View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF21669_high_13 (Length: 355)

Name: NF21669_high_13
Description: NF21669
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF21669_high_13
NF21669_high_13
[»] chr5 (72 HSPs)
chr5 (27-323)||(10463737-10464032)
chr5 (27-323)||(8336843-8337137)
chr5 (27-323)||(8313209-8313503)
chr5 (27-323)||(37103032-37103327)
chr5 (29-323)||(1683165-1683458)
chr5 (27-323)||(34785250-34785544)
chr5 (27-323)||(27335630-27335925)
chr5 (27-323)||(27307819-27308114)
chr5 (27-323)||(24636938-24637234)
chr5 (27-323)||(40158265-40158559)
chr5 (27-320)||(41139025-41139318)
chr5 (34-323)||(621626-621914)
chr5 (27-323)||(8404394-8404690)
chr5 (27-323)||(4462756-4463051)
chr5 (27-270)||(2003952-2004194)
chr5 (27-323)||(4426022-4426317)
chr5 (57-323)||(17742355-17742621)
chr5 (27-323)||(42877612-42877905)
chr5 (27-323)||(8218011-8218293)
chr5 (27-323)||(13920063-13920358)
chr5 (27-316)||(41192983-41193272)
chr5 (27-323)||(31211187-31211484)
chr5 (27-323)||(34527030-34527313)
chr5 (22-198)||(22023191-22023367)
chr5 (100-323)||(34009995-34010217)
chr5 (118-323)||(38693466-38693670)
chr5 (27-323)||(43440873-43441155)
chr5 (27-324)||(4461961-4462245)
chr5 (34-320)||(2005030-2005316)
chr5 (34-320)||(30394087-30394372)
chr5 (146-323)||(9687531-9687708)
chr5 (146-323)||(28456628-28456803)
chr5 (54-323)||(37446432-37446695)
chr5 (131-323)||(42852827-42853018)
chr5 (27-271)||(18261230-18261471)
chr5 (34-323)||(10674648-10674936)
chr5 (27-170)||(16965878-16966021)
chr5 (186-320)||(21837098-21837231)
chr5 (227-323)||(22023097-22023193)
chr5 (27-323)||(26865706-26865975)
chr5 (34-271)||(2262845-2263081)
chr5 (27-110)||(9687715-9687798)
chr5 (55-161)||(9924287-9924393)
chr5 (36-274)||(22166923-22167161)
chr5 (29-208)||(40272459-40272638)
chr5 (34-310)||(43210639-43210914)
chr5 (233-323)||(18950869-18950959)
chr5 (34-217)||(19332468-19332651)
chr5 (187-273)||(9924401-9924486)
chr5 (27-123)||(6365413-6365508)
chr5 (29-320)||(3548350-3548638)
chr5 (55-159)||(14049897-14050000)
chr5 (27-83)||(26865232-26865288)
chr5 (34-320)||(30698685-30698969)
chr5 (178-323)||(14049755-14049899)
chr5 (34-219)||(43209900-43210084)
chr5 (27-79)||(8217510-8217562)
chr5 (34-113)||(32537608-32537687)
chr5 (132-320)||(30733927-30734113)
chr5 (46-273)||(36875874-36876099)
chr5 (232-320)||(27280360-27280445)
chr5 (34-127)||(42645089-42645181)
chr5 (283-323)||(28616025-28616065)
chr5 (34-114)||(37812678-37812757)
chr5 (27-83)||(38693675-38693731)
chr5 (160-219)||(5597755-5597814)
chr5 (160-219)||(24334041-24334100)
chr5 (66-113)||(42852775-42852822)
chr5 (156-209)||(23425337-23425389)
chr5 (27-68)||(28456585-28456626)
chr5 (295-323)||(2004211-2004239)
chr5 (155-219)||(2567432-2567496)
[»] chr6 (45 HSPs)
chr6 (27-320)||(30660778-30661071)
chr6 (27-323)||(15721062-15721360)
chr6 (27-323)||(8709836-8710130)
chr6 (27-323)||(10915301-10915598)
chr6 (27-323)||(5974309-5974604)
chr6 (27-323)||(5087190-5087485)
chr6 (27-323)||(26356528-26356826)
chr6 (34-323)||(17697386-17697674)
chr6 (28-323)||(29691911-29692205)
chr6 (27-323)||(844106-844402)
chr6 (28-323)||(938845-939139)
chr6 (27-319)||(861362-861655)
chr6 (27-323)||(1820983-1821274)
chr6 (27-323)||(5079506-5079802)
chr6 (27-323)||(22731997-22732293)
chr6 (34-274)||(33518406-33518644)
chr6 (27-252)||(2087438-2087661)
chr6 (90-323)||(30492773-30493004)
chr6 (27-320)||(12481765-12482047)
chr6 (27-323)||(14256151-14256440)
chr6 (90-274)||(20510542-20510725)
chr6 (27-323)||(18502992-18503274)
chr6 (27-323)||(28476187-28476486)
chr6 (34-320)||(33744665-33744951)
chr6 (132-323)||(20977467-20977658)
chr6 (164-323)||(17245717-17245875)
chr6 (132-323)||(20977101-20977292)
chr6 (183-323)||(34046542-34046682)
chr6 (34-323)||(3375297-3375585)
chr6 (188-323)||(20897811-20897947)
chr6 (27-219)||(11400171-11400364)
chr6 (34-219)||(289461-289647)
chr6 (34-217)||(21108172-21108355)
chr6 (27-196)||(20898115-20898275)
chr6 (34-208)||(289005-289178)
chr6 (34-271)||(3914474-3914709)
chr6 (228-323)||(30353126-30353220)
chr6 (27-96)||(17246307-17246376)
chr6 (27-111)||(17244540-17244624)
chr6 (284-320)||(16736655-16736691)
chr6 (227-320)||(24958886-24958978)
chr6 (156-219)||(15053930-15053993)
chr6 (29-83)||(5079000-5079054)
chr6 (34-98)||(3913266-3913329)
chr6 (90-122)||(30916905-30916937)
[»] chr7 (63 HSPs)
chr7 (27-323)||(47791838-47792133)
chr7 (27-323)||(22378458-22378753)
chr7 (27-323)||(43597484-43597779)
chr7 (27-323)||(6588687-6588982)
chr7 (27-323)||(7238576-7238871)
chr7 (27-323)||(4926372-4926670)
chr7 (27-323)||(38158948-38159247)
chr7 (27-320)||(18059006-18059296)
chr7 (27-323)||(35482059-35482351)
chr7 (34-323)||(14990548-14990834)
chr7 (34-323)||(15420159-15420445)
chr7 (27-323)||(1961897-1962193)
chr7 (58-323)||(10620520-10620785)
chr7 (34-323)||(46044291-46044580)
chr7 (27-323)||(4899864-4900158)
chr7 (27-298)||(46330799-46331069)
chr7 (110-323)||(6330978-6331191)
chr7 (27-219)||(21109449-21109642)
chr7 (67-323)||(27727226-27727485)
chr7 (27-320)||(43574239-43574532)
chr7 (29-323)||(15652796-15653085)
chr7 (27-323)||(44167794-44168074)
chr7 (28-323)||(11396958-11397252)
chr7 (27-319)||(38199062-38199340)
chr7 (26-323)||(3495655-3495938)
chr7 (27-323)||(43083855-43084137)
chr7 (100-274)||(36019811-36019985)
chr7 (27-215)||(29156073-29156260)
chr7 (27-320)||(1544478-1544769)
chr7 (27-323)||(44080958-44081253)
chr7 (27-160)||(4883775-4883908)
chr7 (34-320)||(38598974-38599260)
chr7 (27-169)||(45958811-45958953)
chr7 (92-323)||(37539849-37540081)
chr7 (33-171)||(16080918-16081056)
chr7 (27-323)||(33624788-33625080)
chr7 (34-208)||(1066517-1066691)
chr7 (29-323)||(9633169-9633461)
chr7 (234-323)||(45958726-45958815)
chr7 (34-271)||(8832715-8832952)
chr7 (34-271)||(12621625-12621861)
chr7 (27-112)||(36020005-36020090)
chr7 (29-82)||(27727998-27728051)
chr7 (176-273)||(15130859-15130955)
chr7 (229-320)||(47139739-47139830)
chr7 (34-127)||(8081814-8081906)
chr7 (26-83)||(38199807-38199864)
chr7 (34-271)||(37107686-37107922)
chr7 (119-306)||(10463312-10463497)
chr7 (106-265)||(1065769-1065928)
chr7 (34-112)||(38593281-38593358)
chr7 (36-265)||(42974165-42974394)
chr7 (234-323)||(16080779-16080868)
chr7 (34-183)||(37108538-37108686)
chr7 (27-82)||(3496423-3496478)
chr7 (284-323)||(29155962-29156001)
chr7 (107-271)||(38594592-38594756)
chr7 (29-85)||(37537487-37537542)
chr7 (34-85)||(8082536-8082586)
chr7 (27-78)||(15130711-15130762)
chr7 (27-83)||(43083327-43083384)
chr7 (27-63)||(15131588-15131624)
chr7 (34-98)||(40304416-40304479)
[»] chr4 (67 HSPs)
chr4 (27-323)||(53323774-53324070)
chr4 (27-323)||(30331278-30331573)
chr4 (27-323)||(47309434-47309729)
chr4 (27-323)||(33177421-33177716)
chr4 (22-316)||(43937996-43938291)
chr4 (27-330)||(19522712-19523014)
chr4 (34-323)||(31316547-31316836)
chr4 (27-323)||(22068097-22068392)
chr4 (34-323)||(55938075-55938362)
chr4 (29-323)||(28448391-28448677)
chr4 (22-265)||(20177934-20178175)
chr4 (27-323)||(53423563-53423859)
chr4 (27-323)||(33689293-33689588)
chr4 (27-320)||(51876007-51876302)
chr4 (27-323)||(10321695-10321990)
chr4 (27-323)||(4850094-4850389)
chr4 (27-219)||(13718078-13718271)
chr4 (27-323)||(25422067-25422361)
chr4 (27-262)||(38114273-38114507)
chr4 (61-323)||(1870140-1870400)
chr4 (27-316)||(10085485-10085772)
chr4 (27-323)||(51395612-51395907)
chr4 (100-320)||(3873155-3873374)
chr4 (72-323)||(42972734-42972983)
chr4 (27-274)||(35060875-35061120)
chr4 (27-323)||(53571542-53571824)
chr4 (66-323)||(7490732-7490988)
chr4 (99-323)||(47463436-47463661)
chr4 (131-323)||(11670210-11670401)
chr4 (27-323)||(44209495-44209777)
chr4 (34-320)||(44289684-44289970)
chr4 (34-323)||(23473478-23473766)
chr4 (27-324)||(47379177-47379471)
chr4 (27-216)||(37329487-37329678)
chr4 (34-320)||(48082450-48082736)
chr4 (34-273)||(35821131-35821357)
chr4 (28-265)||(48219945-48220180)
chr4 (67-219)||(38499327-38499479)
chr4 (227-323)||(7617418-7617514)
chr4 (29-316)||(52947767-52948054)
chr4 (34-217)||(34513123-34513305)
chr4 (29-323)||(13603785-13604077)
chr4 (27-103)||(7617535-7617611)
chr4 (34-271)||(44452093-44452328)
chr4 (27-98)||(3873397-3873468)
chr4 (227-320)||(3862491-3862585)
chr4 (227-320)||(3871248-3871342)
chr4 (282-323)||(13717994-13718035)
chr4 (34-271)||(28163777-28164010)
chr4 (34-320)||(55283115-55283399)
chr4 (27-83)||(11670873-11670929)
chr4 (283-323)||(38114237-38114277)
chr4 (165-252)||(35351735-35351822)
chr4 (34-150)||(47939750-47939865)
chr4 (27-114)||(11670119-11670206)
chr4 (72-208)||(44452920-44453056)
chr4 (156-219)||(16618865-16618928)
chr4 (285-320)||(37437230-37437265)
chr4 (282-320)||(45557893-45557932)
chr4 (34-128)||(6817994-6818087)
chr4 (285-323)||(8770669-8770707)
chr4 (28-98)||(50824411-50824481)
chr4 (27-83)||(53569155-53569212)
chr4 (27-83)||(53571008-53571065)
chr4 (132-219)||(8949622-8949710)
chr4 (284-320)||(20177849-20177885)
chr4 (132-219)||(52788873-52788960)
[»] chr1 (67 HSPs)
chr1 (27-323)||(30719479-30719775)
chr1 (27-330)||(13501206-13501506)
chr1 (27-330)||(51561340-51561642)
chr1 (27-265)||(28700954-28701192)
chr1 (29-323)||(26020399-26020692)
chr1 (22-323)||(35530781-35531081)
chr1 (27-323)||(52493528-52493824)
chr1 (27-323)||(19791239-19791533)
chr1 (27-323)||(26805491-26805786)
chr1 (55-273)||(47008697-47008913)
chr1 (27-323)||(30982382-30982677)
chr1 (27-323)||(33708945-33709240)
chr1 (27-323)||(36367890-36368185)
chr1 (34-323)||(11999725-12000013)
chr1 (27-320)||(43504775-43505059)
chr1 (27-323)||(46596776-46597070)
chr1 (106-323)||(46517172-46517388)
chr1 (34-323)||(10041240-10041528)
chr1 (34-323)||(12368243-12368518)
chr1 (27-323)||(36248333-36248619)
chr1 (27-320)||(31400219-31400512)
chr1 (27-321)||(21091051-21091342)
chr1 (117-320)||(39681883-39682087)
chr1 (27-274)||(15053640-15053873)
chr1 (34-127)||(21794417-21794510)
chr1 (197-323)||(37986744-37986869)
chr1 (34-252)||(49767693-49767910)
chr1 (67-313)||(7565189-7565435)
chr1 (34-252)||(12251439-12251656)
chr1 (34-320)||(31024058-31024344)
chr1 (29-274)||(33707419-33707663)
chr1 (165-320)||(2059484-2059636)
chr1 (34-208)||(27550800-27550974)
chr1 (34-252)||(25351963-25352178)
chr1 (34-217)||(11397039-11397222)
chr1 (29-96)||(2059078-2059145)
chr1 (27-123)||(37986893-37986989)
chr1 (227-323)||(21794533-21794629)
chr1 (34-208)||(49768522-49768696)
chr1 (75-271)||(52882360-52882556)
chr1 (34-127)||(48218046-48218138)
chr1 (227-316)||(42972167-42972256)
chr1 (141-323)||(48410258-48410439)
chr1 (27-82)||(29231884-29231939)
chr1 (47-112)||(26207482-26207547)
chr1 (34-83)||(36249098-36249147)
chr1 (27-83)||(12367703-12367759)
chr1 (27-83)||(15054431-15054487)
chr1 (27-83)||(37986209-37986265)
chr1 (148-271)||(27551561-27551684)
chr1 (289-323)||(29231368-29231402)
chr1 (105-274)||(35188250-35188419)
chr1 (147-219)||(52881707-52881780)
chr1 (129-173)||(2059152-2059196)
chr1 (29-113)||(42971953-42972036)
chr1 (78-209)||(18996922-18997052)
chr1 (156-219)||(26507632-26507695)
chr1 (187-320)||(5430567-5430699)
chr1 (282-316)||(6216382-6216416)
chr1 (282-320)||(28479931-28479969)
chr1 (29-113)||(13083446-13083529)
chr1 (132-219)||(26451181-26451269)
chr1 (132-219)||(31861634-31861722)
chr1 (284-320)||(33707619-33707655)
chr1 (55-127)||(43396432-43396504)
chr1 (132-219)||(47632664-47632752)
chr1 (34-109)||(48410127-48410202)
[»] chr8 (70 HSPs)
chr8 (27-323)||(44265446-44265741)
chr8 (27-323)||(6018037-6018332)
chr8 (27-323)||(25101960-25102255)
chr8 (24-323)||(38706441-38706739)
chr8 (27-323)||(6590263-6590559)
chr8 (24-323)||(36470823-36471121)
chr8 (27-323)||(21135321-21135616)
chr8 (22-323)||(27875445-27875745)
chr8 (22-323)||(28015626-28015926)
chr8 (27-323)||(33322531-33322826)
chr8 (27-323)||(35863039-35863334)
chr8 (27-274)||(17498541-17498787)
chr8 (27-323)||(24451482-24451777)
chr8 (27-323)||(43622789-43623087)
chr8 (27-323)||(5250388-5250684)
chr8 (27-323)||(5695911-5696205)
chr8 (27-323)||(41590337-41590631)
chr8 (27-323)||(35369188-35369483)
chr8 (27-323)||(37967533-37967830)
chr8 (27-323)||(42499379-42499673)
chr8 (27-323)||(8784576-8784871)
chr8 (27-323)||(18839916-18840211)
chr8 (34-323)||(37706722-37707009)
chr8 (24-260)||(21159841-21160077)
chr8 (27-323)||(41281300-41281593)
chr8 (27-323)||(17842463-17842756)
chr8 (27-207)||(6413383-6413563)
chr8 (34-323)||(16472997-16473276)
chr8 (34-323)||(16477568-16477847)
chr8 (27-219)||(30658540-30658731)
chr8 (27-323)||(36063434-36063718)
chr8 (27-219)||(9252645-9252836)
chr8 (92-323)||(18304664-18304896)
chr8 (106-323)||(23483421-23483637)
chr8 (45-273)||(17062413-17062639)
chr8 (45-273)||(17585719-17585945)
chr8 (27-323)||(39336991-39337273)
chr8 (27-219)||(13323652-13323845)
chr8 (37-323)||(30968670-30968957)
chr8 (34-320)||(5765717-5766005)
chr8 (34-320)||(28755176-28755462)
chr8 (27-321)||(43988155-43988446)
chr8 (48-323)||(32514042-32514318)
chr8 (155-323)||(43936514-43936681)
chr8 (27-127)||(14121938-14122038)
chr8 (34-323)||(36018116-36018406)
chr8 (29-208)||(32244511-32244690)
chr8 (34-271)||(3865698-3865934)
chr8 (67-177)||(2826919-2827029)
chr8 (34-159)||(44894574-44894698)
chr8 (67-323)||(42024251-42024504)
chr8 (67-208)||(3866505-3866647)
chr8 (231-323)||(36126455-36126548)
chr8 (27-83)||(39337757-39337813)
chr8 (34-219)||(6243479-6243663)
chr8 (285-323)||(30658453-30658491)
chr8 (131-183)||(1663854-1663906)
chr8 (34-271)||(32243684-32243920)
chr8 (27-83)||(35369928-35369984)
chr8 (285-323)||(12469454-12469492)
chr8 (37-125)||(10409789-10409876)
chr8 (156-219)||(6244275-6244338)
chr8 (285-320)||(31185724-31185759)
chr8 (132-219)||(34050598-34050685)
chr8 (47-109)||(28701866-28701928)
chr8 (27-81)||(41255335-41255389)
chr8 (285-321)||(2827065-2827101)
chr8 (27-63)||(16478432-16478468)
chr8 (47-83)||(28694963-28694999)
chr8 (160-208)||(36333227-36333275)
[»] chr2 (54 HSPs)
chr2 (34-323)||(10357322-10357610)
chr2 (27-323)||(7439220-7439515)
chr2 (27-323)||(3043361-3043656)
chr2 (27-323)||(31771316-31771611)
chr2 (27-323)||(33832124-33832418)
chr2 (27-320)||(42274304-42274596)
chr2 (34-323)||(31436045-31436332)
chr2 (27-323)||(43932734-43933029)
chr2 (27-323)||(40364884-40365179)
chr2 (27-265)||(6457266-6457504)
chr2 (34-323)||(8737811-8738100)
chr2 (27-307)||(41120738-41121016)
chr2 (27-323)||(44492883-44493179)
chr2 (27-323)||(25100585-25100879)
chr2 (35-273)||(36512025-36512263)
chr2 (27-272)||(25666038-25666282)
chr2 (27-323)||(30784185-30784470)
chr2 (27-323)||(42487668-42487963)
chr2 (27-323)||(44286684-44286978)
chr2 (27-323)||(20721229-20721511)
chr2 (27-265)||(37592937-37593171)
chr2 (27-207)||(35498588-35498768)
chr2 (150-323)||(13371995-13372167)
chr2 (27-323)||(21439832-21440114)
chr2 (27-274)||(34073621-34073865)
chr2 (38-323)||(44879718-44879995)
chr2 (34-272)||(33000913-33001147)
chr2 (141-323)||(33031165-33031345)
chr2 (27-323)||(20719949-20720236)
chr2 (90-252)||(29809401-29809562)
chr2 (29-323)||(14200964-14201260)
chr2 (149-323)||(18672317-18672486)
chr2 (34-265)||(32319001-32319232)
chr2 (27-109)||(7654925-7655007)
chr2 (27-125)||(20719228-20719326)
chr2 (34-320)||(8392337-8392615)
chr2 (34-219)||(3117981-3118166)
chr2 (34-208)||(32318223-32318398)
chr2 (29-107)||(33031087-33031165)
chr2 (232-320)||(13027445-13027533)
chr2 (249-323)||(29809254-29809328)
chr2 (282-323)||(35498806-35498847)
chr2 (27-83)||(23787782-23787838)
chr2 (27-83)||(20701256-20701312)
chr2 (27-83)||(21439296-21439352)
chr2 (133-323)||(18917309-18917493)
chr2 (288-323)||(19058643-19058678)
chr2 (34-116)||(13027654-13027735)
chr2 (34-219)||(32319624-32319809)
chr2 (27-80)||(18672259-18672312)
chr2 (288-321)||(37592894-37592927)
chr2 (227-316)||(3118639-3118728)
chr2 (29-79)||(4327848-4327898)
chr2 (132-219)||(45301279-45301367)
[»] scaffold0445 (1 HSPs)
scaffold0445 (34-323)||(5917-6205)
[»] chr3 (63 HSPs)
chr3 (34-323)||(23883390-23883678)
chr3 (27-323)||(29348275-29348567)
chr3 (27-323)||(45419785-45420078)
chr3 (27-323)||(53517784-53518079)
chr3 (27-323)||(38173902-38174197)
chr3 (27-323)||(44808839-44809135)
chr3 (27-330)||(25250016-25250316)
chr3 (27-323)||(37178941-37179237)
chr3 (27-323)||(27492313-27492609)
chr3 (27-323)||(40762600-40762895)
chr3 (27-273)||(21749566-21749811)
chr3 (27-303)||(32146996-32147271)
chr3 (37-315)||(11045412-11045691)
chr3 (27-316)||(19669699-19669988)
chr3 (27-323)||(23917328-23917615)
chr3 (27-274)||(53397095-53397343)
chr3 (27-323)||(50615084-50615366)
chr3 (27-323)||(45235344-45235641)
chr3 (27-323)||(32943000-32943281)
chr3 (27-323)||(11293800-11294089)
chr3 (50-320)||(45406698-45406955)
chr3 (27-323)||(117447-117729)
chr3 (34-320)||(39562552-39562838)
chr3 (24-213)||(28685303-28685487)
chr3 (130-323)||(44557579-44557771)
chr3 (34-320)||(46295058-46295345)
chr3 (27-256)||(19601549-19601777)
chr3 (27-274)||(53439324-53439556)
chr3 (67-271)||(25232695-25232900)
chr3 (29-219)||(54268948-54269138)
chr3 (29-208)||(44555919-44556098)
chr3 (34-271)||(52701168-52701404)
chr3 (175-323)||(23921075-23921220)
chr3 (64-181)||(45387449-45387566)
chr3 (29-184)||(15772002-15772157)
chr3 (29-208)||(33475471-33475650)
chr3 (60-320)||(34995564-34995823)
chr3 (34-271)||(33476241-33476477)
chr3 (29-124)||(3173707-3173802)
chr3 (132-261)||(9018125-9018253)
chr3 (65-209)||(26268683-26268826)
chr3 (34-208)||(41927953-41928126)
chr3 (34-139)||(53377329-53377436)
chr3 (27-124)||(37481253-37481351)
chr3 (34-271)||(8575953-8576191)
chr3 (34-219)||(31991074-31991259)
chr3 (27-83)||(116924-116980)
chr3 (130-271)||(41927360-41927501)
chr3 (156-323)||(44287768-44287933)
chr3 (27-83)||(44555364-44555420)
chr3 (27-83)||(50614546-50614602)
chr3 (191-265)||(53377430-53377503)
chr3 (282-323)||(54268854-54268895)
chr3 (227-316)||(8575377-8575466)
chr3 (57-116)||(44287969-44288028)
chr3 (34-85)||(52701897-52701947)
chr3 (156-219)||(55006177-55006240)
chr3 (107-208)||(53520018-53520120)
chr3 (287-320)||(9018280-9018313)
chr3 (290-323)||(15771903-15771936)
chr3 (155-212)||(53658029-53658086)
chr3 (284-320)||(20078100-20078136)
chr3 (66-114)||(44557774-44557822)
[»] scaffold0651 (1 HSPs)
scaffold0651 (34-323)||(6862-7151)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (29-323)||(17377-17669)
[»] scaffold1160 (1 HSPs)
scaffold1160 (29-323)||(1159-1455)
[»] scaffold0148 (2 HSPs)
scaffold0148 (27-323)||(35273-35568)
scaffold0148 (27-83)||(38618-38674)
[»] scaffold1191 (1 HSPs)
scaffold1191 (27-323)||(669-964)
[»] scaffold0707 (1 HSPs)
scaffold0707 (34-274)||(6950-7188)
[»] scaffold0562 (2 HSPs)
scaffold0562 (100-320)||(3974-4193)
scaffold0562 (27-98)||(4216-4287)
[»] scaffold0097 (3 HSPs)
scaffold0097 (27-323)||(25057-25339)
scaffold0097 (27-323)||(23787-24074)
scaffold0097 (27-125)||(23066-23164)
[»] scaffold0514 (1 HSPs)
scaffold0514 (27-300)||(6197-6470)
[»] scaffold0627 (1 HSPs)
scaffold0627 (27-323)||(6931-7227)
[»] scaffold1190 (1 HSPs)
scaffold1190 (27-323)||(202-486)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (126-323)||(158028-158223)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (27-323)||(240012-240294)
scaffold0003 (27-83)||(239492-239548)
[»] scaffold0640 (1 HSPs)
scaffold0640 (34-320)||(3895-4181)
[»] scaffold0385 (2 HSPs)
scaffold0385 (27-323)||(9960-10245)
scaffold0385 (27-83)||(9424-9479)
[»] scaffold0571 (2 HSPs)
scaffold0571 (27-173)||(8430-8575)
scaffold0571 (185-323)||(8610-8748)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (186-323)||(21750-21886)
[»] scaffold0199 (2 HSPs)
scaffold0199 (27-124)||(6204-6301)
scaffold0199 (141-183)||(6305-6347)
[»] scaffold0734 (2 HSPs)
scaffold0734 (34-208)||(3260-3436)
scaffold0734 (233-320)||(2854-2941)
[»] scaffold0024 (1 HSPs)
scaffold0024 (132-314)||(47860-48041)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (27-113)||(48967-49053)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (34-170)||(282940-283076)
scaffold0005 (34-252)||(283308-283525)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (190-323)||(52512-52645)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (156-209)||(123298-123351)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 72)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Original strand, 10463737 - 10464032
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  10463737 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttgagtttttgaacaattttttacagacgtgttaagaacattactaaaagttcctatgcaaaaaat 10463836  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  10463837 tgtcgcaaaatttgatttctacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgtcgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaa 10463935  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10463936 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 10464032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Original strand, 8336843 - 8337137
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  8336843 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttgagtttttgaacaattttttactgacgtgttaagaacattactaaaagttcctatgcaaaaaat 8336942  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  8336943 tgtcgcaaaatttgatttctacgtctagattttgttaattttatctttaacttttgcagttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaa 8337041  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||       || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8337042 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtctc-aaaaaatcattcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 8337137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Original strand, 8313209 - 8313503
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||    
T  8313209 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttgagtttttgaacaattttttacatacgtgttaagaacattattaaaagttcttatgcaaaaaat 8313308  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  8313309 tgtcgcaaaatttgatttctacgtccatattttgttaattttatttttaacttttgtcgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt--aaaaa 8313406  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8313407 ttctgaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgcctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 8313503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Original strand, 37103032 - 37103327
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37103032 tcaattcaaatttgtttaatttatgcataaactcttgaatttttgaataattttttacaaacgtgttaagaacattactaaaagttcctctgcaaaaaat 37103131  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
    | |  ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||           
T  37103132 tatctcaaaatttaatttctacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgtcgttttaaaaaattcatttttaattcgtttcatgtt-agaaaa 37103230  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37103231 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtctaaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaataaactt 37103327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 29 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 1683458 - 1683165
Alignment:
Q  29 aattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattg 128  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  1683458 aattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttgagtttttggataattttttgcagacatgttaacaacattactaaaagctcctatgcaaaaaattg 1683359  T
Q  129 ttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnntt 228  Q
    |  ||||| |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||    
T  1683358 tcacaaaatttgatttatacgtccatattttattacttttatcattaacttttgtcgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaatt 1683260  T
Q  229 ctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||        ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1683259 ctaaattttagtaaatgaacttttcatagtgttctaaacttgtcttaaagaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggatagttaaacaaactt 1683165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 34785544 - 34785250
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34785544 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaacttttgagtttttgtacaatttttt-cagacgtgttaagaatattactaaaagttcctttgcaaaaaat 34785446  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||           
T  34785445 tgtcgcaaaatttgatttttacgtccaaattttgttaattttatctttaacttttgtcgttttaaaaaatttatatttaattcgttttatgttaaaaaaa 34785346  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||        ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34785345 tt-taaattttagtaaatgaacctttcatagtgttataaacttgtctaaaaaaaatcgttaaaaaatttaagaatttaaggataattaaacaaactt 34785250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Original strand, 27335630 - 27335925
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  27335630 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttgagtttttaaacaattttttgcatatgtgttaagaacattactaaaagttcctctgtaaaaaat 27335729  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
    ||| |||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  27335730 tgtcgcaaaatttgatttttacgcccatattttgttaattttatctttaacttttgtcgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaaaa 27335829  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
     | |||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||        | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27335830 -tataaattttggtaaatgaacctttcataatgttttaaacttgtcttaaaaaaattgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaataaactt 27335925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Original strand, 27307819 - 27308114
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| || |||||| |||||| || ||||||||||    
T  27307819 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttgagtttttgaacaattttttacagacgtgttaaaaacattactgaaagtttctatgcaaaaaat 27307918  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||           
T  27307919 tgtcgcaaaatttgatttctacgtcaagattttgttaattttatctttaacttttgccgttttaaaaaattcatatttaatttgtttcatgtt-aaaaaa 27308017  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    ||||||||| | ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27308018 ttctaaattgtggtaaatgaatctttcatagttttctaaacttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 27308114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 24637234 - 24636938
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  24637234 tcaattcaaatttgattaatttatgcttaaactcttaagttttttaacaattttttgtagacgtgttaagaacattactaaaagttcctccgcaaaaaat 24637135  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
    | | |||||| ||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  24637134 tatcgcaaaatttgatttctacttccagattttattacttttatctttaagttttgccattttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaa 24637036  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtct-cnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24637035 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctaaaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 24636938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Original strand, 40158265 - 40158559
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||     
T  40158265 tcaatttaaatttgtttaatttatgcttaaactcttgagtttttgaacaatttttcgcatacgtgttaagaacattacaaaaagttcctctacaaaaaaa 40158364  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
    | | |||||| ||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  40158365 tttcgcaaaatttgatatctacgtccataatttgttaattttatctttaacttttgtcattttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaa 40158463  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40158464 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatag-gttataaacttgtcataaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 40158559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 27 - 320
Target Start/End: Original strand, 41139025 - 41139318
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  41139025 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaatctcttaagttttttaacaattttttgtagacatgttaagaacattactaaaagttcctccgcaaaaaat 41139124  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
    | | |||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |           
T  41139125 tatcgcaaaatttgatttatatgtccagattttattacttttatctttaacttttatcgttttcaaaaattcatatttaattcatttcatgataaaaaaa 41139224  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaa 320  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| ||||||||       |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41139225 ttctaaattttagtaattgaacctttcacaatgttctaaacttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaaaagtttaaggataattaaacaaa 41139318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 34 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 621914 - 621626
Alignment:
Q  34 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 133  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| || |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  621914 aaatttctttaatttatgcttaaacttttgagtttttgaacaatttttggcagacgtgttaaaaacattactaaaagttcctctgcaaaaaattgtcgca 621815  T
Q  134 aaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaa 233  Q
    |||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||       || ||||    
T  621814 aaatgtgatttctacatccagattttgttaattttatctttaagttttgccgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaattgtaaa 621716  T
Q  234 ttttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||       |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  621715 ttctagtaaatgaaccttttatagtgttctaaatctgtctcataaaaatcgttctaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 621626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 8404690 - 8404394
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |    
T  8404690 tcaattcaagtttgtttaatttatgcttaaactcttgaatttttaaacaattttttgcagacgtgttaagaacattactaaaaattcatctgcaaaaagt 8404591  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
    ||| |||||| ||||||| || || || ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  8404590 tgtcgcaaaatttgatttttaagttcaaattttattaattttatctttaacttttgccgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaaaa 8404491  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
     |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8404490 atctaaattttggtaaatgaaccttttttagtgttctaaacttgtcttaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 8404394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Original strand, 4462756 - 4463051
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| |||| ||| ||| ||||| ||||||||    
T  4462756 tcaattcaaatttgtttcatttatgctttaactcttgagtttttgaacaattatttgcagacgtgttaagaacattattaatagtccctctacaaaaaat 4462855  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||           
T  4462856 tgttgcaaaatttgatttctacatcctgattttgttaattttatctttaacttttgccgtttttaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aacaaa 4462954  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||| ||||||||       |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4462955 ttctaaattttagtcaatgaatctttcatagtactctaaacttgtctcgaaaaaatcgtacaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 4463051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 27 - 270
Target Start/End: Original strand, 2003952 - 2004194
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  2003952 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttgagtttttgaacaactttttgcgtacgtgttaagaacattactaaaagttcatctgcaaaaaat 2004051  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
    ||| |||||| ||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  2004052 tgtcgcaaaatttgatttttatgtccagattttgttaactttatctttaacttttgccgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-taacaa 2004150  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttg 270  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2004151 ttctaaattgtagaaaatgaacctttcatagtgttctaaacttg 2004194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Original strand, 4426022 - 4426317
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| || ||||||||||||||| | |||||  |||||||||||| |||||||| || || | ||||||| |||||||||||||||| |||  |||||    
T  4426022 tcaattcaattttgtttaatttatgtttaaacttctgagtttttgaataattttttacatacgtcttaagaacattactaaaagttcctatgcgcaaaat 4426121  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
    |||||||||| || |||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  4426122 tgttgcaaaatttaatttttacgtctagatttagttaaatttatctttaacttttgccgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaa 4426220  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4426221 ttctaaattttagtaaatgaatatttcatagtgttctaaacttatctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 4426317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 57 - 323
Target Start/End: Original strand, 17742355 - 17742621
Alignment:
Q  57 actcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccagat 156  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||    
T  17742355 actcttgagtttttaaacgattttttgcagacgtgttaagaacattactaaaagttcctctgtaaaatattgtcgcaaaatttgatttctacgtccagat 17742454  T
Q  157 tttgttaattttatctttaacttttgttgtttt-aaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcat 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||        ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  17742455 tttgttaattttatctttaacttttgccgttttaaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaaaa-tctaagttttggtaaatgaacctttcat 17742553  T
Q  256 agtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    |||||||||| ||| |||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17742554 agtgttctaaacttatcttaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 17742621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 42877905 - 42877612
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| | | || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42877905 tcaattcaaatttgtttaattcatgcttaaactcttgagtttttaaacaattttt-gtagacgtgttaagaacattactaaaagttcctctgcaaaaaat 42877807  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
    ||| |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||           
T  42877806 tgtcgcaaaattttatttctacgtccagattttgttaattttatctttatcttttgtcgtttt-aaaaattcatatttaattcgtttcatcttaaaaaaa 42877708  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
     | |||||||| ||||||||||||||||| |  |||||| |||||||        || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42877707 at-taaattttggtaaatgaacctttcatggcattctaaacttgtcttaaaaatatccttcaaaaatttaagagtttaagaataattaaacaaactt 42877612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 8218293 - 8218011
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  8218293 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagttttttaacaattttttgtagacgtgttaagaacattactaaaagttcctccgcaaaaaat 8218194  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
    | |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||             |||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  8218193 tattgcaaaatttgatttatatgtccagattttattacttttatc-------------gttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaa 8218108  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||       |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8218107 ttctaaattttagtaattgaacctttcatagtgttctaaacttatctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagactttaaggataattaaacaaactt 8218011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Original strand, 13920063 - 13920358
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||| | || ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||    
T  13920063 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactattaagttttttaacaattttttgtagacgtgttaagaacattaataaaagttcctccgcaaaaaat 13920162  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
    | | |||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| |  |||| ||| ||||||||||||||  |||||||||           
T  13920163 tatcgcaaaatttgatttatatgtccaaattttattacttttatctttaacttttatcattttcaaatattcatatttaattaatttcatgtt-aaaaaa 13920261  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||       ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13920262 ttctaaattttaataattgaacatttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaattgaagagtttaaggataattaaacaaactt 13920358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 27 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 41193272 - 41192983
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaa-ttttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaa 125  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||| ||  | |||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  41193272 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaacttttgattttttgaacaacttttttacagccgtgttaagaatgttgctaaaagttcctctgcaaaaaa 41193173  T
Q  126 ttgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnn 225  Q
    || | |||||| |||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||          
T  41193172 ttatcgcaaaatttgaattctacgtccagatttagttaattttatctttaacttttaccgttttaaaaaattcatattcaattcgttttatgtt-aaaaa 41193074  T
Q  226 nttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaa 316  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||        | |||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  41193073 attctaaatttttgtaaatgaacctttgatagtgttctaaacttgtctaacaaaaatagttcaaaagtttaagagcttaaggatagttaaa 41192983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Original strand, 31211187 - 31211484
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaatttttt-gcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaa 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||| | | |   |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  31211187 tcaatttaaatttgtttaatttatacttaaattcttaagtttttgaacaatttttttgtagattagttaagaacattactaaaagttcctctgcataaaa 31211286  T
Q  126 ttgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnn 225  Q
    || |||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||| || ||||||||||||||| |||||||||||| || |||| |||||||||||| ||          
T  31211287 ttattgcaaaatttgatttctacgtcccgattttattacttatatctttaacttttgctgttttaaaaaactcctattgaattcgtttcatattaaaaaa 31211386  T
Q  226 nttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtct-cnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
      |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31211387 a-tctaaatttttgtaaataaacctttcatattgttctaaacttgtttaaaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 31211484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Original strand, 34527030 - 34527313
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || | |||||| |||| || |||||||||||| | || ||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||       
T  34527030 tcaattcaaatttgtttaatttattcttatactcttaagttgtttaacaattttttgtagacgtgttaagaacattactaaatgttccgccgcaaaat-- 34527127  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
               |||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||           
T  34527128 -----------ttgatttatatgtccatattttattacttttatctttaacttttattgtttttaaaaattcatatttaatttgtttcatgttaaaaaaa 34527216  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||       |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34527217 ttctaaattttattaattgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaattcgttcaaaaatttaagaatttaaggataattaaacaaactt 34527313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 22 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 22023367 - 22023191
Alignment:
Q  22 catcatcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaa 121  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||| | ||    
T  22023367 catcctcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttgaatttttgaacaattttttgtagacgtgttaagaacattactaaaagttcctcggtaa 22023268  T
Q  122 aaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattc 198  Q
    |||||||| |||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  22023267 aaaattgtcgcaaaatttgatttctacgtccgaattttgttaattttagctttaacttttttcgttttaaaaaattc 22023191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 100 - 323
Target Start/End: Original strand, 34009995 - 34010217
Alignment:
Q  100 attactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattca 199  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  34009995 attactaaaagttcctctccaaaaaattgacgcaaaatttgatttctacgttcagattttgttaattttatcttaaacttttgccgttttaaaaaattca 34010094  T
Q  200 tatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaaga 299  Q
    ||||||||| |||| ||| |       |||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||       | || |||||||||||||    
T  34010095 tatttaatttgttttatggt-aaaaaattctaaattttagttaatgaacctttcttagtattctaaacttgtctcaaaaaaatagtacaaaaatttaaga 34010193  T
Q  300 gtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  34010194 gtttaaggataattaaacaaactt 34010217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 118 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 38693670 - 38693466
Alignment:
Q  118 gcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatg 217  Q
    |||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  38693670 gcaaaaaattatcgcaaaatttgatttatatgtccagattttattacttttatctttaacttttatcattttcaaaaattcatatttaattcgtttcatg 38693571  T
Q  218 ttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaac 317  Q
    ||       || ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38693570 tt-aaaaaattataaattttagtaattgaacctttcatagtattctaaacttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaac 38693472  T
Q  318 aaactt 323  Q
    ||||||    
T  38693471 aaactt 38693466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 43441155 - 43440873
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| | |  ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||    
T  43441155 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagttttttaacaattttttgtagatgtgttaagaacattattaaaagttcctccgcaaaaaat 43441056  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
    | | |||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||             ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||           
T  43441055 tatcgcaaaatttgatttatatgtccatattttattacttttatc-------------gttttcaaaaattcatattgaattcgtttcatgtt-aaaaaa 43440970  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||       || ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  43440969 ttataaattttagtaattgaacctttcatagtgttctaaacttatctcaaaaaaatcattcaaaaatttaagaatttaaggataatcaaacaaactt 43440873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 27 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 4462245 - 4461961
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgc--aaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaa 124  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  | || |||| |||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  4462245 tcaattcaaatgtgtttaatttatgcttaaactcttaagtttttgaacaattttttgcatatacgtgtttagaacattactaaaagttcctccgcaaaaa 4462146  T
Q  125 attgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnn 224  Q
     || | | |||| | ||||| ||| |||||||||||||                ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||         
T  4462145 cttatcgtaaaattagatttctacatccagattttgtt--------------gctttgtcgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-agaa 4462061  T
Q  225 nnttctaaattttagtaaatgaacc-tttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
      ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||| ||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4462060 agttctaaattttagtaaatgaacctttttatagtgtattaaacttgtctc-aaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 4461962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 34 - 320
Target Start/End: Original strand, 2005030 - 2005316
Alignment:
Q  34 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 133  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| || || |||||||||  ||| | |||| ||||| | |||||| | | |||    
T  2005030 aaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagtttttcaacaattttttacagacgtgttaagaacgttatttaaaggtcctccg-aaaaaaatatcgca 2005128  T
Q  134 aaaa-ttgatttatacgtccaga-ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttcta 231  Q
    |||| ||||||| |||||||| | |||| ||| || |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||       || ||    
T  2005129 aaaatttgatttctacgtccatatttttcttacttatatcttaaacttttgtcgttttaaaaaattcatatttaatttatttcatgtt-aaaaaattata 2005227  T
Q  232 aattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaa 320  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |        || || |||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  2005228 gattttagtaaatgaacctttcatagtgttataatcttgtataaaaagaatctttaaaaaatttaagagtttaaagataattaagcaaa 2005316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 34 - 320
Target Start/End: Original strand, 30394087 - 30394372
Alignment:
Q  34 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 133  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| || || |||||||||  ||| |||||| ||||| | |||||| | | |||    
T  30394087 aaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagtttttcaacaattttttacagacgtgttaagaacgttattaaaaggtcctccg-aaaaaaatatcgca 30394185  T
Q  134 aaaa-ttgatttatacgtccaga-ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttcta 231  Q
    |||| ||||||| |||||||| | |||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||       || ||    
T  30394186 aaaatttgatttctacgtccatatttttgttacttatatcttaaacttttgtcgttttaaaaaattcatatttaatttatttcatgtt-aaaaaattata 30394284  T
Q  232 aattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaa 320  Q
     ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||| |        ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  30394285 gattttagcaaatgaacc-ttcatagtgttataaacttgtataaaaagaatcgttaaaaaagttaagagtttaaggataattaagcaaa 30394372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 146 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 9687708 - 9687531
Alignment:
Q  146 tacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgtt-gttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaat 244  Q
    |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||     
T  9687708 tacgtcaaaattttattaattttatctttaactttttttcgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaattctaaattttagtaaac 9687610  T
Q  245 gaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| | ||       ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9687609 gaaccttttatagtgttctaaacttatatcaaaaaaatcgattaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 9687531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 146 - 323
Target Start/End: Original strand, 28456628 - 28456803
Alignment:
Q  146 tacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatg 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||          ||||||||||| ||||    
T  28456628 tacgtccagattttgttaattttatctttaactttt-ttcgtttaaaaaattcatatttaattagtttcatgttaaaaaaa-agtaaattttagttaatg 28456725  T
Q  246 aacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    ||| ||||||||| |||||| ||||||||       |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28456726 aacttttcatagtattctaaacttgtctcacaaaaatcgtacaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 28456803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 54 - 323
Target Start/End: Original strand, 37446432 - 37446695
Alignment:
Q  54 aaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtcca 153  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||||  |||||   || |||||||| ||||||| | | | ||    
T  37446432 aaaactcttaagtttttgaacaattttttacagacatgttaagaacgttactaaaagttccttcgcaaagttttattgcaaaatttgatttctgcataca 37446531  T
Q  154 gattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttc 253  Q
    ||     ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||       |||||||||||||||| |||||| ||     
T  37446532 ga-----ttacttttatctttaacttttgtcgttttaaaaaatttatatttaattcgtttcacattaaaaaaattctaaattttagtaagtgaaccattt 37446626  T
Q  254 atagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    |||  ||||||| ||||| |        || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37446627 atatggttctaaacttgt-tttaaaaaatctttcaacaatttaagagttcaaggataattaaacaaactt 37446695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 131 - 323
Target Start/End: Original strand, 42852827 - 42853018
Alignment:
Q  131 gcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttct 230  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || |||||||||||||||| || ||||||||||| |||       || |    
T  42852827 gcaaaatttgatttctacgtccagattttgttacttttatttttaactttagtcgttttaaaaaattcattttaaattcgtttcacgttgaaaaattt-t 42852925  T
Q  231 aaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||        |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  42852926 aaattttagtaaatgaatctttcatattgttctaaacttatctcataaaaaacgttcaaaaattcaagaatttaagaataattaaacaaactt 42853018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 27 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 18261471 - 18261230
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaa--aaa 124  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||  |||| | |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||    
T  18261471 tcaattcaaatttgtttaatt-atgcttaaattcttaagttttcaaacattcttttacaaacgtgttaagaacattactaaaagttcctctgcaaaaaaa 18261373  T
Q  125 attgttgcaaaaattgatttatacgtccaga-ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnn 223  Q
    ||| | |||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||||    | | ||| ||| |||||||||        
T  18261372 attatcgcaaaatttgatttctacgtccagatttttgttagttttatcttgaacttttgtcgtttaaaaaa----aaaattagttcatttcatgtt-aaa 18261278  T
Q  224 nnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgt 271  Q
       ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||    
T  18261277 aaattctaaattttagtaaatggacctttcatagtgttataaacttgt 18261230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 34 - 323
Target Start/End: Original strand, 10674648 - 10674936
Alignment:
Q  34 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 133  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||||| ||||  |||||| || |||||||||||||| | | ||||||||  |  ||    
T  10674648 aaatttgtataatt-atgcttaaacttttaagattttgaacaattttttacaaaagtgttaaaaacattactaaaagttcatatacaaaaaatcatctca 10674746  T
Q  134 aaaattgatttatacgtccaga-ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaa 232  Q
    ||| ||  ||| |||||||| | |||||||| ||||||||| |||||| ||  ||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||       ||||||    
T  10674747 aaattttgtttctacgtccatatttttgttacttttatcttgaactttggtattttaaaaatattcatatttaattcattttatgtt-aataaattctaa 10674845  T
Q  233 attttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    ||||||||||| ||||||||  | ||||||||| ||||||||       ||||| ||| |||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  10674846 attttagtaaacgaaccttttgtggtgttctaaacttgtctcaaaaaaatcgtttaaagatttaaaagtttaaggataattagagaaactt 10674936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 27 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 16966021 - 16965878
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||| ||||  |||||| |||||| ||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  16966021 tcaatttaaatttgtttaatttatgtttaaagtcttacgttttttaacaatattttgtagacgtgttaagaacattactaaaagttcctccgcaaaaaat 16965922  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttat 170  Q
    | | |||||| ||||||| || ||||||||||| ||| ||||||    
T  16965921 tatcgcaaaatttgatttttatgtccagattttattacttttat 16965878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 186 - 320
Target Start/End: Original strand, 21837098 - 21837231
Alignment:
Q  186 ttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgt 285  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||       || |    
T  21837098 ttttaagaaattcatatttaattcgtttcatgttagaaaa-ttctaaattttagtaaatgaaccttttatagtgttctaaacttgtatcgaaaaaatcat 21837196  T
Q  286 tcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaa 320  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21837197 tcaaaaatttaaaagtttaaggataattaaacaaa 21837231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 227 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 22023193 - 22023097
Alignment:
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22023193 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatggtgttttaaacttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 22023097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 26865975 - 26865706
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||                
T  26865975 tcaattcaaatttgtttaatttattcttaaactcttaagttttttaacaattttttgtagacgtgttaagaacattactaaaagttcc------------ 26865888  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
     |  |||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| |||||             ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||           
T  26865887 -gccgcaaaatttgatttatatgtccatattttattactttta-------------ttgttttcaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaaaa 26865802  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    || ||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| |||||||        || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26865801 tt-taaattttattaattggacctttcatagtgttctaaacttgtctaaaaaaattcattcaaaaatttaagagcttaaggataattaaacaaactt 26865706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 34 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 2263081 - 2262845
Alignment:
Q  34 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 133  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || |  ||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |  ||    
T  2263081 aaatttgtttaatt-atgcttaaacttttaaaattttgaacaattttttgcacaagtgttaagaacattacaaaaagttcatctgcaaaaaattatctca 2262983  T
Q  134 aaaattgatttatacgtccaga-ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaa 232  Q
    ||| || |||||| ||| |||| |||||||| |||||| || |||||||||  ||| |||||||| ||||||||||  |||||| ||       ||||||    
T  2262982 aaattttatttatgcgtacagatttttgttacttttattttgaacttttgtcttttaaaaaaatttatatttaatttatttcatatt-aaaaaattctaa 2262884  T
Q  233 attttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgt 271  Q
    ||||||||||| |||  ||| ||| |||||||| |||||    
T  2262883 attttagtaaacgaagtttttataatgttctaaacttgt 2262845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 27 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 9687798 - 9687715
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaag 110  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||    
T  9687798 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagtttttgaacaattttttgcagacgtgttaagaacattactaaaag 9687715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 55 - 161
Target Start/End: Original strand, 9924287 - 9924393
Alignment:
Q  55 aaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccag 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||| |||| || |||||| ||    
T  9924287 aaactcttgagtttttgaacaattttttacagacttgttaagaacattacttaaagttcctctgcaaaatattgtcacaaaatttgaattctacgtctag 9924386  T
Q  155 attttgt 161  Q
    |||||||    
T  9924387 attttgt 9924393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 36 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 22167161 - 22166923
Alignment:
Q  36 atttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaa 135  Q
    |||||||||||| ||| | ||||||||  | ||||||||||||||||| | || | ||||||| |||||||||||||| || | |||||||| || ||||    
T  22167161 atttgtttaatt-atgtttaaactcttatgcttttgaacaattttttgtagacgtattaagaacattactaaaagttcatccgtaaaaaattatttcaaa 22167063  T
Q  136 aattgatttatacgtccaga-ttttgttaattttatctttaacttttgttgttt-taaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaa 233  Q
    | ||||||| || ||||| | |||||||||||||||||| || |||| |  |||  |||||||||||||| || || |||| ||||       |||||||    
T  22167062 atttgatttctatgtccatatttttgttaattttatcttgaaattttttcatttaaaaaaaattcatattaaactcatttcttgtt-aaaaaattctaaa 22166964  T
Q  234 ttttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctc 274  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  22166963 ttttactaaatgaacctttcgtagtgttctaaatttgtctc 22166923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 29 - 208
Target Start/End: Original strand, 40272459 - 40272638
Alignment:
Q  29 aattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattg 128  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||     
T  40272459 aatttaaatttgtttaatt-atgcttaaacttttaagattttgaacaattttttgcacaagtgttaagaacattacgaaaagttcatctacaaaaaatta 40272557  T
Q  129 ttgcaaaaattgatttatacgtccag-attttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaatt 208  Q
    |  ||||| || |||| | ||||||| ||||||||| |||||| || |||||||||   || ||||||| |||||||||||    
T  40272558 tctcaaaattttatttctgcgtccagaattttgttacttttattttaaacttttgtctattaaaaaaatccatatttaatt 40272638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 34 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 43210914 - 43210639
Alignment:
Q  34 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 133  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| | |  ||||||||| ||||  |||||||| | ||||||||||| |  ||    
T  43210914 aaatttgtttaatt-atgcttaaacttttaagattttgaacaattttttgtacaagtgttaagaacattaagaaaagttcttatgcaaaaaattatctca 43210816  T
Q  134 aaaattgatttatacgtccaga-ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaa 232  Q
    ||| || |||| | |||||||| |||||||| |||||| || |||||||||   ||  ||||||||||||||||||  |||||||||       || |||    
T  43210815 aaattttatttcttcgtccagatttttgttacttttattttgaacttttgtctcttagaaaaattcatatttaatttatttcatgttaaaaaattt-taa 43210717  T
Q  233 attttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggata 310  Q
    ||||||||||| ||||||||  || |||||||| ||||| |        ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  43210716 attttagtaaacgaaccttttgtaatgttctaaacttgtataaaaaaaatcgttgaaaaattttagagtttaaggata 43210639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 233 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 18950959 - 18950869
Alignment:
Q  233 attttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||        ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18950959 attttagtaattgaacctttcatagtgttctaaacttgtctaaaaaaaatcgttcagaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 18950869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 34 - 217
Target Start/End: Original strand, 19332468 - 19332651
Alignment:
Q  34 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 133  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||| ||||||||| | |  ||||||||| ||||| |||||||| |||  |||||||| |  ||    
T  19332468 aaatttgtttaatt-atgcttaaacttttaagattttgaataattttttgtacaagtgttaagaacattacgaaaagttcatctcgaaaaaattatctca 19332566  T
Q  134 aaaattgatttatacgtccaga-ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatg 217  Q
    ||| || |||| | |||||||| |||| ||| |||||| || |||||||||  ||| |||||||||||||||||||  |||||||    
T  19332567 aaattttatttctgcgtccagattttttttacttttattttgaacttttgtcttttaaaaaaattcatatttaatttatttcatg 19332651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 187 - 273
Target Start/End: Original strand, 9924401 - 9924486
Alignment:
Q  187 tttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtct 273  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9924401 tttaaaaatttcatatttaatttgtttcat-tttaaaaaattctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtct 9924486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 27 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 6365508 - 6365413
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaa 123  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||| ||| |   |||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  6365508 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactattaagtttttgaac-atttttcgcagatgcgttaagaacattagtaaaagttcctctgcaaaa 6365413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 29 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 3548638 - 3548350
Alignment:
Q  29 aattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattg 128  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| ||||| || | ||||||||||||| |||| | |  ||| ||||| |||| ||||| ||||||  ||| |||||     
T  3548638 aattaaaatttgtttaatt-atgcttaaacttttaactttttgaacaattatttgtagaagtgtcaagaacattattaaaaattcctcgacaagaaatta 3548540  T
Q  129 ttgcaaaaattgatttatacgtccagattttg-ttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnt 227  Q
    |  ||||| || |||| || |  || | |||| ||| ||||||||| ||||||||   ||| |||||||||||||||||||| |||||  ||       |    
T  3548539 tctcaaaatttaatttctatgcacaaaatttggttacttttatcttgaacttttggcattt-aaaaaattcatatttaattcatttcacattaaataatt 3548441  T
Q  228 tctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaa 320  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||        |||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  3548440 t--aaattttagtaaatgaacctttcataatgttctaaatttgtctaaaataaatcgttcaaatgtttaagtgtttaaggataattaaacaaa 3548350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 55 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 14050000 - 14049897
Alignment:
Q  55 aaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccag 154  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||| ||||||||||||| |||  | ||||||| |  ||||| ||||||| ||||||||     
T  14050000 aaactcttaagtttttgaacaatttttggaacacatgttaagaacattactaaaagtttctccac-aaaaattatctcaaaatttgatttctacgtccat 14049902  T
Q  155 atttt 159  Q
    |||||    
T  14049901 atttt 14049897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 83
Target Start/End: Original strand, 26865232 - 26865288
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttg 83  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  26865232 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagttttttaacaattttttg 26865288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 30698969 - 30698685
Alignment:
Q  34 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 133  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||| |||||| ||||| | || | ||||||| |||||  ||||| ||||| ||||| |||    ||    
T  30698969 aaatttgtttaatt-atgcttaaattcttgaatttttaaacaatcttttgtacacctattaagaacattacggaaagtccctctacaaaatattaactca 30698871  T
Q  134 aaaattgatttatacgtccagattttgt-taattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaa 232  Q
    ||| ||||||| ||||| ||||||||   || | || |||| || |||||| |||| |||||||||||||||||||| | || ||||       || ||     
T  30698870 aaatttgatttctacgttcagatttttactactcttttcttgaatttttgtcgttt-aaaaaattcatatttaattcttctcctgttaaaaaa-ttatat 30698773  T
Q  233 attttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaa 320  Q
     ||||||||||||||| ||| ||| |||||||| | ||||||       |||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||    
T  30698772 tttttagtaaatgaacattttataatgttctaaacatgtctccaaaaaatcgttcaaaaatttaagaattcaagaataattaaacaaa 30698685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 178 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 14049899 - 14049755
Alignment:
Q  178 ttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnn 277  Q
    |||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||       || ||||| ||||||||||||| |||| || |||||||| | ||| |        
T  14049899 ttttgtcgtttaaaaaaatttatatttaattcatttgatgttaaaaaattt-taaatattagtaaatgaacttttcgtaatgttctaaacgtgtattaag 14049801  T
Q  278 nnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
        |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14049800 aaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggatgattaaacaaactt 14049755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 219
Target Start/End: Original strand, 43209900 - 43210084
Alignment:
Q  34 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 133  Q
    |||| ||||||||| |||||  |||| || || ||||||||||||||||||| |  | ||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||| |  ||    
T  43209900 aaatctgtttaatt-atgcttgaacttttaagattttgaacaattttttgcacaagtattaagaacattaccaaaagttcttatgcaaaaaattatctca 43209998  T
Q  134 aaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt 219  Q
    ||| || |||| | ||||||||||||  | | ||| | |  |||||||||  ||| |||||| ||||||||||||  |||||||||    
T  43209999 aaattttatttcttcgtccagatttttcttactttttttcgaacttttgtcttttaaaaaaaatcatatttaatttatttcatgtt 43210084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 27 - 79
Target Start/End: Original strand, 8217510 - 8217562
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattt 79  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||    
T  8217510 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagttttttaacaattt 8217562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 34 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 32537687 - 32537608
Alignment:
Q  34 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgtt-aagaatattactaaaagttc 113  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||    
T  32537687 aaatttgtttaatt-atgcttaaacttttgagattttgaacaatgttttgcaaaagtgttaaagaacattactaaaagttc 32537608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 132 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 30734113 - 30733927
Alignment:
Q  132 caaaaattgatttatacgtccagatttt-gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttct 230  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||| |||| | || |||| ||||||||  ||||  ||||||||||||||||||| | |||||||       ||||    
T  30734113 caaaatttgatttctacgtccagatttttgttactcttttcttgaacttttgacgttt--aaaaattcatatttaattcttgtcatgtt-aaaaaattct 30734017  T
Q  231 aaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaa 320  Q
    |  ||||||||||||||| ||| ||| |||||||| | ||||||       | |||||||||||||||| || |||  ||||||||||||    
T  30734016 attttttagtaaatgaacattttataatgttctaaacatgtctccaaaaaattgttcaaaaatttaagaattcaagagtaattaaacaaa 30733927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 46 - 273
Target Start/End: Original strand, 36875874 - 36876099
Alignment:
Q  46 tttatgctaaaactcttgagtttttgaacaa-ttttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgattt 144  Q
    |||||| | |||||||| ||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||| | ||||||||||||| |  ||||||||  |  ||||| |||||||    
T  36875874 tttatggttaaactcttaagtttttgaacaatttttttgcagatgtgttaagaacactactaaaagttccaccacaaaaaatcatctcaaaatttgattt 36875973  T
Q  145 atacgtccagat-tttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaa 243  Q
     ||| |||| || ||||||| ||||| | |||| |||| |||||| |||| ||| ||||||||||  |||||||||       |||| ||||||||||||    
T  36875974 -tacatccaaatatttgttacttttaac-ttaaatttttttgtttaaaaagatt-atatttaatttatttcatgtt-aaaaaattctgaattttagtaaa 36876069  T
Q  244 tgaacctttcatagtgttctaaccttgtct 273  Q
    | ||||||| ||| ||||| || |||||||    
T  36876070 taaacctttaataatgttccaaacttgtct 36876099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 232 - 320
Target Start/End: Original strand, 27280360 - 27280445
Alignment:
Q  232 aattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaa 320  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||        |   | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27280360 aattttagtaaatgaacctttaataatgttctaaacttgtctaaaaaaaat---ttaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaa 27280445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 34 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 42645181 - 42645089
Alignment:
Q  34 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaatt 127  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||| | || ||||||| ||||  |||| ||| | |||||||||||    
T  42645181 aaatttgtttaatt-atgcttaaacttttaagattttgaacaattttttgcacaaatattaagaacattaaaaaaatttcatatgcaaaaaatt 42645089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 283 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 28616065 - 28616025
Alignment:
Q  283 cgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28616065 cgttcaaagatttaagagtttaaggataataaaacaaactt 28616025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 114
Target Start/End: Original strand, 37812678 - 37812757
Alignment:
Q  34 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcc 114  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||| ||||    
T  37812678 aaatttgtttaatt-atgcttaaacttttaagattttgaacaattttttgcacaagtgttaagaacattacgaaaatttcc 37812757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 38693731 - 38693675
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttg 83  Q
    |||||| | ||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  38693731 tcaattcatatttgtttaatttatacttaaactcttaagttttttaacaattttttg 38693675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 160 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 5597814 - 5597755
Alignment:
Q  160 gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt 219  Q
    |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| | ||||||||||| || ||||||    
T  5597814 gttaattttatcttgaacttttggcgttttaaaaaaattatatttaattcattacatgtt 5597755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 160 - 219
Target Start/End: Original strand, 24334041 - 24334100
Alignment:
Q  160 gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt 219  Q
    |||| ||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  24334041 gttagttttatcttgaatttttggcgttttaaaaaattcatatttaattcattacatgtt 24334100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 66 - 113
Target Start/End: Original strand, 42852775 - 42852822
Alignment:
Q  66 tttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttc 113  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||  |||||||||||||    
T  42852775 tttttgaacaattttttgcatacgtgttaagaacgttactaaaagttc 42852822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23425389 - 23425337
Alignment:
Q  156 ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattc 209  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||   |||| |||||||||||||||||||    
T  23425389 ttttgttaattttatcttgaacttttgcaatttt-aaaaattcatatttaattc 23425337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 68
Target Start/End: Original strand, 28456585 - 28456626
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagttt 68  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  28456585 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttgagttt 28456626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 295 - 323
Target Start/End: Original strand, 2004211 - 2004239
Alignment:
Q  295 taagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2004211 taagagtttaaggataattaaacaaactt 2004239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 155 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 2567496 - 2567432
Alignment:
Q  155 attttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt 219  Q
    |||| |||| ||||||||| || ||||| |||||||||||| | ||||||||||| || ||||||    
T  2567496 atttcgttagttttatcttaaatttttggtgttttaaaaaaattatatttaattcattacatgtt 2567432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 45)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 27 - 320
Target Start/End: Original strand, 30660778 - 30661071
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30660778 tcaatttaaatttgtttaatttatgcttaaactcttgagtttttgaacaattttttgcagacatgttaagaatattactaaaagttcatctgcaaaaaat 30660877  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgtttt-aaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnn 225  Q
    ||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||          
T  30660878 tgtcgcaaaatttgatttctacatccagattttgttaattttatcattaacttttgtcgttttaaaaaaattcatatttaattcgttttatgtt-aaaaa 30660976  T
Q  226 nttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaa 320  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||       ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30660977 attctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaagtataattaaacaaa 30661071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 15721360 - 15721062
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  15721360 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttgagtttttgaacaattttttacagacgtgttaaaaactttactaaaagttcctatgcaaaaaat 15721261  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  15721260 tgtcgcaaaatttgatttctacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgtcgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaaaa 15721161  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctc--nnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15721160 ttctaaaatttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 15721062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Original strand, 8709836 - 8710130
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8709836 tcaatttaaatttgtttaatttatgcttaaactcttgagtttt-gaacaattttttgcagacgtgttaagaatattactaaaagttcctctacaaaaaat 8709934  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  8709935 tgtcgcaaaatttgatttctacgtccaaattttgttaattttatctttaactttttccgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaa 8710033  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||        |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8710034 ttctaaattttagttaatgaacctttcatagtattctaaacttgtcttaaaaaaatcgtacaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 8710130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Original strand, 10915301 - 10915598
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaatttttt--gcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaa 124  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||    
T  10915301 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttgagtttttgaacaattttttttgcagacgtgttaagaacattactaaaaggtcctttacaaaaa 10915400  T
Q  125 attgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnn 224  Q
    ||||| ||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||         
T  10915401 attgtcgcataatttgatttctacgtccatattttgttaattttatctttaacatttttcgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaa 10915499  T
Q  225 nnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||       ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10915500 aattctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaaatcgatcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 10915598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 5974604 - 5974309
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || |||||||||||||||||| ||||||||    
T  5974604 tcaatttaaatttgtttaatttatgcttaaactcttgagtttttgaacaattttttgcagacgtgttaaaaacattactaaaagttcctctacaaaaaat 5974505  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
    ||| |||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  5974504 tgtcgcaaaatttgatttctacatccaaattttgttaattttatctttaactttttccgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaaat 5974405  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||        |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5974404 tt-taaattttagttaatgaacctttcatagtattctaaacttgtctgaaaaaaatcgtacaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 5974309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 5087485 - 5087190
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5087485 tcaattcaaatatgtttaatttatgcttaaactcttgactttttgaacaattttttgtagacgtgttaagaacattactaaaagttcctctgcaaaaaat 5087386  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
    ||| ||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||           
T  5087385 tgtcgcaaaaattaatttttacattcagattttgttaattttatctttaacttttgccgttttaaaaaattcatatttaatttgtttcatgtt-aaaaaa 5087287  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||         |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5087286 ttctaaattttagtaaatgaacatttcatagtgttctaaacttgtctaaaaacaaccgttcaaaaagttaagagtttaaggataattaaacaaactt 5087190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Original strand, 26356528 - 26356826
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttg---caaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaa 123  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    ||  | ||||||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  26356528 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttgagtttttgaacaatttttttttacacgcgtgttaagaacattactaaaagtttctatgcaaaa 26356627  T
Q  124 aattgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnn 223  Q
    ||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||        
T  26356628 aattgtcacaaaatttgatttctacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgccgttttaaaaaattcatatttaattcatttcatgttaaaa 26356727  T
Q  224 nnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
       || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26356728 aattt-taaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 26356826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 34 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 17697674 - 17697386
Alignment:
Q  34 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 133  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | || ||||||||| ||||| ||||| |||| | || |||||||| | |    
T  17697674 aaatttgtttaatttatgcttaaactcgtgagtttttgaacaattttttgaagacgtgttaagaacattacaaaaagctccttttcataaaattgtcgta 17697575  T
Q  134 aaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaa 233  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||       |||||||    
T  17697574 aaatttgatttctacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgtcgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatctt-aataaattctaaa 17697476  T
Q  234 ttttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||        |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17697475 ttttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttttctaaaaaaaatcgttcaaaagtttaagagtttaaggataattaaacaaactt 17697386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 28 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 29692205 - 29691911
Alignment:
Q  28 caattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaatt 127  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29692205 caattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttgagtttttcaacaattttttgtagacgtgttaaacatattacaaaaagttcctctgcaaaaaatt 29692106  T
Q  128 gttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnt 227  Q
     |  ||||| |||||||  ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||       |    
T  29692105 ctcacaaaatttgatttcaacgtccatattttgttacttatatctttaacttttgtcgttttgaaaaattcatatttaattcttttcatgtt-aataaat 29692007  T
Q  228 tctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29692006 tctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttttaagtttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 29691911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Original strand, 844106 - 844402
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| ||| ||| |||||||||| | |||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  844106 tcaattcaaacttgcttaatttatgtttaaactcttaagtttttgaacaactttttgcagacatatttagaacattactaaaagttcctctgcaaaaaat 844205  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgtta-attttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnn 225  Q
    | | |||||| ||||||| ||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||          
T  844206 tatcgcaaaatttgatttctacattcagattttgttactttttatctttaacttttgccattttaaaaaattcatatttaatttgtttcatgtt-aaaaa 844304  T
Q  226 nttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||       ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  844305 attctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaagaataattaaacaaactt 844402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 28 - 323
Target Start/End: Original strand, 938845 - 939139
Alignment:
Q  28 caattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaatt 127  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||    
T  938845 caattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacgtgttaagaacattactaaaagttcctccgcaataaatt 938944  T
Q  128 gttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnt 227  Q
     | |||||| |||| || |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||       |    
T  938945 atcgcaaaatttgaattctacgtccagactttgttgcttttatctttaacttttgtcttttaaaaaaaatcatatttaattcatttcatgttaaaaaaat 939044  T
Q  228 tctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||       |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  939045 t-taaattttagtaaatgaacctttcaaagtgttctaaacatgtctcaaaaaaatcgttcgaaaatttaggagtttgaggataattaaacaaactt 939139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 27 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 861655 - 861362
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgcta-aaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaa 125  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  861655 tcaattcaaatatgcttaatttatgctttaaactcttaagtttttgaacaattttttgcagacatatttagaacattactaaaagttcctcggcaaaaaa 861556  T
Q  126 ttgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgtta-attttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnn 224  Q
    || | |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||         
T  861555 ttatcgcaaaatttgatttctacatccagattttgttactttttatctttaacttttgtcgttttaaaaaattcatatttaatttgtttcatgtt-aaaa 861457  T
Q  225 nnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaa 319  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||       ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  861456 aattctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttcaaaacttttctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaaaataattaaacaa 861362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Original strand, 1820983 - 1821274
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  1820983 tcaattcaaatttgttt--tttatgcttaaactcttgagtttttgaacaattttttgcatacgtattaagaacattactaaaagttcctctgcaaaaagt 1821080  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
    |||  ||||| ||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| || ||| |||||           
T  1821081 tgtcacaaaatttgatttctacgtccaaattttgt--attttatctttaacttttaccgttttaaaaaattcatatttaactcatttaatgtt-aaaaaa 1821177  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||       |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1821178 ttctaaattttagtaaatgaacctttcataatgttataaacttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactt 1821274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 5079802 - 5079506
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |    
T  5079802 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagttttttaacaattttttgtagacgtgttaagaacattactaaaagttcctccgcaaaaagt 5079703  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
    | |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||           
T  5079702 tattgcaaaatttgatttatatgtccagattttattacttttatctttaacttttatcgttttcaaaaattcatatttaatttgtttcatgttaaaaaaa 5079603  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctc-nnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
     | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||        ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  5079602 at-taaattttagtaattgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaaaatcgtttaaaaatttaagactttaaggataatttaacaaactt 5079506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 22732293 - 22731997
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||  || || | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22732293 tcaattcaaatttgtttaaactatgcttaaactcttgagtttttaaacaattttta-catacgtattaagaacattactaaaagttcctctgcaaaaaat 22732195  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
    ||| |||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  22732194 tgtcgcaaaatttgatttctacggccagactttgttaattttatctttaacatttgtcgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaaaa 22732095  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaa-atttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
     |||||||||| |||||||||| | | | |||||||||| |||||||        ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22732094 atctaaattttggtaaatgaacatattacagtgttctaaacttgtcttaaaaaattcgttcaaaatttttaagagtttaagaataattaaacaaactt 22731997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 34 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 33518644 - 33518406
Alignment:
Q  34 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 133  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||  ||    
T  33518644 aaatttgtttaatgtatgcttatactcttgagtttttgaacaattttttgcagacgtgttaaaaacattactaaaagttcatctgcaaaaaattgtcaca 33518545  T
Q  134 aaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaa 233  Q
    ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||       |||||||    
T  33518544 aaatttgatttctacgtccaaattttgttaattttatctttaacttttgccgttttaaaaaattcatatttaattcattttaggtt--aaaaattctaaa 33518447  T
Q  234 ttttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctc 274  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33518446 ttttagttaataaacctttcatagtgttctaaacttgtctc 33518406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 27 - 252
Target Start/End: Original strand, 2087438 - 2087661
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  2087438 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactctt-agtttttgaacaaatttttacagacatgttaagaacattactaaaagttcatctgcaaaaaat 2087536  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
    |||   |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  |||||||           
T  2087537 tgtcataaaatttgatttctacgtccagattttgttaattttatctttaacttttatcgttttaaaaaattcatatttaattcggctcatgtt-aaaaaa 2087635  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaaccttt 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  2087636 ttctaaattttagtaaatgaaccttt 2087661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 90 - 323
Target Start/End: Original strand, 30492773 - 30493004
Alignment:
Q  90 tgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgtttt 189  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||    
T  30492773 tgttaagaacattactaaaagttcctctgctaaaaattgtcgcaaaattt-atttctacgtccagattttgtttattttatctttaacttttttcatttt 30492871  T
Q  190 aaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaa 289  Q
    |||||| | |||||||| ||||||||||||       || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||        ||||||||    
T  30492872 aaaaaaattatatttaactcgtttcatgtt-aaaaaattataaattttagtaaatgaacccttcatagtgttctaaacttgtctaaaaaaaatcgttcaa 30492970  T
Q  290 aaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30492971 aaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 30493004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 27 - 320
Target Start/End: Original strand, 12481765 - 12482047
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||           |||||||||||| || ||||||| | | |||||||| |||| || ||||||||    
T  12481765 tcaattcaaatttgtttaatttatactaaaactctt-----------caattttttgcagacgtgttaagcacaatactaaaaattccgctacaaaaaat 12481853  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
    ||| |||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||| ||||||||||  ||| |||||           
T  12481854 tgtcgcaaaatttgatttctacgtcctgattttgttaattttatctttaacttctttcgttttaaaatatttatatttaatttattttatgttaaaaaaa 12481953  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaa 320  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12481954 ttctaaattttagcaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtctaaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaa 12482047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 14256440 - 14256151
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttg-aacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaa 125  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| | | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  14256440 tcaattcaaatttatttaatttatgcttaaactcttgagtttttttaacaatttttggtagacatgttaaaaacattactaaaagttcctctgcaaaaaa 14256341  T
Q  126 ttgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnn 225  Q
    |||| |||||| |||||||  ||||||| ||||||||| |      |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||          
T  14256340 ttgtcgcaaaatttgatttcaacgtccaaattttgttact------tttaacttttgtcgttttgaaaaattcatatttaattcttttcatgtt-aataa 14256248  T
Q  226 nttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |  ||||| |       | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14256247 attctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgtttcgagtttgtcacaaaaaatt-gttcaaaaatttaagaatttaaggataattaaacaaactt 14256151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 90 - 274
Target Start/End: Original strand, 20510542 - 20510725
Alignment:
Q  90 tgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgtttt 189  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20510542 tgttaagaacattactaaaagttcctctacaaaaaattgtcgtaaaatttaatttctacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgtcgtttt 20510641  T
Q  190 aaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctc 274  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||       |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  20510642 aaaaaattcatatttaattcgattcatgtt-aaaaaattctaaattttagttaatgaacctttcatagtgttctaaatttgtctc 20510725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 18503274 - 18502992
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| |||||| |||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||| | ||||||       
T  18503274 tcaattcaaatttctttaatttattcttaaactcttaagttttttaacaattttttgtagacgtgttaagaacattactaaaagttccgccgcaaaat-- 18503177  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
               |||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||           
T  18503176 -----------ttgatttatatgtccatattttattacttttatctttaacttttattgttttcaaaaattcatatgtaattcgtttcaggttaaaaaaa 18503088  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    || ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||       || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18503087 tt-taaattttattaattgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaattcattcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 18502992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 28476486 - 28476187
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaa-acatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaa 125  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||  | |  | ||||  ||||||||||| ||| ||||| ||||||    
T  28476486 tcaatttaaatttgtttaatttatgtttaaacttttgagtttttcaacaattttttggtagatgtattaaacatattactaaatgtttctctg-aaaaaa 28476388  T
Q  126 ttgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnn 225  Q
    ||||  ||||| |||||||  ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||          
T  28476387 ttgtcacaaaatttgatttcaacgtccatattttgttacttatatctttaacttttgtcgttttgaaaaatttatatttaattcttttcatgtt-aataa 28476289  T
Q  226 nttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaa----atttaagagtttaaggataattaaacaaac 321  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||       ||||||||||    |||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  28476288 attctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttttaagtttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaatttatttaagaatttaagaataattaaacaaac 28476189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 34 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 33744951 - 33744665
Alignment:
Q  34 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 133  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||||||  ||| |||||| ||||| | |||||| | | |||    
T  33744951 aaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagtttttcaacaatgttttacagacgtgttaagaacgttattaaaaggtcctccg-aaaaaaatatcgca 33744853  T
Q  134 aaaa-ttgatttatacgtccaga-ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttcta 231  Q
    |||| ||||||| |||||||| | |||| ||| || |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||       || ||    
T  33744852 aaaatttgatttctacgtccatatttttattacttatatcttaaacttttgtcgttttaaaaaattcatatttaatttatttcatgtt-aaaaaattata 33744754  T
Q  232 aattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaa 320  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |        ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33744753 gattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtataaaaaaaatcgttaaaaaatttaagagtttaaggataattaagcaaa 33744665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 132 - 323
Target Start/End: Original strand, 20977467 - 20977658
Alignment:
Q  132 caaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttat-ctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttct 230  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||       || |    
T  20977467 caaaatttgatttctacgtccagattttgttatttttattctttaatttttgtcgttttaaaaaattcacatttaattcttttcatgttaaatttttt-t 20977565  T
Q  231 aaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||        ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20977566 aaatattagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtctaaaaaatatcgttcaaaaatttaagagtttaaggatagttaaacaaactt 20977658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 164 - 323
Target Start/End: Original strand, 17245717 - 17245875
Alignment:
Q  164 attttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttct 263  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||       |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  17245717 attttatctttaacttttattgttttcaaaaattcatatttatttcgtttcatgttaaaaaa-ttctaaattttattaattgaacctttcatagtgttct 17245815  T
Q  264 aaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    || ||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17245816 aaacttgtctcaaaaaattcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 17245875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 132 - 323
Target Start/End: Original strand, 20977101 - 20977292
Alignment:
Q  132 caaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttat-ctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttct 230  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||       || |    
T  20977101 caaaatttgatttctacgtctagattttgttatttttattctttaatttttgtcgttttaaaaaattcatatttacttcttttcatgttaattgtttt-t 20977199  T
Q  231 aaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||        ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20977200 aaatattagaaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtcttaaaacaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggatagttaaacaaactt 20977292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 183 - 323
Target Start/End: Original strand, 34046542 - 34046682
Alignment:
Q  183 ttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnnt 282  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||       |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||       |    
T  34046542 ttgtttttaaaaattcatatttaatttgtttcatgttaaaaaaattctaaattttattaattgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaatt 34046641  T
Q  283 cgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34046642 cgttcaaaaatttaagaatttaaggataattaaacaaactt 34046682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 34 - 323
Target Start/End: Original strand, 3375297 - 3375585
Alignment:
Q  34 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 133  Q
    |||||||||||||| || || ||| | || || |||||||  |||||||| |||  ||||||||| |||||| ||| |||  |||||||||||| |  ||    
T  3375297 aaatttgtttaatt-atacttaaaattttaagattttgaaggattttttgtaaaagtgttaagaacattacttaaatttcacctgcaaaaaattatctca 3375395  T
Q  134 aaaattgatttatacgtccagatttt-gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaa 232  Q
    ||| || |||| ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||       ||| ||    
T  3375396 aaattttatttctacgttcagatttttgataattttatcttgaacttttgtcgtttaaaaatattcatatttaattcattttatgtt-aaaaaattccaa 3375494  T
Q  233 attttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    ||||||||| | || | |||  || |||||||| ||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  3375495 attttagtatacgagcattttgtaatgttctaaacttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattagagaaactt 3375585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 188 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 20897947 - 20897811
Alignment:
Q  188 ttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtct-cnnnnnnntcgtt 286  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||         |||||    
T  20897947 ttaaaaaattcatgtttaattcgtttcatgttaaaaaaattctaaattttagtaaatgaacctttcatagcgtcttaaacttgtctaaaaaataatcgtt 20897848  T
Q  287 caaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20897847 caaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 20897811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 27 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 11400364 - 11400171
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaa-ttttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttc-ctctgcaaaaa 124  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||    |||||| || || || |||||| |||||||||| ||  || || |||||    
T  11400364 tcaattcaaatttgtttaatttatgattaaactcttgagttttttaaatggttttttacatacgtgctaagaacattactaaaaattatctttg-aaaaa 11400266  T
Q  125 attgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt 219  Q
    ||||| | |||  || ||||| | |||||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  11400265 attgtcgtaaacttttatttaaatgtccagattttgttaattttatatgtaacttttggcgttttaaaaaatttatatttaattagtttcatgtt 11400171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 34 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 289647 - 289461
Alignment:
Q  34 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 133  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||| |  ||||||||| || |  |||||||  ||||||||||||| |   |    
T  289647 aaatttgtttaatt-atgcttaaacttttaagattttgaacaattttttgcacaagtgttaagaacatcatgaaaagtttatctgcaaaaaattatctta 289549  T
Q  134 aaaattgatttatacgtccaga--ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt 219  Q
    ||| || |||| ||||||||||  |||||||| |||||| || |||||||||  ||| |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  289548 aaattttatttctacgtccagattttttgttacttttattttgaacttttgtcttttaaaaaaattcatatttaatttatttcatgtt 289461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 34 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 21108355 - 21108172
Alignment:
Q  34 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 133  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||| ||| ||| ||||||| | |  ||    
T  21108355 aaatttgtttaatt-atgcttaaacttttaagattttgaacaattttttgcacaagtgttaagaacattacgaaaatttcatctccaaaaaaatatctca 21108257  T
Q  134 aaaattgatttatacgtccaga-ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatg 217  Q
    ||| || |||| | |||||||| |||||||| |||||| || |||||||||  ||| |||||||||||||||||||  |||||||    
T  21108256 aaattttatttctgcgtccagatttttgttacttttattttgaacttttgtcttttaaaaaaattcatatttaatttatttcatg 21108172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 27 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 20898275 - 20898115
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  | || | ||||||| |||||||||| |||||| | ||||||     
T  20898275 tcaattcaaatttttttaatttatgcttaaactcttaagtttttgaacaatttttttaagacttcttaagaacattactaaaacttcctccgaaaaaaaa 20898176  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaat 196  Q
      |  ||||| ||||||| ||||||||         ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20898175 aatcacaaaatttgatttctacgtcca---------aattttatctttaacttttgtcgttttaaaaaat 20898115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 34 - 208
Target Start/End: Original strand, 289005 - 289178
Alignment:
Q  34 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 133  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||  || || ||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||| |  ||    
T  289005 aaatttgtttaatt-atgcttaaacatttaagattttgaacaattttttgcacaagtgttaagaacattacgaaaacttcatctgcaaaaaattatctca 289103  T
Q  134 aaaattgatttatacgtccaga-ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaatt 208  Q
    ||| || |||| | |||||||| |||||||| |||||| || |||||||| | | ||||||||| |||||||||||    
T  289104 aaattttatttctgcgtccagatttttgttacttttattttgaacttttg-tctattaaaaaatccatatttaatt 289178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 34 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 3914709 - 3914474
Alignment:
Q  34 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 133  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||| || || ||||||| ||||||| ||| |  ||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||| |  ||    
T  3914709 aaatttgtttaatt-atgtttaaacttttaagattttgaataattttt-gcacaagtgttaagaacattacaaaatgttcatctgcaaaaaattatctca 3914612  T
Q  134 aaaattgatttatacgtccagattt-tgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaa 232  Q
    ||| || |||| |||||| |||||| ||||| |||||| || |||||||||  ||| ||||| ||||||| |||||  |||||||||       ||||||    
T  3914611 aaattttatttctacgtctagatttctgttagttttattttgaacttttgtcttttaaaaaatttcatatctaatttatttcatgtt-aaaaaattctaa 3914513  T
Q  233 attttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgt 271  Q
    ||||||||||| |||| |||  || |||||||| |||||    
T  3914512 attttagtaaacgaactttttgtaatgttctaaacttgt 3914474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 228 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 30353220 - 30353126
Alignment:
Q  228 tctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||        ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  30353220 tctaaattttagtaagtgaacctttcataatgttctaaacttgtct-aaaaaaatcgttcaaaaatttaagtgtttaaagataattaaataaactt 30353126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 27 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 17246376 - 17246307
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaag 96  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| |||  |||||||    
T  17246376 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagttttttaacaattttttgtaaatgtgttaag 17246307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 111
Target Start/End: Original strand, 17244540 - 17244624
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagt 111  Q
    |||||| |||| |||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||| | |  ||||||||| ||||||||||||    
T  17244540 tcaattcaaatatgtttaatttattcttaaactcttaagttttttaacaattttttgtagatgtgttaagaacattactaaaagt 17244624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 284 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 16736691 - 16736655
Alignment:
Q  284 gttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaa 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16736691 gttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaa 16736655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 227 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 24958978 - 24958886
Alignment:
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaa 320  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| |||||||  || |||||||        ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24958978 ttctaaattttagtaaataaatctttcgtagtgttacaaacttgtctaaaaaaaatcgtt-aaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaa 24958886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 156 - 219
Target Start/End: Original strand, 15053930 - 15053993
Alignment:
Q  156 ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt 219  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||| | ||||||||||| || ||||||    
T  15053930 ttttgttagttttatcttgaatttttggtgttttaaaaaaattatatttaattcattacatgtt 15053993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 83
Target Start/End: Original strand, 5079000 - 5079054
Alignment:
Q  29 aattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttg 83  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |  |||| ||||||||||||    
T  5079000 aattcaaatttgtttaatttatgcttaaactctttaagtttttaacaattttttg 5079054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 34 - 98
Target Start/End: Original strand, 3913266 - 3913329
Alignment:
Q  34 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaa 98  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| | || || ||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  3913266 aaatttgtttaatt-atgcttaaatttttaagattttgaacaattttttgcacaaatgttaagaa 3913329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 90 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 30916937 - 30916905
Alignment:
Q  90 tgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30916937 tgttaagaatattactaaaagttactctgcaaa 30916905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 183; Significance: 6e-99; HSPs: 63)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Original strand, 47791838 - 47792133
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  47791838 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttgagtttttaaacaattttttgcagacgtgttaagaacattactaaaagttcctctgcaaaaaat 47791937  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  47791938 tgtcgcaaaatttgatttctacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgccgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaaaa 47792037  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
     |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||        | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47792038 -tctaaattttggtagatgaacctttcatagtgttctaaacttgtcttaaaaacattgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 47792133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 22378753 - 22378458
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||     
T  22378753 tcaatttaaatttgtttaatttatacttaaactattgagtttttgaacagttttttacagacatgttaagaacgttactaaaagttcctatgcaaaaaaa 22378654  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  22378653 tgtcgcaaaatttgatttctacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgtcgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaa 22378555  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22378554 ttctaaattttagtaaatgtacctttcgtagtgttctaaacttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 22378458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 43597779 - 43597484
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  43597779 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttgagtttttgaacaattttttacagacgtgttaagaacattactaaaagttcctatgcaaaaaat 43597680  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
    | | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  43597679 tatcgcaaaatttgatttctacgtccagattttgttaattttatctttaactttttccgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaa 43597581  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||        ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43597580 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtctaaaataaatcgttaaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 43597484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Original strand, 6588687 - 6588982
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  6588687 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttgagtttttgaacaatttttcgcagacgtgttaagaacattactaaaagttcatctccaaaaaat 6588786  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||           
T  6588787 tgttgcaaaatttgatttctacgtccagaatttgttaattttatctttaacttttgtcattttaaaaaatttatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaa 6588885  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6588886 ttctaaattttagtaaatgaacctttcctagtgttataaacttgtcataaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 6588982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 7238871 - 7238576
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||    
T  7238871 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttgaggttttgaacaattttttgcagacgtgttaagaacattattaaaaggtcctctacaaaaaat 7238772  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
    ||| ||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  7238771 tgtcgcataatttgatttctacgtccagattttgttaattttatctttaaactttttcgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaa 7238673  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||       ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7238672 ttctaaattttagtaaatgaacctttcataatgttctaaacttgtctcaaaaaaatcgatcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 7238576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Original strand, 4926372 - 4926670
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctc---tgcaaaa 123  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||    |||||||    
T  4926372 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttgagtttttaaacaattttttacagacgtgttaagaacattactaaaagttcctactatgcaaaa 4926471  T
Q  124 aattgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnn 223  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||        
T  4926472 aattgtcgcaaaatttgatttctacgttcagattttgttaattttatctttaacttgtgccgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaa 4926570  T
Q  224 nnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||       |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4926571 aaattctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttatctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactt 4926670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Original strand, 38158948 - 38159247
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaa----aactcttgagtttttgaacaa-ttttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaa 121  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |    ||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  38158948 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaattaactcttgagtttttgaacaatttttttacagacgtgttaagaacattactaaaagttcctatgcaa 38159047  T
Q  122 aaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnn 221  Q
    |||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  38159048 aaaattgtcgcaaaatttgatttctacctccagattttgttaa-tttatctttaacttttgtcgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-a 38159145  T
Q  222 nnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaac 321  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||       |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38159146 aaaaattctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtgtaaggataattaaacaaac 38159245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 27 - 320
Target Start/End: Original strand, 18059006 - 18059296
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| |||||||| || |||||||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  18059006 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttgagttttcgaacaaatttttgcagacgtgttaagaaagttactaaaggttcctctgcaaaaaat 18059105  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
    ||| |||||| ||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  18059106 tgtcgcaaaatttgatttttatgtttagattttgttaattttatctttaatttttgtcgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaa 18059204  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaa 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18059205 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttg--tccaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaa 18059296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 35482351 - 35482059
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  35482351 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactattgagtttttgaacaattttttgcatacatgttaagaaaattattaaaagttcctctgcaaaaaat 35482252  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
    |||   |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||| ||| |||             
T  35482251 tgtcctaaaatttgatttctacgtccagattttgttaattttatctttaacttttagcg-tttaaaaaattcatatttaattcatttaatg---aaaaaa 35482156  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||       |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  35482155 ttctaaattttagtaaatgaacatttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaacagtttaaagataattaaacaaactt 35482059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 34 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 14990834 - 14990548
Alignment:
Q  34 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 133  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| | | |    
T  14990834 aaatttgtttaatttattcttaaactcttgagtttttgaacaattttttgcatacgtgttaggaacattactaaaagttcctctgcaaaaaattatcgta 14990735  T
Q  134 aaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaa 233  Q
    ||| ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||       || ||||    
T  14990734 aaatttgatttctacattcagattttgttaattttatctttaacttttg-ccttttaaaaaattcatatttaattcatttcatgtt-aaaaaattataaa 14990637  T
Q  234 ttttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||       || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14990636 ttttagt-aatgaacctttcatagtgttctaaacttctctcaaaaaaatcattcaaaaacttaagagtttaaggataattaaacaaactt 14990548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 34 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 15420445 - 15420159
Alignment:
Q  34 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 133  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| | | |    
T  15420445 aaatttgtttaatttattcttaaactcttgagtttttgaacaattttttgcatacgtgttaggaacattactaaaagttcctctgcaaaaaattatcgta 15420346  T
Q  134 aaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaa 233  Q
    ||| ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||       || ||||    
T  15420345 aaatttgatttctacattcagattttgttaattttatctttaacttttg-ccttttaaaaaattcatatttaattcatttcatgtt-aaaaaattataaa 15420248  T
Q  234 ttttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||       || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15420247 ttttagt-aatgaacctttcatagtgttctaaacttctctcaaaaaaatcattcaaaaacttaagagtttaaggataattaaacaaactt 15420159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Original strand, 1961897 - 1962193
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||  || || |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  1961897 tcaattcaaatttgtttcatttatgcttaaatttttgagtttttgaacaatttttcacagacgtgtttagaacattactaaaagttcatctgcaaaaaat 1961996  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttt-taaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnn 225  Q
    ||| |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||          
T  1961997 tgtcgcaaaatttaatttctacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgtcgtttaaaaaaaatacatatttcattcgtttcatgtt-aaaaa 1962095  T
Q  226 nttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
     |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||  ||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1962096 attctaaattttaataaattgacctttcatagtgttctatacttgtctcaaaaatatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacgaactt 1962193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 58 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 10620785 - 10620520
Alignment:
Q  58 ctcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaa-ttgttgcaaaaattgatttatacgtccagat 156  Q
    |||||||||||||| | ||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||    
T  10620785 ctcttgagtttttggataatattttgtatacatgttaagaacattactaaaagcttctctgcaaaaaaattgttacaaaatttgatttatacgtccatat 10620686  T
Q  157 tttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcata 256  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10620685 tttgttacttttatcattaacttttgtcgttttaaaaaaatcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaattctaaattttagtaaatgaacttttcata 10620587  T
Q  257 gtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    |||||| || |||||||        ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10620586 gtgttcaaaacttgtcttaatgaaatcgttcaaaaatttaagagtttaagaataattaaacaaactt 10620520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 34 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 46044580 - 46044291
Alignment:
Q  34 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgtt-gc 132  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| | || |||||| || ||||||||| |||| |||| ||||||||  | ||    
T  46044580 aaatttgtttaattaatgcttaaactcttaagttttttaacaattttttgtagacgtgttaaaaacattactaaatgttcatctgtaaaaaatttatcgc 46044481  T
Q  133 aaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaa 232  Q
    |||| || ||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||       ||||||    
T  46044480 aaaattttatttatatgtccaaattttattacttttatctttaacttttatcatttttaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaattctaa 46044382  T
Q  233 attttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  46044381 attttagtaattgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaaaaaactt 46044291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 4900158 - 4899864
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||| |||| |||| |||||||||||  || ||||||    
T  4900158 tcaattcaaatttgtttaatttatacttaaactcttaagttttt-aacaattttttgcagacttgtttagaacattaataaaagttccttcgcgaaaaat 4900060  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgtta-attttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnn 225  Q
    | | |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||          
T  4900059 tatcgcaaaatttgatttctacatccagattttgttactttttatctttaagttttgcggtttgaaaaaattcatatttaatttgtttcatgtt--agaa 4899962  T
Q  226 nttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||       || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4899961 attctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttataaatttgtctcaaaaaaatcattcaaaaatttaagagtttaaggataattaaataaactt 4899864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 27 - 298
Target Start/End: Original strand, 46330799 - 46331069
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||| | ||  |||||||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  46330799 tcaattcaaatatgtttaatttatgcttaaactctcaagttttttaacaattttttgtagacgcgttaagaacattactaaaagttcatccgcaaaaaat 46330898  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
    | | |||||| |||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||           
T  46330899 tatcgcaaaatttgatttatatgtcgagattttattacttttatctttaacttttatcgttttcaaaaattcatatttaattcgttacatgtt-aaaaaa 46330997  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaag 298  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||       |||||||||||||||||    
T  46330998 ttctaaattttagtaattgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaag 46331069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 110 - 323
Target Start/End: Original strand, 6330978 - 6331191
Alignment:
Q  110 gttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccagatttt-gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaatt 208  Q
    |||||| ||||||||||||| | |||| ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  6330978 gttcctatgcaaaaaattgtcgtaaaatttgatttctatgtccagatttttgttaattttatctttaacttttgccgttttaaaaaattcatatttaatt 6331077  T
Q  209 cgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaagga 308  Q
    | |||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||       |||||||||||||||||||||||||||    
T  6331078 catttcatgttaaaaaa-ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttttaaacttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaagga 6331176  T
Q  309 taattaaacaaactt 323  Q
    |||||||||||||||    
T  6331177 taattaaacaaactt 6331191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 27 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 21109642 - 21109449
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21109642 tcaattcaaatttgtttcatttatgcttaaactcttaaatttttgaacaattttttgcatacgtgtttagaacattactaaaagttcctctgcaaaaaat 21109543  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgtta-attttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt 219  Q
    | | |||||| ||||||| ||| || |||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21109542 tatagcaaaatttgatttctacatcgagattttgttactttttatctttaatttttgtcgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt 21109449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 67 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 27727485 - 27727226
Alignment:
Q  67 ttttgaacaatttttt-gcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgtt-aa 164  Q
    |||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  27727485 ttttgaacaatttttttgcacacgtgttaagaacattactaaaaattcctctacaaaaaattgtcgcaaaatttgatttctacgtccagattttgttaaa 27727386  T
Q  165 ttttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcat-gttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttct 263  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || ||        |||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||    
T  27727385 ttttatcttgaacttttgccgttttaaaaaattcatatttaattcgttttatggtaaaaaaaattctaaatttaagttaatgaacctttcttagtattct 27727286  T
Q  264 aaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    || ||||||||       |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27727285 aaacttgtctcaaaaaaatcgtacaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactt 27727226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 27 - 320
Target Start/End: Original strand, 43574239 - 43574532
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||| ||  |||||||||    
T  43574239 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttaagtttttgaacaattttttgcagacatgtttagaacattactataagttacttcgcaaaaaat 43574338  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgtta-attttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnn 225  Q
    | | |||||| ||||||| ||| || | ||||| |||  |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| |||          
T  43574339 tatcgcaaaatttgatttctacatctaaattttattactttttatctttaacttttgtcattttaaaaaatttatatttaattcgtttcaagtt-agaaa 43574437  T
Q  226 nttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaa 320  Q
     |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |       ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||    
T  43574438 attctaaattttaataaatgaacattttatagtgttctaaacttgtcacaaaaaaatcgttcaaacattttagagtttaagaataattaaacaaa 43574532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 29 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 15653085 - 15652796
Alignment:
Q  29 aattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattg 128  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||     
T  15653085 aattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttaaatttttgaacaattttttacaaacgtgttaagaacattactaaaagttcctccacaaaaaatta 15652986  T
Q  129 ttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-nnnnnnnt 227  Q
    | | |||| ||||||| |||||||| ||||||||| |      ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||             
T  15652985 tcgtaaaatttgatttctacgtccaaattttgttact------tttaacttttgtcattttaaaaaattcatatttaatttgtttcatattaaaaaaaaa 15652892  T
Q  228 tctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| | | ||||       ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15652891 tctaaattttaataaataaacctttcatattgttctaaacgtatctcaaaaaaatcgttaaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 15652796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 44168074 - 44167794
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |  | || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  44168074 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagttttttaacaattttgt--agacgtgttaagaacattactaaaagttcctccgcaaaaaat 44167977  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
    | | | |||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||             ||||||||||||||||||||||||| |||||||||           
T  44167976 tatcgtaaaatttgatttatatgtccagattttattacttttatc-------------gttttaaaaaattcatatttaattcatttcatgtt-aaaaaa 44167891  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44167890 ttctaaattttagtaattgaacctttcatagtgttataaacttgtctaaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 44167794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 28 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 11397252 - 11396958
Alignment:
Q  28 caattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaatt 127  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||| || ||| |||||||||||| || |||||| |    
T  11397252 caattcaaatttgtttaatttatgttcaaactcttaagtttttgaacaatcttttgcatacgtgttaaaaacattgctaaaagttcctttgtaaaaaaat 11397153  T
Q  128 gttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnt 227  Q
     | | |||| ||||||| || ||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | |       |    
T  11397152 atcggaaaatttgatttctatgtttaga-tttgttacttttatctttaacttttgacgttttaaaaaattcatatttaatttgtttcacgctaaaaaaat 11397054  T
Q  228 tctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    ||||||||||||||||||| || |||| |||||| ||| | |||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11397053 tctaaattttagtaaatgatccattcacagtgttataaacctgtcttacacaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 11396958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 27 - 319
Target Start/End: Original strand, 38199062 - 38199340
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||| | || ||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||       
T  38199062 tcaattcaaatttgtttaatttattcttaaactcttaagttttttaacaattttttgtagacgtgttaagaacattcctaaaagttccgccgcaaaat-- 38199159  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
               |||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||           
T  38199160 -----------ttgatttatatgtccatattttattacttttatctttaattttttttgttttcaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaa 38199247  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaa 319  Q
    |||||||||||| | | ||||||||||||||| |||||| ||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38199248 ttctaaattttattgattgaacctttcatagtattctaaacttgtctcaaaaaattcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaa 38199340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 26 - 323
Target Start/End: Original strand, 3495655 - 3495938
Alignment:
Q  26 atcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaa 125  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||| |||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||| |  || ||||    
T  3495655 atcaattcaaatttgtttaatttattcttaaacgcttaagttttttaacaattttttgtagacgtgttaagaacattactaaaagttccgc--cacaaaa 3495752  T
Q  126 ttgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnn 225  Q
    ||           ||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||          
T  3495753 tt-----------tgatttatatgtccatattttattacttttatctttaacttttattgttttcaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaaa 3495841  T
Q  226 nttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
     || ||||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||| |||| |||       || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3495842 att-taaattttattaattgaatctttcatagtgttttaaacttgcctcaaaaaattcattcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 3495938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 43084137 - 43083855
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||| || | ||||||       
T  43084137 tcaattcaaatttgtttaatttattcttaaactcttaagttttttaacaattttttgtagacgtgttaagaacattactaaaagtaccgccgcaaaat-- 43084040  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
               ||||||||||  | || ||||| ||| ||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||           
T  43084039 -----------ttgatttatattttcatattttattacttttatctttatctttaattgttttcaaaaattcatatttaatttttttcatgttaaaaaa- 43083952  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43083951 ttctaaattttattaattgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaattcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 43083855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 100 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 36019985 - 36019811
Alignment:
Q  100 attactaaaagttcctctgcaaaaaa-ttgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattc 198  Q
    ||||||||||||| || ||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  36019985 attactaaaagtttctatgcaaaaaaattgtcgcaaaatttgatttctacgtctagattttgttaattttatctttaacttttgccgttttaaaaaattc 36019886  T
Q  199 atatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctc 274  Q
    |||| ||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||    
T  36019885 atatctaattcgtttcatgtt-aaaaagttctaaattttagtaaatgaacatttcataatgttataaacttgtctc 36019811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 27 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 29156260 - 29156073
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| |||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||| ||| |||| |||||| |||||  ||||||||    
T  29156260 tcaattcaaatttatataatttatgcttaaactcttaagtttttgaacaatttcttgtagacatgttatgaacatta-taaaaggtcctccacaaaaaat 29156162  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttca 215  Q
    | | |||||| ||||||| || ||||||||| | ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29156161 tatcgcaaaatttgatttctatgtccagattctattgcttttagctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttca 29156073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 27 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 1544769 - 1544478
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |  |||| |||||||||||||  || || ||||||||| |||| |||||||| ||   |||||  |    
T  1544769 tcaattcaaatttgtttgatttatgcttaaactttaaagttgttgaacaatttttc-catacgtgttaagaacattattaaaagttacttcacaaaagct 1544671  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
    | | | |||| ||||||| ||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||           
T  1544670 tatcgtaaaatttgatttctacatcccgattttgttactttcatctttaacttttgtcgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcaagtt-aaaaaa 1544572  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaa 320  Q
    ||| |||| |||| ||||||   |||||||||||||||| |||| |||       |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1544571 ttcaaaatcttagcaaatgagtttttcatagtgttctaaacttgactcaaaaatatcgttcaaaaatttaaaagtttaaggataattaaacaaa 1544478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Original strand, 44080958 - 44081253
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||  ||||   |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||    
T  44080958 tcaattcaaacttgtttaatt-atgcttaaactcttaagttttcaaacatgcttttgcaaacgtgttaagaacaatactaaaagttcctccgcaaaaaat 44081056  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccaga-ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnn 225  Q
      | |||||| || |||| |||||||| | |||||||| ||||||||| |  ||| || ||||||||||||||||||||||||  |||||  ||          
T  44081057 gatcgcaaaatttaatttctacgtccatatttttgttacttttatcttgatgtttagtcgttttaaaaaattcatatttaattaatttca-attttaaaa 44081155  T
Q  226 nttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||        ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  44081156 attttaaattttagtaaatgaacctttcatagtattctaaatttgtctaaaaaaattcgctcaaaaatttaagaatttaagtataattaaacaaactt 44081253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 27 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 4883908 - 4883775
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  4883908 tcaatttaaatttgtttaatttatgtttaaactcttgagtttttgaataattttttacagacgtgttaagaacattactaaacgttcctatgcaaaaaat 4883809  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttg 160  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  4883808 tgtcgcaaaatttgatttctacgtccagattttg 4883775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 34 - 320
Target Start/End: Original strand, 38598974 - 38599260
Alignment:
Q  34 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 133  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||  || || |||||||||  ||| |||| | |||||   |||||||  | |||    
T  38598974 aaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagtttttcaacaatttttcacagacgtgttaagaacgttattaaatggtcctccaaaaaaaata-tcgca 38599072  T
Q  134 aaaatt-gatttatacgtccagatttt-gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttcta 231  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||| |||| || |||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||       || ||    
T  38599073 aaaatttgatttctacgtccatatttttgttacttatatcttaaaattttgtcgttttaaaaaattcatatttaatttatttcatgtt-aaaaaattata 38599171  T
Q  232 aattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaa 320  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |        ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  38599172 gattttagtaaatgaatctttcatagtgttctaaacttgtataaaaagaatcgttaaaaaatttaagagtttaaagataattaagcaaa 38599260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 27 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 45958953 - 45958811
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaatttttt-gcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaa 125  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||| ||||||||||| | | || |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  45958953 tcaattcaaatttgtttaatttctgcttaaactcttaagttttt-aacaatttttttgtagacgtgttaataacattactaaaagttcctccgcaaaaaa 45958855  T
Q  126 ttgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaatttta 169  Q
    || || ||||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  45958854 ttatttcaaaatttgatttatatgtccagattttattactttta 45958811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 92 - 323
Target Start/End: Original strand, 37539849 - 37540081
Alignment:
Q  92 ttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccagatttt-gttaattttatctttaacttttgttgtttta 190  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||| |||||||  | ||| |  |||| |||  ||||||||| ||||||||| |||| |    
T  37539849 ttaagaacattactaaaagttcctctgtaaaaaattatctcaaaatttgatttccaagtctaattttttgttgcttttatcttgaacttttgtcgtttaa 37539948  T
Q  191 aaaaa-ttcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaa 289  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||       ||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||   | ||||       ||||||||    
T  37539949 aaaaaattcatatttaattcatttcatgttaaaaaa-ttctaaattttagtaaatgaaccttttgaaatgttctaaatatatctcggaaaaatcgttcaa 37540047  T
Q  290 aaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37540048 aaatttaaaagtttaaggataattaaacaaactt 37540081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 33 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 16081056 - 16080918
Alignment:
Q  33 gaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgc 132  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||| |||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |  |    
T  16081056 gaaatttgtttaatt-atgcttaaactcttaagttttcgaacaattatttgtatacatgttaaaaatattactaaaagttcctctgcaaaaaagtatctc 16080958  T
Q  133 aaaaattgatttatacgtccaga-ttttgttaattttatc 171  Q
    |||  ||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||    
T  16080957 aaattttgatttctacatccagatttttgttacttttatc 16080918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Original strand, 33624788 - 33625080
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttc------------- 113  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||| | || ||||||||| |||||||||| |||                 
T  33624788 tcaatttaaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagttttttaacaa-tttttgtagacgtgttaagaacattactaaaaattcatatgtccaaatt 33624886  T
Q  114 ctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgttt 213  Q
     || |||||||||| | |||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||             ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33624887 atccgcaaaaaattatcgcaaaatttgatttatatgtccaaattttattacttttatc-------------gttttcaaaaattcatatttaattcgttt 33624973  T
Q  214 catgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt 313  Q
    ||||||       |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |        ||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  33624974 catgtt-aaaaaattctaaattttagtaattgaacctttcatagtgttctaaacttgtataaaaaaaatc--tctaaaatttaagagtttaaggataatt 33625070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 34 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 1066691 - 1066517
Alignment:
Q  34 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 133  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||  |  ||    
T  1066691 aaatttgtttaatt-atgcttaaacttttaagattttgaacaattttttgcacaagtgttaagaacattacgaaaagttcatatgcaaaaaatgatctca 1066593  T
Q  134 aaaattgatttatacgtccag-attttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaatt 208  Q
    ||| || |||| ||||||||| ||||||||| |||||| || |||||||||   || ||||||| |||||||||||    
T  1066592 aaattttatttctacgtccagaattttgttacttttattttgaacttttgtctattaaaaaaatccatatttaatt 1066517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 29 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 9633461 - 9633169
Alignment:
Q  29 aattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattg 128  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| | || ||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||     
T  9633461 aattcaaatttgtttaatt-atgcttaaactcttaagtttt-gaacaattttttgcagatattttatgaacattactaaaagttcctccgcaaaaattta 9633364  T
Q  129 ttgcaaaaattgatttatacgtccaga-ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnt 227  Q
    |  |||||  |||||| ||  |||| | |||||||| ||||| ||||||    | | |||| ||| |||||||||||||||  ||||| |||       |    
T  9633363 tctcaaaatgtgatttttatatccaaatttttgttacttttaactttaaaaaatttcgtttaaaagaattcatatttaatttatttcaagtt--aaaaat 9633266  T
Q  228 tctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgtt-caaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    | | ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| |||||||        || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9633265 tatgaattttagtaaatgaaccttttataatgttataaacttgtctaaaaaatatcattaaaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 9633169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 234 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 45958815 - 45958726
Alignment:
Q  234 ttttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||       ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  45958815 ttttagtaattgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaaaataattaaacaaactt 45958726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 34 - 271
Target Start/End: Original strand, 8832715 - 8832952
Alignment:
Q  34 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaa-tattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgc 132  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || |||| |||||||||||||| |  ||| ||||| |||||| |||||||| ||| | || |||| |  |    
T  8832715 aaatttgtttaatt-atgcttaaacttttaagatttttaacaattttttgcacaagtgtcaagaactattacgaaaagttcatctccgaataattatctc 8832813  T
Q  133 aaaaattgatttatacgtccagatttt-gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttcta 231  Q
    |||| || |||| | |||||||||||| |||| |||||| || |||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||||||| |        ||||    
T  8832814 aaaattttatttctgcgtccagatttttgttacttttattttaaacttttgtcttttaaaaaaattcatatttaatttatttcatgctaaatagg-tcta 8832912  T
Q  232 aattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgt 271  Q
    |||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||    
T  8832913 aattttagtaaatgaaccttttgtaatgttctaaacttgt 8832952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 34 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 12621861 - 12621625
Alignment:
Q  34 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 133  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||| ||| |  | ||||||| || || |||||||  ||||||||||||| |  ||    
T  12621861 aaatttgtttaatt-atgcttaaacttttaagattttgaacaatttttagcacaagtattaagaacatcacgaaaagtttatctgcaaaaaattatctca 12621763  T
Q  134 aaaattgatttatacgtccagatttt-gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaa 232  Q
    ||| || |||  | |||||||||||| |||| |||||| || |||||| ||  ||| |||||||||||||||||||  |||||||||       || |||    
T  12621762 aaattttattcctgcgtccagatttttgttacttttattttgaactttcgtcttttaaaaaaattcatatttaatttatttcatgttaaaaaattt-taa 12621664  T
Q  233 attttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgt 271  Q
    ||||||||||| ||||||||  || |||||||| |||||    
T  12621663 attttagtaaacgaacctttagtaatgttctaaacttgt 12621625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 36020090 - 36020005
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagtt 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||| ||||| |||||||||||||    
T  36020090 tcaatttaaatttgtttaatttatacttaaactcttgagtttttaaacaattttttacaaatgtgtcaagaacattactaaaagtt 36020005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 29 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 27728051 - 27727998
Alignment:
Q  29 aattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaatttttt 82  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27728051 aattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttgagtttttgaacaatttttt 27727998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 176 - 273
Target Start/End: Original strand, 15130859 - 15130955
Alignment:
Q  176 acttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtct 273  Q
    |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||       |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15130859 acttttatcgttttcaaaaattcatatttaattcgtttaatatttaaaaa-ttctaaattttagtaattgaacctttcatagtgttctaaacttgtct 15130955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 229 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 47139830 - 47139739
Alignment:
Q  229 ctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaa 320  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||||||       || |||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  47139830 ctaaattttagtaaatgaaccttgcataatgttttaaacttgtctcaaaaaaatcattcaaaaatttaaatgtttaaggataattaaacaaa 47139739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 34 - 127
Target Start/End: Original strand, 8081814 - 8081906
Alignment:
Q  34 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaatt 127  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  8081814 aaatttgtttaatt-atgcttaaacttttaagattttgaacaattttttgcacaagtgttaagaacattacgaaaagttcatctccaaaaaatt 8081906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 26 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 38199864 - 38199807
Alignment:
Q  26 atcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttg 83  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  38199864 atcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagttttttaacaattttttg 38199807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 271
Target Start/End: Original strand, 37107686 - 37107922
Alignment:
Q  34 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 133  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||| |  | ||||||| || || |||| ||   |||||||||||| |   |    
T  37107686 aaatttgcttaatt-atgcttaaacttttaagattttgaacaattttttgcacaagtattaagaacatcacgaaaattttaactgcaaaaaattatctta 37107784  T
Q  134 aaaattgatttatacgtccagatttt-gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaa 232  Q
    ||| || |||  | |||||||||||| |||  |||||| || |||||||||  |||||||||||| ||||||||||  |||||||||       ||||||    
T  37107785 aaattttattcctgcgtccagatttttgttgcttttattttgaacttttgtctttttaaaaaatttatatttaatttatttcatgtt-gaaaaattctaa 37107883  T
Q  233 attttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgt 271  Q
    ||||||||||| ||||||||  || |||||||| |||||    
T  37107884 attttagtaaacgaacctttagtaatgttctaaacttgt 37107922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 10463497 - 10463312
Alignment:
Q  119 caaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccagatttt-gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatg 217  Q
    ||||||||| ||  ||||||| |||| |||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||||||     
T  10463497 caaaaaattatttgaaaaatttatttctacgtccagatttttgttacttttatcttaaatttttgtcttttaaaaaaattcatatttaattaatttcat- 10463399  T
Q  218 ttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaag 306  Q
    ||       |||||||  || ||||| ||||||||  || |||| ||| ||||||||       |||||||||||||||||||||||||    
T  10463398 tttaaaaaattctaaa--ttggtaaacgaaccttttgtaatgttttaaacttgtctcaaaaagatcgttcaaaaatttaagagtttaag 10463312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 106 - 265
Target Start/End: Original strand, 1065769 - 1065928
Alignment:
Q  106 aaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccagatttt-gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatattt 204  Q
    |||||||  ||||||||||||| |  ||||| || |||  |||||| ||||||| |||| |||||| || |||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  1065769 aaaagtttatctgcaaaaaattatctcaaaattttattcctacgtctagatttttgttacttttattttgaacttttgtcttttaaaaaaattcatattt 1065868  T
Q  205 aattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaa 265  Q
    ||||  |||||||||       ||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||    
T  1065869 aatttatttcatgtt-aaaaaattctaaattttagtaaacgaacctttagtaatgttctaa 1065928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 34 - 112
Target Start/End: Original strand, 38593281 - 38593358
Alignment:
Q  34 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagtt 112  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||    
T  38593281 aaatttgtttaatt-atgcttaaacttttaagattttgaacaattttttgcaaaagtgttaagaacattacgaaaagtt 38593358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 42974394 - 42974165
Alignment:
Q  36 atttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaa 135  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| || || |||| |||||||||||||| |  ||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||||| || |  ||||    
T  42974394 atttgtttaatt-atgcttaaacttttaagattttaaacaattttttgcacaagtgtcaagaacattacgaaaagttcatctccaaaaacttatctcaaa 42974296  T
Q  136 aattgatttatacgtccaga-ttttgttaattttatctttaacttttgt-tgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaa 233  Q
    | || |||| | |||||||| |||||||| |||||| |  ||||||||| | ||  |||||| ||||||||||||  || ||||||       |||||||    
T  42974295 attttatttctgcgtccagatttttgttacttttatttcaaacttttgtcttttaaaaaaaaatcatatttaatttattccatgtt-aaataattctaaa 42974197  T
Q  234 ttttagtaaatgaacctttcatagtgttctaa 265  Q
    |||||||||| ||||||||  || ||||||||    
T  42974196 ttttagtaaacgaaccttttgtaatgttctaa 42974165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 234 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 16080868 - 16080779
Alignment:
Q  234 ttttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    ||||||||||||||| |||| || |||||||| ||| ||||       || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16080868 ttttagtaaatgaacatttcttaatgttctaaacttttctcaaagaaatcataaaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 16080779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 34 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 37108686 - 37108538
Alignment:
Q  34 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 133  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||  ||| |  ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |  ||    
T  37108686 aaatttgcttaatt-atgcttaaacttttaagattttgaacaatttt--gcacaagtgttaagaacattacgaaaagttcatctgcaaaaaattatctca 37108590  T
Q  134 aaaa-ttgatttatacgtccag-attttgttaattttatctttaacttttgt 183  Q
    |||| || |||| | ||||||| ||||||||| |||||| || |||||||||    
T  37108589 aaaattttatttttccgtccagaattttgttacttttattttgaacttttgt 37108538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 3496478 - 3496423
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaatttttt 82  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  3496478 tcaatttaaatttgtttaattcatgcttaaactcttaagttttttaacaatttttt 3496423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 284 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 29156001 - 29155962
Alignment:
Q  284 gttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29156001 gttcataaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 29155962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 271
Target Start/End: Original strand, 38594592 - 38594756
Alignment:
Q  107 aaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccagatttt-gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatattta 205  Q
    ||||||| ||| ||||||||| |  ||||| || |||||| |||| ||||||| |||| |||||| || |||||||||  ||| |||||||||||||||     
T  38594592 aaagttcatctccaaaaaattatctcaaaatttaatttatgcgtctagatttttgttacttttattttgaacttttgtcttttaaaaaaattcatatttg 38594691  T
Q  206 attcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgt 271  Q
    |||  ||||||| |       ||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||| |||||    
T  38594692 atttatttcatgct-aaataattctaaattttagtaaacgaaccttttgtaatgttctaaacttgt 38594756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 85
Target Start/End: Original strand, 37537487 - 37537542
Alignment:
Q  29 aattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgca 85  Q
    |||| ||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37537487 aattcaaatttggttaatt-atgcttaaactcttaagtttttgaacaattttttgca 37537542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 34 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 8082586 - 8082536
Alignment:
Q  34 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgca 85  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  8082586 aaatttgtttaatt-atgcttaaacttttgagattttgaacaattttttgca 8082536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 27 - 78
Target Start/End: Original strand, 15130711 - 15130762
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaatt 78  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  15130711 tcaatttaaatttggttaatttatgcttaaactcttaagttttttaacaatt 15130762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 83
Target Start/End: Original strand, 43083327 - 43083384
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgag-tttttgaacaattttttg 83  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||||    
T  43083327 tcaattcaaatttgtttaatttatacttaaactcttaagtttttttaacaattttttg 43083384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 27 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 15131624 - 15131588
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttg 63  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15131624 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttg 15131588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 34 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 40304479 - 40304416
Alignment:
Q  34 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaa 98  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||| | || |||||||    
T  40304479 aaatttgtttaatt-atgcttaaacttttaagattttgaacaattttttgcacaaatattaagaa 40304416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 183; Significance: 6e-99; HSPs: 67)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Original strand, 53323774 - 53324070
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttg-caaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaa 125  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  || || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  53323774 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttgagtttttgaacaatttttttacatacgtgttaagaacattactaaaagttcctatgcaaaaaa 53323873  T
Q  126 ttgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnn 225  Q
    ||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||          
T  53323874 ttgtcacaaaatttgatttctacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgtcgttttaaaaaattcatatttaattcatttcatgtt-aaaaa 53323972  T
Q  226 nttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53323973 attctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 53324070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 30331573 - 30331278
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  30331573 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttgagtttttgaacaattttttacaggcgtgttaagaacattactaaaagttcctatgcaaaaaat 30331474  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||           
T  30331473 tgtcgcaaaatttgatttctacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgccgttttaaaaaattcatatttaattcgttttatgtt-aaaaaa 30331375  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||       ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30331374 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtttcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaagaataattaaacaaactt 30331278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Original strand, 47309434 - 47309729
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  47309434 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttgagtttttgaacaattatttacagacatgttaagaacattaataaaagttcctatgcaaaaaat 47309533  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
    ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  47309534 tgtagcaaaatttgatttatacgtcaagattttgttaattttatctttaacttttgccattttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaa 47309632  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||       ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47309633 ttctaaattttagtaaatgaacctttcacagtgttctaaacttgtctcaaaaaaatcgtttaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 47309729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 33177716 - 33177421
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  33177716 tcaatttaaatttgtttaatttatgtttaaactcttgagtttttgaacaattttttacagacgtgttaagaacattactaaaagctcctatgcaaaaaat 33177617  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
    |||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  33177616 tgtctcaaaatttgatttctacgtccagattttgttaattttatctttaacgtttgccgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaa 33177518  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33177517 ttctaaattttagtaaatgaacttttcatagtattctaaacttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 33177421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 22 - 316
Target Start/End: Original strand, 43937996 - 43938291
Alignment:
Q  22 catcatcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgc-a 120  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  43937996 catcctcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttgagtttttgaacaattttttgtagacatgttaagaacattactaaaagttcctctgcaa 43938095  T
Q  121 aaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttn 220  Q
    ||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| || | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||     
T  43938096 aaaaattgtcgcaaaattttatttatacgttcagattttgttaattttttcttgaactattttcgttttaaaattttcatatttaattcgtttcatgtta 43938195  T
Q  221 nnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaa 316  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||       ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43938196 aaaaaattctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaagcttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagttaaaggataattaaa 43938291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 27 - 330
Target Start/End: Original strand, 19522712 - 19523014
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||  |||| ||||||||||    
T  19522712 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttgagtttttgaacaattttttacagacgtgttaagaacattactaaaaagtcctatgcaaaaaat 19522811  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
    ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||           
T  19522812 tgtcgcaaaatttgatttctacgtccagattttgttaattttatttttaacttttgccgttttaaaaaattcatatttaatttgtttcatgtt-aaaaaa 19522910  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaacttcaa 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||        ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||    
T  19522911 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtctaaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaagaataattaaacaaatttgaa 19523010  T
Q  327 ttga 330  Q
    ||||    
T  19523011 ttga 19523014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 34 - 323
Target Start/End: Original strand, 31316547 - 31316836
Alignment:
Q  34 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 133  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| || |||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  31316547 aaatttgtttaatttatgcttaaactcttgagttttttaacaattttttgtagacgtgttaaaaacattactaaaagttcctctgcaaaaaattatcgca 31316646  T
Q  134 aaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaa 233  Q
    ||| |||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||       |||||||    
T  31316647 aaatttgatttatatgtccaaattttattatttttatctttaatttttatcgttttcaaaaattcatatttaatttgtttcatgttaaaaaaattctaaa 31316746  T
Q  234 ttttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||       ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31316747 ttttagtaattgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaaatcgttcagaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 31316836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Original strand, 22068097 - 22068392
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | |||| |||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22068097 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttgagtttttgaatagttttctgcagacgtgttaagaacattactaaaagttcctctgcaaaaaat 22068196  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
    ||| |||||| |||| || |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  22068197 tgtcgcaaaatttgacttttacgtcccaattttgttaatttaatctttaacttttgccgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaaaa 22068296  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | | ||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22068297 -tctaaattttagaaaatgaacctttcatagtgttctaaacatatctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 22068392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 34 - 323
Target Start/End: Original strand, 55938075 - 55938362
Alignment:
Q  34 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 133  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||    
T  55938075 aaatttgtttaatttatgcttaaactcttgagtttttgaacaattttttgcagacgtgttaagaatattactaaaagtacctctgtgaaaaattgtcgca 55938174  T
Q  134 aaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaa 233  Q
    ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||       |||||||    
T  55938175 aaatttgatttctacgtgcagattttgttaattttatctttaacatttgttgttttaaaaaattcagatttaattcgttttatgtt-aaaaaattctaaa 55938273  T
Q  234 ttttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    || ||||||| | ||||||| ||||||||||| ||| | ||       ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55938274 ttctagtaaacg-acctttcgtagtgttctaaacttatttcaaaaaaatcgtttaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 55938362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 29 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 28448677 - 28448391
Alignment:
Q  29 aattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattg 128  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28448677 aattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttgagtttttgaacaattttttgc-aacgtgttgagaacattactaaaagttcctatgcaaaaaattg 28448579  T
Q  129 ttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnntt 228  Q
    | |||||| ||||||| ||||      ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||       ||    
T  28448578 tcgcaaaatttgatttctacg------ttttgttaattttatctttaagttttgtcgttttgaaaaattcatattcaatttgtttcatgtt-aaaaaatt 28448486  T
Q  229 ctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||       || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28448485 gtaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaaatcattcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 28448391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 22 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 20178175 - 20177934
Alignment:
Q  22 catcatcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaa 121  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  20178175 catcctcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaattcttgggttattgaacaattttttacatacatgttaagaacattactaaaagttcctctacaa 20178076  T
Q  122 aaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnn 221  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      
T  20178075 aaaattgtcgcaaaatttgatttatacgtccagattttgttacttttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcttgttaa 20177976  T
Q  222 nnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaa 265  Q
         |  |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  20177975 aaaatt--taaattttagtaaatgaaccttccatattgttctaa 20177934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 53423859 - 53423563
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  53423859 tcaattcaaatttgtttaatttatactaaa-ctcttgagtttttggacaattttttgcagacatgttaagaacattactaaaagttcctccgcaaaaaat 53423761  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-nnnnnn 225  Q
    ||| |||||| ||| || | ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||           
T  53423760 tgtcgcaaaatttgtttcacacgtccatattttgttacttttatctataacttttgccgttttaaaaaattcatatttaatttatttcatgttaaaaaaa 53423661  T
Q  226 nttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||        | ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  53423660 attctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtcttaaaagaattgttaaaaaatttaagagtttaaggatagttaaacaaactt 53423563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 33689588 - 33689293
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| | |  ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||    
T  33689588 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagttttttaacaattttttgtagatgtgttaagaacattactaaaaattcctccgcaaaaaat 33689489  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
    | | |||||| ||| |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||           
T  33689488 tatcgcaaaatttggtttatatgtccagattttattacttttatctttaacttttatcgtttttaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaa 33689390  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||       ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  33689389 ttctaaattttagtaattgaacctttcatagtgctctaaacttgtctcaaaaaaatcgtttaaaaatttaagaatttaagaataattaaacaaactt 33689293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 27 - 320
Target Start/End: Original strand, 51876007 - 51876302
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  51876007 tcaatttaaatttgtttaatttatgcttaaactcttgagtttttgaacaattttttagagacgtgttaagaacattactaaaagttcctctgcaaaaaat 51876106  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatc-tttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnn 225  Q
    | |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||          
T  51876107 tatcacaaaatttgatttatacgtccagattttgttaattttatcttttaacttttaccgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaac 51876206  T
Q  226 nt-tctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaa 320  Q
     | ||||||||||| ||||||||| ||||| | |||| ||| |||||||        |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  51876207 ttgtctaaattttaataaatgaacatttcacattgttataaacttgtctaaaaaaattcgttcaaaagtttaagagtttaagaataattaatcaaa 51876302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Original strand, 10321695 - 10321990
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  10321695 tcaattaaaatttgtttaatttatacttaaactcttaagttttttaacaattttttgtagacgtgttaagaacattactaaaagtccctccgcaaaaaat 10321794  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
    | | |||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |           
T  10321795 tatcgcaaaatttgatttatatgtccagattttattacttttatctttaacttttatcgttttcaaaaattcatatttaattcttttcatgat-aaaata 10321893  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| ||       | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10321894 ttctaaattttagtaattgaacctttcacagtgttctaaacttgtgtcaaaaaaattgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactt 10321990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Original strand, 4850094 - 4850389
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||    
T  4850094 tcaattcaaatatgtttaatttatgcttaaactcttaagtttttgaacaattttttgcatacgtgttaagaatgttactaaaaatttctccgcaaaaaat 4850193  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
    | | |||||| ||||||| |||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||           
T  4850194 tatcgcaaaatttgatttctacgtctaagttttgttatttttatctttaacttttgtcgttttaaaaaattcatattaaattcgtttcatgtt-gaaaaa 4850292  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    |||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||||||   ||||||       ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4850293 ttctaaatattactaaatgaatctttcatattgttctaaatgtgtctcaataaaatcgttcaaaaattcaagagtttaagaataattaaacaaactt 4850389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 27 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 13718271 - 13718078
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaa-acatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaa 125  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13718271 tcaatttaaatttgtttaatttatgcttaaactcttgagttttttaacaatttttttccagacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaa 13718172  T
Q  126 ttgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt 219  Q
    |||| |||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13718171 ttgtcgcaaaatttgatttctacgtcctgattttgttaattttatcttgatcttttgtcgttttaaaaaattcatatttaatgcgtttcatgtt 13718078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Original strand, 25422067 - 25422361
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| |||| ||||||| | || ||||||||| ||||||||||| || || |||||||||    
T  25422067 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttaagttttttaacatttttttgtagacgtgttaagaacattactaaaagatcatccgcaaaaaat 25422166  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
    | | |||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||           
T  25422167 tatcgcaaaatttgatttatatgtccagatttt-ttacttttatctttaacatttatcgttttcaaaaattcatatttaattcgttttatgtt-aaaaaa 25422264  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||       ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25422265 ttctaaattttagtaattgaacctttgatagtgttctaaacttgtctcaaaaaaatcgtttaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 25422361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 27 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 38114507 - 38114273
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  38114507 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttgagttttttaacaaatttttacagacgtgttaagaacattactaaaagttcctatgcaaaaaat 38114408  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
    |||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  38114407 tgtcacaaaatttgatttatatgtccagattttgttaattttatctttaacttttgccgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaaat 38114308  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttc 262  Q
    || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||    
T  38114307 tt-taaattttagtaaatgaacatttcctagcgttc 38114273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 61 - 323
Target Start/End: Original strand, 1870140 - 1870400
Alignment:
Q  61 ttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttg 160  Q
    ||||||||||  ||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  1870140 ttgagtttttcgacaattttttgtagacatgttaaaaacattactaaaagtttctcggcaaaaaattgtcacaaaatttgatttatacgtccatattttg 1870239  T
Q  161 ttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgt 260  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||       |||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  1870240 ttacttttatctttaacttttgtcgttttaaaaaattcatatttaattcgttttatgtt-aaaaaattctaaattttagtaaatgaacattttatagtgt 1870338  T
Q  261 tctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    ||||| |||||||        |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  1870339 tctaaacttgtct-taaaaaatcgttcaaaaatttaatagtttaaggatagttaaacaaactt 1870400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 27 - 316
Target Start/End: Original strand, 10085485 - 10085772
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  10085485 tcaattcaaatttgtttaatttatgctaaaactcttaagtttgtgaataattttttgcagacatgtttagaacattactaaaagttcctccgcaaaaaat 10085584  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgtta-attttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnn 225  Q
    | | |||||| ||||||| ||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||          
T  10085585 tatcgcaaaatttgatttctatatcctgattttgttactttttatctttaacttttgtcgttttaaaaaattta-atttaatttgtttcatgtt--aaaa 10085681  T
Q  226 nttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaa 316  Q
     |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||| |        ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10085682 attctaaattttagtaaatgaagatttcatagtgttctaaatttgtcacaaaaaaaccgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaa 10085772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 51395907 - 51395612
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||| || ||||||  | |||||||||||||||| | ||||| ||    
T  51395907 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcatgagtttttgaataatttcttgcagacgtgttaaacacattactaaaagttcctgtacaaaatat 51395808  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
    ||| |||||| || |||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||           
T  51395807 tgtcgcaaaatttaattactacatcctgattttgttaattttatctttaacttttttcgttttgaaatattcatatttaatttgtttcatgttaaaaaaa 51395708  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    ||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||| |||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51395707 ttctaaattttagtaaatgaatcactcatagtgtt-taaacttgtctaaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 51395612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 100 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 3873374 - 3873155
Alignment:
Q  100 attactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattca 199  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  3873374 attactaaaagttcctatgcaaaaaattgtcgcaaaatttgatttctacgtacaggttttgttaattttatctttaactttttccgttttaaaaaattca 3873275  T
Q  200 tatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaaga 299  Q
    ||||||||| ||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||       |||||||||||| |||||    
T  3873274 tatttaatttgtttcatgtt-aaaaaattctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaatgtaaga 3873176  T
Q  300 gtttaaggataattaaacaaa 320  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  3873175 gtttaaggataattaaacaaa 3873155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 72 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 42972983 - 42972734
Alignment:
Q  72 aacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatc 171  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||| | |||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  42972983 aacaattttttgcagacgtgttaagaacattgctaaa-gttccactgcaaaaaattgtcgtaaaatttgatttctacgtccaaattttgttaattttatc 42972885  T
Q  172 tttaacttttgttgttttaa-aaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttg 270  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||       || |   ||||  ||||||||||||||||||| |||||| || |    
T  42972884 tttaacttttgttgttttaacaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaaaatttt--tttttgataaatgaacctttcatagtattctaaactcg 42972787  T
Q  271 tctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    |||        |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42972786 tcttaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactt 42972734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 27 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 35061120 - 35060875
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||| | || ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||    
T  35061120 tcaattcaaatttgtttaatttattctaaaactcttaagatttt-aacaattttttgtagacgtgttaagaacattattaaaagttcctccgcaaaaaat 35061022  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
    | | |||||| ||||||||||  |||||||||| ||| |||||| |||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||           
T  35061021 tatcgcaaaatttgatttatatatccagattttattacttttatttttaacttttatcgttttcaaaaaatcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaa 35060923  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctc 274  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||| |||| ||||| ||||||||    
T  35060922 ttctaaattttagtaattgaatatttcaaagtgctctaaacttgtctc 35060875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 53571824 - 53571542
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||| | || ||||||||| |||| |||||||||| | ||||||       
T  53571824 tcaattcaaatttgtttaatttattcttaaactcttaagttttttaacaattttttgtagacgtgttaagaacattattaaaagttccgccgcaaaat-- 53571727  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
               |||||||||| || || ||||| ||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||| |||||||||||||||||||||           
T  53571726 -----------ttgatttatatgtacatattttattacttttatctttaacttttattattttcaaaaatttatatttaattcgtttcatgttaaaaaa- 53571639  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||       |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  53571638 ttctaaattttattaattgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaattcgttcaaaaatttaagagtttaaggatgattaaacaaactt 53571542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 66 - 323
Target Start/End: Original strand, 7490732 - 7490988
Alignment:
Q  66 tttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaat 165  Q
    ||||||||||||||||  || || ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||  ||| |  ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  7490732 tttttgaacaatttttcacagacgtgttaagcacattactaaaa-ttcctctgcaaaaaattgacgcatattttgatttctacgtccaaattttgttaat 7490830  T
Q  166 tttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaa 265  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||        |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  7490831 tttatctttaacttttgccgttttaaaatattcatatttaattcgtttcatcttaaaaaaa-tctaaactttagtaattgaaccttttatagtgttctaa 7490929  T
Q  266 ccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaa-tttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
     |||||||        | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7490930 acttgtctaaaaaaagttgttcaaaaattttaagagtttaaggataattaaacaaactt 7490988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 99 - 323
Target Start/End: Original strand, 47463436 - 47463661
Alignment:
Q  99 tattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattc 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  47463436 tattactaaaagttcctctgcaaaaaattatcacaaaatttgatttctacgtccatattttgttaattttatctttaatttttactgttttaaaaaattc 47463535  T
Q  199 atatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatag---tgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaattt 295  Q
    |||||||||| |||| |||||        | ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||       ||||| ||||||||    
T  47463536 atatttaatttgtttaatgttaaaaaaaat-taaattttagtaaatgaacctttcatagtgttgttctaaacttgtctc-aaaaaatcgttaaaaaattt 47463633  T
Q  296 aagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||    
T  47463634 aagagtttaaagataattaaacaaactt 47463661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 131 - 323
Target Start/End: Original strand, 11670210 - 11670401
Alignment:
Q  131 gcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttct 230  Q
    |||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||       ||||    
T  11670210 gcaaaatttgatttatatgtccatattttattacttttatctttaacttttattgttttcaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaattct 11670308  T
Q  231 aaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||       |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11670309 aaattttattaattgaacctttcgtagtgttctaaacttgtctcaaaaaattcgttcaaaattttaagagtttaaggataattaaacaaactt 11670401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 44209777 - 44209495
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| || ||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||    
T  44209777 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttaagttttttaataattttttgtagacgtgttaagaacattactaaaagttcgtacgcaaaaaat 44209678  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
    | | |||||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||              |||| |||||| |||||||||||| |||| ||||           
T  44209677 tatcgcaaaatttgatttatatgtccagattttattacttttatc-------------cttttcaaaaatacatatttaattcttttcgtgtt-aaaaga 44209592  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44209591 ttctaaattttagtaattgaatctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 44209495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 34 - 320
Target Start/End: Original strand, 44289684 - 44289970
Alignment:
Q  34 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 133  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| || || |||||||||  ||| |||||| || || | |||||| | | |||    
T  44289684 aaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagtttttcaacaattttttacagacgtgttaagaacgttattaaaaggtcatccg-aaaaaaatatcgca 44289782  T
Q  134 aaaa-ttgatttatacgtccaga-ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttcta 231  Q
    |||| ||||||| |||||||| | |||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||       || ||    
T  44289783 aaaatttgatttctacgtccatatttttgttacttatatcttaaacttttgtcgttttaaaaaattcatatttaatttatttcatgtt-aaaaaattata 44289881  T
Q  232 aattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaa 320  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |        ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44289882 gattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtataaaaagaatcgttaaaaaatttaagagtttaaggataattaagcaaa 44289970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 34 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 23473766 - 23473478
Alignment:
Q  34 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaatttttt-gcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgc 132  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| |||||||| | | || ||| |||||  |||| |||||||||||||||||||||| | ||    
T  23473766 aaatttgtttaatttatgcttaaagtcttaagtttttgaataatttttttgtagacgtgtcaagaacgttaccaaaagttcctctgcaaaaaattatcgc 23473667  T
Q  133 aaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaa 232  Q
    |||| ||||||  || ||||||||||| ||| || ||||||||| |||||  || || ||||| |||||||||||| ||||||||||       || |||    
T  23473666 aaaatttgattcttatgtccagattttattacttatatctttaatttttgacgtatttaaaaactcatatttaatttgtttcatgttaaaaaattt-taa 23473568  T
Q  233 attttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||       |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  23473567 attttagt-aatgaacctttcacagtgttctaaacttatctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaccgataattaaacaaactt 23473478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 27 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 47379471 - 47379177
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| | |||||| |||||| ||| |   ||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||    
T  47379471 tcaattcaaatttgtttaatt-atgcttatactcttaagttttcgaaaatgcttttgcagacgtgttaagaacaatactaaaagttcctccgcaaaaaat 47379373  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccaga-ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnn 225  Q
    | | |||||| ||||||| |||||||| | |||||||| ||||||||| |  ||||||  ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||          
T  47379372 tatcgcaaaatttgatttctacgtccatatttttgttacttttatcttgacgttttgtcattttaaaaaatacatatttaattcatttcat-ttttaaaa 47379274  T
Q  226 nttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaacttc 324  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||       ||| ||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||    
T  47379273 attctaaattttagtaaatgaacctttcatagtattctaaacttgtctcaaaatattcgctcaaaa--tttagagtttaagtataattaaacaaacttc 47379177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 27 - 216
Target Start/End: Original strand, 37329487 - 37329678
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||| | ||||| |||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  37329487 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttaaattttttaacaattttttgtagacgtgttaagaacattactaaaagttcatccgcaaaaaat 37329586  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatt--tatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcat 216  Q
    | |||||||| || |||  ||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37329587 tattgcaaaatttaatttatatatatccagattttattacttttatctttaacttttatcgttttcaaaaattcatatttaattcgtttcat 37329678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 34 - 320
Target Start/End: Original strand, 48082450 - 48082736
Alignment:
Q  34 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 133  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| || || |||||||||  ||| |||||| || || | |||||| | | |||    
T  48082450 aaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagtttttcaacaattttttacagacgtgttaagaacgttattaaaaggtcatccg-aaaaaaatatcgca 48082548  T
Q  134 aaaa-ttgatttatacgtccaga-ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttcta 231  Q
    |||| ||||||| |||||||| | |||||||| || |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||||       || ||    
T  48082549 aaaatttgatttctacgtccatatttttgttatttatatcttaaacttttgtcgttttataaaattcatatttaatttatttcatgtt-aaaaaattata 48082647  T
Q  232 aattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaa 320  Q
     ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |        ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  48082648 gatttttgtaaatgaaccgttcatagtgttctaaacttgtataaaaagaatcgttaaaaaatttaagagtttaaggataattaagcaaa 48082736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 34 - 273
Target Start/End: Original strand, 35821131 - 35821357
Alignment:
Q  34 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 133  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| | |||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||           |    
T  35821131 aaatttgtttaatttatacttaaactcttaaatttt-gaacaattttttgcagacgtgttaagaacattactaaaagttcctctgcaa-----------a 35821218  T
Q  134 aaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaa 233  Q
    |||||| ||   |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||| |||  ||||||||||       || ||||    
T  35821219 aaaatt-atcgctacgtccagattttattaattttatttttaagttttgtcgttttataaaattcatattcaataagtttcatgttaaaaaaattgtaaa 35821317  T
Q  234 ttttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtct 273  Q
    || ||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||    
T  35821318 ttctagtatatgaacctttcatgatgttctaaacttgtct 35821357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 28 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 48220180 - 48219945
Alignment:
Q  28 caattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaatt 127  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||| |||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||    
T  48220180 caattcaaatttgtttaatt-atgcttaaactcttatgttttttaacattcttttgcagatatgttaagaacattactaaaaattcctccgcaaaaaatt 48220082  T
Q  128 gttgcaaaaattgatttatacgtccagatttt-gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
     ||| |||| || |||| ||| |||| ||||| |||| |||||| || || ||||||  |||||||| ||||||||||||||  |||| ||||           
T  48220081 attgtaaaatttaatttctacatccaaatttttgttacttttatattgaa-ttttgtcattttaaaacattcatatttaattaatttcttgtt-aaaaaa 48219984  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaa 265  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  48219983 ttctaaattttaacaaatgaacctttcataatgttctaa 48219945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Original strand, 38499327 - 38499479
Alignment:
Q  67 ttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaatt 166  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  |  ||||| || |||| || ||||||||||| ||| ||    
T  38499327 ttttgaacaattttttgcagaagtgttaagaacattactaaaagttcatctgcaaaaaataatctcaaaattttatttctatgtccagatttttttactt 38499426  T
Q  167 ttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt 219  Q
    ||||||| ||||  |||  ||| |||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  38499427 ttatcttgaactcatgtcttttaaaaatattcatatttaattcatttcatgtt 38499479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 227 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 7617514 - 7617418
Alignment:
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7617514 ttctaaattttagtaaatgaacctttcataatgttttaaacttgtcttaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 7617418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 29 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 52948054 - 52947767
Alignment:
Q  29 aattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattg 128  Q
    |||| |||||||||||||| ||| | |||||||||| |||||||||||||||||  | |  |||| | || ||||||||||||| |||  | |||||||     
T  52948054 aattcaaatttgtttaatt-atgtttaaactcttgaatttttgaacaattttttatatatgtgttcaaaacattactaaaagttgctccccgaaaaatta 52947956  T
Q  129 ttgcaaaaattgatttatacgtccaga-ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnt 227  Q
     | ||||||||||||| |||| ||| | |||||| | ||||||||| || ||||||  ||| |||||||||||||||||||  | |||||||       |    
T  52947955 gttcaaaaattgatttctacgaccaaacttttgtgacttttatcttgaaattttgtcattt-aaaaaattcatatttaatttatctcatgttaaaaaaat 52947857  T
Q  228 tctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtct-cnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaa 316  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||   ||||| |       |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  52947856 tctaaattttagtaaatgaactttttataatgttctaaaagtgtctccaaaaaaatcgttctaaaatttaacagtttaaggataattaaa 52947767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 34 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 34513305 - 34513123
Alignment:
Q  34 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 133  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||| |  ||| ||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||| |  ||    
T  34513305 aaatttgtttaatt-atgcttaaacttttaagattttgaacaattttttgcacaagtgtcaagaacattacgaaaagttcatctccaaaaaattatctca 34513207  T
Q  134 aaaattgatttatacgtccaga-ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatg 217  Q
    ||| || |||| | |||||||| |||||||| |||||| || |||||||||  ||| |||||||||||||||||||  |||||||    
T  34513206 aaattttatttctgcgtccagatttttgttacttttat-ttaaacttttgtcttttaaaaaaattcatatttaatttatttcatg 34513123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 29 - 323
Target Start/End: Original strand, 13603785 - 13604077
Alignment:
Q  29 aattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattg 128  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| | || ||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||     
T  13603785 aattcaaatttgtttaatt-atgcttaaactcttaagtttt-gaacaattttttgcagatattttatgaacattactaaaagttcctccgcaaaaattta 13603882  T
Q  129 ttgcaaaaattgatttatacgtccaga-ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnt 227  Q
    |  |||||  |||||| ||  |||| | |||||||| ||||| ||||||    | | |||| ||| |||||||||||||||  ||||| |||       |    
T  13603883 tctcaaaatgtgatttttatatccaaatttttgttacttttaactttaaaaaatttcgtttaaaagaattcatatttaatttatttcaagtt--aaaaat 13603980  T
Q  228 tctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgtt-caaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    | | ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| |||||||        || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13603981 tatgaattttagtaaatgaaccttttataatgttataaacttgtctaaaaaatatcattaaaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 13604077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 27 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 7617611 - 7617535
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatatta 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||    
T  7617611 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttgagtttttgaacaattttttacagacatgttaagaacatta 7617535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 34 - 271
Target Start/End: Original strand, 44452093 - 44452328
Alignment:
Q  34 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 133  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||| |  | ||||||| || || |||||||  |||||||||| || |  ||    
T  44452093 aaatttgtttaatt-atgcttaaacttttaagattttgaacaattttttgcacaagtattaagaacatcacgaaaagtttatctgcaaaaa-ttatctca 44452190  T
Q  134 aaaattgatttatacgtccagatttt-gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaa 232  Q
    ||| || |||  | |||||||||||| |||| |||||| || |||||||||  ||| |||||||||||||||||||  |||||||||       ||||||    
T  44452191 aaattttattcctgcgtccagatttttgttacttttattttgaacttttgtcttttaaaaaaattcatatttaatttatttcatgtt-aaaaaattctaa 44452289  T
Q  233 attttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgt 271  Q
    ||||||||||| ||||||||  || |||||||| |||||    
T  44452290 attttagtaaacgaacctttagtaatgttctaaacttgt 44452328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 27 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 3873468 - 3873397
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaa 98  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  3873468 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttgagtttttgaacaattttttacaggcatgttaagaa 3873397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 227 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 3862585 - 3862491
Alignment:
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnn-tcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaa 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||        ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3862585 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatcgcattctaaacttgtctcaaaaaaaatcgttaaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaa 3862491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 227 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 3871342 - 3871248
Alignment:
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnn-tcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaa 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||        ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3871342 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatcgcattctaaacttgtctcaaaaaaaatcgttaaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaa 3871248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 282 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 13718035 - 13717994
Alignment:
Q  282 tcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13718035 tcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 13717994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 34 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 28164010 - 28163777
Alignment:
Q  34 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 133  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || |  ||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||| |  |     
T  28164010 aaatttgtttaatt-atgcttaaacttttaaaattttgaacaattttttgcaca-gtgttaagaacattacgaaaagttcatctccaaaaaattat--ct 28163915  T
Q  134 aaaattgatttatacgtccaga-ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaa 232  Q
     || || |||| | | |||||| |||||||| |||||| || |||||||||  ||| |||||||||||||| ||||  ||||||| |       ||||||    
T  28163914 caattttatttctgcttccagatttttgttacttttattttcaacttttgtcttttaaaaaaattcatattaaatttatttcatgct-aaataattctaa 28163816  T
Q  233 attttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgt 271  Q
    ||||||||||| ||||||||  || |||||||| |||||    
T  28163815 attttagtaaacgaaccttttgtaatgttctaaacttgt 28163777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 34 - 320
Target Start/End: Original strand, 55283115 - 55283399
Alignment:
Q  34 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 133  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||| |||||| ||||| | || | ||||||| ||||| |||||| ||||| ||||| |||    ||    
T  55283115 aaatttgtttaatt-atgcttaaattcttgaatttttaaacaatcttttgtacacctattaagaacattacgaaaagtccctctacaaaatattaactca 55283213  T
Q  134 aaaattgatttatacgtccagatttt-gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaa 232  Q
    ||| ||||||| ||||| |||||||| |||| | || |||| ||||||||| |||| ||||||| ||||||||| || | || | ||       | |||     
T  55283214 aaatttgatttctacgttcagatttttgttactcttttcttgaacttttgtcgtttaaaaaaat-catatttaaatcttctcctattaaaaaaat-ctat 55283311  T
Q  233 attttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaa 320  Q
     |||||| |||||||| ||| ||| |||||||| | ||||||       |||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||    
T  55283312 tttttagcaaatgaacattttataatgttctaaacatgtctcctaaaaatcgttcaaaaatttaagaattcaagaataattaaacaaa 55283399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 11670929 - 11670873
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttg 83  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  11670929 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagttttttaacaattttttg 11670873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 283 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 38114277 - 38114237
Alignment:
Q  283 cgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38114277 cgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 38114237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 165 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 35351822 - 35351735
Alignment:
Q  165 ttttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaaccttt 252  Q
    ||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||| || ||||||       || |||||||||||||||||||||||    
T  35351822 ttttatcttgaacttttgttgatgaaaaaaattcatatttaattcattacatgttacaaaaattttaaattttagtaaatgaaccttt 35351735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 34 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 47939865 - 47939750
Alignment:
Q  34 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 133  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||   ||||| | |||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||| |  ||    
T  47939865 aaatttgtttaatt-atgcttaaacttttagctttttaagcaattttttgtagacatgttaagaacattactaaaagtttttccgcaaaaaattatctca 47939767  T
Q  134 aaaattgatttatacgt 150  Q
    ||| ||||||| |||||    
T  47939766 aaatttgatttctacgt 47939750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 114
Target Start/End: Original strand, 11670119 - 11670206
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcc 114  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||| |||||||||||| | |  ||||| ||| |||| ||||||||||    
T  11670119 tcaattcaaatttgtttaatttattcttaaacgcttaagttttttaacaattttttgtagatgtgttaggaacattattaaaagttcc 11670206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 72 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 44453056 - 44452920
Alignment:
Q  72 aacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccag-attttgttaattttat 170  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |  |||   ||  ||| | ||||||| |||||| || ||||||    
T  44453056 aacaattttttgcacaagtgttaagaacattacgaaaagttcatctgcaaaaaattatctcaattttttttttctgcgtccagaattttgctacttttat 44452957  T
Q  171 ctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaatt 208  Q
     || |||||||| | | |||||||||||||||||||||    
T  44452956 tttgaacttttg-tctattaaaaaattcatatttaatt 44452920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 156 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 16618928 - 16618865
Alignment:
Q  156 ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt 219  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||| | ||||||||||| || ||||||    
T  16618928 ttttgttagttttatcttgaatttttggtgttttaaaaaaattatatttaattcattacatgtt 16618865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 285 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 37437265 - 37437230
Alignment:
Q  285 ttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaa 320  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37437265 ttcaaaaatttaagagtttaagcataattaaacaaa 37437230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 282 - 320
Target Start/End: Original strand, 45557893 - 45557932
Alignment:
Q  282 tcgttcaaaaattt-aagagtttaaggataattaaacaaa 320  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45557893 tcgttcaaaaattttaagagtttaaggataattaaacaaa 45557932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 6818087 - 6817994
Alignment:
Q  34 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattg 128  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||||   |||||||||||||||||| | || | ||||||| || | | |||||||||| |||||||||||    
T  6818087 aaatttgtttaatt-atgtttaaactcttacatttttgaacaattttttgtatacgttttaagaacataaattaaagttcctccgcaaaaaattg 6817994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 285 - 323
Target Start/End: Original strand, 8770669 - 8770707
Alignment:
Q  285 ttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  8770669 ttcaaaaattcatgagtttaaggataattaaacaaactt 8770707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 50824481 - 50824411
Alignment:
Q  28 caattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaa 98  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||   ||| |||||||||||||| |||| || || |||||||||    
T  50824481 caattcaaatttgtttaatttatgcttaatagcttaagtttttgaacaatatttttcagacgtgttaagaa 50824411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 83
Target Start/End: Original strand, 53569155 - 53569212
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgag-tttttgaacaattttttg 83  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||||    
T  53569155 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactgttaagtttttttaacaattttttg 53569212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 83
Target Start/End: Original strand, 53571008 - 53571065
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgag-tttttgaacaattttttg 83  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||||    
T  53571008 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactgttaagtttttttaacaattttttg 53571065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 132 - 219
Target Start/End: Original strand, 8949622 - 8949710
Alignment:
Q  132 caaaaattgatttatacgtccagatttt-gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt 219  Q
    ||||| || |||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || |||||  ||||||||||| | ||||||||||| || ||||||    
T  8949622 caaaattttatttttaggtccaaattttcgttaattttatcttgaatttttggcgttttaaaaaaattatatttaattcattacatgtt 8949710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 284 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 20177885 - 20177849
Alignment:
Q  284 gttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaa 320  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  20177885 gttcaaaaatttaagagattaagaataattaaacaaa 20177849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 132 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 52788960 - 52788873
Alignment:
Q  132 caaaaattgatttatacgtccagatttt-gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt 219  Q
    ||||| || |||| || ||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  52788960 caaaattttatttttaggtccaaattttcgttagttttatcttgaacttttgacgttttaaaaaatt-atatttaattcattacatgtt 52788873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 67)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Original strand, 30719479 - 30719775
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaa-acatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaa 125  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||||||||||| || |||||||||    
T  30719479 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttgagtttttgaacaattttttacaagacgtgttaagaacattactaaaagtttctatgcaaaaaa 30719578  T
Q  126 ttgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnn 225  Q
    |||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||          
T  30719579 ttgtcgcaaaatttgatttctacgtccaaattttgttaattttatctttaacttttgccgttttaaaaaattcatatttaattcgattcatgtt-aaaaa 30719677  T
Q  226 nttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30719678 attctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 30719775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 27 - 330
Target Start/End: Original strand, 13501206 - 13501506
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  13501206 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttgagtttttgaacaattttttacagacgtgttaataacattactaaaagttcctatgcaaaaaat 13501305  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
    ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  13501306 tgtcgcaaaatttgatttctacgtccagattttgttaattttatttttaacttttgccgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaa 13501404  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaacttcaa 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||       | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  13501405 ttctaaattttagtaaatgaacctttc--agtgttctaaacttgtctcaaaaaaattgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaatttgaa 13501502  T
Q  327 ttga 330  Q
    ||||    
T  13501503 ttga 13501506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 27 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 51561642 - 51561340
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  51561642 tcaattcaaatttgtttactttatgtttaaactcttgagtttttgaacaattttttacagacgtgttaagaacattactaaaagttcctatgcaaaaaat 51561543  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
    ||| |||||| ||||||| ||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  51561542 tgtcgcaaaatttgatttctacgttcaaattttgtttattttatttttaacttttgccattttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaa 51561444  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaacttcaa 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||    
T  51561443 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatttaacaaatttgaa 51561344  T
Q  327 ttga 330  Q
    ||||    
T  51561343 ttga 51561340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 27 - 265
Target Start/End: Original strand, 28700954 - 28701192
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaatttt-ttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaa 125  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28700954 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttgagtttttgaacaatttttttgcaaatgtgttaagaatattactaaaagttcctctgcgaaaaa 28701053  T
Q  126 ttgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnn 225  Q
    |||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||          
T  28701054 ttgtagcaaaatttgatttccacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgtcgttttaaaaaattcatatttaattcgttttatgtt-aaaaa 28701152  T
Q  226 nttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaa 265  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28701153 gttctaaattttagtaaatgaacctctcatagtgttctaa 28701192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 29 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 26020692 - 26020399
Alignment:
Q  29 aattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattg 128  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||    
T  26020692 aattcaaatttgtttaatttatgcttaaaatcttgagtttttgaacaattttttgcagacgtgttaagaacattactaaaagctcctctacataaaattg 26020593  T
Q  129 ttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnntt 228  Q
    | |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||       ||    
T  26020592 tcgcaaaatttgatttctacgttcagattttgttaattttatctttaaattttgccgttttaaaaaattcatatttaattcatttaatgtt-aaaaaatt 26020494  T
Q  229 ctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |       ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  26020493 ctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttataaacttgtcacaaaaaaatcgttcaaaaattcaagagtttaatgataattaaacaaactt 26020399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 22 - 323
Target Start/End: Original strand, 35530781 - 35531081
Alignment:
Q  22 catcatcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaa 121  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||| | || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  35530781 catcatcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttgagcttttaaacaatcttttgtagacgtgttaagaacattactaaaagttcccctgcaa 35530880  T
Q  122 aaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnn 221  Q
    |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| | |||||||||||||||| ||||      
T  35530881 aaaaatgttgcaaaatttgatttctacgtccagattttgttaattttatctttaacttttatcattttaaaaaaattatatttaattcgtttcttgttaa 35530980  T
Q  222 nnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaac 321  Q
          |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35530981 aaaaaatctaaattttggtaaatgaacatttcatagtgttctaaatttgtct-taaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaac 35531079  T
Q  322 tt 323  Q
    ||    
T  35531080 tt 35531081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Original strand, 52493528 - 52493824
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  52493528 tcaattcaaatttgattaatttatgcttaaactcttaagttttttaacaattttttgtagacgtgttaagaacattactaaaagttcctccgcaaaaaat 52493627  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
    | | |||||| ||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  52493628 tatcgcaaaatttgatttctacttccagattttattacttttatctttaagttttgccattttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaa 52493726  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtct-cnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52493727 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctaaaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 52493824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Original strand, 19791239 - 19791533
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  19791239 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttgagtttttgaacaatttttcgcagacgtgttaagaacattactaaaagttcatctacaaaaaat 19791338  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
    ||| |||||| ||||||| ||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||           
T  19791339 tgtcgcaaaatttgatttctacctccaaaatttgttaattttatctttaacttttgtcgttataaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaa 19791437  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| |         |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19791438 ttctaaattttagtaaatgaacatttcatagtgttataaacttg-cataaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactt 19791533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 26805786 - 26805491
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26805786 tcaattcaaatttgtttaatt-atgcttaaactcttgaatttttaaacaattttttgtagacgtgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaaa 26805688  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
      |  ||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  26805687 attcacaaaatttgatttttacgttcagattttgttaattttatctttaacttttgtcgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaaaa 26805588  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
     | |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||        | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26805587 atataaattttggtaaatgaacatttcttagtgttctaaacttgtcttaaaaaaatagttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 26805491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 55 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 47008913 - 47008697
Alignment:
Q  55 aaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccag 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||     
T  47008913 aaactcttgagtttttgaacaattttttacagacgtgttaagaacattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaatttaatttctacgtccac 47008814  T
Q  155 attttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttca 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||       |||||||||||||||||| |||||||||    
T  47008813 attttgttaattttatctttaacttttgtcgttttaaaaaattcatatttaattcgttttatgtt--aaaaattctaaattttagtaaataaacctttca 47008716  T
Q  255 tagtgttctaaccttgtct 273  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  47008715 tagtgttctaaacttgtct 47008697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 30982677 - 30982382
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| | || |||||||||  |||||||||||||||| || ||||||    
T  30982677 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagttttttaacaattttttgtagacgtgttaagaactttactaaaagttcctccgctaaaaat 30982578  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
    | |  ||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||           
T  30982577 tatcacaaaatttgatttatatgtccagattttattacttttatctttaacttttatcgttttcaaaaattcatatttaattcgcttcatgtt-aaaaaa 30982479  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||       |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  30982478 ttctaaattttagtaattgaacctttcatattgttctaaacttgtctcgaaaaaatcgttcaaaaatttaagattttaaggatatttaaacaaactt 30982382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 33709240 - 33708945
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||| || |||| |||||||||||| | || ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  33709240 tcaattcaaatttgtttaatttatacttaaactcttaagatttttaacaattttttgtagacgtgttaagaacattcctaaaagttcctccgcaaaaaat 33709141  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
    | | |||||| |||||||||| ||| | ||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||           
T  33709140 tatcgcaaaatttgatttatatgtctaaattttattacttttatctttaacttttatcgttttcaaaaattcatatttaattcttttcatatt-aaaaaa 33709042  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33709041 ttctaaattttagtaattgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 33708945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 36368185 - 36367890
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  36368185 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagttttttaacaattttttgtagacgtgttaagaacattactaaaagtttctccgcaaaaaat 36368086  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
    | | |||||| || ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||           
T  36368085 tatcgcaaaatttaatttatatgtccagattttattacttttatctttaaattttatcgttttcaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaa 36367987  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||       ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||    
T  36367986 ttctaaattttagtaattaaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaatttatgagtttaaaaataattaaacaaactt 36367890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 34 - 323
Target Start/End: Original strand, 11999725 - 12000013
Alignment:
Q  34 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 133  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||| || |||||||| | || ||    
T  11999725 aaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagttttttaataattttttgtagacgtgttaagaacattactaaaagttcatccgcaaaaaaatatttca 11999824  T
Q  134 aaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaa 233  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||  || |||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||       |||||||    
T  11999825 aaatttgatttatatgtccagattttagtacttttatctttaatttttatcgtttttaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaattctaaa 11999923  T
Q  234 ttttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||| | ||||||       |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11999924 ttttagtaattgaacatttcatagtgttctaaacatgtctcaaaataatcgttcaaaaatttaagactttaaggataattaaacaaactt 12000013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 27 - 320
Target Start/End: Original strand, 43504775 - 43505059
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  || |  ||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||| |    
T  43504775 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaacttttgagtttttgaacaatttttaacagaagtgttaagaacattacgaaaagttcatctacaaaaagt 43504874  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
    |||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||       |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||           
T  43504875 tgttg-taaatttgatttttacgtccagattttgttaa-------tttaacttttgtcgttctaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaa 43504965  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaa 320  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43504966 ttccaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtctaaaaaaaacagttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaa 43505059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 46597070 - 46596776
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  46597070 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagttttttaacaattttttgtagacgtgttaagaacattactaaaagttcatccgcaaaaaat 46596971  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
    | | |||||| ||  || ||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||           
T  46596970 tatcgcaaaatttagttgatatgtccaga-tttattacttttatctttaacttttatcgttttcaaaaattcatatttaattcgttttatgttaaaaaaa 46596872  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
     ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| |||||||         |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  46596871 -tctaaattttaataattgaacctttcacagtgttctaaacttgtctaaaaaaaaccgttcaaaaatttaagagtttaagaataattaaacaaactt 46596776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 106 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 46517388 - 46517172
Alignment:
Q  106 aaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatattta 205  Q
    ||||| |||||| |||||||||||  || || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  46517388 aaaaggtcctctacaaaaaattgtcacataatttgatttctacgtccagattttgttaattttatctttaacttttttcgttttaaaaaattcatattta 46517289  T
Q  206 attcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaa 305  Q
    ||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |       ||| |||||| |||||||||||||    
T  46517288 attcgtttcatgttaaaaaag-tctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtcccaaaaaaatcgatcaaaattttaagagtttaa 46517190  T
Q  306 ggataattaaacaaactt 323  Q
    ||||||||||||||||||    
T  46517189 ggataattaaacaaactt 46517172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 34 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 10041528 - 10041240
Alignment:
Q  34 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 133  Q
    |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||  |    ||||||  | |||||||||||||||||| | ||||||||| |||    
T  10041528 aaatttgtttaatttatgtttaaattcttgagtttttaaacaattttttataggtgtgttaaacacattactaaaagttcctcttcgaaaaattgtcgca 10041429  T
Q  134 aaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaa 233  Q
    ||| || |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||| | |||||       || ||||    
T  10041428 aaatttaatttctacgttcagattttattaattttatctttaacttttgccgttttagaaaatttatatttaattcgtataatgttaaaaaaatt-taaa 10041330  T
Q  234 ttttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||        ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10041329 ttttggtaaatgaacctttcatggtgttctaaacttttcttaaaaaaatcgttaaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactt 10041240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 34 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 12368518 - 12368243
Alignment:
Q  34 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 133  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||| | || ||||||||| |||| |||||||||| | ||||||              
T  12368518 aaatttgtttaatttattcttaaactcttaagttttttaacaattttttgtagacgtgttaagaacattattaaaagttccgccgcaaaat--------- 12368428  T
Q  134 aaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaa 233  Q
        |||||||||| || || ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||       |||||||    
T  12368427 ----ttgatttatatgttcatattttattacttttatctttaacttttattgttttcaaaaattaatatttaatacgtttcatgttaaaaaa-ttctaaa 12368333  T
Q  234 ttttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12368332 ttttattaattgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaattcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 12368243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Original strand, 36248333 - 36248619
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||                
T  36248333 tcaattcaaatttgtttaatttattcttaaactcttaagttttttaacaatttcttgtagacatgttaagaatattactaaaagttcc------------ 36248420  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgtta----attttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnn 222  Q
     || |||||| |||||||||| ||||| ||||| |||    | |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||       
T  36248421 -gtcgcaaaatttgatttatatgtccatattttattactttaatttatctttaacttttattgttttcaaaaattcatatttaatttgtttcatgttaaa 36248519  T
Q  223 nnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaact 322  Q
        || ||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||       || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36248520 aaattt-taaattttattaattgaacctttcatagtgttttaaacttgtctcaaaaaattcattcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaact 36248618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 27 - 320
Target Start/End: Original strand, 31400219 - 31400512
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| ||||||||||| || || |||||||||  ||| |||||| ||||| | ||||||     
T  31400219 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttaagtttttcaacaattttttacagacgtgttaagaacgttattaaaaggtcctccg-aaaaaaa 31400317  T
Q  127 tgttgcaaaaa-ttgatttatacgtccaga-ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnn 224  Q
    | | ||||||| ||||||| |||||||| | |||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |         
T  31400318 tatcgcaaaaatttgatttctacgtccatatttttgttacttatatcttaaacttttgtcgttttaaaaaattcatatttaatttatttcatgat-aaaa 31400416  T
Q  225 nnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaa 320  Q
      || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |        ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31400417 aattatagattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtataaaaagaatcgttaaaatatttaagagtttaaggataattaagcaaa 31400512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 27 - 321
Target Start/End: Original strand, 21091051 - 21091342
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||  |||||||||||| | || ||||| ||| |||||  ||||||| ||  ||| ||||    
T  21091051 tcaattcaaatttgtttagtttatgtttaaactcttaagtttta-aacaattttttgtagacgtgttacgaacattacataaagttcatccacaataaat 21091149  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
    | |  ||||| |||||||||| || |||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||  |||           
T  21091150 tatctcaaaatttgatttatatgttcagattttattactttaatctttaacttttgatgtttt-aaaaattcatatttaattcatttcgcgtt-aaaaaa 21091247  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaac 321  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||        |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  21091248 ttataaattttaataaatgaacctttcacagtgttctaaacttgtctaaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttgaggataatcaaacaaac 21091342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 117 - 320
Target Start/End: Original strand, 39681883 - 39682087
Alignment:
Q  117 tgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcg-tttca 215  Q
    ||||||||||| | |||||| ||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||||| || |||||    
T  39681883 tgcaaaaaattatcgcaaaatttgatttctacatccagattttattacttttatctttaacttttatcgttttaaaaaaatcctatttaatccgttttca 39681982  T
Q  216 tgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaa 315  Q
    ||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||        | ||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  39681983 tgttaaaaaaattctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttttaaacttgtcttaaaaaaattgttcataaacttaagagtttaaggataattaa 39682082  T
Q  316 acaaa 320  Q
    |||||    
T  39682083 acaaa 39682087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 27 - 274
Target Start/End: Original strand, 15053640 - 15053873
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||| |  || |||||    
T  15053640 tcaattcaaatttgtttaatttattcttaaactcttaagttttttaacaattttttgtagacgtgttaagaacattactaaaagttccgc--cacaaaat 15053737  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
    |           ||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||           
T  15053738 t-----------tgatttatatgtccatattttattacttttatctttaacttttattgttttcaaaaatttatatttaattcgtttcatgtt-aaaaca 15053825  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctc 274  Q
    |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  15053826 ttctaaattttattgattgagcctttcatagtgttctaaacttgtctc 15053873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 34 - 127
Target Start/End: Original strand, 21794417 - 21794510
Alignment:
Q  34 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaatt 127  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  21794417 aaatttgtttaatttatgcttaaactcttgagtttttgaacaattttttgcacacgtgttaagaacattaataaaagttcctctacaaaaaatt 21794510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 197 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 37986869 - 37986744
Alignment:
Q  197 tcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaattta 296  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||       |||||||||||||||    
T  37986869 tcatatttaattcgtttcatgttaaacaa-ttctaaattttattaattgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaattcgttcaaaaattta 37986771  T
Q  297 agagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  37986770 agagtttaaggataattaaacaaactt 37986744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 34 - 252
Target Start/End: Original strand, 49767693 - 49767910
Alignment:
Q  34 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 133  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||| |  | ||||||| || || |||||||  ||||||||||||| |  ||    
T  49767693 aaatttgtttaatt-atgcttaaacttttaagattttgaacaattttttgcacaagtattaagaacatcacgaaaagtttatctgcaaaaaattatctca 49767791  T
Q  134 aaaattgatttatacgtccaga-ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaa 232  Q
    |||||| |||| | |||||||| |||||||| |||||| || |||||||||  ||| |||||||||||||||||||  |||||||||       ||||||    
T  49767792 aaaatttatttctgcgtccagatttttgttacttttattttaaacttttgtcttttaaaaaaattcatatttaatttatttcatgtt-aaaaaattctaa 49767890  T
Q  233 attttagtaaatgaaccttt 252  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  49767891 attttagtaaacgaaccttt 49767910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 67 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 7565435 - 7565189
Alignment:
Q  67 ttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccagatttt-gttaat 165  Q
    ||||||||||||| ||| | || |||||| || |||| ||||| ||| || | |||||||| |  ||||| ||||||| || ||||| ||||| ||||||    
T  7565435 ttttgaacaatttcttgtagacgtgttaaaaacattaataaaaattcatccgtaaaaaattatctcaaaatttgatttctatgtccatatttttgttaat 7565336  T
Q  166 tttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaa 265  Q
    |||||||| ||||||| | |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||       ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  7565335 tttatcttgaacttttctcgtttaaaaaaattcatattaaattcatttcatgtt-aaaaaattctaaattttagtaaatgtacctttcgtaatgttctaa 7565237  T
Q  266 ccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt 313  Q
     ||||||||       ||||| ||||| |||||||||| | |||||||    
T  7565236 acttgtctcataaaaatcgttaaaaaagttaagagtttgaagataatt 7565189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 34 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 12251656 - 12251439
Alignment:
Q  34 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 133  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |  ||    
T  12251656 aaatttgtttaatt-atgcttaaacttttaagattttgaacaattttttgcacaagtgttaagaacattacgaaaagttcatctgcaaaaaattatctca 12251558  T
Q  134 aaaattgatttatacgtccag-attttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaa 232  Q
    ||| || |||| | ||||||| ||||||||| |||||| || |||||||||   || ||||||| |||||||||||  |||||| ||       ||||||    
T  12251557 aaattttatttctgcgtccagaattttgttacttttattttgaacttttgtctattaaaaaaatccatatttaatttatttcatatt-aaaaaattctaa 12251459  T
Q  233 attttagtaaatgaaccttt 252  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  12251458 attttagtaaacgaaccttt 12251439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 34 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 31024344 - 31024058
Alignment:
Q  34 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 133  Q
    ||||||||| |||| ||| | ||||||||  ||||||||||||||| ||| | || ||||||||  |||||||||||||| || | || ||||| |   |    
T  31024344 aaatttgttcaatt-atgtttaaactcttatgtttttgaacaatttcttgtagacgtgttaagaccattactaaaagttcatccgtaacaaattatctta 31024246  T
Q  134 aaaattgatttatacgtccaga-ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaa 232  Q
    ||| ||||||| || || || | |||||||||||||||||| ||||||| | |||| |||||||||||||| ||| | |||||||||       | |||     
T  31024245 aaatttgatttctatgttcatatttttgttaattttatcttgaacttttttcgtttaaaaaaattcatattaaatacatttcatgttaaaaaaatcctag 31024146  T
Q  233 attttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaa 320  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |       ||||| ||||| ||||||| || |||||||||| |||||    
T  31024145 attttagtaaatgaacctttcgtagtgttctaaacttatcccataaaaatcgttaaaaaagttaagagcttgaggataattatacaaa 31024058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 29 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 33707663 - 33707419
Alignment:
Q  29 aattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattg 128  Q
    |||| |||||||||||||| || || |||||||| | |||||||||||| ||||||| || |||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||     
T  33707663 aatttaaatttgtttaatt-attcttaaactcttaattttttgaacaatcttttgcagacgtgttgagaacattactaaaagttccttcgcaaaaaatta 33707565  T
Q  129 ttgcaaaaattgatttatacgtccaga-ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnt 227  Q
    |  ||||| ||||||| ||||| || | |||||||  ||||||||| ||||||| | |||| |||||||| ||||||||| | |||||| ||       |    
T  33707564 tctcaaaatttgatttctacgttcaaatttttgttgcttttatcttgaacttttatcgtttgaaaaaatttatatttaatacatttcatattaaaaaaat 33707465  T
Q  228 tctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctc 274  Q
    | |||||||||||||||||| ||||  || |||| ||| ||||||||    
T  33707464 t-taaattttagtaaatgaaacttttgtaatgttttaaacttgtctc 33707419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 165 - 320
Target Start/End: Original strand, 2059484 - 2059636
Alignment:
Q  165 ttttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttcta 264  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||       |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  2059484 ttttatctttaactttt-tcgttttaaaatattcatatttaatttgtttcatgtt-aacaaattctaaattttagtaaatgaaccttttataatgttcta 2059581  T
Q  265 accttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaa 320  Q
    | ||| |||        |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2059582 aacttatct-aaaaaaatcgttcaaaaatttaaaagtttaaggataattaaacaaa 2059636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 34 - 208
Target Start/End: Original strand, 27550800 - 27550974
Alignment:
Q  34 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 133  Q
    |||||||||||||| || || ||||| || || ||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |  ||    
T  27550800 aaatttgtttaatt-atacttaaacttttaagattttgaacaattttttgcacaagtgttaagaacattacgaaaagttcatctgcaaaaaattatctca 27550898  T
Q  134 aaaattgatttatacgtccag-attttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaatt 208  Q
    ||| || |||| | ||||||| ||||||||| |||||| || |||||||||   || ||||||| |||||||||||    
T  27550899 aaattttatttctgcgtccagaattttgttacttttattttgaacttttgtctattaaaaaaatccatatttaatt 27550974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 34 - 252
Target Start/End: Original strand, 25351963 - 25352178
Alignment:
Q  34 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 133  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||| |  |||||| || ||||| |||||||| ||| ||||||||| |  |     
T  25351963 aaatttgtttaatt-atgcttaaacttttaagattttgaacaattttttgcacaagtgttaaaaacattacgaaaagttcatctccaaaaaattat--ct 25352059  T
Q  134 aaaattgatttatacgtccaga-ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaa 232  Q
     || || |||||| |||||||| |||||||| |||||| || |||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||||||| |       ||||||    
T  25352060 caattttatttatgcgtccagatttttgttacttttattttcaacttttgtcttttaaaaaaattcatatttaatttatttcatgct-aaataattctaa 25352158  T
Q  233 attttagtaaatgaaccttt 252  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  25352159 attttagtaaacgaaccttt 25352178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 34 - 217
Target Start/End: Original strand, 11397039 - 11397222
Alignment:
Q  34 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 133  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||  || || ||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||| |  ||    
T  11397039 aaatttgtttaatt-atgcttaaacatttaagattttgaacaattttttgcacaagtgttaagaacattacgaaaagttcatctccaaaaaattatctca 11397137  T
Q  134 aaaattgatttatacgtccaga-ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatg 217  Q
    ||| || |||| | |||||| | |||||||| |||||| ||  ||||||||  ||| |||||||||||||||||||  |||||||    
T  11397138 aaattttatttctgcgtccatatttttgttacttttattttgcacttttgtcttttaaaaaaattcatatttaatttatttcatg 11397222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 29 - 96
Target Start/End: Original strand, 2059078 - 2059145
Alignment:
Q  29 aattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaag 96  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  2059078 aattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttgagtttttgaacaattttttgcatacgtgttaag 2059145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 37986989 - 37986893
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaa 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||| | ||||| |||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  37986989 tcaattcaaatttgtttaatttattcttaaactcttaaattttttaacaattttttgtagacgtgttaagaacattactaaaagttccgccgcaaaa 37986893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 227 - 323
Target Start/End: Original strand, 21794533 - 21794629
Alignment:
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| || | |||||| ||||||||       |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21794533 ttctaaattttagttaatgaacctttcttaatattctaaacttgtctcaaaaaattcgtacaaaaatttaagagtttaaggataattaagcaaactt 21794629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 34 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 49768696 - 49768522
Alignment:
Q  34 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 133  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||   ||||||| | |  ||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||| |  ||    
T  49768696 aaatttgtttaatt-atgcttaaacttttaagattttgaaattttttttggacaagtgttaagaacattacgaaaagttcatttgcaaaaaattatctca 49768598  T
Q  134 aaaattgatttatacgtccag-attttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaatt 208  Q
    ||| || |||| ||||||||| ||||| ||| |||||| || |||||||||   || |||||||||||||||||||    
T  49768597 aaattttatttctacgtccagaattttattacttttattttgaacttttgtctattaaaaaaattcatatttaatt 49768522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 75 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 52882556 - 52882360
Alignment:
Q  75 aattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccagatttt-gttaattttatctt 173  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||| |  ||||| || |||| | | |||||||||| |||| |||||| ||    
T  52882556 aattttttgcacaagtgttaagaatattaagaaaagttcatctccaacaaattatctcaaaattttatttctgcctccagatttttgttacttttatttt 52882457  T
Q  174 taacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgt 271  Q
     || ||||||  ||| |||||||||||||||||||  |||||||||       ||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||| |||||    
T  52882456 gaaattttgtcttttaaaaaaattcatatttaattaatttcatgtt-aaaaaattctaaattttagtaaacgaaccttttgtaatgttctaaacttgt 52882360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 34 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 48218138 - 48218046
Alignment:
Q  34 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaatt 127  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |  || ||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  48218138 aaatttgtttaatt-atgcttaaactttaaagattttgaacaattttttgcacaagtgttaagaacattacaaaaagttcatctgcaaaaaatt 48218046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 227 - 316
Target Start/End: Original strand, 42972167 - 42972256
Alignment:
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaa 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||   ||||||       ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42972167 ttctaaattttagtaaatgaaccttttataatcttctaaaagtgtctccgaaaaatcgttaaaaaatttaagagtttaaggataattaaa 42972256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 141 - 323
Target Start/End: Original strand, 48410258 - 48410439
Alignment:
Q  141 atttatacgtccaga-ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttag 239  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||| | ||||||||| | |||||||||       |||||||||||||    
T  48410258 atttatacgtccagatttttgttacttttatcttgaacttttg-tcttttaaaaaaattatatttaatccatttcatgtt-aaaaaattctaaattttag 48410355  T
Q  240 taaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    | |  ||||||||  || | || ||| ||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  48410356 tgaccgaaccttttgtaattttttaaacttgtctcaaaaagactgttcaaaaatttaagagtttaaggataattagagaaactt 48410439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 29231939 - 29231884
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaatttttt 82  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  29231939 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagttttttaacaatttttt 29231884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 112
Target Start/End: Original strand, 26207482 - 26207547
Alignment:
Q  47 ttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagtt 112  Q
    ||||||| | |||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||    
T  26207482 ttatgcttagactcttaagttttagaacaattttttcgaaacatgttaagaacattactaaaagtt 26207547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 36249147 - 36249098
Alignment:
Q  34 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttg 83  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  36249147 aaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagttttttaacaattttttg 36249098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 27 - 83
Target Start/End: Original strand, 12367703 - 12367759
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttg 83  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  12367703 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttaagttttttaacaattttttg 12367759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 27 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 15054487 - 15054431
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttg 83  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  15054487 tcaattcaaatttatttaatttatgcttaaactcttaagttttttaacaattttttg 15054431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 27 - 83
Target Start/End: Original strand, 37986209 - 37986265
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttg 83  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  37986209 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttaaattttttaacaattttttg 37986265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 27551684 - 27551561
Alignment:
Q  148 cgtccagatttt-gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatga 246  Q
    |||||||||||| |||| |||||| || |||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||||||| |       ||||||||||||||||| ||    
T  27551684 cgtccagatttttgttacttttattttgaacttttgtcttttaaaaaaattcatatttaatttatttcatg-taaaaaaattctaaattttagtaaacga 27551586  T
Q  247 acctttcatagtgttctaaccttgt 271  Q
    ||||||  || |||||||| |||||    
T  27551585 acctttagtaatgttctaaacttgt 27551561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 289 - 323
Target Start/End: Original strand, 29231368 - 29231402
Alignment:
Q  289 aaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29231368 aaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 29231402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 105 - 274
Target Start/End: Original strand, 35188250 - 35188419
Alignment:
Q  105 taaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaa-ttgatttatacgtccaga-ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatat 202  Q
    |||||||||||| |||||||| | | ||||||| ||||||| ||| |  | | |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||||    
T  35188250 taaaagttcctcagcaaaaaaatatcgcaaaaatttgatttctacatttatatttttgttacttttatcttaaacttttgttgtttaaaaaaaat-atat 35188348  T
Q  203 ttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctc 274  Q
    ||||||  |||||||||       ||||| ||||||||| ||||| |||||| || ||| ||| ||||||||    
T  35188349 ttaatttatttcatgtt-aaaaaattctatattttagtatatgaatctttcagagagttttaaacttgtctc 35188419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 147 - 219
Target Start/End: Original strand, 52881707 - 52881780
Alignment:
Q  147 acgtccagatttt-gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt 219  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||  ||| |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  52881707 acgtccagatttttgttacttttattttgaacttttgtcttttaaaaaaattcatatttaatttatttcatgtt 52881780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 173
Target Start/End: Original strand, 2059152 - 2059196
Alignment:
Q  129 ttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctt 173  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2059152 ttgcaaaatttgatttctacgtcctgattttgttaattttatctt 2059196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 113
Target Start/End: Original strand, 42971953 - 42972036
Alignment:
Q  29 aattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttc 113  Q
    |||| |||| ||||||||| ||| | |||||||| |||||| ||| ||| ||||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  42971953 aattcaaatctgtttaatt-atgtttaaactcttaagttttagaaaaatcttttgtagacgtgttaagaatattactaaaagttc 42972036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 78 - 209
Target Start/End: Original strand, 18996922 - 18997052
Alignment:
Q  78 tttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaac 177  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||  |||||||  || |||||||||   |  |||| || |||| || ||||| |||||||||  |||||||| |||    
T  18996922 tttttgcatacatgtttagaatattataaaaagtttatccgcaaaaaataagtttaaaattttatttttaggtccaaattttgttacatttatcttgaac 18997021  T
Q  178 ttttgttgttttaaaaaattcatatttaattc 209  Q
    |||||   || |||||||||||||||||||||    
T  18997022 ttttggc-ttctaaaaaattcatatttaattc 18997052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 156 - 219
Target Start/End: Original strand, 26507632 - 26507695
Alignment:
Q  156 ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt 219  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||| | ||||||||||| || ||||||    
T  26507632 ttttgttagttttatcttgaatttttggtgttttaaaaaaattatatttaattcattacatgtt 26507695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 5430699 - 5430567
Alignment:
Q  187 tttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgtt 286  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||       |||||||||| |||||||||| ||||  || |||| ||| |||||||         ||||    
T  5430699 tttaaaaaaatcatatttaattcattttatgttaaaaaa-ttctaaatttcagtaaatgaatcttttgtaatgttataaacttgtcttagaaaaaccgtt 5430601  T
Q  287 caaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaa 320  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  5430600 caaaaatttacaagtttaaggataattaaacaaa 5430567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 282 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 6216416 - 6216382
Alignment:
Q  282 tcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaa 316  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6216416 tcgttcaaaaatttaatagtttaaggataattaaa 6216382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 282 - 320
Target Start/End: Original strand, 28479931 - 28479969
Alignment:
Q  282 tcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaa 320  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  28479931 tcgttcaaaaacttaatagtttaaggataattaaacaaa 28479969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 113
Target Start/End: Original strand, 13083446 - 13083529
Alignment:
Q  29 aattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttc 113  Q
    |||| ||| |||||||||| ||||| | |||||  ||||||||||||| ||||| || |  ||||||||| ||||||||||||||    
T  13083446 aattcaaacttgtttaatt-atgcttatactctcaagtttttgaacaacttttttcagatgtgttaagaacattactaaaagttc 13083529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 132 - 219
Target Start/End: Original strand, 26451181 - 26451269
Alignment:
Q  132 caaaaattgatttatacgtccagatttt-gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt 219  Q
    ||||| || |||| || ||||| ||||| |||| ||||||||| || ||||| |||||||||||| | ||||||||||| || ||||||    
T  26451181 caaaattttatttttaggtccaaattttcgttagttttatcttgaatttttggtgttttaaaaaaattatatttaattcattacatgtt 26451269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 132 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 31861722 - 31861634
Alignment:
Q  132 caaaaattgatttatacgtccagatttt-gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt 219  Q
    ||||| || |||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || |||||  ||||||||||| | ||||||||||| || ||||||    
T  31861722 caaaattttatttttaggtccatattttcgttaattttatcttgaatttttggcgttttaaaaaaattatatttaattcattacatgtt 31861634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 284 - 320
Target Start/End: Original strand, 33707619 - 33707655
Alignment:
Q  284 gttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaa 320  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  33707619 gttcaaaaaattaagagtttaagaataattaaacaaa 33707655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 55 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 43396504 - 43396432
Alignment:
Q  55 aaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaatt 127  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||  | |||||||||||  || ||||||||| ||| |||| |||||    
T  43396504 aaactcttaagtttttaaacaattttttgtgaccatgttaagaacgttgctaaaagtttctccgcaacaaatt 43396432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 132 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 47632752 - 47632664
Alignment:
Q  132 caaaaattgatttatacgtccagatttt-gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt 219  Q
    ||||| || |||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || |||||  ||||||||||| | ||||||||||| || ||||||    
T  47632752 caaaattttatttttaggtccaaattttcgttaattttatcttgaatttttggcgttttaaaaaaattatatttaattcattacatgtt 47632664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 34 - 109
Target Start/End: Original strand, 48410127 - 48410202
Alignment:
Q  34 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttga-gtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaa 109  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || | | ||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||    
T  48410127 aaatttgtttaatt-atgcttaaactttttaagattttgaacaattttttgcagaagtgttaagaacattactaaaa 48410202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 178; Significance: 6e-96; HSPs: 70)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Original strand, 44265446 - 44265741
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  44265446 tcaatttaaatttgtttaatttatgtttaaactcttgagtttttgaacaattttttgcagacgtgttaagaacattactaaaagttcctctgcaaaaaat 44265545  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
    |||||||||| ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||           
T  44265546 tgttgcaaaatttgatttctaagtccagattttgttgattttatctttaatttttggcgttttaaaaaactcatatttaattcttttcatgtt-aaaaaa 44265644  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||       ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44265645 ttctaaattttagcaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcgaaaaaatcgtttaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 44265741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Original strand, 6018037 - 6018332
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  6018037 tcaattcaaatttgtttaatttatgcataaactcttgagtttttgaacagttttttgcagacatgttaaaaacattactaaaagttcctctgcaaaaaat 6018136  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
    ||| |||||| || |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||           
T  6018137 tgtcgcaaaatttaatttttacgttcagattttgttagttttatctttatcttttgttgttttaataaattcatatttaatttgtttcatgtt-aaaaaa 6018235  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||       | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  6018236 ttataaattttagtaaatgaacctttcataatgttctaaacttgtctcataaaaattgttcaaaaatttaaaagtttaagaataattaaacaaactt 6018332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 25102255 - 25101960
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  25102255 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactctcgagtttttgaacaattttttacagacgtgttaagaacattactaaaagttcctatgcaaaaaat 25102156  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
    |||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||           
T  25102155 tgtcacaaaatttgatttctacgtccagattttgttaattttatttttaacttttgccgttttgaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaa 25102057  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||       | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25102056 ttctaaattttagtaagtgaacctttcatagtgttttaaacttgtctcaaaaaaattgttcaaaagtttaagagtttaaggataattaaacaaactt 25101960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 24 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 38706739 - 38706441
Alignment:
Q  24 tcatcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaa 123  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||  ||||||||||| | | |||||||    
T  38706739 tcatcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttgagtttttgaacaattttttacagacgtgttaagaacgttactaaaagtgcttgtgcaaaa 38706640  T
Q  124 aattgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnn 223  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||        
T  38706639 aattgtcgcaaaatttgatttctacgtccaaattttgttaattttatctttaacttttgtcgttttaaaaaattcatatctaatttgtttcatgtt-aaa 38706541  T
Q  224 nnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||       ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  38706540 aaattctaaattttagtaaatgaacctttcatattgttctaaacttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaattgaagtgtttaagaataattaaacaaactt 38706441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Original strand, 6590263 - 6590559
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6590263 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttgagtttttgaacaattttttggagacgtgttaagaacattactaaaagttcctctgcaaaaaat 6590362  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
    ||| |||||| ||||||| || |  ||||||||||||||||||| ||| | |||| | ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||           
T  6590363 tgtcgcaaaatttgatttctaggctcagattttgttaattttatattttatttttctcgttttaaaaaaatcatatttaatttttttcatgttaaaaaaa 6590462  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||       | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6590463 atctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaaatggttcaaaaatttaagagtttaagaataattaaacaaactt 6590559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 24 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 36471121 - 36470823
Alignment:
Q  24 tcatcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaa 123  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || |  | |||||||  |||| |||||||||| || ||||    
T  36471121 tcatcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttgagtttttgaacaattttttacagatgtattaagaacgttaccaaaagttcctatgtaaaa 36471022  T
Q  124 aattgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnn 223  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        
T  36471021 aattgtcgcaaaatttgatttctacgtccaaattttgttaattttatctttaactttcgctgttttaaaaaattcatatctaattcgtttcatgtt-aaa 36470923  T
Q  224 nnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||        ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36470922 aaattctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttatcttaaaaaaatcgttcaaaaattgaagagtttaaggataattaaacaaactt 36470823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Original strand, 21135321 - 21135616
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  21135321 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttaagttttttaacaattttttgtagacgtgttaagaacattactaaaagttcctccgcaaaaaat 21135420  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
    | | |||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||           
T  21135421 tatcgcaaaatttgatttatatgtccagattttattacttttatctttaacttttatcgttttcaaaaattcatatttaattcgtttcat-tttaaaaaa 21135519  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21135520 ttctaaattttagtaattgaacctttcataatgttctaaatttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 21135616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 22 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 27875745 - 27875445
Alignment:
Q  22 catcatcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaa 121  Q
    |||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  27875745 catcctcaattcaaatttgtttattttatgcttaaactcttgagcttttgaacaattttttacaaacgtgttaaaaacattactaaaagttcctctgcaa 27875646  T
Q  122 aaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnn 221  Q
    |||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| |||||      
T  27875645 aaaattgtcgtaaaatttgatttctacgtccagattttgtttattttatctttaacttttgtcgtgttaaaaaattcatatttaattcatttaatgtt-a 27875547  T
Q  222 nnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaac 321  Q
         |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||        |||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  27875546 aaaaattctaaattttagtaaatgaacctttaatagtgttctaaacttgtctaaaaaaaatcgtccaaaaatttaagagtttataaataattaaacaaac 27875447  T
Q  322 tt 323  Q
    ||    
T  27875446 tt 27875445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 22 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 28015926 - 28015626
Alignment:
Q  22 catcatcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaa 121  Q
    |||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  28015926 catcctcaattcaaatttgtttattttatgcttaaactcttgagcttttgaacaattttttacaaacgtgttaaaaacattactaaaagttcctctgcaa 28015827  T
Q  122 aaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnn 221  Q
    |||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| |||||      
T  28015826 aaaattgtcgtaaaatttgatttctacgtccagattttgtttattttatctttaacttttgtcgtgttaaaaaattcatatttaattcatttaatgtt-a 28015728  T
Q  222 nnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaac 321  Q
         |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||        |||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  28015727 aaaaattctaaattttagtaaatgaacctttaatagtgttctaaacttgtctaaaaaaaatcgtccaaaaatttaagagtttataaataattaaacaaac 28015628  T
Q  322 tt 323  Q
    ||    
T  28015627 tt 28015626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Original strand, 33322531 - 33322826
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||  |||||||||||||| || |||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  33322531 tcaattcaaatttgtttaatttatacttaaactcatgagttttcaaacaattttttgcagacgtgttaaaaacattactaaaagttcctctgcaaaaaat 33322630  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||           
T  33322631 tgtcgcaaaatttgatttttacgtctagattttgttaattttatctttaacttttttcgttttaaaaaatttatatttaattcgtttcatgttaaaaaaa 33322730  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |        |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33322731 -tctaaattttggtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtattgaaaaaatcgttcaaaattttaagagtttaaagataattaaacaaactt 33322826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Original strand, 35863039 - 35863334
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||    
T  35863039 tcaattcaaatttatttaatttatgcttaaactcttaagttttttaacaattttttgtagacgtgttaagaacattactaaaagattctccgcaaaaaat 35863138  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||           
T  35863139 tgttgcaaaatttgatttatatgtccagattttattacttttatctttaacttttatagttttcaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaaat 35863238  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||       | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35863239 tt-taaattttagtaattgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaatattgttcaaaagtttaagagtttaaggataattaaacaaactt 35863334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 27 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 17498787 - 17498541
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17498787 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaacttttgagtttttgaacaattttttgcagacatataaagaaaattactaaaagttcctctgcaaaaaat 17498688  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
    ||| |||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||           
T  17498687 tgtcgcaaaatttgatttctacgttcaaattttgttaattttatctttaacttttgtcgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatatt-aaaaaa 17498589  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctc 274  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||    
T  17498588 ttctaaattttagtaaatgaatcttttatagtgttctaaacttgtctc 17498541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Original strand, 24451482 - 24451777
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| || | || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  24451482 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagttttttaacaattttgtgtagacgtgttaagaacattactaaaagttcctccgcaaaaaat 24451581  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
    | | |||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||           
T  24451582 tatcgcaaaatttgatttatatgtccagattttattacttttatctttaacttttatcgttttcaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaa 24451680  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||       || ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24451681 ttctaaattttagtaattgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaaatcattcaaaattttaagagtttaagaataattaaacaaactt 24451777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 43623087 - 43622789
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| || |||||||||||||||||| ||||||||    
T  43623087 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttgagtttttgaacaatttttcgcagacgtgttaaaaacattactaaaagttcctcttcaaaaaat 43622988  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttg-ttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnn 225  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||          
T  43622987 tgtcgcaaaatttgatttctacgtccataatttgtttaattttatctttaacttttgtcattttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaaa 43622888  T
Q  226 nttctaaatttt-agtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
     ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||         ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43622887 attctaaattttaagtaaatgcacctttcatagtgttataaacttgtcataaaaaaatcgtttaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactt 43622789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 5250684 - 5250388
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||    
T  5250684 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttgagtttttgaacaattttttactgacgtgttaagaacattactaaaagttcctatgccaaaaat 5250585  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaac-ttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnn 225  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||          
T  5250584 tgtcgcaaaatttgatttctacgtttagattttgttaattttatctttaactttttgccgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaa 5250486  T
Q  226 nttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
     |||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |  |||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5250485 attctaaattttagtaaatgaacctttcgcagcgttctgaatttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 5250388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 5696205 - 5695911
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||    
T  5696205 tcaattcaaatttgtttaatttatgattaaactcttcagtttttgaacaattttttgcagacgtgttaagatcattattgaaagttcctctgcaaaaaat 5696106  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
    |||  ||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | |||| ||           
T  5696105 tgtcacaaaatttgattttta-gttcagattttgttaattttatctttaacttttgccgttttaaaaaattcatatttaattcatctcatatt-aaaaaa 5696008  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||       || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5696007 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttttaaacttgtctcgaaaaaatcattcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 5695911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 41590631 - 41590337
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  41590631 tcaattcaaatttgtttaatttgtgcttaaactcttgagcttttgaacaatttttcgcatacgtgttaagaacattactaaaagttcctctacaaaaaat 41590532  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
    ||| |||||| ||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  41590531 tgtcgcaaaatttgatttctacttccagaatttgttaaatttatctttaacttttgtcattttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaa 41590433  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||         | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41590432 ttctaaattttagt-aatgaacctttcatagtgttataaacttgtcataaaaaaattgttcaaaaatttaaaagtttaaggataattaaacaaactt 41590337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Original strand, 35369188 - 35369483
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||| | || |||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  35369188 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttcaactcttaagttttttaacaattttttgtagacgtgttaacaacattactaaaagttactccgcaaaaaat 35369287  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
    | |||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||           
T  35369288 tattgcaaaatttgatttatatgtccaaattttattacttttatctttaacttttatcgttttcaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaa 35369386  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| ||||       |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35369387 ttctaaattttagcaattgaacctttcatagtgttctaaacttatctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagactttaaggataattaaacaaactt 35369483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Original strand, 37967533 - 37967830
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||| ||| || ||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||    
T  37967533 tcaattcaaatttgtttaatttatgcataaactcttgagcttttaaacaatttttcgcagacgtgtaaagaacattactaaaacttcctccgcaaaaaat 37967632  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgt-tgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnn 225  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||          
T  37967633 tgtcgcaaaatttgatttctacgtccatattttgttaattttatctttaacttttttccattttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaat 37967732  T
Q  226 nttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtc-tcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
      |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |        |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37967733 a-tctaaattttggtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtcttaaaaaaaatcgttcaaaactttaagagtttaaggatgattaaacaaactt 37967830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 42499673 - 42499379
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| || ||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||| || | ||||||| ||||||||||| |  | ||||||||||    
T  42499673 tcaattcaattttgtttaatttatgcataaactattaagtttttgaacaattttttgcagacgtattaagaacattactaaaagcttatatgcaaaaaat 42499574  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
    ||| |||||| || |||| |||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||           
T  42499573 tgtcgcaaaatttaatttttacgtccatattgttttaattgtatctttaacttttgtcgtttttaaaaattcatatttaattcgttttatgtt-aaaaaa 42499475  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||       ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42499474 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtctc-aaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaagaataattaaacaaactt 42499379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Original strand, 8784576 - 8784871
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||  || ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  8784576 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttgagtttttaaacaagtttttgctgacgtgttaagaacattactaaaagtttctctgcaaaaaat 8784675  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
    ||| |||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||           
T  8784676 tgtcgcaaaatttgatttctacgttcagattttattaattttatctttaacttcagccgttttaaaaaattcatatttaattctttttatgttaaaaaat 8784775  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||       | |||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  8784776 tt-taaattttagtaaatgaaccttttatagtgttctaaacttatgtcaaaaaaattgttcgaaaatttgagagtttacggataattaaacaaactt 8784871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 18840211 - 18839916
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||| | |  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  18840211 tcaattcaaatttgtttaatttatacttaaactctcaagtttttgaacaattttttgtacatgtgttaagaacattactagaagttcctctgcaaaaaat 18840112  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
    | | |||||| ||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  18840111 tatcgcaaaatttgatttctatgtccagattttattacttttatctttaactcttttcgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaa 18840013  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||         |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18840012 ttctaagttttagtagatgaacctttcatagtgttctaaacatatccaaaaaaaatcgttcgaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 18839916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 34 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 37707009 - 37706722
Alignment:
Q  34 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 133  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||| | || | || |||| ||||||||||||||||| |||||||||| | |||    
T  37707009 aaatttgtgtaatttatgcttaaactcttatgttttttaacaattttttgtagacgtattgagaacattactaaaagttcctccgcaaaaaattatcgca 37706910  T
Q  134 aaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaa 233  Q
    ||| |||||||||| || |||||||| | | ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||       |||||||    
T  37706909 aaatttgatttatatgttcagattttatcacttttatctttaacttttatcgtttttaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-agaaaattctaaa 37706811  T
Q  234 ttttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37706810 ttttaataattgaacctttcatagtgttctaatcttgtct-aaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 37706722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 24 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 21160077 - 21159841
Alignment:
Q  24 tcatcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaa 123  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||    
T  21160077 tcatcaattcaaatttgtttaatttatgcttatacttttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaacatcactaaaagttcatccgcaaaa 21159978  T
Q  124 aattgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnn 223  Q
    | |||| ||| || ||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||        
T  21159977 agttgtcgcacaatttgatttctacatctagattttgttaactttatctttaacttttgccattttaaaaaatttatatttaatccgtttcatattaaaa 21159878  T
Q  224 nnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgt 260  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21159877 aaattctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgt 21159841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 41281593 - 41281300
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||| | ||||| |||||||||| | | || | ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  41281593 tcaatttaaatttgtttaatttatgtttaaactcttaatttttt-aacaattttt-gtagacgtcttaagaacattactaaaagttcctcagcaaaaaat 41281496  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
    | | |||||| ||||||||||  |||||||||  ||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||           
T  41281495 tatcgcaaaatttgatttatatatccagatttcattacttttatctttaacttttatcgttttcaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaa 41281397  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||        ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41281396 ttctaaactttagtaattgaacctttcatagtgttctaaacttgtctaaaaaaaatcgtttaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 41281300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Original strand, 17842463 - 17842756
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||| || ||||||| |||| | || |||||||||    
T  17842463 tcaattcaaatttgtttaatttatacttaaactcttaagtttttcaacaattttttgtatacatgttaaaaacattactagaagtacatcagcaaaaaat 17842562  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
      | |||||  ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  17842563 a-tcgcaaattttgatttctacgtccagattttattacttttatctttaacttttgtcgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaa 17842660  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||| |       |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17842661 ttctaaattttagtaaatgaactttttatagtgttctaaacatgtc-ccaaaaaatcgtttggaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 17842756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 27 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 6413563 - 6413383
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||    
T  6413563 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttgagtttttgaacaattttttgcagacgtgttaagaacatcactaaaagttcctcttcaaaaaat 6413464  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaat 207  Q
    ||| |||||| ||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  6413463 tgtcgcaaaatttgattcctacatccaaattttgttaattttatctttaacttttgccgttttaaaaaattcatatttaat 6413383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 34 - 323
Target Start/End: Original strand, 16472997 - 16473276
Alignment:
Q  34 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 133  Q
    |||||||||||||||||||| ||||      |||||| ||| |||||||| | || |||||||| |||||   ||||||||||||||||||||| | |||    
T  16472997 aaatttgtttaatttatgcttaaac------gttttttaaccattttttgtagacgtgttaagattatta---aaagttcctctgcaaaaaattatcgca 16473087  T
Q  134 aaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaa 233  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||          ||||    
T  16473088 aaatttgatttatatgtccagatttt-ttacttttatctttaacttttatcgttttcaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaaaaaaataaa 16473186  T
Q  234 ttttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||       || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16473187 ttttagtaattgaacctttcatagtgttctaaatttgtctcaaaaaaatcattcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 16473276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 34 - 323
Target Start/End: Original strand, 16477568 - 16477847
Alignment:
Q  34 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 133  Q
    |||||||||||||||||||| ||||      |||||| ||| |||||||| | || |||||||| |||||   ||||||||||||||||||||| | |||    
T  16477568 aaatttgtttaatttatgcttaaac------gttttttaaccattttttgtagacgtgttaagattatta---aaagttcctctgcaaaaaattatcgca 16477658  T
Q  134 aaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaa 233  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||          ||||    
T  16477659 aaatttgatttatatgtccagatttt-ttacttttatctttaacttttatcgttttcaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaaaaaaataaa 16477757  T
Q  234 ttttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||       || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16477758 ttttagtaattgaacctttcatagtgttctaaatttgtctcaaaaaaatcattcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 16477847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 27 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 30658731 - 30658540
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||| |||||||||||||||||| |||||||     
T  30658731 tcaattcaaatttgtttaatt-atgcttaa-ctcttgagtttttaaacaattttttgcagacgtattaagaacattactaaaagttcctcttcaaaaaaa 30658634  T
Q  127 -tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt 219  Q
     |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  30658633 atgttgcaaaatttgatttctacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgtcgttttaaaaaattcataattaatttgtttcatgtt 30658540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 36063718 - 36063434
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaatttttt--gcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaa 124  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||| |||| ||||||| |||||||||||  | | || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  36063718 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaattcttaagttttttaacaattttttttgtagacgtgttaagaacattactaaaagttcctccgcaaaaa 36063619  T
Q  125 attgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnn 224  Q
    ||| | |||||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||             ||||| |||||||||||||||||||||||||||||         
T  36063618 attatcgcaaaatttgatttatatgtccagattttattacttttatc-------------gtttttaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaa 36063533  T
Q  225 nnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
      |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36063532 aattctaaattttagtaattgaacctttcataatgttctaaacttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 36063434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 27 - 219
Target Start/End: Original strand, 9252645 - 9252836
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  9252645 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttgagtttttgaacaatttttcgcagacgtgttaagaacattactaaaagttcctttgcaaaaaat 9252744  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt 219  Q
    ||  |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||  |||||| |||||||||| |||| |||||    
T  9252745 tgccgcaaaatttgatttctacttccagattttgttaattttatctttaacttttaccgtttt-caaaatttatatttaatttgttttatgtt 9252836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 92 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 18304896 - 18304664
Alignment:
Q  92 ttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaa 191  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||    
T  18304896 ttaagaacattactaaaagttcctctgcaaaaaattgtcgcaaaatttgatttctacgtccaaattttgttgattttatctttaaattttgtcgttttaa 18304797  T
Q  192 aaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtct--cnnnnnnntcgttcaa 289  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||        |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||||          || |||||    
T  18304796 aaaattcatatttaattcgtttgaagttacaaaaa-tctaaattttggaaaatgaacctttcatagtgttctaaacatgtcttaaaaaaaaatcattcaa 18304698  T
Q  290 aaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18304697 aaatttaagagtttaaggataattaatcaaactt 18304664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 106 - 323
Target Start/End: Original strand, 23483421 - 23483637
Alignment:
Q  106 aaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatattta 205  Q
    |||||||| ||| ||||||||| | | |||| ||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  23483421 aaaagttcttctacaaaaaattatcgtaaaatttgatttctacgtccacatttggttaatttgatctttaacttttgcaattttaaaaaattcatattta 23483520  T
Q  206 attcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaa 305  Q
    ||||||||||||||        ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||       | ||||||||||||||||||||||    
T  23483521 attcgtttcatgttaaaaaac-tctaaattttaataaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaaattgttcaaaaatttaagagtttaa 23483619  T
Q  306 ggataattaaacaaactt 323  Q
    ||||||||||||||||||    
T  23483620 ggataattaaacaaactt 23483637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 45 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 17062639 - 17062413
Alignment:
Q  45 atttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgattt 144  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |  | || ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||| |||||| |||||||    
T  17062639 atttatgcttaaacttttgagtttttgaacaattttgtatagacgtgttaagaacattattaaaagttcttctgcaaaaa-ttgtcgcaaaatttgattt 17062541  T
Q  145 atacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaat 244  Q
     || |||||||||||||||||||  |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||       ||||||||||||||||||    
T  17062540 ctatgtccagattttgttaatttcgtctttaacttttctcattttaaaaaattcatatttaattcgtttgatgtt-aaaaaattctaaattttagtaaat 17062442  T
Q  245 gaacctttcatagtgttctaaccttgtct 273  Q
    |||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  17062441 gaacatttcatagtgttttaaacttgtct 17062413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 45 - 273
Target Start/End: Original strand, 17585719 - 17585945
Alignment:
Q  45 atttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgattt 144  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |  | || ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||| |||||| |||||||    
T  17585719 atttatgcttaaacttttgagtttttgaacaattttgtatagacgtgttaagaacattattaaaagttcttctgcaaaaa-ttgtcgcaaaatttgattt 17585817  T
Q  145 atacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaat 244  Q
     || |||||||||||||||||||  |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||       ||||||||||||||||||    
T  17585818 ctatgtccagattttgttaatttcgtctttaacttttctcattttaaaaaattcatatttaattcgtttgatgtt-aaaaaattctaaattttagtaaat 17585916  T
Q  245 gaacctttcatagtgttctaaccttgtct 273  Q
    |||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  17585917 gaacatttcatagtgttttaaacttgtct 17585945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Original strand, 39336991 - 39337273
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||||||   || ||||||||| ||||||||||||||| | ||||||       
T  39336991 tcaattcaaatttgtttaatttattcttaaactcttaagttttttaacaattttttgttgacgtgttaagaacattactaaaagttccgccgcaaaat-- 39337088  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
               |||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||           
T  39337089 -----------ttgatttatatgtccatattttattacttttatctttaacttctattgttttcaaaaattcatatttaattcgtttaatgttaaaaaaa 39337177  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    || ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||       || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39337178 tt-taaattttattaattgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaagattcattcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 39337273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 27 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 13323845 - 13323652
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaa-gttcctctgcaaaaaa 125  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| | || ||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||    
T  13323845 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagttttttaacaattttttgtagacgtgttaagaacattactaaaaagttcctccacaaaaaa 13323746  T
Q  126 ttgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt 219  Q
    || | |||||| |||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13323745 ttatcgcaaaatttgatttatatgttcagattttattacttttatctttaacttttatcattttcaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt 13323652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 37 - 323
Target Start/End: Original strand, 30968670 - 30968957
Alignment:
Q  37 tttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaatt-ttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaa 135  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||| ||||||| || |||| | || ||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||    
T  30968670 tttgtttaatttatgcataaactcttaagtttttaaacaattattttgcatacgtgtttataacattactaaaagtttctctacaaaaaattatcgcaaa 30968769  T
Q  136 aattgatttatacgtccagattttgttaatttt-atctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaat 234  Q
    |  |||||| ||| | |||||||||||  |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||| ||       ||||||||    
T  30968770 atatgatttctacattcagattttgttgctttttatcattaacttttgtcgttttaaaaaattcatatttaatttattacatatt-aaaaaattctaaat 30968868  T
Q  235 tttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    ||||||||| |||| ||||||| |||||||| |||||||         |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30968869 tttagtaaacgaacatttcatattgttctaaacttgtctaaaaaaaaccgtttaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 30968957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 34 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 5766005 - 5765717
Alignment:
Q  34 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttg--caaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttg 131  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||   || || |||||||||  ||| |||||| ||||  | |||||||  | |    
T  5766005 aaatttgtttaatttatgcttaaactctgaagtttttcaacaattttttttacagacgtgttaagaacgttattaaaaggtccttcgaaaaaaata-tcg 5765907  T
Q  132 caaaaatt-gatttatacgtccagatttt-gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttc 229  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||| || |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||       ||     
T  5765906 caaaaatttgatttctacgtccatatttttgttacttatatcttaaacttttgtcgttttaaaaaattcatatttaatttatttcatgtt-aaaaaatta 5765808  T
Q  230 taaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaa 320  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |        ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5765807 tagattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtataaaaagaatcgttaaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaa 5765717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 34 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 28755462 - 28755176
Alignment:
Q  34 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 133  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| || || |||||||||  ||| |||||| ||||| | |||||| | | |||    
T  28755462 aaatttgtttaatttatgcttaaattcttaagtttttcaacaattttttacagacgtgttaagaacgttattaaaaggtcctccg-aaaaaaatatcgca 28755364  T
Q  134 aaaa-ttgatttatacgtccaga-ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttcta 231  Q
    |||| ||||||| ||||| || | |||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||       || ||    
T  28755363 aaaatttgatttctacgttcatatttttgttacttatatcttaaacttttgtcgttttaaaaaattcatatttaatttatttcatgtt-aaaaaattata 28755265  T
Q  232 aattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaa 320  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |        ||||| ||||||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  28755264 gattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtataaaaagaatcgttaaaaaatttaagagtttaacaataattaagcaaa 28755176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 27 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 43988446 - 43988155
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||| | |||||||    |||| ||||  ||||||| || |||||  ||||| ||    
T  43988446 tcaattcaaatttgtttaatt-atgcttaaactcttaagttttcgaacattattttgcatg--tgtttagaacgttactaatagctcctccacaaaatat 43988350  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagatttt-gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnn 225  Q
    | | |||||| ||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||          
T  43988349 tatcgcaaaatttgatttttacatccagatttttgttacttttatctttaacttttgctgttttaaaaaattcatatttaactcattttatgtt-aaaaa 43988251  T
Q  226 nttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaac 321  Q
     ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||   |        ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43988250 attctaaattttagtatataaacctttcatagtgttctaaacttaggtaaaaaaaatcgctaaaaaatttaagagtttaagtataattaaacaaac 43988155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 48 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 32514318 - 32514042
Alignment:
Q  48 tatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttata 147  Q
    |||||| ||||| || || |||| ||||||||||| || |  ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |   |||| || || | ||    
T  32514318 tatgcttaaacttttaagattttaaacaattttttacagaagtgttaagaacattactaatagttcatctgcaaaaaattatctgaaaattttatatcta 32514219  T
Q  148 cgtccaga-ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatga 246  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |  |||  ||||||| ||||||||||| |||||||||        |||||||||||||||| ||    
T  32514218 cgtccagaattttgttacttttatctttaacttttttcctttacaaaaatttatatttaattcatttcatgttaaaaaaaatctaaattttagtaaacga 32514119  T
Q  247 acctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    ||||||  ||  ||||||| ||||||||       ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  32514118 accttttgtaacgttctaaacttgtctcaaaataatcgtttaaaaatttaagagtttaaggataattagagaaactt 32514042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 155 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 43936681 - 43936514
Alignment:
Q  155 attttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttca 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||        | |||||||| |||||| || ||||||    
T  43936681 attttgttaattttatctttaacttttgccgttttaaaaaatttatttttaattcgtttcatgttaaaaaaaat-taaattttggtaaataaatctttca 43936583  T
Q  255 tagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    ||| |||| || |||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43936582 tagcgttcaaaacttgtcttaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 43936514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 27 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 14122038 - 14121938
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||    
T  14122038 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttgagtttttgaacaattttttacagacgtgttaagaacattactaaaagttcctatgcaacaaat 14121939  T
Q  127 t 127  Q
    |    
T  14121938 t 14121938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 34 - 323
Target Start/End: Original strand, 36018116 - 36018406
Alignment:
Q  34 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaa-attgttgc 132  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||  | || |||||||||   || |||||||| ||| ||||||| ||| | ||    
T  36018116 aaatttgtttcatttatgcttaaactcttaagtttttcaacaatttttt-tagacgtgttaagaacgctattaaaagtttctccgcaaaaacattatcgc 36018214  T
Q  133 aaaaa-ttgatttatacgtccaga-ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttct 230  Q
    ||||| ||||||| ||| | || | |||||||| ||||||||| ||||||| | |||| ||||||| ||||||| |||  |||||||||        |||    
T  36018215 aaaaatttgatttctacattcatatttttgttacttttatcttaaacttttttggtttaaaaaaatacatattttatttatttcatgttaaaaaaa-tct 36018313  T
Q  231 aaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    | |||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||       | ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36018314 agattttaataaatgaaccttttatagtgttcaaaacttgtctcaaaaaaattgttaagaaatttaagagtttaagaataattaaacaaactt 36018406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 29 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 32244690 - 32244511
Alignment:
Q  29 aattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattg 128  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||     
T  32244690 aatttaaatttgtttaatt-atgcttaaacttttaagattttgaacaattttttgcacaagtgttaagaacattacgaaaagttcatctacaaaaaatta 32244592  T
Q  129 ttgcaaaaattgatttatacgtccag-attttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaatt 208  Q
    |  ||||| || |||||| ||||||| ||||||||| |||||| || |||||||||    | ||||||| |||||||||||    
T  32244591 tctcaaaattttatttatgcgtccagaattttgttacttttattttgaacttttgtctactaaaaaaatccatatttaatt 32244511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 34 - 271
Target Start/End: Original strand, 3865698 - 3865934
Alignment:
Q  34 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 133  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||| |  | ||||||| || || |||||||  ||| ||||||||| |  ||    
T  3865698 aaatttgtttaatt-atgcttaaacttttaagattttgaacaattttttgcacaagtattaagaacatcacgaaaagtttatctccaaaaaattatctca 3865796  T
Q  134 aaaattgatttatacgtccagatttt-gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaa 232  Q
    ||| || |||  | |||||||||||| |||| |||||| || |||||||||  ||| |||||||||||||||||||  |||||||||       ||||||    
T  3865797 aaattttattcctgcgtccagatttttgttacttttattttgaacttttgtcttttaaaaaaattcatatttaatttatttcatgtt-aaaaaattctaa 3865895  T
Q  233 attttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgt 271  Q
    | ||||||||| ||||||||  || |||||||| |||||    
T  3865896 agtttagtaaacgaacctttagtaatgttctaaacttgt 3865934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 67 - 177
Target Start/End: Original strand, 2826919 - 2827029
Alignment:
Q  67 ttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaatt 166  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||| || |||||||||||||| ||  ||||||||  | |||||| ||||||| ||  | |||||||||||| ||    
T  2826919 ttttgaacaattttttgcagacgtgttaaaaacattactaaaagttcatccacaaaaaatcatcgcaaaatttgatttctatattcagattttgttactt 2827018  T
Q  167 ttatctttaac 177  Q
    |||||||||||    
T  2827019 ttatctttaac 2827029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 34 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 44894698 - 44894574
Alignment:
Q  34 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 133  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||| |  ||    
T  44894698 aaatttgtttaatt-atgcttaaacttttaagattttgaacaattttttgcacaagtgttaagaacattacgaaaagttcatctccaaaaaattatctca 44894600  T
Q  134 aaaattgatttatacgtccagatttt 159  Q
    ||| || |||| | ||||||||||||    
T  44894599 aaattttatttctgcgtccagatttt 44894574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 67 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 42024504 - 42024251
Alignment:
Q  67 ttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaa-aaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccagatttt-gttaa 164  Q
    |||| |||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||| | |  ||||| || |||| |||||| ||||||| ||||     
T  42024504 ttttaaacaattttttgcagaagtgttaagaacattactaaaatttcatctgcaagaaaaatct--caaaattttatttctacgtcgagatttttgttac 42024407  T
Q  165 ttttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttcta 264  Q
    ||||||||| |||||||||  ||  |||||||||||||||||  | ||||||| |       |||||||||||||||||  ||| |||  || |||||||    
T  42024406 ttttatcttgaacttttgtctttcaaaaaaattcatatttaacccatttcatggtataaaa-ttctaaattttagtaaacaaacttttggtaatgttcta 42024308  T
Q  265 accttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    | |||||||        |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||    
T  42024307 aacttgtct--aaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattagagaaactt 42024251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 3866647 - 3866505
Alignment:
Q  67 ttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccag-attttgttaat 165  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| |  ||||| || |||| |  || ||| ||||||||| |    
T  3866647 ttttgaacaattttttgcacaagtgttaagaatattacgaaaagttcatatgcaaaaaattatctcaaaattttatttctgtgttcagaattttgttact 3866548  T
Q  166 tttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaatt 208  Q
    ||||| || |||||||||   || ||||||| |||||||||||    
T  3866547 tttattttgaacttttgtctattaaaaaaatccatatttaatt 3866505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 323
Target Start/End: Original strand, 36126455 - 36126548
Alignment:
Q  231 aaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttc-aaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||        |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  36126455 aaattttagtaaatgaaccttttatagtgttttaaacttgtcttaaaaaaatcgttcaaaaaatttaatagtttaaggatagttaaacaaactt 36126548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 39337813 - 39337757
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttg 83  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  39337813 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagttttttaacaattttttg 39337757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 34 - 219
Target Start/End: Original strand, 6243479 - 6243663
Alignment:
Q  34 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 133  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || | |||| |||||| |||||||| |  |||||  || ||||| |||||||| || |||||||||| |  ||    
T  6243479 aaatttgtttaatt-atgcttaaacttttaaatttt-gaacaaatttttgcacaagtgttagtaacattacgaaaagttcatccgcaaaaaattatctca 6243576  T
Q  134 aaaattgatttatacgtccagatttt-gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt 219  Q
    ||| || |||| | | |||| ||||| |||| |||||| || ||||||| |  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6243577 aaatttaatttctgcatccatatttttgttacttttattttgaacttttatcttttaaaaaaattcatatttaatttgtttcatgtt 6243663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 285 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 30658491 - 30658453
Alignment:
Q  285 ttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30658491 ttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 30658453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 131 - 183
Target Start/End: Original strand, 1663854 - 1663906
Alignment:
Q  131 gcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgt 183  Q
    ||||||||| |||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1663854 gcaaaaatttatttctatgtccagattttgttacttttatctttaacttttgt 1663906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 34 - 271
Target Start/End: Original strand, 32243684 - 32243920
Alignment:
Q  34 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 133  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||| |  | ||||||| || || |||||||  ||||||||||||| |  ||    
T  32243684 aaatttgtttaatt-atgcttaaacttttaagattttgaacaattttttgcacaagtattaagaacatcacgaaaagtttatctgcaaaaaattatctca 32243782  T
Q  134 aaaattgatttatacgtccaga-ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaa 232  Q
    ||| || |||  | |||| ||| |||| ||| |||||| || |||||||||  ||| |||||| | |||||||| |  |||||||||       || |||    
T  32243783 aaattttattcctgcgtctagattttttttacttttattttgaacttttgtcttttaaaaaaaattatatttaaattatttcatgtt-aaaaaattataa 32243881  T
Q  233 attttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgt 271  Q
    ||||||||||| ||||||||  || |||||||| |||||    
T  32243882 attttagtaaacgaacctttagtaatgttctaaacttgt 32243920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 27 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 35369984 - 35369928
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttg 83  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||    
T  35369984 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagttttttaataattttttg 35369928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 285 - 323
Target Start/End: Original strand, 12469454 - 12469492
Alignment:
Q  285 ttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12469454 ttcaaaaatttaggagtttaaggataattaaacaaactt 12469492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 125
Target Start/End: Original strand, 10409789 - 10409876
Alignment:
Q  37 tttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaa 125  Q
    ||||||||||| ||| | ||||| || || ||||||||||||| ||||  |  ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  10409789 tttgtttaatt-atgtttaaacttttaagattttgaacaatttcttgcggaagtgttaagaacattactaaaagttcatctgcaaaaaa 10409876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 156 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 6244338 - 6244275
Alignment:
Q  156 ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt 219  Q
    |||||||| |||||| || |||||||||  ||| |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  6244338 ttttgttacttttattttgaacttttgtcttttaaaaaaattcatatttaatttatttcatgtt 6244275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 285 - 320
Target Start/End: Original strand, 31185724 - 31185759
Alignment:
Q  285 ttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaa 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31185724 ttcaaaaatttaagagtttaaggataattaagcaaa 31185759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 132 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 34050685 - 34050598
Alignment:
Q  132 caaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt 219  Q
    ||||| || |||| || ||||| ||||||||| ||||||||| || |||||  ||||||||||| | ||||||||||| || ||||||    
T  34050685 caaaattttatttttaggtccaaattttgttagttttatcttgaatttttggcgttttaaaaaaattatatttaattcattacatgtt 34050598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 28701928 - 28701866
Alignment:
Q  47 ttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaa 109  Q
    ||||||| ||||| || || ||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||    
T  28701928 ttatgcttaaacttttaagattttgaacaattttttgtagaagtgttaagaatattactaaaa 28701866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 81
Target Start/End: Original strand, 41255335 - 41255389
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttt 81  Q
    |||||| ||||||||||||||  || | || ||||||||||||||||||||||||    
T  41255335 tcaattcaaatttgtttaattagtgtttaatctcttgagtttttgaacaattttt 41255389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 285 - 321
Target Start/End: Original strand, 2827065 - 2827101
Alignment:
Q  285 ttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaac 321  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  2827065 ttcaaaaaattaagagtttgaggataattaaacaaac 2827101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 27 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 16478468 - 16478432
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttg 63  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  16478468 tcaattgaaatttgttcaatttatgcttaaactcttg 16478432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 47 - 83
Target Start/End: Original strand, 28694963 - 28694999
Alignment:
Q  47 ttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttg 83  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28694963 ttatgcttaaactctagagtttttgaacaattttttg 28694999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 160 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 36333275 - 36333227
Alignment:
Q  160 gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaatt 208  Q
    |||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||| ||||||||||    
T  36333275 gttaattttatctttaacttttatcattttaaaatatttatatttaatt 36333227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 175; Significance: 4e-94; HSPs: 54)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 34 - 323
Target Start/End: Original strand, 10357322 - 10357610
Alignment:
Q  34 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 133  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  10357322 aaatttgtttaatttatgcttaaactcttgagtttttgaacaattttttgcagacgtgttaagaacattactaaaagttcctctgcaaaaaattgtcgaa 10357421  T
Q  134 aaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaa 233  Q
    ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| | |||       |||||||    
T  10357422 aaatttgatttctacgcccagattttgttaattttatctttaacttttaccgttttaaaaaattcatatttaattcgtttaaggtt-aaaaaattctaaa 10357520  T
Q  234 ttttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||        |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10357521 ttttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtctaaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactt 10357610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Original strand, 7439220 - 7439515
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |  || ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  7439220 tcaattcaattttttttaatttatgcttaaactcttgtgtttttgaacaattttttactgacgtgtcaagaacattactaaaagttcctctacaaaaaat 7439319  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
    ||| |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  7439320 tgtcgcaaaatttaatttctacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgtcgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaa 7439418  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||       ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7439419 ttctaaattttactaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaaatcgtttaaaaatttaagagtttaagaataattaaacaaactt 7439515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 3043656 - 3043361
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||| || ||||||||||| | |||||||||||||    
T  3043656 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttgaattattgaacaattttttgcagacgtgttaaaaacattactaaaagctactctgcaaaaaat 3043557  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||           
T  3043556 tgtggcaaaatttgatttctacgtccaaattttgttaattttatctttaacttttgtcgttttaaaaaattcatatttaattagttttatgtt-aaaata 3043458  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||       ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3043457 ttctgaattttagtaaatgaacctttcatattgttctaaacttgtctcaaaaaattcgttaaaaaatttatgagtttaaggataattaaacaaactt 3043361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Original strand, 31771316 - 31771611
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  31771316 tcaattcaaatttgtttaattgatgcataaactcttaagtttttgaacaattttttgtaaacgtgttaagaacattactaaaagttcctccgcaaaaaat 31771415  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
    | |||||||| || |||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||           
T  31771416 tattgcaaaatttaatttctacatccagattttattacttttatctttaacttttgtcgttttcaaaaattcatatttaattcatttcatgttaaaaaat 31771515  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31771516 tt-taaattttagtaaatgaaactttcatagtgttctaaacttgtgtcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 31771611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 33832418 - 33832124
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | || ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  33832418 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttgagtttttgaacaatttttcgtagacgtgttaagaacattactaaaagttcctctacaaaaaat 33832319  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  ||           
T  33832318 tgtcgcaaaatttgatttgtacgtccagaatttgttaattttatcttatacttttgtcattttaaaaaattcatatttaattcgtttca--tttaaaaaa 33832221  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||         ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33832220 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttataaacttgtcataaaaaaatcgtttaaaaatttaagagtttaaggataattaaacagactt 33832124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 27 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 42274596 - 42274304
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||| |||||||| || |||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  42274596 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcatgagttttcaaacaaatttttgcagacgtgttaaaaacattactaaaagttcctctgcaaaaaat 42274497  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
    ||| |||||| ||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||           
T  42274496 tgtcgcaaaatttgatttctatgtctagattttgttaattttatctttaacttttgccgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatattaaaaaaa 42274397  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaa 320  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42274396 -tctaaattttggtaaatgaacctttcataatgttctaaacttgtcttaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaa 42274304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 34 - 323
Target Start/End: Original strand, 31436045 - 31436332
Alignment:
Q  34 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 133  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || |  |||||| | |||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  31436045 aaatttgtttaatttatgcttaaactcttgagtttttgaacaatttttcgcagacgtactaagaacaatactaaaagttcatctacaaaaaattgttgca 31436144  T
Q  134 aaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaa 233  Q
    ||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||    
T  31436145 aaatttgatttctacgttcagaatttgttaattttatctttaacttttg-tcatttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaattctaaa 31436242  T
Q  234 ttttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||         ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31436243 ttttagtaaatgaacctttcatagtgttataaacttgtcataaaaaaatcgttcaaaaatttaagtgtttaaggataattaaacaaactt 31436332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 43933029 - 43932734
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  43933029 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagttttttaataattttttgtagacgtgttaagaacattactaaaagttcctccgcaaaaaat 43932930  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
    | | |||||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||           
T  43932929 tatcgcaaaatttgatttatatgtccagattttattacttttatctttcacttttatcgttttcaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaa 43932831  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43932830 ttctaaattttaataattgaacctttcatattgttctaaacttctctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 43932734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 40365179 - 40364884
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgct-aaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaa 125  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| || |||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  40365179 tcaatttaaatttgtttaatttatgtttaaaacccttgagttttgga-caattttttgcttatatgttaagaacattactaaaagttcatcggcaaaaaa 40365081  T
Q  126 ttgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnn 225  Q
    ||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||          
T  40365080 ttgtcacaaaatttgatttatacgtccatattttgttacttttatctttaacttttgtcgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaa 40364982  T
Q  226 nttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
     |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||        |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  40364981 attctaaattttagtaaatgaaccttcaatagtgttctaaacttgtcttaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttgaggatagttaaacaaactt 40364884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 27 - 265
Target Start/End: Original strand, 6457266 - 6457504
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| | || |||| |||| |||| |||||| ||||||||||||||     
T  6457266 tcaattcaaatttgtttaatttatggttaaactcttgagtttttgaacaattttttgaagacgtgttgagaacattaataaaagctcctctgcaaaaaaa 6457365  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
      | | |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  6457366 attcgtaaaatttgatttctacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaaaa 6457465  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaa 265  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6457466 ttctaagttttagtaaatgaacctttcatagtgttctaa 6457504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 34 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 8738100 - 8737811
Alignment:
Q  34 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaa-ttgttgc 132  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | || || |||||| || ||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||    
T  8738100 aaatttgtttaatttatgcttaaattcttgagtttttgaacaattttatacagacgtgttaaaaacattacgaaaagtttctctgcaaaaaaattgtcgc 8738001  T
Q  133 aaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaa 232  Q
    |||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||       || |||    
T  8738000 aaaatttgatttctacgtccaaattttgttaattttatctttaacttttgctgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaaaatt-taa 8737902  T
Q  233 attttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||         ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  8737901 attttagtaaacgaacctttcatagtgttctaaacttttctaaaaaaaaccgttcaaaaatttaagattttaaggataattaaataaactt 8737811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 27 - 307
Target Start/End: Original strand, 41120738 - 41121016
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41120738 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaacttttgagtttttaaacaattttttgcagacgtgttaagaacattactaaaagttcctctgcaaaaaat 41120837  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
    ||| |  ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||| ||||||||||||||||||||           
T  41120838 tgtcgtgaaatttgatttctacgtccatattttgttaattttatctttaatttttgccg-tttaaaaaattcttatttaattcgtttcatgttaaaaaag 41120936  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaagg 307  Q
     |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||        ||||||||||||||||||||||||||    
T  41120937 -tctaaattttggtaaatgaacttttcatagtgttctaaacttgtcttaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaagg 41121016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Original strand, 44492883 - 44493179
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  44492883 tcaattcaaatttgtttaagttatgttgaaactcttaagttttttaacaattttttgtagacgtgttaagaacattactaaaagtttccctgcaaaaaat 44492982  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgtt-gttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnn 225  Q
    | | |||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||          
T  44492983 tatcgcaaaatttgatttatatgtccagattttattacttttatctttaactttttttcgttttcaaaaattcatatttaattcgtttgatgtt-aaaat 44493081  T
Q  226 nttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
     || ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44493082 attataaattttagtaattgaacctttcatagagttctaaacttatctcaataaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 44493179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Original strand, 25100585 - 25100879
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||  |||  ||||| |||||||||||||| |||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25100585 tcaattcaaatttgtttaatttattgtaat-ctcttaagtttttgaacaatattttacagacgtgttaagaacattactaaaagttcctctgcaaaaaat 25100683  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
    ||| || ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |           
T  25100684 tgtcgctaaatttgatttttacgttcagattttgttaattttagctttaacttttgccgttttaaaagattcatatttatttcgtttcatgctaaaaaaa 25100783  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
       ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25100784 aattaaattttagtaagtgaacctttcatagtgttctaaacttgtctc-aaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 25100879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 35 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 36512263 - 36512025
Alignment:
Q  35 aatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaa-acatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 133  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||    
T  36512263 aatttgtttaatttatgcttaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaggacgtgttaagaatattactaaaagtttctctgtaaaaaattgtcgca 36512164  T
Q  134 aaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaa 233  Q
    ||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||       |||||||    
T  36512163 aaatttgatttttacatccagattttattaattttatctttaacatttgtcgttttaaaaaatccatatttaatttgttttatgtt-acaaaattctaaa 36512065  T
Q  234 ttttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtct 273  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||| |||||||    
T  36512064 ttttagaaaataaacatttcatagtgttctaaacttgtct 36512025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 25666038 - 25666282
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| |||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| || || | ||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||    
T  25666038 tcaattcaaatttatttaatttatatttaaactcttgagtttttgaacaattttttacagacgtattaagaacattactaaaagttcctatgcgaaaaat 25666137  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
    ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  25666138 tgtcgcaaaatttgatttctacgtccagattttgttaattttacttttaatttttgccgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaaaa 25666237  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtc 272  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25666238 at-taaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtc 25666282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Original strand, 30784185 - 30784470
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||    
T  30784185 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagttttagaacaattttttgcagacgtgttaagaacattactaaaagctcatctgcaaataat 30784284  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  30784285 tgtcgcaaaatttgatttctacgtccata-tttgttaattttatctttaacttttgtcgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaa 30784382  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    ||||||||||||||||||||||        ||||||||| ||||||||       | |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  30784383 ttctaaattttagtaaatgaac--------gtgttctaaacttgtctcaaaaatattgttc-aaaatttaagaattttaggataattaaacaaactt 30784470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 42487963 - 42487668
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||| | |  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  42487963 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttaatttttt-aacaattttttgtagatgtgttaagaacattattaaaagttcctctgcaaaaaat 42487865  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
      | |||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||           
T  42487864 aatcgcaaaatttgatttatatgtccatattttattacttttatctttaacttttatcgttttaaaaaattcatattgaattcatttcatgttaaaaaaa 42487765  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
     | ||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| ||||||||       || ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  42487764 atttaaattttagtaattgaacctttcatagcgttttaaacttgtctcaaaaaaatcattcaaaaatttaagagtttaaagataatcaaacaaactt 42487668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 44286978 - 44286684
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgcta---aaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaa 123  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||   ||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| | |||||||||||||| | |  ||||    
T  44286978 tcaattcaaatttgtttaatttataatacttaaactcttgagtttttgaacaattttttgcggacgtgttaagcacattactaaaagttcatttaaaaaa 44286879  T
Q  124 aattgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnn 223  Q
    |||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||    ||||||||||||||||        
T  44286878 aattgtcgctaaatttgatttctacgttcagattttgttaattttatctttaagttttggcgttttaaaaaattca----taattcgtttcatgtt-aaa 44286784  T
Q  224 nnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
       || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||       |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44286783 aaattgtaaattttagtaaatgaatctttcatagtgttctaaatttgtctcaaaaaaatcgttcaaaagtttaagagtttaaggataattaaacaaactt 44286684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 20721511 - 20721229
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||| |  || |||||    
T  20721511 tcaattcaaatttgtttaatttattcttaaactcttaagttttttaacaattttttgtagacgtgttaagaacattactaaaagttccgc--cacaaaat 20721414  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
    |           ||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||           
T  20721413 t-----------tgatttatatgtccatattttattacttttatctttaacttttattgttttcaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaaa- 20721326  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||       |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20721325 ttctaaattttattaattgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaattcgttcaaaaatttaagagtttaacgataattaaacaaactt 20721229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 27 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 37593171 - 37592937
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37593171 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaattcctgagtttttgaacaattttttgcagctgtgttaagaatattactaaaagttcctttgcaaaaaat 37593072  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
    ||  |||||| |||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||   ||||||||||||||| |||||||||||           
T  37593071 tgccgcaaaatttgacttttacgttcaaattttgttaattttatctttaacttttgtcatttt---aaattcatatttaatccgtttcatgtt-aaaaaa 37592976  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaa 265  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  37592975 ttctaaattttagtaaatgaacttttcatggtgttctaa 37592937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 27 - 207
Target Start/End: Original strand, 35498588 - 35498768
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||    
T  35498588 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttgagttgttgaacaatttttcgcagacgtgttaagaacattactaaaagtttctctacaaaaaat 35498687  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaat 207  Q
    ||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  35498688 tgtcgcgaaatttgatttctacgtccagaatttgttaattttatctttaacttttgtcatttttaaaaattcatatttaat 35498768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 150 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 13372167 - 13371995
Alignment:
Q  150 tccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacc 249  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||    
T  13372167 tccagattttgtttattttatctttaacttttgtcgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaatttctaaattttagtaaatgaacc 13372069  T
Q  250 tttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    |||||||||||||||| |||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13372068 tttcatagtgttctaaacttgtctaaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 13371995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 21440114 - 21439832
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||||| |  || |||||    
T  21440114 tcaattcaaatttgtttaatttattcttaaactcttaagtttttaaacaattttttgtaatcgtgttaagaacattactaaaagttccgc--cataaaat 21440017  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
    |           ||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||           
T  21440016 t-----------tgatttatatgtccatattttattacttttatctttaacttttattgtttttaaaaatttatatttaattcgtttcaagttaaaaaaa 21439928  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    || ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||       || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21439927 tt-taaattttattaattgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaattcattcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 21439832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 27 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 34073865 - 34073621
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||   |||||||    
T  34073865 tcaatttaaatttgttta-tttatgcctaaactcttg--tttttcaacaattttttgcagacatgtttagaacattactaaaagttcctccataaaaaat 34073769  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaatttt-atctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnn 225  Q
    | | |||||| || |||| ||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||          
T  34073768 tatcgcaaaatttaatttctacatccatattttgttactttttatctttaacttttgtagttttaaaaaattcatatttaattcgtttcttgtt-agaaa 34073670  T
Q  226 nttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctc 274  Q
     |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  34073669 attctaaattttattaaatgaatctttcttagtgttctaaacttgtctc 34073621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 38 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 44879995 - 44879718
Alignment:
Q  38 ttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaa 137  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||||||  | |||||||| |||| ||||||     
T  44879995 ttgtttaatttatgcttaaacttttgagtttttaaacaattttttgcagatgtgttaagatcattactaaaagtttatgtgcaaaaatttgtcgcaaaat 44879896  T
Q  138 ttgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaatttt 237  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  44879895 ttgattt-tatgtccagattttcttaactttatctctaacttttg------aaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaaaa-tctaaatttt 44879804  T
Q  238 agtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
      ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||        |||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  44879803 gttaaatgaacttttcatagtgttctaaatttgtcttaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttagagatagttaaacaaactt 44879718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 34 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 33001147 - 33000913
Alignment:
Q  34 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 133  Q
    |||||| |||||||||| |  |||||||| ||||||| |||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| | |||    
T  33001147 aaatttctttaatttatac--aaactcttaagttttttaacaattttttgtagacgtgttaagaacattactaaaagttactccgcaaaaaattatcgca 33001050  T
Q  134 aaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaa 233  Q
    ||| |||| ||||| ||||||| |||  || |||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||       |||||||    
T  33001049 aaatttga-ttatatgtccaga-tttaatacttttctctttaacttttatcgttttcaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaaaattctaaa 33000952  T
Q  234 ttttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtc 272  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  33000951 ttttagtaattgaacatttcatattgttctaaacttgtc 33000913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 141 - 323
Target Start/End: Original strand, 33031165 - 33031345
Alignment:
Q  141 atttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagt 240  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||        |||||||||| ||    
T  33031165 atttttacgtccagattttgttaattttatctttaactttttccgttttaaaaaattcata-ttaattcgtttcatgttaaaaaaa-tctaaattttggt 33031262  T
Q  241 aaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||        |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33031263 aaatgaaccttttatagtgttctaaacttgtcttaaaaaaatcgttcaaaaatttaagaatttaaggataattaaacaaactt 33031345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Original strand, 20719949 - 20720236
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaa-acatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaa 125  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||    ||||||| |||||||||||   | || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  20719949 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaacta---agttttttaacaatttttttatagacgtgttaagaacattactaaaagttcctccgcaaaaaa 20720045  T
Q  126 ttgtt-gcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnn 224  Q
     |  | |||||| |||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||         
T  20720046 ataatcgcaaaatttgatttatatgttcagattttattacttttatctttaacttttatcgttttcaaaaattcatatttaattcatttcaaatt-aaaa 20720144  T
Q  225 nnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
      |||||||||||||||| ||||||       ||||||||| ||||||||       ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  20720145 aattctaaattttagtaattgaacc-------gtgttctaaacttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaaaataattaaacaaactt 20720236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 90 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 29809562 - 29809401
Alignment:
Q  90 tgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgtttt 189  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||  |||||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  29809562 tgttaagaacattactaaaagttcatctacaaaaaattatcgcaaaatctgatttctacatccaaattttgttaattttatcattaacttttgtcgtttt 29809463  T
Q  190 aaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaaccttt 252  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||       ||||||||||||||||||||||||||    
T  29809462 aaaaaaatcatatttaattcctttcatgtt-aaaaaattctaaattttagtaaatgaaccttt 29809401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 29 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 14201260 - 14200964
Alignment:
Q  29 aattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaa--t 126  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||| |  | ||||||||| |||||||||||||| || | ||||||  |    
T  14201260 aattcaaatttgtttaatt-atgcttaaactcttaagtttgtgaataattttttgtagccgtgttaagaacattactaaaagttcatccgtaaaaaaaat 14201162  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaa-ttttatctttaacttttgttgttttaaaaaattc-atatttaattcgtttcatgttnnnnn 224  Q
    | |  ||||| ||||||| ||||||||  |||| ||   ||||||||| |||||||||  ||| |||||| || ||||||||||| |||||||||         
T  14201161 tatctcaaaatttgatttctacgtccaatttttttttgcttttatcttgaacttttgtcatttaaaaaaaatccatatttaattcatttcatgttaaaaa 14201062  T
Q  225 nnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
      |||||||||||| |||||||||||||  || |||||||| ||||||||       | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14201061 a-ttctaaattttattaaatgaaccttttgtaatgttctaagcttgtctcagaaaaattgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 14200964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 149 - 323
Target Start/End: Original strand, 18672317 - 18672486
Alignment:
Q  149 gtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaac 248  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||    ||| | || || |||||||||||||||||||||||||||||       || ||||||||||||| |||||    
T  18672317 gtccagattttattacttttatcttt----tttatcgtcttcaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaaa-ttataaattttagtaattgaac 18672411  T
Q  249 ctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18672412 ctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 18672486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 34 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 32319232 - 32319001
Alignment:
Q  34 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 133  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||| |  ||||||||| || |  |||||||  ||||||||||||| |  ||    
T  32319232 aaatttgtttaatt-atgcttaaacttttaagattttgaacaattttttgcacaagtgttaagaacatcatgaaaagtttatctgcaaaaaattatctca 32319134  T
Q  134 aaaattgatttatacgtccaga-ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaa 232  Q
    |||||| |||  | |||||||| |||||||| |||||| || |||||||||  ||| |||||||||||||||||||  |||||||||       ||||||    
T  32319133 aaaatttattcctgcgtccagatttttgttacttttattttgaacttttgtcttttaaaaaaattcatatttaatttatttcatgttaaaaaaattctaa 32319034  T
Q  233 attttagtaaatgaacctttcatagtgttctaa 265  Q
    | ||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  32319033 aatttagtaaatgaacctttagtaatgttctaa 32319001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 27 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 7655007 - 7654925
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaa 109  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  7655007 tcaatttaaatttgtttaatttatggttaaactcttgagtttttgaatagttttttgcaaacatattaagaacattactaaaa 7654925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 27 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 20719326 - 20719228
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaa 125  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||   || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  20719326 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagttttctaacaattttttgttgacgtgttaagaacattactaaaagttcctccgcaaaaaa 20719228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 34 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 8392615 - 8392337
Alignment:
Q  34 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaa-aattgttgc 132  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||| |||   |||| |||          
T  8392615 aaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagtttttcaacaattttttacaaacgtgttaagaatgttattaaaagtttctccataaaagaatatcata 8392516  T
Q  133 aaaaattgatttatacgtccagatttt-gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttcta 231  Q
    |||||||||||| || ||  | ||||| |||| ||||||||  ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||  ||||| |||       |||||    
T  8392515 aaaaattgatttctatgtgtacattttggttacttttatctgaaacttttgtcgtttacaaaaattcatatttaatttatttcacgtt-aaaaaattcta 8392417  T
Q  232 aattttagtaaatgaacctttcatagtgttct-aaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaa 320  Q
     |||||| ||||||||||||| ||| |||||| || |||||||          ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8392416 gattttattaaatgaaccttttatattgttctaaaacttgtct----------gttgaaaagtttaagagtttaaggataattaaacaaa 8392337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 34 - 219
Target Start/End: Original strand, 3117981 - 3118166
Alignment:
Q  34 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 133  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||| || || |||||||||| || ||||| | |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||  |  ||    
T  3117981 aaatttgtttaatt-atgtttaaacttttaagattttgaacaaattattgcacaaatgttaagaacattacgaaaagttcatctgcaaaaaataatctca 3118079  T
Q  134 aaaattgatttatacgtccaga-ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt 219  Q
    ||| || |||| | |||| ||| |||| ||| |||||| || |||||||||  ||| |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  3118080 aaattttatttctgcgtctagattttttttacttttattttgaacttttgtcttttaaaaaaattcatatttaatttatttcatgtt 3118166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 34 - 208
Target Start/End: Original strand, 32318223 - 32318398
Alignment:
Q  34 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaatttttt-gcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgc 132  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||||| ||| |  ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||  ||| |  |    
T  32318223 aaatttgtttaatt-atgcttaaacttttaagattttgaacaatttttttgcacaagtgttaagaacattacgaaaagttcatctgcaaatgattatctc 32318321  T
Q  133 aaaaattgatttatacgtccagatttt-gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaatt 208  Q
    |||| || |||| | |||||||||||| |||| |||||| || |||||||||   || |||||||||||||||||||    
T  32318322 aaaattttatttctgcgtccagatttttgttacttttattttgaacttttgtctattaaaaaaattcatatttaatt 32318398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 29 - 107
Target Start/End: Original strand, 33031087 - 33031165
Alignment:
Q  29 aattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaa 107  Q
    |||| |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||    
T  33031087 aattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttgaatttttaaacaattttttgcagacgtgttaagaacattactaa 33031165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 232 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 13027533 - 13027445
Alignment:
Q  232 aattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaa 320  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| |||||||| | ||||||       | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13027533 aattttagtaaacgaaccttttataatgttctaaacgtgtctccgaaaaattgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaa 13027445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 249 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 29809328 - 29809254
Alignment:
Q  249 ctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||       |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29809328 ctttcatagtgttttaaacttgtctcaaaaaaatcgttccaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 29809254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 282 - 323
Target Start/End: Original strand, 35498806 - 35498847
Alignment:
Q  282 tcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35498806 tcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 35498847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 23787838 - 23787782
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttg 83  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  23787838 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagttttttaacaattttttg 23787782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 27 - 83
Target Start/End: Original strand, 20701256 - 20701312
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttg 83  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  20701256 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaacttttaagttttttaacaattttttg 20701312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 27 - 83
Target Start/End: Original strand, 21439296 - 21439352
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttg 83  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  21439296 tcaattcaaatttatttaatttatgcttaaactcttaagttttttaacaattttttg 21439352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 133 - 323
Target Start/End: Original strand, 18917309 - 18917493
Alignment:
Q  133 aaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaa 232  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||  | | | |||||| |||| |  ||| |||||| |||||||||||| ||||||||||           ||    
T  18917309 aaaaattgatttttacgttcagattttgtttctataacctttaaattttctcatttaaaaaaaatcatatttaatttgtttcatgttaaaaa------aa 18917402  T
Q  233 attttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    |  |||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||       || ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  18917403 aaattagcaaatgaacctttcatagtgttctaaatatgtctcaaaaaaatcattcgaaaatttaagaatttaaagataattaaacaaactt 18917493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 288 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 19058678 - 19058643
Alignment:
Q  288 aaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19058678 aaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 19058643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 13027735 - 13027654
Alignment:
Q  34 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctc 116  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||  | |  ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  13027735 aaatttgtttaatt-atgcttaaacacttaagtttttgaacaattttttatacatttgttaagaacattactataagttcctc 13027654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 32319809 - 32319624
Alignment:
Q  34 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 133  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||| ||  | ||||||||||||||||||| |  ||||||||| || |  |||||||  ||||||||||||| |  ||    
T  32319809 aaatttgtttaatt-atgtttaaacttttatgattttgaacaattttttgcacaagtgttaagaacatcatgaaaagtttatctgcaaaaaattatctca 32319711  T
Q  134 aaaattgatttatacgtccaga-ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt 219  Q
    ||| || |||  | |||||||| |||||||| |||||| || |||||||    ||| |||||| ||||||||||||  |||||||||    
T  32319710 aaattttattcctgcgtccagatttttgttacttttattttgaacttttcacttttaaaaaaaatcatatttaatttatttcatgtt 32319624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 27 - 80
Target Start/End: Original strand, 18672259 - 18672312
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaatttt 80  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||    
T  18672259 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttgaactcttaagttttttaacaatttt 18672312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 288 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 37592927 - 37592894
Alignment:
Q  288 aaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaac 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37592927 aaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaac 37592894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 227 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 3118728 - 3118639
Alignment:
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaa 316  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  || |||||||| ||||| ||       ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  3118728 ttctaaattttagtaaataaaccttttgtaatgttctaaacttgtatcaaaaaattcgttaaaaattttaagagtttaaggatagttaaa 3118639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 4327898 - 4327848
Alignment:
Q  29 aattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattt 79  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||    
T  4327898 aattcaaatttgtttaatttatgcttaaactattaagcttttgaacaattt 4327848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 132 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 45301367 - 45301279
Alignment:
Q  132 caaaaattgatttatacgtccagatttt-gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt 219  Q
    ||||| || |||| || ||||| ||||| |||||| ||||||| || |||||  ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  45301367 caaaattttatttttaggtccaaattttcgttaatcttatcttgaatttttggcgttttaaaaaaattatatttaattcatttcatgtt 45301279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0445 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0445
Description:

Target: scaffold0445; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 34 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 6205 - 5917
Alignment:
Q  34 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 133  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| |||    
T  6205 aaatttgtttaatttatgtttaaactcttgagtttttgaacaattttttacaaacgtgttaagaacattactaaaagttactatgcaaaaaattgtcgca 6106  T
Q  134 aaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaa 233  Q
    ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||       |||||||    
T  6105 aaatttgatttctacgttcagattttgttaattttatctttaactttttccgttttaaaaaattcatatttaattcgtttgatgtt-aaaaaattctaaa 6007  T
Q  234 ttttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||       ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6006 ttttagtaaatgaacctttcatagtgttccaaacttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaaatcaagagtttaaggataattaaacaaactt 5917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 63)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 34 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 23883678 - 23883390
Alignment:
Q  34 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 133  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23883678 aaatttgtttaatttatgcttaaactctggagtttttgaacaattttttgcatacgtgttaagaacattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttaca 23883579  T
Q  134 aaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaa 233  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||       || ||||    
T  23883578 aaatttgatttctacgtccagattttgttaattttatctttaagttttgccgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaattgtaaa 23883480  T
Q  234 ttttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||        | |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23883479 tattagtaaatgaaccttttatagtgttctaaacttgtctaaaaaaaattgttctaaaatttaagagtttaagaataattaaacaaactt 23883390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Original strand, 29348275 - 29348567
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29348275 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaact--tgagtttttgaacaattttttgcagaagtgttaagaatattactaaaagttcctttgcaaaaaat 29348372  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||           
T  29348373 tgtcgcaaaatttgatttttacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgtcgttttaaaaaattcatatttagttcgttttatgtt-aaaaaa 29348471  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||        ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  29348472 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttataaatttgtct-aaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaatataattaaacaaactt 29348567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 45420078 - 45419785
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  45420078 tcaattcaaatttgttt--tttatgcttaaactcttgagtttttgaacaattttttgcatacgtgttaagaacattactaaaagttcctctgcaaaaaat 45419981  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
    ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||| || ||| |||||           
T  45419980 tgtcgcaaaatttgatttctacgtccagattttgttaattttatatttaacttttaccgttttaaaaaattcatatttaactcatttaatgtt-aaaaaa 45419882  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||        |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45419881 ttctaaattttagtaaatgaacctttcataatgttctaaacttgtctaaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactt 45419785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 53518079 - 53517784
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  53518079 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaacttttgagtttttgaacaatttttcgcagacgtgttaagaacattactaaaagttcatctacaaaaaat 53517980  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  53517979 tgtcgcaaaatttgatttctacgtccagaatttgttaaatttatctttaacttttgtctttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaat 53517881  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||         |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  53517880 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttataaacttatcataaaaaaatcgttcaaaaatttaaaagtttaaggataattaaacaaactt 53517784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Original strand, 38173902 - 38174197
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||    
T  38173902 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttgagtttttgaacaattttttacaggcgtgttaagaacattactaaaagttcctatacaaaaaat 38174001  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  38174002 tgtcgcaaaatttgatttctacgtctagattttgttaattttatctttaactttttctgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaaaa 38174101  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||       |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  38174102 tt-taaattttagtatatgaacctttcatagtgttctaaacttgtttcaaaaaaatcgttcaataatttaagagtttaaagataattaaataaactt 38174197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 44809135 - 44808839
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  44809135 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactctggagtttttaaacaattttttgcacacgtgttaagaatattactaaaagttcctttgcaaaaagt 44809036  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||           
T  44809035 tgtcgcaaaatttgatttttacgtcaaaattttgttaattttatctttaacttttgtcgtttttaaaaattcatatttaattcattttatgtt-aaaaaa 44808937  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtct-cnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||         |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44808936 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttataaacctgtctaaaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattgaacaaactt 44808839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 27 - 330
Target Start/End: Original strand, 25250016 - 25250316
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||    
T  25250016 tcaattcaaatttgtttaatttatatttaaactcttgagtttttgaataattttttacagacgtgttaagaacattactaaaagtttctatgcaaaaaat 25250115  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  25250116 tgtcgcaaaatttgatttctacgtccaaattttgt--attttatttttaacttttgccgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaa 25250212  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaacttcaa 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||       || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||    
T  25250213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaaatcattcaaaaatttaagagtttaaggataatttaacaaatttgaa 25250312  T
Q  327 ttga 330  Q
    ||||    
T  25250313 ttga 25250316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Original strand, 37178941 - 37179237
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||| | ||||| |||||||||||  | || ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  37178941 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttaaattttttaacaattttttatagacgtgttaagaacattactaaaagttcatccgcaaaaaat 37179040  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
    | | |||||| |||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||           
T  37179041 tatcgcaaaatttgatttatatgtccagattttattacatttatctttaacttttatcgttttcaaaaattcatatttaattcgtttgatgttaaaaaaa 37179140  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||       |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37179141 ttctaaattttagtaattgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaaatcgttcaaaattttaagaatttaaggataattaaacaaactt 37179237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Original strand, 27492313 - 27492609
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  27492313 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaattcttaggtttttgaacaattttttgcatacatgtttaaaacattactaaaagtttctccgcaaaaaat 27492412  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgtta-attttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnn 225  Q
    | | |||||| ||||||| ||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||          
T  27492413 tatcgcaaaatttgatttctacatccaaattttgttactttttatctttaacttttttcgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-agaaa 27492511  T
Q  226 nttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
     |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||       ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  27492512 attctaaattttaataaatgaacatttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaatatcgttcaaaaatttgggagtttaaggataattaaacaaactt 27492609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 40762895 - 40762600
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   | || ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||    
T  40762895 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttgagtttttgaacaatttttgatagacgtgttaagaacattactaaaagctcctctacaaaatat 40762796  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
    | | | |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||           
T  40762795 tatcgtaaaatttgatttctacgtcaagattttgttaatttcatctttaacttttgccgttttaaaaaattcatatttaattcatttcatgtt-aaaaaa 40762697  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |        |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40762696 ttctagattttagtaattgaatctttcatagtgttctaaacttgtttaaaaaaaatcgttcaaaattttaagagtttaaggataattaaacaaactt 40762600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 27 - 273
Target Start/End: Original strand, 21749566 - 21749811
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||    
T  21749566 tcaattcaaatttgtttaatttattcttaaactcttgagtttttgaacaattttttacgaacgtgttaagaacattactaaaagtttctatgcaaaaaat 21749665  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
    |||   |||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||           
T  21749666 tgtcttaaaatttaatttctacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgtcgttttaaaaaattcatttttaattcgtttcatatt-aaaaaa 21749764  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtct 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||    
T  21749765 ttctaaattttagtaaatgaacctttcacagtattctaaacttgtct 21749811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 27 - 303
Target Start/End: Original strand, 32146996 - 32147271
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  32146996 tcaattcaaatttgtctaatttatgcttaaactcttaagttttttaacaattttttgtagacgtgttaagaacattactaaaagttcctccgcaaaaaat 32147095  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
    | | |||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||           
T  32147096 tatcgcaaaatttgatttatatgtccatattttattactcttatctttaacttttatcgttttcaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaa 32147194  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagttt 303  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||       ||||||||||||||||||||||    
T  32147195 ttctaaattttagtaattgaacatttcatagtgttctaaacttgtctccaaaaaatcgttcaaaaatttaagagttt 32147271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 37 - 315
Target Start/End: Original strand, 11045412 - 11045691
Alignment:
Q  37 tttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatg---ttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 133  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| || |    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11045412 tttgtttaatttatgcttaaactcttgagtttttgaaca-ttctttgcacacgtcgtattaagaaaattgctaaaagttcctctgcaaaaaattgtcgca 11045510  T
Q  134 aaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaa 233  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |       |||||||    
T  11045511 aaatttgatttctacgtccagattttgttaattttatcttgaacttttgccgttttaaaaaattcatatttaattcgttttatggt-aaaaaattctaaa 11045609  T
Q  234 ttttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaa 315  Q
    ||||||||||||||||||||  | | |||||| ||||||||       |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11045610 ttttagtaaatgaacctttctcactattctaaacttgtctcaaaaaaatcgtacaaaaatttaagagtttaaggataattaa 11045691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 27 - 316
Target Start/End: Original strand, 19669699 - 19669988
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttga-gtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaa 125  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||| | |||||| |||||||||||| | || ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||     
T  19669699 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactctttaagttttttaacaattttttgtagacgtgttaagaacattactaaatgttcctccgcaaaaag 19669798  T
Q  126 ttgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnn 225  Q
    || |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||          
T  19669799 ttattgcaaaatttgatttatatgtccagattttattacttttatctttaacttttatcgttttcaaaaattcgtatttaattcgtttcatgttaaaaaa 19669898  T
Q  226 nttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaa 316  Q
     |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||        ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  19669899 attctaaattttagtaattgaacctttgatagtgttctaaacttgtct-aaaaaaatcgttcaaaaatttaagagttcaagaataattaaa 19669988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Original strand, 23917328 - 23917615
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  23917328 tcaattcaagtttgtttaatttatgcttaaactcttgagtttttgaacaattttttacaaacgtgttaagaacattactaaaagtttctctgcaaaaaat 23917427  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| |||   ||||||||||||||           
T  23917428 tgtcgcaaaatttgatttctacgtccaaattgtgttaattttatttttaacttttgtcgttttaagaaattcctat---attcgtttcatgttaaaaa-- 23917522  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
        |||   |||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||       |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23917523 ----aaaaaatagttaatgaacctttcatagtattctaaatttgtctcaaaaaaatcgtacaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 23917615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 27 - 274
Target Start/End: Original strand, 53397095 - 53397343
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||   || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |    
T  53397095 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagttttttaacaattttttgtcgacgtgttaagaacattactaaaagttcctccgcaaaaatt 53397194  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatg-ttnnnnnn 225  Q
    | | |||||| |||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||          
T  53397195 tatcgcaaaatttgatttatatgtccagattttattacttctatctttaacttttatcgttttcaaaaattcatatttaatttgtttcatgttttaaaaa 53397294  T
Q  226 nttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctc 274  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  53397295 attctaaattttagtaattgaacctttcatagtgttctaaacttttctc 53397343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 50615366 - 50615084
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||| | ||||||       
T  50615366 tcaattcaaatttgtttaatttattcttaaactcttaagttttttaacaattttttgtagacgtgttaagaatattactaaaagttccgccgcaaaat-- 50615269  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
               |||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||           
T  50615268 -----------ttgatttatatgtccatattttattacttttatctttaacttttattgttttcaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaa 50615181  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||       ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  50615180 ttctaaatttttttaattgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaattcgttcaaaaatttaagagtttaaggaaaattaaacaaactt 50615084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 45235641 - 45235344
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaa- 125  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||  | || ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||     
T  45235641 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagttttttaacaattttttatagacgtgttaagaacattattaaaagttcctccgcaaaaaat 45235542  T
Q  126 ttgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatcttt-aacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnn 224  Q
    || | |||||| || ||||||| ||||||||||  ||| || ||||||| || |||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||         
T  45235541 ttatcgcaaaattttatttatatgtccagatttaattacttgtatctttaaaattttatcgtttttaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaa 45235443  T
Q  225 nnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
      |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||        |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45235442 tattctaaattttagtaattgaacctttcaaagtgttctaaacttgtctcaataaaaccgttaaaaaatttaagagtttatggataattaaacaaactt 45235344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Original strand, 32943000 - 32943281
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  32943000 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagttttttaacaattttttgtagacgtgttaagaacattactaaaagttcctccgcaaaaaat 32943099  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
    | | |||||| |||||||||| |||  |||||| ||             |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| || ||           
T  32943100 tatcgcaaaatttgatttatatgtcttgattttatt-------------acttttgttg-tttcaaaaattcatatttaattcttttaatatt-aaaaaa 32943184  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32943185 ttctaaattttagtaattgaacctttcatagtgttcaaaacttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 32943281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Original strand, 11293800 - 11294089
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaaca---tgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaa 123  Q
    |||||| |||| |||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||    ||||||||| ||| |||          |||||||    
T  11293800 tcaattcaaatctgtttaatctatgcttaaactcttgaatttttgaacaattttttgcagacgacgtgttaagaacattccta----------tgcaaaa 11293889  T
Q  124 aattgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatc-tttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnn 222  Q
    ||||||||||||| || |||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||       
T  11293890 aattgttgcaaaattttatttctaagtccagattttgtttattttatcttttaacttttaccattttaaaaaattcatatttaattcgtttcatctt-aa 11293988  T
Q  223 nnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaact 322  Q
        |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11293989 aaaattctaaattttagtaaatgaacttttcatagtgttctaaacttgtgtaaaagaagtcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaact 11294088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 50 - 320
Target Start/End: Original strand, 45406698 - 45406955
Alignment:
Q  50 tgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacg 149  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||              ||||||| |||     
T  45406698 tgcttaaactcttaaatttttgaacaattttttgcagacatgtttagaacattactaaaagtttctccgcaaaat-------------ttgatttttaca 45406784  T
Q  150 tccagattttgttaatttta-tctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaac 248  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||       ||||||||||||||||||||||    
T  45406785 tccagattttgttacttttaatctttaacttttgtcgttttaaaaaattcatatttaattcgattcatgtt-agaaaattctaaattttagtaaatgaac 45406883  T
Q  249 ctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaa 320  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45406884 ctttcatagtgttctaaacttttcttataaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaa 45406955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 117729 - 117447
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||  | |  ||||||||| ||||||||||||||| | ||||||       
T  117729 tcaattcaaatttgtttaatttattcttaaactcttaagttttttaacaattttttttagatgtgttaagaacattactaaaagttccgccgcaaaat-- 117632  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
               |||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||           
T  117631 -----------ttgatttatatgtccatattttattacttttatctttaacttttattgttttcaaaaattcatttttaattcgtttcatgttaaaaaaa 117543  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    || ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||       || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  117542 tt-taaattttattaattgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaattcattcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 117447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 34 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 39562838 - 39562552
Alignment:
Q  34 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 133  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| || || |||||||||  ||| |||||| ||||| | |||||| | | |||    
T  39562838 aaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagtttttcaacaattttttacagacgtgttaagaacgttattaaaaggtcctccg-aaaaaaatatcgca 39562740  T
Q  134 aaaa-ttgatttatacgtccaga-ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttcta 231  Q
    |||| ||||||| |||||||| | |||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||       || ||    
T  39562739 aaaatttgatttctacgtccatatttttgttagttatatcttaaacttttgtcgttttaaaaaattcatatttaatttatttcatgtt-aaaaaattata 39562641  T
Q  232 aattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaa 320  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |        | ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39562640 gattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtataaaaagaattgttaaaaaatttaagagtttaaggataattaagcaaa 39562552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 24 - 213
Target Start/End: Original strand, 28685303 - 28685487
Alignment:
Q  24 tcatcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaa 123  Q
    ||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| | ||||    
T  28685303 tcatcaatttaaatgtgattaatttatgcttaaactcttaagtttttgaacaattatttgcagacgtgttaagaacattactaaaagttcctccgtaaaa 28685402  T
Q  124 aattgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgttt 213  Q
    |||     ||||| || ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28685403 aat-----caaaatttaatttatatgtccaaattttattaattttatctttaacttttaccgttttaaaaaattcatatttaattcgttt 28685487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 130 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 44557771 - 44557579
Alignment:
Q  130 tgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttc 229  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||        |     
T  44557771 tgcaaaatttgatttatatgtccatattttattacttttatctttaacttttattattttcaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaaaaat- 44557673  T
Q  230 taaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||       ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44557672 taaattttattaattgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaattcgttcaaaaatttaagagattaaggataattaaacaaactt 44557579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 34 - 320
Target Start/End: Original strand, 46295058 - 46295345
Alignment:
Q  34 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 133  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||| || || |||||||||  ||| |||||| ||||| | |||||| | | |||    
T  46295058 aaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagtttttcaacaaatttttacagacgtgttaagaacgttattaaaaggtcctccg-aaaaaaatatcgca 46295156  T
Q  134 aaaa-ttgatttatacgtccaga-ttttgttaattttatctttaac-ttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttct 230  Q
    |||| ||||||| |||||||| | |||||||| || |||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||       || |    
T  46295157 aaaatttgatttctacgtccatatttttgttacttatatcttaaactttttgtcgttttaaaaaattcatatttaatttatttaatgtt-aaaaaattat 46295255  T
Q  231 aaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaa 320  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |        ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  46295256 agattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtataaaaagaatcgttaaaaaatttaagagtttaaggataattaagcaaa 46295345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 27 - 256
Target Start/End: Original strand, 19601549 - 19601777
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||  |||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  19601549 tcaattcaaatttgtttaatt-atgtttaaactcttatgttttttaacattcttttgcaaacatgttaagaacattactaaaagttcctccacaaaaaat 19601647  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccaga-ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnn 225  Q
    | | |||||| || |||| ||| |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||||  |||| ||||          
T  19601648 tatcgcaaaatttaatttctacatccagatttttgttacttttatcttgaacttttgtcattttaaaacattcatatttaattaatttcgtgtt-aaaaa 19601746  T
Q  226 nttctaaattttagtaaatgaacctttcata 256  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19601747 attctaaattttagcaaatgaacctttcata 19601777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 27 - 274
Target Start/End: Original strand, 53439324 - 53439556
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||    || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  |    
T  53439324 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttacgttttttaacaattttttttcgacgtgttaagaacattactaaaagttcctccgcaaaattt 53439423  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
    |             ||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||           
T  53439424 t-------------atttatatgtccaaattttattacttttatctttaacttttatcgttttcaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaa 53439509  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctc 274  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  53439510 ttctaaa-tttagtaattgaacctttcatagtgttctaaacttttctc 53439556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 67 - 271
Target Start/End: Original strand, 25232695 - 25232900
Alignment:
Q  67 ttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccaga-ttttgttaat 165  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||| ||| ||| ||||||||| |  ||||| || |||||| |||||||| |||||||| |    
T  25232695 ttttgaacaattttttgcacaagtgttaagaacattacgaaaatttcatctacaaaaaattatctcaaaattttatttatgcgtccagatttttgttact 25232794  T
Q  166 tttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaa 265  Q
    ||||| || |||||||||  ||| |||||||||||||||||||  |||||||||       ||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||    
T  25232795 tttattttaaacttttgtcttttaaaaaaattcatatttaatttatttcatgttaaaaaatttctaaattttagtaaacgaaccttttctaatgttctaa 25232894  T
Q  266 ccttgt 271  Q
     |||||    
T  25232895 acttgt 25232900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 29 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 54269138 - 54268948
Alignment:
Q  29 aattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattg 128  Q
    |||| ||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||     
T  54269138 aattcaaatttggttaatt-atgcttaaactcttaagtttttgaacaattttttgcatgcgtgttaagaacattactaaaagttcctctgtaaaaaatta 54269040  T
Q  129 ttgcaaaaattgatttatacgtcc-agattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt 219  Q
    |  ||||| ||||||| || |||| |  |||||||  ||||||||| |  |||||| |||| |||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  54269039 tctcaaaatttgatttctaagtccaattttttgttgcttttatcttgattttttgtcgtttaaaaaaatttatatttaatttatttcatgtt 54268948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 29 - 208
Target Start/End: Original strand, 44555919 - 44556098
Alignment:
Q  29 aattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattg 128  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||     
T  44555919 aatttaaatttgtttaatt-atgcttaaacttttaagattttgaacaattttttgcacaagtgttaagaacattacgaaaagttcatctgcaaaaaatta 44556017  T
Q  129 ttgcaaaaattgatttatacgtccag-attttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaatt 208  Q
    |  ||||| || |||| | ||||||| |||||||||||||||| || |||||||||   || ||||||| |||||||||||    
T  44556018 tctcaaaattttatttctgcgtccagaattttgttaattttattttgaacttttgtctattaaaaaaatccatatttaatt 44556098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 34 - 271
Target Start/End: Original strand, 52701168 - 52701404
Alignment:
Q  34 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 133  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||||| || |  ||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||| |  ||    
T  52701168 aaatttgtttaatt-atgcttaaacttttaagattttgaacaattttttacacaagtgttaagaacattacgaaaagttcatctccaaaaaattatctca 52701266  T
Q  134 aaaattgatttatacgtccaga-ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaa 232  Q
    ||| || |||||| |||| ||| |||||||| |||||| || |||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||||||| |       ||||||    
T  52701267 aaattttatttatgcgtctagatttttgttacttttattttgaacttttgtcctttaaaaaaattcatatttaatttatttcatgct-aaataattctaa 52701365  T
Q  233 attttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgt 271  Q
    ||||||||||| ||||||||  || |||||||| |||||    
T  52701366 attttagtaaacgaaccttttgtaatgttctaaacttgt 52701404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 175 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 23921220 - 23921075
Alignment:
Q  175 aacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctc 274  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||       ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||| |||     
T  23921220 aacttttgtcgttttaaaaaattcatatttaattc-tttcatgttaaaaaa-ttctaaattttagaaaatgagcctttcatagtgttataaacttatct- 23921124  T
Q  275 nnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23921123 aaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 23921075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 64 - 181
Target Start/End: Original strand, 45387449 - 45387566
Alignment:
Q  64 agtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgtta 163  Q
    ||||||| |||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||| |||    
T  45387449 agttttttaacaattttttgtagacgtgttaagaacattactaaaagttcctacgcaaaaaattatcgcaaaatttgatttatatgtccagattttatta 45387548  T
Q  164 attttatctttaactttt 181  Q
     |||||||||| ||||||    
T  45387549 cttttatcttttactttt 45387566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 29 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 15772157 - 15772002
Alignment:
Q  29 aattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattg 128  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||| |||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||     
T  15772157 aattcaaatttgtttaatt-atgcttaaaatcttaagtttttaaacaattttttgtagacgtgttaagaacattactaaaagttcctccgcaaaaaatta 15772059  T
Q  129 ttgcaaaaattgatttatacgtccaga-ttttgttaattttatctttaacttttgtt 184  Q
    |  ||||| ||||||| |||||| | | |||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  15772058 tctcaaaatttgatttctacgtcgaaatttttgtttcttttatcttgaacttttgtt 15772002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 29 - 208
Target Start/End: Original strand, 33475471 - 33475650
Alignment:
Q  29 aattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattg 128  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||     
T  33475471 aatttaaatttgtttaatt-atgcttaaacttttaagattttgaacaattttttgcacaagtgttaagaacattacgaaaagttcatctacaaaaaatta 33475569  T
Q  129 ttgcaaaaattgatttatacgtccag-attttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaatt 208  Q
    |  ||||| || |||| ||||||||| ||||||||| |||||| || |||||||||   || ||||||| |||||||||||    
T  33475570 tcacaaaattttatttctacgtccagaattttgttacttttattttgaacttttgtctattaaaaaaatccatatttaatt 33475650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 60 - 320
Target Start/End: Original strand, 34995564 - 34995823
Alignment:
Q  60 cttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccagatttt 159  Q
    |||||||||||||||||||||||  | || |||| | || ||||||||||||| |||  | |||||||  | ||||||||||||| |||||||| |  ||    
T  34995564 cttgagtttttgaacaattttttatagacgtgttcaaaacattactaaaagttgctccacgaaaaattagttcaaaaattgatttctacgtcca-agctt 34995662  T
Q  160 gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtg 259  Q
    || | ||||||||| || ||||||  ||| |||||| ||||||||||||| | |||||||       |||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  34995663 gtgacttttatcttgaaattttgtcatttaaaaaaaatcatatttaattcatctcatgtt-aaaaaattctaaattttagtaaatgaaccttttataatg 34995761  T
Q  260 ttctaaccttgtct-cnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaa 320  Q
    ||||||   ||| | |       |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34995762 ttctaaaagtgtttccaaaaaaatcgttctaaaatttaatagtttaaggataattaaacaaa 34995823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 34 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 33476477 - 33476241
Alignment:
Q  34 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 133  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||| |  | ||||||| || || |||||||  ||||||||||||| |  ||    
T  33476477 aaatttgtttaatt-atgcttaaacttttaagattttgaacaattttttgcacaggtattaagaacatcacgaaaagtttatctgcaaaaaattatctca 33476379  T
Q  134 aaaattgatttatacgtccaga-ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaa 232  Q
    ||| || ||| || |||||||| |||| ||| |||||| || |||||||||  ||| |||||||| ||||||||||  |||||||||       ||||||    
T  33476378 aaattttattcatgcgtccagattttttttacttttattttgaacttttgtcttttaaaaaaatttatatttaatttatttcatgtt-aaaaaattctaa 33476280  T
Q  233 attttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgt 271  Q
    ||||||||||| ||||||||  || |||||||| |||||    
T  33476279 attttagtaaacgaacctttagtaatgttctaaacttgt 33476241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 29 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 3173802 - 3173707
Alignment:
Q  29 aattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaa 124  Q
    |||| |||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  3173802 aattcaaatttgtttaatttatgattaaattcttgaatttttgaacaattttttgcagacgcgttaagaacattactataagtttctctgcaaaaa 3173707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 132 - 261
Target Start/End: Original strand, 9018125 - 9018253
Alignment:
Q  132 caaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttcta 231  Q
    ||||| ||||||| ||| |||| |||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||       |||||    
T  9018125 caaaatttgatttttacttccatatttttgttattttatctttaacttttgtcgttttaaaaaattcatattgaatttatttcatgtt-aaaaaattcta 9018223  T
Q  232 aattttagtaaatgaacctttcatagtgtt 261  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  9018224 aatttttgtaaatgaacctttcacagtgtt 9018253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 65 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 26268826 - 26268683
Alignment:
Q  65 gtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccaga-ttttgtta 163  Q
    ||||| ||||||||||||| | || | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    ||||| ||||||| |||| ||| | |||| |||    
T  26268826 gttttcgaacaattttttgtagacgtattaagaacattactaaaagtttctctgcaaaaaattagctcaaaatttgatttctacgcccatatttttatta 26268727  T
Q  164 attttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattc 209  Q
     ||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  26268726 cttttatcttgaacttttgtcg--ttaaaaaattcatatttaattc 26268683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 34 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 41928126 - 41927953
Alignment:
Q  34 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgtt-aagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgc 132  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||| |  |||| ||||| ||||| |||||||| | ||||||||||| |  |    
T  41928126 aaatttgtttaatt-atgcttaaacttttaagattttgaacaattttttgcacaagtgttaaagaacattacgaaaagttcatatgcaaaaaattatatc 41928028  T
Q  133 aaaaattgatttatacgtccaga-ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaatt 208  Q
    |||| || |||| | |||||| | |||||||| |||||| || |||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  41928027 aaaattttatttctgcgtccaaatttttgttacttttattttgaacttttgt--ctttaaaaaattcatatttaatt 41927953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 34 - 139
Target Start/End: Original strand, 53377329 - 53377436
Alignment:
Q  34 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgtt--aagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttg 131  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| || ||||  ||||| |||| |||||||||||  || ||||||| | |    
T  53377329 aaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagtttttgaacaattgtttgcagacgtgttaaaagaacattaataaaagttccttcgcgaaaaattatcg 53377428  T
Q  132 caaaaatt 139  Q
    ||||||||    
T  53377429 caaaaatt 53377436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 27 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 37481351 - 37481253
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttga-gtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaa 124  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||||||  | |  ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  37481351 tcaatttaaatttgtttaatttatgcttaaactcttaatgttttttaacaattttttatagatgtgttaagaacattactaaaagttcctccgcaaaaa 37481253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 8576191 - 8575953
Alignment:
Q  34 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatatt-actaaaagttcctctgcaaaaaattgttgc 132  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||| || || ||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||| |  |||||||| | ||||||||||| |  |    
T  8576191 aaatttgtttaatt-atgtttaaacttttaagattttgaacaattttttgcacaagtgttaagaacatttaggaaaagttcatatgcaaaaaattatctc 8576093  T
Q  133 aaaaattgatttatacgtccagatttt-gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaa-ttcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttct 230  Q
    |||| || |||| |  ||| ||||||| |||| |||||| || |||||||||  ||| |||||| |||||||||||||| |||||||||       ||||    
T  8576092 aaaattttatttctgtgtctagatttttgttacttttattttgaacttttgtcttttaaaaaaaattcatatttaattcatttcatgtt-aaaaaattct 8575994  T
Q  231 aaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgt 271  Q
    ||||||||||||| |||||| |  || |||||||| |||||    
T  8575993 aaattttagtaaacgaacctcttgtaatgttctaaacttgt 8575953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 219
Target Start/End: Original strand, 31991074 - 31991259
Alignment:
Q  34 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 133  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||| || || ||||||||||||||||||| |  |||||| || ||||| |||||||  | |||||||| || |  ||    
T  31991074 aaatttgtttaatt-atgtttaaacttttaagattttgaacaattttttgcacaagtgttaaaaacattacgaaaagtttatttgcaaaaacttatctca 31991172  T
Q  134 aaaattgatttatacgtccaga-ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt 219  Q
    ||| || |||| | |||||| | |||||||| |||||| || |||||||||  ||| ||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  31991173 aaattttatttctgcgtccaaatttttgttacttttattttgaacttttgtcttttaaaaaaattcttatttaatttatttcatgtt 31991259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 83
Target Start/End: Original strand, 116924 - 116980
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttg 83  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  116924 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagttttttaacaattttttg 116980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 130 - 271
Target Start/End: Original strand, 41927360 - 41927501
Alignment:
Q  130 tgcaaaaattgatttatacgtccagatttt-gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnntt 228  Q
    |||||||||| |||| | |||||||||||| |||| |||||| || |||||||||  ||| |||||||||||||||||||  |||||||||       ||    
T  41927360 tgcaaaaatttatttctgcgtccagatttttgttacttttattttgaacttttgtcttttaaaaaaattcatatttaatttatttcatgtt-aaaaaatt 41927458  T
Q  229 ctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgt 271  Q
    |||||||| |||||| ||||||||  || |||||||| |||||    
T  41927459 ctaaatttcagtaaacgaaccttttgtaatgttctaaacttgt 41927501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 44287933 - 44287768
Alignment:
Q  156 ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcat 255  Q
    |||||||| ||||||||| ||| || || |||| |||||||||||||||||||| |||||||||       ||||||||||||| ||||||||||| | |    
T  44287933 ttttgttacttttatcttaaaccttcgtcgtttaaaaaaattcatatttaattcatttcatgtt-aaaaaattctaaattttagcaaatgaaccttccgt 44287835  T
Q  256 agtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
      | ||||||  ||| |||       ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  44287834 gatattctaaaattgactcaaaaaaatcgttcaaaaa-ttatgaatttaaggataattaaacaaactt 44287768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 83
Target Start/End: Original strand, 44555364 - 44555420
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttg 83  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  44555364 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagttttttaacaattttttg 44555420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 83
Target Start/End: Original strand, 50614546 - 50614602
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttg 83  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  50614546 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagttttttaacaattttttg 50614602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 265
Target Start/End: Original strand, 53377430 - 53377503
Alignment:
Q  191 aaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaa 265  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||       |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  53377430 aaaaattcatatttaattcgttccatgttagaaaa-ttctaaattttagtaaatgaacctttcagagtgttctaa 53377503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 282 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 54268895 - 54268854
Alignment:
Q  282 tcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  54268895 tcgttcaaaaatttaaaagtttaaggataattaaacaaactt 54268854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 227 - 316
Target Start/End: Original strand, 8575377 - 8575466
Alignment:
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaa 316  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||| ||||| ||       ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8575377 ttctaaattttagtaaacgaaccttttgtaatgttctaaacttgtatcaaaaaattcgttaaaaaatttaagagtttaaggatagttaaa 8575466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 57 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 44288028 - 44287969
Alignment:
Q  57 actcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctc 116  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||  || || ||||||||| |||||||||||||||||    
T  44288028 actcttaagtttttgaacaacttttgacagacgtgttaagaacattactaaaagttcctc 44287969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 34 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 52701947 - 52701897
Alignment:
Q  34 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgca 85  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  52701947 aaatttgtttaatt-atgcttaaactcttaagattttgaacaattttttgca 52701897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 156 - 219
Target Start/End: Original strand, 55006177 - 55006240
Alignment:
Q  156 ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt 219  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||| | ||||||||||| || ||||||    
T  55006177 ttttgttagttttatcttgaatttttggtgttttaaaaaaattatatttaattcattacatgtt 55006240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 208
Target Start/End: Original strand, 53520018 - 53520120
Alignment:
Q  107 aaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccaga-ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatattta 205  Q
    |||||| || ||||||||||| |  ||||||||||||| || ||||| | |||| ||| ||| |||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||    
T  53520018 aaagtttctttgcaaaaaattatgtcaaaaattgatttttaggtccaaagttttattattttaatctttaattttttgtgtttagaaaaattcatattta 53520117  T
Q  206 att 208  Q
    |||    
T  53520118 att 53520120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 320
Target Start/End: Original strand, 9018280 - 9018313
Alignment:
Q  287 caaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaa 320  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9018280 caaaaatttaagagtttaagtataattaaacaaa 9018313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 290 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 15771936 - 15771903
Alignment:
Q  290 aaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15771936 aaatataagagtttaaggataattaaacaaactt 15771903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 53658086 - 53658029
Alignment:
Q  155 attttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtt 212  Q
    ||||||||| ||||||||| || |||||  ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  53658086 attttgttagttttatcttgaatttttggcgttttaaaaaaattatatttaattcgtt 53658029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 284 - 320
Target Start/End: Original strand, 20078100 - 20078136
Alignment:
Q  284 gttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaa 320  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  20078100 gttcaaaaattgaagagtttaagaataattaaacaaa 20078136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 66 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 44557822 - 44557774
Alignment:
Q  66 tttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcc 114  Q
    ||||| |||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||    
T  44557822 ttttttaacaattttttgtagacgtgttaagaacattactaaaagttcc 44557774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0651 (Bit Score: 160; Significance: 3e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0651
Description:

Target: scaffold0651; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 34 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 7151 - 6862
Alignment:
Q  34 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 133  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| || |||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  7151 aaatttgtttaatttatgcttaaactcttgagttttttaacaattttttgtagacgtgttaaaaacattactaaaagttcctctgcaaaaaattatcgca 7052  T
Q  134 aaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaa 233  Q
    ||| |||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||       |||||||    
T  7051 aaatttgatttatatgtccaaattttattatttttatctttaatttttatcgttttcaaaaattcatatttaatttgtttcatgttaaaaaaattctaaa 6952  T
Q  234 ttttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||       ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6951 ttttagtaattgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaaatcgttcagaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 6862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 156; Significance: 8e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 29 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 17669 - 17377
Alignment:
Q  29 aattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattg 128  Q
    |||| |||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||     
T  17669 aattcaaatttgtttaatttatagttaaactcttaagtttttgaacaattttttgtagacgtgttaagaacattactaaaagttcctccgtaaaaaatta 17570  T
Q  129 ttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnntt 228  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       ||    
T  17569 ttgcaaaatttgatttttaagtccagattttattacttttatctttaacttttgttgttttaaaaaaatcatatttaattcgtttcatgtt--aaaaatt 17472  T
Q  229 ctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||||       || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17471 ctaaattttagtaaatgaatctatcatggtgttctaaacttgtctcaaaaaaatctttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 17377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1160 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold1160
Description:

Target: scaffold1160; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 29 - 323
Target Start/End: Original strand, 1159 - 1455
Alignment:
Q  29 aattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattg 128  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||| |||||| || ||||||||||||    
T  1159 aattcaaatttgttttatttatgcttaaactcatgagtttttgaacaattttttgcagacgtgttaagaacattacttaaagtttctttgcaaaaaattg 1258  T
Q  129 ttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttt---taaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnn 225  Q
    | |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    |||    |||||| |||||||||||||||||||||||          
T  1259 tcgcaaaatttgatttctacgtccagattttgttaattttatctttagcttttaccatttaaaaaaaaaaatcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaa 1357  T
Q  226 nttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1358 attctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgcctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 1455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 146; Significance: 7e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Original strand, 35273 - 35568
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| | || ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||    
T  35273 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagttttttaacaattttttgtagacgtgttaagaacattagtaaaagttcctccgcaaaaaat 35372  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
    | |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||           
T  35373 tattgcaaaatttgatttatatgtccagattttattacttttatctttaacttttatcgttttcaaaaatttatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaa 35471  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||||| ||||| ||       |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35472 ttctaaattttagtaattgaacctttcataataatctaaacttgtttcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagactttaaggataattaaacaaactt 35568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 27 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 38674 - 38618
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttg 83  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  38674 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttgaactcttaagttttttaacaattttttg 38618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1191 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold1191
Description:

Target: scaffold1191; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Original strand, 669 - 964
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||| ||||| | ||||    
T  669 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttgagtttttgaacaattttttgcagacgtgataagaacattactaaaagttcatctgc-acaaat 767  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
    ||| |||||| ||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||           
T  768 tgtcgcaaaatttgatttttgagtccagaatttgttaattttatctttaacttttttcattttaaaaaattcatatttaattcgtttcatctt-aaaaaa 866  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtct-cnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||         ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  867 ttctaaattttagtaaatgaaccttttatagtgttctaaacttatctaaaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaagaataatcaaacaaactt 964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0707 (Bit Score: 131; Significance: 7e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0707
Description:

Target: scaffold0707; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 34 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 7188 - 6950
Alignment:
Q  34 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 133  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||  ||    
T  7188 aaatttgtttaatgtatgcttatactcttgagtttttgaacaattttttgcagacgtgttaaaaacattactaaaagttcatctgcaaaaaattgtcaca 7089  T
Q  134 aaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaa 233  Q
    ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||       |||||||    
T  7088 aaatttgatttctacgtccaaattttgttaattttatctttaacttttgccgttttaaaaaattcatatttaattcattttaggtt--aaaaattctaaa 6991  T
Q  234 ttttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctc 274  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6990 ttttagttaataaacctttcatagtgttctaaacttgtctc 6950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0562 (Bit Score: 126; Significance: 6e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0562
Description:

Target: scaffold0562; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 100 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 4193 - 3974
Alignment:
Q  100 attactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattca 199  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  4193 attactaaaagttcctatgcaaaaaattgtcgcaaaatttgatttctacgtacaggttttgttaattttatctttaactttttccgttttaaaaaattca 4094  T
Q  200 tatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaaga 299  Q
    ||||||||| ||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||       |||||||||||| |||||    
T  4093 tatttaatttgtttcatgtt-aaaaaattctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaatgtaaga 3995  T
Q  300 gtttaaggataattaaacaaa 320  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  3994 gtttaaggataattaaacaaa 3974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0562; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 27 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 4287 - 4216
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaa 98  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  4287 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttgagtttttgaacaattttttacaggcatgttaagaa 4216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0097 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 3)
Name: scaffold0097
Description:

Target: scaffold0097; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 25339 - 25057
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||| |  || |||||    
T  25339 tcaattcaaatttgtttaatttattcttaaactcttaagttttttaacaattttttgtagacgtgttaagaacattactaaaagttccgc--cacaaaat 25242  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
    |           ||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||           
T  25241 t-----------tgatttatatgtccatattttattacttttatctttaacttttattgttttcaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaaa- 25154  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||       |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25153 ttctaaattttattaattgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaattcgttcaaaaatttaagagtttaacgataattaaacaaactt 25057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0097; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Original strand, 23787 - 24074
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaa-acatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaa 125  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||    ||||||| |||||||||||   | || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  23787 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaacta---agttttttaacaatttttttatagacgtgttaagaacattactaaaagttcctccgcaaaaaa 23883  T
Q  126 ttgtt-gcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnn 224  Q
     |  | |||||| |||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||         
T  23884 ataatcgcaaaatttgatttatatgttcagattttattacttttatctttaacttttatcgttttcaaaaattcatatttaattcatttcaaatt-aaaa 23982  T
Q  225 nnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
      |||||||||||||||| ||||||       ||||||||| ||||||||       ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  23983 aattctaaattttagtaattgaacc-------gtgttctaaacttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaaaataattaaacaaactt 24074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0097; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 27 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 23164 - 23066
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaa 125  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||   || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  23164 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagttttctaacaattttttgttgacgtgttaagaacattactaaaagttcctccgcaaaaaa 23066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0514 (Bit Score: 114; Significance: 9e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0514
Description:

Target: scaffold0514; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 27 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 6470 - 6197
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  6470 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttgagtttttcaacaattttttggagacgtgttaagaacattactaaaagttcatctacaaaaaat 6371  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaa--ttcgtttcatgttnnnnn 224  Q
    ||| |||||| ||||||| || | ||| | |||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||  ||  |||||||||         
T  6370 tgtcgcaaaatttgatttctaggcccaaactttgttaa-tttatctttaatttttctggttttaaaaaaatcatatttaatttttttttcatgtt-aaaa 6273  T
Q  225 nnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagag 300  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||       |||||||||||||||||||    
T  6272 aattctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgcctcgaaaaaatcgttcaaaaatttaagag 6197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0627 (Bit Score: 111; Significance: 6e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0627
Description:

Target: scaffold0627; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Original strand, 6931 - 7227
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| | ||||| || | ||||||||   |||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  6931 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaattcttaaattttttaatagttttttgctggcatgtttagaacattactaaaagtttctccgcaaaaaat 7030  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaa-ttttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnn 225  Q
    | | |||||| ||||||| ||| |||| |||||||||| |||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||          
T  7031 tatagcaaaatttgatttctacatccaaattttgttaatttttatatttaacttttatctttttaaaaaattcatatttaatttgtttcgtgtt-agaaa 7129  T
Q  226 nttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||       || || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7130 attctaaattttagtaaatgaacttttcatattgttctaaacttgtctcaaaaaaatcattaaaaaatttaagagtttaatgataattaaacaaactt 7227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1190 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold1190
Description:

Target: scaffold1190; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 486 - 202
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  486 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaacacatgagtttttgaacaattttttggagacgtgttaagaacattactaaaagttcctctgcaaaaaat 387  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaa-ttcgtttcatgttnnnnnn 225  Q
    |||  ||||| ||||||| || | |||||||||||||||            |||||| ||||| ||||| | |||||||| ||  |||||| ||          
T  386 tgtcacaaaatttgatttctaggcccagattttgttaat------------ttttgtcgttttcaaaaaattatatttaattttttttcat-tttaaaaa 300  T
Q  226 nttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  299 attctaaattttagtaaatgaacctttcgtagtgttctgaacttgtctcgaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 106; Significance: 5e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 126 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 158223 - 158028
Alignment:
Q  126 ttgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnn 225  Q
    |||| |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |          
T  158223 ttgtcgcaaaatttaatttctacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgccgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatggt-aaaaa 158125  T
Q  226 nttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||       ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  158124 attctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtctc-aaaaaatcgttcaaaaattgaagagtttaaggagaattaaacaaactt 158028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 240294 - 240012
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||  | |  ||||||||| ||||||||||||||| | ||||||       
T  240294 tcaattcaaatttgtttaatttattcttaaactcttaagttttttaacaattttttttagatgtgttaagaacattactaaaagttccgccgcaaaat-- 240197  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 226  Q
               ||||| |||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||           
T  240196 -----------ttgatctatatgtccatattttattacttttatctttaacttttattgttttcaaatattcatatttaattcgtttcatgttaaaaaa- 240109  T
Q  227 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||       |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  240108 ttctaaattttattaattgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaagtcgttcaaaaatttaacagttgaaggataattaaacaaactt 240012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 83
Target Start/End: Original strand, 239492 - 239548
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttg 83  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  239492 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagttttttaacaattttttg 239548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0640 (Bit Score: 94; Significance: 8e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0640
Description:

Target: scaffold0640; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 34 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 4181 - 3895
Alignment:
Q  34 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 133  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||  ||| |||||  |||||   |||||| | |  ||    
T  4181 aaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagtttttcaacaattttttacagacatgttaagaacgttattaaaacgtcctc-caaaaaaaatatcaca 4083  T
Q  134 aaaa-ttgatttatacgtccaga-ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttcta 231  Q
    |||| ||||||| ||||| || | |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||       || ||    
T  4082 aaaatttgatttctacgttcatatttttgttacttatatcttaaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaatttatttcatgtt-aaaaaattata 3984  T
Q  232 aattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaa 320  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |        ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3983 gattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtataaaaagaatcgttaaaaaatttaagagtttaaggataattaagcaaa 3895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0385 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0385
Description:

Target: scaffold0385; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 10245 - 9960
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||  ||||||||||| | || ||||||||| |||| |||||||||| | ||||||       
T  10245 tcaattcaaatttgtttaatttattcttaaactcttaagtttttttacaattttttgtagacgtgttaagaacattattaaaagttccgccgcaaaat-- 10148  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-nnnnnn 225  Q
               |||||||||| ||||| ||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||           
T  10147 -----------ttgatttatatgtccatattttattgtttttatctttaacttttattgttttcaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaaaa 10059  T
Q  226 nttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctc-nnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
        ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||        || || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10058 aaattaaattttattaattgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaaattcattaaaaaatttaagagtttaagaataattaaacaaactt 9960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0385; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 83
Target Start/End: Original strand, 9424 - 9479
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttg 83  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  9424 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaact-ttaagttttttaacaattttttg 9479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0571 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0571
Description:

Target: scaffold0571; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 27 - 173
Target Start/End: Original strand, 8430 - 8575
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| || ||| |||||||||| ||||| | ||||    
T  8430 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttgagtttttgaacaattttttgtagacatggtaacaacattgctaaaagttcatctgc-acaaat 8528  T
Q  127 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctt 173  Q
    ||| |||||| ||||||| | |||||| |||||||||||||||||||    
T  8529 tgtcgcaaaatttgatttttgcgtccaaattttgttaattttatctt 8575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0571; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 185 - 323
Target Start/End: Original strand, 8610 - 8748
Alignment:
Q  185 gttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacc-tttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntc 283  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||       ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||        ||    
T  8610 gttttaagaaattcatatttaattcgtttcatcttaaaaaa-ttctaaattttagtaaatgaaccttttcatagtgttctaaccttatctaaaaaaaatc 8708  T
Q  284 gttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  8709 gttcaaaaatttaagaatttaagaataatcaaacaaactt 8748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 186 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 21886 - 21750
Alignment:
Q  186 ttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgt 285  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||       ||||    
T  21886 ttttaagaaattcaaatttaattcgtttcatgttagaaaa-ttctaaattttagtaaatgaaccttttatagtgttctaaacttgtctcgaaaaaatcgt 21788  T
Q  286 tcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21787 tcaaaaatttaaaagtttaaggataattaaacaaactt 21750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0199
Description:

Target: scaffold0199; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 27 - 124
Target Start/End: Original strand, 6204 - 6301
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaa 124  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  6204 tcaattcaaatatgtttaatttatgcttaaacttttaagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaacgttactaaaagttcctcagcaaaaa 6301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 141 - 183
Target Start/End: Original strand, 6305 - 6347
Alignment:
Q  141 atttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgt 183  Q
    |||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6305 atttctatgtccagattttgttacttttatctttaacttttgt 6347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0734 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0734
Description:

Target: scaffold0734; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 34 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 3436 - 3260
Alignment:
Q  34 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttg-caaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgc 132  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||  || || |||||||||  ||| |||||| ||||| | |||||||  | ||    
T  3436 aaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagtttttcaacaatttttttacagacgtgttaagaacgttattaaaagatcctccgaaaaaaata-tcgc 3338  T
Q  133 aaaaatt-gatttatacgtccagatttt-gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaatt 208  Q
    ||||||| ||||| ||| |||| ||||| |||| || |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3337 aaaaatttgatttctacatccatatttttgttacttatatcttaaacttttgtcgttttaaaaaattcatatttaatt 3260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0734; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 2941 - 2854
Alignment:
Q  233 attttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaa 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |        ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2941 attttagtaaatgaacctttcatagtgtgctaaacttgtataaaaagaatcgttaaaaaatttaagagtttaacgataattaaacaaa 2854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0024
Description:

Target: scaffold0024; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 132 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 48041 - 47860
Alignment:
Q  132 caaaaattgatttatacgtccagat-tttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttct 230  Q
    ||||| || |||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| |||||||||       ||||    
T  48041 caaaattttatttctacgtccggatatttgttacttttatcttgaacttttgtcgttt-aaaaaatttatatttaattcatttcatgtt-aaaaaattct 47944  T
Q  231 aaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatta 314  Q
    ||||||||| ||| |||||| |  || |||||||| ||||||||       | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47943 aaattttagaaaacgaacctcttgtaatgttctaaacttgtctcaagaaaattgttcaaaaatttaagagtttaaggataatta 47860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 27 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 49053 - 48967
Alignment:
Q  27 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttc 113  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||    
T  49053 tcaattcaaatttgtttaatttattcttaaactcttaagttttttaacaattttttgtagacgtgttaagaacattactaaaagttc 48967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 34 - 170
Target Start/End: Original strand, 282940 - 283076
Alignment:
Q  34 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 133  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |  ||    
T  282940 aaatttgtttaatt-atgcttaaacttttaagattttgaacaattttttgcacaagtgttaagaacattacgaaaagttcatctgcaaaaaattatctca 283038  T
Q  134 aaaattgatttatacgtccag-attttgttaattttat 170  Q
    ||| || |||| | ||||||| ||||||||| ||||||    
T  283039 aaattttatttctgcgtccagaattttgttacttttat 283076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 34 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 283525 - 283308
Alignment:
Q  34 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 133  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||| |  | ||||||| || || |||| ||  ||||||||||||| |  ||    
T  283525 aaatttgtttaatt-atgcttaaacttttaagattttgaacaattttttgcacaagtattaagaacatcacgaaaattttatctgcaaaaaattatctca 283427  T
Q  134 aaaattgatttatacgtccagatttt-gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaa 232  Q
    ||| |  |||  | |||||||||||| |||| |||||| || |||||||||  ||| |||||||||||||||||||  |||||||||       ||||||    
T  283426 aaattgtattcctgcgtccagatttttgttacttttattttgaacttttgtcttttaaaaaaattcatatttaatttatttcatgtt-aaaaaattctaa 283328  T
Q  233 attttagtaaatgaaccttt 252  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  283327 attttagtaaacgaaccttt 283308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 190 - 323
Target Start/End: Original strand, 52512 - 52645
Alignment:
Q  190 aaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtc-tcnnnnnnntcgttca 288  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||       | |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| || |         |||||     
T  52512 aaaaaattcatatttaattcatttcaagttaaaaaaat-ctaaattttagtaaatgaaccttttataatgttctaaacttatcttagaaaaaaccgttcc 52610  T
Q  289 aaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 323  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  52611 aaaatttacgagtctaaggataattaaacaaactt 52645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 123351 - 123298
Alignment:
Q  156 ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattc 209  Q
    |||||||| ||||||||| ||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  123351 ttttgttacttttatcttaaacatttgctgtttgaaaaaatttatatttaattc 123298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University