View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF21667_high_10 (Length: 349)

Name: NF21667_high_10
Description: NF21667
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF21667_high_10
NF21667_high_10
[»] chr1 (16 HSPs)
chr1 (1-342)||(18059666-18060010)
chr1 (1-342)||(17004642-17004986)
chr1 (1-342)||(38054999-38055343)
chr1 (2-338)||(46523394-46523732)
chr1 (77-342)||(17148647-17148916)
chr1 (134-342)||(19962407-19962617)
chr1 (133-342)||(22227947-22228156)
chr1 (133-342)||(22232644-22232853)
chr1 (116-338)||(22035568-22035791)
chr1 (116-338)||(7640846-7641069)
chr1 (167-338)||(5072298-5072467)
chr1 (133-332)||(2116393-2116589)
chr1 (133-332)||(45051561-45051757)
chr1 (167-314)||(18601052-18601197)
chr1 (301-342)||(15861317-15861358)
chr1 (258-332)||(51452765-51452840)
[»] chr6 (27 HSPs)
chr6 (1-342)||(16376281-16376625)
chr6 (1-342)||(16383605-16383949)
chr6 (1-342)||(10488703-10489047)
chr6 (1-342)||(16556047-16556391)
chr6 (1-342)||(16632603-16632947)
chr6 (1-342)||(22225646-22225990)
chr6 (1-338)||(1556009-1556349)
chr6 (1-338)||(19610022-19610362)
chr6 (77-338)||(16231972-16232236)
chr6 (77-338)||(18086735-18086999)
chr6 (77-338)||(23977849-23978113)
chr6 (77-332)||(13620712-13620970)
chr6 (134-342)||(19299375-19299585)
chr6 (168-342)||(22251474-22251648)
chr6 (66-328)||(29665942-29666208)
chr6 (116-338)||(29869688-29869911)
chr6 (223-342)||(25175792-25175911)
chr6 (223-342)||(27653888-27654006)
chr6 (167-332)||(1650022-1650184)
chr6 (223-321)||(16825678-16825775)
chr6 (1-84)||(33314387-33314470)
chr6 (133-342)||(14626035-14626243)
chr6 (62-177)||(27740903-27741021)
chr6 (301-342)||(4991396-4991437)
chr6 (117-338)||(15862592-15862826)
chr6 (258-338)||(1657656-1657738)
chr6 (220-252)||(19629556-19629588)
[»] chr3 (25 HSPs)
chr3 (1-342)||(1467647-1467991)
chr3 (1-342)||(49232440-49232784)
chr3 (1-338)||(25058743-25059083)
chr3 (48-342)||(22275260-22275557)
chr3 (1-342)||(12264700-12265045)
chr3 (4-332)||(12902008-12902339)
chr3 (48-338)||(15468252-15468545)
chr3 (1-338)||(5228317-5228656)
chr3 (77-338)||(18911073-18911337)
chr3 (94-342)||(12811938-12812189)
chr3 (69-342)||(54651529-54651805)
chr3 (167-338)||(18896956-18897127)
chr3 (1-332)||(44228989-44229323)
chr3 (1-113)||(18897139-18897251)
chr3 (135-338)||(16821280-16821480)
chr3 (223-338)||(41270304-41270417)
chr3 (167-338)||(55316392-55316561)
chr3 (231-332)||(15936553-15936654)
chr3 (231-332)||(15938395-15938496)
chr3 (134-332)||(15614973-15615168)
chr3 (66-252)||(11986172-11986361)
chr3 (300-338)||(8268645-8268683)
chr3 (300-338)||(8275745-8275783)
chr3 (277-332)||(2449153-2449208)
chr3 (258-332)||(13954805-13954880)
[»] chr2 (24 HSPs)
chr2 (1-342)||(11231246-11231590)
chr2 (1-342)||(22513093-22513437)
chr2 (1-342)||(28775715-28776059)
chr2 (1-342)||(24685689-24686033)
chr2 (1-338)||(12728396-12728736)
chr2 (1-338)||(34824479-34824819)
chr2 (1-338)||(16935597-16935937)
chr2 (1-338)||(17006257-17006597)
chr2 (1-332)||(23777963-23778297)
chr2 (77-338)||(8943926-8944190)
chr2 (77-338)||(42177881-42178145)
chr2 (77-338)||(12635780-12636044)
chr2 (77-338)||(3798515-3798779)
chr2 (77-332)||(12641560-12641818)
chr2 (1-285)||(21141899-21142187)
chr2 (116-338)||(23774257-23774480)
chr2 (223-342)||(19886566-19886684)
chr2 (116-332)||(5888548-5888765)
chr2 (133-332)||(7507758-7507969)
chr2 (258-332)||(19689316-19689391)
chr2 (301-342)||(25213372-25213413)
chr2 (277-332)||(14906355-14906410)
chr2 (277-332)||(23820364-23820419)
chr2 (258-332)||(17396568-17396643)
[»] scaffold0107 (2 HSPs)
scaffold0107 (1-342)||(31313-31657)
scaffold0107 (1-283)||(39650-39935)
[»] scaffold0076 (2 HSPs)
scaffold0076 (1-342)||(39107-39451)
scaffold0076 (134-342)||(43137-43343)
[»] chr8 (22 HSPs)
chr8 (1-342)||(271268-271612)
chr8 (1-342)||(644308-644652)
chr8 (1-342)||(830043-830387)
chr8 (1-342)||(22088702-22089046)
chr8 (1-342)||(15319067-15319411)
chr8 (1-342)||(15499436-15499780)
chr8 (1-338)||(22006170-22006510)
chr8 (1-338)||(13662177-13662517)
chr8 (77-338)||(13720840-13721104)
chr8 (1-342)||(16195234-16195579)
chr8 (77-338)||(16872963-16873227)
chr8 (134-342)||(21844478-21844684)
chr8 (134-342)||(21851871-21852077)
chr8 (133-342)||(6774165-6774371)
chr8 (133-342)||(24549120-24549326)
chr8 (223-342)||(30120951-30121070)
chr8 (115-338)||(16674302-16674524)
chr8 (258-332)||(22907129-22907204)
chr8 (277-332)||(5238380-5238435)
chr8 (277-332)||(24661163-24661218)
chr8 (277-332)||(43685839-43685894)
chr8 (258-331)||(17345842-17345917)
[»] chr7 (30 HSPs)
chr7 (1-342)||(7822732-7823076)
chr7 (1-342)||(7830043-7830387)
chr7 (1-342)||(27101545-27101889)
chr7 (1-342)||(27108893-27109237)
chr7 (1-342)||(27176437-27176781)
chr7 (1-342)||(38783637-38783981)
chr7 (1-338)||(15950703-15951043)
chr7 (1-338)||(15760026-15760366)
chr7 (77-338)||(18979933-18980197)
chr7 (77-338)||(15927648-15927912)
chr7 (77-338)||(13758450-13758714)
chr7 (77-338)||(14250810-14251074)
chr7 (129-332)||(48622584-48622788)
chr7 (167-342)||(2437630-2437804)
chr7 (134-338)||(13572816-13573018)
chr7 (116-332)||(10000288-10000505)
chr7 (116-332)||(16418618-16418835)
chr7 (133-342)||(16478869-16479075)
chr7 (231-332)||(18253761-18253862)
chr7 (167-342)||(10989582-10989756)
chr7 (249-332)||(15862174-15862257)
chr7 (115-342)||(13910929-13911156)
chr7 (115-332)||(13321134-13321365)
chr7 (258-332)||(7293289-7293364)
chr7 (258-332)||(30262044-30262119)
chr7 (277-332)||(11516520-11516575)
chr7 (277-332)||(14113904-14113959)
chr7 (277-332)||(15441479-15441534)
chr7 (258-332)||(14423555-14423629)
chr7 (301-342)||(15516752-15516793)
[»] chr5 (36 HSPs)
chr5 (1-342)||(35582040-35582384)
chr5 (1-342)||(21932289-21932633)
chr5 (1-342)||(21938459-21938803)
chr5 (1-342)||(22882992-22883336)
chr5 (1-342)||(36989678-36990022)
chr5 (1-338)||(1219432-1219772)
chr5 (1-338)||(7425328-7425668)
chr5 (48-342)||(17471496-17471793)
chr5 (77-342)||(10777878-10778146)
chr5 (1-338)||(35791010-35791351)
chr5 (77-338)||(23514641-23514905)
chr5 (1-342)||(11211973-11212317)
chr5 (116-338)||(23328678-23328901)
chr5 (116-338)||(24616282-24616505)
chr5 (116-338)||(24712658-24712881)
chr5 (116-338)||(24745676-24745899)
chr5 (223-337)||(18777902-18778015)
chr5 (134-338)||(27009981-27010183)
chr5 (223-342)||(12603-12721)
chr5 (223-342)||(21073500-21073618)
chr5 (223-342)||(25426857-25426975)
chr5 (223-342)||(19500128-19500246)
chr5 (223-342)||(22366386-22366504)
chr5 (133-342)||(29188191-29188397)
chr5 (167-342)||(43443302-43443474)
chr5 (115-342)||(4199890-4200117)
chr5 (66-252)||(32950762-32950952)
chr5 (301-338)||(11343008-11343045)
chr5 (277-332)||(20623262-20623317)
chr5 (277-332)||(21233443-21233498)
chr5 (277-332)||(25900321-25900376)
chr5 (277-332)||(37053037-37053092)
chr5 (1-39)||(23328562-23328600)
chr5 (1-39)||(24616167-24616205)
chr5 (1-39)||(24712543-24712581)
chr5 (1-39)||(24745561-24745599)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (1-342)||(29166-29510)
[»] scaffold0023 (3 HSPs)
scaffold0023 (1-338)||(153919-154259)
scaffold0023 (223-342)||(169817-169935)
scaffold0023 (228-342)||(36327-36440)
[»] chr4 (23 HSPs)
chr4 (1-332)||(18168974-18169308)
chr4 (1-332)||(19020490-19020824)
chr4 (1-338)||(15287157-15287497)
chr4 (1-338)||(15294266-15294606)
chr4 (77-338)||(7131977-7132241)
chr4 (77-338)||(20000803-20001067)
chr4 (1-338)||(17145569-17145909)
chr4 (1-342)||(18248222-18248566)
chr4 (117-332)||(22738390-22738607)
chr4 (208-323)||(8378365-8378480)
chr4 (116-338)||(26339140-26339363)
chr4 (131-338)||(22351976-22352184)
chr4 (135-342)||(10644360-10644564)
chr4 (1-210)||(8374512-8374724)
chr4 (223-338)||(47357883-47357995)
chr4 (257-332)||(9795490-9795564)
chr4 (66-227)||(40885585-40885748)
chr4 (294-332)||(8378486-8378524)
chr4 (300-332)||(14996444-14996476)
chr4 (277-332)||(16327841-16327896)
chr4 (277-332)||(16609014-16609069)
chr4 (277-332)||(26680493-26680548)
chr4 (4-38)||(22738276-22738310)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (1-338)||(1487-1827)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (1-338)||(2396-2737)
[»] scaffold0467 (1 HSPs)
scaffold0467 (1-342)||(10247-10591)
[»] scaffold1500 (1 HSPs)
scaffold1500 (77-338)||(1426-1690)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (1-332)||(34076-34410)
[»] scaffold0191 (1 HSPs)
scaffold0191 (1-338)||(7368-7708)
[»] scaffold1666 (1 HSPs)
scaffold1666 (1-243)||(3-248)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (133-342)||(5120-5329)
[»] scaffold0066 (2 HSPs)
scaffold0066 (1-332)||(54420-54755)
scaffold0066 (66-332)||(45099-45369)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (167-342)||(3895-4070)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (129-332)||(54008-54212)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (223-342)||(10656-10775)
[»] scaffold0183 (2 HSPs)
scaffold0183 (116-338)||(6718-6941)
scaffold0183 (1-39)||(6602-6640)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (223-342)||(21021-21139)
scaffold0139 (134-342)||(13967-14173)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (133-338)||(3101-3305)
[»] scaffold0892 (1 HSPs)
scaffold0892 (129-292)||(3547-3711)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (116-332)||(7330-7547)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (133-332)||(9266-9462)
scaffold0215 (133-332)||(16164-16360)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (231-332)||(107983-108084)
scaffold0026 (223-338)||(64433-64546)
[»] scaffold1711 (1 HSPs)
scaffold1711 (167-338)||(1214-1383)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (133-342)||(13232-13438)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (116-338)||(23661-23884)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (136-338)||(177-375)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (228-342)||(31580-31693)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (66-252)||(56105-56294)
[»] scaffold0516 (1 HSPs)
scaffold0516 (228-332)||(12045-12149)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (257-332)||(13268-13342)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (258-332)||(34374-34450)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (301-342)||(130880-130921)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (277-332)||(22833-22888)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (133-252)||(41786-41905)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (277-332)||(1497-1552)
[»] scaffold0361 (1 HSPs)
scaffold0361 (131-252)||(3324-3447)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (301-333)||(42677-42709)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 306; Significance: 1e-172; HSPs: 16)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 18060010 - 18059666
Alignment:
Q  1 atcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18060010 atcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaat 18059911  T
Q  101 caaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcat 197  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18059910 caaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcat 18059811  T
Q  198 caattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattg 297  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18059810 caattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagatta 18059711  T
Q  298 tacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgat 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18059710 tacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgat 18059666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 17004642 - 17004986
Alignment:
Q  1 atcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17004642 atcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcttttcaat 17004741  T
Q  101 caaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcat 197  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17004742 caaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcat 17004841  T
Q  198 caattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattg 297  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17004842 caattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattg 17004941  T
Q  298 tacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgat 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17004942 tacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgat 17004986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 38055343 - 38054999
Alignment:
Q  1 atcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38055343 atcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcttttcaat 38055244  T
Q  101 caaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcat 197  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38055243 caaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcat 38055144  T
Q  198 caattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattg 297  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38055143 caattcaagcacaagaaaataacatcacagtaaaagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaagatgcaaagattg 38055044  T
Q  298 tacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgat 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38055043 tacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgat 38054999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 2 - 338
Target Start/End: Original strand, 46523394 - 46523732
Alignment:
Q  2 tcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatc 101  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| || | |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  46523394 tcaatccataattaagtatacccaagtcatgattcactcacaacagcatcagttaacaataacaacatcaatggaatatgaattacatctcatttcaatc 46523493  T
Q  102 aaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcatc 198  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  46523494 aaaacatatcaaatttcatcaatgaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataacataaacatc 46523593  T
Q  199 aattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgt 298  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |     
T  46523594 aattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-atgga 46523692  T
Q  299 acatgattatgataataactaacccccttacctttgaaga 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  46523693 acatgattatgataataactaacccccttaccttagaaga 46523732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 77 - 342
Target Start/End: Original strand, 17148647 - 17148916
Alignment:
Q  77 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaattt 173  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  17148647 atatgatttacatctcatttcaatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 17148746  T
Q  174 cacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcata 273  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  17148747 cacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaagagcacgaatttagccacaattgttcatcaacccattttcata 17148846  T
Q  274 caacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaa-cccccttacctttgaagatgat 342  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  17148847 caacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaaccccccttacctttgaagttgat 17148916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 134 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 19962617 - 19962407
Alignment:
Q  134 ttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaag 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  19962617 ttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattccacccataaacataccataatcatcaattcaaacacaagaaaatagcattacagcaag 19962518  T
Q  232 agcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacct 331  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19962517 agcacgaatttaacaacaattgtccatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacct 19962418  T
Q  332 ttgaagatgat 342  Q
    |||||| ||||    
T  19962417 ttgaagttgat 19962407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 133 - 342
Target Start/End: Original strand, 22227947 - 22228156
Alignment:
Q  133 tttcataacttaacatttatacatactttgaa-acgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaag 231  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| |||||| | ||||||||||  | || ||||| || |||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||    
T  22227947 tttcataacttatcatttttacata-tttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaattatcatcaattcatgcacaagaaaataacatcacagcaag 22228045  T
Q  232 agcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacct 331  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22228046 agcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacct 22228145  T
Q  332 ttgaagatgat 342  Q
    |||||||||||    
T  22228146 ttgaagatgat 22228156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 133 - 342
Target Start/End: Original strand, 22232644 - 22232853
Alignment:
Q  133 tttcataacttaacatttatacatactttgaa-acgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaag 231  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| |||||| | ||||||||||  | || ||||| || |||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||    
T  22232644 tttcataacttatcatttttacata-tttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaattatcatcaattcatgcacaagaaaataacatcacagcaag 22232742  T
Q  232 agcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacct 331  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22232743 agcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacct 22232842  T
Q  332 ttgaagatgat 342  Q
    |||||||||||    
T  22232843 ttgaagatgat 22232853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 116 - 338
Target Start/End: Original strand, 22035568 - 22035791
Alignment:
Q  116 tcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaaga 213  Q
    |||| ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  22035568 tcattaattaggcaaaatttcacaacttgacatttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcaagtataaga 22035667  T
Q  214 aaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataa 313  Q
    ||  |||| || | ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||| |  ||||||||||||    
T  22035668 aac-agcaacataacaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaagatgtaaaatttgaaattgattatgataa 22035766  T
Q  314 taactaacccccttacctttgaaga 338  Q
    ||||||||||||||||||| |||||    
T  22035767 taactaacccccttaccttagaaga 22035791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 116 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 7641069 - 7640846
Alignment:
Q  116 tcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaaga 213  Q
    |||| ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  7641069 tcattaattaggcaaaatttcacaacttgacatttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcaagtataaga 7640970  T
Q  214 aaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataa 313  Q
    ||  |||| || | ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||  ||| |  ||||||||||||    
T  7640969 aac-agcaacataacaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgaaaagatgtaaaatttgaaattgattatgataa 7640871  T
Q  314 taactaacccccttacctttgaaga 338  Q
    ||||||||||||||||||| |||||    
T  7640870 taactaacccccttaccttagaaga 7640846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 167 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 5072467 - 5072298
Alignment:
Q  167 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 266  Q
    ||||||||||| | || ||||| |  | |||||||||| ||| |  || ||| || ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  5072467 gtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatataaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccat 5072368  T
Q  267 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaaga 338  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5072367 tttcatacaacttgagtaaatgcaaaaat--tacatgattgtgataataactaacccccttacctttgaaga 5072298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 133 - 332
Target Start/End: Original strand, 2116393 - 2116589
Alignment:
Q  133 tttcataacttaacatttatacatactttgaa-acgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaag 231  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||| |||||| | ||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| ||| |  || ||| || ||||| ||     
T  2116393 tttcacaacttatcatttttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagtaaa 2116491  T
Q  232 agcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacct 331  Q
    ||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  2116492 agcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccatttttatacaacatgagaaaatgcaaa-at--tacatgattatgataatcactaacccctttacct 2116588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 133 - 332
Target Start/End: Original strand, 45051561 - 45051757
Alignment:
Q  133 tttcataacttaacatttatacatactttgaa-acgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaag 231  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||| |||||| | ||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| ||| |  ||  || || ||||| |||    
T  45051561 tttcacaacttatcatttttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacgtaacatcacagtaag 45051659  T
Q  232 agcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacct 331  Q
    | ||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  45051660 aacacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-at--cacatgattatgataaagactaacccccttacct 45051756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 167 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 18601197 - 18601052
Alignment:
Q  167 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 266  Q
    ||||||||||| | || ||||| |  | |||||||||| ||| |  || ||| || ||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  18601197 gtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcatgaatttagcatgaattgttcatcaacccat 18601098  T
Q  267 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataat 314  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||    
T  18601097 tttcatacaacatgagcaaatgcaaaaat--tacatgattgtgataat 18601052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 301 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 15861358 - 15861317
Alignment:
Q  301 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgat 342  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  15861358 atgattatgataaagactaacccccttacctttgaagatgat 15861317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 258 - 332
Target Start/End: Original strand, 51452765 - 51452840
Alignment:
Q  258 tcaacccattttcatacaa--catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 332  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||| ||| |||||||| || ||||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  51452765 tcaacccattt-catacaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaacatgattaagataaagactaacccccttacctt 51452840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 294; Significance: 1e-165; HSPs: 27)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 16376625 - 16376281
Alignment:
Q  1 atcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16376625 atcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcttttcaat 16376526  T
Q  101 caaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcat 197  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16376525 caaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcat 16376426  T
Q  198 caattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattg 297  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16376425 caattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattg 16376326  T
Q  298 tacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgat 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16376325 tacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgat 16376281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 16383949 - 16383605
Alignment:
Q  1 atcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16383949 atcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcttttcaat 16383850  T
Q  101 caaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcat 197  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16383849 caaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcat 16383750  T
Q  198 caattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattg 297  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16383749 caattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattg 16383650  T
Q  298 tacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgat 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16383649 tacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgat 16383605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 10488703 - 10489047
Alignment:
Q  1 atcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10488703 atcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcttttcaat 10488802  T
Q  101 caaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcat 197  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10488803 caaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcat 10488902  T
Q  198 caattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattg 297  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10488903 caattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattg 10489002  T
Q  298 tacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgat 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10489003 tacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgat 10489047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 16556391 - 16556047
Alignment:
Q  1 atcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16556391 atcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcttttcaat 16556292  T
Q  101 caaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcat 197  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16556291 caaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcat 16556192  T
Q  198 caattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattg 297  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16556191 caattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaggagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattg 16556092  T
Q  298 tacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgat 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16556091 tacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgat 16556047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 16632947 - 16632603
Alignment:
Q  1 atcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16632947 atcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcttttcaat 16632848  T
Q  101 caaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcat 197  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16632847 caaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcat 16632748  T
Q  198 caattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattg 297  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16632747 caattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaggagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattg 16632648  T
Q  298 tacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgat 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16632647 tacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgat 16632603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 22225990 - 22225646
Alignment:
Q  1 atcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22225990 atcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcatttcaat 22225891  T
Q  101 caaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcat 197  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22225890 caaaacatttcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcat 22225791  T
Q  198 caattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattg 297  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22225790 caattcatgcacaagaaaatagcatcacagaaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattg 22225691  T
Q  298 tacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgat 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22225690 tacatgattatgataataactaacccccatacctttgaagatgat 22225646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Original strand, 1556009 - 1556349
Alignment:
Q  1 atcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1556009 atcaatccacaattaagtatacccaattcataattcactcacaataacatcagttaacaataacaacatcaatggaatatgaattacatctcatttcaat 1556108  T
Q  101 caaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcat 197  Q
     |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1556109 taaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcat 1556208  T
Q  198 caattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattg 297  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1556209 caattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattg 1556308  T
Q  298 tacatgattatgataataactaacccccttacctttgaaga 338  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  1556309 aacatgattatgatgataactaacccccttaccttagaaga 1556349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Original strand, 19610022 - 19610362
Alignment:
Q  1 atcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaat 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| || | |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  19610022 atcaatccataattaagtatacccaagtcatgattcactcacaacagcatcagttaacaataacaacatcaatggaatatgaactacatctcatttcaat 19610121  T
Q  101 caaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcat 197  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  19610122 caaaacatatcaaatttcatcaatgaagtataattttataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataaccat 19610221  T
Q  198 caattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattg 297  Q
    | ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  19610222 cgattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaataattgttcatcaacccattttcatacaacatcagaaaatgcaaaaattg 19610321  T
Q  298 tacatgattatgataataactaacccccttacctttgaaga 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19610322 tacatgattatgataataactaacccccttaccttagaaga 19610362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 77 - 338
Target Start/End: Original strand, 16231972 - 16232236
Alignment:
Q  77 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaattt 173  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  16231972 atatgatttacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 16232071  T
Q  174 cacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcata 273  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16232072 cacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcata 16232171  T
Q  274 caacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaaga 338  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16232172 caacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaaga 16232236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 77 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 18086999 - 18086735
Alignment:
Q  77 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaattt 173  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  18086999 atatgatttacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 18086900  T
Q  174 cacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcata 273  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18086899 cacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcata 18086800  T
Q  274 caacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaaga 338  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  18086799 caacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatactaataactaacccccttaccttagaaga 18086735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 77 - 338
Target Start/End: Original strand, 23977849 - 23978113
Alignment:
Q  77 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaattt 173  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  23977849 atatgatttacatctcatttcaaccaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 23977948  T
Q  174 cacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcata 273  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  23977949 cacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaagagcacgaatttagccacaattgttcatcaacccattttcata 23978048  T
Q  274 caacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaaga 338  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  23978049 caacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacgcccttaccttagaaga 23978113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 77 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 13620970 - 13620712
Alignment:
Q  77 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacgt--aattt 173  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||    
T  13620970 atatgatttacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgcaattt 13620871  T
Q  174 cacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcata 273  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13620870 cacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcattacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcata 13620771  T
Q  274 caacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 332  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||    
T  13620770 caacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgaagaagactaacccccttacctt 13620712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 134 - 342
Target Start/End: Original strand, 19299375 - 19299585
Alignment:
Q  134 ttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaag 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  19299375 ttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattccacccataaacataccataatcatcaattcaaacacaagaaaatagcattacagcaag 19299474  T
Q  232 agcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacct 331  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19299475 agcacgaatttaacaacaattgtccatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacct 19299574  T
Q  332 ttgaagatgat 342  Q
    |||||| ||||    
T  19299575 ttgaagttgat 19299585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 168 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 22251648 - 22251474
Alignment:
Q  168 taatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccatt 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22251648 taatttcacccataaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccatt 22251549  T
Q  268 ttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgat 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22251548 ttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccatacctttgaagatgat 22251474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 66 - 328
Target Start/End: Original strand, 29665942 - 29666208
Alignment:
Q  66 acatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaat-ttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaa 164  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||||||||||||  | ||| || |||  |||| ||||| || | ||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  29665942 acatcaattgaacatgaatcatatctcatttcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagtacaatttcataacttgacatttatgcatactttgaa 29666041  T
Q  165 ac--gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaac 262  Q
    ||  ||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||  || ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| |    
T  29666042 acatgtaatttcacccacaatcatacaattatcatcaattcatacataagaaaataacatcacagctagagcacgaatttaacaacaattatccatcacc 29666141  T
Q  263 ccattttcatacaac-atgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaaccccctta 328  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||  |||| ||||||||||||| |  |||||||| ||||    
T  29666142 ccattttcatacaacaatgagaaattgcaataattgaacatgattatgatgaagactaacccactta 29666208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 116 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 29869911 - 29869688
Alignment:
Q  116 tcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaaga 213  Q
    |||| ||||| ||| ||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||| |  ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | | ||||    
T  29869911 tcattaattaggcaaaatttcacaacttgacacttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcatgtataaga 29869812  T
Q  214 aaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtaca-tgattatgata 312  Q
    ||  |||| || | ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| || | |||||||||||    
T  29869811 aac-agcaacataacaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaagatgtaaa-attttaaattgattatgata 29869714  T
Q  313 ataactaacccccttacctttgaaga 338  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  29869713 ataactaacccccttaccttagaaga 29869688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 223 - 342
Target Start/End: Original strand, 25175792 - 25175911
Alignment:
Q  223 cacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgag-aaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaac 321  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  25175792 cacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagaaaaatgcaaa-attatacatgattatggtaatcactaac 25175890  T
Q  322 ccccttacctttgaagatgat 342  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  25175891 ccccttacctttgaagttgat 25175911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 223 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 27654006 - 27653888
Alignment:
Q  223 cacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacc 322  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||    
T  27654006 cacagcaagagcacgaatttagcatgatttgttcatcaatccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attacacatgattatgataatcactaacc 27653908  T
Q  323 cccttacctttgaagatgat 342  Q
    |||| |||||||||| ||||    
T  27653907 ccctcacctttgaagttgat 27653888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 167 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 1650184 - 1650022
Alignment:
Q  167 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 266  Q
    ||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| ||| |  ||  || || ||||| |||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  1650184 gtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacgtaacatcacagtaagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccat 1650085  T
Q  267 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  1650084 tttcatacaacatgagaaaatgcaaa-at--tacatgattatgataaagactaacccccttacctt 1650022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 223 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 16825775 - 16825678
Alignment:
Q  223 cacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaac 321  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||    
T  16825775 cacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attacacatgattatgataatcactaac 16825678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 33314470 - 33314387
Alignment:
Q  1 atcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaat 84  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33314470 atcaatccacaattaagtatacccaaatcatgattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaat 33314387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 14626243 - 14626035
Alignment:
Q  133 tttcataacttaacatttatacatactttgaa-acgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaag 231  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| |||||| | ||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| ||| |  || ||| || |||||||||    
T  14626243 tttcataacttatcatttttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaag 14626145  T
Q  232 agcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaaca--tgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttac 329  Q
    |||||||||||| ||| |||| | ||| | | ||  |||| ||||||  ||||||  || ||||  || | |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14626144 agcacgaatttagcaataattatccataatcaca-attcaaacaacatttgagaatttgtaaag--tgaagatgattgtgataataactaacccccttac 14626048  T
Q  330 ctttgaagatgat 342  Q
    |||||||| ||||    
T  14626047 ctttgaagttgat 14626035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 177
Target Start/End: Original strand, 27740903 - 27741021
Alignment:
Q  62 aaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaat-ttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactt 160  Q
    |||||||||||| ||| |||||||| |||||| |||||  |  || || |||  |||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27740903 aaccacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacgacttagcaaaattcaccaattgagcacaatttcataacttgacatttatacatactt 27741002  T
Q  161 tgaaac--gtaatttcacc 177  Q
     |||||  |||||||||||    
T  27741003 cgaaacatgtaatttcacc 27741021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 301 - 342
Target Start/End: Original strand, 4991396 - 4991437
Alignment:
Q  301 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgat 342  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  4991396 atgattatgataaagactaacccccttacctttgaagatgat 4991437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 338
Target Start/End: Original strand, 15862592 - 15862826
Alignment:
Q  117 catcaattaagcataattt-cataacttaacatttatacatactttgaaacgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaa 215  Q
    |||||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||  | | || |||||||| | || ||||| || |||||||||||| ||| |  ||     
T  15862592 catcaattgagcacaattttcataacttcacatttatacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaac 15862691  T
Q  216 atagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcat----------caacccattttcatacaaca--tgagaaaatgcaaagattgtacatg 303  Q
    ||| || |||||  ||||||||||||||  ||||||| | |||          |||||||| |||||||||||  ||||||| |||||  | || |||||    
T  15862692 ataacatcacagttagagcacgaatttagtaacaattatccatttattcaattcaacccatattcatacaacaaatgagaaattgcaataaatgaacatg 15862791  T
Q  304 attatgataataactaacccccttacctttgaaga 338  Q
    |||||||| |  ||||||||||||||||| |||||    
T  15862792 attatgatgaagactaacccccttaccttagaaga 15862826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 258 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 1657738 - 1657656
Alignment:
Q  258 tcaacccattttcatacaaca--tgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaaga 338  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||  | || ||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||    
T  1657738 tcaacccatattcatacaacaaatgagaaattgcaataaatgaacatgattatgatgaagactaacccccttaccttagaaga 1657656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 220 - 252
Target Start/End: Original strand, 19629556 - 19629588
Alignment:
Q  220 caccacagcaagagcacgaatttaacaacaatt 252  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19629556 caccacaacaagagcacgaatttaacaacaatt 19629588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 294; Significance: 1e-165; HSPs: 25)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 1467991 - 1467647
Alignment:
Q  1 atcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1467991 atcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcttttcaat 1467892  T
Q  101 caaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcat 197  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1467891 caaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcat 1467792  T
Q  198 caattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattg 297  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1467791 caattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattg 1467692  T
Q  298 tacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgat 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1467691 tacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgat 1467647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 49232440 - 49232784
Alignment:
Q  1 atcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49232440 atcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaat 49232539  T
Q  101 caaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcat 197  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  49232540 caaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcat 49232639  T
Q  198 caattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattg 297  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49232640 caattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattg 49232739  T
Q  298 tacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgat 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  49232740 tacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgat 49232784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Original strand, 25058743 - 25059083
Alignment:
Q  1 atcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaat 100  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||||| || ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25058743 atcaattcacaattaagtatactcaaatcatgattcactcacaatagcataagttaacaataacaacatcaatggaatatgaattacatctcatttcaat 25058842  T
Q  101 caaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcat 197  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25058843 caaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcat 25058942  T
Q  198 caattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattg 297  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25058943 caattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattg 25059042  T
Q  298 tacatgattatgataataactaacccccttacctttgaaga 338  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25059043 tgcatgattatgataataactaacccccttacctttgaaga 25059083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 48 - 342
Target Start/End: Original strand, 22275260 - 22275557
Alignment:
Q  48 catcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaac 146  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  22275260 catcagttaacaataacaacatcaatggaatatgaattacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcatgacttaac 22275359  T
Q  147 atttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaa 244  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||     
T  22275360 atttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatggcatcacagcaagagcacgaatttag 22275459  T
Q  245 caacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgat 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22275460 caacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaatttgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgat 22275557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 12265045 - 12264700
Alignment:
Q  1 atcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaat 100  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||  || | | |||||||| | |  ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  12265045 atcaatccataattatgtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaacaacatcaatggaacatgaatcacatctcatttcaac 12264946  T
Q  101 caaaacatatcaa--tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatca 196  Q
     | ||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12264945 aacaacatatcaaaatttcatcaattaagtataatctcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatca 12264846  T
Q  197 tcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagatt 296  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12264845 tcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaatt 12264746  T
Q  297 gtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgat 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12264745 gtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgat 12264700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 4 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 12902339 - 12902008
Alignment:
Q  4 aatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaa 103  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| || |||| ||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12902339 aatccacaattaagtatatccaaatcatgattcactcacaatagtatcagttaataataacaacatcaatggaatatgaattacatctcatttcaatcaa 12902240  T
Q  104 aacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcatcaa 200  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12902239 aacatatcaaatttaatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaa 12902140  T
Q  201 ttcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtac 300  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  12902139 ttcatgcacaagaaaataacatcacagcaagagcacgaatttagcaaaaattattcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaac 12902040  T
Q  301 atgattatgataataactaacccccttacctt 332  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12902039 atgattatgatgataactaacccccttacctt 12902008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 48 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 15468545 - 15468252
Alignment:
Q  48 catcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaac 146  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  15468545 catcagttaacaataacaacatcaatggaatatgaattacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcatgacttaac 15468446  T
Q  147 atttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaa 244  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||     
T  15468445 atttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcatagcaagagcacgaatttag 15468346  T
Q  245 caacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaaga 338  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15468345 caacaattgttcctcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaatttgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaaga 15468252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Original strand, 5228317 - 5228656
Alignment:
Q  1 atcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaat 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  5228317 atcaattcacaattaagtatacccaaatcatgattcactcacaatagcatcagttaacaataacaacatcaatggaatatgaattacacctcatttcaat 5228416  T
Q  101 caaaacatatc-aatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcat 197  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5228417 caaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatctcataacttaacatttatacatattttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcat 5228516  T
Q  198 caattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattg 297  Q
    ||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  5228517 caattcatgcacaaggaaataacatcacagcaagagcacgaatttagcaacaa-tgttcatcaacccattttcataacacatgagaaaatgcaaaaattg 5228615  T
Q  298 tacatgattatgataataactaacccccttacctttgaaga 338  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  5228616 aacatgattatgatgataactaacccccttaccttagaaga 5228656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 77 - 338
Target Start/End: Original strand, 18911073 - 18911337
Alignment:
Q  77 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaattt 173  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  18911073 atatgatttacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 18911172  T
Q  174 cacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcata 273  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18911173 cacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcata 18911272  T
Q  274 caacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaaga 338  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18911273 caacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaaga 18911337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 94 - 342
Target Start/End: Original strand, 12811938 - 12812189
Alignment:
Q  94 tttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacatacca 190  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  12811938 tttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataaattcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattccacccataaacatacca 12812037  T
Q  191 taatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgca 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12812038 taatcatcaattcaagcacaagaaaatagcattacagcaagagcacgaatttaacaacaattgtccatcaacccattttcatacaatatgagaaaatgca 12812137  T
Q  291 aagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgat 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  12812138 aagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttaaagttgat 12812189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 69 - 342
Target Start/End: Original strand, 54651529 - 54651805
Alignment:
Q  69 tcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaat-ttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacg 167  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||  | ||||||||||  |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  54651529 tcaatggaacatgaattacatctcatttcaacaacaacatatcaaaattcaccaattgagtataatttcataacttaacatttatacatactttgcaaca 54651628  T
Q  168 t--aatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaaccca 265  Q
    |  |||||||| || || ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  54651629 tgcaatttcactcacaatcatacaattatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattattcatcaaccca 54651728  T
Q  266 ttttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgat 342  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| |  || |||||||||||||| || ||||||    
T  54651729 ttttcatacaacatgagaaattgcaaaaattgaacatgattatgatgaagacaaacccccttaccttagatgatgat 54651805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 167 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 18897127 - 18896956
Alignment:
Q  167 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 266  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18897127 gtaattccacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttatcaacaattgttcatcaacccat 18897028  T
Q  267 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaaga 338  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18897027 tttcatacaacatgagaaaatacaaaacttgtacatgattatgataataactaacccccttaccttggaaga 18896956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Original strand, 44228989 - 44229323
Alignment:
Q  1 atcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaat 100  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||  || | | |||||||| | |  ||  || | ||||||| |||||||||||||||||| ||     
T  44228989 atcaatccataattatgtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaataaccttaatggaacatgaatcacatctcattttaac 44229088  T
Q  101 caaaacatatcaat-ttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcat 197  Q
     | ||||||||||  ||||  |||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  44229089 aacaacatatcaagattcactaattgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttgaaacatgtaatttcatccacaaacataccataatcat 44229188  T
Q  198 caattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaac-atgagaaaatgcaaagatt 296  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||    
T  44229189 caattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacggatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaa-tgaaaaaatt 44229287  T
Q  297 gtacatgattatgataataactaacccccttacctt 332  Q
      |  |||||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  44229288 tgaattgattatgatgaaaacaaacccccttacctt 44229323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 18897251 - 18897139
Alignment:
Q  1 atcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18897251 atcaatccacaattaagtatacccaaatcatgattcactcacaatagcatcagttaacaataacaacatcaatggaatatgaattacatctcatttcaat 18897152  T
Q  101 caaaacatatcaa 113  Q
    |||||||||||||    
T  18897151 caaaacatatcaa 18897139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 135 - 338
Target Start/End: Original strand, 16821280 - 16821480
Alignment:
Q  135 tcataacttaacatttatacatactttgaa-acgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagag 233  Q
    ||||| |||||||||| |||||| |||||| | ||||||||||| | || ||||| || |||||||||| | ||| |  || ||| || |||||||||||    
T  16821280 tcatagcttaacatttttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaatttatgcatacaaacataacatcacagcaagag 16821378  T
Q  234 cacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttt 333  Q
    |||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16821379 cacggatttgacataaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttaccttt 16821475  T
Q  334 gaaga 338  Q
    |||||    
T  16821476 gaaga 16821480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 223 - 338
Target Start/End: Original strand, 41270304 - 41270417
Alignment:
Q  223 cacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacc 322  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  41270304 cacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagtagatgcaaaaat--tacatgattgtgataataactaacc 41270401  T
Q  323 cccttacctttgaaga 338  Q
    ||||||||||||||||    
T  41270402 cccttacctttgaaga 41270417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 167 - 338
Target Start/End: Original strand, 55316392 - 55316561
Alignment:
Q  167 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 266  Q
    ||||||||||| | || ||||| |  | |||||||||| ||| |  || ||| || ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  55316392 gtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccat 55316491  T
Q  267 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaaga 338  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  55316492 tttcatacaacatgagcaaatgcaaaaat--tacatgattgtgataataactaacccctttacctttgaaga 55316561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 231 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 15936654 - 15936553
Alignment:
Q  231 gagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacc 330  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  15936654 gagcacgaatttagtaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattataatgataactaacccccatacc 15936555  T
Q  331 tt 332  Q
    ||    
T  15936554 tt 15936553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 231 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 15938496 - 15938395
Alignment:
Q  231 gagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacc 330  Q
    ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  15938496 gagcacgtatttagtaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattataatgataactaacccccttacc 15938397  T
Q  331 tt 332  Q
    ||    
T  15938396 tt 15938395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 134 - 332
Target Start/End: Original strand, 15614973 - 15615168
Alignment:
Q  134 ttcataacttaacatttatacatactttgaa-acgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaaga 232  Q
    |||| |||||| ||||| |||||| |||||| | ||||||||||| | || | ||| || |||||||||||| ||| |  || ||| |||||||| ||||    
T  15614973 ttcacaacttatcatttttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcctacaattatcatcaattcatgcatacaaatataacaccacagtaaga 15615071  T
Q  233 gcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 332  Q
    |||| ||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  15615072 gcacaaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-at--tacatgattatgataaagactaacccccttacctt 15615168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 66 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 11986361 - 11986172
Alignment:
Q  66 acatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaat-ttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaa 164  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || ||||||  | ||| || |||  ||||  | || |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  11986361 acatcaatggaacatgaatcacatatcttttcaacaacaacttagcaaaattcactatttgagcacaatttcataacttgacattaatacatactttaaa 11986262  T
Q  165 ac--gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaatt 252  Q
    ||  ||||||||| ||| || ||||| || ||||| || ||| ||||| ||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  11986261 acatgtaatttcaaccacaatcatacaattatcattaaatcatgcacacgaaaataacatcacagttagagcacgaatttaacaacaatt 11986172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 300 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 8268683 - 8268645
Alignment:
Q  300 catgattatgataataactaacccccttacctttgaaga 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8268683 catgattatgataataactaacccccttaccttagaaga 8268645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 300 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 8275783 - 8275745
Alignment:
Q  300 catgattatgataataactaacccccttacctttgaaga 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8275783 catgattatgataataactaacccccttaccttagaaga 8275745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 277 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 2449208 - 2449153
Alignment:
Q  277 catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 332  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  2449208 catgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttacctt 2449153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 258 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 13954880 - 13954805
Alignment:
Q  258 tcaacccattttcatacaa--catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 332  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||| ||| |||||||| || ||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  13954880 tcaacccattt-catacaattcatgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatggtaaagactaacccccttacctt 13954805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 294; Significance: 1e-165; HSPs: 24)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 11231590 - 11231246
Alignment:
Q  1 atcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11231590 atcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcttttcaat 11231491  T
Q  101 caaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcat 197  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11231490 caaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcat 11231391  T
Q  198 caattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattg 297  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11231390 caattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattg 11231291  T
Q  298 tacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgat 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11231290 tacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgat 11231246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 22513437 - 22513093
Alignment:
Q  1 atcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22513437 atcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcttttcaat 22513338  T
Q  101 caaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcat 197  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22513337 caaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcat 22513238  T
Q  198 caattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattg 297  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22513237 caattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattg 22513138  T
Q  298 tacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgat 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22513137 tacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgat 22513093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 28776059 - 28775715
Alignment:
Q  1 atcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28776059 atcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcttttcaat 28775960  T
Q  101 caaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcat 197  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28775959 caaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcat 28775860  T
Q  198 caattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattg 297  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28775859 caattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattg 28775760  T
Q  298 tacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgat 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28775759 tacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgat 28775715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 24686033 - 24685689
Alignment:
Q  1 atcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24686033 atcaatccacaattaagtatacctaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcttttcaat 24685934  T
Q  101 caaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcat 197  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24685933 caaaacacatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcat 24685834  T
Q  198 caattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattg 297  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24685833 caattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattg 24685734  T
Q  298 tacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgat 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24685733 tacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgat 24685689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Original strand, 12728396 - 12728736
Alignment:
Q  1 atcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12728396 atcaatccacaattaagtatacccaaatcatgattcactcacaatagcatcagttaacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaat 12728495  T
Q  101 caaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcat 197  Q
     |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12728496 aaaaacatatcaaatttcatcaattaagaataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcat 12728595  T
Q  198 caattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattg 297  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12728596 caattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattg 12728695  T
Q  298 tacatgattatgataataactaacccccttacctttgaaga 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12728696 tacatgattatgataataactaacccccttaccttagaaga 12728736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Original strand, 34824479 - 34824819
Alignment:
Q  1 atcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34824479 atcaatccacaattaagtatacccaaatcatgattcactcacaatagcatcagttaacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaat 34824578  T
Q  101 caaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcat 197  Q
     |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34824579 aaaaacatatcaaatttcatcaattaagaataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcat 34824678  T
Q  198 caattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattg 297  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34824679 caattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattg 34824778  T
Q  298 tacatgattatgataataactaacccccttacctttgaaga 338  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  34824779 tacatgattatgataatcactaacccccttaccttagaaga 34824819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Original strand, 16935597 - 16935937
Alignment:
Q  1 atcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16935597 atcaatccacaattaagtatacccaaatcatgattcactcacaatagcatcatttaacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaat 16935696  T
Q  101 caaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcat 197  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  16935697 caaaacatatcaaatttcatcaataaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacgcacaaacataccataatcat 16935796  T
Q  198 caattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattg 297  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16935797 caattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcatgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattg 16935896  T
Q  298 tacatgattatgataataactaacccccttacctttgaaga 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16935897 tacatgattatgataataactaacccccttaccttagaaga 16935937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Original strand, 17006257 - 17006597
Alignment:
Q  1 atcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17006257 atcaatccacaattaagtatacccaaatcatgattcactcacaatagcatcatttaacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaat 17006356  T
Q  101 caaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcat 197  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  17006357 caaaacatatcaaatttcatcaataaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacgcacaaacataccataatcat 17006456  T
Q  198 caattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattg 297  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17006457 caattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcatgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattg 17006556  T
Q  298 tacatgattatgataataactaacccccttacctttgaaga 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17006557 tacatgattatgataataactaacccccttaccttagaaga 17006597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 23778297 - 23777963
Alignment:
Q  1 atcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23778297 atcaatccacaattaagtatacccaaatcatgattcactcacaatagcatcagttaacaataacaacatcaatggaatatgaattacatctcatttcaat 23778198  T
Q  101 caaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcat 197  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  23778197 caaatcatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcatccacaaacataccataatcat 23778098  T
Q  198 caattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattg 297  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23778097 caattcatgcataagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattg 23777998  T
Q  298 tacatgattatgataataactaacccccttacctt 332  Q
     ||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  23777997 aacatgattatgatgataactaacccctttacctt 23777963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 77 - 338
Target Start/End: Original strand, 8943926 - 8944190
Alignment:
Q  77 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaattt 173  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  8943926 atatgatttacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 8944025  T
Q  174 cacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcata 273  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8944026 cacccacaaatataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcata 8944125  T
Q  274 caacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaaga 338  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8944126 caacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaaga 8944190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 77 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 42178145 - 42177881
Alignment:
Q  77 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaattt 173  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  42178145 atatgatttacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 42178046  T
Q  174 cacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcata 273  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42178045 cacccaaaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcattacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcata 42177946  T
Q  274 caacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaaga 338  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42177945 caacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaaga 42177881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 77 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 12636044 - 12635780
Alignment:
Q  77 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaattt 173  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  12636044 atatgatttacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 12635945  T
Q  174 cacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcata 273  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12635944 cacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacctattttcata 12635845  T
Q  274 caacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaaga 338  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12635844 caacatgaggaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaaga 12635780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 77 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 3798779 - 3798515
Alignment:
Q  77 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaattt 173  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  3798779 atatgatttacatctcatttcaaccaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 3798680  T
Q  174 cacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcata 273  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  3798679 cacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaagagcacgaatttagccacaattgttcatcaacccattttcata 3798580  T
Q  274 caacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaaga 338  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3798579 caacatgagaaaatgcaaaaattatacatgattatgataataactaacccccttaccttagaaga 3798515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 77 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 12641818 - 12641560
Alignment:
Q  77 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaattt 173  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  12641818 atatgatttacatctcatttcaaccaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 12641719  T
Q  174 cacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcata 273  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  12641718 cagccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaagagcacgaatttagccacaattgttcatcaacccattttcata 12641619  T
Q  274 caacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 332  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12641618 caacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 12641560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Original strand, 21141899 - 21142187
Alignment:
Q  1 atcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaat 100  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| || ||||||||  || | | |||||||| | |  ||  || | ||||||| |||||||||||||||||| ||     
T  21141899 atcaatccataattatgtatacccaagtcgtaattcacccacaacaacatcagttaatagcaataaccttaatggaacatgaatcacatctcattttaac 21141998  T
Q  101 caaaacatatcaat-ttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcat 197  Q
     | ||||||||||  ||||  |||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| |    
T  21141999 aacaacatatcaagattcactaattgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttgaaacatgtaatttcatccacaaacataccataatcct 21142098  T
Q  198 caattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaa-catgagaaa 285  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21142099 caattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaa 21142187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 116 - 338
Target Start/End: Original strand, 23774257 - 23774480
Alignment:
Q  116 tcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaaga 213  Q
    |||| ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  23774257 tcattaattaggcaaaatttcacaacttgacatttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcaagtataaga 23774356  T
Q  214 aaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataa 313  Q
    ||  |||| || | ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||  ||| || ||||||||||||    
T  23774357 aac-agcaacataacaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgaaaagatgtaaaatttgaacttgattatgataa 23774455  T
Q  314 taactaacccccttacctttgaaga 338  Q
    ||||||||||||||||||| |||||    
T  23774456 taactaacccccttaccttagaaga 23774480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 223 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 19886684 - 19886566
Alignment:
Q  223 cacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacc 322  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  19886684 cacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attacacatgattatgataataactaacc 19886586  T
Q  323 cccttacctttgaagatgat 342  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  19886585 cccttacctttgaagttgat 19886566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 116 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 5888765 - 5888548
Alignment:
Q  116 tcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaaga 213  Q
    |||| ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | | |||     
T  5888765 tcattaattaggcaaaatttcacaacttgacatttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcatgtataagc 5888666  T
Q  214 aaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataa 313  Q
    ||  |||| || | ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||| |  |||||||||| |    
T  5888665 aac-agcaacataacaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaagatgtaaaatttgaaattgattatgatga 5888567  T
Q  314 taactaacccccttacctt 332  Q
     ||| ||||||||||||||    
T  5888566 aaacaaacccccttacctt 5888548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 133 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 7507969 - 7507758
Alignment:
Q  133 tttcataacttaacatttatacatactttgaa-acgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaag 231  Q
    ||||||||||||  |||| |||||| |||||| | ||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  7507969 tttcataacttattatttttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaag 7507871  T
Q  232 agcacgaatttaacaacaattgttca----------tcaacccattttcatacaac--atgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataacta 319  Q
    |||||||||||| ||| |||| ||||          ||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||  | || ||||||||||||| |  ||||    
T  7507870 agcacgaatttagcaataattattcattcattcaattcaacccatattcatacaacaaatgagaaattgcaataaatgaacatgattatgatgaagacta 7507771  T
Q  320 acccccttacctt 332  Q
    |||||||||||||    
T  7507770 acccccttacctt 7507758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 258 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 19689391 - 19689316
Alignment:
Q  258 tcaacccattttcatacaa--catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 332  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  19689391 tcaacccattt-catacaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttacctt 19689316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 301 - 342
Target Start/End: Original strand, 25213372 - 25213413
Alignment:
Q  301 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgat 342  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  25213372 atgattatgataaagactaacccccttacctttgaagatgat 25213413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 277 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 14906410 - 14906355
Alignment:
Q  277 catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 332  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  14906410 catgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttacctt 14906355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 277 - 332
Target Start/End: Original strand, 23820364 - 23820419
Alignment:
Q  277 catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 332  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  23820364 catgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttacctt 23820419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 258 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 17396643 - 17396568
Alignment:
Q  258 tcaacccattttcatacaa--catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 332  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||| ||| |||||||| || ||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  17396643 tcaacccattt-catacaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatggtaaagactaacccccttacctt 17396568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 290; Significance: 1e-163; HSPs: 2)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 31313 - 31657
Alignment:
Q  1 atcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31313 atcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcttttcaat 31412  T
Q  101 caaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcat 197  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31413 caaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcat 31512  T
Q  198 caattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattg 297  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31513 caattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattg 31612  T
Q  298 tacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgat 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31613 tacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgat 31657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 39650 - 39935
Alignment:
Q  1 atcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||     
T  39650 atcaatccacaattaagtatacccaaatcatgattcactcacaatagcatcagttaacaataacaacatcaatgaaatatgaataacatctcatttcaaa 39749  T
Q  101 caaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcat 197  Q
     |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  39750 aaaaacatatcaaatttcatcaattaagaataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaaaataccataatcat 39849  T
Q  198 caattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgaga 283  Q
    ||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39850 caattcatgcacaggaaaatagaatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgaga 39935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 290; Significance: 1e-163; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 39107 - 39451
Alignment:
Q  1 atcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39107 atcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcttttcaat 39206  T
Q  101 caaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcat 197  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39207 caaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcat 39306  T
Q  198 caattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattg 297  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39307 caattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattg 39406  T
Q  298 tacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgat 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39407 tacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgat 39451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 134 - 342
Target Start/End: Original strand, 43137 - 43343
Alignment:
Q  134 ttcataacttaacatttatacatactttgaa-acgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaaga 232  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||| | ||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| ||| |  || ||| || | ||||||||    
T  43137 ttcataacttaacatttttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatagaaacataacatcccagcaaga 43235  T
Q  233 gcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgag-aaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacct 331  Q
    |||||||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  |||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  43236 gcacgaatttgacatgaattgctcatcaacccattttcatacaacatgagaaaaatgcaaa-at--tacatgtttgtgatagtaactaacccccttacct 43332  T
Q  332 ttgaagatgat 342  Q
    |||||| ||||    
T  43333 ttgaagttgat 43343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 290; Significance: 1e-163; HSPs: 22)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 271612 - 271268
Alignment:
Q  1 atcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  271612 atcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcttttcaat 271513  T
Q  101 caaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcat 197  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  271512 caaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcat 271413  T
Q  198 caattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattg 297  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  271412 caattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattg 271313  T
Q  298 tacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgat 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  271312 tacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgat 271268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 644308 - 644652
Alignment:
Q  1 atcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  644308 atcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcttttcaat 644407  T
Q  101 caaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcat 197  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  644408 caaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcat 644507  T
Q  198 caattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattg 297  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  644508 caattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattg 644607  T
Q  298 tacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgat 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  644608 tacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgat 644652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 830043 - 830387
Alignment:
Q  1 atcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  830043 atcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcttttcaat 830142  T
Q  101 caaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcat 197  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  830143 caaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcat 830242  T
Q  198 caattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattg 297  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  830243 caattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattg 830342  T
Q  298 tacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgat 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  830343 tacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgat 830387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 22089046 - 22088702
Alignment:
Q  1 atcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22089046 atcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcttttcaat 22088947  T
Q  101 caaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcat 197  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22088946 caaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacctataaacataccataatcat 22088847  T
Q  198 caattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattg 297  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22088846 caattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacacattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattg 22088747  T
Q  298 tacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgat 342  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22088746 tacatgattatgatgataactaacccccttacctttgaagttgat 22088702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 15319411 - 15319067
Alignment:
Q  1 atcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  15319411 atcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaacatgaatcacatctcttttcaat 15319312  T
Q  101 caaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcat 197  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15319311 caaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataactcaacatttatacatacttagaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcat 15319212  T
Q  198 caattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattg 297  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15319211 caattcaagcacaagaaaatagtatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattg 15319112  T
Q  298 tacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgat 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15319111 tacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgat 15319067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 15499780 - 15499436
Alignment:
Q  1 atcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  15499780 atcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaacatgaatcacatctcttttcaat 15499681  T
Q  101 caaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcat 197  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15499680 caaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataactcaacatttatacatacttagaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcat 15499581  T
Q  198 caattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattg 297  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15499580 caattcaagcacaagaaaatagtatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattg 15499481  T
Q  298 tacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgat 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15499480 tacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgat 15499436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 22006510 - 22006170
Alignment:
Q  1 atcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22006510 atcagtccacaattaagtatacccaaatcatgattcactcacaataacatcagttaacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaat 22006411  T
Q  101 caaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcat 197  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22006410 caaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcat 22006311  T
Q  198 caattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattg 297  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22006310 caattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattg 22006211  T
Q  298 tacatgattatgataataactaacccccttacctttgaaga 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22006210 tacatgattatgataataactaacccccttacctttgaaga 22006170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 13662517 - 13662177
Alignment:
Q  1 atcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaat 100  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13662517 atcaatccataattatgtatacccaaatcatgattcactcacaatagcatcagttaacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaat 13662418  T
Q  101 caaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcat 197  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13662417 caaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcat 13662318  T
Q  198 caattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattg 297  Q
      ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13662317 ncattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgtttatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattg 13662218  T
Q  298 tacatgattatgataataactaacccccttacctttgaaga 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13662217 tacatgattatgataataactaacccccttaccttagaaga 13662177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 77 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 13721104 - 13720840
Alignment:
Q  77 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaattt 173  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  13721104 atatgatttacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 13721005  T
Q  174 cacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcata 273  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13721004 cacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcata 13720905  T
Q  274 caacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaaga 338  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13720904 caacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaaga 13720840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 16195234 - 16195579
Alignment:
Q  1 atcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaat 100  Q
    ||||||||| |||||  |||||| || |||||||||||   | | | |||||||| | |  ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  16195234 atcaatccataattatatatacctaagtcataattcaccctcaacaacatcagttaatagcaacaacatcaatggaacatgaatcacatctcatttcaac 16195333  T
Q  101 caaaacatatcaa--tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatca 196  Q
     | ||||||||||  |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16195334 aacaacatatcaaaatttcataaattaagtataatctcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatca 16195433  T
Q  197 tcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagatt 296  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16195434 tcaattcatgcacaagaacatagcatcacagcacgagaacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaatt 16195533  T
Q  297 gtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgat 342  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  16195534 gtacatgattatgataataattaacccccttaccttagaagatgat 16195579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 77 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 16873227 - 16872963
Alignment:
Q  77 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaattt 173  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  16873227 atatgatttacatctcatttcaaccaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 16873128  T
Q  174 cacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcata 273  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  16873127 cacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaagagcacgaatttagccacaattgttcatcaacccattttcata 16873028  T
Q  274 caacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaaga 338  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16873027 caacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaaga 16872963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 134 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 21844684 - 21844478
Alignment:
Q  134 ttcataacttaacatttatacatactttgaaacgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagag 233  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||  | | ||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| ||| |  || ||| || |||||||||||    
T  21844684 ttcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagag 21844585  T
Q  234 cacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttt 333  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  21844584 cacgaatttgacatgaattgttcatcaacccaatttcatacaacatgagcaaatgcaaaaat--tacatgattgtgataataactaacccccttaccgtt 21844487  T
Q  334 gaagatgat 342  Q
    |||| ||||    
T  21844486 gaagttgat 21844478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 134 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 21852077 - 21851871
Alignment:
Q  134 ttcataacttaacatttatacatactttgaaacgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagag 233  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||  | |  |||||||||| | || ||||| || |||||||||||| ||| |  || ||| || |||||||||||    
T  21852077 ttcataacttatcatttttacatatttaaacatttaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagag 21851978  T
Q  234 cacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttt 333  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21851977 cacgaatttgacatgaattgttcatcaacccaatttcatacaacatgagcaaatgcaaaaat--tacatgattgtgataataactaacccccttaccttt 21851880  T
Q  334 gaagatgat 342  Q
    |||| ||||    
T  21851879 gaagttgat 21851871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 133 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 6774371 - 6774165
Alignment:
Q  133 tttcataacttaacatttatacatactttgaa-acgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaag 231  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||| |||||| | ||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| ||| |  || ||| || ||||| |||    
T  6774371 tttcacaacttatcatttttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagtaag 6774273  T
Q  232 agcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacct 331  Q
    ||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6774272 agcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatataacatgagaaaatgcaaa-at--tacatgattatgataatcactaacccccttacct 6774176  T
Q  332 ttgaagatgat 342  Q
    |||||| ||||    
T  6774175 ttgaagttgat 6774165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 133 - 342
Target Start/End: Original strand, 24549120 - 24549326
Alignment:
Q  133 tttcataacttaacatttatacatactttgaa-acgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaag 231  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||| |||||| | ||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| ||| |  || ||| || ||||| |||    
T  24549120 tttcacaacttatcatttttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagtaag 24549218  T
Q  232 agcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacct 331  Q
    ||||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24549219 agcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-at--tacatgattatgataatcactaacccccttacct 24549315  T
Q  332 ttgaagatgat 342  Q
    | |||| ||||    
T  24549316 tagaagttgat 24549326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 223 - 342
Target Start/End: Original strand, 30120951 - 30121070
Alignment:
Q  223 cacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacc 322  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||| |||  |||||||||||||||| |||||||    
T  30120951 cacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaactcattttcatacaacatgagattatacaaaaattacacatgattatgataatcactaacc 30121050  T
Q  323 cccttacctttgaagatgat 342  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  30121051 cccttacctttgaagatgat 30121070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 115 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 16674524 - 16674302
Alignment:
Q  115 ttcatcaattaagcataat-ttcataacttaacatttatacatactttgaa-acgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaag 212  Q
    |||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||| | |||| | ||||||||||| | || ||||| |  | ||| |||||| ||| ||     
T  16674524 ttcaccaattaagcacaatattcataacttatcatttttgcata-tatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacataaattcatgcataaa 16674426  T
Q  213 aaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgata 312  Q
    || ||| || ||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||    
T  16674425 aacataacatcacagaaagagcacgaatttagcatgaattgttcaacaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaaat--tacatgattgtgata 16674328  T
Q  313 ataactaacccccttacctttgaaga 338  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  16674327 ataactaacccccttaccttagaaga 16674302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 258 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 22907204 - 22907129
Alignment:
Q  258 tcaacccattttcatacaa--catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 332  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  22907204 tcaacccattt-catacaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttacctt 22907129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 277 - 332
Target Start/End: Original strand, 5238380 - 5238435
Alignment:
Q  277 catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 332  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  5238380 catgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttacctt 5238435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 277 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 24661218 - 24661163
Alignment:
Q  277 catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 332  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  24661218 catgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttacctt 24661163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 277 - 332
Target Start/End: Original strand, 43685839 - 43685894
Alignment:
Q  277 catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 332  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  43685839 catgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttacctt 43685894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 258 - 331
Target Start/End: Original strand, 17345842 - 17345917
Alignment:
Q  258 tcaacccattttcatacaaca--tgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacct 331  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||  | || ||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  17345842 tcaacccatattcatacaacaaatgagaaattgcaataaatgaacatgattatgatgaagactaacccccttacct 17345917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 290; Significance: 1e-163; HSPs: 30)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 7822732 - 7823076
Alignment:
Q  1 atcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7822732 atcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcttttcaat 7822831  T
Q  101 caaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcat 197  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7822832 caaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcat 7822931  T
Q  198 caattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattg 297  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7822932 caattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattg 7823031  T
Q  298 tacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgat 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7823032 tacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgat 7823076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 7830043 - 7830387
Alignment:
Q  1 atcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7830043 atcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcttttcaat 7830142  T
Q  101 caaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcat 197  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7830143 caaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcat 7830242  T
Q  198 caattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattg 297  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7830243 caattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattg 7830342  T
Q  298 tacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgat 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7830343 tacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgat 7830387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 27101889 - 27101545
Alignment:
Q  1 atcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27101889 atcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcttttcaat 27101790  T
Q  101 caaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcat 197  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27101789 caaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcat 27101690  T
Q  198 caattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattg 297  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27101689 caattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattg 27101590  T
Q  298 tacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgat 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27101589 tacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgat 27101545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 27109237 - 27108893
Alignment:
Q  1 atcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27109237 atcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcttttcaat 27109138  T
Q  101 caaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcat 197  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27109137 caaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcat 27109038  T
Q  198 caattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattg 297  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27109037 caattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattg 27108938  T
Q  298 tacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgat 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27108937 tacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgat 27108893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 27176437 - 27176781
Alignment:
Q  1 atcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27176437 atcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcttttcaat 27176536  T
Q  101 caaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcat 197  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27176537 caaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcat 27176636  T
Q  198 caattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattg 297  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27176637 caattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattg 27176736  T
Q  298 tacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgat 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27176737 tacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgat 27176781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 38783981 - 38783637
Alignment:
Q  1 atcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38783981 atcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcttttcaat 38783882  T
Q  101 caaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcat 197  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38783881 caaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcat 38783782  T
Q  198 caattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattg 297  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38783781 caattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattg 38783682  T
Q  298 tacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgat 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38783681 tacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgat 38783637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 15951043 - 15950703
Alignment:
Q  1 atcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15951043 atcaatccacaattaagtatacccaaatcatgattcacttacaatagcatcagttaacaataatcacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaat 15950944  T
Q  101 caaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcat 197  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15950943 caaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcat 15950844  T
Q  198 caattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattg 297  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15950843 caattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattg 15950744  T
Q  298 tacatgattatgataataactaacccccttacctttgaaga 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15950743 tacatgattatgataataactaacccccttacctttgaaga 15950703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 15760366 - 15760026
Alignment:
Q  1 atcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15760366 atcaatccacaattaagtatacccaattcattattcactcacaataacatcagttaacaataacaacatcaatggaatatgaattacatctcatttcaat 15760267  T
Q  101 caaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcat 197  Q
     |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  15760266 taaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacatatcataatcat 15760167  T
Q  198 caattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattg 297  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15760166 caattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaataattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattg 15760067  T
Q  298 tacatgattatgataataactaacccccttacctttgaaga 338  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  15760066 aacatgattatgatgataactaacccccttaccttagaaga 15760026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 77 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 18980197 - 18979933
Alignment:
Q  77 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaattt 173  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  18980197 atatgatttacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 18980098  T
Q  174 cacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcata 273  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18980097 cacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcata 18979998  T
Q  274 caacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaaga 338  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18979997 caacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaaga 18979933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 77 - 338
Target Start/End: Original strand, 15927648 - 15927912
Alignment:
Q  77 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaattt 173  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  15927648 atatgatttacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 15927747  T
Q  174 cacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcata 273  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  15927748 cacccacaagcataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaacaattgatcatcaatccattttcata 15927847  T
Q  274 caacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaaga 338  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15927848 caacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaaga 15927912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 77 - 338
Target Start/End: Original strand, 13758450 - 13758714
Alignment:
Q  77 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaattt 173  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  13758450 atatgatttacatctcatttcaaccaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 13758549  T
Q  174 cacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcata 273  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  13758550 cacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaagagcacgaatttagccacaattgttcatcaacccattttcata 13758649  T
Q  274 caacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaaga 338  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13758650 caacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaaga 13758714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 77 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 14251074 - 14250810
Alignment:
Q  77 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaattt 173  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  14251074 atatgatttacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 14250975  T
Q  174 cacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcata 273  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14250974 cacccaaaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcattacaacaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcata 14250875  T
Q  274 caacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaaga 338  Q
    ||||||||||||||||||| | || ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  14250874 caacatgagaaaatgcaaaaaatgaacatgattacgatgataactaacccccttaccttagaaga 14250810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 129 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 48622788 - 48622584
Alignment:
Q  129 ataatttcataacttaacatttatacatactttgaa-acgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacag 227  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  48622788 ataatttcacaacttaacaattatgcatgctttgaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatatcatcacag 48622689  T
Q  228 caagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaaccccctt 327  Q
     ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||  |  |||||||||| | ||| |||||||||    
T  48622688 taagagcacgaatttagcatcaattgttcatcaacccattttcgtaaaacatgagaaaatgcaaaaatttgaattgattatgatgaaaacaaaccccctt 48622589  T
Q  328 acctt 332  Q
    |||||    
T  48622588 acctt 48622584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 167 - 342
Target Start/End: Original strand, 2437630 - 2437804
Alignment:
Q  167 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 266  Q
    ||||||||||| | || ||||| |  | |||||||||| ||| |  || ||| || |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||    
T  2437630 gtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacaacaagagcacgaatttagcaagaattgttcattatcccat 2437729  T
Q  267 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgat 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2437730 tttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgat 2437804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 134 - 338
Target Start/End: Original strand, 13572816 - 13573018
Alignment:
Q  134 ttcataacttaacatttatacatactttgaaacgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagag 233  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||  | | ||||||||||| | || || || || |||||||||||| ||| |  || ||| || |||||||||||    
T  13572816 ttcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcacacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagag 13572915  T
Q  234 cacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttt 333  Q
    ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  13572916 cacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaaat--tacatgattgtgataataactaacccccttacctta 13573013  T
Q  334 gaaga 338  Q
    |||||    
T  13573014 gaaga 13573018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 116 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 10000505 - 10000288
Alignment:
Q  116 tcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaa--acgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaaga 213  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||  | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | | |||     
T  10000505 tcatcaattaagcaaaatttcacaacttgacatttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcatgtataag- 10000407  T
Q  214 aaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataa 313  Q
    ||| | || || | ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||| |  |||||||||| |    
T  10000406 aaacaacaacataacaagagcacgaatttgacataaattgttcatcaacccatttttatacaacatgagaagatgcaaaatttgaaattgattatgatga 10000307  T
Q  314 taactaacccccttacctt 332  Q
      || ||||||||||||||    
T  10000306 agacaaacccccttacctt 10000288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 116 - 332
Target Start/End: Original strand, 16418618 - 16418835
Alignment:
Q  116 tcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaaga 213  Q
    |||| ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | | |||     
T  16418618 tcattaattaggcaaaatttcacaacttgacatttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcatgtataagc 16418717  T
Q  214 aaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataa 313  Q
    ||  |||| || | ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||| |  |||||||||| |    
T  16418718 aac-agcaacataacaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaagatgtaaaatttgaaattgattatgatga 16418816  T
Q  314 taactaacccccttacctt 332  Q
     ||| ||||||||||||||    
T  16418817 aaacaaacccccttacctt 16418835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 133 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 16479075 - 16478869
Alignment:
Q  133 tttcataacttaacatttatacatactttgaa-acgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaag 231  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||| |||||| | ||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| ||| |  || ||| || | ||| |||    
T  16479075 tttcacaacttatcatttttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcgcagtaag 16478977  T
Q  232 agcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacct 331  Q
    ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16478976 agcacgaatctaacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-at--taaatgattatgataatcactaacccccttacct 16478880  T
Q  332 ttgaagatgat 342  Q
    |||||| ||||    
T  16478879 ttgaagttgat 16478869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 231 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 18253862 - 18253761
Alignment:
Q  231 gagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacc 330  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  18253862 gagcacgaatttagtaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattataatgataactaacccccttacc 18253763  T
Q  331 tt 332  Q
    ||    
T  18253762 tt 18253761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 167 - 342
Target Start/End: Original strand, 10989582 - 10989756
Alignment:
Q  167 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 266  Q
    ||||||||||| | || ||||| |  | |||||||||| ||| |  || ||| || ||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||    
T  10989582 gtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgatttgttcatcaacccat 10989681  T
Q  267 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgat 342  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  10989682 tttcatacaacatgagaatatgcaaa-attatacatgattatgataatcactaacccccatacctttgaagttgat 10989756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 249 - 332
Target Start/End: Original strand, 15862174 - 15862257
Alignment:
Q  249 aattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15862174 aattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattatacatgattatgataataactaacccccttacctt 15862257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 115 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 13911156 - 13910929
Alignment:
Q  115 ttcatcaattaagcataat-ttcataacttaacatttatacatactttgaa-acgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaag 212  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| | |||| | |||| | ||||||||||| | || ||||| || | |||||||||| ||| |      
T  13911156 ttcaccaattgagcataatattcataacttatcatttttgcata-tatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattaacatcaattcatgcataca 13911058  T
Q  213 aaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgata 312  Q
    || ||| || |||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||    
T  13911057 aacataacatcacaacaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaactcattttcatacaacatgagaatatgcaaa-attacacatgattatgata 13910959  T
Q  313 ataactaacccccttacctttgaagatgat 342  Q
    || | |||||||||||||||||||| ||||    
T  13910958 atcaataacccccttacctttgaagttgat 13910929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 115 - 332
Target Start/End: Original strand, 13321134 - 13321365
Alignment:
Q  115 ttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaag 212  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| ||| |      
T  13321134 ttcaccaattgagcacaatttcataacttgacatttatacatactttgaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcataca 13321233  T
Q  213 aaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttca----------tcaacccattttcatacaac--atgagaaaatgcaaagattgtac 300  Q
    || ||| || |||||  |||||||||||||| |||||||| | ||          ||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||  | || ||    
T  13321234 aacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccacttattcaattcaacccatattcatacaacaaatgagaaattgcaataaatgaac 13321333  T
Q  301 atgattatgataataactaacccccttacctt 332  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  13321334 atgattatgatgaagactaacccccttacctt 13321365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 258 - 332
Target Start/End: Original strand, 7293289 - 7293364
Alignment:
Q  258 tcaacccattttcatacaa--catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 332  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  7293289 tcaacccattt-catacaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttacctt 7293364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 258 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 30262119 - 30262044
Alignment:
Q  258 tcaacccattttcatacaa--catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 332  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  30262119 tcaacccattt-catacaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttacctt 30262044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 277 - 332
Target Start/End: Original strand, 11516520 - 11516575
Alignment:
Q  277 catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 332  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  11516520 catgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttacctt 11516575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 277 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 14113959 - 14113904
Alignment:
Q  277 catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 332  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  14113959 catgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttacctt 14113904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 277 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 15441534 - 15441479
Alignment:
Q  277 catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 332  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  15441534 catgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttacctt 15441479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 258 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 14423629 - 14423555
Alignment:
Q  258 tcaacccattttcatacaa--catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 332  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  14423629 tcaacccattt-catacaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataa-gactaacccccttacctt 14423555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 301 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 15516793 - 15516752
Alignment:
Q  301 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgat 342  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  15516793 atgattatgataaagactaacccccttacatttgaagatgat 15516752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 290; Significance: 1e-163; HSPs: 36)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 35582040 - 35582384
Alignment:
Q  1 atcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35582040 atcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcttttcaat 35582139  T
Q  101 caaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcat 197  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35582140 caaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcat 35582239  T
Q  198 caattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattg 297  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35582240 caattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattg 35582339  T
Q  298 tacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgat 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35582340 tacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgat 35582384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 21932633 - 21932289
Alignment:
Q  1 atcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21932633 atcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatggcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcttttcaat 21932534  T
Q  101 caaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcat 197  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21932533 caaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcat 21932434  T
Q  198 caattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattg 297  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21932433 caattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattg 21932334  T
Q  298 tacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgat 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21932333 tacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgat 21932289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 21938803 - 21938459
Alignment:
Q  1 atcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21938803 atcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatggcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcttttcaat 21938704  T
Q  101 caaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcat 197  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21938703 caaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcat 21938604  T
Q  198 caattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattg 297  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21938603 caattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattg 21938504  T
Q  298 tacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgat 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21938503 tacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgat 21938459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 22883336 - 22882992
Alignment:
Q  1 atcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22883336 atcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcttttcaat 22883237  T
Q  101 caaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcat 197  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22883236 caaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcatccataaacataccataatcat 22883137  T
Q  198 caattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattg 297  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22883136 caattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacaaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattg 22883037  T
Q  298 tacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgat 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  22883036 tacatgattatgataataactaacccccttatctttgaagttgat 22882992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 36990022 - 36989678
Alignment:
Q  1 atcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36990022 atcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcttttcaat 36989923  T
Q  101 caaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcat 197  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36989922 caaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcat 36989823  T
Q  198 caattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattg 297  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36989822 caattcaagcacaagaaaatagcatcacagctagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaattgcaaagattg 36989723  T
Q  298 tacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgat 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36989722 tacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgat 36989678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 1219772 - 1219432
Alignment:
Q  1 atcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1219772 atcaatccacaattaagtatacccaaatcatgattcactcacaatagcatcagttaacaataaccacatcaatgaaatatgaatcacatctcatttcaat 1219673  T
Q  101 caaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcat 197  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1219672 caaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcat 1219573  T
Q  198 caattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattg 297  Q
    ||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1219572 caattaatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattg 1219473  T
Q  298 tacatgattatgataataactaacccccttacctttgaaga 338  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  1219472 tacatgattatgataatcactaacccccttaccttagaaga 1219432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Original strand, 7425328 - 7425668
Alignment:
Q  1 atcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaat 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||| || | |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7425328 atcaatccataattaagtatatccaagtcatgattcactcacaacagcatcagttaacaataacaacatcaatggaatatgaattacatctcatttcaat 7425427  T
Q  101 caaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcat 197  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  7425428 caaaacatatcaaatttcatcaatgaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataaccat 7425527  T
Q  198 caattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattg 297  Q
    | ||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7425528 cgattcatgcacaagaaaataacatcacagcaagagcacgaatttagcaataattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattg 7425627  T
Q  298 tacatgattatgataataactaacccccttacctttgaaga 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7425628 tacatgattatgataataactaacccccttaccttagaaga 7425668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 48 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 17471793 - 17471496
Alignment:
Q  48 catcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaac 146  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  17471793 catcagttaacaataacaacatcaatggaatatgaattacatcttatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcattacttaac 17471694  T
Q  147 atttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaa 244  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  17471693 atttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttat 17471594  T
Q  245 caacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgat 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17471593 caacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatacaaaatttgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgat 17471496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 77 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 10778146 - 10777878
Alignment:
Q  77 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaattt 173  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  10778146 atatgatttacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 10778047  T
Q  174 cacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcata 273  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10778046 cacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcata 10777947  T
Q  274 caacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgat 342  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  10777946 caacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataatcactaccccccttacctttgaagatgat 10777878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 35791351 - 35791010
Alignment:
Q  1 atcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaat 100  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||   | | | |||||||| | |  ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  35791351 atcaatccataattatgtatacccaagtcataattcaccctcaacaacatcagttaatagcaacaacatcaatggaacatgaatcacatctcatttcaac 35791252  T
Q  101 caaaacatatcaa--tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatca 196  Q
     | ||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||    
T  35791251 aacaacatatcaaaatttcatcaattaagtataatctcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcactcacaaacataccataatca 35791152  T
Q  197 tcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagatt 296  Q
    |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  35791151 tcaattcatgcacaagaaaataacatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaatt 35791052  T
Q  297 gtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaaga 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35791051 gtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaaga 35791010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 77 - 338
Target Start/End: Original strand, 23514641 - 23514905
Alignment:
Q  77 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaattt 173  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  23514641 atatgatttacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 23514740  T
Q  174 cacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcata 273  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23514741 cacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcata 23514840  T
Q  274 caacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaaga 338  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  23514841 caacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgatgataactaacccccttaccttagaaga 23514905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 11212317 - 11211973
Alignment:
Q  1 atcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaat 100  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| |||  || | | |||||||| | |  ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  11212317 atcaatccataattatgtatacccaagtcataatccacccacaacaacatcagttaatagcaacaacatcaatggaacatgaatcacatctcatttcaac 11212218  T
Q  101 caaaacatatcaat-ttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcat 197  Q
     | ||||||| ||  ||||  | || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11212217 aacaacatattaaaattcactacttgagtataatttcataacttaacatttatacacactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcat 11212118  T
Q  198 caattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattg 297  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11212117 caattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattg 11212018  T
Q  298 tacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgat 342  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11212017 aacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgat 11211973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 116 - 338
Target Start/End: Original strand, 23328678 - 23328901
Alignment:
Q  116 tcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaaga 213  Q
    |||| ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  23328678 tcattaattaggcaaaatttcacaacttgacatttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcaagtataaga 23328777  T
Q  214 aaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataa 313  Q
    ||  |||| || | ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||  ||| |  ||||||||||||    
T  23328778 aac-agcaacataacaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgaaaagatgtaaaatttgaaattgattatgataa 23328876  T
Q  314 taactaacccccttacctttgaaga 338  Q
    ||||||||||||||||||| |||||    
T  23328877 taactaacccccttaccttagaaga 23328901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 116 - 338
Target Start/End: Original strand, 24616282 - 24616505
Alignment:
Q  116 tcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaaga 213  Q
    |||| ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||||    
T  24616282 tcattaattaggcaaaatttcacaacttgacatttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataattatcaattcaagtataaga 24616381  T
Q  214 aaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataa 313  Q
    ||  |||| || | ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||  ||| |  ||||||||||||    
T  24616382 aac-agcaacataacaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgaaaagatgtaaaatttgaaattgattatgataa 24616480  T
Q  314 taactaacccccttacctttgaaga 338  Q
    ||||||||||||||||||| |||||    
T  24616481 taactaacccccttaccttagaaga 24616505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 116 - 338
Target Start/End: Original strand, 24712658 - 24712881
Alignment:
Q  116 tcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaaga 213  Q
    |||| ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||||    
T  24712658 tcattaattaggcaaaatttcacaacttgacatttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataattatcaattcaagtataaga 24712757  T
Q  214 aaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataa 313  Q
    ||  |||| || | ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||  ||| |  ||||||||||||    
T  24712758 aac-agcaacataacaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgaaaagatgtaaaatttgaaattgattatgataa 24712856  T
Q  314 taactaacccccttacctttgaaga 338  Q
    ||||||||||||||||||| |||||    
T  24712857 taactaacccccttaccttagaaga 24712881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 116 - 338
Target Start/End: Original strand, 24745676 - 24745899
Alignment:
Q  116 tcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaaga 213  Q
    |||| ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||||    
T  24745676 tcattaattaggcaaaatttcacaacttgacatttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataattatcaattcaagtataaga 24745775  T
Q  214 aaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataa 313  Q
    ||  |||| || | ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||  ||| |  ||||||||||||    
T  24745776 aac-agcaacataacaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgaaaagatgtaaaatttgaaattgattatgataa 24745874  T
Q  314 taactaacccccttacctttgaaga 338  Q
    ||||||||||||||||||| |||||    
T  24745875 taactaacccccttaccttagaaga 24745899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 223 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 18778015 - 18777902
Alignment:
Q  223 cacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacc 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||    
T  18778015 cacagcaagagcacgaatttaacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attacacatgattatgataatcactaacc 18777917  T
Q  323 cccttacctttgaag 337  Q
    |||||||||||||||    
T  18777916 cccttacctttgaag 18777902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 134 - 338
Target Start/End: Original strand, 27009981 - 27010183
Alignment:
Q  134 ttcataacttaacatttatacatactttgaaacgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagag 233  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||  | | ||||||||||| | |  ||||| || |||||||||||| ||| |  || ||| || |||||||||||    
T  27009981 ttcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacactcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagag 27010080  T
Q  234 cacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttt 333  Q
    ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  27010081 cacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaaat--tacatgattgtgataataactaacccccttacctta 27010178  T
Q  334 gaaga 338  Q
    |||||    
T  27010179 gaaga 27010183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 223 - 342
Target Start/End: Original strand, 12603 - 12721
Alignment:
Q  223 cacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacc 322  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  12603 cacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatacaaa-attacacatgattatgataataactaacc 12701  T
Q  323 cccttacctttgaagatgat 342  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  12702 cccttacctttgaagttgat 12721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 223 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 21073618 - 21073500
Alignment:
Q  223 cacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacc 322  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  21073618 cacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcattaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attacacatgattatgataataactaacc 21073520  T
Q  323 cccttacctttgaagatgat 342  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  21073519 cccttacctttgaagttgat 21073500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 223 - 342
Target Start/End: Original strand, 25426857 - 25426975
Alignment:
Q  223 cacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacc 322  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||    
T  25426857 cacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attacacatgattatgataatcactaacc 25426955  T
Q  323 cccttacctttgaagatgat 342  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  25426956 cccttacctttgaagttgat 25426975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 223 - 342
Target Start/End: Original strand, 19500128 - 19500246
Alignment:
Q  223 cacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacc 322  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||    
T  19500128 cacagcaagagcacgaatttagcatgaagtgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attacacatgattatgataatcactaacc 19500226  T
Q  323 cccttacctttgaagatgat 342  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  19500227 cccttacctttgaagttgat 19500246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 223 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 22366504 - 22366386
Alignment:
Q  223 cacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacc 322  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||    
T  22366504 cacagcaagagcacgaatttagcatgaattgctcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attacacatgattatgataatcactaacc 22366406  T
Q  323 cccttacctttgaagatgat 342  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  22366405 cccttacctttgaagttgat 22366386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 133 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 29188397 - 29188191
Alignment:
Q  133 tttcataacttaacatttatacatactttgaa-acgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaag 231  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||| |||||| | ||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| ||| |  || ||| || ||||| |||    
T  29188397 tttcacaacttatcatttttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagtaag 29188299  T
Q  232 agcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacct 331  Q
    ||||||||| || ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  29188298 agcacgaatctagcatgaattgttcatcgacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-at--tacatgattataataatcactaacccccttacct 29188202  T
Q  332 ttgaagatgat 342  Q
    |||||| ||||    
T  29188201 ttgaagttgat 29188191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 167 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 43443474 - 43443302
Alignment:
Q  167 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 266  Q
    ||||||||||| | || ||||| |  | |||||||||| ||| |  || ||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  43443474 gtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttaacatgaattgttcatcaatccat 43443375  T
Q  267 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgat 342  Q
    ||||||| |||||||||| |||||   |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  43443374 tttcatataacatgagaatatgca---attacacatgattatgataatcactaacccccttacctttgaagttgat 43443302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 115 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 4200117 - 4199890
Alignment:
Q  115 ttcatcaattaagcataat-ttcataacttaacatttatacatactttgaa-acgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaag 212  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| | |||| | |||| | ||||||||||| | || ||||| |  | |||||||||| ||| |      
T  4200117 ttcaccaatttagcataatattcataacttatcatttttgcata-tatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcataca 4200019  T
Q  213 aaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgata 312  Q
    || ||| || |||| |||||||||||||||| ||  |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||    
T  4200018 aacataacatcacaacaagagcacgaatttagcatgaattattcatcaactcattttcatacaacatgagaatatgcaaa-attacacatgattatgata 4199920  T
Q  313 ataactaacccccttacctttgaagatgat 342  Q
    ||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  4199919 atccctaacccccttacctttgaagttgat 4199890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 66 - 252
Target Start/End: Original strand, 32950762 - 32950952
Alignment:
Q  66 acatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacata-tcaatttcatcaattaagcataatttcataactta-acatttatacatactttga 163  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||  | |||||| | || |||| || || |||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  32950762 acatcaatggaacatgaatcacatctcttttcaacaacaacatagtaaaattcaccatttgagcacaatttcataactttgacctttatacatactttga 32950861  T
Q  164 aac--gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaatt 252  Q
    |||  ||||||||| ||| || ||||| || |||||||| |||  |||| ||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  32950862 aacatgtaatttcaaccacaatcatacaattatcatcaaatcatacacacgaaaataacatcacagttagagcacgaatttaacaacaatt 32950952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 301 - 338
Target Start/End: Original strand, 11343008 - 11343045
Alignment:
Q  301 atgattatgataataactaacccccttacctttgaaga 338  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11343008 atgattatgataaaaactaacccccttacctttgaaga 11343045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 277 - 332
Target Start/End: Original strand, 20623262 - 20623317
Alignment:
Q  277 catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 332  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  20623262 catgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttacctt 20623317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 277 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 21233498 - 21233443
Alignment:
Q  277 catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 332  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  21233498 catgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttacctt 21233443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 277 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 25900376 - 25900321
Alignment:
Q  277 catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 332  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  25900376 catgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttacctt 25900321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 277 - 332
Target Start/End: Original strand, 37053037 - 37053092
Alignment:
Q  277 catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 332  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  37053037 catgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttacctt 37053092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Original strand, 23328562 - 23328600
Alignment:
Q  1 atcaatccacaattaagtatacccaattcataattcact 39  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  23328562 atcaatccacaattaagtatacccaagttataattcact 23328600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Original strand, 24616167 - 24616205
Alignment:
Q  1 atcaatccacaattaagtatacccaattcataattcact 39  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  24616167 atcaatccacaattaagtatacccaagttataattcact 24616205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Original strand, 24712543 - 24712581
Alignment:
Q  1 atcaatccacaattaagtatacccaattcataattcact 39  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  24712543 atcaatccacaattaagtatacccaagttataattcact 24712581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Original strand, 24745561 - 24745599
Alignment:
Q  1 atcaatccacaattaagtatacccaattcataattcact 39  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  24745561 atcaatccacaattaagtatacccaagttataattcact 24745599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 270; Significance: 1e-151; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 29166 - 29510
Alignment:
Q  1 atcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaat 100  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| || ||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29166 atcaatacacaattaagtataaccaaatcataattcactaacaataacataaattaacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaat 29265  T
Q  101 caaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcat 197  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  29266 caaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttacacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataacataatcaa 29365  T
Q  198 caattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattg 297  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29366 caattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattg 29465  T
Q  298 tacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgat 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29466 tacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgat 29510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 3)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 154259 - 153919
Alignment:
Q  1 atcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  || ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  154259 atcaatccacaattaagtatacccaaatcatgattcacccacaatagcataagttaacaataaccacatcaatggaatatgattcacatctcatttcaat 154160  T
Q  101 caaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcat 197  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  154159 caaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaacttcacccacaaacataccataatcat 154060  T
Q  198 caattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattg 297  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  154059 caattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattg 153960  T
Q  298 tacatgattatgataataactaacccccttacctttgaaga 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  153959 tacatgattatgataataactaacccccttaccttagaaga 153919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 223 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 169935 - 169817
Alignment:
Q  223 cacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacc 322  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  169935 cacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attatacatgattatgataatcactaacc 169837  T
Q  323 cccttacctttgaagatgat 342  Q
    ||||||| ||||||||||||    
T  169836 cccttacttttgaagatgat 169817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 228 - 342
Target Start/End: Original strand, 36327 - 36440
Alignment:
Q  228 caagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaaccccctt 327  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  36327 caagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccagtttcatacaacatgagaatatgcaaa-attacacatgattatgataatcattaaccccctt 36425  T
Q  328 acctttgaagatgat 342  Q
    |||||||||| ||||    
T  36426 acctttgaagttgat 36440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 260; Significance: 1e-145; HSPs: 23)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Original strand, 18168974 - 18169308
Alignment:
Q  1 atcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaat 100  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||| || ||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18168974 atcaattcacaattaagtatatccaaatcatgattcactcacaatagcattatttaacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaat 18169073  T
Q  101 caaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcat 197  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18169074 caaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcat 18169173  T
Q  198 caattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattg 297  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18169174 caattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattg 18169273  T
Q  298 tacatgattatgataataactaacccccttacctt 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18169274 tacatgattatgataataactaacccccttacctt 18169308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Original strand, 19020490 - 19020824
Alignment:
Q  1 atcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19020490 atcaatccacaattaagtatactcaaatcatgattcactcacaatagcatcagttaacaataacaacatcaatggaatatgaattacatctcatttcaat 19020589  T
Q  101 caaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcat 197  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19020590 caaaacatatcaaatttcatccattaaggataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcat 19020689  T
Q  198 caattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattg 297  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  19020690 caattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccattttcatacaacatgacaaaatgcaaaaattg 19020789  T
Q  298 tacatgattatgataataactaacccccttacctt 332  Q
     |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  19020790 aacatgattatgatggtaactaacccccttacctt 19020824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 15287497 - 15287157
Alignment:
Q  1 atcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaat 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| || | |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15287497 atcaatccataattaagtatacccaagtcatgattcactcacaacagcatcagttaacaataacaacatcaatggaatatgaattacatctcatttcaat 15287398  T
Q  101 caaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcat 197  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  15287397 caaaacatatcaaatttcatcaatggagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataaccat 15287298  T
Q  198 caattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattg 297  Q
    | ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15287297 cgattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagctataattgttcatcatcccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattg 15287198  T
Q  298 tacatgattatgataataactaacccccttacctttgaaga 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15287197 tacatgattatgataataactaacccccttaccttagaaga 15287157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 15294606 - 15294266
Alignment:
Q  1 atcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaat 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| || | |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15294606 atcaatccataattaagtatacccaagtcatgattcactcacaacagcatcagttaacaataacaacatcaatggaatatgaattacatctcatttcaat 15294507  T
Q  101 caaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcat 197  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  15294506 caaaacatatcaaatttcatcaatggagtataatttcataacttaacatttatatatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataaccat 15294407  T
Q  198 caattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattg 297  Q
    | ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15294406 cgattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagctataattgttcatcatcccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattg 15294307  T
Q  298 tacatgattatgataataactaacccccttacctttgaaga 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15294306 tacatgattatgataataactaacccccttaccttagaaga 15294266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 77 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 7132241 - 7131977
Alignment:
Q  77 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaattt 173  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  7132241 atatgatttacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 7132142  T
Q  174 cacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcata 273  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7132141 cacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcata 7132042  T
Q  274 caacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaaga 338  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7132041 taacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaaga 7131977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 77 - 338
Target Start/End: Original strand, 20000803 - 20001067
Alignment:
Q  77 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaattt 173  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  20000803 atatgatttacatctcatttcaaccaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 20000902  T
Q  174 cacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcata 273  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  20000903 cacccagaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaagagcacgaatttagccacaattgttcatcaacccattttcata 20001002  T
Q  274 caacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaaga 338  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20001003 caacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaaga 20001067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 17145909 - 17145569
Alignment:
Q  1 atcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaat 100  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||  || | | |||||||| | |  ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  17145909 atcaatccgtaattatgtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaacaacatcaatggaacatgaatcacatctcatttcaac 17145810  T
Q  101 caaaacatatcaat-ttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcat 197  Q
     | ||||||||||  ||||  |||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17145809 aacaacatatcaaaattcactaattgagtataatttcacaacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcat 17145710  T
Q  198 caattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattg 297  Q
    ||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17145709 caattcatgtacaagaaaatagcatcacagtaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaactcattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattg 17145610  T
Q  298 tacatgattatgataataactaacccccttacctttgaaga 338  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17145609 aacatgattatgataataactaacccccttaccttagaaga 17145569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 18248222 - 18248566
Alignment:
Q  1 atcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaat 100  Q
    ||||||| | ||||| ||||||| || |||||||||||  || | | |||||||| | |  ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  18248222 atcaatcgataattatgtataccaaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaacaacatcaatggaacatgaatcacatctcatttcaac 18248321  T
Q  101 caaaacatatcaat-ttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcat 197  Q
     | ||||||| ||  ||||  |||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| |    
T  18248322 aacaacatattaaaattcactaattgagtataatttcatatcttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcatccacaaacataccataatcct 18248421  T
Q  198 caattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattg 297  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  18248422 caattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattg 18248521  T
Q  298 tacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgat 342  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  18248522 tacaagattatgataataactaacccccttaccttagatgatgat 18248566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 117 - 332
Target Start/End: Original strand, 22738390 - 22738607
Alignment:
Q  117 catcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaa 214  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22738390 catcaattaagcataatttcacaacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaa 22738489  T
Q  215 aatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataat 314  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||| |     
T  22738490 aatagcatcacagcaagaacacgaatttaacatcaattgttcctcagcccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaaattgattatgatgaa 22738589  T
Q  315 aactaacccccttacctt 332  Q
     || ||||||||||||||    
T  22738590 gacaaacccccttacctt 22738607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 208 - 323
Target Start/End: Original strand, 8378365 - 8378480
Alignment:
Q  208 acaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgatta 307  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  8378365 acaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgatta 8378464  T
Q  308 tgataataactaaccc 323  Q
    ||||||||||||||||    
T  8378465 tgataataactaaccc 8378480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 116 - 338
Target Start/End: Original strand, 26339140 - 26339363
Alignment:
Q  116 tcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaaga 213  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||  ||||| |  ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  26339140 tcattaattaagcaaaatttcacaacttgacatttatacatagattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcaagtataaga 26339239  T
Q  214 aaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataa 313  Q
    ||  |||| || | ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||  ||| |  ||||||||||||    
T  26339240 aac-agcaacataacaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgaaaagatgtaaaatttgaaattgattatgataa 26339338  T
Q  314 taactaacccccttacctttgaaga 338  Q
    ||||||||||||||||||| |||||    
T  26339339 taactaacccccttaccttagaaga 26339363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 131 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 22352184 - 22351976
Alignment:
Q  131 aatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagc 228  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | | ||||||  |||| || | |    
T  22352184 aatttcacaacttgacatttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcatgtataagaaac-agcaacataac 22352086  T
Q  229 aagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaaccccctta 328  Q
    ||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  22352085 aagagcatgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaagatgtaaaatttgaaattgattatgataataactaaccccctta 22351986  T
Q  329 cctttgaaga 338  Q
    |||| |||||    
T  22351985 ccttagaaga 22351976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 135 - 342
Target Start/End: Original strand, 10644360 - 10644564
Alignment:
Q  135 tcataacttaacatttatacatactttgaa-acgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagag 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| | ||||||||||  | || ||||| || |||||||||||| ||| |  || ||| || |||||||||||    
T  10644360 tcataacttaacatttttacata-tttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagag 10644458  T
Q  234 cacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttt 333  Q
    ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10644459 cacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttaccttt 10644555  T
Q  334 gaagatgat 342  Q
    |||| ||||    
T  10644556 gaagttgat 10644564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 8374512 - 8374724
Alignment:
Q  1 atcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaat 100  Q
    ||||||| | ||||| ||||||||||  ||||||||||  || | | |||||||| | |  ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  8374512 atcaatcgataattatgtatacccaagccataattcacccacaacaacatcagttaatagcaacaacatcaatggaacatgaatcacatctcatttcaac 8374611  T
Q  101 caaaacatatcaat-ttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaa--acgtaatttcacccataaacataccataatcat 197  Q
     | ||||||| ||  ||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8374612 aacaacatattaaaattcactaattgagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaagcatgtaatttcacccacaaacataccataatcat 8374711  T
Q  198 caattcaagcaca 210  Q
    ||||||| |||||    
T  8374712 caattcatgcaca 8374724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 223 - 338
Target Start/End: Original strand, 47357883 - 47357995
Alignment:
Q  223 cacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacc 322  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  47357883 cacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgaggaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacc 47357979  T
Q  323 cccttacctttgaaga 338  Q
    |||||||||| |||||    
T  47357980 cccttaccttagaaga 47357995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 257 - 332
Target Start/End: Original strand, 9795490 - 9795564
Alignment:
Q  257 atcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 332  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9795490 atcaacccattt-catacaacatgagaaaatgaaaaaattgaacatgattatgatgataactaacccccttacctt 9795564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 66 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 40885748 - 40885585
Alignment:
Q  66 acatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaat-ttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaa 164  Q
    |||||||| ||| |||||||| |||||| |||||  | ||| || |||  |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40885748 acatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaataacttagcaaagttcaccaattgagcataatttcataacttgacatttatacatactttgaa 40885649  T
Q  165 -acgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacag 227  Q
     | ||||||||||| | |||||| | || |||| ||||||| ||| |  || ||||||||||||    
T  40885648 catgtaatttcaccaacaaacattcaattatcaccaattcatgcatacaaacatagcaccacag 40885585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 294 - 332
Target Start/End: Original strand, 8378486 - 8378524
Alignment:
Q  294 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8378486 attgtacatgattatgataataactaatccccttacctt 8378524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 300 - 332
Target Start/End: Original strand, 14996444 - 14996476
Alignment:
Q  300 catgattatgataataactaacccccttacctt 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14996444 catgattatgataataactaacccccttacctt 14996476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 277 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 16327896 - 16327841
Alignment:
Q  277 catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 332  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  16327896 catgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttacctt 16327841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 277 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 16609069 - 16609014
Alignment:
Q  277 catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 332  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  16609069 catgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttacctt 16609014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 277 - 332
Target Start/End: Original strand, 26680493 - 26680548
Alignment:
Q  277 catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 332  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  26680493 catgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttacctt 26680548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 38
Target Start/End: Original strand, 22738276 - 22738310
Alignment:
Q  4 aatccacaattaagtatacccaattcataattcac 38  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22738276 aatccacaattaagtatacccaagtcataattcac 22738310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 238; Significance: 1e-132; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 1827 - 1487
Alignment:
Q  1 atcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||   |||||| | |||||||||||||||    
T  1827 atcaatccacaattaagtatacccaaatcatgattcactcacaatagcatcagttaacaataacaacatcaattttatatgatttacatctcatttcaat 1728  T
Q  101 caaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcat 197  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1727 caaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcat 1628  T
Q  198 caattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattg 297  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1627 caattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagtgcacgattttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattg 1528  T
Q  298 tacatgattatgataataactaacccccttacctttgaaga 338  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1527 aacatgattatgataataactaacccccttaccttagaaga 1487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Original strand, 2396 - 2737
Alignment:
Q  1 atcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| || ||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2396 atcaatccacaattaagtatacccaaaccatgattcactcacaataacatcagttaacaataacaacatcaatggaatatgaattacatctcatttcaat 2495  T
Q  101 caaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcat 197  Q
     |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  2496 aaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcatgacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataagcat 2595  T
Q  198 caattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaga-tt 296  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  2596 caattcatgcacaagaaaatagcatcacggcaagagcacgaattgagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattt 2695  T
Q  297 gtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaaga 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2696 gtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaaga 2737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 1)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 10591 - 10247
Alignment:
Q  1 atcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || || |||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10591 atcaatccacaattaagtatacccaagtcatgattccctcacaatagcatcagttaacaacaacaacatcaatggaatatgaattacatctcatttcaat 10492  T
Q  101 caaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcat 197  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10491 caaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttagcatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcat 10392  T
Q  198 caattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattg 297  Q
    ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10391 caattcatgcacaagaaaatatcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattattcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattg 10292  T
Q  298 tacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgat 342  Q
     ||||||||||||  |  || |||||||||||||| || ||||||    
T  10291 aacatgattatgaagaagacaaacccccttaccttagatgatgat 10247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1500 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold1500
Description:

Target: scaffold1500; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 77 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 1690 - 1426
Alignment:
Q  77 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaattt 173  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  1690 atatgatttacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 1591  T
Q  174 cacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcata 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1590 cacccataaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcattacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcata 1491  T
Q  274 caacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaaga 338  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1490 caacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaaga 1426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 34410 - 34076
Alignment:
Q  1 atcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaat 100  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||||| | |  ||| |||| ||||||| |||||||| ||||||||||||     
T  34410 atcaatccataatttagtatacccaagtcatgattcactcacaatagcatcagttaatagcaacaacattaatggaacatgaatcatatctcatttcaac 34311  T
Q  101 caaaacatatc-aatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcat 197  Q
     | |||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34310 aacaacatatccaaattcatcaattaagtataacttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcat 34211  T
Q  198 caattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaac-atgagaaaatgcaaagatt 296  Q
    ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  34210 caattcatgcacaagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttagcaacaatttttcatcaaccca-tttcatacaacaatgagaaaatgcaaaaatt 34112  T
Q  297 gtacatgattatgataataactaacccccttacctt 332  Q
    | ||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  34111 gaacatgattatgatgaagactaacccccttacctt 34076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0191 (Bit Score: 170; Significance: 3e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0191
Description:

Target: scaffold0191; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 7708 - 7368
Alignment:
Q  1 atcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaat 100  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| || | | |||||||| | || ||  || | ||||||| |||||||||||||||||| ||     
T  7708 atcaatccataattatgtatacccaagtcataattcactcacaacaacatcagttaataacaataaccttaatggaacatgaatcacatctcattttaac 7609  T
Q  101 caaaacatatcaat-ttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcat 197  Q
     | ||||||||||  ||||  |||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| |    
T  7608 aacaacatatcaagattcactaattgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttgaaacatgtaatttcatccacaaacataccataatctt 7509  T
Q  198 caattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattg 297  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  7508 caattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagtaataattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaatgg 7409  T
Q  298 tacatgattatgataataactaacccccttacctttgaaga 338  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7408 aacatgattatgataataactaacccccttacctttgaaga 7368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1666 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold1666
Description:

Target: scaffold1666; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 248 - 3
Alignment:
Q  1 atcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  248 atcaatccacaattaagtatacccaaatcatgattcactcacaatagcatcagttaacaataactacatcaatgtaatatgaattacatctcatttcaat 149  T
Q  101 caaaacatatc-aatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcat 197  Q
     |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  148 taaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttacacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcat 49  T
Q  198 caattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaattta 243  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  48 caattcatgcacaagaaaatagcctcacagcaagagcacgaattta 3  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 133 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 5329 - 5120
Alignment:
Q  133 tttcataacttaacatttatacatactttgaa-acgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaag 231  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| |||||| | ||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  5329 tttcataacttatcatttttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaag 5231  T
Q  232 agcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacct 331  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5230 agcacgaatttaacaagaattgttcatcaacccattttcatacaacgtgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaactcccttacct 5131  T
Q  332 ttgaagatgat 342  Q
    |||||||||||    
T  5130 ttgaagatgat 5120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Original strand, 54420 - 54755
Alignment:
Q  1 atcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaat 100  Q
    ||||||||| || || |||||||||| |||| ||||||  || | | |||||||| | |  ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  54420 atcaatccataaatatgtatacccaactcatgattcacccacaacaacatcagttaatagcaacaacatcaatggaacatgaatcacatctcatttcaac 54519  T
Q  101 caaaacatatcaat-ttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacgt--aatttcacccataaacataccataatcat 197  Q
     | ||||||||||  |||| ||||| || | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| || |||||    
T  54520 aacaacatatcaaaattcaccaattgagtacaatttcataacttgacatttatacatactttgaaacatgcaatttcacccacaatcatacaattatcat 54619  T
Q  198 caattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaac-atgagaaaatgcaaagatt 296  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||    
T  54620 caattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaaggacacgaatttaacaacaattattcatcaacccattttcatacaacaatgagaaattgcaataatt 54719  T
Q  297 gtacatgattatgataataactaacccccttacctt 332  Q
    | ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||    
T  54720 gaacatgattatgatgaagactaaccaccttacctt 54755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 66 - 332
Target Start/End: Original strand, 45099 - 45369
Alignment:
Q  66 acatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaat-ttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaa 164  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||||||||  |||| ||||| || | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  45099 acatcaatggaacatgaatcacatctcatttcaacaacaacatatcaaaattcaccaattgagtacaatttcaaaacttgacatttatacatactttgaa 45198  T
Q  165 ac--gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaac 262  Q
    ||  ||||||||||||| || ||||| || |||||||||||| |||||  ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45199 acatgtaatttcacccacaatcatacaattatcatcaattcatgcacatcaaaatagcatcacaacaagggcacgaatttaacaacaattattcatcaac 45298  T
Q  263 ccattttcatacaac-atgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 332  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||  |||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  45299 ccattttcatacaacaatgagaaattgcaataattgaacatgattatgatgaagactaacccccttacctt 45369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 167 - 342
Target Start/End: Original strand, 3895 - 4070
Alignment:
Q  167 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 266  Q
    ||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  3895 gtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccat 3994  T
Q  267 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgat 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  3995 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaaaccccttaccttagaagatgat 4070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 129 - 332
Target Start/End: Original strand, 54008 - 54212
Alignment:
Q  129 ataatttcataacttaacatttatacatactttgaa-acgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacag 227  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  54008 ataatttcacaacttaacaattatacatgctttgaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaacagcatcacag 54107  T
Q  228 caagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaaccccctt 327  Q
     ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  |  |||||||||| | ||| |||||||||    
T  54108 taagagcacgaatttagcatcaattgttcatcaacccattttcataaaacatgagaaaatgcaaaaatttgaattgattatgatgaaaacaaaccccctt 54207  T
Q  328 acctt 332  Q
    |||||    
T  54208 acctt 54212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 108; Significance: 3e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 223 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 10775 - 10656
Alignment:
Q  223 cacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacc 322  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10775 cacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacc 10676  T
Q  323 cccttacctttgaagatgat 342  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  10675 cccttacctttgaagatgat 10656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 116 - 338
Target Start/End: Original strand, 6718 - 6941
Alignment:
Q  116 tcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaaga 213  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | | ||||    
T  6718 tcattaattaagcaaaatttcacaacttgacatttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcatgtataaga 6817  T
Q  214 aaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataa 313  Q
    ||  |||| || | ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||| |  ||||||||||||    
T  6818 aac-agcaacataacaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaagatgtaaaatttgaaattgattatgataa 6916  T
Q  314 taactaacccccttacctttgaaga 338  Q
    ||||||||||||||||||| |||||    
T  6917 taactaacccccttaccttagaaga 6941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Original strand, 6602 - 6640
Alignment:
Q  1 atcaatccacaattaagtatacccaattcataattcact 39  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  6602 atcaatccacaattaagtatacccaagttataattcact 6640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 223 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 21139 - 21021
Alignment:
Q  223 cacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacc 322  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21139 cacaacaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attgtacatgattatgataataactaacc 21041  T
Q  323 cccttacctttgaagatgat 342  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  21040 cccttacctttgaagatgat 21021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 134 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 14173 - 13967
Alignment:
Q  134 ttcataacttaacatttatacatactttgaaacgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagag 233  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||  | | ||||||||||  | || ||||  || |||||||||||| ||| |   | ||| || |||||||||||    
T  14173 ttcataacttatcatttttacatatttcaacatgtaatttcactaacaatcatataattatcatcaattcatgcatacagacataacatcacagcaagag 14074  T
Q  234 cacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttt 333  Q
    ||||| |||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14073 cacga-tttagcaagaattgtgcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attgtacatgattatgataataactaacccccttaccttt 13976  T
Q  334 gaagatgat 342  Q
    |||||||||    
T  13975 gaagatgat 13967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 94; Significance: 8e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 133 - 338
Target Start/End: Original strand, 3101 - 3305
Alignment:
Q  133 tttcataacttaacatttatacatactttgaaacgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaaga 232  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||| ||  | | ||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| | | |  || ||| || ||||||||||    
T  3101 tttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatggatacaaacataacatcacagcaaga 3200  T
Q  233 gcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 332  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3201 gcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attgtacataattatgataataattaacccccttacctt 3299  T
Q  333 tgaaga 338  Q
     |||||    
T  3300 agaaga 3305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0892 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0892
Description:

Target: scaffold0892; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 129 - 292
Target Start/End: Original strand, 3547 - 3711
Alignment:
Q  129 ataatttcataacttaacatttatacatactttgaa-acgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacag 227  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||| | || |||||    
T  3547 ataatttcacaacttaacaattatacatgctttgaacatgtaatttcacccacaatcataccataatcatcaattcatggacaagaaaacaacatcacag 3646  T
Q  228 caagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa 292  Q
     |||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3647 taagagcactaatttagcatcaattgttcatcaacccattttcataaaacatgagaaaatgcaaa 3711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 116 - 332
Target Start/End: Original strand, 7330 - 7547
Alignment:
Q  116 tcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaaga 213  Q
    |||| ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | | |||     
T  7330 tcattaattaggcaaaatttcacaacttgacatttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcatgtataagc 7429  T
Q  214 aaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataa 313  Q
    ||  |||| || | ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||| |  |||||||||| |    
T  7430 aac-agcaacataacaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaagatgtaaaatttgaaattgattatgatga 7528  T
Q  314 taactaacccccttacctt 332  Q
     ||| ||||||||||||||    
T  7529 aaacaaacccccttacctt 7547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 133 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 9462 - 9266
Alignment:
Q  133 tttcataacttaacatttatacatactttgaa-acgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaag 231  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||| |||||| | ||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| ||| |  || ||| || ||||||||     
T  9462 tttcacaacttatcatttttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaaa 9364  T
Q  232 agcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacct 331  Q
    ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9363 agcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacct 9267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 133 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 16360 - 16164
Alignment:
Q  133 tttcataacttaacatttatacatactttgaa-acgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaag 231  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||| |||||| | ||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| ||| |  || ||| || ||||||||     
T  16360 tttcacaacttatcatttttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaaa 16262  T
Q  232 agcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacct 331  Q
    ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16261 agcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacct 16165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 231 - 332
Target Start/End: Original strand, 107983 - 108084
Alignment:
Q  231 gagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacc 330  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  107983 gagcacgaatttagtaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattataatgataactaacccccttacc 108082  T
Q  331 tt 332  Q
    ||    
T  108083 tt 108084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 223 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 64546 - 64433
Alignment:
Q  223 cacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacc 322  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  64546 cacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaaat--tacatgattgtgataataactaacc 64449  T
Q  323 cccttacctttgaaga 338  Q
    |||||||||| |||||    
T  64448 cccttaccttagaaga 64433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1711 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold1711
Description:

Target: scaffold1711; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 167 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 1383 - 1214
Alignment:
Q  167 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 266  Q
    ||||||||||| | || ||||| |  | |||||||||| ||| |  || ||| || ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  1383 gtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccat 1284  T
Q  267 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaaga 338  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1283 tttcatacaacatgagtaaatgcaaaaat--tacatgattgtgataataactaacccccctacctttgaaga 1214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 133 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 13438 - 13232
Alignment:
Q  133 tttcataacttaacatttatacatactttgaa-acgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaag 231  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||| |||||| | ||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| ||| |  || ||| || ||||  |||    
T  13438 tttcacaacttatcatttttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacactaag 13340  T
Q  232 agcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacct 331  Q
    ||||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13339 agcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatg-aaaaat--tacatgattatgataatcactaacccccttacct 13243  T
Q  332 ttgaagatgat 342  Q
    |||||| ||||    
T  13242 ttgaagttgat 13232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 74; Significance: 7e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 116 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 23884 - 23661
Alignment:
Q  116 tcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaaga 213  Q
    |||| ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || | | ||||    
T  23884 tcattaattaggcaaaatttcacaacttgacatttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaatccatgtataaga 23785  T
Q  214 aaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataa 313  Q
    ||  | || || | | ||||||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||| |  ||| ||||||||    
T  23784 aacaa-caacataaccagagcacgaatttgacatgagttgttcatcaacccattttcatacaacatgagaagatgtaaaatttgaaattgaatatgataa 23686  T
Q  314 taactaacccccttacctttgaaga 338  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||    
T  23685 taactaacccccttaacttagaaga 23661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 136 - 338
Target Start/End: Original strand, 177 - 375
Alignment:
Q  136 cataacttaacatttatacatactttgaaacgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagca 235  Q
    ||||||||| ||||| |||||| ||  | | ||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| ||| |  || ||| || |||||||||||||    
T  177 cataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagca 276  T
Q  236 cgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttga 335  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  277 cgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatataacatgag-caatgcaaa-at--tacatgattttgataataactaacccccttaccttaga 372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 228 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 31693 - 31580
Alignment:
Q  228 caagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaaccccctt 327  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31693 caagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaactcattttcatacaacatgagaatatgcaaa-attacacatgattatgataatcactaaccccctt 31595  T
Q  328 acctttgaagatgat 342  Q
    || ||||||| ||||    
T  31594 acatttgaagttgat 31580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 66 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 56294 - 56105
Alignment:
Q  66 acatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaat-ttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaa 164  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || ||||||  | ||| || |||  |||| || || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  56294 acatcaatggaacatgaatcacatatcttttcaacaacaacttagcaaaattcaccatttgagcacaatttcataacttgacatttatacatactttaaa 56195  T
Q  165 ac--gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaatt 252  Q
    ||  ||||||||| ||| || ||||| || |||||||| ||| ||||| ||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  56194 acatgtaatttcagccacaatcatacaattatcatcaaatcatgcacacgaaaataacatcacagttagagcacgaatttaacaacaatt 56105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0516 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0516
Description:

Target: scaffold0516; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 228 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 12149 - 12045
Alignment:
Q  228 caagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaac-atgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaaccccct 326  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||  ||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  12149 caagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaa-tgaaaaatttgaaattgattatgataataactaaccccct 12051  T
Q  327 tacctt 332  Q
    ||||||    
T  12050 tacctt 12045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 257 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 13342 - 13268
Alignment:
Q  257 atcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 332  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13342 atcaacccattt-catacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgatgataactaacccccttacctt 13268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 258 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 34450 - 34374
Alignment:
Q  258 tcaacccattttcatacaaca--tgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 332  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||  | || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34450 tcaacccatattcatacaacaaatgagaaattgcaataaatgaacatgattatgataataactaaccctcttacctt 34374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 301 - 342
Target Start/End: Original strand, 130880 - 130921
Alignment:
Q  301 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgat 342  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  130880 atgattatgataaagactaacccccttacctttgaagatgat 130921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 277 - 332
Target Start/End: Original strand, 22833 - 22888
Alignment:
Q  277 catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 332  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  22833 catgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttacctt 22888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 133 - 252
Target Start/End: Original strand, 41786 - 41905
Alignment:
Q  133 tttcataacttaacatttatacatactttgaaacgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaaga 232  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||| ||  | | ||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| ||| |  || ||| || |||||  |||    
T  41786 tttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttaga 41885  T
Q  233 gcacgaatttaacaacaatt 252  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  41886 gcacgaatttaacaacaatt 41905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 277 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 1552 - 1497
Alignment:
Q  277 catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 332  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  1552 catgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttacctt 1497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0361
Description:

Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 131 - 252
Target Start/End: Original strand, 3324 - 3447
Alignment:
Q  131 aatttcataacttaacatttatacatactttgaaac--gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagc 228  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||   ||||||||||| | || ||||| |  ||||| |||||| ||| |  ||  || || ||||||    
T  3324 aatttcataacttgatatttatacatactttgaaatatgtaatttcaccaacaatcatacaaatatcattaattcatgcatacaaacttaacatcacagc 3423  T
Q  229 aagagcacgaatttaacaacaatt 252  Q
     |||||||||||||| || |||||    
T  3424 tagagcacgaatttagcatcaatt 3447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 301 - 333
Target Start/End: Original strand, 42677 - 42709
Alignment:
Q  301 atgattatgataataactaacccccttaccttt 333  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42677 atgattatgataaaaactaacccccttaccttt 42709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University