View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF21669_high_1 (Length: 753)

Name: NF21669_high_1
Description: NF21669
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF21669_high_1
NF21669_high_1
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (30-520)||(11299-11789)
[»] chr8 (150 HSPs)
chr8 (30-512)||(16412986-16413467)
chr8 (30-512)||(14409115-14409595)
chr8 (30-512)||(1484413-1484893)
chr8 (30-512)||(5852963-5853443)
chr8 (30-512)||(4483292-4483771)
chr8 (30-520)||(22001764-22002252)
chr8 (30-520)||(4542036-4542524)
chr8 (30-512)||(14823785-14824266)
chr8 (32-512)||(15070571-15071052)
chr8 (30-512)||(20045866-20046346)
chr8 (132-520)||(24485706-24486093)
chr8 (202-512)||(27472087-27472395)
chr8 (203-520)||(18677727-18678043)
chr8 (203-512)||(32121912-32122220)
chr8 (241-520)||(16198115-16198394)
chr8 (230-512)||(38549675-38549957)
chr8 (30-304)||(20403238-20403510)
chr8 (250-508)||(24048841-24049098)
chr8 (232-510)||(16401597-16401875)
chr8 (30-304)||(15203110-15203382)
chr8 (227-512)||(15202849-15203134)
chr8 (223-512)||(19896524-19896813)
chr8 (227-512)||(20403486-20403771)
chr8 (30-304)||(19896276-19896552)
chr8 (30-304)||(45290573-45290846)
chr8 (230-510)||(19936580-19936850)
chr8 (230-477)||(1326637-1326884)
chr8 (313-510)||(19896807-19897004)
chr8 (314-520)||(14397403-14397609)
chr8 (525-719)||(36900324-36900518)
chr8 (241-442)||(25657893-25658094)
chr8 (313-512)||(38549482-38549681)
chr8 (312-510)||(15202658-15202856)
chr8 (30-305)||(19936881-19937157)
chr8 (313-512)||(16401210-16401408)
chr8 (313-512)||(16401402-16401601)
chr8 (341-508)||(45290222-45290389)
chr8 (227-439)||(45290385-45290597)
chr8 (30-198)||(41598199-41598367)
chr8 (313-477)||(20403765-20403929)
chr8 (313-477)||(27471929-27472093)
chr8 (313-477)||(32122214-32122378)
chr8 (313-477)||(15202498-15202662)
chr8 (142-304)||(32810054-32810214)
chr8 (324-477)||(38549325-38549478)
chr8 (313-477)||(15071046-15071210)
chr8 (313-477)||(16412828-16412992)
chr8 (525-753)||(17706883-17707091)
chr8 (313-477)||(19897000-19897164)
chr8 (30-198)||(26223930-26224098)
chr8 (35-196)||(19801367-19801527)
chr8 (321-477)||(24049104-24049260)
chr8 (313-477)||(19936420-19936584)
chr8 (30-211)||(25484245-25484419)
chr8 (23-181)||(16092297-16092456)
chr8 (23-196)||(18818348-18818523)
chr8 (23-181)||(6759265-6759421)
chr8 (23-169)||(7372785-7372932)
chr8 (23-181)||(20536215-20536374)
chr8 (23-181)||(28648999-28649158)
chr8 (335-477)||(11361024-11361166)
chr8 (23-161)||(26219721-26219858)
chr8 (202-304)||(38549989-38550090)
chr8 (202-304)||(20982605-20982710)
chr8 (23-166)||(21918969-21919114)
chr8 (23-181)||(22875072-22875230)
chr8 (23-182)||(23406386-23406548)
chr8 (23-164)||(21923900-21924042)
chr8 (23-181)||(22626743-22626901)
chr8 (30-137)||(26225292-26225398)
chr8 (230-304)||(13425337-13425411)
chr8 (230-304)||(20982499-20982573)
chr8 (23-181)||(18879191-18879345)
chr8 (182-304)||(1326916-1327042)
chr8 (34-198)||(13508022-13508188)
chr8 (34-198)||(13597554-13597720)
chr8 (35-198)||(20498581-20498746)
chr8 (230-294)||(13425241-13425305)
chr8 (393-477)||(32810269-32810353)
chr8 (34-187)||(17612059-17612213)
chr8 (193-304)||(16401909-16402020)
chr8 (23-166)||(31971264-31971407)
chr8 (333-431)||(24717722-24717820)
chr8 (333-442)||(15319989-15320098)
chr8 (333-442)||(15500358-15500467)
chr8 (30-137)||(21285611-21285719)
chr8 (313-431)||(1484887-1485005)
chr8 (333-402)||(29759429-29759498)
chr8 (30-144)||(18678094-18678209)
chr8 (230-305)||(18815608-18815683)
chr8 (230-301)||(21513636-21513707)
chr8 (24-137)||(21673712-21673826)
chr8 (30-144)||(23648567-23648682)
chr8 (313-431)||(5852851-5852969)
chr8 (313-431)||(14409003-14409121)
chr8 (313-427)||(20045758-20045872)
chr8 (333-431)||(22007097-22007195)
chr8 (30-177)||(38855212-38855358)
chr8 (35-115)||(45131019-45131098)
chr8 (333-402)||(13663129-13663198)
chr8 (333-430)||(17150628-17150725)
chr8 (98-198)||(37116432-37116532)
chr8 (35-134)||(21389454-21389552)
chr8 (35-134)||(21395984-21396082)
chr8 (333-420)||(21493050-21493137)
chr8 (35-134)||(21778780-21778878)
chr8 (35-134)||(21790477-21790575)
chr8 (23-77)||(26355757-26355812)
chr8 (30-144)||(32121746-32121861)
chr8 (230-305)||(36733301-36733376)
chr8 (230-305)||(38988730-38988805)
chr8 (230-305)||(39019827-39019902)
chr8 (23-69)||(23760912-23760958)
chr8 (333-442)||(223305-223414)
chr8 (333-442)||(272164-272273)
chr8 (333-442)||(643576-643685)
chr8 (333-442)||(688076-688185)
chr8 (333-442)||(736928-737037)
chr8 (333-442)||(829382-829491)
chr8 (333-442)||(860823-860932)
chr8 (30-133)||(6520382-6520486)
chr8 (98-198)||(17266930-17267030)
chr8 (333-402)||(18611952-18612021)
chr8 (333-442)||(22089373-22089482)
chr8 (333-402)||(22146977-22147046)
chr8 (333-429)||(39114415-39114511)
chr8 (230-297)||(5083001-5083068)
chr8 (98-181)||(17439461-17439543)
chr8 (31-69)||(983474-983512)
chr8 (313-431)||(14824260-14824378)
chr8 (35-166)||(16199615-16199746)
chr8 (23-69)||(17140923-17140969)
chr8 (227-305)||(19936828-19936906)
chr8 (23-69)||(21491002-21491048)
chr8 (240-305)||(38549935-38550000)
chr8 (313-352)||(4483765-4483804)
chr8 (23-66)||(21249391-21249434)
chr8 (23-66)||(21255229-21255272)
chr8 (35-69)||(5866342-5866376)
chr8 (227-305)||(13425283-13425361)
chr8 (227-305)||(20982551-20982629)
chr8 (361-431)||(39364118-39364188)
chr8 (361-431)||(44522814-44522884)
chr8 (361-442)||(4381170-4381251)
chr8 (240-305)||(13425389-13425454)
chr8 (333-402)||(18618830-18618899)
chr8 (361-442)||(22258681-22258762)
chr8 (227-292)||(32810190-32810255)
chr8 (361-442)||(44477018-44477099)
chr8 (361-442)||(44480280-44480361)
[»] chr6 (133 HSPs)
chr6 (30-512)||(30676380-30676861)
chr6 (30-520)||(33861805-33862293)
chr6 (30-520)||(12742328-12742817)
chr6 (30-477)||(34963384-34963830)
chr6 (30-512)||(8055040-8055521)
chr6 (30-512)||(24422558-24423038)
chr6 (30-512)||(33864289-33864769)
chr6 (30-512)||(18334263-18334743)
chr6 (30-520)||(1540574-1541062)
chr6 (30-508)||(26924315-26924791)
chr6 (30-512)||(2290851-2291331)
chr6 (30-516)||(19858589-19859070)
chr6 (30-512)||(22782238-22782718)
chr6 (30-519)||(25688513-25689001)
chr6 (30-512)||(19847642-19848102)
chr6 (182-520)||(28288999-28289334)
chr6 (229-512)||(1598266-1598548)
chr6 (181-520)||(12942363-12942689)
chr6 (230-508)||(18914142-18914420)
chr6 (230-509)||(31630214-31630493)
chr6 (30-304)||(19005057-19005329)
chr6 (230-512)||(19005361-19005643)
chr6 (203-477)||(23992604-23992879)
chr6 (223-454)||(17377576-17377807)
chr6 (254-477)||(25535641-25535864)
chr6 (30-288)||(25656640-25656897)
chr6 (313-512)||(1598542-1598741)
chr6 (320-520)||(23415264-23415464)
chr6 (321-517)||(27557023-27557219)
chr6 (321-519)||(25688996-25689194)
chr6 (30-211)||(25754820-25755001)
chr6 (319-512)||(26924118-26924311)
chr6 (30-234)||(1595560-1595763)
chr6 (360-520)||(15892071-15892231)
chr6 (313-476)||(1871-2034)
chr6 (313-476)||(8830-8993)
chr6 (35-198)||(18456735-18456898)
chr6 (30-211)||(20556864-20557043)
chr6 (375-520)||(17883160-17883305)
chr6 (313-476)||(19847485-19847648)
chr6 (319-505)||(18914424-18914610)
chr6 (30-193)||(16448514-16448678)
chr6 (313-477)||(19005637-19005801)
chr6 (30-197)||(3852001-3852168)
chr6 (313-477)||(30676222-30676386)
chr6 (313-477)||(1598735-1598899)
chr6 (35-168)||(18461895-18462028)
chr6 (319-477)||(18914617-18914775)
chr6 (319-477)||(31630053-31630211)
chr6 (321-476)||(79-234)
chr6 (406-512)||(25737028-25737134)
chr6 (23-181)||(25629310-25629469)
chr6 (202-304)||(31630525-31630626)
chr6 (321-442)||(25689189-25689310)
chr6 (23-178)||(29060547-29060703)
chr6 (23-181)||(18409782-18409941)
chr6 (414-512)||(8987-9085)
chr6 (186-304)||(18913994-18914110)
chr6 (28-181)||(20360915-20361069)
chr6 (23-141)||(19303536-19303654)
chr6 (23-141)||(20593780-20593899)
chr6 (230-356)||(15875621-15875737)
chr6 (23-181)||(16496251-16496410)
chr6 (313-432)||(25737128-25737247)
chr6 (182-304)||(15875469-15875589)
chr6 (31-181)||(25644335-25644487)
chr6 (30-164)||(17287768-17287903)
chr6 (23-196)||(22780166-22780341)
chr6 (23-166)||(20638253-20638397)
chr6 (436-512)||(22981410-22981486)
chr6 (436-512)||(23806922-23806998)
chr6 (35-181)||(18821801-18821946)
chr6 (313-408)||(22981321-22981416)
chr6 (313-408)||(23806992-23807087)
chr6 (23-128)||(20076707-20076812)
chr6 (31-196)||(20109153-20109322)
chr6 (604-753)||(1134507-1134655)
chr6 (98-198)||(8227448-8227549)
chr6 (313-431)||(18334151-18334269)
chr6 (186-252)||(18937252-18937317)
chr6 (333-431)||(19984130-19984228)
chr6 (313-431)||(24423032-24423150)
chr6 (333-442)||(16240296-16240405)
chr6 (333-442)||(16556945-16557054)
chr6 (333-442)||(16633501-16633610)
chr6 (333-442)||(16650175-16650284)
chr6 (23-137)||(19652202-19652316)
chr6 (333-442)||(25904474-25904584)
chr6 (313-431)||(33864763-33864881)
chr6 (333-431)||(35016015-35016113)
chr6 (35-181)||(35245605-35245749)
chr6 (617-730)||(7799704-7799817)
chr6 (333-442)||(27654597-27654706)
chr6 (333-431)||(22226580-22226679)
chr6 (30-77)||(25714431-25714478)
chr6 (230-305)||(35056707-35056782)
chr6 (333-431)||(21776107-21776205)
chr6 (333-442)||(10487971-10488080)
chr6 (333-442)||(16377248-16377357)
chr6 (333-442)||(16384572-16384681)
chr6 (333-442)||(16826368-16826477)
chr6 (333-434)||(22593590-22593691)
chr6 (472-512)||(2028-2068)
chr6 (35-137)||(23019425-23019528)
chr6 (392-431)||(10905416-10905455)
chr6 (335-442)||(19609582-19609689)
chr6 (30-69)||(27333286-27333325)
chr6 (30-69)||(27394026-27394065)
chr6 (246-305)||(32259078-32259137)
chr6 (31-69)||(9098582-9098620)
chr6 (43-144)||(15041542-15041644)
chr6 (227-305)||(15875565-15875643)
chr6 (313-431)||(22782712-22782830)
chr6 (313-431)||(26924006-26924124)
chr6 (23-69)||(31155465-31155511)
chr6 (470-519)||(229-278)
chr6 (333-402)||(1555527-1555596)
chr6 (361-442)||(18455449-18455530)
chr6 (657-730)||(19401655-19401728)
chr6 (617-730)||(19597457-19597570)
chr6 (333-402)||(33315116-33315185)
chr6 (26-77)||(11185515-11185567)
chr6 (33-69)||(28496539-28496575)
chr6 (33-69)||(29808950-29808986)
chr6 (313-352)||(2290818-2290857)
chr6 (31-133)||(19668386-19668491)
chr6 (30-69)||(23992441-23992480)
chr6 (333-428)||(29665374-29665469)
chr6 (23-69)||(1561310-1561356)
chr6 (238-268)||(17883303-17883333)
chr6 (227-305)||(18914086-18914164)
chr6 (333-383)||(23153035-23153085)
chr6 (333-442)||(25175112-25175221)
[»] scaffold0716 (2 HSPs)
scaffold0716 (30-512)||(4705-5186)
scaffold0716 (313-477)||(5180-5344)
[»] chr4 (142 HSPs)
chr4 (30-512)||(3515018-3515499)
chr4 (30-512)||(14970377-14970858)
chr4 (30-512)||(15118023-15118503)
chr4 (30-520)||(44615299-44615788)
chr4 (30-520)||(50222002-50222490)
chr4 (30-520)||(19242710-19243200)
chr4 (30-512)||(44772754-44773238)
chr4 (30-511)||(1837191-1837660)
chr4 (30-512)||(7640857-7641333)
chr4 (181-520)||(15534343-15534681)
chr4 (182-520)||(36038033-36038370)
chr4 (182-520)||(49547436-49547773)
chr4 (230-512)||(52872743-52873025)
chr4 (182-520)||(14048740-14049077)
chr4 (230-519)||(362390-362679)
chr4 (238-520)||(29267571-29267853)
chr4 (230-512)||(19617737-19618019)
chr4 (30-304)||(18215153-18215425)
chr4 (30-352)||(18239250-18239570)
chr4 (230-512)||(15495844-15496126)
chr4 (30-304)||(19618051-19618323)
chr4 (230-513)||(14746181-14746464)
chr4 (30-304)||(12186-12458)
chr4 (30-304)||(52312521-52312793)
chr4 (230-512)||(19857798-19858070)
chr4 (30-304)||(15355203-15355476)
chr4 (227-512)||(52312769-52313053)
chr4 (227-477)||(11960-12210)
chr4 (321-512)||(362674-362865)
chr4 (325-508)||(14745993-14746176)
chr4 (30-211)||(51463838-51464019)
chr4 (313-512)||(52313047-52313246)
chr4 (30-211)||(23803235-23803416)
chr4 (30-198)||(44102225-44102393)
chr4 (313-477)||(52872585-52872749)
chr4 (294-519)||(30147189-30147414)
chr4 (313-477)||(19617579-19617743)
chr4 (313-477)||(14970219-14970383)
chr4 (30-211)||(12610961-12611135)
chr4 (313-476)||(18214717-18214880)
chr4 (313-479)||(3515493-3515659)
chr4 (30-187)||(44928873-44929031)
chr4 (313-477)||(19858064-19858228)
chr4 (313-477)||(52313240-52313404)
chr4 (35-198)||(21815568-21815731)
chr4 (34-198)||(15367708-15367873)
chr4 (34-198)||(15402721-15402886)
chr4 (313-477)||(362859-363023)
chr4 (34-198)||(15371220-15371385)
chr4 (34-198)||(15373501-15373666)
chr4 (230-359)||(18214992-18215121)
chr4 (34-198)||(15370036-15370200)
chr4 (30-193)||(20149840-20150004)
chr4 (34-195)||(16223550-16223712)
chr4 (313-447)||(15495716-15495850)
chr4 (23-181)||(22636442-22636601)
chr4 (23-181)||(7088884-7089043)
chr4 (23-196)||(7798781-7798956)
chr4 (23-181)||(14038655-14038814)
chr4 (30-137)||(14280327-14280434)
chr4 (28-181)||(16377478-16377630)
chr4 (313-423)||(14185621-14185731)
chr4 (30-161)||(54798729-54798861)
chr4 (23-181)||(12902764-12902923)
chr4 (230-333)||(15355068-15355171)
chr4 (421-512)||(18214874-18214965)
chr4 (182-304)||(15496950-15497070)
chr4 (183-304)||(52873057-52873176)
chr4 (23-134)||(52873369-52873481)
chr4 (23-181)||(7893710-7893869)
chr4 (23-181)||(44052836-44052995)
chr4 (362-512)||(14185477-14185627)
chr4 (23-181)||(16270191-16270349)
chr4 (35-192)||(22353852-22354010)
chr4 (313-431)||(22725284-22725401)
chr4 (182-304)||(14746496-14746618)
chr4 (23-179)||(16239927-16240083)
chr4 (23-181)||(6899898-6900056)
chr4 (35-198)||(13788-13953)
chr4 (223-304)||(19857685-19857766)
chr4 (33-137)||(8574868-8574971)
chr4 (405-477)||(12778388-12778460)
chr4 (22-181)||(23374314-23374474)
chr4 (445-520)||(12033436-12033511)
chr4 (31-198)||(52243131-52243302)
chr4 (413-510)||(22725397-22725494)
chr4 (31-196)||(43198492-43198661)
chr4 (333-430)||(14951270-14951367)
chr4 (202-271)||(362268-362336)
chr4 (319-383)||(14745925-14745989)
chr4 (676-748)||(42225765-42225837)
chr4 (335-431)||(55377197-55377293)
chr4 (23-101)||(3096300-3096379)
chr4 (313-431)||(15117911-15118029)
chr4 (333-431)||(25120046-25120144)
chr4 (333-442)||(14995644-14995753)
chr4 (98-179)||(15464888-15464969)
chr4 (333-434)||(43281694-43281795)
chr4 (23-141)||(12774014-12774132)
chr4 (333-431)||(18293667-18293765)
chr4 (333-442)||(18247739-18247848)
chr4 (333-442)||(47357183-47357292)
chr4 (35-132)||(14053306-14053403)
chr4 (421-477)||(15489661-15489717)
chr4 (335-442)||(15287859-15287966)
chr4 (335-442)||(15294969-15295076)
chr4 (333-431)||(5683367-5683465)
chr4 (313-431)||(7640745-7640863)
chr4 (321-435)||(9198544-9198658)
chr4 (333-431)||(22355071-22355169)
chr4 (333-442)||(10643746-10643855)
chr4 (345-442)||(16731688-16731785)
chr4 (333-402)||(19698013-19698082)
chr4 (333-402)||(19708598-19708667)
chr4 (30-125)||(39706299-39706395)
chr4 (31-133)||(12288211-12288316)
chr4 (23-69)||(8846363-8846409)
chr4 (23-69)||(15551824-15551870)
chr4 (182-235)||(19857607-19857661)
chr4 (333-402)||(17146320-17146389)
chr4 (333-402)||(18168293-18168362)
chr4 (333-442)||(19020009-19020118)
chr4 (313-350)||(44772723-44772760)
chr4 (218-282)||(26922388-26922452)
chr4 (438-477)||(15355030-15355069)
chr4 (361-431)||(15447804-15447874)
chr4 (35-134)||(17046506-17046604)
chr4 (651-730)||(28427325-28427404)
chr4 (227-305)||(14746442-14746520)
chr4 (227-305)||(15355149-15355227)
chr4 (227-305)||(19617997-19618075)
chr4 (227-305)||(19857742-19857820)
chr4 (240-305)||(362347-362412)
chr4 (361-442)||(630280-630361)
chr4 (333-442)||(8374040-8374149)
chr4 (108-196)||(8846465-8846553)
chr4 (321-374)||(9221267-9221320)
chr4 (361-442)||(15008560-15008641)
chr4 (361-442)||(16998119-16998200)
chr4 (393-430)||(18218875-18218912)
chr4 (361-442)||(40229897-40229978)
chr4 (98-198)||(53082089-53082188)
[»] scaffold0230 (6 HSPs)
scaffold0230 (30-520)||(13958-14447)
scaffold0230 (229-512)||(23201-23484)
scaffold0230 (313-477)||(22883-23047)
scaffold0230 (435-512)||(23041-23118)
scaffold0230 (313-399)||(23121-23207)
scaffold0230 (429-477)||(20716-20764)
[»] chr1 (91 HSPs)
chr1 (30-520)||(21840778-21841266)
chr1 (30-520)||(21922954-21923442)
chr1 (30-512)||(13988877-13989357)
chr1 (30-512)||(21474757-21475238)
chr1 (30-520)||(16361928-16362418)
chr1 (30-520)||(23593396-23593886)
chr1 (30-512)||(15859679-15860160)
chr1 (240-512)||(27161257-27161529)
chr1 (227-510)||(29776947-29777230)
chr1 (230-519)||(16274919-16275209)
chr1 (30-304)||(29776699-29776971)
chr1 (240-512)||(29298461-29298733)
chr1 (30-304)||(31612324-31612596)
chr1 (227-512)||(22122685-22122970)
chr1 (227-512)||(31612572-31612857)
chr1 (30-304)||(29298148-29298419)
chr1 (286-519)||(13227129-13227362)
chr1 (286-519)||(29535317-29535550)
chr1 (30-304)||(16275241-16275515)
chr1 (34-304)||(22122946-22123215)
chr1 (313-510)||(31612851-31613048)
chr1 (227-476)||(22050543-22050792)
chr1 (313-477)||(31613044-31613208)
chr1 (30-198)||(21346972-21347141)
chr1 (313-477)||(29298727-29298891)
chr1 (313-479)||(29777226-29777392)
chr1 (30-198)||(21342107-21342276)
chr1 (35-211)||(45574812-45574989)
chr1 (313-477)||(15859508-15859672)
chr1 (30-198)||(21707178-21707346)
chr1 (30-198)||(21711720-21711888)
chr1 (30-198)||(13212844-13213013)
chr1 (320-476)||(9044711-9044867)
chr1 (30-198)||(433023-433190)
chr1 (313-477)||(22122526-22122691)
chr1 (30-193)||(40389165-40389329)
chr1 (313-477)||(16401407-16401571)
chr1 (321-477)||(16274768-16274924)
chr1 (313-478)||(27161098-27161263)
chr1 (323-477)||(40129387-40129541)
chr1 (23-181)||(50210168-50210327)
chr1 (23-181)||(27250684-27250843)
chr1 (23-141)||(34509787-34509906)
chr1 (390-477)||(43543271-43543358)
chr1 (23-181)||(22532276-22532435)
chr1 (204-304)||(22050768-22050866)
chr1 (361-512)||(10812676-10812827)
chr1 (35-198)||(21896193-21896358)
chr1 (445-520)||(41372896-41372971)
chr1 (30-181)||(22468651-22468803)
chr1 (23-181)||(21026687-21026846)
chr1 (35-195)||(21861510-21861672)
chr1 (313-383)||(10812612-10812682)
chr1 (22-141)||(21754051-21754170)
chr1 (223-304)||(27161518-27161598)
chr1 (364-512)||(16401265-16401413)
chr1 (31-187)||(16758664-16758822)
chr1 (23-196)||(33681014-33681188)
chr1 (23-137)||(22921868-22921983)
chr1 (35-198)||(35261018-35261180)
chr1 (23-117)||(20847173-20847268)
chr1 (313-431)||(13989351-13989469)
chr1 (23-130)||(20248286-20248394)
chr1 (617-730)||(31815261-31815374)
chr1 (30-144)||(20135201-20135316)
chr1 (333-431)||(21858592-21858690)
chr1 (612-753)||(23573220-23573361)
chr1 (240-304)||(29298408-29298472)
chr1 (30-77)||(20454613-20454660)
chr1 (675-753)||(7384449-7384527)
chr1 (98-198)||(41049973-41050072)
chr1 (182-236)||(43543214-43543267)
chr1 (333-431)||(44035830-44035928)
chr1 (333-442)||(17003909-17004018)
chr1 (92-181)||(22354527-22354616)
chr1 (333-429)||(21650883-21650979)
chr1 (23-177)||(22237634-22237788)
chr1 (26-77)||(52928029-52928081)
chr1 (222-305)||(12710129-12710212)
chr1 (333-440)||(18060577-18060684)
chr1 (23-69)||(21161723-21161769)
chr1 (313-431)||(21474645-21474763)
chr1 (427-477)||(43630294-43630344)
chr1 (32-69)||(20918620-20918657)
chr1 (333-402)||(22366527-22366596)
chr1 (98-194)||(50686696-50686792)
chr1 (103-187)||(12271642-12271725)
chr1 (30-69)||(21714556-21714595)
chr1 (36-198)||(14295493-14295652)
chr1 (227-305)||(16275187-16275265)
chr1 (256-305)||(22824135-22824184)
[»] chr2 (143 HSPs)
chr2 (30-512)||(39682324-39682805)
chr2 (30-512)||(18808954-18809434)
chr2 (30-512)||(23711684-23712164)
chr2 (30-512)||(23130873-23131353)
chr2 (30-512)||(23133340-23133820)
chr2 (30-512)||(34402193-34402673)
chr2 (30-506)||(32214607-32215072)
chr2 (30-512)||(23709203-23709683)
chr2 (30-512)||(571408-571889)
chr2 (30-520)||(24897858-24898347)
chr2 (30-520)||(24905295-24905784)
chr2 (30-510)||(28577110-28577588)
chr2 (30-520)||(24900341-24900830)
chr2 (30-520)||(24902818-24903307)
chr2 (30-520)||(24907770-24908259)
chr2 (30-512)||(26505390-26505870)
chr2 (30-512)||(26507868-26508348)
chr2 (30-520)||(23135601-23136079)
chr2 (30-512)||(32039169-32039649)
chr2 (30-512)||(24529217-24529680)
chr2 (181-520)||(20261381-20261719)
chr2 (182-520)||(10684425-10684764)
chr2 (230-512)||(24681654-24681936)
chr2 (230-512)||(24918350-24918632)
chr2 (230-510)||(24671235-24671515)
chr2 (230-504)||(23706896-23707169)
chr2 (230-512)||(24642419-24642701)
chr2 (227-512)||(22105672-22105957)
chr2 (230-520)||(38967689-38967979)
chr2 (30-304)||(6726006-6726278)
chr2 (227-512)||(24368033-24368318)
chr2 (30-301)||(21154942-21155211)
chr2 (30-304)||(24367785-24368057)
chr2 (227-512)||(21154678-21154963)
chr2 (246-512)||(45027575-45027840)
chr2 (227-519)||(6726254-6726546)
chr2 (30-304)||(22105423-22105696)
chr2 (227-512)||(41523743-41524028)
chr2 (30-304)||(38967385-38967657)
chr2 (203-420)||(25616365-25616581)
chr2 (30-252)||(45029784-45030005)
chr2 (313-508)||(41523554-41523749)
chr2 (335-512)||(23931775-23931952)
chr2 (313-510)||(21154487-21154684)
chr2 (313-512)||(23709010-23709209)
chr2 (104-304)||(24642733-24642933)
chr2 (313-477)||(22105951-22106115)
chr2 (319-512)||(23706696-23706888)
chr2 (313-477)||(24529059-24529223)
chr2 (30-197)||(43137310-43137477)
chr2 (313-479)||(24918626-24918792)
chr2 (319-477)||(41523392-41523550)
chr2 (313-477)||(24368312-24368476)
chr2 (321-477)||(6726541-6726697)
chr2 (313-477)||(21154327-21154491)
chr2 (319-477)||(32214442-32214600)
chr2 (319-479)||(23931952-23932112)
chr2 (313-477)||(24681930-24682094)
chr2 (313-477)||(23706538-23706702)
chr2 (313-477)||(24671511-24671675)
chr2 (411-520)||(31345570-31345679)
chr2 (319-476)||(45027418-45027575)
chr2 (23-181)||(22337122-22337281)
chr2 (23-181)||(23060520-23060679)
chr2 (23-181)||(23076449-23076608)
chr2 (23-181)||(22731189-22731348)
chr2 (182-304)||(23707201-23707323)
chr2 (34-196)||(19671848-19672010)
chr2 (30-181)||(22738135-22738286)
chr2 (23-181)||(23285872-23286027)
chr2 (182-304)||(24918196-24918318)
chr2 (23-181)||(23654341-23654500)
chr2 (23-181)||(23660030-23660188)
chr2 (182-302)||(24671081-24671201)
chr2 (182-304)||(24681500-24681622)
chr2 (30-181)||(298769-298922)
chr2 (23-137)||(28405983-28406099)
chr2 (647-753)||(31559068-31559174)
chr2 (31-196)||(23708558-23708725)
chr2 (30-96)||(24643035-24643101)
chr2 (23-115)||(38136-38228)
chr2 (142-211)||(22173799-22173868)
chr2 (314-378)||(31345490-31345554)
chr2 (313-431)||(28577584-28577702)
chr2 (617-730)||(22059654-22059767)
chr2 (35-181)||(7688-7835)
chr2 (35-144)||(23103389-23103497)
chr2 (313-431)||(18809428-18809546)
chr2 (333-434)||(67339-67440)
chr2 (321-402)||(16900803-16900884)
chr2 (321-402)||(16994194-16994275)
chr2 (333-442)||(24686598-24686707)
chr2 (111-187)||(22459511-22459587)
chr2 (230-305)||(21368365-21368440)
chr2 (23-77)||(23040249-23040303)
chr2 (313-431)||(23711572-23711690)
chr2 (313-431)||(26505864-26505982)
chr2 (313-431)||(26508342-26508460)
chr2 (313-431)||(27920323-27920441)
chr2 (313-431)||(32039057-32039175)
chr2 (333-442)||(19887275-19887384)
chr2 (98-198)||(23791358-23791458)
chr2 (23-177)||(25175857-25176010)
chr2 (333-442)||(27261332-27261441)
chr2 (333-402)||(34823750-34823819)
chr2 (333-429)||(12727711-12727807)
chr2 (313-365)||(24642373-24642425)
chr2 (158-198)||(29601478-29601518)
chr2 (35-166)||(20309127-20309257)
chr2 (230-305)||(23799457-23799532)
chr2 (30-144)||(25616199-25616314)
chr2 (23-92)||(8946664-8946734)
chr2 (333-442)||(11232213-11232322)
chr2 (333-442)||(22514060-22514169)
chr2 (333-442)||(28776662-28776771)
chr2 (313-429)||(571883-571999)
chr2 (223-299)||(22686145-22686221)
chr2 (313-352)||(23131347-23131386)
chr2 (313-352)||(34402160-34402199)
chr2 (31-69)||(18786971-18787009)
chr2 (23-77)||(22134266-22134320)
chr2 (361-431)||(34135059-34135129)
chr2 (313-431)||(39682799-39682917)
chr2 (262-304)||(41524004-41524045)
chr2 (98-198)||(20520130-20520229)
chr2 (361-442)||(21081348-21081429)
chr2 (98-198)||(24697543-24697643)
chr2 (333-401)||(22274022-22274090)
chr2 (35-144)||(32451920-32452031)
chr2 (30-69)||(7679599-7679638)
chr2 (23-77)||(23072008-23072063)
chr2 (313-352)||(23133814-23133853)
chr2 (392-431)||(24788047-24788086)
chr2 (617-724)||(42827789-42827896)
chr2 (392-431)||(44584588-44584627)
chr2 (43-77)||(21916158-21916192)
chr2 (103-137)||(23004838-23004872)
chr2 (227-305)||(23707147-23707225)
chr2 (227-305)||(24642679-24642757)
chr2 (227-305)||(24918294-24918372)
chr2 (361-442)||(6483113-6483194)
chr2 (256-305)||(22686062-22686111)
chr2 (361-442)||(23969000-23969081)
[»] scaffold0023 (10 HSPs)
scaffold0023 (30-519)||(17103-17591)
scaffold0023 (30-512)||(94422-94902)
scaffold0023 (30-178)||(44465-44614)
scaffold0023 (321-476)||(16953-17108)
scaffold0023 (23-177)||(100381-100534)
scaffold0023 (313-431)||(94896-95014)
scaffold0023 (23-177)||(40135-40288)
scaffold0023 (23-77)||(101506-101561)
scaffold0023 (23-69)||(119882-119928)
scaffold0023 (333-402)||(154892-154961)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (30-520)||(20758-21248)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (30-520)||(9253-9741)
[»] scaffold0134 (2 HSPs)
scaffold0134 (30-512)||(37832-38313)
scaffold0134 (313-431)||(38307-38425)
[»] chr7 (157 HSPs)
chr7 (30-512)||(16213695-16214176)
chr7 (30-520)||(41522928-41523417)
chr7 (30-520)||(41525390-41525879)
chr7 (30-512)||(15376384-15376864)
chr7 (30-512)||(20384794-20385274)
chr7 (30-512)||(27216871-27217352)
chr7 (30-520)||(32125502-32125990)
chr7 (30-510)||(456332-456811)
chr7 (30-520)||(14948785-14949273)
chr7 (30-511)||(16232531-16233011)
chr7 (30-512)||(16410070-16410550)
chr7 (30-512)||(21189266-21189746)
chr7 (30-520)||(24702249-24702728)
chr7 (30-519)||(18430723-18431210)
chr7 (30-512)||(18640283-18640763)
chr7 (30-520)||(24704699-24705175)
chr7 (30-510)||(13869357-13869837)
chr7 (30-511)||(11392971-11393438)
chr7 (74-512)||(26355652-26356090)
chr7 (74-512)||(26358104-26358542)
chr7 (181-520)||(11303409-11303747)
chr7 (182-520)||(16108351-16108688)
chr7 (182-520)||(23664615-23664952)
chr7 (182-520)||(29796771-29797110)
chr7 (182-520)||(29800590-29800929)
chr7 (170-512)||(18627717-18628057)
chr7 (230-512)||(14269627-14269909)
chr7 (230-512)||(8940489-8940775)
chr7 (230-508)||(15081516-15081794)
chr7 (232-512)||(45847325-45847605)
chr7 (30-304)||(11972507-11972779)
chr7 (525-753)||(28556968-28557196)
chr7 (525-753)||(707565-707793)
chr7 (230-477)||(8468945-8469192)
chr7 (314-520)||(25926792-25926998)
chr7 (313-506)||(8940769-8940961)
chr7 (321-520)||(13918065-13918265)
chr7 (227-470)||(11972755-11972998)
chr7 (321-512)||(14269434-14269625)
chr7 (314-520)||(1856892-1857097)
chr7 (321-510)||(10501066-10501255)
chr7 (313-512)||(14156749-14156944)
chr7 (30-198)||(44116520-44116688)
chr7 (35-211)||(13647344-13647521)
chr7 (313-476)||(38897741-38897904)
chr7 (313-479)||(14269274-14269440)
chr7 (30-197)||(3386344-3386511)
chr7 (240-412)||(13841274-13841446)
chr7 (30-168)||(24275182-24275320)
chr7 (30-198)||(38898359-38898528)
chr7 (317-477)||(15081354-15081514)
chr7 (30-198)||(17061898-17062066)
chr7 (313-477)||(8940962-8941126)
chr7 (112-304)||(15081826-15082019)
chr7 (313-477)||(16214170-16214334)
chr7 (313-476)||(14156592-14156755)
chr7 (321-477)||(21189108-21189264)
chr7 (35-198)||(12756654-12756817)
chr7 (30-196)||(20110567-20110723)
chr7 (346-476)||(10500934-10501064)
chr7 (23-181)||(3564319-3564478)
chr7 (182-304)||(14269941-14270061)
chr7 (321-475)||(17985092-17985246)
chr7 (30-138)||(48273403-48273512)
chr7 (30-145)||(13831384-13831499)
chr7 (202-304)||(45847639-45847739)
chr7 (23-181)||(12698838-12698998)
chr7 (164-279)||(13841157-13841270)
chr7 (31-198)||(2280056-2280225)
chr7 (32-187)||(26212012-26212168)
chr7 (23-181)||(9509196-9509355)
chr7 (23-181)||(38227488-38227646)
chr7 (182-304)||(38898107-38898229)
chr7 (30-181)||(18456368-18456519)
chr7 (182-304)||(8940335-8940457)
chr7 (230-310)||(38897995-38898075)
chr7 (313-431)||(45847213-45847331)
chr7 (182-271)||(8468803-8468891)
chr7 (32-134)||(10589055-10589158)
chr7 (398-512)||(11310133-11310246)
chr7 (31-137)||(15144037-15144143)
chr7 (312-400)||(11310239-11310327)
chr7 (30-137)||(22072927-22073036)
chr7 (410-477)||(23461797-23461864)
chr7 (38-196)||(12255730-12255892)
chr7 (313-431)||(15376272-15376390)
chr7 (313-431)||(20384682-20384800)
chr7 (333-430)||(11286976-11287073)
chr7 (23-177)||(18005653-18005806)
chr7 (98-198)||(19486681-19486782)
chr7 (103-187)||(15113031-15113114)
chr7 (23-144)||(16386239-16386362)
chr7 (23-77)||(44014185-44014240)
chr7 (30-138)||(67759-67868)
chr7 (23-69)||(811199-811245)
chr7 (333-402)||(125965-126034)
chr7 (31-198)||(1867932-1868101)
chr7 (225-310)||(13745563-13745648)
chr7 (23-134)||(16219719-16219831)
chr7 (103-187)||(15116568-15116651)
chr7 (34-198)||(10063760-10063921)
chr7 (313-352)||(13869833-13869872)
chr7 (35-198)||(16495421-16495581)
chr7 (230-304)||(15119919-15119993)
chr7 (313-431)||(27217346-27217464)
chr7 (35-166)||(40443410-40443541)
chr7 (333-442)||(7822013-7822122)
chr7 (333-442)||(7829324-7829433)
chr7 (31-137)||(16056343-16056449)
chr7 (333-442)||(27102512-27102621)
chr7 (333-442)||(27109860-27109969)
chr7 (333-442)||(27175705-27175814)
chr7 (240-305)||(38294567-38294632)
chr7 (333-442)||(38784604-38784713)
chr7 (30-133)||(47831821-47831925)
chr7 (333-429)||(15951607-15951703)
chr7 (313-352)||(16410544-16410583)
chr7 (313-352)||(18628051-18628090)
chr7 (313-352)||(18640757-18640796)
chr7 (313-352)||(26355619-26355658)
chr7 (313-352)||(26358071-26358110)
chr7 (313-431)||(456807-456925)
chr7 (345-431)||(16202766-16202852)
chr7 (23-69)||(28505366-28505412)
chr7 (333-431)||(32495062-32495160)
chr7 (23-69)||(34200793-34200839)
chr7 (98-198)||(15008436-15008535)
chr7 (333-402)||(15760779-15760848)
chr7 (617-730)||(41385287-41385400)
chr7 (351-431)||(10000996-10001076)
chr7 (410-442)||(20110747-20110779)
chr7 (254-305)||(9743794-9743845)
chr7 (23-77)||(11996086-11996141)
chr7 (30-69)||(14932802-14932841)
chr7 (30-69)||(15356237-15356276)
chr7 (30-69)||(15360351-15360390)
chr7 (98-198)||(20220127-20220224)
chr7 (361-431)||(11309903-11309973)
chr7 (227-305)||(14269887-14269965)
chr7 (227-305)||(15081772-15081850)
chr7 (23-69)||(15754955-15755001)
chr7 (227-305)||(38898053-38898131)
chr7 (344-442)||(43277120-43277218)
chr7 (361-442)||(3287584-3287665)
chr7 (240-305)||(8468902-8468967)
chr7 (240-305)||(8940446-8940511)
chr7 (361-442)||(10896371-10896452)
chr7 (361-442)||(16462630-16462711)
chr7 (361-442)||(16550381-16550462)
chr7 (361-442)||(16615200-16615281)
chr7 (361-442)||(23664500-23664581)
chr7 (256-305)||(25941523-25941572)
chr7 (30-79)||(26356096-26356145)
chr7 (30-79)||(26358548-26358597)
chr7 (361-430)||(29004416-29004485)
chr7 (361-442)||(29052532-29052613)
chr7 (240-305)||(43747672-43747737)
[»] chr3 (163 HSPs)
chr3 (30-512)||(17463189-17463669)
chr3 (30-511)||(45606578-45607058)
chr3 (30-520)||(7781009-7781498)
chr3 (30-512)||(34159337-34159817)
chr3 (30-519)||(16453943-16454432)
chr3 (30-512)||(55476502-55476982)
chr3 (30-512)||(6468805-6469285)
chr3 (30-520)||(10247386-10247874)
chr3 (30-512)||(13153926-13154407)
chr3 (30-484)||(12567571-12568023)
chr3 (30-484)||(13544036-13544487)
chr3 (30-520)||(28848284-28848762)
chr3 (30-512)||(8499529-8500012)
chr3 (30-510)||(15412440-15412920)
chr3 (30-512)||(13151461-13151942)
chr3 (30-512)||(53301174-53301658)
chr3 (30-512)||(27165261-27165744)
chr3 (182-520)||(54520985-54521322)
chr3 (182-520)||(15977696-15978032)
chr3 (203-510)||(46822445-46822751)
chr3 (184-520)||(29544504-29544839)
chr3 (202-512)||(10557091-10557400)
chr3 (241-522)||(13436520-13436801)
chr3 (30-304)||(9707485-9707758)
chr3 (30-304)||(8899105-8899377)
chr3 (30-304)||(38961770-38962042)
chr3 (230-477)||(12119359-12119606)
chr3 (30-304)||(16282690-16282962)
chr3 (227-512)||(38961508-38961794)
chr3 (227-512)||(41124146-41124431)
chr3 (227-510)||(16282430-16282714)
chr3 (30-304)||(41123901-41124170)
chr3 (227-519)||(17444427-17444719)
chr3 (240-519)||(20629855-20630138)
chr3 (240-508)||(25237063-25237331)
chr3 (240-508)||(25229476-25229744)
chr3 (254-477)||(24513910-24514133)
chr3 (314-520)||(15465448-15465654)
chr3 (314-520)||(26054927-26055133)
chr3 (313-512)||(55318974-55319173)
chr3 (314-520)||(5223677-5223883)
chr3 (30-222)||(17446614-17446805)
chr3 (189-388)||(12305315-12305513)
chr3 (30-211)||(50242833-50243014)
chr3 (30-198)||(17672637-17672805)
chr3 (30-198)||(29172565-29172734)
chr3 (313-477)||(46822747-46822911)
chr3 (306-477)||(10379613-10379784)
chr3 (313-477)||(27165738-27165902)
chr3 (313-477)||(41124425-41124589)
chr3 (35-198)||(53070636-53070799)
chr3 (313-477)||(10557394-10557558)
chr3 (313-477)||(53301016-53301180)
chr3 (313-476)||(55318817-55318980)
chr3 (30-198)||(12119707-12119876)
chr3 (35-211)||(43550448-43550625)
chr3 (313-477)||(38961350-38961514)
chr3 (319-477)||(8500012-8500170)
chr3 (324-479)||(13937483-13937638)
chr3 (321-477)||(20629704-20629860)
chr3 (313-477)||(16282270-16282434)
chr3 (23-181)||(14972861-14973020)
chr3 (312-434)||(36528447-36528569)
chr3 (390-510)||(15007869-15007992)
chr3 (321-477)||(17444276-17444432)
chr3 (30-149)||(15977526-15977645)
chr3 (30-181)||(40213676-40213827)
chr3 (392-510)||(16358340-16358458)
chr3 (28-196)||(43840944-43841114)
chr3 (313-442)||(14567432-14567561)
chr3 (23-181)||(17487863-17488022)
chr3 (23-181)||(17499345-17499504)
chr3 (31-196)||(26686902-26687069)
chr3 (30-132)||(55500953-55501055)
chr3 (423-520)||(12305525-12305622)
chr3 (34-197)||(42386428-42386593)
chr3 (23-181)||(14576788-14576946)
chr3 (23-181)||(23083316-23083475)
chr3 (23-181)||(25476340-25476499)
chr3 (30-161)||(36166609-36166739)
chr3 (398-519)||(36528340-36528461)
chr3 (23-181)||(13442281-13442440)
chr3 (30-161)||(21618460-21618590)
chr3 (313-423)||(16358234-16358344)
chr3 (23-166)||(12399216-12399360)
chr3 (321-457)||(17393209-17393345)
chr3 (23-134)||(18438541-18438653)
chr3 (23-166)||(20698405-20698549)
chr3 (312-420)||(3264323-3264431)
chr3 (182-304)||(11913929-11914051)
chr3 (30-137)||(10556996-10557104)
chr3 (22-144)||(14572595-14572717)
chr3 (34-198)||(24340660-24340826)
chr3 (35-196)||(52523666-52523831)
chr3 (30-181)||(24153164-24153315)
chr3 (30-118)||(44494820-44494908)
chr3 (225-304)||(17444695-17444773)
chr3 (34-198)||(23274705-23274871)
chr3 (398-512)||(3264424-3264538)
chr3 (414-512)||(14567555-14567653)
chr3 (23-181)||(11424718-11424873)
chr3 (313-377)||(15007988-15008052)
chr3 (30-117)||(17737247-17737337)
chr3 (98-196)||(2051138-2051237)
chr3 (446-511)||(13937644-13937709)
chr3 (23-196)||(16097335-16097509)
chr3 (135-198)||(17248224-17248287)
chr3 (238-304)||(25237009-25237074)
chr3 (321-442)||(25058286-25058407)
chr3 (22-141)||(32307683-32307802)
chr3 (98-198)||(37642202-37642303)
chr3 (413-477)||(8899418-8899482)
chr3 (412-458)||(10555766-10555812)
chr3 (313-431)||(34159811-34159929)
chr3 (647-753)||(34594665-34594771)
chr3 (98-187)||(22147474-22147563)
chr3 (23-137)||(15470931-15471046)
chr3 (23-196)||(16103787-16103960)
chr3 (333-429)||(16934824-16934920)
chr3 (23-69)||(12174327-12174373)
chr3 (333-431)||(14263640-14263738)
chr3 (313-431)||(15412916-15413034)
chr3 (313-431)||(17463663-17463781)
chr3 (333-431)||(49231768-49231866)
chr3 (333-403)||(51158683-51158753)
chr3 (313-431)||(55476976-55477094)
chr3 (333-442)||(14528625-14528734)
chr3 (230-305)||(25201323-25201398)
chr3 (30-144)||(46822279-46822394)
chr3 (23-69)||(49668144-49668190)
chr3 (333-442)||(1468614-1468723)
chr3 (333-442)||(8276474-8276583)
chr3 (333-430)||(30152450-30152547)
chr3 (30-71)||(45577948-45577989)
chr3 (637-724)||(5386732-5386819)
chr3 (246-305)||(15025933-15025992)
chr3 (329-420)||(21026092-21026183)
chr3 (30-69)||(28194704-28194743)
chr3 (335-402)||(54039167-54039234)
chr3 (333-435)||(2281000-2281102)
chr3 (23-69)||(9512927-9512973)
chr3 (23-69)||(9520902-9520948)
chr3 (23-69)||(13210395-13210441)
chr3 (333-442)||(8269363-8269472)
chr3 (30-134)||(12511071-12511176)
chr3 (361-442)||(16979504-16979585)
chr3 (333-402)||(17956869-17956938)
chr3 (240-304)||(17044330-17044394)
chr3 (31-114)||(30029855-30029939)
chr3 (22-77)||(1644733-1644788)
chr3 (313-352)||(6468772-6468811)
chr3 (227-305)||(11913875-11913953)
chr3 (259-305)||(18700199-18700245)
chr3 (333-431)||(28557370-28557468)
chr3 (617-679)||(31200078-31200140)
chr3 (230-288)||(40812144-40812202)
chr3 (240-305)||(12119584-12119649)
chr3 (333-442)||(12808505-12808614)
chr3 (361-442)||(13519877-13519958)
chr3 (361-442)||(18889958-18890039)
chr3 (361-442)||(24546434-24546515)
chr3 (98-179)||(43926043-43926123)
chr3 (250-303)||(50351664-50351717)
[»] chr5 (114 HSPs)
chr5 (30-512)||(39363395-39363875)
chr5 (30-520)||(10732603-10733091)
chr5 (30-512)||(20909023-20909503)
chr5 (30-519)||(42245029-42245516)
chr5 (30-512)||(264439-264919)
chr5 (30-520)||(29345991-29346479)
chr5 (30-512)||(39245147-39245627)
chr5 (30-520)||(29348464-29348952)
chr5 (30-520)||(29350937-29351425)
chr5 (30-510)||(38619445-38619925)
chr5 (30-512)||(23064522-23065005)
chr5 (30-511)||(2154303-2154765)
chr5 (203-512)||(17516834-17517142)
chr5 (182-520)||(37804565-37804902)
chr5 (230-512)||(20901591-20901873)
chr5 (30-304)||(32027404-32027676)
chr5 (227-510)||(32027652-32027935)
chr5 (240-510)||(20917519-20917789)
chr5 (30-304)||(29329945-29330214)
chr5 (227-512)||(29330190-29330474)
chr5 (30-304)||(20917831-20918099)
chr5 (182-442)||(9776521-9776780)
chr5 (31-304)||(20901905-20902159)
chr5 (313-512)||(295945-296144)
chr5 (313-519)||(32028318-32028524)
chr5 (321-510)||(32028132-32028322)
chr5 (313-519)||(32027931-32028137)
chr5 (313-512)||(17516641-17516840)
chr5 (313-477)||(20901433-20901597)
chr5 (30-198)||(36154766-36154931)
chr5 (313-477)||(17516483-17516647)
chr5 (30-196)||(11581184-11581350)
chr5 (30-193)||(18319021-18319185)
chr5 (30-198)||(31061079-31061248)
chr5 (313-477)||(20917359-20917523)
chr5 (321-479)||(32028519-32028677)
chr5 (30-198)||(10775659-10775827)
chr5 (313-477)||(29330468-29330632)
chr5 (320-476)||(2154145-2154301)
chr5 (30-193)||(24067118-24067282)
chr5 (313-477)||(295787-295951)
chr5 (23-181)||(25421539-25421698)
chr5 (23-181)||(23390451-23390610)
chr5 (23-141)||(24529227-24529346)
chr5 (22-181)||(1096473-1096633)
chr5 (23-181)||(9077959-9078118)
chr5 (23-181)||(21729019-21729178)
chr5 (23-181)||(21808344-21808503)
chr5 (36-181)||(25431414-25431560)
chr5 (23-181)||(8286797-8286957)
chr5 (23-181)||(24493576-24493734)
chr5 (23-123)||(21997547-21997648)
chr5 (30-161)||(22412198-22412329)
chr5 (23-181)||(13025318-13025476)
chr5 (23-181)||(13095502-13095660)
chr5 (32-181)||(22075035-22075185)
chr5 (35-181)||(22144068-22144215)
chr5 (333-431)||(27183180-27183278)
chr5 (333-442)||(22883904-22884013)
chr5 (98-198)||(40725936-40726037)
chr5 (23-196)||(21565549-21565723)
chr5 (74-161)||(20766095-20766181)
chr5 (313-431)||(264327-264445)
chr5 (35-194)||(22178161-22178323)
chr5 (333-442)||(43444009-43444118)
chr5 (230-301)||(18743965-18744036)
chr5 (313-431)||(20909497-20909615)
chr5 (23-69)||(22959600-22959646)
chr5 (333-442)||(11903-12012)
chr5 (333-402)||(1220384-1220453)
chr5 (333-402)||(10778832-10778901)
chr5 (333-442)||(25426177-25426286)
chr5 (335-442)||(7424879-7424986)
chr5 (30-114)||(18418594-18418678)
chr5 (35-133)||(20026942-20027043)
chr5 (230-304)||(1628169-1628243)
chr5 (35-115)||(21292992-21293071)
chr5 (313-431)||(23064999-23065117)
chr5 (22-164)||(37723909-37724050)
chr5 (313-431)||(39245621-39245739)
chr5 (333-430)||(11342190-11342287)
chr5 (227-304)||(20917778-20917855)
chr5 (333-442)||(21933243-21933352)
chr5 (333-442)||(21939413-21939522)
chr5 (333-442)||(22367095-22367204)
chr5 (333-442)||(35581340-35581449)
chr5 (333-442)||(36990639-36990748)
chr5 (230-302)||(21399896-21399968)
chr5 (333-401)||(23511127-23511195)
chr5 (30-144)||(17517193-17517308)
chr5 (23-77)||(19668905-19668960)
chr5 (30-69)||(21329565-21329604)
chr5 (313-352)||(39363869-39363908)
chr5 (23-69)||(19660903-19660949)
chr5 (314-352)||(38619922-38619960)
chr5 (333-402)||(1168832-1168901)
chr5 (333-402)||(11212734-11212803)
chr5 (333-442)||(18778606-18778715)
chr5 (333-402)||(21074249-21074318)
chr5 (25-69)||(23535647-23535691)
chr5 (392-431)||(22755231-22755270)
chr5 (263-306)||(24067282-24067325)
chr5 (333-431)||(19499428-19499526)
chr5 (227-305)||(20901851-20901929)
chr5 (377-431)||(23280293-23280347)
chr5 (333-403)||(32950213-32950283)
chr5 (333-431)||(35791736-35791834)
chr5 (35-69)||(36314596-36314630)
chr5 (361-442)||(8833584-8833665)
chr5 (230-305)||(18743852-18743924)
chr5 (361-442)||(19511781-19511862)
chr5 (240-305)||(20198506-20198571)
chr5 (30-71)||(20806852-20806893)
chr5 (361-442)||(37804450-37804531)
[»] scaffold0028 (6 HSPs)
scaffold0028 (30-520)||(136691-137179)
scaffold0028 (30-520)||(139160-139648)
scaffold0028 (30-520)||(144098-144586)
scaffold0028 (30-520)||(134222-134710)
scaffold0028 (30-520)||(141629-142117)
scaffold0028 (23-69)||(132665-132711)
[»] scaffold0444 (2 HSPs)
scaffold0444 (30-512)||(13403-13884)
scaffold0444 (313-431)||(13878-13996)
[»] scaffold0044 (3 HSPs)
scaffold0044 (30-512)||(40411-40891)
scaffold0044 (321-442)||(37848-37968)
scaffold0044 (313-431)||(40885-41003)
[»] scaffold0001 (6 HSPs)
scaffold0001 (30-512)||(501095-501556)
scaffold0001 (313-477)||(501550-501714)
scaffold0001 (30-198)||(85562-85731)
scaffold0001 (23-137)||(160691-160805)
scaffold0001 (323-431)||(139589-139697)
scaffold0001 (25-69)||(173294-173338)
[»] scaffold0695 (1 HSPs)
scaffold0695 (142-520)||(6070-6446)
[»] scaffold0454 (2 HSPs)
scaffold0454 (30-388)||(10784-11140)
scaffold0454 (445-520)||(1-76)
[»] scaffold0422 (1 HSPs)
scaffold0422 (182-520)||(3186-3523)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (30-477)||(38361-38809)
[»] scaffold0741 (4 HSPs)
scaffold0741 (182-512)||(3973-4304)
scaffold0741 (313-508)||(3784-3979)
scaffold0741 (319-511)||(3588-3780)
scaffold0741 (320-365)||(3541-3586)
[»] scaffold0747 (4 HSPs)
scaffold0747 (230-519)||(799-1088)
scaffold0747 (321-462)||(1083-1224)
scaffold0747 (343-477)||(1225-1358)
scaffold0747 (182-304)||(645-767)
[»] scaffold0043 (5 HSPs)
scaffold0043 (230-512)||(10001-10283)
scaffold0043 (313-510)||(10277-10474)
scaffold0043 (313-476)||(10470-10633)
scaffold0043 (271-304)||(9936-9969)
scaffold0043 (227-305)||(9945-10023)
[»] scaffold0317 (2 HSPs)
scaffold0317 (182-512)||(6606-6937)
scaffold0317 (313-477)||(6448-6612)
[»] scaffold1792 (4 HSPs)
scaffold1792 (229-512)||(416-699)
scaffold1792 (313-477)||(853-1017)
scaffold1792 (435-512)||(782-859)
scaffold1792 (313-399)||(693-779)
[»] scaffold0149 (3 HSPs)
scaffold0149 (230-512)||(30229-30511)
scaffold0149 (33-303)||(29946-30196)
scaffold0149 (313-477)||(30505-30669)
[»] scaffold0494 (3 HSPs)
scaffold0494 (230-477)||(229-476)
scaffold0494 (30-236)||(12195-12400)
scaffold0494 (230-304)||(508-582)
[»] scaffold0574 (2 HSPs)
scaffold0574 (241-512)||(6682-6943)
scaffold0574 (313-477)||(6937-7101)
[»] scaffold0306 (5 HSPs)
scaffold0306 (182-512)||(15083-15404)
scaffold0306 (271-512)||(11010-11251)
scaffold0306 (313-477)||(10852-11016)
scaffold0306 (313-477)||(15398-15561)
scaffold0306 (361-442)||(4628-4709)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (286-518)||(68227-68459)
[»] scaffold0278 (4 HSPs)
scaffold0278 (277-512)||(7996-8231)
scaffold0278 (313-512)||(8225-8424)
scaffold0278 (319-477)||(8424-8582)
scaffold0278 (27-177)||(5654-5803)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (182-442)||(53612-53873)
scaffold0022 (30-161)||(116441-116571)
scaffold0022 (98-198)||(128907-129007)
[»] scaffold0040 (3 HSPs)
scaffold0040 (283-512)||(43002-43231)
scaffold0040 (238-430)||(13379-13571)
scaffold0040 (313-477)||(43225-43389)
[»] scaffold1427 (1 HSPs)
scaffold1427 (182-423)||(1591-1831)
[»] scaffold0200 (1 HSPs)
scaffold0200 (314-520)||(17947-18153)
[»] scaffold0138 (3 HSPs)
scaffold0138 (320-520)||(33471-33671)
scaffold0138 (23-133)||(12946-13057)
scaffold0138 (108-197)||(18176-18265)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (314-520)||(31497-31703)
[»] scaffold0436 (1 HSPs)
scaffold0436 (313-520)||(8311-8518)
[»] scaffold0145 (4 HSPs)
scaffold0145 (30-304)||(9760-10015)
scaffold0145 (23-181)||(32949-33107)
scaffold0145 (23-181)||(38768-38926)
scaffold0145 (241-303)||(10005-10067)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (314-520)||(39626-39832)
[»] scaffold0711 (4 HSPs)
scaffold0711 (314-512)||(7361-7558)
scaffold0711 (313-512)||(7168-7367)
scaffold0711 (319-408)||(7079-7168)
scaffold0711 (444-512)||(7553-7621)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (30-211)||(82083-82264)
scaffold0037 (31-196)||(22610-22776)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (30-198)||(158433-158601)
scaffold0003 (31-181)||(339905-340053)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (321-520)||(19751-19950)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (30-211)||(117-298)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (30-198)||(16795-16963)
[»] scaffold0151 (3 HSPs)
scaffold0151 (325-512)||(36869-37056)
scaffold0151 (313-439)||(36749-36875)
scaffold0151 (464-513)||(37061-37110)
[»] scaffold1296 (2 HSPs)
scaffold1296 (313-479)||(1740-1906)
scaffold1296 (400-512)||(1634-1746)
[»] scaffold0059 (1 HSPs)
scaffold0059 (247-404)||(57708-57865)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (30-198)||(4308-4476)
[»] scaffold0322 (2 HSPs)
scaffold0322 (313-477)||(18423-18587)
scaffold0322 (435-512)||(18352-18429)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (30-211)||(12075-12250)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (30-211)||(1250-1432)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (35-198)||(79267-79430)
scaffold0056 (23-181)||(17170-17331)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (32-198)||(161072-161239)
scaffold0007 (98-198)||(164573-164674)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (30-198)||(4225-4393)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (35-198)||(20363-20524)
scaffold0031 (30-181)||(128765-128916)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (30-198)||(2111-2280)
scaffold0247 (34-198)||(17964-18130)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (30-181)||(22897-23048)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (28-181)||(39489-39642)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (28-181)||(75170-75323)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (23-181)||(3106-3264)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (23-181)||(13218-13377)
[»] scaffold0228 (3 HSPs)
scaffold0228 (28-181)||(4520-4673)
scaffold0228 (28-181)||(12102-12255)
scaffold0228 (28-181)||(22054-22207)
[»] scaffold0114 (3 HSPs)
scaffold0114 (227-365)||(28048-28186)
scaffold0114 (188-304)||(27958-28072)
scaffold0114 (23-181)||(15420-15577)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (23-187)||(51920-52085)
scaffold0011 (23-166)||(167948-168092)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (23-166)||(1018-1162)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (30-161)||(44682-44814)
scaffold0122 (23-181)||(26020-26179)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (23-181)||(16555-16714)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (23-181)||(1858-2017)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (23-181)||(3141-3300)
[»] scaffold0513 (3 HSPs)
scaffold0513 (230-317)||(10647-10734)
scaffold0513 (182-304)||(10766-10886)
scaffold0513 (227-305)||(10712-10790)
[»] scaffold0120 (4 HSPs)
scaffold0120 (23-180)||(16120-16278)
scaffold0120 (23-181)||(32913-33070)
scaffold0120 (23-181)||(45935-46092)
scaffold0120 (23-78)||(17388-17443)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (23-181)||(6076-6238)
[»] scaffold0046 (4 HSPs)
scaffold0046 (23-134)||(28421-28533)
scaffold0046 (23-69)||(2004-2050)
scaffold0046 (23-69)||(4559-4605)
scaffold0046 (23-69)||(11299-11345)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (321-477)||(113317-113473)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (31-196)||(8481-8650)
scaffold0621 (23-177)||(6542-6695)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (23-181)||(4856-5015)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (23-181)||(3477-3636)
scaffold0292 (34-181)||(361-508)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (398-482)||(75605-75689)
scaffold0042 (34-181)||(24257-24406)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (23-196)||(8472-8643)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (31-198)||(27686-27855)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (28-181)||(25908-26061)
scaffold0026 (23-181)||(39865-40023)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (80-181)||(3485-3586)
[»] scaffold0106 (5 HSPs)
scaffold0106 (182-304)||(15151-15273)
scaffold0106 (35-134)||(7285-7383)
scaffold0106 (230-279)||(15070-15119)
scaffold0106 (35-134)||(1308-1406)
scaffold0106 (30-69)||(15306-15345)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (23-134)||(8486-8598)
[»] scaffold0357 (2 HSPs)
scaffold0357 (35-198)||(13147-13313)
scaffold0357 (31-198)||(16037-16206)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (103-176)||(13092-13165)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (35-166)||(1971-2103)
[»] scaffold0100 (2 HSPs)
scaffold0100 (182-293)||(35955-36065)
scaffold0100 (23-69)||(23951-23997)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (35-198)||(53486-53651)
[»] scaffold0175 (3 HSPs)
scaffold0175 (80-196)||(13157-13274)
scaffold0175 (28-71)||(285-328)
scaffold0175 (23-130)||(34130-34238)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (90-198)||(225482-225590)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (23-106)||(4719-4803)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (34-198)||(11482-11648)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (34-198)||(38193-38359)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (23-181)||(39920-40078)
[»] scaffold0235 (1 HSPs)
scaffold0235 (23-132)||(11447-11557)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (333-442)||(6196-6305)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (98-181)||(27913-27996)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (23-181)||(10381-10537)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (35-198)||(12587-12751)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (37-166)||(4545-4675)
[»] scaffold0021 (3 HSPs)
scaffold0021 (399-477)||(398-476)
scaffold0021 (35-164)||(174785-174913)
scaffold0021 (23-77)||(121773-121827)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (25-177)||(129914-130066)
scaffold0010 (35-198)||(60652-60818)
[»] scaffold0599 (1 HSPs)
scaffold0599 (182-304)||(1205-1327)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (98-198)||(7996-8097)
[»] scaffold0338 (1 HSPs)
scaffold0338 (333-442)||(8566-8675)
[»] scaffold0129 (1 HSPs)
scaffold0129 (617-730)||(3748-3861)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (23-166)||(32074-32216)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (333-442)||(30470-30579)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (23-177)||(19271-19424)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (23-177)||(136-290)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (26-196)||(10481-10652)
[»] scaffold0503 (2 HSPs)
scaffold0503 (133-198)||(12047-12112)
scaffold0503 (35-95)||(11982-12042)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (35-198)||(6220-6386)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (333-442)||(725-834)
[»] scaffold0140 (1 HSPs)
scaffold0140 (612-753)||(35914-36055)
[»] scaffold0628 (1 HSPs)
scaffold0628 (23-137)||(2805-2920)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (32-115)||(13513-13596)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (23-196)||(45732-45906)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (23-137)||(14696-14811)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (333-404)||(12519-12590)
[»] scaffold0686 (1 HSPs)
scaffold0686 (333-431)||(6941-7039)
[»] scaffold0395 (2 HSPs)
scaffold0395 (23-77)||(4893-4947)
scaffold0395 (92-181)||(918-1006)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (23-69)||(2713-2759)
[»] scaffold0184 (2 HSPs)
scaffold0184 (333-431)||(32118-32216)
scaffold0184 (35-198)||(1011-1171)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (333-431)||(40628-40726)
scaffold0078 (31-137)||(10542-10649)
[»] scaffold1404 (1 HSPs)
scaffold1404 (333-442)||(1375-1484)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (34-181)||(20928-21077)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (333-442)||(110065-110174)
scaffold0035 (333-442)||(118566-118675)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (98-198)||(97090-97190)
scaffold0006 (98-198)||(106368-106468)
[»] scaffold0269 (1 HSPs)
scaffold0269 (335-431)||(15780-15876)
[»] scaffold0174 (2 HSPs)
scaffold0174 (225-305)||(15282-15362)
scaffold0174 (240-298)||(15350-15408)
[»] scaffold0123 (3 HSPs)
scaffold0123 (218-303)||(16239-16326)
scaffold0123 (31-198)||(25121-25289)
scaffold0123 (98-198)||(621-720)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (80-166)||(6675-6761)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (333-431)||(53946-54044)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (333-431)||(19911-20009)
[»] scaffold0034 (4 HSPs)
scaffold0034 (333-403)||(39965-40035)
scaffold0034 (333-403)||(45448-45518)
scaffold0034 (333-403)||(79003-79073)
scaffold0034 (31-137)||(32551-32657)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (35-198)||(267679-267844)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (333-402)||(1296-1365)
[»] scaffold0315 (1 HSPs)
scaffold0315 (333-442)||(18205-18314)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (333-442)||(28469-28578)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (23-68)||(28839-28884)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (333-442)||(38375-38484)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (30-125)||(15788-15884)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (35-137)||(1051-1154)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (30-77)||(1096-1144)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (30-77)||(1093-1141)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (27-133)||(12777-12884)
[»] scaffold0333 (3 HSPs)
scaffold0333 (30-77)||(6625-6673)
scaffold0333 (30-77)||(14005-14053)
scaffold0333 (313-369)||(217-273)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (23-141)||(32105-32224)
[»] scaffold1164 (1 HSPs)
scaffold1164 (335-402)||(912-979)
[»] scaffold0556 (2 HSPs)
scaffold0556 (90-137)||(8090-8137)
scaffold0556 (26-69)||(6822-6865)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (333-428)||(1959-2054)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (30-69)||(6191-6230)
[»] scaffold1753 (1 HSPs)
scaffold1753 (333-403)||(868-938)
[»] scaffold0959 (1 HSPs)
scaffold0959 (321-435)||(1219-1333)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (30-130)||(15675-15776)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (35-132)||(16301-16397)
[»] scaffold0048 (1 HSPs)
scaffold0048 (387-431)||(53934-53978)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (25-69)||(228432-228476)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (30-69)||(23853-23892)
[»] scaffold0191 (1 HSPs)
scaffold0191 (333-428)||(8097-8192)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (30-69)||(36464-36503)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (35-134)||(51601-51699)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (35-69)||(5196-5230)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (43-77)||(9536-9570)
[»] scaffold0515 (1 HSPs)
scaffold0515 (361-442)||(4628-4709)
[»] scaffold0462 (2 HSPs)
scaffold0462 (361-442)||(912-993)
scaffold0462 (361-442)||(6418-6499)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (108-181)||(38411-38483)
[»] scaffold0135 (1 HSPs)
scaffold0135 (321-374)||(31918-31971)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (361-442)||(23581-23662)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (248-305)||(66761-66818)


Alignment Details
Target: scaffold0029 (Bit Score: 431; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 431; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 520
Target Start/End: Original strand, 11299 - 11789
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11299 atcaaattagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 11398  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11399 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaaaatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 11498  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||    
T  11499 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattaactgtgacctacg 11598  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  11599 tgcagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaacccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaagtatcgtgtttaca 11698  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 520  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11699 cctaagaccaattttgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattccgacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 11789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 419; Significance: 0; HSPs: 150)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 419; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 16413467 - 16412986
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16413467 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 16413368  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16413367 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatca-tatata 16413269  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||    
T  16413268 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgatctacg 16413169  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16413168 tgaagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcattagcaagctaacatccatacctacaactgtcgtgtttaca 16413069  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16413068 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 16412986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 387; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 14409595 - 14409115
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14409595 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 14409496  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14409495 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca-tatata 14409397  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  14409396 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 14409298  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  14409297 tgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatacctacaactttcgtgtttaca 14409198  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14409197 cctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 14409115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 383; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 512
Target Start/End: Original strand, 1484413 - 1484893
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1484413 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 1484512  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1484513 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca-tatata 1484611  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  1484612 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 1484710  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  1484711 tgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatacctacaactttcgtgtttaca 1484810  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1484811 cctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 1484893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 5853443 - 5852963
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5853443 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 5853344  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5853343 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca-tatata 5853245  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  5853244 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 5853146  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  5853145 tgcagtaatttgactataactctagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatacctacaactttcgtgtttaca 5853046  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5853045 cctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 5852963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 367; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 512
Target Start/End: Original strand, 4483292 - 4483771
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4483292 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaa-taacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 4483390  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4483391 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca-tatata 4483489  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  4483490 catataacacttcatcaatcatggacaatatcatattcacaaacatacacatacatatactaattcatcaatcataatcaattattcagtgtgacctacg 4483589  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4483590 ttcagtaatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcactagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttata 4483689  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4483690 cctaagaccaattatgtaccaataaataccagttttcatttc-aattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 4483771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 363; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 520
Target Start/End: Original strand, 22001764 - 22002252
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22001764 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 22001863  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22001864 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca-tatata 22001962  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  22001963 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcaatgttacctacg 22002061  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  22002062 tgcagtaatttgactataactcaagttctataaattcttttgaagtcaaaccaacgacattagaaagctaacatttatacctacaactttcatgtttaca 22002161  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 520  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22002162 cctaagaccaattctgtaccaatcaatatcagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcatacaaattcactaagacctc 22002252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 4542524 - 4542036
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4542524 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacaagatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 4542425  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4542424 cgtctcaattattcacatatagttcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca-tatata 4542326  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||    
T  4542325 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacattcatatactaattcatcaatcatatacaattattcactgcgacctacg 4542227  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  4542226 tgcagtaatttgactataactctagttctataaatcattttgaagtcaagcgaacggcattagaaagctaacatttatacctacaactttcgtgtttaca 4542127  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 520  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4542126 cctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 4542036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 512
Target Start/End: Original strand, 14823785 - 14824266
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14823785 atcaatttagacc-actcatgcagcaaagttaaataacaacaacaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 14823883  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatca-atatat 228  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14823884 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacattaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatat 14823983  T
Q  229 acatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctac 328  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  14823984 acatataacacttcatcaatcatggataatatcgtatttacaa-catatacattcatatactaattaatcaatcatattcaattattcactgtgacctac 14824082  T
Q  329 gtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttac 428  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14824083 gtgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacattcatacctacaactttcgtgtttac 14824182  T
Q  429 acctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14824183 acctaagaccaattctataccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 14824266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 512
Target Start/End: Original strand, 15070571 - 15071052
Alignment:
Q  32 caacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaa-caac 130  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15070571 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacagtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaatcaac 15070670  T
Q  131 atctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa-caacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
     ||||||||||||||| || ||  || | ||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||    
T  15070671 gtctcaattattcacagataatctaattgatgcatatacaattatatctgaatataaacaacatcaaatgataatcaacatcttaaaacatca-taaata 15070769  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||    
T  15070770 catataaaacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcataatcaattattcactatgacctacg 15070869  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15070870 ttcagtaatttgaccataactcaagttgtataaatcatttttaagtcaaaccaacggcactagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttata 15070969  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15070970 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 15071052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 20046346 - 20045866
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20046346 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 20046247  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20046246 cgtctcaattatttacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca-tatata 20046148  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||     
T  20046147 catataacacttcatcaatcatggaaaatatcgtattcacaa-catatacattcatatactcattcatcaatcatattcaattattcactatgacctaca 20046049  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  20046048 tgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtgaaaccaacggcattagaaatctaacatttatacctacaactttcgtgtttaca 20045949  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20045948 cctaagaccaattctgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 20045866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 132 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 24486093 - 24485706
Alignment:
Q  132 tctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatataca 231  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  24486093 tctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttagaacatca-tatataca 24485995  T
Q  232 tataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacgtg 331  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  24485994 tataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtg 24485895  T
Q  332 cagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacc 431  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24485894 cagtaatttgactataactcaagttttataaatcattttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacattcatacctacaactttcgtgtttacacc 24485795  T
Q  432 taagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 520  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24485794 caagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 24485706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 202 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 27472395 - 27472087
Alignment:
Q  202 aatcaacatcttaaaacatcaatatatacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaat 301  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27472395 aatcaacatcttaaa-catca-tatatacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaat 27472298  T
Q  302 catgttcaattattcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaac 401  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  27472297 catattcaattattcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacgacattagaaatctaac 27472198  T
Q  402 atccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcat 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  27472197 atccatacctacaactttcgtgtttacagctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaactcggacaaagttgtgctgaaattcat 27472098  T
Q  502 aaaaattcact 512  Q
    |||||||||||    
T  27472097 aaaaattcact 27472087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 203 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 18678043 - 18677727
Alignment:
Q  203 atcaacatcttaaaacatcaatatatacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatc 302  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  18678043 atcaacatcttaaaacatca-tacataaatataacacttcatcaatcatggataatatcgtattcacaaacatatacatatacatactaattcatcaatc 18677945  T
Q  303 atgttcaattattcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaaca 402  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18677944 atattcaattattcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaattcttttgaagtcaaaccaacggcactagaaagctaaca 18677845  T
Q  403 tccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcata 502  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18677844 tccatacctacaactttcgtgtttatacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttaaaattcggacaaagttgtgctgaaattcata 18677745  T
Q  503 aaaattcactaagacctc 520  Q
    ||||||||||||||||||    
T  18677744 aaaattcactaagacctc 18677727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 203 - 512
Target Start/End: Original strand, 32121912 - 32122220
Alignment:
Q  203 atcaacatcttaaaacatcaatatatacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatc 302  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32121912 atcaacatcttaaaacatca-tacatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatgcatacatatactaattcatcaatc 32122010  T
Q  303 atgttcaattattcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaaca 402  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  32122011 atattcaattattcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaactaacggcattagaaagctaaca 32122110  T
Q  403 tccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcata 502  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32122111 tccatacctacaacattcgtgtttacacctaagaacaattctgtaccaatcaatatcagtttacatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcata 32122210  T
Q  503 aaaattcact 512  Q
    ||||||||||    
T  32122211 aaaattcact 32122220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 241 - 520
Target Start/End: Original strand, 16198115 - 16198394
Alignment:
Q  241 tcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacgtgcagtaattt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16198115 tcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcattgtgacctacgtgcagtaattg 16198214  T
Q  341 gaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaa 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16198215 gaccataactcaagttctataaatatttttaaagtcaaaccaacggcattagaaagctaatatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaa 16198314  T
Q  441 ttatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 520  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16198315 ttctgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggacaaagttgtggtgaaattcataaaatttcactaagacctc 16198394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 230 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 38549957 - 38549675
Alignment:
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  38549957 catataaaaattcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacatacg 38549858  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  38549857 tgcagtattttgaccataactcaagttctataaatctttttgaagtcaaaccaacgacattagaaaactaacatccatacctacaacttttgtgtttata 38549758  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38549757 cctaagaccaattctttaccaatcaataccagatttcatttcaaattcggacaaagttgtgatgaaattcataaaaattcact 38549675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 30 - 304
Target Start/End: Original strand, 20403238 - 20403510
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20403238 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 20403337  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20403338 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatc-atatata 20403436  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcat 304  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20403437 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaatcat 20403510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 250 - 508
Target Start/End: Original strand, 24048841 - 24049098
Alignment:
Q  250 atgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataac 349  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24048841 atgnacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctac-tgcagtaatttgaccataac 24048939  T
Q  350 tcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtacc 449  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24048940 tcaagttctataaattgttttgaagtcaaaccaacgacattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtacc 24049039  T
Q  450 aatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaatt 508  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24049040 aatcaataccagtttttatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaatt 24049098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 232 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 16401875 - 16401597
Alignment:
Q  232 tataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacgtg 331  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||    
T  16401875 tataacacttcatcaatcatgaacaatatagtattcacaaacatacacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacctg 16401776  T
Q  332 cagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacc 431  Q
    | ||||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16401775 ctgtaatctgactataactcaagttttataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaatctaacatcaatacctacaactttcgtgtttacacc 16401676  T
Q  432 taagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattca 510  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16401675 taagaccaattatgtatcaatcaatatcagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattca 16401597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 30 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 15203382 - 15203110
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15203382 atcaacttagagcgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgtaagtcaacaa 15203283  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15203282 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatc-atatata 15203184  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcat 304  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15203183 catataacacttcatcaatcatggataatatcttattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaatcat 15203110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 227 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 15203134 - 15202849
Alignment:
Q  227 atacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacct 326  Q
    |||||||||  | |||||||||||| || || ||| || ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  15203134 atacatatactaattcatcaatcataaataacatcatactcataaacatatacattcatatattaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacct 15203035  T
Q  327 acgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgttt 426  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  15203034 acgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaattcttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacattcatacctacaacttttgtgttt 15202935  T
Q  427 acacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15202934 acacctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcgtttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaatattcact 15202849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 223 - 512
Target Start/End: Original strand, 19896524 - 19896813
Alignment:
Q  223 atatatacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtg 322  Q
    |||||||||||||  | |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  19896524 atatatacatatactaattcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatatcctaattcatcaatcacattcaattattcactgtg 19896623  T
Q  323 acctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgt 422  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||| || ||||||||||| ||||||    
T  19896624 acctacgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcgctagaaagttaaaattcatacctacaattttcgt 19896723  T
Q  423 gtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19896724 gtttacacctaagaccaattctctaccaatcaataccagttttcatttaaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 19896813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 227 - 512
Target Start/End: Original strand, 20403486 - 20403771
Alignment:
Q  227 atacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacct 326  Q
    |||||||||  | |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||    
T  20403486 atacatatactaattcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatatactaattcatcaatcatatttaattattcactgtgacct 20403585  T
Q  327 acgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgttt 426  Q
    ||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  20403586 acgcgcagtaatatgacaataactcaagttctataaatccttttcaagtcaaaccaacgacattagaaagctaacattaatacctacaactttcgtgttt 20403685  T
Q  427 acacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20403686 acacctaagaccaattctgtatcaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaacattcact 20403771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 30 - 304
Target Start/End: Original strand, 19896276 - 19896552
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataa---taatatcaaatgcaagtcaa 126  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  19896276 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacggtatacaaaaacagcatgacataataataatatcaaatgcaagtcaa 19896375  T
Q  127 caacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatctt-aaaacatcaata 225  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||| |||    
T  19896376 caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaaatatc-ata 19896474  T
Q  226 tatacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcat 304  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19896475 tatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatatatacatatactaattcatcaatcat 19896552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 180; E-Value: 8e-97
Query Start/End: Original strand, 30 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 45290846 - 45290573
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaa-ca 128  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||    
T  45290846 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgtaagccaatca 45290747  T
Q  129 acatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatat 228  Q
    || |||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45290746 acgtctcaattattcacatataattcaattaatgcagatacaattatatcacagtataacaacgtcaaataataatcaacatcttaaaacatc-atatat 45290648  T
Q  229 acatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcat 304  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45290647 acatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaatcat 45290573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 230 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 19936850 - 19936580
Alignment:
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||          |||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||    
T  19936850 catataacacttcatcaatcatgaacaatataatattcacaaacatatac----------taattcatcaatcataaacaattattcactgtgacctacg 19936761  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19936760 tgcagtaatttgactatacctcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaatgacattagaaatctaacattcatacctacaactttcgtgtttaca 19936661  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattca 510  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19936660 cctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattca 19936580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 230 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 1326884 - 1326637
Alignment:
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  1326884 catataacacttcatcaatcataaacaatatcgtatttacaaacatgtacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 1326785  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||| || ||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  1326784 tgcagtaatttgaccataactcaagttttataaatcgttttgacgtcagaccaacgacattagaaagataacattcatacctacaactttcgtttttaca 1326685  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 477  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1326684 cttaagaccaattctgtaccaatcaataccagatttcatttcaaattc 1326637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 170; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 313 - 510
Target Start/End: Original strand, 19896807 - 19897004
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19896807 attcactgtgacctacttgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 19896906  T
Q  413 caactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattca 510  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19896907 caactttcgtgtttacacctaagaccaattttgtaccaatcaataccagttttcatttaaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattca 19897004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 167; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 314 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 14397609 - 14397403
Alignment:
Q  314 ttcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctac 413  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  14397609 ttcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctacaaatcattttgaagtcaaaccaacgacattagaaagctaacattcatacctac 14397510  T
Q  414 aactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcacta 513  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  14397509 agctttcgtgtttacacctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaattttcacta 14397410  T
Q  514 agacctc 520  Q
    |||||||    
T  14397409 agacctc 14397403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 167; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 525 - 719
Target Start/End: Complemental strand, 36900518 - 36900324
Alignment:
Q  525 agactcaattacccaccaatgaggcagcctaaacaataaaataaacatattaagcttttaattaaattaaacttctttaaaaatatacaacaaacatagt 624  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  36900518 agactcaattacccaccaatgaggcagcctaaacaataaattaaacatattaagcttttaattaaattaaactttgttaaaattatacaacaaacatagt 36900419  T
Q  625 attataacaacgaactcaccgtaaaggttggacatttccaatatctccttttaggattttcatttaaattagagatgaacatccttatgattttg 719  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36900418 attataacaacgaactcaccgtaaaggttggacattttcaatatctccttttagggttttcatttaaattggagatgaacatccttatgattttg 36900324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 241 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 25658094 - 25657893
Alignment:
Q  241 tcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacgtgcagtaattt 340  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25658094 tcatcaatcatgaacaatatcaaattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtgcagtaattt 25657995  T
Q  341 gaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaa 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  25657994 gaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaacaaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcatgtttacaccaaagaccaa 25657895  T
Q  441 tt 442  Q
    ||    
T  25657894 tt 25657893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 160; E-Value: 7e-85
Query Start/End: Original strand, 313 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 38549681 - 38549482
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||    
T  38549681 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggaattaaaaagctaacatccataccta 38549582  T
Q  413 caactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    |||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38549581 caacttccgtgtttatacctaagatcaattctgtaccaatcaataccagttttcattttaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 38549482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 312 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 15202856 - 15202658
Alignment:
Q  312 tattcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacct 411  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  15202856 tattcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaattcttttgaagtcaaaccaatagcattagaaagctaacatccatacct 15202757  T
Q  412 acaactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattca 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15202756 acaactttcgtgtttacacctaagaccaattctgtaccaatcaatatcagttttcatttcaaattcggacaacgttgtgctgaaattcataaaaattca 15202658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 30 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 19937157 - 19936881
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaa-ca 128  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  19937157 atcaacttggaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataagatcaaatgcaagtcaatca 19937058  T
Q  129 acatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatc--ttaaaacatcaatat 226  Q
    || ||||||||| ||||| || ||||||  |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   | ||||||| ||||    
T  19937057 acgtctcaattactcacaaataattcaatcaatgcacatacagttatatcacaatataacaacatcaaatgataatcaacatcaacttaaacatc-atat 19936959  T
Q  227 atacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatg 305  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19936958 atacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcgc-aacatatacatacatatactaattcatcaatcatg 19936881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 313 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 16401408 - 16401210
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16401408 attcactgtgacctacgtgctgtaatttgaccataactcaagttctataaatctttttgacgtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 16401309  T
Q  413 caactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16401308 caactttcgtgtttacacctaa-accaattctggacctatcaataccagatttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 16401210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 313 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 16401601 - 16401402
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  16401601 attcattgtggcatacgtgctgtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcgttggaaagctaacatccataccta 16401502  T
Q  413 caactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  16401501 caactttcgtgtttacacctaagaccaattacgtaccaatcaataccagtttgcatttcaaattctgacaaagttgtattgaaattcataaacattcact 16401402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 341 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 45290389 - 45290222
Alignment:
Q  341 gaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaa 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45290389 gaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacctaagaccaa 45290290  T
Q  441 ttatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaatt 508  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45290289 ttttgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgaacaaagttgtgctgaaattcataaaaatt 45290222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 227 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 45290597 - 45290385
Alignment:
Q  227 atacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacct 326  Q
    |||||||||  | |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||  | |||||||||||| |||||||||||| | ||| ||    
T  45290597 atacatatactaattcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatataacacttcatcaatcatattcaattattcactatgatct 45290498  T
Q  327 acgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgttt 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45290497 acgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgttt 45290398  T
Q  427 acacctaagacca 439  Q
    |||||||||||||    
T  45290397 acacctaagacca 45290385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 30 - 198
Target Start/End: Original strand, 41598199 - 41598367
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41598199 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttgaataacaacagcaacacagtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 41598298  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 198  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41598299 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaat 41598367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 313 - 477
Target Start/End: Original strand, 20403765 - 20403929
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  20403765 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatccttttgacgtcagaccaacggcattagaaagctaacattcataccta 20403864  T
Q  413 caactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 477  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20403865 caacttttgtgtttacacctaagaccaattatgtagcaatcaataccagttttcatttcaaattc 20403929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 313 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 27472093 - 27471929
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  27472093 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaacgacattagaaagctaacatccataccta 27471994  T
Q  413 caactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 477  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27471993 caactttcgtgtttacacctaagaccaattttgtaccaatcaatatcagttttcatttcaaattc 27471929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 313 - 477
Target Start/End: Original strand, 32122214 - 32122378
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32122214 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacatcagaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 32122313  T
Q  413 caactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 477  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32122314 caactttcgtgtttacacctaagaccaattctataccaatcaataccagttttcatttcaaattc 32122378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 313 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 15202662 - 15202498
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  15202662 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatctttttgacgtcagaccaacggtattagaaagctaacatccataccta 15202563  T
Q  413 caactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 477  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| || | | ||||||||||| |||||||||||||||    
T  15202562 caacttttgtgtttacacctaagaccaattctggatctatcaataccagatttcatttcaaattc 15202498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 142 - 304
Target Start/End: Original strand, 32810054 - 32810214
Alignment:
Q  142 tcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatatacatataaaactt 241  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  32810054 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatc-atatatacatgtaacactt 32810152  T
Q  242 catcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcat 304  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32810153 catcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaatcat 32810214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 324 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 38549478 - 38549325
Alignment:
Q  324 cctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtg 423  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38549478 cctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcataccaacgacattagaaagctaacatccatacatacaactttcgtg 38549379  T
Q  424 tttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 477  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  38549378 tttacacctaagaccaattctgtacctatcaataccagatttcatttcaaattc 38549325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 313 - 477
Target Start/End: Original strand, 15071046 - 15071210
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15071046 attcactgtgacctacgttcagtaatttgaccataactcaagttctataaatctttttgacgtcagaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 15071145  T
Q  413 caactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 477  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  15071146 caactttcgtgtttacccctaagatcaattctttaccgatcaataccagtttttatttcaaattc 15071210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 313 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 16412992 - 16412828
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  16412992 attcactgtgacctacgtatagtaatttgaccataactcaagttctataaatctttttgacatcagaccaacggaattagaaagctaacatccataccta 16412893  T
Q  413 caactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 477  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16412892 caactttcgtgtttacacctaagaccagttctgtaccaatcaataccaattttcatttcaaattc 16412828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 525 - 753
Target Start/End: Original strand, 17706883 - 17707091
Alignment:
Q  525 agactcaattacccaccaatgaggcagcctaaacaataaaataaacatattaagcttttaattaaattaaacttctttaaaaatatacaacaaacatagt 624  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||                
T  17706883 agacttaattacccaccaatgaggcagcctaaacaataaattaaacatattaagcttttaattaaattaaactttgttaaaattatac------------ 17706970  T
Q  625 attataacaacgaactcaccgtaaaggttggacatttccaatatctccttttaggattttcatttaaattagagatgaacatccttatgattttgttgca 724  Q
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  17706971 -------caacgaactcaccgtaaaggttggacatttccaatatcttcttt-agggttttcatttaaattggagatgaacatccttatgattttgttgcg 17707062  T
Q  725 cccacatataagcaattcaattgatgatg 753  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  17707063 cccacatataggtaattcaattgatgatg 17707091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 313 - 477
Target Start/End: Original strand, 19897000 - 19897164
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  19897000 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatctttttgacgtcagaccaacggcattagaaatctaacattcataccta 19897099  T
Q  413 caactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 477  Q
    ||||||| || |||||| |||||||||||| || ||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  19897100 caacttttgtatttacagctaagaccaattttggacctatcaataccagatttcatttcaaattc 19897164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 30 - 198
Target Start/End: Original strand, 26223930 - 26224098
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||| |||| |||||| |||| ||||||||||||| ||| | |||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26223930 atcaacttagatcgacccatgcagcttaattaaataacaacagcaataaagcaatatacaaaaatagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 26224029  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 198  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26224030 catctcaattattcacatataatttaattaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaat 26224098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 35 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 19801527 - 19801367
Alignment:
Q  35 cttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatct 134  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  19801527 cttagaccggctcatgcagcttagttaaataacaatagcaacacaacagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaacgcaagtcaacaacgtct 19801429  T
Q  135 caattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaa 196  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  19801428 caattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattataacacaatataacaacatcaa 19801367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 321 - 477
Target Start/End: Original strand, 24049104 - 24049260
Alignment:
Q  321 tgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttc 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24049104 tgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttttataaatcgttttgacgtcagaccaacgacattagaaagctaacatccatacctataactttc 24049203  T
Q  421 gtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 477  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  24049204 gtgtttacacctaagaccaattctggacctatcaataccatatttcatttcaaattc 24049260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 313 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 19936584 - 19936420
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| | | || |||||||| | ||||||||||| ||||||| |||    
T  19936584 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgagcataactcaagttctataaatcgttttaacgccagaccaacggaattagaaagctaatatccatagcta 19936485  T
Q  413 caactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 477  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  19936484 caactttcatgtttacacctaagaccaattctggacctatcaataccagatttcatttcaaattc 19936420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 30 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 25484419 - 25484245
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| | |       |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25484419 atcaacttagaccaactcgtgcagcttagttaaataacaacagcta-------gtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaaatcaacaa 25484327  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatc 211  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  25484326 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataataacatcaaatcataatcaacatc 25484245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 23 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 16092456 - 16092297
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaa 121  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16092456 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 16092357  T
Q  122 gtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcaca 181  Q
    |||||||||||||||| ||| ||   || ||| ||||||||| ||||  |||||||||||    
T  16092356 gtcaacaacatctcaaatatacattcataatttaagtaatgcgtataacattatatcaca 16092297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 18818523 - 18818348
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaa 121  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||    
T  18818523 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaa 18818424  T
Q  122 gtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa-caacatcaa 196  Q
    ||||||| ||||| || ||||||  |||  ||||||||||||| |||  |||||||||||| |||| |||||||||    
T  18818423 gtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacaacataatcaacatcaa 18818348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 181
Target Start/End: Original strand, 6759265 - 6759421
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaa 121  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  6759265 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 6759364  T
Q  122 gtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcaca 181  Q
    ||   ||||||||||||||| |||  || |||||| |||||| ||||  |||||||||||    
T  6759365 gt---caacatctcaattatacactcataattcaattaatgcgtataacattatatcaca 6759421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 23 - 169
Target Start/End: Original strand, 7372785 - 7372932
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaa 121  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  7372785 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaa 7372884  T
Q  122 gtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatat 169  Q
    ||||||| ||||| || ||||||  |||  |||||||||||| |||||    
T  7372885 gtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcttatat 7372932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 23 - 181
Target Start/End: Original strand, 20536215 - 20536374
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaa 121  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  20536215 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagaaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaa 20536314  T
Q  122 gtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcaca 181  Q
     ||| |||||||| || |||||| ||||  ||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  20536315 ttcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcaca 20536374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 23 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 28649158 - 28648999
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaa 121  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| || |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28649158 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaaagcaacataggcagtatacgaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 28649059  T
Q  122 gtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcaca 181  Q
    ||||||||||||| |||||| ||   || ||||||||||||  ||||  |||||||||||    
T  28649058 gtcaacaacatcttaattatacattcataattcaagtaatgtgtataacattatatcaca 28648999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 335 - 477
Target Start/End: Original strand, 11361024 - 11361166
Alignment:
Q  335 taatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaa 434  Q
    |||||| || |||||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||| | | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  11361024 taatttaactataacttaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaacagtattagaaagctaacatccatacctacaagttttgtgtttacacctaa 11361123  T
Q  435 gaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 477  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  11361124 gaccaattatgcacctatcaatactagatttcatttcaaattc 11361166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 23 - 161
Target Start/End: Original strand, 26219721 - 26219858
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaag 122  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  26219721 catcataatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacagcagtatacaaaat-agtatgacataataatatcaaatgcaag 26219819  T
Q  123 tcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaat 161  Q
    ||||||||||||||| ||| ||   || |||||||||||    
T  26219820 tcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat 26219858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 202 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 38550090 - 38549989
Alignment:
Q  202 aatcaacatcttaaaacatcaatatatacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaat 301  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38550090 aatcaacatcttaaaacatca-tatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacgtatactaattcatcaat 38549992  T
Q  302 cat 304  Q
    |||    
T  38549991 cat 38549989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 202 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 20982710 - 20982605
Alignment:
Q  202 aatcaacatcttaaaacatca---atatatacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatc 298  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20982710 aatcaacatcttaaaacatcatatatatatatatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatc 20982611  T
Q  299 aatcat 304  Q
    ||||||    
T  20982610 aatcat 20982605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 21919114 - 21918969
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaa 121  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  21919114 catcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaa 21919015  T
Q  122 gtcaacaacatctcaattattcacat-atgattcaagtaatgcata 166  Q
     |||||||||||| || |||||| || ||  |||||||||||||||    
T  21919014 ttcaacaacatcttaaatattcaaataattcttcaagtaatgcata 21918969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 23 - 181
Target Start/End: Original strand, 22875072 - 22875230
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaa 121  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| || || |||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  22875072 catcttcatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaatagcagcagcaacacaggcagtatacaaaa-caacatgacataataatatcaaatgcaa 22875170  T
Q  122 gtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcaca 181  Q
    |||||||||||||||| ||| ||   || ||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  22875171 gtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcaca 22875230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 23 - 182
Target Start/End: Original strand, 23406386 - 23406548
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaa 121  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  23406386 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaa 23406485  T
Q  122 gtcaac--aacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaa 182  Q
    ||||||  | ||||| || ||||||  |||  ||||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  23406486 gtcaacatatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacaa 23406548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 23 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 21924042 - 21923900
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaa 121  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||| |||||    
T  21924042 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtctacaaaaacaacatgacatgataatatcaattgcaa 21923943  T
Q  122 gtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgca 164  Q
    ||||||||||||| || ||||||  |||  |||||||||||||    
T  21923942 gtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgca 21923900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 23 - 181
Target Start/End: Original strand, 22626743 - 22626901
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaa 121  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| |||    
T  22626743 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacaacatgacataataatatcaaatacaa 22626841  T
Q  122 gtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcaca 181  Q
     |||||||||||| || ||||||  |||  |||||||||||  ||||  |||||||||||    
T  22626842 atcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgtgtataacattatatcaca 22626901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 30 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 26225398 - 26225292
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26225398 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaacaatatac-aaaacagtatgacataataatatcaaatacaagtcaacaa 26225300  T
Q  130 catctcaa 137  Q
    ||||||||    
T  26225299 catctcaa 26225292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 230 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 13425411 - 13425337
Alignment:
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcat 304  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13425411 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcat 13425337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 230 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 20982573 - 20982499
Alignment:
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcat 304  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20982573 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcat 20982499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 18879345 - 18879191
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaa 121  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||     ||||||||||||||| |||||    
T  18879345 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaaca-----acataataatatcaattgcaa 18879251  T
Q  122 gtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcaca 181  Q
     ||| |||||||| || |||||| ||||  ||||||||||||  |||  |||||||||||    
T  18879250 ttcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgctcataacattatatcaca 18879191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 182 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 1327042 - 1326916
Alignment:
Q  182 atataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatca-----atatatacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacata 276  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||      | ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  1327042 atataacaacatcaaataataatcaacatctcaaaacatcgtatatacatatatatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacata 1326944  T
Q  277 tacatacatatactaattcatcaatcat 304  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1326943 tacatacatataccaattcatcaatcat 1326916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 34 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 13508188 - 13508022
Alignment:
Q  34 acttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa-caacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaaca 131  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| || ||||| || || ||| || || ||  |||| ||||||||||| || |||||| |||||||    
T  13508188 acttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcaatatgcacaa-catcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaaca 13508090  T
Q  132 tctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaaat 198  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  13508089 tctcaaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaat 13508022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 34 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 13597720 - 13597554
Alignment:
Q  34 acttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa-caacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaaca 131  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| || ||||| | |||| || ||||| ||  |||| ||||||||||| || |||||| |||||||    
T  13597720 acttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataagcagaatgcaaaa-catcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaaca 13597622  T
Q  132 tctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaaat 198  Q
    || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  13597621 tcccaaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaat 13597554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 35 - 198
Target Start/End: Original strand, 20498581 - 20498746
Alignment:
Q  35 cttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa-caacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacat 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||| || ||||||  ||||  || |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  20498581 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgtaaaat-agcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 20498679  T
Q  133 ctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaaat 198  Q
    |||||  ||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  20498680 ctcaaacattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaat 20498746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 230 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 13425305 - 13425241
Alignment:
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatt 294  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13425305 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatt 13425241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 393 - 477
Target Start/End: Original strand, 32810269 - 32810353
Alignment:
Q  393 aaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 477  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||  || |||||||||||||||    
T  32810269 aaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattctggacctatcaatattagatttcatttcaaattc 32810353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 34 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 17612213 - 17612059
Alignment:
Q  34 acttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa-caacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaaca 131  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| || |||||| ||||| ||  |||| |||||||||||  | | |||| |||||||    
T  17612213 acttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcaacaacataggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatcgcacgtaagtaaacaaca 17612115  T
Q  132 tctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa 187  Q
    |||||| || |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  17612114 tctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataa 17612059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 193 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 16402020 - 16401909
Alignment:
Q  193 tcaaatggtaatcaacatct--taaaacatcaatatatacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatact 290  Q
    ||||||| |||||||||||   | |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  16402020 tcaaatgataatcaacatcaacttaaacatca-tatatacatataacatttcatcaatcatggacaatatcgtattcgcaa-catatacatacatatact 16401923  T
Q  291 aattcatcaatcat 304  Q
    ||||||||||||||    
T  16401922 aattcatcaatcat 16401909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 23 - 166
Target Start/End: Original strand, 31971264 - 31971407
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaa 121  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||| | |||    
T  31971264 catcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacaacatgacataataatatcaattccaa 31971362  T
Q  122 gtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcata 166  Q
     ||| |||||||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  31971363 ttcatcaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 31971407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 333 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 24717820 - 24717722
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacc 431  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| |||| |||||| |||||||   |||||| ||||||| ||||||||||    
T  24717820 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggacgtcaaaccaaaggcattagaaatctaacataattacctaaaactttcatgtttacacc 24717722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 333 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 15320098 - 15319989
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacct 432  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| | || ||||||||||||||   || ||| ||||||| ||||||||||     
T  15320098 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggacgtcaaaccaaagccattagaaagctaacatagttatctaaaactttcatgtttacacca 15319999  T
Q  433 aagaccaatt 442  Q
    ||| ||||||    
T  15319998 aaggccaatt 15319989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 333 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 15500467 - 15500358
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacct 432  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| | || ||||||||||||||   || ||| ||||||| ||||||||||     
T  15500467 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggacgtcaaaccaaagccattagaaagctaacatagttatctaaaactttcatgtttacacca 15500368  T
Q  433 aagaccaatt 442  Q
    ||| ||||||    
T  15500367 aaggccaatt 15500358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 30 - 137
Target Start/End: Original strand, 21285611 - 21285719
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 127  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||||||  |||| |||| |||||||||||||| |||||    
T  21285611 atcaacttagaccgactcatgcagctttgttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaaatcaac 21285709  T
Q  128 aacatctcaa 137  Q
    ||||||||||    
T  21285710 aacatctcaa 21285719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 313 - 431
Target Start/End: Original strand, 1484887 - 1485005
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    | | |||||||||| |||||||||| ||| || | |||||||||||    || |||    
T  1484887 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcataaaccaaaaatcattttcaagtcaaaccgacgccactggaaagctaacacaattatcta 1484986  T
Q  413 caactttcgtgtttacacc 431  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  1484987 caactttcatgtttacacc 1485005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 333 - 402
Target Start/End: Original strand, 29759429 - 29759498
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaaca 402  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | || |||||||||||||    
T  29759429 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggaagtcaaaccaaagccattagaaagctaaca 29759498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 18678209 - 18678094
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 128  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || || | ||||  ||||  ||||| | ||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  18678209 atcaacttagactgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagattacatcaacagcaagacataaaaatatcaattgcaattcaaca 18678110  T
Q  129 acatctcaattattca 144  Q
    |||||| || ||||||    
T  18678109 acatcttaaatattca 18678094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 230 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 18815683 - 18815608
Alignment:
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatg 305  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||    
T  18815683 catataatacttcatcaatcatgaacaacatcatattcatcaacatatacattcacataataattcatcaatcatg 18815608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 230 - 301
Target Start/End: Original strand, 21513636 - 21513707
Alignment:
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaat 301  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  21513636 catataatacttcatcaatcatgaacaacatcatattcatcaacatatacattcatataataattcatcaat 21513707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 137
Target Start/End: Original strand, 21673712 - 21673826
Alignment:
Q  24 atcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| | ||| ||| | ||| ||  |||| |||| |||||| |||||||    
T  21673712 atcatcatcaacttagaccgactcatgcatcatagttaaataacaaacaacaacataggcattatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 21673810  T
Q  122 gtcaacaacatctcaa 137  Q
     |||||||||||||||    
T  21673811 atcaacaacatctcaa 21673826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 23648567 - 23648682
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 128  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||||| | ||||  ||||| ||||  |||||||||||||||||  |||||  |||||    
T  23648567 atcaacttagactgactcatgcaacttagttaattaacaatagcaacataggcagattacaacaacaacatgacataataatatcatttgcaatacaaca 23648666  T
Q  129 acatctcaattattca 144  Q
    |||||| || ||||||    
T  23648667 acatcttaaatattca 23648682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 313 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 5852969 - 5852851
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    | | |||||||||| |||||||||| ||| || |  ||||||||||    || |||    
T  5852969 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcataaaccaaaaatcattttcaagtcaaaccgacgccactgtaaagctaacacaattatcta 5852870  T
Q  413 caactttcgtgtttacacc 431  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  5852869 caactttcatgtttacacc 5852851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 313 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 14409121 - 14409003
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    | | |||||||||| |||||||||| ||| || |  ||||||||||    || |||    
T  14409121 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcataaaccaaaaatcattttcaagtcaaaccgacgccactgtaaagctaacacaattatcta 14409022  T
Q  413 caactttcgtgtttacacc 431  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  14409021 caactttcatgtttacacc 14409003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 313 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 20045872 - 20045758
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    | | |||||||||| |||||||||| ||| || | |||||||||||    || |||    
T  20045872 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcataaaccaaaaatcattttcaagtcaaaccgacgccactggaaagctaacacaattatcta 20045773  T
Q  413 caactttcgtgttta 427  Q
    |||||||| ||||||    
T  20045772 caactttcatgttta 20045758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 333 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 22007195 - 22007097
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacc 431  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||| || |||||||||||||    || ||| ||||||| ||||||||||    
T  22007195 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggacctcaaaccaacgccattagaaagctaacaaaattatctataactttcatgtttacacc 22007097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 38855358 - 38855212
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 127  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| | ||||||| | ||| ||  |||| |||| |||||| ||||||| |||||    
T  38855358 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaac 38855260  T
Q  128 aacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatat 177  Q
    |||||||||| |||  |||||  |||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  38855259 aacatctcaaatatcaacata--attcatataatgtatatacaattatat 38855212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 45131098 - 45131019
Alignment:
Q  35 cttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaa 115  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | |||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  45131098 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtaaac--aaacagcatgacataataatatcaa 45131019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 333 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 13663198 - 13663129
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaaca 402  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||| || |||||||||||||    
T  13663198 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggacctcaaaccaacgccattagaaagctaaca 13663129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 333 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 17150725 - 17150628
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacac 430  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| | || ||||||||||||||   || || |||||||| |||||||||    
T  17150725 agtaatttaatcataactcaagttctaaaaatcatttggaagtccaaccaaagccattagaaagctaacataattatctgcaactttcatgtttacac 17150628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 198
Target Start/End: Original strand, 37116432 - 37116532
Alignment:
Q  98 atgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaata-taacaacatcaa 196  Q
    |||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||  | ||| |||| ||||| |||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||    
T  37116432 atgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaaca-tcatatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaa 37116530  T
Q  197 at 198  Q
    ||    
T  37116531 at 37116532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 21389552 - 21389454
Alignment:
Q  35 cttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacat 132  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | | |||||||   ||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||    
T  21389552 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggtagtatac---aacagcatgacataattatatcaaattcaattcatcaacat 21389456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 21396082 - 21395984
Alignment:
Q  35 cttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacat 132  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | |||||||||   ||||| |||| ||||| ||||||||| ||| ||| ||||||    
T  21396082 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatac---aacagcatgagataattatatcaaattcaattcatcaacat 21395986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 333 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 21493137 - 21493050
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttc 420  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  21493137 agtattttgatcataactcaagttctataaatctaaatgaagtccaaccaatggcaaatgaaagctaacatccatatcttcaactttc 21493050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 21778878 - 21778780
Alignment:
Q  35 cttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacat 132  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | | |||||||   ||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||    
T  21778878 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggtagtatac---aacagcatgacataattatatcaaattcaattcatcaacat 21778782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 21790575 - 21790477
Alignment:
Q  35 cttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacat 132  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | |||||||||   ||||| |||| ||||| ||||||||| ||| ||| ||||||    
T  21790575 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatac---aacagcatgagataattatatcaaattcaattcatcaacat 21790479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 26355812 - 26355757
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacaacaaca 77  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||    
T  26355812 catcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaaca 26355757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 32121746 - 32121861
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 128  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | || || | ||||  ||||  ||||| | ||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  32121746 atcaacttagaatgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagattacatcaacagcaagacataaaaatatcaattgcaattcaaca 32121845  T
Q  129 acatctcaattattca 144  Q
    |||||| || ||||||    
T  32121846 acatcttaaatattca 32121861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 230 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 36733376 - 36733301
Alignment:
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatg 305  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||  ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||    
T  36733376 catataatacttcatcaatcatgaaaaacatcatattcatcaacatatacattcatataataaatcatcaatcatg 36733301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 230 - 305
Target Start/End: Original strand, 38988730 - 38988805
Alignment:
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatg 305  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||  ||| ||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  38988730 catataataattcatcaatcatgaacatcatcatattcatcaacatatacattcatataataattcatcaatcatg 38988805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #112
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 230 - 305
Target Start/End: Original strand, 39019827 - 39019902
Alignment:
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatg 305  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||  ||| ||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  39019827 catataataattcatcaatcatgaacatcatcatattcatcaacatatacattcatataataattcatcaatcatg 39019902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #113
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 23760958 - 23760912
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa 69  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23760958 catcatcttcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 23760912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #114
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 333 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 223414 - 223305
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacct 432  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||| | || ||||||||||| |    || ||||||||||| ||||||||||     
T  223414 agtaatttaatcatatctcaagttctaaaaatcatttggacgtcaaaccaaggccattagaaagctaataaaattatctacaactttcatgtttacacca 223315  T
Q  433 aagaccaatt 442  Q
    ||| ||||||    
T  223314 aagtccaatt 223305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #115
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 333 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 272273 - 272164
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacct 432  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||  | ||||||||| || |||||||||||||    || ||| ||||||| ||||||||||     
T  272273 agtaatttgatcataactcgagttctaaaaatcatttggacctgaaaccaacgccattagaaagctaacaaaattatctaaaactttcatgtttacacca 272174  T
Q  433 aagaccaatt 442  Q
    ||| ||||||    
T  272173 aaggccaatt 272164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #116
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 333 - 442
Target Start/End: Original strand, 643576 - 643685
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacct 432  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||  | ||||||||| || |||||||||||||    || ||| ||||||| ||||||||||     
T  643576 agtaatttgatcataactcgagttctaaaaatcatttggacctgaaaccaacgccattagaaagctaacaaaattatctaaaactttcatgtttacacca 643675  T
Q  433 aagaccaatt 442  Q
    ||| ||||||    
T  643676 aaggccaatt 643685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #117
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 333 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 688185 - 688076
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacct 432  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||| | || ||||||||||| |    || ||||||||||| ||||||||||     
T  688185 agtaatttaatcatatctcaagttctaaaaatcatttggacgtcaaaccaaggccattagaaagctaataaaattatctacaactttcatgtttacacca 688086  T
Q  433 aagaccaatt 442  Q
    ||| ||||||    
T  688085 aagtccaatt 688076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #118
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 333 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 737037 - 736928
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacct 432  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||| | || ||||||||||| |    || ||||||||||| ||||||||||     
T  737037 agtaatttaatcatatctcaagttctaaaaatcatttggacgtcaaaccaaggccattagaaagctaataaaattatctacaactttcatgtttacacca 736938  T
Q  433 aagaccaatt 442  Q
    ||| ||||||    
T  736937 aagtccaatt 736928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #119
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 333 - 442
Target Start/End: Original strand, 829382 - 829491
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacct 432  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||  | ||||||||| || |||||||||||||    || ||| ||||||| ||||||||||     
T  829382 agtaatttgatcataactcgagttctaaaaatcatttggacctgaaaccaacgccattagaaagctaacaaaattatctaaaactttcatgtttacacca 829481  T
Q  433 aagaccaatt 442  Q
    ||| ||||||    
T  829482 aaggccaatt 829491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #120
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 333 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 860932 - 860823
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacct 432  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||| | || ||||||||||| |    || ||||||||||| ||||||||||     
T  860932 agtaatttaatcatatctcaagttctaaaaatcatttggacgtcaaaccaaggccattagaaagctaataaaattatctacaactttcatgtttacacca 860833  T
Q  433 aagaccaatt 442  Q
    ||| ||||||    
T  860832 aagtccaatt 860823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #121
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 133
Target Start/End: Original strand, 6520382 - 6520486
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 127  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| | ||||||| | ||| ||  |||| |||| |||||| ||||||||||| |    
T  6520382 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatc 6520480  T
Q  128 aacatc 133  Q
    ||||||    
T  6520481 aacatc 6520486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #122
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 98 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 17267030 - 17266930
Alignment:
Q  98 atgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaata-taacaacatcaa 196  Q
    |||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||  | ||| |||| ||||  |||||||||||| | |||||||||| || ||||||||||||    
T  17267030 atgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaaca-tcatatataattcttgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaa 17266932  T
Q  197 at 198  Q
    ||    
T  17266931 at 17266930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #123
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 333 - 402
Target Start/End: Original strand, 18611952 - 18612021
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaaca 402  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| | ||| ||||| ||||||    
T  18611952 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggacgtcaaaccaaagccaaaagaaatctaaca 18612021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #124
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 333 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 22089482 - 22089373
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacct 432  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  | ||||||| || |||||||||| | || ||||||||||||||   || ||| ||||||| |||||| |||     
T  22089482 agtaatttgatcataactcaagttcttaatatcatttggacgtcaaaccaaagccattagaaagctaacataattatctaaaactttcatgtttaaacca 22089383  T
Q  433 aagaccaatt 442  Q
    ||| ||||||    
T  22089382 aaggccaatt 22089373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #125
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 333 - 402
Target Start/End: Original strand, 22146977 - 22147046
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaaca 402  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| || |||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  22146977 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaattatttggacgtcaaaccaaagccaaaagaaagctaaca 22147046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #126
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 333 - 429
Target Start/End: Original strand, 39114415 - 39114511
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| | || |||||| |||||||   || ||| ||||||| ||||||||    
T  39114415 agtaatctgatcataactcaagttctaaaaatcatttggatgtcaaaccaaagccattagaaaactaacataattatctaaaactttcatgtttaca 39114511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #127
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 230 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 5083068 - 5083001
Alignment:
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcat 297  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  5083068 catataataattcatcaatcatgaacaacatcatattcatcaacatatacattcatataataattcat 5083001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #128
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 98 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 17439543 - 17439461
Alignment:
Q  98 atgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcaca 181  Q
    |||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||  | ||| |||| ||||| |||||||||||| || |||||||||    
T  17439543 atgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaaca-tcatatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcaca 17439461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #129
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 983512 - 983474
Alignment:
Q  31 tcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa 69  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  983512 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 983474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #130
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 313 - 431
Target Start/End: Original strand, 14824260 - 14824378
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    | | |||| ||||| |||||||||| ||| || |  ||||||||||    || |||    
T  14824260 attcactgtgacctacgtgcaataatttgaccataactcataaaccaaaaataattttcaagtcaaaccgacgccactgtaaagctaacacaattatcta 14824359  T
Q  413 caactttcgtgtttacacc 431  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  14824360 caactttcatgtttacacc 14824378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #131
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 16199746 - 16199615
Alignment:
Q  35 cttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa-caacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacat 132  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| || |||||| ||||  ||  |||||||||||||||||| | ||| ||| | ||||    
T  16199746 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtattcaaa--caacatgacataataatatcaatttcaattcatctacat 16199649  T
Q  133 ctcaattattcacatatgattcaagtaatgcata 166  Q
    || |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  16199648 cttaggtatacaaatattcttcaagtaatgcata 16199615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #132
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 69
Target Start/End: Original strand, 17140923 - 17140969
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa 69  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17140923 catcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 17140969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #133
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 227 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 19936906 - 19936828
Alignment:
Q  227 atacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatg 305  Q
    |||||||||  | |||||||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||  | |||||||||||||    
T  19936906 atacatatactaattcatcaatcatgaacaacatcatactcataaacatatacattcatataacacttcatcaatcatg 19936828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #134
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 69
Target Start/End: Original strand, 21491002 - 21491048
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa 69  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21491002 catcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 21491048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #135
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 240 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 38550000 - 38549935
Alignment:
Q  240 ttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatg 305  Q
    |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||    
T  38550000 ttcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatataaaaattcatcaatcatg 38549935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #136
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 313 - 352
Target Start/End: Original strand, 4483765 - 4483804
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactca 352  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4483765 attcactgtgacctacatgcagtaatttgaccataactca 4483804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #137
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 66
Target Start/End: Original strand, 21249391 - 21249434
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataa 66  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21249391 catcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa 21249434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #138
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 66
Target Start/End: Original strand, 21255229 - 21255272
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataa 66  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21255229 catcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa 21255272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #139
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 35 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 5866376 - 5866342
Alignment:
Q  35 cttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa 69  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5866376 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 5866342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #140
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 227 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 13425361 - 13425283
Alignment:
Q  227 atacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatg 305  Q
    |||||||||  | |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||  | |||||||||||||    
T  13425361 atacatatactaattcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatataacacttcatcaatcatg 13425283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #141
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 227 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 20982629 - 20982551
Alignment:
Q  227 atacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatg 305  Q
    |||||||||  | |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||  | |||||||||||||    
T  20982629 atacatatactaattcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatataacacttcatcaatcatg 20982551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #142
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 361 - 431
Target Start/End: Original strand, 39364118 - 39364188
Alignment:
Q  361 aaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacc 431  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||    || ||||||||||| ||||||||||    
T  39364118 aaatcattttcaagtcaaaccaacgccattggaaagctaacaaaattatctacaactttcatgtttacacc 39364188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #143
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 361 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 44522884 - 44522814
Alignment:
Q  361 aaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacc 431  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||    || ||||||||||| ||||||||||    
T  44522884 aaatcattttcaagtcaaaccaacgccattggaaagctaacaaaattatctacaactttcatgtttacacc 44522814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #144
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 361 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 4381251 - 4381170
Alignment:
Q  361 aaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 442  Q
    |||||||||| ||||||||| || | || |||||||||||||    || ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  4381251 aaatcattttcaagtcaaactaaagccactagaaagctaacacaattatctacaactttcatgtttacaccaaaggccaatt 4381170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #145
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 240 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 13425454 - 13425389
Alignment:
Q  240 ttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatg 305  Q
    |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||  | |||||||||||||    
T  13425454 ttcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatataacacttcatcaatcatg 13425389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #146
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 333 - 402
Target Start/End: Original strand, 18618830 - 18618899
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaaca 402  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||| || | |||||||| | || |||||||||||||    
T  18618830 agtaatttaatcatatctcaagttctaaaaatcatttggacggcaaaccaaagccattagaaagctaaca 18618899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #147
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 361 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 22258762 - 22258681
Alignment:
Q  361 aaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 442  Q
    |||||||||| |||||||||||| | || | |||||||||||    || ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  22258762 aaatcattttcaagtcaaaccaaagccactggaaagctaacacaattatctacaactttcatgtttacaccaaaggccaatt 22258681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #148
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 227 - 292
Target Start/End: Original strand, 32810190 - 32810255
Alignment:
Q  227 atacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaa 292  Q
    |||||||||  | |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||||||    
T  32810190 atacatatactaattcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatatactaa 32810255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #149
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 361 - 442
Target Start/End: Original strand, 44477018 - 44477099
Alignment:
Q  361 aaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 442  Q
    |||||||||| |||||||||||| | || | |||||||||||    || ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  44477018 aaatcattttaaagtcaaaccaaagccattggaaagctaacaaaattatctacaactttcatgtttacaccaaaggccaatt 44477099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #150
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 361 - 442
Target Start/End: Original strand, 44480280 - 44480361
Alignment:
Q  361 aaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 442  Q
    |||||||||| |||||||||||| | || | |||||||||||    || ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  44480280 aaatcattttaaagtcaaaccaaagccattggaaagctaacaaaattatctacaactttcatgtttacaccaaaggccaatt 44480361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 419; Significance: 0; HSPs: 133)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 419; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 30676861 - 30676380
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30676861 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgatataataatatcaaatgcaagtcaacaa 30676762  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30676761 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatca-tatata 30676663  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  30676662 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 30676563  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30676562 tgaagtaattttaccataactcaagttctataaattattttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 30676463  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30676462 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 30676380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 391; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 520
Target Start/End: Original strand, 33861805 - 33862293
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33861805 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 33861904  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33861905 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca-tatata 33862003  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  33862004 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 33862102  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  33862103 tgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatacctacaactttcgtgtttaca 33862202  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 520  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33862203 cctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 33862293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 387; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 520
Target Start/End: Original strand, 12742328 - 12742817
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12742328 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 12742427  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12742428 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca-tatata 12742526  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||     
T  12742527 catataacacttcatcaatcatggacaaggtcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctact 12742626  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  12742627 tgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatacctacaactttcgtgtttaca 12742726  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 520  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12742727 cctaagaccaattctataccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 12742817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 384; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 477
Target Start/End: Original strand, 34963384 - 34963830
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34963384 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 34963483  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34963484 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatca-tatata 34963582  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |    
T  34963583 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgatctatg 34963682  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34963683 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacgacattagaaagctaacatccatacctacaactttcatgtttaca 34963782  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 477  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34963783 cctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 34963830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 383; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 512
Target Start/End: Original strand, 8055040 - 8055521
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8055040 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaaaagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 8055139  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8055140 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca-tatata 8055238  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||     
T  8055239 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcataatcaattattcattgtgacctaca 8055338  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  8055339 ttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatttatacctacaactttcgtgtttaca 8055438  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8055439 cctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggataaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 8055521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 383; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 512
Target Start/End: Original strand, 24422558 - 24423038
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24422558 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 24422657  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24422658 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca-tatata 24422756  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  24422757 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 24422855  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  24422856 tgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatacctacaactttcgtgtttaca 24422955  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24422956 cctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 24423038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 383; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 512
Target Start/End: Original strand, 33864289 - 33864769
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33864289 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 33864388  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33864389 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca-tatata 33864487  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  33864488 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 33864586  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  33864587 tgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatacctacaactttcgtgtttaca 33864686  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33864687 cctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 33864769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 18334743 - 18334263
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18334743 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 18334644  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18334643 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca-tatata 18334545  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  18334544 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 18334446  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  18334445 tgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatacctacaactttcgtgtttaca 18334346  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18334345 cctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 18334263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 1541062 - 1540574
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1541062 atcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagtatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 1540963  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1540962 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattacatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca-tatata 1540864  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  1540863 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 1540765  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  1540764 tgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatacctacaactttcgtgtttaca 1540665  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 520  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1540664 cctaagaccaattctataccaatcaataccagtttgcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 1540574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 371; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 26924791 - 26924315
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26924791 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaatagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 26924692  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  26924691 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca-tatgta 26924593  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| ||||    
T  26924592 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactatgacgtacg 26924494  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26924493 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 26924394  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaatt 508  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26924393 cctaagaacaattctgtaccaatcaatactagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaatt 26924315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 363; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 2291331 - 2290851
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2291331 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 2291232  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2291231 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca-tatata 2291133  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  2291132 catataacacttcatcagtcatggacaatatcgtattcacaa-catatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 2291034  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  2291033 tgcagtaatttgactataactctagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatatctacaactttcgtgtttaca 2290934  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2290933 cctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 2290851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 19859070 - 19858589
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19859070 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 19858971  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||    
T  19858970 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataacaatcaacatcttaaaacatc-atatata 19858872  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |    
T  19858871 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-agcatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctatg 19858773  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||   |||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  19858772 tgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaag---acattcatacctacaacttttgtgtttaca 19858676  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaaga 516  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19858675 cctaagatcaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaaga 19858589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 512
Target Start/End: Original strand, 22782238 - 22782718
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22782238 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 22782337  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22782338 cgtctcaattattcacacataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaatcataatcaacatcttaaaacatca-tatata 22782436  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |    
T  22782437 catataacacttcatcaatcatggacaatatcatattcacaa-catatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctatg 22782535  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |  |||||    
T  22782536 tgcagtaatttgaccataactcaaattctataaattcttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacattcatacctacaactttcctacttaca 22782635  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22782636 cctaagaccaattctgtaccaattaataccatttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 22782718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 519
Target Start/End: Original strand, 25688513 - 25689001
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25688513 atcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaactgcaagtcaacaa 25688612  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  25688613 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatacatatataatcatatcacaatataacaacaccaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatt-tata 25688711  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  25688712 catataacacttcctcaatcatggacaatatcgtattcacaaaaatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtcacctacg 25688811  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25688812 tgcagtaatttgaccataactcaatttttataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattacaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 25688911  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacct 519  Q
     ||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25688912 gctaagaccaattcggtaccaataaataccagttttgatttcaaattcggataaagttgtgctgaaattcataaaaattcactatgacct 25689001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 30 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 19848102 - 19847642
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 128  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || || || |||  ||||  ||||| |  |||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  19848102 atcaacttagactgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagattacatcaacagcaacacataaaaatatcaattgcaattcaaca 19848003  T
Q  129 acatctcaattatt-cacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatata 227  Q
    | |||| || |||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||                   ||||| ||||    
T  19848002 atatcttaaatatttcacatataattcaaataatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaat-------------------catca-tata 19847923  T
Q  228 tacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgaccta 327  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  19847922 tacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgaccta 19847823  T
Q  328 cgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgttta 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||     |||||||||||||||||||||||    
T  19847822 cgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaatcta----gcatacctacaactttcgtgttta 19847727  T
Q  428 cacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19847726 cacctaagaccaattttgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 19847642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 182 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 28289334 - 28288999
Alignment:
Q  182 atataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatatacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacat 281  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||   ||||||| ||||||||    
T  28289334 atataacgacatcaaatggtaattaacatcttaaaacatca-tatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgc--tcacaaatatatacat 28289238  T
Q  282 acatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaacc 381  Q
    ||||||| |||||||||||||||   ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28289237 acatatattaattcatcaatcataaacaattcttcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaacc 28289138  T
Q  382 aacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagac 481  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28289137 aacgacattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacctgagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattctgac 28289038  T
Q  482 aaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 520  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28289037 aaagttgtgctaaaattcataaaaattcactaagacctc 28288999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 229 - 512
Target Start/End: Original strand, 1598266 - 1598548
Alignment:
Q  229 acatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctac 328  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  1598266 acatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctac 1598364  T
Q  329 gtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttac 428  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1598365 gtgcagtaatttgactatgactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttac 1598464  T
Q  429 acctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1598465 acctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 1598548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 181 - 520
Target Start/End: Original strand, 12942363 - 12942689
Alignment:
Q  181 aatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatatacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatataca 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  12942363 aatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatca-tatatacatataacacttcatcaatcattgacaatatcgtattcacaaatatataca 12942461  T
Q  281 tacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaac 380  Q
    |||||||| |||||||||||||||   ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12942462 tacatatattaattcatcaatcataaacaattcttcactgtgacctacgtgcagtaattcgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaac 12942561  T
Q  381 caacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcaga 480  Q
    ||||| || |||||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12942562 caacgacattagaaagct------------tacaactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattctga 12942649  T
Q  481 caaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 520  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12942650 caaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 12942689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 230 - 508
Target Start/End: Original strand, 18914142 - 18914420
Alignment:
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||    
T  18914142 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtatttacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactatgacctacg 18914241  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18914242 tgcagtaatttgaccataactcaagttctatacatccttttgaagttaaaccaacagcattagaaagttaacatccatacctacaactttcgtgtttacc 18914341  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaatt 508  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18914342 cctaagaccaattatgtaccaataaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaatt 18914420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 230 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 31630493 - 31630214
Alignment:
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  31630493 catataacactttatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatatttaattattcattgtgacatacg 31630394  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||    
T  31630393 tgcaataatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaactaacggcattagaaagctaacgtctatacctacaaatttcgtgtttaca 31630294  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattc 509  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31630293 cctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaaattgtgctgaaattcataaaaattc 31630214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 30 - 304
Target Start/End: Original strand, 19005057 - 19005329
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19005057 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 19005156  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19005157 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatc-atatata 19005255  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcat 304  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19005256 catataacatttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaatcat 19005329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 230 - 512
Target Start/End: Original strand, 19005361 - 19005643
Alignment:
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| | ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||     
T  19005361 catataacatttcatcaattatgaacaatatcgcattcacaaacatatacatacctatagtaattcatcaatcatattcaattattcactatgacctaca 19005460  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  19005461 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacgacattagaaagctaacatccatacctacaatttttgtgtttaca 19005560  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19005561 cctaagactaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagatgtgctgaaattcataaaaattcact 19005643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 203 - 477
Target Start/End: Original strand, 23992604 - 23992879
Alignment:
Q  203 atcaacatcttaaaacatca--atatatacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23992604 atcaacatcttaaaacatcatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacatacatatactaattcatcaa 23992702  T
Q  301 tcatgttcaattattcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaa 400  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||  || ||||||||| |    
T  23992703 tcatattcaattattcattgtgacctacgtgcagtaaattgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaacaacattagaaagctga 23992802  T
Q  401 catccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 477  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| | |||||||||||||||    
T  23992803 catccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattctggacctatcaataccggatttcatttcaaattc 23992879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 223 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 17377807 - 17377576
Alignment:
Q  223 atatatacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtg 322  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  17377807 atatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatagtattcacaaacatatacatacatatactatttcatcaatcatattcaattattcactgtg 17377708  T
Q  323 acctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgt 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17377707 acctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatacttttgaagtcaaaccaatggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgt 17377608  T
Q  423 gtttacacctaagaccaattatgtaccaatca 454  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17377607 gtttacacctaagaccaattctgtaccaatca 17377576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 254 - 477
Target Start/End: Original strand, 25535641 - 25535864
Alignment:
Q  254 acaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaa 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25535641 acaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactatgacctacatgcagtaatttgaccataactcaa 25535740  T
Q  354 gttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatc 453  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  25535741 gttctataaatcattttgaagtcaaaccaacgacattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattctctaccaatc 25535840  T
Q  454 aataccagttttcatttcaaattc 477  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  25535841 aataccagttttcatttcaaattc 25535864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 30 - 288
Target Start/End: Original strand, 25656640 - 25656897
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  25656640 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacatagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagttaataa 25656739  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  25656740 cgtctcaattattcacatataattcaactaatacatatataattatatcacaatataaaaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatc-ttatata 25656838  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatata 288  Q
    ||||||| |||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  25656839 catataacacttcatcaatcttggacaatatcgtagtcacaaatatatacatacatata 25656897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 313 - 512
Target Start/End: Original strand, 1598542 - 1598741
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1598542 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaattgttttgatgtcataccaacggcattagaaagctaacatccataccta 1598641  T
Q  413 caactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1598642 caactttcgtgtttatacctaagaccatttatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 1598741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 320 - 520
Target Start/End: Original strand, 23415264 - 23415464
Alignment:
Q  320 gtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaacttt 419  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23415264 gtgacctacgtgcagtaacttgaccataactcaagttctataaattgttttgacgtcagaccaatggcattagaaaactaacatccatacctacaacttt 23415363  T
Q  420 cgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacct 519  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23415364 cgtgtttacacctaagacaaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacct 23415463  T
Q  520 c 520  Q
    |    
T  23415464 c 23415464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 321 - 517
Target Start/End: Original strand, 27557023 - 27557219
Alignment:
Q  321 tgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttc 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | |||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27557023 tgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaattgttttaacgtcagaccaatggcattagaaagctaacatccatacctacaactttc 27557122  T
Q  421 gtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagac 517  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27557123 atgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaatagcagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagac 27557219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 321 - 519
Target Start/End: Original strand, 25688996 - 25689194
Alignment:
Q  321 tgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttc 420  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25688996 tgacctacgtgcagtaatatgaccataacgcaagttctataaatttttttgacgtccgaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttt 25689095  T
Q  421 gtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacct 519  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  25689096 gtgtttacacctaagaccaattttgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgatattcataaaaattcactatgacct 25689194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 30 - 211
Target Start/End: Original strand, 25754820 - 25755001
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25754820 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaaatcaacaa 25754919  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatc 211  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  25754920 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatcataatcaacatc 25755001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 319 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 26924311 - 26924118
Alignment:
Q  319 tgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactt 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  26924311 tgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaacgacattagaaagctaacatttatacctacaactt 26924212  T
Q  419 tcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    || |||||||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26924211 tcatgtttacaccaaaggctaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 26924118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 30 - 234
Target Start/End: Original strand, 1595560 - 1595763
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1595560 atcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataacagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaattcaacaa 1595659  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1595660 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatggatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatc-atatata 1595758  T
Q  230 catat 234  Q
    |||||    
T  1595759 catat 1595763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 360 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 15892231 - 15892071
Alignment:
Q  360 taaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaatacc 459  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15892231 taaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctagcatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaatacc 15892132  T
Q  460 agttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 520  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15892131 agttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaatttcactaagacctc 15892071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 313 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 2034 - 1871
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  2034 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaacgacattagaaagctaacatccataccta 1935  T
Q  413 caactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaatt 476  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1934 caactttcgtgtgtacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaatt 1871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 313 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 8993 - 8830
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  8993 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaacgacattagaaagctaacatccataccta 8894  T
Q  413 caactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaatt 476  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8893 caactttcgtgtgtacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaatt 8830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 35 - 198
Target Start/End: Original strand, 18456735 - 18456898
Alignment:
Q  35 cttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatct 134  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18456735 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaatagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtct 18456834  T
Q  135 caattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 198  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18456835 caattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaat 18456898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 30 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 20557043 - 20556864
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20557043 atcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatggcataataatatcaaatgcaagtcaacaa 20556944  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatc 211  Q
    | |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  20556943 cgtctcaat--ttcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaatcataatcaacatc 20556864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 375 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 17883305 - 17883160
Alignment:
Q  375 tcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaa 474  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17883305 tcaaaccaacgacattagaatgctaacatccatacctacaactttcgtgtttacaccaaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaa 17883206  T
Q  475 ttcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 520  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17883205 ttcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 17883160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 313 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 19847648 - 19847485
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| || || |||| |||||||||||||||||||||||    
T  19847648 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgacgataactcaagttctataaatcgttttgacgtcagactaatggcattagaaagctaacatccataccta 19847549  T
Q  413 caactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaatt 476  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19847548 caactttcgtgtttatacctaggaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaatt 19847485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 319 - 505
Target Start/End: Original strand, 18914424 - 18914610
Alignment:
Q  319 tgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactt 418  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18914424 tgtgacctacgtgcagtactttgaccataactcaagttctatcaatcgttttgacttcagaccaacggtattagaaagctaacttccatacctacaactt 18914523  T
Q  419 tcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaa 505  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| | | |||||||||| ||||||||||||    
T  18914524 tcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtattaatttaaaattcggtctaagttgtgctaaaattcataaaa 18914610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 30 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 16448678 - 16448514
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaa-ca 128  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16448678 atcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaatca 16448579  T
Q  129 acatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacat 193  Q
    || |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16448578 acgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataacaacat 16448514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 313 - 477
Target Start/End: Original strand, 19005637 - 19005801
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  19005637 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaacataactcaagttctataaatcgttttgaagtcagaccaacgacattagaaagctaacatccataccta 19005736  T
Q  413 caactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 477  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||||    
T  19005737 caacttttgtgtttacacctaagaccaattctgtactaatcaataccaaatttcatttcaaattc 19005801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 30 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 3852168 - 3852001
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  3852168 atcaacttagaccgactcatgcagcttagtttaataacaacagcaacacaatagtatacaaaaacagcatgacatgataatataaaatgcaagtcaacaa 3852069  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaa 197  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  3852068 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacatcatcaaa 3852001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 313 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 30676386 - 30676222
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| | |||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  30676386 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcagagcaacggaattagaaagctaacatccataccta 30676287  T
Q  413 caactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 477  Q
    ||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30676286 caactttagtcttatcacctaagaccaattatgtaccattcaataccagttttcatttcaaattc 30676222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 313 - 477
Target Start/End: Original strand, 1598735 - 1598899
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  1598735 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttaacgtcagaccaacggaattagaaagctaacatccataccta 1598834  T
Q  413 caactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 477  Q
    |||||||  ||||||||| || |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1598835 caactttaatgtttacacttatgaccaattctggacctatcaataccagttttcatttcaaattc 1598899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 35 - 168
Target Start/End: Original strand, 18461895 - 18462028
Alignment:
Q  35 cttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatct 134  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18461895 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaatagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtct 18461994  T
Q  135 caattattcacatatgattcaagtaatgcatata 168  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18461995 caattattcacatataattcaagtaatgcatata 18462028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 319 - 477
Target Start/End: Original strand, 18914617 - 18914775
Alignment:
Q  319 tgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactt 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||| || |||||| |||||||  |||||||||||||    
T  18914617 tgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatttttttgatgtcagaccaacgacattagaaatctaacatttatacctacaactt 18914716  T
Q  419 tcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 477  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  18914717 tcgtgtttacacctaagaccaattctggacttatcaataccagatttcatttcaaattc 18914775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 319 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 31630211 - 31630053
Alignment:
Q  319 tgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactt 418  Q
    |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31630211 tgtgacatacatgtagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaacgacattagaaagctaacatccataactacaactt 31630112  T
Q  419 tcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 477  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  31630111 tcgtgtttacacctaagaccaactatgtacttatcaataccagatttcattttaaattc 31630053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 321 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 234 - 79
Alignment:
Q  321 tgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttc 420  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  234 tgacctacgtgcagtactttgaccataactcaagttatataaatcgttttgacgtcagaccaacgacattagaaaactaacatccataccttcaactttc 135  T
Q  421 gtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaatt 476  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  134 gtgtatacacctaagaccaattttgtacaactcaataccagttttcattttaaatt 79  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 406 - 512
Target Start/End: Original strand, 25737028 - 25737134
Alignment:
Q  406 atacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaa 505  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  25737028 atacctacaactttcgtgtttacacctaagacgaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggataaagttgtgctgaaattcataaaa 25737127  T
Q  506 attcact 512  Q
    |||||||    
T  25737128 attcact 25737134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 25629469 - 25629310
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaa 121  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  25629469 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaattacaacaggaacacatgcagtatacgaaaacagcatgacataacaatatcaaatgcaa 25629370  T
Q  122 gtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcaca 181  Q
    |||||||||||||||||||| ||   || ||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  25629369 gtcaacaacatctcaattatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcaca 25629310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 202 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 31630626 - 31630525
Alignment:
Q  202 aatcaacatcttaaaacatcaatatatacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaat 301  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31630626 aatcaacatcttaaaacatca-tatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaat 31630528  T
Q  302 cat 304  Q
    |||    
T  31630527 cat 31630525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 321 - 442
Target Start/End: Original strand, 25689189 - 25689310
Alignment:
Q  321 tgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttc 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||| || ||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  25689189 tgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaattgttttgatgtcagaccaacgtcattagaatgctgacatccacacctacaactttc 25689288  T
Q  421 gtgtttacacctaagaccaatt 442  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  25689289 gtgtttacacctaagaccaatt 25689310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 178
Target Start/End: Original strand, 29060547 - 29060703
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaa 121  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  29060547 catcttcatcagcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 29060646  T
Q  122 gtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatc 178  Q
    |||||||||||||||| ||| ||   || |||||||||||||| |||  ||||||||    
T  29060647 gtcaacaacatctcaagtatacattcataattcaagtaatgcacataacattatatc 29060703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 23 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 18409941 - 18409782
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaa 121  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  18409941 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagctcagttaaataacaacagcaacacaggcagtatacgaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 18409842  T
Q  122 gtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcaca 181  Q
    ||||||||||||||||| || ||   || |||||| |||| ||||||  |||||||||||    
T  18409841 gtcaacaacatctcaatcatccattcataattcaaataatacatataacattatatcaca 18409782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 414 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 9085 - 8987
Alignment:
Q  414 aactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9085 aactttcgtgtttacacctaagaccaattctgtaccaatcattaccagttttcatttaaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 8987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 186 - 304
Target Start/End: Original strand, 18913994 - 18914110
Alignment:
Q  186 aacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatatacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacat 285  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  18913994 aacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca-tatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattca-taacatatacatacat 18914091  T
Q  286 atactaattcatcaatcat 304  Q
    |||||||||||||||||||    
T  18914092 atactaattcatcaatcat 18914110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 28 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 20361069 - 20360915
Alignment:
Q  28 tcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 126  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||     
T  20361069 tcatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagcatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcat 20360970  T
Q  127 caacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcaca 181  Q
    |||||||| || |||||| ||||  |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  20360969 caacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcatataacattatatcaca 20360915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 23 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 19303654 - 19303536
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaa 121  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  19303654 catcttcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacacaggaagtatac-aaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 19303556  T
Q  122 gtcaacaacatctcaattat 141  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  19303555 gtcaacaacatctcaattat 19303536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 23 - 141
Target Start/End: Original strand, 20593780 - 20593899
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaa 121  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20593780 catcttcatcaacttagaccgaatcatgcagctcagttaaataaaaacagcaacacatgcagtatacgaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 20593879  T
Q  122 gtcaacaacatctcaattat 141  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  20593880 gtcaacaacatctcaattat 20593899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 230 - 356
Target Start/End: Original strand, 15875621 - 15875737
Alignment:
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||    
T  15875621 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacat----------atactaattcatcaatcatattcaattatttactgtgacctacg 15875710  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagtt 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  15875711 tgcagtaatttgaccataactcaagtt 15875737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 23 - 181
Target Start/End: Original strand, 16496251 - 16496410
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaa 121  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||    
T  16496251 catcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaattgcaa 16496350  T
Q  122 gtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcaca 181  Q
     |||||||||||| || |||||| |||    |||||||||||||| |  |||||||||||    
T  16496351 ttcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaatattatatcaca 16496410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 313 - 432
Target Start/End: Original strand, 25737128 - 25737247
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  |||||| |||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  25737128 attcactgtgacctacatgcagtaatatgaccataactcatgttctataaattgttttgacgtcagaccaacgacattagaaagctaacatccataccta 25737227  T
Q  413 caactttcgtgtttacacct 432  Q
    ||||||| ||||||||||||    
T  25737228 caacttttgtgtttacacct 25737247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 182 - 304
Target Start/End: Original strand, 15875469 - 15875589
Alignment:
Q  182 atataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatatacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacat 281  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  15875469 atataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatc-atatatacatataacatttcattaatcatttacaatatcgtattcac-aacatatacat 15875566  T
Q  282 acatatactaattcatcaatcat 304  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  15875567 acatataataattcatcaatcat 15875589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 31 - 181
Target Start/End: Original strand, 25644335 - 25644487
Alignment:
Q  31 tcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataaca-acaacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 128  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| || |||||| |||||||||  ||| |||| ||||||||||| |||||| ||    
T  25644335 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcgtgatataacaatatcaaatgtaagtcatca 25644434  T
Q  129 acatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcaca 181  Q
    |||||||||  ||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  25644435 acatctcaaacattcatatataattcaagtaatgcgtatacaattatatcaca 25644487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 30 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 17287903 - 17287768
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagc-agtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 128  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17287903 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggtagtatacaaacacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaaca 17287804  T
Q  129 acatctcaattattcacatatgattcaagtaatgca 164  Q
     ||||| || ||||||  |||  |||||||||||||    
T  17287803 tcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgca 17287768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 23 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 22780341 - 22780166
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaa 121  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  22780341 catcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacaaaaacataggcaatatacaaaaacagcttgacataataatatcaattgcaa 22780242  T
Q  122 gtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa-caacatcaa 196  Q
    ||||||| ||||| || ||||||  |||  |||||||||||||   |  |||||||||||| |||| |||||||||    
T  22780241 gtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacgcaacattatatcacaacataatcaacatcaa 22780166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 20638397 - 20638253
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaa 121  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  20638397 catcttcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaa 20638298  T
Q  122 gtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcata 166  Q
     | | ||||||||  | |||||| | ||  |||||||||||||||    
T  20638297 tttatcaacatctttaatattcaaacattcttcaagtaatgcata 20638253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 436 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 22981486 - 22981410
Alignment:
Q  436 accaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22981486 accaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 22981410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 436 - 512
Target Start/End: Original strand, 23806922 - 23806998
Alignment:
Q  436 accaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23806922 accaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 23806998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 35 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 18821946 - 18821801
Alignment:
Q  35 cttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa-catc 133  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| |||||| || ||||| |||||| ||||    
T  18821946 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgccataacaatatc-aacgcaagccaacaatcatc 18821848  T
Q  134 tcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcaca 181  Q
    |||||||||||  ||   |||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  18821847 tcaattattcatttaaacttcaagtaatgcgtata-cattatatcaca 18821801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 313 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 22981416 - 22981321
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccata 408  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| | |  |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22981416 attcactgtgacctacgtgcagtaatttaaccataactcaagttctataaatcgttttgacgcccgaccaacggcattagaaagctaacatccata 22981321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 313 - 408
Target Start/End: Original strand, 23806992 - 23807087
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccata 408  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| | |  |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23806992 attcactgtgacctacgtgcagtaatttaaccataactcaagttctataaatcgttttgacgcccgaccaacggcattagaaagctaacatccata 23807087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 23 - 128
Target Start/End: Original strand, 20076707 - 20076812
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaa 121  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | |||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20076707 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtaaac-aaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 20076805  T
Q  122 gtcaaca 128  Q
     ||||||    
T  20076806 atcaaca 20076812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 31 - 196
Target Start/End: Original strand, 20109153 - 20109322
Alignment:
Q  31 tcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa-caacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 128  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| || ||||| || |||||| ||||| ||  || | |||| |||||||||||||||||| ||    
T  20109153 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-caacataatataacaatatcaaatgcaagtcatca 20109251  T
Q  129 acatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatata--attatatcacaatat-aacaacatcaa 196  Q
    ||||||||| |||||| |||| |||||||||||| ||||| |  ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  20109252 acatctcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaatattatatcacattataaacaacatcaa 20109322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 604 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 1134655 - 1134507
Alignment:
Q  604 aaaatatacaacaaacatagtattataacaacgaactcaccgtaaaggttggacatttccaatatctccttttaggattttcatttaaattagagatgaa 703  Q
    |||||| |||| ||||| | ||||||||||||  | ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| || |||| | |||| ||||||||    
T  1134655 aaaataaacaaaaaacaaactattataacaacacattcaccataaaggttgggcatttccaatatctctttttagg-ttgtcatgtgaattggagatgaa 1134557  T
Q  704 catccttatgattttgttgcacccacatataagcaattcaattgatgatg 753  Q
    |||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| | | |||||||||    
T  1134556 catcctcataatttttttgcaaccacatataggcaactgatttgatgatg 1134507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 98 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 8227549 - 8227448
Alignment:
Q  98 atgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaa 196  Q
    |||| |||||||||||  | | |||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  8227549 atgatataataatatcgcacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 8227450  T
Q  197 at 198  Q
    ||    
T  8227449 at 8227448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 313 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 18334269 - 18334151
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    | | |||||||||| |||||||||| ||| || | |||||||||||    || |||    
T  18334269 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcataaaccaaaaatcattttcaagtcaaaccgacgccactggaaagctaacacaattatcta 18334170  T
Q  413 caactttcgtgtttacacc 431  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  18334169 caactttcatgtttacacc 18334151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 186 - 252
Target Start/End: Original strand, 18937252 - 18937317
Alignment:
Q  186 aacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatatacatataaaacttcatcaatcatg 252  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18937252 aacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatc-atatatacatataacacttcatcaatcatg 18937317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 333 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 19984228 - 19984130
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacc 431  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| | || |||||||||||| |   |||||| ||||||| ||||||||||    
T  19984228 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggaggtcaaaccaaagtcattagaaagctaacttaattacctaaaactttcatgtttacacc 19984130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 313 - 431
Target Start/End: Original strand, 24423032 - 24423150
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    | | |||||||||| |||||||||| ||| || | |||||||||||    || |||    
T  24423032 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcataaaccaaaaatcattttcaagtcaaaccgacgccactggaaagctaacacaattatcta 24423131  T
Q  413 caactttcgtgtttacacc 431  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  24423132 caactttcatgtttacacc 24423150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 333 - 442
Target Start/End: Original strand, 16240296 - 16240405
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacct 432  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||| | || ||||||||||||||   || ||| ||||||| ||||||||||     
T  16240296 agtaatttgatcataactcaagtcctaaaaatcatttggacgtcaaaccaaagccattagaaagctaacataattatctaaaactttcatgtttacaccg 16240395  T
Q  433 aagaccaatt 442  Q
    ||| ||||||    
T  16240396 aagtccaatt 16240405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 333 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 16557054 - 16556945
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacct 432  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||| | || ||||||||||||||   || ||| ||||||| ||||||||||     
T  16557054 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggacgttaaaccaaagccattagaaagctaacataattatctaaaactttcatgtttacacca 16556955  T
Q  433 aagaccaatt 442  Q
    ||| ||||||    
T  16556954 aaggccaatt 16556945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 333 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 16633610 - 16633501
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacct 432  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||| | || ||||||||||||||   || ||| ||||||| ||||||||||     
T  16633610 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggacgttaaaccaaagccattagaaagctaacataattatctaaaactttcatgtttacacca 16633511  T
Q  433 aagaccaatt 442  Q
    ||| ||||||    
T  16633510 aaggccaatt 16633501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 333 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 16650284 - 16650175
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacct 432  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || |||||| || |||||||||| | || ||||||||||||||   || ||| ||||||| ||||||||||     
T  16650284 agtaatttgatcataactcaagttctaaaattcatttggacgtcaaaccaaagccattagaaagctaacataattatctaaaactttcatgtttacacca 16650185  T
Q  433 aagaccaatt 442  Q
    ||| ||||||    
T  16650184 aaggccaatt 16650175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 23 - 137
Target Start/End: Original strand, 19652202 - 19652316
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgca 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| | ||||||| | ||| ||  |||| |||| |||||| ||||||    
T  19652202 catcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 19652300  T
Q  121 agtcaacaacatctcaa 137  Q
    | |||||||||||||||    
T  19652301 a-tcaacaacatctcaa 19652316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 333 - 442
Target Start/End: Original strand, 25904474 - 25904584
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaa-tcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacc 431  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||| | || ||||||||||||||   || ||| ||||||| ||||||||||    
T  25904474 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaaatcatttggacgtcaaaccaaagccattagaaagctaacataattatctaaaactttcatgtttacacc 25904573  T
Q  432 taagaccaatt 442  Q
     ||| ||||||    
T  25904574 aaaggccaatt 25904584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 313 - 431
Target Start/End: Original strand, 33864763 - 33864881
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    | | |||||||||| |||||||||| ||| || |  ||||||||||    || |||    
T  33864763 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcataaaccaaaaatcattttcaagtcaaaccgacgccactgtaaagctaacacaattatcta 33864862  T
Q  413 caactttcgtgtttacacc 431  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  33864863 caactttcatgtttacacc 33864881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 333 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 35016113 - 35016015
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacc 431  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||| | || ||||||||||||||   || ||| ||||||| ||||||||||    
T  35016113 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggacgtcaaagcaaagccattagaaagctaacataattatctaaaactttcatgtttacacc 35016015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 181
Target Start/End: Original strand, 35245605 - 35245749
Alignment:
Q  35 cttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacat 132  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||| | ||||||||||| |||   |||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||    
T  35245605 cttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaaacaccaacataggcagtatacaacaac---atgacataataatatcaatttcaattcatcaacat 35245701  T
Q  133 ctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcaca 181  Q
    || |  ||| || ||||  ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  35245702 cttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcaca 35245749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 617 - 730
Target Start/End: Original strand, 7799704 - 7799817
Alignment:
Q  617 aacatagtattataacaacgaactcaccgtaaaggttggacatttccaatatctccttttaggattttcatttaaattagagatgaacatccttatgatt 716  Q
    |||| ||||||| |||| | |||||||| || ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| || || |||| || ||||||||  | ||||||    
T  7799704 aacaaagtattacaacagcaaactcaccatataggttgggcatttccagtatctccttttagggtttgcacttgaattggatatgaacattttcatgatt 7799803  T
Q  717 ttgttgcacccaca 730  Q
    |||||||| |||||    
T  7799804 ttgttgcaaccaca 7799817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 333 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 27654706 - 27654597
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacct 432  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||| | || |||||||||||||    || ||||||||||| ||||||||||     
T  27654706 agtaatttaatcatatctcaagttctaaaaatcatttggacgtcaaaccaatgccattagaaagctaacaaaattatctacaactttcatgtttacacca 27654607  T
Q  433 aagaccaatt 442  Q
    ||| ||||||    
T  27654606 aagtccaatt 27654597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 333 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 22226679 - 22226580
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaa-tcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacc 431  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||| | || ||||||||||||||   || ||| ||||||| ||||||||||    
T  22226679 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaaatcatttggacgtcaaaccaaagccattagaaagctaacataattatctaaaactttcatgtttacacc 22226580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 77
Target Start/End: Original strand, 25714431 - 25714478
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaaca 77  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  25714431 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 25714478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 230 - 305
Target Start/End: Original strand, 35056707 - 35056782
Alignment:
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatg 305  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| ||| || |||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  35056707 catataataattcatcaatcatgaacaacatcataatcatcaacatatacattcatataataattcatcaatcatg 35056782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 333 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 21776205 - 21776107
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacc 431  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||| |||||||||||  |||||||||| | || |||||||||||||    || ||||||||||| ||||||||||    
T  21776205 agtaatttaatcatatctcaagttctaaaaatcattttggcgtcaaaccaaagccattagaaagctaacaaagttatctacaactttcatgtttacacc 21776107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 333 - 442
Target Start/End: Original strand, 10487971 - 10488080
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacct 432  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||  | ||||||||| || |||||||||||||    || ||| ||||||| ||||||||||     
T  10487971 agtaatttgatcataactcgagttctaaaaatcatttggacctgaaaccaacgccattagaaagctaacaaaattatctaaaactttcatgtttacacca 10488070  T
Q  433 aagaccaatt 442  Q
    ||| ||||||    
T  10488071 aaggccaatt 10488080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 333 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 16377357 - 16377248
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacct 432  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||  | ||||||||| || |||||||||||||    || ||| ||||||| ||||||||||     
T  16377357 agtaatttgatcataactcgagttctaaaaatcatttggacctgaaaccaacgccattagaaagctaacaaaattatctaaaactttcatgtttacacca 16377258  T
Q  433 aagaccaatt 442  Q
    ||| ||||||    
T  16377257 aaggccaatt 16377248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 333 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 16384681 - 16384572
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacct 432  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||  | ||||||||| || |||||||||||||    || ||| ||||||| ||||||||||     
T  16384681 agtaatttgatcataactcgagttctaaaaatcatttggacctgaaaccaacgccattagaaagctaacaaaattatctaaaactttcatgtttacacca 16384582  T
Q  433 aagaccaatt 442  Q
    ||| ||||||    
T  16384581 aaggccaatt 16384572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 333 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 16826477 - 16826368
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacct 432  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||| | || |||||||||||||    |  ||||||||||| ||||||||||     
T  16826477 agtaatttaatcatatctcaagttctaaaaatcatttggacgtcaaaccaaagccattagaaagctaacaaaattgtctacaactttcatgtttacacca 16826378  T
Q  433 aagaccaatt 442  Q
    ||| ||||||    
T  16826377 aagtccaatt 16826368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 333 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 22593691 - 22593590
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacct 432  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||   || |||||||||||||||   |||||||| |||  |||| ||||||    
T  22593691 agtaatttgatcataactcaagttataaaaatcatttggaagtcaaactaaatccattagaaagctaacatcttaacctacaatttttatgttaacacct 22593592  T
Q  433 aa 434  Q
    ||    
T  22593591 aa 22593590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 472 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 2068 - 2028
Alignment:
Q  472 aaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2068 aaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 2028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 137
Target Start/End: Original strand, 23019425 - 23019528
Alignment:
Q  35 cttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa-caacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacat 132  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||  ||||| || ||||| | ||||||| ||||| ||  |||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23019425 cttagaccgacttatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataagcagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaatgcaagtcaacaacat 23019523  T
Q  133 ctcaa 137  Q
    |||||    
T  23019524 ctcaa 23019528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 392 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 10905455 - 10905416
Alignment:
Q  392 gaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacc 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10905455 gaaagctaacatccatacctacaactttcatgtttacacc 10905416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 335 - 442
Target Start/End: Original strand, 19609582 - 19609689
Alignment:
Q  335 taatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaa 434  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| |||| |||| || |||||||||| | || ||||||||||| |    || ||||||||||| |||||||||| ||    
T  19609582 taatttgatcatatctcaagttctaaaaattatttggacgtcaaaccaaagccattagaaagctaataaaattatctacaactttcatgtttacaccaaa 19609681  T
Q  435 gaccaatt 442  Q
    | ||||||    
T  19609682 gtccaatt 19609689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #107
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 27333325 - 27333286
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa 69  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27333325 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 27333286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #108
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 27394065 - 27394026
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa 69  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27394065 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 27394026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #109
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 246 - 305
Target Start/End: Original strand, 32259078 - 32259137
Alignment:
Q  246 aatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatg 305  Q
    |||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  32259078 aatcatgaacaacatcatattcatcaacatatacattcatataataattcatcaatcatg 32259137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #110
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 9098620 - 9098582
Alignment:
Q  31 tcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa 69  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9098620 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 9098582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #111
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 43 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 15041644 - 15041542
Alignment:
Q  43 gactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattat 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  | || || |||   |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| || |||    
T  15041644 gactcatgcaacttagttaaataacaatagtagcataggcagatcacaacaacagcatgacattataatatcaaatgcaattcaataacatcttaagtat 15041545  T
Q  142 tca 144  Q
    |||    
T  15041544 tca 15041542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #112
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 227 - 305
Target Start/End: Original strand, 15875565 - 15875643
Alignment:
Q  227 atacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatg 305  Q
    |||||||||| | |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||  | |||||||||||||    
T  15875565 atacatataataattcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatataacacttcatcaatcatg 15875643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #113
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 313 - 431
Target Start/End: Original strand, 22782712 - 22782830
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    | | | |||||||| |||||||||  ||| || | |||||||||||    || |||    
T  22782712 attcactgtgacctacatgcagtaatttgaccataactcataaaccaaatatcattttcaagtcaaactgacgccagtggaaagctaacacaattatcta 22782811  T
Q  413 caactttcgtgtttacacc 431  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  22782812 caactttcatgtttacacc 22782830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #114
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 313 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 26924124 - 26924006
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    | | |||||||||| |||||||||| ||| || |  ||||||||||    || |||    
T  26924124 attcactgtgacctacatgcagtaatttgaccataactcataaaccaaaaatcattttcaagtcaaaccgacgccactgtaaagctaacacaattatcta 26924025  T
Q  413 caactttcgtgtttacacc 431  Q
    |||||||| | ||||||||    
T  26924024 caactttcatttttacacc 26924006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #115
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 31155511 - 31155465
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa 69  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  31155511 catcatcatcaacttggattgactcatgcaacttagttaaataacaa 31155465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #116
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 470 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 278 - 229
Alignment:
Q  470 tcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacct 519  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  278 tcaaattcgaacaaagttgtgctgaaattcacaaaaattcactatgacct 229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #117
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 333 - 402
Target Start/End: Original strand, 1555527 - 1555596
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaaca 402  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||| | || |||||||||||||    
T  1555527 agtaatttaatcatatctcaagttctaaaaatcatttggacgtcaaaccaaagccattagaaagctaaca 1555596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #118
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 361 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 18455530 - 18455449
Alignment:
Q  361 aaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 442  Q
    |||||||||| |||||||||||| | || | |||||||||||    |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  18455530 aaatcattttcaagtcaaaccaaagccactggaaagctaacacaattacctacaactttcatgtttacaccaaaggccaatt 18455449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #119
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 657 - 730
Target Start/End: Original strand, 19401655 - 19401728
Alignment:
Q  657 catttccaatatctccttttaggattttcatttaaattagagatgaacatccttatgattttgttgcacccaca 730  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||  | |||| || |||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  19401655 catttccagtatctccttttagggttttcacgtgaattggatatgaacattctcatgattttgttgcaaccaca 19401728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #120
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 617 - 730
Target Start/End: Original strand, 19597457 - 19597570
Alignment:
Q  617 aacatagtattataacaacgaactcaccgtaaaggttggacatttccaatatctccttttaggattttcatttaaattagagatgaacatccttatgatt 716  Q
    |||| ||||||| |||| | |||||||| || |||||||  |||| ||||||||||||||||| || |||  | |||| || |||||||| || || |||    
T  19597457 aacaaagtattacaacagcaaactcaccatataggttgggtattttcaatatctccttttagggttgtcaactgaattggatatgaacattctcataatt 19597556  T
Q  717 ttgttgcacccaca 730  Q
    |||||||| |||||    
T  19597557 ttgttgcaaccaca 19597570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #121
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 333 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 33315185 - 33315116
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaaca 402  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||  | ||||||||| || |||||||||||||    
T  33315185 agtaatttgatcataactcaagttttaaaaatcatttggacctgaaaccaacgccattagaaagctaaca 33315116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #122
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 26 - 77
Target Start/End: Original strand, 11185515 - 11185567
Alignment:
Q  26 catcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacaacaaca 77  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  11185515 catcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaaca 11185567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #123
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 33 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 28496575 - 28496539
Alignment:
Q  33 aacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa 69  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28496575 aacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 28496539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #124
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 33 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 29808986 - 29808950
Alignment:
Q  33 aacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa 69  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29808986 aacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 29808950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #125
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 313 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 2290857 - 2290818
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactca 352  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2290857 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccttaactca 2290818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #126
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 133
Target Start/End: Original strand, 19668386 - 19668491
Alignment:
Q  31 tcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacaacaacacag-cagtatacaaaaacag--aatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 126  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||| ||  ||||| | |||||||   |||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  19668386 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaaacagcaacatagatagtatgc-aaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaa 19668484  T
Q  127 caacatc 133  Q
    |||||||    
T  19668485 caacatc 19668491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #127
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 23992441 - 23992480
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa 69  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  23992441 atcaacttagactgactcatgcaacttagctaaataacaa 23992480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #128
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 333 - 428
Target Start/End: Original strand, 29665374 - 29665469
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttac 428  Q
    |||||||| | ||||||||   ||||| ||||||||| || |||||||||| | |||||||||||||||||   |  ||||||||||| |||||||    
T  29665374 agtaatttaatcataactctcattctaaaaatcatttggacgtcaaaccaaagccaatagaaagctaacataattgtctacaactttcatgtttac 29665469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #129
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 23 - 69
Target Start/End: Original strand, 1561310 - 1561356
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa 69  Q
    |||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  1561310 catcttcaacaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa 1561356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #130
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 17883333 - 17883303
Alignment:
Q  238 acttcatcaatcatgaacaatatcgtattca 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17883333 acttcatcaatcatgaacaatatcgtattca 17883303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #131
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 227 - 305
Target Start/End: Original strand, 18914086 - 18914164
Alignment:
Q  227 atacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatg 305  Q
    |||||||||  | |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||  | |||||||||||||    
T  18914086 atacatatactaattcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatataacacttcatcaatcatg 18914164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #132
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 333 - 383
Target Start/End: Original strand, 23153035 - 23153085
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaa 383  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  23153035 agtaattttatcataactcaagttctaaaaatcatttggacgtcaaaccaa 23153085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #133
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 333 - 442
Target Start/End: Original strand, 25175112 - 25175221
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacct 432  Q
    |||||||| | |||| |||||  |||| ||||||||| || |||||||||| | || |||||||||||||    || ||||||||||  ||||||||||     
T  25175112 agtaatttaatcatatctcaatatctaaaaatcatttggacgtcaaaccaatgccattagaaagctaacaaaattatctacaactttgatgtttacacca 25175211  T
Q  433 aagaccaatt 442  Q
    ||| ||||||    
T  25175212 aagtccaatt 25175221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 399; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 399; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 512
Target Start/End: Original strand, 4705 - 5186
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4705 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 4804  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  4805 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacaaca-tatata 4903  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||    
T  4904 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactatgacctacg 5003  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5004 tgctgtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 5103  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5104 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggccaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 5186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 313 - 477
Target Start/End: Original strand, 5180 - 5344
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  5180 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctatatatcgttttgacgtcagaccaacggcataagaaaactaacatccataccta 5279  T
Q  413 caactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 477  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5280 caactttcatgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaatatcagttttcatttcaaattc 5344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 399; Significance: 0; HSPs: 142)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 399; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 512
Target Start/End: Original strand, 3515018 - 3515499
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3515018 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaaaaacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcaagacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 3515117  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3515118 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatca-tatata 3515216  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  3515217 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaaaatatacatacatataataattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 3515316  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3515317 tgcagtaatttgaccatagctcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttaca 3515416  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3515417 cctaagaccaattttgtaccgatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctaaaattcataaaaattcact 3515499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 399; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 14970858 - 14970377
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14970858 atcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaaacagcaatatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 14970759  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14970758 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatacatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatca-tatata 14970660  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |    
T  14970659 catataacacttcatcaattatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatattaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctatg 14970560  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14970559 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 14970460  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14970459 cctaagaccaattctataccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 14970377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 383; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 15118503 - 15118023
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15118503 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 15118404  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15118403 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca-tatata 15118305  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  15118304 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 15118206  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  15118205 tgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatacctacaactttcgtgtttaca 15118106  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15118105 cctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 15118023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 520
Target Start/End: Original strand, 44615299 - 44615788
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44615299 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 44615398  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44615399 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca-tatata 44615497  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  44615498 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 44615597  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  44615598 tgcagtaatttgactataactctagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatacctacaaatttcgtgtttaca 44615697  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 520  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44615698 cttaagaccaattatgtactaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 44615788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 367; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 50222490 - 50222002
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50222490 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacattatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 50222391  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  50222390 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaatatcaaataataatcaacatcttaaaacatca-tatata 50222292  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  50222291 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 50222193  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||    
T  50222192 tgcagtaatttgactataactctagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatacctacatcttttgtgtttaca 50222093  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 520  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50222092 cctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 50222002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 520
Target Start/End: Original strand, 19242710 - 19243200
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19242710 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 19242809  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa-caacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatat 228  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19242810 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataaacaactccaaatggtaatcaacatcttaaaacatca-tatat 19242908  T
Q  229 acatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctac 328  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||    
T  19242909 acatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcataatcaattattcactatgacctac 19243008  T
Q  329 gtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttac 428  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||     
T  19243009 gttcagtaatttaaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaacgacattagaaagctaacatacatacctacaactttcttgtttat 19243108  T
Q  429 acctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 520  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19243109 acctaagactaattctgtaccaatcaataccagttttcgtttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 19243200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 44773238 - 44772754
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44773238 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 44773139  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatca---atat 226  Q
    | ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||   ||||    
T  44773138 cgtctcaattattcacaaataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaatatcatatatat 44773039  T
Q  227 atacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacct 326  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44773038 atacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacattcgtatactaattcatcaatcatattcaattattcattgtgacct 44772940  T
Q  327 acgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgttt 426  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44772939 acgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaatctttttgaagtcaaaccaacgacattagaaagctaacattcatacctacaactttcgtgttt 44772840  T
Q  427 acacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44772839 acacctaagaccaattctctaccaataaataccagttttcatttaaaattcggacaatgttgtgctgaaattcataaaaattcact 44772754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 1837660 - 1837191
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1837660 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataataccaaatgcaagtcaacaa 1837561  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1837560 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacgattatatcacattataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca-tatata 1837462  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||           |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||    
T  1837461 catataaaacttcatcaatcatggacaatatcgttttcacaa-----------catatactaattcatcaatcatattcaattattcactatgacctacg 1837373  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  1837372 tgcagtaatttgactataactctagttctataaatcctttttaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatacctacaactttcatgtttaca 1837273  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcac 511  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1837272 cctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcac 1837191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 30 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 7641333 - 7640857
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||          ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7641333 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca----------aaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 7641244  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatca-----at 224  Q
    | ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||     ||    
T  7641243 cgtctcaattatttacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaatatcatatatat 7641144  T
Q  225 atatacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgac 324  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  7641143 atatatatataacacttcatcaatcatgaaaaatatcgtattcacaa-catatacattcatatactcattcatcaatcatattcaattattcactgtgac 7641045  T
Q  325 ctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgt 424  Q
    ||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  7641044 ctacaggcagtaatttaactataactcaagttctataaatccttttgaagtgaaaccaatggcattagaaagctaacatttatacctacaactttcgtgt 7640945  T
Q  425 ttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7640944 ttacacctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 7640857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 181 - 520
Target Start/End: Original strand, 15534343 - 15534681
Alignment:
Q  181 aatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatatacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatataca 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  15534343 aatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatca-tatatacatataacacttcatcaatcattgacaatatcgtattcacaaatatataca 15534441  T
Q  281 tacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaac 380  Q
    |||||||| |||||||||||||||   ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15534442 tacatatattaattcatcaatcataaacaattcttcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaac 15534541  T
Q  381 caacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcaga 480  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15534542 caacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattctga 15534641  T
Q  481 caaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 520  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15534642 caaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 15534681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 182 - 520
Target Start/End: Original strand, 36038033 - 36038370
Alignment:
Q  182 atataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatatacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacat 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36038033 atataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatca-tatatacatataacacttcatcaatcattgacaatatcgtattcacaaatatatacat 36038131  T
Q  282 acatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaacc 381  Q
    ||||||  |||||||||||||||   ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36038132 acatatcttaattcatcaatcataaacaattcttcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaacc 36038231  T
Q  382 aacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagac 481  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  36038232 aacggtattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaaggccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattctgac 36038331  T
Q  482 aaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 520  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36038332 aaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 36038370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 182 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 49547773 - 49547436
Alignment:
Q  182 atataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatatacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacat 281  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  49547773 atataacaacatcaaatgataatcaacatcttaaaacatca-tagatacatataacacttcatcaatcattgacaatatcgtattcacaaatatatacat 49547675  T
Q  282 acatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaacc 381  Q
    ||||||| |||||||||||||||    |||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  49547674 acatatattaattcatcaatcataaataattcttcactatgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaacc 49547575  T
Q  382 aacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagac 481  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  49547574 aacggcattagaaagctaacatccatacctacaaatttcgtgtttacacctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattctgac 49547475  T
Q  482 aaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 520  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  49547474 aaatttgtgctgaaattcataaaaattcattaagacctc 49547436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 230 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 52873025 - 52872743
Alignment:
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  52873025 catataacacatcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 52872926  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  52872925 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctagcatccatacctacaactttcgtgtttaca 52872826  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  52872825 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaacattcact 52872743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 182 - 520
Target Start/End: Original strand, 14048740 - 14049077
Alignment:
Q  182 atataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatatacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacat 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14048740 atataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatca-tatatacatataacacctcatcaatcattgacaatatcgtattcacaaacatatacat 14048838  T
Q  282 acatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaacc 381  Q
    ||||||| ||||| |||||||||   ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  14048839 acatatattaatttatcaatcataaacaattcttcactgtgacctacgtgtagtaatttgaccataacacaagttctgtaaatccttttgaagtcaaacc 14048938  T
Q  382 aacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagac 481  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  14048939 aacggcattagaaagctaacattcatacccacaactttcatgtttacacctaaaaccaattatgtaccaatcaatactagttttcatttcaaattctgac 14049038  T
Q  482 aaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 520  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14049039 aaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 14049077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 230 - 519
Target Start/End: Original strand, 362390 - 362679
Alignment:
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  362390 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 362489  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  362490 tgcagtaatttgaccataaatcaagttctataaatcgttttgaagtcaaactaacgacattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 362589  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacct 519  Q
    |||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  362590 cctaagactaattttgtatcaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaaatcactatgacct 362679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 238 - 520
Target Start/End: Original strand, 29267571 - 29267853
Alignment:
Q  238 acttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacgtgcagtaa 337  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  29267571 acttcatcaatcatggacaatatcgtattcgcaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgttcagtaa 29267670  T
Q  338 tttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagac 437  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29267671 tttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatttatacctacaactttcgtgtttacacctaagac 29267770  T
Q  438 caattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 520  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29267771 caattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactgagacctc 29267853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 230 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 19618019 - 19617737
Alignment:
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  19618019 catataacacttcatcaatcatgaacaatatagtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 19617920  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||    
T  19617919 tgcagtaatttgaccataactcaacttctataaatccttttgaagtcacaccaacagcattagaaagctaacatccatacctataacttttgtgttaaca 19617820  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19617819 cctaagaccaactctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 19617737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 30 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 18215425 - 18215153
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18215425 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 18215326  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18215325 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaatcataatcaacatcttaaaacatc-atatata 18215227  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcat 304  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18215226 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaatcat 18215153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 30 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 18239570 - 18239250
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18239570 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcagcacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 18239471  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18239470 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattacatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatc-atatata 18239372  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||    
T  18239371 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactcattcatcaatcatattcaaaaattcactgtgacctacg 18239273  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactca 352  Q
    || ||||||||||| ||||||||    
T  18239272 tgaagtaatttgacaataactca 18239250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 230 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 15496126 - 15495844
Alignment:
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  15496126 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcagaaacatatacatacatatattaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacttacg 15496027  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15496026 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaaacctttcgaatttaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttaca 15495927  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15495926 cctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcattccaaattaggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 15495844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 30 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 19618323 - 19618051
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19618323 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 19618224  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19618223 cgtctcaattattcacctataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatc-atatata 19618125  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcat 304  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19618124 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcgc-aacatatacatacatataccaattcatcaatcat 19618051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 230 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 14746464 - 14746181
Alignment:
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||    
T  14746464 catataacacttcatcaatcatgaacataatagtattcacaaacatatacatatatatactaattcatcaatcatatttaattattcactgtgacctacg 14746365  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||    
T  14746364 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatccttttaaagtcaaaccaacggaattagaaagctaacattcatacctacaactttcgtccttaca 14746265  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcacta 513  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14746264 ccgaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcacta 14746181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 30 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 12458 - 12186
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12458 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 12359  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12358 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatccaataataatcaacatcttaaaacatc-atatata 12260  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcat 304  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12259 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaatcat 12186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 30 - 304
Target Start/End: Original strand, 52312521 - 52312793
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52312521 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 52312620  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  52312621 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatc-atatata 52312719  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcat 304  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52312720 catataacacttcattaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaatcat 52312793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 230 - 512
Target Start/End: Original strand, 19857798 - 19858070
Alignment:
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  19857798 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacat----------atactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 19857887  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19857888 tgcagtaatttgaccataaatcaagttctataaattattttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatacatacctacaactttcgtgtttaca 19857987  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19857988 cctaagaccaattttgtaccaatcaataccagttttcatttctcattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 19858070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 30 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 15355476 - 15355203
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaa-ca 128  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15355476 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaatca 15355377  T
Q  129 acatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatat 228  Q
    || |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15355376 acgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatc-atatat 15355278  T
Q  229 acatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcat 304  Q
    |||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15355277 acatataacatttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaatcat 15355203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 227 - 512
Target Start/End: Original strand, 52312769 - 52313053
Alignment:
Q  227 atacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacct 326  Q
    |||||||||  | |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  52312769 atacatatactaattcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacct 52312868  T
Q  327 acgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgttt 426  Q
     |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  52312869 gcgtgcagtaatt-gactataactcaagttctataaatccttttgaagtaaaaccaacggcattagaaagctaacattcatacctacaactttcgtgttt 52312967  T
Q  427 acacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  52312968 acacctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaacttgtgctgaaattcataaaaattcact 52313053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 227 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 12210 - 11960
Alignment:
Q  227 atacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacct 326  Q
    |||||||||  | |||||||||||| ||||| ||  ||  || |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  12210 atacatatactaattcatcaatcataaacaacataatacacataaacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacct 12111  T
Q  327 acgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgttt 426  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  12110 acgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacgacattagaaagctaacattgatacctacaactttcgtgttt 12011  T
Q  427 acacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 477  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  12010 acacctaagaccaattctgtacctatcaataccagatttcatttcaaattc 11960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 160; E-Value: 7e-85
Query Start/End: Original strand, 321 - 512
Target Start/End: Original strand, 362674 - 362865
Alignment:
Q  321 tgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttc 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  362674 tgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatctttttgatgtcagaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaacttta 362773  T
Q  421 gtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  362774 gtgtttacacctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgatattcataaaaattcact 362865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 325 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 14746176 - 14745993
Alignment:
Q  325 ctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgt 424  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  14746176 ctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaacgacattagaaagataacatccatacctacaactttcttgt 14746077  T
Q  425 ttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaatt 508  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14746076 ttacacctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaatt 14745993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 30 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 51464019 - 51463838
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  51464019 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaaatcaacaa 51463920  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatc 211  Q
    | |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  51463919 cgtctcaattattcacatataattcaaataatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatcataatcaacatc 51463838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 313 - 512
Target Start/End: Original strand, 52313047 - 52313246
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  52313047 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataaatcaagttctataaatcgttttgacgtcataccaaaggcattagaaatctaacatccataccta 52313146  T
Q  413 caactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52313147 caacttttgtgtttacacctaagatcaattctggacctatcaataccagatttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 52313246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 30 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 23803416 - 23803235
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23803416 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaaatcaacaa 23803317  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatc 211  Q
    | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  23803316 cgtctaaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacataaaatcataatcaacatc 23803235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 30 - 198
Target Start/End: Original strand, 44102225 - 44102393
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44102225 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaataacacagtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtaaacaa 44102324  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 198  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44102325 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacatcatcaaat 44102393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 313 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 52872749 - 52872585
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| | | |||||||||||||||||||||||    
T  52872749 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaacagaattagaaagctaacatccataccta 52872650  T
Q  413 caactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 477  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52872649 caactttcgtgtttacacctaagaccaattttgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 52872585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 294 - 519
Target Start/End: Original strand, 30147189 - 30147414
Alignment:
Q  294 tcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaataga 393  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||| | || |       
T  30147189 tcatcaatcatattcaattattcactgtgacctatgtgtagtaatttgaccataactcaagttctataaatctttttgttgtcataccaatgtcattttt 30147288  T
Q  394 aagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctg 493  Q
    ||  | | |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30147289 aattttatatccatacttacaacttttgtgtttacacctaagaccaattttgtaccaatcaattccatttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctg 30147388  T
Q  494 aaattcataaaaattcactaagacct 519  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  30147389 aaattcataaaaattcactaagacct 30147414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 313 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 19617743 - 19617579
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || | |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19617743 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttcaataaatcattttggcgttagaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 19617644  T
Q  413 caactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 477  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19617643 caactttcgtgtctacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagatttcatttcaaattc 19617579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 313 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 14970383 - 14970219
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14970383 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 14970284  T
Q  413 caactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 477  Q
    ||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14970283 caacttttgtgttatcacctaagaccaattgtgtacaaatcaataccagttttcatttcaaattc 14970219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 30 - 211
Target Start/End: Original strand, 12610961 - 12611135
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||       |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12610961 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-------acaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaaatcaacaa 12611053  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatc 211  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  12611054 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatcataatcaacatc 12611135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 313 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 18214880 - 18214717
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18214880 attcactgtgacctacgtgcagtaatatgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 18214781  T
Q  413 caactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaatt 476  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  18214780 caactttcgtgtttacacctaagaccaattctggacctatcaataccagatttcatttcaaatt 18214717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 313 - 479
Target Start/End: Original strand, 3515493 - 3515659
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3515493 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtgagaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 3515592  T
Q  413 caactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcag 479  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3515593 caactttcgtgtttacgcctaagaccaattctggacctatcaataccagatttcatttcaaattcag 3515659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 30 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 44929031 - 44928873
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 128  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  44929031 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacagcatgacataataatgtcaaatgcaagtcaata 44928932  T
Q  129 acatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa 187  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44928931 acatctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa 44928873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 313 - 477
Target Start/End: Original strand, 19858064 - 19858228
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  19858064 attcactgtgacctacgtgcaataatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaacgacattagaaagctaacatccataccta 19858163  T
Q  413 caactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 477  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19858164 caacttttgtgtttgcacctaagaccaattctgtaccaatcaataccatttttcatttcaaattc 19858228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 313 - 477
Target Start/End: Original strand, 52313240 - 52313404
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  52313240 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 52313339  T
Q  413 caactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 477  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  52313340 taactttcgtgtttacacctaagatcaattcttgacctatcaataccagatttcatttcaaattc 52313404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 35 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 21815731 - 21815568
Alignment:
Q  35 cttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatct 134  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  21815731 cttagaccgactcgtgcagcttagttaaataacgacagcaacacaactgtatacaaaaacagcatgacataataatataaaatgcaagtcaacaacgtct 21815632  T
Q  135 caattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 198  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21815631 caattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcataatataacaacatcaaat 21815568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 34 - 198
Target Start/End: Original strand, 15367708 - 15367873
Alignment:
Q  34 acttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaa-caacat 132  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  15367708 acttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaatcaacgt 15367807  T
Q  133 ctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 198  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15367808 ctcaattattcacatataattcaactaacgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaat 15367873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 34 - 198
Target Start/End: Original strand, 15402721 - 15402886
Alignment:
Q  34 acttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaa-caacat 132  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  15402721 acttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaatcaacgt 15402820  T
Q  133 ctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 198  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15402821 ctcaattattcacatataattcaactaacgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaat 15402886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 313 - 477
Target Start/End: Original strand, 362859 - 363023
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  362859 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaaattctataaatctttttgacgtcagaccaacgacattagaaagctaacatccataccta 362958  T
Q  413 caactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 477  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||  |||||||||||||||    
T  362959 caactttcgggtttacacctaagaccaattctatacaaatcaataccacatttcatttcaaattc 363023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 34 - 198
Target Start/End: Original strand, 15371220 - 15371385
Alignment:
Q  34 acttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaa-caacat 132  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |    
T  15371220 acttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaatcaatgt 15371319  T
Q  133 ctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 198  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15371320 ctcaattattcacatataattcaactaacgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaat 15371385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 34 - 198
Target Start/End: Original strand, 15373501 - 15373666
Alignment:
Q  34 acttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaa-caacat 132  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |    
T  15373501 acttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaatcaatgt 15373600  T
Q  133 ctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 198  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15373601 ctcaattattcacatataattcaactaacgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaat 15373666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 230 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 18215121 - 18214992
Alignment:
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  18215121 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattaataaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 18215022  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttcta 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18215021 tgcagtaatttgaccataactcaagttcta 18214992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 34 - 198
Target Start/End: Original strand, 15370036 - 15370200
Alignment:
Q  34 acttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaa-caacat 132  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  15370036 acttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaatcaacgt 15370135  T
Q  133 ctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 198  Q
    ||||||||||||||||| |||||| | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15370136 ctcaattattcacatataattcaact-acgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaat 15370200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 30 - 193
Target Start/End: Original strand, 20149840 - 20150004
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaa-ca 128  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20149840 atcaacttagactgactcatgcaacttgataaaataacaacagcgacacatcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaatca 20149939  T
Q  129 acatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacat 193  Q
     | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20149940 tcgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataacaacat 20150004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 34 - 195
Target Start/End: Original strand, 16223550 - 16223712
Alignment:
Q  34 acttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaa-caacat 132  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| |    
T  16223550 acttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatctaatgcaagtcaatcaacgt 16223649  T
Q  133 ctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatca 195  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16223650 ctcaattattcacatataattcaactaacccatatacaattatatcacaatataacaacatca 16223712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 313 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 15495850 - 15495716
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  15495850 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaattgttttgacgtcagaccaacgacattagaaagctaacatccataccta 15495751  T
Q  413 caactttcgtgtttacacctaagaccaattatgta 447  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  15495750 caacttttgtgtttacacctaagaccaattctgta 15495716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 23 - 181
Target Start/End: Original strand, 22636442 - 22636601
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaa 121  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  22636442 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacatagacagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaa 22636541  T
Q  122 gtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcaca 181  Q
     ||| |||||||| || |||||| ||||  |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  22636542 ttcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcatataacattatatcaca 22636601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 181
Target Start/End: Original strand, 7088884 - 7089043
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaa 121  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  7088884 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaa 7088983  T
Q  122 gtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcaca 181  Q
     ||| |||||||| |  |||||| |||| |||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  7088984 ttcatcaacatcttacatattcaaatattattcaagtaatgcataaaacattatatcaca 7089043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 196
Target Start/End: Original strand, 7798781 - 7798956
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaa 121  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  7798781 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaa 7798880  T
Q  122 gtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa-caacatcaa 196  Q
    |||| |||||||| || ||||||  |||  ||||||||||||| |||  ||| |||||||| |||| |||||||||    
T  7798881 gtcatcaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattgtatcacaacataatcaacatcaa 7798956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 181
Target Start/End: Original strand, 14038655 - 14038814
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaa 121  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  14038655 catcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacatgcagtatacaaaaacaacatggcataataatatcaaatgcaa 14038754  T
Q  122 gtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcaca 181  Q
    |||||||||||||||||||| ||   ||  ||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  14038755 gtcaacaacatctcaattatacattcatatttcaagtaatgcacataacattatatcaca 14038814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 30 - 137
Target Start/End: Original strand, 14280327 - 14280434
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14280327 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 14280426  T
Q  130 catctcaa 137  Q
    ||||||||    
T  14280427 catctcaa 14280434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 28 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 16377630 - 16377478
Alignment:
Q  28 tcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16377630 tcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaa--cagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 16377533  T
Q  127 caacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcaca 181  Q
    ||||||||||||||| ||   || ||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  16377532 caacatctcaattatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcaca 16377478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 313 - 423
Target Start/End: Original strand, 14185621 - 14185731
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14185621 attcactgtgacctacgttcaataatttgaccataactcaagttctataaatccttttgacgtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 14185720  T
Q  413 caactttcgtg 423  Q
    |||||||||||    
T  14185721 caactttcgtg 14185731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 30 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 54798861 - 54798729
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 128  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54798861 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttgaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 54798762  T
Q  129 acatctcaattattcacatatgattcaagtaat 161  Q
    ||||||||| ||| ||   || |||||||||||    
T  54798761 acatctcaaatatacattcataattcaagtaat 54798729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 23 - 181
Target Start/End: Original strand, 12902764 - 12902923
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaa 121  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||    
T  12902764 catcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaa 12902863  T
Q  122 gtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcaca 181  Q
     ||| |||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  12902864 ttcatcaacatcttaaatattcaaatattattcaagtaatgcataaaacattatatcaca 12902923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 230 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 15355171 - 15355068
Alignment:
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||    
T  15355171 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatatatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactatgacctacg 15355072  T
Q  330 tgca 333  Q
    ||||    
T  15355071 tgca 15355068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 421 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 18214965 - 18214874
Alignment:
Q  421 gtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18214965 gtgtttacacctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 18214874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 182 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 15497070 - 15496950
Alignment:
Q  182 atataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatatacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacat 281  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  15497070 atataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca-tatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcatattcac-aacatatacat 15496973  T
Q  282 acatatactaattcatcaatcat 304  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  15496972 acatatattaattcatcaatcat 15496950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 183 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 52873176 - 52873057
Alignment:
Q  183 tataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatatacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacata 282  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  52873176 tataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca-tatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacata 52873079  T
Q  283 catatactaattcatcaatcat 304  Q
    | |||| |||||||||||||||    
T  52873078 cgtatattaattcatcaatcat 52873057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 23 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 52873481 - 52873369
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaa 121  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  52873481 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaa 52873382  T
Q  122 gtcaacaacatct 134  Q
    ||||||| |||||    
T  52873381 gtcaacatcatct 52873369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 23 - 181
Target Start/End: Original strand, 7893710 - 7893869
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaa 121  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  7893710 catcttcatcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaa 7893809  T
Q  122 gtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcaca 181  Q
    ||||||| ||||| || ||||||  |||  ||||||||||||| |||  ||||| |||||    
T  7893810 gtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataccattatttcaca 7893869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 23 - 181
Target Start/End: Original strand, 44052836 - 44052995
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaa 121  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  44052836 catcttcatcaacttaggccgactcatgcagctcagttaaataacaacatcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaa 44052935  T
Q  122 gtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcaca 181  Q
     ||| |||||||| || |||||| ||||  ||||||||||||  |||  |||||||||||    
T  44052936 ttcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgctcataacattatatcaca 44052995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 362 - 512
Target Start/End: Original strand, 14185477 - 14185627
Alignment:
Q  362 aatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccag 461  Q
    ||||||||| |||||| ||||| | || | |||||||||||  | || ||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14185477 aatcattttcaagtcacaccaaagccactggaaagctaacacacttatctacaactttcatgttaacacctaagaccaattctgtaccaatcaataccag 14185576  T
Q  462 ttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    |||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  14185577 tttttatttcaaattcgggaaaagttgtgctgaaattcctaaagattcact 14185627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 23 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 16270349 - 16270191
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaa 121  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | ||||| || |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16270349 catcttcatcaagttagaccgactcatgcagcttaattaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaatgcaa 16270251  T
Q  122 gtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcaca 181  Q
    || |||||||||| || ||||||  |||  ||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  16270250 gttaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcaca 16270191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 35 - 192
Target Start/End: Original strand, 22353852 - 22354010
Alignment:
Q  35 cttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatc 133  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || || || |||  |  |  ||||  ||||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||    
T  22353852 cttagaccgactcatgcagcttaggtaaataacaacagcagcataggcagattgtagcaacaacatgacataacaatatcaattacaattcaacaacgtc 22353951  T
Q  134 tcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaaca 192  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22353952 tcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaaca 22354010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 313 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 22725401 - 22725284
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||    || |||    
T  22725401 attcagtgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagtcctataaatcattttgatgtcaaaccaacgg-attagaaagctaacacaattatcta 22725303  T
Q  413 caactttcgtgtttacacc 431  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  22725302 caactttcatgtttacacc 22725284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 182 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 14746618 - 14746496
Alignment:
Q  182 atataacaacatcaaatggtaatcaacatct--taaaacatcaatatatacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatac 279  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||   | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||    
T  14746618 atataacaacatcaaatgataatcaacatcaacttaaacatca-tatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcatattcgcaa-catatac 14746521  T
Q  280 atacatatactaattcatcaatcat 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  14746520 atacatatactaattcatcaatcat 14746496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 16240083 - 16239927
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaa 121  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||| | || |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16240083 catcttcatcaacttagaccaactcatgcaacttaattaaataacaatagcaaaataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaatgcaa 16239985  T
Q  122 gtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatca 179  Q
    ||||||||||||| || ||||||  |||  || |||||||||| |||  |||||||||    
T  16239984 gtcaacaacatcttaaatattcaattatactttaagtaatgcaaataacattatatca 16239927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 181
Target Start/End: Original strand, 6899898 - 6900056
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaa 121  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||| ||  ||  ||||||||||||||||||||    
T  6899898 catcttcatcaacttagaccgactcatgcatcttagttaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaa-caacatagcataataatatcaaatgcaa 6899996  T
Q  122 gtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcaca 181  Q
    ||||||||||||| || ||||||  |||  ||||||||||| | |||  |||||||||||    
T  6899997 gtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgtacataacattatatcaca 6900056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 35 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 13953 - 13788
Alignment:
Q  35 cttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa-caacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacat 132  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||| || ||||| || |||||| ||||| ||  |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  13953 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 13855  T
Q  133 ctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaaat 198  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  13854 ctcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaat 13788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 223 - 304
Target Start/End: Original strand, 19857685 - 19857766
Alignment:
Q  223 atatatacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcat 304  Q
    ||||||| ||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19857685 atatatatataaaatacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcat 19857766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 33 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 8574971 - 8574868
Alignment:
Q  33 aacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacat 132  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  8574971 aacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaacagtatac-aaaacaacatgacataataatatcaaatgtaattcaacaacat 8574873  T
Q  133 ctcaa 137  Q
    |||||    
T  8574872 ctcaa 8574868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 405 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 12778460 - 12778388
Alignment:
Q  405 catacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 477  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12778460 catacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattctgtaccaatcaataccagatttcatttcaaattc 12778388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 22 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 23374474 - 23374314
Alignment:
Q  22 acatcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgca 120  Q
    ||||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||| ||||    
T  23374474 acatcttcaacaacttagaacgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgca 23374375  T
Q  121 agtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcaca 181  Q
    | |||||||||||| || |||||| |||    |||||||||||||| |  |||||||||||    
T  23374374 attcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcaca 23374314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 445 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 12033511 - 12033436
Alignment:
Q  445 gtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 520  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12033511 gtaccaatctttaccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 12033436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 31 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 52243302 - 52243131
Alignment:
Q  31 tcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa-caacaacacag-cagtatacaaaaacaga--atgacataataatatcaaatgcaagtcaa 126  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| || |||||| ||||  |||   |||| |||| ||||||||||| || ||||    
T  52243302 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaat-cagttcatgatataacaatatcaaatgaaattcaa 52243204  T
Q  127 caacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaaat 198  Q
    |||||||||||  ||||| |||| || ||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  52243203 caacatctcaaacattcatatataatccaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaat 52243131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 413 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 22725494 - 22725397
Alignment:
Q  413 caactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattca 510  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22725494 caactttcatgtttacaccaaagaccaattctgtacctatcaatatcagttttcatttcaaatttgggaaaagttgtgctgaaattcataaagattca 22725397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 31 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 43198661 - 43198492
Alignment:
Q  31 tcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa-caacaacacag-cagtatacaaaaacaga-atgacataataatatcaaatgcaagtcaac 127  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| || || ||| |||||  |   |||| ||||  ||||||||||||||||| |    
T  43198661 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacaatatgcaaaacaattcatgatataaccatatcaaatgcaagtcatc 43198562  T
Q  128 aacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaa 196  Q
    || ||||||| |||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  43198561 aatatctcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 43198492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 333 - 430
Target Start/End: Original strand, 14951270 - 14951367
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacac 430  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | || ||||||||||||||   || ||||||||||| |||||||||    
T  14951270 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggaagtcaaaccaaagccattagaaagctaacataattatctacaactttcatgtttacac 14951367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 202 - 271
Target Start/End: Original strand, 362268 - 362336
Alignment:
Q  202 aatcaacatcttaaaacatcaatatatacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaa 271  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  362268 aatcaacatcttaaaacatca-tatatacatataacacttcatcaatcatggacaatattgtattcacaa 362336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 319 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 14745989 - 14745925
Alignment:
Q  319 tgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaa 383  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| |||||    
T  14745989 tgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagtgctataaatcgttttgacgtcagaccaa 14745925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 676 - 748
Target Start/End: Complemental strand, 42225837 - 42225765
Alignment:
Q  676 taggattttcatttaaattagagatgaacatccttatgattttgttgcacccacatataagcaattcaattga 748  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  42225837 tagggttttcatttgaattggagatgaacatcctcatgattttgttgcaaccacatataagcaattaaattga 42225765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 335 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 55377293 - 55377197
Alignment:
Q  335 taatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacc 431  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | || ||||||||||||||   || ||| ||||||| ||||||||||    
T  55377293 taatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggaagtcaaaccaaagccattagaaagctaacataattatctaaaactttcatgtttacacc 55377197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 23 - 101
Target Start/End: Original strand, 3096300 - 3096379
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatga 101  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||    
T  3096300 catcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatga 3096379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 313 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 15118029 - 15117911
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    | | |||||||||| |||||||||| ||| || | |||||||||||    || |||    
T  15118029 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcataaaccaaaaatcattttcaagtcaaaccgacgccactggaaagctaacacaattatcta 15117930  T
Q  413 caactttcgtgtttacacc 431  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  15117929 caactttcatgtttacacc 15117911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 333 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 25120144 - 25120046
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacc 431  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| | || |||||||||||| |   |||||| ||||||| ||||||||||    
T  25120144 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggacgtcaaaccaaagccattagaaagctaacttaattacctaaaactttcatgtttacacc 25120046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 333 - 442
Target Start/End: Original strand, 14995644 - 14995753
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacct 432  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||| || |||||||||||||    || ||| ||||||| ||||||||||     
T  14995644 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttagacctcaaaccaacgacattagaaagctaacaaaattatctaaaactttcatgtttacacca 14995743  T
Q  433 aagaccaatt 442  Q
    ||| ||||||    
T  14995744 aaggccaatt 14995753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 98 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 15464969 - 15464888
Alignment:
Q  98 atgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatca 179  Q
    |||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  15464969 atgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacattcatatataattcaagtattgcatatacaattatatca 15464888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 333 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 43281795 - 43281694
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacct 432  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||  | || |||||||||||||||   |||||||| |||| |||| ||||||    
T  43281795 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggaagtaaaaccatagccattagaaagctaacatcttaacctacaattttcatgttaacacct 43281696  T
Q  433 aa 434  Q
    ||    
T  43281695 aa 43281694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 23 - 141
Target Start/End: Original strand, 12774014 - 12774132
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgca 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| | ||||||| | ||| ||  |||| |||| |||||| ||| ||    
T  12774014 catcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaataca 12774112  T
Q  121 agtcaacaacatctcaattat 141  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  12774113 a-tcaacaacatctcaattat 12774132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 333 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 18293765 - 18293667
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacc 431  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| | || |||||| |||||||   || ||| ||||||| ||||||||||    
T  18293765 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggacgtcaaaccaaagccattagaaatctaacataattatctaaaactttcatgtttacacc 18293667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 333 - 442
Target Start/End: Original strand, 18247739 - 18247848
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacct 432  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||| | || |||||||||||||    || ||||||||||| ||||||||||     
T  18247739 agtaatttaatcatatctcaagttctaaaaatcatttggacgtcaaaccaaagccattagaaagctaacaaaattatctacaactttcatgtttacacca 18247838  T
Q  433 aagaccaatt 442  Q
    ||| ||||||    
T  18247839 aagtccaatt 18247848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 333 - 442
Target Start/End: Original strand, 47357183 - 47357292
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacct 432  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||| | || |||||||||||||    || ||||||||||| ||||||||||     
T  47357183 agtaatttaatcatatctcaagttctaaaaatcatttggatgtcaaaccaaggccattagaaagctaacaaaattatctacaactttcatgtttacacca 47357282  T
Q  433 aagaccaatt 442  Q
    ||| ||||||    
T  47357283 aagtccaatt 47357292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 35 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 14053403 - 14053306
Alignment:
Q  35 cttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacaacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacat 132  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||  |||||| |||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||    
T  14053403 cttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaaacaacagcatagacagtatac--aaacagcatgacataataatatcaatttcaattcatcaacat 14053306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 421 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 15489717 - 15489661
Alignment:
Q  421 gtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 477  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  15489717 gtgtttacacctaagaccaattctgtatcaatcaataccagacttcatttcaaattc 15489661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 335 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 15287966 - 15287859
Alignment:
Q  335 taatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaa 434  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||| | || ||||||||||| |    || ||||||||||| |||||||||| ||    
T  15287966 taatttgatcatatctcaagttctaaaaatcatttggacgtcaaaccaaagccattagaaagctaataaaattatctacaactttcatgtttacaccaaa 15287867  T
Q  435 gaccaatt 442  Q
    | ||||||    
T  15287866 gtccaatt 15287859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 335 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 15295076 - 15294969
Alignment:
Q  335 taatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaa 434  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||| | || ||||||||||| |    || ||||||||||| |||||||||| ||    
T  15295076 taatttgatcatatctcaagttctaaaaatcatttggacgtcaaaccaaagccattagaaagctaataaaattatctacaactttcatgtttacaccaaa 15294977  T
Q  435 gaccaatt 442  Q
    | ||||||    
T  15294976 gtccaatt 15294969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 333 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 5683465 - 5683367
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacc 431  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||   || | |||||||||||    |||||| ||||||| ||||||||||    
T  5683465 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggacgtcaaaccaaaaccattggaaagctaacaaaattacctaaaactttcatgtttacacc 5683367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 313 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 7640863 - 7640745
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    |   |||||||||| |||||||||| ||| || | |||||||||||    || |||    
T  7640863 attcactgtgacctacgtgcagtaatttaaccataactcataaaccgaaaatcattttcaagtcaaaccgacgccactggaaagctaacacaattatcta 7640764  T
Q  413 caactttcgtgtttacacc 431  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  7640763 caactttcatgtttacacc 7640745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 435
Target Start/End: Original strand, 9198544 - 9198658
Alignment:
Q  321 tgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttc 420  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| | |||||   || ||||||  |||||||||||  || |||||||    
T  9198544 tgacatacgtgtattaatttgaccataaatcaagttgtagaaatcattttgaagtaagaccaaatccattagaaatataacatccatatataaaactttc 9198643  T
Q  421 gtgtttacacctaag 435  Q
     |||||||| |||||    
T  9198644 atgtttacaactaag 9198658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 333 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 22355169 - 22355071
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacc 431  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||| | || |||||||||||||    || ||||||||||| ||||||||||    
T  22355169 agtaatttaatcatatctcaagttctaaaaatcatttggacgtcaaaccaaagccattagaaagctaacaaaattatctacaactttcatgtttacacc 22355071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 333 - 442
Target Start/End: Original strand, 10643746 - 10643855
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacct 432  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||   || ||||||||||||||   || ||||||||||| ||||| ||||     
T  10643746 agtaatttaatcatatctcaagttctaaaaatcatttggatgtcaaaccaaaaccattagaaagctaacataattatctacaactttcatgtttgcacca 10643845  T
Q  433 aagaccaatt 442  Q
    ||| ||||||    
T  10643846 aagtccaatt 10643855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 345 - 442
Target Start/End: Original strand, 16731688 - 16731785
Alignment:
Q  345 ataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 442  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| | || |||| |||||||||   || ||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  16731688 ataactcaagttcaaaaaatcatttggaagtcaaaccaaagccattagagagctaacataattatctaaaactttcatgtttacaccaaaggccaatt 16731785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 333 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 19698082 - 19698013
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaaca 402  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| | ||| ||||| ||||||    
T  19698082 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggacgtcaaaccaaagccaaaagaaatctaaca 19698013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 333 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 19708667 - 19708598
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaaca 402  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| | ||| ||||| ||||||    
T  19708667 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggacgtcaaaccaaagccaaaagaaatctaaca 19708598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 39706395 - 39706299
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtca 125  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| ||  |||| |||| |||||| |||||||||||    
T  39706395 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtca 39706299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 31 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 12288316 - 12288211
Alignment:
Q  31 tcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacaacaacaca-gcagtatacaaaaacag--aatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 126  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| | ||||||| | ||| |||   |||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  12288316 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaccagttcatgatataacaatatcaaatgcaattcaa 12288218  T
Q  127 caacatc 133  Q
    |||||||    
T  12288217 caacatc 12288211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 69
Target Start/End: Original strand, 8846363 - 8846409
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa 69  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  8846363 catcatcatcaacttagaccgacttattcagcttagttaaataacaa 8846409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 69
Target Start/End: Original strand, 15551824 - 15551870
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa 69  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15551824 catcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 15551870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 182 - 235
Target Start/End: Original strand, 19857607 - 19857661
Alignment:
Q  182 atataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatca-atatatacatata 235  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  19857607 atataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatatatatata 19857661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 333 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 17146389 - 17146320
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaaca 402  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||| | || |||||||||||||    
T  17146389 agtaatttaatcatatctcaagttctaaaaatcatttggacgtcaaaccaaagccattagaaagctaaca 17146320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 333 - 402
Target Start/End: Original strand, 18168293 - 18168362
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaaca 402  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||| ||||| || |||||||||||||    
T  18168293 agtaatttaatcataactcaagttctaaaaatcatttggacctcaaatcaacgccattagaaagctaaca 18168362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 333 - 442
Target Start/End: Original strand, 19020009 - 19020118
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacct 432  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||   || |||||||||||||    || ||| ||||||| ||||||||||     
T  19020009 agtaatttaatcatatctcaagttctaaaaatcatttggacgtcaaaccaaaaccattagaaagctaacaaaattatctaaaactttcatgtttacacca 19020108  T
Q  433 aagaccaatt 442  Q
    ||| ||||||    
T  19020109 aagtccaatt 19020118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 313 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 44772760 - 44772723
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataact 350  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44772760 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataact 44772723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 218 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 26922452 - 26922388
Alignment:
Q  218 catcaatatatacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacata 282  Q
    |||||| |||||||||||| | ||||||| |||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||    
T  26922452 catcaacatatacatataataattcatcagtcatgaacaacatcatattcatcaacatatacata 26922388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 438 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 15355069 - 15355030
Alignment:
Q  438 caattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 477  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15355069 caattatgtagcaatcgataccagttttcatttcaaattc 15355030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 361 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 15447874 - 15447804
Alignment:
Q  361 aaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatcca-tacctacaactttcgtgtttacacc 431  Q
    |||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||||    
T  15447874 aaatcattttcaagtcagaccaaagccaatagaaagctaac-tcaattacctacaactttcatgtttacacc 15447804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 134
Target Start/End: Original strand, 17046506 - 17046604
Alignment:
Q  35 cttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacat 132  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| | | |||||| || |||   |||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||    
T  17046506 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggtagtatagaacaac---atgacataattatatcaaattcaattcatcaacat 17046602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 651 - 730
Target Start/End: Complemental strand, 28427404 - 28427325
Alignment:
Q  651 gttggacatttccaatatctccttttaggattttcatttaaattagagatgaacatccttatgattttgttgcacccaca 730  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| || |||| || |||||||||||   | |||||||||| |||||    
T  28427404 gttgggcatttccaatatctctttttagggttttcaattgaattggatatgaacatcctcgcggttttgttgcaaccaca 28427325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 227 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 14746520 - 14746442
Alignment:
Q  227 atacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatg 305  Q
    |||||||||  | |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||  | |||||||||||||    
T  14746520 atacatatactaattcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatataacacttcatcaatcatg 14746442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 227 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 15355227 - 15355149
Alignment:
Q  227 atacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatg 305  Q
    |||||||||  | |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||  | |||||||||||||    
T  15355227 atacatatactaattcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatataacacttcatcaatcatg 15355149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 227 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 19618075 - 19617997
Alignment:
Q  227 atacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatg 305  Q
    |||||||||  | |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||  | |||||||||||||    
T  19618075 atacatataccaattcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatataacacttcatcaatcatg 19617997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 227 - 305
Target Start/End: Original strand, 19857742 - 19857820
Alignment:
Q  227 atacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatg 305  Q
    |||||||||  | |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||  | |||||||||||||    
T  19857742 atacatatactaattcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatataacacttcatcaatcatg 19857820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 240 - 305
Target Start/End: Original strand, 362347 - 362412
Alignment:
Q  240 ttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatg 305  Q
    |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||  | |||||||||||||    
T  362347 ttcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatataacacttcatcaatcatg 362412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 361 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 630361 - 630280
Alignment:
Q  361 aaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 442  Q
    |||||||||| |||||||||||| | || | |||||||||||    || ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  630361 aaatcattttcaagtcaaaccaaagtcattggaaagctaacaaaattatctacaactttcatgtttacaccaaaggccaatt 630280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 333 - 442
Target Start/End: Original strand, 8374040 - 8374149
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacct 432  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||| || || ||| ||| | || ||||||| |||||    || ||||||||||| ||||||||||     
T  8374040 agtaatttaatcatatctcaagttctaaaaatcatttggacgtaaaatcaaagccattagaaagttaacaaaattatctacaactttcatgtttacacca 8374139  T
Q  433 aagaccaatt 442  Q
    ||| ||||||    
T  8374140 aagtccaatt 8374149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 196
Target Start/End: Original strand, 8846465 - 8846553
Alignment:
Q  108 aatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaa 196  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||| | || ||||| |||||| ||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  8846465 aatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaa 8846553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 321 - 374
Target Start/End: Original strand, 9221267 - 9221320
Alignment:
Q  321 tgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaag 374  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||    
T  9221267 tgacctatgtgtagtaatttgaccataaatcaaattctagaaaacattttgaag 9221320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 361 - 442
Target Start/End: Original strand, 15008560 - 15008641
Alignment:
Q  361 aaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 442  Q
    |||||||||| |||| ||||||| | || | |||||||||||    || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  15008560 aaatcattttcaagtaaaaccaaagccactggaaagctaacacaattatctacaactttcatgtttacaccaaagaccaatt 15008641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 361 - 442
Target Start/End: Original strand, 16998119 - 16998200
Alignment:
Q  361 aaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 442  Q
    |||||||||| |||||||||||| | || | |||||||||||    || ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  16998119 aaatcatttttaagtcaaaccaaagccactggaaagctaacacaattatctacaactttcatgtttacaccaaaggccaatt 16998200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 393 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 18218912 - 18218875
Alignment:
Q  393 aaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacac 430  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  18218912 aaagctaacattcatacctacaactttcatgtttacac 18218875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #141
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 361 - 442
Target Start/End: Original strand, 40229897 - 40229978
Alignment:
Q  361 aaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 442  Q
    |||||||||| |||||||||||| | || | |||||||||||    || ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  40229897 aaatcattttcaagtcaaaccaaagccactggaaagctaacacaattatctacaactttcatgtttacaccaaaggccaatt 40229978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #142
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 98 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 53082188 - 53082089
Alignment:
Q  98 atgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaata-taacaacatcaa 196  Q
    |||| |||| ||||||||| |||| |||| ||||||||||  || || |||| ||||| |||||||||||| | |||||||||| || ||||||||||||    
T  53082188 atgatataacaatatcaaa-gcaaatcaataacatctcaaacat-catatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaa 53082091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 395; Significance: 0; HSPs: 6)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 395; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 520
Target Start/End: Original strand, 13958 - 14447
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13958 atcaacttagaccgactcatgcagcttagataaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 14057  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14058 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca-tatata 14156  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  14157 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 14256  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  14257 ttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatacctacaacgttcgtgtttaca 14356  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 520  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14357 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 14447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #2
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 229 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 23484 - 23201
Alignment:
Q  229 acatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctac 328  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23484 acatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcattgtgacctac 23385  T
Q  329 gtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttac 428  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  23384 gtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatctatacctacaacttttgtgtttac 23285  T
Q  429 acctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    |||| |||| |||| | || |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23284 accttagactaattctatatcaataaataccagttttcatttcaaatttggacaaagttgtgctgaaattcatacaaattcact 23201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #3
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 313 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 23047 - 22883
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  23047 attcactgtgacctacgtgcagtaatatgaccataactcatgttctataaatcgttttgacgtcagaccaacggcattagaaagctaacatccatatcta 22948  T
Q  413 caactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 477  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22947 caacttttgtgtttacacctaagaccaattttgtaccaatcaataccagatttcatttcaaattc 22883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #4
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 435 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 23118 - 23041
Alignment:
Q  435 gaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23118 gaccaattttgtaccaatcaataccagatttcatttcaaattcggaaaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 23041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #5
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 313 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 23207 - 23121
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagcta 399  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| || ||||||||||    
T  23207 attcactgtgacctacatgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaacgacattagaaagcta 23121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #6
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 429 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 20764 - 20716
Alignment:
Q  429 acctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 477  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| |||||    
T  20764 acctaagaccaattctgtaccaatcaatatcagatttcatttccaattc 20716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 395; Significance: 0; HSPs: 91)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 395; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 520
Target Start/End: Original strand, 21840778 - 21841266
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21840778 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 21840877  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21840878 cgtctcaattattcacatataatttaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatca-tatata 21840976  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||     
T  21840977 catataacacttcatcaatcatggacaatatcatattcacaa-catatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgttacctaca 21841075  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21841076 tgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacattcatacctacaactttcgtgtttaca 21841175  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 520  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21841176 cctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 21841266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 387; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 21923442 - 21922954
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21923442 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 21923343  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21923342 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca-tatata 21923244  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  21923243 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 21923145  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  21923144 tgcagtaatttgactataactctagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatacctacaactttcgtgtttaca 21923045  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 520  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21923044 cctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 21922954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 383; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 512
Target Start/End: Original strand, 13988877 - 13989357
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13988877 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 13988976  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13988977 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca-tatata 13989075  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  13989076 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 13989174  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  13989175 tgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatacctacaactttcgtgtttaca 13989274  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13989275 cctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 13989357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 371; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 21475238 - 21474757
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21475238 atcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 21475139  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21475138 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca-tatata 21475040  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  21475039 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcataatcaattattcactgtgacctacg 21474940  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  21474939 tttagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatacctacaactttcgtgtttaca 21474840  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21474839 cctaagaccaattctgtaccaatcaataccggttttcatttcatattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 21474757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 520
Target Start/End: Original strand, 16361928 - 16362418
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16361928 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacgacagcaacacaacagtatataaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 16362027  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa-caacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatat 228  Q
    | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16362028 cgtctcaattattcacaaataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataaacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatca-tatat 16362126  T
Q  229 acatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctac 328  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||    
T  16362127 acatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattaacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcataataaattattcactgtgacctac 16362226  T
Q  329 gtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttac 428  Q
    || ||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16362227 gttcagtaatttgaccataacttaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaaccgcattagaaagctaacttccatacctacaactttcgtgtttac 16362326  T
Q  429 acctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 520  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16362327 acccaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 16362418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 23593886 - 23593396
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23593886 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 23593787  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa-caacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatat 228  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23593786 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataaacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatca-tatat 23593688  T
Q  229 acatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctac 328  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  23593687 acatataacacttcattaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcataatcaattattcactgtgacctac 23593588  T
Q  329 gtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttac 428  Q
    || ||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  23593587 gttcagtaatttaactataacgcaagttctataaattattttgacgtcagaccaacggcattagaaagctaacatacatacctacaactttcttgtttac 23593488  T
Q  429 acctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 520  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  23593487 acctaagactaattatgcaccaatcaataccagttttcatttcaaactcggacaaagttgtgctgaaattcgtgaaaattcactaagacctc 23593396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 15860160 - 15859679
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaa-ca 128  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  15860160 atcaacttggaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacagcagtatacaaaaacaacatgacataataatattaaatgcaagtcaatca 15860061  T
Q  129 acatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatat 228  Q
    || ||| ||||| ||||| || ||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  15860060 acgtcttaattactcacaaataattcaatcaatgcacatacaattatatcacaatataacaacatcagatggtaatcaacatcttaagacatca-tatat 15859962  T
Q  229 acatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctac 328  Q
    |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  15859961 acatataacacttcatcaaccatggacaatatcgtattcgcaag-atatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctac 15859863  T
Q  329 gtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttac 428  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15859862 gtgcagttatttgaccataactcaagttgtataaattcttttgaagtcaaaccaacggcattagaaaactaacatccatacctacaactttcgtgcttac 15859763  T
Q  429 acctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15859762 acctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 15859679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 240 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 27161529 - 27161257
Alignment:
Q  240 ttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacgtgcagtaatt 339  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27161529 ttcatcaatcattaacaatattttattcataaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcattgtgacctacgtgcagtaatt 27161430  T
Q  340 tgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagacca 439  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27161429 tgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacgacattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagacca 27161330  T
Q  440 attatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27161329 attttgtaccaatcaatacctgttttcatttcaaattctgacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 27161257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 227 - 510
Target Start/End: Original strand, 29776947 - 29777230
Alignment:
Q  227 atacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacct 326  Q
    |||||||||  | |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  29776947 atacatatactaattcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacct 29777046  T
Q  327 acgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgttt 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29777047 acgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaacccaacgacattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgatt 29777146  T
Q  427 acacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattca 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29777147 acacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattca 29777230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 230 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 16275209 - 16274919
Alignment:
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||    
T  16275209 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgaattcacaaacatatacatacatatattaattcatcaatcgtattcaattattcactgtgacctacg 16275110  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggca-atagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttac 428  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16275109 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtgaaaccaatgacatttagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttac 16275010  T
Q  429 acctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacct 519  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  16275009 acctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttccaattcggacagagttgtgctaaaattcataaacattcactatgacct 16274919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 30 - 304
Target Start/End: Original strand, 29776699 - 29776971
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29776699 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaataacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 29776798  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29776799 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatc-atatata 29776897  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcat 304  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29776898 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaatcat 29776971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 240 - 512
Target Start/End: Original strand, 29298461 - 29298733
Alignment:
Q  240 ttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacgtgcagtaatt 339  Q
    |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| || |||||||||||    
T  29298461 ttcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacttatgtgcagtaatt 29298560  T
Q  340 tgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagacca 439  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29298561 tgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaatggcattagaaagctaacattcatacctacaactttcgtgtttacacctaagacca 29298660  T
Q  440 attatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29298661 attatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgaacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 29298733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 30 - 304
Target Start/End: Original strand, 31612324 - 31612596
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31612324 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaatagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 31612423  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  31612424 catctcagttattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaatatcttaaaacatc-atatata 31612522  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcat 304  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31612523 catataatacttcatcaatcatggacaatattgtattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaatcat 31612596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 227 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 22122970 - 22122685
Alignment:
Q  227 atacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacct 326  Q
    |||||||||  | |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  22122970 atacatataccaattcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacct 22122871  T
Q  327 acgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgttt 426  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  22122870 acgtgcagtaatttgactataacccaagttctataaatcgttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctagcatccatacctacaactttcatgttt 22122771  T
Q  427 acacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22122770 acacctaagaccaattctggacctatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 22122685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 227 - 512
Target Start/End: Original strand, 31612572 - 31612857
Alignment:
Q  227 atacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacct 326  Q
    |||||||||  | |||||||||||| ||||||||| || | | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  31612572 atacatatactaattcatcaatcataaacaatatcatactgataaacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactttgacct 31612671  T
Q  327 acgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgttt 426  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31612672 acgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacgacatttgaaagctaacattcatacctacaactttcgtgttt 31612771  T
Q  427 acacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31612772 acacctaagaccaattcggtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 31612857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 30 - 304
Target Start/End: Original strand, 29298148 - 29298419
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29298148 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatga-ataataatatcaaatgcaagtcaacaa 29298246  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29298247 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataataacatcaaataataatcaacatcttaaaacatc-atatata 29298345  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcat 304  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29298346 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacatatatatactaattcatcaatcat 29298419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 286 - 519
Target Start/End: Original strand, 13227129 - 13227362
Alignment:
Q  286 atactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacg 385  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13227129 atactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtgtagtaatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacg 13227228  T
Q  386 gcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaag 485  Q
    ||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13227229 gcactagaaagctaacatccatacataaaactttcgtgtttacacctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaag 13227328  T
Q  486 ttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacct 519  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13227329 ttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacct 13227362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 286 - 519
Target Start/End: Original strand, 29535317 - 29535550
Alignment:
Q  286 atactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacg 385  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  29535317 atactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtgtagtaatttgaccataactcaagttctataaattcttttgaagtcaaaccaacg 29535416  T
Q  386 gcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaag 485  Q
     || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29535417 acactagaaagctaacatccatacatacaactttcgtgtttatacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaag 29535516  T
Q  486 ttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacct 519  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29535517 ttgtgttgaaattcataaaaattcactaagacct 29535550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 30 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 16275515 - 16275241
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaa-ca 128  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  16275515 atcaacttagaccgactcatacaacttagttaaataacaacaacgacatagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaatca 16275416  T
Q  129 acatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatat 228  Q
    || |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  16275415 acgtctcaattattcacataaaattcaattaatgcatataccattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaatatcttgaaacatc-atatat 16275317  T
Q  229 acatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcat 304  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16275316 acatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcgcaaacatatacatacatatactaattcatcaatcat 16275241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 34 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 22123215 - 22122946
Alignment:
Q  34 acttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa-caacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacat 132  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  22123215 acttagaccgactcatgcagcttagttaaatagcaaacagcaacacaacagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaatgt 22123116  T
Q  133 ctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatatacat 232  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  22123115 ctcaattattcacatttaattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaatatcttaaaacatc-atatatacat 22123017  T
Q  233 ataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcat 304  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  22123016 ataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacataaacatacatataccaattcatcaatcat 22122946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 313 - 510
Target Start/End: Original strand, 31612851 - 31613048
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  31612851 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagcttaaatccataccta 31612950  T
Q  413 caactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattca 510  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31612951 taactttagtgtttacacctaagaccaattctataccaatcaataccagttttcagttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattca 31613048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 227 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 22050792 - 22050543
Alignment:
Q  227 atacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacct 326  Q
    |||||||||  | |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  22050792 atacatatactaattcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacct 22050693  T
Q  327 acgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgttt 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | | ||||  | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22050692 acgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacattagaccattgacattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgttt 22050593  T
Q  427 acacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaatt 476  Q
    |||||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  22050592 acacctaagaccaattctggacctatcaataccagatttcatttcaaatt 22050543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 313 - 477
Target Start/End: Original strand, 31613044 - 31613208
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  31613044 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaacggtattagaaacctaacatccataccta 31613143  T
Q  413 caactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 477  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  31613144 caactttcgtgtttacacctaagaccaattatgaacctatcaataccatatttcatttcaaattc 31613208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 30 - 198
Target Start/End: Original strand, 21346972 - 21347141
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaa-ca 128  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21346972 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaaagacacagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaatca 21347071  T
Q  129 acatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 198  Q
    || ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21347072 acgtctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaat 21347141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 313 - 477
Target Start/End: Original strand, 29298727 - 29298891
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29298727 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttttataaatcgttttgacgtcagaacaacggcattagaaagctaacatccataccta 29298826  T
Q  413 caactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 477  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  29298827 caactttcgtgtttacacctaagaccaattctggacctatcaataccagatttcatttcaaattc 29298891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 313 - 479
Target Start/End: Original strand, 29777226 - 29777392
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  29777226 attcattgtgacctacgttcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttaacgtcagaccaacggcattagaaagctaacatacataccta 29777325  T
Q  413 caactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcag 479  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29777326 caacttttgtgtttacacctaagactaattctgtaccgatcaataccagtttttatttcaaattcag 29777392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 30 - 198
Target Start/End: Original strand, 21342107 - 21342276
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaa-ca 128  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21342107 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaaagacacagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaatca 21342206  T
Q  129 acatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 198  Q
    || ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21342207 acgtctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattacatcacaatataacaacatcaaat 21342276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 35 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 45574989 - 45574812
Alignment:
Q  35 cttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatc 133  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  45574989 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatgacataataataccaaatgcaagtcaacaacgtc 45574890  T
Q  134 tcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatc 211  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  45574889 tcaattattaacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataagaacatcaaatcataatcaacatc 45574812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 313 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 15859672 - 15859508
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  15859672 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgatcataactcaagttctataaatagttttgaggtcagaccaacgacattagaaagctaacattcataccta 15859573  T
Q  413 caactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 477  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15859572 caactttcgtgtatacacctaagaccaattctgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattc 15859508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 30 - 198
Target Start/End: Original strand, 21707178 - 21707346
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21707178 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacacaatagtatacaaaaaaagcatgacagaataatatcaaatgcaagtcaacaa 21707277  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 198  Q
    | |||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21707278 cgtctcaattattcacatataaatcatgtaatgcctatacaattatatcacaatataacatcatcaaat 21707346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 30 - 198
Target Start/End: Original strand, 21711720 - 21711888
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21711720 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacacaatagtatacaaaaaaagcatgacagaataatatcaaatgcaagtcaacaa 21711819  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 198  Q
    | |||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21711820 cgtctcaattattcacatataaatcatgtaatgcctatacaattatatcacaatataacatcatcaaat 21711888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 30 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 13213013 - 13212844
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaa-ca 128  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || || |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13213013 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacgcaacagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaatca 13212914  T
Q  129 acatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 198  Q
    || ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13212913 acgtctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaat 13212844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 320 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 9044867 - 9044711
Alignment:
Q  320 gtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaacttt 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  9044867 gtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgttagaccaacggcattagaaaactaacatacatacctacaacttt 9044768  T
Q  420 cgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaatt 476  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  9044767 cgtgtttacacctaagactaattctgtaccgatcaataccagtttttatttcaaatt 9044711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 30 - 198
Target Start/End: Original strand, 433023 - 433190
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||  ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  433023 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacggcaaca-cag-gcagtatacaaaaacatcaagacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 433120  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaaat 198  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  433121 catctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataaacaacatcaaat 433190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 313 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 22122691 - 22122526
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22122691 attcactgtgatctatgtgcagtaatttgaccataactcaagttctacaaatcgttttgaagtaaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 22122592  T
Q  413 caac-tttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 477  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  22122591 caacttttagtgtttacacctaagaccaattctggacctatcaataccagatttcatttcaaattc 22122526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 30 - 193
Target Start/End: Original strand, 40389165 - 40389329
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaa-ca 128  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  40389165 atcaacctagactgactcatgcaacttggttaaataacaacagcgacacatcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaatca 40389264  T
Q  129 acatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacat 193  Q
     | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40389265 tcgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataacaacat 40389329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 313 - 477
Target Start/End: Original strand, 16401407 - 16401571
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  | || | ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  16401407 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttatataaatcctttccacgttagaccaatggaaatagaaagctaacatccataccta 16401506  T
Q  413 caactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 477  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  16401507 caacttttgtgtctacacctaagaccaattctgtaccgatcaataccagtttttatttcaaattc 16401571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 321 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 16274924 - 16274768
Alignment:
Q  321 tgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttc 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||| |  | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16274924 tgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatagttttgacgtcagaccaatgatattagaaagctaacatccatacctacaactttc 16274825  T
Q  421 gtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 477  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||| || ||||||||||||    
T  16274824 gtgtttacacctaagaccaattctggacctatcaacaccagattccatttcaaattc 16274768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 313 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 27161263 - 27161098
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| |||||| | | |||||||||||||||||||||||    
T  27161263 attcactgtgacctacatgcagtaatttgaccataattcaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaacagtattagaaagctaacatccataccta 27161164  T
Q  413 caactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattca 478  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| |  || |||||||||||||    
T  27161163 caactttcctgtttacacctaagaccaattctggacctatcaatactatattccatttcaaattca 27161098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 323 - 477
Target Start/End: Original strand, 40129387 - 40129541
Alignment:
Q  323 acctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgt 422  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  40129387 acctacgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaatcgttttgatgccagaccaacgacattagaaatctaacattcatacctacaactttagt 40129486  T
Q  423 gtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 477  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  40129487 gtttacacctaagatcaattctggacctatcaataccatatttcatttcaaattc 40129541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 50210327 - 50210168
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaa 121  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  50210327 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 50210228  T
Q  122 gtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcaca 181  Q
    |||||||||||||||| ||| ||   || ||||||||||||| | ||  |||||||||||    
T  50210227 gtcaacaacatctcaagtatacattcataattcaagtaatgcgtttaacattatatcaca 50210168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 23 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 27250843 - 27250684
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaa 121  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  27250843 catcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaa 27250744  T
Q  122 gtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcaca 181  Q
     ||| |||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  27250743 ttcatcaacatcttaaatattcaaatattattcaagtaatgcataaaacattatatcaca 27250684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 23 - 141
Target Start/End: Original strand, 34509787 - 34509906
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaa 121  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  34509787 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataatgatatcaaatgcaa 34509886  T
Q  122 gtcaacaacatctcaattat 141  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  34509887 gtcaacaacatcttaattat 34509906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 390 - 477
Target Start/End: Original strand, 43543271 - 43543358
Alignment:
Q  390 tagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 477  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43543271 tagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 43543358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 23 - 181
Target Start/End: Original strand, 22532276 - 22532435
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaa 121  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||    
T  22532276 catcttcatcaacttagaccaactcatgcaatttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatccattgcaa 22532375  T
Q  122 gtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcaca 181  Q
     |||||||||||| || ||||||   || |||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  22532376 ttcaacaacatcttaaatattcattcataattcaagtaatgcacataacattatatcaca 22532435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 204 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 22050866 - 22050768
Alignment:
Q  204 tcaacatcttaaaacatcaatatatacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatca 303  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22050866 tcaacatcttaaaacatca-tatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaatca 22050769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 361 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 10812827 - 10812676
Alignment:
Q  361 aaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaatacca 460  Q
    |||||||||  |||||||||||| |||| | |||||||||||    || |||| |||||| ||||||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||    
T  10812827 aaatcatttctaagtcaaaccaaaggcactggaaagctaacacaattatctacgactttcatgtttacacctaagatcaattcagtaccgatcaatacca 10812728  T
Q  461 gttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10812727 gttttaatttcaaattcggagaaagttgtgctgaaattcatagaaattcact 10812676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 35 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 21896358 - 21896193
Alignment:
Q  35 cttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa-caacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacat 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||| || |||||||||||| ||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  21896358 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 21896260  T
Q  133 ctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaaat 198  Q
    |||||  ||||| |||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  21896259 ctcaaacattcatatataattcatgtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaat 21896193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 445 - 520
Target Start/End: Original strand, 41372896 - 41372971
Alignment:
Q  445 gtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 520  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41372896 gtaccaatctttaccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 41372971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 30 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 22468803 - 22468651
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 128  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | ||||  ||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  22468803 atcaacttagactgactcatgcaacttagttaaataacaatagcaacataggcagattacaacaacagcatgacatcataatatcaattgcaattcaaca 22468704  T
Q  129 acatctcaattattcacatatgat-tcaagtaatgcatatataattatatcaca 181  Q
    |||||| ||||||||| |||  || |||||||||||| |||  |||||||||||    
T  22468703 acatcttaattattca-ataatatctcaagtaatgcacataacattatatcaca 22468651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 23 - 181
Target Start/End: Original strand, 21026687 - 21026846
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaa 121  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | | ||||||||||||| ||| ||||| |||  ||||||| |||||    
T  21026687 catcgtcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaatataggcagtatacaaaatcagcatgacgtaaatatatcaattgcaa 21026786  T
Q  122 gtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcaca 181  Q
     |||||||||||| || |||||| |||    |||||||||||||| |  |||||||||||    
T  21026787 ttcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcaca 21026846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 35 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 21861672 - 21861510
Alignment:
Q  35 cttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa-caacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacat 132  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||  ||||| || ||||| || |||||| ||||| ||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  21861672 cttagaccgactcatgcagcttagctaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-cagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 21861574  T
Q  133 ctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatca 195  Q
    |||||  ||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  21861573 ctcaaacattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatca 21861510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 313 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 10812682 - 10812612
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaa 383  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10812682 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccatagctcaagttttataaatcattttgaagtcaaaccaa 10812612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 22 - 141
Target Start/End: Original strand, 21754051 - 21754170
Alignment:
Q  22 acatcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgc 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| ||  |||| |||| ||||||||||||    
T  21754051 acatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcaaatgc 21754149  T
Q  120 aagtcaacaacatctcaattat 141  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  21754150 aa-tcaacaacatctcaattat 21754170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 223 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 27161598 - 27161518
Alignment:
Q  223 atatatacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcat 304  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27161598 atatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcgc-aacatatacatatatatactaattcatcaatcat 27161518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 364 - 512
Target Start/End: Original strand, 16401265 - 16401413
Alignment:
Q  364 tcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtt 463  Q
    |||||||  ||||||||||| | || | |||||||||||    || ||| ||||||| |||||||||  ||  |||||| |||||| | |||||||||||    
T  16401265 tcatttttgagtcaaaccaaagccattggaaagctaacacaattatctaaaactttcatgtttacactaaatgccaattttgtaccgaccaataccagtt 16401364  T
Q  464 ttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16401365 ttcatttcaaattcgggaaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 16401413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 187
Target Start/End: Original strand, 16758664 - 16758822
Alignment:
Q  31 tcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacaacaacaca-gcagtatacaaaaacag--aatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||| | ||| |||   |||| |||| |||||||||| |||  |||    
T  16758664 tcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaccagttcatgatataacaatatcaaatacaatacaa 16758762  T
Q  127 caacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa 187  Q
    ||||||| |||  ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  16758763 caacatcacaa-cattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataa 16758822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 23 - 196
Target Start/End: Original strand, 33681014 - 33681188
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgca 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||| | ||| ||  |||| |||| |||||| ||||||    
T  33681014 catcatcttcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 33681112  T
Q  121 agtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaa 196  Q
    ||||  ||||||||||| || ||| | || ||||| |||||| ||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  33681113 agtcgtcaacatctcaaata-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaa 33681188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 23 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 22921983 - 22921868
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgca 120  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| ||  |||| |||| |||||| ||||||    
T  22921983 catcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 22921885  T
Q  121 agtcaacaacatctcaa 137  Q
    | |||||||||||||||    
T  22921884 aatcaacaacatctcaa 22921868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 35 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 35261180 - 35261018
Alignment:
Q  35 cttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa-caacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacat 132  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||| || ||||| || |||||| ||||| ||| |||| |||| |||||||||||||| ||||||   |    
T  35261180 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-cagcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaaca---t 35261085  T
Q  133 ctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaata-taacaacatcaaat 198  Q
    |||||  ||||| | || |||||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||||||    
T  35261084 ctcaaacattcatacataattcaagtaatgcatatacaattacatcacattattaacaacatcaaat 35261018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 23 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 20847268 - 20847173
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaat 117  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | |||||| |||||| ||| |||||||||  |||||||||    
T  20847268 catcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtacacaaaatcagcatgacataaatatatcaaat 20847173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 313 - 431
Target Start/End: Original strand, 13989351 - 13989469
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    | | |||||||||| |||||||||| ||| || | |||||||||||    || |||    
T  13989351 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcataaaccaaaaatcattttcaagtcaaaccgacgccactggaaagctaacacaattatcta 13989450  T
Q  413 caactttcgtgtttacacc 431  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  13989451 caactttcatgtttacacc 13989469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 23 - 130
Target Start/End: Original strand, 20248286 - 20248394
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgca 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||| | ||| ||  |||| |||| |||||| ||||||    
T  20248286 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaaaaacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 20248384  T
Q  121 agtcaacaac 130  Q
    | ||||||||    
T  20248385 aatcaacaac 20248394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 617 - 730
Target Start/End: Original strand, 31815261 - 31815374
Alignment:
Q  617 aacatagtattataacaacgaactcaccgtaaaggttggacatttccaatatctccttttaggattttcatttaaattagagatgaacatccttatgatt 716  Q
    |||| ||||||| |||| | |||||| | || ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| | |||| || |||||||| || ||||||    
T  31815261 aacaaagtattacaacagcaaactcatcatataggttgggcatttccagtatctccttttagggttttcatgtgaattggatatgaacattctcatgatt 31815360  T
Q  717 ttgttgcacccaca 730  Q
    |||||||| |||||    
T  31815361 ttgttgcaaccaca 31815374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 20135201 - 20135316
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 128  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | || || | ||||  ||||| ||||  |||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  20135201 atcaacttagactgactcatgcaacttagttaaacaacaatagcagcataggcagattacaacaacatcatgacataataatatcatgtgcaattcaaca 20135300  T
Q  129 acatctcaattattca 144  Q
    |||||| || ||||||    
T  20135301 acatcttaagtattca 20135316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 333 - 431
Target Start/End: Original strand, 21858592 - 21858690
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacc 431  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| | |  ||||||||||||||   || ||| ||||||| ||||||||||    
T  21858592 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggacgtcaaaccaaagccgttagaaagctaacataactatctaaaactttcatgtttacacc 21858690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 612 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 23573361 - 23573220
Alignment:
Q  612 caacaaacatagtattataacaacgaactcaccgtaaaggttggacatttccaatatctccttttaggattttcatttaaattagagatgaacatcctta 711  Q
    |||||| || |||||||||  ||  |||||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| || |||| ||||| |||||| | |    
T  23573361 caacaatcaaagtattatacaaaataactcaccataaatgttgggcatttccagtatctccttttaggattctcagttgaatttgagataaacatcttca 23573262  T
Q  712 tgattttgttgcacccacatataagcaattcaattgatgatg 753  Q
    |  |||||||||| ||||| ||| ||| |||| |||| ||||    
T  23573261 ttgttttgttgcaaccacaaataggcatttcagttgaagatg 23573220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 240 - 304
Target Start/End: Original strand, 29298408 - 29298472
Alignment:
Q  240 ttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcat 304  Q
    |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29298408 ttcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatatactaattcatcaatcat 29298472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 20454660 - 20454613
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaaca 77  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  20454660 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 20454613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 675 - 753
Target Start/End: Original strand, 7384449 - 7384527
Alignment:
Q  675 ttaggattttcatttaaattagagatgaacatccttatgattttgttgcacccacatataagcaattcaattgatgatg 753  Q
    ||||| |||| |||| |||| |||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||    
T  7384449 ttagggtttttatttgaattggagatgaacatcctcataattttgttgcacgcacatataggcaactcaattgaagatg 7384527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 41050072 - 41049973
Alignment:
Q  98 atgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaata-taacaacatcaa 196  Q
    |||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||    ||| |||| |||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||| ||||    
T  41050072 atgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaa--catcatatataattcaagtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacgtcaa 41049975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 182 - 236
Target Start/End: Original strand, 43543214 - 43543267
Alignment:
Q  182 atataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatatacatataa 236  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43543214 atataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatc-atatatacatataa 43543267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 333 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 44035928 - 44035830
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacc 431  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||| | || |||||||||||| |   |||||| ||||||  ||||||||||    
T  44035928 agtaatttgatcataactcaagttataaaaatcatttggacgtcaaaccaaagccattagaaagctaacttaattacctaaaactttgatgtttacacc 44035830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 333 - 442
Target Start/End: Original strand, 17003909 - 17004018
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacct 432  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||  | ||||||||| || |||||||||||||    || ||| ||||||| ||||||||||     
T  17003909 agtaatttgatcataactcgagttctaaaaatcatttggacctgaaaccaacgccattagaaagctaacaaaattatctaaaactttcatgtttacacca 17004008  T
Q  433 aagaccaatt 442  Q
    ||| ||||||    
T  17004009 aaggccaatt 17004018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 92 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 22354616 - 22354527
Alignment:
Q  92 aacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcaca 181  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  22354616 aacagcatgacataaaaatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 22354527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 333 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 21650979 - 21650883
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    |||||||||| |||||||| |||| || ||||||||| || |||||||||| | || |||||||||||||    |||||| ||||||| ||||||||    
T  21650979 agtaatttgatcataactctagttttaaaaatcatttggacgtcaaaccaaggccattagaaagctaacaaaattacctaaaactttcatgtttaca 21650883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 177
Target Start/End: Original strand, 22237634 - 22237788
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgca 120  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| | ||| | ||| ||| | ||| ||  |||| |||| |||||| ||||||    
T  22237634 catcatcttcaacttagaccgactcatgaagcttagttaaataacaaacagcgacataggcattatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 22237732  T
Q  121 agtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatat 177  Q
    ||||| ||||||||||| || ||| | || ||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  22237733 agtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatat 22237788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 52928081 - 52928029
Alignment:
Q  26 catcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacaacaaca 77  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  52928081 catcttcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaaca 52928029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 222 - 305
Target Start/End: Original strand, 12710129 - 12710212
Alignment:
Q  222 aatatatacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatg 305  Q
    ||||||| ||||||| | | || ||||| ||||||| ||| ||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  12710129 aatatattcatataataatccagcaatcgtgaacaacatcatattcatcaacatatacattcatataataattcatcaatcatg 12710212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 333 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 18060684 - 18060577
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacct 432  Q
    |||||||| | |||| |||||||| |  ||||||||| || |||||||||| | || ||||||||||||||   |||||| ||||||| ||||||||||     
T  18060684 agtaatttaatcatatctcaagtttttaaaatcatttggacgtcaaaccaaagccattagaaagctaacataattacctaaaactttcatgtttacacca 18060585  T
Q  433 aagaccaa 440  Q
    ||| ||||    
T  18060584 aaggccaa 18060577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 69
Target Start/End: Original strand, 21161723 - 21161769
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa 69  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||    
T  21161723 catcatcatcaacttggatcgactcatgcaacttagttaaacaacaa 21161769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 313 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 21474763 - 21474645
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    | | || ||||||| |||||||||| ||| || | ||| |||||||    || |||    
T  21474763 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccttaactcataaaccaaaattcattttcaagtcaaaccgacgccactggaaggctaacacaagtatcta 21474664  T
Q  413 caactttcgtgtttacacc 431  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  21474663 caactttcatgtttacacc 21474645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 427 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 43630344 - 43630294
Alignment:
Q  427 acacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 477  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  43630344 acacctgagaccaattctgtaccaatcaataccatatttcatttcaaattc 43630294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 69
Target Start/End: Original strand, 20918620 - 20918657
Alignment:
Q  32 caacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa 69  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20918620 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 20918657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 333 - 402
Target Start/End: Original strand, 22366527 - 22366596
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaaca 402  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||| | || |||||||||||||    
T  22366527 agtaatttaatcatatctcaagttctaaaaatcatttcgatgtcaaaccaaagtcattagaaagctaaca 22366596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 194
Target Start/End: Original strand, 50686696 - 50686792
Alignment:
Q  98 atgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaata-taacaacatc 194  Q
    |||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||  | ||| |||| ||||| |||||||||||| | |||||||||| || ||||||||||    
T  50686696 atgatataacaatgtcaaatgcaaatcaacaacatctcaaaca-tcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatc 50686792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 103 - 187
Target Start/End: Original strand, 12271642 - 12271725
Alignment:
Q  103 ataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa 187  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||| | | |||||||  ||||| |||||||||||| |||||    
T  12271642 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaa-tatttacgtataactaaagtaatatatatacaattatatcacattataa 12271725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 21714556 - 21714595
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa 69  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  21714556 atcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaa 21714595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 36 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 14295652 - 14295493
Alignment:
Q  36 ttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatc 133  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| | | ||||| | ||| ||  |||| ||||||||||| |||| || |||||||   |    
T  14295652 ttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggtagtatgc-aaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaa---c 14295557  T
Q  134 tcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 198  Q
    ||||||| ||| |  | | ||| |||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  14295556 tcaatta-tcagacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataacaacatcaaat 14295493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 227 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 16275265 - 16275187
Alignment:
Q  227 atacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatg 305  Q
    |||||||||  | |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||  | |||||||||||||    
T  16275265 atacatatactaattcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatataacacttcatcaatcatg 16275187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 256 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 22824184 - 22824135
Alignment:
Q  256 aatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatg 305  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  22824184 aatatcatattcatcaacatatacattcatataataattcatcaatcatg 22824135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 391; Significance: 0; HSPs: 143)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 391; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 512
Target Start/End: Original strand, 39682324 - 39682805
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39682324 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 39682423  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39682424 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca-tatata 39682522  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  39682523 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 39682622  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  39682623 ttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatacctacaactttcgtgtttaca 39682722  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39682723 cctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 39682805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 383; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 512
Target Start/End: Original strand, 18808954 - 18809434
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18808954 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 18809053  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18809054 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca-tatata 18809152  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  18809153 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 18809251  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  18809252 tgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatacctacaactttcgtgtttaca 18809351  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18809352 cctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 18809434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 383; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 23712164 - 23711684
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23712164 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 23712065  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23712064 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca-tatata 23711966  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  23711965 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 23711867  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  23711866 tgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatacctacaactttcgtgtttaca 23711767  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23711766 cctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 23711684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 512
Target Start/End: Original strand, 23130873 - 23131353
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23130873 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 23130972  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23130973 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca-tatata 23131071  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  23131072 catataacacttcatcaatcatggacaatatcatattcacaaacatacacatacatatactaattcatcaatcataatcaattattcactgtgacctacg 23131171  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23131172 ttcagtaatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcactagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttata 23131271  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23131272 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttc-aattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 23131353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 512
Target Start/End: Original strand, 23133340 - 23133820
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23133340 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 23133439  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23133440 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca-tatata 23133538  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  23133539 catataacacttcatcaatcatggacaatatcatattcacaaacatacacatacatatactaattcatcaatcataatcaattattcactgtgacctacg 23133638  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23133639 ttcagtaatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcactagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttata 23133738  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23133739 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttc-aattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 23133820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 34402673 - 34402193
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34402673 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 34402574  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34402573 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca-tatata 34402475  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  34402474 catataacacttcatcaatcatggacaatatcatattcacaaacatacacatacatatactaattcatcaatcataatcaattattcactgtgacctacg 34402375  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34402374 ttcagtaatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcactagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttata 34402275  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34402274 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttc-aattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 34402193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 378; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 32215072 - 32214607
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32215072 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 32214973  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32214972 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatc-atatata 32214874  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||          ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  32214873 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtatacacaa----------acatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 32214784  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32214783 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaatggcattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttaca 32214684  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaa 506  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32214683 cctaagaacaattttgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaa 32214607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 23709683 - 23709203
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23709683 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 23709584  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23709583 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca-tatata 23709485  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  23709484 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattcttcattgtgacctacg 23709386  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  23709385 tgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaactgcattagaaagctaacattcatacctacaacttttgtgtttaca 23709286  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23709285 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtatttatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 23709203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 371; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 512
Target Start/End: Original strand, 571408 - 571889
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  571408 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 571507  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  571508 cgtctcaattgttcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca-tatata 571606  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  571607 catataacacttcattaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcataatcaattattcactgtgacctacg 571706  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| || ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  571707 ttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgacgtcaaaccaacgacattagaaagctaacatttatacctacaactttcgtgtttaca 571806  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  571807 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 571889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 24898347 - 24897858
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaactt-agttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 128  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24898347 atcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 24898248  T
Q  129 acatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatat 228  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  24898247 acgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca-tatat 24898149  T
Q  229 acatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctac 328  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| ||||||    
T  24898148 acatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacattcatatactaattcatcaatcatatacaattattcactgttacctac 24898050  T
Q  329 gtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttac 428  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24898049 gtgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaactaacggcattagaaagctaacattcatacctacaactttcgtgtttac 24897950  T
Q  429 acctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 520  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24897949 acctatgaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggataaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 24897858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 24905784 - 24905295
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaactt-agttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 128  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24905784 atcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 24905685  T
Q  129 acatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatat 228  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  24905684 acgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca-tatat 24905586  T
Q  229 acatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctac 328  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| ||||||    
T  24905585 acatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacattcatatactaattcatcaatcatatacaattattcactgttacctac 24905487  T
Q  329 gtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttac 428  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24905486 gtgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaactaacggcattagaaagctaacattcatacctacaactttcgtgtttac 24905387  T
Q  429 acctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 520  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24905386 acctatgaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggataaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 24905295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 365; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 510
Target Start/End: Original strand, 28577110 - 28577588
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  28577110 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacgcaacagtatacaaaaacagcatgatataataatatcaaatgcaagccaacaa 28577209  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28577210 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca-tatata 28577308  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  28577309 catataacacttcatcaatcatggacaatattgtattcacaa-catatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 28577407  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28577408 tgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacattcatacctacaactttcgtgtttaca 28577507  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattca 510  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28577508 cctaagaccaattctgtaccaatcaatatcagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattca 28577588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 24900830 - 24900341
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaactt-agttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 128  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24900830 atcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 24900731  T
Q  129 acatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatat 228  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  24900730 acgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca-tatat 24900632  T
Q  229 acatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctac 328  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| ||||||    
T  24900631 acatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catataaattcatatactaattcatcaatcatatacaattattcactgttacctac 24900533  T
Q  329 gtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttac 428  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24900532 gtgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaactaacggcattagaaagctaacattcatacctacaactttcgtgtttac 24900433  T
Q  429 acctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 520  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24900432 acctatgaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggataaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 24900341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 24903307 - 24902818
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaactt-agttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 128  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24903307 atcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 24903208  T
Q  129 acatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatat 228  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  24903207 acgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca-tatat 24903109  T
Q  229 acatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctac 328  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| ||||||    
T  24903108 acatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catataaattcatatactaattcatcaatcatatacaattattcactgttacctac 24903010  T
Q  329 gtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttac 428  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24903009 gtgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaactaacggcattagaaagctaacattcatacctacaactttcgtgtttac 24902910  T
Q  429 acctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 520  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24902909 acctatgaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggataaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 24902818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 24908259 - 24907770
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaactt-agttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 128  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24908259 atcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 24908160  T
Q  129 acatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatat 228  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  24908159 acgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca-tatat 24908061  T
Q  229 acatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctac 328  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| ||||||    
T  24908060 acatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacattcatatactaattcatcaatcatatacaattattcactgttacctac 24907962  T
Q  329 gtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttac 428  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  24907961 gtgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaactaacggcattagaaagctaacattcatacctacaactttcatgtttac 24907862  T
Q  429 acctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 520  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24907861 acctatgaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggataaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 24907770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 512
Target Start/End: Original strand, 26505390 - 26505870
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26505390 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 26505489  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26505490 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca-tatata 26505588  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  26505589 catataacacttcatcaatcatggaaaatatcgtattcacaa-catatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 26505687  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  26505688 tgcagtaatttgactataactctagttctataaattcttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatacctacaactttcgtgtttaca 26505787  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26505788 cctaagatcaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaggttgtgctgaaattcataaaaattcact 26505870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 512
Target Start/End: Original strand, 26507868 - 26508348
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26507868 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 26507967  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26507968 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca-tatata 26508066  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  26508067 catataacacttcatcaatcatggaaaatatcgtattcacaa-catatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 26508165  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  26508166 tgcagtaatttgactataactctagttctataaattcttttgaagtcaaactaacggcattagaaagctaacatttatacctacaactttcgtgtttaca 26508265  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26508266 cctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaggttgtgctgaaattcataaaaattcact 26508348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 520
Target Start/End: Original strand, 23135601 - 23136079
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23135601 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 23135700  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  23135701 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattacatcacagtataacaacatcaaatgataatcagcatcttaaaacatca-tatata 23135799  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  23135800 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-----------catatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 23135888  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  23135889 tgcagtaatttgactataactctagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacgggattagaaagctaacatttatacctacaactttcgtgtttaca 23135988  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 520  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23135989 cctaagaccaattttgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 23136079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 32039649 - 32039169
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32039649 atcaacttagaccggctcatgcagcttagttaaataacaacagtaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 32039550  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32039549 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaatcataatcaacatcttaaaacatca-tatata 32039451  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| |||||||| |||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  32039450 catataacacttcatcgatcatggacaatatcagattcacaa-catatacatacatatactaattcatcaatcataatcaattattcactgtgacctacg 32039352  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    | ||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  32039351 ttcagtaatttgaccataacttaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaaaatttatacctacaactttcgtgtttaca 32039252  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32039251 cctaagaccaatcctttaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 32039169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 30 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 24529680 - 24529217
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  24529680 atcaacttagaccgactcatgcagcatagttaaataacaacaacaacacatcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaagtgcaagttaacaa 24529581  T
Q  130 catctcaattatt-cacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatat 228  Q
    | ||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||                   ||||| ||||     
T  24529580 cgtctcaattatttcatatataattcaaataatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaat-------------------catca-tatac 24529501  T
Q  229 acatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctac 328  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  24529500 acatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctac 24529401  T
Q  329 gtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttac 428  Q
    ||  |||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24529400 gtttagtaatttcaccatatctcaagtgctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaaggtaacatccatacctacaacttttgtgtttac 24529301  T
Q  429 acctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24529300 acctaagaccaattttgtaccaatcaatacaagttttcattttaaatttggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 24529217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 181 - 520
Target Start/End: Original strand, 20261381 - 20261719
Alignment:
Q  181 aatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatatacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatataca 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  20261381 aatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatca-tatatacatataacacttcatcaatcattgacaatatcgtattcacaaatatataca 20261479  T
Q  281 tacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaac 380  Q
    |||||||| |||||||||||||||   ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20261480 tacatatattaattcatcaatcataaacaattcttcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaac 20261579  T
Q  381 caacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcaga 480  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20261580 caacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattctga 20261679  T
Q  481 caaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 520  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20261680 caaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 20261719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 182 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 10684764 - 10684425
Alignment:
Q  182 atataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatca-atatatacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatataca 280  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  10684764 atataacaacatcaaatggtaattaacatcttaaaacatcatatatatacatataacccttcatcaatcattgacaatatcgtattcacaaatatataca 10684665  T
Q  281 tacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaac 380  Q
    |||||||| |||||||||||||||   ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10684664 tacatatattaattcatcaatcataaacaattcttcactgtgatctacgtgcagtaatttgaccatagctcaagttctataaatccttttgaagtcaaac 10684565  T
Q  381 caacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcaga 480  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10684564 caacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaattctgtatcaatcaataccagttttcatttcaaattctga 10684465  T
Q  481 caaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 520  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10684464 caaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 10684425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 230 - 512
Target Start/End: Original strand, 24681654 - 24681936
Alignment:
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24681654 catataacacttcatcaatcatgaacaatatagtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcattgtgacctacg 24681753  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| | |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24681754 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcctttggaagcccaaccaacgacattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 24681853  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
     |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24681854 gctaagaccaattctgtaccaaccaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 24681936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 230 - 512
Target Start/End: Original strand, 24918350 - 24918632
Alignment:
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  24918350 catataacacttcatcaatcatgaacaatatagtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 24918449  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24918450 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggaattagaaagctaacatccatacctacaactttcatgtttaca 24918549  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    | ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24918550 cttaagaccaattctctaccaatcaatatcagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 24918632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 230 - 510
Target Start/End: Original strand, 24671235 - 24671515
Alignment:
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24671235 catataacacttcatcaatcatgaacaatatagtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcattgtgacctacg 24671334  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24671335 tgcagtaatttgacaataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacaacattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtttttaca 24671434  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattca 510  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24671435 cctaagaccaattctgtaccaataaataccagtttgcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcttaaaaattca 24671515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 230 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 23707169 - 23706896
Alignment:
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  23707169 catataacacttcatcaatcatgaacaatatagtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 23707070  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23707069 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttaca 23706970  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaa 504  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  23706969 cctaagaccaattctgtaccaatcaatatcagttttcatttcaaattcgga-aaagttgtgctgaaattcataaa 23706896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 230 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 24642701 - 24642419
Alignment:
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||     
T  24642701 catataacacttcatcaatcatgaacaatatagtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctaca 24642602  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  24642601 tgcagtaatttgaccataacttaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacgacattagaaagctaacatccatacctacaacttttgggtttaca 24642502  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24642501 cctaagagcaattctgtaccaatcaataccagttttcttttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 24642419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 227 - 512
Target Start/End: Original strand, 22105672 - 22105957
Alignment:
Q  227 atacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacct 326  Q
    |||||||||  | |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  22105672 atacatatactaattcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacct 22105771  T
Q  327 acgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgttt 426  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22105772 acgttcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgttt 22105871  T
Q  427 acacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22105872 acacctaagaccaattctgcaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 22105957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 230 - 520
Target Start/End: Original strand, 38967689 - 38967979
Alignment:
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || ||    
T  38967689 catataacacttcaacaatcatgaacaatatagtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgagctgcg 38967788  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  38967789 tgcagtaatttcactataactcaagttctataaatacttttgaagtcaaaccaacgacattagaaacctaacatccatatctacaactttcgtatttaca 38967888  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 520  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38967889 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgaacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 38967979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 30 - 304
Target Start/End: Original strand, 6726006 - 6726278
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6726006 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgtaagtcaacaa 6726105  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6726106 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatc-atatata 6726204  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcat 304  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6726205 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaatcat 6726278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 227 - 512
Target Start/End: Original strand, 24368033 - 24368318
Alignment:
Q  227 atacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacct 326  Q
    |||||||||  | |||||||||||| ||||| ||  || ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  24368033 atacatatactaattcatcaatcataaacaacatgatactcataaacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacct 24368132  T
Q  327 acgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgttt 426  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24368133 acgtgcagtaatttaactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacattcatacctacaactttcgtgttt 24368232  T
Q  427 acacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24368233 acacctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgttgaaattcataaaaattcact 24368318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 30 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 21155211 - 21154942
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21155211 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaa 21155112  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21155111 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatc-atatata 21155013  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaat 301  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21155012 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaat 21154942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 30 - 304
Target Start/End: Original strand, 24367785 - 24368057
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24367785 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 24367884  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  24367885 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataaccaacatcttaaaacatc-atatata 24367983  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcat 304  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24367984 catataatacttcatcaatcatggaaaatatcgtattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaatcat 24368057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 227 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 21154963 - 21154678
Alignment:
Q  227 atacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacct 326  Q
    |||||||||  | ||||||||| || ||||| ||| || ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  21154963 atacatatactaattcatcaattataaacaacatcatactcataaacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacct 21154864  T
Q  327 acgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgttt 426  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21154863 atgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacattcatacctacaactttcgtgttt 21154764  T
Q  427 acacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    || |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21154763 acccctaagacaaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 21154678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 246 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 45027840 - 45027575
Alignment:
Q  246 aatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacgtgcagtaatttgacca 345  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |    
T  45027840 aatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactatgacctacgtgcagtaatttgacta 45027742  T
Q  346 taactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattatg 445  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  45027741 taattcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaatggcattagaaagctaacattcatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattctg 45027642  T
Q  446 taccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45027641 taccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaaatcact 45027575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 227 - 519
Target Start/End: Original strand, 6726254 - 6726546
Alignment:
Q  227 atacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacct 326  Q
    |||||||||  | |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  6726254 atacatatactaattcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatatgctaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacct 6726353  T
Q  327 acgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgttt 426  Q
    | ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6726354 atgtgcagtaatttgactataacttaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacgacattagaaagctaacattcatacctacaactttcgtgttt 6726453  T
Q  427 acacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacct 519  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6726454 acacctaagaccacttatgtatcaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactatgacct 6726546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 30 - 304
Target Start/End: Original strand, 22105423 - 22105696
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 128  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22105423 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 22105522  T
Q  129 acatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatat 228  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22105523 acttctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaattataatcaacatcttaaaacatc-atatat 22105621  T
Q  229 acatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcat 304  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22105622 acatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatttacatacatatactaattcatcaatcat 22105696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 227 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 41524028 - 41523743
Alignment:
Q  227 atacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacct 326  Q
    |||||||||  | |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  41524028 atacatatactaattcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcgtatactaattcatcaatcatattcaattattcactatgacct 41523929  T
Q  327 acgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgttt 426  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41523928 acgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacgacgttagaaagctaacattcatacctacaactttcgtgttt 41523829  T
Q  427 acacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41523828 acacctaagactaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 41523743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 30 - 304
Target Start/End: Original strand, 38967385 - 38967657
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaa-ca 128  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  38967385 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacatcgacacaacaatatacaaaaatagcatgaaataataatatcaaatgcaagtcaatca 38967484  T
Q  129 acatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatat 228  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  38967485 acatctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatat-acaacatcaaataataatcaacatcttaagacatc-atatat 38967582  T
Q  229 acatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcat 304  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38967583 acatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactaattcatcaatcat 38967657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 203 - 420
Target Start/End: Original strand, 25616365 - 25616581
Alignment:
Q  203 atcaacatcttaaaacatcaatatatacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatc 302  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25616365 atcaacatcttaaaacatca-tacatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatc 25616463  T
Q  303 atgttcaattattcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaaca 402  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| || |||||||||||||    
T  25616464 atattcaattattcattgtgacctacgtgaagtaatttgacgataactcaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaacgacattagaaagctaaca 25616563  T
Q  403 tccatacctacaactttc 420  Q
    ||||||||||||||||||    
T  25616564 tccatacctacaactttc 25616581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 30 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 45030005 - 45029784
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45030005 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacacaacaatatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 45029906  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||| |||||||    
T  45029905 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacatttatatcacaatataacaacatgaaataataatcatcatcttaaaacatc-atatata 45029807  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatg 252  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  45029806 catataacacttcatcaatcatg 45029784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 313 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 41523749 - 41523554
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| |||||||||||||||    
T  41523749 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaagggcattataaagataacatccataccta 41523650  T
Q  413 caactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaatt 508  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41523649 caaccttcgtgtttacacctaagaccaattctgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcgtacaaagttgtgctgaaattcataaaaatt 41523554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 335 - 512
Target Start/End: Original strand, 23931775 - 23931952
Alignment:
Q  335 taatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaa 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23931775 taatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatcaatacctacaactttagtgtttacacctaa 23931874  T
Q  435 gaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23931875 gaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaatacact 23931952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 313 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 21154684 - 21154487
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21154684 attcactgtgatctacgtgcagtaatttgaccgtaactcaaattctataaatcgttttgacgtcagaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 21154585  T
Q  413 caactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattca 510  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21154584 caactttcgtgtttacacctaggaccaattctataacaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttctgctgaaattcataaaaattca 21154487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 313 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 23709209 - 23709010
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  23709209 attcactgtgacctatgtgcagtaattagaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaacggcattagaaatctaacatccataccta 23709110  T
Q  413 caactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23709109 caacttacgtgtttacacctaggacgaattctgtgccaatcaataccagttttcatttcaaaatcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 23709010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 104 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 24642933 - 24642733
Alignment:
Q  104 taataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaa 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  24642933 taataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaatcataa 24642834  T
Q  204 tcaacatc--ttaaaacatcaatatatacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaat 301  Q
    ||||||||   | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24642833 tcaacatcaacttaaacatc-atatatacatataacacttcatcaatcatgtacaatatcgtattcgc-aacatatacatacatatactaattcatcaat 24642736  T
Q  302 cat 304  Q
    |||    
T  24642735 cat 24642733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 313 - 477
Target Start/End: Original strand, 22105951 - 22106115
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22105951 attcactgtgacctacgtgtagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgacatcagaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 22106050  T
Q  413 caactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 477  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22106051 caacttttgtgtttacacctaagaccaattttgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 22106115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 319 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 23706888 - 23706696
Alignment:
Q  319 tgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactt 418  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  23706888 tgtgacttacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataattcgttttgacgtcagacctacggcattagaaaggtaacatccataactataactt 23706789  T
Q  419 tcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23706788 tcgtgtttacacctaagaccaattctgtaccaatcaatagccgttttcatttcaaattcgga-aaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 23706696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 313 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 24529223 - 24529059
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24529223 attcactgtgacctacgtgcagtaatatgaccataactcaagttctataaatcattttgacgtcataccaacggcattagaaagctaacatccataccta 24529124  T
Q  413 caactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 477  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  24529123 caactttcgtgtttacacctaagaccaattaaggacctatcaataccagatttcatttcaaattc 24529059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 30 - 197
Target Start/End: Original strand, 43137310 - 43137477
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43137310 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagtaatatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 43137409  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaa 197  Q
    | |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  43137410 cgtctcaattgttcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacatcatcaaa 43137477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 313 - 479
Target Start/End: Original strand, 24918626 - 24918792
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  24918626 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgacgtcagaccaacggtattagaaagataacatccataccta 24918725  T
Q  413 caactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcag 479  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24918726 caactttcgtgtttacacctaagaccaattcttgacctatcaataccagatttcatttcaaattcag 24918792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 319 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 41523550 - 41523392
Alignment:
Q  319 tgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactt 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41523550 tgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatctttttgacgtcagaccaacgacattagaaagctaacatccatacctacaactt 41523451  T
Q  419 tcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 477  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  41523450 tcgtgtttacacgtaagaccaattatggacctatcaataccagatttcatttcaaattc 41523392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 313 - 477
Target Start/End: Original strand, 24368312 - 24368476
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24368312 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataacttaagttctataaatcgttttgacatcagaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 24368411  T
Q  413 caactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 477  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  24368412 caactttcgtgtttacacctaagaccaactattgacctatcaataccagatttcatttcaaattc 24368476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 321 - 477
Target Start/End: Original strand, 6726541 - 6726697
Alignment:
Q  321 tgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttc 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6726541 tgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttc 6726640  T
Q  421 gtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 477  Q
    |||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||  || |||||||||||||||    
T  6726641 gtgtttacacctaagaccaattcttgacctatcaatatgagatttcatttcaaattc 6726697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 313 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 21154491 - 21154327
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21154491 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgactaaaagtcaagttctataaatcattttgacatcagaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 21154392  T
Q  413 caactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 477  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  21154391 caactttcgtgtttacacctaagaccaattctagacctatcaatactagatttcatttcaaattc 21154327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 319 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 32214600 - 32214442
Alignment:
Q  319 tgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactt 418  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32214600 tgtgacctacgtgctgtaatttgaccataacttaagttctataaattgttttgacgtcagagcaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactt 32214501  T
Q  419 tcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 477  Q
    |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32214500 tcgtgttatcacctaagaccaattttgtaccaatcaataccagttttcattttaaattc 32214442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 319 - 479
Target Start/End: Original strand, 23931952 - 23932112
Alignment:
Q  319 tgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactt 418  Q
    ||||||||| ||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23931952 tgtgacctaagtgaagtaaattgaccataactaaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaacgaaattagaaagctaacatccatacctacaactt 23932051  T
Q  419 tcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcag 479  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23932052 tcgtgtttacacctaagaccaattctataccaatcaataccagctttcatttcaaattcag 23932112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 313 - 477
Target Start/End: Original strand, 24681930 - 24682094
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| || ||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  24681930 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagctctataaatctttttgatgtcagactaacggcattagaatgctaacatccacaccta 24682029  T
Q  413 caactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 477  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  24682030 caacttttgtgtttacacctaagaccaattctggacctatcaataccagatttcatttcaaattc 24682094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 313 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 23706702 - 23706538
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |  |||||||  || |||||||||||||||||||||||    
T  23706702 attcactgtgacctacgtgcagtaacttgaccataactcaagttctataaattgttttgacatagaaccaacaccattagaaagctaacatccataccta 23706603  T
Q  413 caactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 477  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  23706602 caactttcgtgtttacacctaagaccaattctggacctatcaataccagatttcatttcaaattc 23706538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 313 - 477
Target Start/End: Original strand, 24671511 - 24671675
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||  || |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  24671511 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatatttttgatgtcaaataaatggcattagaaagctaacatccacaccta 24671610  T
Q  413 caactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 477  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||| ||||||| |||||||    
T  24671611 caacttttgtgtttacacctaagaccaattctggacatatcaataccagatttcattccaaattc 24671675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 411 - 520
Target Start/End: Original strand, 31345570 - 31345679
Alignment:
Q  411 tacaactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattca 510  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31345570 tacaactttcgtgtttacacctaagatcaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattta 31345669  T
Q  511 ctaagacctc 520  Q
    ||||||||||    
T  31345670 ctaagacctc 31345679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 319 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 45027575 - 45027418
Alignment:
Q  319 tgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactt 418  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||||| || | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  45027575 tgtgacctacgtgtagtaatttgaccataactaaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaacgacattcgaaatctaacatccatacctacaactt 45027476  T
Q  419 tcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaatt 476  Q
    | |||||||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||| || |||||||||||    
T  45027475 ttgtgtttacacctaagaccaattctggacctatcaacaccagattccatttcaaatt 45027418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 181
Target Start/End: Original strand, 22337122 - 22337281
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaa 121  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22337122 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggctgtatataaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 22337221  T
Q  122 gtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcaca 181  Q
    | |||||||||||||| ||| ||   || ||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  22337222 gacaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcaca 22337281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 23 - 181
Target Start/End: Original strand, 23060520 - 23060679
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaa 121  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  23060520 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaa 23060619  T
Q  122 gtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcaca 181  Q
    ||||||||||||| || |||| |  |||  ||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  23060620 gtcaacaacatcttaaatattaaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcaca 23060679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 23 - 181
Target Start/End: Original strand, 23076449 - 23076608
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaa 121  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  23076449 catcttcatccacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaa 23076548  T
Q  122 gtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcaca 181  Q
    |||||||| |||| || ||||||  |||  ||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  23076549 gtcaacaatatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcaca 23076608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 23 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 22731348 - 22731189
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaa 121  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  22731348 catcttcatcaagttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaa 22731249  T
Q  122 gtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcaca 181  Q
     ||| |||||| | || |||||| ||||  ||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  22731248 ttcatcaacatattaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcaca 22731189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 182 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 23707323 - 23707201
Alignment:
Q  182 atataacaacatcaaatggtaatcaacatct--taaaacatcaatatatacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatac 279  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||   | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  23707323 atataacaacatcaaatgataatcaacatcaacttaaacatca-tatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcgc-aacatatac 23707226  T
Q  280 atacatatactaattcatcaatcat 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  23707225 atacatatactaattcatcaatcat 23707201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 34 - 196
Target Start/End: Original strand, 19671848 - 19672010
Alignment:
Q  34 acttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa-caacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaaca 131  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| || ||||| || |||||| ||||| ||  |||| ||||||||||| || |||||| |||||||    
T  19671848 acttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaaca 19671946  T
Q  132 tctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaa 196  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  19671947 tctcaat-attcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataacaacatcaa 19672010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 30 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 22738286 - 22738135
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| |||    
T  22738286 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacattaaataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaa 22738187  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcaca 181  Q
    ||||| || |||||| ||||  ||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  22738186 catcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcaca 22738135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 23 - 181
Target Start/End: Original strand, 23285872 - 23286027
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaa 121  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    |||||||||||||||| |||||    
T  23285872 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaaca----gacataataatatcaattgcaa 23285967  T
Q  122 gtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcaca 181  Q
     ||| |||||||| || |||||| || |  ||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  23285968 ttcatcaacatcttaaatattcaaatgttcttcaagtaatgcataaaacattatatcaca 23286027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 182 - 304
Target Start/End: Original strand, 24918196 - 24918318
Alignment:
Q  182 atataacaacatcaaatggtaatcaacatct--taaaacatcaatatatacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatac 279  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||   | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| |    
T  24918196 atataacaacatcaaatgataatcaacatcaacttaaacatca-tatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcgc-aacatatgc 24918293  T
Q  280 atacatatactaattcatcaatcat 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  24918294 atacatatactaattcatcaatcat 24918318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 23654500 - 23654341
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaa 121  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || | |||| ||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||    
T  23654500 catcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacagcataggcagcatacaaatacatcatgacataataatatcaattgcaa 23654401  T
Q  122 gtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcaca 181  Q
     ||| |||||||| || ||||||  ||| | |||||||||||||| |  |||||||||||    
T  23654400 ttcatcaacatcttaaatattcaagtattactcaagtaatgcataaaacattatatcaca 23654341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 181
Target Start/End: Original strand, 23660030 - 23660188
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaa 121  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||| || |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23660030 catcttcatcaacttagaccgactcatgtatcttagttaaacaacaacagcaacataggcagtatacgaaa-caggatgacataataatatcaaatgcaa 23660128  T
Q  122 gtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcaca 181  Q
     |||||||||||| || ||||||   || | ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  23660129 atcaacaacatcttaaatattcaatcataactcaagtaatgcgtataacattatatcaca 23660188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 182 - 302
Target Start/End: Original strand, 24671081 - 24671201
Alignment:
Q  182 atataacaacatcaaatggtaatcaacatct--taaaacatcaatatatacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatac 279  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||   | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  24671081 atataacaatatcaaatgataatcaacatcaacttaaacatca-tatatacatataatacttcatcaatcatggacaatatcgtattcgc-aacatatac 24671178  T
Q  280 atacatatactaattcatcaatc 302  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  24671179 atacatatactaattcatcaatc 24671201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 182 - 304
Target Start/End: Original strand, 24681500 - 24681622
Alignment:
Q  182 atataacaacatcaaatggtaatcaacatct--taaaacatcaatatatacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatac 279  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||   | |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||    
T  24681500 atataacaacatcaaatgatgatcaacatcaacttaaacatca-tatatacatctaatacttcatcaatcatggacaatatcgtattcgcaa-catatac 24681597  T
Q  280 atacatatactaattcatcaatcat 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  24681598 atacatatactaattcatcaatcat 24681622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 30 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 298922 - 298769
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 127  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||| ||||| |||||    
T  298922 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgcaattcaac 298823  T
Q  128 aacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcaca 181  Q
    ||||||| || |||||| |||    |||||||||||||| |  |||||||||||    
T  298822 aacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcaca 298769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 23 - 137
Target Start/End: Original strand, 28405983 - 28406099
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgca 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||| ||||| ||  |||| |||| |||||| ||||||    
T  28405983 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 28406082  T
Q  121 agtcaacaacatctcaa 137  Q
    | |||||||||||||||    
T  28406083 aatcaacaacatctcaa 28406099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 647 - 753
Target Start/End: Original strand, 31559068 - 31559174
Alignment:
Q  647 aaaggttggacatttccaatatctccttttaggattttcatttaaattagagatgaacatccttatgattttgttgcacccacatataagcaattcaatt 746  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| || | || |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||    
T  31559068 aaaggttgggcatttccaatatctcgttttagggttgtaatataaattggagatgaacatcctcattattttgttgcaaccacatataggcaactcaatt 31559167  T
Q  747 gatgatg 753  Q
    |||||||    
T  31559168 gatgatg 31559174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 31 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 23708725 - 23708558
Alignment:
Q  31 tcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataaca-acaacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 128  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | | ||||| || |||||| ||||| ||  |||| |||| |||||||| ||||| ||| |     
T  23708725 tcaacttagaccgactcaagcagcttagttaaataacagatagcaacataggcagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaattgcaaatcatcg 23708627  T
Q  129 acatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaa 196  Q
    |||||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  23708626 acatctcaaacattcaaatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 23708558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 30 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 24643101 - 24643035
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacag 96  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  24643101 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacatcagtatacaaaaacag 24643035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 23 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 38228 - 38136
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaa 115  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  38228 catcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaa 38136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 142 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 22173868 - 22173799
Alignment:
Q  142 tcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatc 211  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  22173868 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaatcataatcaacatc 22173799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 314 - 378
Target Start/End: Original strand, 31345490 - 31345554
Alignment:
Q  314 ttcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaa 378  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  31345490 ttcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcaa 31345554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 313 - 431
Target Start/End: Original strand, 28577584 - 28577702
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    | | |||||||||| |||||||||| ||| || | |||||||||||    || |||    
T  28577584 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcataaaccaaaaatcattttcaagtcaaaccgacgccactggaaagctaacacaattatcta 28577683  T
Q  413 caactttcgtgtttacacc 431  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  28577684 caactttcatgtttacacc 28577702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 617 - 730
Target Start/End: Original strand, 22059654 - 22059767
Alignment:
Q  617 aacatagtattataacaacgaactcaccgtaaaggttggacatttccaatatctccttttaggattttcatttaaattagagatgaacatccttatgatt 716  Q
    |||| ||||||| |||| | |||||||| || ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| | |||| || |||||||| || ||||||    
T  22059654 aacaaagtattacaacagcaaactcaccatataggttgggcatttccagtatctccttttagggttttcatgtgaattggatatgaacattctcatgatt 22059753  T
Q  717 ttgttgcacccaca 730  Q
    |||||||| |||||    
T  22059754 ttgttgcaaccaca 22059767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 35 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 7835 - 7688
Alignment:
Q  35 cttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa-caacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacat 132  Q
    ||||||| || ||||||| |||||||||  ||||| || ||||| || |||||| ||||| ||  |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  7835 cttagactgaatcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 7737  T
Q  133 ctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcaca 181  Q
    |||||  ||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  7736 ctcaaacattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcaca 7688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 35 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 23103497 - 23103389
Alignment:
Q  35 cttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatc 133  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||  |||||| ||||||| || ||||||||| ||| ||| |||||||    
T  23103497 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataaaaacagcaacataggcagtatac--aaacagcatgacatgattatatcaaattcaattcatcaacatc 23103400  T
Q  134 tcaattattca 144  Q
    ||||| |||||    
T  23103399 tcaatcattca 23103389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 313 - 431
Target Start/End: Original strand, 18809428 - 18809546
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    | | |||||||||| |||||||||| ||| || | |||||||||||    || |||    
T  18809428 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcataaaccaaaaatcattttcaagtcaaaccgacgccactggaaagctaacacaattatcta 18809527  T
Q  413 caactttcgtgtttacacc 431  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  18809528 caactttcatgtttacacc 18809546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 333 - 434
Target Start/End: Original strand, 67339 - 67440
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacct 432  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | || |||||| ||||||||   |||||||| |||| |||| ||| ||    
T  67339 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggaagtcaaaccaaagccattagaaatctaacatcttaacctacaattttcatgttaacaact 67438  T
Q  433 aa 434  Q
    ||    
T  67439 aa 67440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 321 - 402
Target Start/End: Original strand, 16900803 - 16900884
Alignment:
Q  321 tgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaaca 402  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| | || |||||||||||||    
T  16900803 tgacccacgtgtagtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggacgtcaaaccaaagtcattagaaagctaaca 16900884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 321 - 402
Target Start/End: Original strand, 16994194 - 16994275
Alignment:
Q  321 tgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaaca 402  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| | || |||||||||||||    
T  16994194 tgacccacgtgtagtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggacgtcaaaccaaagtcattagaaagctaaca 16994275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 333 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 24686707 - 24686598
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacct 432  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||||| | || |||||||||||| |   || ||| ||||||| ||||||||||     
T  24686707 agtaatttgatcataacgcaagttctaaaaatcatttggacgtcaaaccaaagccattagaaagctaacttaattatctaaaactttcatgtttacacca 24686608  T
Q  433 aagaccaatt 442  Q
    ||||||||||    
T  24686607 aagaccaatt 24686598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 111 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 22459587 - 22459511
Alignment:
Q  111 atcaaatgcaagtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa 187  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  22459587 atcaaatgaaagtcatcaacatctcaaatattcacatataactcaagtaatgtatatacaattatatcacattataa 22459511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 230 - 305
Target Start/End: Original strand, 21368365 - 21368440
Alignment:
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatg 305  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  21368365 catataataattcatcaatcatgaacaacatcatattcatcaacatatacattcatataataattcatcaatcatg 21368440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 23 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 23040303 - 23040249
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaaca 77  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  23040303 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 23040249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 313 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 23711690 - 23711572
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    | | |||||||||| |||||||||| ||| || |  ||||||||||    || |||    
T  23711690 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcataaaccaaaaatcattttcaagtcaaaccgacgccactgtaaagctaacacaattatcta 23711591  T
Q  413 caactttcgtgtttacacc 431  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  23711590 caactttcatgtttacacc 23711572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 313 - 431
Target Start/End: Original strand, 26505864 - 26505982
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    | | |||||||||| |||||||||| ||| || |  ||||||||||    || |||    
T  26505864 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcataaaccaaaaatcattttcaagtcaaaccgacgccactgtaaagctaacacaattatcta 26505963  T
Q  413 caactttcgtgtttacacc 431  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  26505964 caactttcatgtttacacc 26505982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 313 - 431
Target Start/End: Original strand, 26508342 - 26508460
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    | | |||||||||| |||||||||| ||| || |  ||||||||||    || |||    
T  26508342 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcataaaccaaaaatcattttcaagtcaaaccgacgccactgtaaagctaacacaattatcta 26508441  T
Q  413 caactttcgtgtttacacc 431  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  26508442 caactttcatgtttacacc 26508460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 313 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 27920441 - 27920323
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    | | |||||||||| |||||||||| ||| || |  ||||||||||    || |||    
T  27920441 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcataaaccaaaaatcattttcaagtcaaaccgacgccactgtaaagctaacacaattatcta 27920342  T
Q  413 caactttcgtgtttacacc 431  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  27920341 caactttcatgtttacacc 27920323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 313 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 32039175 - 32039057
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    | | |||||||||| |||||||||| ||| || |  ||||||||||    || |||    
T  32039175 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcataaaccaaaaatcattttcaagtcaaaccgacgccactgtaaagctaacacaattatcta 32039076  T
Q  413 caactttcgtgtttacacc 431  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  32039075 caactttcatgtttacacc 32039057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 333 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 19887384 - 19887275
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacct 432  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||| | || |||||||||||||    || ||||||||||| ||||||||||     
T  19887384 agtaatttaatcatatctcaagttctaaaaatcatttggacgtcaaaccaaagccattagaaagctaacaaaattatctacaactttcatgtttacacca 19887285  T
Q  433 aagaccaatt 442  Q
    ||| ||||||    
T  19887284 aagtccaatt 19887275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 198
Target Start/End: Original strand, 23791358 - 23791458
Alignment:
Q  98 atgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaata-taacaacatcaa 196  Q
    |||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||| | |||| ||||| |||||||||||| | |||||||||| || ||||||||||||    
T  23791358 atgatataaaaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacatt-atatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaa 23791456  T
Q  197 at 198  Q
    ||    
T  23791457 at 23791458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 177
Target Start/End: Original strand, 25175857 - 25176010
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgca 120  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||| ||||| | ||||||| | ||| ||  |||| |||| |||||| ||||||    
T  25175857 catcatcatcaacttagacagattcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 25175955  T
Q  121 agtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatat 177  Q
    | ||||||||||||||| |||  |||||  |||||  ||| | ||||||||||||||    
T  25175956 aatcaacaacatctcaaatatcaacata--attcatataacgtatatataattatat 25176010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 333 - 442
Target Start/End: Original strand, 27261332 - 27261441
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacct 432  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || |||| |||| ||||||||||||| | || ||||||||||||||   || ||| || |||| ||||||||||     
T  27261332 agtaatttgatcataactcaagttataaaaattatttggaagtcaaaccaaagccattagaaagctaacataattatctaaaattttcatgtttacacca 27261431  T
Q  433 aagaccaatt 442  Q
    ||| ||||||    
T  27261432 aaggccaatt 27261441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 333 - 402
Target Start/End: Original strand, 34823750 - 34823819
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaaca 402  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||| || |||||||||||||    
T  34823750 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggacctcaaaccaacgtcattagaaagctaaca 34823819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 333 - 429
Target Start/End: Original strand, 12727711 - 12727807
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||| | || |||||||||||||    |||||| ||||||| ||||||||    
T  12727711 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggacgtcaacccaaggccattagaaagctaacaaaattacctaaaactttcatgtttaca 12727807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 313 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 24642425 - 24642373
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatc 365  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24642425 attcactgtgacctacgtgtagttatttgaccataactcaagttctataaatc 24642373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 158 - 198
Target Start/End: Original strand, 29601478 - 29601518
Alignment:
Q  158 taatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29601478 taatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 29601518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 166
Target Start/End: Original strand, 20309127 - 20309257
Alignment:
Q  35 cttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacat 132  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||| | |||||||||   ||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||    
T  20309127 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatac---aacagcatgacataattatatcaaattcaattcatcaacat 20309223  T
Q  133 ctcaattattcacatatgattcaagtaatgcata 166  Q
    || |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  20309224 cttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 20309257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 230 - 305
Target Start/End: Original strand, 23799457 - 23799532
Alignment:
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatg 305  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| || ||| ||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  23799457 catataataattcatcaatcatgaataacatcatattcaacaacatatacattcatataataattcatcaatcatg 23799532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 25616199 - 25616314
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 128  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| | || || | ||||  ||||  ||||| | ||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  25616199 atcaacttagactgactcatgcaacttagttaaattacaatagcagcataggcagattacatcaacagcaagacataaaaatatcaattgcaattcaaca 25616298  T
Q  129 acatctcaattattca 144  Q
    |||||| || ||||||    
T  25616299 acatcttaaatattca 25616314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 92
Target Start/End: Original strand, 8946664 - 8946734
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaa 92  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||| | |||||||||||||    
T  8946664 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttagataacaatagcaacataggcagtatacaaaa 8946734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 333 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 11232322 - 11232213
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacct 432  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||  | ||||||||| || |||||||||||||    || ||| ||||||| ||||||||||     
T  11232322 agtaatttgatcataactcgagttctaaaaatcatttggacctgaaaccaacgccattagaaagctaacaaaattatctaaaactttcatgtttacacca 11232223  T
Q  433 aagaccaatt 442  Q
    ||| ||||||    
T  11232222 aaggccaatt 11232213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #114
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 333 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 22514169 - 22514060
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacct 432  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||  | ||||||||| || |||||||||||||    || ||| ||||||| ||||||||||     
T  22514169 agtaatttgatcataactcgagttctaaaaatcatttggacctgaaaccaacgccattagaaagctaacaaaattatctaaaactttcatgtttacacca 22514070  T
Q  433 aagaccaatt 442  Q
    ||| ||||||    
T  22514069 aaggccaatt 22514060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #115
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 333 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 28776771 - 28776662
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacct 432  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||  | ||||||||| || |||||||||||||    || ||| ||||||| ||||||||||     
T  28776771 agtaatttgatcataactcgagttctaaaaatcatttggacctgaaaccaacgccattagaaagctaacaaaattatctaaaactttcatgtttacacca 28776672  T
Q  433 aagaccaatt 442  Q
    ||| ||||||    
T  28776671 aaggccaatt 28776662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #116
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 313 - 429
Target Start/End: Original strand, 571883 - 571999
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    | | || ||||||| |||||||||| ||| || | |||||||||||    || |||    
T  571883 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccttaactcataaaccaaaattcattttcaagtcaaaccgacgccactggaaagctaacacaattatcta 571982  T
Q  413 caactttcgtgtttaca 429  Q
    |||||||| ||||||||    
T  571983 caactttcatgtttaca 571999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #117
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 223 - 299
Target Start/End: Original strand, 22686145 - 22686221
Alignment:
Q  223 atatatacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatca 299  Q
    |||||| ||||||| | ||||||||||||||| || ||| ||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  22686145 atatattcatataataattcatcaatcatgaaaaacatcatattcatcaacatatacattcatataataattcatca 22686221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #118
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 313 - 352
Target Start/End: Original strand, 23131347 - 23131386
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactca 352  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23131347 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactca 23131386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #119
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 313 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 34402199 - 34402160
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactca 352  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34402199 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactca 34402160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #120
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 18787009 - 18786971
Alignment:
Q  31 tcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa 69  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18787009 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 18786971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #121
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 22134320 - 22134266
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaaca 77  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||    
T  22134320 catcatcatcatcatagaccgactcatgcagcttagttaaatatcaacagcaaca 22134266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #122
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 361 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 34135129 - 34135059
Alignment:
Q  361 aaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacc 431  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |  | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  34135129 aaatcatatggaagtcaaaccaaagcaattagaaagctaacttccatacctacaactttcatgtgtacacc 34135059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #123
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 313 - 431
Target Start/End: Original strand, 39682799 - 39682917
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    | | || ||||||| |||||||||| | | || | |||||||||||    || |||    
T  39682799 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccttaactcataaaccaaaattcattttcaagtcaaaccgatgccactggaaagctaacacaattagcta 39682898  T
Q  413 caactttcgtgtttacacc 431  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  39682899 caactttcatgtttacacc 39682917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #124
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 262 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 41524045 - 41524004
Alignment:
Q  262 gtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcat 304  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41524045 gtattcacaa-catatacatacatatactaattcatcaatcat 41524004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #125
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 20520229 - 20520130
Alignment:
Q  98 atgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaata-taacaacatcaa 196  Q
    |||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||  || || |||| |||||||||||||||||| || ||||||||| || |||| |||||||    
T  20520229 atgatataacaatatcaa-tgcaaatcaacaacatctcaaacat-catatataattcaagtaatgcatatacaaatatatcacattattaacgacatcaa 20520132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #126
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 361 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 21081429 - 21081348
Alignment:
Q  361 aaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 442  Q
    |||||||||| |||||||||||| | || |||||||||||||    || ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  21081429 aaatcatttttaagtcaaaccaaagccactagaaagctaacacaattatctacaactttcatgtttacaccaaaggccaatt 21081348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #127
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 24697643 - 24697543
Alignment:
Q  98 atgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaata-taacaacatcaa 196  Q
    |||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||   |||| |||  ||||| |||||||||||| | |||||||||| || ||||||||| ||    
T  24697643 atgatataacaatatcaaatgcaattcaacaacatctcaa-acttcatatacaattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacataaa 24697545  T
Q  197 at 198  Q
    ||    
T  24697544 at 24697543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #128
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 333 - 401
Target Start/End: Original strand, 22274022 - 22274090
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaac 401  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||  ||||||||| | || ||||||||||||    
T  22274022 agtaatttgatcataactcaagttttaaaaatcatttagacatcaaaccaaggccattagaaagctaac 22274090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #129
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 35 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 32452031 - 32451920
Alignment:
Q  35 cttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa-ca 131  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||| | | |||| ||||| | |||| || |||||| || ||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||    
T  32452031 cttagaccgactcatgcagcttggttaaacatcaaacagcaacataggcagcattcaaaaatagcatgacataacaatatc-aatgcaagccaacaatca 32451933  T
Q  132 tctcaattattca 144  Q
    |||||||||||||    
T  32451932 tctcaattattca 32451920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #130
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 7679599 - 7679638
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa 69  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  7679599 atcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa 7679638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #131
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 23072063 - 23072008
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacaacaaca 77  Q
    |||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  23072063 catcttcaacaacttagtccgactcatgcagcttagttaaataacgaacaacaaca 23072008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #132
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 313 - 352
Target Start/End: Original strand, 23133814 - 23133853
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactca 352  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23133814 attcactgtgacctacgtgtagtaatttgaccataactca 23133853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #133
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 392 - 431
Target Start/End: Original strand, 24788047 - 24788086
Alignment:
Q  392 gaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacc 431  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24788047 gaaagataacatccatacctacaactttcatgtttacacc 24788086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #134
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 617 - 724
Target Start/End: Complemental strand, 42827896 - 42827789
Alignment:
Q  617 aacatagtattataacaacgaactcaccgtaaaggttggacatttccaatatctccttttaggattttcatttaaattagagatgaacatccttatgatt 716  Q
    |||| ||||||| |||| | |||||||| || ||||||   |||||||||||||||||||||| || |||  | |||| || |||||||| || || |||    
T  42827896 aacaaagtattacaacagcaaactcaccatataggttgtgtatttccaatatctccttttagggttgtcaagtgaattggatatgaacattctcataatt 42827797  T
Q  717 ttgttgca 724  Q
    ||||||||    
T  42827796 ttgttgca 42827789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #135
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 392 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 44584627 - 44584588
Alignment:
Q  392 gaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacc 431  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  44584627 gaaagctaacatacatacctacaacttttgtgtttacacc 44584588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #136
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 43 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 21916192 - 21916158
Alignment:
Q  43 gactcatgcaacttagttaaataacaacaacaaca 77  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21916192 gactcatgcaacttagttaaataacaaaaacaaca 21916158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #137
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 103 - 137
Target Start/End: Original strand, 23004838 - 23004872
Alignment:
Q  103 ataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaa 137  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23004838 ataataatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaa 23004872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #138
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 227 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 23707225 - 23707147
Alignment:
Q  227 atacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatg 305  Q
    |||||||||  | |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||  | |||||||||||||    
T  23707225 atacatatactaattcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatataacacttcatcaatcatg 23707147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #139
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 227 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 24642757 - 24642679
Alignment:
Q  227 atacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatg 305  Q
    |||||||||  | |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||  | |||||||||||||    
T  24642757 atacatatactaattcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatataacacttcatcaatcatg 24642679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #140
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 227 - 305
Target Start/End: Original strand, 24918294 - 24918372
Alignment:
Q  227 atacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatg 305  Q
    |||||||||  | |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||  | |||||||||||||    
T  24918294 atacatatactaattcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatataacacttcatcaatcatg 24918372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #141
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 361 - 442
Target Start/End: Original strand, 6483113 - 6483194
Alignment:
Q  361 aaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 442  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || | |||||||||||    || ||||||||||  |||||||||| ||| ||||||    
T  6483113 aaatcattttgaagtcaaaccaaagccattggaaagctaacaaaattatctacaacttttatgtttacaccaaaggccaatt 6483194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #142
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 256 - 305
Target Start/End: Original strand, 22686062 - 22686111
Alignment:
Q  256 aatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatg 305  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  22686062 aatatcatattcatcaacatatacattcatataataattcatcaatcatg 22686111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #143
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 361 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 23969081 - 23969000
Alignment:
Q  361 aaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 442  Q
    |||||||||| |||||||||||| | || | |||||||||||    || ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  23969081 aaatcattttcaagtcaaaccaaagccactggaaagctaacacaattatctacaactttcatgtttacaccaaaggccaatt 23969000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 390; Significance: 0; HSPs: 10)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 390; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 17591 - 17103
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17591 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 17492  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17491 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacagtataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatca-tatata 17393  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  17392 catatgacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaagcatatacatacatatactaattcatcgatcatattcaactattcactgtgacctacg 17293  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  17292 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacaaaaatacctacaactttcgtgtttaca 17193  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacct 519  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17192 cctaagaccaattctataccaatcaatacaagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactatgacct 17103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 387; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 512
Target Start/End: Original strand, 94422 - 94902
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  94422 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 94521  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  94522 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca-tatata 94620  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  94621 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 94719  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  94720 tgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacattcatacctacaactttcgtgtttaca 94819  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  94820 cctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 94902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 30 - 178
Target Start/End: Original strand, 44465 - 44614
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaa-cagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 128  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44465 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 44564  T
Q  129 acatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatc 178  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  44565 acatctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatagaattatatc 44614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 321 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 17108 - 16953
Alignment:
Q  321 tgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttc 420  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||  ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17108 tgacctacgtgcattaatttgatcataactcaagttctataaacctttttgatatcagaccaacgacattagaaagctaacatccatacctacaactttc 17009  T
Q  421 gtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaatt 476  Q
    |||||  | ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17008 gtgttatcccctaacacaaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaatt 16953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 23 - 177
Target Start/End: Original strand, 100381 - 100534
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgca 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| | ||||||| | ||| ||  |||| ||||||||||| ||||||    
T  100381 catcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataataatatcgaatgca 100479  T
Q  121 agtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatat 177  Q
    | ||||||||||||||| |||| |||||  |||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  100480 aatcaacaacatctcaaatattaacata--attcatataatgtatatacaattatat 100534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 313 - 431
Target Start/End: Original strand, 94896 - 95014
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    | | |||||||||| |||||||||| ||| || | |||||||||||    || |||    
T  94896 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcataaaccaaaaatcattttcaagtcaaaccgacgccactggaaagctaacacaattatcta 94995  T
Q  413 caactttcgtgtttacacc 431  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  94996 caactttcatgtttacacc 95014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 23 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 40288 - 40135
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataa-caacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgca 120  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||| ||||| | ||||||  | ||| ||  |||| |||| |||||| ||||||    
T  40288 catcatcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataataaacagcaacataggcagtaggc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 40190  T
Q  121 agtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatat 177  Q
    | ||||||||||||||| |||  |||||  |||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  40189 aatcaacaacatctcaaatatcaacata--attcatataatgtatatacaattatat 40135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #8
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 23 - 77
Target Start/End: Original strand, 101506 - 101561
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacaacaaca 77  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||    
T  101506 catcatcatcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaaca 101561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #9
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 69
Target Start/End: Original strand, 119882 - 119928
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa 69  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  119882 catcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 119928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #10
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 333 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 154961 - 154892
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaaca 402  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| ||  ||||||||||| || || ||||||||||    
T  154961 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatgatttggacctcaaaccaacgtcattataaagctaaca 154892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 388; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 388; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 520
Target Start/End: Original strand, 20758 - 21248
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20758 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 20857  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20858 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca-tatata 20956  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  20957 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcataatcaattattcactgtgacctacg 21056  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  21057 ttcagtaatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatacctacaactttcttgtttaca 21156  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttc-atttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 520  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21157 cctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttctatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 21248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 387; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 387; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 520
Target Start/End: Original strand, 9253 - 9741
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9253 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatataaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 9352  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9353 cgtctcaattattcacatataatttaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaa-atata 9451  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  9452 catataacacttcatcaatcatggacaatatcatattcacaa-catatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgttacctacg 9550  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9551 tgcagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcattagagagctaacattcatacctacaactttcgtgtttaca 9650  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 520  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9651 cctaagaccaattctgtaccaataaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 9741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 387; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 387; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 512
Target Start/End: Original strand, 37832 - 38313
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37832 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 37931  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37932 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca-tatata 38030  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  38031 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcataatcaattattcactgtgacctacg 38130  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  38131 ttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatacctacaactttcgtgtttaca 38230  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38231 cctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 38313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 313 - 431
Target Start/End: Original strand, 38307 - 38425
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    | | |||||||||| |||||||||| ||| || | |||||||||||    || |||    
T  38307 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcataaaccaaaaatcattttcaagtcaaaccgacgccactggaaagctaacacaattatcta 38406  T
Q  413 caactttcgtgtttacacc 431  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  38407 caactttcatgtttacacc 38425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 387; Significance: 0; HSPs: 157)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 387; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 512
Target Start/End: Original strand, 16213695 - 16214176
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16213695 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatccaagtcaacaa 16213794  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  16213795 cgtcttaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaacataacaacatcaaatggtaatcaacatatgaaaacatca-tatata 16213893  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||    
T  16213894 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcttattcaattattcactgtgacctacg 16213993  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16213994 tgcagtcatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttaca 16214093  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    | ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16214094 cgtaagaccaattctgtatcaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 16214176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 387; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 520
Target Start/End: Original strand, 41522928 - 41523417
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41522928 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 41523027  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41523028 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca-tatata 41523126  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  41523127 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcataatcaattattcactgtgacctacg 41523226  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||    
T  41523227 ttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatacctacaacttttatgtttaca 41523326  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 520  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41523327 cctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 41523417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 387; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 520
Target Start/End: Original strand, 41525390 - 41525879
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41525390 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 41525489  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41525490 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca-tatata 41525588  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  41525589 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcataatcaattattcactgtgacctacg 41525688  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||    
T  41525689 ttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatacctacaacttttatgtttaca 41525788  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 520  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41525789 cctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 41525879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 383; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 15376864 - 15376384
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15376864 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 15376765  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15376764 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca-tatata 15376666  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  15376665 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 15376567  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  15376566 tgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatacctacaactttcgtgtttaca 15376467  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15376466 cctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 15376384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 383; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 20385274 - 20384794
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20385274 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 20385175  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20385174 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca-tatata 20385076  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  20385075 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 20384977  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  20384976 tgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatacctacaactttcgtgtttaca 20384877  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20384876 cctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 20384794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 383; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 512
Target Start/End: Original strand, 27216871 - 27217352
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27216871 atcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 27216970  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27216971 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca-tatata 27217069  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  27217070 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcataatcaattattcactgtgacctacg 27217169  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  27217170 ttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatacctacaactttcgtgtttaca 27217269  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27217270 cctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 27217352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 383; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 520
Target Start/End: Original strand, 32125502 - 32125990
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32125502 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 32125601  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32125602 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca-tatata 32125700  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  32125701 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 32125799  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  32125800 tgcagtaatttgactataactctagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggtattagaaagctaacatttatacctacaactttcgtgtttaca 32125899  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 520  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32125900 cctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 32125990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 381; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 510
Target Start/End: Original strand, 456332 - 456811
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  456332 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 456431  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  456432 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca-tatata 456530  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  456531 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcataatcaattattcactgtgacctacg 456630  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  456631 ttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatacctacaactttcgtgtttaca 456730  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattca 510  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  456731 cctaagaccaattctgtaccaatcaataccggttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattca 456811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 14949273 - 14948785
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14949273 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 14949174  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14949173 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca-tatata 14949075  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  14949074 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 14948976  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  14948975 tgcagtaatttgactataactctagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatacctacaactttcgtgtttaca 14948876  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 520  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14948875 cctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctaaaattcataaaaattcactaagacctc 14948785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 378; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 511
Target Start/End: Original strand, 16232531 - 16233011
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16232531 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 16232630  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16232631 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca-tatata 16232729  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  16232730 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcataatcaattattcactgtgacctacg 16232829  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  16232830 ttcagtaatttgacaataactcaaattctataaatccttttgaattcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatacctacaactttcgtgtttaca 16232929  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcac 511  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16232930 cctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcac 16233011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 367; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 512
Target Start/End: Original strand, 16410070 - 16410550
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16410070 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 16410169  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16410170 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatacatatacaattatatcatagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca-tatata 16410268  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  16410269 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacattgatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 16410367  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  16410368 tgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatacctacaactttcgtgtttaca 16410467  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16410468 cctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 16410550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 363; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 21189746 - 21189266
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21189746 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 21189647  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21189646 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca-tatata 21189548  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  21189547 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaac-tatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 21189449  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  21189448 tgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattaaaaagctaacattcatacctacaactttcttgtttaca 21189349  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21189348 cctaagaccaactctgtaccaataaataccagttttcatttcaaatttggacaaagttgtgcggaaattcataaaaattcact 21189266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 520
Target Start/End: Original strand, 24702249 - 24702728
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24702249 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 24702348  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24702349 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatc-atatata 24702447  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  24702448 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaa----------acatatactaattcatgaatcatattcaattattcactgtgacctacg 24702537  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  24702538 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatacctacaaccttcgtgtttaca 24702637  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 520  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24702638 cctaagaccaattctgtaccaaccaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 24702728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 519
Target Start/End: Original strand, 18430723 - 18431210
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18430723 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatataaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 18430822  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18430823 catctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca-tatata 18430921  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||  |||||    
T  18430922 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacattcatatactaattcatcaatcagattcaattattcactatgttctacg 18431020  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  18431021 tgcagtaatttgactataactctagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaacctaagattcatacctacaactttcgtgtttaca 18431120  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacct 519  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18431121 cctaagaccagttctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacct 18431210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 512
Target Start/End: Original strand, 18640283 - 18640763
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18640283 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 18640382  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18640383 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacataaaataataatcaacatcttaaaacatca-tatata 18640481  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  18640482 catataacacttcatcaatcatggaaaatatcgtattcacaa-catatacattcatatagtaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 18640580  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  18640581 tgcagtaatttgactataaatcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattataaagctaacatttatacctacaactttcgtgtttaca 18640680  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18640681 cctaagaccaattctgtgccaatcaatatcagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcttaaaaattcact 18640763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 520
Target Start/End: Original strand, 24704699 - 24705175
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24704699 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacaa---gacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 24704795  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24704796 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca-tatata 24704894  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  24704895 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacat----------atactaattcatgaatcatattcaattattcactgtgacctacg 24704984  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  24704985 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatacctacaaccttcgtgtttaca 24705084  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 520  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24705085 cctaagaccaattctgtaccaaccaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 24705175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 510
Target Start/End: Original strand, 13869357 - 13869837
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaa-ca 128  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13869357 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacagtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaatca 13869456  T
Q  129 acatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa-caacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatata 227  Q
    || ||||||||||||| | || ||  || | ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  13869457 acgtctcaattattcaaagataatctaattgatgcatatacaattatatcccaatataaacaacatcaaatgataatcaacatcttaaaacatca-tata 13869555  T
Q  228 tacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgaccta 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  13869556 tacatataaaacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcataatcaattattcactgtgaccta 13869655  T
Q  328 cgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgttta 427  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13869656 cgttcagtaatttaaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcactagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgttta 13869755  T
Q  428 cacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattca 510  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13869756 tacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttc-aattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattca 13869837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 11393438 - 11392971
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11393438 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 11393339  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11393338 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca-tatata 11393240  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||    
T  11393239 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcataatcaattattcactatgacctacg 11393140  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||     
T  11393139 ttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatacctacaactttcgtgtttac- 11393041  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcac 511  Q
                | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11393040 ------------tctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttatgctgaaattcataaaaattcac 11392971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 312; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 74 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 26356090 - 26355652
Alignment:
Q  74 aacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataatt 173  Q
    |||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  26356090 aacacaacagtatacaaaaacagcataacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaatt 26355991  T
Q  174 atatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatca-atatatacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaa 272  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||     
T  26355990 atatcacaatataacaacattaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatatacatataacacttcatcaattatggacaatatcgtatttacaa- 26355892  T
Q  273 catatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttga 372  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26355891 catatacattcatatactaattaatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtgtagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttga 26355792  T
Q  373 agtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttca 472  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26355791 agtcaaaccaacggaattagaaagctaacattcatacctacaactttcgtgttaacacataagaccaattctgtaccaatcaataccagtttttatttca 26355692  T
Q  473 aattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26355691 aattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 26355652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 312; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 74 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 26358542 - 26358104
Alignment:
Q  74 aacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataatt 173  Q
    |||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  26358542 aacacaacagtatacaaaaacagcataacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaatt 26358443  T
Q  174 atatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatca-atatatacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaa 272  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||     
T  26358442 atatcacaatataacaacattaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatatacatataacacttcatcaattatggacaatatcgtatttacaa- 26358344  T
Q  273 catatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttga 372  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26358343 catatacattcatatactaattaatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtgtagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttga 26358244  T
Q  373 agtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttca 472  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26358243 agtcaaaccaacggaattagaaagctaacattcatacctacaactttcgtgttaacacataagaccaattctgtaccaatcaataccagtttttatttca 26358144  T
Q  473 aattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26358143 aattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 26358104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 272; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 181 - 520
Target Start/End: Original strand, 11303409 - 11303747
Alignment:
Q  181 aatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatatacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatataca 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  11303409 aatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatca-tatatacatataacacttcatcaatcattgacaatatcgtattcacaaatatataca 11303507  T
Q  281 tacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaac 380  Q
    |||||||| |||||||||||||||   ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  11303508 tacatatattaattcatcaatcataaacaattcttcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaac 11303607  T
Q  381 caacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcaga 480  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11303608 caacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacatctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattctga 11303707  T
Q  481 caaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 520  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11303708 caaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 11303747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 182 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 16108688 - 16108351
Alignment:
Q  182 atataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatatacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacat 281  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  16108688 atataacaacatcaaacggtaatcaacatcttaaaacatca-tatatacatataacacttcatcaatcattgacaatattgtattcacaaatatatacat 16108590  T
Q  282 acatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaacc 381  Q
    ||||||| |||||||||||||||   ||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16108589 acatatattaattcatcaatcataaacaattcttcactgtgacgtacgtgtagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaacc 16108490  T
Q  382 aacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagac 481  Q
    ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16108489 aacagcattagaaaactaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattctgac 16108390  T
Q  482 aaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 520  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16108389 aaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 16108351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 182 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 23664952 - 23664615
Alignment:
Q  182 atataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatatacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacat 281  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23664952 atataacaacatcaaatggtaattaacatcttaaaacatca-tatatacatataacctttcatcaatcattgacaatatcgtattcacaaatatatacat 23664854  T
Q  282 acatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaacc 381  Q
    ||||||| |||||||||||||||   ||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23664853 acatatattaattcatcaatcatcaacaattcttcactgtgacctacatgcaataatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaacc 23664754  T
Q  382 aacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagac 481  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  23664753 aacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattctgtaccaatcaataccatttttcatttcaaattctgac 23664654  T
Q  482 aaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 520  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23664653 aaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 23664615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 182 - 520
Target Start/End: Original strand, 29796771 - 29797110
Alignment:
Q  182 atataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatca-atatatacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatataca 280  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  29796771 atataacaacatcaaatggtaattaacatcttaaaacatcatatatatacatataacccttcatcaatcattgacaatatcgtattcacaaatatataca 29796870  T
Q  281 tacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaac 380  Q
    |||||||| |||||||||||||||   ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  29796871 tacatatattaattcatcaatcataaacaattcttcactgtgatctacgtgcagtaatttgaccatagctcaagttctataaattcttttgaagtcaaac 29796970  T
Q  381 caacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcaga 480  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29796971 caacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaattctgtatcaatcaataccagttttcatttcaaattctga 29797070  T
Q  481 caaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 520  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29797071 caaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 29797110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 182 - 520
Target Start/End: Original strand, 29800590 - 29800929
Alignment:
Q  182 atataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatca-atatatacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatataca 280  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  29800590 atataacaacatcaaatggtaattaacatcttaaaacatcatatatatacatataacccttcatcaatcattgacaatatcgtattcacaaatatataca 29800689  T
Q  281 tacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaac 380  Q
    |||||||| |||||||||||||||   ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  29800690 tacatatattaattcatcaatcataaacaattcttcactgtgatctacgtgcagtaatttgaccatagctcaagttctataaattcttttgaagtcaaac 29800789  T
Q  381 caacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcaga 480  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29800790 caacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaattctgtatcaatcaataccagttttcatttcaaattctga 29800889  T
Q  481 caaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 520  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29800890 caaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 29800929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 170 - 512
Target Start/End: Original strand, 18627717 - 18628057
Alignment:
Q  170 aattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatatacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcac 269  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  18627717 aattatatcacaatataacaagatcaaatactaatcaacatcttaaaacatca-tatatacatataacacttcatcaatcacggaaaatatcgtattcac 18627815  T
Q  270 aaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattt 369  Q
    || ||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||    
T  18627816 aa-catatacattcatataataattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtgcagtaatttgactataaatcaagttctataaatccttt 18627914  T
Q  370 tgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatt 469  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||    
T  18627915 tgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattctgtgccaatcaatatcagttttcatt 18628014  T
Q  470 tcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18628015 ttaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 18628057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 230 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 14269909 - 14269627
Alignment:
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  14269909 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 14269810  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14269809 tgcaaaaatttgaccataactcaatttctataaatccttttgaagtcgaaccaacggaattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 14269710  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14269709 cctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 14269627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 230 - 512
Target Start/End: Original strand, 8940489 - 8940775
Alignment:
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  8940489 catataacacttcatcaatcatgaacaatatagtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 8940588  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttc----gtgtt 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    |||||    
T  8940589 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacattcatacctacaactttcgtgtgtgtt 8940688  T
Q  426 tacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8940689 tacacctaagaccaattttgtaccaatcaatagcagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgcttaaattcataaaaattcact 8940775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 230 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 15081794 - 15081516
Alignment:
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||    
T  15081794 catataacacttcatcaatcatgaacaatatagtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcacttagacctacg 15081695  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  15081694 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaattcttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacattcatacctacaacttttgtgtttaca 15081595  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaatt 508  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15081594 cctaagaccaattctgtaccaatcaatatcagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaatt 15081516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 232 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 45847605 - 45847325
Alignment:
Q  232 tataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacgtg 331  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  45847605 tataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacagacatatacatacatataccaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtg 45847506  T
Q  332 cagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacc 431  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  45847505 caataatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaactaacagagttagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttatacc 45847406  T
Q  432 taagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45847405 taagaccaattttgtaccaatcaatattatttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 45847325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 30 - 304
Target Start/End: Original strand, 11972507 - 11972779
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11972507 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 11972606  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  11972607 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaatatcttaaaacatc-atatata 11972705  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcat 304  Q
    ||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11972706 catgtaacacttcatcaatcatgggcaatatcgtattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaatcat 11972779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 525 - 753
Target Start/End: Original strand, 28556968 - 28557196
Alignment:
Q  525 agactcaattacccaccaatgaggcagcctaaacaataaaataaacatattaagcttttaattaaattaaacttctttaaaaatatacaacaaacatagt 624  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||    
T  28556968 agactcaattacccaccaatgaggcaacctacacaataaattaaacatattaagcttttaattaaattaaactttgttaaaattatacaacaatcatagt 28557067  T
Q  625 attataacaacgaactcaccgtaaaggttggacatttccaatatctccttttaggattttcatttaaattagagatgaacatccttatgattttgttgca 724  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28557068 attataacaacgaactcaccgtaaaggttggacatttccaatatctccttttaggattttcatttaaattggagatgaacatccttatgattttgttgca 28557167  T
Q  725 cccacatataagcaattcaattgatgatg 753  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28557168 cccacatataggcaattcaattgatgatg 28557196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 525 - 753
Target Start/End: Original strand, 707565 - 707793
Alignment:
Q  525 agactcaattacccaccaatgaggcagcctaaacaataaaataaacatattaagcttttaattaaattaaacttctttaaaaatatacaacaaacatagt 624  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  707565 agactcaattacccactaatgaggtagcctaaacaataaattaaacatattaagcttttaattaaattaaactttgttaaaattatacaacaaacatagt 707664  T
Q  625 attataacaacgaactcaccgtaaaggttggacatttccaatatctccttttaggattttcatttaaattagagatgaacatccttatgattttgttgca 724  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  707665 attataacaacgaacacaccgtaaaggttggacatttccaatatctccttttagggttttcatttaaattggagatgaacatccttatgattttgttgca 707764  T
Q  725 cccacatataagcaattcaattgatgatg 753  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  707765 cccacatataggcaattcaattgatgatg 707793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 230 - 477
Target Start/End: Original strand, 8468945 - 8469192
Alignment:
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  8468945 catataacatttcatcaatcatgaacaatatcgtattcaaaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcattgtgacctaca 8469044  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8469045 tgcagtaatttgatcataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacgtcattagaaaactaacatctatacctacaactttcgtgtttaca 8469144  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 477  Q
     |||||||||||| || ||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  8469145 gctaagaccaattctggacctatcaataccagatttcatttcaaattc 8469192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 167; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 314 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 25926998 - 25926792
Alignment:
Q  314 ttcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctac 413  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  25926998 ttcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataactctttttgacgtcagaccaatggcattagaaagctaatatccatacctac 25926899  T
Q  414 aactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcacta 513  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25926898 aactttcgtgtttacacctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcacta 25926799  T
Q  514 agacctc 520  Q
    |||||||    
T  25926798 agacctc 25926792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 313 - 506
Target Start/End: Original strand, 8940769 - 8940961
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8940769 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 8940868  T
Q  413 caactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaa 506  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8940869 caacttt-ttgtttacacctaagaccaattatgtatcaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaa 8940961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 321 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 13918265 - 13918065
Alignment:
Q  321 tgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttc 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| || | |||||||||||||| ||||||||||  ||||    
T  13918265 tgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaatggaattagaaagctaacattcatacctacagttttc 13918166  T
Q  421 gtgtttacacctaa-gaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacct 519  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13918165 gtgtttacacctaaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacct 13918066  T
Q  520 c 520  Q
    |    
T  13918065 c 13918065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 227 - 470
Target Start/End: Original strand, 11972755 - 11972998
Alignment:
Q  227 atacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacct 326  Q
    |||||||||  | |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  11972755 atacatatactaattcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatgcattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacct 11972854  T
Q  327 acgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgttt 426  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  11972855 acgtacagtaatttgactataactcaagttctatagatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatacctacaactttcgtgttt 11972954  T
Q  427 acacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcattt 470  Q
    ||||||||||| |||| || ||| ||||||||||| ||||||||    
T  11972955 acacctaagacaaattctggacctatcaataccagatttcattt 11972998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 321 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 14269625 - 14269434
Alignment:
Q  321 tgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttc 420  Q
    |||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14269625 tgacctgcgtgcaataatttgatgataactcaagttctataaatttttttgacgtcataccaaaggcattagaaagctaacatccatacctacaactttc 14269526  T
Q  421 gtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14269525 gtgtttacacctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 14269434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 314 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 1857097 - 1856892
Alignment:
Q  314 ttcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctac 413  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||| | || |||||||||||||| |||||||||    
T  1857097 ttcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttatataaatcgttttgacgtcagaccaatgacattagaaagctaacattcatacctac 1856998  T
Q  414 aactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcacta 513  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1856997 aactt-cgtgtttacacctaagaccaattcggtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggacaaagttgttctgaaattcataaaaattcacta 1856899  T
Q  514 agacctc 520  Q
    |||||||    
T  1856898 agacctc 1856892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 321 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 10501255 - 10501066
Alignment:
Q  321 tgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttc 420  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||     
T  10501255 tgaccttcgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatccatttgaagtcaaaccaacgacattagaaatctaacatccatacctacaactttt 10501156  T
Q  421 gtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattca 510  Q
    |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10501155 gtgtttacacctaagaccaactctgtatcaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaggttgtgctgaaattcataaaaattca 10501066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 313 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 14156944 - 14156749
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  14156944 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaacataactcacgttctataaatccttttgaagtcaaaccaacgacattagaaagctaacattcataccta 14156845  T
Q  413 caactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    ||||||| ||||    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14156844 caactttagtgt----acctaagaccaattttgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaggttgtgctgaaattcataaaaattcact 14156749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 30 - 198
Target Start/End: Original strand, 44116520 - 44116688
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44116520 atcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 44116619  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 198  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44116620 cgtctcaattattcacatataattcaagcaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaat 44116688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 35 - 211
Target Start/End: Original strand, 13647344 - 13647521
Alignment:
Q  35 cttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatc 133  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13647344 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtc 13647443  T
Q  134 tcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatc 211  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  13647444 tcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaatcataatcaacatc 13647521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 313 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 38897904 - 38897741
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38897904 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatctttttgacgtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 38897805  T
Q  413 caactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaatt 476  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  38897804 caactttcgagtttacacctaagaccaattctggacctatcaataccagatttcatttcaaatt 38897741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 313 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 14269440 - 14269274
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  14269440 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgacaataactcaagttctataaatcgttttgacatcaaaccaacggaattagaaagctaacatccataccta 14269341  T
Q  413 caactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcag 479  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14269340 caacttttgtgtttacacctaagaccaattctgtaccaatcaataccagatttcatttcaaattcag 14269274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 30 - 197
Target Start/End: Original strand, 3386344 - 3386511
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3386344 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaatagtatacaaaaacagcatgacatgataatatcaaatgcaagtcaacaa 3386443  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaa 197  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  3386444 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatacatatacaattatatcacaatataacatcatcaaa 3386511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 240 - 412
Target Start/End: Original strand, 13841274 - 13841446
Alignment:
Q  240 ttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacgtgcagtaatt 339  Q
    |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13841274 ttcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtgcagtaatt 13841373  T
Q  340 tgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||    
T  13841374 tgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggaattagaaagctaacattcataccta 13841446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 30 - 168
Target Start/End: Original strand, 24275182 - 24275320
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24275182 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 24275281  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatata 168  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24275282 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatata 24275320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 30 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 38898528 - 38898359
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaa-ca 128  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  38898528 atcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacgacacagcagtatataaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaatca 38898429  T
Q  129 acatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 198  Q
    |||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  38898428 acatctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcacagtataacaacgtcaaat 38898359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 317 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 15081514 - 15081354
Alignment:
Q  317 attgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaac 416  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15081514 attgtgacctacgtgcagtaatttaaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaac 15081415  T
Q  417 tttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 477  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  15081414 tttcgtgtttacttctaagaccaattatggacctatcaataccatatttcatttcaaattc 15081354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 30 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 17062066 - 17061898
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa-caacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 128  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17062066 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaactcagcagtatacaaaat-agcatgacataataatatcaaatgcaagtcagca 17061968  T
Q  129 acatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 198  Q
    || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17061967 acgtctcaattattaacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaat 17061898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 313 - 477
Target Start/End: Original strand, 8940962 - 8941126
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| || |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8940962 attcactgcgacctatgtgcagtagtttgagcataactcaagttctataaatcattttgacttcagaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 8941061  T
Q  413 caactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 477  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  8941062 caactttcgtgtttacacctaagaccaattctggacctatcaataccagatttcatttcaaattc 8941126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 112 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 15082019 - 15081826
Alignment:
Q  112 tcaaatgcaagtcaa-caacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacat 210  Q
    ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  15082019 tcaaatgcaagtcaatcaatgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaatcataatcaacat 15081920  T
Q  211 c--ttaaaacatcaatatatacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcat 304  Q
    |   | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15081919 caacttaaacatc-atatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcgc-aacatatacatacatatactaattcatcaatcat 15081826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 313 - 477
Target Start/End: Original strand, 16214170 - 16214334
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16214170 attcactgtgacctacgtgcagtaatatgaccataactcaagttctataaatctttttgacgtcataccaacggcattagaaagctaacatccataccta 16214269  T
Q  413 caactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 477  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  16214270 caacctttgtgtttacacctaagaccaattctggacctatcaataccaaatttcatttcaaattc 16214334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 313 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 14156755 - 14156592
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14156755 attcactgtgacctacatgcggtaatttgatcataagtcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 14156656  T
Q  413 caactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaatt 476  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  14156655 caactttcgtgttatcacctaagaccaattctgtaccgatcaataccagtttttgtttcaaatt 14156592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 321 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 21189264 - 21189108
Alignment:
Q  321 tgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttc 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  21189264 tgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaattgttttgacgtcagaccaacggcattaaaaagctaatatccatacctacaactttc 21189165  T
Q  421 gtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 477  Q
    |||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  21189164 gtgtttacacctaagaccaattgttgacctatcaataccagatttcatttcaaattc 21189108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 35 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 12756817 - 12756654
Alignment:
Q  35 cttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatct 134  Q
    |||||||||||||  |||  ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  12756817 cttagaccgactcgagcagtttagttaaataacaacagcaacacaacaatatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtaaacaacgtct 12756718  T
Q  135 caattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 198  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12756717 caattattcacataaaattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaat 12756654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 30 - 196
Target Start/End: Original strand, 20110567 - 20110723
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |          ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20110567 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagc----------tatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaataa 20110656  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaa 196  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20110657 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaa 20110723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 346 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 10501064 - 10500934
Alignment:
Q  346 taactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattatg 445  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||    
T  10501064 taactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcatgttatcacctaagaccaattctg 10500965  T
Q  446 taccaatcaataccagttttcatttcaaatt 476  Q
    |||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  10500964 taccgatcaataccagtttttgtttcaaatt 10500934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 3564478 - 3564319
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaa 121  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||    
T  3564478 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgtaa 3564379  T
Q  122 gtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcaca 181  Q
    |||||||||||||||||||| ||   || ||||||||||||| ||||  |||| ||||||    
T  3564378 gtcaacaacatctcaattatacattcataattcaagtaatgcgtataacattagatcaca 3564319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 182 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 14270061 - 14269941
Alignment:
Q  182 atataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatatacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacat 281  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  14270061 atataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca-tatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacat 14269964  T
Q  282 acatatactaattcatcaatcat 304  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  14269963 acatatattaattcatcaatcat 14269941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 321 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 17985246 - 17985092
Alignment:
Q  321 tgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttc 420  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||  || ||||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  17985246 tgacctacgtgtagtaatttgactataactcaagttctaaatatcattttggaatcaaaccaactccattagaaatttaacatccttacctacaactttc 17985147  T
Q  421 gtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaat 475  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  17985146 atgtttacacctaagaccaattctgtaccgatcaataccagatttcatttgaaat 17985092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 30 - 138
Target Start/End: Original strand, 48273403 - 48273512
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 128  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48273403 atcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 48273502  T
Q  129 acatctcaat 138  Q
    ||||||||||    
T  48273503 acatctcaat 48273512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 30 - 145
Target Start/End: Original strand, 13831384 - 13831499
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13831384 atcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacacggtagtatacaaaaacaacatgacataataatataaaatgcaagtcaacaa 13831483  T
Q  130 catctcaattattcac 145  Q
    | ||||||||||||||    
T  13831484 cgtctcaattattcac 13831499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 202 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 45847739 - 45847639
Alignment:
Q  202 aatcaacatcttaaaacatcaatatatacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaat 301  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45847739 aatcaacatcttaaa-catca-tatatacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatattaattcatcaat 45847642  T
Q  302 cat 304  Q
    |||    
T  45847641 cat 45847639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 23 - 181
Target Start/End: Original strand, 12698838 - 12698998
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaa-acagaatgacataataatatcaaatgca 120  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  12698838 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaacacagcatgacataataatatcaattgca 12698937  T
Q  121 agtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcaca 181  Q
    | ||| |||||||| || |||||| ||||  ||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  12698938 attcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcaca 12698998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 164 - 279
Target Start/End: Original strand, 13841157 - 13841270
Alignment:
Q  164 atatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatatacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgt 263  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  13841157 atatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatc-atatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgt 13841255  T
Q  264 attcacaaacatatac 279  Q
    ||||| ||||||||||    
T  13841256 attca-aaacatatac 13841270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 31 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 2280225 - 2280056
Alignment:
Q  31 tcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa-caacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 128  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||| || |||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  2280225 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatgcaaaa-cagcatgatataataatatcaaatgcaaatcaaca 2280127  T
Q  129 acatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaaat 198  Q
    ||||||||| |||||| |||| |||||| |||| |||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  2280126 acatctcaaatattcatatataattcaaataatacatataaaattatatcacattataaacaacatcaaat 2280056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 32 - 187
Target Start/End: Original strand, 26212012 - 26212168
Alignment:
Q  32 caacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 130  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  26212012 caacttagaccgactcatacaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaattgcaattcaacaac 26212111  T
Q  131 atctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa 187  Q
    |||| || |||||| |||    |||||||||||||| |  ||||||||||| |||||    
T  26212112 atcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcacattataa 26212168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 23 - 181
Target Start/End: Original strand, 9509196 - 9509355
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaa 121  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| || |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  9509196 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagtaacataggcagtatacaataacagcatgacataataatatcaattgcaa 9509295  T
Q  122 gtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcaca 181  Q
     ||| |||||||| || |||||| ||||  ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  9509296 ttcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacactatatcaca 9509355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 23 - 181
Target Start/End: Original strand, 38227488 - 38227646
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaa 121  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38227488 catcttcatctacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaatgcaa 38227586  T
Q  122 gtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcaca 181  Q
    ||||||||||||| || ||||||  |||  ||||| ||||| | |||| |||||||||||    
T  38227587 gtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaattaatgtacatatcattatatcaca 38227646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 182 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 38898229 - 38898107
Alignment:
Q  182 atataacaacatcaaatggtaatcaacatct--taaaacatcaatatatacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatac 279  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||   | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  38898229 atataacaacatcaaatgataatcaacatcaacttaaacatca-tatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcgc-aacatatac 38898132  T
Q  280 atacatatactaattcatcaatcat 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  38898131 atacatatactaattcatcaatcat 38898107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 30 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 18456519 - 18456368
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 128  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | ||||| || |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18456519 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacgatagcaacataggcagtatacaaaa-caacatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 18456421  T
Q  129 acatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcaca 181  Q
    |||||| || ||||||  |||  ||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  18456420 acatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcaca 18456368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 182 - 304
Target Start/End: Original strand, 8940335 - 8940457
Alignment:
Q  182 atataacaacatcaaatggtaatcaacatct--taaaacatcaatatatacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatac 279  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||   | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  8940335 atataacaacatcaaatgataatcaacatcaacttaaacatca-tatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcgc-aacatatac 8940432  T
Q  280 atacatatactaattcatcaatcat 304  Q
    ||| |||||||||||||||||||||    
T  8940433 ataaatatactaattcatcaatcat 8940457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 230 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 38898075 - 38897995
Alignment:
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaa 310  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38898075 catataacacttcatcaatcatgaacaatatagtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaa 38897995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 313 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 45847331 - 45847213
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| || ||||||| |||||    || |||    
T  45847331 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcataccaacgacattagaaagttaacacaattatcta 45847232  T
Q  413 caactttcgtgtttacacc 431  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  45847231 caactttcatgtttacacc 45847213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 182 - 271
Target Start/End: Original strand, 8468803 - 8468891
Alignment:
Q  182 atataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatatacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaa 271  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8468803 atataacaacatcaaataataatcaacatcataaaacatca-tatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa 8468891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 32 - 134
Target Start/End: Original strand, 10589055 - 10589158
Alignment:
Q  32 caacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 130  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  10589055 caacttagatcgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacatatgcagtatacaaaaacaacatgacataatcatatcaattgcaattcaacaac 10589154  T
Q  131 atct 134  Q
    ||||    
T  10589155 atct 10589158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 398 - 512
Target Start/End: Original strand, 11310133 - 11310246
Alignment:
Q  398 taacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaat 497  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| |  || |||||||||||||    
T  11310133 taacatctatacctacaacttttgtgaaaacacctaagaccaattatgtacttatcaatac-agttttcatttcaaattcgggaaaggttgtgctgaaat 11310231  T
Q  498 tcataaaaattcact 512  Q
    ||||||| |||||||    
T  11310232 tcataaatattcact 11310246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 31 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 15144143 - 15144037
Alignment:
Q  31 tcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 130  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||   |||||| ||| ||||| | || || ||||||||||||||||| |||||||    
T  15144143 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacatctcagtatgcaataacagcaagatatcataatatcaaatgcaagccaacaac 15144044  T
Q  131 atctcaa 137  Q
    |||||||    
T  15144043 atctcaa 15144037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 312 - 400
Target Start/End: Original strand, 11310239 - 11310327
Alignment:
Q  312 tattcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaa 400  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||| |||| |||||||||||    
T  11310239 tattcactctgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttatataattcatttagacgtcaaaccaatggcattagaaagctaa 11310327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 30 - 137
Target Start/End: Original strand, 22072927 - 22073036
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa-caacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 127  Q
    |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| || || ||| ||||| ||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||    
T  22072927 atcaacttagactgacccatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcactatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaac 22073026  T
Q  128 aacatctcaa 137  Q
    ||||||||||    
T  22073027 aacatctcaa 22073036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 410 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 23461864 - 23461797
Alignment:
Q  410 ctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 477  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  23461864 ctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattctggacctatcaataccagacttcatttcaaattc 23461797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 38 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 12255892 - 12255730
Alignment:
Q  38 agaccgactcatgcaacttagttaaataacaa-caacaacacag-cagtatacaaaaacaga-atgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatct 134  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||   |   |||| |||| ||||||||||| || || |||||||||    
T  12255892 agacagactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatagtcagtatgcaaatcaattcatgatataacaatatcaaatgaaattctacaacatct 12255793  T
Q  135 caattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaa 196  Q
    |||  ||||| |||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  12255792 caaacattcatatataattcaagtaatacatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 12255730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 313 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 15376390 - 15376272
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    | | |||||||||| |||||||||| ||| || | |||||||||||    || |||    
T  15376390 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcataaaccaaaaatcattttcaagtcaaaccgacgccactggaaagctaacacaattatcta 15376291  T
Q  413 caactttcgtgtttacacc 431  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  15376290 caactttcatgtttacacc 15376272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 313 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 20384800 - 20384682
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    | | |||||||||| |||||||||| ||| || | |||||||||||    || |||    
T  20384800 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcataaaccaaaaatcattttcaagtcaaaccgacgccactggaaagctaacacaattatcta 20384701  T
Q  413 caactttcgtgtttacacc 431  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  20384700 caactttcatgtttacacc 20384682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 333 - 430
Target Start/End: Original strand, 11286976 - 11287073
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacac 430  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| | || ||||||||||||||   || ||| ||||||| |||||||||    
T  11286976 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggaagacaaaccaaagccattagaaagctaacataattatctaaaactttcatgtttacac 11287073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 23 - 177
Target Start/End: Original strand, 18005653 - 18005806
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacaacaaca-cagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgca 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||  ||||||||   ||| ||  |||| |||| |||||| ||||||    
T  18005653 catcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataagcagtat-ggaaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 18005751  T
Q  121 agtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatat 177  Q
    | ||||||||||||||| |||  |||||  |||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  18005752 aatcaacaacatctcaaatatcaacata--attcatataatgtatatacaattatat 18005806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 98 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 19486782 - 19486681
Alignment:
Q  98 atgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaa 196  Q
    |||| |||||||||||  | | |||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  19486782 atgatataataatatcgcacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagttatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 19486683  T
Q  197 at 198  Q
    ||    
T  19486682 at 19486681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 103 - 187
Target Start/End: Original strand, 15113031 - 15113114
Alignment:
Q  103 ataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa 187  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||  ||||| |||||||||||| |||||    
T  15113031 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaa-tattcacatataactcaagtaatatatatacaattatatcacattataa 15113114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 16386362 - 16386239
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgca 120  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||| || |    
T  16386362 catcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacgacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgta 16386263  T
Q  121 agtcaacaacatctcaattattca 144  Q
      ||| |||||||| || ||||||    
T  16386262 tttcatcaacatcttaaatattca 16386239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 77
Target Start/End: Original strand, 44014185 - 44014240
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacaacaaca 77  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  44014185 catcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaaca 44014240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 138
Target Start/End: Original strand, 67759 - 67868
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 127  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| | ||||||| | ||| ||  |||| |||| |||||| ||||||| |||||    
T  67759 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaac 67857  T
Q  128 aacatctcaat 138  Q
    |||||||||||    
T  67858 aacatctcaat 67868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 23 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 811245 - 811199
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa 69  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  811245 catcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 811199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 333 - 402
Target Start/End: Original strand, 125965 - 126034
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaaca 402  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| | || |||||||||||||    
T  125965 agtaatttgatcataactcaagttctaaaactcatttggaagtcaaaccaaagccattagaaagctaaca 126034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 1868101 - 1867932
Alignment:
Q  31 tcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacaacaacacag-cagtatacaaaaacaga--atgacataataatatcaaatgcaagtcaa 126  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||| || ||||||| |||| |||   |||| |||| |||||||| ||||| | ||    
T  1868101 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaactaacaacaacataggcagtatataaaa-cagctcatgatataacaatatcaa-tgcaaatgaa 1868004  T
Q  127 caacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaata-taacaacatcaaat 198  Q
    |||||||||||  || || |||| ||||| |||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||    
T  1868003 caacatctcaaacat-catatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaat 1867932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 13745648 - 13745563
Alignment:
Q  225 atatacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaa 310  Q
    |||| ||||||| | ||||| |||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  13745648 atattcatataataattcattaatcatgaacaacatcatattcatcaacatatacattcatataataattcatcaatcatgatcaa 13745563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 16219831 - 16219719
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgca 120  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| ||  |||| |||| |||||| ||||||    
T  16219831 catcatcttcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 16219733  T
Q  121 agtcaacaacatct 134  Q
    ||||| ||||||||    
T  16219732 agtcatcaacatct 16219719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 103 - 187
Target Start/End: Original strand, 15116568 - 15116651
Alignment:
Q  103 ataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa 187  Q
    |||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||| | |||||||||  ||||| |||||||||||| |||||    
T  15116568 ataacaatatcaattgcaagtcatcaacatctcaat-attcacatataactcaagtaatatatatacaattatatcacattataa 15116651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 10063921 - 10063760
Alignment:
Q  34 acttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa-caacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaaca 131  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| || | |||| || || ||  |||| ||||||||||| ||  ||||| |||||||    
T  10063921 acttagactgactcatgcaacttagttaattaacaatcagcaacataggcggtatgcacaa-catcatgatataataatatcgaacacaagtaaacaaca 10063823  T
Q  132 tctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaaat 198  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||      |||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  10063822 tctcaaatattcacatataattcaa-----acatatacaattatatcacattataaacaacatcaaat 10063760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 313 - 352
Target Start/End: Original strand, 13869833 - 13869872
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactca 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13869833 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactca 13869872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 198
Target Start/End: Original strand, 16495421 - 16495581
Alignment:
Q  35 cttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacat 132  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| ||  |||| ||||||||||| |||| || |||||||       
T  16495421 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaa--- 16495516  T
Q  133 ctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 198  Q
    |||||||| ||| |  | | ||| |||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  16495517 ctcaatta-tcagacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataacaacatcaaat 16495581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 230 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 15119993 - 15119919
Alignment:
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcat 304  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  15119993 catataataattcatcaatcatgaacaacatcatattcatcaacatatacattcatataataattcataaatcat 15119919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 313 - 431
Target Start/End: Original strand, 27217346 - 27217464
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    | | |||||||||| |||||||||| ||| || |  ||||||||||    || |||    
T  27217346 attcactgtgacctacgtgtagtaatttgaccataactcataaaccaaaaatcattttcaagtcaaaccgacgccactgtaaagctaacacaattatcta 27217445  T
Q  413 caactttcgtgtttacacc 431  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  27217446 caactttcatgtttacacc 27217464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 166
Target Start/End: Original strand, 40443410 - 40443541
Alignment:
Q  35 cttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa-caacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacat 132  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| || ||||| | |||||| |||||  ||| |||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||    
T  40443410 cttagaccgactcgtgcagcttagttaaataacaaacagcaacatacgcagtaaacaaa--cagcatgacataataatatcaatttcaattcatcaacat 40443507  T
Q  133 ctcaattattcacatatgattcaagtaatgcata 166  Q
    || |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  40443508 cttaggtatacaaatattcttcaagtaatgcata 40443541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 333 - 442
Target Start/End: Original strand, 7822013 - 7822122
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacct 432  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||  | ||||||||| || |||||||||||||    || ||| ||||||| ||||||||||     
T  7822013 agtaatttgatcataactcgagttctaaaaatcatttggacctgaaaccaacgccattagaaagctaacaaaattatctaaaactttcatgtttacacca 7822112  T
Q  433 aagaccaatt 442  Q
    ||| ||||||    
T  7822113 aaggccaatt 7822122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 333 - 442
Target Start/End: Original strand, 7829324 - 7829433
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacct 432  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||  | ||||||||| || |||||||||||||    || ||| ||||||| ||||||||||     
T  7829324 agtaatttgatcataactcgagttctaaaaatcatttggacctgaaaccaacgccattagaaagctaacaaaattatctaaaactttcatgtttacacca 7829423  T
Q  433 aagaccaatt 442  Q
    ||| ||||||    
T  7829424 aaggccaatt 7829433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 137
Target Start/End: Original strand, 16056343 - 16056449
Alignment:
Q  31 tcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacaacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 128  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||| || || ||| |  |||||  |||| |||| |||||||||||||| ||||||    
T  16056343 tcaacttagaccgactgatgcaccttagttaaataacaaacagcaacatagacattatgc--aaacaacatgatataacaatatcaaatgcaaatcaaca 16056440  T
Q  129 acatctcaa 137  Q
    |||||||||    
T  16056441 acatctcaa 16056449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 333 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 27102621 - 27102512
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacct 432  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||  | ||||||||| || |||||||||||||    || ||| ||||||| ||||||||||     
T  27102621 agtaatttgatcataactcgagttctaaaaatcatttggacctgaaaccaacgccattagaaagctaacaaaattatctaaaactttcatgtttacacca 27102522  T
Q  433 aagaccaatt 442  Q
    ||| ||||||    
T  27102521 aaggccaatt 27102512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 333 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 27109969 - 27109860
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacct 432  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||  | ||||||||| || |||||||||||||    || ||| ||||||| ||||||||||     
T  27109969 agtaatttgatcataactcgagttctaaaaatcatttggacctgaaaccaacgccattagaaagctaacaaaattatctaaaactttcatgtttacacca 27109870  T
Q  433 aagaccaatt 442  Q
    ||| ||||||    
T  27109869 aaggccaatt 27109860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 333 - 442
Target Start/End: Original strand, 27175705 - 27175814
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacct 432  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||  | ||||||||| || |||||||||||||    || ||| ||||||| ||||||||||     
T  27175705 agtaatttgatcataactcgagttctaaaaatcatttggacctgaaaccaacgccattagaaagctaacaaaattatctaaaactttcatgtttacacca 27175804  T
Q  433 aagaccaatt 442  Q
    ||| ||||||    
T  27175805 aaggccaatt 27175814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 240 - 305
Target Start/End: Original strand, 38294567 - 38294632
Alignment:
Q  240 ttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatg 305  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  38294567 ttcatcaatcatgaacaacatcatattcgccaacatatacattcatagaataattcatcaatcatg 38294632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 333 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 38784713 - 38784604
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacct 432  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||  | ||||||||| || |||||||||||||    || ||| ||||||| ||||||||||     
T  38784713 agtaatttgatcataactcgagttctaaaaatcatttggacctgaaaccaacgccattagaaagctaacaaaattatctaaaactttcatgtttacacca 38784614  T
Q  433 aagaccaatt 442  Q
    ||| ||||||    
T  38784613 aaggccaatt 38784604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 133
Target Start/End: Original strand, 47831821 - 47831925
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacaacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 127  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || |||||| | | | ||  |||| |||| |||||| ||||||||||| |    
T  47831821 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatagacagtatgc-atatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatc 47831919  T
Q  128 aacatc 133  Q
    ||||||    
T  47831920 aacatc 47831925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 333 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 15951703 - 15951607
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||| || |||||||||| ||    || ||| ||||||||||||||||    
T  15951703 agtaatttaatcataactcaagttctaaaaatcatttggacctcaaaccaacgccattagaaagctaccaaaattatctaaaactttcgtgtttaca 15951607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 313 - 352
Target Start/End: Original strand, 16410544 - 16410583
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactca 352  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16410544 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactca 16410583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 313 - 352
Target Start/End: Original strand, 18628051 - 18628090
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactca 352  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18628051 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactca 18628090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 313 - 352
Target Start/End: Original strand, 18640757 - 18640796
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactca 352  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18640757 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactca 18640796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 313 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 26355658 - 26355619
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactca 352  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26355658 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactca 26355619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 313 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 26358110 - 26358071
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactca 352  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26358110 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactca 26358071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 313 - 431
Target Start/End: Original strand, 456807 - 456925
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    | | || ||||||| ||||| |||| ||| || | |||||||||||    || |||    
T  456807 attcaatgtgacctacgtgcagtaatttgaccttaactcataaaccaaaattcattttcaagtccaaccgacgccattggaaagctaacacaattatcta 456906  T
Q  413 caactttcgtgtttacacc 431  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  456907 caactttcatgtttacacc 456925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 16202852 - 16202766
Alignment:
Q  345 ataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacc 431  Q
    ||||||||| ||||| |||||||  |||||| ||||||| | || |||||| ||||||||  |||||||||||||  ||||||||||    
T  16202852 ataactcaaattctagaaatcatcatgaagtaaaaccaaagccattagaaatctaacatcactacctacaacttttatgtttacacc 16202766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 28505412 - 28505366
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa 69  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28505412 catcttcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 28505366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 333 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 32495160 - 32495062
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacc 431  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| | || ||||||| |||| |   |||||| ||||||| ||||||||||    
T  32495160 agtaatatgatcataactcaagttctaaaaatcatttggacatcaaaccaaagccattagaaagataacttaattacctaaaactttcatgtttacacc 32495062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 69
Target Start/End: Original strand, 34200793 - 34200839
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa 69  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34200793 catcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 34200839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 15008535 - 15008436
Alignment:
Q  98 atgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaata-taacaacatcaa 196  Q
    |||| |||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||  || || |||| |||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||    
T  15008535 atgatataacaatatcaa-tgcaaatcaacaacacctcaaacat-catatataattcaagtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaa 15008438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 333 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 15760848 - 15760779
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaaca 402  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||| | || |||||||||||||    
T  15760848 agtaatttaatcatatctcaagttctaaaaatcatttggacgtcaaaccaaagccattagaaagctaaca 15760779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 617 - 730
Target Start/End: Original strand, 41385287 - 41385400
Alignment:
Q  617 aacatagtattataacaacgaactcaccgtaaaggttggacatttccaatatctccttttaggattttcatttaaattagagatgaacatccttatgatt 716  Q
    |||| ||||||| |||| | |||||||  || |||||||  |||||||||||||||||||||| || |||  | |||| || |||||||| || || |||    
T  41385287 aacaaagtattacaacagcaaactcacaatataggttgggtatttccaatatctccttttagggttgtcaagtgaattggatatgaacattctcataatt 41385386  T
Q  717 ttgttgcacccaca 730  Q
    |||||||| |||||    
T  41385387 ttgttgcaaccaca 41385400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 351 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 10001076 - 10000996
Alignment:
Q  351 caagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacc 431  Q
    ||||||||| ||||||||| || |||||||||| | || |||||||||||||    || ||||||||||| ||||||||||    
T  10001076 caagttctaaaaatcatttggacgtcaaaccaaagtcattagaaagctaacaaaattatctacaactttcatgtttacacc 10000996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 410 - 442
Target Start/End: Original strand, 20110747 - 20110779
Alignment:
Q  410 ctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 442  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20110747 ctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 20110779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 254 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 9743845 - 9743794
Alignment:
Q  254 acaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatg 305  Q
    |||||||| ||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  9743845 acaatatcatattcatcaacatatacattcatataataattcatcaatcatg 9743794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 11996141 - 11996086
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacaacaaca 77  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  11996141 catcttcaacaacttagaccgactcatgcatcttagttaattaacaaacaacaaca 11996086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 14932841 - 14932802
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa 69  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  14932841 atcaacttagactgactcatgcgacttagttaaataacaa 14932802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 15356276 - 15356237
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa 69  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  15356276 atcaacttagactgactcatgcgacttagttaaataacaa 15356237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 15360390 - 15360351
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa 69  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  15360390 atcaacttagactgactcatgcgacttagttaaataacaa 15360351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 20220224 - 20220127
Alignment:
Q  98 atgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaata-taacaacatcaa 196  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||   ||||||  || || |||| ||||| |||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||    
T  20220224 atgatataacaatatcaaatgcaaatcaaca---tctcaaacat-catatataattcatgtaatgcatatacaattatatcacattattaacaacatcaa 20220129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 361 - 431
Target Start/End: Original strand, 11309903 - 11309973
Alignment:
Q  361 aaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacc 431  Q
    |||||||||| |||||||||||| | |||| |||||||||||    || ||||||||||| ||||||||||    
T  11309903 aaatcattttcaagtcaaaccaaagccaatggaaagctaacacaattatctacaactttcatgtttacacc 11309973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #139
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 227 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 14269965 - 14269887
Alignment:
Q  227 atacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatg 305  Q
    |||||||||  | |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||  | |||||||||||||    
T  14269965 atacatatattaattcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatataacacttcatcaatcatg 14269887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #140
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 227 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 15081850 - 15081772
Alignment:
Q  227 atacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatg 305  Q
    |||||||||  | |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||  | |||||||||||||    
T  15081850 atacatatactaattcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatataacacttcatcaatcatg 15081772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #141
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 23 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 15755001 - 15754955
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa 69  Q
    |||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  15755001 catcttcaacaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa 15754955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #142
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 227 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 38898131 - 38898053
Alignment:
Q  227 atacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatg 305  Q
    |||||||||  | |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||  | |||||||||||||    
T  38898131 atacatatactaattcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatataacacttcatcaatcatg 38898053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #143
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 344 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 43277218 - 43277120
Alignment:
Q  344 cataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 442  Q
    ||||||||||   ||| |||||||||| |||||||||||| | || | |||||||||||    || ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  43277218 cataactcaaaaactaaaaatcattttcaagtcaaaccaaagccacttgaaagctaacacaattatctacaactttcatgtttacaccaaaggccaatt 43277120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #144
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 361 - 442
Target Start/End: Original strand, 3287584 - 3287665
Alignment:
Q  361 aaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 442  Q
    |||||||||| |||||||||||| | || |||||||||||||    || |||||||| || |||||||||| ||| ||||||    
T  3287584 aaatcattttcaagtcaaaccaaagccactagaaagctaacacaattatctacaactgtcatgtttacaccaaaggccaatt 3287665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #145
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 240 - 305
Target Start/End: Original strand, 8468902 - 8468967
Alignment:
Q  240 ttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatg 305  Q
    |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||  | |||||||||||||    
T  8468902 ttcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatataacatttcatcaatcatg 8468967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #146
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 240 - 305
Target Start/End: Original strand, 8940446 - 8940511
Alignment:
Q  240 ttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatg 305  Q
    |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||  | |||||||||||||    
T  8940446 ttcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatataacacttcatcaatcatg 8940511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #147
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 361 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 10896452 - 10896371
Alignment:
Q  361 aaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 442  Q
    |||||||||| |||||||||||| | || | |||||||||||    || ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  10896452 aaatcattttaaagtcaaaccaaagccattggaaagctaacaaaattatctacaactttcatgtttacaccaaaggccaatt 10896371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #148
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 361 - 442
Target Start/End: Original strand, 16462630 - 16462711
Alignment:
Q  361 aaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 442  Q
    |||||||||| |||||||||||| | || | |||||||||||    || ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  16462630 aaatcattttcaagtcaaaccaaagccactggaaagctaacacaattatctacaactttcatgtttacaccaaaggccaatt 16462711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #149
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 361 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 16550462 - 16550381
Alignment:
Q  361 aaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 442  Q
    |||||||||| |||||||||||| | || | |||||||||||    || ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  16550462 aaatcattttcaagtcaaaccaaagccactggaaagctaacacaattatctacaactttcatgtttacaccaaaggccaatt 16550381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #150
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 361 - 442
Target Start/End: Original strand, 16615200 - 16615281
Alignment:
Q  361 aaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 442  Q
    |||||||||| |||||||||||| | || | |||||||||||    || ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  16615200 aaatcattttcaagtcaaaccaaagccactggaaagctaacacaattatctacaactttcatgtttacaccaaaggccaatt 16615281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #151
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 361 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 23664581 - 23664500
Alignment:
Q  361 aaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 442  Q
    ||||||||||  |||||||| || | || |||||||||||||    || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  23664581 aaatcattttcgagtcaaactaaagccattagaaagctaacaaaattatctacaactttcatgtttacaccaaagaccaatt 23664500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #152
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 256 - 305
Target Start/End: Original strand, 25941523 - 25941572
Alignment:
Q  256 aatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatg 305  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  25941523 aatatcatattcatcaacatatacattcatataataattcatcaatcatg 25941572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #153
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 26356145 - 26356096
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacaca 79  Q
    ||||| |||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  26356145 atcaatttagactgactcatgcagcaaagttaaataacaacaacaacaca 26356096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #154
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 26358597 - 26358548
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacaca 79  Q
    ||||| |||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  26358597 atcaatttagactgactcatgcagcaaagttaaataacaacaacaacaca 26358548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #155
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 361 - 430
Target Start/End: Original strand, 29004416 - 29004485
Alignment:
Q  361 aaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacac 430  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||    || ||||||||||| |||||||||    
T  29004416 aaatcattttcaagtcaaaccaacgccattggaaagctaacaaaattatctacaactttcatgtttacac 29004485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #156
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 361 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 29052613 - 29052532
Alignment:
Q  361 aaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 442  Q
    |||||||||| ||||||||||||   || | |||||||||||    |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  29052613 aaatcattttcaagtcaaaccaaaaccactggaaagctaacacaattacctacaactttcatgtttacaccaaaggccaatt 29052532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #157
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 240 - 305
Target Start/End: Original strand, 43747672 - 43747737
Alignment:
Q  240 ttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatg 305  Q
    ||||||||| |||||||| ||| ||||||  ||||||||| | |||||| || |||||||||||||    
T  43747672 ttcatcaattatgaacaacatcatattcatcaacatatactttcatataatacttcatcaatcatg 43747737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 383; Significance: 0; HSPs: 163)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 383; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 512
Target Start/End: Original strand, 17463189 - 17463669
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17463189 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 17463288  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17463289 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca-tatata 17463387  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  17463388 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 17463486  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  17463487 tgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatacctacaactttcgtgtttaca 17463586  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17463587 cctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 17463669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 382; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 45607058 - 45606578
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45607058 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 45606959  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45606958 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca-tatata 45606860  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||     
T  45606859 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcataatcaattattcactgtgacctaca 45606760  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  45606759 ttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatacctacaactttcgtgtttaca 45606660  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcac 511  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45606659 cctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcac 45606578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 7781498 - 7781009
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7781498 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaaatcaacaa 7781399  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7781398 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca-tatata 7781300  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||| |    
T  7781299 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcgatcataatcaattattcactgtgacctatg 7781200  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||    
T  7781199 ttcagtaatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacgtttatacctacaacttttgtgtttaca 7781100  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 520  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7781099 cctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 7781009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 512
Target Start/End: Original strand, 34159337 - 34159817
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34159337 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 34159436  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34159437 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca-tatata 34159535  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  34159536 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 34159634  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  34159635 tgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatacctacaactttcgtgtttaca 34159734  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34159735 cctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 34159817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 16454432 - 16453943
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16454432 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 16454333  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16454332 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatc-atatata 16454234  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  16454233 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 16454135  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaat-cattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttac 428  Q
    |||||||||||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  16454134 tgcagtaatttgactataactatagttctataaatccattttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatacctacaactttcgtgtttac 16454035  T
Q  429 acctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcat-aaaaattcactaagacct 519  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16454034 acctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaaattcactaagacct 16453943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 367; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 512
Target Start/End: Original strand, 55476502 - 55476982
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55476502 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 55476601  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  55476602 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca-tatata 55476700  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  55476701 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 55476799  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  55476800 tgcagtaatttgactataactctagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatacctacaactttcgtgtttaca 55476899  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55476900 cctaagaccaattctgtaccagtcaataccagttttaatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 55476982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 363; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 6469285 - 6468805
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6469285 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 6469186  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6469185 cgtctcaattagtcacatataattgaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca-tatata 6469087  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  6469086 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 6468988  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  6468987 tgcagtaatttgactataactcaagttctataaattcttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatacctccaactttcgtgtttaca 6468888  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6468887 gctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 6468805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 363; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 10247874 - 10247386
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10247874 atcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataacaacagcagcacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 10247775  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10247774 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca-tatata 10247676  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||| ||||| |||||||||||| | |||||||||    
T  10247675 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacattcatatactagttgatccatcatattcaattattcactctgacctacg 10247577  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  10247576 tgcagtaatttgagtataaatcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatacctacaactttcgtgtttaca 10247477  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 520  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10247476 cctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 10247386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 13154407 - 13153926
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaactt-agttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 128  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13154407 atcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 13154308  T
Q  129 acatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatat 228  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  13154307 acgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca-tatat 13154209  T
Q  229 acatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctac 328  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| ||||||    
T  13154208 acatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacattcatatactaattcatcaatcatatacaattattcactgttacctac 13154110  T
Q  329 gtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttac 428  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  13154109 gtgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaactaacggcattagaaagctaacattcatacctaaaactttcgtgtttac 13154010  T
Q  429 acctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13154009 acctatgaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 13153926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 484
Target Start/End: Original strand, 12567571 - 12568023
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12567571 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcaatatacaaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 12567670  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12567671 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatgataatcaacatcttaaaacatca-tatata 12567769  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||     
T  12567770 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgttacctaca 12567868  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12567869 tgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacattcatacctacaactttcgtgtttaca 12567968  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaa 484  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  12567969 cctaagaccaattctgtaccaatcaatactagttttcatttcaaattcggacaaa 12568023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 484
Target Start/End: Original strand, 13544036 - 13544487
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13544036 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcaatatacaaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 13544135  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13544136 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatgataatcaacatcttaaaacatc-atatata 13544234  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  13544235 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgttacctacg 13544333  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13544334 tgcagt-atttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacattcatacctacaactttcgtgtttaca 13544432  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaa 484  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  13544433 cctaagaccaattctgtaccaatcaatactagttttcatttcaaattcggacaaa 13544487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 28848762 - 28848284
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28848762 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 28848663  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28848662 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattacatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca-tatata 28848564  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  28848563 catataacacttcatcaatcatggaaaatatcgtattcacaa-----------catatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 28848475  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  28848474 tgcagtaatttgactataactctagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatacctacaactttcgtgtttaca 28848375  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 520  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28848374 cctaagaccaattcagtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 28848284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 512
Target Start/End: Original strand, 8499529 - 8500012
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaa-ca 128  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8499529 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacagtagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaatca 8499628  T
Q  129 acatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa-caacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatata 227  Q
    |  ||||||||||||||| || ||  || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  8499629 atgtctcaattattcacagataatctaattaatgcatatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgataatcaacatcttaaaacatca-tata 8499727  T
Q  228 tacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgaccta 327  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  8499728 tacatataaaacttcattaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcataatcaattattcactgtgaccta 8499827  T
Q  328 cgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgttta 427  Q
     || | ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  8499828 tgttccgtaatttcaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacttccatatctacaactttcgtgttta 8499927  T
Q  428 cacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8499928 cacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaatacact 8500012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 510
Target Start/End: Original strand, 15412440 - 15412920
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaa-ca 128  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15412440 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacagtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaatca 15412539  T
Q  129 acatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa-caacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatata 227  Q
    || ||||||||||||||| || ||  || | ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||    
T  15412540 acgtctcaattattcacagataatctaattgatgcatatacaattatatcccaatataaacaacatcaaatgataatcaacatcttaaaacttca-tata 15412638  T
Q  228 tacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgaccta 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| || |||||||||    
T  15412639 tacatataaaacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcgatcataatcaattatacactgtgaccta 15412738  T
Q  328 cgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgttta 427  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15412739 cgttcagtaatttgaccataaatcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcactagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgttta 15412838  T
Q  428 cacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattca 510  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15412839 tacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttc-aattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattca 15412920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 13151942 - 13151461
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaactt-agttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 128  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13151942 atcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 13151843  T
Q  129 acatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatat 228  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  13151842 acgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca-tatat 13151744  T
Q  229 acatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctac 328  Q
    |||||| | |||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| ||||||    
T  13151743 acatatcacacttcatcaggcatggacaatatcgtattcacaa-catataccttcatatactaattcatcaatcatatacaattattcactgttacctac 13151645  T
Q  329 gtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttac 428  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  13151644 gtgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaactaacggcattagaaagctaacattcatacctaaaactttcgtgtttac 13151545  T
Q  429 acctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13151544 acctatgaccaattctgttccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 13151461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 30 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 53301658 - 53301174
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa-caacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaa- 126  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| || |||||| ||||| ||  |||| |||| ||||||||||||||||||      
T  53301658 atcaacttagaccgactcatacaacttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatt 53301560  T
Q  127 caacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa-caacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaata 225  Q
    ||| ||||||| |||||| |||| ||||||||| | | |||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  53301559 caatatctcaaatattcatatataattcaagtattacgtatacaattatatcacaatataaacaacataaaatggtaatcaacatcttaaaacatca-ta 53301461  T
Q  226 tatacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacc 325  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  53301460 tatacatataacacttcatcaatcatgtacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcataatcaattattcactgtgacc 53301361  T
Q  326 tacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtt 425  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  53301360 tacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaatatccatacctacaactttcgtgtt 53301261  T
Q  426 tacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53301260 tacacctaagaccaattctgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggtcaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 53301174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 30 - 512
Target Start/End: Original strand, 27165261 - 27165744
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa-caacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 127  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| | || |||||| ||||| ||  |||| |||  |||||||||||||||||| |    
T  27165261 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaatatagacagtatgcaaaa-caacatgatataccaatatcaaatgcaagtcatc 27165359  T
Q  128 aacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa-caacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatat 226  Q
    || ||||||| |||||| |||| ||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27165360 aatatctcaaatattcatatataatttaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatca-tat 27165458  T
Q  227 atacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacct 326  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  27165459 atacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcataatcaattattcactgtgacct 27165558  T
Q  327 acgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgttt 426  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27165559 acgttcagtaatttgatcataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaactaacggcattagaaagctaagatccatacctacaactttcgtgttt 27165658  T
Q  427 acacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27165659 acccctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaaatcggacaaagttgtgttgaaattcataaaaattcact 27165744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 267; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 182 - 520
Target Start/End: Original strand, 54520985 - 54521322
Alignment:
Q  182 atataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatatacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacat 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  54520985 atataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatca-tatatacatataacacttcatcaatcattgacaatatcgtattcacaaatatatacat 54521083  T
Q  282 acatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaacc 381  Q
    ||||||| |||||||||||||||   ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  54521084 acatatattaattcatcaatcataaacaattcttcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaacc 54521183  T
Q  382 aacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagac 481  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  54521184 aacggcattagaaagctaacatccatacccacaactttcgtgtttacacctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattctgac 54521283  T
Q  482 aaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 520  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  54521284 aaagttgtgctgaaatccataaaaattcactaagacctc 54521322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 182 - 520
Target Start/End: Original strand, 15977696 - 15978032
Alignment:
Q  182 atataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatatacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacat 281  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  15977696 atataacaacatcaaataataaccaacatcttaaaacatca-tatatacatataacactttatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacat 15977793  T
Q  282 acatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaacc 381  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  15977794 tcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaattcttttgaagtcaaacc 15977893  T
Q  382 aacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagac 481  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15977894 aacggcattagaaagctaacatttatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggac 15977993  T
Q  482 aaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 520  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15977994 aaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 15978032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 203 - 510
Target Start/End: Original strand, 46822445 - 46822751
Alignment:
Q  203 atcaacatcttaaaacatcaatatatacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatc 302  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46822445 atcaacatcttaaaacatca-tacatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatc 46822543  T
Q  303 atgttcaattattcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaaca 402  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  46822544 atattcaattattcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaaca 46822643  T
Q  403 tccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcata 502  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  46822644 tccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattgtttaccaatcaataccacttttcatttcaaaatcggacaaagttgtgctgaaattcata 46822743  T
Q  503 aaaattca 510  Q
    ||||||||    
T  46822744 aaaattca 46822751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 184 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 29544839 - 29544504
Alignment:
Q  184 ataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatatacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| | || ||||| ||||| ||||    
T  29544839 ataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatca-tatatacatataacacttcatcaatcattgacaatatcattttaacaaatatatagatac 29544741  T
Q  284 atatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaa 383  Q
    ||||| |||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  29544740 atatattaattcatcaatcataaacaattcttcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaattcttttgaaatcaaaccaa 29544641  T
Q  384 cggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaa 483  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  29544640 cggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattctgtaccaatcaataacagttttcatttcaaattctgacaa 29544541  T
Q  484 agttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 520  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29544540 agttgtgctgaaattcataaaaattcaccaagacctc 29544504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 202 - 512
Target Start/End: Original strand, 10557091 - 10557400
Alignment:
Q  202 aatcaacatcttaaaacatcaatatatacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaat 301  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10557091 aatcaacatctcaaaacatca-tatatacatataaaacttcatcaatcatggacaatatcgaattcacaaacatatacatacatatattaattcatcaat 10557189  T
Q  302 catgttcaattattcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaac 401  Q
    ||| ||||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||    
T  10557190 catattcaattattcacagtgacctatgtgcagtaatctgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtaaaactaacggcattagaaagctaac 10557289  T
Q  402 atccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcat 501  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  10557290 atccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattatttaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgttctgaaattcat 10557389  T
Q  502 aaaaattcact 512  Q
    |||||||||||    
T  10557390 aaaaattcact 10557400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 241 - 522
Target Start/End: Original strand, 13436520 - 13436801
Alignment:
Q  241 tcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacgtgcagtaattt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  13436520 tcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatatatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtgcagtaattg 13436619  T
Q  341 gaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaa 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  13436620 gaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtatttatacctaagaccaa 13436719  T
Q  441 ttatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctctt 522  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  13436720 ttatgtaccaatcaatacaagttttcatttcaaactcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactgagatctctt 13436801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 30 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 9707758 - 9707485
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9707758 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatacaagtcaacaa 9707659  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9707658 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatc-atatata 9707560  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcat 304  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9707559 catataaaacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcat 9707485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 30 - 304
Target Start/End: Original strand, 8899105 - 8899377
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8899105 atcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 8899204  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8899205 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaatcataatcaacatcttaaaacatc-atatata 8899303  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcat 304  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8899304 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaatcat 8899377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 30 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 38962042 - 38961770
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38962042 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 38961943  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  38961942 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataaccaacatcttaaaacatc-atatata 38961844  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcat 304  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38961843 catataatacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaatcat 38961770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 230 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 12119606 - 12119359
Alignment:
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  12119606 catataatacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 12119507  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12119506 tgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcactagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 12119407  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 477  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  12119406 cctaagaccaattctgtactgatcaataccagtttttatttcaaattc 12119359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 30 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 16282962 - 16282690
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  16282962 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatattgaatgcaagtcaacaa 16282863  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16282862 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatc-atatata 16282764  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcat 304  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16282763 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaatcat 16282690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 227 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 38961794 - 38961508
Alignment:
Q  227 atacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacct 326  Q
    |||||||||  | |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  38961794 atacatatactaattcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacct 38961695  T
Q  327 acgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacgg-caatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtt 425  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38961694 acgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggccattagaaggctaacattcatacctacaactttcgtgtt 38961595  T
Q  426 tacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38961594 tacacctaagaccaattctgtatcaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 38961508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 227 - 512
Target Start/End: Original strand, 41124146 - 41124431
Alignment:
Q  227 atacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacct 326  Q
    |||||||||  | |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  41124146 atacatatactaattcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatatactagttcatcaatcatattcaattattcactgtgacct 41124245  T
Q  327 acgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgttt 426  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41124246 acgtgcaataatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaatcaacggcattagaaagctaacattcatacctacaactttcgtgttt 41124345  T
Q  427 acacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41124346 acacctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcacattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 41124431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 227 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 16282714 - 16282430
Alignment:
Q  227 atacatataaaacttcatcaatcatgaa-caatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacc 325  Q
    |||||||||  | |||||||||||| || ||| ||| || ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16282714 atacatatactaattcatcaatcataaaacaacatcatactcataaacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcattgtgacc 16282615  T
Q  326 tacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtt 425  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16282614 tacgtgcagtaatttgacaataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaatggcattagaaatctaacattcatacctacaactttcgtgtt 16282515  T
Q  426 tacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattca 510  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16282514 tacacctaagaccaattctgtaccaatcaatactagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattca 16282430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 30 - 304
Target Start/End: Original strand, 41123901 - 41124170
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41123901 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca---acaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 41123997  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41123998 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatc-atatata 41124096  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcat 304  Q
    ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41124097 catataacacttcaccaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaatcat 41124170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 227 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 17444719 - 17444427
Alignment:
Q  227 atacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacct 326  Q
    |||||||||  | |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  17444719 atacatatactaattcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactatgacct 17444620  T
Q  327 acgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgttt 426  Q
    |||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17444619 acgtgcaaaaatttgactataactcaagttcaataaatccttttgaagtcaaaccaacgacattagaaagctaacattcatacctacaactttcgtgttt 17444520  T
Q  427 acacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacct 519  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17444519 acacttaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactatgacct 17444427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 240 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 20630138 - 20629855
Alignment:
Q  240 ttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatca----atcatgttcaattattcattgtgacctacgtgcagt 335  Q
    |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| || |||  | |||||||    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20630138 ttcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcagataacacttcatcaatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtgcagt 20630039  T
Q  336 aatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaag 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20630038 aatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacctaag 20629939  T
Q  436 accaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacct 519  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20629938 accaattctgtaccaatcaatacaagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactatgacct 20629855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 240 - 508
Target Start/End: Original strand, 25237063 - 25237331
Alignment:
Q  240 ttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacgtgcagtaatt 339  Q
    |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25237063 ttcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtgcagtaatt 25237162  T
Q  340 tgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagacca 439  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25237163 tgactataactcaagttctataaatccttttgaagttaaacacacggcattagaaacctaacattcataccaacaactttcgtgtttacacctaagacca 25237262  T
Q  440 attatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaatt 508  Q
    ||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25237263 attctgtatcaatcaataccaattttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaatt 25237331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 240 - 508
Target Start/End: Original strand, 25229476 - 25229744
Alignment:
Q  240 ttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacgtgcagtaatt 339  Q
    |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| || ||| |||||||    
T  25229476 ttcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacttatgtgtagtaatt 25229575  T
Q  340 tgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagacca 439  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25229576 tgactataactcaagttctataaatccttttgaagttaaacacacggcattagaaacctaacattcataccaacaactttcgtgtttacacctaagacca 25229675  T
Q  440 attatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaatt 508  Q
    ||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25229676 attctgtatcaatcaataccaattttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaatt 25229744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 254 - 477
Target Start/End: Original strand, 24513910 - 24514133
Alignment:
Q  254 acaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaa 353  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24513910 acaatatagtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgatctacgtgcagtaatttgaccataactcaa 24514009  T
Q  354 gttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatc 453  Q
    |||||||||||| |||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | |||    
T  24514010 gttctataaatcgttttgacgtcagaccaacgacattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattctggagctatc 24514109  T
Q  454 aataccagttttcatttcaaattc 477  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
T  24514110 aataccagatttcatttcaaattc 24514133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 167; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 314 - 520
Target Start/End: Original strand, 15465448 - 15465654
Alignment:
Q  314 ttcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctac 413  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||    
T  15465448 ttcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaatggcattagaaagctaacattcatacctac 15465547  T
Q  414 aactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcacta 513  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15465548 aactttcgtgtttacacctaagaccaattctgtaccaatcaataccaattttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcacta 15465647  T
Q  514 agacctc 520  Q
    |||||||    
T  15465648 agacctc 15465654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 314 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 26055133 - 26054927
Alignment:
Q  314 ttcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctac 413  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26055133 ttcactgtgacctacgtgcagtaattttaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaaaggcattagaaagctaacatccatacctac 26055034  T
Q  414 aactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcacta 513  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26055033 aactttcatgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccaattttcctttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcacta 26054934  T
Q  514 agacctc 520  Q
    |||||||    
T  26054933 agacctc 26054927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 313 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 55319173 - 55318974
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  55319173 attcactgtgacttacgtgcagtaatttgaccataattcaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 55319074  T
Q  413 caactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55319073 caactttcgtgtttacacctaagaccaattctgtaccaatcaataccaattttcatttcaaatttggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 55318974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 155; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 314 - 520
Target Start/End: Original strand, 5223677 - 5223883
Alignment:
Q  314 ttcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctac 413  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||     
T  5223677 ttcactgtgacctacgtggagtaatttgatcataactcaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaatggcattagaaagctaacatccatacctat 5223776  T
Q  414 aactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcacta 513  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5223777 aactttcgtgtttacacctaagacgaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgttctgaaattcataaaaattcacta 5223876  T
Q  514 agacctc 520  Q
    |||||||    
T  5223877 agacctc 5223883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 30 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 17446805 - 17446614
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17446805 atcaacttagac-gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 17446707  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatca 222  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  17446706 cgtctcaattattcacatatcattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca 17446614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 189 - 388
Target Start/End: Original strand, 12305315 - 12305513
Alignment:
Q  189 aacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatatacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatata 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12305315 aacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatca-tatatacatataacacttcatcaatcattgacaatatcgtattcacaaatatatacatacatata 12305413  T
Q  289 ctaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggca 388  Q
     |||||||||||||||   ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12305414 ttaattcatcaatcataaacaattcttcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggca 12305513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 30 - 211
Target Start/End: Original strand, 50242833 - 50243014
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  50242833 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagtagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaaatcaacaa 50242932  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatc 211  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  50242933 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatcataatcaacatc 50243014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 30 - 198
Target Start/End: Original strand, 17672637 - 17672805
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17672637 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacatagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaaatcaacaa 17672736  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 198  Q
    | |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17672737 cgtctcaattattcacatataattcaaataatgcatatataattatatcacaatataacatcatcaaat 17672805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 30 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 29172734 - 29172565
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29172734 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 29172635  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaata-taacaacatcaaat 198  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  29172634 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatactatcaacatcaaat 29172565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 313 - 477
Target Start/End: Original strand, 46822747 - 46822911
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  46822747 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgacgataactcaagttttataaatcgttttgacgtcagaccaacgacattagaaagctaacatccataccta 46822846  T
Q  413 caactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 477  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  46822847 caacttccgtgtttacacctaagaccaattatgtagcaatcaataccagttttcatttcaaattc 46822911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 306 - 477
Target Start/End: Original strand, 10379613 - 10379784
Alignment:
Q  306 ttcaattattcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatcc 405  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||    
T  10379613 ttcaattattcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaattgttttgacgtcagaccaacgacattagaaagctaacatcc 10379712  T
Q  406 atacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 477  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  10379713 atacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattctgtatcaatcaataccagtttttatttcatattc 10379784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 313 - 477
Target Start/End: Original strand, 27165738 - 27165902
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  27165738 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaacggcattagaaagctaacatacataccta 27165837  T
Q  413 caactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 477  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| |||||||||||    
T  27165838 caactttcgtgtttacacctaagaccaattctgtaccgatcaatactagtttttatttcaaattc 27165902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 313 - 477
Target Start/End: Original strand, 41124425 - 41124589
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  41124425 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgatcataactcaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaacgacattagaaagctaacattcataccta 41124524  T
Q  413 caactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 477  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41124525 caacttttgtgtttacacctaagaccaattctttaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 41124589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 35 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 53070799 - 53070636
Alignment:
Q  35 cttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatct 134  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  53070799 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataacagtatacaaaaacaacaagacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtct 53070700  T
Q  135 caattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 198  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  53070699 caattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatctaacaacatcaaat 53070636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 313 - 477
Target Start/End: Original strand, 10557394 - 10557558
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10557394 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtccgaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 10557493  T
Q  413 caactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 477  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  10557494 caacttttgtgtttacaactaagaccaattctgtaccaatcaataccatatttcgtttcaaattc 10557558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 313 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 53301180 - 53301016
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  53301180 attcactgtgacctatgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaacgacattagaaagctaacatacataccta 53301081  T
Q  413 caactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 477  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||    
T  53301080 caactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccgatcaatacttgtttttatttcaaattc 53301016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 313 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 55318980 - 55318817
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  55318980 attcactgcgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgatgtcataccaacggcattagaaagctaccatccataccta 55318881  T
Q  413 caactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaatt 476  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || || ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  55318880 caactttcgtgtttacacctaagaccagttctggacctatcaataccagatttcatttcaaatt 55318817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 30 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 12119876 - 12119707
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaa-ca 128  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12119876 atcaacttagaccgactcatgcagctttgttaaataacaacagcgacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaatca 12119777  T
Q  129 acatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 198  Q
    || ||||||||||||||| || ||  || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12119776 acgtctcaattattcacagataatctaattaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaat 12119707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 35 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 43550625 - 43550448
Alignment:
Q  35 cttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatc 133  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||| | ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  43550625 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataatgacagcaacatatgcagtatgcaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtc 43550526  T
Q  134 tcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatc 211  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  43550525 tcaattattcacatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacaatataacaacatcaaatcataatcaacatc 43550448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 313 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 38961514 - 38961350
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  38961514 attcactgtgacctacgtgcagcaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaacgacattagaaagctaacatccataccta 38961415  T
Q  413 caactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 477  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  38961414 caactttcgtgtttacacctaagaccaattcttgacctatcaataccatatttcatttcaaattc 38961350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 319 - 477
Target Start/End: Original strand, 8500012 - 8500170
Alignment:
Q  319 tgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactt 418  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8500012 tgtgacctacgtgcagtaacttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaacggcattagaaagctaacatctatacctacaactt 8500111  T
Q  419 tcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 477  Q
    | |||||||||||||||||||||| | || | ||||||||||||||| |||||||||||    
T  8500112 ttgtgtttacacctaagaccaattctatatcgatcaataccagtttttatttcaaattc 8500170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 324 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 13937638 - 13937483
Alignment:
Q  324 cctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtg 423  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13937638 cctacgtgcagtaatttgaccataacacaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaacgacattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtg 13937539  T
Q  424 tttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcag 479  Q
    ||||||||||||||||||| |   || ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13937538 tttacacctaagaccaattcttgtcctatcaataccagatttcatttcaaattcag 13937483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 321 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 20629860 - 20629704
Alignment:
Q  321 tgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttc 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  20629860 tgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgctttaatgtcagaccaacgacattagaaagctaacatccatacctataactttt 20629761  T
Q  421 gtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 477  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  20629760 gtgtttacacctaagaccaattctggacctatcaataccagatttcatttcaaattc 20629704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 313 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 16282434 - 16282270
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| || |||  || || |||| ||||||| |||||||    
T  16282434 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacatcagactaacaacattaaaaagataacatctataccta 16282335  T
Q  413 caactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 477  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  16282334 caactttcgtgtttacacctaagaccaattcttgacctatcaataccagatttcattttaaattc 16282270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 23 - 181
Target Start/End: Original strand, 14972861 - 14973020
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaa 121  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14972861 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 14972960  T
Q  122 gtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcaca 181  Q
     ||||||||||||||  ||| ||   || ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  14972961 atcaacaacatctcatatatacattcataattcaagtaatgcatataacattatatcaca 14973020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 312 - 434
Target Start/End: Original strand, 36528447 - 36528569
Alignment:
Q  312 tattcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacct 411  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  36528447 tattcactatgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataattcatttagacgtcaaaccaatggcattagaaagctaacatccatacct 36528546  T
Q  412 acaactttcgtgtttacacctaa 434  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  36528547 acaactttcgtgtttacacctaa 36528569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 390 - 510
Target Start/End: Original strand, 15007869 - 15007992
Alignment:
Q  390 tagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccag---ttttcatttcaaattcagacaaagt 486  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||    
T  15007869 tagaaagctaacatccatacctataactttcgtgtttacacctaaaaccaattttgtaccaatcaataccagtacttttcatttcaaattcggacaaagt 15007968  T
Q  487 tgtgctgaaattcataaaaattca 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  15007969 tgtgctgaaattcataaaaattca 15007992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 321 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 17444432 - 17444276
Alignment:
Q  321 tgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttc 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||| || | ||||||| || ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  17444432 tgacctacgtgcagtaatttgaccatagctcaagttgtataaattgttttgacgttagaccaacgacattagaaagataacatccatacttacaactttc 17444333  T
Q  421 gtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 477  Q
     ||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  17444332 ctgtttacacctaagaccaattctggacctatcaataccagatttcatttcaaattc 17444276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 30 - 149
Target Start/End: Original strand, 15977526 - 15977645
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15977526 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaatagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 15977625  T
Q  130 catctcaattattcacatat 149  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  15977626 cgtctcaattattcacatat 15977645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 30 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 40213827 - 40213676
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40213827 atcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacatcaacacagcagtatacataaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 40213728  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcaca 181  Q
    |||||||||||| ||   || || |||||||||| ||||  |||||||||||    
T  40213727 catctcaattatacattcataatccaagtaatgcgtataacattatatcaca 40213676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 392 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 16358458 - 16358340
Alignment:
Q  392 gaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgc 491  Q
    ||||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  16358458 gaaagctaacatctatatctaaaactttcatgtttacacctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaaattgtgc 16358359  T
Q  492 tgaaattcataaaaattca 510  Q
    |||||||||||||||||||    
T  16358358 tgaaattcataaaaattca 16358340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 28 - 196
Target Start/End: Original strand, 43840944 - 43841114
Alignment:
Q  28 tcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 126  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43840944 tcatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacatagacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaa 43841043  T
Q  127 caacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa-caacatcaa 196  Q
    || ||||| || ||||||  |||  ||||||||||||| |||  |||||||||||| |||| |||||||||    
T  43841044 catcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacaacataatcaacatcaa 43841114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 313 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 14567561 - 14567432
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  14567561 attcactgtgacctacgtgtagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgatgttagaccaacgacattagaaagctaacattcataccta 14567462  T
Q  413 caactttcgtgtttacacctaagaccaatt 442  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14567461 caactttcgtgtttacacctaagaccaatt 14567432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 181
Target Start/End: Original strand, 17487863 - 17488022
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaa 121  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  17487863 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaaatagacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaa 17487962  T
Q  122 gtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcaca 181  Q
     ||| |||||||| || |||||| ||||  |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  17487963 ttcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcatataacattatatcaca 17488022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 181
Target Start/End: Original strand, 17499345 - 17499504
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaa 121  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  17499345 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaaatagacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaa 17499444  T
Q  122 gtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcaca 181  Q
     ||| |||||||| || |||||| ||||  |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  17499445 ttcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcatataacattatatcaca 17499504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 31 - 196
Target Start/End: Original strand, 26686902 - 26687069
Alignment:
Q  31 tcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  26686902 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacat 26687001  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa-caacatcaa 196  Q
    ||||| || |||||   |||  ||||||||||||| |||  |||||||||||| |||| |||||||||    
T  26687002 catcttaaatattccattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacaacataatcaacatcaa 26687069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 30 - 132
Target Start/End: Original strand, 55500953 - 55501055
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55500953 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 55501052  T
Q  130 cat 132  Q
    |||    
T  55501053 cat 55501055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 423 - 520
Target Start/End: Original strand, 12305525 - 12305622
Alignment:
Q  423 gtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 520  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12305525 gtttacacctaagaccaattctgtaccaatcaatatcagttttcatttcaaattctgacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 12305622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Original strand, 42386428 - 42386593
Alignment:
Q  34 acttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacat 132  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42386428 acttagaccgactcatgcagtttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataacaatatcaaatgcaagtcaacaacat 42386527  T
Q  133 ctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa-caacatcaaa 197  Q
    ||||| ||||||   || ||||||| ||||||||||  |||||||||||  |||| ||||||||||    
T  42386528 ctcaaatattcattcataattcaagcaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaaa 42386593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 23 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 14576946 - 14576788
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaa 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  14576946 catcaacatcaacttagaccgactcattcaacttagttaaataacaacagcaacatagacagtata-aacaacagcatgacataataatatcaattgcaa 14576848  T
Q  122 gtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcaca 181  Q
    ||||||||||||| || ||||||  |||  |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  14576847 gtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 14576788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 23 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 23083475 - 23083316
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaa 121  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23083475 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaattgcaa 23083376  T
Q  122 gtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcaca 181  Q
    ||||||||||||| || ||||||  | |  ||| ||||||||| |||  |||||||||||    
T  23083375 gtcaacaacatcttaaatattcaattttacttctagtaatgcacataacattatatcaca 23083316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 23 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 25476499 - 25476340
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagc-agtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaa 121  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25476499 catcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaaaaacaacagcaacacaggtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 25476400  T
Q  122 gtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcaca 181  Q
    |||||||||||||||| ||| ||   || |||||||||||||  |||  |||||||||||    
T  25476399 gtcaacaacatctcaagtatacattcataattcaagtaatgcgcataacattatatcaca 25476340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 30 - 161
Target Start/End: Original strand, 36166609 - 36166739
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36166609 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacagcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 36166707  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaat 161  Q
    |||||||| ||| ||   || |||||||||||    
T  36166708 catctcaaatatacattcataattcaagtaat 36166739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 398 - 519
Target Start/End: Original strand, 36528340 - 36528461
Alignment:
Q  398 taacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaat 497  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||    
T  36528340 taacatccatacctacaactttcgtgtttacatctaagaccaattctgtacttatcaataccagttttcatttcaaattcgggaaaggttgtgctgaaat 36528439  T
Q  498 tcataaaaattcactaagacct 519  Q
    ||||||| |||||||| |||||    
T  36528440 tcataaatattcactatgacct 36528461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 23 - 181
Target Start/End: Original strand, 13442281 - 13442440
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaa 121  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  13442281 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacggcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaa 13442380  T
Q  122 gtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcaca 181  Q
     ||| |||||||| || |||||| ||||  ||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  13442381 ttcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcaca 13442440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 30 - 161
Target Start/End: Original strand, 21618460 - 21618590
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21618460 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaacagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 21618558  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaat 161  Q
    |||||||| ||| ||   || |||||||||||    
T  21618559 catctcaaatatacattcataattcaagtaat 21618590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 313 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 16358344 - 16358234
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16358344 attcaatgtgacctatgcgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatccgtttgacgtcagaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 16358245  T
Q  413 caactttcgtg 423  Q
    |||||||||||    
T  16358244 caactttcgtg 16358234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 23 - 166
Target Start/End: Original strand, 12399216 - 12399360
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaa 121  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12399216 catcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaaatgcaa 12399315  T
Q  122 gtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcata 166  Q
     |||||||||||| || |||||| |||    ||||||||||||||    
T  12399316 ttcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcata 12399360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 321 - 457
Target Start/End: Original strand, 17393209 - 17393345
Alignment:
Q  321 tgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttc 420  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||||| | |||||| ||||||||||| ||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||     
T  17393209 tgacctatgtgtagtaatttgactataactaatgttctaaaaatcattttggagtcaaaccaacgccattggaaaggtaacatccatacctacaactttt 17393308  T
Q  421 gtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaata 457  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||    
T  17393309 gtgtttacatctaagaccaattctgtaccgatcaata 17393345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 23 - 134
Target Start/End: Original strand, 18438541 - 18438653
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaa 121  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  18438541 catcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgatataataatatcaaatgcaa 18438640  T
Q  122 gtcaacaacatct 134  Q
    |||||||||||||    
T  18438641 gtcaacaacatct 18438653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 23 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 20698549 - 20698405
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaa 121  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  20698549 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacgtaataatatcaattgcaa 20698450  T
Q  122 gtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcata 166  Q
     ||| |||||||| |  |||||| ||||  |||||||||||||||    
T  20698449 ttcatcaacatcttatatattcaaatattcttcaagtaatgcata 20698405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 312 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 3264431 - 3264323
Alignment:
Q  312 tattcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacct 411  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  3264431 tattcactgtgacctacgtgtagtaatttgaccataactcaagttctataattcatttagacgtcaaatcaacggccttagaaatctaacatccatacct 3264332  T
Q  412 acaactttc 420  Q
    |||||||||    
T  3264331 acaactttc 3264323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 182 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 11914051 - 11913929
Alignment:
Q  182 atataacaacatcaaatggtaatcaacatct--taaaacatcaatatatacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatac 279  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||   | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||| |||    
T  11914051 atataacaacatcaaatgataatcaacatcaacttaaacatca-tatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcgc-aacatgtac 11913954  T
Q  280 atacatatactaattcatcaatcat 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  11913953 atacatatactaattcatcaatcat 11913929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 30 - 137
Target Start/End: Original strand, 10556996 - 10557104
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaa-ca 128  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  10556996 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacatcagcatacaaaaacggcatgacataataatatcaaatgcaagccaatca 10557095  T
Q  129 acatctcaa 137  Q
    |||||||||    
T  10557096 acatctcaa 10557104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 22 - 144
Target Start/End: Original strand, 14572595 - 14572717
Alignment:
Q  22 acatcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgca 120  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||      
T  14572595 acatcaacatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacatagacagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaattgag 14572693  T
Q  121 agtcaacaacatctcaattattca 144  Q
    |||||||||||||| || ||||||    
T  14572694 agtcaacaacatcttaaatattca 14572717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 34 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 24340826 - 24340660
Alignment:
Q  34 acttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa-caacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaaca 131  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| || ||||| | ||||||| || || ||  |||| ||||||||||| || |||||| |||||||    
T  24340826 acttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacatatgcagtatgcacaa-catcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaaca 24340728  T
Q  132 tctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaaat 198  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  24340727 tctcaaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaat 24340660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 35 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 52523831 - 52523666
Alignment:
Q  35 cttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa-caacaacacag-cagtatacaaaaacaga--atgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 130  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||| |||   |||| |||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  52523831 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaa-cagttcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaac 52523733  T
Q  131 atctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaa 196  Q
    |||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  52523732 atctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 52523666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 30 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 24153315 - 24153164
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagc-agtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 128  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | ||||| ||  ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24153315 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacgatagcaacataggtagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 24153217  T
Q  129 acatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcaca 181  Q
    |||||| || ||||||  |||  ||||| ||||||| |||  || ||||||||    
T  24153216 acatcttaaatattcaattatacttcaaataatgcacataacataatatcaca 24153164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 30 - 118
Target Start/End: Original strand, 44494820 - 44494908
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatg 118  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  44494820 atcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacagcagtatacaaaaacagcataacataataatatcaaatg 44494908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 225 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 17444773 - 17444695
Alignment:
Q  225 atatacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcat 304  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17444773 atatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaatcat 17444695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 34 - 198
Target Start/End: Original strand, 23274705 - 23274871
Alignment:
Q  34 acttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa-caacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaaca 131  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| || |||||| ||||| ||  |||| ||||||||||| || |||||| |||||||    
T  23274705 acttagactgactcatgcaacttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaaca 23274803  T
Q  132 tctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaaat 198  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||    
T  23274804 tctcaaatattcacatataattcaagtaaagaatatacaattacatcacattataaacaacatcaaat 23274871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 398 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 3264538 - 3264424
Alignment:
Q  398 taacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaat 497  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||| | |||  |||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||||    
T  3264538 taacatccatacctacaactttcgtgaagacacctaagatcaattctatacttatcaataccaattttcatttcaaattcaggaaaggttgtgctgaaat 3264439  T
Q  498 tcataaaaattcact 512  Q
    ||||||| |||||||    
T  3264438 tcataaatattcact 3264424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 414 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 14567653 - 14567555
Alignment:
Q  414 aactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14567653 aactttcatgtttacaccaaaggccaattctgtacctaccaataccagttttcatttcaaattcgggaaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 14567555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 23 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 11424873 - 11424718
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaa 121  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||  ||||    
T  11424873 catcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataacaatatcaatagcaa 11424775  T
Q  122 gtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcaca 181  Q
       | ||||||||||||||| ||   || ||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  11424774 ---atcaacatctcaattatgcattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcaca 11424718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 313 - 377
Target Start/End: Original strand, 15007988 - 15008052
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtca 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  15007988 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtca 15008052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 30 - 117
Target Start/End: Original strand, 17737247 - 17737337
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagta---tacaaaaacagaatgacataataatatcaaat 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||   ||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  17737247 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcaatatactacaacaacagcatgacataataatatcaaat 17737337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 98 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 2051237 - 2051138
Alignment:
Q  98 atgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaa 196  Q
    |||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  2051237 atgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 2051138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 446 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 13937709 - 13937644
Alignment:
Q  446 taccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcac 511  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13937709 taccaatcaataccagtttttatttcaaattcggacaaagttgtgctaaaattcataaaaattcac 13937644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 23 - 196
Target Start/End: Original strand, 16097335 - 16097509
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgca 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | ||| ||| | ||| ||  || | |||| |||||| ||||||    
T  16097335 catcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcaatatgc-aaatcatcatcatataacaatatcgaatgca 16097433  T
Q  121 agtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaa 196  Q
    ||||| ||||||||||| || ||| | || ||||| |||||| ||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  16097434 agtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaa 16097509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 135 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 17248287 - 17248224
Alignment:
Q  135 caattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 198  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17248287 caattattcacatataattcaaataatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaat 17248224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 238 - 304
Target Start/End: Original strand, 25237009 - 25237074
Alignment:
Q  238 acttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcat 304  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25237009 acttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactaattcatcaatcat 25237074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 321 - 442
Target Start/End: Original strand, 25058286 - 25058407
Alignment:
Q  321 tgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttc 420  Q
    ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||| || |||||||||||||    || ||| |||||||    
T  25058286 tgacctatgtgtagtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggacctcaaaccaacgccattagaaagctaacaaaattatctaaaactttc 25058385  T
Q  421 gtgtttacacctaagaccaatt 442  Q
     |||||||||| ||| ||||||    
T  25058386 atgtttacaccaaaggccaatt 25058407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 22 - 141
Target Start/End: Original strand, 32307683 - 32307802
Alignment:
Q  22 acatcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgc 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| | ||||||| | ||| ||  |||| |||| |||||| |||||    
T  32307683 acatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgc 32307781  T
Q  120 aagtcaacaacatctcaattat 141  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  32307782 aa-tcaacaacatctcaattat 32307802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 98 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 37642303 - 37642202
Alignment:
Q  98 atgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaa 196  Q
    |||| |||||||||||  | | |||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  37642303 atgatataataatatcgcacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 37642204  T
Q  197 at 198  Q
    ||    
T  37642203 at 37642202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 413 - 477
Target Start/End: Original strand, 8899418 - 8899482
Alignment:
Q  413 caactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 477  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  8899418 caactttcgtgtttacacctaagaccaattctggacctatcaataccagatttcatttcaaattc 8899482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 412 - 458
Target Start/End: Original strand, 10555766 - 10555812
Alignment:
Q  412 acaactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaatac 458  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10555766 acaactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaatac 10555812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 313 - 431
Target Start/End: Original strand, 34159811 - 34159929
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    | | |||||||||| |||||||||| ||| || | |||||||||||    || |||    
T  34159811 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcataaaccaaaaatcattttcaagtcaaaccgacgccactggaaagctaacacaattatcta 34159910  T
Q  413 caactttcgtgtttacacc 431  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  34159911 caactttcatgtttacacc 34159929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 647 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 34594771 - 34594665
Alignment:
Q  647 aaaggttggacatttccaatatctccttttaggattttcatttaaattagagatgaacatccttatgattttgttgcacccacatataagcaattcaatt 746  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||  | ||||| ||||| | | ||||| |||| ||||||    
T  34594771 aaaggttggacattttcaatatcttcttttaggattgtcatgtgaattggagatgaacatcctcgttattttattgcaactatatataggcaactcaatt 34594672  T
Q  747 gatgatg 753  Q
    |||||||    
T  34594671 gatgatg 34594665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 98 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 22147563 - 22147474
Alignment:
Q  98 atgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa 187  Q
    |||| |||||||||||  | | |||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  22147563 atgatataataatatcgcacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataa 22147474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 23 - 137
Target Start/End: Original strand, 15470931 - 15471046
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataaca-acaacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgca 120  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||| | ||| ||  |||| |||| |||||| ||||||    
T  15470931 catcatcttcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 15471029  T
Q  121 agtcaacaacatctcaa 137  Q
    ||||| |||||||||||    
T  15471030 agtcatcaacatctcaa 15471046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 23 - 196
Target Start/End: Original strand, 16103787 - 16103960
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgca 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||| | ||||||| | ||| ||  |||| |||| |||||| ||||||    
T  16103787 catcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacgaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 16103885  T
Q  121 agtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaa 196  Q
    | ||||||||||||||| || ||| | || |||||  ||||| ||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  16103886 a-tcaacaacatctcaaata-tcaaacataattcatttaatgtatataaaattatataacattataaacaacatcaa 16103960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 333 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 16934920 - 16934824
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| | || |||||||||||||    |||||| ||||||| ||||||||    
T  16934920 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggacgtcaaaccaaggccattagaaagctaacaaaattacctaaaactttcatgtttaca 16934824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 23 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 12174373 - 12174327
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa 69  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12174373 catcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 12174327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 333 - 431
Target Start/End: Original strand, 14263640 - 14263738
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacc 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||   | | ||||||||||||||||||  ||||| |||  ||||||||||    
T  14263640 agtaatttgaccataactcaagttctagaaatcataatggagtcaaaccaaaccccaaagaaagctaacatccatagatacaaatttaatgtttacacc 14263738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 313 - 431
Target Start/End: Original strand, 15412916 - 15413034
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |   |||||||||| |||||||| | ||| || | |||||||||||    || |||    
T  15412916 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcataaaccgaaaatcattttcaagtcaaatcgacgccactggaaagctaacacaattatcta 15413015  T
Q  413 caactttcgtgtttacacc 431  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  15413016 caactttcatgtttacacc 15413034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 313 - 431
Target Start/End: Original strand, 17463663 - 17463781
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    | | |||||||||| |||||||||| ||| || |  ||||||||||    || |||    
T  17463663 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcataaaccaaaaatcattttcaagtcaaaccgacgccactgtaaagctaacacaattatcta 17463762  T
Q  413 caactttcgtgtttacacc 431  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  17463763 caactttcatgtttacacc 17463781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 333 - 431
Target Start/End: Original strand, 49231768 - 49231866
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacc 431  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||| || |||||||||||||    || ||| ||||||| ||||||||||    
T  49231768 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggacctcaaaccaacgccattagaaagctaacaaaattatctaaaactttcatgtttacacc 49231866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 333 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 51158753 - 51158683
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacat 403  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| | || ||||||||||||||    
T  51158753 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggacgtcaaaccaaagccattagaaagctaacat 51158683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 313 - 431
Target Start/End: Original strand, 55476976 - 55477094
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    |   |||||||||| |||||||||| ||| || | |||||||||||    || |||    
T  55476976 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcataaaccgaaaatcattttcaagtcaaaccgacgccactggaaagctaacacaattatcta 55477075  T
Q  413 caactttcgtgtttacacc 431  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  55477076 caactttcatgtttacacc 55477094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 333 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 14528734 - 14528625
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacct 432  Q
    |||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||   || ||||||||||||||   || ||| ||||||| ||||||||||     
T  14528734 agtaatttaatcataactaaagttctaaaaatcatttggaagtcaaaccaaatccattagaaagctaacataattatctaaaactttcatgtttacacca 14528635  T
Q  433 aagaccaatt 442  Q
    ||| ||||||    
T  14528634 aaggccaatt 14528625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 230 - 305
Target Start/End: Original strand, 25201323 - 25201398
Alignment:
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatg 305  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||||| ||||||  || |||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  25201323 catataataattcattaatcatgaacaatatcatattcatcaatatatacattcatataataattcatcaatcatg 25201398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 46822279 - 46822394
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 128  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || || | ||||  ||||  ||||  | ||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  46822279 atcaacttagactgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagattacatcaacaacaagacataaaaatatcaattgcaattcaaca 46822378  T
Q  129 acatctcaattattca 144  Q
    |||||| || ||||||    
T  46822379 acatcttaaatattca 46822394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 49668190 - 49668144
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa 69  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  49668190 catcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 49668144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 333 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 1468723 - 1468614
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacct 432  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||  | ||||||||| || |||||||||||||    || ||| ||||||| ||||||||||     
T  1468723 agtaatttgatcataactcgagttctaaaaatcatttggacctgaaaccaacgccattagaaagctaacaaaattatctaaaactttcatgtttacacca 1468624  T
Q  433 aagaccaatt 442  Q
    ||| ||||||    
T  1468623 aaggccaatt 1468614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 333 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 8276583 - 8276474
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacct 432  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||| | || ||||||||||| |    || ||||||||||| ||||||||||     
T  8276583 agtaatttaatcatatctcaagttctaaaaatcatttcgacgtcaaaccaaagccattagaaagctaataaaattatctacaactttcatgtttacacca 8276484  T
Q  433 aagaccaatt 442  Q
    ||| ||||||    
T  8276483 aagtccaatt 8276474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 333 - 430
Target Start/End: Original strand, 30152450 - 30152547
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacac 430  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||| | || |||||||||||| |   || ||| ||||||| |||||||||    
T  30152450 agtaatttgatcataactcaaattctaaaaatcatttggacgtcaaaccaaagccattagaaagctaacttaattatctaaaactttcatgtttacac 30152547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 45577989 - 45577948
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaaca 71  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45577989 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaca 45577948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 637 - 724
Target Start/End: Original strand, 5386732 - 5386819
Alignment:
Q  637 aactcaccgtaaaggttggacatttccaatatctccttttaggattttcatttaaattagagatgaacatccttatgattttgttgca 724  Q
    ||||||| ||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| || |||| || || |||||||| ||| ||||||||||    
T  5386732 aactcacggtatatgttgggcatttccaatacctccttttagggttttcaattgaattggatattaacatcctcatggttttgttgca 5386819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 246 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 15025992 - 15025933
Alignment:
Q  246 aatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatg 305  Q
    |||||||||||||||| ||||||  | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  15025992 aatcatgaacaatatcatattcatcatcatatacattcatataataattcatcaatcatg 15025933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 329 - 420
Target Start/End: Original strand, 21026092 - 21026183
Alignment:
Q  329 gtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttc 420  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| |||  | |||||| |||  ||||| ||| | || |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21026092 gtgcagtattttgatcataactcaagatctgaacatcattatgacttcaaaacaaagccattagaaatctaacatccatacctacaactttc 21026183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 28194704 - 28194743
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa 69  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28194704 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 28194743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 335 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 54039234 - 54039167
Alignment:
Q  335 taatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaaca 402  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||| | || |||||||||||||    
T  54039234 taatttgatcatatctcaagttctaaaaatcatttggacgtcaaaccaaagccattagaaagctaaca 54039167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 333 - 435
Target Start/End: Original strand, 2281000 - 2281102
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacct 432  Q
    |||||||| | ||||||||||||| || |||| ||  |||||||||||||| | |  || |||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||    
T  2281000 agtaatttaatcataactcaagttatagaaataataatgaagtcaaaccaaagcctttacaaaggtaacatacatacctaaaactttcatgtttacaact 2281099  T
Q  433 aag 435  Q
    |||    
T  2281100 aag 2281102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 69
Target Start/End: Original strand, 9512927 - 9512973
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa 69  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  9512927 catcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaa 9512973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 69
Target Start/End: Original strand, 9520902 - 9520948
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa 69  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  9520902 catcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaa 9520948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 13210441 - 13210395
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa 69  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13210441 catcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 13210395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 333 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 8269472 - 8269363
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacct 432  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||| | | || ||||||||||| |    || ||||||||||| ||||||||||     
T  8269472 agtaatttaatcatatctcaagttctaaaaatcatttggacgtcaaacccaagccattagaaagctaataaaattatctacaactttcatgtttacacca 8269373  T
Q  433 aagaccaatt 442  Q
    ||| ||||||    
T  8269372 aagtccaatt 8269363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 134
Target Start/End: Original strand, 12511071 - 12511176
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 128  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | || || | ||||  ||||  ||||  | ||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  12511071 atcaacttagaatgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagattacatcaacaacaagacataaaaatatcaattgcaattcaaca 12511170  T
Q  129 acatct 134  Q
    ||||||    
T  12511171 acatct 12511176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 361 - 442
Target Start/End: Original strand, 16979504 - 16979585
Alignment:
Q  361 aaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 442  Q
    |||||||||| |||||||||||| | || |||||||||||||    || ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  16979504 aaatcattttcaagtcaaaccaaagccactagaaagctaacacaattatctacaactttcatgtttacaccaaaggccaatt 16979585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 333 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 17956938 - 17956869
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaaca 402  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||| | || | |||||||||||    
T  17956938 agtaatttgatcataactcaagttctaaatatcatttagatgtcaaaccaaagccattggaaagctaaca 17956869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 240 - 304
Target Start/End: Original strand, 17044330 - 17044394
Alignment:
Q  240 ttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcat 304  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||   || |||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  17044330 ttcatcaatcatgaacaacatcatattcgtcaatatatacattcatataataattcatcaatcat 17044394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 31 - 114
Target Start/End: Original strand, 30029855 - 30029939
Alignment:
Q  31 tcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatca 114  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| | || || || |||  ||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  30029855 tcaacttagactgactcatgcaacttagtttaataacaatagcagcatagacagattacaacaacagcatgacataagaatatca 30029939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 1644788 - 1644733
Alignment:
Q  22 acatcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaaca 77  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| |||   ||||||||||||||||||||||||    
T  1644788 acatcgtcatcaacttagaccaacttatgttgcttagttaaataacaacaacaaca 1644733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 313 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 6468811 - 6468772
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactca 352  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6468811 attcactgtgacatacgtgcagtaatttgaccataactca 6468772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 227 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 11913953 - 11913875
Alignment:
Q  227 atacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatg 305  Q
    |||||||||  | |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||  | |||||||||||||    
T  11913953 atacatatactaattcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatataacacttcatcaatcatg 11913875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 259 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 18700245 - 18700199
Alignment:
Q  259 atcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatg 305  Q
    ||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  18700245 atcgtattcatcaacatatacattcatataataattcatcaatcatg 18700199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 333 - 431
Target Start/End: Original strand, 28557370 - 28557468
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacc 431  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||  ||||| ||| | || | ||||||||||||   || ||| ||||||| ||||||||||    
T  28557370 agtaatttgatcataactcaagttctaaatatcatttggacttcaaatcaaagccatttgaaagctaacataattatctaaaactttcatgtttacacc 28557468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 31200140 - 31200078
Alignment:
Q  617 aacatagtattataacaacgaactcaccgtaaaggttggacatttccaatatctccttttagg 679  Q
    |||| ||||||| |||| | |||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  31200140 aacaaagtattacaacatcaaactcaccatataggttgggtatttccaatatctccttttagg 31200078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 230 - 288
Target Start/End: Original strand, 40812144 - 40812202
Alignment:
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatata 288  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||  ||||||||||| ||||||    
T  40812144 catataaaaattcatcaatcataaacaacatcatattcatcaacatatacattcatata 40812202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 240 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 12119649 - 12119584
Alignment:
Q  240 ttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatg 305  Q
    |||||||||||| ||||| ||| || ||| ||| |||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  12119649 ttcatcaatcataaacaacatcatactcataaatatatacattcatataatacttcatcaatcatg 12119584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 333 - 442
Target Start/End: Original strand, 12808505 - 12808614
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacct 432  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||| ||||| ||| ||  | |||| |||| || |||||||||||||    || ||| ||||||| ||||||||||     
T  12808505 agtaatttaatcatatctcaagttctaaaaatcgtttggacctgaaactaacgccattagaaagctaacaaaattatctaaaactttcatgtttacacca 12808604  T
Q  433 aagaccaatt 442  Q
    ||||||||||    
T  12808605 aagaccaatt 12808614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 361 - 442
Target Start/End: Original strand, 13519877 - 13519958
Alignment:
Q  361 aaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 442  Q
    |||||| ||| ||||||||| || | |||||||||||||||||   || |||  ||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  13519877 aaatcaatttcaagtcaaacgaaagtcaatagaaagctaacataattatctaagactttcgtgtttacaccaaaggccaatt 13519958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 361 - 442
Target Start/End: Original strand, 18889958 - 18890039
Alignment:
Q  361 aaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 442  Q
    |||||||||| |||||||||||| | || | |||||||||||    || ||| |||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  18889958 aaatcattttcaagtcaaaccaaagccattggaaagctaacaaaattatctaaaactttcgtgtttacaccaaagtccaatt 18890039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 361 - 442
Target Start/End: Original strand, 24546434 - 24546515
Alignment:
Q  361 aaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 442  Q
    |||||||||| |||||||||||| | || | |||||||||||    || ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  24546434 aaatcattttcaagtcaaaccaaagccactggaaagctaacacaattatctacaactttcatgtttacaccaaaggccaatt 24546515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 98 - 179
Target Start/End: Original strand, 43926043 - 43926123
Alignment:
Q  98 atgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatca 179  Q
    |||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||  | ||| |||  ||||| |||||||||||| | ||||||||    
T  43926043 atgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaaca-tcatatacaattcatgtaatgcatatacatttatatca 43926123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 250 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 50351717 - 50351664
Alignment:
Q  250 atgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatca 303  Q
    |||||||| ||| ||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  50351717 atgaacaacatcatattcatcaacatatacattcatataataattcatcaatca 50351664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 379; Significance: 0; HSPs: 114)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 512
Target Start/End: Original strand, 39363395 - 39363875
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39363395 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 39363494  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39363495 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca-tatata 39363593  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  39363594 catataacacttcatcaatcatggacaatatcatattcacaaacatacacatacatatactaattcatcaatcataatcaattattcagtgtgacctacg 39363693  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  39363694 ttcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaatcaacggcactagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttata 39363793  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39363794 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttc-aattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 39363875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 10733091 - 10732603
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10733091 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 10732992  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10732991 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaccgtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca-tatata 10732893  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||    
T  10732892 catataacacttcatcaatcatggacaaaatcgtattcacaa-catatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgatctacg 10732794  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  10732793 tgcagtaatttgactataactctagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatacctacaactttcgtgtttaca 10732694  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 520  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10732693 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 10732603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 512
Target Start/End: Original strand, 20909023 - 20909503
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20909023 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaaagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 20909122  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20909123 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca-tatata 20909221  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||    
T  20909222 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactctgacctacg 20909320  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  20909321 tgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatacctacaactttcgtgtttaca 20909420  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20909421 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 20909503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 370; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 42245516 - 42245029
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42245516 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 42245417  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42245416 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca-tatata 42245318  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  42245317 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 42245219  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  42245218 tgcagtaatttgactataactatagttctataaatccatttgaagtcaaaccaacggcattagaaatctaacatttatacctacaactttcgtgtttaca 42245119  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacct 519  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42245118 cctaagaccaattctgtatcaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacct 42245029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 367; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 264919 - 264439
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  264919 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 264820  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  264819 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca-tatata 264721  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||    
T  264720 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacattcatatactaattcatcaatcatatttaattattcactgtgacctacg 264622  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  264621 tgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaatctaacatttatacctacaacttttgtgtttaca 264522  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  264521 cctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaggttgtgctgaaattcataaaaattcact 264439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 363; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 520
Target Start/End: Original strand, 29345991 - 29346479
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29345991 atcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataacaacagcatcacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 29346090  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29346091 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca-tatata 29346189  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||| ||||| |||||||||||| | |||||||||    
T  29346190 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacattcatatactagttgatccatcatattcaattattcactctgacctacg 29346288  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  29346289 tgcagtaatttgagtataaatcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatacctacaactttcgtgtttaca 29346388  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 520  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29346389 cctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 29346479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 512
Target Start/End: Original strand, 39245147 - 39245627
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  39245147 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaataa 39245246  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39245247 cgtcccaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattacatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca-tatata 39245345  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  39245346 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 39245444  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    ||||||||||| || |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  39245445 tgcagtaatttaactataaatcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatacctacaactttcgtgtttaca 39245544  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39245545 cataagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctcaaattcataaaaattcact 39245627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 520
Target Start/End: Original strand, 29348464 - 29348952
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| || |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29348464 atcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataagaacagcatcacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 29348563  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29348564 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca-tatata 29348662  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||| ||||| |||||||||||| | |||||||||    
T  29348663 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacattcatatactagttgatccatcatattcaattattcactctgacctacg 29348761  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  29348762 tgcagtaatttgagtataaatcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcatttgaaagctaacatttatacctacaactttcgtgtttaca 29348861  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 520  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29348862 cctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 29348952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 520
Target Start/End: Original strand, 29350937 - 29351425
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| || |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29350937 atcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataagaacagcatcacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 29351036  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29351037 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca-tatata 29351135  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||| ||||| |||||||||||| | |||||||||    
T  29351136 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacattcatatactagttgatccatcatattcaattattcactctgacctacg 29351234  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  29351235 tgcagtaatttgagtataaatcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcatttgaaagctaacatttatacctacaactttcgtgtttaca 29351334  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 520  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29351335 cctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 29351425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 510
Target Start/End: Original strand, 38619445 - 38619925
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaa-ca 128  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  38619445 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacgacacagtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaatca 38619544  T
Q  129 acatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa-caacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatata 227  Q
    || ||||||||||||||| || ||  || | ||||||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  38619545 acgtctcaattattcacagataatctaattgatgcatatacaattatattccaatataaacaacatcaaatgataatcaacatcttaaaacatca-tata 38619643  T
Q  228 tacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgaccta 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  38619644 tacatataaaacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcataatcaattattcactgtgaccta 38619743  T
Q  328 cgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgttta 427  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38619744 cgttcagtaatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcactagaaatctaacatccatacctacaactttcgtgttta 38619843  T
Q  428 cacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattca 510  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38619844 tacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttttatttc-aattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaatttca 38619925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 512
Target Start/End: Original strand, 23064522 - 23065005
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaa-ca 128  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  23064522 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacgacacagtagtatacaaaaacagcatgacctaataatatcaaatgcaagtcaatca 23064621  T
Q  129 acatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa-caacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatata 227  Q
    || ||||||||||||||| || ||  || | ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  23064622 acgtctcaattattcacagataatctaattgatgcatatacaattatatcccaatataaacaacatcaaatgataatcaacatcttaaaacat-aatata 23064720  T
Q  228 tacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgaccta 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||    
T  23064721 tacatataaaacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcataataaattattcactgtgaccta 23064820  T
Q  328 cgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgttta 427  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23064821 cgttcagtaatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaacgaacggcactagaaagctgacatccatacctacaactttcgtgttta 23064920  T
Q  428 cacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
     | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23064921 tatctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttaatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 23065005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 30 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 2154765 - 2154303
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2154765 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaactgcaagtcaacaa 2154666  T
Q  130 catctcaattatt-cacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatat 228  Q
    | ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||                   ||||| |||||    
T  2154665 cgtctcaattatttcacatataattcaaataatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaat-------------------catca-tatat 2154586  T
Q  229 acatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctac 328  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  2154585 acatataacacttcatcaatcatggacagtatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctac 2154486  T
Q  329 gtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttac 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||    
T  2154485 gtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaatattcatacctacaactttagtgtttac 2154386  T
Q  429 acctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcac 511  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2154385 acctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcac 2154303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 203 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 17517142 - 17516834
Alignment:
Q  203 atcaacatcttaaaacatcaatatatacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatc 302  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17517142 atcaacatcttaaaacatca-tacatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatc 17517044  T
Q  303 atgttcaattattcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaaca 402  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17517043 atattcaattattcactgtgacctacgtgcagtaatttgacgataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaaca 17516944  T
Q  403 tccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcata 502  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17516943 tccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcata 17516844  T
Q  503 aaaattcact 512  Q
    ||||||||||    
T  17516843 aaaattcact 17516834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 182 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 37804902 - 37804565
Alignment:
Q  182 atataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatatacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacat 281  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37804902 atataacaacatcaaattctaattaacatcttaaaacatca-tatatacatataacgcttcattaatcattgacaatatcgtattcacaaatatatacat 37804804  T
Q  282 acatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaacc 381  Q
    ||||||| |||||||||||||||   ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  37804803 acatatattaattcatcaatcataaacaattcttcactgtgacctacgtgcattaatttgaccataactcaagttttataaatccttttgaagtcaaacc 37804704  T
Q  382 aacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagac 481  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||    
T  37804703 aacggcattagaaagctaacattcatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaatgccagttttcatttcaaattatgac 37804604  T
Q  482 aaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 520  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37804603 aaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 37804565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 230 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 20901873 - 20901591
Alignment:
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  20901873 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcacagtgacctacg 20901774  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20901773 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaatctaacatccatacctacaactttcatgtttaca 20901674  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20901673 cctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaaatcggacaaagttgtgttgaaattcataaaaattcact 20901591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 30 - 304
Target Start/End: Original strand, 32027404 - 32027676
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32027404 atcaacttagaccgactcatacaacttagttaaataacaacaacaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatccaagtcaacaa 32027503  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32027504 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatc-atatata 32027602  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcat 304  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32027603 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaatcat 32027676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 227 - 510
Target Start/End: Original strand, 32027652 - 32027935
Alignment:
Q  227 atacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacct 326  Q
    |||||||||  | |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  32027652 atacatatactaattcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcacagtgacct 32027751  T
Q  327 acgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgttt 426  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  32027752 acgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaatctaacattcatacctacaactttcttgttt 32027851  T
Q  427 acacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattca 510  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32027852 acacctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattca 32027935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 240 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 20917789 - 20917519
Alignment:
Q  240 ttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacgtgcagtaatt 339  Q
    |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  20917789 ttcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcaccgtgacttacgtgcagtaatt 20917690  T
Q  340 tgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagacca 439  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20917689 tgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacattcatacctacaactttcgtgtttacacctaagacca 20917590  T
Q  440 attatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattca 510  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20917589 attctgtaccaatcaataccagttttcatttcgaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattca 20917519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 30 - 304
Target Start/End: Original strand, 29329945 - 29330214
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29329945 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 29330044  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||| | |||||||||||||| |||||||    
T  29330045 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaa---taataatcatcttaaaacatc-atatata 29330140  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcat 304  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29330141 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaatcat 29330214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 227 - 512
Target Start/End: Original strand, 29330190 - 29330474
Alignment:
Q  227 atacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacct 326  Q
    |||||||||  | |||||||||||| ||||| ||| || ||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||    
T  29330190 atacatatactaattcatcaatcataaacaacatcatactcgtaaacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaatt-ttcactgttacct 29330288  T
Q  327 acgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgttt 426  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29330289 acgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaaatcaaaccaacagcattagaaagctaacattcatacctacaactttcgtgttt 29330388  T
Q  427 acacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29330389 acacctaagaccaattctgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 29330474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 30 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 20918099 - 20917831
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| |||    |||||||||    
T  20918099 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacaaaataatataaaa----agtcaacaa 20918004  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20918003 cgtctcaattattcacatctaattcaagtaaagcatatataattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatc-atatata 20917905  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcat 304  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20917904 catataacacttcatcaatcatggacaagatcgtattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaatcat 20917831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 182 - 442
Target Start/End: Original strand, 9776521 - 9776780
Alignment:
Q  182 atataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatatacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacat 281  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| |||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9776521 atataacaacatcaaatggtaattaacatcttaaaacatca-tatatacatataacccttcaccaatcattgacaatatcgtattcacaaatatatacat 9776619  T
Q  282 acatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaacc 381  Q
    ||||||| |||||||||||||||   ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9776620 acatatattaattcatcaatcataaacaattcttcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccatagctcaagttctataaatccttttgaagtcaaacc 9776719  T
Q  382 aacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 442  Q
    ||||| | ||||||||||||||   || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  9776720 aacggtattagaaagctaacataattatctacaactttcatgtttacaccaaagaccaatt 9776780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 31 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 20902159 - 20901905
Alignment:
Q  31 tcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 130  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20902159 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaagtgcaagtcaacaac 20902060  T
Q  131 atctcaatta-ttcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
     ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||         ||||           |||||||    
T  20902059 gtctcaattatttcacatataattcaaataatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaat---------catc-----------atatata 20901980  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcat 304  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20901979 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcat 20901905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 313 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 296144 - 295945
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  296144 attcagtgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaattgttttgacgtcagaccaacgtcattagaaagctaacatccataccta 296045  T
Q  413 caactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  296044 caacttttgtgtatacacctaagaccaattctgtaccaatcaatatcagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 295945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 313 - 519
Target Start/End: Original strand, 32028318 - 32028524
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |||| |||||| ||| ||||||||||||||  |||||||    
T  32028318 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagctctataaattgttttgacgtcagaccaacagcactagaaagctaacatatataccta 32028417  T
Q  413 caactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32028418 caactttcgtgttttcacctaaaaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 32028517  T
Q  513 aagacct 519  Q
    | |||||    
T  32028518 atgacct 32028524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 321 - 510
Target Start/End: Original strand, 32028132 - 32028322
Alignment:
Q  321 tgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaa-ccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaacttt 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32028132 tgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagctctataaatcgttttgacgtcaaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaacttt 32028231  T
Q  420 cgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattca 510  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32028232 cgtgtttacacctaagaccaattcttgacctatcaataccagatttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattca 32028322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 313 - 519
Target Start/End: Original strand, 32027931 - 32028137
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||  ||||| |||| |||||||||||||||||||  ||    
T  32027931 attcattgtgacttacgtgcagtaatttgaccataactcaagctctataaatcgttttgacgtccgaccaatggcattagaaagctaacatccataaata 32028030  T
Q  413 caactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32028031 caatttttgtgtttacacctaagaccaattctgtaccaatcaataacaattttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 32028130  T
Q  513 aagacct 519  Q
    | |||||    
T  32028131 atgacct 32028137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 313 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 17516840 - 17516641
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  17516840 attcactgtgacctatgtgcagtaattcgacgataactcaagttctataaatctttttgacgtcagaccaacgacattagaaagctaacatccataccta 17516741  T
Q  413 caactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17516740 caactttcgtgtttacacctaggaccaattctgtgccaatcaataccatttttcatttaaaaatcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 17516641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 313 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 20901597 - 20901433
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  20901597 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactaaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaacggcattagaaagctgacatccataccta 20901498  T
Q  413 caactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 477  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20901497 caacgttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 20901433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 30 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 36154931 - 36154766
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36154931 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaaca---cagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 36154835  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 198  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36154834 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacatcatcaaat 36154766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 313 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 17516647 - 17516483
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17516647 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacatcagaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 17516548  T
Q  413 caactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 477  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17516547 caactttcgtgtttacacctaagaccaattttgtaccaatcaataccggttttcatttcaaattc 17516483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 30 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 11581350 - 11581184
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11581350 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaataa 11581251  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaa 196  Q
    | |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11581250 cgtctcaattattcacgtataattcaagtaatgtatatacaattatatcacaatataacaacatcaa 11581184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 30 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 18319185 - 18319021
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaa-ca 128  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18319185 atcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaatca 18319086  T
Q  129 acatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacat 193  Q
    || |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18319085 acgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataacaacat 18319021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 30 - 198
Target Start/End: Original strand, 31061079 - 31061248
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaa-ca 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31061079 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaaaacagtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaatca 31061178  T
Q  129 acatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 198  Q
    || | ||||||||||||| || ||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31061179 acgtatcaattattcacaaataatttaattaatgcatataaaattatatcacaatataacaacatcaaat 31061248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 313 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 20917523 - 20917359
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  20917523 attcattgtgacctacgtgtagtaatttgaccataactcaagttttataaatgattttgacgtcagaccagcggcattagaaagctaacattcataccta 20917424  T
Q  413 caactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 477  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||    
T  20917423 caactttcgtgtttacacctaagatcaattatggacctatcaatacctgatttcatttcaaattc 20917359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 321 - 479
Target Start/End: Original strand, 32028519 - 32028677
Alignment:
Q  321 tgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttc 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32028519 tgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagctctataaatcgttttgatgtcagaccaacgatattagaaagctaacatccatacctacaactttc 32028618  T
Q  421 gtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcag 479  Q
    |||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32028619 gtgtttacacctaagaccaatttttgacctatcaataccagatttcatttcaaattcag 32028677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 30 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 10775827 - 10775659
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaa-ca 128  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10775827 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacgacagcgacacagcagtatataaaaccagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaatca 10775728  T
Q  129 acatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 198  Q
    || |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10775727 acgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatat-acaacatcaaat 10775659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 313 - 477
Target Start/End: Original strand, 29330468 - 29330632
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  29330468 attcactgtgacatacgtgcattaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaacggccttagaaagctaacatccataccta 29330567  T
Q  413 caactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 477  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  29330568 caacttttgtgtttacacctaagaccaattcttgacctatcaataccagatttcatttcaaattc 29330632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 320 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 2154301 - 2154145
Alignment:
Q  320 gtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaacttt 419  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||    
T  2154301 gtgacatacgtgcagtaatttgactataacttaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaacgacattaaaaagctaacatccatacctacaacttt 2154202  T
Q  420 cgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaatt 476  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  2154201 cgtgtttacacctaagaccaattctggacctatcaataccagatttcatttcaaatt 2154145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 30 - 193
Target Start/End: Original strand, 24067118 - 24067282
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaa-ca 128  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24067118 atcaacttagaccgaccaatgcagcttggttaaataacaacagcgacacaacagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaatca 24067217  T
Q  129 acatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacat 193  Q
     | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24067218 tcgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataacaacat 24067282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 313 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 295951 - 295787
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| | ||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  295951 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgatgtcagatcaacgacattagaaagctaacattcataccta 295852  T
Q  413 caactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 477  Q
    |||||||| || |||||||||||||| |||  | ||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  295851 caactttcatggttacacctaagacctattccggacttatcaataccagatttcatttcaaattc 295787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 181
Target Start/End: Original strand, 25421539 - 25421698
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaa 121  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  25421539 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaa 25421638  T
Q  122 gtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcaca 181  Q
    ||||||| ||||| || ||||||  |||  ||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  25421639 gtcaacagcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcaca 25421698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 23 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 23390610 - 23390451
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaa 121  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  23390610 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacatagacagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaa 23390511  T
Q  122 gtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcaca 181  Q
     ||| |||||||| || |||||| ||||  ||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  23390510 ttcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcaca 23390451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 23 - 141
Target Start/End: Original strand, 24529227 - 24529346
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaa 121  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  24529227 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataatgatatcaaatgcaa 24529326  T
Q  122 gtcaacaacatctcaattat 141  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  24529327 gtcaacaacatcttaattat 24529346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 22 - 181
Target Start/End: Original strand, 1096473 - 1096633
Alignment:
Q  22 acatcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgca 120  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  1096473 acatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggtagtatgcaaaaacaacataacataataatatcaaatgca 1096572  T
Q  121 agtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcaca 181  Q
    | ||||||||||||||  ||| ||   || ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  1096573 aatcaacaacatctcacatatacattcataattcaagtaatgcatataacattatatcaca 1096633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 23 - 181
Target Start/End: Original strand, 9077959 - 9078118
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaa 121  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  9077959 catcttcatcaacttagactgacccatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacagcatgacataataatatcaagtgcaa 9078058  T
Q  122 gtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcaca 181  Q
    |||||||||||||||||||| ||   || | ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  9078059 gtcaacaacatctcaattatacattcataactcaagtaatgcgtataacattatatcaca 9078118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 23 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 21729178 - 21729019
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaa 121  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||    
T  21729178 catcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaattgcaa 21729079  T
Q  122 gtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcaca 181  Q
     |||||||||||| || |||||| |||    |||||||||||||| |  |||||||||||    
T  21729078 ttcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaatattatatcaca 21729019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 23 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 21808503 - 21808344
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaa 121  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||    
T  21808503 catcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaattgcaa 21808404  T
Q  122 gtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcaca 181  Q
     |||||||||||| || |||||| |||    |||||||||||||| |  |||||||||||    
T  21808403 ttcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcaca 21808344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 36 - 181
Target Start/End: Original strand, 25431414 - 25431560
Alignment:
Q  36 ttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatct 134  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25431414 ttagaccgactcatgcatcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatct 25431513  T
Q  135 caattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcaca 181  Q
     || | ||||  |||  ||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  25431514 taaatgttcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcaca 25431560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 23 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 8286957 - 8286797
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacaca-gcagtatac-aaaaacagaatgacataataatatcaaatgca 120  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  8286957 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaaacagcatgacataataatatcaattgca 8286858  T
Q  121 agtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcaca 181  Q
    | ||| |||||||| || || ||| | ||  ||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  8286857 attcatcaacatcttaaataatcaaacattcttcaagtaatgcacataacattatatcaca 8286797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 23 - 181
Target Start/End: Original strand, 24493576 - 24493734
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaa 121  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| | ||||| || |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24493576 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaagtaacaatagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaatgcaa 24493674  T
Q  122 gtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcaca 181  Q
    ||||||||||||| || ||||||  |||  ||||||| ||||| |||  |||||||||||    
T  24493675 gtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtgatgcacataacattatatcaca 24493734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 21997648 - 21997547
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaa 121  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  21997648 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 21997549  T
Q  122 gt 123  Q
    ||    
T  21997548 gt 21997547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 30 - 161
Target Start/End: Original strand, 22412198 - 22412329
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 128  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22412198 atcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacgataacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 22412296  T
Q  129 acatctcaattattcacatatgattcaagtaat 161  Q
    ||||||||| ||| ||   || |||||||||||    
T  22412297 acatctcaaatatacattcataattcaagtaat 22412329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 23 - 181
Target Start/End: Original strand, 13025318 - 13025476
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaa 121  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | ||||| || |||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||    
T  13025318 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcatagttaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacatattgatatcaaatgcaa 13025416  T
Q  122 gtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcaca 181  Q
    ||||||||||||| || ||||||  |||  ||||| ||||| | |||  |||||||||||    
T  13025417 gtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaaataatgtacataacattatatcaca 13025476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 23 - 181
Target Start/End: Original strand, 13095502 - 13095660
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaa 121  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | ||||| || |||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||    
T  13095502 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcatagttaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacatattgatatcaaatgcaa 13095600  T
Q  122 gtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcaca 181  Q
    ||||||||||||| || ||||||  |||  ||||| ||||| | |||  |||||||||||    
T  13095601 gtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaaataatgtacataacattatatcaca 13095660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 32 - 181
Target Start/End: Original strand, 22075035 - 22075185
Alignment:
Q  32 caacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagca-gtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 130  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  22075035 caacttagaccgactcattcagcttagttaaataacaacagcaacataggaagtatacaaaatcaacatgacataataatatcaattgcaattcaacaac 22075134  T
Q  131 atctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcaca 181  Q
    |||| || |||||| |||    |||||||||||||| |  |||||||||||    
T  22075135 atcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcaca 22075185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 35 - 181
Target Start/End: Original strand, 22144068 - 22144215
Alignment:
Q  35 cttagaccgactcatgcaacttagttaaataaca-acaacaacacagc-agtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacat 132  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| ||  ||||| ||||| ||  |||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  22144068 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacagacatcaacataggtagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaattgcaaatcaacaacat 22144166  T
Q  133 ctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcaca 181  Q
    |||||  ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22144167 ctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 22144215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 333 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 27183278 - 27183180
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacc 431  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | || ||||||||||||||   || ||| ||||||| ||||||||||    
T  27183278 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggaagtcaaaccaaagccattagaaagctaacataattatctaaaactttcatgtttacacc 27183180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 333 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 22884013 - 22883904
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacct 432  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  | |||||||||| | || ||||||||||||||   |||||| ||||||| ||||||||||     
T  22884013 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttgaacgtcaaaccaaagccattagaaagctaacataattacctaaaactttcatgtttacaccc 22883914  T
Q  433 aagaccaatt 442  Q
    ||| ||||||    
T  22883913 aaggccaatt 22883904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 98 - 198
Target Start/End: Original strand, 40725936 - 40726037
Alignment:
Q  98 atgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaa 196  Q
    |||| |||||||||||  | | |||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  40725936 atgatataataatatcgcacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 40726035  T
Q  197 at 198  Q
    ||    
T  40726036 at 40726037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 23 - 196
Target Start/End: Original strand, 21565549 - 21565723
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgca 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||| | ||||||| | ||| ||  |||| |||| |||||| ||||||    
T  21565549 catcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtat-ccaaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 21565647  T
Q  121 agtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaa 196  Q
    ||||| |||||| |||| || ||| | || ||||| |||||| ||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  21565648 agtcatcaacatttcaaata-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaa 21565723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 74 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 20766181 - 20766095
Alignment:
Q  74 aacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaat 161  Q
    |||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||   || |||||||||||    
T  20766181 aacacaacagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat 20766095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 313 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 264445 - 264327
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    | | |||||||||| |||||||||| |||||| |  ||||||||||    || |||    
T  264445 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcataaaccaaaaatcattttcaagtcaaaccgacggcactgtaaagctaacacaattatcta 264346  T
Q  413 caactttcgtgtttacacc 431  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  264345 caactttcatgtttacacc 264327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 35 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 22178323 - 22178161
Alignment:
Q  35 cttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa-caacaacacag-cagtatacaaaaacaga--atgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| || ||||||| |||| |||   |||| || | |||||||||||||| ||||||||    
T  22178323 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatataaaa-cagctcatgatatgacaatatcaaatgcaaatcaacaac 22178225  T
Q  131 atctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaata-taacaacatc 194  Q
    |||||||  | ||| |||| ||||| |||||||||||| | |||||||||| || ||||||||||    
T  22178224 atctcaaaca-tcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatc 22178161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 333 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 43444118 - 43444009
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacct 432  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| | || |||||||||||||    || ||||||||||| ||||||||||     
T  43444118 agtaatttaatcataactcaagttctaaaaatcatttggacgtcaaaccaaagccattagaaagctaacaaagttatctacaactttcatgtttacacca 43444019  T
Q  433 aagaccaatt 442  Q
    ||| ||||||    
T  43444018 aagtccaatt 43444009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 230 - 301
Target Start/End: Original strand, 18743965 - 18744036
Alignment:
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaat 301  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  18743965 catataatacttcatcaatcatgaacaacatcatattcatcaacatatacattcatataataattcatcaat 18744036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 313 - 431
Target Start/End: Original strand, 20909497 - 20909615
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    | | |||||||||| |||||||||| ||| || |  ||||||||||    || |||    
T  20909497 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcataaaccaaaaatcattttcaagtcaaaccgacgccactgtaaagctaacacaattatcta 20909596  T
Q  413 caactttcgtgtttacacc 431  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  20909597 caactttcatgtttacacc 20909615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 23 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 22959646 - 22959600
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa 69  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22959646 catcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 22959600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 333 - 442
Target Start/End: Original strand, 11903 - 12012
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacct 432  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||| | || |||||||||||||    || ||||||||||| ||||||||||     
T  11903 agtaatttaatcatatctcaagttctaaaaatcatttggacgtcaaaccaatgccattagaaagctaacaaaattatctacaactttcatgtttacacca 12002  T
Q  433 aagaccaatt 442  Q
    ||| ||||||    
T  12003 aagtccaatt 12012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 333 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 1220453 - 1220384
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaaca 402  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||| || |||||||||||||    
T  1220453 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggacctcaaaccaacgccattagaaagctaaca 1220384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 333 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 10778901 - 10778832
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaaca 402  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||| || |||||||||||||    
T  10778901 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggacctcaaaccaacgccattagaaagctaaca 10778832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 333 - 442
Target Start/End: Original strand, 25426177 - 25426286
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacct 432  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||| | || |||||||||||||    || ||||||||||| ||||||||||     
T  25426177 agtaatttaatcatatctcaagttctaaaaatcatttggacgtcaaaccaatgccattagaaagctaacaaaattatctacaactttcatgtttacacca 25426276  T
Q  433 aagaccaatt 442  Q
    ||| ||||||    
T  25426277 aagtccaatt 25426286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 335 - 442
Target Start/End: Original strand, 7424879 - 7424986
Alignment:
Q  335 taatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaa 434  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||| | || ||||||||||| |    || ||||||||||| |||||||||| ||    
T  7424879 taatttgatcatatctcaagttctaaaaatcatttggacgtcaaaccaaagccattagaaagctaataaaattatctacaactttcatgtttacaccaaa 7424978  T
Q  435 gaccaatt 442  Q
    | ||||||    
T  7424979 gtccaatt 7424986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 114
Target Start/End: Original strand, 18418594 - 18418678
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagtt-aaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatca 114  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  18418594 atcaacttagactgactcgtgcaacttagttaaaataacaacatcaacataggcagtatac--aaacagcatgacataataatatca 18418678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 20027043 - 20026942
Alignment:
Q  35 cttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacaacaacaca-gcagtatacaaaaacag--aatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 130  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| | ||||||| | |||||||   |||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20027043 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat-ccaaaacagttcatgatataataatatcaaatgcaattcaacaac 20026945  T
Q  131 atc 133  Q
    |||    
T  20026944 atc 20026942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 230 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 1628243 - 1628169
Alignment:
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcat 304  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||  ||||||||||| |||||| || ||||||||||||    
T  1628243 catataatacttcatcaatcattaacaacatcatattcatcaacatatacattcatataatagttcatcaatcat 1628169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 21293071 - 21292992
Alignment:
Q  35 cttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaa 115  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| | |||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  21293071 cttagaccgattcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtaaac--aaacagtatgacataataatatcaa 21292992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 313 - 431
Target Start/End: Original strand, 23064999 - 23065117
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    |   |||||||||| |||||||||| ||| || | |||||||||||    || |||    
T  23064999 attcactgtgacctacgtgcagtaattggaccataactcataaaccgaaaatcattttcaagtcaaaccgacgccactggaaagctaacacaattatcta 23065098  T
Q  413 caactttcgtgtttacacc 431  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  23065099 caactttcatgtttacacc 23065117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 164
Target Start/End: Original strand, 37723909 - 37724050
Alignment:
Q  22 acatcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataaca-acaacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgc 119  Q
    ||||| ||| || ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||   ||||| ||||||| || |||||||||      
T  37723909 acatcttcaacatcttagactgactcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcagtatac---aacagcatgacatgattatatcaaatta 37724005  T
Q  120 aagtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgca 164  Q
    || ||| |||||||||||| |||||   || ||||||||||||||    
T  37724006 aattcatcaacatctcaatcattcattcataattcaagtaatgca 37724050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 313 - 431
Target Start/End: Original strand, 39245621 - 39245739
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    |   |||| ||||| |||||||||| ||| || | |||||||||||    || |||    
T  39245621 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcataaaccgaaaataattttcaagtcaaaccgacgccactggaaagctaacacaattatcta 39245720  T
Q  413 caactttcgtgtttacacc 431  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  39245721 caactttcatgtttacacc 39245739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 333 - 430
Target Start/End: Original strand, 11342190 - 11342287
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacac 430  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||| | || |||||||||||| |   || ||||||||||| |||||||||    
T  11342190 agtaatttaatcatatctcaagttctaaaaatcatttggacgtcaaaccaaagccattagaaagctaacttaattatctacaactttcatgtttacac 11342287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 227 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 20917855 - 20917778
Alignment:
Q  227 atacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcat 304  Q
    |||||||||  | |||||||||||| ||||| ||  || ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20917855 atacatatactaattcatcaatcataaacaacataatactcataaacatatacattcatatactaattcatcaatcat 20917778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 333 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 21933352 - 21933243
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacct 432  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||  | ||||||||| || |||||||||||||    || ||| ||||||| ||||||||||     
T  21933352 agtaatttgatcataactcgagttctaaaaatcatttggacctgaaaccaacgccattagaaagctaacaaaattatctaaaactttcatgtttacacca 21933253  T
Q  433 aagaccaatt 442  Q
    ||| ||||||    
T  21933252 aaggccaatt 21933243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 333 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 21939522 - 21939413
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacct 432  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||  | ||||||||| || |||||||||||||    || ||| ||||||| ||||||||||     
T  21939522 agtaatttgatcataactcgagttctaaaaatcatttggacctgaaaccaacgccattagaaagctaacaaaattatctaaaactttcatgtttacacca 21939423  T
Q  433 aagaccaatt 442  Q
    ||| ||||||    
T  21939422 aaggccaatt 21939413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 333 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 22367204 - 22367095
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacct 432  Q
    |||||||| | |||| |||||||| || ||||||||| || |||||||||| | || |||||||||||||    || ||||||||||| ||||||||||     
T  22367204 agtaatttaatcatatctcaagttttaaaaatcatttggacgtcaaaccaaagccattagaaagctaacaaaattatctacaactttcatgtttacacca 22367105  T
Q  433 aagaccaatt 442  Q
    ||| ||||||    
T  22367104 aagtccaatt 22367095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 333 - 442
Target Start/End: Original strand, 35581340 - 35581449
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacct 432  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||  | ||||||||| || |||||||||||||    || ||| ||||||| ||||||||||     
T  35581340 agtaatttgatcataactcgagttctaaaaatcatttggacctgaaaccaacgccattagaaagctaacaaaattatctaaaactttcatgtttacacca 35581439  T
Q  433 aagaccaatt 442  Q
    ||| ||||||    
T  35581440 aaggccaatt 35581449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 333 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 36990748 - 36990639
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacct 432  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||  | ||||||||| || |||||||||||||    || ||| ||||||| ||||||||||     
T  36990748 agtaatttgatcataactcgagttctaaaaatcatttggacctgaaaccaacgccattagaaagctaacaaaattatctaaaactttcatgtttacacca 36990649  T
Q  433 aagaccaatt 442  Q
    ||| ||||||    
T  36990648 aaggccaatt 36990639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 230 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 21399968 - 21399896
Alignment:
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatc 302  Q
    ||||||| | |||||||| ||||||||| ||| ||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  21399968 catataataattcatcaaccatgaacaacatcatattcattaacatatacattcatataataattcatcaatc 21399896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 333 - 401
Target Start/End: Original strand, 23511127 - 23511195
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaac 401  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| | || || |||||||||    
T  23511127 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggatgtcaaaccaaagccattaaaaagctaac 23511195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 17517308 - 17517193
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 128  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| | || || | ||||  ||||  ||||| | ||||||| ||||||||  |||| ||||||    
T  17517308 atcaacttagactgactcatgcaacttagtttaataacaatagcagcataggcagattacatcaacagcaagacataaaaatatcaatcgcaattcaaca 17517209  T
Q  129 acatctcaattattca 144  Q
    |||||| || ||||||    
T  17517208 acatcttaaatattca 17517193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 23 - 77
Target Start/End: Original strand, 19668905 - 19668960
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacaacaaca 77  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  19668905 catcatcatcaacttagaccgactcttgcagctcagttaaataacaaacaacaaca 19668960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 21329604 - 21329565
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa 69  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21329604 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 21329565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 313 - 352
Target Start/End: Original strand, 39363869 - 39363908
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactca 352  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39363869 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactca 39363908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 19660949 - 19660903
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa 69  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19660949 catcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 19660903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 314 - 352
Target Start/End: Original strand, 38619922 - 38619960
Alignment:
Q  314 ttcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactca 352  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38619922 ttcattgtgacctacgtgcagtaattggaccataactca 38619960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 333 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 1168901 - 1168832
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaaca 402  Q
    |||||||||| |||||||||||| | | ||||||||| |||| |||||||| | || |||||||||||||    
T  1168901 agtaatttgatcataactcaagtccaaaaaatcatttggaagccaaaccaaagccattagaaagctaaca 1168832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 333 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 11212803 - 11212734
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaaca 402  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||| | ||  ||||||||||||    
T  11212803 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggacgttaaaccaaagccataagaaagctaaca 11212734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 333 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 18778715 - 18778606
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacct 432  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||| || || ||||||| | || |||||| ||||||    || ||||||||||| ||||||||||     
T  18778715 agtaatttaatcatatctcaagttctaaaaatcatttggacgtaaaaccaaagccattagaaatctaacaaaattatctacaactttcatgtttacacca 18778616  T
Q  433 aagaccaatt 442  Q
    ||| ||||||    
T  18778615 aagtccaatt 18778606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 333 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 21074318 - 21074249
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaaca 402  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||| | || |||||||||||||    
T  21074318 agtaatttaatcatatctcaagttctaaaaatcatttggacgtcaaaccaatgccattagaaagctaaca 21074249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 23535691 - 23535647
Alignment:
Q  25 tcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa 69  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  23535691 tcatcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaaataacaa 23535647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 392 - 431
Target Start/End: Original strand, 22755231 - 22755270
Alignment:
Q  392 gaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacc 431  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  22755231 gaaagctaacatccatatctacaactttcatgtttacacc 22755270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 263 - 306
Target Start/End: Original strand, 24067282 - 24067325
Alignment:
Q  263 tattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgt 306  Q
    |||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  24067282 tattcataaacatatacattcatataataattcatcaatcatgt 24067325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 333 - 431
Target Start/End: Original strand, 19499428 - 19499526
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacc 431  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||| || |||||| || |||||||||| |  | |||||||||||||    || ||||||||||| ||||||||||    
T  19499428 agtaatttaatcatatctcaagttctaaaactcatttggacgtcaaaccaaagctattagaaagctaacaaaattatctacaactttcatgtttacacc 19499526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 227 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 20901929 - 20901851
Alignment:
Q  227 atacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatg 305  Q
    |||||||||  | |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||  | |||||||||||||    
T  20901929 atacatatactaattcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatataacacttcatcaatcatg 20901851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 377 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 23280347 - 23280293
Alignment:
Q  377 aaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacc 431  Q
    |||||||||||||   |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||    
T  23280347 aaaccaacggcaaataaaagctaacatcaatatctacaacttttgtgtttacacc 23280293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 333 - 403
Target Start/End: Original strand, 32950213 - 32950283
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacat 403  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||| |||| |||| || |||||||||| | || ||||||||||||||    
T  32950213 agtaatttgatcataactcacattctaaaaattatttggacgtcaaaccaaagccattagaaagctaacat 32950283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 333 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 35791834 - 35791736
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacc 431  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||| |||| ||||  | |||||||||| | || |||||||||||||    || ||||||||||| ||||||||||    
T  35791834 agtaatttaatcatatctcaagttctaaaaattatttgaacgtcaaaccaaagtcattagaaagctaacaaaattatctacaactttcatgtttacacc 35791736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 35 - 69
Target Start/End: Original strand, 36314596 - 36314630
Alignment:
Q  35 cttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa 69  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36314596 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 36314630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 361 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 8833665 - 8833584
Alignment:
Q  361 aaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 442  Q
    |||||||||| |||||||||||| | || | |||||||||||    || ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  8833665 aaatcattttcaagtcaaaccaaagccactggaaagctaacacaattatctacaactttcatgtttacaccaaaggccaatt 8833584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 230 - 305
Target Start/End: Original strand, 18743852 - 18743924
Alignment:
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatg 305  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||   || ||||||  ||||||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  18743852 catataataattcatcaatcatgaaca---tcatattcattaacatatacattcatataatacttcatcaatcatg 18743924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 361 - 442
Target Start/End: Original strand, 19511781 - 19511862
Alignment:
Q  361 aaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 442  Q
    |||||||||| |||||||||||| | || | |||||||||||    || ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  19511781 aaatcattttaaagtcaaaccaaagccattggaaagctaacaaaattatctacaactttcatgtttacaccaaaggccaatt 19511862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 240 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 20198571 - 20198506
Alignment:
Q  240 ttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatg 305  Q
    ||||||||| |||||||| ||| ||||||  ||||||||| | |||||| || |||||||||||||    
T  20198571 ttcatcaattatgaacaacatcatattcattaacatataccttcatataatacttcatcaatcatg 20198506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 20806893 - 20806852
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaaca 71  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  20806893 atcaacatagaccgactcatgcagcttaattaaataacaaca 20806852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 361 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 37804531 - 37804450
Alignment:
Q  361 aaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 442  Q
    ||||||||||  |||||||| || | || | ||||||||||| |  || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  37804531 aaatcattttcgagtcaaactaaagccattggaaagctaacaacattatctacaactttcatgtttacaccaaagaccaatt 37804450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 375; Significance: 0; HSPs: 6)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 520
Target Start/End: Original strand, 136691 - 137179
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  136691 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 136790  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  136791 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca-tatata 136889  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  136890 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 136988  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  136989 tgcagtaatttgactataactctagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatacctacaactttcgtgtttaca 137088  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 520  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  137089 cttaagaccaattatgtactaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 137179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 520
Target Start/End: Original strand, 139160 - 139648
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  139160 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 139259  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  139260 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca-tatata 139358  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  139359 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 139457  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  139458 tgcagtaatttgactataactctagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatacctacaactttcgtgtttaca 139557  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 520  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  139558 cttaagaccaattatgtactaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 139648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 520
Target Start/End: Original strand, 144098 - 144586
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  144098 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 144197  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  144198 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca-tatata 144296  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  144297 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 144395  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  144396 tgcagtaatttgactataactctagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatacctacaactttcgtgtttaca 144495  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 520  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  144496 cttaagaccaattatgtactaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 144586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 371; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 520
Target Start/End: Original strand, 134222 - 134710
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  134222 atcaacatagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 134321  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  134322 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca-tatata 134420  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  134421 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 134519  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  134520 tgcagtaatttgactataactctagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatacctacaactttcgtgtttaca 134619  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 520  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  134620 cttaagaccaattatgtactaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 134710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 371; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 520
Target Start/End: Original strand, 141629 - 142117
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  141629 atcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 141728  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  141729 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca-tatata 141827  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  141828 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 141926  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  141927 tgcagtaatttgactataactctagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatacctacaactttcgtgtttaca 142026  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 520  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  142027 cttaagaccaattatgtactaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 142117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 69
Target Start/End: Original strand, 132665 - 132711
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa 69  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  132665 catcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagataaataacaa 132711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 367; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 367; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 512
Target Start/End: Original strand, 13403 - 13884
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13403 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 13502  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13503 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattacatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca-tatata 13601  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  13602 catgtaacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcataatcaattattcactgtgacctacg 13701  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  13702 ttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagataacatttatacctacaacttttgtgtttaca 13801  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13802 cctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 13884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 313 - 431
Target Start/End: Original strand, 13878 - 13996
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||   | | || ||||||| |||||||||| |   || | |||||||||||    || |||    
T  13878 attcactgtgacctacgttcagtaatttgaccataactcaaaaaccaaaactcattttcaagtcaaaccgattccactggaaagctaacacaattatcta 13977  T
Q  413 caactttcgtgtttacacc 431  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  13978 caactttcatgtttacacc 13996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 355; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 512
Target Start/End: Original strand, 40411 - 40891
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40411 atcaacttagaccgactcgtgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacaggatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 40510  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  40511 cgtctcaattattcacataaaattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacttca-tatata 40609  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||    
T  40610 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactctgacctacg 40708  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  40709 tgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatatctacaactttcgtgtttaca 40808  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40809 cctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttaatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 40891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 321 - 442
Target Start/End: Original strand, 37848 - 37968
Alignment:
Q  321 tgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttc 420  Q
    ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | || | ||||||||||||   || ||| |||||||    
T  37848 tgacctatgtgtagtaatttgatcataactcaagttcta-aaatcatttggaagtcaaaccaaagccatttgaaagctaacataattatctaaaactttc 37946  T
Q  421 gtgtttacacctaagaccaatt 442  Q
     |||||||||| ||| ||||||    
T  37947 atgtttacaccaaaggccaatt 37968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 313 - 431
Target Start/End: Original strand, 40885 - 41003
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |   |||||||||| |||||||||| | | || |  ||||||||||    || |||    
T  40885 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaaaaaccgaaaatcattttcaagtcaaaccgatgccactgtaaagctaacacaattatcta 40984  T
Q  413 caactttcgtgtttacacc 431  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  40985 caactttcatgtttacacc 41003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 313; Significance: 1e-176; HSPs: 6)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 30 - 512
Target Start/End: Original strand, 501095 - 501556
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  501095 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcaatatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 501194  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||    
T  501195 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatagtaatcaacatcttaaaacat-tatatata 501293  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                   |||||||||||| |||||||||||    
T  501294 catataacacatcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacata-------------------ttcaattattcactgtgacctacg 501374  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  501375 tgcagtaatttgatcataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatctat-cctacaactttcgtgtttaca 501473  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    | ||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  501474 cataagaccaattctgtaacaatcaatatcacttttcatttcaaattcgcacaatgttgtgctgaaattcataaaaattcact 501556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 313 - 477
Target Start/End: Original strand, 501550 - 501714
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  501550 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacatcagaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 501649  T
Q  413 caactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 477  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |  ||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  501650 caactttcgtgtttacacctaagaccagttcttgacctatcaataccagatttcatttcaaattc 501714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 30 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 85731 - 85562
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaa-ca 128  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  85731 atcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaatca 85632  T
Q  129 acatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 198  Q
    || ||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  85631 acgtctgaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaat 85562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 23 - 137
Target Start/End: Original strand, 160691 - 160805
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa-caacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgca 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| | ||||||| | ||| ||  |||| |||| |||||||||||||    
T  160691 catcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcaaatgca 160789  T
Q  121 agtcaacaacatctcaa 137  Q
    | |||||||||| ||||    
T  160790 a-tcaacaacatgtcaa 160805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #5
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 323 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 139697 - 139589
Alignment:
Q  323 acctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgt 422  Q
    |||||| || |||| ||| ||||||||| ||  |||| ||||||| | ||  ||||||||| | || |||||||||||| | ||||||||| |||||| |    
T  139697 acctacctgtagtattttcaccataactaaaaatctaaaaatcatatggagctcaaaccaaagccattagaaagctaactttcatacctacgactttcat 139598  T
Q  423 gtttacacc 431  Q
    |||||||||    
T  139597 gtttacacc 139589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #6
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 69
Target Start/End: Original strand, 173294 - 173338
Alignment:
Q  25 tcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa 69  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  173294 tcatcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaaataacaa 173338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0695 (Bit Score: 287; Significance: 1e-160; HSPs: 1)
Name: scaffold0695
Description:

Target: scaffold0695; HSP #1
Raw Score: 287; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 142 - 520
Target Start/End: Original strand, 6070 - 6446
Alignment:
Q  142 tcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatatacatataaaactt 241  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  6070 tcacatataattcaagtaatgcatatgcaattaaatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca-tatatacatataacactt 6168  T
Q  242 catcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacgtgcagtaatttg 341  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6169 catcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtgcagtaatttg 6267  T
Q  342 accataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaat 441  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6268 actataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacattcatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaat 6367  T
Q  442 tatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 520  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6368 tctgtaccaatgaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcattaagacctc 6446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 279; Significance: 1e-156; HSPs: 2)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 30 - 388
Target Start/End: Original strand, 10784 - 11140
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10784 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 10883  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10884 cgtctcaattattcacatataatttaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatc-atatata 10982  T
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||     
T  10983 catataacacttcatcaatcatggacaatatcatattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgttacctaca 11081  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggca 388  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11082 tgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggca 11140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 445 - 520
Target Start/End: Original strand, 1 - 76
Alignment:
Q  445 gtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 520  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1 gtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 76  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422 (Bit Score: 267; Significance: 1e-148; HSPs: 1)
Name: scaffold0422
Description:

Target: scaffold0422; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 182 - 520
Target Start/End: Original strand, 3186 - 3523
Alignment:
Q  182 atataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatatacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacat 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3186 atataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatca-tatctacatataacacttcatcaatcattgacaatatcgtattcacaaacatatacat 3284  T
Q  282 acatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaacc 381  Q
    ||||||| |||||||||||||||   ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3285 acatatattaattcatcaatcataaacaattcttcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaacc 3384  T
Q  382 aacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagac 481  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3385 aacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacaactaagaacaattatgtaacaatcaataccagttttcatttcaaattctgac 3484  T
Q  482 aaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 520  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3485 aaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 3523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 247; Significance: 1e-137; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 30 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 38809 - 38361
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa-caacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 127  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || ||||| || |||||| ||||| ||  |||| |||| |||||||||||||||||| |    
T  38809 atcaacttagacctactcatgcaccttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatc 38711  T
Q  128 aacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa-caacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatat 226  Q
    || ||||||| |||| | |||| ||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  38710 aatatctcaaatatttatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatca-tat 38612  T
Q  227 atacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacct 326  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||      
T  38611 atacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcataatcaattattcaatatgacaa 38512  T
Q  327 acgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgttt 426  Q
    || | ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38511 acatacagtaatttgaacataactcaaattctataaatcattttgaagtcaaaccaacgacattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgttt 38412  T
Q  427 acacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 477  Q
    |  ||||||| ||||| | |||  |||||||| | |||| |||||||||||    
T  38411 agccctaagatcaattctttacggatcaatactaatttttatttcaaattc 38361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 4)
Name: scaffold0741
Description:

Target: scaffold0741; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 182 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 4304 - 3973
Alignment:
Q  182 atataacaacatcaaatggtaatcaacatct--taaaacatcaatatatacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatac 279  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||   | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  4304 atataacaacatcaaatgataatcaacatcaacttaaacatca-tatatacatataacacttcatcaatcatggacaatataatattcacaaacatatac 4206  T
Q  280 atacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaa 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4205 atacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacccacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaa 4106  T
Q  380 ccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcag 479  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4105 ccaacgacattagaaagctaacatccatacctacacctttcatgtttacacctatgaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcgg 4006  T
Q  480 acaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4005 acaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 3973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 313 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 3979 - 3784
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||  ||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||||    
T  3979 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgatcataactcaagtttcataaatcgttttgacatcagaccaacggaattagaaagctaacatcaataccta 3880  T
Q  413 caactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaatt 508  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3879 caactttcgtgtttccacctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaatt 3784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 319 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 3780 - 3588
Alignment:
Q  319 tgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactt 418  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3780 tgtgacctacgttcagtaatttgagcataactcaagttacataaatcgttttgacctcataccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactt 3681  T
Q  419 tcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcac 511  Q
    || |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  3680 tcatgtttacagctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaacttgtgttgaaattcataaaaattcac 3588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 320 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 3586 - 3541
Alignment:
Q  320 gtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatc 365  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3586 gtgacctacgtgcagtattttgaccataactcaagttctataaatc 3541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 4)
Name: scaffold0747
Description:

Target: scaffold0747; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 230 - 519
Target Start/End: Original strand, 799 - 1088
Alignment:
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||    
T  799 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatagtattcacaaacatatacatacatatacaaattcatcaatcatattcaattattcactatgacctacg 898  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  899 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaataattttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttact 998  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacct 519  Q
    |||||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  999 cctaagacgaatgctgtaccaatcaataccagtttttatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactatgacct 1088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 321 - 462
Target Start/End: Original strand, 1083 - 1224
Alignment:
Q  321 tgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttc 420  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  1083 tgacctgcgtgtagtaatttgaccataactcaagttctataaatctttttgacatcagaccaacggaattagaaagctaacatccatacctacaactttt 1182  T
Q  421 gtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagt 462  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1183 gtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagt 1224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 343 - 477
Target Start/End: Original strand, 1225 - 1358
Alignment:
Q  343 ccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 442  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| || |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1225 ccataactcaagttctataaatcgtttagacgtcagaccaacggca-tagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 1323  T
Q  443 atgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 477  Q
     || ||| |||||||  || |||||||||||||||    
T  1324 ctggacctatcaatatgagatttcatttcaaattc 1358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747; HSP #4
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 182 - 304
Target Start/End: Original strand, 645 - 767
Alignment:
Q  182 atataacaacatcaaatggtaatcaacatct--taaaacatcaatatatacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatac 279  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||   | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  645 atataacaacatcaaatgataatcaacatcaacttaaacatca-tatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcgc-aacatatac 742  T
Q  280 atacatatactaattcatcaatcat 304  Q
    ||||||||||||||| |||||||||    
T  743 atacatatactaattaatcaatcat 767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 5)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 230 - 512
Target Start/End: Original strand, 10001 - 10283
Alignment:
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||     
T  10001 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacacacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctaca 10100  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10101 tgaaataatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 10200  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10201 cctaagaccaacactgtaccaatcaatactagttttcatttcaaattcagtcaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 10283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 313 - 510
Target Start/End: Original strand, 10277 - 10474
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  10277 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgacaataactcaagttctataaatcgttttgatgtcagaccaacggcattagaaatctaacatccataccta 10376  T
Q  413 caactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattca 510  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10377 caactttcgtgttgacacataagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcattttaaattcagataaagttgtgctgaaattcacaaaaattca 10474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 313 - 476
Target Start/End: Original strand, 10470 - 10633
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  10470 attcattgtgacctacatgcagtaatttgaccataacgcaagttctataaatctttttgacgtcagaccaacggtattagaaagctaacatccataccta 10569  T
Q  413 caactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaatt 476  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  10570 caactttcgtgtttacacctaagaccaattatggacctatcaataccagatttcagttcaaatt 10633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 271 - 304
Target Start/End: Original strand, 9936 - 9969
Alignment:
Q  271 aacatatacatacatatactaattcatcaatcat 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9936 aacatatacatacatatactaattcatcaatcat 9969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 227 - 305
Target Start/End: Original strand, 9945 - 10023
Alignment:
Q  227 atacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatg 305  Q
    |||||||||  | |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||  | |||||||||||||    
T  9945 atacatatactaattcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatataacacttcatcaatcatg 10023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 2)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 182 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 6937 - 6606
Alignment:
Q  182 atataacaacatcaaatggtaatcaacatct--taaaacatcaatatatacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatac 279  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||   | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  6937 atataacaacattaaatgatactcaacatcaacttaaacatca-tatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatagtattcacaaacatatac 6839  T
Q  280 atacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaa 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  |    
T  6838 atacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtgtagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcgga 6739  T
Q  380 ccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcag 479  Q
    ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  6738 ccaacggcattggaaatctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattctgtaccaatcaataccaattttcatttcaaattcgg 6639  T
Q  480 acaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6638 acaaagttgtgctgaaattcattaaaattcact 6606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 313 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 6612 - 6448
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  6612 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgacgtcagaccaacggcattagaaaactaacatccataccta 6513  T
Q  413 caactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 477  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| || ||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  6512 caactttcgtgtttacagctaagaccaattctggacctatcaataccacatttcatttcaaattc 6448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1792 (Bit Score: 220; Significance: 1e-120; HSPs: 4)
Name: scaffold1792
Description:

Target: scaffold1792; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 229 - 512
Target Start/End: Original strand, 416 - 699
Alignment:
Q  229 acatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctac 328  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  416 acatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacttacatatactaattcatcaatcatattcaattattcattgtgacctac 515  T
Q  329 gtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttac 428  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  516 gtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatctatacctacaacttttgtgtttac 615  T
Q  429 acctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    |||| |||| |||| | || |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  616 accttagactaattctatatcaataaataccagttttcatttcaaatttggacaaagttgtgctgaaattcatacaaattcact 699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1792; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 313 - 477
Target Start/End: Original strand, 853 - 1017
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  853 attcactgtgacctacgtgcagtaatatgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaacggcattagaaagctaacatccatatcta 952  T
Q  413 caactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 477  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  953 caacttttgtgtttacacctaagaccaattttgtaccaatcaataccagatttcatttcaaattc 1017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1792; HSP #3
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 435 - 512
Target Start/End: Original strand, 782 - 859
Alignment:
Q  435 gaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  782 gaccaattttgtaccaatcaataccagatttcatttcaaattcggaaaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1792; HSP #4
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 313 - 399
Target Start/End: Original strand, 693 - 779
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagcta 399  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| || ||||||||||    
T  693 attcactgtgacctacatgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaacgacattagaaagcta 779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 3)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 230 - 512
Target Start/End: Original strand, 30229 - 30511
Alignment:
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  30229 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 30328  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  30329 tgcagtaatttgaccataactcaagtactacaaatccttttgaagtgaaaccaacggtattagaaagctaacatccatacctacaactttaatgtttaca 30428  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30429 ccgaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaaatcggacaaagttgtgttgaaattcataaaaattcact 30511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 33 - 303
Target Start/End: Original strand, 29946 - 30196
Alignment:
Q  33 aacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacat 132  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| |    
T  29946 aacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaagtgtaagtcaacaacgt 30045  T
Q  133 ctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatatacat 232  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||         ||||           ||||||||||    
T  30046 ctcaattattcacatataattcaaataattcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaat---------catc-----------atatatacat 30125  T
Q  233 ataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatca 303  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30126 ataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaagcatatacatacatatactaattcatcaatca 30196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #3
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 313 - 477
Target Start/End: Original strand, 30505 - 30669
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||| ||||| |||| | |||||||||||||||||||||    
T  30505 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactaaagttttataaatcgttttgacgtcacaccaatggcattggaaagctaacatccataccta 30604  T
Q  413 caactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 477  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30605 caactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 30669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 3)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 230 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 476 - 229
Alignment:
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacg 329  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  476 catataacactttatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcactgtgacctacg 377  T
Q  330 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  376 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatctttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctataactttcttgtttaca 277  T
Q  430 cctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 477  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  276 cctaagaccatttatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 30 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 12400 - 12195
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12400 atcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagaatacaaaaacagcatgacaaaataatatcaaatgcaagtcaacaa 12301  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 229  Q
    | |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12300 cgtctcaattattcacatttaattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatc-atatata 12202  T
Q  230 catataa 236  Q
    |||||||    
T  12201 catataa 12195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 230 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 582 - 508
Alignment:
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcat 304  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  582 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcat 508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 2)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 241 - 512
Target Start/End: Original strand, 6682 - 6943
Alignment:
Q  241 tcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacgtgcagtaattt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  6682 tcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacat----------atactaattcatcaatcatattcaattattcactatgacctacgtgcagtaattt 6771  T
Q  341 gaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaa 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6772 gaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaa 6871  T
Q  441 ttatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6872 ttctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 6943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 313 - 477
Target Start/End: Original strand, 6937 - 7101
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6937 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgacgtcataccaacggcattagaaagctaacatccataccta 7036  T
Q  413 caactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 477  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  7037 caactttcgtgtttacacctaagaccaattctgtaccaatcaatagcaattttcatttcatattc 7101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 5)
Name: scaffold0306
Description:

Target: scaffold0306; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 182 - 512
Target Start/End: Original strand, 15083 - 15404
Alignment:
Q  182 atataacaacatcaaatggtaatcaacatct--taaaacatcaatatatacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatac 279  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||   | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  15083 atataacaacatcaaatgataatcaacatcaacttaaacatca-tatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatagtattcacaaacatataa 15181  T
Q  280 atacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaa 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |    
T  15182 atacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactatgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcaga 15281  T
Q  380 ccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcag 479  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||          ||||  ||||||||||||||||||||||      
T  15282 ccagcggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtggttacacctaagacca----------aatctgtaccagttttcatttcaaattcga 15371  T
Q  480 acaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15372 acaaagttgtgctgaaattcataaacattcact 15404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 271 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 11251 - 11010
Alignment:
Q  271 aacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcatttt 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  11251 aacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtgtagtaatttgaccataactcaagtactataaatcgtttt 11152  T
Q  371 gaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcattt 470  Q
    || |||  |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  11151 gacgtcggaccaacggcattggaaatctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattctgtaccaatcaataccaattttcattt 11052  T
Q  471 caaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  11051 caaattcggacaaagttgtgctgaaattcaggaaaattcact 11010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306; HSP #3
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 313 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 11016 - 10852
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  11016 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgacgtcagaccaacggcattagaaaactaacatccataccta 10917  T
Q  413 caactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 477  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| || ||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  10916 caactttcgtgtttacagctaagaccaattctggacctatcaataccacatttcatttcaaattc 10852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306; HSP #4
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 313 - 477
Target Start/End: Original strand, 15398 - 15561
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  15398 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaattgttttgatgtcagaccaacgacattagaaagctaacgtccataccta 15497  T
Q  413 caactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 477  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| || ||| || |||||||| |||||||||||||||    
T  15498 caactttcgtgtttaca-ctaagaccaattctggacctattaataccagatttcatttcaaattc 15561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 361 - 442
Target Start/End: Original strand, 4628 - 4709
Alignment:
Q  361 aaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 442  Q
    |||||||||| |||||||||||| | || | |||||||||||    || ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  4628 aaatcattttcaagtcaaaccaaagccactggaaagctaacacaattatctacaactttcatgtttacaccaaaggccaatt 4709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 193; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 286 - 518
Target Start/End: Original strand, 68227 - 68459
Alignment:
Q  286 atactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacg 385  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  68227 atactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtgtagtaatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaatg 68326  T
Q  386 gcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaag 485  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  68327 gcactagaaagctaacatccatacatacaactttcgtgtttacacataagaccaattttgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaag 68426  T
Q  486 ttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacc 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  68427 ttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacc 68459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 4)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 277 - 512
Target Start/End: Original strand, 7996 - 8231
Alignment:
Q  277 tacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtc 376  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  7996 tacatacatatattaattcatcaatcatattcaattattcactatgacctacgtgcagtaatttgaccataattcaaattctataaatccttttgaagtc 8095  T
Q  377 aaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaatt 476  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8096 aaaccaacggaattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattctgtactaatcaataccagttttcatttcaaatt 8195  T
Q  477 cagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8196 cagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 8231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 313 - 512
Target Start/End: Original strand, 8225 - 8424
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||| |||    
T  8225 attcactgtgacctacgtgtagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcaaaccaaggggattagaaagctaacatccatatcta 8324  T
Q  413 caactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  8325 caacttttgtgtttacacctaagaccagttatgtaccaatcaataccagttttcatttcacattcggacaaagttgtgctgaaaatcataaaaatgcact 8424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #3
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 319 - 477
Target Start/End: Original strand, 8424 - 8582
Alignment:
Q  319 tgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactt 418  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8424 tgtgacctacgtgcagtaatttcaccataactcaagttgtataaatctttttgacgtcataccaatggaattagaaagctaacatccatatctacaactt 8523  T
Q  419 tcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 477  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8524 ttgtgtttacacgtaagaccaattatgtaccaatcaataccagtttccatttcaaattc 8582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 177
Target Start/End: Original strand, 5654 - 5803
Alignment:
Q  27 atcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtc 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||| | |||||||  |||| ||  |||| |||| |||||| ||||||| ||    
T  5654 atcatcaacttagaccgactcatgcagcttagtaaaataacaaacagcaacataggcagtat-gaaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatc 5752  T
Q  125 aacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatat 177  Q
    ||||||||||||| |||  |||||  |||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  5753 aacaacatctcaaatatcaacata--attcatataatgtatatacaattatat 5803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 188; Significance: 1e-101; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 182 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 53873 - 53612
Alignment:
Q  182 atataacaacatcaaatggtaatcaacatct--taaaacatcaatatatacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatac 279  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  53873 atataacaacatcaaatgataatcaacatctacttaaacatca-tatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatataatattcacaaacatatac 53775  T
Q  280 atacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaa 379  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  53774 atacatatactaatttatcaatcatattcaattattcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccatatctcaagttctataaatccctttgacgtcaaa 53675  T
Q  380 ccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 442  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  53674 ccaatggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacagctaagaccaatt 53612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 30 - 161
Target Start/End: Original strand, 116441 - 116571
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  116441 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaacagtatacaaaa-cagcatgacataatcatatcaaatgcaagtcaacaa 116539  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaat 161  Q
    |||||||| ||| ||   || |||||||||||    
T  116540 catctcaaatatacattcataattcaagtaat 116571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 98 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 129007 - 128907
Alignment:
Q  98 atgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaata-taacaacatcaa 196  Q
    |||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||  | ||| |||| ||||| |||||| ||||| || ||||||||| || ||||||||||||    
T  129007 atgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaaca-tcatatataattcatgtaatggatatacaaatatatcacattattaacaacatcaa 128909  T
Q  197 at 198  Q
    ||    
T  128908 at 128907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 182; Significance: 5e-98; HSPs: 3)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 283 - 512
Target Start/End: Original strand, 43002 - 43231
Alignment:
Q  283 catatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaacca 382  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  43002 catatactaattcatcaatcatattcagttattcactgtgacctacgtgcactaatttgactataactcaagttctataaacccttttgaagtcaaacca 43101  T
Q  383 acggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagaca 482  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43102 acggcattagaaagctaacattcatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaaaaatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggaca 43201  T
Q  483 aagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43202 aagttgtgctgaaattcataaaaattcact 43231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 238 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 13571 - 13379
Alignment:
Q  238 acttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacgtgcagtaa 337  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13571 acttcatcaatcatggacaatatcatattcacaaacatacacatacatatactaattcatcaatcataatcaattattcattgtgacctacgttcagtaa 13472  T
Q  338 tttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacac 430  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13471 tttgaccataactcaagttttataaatccttttgaagtcaaaccaacggcactagtaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacac 13379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 313 - 477
Target Start/End: Original strand, 43225 - 43389
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  43225 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaacgacattagaaagctaacattcataccta 43324  T
Q  413 caactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 477  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  43325 caacttttgtgtttacacctaagaccaattcttgacctatcaataccagatttcatttcaaattc 43389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1427 (Bit Score: 178; Significance: 1e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold1427
Description:

Target: scaffold1427; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 182 - 423
Target Start/End: Original strand, 1591 - 1831
Alignment:
Q  182 atataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatatacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacat 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  1591 atataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatca-tatatacatataacacttcatcaatcattgacaatatcgtattcacaaatatataaat 1689  T
Q  282 acatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaacc 381  Q
    ||||||| |||||||||||||||   ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1690 acatatattaattcatcaatcataaacaattcttcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaacc 1789  T
Q  382 aacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtg 423  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1790 aacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtg 1831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200 (Bit Score: 167; Significance: 5e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0200
Description:

Target: scaffold0200; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 314 - 520
Target Start/End: Original strand, 17947 - 18153
Alignment:
Q  314 ttcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctac 413  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || | ||||||||||||||||||||||||    
T  17947 ttcactgtgacctatgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgacgtcagaccaatggtattagaaagctaacatccatacctac 18046  T
Q  414 aactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcacta 513  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18047 aacttttgtgtttacacctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattctgacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcacta 18146  T
Q  514 agacctc 520  Q
    |||||||    
T  18147 agacctc 18153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 165; Significance: 7e-88; HSPs: 3)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 7e-88
Query Start/End: Original strand, 320 - 520
Target Start/End: Original strand, 33471 - 33671
Alignment:
Q  320 gtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaacttt 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33471 gtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgtttttacgtcagaccaacgacattagaaatctaacatccatacctacaacttt 33570  T
Q  420 cgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacct 519  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33571 tgtgtttacacctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacct 33670  T
Q  520 c 520  Q
    |    
T  33671 c 33671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 23 - 133
Target Start/End: Original strand, 12946 - 13057
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgca 120  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| ||| |||| |||| |||||| ||||||    
T  12946 catcatcttcaacttagaccgactcatgctgctcagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcagcatgatataacaatatcgaatgca 13044  T
Q  121 agtcaacaacatc 133  Q
    ||||| |||||||    
T  13045 agtcatcaacatc 13057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 18265 - 18176
Alignment:
Q  108 aatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaat-ataacaacatcaaa 197  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  | ||| |||| ||||| |||||||||||| | |||||||||| | ||||||||||||||    
T  18265 aatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaaca-tcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattaataacaacatcaaa 18176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 159; Significance: 3e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 314 - 520
Target Start/End: Original strand, 31497 - 31703
Alignment:
Q  314 ttcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctac 413  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  31497 ttcactgtgacctacgtgcagtaatttaaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaatggcattagaaagctaacattaatacctac 31596  T
Q  414 aactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcacta 513  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31597 aactttcgtgtttacacctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgatgaaattcataaaaattcacta 31696  T
Q  514 agacctc 520  Q
    |||||||    
T  31697 agacctc 31703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0436 (Bit Score: 152; Significance: 4e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0436
Description:

Target: scaffold0436; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 313 - 520
Target Start/End: Original strand, 8311 - 8518
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  8311 attcactgtgaccaacgtgcagtaattttaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaatagcattagaaagctaacatccataccta 8410  T
Q  413 caactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8411 caactttcatgtttacacctaagagcaattctataccaatcaatatcagttttcatttcaaattcggacaaagctgtgctgaaattcataaaaattcact 8510  T
Q  513 aagacctc 520  Q
    ||||||||    
T  8511 aagacctc 8518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 147; Significance: 4e-77; HSPs: 4)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 30 - 304
Target Start/End: Original strand, 9760 - 10015
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9760 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaagtgcaagtcaacaa 9859  T
Q  130 catctcaatta-ttcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatat 228  Q
    | ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||                     ||||||    
T  9860 cgtctcaattatttcacatataattcaaataatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaatcgt--------------------catatat 9939  T
Q  229 acatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcat 304  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9940 acatataacacttcatcaatcatgtacaatatcgtattcacaaacttatacatacatatactaactcatcaatcat 10015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 23 - 181
Target Start/End: Original strand, 32949 - 33107
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaa 121  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | ||||| || |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32949 catcttcatcaagttagaccgactcatgcagcttaattaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaatgcaa 33047  T
Q  122 gtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcaca 181  Q
    || |||||||||| || ||||||  |||  ||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  33048 gttaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcaca 33107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 181
Target Start/End: Original strand, 38768 - 38926
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaa 121  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| | ||||| || |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38768 catcttcatcaacttagaccgagtcatgcagcttaattaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaatgcaa 38866  T
Q  122 gtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcaca 181  Q
     | |||||||||| || ||||||  |||  ||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  38867 ataaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcaca 38926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 241 - 303
Target Start/End: Original strand, 10005 - 10067
Alignment:
Q  241 tcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatca 303  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10005 tcatcaatcataaacaacatcgtactcataaacatatacattcatatactaattcatcaatca 10067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 147; Significance: 4e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 314 - 520
Target Start/End: Original strand, 39626 - 39832
Alignment:
Q  314 ttcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctac 413  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  39626 ttcactgtgacctacgtgtaataatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgttagaccaatggcattagaaagctaacatccataactac 39725  T
Q  414 aactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcacta 513  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39726 aacttttgtgtttacacctaagaccaattctgtaccaatcaatatcagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaagttcacta 39825  T
Q  514 agacctc 520  Q
    |||||||    
T  39826 agacctc 39832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0711 (Bit Score: 143; Significance: 1e-74; HSPs: 4)
Name: scaffold0711
Description:

Target: scaffold0711; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 314 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 7558 - 7361
Alignment:
Q  314 ttcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctac 413  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  7558 ttcactgtgacctacgtgtagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgatgtcagaccaacggtattagaaagctaacatccatacctac 7459  T
Q  414 aactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7458 aacttttgtgtttacacccaagaccaattctgtaccaatcaataccag-tttcatttcaaattcgaacaatgttgtgctgaaattcataaaaattcact 7361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0711; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 313 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 7367 - 7168
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| |||| ||||||| || ||||| | ||||||  |||||||    
T  7367 attcactgtgacctacgtgcaataatttgaccataactcaagttttataaattgttttgacgtcagaccaacgacattagaaggataacatttataccta 7268  T
Q  413 caactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7267 caactttcgtgtttacacctaagacatattctttaccaatcaataccagattgcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaagtcact 7168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0711; HSP #3
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 319 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 7168 - 7079
Alignment:
Q  319 tgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccata 408  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | || | |||||||| |||||||||||||||||||    
T  7168 tgtgacctatgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacggcagagcaacggcattagaaagctaacatccata 7079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0711; HSP #4
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 444 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 7621 - 7553
Alignment:
Q  444 tgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7621 tgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaatttcact 7553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 142; Significance: 4e-74; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 30 - 211
Target Start/End: Original strand, 82083 - 82264
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  82083 atcaacttagaccgactcatgaagcttagttaaataacaacagcaacacagtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaaatcaacaa 82182  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatc 211  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  82183 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatcataatcaacatc 82264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 22776 - 22610
Alignment:
Q  31 tcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacaacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 128  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | ||| || |||||| | ||| ||  |||| |||| |||||| ||||||||||| ||    
T  22776 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcgacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatca 22678  T
Q  129 acatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaa 196  Q
    ||||||||| || ||| | || ||||| |||||| ||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  22677 acatctcaaata-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaa 22610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 141; Significance: 2e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 30 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 158601 - 158433
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  158601 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 158502  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 198  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  158501 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaat 158433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 31 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 340053 - 339905
Alignment:
Q  31 tcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  340053 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-acaacaacataggcagtatac-aaaacaacatgacataataatatcaaat-caagtcaacaa 339957  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcaca 181  Q
    |||||||| ||| ||   || ||||||||||||  ||||  |||||||||||    
T  339956 catctcaagtatacattcataattcaagtaatgtgtataacattatatcaca 339905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 140; Significance: 6e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 321 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 19950 - 19751
Alignment:
Q  321 tgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttc 420  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||| |||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19950 tgacctacgtgtagtaatttgacgataactcaagttatataattcgttttgacgtcagaccaatggcattagaaagctaacatccatacctacaactttt 19851  T
Q  421 gtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 520  Q
    | |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19850 gcgtttacacctaagaccaattctataccaatcaataccagttttcatttcaaattcggacaaagttttgctgaaattcataaaaattcactaagacctc 19751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 134; Significance: 2e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 30 - 211
Target Start/End: Original strand, 117 - 298
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  117 atcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaatagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaaatcaacaa 216  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatc 211  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  217 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatcataatcaacatc 298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 129; Significance: 2e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 30 - 198
Target Start/End: Original strand, 16795 - 16963
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16795 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagtagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 16894  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 198  Q
    | ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16895 cgtctcaattatttacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacatcatcaaat 16963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 128; Significance: 9e-66; HSPs: 3)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 325 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 37056 - 36869
Alignment:
Q  325 ctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgt 424  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37056 ctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatctttttgacgtcagaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgt 36957  T
Q  425 ttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    ||||| ||| ||| |||| | | ||||||||||  |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36956 ttacatctatgactaatttttttccaatcaatattagttttcatttcaaattttgataaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 36869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 313 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 36875 - 36749
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||  || ||||||| |||||||||||||||    
T  36875 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatctttttgacgtcagaccaacaacattagaaagttaacatccataccta 36776  T
Q  413 caactttcgtgtttacacctaagacca 439  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  36775 caactttcgtgtttacacctaagacca 36749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 464 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 37110 - 37061
Alignment:
Q  464 ttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcacta 513  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37110 ttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcacta 37061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1296 (Bit Score: 127; Significance: 4e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold1296
Description:

Target: scaffold1296; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 313 - 479
Target Start/End: Original strand, 1740 - 1906
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  1740 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacgacattagaaagctaacatccataccta 1839  T
Q  413 caactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcag 479  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1840 caactttcttgtttacacctaagaccaattctggacctatcaataccagatttcatttcaaattcag 1906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1296; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 400 - 512
Target Start/End: Original strand, 1634 - 1746
Alignment:
Q  400 acatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattc 499  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1634 acatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattttgtaccaatcaataccaattttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattc 1733  T
Q  500 ataaaaattcact 512  Q
    |||||||||||||    
T  1734 ataaaaattcact 1746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059 (Bit Score: 126; Significance: 1e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0059
Description:

Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 247 - 404
Target Start/End: Original strand, 57708 - 57865
Alignment:
Q  247 atcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccat 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  57708 atcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcactcatattcaagtattcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccat 57807  T
Q  347 aactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatc 404  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  57808 aactcaagttttataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatc 57865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 125; Significance: 5e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 30 - 198
Target Start/End: Original strand, 4308 - 4476
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  4308 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagtagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaaatcaacaa 4407  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 198  Q
    | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4408 cgtctcaattaatcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacatcatcaaat 4476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 125; Significance: 5e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 313 - 477
Target Start/End: Original strand, 18423 - 18587
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccataccta 412  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| | || |||||||||||||||||||||||    
T  18423 attcactgtgacctacgtgtagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaatgacattagaaagctaacatccataccta 18522  T
Q  413 caactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 477  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18523 caacttttgtgtttacacctaagaccaattctgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 18587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 435 - 512
Target Start/End: Original strand, 18352 - 18429
Alignment:
Q  435 gaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 512  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18352 gaccatttctgtaccaatcaatgccagttttcatttcaaattcggacaaagttgtgctgaaattcataaaaattcact 18429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 123; Significance: 9e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 30 - 211
Target Start/End: Original strand, 12075 - 12250
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||      || |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12075 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaa------cagcaacacagcagtatactaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 12168  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatc 211  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  12169 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaatcataatcaacatc 12250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 123; Significance: 9e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 30 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 1432 - 1250
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaa-ca 128  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1432 atcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaacaataacacatgagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaatca 1333  T
Q  129 acatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatc 211  Q
     | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  1332 tcgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaatcataatcaacatc 1250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 120; Significance: 5e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 35 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 79430 - 79267
Alignment:
Q  35 cttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatct 134  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  79430 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacgacagtatataaaaacagcatgacataataatttcaaatgcaagtcaacaacgtct 79331  T
Q  135 caattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 198  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  79330 caattattcacatataattcaagtaatgcatatacaagtatatcacaatataacaacatcaaat 79267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 23 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 17331 - 17170
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaa--cagaatgacataataatatcaaatgc 119  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  17331 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaaaacagcatgacataataatatcaaatgc 17232  T
Q  120 aagtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcaca 181  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||   || ||||||||||||| | ||  |||||||||||    
T  17231 aagtcaacaacatctcaagtatacattcataattcaagtaatgcgtttaacattatatcaca 17170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 120; Significance: 5e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 32 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 161239 - 161072
Alignment:
Q  32 caacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaa-caac 130  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  161239 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaatatcaacagcgacacagcagtatacaaaaacataatgacataataatatcaaatgcaagtcaatcaac 161140  T
Q  131 atctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 198  Q
    |||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  161139 atctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataacaatatcaaat 161072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 98 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 164674 - 164573
Alignment:
Q  98 atgacataataatatcaaatgcaagtcaa-caacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaa 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  164674 atgacataataatatcaaatgcaagtcaatcaacatctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaa 164575  T
Q  197 at 198  Q
    ||    
T  164574 at 164573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 118; Significance: 8e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 30 - 198
Target Start/End: Original strand, 4225 - 4393
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaa-ca 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4225 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacgacagcgacacagcagtatacaaaaccagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaatca 4324  T
Q  129 acatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 198  Q
    || |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4325 acgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatat-acaacatcaaat 4393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 116; Significance: 1e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 35 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 20524 - 20363
Alignment:
Q  35 cttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatct 134  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20524 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacatcagtatacaaaa-caacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtct 20426  T
Q  135 caattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 198  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20425 caattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-aacatcaaat 20363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 30 - 181
Target Start/End: Original strand, 128765 - 128916
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||| |  |  | | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  128765 atcaaattagaccaactcatgcaacttagttaaataacaaaagcaacaaaaaaaaaaaaaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 128864  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcaca 181  Q
    ||||| || ||||||  |||  ||||||||||| | |||  |||||||||||    
T  128865 catcttaaatattcaattatacttcaagtaatgtacataacattatatcaca 128916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 110; Significance: 5e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 30 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 2280 - 2111
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaa-ca 128  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  2280 atcaacttagaccgactcttgcagcttagttaaataacaacagcgacacaacagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaatta 2181  T
Q  129 acatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 198  Q
    || ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2180 acgtctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaat 2111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 34 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 18130 - 17964
Alignment:
Q  34 acttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa-caacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaaca 131  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| || ||||| | ||| ||| || || ||  |||| ||||||||||| || |||||| |||||||    
T  18130 acttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacatatgcattatgcacaa-catcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaaca 18032  T
Q  132 tctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaaat 198  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  18031 tctcaaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaat 17964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 100; Significance: 5e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 30 - 181
Target Start/End: Original strand, 22897 - 23048
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22897 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaccagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 22996  T
Q  130 catctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcaca 181  Q
    ||||| || ||||||  |||  ||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  22997 catcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcaca 23048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 91; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 28 - 181
Target Start/End: Original strand, 39489 - 39642
Alignment:
Q  28 tcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39489 tcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 39587  T
Q  127 caacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcaca 181  Q
    ||||||||||| ||| ||   || |||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  39588 caacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacataacattatatcaca 39642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 91; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 28 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 75323 - 75170
Alignment:
Q  28 tcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  75323 tcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 75225  T
Q  127 caacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcaca 181  Q
    ||||||||||| ||| ||   || |||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  75224 caacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacataacattatatcaca 75170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 88; Significance: 7e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 3264 - 3106
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaa 121  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  3264 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-caacatgacataataatatcaaatgcaa 3166  T
Q  122 gtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcaca 181  Q
    |||||||||||||||| ||| ||   || ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  3165 gtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcatataacattatatcaca 3106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 88; Significance: 7e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 181
Target Start/End: Original strand, 13218 - 13377
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaa 121  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  13218 catcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaa 13317  T
Q  122 gtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcaca 181  Q
     ||| |||||||| || |||||| ||||  |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  13318 ttcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcatataacattatatcaca 13377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 87; Significance: 3e-41; HSPs: 3)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 28 - 181
Target Start/End: Original strand, 4520 - 4673
Alignment:
Q  28 tcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4520 tcatcaacttagaccgactcatgcg-cttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatataaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 4618  T
Q  127 caacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcaca 181  Q
    ||||||||||| ||| ||   || ||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  4619 caacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcaca 4673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 28 - 181
Target Start/End: Original strand, 12102 - 12255
Alignment:
Q  28 tcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12102 tcatcaacttagaccgactcatgcg-cttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatataaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 12200  T
Q  127 caacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcaca 181  Q
    ||||||||||| ||| ||   || ||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  12201 caacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcaca 12255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 28 - 181
Target Start/End: Original strand, 22054 - 22207
Alignment:
Q  28 tcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22054 tcatcaacttagaccgactcatgcg-cttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatataaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 22152  T
Q  127 caacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcaca 181  Q
    ||||||||||| ||| ||   || ||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  22153 caacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcaca 22207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 87; Significance: 3e-41; HSPs: 3)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 227 - 365
Target Start/End: Original strand, 28048 - 28186
Alignment:
Q  227 atacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcattgtgacct 326  Q
    |||||||||  | |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  28048 atacatatactaattcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacct 28147  T
Q  327 acgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatc 365  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28148 acgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatc 28186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 188 - 304
Target Start/End: Original strand, 27958 - 28072
Alignment:
Q  188 caacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatatacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatat 287  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27958 caacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca-tatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacatacatat 28055  T
Q  288 actaattcatcaatcat 304  Q
    |||||||||||||||||    
T  28056 actaattcatcaatcat 28072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 23 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 15577 - 15420
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaa 121  Q
    |||| ||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||| | ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||| | |||    
T  15577 catcttcaacaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaagagcaacataggcagtatac-aaaacaacatgacataataatatcaatttcaa 15479  T
Q  122 gtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcaca 181  Q
     ||| |||||||| |  |||  | ||||  ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  15478 ttcatcaacatcttatgtataaaaatattcttcaagtaatgcataaat-attatatcaca 15420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 86; Significance: 1e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 187
Target Start/End: Original strand, 51920 - 52085
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaa 121  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  51920 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcaatatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaa 52019  T
Q  122 gtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa 187  Q
    ||||||| ||||| || ||||||  |||  ||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||    
T  52020 gtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacaacataa 52085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 168092 - 167948
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaa 121  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||    
T  168092 catcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaattgcaa 167993  T
Q  122 gtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcata 166  Q
     ||| |||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  167992 ttcatcaacatcttaaatattcaaatattattcaagtaatgcata 167948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 85; Significance: 4e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 1162 - 1018
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaa 121  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||    
T  1162 catcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaattgcaa 1063  T
Q  122 gtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcata 166  Q
     ||| |||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  1062 ttcatcaacatcttaaatattcaaatattattcaagtaatgcata 1018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 85; Significance: 4e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 30 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 44814 - 44682
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 128  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44814 atcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 44715  T
Q  129 acatctcaattattcacatatgattcaagtaat 161  Q
    ||||||||| ||| ||   || |||||||||||    
T  44714 acatctcaaatatacattcataattcaagtaat 44682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 23 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 26179 - 26020
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaa 121  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  26179 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgtaa 26080  T
Q  122 gtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcaca 181  Q
     |||||||| |||||| ||| ||   || ||||||||||||| | ||  |||||||||||    
T  26079 ttcaacaacgtctcaagtatacattcataattcaagtaatgcgtttaacattatatcaca 26020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 84; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 23 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 16714 - 16555
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaa 121  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  16714 catcttcatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacgaaaacagcatgacataataatatcaaatggaa 16615  T
Q  122 gtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcaca 181  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||   || ||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  16614 gtcaacagcatctcaagtatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcaca 16555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 84; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 23 - 181
Target Start/End: Original strand, 1858 - 2017
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaa 121  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  1858 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacatagacagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaa 1957  T
Q  122 gtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcaca 181  Q
     ||| |||||||| || |||||| ||||  ||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  1958 ttcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcaca 2017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 80; Significance: 4e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 23 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 3300 - 3141
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaa 121  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||    
T  3300 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgatataataatatcaaatgtaa 3201  T
Q  122 gtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcaca 181  Q
     ||||||||||||||| ||| ||   || ||||||||||||| | ||  |||||||||||    
T  3200 ttcaacaacatctcaagtatacattcataattcaagtaatgcgtttaacattatatcaca 3141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513 (Bit Score: 80; Significance: 4e-37; HSPs: 3)
Name: scaffold0513
Description:

Target: scaffold0513; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 230 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 10734 - 10647
Alignment:
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattca 317  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10734 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattca 10647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 182 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 10886 - 10766
Alignment:
Q  182 atataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatatacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacat 281  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  10886 atataacaacatcaaataatactcaacattttaaaacatca-tatatacatataacacttcatcaattatggacagtatcgtattcacaa-catatacat 10789  T
Q  282 acatatactaattcatcaatcat 304  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  10788 acatatactaattcatcaatcat 10766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 227 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 10790 - 10712
Alignment:
Q  227 atacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatg 305  Q
    |||||||||  | |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||  | |||||||||||||    
T  10790 atacatatactaattcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatataacacttcatcaatcatg 10712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 79; Significance: 2e-36; HSPs: 4)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 180
Target Start/End: Original strand, 16120 - 16278
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaa 121  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | || || ||||||||||||||||    
T  16120 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacagcaagatatcataatatcaaatgcaa 16219  T
Q  122 gtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcac 180  Q
    | ||||| |||||||| ||| ||   || | ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  16220 gccaacatcatctcaagtatacattcataactcaagtaatgcatataacattatatcac 16278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 23 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 33070 - 32913
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaa 121  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  33070 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaacagcaacacaggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaattgcaa 32972  T
Q  122 gtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcaca 181  Q
     |||||||||||| || ||||||  |||  ||| |||||||||||||  |||||| ||||    
T  32971 ttcaacaacatcttaaatattca-ttatacttcgagtaatgcatataacattataacaca 32913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 23 - 181
Target Start/End: Original strand, 45935 - 46092
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaa 121  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  45935 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaacagcaacacaggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaattgcaa 46033  T
Q  122 gtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcaca 181  Q
     |||||||||||| || ||||||  |||  ||| |||||||||||||  |||||| ||||    
T  46034 ttcaacaacatcttaaatattca-ttatacttcgagtaatgcatataacattataacaca 46092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 17443 - 17388
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacac 78  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||    
T  17443 catcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacac 17388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 23 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 6238 - 6076
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaaca-ca---gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatg 118  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||   | ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||    
T  6238 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacaacataggtagtatacaaaaacagcatgacatgataatatcaattg 6139  T
Q  119 caagtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcaca 181  Q
    ||| ||| |||||||| || |||||| ||||  ||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  6138 caattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcaca 6076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 4)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 23 - 134
Target Start/End: Original strand, 28421 - 28533
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaa 121  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  28421 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaa 28520  T
Q  122 gtcaacaacatct 134  Q
     ||||||||||||    
T  28521 ttcaacaacatct 28533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 69
Target Start/End: Original strand, 2004 - 2050
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa 69  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2004 catcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 2050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 69
Target Start/End: Original strand, 4559 - 4605
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa 69  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4559 catcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 4605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 69
Target Start/End: Original strand, 11299 - 11345
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa 69  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11299 catcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 11345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 321 - 477
Target Start/End: Original strand, 113317 - 113473
Alignment:
Q  321 tgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttc 420  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||||||||||| |    
T  113317 tgacctacgtttagtaatttgaccataactcaagttctaaaactcattttggagtcaaaccaacgtcattagaaatgtaacatccatacctacaacttcc 113416  T
Q  421 gtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 477  Q
     |||||||| | ||| |||| |  | ||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  113417 atgtttacatcaaaggccaaatccgcaccgatcaataccagtttttatttcaaattc 113473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 76; Significance: 1e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 31 - 196
Target Start/End: Original strand, 8481 - 8650
Alignment:
Q  31 tcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa-caacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 128  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||| ||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||    
T  8481 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaa-cagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatca 8579  T
Q  129 acatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatata--attatatcacaatat-aacaacatcaa 196  Q
    ||||||||| |||||| |||| |||||||||||| ||||| |  ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  8580 acatctcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaatattatatcacattataaacaacatcaa 8650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 23 - 177
Target Start/End: Original strand, 6542 - 6695
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgca 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| | ||||||| | ||| ||  |||| |||| |||||| ||||||    
T  6542 catcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 6640  T
Q  121 agtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatat 177  Q
    | ||||||||||||||| |||  |||||  |||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  6641 aatcaacaacatctcaaatatcaacata--attcatataatgtatatacaattatat 6695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 76; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 23 - 181
Target Start/End: Original strand, 4856 - 5015
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaa 121  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4856 catcttcaacaacttagaccgactcatgcagattagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaaatgcaa 4955  T
Q  122 gtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcaca 181  Q
     |||||||||||| || |||||| |||    |||||||||||||| |  |||||||||||    
T  4956 ttcaacaacatcttaagtattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcaca 5015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 76; Significance: 1e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 23 - 181
Target Start/End: Original strand, 3477 - 3636
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaa 121  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | | ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  3477 catcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataactaaagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaa 3576  T
Q  122 gtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcaca 181  Q
     ||| |||||||| || |||||| ||||  ||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  3577 ttcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcaaataacattatatcaca 3636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 34 - 181
Target Start/End: Original strand, 361 - 508
Alignment:
Q  34 acttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacat 132  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| |||| || ||||| |||||||||||| || |||||||||||||    
T  361 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaataacataggcagtatac-aaaatagcatgacgtaataatatcaattggaagtcaacaacat 459  T
Q  133 ctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcaca 181  Q
    || || |||||   |||  ||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  460 cttaaatattcgattatacttcaagtaatgcacataacattatatcaca 508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 73; Significance: 6e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 398 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 75689 - 75605
Alignment:
Q  398 taacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattcagaca 482  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  75689 taacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattttgtaccaatcaatactagttttcatttcaaattcggaca 75605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 34 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 24406 - 24257
Alignment:
Q  34 acttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaa-acagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaaca 131  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||| ||| |||||    
T  24406 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaacacagcatgacataaaaatatcaattgcaattcatcaaca 24307  T
Q  132 tctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcaca 181  Q
    ||| || |||||| ||||  ||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  24306 tcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcaca 24257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 23 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 8643 - 8472
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaag 122  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||     ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  8643 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacagcaacatag--gcagtat-caaaaacagcatgacataataatatcaattgcaag 8547  T
Q  123 tcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa-caacatcaa 196  Q
    |||||| ||||| || ||||||  |||  ||||||||||||| |||  |||||||||||| |||| |||||||||    
T  8546 tcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacaacataatcaacatcaa 8472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 71; Significance: 9e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 31 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 27855 - 27686
Alignment:
Q  31 tcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa-caacaacacagc-agtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 128  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||| ||  ||||| ||||| ||| |||| |||| ||||||||||| || ||||||    
T  27855 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggtagtatgcaaaa-cagcatgatataacaatatcaaatgtaaatcaaca 27757  T
Q  129 acatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa-caacatcaaat 198  Q
    |||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  27756 acatctcaaacattcacatataattctagtaatgcatatacaattatatcacattataaccaacatcaaat 27686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 71; Significance: 9e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 28 - 181
Target Start/End: Original strand, 25908 - 26061
Alignment:
Q  28 tcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 126  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25908 tcatcaacttagaccgactcatgaagcttagttaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaat-atcatgacataataatatcaaatgcaagtaaa 26006  T
Q  127 caacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcaca 181  Q
    ||||||||||| ||||||  |||  |||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  26007 caacatctcaaatattcaattatacttcaagtaatgcatttaacattatatcaca 26061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 181
Target Start/End: Original strand, 39865 - 40023
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaa 121  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||    
T  39865 catcttcatcaacttagaccaactcatgaagcttagttaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaat-atcatgacataataatatcaaatgcaa 39963  T
Q  122 gtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcaca 181  Q
    || ||||||||||||| ||||||  |||  |||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  39964 gtaaacaacatctcaaatattcaattatacttcaagtaatgcatttaacattatatcaca 40023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 70; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 80 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 3586 - 3485
Alignment:
Q  80 gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatca 179  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  3586 gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattatacactcataattcaagtaatgcgtataacattatatca 3487  T
Q  180 ca 181  Q
    ||    
T  3486 ca 3485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 70; Significance: 4e-31; HSPs: 5)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 182 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 15273 - 15151
Alignment:
Q  182 atataacaacatcaaatggtaatcaacatct--taaaacatcaatatatacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatac 279  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||   | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||    
T  15273 atataacaacatcaaatgataatcaacatcaacttaaacatca-tatatacatataacacttcatcaatcatggacaatattgtattcgcaa-catatac 15176  T
Q  280 atacatatactaattcatcaatcat 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  15175 atacatatactaattcatcaatcat 15151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 134
Target Start/End: Original strand, 7285 - 7383
Alignment:
Q  35 cttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacat 132  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| |||   |||| ||||| ||||||||| ||| ||| ||||||    
T  7285 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaacaac---atgaaataattatatcaaattcaattcatcaacat 7381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 230 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 15119 - 15070
Alignment:
Q  230 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatac 279  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15119 catataacacttcatcaattatgaacaatatagtattcacaaacatatac 15070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 134
Target Start/End: Original strand, 1308 - 1406
Alignment:
Q  35 cttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacat 132  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| | ||||| |||   ||||  |||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||    
T  1308 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtgtac---aacatcatgacataattatatcaaattcaattcatcaacat 1404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 15345 - 15306
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa 69  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15345 atcaacgtagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 15306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 134
Target Start/End: Original strand, 8486 - 8598
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagc-agtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaa 121  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  8486 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagcaacataggtagtatacaaaaacagtatgacataataatatcaattgcaa 8585  T
Q  122 gtcaacaacatct 134  Q
    |||||||||||||    
T  8586 gtcaacaacatct 8598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 64; Significance: 1e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 35 - 198
Target Start/End: Original strand, 13147 - 13313
Alignment:
Q  35 cttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa-caacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacat 132  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||| || |||||| ||||| ||| |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  13147 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatgcaaaa-cagcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacat 13245  T
Q  133 ctcaatt-attcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa-caacatcaaat 198  Q
    || ||   ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  13246 ctgaaaccattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaccaacatcaaat 13313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 31 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 16206 - 16037
Alignment:
Q  31 tcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa-caacaacacagc-agtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 128  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||| ||  ||||| ||||| ||  |||| |||| ||||||||||| || ||||||    
T  16206 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggtagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaatgtaaatcaaca 16108  T
Q  129 acatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa-caacatcaaat 198  Q
    |||||||||  ||||  |||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  16107 acatctcaaacattcttatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaccaacatcaaat 16037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 62; Significance: 2e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 103 - 176
Target Start/End: Original strand, 13092 - 13165
Alignment:
Q  103 ataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattata 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  13092 ataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattgaagtaatgcatatataattata 13165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 61; Significance: 9e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 35 - 166
Target Start/End: Original strand, 1971 - 2103
Alignment:
Q  35 cttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatc 133  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||| || |||||||||||| ||  |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  1971 cttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaacagcgacataggcagtatacaaaatcaacatgacataatgatatcaattgcaattcaacaacatc 2070  T
Q  134 tcaattattcacatatgattcaagtaatgcata 166  Q
    | || |||||| | || ||||||||||||||||    
T  2071 ttaaatattcaaacattattcaagtaatgcata 2103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 61; Significance: 9e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 182 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 36065 - 35955
Alignment:
Q  182 atataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatatacatataaaac-ttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatataca 280  Q
    |||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||    
T  36065 atataagaacatcaaaaaataatcaacatcttaaaacatc-atatatacatataacactttcatcaatcatggacaatatcatattcac-aacatataca 35968  T
Q  281 tacatatactaat 293  Q
    |||||||||||||    
T  35967 tacatatactaat 35955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 23997 - 23951
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa 69  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  23997 catcatcttcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaa 23951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 59; Significance: 1e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 35 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 53651 - 53486
Alignment:
Q  35 cttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa-caacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacat 132  Q
    ||||||| || ||||||| |||||||||  ||||| || ||||| || |||||| ||||| ||  |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  53651 cttagactgattcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 53553  T
Q  133 ctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaaat 198  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  53552 ctcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaat 53486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 58; Significance: 5e-24; HSPs: 3)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 80 - 196
Target Start/End: Original strand, 13157 - 13274
Alignment:
Q  80 gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatca 179  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||  |||  ||||||||||||| |||  |||||||||    
T  13157 gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatca 13256  T
Q  180 caatataa-caacatcaa 196  Q
    ||| |||| |||||||||    
T  13257 caacataatcaacatcaa 13274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 28 - 71
Target Start/End: Original strand, 285 - 328
Alignment:
Q  28 tcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaaca 71  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  285 tcatcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaataacaaca 328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 130
Target Start/End: Original strand, 34130 - 34238
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa-caacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgca 120  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||   ||  |||| ||||||||||| |||| |    
T  34130 catcttcaacaacttagaccgactcatacagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaacc-catcatgatataataatatcgaatgta 34228  T
Q  121 agtcaacaac 130  Q
    | ||||||||    
T  34229 aatcaacaac 34238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 58; Significance: 5e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 90 - 198
Target Start/End: Original strand, 225482 - 225590
Alignment:
Q  90 aaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aac 188  Q
    |||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||    
T  225482 aaaacagcgtgatataataatatcaaatgcaa-tcaacaacatctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaac 225580  T
Q  189 aacatcaaat 198  Q
    ||||||||||    
T  225581 aacatcaaat 225590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 57; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 23 - 106
Target Start/End: Original strand, 4719 - 4803
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataa 106  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||    
T  4719 catcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataa 4803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 56; Significance: 8e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 34 - 198
Target Start/End: Original strand, 11482 - 11648
Alignment:
Q  34 acttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa-caacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaaca 131  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||||| |||||| || ||||| || |||||| ||||| ||  |||| |||||||||||  | | |||| |||||||    
T  11482 acttagattgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatcgcacgtaagtaaacaaca 11580  T
Q  132 tctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaaat 198  Q
    |||||| || |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  11581 tctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaat 11648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 56; Significance: 8e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 34 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 38359 - 38193
Alignment:
Q  34 acttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa-caacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaaca 131  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||||| |||||| || ||||| || |||||| ||||| ||  |||| |||||||||||  | | |||| |||||||    
T  38359 acttagattgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatcgcacgtaagtaaacaaca 38261  T
Q  132 tctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaaat 198  Q
    |||||| || |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  38260 tctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaat 38193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 56; Significance: 8e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 23 - 181
Target Start/End: Original strand, 39920 - 40078
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaa 121  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| | ||||| | ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||     
T  39920 catcttcatcaacttagaccaactcatgcagcttaattaaataacaatagcaacataggcagtatac-aaaacaacatgacataataatatcaaatgcat 40018  T
Q  122 gtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcaca 181  Q
    ||||| ||||||| || ||||    |||  ||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  40019 gtcaataacatcttaaatatttgattatacttcaagtaatgcacataacattatatcaca 40078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 55; Significance: 3e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 11557 - 11447
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaa 121  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||  |||||||||||||||||| | |||    
T  11557 catcttcaacaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggtagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatttcaa 11458  T
Q  122 gtcaacaacat 132  Q
     ||| ||||||    
T  11457 ttcatcaacat 11447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 54; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 333 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 6305 - 6196
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacct 432  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | || ||||||||||||||   || ||| ||||||| ||||||||||     
T  6305 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttagaagtcaaaccaaagccattagaaagctaacataattatctataactttcatgtttacacca 6206  T
Q  433 aagaccaatt 442  Q
    ||| ||||||    
T  6205 aaggccaatt 6196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 52; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 98 - 181
Target Start/End: Original strand, 27913 - 27996
Alignment:
Q  98 atgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcaca 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||   || ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  27913 atgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcatataacattatatcaca 27996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 51; Significance: 8e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 23 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 10537 - 10381
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa-caacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgca 120  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| || ||||| || ||||||||||   ||| |||||||||||||||||| | ||    
T  10537 catcttcaacaacttagaccgactcatgcagcatagttaattaacaaacagcaacataggcagtatacaa---cagcatgacataataatatcaatttca 10441  T
Q  121 agtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcaca 181  Q
    | |||||||||||| || ||| || ||||  ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  10440 attcaacaacatcttaagtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcaca 10381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 51; Significance: 8e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 35 - 198
Target Start/End: Original strand, 12587 - 12751
Alignment:
Q  35 cttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa-caacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacat 132  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||  ||||| || ||||| || |||||| ||||| ||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  12587 cttagaccgactcatgtagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-cagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 12685  T
Q  133 ctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaaat 198  Q
    ||||| || | | |||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  12686 ctcaaatacttatatataattc-agtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaat 12751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 51; Significance: 8e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 37 - 166
Target Start/End: Original strand, 4545 - 4675
Alignment:
Q  37 tagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctc 135  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| ||| | ||| | || || ||||||||||||  || ||||||||||||     
T  4545 tagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacagcataggcagtatgcaacagcagcaagatatcataatatcaaatataattcaacaacatctt 4644  T
Q  136 aattattcacatatgattcaagtaatgcata 166  Q
    || ||||||  |||  |||||||||||||||    
T  4645 aaatattcatttatacttcaagtaatgcata 4675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 51; Significance: 8e-20; HSPs: 3)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 399 - 477
Target Start/End: Original strand, 398 - 476
Alignment:
Q  399 aacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattatgtaccaatcaataccagttttcatttcaaattc 477  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  398 aacatccatacgtacgactttcgtgtttacacctaagaccaattctggacctatcaataccagattttatttcaaattc 476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 35 - 164
Target Start/End: Original strand, 174785 - 174913
Alignment:
Q  35 cttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa-caacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacat 132  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||   ||| ||||||| || ||||||||| ||| ||||||||||    
T  174785 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatacaa---cagcatgacatgattatatcaaattcaattcaacaacat 174881  T
Q  133 ctcaattattcacatatgattcaagtaatgca 164  Q
    |||||| |||||   || ||||||||||||||    
T  174882 ctcaatcattcattcataattcaagtaatgca 174913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 23 - 77
Target Start/End: Original strand, 121773 - 121827
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaaca 77  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  121773 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaaca 121827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 51; Significance: 8e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 25 - 177
Target Start/End: Original strand, 129914 - 130066
Alignment:
Q  25 tcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataaca-acaacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaag 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||| | ||| ||  |||| |||| |||||| ||||||||    
T  129914 tcatcatcaacttagaccgactcatgcatcttagttaaataacacacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaag 130012  T
Q  123 tcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatat 177  Q
    ||| ||||||||||| || ||| | || ||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  130013 tcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatat 130066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 60818 - 60652
Alignment:
Q  35 cttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa-caacaacacag-cagtatacaaaaacaga--atgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 130  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||  ||||| || ||||| || |||||||||||| |||   |||| |||  |||||||| ||||| ||||||||    
T  60818 cttaaaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagctcatgatataccaatatcaa-tgcaaatcaacaac 60721  T
Q  131 atctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcaca-atataacaacatcaaat 198  Q
    |||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||| || ||||||||| |  ||||||||||||||    
T  60720 atctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaaatatatcacataattaacaacatcaaat 60652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0599 (Bit Score: 50; Significance: 3e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0599
Description:

Target: scaffold0599; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 182 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 1327 - 1205
Alignment:
Q  182 atataacaacatcaaatggtaatcaacatct--taaaacatcaatatatacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatac 279  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||   | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||| ||     
T  1327 atataacaacatcaaatgataatcaacatcaacttaaacatca-tatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcttattctc-aacatttat 1230  T
Q  280 atacatatactaattcatcaatcat 304  Q
    || |||||||||||| || ||||||    
T  1229 attcatatactaatttattaatcat 1205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 50; Significance: 3e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 98 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 8097 - 7996
Alignment:
Q  98 atgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaa 196  Q
    |||| |||||||||||||||| || |||||||||||| ||  ||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  8097 atgatataataatatcaaatgaaattcaacaacatcttaaacattcatatataattcaagtaatgtatataaaattatatcacattataaacaacatcaa 7998  T
Q  197 at 198  Q
    ||    
T  7997 at 7996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 50; Significance: 3e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 333 - 442
Target Start/End: Original strand, 8566 - 8675
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacct 432  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| | || ||||||||||||||   || ||| ||||||| ||||||||||     
T  8566 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatctagaagtcaaaccaaagccattagaaagctaacataattatctaaaactttcatgtttacacca 8665  T
Q  433 aagaccaatt 442  Q
    ||| ||||||    
T  8666 aaggccaatt 8675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0129 (Bit Score: 50; Significance: 3e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0129
Description:

Target: scaffold0129; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 617 - 730
Target Start/End: Original strand, 3748 - 3861
Alignment:
Q  617 aacatagtattataacaacgaactcaccgtaaaggttggacatttccaatatctccttttaggattttcatttaaattagagatgaacatccttatgatt 716  Q
    |||| ||||||| |||| | |||||||| || ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| | |||| || |||||||| || ||||||    
T  3748 aacaaagtattacaacagcaaactcaccatataggttgggcatttccagtatctccttttagggttttcatgtgaattggatatgaacattctcatgatt 3847  T
Q  717 ttgttgcacccaca 730  Q
    |||||||| |||||    
T  3848 ttgttgcaaccaca 3861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 50; Significance: 3e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 23 - 166
Target Start/End: Original strand, 32074 - 32216
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaa 121  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | |||||| ||  |||||  |||||||||||||||||| | |||    
T  32074 catcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtaaac--aaacaacatgacataataatatcaatttcaa 32171  T
Q  122 gtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcata 166  Q
     ||| |||||||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  32172 ttcatcaacatcttaggtatacaaatattcttcaagtaatgcata 32216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 50; Significance: 3e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 333 - 442
Target Start/End: Original strand, 30470 - 30579
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacct 432  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| | || ||||||||||||||   || ||| ||||||| ||||||||||     
T  30470 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggacgtcaaaccaaagccattagaaagctaacataattatctaaaactttcatgtttacacca 30569  T
Q  433 aagaccaatt 442  Q
    ||| ||||||    
T  30570 aaggccaatt 30579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 50; Significance: 3e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 23 - 177
Target Start/End: Original strand, 19271 - 19424
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgca 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| | ||||||| | ||| ||  |||| |||| |||||| ||||||    
T  19271 catcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 19369  T
Q  121 agtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatat 177  Q
    | ||||||||||||||| |||  |||||  |||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  19370 aatcaacaacatctcaaatatcaacata--attcatataatgtatatacaattatat 19424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 49; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 23 - 177
Target Start/End: Original strand, 136 - 290
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgca 120  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||||| | ||||||| | ||| ||  |||| |||| |||||| ||||||    
T  136 catcatcatcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 234  T
Q  121 agtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatat 177  Q
    | ||||||||||||||| || ||| | || ||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  235 aatcaacaacatctcaaata-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatat 290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 46; Significance: 8e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 26 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 10652 - 10481
Alignment:
Q  26 catcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa-caacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagt 123  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| || ||||| || |||||| ||||  ||  |||| |||| |||||| |||||||||    
T  10652 catcttcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaagt 10554  T
Q  124 caacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaa 196  Q
    || ||||||||||| || ||| | || ||||| |||||| ||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  10553 catcaacatctcaaata-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaa 10481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 46; Significance: 8e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 133 - 198
Target Start/End: Original strand, 12047 - 12112
Alignment:
Q  133 ctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 198  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  12047 ctcaattattcacatataattcaagcaatgcatatacaattatatcacaatataacagtatcaaat 12112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 35 - 95
Target Start/End: Original strand, 11982 - 12042
Alignment:
Q  35 cttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaaca 95  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  11982 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtataccaaaaca 12042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 46; Significance: 8e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 35 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 6386 - 6220
Alignment:
Q  35 cttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa-caacaacacag-cagtatacaaaaacaga--atgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||| || ||||||| |||| |||   |||| || | |||||||||||||| ||||||||    
T  6386 cttagaccgactcatgcaacttagttaatgaacaaacagcaacataggcagtatataaaa-cagctcatgatatgacaatatcaaatgcaaatcaacaac 6288  T
Q  131 atctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaat-ataacaacatcaaat 198  Q
    |||||||  | ||| |||| ||||| |||||||||||| | |||||||||| | |||||||||||||||    
T  6287 atctcaaaca-tcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattaataacaacatcaaat 6220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 46; Significance: 8e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 333 - 442
Target Start/End: Original strand, 725 - 834
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacct 432  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||| | || |||||||||||| |   || ||||||||||| ||||||||||     
T  725 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggacgtcagaccaaagccattagaaagctaacgtaattatctacaactttcatgtttacacca 824  T
Q  433 aagaccaatt 442  Q
    ||| ||||||    
T  825 aagtccaatt 834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 46; Significance: 8e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 612 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 36055 - 35914
Alignment:
Q  612 caacaaacatagtattataacaacgaactcaccgtaaaggttggacatttccaatatctccttttaggattttcatttaaattagagatgaacatcctta 711  Q
    ||||||||| |||||||||  ||  |||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||| || |||| ||||| |||||| | |    
T  36055 caacaaacaaagtattatacaaaataactcaccataaatgttgggcatttccagtatctccttttagggttgtcaattgaatttgagataaacatcttca 35956  T
Q  712 tgattttgttgcacccacatataagcaattcaattgatgatg 753  Q
    |  |||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||| ||||    
T  35955 ttgttttgttgcaaccacaaataggcatttcaattgaagatg 35914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 45; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 23 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 2920 - 2805
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgca 120  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | ||| | ||||||| | ||| ||  |||| |||| |||||||||||||    
T  2920 catcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagctacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcaaatgca 2822  T
Q  121 agtcaacaacatctcaa 137  Q
    | |||||||||||||||    
T  2821 aatcaacaacatctcaa 2805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 45; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 32 - 115
Target Start/End: Original strand, 13513 - 13596
Alignment:
Q  32 caacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||    
T  13513 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacaacatgacatgataatatcaa 13596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 45; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 23 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 45906 - 45732
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgca 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  || | | ||||||| | ||| ||  |||| |||| |||||| |||| |    
T  45906 catcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagaaaaataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgta 45808  T
Q  121 agtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaa 196  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| | || ||||| || ||| ||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  45807 agtcatcaacatctcaatta-tcaaacataattcatgtgatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaa 45732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 45; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 23 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 14811 - 14696
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgca 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||| | |||||| | |||| ||  |||| ||| ||||||| ||||||    
T  14811 catcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaactaacaaacagcaacataggcagta-agaaaatcatcatgatatagtaatatcgaatgca 14713  T
Q  121 agtcaacaacatctcaa 137  Q
    | |||||||||||||||    
T  14712 aatcaacaacatctcaa 14696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 333 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 12590 - 12519
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatc 404  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| | || |||||||||||||||    
T  12590 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggaagtcaacccaaagccattagaaagctaacatc 12519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0686
Description:

Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 333 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 7039 - 6941
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacc 431  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||| || |||||||||||||    || ||| ||||||| ||||||||||    
T  7039 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggacctcaaaccaacgccattagaaagctaacaaaattatctaaaactttcatgtttacacc 6941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 23 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 4947 - 4893
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacaaca 77  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4947 catcttcatcaacttagaccaactcatgcaacttagttaaataacaacagcaaca 4893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 92 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 1006 - 918
Alignment:
Q  92 aacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcaca 181  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||   || |||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  1006 aacagcatggcataataatatcaa-tgcaagtcaacaaaatctcaaatattcaatcataattcaagtaatgcacataacattatatcaca 918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 23 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 2759 - 2713
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa 69  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2759 catcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 2713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 333 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 32216 - 32118
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacc 431  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||| | || |||||||||||| |   |||||| ||||||| ||||||||||    
T  32216 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggacgttaaaccaaagccattagaaagctaacttaattacctaaaactttcatgtttacacc 32118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 1171 - 1011
Alignment:
Q  35 cttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacat 132  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| ||  |||| ||||||||||| |||| || |||||||       
T  1171 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaa--- 1076  T
Q  133 ctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 198  Q
    |||||||| ||| |  | | ||| |||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  1075 ctcaatta-tcagacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataacaacatcaaat 1011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 333 - 431
Target Start/End: Original strand, 40628 - 40726
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacc 431  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||| | || |||||||||||| |   |||||| ||||||| ||||||||||    
T  40628 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggacgttaaaccaaagccattagaaagctaacttaattacctaaaactttcatgtttacacc 40726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 137
Target Start/End: Original strand, 10542 - 10649
Alignment:
Q  31 tcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 128  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| ||  |||| |||| |||||| ||||||||||| ||    
T  10542 tcaacttagaccgactcatgcagcttttttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatca 10640  T
Q  129 acatctcaa 137  Q
    |||||||||    
T  10641 acatctcaa 10649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1404 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1404
Description:

Target: scaffold1404; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 333 - 442
Target Start/End: Original strand, 1375 - 1484
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacct 432  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || |||||| || |||||||||| | || |||||||||||||    || ||| ||||||| ||||||||||     
T  1375 agtaatttgatcataactcaagttctaaaactcatttggacgtcaaaccaaagccattagaaagctaacaaaattatctaaaactttcatgtttacaccg 1474  T
Q  433 aagaccaatt 442  Q
    ||| ||||||    
T  1475 aaggccaatt 1484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 181
Target Start/End: Original strand, 20928 - 21077
Alignment:
Q  34 acttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa-caacaacacag-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaaca 131  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||||| |||||| || ||||| || || ||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  20928 acttagaccgactcataaagcttagttaattaacaatcagcaacataggcaatatgcaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaattcaacaaca 21027  T
Q  132 tctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcaca 181  Q
    ||| |  |||||| || |  | ||||||||||||| |  |||||||||||    
T  21028 tcttatatattcaaatgttctacaagtaatgcataaaacattatatcaca 21077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 333 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 110174 - 110065
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacct 432  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||| | || |||||||||||| |   || ||| ||||||| ||||||||||     
T  110174 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggatgtcaaatcaaagccattagaaagctaacgtaattatctaaaactttcatgtttacacca 110075  T
Q  433 aagaccaatt 442  Q
    ||| ||||||    
T  110074 aaggccaatt 110065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 333 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 118675 - 118566
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacct 432  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||| | || |||||||||||| |   || ||| ||||||| ||||||||||     
T  118675 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggatgtcaaatcaaagccattagaaagctaacgtaattatctaaaactttcatgtttacacca 118576  T
Q  433 aagaccaatt 442  Q
    ||| ||||||    
T  118575 aaggccaatt 118566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 198
Target Start/End: Original strand, 97090 - 97190
Alignment:
Q  98 atgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaata-taacaacatcaa 196  Q
    |||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||  | ||| |||| ||||| |||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||    
T  97090 atgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaaca-tcatatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaa 97188  T
Q  197 at 198  Q
    ||    
T  97189 at 97190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 198
Target Start/End: Original strand, 106368 - 106468
Alignment:
Q  98 atgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaata-taacaacatcaa 196  Q
    |||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||  | ||| |||| ||||| |||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||    
T  106368 atgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaaca-tcatatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaa 106466  T
Q  197 at 198  Q
    ||    
T  106467 at 106468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 335 - 431
Target Start/End: Original strand, 15780 - 15876
Alignment:
Q  335 taatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacc 431  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | || |||||| ||||| |   || ||| ||||||| ||||||||||    
T  15780 taatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggaagtcaaaccaaagccattagaaatctaacttaattatctaaaactttcatgtttacacc 15876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0174
Description:

Target: scaffold0174; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 225 - 305
Target Start/End: Original strand, 15282 - 15362
Alignment:
Q  225 atatacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatg 305  Q
    |||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||| || ||| ||||||||||||||||    
T  15282 atattcatataataattcatcaatcatgaacaatatcatattcatcgacatatacattcaaataataattcatcaatcatg 15362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 240 - 298
Target Start/End: Original strand, 15350 - 15408
Alignment:
Q  240 ttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatc 298  Q
    ||||||||||||||| || ||| ||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||    
T  15350 ttcatcaatcatgaataacatcatattcatcaacatatacattcatataataattcatc 15408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000007; HSPs: 3)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 218 - 303
Target Start/End: Original strand, 16239 - 16326
Alignment:
Q  218 catcaatatatacat--ataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatca 303  Q
    |||||| ||||||||  ||| || |||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  16239 catcaacatatacattcatataaattcatcaatcatgaacaacatcatattcatcaacatatacattcatataataattcatcaatca 16326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 198
Target Start/End: Original strand, 25121 - 25289
Alignment:
Q  31 tcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa-caacaacacag-cagtatacaaaaacaga--atgacataataatatcaaatgcaagtcaa 126  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| || ||||| || ||||||| |||| |||   |||| ||||  ||||||| ||||| ||||    
T  25121 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaa-cagctcatgatataacgatatcaa-tgcaaatcaa 25218  T
Q  127 caacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 198  Q
    |||||||||||  || || |||| ||||| |||||| ||||| || ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  25219 caacatctcaaacat-catatataattcatgtaatgtatatacaaatatatcacattattacaacatcaaat 25289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 98 - 198
Target Start/End: Original strand, 621 - 720
Alignment:
Q  98 atgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaata-taacaacatcaa 196  Q
    |||| |||| ||||||||| |||| |||| ||||||||||  || || |||| ||||| |||||||||||| | |||||||||| || ||||||||||||    
T  621 atgatataacaatatcaaa-gcaaatcaataacatctcaaacat-catatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaa 718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 166
Target Start/End: Original strand, 6675 - 6761
Alignment:
Q  80 gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcata 166  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||  |||| |||||||||||| || |||||| | || ||||||||||||||||    
T  6675 gcagtatacaaaatcaacatgacataatgatatcaatagcaattcaacaacatcttaaatattcaaacattattcaagtaatgcata 6761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 333 - 431
Target Start/End: Original strand, 53946 - 54044
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacc 431  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| | || ||||||| ||||||   || ||| ||||||| ||||||||||    
T  53946 agtaatttaatcataactcaagttctaaaaatcatttgaaagtcaaaccaaagccattagaaagttaacataattatctaaaactttcatgtttacacc 54044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 333 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 20009 - 19911
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacc 431  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| | || | ||||||||||||   || ||| ||||||| ||||||||||    
T  20009 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggacttcaaaccaaagccattggaaagctaacataattatctaaaactttcatgtttacacc 19911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000001; HSPs: 4)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 333 - 403
Target Start/End: Original strand, 39965 - 40035
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacat 403  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| | || ||||||||| ||||    
T  39965 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggaagtaaaaccaaagccattagaaagctgacat 40035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 333 - 403
Target Start/End: Original strand, 45448 - 45518
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacat 403  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| ||||| ||||||| | || ||||||||||||||    
T  45448 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaattatttggaagtaaaaccaaagccattagaaagctaacat 45518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 333 - 403
Target Start/End: Original strand, 79003 - 79073
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacat 403  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| |  | ||||||||||||||    
T  79003 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggatgtcaaaccaaagcaattagaaagctaacat 79073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 137
Target Start/End: Original strand, 32551 - 32657
Alignment:
Q  31 tcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 128  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||| ||||| | ||||||| | ||||||  |||| |||| |||||||||||||| ||||||    
T  32551 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaa-tcaaca 32648  T
Q  129 acatctcaa 137  Q
    |||||||||    
T  32649 acatctcaa 32657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 198
Target Start/End: Original strand, 267679 - 267844
Alignment:
Q  35 cttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa-caacaacaca-gcagtatacaaaaacaga--atgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||| | |||||||| |||| |||   |||| |||| |||||||||||||| |||||||     
T  267679 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacatcaacatatgcagtatataaaa-cagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaat 267777  T
Q  131 atctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaata-taacaacatcaaat 198  Q
    |||||||    ||| |||| ||||| |||||||||||| | |||||||||| || ||||| ||||||||    
T  267778 atctcaa--catcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaccatcaaat 267844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 333 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 1365 - 1296
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaaca 402  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||   || |||||||||||||    
T  1365 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggaaatcaaaccaaaaccattagaaagctaaca 1296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0315
Description:

Target: scaffold0315; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 333 - 442
Target Start/End: Original strand, 18205 - 18314
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacct 432  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||  ||||||||| | || |||||||||||||    || ||| ||||||| ||||||||||     
T  18205 agtaatttgatcataactcaagttataaaaatcatttggacctcaaaccaaagccattagaaagctaacaaaattatctaaaactttcatgtttacacca 18304  T
Q  433 aagaccaatt 442  Q
    ||| ||||||    
T  18305 aaggccaatt 18314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 333 - 442
Target Start/End: Original strand, 28469 - 28578
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacct 432  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||| | || |||||| |||| |    || ||||||||||| ||||||||||     
T  28469 agtaatttgatcataactcaagttataaaaatcatttggacgtcaaaccaaagccattagaaaactaaaaaaattatctacaactttcatgtttacacca 28568  T
Q  433 aagaccaatt 442  Q
    ||| ||||||    
T  28569 aagtccaatt 28578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 23 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 28884 - 28839
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataaca 68  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  28884 catcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaaca 28839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 333 - 442
Target Start/End: Original strand, 38375 - 38484
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacct 432  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||  | ||||||||| || |||||||||||||    || ||| ||||||| ||||||||||     
T  38375 agtaatttgatcataactcgagttctaaaaatcatttggacctgaaaccaacgccattagaaagctaacaaaattatctaaaactttcatgtttacacca 38474  T
Q  433 aagaccaatt 442  Q
    ||| ||||||    
T  38475 aaggccaatt 38484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 15884 - 15788
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtca 125  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| ||  |||| |||| |||||| |||||||||||    
T  15884 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatgatgatataacaatatcgaatgcaagtca 15788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 137
Target Start/End: Original strand, 1051 - 1154
Alignment:
Q  35 cttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacat 132  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| | ||||||| | ||||||| |||| |||| |||||||||| | | ||| ||||||    
T  1051 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaacagcatgatataacaatatcaaatacgaatcatcaacat 1149  T
Q  133 ctcaa 137  Q
    |||||    
T  1150 ctcaa 1154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 77
Target Start/End: Original strand, 1096 - 1144
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacaacaaca 77  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  1096 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaaca 1144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 1141 - 1093
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacaacaaca 77  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  1141 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaaca 1093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 133
Target Start/End: Original strand, 12777 - 12884
Alignment:
Q  27 atcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtc 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| | ||| ||| | ||| ||  |||| |||| |||||| ||||||||||    
T  12777 atcatcaacttagaccgactcatgcagcttagctaaataacaaacaacaacataggcaatatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtc 12875  T
Q  125 aacaacatc 133  Q
    | |||||||    
T  12876 atcaacatc 12884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 3)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 77
Target Start/End: Original strand, 6625 - 6673
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacaacaaca 77  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  6625 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaaca 6673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 77
Target Start/End: Original strand, 14005 - 14053
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacaacaaca 77  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  14005 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaaca 14053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 313 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 273 - 217
Alignment:
Q  313 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattt 369  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||  |||| |||||||||    
T  273 attcattgtgacctacgtgtagtagtttgaccataaatcaaaatctaaaaatcattt 217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 141
Target Start/End: Original strand, 32105 - 32224
Alignment:
Q  23 catcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacaacaaca-cagcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgca 120  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||  || ||||| ||||| ||  |||| |||| |||||| |||| |    
T  32105 catcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagataaataacaaacaacaacataagtagtatgcaaaatcatcatgatataacaatatcgaatgta 32204  T
Q  121 agtcaacaacatctcaattat 141  Q
    | ||| |||| ||||||||||    
T  32205 a-tcatcaacgtctcaattat 32224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1164 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold1164
Description:

Target: scaffold1164; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 335 - 402
Target Start/End: Original strand, 912 - 979
Alignment:
Q  335 taatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaaca 402  Q
    |||||||| ||||| ||||||| || ||||||||| ||||||||||||| | || |||||||||||||    
T  912 taatttgatcataattcaagttataaaaatcatttggaagtcaaaccaaagccattagaaagctaaca 979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 90 - 137
Target Start/End: Original strand, 8090 - 8137
Alignment:
Q  90 aaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaa 137  Q
    ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8090 aaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaa 8137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 69
Target Start/End: Original strand, 6822 - 6865
Alignment:
Q  26 catcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  6822 catcatcatcttagaccgactcatgcagctcagttaaataacaa 6865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 333 - 428
Target Start/End: Original strand, 1959 - 2054
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttac 428  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| || |||||||||| | ||| ||| |||||||||   |  ||||||||||| |||||||    
T  1959 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaataatttggacgtcaaaccaaagccaaaagatagctaacataattgtctacaactttcatgtttac 2054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 6230 - 6191
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa 69  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6230 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 6191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1753 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1753
Description:

Target: scaffold1753; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 333 - 403
Target Start/End: Original strand, 868 - 938
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacat 403  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||  | |||||||||| | || ||||||||||||||    
T  868 agtaatttgatcataactcaggttctaaaaatcatttgcacgtcaaaccaaagccattagaaagctaacat 938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0959 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0959
Description:

Target: scaffold0959; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 321 - 435
Target Start/End: Original strand, 1219 - 1333
Alignment:
Q  321 tgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttc 420  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||||||| | |||||   || ||||||  |||||||||||  || ||||||     
T  1219 tgacctatgtgtagtaatttgaccataaatcaagttttagaaaacattttgaagtgagaccaaatccattagaaatataacatccatatataaaactttt 1318  T
Q  421 gtgtttacacctaag 435  Q
     |||||||| |||||    
T  1319 atgtttacatctaag 1333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 130
Target Start/End: Original strand, 15675 - 15776
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 127  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||| |||| || |||||    
T  15675 atcaacttagaccgactcgtgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatac-aaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaac 15773  T
Q  128 aac 130  Q
    |||    
T  15774 aac 15776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 132
Target Start/End: Original strand, 16301 - 16397
Alignment:
Q  35 cttagaccgactcatgcaacttagttaaataa-caacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacat 132  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||| | |||||||||   ||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||    
T  16301 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataagaaacagcaacataggcagtatac---aacagcatgacataattatatcaaattcaattcatcaacat 16397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0048 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0048
Description:

Target: scaffold0048; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 387 - 431
Target Start/End: Original strand, 53934 - 53978
Alignment:
Q  387 caatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacc 431  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  53934 caatggaaagctaacgtccatacctacaactttcatgtttacacc 53978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 228476 - 228432
Alignment:
Q  25 tcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa 69  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  228476 tcatcatcaacttattcagactcatgcaacttagttaaataacaa 228432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 23853 - 23892
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa 69  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  23853 atcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaa 23892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0191 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0191
Description:

Target: scaffold0191; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 333 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 8192 - 8097
Alignment:
Q  333 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttac 428  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||| | || |||| |||||||||   |  ||||||||||| |||||||    
T  8192 agtaatttaatcatatctcaagttctaaaaatcatttggacgtcaaaccaaagccattagatagctaacataattgtctacaactttcatgtttac 8097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 36464 - 36503
Alignment:
Q  30 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa 69  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  36464 atcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaa 36503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 134
Target Start/End: Original strand, 51601 - 51699
Alignment:
Q  35 cttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacat 132  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||   ||||  |||||||||| ||| ||||| ||| ||| ||||||    
T  51601 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatac---aacatcatgacataattataacaaattcaattcatcaacat 51697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 35 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 5230 - 5196
Alignment:
Q  35 cttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa 69  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5230 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 5196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 43 - 77
Target Start/End: Original strand, 9536 - 9570
Alignment:
Q  43 gactcatgcaacttagttaaataacaacaacaaca 77  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9536 gactcatgcaacttagttaaataacaataacaaca 9570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0515 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0515
Description:

Target: scaffold0515; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 361 - 442
Target Start/End: Original strand, 4628 - 4709
Alignment:
Q  361 aaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 442  Q
    |||||||||| |||||||||||| | || | |||||||||||    || ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  4628 aaatcattttcaagtcaaaccaaagccactggaaagctaacacaattatctacaactttcatgtttacaccaaaggccaatt 4709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0462
Description:

Target: scaffold0462; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 361 - 442
Target Start/End: Original strand, 912 - 993
Alignment:
Q  361 aaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 442  Q
    |||||||||| ||||||||||||   || |||||||||||||    || ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  912 aaatcattttcaagtcaaaccaaacccactagaaagctaacacaattatctacaactttcatgtttacaccaaaggccaatt 993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 361 - 442
Target Start/End: Original strand, 6418 - 6499
Alignment:
Q  361 aaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 442  Q
    |||||||||| ||||||||||||   || |||||||||||||    || ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  6418 aaatcattttcaagtcaaaccaaacccactagaaagctaacacaattatctacaactttcatgtttacaccaaaggccaatt 6499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 181
Target Start/End: Original strand, 38411 - 38483
Alignment:
Q  108 aatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcaca 181  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  | ||| |||| ||||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  38411 aatatcaaatgcaattcaacaacatctcaaaca-tcatatataattcatgtaatgcatatacatatatatcaca 38483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0135 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0135
Description:

Target: scaffold0135; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 321 - 374
Target Start/End: Original strand, 31918 - 31971
Alignment:
Q  321 tgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaag 374  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||    
T  31918 tgacctatgtgtagtaatttgaccataaatcaaattctagaaaacattttgaag 31971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 361 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 23662 - 23581
Alignment:
Q  361 aaatcattttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 442  Q
    |||||||||| |||||||||||| | || | |||||||||||    || ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  23662 aaatcatttttaagtcaaaccaaagccactggaaagctaacacaattatctacaactttcatgtttacaccaaaggccaatt 23581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 248 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 66818 - 66761
Alignment:
Q  248 tcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatg 305  Q
    |||||||||| ||| ||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  66818 tcatgaacaacatcatattcatcaacatatacattcatataataattcatcattcatg 66761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University