View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF21669_high_10 (Length: 361)

Name: NF21669_high_10
Description: NF21669
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF21669_high_10
NF21669_high_10
[»] chr8 (9 HSPs)
chr8 (108-354)||(13816179-13816425)
chr8 (108-354)||(30531129-30531375)
chr8 (108-354)||(15054877-15055123)
chr8 (108-354)||(1956802-1957048)
chr8 (108-354)||(17742929-17743175)
chr8 (13-97)||(15601245-15601329)
chr8 (13-97)||(15632528-15632612)
chr8 (283-354)||(38205750-38205821)
chr8 (283-354)||(35100675-35100746)
[»] chr2 (9 HSPs)
chr2 (108-354)||(40880318-40880564)
chr2 (108-354)||(8853299-8853545)
chr2 (108-354)||(12856261-12856507)
chr2 (108-354)||(7587082-7587328)
chr2 (108-354)||(30821162-30821408)
chr2 (108-354)||(22350193-22350439)
chr2 (108-351)||(31206491-31206733)
chr2 (237-354)||(2779510-2779627)
chr2 (318-354)||(39432788-39432824)
[»] chr7 (5 HSPs)
chr7 (110-354)||(32128828-32129072)
chr7 (108-354)||(26813379-26813625)
chr7 (108-354)||(22192451-22192697)
chr7 (108-354)||(22657918-22658164)
chr7 (108-354)||(36519750-36519996)
[»] chr3 (17 HSPs)
chr3 (108-354)||(51428334-51428580)
chr3 (116-354)||(42600106-42600344)
chr3 (108-354)||(33749924-33750169)
chr3 (108-354)||(42562145-42562391)
chr3 (108-354)||(25831317-25831563)
chr3 (108-354)||(47145409-47145655)
chr3 (108-354)||(50018233-50018479)
chr3 (108-347)||(30689700-30689939)
chr3 (108-354)||(25789360-25789606)
chr3 (108-354)||(17467758-17468004)
chr3 (108-354)||(30417009-30417255)
chr3 (108-354)||(6047275-6047521)
chr3 (108-354)||(33189425-33189671)
chr3 (108-352)||(21231015-21231243)
chr3 (237-354)||(21226531-21226648)
chr3 (108-205)||(21226656-21226753)
chr3 (285-354)||(51974151-51974220)
[»] chr5 (9 HSPs)
chr5 (116-354)||(4578237-4578475)
chr5 (108-354)||(9273853-9274099)
chr5 (108-354)||(29618181-29618427)
chr5 (108-354)||(32975149-32975395)
chr5 (108-354)||(40890141-40890387)
chr5 (108-351)||(27943739-27943982)
chr5 (125-354)||(30647016-30647245)
chr5 (159-354)||(31012490-31012685)
chr5 (260-354)||(3559265-3559359)
[»] chr4 (11 HSPs)
chr4 (108-354)||(33605377-33605623)
chr4 (108-354)||(2213868-2214114)
chr4 (108-354)||(46916095-46916341)
chr4 (108-354)||(3531888-3532134)
chr4 (108-354)||(3617033-3617279)
chr4 (108-354)||(8993030-8993276)
chr4 (108-354)||(13111808-13112054)
chr4 (108-354)||(34436723-34436969)
chr4 (159-354)||(53182741-53182936)
chr4 (108-354)||(16173599-16173845)
chr4 (283-354)||(28446207-28446278)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (108-354)||(29128-29374)
[»] chr6 (7 HSPs)
chr6 (108-354)||(24931843-24932089)
chr6 (108-354)||(6379082-6379328)
chr6 (108-354)||(632758-633004)
chr6 (108-354)||(17959843-17960089)
chr6 (108-354)||(34839825-34840071)
chr6 (108-354)||(8220188-8220434)
chr6 (108-191)||(18640810-18640893)
[»] chr1 (11 HSPs)
chr1 (108-354)||(17784605-17784851)
chr1 (108-354)||(31469369-31469615)
chr1 (108-352)||(47299080-47299324)
chr1 (108-354)||(2476908-2477154)
chr1 (108-354)||(45240382-45240628)
chr1 (108-354)||(48386687-48386933)
chr1 (104-346)||(51521442-51521684)
chr1 (108-354)||(48405566-48405812)
chr1 (108-354)||(33165612-33165858)
chr1 (108-354)||(8469562-8469808)
chr1 (108-354)||(17679845-17680091)
[»] scaffold1240 (1 HSPs)
scaffold1240 (108-354)||(1352-1598)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (108-354)||(167822-168068)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (108-255)||(104184-104331)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 9)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 108 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 13816425 - 13816179
Alignment:
Q  108 ccaatgagcctacatacgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccgaatggaaaaacatgttttccttcgaatcgttggagacctttcaggtagtgataa 207  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13816425 ccaatgagcctacatacgatgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccggatgcaaaaacatgttttccttcgaatcgttggagacctttcatgtagtgataa 13816326  T
Q  208 ctacttcatccaacgagttgatgcagccaataaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacaacaatacaaatgttagcatatggtgtggcagca 307  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  13816325 ctacttcacccaacgaattgatgcagccaataaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacaacaatgcgaatgttagcatatggtgtggcagca 13816226  T
Q  308 tatgcgttcgatgaatacatcaaaataggaagtagtacaacattgga 354  Q
     ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13816225 gatgcggtcgatgcatacatcaaaataggaagtagtacatcattgga 13816179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 108 - 354
Target Start/End: Original strand, 30531129 - 30531375
Alignment:
Q  108 ccaatgagcctacatacgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccgaatggaaaaacatgttttccttcgaatcgttggagacctttcaggtagtgataa 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||    
T  30531129 ccaatgagcctacatacgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccggatgcgaaaacacgttttccttcgaatcgttggagacctatcaagtattgataa 30531228  T
Q  208 ctacttcatccaacgagttgatgcagccaataaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacaacaatacaaatgttagcatatggtgtggcagca 307  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  30531229 ctacttcacccaacgagttgatgcagccaataaagaaggtatatcgccgttagcaaaatgtaccacaacaatgcgaatgttagcatatggtgtggcagca 30531328  T
Q  308 tatgcgttcgatgaatacatcaaaataggaagtagtacaacattgga 354  Q
     ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30531329 gatgcggttgatgaatacatcaaaataggaagtagtacaacattgga 30531375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 108 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 15055123 - 15054877
Alignment:
Q  108 ccaatgagcctacatacgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccgaatggaaaaacatgttttccttcgaatcgttggagacctttcaggtagtgataa 207  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||    
T  15055123 ccaatgagcctacatatgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccggatgcaaaagcatgttttccttcgaatcgttggagacctttcaattactgataa 15055024  T
Q  208 ctacttcatccaacgagttgatgcagccaataaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacaacaatacaaatgttagcatatggtgtggcagca 307  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  15055023 ctacttcacccagcgagttgatgccgccaacaaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacaacaatgcgaatgttagcatatggtgtggcagca 15054924  T
Q  308 tatgcgttcgatgaatacatcaaaataggaagtagtacaacattgga 354  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  15054923 gatgcggtcgatgaatacatcaaaataggaggtactacaacattgga 15054877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 108 - 354
Target Start/End: Original strand, 1956802 - 1957048
Alignment:
Q  108 ccaatgagcctacatacgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccgaatggaaaaacatgttttccttcgaatcgttggagacctttcaggtagtgataa 207  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||    
T  1956802 ccaatgagcctacatatggcgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccggatgcaaaagcatgttttccttcgaatcgttggagacctttcaattactgataa 1956901  T
Q  208 ctacttcatccaacgagttgatgcagccaataaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacaacaatacaaatgttagcatatggtgtggcagca 307  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||||||||    
T  1956902 ctacttcacccagcgagttgatgccgccaacaaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacagcaatgcgaatgttagcatatggcgtggcagca 1957001  T
Q  308 tatgcgttcgatgaatacatcaaaataggaagtagtacaacattgga 354  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  1957002 gatgcggtcgatgaatacatcaaaataggaggtactacagcattgga 1957048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 108 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 17743175 - 17742929
Alignment:
Q  108 ccaatgagcctacatacgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccgaatggaaaaacatgttttccttcgaatcgttggagacctttcaggtagtgataa 207  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  17743175 ccaatgagcctacatatgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtactggatgcaaaaacacgttttccttcgaatcgttggagatctttcaagtagtgataa 17743076  T
Q  208 ctacttcatccaacgagttgatgcagccaataaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacaacaatacaaatgttagcatatggtgtggcagca 307  Q
    ||||||||  |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |    
T  17743075 ctacttcactcaactagttgatgcagccaataaataaggtatatcactgttagcaaaatgtaccacaacaatgcgaatgttagcatatgatgtggcagta 17742976  T
Q  308 tatgcgttcgatgaatacatcaaaataggaagtagtacaacattgga 354  Q
     ||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17742975 gatgcggtcaataaatacatcaaaataggaagtagtacagcattgga 17742929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 97
Target Start/End: Original strand, 15601245 - 15601329
Alignment:
Q  13 acatcatcaatttaacaacaatatctatcagcttcaccatcagaaataaatttggatacaaccatcaatttcacaacgttaatca 97  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15601245 acatcatcaatttaacaacaatgtctatcagcttcaccataaaagataaatttgaatacaaccatcaatttcacaacattaatca 15601329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 97
Target Start/End: Original strand, 15632528 - 15632612
Alignment:
Q  13 acatcatcaatttaacaacaatatctatcagcttcaccatcagaaataaatttggatacaaccatcaatttcacaacgttaatca 97  Q
    ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15632528 acatcattaatttaacaacaacatatatcagcttcaccataacaaataaatttggatacaaccatcaatttcataacgttaatca 15632612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 283 - 354
Target Start/End: Original strand, 38205750 - 38205821
Alignment:
Q  283 aatgttagcatatggtgtggcagcatatgcgttcgatgaatacatcaaaataggaagtagtacaacattgga 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38205750 aatgttagcatatggtgtggcagcagatgcggtcgatgaatacatcaaaataggaagtagtacagcattgga 38205821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 283 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 35100746 - 35100675
Alignment:
Q  283 aatgttagcatatggtgtggcagcatatgcgttcgatgaatacatcaaaataggaagtagtacaacattgga 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||    
T  35100746 aatgttagcatatggtgtggcagcagatgcggtagatgaatacataaaaataggaggtattacagcattgga 35100675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 9)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 108 - 354
Target Start/End: Original strand, 40880318 - 40880564
Alignment:
Q  108 ccaatgagcctacatacgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccgaatggaaaaacatgttttccttcgaatcgttggagacctttcaggtagtgataa 207  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40880318 ccaatgagcctacatacgatgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccggatgcaaaaacatgttttccttcgaatcgttggagacctttcaagtagtgataa 40880417  T
Q  208 ctacttcatccaacgagttgatgcagccaataaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacaacaatacaaatgttagcatatggtgtggcagca 307  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  40880418 ctacttcacccaacaagttgatgcagccaataaaaaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacagcaatgcgaatgttagcatatggtgtggcagca 40880517  T
Q  308 tatgcgttcgatgaatacatcaaaataggaagtagtacaacattgga 354  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40880518 gatgcggtcgatgaatacatcaaaataggaagtagtacaacattgga 40880564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 108 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 8853545 - 8853299
Alignment:
Q  108 ccaatgagcctacatacgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccgaatggaaaaacatgttttccttcgaatcgttggagacctttcaggtagtgataa 207  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8853545 ccaatgagcctacatatgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccggatgcaaaaacatgtcttccttcgaatcgttggagacctttcaagtagtgataa 8853446  T
Q  208 ctacttcatccaacgagttgatgcagccaataaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacaacaatacaaatgttagcatatggtgtggcagca 307  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  8853445 ctacttcacccagcgagttgatgccgccaacaaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacagcaatgcgaatgttagcatatggtgtggcagca 8853346  T
Q  308 tatgcgttcgatgaatacatcaaaataggaagtagtacaacattgga 354  Q
     ||||| | ||||||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||    
T  8853345 gatgcggtagatgaatacataaaaataggaggtactacagcattgga 8853299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 108 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 12856507 - 12856261
Alignment:
Q  108 ccaatgagcctacatacgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccgaatggaaaaacatgttttccttcgaatcgttggagacctttcaggtagtgataa 207  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12856507 ccaatgagcctacatatgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccggatgcaaaaacatgtcttccttcgaatcgttggagacctttcaagtagtgataa 12856408  T
Q  208 ctacttcatccaacgagttgatgcagccaataaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacaacaatacaaatgttagcatatggtgtggcagca 307  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  12856407 ctacttcacccagcgagttgatgccgccaacaaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacagcaatgcgaatgttagcatatggtgtggcagca 12856308  T
Q  308 tatgcgttcgatgaatacatcaaaataggaagtagtacaacattgga 354  Q
     ||||| | ||||||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||    
T  12856307 gatgcggtagatgaatacataaaaataggaggtactacagcattgga 12856261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 108 - 354
Target Start/End: Original strand, 7587082 - 7587328
Alignment:
Q  108 ccaatgagcctacatacgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccgaatggaaaaacatgttttccttcgaatcgttggagacctttcaggtagtgataa 207  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||    
T  7587082 ccaatgagcctacatatgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccggatgcaaaagcatgttttccttcgaatcgttggagacctttcaattactgataa 7587181  T
Q  208 ctacttcatccaacgagttgatgcagccaataaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacaacaatacaaatgttagcatatggtgtggcagca 307  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||||||||    
T  7587182 ctacttcacccagcgagttgatgccgccaacaaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacagcaatgcgaatgttagcatatggcgtggcagca 7587281  T
Q  308 tatgcgttcgatgaatacatcaaaataggaagtagtacaacattgga 354  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  7587282 gatgcggtcgatgaatacatcaaaataggaggtactacagcattgga 7587328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 108 - 354
Target Start/End: Original strand, 30821162 - 30821408
Alignment:
Q  108 ccaatgagcctacatacgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccgaatggaaaaacatgttttccttcgaatcgttggagacctttcaggtagtgataa 207  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||    
T  30821162 ccaatgagcctacatatgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccggatgcaaaagcatgttttccttcgaatcgttggagacctttcaattactgataa 30821261  T
Q  208 ctacttcatccaacgagttgatgcagccaataaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacaacaatacaaatgttagcatatggtgtggcagca 307  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||||||||    
T  30821262 ctacttcacccagcgagttgatgccgccaacaaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacagcaatgcgaatgttagcatatggcgtggcagca 30821361  T
Q  308 tatgcgttcgatgaatacatcaaaataggaagtagtacaacattgga 354  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  30821362 gatgcggtcgatgaatacatcaaaataggaggtactacagcattgga 30821408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 108 - 354
Target Start/End: Original strand, 22350193 - 22350439
Alignment:
Q  108 ccaatgagcctacatacgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccgaatggaaaaacatgttttccttcgaatcgttggagacctttcaggtagtgataa 207  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||    
T  22350193 ccaatgagcctacatatgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccggatgcaaaagcatgttttccttcgaatcgttggagacctttcaattactgataa 22350292  T
Q  208 ctacttcatccaacgagttgatgcagccaataaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacaacaatacaaatgttagcatatggtgtggcagca 307  Q
    |||||||| ||| |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||||||||    
T  22350293 ctacttcacccagcgagttgatgcctccaacaaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacagcaatgcgaatgttagcatatggcgtggcagca 22350392  T
Q  308 tatgcgttcgatgaatacatcaaaataggaagtagtacaacattgga 354  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  22350393 gatgcggtcgatgaatacatcaaaataggaggtactacagcattgga 22350439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 108 - 351
Target Start/End: Original strand, 31206491 - 31206733
Alignment:
Q  108 ccaatgagcctacatacgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccgaatggaaaaacatgttttccttcgaatcgttggagacctttcaggtagtgataa 207  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31206491 ccaatgagcctacatatgacgatgcaatgttttgtcgtcggtacctgatgcaaaaatacgttttccatcgaatcgttggagacctttcaagtagtgataa 31206590  T
Q  208 ctacttcatccaacgagttgatgcagccaataaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacaacaatacaaatgttagcatatggtgtggcagca 307  Q
    ||| |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||    
T  31206591 ctagttcacccaacg-gttgatgaagccaataaagaaggtatatcatagttagcaaaatgtatcacaacaatgcgaatgttagcatatggtgtggctgca 31206689  T
Q  308 tatgcgttcgatgaatacatcaaaataggaagtagtacaacatt 351  Q
     |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31206690 gatgcggacgatgaatacatcaaaataggaattagtacaacatt 31206733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 237 - 354
Target Start/End: Original strand, 2779510 - 2779627
Alignment:
Q  237 ataaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacaacaatacaaatgttagcatatggtgtggcagcatatgcgttcgatgaatacatcaaaatagg 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || || | ||||||||||||||||||||    
T  2779510 ataaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacaacaatgcgaatgttagcatatggtgtggcagcagatacggttgatgaatacatcaaaatagg 2779609  T
Q  337 aagtagtacaacattgga 354  Q
    ||||||||||||||||||    
T  2779610 aagtagtacaacattgga 2779627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 318 - 354
Target Start/End: Original strand, 39432788 - 39432824
Alignment:
Q  318 atgaatacatcaaaataggaagtagtacaacattgga 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39432788 atgaatacatcaaaataggaagtagtacagcattgga 39432824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 5)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 110 - 354
Target Start/End: Original strand, 32128828 - 32129072
Alignment:
Q  110 aatgagcctacatacgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccgaatggaaaaacatgttttccttcgaatcgttggagacctttcaggtagtgataact 209  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32128828 aatgagcctacatacgacaatgcaatatttcgtcgtcggtaccggatgcaaaaacatgttttccttcgaatcgttggagacctttcaagtagtgataact 32128927  T
Q  210 acttcatccaacgagttgatgcagccaataaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacaacaatacaaatgttagcatatggtgtggcagcata 309  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| |    
T  32128928 acttcacccaacgagttgatgcagccaataaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacagcaatgcgaatgttagcatatggtgtggcagcaga 32129027  T
Q  310 tgcgttcgatgaatacatcaaaataggaagtagtacaacattgga 354  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32129028 tgcggtcgatgaatacatcaaaataggaagtagtacagcattgga 32129072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 108 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 26813625 - 26813379
Alignment:
Q  108 ccaatgagcctacatacgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccgaatggaaaaacatgttttccttcgaatcgttggagacctttcaggtagtgataa 207  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26813625 ccaatgagcctacataggacgatacaatgtttcgtcgtctgtaccggatgcaaaaacacgttttccttcgaatcgttggagacctttcaagtagtgataa 26813526  T
Q  208 ctacttcatccaacgagttgatgcagccaataaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacaacaatacaaatgttagcatatggtgtggcagca 307  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  26813525 ctacttcacccaacgagttgatgcagccaataaataaggtatatcaccgttagcaaaacgtaccacaacaatgcgaatgttagcatatggtgtggcagca 26813426  T
Q  308 tatgcgttcgatgaatacatcaaaataggaagtagtacaacattgga 354  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26813425 gatgcggtcgatgaatacatcaaaataggaagtattacaacattgga 26813379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 108 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 22192697 - 22192451
Alignment:
Q  108 ccaatgagcctacatacgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccgaatggaaaaacatgttttccttcgaatcgttggagacctttcaggtagtgataa 207  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22192697 ccaatgagcctacatatgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccggatgcaaaaacatgtcttccttcgaatcgttggagacctttcaagtagtgataa 22192598  T
Q  208 ctacttcatccaacgagttgatgcagccaataaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacaacaatacaaatgttagcatatggtgtggcagca 307  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  22192597 ctacttcacccagcgagttgatgccgccaacaaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacagcaatgcgaatgttagcatatggtgtggcagca 22192498  T
Q  308 tatgcgttcgatgaatacatcaaaataggaagtagtacaacattgga 354  Q
     ||||| | ||||||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||    
T  22192497 gatgcggtagatgaatacataaaaataggaggtactacagcattgga 22192451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 108 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 22658164 - 22657918
Alignment:
Q  108 ccaatgagcctacatacgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccgaatggaaaaacatgttttccttcgaatcgttggagacctttcaggtagtgataa 207  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||    
T  22658164 ccaacgagcctacatatgacgatccaatgtttcgtcgtcggtaccggatgcaaaagcatgttttccttcgaatcgttggagacctttcaattactgataa 22658065  T
Q  208 ctacttcatccaacgagttgatgcagccaataaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacaacaatacaaatgttagcatatggtgtggcagca 307  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  22658064 ctacttcacccagcgagttgatgccgccaacaaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacaacaatgcgaatgttagcatatggtgtggcagca 22657965  T
Q  308 tatgcgttcgatgaatacatcaaaataggaagtagtacaacattgga 354  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  22657964 gatgcggtcgatgaatacatcaaaataggaggtactacatcattgga 22657918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 108 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 36519996 - 36519750
Alignment:
Q  108 ccaatgagcctacatacgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccgaatggaaaaacatgttttccttcgaatcgttggagacctttcaggtagtgataa 207  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||    
T  36519996 ccaatgagcctacatatgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccggatgcaaaagcatgttttccttcgaatcgttggagacctttcaattactgataa 36519897  T
Q  208 ctacttcatccaacgagttgatgcagccaataaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacaacaatacaaatgttagcatatggtgtggcagca 307  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||||||||    
T  36519896 ctacttcacccagcgagttgatgccgccaacaaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacagcaatgcgaatgttagcatatggcgtggcagca 36519797  T
Q  308 tatgcgttcgatgaatacatcaaaataggaagtagtacaacattgga 354  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  36519796 gatgcggtcgatgaatacatcaaaataggaggtactacagcattgga 36519750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 17)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 108 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 51428580 - 51428334
Alignment:
Q  108 ccaatgagcctacatacgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccgaatggaaaaacatgttttccttcgaatcgttggagacctttcaggtagtgataa 207  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  51428580 ccaatgagcctacatacgaagatgcaatgtttcgtcgtcggtaccggatgcaaaaacatgttttccttcgaaacgttggagatctttcaagtagtgataa 51428481  T
Q  208 ctacttcatccaacgagttgatgcagccaataaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacaacaatacaaatgttagcatatggtgtggcagca 307  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  51428480 ctacttcacccaacgaattgatgcagccaataaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacagcaatgcgaatgttagcatatggtgtggcagca 51428381  T
Q  308 tatgcgttcgatgaatacatcaaaataggaagtagtacaacattgga 354  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51428380 gatgcggtcgatgaatacatcaaaataggaagtagtacaacattgga 51428334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 116 - 354
Target Start/End: Original strand, 42600106 - 42600344
Alignment:
Q  116 cctacatacgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccgaatggaaaaacatgttttccttcgaatcgttggagacctttcaggtagtgataactacttca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  42600106 cctacatacgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtatcggatgcaaaaacatgttttccttcgaatcgttggagatctttcaagtagtgataactacttca 42600205  T
Q  216 tccaacgagttgatgcagccaataaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacaacaatacaaatgttagcatatggtgtggcagcatatgcgtt 315  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  42600206 cccaacgaattgatgcagccaataaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacaacaatgcgaatgttagcatatggtgtggcagcagatgcggt 42600305  T
Q  316 cgatgaatacatcaaaataggaagtagtacaacattgga 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42600306 cgatgaatacatcaaaataggaagtagtacagcattgga 42600344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 108 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 33750169 - 33749924
Alignment:
Q  108 ccaatgagcctacatacgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccgaatggaaaaacatgttttccttcgaatcgttggagacctttcaggtagtgataa 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  33750169 ccaatgagcctacatacgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccggatgcaaaaatacgtttttcttcgaatcgttggagat-tttcaagtagtgataa 33750071  T
Q  208 ctacttcatccaacgagttgatgcagccaataaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacaacaatacaaatgttagcatatggtgtggcagca 307  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  33750070 ctacttcacccaacgaattgatgcagccaataaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacatcaatgcgaatgttagcatatggtgtggcagca 33749971  T
Q  308 tatgcgttcgatgaatacatcaaaataggaagtagtacaacattgga 354  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33749970 gatgcggtcgatgaatacatcaaaataggaagtagtacaacattgga 33749924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 108 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 42562391 - 42562145
Alignment:
Q  108 ccaatgagcctacatacgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccgaatggaaaaacatgttttccttcgaatcgttggagacctttcaggtagtgataa 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||    
T  42562391 ccaatgagcctacatacgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccggatgtaaaagcatcttttccttcgaatcgttggagacctttcaattactgataa 42562292  T
Q  208 ctacttcatccaacgagttgatgcagccaataaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacaacaatacaaatgttagcatatggtgtggcagca 307  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  42562291 ctacttcacccaacgagttgatgccgccaacaaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacaacaatgcgaatgttagcatatggtgtggcagca 42562192  T
Q  308 tatgcgttcgatgaatacatcaaaataggaagtagtacaacattgga 354  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  42562191 gatgcggtcgatgaatacatcaaaataggaggtacgacaacattgga 42562145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 108 - 354
Target Start/End: Original strand, 25831317 - 25831563
Alignment:
Q  108 ccaatgagcctacatacgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccgaatggaaaaacatgttttccttcgaatcgttggagacctttcaggtagtgataa 207  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25831317 ccaatgagcctacatatgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccggatgcaaaaacatgtcttccttcgaatcgttggagacctttcaagtagtgataa 25831416  T
Q  208 ctacttcatccaacgagttgatgcagccaataaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacaacaatacaaatgttagcatatggtgtggcagca 307  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  25831417 ctacttcacccagcgagttgatgccgccaacaaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacagcaatgcgaatgttagcatatggtgtggcagca 25831516  T
Q  308 tatgcgttcgatgaatacatcaaaataggaagtagtacaacattgga 354  Q
     ||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  25831517 gatgcggtagatgaatacatcaaaataggaggtactacagcattgga 25831563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 108 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 47145655 - 47145409
Alignment:
Q  108 ccaatgagcctacatacgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccgaatggaaaaacatgttttccttcgaatcgttggagacctttcaggtagtgataa 207  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47145655 ccaatgagcctacatatgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccggatgcaaaaacatgtcttccttcgaatcgttggagacctttcaagtagtgataa 47145556  T
Q  208 ctacttcatccaacgagttgatgcagccaataaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacaacaatacaaatgttagcatatggtgtggcagca 307  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  47145555 ctacttcacccagcgagttgatgccgccaacaaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacagcaatgcgaatgttagcatatggtgtggcagca 47145456  T
Q  308 tatgcgttcgatgaatacatcaaaataggaagtagtacaacattgga 354  Q
     ||||| | ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  47145455 gatgcggtagatgaatacataaaaataggaggtactacaacattgga 47145409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 108 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 50018479 - 50018233
Alignment:
Q  108 ccaatgagcctacatacgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccgaatggaaaaacatgttttccttcgaatcgttggagacctttcaggtagtgataa 207  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  50018479 ccaatgagcctacatacaacgatataatgtttcgtcgtcggtaccggatacaaaaacacgttttccttcgaatcgttggagaccttttaagtagtgataa 50018380  T
Q  208 ctacttcatccaacgagttgatgcagccaataaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacaacaatacaaatgttagcatatggtgtggcagca 307  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||    
T  50018379 ctacttcacccaacgaattgatgcaaccaataaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacaacaatgcgaatgttagcatatggtgcggcaaca 50018280  T
Q  308 tatgcgttcgatgaatacatcaaaataggaagtagtacaacattgga 354  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50018279 gatgcggtcgatgaatacatcaaaataggaagtagtacaacattgga 50018233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 108 - 347
Target Start/End: Original strand, 30689700 - 30689939
Alignment:
Q  108 ccaatgagcctacatacgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccgaatggaaaaacatgttttccttcgaatcgttggagacctttcaggtagtgataa 207  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  30689700 ccaatgagcctacatatgacgatgcaatgtttcgtcatcggtacctgatgcaaaaacacgttttccttcgaatcattggagacctttcaagtagtgataa 30689799  T
Q  208 ctacttcatccaacgagttgatgcagccaataaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacaacaatacaaatgttagcatatggtgtggcagca 307  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  30689800 ctacttcacccagcgagttgatgcagccaataaagaaggtatatcactgttagcaaaatgtaccacaacaatgtgaatgttagcatatggtgtggcagca 30689899  T
Q  308 tatgcgttcgatgaatacatcaaaataggaagtagtacaa 347  Q
     ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30689900 gatgcggtcgatgactacatcaaaataggaagtagtacaa 30689939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 108 - 354
Target Start/End: Original strand, 25789360 - 25789606
Alignment:
Q  108 ccaatgagcctacatacgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccgaatggaaaaacatgttttccttcgaatcgttggagacctttcaggtagtgataa 207  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25789360 ccaatgagcctacatatgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccggatgcaaaaacatgtcttccttcgaatcgttggagacctttcaagtagtgataa 25789459  T
Q  208 ctacttcatccaacgagttgatgcagccaataaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacaacaatacaaatgttagcatatggtgtggcagca 307  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  25789460 ctacttcacccagcgagttgatgccgccaacaaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacagcaatgcgaatgttagcatatggtgtggcagca 25789559  T
Q  308 tatgcgttcgatgaatacatcaaaataggaagtagtacaacattgga 354  Q
     ||||| | ||||||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||    
T  25789560 gatgcggtagatgaatacataaaaataggaggtactacagcattgga 25789606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 108 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 17468004 - 17467758
Alignment:
Q  108 ccaatgagcctacatacgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccgaatggaaaaacatgttttccttcgaatcgttggagacctttcaggtagtgataa 207  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||    
T  17468004 ccaatgagcctacatatgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccggatgcaaaagcatgttttccttcgaatcgttggagacctttcaattactgataa 17467905  T
Q  208 ctacttcatccaacgagttgatgcagccaataaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacaacaatacaaatgttagcatatggtgtggcagca 307  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||||||||    
T  17467904 ctacttcacccagcgagttgatgccgccaacaaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacagcaatgcgaatgttagcatatggcgtggcagca 17467805  T
Q  308 tatgcgttcgatgaatacatcaaaataggaagtagtacaacattgga 354  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  17467804 gatgcggtcgatgaatacatcaaaataggaggtactacagcattgga 17467758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 108 - 354
Target Start/End: Original strand, 30417009 - 30417255
Alignment:
Q  108 ccaatgagcctacatacgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccgaatggaaaaacatgttttccttcgaatcgttggagacctttcaggtagtgataa 207  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||    
T  30417009 ccaatgagcctacatatgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccggatgcaaaagcatgttttccttcgaatcgttggagacctttcaattactgataa 30417108  T
Q  208 ctacttcatccaacgagttgatgcagccaataaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacaacaatacaaatgttagcatatggtgtggcagca 307  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||||||||    
T  30417109 ctacttcacccagcgagttgatgccgccaacaaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacagcaatgcgaatgttagcatatggcgtggcagca 30417208  T
Q  308 tatgcgttcgatgaatacatcaaaataggaagtagtacaacattgga 354  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  30417209 gatgcggtcgatgaatacatcaaaataggaggtactacagcattgga 30417255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 108 - 354
Target Start/End: Original strand, 6047275 - 6047521
Alignment:
Q  108 ccaatgagcctacatacgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccgaatggaaaaacatgttttccttcgaatcgttggagacctttcaggtagtgataa 207  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||    
T  6047275 ccaatgagcctacatatgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccggatgcaaaagcatgttttccttcgaatcgttggagacctttcaattactgataa 6047374  T
Q  208 ctacttcatccaacgagttgatgcagccaataaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacaacaatacaaatgttagcatatggtgtggcagca 307  Q
    |||||||| ||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||||||||    
T  6047375 ctacttcacccagcgagttgatcccgccaacaaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacagcaatgcgaatgttagcatatggcgtggcagca 6047474  T
Q  308 tatgcgttcgatgaatacatcaaaataggaagtagtacaacattgga 354  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  6047475 gatgcggtcgatgaatacatcaaaataggaggtactacagcattgga 6047521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 108 - 354
Target Start/End: Original strand, 33189425 - 33189671
Alignment:
Q  108 ccaatgagcctacatacgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccgaatggaaaaacatgttttccttcgaatcgttggagacctttcaggtagtgataa 207  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||  || ||||||    
T  33189425 ccaatgagcctacatatgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccggatgcaaaatcatgttttccttcgaatctttggagatctttcaattattgataa 33189524  T
Q  208 ctacttcatccaacgagttgatgcagccaataaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacaacaatacaaatgttagcatatggtgtggcagca 307  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  33189525 ctacttcacccagcgagttgatgccgccaacaaagaaggtatatcaccgttagccaaatgcaccacatcaatgcgaatgttagcatatggtgtggcagca 33189624  T
Q  308 tatgcgttcgatgaatacatcaaaataggaagtagtacaacattgga 354  Q
     ||||| || |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  33189625 gatgcggtcaatgaatacatcaaaataggaggtactacaacattgga 33189671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 108 - 352
Target Start/End: Original strand, 21231015 - 21231243
Alignment:
Q  108 ccaatgagcctacatacgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccgaatggaaaaacatgttttccttcgaatcgttggagacctttcaggtagtgataa 207  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||       
T  21231015 ccaatgagcctacatatgacgatgcaatgtttcatcgtcagtaccggatgtaaaaacatgttttccttcaaatcgttggggacctttcaagtagtga--- 21231111  T
Q  208 ctacttcatccaacgagttgatgcagccaataaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacaacaatacaaatgttagcatatggtgtggcagca 307  Q
                |   || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  21231112 ------------agtggtcgatgcagccaataaagaaggtatatcacccttagcaaaatgtacatcaa-aatgcgaatgttagcatatggtgtggcagca 21231198  T
Q  308 tatgcgttcgatgaatacatcaaaataggaagtagtacaacattg 352  Q
     ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  21231199 gatgcggtcgatgagtacatcaaaataggaggtactacaacattg 21231243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 237 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 21226648 - 21226531
Alignment:
Q  237 ataaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacaacaatacaaatgttagcatatggtgtggcagcatatgcgttcgatgaatacatcaaaatagg 336  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21226648 ataaagaaggtatatcacccttagcaaaatgtaccacaacaatgtgaacgttagtatatggtgtggcagcaaatgcggtcgatgaatacatcaaaatagg 21226549  T
Q  337 aagtagtacaacattgga 354  Q
    | ||| ||||||||||||    
T  21226548 aggtactacaacattgga 21226531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 108 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 21226753 - 21226656
Alignment:
Q  108 ccaatgagcctacatacgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccgaatggaaaaacatgttttccttcgaatcgttggagacctttcaggtagtgat 205  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||    
T  21226753 ccaataagcctacatatgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccaaatgcaaaaacatgttttccttcgaatcgttggggacatttcaagaagtgat 21226656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 285 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 51974220 - 51974151
Alignment:
Q  285 tgttagcatatggtgtggcagcatatgcgttcgatgaatacatcaaaataggaagtagtacaacattgga 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  51974220 tgttagcatatggtgtggcagcatatgcggtcgatgagtacatcaaaataggatgtactacaactttgga 51974151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 9)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 116 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 4578475 - 4578237
Alignment:
Q  116 cctacatacgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccgaatggaaaaacatgttttccttcgaatcgttggagacctttcaggtagtgataactacttca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  4578475 cctacatacgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtatcggatgcaaaaacatgttttccttcgaatcgttggagatctttcaagtagtgataactacttca 4578376  T
Q  216 tccaacgagttgatgcagccaataaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacaacaatacaaatgttagcatatggtgtggcagcatatgcgtt 315  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  4578375 cccaacgaattgatgcagccaataaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacagcaatgcgaatgttagcatatggtgtggcagcagatgcggt 4578276  T
Q  316 cgatgaatacatcaaaataggaagtagtacaacattgga 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4578275 cgatgaatacatcaaaataggaagtagtacaacattgga 4578237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 108 - 354
Target Start/End: Original strand, 9273853 - 9274099
Alignment:
Q  108 ccaatgagcctacatacgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccgaatggaaaaacatgttttccttcgaatcgttggagacctttcaggtagtgataa 207  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  9273853 ccaatgagcctacatatgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccggatgcaaaaacacgttttccttcgaatcgttaaagacctttcaagtagtgataa 9273952  T
Q  208 ctacttcatccaacgagttgatgcagccaataaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacaacaatacaaatgttagcatatggtgtggcagca 307  Q
    ||| |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||    
T  9273953 ctatttcacccagcgagttgatgcagccaatatagaaggtatatcacccttagaaaaatgtaccacaacaatgcgaatgttagcatatggtgtggcatca 9274052  T
Q  308 tatgcgttcgatgaatacatcaaaataggaagtagtacaacattgga 354  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9274053 gatgcggtcgatgaatacatcaaaataggaagtggtacaacattgga 9274099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 108 - 354
Target Start/End: Original strand, 29618181 - 29618427
Alignment:
Q  108 ccaatgagcctacatacgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccgaatggaaaaacatgttttccttcgaatcgttggagacctttcaggtagtgataa 207  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||    
T  29618181 ccaatgagcctacatatgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccgggtgcaaaagcatgttttccttcgaatcgttggagacctttcaattactgataa 29618280  T
Q  208 ctacttcatccaacgagttgatgcagccaataaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacaacaatacaaatgttagcatatggtgtggcagca 307  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  29618281 ctacttcacccagcgagttgatgccgccaacaaagaaggtatatcaccgttaccaaaatgtaccacaacaatgcgaatgttagcatatggtgtggcagca 29618380  T
Q  308 tatgcgttcgatgaatacatcaaaataggaagtagtacaacattgga 354  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  29618381 gatgcggtcgatgaatacatcaaaataggaggtactacatcattgga 29618427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 108 - 354
Target Start/End: Original strand, 32975149 - 32975395
Alignment:
Q  108 ccaatgagcctacatacgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccgaatggaaaaacatgttttccttcgaatcgttggagacctttcaggtagtgataa 207  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||    
T  32975149 ccaatgagcctacatatgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccggatgcaaaagcatgttttccttcgaatcgttggagacctttcaattactgataa 32975248  T
Q  208 ctacttcatccaacgagttgatgcagccaataaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacaacaatacaaatgttagcatatggtgtggcagca 307  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||||||||    
T  32975249 ctacttcacccagcgagttgatgccgccaacaaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacagcaatgcgaatgttagcatatggcgtggcagca 32975348  T
Q  308 tatgcgttcgatgaatacatcaaaataggaagtagtacaacattgga 354  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  32975349 gatgcggtcgatgaatacatcaaaataggaggtactacagcattgga 32975395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 108 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 40890387 - 40890141
Alignment:
Q  108 ccaatgagcctacatacgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccgaatggaaaaacatgttttccttcgaatcgttggagacctttcaggtagtgataa 207  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||    
T  40890387 ccaatgagcctacatatgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccggatgcaaaagcatgttttccttcgaatcgttggagacctttcaattactgataa 40890288  T
Q  208 ctacttcatccaacgagttgatgcagccaataaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacaacaatacaaatgttagcatatggtgtggcagca 307  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||||||||    
T  40890287 ctacttcacccaacgagttgatgccgccaacaaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacagcaatgcgaatgttagcatatggcgtggcagca 40890188  T
Q  308 tatgcgttcgatgaatacatcaaaataggaagtagtacaacattgga 354  Q
     ||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  40890187 gatgcggttgatgaatacatcaaaataggaggtactacagcattgga 40890141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 108 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 27943982 - 27943739
Alignment:
Q  108 ccaatgagcctacatacgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccgaatggaaaaacatgttttccttcgaatcgttggagacctttcaggtagtgataa 207  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||    
T  27943982 ccaatgagcctacatatgacgatgcaatgtctcgtcgtcggtaccggatgcaaaagcatgttttccttcgaatcgttggagacctttcaattactgataa 27943883  T
Q  208 ctacttcatccaacgagttgatgcagccaataaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacaacaatacaaatgttagcatatggtgtggcagca 307  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||    
T  27943882 ctacttcacccagcgagttgatgccgctaacaaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacaacaatgcgaatgttagcatatggcgtggcagca 27943783  T
Q  308 tatgcgttcgatgaatacatcaaaataggaagtagtacaacatt 351  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  27943782 gatgcggtcgatgaatacatcaaaataggaggtactacagcatt 27943739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 125 - 354
Target Start/End: Original strand, 30647016 - 30647245
Alignment:
Q  125 gacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccgaatggaaaaacatgttttccttcgaatcgttggagacctttcaggtagtgataactacttcatccaacgag 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || |||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||    
T  30647016 gacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccggatgcaaaagcacgttttcattcgaatcgttgtagacctttcaattagtgataactacttcacccaatgag 30647115  T
Q  225 ttgatgcagccaataaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacaacaatacaaatgttagcatatggtgtggcagcatatgcgttcgatgaata 324  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  30647116 ttgatgctgccaacaaagaaggtatatcaccgctagcaaaatttaccacagcaatgcgaatgttagcatatggtgtggcaacagatgcggtcgatgaata 30647215  T
Q  325 catcaaaataggaagtagtacaacattgga 354  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  30647216 catcaaaataggaggtactacaacattgga 30647245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 159 - 354
Target Start/End: Original strand, 31012490 - 31012685
Alignment:
Q  159 aaaaacatgttttccttcgaatcgttggagacctttcaggtagtgataactacttcatccaacgagttgatgcagccaataaagaaggtatatcaccgtt 258  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  31012490 aaaaacatgtcttccttcgaatcgttggagacctttcaagtagtgataactacttcacccagcgagttgatgccgccaacaaagaaggtatatcaccgtt 31012589  T
Q  259 agcaaaatgtaccacaacaatacaaatgttagcatatggtgtggcagcatatgcgttcgatgaatacatcaaaataggaagtagtacaacattgga 354  Q
    |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||    
T  31012590 agcaaaatgtaccacagcaatgcgaatgttagcatatggtgtggcagcagatgcggtagatgaatacataaaaataggaggtactacagcattgga 31012685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 260 - 354
Target Start/End: Original strand, 3559265 - 3559359
Alignment:
Q  260 gcaaaatgtaccacaacaatacaaatgttagcatatggtgtggcagcatatgcgttcgatgaatacatcaaaataggaagtagtacaacattgga 354  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3559265 gcaaaatgtaccacaacaatgcaaatgttaacatatggtgtggcagcagatgtggtcgatgaatacatcaaaataggaagtagtacaacattgga 3559359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 11)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 108 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 33605623 - 33605377
Alignment:
Q  108 ccaatgagcctacatacgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccgaatggaaaaacatgttttccttcgaatcgttggagacctttcaggtagtgataa 207  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  33605623 ccaatgagcgtacatacgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccggatgcaaaaacatgttttccttcgaatcgttggagaccattcaagtagtgataa 33605524  T
Q  208 ctacttcatccaacgagttgatgcagccaataaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacaacaatacaaatgttagcatatggtgtggcagca 307  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  33605523 ctacttcgcccaacgatttgatgcagccaataaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacatcaatgcgaatgttagcatatggtgtggcagca 33605424  T
Q  308 tatgcgttcgatgaatacatcaaaataggaagtagtacaacattgga 354  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33605423 gatgcggtcgatgaatacatcaaaataggaagtagtacatcattgga 33605377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 108 - 354
Target Start/End: Original strand, 2213868 - 2214114
Alignment:
Q  108 ccaatgagcctacatacgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccgaatggaaaaacatgttttccttcgaatcgttggagacctttcaggtagtgataa 207  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2213868 ccaatgagcctacatatgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccggatgcaaaaacatgtcttccttcgaatcgttggagacctttcaagtagtgataa 2213967  T
Q  208 ctacttcatccaacgagttgatgcagccaataaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacaacaatacaaatgttagcatatggtgtggcagca 307  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2213968 ctacttcacccagcgagttgatgccgccaacaaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacagcaatgcaaatgttagcatatggtgtggcagca 2214067  T
Q  308 tatgcgttcgatgaatacatcaaaataggaagtagtacaacattgga 354  Q
     ||||| | ||||||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||    
T  2214068 gatgcggtagatgaatacataaaaataggaggtactacagcattgga 2214114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 108 - 354
Target Start/End: Original strand, 46916095 - 46916341
Alignment:
Q  108 ccaatgagcctacatacgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccgaatggaaaaacatgttttccttcgaatcgttggagacctttcaggtagtgataa 207  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  46916095 ccaatgagcctacatatgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccggatgcaaaaacatgtcttccttcgaatcgttggagacctttcaagtagtgataa 46916194  T
Q  208 ctacttcatccaacgagttgatgcagccaataaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacaacaatacaaatgttagcatatggtgtggcagca 307  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  46916195 ctacttcacccagcgagttgatgccgccaacaaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacagcaatgcgaatgttagcatatggtgtggcagca 46916294  T
Q  308 tatgcgttcgatgaatacatcaaaataggaagtagtacaacattgga 354  Q
     ||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  46916295 gatgcggtagatgaatacatcaaaataggaggtactacagcattgga 46916341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 108 - 354
Target Start/End: Original strand, 3531888 - 3532134
Alignment:
Q  108 ccaatgagcctacatacgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccgaatggaaaaacatgttttccttcgaatcgttggagacctttcaggtagtgataa 207  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||    
T  3531888 ccaatgagcctacatatgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccggatgcaaaagcatgttttccttcgaatcgttggaggcctttcaattactgataa 3531987  T
Q  208 ctacttcatccaacgagttgatgcagccaataaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacaacaatacaaatgttagcatatggtgtggcagca 307  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||||||||    
T  3531988 ctacttcacccagcgagttgatgccgccaacaaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacagcaatgcgaatgttagcatatggcgtggcagca 3532087  T
Q  308 tatgcgttcgatgaatacatcaaaataggaagtagtacaacattgga 354  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  3532088 gatgcggtcgatgaatacatcaaaataggaggtactacaacattgga 3532134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 108 - 354
Target Start/End: Original strand, 3617033 - 3617279
Alignment:
Q  108 ccaatgagcctacatacgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccgaatggaaaaacatgttttccttcgaatcgttggagacctttcaggtagtgataa 207  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||    
T  3617033 ccaatgagcctacatatgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccggatgcaaaagcatgttttccttcgaatcgttggagacctttcaattactgataa 3617132  T
Q  208 ctacttcatccaacgagttgatgcagccaataaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacaacaatacaaatgttagcatatggtgtggcagca 307  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||||||||    
T  3617133 ctacttcacccagcgagttgatgccgccaacaaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacagcaatgcgaatgttagcatatggcgtggcagca 3617232  T
Q  308 tatgcgttcgatgaatacatcaaaataggaagtagtacaacattgga 354  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  3617233 gatgcggtcgatgaatacatcaaaataggaggtactacagcattgga 3617279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 108 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 8993276 - 8993030
Alignment:
Q  108 ccaatgagcctacatacgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccgaatggaaaaacatgttttccttcgaatcgttggagacctttcaggtagtgataa 207  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||    
T  8993276 ccaatgagcctacatatgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccggatgcaaaagcatgttttccttcgaatcgttggagacctttcaattactgataa 8993177  T
Q  208 ctacttcatccaacgagttgatgcagccaataaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacaacaatacaaatgttagcatatggtgtggcagca 307  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||||||||    
T  8993176 ctacttcacccagcgagttgatgccgccaacaaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacagcaatgcgaatgttagcatatggcgtggcagca 8993077  T
Q  308 tatgcgttcgatgaatacatcaaaataggaagtagtacaacattgga 354  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  8993076 gatgcggtcgatgaatacatcaaaataggaggtactacagcattgga 8993030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 108 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 13112054 - 13111808
Alignment:
Q  108 ccaatgagcctacatacgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccgaatggaaaaacatgttttccttcgaatcgttggagacctttcaggtagtgataa 207  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||    
T  13112054 ccaatgagcctacatatgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccggatgcaaaagcatgttttccttcgaatcgttggagacctttcaattactgataa 13111955  T
Q  208 ctacttcatccaacgagttgatgcagccaataaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacaacaatacaaatgttagcatatggtgtggcagca 307  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||||||||    
T  13111954 ctacttcacccagcgagttgatgccgccaacaaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacagcaatgcgaatgttagcatatggcgtggcagca 13111855  T
Q  308 tatgcgttcgatgaatacatcaaaataggaagtagtacaacattgga 354  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  13111854 gatgcggtcgatgaatacatcaaaataggaggtactacagcattgga 13111808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 108 - 354
Target Start/End: Original strand, 34436723 - 34436969
Alignment:
Q  108 ccaatgagcctacatacgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccgaatggaaaaacatgttttccttcgaatcgttggagacctttcaggtagtgataa 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| || |||||||    
T  34436723 ccaatgagcctacatacgacgatgcaatgtttcgtcaccggtaccggatgcaaaaacacgttttcctttaaattgttggagacctttcaagttgtgataa 34436822  T
Q  208 ctacttcatccaacgagttgatgcagccaataaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacaacaatacaaatgttagcatatggtgtggcagca 307  Q
    |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||    
T  34436823 ctacctcacccaacgagttgatgtagccaataaagaaggtatatcatcgttagcaaaatgtaccacaacaatgcgaattttagcatatggtgtggcagca 34436922  T
Q  308 tatgcgttcgatgaatacatcaaaataggaagtagtacaacattgga 354  Q
     ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34436923 gatgcggttaatgaatacatcaaaataggaagtagtacatcattgga 34436969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 159 - 354
Target Start/End: Original strand, 53182741 - 53182936
Alignment:
Q  159 aaaaacatgttttccttcgaatcgttggagacctttcaggtagtgataactacttcatccaacgagttgatgcagccaataaagaaggtatatcaccgtt 258  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53182741 aaaaacatgttttccttcgaatagttggagatctttcaagtagtgataactacttcacccaacgaattgatgcagccaataaagaaggtatatcaccgtt 53182840  T
Q  259 agcaaaatgtaccacaacaatacaaatgttagcatatggtgtggcagcatatgcgttcgatgaatacatcaaaataggaagtagtacaacattgga 354  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  53182841 agcaaaatgtaccacaacaatgcgaatgttagcatatggtgtggcagcagatgcggtcgatgaatacattaaaataggaagtagtacaacattgga 53182936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 108 - 354
Target Start/End: Original strand, 16173599 - 16173845
Alignment:
Q  108 ccaatgagcctacatacgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccgaatggaaaaacatgttttccttcgaatcgttggagacctttcaggtagtgataa 207  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  16173599 ccaatgagcctatatatgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccggatgcaaaaacacgttttcattcgaatcgttggagacctttcaattagtgataa 16173698  T
Q  208 ctacttcatccaacgagttgatgcagccaataaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacaacaatacaaatgttagcatatggtgtggcagca 307  Q
    |||||||| | | ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||| ||||||    
T  16173699 ctacttcacctagcgagttgatgccgccaacaaaaaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacaacaatgcgtatgttagcatatagtgtcgcagca 16173798  T
Q  308 tatgcgttcgatgaatacatcaaaataggaagtagtacaacattgga 354  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  16173799 gatgcggtcgatgaatacatcaaaataggaggtactacaacattgga 16173845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 283 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 28446278 - 28446207
Alignment:
Q  283 aatgttagcatatggtgtggcagcatatgcgttcgatgaatacatcaaaataggaagtagtacaacattgga 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28446278 aatgttagcatatggtgtggcagcagatgcggtcgatgaatacatcaaaataggaagtggtacaacattgga 28446207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 108 - 354
Target Start/End: Original strand, 29128 - 29374
Alignment:
Q  108 ccaatgagcctacatacgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccgaatggaaaaacatgttttccttcgaatcgttggagacctttcaggtagtgataa 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29128 ccaatgagcctacatacgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccggatgcaaaaacacgtttttcttcgaatcgttggagacctttcaagtagtgataa 29227  T
Q  208 ctacttcatccaacgagttgatgcagccaataaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacaacaatacaaatgttagcatatggtgtggcagca 307  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  29228 ctacttcacccaacgaattgatgcagccaataaagaaggtatatcaccgttaacaaaatgtaccacagcaatgcgaatgttagcatatggtgtgacagca 29327  T
Q  308 tatgcgttcgatgaatacatcaaaataggaagtagtacaacattgga 354  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29328 gatgcggtcgatgaatacatcaaaataggaagtagtacagcattgga 29374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 7)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 108 - 354
Target Start/End: Original strand, 24931843 - 24932089
Alignment:
Q  108 ccaatgagcctacatacgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccgaatggaaaaacatgttttccttcgaatcgttggagacctttcaggtagtgataa 207  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  24931843 ccaatgagcctaaatacgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccggatgcaaaaacacgttttccttcgaatcgtttgagacctttcaagtagtgataa 24931942  T
Q  208 ctacttcatccaacgagttgatgcagccaataaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacaacaatacaaatgttagcatatggtgtggcagca 307  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  24931943 ctacttcacccaacgagttgatgcaaccaataaagaaggtatattaccgttagcaaaatgtaccacagcaatgcgaatgttagcatatggtgtggcagca 24932042  T
Q  308 tatgcgttcgatgaatacatcaaaataggaagtagtacaacattgga 354  Q
     ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24932043 gatgcagtcgatgaatacatcaaaataggaagtagtacaacattgga 24932089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 108 - 354
Target Start/End: Original strand, 6379082 - 6379328
Alignment:
Q  108 ccaatgagcctacatacgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccgaatggaaaaacatgttttccttcgaatcgttggagacctttcaggtagtgataa 207  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6379082 ccaatgagcctacatatgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccggatgcaaaaacatgtcttccttcgaatcgttggagacctttcaagtagtgataa 6379181  T
Q  208 ctacttcatccaacgagttgatgcagccaataaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacaacaatacaaatgttagcatatggtgtggcagca 307  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  6379182 ctacttcacccagcgagttgatgccgccaacaaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacagcaatgcgaatgttagcatatggtgtggcagca 6379281  T
Q  308 tatgcgttcgatgaatacatcaaaataggaagtagtacaacattgga 354  Q
     ||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  6379282 gatgcggtagatgaatacatcaaaataggaggtactacagcattgga 6379328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 108 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 633004 - 632758
Alignment:
Q  108 ccaatgagcctacatacgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccgaatggaaaaacatgttttccttcgaatcgttggagacctttcaggtagtgataa 207  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  633004 ccaatgagcctacatatgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccggatgcaaaaacatgtcttccttcgaatcgttggagacctttcaagtagtgataa 632905  T
Q  208 ctacttcatccaacgagttgatgcagccaataaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacaacaatacaaatgttagcatatggtgtggcagca 307  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  632904 ctacttcacccagcgagttgatgccgccaacaaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacagcaatgcgaatgttagcatatggtgtggcagca 632805  T
Q  308 tatgcgttcgatgaatacatcaaaataggaagtagtacaacattgga 354  Q
     ||||| | ||||||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||    
T  632804 gatgcggtagatgaatacataaaaataggaggtactacagcattgga 632758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 108 - 354
Target Start/End: Original strand, 17959843 - 17960089
Alignment:
Q  108 ccaatgagcctacatacgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccgaatggaaaaacatgttttccttcgaatcgttggagacctttcaggtagtgataa 207  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||    
T  17959843 ccaatgagcctacatatgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccggatgcaaaagcatgttttccttcgaatcgttggagacctttcaattactgataa 17959942  T
Q  208 ctacttcatccaacgagttgatgcagccaataaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacaacaatacaaatgttagcatatggtgtggcagca 307  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||||||||    
T  17959943 ctacttcacccagcgagttgatgccgccaacaaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacagcaatgcgaatgttagcatatggcgtggcagca 17960042  T
Q  308 tatgcgttcgatgaatacatcaaaataggaagtagtacaacattgga 354  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  17960043 gatgcggtcgatgaatacatcaaaataggaggtactacagcattgga 17960089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 108 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 34840071 - 34839825
Alignment:
Q  108 ccaatgagcctacatacgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccgaatggaaaaacatgttttccttcgaatcgttggagacctttcaggtagtgataa 207  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||    
T  34840071 ccaatgagcctacatatgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccggatgcaaaagcatgttttccttcgaatcgttggagacctttcaattactgataa 34839972  T
Q  208 ctacttcatccaacgagttgatgcagccaataaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacaacaatacaaatgttagcatatggtgtggcagca 307  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||||||||    
T  34839971 ctacttcacccagcgagttgatgccgccaacaaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacagcaatgcgaatgttagcatatggcgtggcagca 34839872  T
Q  308 tatgcgttcgatgaatacatcaaaataggaagtagtacaacattgga 354  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  34839871 gatgcggtcgatgaatacatcaaaataggaggtactacagcattgga 34839825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 108 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 8220434 - 8220188
Alignment:
Q  108 ccaatgagcctacatacgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccgaatggaaaaacatgttttccttcgaatcgttggagacctttcaggtagtgataa 207  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8220434 ccaatgagcctacatatgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccggatgcaaaagtacgttttccttcgaatcgttggagacctttcaagtagtgataa 8220335  T
Q  208 ctacttcatccaacgagttgatgcagccaataaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacaacaatacaaatgttagcatatggtgtggcagca 307  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||| | |||||||||||||||| | ||||||    
T  8220334 ctacttcacccagcgagttgatgccgccaacaaagaaggtatatcacccttagcaaaatgtaccaaagcaatgcgaatgttagcatatggtttagcagca 8220235  T
Q  308 tatgcgttcgatgaatacatcaaaataggaagtagtacaacattgga 354  Q
     ||||| || ||||||||||||||||| || ||| |||| |||||||    
T  8220234 gatgcggtccatgaatacatcaaaatatgaggtactacagcattgga 8220188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 108 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 18640893 - 18640810
Alignment:
Q  108 ccaatgagcctacatacgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccgaatggaaaaacatgttttccttcgaatcgttggagacc 191  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  18640893 ccaatgagcctacatacgacgattcaatgtttcgtcgtcggtaccggatgcaaaaacacgttttccttcgaattgttggagacc 18640810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 11)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 108 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 17784851 - 17784605
Alignment:
Q  108 ccaatgagcctacatacgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccgaatggaaaaacatgttttccttcgaatcgttggagacctttcaggtagtgataa 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||  |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17784851 ccaatgagcctacatacgacgatgcaatgtttcgtcatcggtaccggatgcaaaaatctgttttcctttgaatcgttggagacctttcaagtagtgataa 17784752  T
Q  208 ctacttcatccaacgagttgatgcagccaataaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacaacaatacaaatgttagcatatggtgtggcagca 307  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  17784751 ctacttcacccaacgaattgatgcagccaataaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccatagcaatgcgaatgttagcatatggtgtggcagca 17784652  T
Q  308 tatgcgttcgatgaatacatcaaaataggaagtagtacaacattgga 354  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17784651 gatgcggtcgatgaatacatcaaaataggaagtagtacaacattgga 17784605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 108 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 31469615 - 31469369
Alignment:
Q  108 ccaatgagcctacatacgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccgaatggaaaaacatgttttccttcgaatcgttggagacctttcaggtagtgataa 207  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31469615 ccaatgagcctacatatgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccggatgcaaaaacatgtcttccttcgaatcgttggagacctttcaagtagtgataa 31469516  T
Q  208 ctacttcatccaacgagttgatgcagccaataaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacaacaatacaaatgttagcatatggtgtggcagca 307  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  31469515 ctacttcacccagcgagttgatgccgccaacaaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacagcaatgcgaatgttagcatatggtgtggcagca 31469416  T
Q  308 tatgcgttcgatgaatacatcaaaataggaagtagtacaacattgga 354  Q
     ||||| | ||||||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||    
T  31469415 gatgcggtagatgaatacataaaaataggaggtactacagcattgga 31469369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 108 - 352
Target Start/End: Original strand, 47299080 - 47299324
Alignment:
Q  108 ccaatgagcctacatacgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccgaatggaaaaacatgttttccttcgaatcgttggagacctttcaggtagtgataa 207  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  47299080 ccaatgagcctacatatgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtactggatgcaaaaacacgttttccttcgaatcgttggagaactttcaattagtgataa 47299179  T
Q  208 ctacttcatccaacgagttgatgcagccaataaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacaacaatacaaatgttagcatatggtgtggcagca 307  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  47299180 ctacttcacccagcgagttgatgccgccaacaaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacatcaatgcgaatgttagcatatggtgtggcagca 47299279  T
Q  308 tatgcgttcgatgaatacatcaaaataggaagtagtacaacattg 352  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  47299280 gatgcggtcgatgaatacatcaaaataggaggtactacaacattg 47299324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 108 - 354
Target Start/End: Original strand, 2476908 - 2477154
Alignment:
Q  108 ccaatgagcctacatacgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccgaatggaaaaacatgttttccttcgaatcgttggagacctttcaggtagtgataa 207  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||    
T  2476908 ccaatgagcctacatatgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccggatgcaaaagcatgttttccttcgaatcgttggagacctttcaattactgataa 2477007  T
Q  208 ctacttcatccaacgagttgatgcagccaataaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacaacaatacaaatgttagcatatggtgtggcagca 307  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||||||||    
T  2477008 ctacttcacccagcgagttgatgccgccaacaaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacagcaatgcgaatgttagcatatggcgtggcagca 2477107  T
Q  308 tatgcgttcgatgaatacatcaaaataggaagtagtacaacattgga 354  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  2477108 gatgcggtcgatgaatacatcaaaataggaggtactacagcattgga 2477154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 108 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 45240628 - 45240382
Alignment:
Q  108 ccaatgagcctacatacgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccgaatggaaaaacatgttttccttcgaatcgttggagacctttcaggtagtgataa 207  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||    
T  45240628 ccaatgagcctacatatgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccggatgcaaaagcatgttttccttcgaatcgttggagacctttcaattactgataa 45240529  T
Q  208 ctacttcatccaacgagttgatgcagccaataaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacaacaatacaaatgttagcatatggtgtggcagca 307  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||||||||    
T  45240528 ctacttcacccagcgagttgatgccgccaacaaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacagcaatgcgaatgttagcatatggcgtggcagca 45240429  T
Q  308 tatgcgttcgatgaatacatcaaaataggaagtagtacaacattgga 354  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  45240428 gatgcggtcgatgaatacatcaaaataggaggtactacagcattgga 45240382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 108 - 354
Target Start/End: Original strand, 48386687 - 48386933
Alignment:
Q  108 ccaatgagcctacatacgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccgaatggaaaaacatgttttccttcgaatcgttggagacctttcaggtagtgataa 207  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||    
T  48386687 ccaatgagcctacatatgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccggatgcaaaagcatgttttccttcgaatcgttggagacctttcaattactgataa 48386786  T
Q  208 ctacttcatccaacgagttgatgcagccaataaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacaacaatacaaatgttagcatatggtgtggcagca 307  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||||||||    
T  48386787 ctacttcacccagcgagttgatgccgccaacaaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacagcaatgcgaatgttagcatatggcgtggcagca 48386886  T
Q  308 tatgcgttcgatgaatacatcaaaataggaagtagtacaacattgga 354  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  48386887 gatgcggtcgatgaatacatcaaaataggaggtactacagcattgga 48386933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 104 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 51521684 - 51521442
Alignment:
Q  104 ttttccaatgagcctacatacgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccgaatggaaaaacatgttttccttcgaatcgttggagacctttcaggtagtg 203  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||    
T  51521684 ttttccaatgagcctacatatgacgatgcaatctttcgtcgtcggtaccggatgcaaaaacacgttttccttcgaattattggagaccattcaagtagtg 51521585  T
Q  204 ataactacttcatccaacgagttgatgcagccaataaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacaacaatacaaatgttagcatatggtgtggc 303  Q
    |||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  51521584 ataactacttcacctagcgagttgatgcagccaataaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacaacaatgtgaatgttagcatatggtgtggc 51521485  T
Q  304 agcatatgcgttcgatgaatacatcaaaataggaagtagtaca 346  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  51521484 agcagatgcggtcgatgaatacatcgaaataggatgtagtaca 51521442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 108 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 48405812 - 48405566
Alignment:
Q  108 ccaatgagcctacatacgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccgaatggaaaaacatgttttccttcgaatcgttggagacctttcaggtagtgataa 207  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||    
T  48405812 ccaatgagcctacatatgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccggatgcaaaagcatgttttccttcgaatcgttggagacctttcaattactgataa 48405713  T
Q  208 ctacttcatccaacgagttgatgcagccaataaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacaacaatacaaatgttagcatatggtgtggcagca 307  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  48405712 ctacttcacccagcgagttgatgccgccaacaaagaaggtatatcactgttagcaaaatgtaccacatcaatgcgaatgttagcatatggtgtggcagca 48405613  T
Q  308 tatgcgttcgatgaatacatcaaaataggaagtagtacaacattgga 354  Q
     ||| | ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  48405612 gatgtggtcgatgaatacatcaaaataggaggtactacagcattgga 48405566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 108 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 33165858 - 33165612
Alignment:
Q  108 ccaatgagcctacatacgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccgaatggaaaaacatgttttccttcgaatcgttggagacctttcaggtagtgataa 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||    
T  33165858 ccaatgagcctacatacgacgatgcaatgtttcgttgtcggtacctgatacaaaaacacgttttccttcgaatcattggagacctttcgagtggtgataa 33165759  T
Q  208 ctacttcatccaacgagttgatgcagccaataaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacaacaatacaaatgttagcatatggtgtggcagca 307  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||    
T  33165758 ctacttcacccaacgagttgatgcaaacaaaatagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacaacgatgtgaatgttagcatatggtgtggcagca 33165659  T
Q  308 tatgcgttcgatgaatacatcaaaataggaagtagtacaacattgga 354  Q
     ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33165658 gatgcggttgatgaatacatcaaaataggaagtagtacaacattgga 33165612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 108 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 8469808 - 8469562
Alignment:
Q  108 ccaatgagcctacatacgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccgaatggaaaaacatgttttccttcgaatcgttggagacctttcaggtagtgataa 207  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  8469808 ccaatgagcctacatatgacgatgcaatgtttcgtcgtcgataccagatgcaaaaacacgttttccttcgaatcgttgaagacctttcaagtagtgataa 8469709  T
Q  208 ctacttcatccaacgagttgatgcagccaataaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacaacaatacaaatgttagcatatggtgtggcagca 307  Q
    |||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||   |||| |||||||||||||| |||||    
T  8469708 ctacttcacctaacgagttgatgccgccaacaaagaaggtatatcacccttagcaaaatgtacgacataaatgtgaatgctagcatatggtgtgacagca 8469609  T
Q  308 tatgcgttcgatgaatacatcaaaataggaagtagtacaacattgga 354  Q
     ||||  | ||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  8469608 gatgcagttgatgaatacatcaaaataggaggtactacatcattgga 8469562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 108 - 354
Target Start/End: Original strand, 17679845 - 17680091
Alignment:
Q  108 ccaatgagcctacatacgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccgaatggaaaaacatgttttccttcgaatcgttggagacctttcaggtagtgataa 207  Q
    |||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||||  |||| ||||    
T  17679845 ccaatgagcctacatatgatgttgcaatgtttcgtcgtcggtaccggatgcaaaaacacgttttccttcgaattgttagagaactttcaattagtcataa 17679944  T
Q  208 ctacttcatccaacgagttgatgcagccaataaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacaacaatacaaatgttagcatatggtgtggcagca 307  Q
    |||||||| ||||| ||||||| | ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  17679945 ctacttcacccaacaagttgattccgccaacaaaaaaggtatatcactgttagcaaaatgtaccttaacaatgtgaatgttagcatatggtgtggcagca 17680044  T
Q  308 tatgcgttcgatgaatacatcaaaataggaagtagtacaacattgga 354  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  17680045 gatgcggtcgatgaatacatcaaaataggaggtactacaacattgga 17680091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1240 (Bit Score: 183; Significance: 6e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold1240
Description:

Target: scaffold1240; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 108 - 354
Target Start/End: Original strand, 1352 - 1598
Alignment:
Q  108 ccaatgagcctacatacgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccgaatggaaaaacatgttttccttcgaatcgttggagacctttcaggtagtgataa 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  1352 ccaatgagcctacatacgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccggaggcaaaaacacgttttccttcaaatcgttggagacctttcaagcagtgataa 1451  T
Q  208 ctacttcatccaacgagttgatgcagccaataaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacaacaatacaaatgttagcatatggtgtggcagca 307  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||    
T  1452 ctacttcacccaacgaattgatgcagccaataaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacaacaatgcgaatgttagcatatgatgtagcagca 1551  T
Q  308 tatgcgttcgatgaatacatcaaaataggaagtagtacaacattgga 354  Q
     ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1552 gatgcggtcgatgaagacatcaaaataggaagtagtacaacattgga 1598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 171; Significance: 9e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 108 - 354
Target Start/End: Original strand, 167822 - 168068
Alignment:
Q  108 ccaatgagcctacatacgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccgaatggaaaaacatgttttccttcgaatcgttggagacctttcaggtagtgataa 207  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |    
T  167822 ccaatgagcctacatatgacgatgcaatgtttcgtcgttggtaccggatgcaaaaacatgttttccttcgaatcgttggggacctttcaagtagtgatga 167921  T
Q  208 ctacttcatccaacgagttgatgcagccaataaagaaggtatatcaccgttagcaaaatgtaccacaacaatacaaatgttagcatatggtgtggcagca 307  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  167922 ctacttcacccagcaagttgatgcagccaataaagaaggtatatcacccttagcaaaatgtaccacaacaatacgaatgttagcatatggtgtggcaaca 168021  T
Q  308 tatgcgttcgatgaatacatcaaaataggaagtagtacaacattgga 354  Q
     ||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  168022 gatgcgatcgatcaatacataaaaataggaggtactacaacattgga 168068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 108 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 104331 - 104184
Alignment:
Q  108 ccaatgagcctacatacgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtaccgaatggaaaaacatgttttccttcgaatcgttggagacctttcaggtagtgataa 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  104331 ccaatgagcctacatacgacgatgcaatgtttcgtcgtcggtacctgatgcaaaaacacgttttccttcgaatcgttggagacctttcaagtagtgataa 104232  T
Q  208 ctacttcatccaacgagttgatgcagccaataaagaaggtatatcacc 255  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  104231 ctacttcacccaacgagttgatgcagccaataaagaaggtatatcacc 104184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University