View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF21669_high_3 (Length: 494)

Name: NF21669_high_3
Description: NF21669
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF21669_high_3
NF21669_high_3
[»] chr7 (55 HSPs)
chr7 (27-474)||(14956459-14956906)
chr7 (27-474)||(11551020-11551467)
chr7 (27-474)||(12689407-12689854)
chr7 (27-474)||(11235131-11235578)
chr7 (27-474)||(15158975-15159422)
chr7 (27-474)||(8709510-8709957)
chr7 (27-474)||(14334301-14334748)
chr7 (27-474)||(10872595-10873042)
chr7 (26-474)||(15267-15715)
chr7 (27-466)||(44789269-44789708)
chr7 (27-468)||(18179656-18180097)
chr7 (27-397)||(13688023-13688393)
chr7 (26-468)||(15146801-15147244)
chr7 (27-373)||(18588089-18588435)
chr7 (30-462)||(14041612-14042044)
chr7 (30-462)||(14351642-14352074)
chr7 (26-268)||(9590479-9590721)
chr7 (27-468)||(48813170-48813610)
chr7 (26-468)||(15100498-15100940)
chr7 (48-468)||(12204717-12205137)
chr7 (48-468)||(15626436-15626856)
chr7 (48-467)||(14262162-14262580)
chr7 (48-468)||(19149123-19149541)
chr7 (48-468)||(20748522-20748940)
chr7 (56-468)||(16070222-16070632)
chr7 (30-474)||(14139585-14140029)
chr7 (26-468)||(13675364-13675806)
chr7 (48-468)||(16948389-16948809)
chr7 (30-474)||(23503769-23504213)
chr7 (26-468)||(13023269-13023711)
chr7 (303-468)||(11770435-11770600)
chr7 (26-468)||(11386324-11386766)
chr7 (26-433)||(12458587-12458994)
chr7 (26-433)||(13966563-13966970)
chr7 (26-468)||(15342343-15342785)
chr7 (26-468)||(19614587-19615029)
chr7 (30-474)||(18051852-18052296)
chr7 (26-433)||(26116485-26116892)
chr7 (26-468)||(26092693-26093135)
chr7 (26-468)||(49154213-49154655)
chr7 (159-468)||(14284404-14284713)
chr7 (27-467)||(7825812-7826252)
chr7 (27-467)||(27105692-27106132)
chr7 (27-467)||(27172193-27172633)
chr7 (26-468)||(11301108-11301550)
chr7 (375-474)||(14213579-14213678)
chr7 (389-474)||(8200533-8200618)
chr7 (27-130)||(11770320-11770423)
chr7 (26-86)||(16727300-16727360)
chr7 (26-86)||(17704372-17704432)
chr7 (421-474)||(13687969-13688022)
chr7 (27-157)||(4442150-4442280)
chr7 (173-326)||(39210-39363)
chr7 (28-150)||(17925879-17926001)
chr7 (27-92)||(13379170-13379235)
[»] chr2 (44 HSPs)
chr2 (27-474)||(21143490-21143937)
chr2 (27-474)||(24875199-24875646)
chr2 (27-466)||(44384019-44384458)
chr2 (27-467)||(41606834-41607274)
chr2 (27-474)||(24263917-24264364)
chr2 (27-474)||(27372816-27373263)
chr2 (27-466)||(16926915-16927354)
chr2 (27-466)||(17000555-17000994)
chr2 (28-474)||(24711581-24712027)
chr2 (27-474)||(9485763-9486210)
chr2 (27-466)||(10870405-10870844)
chr2 (27-466)||(27219571-27220010)
chr2 (27-468)||(21323715-21324156)
chr2 (26-474)||(24677036-24677484)
chr2 (27-474)||(24705931-24706378)
chr2 (60-474)||(23189466-23189879)
chr2 (27-397)||(9337206-9337576)
chr2 (30-468)||(22734226-22734664)
chr2 (27-468)||(23106177-23106618)
chr2 (27-468)||(23073416-23073857)
chr2 (27-468)||(24818679-24819120)
chr2 (48-467)||(23112290-23112712)
chr2 (26-468)||(19650498-19650940)
chr2 (302-474)||(22323580-22323752)
chr2 (26-283)||(25255657-25255914)
chr2 (30-474)||(27789287-27789731)
chr2 (30-474)||(12575900-12576344)
chr2 (26-468)||(23098466-23098908)
chr2 (26-457)||(23278340-23278771)
chr2 (48-451)||(30209387-30209790)
chr2 (26-388)||(1065384-1065746)
chr2 (48-468)||(30010654-30011074)
chr2 (26-433)||(19717465-19717872)
chr2 (26-433)||(31832246-31832653)
chr2 (120-457)||(24950154-24950491)
chr2 (306-468)||(25264607-25264769)
chr2 (208-468)||(27208802-27209062)
chr2 (251-457)||(23295499-23295705)
chr2 (27-467)||(24829637-24830077)
chr2 (348-468)||(45534493-45534613)
chr2 (60-125)||(23611069-23611134)
chr2 (30-104)||(22280022-22280096)
chr2 (26-62)||(23204273-23204309)
chr2 (27-91)||(25130539-25130603)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (27-474)||(9313-9760)
[»] chr6 (60 HSPs)
chr6 (27-474)||(22828409-22828856)
chr6 (27-466)||(25114340-25114779)
chr6 (28-467)||(24293837-24294276)
chr6 (27-466)||(2872857-2873296)
chr6 (26-474)||(19866467-19866915)
chr6 (26-474)||(27563886-27564334)
chr6 (27-466)||(28261251-28261690)
chr6 (27-466)||(28284226-28284665)
chr6 (27-466)||(28340000-28340439)
chr6 (27-466)||(27189224-27189663)
chr6 (27-466)||(27259577-27260016)
chr6 (26-474)||(22435649-22436097)
chr6 (26-468)||(16925692-16926133)
chr6 (28-468)||(16961537-16961977)
chr6 (26-468)||(5837272-5837714)
chr6 (42-468)||(25763297-25763723)
chr6 (22-465)||(22760504-22760947)
chr6 (27-468)||(20633994-20634435)
chr6 (30-468)||(25607918-25608356)
chr6 (106-474)||(22444047-22444415)
chr6 (27-468)||(18405998-18406439)
chr6 (27-265)||(16573879-16574117)
chr6 (27-265)||(16621263-16621501)
chr6 (163-465)||(23080258-23080560)
chr6 (27-406)||(23085825-23086204)
chr6 (26-468)||(25769630-25770072)
chr6 (28-269)||(18183422-18183663)
chr6 (51-468)||(19881084-19881501)
chr6 (48-468)||(14377991-14378411)
chr6 (48-468)||(14379541-14379961)
chr6 (26-185)||(21755002-21755160)
chr6 (26-457)||(19454821-19455251)
chr6 (26-457)||(21473398-21473828)
chr6 (27-468)||(15461122-15461563)
chr6 (26-470)||(10466902-10467346)
chr6 (48-468)||(18796476-18796896)
chr6 (27-270)||(18963142-18963385)
chr6 (264-468)||(18196024-18196228)
chr6 (30-474)||(28280870-28281314)
chr6 (26-468)||(34643639-34644081)
chr6 (26-380)||(19436876-19437230)
chr6 (27-467)||(16380427-16380867)
chr6 (26-433)||(24366233-24366640)
chr6 (27-181)||(30679061-30679215)
chr6 (307-468)||(18965629-18965790)
chr6 (26-235)||(24516461-24516670)
chr6 (27-467)||(16648023-16648463)
chr6 (219-468)||(19487528-19487767)
chr6 (28-468)||(21568046-21568486)
chr6 (27-467)||(23998035-23998475)
chr6 (27-467)||(1646868-1647308)
chr6 (27-118)||(23080559-23080650)
chr6 (26-151)||(8761805-8761930)
chr6 (340-468)||(5295573-5295701)
chr6 (55-468)||(18450289-18450702)
chr6 (27-150)||(14130573-14130696)
chr6 (27-150)||(23025800-23025923)
chr6 (27-65)||(28311819-28311857)
chr6 (26-62)||(23496245-23496281)
chr6 (27-150)||(16100119-16100242)
[»] chr4 (42 HSPs)
chr4 (27-474)||(14682483-14682930)
chr4 (27-474)||(14301628-14302075)
chr4 (27-474)||(40474956-40475403)
chr4 (27-474)||(8051272-8051719)
chr4 (27-474)||(12478516-12478963)
chr4 (27-474)||(19776442-19776889)
chr4 (27-474)||(23957663-23958110)
chr4 (27-466)||(8388336-8388775)
chr4 (27-474)||(27713252-27713699)
chr4 (26-474)||(18225094-18225542)
chr4 (26-474)||(15145541-15145981)
chr4 (27-398)||(16234641-16235012)
chr4 (27-395)||(17092798-17093166)
chr4 (112-474)||(16353241-16353604)
chr4 (27-468)||(14849015-14849456)
chr4 (27-467)||(14696036-14696476)
chr4 (26-468)||(15001273-15001714)
chr4 (27-457)||(14161403-14161833)
chr4 (28-295)||(16218325-16218592)
chr4 (28-295)||(16221645-16221912)
chr4 (26-468)||(15357028-15357470)
chr4 (48-467)||(15072282-15072701)
chr4 (297-474)||(18613743-18613920)
chr4 (30-474)||(51604704-51605148)
chr4 (26-468)||(16149633-16150075)
chr4 (26-468)||(16153779-16154221)
chr4 (26-468)||(8707833-8708271)
chr4 (27-184)||(22631910-22632067)
chr4 (48-378)||(1647207-1647537)
chr4 (28-259)||(23443237-23443467)
chr4 (26-468)||(27902308-27902750)
chr4 (26-431)||(44659774-44660179)
chr4 (27-397)||(15257921-15258290)
chr4 (26-468)||(29451445-29451887)
chr4 (26-468)||(3262702-3263144)
chr4 (222-468)||(15323139-15323385)
chr4 (26-388)||(11205140-11205502)
chr4 (26-130)||(16251498-16251602)
chr4 (364-474)||(1640326-1640436)
chr4 (27-467)||(15291067-15291507)
chr4 (22-92)||(16353174-16353244)
chr4 (401-474)||(29037427-29037500)
[»] chr5 (48 HSPs)
chr5 (27-474)||(22349767-22350214)
chr5 (27-474)||(14997830-14998277)
chr5 (30-474)||(22330981-22331425)
chr5 (27-474)||(37289587-37290034)
chr5 (27-474)||(27612202-27612649)
chr5 (27-474)||(29474164-29474611)
chr5 (27-474)||(41772690-41773137)
chr5 (27-474)||(27520254-27520701)
chr5 (27-474)||(16358350-16358797)
chr5 (27-474)||(22136516-22136963)
chr5 (27-474)||(27683491-27683938)
chr5 (27-474)||(34568342-34568789)
chr5 (27-474)||(19771808-19772255)
chr5 (27-466)||(27666581-27667020)
chr5 (27-466)||(40710636-40711075)
chr5 (50-474)||(20801245-20801669)
chr5 (27-474)||(18780962-18781409)
chr5 (27-468)||(25428287-25428728)
chr5 (27-468)||(26736818-26737259)
chr5 (27-468)||(21337385-21337826)
chr5 (30-468)||(23473081-23473519)
chr5 (27-468)||(20466190-20466631)
chr5 (48-467)||(22234032-22234451)
chr5 (26-424)||(21562115-21562512)
chr5 (30-474)||(17267428-17267872)
chr5 (26-468)||(20823289-20823731)
chr5 (26-468)||(28893032-28893474)
chr5 (26-468)||(28921858-28922300)
chr5 (26-433)||(20344153-20344560)
chr5 (26-433)||(24796487-24796894)
chr5 (26-468)||(25849911-25850353)
chr5 (26-433)||(14885081-14885488)
chr5 (26-474)||(22463781-22464229)
chr5 (26-468)||(22504515-22504957)
chr5 (26-468)||(20777749-20778191)
chr5 (26-451)||(37541471-37541896)
chr5 (27-467)||(21935279-21935719)
chr5 (27-467)||(23507521-23507961)
chr5 (48-468)||(21408991-21409408)
chr5 (163-468)||(28914640-28914945)
chr5 (163-468)||(28929908-28930213)
chr5 (195-468)||(21679037-21679310)
chr5 (27-467)||(24583047-24583487)
chr5 (341-464)||(24618700-24618823)
chr5 (341-464)||(24714931-24715054)
chr5 (341-464)||(24747959-24748082)
chr5 (426-474)||(23442056-23442104)
chr5 (48-163)||(21676946-21677061)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (27-474)||(8885-9332)
[»] chr3 (73 HSPs)
chr3 (27-474)||(15400665-15401112)
chr3 (27-466)||(12888252-12888691)
chr3 (27-466)||(5108759-5109198)
chr3 (27-468)||(10007141-10007582)
chr3 (27-468)||(10907751-10908192)
chr3 (27-474)||(13254225-13254672)
chr3 (27-474)||(20060202-20060649)
chr3 (27-466)||(3687486-3687925)
chr3 (27-466)||(5423078-5423517)
chr3 (27-466)||(15346393-15346832)
chr3 (27-474)||(48426982-48427429)
chr3 (27-474)||(16637308-16637755)
chr3 (27-468)||(6602277-6602718)
chr3 (27-474)||(15587540-15587987)
chr3 (26-467)||(16805094-16805535)
chr3 (29-466)||(53383168-53383605)
chr3 (27-466)||(16754849-16755288)
chr3 (26-474)||(16693699-16694147)
chr3 (56-474)||(14874676-14875094)
chr3 (115-474)||(15723170-15723529)
chr3 (30-468)||(17491391-17491829)
chr3 (165-474)||(12499783-12500092)
chr3 (27-468)||(15261171-15261612)
chr3 (202-474)||(15340804-15341076)
chr3 (27-206)||(15357886-15358065)
chr3 (28-248)||(14579557-14579777)
chr3 (26-451)||(11959305-11959730)
chr3 (48-468)||(15229154-15229574)
chr3 (48-468)||(15235022-15235442)
chr3 (26-468)||(12179889-12180337)
chr3 (27-164)||(24185035-24185172)
chr3 (26-468)||(11950044-11950486)
chr3 (48-368)||(16826439-16826754)
chr3 (48-468)||(17187925-17188345)
chr3 (26-457)||(31693321-31693752)
chr3 (26-457)||(31940465-31940896)
chr3 (26-468)||(12358663-12359105)
chr3 (27-467)||(15013904-15014344)
chr3 (22-468)||(13318634-13319080)
chr3 (30-474)||(16379068-16379512)
chr3 (30-474)||(41179067-41179511)
chr3 (30-474)||(13943569-13944013)
chr3 (30-474)||(44778792-44779236)
chr3 (26-468)||(10418181-10418623)
chr3 (26-468)||(14088224-14088666)
chr3 (26-433)||(47125530-47125937)
chr3 (26-474)||(16834651-16835094)
chr3 (30-468)||(28755869-28756307)
chr3 (51-212)||(11888526-11888687)
chr3 (48-257)||(14291690-14291899)
chr3 (48-468)||(18132504-18132924)
chr3 (27-118)||(15714204-15714295)
chr3 (48-468)||(13970278-13970698)
chr3 (27-467)||(30139358-30139798)
chr3 (27-467)||(30148909-30149349)
chr3 (27-118)||(43164566-43164657)
chr3 (100-354)||(12269875-12270129)
chr3 (28-467)||(8272548-8272987)
chr3 (27-445)||(15948618-15949036)
chr3 (26-267)||(10407720-10407961)
chr3 (27-467)||(13965500-13965941)
chr3 (27-467)||(15611655-15612095)
chr3 (222-397)||(11889623-11889798)
chr3 (26-293)||(12510619-12510886)
chr3 (26-468)||(16327796-16328238)
chr3 (26-247)||(24189076-24189297)
chr3 (27-127)||(18437022-18437122)
chr3 (27-79)||(26791561-26791613)
chr3 (259-433)||(10385257-10385431)
chr3 (30-235)||(8745530-8745735)
chr3 (27-467)||(6151001-6151441)
chr3 (33-103)||(12272254-12272324)
chr3 (26-91)||(17200562-17200627)
[»] chr1 (44 HSPs)
chr1 (27-474)||(21838881-21839328)
chr1 (27-474)||(19108299-19108746)
chr1 (27-466)||(16348576-16349016)
chr1 (27-474)||(21832233-21832680)
chr1 (27-466)||(33389010-33389449)
chr1 (39-474)||(24792609-24793044)
chr1 (26-474)||(21233711-21234159)
chr1 (27-467)||(51331474-51331914)
chr1 (26-474)||(17042995-17043443)
chr1 (39-474)||(22503282-22503717)
chr1 (27-466)||(41351649-41352082)
chr1 (26-467)||(20140021-20140462)
chr1 (27-468)||(430097-430538)
chr1 (48-468)||(50618400-50618820)
chr1 (27-468)||(21750877-21751318)
chr1 (26-468)||(22360224-22360666)
chr1 (27-465)||(21862354-21862792)
chr1 (48-468)||(21743554-21743974)
chr1 (27-350)||(16378150-16378473)
chr1 (26-468)||(19661116-19661558)
chr1 (303-474)||(21026104-21026275)
chr1 (22-468)||(19856242-19856688)
chr1 (26-474)||(20854740-20855188)
chr1 (48-468)||(20833902-20834322)
chr1 (24-268)||(41310694-41310938)
chr1 (26-433)||(20296384-20296791)
chr1 (30-468)||(24097587-24098025)
chr1 (195-316)||(20944119-20944240)
chr1 (26-468)||(20938043-20938485)
chr1 (26-433)||(37679052-37679459)
chr1 (26-468)||(48424841-48425283)
chr1 (26-468)||(52987709-52988151)
chr1 (26-433)||(21952881-21953288)
chr1 (26-468)||(38910806-38911248)
chr1 (27-467)||(20829373-20829813)
chr1 (26-468)||(31537977-31538419)
chr1 (302-468)||(41308610-41308776)
chr1 (391-468)||(16378079-16378156)
chr1 (340-457)||(23196543-23196660)
chr1 (27-103)||(35930806-35930882)
chr1 (27-92)||(20527366-20527431)
chr1 (27-92)||(41215837-41215902)
chr1 (306-394)||(20927065-20927153)
chr1 (27-169)||(20927290-20927432)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (27-474)||(40100-40547)
scaffold0109 (22-474)||(14031-14484)
[»] scaffold0079 (4 HSPs)
scaffold0079 (26-474)||(35442-35891)
scaffold0079 (112-295)||(28225-28408)
scaffold0079 (26-468)||(2669-3111)
scaffold0079 (22-92)||(28405-28475)
[»] scaffold0028 (4 HSPs)
scaffold0028 (30-467)||(10428-10865)
scaffold0028 (30-467)||(16890-17327)
scaffold0028 (31-466)||(45106-45541)
scaffold0028 (48-468)||(48447-48867)
[»] chr8 (59 HSPs)
chr8 (27-466)||(17672375-17672814)
chr8 (27-474)||(18858559-18859006)
chr8 (27-474)||(20016615-20017062)
chr8 (27-474)||(22118527-22118974)
chr8 (27-474)||(22127311-22127758)
chr8 (26-474)||(30311495-30311943)
chr8 (26-474)||(15535365-15535813)
chr8 (26-474)||(22041809-22042257)
chr8 (26-474)||(21164889-21165337)
chr8 (26-474)||(22131392-22131840)
chr8 (26-468)||(32602132-32602575)
chr8 (26-474)||(19979949-19980397)
chr8 (27-466)||(19482424-19482855)
chr8 (48-468)||(23652029-23652449)
chr8 (27-468)||(21252932-21253373)
chr8 (27-468)||(21392213-21392654)
chr8 (27-468)||(21782772-21783213)
chr8 (27-468)||(21786707-21787148)
chr8 (27-474)||(22422244-22422691)
chr8 (28-468)||(19864446-19864887)
chr8 (28-468)||(22375806-22376246)
chr8 (30-468)||(22246788-22247226)
chr8 (112-468)||(21920185-21920541)
chr8 (26-468)||(29301777-29302219)
chr8 (27-465)||(23887015-23887457)
chr8 (48-468)||(21927415-21927836)
chr8 (249-468)||(22988718-22988937)
chr8 (48-468)||(20008294-20008714)
chr8 (26-454)||(31414820-31415248)
chr8 (30-468)||(20394488-20394926)
chr8 (30-465)||(23656918-23657353)
chr8 (27-291)||(22522711-22522975)
chr8 (57-468)||(19861423-19861834)
chr8 (312-474)||(19114672-19114834)
chr8 (26-468)||(21323630-21324071)
chr8 (26-433)||(16269575-16269982)
chr8 (30-474)||(31569198-31569641)
chr8 (26-465)||(20390090-20390516)
chr8 (29-226)||(22989275-22989472)
chr8 (27-179)||(21781539-21781691)
chr8 (26-468)||(22052851-22053293)
chr8 (48-235)||(19984401-19984588)
chr8 (26-433)||(4984065-4984472)
chr8 (26-433)||(28982934-28983341)
chr8 (26-433)||(28988153-28988560)
chr8 (26-433)||(27356559-27356966)
chr8 (109-433)||(6605681-6606005)
chr8 (27-467)||(16875447-16875887)
chr8 (26-151)||(22373173-22373298)
chr8 (219-433)||(22372954-22373168)
chr8 (27-467)||(21848689-21849129)
chr8 (26-89)||(22030470-22030533)
chr8 (26-241)||(22061030-22061245)
chr8 (192-433)||(14567165-14567406)
chr8 (27-467)||(20650707-20651147)
chr8 (173-326)||(19869823-19869976)
chr8 (27-150)||(23155394-23155517)
chr8 (27-92)||(16414455-16414520)
chr8 (27-92)||(21194892-21194957)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (26-474)||(37731-38179)
scaffold0042 (27-465)||(22661-23099)
[»] scaffold0029 (3 HSPs)
scaffold0029 (27-468)||(107723-108164)
scaffold0029 (24-468)||(114512-114956)
scaffold0029 (26-266)||(94805-95045)
[»] scaffold0080 (6 HSPs)
scaffold0080 (26-474)||(11150-11598)
scaffold0080 (30-474)||(30829-31273)
scaffold0080 (30-474)||(36294-36739)
scaffold0080 (27-418)||(53638-54029)
scaffold0080 (252-467)||(50044-50259)
scaffold0080 (26-104)||(13805-13883)
[»] scaffold0008 (5 HSPs)
scaffold0008 (28-463)||(85709-86144)
scaffold0008 (27-466)||(85142-85581)
scaffold0008 (27-169)||(132401-132543)
scaffold0008 (345-467)||(132719-132841)
scaffold0008 (306-394)||(25853-25941)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (26-466)||(16113-16553)
scaffold0044 (27-466)||(2375-2816)
[»] scaffold0017 (3 HSPs)
scaffold0017 (26-474)||(57962-58410)
scaffold0017 (72-468)||(195444-195840)
scaffold0017 (24-474)||(17975-18426)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (26-474)||(54902-55350)
scaffold0031 (28-467)||(109584-110023)
[»] scaffold0102 (2 HSPs)
scaffold0102 (28-438)||(51258-51668)
scaffold0102 (26-468)||(41650-42091)
[»] scaffold0081 (2 HSPs)
scaffold0081 (30-474)||(35973-36417)
scaffold0081 (30-474)||(20549-20993)
[»] scaffold0055 (1 HSPs)
scaffold0055 (27-370)||(21296-21639)
[»] scaffold0621 (1 HSPs)
scaffold0621 (27-468)||(3385-3826)
[»] scaffold0022 (5 HSPs)
scaffold0022 (27-465)||(40588-41026)
scaffold0022 (27-465)||(74308-74746)
scaffold0022 (48-468)||(55708-56128)
scaffold0022 (306-467)||(9017-9178)
scaffold0022 (27-103)||(8738-8814)
[»] scaffold0256 (1 HSPs)
scaffold0256 (136-468)||(23095-23427)
[»] scaffold0309 (2 HSPs)
scaffold0309 (27-468)||(16594-17035)
scaffold0309 (48-468)||(11746-12167)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (27-468)||(24857-25298)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (27-468)||(6999-7440)
[»] scaffold0023 (4 HSPs)
scaffold0023 (27-468)||(151063-151504)
scaffold0023 (27-467)||(2417-2857)
scaffold0023 (98-468)||(86722-87091)
scaffold0023 (434-474)||(27725-27765)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (27-465)||(691-1126)
[»] scaffold0647 (2 HSPs)
scaffold0647 (27-468)||(7571-8012)
scaffold0647 (27-468)||(2852-3293)
[»] scaffold0319 (1 HSPs)
scaffold0319 (28-468)||(719-1157)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (27-468)||(7973-8414)
scaffold0120 (27-91)||(24506-24570)
[»] scaffold2004 (1 HSPs)
scaffold2004 (27-468)||(725-1162)
[»] scaffold0312 (1 HSPs)
scaffold0312 (27-468)||(12-453)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (28-468)||(3534-3974)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (27-468)||(13123-13564)
[»] scaffold1602 (1 HSPs)
scaffold1602 (49-468)||(1-420)
[»] scaffold0358 (2 HSPs)
scaffold0358 (27-468)||(8002-8443)
scaffold0358 (27-468)||(17198-17639)
[»] scaffold0228 (1 HSPs)
scaffold0228 (27-468)||(20191-20632)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (27-467)||(24445-24885)
scaffold0011 (26-468)||(150522-150964)
scaffold0011 (360-468)||(193949-194057)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (108-474)||(7961-8327)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (27-468)||(7174-7615)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (27-467)||(8326-8765)
[»] scaffold1423 (1 HSPs)
scaffold1423 (27-468)||(1294-1735)
[»] scaffold0501 (1 HSPs)
scaffold0501 (141-474)||(4141-4474)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (30-468)||(14394-14832)
[»] scaffold0114 (3 HSPs)
scaffold0114 (27-465)||(18253-18691)
scaffold0114 (22-293)||(22002-22273)
scaffold0114 (30-170)||(39307-39447)
[»] scaffold0333 (1 HSPs)
scaffold0333 (27-468)||(17607-18042)
[»] scaffold0010 (4 HSPs)
scaffold0010 (39-468)||(3867-4296)
scaffold0010 (26-468)||(40244-40686)
scaffold0010 (30-268)||(45342-45580)
scaffold0010 (341-468)||(45626-45752)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (92-468)||(30898-31274)
scaffold0026 (48-468)||(50763-51183)
[»] scaffold0215 (3 HSPs)
scaffold0215 (79-424)||(28446-28772)
scaffold0215 (318-474)||(28774-28930)
scaffold0215 (26-58)||(28406-28438)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (28-468)||(103186-103618)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (39-467)||(405-832)
[»] scaffold0018 (3 HSPs)
scaffold0018 (27-468)||(10653-11094)
scaffold0018 (27-468)||(24210-24651)
scaffold0018 (140-468)||(16958-17286)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (27-461)||(494978-495412)
scaffold0001 (48-468)||(453146-453566)
scaffold0001 (26-468)||(515264-515706)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (27-468)||(16830-17270)
scaffold0040 (402-468)||(111775-111841)
[»] scaffold0270 (2 HSPs)
scaffold0270 (28-467)||(5825-6264)
scaffold0270 (28-467)||(12955-13394)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (136-464)||(6352-6680)
[»] scaffold0074 (2 HSPs)
scaffold0074 (28-468)||(5065-5504)
scaffold0074 (56-370)||(11172-11486)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (48-466)||(14423-14841)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (29-468)||(15135-15574)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (27-397)||(2623-2993)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (30-468)||(217335-217773)
[»] scaffold1985 (1 HSPs)
scaffold1985 (182-474)||(407-699)
[»] scaffold0181 (1 HSPs)
scaffold0181 (28-295)||(29828-30095)
[»] scaffold0393 (1 HSPs)
scaffold0393 (27-248)||(15906-16128)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (27-468)||(15890-16330)
[»] scaffold0083 (3 HSPs)
scaffold0083 (39-468)||(8958-9387)
scaffold0083 (39-129)||(1324-1414)
scaffold0083 (39-129)||(6628-6718)
[»] scaffold0509 (1 HSPs)
scaffold0509 (26-468)||(10781-11223)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (26-468)||(201379-201821)
scaffold0004 (56-468)||(324657-325069)
[»] scaffold0149 (3 HSPs)
scaffold0149 (30-247)||(1-218)
scaffold0149 (26-457)||(5262-5692)
scaffold0149 (26-457)||(9693-10123)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (30-468)||(5804-6242)
[»] scaffold0067 (4 HSPs)
scaffold0067 (27-433)||(28610-29016)
scaffold0067 (48-394)||(50113-50459)
scaffold0067 (48-394)||(59147-59493)
scaffold0067 (48-394)||(65535-65881)
[»] scaffold0130 (3 HSPs)
scaffold0130 (267-468)||(44795-44996)
scaffold0130 (195-468)||(8888-9161)
scaffold0130 (48-181)||(4822-4955)
[»] scaffold0865 (1 HSPs)
scaffold0865 (26-457)||(2183-2614)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (26-457)||(29196-29627)
[»] scaffold0523 (1 HSPs)
scaffold0523 (26-468)||(1822-2264)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (237-468)||(38070-38301)
scaffold0122 (27-92)||(41417-41482)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (48-458)||(49067-49477)
[»] scaffold0244 (1 HSPs)
scaffold0244 (48-468)||(19305-19725)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (26-468)||(24167-24609)
scaffold0104 (48-456)||(44350-44758)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (27-468)||(4702-5143)
scaffold0035 (27-466)||(42019-42458)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (48-465)||(16068-16485)
scaffold0266 (22-467)||(7768-8213)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (266-474)||(7844-8052)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (48-468)||(49808-50228)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (48-458)||(4139-4552)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (26-468)||(33287-33730)
[»] scaffold0993 (1 HSPs)
scaffold0993 (26-300)||(1-275)
[»] scaffold0476 (2 HSPs)
scaffold0476 (73-303)||(10284-10514)
scaffold0476 (72-468)||(1502-1898)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (48-465)||(5022-5439)
[»] scaffold0261 (2 HSPs)
scaffold0261 (26-468)||(13247-13689)
scaffold0261 (26-468)||(21426-21868)
[»] scaffold0304 (1 HSPs)
scaffold0304 (48-457)||(1418-1827)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (48-465)||(28481-28898)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (28-468)||(22099-22538)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (26-468)||(250573-251015)
[»] scaffold0560 (2 HSPs)
scaffold0560 (30-195)||(8657-8822)
scaffold0560 (191-250)||(10916-10975)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (48-465)||(176277-176694)
[»] scaffold0298 (1 HSPs)
scaffold0298 (26-468)||(9969-10410)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (54-468)||(2892-3306)
scaffold0034 (26-468)||(69323-69765)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (26-468)||(14153-14601)
scaffold0124 (27-467)||(5718-6160)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (318-474)||(3556-3712)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (81-468)||(6703-7090)
[»] scaffold1288 (1 HSPs)
scaffold1288 (26-468)||(766-1207)
[»] scaffold0405 (1 HSPs)
scaffold0405 (26-355)||(566-895)
[»] scaffold0053 (2 HSPs)
scaffold0053 (48-468)||(46967-47387)
scaffold0053 (48-468)||(55780-56200)
[»] scaffold0739 (1 HSPs)
scaffold0739 (315-474)||(999-1158)
[»] scaffold0206 (1 HSPs)
scaffold0206 (26-468)||(25066-25508)
[»] scaffold1477 (1 HSPs)
scaffold1477 (26-467)||(181-621)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (54-468)||(950-1364)
[»] scaffold0077 (2 HSPs)
scaffold0077 (26-420)||(19545-19939)
scaffold0077 (306-467)||(26457-26618)
[»] scaffold0054 (1 HSPs)
scaffold0054 (48-467)||(64452-64860)
[»] scaffold0445 (1 HSPs)
scaffold0445 (166-468)||(1900-2202)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (48-468)||(31252-31672)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (26-457)||(37612-38043)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (26-468)||(268561-269003)
scaffold0007 (27-466)||(84432-84870)
[»] scaffold0076 (4 HSPs)
scaffold0076 (26-468)||(31588-32030)
scaffold0076 (26-235)||(54322-54531)
scaffold0076 (27-467)||(42212-42652)
scaffold0076 (249-468)||(55034-55253)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (26-468)||(99473-99915)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (305-468)||(115171-115334)
scaffold0037 (27-240)||(114950-115163)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (26-424)||(10697-11095)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (26-468)||(262177-262619)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (27-468)||(27160-27600)
scaffold0058 (26-391)||(21150-21515)
[»] scaffold0420 (2 HSPs)
scaffold0420 (26-424)||(642-1038)
scaffold0420 (26-178)||(7857-8007)
[»] scaffold0046 (1 HSPs)
scaffold0046 (26-465)||(79742-80181)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (26-433)||(42905-43311)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (26-468)||(20802-21244)
scaffold0090 (228-468)||(24964-25204)
[»] scaffold0222 (2 HSPs)
scaffold0222 (26-468)||(9014-9456)
scaffold0222 (26-268)||(1400-1642)
[»] scaffold0730 (1 HSPs)
scaffold0730 (117-468)||(3-354)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (48-178)||(11201-11331)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (26-468)||(52998-53440)
[»] scaffold1373 (1 HSPs)
scaffold1373 (28-468)||(747-1187)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (27-467)||(25348-25788)
[»] scaffold0162 (3 HSPs)
scaffold0162 (27-467)||(14862-15302)
scaffold0162 (306-394)||(11365-11453)
scaffold0162 (30-91)||(11089-11150)
[»] scaffold0550 (1 HSPs)
scaffold0550 (24-145)||(11067-11189)
[»] scaffold1830 (1 HSPs)
scaffold1830 (243-468)||(947-1172)
[»] scaffold1715 (1 HSPs)
scaffold1715 (26-451)||(922-1347)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (26-468)||(9372-9810)
scaffold0235 (26-468)||(19586-20024)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (26-433)||(28921-29327)
[»] scaffold0170 (1 HSPs)
scaffold0170 (27-467)||(34039-34479)
[»] scaffold0285 (1 HSPs)
scaffold0285 (356-431)||(9215-9290)
[»] scaffold2111 (1 HSPs)
scaffold2111 (48-269)||(520-741)
[»] scaffold0177 (1 HSPs)
scaffold0177 (26-94)||(12267-12335)
[»] scaffold0180 (3 HSPs)
scaffold0180 (276-470)||(33914-34108)
scaffold0180 (255-457)||(380-582)
scaffold0180 (255-457)||(4700-4902)
[»] scaffold0708 (1 HSPs)
scaffold0708 (26-451)||(6056-6481)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (219-468)||(44736-44985)
[»] scaffold1646 (1 HSPs)
scaffold1646 (228-468)||(1277-1517)
[»] scaffold0894 (1 HSPs)
scaffold0894 (349-465)||(3882-3998)
[»] scaffold0348 (3 HSPs)
scaffold0348 (26-235)||(18394-18603)
scaffold0348 (72-468)||(9831-10242)
scaffold0348 (26-104)||(5760-5838)
[»] scaffold0089 (2 HSPs)
scaffold0089 (192-429)||(14790-15027)
scaffold0089 (255-457)||(416-618)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (195-394)||(12379-12578)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (195-468)||(16229-16502)
[»] scaffold0302 (2 HSPs)
scaffold0302 (26-467)||(165-606)
scaffold0302 (26-467)||(7107-7548)
[»] scaffold0146 (2 HSPs)
scaffold0146 (26-134)||(9865-9973)
scaffold0146 (26-134)||(17532-17640)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (28-157)||(1797-1926)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (375-468)||(23339-23432)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (351-468)||(195193-195310)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (28-92)||(16387-16451)
[»] scaffold0697 (1 HSPs)
scaffold0697 (401-468)||(6939-7006)
[»] scaffold0218 (3 HSPs)
scaffold0218 (27-97)||(26651-26721)
scaffold0218 (28-92)||(1865-1929)
scaffold0218 (306-465)||(2143-2302)
[»] scaffold0467 (2 HSPs)
scaffold0467 (27-104)||(1533-1610)
scaffold0467 (306-382)||(1812-1888)
[»] scaffold1488 (1 HSPs)
scaffold1488 (27-103)||(715-791)
[»] scaffold0876 (2 HSPs)
scaffold0876 (28-92)||(859-923)
scaffold0876 (306-394)||(1137-1225)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (27-94)||(4838-4905)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (30-157)||(7008-7135)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (366-465)||(36069-36168)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (27-104)||(13537-13614)
[»] scaffold0269 (1 HSPs)
scaffold0269 (411-467)||(2218-2274)
[»] scaffold0249 (1 HSPs)
scaffold0249 (384-468)||(242-326)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (27-91)||(422-486)
[»] scaffold0827 (1 HSPs)
scaffold0827 (173-268)||(5259-5354)
[»] scaffold0375 (1 HSPs)
scaffold0375 (26-61)||(2838-2873)
[»] scaffold0062 (1 HSPs)
scaffold0062 (252-451)||(8920-9119)
[»] scaffold1208 (1 HSPs)
scaffold1208 (195-269)||(1769-1843)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 408; Significance: 0; HSPs: 55)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 408; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 14956906 - 14956459
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14956906 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatt 14956807  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14956806 tgaggtcaggttatcaccaaattaaagtaaaagatgaaaatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 14956707  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14956706 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 14956607  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14956606 atttactccaagactgaagaagaagatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgaat 14956507  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14956506 tctggttgaaagaagtgagttttcttggccatgttatttctggtgatg 14956459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 400; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 474
Target Start/End: Original strand, 11551020 - 11551467
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11551020 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccaagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatt 11551119  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11551120 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagcttttagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 11551219  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11551220 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 11551319  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11551320 atttattccaagactgaagaagaacatgttgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgaat 11551419  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11551420 tctggttgaaagaagtgagttttcttggccatgttatttctggtgatg 11551467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 392; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 12689854 - 12689407
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12689854 cagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatt 12689755  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12689754 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctctgagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 12689655  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12689654 tggtgttaccaatgcacctagagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtattcatcgatgatattttg 12689555  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  12689554 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgagt 12689455  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12689454 tctggttgaaagaagtgagttttcttggccatgttatttctggtgatg 12689407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 380; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 474
Target Start/End: Original strand, 11235131 - 11235578
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11235131 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatt 11235230  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11235231 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacacgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 11235330  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||    
T  11235331 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 11235430  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  11235431 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaat 11235530  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  11235531 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggtgatg 11235578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 474
Target Start/End: Original strand, 15158975 - 15159422
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  15158975 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtttttagcaagattgatt 15159074  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15159075 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 15159174  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||    
T  15159175 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 15159274  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  15159275 atttactccaagactgacgaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaat 15159374  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  15159375 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggtgatg 15159422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 8709957 - 8709510
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  8709957 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgtgtttttagcaagattgatt 8709858  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8709857 tgaggtcaggatatcaccagattaaggtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 8709758  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||| ||||| |||||||||    
T  8709757 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttatggttgtgtttatcgacgatattttg 8709658  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  8709657 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaat 8709558  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  8709557 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggtgatg 8709510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 14334748 - 14334301
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  14334748 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 14334649  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14334648 tgaggtcaggttatcaccagattaaggtaaaggatgaggatatgcagaagacagctttcaaaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 14334549  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||    
T  14334548 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 14334449  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14334448 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgaat 14334349  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  14334348 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggtgatg 14334301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 10873042 - 10872595
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  10873042 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 10872943  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10872942 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 10872843  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || || || ||||| ||||| |||||||||    
T  10872842 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttctggatcggtttgtggtcgtgtttatcgacgatattttg 10872743  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||    
T  10872742 atctactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatcctaaattgtctaagtgtgaat 10872643  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  10872642 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggtgatg 10872595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 474
Target Start/End: Original strand, 15267 - 15715
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||    
T  15267 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgaggatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 15366  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15367 ttgaggtcaggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 15466  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | ||||| | |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  15467 tcggtgtaaacaatgcgcctagagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcctttttggatcggttcgtagttgcgtttatcgacgatatttt 15566  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  15567 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgatgattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 15666  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| || |||||    
T  15667 ttctggttgaaggaagtaagttttcttggccatgttatttttggtgatg 15715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Original strand, 44789269 - 44789708
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  44789269 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 44789368  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44789369 tgagatcaggttgtcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 44789468  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||| |||| ||||| |||||||||    
T  44789469 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttatgtttatcgacgatattttg 44789568  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  44789569 atctactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaat 44789668  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttc 466  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  44789669 tctggttgaaagaggtgagtttccttggccatgttatttc 44789708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 27 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 18180097 - 18179656
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  18180097 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttcagagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 18179998  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  18179997 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggccactacgaatataaagttatgccttt 18179898  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||  ||||||||    
T  18179897 cggtgtgaccaatgcacctagagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggattggttcgtaattgtgtttatcgaccatattttg 18179798  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaa-gaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||    
T  18179797 atttactccaagactgaagaagaacatgccgagcatctcaagattgtcttacaagtgttg-aagagaangacactttatgccaaattgtctaagtatgaa 18179699  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18179698 ttctggttgaaagaggtgagttttcttggccatgttatttctg 18179656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 27 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 13688393 - 13688023
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  13688393 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtttttagcaagattgatt 13688294  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13688293 tgaggtcaggttatcactagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtccctatgaatataaagttatgccttt 13688194  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||    
T  13688193 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 13688094  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaa 397  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13688093 atttactccaagactgacgaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaa 13688023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 26 - 468
Target Start/End: Original strand, 15146801 - 15147244
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  15146801 tcagttgaataaagtaactatgaagaataggtatccacttccaagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagatagat 15146900  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||| ||||| || || || ||||||||||||||||    
T  15146901 ttgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacggcttttaaaacgcgatatggacattacgagtataaagttatgcctt 15147000  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgca-tttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattt 324  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||| ||||||||||    
T  15147001 ttggtgttacaaatgcacctggtgtgtttatggagtacatgaatcgcattttccatgcattttttggatcggttcgtggtttttttcattgatgatattt 15147100  T
Q  325 tgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtga 424  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  15147101 ttatctactccaagactgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgcaaaattgtctaagtgtga 15147200  T
Q  425 attctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
     |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  15147201 gttctggttgaaagaggtaagttttcttggccatgttatttctg 15147244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 27 - 373
Target Start/End: Original strand, 18588089 - 18588435
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  18588089 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgtgtttttagcaagattgatt 18588188  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18588189 tgaggtcaggatatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacaactttcagaacgcgttatggtcactatgaaaataaagttatgccttt 18588288  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||    
T  18588289 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaattgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 18588388  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgt 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18588389 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgt 18588435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 30 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 14042044 - 14041612
Alignment:
Q  30 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttga 129  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||| |||||||||  |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  14042044 ttgaacaaagtaacgataaagaataggtgtccacttccaagaattgagaacttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgacttga 14041945  T
Q  130 ggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttgg 229  Q
    | ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||| || ||||| |||||||| ||    
T  14041944 gatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatggagaagacagcttttagaacgcgttatggacattatgagtacaaagtgatgcctttcgg 14041845  T
Q  230 tgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatt 329  Q
    |||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  14041844 tgttacaaatgcacctgatgtgtttatggagtacatgaatcacatttttcatgcatttttggatcgtttcgtagttattttcattgatgatattttgatt 14041745  T
Q  330 tactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattct 429  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||||    
T  14041744 tactccaagactgaggaagaacatgatgagcatttgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaataaactttatgctaaattatcaaagtgtgaattct 14041645  T
Q  430 ggttgaaagacgtgagttttcttggccatgtta 462  Q
     ||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  14041644 agttgaaagaggtgagttttcttggacatgtta 14041612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 30 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 14352074 - 14351642
Alignment:
Q  30 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttga 129  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||| |||||||||  |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  14352074 ttgaacaaagtaacgataaagaataggtgtccacttccaagaattgagaacttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgacttga 14351975  T
Q  130 ggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttgg 229  Q
    | ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||| || ||||| |||||||| ||    
T  14351974 gatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatggagaagacagcttttagaacgcgttatggacattatgagtacaaagtgatgcctttcgg 14351875  T
Q  230 tgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatt 329  Q
    |||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  14351874 tgttacaaatgcacctgatgtgtttatggagtacatgaatcacatttttcatgcatttttggatcgtttcgtagttattttcattgatgatattttgatt 14351775  T
Q  330 tactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattct 429  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||||    
T  14351774 tactccaagactgaggaagaacatgatgagcatttgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaataaactttatgctaaattatcaaagtgtgaattct 14351675  T
Q  430 ggttgaaagacgtgagttttcttggccatgtta 462  Q
     ||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  14351674 agttgaaagaggtgagttttcttggacatgtta 14351642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 26 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 9590721 - 9590479
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||| ||||||    
T  9590721 tcagttgaacaaggtaactatcaagtataggtatccacttctgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaatttttcagcaagattgat 9590622  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9590621 ttgaggtcaggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 9590522  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaa 268  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9590521 ttggtgtgaccaatgcacttggagtgtttatggagtatatgaa 9590479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 27 - 468
Target Start/End: Original strand, 48813170 - 48813610
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||| || ||||| || ||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||    
T  48813170 cagttgaataaagtaacgataaagtattggtatccacttccaagaattgatgatttgatggatcagttagtgggcgcacgtgtgtttagcaagattgatt 48813269  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| |||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||| | || || |  |||||||| || || ||||||  ||| ||||||||    
T  48813270 tgagatcaggttatcaccaaattaaagtgaaagacgaggatatgcagaagacaacctttaggacacgttatggacattacgaatattcagtgatgccttt 48813369  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     |||||||| ||||| ||  | |||||||||||||| |||||| | || || ||||| | ||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  48813370 cggtgttactaatgcgccaagtgtgtttatggagtacatgaattgtatttttcatgcttatttagatcgcttcgtggttgtgttcattgatgatattttg 48813469  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    || ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||  | |||||| ||||||| || |||||||    
T  48813470 atatactctaagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgtgttgcaagtgctgaaggagaagaagttatatgcc-aattgtcaaagtgtgaat 48813568  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  48813569 tctggttgaatgaggtgagttttcttggccatgttatttctg 48813610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 26 - 468
Target Start/End: Original strand, 15100498 - 15100940
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  15100498 tcagttgaacaaggttacgataaagaataggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcagttagtgggtgctcgtgtattcagcaaaattgat 15100597  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||| |||| || |||||||| || || ||||| ||||||||||||||  | || || |  || |||||||| ||  ||||||| || |||||||    
T  15100598 ttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacgacctttaggacacgatatggtcattacaaatataaggtgatgcctt 15100697  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| |   |||||  |||||| |||||||| || ||||| || ||    
T  15100698 tcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggataaattcgtggttgtgtttattgatgacatctt 15100797  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  | |||||||| ||||| ||||||||     
T  15100798 gatttattctaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaagatcgtcttgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgag 15100897  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    |||||||| |  || || ||||||||||||||  |||||||||    
T  15100898 ttctggttaagtgaagtaagttttcttggccacattatttctg 15100940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 48 - 468
Target Start/End: Original strand, 12204717 - 12205137
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttgaggtcaagttatcaccaga 147  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| |||| || ||||    
T  12204717 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttaatggatcagttagtgggtgcatgcgtgttcagcaaaattgatttgaggtcaggttaccatcaga 12204816  T
Q  148 ttaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctgg 247  Q
    |||| || ||  |||||||||||||||| || || || || || || ||||| || ||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  12204817 ttaaggtgaagtatgaagatatgcagaaaacggcctttaggatacgatatggacattatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctgg 12204916  T
Q  248 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaa 347  Q
     |||||||||||||| |||||| | || |||||||| | | |||||  ||  || || ||||| || |||||||| || ||||| |  ||||||||||||    
T  12204917 tgtgtttatggagtacatgaatagaattttccatgcttatctggataaatctgtggtcgtgtttattgatgatatcttaatttattttaagactgaagaa 12205016  T
Q  348 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagtt 447  Q
    || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||  | |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |  || || ||||    
T  12205017 gagcatgcagagcatctgaaaattgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtccaaatgtgaattctggttaagtgaagtaagtt 12205116  T
Q  448 ttcttggccatgttatttctg 468  Q
    ||||||||||  |||||||||    
T  12205117 ttcttggccacattatttctg 12205137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 48 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 15626856 - 15626436
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttgaggtcaagttatcaccaga 147  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||  | ||||||||||    
T  15626856 aagaataggtatccacttccaagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtgtttagcaagattgatttgagatcgggctatcaccaga 15626757  T
Q  148 ttaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctgg 247  Q
    ||||| | ||||||||||||| | ||||||| ||||| || |  |||||  | || || ||||||   || ||||||||  ||||||| |||||||| ||    
T  15626756 ttaaactgaaagatgaagatacgaagaagacggcttttaggacacgttacagacattacgaatattcggtgatgcctttcagtgttactaatgcaccagg 15626657  T
Q  248 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaa 347  Q
     || ||||||||||| ||||| || || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| || ||||  ||| ||||||||    
T  15626656 tgtatttatggagtacatgaaccgtatttttcatgcttatttagatcgcttcgtggttgcgttcatcgatgatattttaatatactataagtctgaagaa 15626557  T
Q  348 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagtt 447  Q
    |||||||  ||| || |||||||||| ||||||||| |||||||||||||  | ||||| || ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||    
T  15626556 gaacatgtcgagtatttgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagttatatgctaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagtt 15626457  T
Q  448 ttcttggccatgttatttctg 468  Q
    | ||||||||| |||||||||    
T  15626456 tccttggccatattatttctg 15626436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 48 - 467
Target Start/End: Original strand, 14262162 - 14262580
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttgaggtcaagttatcaccaga 147  Q
    ||||||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| || || |    
T  14262162 aagaataggtatccacttccgaggtttgatgatttaatggatcagttagtgggtgctcgtgtgttcagcaagattgatttgaggtcaggttaccatcata 14262261  T
Q  148 ttaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctgg 247  Q
    |||| || || ||||| |||||||||||||  || || || |  |  |||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  14262262 ttaaggtgaaggatgaggatatgcagaagatggcctttaggacacaatatggtcattatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctgg 14262361  T
Q  248 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaa 347  Q
     ||||||||||||||||||||| | || |||||||| | | |||||  ||| || |||||||| || ||||| || || ||||| || | ||||||||||    
T  14262362 tgtgtttatggagtatatgaatagaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttaatttattcta-gactgaagaa 14262460  T
Q  348 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagtt 447  Q
    || ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||  | |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |  || || ||||    
T  14262461 gagcatgcagagcatctgaagattatgttgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgaattttggttaagtgaagtaagtt 14262560  T
Q  448 ttcttggccatgttatttct 467  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  14262561 ttcttggccatattatttct 14262580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 48 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 19149541 - 19149123
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttgaggtcaagttatcaccaga 147  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| | || || |||||||||||||||||| |||| |   |||    
T  19149541 aagaataggtatccacttccaagaattgacgatttaatggatcggttagtgggtgcacgtatgtttagtaaaattgatttgaggtcaggttaccta-aga 19149443  T
Q  148 ttaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctgg 247  Q
    |||| || || ||||| ||| |||||||||| || || || |  ||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  19149442 ttaaggtgaaggatgaggat-tgcagaagacggcctttaggacacgttacggtcactatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctgg 19149344  T
Q  248 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaa 347  Q
     ||||||||||||||||||||| | || |||||||| | | |||||  ||| || |||||||| || ||||| || || ||||| || |||||||| |||    
T  19149343 tgtgtttatggagtatatgaattgaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttaatttattctaagactgatgaa 19149244  T
Q  348 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagtt 447  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  | | || ||| ||||| ||||||||||||||||| |  || || ||||    
T  19149243 gagcatgcagagcatctgaagattgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtgtgtcaagttgtccaaatgtgaattctggttaagtgaagtaagtt 19149144  T
Q  448 ttcttggccatgttatttctg 468  Q
    ||||||||||| |||||||||    
T  19149143 ttcttggccatattatttctg 19149123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 48 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 20748940 - 20748522
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttgaggtcaagttatcaccaga 147  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| | || || |||||||||||||||||| |||| |   |||    
T  20748940 aagaataggtatccacttccaagaattgacgatttaatggatcggttagtgggtgcacgtatgtttagtaaaattgatttgaggtcaggttaccta-aga 20748842  T
Q  148 ttaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctgg 247  Q
    |||| || || ||||| ||| |||||||||| || || || |  ||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  20748841 ttaaggtgaaggatgaggat-tgcagaagacggcctttaggacacgttacggtcactatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctgg 20748743  T
Q  248 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaa 347  Q
     ||||||||||||||||||||  | || |||||||| | | |||||  ||| || |||||||| || ||||| || || ||||| || |||||||| |||    
T  20748742 tgtgtttatggagtatatgaacagaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttaatttattctaagactgatgaa 20748643  T
Q  348 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagtt 447  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  | | || ||| ||||| ||||||||||||||||| |  || || ||||    
T  20748642 gagcatgcagagcatctgaagattgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtgtgtcaagttgtccaaatgtgaattctggttaagtgaagtaagtt 20748543  T
Q  448 ttcttggccatgttatttctg 468  Q
    ||||||||||| |||||||||    
T  20748542 ttcttggccatattatttctg 20748522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 56 - 468
Target Start/End: Original strand, 16070222 - 16070632
Alignment:
Q  56 gtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttgaggtcaagttatcaccagattaaagta 155  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||  | || |||||||||||||||||| |||| || |||||||| ||     
T  16070222 gtatccacttccgagaattgatgacttgatggaccagttagtgggtgctcgtgtgcttagtaaaattgatttgaggtcaggttaccatcagattaaggtg 16070321  T
Q  156 aaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgttta 255  Q
    || ||||| |||||||||||||| || || || |  || ||||| || ||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||  ||||||||    
T  16070322 aaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcct--agtgttta 16070419  T
Q  256 tggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgc 355  Q
    |||||||||||||  | || |||||||  | | |||||  ||| || |||||||| || ||||||||| | ||||| || |||||||||||||| |||||    
T  16070420 tggagtatatgaacagaattttccatgtctatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgatattctcatttattctaagactgaagaagagcatgc 16070519  T
Q  356 tgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggc 455  Q
     ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  | |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |  || || |||||||| ||     
T  16070520 agagtatctgaagattgtattgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtccaaatgtgagttctggttaagtgaagtaagttttctgggt 16070619  T
Q  456 catgttatttctg 468  Q
    ||| |||||||||    
T  16070620 catattatttctg 16070632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 30 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 14140029 - 14139585
Alignment:
Q  30 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttga 129  Q
    |||||||| || || || ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||| | |||||||||   ||||| || || ||||| ||||    
T  14140029 ttgaacaaagttacaattaagaataggtatccacttccgaggattgatgacttgatggaccagctggtgggtgcaaaggtttttagtaatattgacttga 14139930  T
Q  130 ggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttgg 229  Q
    ||||| |||| || || ||||| || || |||||||||||||||||||| || || || |  || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||    
T  14139929 ggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcgg 14139830  T
Q  230 tgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatt 329  Q
    |||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||| |||||  |||||| || || || || |||||||||||||||    
T  14139829 tgttactaacgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaatcgaatttttcatgcttttctggataaattcgtggtggtatttattgatgatattttgatt 14139730  T
Q  330 tactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattct 429  Q
    || || |||||||||||||| ||||| || |||||||  ||||| |||||||| |||||||| |||||  | |||||||||||||| |||||||| || |    
T  14139729 tattctaagactgaagaagagcatgcagaacatctgagaattgtgttgcaagtattgaaagaaaagaagttgtatgccaaattgtcaaaatgtgagtttt 14139630  T
Q  430 ggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    || | |  || || ||||| ||||| ||| ||||||||| |||||    
T  14139629 ggctaagtgaagtaagtttccttggtcatattatttctggtgatg 14139585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 26 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 13675806 - 13675364
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    |||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||| | ||||||||  | |||||||||||||||||||||   ||||||| ||| |||||     
T  13675806 tcagttgaacaaagttacaataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacataatggatcagttagtgggtgcaaaggttttcaacaagattgac 13675707  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||| |||| || |||||||| || || ||||| |||||| ||||||| || || || |  || ||||| || || ||||| || || |||||||    
T  13675706 ttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatggagaagacggcctttaggacacgatatggacattacgaatacaaggtgatgcctt 13675607  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| |   |||||  ||| || ||||| || || ||||| ||| |    
T  13675606 tcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggataaatttgtggttgtatttattgatgacattct 13675507  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||  | ||||| || ||||| || |||||     
T  13675506 gatttattcaaagactgaagaagagcatgcagagcatctgaagattgtattgcaagtattgaatgagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgag 13675407  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    |||||||| |  || ||||||| |||||||||  |||||||||    
T  13675406 ttctggttaagtgaagtgagttatcttggccacattatttctg 13675364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 48 - 468
Target Start/End: Original strand, 16948389 - 16948809
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttgaggtcaagttatcaccaga 147  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||| ||||||||| |||| || || |    
T  16948389 aagaataggtatccactcccgagaattgatgacttaatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcagcaagattgacttgaggtcaggttaccatcaaa 16948488  T
Q  148 ttaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctgg 247  Q
    |||| || || ||||| |||||||||||||| || || || |  || ||||| || || ||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  16948489 ttaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattacgaataaaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctgg 16948588  T
Q  248 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaa 347  Q
     |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||  ||| || |||||||| || ||||||||| ||||||| || || |  |||||     
T  16948589 cgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggttgtgtttattgatgatattctgatttattctaaaatcgaagag 16948688  T
Q  348 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagtt 447  Q
    || || || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||  | ||||| ||  |||| || ||||| || ||||| |  || |||||||    
T  16948689 gagcacgcagagcatctgaagattgtgttgcaagtcttgaaagaaaagaagttgtatgctaagctgtcaaagtgtgagttttggttaagtgaagtgagtt 16948788  T
Q  448 ttcttggccatgttatttctg 468  Q
    |||| |||||  |||||||||    
T  16948789 ttctgggccacattatttctg 16948809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 30 - 474
Target Start/End: Original strand, 23503769 - 23504213
Alignment:
Q  30 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttga 129  Q
    |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||| | |||||||| |||||||| ||| |||||||||||   || ||||| || ||||| ||||    
T  23503769 ttgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttgatggaccagctagtgggtgcaaaggtgttcagtaagattgacttga 23503868  T
Q  130 ggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttgg 229  Q
    ||||| |||| || || ||||| || ||||||||||||||||||||||| || || || |  || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||    
T  23503869 ggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcgg 23503968  T
Q  230 tgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatt 329  Q
    |||||| || || || || ||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||| |||||  |||||| || || || || ||||||||| |||||    
T  23503969 tgttactaacgcgcccggtgtgttcatggagtatatgaatcgaatttttcatgcttttctggataaattcgtggtggtatttattgatgatattctgatt 23504068  T
Q  330 tactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattct 429  Q
    || || |||||||||||||| ||||| || |||||||  ||||| |||||||| |||||||| | |||  | ||||||||| |||| |||||||| || |    
T  23504069 tattcgaagactgaagaagagcatgcagaacatctgagaattgtgttgcaagttttgaaagaaaggaagttgtatgccaaactgtcgaaatgtgagtttt 23504168  T
Q  430 ggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    || | |  || |||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||    
T  23504169 ggctaagtgaagtgagtttccttggtcatattatttctggtgatg 23504213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 26 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 13023711 - 13023269
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    |||||||||||| || || || |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||    || || ||||| |||||     
T  13023711 tcagttgaacaaagttacgataaagaatagatatccacttccgagaattgatgatttgatggatcaattggtgggtgcgaaggtgtttagcaagattgac 13023612  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||  |||| || ||||| || || || ||||| |||||||||||||| || || || |  || |||||||| || ||||| || || |||||||    
T  13023611 ttgaggtctggttaccatcagataaaggtgaatgatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctt 13023512  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | |||||||| ||||| ||||| || |||||| | |||||||| || || |||||||| ||| |||||  ||| || || ||||| || ||||||| |||    
T  13023511 tcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatgtattatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggtggtgtttattgatgataattt 13023412  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||||| || |||||||  ||||| |||||||| |||||||| |||||  | |||||||| ||||| ||||||||     
T  13023411 gatttattctaagactgaagaggagcatgcagaacatctgagaattgtattgcaagttttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgag 13023312  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    || ||||| |  || ||||||||||| || ||  |||||||||    
T  13023311 ttgtggttaagtgaagtgagttttctgggtcacattatttctg 13023269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 303 - 468
Target Start/End: Original strand, 11770435 - 11770600
Alignment:
Q  303 gttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaacttt 402  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |    
T  11770435 gttgtgttcatcgatgatattttgatatactccaagtctgagggagaacatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagttat 11770534  T
Q  403 atgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  11770535 atgttaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaggtaagttttcttggccatgttatttctg 11770600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 26 - 468
Target Start/End: Original strand, 11386324 - 11386766
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    |||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||| | ||||| || |||||||||||||| || ||||||    |||| || || |||||     
T  11386324 tcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccgcttccgaggattgacgacttgatggatcagttggttggtgcaaagatttttagtaagattgac 11386423  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||| |||| || ||||| || || || |||||||||||||||||||| |  || || |  |||| |||||| || ||||| || || |||||||    
T  11386424 ttgaggtcaggttaccatcagataaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggactttaggacacgttgtggtcattacgaatacaaggtgatgcctt 11386523  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | |||||||| ||||| || || || ||||||||||||| |||  | || || ||||| ||| ||||| ||||||| || ||||| || |||||||||||    
T  11386524 tcggtgttactaatgcgccaggtgtatttatggagtataagaacagaatttttcatgcttttctggatagattcgtggtggtgtttattgatgatatttt 11386623  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
     ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| || || ||  |||||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||||||    
T  11386624 aatttattctaagactgaagaagagcatgccgagcatctgaggattgtattacaggttctgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaaatgtgaa 11386723  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    |||||||| |  || ||||||||||| |||||  |||||||||    
T  11386724 ttctggttaagtgaagtgagttttctcggccacattatttctg 11386766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 26 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 12458994 - 12458587
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    |||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||| | ||||||||  | |||||||||||||| |||||    || ||||| || || |||    
T  12458994 tcagttgaacaaagttacaataaagaacaggtatccgcttccgaggattgatgacctaatggatcagttagtaggtgcgaaagtgttcagtaagatcgat 12458895  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||  |||| || ||||| || || |||||||| |||||||||||||| || || ||||  || |||||||| || ||||| ||||| |||||||    
T  12458894 ttgaggtctggttaccatcagataaaggtgaaagatgaggatatgcagaagacggcctttagaacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctt 12458795  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||| ||||    ||||||||||| ||| |||||   ||||| |||||||| || |||||||||||    
T  12458794 tcggtgttactaacgcgcctggtgtgttcatggagtatttgaacataatcttccatgcttttctggataatttcgttgttgtgtttattgatgatatttt 12458695  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
     || || ||||||| |||||| || ||||| ||||||||||  ||||| |||||||| |||||||| |||||  | ||||| || ||||| ||||||||     
T  12458694 aatctattccaagaatgaagaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagttttgaaagaaaagaagttgtatgcaaagttgtcaaaatgtgag 12458595  T
Q  426 ttctggtt 433  Q
    ||||||||    
T  12458594 ttctggtt 12458587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 26 - 433
Target Start/End: Original strand, 13966563 - 13966970
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    |||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||  ||||||| || |||||||||||||| || |||||     |||| || || ||||||    
T  13966563 tcagttgaacaaagtcacgataaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaaaatttttagtaagattgat 13966662  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||  |||| || |||||||| || || ||||| ||||||||||||||  | || || |  ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  13966663 ttgagatctggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacgacctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 13966762  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | |||||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||| |||||   || || || ||||| || |||||||| ||    
T  13966763 tcggtgttactaacgcgcctggtgtgtttatggagtacatgaaccgaatcttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatctt 13966862  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
     ||||| ||||||| |||||| || ||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||   | ||||| || ||||| ||||||||     
T  13966863 aatttattccaagaatgaagaggagcatgcagagcatctgagaattgtcttgcaagttttgaaagagaagaggttgtatgctaagttgtcaaaatgtgag 13966962  T
Q  426 ttctggtt 433  Q
    ||||||||    
T  13966963 ttctggtt 13966970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 26 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 15342785 - 15342343
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    |||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||| || | ||| |||| |||||||||||||| || ||||||    ||||||| || |||||     
T  15342785 tcagttgaacaaagttacaataaagaacaggtatccgctttcgaggatttatgacttgatggatcagttggttggtgcaaagattttcagtaagattgac 15342686  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||  |||| || || ||||| || || |||||||||||||||||||| || || || |  ||||||||||| || ||||| || || |||||||    
T  15342685 ttgaggtctggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgaatacaaggtgatgcctt 15342586  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  | || |||||||  ||| |||||   || || ||||| ||||| || |||||  |    
T  15342585 tcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaactgaattttccatgtctttctggataagtttgtggttgtattcattgacgatatcct 15342486  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
     ||||| || |||||| |||| || ||||| || ||||||| |||||| ||||||||  |||||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||||||    
T  15342485 aatttattctaagactaaagaggagcatgcagaacatctgaggattgtattgcaagtactgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaaatgtgaa 15342386  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    |||||||| |  || |||||||||||||||||  |||||||||    
T  15342385 ttctggttaagtgaagtgagttttcttggccacattatttctg 15342343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 26 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 19615029 - 19614587
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    ||||||||| || || || || ||||| || ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||| || ||||||    |||| || ||||||||     
T  19615029 tcagttgaataaagttacgataaagaacagatatccgcttccgagaattgacgacctgatggatcagttggttggtgcaaagatttttagtaaaattgac 19614930  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||| |||| || ||||| || || |||||||| || ||||||||||| || || || |  || |||||||| || |||||||| || |||||||    
T  19614929 ttgaggtcaggttaccatcagatcaaggtgaaagatgaggacatgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctt 19614830  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  | || || ||||| |   |||||  ||| || ||||| ||||| ||||| |||||    
T  19614829 tcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaacagaatttttcatgcttacctggataaatttgtggttgtattcattgatgacatttt 19614730  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
    ||| || || |  ||||| ||||| ||||| || ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||| || || ||     
T  19614729 gatctattcgagaactgaggaagagcatgcagaacatctgaggattgtattgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcaaagtgcgag 19614630  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    || ||||| |  || |||||||||||||||||| |||||||||    
T  19614629 ttttggttaagtgaagtgagttttcttggccatattatttctg 19614587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 30 - 474
Target Start/End: Original strand, 18051852 - 18052296
Alignment:
Q  30 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttga 129  Q
    |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||| | |||||||| |||||||| ||| |||||||||||   || ||||| || ||||| ||||    
T  18051852 ttgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttgatggaccagctagtgggtgcaaaggtgttcagtaagattgacttga 18051951  T
Q  130 ggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttgg 229  Q
    ||||| |||| || || ||||| || || ||||| |||||||||||||| || || || |  || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||    
T  18051952 ggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcgg 18052051  T
Q  230 tgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatt 329  Q
    |||||| || || || || || || ||||||||||||||||| || || ||||| ||| |||||  |||||| || || || || ||||| ||| |||||    
T  18052052 tgttactaacgcgcccggtgtattcatggagtatatgaatcgaatttttcatgcttttctggataaattcgtggtggtatttattgatgacattctgatt 18052151  T
Q  330 tactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattct 429  Q
    || || |||||||||||||| ||||| || |||||||  ||||| |||||||| |||||||| | |||  | ||||||||| |||| |||||||| || |    
T  18052152 tattcgaagactgaagaagagcatgcagaacatctgagaattgtgttgcaagttttgaaagaaaggaagttgtatgccaaactgtcgaaatgtgagtttt 18052251  T
Q  430 ggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    || | |  || |||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||    
T  18052252 ggctaagtgaagtgagtttccttggtcatattatttctggtgatg 18052296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 26 - 433
Target Start/End: Original strand, 26116485 - 26116892
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||||| |||||  ||||||| || |||||||||||||| || |||||     ||||||| || ||||||    
T  26116485 tcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagattttcagtaagattgat 26116584  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||  ||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||| || || || |  | ||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  26116585 ttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacattatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 26116684  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | |||||||| || || ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||   ||  | || ||||| || || ||||||||    
T  26116685 tcggtgttactaacgcgcctggtgtttttatggagtacatgaatcgaatcttccatgcttttctggataagtttcttgtggtgtttattgacgatatttt 26116784  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
     || || ||||||| ||| || || ||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||| || ||||   | ||||| || ||||| ||||||||     
T  26116785 aatctattccaagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtgttgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgcaaagttgtcgaaatgtgag 26116884  T
Q  426 ttctggtt 433  Q
    ||||||||    
T  26116885 ttctggtt 26116892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 26 - 468
Target Start/End: Original strand, 26092693 - 26093135
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||||| |||||  ||||||| || |||||||||||||| || |||||     |||| || || ||||||    
T  26092693 tcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagatttttagtaagattgat 26092792  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||  ||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||| || || || |  ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  26092793 ttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 26092892  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||| |||||   || || || ||||| || |||||||||||    
T  26092893 tcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatttt 26092992  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
     || || ||||||| ||| || || ||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||| || ||||   | ||||| || || || ||||||||     
T  26092993 aatctattccaagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttatcaaaatgtgag 26093092  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    |||||||| || || || |||||||| || ||  |||||||||    
T  26093093 ttctggttaaatgaagtaagttttctgggtcacattatttctg 26093135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 26 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 49154655 - 49154213
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||||| |||||  ||||||| || |||||||||||||| || |||||     | || || || ||||||    
T  49154655 tcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagatatttagtaagattgat 49154556  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||  ||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||| || || || |  ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  49154555 ttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 49154456  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | |||||||| ||||| ||||| || ||||||| ||| ||||| || || |||||||| ||| |||||   || || || ||||| || |||||||||||    
T  49154455 tcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggggtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatttt 49154356  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
     || || ||||||| ||| || || ||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||| || ||||   | ||||| || || || ||||||||     
T  49154355 aatctattccaagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttatcaaaatgtgag 49154256  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    |||||||| || || || |||||||| || ||  |||||||||    
T  49154255 ttctggttaaatgaagtaagttttctgggtcacattatttctg 49154213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 159 - 468
Target Start/End: Original strand, 14284404 - 14284713
Alignment:
Q  159 gatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatgg 258  Q
    |||||||||||||||||||| || || || |  |||||| |||| || |||||||| || |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||    
T  14284404 gatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttattgtcattacgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggcgtgttcatgg 14284503  T
Q  259 agtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctga 358  Q
    ||||||| ||  | || || ||||| ||  |||||   || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||| || ||| | ||    
T  14284504 agtatataaacaggatttttcatgctttcctggataagtttgtggttgtattcattgatgacattttgatttattctaagactgaagaggagcatacaga 14284603  T
Q  359 gcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccat 458  Q
     ||||||| |||| | |||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||| |||| ||| |  || |||||||||||||||||     
T  14284604 acatctgaggattatattgcaagtattgaaagagaagaagctgtatgctaagttgtcgaaatgtgagttctagttaagtgaagtgagttttcttggccac 14284703  T
Q  459 gttatttctg 468  Q
     |||||||||    
T  14284704 attatttctg 14284713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 27 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 7826252 - 7825812
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||   || || || || |||||||    
T  7826252 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 7826153  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| | ||||| ||||||| |||||| |  ||||||||    || || || ||| ||| | | ||||| |||||||| |||   || ||||| ||    
T  7826152 tgagatcaggatatcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatt 7826053  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    ||| ||  | |||||||| || || |||||||| || |||||| | || || ||| | | | |||| || || || || |||||||| ||||||||||||    
T  7826052 tggagtatctaatgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttg 7825953  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
     | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||  |  | | |||||| |||||||| ||||| |    
T  7825952 gtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagt 7825853  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttct 467  Q
    | |||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  7825852 tttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 7825812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 27 - 467
Target Start/End: Original strand, 27105692 - 27106132
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||   || || || || |||||||    
T  27105692 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 27105791  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| | ||||| ||||||| |||||| |  ||||||||    || || || ||| ||| | | ||||| |||||||| |||   || ||||| ||    
T  27105792 tgagatcaggatatcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatt 27105891  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    ||| ||  | |||||||| || || |||||||| || |||||| | || || ||| | | | |||| || || || || |||||||| ||||||||||||    
T  27105892 tggagtatctaatgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttg 27105991  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
     | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||  |  | | |||||| |||||||| ||||| |    
T  27105992 gtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagt 27106091  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttct 467  Q
    | |||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  27106092 tttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 27106132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 27 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 27172633 - 27172193
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||   || || || || |||||||    
T  27172633 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 27172534  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| | ||||| ||||||| |||||| |  ||||||||    || || || ||| ||| | | ||||| |||||||| |||   || ||||| ||    
T  27172533 tgagatcaggatatcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatt 27172434  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    ||| ||  | |||||||| || || |||||||| || |||||| | || || ||| | | | |||| || || || || |||||||| ||||||||||||    
T  27172433 tggagtatctaatgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttg 27172334  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
     | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||  |  | | |||||| |||||||| ||||| |    
T  27172333 gtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagt 27172234  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttct 467  Q
    | |||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  27172233 tttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 27172193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 26 - 468
Target Start/End: Original strand, 11301108 - 11301550
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    |||||||||||| || || |||||||| || ||||| |||||  ||||||| || |||||||||||||| || |||||     | || || || ||||||    
T  11301108 tcagttgaacaaagttacgatcaagaacagatatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagatatttagtaagattgat 11301207  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||  |||| || ||||| || || || ||||| |||||||||||||| || || || |  ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  11301208 ttgaggtctggttaccatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 11301307  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||| |||||   || || || ||||| || |||||||| ||    
T  11301308 tcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatctt 11301407  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
     ||||| ||||||| ||| || || ||||| ||||||||||  || || |||||||||||||| || ||||   | ||||| || ||||| ||||||||     
T  11301408 aatttattccaagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaatagtgttgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttgtcaaaatgtgag 11301507  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
     ||||||| || || || |||||||| || ||  |||||||||    
T  11301508 atctggttaaatgaagtaagttttctgggtcacattatttctg 11301550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 375 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 14213678 - 14213579
Alignment:
Q  375 ttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14213678 ttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtcaaagtgtgaattctggttgaaagaagtaagttttcttggccatgttatttctggtgatg 14213579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 389 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 8200618 - 8200533
Alignment:
Q  389 agagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  8200618 agagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggtgatg 8200533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 27 - 130
Target Start/End: Original strand, 11770320 - 11770423
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||| |||    
T  11770320 cagttgaacaaagtaacgataaagaataggtatccacttccaagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgctcgtgtgtttagcaagattaatt 11770419  T
Q  127 tgag 130  Q
    ||||    
T  11770420 tgag 11770423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 26 - 86
Target Start/End: Original strand, 16727300 - 16727360
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatg 86  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  16727300 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttctgagaattgatgatttgatg 16727360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 26 - 86
Target Start/End: Original strand, 17704372 - 17704432
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatg 86  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  17704372 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttctgagaattgatgatttgatg 17704432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 421 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 13688022 - 13687969
Alignment:
Q  421 gtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  13688022 gtgaattctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggtgatg 13687969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 4442280 - 4442150
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||| ||||| || || |||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| | || |||||    || || || || |||||||    
T  4442280 cagttgaagaaggtgacgattaagaatcggtatccgcttccgaggattgatgatttgatggatcagctggttggtgcggaagtgtttagtaagattgatt 4442181  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaa 157  Q
    |||| ||| | ||||| ||||||| ||||||    
T  4442180 tgagatcaggatatcatcagattagagtaaa 4442150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 173 - 326
Target Start/End: Original strand, 39210 - 39363
Alignment:
Q  173 gaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgc 272  Q
    |||||| || |||||||  ||||||||||| ||||| |||   || ||||||||||| ||  |||| || || ||||| |||||||||||||||||  |     
T  39210 gaagactgccttcagaacccgttatggtcattatgagtattcggtgatgccttttggagtgtccaacgcgccaggagtttttatggagtatatgaacaga 39309  T
Q  273 atcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    || |||||| ||| ||| ||||  ||||| || || ||||| ||||||||||||    
T  39310 attttccatccatatttagatcagttcgttgtagtattcattgatgatattttg 39363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 17926001 - 17925879
Alignment:
Q  28 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgattt 127  Q
    ||||||||||||| || || ||||||  |||||| |||||| | ||||||||||||| ||||||| | || ||||     || || || |||||||||||    
T  17926001 agttgaacaaggtgacgattaagaatcagtatccgcttccgaggattgatgatttgagggatcagctggttggtgtggaagtatttagtaaaattgattt 17925902  T
Q  128 gaggtcaagttatcaccagatta 150  Q
    ||| ||||| ||||| |||||||    
T  17925901 gagatcaagatatcatcagatta 17925879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 13379235 - 13379170
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcag 92  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||   ||||| |||||  | |||||||||||||||||||||    
T  13379235 cagttgaacaaggtgactattaagaatctttatcctcttccaaggattgatgatttgatggatcag 13379170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 404; Significance: 0; HSPs: 44)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 404; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 474
Target Start/End: Original strand, 21143490 - 21143937
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21143490 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatcaacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatt 21143589  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21143590 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatacagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 21143689  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21143690 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 21143789  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  21143790 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgagt 21143889  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21143890 tctggttgaaagaagtgagttttcttggccatgttatttctggtgatg 21143937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 384; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 474
Target Start/End: Original strand, 24875199 - 24875646
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24875199 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcgattagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatt 24875298  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24875299 tgaggtcaggttatcatcagattaaagtaaaagatgaggatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 24875398  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  24875399 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtattcattgatgatattttg 24875498  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  24875499 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgagt 24875598  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24875599 tctggttgaaagaagtgagttttcttggccatgttatttctggtgatg 24875646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Original strand, 44384019 - 44384458
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  44384019 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 44384118  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44384119 tgagattaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 44384218  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44384219 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgacgatattttg 44384318  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  44384319 atctactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 44384418  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttc 466  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  44384419 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttc 44384458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 467
Target Start/End: Original strand, 41606834 - 41607274
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  41606834 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtttttagcaagattgatt 41606933  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41606934 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 41607033  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||    
T  41607034 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcacatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 41607133  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  41607134 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaat 41607233  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttct 467  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  41607234 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttct 41607274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 24264364 - 24263917
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24264364 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatt 24264265  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24264264 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 24264165  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || || |||||||| ||||| |||||||||    
T  24264164 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggattggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 24264065  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  24264064 atttactccaagactgaagaggaacatgttgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaat 24263965  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  24263964 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggtgatg 24263917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 27373263 - 27372816
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  27373263 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgtgtttttagcaagattgatt 27373164  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27373163 tgaggtcaggatatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 27373064  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||    
T  27373063 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggaatatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 27372964  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  27372963 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaat 27372864  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  27372863 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggtgatg 27372816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 16927354 - 16926915
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  16927354 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 16927255  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16927254 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 16927155  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  16927154 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatcgacgatattttg 16927055  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  16927054 atctactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaat 16926955  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttc 466  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  16926954 tctggttgaaagaggtgagtttccttggccatgttatttc 16926915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 17000994 - 17000555
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  17000994 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 17000895  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17000894 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 17000795  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  17000794 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatcgacgatattttg 17000695  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  17000694 atctactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaat 17000595  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttc 466  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  17000594 tctggttgaaagaggtgagtttccttggccatgttatttc 17000555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 24712027 - 24711581
Alignment:
Q  28 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgattt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  24712027 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgagttttcagcaagattgattt 24711928  T
Q  128 gaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttt 227  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24711927 gagatcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttc 24711828  T
Q  228 ggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttga 327  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||    
T  24711827 ggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcattttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttga 24711728  T
Q  328 tttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaatt 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  24711727 tttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaatt 24711628  T
Q  428 ctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  24711627 ctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggtgatg 24711581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 9486210 - 9485763
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  9486210 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 9486111  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9486110 tgagatcaggctatcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccctt 9486011  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  9486010 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatcgacgatattttg 9485911  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  9485910 atctactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaat 9485811  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  9485810 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggtgatg 9485763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 10870844 - 10870405
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  10870844 cagttgaacaaggtaactatcaagaacaggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggagcacgagttttcagcaagattgatt 10870745  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10870744 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 10870645  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||    
T  10870644 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 10870545  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  10870544 atctactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgcgaaattgtctaagtgtgaat 10870445  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttc 466  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  10870444 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttc 10870405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 27220010 - 27219571
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  27220010 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 27219911  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27219910 tgagatcaggctatcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgatatggtcactatgaatataaagttatgccttt 27219811  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||    
T  27219810 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 27219711  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  27219710 atctactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaat 27219611  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttc 466  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  27219610 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttc 27219571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 468
Target Start/End: Original strand, 21323715 - 21324156
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21323715 cagttaaacaaggtaactatcaagaatagatatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatt 21323814  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  21323815 tgagatcgggttatcaccagattaaggtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacacgttatggccactatgagtataaagttatgccttt 21323914  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  21323915 tggtgttaccaatacacctggagtatttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggattggttcgtagttgttttcatcgacgatattttg 21324014  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||| |    
T  21324015 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaggagaagaaactttatgctaaactatctaagtgtgagt 21324114  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||    
T  21324115 tctggttgaaagaggtaagttttcttggccatgtcatttctg 21324156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 24677484 - 24677036
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||| ||||||    
T  24677484 tcagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagatttcagcaagattgat 24677385  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24677384 ttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagatagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatacaaagttatgcctt 24677285  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  24677284 tcggtgttacgaatgcacctgtagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtggtttttttcatcgatgatatttt 24677185  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||     
T  24677184 aatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttaaaagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgag 24677085  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  24677084 ttctggttgaaagaggtaagttttctgggccatgttatttctggtgatg 24677036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 474
Target Start/End: Original strand, 24705931 - 24706378
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    ||||||||||| |||||||    
T  24705931 cagttgaacaaggtaactatcaaaaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggattagttagtgggtgcgaaagttttcagcaagattgatt 24706030  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24706031 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaaaaagaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 24706130  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| || |||||||||||||| ||||| | ||| ||||| ||||||||||||    
T  24706131 tggtgttaccaatgtacctggagtgtttatggagtacatgaatcatatctttcacgcatttttggatcggttcgtggctgttttcattgatgatattttg 24706230  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  24706231 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatctaaatgtgagt 24706330  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24706331 tctggttgaaagaggtaagttttcttggccatgttatttctggtgatg 24706378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 60 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 23189879 - 23189466
Alignment:
Q  60 ccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaag 159  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  23189879 ccacttccgagaattgatgatttgatggatcggttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgacttgaggttaggttatcactagattaaagtaaaag 23189780  T
Q  160 atgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatgga 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23189779 atgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatgga 23189680  T
Q  260 gtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgag 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23189679 gtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatagacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgag 23189580  T
Q  360 catctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatg 459  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||  | || |||||||| |||||||    
T  23189579 catctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtg-attctggttgaagaaagtaagttttctgggccatg 23189481  T
Q  460 ttatttctgatgatg 474  Q
    ||||||||| |||||    
T  23189480 ttatttctggtgatg 23189466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 27 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 9337576 - 9337206
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  9337576 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 9337477  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9337476 tgagatcaggctatcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccctt 9337377  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||    
T  9337376 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 9337277  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaa 397  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9337276 atctactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaa 9337206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 30 - 468
Target Start/End: Original strand, 22734226 - 22734664
Alignment:
Q  30 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttga 129  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| || |||||||    
T  22734226 ttgaacaaggtaacaataaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtacaagtgttttcaacaagatagatttga 22734325  T
Q  130 ggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttgg 229  Q
    | ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||||| || |||||||||||||| ||    
T  22734326 gatcaggttatcaccatattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacaactttcagaacgcgttatggacattatgagtacaaagttatgcctttcgg 22734425  T
Q  230 tgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatt 329  Q
    |||||  |||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| |||    
T  22734426 tgttataaatgcacctggagtatttatgtagtacatgaatcgcatctttcatgaatttttggatcggttcgtggttgtttttattgatgatattttaatt 22734525  T
Q  330 tactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattct 429  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  22734526 tactccaagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaagtgtaaattct 22734625  T
Q  430 ggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  22734626 ggttgaaagaagtgagctttcttggacatgttatttctg 22734664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 27 - 468
Target Start/End: Original strand, 23106177 - 23106618
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||||   ||||||||||| || ||||    
T  23106177 cagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttccgaggattgatgacttgatggatcagttggtgggtgcaaaagttttcagcaagatagatt 23106276  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  23106277 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagcttttagaacgcggtatggtcactatgagtacaaagttatgccttt 23106376  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  23106377 cggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatttttcatgcatttttggatcagttcgtggttgttttcattgatgatattttg 23106476  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||    
T  23106477 atttactccaagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaagtgcgaat 23106576  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  23106577 tatggttaaaagaagtgagctttcttggacatgttatttctg 23106618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 27 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 23073857 - 23073416
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| || |||     
T  23073857 cagttgaacaaagtaacaataaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaagtattttcagcaagatagatc 23073758  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  23073757 tgagatcgggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgatatggccattatgaatacaaagttatgccttt 23073658  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  23073657 cggtgttacaaatgcacctggagtatttatggagtacatgaaccgcatctttcatgcatttttggaatgtttcgtggttgttttcattgatgatattttg 23073558  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||   ||| ||||| | || || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  23073557 atttactccaagtctgaagaagaacatactagccatttgaagttggttttccaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaat 23073458  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  23073457 tctggttgaaagaagtgagctttcttggacatgttatttctg 23073416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 27 - 468
Target Start/End: Original strand, 24818679 - 24819120
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  24818679 cagttgaataaggtaacgataaagaataggtatccacttccaagaactgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtattcagcaagattgatt 24818778  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || |  |||||||| || || ||||||  ||| ||||||||    
T  24818779 tgagatcgggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggacattacgaatattcagtgatgccttt 24818878  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     |||||||| ||||| || || ||||||||||||||  ||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||    
T  24818879 cggtgttacaaatgcgccaggtgtgtttatggagtacttgaatcgtatttttcatgcgtatttagatcgcttcatggttgtgttcattgatgatattttg 24818978  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||| || ||||| || ||||||     
T  24818979 atatactctaagactgaagaagaacatgctgagcatttgaggattgtcttgcaagtgctgaaggagaagaagctttatgctaagttgtcaaagtgtgaac 24819078  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  24819079 tctggttgaatgaagtaagttttcttggccatgttatttctg 24819120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 48 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 23112712 - 23112290
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat---ttgaggtcaagttatcacc 144  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||   ||||||||  |||| || |    
T  23112712 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttaatggatcagttagtgggtgcacgcatattcagcaagattgatgatttgaggtcgggttaccatc 23112613  T
Q  145 agattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacc 244  Q
    ||||||| || ||||||||||||||| |||| || || || || | ||| ||||| || |||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||| ||    
T  23112612 agattaaggtgaaagatgaagatatgtagaaaacggcctttaggacgcgatatggacattatgaatataaagtgatgtctttcggtgttactaatgcgcc 23112513  T
Q  245 tggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaa 344  Q
    | | |||||||||||||| |||||| | || |||||||| | | ||||||  || ||||||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||||    
T  23112512 tagtgtgtttatggagtacatgaatagaattttccatgcttatctggatcagtttgtagttgtgtttattgatgatatcttgatttattctaagactgaa 23112413  T
Q  345 gaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtga 444  Q
    ||||| ||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||| || |||||  | |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |  || || |    
T  23112412 gaagagcatgcagagcatttaaagattgtgttgcaagtgttgaaggaaaagaagttgtatgccaagttgtccaaatgtgaattctggttaagtgaagtaa 23112313  T
Q  445 gttttcttggccatgttatttct 467  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  23112312 gttttcttggccatattatttct 23112290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 26 - 468
Target Start/End: Original strand, 19650498 - 19650940
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    |||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||   |||||||| || |||||     
T  19650498 tcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcagttagtgggtgcaaaggttttcagtaagattgac 19650597  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    |||| |||| |||| || |||||||| || || ||||||||||||||||||||  | || || |  || |||||||| || || || || || |||||||    
T  19650598 ttgaagtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacgacctttaggacacgatatggtcattacgagtacaaggtgatgcctt 19650697  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | ||||| || || || ||||| ||||| |||||||||||||| |  || |||||||| |||||||||  ||| || |||||||| || ||||||||| |    
T  19650698 tcggtgtcactaacgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccaaattttccatgcttttttggataaatttgtggttgtgtttattgatgatattct 19650797  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
     ||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||  | ||||| || ||||| ||||||||     
T  19650798 aatttattctaagaccgaagaggagcatgcagagcatctgaagattgtattgcaagttttgaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcaaaatgtgag 19650897  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    |||| ||| |  || || ||||||||||||||  |||||||||    
T  19650898 ttctagttaagtgaagtaagttttcttggccacattatttctg 19650940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 302 - 474
Target Start/End: Original strand, 22323580 - 22323752
Alignment:
Q  302 agttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactt 401  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  22323580 agttgtgtttatcgacgatatcttgatttactccaagactgaagaagaacatgccgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctt 22323679  T
Q  402 tatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||    
T  22323680 tatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttgtttctggtgatg 22323752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 26 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 25255914 - 25255657
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25255914 tcagttgaacaaggttacgataaagaataggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcagttagtgggtgcacgtgtgttcagcaaaattgat 25255815  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||| |||| || |||||||| || || ||||| |||||||||||||| || || || |  || |||||||| || |||||||| || |||||||    
T  25255814 ttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctt 25255715  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgc 283  Q
    | |||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  25255714 tcggtgttactaatgcgcttggtgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgc 25255657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 30 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 27789731 - 27789287
Alignment:
Q  30 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttga 129  Q
    |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||| | |||||||| |||||||| ||| |||||||||||   || ||||| || ||||| ||||    
T  27789731 ttgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttgatggaccagctagtgggtgcaaaggtgttcagtaagattgacttga 27789632  T
Q  130 ggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttgg 229  Q
    ||||| |||| || || ||||| || ||||||||||||||||||||||| || || || |  || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||    
T  27789631 ggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcgg 27789532  T
Q  230 tgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatt 329  Q
    |||||| || || || || ||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||| |||||  |||||| || || || || ||||||||| |||||    
T  27789531 tgttactaacgcgcccggtgtgttcatggagtatatgaatcgaatttttcatgcttttctggataaattcgtggtggtatttattgatgatattctgatt 27789432  T
Q  330 tactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattct 429  Q
    || || |||||||||||||| ||||| || |||||||  |||||  ||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||| || |    
T  27789431 tattcgaagactgaagaagagcatgcagaacatctgagaattgtgctgcaagttttgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcgaaatgtgagtttt 27789332  T
Q  430 ggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    || | |  || |||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||    
T  27789331 ggctaagtgaagtgagtttccttggtcatattatttctggtgatg 27789287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 30 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 12576344 - 12575900
Alignment:
Q  30 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttga 129  Q
    |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||| | |||||||| |||||||| ||| |||||||||||   || ||||| || ||||| ||||    
T  12576344 ttgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttgatggaccagctagtgggtgcaaaggtgttcagtaagattgacttga 12576245  T
Q  130 ggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttgg 229  Q
    ||||| |||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| || || || |  || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||    
T  12576244 ggtcaggttaccaccaaattaaggtgaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcgg 12576145  T
Q  230 tgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatt 329  Q
    |||||| || || || || || || ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||  |||||| || || || || ||||| ||| |||||    
T  12576144 tgttactaacgcgcccggtgtattcatggagtatatgaatcgaatttttcatgcttttttggataaattcgtggtggtatttattgatgacattctgatt 12576045  T
Q  330 tactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattct 429  Q
    || || |||||||||||||| ||||| || |||||||  ||||| |||||||| |||||||| | |||  | ||||||||| |||| ||||||||||| |    
T  12576044 tattcgaagactgaagaagagcatgcagaacatctgagaattgtgttgcaagttttgaaagaaaggaagttgtatgccaaactgtcgaaatgtgaatttt 12575945  T
Q  430 ggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    || | |  || |||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||    
T  12575944 ggctaagtgaagtgagtttccttggtcatattatttctggtgatg 12575900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 26 - 468
Target Start/End: Original strand, 23098466 - 23098908
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    |||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||| | | ||||| || |||||||||||||| || ||||||    |||| || || |||||     
T  23098466 tcagttgaacaaagtgacgataaagaacaggtatccgcttctgaggattgacgacttgatggatcagttggttggtgcaaagatttttagtaagattgac 23098565  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||| | || || ||||| || || || |||||||||||||||||||| || || || |  ||||||||||| || ||||| || || |||||||    
T  23098566 ttgaggtcaggataccatcagataaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgaatagaaggtgatgcctt 23098665  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||| | || || ||||| ||| ||||| ||||||| || ||||| || |||||||||||    
T  23098666 tcggtgttactaatgcgcctggtgtatttatggagtatatgaataggatttttcatgcttttctggatagattcgtggtggtgtttattgatgatatttt 23098765  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
     ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| || || ||  |||||||||| |   | ||||| || ||||| |||||||||    
T  23098766 aatttattctaagactgaagaagagcatgccgagcatctgaggattgtattacaggttctgaaagagaaaatgttgtatgctaagttgtcgaaatgtgaa 23098865  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    |||||||| |  || ||||||||||| |||||  |||||||||    
T  23098866 ttctggttaagtgaagtgagttttctcggccacattatttctg 23098908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 26 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 23278771 - 23278340
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    |||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||| || || |||||     
T  23278771 tcagttgaacaaagttacaatcaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtttttagtaagattgac 23278672  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    |||| |||| |||| || || ||||| || || ||  | ||||||||||||||  | || || |  || ||||| || || ||||| || || |||||||    
T  23278671 ttgaagtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggacaaggatatgcagaagacgacctttaggacacgatatggacattacgaatacaaggtgatgcctt 23278572  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| | | |||||   ||||| ||||| || || ||||| ||| |    
T  23278571 tcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttatctggataatttcgtggttgtttttattgatgacattct 23278472  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||  | ||||| || ||||| || || ||     
T  23278471 gatttattctaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtgttgcaaatattgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaagtgcgag 23278372  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttcttggcca 457  Q
    |||||||| |  || ||||||||||| |||||    
T  23278371 ttctggttaagtgaagtgagttttctaggcca 23278340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 48 - 451
Target Start/End: Original strand, 30209387 - 30209790
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttgaggtcaagttatcaccaga 147  Q
    ||||||| ||||||||||||| | || || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||| | ||||||||||    
T  30209387 aagaataagtatccacttccgaggatcgaagatttgatggatcagttagtgggtgcgcgtgtgttcagtaaaattgagttaaggtcaggctatcaccaga 30209486  T
Q  148 ttaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctgg 247  Q
    | ||||| |||||||| ||||| |||||||| || || || |  |||||  | || ||  |||||   || |||||||| |||||||| ||||| |  ||    
T  30209487 tcaaagtgaaagatgaggatattcagaagacggcctttaggacacgttacagacattacaaatattttgtgatgcctttcggtgttactaatgcgctggg 30209586  T
Q  248 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaa 347  Q
    |||||||||||| ||||||||||  || || ||| | | | ||||||| || || |||||||| || |||||||||||||| ||||||||| | || ||     
T  30209587 agtgtttatggaatatatgaatcatatttttcatacttatctggatcgttttgttgttgtgtttatagatgatattttgatatactccaagtccgaggag 30209686  T
Q  348 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagtt 447  Q
    |||||||  || ||| |||  ||||| || |||||| |||||||||||||  | | |||||| || || || || |||||||||||||| || |||||||    
T  30209687 gaacatgtcgaacatttgagaattgtttttcaagtgctgaaagagaagaagttatctgccaagttatcgaagtgcgaattctggttgaacgaagtgagtt 30209786  T
Q  448 ttct 451  Q
    ||||    
T  30209787 ttct 30209790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 26 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 1065746 - 1065384
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||||| |||||  ||||||| || |||||||||||||| || |||||     ||||||| || ||||||    
T  1065746 tcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagattttcagtaagattgat 1065647  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||  ||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||| || || || |  ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  1065646 ttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 1065547  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||   || || || || || || |||||||||||    
T  1065546 tcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaatcgaatcttccatgcttttctggataagtttgtggtggtatttattgatgatatttt 1065447  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaa 388  Q
     || || ||||||| ||| || || ||||| ||||||||||  || || ||||||||||||||    
T  1065446 aatctattccaagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaatagtgttgcaagtgttgaa 1065384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 48 - 468
Target Start/End: Original strand, 30010654 - 30011074
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttgaggtcaagttatcaccaga 147  Q
    ||||||| ||||||||||||| | || || ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || || | | | ||||||||||    
T  30010654 aagaataagtatccacttccgaggatcgacgatttgatggatccgttagtgggtgcgcgtgtgttcagtaaaatggacttaagattaggctatcaccaga 30010753  T
Q  148 ttaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctgg 247  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||||||  | || || |  ||||| || || || ||||||   || ||||||||  ||||||| ||||| || ||    
T  30010754 ttaaagtgaaagatgaggatattcagaagacgacctttaggacacgttacggacattacgaatattctgtgatgcctttcagtgttactaatgcgccagg 30010853  T
Q  248 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaa 347  Q
    |||||||||| | ||||||||||| || || ||| | | | ||||||| || || || ||||| || |||||||||||||| ||||||||| | || ||     
T  30010854 agtgtttatgaaatatatgaatcgtatttttcatacttatctggatcgttttgttgtcgtgtttatagatgatattttgatatactccaagtccgaggag 30010953  T
Q  348 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagtt 447  Q
    |||||||  |||||| |||  ||||| ||||||||| || ||||||||||  | |||||||| || || |  || |||||||||||||| || |||||||    
T  30010954 gaacatgtcgagcatttgagaattgttttgcaagtgctgcaagagaagaagttatatgccaagttatcgatgtgcgaattctggttgaacgaagtgagtt 30011053  T
Q  448 ttcttggccatgttatttctg 468  Q
    |||| || ||| |||||||||    
T  30011054 ttctcggtcatattatttctg 30011074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 26 - 433
Target Start/End: Original strand, 19717465 - 19717872
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    |||||||||||| || || || ||||| || |||||||||| | | |||||||| |||||||||||||| |||||||||   ||||| | ||| |||||     
T  19717465 tcagttgaacaaagttacgataaagaacagatatccacttctgaggattgatgacttgatggatcagttggtgggtgcaaaggtttttaacaagattgac 19717564  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||| |||| || ||||| ||  | || ||||| |||||||| ||||| || || || |  || |||||||| || ||||| || || |||||||    
T  19717565 ttgaggtcaggttaccatcagatcaagttgaaggatgaggatatgcacaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctt 19717664  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | |||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||  |||    |||||||| || ||||||||| |    
T  19717665 tcggtgttactaaagcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaattttgggttgtgtttattgatgatattct 19717764  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
     ||||| || |||||||||||  | ||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||||     
T  19717765 aatttattctaagactgaagatcagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagttttgaaagaaaagaagctgtatgctaagttgtcgaagtgtgag 19717864  T
Q  426 ttctggtt 433  Q
    ||||||||    
T  19717865 ttctggtt 19717872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 26 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 31832653 - 31832246
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||||| |||||  ||||||| || ||||||||||| || || |||||     |||| || || ||||||    
T  31832653 tcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcaattggttggtgctaagatttttagtaagattgat 31832554  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||  ||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||| || || || |  ||||||||||| || || || || || |||||||    
T  31832553 ttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaggtgatgcctt 31832454  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||| |||||   || || || ||||| || |||||||| ||    
T  31832453 tcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatctt 31832354  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
     ||||| ||||||| ||| || || ||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||| || ||||   | ||||| || ||||| ||||||||     
T  31832353 aatttattccaagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgcaaagttgtcgaaatgtgag 31832254  T
Q  426 ttctggtt 433  Q
    ||||||||    
T  31832253 ttctggtt 31832246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 120 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 24950491 - 24950154
Alignment:
Q  120 attgatttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagtta 219  Q
    ||||| ||||||||| |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || || |  || |||||||| || ||||| || || |    
T  24950491 attgacttgaggtcaggttaccatcagattaaggtaaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtga 24950392  T
Q  220 tgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatga 319  Q
    ||||||| |||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| |   |||||  ||| |  ||||| ||  | |||||    
T  24950391 tgcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggataaatttgcggttgtatttgttgatga 24950292  T
Q  320 tattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaa 419  Q
    |||| ||||||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||  | ||||| || ||||| ||     
T  24950291 tattctgatttattcaaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtgttgcaaatattgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaag 24950192  T
Q  420 tgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggcca 457  Q
    ||||| || ||||| |  || |||||| ||||||||||    
T  24950191 tgtgagttatggttaagtgaagtgagtcttcttggcca 24950154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 306 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 25264769 - 25264607
Alignment:
Q  306 gtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatg 405  Q
    ||||| || ||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||    
T  25264769 gtgtttattgatgacatcttgatttattctaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatg 25264670  T
Q  406 ccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||| |  || || ||||||||||||||  |||||||||    
T  25264669 ccaagttgtcaaaatgtgagttctggttaagtgaagtaagttttcttggccacattatttctg 25264607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 208 - 468
Target Start/End: Original strand, 27208802 - 27209062
Alignment:
Q  208 aatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgt 307  Q
    |||| ||||| ||| |||| |||||||| || || ||| | ||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||  |||||| || ||    
T  27208802 aatacaaagtgatgtctttcggtgttactaaagcgcctagtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaattcgtggtggt 27208901  T
Q  308 gttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactt-tatgc 406  Q
    ||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||| |  ||||| ||||| ||||||||||| |||||  | ||||||||| ||||| || |||||    
T  27208902 gtttatagatgatattttgatttattctaagactgaagaggtgcatgcagagcacctgaagattgtgttgcagattttgaaagag-agaaagttgtatgc 27209000  T
Q  407 caaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    ||| ||||| || || || |||||||| |  || ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  27209001 caacttgtcgaagtgcgagttctggttaagtgaagtgagttttctaggccacgttatttctg 27209062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 251 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 23295705 - 23295499
Alignment:
Q  251 gtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaa 350  Q
    ||| |||||||||||||| || || |||||||| |   |||||  ||| || |||||||| || ||||| ||  ||||||| || ||||||||||||||     
T  23295705 gttnatggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcctgatttattcaaagactgaagaagag 23295606  T
Q  351 catgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttc 450  Q
    ||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||  | ||||| || ||||| || ||||| |||||||| |  || ||||||||||    
T  23295605 catgcagaacatctgaagattgtgttacaagttttgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggttaattgaagtgagttttc 23295506  T
Q  451 ttggcca 457  Q
    | |||||    
T  23295505 tgggcca 23295499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 467
Target Start/End: Original strand, 24829637 - 24830077
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||| ||||||   || || || || |||||||    
T  24829637 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagttggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 24829736  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
     ||| |||   ||||| ||||||| |||||| |  ||||||||    || || || ||  ||| | | ||||| |||||||| |||   || ||||| ||    
T  24829737 agagatcagaatatcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaaccgcgtttcgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatt 24829836  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    ||| ||  | ||||| || || || |||||||| || |||||| | || || ||| | | | |||| || || || || |||||||| ||||||||||||    
T  24829837 tggagtatctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttg 24829936  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
     | || || ||| |||| ||||| ||||| |||||| ||| |||||| |||||| | |||||||||||  |  | | |||||| |||||||| ||||| |    
T  24829937 gtgtattcaaagtctgaggaagagcatgcggagcatttgaggattgtgttgcaattcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagt 24830036  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttct 467  Q
    | ||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  24830037 tttggttcaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 24830077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 348 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 45534613 - 45534493
Alignment:
Q  348 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagtt 447  Q
    |||||||| |||||| |||  ||||| ||||||||| |||||||||||||  | |||||||| || || || || |||||||||||||| || |||||||    
T  45534613 gaacatgccgagcatttgagaattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagttatatgccaagttatcgaagtgcgaattctggttgaacgaagtgagtt 45534514  T
Q  448 ttcttggccatgttatttctg 468  Q
    |||| || ||| |||||||||    
T  45534513 ttctcggtcatattatttctg 45534493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 23611134 - 23611069
Alignment:
Q  60 ccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||| ||||||    
T  23611134 ccacttccgagaattgatgatttgatggatcggttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 23611069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 30 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 22280096 - 22280022
Alignment:
Q  30 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgca 104  Q
    ||||||||||| || || |||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  22280096 ttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagttggtgca 22280022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 23204309 - 23204273
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatcca 62  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23204309 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatcca 23204273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 27 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 25130603 - 25130539
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatca 91  Q
    ||||||||| |||| || || |||||| ||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  25130603 cagttgaactaggtgacgattaagaatcggtatccgcttccgaggattgatgattttatggatca 25130539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 396; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 396; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 9760 - 9313
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  9760 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatctgatggatcagttagtgggtacacgtgttttcagcaagattgatt 9661  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9660 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 9561  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||     
T  9560 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtattcatcgatgatattttt 9461  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  9460 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgagt 9361  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9360 tctggttgaaagaagtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 9313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 396; Significance: 0; HSPs: 60)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 396; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 474
Target Start/End: Original strand, 22828409 - 22828856
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22828409 cagttgaataaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatt 22828508  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22828509 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaagataaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 22828608  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22828609 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgtatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgcgttcatcgatgatattttg 22828708  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  22828709 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgagt 22828808  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22828809 tctggttgaaagaagtgagttttcttggccatgttatttctggtgatg 22828856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 25114779 - 25114340
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25114779 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatt 25114680  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    || || || ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25114679 tggggccaggttatcatcagattaaagtaaaggttgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactgtgaatataaagttatgccttt 25114580  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25114579 tggtgttaccaatacacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttttgttcatcgatgatattttg 25114480  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  25114479 atctactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgtcaaattatctaagtgtgaat 25114380  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttc 466  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25114379 tctggttgaaagaggtgagttttcttggccatgttatttc 25114340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 467
Target Start/End: Original strand, 24293837 - 24294276
Alignment:
Q  28 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgattt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  24293837 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgtgtttttagcaagattgattt 24293936  T
Q  128 gaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttt 227  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24293937 gaggtcaggatatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgtgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttt 24294036  T
Q  228 ggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttga 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||    
T  24294037 ggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttga 24294136  T
Q  328 tttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaatt 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  24294137 tttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaatt 24294236  T
Q  428 ctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttct 467  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  24294237 ctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttct 24294276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Original strand, 2872857 - 2873296
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  2872857 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtttttagcaagattgatt 2872956  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2872957 tgaggtcgggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 2873056  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||| |||| ||||| |||||||||    
T  2873057 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttatgtttatcgacgatattttg 2873156  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  2873157 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaggagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaat 2873256  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttc 466  Q
    | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  2873257 tttggttgaaagaagtgagtttccttggccatgttatttc 2873296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 19866915 - 19866467
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19866915 tcagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgat 19866816  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    || || ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19866815 ttaagatcaggttatcacgagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcggtatggtcactatgaatataaagttatgcctt 19866716  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| || ||||||||||||||    
T  19866715 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgctttgtggttgtttttatcgatgatatttt 19866616  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||  ||||     
T  19866615 gatttactccaagactgaaaaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaactatctaagcgtgag 19866516  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19866515 ttctggttgaaagaggtaagttttcttggccatgttatttctggtgatg 19866467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 474
Target Start/End: Original strand, 27563886 - 27564334
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27563886 tcagttgaacaaagttactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgat 27563985  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    || || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27563986 ttaagatcaggttatcaccaaattaaagtaaaagatgaagatatgcagaaggcagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 27564085  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | ||||| |||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  27564086 tcggtgtgaccattgcacctaaagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttagatcggttcgtggttgtgttcatcgatgaaatttt 27564185  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  27564186 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgaa 27564285  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27564286 ttctggttgaaagaagtaagttttcttggccatgttatttctggtgatg 27564334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Original strand, 28261251 - 28261690
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  28261251 cagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacaagttttcagcaagattgatt 28261350  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28261351 tgagatcgggttatcaccagattaaagtaaaagatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgctatggtcactatgaatacaaagttatgccttt 28261450  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28261451 cgttgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgacgatattttg 28261550  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28261551 atttactccaagactgaagaagaacatgcagagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgaat 28261650  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttc 466  Q
    ||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  28261651 tctggttgaaagaagtgagtttccctggccatgttatttc 28261690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 28284665 - 28284226
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  28284665 cagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacaagttttcagcaagattgatt 28284566  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28284565 tgagatcgggttatcaccagattaaagtaaaagatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgctatggtcactatgaatacaaagttatgccttt 28284466  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28284465 cgttgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgacgatattttg 28284366  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28284365 atttactccaagactgaagaagaacatgcagagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgaat 28284266  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttc 466  Q
    ||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  28284265 tctggttgaaagaagtgagtttccctggccatgttatttc 28284226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Original strand, 28340000 - 28340439
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  28340000 cagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacaagttttcagcaagattgatt 28340099  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28340100 tgagatcgggttatcaccagattaaagtaaaagatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgctatggtcactatgaatacaaagttatgccttt 28340199  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28340200 cgttgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgacgatattttg 28340299  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28340300 atttactccaagactgaagaagaacatgcagagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgaat 28340399  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttc 466  Q
    ||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  28340400 tctggttgaaagaagtgagtttccctggccatgttatttc 28340439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 27189663 - 27189224
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  27189663 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacaagttttcagcaagattgatt 27189564  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  27189563 tgagatcgggttatcaccagattaaggtaaaagatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactacgaatacaaagttatgccttt 27189464  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||    
T  27189463 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttagatcggttcgtggttgtattcatcgacgatatcttg 27189364  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  27189363 atttactccaagactgaagaagaacatgcggaacatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtccaagtgtgaat 27189264  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttc 466  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  27189263 tctggttgaaagaagtgagtttccttggccatgttatttc 27189224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Original strand, 27259577 - 27260016
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  27259577 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacaagttttcagcaagattgatt 27259676  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  27259677 tgagatcgggttatcaccagattaaggtaaaagatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactacgaatacaaagttatgccttt 27259776  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||    
T  27259777 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttagatcggttcgtggttgtattcatcgacgatatcttg 27259876  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  27259877 atttactccaagactgaagaagaacatgcggaacatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtccaagtgtgaat 27259976  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttc 466  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  27259977 tctggttgaaagaagtgagtttccttggccatgttatttc 27260016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 22436097 - 22435649
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  22436097 tcagttaaacaaagtaactatcaataataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcatgtgttttcagcaagattgat 22435998  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22435997 ttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcaaaacgtgttatggtcactatgaatacaaagttatgcctt 22435898  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  22435897 ttggtgttaccaatgcacctagagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgtttttatcgatgatatttt 22435798  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||     
T  22435797 aatttactccaagactaaagaagaacatgttgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatcctaaattatctaagtgtgag 22435698  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22435697 ttctggttgaaagaggtaagttttcttggccatgttatttctggtgatg 22435649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 468
Target Start/End: Original strand, 16925692 - 16926133
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  16925692 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatctacttc-gagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagtttttagcaagattgat 16925790  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  16925791 ttgaggtaaggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgtagaagacagctttcagaacgcggtatggtcactatgaatataatgttatgccgt 16925890  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  16925891 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttttggagtatatgaagcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtggttgttttcatcgatgatatttt 16925990  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  16925991 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaagttatctaagtgtgaa 16926090  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||    
T  16926091 ttctggttgaaagaggtaagttttcttggccatgtcatttctg 16926133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 468
Target Start/End: Original strand, 16961537 - 16961977
Alignment:
Q  28 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgattt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||    ||||| ||||| ||||||||    
T  16961537 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccaagaattgatgatttgatggatcagttagtcggtgcgaaagtttttagcaagattgattt 16961636  T
Q  128 gaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttt 227  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||     
T  16961637 gaggtcaggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcggtatggtcactatgaatataaagttatgtcgttc 16961736  T
Q  228 ggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttga 327  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||    
T  16961737 ggtgtgaccaatgcacctgaagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtggttgttttcattgacgatattttga 16961836  T
Q  328 tttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaatt 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||    
T  16961837 tttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaagtcatctaagtgtgaatt 16961936  T
Q  428 ctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||    
T  16961937 ctggttgaaagaggtaagttttcttggccatgtcatttctg 16961977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 26 - 468
Target Start/End: Original strand, 5837272 - 5837714
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||    
T  5837272 tcagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcttttgttttcagcaagattgat 5837371  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  5837372 ttgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagaccgctttcagaacgcgttatggtcactatgagtacaaagttatgcctt 5837471  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| || || ||| |    
T  5837472 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgctttgtggttgtcttcattgacgacattct 5837571  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||     
T  5837572 gatttattccaagactgaggaagaacatgttgagcatctgaagactgttttgcaagtgttgaaagaaaagaagctttatgccaagttgtctaagtgtgag 5837671  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  5837672 ttctggttgaaagaggtaagttttcttggccacgttatttctg 5837714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 42 - 468
Target Start/End: Original strand, 25763297 - 25763723
Alignment:
Q  42 actatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttgaggtcaagttatc 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  25763297 actatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatttgagatcaggttatc 25763396  T
Q  142 accagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgc 241  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  25763397 accagaaaaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggccactatgagtataaagttatgcctttcggtgttacaaatgc 25763496  T
Q  242 acctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagact 341  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  | ||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  25763497 acctggactgtttatggagtatatgaatcgcatcttccttgcatttttggatcgctttatggttgtctttattgatgacattttaatttactccaagact 25763596  T
Q  342 gaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacg 441  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  25763597 gaaggagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagataaaaatgtatgctaaattatctaattgtgaattctggttgaaagagg 25763696  T
Q  442 tgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||    
T  25763697 taagttttcttggccatgtcatttctg 25763723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 22 - 465
Target Start/End: Original strand, 22760504 - 22760947
Alignment:
Q  22 atcatcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaat 121  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  22760504 atcaacagttgaacaatgtaacaataaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggattagttagtgggtgcacgtgttgtcagcaagat 22760603  T
Q  122 tgatttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatg 221  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||||||||    
T  22760604 tgatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcacaagacagctttcagaacgcgttatggacattatgagtataaagttatg 22760703  T
Q  222 ccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgata 321  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||  ||||||    
T  22760704 cctttcggtgttacaaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgtttttattaatgata 22760803  T
Q  322 ttttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatg 421  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| | || ||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  22760804 ttttgatttactccaagtctgaagaagagcatgctgagcatttgaagctggttttgtaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaagtg 22760903  T
Q  422 tgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttattt 465  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  22760904 tgaattctggttgaaagaagtgagctttcttggacatgttattt 22760947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 27 - 468
Target Start/End: Original strand, 20633994 - 20634435
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| || ||||    
T  20633994 cagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagatagatt 20634093  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| || ||||||||||||||    
T  20634094 tgagatctggttatcaccagattaaagtagaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggacattatgagtacaaagttatgccttt 20634193  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||    
T  20634194 cggtgttacaaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgtttttattgatgatattttg 20634293  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  20634294 atttactccaagtctaaagaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaagtgtgaat 20634393  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  20634394 tctggttgaaagaagtgagctttcttggacatgttatttctg 20634435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 30 - 468
Target Start/End: Original strand, 25607918 - 25608356
Alignment:
Q  30 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttga 129  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  25607918 ttgaacaaggtgactataaagaataggtatccacttccgaggattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcatgtgttttcagcaagatagatttga 25608017  T
Q  130 ggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttgg 229  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| || || || ||||  || ||    
T  25608018 gatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagacatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggacattatgagtacaaggtaatgctgttcgg 25608117  T
Q  230 tgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatt 329  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  25608118 tgttacaaatgcacctggagtatttatggagtacatgaattgcatctttcatgcatttttggatcgattcgtagttgtttttattgatgatattttgatt 25608217  T
Q  330 tactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattct 429  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  25608218 tactccaagtctgaagaagaagatgctgagcatttgaagattgttttacaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtcaaagtgtgaattct 25608317  T
Q  430 ggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  25608318 ggttgaaagaggtaagttttcttggccatgttatttctg 25608356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 106 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 22444415 - 22444047
Alignment:
Q  106 gtgttttcagcaaaattgatttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcacta 205  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  22444415 gtgttttcagcaagattgatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcataacgtgttatggtcacta 22444316  T
Q  206 tgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagtt 305  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||    
T  22444315 tgaatacaaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctagagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggttcgtggtt 22444216  T
Q  306 gtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatg 405  Q
    || || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22444215 gtttttatcgatgatattttaatttactccaagactaaagaagaacatgttgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatc 22444116  T
Q  406 ccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    | ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22444115 ctaaattatctaagtgtgagttctggttgaaagaggtaagttttcttggccatgttatttctggtgatg 22444047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 27 - 468
Target Start/End: Original strand, 18405998 - 18406439
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||    
T  18405998 cagttgaacaaggtaacaataaagaataggtatccacctccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaagtgttttcagcaagatagatt 18406097  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||  || |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||| || ||||| ||||| || ||||| ||    
T  18406098 tgagatcgggtcatcaccagattaaagtgaaagattaagatatgcagaagacagccttcagaacgtattatggacattatgagtataaggtgatgccgtt 18406197  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||    
T  18406198 cggtgttacaaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcgttttgtggttgttttcattgatgatattttg 18406297  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||    
T  18406298 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatttgaaactggttttgcaagtgttgaaagagaagaaactatatgctaaattgtttaagtgtgaat 18406397  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  18406398 tctggttgaaagaagtgagctttcttggacatgttatttctg 18406439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 27 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 16574117 - 16573879
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  16574117 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgtgtttttagcaagattgatt 16574018  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16574017 tgaggtcaggatatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 16573918  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatat 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16573917 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatat 16573879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 27 - 265
Target Start/End: Original strand, 16621263 - 16621501
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  16621263 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgtgtttttagcaagattgatt 16621362  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16621363 tgaggtcaggatatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 16621462  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatat 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16621463 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatat 16621501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 163 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 23080560 - 23080258
Alignment:
Q  163 aagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagta 262  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||| ||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23080560 aagatatgcagaagacggattttagaacgcgttatggacattatgaatataaagtgatgtctttcggtgttacaaatgcacctggagtgtttatggagta 23080461  T
Q  263 tatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcat 362  Q
     ||||||||||| || ||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  23080460 catgaatcgcatttttcatgcatttctagatcgtttcgtggttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagtctgaggaagaacatgctgagcat 23080361  T
Q  363 ctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgtta 462  Q
     |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || || | |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  23080360 ttgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaaactttatgctaaattatcaaagtttgaattctggttgaaagaggtgagtttccttggccatgtta 23080261  T
Q  463 ttt 465  Q
    |||    
T  23080260 ttt 23080258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 27 - 406
Target Start/End: Original strand, 23085825 - 23086204
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||| || ||||| || |||||||||||| | |||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |    
T  23085825 cagttgaataaagtaacgataaagaataggtattcccttccaagaattgacgacttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtgtttagcaagattgact 23085924  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || || || |  |||||||| || |||||||||  ||| ||||||||    
T  23085925 tgaggtcgggttaccatcagattaaagtaaaagatgaagatatctagaagacggcctttaggacacgttatggacattatgaatattcagtgatgccttt 23086024  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     |||||||| ||||| || || |||||||||||||| |||||||| || || ||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23086025 cggtgttacaaatgcgccgggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatttttcatgcgtatttggatcgcttcgtggttgtgttcatcgatgatattttg 23086124  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgc 406  Q
    || ||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || | |||||||| ||||||||    
T  23086125 atatactctaagtatgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtgctggaggagaagaagctttatgc 23086204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 26 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 25770072 - 25769630
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    ||||||||| || || || || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  25770072 tcagttgaataaagtgacgataaagaacaggtatccacttccgagaattgatgatttaatggatcagttagtgggtgctcgtgtattcagcaaaattgat 25769973  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||| |||| || |||||||| || || ||||| ||||||||||| |  || || || |  || ||||| || ||||| ||||| || ||| |||    
T  25769972 ttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaatgatgaggatatgcagaaaatggcctttaggacacgatatggacattatgagtataaggtgatgtctt 25769873  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || |||||||| | |  ||||  ||| || |||||||| || ||||||||  |    
T  25769872 tcggtgttactaatgcgcctggtgtatttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttatccggataaatttgtggttgtgtttattgatgatatcct 25769773  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
     ||||| || |||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | |||  | ||||| || ||||| |||||||||    
T  25769772 aatttattctaagtatgaagaagagcatgcagagcatctgaagattgtgttgcaagtgttgaaataaatgaagttgtatgctaagttgtccaaatgtgaa 25769673  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    |||||||| |  || || ||||||||||||||  |||||||||    
T  25769672 ttctggttaagtgaagtaagttttcttggccacattatttctg 25769630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 28 - 269
Target Start/End: Original strand, 18183422 - 18183663
Alignment:
Q  28 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgattt 127  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  18183422 agttgaataaggtaacgataaagaataggtatccacttccgagaattgatgacttgatgcatcagttagtgggtgcacgtgtgtttagcaagattgattt 18183521  T
Q  128 gaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttt 227  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| || | ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||     
T  18183522 gaggtccggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacgtcttttagcacgcgttatggacattatgaatataaagtgatgcctttc 18183621  T
Q  228 ggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaat 269  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  18183622 ggtgttacaaatgcgcctggtgtgtttatggtgtacatgaat 18183663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 51 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 19881501 - 19881084
Alignment:
Q  51 aataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttgaggtcaagttatcaccagatta 150  Q
    ||||| ||||| |||||| | ||||| || |||||||||||||| || ||||||    |||| || |||||||| ||||||||| |||| || ||||| |    
T  19881501 aatagatatccgcttccgaggattgacgacttgatggatcagttggttggtgcaaagatttttagtaaaattgacttgaggtcaggttaccatcagatca 19881402  T
Q  151 aagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagt 250  Q
    | || ||||||||||| ||||||||||| || || || |  || |||||||| ||  ||||||| || |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||    
T  19881401 aggtgaaagatgaagacatgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcattacaaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgt 19881302  T
Q  251 gtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaa 350  Q
    ||| ||||||||||||||| | || || ||||| |   |||||  ||| || ||||||||||| ||||| |||||||| || || |  ||||| |||||     
T  19881301 gttcatggagtatatgaataggatttttcatgcttacctggataaatttgtggttgtgttcattgatgacattttgatctattcgagaactgaggaagag 19881202  T
Q  351 catgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttc 450  Q
    ||||| || ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || |||||||| |  || ||||||||||    
T  19881201 catgcagaacatctgaggattgtattgcaagtattgaaagagaagaaactgtatgccaaattgtcaaagtgcgagttctggttaagtgaagtgagttttc 19881102  T
Q  451 ttggccatgttatttctg 468  Q
    |||||||| |||||||||    
T  19881101 ttggccatattatttctg 19881084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 48 - 468
Target Start/End: Original strand, 14377991 - 14378411
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttgaggtcaagttatcaccaga 147  Q
    ||||| ||||||||||||||  | ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||   |||||||| || ||||| ||||| ||| |||| || || |    
T  14377991 aagaacaggtatccacttcctaggatttatgacttgttggatcagttagtgggtgcaaaggttttcagtaagattgaattgagatcaggttaccatcaaa 14378090  T
Q  148 ttaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctgg 247  Q
    |||| || || ||||| |||||||||||||| || || || |  || |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  14378091 ttaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctgg 14378190  T
Q  248 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaa 347  Q
     ||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||| |||||  ||| || ||||| || || ||||||| | ||||||| || |||||||||||     
T  14378191 tgtgttcatggagtatatgaaccgaattttacatgcttttctggataaatttgtggttgtatttattgatgatagtctgatttattctaagactgaagag 14378290  T
Q  348 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagtt 447  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||  | |||||||| ||||| |||||||| || ||||| |  || || ||||    
T  14378291 gagcatgcagagcatctgaagattgtattgcaagtcttgaaagagaaaaagttgtatgccaagttgtcgaaatgtgagttttggttaagtgaagtaagtt 14378390  T
Q  448 ttcttggccatgttatttctg 468  Q
    ||||||||||  |||||||||    
T  14378391 ttcttggccacattatttctg 14378411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 48 - 468
Target Start/End: Original strand, 14379541 - 14379961
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttgaggtcaagttatcaccaga 147  Q
    ||||| ||||||||||||||  | ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||   |||||||| || ||||| ||||| ||| |||| || || |    
T  14379541 aagaacaggtatccacttcctaggatttatgacttgttggatcagttagtgggtgcaaaggttttcagtaagattgaattgagatcaggttaccatcaaa 14379640  T
Q  148 ttaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctgg 247  Q
    |||| || || ||||| |||||||||||||| || || || |  || |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  14379641 ttaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctgg 14379740  T
Q  248 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaa 347  Q
     ||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||| |||||  ||| || ||||| || || ||||||| | ||||||| || |||||||||||     
T  14379741 tgtgttcatggagtatatgaaccgaattttacatgcttttctggataaatttgtggttgtatttattgatgatagtctgatttattctaagactgaagag 14379840  T
Q  348 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagtt 447  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||  | |||||||| ||||| |||||||| || ||||| |  || || ||||    
T  14379841 gagcatgcagagcatctgaagattgtattgcaagtcttgaaagagaaaaagttgtatgccaagttgtcgaaatgtgagttttggttaagtgaagtaagtt 14379940  T
Q  448 ttcttggccatgttatttctg 468  Q
    ||||||||||  |||||||||    
T  14379941 ttcttggccacattatttctg 14379961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 26 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 21755160 - 21755002
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||    
T  21755160 tcagttgaacaag-taactatcaagaataggtatccacttccgaggattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcatttgttttcagcaagatagat 21755062  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttc 185  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21755061 ttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttc 21755002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 26 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 19455251 - 19454821
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    |||||||||||| || || || | ||| ||| ||||||| ||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || || || ||| |     
T  19455251 tcagttgaacaaagttacgataacgaacaggaatccact-ccgaggattgatgacttaatggatcagttagtgggtgcacgtgtatttagtaagatttac 19455153  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||| |||| || |||||||| || || |||||||||||| ||||||| || || || |  || |||||||| || ||||| || || ||| |||    
T  19455152 ttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaagatatgtagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgtctt 19455053  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| |  ||||||  ||| || ||||| || || ||||| || ||    
T  19455052 tcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcctacttggataaatttgtggttgtatttattgatgacatctt 19454953  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
    |||||| || |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||  | ||||| || ||||| || |||||     
T  19454952 gatttattcaaagactaaagaagagcatgcagagcatctgaagatagtattgcaagttttgaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcaaagtgtgag 19454853  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttcttggcca 457  Q
    |||||||| |  || |||||||||||||||||    
T  19454852 ttctggttaagtgaagtgagttttcttggcca 19454821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 26 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 21473828 - 21473398
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    ||||||||| || || || || ||||| | ||||| ||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  21473828 tcagttgaataaagtgacgataaagaacatgtatcgacttcctagaattgatgatttaatgaatcagttagtgggtgctcgtgtgttcaacaaaattgat 21473729  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||| |||| || ||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || || || |  || ||||| || ||||| ||||| || ||| |||    
T  21473728 ttgaggtcaggttaccatcagattaaagtgaaggatgaggatatgcagaaaacggcctttaggacacgatatggacattatgagtataaggtgatgtctt 21473629  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | | |||||| |||||  |||| |||||||||||||||||||| || || || ||||| | | |||||  ||| || |||||||| ||  |||||||  |    
T  21473628 tcgatgttactaatgc-gctggtgtgtttatggagtatatgaaccgaatttttcatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttatttatgatatcct 21473530  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
     ||||| || |||| |||||| || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||  | |||| ||| ||||| |||||||||    
T  21473529 aatttattctaagaatgaagaggagcatgcagaacatctgaagattgtgttgcaagtgttgaaagaaaggaagttgtatgtcaagttgtccaaatgtgaa 21473430  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttcttggcca 457  Q
    |||||||| |  || || ||||||||||||||    
T  21473429 ttctggttaagtgaagtaagttttcttggcca 21473398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 27 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 15461563 - 15461122
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| || |||||    ||||| ||||| ||||| |    
T  15461563 cagttgaacaaagttacaatcaagaatagatatccacttccgcggattgatgatttgatggaccagttggtaggtgctaaagtttttagcaagattgact 15461464  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||  |||| || || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||  || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||    
T  15461463 tgaggtcgggttaccatcaaattaaagtgaaagacgaagatatgcaaaagacggcctttagaacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgccttt 15461364  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     |||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| | |||  ||| || || ||||| || ||||||||| ||    
T  15461363 cggtgttactaacgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcctttctagataaatttgtggtggtgtttatagatgatattctg 15461264  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactt-tatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
    ||||| || || |||||||| ||||| || || ||  |||||||||| |||||  | ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || ||     
T  15461263 atttattctaaaactgaagaggaacacgccgaacacttgaagattgtgttgcagattttgaaagag-agaaagttgtatgccaagttgtcgaagtgcgat 15461165  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    |||||||| |  || ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  15461164 ttctggttaagtgaagtgagttttctaggccacgttatttctg 15461122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 26 - 470
Target Start/End: Original strand, 10466902 - 10467346
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    |||||||||||| || ||  | ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || ||||| || |||||     
T  10466902 tcagttgaacaaagttacagtaaagaacaggtatccacttccgagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcagtaagattgac 10467001  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||  |||| || ||||| || || || ||||| |||||||||||||| || || || |  || ||  |||| || ||||| ||||| |||||||    
T  10467002 ttgaggtctggttaccatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgataaagtcattacgaatacaaagtgatgcctt 10467101  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | |||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   || || || ||||| || ||||||||| |    
T  10467102 tcggtgttactaacgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttatggataagtttgttgtggtgtttattgatgatattct 10467201  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
     || || ||||||| |||||| || ||||| ||||||||||  ||||| |||||||| |||||||| ||||   | ||||| || ||||| ||||||||     
T  10467202 aatctattccaagaatgaagaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagttttgaaagaaaagaggttgtatgcaaagttgtcaaaatgtgag 10467301  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgat 470  Q
    |||||||| |  || ||||||||||| || ||  |||||||||||    
T  10467302 ttctggttaagcgaagtgagttttctgggtcacattatttctgat 10467346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 48 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 18796896 - 18796476
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttgaggtcaagttatcaccaga 147  Q
    ||||| |||||||| |||||| | ||||| || |||||||||||||| || ||||||    |||| || |||||||| ||||||||| | || || ||||    
T  18796896 aagaacaggtatccgcttccgaggattgacgacttgatggatcagttggttggtgcaaagatttttagtaaaattgacttgaggtcaggctaccatcaga 18796797  T
Q  148 ttaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctgg 247  Q
    | || || || ||||| |||||||||||||| || || || |  || |||||||| || |||||||| || ||||||||  ||||||| ||||  |||||    
T  18796796 tcaaggtgaaggatgaggatatgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctttcagtgttactaatgtgcctgg 18796697  T
Q  248 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaa 347  Q
     ||||| ||||||||||||||  | || |||||||| | | |||||  ||| || ||||| ||||| ||| | |||||||| || || |  |||||||||    
T  18796696 tgtgttcatggagtatatgaacagaattttccatgcctatctggataaatttgtggttgtattcattgataacattttgatctattctagaactgaagaa 18796597  T
Q  348 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagtt 447  Q
    || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||| || ||||| |||||||| || || |||||||    
T  18796596 gagcatgcagaacatctgaagattgtgttgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcgaagtgtgagttctggttaaatgaagtgagtt 18796497  T
Q  448 ttcttggccatgttatttctg 468  Q
    ||| ||||||  |||||||||    
T  18796496 ttcatggccacattatttctg 18796476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 27 - 270
Target Start/End: Original strand, 18963142 - 18963385
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  18963142 cagttgaataaagtgacgataaagaataggtatccacttccaagaattgatgatttgatgtatcagttagtgggtgcacgtgtgtttagcaagattgatt 18963241  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||| || |  |||||||| || || ||||||  ||| ||||||||    
T  18963242 tgagatcgggctatcaccagattaaagtgaaagatgacgatatgcagaagacgacttttaggacacgttatggacattacgaatattcagtgatgccttt 18963341  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatc 270  Q
     |||||||| |||||||| || || ||||||||||| |||||||    
T  18963342 cggtgttactaatgcaccaggtgtatttatggagtacatgaatc 18963385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 264 - 468
Target Start/End: Original strand, 18196024 - 18196228
Alignment:
Q  264 atgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatc 363  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||| || || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||| |||||     
T  18196024 atgaatcgtatttttcatgcgtttttggatcgttttgtggttgtgttcatttatgatattttgatatactccaagtccgaagaagagcatgctaagcatt 18196123  T
Q  364 tgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttat 463  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||| || | |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  18196124 tgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagctatatgctaaattgtcaaagtatgaattttggttgaaagatgtgaattttcttggccatgttat 18196223  T
Q  464 ttctg 468  Q
    |||||    
T  18196224 ttctg 18196228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 30 - 474
Target Start/End: Original strand, 28280870 - 28281314
Alignment:
Q  30 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttga 129  Q
    |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||| | |||||||| |||||||| ||| | || ||||||   || ||||| || ||||| ||||    
T  28280870 ttgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttgatggaccagctggtaggtgcaaaggtgttcagtaagattgacttga 28280969  T
Q  130 ggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttgg 229  Q
    ||||| |||| || || ||||| || ||||||||||||||||||||||| || || || |  || |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||    
T  28280970 ggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcgg 28281069  T
Q  230 tgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatt 329  Q
    |||||| || || || || ||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||| |||||  |||||| || || || || ||||| ||| |||||    
T  28281070 tgttactaacgcgccgggtgtgttcatggagtatatgaatcgaatttttcatgcttttctggataaattcgtggtggtatttattgatgacattctgatt 28281169  T
Q  330 tactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattct 429  Q
    || || |||||||||| ||| ||||| || |||||||  ||||| |||||||| |||||||| | |||  | ||||||||| |||| ||||||||||| |    
T  28281170 tattcgaagactgaaggagagcatgcagaacatctgagaattgtgttgcaagttttgaaagaaaggaagttgtatgccaaactgtcgaaatgtgaatttt 28281269  T
Q  430 ggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    || | |  || |||||||| ||||| ||  ||||||||| |||||    
T  28281270 ggctaagtgaagtgagtttccttggtcacattatttctggtgatg 28281314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 26 - 468
Target Start/End: Original strand, 34643639 - 34644081
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    ||||||||| || || || || ||||| || ||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||| || |||||     |||| || ||||||||     
T  34643639 tcagttgaataaagttacgataaagaacagatatcctcttccgagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgccaagatttttagtaaaattgac 34643738  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||| |||| || || || || || ||||||||||| ||||||||||| || || || |  || |||||||| || |||||||| || |||||||    
T  34643739 ttgaggtcaggttaccatcaaatcaaggtgaaagatgaagacatgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctt 34643838  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||| | || || ||||| | | |||||  ||| || ||||||| ||| ||||| |||||    
T  34643839 tcggtgttactaacgcgcctggggtgttcatggagtatatgaatagaatttttcatgcttatctggataaatttgtggttgtgtacattgatgacatttt 34643938  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
    ||| || || |  || || ||||| ||||| || ||||| |  ||||| |||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||| || |||||     
T  34643939 gatctattcgacaacggaggaagagcatgcagaacatctaagaattgtgttgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcgaagtgtgag 34644038  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    |||||||| |  || || ||||| ||||||||| |||||||||    
T  34644039 ttctggttaagtgaagtaagtttccttggccatattatttctg 34644081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 26 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 19437230 - 19436876
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    ||||||||| || || || || ||||| ||||||||||||||| | ||| |||| |||||||||||||| |||||||||   ||||| || || |||||     
T  19437230 tcagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccacttccgaggatttatgacttgatggatcagttggtgggtgcagaggtttttagtaagattgac 19437131  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||| |||| || ||||| || || || ||||| ||||||||||||||||| || || |  || ||||| || || ||||| || || |||||||    
T  19437130 ttgaggtcaggttaccatcagatcaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacagcctttaggacacgatatggacattacgaatacaaggtgatgcctt 19437031  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | |||||||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||| |  || |||||||| | | |||||  ||| || |||||||| || ||||| ||| |    
T  19437030 tcggtgttactaatgcgcctagtgtgttcatggagtatatgaaccaaattttccatgcctatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacattct 19436931  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaa 380  Q
    ||| || || |  ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  19436930 gatctattctagaactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtgttgcaa 19436876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 27 - 467
Target Start/End: Original strand, 16380427 - 16380867
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||   || || || || |||||||    
T  16380427 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 16380526  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| | ||||| ||||||| |||||| |  ||||||||    || || || ||| ||| | | ||||| |||||||| |||   || ||||| ||    
T  16380527 tgagatcaggatatcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatt 16380626  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    ||| ||  | |||||||| || || |||||||| || |||||| | || || ||| | | | |||| || || || || |||||||| ||||||||||||    
T  16380627 tggagtatctaatgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttg 16380726  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
     | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||  |  | | |||||| |||||||| ||||| |    
T  16380727 gtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagt 16380826  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttct 467  Q
    | |||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  16380827 tttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 16380867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 24366640 - 24366233
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||||| |||||  ||||||| || |||||||||||||| || |||||     ||||||| || ||||||    
T  24366640 tcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagattttcagtaagattgat 24366541  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||  ||||||| ||||| || || || ||||| |||||||| ||||| || || || |  ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  24366540 ttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcaaaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 24366441  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | |||||||| ||||  || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||| |||||   || || || ||||| || |||||||||||    
T  24366440 tcggtgttactaatgtgccaggtgtatttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatttt 24366341  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
     || || ||||||| ||| || || ||||| ||||| ||||  ||||| |||||||||||||| || ||||   | ||||| || ||||| || |||||     
T  24366340 aatctattccaagaatgaggaggagcatgcagagcacctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgcaaagttgtcgaagtgtgag 24366241  T
Q  426 ttctggtt 433  Q
    ||||||||    
T  24366240 ttctggtt 24366233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 27 - 181
Target Start/End: Original strand, 30679061 - 30679215
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    ||||||||||| || || || ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||    
T  30679061 cagttgaacaaagtgacaataaagaataggtatctacttccaagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtacacgtgtgtttagcaagattgatt 30679160  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagc 181  Q
    |||| ||| | ||||| ||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||    
T  30679161 tgagatcaggctatcatcagattaaagtgacggatgaggatatgcagaagacagc 30679215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 307 - 468
Target Start/End: Original strand, 18965629 - 18965790
Alignment:
Q  307 tgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgc 406  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  | ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| || |||||| |||||||||||||  | |||||    
T  18965629 tgttcattgatgatattttgatatatgctaagtctgaagaagaacattctgagcatttgaagattgtttttcaagtgatgaaagagaagaagttatatgc 18965728  T
Q  407 caaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
     || ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  18965729 taagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagtttccttggccatattatttctg 18965790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 26 - 235
Target Start/End: Original strand, 24516461 - 24516670
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    ||||||||| || || || || ||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||| || || |||||     
T  24516461 tcagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtttttagtaagattgac 24516560  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||| |||| || || ||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| || |  || |||||||| || ||||| ||||| |||||||    
T  24516561 ttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctt 24516660  T
Q  226 ttggtgttac 235  Q
    | ||||||||    
T  24516661 tcggtgttac 24516670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 27 - 467
Target Start/End: Original strand, 16648023 - 16648463
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||   || || || || |||||||    
T  16648023 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcaaaggtgtttagtaagattgatt 16648122  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| | ||||| ||||||| |||||| |  ||||||||    || || || ||| ||| | | ||||| |||||||| |||   || ||||| ||    
T  16648123 tgagatcaggatatcatcagattagagtaaaggcagaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatt 16648222  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    ||| ||  | ||||| || || || |||||||| || |||||| | || || ||| | | | |||| || || || || |||||||| ||||||||||||    
T  16648223 tggagtatctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttg 16648322  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
     | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||  |  | |  ||||| |||||||| ||||| |    
T  16648323 gtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgcgccaagttgtctaagtgtgagt 16648422  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttct 467  Q
    | |||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  16648423 tttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 16648463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 219 - 468
Target Start/End: Original strand, 19487528 - 19487767
Alignment:
Q  219 atgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatg 318  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||          |||| | ||||||||| || || ||||| || || ||||    
T  19487528 atgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtacatgaat----------atgcttatttggatcggtttgtggttgtttttattgatg 19487617  T
Q  319 atattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaa 418  Q
    | || |||||||| || ||| |||||||||| ||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||| |  |||||  | |||||||| ||||| ||    
T  19487618 acatcttgatttattctaagtctgaagaagagcatgcagagcatttaaagattgtgttgcaagtgttgaaggtaaagaagttgtatgccaagttgtccaa 19487717  T
Q  419 atgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    ||||||||||||||| |  || || ||||||||||||||| |||||||||    
T  19487718 atgtgaattctggttaagtgaagtaagttttcttggccatattatttctg 19487767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 28 - 468
Target Start/End: Original strand, 21568046 - 21568486
Alignment:
Q  28 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgattt 127  Q
    |||||||||| || || || ||||| |||||||| || ||| | ||||| || ||||||||||| ||  | ||||||    |||| || || ||||| ||    
T  21568046 agttgaacaaagtgacgataaagaacaggtatccgctgccgaggattgacgacttgatggatcaattgtttggtgcaaagatttttagtaagattgactt 21568145  T
Q  128 gaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttt 227  Q
    ||||||| |||| || ||||| || || || |||||||||||||||||||| || || || |  | ||||||||| || ||||| ||||| ||| ||||     
T  21568146 gaggtcaggttaccatcagataaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacactttatggtcattacgaatacaaagtgatgtctttc 21568245  T
Q  228 ggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttga 327  Q
    |||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||| |||||  |||  | ||||| || || ||||||||| |||    
T  21568246 ggtgttactaacgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaatttttcatgcttttctggataaatttatggttgtatttattgatgatattctga 21568345  T
Q  328 tttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaatt 427  Q
    |||| || ||||| ||||| || ||||  || ||||||| |||||  ||  | || |||||||| |||||  | ||||| || ||||| |||||||||||    
T  21568346 tttattctaagaccgaagaggagcatgtagaacatctgaggattgaattataggttttgaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcgaaatgtgaatt 21568445  T
Q  428 ctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    |||| | |  || || |||||||| |||||  |||||||||    
T  21568446 ctggctaattgaagtaagttttctcggccacattatttctg 21568486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 27 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 23998475 - 23998035
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||   || || ||||| |||||||    
T  23998475 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcagaggtgtttagcaagattgatt 23998376  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| | ||||| ||||||| |||||| |  ||||||||    || || || ||| ||| | | ||||| |||||||| |||   || ||||| ||    
T  23998375 tgagatcaggatatcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatt 23998276  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    ||| ||  | ||||| || || || |||||||| || |||||| | || || ||| | | | |||| || || || || |||||||| ||||||||||||    
T  23998275 tggagtatctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttg 23998176  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
     | || |  ||| | || ||||| |||||||| ||| ||| |||||| ||| |||| |||||||||||  |  | | |||||| |||||||| ||||| |    
T  23998175 gtgtattgaaagtccgaggaagagcatgctgaacatttgaggattgtgttgtaagtcttgaaagagaaccagttatgtgccaagttgtctaagtgtgagt 23998076  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttct 467  Q
    | |||||| | || |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  23998075 tttggttggaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 23998035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 27 - 467
Target Start/End: Original strand, 1646868 - 1647308
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||| |||||    || || || || |||||||    
T  1646868 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagttggtgctgaggtgtttagtaagattgatt 1646967  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| | ||||| ||||||| ||| || |  ||||||||    || || || ||| ||| | | ||||| |||||||| |||   || ||||| ||    
T  1646968 tgagatcaggatatcatcagattagagtgaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatt 1647067  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    ||| ||  | ||||| || || || |||||||| ||||||||| | || || ||| | | | |||| || || || || |||||||| ||||| ||||||    
T  1647068 tggagtatctaatgcgccaggtgtctttatggaatatatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgacattttg 1647167  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
     | || || |||  ||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||| ||     | | |||||| |||||||| ||||| |    
T  1647168 gtgtattcgaagtttgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagataaccggttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagt 1647267  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttct 467  Q
    | |||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  1647268 tttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 1647308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 27 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 23080650 - 23080559
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaa 118  Q
    |||||||| || ||||| || |||||||| ||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  23080650 cagttgaataaagtaacgataaagaatagatattcacttccaagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtgtttagcaa 23080559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 26 - 151
Target Start/End: Original strand, 8761805 - 8761930
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    |||||||||||| |  || || ||||| | ||||||||||||| | |||||||| || ||||||||||||||||||||    ||||||||||| |||||     
T  8761805 tcagttgaacaaaggtacaataaagaacaagtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcagttagtgggtgcgaaagttttcagcaagattgac 8761904  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaa 151  Q
    ||||||||| |||| || ||||||||    
T  8761905 ttgaggtcaggttaccatcagattaa 8761930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 340 - 468
Target Start/End: Original strand, 5295573 - 5295701
Alignment:
Q  340 ctgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaaga 439  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||   | |||||||| ||||| ||||| |  |||||||| |  ||    
T  5295573 ctgaagaagagcatgcagagcatctgaaaattgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaggttgtatgccaagttgtccaaatgcgtgttctggttaagtga 5295672  T
Q  440 cgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
     || ||||||||||||||  |||||||||    
T  5295673 agtaagttttcttggccacattatttctg 5295701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 55 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 18450702 - 18450289
Alignment:
Q  55 ggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttgaggtcaagttatcaccagattaaagt 154  Q
    |||||||||||||| | ||  | |||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||| |||||||| || || ||  | |||||| |||| |||||    
T  18450702 ggtatccacttccgaggatcaacgatttgatggatcaattagtgggtgcgcttgtgttcagtaaaattgacttaagctcgggctatcactagatcaaagt 18450603  T
Q  155 aaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgttt 254  Q
     ||||| || ||||| ||||||||  | || || |  |||||  |  | || ||||||   || |||||||| |||||||| ||||| |  ||||| |||    
T  18450602 gaaagaagaggatattcagaagacgacctttaggacacgttacagaaattacgaatattttgtgatgcctttcggtgttactaatgcgctgggagtattt 18450503  T
Q  255 atggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaa-gaagaacat 353  Q
    ||||| ||||| || || || || ||| | | | | ||||| || || |||||||| || ||||||||| |||| ||||| || | | || || ||||||    
T  18450502 atggaatatattaaccgtatttttcatacttatctagatcgttttgttgttgtgtttatagatgatattctgatatactctaa-attcaaggaggaacat 18450404  T
Q  354 gctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttg 453  Q
    |  |||||| |||  ||||| ||||||||| |||| | ||||||  | |||||||| || || || || |||||||||||||| || | |||||||||||    
T  18450403 gtcgagcatttgagaattgttttgcaagtgctgaaggggaagaagttatatgccaagttatcgaagtgcgaattctggttgaacgaagggagttttcttg 18450304  T
Q  454 gccatgttatttctg 468  Q
    | ||| |||||||||    
T  18450303 gtcatattatttctg 18450289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 14130696 - 14130573
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    ||||||||||| || || || || ||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| | || |||||    || || ||||| |||||||    
T  14130696 cagttgaacaaagtgacgattaaaaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctggttggtgcggaagtgtttagcaagattgatt 14130597  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagatta 150  Q
    |||||||||| ||||| |||||||    
T  14130596 tgaggtcaagatatcatcagatta 14130573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 150
Target Start/End: Original strand, 23025800 - 23025923
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| | || ||||     || || || || |||||||    
T  23025800 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccgcttccgaggattgatgatttgatggatcagctggttggtgtggaggtgtttagtaagattgatt 23025899  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagatta 150  Q
    |||||||||| ||||| |||||||    
T  23025900 tgaggtcaagatatcatcagatta 23025923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 27 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 28311857 - 28311819
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccactt 65  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28311857 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccactt 28311819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 62
Target Start/End: Original strand, 23496245 - 23496281
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatcca 62  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23496245 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatcca 23496281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 27 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 16100242 - 16100119
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||| || || |||||| |||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||  |||| ||||||   || || || || |||||||    
T  16100242 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccactaccaaggattgatgatttgatggatcaactagttggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 16100143  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagatta 150  Q
    |||| ||| | ||||| |||||||    
T  16100142 tgagatcaggatatcatcagatta 16100119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 396; Significance: 0; HSPs: 42)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 396; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 14682930 - 14682483
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  14682930 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatc 14682831  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14682830 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgacgatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaggttatgccttt 14682731  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14682730 tggtgttaccaatgcacctggagagtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 14682631  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14682630 atttactccaagactgaaaaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgaat 14682531  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14682530 tctggttgaaagaagtgagttttcttggccatgttatttctggtgatg 14682483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 384; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 474
Target Start/End: Original strand, 14301628 - 14302075
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14301628 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatt 14301727  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14301728 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaactttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 14301827  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||    
T  14301828 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgatgatattttg 14301927  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  14301928 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 14302027  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  14302028 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggtgatg 14302075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 40475403 - 40474956
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  40475403 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtttttagcaagattgatt 40475304  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40475303 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcataagacagctttcagaacccgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 40475204  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||    
T  40475203 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggtttgtggttgtgttcatcgatgatattttg 40475104  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  40475103 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtcgaagtgtgaat 40475004  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  40475003 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggtgatg 40474956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 474
Target Start/End: Original strand, 8051272 - 8051719
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  8051272 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 8051371  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8051372 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 8051471  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||    
T  8051472 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 8051571  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8051572 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgaat 8051671  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  8051672 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggtgatg 8051719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 12478963 - 12478516
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  12478963 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 12478864  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12478863 tgagatcgggttatcaccagattaaagtaaaggatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 12478764  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12478763 tggagttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgacgatattttg 12478664  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12478663 atttactccaagaccgaagaagaacatgccgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgaat 12478564  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  12478563 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggtgatg 12478516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 474
Target Start/End: Original strand, 19776442 - 19776889
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  19776442 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 19776541  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19776542 tgagatcgggttatcaccagattaaagtaaaggatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 19776641  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19776642 tggagttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgacgatattttg 19776741  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19776742 atttactccaagaccgaagaagaacatgccgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgaat 19776841  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  19776842 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggtgatg 19776889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 23958110 - 23957663
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  23958110 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgtgtttttagcaagattgatt 23958011  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23958010 tgaggtcaggatatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 23957911  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||    
T  23957910 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 23957811  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  23957810 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaat 23957711  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  23957710 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggtgatg 23957663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 8388775 - 8388336
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  8388775 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 8388676  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8388675 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 8388576  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  8388575 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatcgacgatatttta 8388476  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  8388475 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 8388376  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttc 466  Q
    |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  8388375 tctggttgaatgaggtgagtttccttggccatgttatttc 8388336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 27713699 - 27713252
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  27713699 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatgggtcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 27713600  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27713599 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 27713500  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||    
T  27713499 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 27713400  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  27713399 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaat 27713300  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  27713299 tctagttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggtgatg 27713252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 474
Target Start/End: Original strand, 18225094 - 18225542
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||    
T  18225094 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 18225193  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18225194 ttgagatcagggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 18225293  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  18225294 tcggtgtgaccaatgcacctggactgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcctttttggatcggttcgtagttgtgtttattgacgacatttt 18225393  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  18225394 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 18225493  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    |||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18225494 ttctggttgaaagaagtaccttttcttggccatgttatttctggtgatg 18225542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 474
Target Start/End: Original strand, 15145541 - 15145981
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15145541 tcagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattga--------tggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaacattgat 15145632  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15145633 ttgagatcgggttatcactagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 15145732  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  15145733 tcggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtacatgaatcgtatctttcatgcatttttggatcgattcgtggttgtctttatcgatgatatttt 15145832  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||     
T  15145833 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaacattgtcttgcaagtgttgaaagagaggaaactttatgctaaattatctaagtgtgag 15145932  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15145933 ttctggttgaaagaggtaagttttcttggccatgttatttctggtgatg 15145981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 27 - 398
Target Start/End: Original strand, 16234641 - 16235012
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  16234641 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 16234740  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16234741 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 16234840  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16234841 tggagttaccaatacacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgacgatattttg 16234940  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaa 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16234941 atttactccaagactgaagaagaacatgccgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaa 16235012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 27 - 395
Target Start/End: Original strand, 17092798 - 17093166
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  17092798 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcaactagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 17092897  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17092898 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 17092997  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||    
T  17092998 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 17093097  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaag 395  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17093098 atctactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaag 17093166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 112 - 474
Target Start/End: Original strand, 16353241 - 16353604
Alignment:
Q  112 tcagcaaaattgatttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaata 211  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16353241 tcagcaagattgatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaata 16353340  T
Q  212 taaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttc 311  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||    
T  16353341 caaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtggttgttctc 16353440  T
Q  312 atcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaat 411  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16353441 atcgatgatattttaatttactccaagaccgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaat 16353540  T
Q  412 tgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttct-tggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    | ||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  16353541 tatctaagtgtgagttctggttaaaagaggtaagttttctntggccatgttatttctggtgatg 16353604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 27 - 468
Target Start/End: Original strand, 14849015 - 14849456
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||| || ||||| || |||||||| |||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||  ||||||    
T  14849015 cagttgaataaagtaacgataaagaatagatatccacttccaaaaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcgcgtgtatttagcaaggttgatt 14849114  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||  |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| || |||||||||||||  ||||||||    
T  14849115 tgagatcgggttatcaccaaattaaagtgagagatgaagatatgcagaagacggcttttagaacgcgttatggacattatgaatataaagagatgccttt 14849214  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     |||||||| ||||| || || |||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  14849215 cggtgttacaaatgcgccaggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatttttcatgcatttttggatcgcttcgtggttgtgttcatcgacgatattttg 14849314  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    || ||||||||| | ||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||  | ||||| |||||||| || |||||||    
T  14849315 atatactccaagtccgaagaagaacatgttgagcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaggagaagaagttatatgctaaattgtcaaagtgtgaat 14849414  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  14849415 tctggttgaaagaggtaagttttcttggccaagttatttctg 14849456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 27 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 14696476 - 14696036
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||    
T  14696476 cagttgaacaaagtaacgataaagaatatgtatctacttccaagaattgatgattttatggatcagttagtgggtgtacgtgtgtttagcaagattgatt 14696377  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||  |||| ||||| |||||||| |||||| | |||||||||||||| || || |||| ||||||||| || ||| |||||  ||| ||||||||    
T  14696376 tgagatcgggttaacaccaaattaaagtgaaagataaggatatgcagaagacggcctttagaacgcgttatggacattattaatattcagtgatgccttt 14696277  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    ||||||||| ||||| || || |||||||||||||| |||||    || || ||||| | ||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  14696276 tggtgttacaaatgcgccaggtgtgtttatggagtacatgaactctatttttcatgcgtatttggattgcttcgtggttgtgttcattgatgatattttg 14696177  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    || ||||| ||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||  | ||||| || ||||| || ||||| |    
T  14696176 atatactcgaagtccgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaatttatatgctaagttgtcaaagtgtgagt 14696077  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttct 467  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  14696076 tctggttgaatgaggtgagttttcttggccatgttatttct 14696036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 26 - 468
Target Start/End: Original strand, 15001273 - 15001714
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    ||||||||| || || || || ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  15001273 tcagttgaataaagtgacgataaagaataggtatccacttccgaggattgacgatttaatggatcagttagtgggtgcacgtgtgtttagtaaaattgat 15001372  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||| |||| || |||||||| || || ||||| |||||||||||||| || || || |   |||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  15001373 ttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacatgttatggtcactatgaatataaggtgatgcctt 15001472  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | |||| ||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| || || |||||||| | | |||||  ||| || |||||||| || ||||| || ||    
T  15001473 tcggtgatactaatgcgcctgttgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatctt 15001572  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
    |||||| || |||| ||||||||| ||||| || ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||  | |||||||| |||| |||||||| |    
T  15001573 gatttattctaagattgaagaagagcatgcagaacatctgaggattgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtttaaatgtg-a 15001671  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
     ||||||| |  || || ||||||||||||||  |||||||||    
T  15001672 gtctggttaagtgaagtaagttttcttggccacattatttctg 15001714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 27 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 14161833 - 14161403
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||    
T  14161833 cagttgaacaaggtaacgatacagaataggtatccacttccaagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgcgtgttcaacaagattgatt 14161734  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||  ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||| ||||| || |  |||||  | || ||||||| |  ||| ||||||||    
T  14161733 tgagatcgggttatcaccagattagagtaaagaatgaagatatacagaagacggcttttaggacacgttacagacattatgaattttcagtgatgccttt 14161634  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     |||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||  | || || ||||| | | |||||   ||||||||||| || || ||||||||  |     
T  14161633 cggtgtttctaatgcacctggagtatttatggagtatatgaacagaatttttcatgcttatctggataagttcgtagttgtatttattgatgatatccta 14161534  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactt-tatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
    ||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  | || |||||||| || ||| || || |||||||| ||||| |||||||||    
T  14161533 atttattctgagacagaagaagaacatgctgagcatttgaagattgttctacaggtgttgaagga-aagtaagttgtatgccaagttgtcgaaatgtgaa 14161435  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttcttggcca 457  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  14161434 ttctggttgaatgaggtgagttttcttggcca 14161403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 28 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 16218592 - 16218325
Alignment:
Q  28 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgattt 127  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  16218592 agttgaacaaagtaacgataaagaataggtatccacttccgagaattgatgacttaatggattagttagtgggtgcacgtgtgtttagcaagattgactt 16218493  T
Q  128 gaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttt 227  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||     
T  16218492 gaggtcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaggatatgcagaagacagcttttagaacacgttatggacattatgaatataaagtgatgcccttc 16218393  T
Q  228 ggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcg 295  Q
    |||||||| ||||   | || |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  16218392 ggtgttacaaatgtgtcaggtgtgtttatggagtacatgaatcgcatttttcatgcatttttggatcg 16218325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 28 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 16221912 - 16221645
Alignment:
Q  28 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgattt 127  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  16221912 agttgaacaaagtaacgataaagaataggtatccacttccgagaattgatgacttaatggattagttagtgggtgcacgtgtgtttagcaagattgactt 16221813  T
Q  128 gaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttt 227  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||     
T  16221812 gaggtcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaggatatgcagaagacagcttttagaacacgttatggacattatgaatataaagtgatgcccttc 16221713  T
Q  228 ggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcg 295  Q
    |||||||| ||||   | || |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  16221712 ggtgttacaaatgtgtcaggtgtgtttatggagtacatgaatcgcatttttcatgcatttttggatcg 16221645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 26 - 468
Target Start/End: Original strand, 15357028 - 15357470
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    |||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||     
T  15357028 tcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcagttagtgggtgcaaaggttttcagcaagattgac 15357127  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    || |||||| |||| || |||||||| || || ||||| |||||||||||||| || || || |  |||||||||||||||||||| || || |||||||    
T  15357128 ttaaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcactatgaatacaaggtgatgcctt 15357227  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| |   |||||   ||||  ||||| || || ||||| ||| |    
T  15357228 tcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcctacctggataagttcgcggttgtatttattgatgacattct 15357327  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||  | |||||||| ||||| ||||||||     
T  15357328 gatttattctaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtattacaagtattgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtcgaaatgtgag 15357427  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    |||||||| |  ||  | ||||||||||||||  |||||||||    
T  15357428 ttctggttaagtgaattaagttttcttggccacattatttctg 15357470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 48 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 15072701 - 15072282
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttgaggtcaagttatcaccaga 147  Q
    ||||| || ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || || |    
T  15072701 aagaacagatatccacttccgataattgatgatttaatggatcagttagtgggtgctcgtgtgttcagcaaaattgatttgaggtcaggttaccatcaaa 15072602  T
Q  148 ttaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctgg 247  Q
    |||| || || |||||||||| ||| || || || || || |  || ||||| || ||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  15072601 ttaaggtgaaggatgaagatacgcaaaaaacggcctttaggacacgatatggacattatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctgg 15072502  T
Q  248 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaa 347  Q
     |||||||||||||| |||||| |  | |||||||| | | |||||  ||| || |||||||| || ||||||||  | ||||| || |||| |||| ||    
T  15072501 tgtgtttatggagtacatgaatagagttttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgatatcctaatttattctaagaatgaataa 15072402  T
Q  348 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagtt 447  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||   | |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |  || || ||||    
T  15072401 gagcatgcagagcatctgaagattgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaggttgtatgccaagttgtccaaatgtgaattctggttaagtgaagtaagtt 15072302  T
Q  448 ttcttggccatgttatttct 467  Q
    ||||||| ||  ||||||||    
T  15072301 ttcttggtcacattatttct 15072282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 297 - 474
Target Start/End: Original strand, 18613743 - 18613920
Alignment:
Q  297 ttcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaaga 396  Q
    |||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18613743 ttcgtagttgtgtttattgacgacattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaaga 18613842  T
Q  397 aactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  18613843 aactttatgcaaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaaaaagtaagttttctaggccatgttatatctggtgatg 18613920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 30 - 474
Target Start/End: Original strand, 51604704 - 51605148
Alignment:
Q  30 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttga 129  Q
    |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||| | |||||||| |||||||| ||| |||||||||||   || ||||| || ||||| ||||    
T  51604704 ttgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttgatggaccagctagtgggtgcaaaggtgttcagtaagattgacttga 51604803  T
Q  130 ggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttgg 229  Q
    ||||| |||| || || ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || |  || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||    
T  51604804 ggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaagatgaagatatgcagaagacggcttttaggacacgatacggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcgg 51604903  T
Q  230 tgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatt 329  Q
    |||||| || || || || ||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||| |||||  |||||| || || || || ||||||||| |||||    
T  51604904 tgttactaacgcgcccggtgtgttcatggagtatatgaatcgaatttttcatgcttttctggataaattcgtggtggtatttattgatgatattctgatt 51605003  T
Q  330 tactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattct 429  Q
    || || |||||||||||||| ||||| || |||||||  |||||  ||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||| || |    
T  51605004 tattcgaagactgaagaagagcatgcagaacatctgagaattgtgctgcaagttttgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcgaaatgtgagtttt 51605103  T
Q  430 ggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    || | |  || |||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||    
T  51605104 ggctaagtgaagtgagtttccttggtcatattatttctggtgatg 51605148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 26 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 16150075 - 16149633
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    ||||||||| || || || || ||||| ||||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||   |||||||| || |||||     
T  16150075 tcagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcagttagtgggtgcaaaggttttcagtaagattgac 16149976  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| || || || |  || |||||||| || ||||| || || |||||||    
T  16149975 ttgaggtcaggttaccaccagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctt 16149876  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| |   |||||  ||| || |||||||| || || |||||| |    
T  16149875 tcggtgttactaatgcacctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcctacctggataaatttgtggttgtgtttattgacgatattct 16149776  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
    |||||| || | |||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||| | |||||||| |||||  | ||||| || || || || |||||     
T  16149775 gatttattcaatgactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaaatattgaaagaaaagaagttgtatgctaagttatcgaagtgtgag 16149676  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    |||||||| |  || || ||||||||| ||||  |||||||||    
T  16149675 ttctggttaagtgaagtaagttttctttgccacattatttctg 16149633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 26 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 16154221 - 16153779
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    ||||||||| || || || || ||||| ||||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||   |||||||| || |||||     
T  16154221 tcagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcagttagtgggtgcaaaggttttcagtaagattgac 16154122  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| || || || |  || |||||||| || ||||| || || |||||||    
T  16154121 ttgaggtcaggttaccaccagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctt 16154022  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| |   |||||  ||| || |||||||| || || |||||| |    
T  16154021 tcggtgttactaatgcacctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcctacctggataaatttgtggttgtgtttattgacgatattct 16153922  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
    |||||| || | |||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||| | |||||||| |||||  | ||||| || || || || |||||     
T  16153921 gatttattcaatgactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaaatattgaaagaaaagaagttgtatgctaagttatcgaagtgtgag 16153822  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    |||||||| |  || || ||||||||| ||||  |||||||||    
T  16153821 ttctggttaagtgaagtaagttttcttagccacattatttctg 16153779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 26 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 8708271 - 8707833
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    ||||||||| || || || || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || || ||    |||    
T  8708271 tcagttgaataaagtgacgataaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttaatggatcagttagtgggtgcacgcgtgtttagtaa----gat 8708176  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||  |||| || || |||||||||||||||||||||||| |||| || || || || |  || ||||| || || ||||||  ||| |||||||    
T  8708175 ttgaggtcgggttaccatcatattaaagtaaaagatgaagatatgtagaaaacggcctttagcacacgatatggacattacgaatattcagtgatgcctt 8708076  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | |||||||| || || |  || |||||||||||||| |||||| | || |||||||| | ||||||||| || || |||||||| || ||||| || ||    
T  8708075 tcggtgttactaacgcgcggggtgtgtttatggagtacatgaatagaattttccatgcttatttggatcggtttgtggttgtgtttattgatgacatctt 8707976  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
    |||||| || ||| |||||||||| ||||| ||||||  |||  |||| |||||||||||||| || |||||  | |||||||| ||||| |||||||||    
T  8707975 gatttattctaagtctgaagaagagcatgcagagcattagaaagttgtgttgcaagtgttgaaggaaaagaagatgtatgccaagttgtccaaatgtgaa 8707876  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    || ||||| |  || || |||||| |||||||| |||||||||    
T  8707875 ttttggttaagtgaagtaagttttattggccatattatttctg 8707833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 27 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 22632067 - 22631910
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||    
T  22632067 cagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaagtgttttcagcaagatagatt 22631968  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagcttt 184  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22631967 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagcttt 22631910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 48 - 378
Target Start/End: Original strand, 1647207 - 1647537
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttgaggtcaagttatcaccaga 147  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| || ||||||   ||||| || |||||||| ||||||||| |||| || || |    
T  1647207 aagaataggtatccacttccgaggattgatgacttgatggaccagttggtaggtgcaaaagtttttagtaaaattgacttgaggtcaggttaccatcaaa 1647306  T
Q  148 ttaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctgg 247  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||||||| || || || |  || |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  1647307 ttaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggactcgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctgg 1647406  T
Q  248 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaa 347  Q
     ||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||| |||||  |||||| || || ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||     
T  1647407 tgtgtttatggagtatatgaataggattttccatgcttttctggataaattcgtggtggtattcattgatgatattttgatttattctaagactgaagag 1647506  T
Q  348 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgc 378  Q
    || ||||| || || ||||||||||| ||||    
T  1647507 gagcatgcagaacacctgaagattgtgttgc 1647537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 28 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 23443467 - 23443237
Alignment:
Q  28 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgattt 127  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || | ||| ||||||||    
T  23443467 agttgaacaaagtaacgataaagaatatgtatccacttccgagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcatgtgtgtttaccaagattgattt 23443368  T
Q  128 gaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttt 227  Q
    ||| |   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||  |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||     
T  23443367 gagattgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcataagacaacttttagaacacgttatggacattatgagtataaagtgatgcctttc 23443268  T
Q  228 ggtgttaccaatgcacctggagtgtttatgga 259  Q
    ||| |||| ||||| || || |||||||||||    
T  23443267 ggt-ttacgaatgcgccaggtgtgtttatgga 23443237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 26 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 27902750 - 27902308
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    |||||||||||| || || || ||||| || |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||  | || ||||||   ||||| || ||||||||     
T  27902750 tcagttgaacaaagttacaataaagaacagatatccacttccgaggattgatgacttgatggaccaaatggtaggtgcaaaagtttttagtaaaattgac 27902651  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||| |||| || || |||||||| || |||||||||||||||||||| || || || |  || |||||||| || ||||| ||||| |||||||    
T  27902650 ttgaggtcaggttaccatcaaattaaagtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctt 27902551  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | |||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||  |||||  |||||| || || || || ||| |||||||    
T  27902550 tcggtgttactaaagcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgctttcctggataaattcgtggtggtatttattgatcatatttt 27902451  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactt-tatgccaaattgtctaaatgtga 424  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||||| || ||  |||||||||| |||||  | ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || ||    
T  27902450 gatttattctaagactgaagaggagcatgcagaacacatgaagattgtgttgcagattttgaaagag-agaaagttgtatgccaagttgtcgaagtgcga 27902352  T
Q  425 attctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
     |||| ||| || || ||||||||||| |||||  |||||||||    
T  27902351 gttctagttaaatgaagtgagttttctaggccacattatttctg 27902308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 26 - 431
Target Start/End: Original strand, 44659774 - 44660179
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| || ||||| || ||  ||||||| || |||||||||||||| || |||||     ||||||| || ||||||    
T  44659774 tcagttgaacaaggttacgatcaagaacagatatccgctccctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagattttcagtaagattgat 44659873  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||| || || || |  ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  44659874 ttgaggtcaggttatcatcagataaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 44659973  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | |||||||| || || ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||   || || || ||||| || || ||||||||    
T  44659974 tcggtgttactaacgcgcctggtgtatttatggagtacatgaatcgaatcttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgacgatatttt 44660073  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
     || || ||||||| ||| || || ||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||| || ||||   | ||||| || ||||| ||||||||     
T  44660074 aatctattccaagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtgttgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgcaaagttgtcgaaatgtgag 44660173  T
Q  426 ttctgg 431  Q
    ||||||    
T  44660174 ttctgg 44660179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 27 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 15258290 - 15257921
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||| ||||| || || ||||| |||||||||||| || | ||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |    
T  15258290 cagttgaataaggttacgataaagaacaggtatccactttcgaggattgatgatta-atcgatcagttagtgggtgctcgtgtgtttagcaagattgact 15258192  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| |||| || ||||| || || || |||||  ||||||||||||| || || || |  || |||||||| || |||||||| || ||||||||    
T  15258191 tgaggtcaggttaccatcagatcaaggtgaaggatgagaatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgccttt 15258092  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||||| | | || ||  ||| || |||||||| || |||||||| |||    
T  15258091 cggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggaatatatgaaccgaattttccatgcctatctgaataaatttgtggttgtgtttattgatgatatcttg 15257992  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaa 397  Q
    ||||| || | ||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| | |||||| |||||    
T  15257991 atttattcaaggaccgaagaagagcatgcagagcatctaaagattgtattgcaagtatcgaaagaaaagaa 15257921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 26 - 468
Target Start/End: Original strand, 29451445 - 29451887
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||  ||||||| || |||||||||||||| || |||||     ||||||| || ||||||    
T  29451445 tcagttgaacaaggttacgatcaagaacagatatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagattttcagtaagattgat 29451544  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||  ||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||| || || || |  ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  29451545 ttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 29451644  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||| |||||   || || || || || || |||||||||||    
T  29451645 tcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtatttattgatgatatttt 29451744  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
     || || ||||||| ||| || || ||||| || |||||||  ||||| |||||||||||||| || |||| | | ||||| || ||||| ||||||||     
T  29451745 aatctattccaagaatgaggaggagcatgcagatcatctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagagattgtatgcaaagttgtcgaaatgtgag 29451844  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    |||||||| |  || ||||| ||||| || ||| |||||||||    
T  29451845 ttctggttaagtgaagtgagctttctgggtcatattatttctg 29451887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 26 - 468
Target Start/End: Original strand, 3262702 - 3263144
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||||| |||||  ||||||| || |||||||||||||| || |||||     |||| || || ||||||    
T  3262702 tcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagatttttagtaagattgat 3262801  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||  ||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||| || || || |  ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  3262802 ttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 3262901  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||| |||||   || || || ||||| || |||||||||||    
T  3262902 tcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatttt 3263001  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
     || || ||||||| ||| || || ||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||| || ||||   | ||||| || || || ||||||||     
T  3263002 aatctattccaagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttatcaaaatgtgag 3263101  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    |||||||| || || || |||||||| || ||  |||||||||    
T  3263102 ttctggttaaatgaagtaagttttctgggtcacattatttctg 3263144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 222 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 15323385 - 15323139
Alignment:
Q  222 ccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgata 321  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || |||||| | || |||||||| | | |||||  ||| || |||||||| || |||||||    
T  15323385 cctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatggaatacatgaatagaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgata 15323286  T
Q  322 ttttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatg 421  Q
    || | ||||| || |||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||  | |||||||| ||||| |||||    
T  15323285 ttgtaatttattctaagagtgaagaagagcatgcagagcatctgaaaattgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtccaaatg 15323186  T
Q  422 tgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    |||||||||||| |  || || ||||||||||||||| |||||||||    
T  15323185 tgaattctggttaagtgaagtaagttttcttggccatattatttctg 15323139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 26 - 388
Target Start/End: Original strand, 11205140 - 11205502
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    ||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||  ||||||| || ||||||||||| || || |||||     | || ||||| |||||     
T  11205140 tcagttgaacaaggttacgataaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcaattggttggtgctaagatctttagcaagattgac 11205239  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||  ||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||| || || || |  ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  11205240 ttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 11205339  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | |||||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||| |||||   || || || ||||| || |||||||| ||    
T  11205340 tcggtgttactaacgcgcctggtgtgtttatggagtacatgaaccgaatcttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatctt 11205439  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaa 388  Q
     ||||| ||||||| |||||| || ||||| || || ||||  ||||| ||||||||||||||    
T  11205440 aatttattccaagaatgaagaggagcatgcagaacacctgagaattgtattgcaagtgttgaa 11205502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 26 - 130
Target Start/End: Original strand, 16251498 - 16251602
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||    
T  16251498 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatgtatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 16251597  T
Q  126 ttgag 130  Q
    |||||    
T  16251598 ttgag 16251602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 364 - 474
Target Start/End: Original strand, 1640326 - 1640436
Alignment:
Q  364 tgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttat 463  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  1640326 tgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattttcaaagtgtgaattctggttgaaagaggtaagttttcttagccatgttat 1640425  T
Q  464 ttctgatgatg 474  Q
    ||||| |||||    
T  1640426 ttctggtgatg 1640436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 27 - 467
Target Start/End: Original strand, 15291067 - 15291507
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||| ||||||   || || || || |||||||    
T  15291067 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagttggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 15291166  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| | ||||| ||||||| |||||| |  ||||||||    || || || ||| ||| | | ||||| |||||||| |||   || ||||| ||    
T  15291167 tgagatcaggatatcatcagattagagtaaaggcagaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatt 15291266  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    ||| ||  | ||||| || || || |||||||| || ||||||   || || ||| | | | |||| |  || || || |||||||| ||||||||||||    
T  15291267 tggagtatctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaataaaatatttcatccttatctggaccattttgtggtggtgttcatagatgatattttg 15291366  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
     | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||  |  | |  ||||| |||||||| ||||| |    
T  15291367 gtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgcgccaagttgtctaagtgtgagt 15291466  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttct 467  Q
    | |||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  15291467 tttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 15291507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 22 - 92
Target Start/End: Original strand, 16353174 - 16353244
Alignment:
Q  22 atcatcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcag 92  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16353174 atcatcagttgaataaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcag 16353244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 401 - 474
Target Start/End: Original strand, 29037427 - 29037500
Alignment:
Q  401 ttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  29037427 ttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggtgatg 29037500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 388; Significance: 0; HSPs: 48)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 388; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 22350214 - 22349767
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22350214 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccatttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatt 22350115  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22350114 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaggatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 22350015  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22350014 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcacatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtattcatcgatgatattttg 22349915  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  22349914 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgagt 22349815  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  22349814 tctggttgaaagaagtgagttttcttggccatgttatttatggtgatg 22349767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 474
Target Start/End: Original strand, 14997830 - 14998277
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  14997830 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtttttagcaagattgatt 14997929  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14997930 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 14998029  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||    
T  14998030 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 14998129  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  14998130 atttactccaagactgaagaggaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaat 14998229  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  14998230 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggtgatg 14998277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 474
Target Start/End: Original strand, 22330981 - 22331425
Alignment:
Q  30 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttga 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  22330981 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtttttagcaagattgatttga 22331080  T
Q  130 ggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttgg 229  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22331081 ggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttgg 22331180  T
Q  230 tgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatt 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  22331181 tgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatt 22331280  T
Q  330 tactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattct 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  22331281 tactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattct 22331380  T
Q  430 ggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  22331381 ggttgaaagaagtgagttttctaggctatgttatttctggtgatg 22331425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 474
Target Start/End: Original strand, 37289587 - 37290034
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  37289587 cagttgaataaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtttttagcaagattgatt 37289686  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37289687 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcattatgaatataaagttatgccttt 37289786  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||    
T  37289787 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 37289886  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  37289887 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 37289986  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  37289987 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggtgatg 37290034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 27612649 - 27612202
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  27612649 cagttgaacaaggtaactatcaaaaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggaccagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 27612550  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27612549 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 27612450  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  27612449 tggagttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtggttgtgtttatcgacgatattttg 27612350  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  27612349 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 27612250  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  27612249 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggtgatg 27612202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 474
Target Start/End: Original strand, 29474164 - 29474611
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  29474164 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtttttagcaagattgatt 29474263  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29474264 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatggagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 29474363  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || || |||||||| |||||||||||||||    
T  29474364 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcagtttgtggttgtgtttatcgatgatattttg 29474463  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || || |||||||    
T  29474464 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgataaattatcgaagtgtgaat 29474563  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  29474564 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggtgatg 29474611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 41773137 - 41772690
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  41773137 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 41773038  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41773037 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 41772938  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||| |||    
T  41772937 tggtgttaccaatgcacctagagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatatcttg 41772838  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  41772837 atttactccaagactgaagaagaacatgccgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaatttttatgctaaattgtctaaatgtgaat 41772738  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  41772737 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggtgatg 41772690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 27520701 - 27520254
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  27520701 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 27520602  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27520601 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaggatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 27520502  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||     
T  27520501 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatatttta 27520402  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  27520401 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 27520302  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  27520301 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggtgatg 27520254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 16358797 - 16358350
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  16358797 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 16358698  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16358697 tgagatcaggctatcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccctt 16358598  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  16358597 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatcgacgatattttg 16358498  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  16358497 atctactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaat 16358398  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  16358397 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggtgatg 16358350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 22136963 - 22136516
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  22136963 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtttttagcaagattgatt 22136864  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22136863 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacggctttcaggacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 22136764  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| || ||||||    
T  22136763 tggtgttactaatgcacctggagtgtttatggggtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgacattttg 22136664  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  22136663 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttttgctaaattgtctaagtgtgaat 22136564  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  22136563 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggtgatg 22136516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 474
Target Start/End: Original strand, 27683491 - 27683938
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  27683491 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtttttagcaagattgatt 27683590  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27683591 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 27683690  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  ||||||||    
T  27683691 tggtgttaccaatgcacctggagtgtctatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacaatattttg 27683790  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  27683791 atttactccaagactgacgaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgagagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaat 27683890  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  27683891 tctggttcaaagaagtgagttttctaggccatgttatctctggtgatg 27683938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 34568789 - 34568342
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  34568789 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 34568690  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34568689 tgagatcaggctatcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccctt 34568590  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  34568589 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatcgacgatattttg 34568490  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  34568489 atctactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaat 34568390  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  34568389 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggtgatg 34568342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 19772255 - 19771808
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  19772255 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcaactagtgggtgcacgtgtttttagcaagattgatt 19772156  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19772155 tgaggtgaggatatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 19772056  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| |||    
T  19772055 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgttcatcgacgatatcttg 19771956  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  19771955 atttactccaagactgaagaagaacatgccgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaat 19771856  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  19771855 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttttggtgatg 19771808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Original strand, 27666581 - 27667020
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||    
T  27666581 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccactttcgagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcacgagttttcagcaagatagatt 27666680  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27666681 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttttgccttt 27666780  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||    
T  27666781 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtggttgtgttcatcgacgatatcttg 27666880  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  27666881 atttactccaagactgaagaagaacatgccgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 27666980  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttc 466  Q
    |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  27666981 tctggttgaatgaagtgagtttccttggccatgttatttc 27667020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 40711075 - 40710636
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  40711075 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 40710976  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40710975 tgagatcaggctatcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 40710876  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||    
T  40710875 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 40710776  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  40710775 atctactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaat 40710676  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttc 466  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  40710675 tctggttgaaagaggtgagtttccttggccatgttatttc 40710636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 50 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 20801669 - 20801245
Alignment:
Q  50 gaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttgaggtcaagttatcaccagatt 149  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  20801669 gaataggtatcctcttccgagaattgatgatttcatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatttgagatcagggtatcaccagatt 20801570  T
Q  150 aaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctggag 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20801569 aaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctggag 20801470  T
Q  250 tgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaaga 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20801469 tgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttttctttatcgatgatattttaatttactccaagactgaagaaga 20801370  T
Q  350 acatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagtttt 449  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || |||||     
T  20801369 acatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgctgaaagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgagttctggttgaaagaggtaagtttc 20801270  T
Q  450 cttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||    
T  20801269 cttggccatgtcatttctggtgatg 20801245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 18781409 - 18780962
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||    
T  18781409 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacctccgagaattgatgatttaatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 18781310  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18781309 tgagatcagggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 18781210  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  18781209 cggtgtgaccaacgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcctttttggatcggttcgtagttgtgtttatcgacgacattttg 18781110  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  18781109 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttttgcgaaattgtctaagtgtgaat 18781010  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    |||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18781009 tctgattgaaggaagtaagttttcttggccatgttatttctggtgatg 18780962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 27 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 25428728 - 25428287
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||     
T  25428728 cagttgaacaaggtaacaataaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaagtgttttcagcaagatagatc 25428629  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  25428628 tgagatcgggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacaactttcagaacgcggtatggccactatgaatacaaagttatgccttt 25428529  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     |||||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||||||||||    
T  25428528 cggtgttacaaatgcacctggactatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggaccgattcgtggttgtttttattgatgatattttg 25428429  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  | || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  25428428 atttactccaagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaatctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaagtgtgaat 25428329  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    ||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  25428328 tctagttgaaagaagtgagctttcttggacatgttatttctg 25428287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 27 - 468
Target Start/End: Original strand, 26736818 - 26737259
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||    
T  26736818 cagttgaacaaagtaacgataaagaatatgtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacatgtatttagcaagattgatt 26736917  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  26736918 tgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaacttttagaacacgttatggacaatatgaatataaagtgatgccttt 26737017  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||  || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26737018 cggtgttacaaatgcacctggtgtgtttatggagtacatgaatcaaatttttcatgcatttttagatcgtttcgtggttgtgttcatcgatgatattttg 26737117  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||| ||||||| |||||  | ||||| ||||| || || |||||||    
T  26737118 atttactccaagtccgaagaagaacatgctgaacatttgaagattattttgcaagtgctgaaagataagaagttatatgctaaattatcaaagtgtgaat 26737217  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  26737218 tctggttgaaagaggtaagttttcttggccatgttatttctg 26737259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 27 - 468
Target Start/End: Original strand, 21337385 - 21337826
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    ||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| || ||||| |||||||    
T  21337385 cagttgaccaaagtaacgataaagaataggtatccaattccaagaattgatgacttgatggatcagttattgggtgcatgtgtgtttagcaagattgatt 21337484  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||  | |||||||||||||| ||||||||    
T  21337485 tgaggtcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaatacagcttttagaacacgttatggatattatgaatataaagtgatgccttt 21337584  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     |||||||| ||||| || || ||||||||||| || |||||||| || || ||||| ||||||||| | || || ||||| |||||||| |||||||||    
T  21337585 cggtgttacgaatgcgccaggtgtgtttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcgtttttggatagcttagtggttgtattcatcgacgatattttg 21337684  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||    
T  21337685 atttactccaagtttgaagaagaacatgctgagcacttgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaaactttatgctaaattatcaaagtgtgaat 21337784  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  21337785 tctggttgaaagaggtgagttttctcggccacgttatttctg 21337826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 30 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 23473519 - 23473081
Alignment:
Q  30 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttga 129  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  23473519 ttgaacaaagtaacgataaagaataggtatccacttccaagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtgtttagcaagattgatttga 23473420  T
Q  130 ggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttgg 229  Q
    | ||   |||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||  |||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||    
T  23473419 gatcggtttatcatcaaattaaagtgaaagatgaagatatgtagaagacggcttttagaacacgttatggacattatgaatataaagtgatgcctttcgg 23473320  T
Q  230 tgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatt 329  Q
    |||||| ||||| || || |||| ||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||     
T  23473319 tgttacaaatgcgccaggtgtgtctatggagtacatgaatcgtatttttcatgcatttttggatcgtttcgtggttgtgttcatcgacgatattttgatg 23473220  T
Q  330 tactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattct 429  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||| | | ||  |||| ||||||||| |||||||||||||  | ||||| |||||||| || ||||| ||||    
T  23473219 tactcaaagtctgaagaagaacatgctgagcgtttaaaagttgttttgcaagtgctgaaagagaagaagttatatgctaaattgtcaaagtgtgagttct 23473120  T
Q  430 ggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
     |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23473119 agttgaatgaggtgagttttcttggccatgttatttctg 23473081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 27 - 468
Target Start/End: Original strand, 20466190 - 20466631
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||| ||  |||| || ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  20466190 cagttgaataaactaacaataaagaataagtatccacttccaagaattgatgatttgatggatcagttactgggtgcacgtgtgtttagcaagattgatt 20466289  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    | || ||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || |  |||||||| || || ||||||  ||| ||||||||    
T  20466290 taagatcaggttatcaccagattaaagtgaaagacgaggatatgcaaaagacggcctttaggacacgttatggacattacgaatattcagtgatgccttt 20466389  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    ||||||||| |||||||| || ||||||||| |||| |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  20466390 tggtgttactaatgcaccgggtgtgtttatgaagtacatgaatcgtatttttcatgcgtatttagatcgcttcgtggttgtgatcatcgatgatattttg 20466489  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    || ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||  | |||||||| ||||| || ||||| |    
T  20466490 atatactctaagtctgaagaagaacatgttgagcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaggagaagaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgagt 20466589  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20466590 tctggttgaatgaggtgagttttcttggccatgttatttctg 20466631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 48 - 467
Target Start/End: Original strand, 22234032 - 22234451
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttgaggtcaagttatcaccaga 147  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| | |||| || ||||    
T  22234032 aagaataggtatccacttccgaggattgatgatttaatggatcagttagtgggtgcacgtgtgtttagtaaaattgatttgaggttaggttaccatcaga 22234131  T
Q  148 ttaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctgg 247  Q
    |||| || |  ||||| ||||||| |||||| || || || |   |||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  22234132 ttaaggtgatggatgaggatatgccgaagacggcctttaggacatgttatggtcactatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctgg 22234231  T
Q  248 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaa 347  Q
     |||||| |||||||||||||    || |||||||| | | |||||  ||| || |||||||| || ||||| || || ||||| || ||||||||||||    
T  22234232 tgtgtttgtggagtatatgaacaaaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttaatttattctaagactgaagaa 22234331  T
Q  348 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagtt 447  Q
    || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||||||||||||||| |  || || ||||    
T  22234332 gagcatgcagatcatctgaagattgtattgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgtcaagttatcaaaatgtgaattctggttaagtgaagtaagtt 22234431  T
Q  448 ttcttggccatgttatttct 467  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  22234432 ttcttggccatattatttct 22234451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 26 - 424
Target Start/End: Original strand, 21562115 - 21562512
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    ||||||||| || || || || ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| || |||||||| ||||||    
T  21562115 tcagttgaataaagtgacgataaagaataggtatccacttccgagaattgatggtttaatggatcagttagtgg-tgcacgcgtgttcagcaagattgat 21562213  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || || || |  || ||||| || |||||||||||||| ||| |||    
T  21562214 ttgaggtcgggttaccaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaaaacggcctttaggacacgatatggacattatgaatataaagtgatgtctt 21562313  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | |||||||| |||||  |||| |||||||||||||| |||||| | || |||||||| | ||| ||| | || ||||||||||| || ||||| ||  |    
T  21562314 tcggtgttactaatgcgtctggtgtgtttatggagtacatgaatagaattttccatgcctatttagattggtttgtagttgtgtttatagatgacatcct 21562413  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtga 424  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||| |||||| | || ||||| || ||||||||||| || || || || |||||||| || || ||||||||    
T  21562414 gatttattctaagactgaagaagagcatgcagagcatttaaaaattgtgtttcaagtgttgaaggaaaaaaagctgtatgccaagttttccaaatgtga 21562512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 30 - 474
Target Start/End: Original strand, 17267428 - 17267872
Alignment:
Q  30 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttga 129  Q
    |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||| | |||||||| |||||||| ||| |||||||||||   || ||||| || ||||| ||||    
T  17267428 ttgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttgatggaccagctagtgggtgcaaaggtgttcagtaagattgacttga 17267527  T
Q  130 ggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttgg 229  Q
    ||||| |||| || || ||||| || |||||||| |||||||||||||| || || || |  || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||    
T  17267528 ggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaagatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcgg 17267627  T
Q  230 tgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatt 329  Q
    |||||| || || || || ||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||| |||||  ||| || || || || || ||||||||| |||||    
T  17267628 tgttactaacgcgcccggtgtgttcatggagtatatgaatcgaatttttcatgcctttctggataaatttgtggtggtatttattgatgatattctgatt 17267727  T
Q  330 tactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattct 429  Q
    || || |||||||||||||| ||||| || || ||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||| |||||| | || |    
T  17267728 tattcaaagactgaagaagagcatgcagaacacctgagaattgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaaattgtcgaaatgtaagtttt 17267827  T
Q  430 ggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    || | |  || |||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||    
T  17267828 ggctaagtgaagtgagtttccttggtcatattatttctggtgatg 17267872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 26 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 20823731 - 20823289
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    |||||||||||| || || || |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| || |||||    ||||| || || |||||     
T  20823731 tcagttgaacaaagttacaataaagaatagatatccacttccgcggattgatgatttgatggaccagttggtaggtgctaaagtttttagtaagattgac 20823632  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||  |||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || |  || |||||||| || ||||| ||||| |||||||    
T  20823631 ttgaggtcgggttaccatcaaattaaagtgaaagacgaagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctt 20823532  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | |||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||  ||| || || ||||| || |||||||| ||    
T  20823531 tcggtgttactaacgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggtggtgtttatagatgatatatt 20823432  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactt-tatgccaaattgtctaaatgtga 424  Q
    ||| || || || |||||||| ||||| || || || ||||||||||| |||||  | ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || ||    
T  20823431 gatctattcaaaaactgaagaggaacacgccgaacacctgaagattgtgttgcagattttgaaagag-agaaagttgtatgccaagttgtcgaagtgcga 20823333  T
Q  425 attctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
     |||||||| |  || |||||||| || ||||| ||||||||||    
T  20823332 gttctggttaagtgaagtgagtttcctcggccacgttatttctg 20823289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 26 - 468
Target Start/End: Original strand, 28893032 - 28893474
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    |||||||||||| || || || |||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| || |||||    ||||| ||||| |||||     
T  28893032 tcagttgaacaaagttacaataaagaatagatatccacttccgcggattgatgacttgatggaccagttggtaggtgctaaagtttttagcaagattgac 28893131  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||  |||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |  || |||||||| || ||||| ||||| |||||||    
T  28893132 ttgaggtcgggttaccatcagattaaagtgaaggatgaagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctt 28893231  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | |||||||| || || || || ||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||  ||| || || || || || |||||||| ||    
T  28893232 tcggtgttactaacgcgccgggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggtggtatttatagatgatatatt 28893331  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactt-tatgccaaattgtctaaatgtga 424  Q
    ||| || || || |||||||| ||||| || || || ||||||||||| |||||  | ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || ||    
T  28893332 gatctattctaaaactgaagaggaacacgccgaacacctgaagattgtgttgcagattttgaaagag-agaaagttgtatgccaagttgtcgaagtgcga 28893430  T
Q  425 attctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
     |||||||| |  || ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  28893431 gttctggttaagtgaagtgagttttctaggccatgtcatttctg 28893474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 26 - 468
Target Start/End: Original strand, 28921858 - 28922300
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    |||||||||||| || || || |||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| || |||||    ||||| ||||| |||||     
T  28921858 tcagttgaacaaagttacaataaagaatagatatccacttccgcggattgatgacttgatggaccagttggtaggtgctaaagtttttagcaagattgac 28921957  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||  |||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |  || |||||||| || ||||| ||||| |||||||    
T  28921958 ttgaggtcgggttaccatcagattaaagtgaaggatgaagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctt 28922057  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | |||||||| || || || || ||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||  ||| || || || || || |||||||| ||    
T  28922058 tcggtgttactaacgcgccgggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggtggtatttatagatgatatatt 28922157  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactt-tatgccaaattgtctaaatgtga 424  Q
    ||| || || || |||||||| ||||| || || || ||||||||||| |||||  | ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || ||    
T  28922158 gatctattctaaaactgaagaggaacacgccgaacacctgaagattgtgttgcagattttgaaagag-agaaagttgtatgccaagttgtcgaagtgcga 28922256  T
Q  425 attctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
     |||||||| |  || ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  28922257 gttctggttaagtgaagtgagttttctaggccatgtcatttctg 28922300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 26 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 20344560 - 20344153
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    |||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||  ||||||| || |||||||||||||| || |||||     |||| ||||| |||||     
T  20344560 tcagttgaacaaagtcacgataaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagatttttagcaagattgac 20344461  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||  ||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||| || || || |  ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  20344460 ttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 20344361  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | |||||||| || |  ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||| |||||   || || || ||||| || |||||||| ||    
T  20344360 tcggtgttactaacgtgcctggtgtgtttatggagtacatgaaccgaatcttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatctt 20344261  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
     ||||| ||||||| |||||| || ||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||   | ||||| || ||||| ||||||||     
T  20344260 aatttattccaagaatgaagaggagcatgcagagcatctgagaattgtcttgcaagttttgaaagagaagaggttgtatgctaagttgtcaaaatgtgag 20344161  T
Q  426 ttctggtt 433  Q
    ||||||||    
T  20344160 ttctggtt 20344153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 26 - 433
Target Start/End: Original strand, 24796487 - 24796894
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||||| |||||  ||||||| || |||||||||||||| || |||||     ||||||| || ||||||    
T  24796487 tcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgccaagattttcagtaagattgat 24796586  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||  ||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||| || || || |  ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  24796587 ttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaagatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 24796686  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||| |||||   || || || ||||| || ||||||||| |    
T  24796687 tcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatattct 24796786  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
     ||||| ||||||| ||| || || ||||| ||||||||||  || || |||||||||||||| || ||||   | ||||| || || || |||||||||    
T  24796787 aatttattccaagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaatagtgttgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttatcaaaatgtgaa 24796886  T
Q  426 ttctggtt 433  Q
    ||||||||    
T  24796887 ttctggtt 24796894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 26 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 25850353 - 25849911
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||| || |||||     |||| || || ||||||    
T  25850353 tcagttgaacaaggttacgataaagaacagatatccgcttccgagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaaaatttttagtaagattgat 25850254  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||  ||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||| || || || |  ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  25850253 ttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 25850154  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | |||||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| ||| |||||   || || || |||||||| |||||||| ||    
T  25850153 tcggtgttactaacgcgcctggtgtatttatggagtacatgaaccaaatcttccatgcttttctggataagtttgttgtagtgttcattgatgatatctt 25850054  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
    |||||| || |||| |||||| || ||||| ||||||||||  || || |||||||||||||| || ||||   | ||||| || ||||| ||||||||     
T  25850053 gatttattcgaagaatgaagaggagcatgcagagcatctgagaatagtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgcaaagttgtcgaaatgtgag 25849954  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    |||||||| |  || ||||||||||| || ||  |||||||||    
T  25849953 ttctggttaagtgaagtgagttttctgggtcacattatttctg 25849911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 26 - 433
Target Start/End: Original strand, 14885081 - 14885488
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||||| |||||  ||||||| || |||||||||||||| || |||||     ||||||| || ||||||    
T  14885081 tcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgccaagattttcagtaagattgat 14885180  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||  ||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || |  ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  14885181 ttgaggtctggttatcatcagataaaggtaaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 14885280  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||| |||||   || || || || || || |||||||| ||    
T  14885281 tcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgtggtggtatttattgatgatatctt 14885380  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
     ||||| ||||||| ||| || ||||| || ||||||||||  || || |||||||||||||| || ||||   | ||||| || ||||| ||||||||     
T  14885381 aatttattccaagaatgaggaggaacacgcagagcatctgagaatagtgttgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttgtcaaaatgtgag 14885480  T
Q  426 ttctggtt 433  Q
    ||||||||    
T  14885481 ttctggtt 14885488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 26 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 22464229 - 22463781
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    |||||||||||| || || || |||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| || |||||    ||||| || || |||||     
T  22464229 tcagttgaacaaagttacaataaagaatagatatccacttccgcggattgatgacttgatggaccagttggtaggtgctaaagtttttagtaagattgac 22464130  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
     |||||||  |||| || || |||||||| || |||||||||||||||||||| || || || |  || |||||||| || ||||| ||||| |||||||    
T  22464129 ctgaggtcgggttaccatcaaattaaagtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctt 22464030  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | |||||||| || || |||||  |||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||  ||| || || || || || |||||||||||    
T  22464029 tcggtgttactaacgcgcctggtatgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggtggtatttatagatgatatttt 22463930  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactt-tatgccaaattgtctaaatgtga 424  Q
    |||||| || || |||||||| || ||||| || ||  |||||||||| |||||  | ||||| ||| ||||| || |||||||| ||||| || |  ||    
T  22463929 gatttattctaaaactgaagaggagcatgcagaacacttgaagattgtgttgcagattttgaaggag-agaaagttgtatgccaagttgtcgaagtacga 22463831  T
Q  425 attctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
     |||||||| |  || ||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  22463830 gttctggttaagtgaagtgagttttctaggccatgttatttctggtgatg 22463781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 26 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 22504957 - 22504515
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    ||||||||||||||| || || ||||| |||||||| ||||   |||||||||| |||||| ||||||| || |||||  |  ||||||| || |||||     
T  22504957 tcagttgaacaaggttacgataaagaacaggtatccgcttcatagaattgatgacttgatgaatcagttggttggtgctaggattttcagtaagattgac 22504858  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||  ||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||  || || || |  || |||||||| || || || ||||| |||||||    
T  22504857 ttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagatggcctttaggacacgatatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 22504758  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | |||||||| || |  ||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||| |||||   || || || ||||| || |||||||| ||    
T  22504757 tcggtgttactaacgagcctggtgtgtttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatctt 22504658  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
     ||||| || ||||  ||||| || ||||| ||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||   | ||||| || ||||| ||||||||     
T  22504657 aatttattctaagaacgaagaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagttttgaaagagaagaggttgtatgcaaagttgtcaaaatgtgag 22504558  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    |||||||| |  || ||||||||||| || ||  |||||||||    
T  22504557 ttctggttaagtgaagtgagttttctgggtcacattatttctg 22504515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 26 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 20778191 - 20777749
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||| | ||||| || |||||||| ||||| || |||||    ||||| || || |||||     
T  20778191 tcagttgaacaaggttacaataaagaataggtatccactcccgcggattgacgacttgatggaccagttggtaggtgctaaagtttttagtaagattgac 20778092  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||  |||| || || |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||  || ||||| || || ||||| ||||| |||||||    
T  20778091 ttgaggtcgggttaccatcaaattaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttagaacacgatatggacattacgaatacaaagtgatgcctt 20777992  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | |||||||| || || ||||| || || |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||  ||| || || ||||| || |||||||||||    
T  20777991 tcggtgttactaacgcgcctggtgtattcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggtggtgtttatagatgatatttt 20777892  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactt-tatgccaaattgtctaaatgtga 424  Q
    ||| || || || | |||||| ||||| ||  | || || |||||||| |||||  | ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || ||    
T  20777891 gatctattctaaaattgaagaggaacacgccaaacacctaaagattgtgttgcagattttgaaagag-agaaagttgtatgccaagttgtcgaagtgcga 20777793  T
Q  425 attctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
     |||||||| |  || |||||||| || |||||||||| |||||    
T  20777792 gttctggttaagtgaagtgagtttcctaggccatgttacttctg 20777749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 26 - 451
Target Start/End: Original strand, 37541471 - 37541896
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||||| |||||  ||||||| || ||||||||||| || || |||||     |||| || || ||||||    
T  37541471 tcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcaattggttggtgctaagatttttagtaagattgat 37541570  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||  ||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||| || || || |  ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  37541571 ttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 37541670  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | |||||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||| || |||||||| ||| |||||   || || || || || || ||||||||| |    
T  37541671 tcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggaatacatgaatcgaattttccatgcctttctggataagtttgttgtggtatttattgatgatattct 37541770  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
     || || ||||||| ||| || ||||| || ||||||||||  || || |||||||||||||| || ||||   | ||||| || || || ||||||||     
T  37541771 aatctattccaagaatgaggaggaacacgcagagcatctgagaatagtgttgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttatcaaaatgtgag 37541870  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttct 451  Q
    |||||||| || || || ||||||||    
T  37541871 ttctggttaaatgaagtaagttttct 37541896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 27 - 467
Target Start/End: Original strand, 21935279 - 21935719
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||   || || || || |||||||    
T  21935279 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 21935378  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| | ||||| ||||||| |||||| |  ||||||||    || || || ||| |||   | ||||| |||||||| |||   || ||||| ||    
T  21935379 tgagatcaggatatcatcagattagagtaaaggcagaagatatatccaaaactgcgttccgaacaaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatt 21935478  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    ||| ||  | |||||||| || || |||||||| || |||||| | || || ||| | | | |||| || || || || |||||||| ||||||||||||    
T  21935479 tggagtatctaatgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttg 21935578  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
     | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||  |  | | |||||| |||||||| ||||| |    
T  21935579 gtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagt 21935678  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttct 467  Q
    | |||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  21935679 tttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 21935719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 27 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 23507961 - 23507521
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||   || || || || |||||||    
T  23507961 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 23507862  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| | ||||| ||||||| |||||| |  ||||||||    || || || ||| ||| | | ||||| |||||||| |||   || ||||| ||    
T  23507861 tgagatcaggatatcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatt 23507762  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    ||| ||  | |||||||| || || |||||||| || |||||| | || || ||| | | | |||| || || || || |||||||| ||||||||||||    
T  23507761 tggagtatctaatgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttg 23507662  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
     | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||  |    | ||| || |||||||| ||||| |    
T  23507661 gtgtattcgaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtattgaaagagaaccagtgatgtgcaaagttgtctaagtgtgagt 23507562  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttct 467  Q
    | |||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  23507561 tttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 23507521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 48 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 21409408 - 21408991
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttgaggtcaagttatcaccaga 147  Q
    |||||||| ||||||| |||| | || || |||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||| |||||||| || || |   | |||||||| |    
T  21409408 aagaatagatatccacctccgaggatcgacgatttgatggatcagttgatgggtgcgcgtgtgttcagtaaaattgacttaagatggggctatcaccata 21409309  T
Q  148 ttaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctgg 247  Q
    | ||||| |||||||| ||||| |||||||| || || || |  | ||| || ||  | ||||||   || |||||||| |||||||  ||||| || ||    
T  21409308 tcaaagtgaaagatgaggatattcagaagacggcctttaggacacattacggacataacgaatattctgtgatgcctttcggtgttattaatgcgccagg 21409209  T
Q  248 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaa 347  Q
    ||| |||||||| ||||||||| | || || ||| | | | | ||||| || || |||||||| || ||||||||| |||  ||||| ||| |||| ||     
T  21409208 agtatttatggaatatatgaattgtatttttcatacttatctagatcgttttgttgttgtgtttatagatgatattctgaaatactctaagtctgaggag 21409109  T
Q  348 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagtt 447  Q
    |||||||| |||||| |||  ||||| ||||||||| ||||   ||||||  | |||||||| || || || || |||||||||||||| || |||||||    
T  21409108 gaacatgccgagcatttgagaattgttttgcaagtgctgaa---gaagaatttatatgccaagttatcgaagtgcgaattctggttgaacgaagtgagtt 21409012  T
Q  448 ttcttggccatgttatttctg 468  Q
    ||||||| ||| |||||||||    
T  21409011 ttcttggtcatattatttctg 21408991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 163 - 468
Target Start/End: Original strand, 28914640 - 28914945
Alignment:
Q  163 aagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagta 262  Q
    |||||||||||||||| ||||| || |  || |||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| || || || || ||||| ||||||||    
T  28914640 aagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgccgggtgtgttcatggagta 28914739  T
Q  263 tatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcat 362  Q
    |||||| || || |||||||| ||| |||||  ||| || || || || || |||||||| ||||| || || || |||||||| ||||| || || ||     
T  28914740 tatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggtggtatttatagatgatatattgatctattctaaaactgaagaggaacacgccgaacac 28914839  T
Q  363 ctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactt-tatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgtt 461  Q
    ||||||||||| |||||  | ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || |||||||| |  || ||||||||||| ||||||||     
T  28914840 ctgaagattgtgttgcagattttgaaagag-agaaagttgtatgccaagttgtcgaagtgcgagttctggttaagtgaagtgagttttctaggccatgtc 28914938  T
Q  462 atttctg 468  Q
    |||||||    
T  28914939 atttctg 28914945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 163 - 468
Target Start/End: Original strand, 28929908 - 28930213
Alignment:
Q  163 aagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagta 262  Q
    |||||||||||||||| ||||| || |  || |||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| || || || || ||||| ||||||||    
T  28929908 aagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgccgggtgtgttcatggagta 28930007  T
Q  263 tatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcat 362  Q
    |||||| || || |||||||| ||| |||||  ||| || || || || || |||||||| ||||| || || || |||||||| ||||| || || ||     
T  28930008 tatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggtggtatttatagatgatatattgatctattctaaaactgaagaggaacacgccgaacac 28930107  T
Q  363 ctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactt-tatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgtt 461  Q
    ||||||||||| |||||  | ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || |||||||| |  || ||||||||||| ||||||||     
T  28930108 ctgaagattgtgttgcagattttgaaagag-agaaagttgtatgccaagttgtcgaagtgcgagttctggttaagtgaagtgagttttctaggccatgtc 28930206  T
Q  462 atttctg 468  Q
    |||||||    
T  28930207 atttctg 28930213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 195 - 468
Target Start/End: Original strand, 21679037 - 21679310
Alignment:
Q  195 tatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatc 294  Q
    |||||||| || | |||||| || |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  | || || ||||  |   | |||     
T  21679037 tatggtcattacggatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaacagaatttttcatgtttacctagata 21679136  T
Q  295 gattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaa 394  Q
     ||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |  ||||| ||||| ||||| || |||| || |||||| |||||||| |||||||||||    
T  21679137 aatttgtggttgtattcattgatgacattttgatctattcgagaactgaggaagagcatgcagaacatccgaggattgtattgcaagtattgaaagagaa 21679236  T
Q  395 gaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    |||  | |||||||||||||| || || || || ||||| |  || |||||||||||||||||| |||||||||    
T  21679237 gaagttgtatgccaaattgtcaaagtgcgagttttggttaagtgaagtgagttttcttggccatattatttctg 21679310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 27 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 24583487 - 24583047
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||| ||||||   || || || || |||||||    
T  24583487 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagttggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 24583388  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| | ||||| ||||||| |||||| |   |||||||    || || || ||| ||| | | ||||| |||||||| |||   || ||||| ||    
T  24583387 tgagatcaggatatcatcagattagagtaaaggcaaaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatt 24583288  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    ||| ||  | ||||| || || || |||||||| || |||||| | || || ||| | | | |||| || || || || |||||||| ||||||||||||    
T  24583287 tggagtatctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttg 24583188  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
     | || || |||  ||| ||||| |||||||||||| |||  ||||| |||||||| |||||||||||  |  | |  ||||| |||||||| ||||| |    
T  24583187 gtgtattcaaagtttgaggaagagcatgctgagcatttgagaattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgcgccaagttgtctaagtgtgagt 24583088  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttct 467  Q
    | |||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  24583087 tttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 24583047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 341 - 464
Target Start/End: Original strand, 24618700 - 24618823
Alignment:
Q  341 tgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 440  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||   | |||||||| ||||| ||||| || |||||||| |  ||     
T  24618700 tgaagaagagcatgcagagcatctgaaaattgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaggttgtatgccaagttgtccaaatgcgagttctggttaagtgaa 24618799  T
Q  441 gtgagttttcttggccatgttatt 464  Q
    || |||||||| |||||| |||||    
T  24618800 gtaagttttctgggccatattatt 24618823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 341 - 464
Target Start/End: Original strand, 24714931 - 24715054
Alignment:
Q  341 tgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 440  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||   | |||||||| ||||| ||||| || |||||||| |  ||     
T  24714931 tgaagaagagcatgcagagcatctgaaaattgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaggttgtatgccaagttgtccaaatgcgagttctggttaagtgaa 24715030  T
Q  441 gtgagttttcttggccatgttatt 464  Q
    || |||||||| |||||| |||||    
T  24715031 gtaagttttctgggccatattatt 24715054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 341 - 464
Target Start/End: Original strand, 24747959 - 24748082
Alignment:
Q  341 tgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 440  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||   | |||||||| ||||| ||||| || |||||||| |  ||     
T  24747959 tgaagaagagcatgcagagcatctgaaaattgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaggttgtatgccaagttgtccaaatgcgagttctggttaagtgaa 24748058  T
Q  441 gtgagttttcttggccatgttatt 464  Q
    || |||||||| |||||| |||||    
T  24748059 gtaagttttctgggccatattatt 24748082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 426 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 23442104 - 23442056
Alignment:
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  23442104 ttctggttgaaagaagtgagttttcttggccatgtcatttctggtgatg 23442056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 48 - 163
Target Start/End: Original strand, 21676946 - 21677061
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttgaggtcaagttatcaccaga 147  Q
    |||||||| ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||| || ||||||    |||| || |||||||| ||||||||| |||| || ||||    
T  21676946 aagaatagatatccgcttccgagaattgacgacctgatggatcagttggttggtgcaaagatttttagtaaaattgacttgaggtcaggttaccatcaga 21677045  T
Q  148 ttaaagtaaaagatga 163  Q
    | || || ||||||||    
T  21677046 tcaaggtgaaagatga 21677061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 384; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 384; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 9332 - 8885
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9332 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatt 9233  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9232 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaactttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 9133  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||    
T  9132 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgatgatattttg 9033  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  9032 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 8933  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  8932 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggtgatg 8885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 384; Significance: 0; HSPs: 73)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 384; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 474
Target Start/End: Original strand, 15400665 - 15401112
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15400665 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatt 15400764  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15400765 tgaggtcaggttatcaccaaattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 15400864  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||    
T  15400865 tggtgttaccaatgcacttggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgatgatattttg 15400964  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  15400965 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcgagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgagt 15401064  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15401065 tctggttgaaagaagtgagttttcttggccatgttatttctggtgatg 15401112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 12888691 - 12888252
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  12888691 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 12888592  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12888591 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 12888492  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12888491 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtagtgttcatcgatgatattttg 12888392  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  12888391 atttactccaagactgaagaagaacatgccgagcacctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgcaaaattgtctaagtgtgaat 12888292  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttc 466  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  12888291 tctggttgaaagaagtgagtttacttggccatgttatttc 12888252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Original strand, 5108759 - 5109198
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  5108759 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 5108858  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5108859 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 5108958  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  5108959 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgacgatatcttg 5109058  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  5109059 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagaaaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaat 5109158  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttc 466  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  5109159 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttc 5109198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 10007582 - 10007141
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  10007582 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 10007483  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10007482 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 10007383  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10007382 tggagttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgacgatattttg 10007283  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  10007282 atttactccaagactgaagaagaacattctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaat 10007183  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10007182 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctg 10007141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 362; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 10908192 - 10907751
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  10908192 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 10908093  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10908092 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 10907993  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10907992 tggagttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgacgatattttg 10907893  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  10907892 atttactccaagactgaagaagaacattttgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaat 10907793  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10907792 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctg 10907751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 13254672 - 13254225
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  13254672 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcaactagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 13254573  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13254572 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 13254473  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||    
T  13254472 tggagttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 13254373  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  13254372 atctactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaat 13254273  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  13254272 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggtgatg 13254225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 474
Target Start/End: Original strand, 20060202 - 20060649
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  20060202 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 20060301  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20060302 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 20060401  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||    
T  20060402 tggagttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttctggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 20060501  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20060502 atttactccaagactgaagaagaacatgccgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgaat 20060601  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  20060602 tttggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggtgatg 20060649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 3687925 - 3687486
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  3687925 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggagcacgagttttcagcaagattgatt 3687826  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3687825 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 3687726  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3687725 tggagttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgacgatattttg 3687626  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  3687625 atttactccaagactgaagaagaacatgcagagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgaat 3687526  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttc 466  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  3687525 tctggttgaaagaagtgagttttctaggtcatgttatttc 3687486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Original strand, 5423078 - 5423517
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  5423078 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 5423177  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5423178 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagcttttagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 5423277  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||    
T  5423278 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttatgttcatcgacgatatcttg 5423377  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  5423378 atttactctaagactgaagaagaacatgccgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 5423477  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttc 466  Q
    ||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  5423478 tcttgttgaatgaagtgagtttccttggccatgttatttc 5423517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Original strand, 15346393 - 15346832
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  15346393 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 15346492  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15346493 tgaggtcaggttatcaccagcttaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 15346592  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||    
T  15346593 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 15346692  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  15346693 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaat 15346792  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttc 466  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  15346793 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttc 15346832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 48427429 - 48426982
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  48427429 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 48427330  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48427329 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 48427230  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  48427229 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatcgacgatattttg 48427130  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  48427129 atctactccaagactgaagaagaacatgccgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaat 48427030  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  48427029 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggtgatg 48426982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 16637755 - 16637308
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  16637755 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 16637656  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16637655 tgagatcaggctatcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccctt 16637556  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  16637555 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatcgacgatattttg 16637456  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  16637455 atctactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaat 16637356  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  16637355 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggtgatg 16637308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 6602718 - 6602277
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  6602718 cagttgagcaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 6602619  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6602618 tgagatcgggttatcaccagattaaagtaaaagatgaggatatgcaaaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatacaaagttatgccttt 6602519  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6602518 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgacgatattttg 6602419  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  6602418 atttactccaagaccgaagaagaacatgctgagcatctgacgattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 6602319  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  6602318 tctggttgaatgaagtgagtttccttggccatgttatttctg 6602277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 474
Target Start/End: Original strand, 15587540 - 15587987
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  15587540 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 15587639  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15587640 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgatatggtcactatgaatataaagttatgccttt 15587739  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||    
T  15587740 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttctggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 15587839  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  15587840 atctactccaagactgaagaagaacatgttgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 15587939  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  15587940 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggtgatg 15587987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 467
Target Start/End: Original strand, 16805094 - 16805535
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||    
T  16805094 tcagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 16805193  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16805194 ttgagatcagggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagcacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 16805293  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||    
T  16805294 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtacatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatcgacgacatttt 16805393  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  16805394 gatttactccaagactgaaggagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 16805493  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttct 467  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  16805494 ttctggttgaaagaagtaagttttcttggccatgttatttct 16805535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 29 - 466
Target Start/End: Original strand, 53383168 - 53383605
Alignment:
Q  29 gttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttg 128  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  53383168 gttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatttg 53383267  T
Q  129 aggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttg 228  Q
    || ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  53383268 agatcgggttatcaccagattaaagtaaaagatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatacaaagttatgcctttcg 53383367  T
Q  229 gtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgat 328  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  53383368 gtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtggttgtgttcatcgacgatattttgat 53383467  T
Q  329 ttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattc 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  53383468 ttactccaagactgaagaagaacatgcggaacatctgaagattgtcttacaggtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattc 53383567  T
Q  429 tggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttc 466  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  53383568 tggttgaatgaagtgagtttccttggccatgttatttc 53383605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Original strand, 16754849 - 16755288
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  16754849 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 16754948  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16754949 tgagatcgggttatcaccagattaaagtaaaagatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatacaaagttatgccttt 16755048  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| || || |||||||||    
T  16755049 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttattgacgatattttg 16755148  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |   |||||||    
T  16755149 atttactccaagactgaagaagaacatgcggaacatttgaagattgttttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtttgtgtgtgaat 16755248  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttc 466  Q
    |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  16755249 tctggttgaatgaagtgagtttccttggccatgttatttc 16755288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 26 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 16694147 - 16693699
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    || |||||||| ||||||    
T  16694147 tcagttgaataaggtaactatcaagaatatgtatccacttccgagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcgaaagtcttcagcaagattgat 16694048  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16694047 ttgagatcaggttatcaccagattaatgtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgctatggtcactatgaatataaagttatgccat 16693948  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || || || |||||    
T  16693947 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtaaatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttagtagttgtgtttatagacgaaatttt 16693848  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||     
T  16693847 gatatactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgag 16693748  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  16693747 ttctggttgaaagaagtaagttttcttggtcatgttatttctggtgatg 16693699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 56 - 474
Target Start/End: Original strand, 14874676 - 14875094
Alignment:
Q  56 gtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttgaggtcaagttatcaccagattaaagta 155  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  14874676 gtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagatagatttgagatcaggttatcaccagattaaagta 14874775  T
Q  156 aaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgttta 255  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |    
T  14874776 aaagacgaagatttgcagaagacatctttcagaacgcggtatggtcactatgaatacaaagttatgcctttcggtgttacgaatgcacctggagtattca 14874875  T
Q  256 tggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgc 355  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14874876 tggagtacatgaatcgcatctttcatgcctttttggatcgattcgtggttgtttttatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgc 14874975  T
Q  356 tgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggc 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||    
T  14874976 tgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgagttctggttgaaagaagtaagttttcttggc 14875075  T
Q  456 catgttatttctgatgatg 474  Q
    | ||||||||||| |||||    
T  14875076 cttgttatttctggtgatg 14875094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 115 - 474
Target Start/End: Original strand, 15723170 - 15723529
Alignment:
Q  115 gcaaaattgatttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataa 214  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  15723170 gcaagattgatttgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacacgttatggtcactatgaatataa 15723269  T
Q  215 agttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatc 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||| |||    
T  15723270 agttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatc 15723369  T
Q  315 gatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgt 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15723370 gatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgt 15723469  T
Q  415 ctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    | || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  15723470 cgaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggtgatg 15723529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 30 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 17491829 - 17491391
Alignment:
Q  30 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttga 129  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  17491829 ttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttccgagaattgattatttgatggatcagttagtgggtgcaagtgttttcagcaagatagatttga 17491730  T
Q  130 ggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttgg 229  Q
    | ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||| || ||||||||||||||  |    
T  17491729 gatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaaaacagctttcagaacgcgttatggacattatgagtacaaagttatgcctttcag 17491630  T
Q  230 tgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatt 329  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| |||    
T  17491629 tgttacaaatgcacctggagtatttatgaagtacatgaatcgcatctttcattcatttttggatcggttcgtggttgtttttattgatgatattttaatt 17491530  T
Q  330 tactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattct 429  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  17491529 tactccaagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaagtgtgaattct 17491430  T
Q  430 ggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  17491429 ggttgaaagaagtgagctttcttggacatgttatttctg 17491391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 165 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 12500092 - 12499783
Alignment:
Q  165 gatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtata 264  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12500092 gatatgcataagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtaca 12499993  T
Q  265 tgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatct 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12499992 tgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtggttgtttttatcgacgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatct 12499893  T
Q  365 gaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatt 464  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  12499892 gaagattgtcttgcaagtgttgatagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgagttctggttgaaagaggtaagttttcttggccatgttatt 12499793  T
Q  465 tctgatgatg 474  Q
    |||| |||||    
T  12499792 tctggtgatg 12499783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 27 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 15261612 - 15261171
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    ||||| ||||| || || || |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  15261612 cagttaaacaaagtgacgataaagaatagatatccacttccgagaattgatgaattgatggatcagttagtgggtgcacgtgtgtttagcaagattgatt 15261513  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||  |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||  |||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  15261512 tgagatcgggttatcactagattaaactgaaagatgaagatatgcagaagatggcttttagaacacgttatggacattatgaatataaagtgatgccttt 15261413  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     |||||||  ||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  15261412 cggtgttagaaatgcgccaggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatctttcatgcgtttttggatcgtttcgtggttgtattcatcgatgatattttg 15261313  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||| |||||||  || |||||||    
T  15261312 atatattccaagactgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaggagaagaagctttatgctaaattgtaaaagtgtgaat 15261213  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15261212 tctggttgaaagaggtgagttttcttggccatgttatttctg 15261171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 202 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 15341076 - 15340804
Alignment:
Q  202 actatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgt 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  15341076 actatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgt 15340977  T
Q  302 agttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactt 401  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15340976 ggttgtgtttatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcgagtgttgaaagagaagaaactt 15340877  T
Q  402 tatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15340876 tatgccaaattgtctaagtgtgagttctggttgaaagaagtgagttttcttggccatgttatttctggtgatg 15340804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 27 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 15358065 - 15357886
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15358065 cagttgaacaaggttactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatt 15357966  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactat 206  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15357965 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtgaaagatgatgatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactat 15357886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 28 - 248
Target Start/End: Original strand, 14579557 - 14579777
Alignment:
Q  28 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgattt 127  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14579557 agttgaataaggtaacgataaagaataggtatccacttccaagaattgatgatttgatggatcaattagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgattt 14579656  T
Q  128 gaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttt 227  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| || ||| | ||     
T  14579657 gaggtcaggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagcttttagaatgcggtatggacattatgagtataaggtgatgtcgttc 14579756  T
Q  228 ggtgttaccaatgcacctgga 248  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  14579757 ggtgttacaaatgcacctgga 14579777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 26 - 451
Target Start/End: Original strand, 11959305 - 11959730
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    |||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||   || ||||| || ||||||    
T  11959305 tcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgagaattgatgacttgatggatcagttagtgagtgcaaaggtgttcagtaagattgat 11959404  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||  |||| || ||||| || || || ||||| ||||||||||||||  |||| || |  || |||||||| || ||||| || || |||||||    
T  11959405 ttgaggtctggttaccatcagatgaaggtcaaggatgaggatatgcagaagacgacttttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctt 11959504  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| | || |||||||| ||| |||||  |||  |||||||||| || |||||||||||    
T  11959505 tcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatggaatatatgaataggattttccatgcttttctggataaatttctagttgtgtttattgatgatatttt 11959604  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
     || || ||||||| |||||| || ||||| ||||||||||  ||||| |||||||| |||||||| ||||   | ||||| || ||||| |||||||||    
T  11959605 aatctattccaagaatgaagaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagttttgaaagaaaagaggttgtatgcaaagttgtcaaaatgtgaa 11959704  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttct 451  Q
    |||||||| |  || |||||||||||    
T  11959705 ttctggttaagtgaagtgagttttct 11959730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 48 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 15229574 - 15229154
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttgaggtcaagttatcaccaga 147  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| || ||||    
T  15229574 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttaatcgatcagttagtgggtgcacgcgtgttcagcaaaattgatttgaggtcaggttaccatcaga 15229475  T
Q  148 ttaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctgg 247  Q
    |||| || || |  ||||||||| |||| || || || || |  || ||||| || ||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||| |    
T  15229474 ttaaggtgaagggggaagatatgtagaaaacggcctttaggacacgatatggacattatgaatataaggtgatgcctttcggcgttactaatgcgcctag 15229375  T
Q  248 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaa 347  Q
     ||||||||||| || |||||| | |  |||||||| | | | |||  ||| || |||||||| || |||||||| || ||||| || ||||||||||||    
T  15229374 tgtgtttatggaatacatgaatagaactttccatgcttatctagataaatttgtggttgtgtttattgatgatatcttaatttattctaagactgaagaa 15229275  T
Q  348 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagtt 447  Q
    || ||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||||||||||| |||| |  || || ||||    
T  15229274 gagcatgcagagcatctgaaaattatgttgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccatgttgtccaaatgtgaattcgggttaagtgaagtaagtt 15229175  T
Q  448 ttcttggccatgttatttctg 468  Q
    ||||||||||  |||||||||    
T  15229174 ttcttggccacattatttctg 15229154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 48 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 15235442 - 15235022
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttgaggtcaagttatcaccaga 147  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| || ||||    
T  15235442 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttaatcgatcagttagtgggtgcacgcgtgttcagcaaaattgatttgaggtcaggttaccatcaga 15235343  T
Q  148 ttaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctgg 247  Q
    |||| || || |  ||||||||| |||| || || || || |  || ||||| || ||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||| |    
T  15235342 ttaaggtgaagggggaagatatgtagaaaacggcctttaggacacgatatggacattatgaatataaggtgatgcctttcggcgttactaatgcgcctag 15235243  T
Q  248 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaa 347  Q
     ||||||||||| || |||||| | |  |||||||| | | | |||  ||| || |||||||| || |||||||| || ||||| || ||||||||||||    
T  15235242 tgtgtttatggaatacatgaatagaactttccatgcttatctagataaatttgtggttgtgtttattgatgatatcttaatttattctaagactgaagaa 15235143  T
Q  348 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagtt 447  Q
    || ||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||||||||||| |||| |  || || ||||    
T  15235142 gagcatgcagagcatctgaaaattatgttgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccatgttgtccaaatgtgaattcgggttaagtgaagtaagtt 15235043  T
Q  448 ttcttggccatgttatttctg 468  Q
    ||||||||||  |||||||||    
T  15235042 ttcttggccacattatttctg 15235022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 26 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 12180337 - 12179889
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    |||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || || || |||||     
T  12180337 tcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcagttagtgggtgcacgtgtatttagtaagattgac 12180238  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcac------tatgaatataaagtta 219  Q
    ||||||||| |||| || || ||||| || || ||||| |||||||||||||| || || || |  ||||||||||||      ||||||||||| || |    
T  12180237 ttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcactatatatatgaatataaggtga 12180138  T
Q  220 tgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatga 319  Q
    || |||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| |   || ||  |||||| |||||||  || |||||    
T  12180137 tgtctttcggtgttactaatgcacctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcctacctgaataaattcgtggttgtgtctattgatga 12180038  T
Q  320 tattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaa 419  Q
     ||| | ||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||||  | ||||| || ||||| ||     
T  12180037 cattctaatttattataagactgaagaagagcatgcagagcatctgaagattgtgttgcaaatattgaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcgaag 12179938  T
Q  420 tgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    ||||| |||||||| |  || |||||||||||||||||  |||||||||    
T  12179937 tgtgagttctggttaattgaagtgagttttcttggccacattatttctg 12179889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 27 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 24185172 - 24185035
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24185172 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatt 24185073  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaa 164  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24185072 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaa 24185035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 26 - 468
Target Start/End: Original strand, 11950044 - 11950486
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    ||||||||| || || || || ||||| ||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||| || ||||||||| | ||||| || || |||||     
T  11950044 tcagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccacttccgaggattgacgacttgatggatcatttggtgggtgcaagggtttttagtaagattgac 11950143  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||| |||| || ||||| || || || ||||| |||||||||||||| || || || |  || |||||||| || ||||| || |  |||||||    
T  11950144 ttgaggtcaggttaccatcagatcaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggggatgcctt 11950243  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||||| |   |||||  |||||| |||||||| || ||||||||| |    
T  11950244 tcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtagatgaaccgaattttccatgcttacctggataaattcgtggttgtgtttattgatgatattct 11950343  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||  | ||||| || ||||| || |||||     
T  11950344 gatttattctaagactgaagaagagcatgcagaacatttgaagattgtgttgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgag 11950443  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    |||||||| |  || |||||||||||||||||  |||||||||    
T  11950444 ttctggttaagtgaagtgagttttcttggccacattatttctg 11950486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 48 - 368
Target Start/End: Original strand, 16826439 - 16826754
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttgaggtcaagttatcaccaga 147  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| |||| || ||||    
T  16826439 aagaataggtatccacttccgaggattgacgatttaatggatcagttagtgggtgcacgtgtgtttagtaaaattgatttgaggtcaggttaccatcaga 16826538  T
Q  148 ttaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctgg 247  Q
    |||| || || ||||| ||||||||||||||  | || || |  |||| |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||  ||||    
T  16826539 ttaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacgacctttaggacacgttttggtcactatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgtctgg 16826638  T
Q  248 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaa 347  Q
     |||||||||||||||||||| || || ||||||||     |||||  ||| || |||||||| || ||||| || |||||||| ||  |||||||||||    
T  16826639 tgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgc-----tggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttattctgagactgaagaa 16826733  T
Q  348 gaacatgctgagcatctgaag 368  Q
    || ||||| ||||||||||||    
T  16826734 gagcatgcagagcatctgaag 16826754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 48 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 17188345 - 17187925
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttgaggtcaagttatcaccaga 147  Q
    ||||| ||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||| |||||||||   ||||| || || ||||| ||||||||| |||| || ||||    
T  17188345 aagaacaggtatccacttccgaggatggatgacttgatggatcagttggtgggtgcaaaggtttttagtaagattgacttgaggtcaggttaccatcaga 17188246  T
Q  148 ttaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctgg 247  Q
    | || || || ||||| |||||||||||||| || || || |  || || ||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  17188245 tcaaggtgaaggatgaggatatgcagaagactgcctttaggacacgatacggtcattacgaatataaagtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctgg 17188146  T
Q  248 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaa 347  Q
     ||||| ||||||||||||||  | || || ||||| | |||||||  ||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||| || | |||||| |||    
T  17188145 tgtgttcatggagtatatgaacagaatttttcatgcctatttggataaatttgtggttgtattcattgatgacattctgatttattcaaggactgaggaa 17188046  T
Q  348 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagtt 447  Q
    || ||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  | |||||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |||||||    
T  17188045 gagcatgcagaacatctgaaaattgtattgcaagtattgaaagagaaaaagttgtatgccaaattgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaagtgagtt 17187946  T
Q  448 ttcttggccatgttatttctg 468  Q
    ||||||||||  |||||||||    
T  17187945 ttcttggccacattatttctg 17187925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 26 - 457
Target Start/End: Original strand, 31693321 - 31693752
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    |||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||| |  |||| || |||||||| |||||||||||||||   |||||||| || |||||     
T  31693321 tcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacttccgagggttgacgacttgatggaccagttagtgggtgcaaaggttttcagtaagattgac 31693420  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||| |||| || || || || || || ||||| |||||||||||||| ||||| || |  || ||||| || |||||||| || || |||||||    
T  31693421 ttgaggtcaggttaccatcaaatcaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggacattatgaatacaaggtgatgcctt 31693520  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||  | || |||||||| | | |||||  |||||| ||||| || || ||||| ||  |    
T  31693521 tcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaactgaattttccatgcttatctggataaattcgtggttgtatttattgatgacatact 31693620  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
    |||||| |  |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||  | ||||| || ||||| ||||||||     
T  31693621 gatttatttaaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagttttgaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcaaaatgtgag 31693720  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttcttggcca 457  Q
    |||||||| |  || || ||||||||||||||    
T  31693721 ttctggttaagtgaagtaagttttcttggcca 31693752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 26 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 31940896 - 31940465
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    |||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||| | ||||| || |||||||| |||||||||||||||   |||||||| || |||||     
T  31940896 tcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgacgacttgatggaccagttagtgggtgcaaaggttttcagtaagattgac 31940797  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||| |||| || || || || || || ||||| |||||||| |||||||| || || |  || ||||  || |||||||| || || |||||||    
T  31940796 ttgaggtcaggttaccatcaaatcaaggtgaaggatgaggatatgcataagacagcctttaggacacgatatgcacattatgaatacaaggtgatgcctt 31940697  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| | | |||||  |||||| ||||| || || ||||| ||  |    
T  31940696 tcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttatctggataaattcgtggttgtatttattgatgacatact 31940597  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
    |||||| || |||||||||||| | ||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||  | ||||| || ||||| ||||||||     
T  31940596 gatttattcaaagactgaagaatagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagttttgaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcaaaatgtgag 31940497  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttcttggcca 457  Q
    |||||||| |  || || ||||||||||||||    
T  31940496 ttctggttaagtgaagtaagttttcttggcca 31940465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 26 - 468
Target Start/End: Original strand, 12358663 - 12359105
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    ||||||| |||| || || || ||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||| || | |||     
T  12358663 tcagttgcacaaagttacaataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggttttcagtaagaatgac 12358762  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||| |||| || |||||||| || || ||||| |||||||||||||| || || |  |  || ||||| || || ||||| || || |||||||    
T  12358763 ttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaagacacgatatggacattacgaatacaaggtgatgcctt 12358862  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | |||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| |   |||||  ||| || ||||| || || ||||| ||| |    
T  12358863 tcggtgttactaaagcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggataaattagtggttgtatttattgatgacattct 12358962  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||  | ||||| || ||||| || |||||     
T  12358963 gatttattcaaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagtattgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgag 12359062  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    |||||||| |  || |||||||||||||||||  |||||||||    
T  12359063 ttctggttaagtgaagtgagttttcttggccacattatttctg 12359105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 27 - 467
Target Start/End: Original strand, 15013904 - 15014344
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| | ||  | |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||    
T  15013904 cagttgaacaaagtgacaataaagaataggtatccacttccgaggatccacgatttgatggattagttagtggatgcacgtgtgttcagtaagattgatt 15014003  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    | || ||  | |||||||| || | ||| |||||||| ||||| ||||||||  | || || |   ||||||| || || ||||||   || ||||||||    
T  15014004 taagatcgggctatcaccatatcagagtgaaagatgaggatattcagaagacgacctttaggacatgttatggacattacgaatattcggtgatgccttt 15014103  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     |||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||| | |||||||||||| || |||||||| || ||||||||| |     
T  15014104 cggtgttactaacgcgcctggagtgtttatggaatatatgaatcgtatttttcatgcttatttggatcgatttgttgttgtgtttatagatgatattcta 15014203  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaag-attgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
    || ||||| ||||| || || |||||||| |||||| || || ||||| ||||||||| |||| ||||||||  | |||||||| || || || || |||    
T  15014204 atatactctaagaccgaggaggaacatgccgagcat-tgtagaattgttttgcaagtgctgaaggagaagaagttatatgccaagttatcgaagtgcgaa 15014302  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttct 467  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||    
T  15014303 ttctggttgaacgaagtgagttttcttggccatattatttct 15014344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 22 - 468
Target Start/End: Original strand, 13318634 - 13319080
Alignment:
Q  22 atcatcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaat 121  Q
    ||||||||||||| || || || || ||||| || |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||| || |||||    
T  13318634 atcatcagttgaataaagttacaataaagaacagatatccactcccgaggattgatgatttgatggatcagttggtgggtgcaaaagtttttagtaaaat 13318733  T
Q  122 tgatttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatg 221  Q
    ||| ||||||||| |||| || || ||||| || ||||||||||||||||||||||| || || || |  |  |||||||| || ||||| || || |||    
T  13318734 tgacttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacaatatggtcattacgaatacaaggtgatg 13318833  T
Q  222 ccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgata 321  Q
    || || |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||| |||||  ||| || || || || || |||||||    
T  13318834 ccattcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaatttttcatgcttttctggataaatttgtggtggtatttattgatgata 13318933  T
Q  322 ttttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactt-tatgccaaattgtctaaat 420  Q
    |||| ||||| ||||||||| |||| || ||||| || |||||||||||| | |||||| | ||||||||| ||||| || ||||| |||||||| || |    
T  13318934 ttttaatttattccaagactaaagaggagcatgcagaacatctgaagattatgttgcaaattttgaaagag-agaaatttgtatgctaaattgtcgaagt 13319032  T
Q  421 gtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    | || |||||||| |  || ||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  13319033 gcgagttctggttaagtgaagtgagttttctaggctacgttatttctg 13319080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 30 - 474
Target Start/End: Original strand, 16379068 - 16379512
Alignment:
Q  30 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttga 129  Q
    |||||||| || || || ||||||||| ||||||||||| | |||||||| |||||||| ||  |||||||||||   ||||| || || ||||||||||    
T  16379068 ttgaacaaagttacaattaagaataggcatccacttccgaggattgatgacttgatggaccacctagtgggtgcaaaggtttttagtaagattgatttga 16379167  T
Q  130 ggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttgg 229  Q
    ||||| |||| || || ||||| || || |||||||||||||||||||| || || || |  || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||    
T  16379168 ggtcaggttaccatcaaattaaggtgaatgatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcgg 16379267  T
Q  230 tgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatt 329  Q
    |||||| || || || || ||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||| |||||  |||| | || || || || ||||||||| |||||    
T  16379268 tgttactaacgcgcccggtgtgttcatggagtatatgaatcgaatttttcatgcctttctggataaattcctggtggtatttattgatgatattctgatt 16379367  T
Q  330 tactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattct 429  Q
    || || |||||| ||||||| ||||| || |||||||  ||||| |||||||| |||||||| |||||  | |||||||||||||| |||||||| || |    
T  16379368 tattctaagacttaagaagagcatgcagaacatctgagaattgtgttgcaagtattgaaagaaaagaagttgtatgccaaattgtcaaaatgtgagtttt 16379467  T
Q  430 ggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    || | |  || || ||||| ||||| ||| ||||||||| |||||    
T  16379468 ggctaagtgaagtaagtttccttggtcatattatttctggtgatg 16379512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 30 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 41179511 - 41179067
Alignment:
Q  30 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttga 129  Q
    |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||| | |||||||| |||||||| ||| |||||||||||   || ||||| || ||||| ||||    
T  41179511 ttgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttgatggaccagctagtgggtgcaaaggtgttcagtaagattgacttga 41179412  T
Q  130 ggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttgg 229  Q
    ||||| |||| || || ||||| || || ||||| |||||||||||||| || || || |  || || ||||| || || || ||||| |||||||| ||    
T  41179411 ggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcgg 41179312  T
Q  230 tgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatt 329  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||| |||||  |||||| || || || || ||||||||| |||||    
T  41179311 tgttactaacgcacccggtgtgttcatggagtatatgaatcgaatttttcatgcttttctggataaattcgtggtggtatttattgatgatattctgatt 41179212  T
Q  330 tactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattct 429  Q
    || || |||||||||||||| ||| | || |||||||  |||||  ||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||| || |    
T  41179211 tattcgaagactgaagaagagcattcagaacatctgagaattgtgctgcaagttttgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcgaaatgtgagtttt 41179112  T
Q  430 ggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    || | |  || |||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||    
T  41179111 ggctaagtgaagtgagtttccttggtcatattatttctggtgatg 41179067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 30 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 13944013 - 13943569
Alignment:
Q  30 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttga 129  Q
    |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||| | |||||||| |||||||| ||| |||||||||||   || ||||| || ||||| ||||    
T  13944013 ttgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttgatggaccagctagtgggtgcaaaggtgttcagtaagattgacttga 13943914  T
Q  130 ggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttgg 229  Q
    ||||| |||| || || ||||| || ||||||||||||||||||||||| || || || |  || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||    
T  13943913 ggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcgg 13943814  T
Q  230 tgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatt 329  Q
    |||||| || || || || ||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||| |||||  |||||| || || || || ||||||||| |||||    
T  13943813 tgttactaacgcgcccggtgtgttcatggagtatatgaatcgaatttttcatgcttttctggataaattcgtggtggtatttattgatgatattctgatt 13943714  T
Q  330 tactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattct 429  Q
    || || |||||||||||||| ||||| || |||||||  ||| |  ||||||| |||||||| | |||  | ||||||||| |||| |||||||| || |    
T  13943713 tattcgaagactgaagaagagcatgcagaacatctgagaattatgctgcaagttttgaaagaaaggaagttgtatgccaaactgtcgaaatgtgagtttt 13943614  T
Q  430 ggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    || | |  || |||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||    
T  13943613 ggctaagtgaagtgagtttccttggtcatattatttctggtgatg 13943569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 30 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 44779236 - 44778792
Alignment:
Q  30 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttga 129  Q
    |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||   || ||||| || ||||| ||||    
T  44779236 ttgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgagaattgatgacttgatggaccagctagtgggtgcaaaggtgttcagtaagattgacttga 44779137  T
Q  130 ggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttgg 229  Q
    ||||| |||| || || ||||| || || ||||| |||||||||||||| || || || |  || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||    
T  44779136 ggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcgg 44779037  T
Q  230 tgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatt 329  Q
    |||||| || || || || || || ||||||| ||||||||| || || ||||| ||| |||||  |||||| || || || || ||||| ||| |||||    
T  44779036 tgttactaacgcgcccggtgtattcatggagtttatgaatcgaatttttcatgcttttctggataaattcgtggtggtatttattgatgacattctgatt 44778937  T
Q  330 tactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattct 429  Q
    || || |||||||||||||| ||||| || |||||||  ||||| |||||||| |||||||| | |||| | ||||||||| |||| |||||||| || |    
T  44778936 tattcgaagactgaagaagagcatgcagaacatctgagaattgtgttgcaagttttgaaagaaaggaaattgtatgccaaactgtcgaaatgtgagtttt 44778837  T
Q  430 ggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    || | |  || |||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||    
T  44778836 ggctaagtgaagtgagtttccttggtcatattatttctggtgatg 44778792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 26 - 468
Target Start/End: Original strand, 10418181 - 10418623
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    |||||||||||| || || || |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| || |||||    ||||| || || |||||     
T  10418181 tcagttgaacaaagttacaataaagaatagatatccacttccgcggattgatgatttgatggaccagttggtaggtgctaaagtttttagtaagattgac 10418280  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||  |||| || || |||||||| || || ||||||||||||||||| || || || |  || || ||||| || || || ||||| |||||||    
T  10418281 ttgaggtcgggttaccatcaaattaaagtgaaggacgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 10418380  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | |||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||  ||| || || || || || |||||||| ||    
T  10418381 tcggtgttactaacgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggtggtatttatagatgatatctt 10418480  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
    ||| || || || |||||||| ||||| || || || ||||||||||| |||||| | |||||||||| |||  | ||||||||  |||| || || ||     
T  10418481 gatctattcaaaaactgaagaggaacacgccgaacacctgaagattgtgttgcaaatattgaaagagaggaagttgtatgccaagctgtcgaagtgcgag 10418580  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    |||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  10418581 ttctggttaaatgaagtgagttttctaggccacgttatttctg 10418623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 26 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 14088666 - 14088224
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    ||||||||| || || || || ||||| || ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||| || ||||||    |||| || ||||||||     
T  14088666 tcagttgaataaagttacgataaagaacagatatccgcttccgagaattgacgacctgatggatcagttggttggtgcaaagatttttagtaaaattgac 14088567  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||| |||| || ||||| || || |||||||| || ||||||||||| || || || |  || |||||||| || |||||||| || |||||||    
T  14088566 ttgaggtcaggttaccatcagatcaaggtgaaagatgaggacatgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctt 14088467  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  | || || ||||| |   |||||  ||| || ||||| ||||| ||||| |||||    
T  14088466 tcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaacagaatttttcatgcttacctggataaatttgtggttgtattcattgatgacatttt 14088367  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
    ||| || || |  ||||| ||||| ||||| || ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||| || || ||     
T  14088366 gatctattcgagaactgaggaagagcatgcagaacatctgaggattgtattgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcaaagtgcgag 14088267  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    || ||||| |  || |||||||||||||||||| |||||||||    
T  14088266 ttttggttaagtgaagtgagttttcttggccatattatttctg 14088224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 26 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 47125937 - 47125530
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||||| |||||  ||||||| || |||||||||||||| || |||||     |||| || || ||||||    
T  47125937 tcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgccaagatttttagtaagattgat 47125838  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||  ||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| || || || |  ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  47125837 ttgaggtctggttatcatcagataaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 47125738  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||| |||||   || || || ||||| || ||||||||| |    
T  47125737 tcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatattct 47125638  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
     || || ||||||| ||| || || ||||| ||||||||||  || || |||||||||||||| || ||||   | ||||| || || || |||||||||    
T  47125637 aatctattccaagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaatagtgttgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttatcaaaatgtgaa 47125538  T
Q  426 ttctggtt 433  Q
    ||||||||    
T  47125537 ttctggtt 47125530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 26 - 474
Target Start/End: Original strand, 16834651 - 16835094
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    |||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||| ||     ||| |||||||||||||| || ||||||    ||||||| || |||||     
T  16834651 tcagttgaacaaagttacaataaagaacaggtatccgcttccgaga-----tgacttgatggatcagttggttggtgcaaagattttcagtaagattgac 16834745  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||  |||| || || ||||| || || |||| ||||||||||||||| || || || |  ||||||||||| || | ||| || || |||||||    
T  16834746 ttgaggtctggttaccatcaaattaaggtgaaggatggagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgtatacaaggtgatgcctt 16834845  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||| |||||   || || ||||| || || ||||| ||  |    
T  16834846 tcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaatttttcatgcatttctggataagtttgtggttgtatttattgatgacatcct 16834945  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
     ||||| || |||||||| || || ||||| || ||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||  | |||||||||||||| ||||||||     
T  16834946 aatttattctaagactgacgaggagcatgcagaacatctgaggattgtattgcaagtattgaaagaaaagaagttgtatgccaaattgtcaaaatgtgag 16835045  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    || ||| | |  || |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||    
T  16835046 ttttggctaagtgaagtgagtttccttggccatattatttctggtgatg 16835094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 30 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 28756307 - 28755869
Alignment:
Q  30 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttga 129  Q
    |||||||| || || |||||||| |||||||| |||||  ||||||| || ||||||||||| || || ||||      |||| || || ||||||||||    
T  28756307 ttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcaattggttggtgttaagatttttagtaagattgatttga 28756208  T
Q  130 ggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttgg 229  Q
    ||||  ||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| || || || |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||    
T  28756207 ggtctggttatcatcagataaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcgg 28756108  T
Q  230 tgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatt 329  Q
    |||||| ||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||| |||||   || || || ||||| || |||||||| || |||    
T  28756107 tgttactaatgcgccgggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatcttaatt 28756008  T
Q  330 tactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattct 429  Q
    || ||||||| ||| || || ||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||| || ||||   | ||||| || || || |||||||| ||||    
T  28756007 tattccaagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtgttgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttatcaaaatgtgagttct 28755908  T
Q  430 ggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    |||| || || || |||||||| || ||  |||||||||    
T  28755907 ggttaaatgaagtaagttttctgggtcacattatttctg 28755869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 51 - 212
Target Start/End: Original strand, 11888526 - 11888687
Alignment:
Q  51 aataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttgaggtcaagttatcaccagatta 150  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  11888526 aataggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtgtttagcaagattgatttgagatcgggttatcaccagatta 11888625  T
Q  151 aagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatat 212  Q
    |||| ||||| || ||||||||||||||||| || || |  |||||||| || |||||||||    
T  11888626 aagtgaaagacgaggatatgcagaagacagcctttaggacacgttatggacattatgaatat 11888687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 48 - 257
Target Start/End: Original strand, 14291690 - 14291899
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttgaggtcaagttatcaccaga 147  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||  |||| || ||||    
T  14291690 aagaacaggtatccacttctgagaattgacgatttaatggatcagttagtgggtgcttgtgtgttcagcaaaattgatttgaggtcgggttaccatcaga 14291789  T
Q  148 ttaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctgg 247  Q
    |||| || || ||||| |||||||||||||| || || || |  |||| ||||||||||||||||||  | |||| ||| |||||||| ||||| |||||    
T  14291790 ttaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttttggtcactatgaatataagatgatgcatttcggtgttactaatgcgcctgg 14291889  T
Q  248 agtgtttatg 257  Q
     |||||||||    
T  14291890 tgtgtttatg 14291899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 48 - 468
Target Start/End: Original strand, 18132504 - 18132924
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttgaggtcaagttatcaccaga 147  Q
    ||||| ||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||||   |||||||| || ||||| ||||||||| |||| || ||||    
T  18132504 aagaacaggtatccacttccgaggattgacgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggttttcagtaagattgacttgaggtcaggttaccatcaga 18132603  T
Q  148 ttaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctgg 247  Q
    |||| || || ||||| |||||||| ||||| || || || |  || || ||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  18132604 ttaaggtgaaggatgaggatatgcaaaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctgg 18132703  T
Q  248 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaa 347  Q
     ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |   |||||  ||| || |||||||| || || |||||  | ||||| || |||||||||||     
T  18132704 tgtgttcatggagtatatgaaccgaatttttcatgcttacctggataaatttgtggttgtgtttattgacgatatcctaatttattcaaagactgaagag 18132803  T
Q  348 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagtt 447  Q
    || | | | || ||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||  | ||||| || ||||| || || || ||||| || |  || |||| ||    
T  18132804 gagcttacggaacatctgaggattatgttgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcgaagtgcgagttctgattaagtgaagtgactt 18132903  T
Q  448 ttcttggccatgttatttctg 468  Q
    ||||||||||  |||||||||    
T  18132904 ttcttggccacattatttctg 18132924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 27 - 118
Target Start/End: Original strand, 15714204 - 15714295
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaa 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15714204 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtttttagcaa 15714295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 48 - 468
Target Start/End: Original strand, 13970278 - 13970698
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttgaggtcaagttatcaccaga 147  Q
    ||||| || ||||| |||||| | ||||| ||  ||||||||||||| || |||||     |||| || |||||||| ||||| ||| |||| || ||||    
T  13970278 aagaacagatatccgcttccgaggattgacgacctgatggatcagttggttggtgcgaagatttttagtaaaattgacttgagatcaggttaccatcaga 13970377  T
Q  148 ttaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctgg 247  Q
    | || || |||||||| || ||||||||||| || || || |  || |||||||| || |||||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  13970378 tcaaggtgaaagatgaggacatgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctgg 13970477  T
Q  248 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaa 347  Q
     ||||| ||||||||||||||  | || || ||||| |   |||||  ||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |  ||||| |||    
T  13970478 tgtgttcatggagtatatgaacagaatttttcatgcttacctggataaatttgtggttgtattcattgatgacattttgatctattcgagaactgaggaa 13970577  T
Q  348 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagtt 447  Q
    || ||||| || ||||||| | |||| |||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||| || || || || ||||| |  || |||||||    
T  13970578 gagcatgcagaacatctgagggttgtattgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcaaagtgcgagttttggttaagtgaagtgagtt 13970677  T
Q  448 ttcttggccatgttatttctg 468  Q
    ||||||||||| |||||||||    
T  13970678 ttcttggccatattatttctg 13970698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 27 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 30139798 - 30139358
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||   || || || || |||||||    
T  30139798 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 30139699  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| | ||||| ||||||| |||||| |  ||||||||    || || || ||| ||| | | ||||| |||||||| |||   || ||||| ||    
T  30139698 tgagatcaggatatcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatt 30139599  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    ||| ||  | |||||||| || || |||||||| || |||||| | || || ||| | | | |||| || || || || |||||||| ||||||||||||    
T  30139598 tggagtatctaatgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttg 30139499  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
     | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||  |  | | |||||| |||||||| ||||| |    
T  30139498 gtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagt 30139399  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttct 467  Q
    | |||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  30139398 tttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 30139358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 27 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 30149349 - 30148909
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||   || || || || |||||||    
T  30149349 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 30149250  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| | ||||| ||||||| |||||| |  ||||||||    || || || ||| ||| | | ||||| |||||||| |||   || ||||| ||    
T  30149249 tgagatcaggatatcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatt 30149150  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    ||| ||  | |||||||| || || |||||||| || |||||| | || || ||| | | | |||| || || || || |||||||| ||||||||||||    
T  30149149 tggagtatctaatgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttg 30149050  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
     | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||  |  | | |||||| |||||||| ||||| |    
T  30149049 gtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagt 30148950  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttct 467  Q
    | |||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  30148949 tttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 30148909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 27 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 43164657 - 43164566
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaa 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  43164657 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaa 43164566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 100 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 12270129 - 12269875
Alignment:
Q  100 gtgcacgtgttttcagcaaaattgatttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatgg 199  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| || |||||||| || || ||||| |||||||||||||| || || || |  || |||||    
T  12270129 gtgctcgtgtattcagcaagattgatttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatgg 12270030  T
Q  200 tcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattc 299  Q
     |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||  ||||  |||||||||||||||||||| || || |||||||| | | | |||  |||     
T  12270029 acactatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgttcctgatgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttatcttgataaattt 12269930  T
Q  300 gtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatg 354  Q
    || |||||||| || ||||| || |||||||| || |||| ||||||||| ||||    
T  12269929 gtggttgtgtttattgatgacatcttgatttattcaaagattgaagaagagcatg 12269875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 28 - 467
Target Start/End: Original strand, 8272548 - 8272987
Alignment:
Q  28 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgattt 127  Q
    ||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||   || || || || ||||||||    
T  8272548 agttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcagaggtgtttagtaagattgattt 8272647  T
Q  128 gaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttt 227  Q
    ||| ||| | ||||| ||||||| |||||| |  ||||||||    || || || ||| ||| | | ||||| |||||||| |||   || ||||| |||    
T  8272648 gagatcaggatatcatcagattagagtaaaggcagaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccattt 8272747  T
Q  228 ggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttga 327  Q
    || ||  | ||||| || || || |||||||| || |||||| | || || ||| | | | |||| || || || || |||||||| ||||||||||||     
T  8272748 ggagtatctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttgg 8272847  T
Q  328 tttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaatt 427  Q
    | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||  |  | |  ||||| |||||||| ||||| ||    
T  8272848 tgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgcgccaagttgtctaagtgtgagtt 8272947  T
Q  428 ctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttct 467  Q
     |||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  8272948 ttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 8272987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 27 - 445
Target Start/End: Original strand, 15948618 - 15949036
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| | || ||||||   || || || || |||||||    
T  15948618 cagttgaacaaagtaacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctggttggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 15948717  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| | | | ||||| ||||||| |||||| |  ||||||||    || || || ||| ||| | | ||||| |||||||| |||   || ||||| ||    
T  15948718 tgagattaggatatcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaaccgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattccgtgatgccatt 15948817  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    ||| ||  ||||||| || || || |||||||| ||||||||| | || || ||| | | |||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||||    
T  15948818 tggagtatccaatgcgccaggtgtctttatggaatatatgaatagaatatttcatccttatttggaccgatttgtggtggttttcatagatgatattttg 15948917  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
     | || || ||| |||| ||||| |||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||  |  | |  ||||| |||||||| |||||||    
T  15948918 gtgtattcgaagtctgaggaagagcatgttgagcatctgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgagccaagttgtctaagtgtgaat 15949017  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgag 445  Q
    | |||||||| || |||||    
T  15949018 tttggttgaaggaagtgag 15949036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 26 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 10407961 - 10407720
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||||| |||||  ||||||| || |||||||||||||| || |||||     ||||||| || ||||||    
T  10407961 tcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagattttcagtaagattgat 10407862  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||  ||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||| || || || |  ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  10407861 ttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtaatgcctt 10407762  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatga 267  Q
    |  ||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||    
T  10407761 tctgtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagtacatga 10407720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 27 - 467
Target Start/End: Original strand, 13965500 - 13965941
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||| ||||||   || || || || |||||||    
T  13965500 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagttggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 13965599  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
     ||| ||| | ||||| ||||||| |||||| |  | ||||||    || || || ||| ||| | | ||||| |||||||| |||   || ||||| ||    
T  13965600 cgagatcaggatatcatcagattagagtaaaggcggtagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatt 13965699  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    ||| ||  ||||||| || || || |||||||| || |||||| | || || ||| | | | |||| || || || || |||||||| ||||||||||||    
T  13965700 tggagtatccaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttg 13965799  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaa-catgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
     | || || ||| |||| |||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||  |||||||||||  |  | | |||||| |||||||| |||||     
T  13965800 gtgtattcgaagtctgaggaagaagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagacttgaaagagaaccagttgtctgccaatttgtctaagtgtgag 13965899  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttct 467  Q
    || |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  13965900 ttttggttgaaggaagtgagttttcttggtcatgtgatttct 13965941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 27 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 15612095 - 15611655
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||| |||||    || || || || |||||||    
T  15612095 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagttggtgctgaggtgtttagtaagattgatt 15611996  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| | ||||| ||||||| ||| || |  ||||||||    || || || ||| ||| | | ||||| |||||||| |||   || ||||| ||    
T  15611995 tgagatcaggatatcatcagattagagtgaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatt 15611896  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    ||| ||  | |||||||| || || |||||||| ||||||||| | || || ||| | | | |||| || || || || |||||||| ||||||||||||    
T  15611895 tggagtatctaatgcaccaggtgtctttatggaatatatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttg 15611796  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
     | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||     | | |||||| ||||||||  |||| |    
T  15611795 gtgtattcgaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtcttgcaagttttgaaagataaccggttgtgtgccaagttgtctaagcgtgagt 15611696  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttct 467  Q
    | |||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  15611695 tttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 15611655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 222 - 397
Target Start/End: Original strand, 11889623 - 11889798
Alignment:
Q  222 ccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgata 321  Q
    ||||| ||||| || ||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  11889623 cctttcggtgtcactaatgcgccaggtgtgttcatggaatacatgaatcgtatttttcatgcgtatttagatcgcttcgtggttgtgttcattgatgata 11889722  T
Q  322 ttttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaa 397  Q
    ||||||| ||||| |||  | | |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  11889723 ttttgatatactctaagtttaaggaagaacatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaggagaagaa 11889798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 26 - 293
Target Start/End: Original strand, 12510619 - 12510886
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||||     ||||||| || |||||     
T  12510619 tcagttgaaaaaggttacgataaagaacaggtatccgcttccgagaattgacgatttgatggatcagttggttggtgctaagattttcagtaagattgac 12510718  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||  |||| ||  |||| || || || ||||| |||||||||||||| || || || |  ||||||||||| || || || ||| | |||||||    
T  12510719 ttgaggtctggttaccattagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcatttaggacacgttatggtcattacgagtacaaaatgatgcctt 12510818  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 293  Q
    | |||||||| || || ||||| ||||||||| |||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  12510819 tcggtgttactaacgcgcctggtgtgtttatgaagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 12510886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 26 - 468
Target Start/End: Original strand, 16327796 - 16328238
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    ||||||||| ||||| |  || ||||| |||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||| || |||||     |||| || || |||||     
T  16327796 tcagttgaataaggtcatgataaagaacaggtatccactttcgagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagatttttagtaagattgac 16327895  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    |||| |||  |||| || |||||||| || ||  |||| ||||||||||| ||  |||| || |  || |||||||| || || || || || |||||||    
T  16327896 ttgatgtctggttaccatcagattaaggtgaagaatgaggatatgcagaaaacgacttttaggacacgatatggtcattacgagtacaaggtgatgcctt 16327995  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | |||||||| ||  | ||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||||| |||  ||||   || || || ||||| || |||||||||||    
T  16327996 tcggtgttactaacacgcctggtgtgtttatggagtacatgaaccgaattttccatgcctttccggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatttt 16328095  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
     || || || |||| |||||| || ||||| ||||||||||  ||||| |||||||  |||||||||||||   | ||||| || ||||| ||||||||     
T  16328096 aatctattctaagaatgaagaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagatttgaaagagaagaggttgtatgcaaagttgtcaaaatgtgag 16328195  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    || ||||| |  || ||||||||||| || ||| |||||||||    
T  16328196 ttatggttaagtgaagtgagttttctgggtcatattatttctg 16328238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 24189297 - 24189076
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    ||||||||| || || || || ||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||||   ||||| || || |||||     
T  24189297 tcagttgaataaagttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttgatggatcagttggtgggtgcaaaggtttttagtaagattgac 24189198  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||| |||| || ||||| || || || ||||| |||||||||||||| || || || |  || || ||||| || ||||||||||| ||| |||    
T  24189197 ttgaggtcaggttaccatcagatcaaggtgaaggatgaggatatgcagaagactgcctttaggacacgatacggtcattacgaatataaagtgatgtctt 24189098  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctgg 247  Q
    | |||||||| ||||| |||||    
T  24189097 tcggtgttactaatgcgcctgg 24189076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 27 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 18437122 - 18437022
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    ||||| ||||| || || || ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||    
T  18437122 cagtttaacaaagtgacaataaagaatatgtatccactcccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaagtgttttcagcaagatagatt 18437023  T
Q  127 t 127  Q
    |    
T  18437022 t 18437022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 79
Target Start/End: Original strand, 26791561 - 26791613
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatga 79  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26791561 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatga 26791613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 259 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 10385431 - 10385257
Alignment:
Q  259 agtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctga 358  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| ||| | |||   || || || |||||||| |||||||| |||||||| |||||||  || ||||| ||||| |     
T  10385431 agtacatgaatcgaatcttccatgcttttctagataagtttgttgtggtgttcattgatgatatcttgatttattccaagaacgaggaagagcatgcagg 10385332  T
Q  359 gcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggtt 433  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||| || ||||   | ||||| || ||||| |||||||| ||||||||    
T  10385331 gcatctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttgtcaaaatgtgagttctggtt 10385257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 235
Target Start/End: Original strand, 8745530 - 8745735
Alignment:
Q  30 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttga 129  Q
    |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||| | |||||||| |||||||| ||| |||||||||||   || ||||| || ||||| ||||    
T  8745530 ttgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttgatggaccagctagtgggtgcaaaggtgttcagtaagattgacttga 8745629  T
Q  130 ggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttgg 229  Q
    || || |||| || || ||||| || || ||||| ||||||||||||||  | || || |  || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||    
T  8745630 ggacaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacgccctttaggacacgatacggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcgg 8745729  T
Q  230 tgttac 235  Q
    ||||||    
T  8745730 tgttac 8745735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 27 - 467
Target Start/End: Original strand, 6151001 - 6151441
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||| || || |||||| | |||||||||||  | ||||||||||||||||||||| | || ||||||   || || || || |||||||    
T  6151001 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcgatatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctggttggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 6151100  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| | ||||| ||||||| ||| || |  ||||||||    || || |  ||| ||| | | ||||| |||||||| |||   || ||||| ||    
T  6151101 tgagatcaggatatcatcagattagagtgaaggcagaagatatatccaaaactgtgttccgaacgaggtatggacactatgagtattttgtgatgccatt 6151200  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    ||| ||  | ||||| || || || ||||||||||||||||||   || || ||| | | | | || || || || || ||||| || ||||||||||||    
T  6151201 tggagtatctaatgcgccaggtgtctttatggagtatatgaataaaatatttcatccttatctagaccgttttgtggtggtgtttatagatgatattttg 6151300  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
     | || || ||  |||| || || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||  |  | | ||| || |||||||| || || |    
T  6151301 gtgtattcgaaatctgaggaggagcatgctgagcatctgacgattgtgttgcaagtgttgaaggagaaccagttatgtgctaagttgtctaagtgcgagt 6151400  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttct 467  Q
    | |||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  6151401 tttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 6151441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 33 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 12272324 - 12272254
Alignment:
Q  33 aacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgc 103  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||||||| | |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  12272324 aacaaggttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcagttagtgggtgc 12272254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 26 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 17200627 - 17200562
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatca 91  Q
    ||||||||||||||| || || |||||| ||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||    
T  17200627 tcagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccgctcccgaggattgatgatttgatggatca 17200562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 384; Significance: 0; HSPs: 44)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 384; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 21839328 - 21838881
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21839328 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatt 21839229  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21839228 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaactttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 21839129  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||    
T  21839128 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgatgatattttg 21839029  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  21839028 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 21838929  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  21838928 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggtgatg 21838881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 380; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 19108746 - 19108299
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19108746 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatt 19108647  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19108646 tgaggtcaggttatcaccagataaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacaactttcagaacgcgttatggtcaccatgaatataaagttatgccttt 19108547  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19108546 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccacgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatcgatgatattttg 19108447  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  19108446 atttactctaagactgaaaaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttccaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgagt 19108347  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19108346 tctggttgaaagaagtgagttttcttggccatgttatttctggtgatg 19108299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Original strand, 16348576 - 16349016
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  16348576 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 16348675  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16348676 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 16348775  T
Q  227 tggt-gttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16348776 tgggagttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgacgatatttt 16348875  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  16348876 gatttactccaagactgaagaagaacatgcagagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 16348975  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttc 466  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  16348976 ttctggttgaaagaagtgagttttctaggtcatgttatttc 16349016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 21832680 - 21832233
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  21832680 cagttgaacaaggtaactatcaagattaggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 21832581  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21832580 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcaaaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 21832481  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||    
T  21832480 cggtgtgaccaatgcacatggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 21832381  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  21832380 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 21832281  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  21832280 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggtgatg 21832233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Original strand, 33389010 - 33389449
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  33389010 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 33389109  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33389110 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 33389209  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||    
T  33389210 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 33389309  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  33389310 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaat 33389409  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttc 466  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  33389410 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttc 33389449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 39 - 474
Target Start/End: Original strand, 24792609 - 24793044
Alignment:
Q  39 gtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttgaggtcaagtt 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  24792609 gtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatttgaggtcaggtt 24792708  T
Q  139 atcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaa 238  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  24792709 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaaggtatgccttttggtgtgaccaa 24792808  T
Q  239 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaag 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||    
T  24792809 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtggttgtttttattgatgatattttgatttactccaag 24792908  T
Q  339 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaag 438  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  24792909 actgaagaagaacatgttgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagaaaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgagttctggttgaaag 24793008  T
Q  439 acgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24793009 aagtaagttttcttggccatgttatttctggtgatg 24793044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 474
Target Start/End: Original strand, 21233711 - 21234159
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||    
T  21233711 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 21233810  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21233811 ttgagatcagggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaactttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 21233910  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | ||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||    
T  21233911 tcggtgtgatcaatgcacctcgagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatcgacgacatttt 21234010  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  21234011 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgaacatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 21234110  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21234111 ttctggttgaaagaagtaagttttcttggccatgttatttctggtgatg 21234159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 467
Target Start/End: Original strand, 51331474 - 51331914
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  51331474 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 51331573  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51331574 tgagatcaggctatcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 51331673  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||    
T  51331674 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 51331773  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||    
T  51331774 atttactccaagactgaagaagaacatgcggagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagttttatgctaaattgtctaagtgtgaat 51331873  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttct 467  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  51331874 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttct 51331914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 474
Target Start/End: Original strand, 17042995 - 17043443
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||    
T  17042995 tcagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccactaccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 17043094  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17043095 ttgagatcagggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacatctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 17043194  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  17043195 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcctttttggatcggttcgttgttgtgtttatcgatgatatttt 17043294  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||    
T  17043295 gatttactccaagactaaagaagaacatgctgagcatatgaagattgtcttgcaagtattgaaagagaagaaactttatgctaaattgtcaaagtgtgaa 17043394  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17043395 ttctggttgaaagaagtaagttttcttggccatgttatttctggtgatg 17043443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 39 - 474
Target Start/End: Original strand, 22503282 - 22503717
Alignment:
Q  39 gtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttgaggtcaagtt 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||    
T  22503282 gtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagatagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatttgagatcaggtt 22503381  T
Q  139 atcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaa 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  22503382 atcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcggtatggtcactatgaatataaagttatgtctttcggtgttaccaa 22503481  T
Q  239 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaag 338  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22503482 tgcacctggagtgtttatggagtaaatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcggggttgttttcatcgatgatattttgatttactccaag 22503581  T
Q  339 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaag 438  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||| |||||||||||||    
T  22503582 actgaagaagaacatgttgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttaaaagagaagaaactttatgctaaaatatctaagtgtgagttctggttgaaag 22503681  T
Q  439 acgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    | || ||||||||||||||||| |||| || |||||    
T  22503682 aggtaagttttcttggccatgtcatttatggtgatg 22503717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Original strand, 41351649 - 41352082
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaa-taggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |       |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  41351649 cagttgaacaaggtaactatcaagaaataggtatccacttccgagaaat-------tgatggatcagttagtgggtgcgcgagttttcagcaagattgat 41351741  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41351742 ttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatacaaagttatgcctt 41351841  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  41351842 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggggtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcagttcgtggttgtgttcatcgacgatatttt 41351941  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  41351942 gatttactccaagactgaagaagaacatgcagaacatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 41352041  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttc 466  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  41352042 ttctggttgaaagaagtgagttttcttggtcatgttatttc 41352082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 26 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 20140462 - 20140021
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    |||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20140462 tcagttgaacaaagtgacaataaagaataggtatccacttccgagaatcgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgat 20140363  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| || || || ||| | |    
T  20140362 ttgagttcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggacattatgagtacaaggtaatgtcgt 20140263  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  | ||||| ||||| |||||||||||    
T  20140262 tcggtgtcacaaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcgttttttggttgttttcattgatgatatttt 20140163  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||    
T  20140162 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgatcacttgaagattgttttgcaagtgttgaaagaaaagaagctctatgctaaattgtctaagtgtgaa 20140063  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttct 467  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  20140062 ttctggttgaaaaaagtgagctttcttggccatgttatttct 20140021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 27 - 468
Target Start/End: Original strand, 430097 - 430538
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||| ||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| || ||||    
T  430097 cagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatcaacttccaaggattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagatagatt 430196  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||| || || |||||||||||    
T  430197 tgagatcaggttatcaccatattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagccttcagaacgcggtatgctcactatgagtacaaggttatgccttt 430296  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  430297 cggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtacatgattcgcatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgttttcattgatgatattttg 430396  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  430397 atttactccaagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattatctaagtgtgaat 430496  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  430497 tctggttaaaagaagtgagctttcttgggcatgttatttctg 430538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 48 - 468
Target Start/End: Original strand, 50618400 - 50618820
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttgaggtcaagttatcaccaga 147  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  50618400 aagaataggtatccacttccgagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtgtttaacaagattgatttgagatcgggttatcaccaga 50618499  T
Q  148 ttaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctgg 247  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  50618500 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaacttttagaacgcgatatggacattatgagtataaagtgatgcctttcggtgttacaaatgcccctgg 50618599  T
Q  248 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaa 347  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  50618600 agtgtttatggagtacatgaatcacatttttcatgcattttttgatcgtttcgtggttgttttcattgatgacattttgatttactccaagactgaggaa 50618699  T
Q  348 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagtt 447  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  50618700 gaacatgttgagcatttgaagactgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatcaaagtgtgaattctggttgaaagaggtgagtt 50618799  T
Q  448 ttcttggccatgttatttctg 468  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  50618800 ttcttggacatgttatttctg 50618820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 27 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 21751318 - 21750877
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| || ||||    
T  21751318 cagttgaacaaagtaacaataaagaataggtatccacttccgaggattgatgatttgatggatcagttagtaggtgcaagtgttttcaacaagatagatt 21751219  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||  || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| || | ||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  21751218 tgagatcgggtcatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgtagaagacaacttttaggacgcggtatggacattatgagtataaagttatgccttt 21751119  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    ||||||||| ||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||     
T  21751118 tggtgttactaatgctcttggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcgtttcgtggttgttttcattgatgatatttta 21751019  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  21751018 atttactccaagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagttggttttgcaagtgttgaaaaagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaat 21750919  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    ||||||| ||||| || | ||||||||| |||||||||||||    
T  21750918 tctggttaaaagaagtaatttttcttggacatgttatttctg 21750877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 26 - 468
Target Start/End: Original strand, 22360224 - 22360666
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    ||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||| || |||    
T  22360224 tcagttgaacaaggtgacaataaagaatagatatccacttccgaggattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcaacaagatagat 22360323  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| || |||||||||||||    
T  22360324 ttgagatcgggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggacattatgagtacaaagttatgcctt 22360423  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||| || || |||||||||||    
T  22360424 tcggtgttacaaatgcaccttgagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcattttaggatcggttcgtcgttgtttttattgatgatatttt 22360523  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||  | || ||||| ||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  22360524 gatttactccaagtctgaagaagaacctgctgagcatttgaaactggttttgcaggtgttgaaagagaagatgatttatgcgaaattgtctaagtgtgaa 22360623  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    ||||||||||| || ||||| | |||||| |||||||||||||    
T  22360624 ttctggttgaaggaagtgagctatcttggacatgttatttctg 22360666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 27 - 465
Target Start/End: Original strand, 21862354 - 21862792
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    ||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||  |||    
T  21862354 cagttgaacaaagtaacgagaaagaataggtatccacttccaagaatagatgacttgatggatcagttggtgggtgcacgtgtgttcagcaagatacatt 21862453  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||  || ||||| |||||||||||||||||    
T  21862454 tgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagcttttagaacgcggtatgcacattatgagtataaagttatgccttt 21862553  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     |||||||| ||||||||| | |||||||||||| | ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||| || || ||||| |||||     
T  21862554 cggtgttacaaatgcacctagtgtgtttatggagcacatgaatcgcatttttcatgcatttttggaccgtttcgtggttgtttttattgatgacatttta 21862653  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  21862654 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatttgaagatggttttgcaagtgttcaaagagaagaagctttatgctaaattatctaagtgtgaat 21862753  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttattt 465  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  21862754 tctggttgaaagaggtgagttttcttggacatgttattt 21862792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 48 - 468
Target Start/End: Original strand, 21743554 - 21743974
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttgaggtcaagttatcaccaga 147  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| |||| || ||||    
T  21743554 aagaataggtatccacttccgagaattgacgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtgtttagtaaaattgatttgaggtcaggttaccatcaga 21743653  T
Q  148 ttaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctgg 247  Q
    |||| || ||  |||| |||||||||||||| || || || |  ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  21743654 ttaaggtgaagaatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcactatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctgg 21743753  T
Q  248 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaa 347  Q
     ||||||||||||||||||||  | || |||||||| | | |||||  ||| || |||||||| || ||| | || || ||||| || ||||||||||||    
T  21743754 tgtgtttatggagtatatgaacagaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatcacatcttaatttattctaagactgaagaa 21743853  T
Q  348 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagtt 447  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  | |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |  || || |||     
T  21743854 gagcatgcagagcatctgaagattgtattgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtccaaatgtgagttctggttaagtgaagtaagtc 21743953  T
Q  448 ttcttggccatgttatttctg 468  Q
    ||||||||||  |||||||||    
T  21743954 ttcttggccacattatttctg 21743974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 27 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 16378473 - 16378150
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||    
T  16378473 cagttgaataaagtaacgataaagaataggtatccacttccaagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgcgtgttcaacaagattgatt 16378374  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| |||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  16378373 tgagatcaggttatcactagattaaagtgaaagatgaggatatgcagaagacggcttttagaacgcgttatggacattatgaatataaagtgatgccttt 16378274  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||  ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||    
T  16378273 cggtgttacaaatgcgcctggtgtgttcatggagtacatgaatcgaatttttcatgtgtttttggatcgtttcgtggttgtgtttattgatgacattttg 16378174  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaa 350  Q
    || |||| |||| | |||||||||    
T  16378173 atatacttcaagtccgaagaagaa 16378150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 26 - 468
Target Start/End: Original strand, 19661116 - 19661558
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    ||||||||| || || || || ||||| ||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||||  ||||||||| || |||||     
T  19661116 tcagttgaataaagttacgataaagaacaggtatccacttccgagaattgacgacttaatggatcagttagtgggtgcaaatgttttcagtaagattgac 19661215  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||| |||| || |||||||| || || ||||| |||||||||||||| || |  || |  ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  19661216 ttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctctaggacacgttatggtcactatgaatataaggtgatgcctt 19661315  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| |   | |||  |||||| |||||||| || ||||| || ||    
T  19661316 tcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcctacctagataaattcgtggttgtgtttattgatgacatctt 19661415  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
    |||||| || | |||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||  | ||||| || ||||| || |||||     
T  19661416 gatttattcaaggactgaagaagagcatgcatagcatctgaagattgtattgtaagtgttaaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgag 19661515  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    |||||||| |  || |||||||||| ||||||  |||||||||    
T  19661516 ttctggttaagtgaagtgagttttcctggccacattatttctg 19661558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 303 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 21026275 - 21026104
Alignment:
Q  303 gttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaacttt 402  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21026275 gttgttttcatcgatgatattttaatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaacttt 21026176  T
Q  403 atgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    |||| ||| | ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  21026175 atgctaaaatatctaagtgtgagttctggttgaaagaagtgagtttttttggccatgttatttctggtgatg 21026104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 22 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 19856688 - 19856242
Alignment:
Q  22 atcatcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaat 121  Q
    ||||||||||||| || || || || ||||| ||||||||||||||| ||||||| || || |||||||| ||||||||||||   |||||||| || ||    
T  19856688 atcatcagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccacttccgagaattgacgacttaatggatcaattagtgggtgcaaaggttttcagtaagat 19856589  T
Q  122 tgatttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatg 221  Q
    ||| || |||||| |||| || |||||||| || || ||||| |||||||||||||| || || || |  ||||||||| ||||||||||||| || |||    
T  19856588 tgacttaaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggttactatgaatataaggtgatg 19856489  T
Q  222 ccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgata 321  Q
    ||||| | ||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| |   |||||  |||||| |||||||| || | ||| |    
T  19856488 cctttcgttgttactcatgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcctacctggataaattcgtggttgtgtttattggtgaca 19856389  T
Q  322 ttttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatg 421  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| ||||  || ||||||||||| || |||||| | || ||||| |||||  | ||||| || ||||| || ||    
T  19856388 ttttgatttattctaagactgaagaagagcatgaagaacatctgaagatagtattgcaaatattaaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcaaagtg 19856289  T
Q  422 tgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    ||| |||| ||| |  || |||||||| ||||||||  |||||||||    
T  19856288 tgagttctagttaagtgaagtgagtttccttggccacattatttctg 19856242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 26 - 474
Target Start/End: Original strand, 20854740 - 20855188
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    |||||||||||| || || || |||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| || |||||    ||||| || || |||||     
T  20854740 tcagttgaacaaagttacaataaagaatagatatccacttccgcggattgatgacttgatggaccagttggtaggtgctaaagtttttagtaagattgac 20854839  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||  |||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |  || |||||||| || ||||| ||||| |||||||    
T  20854840 ttgaggtcgggttaccatcagattaaagtgaaggatgaagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctt 20854939  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | |||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||  ||| || || || || || |||||||||||    
T  20854940 tcggtgttactaacgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggtggtatttatagatgatatttt 20855039  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactt-tatgccaaattgtctaaatgtga 424  Q
    |||||| || || |||||||| || ||||| || ||  |||||||||| |||||  | ||||| ||| ||||| || |||||||| ||||| || || ||    
T  20855040 gatttattctaaaactgaagaggagcatgcagaacacttgaagattgtgttgcagattttgaaggag-agaaagttgtatgccaagttgtcgaagtgcga 20855138  T
Q  425 attctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
     |||||||| |  || ||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  20855139 gttctggttaagtgaagtgagttttctaggccatgttatttctggtgatg 20855188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 48 - 468
Target Start/End: Original strand, 20833902 - 20834322
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttgaggtcaagttatcaccaga 147  Q
    ||||| || |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||||   |||||||| |  ||||| ||||||||| |||| || || |    
T  20833902 aagaacagatatccacttccgaggattgatgacttgatggatcagttggtgggtgcaaaggttttcagtatgattgacttgaggtcaggttaccatcaaa 20834001  T
Q  148 ttaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctgg 247  Q
    |||| || || |||||||||||||||||||| || || || |  || |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| ||||| | |||    
T  20834002 ttaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttaggtgttactaatgcgcgtgg 20834101  T
Q  248 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaa 347  Q
     ||||| |||||||||||||| || || |||||||| |   |||||  |||||| |||||||| || ||||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  20834102 tgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggataaattcgtggttgtgtttattgatgatattctgatttattcaaagactgaagaa 20834201  T
Q  348 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagtt 447  Q
    |||||||| || ||| |||||||||| |||||| | ||||||||||| |   | ||||| || ||||| || ||||| ||||||||    || | |||||    
T  20834202 gaacatgcagaacatttgaagattgtgttgcaaattttgaaagagaaaaggttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggttatgtgaagcgagtt 20834301  T
Q  448 ttcttggccatgttatttctg 468  Q
    ||||||||||  |||||||||    
T  20834302 ttcttggccacattatttctg 20834322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 24 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 41310938 - 41310694
Alignment:
Q  24 catcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattg 123  Q
    ||||||||||| || || || || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  | |||| ||    
T  41310938 catcagttgaataaagtgacgataaagaataggtatccacttccgagaattgacgatttaatggatcagttagtgggtgcacgtgtgtttcgtaaaactg 41310839  T
Q  124 atttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcc 223  Q
    ||||||||||  |||| || |||||||| || || ||||| |||||||||||||| || || || |  ||||||||||||||||||||||| || ||| |    
T  41310838 atttgaggtccggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcactatgaatataacgtgatgtc 41310739  T
Q  224 ttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaa 268  Q
    ||| |||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  41310738 tttcggtgttactaatgcgcctagtgtgtttatggagtatatgaa 41310694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 26 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 20296791 - 20296384
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    ||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||||     |||| || || ||||||    
T  20296791 tcagttgaacaaggttacgataaagaacaggtatccgcttccgagaattgaggatttgatggatcagttggttggtgctaagatttttagtaagattgat 20296692  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||  |||| || |||||||| || || ||||| |||||||||||||| || || || |  ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  20296691 ttgaggtctggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 20296592  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | |||||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||| |||||   || || || ||||| || |||||||| ||    
T  20296591 tcggtgttactaacgcgcctggtgtgttcatggagtacatgaaccgaatcttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatctt 20296492  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
     ||||| || |||| |||||| || ||||| |||||||| |  ||||| |||||||||||||| || |||| | | ||||| || ||||| ||||||||     
T  20296491 aatttattctaagaatgaagaggagcatgcagagcatctaagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagagattgtatgcaaagttgtcaaaatgtgag 20296392  T
Q  426 ttctggtt 433  Q
    ||||||||    
T  20296391 ttctggtt 20296384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 30 - 468
Target Start/End: Original strand, 24097587 - 24098025
Alignment:
Q  30 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttga 129  Q
    |||||||| || || || ||||| ||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||   || |||||||| || || ||||    
T  24097587 ttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacttccgagaattgatgacttaatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcagcaagatcgacttga 24097686  T
Q  130 ggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttgg 229  Q
    ||||| |||| || |||||||| || || ||||| |||||||||||||| || || || |  || ||||  || || ||||| || || |||||||| ||    
T  24097687 ggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatgaacattacgaatacaaggtgatgcctttcgg 24097786  T
Q  230 tgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatt 329  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |  || |||||||| ||| |||||  |||||| || || || || ||||| ||| ||||     
T  24097787 tgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccaaattttccatgcttttctggataaattcgtggtggtatttattgatgacattctgatc 24097886  T
Q  330 tactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattct 429  Q
    || || ||||||||||| || ||||| ||  ||||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||  | ||||| || ||||| || ||||| ||||    
T  24097887 tattctaagactgaagaggagcatgcagaaaatctgaagattgtattgtaagtcttgaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcaaagtgtgagttct 24097986  T
Q  430 ggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    |||| |  || ||||||||||| || ||  |||||||||    
T  24097987 ggttaagtgaagtgagttttctgggtcacattatttctg 24098025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 195 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 20944240 - 20944119
Alignment:
Q  195 tatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatc 294  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20944240 tatggtcattatgaataaaaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatc 20944141  T
Q  295 gattcgtagttgtgttcatcga 316  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  20944140 ggttcgtagttgtgttcatcga 20944119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 26 - 468
Target Start/End: Original strand, 20938043 - 20938485
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    ||||||||| || || || || ||||| ||||||||||||||  | ||||| || ||||||||||||||||||||||||   ||||| || || |||||     
T  20938043 tcagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccacttcctaggattgacgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtttttagtaagattgac 20938142  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||| |||| || || ||||| || || ||||| ||||||||||| || || || || |  || |||||||| || ||||| || || |||||||    
T  20938143 ttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaggatatgcagaaaacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctt 20938242  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | |||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| |  ||||||  |||||| |||||||| || ||||| | | |    
T  20938243 tcggtgttactaacgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttacttggataaattcgtggttgtgtttattgatgacagtct 20938342  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||  ||||||||||  || || || ||||| ||||||||||| ||  | ||||| || ||||| || |||||     
T  20938343 gatttattcgaagactgaagaagagcatgtagagcatctgagaatagtattacaagtattgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgag 20938442  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    |||||||| |  || || ||||||||||||||  |||||||||    
T  20938443 ttctggttaattgaagtaagttttcttggccacattatttctg 20938485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 26 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 37679459 - 37679052
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||||| |||||  ||||||| || ||||||||||| || || |||||     | || || || ||||||    
T  37679459 tcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcaattggttggtgctaagatatttagtaagattgat 37679360  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||  ||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||| || || || |  ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  37679359 ttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaagatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 37679260  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||   || || || ||||| || |||||||||||    
T  37679259 tcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaatcgaatcttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatttt 37679160  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
     || || ||||||| ||| ||  | ||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||| || ||||   | ||||| || || || |||||||||    
T  37679159 aatctattccaagaatgaggagaagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttatcaaaatgtgaa 37679060  T
Q  426 ttctggtt 433  Q
    ||||||||    
T  37679059 ttctggtt 37679052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 26 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 48425283 - 48424841
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||||| |||||  ||||||| || |||||||||||||| || |||||     |||| || || ||||||    
T  48425283 tcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagatttttagtaagattgat 48425184  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||  ||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||| || || || |  ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  48425183 ttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 48425084  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||| |||||   || || || ||||| || |||||||||||    
T  48425083 tcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatttt 48424984  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
     || || ||||||| ||| || || ||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||| || ||||   | ||||| || || || ||||||||     
T  48424983 aatctattccaagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttatcaaaatgtgag 48424884  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    |||||||| || || || |||||||| || ||  |||||||||    
T  48424883 ttctggttaaatgaagtaagttttctgggtcacattatttctg 48424841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 26 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 52988151 - 52987709
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||||| |||||  ||||||| || |||||||||||||| || |||||     |||| || || ||||||    
T  52988151 tcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagatttttagtaagattgat 52988052  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||  ||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||| || || || |  ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  52988051 ttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 52987952  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||| |||||   || || || ||||| || |||||||||||    
T  52987951 tcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatttt 52987852  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
     || || ||||||| ||| || || ||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||| || ||||   | ||||| || || || ||||||||     
T  52987851 aatctattccaagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttatcaaaatgtgag 52987752  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    |||||||| || || || |||||||| || ||  |||||||||    
T  52987751 ttctggttaaatgaagtaagttttctgggtcacattatttctg 52987709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 26 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 21953288 - 21952881
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    |||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||  ||||||| || |||||||||||||| || |||||     |||| || || |||||     
T  21953288 tcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccgcttcctggaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagatttttagtaagattgac 21953189  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||  |||| || ||||| || || || ||||| |||||||||||||| || || || |  ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  21953188 ttgaggtcgggttaccatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 21953089  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | |||||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||| |||||   || || || ||||| || |||||||| ||    
T  21953088 tcggtgttactaacgcgcctggtgtgtttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatctt 21952989  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
     ||||| |||||||  ||||| || ||||| ||||||||||  ||||| |||||||| |||||||| ||||   | ||||| || ||||| ||||||||     
T  21952988 aatttattccaagaacgaagaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagttttgaaagaaaagaggttgtatgcgaagttgtcaaaatgtgag 21952889  T
Q  426 ttctggtt 433  Q
    ||||||||    
T  21952888 ttctggtt 21952881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 26 - 468
Target Start/End: Original strand, 38910806 - 38911248
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    |||||||||||| || || |||||||| || ||||| |||||  ||||||| || |||||||||||||| || |||||     ||||||| || ||||||    
T  38910806 tcagttgaacaaagttacgatcaagaacagatatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagattttcagtaagattgat 38910905  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||  ||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||| || || || |  |||||||| || || ||||| || || |||||||    
T  38910906 ttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggacattacgaatacaaggtgatgcctt 38911005  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |  || |||||||| ||  |||||   || || || || || || |||||||||||    
T  38911006 tcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccaaattttccatgctttcctggataagtttgttgtggtatttattgatgatatttt 38911105  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
     || || ||||||| ||| || || ||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||| || ||||   | ||||| ||  |||| ||||||||     
T  38911106 aatctattccaagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagctgtcgaaatgtgag 38911205  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    |||||||| |  || ||||| ||||| || ||| |||||||||    
T  38911206 ttctggttaagtgaagtgagctttctgggtcatattatttctg 38911248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 27 - 467
Target Start/End: Original strand, 20829373 - 20829813
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||   || || || || |||||||    
T  20829373 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 20829472  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| | ||||| ||||||| |||||| |  ||||||||    || || || ||| ||| | | ||||| |||||||| |||   || ||||| ||    
T  20829473 tgagatcaggatatcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatt 20829572  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    ||| ||  | |||||||| || || |||||||| || |||||| | || || ||| | | | |||| || || || || |||||||| ||||||||||||    
T  20829573 tggagtatctaatgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttg 20829672  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
     | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||  |  | | |||||| |||||||| ||||| |    
T  20829673 gtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagt 20829772  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttct 467  Q
    | |||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  20829773 tttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 20829813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 26 - 468
Target Start/End: Original strand, 31537977 - 31538419
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    |||||||||||| || || |||||||| || ||||| |||||  ||||||| || |||||||||||  | || |||||     | || || || || |||    
T  31537977 tcagttgaacaaagttacgatcaagaacagatatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcaactggttggtgctaagatatttagtaagatagat 31538076  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||  ||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| || || || |  ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  31538077 ttgaggtctggttatcatcagataaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 31538176  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||| |||||   || || || ||||| || |||||||||||    
T  31538177 tcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatttt 31538276  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
     || || ||||||| ||| || || ||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||| || ||||   | ||||| || || || ||||||||     
T  31538277 aatctattccaagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttatcaaaatgtgag 31538376  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    |||||||| || || || |||||||| || ||  |||||||||    
T  31538377 ttctggttaaatgaagtaagttttctgggtcacattatttctg 31538419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 302 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 41308776 - 41308610
Alignment:
Q  302 agttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactt 401  Q
    ||||||||| || ||||| || || ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |     
T  41308776 agttgtgtttattgatgacatcttaatttattctaagactgaagaagagcatgcagagcatctgaagattgtattgcaagtgttgaaagaaaagaagttg 41308677  T
Q  402 tatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |  || || ||||||||||||||| |||||||||    
T  41308676 tatgccaagttgtccaaatgtgaattttggttaagtgaagtaagttttcttggccatattatttctg 41308610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 391 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 16378156 - 16378079
Alignment:
Q  391 agaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    ||||||| || ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  16378156 agaagaagctatatgctaaattgtcaaagtgtgaattctggttgaaagaggttagttttcttggccatgttatttctg 16378079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 340 - 457
Target Start/End: Original strand, 23196543 - 23196660
Alignment:
Q  340 ctgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaaga 439  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||   | |||||||| ||||| ||||| || |||||||| |  ||    
T  23196543 ctgaagaagagcatgtagagcatctgaaaattgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaggttgtatgccaagttgtccaaatgcgagttctggttaagtga 23196642  T
Q  440 cgtgagttttcttggcca 457  Q
     || ||||||||||||||    
T  23196643 agtaagttttcttggcca 23196660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 27 - 103
Target Start/End: Original strand, 35930806 - 35930882
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgc 103  Q
    |||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  35930806 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagttggtgc 35930882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 27 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 20527431 - 20527366
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcag 92  Q
    ||||||||||| || || || |||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  20527431 cagttgaacaaagtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcag 20527366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 27 - 92
Target Start/End: Original strand, 41215837 - 41215902
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcag 92  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||||| |||||  | |||||||||||||||||||||    
T  41215837 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccgcttccaaggattgatgatttgatggatcag 41215902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 306 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 20927153 - 20927065
Alignment:
Q  306 gtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaa 394  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || ||| |||| ||||| |||| ||||||| ||| |||||| |||||||| ||||| |||||    
T  20927153 gtgttcatagatgatattttggtgtattcgaagtctgaggaagagcatgatgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaggagaa 20927065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 27 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 20927432 - 20927290
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    ||||||||||| || || || |||||| | ||||||||||   | ||||||||||||||||||||| | || ||||||   || || ||||| ||||||     
T  20927432 cagttgaacaaagtgacgattaagaatcgatatccacttcaaaggattgatgatttgatggatcagctggttggtgcagaggtgtttagcaagattgata 20927333  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatat 169  Q
    |||| ||| | ||||| ||||||| |||||| |  ||||||||    
T  20927332 tgagatcaggatatcatcagattagagtaaaggcggaagatat 20927290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 368; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 40547 - 40100
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40547 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaactgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatt 40448  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40447 tgagatcagggtatcactagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcaaaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 40348  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  40347 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatcgatgacattttg 40248  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  40247 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 40148  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40147 tctggttgaaagaagtaagttttcttggccatgttatttctggtgatg 40100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 22 - 474
Target Start/End: Original strand, 14031 - 14484
Alignment:
Q  22 atcatcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaat 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||    
T  14031 atcatcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagat 14130  T
Q  122 tgatttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatg 221  Q
    ||||||||| ||  | |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14131 tgatttgagatcggggtatcactagattaaagtgaaagatgatgatatgcagaagatagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatg 14230  T
Q  222 ccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgata 321  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||    
T  14231 cctttcggtgtgaccaatgcacctggaatgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcctttttggatcggttcgtggtggtgtttatcgatgata 14330  T
Q  322 -ttttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaat 420  Q
     |||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  14331 ttttttatttactccatgactgaagaagaatatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattttctaagt 14430  T
Q  421 gtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    |||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14431 gtgaattctgtttgaaggaagtaagttttcttggccatgttatttctggtgatg 14484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 366; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 35891 - 35442
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35891 tcagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgat 35792  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35791 ttgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 35692  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  35691 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtggttgttctcatcgatgatatttt 35592  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||     
T  35591 aatttactccaagaccgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgag 35492  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtga-gttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    |||||||||||||| || | ||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  35491 ttctggttgaaagaggtaaggttttgttggccatgttatttctggtgatg 35442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 112 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 28408 - 28225
Alignment:
Q  112 tcagcaaaattgatttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaata 211  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28408 tcagcaagattgatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaata 28309  T
Q  212 taaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcg 295  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28308 caaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcg 28225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079; HSP #3
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 26 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 3111 - 2669
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    |||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||||   |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  3111 tcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacttccgacgattgatgacttaatggatcagttagtgggtgcacgtgtgtttagtaaaattgat 3012  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||| |||| || ||||||||    || ||||| ||||||||||||||  | || || |   | ||||| || || ||||||||||| |||||||    
T  3011 ttgaggtcaggttaccatcagattaagtcgaaggatgaggatatgcagaagacgacctttaggacatgatatggacattacgaatataaagtgatgcctt 2912  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| |   |||||  |||||| |||||||| || ||||| || ||    
T  2911 tcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggataaattcgtggttgtgtttattgatgacatctt 2812  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||     
T  2811 gatttattcaaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagtgttgaaagagaagaagttgtatgccaagttgtctaaatgtgag 2712  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    |||||||| |  || || ||||||||||||||  |||||||||    
T  2711 ttctggttaagtgaagtaagttttcttggccacattatttctg 2669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079; HSP #4
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 22 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 28475 - 28405
Alignment:
Q  22 atcatcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcag 92  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28475 atcatcagttgaataaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcag 28405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 366; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 10865 - 10428
Alignment:
Q  30 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttga 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10865 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatcgacttccaagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatttga 10766  T
Q  130 ggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttgg 229  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10765 ggtcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaggatatgcagaagacgactttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttgg 10666  T
Q  230 tgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatt 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10665 tgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtattcatcgatgatattttgatt 10566  T
Q  330 tactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattct 429  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  10565 tactccaagactgaaaaagaacatgctgagcatctaaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgagttct 10466  T
Q  430 ggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttct 467  Q
    |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  10465 ggttgagagaagtgagtttccttggccatgttatttct 10428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 17327 - 16890
Alignment:
Q  30 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttga 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17327 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatcgacttccaagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatttga 17228  T
Q  130 ggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttgg 229  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17227 ggtcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaggatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttgg 17128  T
Q  230 tgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatt 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17127 tgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcacatcttccatgcatttttggattggttcgtagttgtattcatcgatgatattttgatt 17028  T
Q  330 tactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattct 429  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  17027 tactccaagactgaaaaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgagttct 16928  T
Q  430 ggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttct 467  Q
    |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  16927 ggttgagagaagtgagtttccttggccatgttatttct 16890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 31 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 45541 - 45106
Alignment:
Q  31 tgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttgag 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45541 tgaacaaggtaactatcaagaataggtatccgcttccaagaattgacgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatttgag 45442  T
Q  131 gtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggt 230  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45441 gtcaggttatcaccagattaaggtaaaggatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggt 45342  T
Q  231 gttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgattt 330  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45341 gttaccaatgcacctagagtatttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgatgatattttgattt 45242  T
Q  331 actccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctg 430  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45241 actccaagactgaagaagaacatgctgatcatctgaagattgtcttgcaagtattgaaagagaaaaaactttatgccaaattgtctaagtgtgaattctg 45142  T
Q  431 gttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttc 466  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  45141 gttgaaagaggtgagttttcttggccatgttatttc 45106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 48 - 468
Target Start/End: Original strand, 48447 - 48867
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttgaggtcaagttatcaccaga 147  Q
    |||||||| ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||| || ||||||    |||| || |||||||| ||||||||| |||| || ||||    
T  48447 aagaatagatatccgcttccgagaattgacgacctgatggatcagttggttggtgcaaagatttttagtaaaattgacttgaggtcaggttaccatcaga 48546  T
Q  148 ttaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctgg 247  Q
    | || || |||||||| || ||||||||||| || || || |  || |||||||| || |||||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  48547 tcaaggtgaaagatgaggacatgcagaagactgcctttagcacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctgg 48646  T
Q  248 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaa 347  Q
     ||||| ||||||||||||||  | || || ||||| |   |||||  ||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |  ||||| |||    
T  48647 tgtgttcatggagtatatgaacagaatttttcatgcttacctggataaatttgtggttgtattcattgatgacattttgatctattcgagaactgaggaa 48746  T
Q  348 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagtt 447  Q
    || ||||| || ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||| || || || || ||||| |  || |||||||    
T  48747 gagcatgcagaacatctgaggattgtattgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcaaagtgcgagttttggttaagtgaagtgagtt 48846  T
Q  448 ttcttggccatgttatttctg 468  Q
    ||||||||||| |||||||||    
T  48847 ttcttggccatattatttctg 48867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 364; Significance: 0; HSPs: 59)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Original strand, 17672375 - 17672814
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  17672375 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 17672474  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17672475 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 17672574  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||    
T  17672575 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 17672674  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  17672675 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 17672774  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttc 466  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  17672775 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttc 17672814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 18859006 - 18858559
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  18859006 cagtggaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtttttagcaagattgatt 18858907  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18858906 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacggctttcaggacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 18858807  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| || ||||||    
T  18858806 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgacattttg 18858707  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  18858706 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 18858607  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18858606 tctggttgaaagaagtgagttttcttggccatgttatttctggtgatg 18858559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 474
Target Start/End: Original strand, 20016615 - 20017062
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  20016615 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 20016714  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20016715 tgaggtcaggttatcaccagattaaggtaaaggatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 20016814  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||    
T  20016815 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 20016914  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20016915 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgaat 20017014  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  20017015 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggtgatg 20017062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 474
Target Start/End: Original strand, 22118527 - 22118974
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  22118527 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtttttagcaagattgatt 22118626  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22118627 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgtagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactttgaatataaagttatgccttt 22118726  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||    
T  22118727 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 22118826  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  22118827 atttactccaagactgaagaagaacgtgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaat 22118926  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  22118927 tctggtcgaaagaggtgagttttctaggccatgttatttctggtgatg 22118974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 474
Target Start/End: Original strand, 22127311 - 22127758
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  22127311 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtttttagcaagattgatt 22127410  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22127411 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgtagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactttgaatataaagttatgccttt 22127510  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||    
T  22127511 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 22127610  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  22127611 atttactccaagactgaagaagaacgtgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaat 22127710  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  22127711 tctggtcgaaagaggtgagttttctaggccatgttatttctggtgatg 22127758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 474
Target Start/End: Original strand, 30311495 - 30311943
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||    
T  30311495 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgataattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 30311594  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30311595 ttgagatcagggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 30311694  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||||||    
T  30311695 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgttgttgtgtttattgacgatatttt 30311794  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  30311795 aatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 30311894  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30311895 ttctggttgaaagaagtaagttttcttggccatgttatttctggtgatg 30311943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 15535813 - 15535365
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||    
T  15535813 tcagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 15535714  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15535713 ttgagatcagggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaaaacagttatcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 15535614  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||    
T  15535613 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcacatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatcgacgacatttt 15535514  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  15535513 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 15535414  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15535413 ttctggttgaaagaagtaagttttcttggccatgttatttctggtgatg 15535365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 22042257 - 22041809
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| ||||||    
T  22042257 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcgaaagttttcagcaagattgat 22042158  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22042157 ttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgtgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 22042058  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  22042057 tcggtgtgaccaattcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtggttgtgtttatcgacgatatttt 22041958  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||    
T  22041957 gatgtactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagcgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgagaa 22041858  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22041857 ttctggttgaaagaaataagttttcttggccatgttatttctggtgatg 22041809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 474
Target Start/End: Original strand, 21164889 - 21165337
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  21164889 tcagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgcattttcagcaagattgat 21164988  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21164989 ttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcggtatggtcactatgaatataaagttatgcctt 21165088  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||    
T  21165089 tcggtgttacgaatgcacctggagtgtttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcattcttggatcgattcgtggttgtttttatctatgatatttt 21165188  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || |||||     
T  21165189 aatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttaaaagagaagaaactttatgctaaattatccaagtgtgag 21165288  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21165289 ttctggttgaaagaggtaagttttcttggccatgttatttctggtgatg 21165337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 474
Target Start/End: Original strand, 22131392 - 22131840
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||    
T  22131392 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 22131491  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    |||||  || | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22131492 ttgagaacagggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttaagaacgcattacggtcactatgaatataaagttatgcctt 22131591  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  22131592 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcctttttggatcgattctttgttgtgtttatcgatgatatttt 22131691  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  22131692 gatctactccaagactgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 22131791  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22131792 ttctggttgaaggaagtaagttttcttggccatgttatttctggtgatg 22131840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 32602575 - 32602132
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||| ||||||    
T  32602575 tcagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccactaccgagaattgatgatttgatggatcagttagagggtgcaaaagttttcagcaagattgat 32602476  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||| | |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32602475 ttgagatcagggtatcaccagattaaggtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 32602376  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  32602375 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcctttttggatcggttcgttgttgtgtttatcgatgatatttt 32602276  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||    
T  32602275 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtcaaagtgtgaa 32602176  T
Q  426 ttc-tggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    ||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||    
T  32602175 ttcttggttgaaagaagtaagtttttttggccatgttatttctg 32602132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 19980397 - 19979949
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19980397 tcagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgat 19980298  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19980297 ttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgtagaagacaactttcagaacactgtatggtcactatgaatataaagttatgcctt 19980198  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  19980197 ttggtgttaccaatgcgcctggagtgtttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgtttttatcgacgatatttt 19980098  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| | |||     
T  19980097 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagaatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaattttatgctaaattatctaagtatgat 19979998  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19979997 ttctggttgaaagaggtaagttttcttggccatgttatttctggtgatg 19979949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Original strand, 19482424 - 19482855
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||        ||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||    
T  19482424 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattga--------tggatcagttagtgggtgcgcgagttttcagcaagattgatt 19482515  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19482516 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatacaaagttatgccttt 19482615  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  19482616 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggggtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcagttcgtggttgtgttcatcgacgatattttg 19482715  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  19482716 atttactccaagactgaagaagaacatgcagaacatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 19482815  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttc 466  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  19482816 tctggttgaaagaagtgagttttcttggtcatgttatttc 19482855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 48 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 23652449 - 23652029
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttgaggtcaagttatcaccaga 147  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||    
T  23652449 aagaataggtatctacttctgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatttaagatcaggttatcaccaga 23652350  T
Q  148 ttaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctgg 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23652349 ttaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacaggtttcagaacgcgttatggacattatgagtacaaagttatgccttttggtgttacaaatgcacctgg 23652250  T
Q  248 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaa 347  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  23652249 tgtgtttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgttttcattgatgatactttgatttactccaagactgaagag 23652150  T
Q  348 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagtt 447  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||    
T  23652149 gaacatgctgagcatttgaagattgttttacaagtgttgaaagagaagaagctatatgctaaattgtctaagtgtgaattttggttgaaagaggtaagtt 23652050  T
Q  448 ttcttggccatgttatttctg 468  Q
    ||||||||||||| |||||||    
T  23652049 ttcttggccatgtcatttctg 23652029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 27 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 21253373 - 21252932
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| || ||||    
T  21253373 cagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatcaactttcgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagatagatt 21253274  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  21253273 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcggtatggtcactatgagtacaaagttatgccttt 21253174  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||| || |||||||||||||||    
T  21253173 cggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggttcgaggttgtttttatcgatgatattttg 21253074  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||  ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||    
T  21253073 atttactccaagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggttctgcaagtattgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaagtgagaat 21252974  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  21252973 tctggttgaaagaagtgagctttcttggacatgttatttctg 21252932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 27 - 468
Target Start/End: Original strand, 21392213 - 21392654
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| || ||||    
T  21392213 cagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttccgaggattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagatagatt 21392312  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  21392313 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacaactttcagagcgcggtatggtcactatgagtacaaagttatgccttt 21392412  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     |||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||| || ||||||||||| |||    
T  21392413 cggtgttacgaatgcacctggagtatttatggattacatgaatcgcatctttcatgcatttttggattggttcgtggttgtttttatcgatgatatattg 21392512  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||    
T  21392513 atttactccaagtctgaagaagaacatgttgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcaaaattgtctaagtgcgaat 21392612  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  21392613 tctggttgaaagaagtgagctttcttggacatgttatttctg 21392654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 27 - 468
Target Start/End: Original strand, 21782772 - 21783213
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| || ||||    
T  21782772 cagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttccgaggattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagatagatt 21782871  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  21782872 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacaactttcagagcgcggtatggtcactatgagtacaaagttatgccttt 21782971  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     |||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||| || ||||||||||| |||    
T  21782972 cggtgttacgaatgcacctggagtatttatggattacatgaatcgcatctttcatgcatttttggattggttcgtggttgtttttatcgatgatatattg 21783071  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||    
T  21783072 atttactccaagtctgaagaagaacatgttgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgcgaat 21783171  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  21783172 tctggttgaaagaagtgagctttcttggacatgttatttctg 21783213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 27 - 468
Target Start/End: Original strand, 21786707 - 21787148
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| || ||||    
T  21786707 cagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttccgaggattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagatagatt 21786806  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  21786807 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacaactttcagagcgcggtatggtcactatgagtacaaagttatgccttt 21786906  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     |||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||| || ||||||||||| |||    
T  21786907 cggtgttacgaatgcacctggagtatttatggattacatgaatcgcatctttcatgcatttttggattggttcgtggttgtttttatcgatgatatattg 21787006  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||    
T  21787007 atttactccaagtctgaagaagaacatgttgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcaaaattgtctaagtgcgaat 21787106  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  21787107 tctggttgaaagaagtgagctttcttggacatgttatttctg 21787148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 27 - 474
Target Start/End: Original strand, 22422244 - 22422691
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||| || || || || |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |    
T  22422244 cagttgaataaagtgacgataaagaataggtattcacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtgtttagcaagattgact 22422343  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  22422344 tgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagatagcattcagaacgcgttatggacattatgaatataaagtgatgccttt 22422443  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     |||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  22422444 cggtgttacaaatgcgccaggtgtgtttatggagtacatgaatcgcatttttcatgcatttttggatcgtttcgtggttgtattcattgatgatattttg 22422543  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||    
T  22422544 atttactccaagtccgaagaagaacatgttgaacatttgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatcaaagtgtgaat 22422643  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  22422644 tatggttgaaagaggtgagtttccttggccatgttatttctggtgatg 22422691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 28 - 468
Target Start/End: Original strand, 19864446 - 19864887
Alignment:
Q  28 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgattt 127  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||| || |||||    
T  19864446 agttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttccgaggattgatgatttgatggatcagttagtgggtgctaaatttttcagcaagatagattt 19864545  T
Q  128 gaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttt 227  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||     
T  19864546 gagatcaggttatcaccagattaaagtaaaatatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcggtatggtcactatgagtagaaagttatgcctttc 19864645  T
Q  228 ggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttga 327  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||| | ||||| ||||| |||||||||||||    
T  19864646 ggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatctcatctttcatgcatttttggattggttcatggttgttttcattgatgatattttga 19864745  T
Q  328 tttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattg-tcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||| ||||  | | | || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||    
T  19864746 tttactctaagtctgaagaagaacatattgagcatttgaaactggtttttacaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaagtgcgaat 19864845  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  19864846 tctggttgaaagaagtgagttttcttggacatgttatttctg 19864887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 28 - 468
Target Start/End: Original strand, 22375806 - 22376246
Alignment:
Q  28 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgattt 127  Q
    ||||||| || ||||| || |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  22375806 agttgaataaagtaacgataaagaatagatatccacttccaagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtattcagcaagattgattt 22375905  T
Q  128 gaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttt 227  Q
    ||| ||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||| || ||| |||||||||| ||||||||     
T  22375906 gagatcgggttatcaacagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacggcttttagaacacgttatggacattattaatataaagtgatgcctttc 22376005  T
Q  228 ggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttga 327  Q
     |  |||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| |    
T  22376006 agcattacaaatgcaccaggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatttttcatgcatttttggatcgttttgtggttgtgttcatcgacgatattttta 22376105  T
Q  328 tttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaatt 427  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||  | ||||| |||||||| || | | ||||    
T  22376106 tatactccaagactgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagttatatgctaaattgtcaaactataaatt 22376205  T
Q  428 ctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  22376206 ctggttgaaatagatgagttttcttggccatgttatttctg 22376246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 30 - 468
Target Start/End: Original strand, 22246788 - 22247226
Alignment:
Q  30 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttga 129  Q
    ||||| |||||||| || |||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  22246788 ttgaataaggtaacgataaagaatgggtatccacttccaagaattgatgctttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtgttcagcaagattgatttga 22246887  T
Q  130 ggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttgg 229  Q
    | ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||   ||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||    
T  22246888 gatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagaccgcttttagaacaagttatggacattatgaatataaagtgatgcctttcgg 22246987  T
Q  230 tgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatt 329  Q
    |||||| ||||| || || |||||||||||||| |||||||| || || | ||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||||     
T  22246988 tgttacaaatgcgccaggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatttttcctgcgtttttggatcgtttcatggttgtgttcatcgacgatattttgata 22247087  T
Q  330 tactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattct 429  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||||||||  | ||||| ||||| || || ||||||||||    
T  22247088 tactccaagattgaaggagaacatgttgagcatttgtagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagttatatgctaaattttcaaagtgtgaattct 22247187  T
Q  430 ggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    |||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||    
T  22247188 ggttgaaagaggcgagttttcatggccatgttatttctg 22247226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 112 - 468
Target Start/End: Original strand, 21920185 - 21920541
Alignment:
Q  112 tcagcaaaattgatttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaata 211  Q
    ||||||| || |||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||| ||    
T  21920185 tcagcaagatagatttgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagcttttagaacgcgttatggacattatgagta 21920284  T
Q  212 taaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttc 311  Q
    ||| || ||| | || |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||| | ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||     
T  21920285 taaggtgatgtcgttcggtgttacaaatgcacatggagtatttatggagtacatgaattgtatctttcaagcatttttggatcggttcgtggttgttttt 21920384  T
Q  312 atcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaat 411  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21920385 attgatgatattttgatttacttcaagactgaagaagaatatgctgagcatttgaagttagttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgcgaaat 21920484  T
Q  412 tgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  21920485 tgtctaagtgtgagttctggttgaaagaagtgagctttcttggacatgttatttctg 21920541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 26 - 468
Target Start/End: Original strand, 29301777 - 29302219
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    |||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  29301777 tcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccgcttccgaggattgatgatctgatggatcagttagtgggtgcacgtgtgttcagtaaaattgac 29301876  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||| || ||||||||  ||||||||||||| || |||||||  |||||||| || ||||| ||||| || |||||||    
T  29301877 ttgaggtcgggttatcactagattaaggtgaaagatgagaatatgcagaagacggcattcagaacacgttatgggcattatgagtataaggtgatgcctt 29301976  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||  | || || |||||||| || ||||  || || || || || || ||||| ||| |    
T  29301977 ttggtgttacaaatgcacctggggtatttatggagtacatgaacagaatttttcatgcattcttagatcagtttgttgtggtatttattgatgacattct 29302076  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
    ||||||||| ||||| |||||| ||||||| || ||  |||||||||| || |||||||||||||||| |||  | |||||||| ||||| |||||||||    
T  29302077 gatttactctaagaccgaagaataacatgcagaacacttgaagattgtgttacaagtgttgaaagagaggaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgaa 29302176  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    ||||||||||  || || |||||||||||||| ||||||||||    
T  29302177 ttctggttgagtgaagtaagttttcttggccacgttatttctg 29302219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 27 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 23887457 - 23887015
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  23887457 cagttgaataaagtaacgataaagaataggtatccacttcgaagaattgatgatttgatggattagttagtgggtgcacgtgtgtttagcaagattgatt 23887358  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    ||||||   ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || |  |||||||| || || || |||  ||| ||||||||    
T  23887357 tgaggttgggttatcaccagattaaagtgaaagacgaggatatgcataagacggcctttaggacacgttatggacattacgagtattcagtgatgccttt 23887258  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     |||||||| ||||| || |  |||||||||||||| |||||||  || || ||||| | ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23887257 cggtgttactaatgcgccagatgtgtttatggagtacatgaatcatatttttcatgcttatttagatcgcttcgtggttgtgttcatcgatgatattttg 23887158  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgc----tgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgt 422  Q
    || ||||| ||| || ||||||||||||     ||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||  | |||||||| ||||| || |||    
T  23887157 atatactctaagtctaaagaagaacatgtatgttgagcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaggagaagaagttatatgccaagttgtcaaagtgt 23887058  T
Q  423 gaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttattt 465  Q
    ||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  23887057 gaattctagttgaatgaggtgagttttcttggccatgttattt 23887015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 48 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 21927836 - 21927415
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttgaggtcaagttatcaccaga 147  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||    
T  21927836 aagaataggtatccacttccgagaattgacgacttaatggatcagttagtgggtgctcgtgtgttcagtaaaattgatttgaggtcaggttaccatcaga 21927737  T
Q  148 ttaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctgg 247  Q
    |||| || || |||||  |||||||||||||  | || || |  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||  ||||||| ||||| |||||    
T  21927736 ttaaggtgaaggatgagcatatgcagaagacgacctttaggacacgttatggtcactatgaatataaggtgatgcctttcagtgttactaatgcgcctgg 21927637  T
Q  248 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaa 347  Q
     ||||||||||||||||||||  | || |||||||| | | |||||  ||| || |||||||| || ||||| || || ||||| || ||||||||||||    
T  21927636 tgtgtttatggagtatatgaacagaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttaatttattctaagactgaagaa 21927537  T
Q  348 gaaca-tgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagt 446  Q
    || || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  | |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |  || || ||     
T  21927536 gagcattgcagagcatctgaagattgtattgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgaattctggttaagtgaagtaaga 21927437  T
Q  447 tttcttggccatgttatttctg 468  Q
    |||||||||||| |||||||||    
T  21927436 tttcttggccatattatttctg 21927415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 249 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 22988937 - 22988718
Alignment:
Q  249 gtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaag 348  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  22988937 gtgtttatggaatacatgaatcacatttttcatgcatttttggatcgtttcgtggttgtgttcatcgatgatattttgatatattccaagactgaagaag 22988838  T
Q  349 aacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttt 448  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22988837 aacatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagctttatgctaaattgtcaaagtgtgaattctggttgaaagaggtgagttt 22988738  T
Q  449 tcttggccatgttatttctg 468  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  22988737 tcttggccatgttatttctg 22988718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 48 - 468
Target Start/End: Original strand, 20008294 - 20008714
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttgaggtcaagttatcaccaga 147  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||||||||| ||| |||| || ||||    
T  20008294 aagaatagatatccacttccgagaattgatgatttaatggatcaattagtgggtgcacgcgtgttcagtaagattgatttgagctcaggttaccatcaga 20008393  T
Q  148 ttaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctgg 247  Q
    |||| || |||||||| |||||||||||||| || || || |  || ||||| || ||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  20008394 ttaaggtgaaagatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctgg 20008493  T
Q  248 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaa 347  Q
     ||||||||||||||||||||  | || |||||||| | | |||||  ||| || |||||||| |  ||||||||  | ||||| || |||| |||||||    
T  20008494 tgtgtttatggagtatatgaacagaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttagtgatgatatcctaatttattctaagaatgaagaa 20008593  T
Q  348 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagtt 447  Q
    || ||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||||  | |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |  || || ||||    
T  20008594 gagcatgcagagcatatgaagattgtgttgcaactgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtccaaatgtgaattttggttaagtgaagtaagtt 20008693  T
Q  448 ttcttggccatgttatttctg 468  Q
    ||||||||||| |||||||||    
T  20008694 ttcttggccatattatttctg 20008714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 26 - 454
Target Start/End: Original strand, 31414820 - 31415248
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    |||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||   || |||||||| |||||     
T  31414820 tcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgagaattgatgacttaatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcagcaagattgac 31414919  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||| |||| || |||||||| || || |||||||||||||||||||| || || || |  || |||||||| || ||||| || || |||||||    
T  31414920 ttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctt 31415019  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||  ||| || |||||||| || ||||||||| |    
T  31415020 tcggtgttactaatgcgcctggggtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggttgtgtttattgatgatattct 31415119  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
    |||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||  | ||||| || ||||| || ||| |     
T  31415120 gatttattctaagaccgaagaggagcatgcagagcatctgaagattgtattgcaagtgttaaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcaaagtgtaag 31415219  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttcttgg 454  Q
    |||||||| |  || |||| |||||||||    
T  31415220 ttctggttaagtgaagtgaattttcttgg 31415248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 30 - 468
Target Start/End: Original strand, 20394488 - 20394926
Alignment:
Q  30 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttga 129  Q
    |||||||| || || || ||||||||| |||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  || ||||||||||    
T  20394488 ttgaacaaagtgacaataaagaatagggatccacttctaagaatcgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtgtttattaagattgatttga 20394587  T
Q  130 ggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttgg 229  Q
    | ||  | ||||| ||||||||| | || |||||||||||| ||||||| ||||| || |  ||||| || || || |||||   | | ||||||||| |    
T  20394588 gatcgggctatcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcaatgatgccttttag 20394687  T
Q  230 tgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatt 329  Q
    || ||| |||||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||||||||| || |||||||||||     
T  20394688 tgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgctttgttgttgtgttcattgacgatattttgata 20394787  T
Q  330 tactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattct 429  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||  | |||||||| ||||| || ||||||||||    
T  20394788 tactctaagtctgaagaagaacatgccgagcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattct 20394887  T
Q  430 ggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    |||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||    
T  20394888 ggttgaataaggtgagttttcttggccatattatttctg 20394926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 30 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 23657353 - 23656918
Alignment:
Q  30 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttga 129  Q
    |||||||| || || || ||||| ||||||||||||||| | |||||||| || ||||||||||| || ||||||   ||||||||||| ||||| ||||    
T  23657353 ttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcagttcgtaggtgcaaaagttttcagcaagattgacttga 23657254  T
Q  130 ggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttgg 229  Q
    ||||| |||| || ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || || || |  || |||||||| || |||||||| || |||||||| ||    
T  23657253 ggtcaggttaccatcagattaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctttcgg 23657154  T
Q  230 tgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatt 329  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||  |||  | ||||| || || ||||||||| | ||     
T  23657153 tgttactaatgcgcctggcgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttatggttgtatttattgatgatattctaata 23657054  T
Q  330 tactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattct 429  Q
    || || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  | |||||||| ||||| || ||||| || |    
T  23657053 tattctaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgccaagttgtcaaagtgtgagttat 23656954  T
Q  430 ggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttattt 465  Q
    |||| |  || || ||||||||||||||| ||||||    
T  23656953 ggttaagtgaagtaagttttcttggccatattattt 23656918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 27 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 22522975 - 22522711
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||    
T  22522975 cagttgaacaaagtaacgataaagaacaggtatccacttccaagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgctcgtgtgtttagcaagattgatt 22522876  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||  |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||  |||||| | || ||||| |||||||| ||||||||    
T  22522875 tgagatcgggttatcaccagaataaagtgaaagatgaagatatgcagaaaacggcttttagaacacgttatcgacattatgagtataaagtgatgccttt 22522776  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttgg 291  Q
     |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||    
T  22522775 cggtgttacaaatgcgccaggagtgtttatggagtacatgaatcgcatttttcatgcatttttgg 22522711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 57 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 19861834 - 19861423
Alignment:
Q  57 tatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaa 156  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||   ||||| ||||||||||| |||| || |||||||| || |    
T  19861834 tatcgacttccgagaattgatgatttaatggatcagttagtgggtggtcgtgtgttcatgtaaattaatttgaggtcaggttaccatcagattaaggtga 19861735  T
Q  157 aagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttat 256  Q
    | |||||||||||||||||||| || || || |  || ||||| || ||||| ||||| || ||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  19861734 aggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattatgagtataaggtaatgcccttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttat 19861635  T
Q  257 ggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgct 356  Q
    | ||||||||||  | || |||||||| | | |||||  ||| || |||||||| || ||||||||  | ||||| || |||| |||||||||||||||     
T  19861634 gaagtatatgaacagaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgatatcctaatttattctaagaatgaagaagaacatgca 19861535  T
Q  357 gagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggcc 456  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||| | |||||  | |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |  || || |||||||||||||    
T  19861534 gagcatctgaagattgagttgcaagtgttgaaataaaagaagttgtatgccaagttgtccaaatgtgaattttggttaagtgaagtaagttttcttggcc 19861435  T
Q  457 atgttatttctg 468  Q
    || |||||||||    
T  19861434 atattatttctg 19861423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 312 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 19114834 - 19114672
Alignment:
Q  312 atcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaat 411  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  19114834 atcgacgatattttgatttactccaagaccgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaat 19114735  T
Q  412 tgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  19114734 tgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggtgatg 19114672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 26 - 468
Target Start/End: Original strand, 21323630 - 21324071
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    ||||||||| || || || || ||||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||||   ||||| || || |||||     
T  21323630 tcagttgaataaagttacaataaagaataggtatccacttccgaggattgacgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaagtttttagtaagattgac 21323729  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||| |||| || |||||||| || || |||||||||||||||||||| || || || |  || ||||| || || || || || || |||||||    
T  21323730 ttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattacgagtacaatgtgatgcctt 21323829  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| |   |||||  |||||| |||||||| |||||||| ||| |    
T  21323830 tcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggataaattcgtggttgtgtttatcgatgacattct 21323929  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
    ||| || || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||  | ||||| || ||||| || |||||     
T  21323930 gatctattcaaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtgttgcaaattttgaaagagaa-aagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgag 21324028  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    |||||||| |  || |||||||||||||||||  |||||||||    
T  21324029 ttctggttaagtgaagtgagttttcttggccacattatttctg 21324071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 26 - 433
Target Start/End: Original strand, 16269575 - 16269982
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    ||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||||     |||| || || ||||||    
T  16269575 tcagttgaacaaggttacgataaagaacaggtatccgcttccgagaattgacgatttgatggatcagttggttggtgctaagatttttagtaagattgat 16269674  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||| || || || |  ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  16269675 ttgaggtctagttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 16269774  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | |||||||| || |  ||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||| |||||   || || || |||||||| |||||||| ||    
T  16269775 tcggtgttactaacgggcctggtgtgtttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgttcattgatgatatctt 16269874  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
    |||||| ||||||| |||||| || ||||| ||||| ||||  ||||| |||||||||||||| || ||||   | ||||| || ||||| ||||||||     
T  16269875 gatttattccaagaatgaagaggagcatgcagagcacctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgcaaagttgtcaaaatgtgag 16269974  T
Q  426 ttctggtt 433  Q
    ||||||||    
T  16269975 ttctggtt 16269982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 30 - 474
Target Start/End: Original strand, 31569198 - 31569641
Alignment:
Q  30 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttga 129  Q
    |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||| | |||||||| |||||||| ||| |||||||||||   || ||||| || ||||| ||||    
T  31569198 ttgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttgatggaccagctagtgggtgcaaaggtgttcagtaagattgacttga 31569297  T
Q  130 ggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttgg 229  Q
    ||||| |||| || || ||||| || || ||||| |||||||||||||| || || || |  || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||    
T  31569298 ggtca-gttaccatcaaattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcgg 31569396  T
Q  230 tgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatt 329  Q
    |||||| || || || || ||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||| |||||  |||||| || || || || ||||||||| |||||    
T  31569397 tgttactaacgcgcccggtgtgttcatggagtatatgaatcgaatttttcatgcttttctggataaattcgtggtggtatttattgatgatattctgatt 31569496  T
Q  330 tactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattct 429  Q
    || || |||||||||||||| ||||| || |||||||  |||||  ||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||| || |    
T  31569497 tattcgaagactgaagaagagcatgcagaacatctgagaattgtgctgcaagttttgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcgaaatgtgagtttt 31569596  T
Q  430 ggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    || | |  || |||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||    
T  31569597 ggctaagtgaagtgagtttccttggtcatattatttctggtgatg 31569641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 26 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 20390516 - 20390090
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    ||||||||| || || || || || |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||    
T  20390516 tcagttgaataaagtgacgataaataataggtatccacttccgagaattgatgattttatggatcagttagtgggttcacgtgtgtttagcaagattgat 20390417  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || || || || |  || ||||| || ||  |||||||||| ||| |||    
T  20390416 ttgaggtcgggttaccatcagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaaaacggcctttaggacacgatatggacattacaaatataaagtgatgtctt 20390317  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | |||||||| ||||  ||||             ||  |||||| | || |||||||| || |||||||| || || |||||||| || ||||| || ||    
T  20390316 tcggtgttactaatgtgcctg-------------gtgcatgaatagaattttccatgctttcttggatcggtttgtggttgtgtttattgatgacatctt 20390230  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||| || || ||  | |||||||| ||||| |||| ||||    
T  20390229 gatttattctaagactgaagaagagcatgcggagcatttaaagattgtgttgcaagtgttgaaggaaaaaaagttgtatgccaagttgtccaaatttgaa 20390130  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttattt 465  Q
    |||| ||| |  || |  ||||||||||||||| ||||||    
T  20390129 ttctagttaagtgaagcaagttttcttggccatattattt 20390090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 29 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 22989472 - 22989275
Alignment:
Q  29 gttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttg 128  Q
    |||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| || ||||| |||||||||    
T  22989472 gttgaataaagtaacgataaagaataggtatccacttccaataattgatgacttgatggatcagttagtggctgcaagtgtgtttagcaagattgatttg 22989373  T
Q  129 aggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    || ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  | |||||||||||||| ||||||||    
T  22989372 agatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaatacagctttcagaacgcgttatgggtattatgaatataaagtgatgccttt 22989275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 27 - 179
Target Start/End: Original strand, 21781539 - 21781691
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| || ||||    
T  21781539 cagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttccgaggattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagatagatt 21781638  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagaca 179  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21781639 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagaca 21781691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 26 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 22053293 - 22052851
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    |||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| | || ||||||    ||||||  || |||||     
T  22053293 tcagttgaacaaagttacaataaagaacaggtatccgcttccgagaattgatgacttgatggatcagctggttggtgcaaagattttcaataagattgac 22053194  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||  |||| || || ||||| || || |||||||||||||||||||| || || || |  ||||||||||| || |||||  | || |||||||    
T  22053193 ttgaggtctggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgaataccaggtgatgcctt 22053094  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||| |||||   || || | ||| ||||| ||||||||  |    
T  22053093 tcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaatttttcatgcctttctggataagtttgtgggtgtattcattgatgatatcct 22052994  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
     ||||| || ||||||||||| || ||||| || ||||||| |||||| ||||||||  |||||||||| ||  | ||||| || ||||  |||||||||    
T  22052993 aatttattctaagactgaagaggagcatgcagaacatctgaggattgtattgcaagtactgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgttgaaatgtgaa 22052894  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    |||||||| |  || |||||||||||||||||  |||||||||    
T  22052893 ttctggttaagtgaagtgagttttcttggccacattatttctg 22052851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 48 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 19984588 - 19984401
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttgaggtcaagttatcaccaga 147  Q
    ||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||    
T  19984588 aagaataggtatccacttctgaggattgatgatttaatggatcagttagtgggtgcacgtgtgttcagtaaaattgatttgaggtcaggttaccatcaga 19984489  T
Q  148 ttaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttac 235  Q
    |||| || || ||||| |||||||||||||| || || || |  || |||||||| |||||||| || || |||||||| ||||||||    
T  19984488 ttaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattatgaataaaaggtgatgcctttcggtgttac 19984401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 26 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 4984472 - 4984065
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    |||||||||||| || || |||||||| | |||||| |||||  ||||||| || |||||||||||||| || |||||     |||| || || ||||||    
T  4984472 tcagttgaacaaagttacgatcaagaacaagtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagatttttagtaagattgat 4984373  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||| || || || |  ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  4984372 ttgaggtctggttatcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 4984273  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | ||||| || || || ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| | |||   || || || ||||||||  ||||||  ||    
T  4984272 tcggtgtaactaaagcgcctggtgtttttatggagtacatgaatcgaatcttccatgcttttctagataagtttgttgtggtgttcattaatgatacctt 4984173  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
    |||||| |||||||  || ||||| ||||| ||||||||||  || || ||||||||||| || ||||||  | | ||||  || ||||| ||||||||     
T  4984172 gatttattccaagaacgaggaagagcatgcagagcatctgagaatagtattgcaagtgttaaaggagaagcgattgtatgttaagttgtcaaaatgtgag 4984073  T
Q  426 ttctggtt 433  Q
    ||||||||    
T  4984072 ttctggtt 4984065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 26 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 28983341 - 28982934
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||||| |||||  ||||||| || |||||||||||||| || |||||     ||||||| || ||||||    
T  28983341 tcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgccaagattttcagtaagattgat 28983242  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    |||||| |  ||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| || || || |  ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  28983241 ttgagggctggttatcatcagataaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 28983142  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||| |||||   || || || || || || ||||||||| |    
T  28983141 tcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgtggtggtatttattgatgatattct 28983042  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
     || || ||||||| ||| || || ||||| ||||||||||  || || |||||||||||||| || ||||   | ||||| || || ||  ||||||||    
T  28983041 aatctattccaagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaatagtgttgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttatcacaatgtgaa 28982942  T
Q  426 ttctggtt 433  Q
    ||||||||    
T  28982941 ttctggtt 28982934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 26 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 28988560 - 28988153
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||||| |||||  ||||||| || |||||||||||||| || |||||     ||||||| || ||||||    
T  28988560 tcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgccaagattttcagtaagattgat 28988461  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    |||||| |  ||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| || || || |  ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  28988460 ttgagggctggttatcatcagataaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 28988361  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||| |||||   || || || || || || ||||||||| |    
T  28988360 tcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgtggtggtatttattgatgatattct 28988261  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
     || || ||||||| ||| || || ||||| ||||||||||  || || |||||||||||||| || ||||   | ||||| || || ||  ||||||||    
T  28988260 aatctattccaagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaatagtgttgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttatcacaatgtgaa 28988161  T
Q  426 ttctggtt 433  Q
    ||||||||    
T  28988160 ttctggtt 28988153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 27356966 - 27356559
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    |||||||||||| ||  | || ||||| |||||||| |||||  ||||||| || |||||||||||||| || |||||     |||| || || |||||     
T  27356966 tcagttgaacaaagtttcgataaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagatttttagtaagattgac 27356867  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||  ||||  | ||||| || || || ||||| |||||||||||||| || || || |  || |||||||| || ||||| || || |||||||    
T  27356866 ttgagatctggttactatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctt 27356767  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||| |||||   || || || ||||| || |||||||| ||    
T  27356766 tcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtacatgaaccgaatcttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatctt 27356667  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
     ||||| ||||||| |||||| || ||||| ||||||||||  ||||| |||||||| || ||||||||||   | ||||| || ||||| ||||||||     
T  27356666 aatttattccaagaatgaagaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagttttaaaagagaagaggttgtatgcgaagttgtcgaaatgtgag 27356567  T
Q  426 ttctggtt 433  Q
    ||||||||    
T  27356566 ttctggtt 27356559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 109 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 6606005 - 6605681
Alignment:
Q  109 ttttcagcaaaattgatttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatga 208  Q
    ||||||| || ||||||||||||||  ||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||| || || || |  ||||||||||| || ||    
T  6606005 ttttcagtaagattgatttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacga 6605906  T
Q  209 atataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtg 308  Q
     || ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||| |||||   || || || ||     
T  6605905 gtacaaagtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggta 6605806  T
Q  309 ttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgcca 408  Q
    || || ||||||||||| || || ||||||| ||| || || ||||| ||||||||||  ||||| ||||| |||||||| || ||||   | ||||| |    
T  6605805 tttattgatgatattttaatctattccaagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaggtgttgaaggaaaagaggttgtatgcta 6605706  T
Q  409 aattgtctaaatgtgaattctggtt 433  Q
    | || || |||||||| ||||||||    
T  6605705 agttatcaaaatgtgagttctggtt 6605681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 27 - 467
Target Start/End: Original strand, 16875447 - 16875887
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||| ||||||   || || || || |||||||    
T  16875447 cagttgaacaaggtgacgattaagaattggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagttggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 16875546  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| | ||||| ||||||| |||||| |  ||||||||    || || || ||| ||| | | ||||| |||||||| |||   || ||||| ||    
T  16875547 tgagatcaggatatcatcagattagagtaaaggcagaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatt 16875646  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    ||| ||  | ||||| || || || |||||||| || |||||| | || || ||| | | | |||| || || || || |||||||| ||||||||||||    
T  16875647 tggagtatctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttg 16875746  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
     | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||  |  | | |||||| |||||||| ||||| |    
T  16875747 gtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagt 16875846  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttct 467  Q
    | |||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  16875847 tttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 16875887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 26 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 22373298 - 22373173
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    ||||||||| || || || || |||||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  22373298 tcagttgaataaagtgacgataaagaatagatatccacttccaagaattgatgatttaatggatcagttagtgggtgctcgtgtgttcagcaaaattgat 22373199  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaa 151  Q
    ||||||||| |||| || ||||||||    
T  22373198 ttgaggtcaggttaccatcagattaa 22373173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 219 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 22373168 - 22372954
Alignment:
Q  219 atgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatg 318  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||| | || |||||||| | | |||||  ||| || |||||||| |  ||||    
T  22373168 atgcctttgggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtacatgaattgaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttactgatg 22373069  T
Q  319 atattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaa 418  Q
    ||||  | ||||| || |||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||  | |||||||| | ||| ||    
T  22373068 atatcctaatttattctaagaatgaagaagaccatgcagagcatcttaagattgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagtggtccaa 22372969  T
Q  419 atgtgaattctggtt 433  Q
    ||||||||| |||||    
T  22372968 atgtgaattatggtt 22372954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 27 - 467
Target Start/End: Original strand, 21848689 - 21849129
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||| || || |||||| |||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||| |||| ||||||   || || || || |||||||    
T  21848689 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccatttccaaggattgatgatttgatggatcagctagttggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 21848788  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| | ||||| ||||||| |||||| |   |||||||    || || || ||| |||   | ||||| |||||||| |||   || ||||| ||    
T  21848789 tgagatcaggatatcatcagattagagtaaaggcgaaagatatatccaaaactgcgttccgaacaaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatt 21848888  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    ||| ||  | ||||| || || || |||||||| || |||||| | || || ||| | | | |||| || || || || |||||||| ||||||||||||    
T  21848889 tggagtatctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttg 21848988  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
     | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||  |  | | |||||| |||||||| || || |    
T  21848989 gtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgggagt 21849088  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttct 467  Q
    | |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  21849089 tttggttgaaggaagtgagttttcttggtcatgtgatttct 21849129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 26 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 22030533 - 22030470
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggat 89  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22030533 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggat 22030470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 26 - 241
Target Start/End: Original strand, 22061030 - 22061245
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    |||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||  | |||||||| || ||| ||||||| |||||||||   |||||||| || |||||     
T  22061030 tcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacttcccaggattgatgacttaatgaatcagttggtgggtgcaaaagttttcagtaagattgac 22061129  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||| |||| || |||||||| || || ||||| || ||||||||||  || || || |  || |||||||| |||||||| || || |||||||    
T  22061130 ttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggaaatgcagaagaaggcctttaggacacgatatggtcattatgaatacaaggtgatgcctt 22061229  T
Q  226 ttggtgttaccaatgc 241  Q
    | |||||||| |||||    
T  22061230 tcggtgttactaatgc 22061245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 192 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 14567406 - 14567165
Alignment:
Q  192 cgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttgg 291  Q
    ||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||| |||    
T  14567406 cgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaaggcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctgg 14567307  T
Q  292 atcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaaga 391  Q
    ||   || || || ||||| || |||||||| || ||||| ||||||| ||| || || |||||  |||| || || || || |||||||||||||| ||    
T  14567306 ataagtttgttgtggtgtttattgatgatatcttaatttattccaagaatgaggaggagcatgcaaagcacctaaaaatagtgttgcaagtgttgaagga 14567207  T
Q  392 gaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggtt 433  Q
     |||| | | ||||| || ||||| |||||||| ||||||||    
T  14567206 aaagagattgtatgcaaagttgtcgaaatgtgagttctggtt 14567165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 467
Target Start/End: Original strand, 20650707 - 20651147
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||| ||||||   || || || || |||||||    
T  20650707 cagttgaacaaggtgacaattaagaatcggtatccacttccgaggattgatgatttgatggatcaactagttggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 20650806  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| | ||||| || |||| |||||| |  ||||||||    || ||||| ||| ||| | | ||||| |||||||| |||   || ||||| ||    
T  20650807 tgagatcaggatatcatcaaattagagtaaaggcagaagatatatccaaaacagcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatt 20650906  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    ||| ||  | ||||| || || || || || |||||||||||| | || ||  || | | | |||| || || ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  20650907 tggagtatctaatgcgccaggtgtcttcatagagtatatgaatagaatattttatccttatctggaccgttttgtagtggtgttcatagatgatattttg 20651006  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
     | || || ||  |||| || || ||||| |||||| ||| |||||| |||||||| ||||| |||||  |  | | ||| || |||||||| |||||      
T  20651007 gtgtattcgaaatctgaggaggagcatgccgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaggagaaccagttatgtgctaagttgtctaagtgtgaga 20651106  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttct 467  Q
    | |||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  20651107 tttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 20651147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 173 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 19869976 - 19869823
Alignment:
Q  173 gaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgc 272  Q
    |||||| || |||||||  ||||||||||| ||||| |||  ||| ||||||||||| ||  |||| || || |||||||||||||||||||||||  |     
T  19869976 gaagactgccttcagaacccgttatggtcattatgagtattcagtgatgccttttggagtgtccaacgcgccaggagtgtttatggagtatatgaacaga 19869877  T
Q  273 atcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    || |||||| | | ||| ||||  ||||| || || ||||| ||||||||||||    
T  19869876 attttccatccgtatttagatcagttcgttgtagtattcattgatgatattttg 19869823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 27 - 150
Target Start/End: Original strand, 23155394 - 23155517
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||| | || ||||||   || || || || |||||||    
T  23155394 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccgcttctgaggattgatgatttgatggatcagctggttggtgcagaagtgtttagtaagattgatt 23155493  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagatta 150  Q
    |||| ||| | ||||| |||||||    
T  23155494 tgagatcaggatatcatcagatta 23155517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 27 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 16414520 - 16414455
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcag 92  Q
    ||||||||||| || || || |||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  16414520 cagttgaacaaagtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcag 16414455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 92
Target Start/End: Original strand, 21194892 - 21194957
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcag 92  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||||| |||| | | ||||||||||| |||||||||    
T  21194892 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccgcttctgaggattgatgatttaatggatcag 21194957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 357; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 474
Target Start/End: Original strand, 37731 - 38179
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  37731 tcagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggattagttagtgggtgcacatgttttcagcaagattgat 37830  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37831 ttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcggtatggtcactatgaatataaagttatgcctt 37930  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  37931 tcggtgttacgaatgcacctggagtgtttatggagtatataaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgcggttgttttcatcgatgatatttt 38030  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||     
T  38031 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgag 38130  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38131 ttctggttgaaagaggtaagttttcttggccatgttatttctggtgatg 38179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 27 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 23099 - 22661
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| | || | || ||||| |||||||    
T  23099 cagttgaataaagtaacgataaagaataggtatccacttccaagaatagatgatttgatggatcagttagtgggtgaatgtctgtttagcaagattgatt 23000  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||  | || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || || || |  |||||||| || || ||||||   || ||||||||    
T  22999 tgagatcgggctaccaccagattaaagtgaaagacgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggacattacgaatattcggtgatgccttt 22900  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     | |||||| | ||| || || |||||||||||||| |||||||| || || ||||| | ||||||||  ||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  22899 cgttgttacaactgcgccaggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatttttcatgcgtatttggatcacttcgtggttgtgttcatcaatgatattttg 22800  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    || ||||| ||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| || |||||  | |||||||| ||||| || ||||| |    
T  22799 atatactctaagtctgaagaagaacacactgagcatttgaagattgttttgcaagtgccgaaggaaaagaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgagt 22700  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttattt 465  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||||||||||    
T  22699 tctggttgaatgaggtaagttttcttggccatgttattt 22661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 354; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 468
Target Start/End: Original strand, 107723 - 108164
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||    
T  107723 cagttgaacaagataactatcaagaataggtatccacttccgagaatggatgatttgatggatcagttagtgggtgcaagagttttcagcaagattgatt 107822  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  107823 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaggatatgtagaagatagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 107922  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  107923 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgagtcgcatcttccatgcgtttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 108022  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  108023 atttactccaagattgaagaggaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgaat 108122  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  108123 tctggttgaaagaggtaagttttcttggccatgttatttctg 108164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 24 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 114956 - 114512
Alignment:
Q  24 catcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattg 123  Q
    ||||||||||| || || || || ||||| || ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||| || ||||||    |||| || |||||||    
T  114956 catcagttgaataaagttacgataaagaacagatatcctcttccgagaattgacgacctgatggatcagttggttggtgcaaagatttttagtaaaattg 114857  T
Q  124 atttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcc 223  Q
    | ||| ||||| |||| || ||||| || || ||||||||||| ||||||||||| || || || |  || |||||||| || |||||||| || |||||    
T  114856 acttgtggtcaggttaccatcagatcaaggtgaaagatgaagacatgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcc 114757  T
Q  224 ttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatt 323  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||| | || || ||||| |   |||||  ||| || ||||| ||||| ||||| |||    
T  114756 tttcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggaatatatgaatagaatttttcatgcttacctggataaatttgtggttgtattcattgatgacatt 114657  T
Q  324 ttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtg 423  Q
    ||||| || || |  ||||| ||||| ||||| || ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| || || |    
T  114656 ttgatctattcaagaactgaggaagagcatgcagaacatctgatgattgtattgcaagtattgaaagagaagaaattgtatgccaaattgtcgaagtgcg 114557  T
Q  424 aattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    | |||||||| || || |||||||||||||||||| |||||||||    
T  114556 agttctggttaaatgaagtgagttttcttggccatattatttctg 114512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 26 - 266
Target Start/End: Original strand, 94805 - 95045
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    |||||||||||| || || || |||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| || |||||    ||||| ||||| |||||     
T  94805 tcagttgaacaaagttacaataaagaatagatatccacttccgcggattgatgacttgatggaccagttggtaggtgctaaagtttttagcaagattgac 94904  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||  |||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |  || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  94905 ttgaggtcgggttaccatcagattaaagtgaaggatgaagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcactacgaatacaaagtgatgcctt 95004  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatg 266  Q
    | |||||||| || || || || ||||| ||||||||||||    
T  95005 tcggtgttactaacgcgccgggtgtgttcatggagtatatg 95045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 349; Significance: 0; HSPs: 6)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 474
Target Start/End: Original strand, 11150 - 11598
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||    
T  11150 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 11249  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11250 ttgagatcagggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaactttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 11349  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  11350 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcctttttggatcggttcgtggtggtgtttatcgatgatatttt 11449  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  11450 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaattttatgctaaattgtctaagtgtgaa 11549  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11550 ttctggttgaaggaagtaagttttcttggccatgttatttctggtgatg 11598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 31273 - 30829
Alignment:
Q  30 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttga 129  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  31273 ttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagatatgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattaatttga 31174  T
Q  130 ggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttgg 229  Q
    | | | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |     
T  31173 gattaggttatcaccagatcaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatacaaagttatgcctttcga 31074  T
Q  230 tgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatt 329  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||    
T  31073 tgttatgaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcagttcgtggttgttttcatcgaagatattttaatt 30974  T
Q  330 tactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattct 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||    
T  30973 tactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaggtgttaaaagaaaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgagttct 30874  T
Q  430 ggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30873 ggttgaaagaggtcagttttcttggccatgttatttctggtgatg 30829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 30 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 36739 - 36294
Alignment:
Q  30 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttga 129  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  36739 ttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagatttgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattaatttga 36640  T
Q  130 ggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttgg 229  Q
    | | | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |     
T  36639 gattaggttatcaccagatcaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatacaaagttatgcctttcga 36540  T
Q  230 tgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatt 329  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || || ||||| || || ||||||||||| |||    
T  36539 tgttatgaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatctttttgtggttgtttttattgatgatatttttatt 36440  T
Q  330 tactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattct 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||    
T  36439 tactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaggtgttaaaagaaaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgagttct 36340  T
Q  430 ggttgaaagacgtga-gttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    |||||||||| || | ||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  36339 ggttgaaagaggtaaggttttgttggccatgttatttctggtgatg 36294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #4
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 27 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 54029 - 53638
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| || ||||    
T  54029 cagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttccgaggattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagatagatt 53930  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || ||||||| |||||| || ||||||||||||||    
T  53929 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttctgaacacggtatggtccctatgagtacaaagttatgccttt 53830  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||  ||||||||||||    
T  53829 cggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcacatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgttttcaatgatgatattttg 53730  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaa 418  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  53729 atttactccaagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaa 53638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #5
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 252 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 50259 - 50044
Alignment:
Q  252 tttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaac 351  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  50259 tttatggagtacatgaatcacatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgttttcaatgatgatattttgatttactccaagtctgaagaagaac 50160  T
Q  352 atgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttct 451  Q
    ||| ||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||| | |||||    
T  50159 atgttgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaagtgcgaattttggttgaaagaagtgggctttct 50060  T
Q  452 tggccatgttatttct 467  Q
    ||| ||||||||||||    
T  50059 tggacatgttatttct 50044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #6
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 26 - 104
Target Start/End: Original strand, 13805 - 13883
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgca 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13805 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgca 13883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 348; Significance: 0; HSPs: 5)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 463
Target Start/End: Original strand, 85709 - 86144
Alignment:
Q  28 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgattt 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  85709 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttacgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagtaagattgattt 85808  T
Q  128 gaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttt 227  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  85809 gagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttt 85908  T
Q  228 ggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttga 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||||    
T  85909 ggtgttaccaatgcacctggagtgtttatagagtaaatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgttttcatcgatgacattttga 86008  T
Q  328 tttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaatt 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  86009 tttactccaagactgaagaagaacatattgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaggagaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgaatt 86108  T
Q  428 ctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttat 463  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  86109 ctggttgaaagaggtaagttttcttggccatgttat 86144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Original strand, 85142 - 85581
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||| || ||||    
T  85142 cagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttacgaggattgatgatttgatggatcagttagtgggtacaaaagttttcagcaagatagatt 85241  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  85242 tgagataaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacacggtatggtcactatgagtacaaagttatgccttt 85341  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||     
T  85342 cggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttagatcggttcgtggttgtttttattgatgatatttta 85441  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||    
T  85442 atttcctccaagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagcttgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaagtgcgaat 85541  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttc 466  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  85542 tctggttgaaagaagtgagctttcttggacatgttatttc 85581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 27 - 169
Target Start/End: Original strand, 132401 - 132543
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    ||||||||||| ||  | || |||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| | || ||||||   || || || || |||||||    
T  132401 cagttgaacaaagtggcgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctggttggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 132500  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatat 169  Q
    |||| ||| | ||||| ||||||| |||||| | |||||||||    
T  132501 tgagatcaggatatcatcagattagagtaaaggctgaagatat 132543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 345 - 467
Target Start/End: Original strand, 132719 - 132841
Alignment:
Q  345 gaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtga 444  Q
    ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||  |  | | ||| || |||||||| ||||| || |||||||| || ||||    
T  132719 gaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagttttgaaagagaaccagttatgtgctaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtga 132818  T
Q  445 gttttcttggccatgttatttct 467  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||    
T  132819 gtttccttggtcatgtgatttct 132841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #5
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 306 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 25941 - 25853
Alignment:
Q  306 gtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaa 394  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || ||  |||| |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||  ||||| |||||    
T  25941 gtgttcatagatgatattttggtatattcgaaatctgaggaagaacatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagatttgaaggagaa 25853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 345; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 16553 - 16113
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||    
T  16553 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 16454  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16453 ttgaggtcaggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagttttcagaacgcgttgtggtcactatgaatataaagttatgcctt 16354  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||    
T  16353 tccgtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttattgacgatatttt 16254  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||    
T  16253 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaaatttatgctaacttgtctaagtgtgaa 16154  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttc 466  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  16153 ttctggttgaaagaattaagttttcttggccatgttatttc 16113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 2816 - 2375
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  2816 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggattagttagtgggtgaacgtgtttttagcaagattgatt 2717  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2716 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagttttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 2617  T
Q  227 -tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
      ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  2616 ccggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtggttgtgtttatcgacgatatttt 2517  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaatt-gtctaaatgtga 424  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || || |||||| |||||    
T  2516 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaataacctttatgctaacttggtctaagtgtga 2417  T
Q  425 attctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttc 466  Q
    |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  2416 attctggttgaaagaattaagttttcttggccatgttatttc 2375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 345; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 58410 - 57962
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  58410 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcaattagtgggtgcaaaagtttttagcaagattgat 58311  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  58310 ttgaggtcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcggtatggtcactatgaatataaagttatgcctt 58211  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  58210 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggattatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcagttcgtagttgtgtttatcgatgacatttt 58111  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  58110 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgtgcatctgaagattgtcttccaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 58011  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  58010 ttctggttgaaagaggtaagttttcttggccatgttatttctggtgatg 57962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 72 - 468
Target Start/End: Original strand, 195444 - 195840
Alignment:
Q  72 attgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgc 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  195444 attgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatttgagatcgggttatcaccagattaagataaatgatgaagatatgc 195543  T
Q  172 agaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcg 271  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||    
T  195544 agaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcaccagaagtatttatggagtatatgaatcg 195643  T
Q  272 catcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagatt 371  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  195644 catcttccatgcatttctggatcgttttgtggttgtctttatcgatgatattttgatttactccaagtctgaagaagaacatgctgagcatctgaaggtt 195743  T
Q  372 gtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||    
T  195744 gtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaactatctaagtgtgagttctggttgaaagaggtaagttttcttggccatgtcatttctg 195840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 24 - 474
Target Start/End: Original strand, 17975 - 18426
Alignment:
Q  24 catcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattg 123  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||    
T  17975 catcagttgaacaaagtaactatcaaaaataggtatccactaccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattg 18074  T
Q  124 atttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcc 223  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18075 atttgagatcatgttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagatatctttcagtacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcc 18174  T
Q  224 ttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatt 323  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||    
T  18175 tttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatgtagtacatgaatcgcatcttccaagcatttttggagcggttcgtggttgttttcattgatgacatt 18274  T
Q  324 ttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatct-gaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgt 422  Q
    || ||||||||||||  | |||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||    
T  18275 tt-atttactccaagtattaagaagaacatgctgaacatctaaaaaattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgt 18373  T
Q  423 gaattctggttgaaagacgtga-gttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    || |||||||||||||| || | ||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  18374 gagttctggttgaaagaggtaaggttttgttggccatgttatttctggtgatg 18426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 321; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 474
Target Start/End: Original strand, 54902 - 55350
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  54902 tcagttgaacaaagtaactatcaagaatagatatccacttccaagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgat 55001  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55002 ttgagatcaggttataaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacacgatatggtcactatgaatataaagttatgcctt 55101  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  || || ||||| ||  | |||||||||||    
T  55102 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtaattgaatcgcatcttccatgcatttttggatccctttgtggttgtttttctggatgatatttt 55201  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||     
T  55202 tatttactccaatactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtttaaagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgag 55301  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    |||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  55302 ttctggttgaaaaaggtaagttttcttggccatgttatttctggtgatg 55350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 28 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 110023 - 109584
Alignment:
Q  28 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgattt 127  Q
    ||||||||| ||| || || ||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  110023 agttgaacatggttacgataaagaacaggtatccgcttccgagaattgacgatttaatggatcagttagtgggtgcacgtgtgtttagtaaaattgattt 109924  T
Q  128 gaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttt 227  Q
    ||||||  |||| || |||||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||| || |  || |||||||| ||||||||||| || ||||||||     
T  109923 gaggtctggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcattatgaatataaggtgatgcctttc 109824  T
Q  228 ggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttga 327  Q
    |||||||| ||||  ||| | ||||||||||||| |||||| || || |||||||| | | | |||  ||| || |||||||| || ||||| ||  |||    
T  109823 ggtgttactaatgtgcctagtgtgtttatggagtctatgaaccgaattttccatgcctatctagataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcgtga 109724  T
Q  328 tttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaatt 427  Q
    |||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||| || ||    
T  109723 tttattctaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcaaaatgcgagtt 109624  T
Q  428 ctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttct 467  Q
    |||||| |  || || ||||||||||||||| ||||||||    
T  109623 ctggttaagtgaagtaagttttcttggccatattatttct 109584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 303; Significance: 1e-170; HSPs: 2)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 28 - 438
Target Start/End: Original strand, 51258 - 51668
Alignment:
Q  28 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgattt 127  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  51258 agttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgattt 51357  T
Q  128 gaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttt 227  Q
    ||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  51358 gagatcgggttatcaccagattaaggtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatacaaagtcatgcctttt 51457  T
Q  228 ggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttga 327  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  || || ||||| ||||||||||| |||||||    
T  51458 ggtgttaccaatgcacctcgagtatttatggagtatatgaatcgcatctttcatgcacttttggatcactttgtggttgttttcatcgatgacattttga 51557  T
Q  328 tttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaatt 427  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||| ||    
T  51558 tttactccaagactgaagaagaagatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaactatctaagtgtgagtt 51657  T
Q  428 ctggttgaaag 438  Q
    || ||||||||    
T  51658 ctagttgaaag 51668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 26 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 42091 - 41650
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    ||||||||| || || || || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||    
T  42091 tcagttgaataaagtgacgattaagaacaggtatccacttccgagaattgatgatttaatggatcagttagtgggtgctcgtgtgtttagtaaaattgat 41992  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||| |||| || |||||||| || || ||||| ||||||||||| || || || || |  ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  41991 ttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaatacggcctttaggacacgttatggtcactatgaatataaggtgatgcctt 41892  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||  | || || ||||| | | |||||  ||| || |||||||| || ||||| || ||    
T  41891 tcggagttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaacagaattttgcatgcttatatggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatctt 41792  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
     ||||| || |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||  | |||| |||  |||| || ||||||    
T  41791 aatttattctaagaatgaagaagagcatgcagagcatctgaagattgtgttgcaagtgttg-aagaaaagaagttgtatgacaagctgtccaagtgtgaa 41693  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    ||||||||    || || ||||||||||||||| |||| ||||    
T  41692 ttctggttacgcgaagtaagttttcttggccatattatatctg 41650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 289; Significance: 1e-162; HSPs: 2)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 30 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 36417 - 35973
Alignment:
Q  30 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttga 129  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |   ||||||||||| || |||||||    
T  36417 ttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttccgagaattaatgatttgatggatcagttagtgggttgaaaagttttcagcaagatagatttga 36318  T
Q  130 ggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttgg 229  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  36317 gatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcggtatggtcactatgagtataaagttatgcctttcgg 36218  T
Q  230 tgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatt 329  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||    
T  36217 tgttacgaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcacatctttcatgcatttttggatcgatttgtggttgttttcattgatgatattttaatt 36118  T
Q  330 tactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattct 429  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||    
T  36117 tactctaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttaatagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgagttct 36018  T
Q  430 ggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36017 ggatgaaagaagtaagttttcttggccatgttatttctggtgatg 35973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 30 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 20993 - 20549
Alignment:
Q  30 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttga 129  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |   ||||||||||| || |||||||    
T  20993 ttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttccgagaattaatgatttgatggatcagttagtgggttgaaaagttttcagcaagatagatttga 20894  T
Q  130 ggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttgg 229  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||| ||||||||| ||    
T  20893 gatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcggtatggtcactatgagtacaaagatatgcctttcgg 20794  T
Q  230 tgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatt 329  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||    
T  20793 tgttacgaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcacatctttcatgcatttttggatcgatttgtggttgttttcattgatgatattttaatt 20694  T
Q  330 tactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattct 429  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||    
T  20693 tactctaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttaagagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgagttct 20594  T
Q  430 ggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20593 ggatgaaagaagtaagttttcttggccatgttatttctggtgatg 20549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0055 (Bit Score: 280; Significance: 1e-156; HSPs: 1)
Name: scaffold0055
Description:

Target: scaffold0055; HSP #1
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 27 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 21639 - 21296
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  21639 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgtgtttttagcaagattgatt 21540  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21539 tgaggtcaggatatcaccagattaaagtaaaggatggagagatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggttactatgaatataaagttatgccttt 21440  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||    
T  21439 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 21340  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagat 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21339 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagat 21296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 278; Significance: 1e-155; HSPs: 1)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 27 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 3826 - 3385
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||     
T  3826 cagttgaacaaagtaacaataaagaataggtatccactttcgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaagtgttttcagcaagatagatc 3727  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  3726 tgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcagtatggacattatgagtataaagttatgccttt 3627  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||    
T  3626 cggtgttactaattcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcgttttgtggttgttttcattgatgatattttg 3527  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  3526 atttactccaactctgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaattgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgaat 3427  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3426 tctggttgaaagaagtgagttttcttggccatgttatttctg 3385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 271; Significance: 1e-151; HSPs: 5)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 27 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 41026 - 40588
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41026 cagttgaacaaagtaacaataaagaataggtatccacttccaagaactgatgacttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatt 40927  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||||    
T  40926 tgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagataaagatatgcagaagacagcttttagaatgcgatatggacattatgagtataaagtgatgccttt 40827  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||| ||||| |||||     
T  40826 cggtgttacaaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatttttcatgcatttttggatcgtttcgtggtttttttcattgatgacatttta 40727  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  40726 atttactccaagaccgaggaagatcatgctgagcatttgaagactgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgaat 40627  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttattt 465  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40626 tctggttgaaagaggtgagttttcttggccatgttattt 40588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 27 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 74746 - 74308
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  74746 cagttgaacaaagtaacaataaagaataggtatccacttccaagaactgatgacttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatt 74647  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||||    
T  74646 tgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagataaagatatgcagaagacagcttttagaatgcgatatggacattatgagtataaagtgatgccttt 74547  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||| ||||| |||||     
T  74546 cggtgttacaaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatttttcatgcatttttggatcgtttcgtggtttttttcattgatgacatttta 74447  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  74446 atttactccaagaccgaggaagatcatgctgagcatttgaagactgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgaat 74347  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttattt 465  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  74346 tctggttgaaagaggtgagttttcttggccatgttattt 74308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 48 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 56128 - 55708
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttgaggtcaagttatcaccaga 147  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  56128 aagaataggtatccacttccgagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtgtttaacaagattgatttgagatcgggttatcaccaga 56029  T
Q  148 ttaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctgg 247  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  56028 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaacttttagaacgcgatatggacattatgagtataaagtgatgcctttcggtgttacaaatgcccctgg 55929  T
Q  248 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaa 347  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  55928 agtgtttatggagtacatgaatcacatttttcatgcattttttgatcgtttcgtggttgttttcattgatgacattttgatttactccaagactgaggaa 55829  T
Q  348 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagtt 447  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  55828 gaacatgttgagcatttgaagactgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatcaaagtgtgaattctggttgaaagaggtgagtt 55729  T
Q  448 ttcttggccatgttatttctg 468  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  55728 ttcttggacatgttatttctg 55708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 467
Target Start/End: Original strand, 9017 - 9178
Alignment:
Q  306 gtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatg 405  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||  |  | | ||    
T  9017 gtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtattgaaagagaactagttatgtg 9116  T
Q  406 ccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttct 467  Q
      || || ||||| ||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  9117 ttaagttatctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 9178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #5
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 103
Target Start/End: Original strand, 8738 - 8814
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgc 103  Q
    |||||||||||  | ||||| |||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  8738 cagttgaacaatttgactattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagttggtgc 8814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 269; Significance: 1e-150; HSPs: 1)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 136 - 468
Target Start/End: Original strand, 23095 - 23427
Alignment:
Q  136 gttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttac 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  23095 gttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagcgttcagaacgcgttatggtcactatgagtacaaagttatgcctttcggtgttac 23194  T
Q  236 caatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactcc 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  23195 caatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcacatcttccatgcatttttggatcggttagtagttgtgtttatcgacgacattttgatttactcc 23294  T
Q  336 aagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttga 435  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  23295 aaaactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaactgtctaagtgtgaattctggttga 23394  T
Q  436 aagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23395 aagaagtgagttttcttggccatgttatttctg 23427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 2)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 27 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 17035 - 16594
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| || ||||    
T  17035 cagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttccgaggattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagatagatt 16936  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  16935 tgagatcaggttatcaccagattaaagtgaaaggtgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcggtatggtcattatgagtacaaagttatgccttt 16836  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||    
T  16835 cggtgttacaaatgcaccaggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcacttttggatcggttcgtggtggtttttatcgatgatattttg 16736  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||    
T  16735 atttactccaagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgtaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaattgcgaat 16636  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  16635 tctggttgaaagaagtgagctttcttggacatgttatttctg 16594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 48 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 12167 - 11746
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattga-tttgaggtcaagttatcaccag 146  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||| |||| || |||    
T  12167 aagaacaggtatccacttccgagaattgacgatttaatggatcaattagtgggtgcacgtgtgtttagtaaaattgaatttgaggtcaggttaccatcag 12068  T
Q  147 attaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctg 246  Q
    ||||| || || ||||| |||||||||||||| || || || |  ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  12067 attaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcactatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctg 11968  T
Q  247 gagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaaga 346  Q
    | ||||||||||||||||||||  | || || ||||| | | |||||  ||| || |||||||| || ||||||||  | ||||| || |||| ||||||    
T  11967 gtgtgtttatggagtatatgaacagaatttttcatgcctatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgatatcctaatttattctaagaatgaaga 11868  T
Q  347 agaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagt 446  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||  | |||    
T  11867 agagcatgcagagcatctgaagattgtattgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtccaaatgtgaattctggttgagtgaattaagt 11768  T
Q  447 tttcttggccatgttatttctg 468  Q
    |||||||||||| |||||||||    
T  11767 tttcttggccatattatttctg 11746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 27 - 468
Target Start/End: Original strand, 24857 - 25298
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |    
T  24857 cagttgaacaaaataacgataaagaataggtatccacttccgataattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaagtgttttcagcaagattgact 24956  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  24957 tgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgatgatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggacaatatgaatataaagtgatgccttt 25056  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| | || || || |||||||||    
T  25057 cggtgttacaaatgcacctgaagtgtttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcgtttcgtggttctttttattgacgatattttg 25156  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  25157 atttactccaagattgaggaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagataagaaactttatgctaaattatctaagtgtgaat 25256  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||    
T  25257 tctggttgaaagaattgagttttcttggatatgttatttctg 25298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 27 - 468
Target Start/End: Original strand, 6999 - 7440
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    ||||| ||||| || || || ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  6999 cagttaaacaaagtgacgataaagaataggtatccacttccaagaattgacgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtgtttagcaagattgatt 7098  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| || ||||| |||||||| ||| | ||    
T  7099 tgagatcaggttatcaccagattaaagtgaaagatggagatatgcagaagacaacttttagaacgcgttatggacattatgagtataaagtgatgtcgtt 7198  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||| ||||||    
T  7199 cggtgttacaaatgcacctggtgtgtttatggagtacatgaatcgaatctttcatgcatttttggatcgtttcatggttgtattcatcgatgacattttg 7298  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  7299 gtttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatttgaagactgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtcaaagtgtgaat 7398  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7399 tctggttgaatgaggtgagttttcttggccatgttatttctg 7440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 4)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 27 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 151504 - 151063
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| || ||||    
T  151504 cagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttccgaggattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagatagatt 151405  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  151404 tgagatctggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgagtacaaagttatgccttt 151305  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     |||||||  ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||| |||||||     
T  151304 cggtgttatgaatgcacttggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgtttttatcgataatatttta 151205  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || ||||    
T  151204 atttactccaagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggtgttgcaagtgttgaaagagaataagctttatgcgaaattgtctaagtgcgaat 151105  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||    
T  151104 tctggttgaaagaagtgagctttctaggacatgtaatttctg 151063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 27 - 467
Target Start/End: Original strand, 2417 - 2857
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  2417 cagttgaacaaagtaacgataaagaataggtatccacttccgagaattgatgacttgatggatgaattagtgggtgcacgtgtgtttagcaagattgatt 2516  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| || ||||| |||||||| |||||||     
T  2517 tgagatccggttatcaccatattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacggcttttagaacgcgttatggacattatgagtataaagtgatgccttc 2616  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    ||||||||| || || | ||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  2617 tggtgttacaaacgcgcttggtgtgtttatggagtacatgaatcgcatttttcatgcatttttggatcgtttcgtggttgtattcattgatgatattttg 2716  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||    
T  2717 atttactccaagtctgaggaagaacatgctgagcatttgaagactagtttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatcaaagtgtgaat 2816  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttct 467  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  2817 tctggttgaaagagatgagttttcttggccatgttatttct 2857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 98 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 87091 - 86722
Alignment:
Q  98 gggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttat 197  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||| || ||  | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || || || |  |||||     
T  87091 gggtgcacgtgtgttcagtaagattgatttaagatcgggctatcaccagatcaaagtgaaagatgaggatattcagaagacggcctttaggacacgttac 86992  T
Q  198 ggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgat 297  Q
    || || ||  |||||    | |||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||  || || ||||| | |||| ||||||    
T  86991 ggacattacaaatattcgatgatgcctttcggtgttactaacgcccctggagtgtttatggaatatatgaatcatatttttcatgcttatttgaatcgat 86892  T
Q  298 tcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaa 397  Q
    | || ||| |||| || ||||| ||| | || ||||| ||||| || || |||||||| |||||| | |||| ||| ||||||||| |||| ||||| ||    
T  86891 ttgttgttatgtttatagatgagattctaatatactctaagaccgaggaggaacatgccgagcat-ttaagaatgttttgcaagtgctgaaggagaataa 86793  T
Q  398 actttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
      | |||||| | || || || || |||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||    
T  86792 gttatatgcctagttatcgaagtgcgaattctggttgaacgaagtaagttttcttggccatattatttctg 86722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 434 - 474
Target Start/End: Original strand, 27725 - 27765
Alignment:
Q  434 gaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27725 gaaagaggtaagttttcttggccatgttatttctggtgatg 27765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 265; Significance: 1e-147; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 27 - 465
Target Start/End: Original strand, 691 - 1126
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  691 cagttgaataaggtaacaataaagaataggtatccacttccaagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgaacgtgttttcagcaagattgatt 790  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||| || ||||| ||    
T  791 tgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggacattatgagtataaggtgatgccgtt 890  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  891 cggtgttacaaatgcacctagagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcgtttcgtggttgttttcattgatgatattttg 990  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    |||||||||||| ||   |||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  991 atttactccaagtct---gaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaagtgtgaat 1087  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttattt 465  Q
    ||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  1088 tctggttgagagaagtgagctttcttggacatgttattt 1126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 2)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 27 - 468
Target Start/End: Original strand, 7571 - 8012
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||    
T  7571 cagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccactttcaagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaatgttttcagcaagatagatt 7670  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| || ||||| || ||||||||||||||    
T  7671 tgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagactgctttcagaacgggttatggacattatgagtacaaagttatgccttt 7770  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| || || ||||||||||||    
T  7771 cggtgttacaaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggttcatagttgtttttattgatgatattttg 7870  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | |||||    
T  7871 atttactccaagtctgaagaagaacatgttgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaagtatgaat 7970  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  7971 tctggttgaaaggagtgagctttcttggacatgttatttctg 8012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 27 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 3293 - 2852
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  3293 cagttgaataaagtgacgataaagaataggtacccacttccaagaattgatgatttgatggatcaattagtgggtgcacgtgtgtttagcaagattgatt 3194  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  || || || |  ||||| || || ||  |||||  ||| ||||||||    
T  3193 tgagatcgggctatcaccagattaaagtgaaagatgaggatatgcagaagatggcctttaggacacgttacggacattacaaatattcagtgatgccttt 3094  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     |||||||| |||||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3093 cggtgttactaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttggatcgtttcgtggttgtgttcatcgatgatattttg 2994  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    || || || ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||||  | |||||  ||||||| || |||||||    
T  2993 atataatctaagtctgaagaagaacatgctgaacatttgaagattattttgcaagtgctgaaagagaagaagttatatgctcaattgtcaaagtgtgaat 2894  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    |||||||||| || |||||||| | ||||||| |||||||||    
T  2893 tctggttgaatgaggtgagtttccgtggccatattatttctg 2852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0319 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 1)
Name: scaffold0319
Description:

Target: scaffold0319; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 28 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 1157 - 719
Alignment:
Q  28 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgattt 127  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||| || |||||    
T  1157 agttgaacaaggtgacaatcaagaataggtatccacttccgagtattgatgatttgatggatcagttggtgggtgcaaaagttttcagcaagatagattt 1058  T
Q  128 gaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttt 227  Q
    ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| || ||||| ||||| || ||||| ||     
T  1057 gagatc--gttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcggtatggccattatgagtataaggtgatgccgttc 960  T
Q  228 ggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttga 327  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  959 ggtgttacaaatgcgcctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgtttttatcgatgatattttga 860  T
Q  328 tttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaatt 427  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||    
T  859 tttacttcaagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaacctttatgcgaaattgtctaagggtgaatt 760  T
Q  428 ctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  759 ctggttgaaagaagtgagctttcttggacatgttatttctg 719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 27 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 8414 - 7973
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||    
T  8414 cagttgaataaagtgacaataaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaagtgttttcagcaagatagatt 8315  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  | ||||| ||||| || ||||| ||    
T  8314 tgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagttttcagaacgcgttatggagattatgagtataaggtgatgccgtt 8215  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||    
T  8214 cggtgttacaaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcgttttgtggttgttttcattgatgatattttg 8115  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  8114 atttactccatgtctgaagaagaacatgctaagcatttgaagctagttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaagtgtgaat 8015  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  8014 tctggttgaaagaagtgagctttcttggacatgttatttctg 7973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 24570 - 24506
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatca 91  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||    
T  24570 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccgcttccaaggattgatgatttgatggatca 24506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2004 (Bit Score: 260; Significance: 1e-144; HSPs: 1)
Name: scaffold2004
Description:

Target: scaffold2004; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 27 - 468
Target Start/End: Original strand, 725 - 1162
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || ||||    
T  725 cagttgaaaaaagtaacaataaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggattagttagtgggtgcaagtgttttcagcaagatagatt 824  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    ||||   ||||   ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  825 tgaga--aagtg--cagaagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagcttttagaacgcggtatggtcactatgaatataaagtgatgccttt 920  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  || || ||||| ||||| |||| |||||||    
T  921 cggtgttacaaatgcacctggagtgtttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcagtttgtggttgttttcatagatggtattttg 1020  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  1021 atttactccaagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattatctaagtgtgaat 1120  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  1121 tctggttgaaagaggtgagttttcttggacatgttatttctg 1162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0312 (Bit Score: 258; Significance: 1e-143; HSPs: 1)
Name: scaffold0312
Description:

Target: scaffold0312; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 27 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 453 - 12
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||| ||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| || ||||    
T  453 cagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatcaacttccaaggattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagatagatt 354  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||| || || |||||||||||    
T  353 tgagatcaggttatcaccatattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagccttcagaacgcggtatgctcactatgagtacaaggttatgccttt 254  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  253 cggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtacatgattcgcatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgttttcattgatgatattttg 154  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  153 atttactccaagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattatctaagtgtgaat 54  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  53 tctggttaaaagaagtgagctttcttgggcatgttatttctg 12  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 28 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 3974 - 3534
Alignment:
Q  28 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgattt 127  Q
    |||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  3974 agttgaacaaagtaacgataaaaaataggtatccacttccaagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagatagattt 3875  T
Q  128 gaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttt 227  Q
    ||| ||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||     
T  3874 gagatcgggttatcaccatattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagcttttagaacgcgttatggacactatgaatataaagtgatgcctttc 3775  T
Q  228 ggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttga 327  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  3774 ggtgttacaaatgcacctgctgtgtttatggagtacgtgaatcgcatttttcatgcatttttggatcgtttcgtggttgttttcattgatgacattttga 3675  T
Q  328 tttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaatt 427  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||| || ||||||||    
T  3674 tttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatttgaagactgttttggaagtgttgaaagagaaaaagttttatgctaaattgtcaaagtgtgaatt 3575  T
Q  428 ctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
     ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||    
T  3574 atggttgaaagaggtgagttttcttagacatgttatttctg 3534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 27 - 468
Target Start/End: Original strand, 13123 - 13564
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||    
T  13123 cagttgaacaaagtaacgataaagaataagtatccacttccaagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagaagaatagatt 13222  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||  |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  13223 tgagatcgggttatctccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaactttcagaacacggtatggtcactatgagtacaaagttatgccttt 13322  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||  || |  ||||||||||||    
T  13323 tggtgttacgaatgcacgtggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgatttaaaagatgatattttg 13422  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||    
T  13423 atttactccaagtctgaagaagaacatgatgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaagtgcgaat 13522  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  13523 tctggttaaaagaagtgagctttcttggacatgttatttctg 13564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1602 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 1)
Name: scaffold1602
Description:

Target: scaffold1602; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 49 - 468
Target Start/End: Original strand, 1 - 420
Alignment:
Q  49 agaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttgaggtcaagttatcaccagat 148  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||  |||||||||||||    
T  1 agaataggtatccacttccaagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcacgcgtgttcagcaagattgacttgagatcgggttatcaccagat 100  T
Q  149 taaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctgga 248  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| || ||||| ||||| || ||||| || |||||||| |||||||||||     
T  101 taaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagcttttagaacgtgttatggacattatgagtataacgtgatgccgttcggtgttacaaatgcacctggt 200  T
Q  249 gtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaag 348  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  201 gtgttgatggagtacatgaatcgcatttttcatgcatttttggatcgtttcgtggttgttttcattgatgacattttgatttactccaagactgaggaag 300  T
Q  349 aacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttt 448  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  301 aacatgctgagcatttgaagactgtgttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttt 400  T
Q  449 tcttggccatgttatttctg 468  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  401 tcttggccatgttatttctg 420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 250; Significance: 1e-139; HSPs: 2)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 27 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 8443 - 8002
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    ||||||||||||||  | || |||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||| || ||||    
T  8443 cagttgaacaaggtgtcaataaagaataggtatccactttcgaggattgatgatttgatggatcaattagtgggtgcaaaagttttcagcaagatagatt 8344  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  8343 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcagtatggtcactatgagtacaaagttatgccttt 8244  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||  |||| ||||| ||||||||||||    
T  8243 cggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtatatgaatcacatctttcatgcatttttggatcggttcgtgcttgttttcattgatgatattttg 8144  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    ||||||||||||  ||| |||||| ||| ||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||    
T  8143 atttactccaagtttgaggaagaatatgttgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaagtgcgaat 8044  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  8043 tctggttgaaagaagtgagctttcttggatatgttatttctg 8002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 27 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 17639 - 17198
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    ||||||||||||||  | || |||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||| || ||||    
T  17639 cagttgaacaaggtgtcaataaagaataggtatccactttcgaggattgatgatttgatggatcaattagtgggtgcaaaagttttcagcaagatagatt 17540  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  17539 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcagtatggtcactatgagtacaaagttatgccttt 17440  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |  |||| ||||| ||||||||||||    
T  17439 cggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtatatgaatcacatctttcatgcatttttggatcggttcttgcttgttttcattgatgatattttg 17340  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    ||||||||||||  ||| |||||| ||  ||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||    
T  17339 atttactccaagtttgatgaagaatattttgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaagtgcgaat 17240  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  17239 tctggttgaaagaagtgagctttcttggatatgttatttctg 17198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 250; Significance: 1e-139; HSPs: 1)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 27 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 20632 - 20191
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |    
T  20632 cagttgaacaaagtgacaataaagaataggtatccacttccaagaattgatgacttaatggatcagttagtgggtgctagtgttttcagcaagattgact 20533  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| || ||||| ||||| || ||||| ||    
T  20532 tgagatcaggttatcaacagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaactttcagaacgcggtatggacattatgagtataaggtgatgccgtt 20433  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||    
T  20432 cggtgttacaaatgcacctagagtgtttatggagtacatgaatcatatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgtttttattgatgatattttg 20333  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  20332 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatttgaagttggttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 20233  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    |||||||||||||  |||| |||||||| |||| ||||||||    
T  20232 tctggttgaaagaattgagctttcttggacatgctatttctg 20191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 27 - 467
Target Start/End: Original strand, 24445 - 24885
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  24445 cagttgaataaagtaacgataaagaataggtatccacttccaagaattgacgacttaatggatcaattagtgggtgcacgtgtgtttagcaagattgatt 24544  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  24545 tgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacggcttttagaacgcgttatggacattatgaatataaagtgatgccttt 24644  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     |||||||| ||||| || || |||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24645 cggtgttacaaatgcgccaggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatttttcatgcatttttggaacgtttcgtggttgtgttcatcgatgatattttg 24744  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||| || || |||||||    
T  24745 atatactcgaagactgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagttatatgctaaattatcaaagtgtgaat 24844  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttct 467  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  24845 tctggttgaaagaggtaagttttcttggccatgttatttct 24885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 26 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 150964 - 150522
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    |||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || || || |||||     
T  150964 tcagttgaacaaagttacaataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcagttagtgggtgcacgtgtatttagtaagattgac 150865  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||| |||| || |||||||| || || ||||| |||||||||||||| || || || |   | ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  150864 ttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacatgatatggacactatgaatataaagtgatgcctt 150765  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | |||||||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||| || || |||||||| |   |||||  |||| | ||||  || || ||||| |||||    
T  150764 tcggtgttactaatgcgcctagtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggataaattcatggttgaatttattgatgacatttt 150665  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||  | |||||||| ||||| || ||||||    
T  150664 gatttattctaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagtattgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtcaaagtgtgaa 150565  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    |||||||| |  || || ||||||||||||||  |||||||||    
T  150564 ttctggttaagtgaggtaagttttcttggccacattatttctg 150522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 360 - 468
Target Start/End: Original strand, 193949 - 194057
Alignment:
Q  360 catctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatg 459  Q
    ||||||| |||||| || ||||| |||||||| |||||    ||||| || ||||| || ||||| |||||||| |  || |||||||||||||||||      
T  193949 catctgaggattgtgttacaagttttgaaagaaaagaagtcgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaagtgagttttcttggccaca 194048  T
Q  460 ttatttctg 468  Q
    |||||||||    
T  194049 ttatttctg 194057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 247; Significance: 1e-137; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 108 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 8327 - 7961
Alignment:
Q  108 gttttcagcaaaattgatttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatg 207  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8327 gttttcagcaagattgatttgagatcagggtatcaccatattaaagtgaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgctttatggtcactatg 8228  T
Q  208 aatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgt 307  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||    
T  8227 aatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcacatcttccatgcctttttggatcggttcattgttgt 8128  T
Q  308 gttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgcc 407  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8127 gtttatcgacgatattttgatttacttcaaaactgaggaggaacatgctgaacatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgct 8028  T
Q  408 aaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||| | |||||||||||||||| |||||    
T  8027 aaattatctaaatgtgagttctggttgaaagaggtaagttttatgggccatgttatttctggtgatg 7961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 27 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 7615 - 7174
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||| |    
T  7615 cagttgaacaaagtaacgataaagaataggtatccacttccgaggattgatgacttgatggatcagttagtgggtgctaatgttttcagcaagattgact 7516  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||||| || ||||| ||||| || ||| | ||    
T  7515 tgagatcgggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagcgttcagaacgtggtatggacattatgagtataaggtgatgtcgtt 7416  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||    
T  7415 cggtgttacaaatgcacctagagtgtttatggagtacatgaatcgtatctttcatgcatttttagatcggttcgtggttgtttttattgatgatattttg 7316  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  7315 atttactccaagaccgaggaagaacatgttgagcatttgaagttggttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgcgaaattgtctaagtgtgaat 7216  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  7215 tctggttaaaagaagtgagttttcttggacatgttatttctg 7174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 245; Significance: 1e-136; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 27 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 8765 - 8326
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||| ||||| || || |||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||| |||||| || ||||    
T  8765 cagttgaaaaaggtgacaataaagaataggtattcacttccgaggattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttt-cagcaagatagatt 8667  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  8666 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacatctttcataacgcgttatggtcactatgagtacaaagttatgccttt 8567  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  8566 cggtgttacgaatgcacctgtagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcgtttcgtggttgtttttatcgatgatattttg 8467  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    |||||||||||| || | ||||||||| |||||||| ||||| | || ||||||||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||||| || ||||    
T  8466 atttactccaagtctaaggaagaacattctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagaaaagaagcattatgcgaaattgtctaagtgcgaat 8367  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttct 467  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  8366 tctggttgaaagaagtgagctttcttggacatgttatttct 8326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1423 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 1)
Name: scaffold1423
Description:

Target: scaffold1423; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 27 - 468
Target Start/End: Original strand, 1294 - 1735
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    ||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||| || | ||    
T  1294 cagttaaacaaggtgacaataaagaaaaggtatccacttccgaggattgatgattttatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagatagctt 1393  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| || ||||| || ||||||||||||||    
T  1394 tgagatcgggttatcaccatattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcagtatggccattatgagtacaaagttatgccttt 1493  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||| | ||||| ||||| ||||||||||||    
T  1494 cggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcacatctttcatgcatttttggattggttcatggttgttttcattgatgatattttg 1593  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  1594 atttactccaagtctgaagaagaacatgttgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaagtgtgaat 1693  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||    
T  1694 tctggttgaaagaagtgagctttcttgtacatgttatttctg 1735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0501 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 1)
Name: scaffold0501
Description:

Target: scaffold0501; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 141 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 4474 - 4141
Alignment:
Q  141 caccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatg 240  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4474 caccagattaaggtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcaaaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatg 4375  T
Q  241 cacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagac 340  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || || ||||| || || ||||||||| ||||||||| |||||     
T  4374 cacttggagtgtttatggagtatatgaatcgtatcttccatgcatttttggatggctttgtggttgtttttattgatgatattctgatttacttcaagaa 4275  T
Q  341 tgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||     
T  4274 tgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgagttctggttgaaagag 4175  T
Q  441 gtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    || |||||||||||||||||||||| || |||||    
T  4174 gtaagttttcttggccatgttatttttggtgatg 4141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 30 - 468
Target Start/End: Original strand, 14394 - 14832
Alignment:
Q  30 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttga 129  Q
    ||||| || ||||| || |||||||  |||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  14394 ttgaataaagtaacgataaagaataaatatccacttccaagaattaatgattttatggatcagttagtgggtgcacgtgtgttcagcaagattgatttga 14493  T
Q  130 ggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttgg 229  Q
    | ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||    
T  14494 gatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagactgcttttagaacacgttatggacattatgaatataaagtgatgcctttcgg 14593  T
Q  230 tgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatt 329  Q
    |||||| ||||| || || |||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||     
T  14594 tgttacaaatgcgccaggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatttttcatgcatttttggatagtttcgtggttgtgttcatcgacgatattttgata 14693  T
Q  330 tactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattct 429  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||  | ||||| |||||||| || ||||||||||    
T  14694 tactccaagattgaagaagaacatgttgagcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagttatatgctaaattgtcaaagtgtgaattct 14793  T
Q  430 ggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14794 agttgaaagaggtgagttttcttggccatgttatttctg 14832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 3)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 27 - 465
Target Start/End: Original strand, 18253 - 18691
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||| || ||||    
T  18253 cagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttctgaggattgatgatttgatggatcagttagtgagtgcaaaagttttcagcaagatagatt 18352  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||    
T  18353 tgagatcaggttatcactagattatagtaaaagatgaagatatgcagaagacaactttcagaacgcggtatgatcactatgagtacaaagttatgccttt 18452  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  18453 cggtgttacgaatgcacctagagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcagttcgtggttgtttttatcgatgatattttg 18552  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    |||||| |||||  |||||||||||||| ||||||| ||||| | || ||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||| || ||||    
T  18553 atttaccccaagtttgaagaagaacatgatgagcatttgaagctggttttgcaagtgttaaaagagatgaagctttatgcgaaattgtctaagtgcgaat 18652  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttattt 465  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  18653 tctggttgaaagaagtgagctttcttggacatgttattt 18691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 22 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 22273 - 22002
Alignment:
Q  22 atcatcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaat 121  Q
    |||||||||||||||| || || || ||||| || |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| ||||||| |   ||||| || || ||    
T  22273 atcatcagttgaacaaagttacgataaagaacagatatccacttccgaggattgatgacttgatggaccagttggtgggtgaaaaagtttttagtaagat 22174  T
Q  122 tgatttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatg 221  Q
     || ||||||||| |||| || || ||||| || || ||||| |||||||||||||| || || || |  || |||||||| ||||| || || || |||    
T  22173 cgacttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattatgagtacaaggtgatg 22074  T
Q  222 ccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 293  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  22073 cctttcggtgttactaacgcacctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 22002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 39447 - 39307
Alignment:
Q  30 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttga 129  Q
    |||||||| || || || ||||| ||||||||||||||| | |||||||| || ||||| ||||| |||||||||   ||||| || || || || ||||    
T  39447 ttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttcatggaccagttggtgggtgcaaaagtttttagtaagatcgacttga 39348  T
Q  130 ggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatg 170  Q
    ||||| |||| || || ||||| || || ||||||||||||    
T  39347 ggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaagatatg 39307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 238; Significance: 1e-131; HSPs: 1)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 27 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 18042 - 17607
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||    
T  18042 cagttgaacaaagtaacaataaagaataggtatccacttccaataattgatgacttgatggatcagttggtgggtg-acgtgttttcagcaagatagatt 17944  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||| || ||||| ||||| || ||||||||    
T  17943 tgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaacttttagaacgcggtatggacattatgagtataaggtgatgccttt 17844  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||  |||||     ||    
T  17843 cggtgttacaaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcgtttcgtggttgttttcaatgatga-----tg 17749  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  17748 atttacttcaatactgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaatctttatgctaaattatctaagtgtgaat 17649  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17648 tctggttgaaagaagtgagttttcttggccatgttatttctg 17607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 238; Significance: 1e-131; HSPs: 4)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 39 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 4296 - 3867
Alignment:
Q  39 gtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttgaggtcaagtt 138  Q
    ||||| || |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||||| || ||  |||    
T  4296 gtaacgataaagaataggtatccgcttccaagaattgatgatttgatggatcattttgtgggtgcacgtgtgtttagcaagattgatttaagatcgggtt 4197  T
Q  139 atcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaa 238  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||| | || |||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||    
T  4196 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacggcttttagaacacgttatagacattatgaatataaagtgatgtctttcggtgttacaaa 4097  T
Q  239 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaag 338  Q
    | | || || |||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  4096 tacgccaggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatttttcatgcatttttggatcgtttcgtggttgtgttcatcgacgatattttgatatactccaag 3997  T
Q  339 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaag 438  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  3996 actgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgtattgcaagtgctgaaagagaagaagctatatgctaaattgtcaaagtgtgaattctggttgaaag 3897  T
Q  439 acgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3896 aggtgagttttcttggcaatgttatttctg 3867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 26 - 468
Target Start/End: Original strand, 40244 - 40686
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||||| |||||  ||||||| || |||||||||||||| || |||||     | || || || ||||||    
T  40244 tcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagatatttagtaagattgat 40343  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||  ||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| || || || |  ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  40344 ttgaggtctggttatcatcagataaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 40443  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||| |||||   || || || ||||| || |||||||||||    
T  40444 tcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatttt 40543  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
     || || ||||||| ||| || || ||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||| || ||||   | ||||| || || || ||||||||     
T  40544 aatctattccaagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttatcaaaatgtgag 40643  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    |||||||| || || || |||||||| || ||  |||||||||    
T  40644 ttctggttaaatgaagtaagttttctgggtcacattatttctg 40686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 30 - 268
Target Start/End: Original strand, 45342 - 45580
Alignment:
Q  30 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttga 129  Q
    |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||| || || ||||| ||||    
T  45342 ttgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtttttagtaagattgacttga 45441  T
Q  130 ggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttgg 229  Q
    ||||| |||| || |||||||| || || ||||| |||||||||||||  || || || |  || |||||||| || ||||| || || |||||||| ||    
T  45442 ggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagatggcctttaggacacgatatggtcattaagaataaaaggtgatgcctttcgg 45541  T
Q  230 tgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaa 268  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  45542 tgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaa 45580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 341 - 468
Target Start/End: Original strand, 45626 - 45752
Alignment:
Q  341 tgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 440  Q
    ||||||||| |||||  | |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||  | |||| | ||||||| || ||||| |||||||| |  ||     
T  45626 tgaagaagagcatgcaaaacatctgaagattgtgttacaagttttgaaagagaagaagttgtatg-ctaattgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaa 45724  T
Q  441 gtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    || ||||||||||||||  |||||||||    
T  45725 gtaagttttcttggccacattatttctg 45752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 92 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 31274 - 30898
Alignment:
Q  92 gttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatg 191  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| || ||| |||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31274 gttagtgggtgcaagtgttttcagcaagatagatctgagatcgagttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacg 31175  T
Q  192 cgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttgg 291  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||    
T  31174 cggtatggccactatgaatataaagttatgcctttcggtgttacaaatgcacctagagtatttatggagtgcatgaatcgcatctttcatgcatttttgg 31075  T
Q  292 atcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaaga 391  Q
    |||| ||| | ||||| || || |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||    
T  31074 atcggttcatggttgtttttattgatgatattttgatttactccaagtcttaataagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaaga 30975  T
Q  392 gaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  30974 gaagaagctttatgttaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagctttcttggacatgttatttctg 30898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 48 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 51183 - 50763
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttgaggtcaagttatcaccaga 147  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| | ||| || || |||||||||||||||||| |||| || ||||    
T  51183 aagaataggtatccactttcgagaattgaagatttaatggatcagttagtgggtgctcttgtatttagtaaaattgatttgaggtcaggttaccatcaga 51084  T
Q  148 ttaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctgg 247  Q
    |||| || || ||||| ||||||| |||||| || || || |  || |||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  51083 ttaaggtgaaggatgaggatatgccgaagacggcctttaggacacgatatggtcattatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctgg 50984  T
Q  248 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaa 347  Q
     ||||||||||||||||||||| | || || ||||| | | |||||  |||  | |||||||| || ||||| || || ||||| || | ||||||||||    
T  50983 tgtgtttatggagtatatgaatagaatttttcatgcctatctggataaatttttggttgtgtttattgatgacatcttaatttattctatgactgaagaa 50884  T
Q  348 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagtt 447  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  | |||||||| ||||| ||||||||||||| ||| |  || || ||||    
T  50883 gagcatgcagagcatctgaagattgtattgcaagtgttgaaagataagaagttgtatgccaagttgtccaaatgtgaattcttgttaagtgaagtaagtt 50784  T
Q  448 ttcttggccatgttatttctg 468  Q
    ||||||||||| |||||||||    
T  50783 ttcttggccatattatttctg 50763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 228; Significance: 1e-125; HSPs: 3)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 79 - 424
Target Start/End: Original strand, 28446 - 28772
Alignment:
Q  79 atttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagac 178  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28446 atttaatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagac 28545  T
Q  179 agctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttc 278  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||                   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28546 agctttcagaacgcgttatggtcactatgaatacaaagttatgc-------------------acctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttc 28626  T
Q  279 catgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgc 378  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28627 catgcatttttggatcgtttcgtggttgtttttatcgacgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgc 28726  T
Q  379 aagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtga 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  28727 aagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgtga 28772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 318 - 474
Target Start/End: Original strand, 28774 - 28930
Alignment:
Q  318 gatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtcta 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  28774 gatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatcta 28873  T
Q  418 aatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    | ||| | || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28874 agtgtaagttatggttgaaagaggtaagttttcttggccatgttatttctggtgatg 28930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 26 - 58
Target Start/End: Original strand, 28406 - 28438
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggta 58  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28406 tcagttgaacaaagtaactatcaagaataggta 28438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 228; Significance: 1e-125; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 28 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 103618 - 103186
Alignment:
Q  28 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgattt 127  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||        ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  103618 agttgaacaaagtaacgataaagaataggtatccacttccgagaattgatg--------gatcaattagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgattt 103527  T
Q  128 gaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttt 227  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | ||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||     
T  103526 gagatcaggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagatggattttagaacgcgttatggacactatgagtataaagtgatgcctttc 103427  T
Q  228 ggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttga 327  Q
    |||||| | ||||| || || |||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||    
T  103426 ggtgttgcaaatgcgccaggtgtgtttatggagtgcatgaatcgcatttttcatgcatttttggatcgtttcgtggtagtattcatcgatgatattttga 103327  T
Q  328 tttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaatt 427  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||| || ||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||||||    
T  103326 tttactccaagtctgaggaagaacatgccgaacatttgaagactgttttgcaagtgctgaaagagaagaagctttatgctaaattatcaaagtgtgaatt 103227  T
Q  428 ctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  103226 ctgattgaaagaggtgagttttcttggccatgttatttctg 103186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 39 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 832 - 405
Alignment:
Q  39 gtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttgaggtcaagtt 138  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || |||||||| ||  |||    
T  832 gtaacaataaagaataggtatccacttccgagaattgataacttgatggatcagttagtgagtgcacgtgttttccgcaagatagatttgagatcgggtt 733  T
Q  139 atcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaa 238  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| |||||||  ||||| || ||||| ||||| || ||||||||  || |||| ||    
T  732 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatgtccagaagacagcttttagaatgcagtatggacattatgagtataaggtaatgcctttcagttttactaa 633  T
Q  239 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaag 338  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||| |||    
T  632 tgcacctggagtatttatggagtatatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcagttcgtagttgtttttatttatgatattttgatttactctaag 533  T
Q  339 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaag 438  Q
     ||||||||||||||  ||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||    
T  532 tctgaagaagaacat-atgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgcgaagttatctaactgtgaattttggttgaaag 434  T
Q  439 acgtgagttttcttggccatgttatttct 467  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||    
T  433 aggtaagttttcttggccatgttatttct 405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 3)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 27 - 468
Target Start/End: Original strand, 10653 - 11094
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  10653 cagttgaataaggtaacgataaagaataggtatccacttccaagaactgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtattcagcaagattgatt 10752  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || |  |||||||| || || ||||||  ||| ||||||||    
T  10753 tgagatcgggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggacattacgaatattcagtgatgccttt 10852  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     |||||||| ||||| || || ||||||||||||||  ||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||    
T  10853 cggtgttacaaatgcgccaggtgtgtttatggagtacttgaatcgtatttttcatgcgtatttagatcgcttcatggttgtgttcattgatgatattttg 10952  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||| || ||||| || ||||||     
T  10953 atatactctaagactgaagaagaacatgctgagcatttgaggattgtcttgcaagtgctgaaggagaagaagctttatgctaagttgtcaaagtgtgaac 11052  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  11053 tctggttgaatgaagtaagttttcttggccatgttatttctg 11094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 27 - 468
Target Start/End: Original strand, 24210 - 24651
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |    
T  24210 cagttgaataaggtaacgataaagaataggtatccacttccgagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtgtttagcaagattgact 24309  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| |   |||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| ||||  |||||| | |||||| |||||  ||| ||||||||    
T  24310 tgagattgggttatcactagattaaagtaaaagacgaggatatgcagaagacaacttttagaacacgttattgacactataaatattcagtgatgccttt 24409  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     |||||||| || || ||  | |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| | | | ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  24410 cggtgttacaaacgcgccaagtgtgtttatggagtacatgaatcgcatttttcatgcgtatctagatcgtttcgtggttgtgttcatcgacgacattttg 24509  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    || ||||| |||||||||||||||| || || |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||  | ||||| || ||||| ||||||||||    
T  24510 atatactctaagactgaagaagaacttgttgcgcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagttatatgctaagttgtcaaaatgtgaat 24609  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24610 tctggttgaatgaggtgagttttctaggccatgttatttctg 24651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #3
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 140 - 468
Target Start/End: Original strand, 16958 - 17286
Alignment:
Q  140 tcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaat 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || |  |||||||| || || ||||||  ||| |||||||| |||||||| |||    
T  16958 tcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggacattacgaatattcagtgatgcctttcggtgttacaaat 17057  T
Q  240 gcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaaga 339  Q
    || || || ||||||||||||||  ||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  17058 gcgccaggtgtgtttatggagtacttgaatcgtatttttcatgcgtatttagatcgcttcatggttgtgttcattgatgatattttgatatactctaaga 17157  T
Q  340 ctgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaaga 439  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||| || ||||| || |||||| |||||||||| ||    
T  17158 ctgaagaagaacatgctgagcatttgaggattgtcttgcaagtgctgaaggagaagaagctttatgctaagttgtcaaagtgtgaactctggttgaatga 17257  T
Q  440 cgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
     || |||||||||||||||||||||||||    
T  17258 agtaagttttcttggccatgttatttctg 17286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 27 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 495412 - 494978
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||| |||    
T  495412 cagttgaacaaagtaacgataaagaataggtatccacttccaagaattgatgacttgatggatcagttagtgggttcacgtgtgtttagcaatatttatt 495313  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  495312 tgagatctggttatcacctgattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacggcttttagaacacgttatggacattatgaatataaagtgatgccttt 495213  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     |||||||| ||||| || || |||||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||    
T  495212 cggtgttacaaatgcgccaggtgtgtttattgagtacatgaatcgtatttttcatgcgtttttggatcgttttgtggttgtgttcatcgacgatattttg 495113  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    || ||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||| || | ||| |    
T  495112 atatactcgaagtctgaagaagaacatgctgagtatttgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagctatatgctaaattgtcaaagtctgagt 495013  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgtt 461  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  495012 tctggttgaatgaggtgagttttcttggccatgtt 494978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 48 - 468
Target Start/End: Original strand, 453146 - 453566
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttgaggtcaagttatcaccaga 147  Q
    ||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||  |||| || ||||    
T  453146 aagaataggtatccacttccgaggatcgatgatttaatggatcagttagtgggtgctagtgtattcagcaaaattgatttgaggtcgggttaccatcaga 453245  T
Q  148 ttaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctgg 247  Q
    |||| || || ||||| |||||||||||||| || || |  |  || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  453246 ttaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaagacacgatatggacactatgaatataaagtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctgg 453345  T
Q  248 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaa 347  Q
     ||||||||||| |||||||| || || |||||||| | | |||||  ||| || |||||||| || ||||| || |||||||| |  ||||||||||||    
T  453346 tgtgtttatggaatatatgaaccgaattttccatgcctatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttatttgaagactgaagaa 453445  T
Q  348 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagtt 447  Q
    || ||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||  | |||| ||| ||||| |||||||| |||||||| |  || || || |    
T  453446 gagcatgcagaacatctgaagattgtattacaagtattgaaagagaagaagttgtatgtcaagttgtcaaaatgtgagttctggttaagtgaagtaagat 453545  T
Q  448 ttcttggccatgttatttctg 468  Q
    ||||||||||  |||||||||    
T  453546 ttcttggccacattatttctg 453566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 26 - 468
Target Start/End: Original strand, 515264 - 515706
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    ||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| || |||||     |||| || || |||||     
T  515264 tcagttgaacaaggttacgataaagaataggtatccgcttcctagaattgatgacttgatggatcagttggttggtgctaagatttttagtaagattgac 515363  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||  |||| || ||||| || || || ||||| |||||||||||||| || || || |  || |||||||| || || || ||||| |||||||    
T  515364 ttgaggtctggttaccatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgattacaaagtgatgcctt 515463  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | |||||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||| |||||   || || |||||||| || |||||||| ||    
T  515464 tcggtgttactaacgcgcctggtgtatttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgtcgttgtgtttattgatgatatctt 515563  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
     ||||| ||||||| |||||| ||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| || ||||| ||||||||     
T  515564 aatttattccaagaatgaagaggaacacgcagagcatctgagaattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaggttgtatgcaaagttgtcaaaatgtgag 515663  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    |||||||| |  || ||||||||||| || ||  |||||||||    
T  515664 ttctggttaagtgaagtgagttttctgggtcacattatttctg 515706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 27 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 17270 - 16830
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || || ||| |||    
T  17270 cagttgaataaagtaacgataaagaataggtatccacttccaagaattgatgatttgatggatcaattagtgggtgcacgtgtgtttagtaagattaatt 17171  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||  ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||| ||||  |||||||| || |||||||||  ||| || |||||    
T  17170 tgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagacgaggatatgcagaagacaacttttagaacacgttatggacattatgaatattcagtgat-ccttt 17072  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  17071 cggtgttaccaatgcgccaggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatttttcatgcgtatttagatcgcttcgtggttgtgttcatcgacgatattttg 16972  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| || ||| |||    
T  16971 atatactccaagactgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagttatatgccaaattgtcaaagtgtcaat 16872  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    |||| |||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||    
T  16871 tctgattgaaagaggtgagtgtttttggcaatgttatttctg 16830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 402 - 468
Target Start/End: Original strand, 111775 - 111841
Alignment:
Q  402 tatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  111775 tatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaggtgagttttcttggccatattatttctg 111841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 2)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 28 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 6264 - 5825
Alignment:
Q  28 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgattt 127  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||||    
T  6264 agttgaacaaagtaacgataaagaataggtatccacttccaagaattgatgacttgttggatcagttagtgagtgcacgtgtgtttagcaagattgattt 6165  T
Q  128 gaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttt 227  Q
    ||| ||  ||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||  |||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||     
T  6164 gagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatcaggatatgcagaagacgacttttagaatgcgttatggacattatgaatataaagtgatgtctttc 6065  T
Q  228 ggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttga 327  Q
    |||||||| ||||| || || ||||||||||| || |||||||| ||  | || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6064 ggtgttacaaatgcgccaggtgtgtttatggaatacatgaatcgtattattcaagcattttttgatcgcttcgtggttgtgttcatcgatgatattttga 5965  T
Q  328 tttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaatt 427  Q
    | ||||| ||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||  || ||| ||||    
T  5964 tatactcgaagtccgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgttttacaagtgttgaaagagaagaagctatatgctaaactgttaaagtgtaaatt 5865  T
Q  428 ctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttct 467  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  5864 ctggttgaaagaggtaagttttcttggccacgttatttct 5825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #2
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 28 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 13394 - 12955
Alignment:
Q  28 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgattt 127  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||||    
T  13394 agttgaacaaagtaacgataaagaataggtatccacttccaagaattgatgacttgttggatcagttagtgagtgcacgtgtgtttagcaagattgattt 13295  T
Q  128 gaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttt 227  Q
    ||| ||  ||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||  |||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||     
T  13294 gagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatcaggatatgcagaagacgacttttagaatgcgttatggacattatgaatataaagtgatgtctttc 13195  T
Q  228 ggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttga 327  Q
    |||||||| ||||| || || ||||||||||| || |||||||| ||  | || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13194 ggtgttacaaatgcgccaggtgtgtttatggaatacatgaatcgtattattcaagcattttttgatcgcttcgtggttgtgttcatcgatgatattttga 13095  T
Q  328 tttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaatt 427  Q
    | ||||| ||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||  || ||| ||||    
T  13094 tatactcgaagtccgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgttttacaagtgttgaaagagaagaagctatatgctaaactgttaaagtgtaaatt 12995  T
Q  428 ctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttct 467  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  12994 ctggttgaaagaggtaagttttcttggccacgttatttct 12955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 136 - 464
Target Start/End: Original strand, 6352 - 6680
Alignment:
Q  136 gttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttac 235  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||    
T  6352 gttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaactttcagaacgcggtatggtcactatgagtacaaagttttgcctttcggtgttac 6451  T
Q  236 caatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactcc 335  Q
     |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  6452 gaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcgtttttggatcggttcgtggttgtttttatcgatgatattttgatttactcc 6551  T
Q  336 aagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttga 435  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||    
T  6552 aagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaagtgcgaattctggttga 6651  T
Q  436 aagacgtgagttttcttggccatgttatt 464  Q
    |||| ||| | |||||||| |||||||||    
T  6652 aagaagtgtgctttcttggacatgttatt 6680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 2)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 28 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 5504 - 5065
Alignment:
Q  28 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgattt 127  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  5504 agttgaacaaagtaacgataaagaataggtatccacttcctataattgatgatttgttggatcagttagtgggtgcacgtgtgtttagcaagattgattt 5405  T
Q  128 gaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttt 227  Q
    ||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||  |||||||| |  |||||||||  ||| ||||||||     
T  5404 gagattgggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacggcctttagaacacgttatgggctttatgaatattcagtgatgcctttc 5305  T
Q  228 ggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttga 327  Q
    |||||||| ||||| || || ||||| ||| |||| |||||||| || || ||||| | ||||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||    
T  5304 ggtgttacgaatgcgccaggtgtgttcatg-agtacatgaatcgtatttttcatgcgtatttggatcgctttgtggttgtgttcattgacgatattttga 5206  T
Q  328 tttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaatt 427  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||  | ||||| || ||||| || ||||| ||    
T  5205 tatactccaagactgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagttatatgcaaagttgtcaaagtgtgagtt 5106  T
Q  428 ctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5105 ctggttgaatgaggtgagttttcttggccatgttatttctg 5065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 56 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 11486 - 11172
Alignment:
Q  56 gtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttgaggtcaagttatcaccagattaaagta 155  Q
    ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||||   ||||| || || ||||| ||||||||| |||| || | |||||| ||     
T  11486 gtatccacttccgaggattgatgacttgatggatcagttggtgggtgcaaaggtttttagtaagattgacttgaggtcaggttaccatctgattaaggtg 11387  T
Q  156 aaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgttta 255  Q
    || ||| | |||||||||||||| || || || |  || ||||| || || ||||| || || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  11386 aaggattaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcacctggtgtgttca 11287  T
Q  256 tggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgc 355  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| | |||||||  ||| || |||||||| || ||||||||| | ||||| || ||||||||||| || |||||    
T  11286 tggagtatatgaaccgaattttccatgcttctttggataaatttgtggttgtgtttattgatgatattctaatttattctaagactgaagaggagcatgc 11187  T
Q  356 tgagcatctgaagat 370  Q
     || |||||||||||    
T  11186 agaacatctgaagat 11172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 48 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 14841 - 14423
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttgaggtcaagttatcaccaga 147  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||  ||||||| ||| ||||||||| ||    
T  14841 aagaataggtatccacttccaagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtacacgtgtgtttagcaacatcaatttgagatcaggttatcacccga 14742  T
Q  148 ttaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctgg 247  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| ||||  |||||||| || |||||||||||||| |||||||| | |||||| || ||||||||    
T  14741 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacgacttttagaacacgttatggacattatgaatataaagtgatgcctttcgatgttacaaaggcacctgg 14642  T
Q  248 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaa 347  Q
     ||||||||||| || |||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||||    
T  14641 tgtgtttatggaatacatgaatcgaatttttcatgcgtttttggatcgtttcgtggttgtgttcatcgacgatattttgatatactcgaagtccgaagaa 14542  T
Q  348 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagtt 447  Q
    || |||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||| | |||||||| || ||||| ||||||||||| || || ||||    
T  14541 gagcatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagctatattctaaattgtcaaagtgtgagttctggttgaatgaggttagtt 14442  T
Q  448 ttcttggccatgttatttc 466  Q
    |||||||||||||||||||    
T  14441 ttcttggccatgttatttc 14423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 29 - 468
Target Start/End: Original strand, 15135 - 15574
Alignment:
Q  29 gttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttg 128  Q
    |||||| || ||||| || |||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||    
T  15135 gttgaagaaagtaacaataaagaataggtatacacttccaagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtgtttagcaagattgctttg 15234  T
Q  129 aggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttg 228  Q
    || ||  ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||   ||||| | || |||||||||||||| || ||||| |    
T  15235 agatcgggttatcatcggattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacggcttttagaacttgttatagacattatgaatataaagtgattcctttcg 15334  T
Q  229 gtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgat 328  Q
    ||||||| ||||| || ||  | ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  15335 gtgttacaaatgcgccaggtatctttatggagtacatgaatcgtatttttcatgcatttttggatcgtttcgtgattgtgttcatcgacgatattttgat 15434  T
Q  329 ttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattc 428  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||| ||  | ||||| |||||||| || |||||||||    
T  15435 atactccaagactgaagaagaacaagctgagcatttgaagattgttttgcaagtgctaaaagagaaaaagttatatgctaaattgtcaaagtgtgaattc 15534  T
Q  429 tggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  15535 tagttgaaagaggtgagttttcttggccatgtaatttctg 15574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 27 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 2993 - 2623
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || ||||    
T  2993 cagttgaacaaagtaacgataaagaataggtatccacttccatgaattgatgacttgatggatcagttagtggatgcacgtgttttcatcaagatagatt 2894  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  2893 tgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatccagaagacaccttttagaacgcgatatggacactatgaataaaaagtgatgccgtt 2794  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
      ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||| ||||| || || ||||||||||||    
T  2793 cagtgttacaaatgcacctcgagtgtttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttgaatcatttcgtggttgtttttattgatgatattttg 2694  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaa 397  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||| || ||||||||    
T  2693 atttactgcaagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttaaaggagaagaa 2623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 30 - 468
Target Start/End: Original strand, 217335 - 217773
Alignment:
Q  30 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttga 129  Q
    |||||||| || || || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||    
T  217335 ttgaacaaagtgacgataaagaataggtatccacttccaagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtgttttgcaagattgatttga 217434  T
Q  130 ggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttgg 229  Q
    | ||  ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||  | || ||||  |||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||    
T  217435 gatcgggttatcaccagattaaagtgaaagacgaggatatgcagaagacgtcctttagaacacgttatggacattatgaatataaagtgatgcctttcgg 217534  T
Q  230 tgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatt 329  Q
    |||||| ||||| || || |||||||||||||| |||||||  || || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||     
T  217535 tgttacaaatgccccaggtgtgtttatggagtacatgaatcatatttttcatgcgttttttgatcgtttcgtggttgtgatcattgatgatattttgata 217634  T
Q  330 tactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattct 429  Q
    ||||| |||   ||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||  |||||||| || ||||| ||||    
T  217635 tactcgaagttcgaagaagaacatgttgagcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagctatatgttaaattgtcaaagtgtgagttct 217734  T
Q  430 ggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
     |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  217735 agttgaatgaggtgagttttcttggccacgttatttctg 217773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1985 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold1985
Description:

Target: scaffold1985; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 182 - 474
Target Start/End: Original strand, 407 - 699
Alignment:
Q  182 tttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccat 281  Q
    ||||||||  || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  407 tttcagaacacggtatggtcactattaatataaagttatgcctttcggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatcttccat 506  T
Q  282 gcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaag 381  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  507 gcatttttggatcggttcttagttgtgttcatcgatgataatttgattgactccaagactaaagaagaacatgctgagcatttgaagattgtcctgcaag 606  T
Q  382 tgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  607 tgttaaaagagaagaaactttatgctaaattatcaaagtgtgagttctggctgaaagaagtaagttttcttggccatgttatttctggtgatg 699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0181 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0181
Description:

Target: scaffold0181; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 28 - 295
Target Start/End: Original strand, 29828 - 30095
Alignment:
Q  28 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgattt 127  Q
    |||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  29828 agttgaacaaagttagtatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagatagtgggtgcacaagttttcagcaagattgattt 29927  T
Q  128 gaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttt 227  Q
    ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29928 gagatcgggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagacatgtagaagacagctttcaaaacccgatatggtcactatgaatataaagttatgcctttt 30027  T
Q  228 ggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcg 295  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30028 ggtgttaccaatgcacctggagtaattatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcg 30095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0393 (Bit Score: 183; Significance: 9e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0393
Description:

Target: scaffold0393; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 27 - 248
Target Start/End: Original strand, 15906 - 16128
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15906 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatt 16005  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagt-aaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  16006 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcattatgaatataaggttatgcgtt 16105  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctgga 248  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  16106 ttggtgttaccaatgcacctgga 16128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 182; Significance: 3e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 27 - 468
Target Start/End: Original strand, 15890 - 16330
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  15890 cagttgaataaagtgacaataaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggattagttagtgggtgcacatgtgttcagcaagattgatt 15989  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||| ||||  |||||||| || ||||| |||  ||| ||||||||    
T  15990 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagacgaggatatgcagaagatggcttttagaaaacgttatggacattatgagtattcagtgatgccttt 16089  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     |||||||| || || || || ||||||||| |||| ||||||||||| || ||||| | | | ||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  16090 gggtgttacaaacgcgccaggtgtgtttatgtagtacatgaatcgcatttttcatgcgtatctagatcgtttcgtggttatattcatcgatgatattttg 16189  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    || ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||||| || ||||||||  | ||||| || ||||| || |||||||    
T  16190 atatactctaagactgaagaggaatatgctgagcatttgaagatt-ttttgcaagtgttcaaggagaagaagttatatgctaagttgtcaaagtgtgaat 16288  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    |||||||||| || || |||||||||| || |||||||||||    
T  16289 tctggttgaatgaggtaagttttcttgaccgtgttatttctg 16330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 178; Significance: 8e-96; HSPs: 3)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 39 - 468
Target Start/End: Original strand, 8958 - 9387
Alignment:
Q  39 gtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttgaggtcaagtt 138  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||  |||    
T  8958 gtaacgataaagaataggtatccacttccaaggatagatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgcgtgtttagcaagattgatttgagatcgggtt 9057  T
Q  139 atcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaa 238  Q
    ||||||||||||| || ||||| |  |||||| ||||||| ||||| || |  |||||||| || |||||||||  ||| |||||||| |||||||| ||    
T  9058 atcaccagattaaggtgaaagacggggatatggagaagacggcttttaggacacgttatggacattatgaatattcagtgatgcctttcggtgttacaaa 9157  T
Q  239 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaag 338  Q
    ||| || || |||||||||||||| |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||    
T  9158 tgcgccaggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatttttcatgcgtatttagatcgtttcgtggttgtgttcatggatgatattttgatatactctaag 9257  T
Q  339 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaag 438  Q
     ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||  | ||||||||  |||| || ||||||||||||||| | |    
T  9258 tctgaagaagaacatgttgagcatttgaggattgttttgcaagtgctgaaggagaagaagttatatgccaagctgtcaaagtgtgaattctggttggatg 9357  T
Q  439 acgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9358 aggtgagttttcttggccatgttatttctg 9387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 39 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 1414 - 1324
Alignment:
Q  39 gtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttga 129  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||    
T  1414 gtaacgataaagaataggtatccacttccaaggatagatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgcgtgtttagcaagattgatttga 1324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 39 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 6718 - 6628
Alignment:
Q  39 gtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttga 129  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||    
T  6718 gtaacgataaagaataggtatccacttccaaggatagatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgcgtgtttagcaagattgatttga 6628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0509 (Bit Score: 171; Significance: 1e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0509
Description:

Target: scaffold0509; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 26 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 11223 - 10781
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    ||||||||| || || || || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||     
T  11223 tcagttgaataaagtgacaataaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttaatggatcagttagtgggtgcacgcgtgttcaacaagattgac 11124  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||  |||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||| || || || |  |  || || || || |||||||||||||| |||||||    
T  11123 ttgaggtcgggttaccatcagattaaagtgaaagaaaaagatatgcagaaaacggcctttaagacacgatacgggcattatgaatataaagtgatgcctt 11024  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| | || |||||||| | |||||||| ||| ||||||||||| || ||||| || ||    
T  11023 tcggtgttaccaatgcgcctggtgtgtttatggagtacatgaatagaattttccatgcttatttggatcaatttgtagttgtgtttattgatgacatctt 10924  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||| | |||||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||||  | |||||||| ||||| |||||||||    
T  10923 gatttattctaagactgaagaagagcatacagagcatttaaagattgtattgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtccaaatgtgaa 10824  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    |||||||| |  || || ||||||||||||||| | |||||||    
T  10823 ttctggttaagtgaagtaagttttcttggccatatcatttctg 10781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 167; Significance: 3e-89; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 26 - 468
Target Start/End: Original strand, 201379 - 201821
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    ||||||||| || || || || || |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || || ||||| ||||||    
T  201379 tcagttgaataaagtgacgataaaaaataggtatccacttccgagaattgatgatttaatggatcagttagtgggtacacgagtgtttagcaagattgat 201478  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || || || || |  || ||||| || || ||||||  ||| |||||||    
T  201479 ttgaggtcgggttaccatcagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaaaacggcctttaggacacgatatggacattacgaatattcagtgatgcctt 201578  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | |||||||| ||  | || || |||||||||||||| |||||| | || |||||||| | ||||||||| || || |||||||| || |||||||||||    
T  201579 tcggtgttactaacacgccgggtgtgtttatggagtacatgaatagaattttccatgcttatttggatcggtttgtggttgtgtttattgatgatatttt 201678  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||| ||||| |||| |||||||||||||| || ||||| || |||||||||| ||| |||||||||    
T  201679 gatatactctaagactgaagaagaacatgcagaacatttgaaggttgtgttgcaagtgttgaaggaaaagaagctgtatgccaaatggtccaaatgtgaa 201778  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    |||||||| |  || || | ||||||||||||| |||||||||    
T  201779 ttctggttaagtgaagtaaattttcttggccatattatttctg 201821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 56 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 325069 - 324657
Alignment:
Q  56 gtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttgaggtcaagttatcaccagattaaagta 155  Q
    ||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||    ||||| || || ||||| || |||||| |||| || |||||||| ||     
T  325069 gtatccacttccgaggattgacgacttgatggatcagttagtgggtgcgaaggtttttagtaagattgacttaaggtcaggttaccatcagattaaggtg 324970  T
Q  156 aaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgttta 255  Q
    || |||||||||||||||||||| || || || |  || |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |    
T  324969 aaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgttca 324870  T
Q  256 tggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgc 355  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| | | |||||  |||||| ||||| || || ||||| ||| |||| || || | |||||||||||| ||||     
T  324869 tggagtatatgaaccgaattttccatgcctatctggataaattcgtggttgtatttattgatgacattctgatctattcaaggactgaagaagagcatgt 324770  T
Q  356 tgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggc 455  Q
     || |||||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||  | ||||| || | ||| || |||||||||||||| |  || || ||||||||||||    
T  324769 agaacatctgaagattgtattgcaaattttgaaagagaaaaagttgtatgctaagtcgtcgaagtgtgaattctggttaagtgaagtaagttttcttggc 324670  T
Q  456 catgttatttctg 468  Q
    ||  |||||||||    
T  324669 cacattatttctg 324657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 166; Significance: 1e-88; HSPs: 3)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 30 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 218 - 1
Alignment:
Q  30 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttga 129  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  218 ttgaacaatgtgactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagtttgtgggtgcacgcgttttcagcaagattgatttga 119  T
Q  130 ggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttgg 229  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  118 gatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagatttcagaacacggtatggtcactatgtatataaagttatgccttttgg 19  T
Q  230 tgttaccaatgcacctgg 247  Q
    ||||||||||||||||||    
T  18 tgttaccaatgcacctgg 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 26 - 457
Target Start/End: Original strand, 5262 - 5692
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    ||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||| | |||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  5262 tcagttgaacaaggttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcaattagtgggtgctcgtgtattcagcaagattgat 5361  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||| |||| || |||||||| || || ||||| |||||||||||||| || || || |  || |||||||||||||||||||| || |||| ||    
T  5362 ttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcactatgaatataaggtgatgcatt 5461  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | |||||||| |||||  |||  |||||||||||||||||||| || || |||||||| | | |||||  ||| || |||||||| || ||||| || ||    
T  5462 tcggtgttactaatgcgactgc-gtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatctt 5560  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||| ||||||||     
T  5561 gatttattcaaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtgttgcaagtgttgaaagagaagaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgag 5660  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttcttggcca 457  Q
    |||||||| |  || || ||||||||||||||    
T  5661 ttctggttaagtgaagtaagttttcttggcca 5692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #3
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 26 - 457
Target Start/End: Original strand, 9693 - 10123
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    ||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||| | |||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  9693 tcagttgaacaaggttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcaattagtgggtgctcgtgtattcagcaagattgat 9792  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||| |||| || |||||||| || || ||||| |||||||||||||| || || || |  || |||||||||||||||||||| || |||| ||    
T  9793 ttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcactatgaatataaggtgatgcatt 9892  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | |||||||| |||||  |||  |||||||||||||||||||| || || |||||||| | | |||||  ||| || |||||||| || ||||| || ||    
T  9893 tcggtgttactaatgcgactgc-gtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatctt 9991  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||| ||||||||     
T  9992 gatttattcaaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtgttgcaagtgttgaaagagaagaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgag 10091  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttcttggcca 457  Q
    |||||||| |  || || ||||||||||||||    
T  10092 ttctggttaagtgaagtaagttttcttggcca 10123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 163; Significance: 7e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 30 - 468
Target Start/End: Original strand, 5804 - 6242
Alignment:
Q  30 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttga 129  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||    
T  5804 ttgaataaagtaacgataaagaataggtatccacttccaagaattgacgacttgatggaccagttagtgggtgcacgtgtgtttagcaagattgacttga 5903  T
Q  130 ggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttgg 229  Q
    | ||  ||||||||||||||||||| || || ||  ||||||| ||||| ||||| ||||  ||  |||| || || ||||||   || |||||||| ||    
T  5904 gatcgggttatcaccagattaaagtgaaggacgacaatatgcaaaagacggcttttagaacacgacatggacattaggaatattcggtgatgcctttcgg 6003  T
Q  230 tgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatt 329  Q
    |||||| || || || || |||||||||||||| |||||||| || |||||||||| | | ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||     
T  6004 tgttacaaacgcgccaggtgtgtttatggagtacatgaatcgtattttccatgcatatctagatcgtttcgtggttgtgttcatcgacgatattttgata 6103  T
Q  330 tactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattct 429  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||  | ||||| || ||||| || ||||||||||    
T  6104 tactctaaggctgaagaagaacatgctgagcaattgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagttatatgctaagttgtcaaagtgtgaattct 6203  T
Q  430 ggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    ||||||| || || | ||||||||| |||||||||||||    
T  6204 ggttgaatgaggtcatttttcttggtcatgttatttctg 6242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 163; Significance: 7e-87; HSPs: 4)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 27 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 29016 - 28610
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  29016 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcagttagtgggtgctcgtgtattcaacaaaattgatt 28917  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| |||| || |||||||| || || ||||| |||||||||||||| || || || |  || |||||||| || |||||||| || ||||||||    
T  28916 tgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgccttt 28817  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     |||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||| || || |||||||| |   |||||  ||| || |||||||| || ||||| || |||    
T  28816 cggtgttactaatgcgcctggtgtgcttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttg 28717  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||  | | ||| || ||||| |||||||| |    
T  28716 atttattctaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaagatcgtcttgaaagtgttgaaagaaaagaagttgtctgcgaagttgtcaaaatgtgagt 28617  T
Q  427 tctggtt 433  Q
    |||||||    
T  28616 tctggtt 28610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 48 - 394
Target Start/End: Original strand, 50113 - 50459
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttgaggtcaagttatcaccaga 147  Q
    ||||| ||||||||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||| ||| |||||   ||||| || || || || ||||||||| |||| || || |    
T  50113 aagaacaggtatccactaccgaggattgatgacttgatggaccagttggtgagtgcaaaagtttttagtaagatcgacttgaggtcaggttaccatcaaa 50212  T
Q  148 ttaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctgg 247  Q
    |||| || || |||||||||||||||||||| || || || |  || ||||| || || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||  | || ||    
T  50213 ttaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcatttaggacacgatatggacattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacacgcccgg 50312  T
Q  248 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaa 347  Q
     ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||||  |||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||    
T  50313 tgtgttcatggagtatatgaaccgaatttttcatgcttttttggataaattcgtggttgtattcattgatgatattttaatttattctaagacggaagaa 50412  T
Q  348 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaa 394  Q
    || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  50413 gagcatgcggaacatctgaagattgtgttgcaagtgttgaaagagaa 50459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 48 - 394
Target Start/End: Original strand, 59147 - 59493
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttgaggtcaagttatcaccaga 147  Q
    ||||| ||||||||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||| ||| |||||   ||||| || || || || ||||||||| |||| || || |    
T  59147 aagaacaggtatccactaccgaggattgatgacttgatggaccagttggtgagtgcaaaagtttttagtaagatcgacttgaggtcaggttaccatcaaa 59246  T
Q  148 ttaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctgg 247  Q
    |||| || || |||||||||||||||||||| || || || |  || ||||| || || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||  | || ||    
T  59247 ttaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacacgcccgg 59346  T
Q  248 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaa 347  Q
     ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||||  |||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||    
T  59347 tgtgttcatggagtatatgaaccgaatttttcatgcttttttggataaattcgtggttgtattcattgatgatattttaatttattctaagacggaagaa 59446  T
Q  348 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaa 394  Q
    || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  59447 gagcatgcggaacatctgaagattgtgttgcaagtgttgaaagagaa 59493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #4
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 48 - 394
Target Start/End: Original strand, 65535 - 65881
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttgaggtcaagttatcaccaga 147  Q
    ||||| ||||||||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||| ||| |||||   ||||| || || || || ||||||||| |||| || || |    
T  65535 aagaacaggtatccactaccgaggattgatgacttgatggaccagttggtgagtgcaaaagtttttagtaagatcgacttgaggtcaggttaccatcaaa 65634  T
Q  148 ttaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctgg 247  Q
    |||| || || |||||||||||||||||||| || || || |  || ||||| || || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||  | || ||    
T  65635 ttaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcatttaggacacgatatggacattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacacgcccgg 65734  T
Q  248 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaa 347  Q
     ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||||  |||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||    
T  65735 tgtgttcatggagtatatgaaccgaatttttcatgcttttttggataaattcgtggttgtattcattgatgatattttaatttattctaagacggaagaa 65834  T
Q  348 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaa 394  Q
    || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  65835 gagcatgcggaacatctgaagattgtgttgcaagtgttgaaagagaa 65881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 162; Significance: 3e-86; HSPs: 3)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 267 - 468
Target Start/End: Original strand, 44795 - 44996
Alignment:
Q  267 aatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctga 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44795 aatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgaattaatcgaagatattttgatatactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctga 44894  T
Q  367 agattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttc 466  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44895 agattgtcttgcaaatgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgacttctggttgaaagaggtgagttttcttggccatgttatttc 44994  T
Q  467 tg 468  Q
    ||    
T  44995 tg 44996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 195 - 468
Target Start/End: Original strand, 8888 - 9161
Alignment:
Q  195 tatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatc 294  Q
    ||||| || ||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||| |||||    || |||||||| | | |||||     
T  8888 tatggacattatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatgaagtacatgaacttaattttccatgcttatctggata 8987  T
Q  295 gattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaa 394  Q
     ||| || || ||||| || |||||||| || ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||    
T  8988 aatttgtggtcgtgtttattgatgatatctttatttattctaagactgaagaagagcatgcagagcatctgaaaattatgttgcaagtgttgaaagaaaa 9087  T
Q  395 gaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    |||  | |||||||| ||||| |||||||||||||||||    || ||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  9088 gaagttgtatgccaagttgtccaaatgtgaattctggttatgtgaagtgtgttttcttcgccatattatttctg 9161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #3
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 48 - 181
Target Start/End: Original strand, 4822 - 4955
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttgaggtcaagttatcaccaga 147  Q
    |||||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| || | ||    
T  4822 aagaatagatatccacttctgagaattgatgatttaatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaatttatttgaggttaggttaccatctga 4921  T
Q  148 ttaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagc 181  Q
    |||| || || ||||||||||||||||| |||||    
T  4922 ttaaggtgaaggatgaagatatgcagaaaacagc 4955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0865 (Bit Score: 160; Significance: 5e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0865
Description:

Target: scaffold0865; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 26 - 457
Target Start/End: Original strand, 2183 - 2614
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    ||||||||| || || || || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||    
T  2183 tcagttgaataaagttacgataaagaacaggtatccacttccgagaattgatgatttaatggatcagttagtgggtgcttgtgtattcaacaaaattgat 2282  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||| |||| || |||||||| || || ||||| ||||||||||| ||  | || || |  || ||||| || |||||||||||||| |||||||    
T  2283 ttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaaaacgacctttaggacacgatatggacattatgaatataaagtaatgcctt 2382  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| | |||||||  ||| || |||||||| || ||||||||| |    
T  2383 tcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttatttggataaatttgtggttgtgtttattgatgatattct 2482  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
     ||||| || |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| | |||  | |||||||| |||||||||||||||    
T  2483 aatttattctaagaatgaagaagagcatgcagagcatctgaagattttgttgcaagtgtttaaagaaaggaagttgtatgccaagttgtctaaatgtgaa 2582  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttcttggcca 457  Q
    |||||||| |  || || ||||||||||||||    
T  2583 ttctggttaagtgaagtaagttttcttggcca 2614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 160; Significance: 5e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 26 - 457
Target Start/End: Original strand, 29196 - 29627
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    ||||||||| || || || || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||    
T  29196 tcagttgaataaagttacgataaagaacaggtatccacttccgagaattgatgatttaatggatcagttagtgggtgcttgtgtattcaacaaaattgat 29295  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||| |||| || |||||||| || || ||||| ||||||||||| ||  | || || |  || ||||| || |||||||||||||| |||||||    
T  29296 ttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaaaacgacctttaggacacgatatggacattatgaatataaagtaatgcctt 29395  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| | |||||||  ||| || |||||||| || ||||||||| |    
T  29396 tcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttatttggataaatttgtggttgtgtttattgatgatattct 29495  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
     ||||| || |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| | |||  | |||||||| |||||||||||||||    
T  29496 aatttattctaagaatgaagaagagcatgcagagcatctgaagattttgttgcaagtgtttaaagaaaggaagttgtatgccaagttgtctaaatgtgaa 29595  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttcttggcca 457  Q
    |||||||| |  || || ||||||||||||||    
T  29596 ttctggttaagtgaagtaagttttcttggcca 29627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 159; Significance: 2e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 26 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 2264 - 1822
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    ||||||||| || || || || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  2264 tcagttgaataaagtgacgataaagaataggtatccacttccgagaattgacgatttaatggatcaattagtgggtgcacgtgtgtttagtaaaattgat 2165  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||  |||| || |||||||| || || ||||| |||||||||||||| || || || |  ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  2164 ttgaggtctggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcactatgaatataaggtgatgcctt 2065  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | |||| ||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||||  | || |||||||| | | |||||  | | || |||||||| || ||||| || ||    
T  2064 tcggtgctactaatgcgcctagtgtgtttatggagtatatgaacagaattttccatgcttatctggataaaattgtggttgtgtttattgatgacatctt 1965  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
     ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||  | |||||||| ||||| |||||||||    
T  1964 aatttattctaagactgaagaagagcatgcagagcatctgaagattgtattgcaagtgttgaaagaaaataagttgtatgccaagttgtccaaatgtgaa 1865  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    || ||||| |  || || |||||||||| |||| |||||||||    
T  1864 ttttggttaagtgaagtaagttttcttgaccatattatttctg 1822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 156; Significance: 1e-82; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 237 - 468
Target Start/End: Original strand, 38070 - 38301
Alignment:
Q  237 aatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactcca 336  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  38070 aatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcgtttcgtggttgttttcattgatgatattttgatttactaca 38169  T
Q  337 agactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaa 436  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38170 agtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaa 38269  T
Q  437 agacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  38270 agaagtgagctttcttggacatgttatttctg 38301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 92
Target Start/End: Original strand, 41417 - 41482
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcag 92  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41417 cagttgaacaaggtgaccataaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcag 41482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 155; Significance: 4e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 48 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 49477 - 49067
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttgaggtcaagttatcaccaga 147  Q
    |||| |||||||||||||| | | || |||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || ||||    
T  49477 aagattaggtatccacttctgaggatcgatggtttaatggatcagttagtgggtgctcgtgtattcagcaaaattgatttgaggtcaggttaccatcaga 49378  T
Q  148 ttaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctgg 247  Q
    |||| || || ||||| |||||||||||||| || || || |  ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  49377 ttaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcactatgaatataaggtgatgcctttcggcgttactaatgcgcctgg 49278  T
Q  248 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaa 347  Q
     ||||||||||||||||||||    || |||||||| | | |||||  ||| || |||||||| || ||||| || |||||||| || ||||||||||||    
T  49277 tgtgtttatggagtatatgaacaaaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttattctaagactgaagaa 49178  T
Q  348 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagtt 447  Q
    || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  | |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |   | || ||||    
T  49177 gagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgagttctggttaagtcaagtaagtt 49078  T
Q  448 ttcttggccat 458  Q
    |||||||||||    
T  49077 ttcttggccat 49067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 153; Significance: 7e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 48 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 19725 - 19305
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttgaggtcaagttatcaccaga 147  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| || ||||    
T  19725 aagaataggtatccacttccgaggattgatgatctaatggatcaattagtgggtgctcgtgtgttcagcaagattgatttgaggtcaggttaccatcaga 19626  T
Q  148 ttaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctgg 247  Q
    |||| || || ||||| |||||||||||||| || || || |  ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  19625 ttaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcactatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctgg 19526  T
Q  248 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaa 347  Q
     ||||||||||||||||| ||    || |||||||| | | | |||  ||| || ||| |||| || ||||| || || ||||| || ||||| |||||     
T  19525 tgtgtttatggagtatataaacaaaattttccatgcttatctagataaatttgtggttatgtttattgatgacatcttaatttattctaagaccgaagag 19426  T
Q  348 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagtt 447  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  | |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |  || || ||||    
T  19425 gagcatgcagagcatctgaagattgtattgcaagtgttgaaagataagaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgaattctggttaagtgaagtaagtt 19326  T
Q  448 ttcttggccatgttatttctg 468  Q
    ||||||||||  |||||||||    
T  19325 ttcttggccacattatttctg 19305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 151; Significance: 1e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 26 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 24609 - 24167
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    |||||| ||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| | || ||||| || |||||     
T  24609 tcagttaaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgagaattgatgacttaatggatcagttagtgggtgcaagggtgttcagtaagattgac 24510  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| || || |  || ||||| || || ||||| || || |||||||    
T  24509 ttgaggtcaagttaccaccagattaaggtgaaggatgacgatatgcagaagacagcctttaggacacgatatggacattacgaatacaaggtgatgcctt 24410  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| | | |||||  ||| || |||||||| || ||||||||| |    
T  24409 tcggtgttactaatgcgcctggggtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttctctggataaatttgtggttgtgtttattgatgatattct 24310  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||  | ||||| || ||||| || |||||     
T  24309 gatttattctaagactgaagaggagcatgcagaacatctgaagattgtgttgcaagtattaaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgag 24210  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    |||||||| |  || || ||||||||||||||  |||||||||    
T  24209 ttctggttaagtgaagtaagttttcttggccacattatttctg 24167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 48 - 456
Target Start/End: Original strand, 44350 - 44758
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttgaggtcaagttatcaccaga 147  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||  |||| || ||||    
T  44350 aagaacaggtatccacttccgagaattgacgatttgatggatcagttagtgggtgctcgtgtgttcagtaaaattgatttgaggtcgggttaccatcaga 44449  T
Q  148 ttaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctgg 247  Q
    |||| || || ||||| |||||| ||||||| || || || |  ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  44450 ttaaggtgaaggatgaggatatggagaagacggcctttaggacacgttatggtcactatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctgg 44549  T
Q  248 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaa 347  Q
     ||||||||||||||||||||    || |||||||||| | |||||  ||| || |||||||| || ||||| || || ||||| || |||||| |||||    
T  44550 tgtgtttatggagtatatgaaaaaaattttccatgcatatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttaatttattctaagactaaagaa 44649  T
Q  348 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagtt 447  Q
    || ||| |  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||  | |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |  || || ||||    
T  44650 gagcatacaaaacatctgaagattgtattgcaagtattgaaagaaaataagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgaattttggttaagtgaagtaagtt 44749  T
Q  448 ttcttggcc 456  Q
    |||||||||    
T  44750 ttcttggcc 44758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 150; Significance: 4e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 27 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 5143 - 4702
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||| |    
T  5143 cagttgaataaggttacgataaagaacaggtatccacttccgagaattgacgatttaatggatcaattagtgggtgcacgtgtgtttagtaaaattgact 5044  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| |||| || |||||||| || || ||||| ||||||| |||||| || || ||    ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  5043 tgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgccgaagacggcctttaggtcacgttatggttactatgaatataaggtgatgccttt 4944  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| |   |||||  ||||||||||||||| || ||||| ||| ||    
T  4943 cggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcctacctggataaattcgtagttgtgtttattgatgacattctg 4844  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||  | ||||| || ||||| || ||||| |    
T  4843 atttattctaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtattacaagtattgaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcgaattgtgagt 4744  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    ||||||| |  || || ||||||||||||||  |||||||||    
T  4743 tctggttaagtgaagtcagttttcttggccacattatttctg 4702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Original strand, 42019 - 42458
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||| | | || || |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||   || ||||| |    
T  42019 cagttgaacaaagtgacaataaagaataggtatccacttctgaggatcgacgatttgatggatcagttagtgggtgcatttgtgttctttaagattgact 42118  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    | || ||| | ||||||||||| ||||| |||||||  ||||| |||||||| || || || |  | ||| |  || || ||||||   || ||||||||    
T  42119 taagatcaggctatcaccagatcaaagtgaaagatggggatattcagaagacggcctttaggacacattacgaacattacgaatattcggtgatgccttt 42218  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     |||||||| || || |  |||||||||||||| ||||||||||  || || ||||| | |||||||||||| ||  ||||||| || ||||||||| ||    
T  42219 cggtgttactaacgcgcaaggagtgtttatggaatatatgaatcatatttttcatgcttatttggatcgatttgtttttgtgtttatagatgatattctg 42318  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    || ||||||||||| || || |||||||| |||||| |||   |||| ||||||||| |||| ||||||||  | |||||||  || || || || ||||    
T  42319 atatactccaagaccgaggaggaacatgccgagcatttgagatttgttttgcaagtgctgaaggagaagaagttatatgccagtttatcgaagtgcgaat 42418  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttc 466  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| ||| |||||||    
T  42419 tctggttgaacgaagtgagttttcttggtcatattatttc 42458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 146; Significance: 1e-76; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 48 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 16485 - 16068
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttgaggtcaagttatcaccaga 147  Q
    ||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || || |||||| ||||||||||| |||| || ||||    
T  16485 aagaacaggtatccagttccgagaattgacgatttaatggatcagttagtgggtgcttgtgtgtttagtaaaatttatttgaggtcaggttaccatcaga 16386  T
Q  148 ttaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctgg 247  Q
    |||| || || ||||| ||| |||||||||| || || || |  ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  16385 ttaaggtgaaggatgaggatttgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcactatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctgg 16286  T
Q  248 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaa 347  Q
     ||||||||||||||||||||  | || |||||||| | | |||||  ||| || |||||||| || ||||| || || ||||| || | ||||||||||    
T  16285 tgtgtttatggagtatatgaacggaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttaatttattctacgactgaagaa 16186  T
Q  348 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagtt 447  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||   | |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |  || || ||||    
T  16185 gagcatgcagagcatctgaagattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgccaagttgtcaaaatgtgaattttggttaagtgaagtaagtt 16086  T
Q  448 ttcttggccatgttattt 465  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  16085 ttcttggccatattattt 16068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 467
Target Start/End: Original strand, 7768 - 8213
Alignment:
Q  22 atcatcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaat 121  Q
    |||| |||||||||||||| || || |||||| | |||||||||||  | ||||||||||||||||||||  | || ||||||   || || || || ||    
T  7768 atcaacagttgaacaaggtgacgattaagaatcgatatccacttccacggattgatgatttgatggatcaactggttggtgcagaggtgtttagtaagat 7867  T
Q  122 tgatttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatg 221  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||| |   |||||||    || || || ||| ||| | | ||||| |||||||| |||   || |||    
T  7868 tgatttgaggtcaggatatcatcagattagagtaaaggcgaaagatatatccaaaaccgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatg 7967  T
Q  222 ccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgata 321  Q
    || ||||| ||  | |||||||| || || |||||||| || |||||| | || || ||| | | | |||| || ||  | || ||||| || |||||||    
T  7968 ccatttggagtatctaatgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttttggtggtgtttatagatgata 8067  T
Q  322 ttttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatg 421  Q
    ||||  | || || ||| | || ||||| |||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||  |  | | ||| || |||||||| ||    
T  8068 ttttagtgtattcgaagtcggaggaagagcatgttgagcatctgaggattgtgttgcaagttttgaaagagaaccagttatgtgctaagttgtctaagtg 8167  T
Q  422 tgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttct 467  Q
    ||  || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  8168 tgtgttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 8213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 145; Significance: 4e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 266 - 474
Target Start/End: Original strand, 7844 - 8052
Alignment:
Q  266 gaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctg 365  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7844 gaatcgcatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgtttttgtcgacgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctg 7943  T
Q  366 aagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttattt 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||    
T  7944 aagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaactatctaagtgtgagttctggttgaaagaggtaagttttcttgcccatgttattt 8043  T
Q  466 ctgatgatg 474  Q
    ||| |||||    
T  8044 ctggtgatg 8052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 145; Significance: 4e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 48 - 468
Target Start/End: Original strand, 49808 - 50228
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttgaggtcaagttatcaccaga 147  Q
    ||||| ||||||| |||| || ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||| ||  |||    
T  49808 aagaacaggtatctactttcgagaattgacgatttcatggatcagttagtgggtgctcgtgtgttctgcaagattgatttgaggtcaggttaccattaga 49907  T
Q  148 ttaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctgg 247  Q
    |||| || || ||||| ||||||||||| ||  | || || |  || |||||||| ||||||||||| || |||||||| | |||||| ||||| |||||    
T  49908 ttaaggtgaatgatgaggatatgcagaatacgccctttaggacacgatatggtcattatgaatataaggtgatgcctttcgatgttactaatgcgcctgg 50007  T
Q  248 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaa 347  Q
     |||||||||||||||||||| || || |||||||| | | |||||  ||| || |||||||| || ||||| || || ||||| || ||||||||||||    
T  50008 tgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcctatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttaatttattctaagactgaagaa 50107  T
Q  348 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagtt 447  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||  | |||||||| ||||| ||||||||||||| ||| |  || || ||||    
T  50108 gagcatgcagagcatctgaagattgtgtttcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgaattcttgttaagtgaagtaagtt 50207  T
Q  448 ttcttggccatgttatttctg 468  Q
    ||||||||||| |||||||||    
T  50208 ttcttggccatattatttctg 50228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 144; Significance: 2e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 48 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 4552 - 4139
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttgaggtcaagttatcaccaga 147  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||| || || |||||||||||||||||  |||| || ||||    
T  4552 aagaacaggtatccacttccgagaattgacgatttaatggatcagtttgtgggtgcacctgtgtttagtaaaattgatttgaggtccggttaccatcaga 4453  T
Q  148 ttaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaa---gttatgccttttggtgttaccaatgcacc 244  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||||||| || || || |  ||||||||||| |||||||||||    || |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  4452 ttaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattatgaatataataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcc 4353  T
Q  245 tggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaa 344  Q
    ||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| | | |||||  ||| || |||||||| || ||| | || |||||||| |  |||||||||    
T  4352 tggtgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcctatctggataaatttgtggttgtgtttattgatcacatcttgatttattataagactgaa 4253  T
Q  345 gaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtga 444  Q
    ||||| |||||  | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |  || || |    
T  4252 gaagagcatgcataacatctgaagattgtattgcaagtgttgaaagagaagaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgaattttggttaagtgaagtaa 4153  T
Q  445 gttttcttggccat 458  Q
    ||||||| ||||||    
T  4152 gttttctgggccat 4139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 144; Significance: 2e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 26 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 33730 - 33287
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaa-gaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattga 124  Q
    ||||||||||||||| || || || ||| ||||||||||||||| | |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| || | ||| |||||    
T  33730 tcagttgaacaaggttaccattaaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcaattagtgggtgcacgtgtgtttaacaagattga 33631  T
Q  125 tttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcct 224  Q
     ||||||||| |||| || |||||||| || || ||||| |||||||||||||| || || || |  || ||||| || || |||||||| || ||||||    
T  33630 cttgaggtcaggttaccatcagattaatgtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattacgaatataaggtgatgcct 33531  T
Q  225 tttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattt 324  Q
    || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |  || |||||||| | |||||||  |||||| ||||||||||| ||||| || |    
T  33530 ttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaaccaaattttccatgcctatttggataaattcgtggttgtgttcattgatgacatct 33431  T
Q  325 tgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtga 424  Q
    ||||||| || |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||  | |||||||| ||||  ||||||||    
T  33430 tgatttattctaagactgaagaagagcatgcagaacatctaaagattgtattacaggtgttgaaagagaagaagttgtatgccaagttgttaaaatgtga 33331  T
Q  425 attctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
     |||| ||| |  || || ||||||||||||||  |||||||||    
T  33330 gttctagttaagtgaagtaagttttcttggccacattatttctg 33287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0993 (Bit Score: 143; Significance: 6e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0993
Description:

Target: scaffold0993; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 26 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 275 - 1
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| || |||    
T  275 tcagttgaaaaaagtaactataaagaataggtatccacttccaagaattgatgacttgatggatccgttagtgggtgcgcgtgttttcaacaagatagat 176  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||  |||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||| || ||||| ||||||||| |||||     
T  175 ttgagatcgggttatcactagattaaagtgaaggatgaagatatgcagaagacggcttttagaacgcggtatggacattatgagtataaagttttgcctc 76  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcg 300  Q
    |  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  75 tcagtgttacaaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcgtttcg 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 143; Significance: 6e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 73 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 10514 - 10284
Alignment:
Q  73 ttgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgca 172  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10514 ttgatgacttgatggatcagttagtgggtgcatgtgttttcagcaagatagatttgagatcaggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgca 10415  T
Q  173 gaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgc 272  Q
    |||||||||||| |||| |||  ||||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  10414 gaagacagcttttagaacgcgggatggtcattatgagtataaggtgatgcctttcggtgttacaaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgc 10315  T
Q  273 atcttccatgcatttttggatcgattcgtag 303  Q
    ||||| || |||||||||||||| |||||||    
T  10314 atctttcaagcatttttggatcggttcgtag 10284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 72 - 468
Target Start/End: Original strand, 1502 - 1898
Alignment:
Q  72 attgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgc 171  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||  | |||||||| || ||||| ||||||||| | || || ||||| || || || ||| | |||||||    
T  1502 attgatgacttgatggatcagctagtgggtgcgagggttttcagtaagattgacttgaggtcaggctaccatcagatcaaggtgaaggataaggatatgc 1601  T
Q  172 agaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcg 271  Q
    ||||||| || || || |  || |||||||| || |||||||| || ||| |||| | |||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  |    
T  1602 agaagactgcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgtctttcgttgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaacag 1701  T
Q  272 catcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagatt 371  Q
     || || ||||| |   |||||  ||| || ||| | ||||| ||||| ||| ||||| | || | ||| |||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  1702 aatttttcatgcctacctggataaatttgtggttctattcattgatgacattctgattaattcaaggacagaagaagagcatgcagaacatctgaagatt 1801  T
Q  372 gtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    || |||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |||||||||||||||||  |||||||||    
T  1802 gtattgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaagtgagttttcttggccacattatttctg 1898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 142; Significance: 3e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 48 - 465
Target Start/End: Original strand, 5022 - 5439
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttgaggtcaagttatcaccaga 147  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||| |||| || || |    
T  5022 aagaatagatatccacttccgagaattgatgatttaatggatcagttagtgggtgctcgtgtgttcagacaaattgatttgaggtcaggttaccatcaaa 5121  T
Q  148 ttaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctgg 247  Q
    |||| || || ||||||||||||||||| || || || || |  || ||||| || ||||| |||||  | ||| |||| |||||||| ||||| |||||    
T  5122 ttaaggtgaaggatgaagatatgcagaaaacggcctttaggacacgatatggacattatgagtataagatgatgtctttcggtgttactaatgcgcctgg 5221  T
Q  248 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaa 347  Q
     |||||||||||||| |||||| | || |||||||| | | |||||  ||| || |||||||| || ||||||||  | ||||| || |||| |||||||    
T  5222 tgtgtttatggagtacatgaatagaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgatatcctaatttattctaagaatgaagaa 5321  T
Q  348 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagtt 447  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  | |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |  |  || ||||    
T  5322 gagcatgcagagcatctgaagattgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtccaaatgtgaattttggttaagtggagtaagtt 5421  T
Q  448 ttcttggccatgttattt 465  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  5422 ttcttggccatattattt 5439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 139; Significance: 2e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 26 - 468
Target Start/End: Original strand, 13247 - 13689
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||||||| | |||||| | || |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||    
T  13247 tcagttgaataaggttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgataacttcatggatcatttagtgggtgctcgtgtgtttagcaagattgat 13346  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||| |||| || |||||||| || || ||||| |||||||||||||| || || || |   | ||||| || || |||||||| || |||||||    
T  13347 ttgaggtcaggttaccatcagattaatgtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacatgatatggacattacgaatataaggtgatgcctt 13446  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | ||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| || | | |||||  ||| || |||||||| || ||||| || ||    
T  13447 tcggtcttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccacgcctatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatctt 13546  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  | ||||| |||||||| ||||||||     
T  13547 gatttattcgaagacagaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgcaaaattgtcaaaatgtgag 13646  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    |||||||| |  || || ||||||||||||||  |||||||||    
T  13647 ttctggttaagtgaagtaagttttcttggccacattatttctg 13689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 26 - 468
Target Start/End: Original strand, 21426 - 21868
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||||||| | |||||| | || |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||    
T  21426 tcagttgaataaggttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgataacttcatggatcatttagtgggtgctcgtgtgtttagcaagattgat 21525  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||| |||| || |||||||| || || ||||| |||||||||||||| || || || |   | ||||| || || |||||||| || |||||||    
T  21526 ttgaggtcaggttaccatcagattaatgtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacatgatatggacattacgaatataaggtgatgcctt 21625  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | ||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| || | | |||||  ||| || |||||||| || ||||| || ||    
T  21626 tcggtcttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccacgcctatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatctt 21725  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  | ||||| || ||||| ||||||||     
T  21726 gatttattcgaagacagaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgcgaagttgtcaaaatgtgag 21825  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    |||||||| |  || || ||||||||||||||  |||||||||    
T  21826 ttctggttaagtgaagtaagttttcttggccacattatttctg 21868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0304 (Bit Score: 138; Significance: 6e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0304
Description:

Target: scaffold0304; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 48 - 457
Target Start/End: Original strand, 1418 - 1827
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttgaggtcaagttatcaccaga 147  Q
    ||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |  || |||||||||||||||||| |||| || ||||    
T  1418 aagaacaggtatccatttccgaggattgatgatttaatggatcagtcagtgggtgctcgtgtgtatagtaaaattgatttgaggtcaggttaccatcaga 1517  T
Q  148 ttaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctgg 247  Q
    |||| || || ||||| |||||||||||||| |  || || |  || ||||  |||||||||||||| || ||  |||| |||||||| ||||| |||||    
T  1518 ttaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggtctttaggacacgatatgaacactatgaatataaggtgatatctttcggtgttactaatgcgcctgg 1617  T
Q  248 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaa 347  Q
     ||||||||||||||||| || || || |||||||| | | |||||  ||| || |||||||| || ||||| || |||||||| || ||||||||||||    
T  1618 tgtgtttatggagtatataaaccgaattttccatgcctatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttattctaagactgaagaa 1717  T
Q  348 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagtt 447  Q
    || ||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || || ||||    
T  1718 gagcatgcagaagatctgaagattgtattgcaagtgttgaaagagaagaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgagttctggttaaatgaagttagtt 1817  T
Q  448 ttcttggcca 457  Q
    ||||||||||    
T  1818 ttcttggcca 1827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 138; Significance: 6e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 48 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 28898 - 28481
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttgaggtcaagttatcaccaga 147  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||| |||| || ||||    
T  28898 aagaatagatatccacttccgagaattgatgatttaatagatcagttagtgggtgcacgcgtgttcagtaaaattgacttgaggtcaggttaccatcaga 28799  T
Q  148 ttaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctgg 247  Q
    |||| || || ||||| ||||||||||| ||  | || || |  || ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  28798 ttaaggtgaaggatgaggatatgcagaaaacgacctttaggacacgatatggacattatgagtataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctgg 28699  T
Q  248 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaa 347  Q
     || |||||||||||||||||  | || |||||||| | | |||||  ||| || |||||||| || ||||||||  | ||||| || | || |||||||    
T  28698 tgtatttatggagtatatgaacagaattttccatgcctatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgatatcctaatttattctaggaatgaagaa 28599  T
Q  348 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagtt 447  Q
     | ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |  || || ||||    
T  28598 aagcatgcagagcatctgatgattgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaaattgtatgccaagttgtccaaatgtgaattctggttaagtgaagtaagtt 28499  T
Q  448 ttcttggccatgttattt 465  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  28498 ttcttggccatattattt 28481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 28 - 468
Target Start/End: Original strand, 22099 - 22538
Alignment:
Q  28 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgattt 127  Q
    |||||||||| || || || |||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  22099 agttgaacaaagtgacaataaagaatagttatccacttccaagaatcgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtgtttagcaagattgattt 22198  T
Q  128 gaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttt 227  Q
    ||| || || ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || || || |  ||||| || || ||  |||||  ||| ||||| |||    
T  22199 gagatcgagctatcatcagattaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttacggacattacaaatattcagtgatgcc-ttt 22297  T
Q  228 ggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttga 327  Q
     ||||||| |||||||| || || |||| ||| || |||||| |||| |  ||||| | ||| |||||  | || ||||||||||| |||||||||||||    
T  22298 cgtgttactaatgcaccgggtgtatttacggaatacatgaattgcatttctcatgcttatttagatcgcattgttgttgtgttcattgatgatattttga 22397  T
Q  328 tttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaatt 427  Q
    | ||||| ||| ||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||| |   | |||||||| ||||| || ||||||||    
T  22398 tatactctaagtctgaagaagaacacgccaagcatttgaagattgttttgcaagtgctgcaagagaaaacgttatatgccaagttgtcaaagtgtgaatt 22497  T
Q  428 ctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    ||||||||| || ||||||||| |||||||| |||||||||    
T  22498 ctggttgaatgaggtgagtttttttggccatattatttctg 22538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 135; Significance: 4e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 26 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 251015 - 250573
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    |||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||| || |||||||||   || |||||||| |||||     
T  251015 tcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgagaattgatgacttaatggatcaattggtgggtgcaaaggtgttcagcaagattgac 250916  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||  |||| || |||||||| || || |||||  ||||||||||||| || || || |  || |||||||| || ||||| || || |||||||    
T  250915 ttgaggtctggttaccatcagattaaggtgaaggatgagaatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctt 250816  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||  ||| || |||||||| || ||||| || ||    
T  250815 tcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgatgacatctt 250716  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||   | ||||| || ||||| ||||||||     
T  250715 gatttattctaagactgaagaggagcatgcagagcatctgaagattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttgtcgaaatgtgag 250616  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    |||||||| |  || ||||||||||| || ||  |||||||||    
T  250615 ttctggttaagtgaagtgagttttctgggtcacattatttctg 250573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0560 (Bit Score: 134; Significance: 2e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0560
Description:

Target: scaffold0560; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 30 - 195
Target Start/End: Original strand, 8657 - 8822
Alignment:
Q  30 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttga 129  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8657 ttgaagaaggtaactatcaagaataggaatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatttga 8756  T
Q  130 ggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgtt 195  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  8757 ggtcaggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacatctttcagaacgcgtt 8822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0560; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 191 - 250
Target Start/End: Original strand, 10916 - 10975
Alignment:
Q  191 gcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagt 250  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  10916 gcgttatggtcactatgagtataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagt 10975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 134; Significance: 2e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 48 - 465
Target Start/End: Original strand, 176277 - 176694
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttgaggtcaagttatcaccaga 147  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||  ||||||||||||||  |||| ||  |||    
T  176277 aagaataggtatccacttccgcgaattgatgatttaatggatcagttagtgggtgcacgcgtgtttagcatgattgatttgaggtcgggttaccattaga 176376  T
Q  148 ttaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctgg 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||  | || || |  || ||||| || || ||||||  ||| ||  |||| |||||||| ||||| |||||    
T  176377 ttaaagtaaaagatgaagatatgcataaaacgacctttaggacacgatatggacattacgaatattcagtgatatctttcggtgttactaatgcgcctgg 176476  T
Q  248 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaa 347  Q
     |||||||||||||| |||||| | || |||||||| | ||||||||| || || ||||| || || ||||| || |||||||| || ||| ||||||||    
T  176477 tgtgtttatggagtacatgaatagaattttccatgcttatttggatcggtttgttgttgtatttattgatgacatcttgatttattctaagtctgaagaa 176576  T
Q  348 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagtt 447  Q
    || ||||| |||||| | |||||||| ||| |||||||||| || |||||  | |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |  || || | ||    
T  176577 gagcatgcagagcatttaaagattgtgttgtaagtgttgaatgaaaagaagttgtatgccaagttgtccaaatgtgaattctggttaagtgaagtaaatt 176676  T
Q  448 ttcttggccatgttattt 465  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  176677 ttcttggccatattattt 176694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 131; Significance: 9e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 26 - 468
Target Start/End: Original strand, 9969 - 10410
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    |||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||| | ||||| || || |||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||     
T  9969 tcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgacgacttaatggatcagttagtgggtgcaaaggttttcagcaagattgac 10068  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    || |||||| || | || |||||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||  | |  || |||||||| || |||||||| || |||||||    
T  10069 ttaaggtcaggt-accatcagattaaggtgaaagatgaggatatgcagaagacggcctttgggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctt 10167  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | |||||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||||| || || |||||||| |   | |||  |||||| |||||||| || ||||| || ||    
T  10168 tcggtgttactaatgcgcctagtgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctagataaattcgtggttgtgtttattgatgacatctt 10267  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||  | |||| ||| ||||| || |||||     
T  10268 gatttattcaaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagtattgaaagaaaagaagttgtatgtcaagttgtcaaagtgtgag 10367  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    |||||||| |  || || ||||||||||||||| |||||||||    
T  10368 ttctggttaagtgaagtaagttttcttggccatattatttctg 10410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 131; Significance: 9e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 54 - 468
Target Start/End: Original strand, 2892 - 3306
Alignment:
Q  54 aggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttgaggtcaagttatcaccagattaaag 153  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||| ||||||||| |||| || |||||||| |    
T  2892 aggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcagttagtgggtgcaaaggttttcagcaagattgacttgaggtcaggttaccatcagattaagg 2991  T
Q  154 taaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtt 253  Q
    | || ||||| |||||||||||||| ||||| || |  || ||||| || || ||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  2992 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggacattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 3091  T
Q  254 tatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacat 353  Q
     |||||||||||||| || || |||||||| | | |||||  |||||| |||||||| || ||||| ||  | ||||| || |||||||||||||| |||    
T  3092 catggagtatatgaaccgaattttccatgcctatctggataaattcgtggttgtgtttattgatgacatcctaatttattcaaagactgaagaagagcat 3191  T
Q  354 gctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttg 453  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||  | ||||| || ||||| || ||||| |||||||| |  || ||  |||||||||    
T  3192 gcagagcatctgaagattgtattgcaagtattgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggtttagtgaagtttgttttcttg 3291  T
Q  454 gccatgttatttctg 468  Q
    ||||  |||||||||    
T  3292 gccacattatttctg 3306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 26 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 69765 - 69323
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    |||||||||||| || || || ||||| || |||||||||||| | |||||||| |||||||| || || || ||||||   ||||| || ||||||||     
T  69765 tcagttgaacaaagttacaataaagaacagatatccacttccgaggattgatgacttgatggaccaattggtaggtgcaaaagtttttagtaaaattgac 69666  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||| |||| || || |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |  || |||||||| || ||||| || || |||||||    
T  69665 ttgaggtcaggttaccatcaaattaaagtgaaggatgaagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctt 69566  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | |||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||  |||||| || || || || |||||||||||    
T  69565 tcggtgttactaacgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaattcgtggtggtatttattgatgatatttt 69466  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactt-tatgccaaattgtctaaatgtga 424  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||||| || |   |||||||||| |||||  | ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || ||    
T  69465 gatttattctaagactgaagaggagcatgcagaacgcttgaagattgtgttgcagattttgaaagag-agaaagttgtatgccaagttgtcgaagtgcga 69367  T
Q  425 attctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
     |||| ||| |  || ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  69366 gttcttgttaagtgaagtgagttttctaggccacgttatttctg 69323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 126; Significance: 9e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 26 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 14601 - 14153
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    |||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || || || |||||     
T  14601 tcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcagttagtgggtgcacgtgtgtttagtaagattgac 14502  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcac------tatgaatataaagtta 219  Q
    ||||||||| |||| || || ||||| || || ||||| |||||||||||||| || || || |  ||||||||||||      ||||||||||| || |    
T  14501 ttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcactatatatatgaatataaggtga 14402  T
Q  220 tgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatga 319  Q
    || |||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| |   || ||  |||||| |||||||  || |||||    
T  14401 tgtctttcggtgttactaatgcacctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcctacctgaataaattcgtggttgtgtctattgatga 14302  T
Q  320 tattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaa 419  Q
     ||| | ||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||||  | ||||| || ||||| ||     
T  14301 cattctaatttattataagactgaagaagagcatgcagagcatctgaagattgtgttgcaaatattgaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcgaag 14202  T
Q  420 tgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    ||||| |||||||| |  || |||||||||||||||||  |||||||||    
T  14201 tgtgagttctggttaattgaagtgagttttcttggccacattatttctg 14153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 27 - 467
Target Start/End: Original strand, 5718 - 6160
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||   || || || || |||||||    
T  5718 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 5817  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| | ||||| ||||||| |||||| |  ||||||||    || || || ||| ||| | | ||||| |||||||| |||   || ||||| ||    
T  5818 tgagatcaggatatcatcagattagagtaaaggcagaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatt 5917  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggag-tatatgaatc-gcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattt 324  Q
    ||| ||  | ||||| || || || ||||| ||  || ||||||  | || || ||| | | | |||| || || || || |||||||| ||||||||||    
T  5918 tggagtatctaatgcgccaggtgtctttattgaaatacatgaataagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattt 6017  T
Q  325 tgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtga 424  Q
    || | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||  |  | | |||||| |||||||| |||||    
T  6018 tggtgtattcgaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtga 6117  T
Q  425 attctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttct 467  Q
     || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  6118 gttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 6160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 125; Significance: 4e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 318 - 474
Target Start/End: Original strand, 3556 - 3712
Alignment:
Q  318 gatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtcta 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  3556 gatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattatcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatcta 3655  T
Q  418 aatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    | ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3656 agtgtgagttctggttgaaagaggtaagttttcttggccatgttatttctggtgatg 3712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 81 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 7090 - 6703
Alignment:
Q  81 ttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacag 180  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||| ||| | || ||||||||||||||| |||| || ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |    
T  7090 ttgatggatcggttagtgggtgctcgtgtattccgtaagattgatttgaggtcaggttaccatcagattaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacgg 6991  T
Q  181 ctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttcca 280  Q
    | || || |  || |||||||| || |||||||| || |||||||| |||||||| ||||| ||||  |||||||| ||||||||||| || || || ||    
T  6990 cctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctgatgtgtttatagagtatatgaaccgaatttttca 6891  T
Q  281 tgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaa 380  Q
    ||| ||| ||  |  ||| || |||||||| || ||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||  || |||||||||||||| ||||||    
T  6890 tgcttttctgattaaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttattctaagactgaggaagagcatgtagaacatctgaagattgtattgcaa 6791  T
Q  381 gtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    || ||||||||||||||  | |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |  || |||||||||||||||||  |||||||||    
T  6790 gtattgaaagagaagaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgagttctggttaagtgaagtgagttttcttggccacattatttctg 6703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1288 (Bit Score: 123; Significance: 6e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold1288
Description:

Target: scaffold1288; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 26 - 468
Target Start/End: Original strand, 766 - 1207
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    |||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||| | ||||| || || |||||||||||||||||||||   |||| |||||| |||||     
T  766 tcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgacgacttaatggatcagttagtgggtgcaaaggttt-cagcaagattgac 864  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||| |||| || |||||||| || || ||||| ||||||||||||||  | || || |  || ||||| || || |||||||| || |||||||    
T  865 ttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacgacctttaggacacgatatggacattacgaatataaggtgatgcctt 964  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| |   |||||  |||||| |||| ||| || ||||| || ||    
T  965 tcggtgttactaatgcgcctggcgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcctacctggataaattcgtggttgagtttattgatgacatctt 1064  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
    |||||| || |||| |||||||||  |||| || |||||||||||||| |||||||| || || ||||||||  | |||||||| ||||| || ||||||    
T  1065 gatttattctaagaatgaagaagagaatgcagaacatctgaagattgtattgcaagtattaaaggagaagaagttgtatgccaagttgtcgaagtgtgaa 1164  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    || ||||| |  || |||||||||||||||||  |||||||||    
T  1165 ttttggttaagtgaagtgagttttcttggccacattatttctg 1207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0405 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0405
Description:

Target: scaffold0405; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 26 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 895 - 566
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    ||||||||| || || || || ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| |    
T  895 tcagttgaataaagtgacgataaagaataggtatcaacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgctcgtgtgtttagcaaaattggt 796  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||| |||| || |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| || || |  || |||||||| ||||||||||| || ||||| |    
T  795 ttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacagcctttaggacacgatatggtcattatgaatataaggtgatgccat 696  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||  | || |||||||| | | | |||  ||| || |||||||| || ||||| || ||    
T  695 tcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaacagaattttccatgcttatctagataaatttgtggttgtgtttattgatgacatctt 596  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgc 355  Q
     ||||| || |||||||||||||| |||||    
T  595 aatttattctaagactgaagaagagcatgc 566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 121; Significance: 9e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 48 - 468
Target Start/End: Original strand, 46967 - 47387
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttgaggtcaagttatcaccaga 147  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||| || || |||||||||| ||||||  |||| || ||||    
T  46967 aagaataggtatccacttccgagaattaacgatttaatggatcagctagtgggtgcacgtgtgtttagtaaaattgattggaggtccggttaccatcaga 47066  T
Q  148 ttaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctgg 247  Q
    |||| || || ||||| |||||||||||||  || || || |  ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  47067 ttaaggtgaaggatgaggatatgcagaagatggcctttaggacacgttatggtcattatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctgg 47166  T
Q  248 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaa 347  Q
     ||||||||| |||||||||| |  || |||||||| | | | |||  ||| || |||||||| || ||||||||  | ||||| |  |||| ||||||     
T  47167 tgtgtttatgaagtatatgaaccaaattttccatgcctatctagataaatttgtggttgtgtttattgatgatatcctaatttattttaagaatgaagat 47266  T
Q  348 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagtt 447  Q
    || ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||  | ||||| |  ||||| ||||||||||| ||||| |  || ||  |||    
T  47267 gagcatgcagagcatctgcagattgtattgcaagtgttgaaagaaaaaaagttgtatgcgacgttgtcaaaatgtgaattttggttaagtgaagtaggtt 47366  T
Q  448 ttcttggccatgttatttctg 468  Q
    ||||||||||| |||||||||    
T  47367 ttcttggccatattatttctg 47387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 48 - 468
Target Start/End: Original strand, 55780 - 56200
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttgaggtcaagttatcaccaga 147  Q
    ||||| || ||||| |||||| | ||||| || |||||||| ||||| || ||||||    ||||||  || ||||| ||||||||| |||| || || |    
T  55780 aagaacagatatccgcttccgaggattgacgacttgatggaccagttggtcggtgcaaagattttcaataagattgacttgaggtcaggttaccatcaaa 55879  T
Q  148 ttaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctgg 247  Q
    || | || || ||||||||||||||||||||  | || || |  ||||||||||| || ||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  55880 ttcaggtgaaggatgaagatatgcagaagacgacctttaggacacgttatggtcattacgaatacaaattgatgcctttcggtgttactaatgcgcctgg 55979  T
Q  248 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaa 347  Q
     || || |||||||||||||| || || || ||||| ||| |||||   ||  | ||||| ||||| ||||| ||  | ||||| ||||||||||||||     
T  55980 tgtattcatggagtatatgaaccgtatttttcatgcttttctggataagtttatggttgtattcattgatgacatcctaatttattccaagactgaagag 56079  T
Q  348 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagtt 447  Q
    || ||||| || ||||||| |||||| ||||||||  |||||||||| ||  | ||||| || ||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||    
T  56080 gagcatgcagaacatctgaggattgtattgcaagtactgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaaatgtgaattctggttaagtgaagtgagtt 56179  T
Q  448 ttcttggccatgttatttctg 468  Q
    ||||| ||||  |||||||||    
T  56180 ttcttagccacattatttctg 56200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0739 (Bit Score: 120; Significance: 3e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0739
Description:

Target: scaffold0739; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 315 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 1158 - 999
Alignment:
Q  315 gatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgt 414  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | |    
T  1158 gatgatattctgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagaaaagaaactttatgctaaactat 1059  T
Q  415 ctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgatgatg 474  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1058 ctaagtgtgagttctggttgaaagaggtaagttttcttggccatgttatttctggtgatg 999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0206 (Bit Score: 120; Significance: 3e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0206
Description:

Target: scaffold0206; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 26 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 25508 - 25066
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    |||||||||||| || || || ||||| || |||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||| |||||||||   ||||| || ||||||||     
T  25508 tcagttgaacaaagttacaataaagaacagatatccacttccgagatttgatgacttgatggaccagttggtgggtgcaaaagtttttagtaaaattgac 25409  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||  |||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||| || || || |  |  |||||||| || ||||| ||||| |||||||    
T  25408 ttgaggtctggttaccatcaaattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacaatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctt 25309  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | |||||||  || || ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||  |||||| || || || || |||||||||||    
T  25308 tcggtgttattaacgcgcctggcgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcctttctggataaattcgtggtggtatttatagatgatatttt 25209  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactt-tatgccaaattgtctaaatgtga 424  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||||| |||||  |||||||||| |||||  | ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || ||    
T  25208 gatttattctaagactgaagaggagcatgcagagcacttgaagattgtgttgcagattttgaaagag-agaaagttgtatgccaagttgtcgaagtggga 25110  T
Q  425 attctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
     |||||||| |  || ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  25109 gttctggttaactgaagtgagttttctaggccacgttatttctg 25066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1477 (Bit Score: 118; Significance: 5e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold1477
Description:

Target: scaffold1477; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 26 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 621 - 181
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    |||||||||||| || || || |||||  |||||||||||||| | ||||| || || |||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||     
T  621 tcagttgaacaaagttacaataaagaacgggtatccacttccgaggattgacgacttaatggatcagttagtgggtgcaaaggttttcagcaagattgac 522  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    |||||||||  ||| || |||||||| || || ||||| |||||||||||||| || || || |  || ||||| || || ||||| ||||| |||||||    
T  521 ttgaggtcagcttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattaagaatacaaagtgatgcctt 422  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | |||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||| || || |||||||| | | |||||  |||| | ||||| || || ||||| |||||    
T  421 tcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatgaagtatatgaaccgaattttccatgcctatctggataaattcatggttgtatttattgatgacatttt 322  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
    |||| | |  | |||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||  | |||||||| ||||| || |||||     
T  321 gatt-attttaggactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagtattgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtcaaagtgtgat 223  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttct 467  Q
    |||||||| |  || || ||||||||||||||  ||||||||    
T  222 ttctggttaagtgatgttagttttcttggccacattatttct 181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 115; Significance: 3e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 54 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 1364 - 950
Alignment:
Q  54 aggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttgaggtcaagttatcaccagattaaag 153  Q
    ||||||||||||||| | || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| || ||  |  |||||||||| ||||    
T  1364 aggtatccacttccgaggatcgacaatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtgttcagtaagattgatttaagatcgggccatcaccagatcaaag 1265  T
Q  154 taaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtt 253  Q
    | |||||||| ||||| || |||||||| || || |  |||||  | || ||  |||||   || |||||||| |||||||| || || || ||||||||    
T  1264 tgaaagatgaggatattcataagacagcctttaggacacgttacagacattacaaatattcggtgatgcctttcggtgttactaacgcgccgggagtgtt 1165  T
Q  254 tatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacat 353  Q
    |||||| ||||||||||| || || ||||| | ||||||||  || || |||||||| || ||||||||| |||| ||||| ||||| ||||| ||||||    
T  1164 tatggaatatatgaatcgtatttttcatgcttatttggatcagtttgttgttgtgtttatagatgatattatgatatactctaagaccgaagaggaacat 1065  T
Q  354 gctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttg 453  Q
    || |||||| |||  ||||| ||||||||  |||| ||||||||  | ||||||||||| || || ||||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  1064 gcggagcatttgagaattgttttgcaagtactgaaggagaagaagttatatgccaaattatcgaagtgtgaattctggttgaacgaagtgacttttcttg 965  T
Q  454 gccatgttatttctg 468  Q
    ||||| | |||||||    
T  964 gccatatcatttctg 950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 115; Significance: 3e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 26 - 420
Target Start/End: Original strand, 19545 - 19939
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    ||||||||| || || || || ||||| ||||||||||||| | | ||||| || || |||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||    
T  19545 tcagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccacttctgaggattgacgacttaatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 19644  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||  |||| || |||||||| || || ||||| |||||||||||||| || || || |  || ||||| || || |||||||| || |||||||    
T  19645 ttgaggtcgggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattacgaatataaggtgatgcctt 19744  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    |  ||||||| |||||  |||  |||||||||||||||||||| || || |||||||| |  ||||||  |||||| |||||||| || ||||| || ||    
T  19745 tcagtgttactaatgcgtctgacgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcctacttggataaattcgtggttgtgtttattgatgacatctt 19844  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaat 420  Q
    |||||| || |||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||  | |||||||| ||||||||||    
T  19845 gatttattctaagaatgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagtattcaaagagaataagttgtatgccaagttgtctaaat 19939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 306 - 467
Target Start/End: Original strand, 26457 - 26618
Alignment:
Q  306 gtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatg 405  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || ||| |||| ||||| |||||||| ||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||  |  | | ||    
T  26457 gtgttcatagatgatattttggtgtattcgaagtctgaggaagagcatgctgaacatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttatgtg 26556  T
Q  406 ccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttct 467  Q
    | || |||||||| ||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  26557 ctaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 26618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 48 - 467
Target Start/End: Original strand, 64452 - 64860
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttgaggtcaagttatcaccaga 147  Q
    |||||||||||||||||| || | ||||||| ||| || ||||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||  |||| || ||||    
T  64452 aagaataggtatccacttacgaggattgatggtttaattgatcagttagtggatgctcgtgtgttcagcaagattgatttgaggtccggttaccatcaga 64551  T
Q  148 ttaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctgg 247  Q
    |||| || || ||||| ||||||||||||||  | || || |  || |||||||| || |||||||| || ||||| || || |           |||||    
T  64552 ttaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacgtcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgccgttcggcg-----------cctgg 64640  T
Q  248 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaa 347  Q
     |||||||||||||||||||| || || |||||||| | | |||||  ||| || |||||||| || ||||| || || ||||| || ||||||||||||    
T  64641 tgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttaatttattcaaagactgaagaa 64740  T
Q  348 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagtt 447  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  | |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |  || || ||||    
T  64741 gagcatgcagagcatctgaagattgtgttgcaagtgttgaaaaagaagaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgaattctggttaagtgaagtaagtt 64840  T
Q  448 ttcttggccatgttatttct 467  Q
    ||||||||||  ||||||||    
T  64841 ttcttggccacattatttct 64860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0445 (Bit Score: 111; Significance: 8e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0445
Description:

Target: scaffold0445; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 166 - 468
Target Start/End: Original strand, 1900 - 2202
Alignment:
Q  166 atatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatat 265  Q
    ||||||||||||| || || || |  |||||||| || || ||||||  ||| ||| |||| |||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||    
T  1900 atatgcagaagacggcctttaggacacgttatggacattacgaatatgcagtgatggctttcggtgttactaatgcgccgggtgtgtttatggagtacat 1999  T
Q  266 gaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctg 365  Q
    |||||| || || ||||| | ||| ||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||| ||||||| ||    
T  2000 gaatcgtatttttcatgcgtatttagatcgcttcatggttgtgttcattgatgatattttgatatactctaagtctcaagaagaacatgttgagcatttg 2099  T
Q  366 aagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttattt 465  Q
    |||||||| ||||||||| |||| ||||||||  |  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  2100 aagattgttttgcaagtgctgaaggagaagaagttaaatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggtcatgttattt 2199  T
Q  466 ctg 468  Q
    |||    
T  2200 ctg 2202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 48 - 468
Target Start/End: Original strand, 31252 - 31672
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttgaggtcaagttatcaccaga 147  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || ||||| || ||||| ||||||||  |||| || ||||    
T  31252 aagaataggtatccacttccgagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcagtaagattgacttgaggtctggttaccatcaga 31351  T
Q  148 ttaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctgg 247  Q
    | || || |||||||| |||||||||||||| || || || |  || ||||| || || ||||| ||  | ||||||||  ||||||| ||||| |||||    
T  31352 taaaggtgaaagatgaggatatgcagaagacggcctttaggagacgatatggacattacgaatacaagttgatgcctttcagtgttactaatgcgcctgg 31451  T
Q  248 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaa 347  Q
     || |||||||| |||||||| || || |||||||| ||| ||| |  ||| || || ||||| || ||||||||| ||||||| || |||||||||||     
T  31452 ggtatttatggaatatatgaaccgaattttccatgcttttctggttaaatttgtggtggtgtttattgatgatattctgatttattctaagactgaagag 31551  T
Q  348 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagtt 447  Q
    || ||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||  | ||||| ||  |||| || ||||| |||||||| |  || |||||||    
T  31552 gagcatgcagagcatctgaagattatattgcaagtcttgaaagaaaagaagttgtatgcaaagctgtcaaagtgtgagttctggttaagtgaagtgagtt 31651  T
Q  448 ttcttggccatgttatttctg 468  Q
    |||| || ||  |||||||||    
T  31652 ttctgggtcacattatttctg 31672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 26 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 38043 - 37612
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    |||||||||||| || || || ||||| |||||||||||| || | |||||||| || |||||||| ||||||||||||   |||||||| || |||||     
T  38043 tcagttgaacaaagttacaataaagaacaggtatccactttcgaggattgatgacttaatggatcaattagtgggtgcaaaggttttcagtaagattgac 37944  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||| |||| || || ||||| || || ||||| |||||||||||||| || || ||||  ||||||||||| || ||||| || || |||||||    
T  37943 ttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttagaacacgttatggtcattacgaatacaaggtgatgcctt 37844  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
      |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| |   |||||  ||| || ||||  || || ||||| ||| |    
T  37843 acggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggataaatttgtggttgaatttattgatgacattct 37744  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||  |||| |||||||| |||||  | ||||| || ||||| || |||||     
T  37743 gatttattcaaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtattagaagtattgaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcaaagtgtgag 37644  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttcttggcca 457  Q
    || ||||| |   | |||||||||||||||||    
T  37643 ttttggttaagtaaagtgagttttcttggcca 37612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 26 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 269003 - 268561
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    |||||||||||| || || || ||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||| || |||||    ||||| || || |||||     
T  269003 tcagttgaacaaagttacaataaagaataggtatccactcccgcggattgatgacttgatggaccagttggtaggtgctaaagtttttagtaagattgac 268904  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||  |||| || || |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || || |  || | |||||| || ||||| ||||| |||||||    
T  268903 ttgaggtcgggttaccatcaaattaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatgtggtcattacgaatacaaagtgatgcctt 268804  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | |||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||| |  || |||||||| ||| |||||  |||||| || ||||| || |||||||||||    
T  268803 tcggtgttactaacgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccagattttccatgcttttctggataaattcgtggtggtgtttatagatgatatttt 268704  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactt-tatgccaaattgtctaaatgtga 424  Q
    |||||| || || |||||||| ||||| || || || ||||||||||| |||||  | ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || ||    
T  268703 gatttattctaaaactgaagaggaacacgccgaacacctgaagattgtgttgcagattttgaaagag-agaaagttgtatgccaagttgtcgaagtgcga 268605  T
Q  425 attctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
     |||||||| |  || |||||||| || ||||||||||||||||    
T  268604 gttctggttaagtgaagtgagtttcctaggccatgttatttctg 268561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Original strand, 84432 - 84870
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||||| ||||||| | ||| | |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||  |||||||| |    
T  84432 cagttgaataaagtgacaataaagaataggtatcgacttccgaggattaacgatttgatggat-agttagtgggtgcgcgtgtgttcaataaaattgact 84530  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||  | ||||||| ||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||  | || || |  ||||| || || || ||||||   || ||||||||    
T  84531 tgagatcgggctatcaccggatcaaagtgaaagatgaggatattcagaagacgacctttaggacacgttacggacattacgaatattttgtgatgccttt 84630  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     |||||||| ||||| |   |||| |||||||| ||||||||||| || || ||| | | | | ||||| || || |||||||| || ||||||||| ||    
T  84631 cggtgttactaatgcgctgagagtatttatggaatatatgaatcgtatttttcatacttatctagatcgttttgttgttgtgtttatagatgatattatg 84730  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    || ||||| |||||  | || || ||||| |||||| |||  ||||| ||||||||| |||||||||||||  | |||||||| || || || || ||||    
T  84731 atatactctaagaccaaggaggagcatgccgagcatttgagaattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagttatatgccaagttatcaaagtgcgaat 84830  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttc 466  Q
    ||||||||||  | |||||||| ||||| ||| |||||||    
T  84831 tctggttgaacaaagtgagtttccttggtcatattatttc 84870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 103; Significance: 5e-51; HSPs: 4)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 26 - 468
Target Start/End: Original strand, 31588 - 32030
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    ||||||||| || || || || ||||| || |||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||| || ||||||    |||| || ||||||||     
T  31588 tcagttgaataaagttacaataaagaaaagatatccacttccgagaattgacgacatgatggatcagttggttggtgcaaagatttttagtaaaattgac 31687  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||| |||| || ||||| || || |||||||| || ||||||||||| || || || |  || |||||||| || |||||||| || |||||||    
T  31688 ttgaggtcaggttaccatcagatcaaggtgaaagatgaggacatgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctt 31787  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  | || || ||||| |   |||||  ||| || ||||| ||||| ||||| |||||    
T  31788 tcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaacagaatttttcatgcttacctggataaatttgtggttgtattcattgatgacatttt 31887  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
    ||| || || |  ||||| ||||| ||||| || ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||| || || ||     
T  31888 gatctattcgagaactgaggaagagcatgcagaacatctgaggattgtattgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcaaagtgcgag 31987  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    || ||||| |  || |||||||||||||||||| |||||||||    
T  31988 ttttggttaagtgaagtgagttttcttggccatattatttctg 32030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 26 - 235
Target Start/End: Original strand, 54322 - 54531
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    |||||||||||| || || || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||   || ||||| || |||||     
T  54322 tcagttgaacaaagttacgataaagaatagatatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagatagtgggtgcaaaggtgttcagtaagattgac 54421  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||| |||| || |||||||| || || ||||| |||||||||||||| || || || |  || ||||| || || ||||| || || |||||||    
T  54422 ttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattacgaatacaaggtgatgcctt 54521  T
Q  226 ttggtgttac 235  Q
    | ||||||||    
T  54522 tcggtgttac 54531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 42652 - 42212
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||| ||||||   || || || || |||||||    
T  42652 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagttggtgcataggtgtttagtaagattgatt 42553  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| | ||||| ||||||| |||||| |  ||||||||    || || || ||| ||| | | ||||| |||||||| |||   || ||||| ||    
T  42552 tgagatcaggatatcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattttgtgatgccatt 42453  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    ||| ||  | ||||| |  || || |||||||| || |||||| | || || ||| | | | |||| || || || || |||||||| ||||||||||||    
T  42452 tggagtatctaatgcgctaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttg 42353  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
     | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||  |  | | |||||| |||||||| ||||| |    
T  42352 gtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagt 42253  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttct 467  Q
    | |||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  42252 tttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 42212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #4
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 249 - 468
Target Start/End: Original strand, 55034 - 55253
Alignment:
Q  249 gtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaag 348  Q
    ||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| | | |  |||||| || || || || ||||||||| | || || || ||||||||||| |    
T  55034 gtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctagttaaattcgtggtggtatttattgatgatattctaatctattctaagactgaagagg 55133  T
Q  349 aacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttt 448  Q
    | ||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||  | ||||| || ||||| ||||  || || ||||| |  || || |||||    
T  55134 agcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagttttgaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcgaaataagagttttggttaagtgaagtaagttt 55233  T
Q  449 tcttggccatgttatttctg 468  Q
    |||||||||  |||||||||    
T  55234 tcttggccacattatttctg 55253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 103; Significance: 5e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 26 - 468
Target Start/End: Original strand, 99473 - 99915
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    ||||||||| || || || || ||||| ||||||||||||||| | |||||||| || ||||||||||| |||||||||   ||||| || || |||||     
T  99473 tcagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcagttggtgggtgcaaaggtttttagtaagattgaa 99572  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||| |||| || ||||| || || || ||||| ||||||||||||||||| || || |  || ||||| || || ||||| || || |||||||    
T  99573 ttgaggtcaggttaccatcagatcaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacagcctttaggacacgatatggacattacgaatacaaggtgatgcctt 99672  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||| | | |||||  ||| || |||||||| || ||||| ||| |    
T  99673 tcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaatcgaattttccatgcctatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacattct 99772  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
    ||| || || |  ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||| |  | |||||||| ||  | ||||| || ||||| || |||||     
T  99773 gatctattctagaactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtgttgcaaattctaaaagagaaaaagttatatgctaagttgtcgaagtgtgag 99872  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    |||||||| |  || ||||||||||| |||||  |||||||||    
T  99873 ttctggttaagtgaagtgagttttctgggccacattatttctg 99915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 100; Significance: 3e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 305 - 468
Target Start/End: Original strand, 115171 - 115334
Alignment:
Q  305 tgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttat 404  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| |||||| |  | |||    
T  115171 tgtgttcatcgatgatattttgatatactctaagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaggagaagtagttatat 115270  T
Q  405 gccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  115271 gccaagttgtcaaagtgtgaattttggttgaaagaggtgagttttcttggccatgttatttctg 115334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 27 - 240
Target Start/End: Original strand, 114950 - 115163
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  114950 cagttgaataaagtaacgataaagaataggtatccacttccaagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtgtttagcaagattgatt 115049  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||  ||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||  || || || |  |||||||| || || ||||||  ||| ||||||||    
T  115050 tgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagacgaggatatccagaagatggcctttaggacacgttatggacattacgaatattgagtgatgccttt 115149  T
Q  227 tggtgttaccaatg 240  Q
     |||||||| ||||    
T  115150 cggtgttacaaatg 115163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 26 - 424
Target Start/End: Original strand, 10697 - 11095
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    |||||||||||| || || || ||||| |||||||  |||| |   |||||||| |||||||||||||| || ||||||  | |||| || || || ||     
T  10697 tcagttgaacaaagttacaataaagaacaggtatctgcttctgaagattgatgacttgatggatcagttggttggtgcaaatatttttagtaagatcgac 10796  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||  |||| || ||||| || || || |||||||||||||||||||| || || || |  || |||||||| || ||||| ||||| |||||||    
T  10797 ttgaggtctggttaccatcagataaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctt 10896  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | |||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||  |||||  ||||||||| || || || |||||||||||    
T  10897 tcggtgttactaacgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaatttttcatgctttcctggataaattcgtagtggtatttattgatgatatttt 10996  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtga 424  Q
     ||||| || ||||||||||| || ||||| || ||||||| |||||| |||||||| || |||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||    
T  10997 aatttattctaagactgaagaggagcatgcagaacatctgaggattgtattgcaagtatttaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcaaaatgtga 11095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 26 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 262619 - 262177
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    |||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||| || | ||| |||| |||||||||||||| || ||||||    ||||||| || |||||     
T  262619 tcagttgaacaaagttacaataaagaacaggtatccgctttcgaggatttatgacttgatggatcagttggttggtgcaaagattttcagtaagattgac 262520  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||  |||| || || ||||| || || |||||||||||||||||||| || || || |  ||||||||||| || ||||| || || |||||||    
T  262519 ttgaggtctggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgaatacaaggtgatgcctt 262420  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  | || |||||||  ||| |||||   || || ||||| ||||| || |||||  |    
T  262419 tcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaactgaattttccatgtctttctggataagtttgtggttgtattcattgacgatatcct 262320  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
     ||||| || |||||| |||| || ||||| || ||||||| |||||| ||||||||  |||||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||||||    
T  262319 aatttattctaagactaaagaggagcatgcagaacatctgaggattgtattgcaagtactgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaaatgtgaa 262220  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    |||||||| |  || |||||||||||||||||  |||||||||    
T  262219 ttctggttaagtgaagtgagttttcttggccacattatttctg 262177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 98; Significance: 5e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 27 - 468
Target Start/End: Original strand, 27160 - 27600
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  27160 cagttgaataaagtgacaataaagaataggtatccacttccgaggatcaatgatttgatgtatcagttagtgggtgcacgtgtgttcagtaaaattgact 27259  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    | || ||  | ||||||| ||| ||| | |||||||| || || |||||||  |  || || || ||||| ||  | |||||||||   || ||||||||    
T  27260 taagatcgggctatcaccggatcaaactgaaagatgaggacattcagaagatggactttaggatacgttacggaaattatgaatattctgtgatgccttt 27359  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     |||||||| ||||| || ||||| ||| |||| ||||||||||| || || ||| | | | | ||||| || || |||||||| || ||||||||  ||    
T  27360 cggtgttactaatgcgccgggagtatttgtggaatatatgaatcgtatttttcatacttatctagatcgttttgttgttgtgtttatagatgatatcctg 27459  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
    || ||||| ||| |||| || |||||||| |||||| |||  ||||| ||||||||| |||||||||||||  | |||||||| || || || || ||||    
T  27460 atatactctaagtctgaggaggaacatgccgagcatttgagaattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagttatatgccaagttatcaaagtgagaat 27559  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  27560 tctggttgaacga-gtgagttttcttggtcatattatttctg 27600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 26 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 21515 - 21150
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    |||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||| | ||||| || ||| |||||||  | |||||||||   ||||| || || |||||     
T  21515 tcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgacgacttggtggatcaagtggtgggtgcaaaagtttttagtaagattgac 21416  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||| |||| || || |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || || |  ||  | ||||| |||||||| || || || ||||    
T  21415 ttgaggtcaggttaccatcaaattaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgacacggtcattatgaatagaaggtgatacctt 21316  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | |||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| || || || ||||| ||| |||||  ||| |||||||| ||  | ||||||||| |    
T  21315 tcggtgttactaatgcgcctggtgtattcatggagtatatgaaccgaatttttcatgcttttctggataaatttgtagttgtatttcttgatgatattct 21216  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaaga 391  Q
     ||||| || ||||||||||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  21215 aatttattctaagactgaagaggagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagttttgaaaga 21150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 96; Significance: 7e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 26 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 1038 - 642
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    ||||||||| || || || || ||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||| |  ||    |||| || || |||||     
T  1038 tcagttgaataaagttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttgatggatcagttggtgag--caaagttttttagtaatattgac 941  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||| |||| || || ||||| || || |||||||||||||||||||| || || || |  || |||||||| || ||||| || || |||||||    
T  940 ttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctt 841  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | |||||||| ||||| || || ||||| ||| |||||||||| || || |||||||| ||| |||||  ||| || || ||||| || ||||| ||| |    
T  840 tcggtgttactaatgcgccgggtgtgttcatgtagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggtggtgtttattgatgacattct 741  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtga 424  Q
     ||||| || ||||||||||| || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  | ||||| |||||||| ||||||||    
T  740 aatttattctaagactgaagaggagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgctaaattgtcgaaatgtga 642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 8007 - 7857
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    ||||||||| || || || || ||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||  | |||    |||| || || |||||     
T  8007 tcagttgaataaagttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttgatggatcagttggt--gagcaaagttttttagtaatattgac 7910  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagac 178  Q
    ||||||||| |||| || || ||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  7909 ttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagac 7857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 96; Significance: 7e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 26 - 465
Target Start/End: Original strand, 79742 - 80181
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    |||||||||||| || || || ||||| |||||||||||| || | |||||||| |||||||||||||| || ||||||    ||||||| || |||||     
T  79742 tcagttgaacaaagttaccataaagaacaggtatccactttcgaggattgatgacttgatggatcagttggttggtgcaaagattttcagtaagattgac 79841  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||| |||| || || ||||| || || |||||||||||||||||||| || || || |  || |||||||| || ||||| ||||| |||||||    
T  79842 ttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctt 79941  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | |||||||| ||||| | ||| ||||| ||||||||||||||  | || || ||||| ||  |||||   || || || || ||||| |||||||||||    
T  79942 tcggtgttactaatgcgcttggtgtgttcatggagtatatgaacaggatttttcatgctttcctggataagtttgtggtagtattcattgatgatatttt 80041  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
     ||||| || ||||||||||| || |||||  ||||||||| |||||| || || || |||||||| |||||  | ||||| |||||||| ||||| ||     
T  80042 aatttattctaagactgaagaggagcatgcaaagcatctgaggattgtattacaggttttgaaagaaaagaagttgtatgctaaattgtcaaaatgcgag 80141  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttattt 465  Q
    || ||||| |  || || ||||| ||||||||| ||||||    
T  80142 ttttggttaagtgaagtaagtttccttggccatattattt 80181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 26 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 43311 - 42905
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    ||||||||| || || || || ||||| |||||||||||| || | ||||| || ||||||||||||||||||||||||   |||||||| || |||||     
T  43311 tcagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccactttcgaggattgacgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggttttcagtaagattgac 43212  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||| |||| || || ||||| || || ||||| | |||||||||||  || || || |  || |||||||| || ||||| || || |||||||    
T  43211 ttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgagggtatgcagaagagggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctt 43112  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | |||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || || ||| |||| |   |||||  ||| || |||||||| || ||||||||| |    
T  43111 tcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatcgagtatatgaaccgaat-ttctatgcttacctggataaatttgtggttgtgtttattgatgatattct 43013  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
    ||| || || |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||||  | ||||| || ||||| || |||||     
T  43012 gatctattcaaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaaaattgtgttgcaaatattgaaagagaagaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgag 42913  T
Q  426 ttctggtt 433  Q
    ||||||||    
T  42912 ttctggtt 42905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 91; Significance: 7e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 26 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 21244 - 20802
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    ||||||||| || || || || ||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| || ||||||    |||| || ||||||||     
T  21244 tcagttgaataaagttacgataaagaacagatatccgcttccgagaattgatgacttgatggaccagttggttggtgcaaagatttttagtaaaattgac 21145  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||| |||| ||  ||||||| || |||||||| || ||||||||||| || || || |  || ||||||||||| |||||||| || |||| ||    
T  21144 ttgaggtcaggttaccattagattaaggtgaaagatgaggacatgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcactacgaatataaggtgatgcttt 21045  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  | || || ||||| |   |||||  ||| || || || ||||| ||||| |||||    
T  21044 tcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaacagaatttttcatgcctacctggataaatttgtggtggtattcattgatgacatttt 20945  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
    ||| || || |  | ||| ||||| ||||| || ||||||| || ||| |||||||| || | |||||||||  | |||||||||||||| || |||||     
T  20944 gatctattctagaaatgaggaagagcatgcagaacatctgaggactgtattgcaagtattcatagagaagaagttgtatgccaaattgtcgaagtgtgag 20845  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    |||||||| |  || |||||||||||||||||| |||||||||    
T  20844 ttctggttaagtgaagtgagttttcttggccatattatttctg 20802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 228 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 25204 - 24964
Alignment:
Q  228 ggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttga 327  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  | || || ||||| |   |||||  ||| || || || ||||| ||||| |||||||    
T  25204 ggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaacagaatttttcatgcctacctggataaatttgtggtggtattcattgatgacattttga 25105  T
Q  328 tttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaatt 427  Q
    | || || |  | ||| ||||| ||||| || ||||||| || ||| |||||||| || | |||||||||  | |||||||||||||| || ||||| ||    
T  25104 tctattctagaaatgaggaagagcatgcagaacatctgaggactgtattgcaagtattcatagagaagaagttgtatgccaaattgtcgaagtgtgagtt 25005  T
Q  428 ctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    |||||| |  || |||||||||||||||||| |||||||||    
T  25004 ctggttaagtgaagtgagttttcttggccatattatttctg 24964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 26 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 9456 - 9014
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    ||||||||| || || || || ||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||| ||||   ||||| || || |||||     
T  9456 tcagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttgatggatcagttagtggatgcaaaggtttttagtaagattgac 9357  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||| |||| || || ||||| || || || || |||||||||||||| || || || |  || |||||||| || ||||| || || ||| |||    
T  9356 ttgagatcaggttaccatcaaattaaggtgaaggacgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgtctt 9257  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | |||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||| |  || |||||||| | | |||||  ||| || ||||| || || ||||| || ||    
T  9256 tcggtgttactaacgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccaaattttccatgcctatctggataaatttgtggttgtatttattgatgacatctt 9157  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
     ||||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||  | | ||| || ||||| || |||||     
T  9156 aatttattcaaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtgttacaagttttgaaagagaaaaagttgtgtgctaagttgtcgaagtgtgag 9057  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    |||| ||| |  || ||||||||||| |||||  |||||||||    
T  9056 ttctagttaagtgaagtgagttttctgggccacattatttctg 9014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 26 - 268
Target Start/End: Original strand, 1400 - 1642
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    |||||||||||| || || || ||||| || |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||||   ||||| || || |||||     
T  1400 tcagttgaacaaagttacgataaagaacagatatccacttccgaggattgatgacttgatggatcagttggtgggtgcaaaagtttttagtaagattgac 1499  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||| |||| || |||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||| || || || |  || |||||||| || ||||| ||||| |||||||    
T  1500 ttgaggtcaggttaccatcagattaaggtaaaggatgaggatatgaagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctt 1599  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaa 268  Q
    | |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| |||||||    
T  1600 tcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggaggatatgaa 1642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0730 (Bit Score: 84; Significance: 1e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0730
Description:

Target: scaffold0730; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 117 - 468
Target Start/End: Original strand, 3 - 354
Alignment:
Q  117 aaaattgatttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaag 216  Q
    |||||||| ||||||||| |||| || || || || || ||||||||||| ||||||||||| || || || |  || |||||||| || |||||||| |    
T  3 aaaattgacttgaggtcaggttaccatcaaatcaaggtgaaagatgaagacatgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcattacgaatataagg 102  T
Q  217 ttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcga 316  Q
    | |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| | || || ||||| | | |||||  ||| || || |||| ||| ||    
T  103 tgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaatagaatttttcatgcttatctggataaatttgtggtagtgtacattga 202  T
Q  317 tgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtct 416  Q
    ||| |||||||| || || |  || || ||||| ||||| || |||||||  ||||| |||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||     
T  203 tgacattttgatctattcgacaacggaggaagagcatgcagaacatctgagaattgtgttgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcg 302  T
Q  417 aaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    || ||||| |||||||| |  || || ||||| ||||||||| |||||||||    
T  303 aagtgtgagttctggttaagtgaagtaagtttccttggccatattatttctg 354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 48 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 11331 - 11201
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttgaggtcaagttatcaccaga 147  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || ||||    
T  11331 aagaataggtatccacttccgagaattgacgatttaatggatcagttagtgggtgctcgtgtgttcagcaaaattgatttgaggtcaggttaccatcaga 11232  T
Q  148 ttaaagtaaaagatgaagatatgcagaagac 178  Q
    |||| || || ||||| ||||||||||||||    
T  11231 ttaaggtgaaggatgaggatatgcagaagac 11201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 26 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 53440 - 52998
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    ||||||||| || || || || ||||| || ||||||||| |  | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||   ||||| || || |||||     
T  53440 tcagttgaataaagttacaataaagaacagatatccactttctaggattgatgacttgatggatcaattagtgggtgcaaaggtttttagtaagattgac 53341  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||| |||| || || ||||| || || |||||||||||||||||||| || || || |  || ||||| || || || || || || || ||||    
T  53340 ttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattacgagtacaaggtgatacctt 53241  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | | |||||| ||||  |||||  |||| |||||||||||||| || || |||||||| |   |||||  ||| || ||||| || || ||||||||| |    
T  53240 tcgatgttactaatgtgcctggtttgttcatggagtatatgaaccggattttccatgcttacctggataaatttgtggttgtatttattgatgatattct 53141  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||  | ||||  || ||||| || |||||     
T  53140 gatttattctaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtgttgcaaatattgaaagagaaaaagttgtatgttaagttgtcgaagtgtgag 53041  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    |||||||| |  || ||||||||||| |||||  |||||||||    
T  53040 ttctggttaagtgaagtgagttttctgggccacattatttctg 52998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1373 (Bit Score: 81; Significance: 6e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold1373
Description:

Target: scaffold1373; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 468
Target Start/End: Original strand, 747 - 1187
Alignment:
Q  28 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgattt 127  Q
    |||||||||| || || || |||||  ||||||  |||||| | ||||| || |||||||||||||| || |||||     |||| || || ||||| ||    
T  747 agttgaacaaagttacgataaagaaccggtatctgcttccgaggattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagatttttagtaagattgactt 846  T
Q  128 gaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttt 227  Q
    ||||||  |||| || ||||| || || || ||||| |||||||||||||| || || || |  || |||||||| || || || ||||| ||||||||     
T  847 gaggtctggttaccatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttc 946  T
Q  228 ggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttga 327  Q
    |||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||| |  || |||||||  ||| |||||  ||| || ||||| ||||| || |||||||| |    
T  947 ggtgttactaacgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaaccaaattttccatgattttctggataaatttgttgttgtattcattgacgatattttaa 1046  T
Q  328 tttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaatt 427  Q
    | || ||||||| |||||| || ||||| ||||||||||  ||||| |||||||| |||||||| ||||   | ||||| || ||||| |||||||| ||    
T  1047 tctattccaagaatgaagaggagcatgcagagcatctgagaattgtgttgcaagttttgaaagaaaagaggttgtatgcaaagttgtcaaaatgtgagtt 1146  T
Q  428 ctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    |||||| |  || ||||||||||| || ||| |||||||||    
T  1147 ctggttaagtgaagtgagttttctgggtcatattatttctg 1187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 81; Significance: 6e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 27 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 25788 - 25348
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||   || || || || |||||||    
T  25788 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 25689  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| | ||||| ||||||| |||||| |  ||||||||    || || || ||| ||| | | ||||| |||||||| |||   || ||||| ||    
T  25688 tgagatcaggatatcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatt 25589  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    ||| ||  | |||||||| || || |||||||| || |||||| | || || ||| | | | |||| || || || || |||||||| ||||||||||||    
T  25588 tggagtatctaatgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttg 25489  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
     | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||  |  | | |||||| |||||||| ||||| |    
T  25488 gtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagt 25389  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttct 467  Q
    | |||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  25388 tttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 25348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 81; Significance: 6e-38; HSPs: 3)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 27 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 15302 - 14862
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||   || || || || |||||||    
T  15302 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 15203  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| | ||||| ||||||| |||||| |  ||||||||    || || || ||| ||| | | ||||| |||||||| |||   || ||||| ||    
T  15202 tgagatcaggatatcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatt 15103  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    ||| ||  | |||||||| || || |||||||| || |||||| | || || ||| | | | |||| || || || || |||||||| ||||||||||||    
T  15102 tggagtatctaatgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttg 15003  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
     | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||  |  | | |||||| |||||||| ||||| |    
T  15002 gtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagt 14903  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttct 467  Q
    | |||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  14902 tttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 14862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 306 - 394
Target Start/End: Original strand, 11365 - 11453
Alignment:
Q  306 gtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaa 394  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || ||| |||| ||||| |||  ||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  11365 gtgttcatagatgatattttggtgtattcgaagtctgaggaagagcataatgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaa 11453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 91
Target Start/End: Original strand, 11089 - 11150
Alignment:
Q  30 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatca 91  Q
    |||||||| || || || |||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  11089 ttgaacaaagtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatca 11150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0550
Description:

Target: scaffold0550; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 24 - 145
Target Start/End: Original strand, 11067 - 11189
Alignment:
Q  24 catcagttgaacaag-gtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaatt 122  Q
    ||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||     
T  11067 catcagttgaacaaaagtaactattaagaacaggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacatgttttcagcaagata 11166  T
Q  123 gatttgaggtcaagttatcacca 145  Q
    |||||||| ||| ||||||||||    
T  11167 gatttgagatcaggttatcacca 11189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1830 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold1830
Description:

Target: scaffold1830; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 243 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 1172 - 947
Alignment:
Q  243 cctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactg 342  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  | || |||||||| | | |||||  ||| || |||||||| || ||||| || |||||||| || |||||||    
T  1172 cctggtgtgtttatggagtatatgaacagaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttattcaaagactg 1073  T
Q  343 aagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgt 442  Q
    ||||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||  | |||||||| ||||| |||||||| |||| ||| || || ||    
T  1072 aagaagagcatgcagaacatctgaatattgtattgcaagtattgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgagttctagttaaatgaagt 973  T
Q  443 gagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
     ||||||||||||||| |||||||||    
T  972 aagttttcttggccatattatttctg 947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1715 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold1715
Description:

Target: scaffold1715; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 26 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 1347 - 922
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    ||||||||||||||| || || ||||| |  ||||| |||||| | ||||| || |||||||||||||| || |||||     |||| || || || ||     
T  1347 tcagttgaacaaggttacgataaagaacatatatccgcttccgaggattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagatttttagtaagatcgac 1248  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||  |||| || |||||||| || || ||||| ||||| |||||||| || || || |  || |||||||| || || || ||||| |||||||    
T  1247 ttgaggtctggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatattcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgagtacaaagtaatgcctt 1148  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | |||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| ||||   ||| || ||||| || || |||||||||||    
T  1147 tcggtgttactaacgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggacaaatttgttgttgtatttattgatgatatttt 1048  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
     ||||| || |||| |||||| || ||||| ||||||||||  ||||| |||||||| |||||||| |||| | | ||||| ||  |||| ||||||||     
T  1047 aatttattctaagaatgaagaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagttttgaaagaaaagagattgtatgcaaagctgtcaaaatgtgag 948  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttct 451  Q
    |||| ||| |  || |||||||||||    
T  947 ttctagttaagtgaagtgagttttct 922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 26 - 468
Target Start/End: Original strand, 9372 - 9810
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    ||||||||| || || || || ||||| ||||||||||||| | | |||||||| |||| ||||||| |||||||||||   |||||  |  |||||||     
T  9372 tcagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccacttctgaggattgatgacttgacggatcagctagtgggtgcaaaggttttttgttaaattgac 9471  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||| |||| || || ||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| || |  || |||||||| || ||||| || || |||||||    
T  9472 ttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctt 9571  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | |||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||||||     |   |  ||| || |||||||| || ||||||||| |    
T  9572 tcggtgttactaacgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgc----ctacctaaatttgtggttgtgtttattgatgatattct 9667  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
    ||||||  | | ||||||||| || ||| | || ||| |||||||||| |||||| | ||||||||||| ||  | ||||| || ||||| || |||||     
T  9668 gatttaagctaggactgaagaggagcatacagaacatttgaagattgtgttgcaaattttgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgag 9767  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    |||||||| |  || || || |||||||||||  |||||||||    
T  9768 ttctggttaagtgaagtaagatttcttggccacattatttctg 9810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 26 - 468
Target Start/End: Original strand, 19586 - 20024
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    ||||||||| || || || || ||||| ||||||||||||| | | |||||||| |||| ||||||| |||||||||||   |||||  |  |||||||     
T  19586 tcagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccacttctgaggattgatgacttgacggatcagctagtgggtgcaaaggttttttgttaaattgac 19685  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||| |||| || || ||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| || |  || |||||||| || ||||| || || |||||||    
T  19686 ttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctt 19785  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | |||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||||||     |   |  ||| || |||||||| || ||||||||| |    
T  19786 tcggtgttactaacgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgc----ctacctaaatttgtggttgtgtttattgatgatattct 19881  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
    ||||||  | | ||||||||| || ||| | || ||| |||||||||| |||||| | ||||||||||| ||  | ||||| || ||||| || |||||     
T  19882 gatttaagctaggactgaagaggagcatacagaacatttgaagattgtgttgcaaattttgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgag 19981  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    |||||||| |  || || || |||||||||||  |||||||||    
T  19982 ttctggttaagtgaagtaagctttcttggccacattatttctg 20024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 26 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 29327 - 28921
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| || || |||||  |  ||||||| || |||||     
T  29327 tcagttgaataaggttacgataaagaacaggtatccgcttccgagaattgacgatttgatggatcaattggttggtgctaggattttcagtaagattgac 29228  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    |||||||   |||| || ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||  || || || |  || |||||||| || || || ||||| |||||||    
T  29227 ttgaggtttggttaccatcagataaaagtgaaggatgaggatatgcagaagatggcctttaggacacgatatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 29128  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | |||||||| || || ||||| ||||||||| |||||||||| |  || |||||||| ||| |||||   || || || ||||| || |||||||| ||    
T  29127 tcggtgttactaacgcgcctggtgtgtttatgtagtatatgaacctaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatctt 29028  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
     || || || |||| ||||| ||| ||||| ||||| ||||  ||||| |||||||| |||||||| ||||   | ||||| || ||||| ||||||||     
T  29027 aatctattctaagaatgaag-agagcatgcagagcacctgagaattgtgttgcaagttttgaaagaaaagaggttgtatgcgaagttgtcaaaatgtgag 28929  T
Q  426 ttctggtt 433  Q
    ||||||||    
T  28928 ttctggtt 28921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0170 (Bit Score: 69; Significance: 9e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0170
Description:

Target: scaffold0170; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 34479 - 34039
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatt 126  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| | || ||||||   || || || || |||||||    
T  34479 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatgcacttccgaggattgatgatttgatggatcagctggtcggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 34380  T
Q  127 tgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| | ||||| ||||||| |||||| |  |||||||| |  || || || ||  ||| | | ||||| |||||||| |||   || ||||| ||    
T  34379 tgagatcaggatatcatcagattagagtaaaggcggaagatatacccaaaaccgcgtttcgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatt 34280  T
Q  227 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    ||| ||  ||||||| || || || || ||||||||||||||| | || || ||| | | | |||| || || || || |||||||| ||||||||||||    
T  34279 tggagtatccaatgcgccaggtgtcttcatggagtatatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttg 34180  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaat 426  Q
     | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||  |  | | ||| || |||||||| |||||||    
T  34179 gtgtattcgaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttatgtgcaaagttgtctaagtgtgaat 34080  T
Q  427 tctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttct 467  Q
    | |||||| | || || ||||| ||||| ||||| ||||||    
T  34079 tttggttggaggaagtaagtttccttggtcatgtgatttct 34039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0285 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0285
Description:

Target: scaffold0285; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 356 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 9290 - 9215
Alignment:
Q  356 tgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctgg 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  9290 tgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctgg 9215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2111 (Bit Score: 66; Significance: 6e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold2111
Description:

Target: scaffold2111; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 48 - 269
Target Start/End: Original strand, 520 - 741
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttgaggtcaagttatcaccaga 147  Q
    ||||| || ||||| |||||| ||| ||| ||  ||||||||||||| || ||||||   ||||| || || ||||| ||||||||  |||| ||  | |    
T  520 aagaacagatatccgcttccgagaactgacgacctgatggatcagttggttggtgcaaaagtttttagtaagattgacttgaggtcgggttaccatgaaa 619  T
Q  148 ttaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctgg 247  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| || || || |  || |||||||| || |||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  620 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcacctgg 719  T
Q  248 agtgtttatggagtatatgaat 269  Q
     ||||| |||||||||||||||    
T  720 tgtgttcatggagtatatgaat 741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 26 - 94
Target Start/End: Original strand, 12267 - 12335
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagtt 94  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12267 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagtt 12335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 3)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 276 - 470
Target Start/End: Original strand, 33914 - 34108
Alignment:
Q  276 ttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtct 375  Q
    |||||||| | ||||||| | ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| || | | |||||||||| ||||| |||||| | |||||| | |    
T  33914 ttccatgcttatttggattggttcgtggttgtatttattgatgacattttgatttattctaggtctgaagaagagcatgcagagcatttaaagattatgt 34013  T
Q  376 tgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctgat 470  Q
    |||||||||| || || |||||  | |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |  || || ||||||||||||||| |||||||||||    
T  34014 tgcaagtgttaaaggaaaagaagatgtatgccaagttgtccaaatgtgaattctggttaagtgaagtaagttttcttggccatattatttctgat 34108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 255 - 457
Target Start/End: Original strand, 380 - 582
Alignment:
Q  255 atggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatg 354  Q
    |||||||||||||| || || |||||||| | | |||||  ||| || |||||||| || ||||| ||| |||| || || | |||||||||| | |||     
T  380 atggagtatatgaaccgaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacattctgatctattcaaggactgaagaatagcatt 479  T
Q  355 ctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttgg 454  Q
    | || |||||||||||||| |||||  | ||||||||||| ||  | ||||| || ||||| || ||||| |||||||| |  || ||||||||||||||    
T  480 cagaacatctgaagattgtgttgcagattttgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaagtgagttttcttgg 579  T
Q  455 cca 457  Q
    |||    
T  580 cca 582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 255 - 457
Target Start/End: Original strand, 4700 - 4902
Alignment:
Q  255 atggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatg 354  Q
    |||||||||||||| || || |||||||| | | |||||  ||| || |||||||| || ||||| ||| |||| || || | |||||||||| | |||     
T  4700 atggagtatatgaaccgaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacattctgatctattcaaggactgaagaatagcatt 4799  T
Q  355 ctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttgg 454  Q
    | || |||||||||||||| |||||  | ||||||||||| ||  | ||||| || ||||| || ||||| |||||||| |  || ||||||||||||||    
T  4800 cagaacatctgaagattgtgttgcagattttgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaagtgagttttcttgg 4899  T
Q  455 cca 457  Q
    |||    
T  4900 cca 4902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0708 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0708
Description:

Target: scaffold0708; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 26 - 451
Target Start/End: Original strand, 6056 - 6481
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    ||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||| | | ||||| || |||||||||||||| || ||||||    |||| || || || ||     
T  6056 tcagttgaacaaggttacgataaagaacaggtatccgcttctgaggattgacgacttgatggatcagttggttggtgcaaagatttttagtaagatcgac 6155  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||  |||| || ||||| || |  || |||||||| ||||||||||| || || || |  ||  ||||||| || ||||| ||||| |||||||    
T  6156 ttgaggtctggttaccatcagataaaggggaaggatgaagacatgcagaagacggcctttaggacacgaaatggtcattacgaatacaaagtgatgcctt 6255  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | |||||||| || || | ||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||  |||||  |||| | || || || || |||||||||||    
T  6256 tcggtgttactaacgcgcatggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgctttcctggataaattcatggtggtatttattgatgatatttt 6355  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
     || || ||||||| |||||| || ||||| || |||||||  ||||| ||||| || |||||||| |||||  | ||||| || ||||  ||||||||     
T  6356 aatctattccaagaatgaagaggagcatgcagaacatctgagaattgtattgcacgttttgaaagaaaagaagttgtatgcaaagttgttaaaatgtgag 6455  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttct 451  Q
    || ||||| |  || |||||||||||    
T  6456 ttatggttaagtgaagtgagttttct 6481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 219 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 44985 - 44736
Alignment:
Q  219 atgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatg 318  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||  ||| || |||||||| || ||||    
T  44985 atgcctttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggttgtgtttattgatg 44886  T
Q  319 atattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaa 418  Q
    | || |||||||| ||||||| |||||| || |||||  | |||||||  ||| | |||||||||||||| || ||||   | ||||| ||  |||| ||    
T  44885 acatcttgatttattccaagaatgaagaggagcatgcaaaacatctgagaattatattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagctgtcaaa 44786  T
Q  419 atgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    |||||| |||||||| |  || ||||||||||| || ||  |||||||||    
T  44785 atgtgagttctggttaagtgaagtgagttttctaggtcacattatttctg 44736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1646 (Bit Score: 61; Significance: 6e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold1646
Description:

Target: scaffold1646; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 228 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 1517 - 1277
Alignment:
Q  228 ggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttga 327  Q
    |||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||| |||||  |||||| || || ||||| ||||||||||| |    
T  1517 ggtgttactaacgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaatttttcatgcttttctggataaattcgtggtagtattcattgatgatattttaa 1418  T
Q  328 tttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaatt 427  Q
    |||| || ||||||||||| || ||||| || ||||||| |||||| || || || |||||||| |||||  | ||||| |||||||| ||||| || ||    
T  1417 tttattctaagactgaagaggagcatgcagaacatctgaggattgtattacaggttttgaaagaaaagaagttgtatgctaaattgtcaaaatgcgagtt 1318  T
Q  428 ctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
     ||||| |  || || ||||| ||||||||| |||||||||    
T  1317 ttggttaagtgaagtaagtttccttggccatattatttctg 1277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0894 (Bit Score: 61; Significance: 6e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0894
Description:

Target: scaffold0894; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 349 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 3998 - 3882
Alignment:
Q  349 aacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttt 448  Q
    |||||||||||||| ||||| |  | ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||| || |||||    
T  3998 aacatgctgagcatttgaaggtgattttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctatgtgtgaattctggttaaaagaagtaagttt 3899  T
Q  449 tcttggccatgttattt 465  Q
    |||| | ||||||||||    
T  3898 tcttagacatgttattt 3882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 3)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 26 - 235
Target Start/End: Original strand, 18394 - 18603
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    |||||||||||| || || || ||||| |||||||||| |||| | |||||||| |||||||| || || |||||||||   ||||| || || || ||     
T  18394 tcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacatccgaggattgatgacttgatggaccaattggtgggtgcaaaagtttttagtaagatcgac 18493  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||| |||| || || ||||| || || |||||||||||||||||||| || || ||||  || |||||||| || ||||| ||||| |||||||    
T  18494 ttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttagaacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctt 18593  T
Q  226 ttggtgttac 235  Q
    | ||||||||    
T  18594 tcggtgttac 18603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 72 - 468
Target Start/End: Original strand, 9831 - 10242
Alignment:
Q  72 attgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgc 171  Q
    |||||||| |||||||| ||||| |||||||||   ||||| || || || || ||||||||| |||| || || ||||| || || |||||||||||||    
T  9831 attgatgacttgatggaccagttggtgggtgcaaaagtttttagtaagatcgacttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaagatatgc 9930  T
Q  172 agaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcg 271  Q
    ||||||| || || || |  || |||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| |||||||||||||| ||    
T  9931 agaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaatgcgccaggtgtgttcatggagtatatgaaccg 10030  T
Q  272 catcttccatgcatttttggat-----cg----------attcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgct 356  Q
     || || ||||| ||| ||| |     ||          |||||| || || || || |||||||| || ||||| || ||||||||||| || |||||     
T  10031 aatttttcatgcttttctggttaaattcgttctggttaaattcgtggtggtatttattgatgatatgttaatttattctaagactgaagaggagcatgca 10130  T
Q  357 gagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggcc 456  Q
    || ||||||| |||||| || |  || |||||||| |||||  | |||||||||||||| |||||||| || ||||| |  || || ||||| |||||||    
T  10131 gaacatctgaggattgtgttacgtgttttgaaagaaaagaagttgtatgccaaattgtcaaaatgtgagttttggttaagtgaagtaagtttccttggcc 10230  T
Q  457 atgttatttctg 468  Q
    || |||||||||    
T  10231 atattatttctg 10242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 26 - 104
Target Start/End: Original strand, 5760 - 5838
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgca 104  Q
    |||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  5760 tcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttgatggaccagttggtgggtgca 5838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 192 - 429
Target Start/End: Original strand, 14790 - 15027
Alignment:
Q  192 cgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttgg 291  Q
    ||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||||| || || ||||| || ||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||| |||    
T  14790 cgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtttttatggagtacatgaatctaatcttccatgcttttctgg 14889  T
Q  292 atcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaaga 391  Q
    ||   || || || ||||| || ||||||||||| || || ||||||| ||| || || ||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||    
T  14890 ataagtttgttgtggtgtttattgatgatattttaatctattccaagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagtgttgaagga 14989  T
Q  392 gaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattct 429  Q
     ||||   | ||||| || ||||| |||||||| ||||    
T  14990 aaagaggttgtatgcaaagttgtcgaaatgtgagttct 15027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 255 - 457
Target Start/End: Original strand, 416 - 618
Alignment:
Q  255 atggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatg 354  Q
    |||||||||||||| || || |||||||| | | |||||  ||| || |||||||| || ||||| ||| |||| || || | |||||||||| | |||     
T  416 atggagtatatgaaccgaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacattctgatctattcaaggactgaagaatagcatt 515  T
Q  355 ctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttgg 454  Q
    | || |||||||||||||| |||||  | ||||||||||| ||  | ||||| || ||||| || ||||| |||||||| |  || ||||||||||||||    
T  516 cagaacatctgaagattgtgttgcagattttgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaagtgagttttcttgg 615  T
Q  455 cca 457  Q
    |||    
T  616 cca 618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 195 - 394
Target Start/End: Original strand, 12379 - 12578
Alignment:
Q  195 tatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatc 294  Q
    |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||| ||| || || |||||||| |  |||||      
T  12379 tatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatacgaaccgaattttccatgcttacttggaaa 12478  T
Q  295 gattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaa 394  Q
     ||| || ||||| || || ||| ||||| |||| || || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  12479 aatttgtggttgtatttattgataatattctgatctattcaaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtgttgcaattattgaaagagaa 12578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 54; Significance: 8e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 195 - 468
Target Start/End: Original strand, 16229 - 16502
Alignment:
Q  195 tatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatc 294  Q
    |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || || ||||| |||||  | ||||||||||| || || |||||||| |   |||||     
T  16229 tatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtgttcctagagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggata 16328  T
Q  295 gattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaa 394  Q
     |||||| |||||||| || ||||||||| ||||||| || ||||||||| |||  ||||  || ||||||||||| || |||||| | ||||| || ||    
T  16329 aattcgtggttgtgtttattgatgatattctgatttattcaaagactgaaaaagtgcatgtagaacatctgaagatagtattgcaaatattgaaggaaaa 16428  T
Q  395 gaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    |||  | ||||| || ||||| || ||||| |||||||| |  || || ||||||||||||||  |||||||||    
T  16429 gaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaagtaagttttcttggccacattatttctg 16502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 26 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 606 - 165
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    ||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||||| | | || ||||||   || || || || ||||||    
T  606 tcagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatctgctggttggtgcagaggtgtttagtaagattgat 507  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||| | ||||||||||||| |||||| |  ||||||||    || || || ||| ||| | | ||||| |||||||| |||   || ||| | |    
T  506 ttgagatcaggatatcaccagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaaccgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgtcat 407  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    |||| ||  | ||||| || || || |||||||| || |||||| | || || ||| | | | |||| || || || || ||||| || |||||||||||    
T  406 ttggagtatctaatgcgccaggtgtttttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgtttatagatgatatttt 307  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
    | | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||  |  | | ||| || || ||||| |||||     
T  306 ggtgtattcgaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagttttgaaagagaaccagttatgtgctaagttttctaagtgtgag 207  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttct 467  Q
    || |||||||| || |||||||| ||||| ||| | ||||||    
T  206 ttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatttgatttct 165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 26 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 7548 - 7107
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    ||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||| | || ||||||   || || || || ||||||    
T  7548 tcagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatatgatggatcagctggttggtgcataggtgtttagtaagattgat 7449  T
Q  126 ttgaggtcaagttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||| | ||||| ||||||| |||||| |  ||||||||    || || || ||| ||| | | ||||| |||||||| |||   || ||| | |    
T  7448 ttgagatcaggatatcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaaccgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgtcat 7349  T
Q  226 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    |||| ||  | ||||| || || || |||||||| || |||||| | || || ||| | | | |||| || || || || ||||| || |||||||||||    
T  7348 ttggagtatctaatgcgccaggtgtttttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgtttatagatgatatttt 7249  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaa 425  Q
    | | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||  |  | | ||| || |||||||| |||||     
T  7248 ggtgtattcgaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttatgtgctaagttgtctaagtgtgag 7149  T
Q  426 ttctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttct 467  Q
    || |||||||| || |||||||| ||||| ||| | ||||||    
T  7148 ttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatttgatttct 7107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 26 - 134
Target Start/End: Original strand, 9865 - 9973
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||||||| | |||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| || || || |||||     
T  9865 tcagttgaataaggttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcacttagtgggtgctcgtgtgtttagtaagattgac 9964  T
Q  126 ttgaggtca 134  Q
    |||||||||    
T  9965 ttgaggtca 9973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 26 - 134
Target Start/End: Original strand, 17532 - 17640
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgat 125  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||||||| | |||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| || || || |||||     
T  17532 tcagttgaataaggttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcacttagtgggtgctcgtgtgtttagtaagattgac 17631  T
Q  126 ttgaggtca 134  Q
    |||||||||    
T  17632 ttgaggtca 17640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 157
Target Start/End: Original strand, 1797 - 1926
Alignment:
Q  28 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgattt 127  Q
    |||||||||| || || || | |||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| || ||||||   || || ||||| ||||||||    
T  1797 agttgaacaaagtgacgattatgaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagttggttggtgcagaggtgtttagcaagattgattt 1896  T
Q  128 gaggtcaagttatcaccagattaaagtaaa 157  Q
    ||| ||| | ||||| ||||||| ||||||    
T  1897 gagatcaggatatcatcagattagagtaaa 1926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 375 - 468
Target Start/End: Original strand, 23339 - 23432
Alignment:
Q  375 ttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    |||||||||||||| || |||||  | |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |  || || ||||||||||||||| |||||||||    
T  23339 ttgcaagtgttgaaggaaaagaaggtgtatgccaagttgtccaaatgtgaattctggttaagtgaagtaagttttcttggccatattatttctg 23432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 351 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 195310 - 195193
Alignment:
Q  351 catgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttc 450  Q
    ||||| || ||||||| |||||| ||||||||  |||||||||| ||  | ||||| || ||||| ||||||||||||||||| |  || ||||||||||    
T  195310 catgcagaacatctgaggattgtattgcaagtactgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaaatgtgaattctggttaagtgaagtgagttttc 195211  T
Q  451 ttggccatgttatttctg 468  Q
    |||||||  |||||||||    
T  195210 ttggccacattatttctg 195193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 28 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 16451 - 16387
Alignment:
Q  28 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcag 92  Q
    ||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  16451 agttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccgaggattgatgatttgatggatcag 16387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0697 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0697
Description:

Target: scaffold0697; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 401 - 468
Target Start/End: Original strand, 6939 - 7006
Alignment:
Q  401 ttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || | ||||||||| |||||||||||||    
T  6939 ttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttaaaagaagtaatttttcttggacatgttatttctg 7006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000007; HSPs: 3)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 27 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 26721 - 26651
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagt 97  Q
    |||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||| |||||| | |||||| |||||||||||||||||||    
T  26721 cagttgaacatggtgactataaagaattggtatccgcttccgaggattgattatttgatggatcagttagt 26651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 92
Target Start/End: Original strand, 1865 - 1929
Alignment:
Q  28 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcag 92  Q
    |||||||||| || || || |||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  1865 agttgaacaaagtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcag 1929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 465
Target Start/End: Original strand, 2143 - 2302
Alignment:
Q  306 gtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatg 405  Q
    ||||| || |||||||||||| | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||| | ||||| || |||||||||||  |  | | ||    
T  2143 gtgttaatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattatgttgcaggtcttgaaagagaaccagttatgtg 2242  T
Q  406 ccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttattt 465  Q
    | || |||||||| ||||| || |||||| | || |||||||| ||||| ||||| ||||    
T  2243 ctaagttgtctaagtgtgagttttggttggaggaagtgagtttccttggtcatgtgattt 2302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 104
Target Start/End: Original strand, 1533 - 1610
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgca 104  Q
    ||||||||||| || || || |||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  1533 cagttgaacaaagtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagttggttggtgca 1610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 306 - 382
Target Start/End: Original strand, 1812 - 1888
Alignment:
Q  306 gtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagt 382  Q
    ||||| || |||||||||||| | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||    
T  1812 gtgtttatagatgatattttggtgtattcgaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagt 1888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1488 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1488
Description:

Target: scaffold1488; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 103
Target Start/End: Original strand, 715 - 791
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgc 103  Q
    |||||||||||||| || || |||||| |||||||  ||||| | ||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  715 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccgattccgaggattgatgatttgatggatcagttggttggtgc 791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0876
Description:

Target: scaffold0876; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 92
Target Start/End: Original strand, 859 - 923
Alignment:
Q  28 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcag 92  Q
    ||||||||||||| || || |||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  859 agttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccgcttccgaggattgatgatttgatggatcag 923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 306 - 394
Target Start/End: Original strand, 1137 - 1225
Alignment:
Q  306 gtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaa 394  Q
    ||||| || |||||||||||| | || || ||| |||| || || |||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||| |||||    
T  1137 gtgtttatagatgatattttggtgtattcgaagtctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaggagaa 1225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 27 - 94
Target Start/End: Original strand, 4838 - 4905
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagtt 94  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||||  |||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  4838 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatctgcttccgaggattgatgatttgatggatcagtt 4905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 7135 - 7008
Alignment:
Q  30 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaattgatttga 129  Q
    ||||||||||| || || || ||| |||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| | || ||||||   || || || || ||||||||||    
T  7135 ttgaacaaggtgacgattaaaaatcggtatccacttcagaggattgatgatttgatggatcagctggttggtgcagaggtgtttagtaagattgatttga 7036  T
Q  130 ggtcaagttatcaccagattaaagtaaa 157  Q
    | ||| | ||||| ||||||| ||||||    
T  7035 gatcaggatatcatcagattagagtaaa 7008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 366 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 36168 - 36069
Alignment:
Q  366 aagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttattt 465  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| |||||  | |||||||| ||||| || ||||| |||||||| |  || || ||||||||||||||| ||||||    
T  36168 aagattgtattgcaagtattgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtcaaagtgtgagttctggttaagtgaagtaagttttcttggccatattattt 36069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 27 - 104
Target Start/End: Original strand, 13537 - 13614
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgca 104  Q
    ||||||||||| || || || ||||||  ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  13537 cagttgaacaaagtgacgattaagaatgagtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagttggtgca 13614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 411 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 2274 - 2218
Alignment:
Q  411 ttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttct 467  Q
    |||||||| ||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  2274 ttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagttttcttggtcatgttatttct 2218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 384 - 468
Target Start/End: Original strand, 242 - 326
Alignment:
Q  384 ttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttctg 468  Q
    |||||||| |||||  | |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |  || || ||||||||||||||| |||||||||    
T  242 ttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtccaaatgtgaattttggttaagtgaagtaagttttcttggccatattatttctg 326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 486 - 422
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgtgaattgatgatttgatggatca 91  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||| || |||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  486 cagttgaacaaagtaacgattaagaatcggaatccacttccgaagattgatgatttgatggatca 422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0827 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0827
Description:

Target: scaffold0827; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 173 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 5354 - 5259
Alignment:
Q  173 gaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaa 268  Q
    |||||| || |||||||  ||||||||||| ||||| |||   || ||||||||||| ||  |||| || || |||||||||||||||||||||||    
T  5354 gaagactgccttcagaagccgttatggtcattatgagtattcggtgatgccttttggagtgtccaacgcgccaggagtgtttatggagtatatgaa 5259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 61
Target Start/End: Original strand, 2838 - 2873
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatcc 61  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2838 tcagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatcc 2873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0062 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0062
Description:

Target: scaffold0062; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 252 - 451
Target Start/End: Original strand, 8920 - 9119
Alignment:
Q  252 tttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaac 351  Q
    ||||||||||| ||||| |  || |||||||| ||| |||||   || || || ||||| || |||||||| || || || ||||||| ||| || || |    
T  8920 tttatggagtacatgaaccaaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatattaatatattccaagaatgaggaggagc 9019  T
Q  352 atgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttct 451  Q
    |||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||| || ||||   | ||||| || || || |||||||| |||||||| || || || ||||||||    
T  9020 atgcagagcatctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttatcaaaatgtgagttctggttaaatgaagtaagttttct 9119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1208 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1208
Description:

Target: scaffold1208; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 195 - 269
Target Start/End: Original strand, 1769 - 1843
Alignment:
Q  195 tatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaat 269  Q
    ||||||||||| ||||||   |||||||||||||| || || |||||||| |||||||| |||||| | ||||||    
T  1769 tatggtcactacgaatatttggttatgccttttggggtgactaatgcaccaggagtgttcatggagcacatgaat 1843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University