target Start/End: Original strand, 31483698 - 31484067
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  31483698 accacagactatcctggaggagaacctgctcgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaaggtaccttgttg 31483797  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31483798 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 31483897  T
Q  209 agctttgaaagtagaaga--aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 306  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  31483898 agctttgaaagtagaagaacaaaatagaattttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 31483997  T
Q  307 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcc 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31483998 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcc 31484067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 9 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 19680835 - 19680430
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19680835 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcgtgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 19680736  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  19680735 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatat 19680636  T
Q  209 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 308  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  19680635 agctttgaaaatagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 19680538  T
Q  309 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacattt-cctggaaactctgaattcacaagcacagaaact 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   ||||| |||||||||||| |||||| ||    
T  19680537 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaaactttgaattcacaagtacagaagct 19680438  T
Q  408 tctgatga 415  Q
    || |||||    
T  19680437 tcagatga 19680430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 9 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 29835710 - 29835317
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    |||||||| |||| ||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29835710 accacagattatcttggaggagaacctgctcgtaacacatattgaaatagacaccaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 29835611  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  29835610 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatat 29835511  T
Q  209 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 308  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  29835510 agctttgaaagtagaag-aaaatggagttttcaaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 29835412  T
Q  309 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagcacaga 403  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||| |||||    
T  29835411 tacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcccgaaaactttgaattcacaagtacaga 29835317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 9 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 44567371 - 44566979
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    |||||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44567371 accacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgcttatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 44567272  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa----tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgt 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44567271 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgt 44567172  T
Q  205 atatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacg 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  44567171 atatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaaattgatgtatgagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacg 44567074  T
Q  305 gattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcct-ggaaactctgaattcacaagc 398  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||    
T  44567073 gatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctgggaaactttgaattcgcaagc 44566979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 9 - 415
Target Start/End: Original strand, 12086551 - 12086958
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    |||||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12086551 accacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacattaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaacgtaccctgttg 12086650  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 207  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12086651 ctcaggcttgcttttcaaaacagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 12086750  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 307  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12086751 cagctttgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaacagcacaagctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggat 12086849  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagcacagaaac 406  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| | |||||| |||||||||||| |||||| |    
T  12086850 tcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagc 12086949  T
Q  407 ttctgatga 415  Q
    || ||||||    
T  12086950 ttttgatga 12086958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 9 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 15773962 - 15773573
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15773962 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 15773863  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15773862 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaagagaaagaaaatgttttgtata 15773763  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 307  Q
    ||||| |||||||| ||  |||  |||| ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  15773762 tagctctgaaagtaaaaagaaagcagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgacgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 15773664  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagc 398  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||| ||||||| |||||    
T  15773663 ttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagc 15773573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 9 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 18715870 - 18715478
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18715870 accacagactatcctggaggagaacccgcttgtaacatatattgaaatagtcatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 18715771  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc----aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgt 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18715770 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaatttttcaaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgt 18715671  T
Q  205 atatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacg 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  18715670 atatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagaggggtggtcagccgaaggcgtgactccacg 18715573  T
Q  305 gattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagca 399  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  18715572 gatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtgatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagca 18715478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 9 - 391
Target Start/End: Original strand, 21341998 - 21342381
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    |||||||||||| |||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21341998 accacagactattctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 21342097  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21342098 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgcttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtata 21342197  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 307  Q
    |||||||||||||| ||  |||  |||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  21342198 tagctttgaaagtaaaaagaaagcagag-tttcaaacagaagcacaggctcaaatcgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 21342296  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaatt 391  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||    
T  21342297 ttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcctagaaactttgaatt 21342381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 9 - 391
Target Start/End: Original strand, 19910990 - 19911374
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19910990 accacagactatcttggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 19911089  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagtttt-caattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt--gta 205  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  19911090 ctcaggtttgctttcaaaaatagacaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttttgta 19911189  T
Q  206 tatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgg 305  Q
     ||||||||||||||| ||   |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  19911190 catagctttgaaagtaaaaaggaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgg 19911288  T
Q  306 attcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaatt 391  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||    
T  19911289 atttacaaagcttggaaaaaggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatctcctagaaactttgaatt 19911374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 48 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 33265079 - 33264729
Alignment:
Q  48 tattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaat 147  Q
    |||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33265079 tattgaaatagacattgacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagtttttaat 33264980  T
Q  148 tttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaa 246  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||    
T  33264979 tttcaaaaatgttcgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttcgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagaattt-caaacaa 33264882  T
Q  247 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 346  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33264881 aagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 33264782  T
Q  347 tacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagca 399  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||| | |||| ||||||| ||||||    
T  33264781 tacattgaacacagtaatcatggcatttcctaggaactttgaattcgcaagca 33264729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 9 - 415
Target Start/End: Original strand, 19202203 - 19202598
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    |||||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19202203 accacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaacagacatcgacatactctcgcttatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttg 19202302  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  19202303 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatat 19202402  T
Q  209 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 308  Q
    |||||||           ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  19202403 agctttg-----------aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 19202490  T
Q  309 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaa-actctgaattcacaagcacagaaact 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   || ||| |||||||||||| |||||||||    
T  19202491 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaagactttgaattcacaagtacagaaact 19202590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 10 - 415
Target Start/End: Original strand, 22074758 - 22075164
Alignment:
Q  10 ccacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgc 109  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||    
T  22074758 ccacagactatcctagggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcgacatacgctcgctcatgcacgtttcgtttgaatgtaccttgttgc 22074857  T
Q  110 tcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt---gtat 206  Q
    ||| | ||||||| ||||| ||||||||| ||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||     
T  22074858 tcatgcttgcttt-caaaacagacaaaaacttttttattttcaagaagtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttttgtac 22074956  T
Q  207 atagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 306  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  22074957 atagctttgaaagtagaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcctaggctcgaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 22075055  T
Q  307 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagcacagaaac 406  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||| || |    
T  22075056 tttacaaagcttggaaaatggcaattttattggttggtggtacattgaacacggcaaccactacatttcctagaaactttgaattcgcaaacacaaaagc 22075155  T
Q  407 ttctgatga 415  Q
    |||||||||    
T  22075156 ttctgatga 22075164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 9 - 415
Target Start/End: Original strand, 27602742 - 27603141
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  27602742 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttg 27602840  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gta 205  Q
    | ||||||||||||||||||        || |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||    
T  27602841 cacaggtttgcttttcaaaa--------aacttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgta 27602932  T
Q  206 tatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgg 305  Q
     ||||||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27602933 catagctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtctaagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgg 27603031  T
Q  306 attcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagcacagaaa 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | |||||| |||||||||||| ||||||     
T  27603032 attcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaag 27603131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 139 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 16260480 - 16260205
Alignment:
Q  139 gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttt 238  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16260480 gttttcgattttcaaaatgtttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagttt 16260382  T
Q  239 tcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16260381 tcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccgcggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattg 16260282  T
Q  339 gttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagcacagaaacttctgatga 415  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||| |||||| |||||| ||| ||||||    
T  16260281 gttggtggtacattgaacacagcaatcactacatttcttagaaactttgaatccacaagtacagaagcttttgatga 16260205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 9 - 399
Target Start/End: Original strand, 19655175 - 19655562
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  19655175 accaaagactatcctggggaagagtctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacatacactcgctcatgcacgttttgtttgaatgtaccctgttg 19655274  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gta 205  Q
    |||||||||||||| |||||      |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||    
T  19655275 ctcaggtttgcttt-caaaa------aaaacttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgta 19655367  T
Q  206 tatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgg 305  Q
     ||| ||||||||||| ||  ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  19655368 cataactttgaaagtaaaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgagactccacgg 19655466  T
Q  306 attcacaaagcttggaaaatggtaa--ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagca 399  Q
    ||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  19655467 atttacaaagcttggaaaatggtaattttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagca 19655562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 9 - 398
Target Start/End: Original strand, 2131096 - 2131479
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  2131096 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttg 2131194  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gta 205  Q
    |||||||||||||||||||        ||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||    
T  2131195 ctcaggtttgcttttcaaag-------aactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgta 2131287  T
Q  206 tatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgg 305  Q
     ||| ||||||||||| ||  ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  2131288 cataactttgaaagtaaaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgcgactccacgg 2131386  T
Q  306 attcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagc 398  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  2131387 atttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgatacattgaacacatcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagc 2131479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 9 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 22139288 - 22138904
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  22139288 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacatacactcgctcatgcacgtttcatttcaatgtaccctgttg 22139189  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gta 205  Q
    |||| ||||||||| |||||        |  |||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||    
T  22139188 ctcaagtttgcttt-caaaa--------actttttcaattttcaagacgtttgtttcaagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgta 22139098  T
Q  206 tatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgg 305  Q
     ||| ||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  22139097 cataactttgaaagtaaaaagaaaatagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgg 22138999  T
Q  306 attcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagca 399  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  22138998 atttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacaacaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagca 22138904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 9 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 19694479 - 19694094
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  19694479 accacagactatcctggaggagaacttgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttg 19694381  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gta 205  Q
    ||||||||||||||||||||      |||  |||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||    
T  19694380 ctcaggtttgcttttcaaaa------aaactttttcaattttcaagatgcttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgta 19694287  T
Q  206 tatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgg 305  Q
     ||| ||||||||||| ||  |||   ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  19694286 cataactttgaaagtaaaaagaaagcggagtttt-aaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgg 19694188  T
Q  306 attcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagc 398  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  19694187 atttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagc 19694094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 9 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 14569542 - 14569180
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    |||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  14569542 accacagaatatcctggaggagaacctgcttgtaacatgtattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttg 14569444  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgttttgtat 206  Q
    ||||||||||  ||||||||       ||  |||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| | |    
T  14569443 ctcaggtttgtctttcaaaa-------aactttttcaattttcaagatgcttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttttt 14569351  T
Q  207 -----atagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactcc 301  Q
         ||| ||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  14569350 tgaacataactttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactcc 14569252  T
Q  302 acggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatt 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  14569251 acggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacaacaatcattacatt 14569180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 326; Significance: 0; HSPs: 11)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 3647536 - 3647147
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3647536 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 3647437  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3647436 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 3647337  T
Q  209 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 308  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  3647336 agctttgaaagtagaagaaaaatggagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 3647237  T
Q  309 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagc 398  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  3647236 tacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccattacatttcctagaaactttgaattcgcaagc 3647147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 10969056 - 10968666
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||| ||||||| | ||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10969056 accacagaccatcctggaggagaacctgtttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 10968957  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10968956 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatattttgtatat 10968857  T
Q  209 agctttgaaagtagaaga-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 307  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10968856 agctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 10968757  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagc 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||| ||||||| |||||    
T  10968756 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcaggacatctcctagaaactttgaattcgcaagc 10968666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 9 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 10951482 - 10951100
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    |||||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10951482 accacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcgacatactctcgcttatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttg 10951383  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 208  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10951382 ctcaggtttacttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaataaaaagaaaatgttttgtatat 10951283  T
Q  209 agctttgaaagtagaaga-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 307  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10951282 agctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacagat 10951183  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaat 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  10951182 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaat 10951100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 9 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 28591472 - 28591085
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28591472 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcgacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 28591373  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28591372 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagagaatgttttgtatat 28591273  T
Q  209 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 308  Q
    ||||||||||||| ||  |||  |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28591272 agctttgaaagtaaaaagaaagcagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggatt 28591174  T
Q  309 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaag 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  28591173 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaag 28591085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 9 - 415
Target Start/End: Original strand, 20334281 - 20334689
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20334281 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 20334380  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagtttt-caattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt---gt 204  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||    
T  20334381 ctcaggtttgcttt-caaaatagacaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttttgt 20334479  T
Q  205 atatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacg 304  Q
    | ||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  20334480 acatagctttgaaagtagaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcacaatttcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatg 20334578  T
Q  305 gattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagcacagaa 404  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  20334579 gatttacaaggcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacagaa 20334678  T
Q  405 acttctgatga 415  Q
     |||| |||||    
T  20334679 gcttcagatga 20334689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 33 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 51644588 - 51644204
Alignment:
Q  33 cctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaataga 132  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51644588 cctgcttgtaacatatattgaaatagacatcgacatactctcgcttatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaataga 51644489  T
Q  133 caaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaa- 230  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  51644488 caaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaaa 51644389  T
Q  231 tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaa 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  51644388 tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtgtaagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaa 51644289  T
Q  331 ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagcacagaaacttctgatga 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| | |||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  51644288 ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttttgatga 51644204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 9 - 398
Target Start/End: Original strand, 41787175 - 41787566
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41787175 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 41787274  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc---aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgta 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41787275 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaaatgtttgtttcgagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgta 41787374  T
Q  206 tatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgg 305  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||    
T  41787375 tatagctttgaaagtagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccggaggcgtgaccccacgg 41787472  T
Q  306 attcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagc 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  41787473 attcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 41787566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 9 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 28156118 - 28155726
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28156118 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 28156019  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc----aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgt 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28156018 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgt 28155919  T
Q  205 atatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacg 304  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  28155918 atatagctttgaaagtagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagaggggtggtcagccgaaggcgtgactccacg 28155821  T
Q  305 gattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagca 399  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  28155820 gatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtgatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagca 28155726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 9 - 415
Target Start/End: Original strand, 16201893 - 16202307
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16201893 accacagactatcctggagaagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatacgctcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttg 16201992  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaag---ttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt- 202  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  16201993 ctcaggtttgcttt-caaaatagacgaaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcatttgtcattatcaaaaatagaaagaaaatgttttt 16202091  T
Q  203 ----gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgac 298  Q
        ||| || |||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  16202092 ttttgtacatggctttgaaagtaaaaagaaaatagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgac 16202190  T
Q  299 tccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagc 398  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  16202191 tccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaattactacatgtcctggaaactttgaattcgcaagc 16202290  T
Q  399 acagaaacttctgatga 415  Q
    |||| | ||||||||||    
T  16202291 acaggagcttctgatga 16202307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 9 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 20467175 - 20466761
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||| || ||    
T  20467175 accacagactatcatggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatacactcgctcacgcatgtttcgtttgaatgtaccttgctg 20467076  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttc--------aattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg-- 198  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  || ||||         |||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||      
T  20467075 ctcaggtttgcttt-caaaatagacaggaactttttttttttctaattttgaagatgtttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatggt 20466977  T
Q  199 ttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgac 298  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||  ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  20466976 ttttgtacatagctttgaaagtggaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgac 20466878  T
Q  299 tccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagc 398  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||  |||||    
T  20466877 tccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaacgactacatttcctagaaactttgaatttgcaagc 20466778  T
Q  399 acagaaacttctgatga 415  Q
    | |||| ||||||||||    
T  20466777 atagaagcttctgatga 20466761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 9 - 415
Target Start/End: Original strand, 21891628 - 21892020
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  21891628 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcgacacacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttg 21891726  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgttttgtat 206  Q
    |||||||||||||||||||| | ||      |||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||||        
T  21891727 ctcaggtttgcttttcaaaaaaaactt----ttttcaattttcaagatgcttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttt---- 21891818  T
Q  207 atagctttgaaagtagaagaaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgg 305  Q
           ||||  || || | ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  21891819 -------tgaacataaaaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgg 21891910  T
Q  306 attcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagcacagaaa 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  21891911 attcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacatagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaag 21892010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 323; Significance: 0; HSPs: 32)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 398
Target Start/End: Original strand, 26678856 - 26679246
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26678856 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccccgttg 26678955  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26678956 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcattgtcgttatcaaaatataaagaaaatgttttgtatat 26679055  T
Q  209 agctttgaaagtagaag-aaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 307  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26679056 agctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagtaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 26679155  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagc 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  26679156 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 26679246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 415
Target Start/End: Original strand, 5141086 - 5141493
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5141086 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacataccctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 5141185  T
Q  109 ctcaggtttgctttt-caaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtat 206  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  5141186 ctcaggtttgctttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtat 5141285  T
Q  207 atagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 306  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5141286 ataactttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 5141384  T
Q  307 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagcacagaaac 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | |||||| |||||||||||| |||||| |    
T  5141385 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagc 5141484  T
Q  407 ttctgatga 415  Q
    ||| |||||    
T  5141485 ttcagatga 5141493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 9 - 398
Target Start/End: Original strand, 26663664 - 26664054
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26663664 accacagactatcctggaggggaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccccgttg 26663763  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26663764 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcattgtcgttatcaaaatataaagaaaatgttttgtatat 26663863  T
Q  209 agctttgaaagtagaag-aaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 307  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26663864 agctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagtaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 26663963  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagc 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  26663964 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 26664054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 9 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 26441639 - 26441238
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26441639 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacacactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 26441540  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26441539 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatat 26441440  T
Q  209 agctttgaaagtagaag-aaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 307  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26441439 agctttgaaagtaaaagaaaaaatggagtttttaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggcggtcagccaaaggcatgactccacggat 26441340  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagcacagaaact 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | |||||| |||||||||||| |||||| ||    
T  26441339 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcatagaaactttgaattcacaagtacagaagct 26441240  T
Q  408 tc 409  Q
    ||    
T  26441239 tc 26441238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 9 - 415
Target Start/End: Original strand, 16745272 - 16745679
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||  | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  16745272 accacagactatcctgaaggagaacttgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcattcatgcatgtttcgtttgaatataccctgttg 16745371  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa--tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtat 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16745372 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtat 16745471  T
Q  207 atagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 306  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16745472 atagctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 16745570  T
Q  307 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagcacagaaac 406  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||| ||||||| ||||||||||| |    
T  16745571 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaactttgaattcgcaagcacagaagc 16745670  T
Q  407 ttctgatga 415  Q
    ||| |||||    
T  16745671 ttcagatga 16745679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 9 - 376
Target Start/End: Original strand, 4138997 - 4139366
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    |||||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4138997 accacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 4139096  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4139097 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 4139196  T
Q  209 agctttgaaagtagaaga--aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 306  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  4139197 agctttgaaagtagaagaacaaaatagaattttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 4139296  T
Q  307 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcc 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4139297 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcc 4139366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 9 - 398
Target Start/End: Original strand, 39206891 - 39207280
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39206891 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacattaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 39206990  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 207  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  39206991 ctcaggtttgcttttcaaaataaacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatattttgtata 39207090  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 307  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39207091 tagctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 39207189  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagc 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||    
T  39207190 tcacaaagcttggaaaatggtaattttatcggttggtggtacattgaacacagcaatcattacacttcctggaaactttgaattcgcaagc 39207280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 9 - 404
Target Start/End: Original strand, 24586287 - 24586682
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24586287 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 24586386  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24586387 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaataggaagaaaatgttttgtatat 24586486  T
Q  209 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  24586487 agctttgaaagtagaagaaaaatagagtctt-aaacgaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 24586585  T
Q  309 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacattt-cctggaaactctgaattcacaagcacagaa 404  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   ||||| |||||||||||| ||||||    
T  24586586 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaaactttgaattcacaagtacagaa 24586682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 9 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 5164769 - 5164387
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5164769 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttggatgtaccctgttg 5164670  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5164669 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgttattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 5164570  T
Q  209 a-gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 307  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  5164569 aggctttgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaagcgtgactccacggat 5164471  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaatt 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||    
T  5164470 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcctagaaactttgaatt 5164387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 9 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 26519176 - 26518789
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26519176 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcgtgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 26519077  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  26519076 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatat 26518977  T
Q  209 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 308  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  26518976 agctttgaaaatagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 26518879  T
Q  309 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagc 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  26518878 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 26518789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 9 - 398
Target Start/End: Original strand, 31558146 - 31558535
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31558146 accacagactatcctgaaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 31558245  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  31558246 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagtattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtata 31558345  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 307  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  31558346 tagctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaacttgatgtataaaagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 31558444  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagc 398  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  31558445 ttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtgatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 31558535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 9 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 5154468 - 5154079
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5154468 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttggatgtaccctgttg 5154369  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5154368 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 5154269  T
Q  209 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 308  Q
    ||||||||||||| ||  |||  |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  5154268 agctttgaaagtaaaaagaaagcagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 5154170  T
Q  309 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagca 399  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  5154169 tacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagca 5154079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 9 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 11447273 - 11446867
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||  | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  11447273 accacagactatcctgaaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacattcacataccctcgctcatgcatgtttcacttgattgtaccctgttg 11447174  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc--aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtat 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11447173 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaatttttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtat 11447074  T
Q  207 atagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 306  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11447073 atagctttgaaagtagaagaaaa-tagaattt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacgga 11446976  T
Q  307 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagcacagaaac 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||| |    
T  11446975 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagc 11446876  T
Q  407 ttctgatga 415  Q
    || ||||||    
T  11446875 ttttgatga 11446867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 33 - 399
Target Start/End: Original strand, 26509471 - 26509839
Alignment:
Q  33 cctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaataga 132  Q
    ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26509471 cctgcttgtgacatgtattgaaatagacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaataga 26509570  T
Q  133 caaaaag-ttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaat 231  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26509571 caaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaat 26509670  T
Q  232 agagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaa- 330  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  26509671 ggagttttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaat 26509770  T
Q  331 ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagca 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  26509771 ttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagca 26509839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 9 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 16047697 - 16047294
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  16047697 accacagactatcccggggaagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcgacatacgctcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtatcctgttg 16047598  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 208  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||    
T  16047597 ctcaggcttgcttt-caaaatagacaaaaacttttcaattttcaggatgtttgtttcaagcattgtcattatcaagatagaaagaaaat-ttttgtacat 16047500  T
Q  209 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 308  Q
    |||||||| |||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16047499 agctttgacagtagaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 16047401  T
Q  309 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagcacagaaactt 408  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||    
T  16047400 tacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacatagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacagaagctt 16047301  T
Q  409 ctgatga 415  Q
    |||||||    
T  16047300 ctgatga 16047294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 9 - 401
Target Start/End: Original strand, 16443755 - 16444148
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16443755 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatgctcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttg 16443854  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagtttt-caattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt--gta 205  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||    
T  16443855 ctcaggtttgcttt-caaaatagacaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaagatagaaagaaaatgttttttgta 16443953  T
Q  206 tatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgg 305  Q
     ||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  16443954 catagctttgaaagtagaaagaaagtagagtttt-aaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcaggcgaaggcgtgactccacgg 16444052  T
Q  306 attcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagcaca 401  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||    
T  16444053 atttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaacgactacatttcttagaaactttgaattcgcaagcaca 16444148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 9 - 415
Target Start/End: Original strand, 26268837 - 26269247
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26268837 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 26268936  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa----tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-g 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26268937 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttg 26269036  T
Q  204 tatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccac 303  Q
    || ||||||||||||||| ||  |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  26269037 tacatagctttgaaagtaaaaagaaaacagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccac 26269135  T
Q  304 ggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagcacaga 403  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| | |||||| |||||||||||| |||||    
T  26269136 ggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacagttcttagaaactttgaattcacaagtacaga 26269235  T
Q  404 aacttctgatga 415  Q
    | ||| ||||||    
T  26269236 agcttttgatga 26269247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 9 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 2160957 - 2160566
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2160957 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 2160858  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagtttt-caattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt--gta 205  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  2160857 ctcagatttgctttcaaaaatagacaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttttgta 2160758  T
Q  206 tatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgg 305  Q
     ||||||||||||||| ||   |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  2160757 catagctttgaaagtaaaaaggaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgg 2160659  T
Q  306 attcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagc 398  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  2160658 atttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgatacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 2160566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 9 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 45393604 - 45393216
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45393604 accacagactatcctgaaggagaacctgcttgtaacatatactgaaatggacatcaccatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 45393505  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  45393504 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaggcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtgta 45393405  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 307  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45393404 tagctttgaaagtagaagaaaagtagagtttt-aaacaaaagcacaagctcaaattgatgtgtaagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggat 45393306  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaag 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||    
T  45393305 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcttagaaactttgaatccacaag 45393216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 9 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 45737688 - 45737296
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45737688 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagatatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 45737589  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc----aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgt 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45737588 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgt 45737489  T
Q  205 atatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacg 304  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  45737488 atatagctttgaaagtagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagaggggtggtcagccgaaggcgtgactccacg 45737391  T
Q  305 gattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagca 399  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  45737390 gatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtgatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagca 45737296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 9 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 4205774 - 4205368
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    |||||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4205774 accacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacaccaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 4205675  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaatttt-caaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  4205674 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaatttttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtata 4205575  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 307  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  4205574 tagctttgaaaatagaagaaaa-tagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 4205477  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacattt-cctggaaactctgaattcacaagcacagaaac 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   ||||| |||||||||||| |||||| |    
T  4205476 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaaactttgaattcacaagtacagaagc 4205377  T
Q  407 ttctgatga 415  Q
    ||| |||||    
T  4205376 ttcagatga 4205368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 9 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 3451704 - 3451297
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    |||||| |||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||  |||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  3451704 accacatactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattggaatagacattcacataccctcgctcatgcatgttccatttgattgtaccctgttg 3451605  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa---tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgta 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3451604 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgta 3451505  T
Q  206 tatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgg 305  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3451504 tatagctttgaaagtagaagaaaa-tagaattt-caaacaaaagcaccagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgg 3451407  T
Q  306 attcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagcacagaaa 405  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||| |||||||||||| ||||||     
T  3451406 attcacaaaacttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtgatcactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaag 3451307  T
Q  406 cttctgatga 415  Q
    |||| |||||    
T  3451306 cttcagatga 3451297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 9 - 391
Target Start/End: Original strand, 11418531 - 11418913
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11418531 accacagactatcctggaggaggacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcgtgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 11418630  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 207  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11418631 ctcaggtttgcttttcaaaacagacagaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtata 11418730  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 307  Q
    |||||||||||||| ||  ||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  11418731 tagctttgaaagtaaaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaatcgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 11418829  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaatt 391  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||    
T  11418830 ttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcctagaaactttgaatt 11418913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 9 - 415
Target Start/End: Original strand, 26313601 - 26314006
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    |||||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26313601 accacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcgacatactctcgcttatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttg 26313700  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  26313701 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatat 26313800  T
Q  209 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 308  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  26313801 agctttgaaaatagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 26313898  T
Q  309 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacattt-cctggaaactctgaattcacaagcacagaaact 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   ||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  26313899 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaaactttgaattcataagtacagaaact 26313998  T
Q  408 tctgatga 415  Q
    || |||||    
T  26313999 tcagatga 26314006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 9 - 415
Target Start/End: Original strand, 31084374 - 31084781
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    |||||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31084374 accacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcgacatactctcgcttatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttg 31084473  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31084474 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaaaatttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgccattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 31084573  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  31084574 tagctttgaaagtagaagaaaaataga-atttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcaaccgaaggcgtgactccacggat 31084672  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagcacagaaac 406  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||   ||||| |||||||||||| |||||| |    
T  31084673 tcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagc 31084772  T
Q  407 ttctgatga 415  Q
    ||| |||||    
T  31084773 ttcagatga 31084781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 9 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 26596055 - 26595750
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26596055 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 26595956  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  26595955 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaataaaaagaaaatgtgttgtata 26595856  T
Q  208 tagctttgaaagtagaag-aaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 306  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26595855 tagctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 26595756  T
Q  307 ttcaca 312  Q
    ||||||    
T  26595755 ttcaca 26595750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 9 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 2779631 - 2779247
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    |||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2779631 accaaagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtctcatttgaatgtaccctgttg 2779532  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 208  Q
    ||||||||||||||||||||     ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2779531 ctcaggtttgcttttcaaaa-----aaaactttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 2779437  T
Q  209 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 308  Q
    ||||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  2779436 agctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 2779338  T
Q  309 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagca 399  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||| ||||||| ||||||    
T  2779337 tacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagca 2779247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 9 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 31130284 - 31129900
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    |||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31130284 accacagattatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtctcatttgaatgtaccctgttg 31130185  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 208  Q
    ||||||||||||||||||||     ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31130184 ctcaggtttgcttttcaaaa-----aaaactttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 31130090  T
Q  209 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 308  Q
    ||||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  31130089 agctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 31129991  T
Q  309 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagca 399  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||| ||||||| ||||||    
T  31129990 tacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagca 31129900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 9 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 10847970 - 10847562
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||  ||| |||||||| ||||| |||||| ||||| |||||    
T  10847970 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacat--tgaaatagacatcgacatacgctcactcatgcacgtttcgtttgaacgtaccttgttg 10847873  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaag---ttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt--- 202  Q
    ||||||||| |||| ||||| |||||||||    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||       
T  10847872 ctcaggtttacttt-caaaacagacaaaaaacttttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaagatagaaagaaaatgttttttt 10847774  T
Q  203 gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactcca 302  Q
    ||| |||||||||||||||||   |||||||||||| || ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  10847773 gtacatagctttgaaagtagagagaaaatagagttt-cagacaaaagcacaggctcgaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactcca 10847675  T
Q  303 cggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagcacag 402  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  10847674 cggatttacaaagcttggaaaatggcaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacatttcctagaaactttgaattcgcaagcacag 10847575  T
Q  403 aaacttctgatga 415  Q
    || ||||||||||    
T  10847574 aagcttctgatga 10847562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 9 - 398
Target Start/End: Original strand, 10910678 - 10911061
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||    
T  10910678 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacatacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccatgttg 10910776  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gta 205  Q
    ||||||||||||||||||||       ||  |||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||    
T  10910777 ctcaggtttgcttttcaaaa-------aactttttcaattttcaagatgcttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgta 10910869  T
Q  206 tatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgg 305  Q
     ||| ||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  10910870 cataactttgaaagtaaaaagaaaatagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgg 10910968  T
Q  306 attcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagc 398  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| || |||| |||||    
T  10910969 atttacaaagcttggaaaatggtaattttatgggttagtgatacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgtattcgcaagc 10911061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 11 - 399
Target Start/End: Original strand, 16512194 - 16512576
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16512194 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatgttgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatatttcatttgaatgtaccctgttgct 16512293  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtata 207  Q
    ||||||||||||||||||        |  ||| ||||| |||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| |    
T  16512294 caggtttgcttttcaaaa--------acttttccaattatcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtaca 16512385  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 307  Q
    || ||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  16512386 taactttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaggcttaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 16512484  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagca 399  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  16512485 ttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagca 16512576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 313 - 398
Target Start/End: Original strand, 26531926 - 26532011
Alignment:
Q  313 aagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagc 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  26531926 aagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 26532011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0547 (Bit Score: 311; Significance: 1e-175; HSPs: 1)
Name: scaffold0547
Description:

Target: scaffold0547; HSP #1
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 9 - 399
Target Start/End: Original strand, 9508 - 9897
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9508 accacagactatcctggaggagaacctgcttataacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 9607  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9608 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 9707  T
Q  209 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  9708 agctttgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaagcgtgactccacggatt 9806  T
Q  309 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagca 399  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  9807 tacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgatacattgaacacagtaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagca 9897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0792 (Bit Score: 303; Significance: 1e-170; HSPs: 1)
Name: scaffold0792
Description:

Target: scaffold0792; HSP #1
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 9 - 399
Target Start/End: Original strand, 4469 - 4862
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4469 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 4568  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtat 206  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4569 ctcaggtttgctttcaaaaatagacaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtat 4668  T
Q  207 atagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  4669 atagctttgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 4767  T
Q  307 ttcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattgg-ttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagca 399  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  4768 ttcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggtttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaagca 4862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 293; Significance: 1e-164; HSPs: 2)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 9 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 2045 - 1639
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    |||||||||||||| || | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  2045 accacagactatcccggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacattaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgatcgtaccctgttg 1946  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 207  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  1945 ctcaggtttgcttttcaaagtaaacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatggaaggaaaatgttttgtata 1846  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 307  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  1845 tagctttgaaagtagaag-aaaatagag-tttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 1748  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagcacagaaac 406  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  1747 ttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcataagcacagaaac 1648  T
Q  407 ttctgatga 415  Q
    |||||||||    
T  1647 ttctgatga 1639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322; HSP #2
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 9 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 12445 - 12028
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12445 accacagactatcctggagaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacataccctcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttg 12346  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg--------- 198  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||             
T  12345 ctcaggtttgc-tttcaaaatagacaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagcaaatgttttttttt 12247  T
Q  199 --ttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctc-aaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcat 295  Q
      |||| || ||||||||||||||||||  | | ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  12246 ttttttttacatagctttgaaagtagaaagatagtagag-tttcaaacaaaagcacaggctcaaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgt 12148  T
Q  296 gactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcaca 395  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||    
T  12147 gactccatggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacatagtaatcactacatttcctggaaactttgagttcgca 12048  T
Q  396 agcacagaaacttctgatga 415  Q
    || |||||| ||||||||||    
T  12047 agtacagaagcttctgatga 12028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 288; Significance: 1e-161; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 9 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 18975 - 18584
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18975 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 18876  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc---aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgta 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18875 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaaatgtttgtttcgagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgta 18776  T
Q  206 tatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgg 305  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||    
T  18775 tatagctttgaaagtagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccggaggcgtgaccccacgg 18678  T
Q  306 attcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagc 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  18677 attcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 18584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 288; Significance: 1e-161; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 9 - 399
Target Start/End: Original strand, 8795 - 9184
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8795 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 8894  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 207  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8895 ctcaagtttgcttttcaaaatagacaaaaagtttttaattttcaaaaatgttcgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 8994  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 307  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8995 tagctttgaaagtagaagaaaa-tagaattt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggat 9092  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagca 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||   ||||| ||||||| ||||||    
T  9093 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcccaaaaactttgaattcgcaagca 9184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 284; Significance: 1e-159; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 9 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 15964 - 15551
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15964 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 15865  T
Q  109 ctcaggtttgctttt-caaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa------tgtttgtttcaagcattgtcattatc-aaaatagaaagaaaatgtt 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||| |||||||||||  |  ||||||||| |||||||||    
T  15864 ctcaggtttgctttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaaaaaatgtttgtttcgagcattgtcatcgtttaaaatagaaggaaaatgtt 15765  T
Q  201 ttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15764 ttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactc 15666  T
Q  301 cacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagcac 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| | |||||| |||||||||||| ||    
T  15665 cacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtac 15566  T
Q  401 agaaacttctgatga 415  Q
    |||| ||| ||||||    
T  15565 agaagcttttgatga 15551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 284; Significance: 1e-159; HSPs: 2)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 9 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 10301 - 9912
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10301 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgcttatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 10202  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10201 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaaacattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtata 10102  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 307  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||    
T  10101 tagctttgaaaatagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgacttcatggat 10004  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagca 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  10003 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgatacattgaacacagtaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagca 9912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #2
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 9 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 33682 - 33295
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33682 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttg 33584  T
Q  109 ctcaggtttgctttt-caaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gta 205  Q
    ||||||||||||||| |||||     ||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||    
T  33583 ctcaggtttgcttttacaaaa-----aaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaatagaaggaaaatgtttttgta 33489  T
Q  206 tatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgg 305  Q
     ||| ||||||||||| ||  |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  33488 cataactttgaaagtaaaaagaaaacagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgg 33390  T
Q  306 attcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagca 399  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  33389 atttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtgatacattgaacacaacaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagca 33295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 273; Significance: 1e-152; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 9 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 14338 - 13931
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    |||||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14338 accacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacattaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaacgtaccctgttg 14239  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 207  Q
    |||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14238 ctcaggcttgcttttcaaaacacacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 14139  T
Q  208 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 307  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14138 cagctttgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaacagcacaagctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggat 14040  T
Q  308 tcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagcacagaaac 406  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| | |||||| |||||||||||| |||||| |    
T  14039 tcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagc 13940  T
Q  407 ttctgatga 415  Q
    || ||||||    
T  13939 ttttgatga 13931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 248; Significance: 1e-137; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 10 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 25510 - 25097
Alignment:
Q  10 ccacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgc 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  25510 ccacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcgacatacgctcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccttgttgc 25411  T
Q  110 tcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaag-------ttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt 202  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  25410 tcaggtttgcttt-caaaacagacaaaaaacttttttttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaagatagaaagataatgtttt 25312  T
Q  203 ---gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgact 299  Q
       ||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||    
T  25311 ttcgtacatagctttgaaagtagaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcgcaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggtgtgact 25213  T
Q  300 ccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagca 399  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||    
T  25212 ccacggatttacaaagcttggaaaatggcaattttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacatttcctagaaactttgaatttgcaagca 25113  T
Q  400 cagaaacttctgatga 415  Q
    ||||| ||||||||||    
T  25112 cagaagcttctgatga 25097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 9 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 6451 - 6065
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6451 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 6352  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgttttgt-- 204  Q
    ||||||||||||||||||||       ||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| |      
T  6351 ctcaggtttgcttttcaaaa-------aactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgttttttga 6259  T
Q  205 atatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacg 304  Q
    | ||| ||||||||||| ||  ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  6258 acataactttgaaagtaaaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcacaggctcaatatgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacg 6160  T
Q  305 gattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagc 398  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  6159 gatttacaaagcttggaaaatggtaatttttactggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagc 6065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 9 - 391
Target Start/End: Original strand, 24772 - 25150
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  24772 accacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaacagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttg 24870  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gta 205  Q
    ||||||||| ||||||||||      |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||    
T  24871 ctcaggttttcttttcaaaa------aaaaattttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgta 24964  T
Q  206 tatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgg 305  Q
     ||| ||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  24965 cataactttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgg 25063  T
Q  306 attcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaatt 391  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||    
T  25064 atttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacccagcaatcattacatttcctagaaactttgaatt 25150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 9 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 175 - 1
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  175 accacagactatcctagggaagagcctgcttgtagcacatattgaaatagacatcaacatacacttgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttg 76  T
Q  109 ctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaa 183  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  75 ctcaggtttgc-tttcaaaatagacaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaa 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0288 (Bit Score: 123; Significance: 5e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0288
Description:

Target: scaffold0288; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 237 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 537 - 359
Alignment:
Q  237 tttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttat 336  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  537 tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtatgagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttat 438  T
Q  337 tggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagcacagaaacttctgatga 415  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| | |||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  437 tggttggtggtacattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttttgatga 359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241 (Bit Score: 95; Significance: 3e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0241
Description:

Target: scaffold0241; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 253 - 415
Target Start/End: Original strand, 26243 - 26405
Alignment:
Q  253 aggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacatt 352  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  26243 aggctcgaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgacttcacagatttacaaagcttgaaaaatggaaattttatttgttggtggtacatt 26342  T
Q  353 gaacacagtaatcactacatttcctggaaactctgaattcacaagcacagaaacttctgatga 415  Q
    || ||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  26343 gagcacggtaaccactacatttcctagaaactttgaattagcaagcacagaagcttctgatga 26405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 391
Target Start/End: Original strand, 40495 - 40898
Alignment:
Q  9 accacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacac-atattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatg-tttcatttgaatgtaccctgt 106  Q
    |||||| |||||||||| | ||| |||||||||||||  || |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  40495 accacatactatcctggaggagaacctgcttgtaacattatgttgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcattatttcgtttgaatgtaccctgt 40594  T
Q  107 tgctcaggtttg-cttttcaaaatagacaaaaagttttcaa-ttttcaa-aatgtttgtttc-aagca--ttgt-cattat--caaaatagaaagaaaa- 196  Q
    |||||||||||| |||||| |||     |||   ||| ||| ||||||| | |||||||||| |||||  |||| ||||||   ||||||||| |||||     
T  40595 tgctcaggtttgtcttttctaaa-----aaactttttccaatttttcaagattgtttgtttcgaagcaatttgtacattattaaaaaatagaaggaaaaa 40689  T
Q  197 --tgttttgtatatagctttg-aaagtagaaga-aaaatagagttttcaaa--caaaagcaaaggctc-aaattgatgtataagagtggtggtc-agcca 288  Q
      | ||||||| ||| ||||| |||||| || | |||  ||||||||||||   ||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  40690 tgttttttgtacataactttgaaaagtaaaaaagaaagcagagttttcaaaacaaaaagcacagactcaaaattgatgtataagagtggtggtcaagccg 40789  T
Q  289 aaggcatgactcc-acggattcac-aaagcttgg-aaaatggtaa-ttttattggttggtggtac-attg-aacacagtaatcactacatttcctggaaa 382  Q
    ||||| ||||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||| |||||||||| ||||    
T  40790 aaggcgtgactccaacggatttacaaaagcttggaaaaatggtaatttttattggttggtggtacaattgaaacacaacaatcattacatttcctagaaa 40889  T
Q  383 ctctgaatt 391  Q
    || ||||||    
T  40890 ctttgaatt 40898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University